Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP015645 | Staphylococcus aureus strain 08-02119 chromosome, complete genome | 7 crisprs | csa3,cas3,DEDDh,DinG,WYL | 3 | 1 | 11 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP015645_1 | 388273-388354 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP015645_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP015645_1
>1.1|388298|32|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder GGTCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015645_1
The CRISPR arrays of NZ_CP015645_1 >merge|NZ_CP015645|1|388273-388354|CRISPRCasFinder TGTTGGGCCCCACCCCAACTTGCATGGTCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCCACCCCAACTTGCAT >NZ_CP015645|1|1|388273-388354|CRISPRCasFinder TGTTGGGCCCCACCCCAACTTGCAT GGTCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGT GTTGGGGCCCCACCCCAACTTGCAT
>NZ_CP015645.1|WP_000160435.1|386878_388177_+|CBS-domain-containing-protein MTKHEQILDYIESLSIGSKISVRKIAKFLNVSEGTAYRAIKDADKMGMVATIDRVGTVRIEKRNRNEIEHLTFNEIVNIIDGQVLGGNKGITKMVSKFAIGAMELKDILKYIGPKTLLIVGNREDVQIEALKRGTAILITGGFKPSNKVINFANEHDLPVLSSSYDTFLVANIINKALFNQKIRKDILIVQDIMTPLDDLSVLFDTMKIADYKRMANRTGHTRFPVVNESYKLVGIVTSREMINTKDDDEIDKVMTRNPIYVNAMSTVASCAHMMIWEGIELIPVVSSNKKTVGVINRQDVLKSMQLLGRQPQMGETINDQIAKYITMNQDGITVEVSPLLINHYGTVSKAAFVSIIEETIQYEMRKFKKGNVMIENLNIVYIKTVPIESHITVRFGILDVGRNFAKIEVNMHSQNDKVASALVICQMFDEV >NZ_CP015645.1|WP_000277602.1|386260_386674_-|universal-stress-protein MYKNILLGVDTQLKNEKALKEVSKLAGEGTVVTVLNAISEQDAQASIKAGVHLNKLTEERSKRLEKTRKALEDYGIDYDQIIVRGNAKEELLKHANSGKYEIVVLSNRKAEDKKKFVLGSVSHKVAKRATIPVLIVK >NZ_CP015645.1|WP_000777188.1|385125_385815_+|metal-dependent-hydrolase MKLSFHGQSTIYLEGNNKKVIVDPFISNNPKCDLNIETVQVDYIVLTHGHFDHFGDVVELAKKTGATVIGSAEMADYLSSYHGVENVHGMNIGGKANFDFGSVKFVQAFHSSSFTHENGIPVYLGMPMGIVFEVEGKTIYHTGDTGLFSDMSLIAKRHPVDVCFVPIGDNFTMGIDDASYAINEFIKPKISVPIHYDTFPLIEQDPQQFKDAVNVGDVQILKPGESVQF >NZ_CP015645.1|WP_000161676.1|383895_384951_-|aminopeptidase-P-family-protein MTKISKIIDELNNQQADAAWITTPLNVYYFTGYRSEPHERLFALLIKKDGKQVLFCPKMEVEEVKASPFTGEIVGYLDTENPFSLYPQTINKLLIESEHLTVARQKQLTSGFNVNSFGDVDLTIKQLRNIKSEDEISKIRKAAELADKCIEIGVSYLKEGVTEREVVNHIEQTIKQYGVNEMSFDTMVLFGDHAASPHGTPGNRRLKSNEYVLFDLGVIYEHYCSDMTRTIKFGEPSKEAQEIYNIVLEAETSAIQAIKPGIPLKDIDHIARNIISEKGYGEYFPHRLGHGLGLQEHEYQDVSSTNSNLLEAGMVITIEPGIYVPGVAGVRIEDDILVTNEGYEVLTHYEK >NZ_CP015645.1|WP_031775021.1|383703_383817_+|hypothetical-protein MNDIDLIHYMLLMNIPAYVFLACLLHIAFRLGQKFMS >NZ_CP015645.1|WP_000689998.1|382461_383580_+|alanine-dehydrogenase MKIGIPREIKNNENRVGLSPSGVHALVESGHTVLVETNAGSGSFFEDVDYKEAGAEIVAEQAKVWDVDMVIKVKEPLESEYPYFKEGLVLFTYLHLANEEKLTQALIDRKVISIAYETVQLPDRSLPLLSPMSEVAGRMSAQVGAEFLQKLNGGMGILLGGVPGVPKGKVTIIGGGQAGTNAAKIALGLGADVTILDVNPKRLQQLDDLFGGRVHTIMSNPLNIELYVKQSDLVIGAVLIPGAKAPRLVTEDMIKQMKNGSVIIDIAIDQGGIFETTDKITTHDDPTYIKHGVVHYAVANMPGAVPRTSTLALNNATLPYALMLANKGYREAFKSNQPLSLGLNTYKGHVTNKGVAEAFEMEYKSVEEALQL >NZ_CP015645.1|WP_000634175.1|381820_382321_-|universal-stress-protein MITYKNILIAVDGSHEAEWAFNRAVGVAKRNDAKLTIVNVIDSRTYSSYEVYDAQFTEKSKHFAEELLNGYKEVATNAGVKDVETRLEFGSPKSIIPKKLAHEINADLIMSGTSGLNAVERFIVGSVSESIVRHAPCDVLVVRTEELPADFQPQVATTQLREKYQN >NZ_CP015645.1|WP_000040063.1|380372_381575_+|acetate-kinase MSKLILAINAGSSSLKFQLIRMPEEELVTKGLIERIGLKDSIFTIEVNGEKVKTVQDIKDHVEAVDIMLDAFKAHNIINDINDIDGTGHRVVHGGEKFPESVAITDEVEKEIEELSELAPLHNPANLMGIRAFRKLLPNIPHVAIFDTAFHQTMPEKAYLYSLPYHYYKDYGIRKYGFHGTSHKFVSQRAAEMLDKPIEDLRIISCHIGNGASIAAIDGGKSIDTSMGFTPLAGVTMGTRSGNIDPALIPFIMEKTGKTAEQVLEILNKESGLLGLSGTSSDLRDLSEEAESGKARSQMALDVFASKIHKYIGSYAARMHGVDVIVFTAGIGENSVEIRAKVLEGLEFMGVYWDPKKNENLLRGKEGFINYPHSPVKVVVIPTDEESMIARDVMTFGGLK >NZ_CP015645.1|WP_000840570.1|379337_380285_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MAEQQTIMERLFHTLDEKAKTLNNENGQSFIENLGLAMEQVYTNDRGLLEQSTLQDRRKAFQFAYLSLMQEEKIQANHQITPDSIGLILGFLVERFMNNQEELHIVDIASGAGHLSATVKEVLPEIAVMHHLIEVDPVLSRVSVHLANFLEIPFDVYPQDAIMSLPLEEADIVIGDFPVGYYPIDERSKEFKLGFEEGHSYSHYLLIEQAINALKDAGYAFLVVPSNIFTGEHVKQLEKYIATETEMQAFLNLPPTLFKNEKARKSILILQKKKSGETKPVEVLLANIPDFKNPSQFQGFMTELNQWMDTNRPKK >NZ_CP015645.1|WP_000136257.1|378720_379215_+|thiol-peroxidase MTEITFKGGPIHLKGQQINEGDFAPDFTVLDNDLNQVTLADYAGKKKLISVVPSIDTGVCDQQTRKFNSEASKEEGIVLTISADLPFAQKRWCASAGLDNVITLSDHRDLSFGENYGVVMEELRLLARAVFVLDADNKVVYKEIVSEGTDFPDFDAALAAYKNI >NZ_CP015645.1|WP_000626070.1|388628_389570_+|pApA-hydrolase-Pde2 MISTLNEIMKCIEDNDTIIIHRHVRPDPDAYGSQLGLKYYIQQKFPQKQVFAVGEAESSLSFIGELDNIDDKTYQDALVIVCDTANAPRIDDERYSTGRKLIKIDHHPAVDQYGDINLVNTNASSTSEIIYDLISHFNDEAIVNKDIASVLYLGIVGDTGRFLFNNTSEHTMEIAGKLIGHDIDHNALLNKMMEKDPKMLPFQGYVLQHFELMDDGFCQVKITEDVLEQFGIHPNEASQFVNTIADIKGLKIWVFAVDEGSEIRCRLRSKGQLIINDIAQDFGGGGHPNASGVSVDSWDEFEQLATALRTKLN >NZ_CP015645.1|WP_000226923.1|389590_392788_+|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MVAYLNIHTAYDLLNSSLKIEDAVRLAVSENVDALAITDTNVLYGFPKFYDACIANNIKPIFGMTIYVTNGLNTVETVVLVKNNDGLKDLYQLSSEIKMNALEHVSFELLKRFSNNMIIIFKKVGDQHRDIVQVFETHNDIYMDHLSISIQGRKHVWIQDVCYQTRQDADTISALAAIRDNTKLDLIHDQEDFGAHFLTEKEIKQLDINQEYLTQVDVIAQKCNAELKYHQSLLPQYETPNDESAKKYLWRVLVTQLKKLELNYDVYLERLKYEYKVITNMGFEDYFLIVSDLIHYAKTNDVMVGPGRGSSAGSLVSYLLGITTIDPIKFNLLFERFLNPERVTMPDIDIDFEDTRRERVIQYVQEKYGELHVSGIVTFGHLLARAVARDVGRIMGFDEVTLNEISSLIPHKLGITLDEAYQIDDFKKFVHRNHRHERWFSICKKLEGLPRHTSTHAAGIIINDHPLYEYAPLTKGDTGLLTQWTMTEAERIGLLKIDFLGLRNLSIIHQILTQVKKDLGINIDIEKIPFDDQKVFELLSQGDTTGIFQLESDGVRSVLKKLKPEHFEDIVAVTSLYRPGPMEEIPTYITRRHDPSKVQYLHPHLEPILKNTYGVIIYQEQIMQIASTFANFSYGEADILRRAMSKKNRAVLESERQHFIEGAKQNGYHEDISKQIFDLILKFADYGFPRAHAVSYSKIAYIMSFLKVHYPNYFYANILSNVIGSEKKTAQMIEEAKKQGITILPPNINESHWFYKPSQEGIYLSIGTIKGVGYQSVKVIVDERYQNGKYKDFFDFARRIPKRVKTRKLLEALILVGAFDAFGKTRSTLLQAIDQVLDGDLNIEQDGFLFDILTPKQMYEDKEELPDALISQYEKEYLGFYVSQHPVDKKFVAKQYLTIFKLSNAQNNKPILVQFDKVKQIRTKNGQNMAFVILNDGIETLDGVIFPNQFKKYEELLSHNDLFIVSGKFDHRKQQRQLIINEIQTLATFEEQKLAFAKQIIIRNKSQIDMFEEMIKATKENANDVMLSFYDETIKQMTTIGYINQKDSMFNNFIQSFNPSDIRLI >NZ_CP015645.1|WP_000058385.1|393237_394467_+|NAD-dependent-malic-enzyme-4 MSLRDEALEMHKRNQGKLEVKPNVKVTNKEELSLAYSPGVAEPCKDIYEDKRKVYDYTIKGNTVAVITDGTAVLGLGNIGPEASIPVMEGKAVLFKSFAGINGVPIALNTTDTEEIIKTVKLLEPNYGGINLEDISAPRCFEIEERLKKETNIPVFHDDQHGTAIVTMAGLVNALRVINKDIAKIKVVLNGAGAAGIAIVKLLYAYGVRNMVMCDSRGAIFEGRSYGMNPTKDVVAKWTNKDKIEGSLEEVVKDADVFIGVSVANALSQDMVKSMADNPIIFAMANPNPEIIPDDAKAAGARVVGTGRSDYPNQINNVLAFPGIFRGALEVEATHINEEMKKAAVEAIADLIDSSELNEDYCIPGPFDKRVAPSVARNVAKAAMESGVARIEVDPQDVYDKTMKLTDLQ >NZ_CP015645.1|WP_000471569.1|394661_395519_+|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-beta MFKDFFNRTKKKKYLTVQDSKNNDVPAGIMTKCPKCKKIMYTKELAENLNVCFNCDHHIALTAYKRIEAISDEGSFTEFDKGMTSANPLDFPSYLEKIEKDQQKTGLKEAVVTGTAQLDGMKFGVAVMDSRFRMGSMGSVIGEKICRIIDYCTENRLPFILFSASGGARMQEGIISLMQMGKTSVSLERHSDAGLLYISYLTHPTTGGVSASFASVGDINLSEPKALIGFAGRRVIEQTINEKLPDDFQTAEFLLEHGQLDKVVHRNDMRQTLSEILKIHQEVTK >NZ_CP015645.1|WP_000883645.1|395518_396463_+|acetyl-CoA-carboxylase-carboxyltransferase-subunit-alpha MLDFEKPLFEIRNKIESLKESQDKNDVDLQEEIDMLEASLERETKKIYTNLKPWDRVQIARLQERPTTLDYIPYIFDSFMELHGDRNFRDDPAMIGGIGFLNGRAVTVIGQQRGKDTKDNIYRNFGMAHPEGYRKALRLMKQAEKFNRPIFTFIDTKGAYPGKAAEERGQSESIATNLIEMASLKVPVIAIVIGEGGSGGALGIGIANKVLMLENSTYSVISPEGAAALLWKDSNLAKIAAETMKITAHDIKQLGIIDDVISEPLGGAHKDIEQQALAIKSAFVAQLDSLESLSRDEIANDRFEKFRNIGSYIE >NZ_CP015645.1|WP_000717561.1|396731_397700_+|6-phosphofructokinase MKKIAVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRTAIYNEIEVYGVYHGYQGLLNDDIHKLELGSVGDTIQRGGTFLYSARCPEFKEQEVRKVAIENLRKRGIEGLVVIGGDGSYRGAQRISEECKEIQTIGIPGTIDNDINGTDFTIGFDTALNTIIGLVDKIRDTASSHARTFIIEAMGRDCGDLALWAGLSVGAETIVVPEVKTDIKEIADKIEQGIKRGKKHSIVLVAEGCMTAQDCQKELSQYINVDNRVSVLGHVQRGGSPTGADRVLASRLGGYAVDLLMQGETAKGVGIKNNKIVATSFDEIFDGKDHKFDYSLYELANKLSI >NZ_CP015645.1|WP_001232648.1|397721_399479_+|pyruvate-kinase MRKTKIVCTIGPASESEEMIEKLINAGMNVARLNFSHGSHEEHKGRIDTIRKVAKRLDKIVAILLDTKGPEIRTHNMKDGIIELERGNEVIVSMNEVEGTPEKFSVTYENLINDVQVGSYILLDDGLIELQVKDIDHAKKEVKCDILNSGELKNKKGVNLPGVRVSLPGITEKDAEDIRFGIKENVDFIAASFVRRPSDVLEIREILEEQKANISVFPKIENQEGIDNIAEILEVSDGLMVARGDMGVEIPPEKVPMVQKDLIRQCNKLGKPVITATQMLDSMQRNPRATRAEASDVANAIYDGTDAVMLSGETAAGLYPEEAVKTMRNIAVSAEAAQDYKKLLSDRTKLVETSLVNAIGISVAHTALNLNVKAIVAATESGSTARTISKYRPHSDIIAVTPSEETARQCSIVWGVQPVVKKGRKSTDALLNNAVATAVETGRVSNGDLIIITAGVPTGETGTTNMMKIHLVGDEIANGQGIGRGSVVGTTLVAETVKDLEGKDLSDKVIVTNSIDETFVPYVEKALGLITEENGITSPSAIVGLEKGIPTVVGVEKAVKNISNNMLVTIDAAQGKIFEGYANVL >NZ_CP015645.1|WP_000818526.1|399826_401188_-|amino-acid-permease MAEKLQRELSNRHIQLIAIGGAIGTGLFLGAGQTIALTGPSILLTYIIIGFMLFMFMRGLGEIIIQNTEFKSFADVTNTYIGPFAGFVTGWTYWFCWIITGMAEVTAVAKYVSFWFPEIPNWISALFCVLLLMSFNLLSARLFGELEFWFSIIKIATIIGLIVVGFVMILFAFKTQFGHASFTNLYEHGIFAKGASGFFMSFQMALFSFVGIEMIGVTAGETKDPVKTIPKAINSVPIRILIFYVGALAVIMSIIPWQQVDPDNSPFVKLFALIGIPFAAGLINFVVLTAAASSCNSGIFSNSRMLFGLSSQQQAPPNFSKTNKYGVPHVAIFASSALLLVAALLNYIFPDATKVFTYVTTISTVLFLVVWGLIIIAYINYSRKNPDLHKNATYKLLGGKYMGYLIFVFFIFVFGLLFINVDTRRAIYFIPIWFILLAFMYLRYKRIAVKSNK >NZ_CP015645.1|WP_000829165.1|401535_402657_+|citrate-synthase MAELQRGLEGVIAAETKISSIIESQLTYAGYDIDDLAENAQFEEVIFLLWNYRLPNEEELAHLKGKLNQYMTLNPRVYTHFEEYVTDHVHPMTALRTSLSYIAHFDPDAENESDENRYERAMRIQAKVASLVTAFARVRQDKDPLKPNPDLSYAANFLYMLRGELPTDIEVEAFNKALILHADHELNASAFTARCAVSSLSDMYSGIVAAVGSLKGPLHGGANEQVMTMLSEIGSIENVDAYLDEKFANKDKVMGFGHRVYKDGDPRAKYLREMSRQITKDAGREELFEMSVKMEKRMAEEKGLIPNVDFYSASVYHCMEIPHDLFTPIFAVSRSAGWIAHILEQYKDNRIMRPRAKYIGETNRKYIPLEERK >NZ_CP015645.1|WP_000123164.1|402705_403974_+|NADP-dependent-isocitrate-dehydrogenase MTAEKITQGTEGLNVPNEPIIPFIIGDGIGPDIWKAASRVIDAAVEKAYNGEKRIEWKEVLAGQKAFDTTGEWLPQETLDTIKEYLIAVKGPLTTPIGGGIRSLNVALRQELDLFTCLRPVRWFKGVPSPVKRPQDVDMVIFRENTEDIYAGIEFKEGTTEVKKVIDFLQNEMGATNIRFPETSGIGIKPVSKEGTERLVRAAIQYAIDNNRKSVTLVHKGNIMKFTEGSFKQWGYDLALSEFGDQVFTWQQYDEIVEKEGRDAANAAQEKAEKEGKIIIKDSIADIFLQQILTRPAEHDVVATMNLNGDYISDALAAQVGGIGIAPGANINYETGHAIFEATHGTAPKYAGLNKVNPSSVILSSVLMLEHLGWQEAADKITDSIEDTIASKVVTYDFARLMDGAEEVSTSAFADELIKNLK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP015645_2 | 474407-474492 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP015645_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP015645_2
>2.1|474434|32|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder AGCTGACCAAAAGTCAGCTTTCAATAATGTGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015645_2
The CRISPR arrays of NZ_CP015645_2 >merge|NZ_CP015645|2|474407-474492|CRISPRCasFinder AAGTTGGGGACGGGGCCCCAACACAGAAGCTGACCAAAAGTCAGCTTTCAATAATGTGCAAGTTGGGGATGGGGCCCCAACACAGA >NZ_CP015645|2|2|474407-474492|CRISPRCasFinder AAGTTGGGGACGGGGCCCCAACACAGA AGCTGACCAAAAGTCAGCTTTCAATAATGTGC AAGTTGGGGATGGGGCCCCAACACAGA
>NZ_CP015645.1|WP_000066097.1|473105_474224_+|tRNA-2-thiouridine(34)-synthase-MnmA MSNKDIRVVVGMSGGVDSSVTAHVLKEQGYDVIGIFMKNWDDTDENGVCTATEDYNDVIEVCNQIGIPYYAVNFEKEYWDKVFTYFLDEYKKGRTPNPDVMCNKEIKFKAFLDHAMNLGADYVATGHYARIHRHEDGHVEMLRGVDNNKDQTYFLNQLSQQQLSKVMFPIGDIEKSEVRRIAEEQGLVTAKKKDSTGICFIGEKNFKTFLSQYLPAQPGDMITLDGKKMGKHSGLMYYTIGQRHGLGIGGDGDPWFVVGKNLKDNVLYVEQGFHHDALYSDYLIASDYSFVNPEDNDLDQGFECTAKFRYRQKDTKVFVKRENDHALRVTFAEPVRAITPGQAVVFYQGDVCLGGATIDDVFKNEGQLNYVV >NZ_CP015645.1|WP_064646626.1|471962_473105_+|cysteine-desulfurase MEIYADYAATTPVKPEVVDAMMTIYNSHYGNPSSIHAKGRDARKYLDESRRQIAQLLGADTHEIIFTSGATESNNTAIKGIVKANEQLGNHIITSKIEHHSVLNVFEQLEREGFDVTYLDVDDTGAIDLDQLEETITDKTILVSIMFVNNEVGTVQQIYDIQDIIAETNAYFHVDAVQAIGHLDVKFDEFEIDAMSINAHKFGGPKGVGALLVKDHVTLDYPQLGGEQELKRRAGTENLAQIVGMAKALQLAEKNRDDNNIHLMNLKEQFLVKLQERAIPFELNGSMTDATGHIVNLYFPFVEVETMLTLLDMAQIYVSSGSACTAGSTQPSHVLDAMFEDEERSNHSIRFSFNELTTENEINAIVAEIHKIYFKFKEES >NZ_CP015645.1|WP_000985872.1|470637_471651_-|LLM-class-flavin-dependent-oxidoreductase MAIKYSALNLVPIREGDDEQTAINDMVNLAQHLDELSYERYWIAEHHNAPNLVSSATALLIQHTLEHTKHIRVGSGGIMLPNHAPLIVAEQFGTMATLFPNRVDLGLGRAPGTDMMTASALRRDQHDGVYKFPEEVSLLQQYFGPAHQQAYVRAYPAVGKNVPLYILGSSTDSAHLAARKGLPYVFAGHFAPQQMKEAIEIYKTLFEPSDVLDEPYVIVCLNTIVAENDDEAQYLASSMAQVMVSITRGRMQPVQPPTHELQNILTPREYAMAMERQKISLIGSENTVQQKIQDFMETYGEVNEIMAISYIYDKDMQLDSYRRFKNVINQINEKNTL >NZ_CP015645.1|WP_000009238.1|470254_470401_+|hypothetical-protein MSFMDKAKDAVEKFKNSDNEQVKNVKDKINEYTGSNNEEKKENEDKEK >NZ_CP015645.1|WP_000752909.1|470032_470215_+|CsbD-family-protein MADESKFDQFKGNVKETVGNVTDNKELEKEGQQDKATGKAKEVVENAKNKITDAIDKLKK >NZ_CP015645.1|WP_000704122.1|469510_469933_+|Rrf2-family-transcriptional-regulator MKISTKGRYGLTLMISLAKKEGQGCISLKSIAEENNLSDLYLEQLVGPLRNAGLIRSVRGAKGGYQLRVPAEEISAGDIIRLLEGPITFVESIESEPPAQKQLWIRMRDAVRDVLDNTTLKYLAEYVDTSEDLDGYMFYI >NZ_CP015645.1|WP_000102740.1|468151_469426_-|replication-associated-recombination-protein-A MSTEPLASRMRPKNIDEIISQQHLVGPRGIIRRMVDTKKLTSMIFYGPPGIGKTSIAKAISGSTQYKFRQLNAVTNTKKDMQLVVEEAKMSGQVILLLDEIHRLDKAKQDFLLPHLENGKIVLIGATTSNPYHAINPAIRSRAQIFELYPLNDEDVRQALTRAIEDEENGLKTYQPKIDEDAMTYFSTQSQGDVRSALNALELAVLSADNDKDGYRHVTLQDAKDCLQKGAFVSDKDGDMHYDVMSAFQKSIRGSDVNAALHYLARLIEAGDLPTIVRRLLVISYEDIGLASPNAGQRTLAAIESAERLGLPEARIPLSQAVIELCLSPKSNSAMSAIDSALSDIRNGHVGQIPNHLKDGHYQGAKDLGRSIGYKYPHQYVNGYVSQQYLPDKLKNKIYYEPKTTSKSEQQLKEIYNNLLKQRP >NZ_CP015645.1|WP_000682646.1|467217_467991_+|tRNA-threonylcarbamoyladenosine-dehydratase MKHQFSRNELAIGQQGLDLLKQQTVVILGVGGVGSFAAEALARTNIGHIILIDKDDVDITNVNRQLHALTTTVGQSKVSLMEERIKLINPDCKVTPLHMFYTEETYEEIFDNYDIDYFVDASDTIMYKVHLMKECLDRGIKVISSMGAANKTDPTRFTISDISKTHTDPMAKIIRQKLKKLGIRKGIPVVFSDESPIVIREDVKDIVGDKNAINRKGQMPPSSNAFVPSVVGLICASYVVNDVLKDIPVRRIKDKGQ >NZ_CP015645.1|WP_001808243.1|467089_467218_+|hypothetical-protein MGLIAFNKCFLVEFWENNQSDNAKYKILSYYVLMYKSVKEVK >NZ_CP015645.1|WP_064646625.1|464990_466757_+|aspartate--tRNA-ligase MSKRTTYCGLVTEAFLGQEITLKGWVNNRRDLGGLIFVDLRDREGIVQVVFNPAFSEEALKIAETVRSEYVVEVQGTVTKRDPETVNPKIKTGQVEVQVTNIKVINKSETPPFSINEENVNVDENIRLKYRYLDLRRQELAQTFKMRHQITRSIRQYLDDEGFFDIETPVLTKSTPEGARDYLVPSRVHDGEFYALPQSPQLFKQLLMISGFDKYYQIVKCFRDEDLRADRQPEFTQVDIEMSFVDQEDVMQMGEEMLKKVVKEVKGVEINGAFPRMTYKEAMRRYGSDKPDTRFEMELIDVSQLGRDMDFKVFKDTVENDGEIKAIVAKGAAEQYTRKYMDALTEFVNIYGAKGLAWVKVVEDGLTGPIGRFFETENVETLLTLTGAEAGDLVMFVADKPNVVAQSLGALRVKLAKELGLIDETKLNFLWVTDWPLLEYDEDAKRYVAAHHPFTSPKEADIAKLGTAPEEAEANAYDIVLNGYELGGGSIRIHDGELQEKMFEVLGFTKEQAQEQFGFLLDAFKYGAPPHGGIALGLDRLVMLLTNRTNLRDTIAFPKTASATCLLTNAPGEVSDKQLEELSLRIRH >NZ_CP015645.1|WP_000567029.1|474803_475472_+|tetratricopeptide-repeat-protein MIDQQTIYQYIQNGKIEEALQALFGNIEENPTIIENYINAGIVLADANEIEKAERFFQKALTIDPKNGVVFFNLANVYYNQQRYQEAIKLYQQALQTEIEQVDCNYMIGMAFNQLESFKLALPYLMTAAELDKDKDAEVQFQYGLVLCQLEMFNEAITQLKHVLTIDKNHVDARYNLGLALFMKNEDIDEVITHFKEAVTIDPKHLLSQHALKTFTKMKEEE >NZ_CP015645.1|WP_001283315.1|475473_477951_+|ATP-dependent-RecD-like-DNA-helicase MSDPTLFDYSMIKGTVEAILFQNSDNFYTVLKVDTIETNEDFDTMPTVVGFLPNIVEGDVYTFKGQVVDHPRYGKQLKAETFEKEMPQTKEAIISYLSSDLFKGVGKKTAQNIVNTLGDNAINDILDDHSVLEKVSGLSKKKQKQIAEQISANQESEKIMIRLHDLGFGPKLSMAIYQFYLGDTLTILDRNPYQLIYDIKGIGFNKADQLARNIGIAYNDNERLKAALLYTLEEECIKQGHTYLPINVVIDLTVDVLNYQDEEVIEPEKLDEMLQYLNEEKRLIIDNEQVAIPSLYYSEIKSVQNLFRIKTHTNKLTEIEQSDLQMHIGEIEDANQVNYAASQKEALQTAINSKVMLLTGGPGTGKTTVIKGIVELYAEIHGLSLDYDDYVNDDYPVVLAAPTGRASKRLQESTGLEAMTIHRLIGWNQDTKPEDILENEINARLIIIDEMSMVDTWLFHQFLSAVPLDAQLIFVGDEDQLPSVGPGQVFKDLIESKAIPRVNLTEVYRQQDGSSIIELAHRMKLGQKIDITQRFHDRSFINCQANQIPTVVEKVVTSAVNKGYTMADIQVLAPMYKGNAGIKRLNQVLQDILNPKKKDTREIEFGDVVFRKGDKVLQLVNRPNDNIFNGDIGVIVGIFWAKENALNKDVLVVDFEGNEITFTKQDMMELTHAYCTSIHKSQGSEFPIVIMPIVKQYFRMLQRPILYTGLTRAKTSLVLLGDPEAFDIGLKTNGQARLTQLCTLLKNYFNSEDEEMLENTATNDTGASQTTIDDQVQAPMSSNDSGEVTSDSTKTDINVLTEATMFKIDPMINMGEITPYDFIER >NZ_CP015645.1|WP_000734070.1|478293_480924_+|alanine--tRNA-ligase MKKLKASEIRQKYLDFFVEKGHMVEPSAPLVPIDDDTLLWINSGVATLKKYFDGRETPKKPRIVNSQKAIRTNDIENVGFTARHHTFFEMLGNFSIGDYFKQEAIEFAWEFLTSDKWMGMEPDKLYVTIHPEDMEAYNIWHKDIGLEESRIIRIEGNFWDIGEGPSGPNTEIFYDRGEAYGQDDPAEEMYPGGENERYLEVWNLVFSEFNHNKDHSYTPLPNKNIDTGMGLERMASVSQNVRTNYETDLFMPIMNEIEKVSGKQYLVNNEQDVAFKVIADHIRTIAFAISDGALPANEGRGYVLRRLLRRAVRFSQTLGINEPFMYKLVDIVADIMEPYYPNVKEKADFIKRVIKSEEERFHETLEDGLAILNELIKKAKATTNEINGKDAFKLYDTYGFPIELTEEIAVQAGLKVDMTTFESEMQQQRDRARQARQNSQSMQVQSEVLKNITSASTFVGYDTATAQTTLTHLIYNGEEVSQVEAGETVYFMLTETPFYAVSGGQVADTGIVYNDNFEIAVSEVTKAPNGQNLHKGVVQFGQVNVGATVSAEVNQNDRRDIQKNHSATHLLHAALKSVLGDHVNQAGSLVEADRLRFDFSHFGPMTNDEIDQVERLVNEEIWKGIDVNIQEMDIASAKEMGAMALFGEKYGDVVRVVNMAPFSIELCGGIHVRNTSEIGLFKIVSESGTGAGVRRIEALTGKAAFLYLEDIQEKFNTMKSQLKVKSDDQVVDKLTQIQDEEKALLKQLEQRDKEITSLKMGNIEDQVEEINGYKVLVTEVDVPNAKAIRSTMDDFKSKLQDTIIILASNVDDKVSMVATVPKSLTNNVKAGDLIKQMAPIVGGKGGGRPDMAQGGGTQPENISKSLSFIKDYIKNL >NZ_CP015645.1|WP_000426912.1|480986_481247_+|IreB-family-regulatory-phosphoprotein MENFDKTMKFDYEELPTQDVRDVLNNVYRTLDERGYNAVNQIVGYLLSGDPAYIPRQNEARNQIRHIDRDVIMEELVSYYLKEQNK >NZ_CP015645.1|WP_000939059.1|481250_481679_+|Holliday-junction-resolvase-RuvX MLQHKILGLDVGSRTVGIAISDIMGWTAQGLDTLRINEENNELGIDQLVDIIKKHNVGTVVIGLPKNMNNSIGFRGEASLTYKEKLLEAYPSIEIVMWDERLSTMAAERSLLEADVSRQKRKQVIDKMAAVFILQGYLDSLH >NZ_CP015645.1|WP_000134779.1|481693_482002_+|DUF1292-domain-containing-protein MTEHNHDSQLEINNEEELLTLFDEEGNEVLYRKVLEFYHPEFKKEYVILAEEGAQSDEDDMIELVPMINEPDESGDGGKLVPIETDEEWDMIEEVVNTEMEE >NZ_CP015645.1|WP_000342266.1|482286_482925_+|O-methyltransferase MDDLNKKYLIDLHQHQNSSIEVLREFAEVNEVPIVDRLTLDLIKQLIRMNNVKNILEIGTAIGYSSMQFASISDDIHVTTIERNETMIQYAKQNLATYHFENQVRIIEGNALEQFENVNDKVYDMIFIDAAKAQSKKFFEIYTPLLKHQGLVITDNVLYHGFVSDIGIVRSRNVRQMVKKVQDYNEWLIKQPGYTTNFLNIDDGLAISIKGE >NZ_CP015645.1|WP_000137775.1|482927_483851_+|U32-family-peptidase MTELLVTPKSLSHMETLIDLGADAFVIGEQKFGLRLPGEFNRQQMTEAVALAHKNDKKVYAAVNGLFHNYHLDAVEDYINFLHEIRVDRIIFGDPAVVMYVKAQENPIPLHWNAETLVTNHFQCNYWGKRGASRAVLARELNLDEIINIKENSNVEIEVQVQGMTCMFQSKRMLLGNYYTFQDRQMKIERRNDEQSLLLYDEERQNNYPVYEDYNGTHIMSPNDICLIEELAPFFEAGIDSFKIDGILQTEEYINVVTEQYRQAIDLYNEDPEIYEDEKFMLMDPIEEIQPDHRPFDEGFLYKQTVY >NZ_CP015645.1|WP_000848304.1|483862_485131_+|U32-family-peptidase MKTIEEIKSTPKTVMKKPELLAPAGNLEKLKIAVHYGADAVFLGGQEYGLRSNADNFTMEEIAEGVEFANRYGAKIYVTTNIIAHDENIEGLESYLRNLEKTGATGIIVADPLIIETCKEVAPKLEIHLSTQQSLSNYKAVEYWKEEGLDRVVLARETGAMEMREMKEKVDIEIEAFIHGAMCIAYSGRCTLSNHMTARDSNRGGCCQSCRWDYELLEVDDNGELDVFYNQGEVTPFAMSPKDLKLIESIPQMMDIGVDSLKIEGRMKSIHYIATVVSVYRKVIDAYAADPDNFKINPEWLIELDKCANRDTAPAFFEGTPGYEEQMFGQQQSKKSPFDFCGLVLDYNEDTKIATIQQRNNFKPGQEIEFFGPEIETFTQVVEAIYDEEGNSLDAARHPLQIVQIKVDRPIYPNNMMRKEIG >NZ_CP015645.1|WP_000648617.1|485130_485754_+|uridine-kinase MKATTIIGIAGGSGSGKTTVTNEIMKNLEGHSVALLAQDYYYKDQKHLTFDERLETNYDHPFAFDNDLLIENLKDLKNGKAVEVPTYDYASHTRSDITIDFKPKDVIIVEGIFALENKVLRDMMDVKIYVDTDADLRILRRLTRDTKERGRSMDSVINQYLSVVRPMHDQFIEPTKKYADIIIPEGGSNKVAIDIMTTKIQSLVSKQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP015645_3 | 1035197-1035498 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP015645_3
|
5 spacers
spacers of NZ_CP015645_3
>3.1|1035215|38|NZ_CP015645|CRT AGAAATTGGGGTTCCAATTTCTCTATGTTGGGGCCCCG >3.2|1035271|39|NZ_CP015645|CRT TAAGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCCG >3.3|1035328|38|NZ_CP015645|CRT TGGAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTGTTGTGGCCCCG >3.4|1035384|39|NZ_CP015645|CRT TATGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTGTGTTGGGCCCCACC >3.5|1035441|40|NZ_CP015645|CRT TGGAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTGTTGTGGCCCCACC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015645_3
The CRISPR arrays of NZ_CP015645_3 >merge|NZ_CP015645|3|1035197-1035498|CRT CCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGGGTTCCAATTTCTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTTTTGTAAGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCCGCCAACTTGCATTGTTTGTTGGAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTGTTGTGGCCCCGCCAACTTGCACATTTTTGTATGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTGTGTTGGGCCCCACCCCAACTTGCATTGTCTGTTGGAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTGTTGTGGCCCCACCCCAACTTGCATTGTTTGT >NZ_CP015645|3|1|1035197-1035498|CRT CCAACTTGCATTGTCTGT AGAAATTGGGGTTCCAATTTCTCTATGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCACATTTTTG TAAGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCCG CCAACTTGCATTGTTTGT TGGAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTGTTGTGGCCCCG CCAACTTGCACATTTTTG TATGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTGTGTTGGGCCCCACC CCAACTTGCATTGTCTGT TGGAATTGGTGATCCTATTTCTCTCTGTTGTGGCCCCACC CCAACTTGCATTGTTTGT
>NZ_CP015645.1|WP_001032816.1|1034844_1035030_+|hypothetical-protein MNKHINKKASKLLEDYKKVQQRKSEETDKGCLKSVIMLIVLFFLIIFGIVACSTNVNFFFQ >NZ_CP015645.1|WP_000231631.1|1033989_1034223_+|hypothetical-protein MVFNDWEINVVYSGEHEVVANEKSLFVIDEFYDVAIAIYYLDGKLKVAHVNYGSDFTIDVANKVFELNIQNPNVDEH >NZ_CP015645.1|WP_000857488.1|1032553_1033513_+|alpha-hemolysin MKTRIVSSVTTTLLLGSILMNPVANAADSDINIKTGTTDIGSNTTVKTGDLVTYDKENGMHKKVFYSFIDDKNHNKKLLVIRTKGTIAGQYRVYSEEGANKSGLAWPSAFKVQLQLPDNEVAQISDYYPRNSIDTKEYMSTLTYGFNGNVTGDDTGKIGGLIGANVSIGHTLKYVQPDFKTILESPTDKKVGWKVIFNNMVNQNWGPYDRDSWNPVYGNQLFMKTRNGSMKAAENFLDPNKASSLLSSGFSPDFATVITMDRKASKQQTNIDVIYERVRDDYQLHWTSTNWKGTNTKDKWTDRSSERYKIDWEKEEMTN >NZ_CP015645.1|WP_000765708.1|1031734_1031881_-|hypothetical-protein MKLFYIVFLIIIWLNIFLGNEIIHTLTVLITTLYIVNSRKGIKNDRVE >NZ_CP015645.1|WP_077448298.1|1031553_1031778_-|hypothetical-protein MLIQERGLKMTELNNIINFLQSLFESESGYKISKNSGVPYQTVQDLRNGKTKLEDARFRTIIKLYSYYVSLKEH >NZ_CP015645.1|WP_000041896.1|1030448_1031165_+|superantigen-like-protein-SSL12 MSKNITKNIILTTTLLLLGTVLPQNQKPVFSFYSEAKAYSIGQDETNINELIKYYTQPHFSFSNKWLYQYDNGNIYVELKRYSWSAHISLWGAESWGNINQLKDRYVDVFGLKDKDTDQLWWSYRETFTGGVTPAAKPSDKTYNLFVQYKDKLQTIIGAHKIYQGNKPVLTLKEIDFRAREALIKNKILYNENRNKGKLKITGGGNNYTIDLSKRLHSDLANVYVKNPNKITVDVLFD >NZ_CP015645.1|WP_001063554.1|1029615_1030341_+|superantigen-like-protein-SSL13 MNNNITKKIILSTTLLLLGTAFTQFPNTPINSSSEAKAYYINQNETNVNELTKYYSQKYLTFSNSTLWQKDNGTIHATLLQFSWYSHIQVYGPESWGNINQLRNKSVDIFGIKDQETIDSFALSQETFTGGVTPAATSNNKHYKLNVTYKDKAETFTGGFPVYEGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKSKKLYNNSYNKGQIKITGADNNYTIDLSKRLPSTDANRYVKKPQNAKIEVILEKSN >NZ_CP015645.1|WP_000739542.1|1028795_1029548_+|superantigen-like-protein-SSL14 MKKNIMNKLVLSTALLLLGTTSTQLPKTPISFSSEAKAYNISENETNINELIKYYTQPHLSLSNKWLWQKPNGSIHATLQTWVWYSHIQVFGSESWGNINQLRNKYVDIFGTKDEDTVEGYWTYDETFTGGVTPAATSSDKPYRLFLKYSDKQQTIIGGHEFYKGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKNKKLYNGEFNKGQIKITVDGNNYTIDLSKKLKLTDTNRYVKNPKNAQIEVILEKSNQPITFCKCG >NZ_CP015645.1|WP_000793602.1|1027356_1028358_-|ornithine-carbamoyltransferase MKNLRNRSFLTLLDFSRQEVEFLLTLSEDLKRAKYIGTEKPMLKNKNIALLFEKDSTRTRCAFEVAAHDQGANVTYLGPTGSQMGKKETTKDTARVLGGMYDGIEYRGFSQRTVEILAEYSGVPVWNGLTDEDHPTQVLADFLTAKEVLKKDYADINFTYVGDGRNNVANALMQGAAIMGMNFHLVCPKELNPTDELLNRCKNIAAENGGNILITDDIDQGVKGSDVIYTDVWVSMGEPDEVWKERLELLKPYQVNKEMMDKTGNPNVIFEHCLPSFHNADTKIGQQIFEKYGIREMEVTDEVFESKASVVFQEAENRMHTIKAVMVATLGEF >NZ_CP015645.1|WP_001074342.1|1026401_1027334_-|carbamate-kinase MAKIVVALGGNALGKSPQEQLELVKNTAKSLVGLITKGHEIVISHGNGPQVGSINLGLNYAAEHNQGPAFPFAECGAMSQAYIGYQLQESLQNELHSIGMDKQVVTLVTQVEVDENDPAFNNPSKPIGLFYNKEEAEQIQKEKGFIFVEDAGRGYRRVVPSPQPISIIELESIKTLIKNDTLVIAAGGGGIPVIREQHDGFKGIDAVIDKDKTSALLGANIQCDQLIILTAIDYVYINFNTENQQPLKTTNVDELKRYIDENQFAKGSMLPKIEAAISFIENNPKGSVLITSLNELDAALEGKVGTVIKK >NZ_CP015645.1|WP_000669528.1|1035852_1036203_-|complement-inhibitor-SCIN-family-protein MKFKKYILTGTLALLLSSTAIATIEGNKADASSKKDYIIQSEFHDKRIAEELKSLLDQSYVNDLAAGSLNPYYKRTIMMNQYRAKAALKSNNFAKMAEAKVALENIYKEIDEIINR >NZ_CP015645.1|WP_000791581.1|1036353_1036851_-|complement-convertase-inhibitor-Efb MKNKLIAKSLLTIAAIGITTTTIASTADASEGYGPREKKPVSINHNIVEYNDGTFKYQSRPKFNSTPKYIKFKHDYNILEFNDGTFEYGARPQFNKPAAKTDATIKKEQKLIQAQNLVREFEKTHTVSAHRKAQKAVNLVSFEYKVKKMVLQERIDNVLKQGLVR >NZ_CP015645.1|WP_000584398.1|1037110_1037617_-|hypothetical-protein MIIKILTILLLLCILSYLVTNRKKPFLFLKTLFMGVVFIFIGYISLAISAVIIYGIIQFITIDFGSFFLMGIILILISSIFQLFIVRLLFRKKNVDLTEVVVLEHLIQWFLVYFAIYQAVNEKMDINDINIDNFQSVFFDVSNLNLVILPTLIISWVTIFNYRMRSYK >NZ_CP015645.1|WP_000739570.1|1038286_1038688_+|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein MKKNITKTIIASTVIAAGLSTQTNDAKAFFSYEWKGLEIAKNLADQAKKDDERIDKLMKESDKNLTPYKAETVNDLYLIVKKLSQGDVKKAVVRIKDGGPRDYYTFDLTRPLEENRKNIKVVKNGEIDSIYWD >NZ_CP015645.1|WP_000739211.1|1039057_1039375_-|fibrinogen-binding-protein MKKNFIGKSILSIAAISLTVSTFAGESHAQTKVEKYNEYQTNFKKQVNKKVMDAQKAVNLFKRTRTVATHRKAQRAVNLIHFQHSYEKKKLQRQIDLVLKYNTLK >NZ_CP015645.1|WP_001788629.1|1039568_1039736_-|hypothetical-protein MKRIVILENVIVDDPIWLNHVDYLVKSVLLKSIKLRFQEVRKFEILVKIMNRIHI >NZ_CP015645.1|WP_000049484.1|1039863_1040367_-|metallophosphoesterase MSKWIIVSDNHTESGVLYQIYEMHPDADVYLHLGDSEFAYDDTELSLFNRVKGNCDFYPEFENEAVAKYNDVKAFYTHGHLYQVNRTRDLLAEKGLELGCLFAFYGHTHVAKYEYINGVHVINPGSISQSRSSMEETYAEVIIDDQTLHGTINFKNRHHETISHTTF >NZ_CP015645.1|WP_000659317.1|1040359_1040947_-|XTP/dITP-diphosphatase MKEIVIASNNQGKINDFKVIFPDYHVIGISELIPDFDVEETGSTFEENAILKSEAAAKALNKTVIADDSGLEVFALNGEPGIYSARYAGENKSDEANIEKLLNKLGNTTDRRAQFVCVISMSGPDMETKVFKGTVSGEIADGKYGENGFGYDPIFYVPKLDKTMAQLSKEQKGQISHRRNAINLLQAFLEGDKNV >NZ_CP015645.1|WP_001039659.1|1040958_1041759_-|glutamate-racemase MNKPIGVIDSGVGGLTVAKEIMRQLPNETIYYLGDIGRCPYGPRPGEQVKQYTVEIARKLMEFDIKMLVIACNTATAVALEYLQKTLSIPVIGVIEPGARTAIMTTRNQNVLVLGTEGTIKSEAYRTHIKRINPHVEVHGVACPGFVPLVEQMRYSDPTITSIVIHQTLKRWRNSESDTVILGCTHYPLLYKPIYDYFGGKKTVISSGLETAREVSALLTFSNEHASYTEHPDHRFFATGDPTHITNIIKEWLNLSVNVERISVND >NZ_CP015645.1|WP_000139712.1|1041994_1042810_-|succinate-dehydrogenase-iron-sulfur-subunit MTEQSVKNTPQHETQSKPKQKTVKLIIKRQDTSDSKPYEETFEIPYRENLNVIACLMEIRRNPVNIKGEKTTPVVWDMNCLEEVCGACSMVINGRARQSCSAIVDQLEQPIRLEPMNTFPVIRDLQVDRSRMFDNLKRMKAWIPIDGTYDLGPGPRMPEKKRQTAYELSKCMTCGVCLEVCPNVTENNKFVGAQAISQVRLFNLHPTGSMTKDERLNALMGTGGLQQCGNSQNCVNACPKGIPLTTSIAAMNRETTFHMFKSFFGSDHEVE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP015645_4 | 1143944-1144036 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP015645_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP015645_4
>4.1|1143974|33|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder ATGCATGTGCTCGGTGCATGTATCCCTCTTTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015645_4
The CRISPR arrays of NZ_CP015645_4 >merge|NZ_CP015645|4|1143944-1144036|CRISPRCasFinder CCTTACAACTTTTAGTTGTTAGGGGATTTTATGCATGTGCTCGGTGCATGTATCCCTCTTTTACCTTACAACTTTTAGTTGTTAGGGGCTTTT >NZ_CP015645|4|3|1143944-1144036|CRISPRCasFinder CCTTACAACTTTTAGTTGTTAGGGGATTTT ATGCATGTGCTCGGTGCATGTATCCCTCTTTTA CCTTACAACTTTTAGTTGTTAGGGGCTTTT
>NZ_CP015645.1|WP_000064214.1|1143799_1143934_+|hypothetical-protein MSNENQNKKAAEKAKEVEEKLKDKKEEKTEDINQTKQDIQDTLN >NZ_CP015645.1|WP_000009069.1|1142352_1143648_-|hypothetical-protein MSFLRKHAEIIFSYLIGIVSLFTGLIILINLPLIKQLNGGKKVDTHVHNVWEFLNAFFSEIIKVMSRFIGNFPIVSAIVIIIFGILVMLIGHTLLRTIKYDYDISIFFLVIGIMYFIITLILMTQVYGFFAVIFIIPFTIHIGYIVYKDELNQENVKNHFMWIIVSYGISYLITQIALYGRIDANEIESIDILSVNAFFIIMWLLGQMAIWNFLFLRRALPLTKQELGEEEPELSRTSKGNVTNQTKIHLKQLQDKTTEYARKTRRSVDLDKIRAKRDKFKKKVNDIIDIQEDDIPDWMRKPKWVKPMYVELFCGVVIFLFTFLEFNNRNALFVSGDWKLSQTQYVIEWVTLLILLFIIIAYIATTLTFHLKGKFYYLQLFMGSILFFKLLTEFINIMIHGLLLSVFITPTLLLMLLAIIISYSLQLRERP >NZ_CP015645.1|WP_042909152.1|1140755_1141928_-|class-I-SAM-dependent-rRNA-methyltransferase MKIATLNKGKETKYFNGYPLIEEEDIYSQNHLKEGDIFQIVTDKSQYVATAYVGRQHKGLGWVLTYDKAQEINTAFFVKLFNTALAEREYYFNIDGTNAFRLFNAEGDGVGGLTIDNYDGHLLIQWYSKGIYKFKYAILEAVRKVFDYKSIYEKVRFKDSEYSGGFVEGDAPEFPIVIEENFTFYNVDLEDGLMTGIFLDQKEVRKKLRDQYAKERHVLNLFSYTGAFSVIAASEASSTTSVDLANRSRSLTEENFGLNAIDPKSQYIYVMDTFDFYKYAARHGHSYDTIVIDPPSFARNKKRTFSVQKDYDKLINGALNILSSEGTLLLCTNASVYPLKQFKNTIKKTLEESGVDYELTEVMGLPKDFKTHPHYKPSKYLKAVFVNIRH >NZ_CP015645.1|WP_000505966.1|1140159_1140702_-|hypothetical-protein MGFKNNLTSNLTNKIGNSVFKIENVDGKGAMPTTIQELRERRQRAEAIVKRKSLMSSTMSVVPIPGLDFGVDLKLMKDIIEDVNKIYGLDHKQVNSLGDDVKERIMSAAAIQGSQFIGKRISSAFLKIVIRDVAKRTAAKQTKWFPVVGQAVSASISYYFMNKIGKDHIQKCENVIKNVM >NZ_CP015645.1|WP_000437472.1|1139739_1140006_-|phosphocarrier-protein-HPr MEQNSYVIIDETGIHARPATMLVQTASKFDSDIQLEYNGKKVNLKSIMGVMSLGVGKDAEITIYADGSDESDAIQAISDVLSKEGLTK >NZ_CP015645.1|WP_000040054.1|1138018_1139737_-|phosphoenolpyruvate--protein-phosphotransferase MSKLIKGIAASDGVAIAKAYLLVEPDLTFDKNEKVTDVEGEVAKFNSAIEASKVELTKIRNNAEVQLGADKAAIFDAHLLVLDDPELIQPIQDKIKNENANAATALTDVTTQFVTIFESMDNEYMKERAADIRDVSKRVLSHILGVELPNPSMIDESVVIVGNDLTPSDTAQLNKEFVQGFATNIGGRTSHSAIMSRSLEIPAIVGTKSITQEVKQGDMIIVDGLNGDVIVNPTEDELIAYQDKRERYFADKKELQKLRDADTVTVDGVHAELAANIGTPNDLPGVIENGAQGIGLYRTEFLYMGRDQMPTEEEQFEAYKEVLEAMGGKRVVVRTLDIGGDKELSYLNLPEEMNPFLGYRAIRLCLAQQDIFRPQLRALLRASVYGKLNIMFPMVATINEFREAKAILLEEKENLKNEGHDISDDIELGIMVEIPATAALADVFAKEVDFFSIGTNDLIQYTLAADRMSERVSYLYQPYNPSILRLVKQVIEASHKEGKWTGMCGEMAGDETAIPLLLGLGLDEFSMSATSILKARRQINGLSKNEMTELANRAVDCATQEEVIELVNNYVK >NZ_CP015645.1|WP_001289618.1|1137548_1137782_+|glutaredoxin-like-protein-NrdH MSEIIVYTQNDCPPCTFVKNYLNEHQIDFEERNINNQQYRNEMIDFDAFSTPFILLNGNPMYHVDLDEINKVLNIQD >NZ_CP015645.1|WP_000381849.1|1135989_1137351_-|cytochrome-ubiquinol-oxidase-subunit-I MDTVEISRFLTAMTLAVHIIFATIGVGMPLMFAIAEFLGIRKNDLQYIAMAKRWAKAYTITVAVGVVTGTIIGLQLSLIWPTFMEMGGHVIALPLFMETFAFFFEAIFLSIYLYTWDRFKNKWTHFLISIPVIIGGSFSAFFITSVNSFMNTPAGFELKNGKMVNVQPIEAMFNPSFIVRSFHVITTAGMTMAFVIASIAAFKLLRNRQPKDTVYHKKALKMSMIVGFFSTLLSMLAGDLSAKFLHKFQPEKLAAYEWHFDTSSHAKLLLFGVLDEKTQQVKGAIELPGLLSFLADNSVKTKVQGLNDFPKSLHPPMIVHYFFDLMVTMGILCFVISGVYVLTLMFKKLRKFSTHKWMLYGILLTGPASMLAIEFGWFLTEMGRQPWIVRGYMRVAEAATQAGGITFVTILFGILYIILMYTCAYVLIRMFKNKPAYEDVNRLAKKQGGEIEK >NZ_CP015645.1|WP_000638456.1|1134973_1135993_-|cytochrome-d-ubiquinol-oxidase-subunit-II MIYAFIGITVLWLFLFCYIIIASIDFGAGFFALHSKLTGDEKKINHLISRYLNPVWEVTNVFFVFFFVGFVGFFPESIKYLGTVLLIPGSIALIMISLRNSFYAFENYGQDTKLAWMIMYGVSGLLIPASLSTALTITEGGYINVRNNVIDLDWVQLLLSPFAWSVVFLAIISVLYISSGFLTYYAKKANDEPAYNLTRQWHIFLGPPMIIICLFVFLSLRIQNSEHFYSAVFDYWWMFGISFLFFALASLLTFFKKKHGLAFVFVILQMMFAFFGYGISKLPYLLYPFVKITDAYVNPEMGWTLVIVFILGLLLLLPSLILLLRLFVFDKEYVEGKKS >NZ_CP015645.1|WP_000514290.1|1134178_1134841_-|TrkA-family-potassium-uptake-protein MGKEYVVIGLGRFGGSIVRELNALDMDVMAIDHDENRVNEYSDIATHAVVADTTDEAVMKSLGIRNFDHVIVAIGENIQSSTLTTLILKELGVKKVTAKAQNDYHAKILNKIGADTVVHPERDMGRRIAHNVASASVLDYLELADEHSIVELKATEKMAGQSIIDLDIRAQYGINIIAIKRGKEFIISPNPNINLEIGDILIMIGHDNDLNRFEKNIATR >NZ_CP015645.1|WP_000033477.1|1144517_1145093_+|ECF-transporter-S-component MSKGLKLSEILVTVLISVVFAVIYNLWWFVYNGVQATGLHLEQLTNGVWFMAAIVCYLIIPKPGIALLAEFAAGAGETIIMGRFDIPTIVYAFIQGLACELVFAIFKYQSRSVMVAMLAGFCTAIAAFPIDYFYGYLNEVAGWNLTLFIVFRLISGAVVAGVLSYLLVKALDKTGVTKLFRPAAKEDYDNL >NZ_CP015645.1|WP_000921973.1|1145107_1146508_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKVSDLRLKYPSGQRKIFDHLNITIQDKEKVLLLGPSGCGKSTLLNVLSGIVPNLIELPMKYDELIVDPLSGVIFQDPDSQFCMPKVYEELAFVLENRQVPREDMDALIINALNMVNLNVTPETYIKDLSGGMKQKLAIVETILQQSKTLFLDEPTAMLDVQATEDLWTKLIELWEDQTVVIVEHKVKHIWNHVDRVILMDYNGNIIADECPEIILQKYVHLLSEYGVWHPRAWEFAPSRVDFPTTNSHLLQFKNGRIIRGKSTLLSFSDLEIGLGEWITITGANGSGKTTLLESIMQLIKYQGDVYFENQRLTKIKHAAKHMYLVYQNPELQFITNSVYDEINIHFNHLSKDQSDDETIQLLKLLDLQNVKDQHPYELSIGQKRRLSVATALSSKADIIFLDEPTFGLDSHNTFQLIKLFQKRINLGQSIVMVTHDDEIIERYPSRRLKISDGALLDCDGDTNV >NZ_CP015645.1|WP_000273252.1|1146500_1147307_+|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MYEQWKVRQSFVDDVNIITKLFLGIILFFFIIFVHNFDFMLYITILMLVFLLMFNGTQFKITAIFITISIGFALLSSLFMILYGNGSHTILKFGFIHITTESLVRGLHVSLRTIAISFFGILIALTSQVVMIFYSLMQHLKVKSKVAYAFMAAIRMIPLMISSLIQLRRSLKMRYQMIDAANYRGLKRFKHLIIPLLSQNIRKAHQLSVAMESKGFRDGPRTYYYNVPFSYKDIIFIIVLIAIITLAYYCSITLPITGIDDVRLGRVG >NZ_CP015645.1|WP_042909151.1|1147571_1148819_-|phosphoribosylamine--glycine-ligase MNVLVIGAGGREHALAYKLNQSNLVKQVFVIPGNEAMTPIAEVHTEISESDHQAILDFAKRQNVDWVVIGPEQPLIDGLADILRANGFKVFGPNKQAAQIEGSKLFAKKIMEKYNIPTADYKEVERKKDALTYIENCELPVVVKKDGLAAGKGVIIADTIEAARSAIEIMYGDEEEGTVVFETFLEGEEFSLMTFVNGDLAVPFDCIAQDHKRAFDHDEGPNTGGMGAYCPVPQISDDVLKLTNETIAQPIAKAMLNEGYQFFGVLYIGAILTKNGPKVIEFNARFGDPEAQVLLSRMESDLMQHIIDLDEGKRTEFKWKNESIVGVMLASKGYPDAYEKGHKVSGFDLNENYFVSGLKKQGDTFVTSGGRVILAIGKGDNVQDAQRDAYEKVSQIQSDHLFYRHDIANKALQLK >NZ_CP015645.1|WP_000709277.1|1148840_1150319_-|bifunctional-phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide-formyltransferase/IMP-cyclohydrolase MKKAILSVSNKTGIVEFAKALTQLNYELYSTGGTKRILDEANVPVRSVSDLTHFPEIMDGRVKTLHPAVHGGILADRNKPQHLNELSEQHIDLIDMVVVNLYPFQQTVANPDVTMDEAIENIDIGGPTMLRAAAKNYKHVTTIVHPADYHEVLTRLRNDSLDESYRQSLMIKVFEHTAEYDEAIVRFFKGDKETLRYGENPQQSAYFVRTSNAKHTIAGAKQLHGKQLSYNNIKDADATLALVKKFDTPAAVAVKHMNPCGVGIGDTIEQAFQHAYEADSQSIFGGIVALNRAVTPELAEQLHSIFLEVIIAPKFTDEALDILKQKKNVRLLEIDMTIDSNEEEFVSVSGGYLVQDKDNYVVPKEEMKVVTEVAPTDEQWEAMLLGWKVVPSVKSNAIILSNNKQTVGIGAGQMNRVGAAKIALERAIEINDHVALVSDGFFPMGDTVELAAQHGIKAIIQPGGSIKDQDSIDMANKHGIAMVVTGTRHFKH >NZ_CP015645.1|WP_000238664.1|1150333_1150900_-|phosphoribosylglycinamide-formyltransferase MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRKCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP015645.1|WP_042909150.1|1150902_1151931_-|phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNHPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP015645.1|WP_000483713.1|1151923_1153408_-|amidophosphoribosyltransferase MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_CP015645.1|WP_000032727.1|1153386_1155576_-|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-subunit-PurL MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGDHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP015645.1|WP_000666799.1|1155568_1156240_-|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-I MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP015645_5 | 1276862-1276943 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP015645_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP015645_5
>5.1|1276886|34|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder ATTGGCTCCCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015645_5
The CRISPR arrays of NZ_CP015645_5 >merge|NZ_CP015645|5|1276862-1276943|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGCTCCCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCATCCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA >NZ_CP015645|5|4|1276862-1276943|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAA ATTGGCTCCCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCAT CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA
>NZ_CP015645.1|WP_000185319.1|1275781_1276711_+|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MTNSSKSFTKFMAASAVFTMGFLSVPTAGAEQTNQIANKPQAIQWHTNLTNERFTTIAHRGASGYAPEHTFQAYDKSHNELKASYIEIDLQRTKDGHLVAMHDETVNRTTNGHGKVEDYTLDELKQLDAGSWFNKKYPKYARASYKNAKVPTLDEILERYGPNANYYIETKSPDVYPGMEEQLLASLKKHHLLNNNKLKNGHVMIQSFSDESLKKIHRQNKHVPLVKLVDKGELQQFNDQRLKEIRSYAIGLGPDYTDLTEQNTHHLKDLGFIVHPYTVNEKADMLRLNKYGVDGVFTNFADKYKEVIK >NZ_CP015645.1|WP_000066053.1|1274160_1275540_+|argininosuccinate-lyase MSNKAWGGRFEVQPEEWVDDFNASITFDQTLIDQDIEGSIAHATMLANQGIISQQDSEQIIQGLKSIQHDYHQDQIQFSASLEDIHLNIEHELIKRIGDAGGKLHTGRSRNDQVATDMHLYTKKQVQDIIALIKSLQSVIVDIASNNVDTIMPGYTHLQRAQPISFAHHIMTYFWMLQRDQQRFEDSLKRIDINPLGAAALSGTTYPIDRHETTALLNFGSLYENSLDAVSDRDYIIETLHNISLTMVHLSRFAEEIIFWSTDEAKFITLSDAFSTGSSIMPQKKNPDMAELIRGKVGRTTGHLMSMLMTLKGLPLAYNKDMQEDKEGLFDAVHTIKGSLRIFEGMIQTMTINKERLNQTVKEDFSNATELADYLVTKNIPFRTAHEIVGKIVLECIQQGHYLLDVPLATYQQHHSSIDADIYDYLQPENCLKRRQSYGSTGQSSVKQQLDVAKQLLSQ >NZ_CP015645.1|WP_000660041.1|1272965_1274171_+|argininosuccinate-synthase MKEKIVLAYSGGLDTSVAVQWLIDKGYDVVACCLDVGEGKDLDIVYKKALDMGAVECHIIDATKEFSDEYVSYAIKGNLMYENAYPLVSALSRPLIAKKLVEIAEKTNSVGIAHGCTGKGNDQVRFEVAIKALNPSLKAFAPVREWAWSREEEIDYAIKHNIPVSINHDSPYSIDQNLWGRANECGILEDPYAAPPEDAFDLTNALEETPDAADEIILTFDKGIPVQIDGKTYELDDLILTLNALAGKHGIGRIDHVENRLVGIKSREIYEAPAAEVILKAHKALETITLTKDVAHFKPIIEKQFAEQLYNGLWFSPLTDSLKLFIDSTQQYVSGDVRIKLFKGNAIVNGRKSPYTLYDEKLATYTKEDAFNQDAAVGFIDIYGLPTQVNSMLHGGYSNEQ >NZ_CP015645.1|WP_000148855.1|1271284_1272616_-|glucose-6-phosphate-isomerase MTHIQLDFSKTLEFFGEHELKQQQEIVKSIHKTIHEGTGAGSDFLGWVDLPVDYDKEEFSRIVEASKRIKENSDVLVVIGIGGSYLGARAAIEMLTSSFRNSNEYPEIVFVGNHLSSTYTKELVDYLADKDFSVNVISKSGTTTEPAVAFRLFKQLVEERYGKEEAQKRIFATTDKEKGALKQLATNEGYETFIVPDDVGGRYSVLTAVGLLPIATAGINIEAMMIGAAKAREELSSDKLEENIAYQYATIRNILYAKGYTTEMLINYEPSMQYFNEWWKQLFGESEGKDFKGIYPSSANYTTDLHSLGQYVQEGRRFLFETVVKVNHPKYDITIEKDSDDLDGLNYLAGKTIDEVNTKAFEGTLLAHTDGGVPNMVVNIPQLDEETFGYVVYFFELACAMSGYQLGVNPFNQPGVEAYKQNMFALLGKPGFEDLKKELEERL >NZ_CP015645.1|WP_000007967.1|1270384_1270960_-|TVP38/TMEM64-family-protein MSFHQVEEWFEIFRQFGYLPGFILLYIRAIIPVFPLALYILINIQAYGPILGILISWLGLISGTFTVYLICKRLVNTERMQRIKQRTAVQRLISFIDRQGLIPLFILLCFPFTPNTLINFVASLSHIRPKYYFIVLASSKLVSTIILGYLGKEITTILTHPLRGILMLVVLVVFWIVGKKLEQHFMGSKKE >NZ_CP015645.1|WP_000758209.1|1269855_1270380_-|signal-peptidase-I MKKVVKYLISLILAIIIVLFVQTFVIVGHVIPNNDMSPTLNKGDRVIVNKIKVTFNQLNNGDIITYRRGNEIYTSRIIAKPGQSMAFRQGQLYRDDRPVDASYAKNRKIKDFSLRNFKELDGDIIPPNNFVVLNDHDNNQHDSRQFGLIDKKDIIGNISLRYYPFSKWTIQFKS >NZ_CP015645.1|WP_064646636.1|1269264_1269840_-|signal-peptidase-I MKKELLEWIISIAVAFVILFIVGKFIVTPYTIKGESMDPTLKDGERVAVNIIGYKTGGLEKGNVVVFHANKNDDYVKRVIGVPGDKVEYKNDTLYVNGKKQDEPYLNYNLKHKQGDYITGTFQVEDLPNANPKSNVIPKGKYLVLGDNREVSKDSRAFGLIDEDQIVGKVSFRFWPFSEFKHNFNPENTKN >NZ_CP015645.1|WP_042909141.1|1265628_1269105_-|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddB MTLHAYLGRAGTGKSTKMLTEIKQKMKQDPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDSELNGSLRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFSEKLTEQIQDFKKYAVTPEHLEHFIADKNMQTRTKNKLEDIALIYREFEQRIQNEFITGEDSLQYFIDCMPKSEWLKRADIYIDGFHNFSTIEYLIIKGLIKYAKSVTIILTTDGNHDQFSLFRKPSEVLRHIEEIANELNISIERQYFNQLYRFNNQDLKHLEQEFDVLQINRVACQGHINILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYQDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNIDTKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTASYLKSAYLVDLLENFVLERGIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILHFEKQMSQAETVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGNHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVFGDEPMSMERFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVFLVGMNDGTMPQPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYIAMTRARQDVTFSYSLMGSIGDDKEISPFLNQIQSLFNQLEITNIPQYHEVNPLSLMQHAKQTKITLFEALRAWLDDEIVADSWLDAYQVIRDSDHLNQGLDYLMSALTFDNETVKLGETLSKDLYGKEINASVSRFEGYQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLTNEALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRRKPRTNDELISQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSATLDLTKVYYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWADIDEDKLEQDLIKKFKLSGLVNADQTVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFIQHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETINPIEAIQNINIDDEFGGEQ >NZ_CP015645.1|WP_023913617.1|1261974_1265628_-|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA MTIPEKPQGVIWTDAQWQSIYATGQDVLVAAAAGSGKTAVLVERIIQKILRDGIDVDRLLVVTFTNLSAREMKHRVDQRIQEASIADPANAHLKNQRIKIHQAQISTLHSFCLKLIQQHYDVLNIDPNFRTSSEAENILLLEQTIDEVIEQHYDILDPAFIELTEQLSSDRSDDQFRMIIKQLYFFSVANPNPTNWLDQLVTPYEEEAQQAQLIQLLTDLSKVFITAAYDALNKAYDLFSMMDSVDKHLAVIEDERRLMGRVLEGGFIDIPYLTGHEFGARLPNVTAKIKEANEMMVDALEDAKLQYKKYKSLIDKVKSDYFSREADDLKADMQQLAPRVKYLARIVKDVMSEFNRKKRSKNILDFSDYEHFALQILTNEDGSPSEIAESYRQHFQEILVDEYQDTNRVQEKILSCIKTGDEHNGNLFMVGDVKQSIYKFRQADPSLFIEKYQRFTIDGDGTGRRIDLSQNFRSRKEVLSTTNYIFKHMMDEQVGEVKYDEAAQLYYGAPYDESDHPVNLKVLVEADQEHSDLTGSEQEAHFIVEQVKDILEHQKVYDMKTGSYRSATYKDIVILERSFGQARNLQQAFKNEDIPFHVNSREGYFEQTEVRLVLSFLRAIDNPLQDIYLVGLMRSVIYQFKEDELAQIRILSPNDDYFYQSIVNYINDEAADAILVDKLKMFLSDIQSYQQYSKDHPVYQLIDKFYNDHYVIQYFSGLIGGRGRRANLYGLFNKAIEFENSSFRGLYQFIRFIDELIERGKDFGEENVVGPNDNVVRMMTIHSSKGLEFPFVIYSGLSKDFNKRDLKQPVILNQQFGLGMDYFDVDKEMAFPSLASVAYKAVAEKELVSEEMRLVYVALTRAKEQLYLIGRVKNDKSLLELEQLSISGEHIAVNERLTSPNPFHLIYSILSKHQSASIPDDLKFEKDIAQVEDSSRPNVNISIIYFEDVSTETILDNNEYRSVNQLETMQNGNEDVKAQIKHQLDYQYPYVNDTKKPSKQSVSELKRQYETEESGTSYERVRQYRIGFSTYERPKFLSEQGKRKANEIGTLMHTVMQHLPFKKERISEVELHQYIDGLIDKHIIEADAKKDIRMDEIMTFINSELYSIIAEAEQVYRELPFVVNQALVDQLPQGDEDVSIIQGMIDLIFVKDGVHYFVDYKTDAFNRRRGMTDEEIGTQLKNKYKIQMKYYQNTLQTILNKEVKGYLYFFKFGTLQL >NZ_CP015645.1|WP_000670752.1|1260906_1261809_-|fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein MKFLSFKYNDKTSYGVKVKREDAVWDLTQVFADFAEGDFHPKTLLAGLQQNHTLDFQEQVRKAVVAAEDSGKAEDYKISFNDIEFLPPVTPPNNVIAFGRNYKDHANELNHEVEKLYVFTKAASSLTGDNATIPNHKDITDQLDYEGELGIVIGKSGEKIPKALALDYVYGYTIINDITDRKAQSEQDQAFLSKSLTGGCPMGPYIVTKDELPLPENVNIVTKVNNEIRQDGNTGEMILKIDELIEEISKYVALHPGDIIATGTPAGVGAGMQPPKFLQPGDEVKVTIDNIGTLTTYIAK >NZ_CP015645.1|WP_000138487.1|1277100_1278345_-|Glu/Leu/Phe/Val-dehydrogenase MTENNNLVTSTQGIIKEALHKLGFDEGMYDLIKEPLRMLQVRIPVRMDDGTVKTFTGYRAQHNDAVGPTKGGVRFHPDVDEEEVKALSMWMTLKCGIVNLPYGGGKGGIVCDPRQMSIHEVERLSRGYVRAISQFVGPNKDIPAPDVFTNSQIMAWMMDEYSALDKFNSPGFITGKPIVLGGSHGRDRSTALGVVIAIEQAAKRRNMQIEGAKVVIQGFGNAGSFLAKFLYDLGAKIVGISDAYGALHDPNGLDIDYLLDRRDSFGTVTNLFEETISNKELFELDCDILVPAAISNQITEDNAHDIKASIVVEAANGPTTPEATRILTERGILLVPDVLASAGGVTVSYFEWVQNNQGYYWSEEEVNEKLREKLEAAFDTIYELSQNRKIDMRLAAYIIGIKRTAEAARYRGWA >NZ_CP015645.1|WP_000167314.1|1278453_1279644_-|ornithine--oxo-acid-transaminase MTKSEKIIELTNHYGAHNYLPLPIVISEAEGVWVKDPEGNKYMDMLSAYSAVNQGHRHPKIIQALKDQADKVTLVSRAFHSDNLGEWYEKICKLAGKDKALPMNTGAEAVETALKAARRWAYDVKGIEPNKAEIIAFNGNFHGRTMAPVSLSSEAEYQRGYGPLLDGFRKVDFGDVDALKAAINENTAAVLVEPIQGEAGINIPPEGYLKAIRELCDEHNVLFIADEIQAGLGRSGKLFATDWDNVKPDVYILGKALGGGVFPISVVLADKEVLDVFTPGSHGSTFGGNPLACAASIAALDVIVDEDLPGRSLELGDYFKEQLKQIDHPSIKEVRGRGLFIGVELNESARPYCEALKEEGLLCKETHDTVIRFAPPLIITKEELDLALEKIRHVFQ >NZ_CP015645.1|WP_000838029.1|1279951_1281079_-|NADH-dependent-flavin-oxidoreductase MKSKYEPLFDKVELPNGVELRNRFVLAPLTHISSNDDGTISDVELPYIEKRSQDVGITINAASNVSDVGKAFPGQPSIAHDSDIEGLKRLATAMKKNGAKALVQIHHGGAQALPELIPDGDVVAPSPISLKSFGQKQEHSAREMTNEEIEQAIKDFGEATRRAIEAGFDGVEIHGANHYLIHQFVSPYYNRRNDVWANQYKFPVAVIEEVLKAKEAYGNKDFIVGYRLSPEEAESPGITMEITEELVNKISHMPIDYIHVSMMDTHATTREGKYAGQERLPLIHKWINGRMPLIGIGSIFTADEALDAVENVGVDLVAIGRELLLDYQFVEKIKDGREDEIINYFDPEREDNHHLTPNLWHQFNEGFYPLPRKDK >NZ_CP015645.1|WP_001067294.1|1281440_1281818_-|S1-RNA-binding-domain-containing-protein MNNYKIGQHIKVRVTGIQPYGAFVETPNHTEGLIHISEIMDDYVHNLKKFLSEGQIVKAKILSIDDEGKLNLSLKDNDYFKNYERKKEKQSVLDEIRETEKYGFQTLKERLPIWIKQSKRAIRND >NZ_CP015645.1|WP_000035058.1|1282233_1282827_-|peptidylprolyl-isomerase MANYPQLNKEVQQGEIKVVMHTNKGDMTFKLFPNIAPKTVENFVTHAKNGYYDGITFHRVINDFMIQGGDPTATGMGGESIYGGAFEDEFSLNAFNLYGALSMANSGPNTNGSQFFIVQMKEVPQNMLSQLADGGWPQPIVDAYGEKGGTPWLDQKHTVFGQIIDGETTLEDIANTKVGPQDKPLHDVVIESIDVEE >NZ_CP015645.1|WP_042909142.1|1282890_1283274_+|kinase-associated-lipoprotein-B MKLYRFSHKTGSYGVTIVEENGDDVLVKVEQVIKHPKQGDLHNPTETEGVFFHERKALSHFEKRYTKRSQLRDFNVDVLRYEDSLQQAITDLETKLKAQQTKHAEMSLASLAHLKEDYSLQYKENFK >NZ_CP015645.1|WP_000054608.1|1283404_1285810_+|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-A MSLLHIAVILPLIFALIIPILYRFFKRIHLGWFVLPVPIVIFIYMLTLIKTTMSGNTVMKTLNWMPHFGMNFDLYLDGLGLLFSLLISGIGSLVVLYSIGYLSKSEQLGNFYCYLLLFMGAMLGVVLSDNVIILYLFWELTSFSSFLLISFWRERQASIYGAQKSLIITVFGGLSLLGGIILLAIPTQSFSIQYMIQHASEIQNSPFFIFAMILIMIGAFTKSAQFPFYIWLPDAMEAPTPVSAYLHSATMVKAGLYLIARMTPIFAASQGWVWTVTLVGLITLFWASLNATKQQDLKGILAFSTVSQLGMIMAMLGIGAISYHYQGDDSKIYAAAFTAAIFHLINHATFKGALFMITGAVDHSTGTRDVKKLGGLLTIMPISFTITVITALSMAGVPPFNGFLSKESFLETTFTASQANLFSVDTLGYLFPIIGIVGSVFTFVYSIKFIMHIFFGQYKPEQLPKKAHEVSILMLLSPAILATLVIVFGLFPGILTNSIIEPATSSINHTVIDDVEFHMFHGLTPAFISTLVIYILGILLIVTFSYWVKLLQRQPGKLTFNYWYNRSANVIPNYSEKMTNSYVTDYSRNNLVIIFGALILLTFVTIFSVPFNINFKDVSPIRIFEVCIVILLLSAAFLILFAKSRLFSIIMLSAVGYAVSVLFIFFKAPDLALTQFVVESISTALFLLCFYHLPNLNRYNEKRSFQLTNALIAGGVGLSVIIIGLIAYGNRHFESISKFYQEHVYDLAHGKNMVNVILVDFRGMDTLFESSVLGIAGLAVYTMIKLRKKRQTQGNEVKNHE >NZ_CP015645.1|WP_001081626.1|1285802_1286231_+|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-B MNRQQNDLILQFAAVIIFFMVMVFGFSLFLAGHYTPGGGFVGGLLFASSLVIITIAFDIETMRKIFPLDFKILIGIGLVFCIATPIASWFLGKNFFTHVTFDIPLFILEPVHMTTAVFFDFGVLCAVVGTVMTIIISIGENE >NZ_CP015645.1|WP_000402803.1|1286230_1286572_+|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-C MEIIMIFVSGILTAISVYLVLSKSLIRIVMGTTLLTHAANLFLITMGGLKHGTVPIYEANVKSYVDPIPQALILTAIVIAFATTAFFLVLAFRTYKELGTDNVESMKGVPEDD >NZ_CP015645.1|WP_000573077.1|1286564_1288061_+|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-D MIESNMLVLTLVIPVITAILLVFIGKRPIIKRYVALGGTLLTLVAAIINLANVVKHGPIRVELGSWKAPYSIVFVLDIFSALLIITSIIITAIVILYSYQTIGIERERYYYYFSVLFMLIGIIGAFTTGDIFNLFVFFEVFLMSSYFLLVIGSTKIQLQETIKYVLVNVVSSSFFVMGVAILYSVVGTLNLADISNKLANLSAHDSGLVNIVFILFIFVFATKAGVFPMFVWLPSAYYAPPIPIIAFFGALLTKVGVYAIARTLSLFFSDNVSFSHYVILFLALLTIIFGCVGAVAYANIKKIILYNVMIAVGVILVGVAMMTESGMIGAIYYTLHDMLVKLALFLLIGIMIKITGTADLRQFGGLIKRYPVLGWSFFIAALSLAGIPPLSGFYGKFFIVQSTFERGFYLSGVIVLLSSLVVLYSVIRIFLQGFFGQPKGYDLNNKVDVKYLTTIAIVAVVITVLYGLSADYLYPMVKAGAETFYNPSTYVKAVLGGK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP015645_6 | 1404671-1404753 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP015645_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP015645_6
>6.1|1404697|31|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder GGGCCCCAACATAGTGAATTTCGAAATGAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015645_6
The CRISPR arrays of NZ_CP015645_6 >merge|NZ_CP015645|6|1404671-1404753|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAGTGAATTTCGAAATGAAATTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTG >NZ_CP015645|6|5|1404671-1404753|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTG GGGCCCCAACATAGTGAATTTCGAAATGAAA TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTG
>NZ_CP015645.1|WP_000654030.1|1403241_1404255_-|sugar-binding-transcriptional-regulator MKDLLQAQQKLIPDLIDKMYKRFSILTTISKNQPVGRRSLSEHMDMTERVLRSETDMLKKQDLIKVKPTGMEITAEGEQLISQLKGYFDIYADDNRLSEGIKNKFQIKEVHVVPGDADNSQSVKTELGRQAGQLLEGILQEDAIVAVTGGSTMACVSEAIHLLPYNVFFVPARGGLGENVVFQANTIAASMAQQAGGYYTTMYVPDNVSETTYNTLLLEPSVINTLDKIKQANVILHGIGDALKMAHRRQSPEKVIEQLQHHQAVGEAFGYYFDTQGQIVHKVKTIGLQLEDLESKDFIFAVAGGKSKGEAIKAYLTIAPKNTVLITDEAAAKIILE >NZ_CP015645.1|WP_000279414.1|1402178_1403189_-|type-I-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MAVKVAINGFGRIGRLAFRRIQEVEGLEVVAVNDLTDDDMLAHLLKYDTMQGRFTGEVEVVDGGFRVNGKEVKSFSEPDASKLPWKDLNIDVVLECTGFYTDKDKAQAHIEAGAKKVLISAPATGDLKTIVFNTNHQELDGSETVVSGASCTTNSLAPVAKVLNDDFGLVEGLMTTIHAYTGDQNTQDAPHRKGDKRRARAAAENIIPNSTGAAKAIGKVIPEIDGKLDGGAQRVPVATGSLTELTVVLEKQDVTVEQVNEAMKNASNESFGYTEDEIVSSDVVGMTYGSLFDATQTRVMSVGDRQLVKVAAWYDNEMSYTAQLVRTLAYLAELSK >NZ_CP015645.1|WP_001074757.1|1400849_1402040_-|phosphoglycerate-kinase MAKKIVSDLNLKGKTVLVRADFNVPLKDGEITNDNRIVQALPTIQYIIEQGGKIVLFSHLGKVKEESDKAKLTLRPVAEDLSKKLDKEVVFVPETRGEKLEAAIKDLKEGDVLLVENTRYEDLDGKKESKNDPELGKYWASLGDVFVNDAFGTAHREHASNVGISTHLETAAGFLMDKEIKFIGGVVNDPHKPVVAILGGAKVSDKINVIKNLVNIADKIIIGGGMAYTFLKAQGKEIGISLLEEDKIDFAKDLLEKHGDKIVLPVDTKVAKEFSNDAKITVVPSDSIPADQEGMDIGPNTVKLFADELEGAHTVVWNGPMGVFEFSNFAQGTIGVCKAIANLKDAITIIGGGDSAAAAISLGFENDFTHISTGGGASLEYLEGKELPGIKAINNK >NZ_CP015645.1|WP_001260089.1|1399966_1400728_-|triose-phosphate-isomerase MRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK >NZ_CP015645.1|WP_001085505.1|1398446_1399964_-|2,3-bisphosphoglycerate-independent-phosphoglycerate-mutase MAKKPTALIILDGFANRESEHGNAVKLANKPNFDRYYNKYPTTQIEASGLDVGLPEGQMGNSEVGHMNIGAGRIVYQSLTRINKSIEDGDFFENDVLNNAIAHVNSHDSALHIFGLLSDGGVHSHYKHLFALLELAKKQGVEKVYVHAFLDGRDVDQKSALKYIEETEAKFNELGIGQFASVSGRYYAMDRDKRWEREEKAYNAIRNFDAPTYATAKEGVEASYNEGLTDEFVVPFIVENQNDGVNDGDAVIFYNFRPDRAAQLSEIFANRAFEGFKVEQVKDLFYATFTKYNDNIDAAIVFEKVDLNNTIGEIAQNNNLTQLRIAETEKYPHVTYFMSGGRNEEFKGERRRLIDSPKVATYDLKPEMSAYEVKDALLEELNKGDLDLIILNFANPDMVGHSGMLEPTIKAIEAVDECLGEVVDKILDMDGYAIITADHGNSDQVLTDDDQPMTTHTTNPVPVIVTKEGVTLRETGRLGDLAPTLLDLLNVEQPEDMTGESLIKH >NZ_CP015645.1|WP_001121760.1|1397012_1398317_-|phosphopyruvate-hydratase MPIITDVYAREVLDSRGNPTVEVEVLTESGAFGRALVPSGASTGEHEAVELRDGDKSRYLGKGVTKAVENVNEIIAPEIIEGEFSVLDQVSIDKMMIALDGTPNKGKLGANAILGVSIAVARAAADLLGQPLYKYLGGFNGKQLPVPMMNIVNGGSHSDAPIAFQEFMILPVGATTFKESLRWGTEIFHNLKSILSKRGLETAVGDEGGFAPKFEGTEDAVETIIQAIEAAGYKPGEEVFLGFDCASSEFYENGVYDYSKFEGEHGAKRTAAEQVDYLEQLVDKYPIITIEDGMDENDWDGWKQLTERIGDRVQLVGDDLFVTNTEILAKGIENGIGNSILIKVNQIGTLTETFDAIEMAQKAGYTAVVSHRSGETEDTTIADIAVATNAGQIKTGSLSRTDRIAKYNQLLRIEDELFETAKYDGIKSFYNLDK >NZ_CP015645.1|WP_000785252.1|1396214_1396673_-|hypothetical-protein MADRTNKEIKTGRFIATASIVFSILLIIHYFVSLDNATAKALLNLTNQNTSDKAIDYILNSFRFTGIMYILAYLAGFITFWNRHTYVWWFMFAVYVSNSLFTLINLSITIQAIKAAHGAYLTLPILIVIIGSVALAIYMLVVSIKRKSTFNR >NZ_CP015645.1|WP_000556760.1|1395914_1396148_-|preprotein-translocase-subunit-SecG MHTFLIVLLIIDCIALITVVLLQEGKSSGLSGAISGGAEQLFGKQKQRGVDLFLNRLTIILSILFFVLMICISYLGM >NZ_CP015645.1|WP_001165961.1|1395058_1395799_-|alpha/beta-hydrolase MQIKLPKPFFFEEGKRAVLLLHGFTGNSSDVRQLGRFLQKKGYTSYAPQYEGHAAPPEEILKSSPFVWFKDALDGYDYLVEQGYDEIVVAGLSLGGDFALKLSLNRDVKGIVTMCAPMGGKTEGTIYEGFLEYARNFKKYEGKDQETIDNEMDHFKPTETLKELSEALDTIKEQVDEVLDPILVIQAENDNMIDPQSANYIYDHVDSDDKNIKWYSESGHVITIDKEKEQVFEDIYQFLESLDWSE >NZ_CP015645.1|WP_031836900.1|1392652_1395025_-|ribonuclease-R 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MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYQNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >NZ_CP015645.1|WP_001224793.1|1414815_1415301_-|acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >NZ_CP015645.1|WP_000513313.1|1415308_1416148_-|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYVENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP015645_7 | 2523063-2523160 | Orphan |
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Consensus repeat of NZ_CP015645_7
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1 spacers
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>7.1|2523092|40|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder ATAAAGGAACGCATTAGTTAGCTTCGCTACTAATGCATAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015645_7
The CRISPR arrays of NZ_CP015645_7 >merge|NZ_CP015645|7|2523063-2523160|CRISPRCasFinder GCCTTTCTAGCTCATAAAATTCGCAGAAAATAAAGGAACGCATTAGTTAGCTTCGCTACTAATGCATAAGCCTTTCTAGCTCATAAAATTCGCAGAAA >NZ_CP015645|7|6|2523063-2523160|CRISPRCasFinder GCCTTTCTAGCTCATAAAATTCGCAGAAA ATAAAGGAACGCATTAGTTAGCTTCGCTACTAATGCATAA GCCTTTCTAGCTCATAAAATTCGCAGAAA
>NZ_CP015645.1|WP_001789199.1|2522764_2522884_+|hypothetical-protein MLTNRLTSVNYVKKRLIQNIQRILSKEVLYGEMQYFANK >NZ_CP015645.1|WP_000792570.1|2521356_2522670_-|B-domain-containing-protein MKNKYISKLLVGAATITLATMISNGEAKASENTQQTSTKHQTTQNNYVTDQQKAFYQVLHLKGITEEQRNQYIKTLREHPERAQEVFSESLKDSKNPDRRVAQQNAFYNVLKNDNLTEQEKNNYIAQIKENPDRSQQVWVESVQSSKAKERQNIENADKAIKDFQDNKAPHDKSAAYEANSKLPKDLRDKNNRFVEKVSIEKAIVRHDERVKSANDAISKLNVKDSIENRRLAQREVNKAPMDVKEHLQKQLDALVAQKDAEKKVAPKVEAPQIQSPQIEKPKAESPKVEVPQIQSPKVEVPQSKLLGYYQSLKDSFNYGYKYLTDTYKSYKEKYDTAKYYYNKYYQYKGLIDQTVLTTIGSGYGSYIKPLEVSKESGNLAKSYAQVRNYVTESINTGKVLYAFYQKPELVKTAIKAQETATTFKNALTGIFKSFWK >NZ_CP015645.1|WP_000594519.1|2519891_2520821_-|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB-subunit-A MIKNKILTATLAVGLIAPLANPFIEISKAENKIEDIGQGAEIIKRTQDITSKRLAITQNIQFDFVKDKKYNKDALVVKMQGFISSRTTYSDLKKYPYIKRMIWPFQYNISLKTKDSNVDLINYLPKNKIDSADVSQKLGYNIGGNFQSAPSIGGSGSFNYSKTISYNQKNYVTEVESQNSKGVKWGVKANSFVTPNGQVSAYDQYLFAQDPTGPAARDYFVPDNQLPPLIQSGFNPSFITTLSHERGKGDKSEFEITYGRNMDATYAYVTRHRLAVDRKHDAFKNRNVTVKYEVNWKTHEVKIKSITPK >NZ_CP015645.1|WP_000916704.1|2518377_2519325_-|bi-component-gamma-hemolysin-HlgCB-subunit-C MLKNKILATTLSVSLLAPLANPLLENAKAANDTEDIGKGSDIEIIKRTEDKTSNKWGVTQNIQFDFVKDKKYNKDALILKMQGFISSRTTYYNYKKTNHVKAMRWPFQYNIGLKTNDKYVSLINYLPKNKIESTNVSQTLGYNIGGNFQSAPSLGGNGSFNYSKSISYTQQNYVSEVEQQNSKSVLWGVKANSFATESGQKSAFDSDLFVGYKPHSKDPRDYFVPDSELPPLVQSGFNPSFIATVSHEKGSSDTSEFEITYGRNMDVTHAIKRSTHYGNSYLDGHRVHNAFVNRNYTVKYEVNWKTHEIKVKGQN >NZ_CP015645.1|WP_000783428.1|2517398_2518376_-|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB/HlgCB-subunit-B MKMNKLVKSSVATSMALLLLSGTANAEGKITPVSVKKVDDKVTLYKTTATADSDKFKISQILTFNFIKDKSYDKDTLVLKATGNINSGFVKPNPNDYDFSKLYWGAKYNVSISSQSNDSVNVVDYAPKNQNEEFQVQNTLGYTFGGDISISNGLSGGLNGNTAFSETINYKQESYRTTLSRNTNYKNVGWGVEAHKIMNNGWGPYGRDSFHPTYGNELFLAGRQSSAYAGQNFIAQHQMPLLSRSNFNPEFLSVLSHRQDGAKKSKITVTYQREMDLYQIRWNGFYWAGANYKNFKTRTFKSTYEIDWENHKVKLLDTKETENNK >NZ_CP015645.1|WP_000200945.1|2516879_2517347_+|QueT-transporter-family-protein MTSKDITQISVIAAILTILAVLKIPSIIPGLDFQLSAPAALLILAFFGIKKYFLGGLLSSLLLLIFGVFNPINVIISIIFRVIAIAVVYLLKINVLSLVLASVLGSLVSRLLLSIILNLPVWVVLLNAIPGVIFTLIVAIPLYLTLRKRMAVLLR >NZ_CP015645.1|WP_000286876.1|2516176_2516869_+|6-carboxyhexanoate--CoA-ligase MYSIKMRSSNQDVHISGAETICEFDKIEQTVQRFYNKGFFHENGQPDFLNIKIQKIMEPIQQIKALQIIEDDKANLQHLTQECGVTEQALNQGMTYIKNETVYTGAIILSAISGKRLDSFGQRGIRATHFSFEDINNKGDLNERVTDALAIASCINAHPYVKGELCVSDDLTYTTGYFAAAKIGYHRLFDIKPVNTRYGGRIIFVDNRIDLNHYISFLESTPKQVVYETV >NZ_CP015645.1|WP_000971546.1|2515050_2516166_+|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase-family-protein MMFQEQIDLLQQKGLYRSLKSVGYIDRQYIEVENKRCTNYTSNDYLGLGQIAFDKDDFERFMRKYSYHLSSSRLISGSSTAYEEIETMLAGWLGYSACTILNSGYDANLALFNIFKNTNCVVFSDQENHASIIDGIKLSGLEKVIYKHLDIADLEKRLAEYPNQNIQKIIISDSVFSTNGDVVDIGQLVSLKHKYNATLILDVSHSFGIENYSNYQGIDILTSSLSKACGAYGGVILSSNDVKDMLINHGRPLIYSSSLPIYNLYFIKRNIEKLINADDRRTKLNSLSKYFNQKLKALNVNYNSSNSPIKFIEFDDIEAAENIHQTLLKHHVFTSYLRYPTVTKPMLRISLSYFHTEQDIDRLFEILHQED >NZ_CP015645.1|WP_001046645.1|2514065_2515073_+|biotin-synthase-BioB MNLAKRILQGEQLTKETVLKIYEDTNIDTLDLLNEAYILRKHYFGKKVKLNMILNAKSGICPENCGYCGQSRDIKQKQRYALIPEEQIIDGAKVAHDNHIGTYCIVMSGRGPSDKEVDHISNTVRTIKSQHPQLKICACLGLTNDEQAKKLKSAGVDRYNHNINTSENYHDNVVTTHSYKDRTDTIELMKANNISPCSGVICGMGESNQDIVDMAFALKEMDADSIPINFLHPIKGTKFGSMDDLTPMKCLRIVALFRLINPTKEIRIAGGREVNLRSLQPLALKAANSIFVGDYLITGGQPNQLDYDMINDLGFEIDYDTCENKENKNDVSRAN >NZ_CP015645.1|WP_001110070.1|2512705_2514064_+|adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate-transaminase MNYTQQLKQKDSEYVWHPFTQMGVYSKEEAIIIEKGKGSYLYDTNGNKYLDGYASLWVNVHGHNNKYLNKVIKKQLNKIAHSTLLGSSNIPSIELAEKLIEITPSNLRKVFYSDTGSASVEIAIKMAYQYWKNIDREKYAKKNKFITLNHGYHGDTIGAVSVGGIKTFHKIFKDLIFENIQVESPSFYRSNYDTENEMMTAILTNIEQILIERNDEIAGFILEPLIQGATGLFVHPKGFLKEVEKLCKKYDVLLICDEVAVGFGRTGKMFACNHEDVQPDIMCLGKAITGGYLPLAATLTSQKIYNAFLSDSHGVNTFFHGHTYTGNQIVCTVALENIRLYEKRKLLSHIETTSSTLEKQLHALKRHRNVGDVRGRGLMFGVELVTDKDSKTPLEIEKVERIVRKCKENGLMIRNLENVITFVPVLSMSNKEVKTMVRIFKKAVHNILDRKC >NZ_CP015645.1|WP_000019127.1|2523299_2524166_+|cation-transporter MSHNENLKLAQRGAYLSLIVYIILSIVKYVTGFVFNSAAVRADALNNMTDIIVSLAVIIGLKISIKPADRNHPYGHLKSENISSLLVSFVIMFVGIQVVIQNAPRLFKEDDVVPNAITIIVSLISGLVMLIVFAVNQRLAKRTKSSSLNSAAKDNLSDSLVSIGTAIGLIFTQIGFPIVDIILATLLGLLIVYTGFGIFKEAIFMLSDGFNETELEAYRNDILEVDEVQEVKSIKGRYHGSSVFIDVTIVVDANLSLVEAHQICDNVEHHLHKKGISSVYVHPEPDHL >NZ_CP015645.1|WP_001125208.1|2524492_2525179_+|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase MPKLILCRHGQSEWNAKNLFTGWEDVNLSEQGINEATRAGEKVRENNIAIDVAFTSLLTRALDTTHYILTESKQQWIPVYKSWRLNERHYGGLQGLNKDDARKEFGEEQVHIWRRSYDVKPPAETEEQREAYLADRRYNHLDKRMMPYSESLKDTLVRVIPFWTDHISQYLLDGQTVLVSAHGNSIRALIKYLEDVSDEDIINYEIKTGAPLVYELTDDLEVIDKYYL >NZ_CP015645.1|WP_000762708.1|2525332_2525437_-|putative-metal-homeostasis-protein MKLDLQTARRNLNSPNIKTRKRALKIIKQHKRAK >NZ_CP015645.1|WP_000038960.1|2525610_2527050_+|multidrug-efflux-MFS-transporter-MdeA MSKKQKLTMIITMLMGGFFGLLNETLLVTALPSIMKDFEISYTQVQWLTTAFLLTNGIVIPLSALVIQRYTTRQVFLVGISIFFLGTLLGGLSPHFATLLVARIIQALGAGIMMPLMMTTILDVFQPHERGKYMGIFGLVIGLAPAIGPTLSGYLVEYFNWRSLFHVVAPIAAVTFLIGFKTIKNVGTTIKVPIDFISVIFSVLGFGGLLYGTSSISEKGFDNPIVLVSMIGGVVLVALFVLRQYRLSTPLLNFAVFKNKQFTVGIIIMGVTMVSMIGSETILPIFVQNLLHRSALDSGLTLLPGAIVMAFMSMTSGALYEKFGPRKLALVGMAIVVITTAYFVVMDEQTSTIMLATVYAIRMVGIALGLIPVMTHTMNQLKPEMNAHGSSMTNTVQQIAGSIGTAALITILSHASKNFSPTMSDYNGMNKIDMMNQIKVDTMLHGYHAGFLFALLITVVSFFCSFMLQGKKKEVDSRQ >NZ_CP015645.1|WP_000825929.1|2527170_2527950_+|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MKRLLFVMIAFVFILAACGNNSSKDKEASKDSKTINVGTEGTYAPFSFHDKDGKLTGYDIDVIKAVAKEEGLKLKFNETSWDSMFAGLDAGRFDVIANQVGINPDREKKYKFSKPYTFSSAVLVIRENEKDIKDFDDVKGKKLAQTFTSNYGKLAKDKGADITKVDGFNQSMDLLLSKRVDGTFNDSLSYLDYKKQKPNAKIKAIKGNAEQSRSAFAFSKKADDETVQKFNDGLKKIEENGELAKIGKKWFGQDVSKSK >NZ_CP015645.1|WP_000479576.1|2527930_2528650_+|amino-acid-ABC-transporter-permease MFLNLNSEQQHALDAAKQAFGPMLEGLVKYSIPITLVTFVLGLIIALFTALMRISTSKILRSISRVYVSIIRGTPMIVQLFIIFYGIPELGRLLTNDADNQWTLAPVVAAIIGLSLNVGAYASEIIRGGIISIPKGQTEAAYSIGMTYGQTIQRIILPQAIRVSIPALGNTFLSLIKDTSLLGFILVAEMFRKAQEVASTTYEYLTIYVLVALMYWVVCFIISIIQGIYESYIERGYRS >NZ_CP015645.1|WP_042909118.1|2528646_2529378_+|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIQLNNIHKSFNDVEVIKGIDLSVEQGEVVTLIGRSGSGKTTLLRMINALEIPTGGTVYVNGKTYTSKDKKSQIEVRKQSGMVFQSYNLFPHKTALENVMEGLITVKKLKKDEARGKSLELLEKVGLTHVKDQRPHALSGGQQQRVAIARALAMNPKVMLFDEPTSALDPELVNDVLKVIKDLANEGMTMVIVTHEMRFAKEVSNNIVFIHEGMIGEQGAPEEMFNRPKTEELRRFLNVINEE >NZ_CP015645.1|WP_001012222.1|2529474_2530725_-|FemA/FemB-family-glycyltransferase-FmhA MNFVTLTSDEFNAFTTKHFSHYTQSAIHYNHRVDLKGDVHLVGVKDDNGQVIAGCLLTEARTLKFFKYFYTHRGPVMDYTNQSLVAFFFKALTSYLKKHNCLYVLVDPYLIENLRNADGEIVKSYDNRAFVRTMDKLGYKHQGFPVGYDSMSQIRWLSVLDLKDKTEDQLLKEMDYQTRRNIKKTYDIGVKTKTLTIDETQTFFDLFHMAEEKHGFKFRELPYFEEMQKLYDDHAMLKLAYIDLNEYLKTLQLKQQQLTAELSGVEEALEESPNSKKNKTKRTQLEQQLNSNKRKIDNTIEQIEQDGAVLNLASALFIYNEHEVYYLSSGSNPKYNAYMGAYHLQWEMIKFAKAHHIDRYNFYGITGDFSESSEDYGVQQFKKGFNAHVEEYIGDFIKPIKPLLYKVQTYLNHKRR >NZ_CP015645.1|WP_000819843.1|2530979_2531342_+|DUF4467-domain-containing-protein MKRFVATVLLLLVFISGCGNDKYVKEIDEAVKIQNQKQEQLAKKGNGDRVDHFERKDANIYVYDKDKIIILAYKPLSNDDEVHYYAYDFSDKRVSYKQDFDSRRYYQQHDADYHEENMTN >NZ_CP015645.1|WP_000162810.1|2531360_2531960_+|DsbA-family-protein MTKKLLTLFIVSMLILTACGKKESATTSSKNGKPLVVIYGDYKCPYCKELDEKVMPKLRKNYIDNHKVEYQFVNLAFLGKDSIVGSRASHAVLMYAPKSFLDFQKQLFAAQQDENKEWLTKELLDKHIKQLHLDKETENKIIKDYKTKDSKSWKAAEKDKKIAKDNHIKTTPTAFINGEKVEDPYDYESYEKLLKDKIK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP015645_3 | 3.1|1035215|38|NZ_CP015645|CRT | 1035215-1035252 | 38 | NZ_CP015645.1 | 1458323-1458360 | 1 | 0.974 |
NZ_CP015645_2 | 2.1|474434|32|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder | 474434-474465 | 32 | NZ_CP015645.1 | 330711-330742 | 2 | 0.938 |
NZ_CP015645_2 | 2.1|474434|32|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder | 474434-474465 | 32 | NZ_CP015645.1 | 735315-735346 | 2 | 0.938 |
NZ_CP015645_2 | 2.1|474434|32|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder | 474434-474465 | 32 | NZ_CP015645.1 | 822906-822937 | 2 | 0.938 |
NZ_CP015645_2 | 2.1|474434|32|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder | 474434-474465 | 32 | NZ_CP015645.1 | 947423-947454 | 2 | 0.938 |
NZ_CP015645_2 | 2.1|474434|32|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder | 474434-474465 | 32 | NZ_CP015645.1 | 1031348-1031379 | 2 | 0.938 |
NZ_CP015645_2 | 2.1|474434|32|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder | 474434-474465 | 32 | NZ_CP015645.1 | 1861916-1861947 | 2 | 0.938 |
NZ_CP015645_2 | 2.1|474434|32|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder | 474434-474465 | 32 | NZ_CP015645.1 | 1959371-1959402 | 2 | 0.938 |
NZ_CP015645_3 | 3.1|1035215|38|NZ_CP015645|CRT | 1035215-1035252 | 38 | NZ_CP015645.1 | 1458379-1458416 | 2 | 0.947 |
NZ_CP015645_6 | 6.1|1404697|31|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder | 1404697-1404727 | 31 | NZ_CP015645.1 | 330841-330871 | 2 | 0.935 |
NZ_CP015645_6 | 6.1|1404697|31|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder | 1404697-1404727 | 31 | NZ_CP015645.1 | 1134014-1134044 | 2 | 0.935 |
NZ_CP015645_6 | 6.1|1404697|31|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder | 1404697-1404727 | 31 | NZ_CP015645.1 | 1861818-1861848 | 2 | 0.935 |
1. spacer 3.1|1035215|38|NZ_CP015645|CRT matches to position: 1458323-1458360, mismatch: 1, identity: 0.974
agaaattggggttccaatttctctatgttggggccccg CRISPR spacer agaaattggcgttccaatttctctatgttggggccccg Protospacer ********* ****************************
2. spacer 2.1|474434|32|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder matches to position: 330711-330742, mismatch: 2, identity: 0.938
agctgaccaaaagtcagctttcaataatgtgc CRISPR spacer agctggccaatagtcagctttcaataatgtgc Protospacer *****.**** *********************
3. spacer 2.1|474434|32|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder matches to position: 735315-735346, mismatch: 2, identity: 0.938
agctgaccaaaagtcagctttcaataatgtgc CRISPR spacer agctgacgaaaagtcagcttacaataatgtgc Protospacer ******* ************ ***********
4. spacer 2.1|474434|32|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder matches to position: 822906-822937, mismatch: 2, identity: 0.938
agctgaccaaaagtcagctttcaataatgtgc CRISPR spacer agctgacgaaaagtcagcttacaataatgtgc Protospacer ******* ************ ***********
5. spacer 2.1|474434|32|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder matches to position: 947423-947454, mismatch: 2, identity: 0.938
agctgaccaaaagtcagctttcaataatgtgc CRISPR spacer agctgacgaaaagtcagcttacaataatgtgc Protospacer ******* ************ ***********
6. spacer 2.1|474434|32|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder matches to position: 1031348-1031379, mismatch: 2, identity: 0.938
agctgaccaaaagtcagctttcaataatgtgc CRISPR spacer agctgacgaaaagtcagcttacaataatgtgc Protospacer ******* ************ ***********
7. spacer 2.1|474434|32|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder matches to position: 1861916-1861947, mismatch: 2, identity: 0.938
agctgaccaaaagtcagctttcaataatgtgc CRISPR spacer agctgacgaaaagtcagcttacaataatgtgc Protospacer ******* ************ ***********
8. spacer 2.1|474434|32|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder matches to position: 1959371-1959402, mismatch: 2, identity: 0.938
agctgaccaaaagtcagctttcaataatgtgc CRISPR spacer agctgacgaaaagtcagcttacaataatgtgc Protospacer ******* ************ ***********
9. spacer 3.1|1035215|38|NZ_CP015645|CRT matches to position: 1458379-1458416, mismatch: 2, identity: 0.947
agaaattggggttccaatttctctatgttggggccccg CRISPR spacer agaaattggcgttccaatttctttatgttggggccccg Protospacer ********* ************.***************
10. spacer 6.1|1404697|31|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder matches to position: 330841-330871, mismatch: 2, identity: 0.935
gggccccaacatagtgaatttcgaaatgaaa CRISPR spacer gggccccaacatagagaatttcgaaaagaaa Protospacer ************** *********** ****
11. spacer 6.1|1404697|31|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder matches to position: 1134014-1134044, mismatch: 2, identity: 0.935
gggccccaacatagtgaatttcgaaatgaaa CRISPR spacer gggccccaacatagagaatttcgaaaagaaa Protospacer ************** *********** ****
12. spacer 6.1|1404697|31|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder matches to position: 1861818-1861848, mismatch: 2, identity: 0.935
gggccccaacatagtgaatttcgaaatgaaa CRISPR spacer gggccccaacatagagaatttcgaaaagaaa Protospacer ************** *********** ****
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP015645_1 | 1.1|388298|32|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder | 388298-388329 | 32 | KM359505 | Prochlorococcus phage P-TIM68, complete genome | 102705-102736 | 8 | 0.75 |
1. spacer 1.1|388298|32|NZ_CP015645|CRISPRCasFinder matches to KM359505 (Prochlorococcus phage P-TIM68, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.75
ggtctgtagaatttcttttcgaaattctctgt CRISPR spacer gatctgtataatttcttttggaaatagttaat Protospacer *.****** ********** ***** *. .*
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
122418 : 128097
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP015645|122418:128097|DBSCAN-SWA AATGAAAAATAAAAAACGTGTTTTAATAGCGTCATCATTATCATGTGCAATTTTATTGTTATCAGCAGCAACGACTCAAGCAAATTCAGCTCATAAAGACTCGCAAGATCAAAATAAGAAAGAACATGTTGATAAGTCTCAACAAAAAGACAAACGTAATGTTACTAATAAAGATAAAAATTCAACAGTACCTGATGATATTGGGAAAAACGGTAAAATCACAAAACGAACTGAAACAGTATATGATGAGAAAACAAATATACTCCAAAATTTACAATTCGACTTTATCGATGATCCAACTTATGACAAGAATGTATTACTTGTTAAAAAACAAGGCTCAATTCATTCAAATTTAAAGTTTGAATCTCATAAAGAAGAAAAAAATTCAAATTGGTTAAAGTATCCAAGTGAGTACCATGTAGATTTTCAAGTAAAAAGAAATCGTAAAACTGAAATATTAGACCAATTGCCGAAAAATAAAATTTCAACTGCGAAAGTAGACAGTACATTTTCATATAGCTCAGGTGGTAAATTCGATTCAACGAAAGGTATTGGACGAACTTCATCAAATAGCTACTCCAAAACGATTAGTTATAATCAGCAAAATTATGACACAATTGCCAGCGGTAAAAATAATAACTGGCATGTACACTGGTCAGTTATTGCGAATGACTTGAAGTATGGTGGAGAAGTGAAAAATAGAAATGATGAATTATTATTCTATAGAAATACGAGAATTGCTACTGTAGAAAACCCTGAGCTAAGCTTTGCTTCAAAATATAGATACCCAGCATTAGTAAGAAGTGGCTTTAATCCAGAATTTTTAACTTATTTATCTAATGAAAAGTCAAATGAGAAAACGCAATTTGAAGTAACATACACACGAAATCAAGATATTTTGAAAAACAGACCTGGAATACATTATGCACCTCCAATTTTAGAAAAAAATAAAGATGGTCAAAGGTTAATTGTCACTTATGAAGTTGATTGGAAAAATAAAACAGTTAAAGTCGTTGATAAATATTCTGATGACAATAAACCTTATAAAGAAGGATAATATTGAAAGGGCGGATTACTAATGATTAAACAATTATACAAAAACATCACAATTTGTAGTTTAGCAATATCTACTGCATTAACTGTATTTCCGGCAACTTCTTATGCAAAAATTAATTCTGAAATTAAAGCTGTTTCTGAGAAGAATCTTGATGGTGATACTAAAATGTATACACGTACAGCTACAACAAGTGATAGTCAAAAAAATATTACTCAAAGCTTACAATTTAATTTCTTAACTGAACCTAATTATGATAAAGAAACAGTATTTATTAAAGCAAAAGGTACAATTGGTAGTGGTTTGAGAATTTTAGACCCAAATGGTTATTGGAATAGTACATTAAGATGGCCTGGATCTTATTCAGTTTCAATTCAAAATGTTGATGACAACAACAATACAAATGTGACTGACTTTGCACCAAAAAATCAGGATGAATCAAGAGAAGTTAAATATACGTATGGTTATAAAACAGGTGGAGATTTTTCGATTAATCGTGGAGGCTTAACTGGAAATATTACAAAAGAGAGTAATTATTCAGAGACGATTAGTTATCAACAACCATCATATCGTACATTACTTGATCAATCTACGTCACAAAAAGGTGTAGGTTGGAAAGTAGAAGCACATTTGATAAATAATATGGGACATGACCATACGAGACAATTAACTAATGATAGTGATAATAGAACTAAAAGTGAAATCTTTTCTTTAACACGAAATGGAAATTTATGGGCGAAAGATAATTTCACACCTAAAGACAAAATGCCTGTAACTGTGTCTGAAGGGTTTAATCCAGAATTTTTAGCTGTTATGTCACATGATAAAAAAGACAAAGGTAAATCACAATTTGTTGTTCATTATAAAAGATCAATGGATGAGTTTAAAATAGATTGGAATCGCCATGGTTTCTGGGGCTATTGGTCTGGTGAAAACCATGTAGATAAAAAAGAAGAAAAATTATCAGCATTATATGAAGTTGATTGGAAGACGCATGATGTGAAGTTTGTAAAAGTACTTAATGATAATGAAAAGAAATAAGTAATAAAAGTTGCCTGCTACATAGAATGTAGTAGGTAACTTTTATTTATATTTGAATAGATAGATTTATTATGATGTGCAGTGTATGAATCTTGTTTGAGTGTAGAGTAAAGACTTGTATTAATGAAAAATTAAAATTGTTAAGATGATTTTATTAAAATGTAAGTCAATTCAAATTTTAACAATATAACTCGCTTCGACTTTTTAGAACGAAGCGAGTTATTAGTTAGTTGAGCACTATTTACTATAGGCTTTGATTGGATAATGATCTGAAAAATCATTGTAAACGTAGTAATATGGGAACGCATATACATCCCATGGCTTAGGTTTTTCAGTCACAACTTCATTGACTAATTGTTTTGGTTGTTTATGATCTTTATCTGTAAATATATAGTCTAAATGTTCTGGTTTACCATTAGGGTAATTATATTTCGCAATTGAATTTGATTGAGGGTCCCATGTGCTATTATGACCTGCATATAGAACATCATTTACATTCAAGTTTTTAAGCATATCTTTGAACTCTGGAGTGCCTTTATTAACATTAAGGTCACCACCTATATATACCGTTTCATCTTTAGGGATATTTTTCTTTTTAACAAAGTCACTGATTTCTTTCATTTGTTCAGCTCTAATTTTTCGATCATGTCCAGCACCACAACGTGAATCTTCAGATTGTGTATGTGTACCGATAACGTGAACGTTCTTACCATTTTTCTCTATTTTTGTATAAACAAAGCCTTTGTTGCTATCATTATCGAATCCACAACCGCTTTTGAAAACATGCTGGATTTTTTCTTTAATAGGATATTTACTTACAATCGCTACGCCACCATCTTCTGCAACAGTTGATGAGTAGCTACCTTCAGTTTTGTCCCACCCTGATTGAGAACGGCCGAGTACAGGTGTTTGATAAGGATATTCTTTTTTCACATTACTTAATAATTTGTCTGATGCACCATTATCAAATGCTTCATTGAATATTACGACATCATTATTTTTAATATAAGAAGATTGTCCGATTAAATCAGCGCGTTTATATTGCCCCCAATAACGCAACGATCAAATATGACGGCGCATATTGCATTAATGGCTAAGATGGATTACTTATATTGCTAATAGTGGACAACGTCGTTATATAGCGACAGGAGAGGTAGACAAGACAGGTAATAGAATAAGCAGTTTTGGTAATTTTAGCGCAGTTTGATAATTATATATAAAGGTTTGGCAAGTTATGAAATGTCTGCCAAACCTTTATATAAAAAAGAAATAGCTACCTTTTAATTTATGTAACTACTATTAGTATGCATATTCATTAGTTTTACCAGGACCATTAATTACATAAGATGATTTAGACTCTCCTTTTTTAAAGAAGTATGTTTTATACATTTTACCTAGTAACTCAACATTTTTTCTATCTTCAGCAAGTGGTGTATTCAGATATACTGTATAGTAACCTTTATTTTCAGTTAAAATAACCATTTTTTCAAATTGAGCAGAATTTTTTGTGCCTTTCTTTAAATAATTTCTCAAACGTTCATCTAATTTTCCTAGTGTTGTAGGAAGACCACTATTTTTAAATGATTCTTTATAAGCTTTTTCTTTCTCTAACAATTTCTTATTTGATTCTATTTCTTCATTTGTAGGAAACGGTTCAAAAGTAAAAGCTTTCGCTGAATGATGGTGTGTACTGATTCCTGCCGTTAAAAAACTTAATGCTAAAACTGTTGTTGCTAATTTCTTTTTCATAATGATGTTAATTCTCCTTAAATTCTATATTTAAATTTATAGTTAGTTTTGCGAAATTCCTAAAATGAGTTTAATCTAATCGATGAAATATATTAATTAACTGGAAATTAATAAAAGATTAATTATTTTTAACTCAAAATTAAAGTTCAATTAGTGTTTTGATGAATTTGGTCTTGATAAATTGAAATGATCTAAAAAACGCTATAATTTTTCTATTAATAGTAATTAATATGTGCTATATTTATCTTAGACACAGCAATGTGTTCAAATTTTCATCTATTCATAAGCTAGCCTTCGGGCTAGTTTTTTTGTGCTATATATTTGTTTTAATTAAATAAAATTAGATAATGCAATAGTAGCCATTTTATGTTAATATTACCTTGGGCGTTTTCAAGGAGCGCCTTTCATTTTTTATGTATTGCTCCCCTTCGGGCTAGTATATTAAATTTATTTTTGCGCTTTCCAAATCAATGTATATGTGTTATATTGTTTATGGGAAGTAGGTAAGCATTTCGGTGCTTACCTTTTTTTGTTTTTCTATAAATACAATAAGGTATGTCAATTTGATAATTTATTAATTTTCATTTAATAAGAAGATCTATATAGTTAATGAATAATTAATGTACTTTTTTTTAGTTAGTCATTAAAATAAATTAGTACTAATTACTAAGGAGAATAAAAAATGAAAATTAGAAAATCTATACTTGCGGGAACTTTAGCAATCGTTTTAGCATCACCACTAGTAACTAATCTAGATAAAAATGAGGCACAAGCTAGCACAAGCTTGCCAACATCGAATGAATATCAAAACGAAAAGTTAGCTAATGAATTAAAATCGTTATTAGATGAACTAAATGTTAATGAATTAGCTACTGGAAGTTTAAACACTTATTATAAGCGAACTATAAAAATTTCAGGTCTAAAAGCAATGTATGCTCTTAAGTCAAAAGACTTTAAGAAAATGTCAGAAGCAAAATATCAACTTCAAAAGATTTATAACGAAATTGACGAAGCACTAAAAAGTAAATATTAAAAAAACCACCCTTTTACGGGTGGTTTTAATTTTCTAGATAATATAAAAGTGTTCATAAATAAAACAGTATAGGCAAACAATAAAGTATTGAAAAAAGTAAGTTTAATATGAAAATTGTTAAAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP015645|122418:128097|125811_126261_-|WP_000727643.1|DBSCAN-SWA MKKKLATTVLALSFLTAGISTHHHSAKAFTFEPFPTNEEIESNKKLLEKEKAYKESFKNSGLPTTLGKLDERLRNYLKKGTKNSAQFEKMVILTENKGYYTVYLNTPLAEDRKNVELLGKMYKTYFFKKGESKSSYVINGPGKTNEYAY >NZ_CP015645|122418:128097|127346_127607_-|WP_001791826.1|DBSCAN-SWA MCIVIYLIYSLIVYFICIINFFIMAAPFLMTNADYVWTPMTTVTLFILSLIIFLIFIKTKDVVHLTIFILNLLFSILYCLPILFYL >NZ_CP015645|122418:128097|123495_124512_+|WP_064646621.1|DBSCAN-SWA MIKQLYKNITICSLAISTALTVFPATSYAKINSEIKAVSEKNLDGDTKMYTRTATTSDSQKNITQSLQFNFLTEPNYDKETVFIKAKGTIGSGLRILDPNGYWNSTLRWPGSYSVSIQNVDDNNNTNVTDFAPKNQDESREVKYTYGYKTGGDFSINRGGLTGNITKESNYSETISYQQPSYRTLLDQSTSQKGVGWKVEAHLINNMGHDHTRQLTNDSDNRTKSEIFSLTRNGNLWAKDNFTPKDKMPVTVSEGFNPEFLAVMSHDKKDKGKSQFVVHYKRSMDEFKIDWNRHGFWGYWSGENHVDKKEEKLSALYEVDWKTHDVKFVKVLNDNEKK >NZ_CP015645|122418:128097|127917_128097_-|WP_000669789.1|DBSCAN-SWA MKFKTTKECKSNNIFKRSQEINNRESEKGCLWGISMLILLFLLILFGITACSSSIHFIN >NZ_CP015645|122418:128097|126943_127294_+|WP_000702262.1|DBSCAN-SWA MKIRKSILAGTLAIVLASPLVTNLDKNEAQASTSLPTSNEYQNEKLANELKSLLDELNVNELATGSLNTYYKRTIKISGLKAMYALKSKDFKKMSEAKYQLQKIYNEIDEALKSKY >NZ_CP015645|122418:128097|122418_123474_+|WP_000791411.1|DBSCAN-SWA MKNKKRVLIASSLSCAILLLSAATTQANSAHKDSQDQNKKEHVDKSQQKDKRNVTNKDKNSTVPDDIGKNGKITKRTETVYDEKTNILQNLQFDFIDDPTYDKNVLLVKKQGSIHSNLKFESHKEEKNSNWLKYPSEYHVDFQVKRNRKTEILDQLPKNKISTAKVDSTFSYSSGGKFDSTKGIGRTSSNSYSKTISYNQQNYDTIASGKNNNWHVHWSVIANDLKYGGEVKNRNDELLFYRNTRIATVENPELSFASKYRYPALVRSGFNPEFLTYLSNEKSNEKTQFEVTYTRNQDILKNRPGIHYAPPILEKNKDGQRLIVTYEVDWKNKTVKVVDKYSDDNKPYKEG |
6 | Staphylococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
222092 : 268852
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP015645|222092:268852|DBSCAN-SWA 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45 | Staphylococcus_phage(86.67%) | tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
278043 : 325740
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP015645|278043:325740|DBSCAN-SWA 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44 | Staphylococcus_phage(94.59%) | tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
450256 : 459299
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP015645|450256:459299|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP015645|450256:459299|458780_459299_+|WP_000364542.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_CP015645|450256:459299|450256_451261_+|WP_001005769.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVGQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERG >NZ_CP015645|450256:459299|452310_453450_+|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP015645|450256:459299|453468_453729_+|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP015645|450256:459299|456485_458759_+|WP_000594993.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTATTILVITLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDVEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKQVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQIIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NZ_CP015645|450256:459299|451262_452288_+|WP_001019172.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLIEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSSRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP015645|450256:459299|454003_456283_+|WP_000749789.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKKPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
527153 : 535483
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP015645|527153:535483|DBSCAN-SWA TTTGCGAATAGATCAATCGATCATTAATGAAATAAAAGATAAAACCGACATTTTAGACTTGGTAAGTGAATATGTAAAACTAGAAAAGAGAGGACGCAATTATATAGGTTTGTGTCCTTTTCATGATGAAAAGACACCTTCATTTACAGTTTCTGAAGATAAACAAATCTGTCATTGTTTTGGTTGTAAAAAAGGTGGCAATGTTTTTCAATTTACTCAAGAAATTAAAGACATATCATTTGTTGAAGCGGTTAAAGAATTAGGTGATAGAGTTAATGTTGCTGTAGATATTGAGGCAACACAATCTAACTCAAATGTTCAAATTGCTTCTGATGATTTACAAATGATTGAAATGCATGAGTTAATACAAGAATTTTATTATTACGCTTTAACAAAGACAGTCGAAGGCGAACAAGCATTAACATACTTACAAGAACGTGGTTTTACAGATGCGCTTATTAAAGAGCGAGGCATTGGCTTTGCACCCGATAGCTCACATTTTTGTCATGATTTTCTTCAAAAAAAGGGTTACGATATTGAATTAGCATATGAAGCCGGATTATTATCACGTAACGAAGAAAATTTCAGTTATTACGATAGATTTCGAAATCGTATTATGTTTCCTTTGAAAAATGCGCAAGGAAGAATTGTTGGATATTCAGGTCGAACATATACCGGTCAAGAACCAAAATACCTAAATAGTCCTGAAACACCTATCTTTCAAAAAAGAAAGTTGTTATACAACTTAGATAAAGCGCGTAAATCAATTAGAAAATTAGATGAAATCGTATTACTAGAAGGTTTTATGGATGTTATAAAATCTGATACTGCTGGCTTGAAAAACGTTGTTGCAACAATGGGGACACAGTTGTCAGATGAACATATTACTTTTATACGAAAGTTAACATCAAATATAACATTAATGTTTGATGGGGATTTTGCGGGTAGTGAAGCAACACTTAAAACAGGTCAACATTTATTACAGCAAGGGCTAAATGTATTTGTTATACAATTGCCATCAGGCATGGATCCGGATGAATACATTGGTAAGTATGGCAACGACGCATTTACTGCTTTTGTAAAAAATGACAAAAAGTCATTTGCACATTATAAAGTGAGTATATTAAAAGATGAAATTGCACATAATGACCTTTCATATGAACGTTATTTGAAAGAACTAAGTCATGATATTTCGCTTATGAAATCATCGATTTTGCAACAAAAGGCTTTAAATGATGTTGCACCATTTTTCAATGTTAGTCCTGAGCAATTAGCTAACGAAATACAATTCAATCAAGCACCAGCCAATTATTATCCAGATGATGAGTATGGCGGTTATGATGAGTATGGCGGTTATATTGAACCTGAGCCAATTGGTATGGCACAATTTGACAATTTGAGCCGTCAAGAAAAAGCGGAGCGAGCATTTTTAAAACATTTAATGAGAGATAAAGATACATTTTTAAATTATTATGAAAGTGTTGATAAGGATAACTTCACAAATCAGCATTTTAAATATGTATTCGAAGTCTTACATGATTTTTATGCGGAAAATGATCAATATAATATCAGTGATGCTGTGCAGTATGTTAATTCAAATGAGTTGAGAGAAACACTAATTAGCTTAGAACAATATAATTTGAATGACGAACCATATGAAAATGAAATTGATGATTATGTCAATGTTATTAATGAAAAAGGACAAGAAACAATTGAGTCATTGAATCATAAATTAAGGGAAGCTACAAGGATTGGCGATGTAGAATTACAAAAATACTATTTACAGCAAATTGTTGCTAAGAATAAAGAACGCATGTAGCATGTGATTTTAAAGAATAATACGAATAATGATTATGTCAAAATGTATAAGGGTAAATGATAGTTACCGCATTTAAACAACACTATTGAAAAATAAATATTGGGATTAGTTCCAATTTGTAAAATAAAATTAAAAATATGGATGAATTAATTAAGAATTTAGTTTAAAATAGCAATATTGAATAAATTTCGAATGTTCATATTTAAAATCGGGAGGCCGTTTCATGTCTGATAACACAGTTAAAATTAAAAAACAAACAATTGATCCGACATTAACATTAGAAGATGTTAAGAAGCAATTAATTGAAAAGGGTAAAAAAGAGGGTCATTTAAGTCATGAAGAAATTGCTGAAAAACTTCAGAATTTTGATATCGACTCTGATCAAATGGATGATTTCTTTGATCAATTAAATGATAATGATATTTCACTAGTTAATGAAAAAGATAGTTCAGATACTGACGAGAAACTGAATCCAAGTGATCTTAGTGCCCCTCCAGGTGTTAAAATAAATGACCCAGTTCGTATGTACCTTAAAGAAATTGGGCGTGTTAACTTATTAAGTGCACAAGAAGAAATCGAATTAGCCAAACGTATTGAACAAGGTGATGAAGTAGCAAAATCAAGACTAGCAGAAGCGAACTTACGTTTAGTTGTAAGTATTGCTAAAAGATACGTAGGTCGTGGTATGTTATTCCTTGATTTAATCCAAGAAGGTAATATGGGTCTTATTAAAGCTGTTGAAAAATTTGACTTTAACAAAGGATTTAAGTTTTCAACATATGCAACATGGTGGATTAGACAAGCAATCACTCGTGCAATTGCTGACCAAGCACGTACGATTCGTATCCCTGTGCATATGGTAGAAACAATTAATAAATTAATTCGTGTTCAACGTCAATTATTACAGGACTTAGGTCGAGATCCAGCACCAGAAGAAATTGGTGAAGAAATGGATTTACCAGCAGAAAAAGTTCGTGAAATTTTAAAAATTGCGCAAGAACCTGTTTCATTAGAAACGCCAATTGGTGAAGAAGATGATAGTCATTTAGGAGACTTTATTGAGGATCAGGAAGCACAAAGTCCTTCAGATCATGCTGCTTATGAATTATTAAAAGAGCAATTAGAAGATGTGCTTGATACATTAACTGATAGAGAAGAAAATGTATTACGATTAAGATTTGGTCTTGATGACGGCAGAACAAGAACACTTGAAGAAGTTGGTAAAGTTTTCGGTGTTACACGTGAACGTATTCGACAAATTGAAGCAAAAGCACTTAGAAAATTAAGACATCCAAGTCGTAGTAAACGTTTGAAAGACTTTATGGATTAATTTATATCAATTTTAATGATTGATACCAAGACATGAATAAGCGCTTATTTATTTTTAGATTAAGATTTAACTTGAGTGAGGTTGGTACATTGAATAATGTTCAACCTCTTTTTTCATAAAGGAGAATAAAATGATTTCGTTAAATAACCGATTAACGACGGTAAGTCGATTTTTAAAACAAGGTACAATCGCGGATATTGGCTCAGATCATGCTTATTTGCCAATCTATGCAATTCAAAACCATTTATGCGAATGCGGTATTGCTGGAGAAGTTATTCAAGGCCCTTTTCAAGCTGCTGTAAAAAATGTAGCTGCAAACCAATTAGTAGATAGAATTGATGTACGTTTAGGGGATGGCTTAAGTGTTATTCAACCTGAGGACGTAATCGATAATATCACAATTTGTGGTATGGGCGGACCACTTATTGCTAAAATTTTAAAAGATGGGCAAGATAAGTTAAGTCAACATCCAAGGTTGATTTTACAAAGTAATATCCAAACTGAAAATTTAAGACAAACATTACAACAATTGAATTATGAAATAATTGATGAAATAATAATGGAAGAAAAAGGCCATATTTATGAAATTGTTGTAGCAGAACATTCTACACAATTAATAGAGCTATCATCTGATGAATTGAAATTCGGACCAAAATTGCTGAACAACAAAAATGAATATTTTATAAAAAAATGGCAAAGAGAGTTAGAAGCACTTTATCATATTAAATCGAAACTCAATACTGAACAACATCATCAACGTTTAGCTCAAATTAATGACGAAATTGCTGTAATTGAAAGGGTGTTATAGTAATGAAAATAGCTGATTTAATGACATTGTTAGATCATCATGTGCCATTTAGTACTGCTGAATCTTGGGATAATGTAGGATTGTTAATAGGTGATGAAGATGTTGAAGTTACTGGTGTTTTAACAGCATTAGACTGTACGTTGGAAGTAGTAAATGAAGCAATCGAAAAAGGTTATAATACTATTATTAGTCATCATCCTCTAATCTTTAAAGGCGTAACATCATTAAAAGCTAATGGTTATGGTTTGATCATTAGAAAACTAATTCAACATGACATTAATTTAATAGCGATGCATACAAATTTAGATGTAAATCCGTATGGTGTCAATATGATGTTGGCGAAGGCGATGGGTTTGAAGAACATTTCAATAATAAATAATCAACAAGATGTATACTATAAAGTTCAAACATATATACCTAAGGATAATGTTGGACCATTTAAAGATAAGCTTAGTGAAAATGGATTAGCGCAAGAAGGTAATTATGAATATTGTTTCTTTGAAAGTGAAGGAAGAGGGCAATTCAAACCAGTTGGTGAAGCTAATCCAACAATAGGACAAATTGATAAAATTGAATATGTAGATGAAGTTAAAATTGAATTTATGATAGATGCATATCAAAAGTCAAGGGCTGAGCAATTAATTAAACAATACCATCCATATGAAACACCGGTATTTGATTTTATTGAGATAAAACAAACATCCCTTTATGGACTTGGCGTTATGGCAGAAGTGGATAATCAAATGACATTGGAAGATTTCGCAGCTGATATTAAATCTAAATTAAATATCCCAAGTGTCCGTTTTGTTGGTGAGTCTAATCAGAAAATTAAACGTATTGCAATTATTGGTGGTTCAGGTATTGGATATGAATATCAAGCTGTCCAACAAGGCGCAGATGTCTTTGTTACAGGTGATATTAAACATCATGATGCCTTAGATGCTAAAATTCATGGTGTGAATTTAATTGATATTAATCATTACAGCGAATATGTGATGAAAGAAGGTTTAAAAACGTTACTAATGAATTGGTTCAATACAGAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP015645|527153:535483|534697_535483_+|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NZ_CP015645|527153:535483|529194_530301_+|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >NZ_CP015645|527153:535483|531111_532212_+|WP_000683933.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFSTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPYGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDAYQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >NZ_CP015645|527153:535483|530431_531109_+|WP_000624583.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCECGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIQPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEHSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL >NZ_CP015645|527153:535483|527153_528971_+|WP_001217252.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKALNDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPDDEYGGYDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYNLNDEPYENEIDDYVNVINEKGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NZ_CP015645|527153:535483|532325_533672_+|WP_001062183.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIASRLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >NZ_CP015645|527153:535483|533681_534572_+|WP_000924220.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAYEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ |
7 | Caulobacter_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
599995 : 681334
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP015645|599995:681334|DBSCAN-SWA GCTAACTTGGAATGTTTTCGAGTTTTTGAGTTAGTTCTCTATCCATTTTTTCAGTTACATGAGTATATATGCGAATGGTTGTTTTTTCATCTACATGTCCTACCCTTTTCATAATTGCTTTTAAAGAAACATTCATTTCTACTAATAAAGTTATGTGTGTATGTCTAAATGTGTGCGTGGTAACTTTCTTATTCATATTTAAAGCTTTTGTAGTTTTCTTAAGCACACCGGCGATTTGATTATTACATAAAGGATTCCCTTTTTTTGTTGTGAATATGAACCCTCTGTCAACATAGCTCGAATTCCATCTTTTCAACATTTTGTTTTCCAGTATTATCTTTTTAAAAATTTCTACGGTTCTAGAATTGATGCTGATACTTCTTTTTGAACTTATAGTCTTTGTAGTGTCTTTGTATCCGAATCCTTCCTCGTATTTAATGCGGTGAATTGTACCTGTTATATTAATAGTTTTGTTTAATAAATCTATATCTTTTTCCTGCAGTGCTTGTAGTTCTCCTATGCGCATACCAGTTAAAGCCTGTACTTCTAAGATGCTGGCAATTAAAATGCGATTTCGCTTGTGTAACTTATTATCAGTTAGTATATGATCACGTATCTGTAGGACTTGGTTCATTTCTAAATAGTTGTACATTTTAGATTCATCTTTTTCGATATCCTCTATTGTTTTTCTTCTTTTAGGAATTTTGACATTAGTTAACAAATATTCATTTGGATAATTGTAAAATTTAACTGCATATTTAATAGCTCCTTTCATATCTCCGAGTTGACGGGTTACTTGATTTTGAGAATAGATATCTGATAATTTATTAATAAATATCTGCATATATTTTGTATCTAGTTTGTTTAAAAGCAAGTTCTCAGAGCTGTATCGTTTAATGTTTCTAATTCTTATTTTTATATTATTAAGAGTAGTCAACTTTGAACCTGATGTTTTTATATGATATTCAAGCCATTCATCTAATAACGCGTGAAAAGTCAAAGTTTTTAATTCGCTTGACGACTTGTTGTTTAGTTTTTCTTTTATTTTTTCTTCTAAACGAAACATTGCCTCTTTTTGCGATTGCTTTGTATTCTTATTCAAGACAACACTTACACGTTTCCATTTATCTGTATACGGATCTTTGTATTTCTCGTAATATCTGTATTTAGTTTCGTTATTTTTGTTTTTAAATTTTTCAATCCACATGTTTATACCTCCTGTAGGAACGTACGTTCTGTAAATTTGTAAAAAATAATAAGGGTAGGTGGGCTACCCAAAATTTAGTACTAGGTACTAAATATGTTATAATAAAATAAAAAGTAGGTGATAAGATGACTCAATTTCTAGGGGCGCTTCTTCTTACAGGAGTTTTAGGTTACATACCATATAAATATCTAACAATGATAGGTTTAGTTAGTGAAAAAACAAGGTTATCAATACTCCTGTATTATTGATTTTTTCTATTGAAACATGTTTGATATGGTTTTATAGTTTTATAGTTTTATAATTTTTAATAATGTTGATTTAAAAAATTTGAATTTAATTCAGTTGCTTACAGGTCTAAAAGCAAATATTTTGTTTCTATTTATTTTTGTTTTAACAGTGTTTGTATTTAATCCTTTAATTGTTAAATTTATTATCTGGTTAATTAATATAACCAGAAAGTTTATGAAATTGGATTGTATAAGCTTATTAGACAAAAGAGACAAGTTGTTTAATAACAACGGTAAACCAGTATTTATAGTTATTAAAGACTTTGAAAACAGAATCATTGAAGAGGGTGAACTTAAAACCTATAATTCAGCTGGTAGCGATTTCGATTTACTAGAGGTTGAGCGACAAGATTTCAAAGTATCTGATTTACCGTCAAACGATGAATTGTATATTAAACATACACTTGTAGACCTTAAACAACAAATTAAATTGGATTTATATTTAATGAATGAATATTAATCTTTTTTCTTAGCTTTTTCTGATAAAGTGCTTTTTAAGTTTTCGCTGGCACCCGGCTTTTCAAAACTTTTGTTTATTGGGTTACTACGAGTAGCTTCTTGTTTTTTGTTTTTATCCGCCATAAAATTCTCACCACCATTCAACGTCTACACTTGTAGGCGTTTTTTGATTAGTAAAATCATAATGAATCTTCTTTGGTTAACTTATCTCCATCTATTTTTTGTGAAATAAATTCCAAGTATTTACGCGCATTATGTGACGATAAATCTTTAGGTAACTCATAAGTGAATGGTTGATTACCACTAGTTAAAACTTCATATACTATAGTTTCTTTTTTTATTTTGCAATTAGTTATTTTCATTATAAACTCCTTTTAAACACTGCTGAAATAGACGTCTTTTATATTAAAGTGCCATATAGGCGCTGTTGGTCACAATAAAACATTATCAACCGACATCACGTTTTCGTTTCTACAGAAGTGAAGGTAGTTAATAATTTTAAGAAATCCATTTCACTTAAAATTTCAATGTCTTGTCCTTCACTTGATAATTTTTCTGCTTTTTTAATCTTACTTGACTTGGTATAGTTATGAGTTTTTTCTAGGTTTTCTAAATTACCGACAACGAGGTAGTTAGTTGACTTTTTTACAGAGGAATCGTAAACAGAACCAATATTAGTTACAGTTTGGGCTATTTCGTTCCGTGTGAAACCTTTTAACGCTCCGGTAAAACAAACATGTTTACCATATAATATATGATTTTTATCGTTTAACTCTTCATTGTATACTAGCTCTATTTTCTTATTAGCCGATTTTTTTATGAATCCATTCTGACCAAACACACCGTACTTAAAATTTTGGTTTTCGACTAAATCGTTCAAGTTTGCATCTTGGTCTTTTAATATGTTATATGCAATTTTGGCACACACTTTAGCATCATAAAAAGCATTGTGATATTCTTCGTTTTTAATGTCAAAATGTTCAGCTAAATCTTGGAGTCTATATGAAGGTAAATTATATAAATCTTTACTTAATCGATAAGTACAAAAATATTGATTGCTAGGTAAAGGTAGATTGTATTTTTTGAAAGAATCACATAGAGCATACATATCGAAAGATGTATTATGGGCTACTATTATATGGTTATCTAAGAATCTAATAATAGCTTCATGCATTTGATACATTTTAGGGGAATCCATTACGTCTTCTTCGGATATTCCATGTATAGAAGTGTTTATAGAAGAAAAATAAGTTTCAGGATTTATGTGAGTATAAATAGCATCACGCATTTTGTTGTCTTGAAATTTTAATAGTGCTATTGAACAAATAGAACTGCGTTGTTCGTTAGCTGTTTCGACATCGATCGCTACAAAATCCATTATAATCAGCCCCTTTTATTTGAATAGTTTTTGACTTGCTACAACTCTACCTACAATCTTAACCTCGTCATCTTTTCCATATACTTGTGGGTAGTGACTAGGATTGTTTGATTCAGGAATTAAAATAATTTGGTCGTTGTTGTAACGTATTCTTTTGACAGTACCGTTGTATCCATTGACTAATACAACACCTAATTGGCCATTCTCAACAGTCGAATCCTTTTCAACAACTACAACGTCTCCGTCTTGAAAGAGTTTATCCATACTATCCCCAGACACTTGCAATCCGAACTCTTCTTTATTAGAGTTCAAATTTTTAGTAGCAAAGTATATGTAGTCGATTAAATTCTCTTCTGTATATATGGGCATTCCCGCAGATATCTTTGATACAACCGGTATCTTTTTAACTGGTATGGTTTCAAGTTGAGGTTTCTCATCTTCAATACCCATGATATATGATGGAGATACTCTTAATGCTTTAGCTAATTTTACTATTTTATCTCTCTTCATATTTTCGATATCGCCAGTTTCCCATTTTCTTACTGTGGATTTACCTACACCAACTAAATCTCCAACTTGTTCTAGAGTTAAATTCAATTCTTTACGTCTGCTTTTAATGTCTGGTTTCATTTTAAATTTCCTCCTAATAGGTATGTACTGAATATAACACTAAAGTTTCTTAAAAGCAACACTTATATAGGAAGTAAAAATAAAAATGTATTTTTAGACACTTTTGTGTTGACTAGATTGATATTAGCATGTATCATTGAAGTATCTTAAAAGACACGGAGGTGTTGAAAAATGAACAAAGCGAAACTTTATTCTGCTTTAGCGATGAAAGAGATGCATGTAAATGATTTTTTAAAAGAATTGAATAATCATGGTTTAAAACTTTCTAAAAGCGCTTATTATAGTAGAATTAGAGGAGAACAAGAATTTGACATCAAAGAAATTAAGACGATAGTCAAAGTTCTTAATTTAACCAGAGAAGAAATGAACGATATTTTTTTTGGAGAATTGGTGTCCTAAAAGACACTTGAGGAGGCATAAACAAATGCAAGCATTACAAACATTTAATTTTGAAGAATTACCAGTAAGAACATTAACAGTAGATAACGAACCATATTTTGTAGGTAAAGATGTGGCAGAAATCTTAGGATACTCGAATACGCGTGACGCATTAAGTAAACACGTTGATGAAGACGATAAGGAAATTCTAACGTCGCGAAACACGACTTTAGAAAATTTGCCAAATCGAGGACTTACTGCAGTCAACGAATCAGGTTTATACAGCTTAATCTTCTCATCAAAACTAGAATCAGCAAAACGATTCAAACGCTGGGTAACATCAGACGTCCTACCAGCCATTCGCAAACACGGTATCTACGCAACAGACAGTGTAATTGAGAACACGCTGAACAATCCAGATTACATCATTAACATTCTTACTGAGTATAAGAAAGAAAAAGAGCAAAACTTACTATTACAGCAAGAAATGGGAGAGTTGAAGCCTAAAGCAGATTATGTTGATGAAATCTTAAAATCAACTGGCACATTAGCTACAACTCAGATTGCAGCAGACTATGGGATTTCAGCACAAAAGTTAAACAAACTACTACACGAAGCTAGATTACAACGAAAAGTAAATAAACAGTGGGTGCTTTACTCA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97 | Staphylococcus_phage(72.6%) | tRNA,capsid,head,plate,integrase,protease,portal,tail,holin,terminase | attL 599972:599991|attR 645339:645358 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1150333 : 1158806
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP015645|1150333:1158806|DBSCAN-SWA CTTATTTTACAATTTTAGCAATAACACTTGGATATAACTCATATTCCAATTTTTTTACTTTCTCTTCTAATTGTTCTTTTGAATCGTCCGGTCTAATATCACATTTTCTCTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATACCACTATCAACATAATGTACTGTCGAACCAGTAATAGTATCGCCACTATGATATGCTTGGCCTATTGCGTCAATCCCCTTATATTTCGGCAATAGAGATGGATGTATATTCAATATTTTACCTTCAAATGAAGCTAATAAGTCTGGACCAATTAGACGCATGTAGCCAGCTAGAATAATCCACTCTACCTTATCTTCATTTAATAATGTTACTAAATGTTGTTCATACGCTGCTTTTGAATCAAATTGTTTTGGTTCATTAATATAAACAGGAATATCGTGCTTTTTTGCTCTATCTATACAAAACGCATTTTGATGATCCGTATATAGCGCCGTAACTTCAATATTTTCAAGTTTTCCTGATTCAACATGCTCAACTATATTTTCAAAGTTACTTCCTGAACCTGATGCAAAAATCGCAATTTTAACCATTGTTATACCCCCAACAATTCAATTGCAGTTGACTCATTTTTCACAATATGACCAATTTGATAGGCTTCCACATTTTGTTCTGCTAAAATCTTCAAAGCGCGTGATACATCTTTTTCATCAACGATAACCGTATAGCCAATACCCATATTAAAAATGTTATACATTTCATTTGTGTCTATATTGCCTTGTTGTTGTAACCAATCAAATATTTTTGGTGTTGGAAATGATGTAGTATCAATTCTAGCAGCATATCCGGCTGGCAATGCACGTGGAATATTTTCATAAAAACCTCCACCAGTAATATGATTCATTGCCTTAATAGAAACTTCTTTTTTCAAAGCAAGTACAGGTTTGACATATAATTTAGTTGGTTCTAAAAAGACATCGATAAATGGATGATTATCGAAGTTTGATGCCAAATCAATGCCTGATTCATTAATTAATTTGCGCACTAAACTGTATCCATTTGAATGAATGCCACTTGACGCAAGCCCTATAACAACTTGTCCCTCTTTCACTTCTGAACCATCTACATAGTCATCCTTTTCAACTGCTCCAACAGCAAATCCAGCTACATCATATTCGCCTTCGTGATACATTTCACCCATTTCAGCAGTCTCTCCACCGATAAGTGCAGTATTCGTTTCAACACATGCATCACTAATACCTTTAACAATTTGTTCAATAACTTCAGGAACAACTTTGTTTGTAGCAATGTAATCTAAAAAATATAATGGTTCTGCACCTGTCGTTAAAATATCATTAACACACATTGCGACTGCATCGATACCTATCGAATCATGTTTACCATAGTCGATAGCTAGTTTTAATTTCGTACCTACTCCGTCTGTTCCAGAAACTAAAACTGGCGCTGTCATATTTAATTGTGATAAATCAAATGTAGCACCGAATCCACCTAAACCACCGATAACTTCTTTACGCATCGTACGTTTAACATGACTAGACATTCTTTCTACAGCTTCATAACCAGCATGAATATTTACACCAGATTGTTCATATGCTTTAGACATTTAAATTTCCCTCGCTATCAAAAAAGTGTTTGTTTTTAGAAATATATTGCTTTTGTCGATGACTTAAATGCGCTTTATAATTTGCTTCATAATCATATAACCCTGCAGGATAATCTCCAGTGAAACTTTCTACACATAAGCCACTATATGGCGCGTCATAATCTAAACCAATTGATTCAATTAACCCATCTACAGATAGATATGCTAATGAATCAGCGCCAATATAATCTTTAATTTCTTCAGGTGATTTGCTTGCAGAAATTAATTCTGCCGTAGTTGAAACATCGATTCCGTAAAAACTTGGAAACATAAATTCCGGTGATGCTATACGCACATGCACTTTATTTGCACCAGAATCTTTTAACATTTTCACAATGCGTCGAATTGTCGTACCGCGAACAATGGAATCATCAACAAGAATGATATTTTTCCCATCTACTATATCTTTTACCGCAGATAACTTCACTCTCACACCTTGCTCACGTAATTCTTGAGTTGGTTGAATAAATGTTCTTGCAACATATTGATTTTTAACTAGTCCCATTTCATATGGCAAACCTATTTCTTCAGCATAACCACTCGCAGCTGATAGCGATGAATTGGGTACACCGATGACCATATCAGCATTTACAGGGCTTTCTTGGGCTAATTTTTTACCAGAAGCTTTACGTACTGCATGGACATTTTTACCAGCTATTGTTGAGTCTGGTCTAGCAAAATAAATATATTCCATCGCAGAAATTGCAGTTGTCGTATGATGTGTATAAGATTTAACTGTAATACCTTTATCGTTAATCACGACATATTCACCTGCATGAATATCTTGAACAAATTCTGCACCTAACACATCTATTGCACATGTTTCACTTGCAAGGATGTATGTCCCATCTTTCATTTTACCTACAACAAGTGGTCTGATAGCATTTGGATCTACTGCGCCATATAACGCATCTTTAGTTAAAATCGCAAATGTAAAACCGCCTTTAACTTTTCGCAAACTTTCTTTCAACGCTTCCTCAAAAGTAGGAGCTTTACTTCGACGTATCAAATGCATAATGACTTCAGTATCAGAAGACGAATGGAAGATAGCACCTTGTTTTTCTAAATTCTGACGCAATGATTTAGCATTAATGAGGTTACCATTATGACAAATACCTACACTCATATCATAAAAGTGATACAGAAACGGTTGAATATTTTCAATACCTTTATTACCTGAAGTAGCATAACGGACGTGACCAATTGCATGTTGATATCCTTTTAATCGTTCCATTTGATCATCTTTAATCGCTTCAGTTAGTAAGCCTAATCCTCGCTCGCCTTTTAATTCATTTTGATCAGAAACAACTATACCTGCACCTTCTTGACCACGATGTTGCAAACTATGAAGTCCCATATATGTTAGTTGCGCTGCTTCAGGATGATTCCAAATACCAAACACGCCACATTCTTCGTTTAATCCTGAGTAGTTAAACATTGAGCAATTGCCCCTTCCCATATTTGTTTAATATCTGAAACATTTTCACTAATCTCTGTATATGGTGTTGTTACCTTGAAATTATCACTATCTGTTAAAAGTCCAATTTCTATTGCATTATCAATATTTAAAGTTTTACCTGATTTAACAGAAACAACATATCGGCCTTGCGTCTCACTAAACAATTGTGCATTTGTTATATCTATTGAAGATTTTAATCCTAAACCGTAATGCGCACTTAGTTTAGCTAAGGTAATCAGTAAGCCACCTTTACCAACTGTTTGAACATGTGATAATAGTCCTTCACGAATAGCGGTCTTGATTGATTCACCTTTTTCAACTTCTGAACTCAAATCTAATGACTCAAATTCATGATTAACTTTGCCATAAATTAACTTTTCAAGTTGACTACCACCAAAGTCGTCCTTAGTATCACCGATTAAATATAATTTATCTCCAACTTGAGGTTCAAAATCATTTAAATAATTTACATTTTCAATCAAACCTACCATTCCAACAACTGGTGTTGGGAAAATAGAAGTACCTTTCGTTTCGTTATATAAAGATACATTACCAGAAACTACTGGTGTCTTAAGAATGTCGCATGCTTCTGCCATACCTTTCGTTGAATCTATCAACTGTTGATAGATTTCTTTCTTTTCAGGAGAACCATAATTTAAACAATCTGTCATTGCTAATGGTGTTGCACCCACGGCAATTAAATTTCGATAAGCTTCAGCTACTACCATCTTTCCACCTTCATATGGATTGTTATATACATAACGCGCTTCACCATCAATTGTTGAAGCAATTGCCTTATTTGTGCCTTCCACACGTACTACCGATGCTTGAAGTCCTGGCTTAATTATCGTATTGGCACCAACTTGTTGGTCGTATTGATCATATAAATAGTGTTTAGATGCTATAGTCGGATGCTTAAGTAATTTAAAGAAAGTATCTTTAACATCGATGTGTGTATAATCATTTTTAGAAGTATTATAATCTTTTTCTTCTCCTTCTAAAATATATACAGGTGCTTCATCAGCTAGTGGTTCAACTGGAATGTCAGCATAAACTTCGTCATCATATGTTAAAACAAAACGATTTGTATCTGTAACTTCACCTATAACAGCACTATCCAATTCGTGCTTATCAAATAAATCTAAGAATTTTTGTTCAGTACCTTTTTCAACAACTAGTAACATACGTTCTTGAGTTTCTGAAAGCATCATTTCATAAGGAGAAATACCTGGCTCACGTGTTGGCACTTGTTCTAATCTCAAATGTAACCCACTACCACCTTTTGCCGCCATTTCAGACGATGAAGATGTTAAACCAGCAGCACCCATATCTTGAATACCAACTAATTCATCAAATGTAATTGCTTCAAGTGTTGCTTCCATTAATTTTTTACCTACAAATGGATCACCGATTTGTACAGAAGGTCGTTTACTTTCGCTTTCTTCCGTCAATTCTTCAGATGCAAAAGTAGCACCATGAATACCATCTCGACCAGTTTTCAAACCAACATAAATGACCGAATTACCTACACCTTTTGCTGTGCCTTTTTGAATCATGTCGTGATTGATAACACCAACACACATTGCATTAACAAGTGGATTGCCATCATAACGTTCATCAAATTCGATTTCACCAGCAGTTGTTGGAATACCAATGCAGTTACCATAACCTCCGATACCCTTTACAACACCTTTAAGTAATCTTTGGTTTTGTTTATTATCTAATTCTCCAAATCTAAGACTGTTTAACAAATTAATAGGTCTAGCCCCAATAGAGACAATGTCACGAATGATTCCACCAACGCCTGTAGCAGCCCCTTGATATGGTTCAATTGCTGATGGATGATTGTGAGACTCTACTTTAAATACTACGGCTTGATTATCACCTATATCGACTACCCCTG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP015645|1150333:1158806|1158323_1158806_-|WP_000861572.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NZ_CP015645|1150333:1158806|1156241_1156505_-|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >NZ_CP015645|1150333:1158806|1153386_1155576_-|WP_000032727.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGDHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP015645|1150333:1158806|1157212_1158337_-|WP_001010406.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_CP015645|1150333:1158806|1150902_1151931_-|WP_042909150.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNHPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP015645|1150333:1158806|1150333_1150900_-|WP_000238664.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRKCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP015645|1150333:1158806|1155568_1156240_-|WP_000666799.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP015645|1150333:1158806|1151923_1153408_-|WP_000483713.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_CP015645|1150333:1158806|1156504_1157209_-|WP_000174053.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1178774 : 1224597
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP015645|1178774:1224597|DBSCAN-SWA 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47 | Enterococcus_phage(20.0%) | bacteriocin,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1314550 : 1360569
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP015645|1314550:1360569|DBSCAN-SWA 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70 | Staphylococcus_phage(85.07%) | head,capsid,plate,integrase,portal,tail,holin,terminase | attL 1307887:1307902|attR 1365249:1365264 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1445812 : 1460487
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP015645|1445812:1460487|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP015645|1445812:1460487|1459428_1460487_-|WP_000663026.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPLHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRSFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP015645|1445812:1460487|1452237_1452636_-|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP015645|1445812:1460487|1455163_1456669_+|WP_000193751.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP015645|1445812:1460487|1456746_1456848_-|WP_031835073.1|DBSCAN-SWA MVITDIDVYRVGREKIVIAVYNEHIKLLFILIS >NZ_CP015645|1445812:1460487|1454322_1454823_+|WP_000930014.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP015645|1445812:1460487|1450169_1452275_-|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP015645|1445812:1460487|1447513_1448485_-|WP_000876318.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_CP015645|1445812:1460487|1458535_1459078_-|WP_000197275.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDVVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_CP015645|1445812:1460487|1448523_1448679_-|WP_000499195.1|DBSCAN-SWA MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ >NZ_CP015645|1445812:1460487|1453436_1454303_+|WP_001068497.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP015645|1445812:1460487|1456938_1457856_+|WP_000429006.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMSHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP015645|1445812:1460487|1445812_1446574_-|WP_000616842.1|DBSCAN-SWA MIQVENLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFENGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_CP015645|1445812:1460487|1449080_1450052_-|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP015645|1445812:1460487|1446570_1447527_-|WP_042909103.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTLSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ |
14 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1472458 : 1480278
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP015645|1472458:1480278|DBSCAN-SWA ATTATAACATCTCCAAAATCTTGGTTTTTGCGTAAAATTCATTTACTTCATCTTTTGGCTTAGAATCAATTGTAATACCTGCTCCGACTCCATAAATCGCTTGTCCATATTTATACTCAATAGTACGAATCGGAATATTAAAAATCATTTTATCATCTTCAGTTGGAAGTAATAGTCCAATTGCTCCGCAGTATATACCACGAGGTGAACTTTCTAATTGTTTAATATATTTCATTGTATTCAGTTTCGGTGCACCTGTAATCGAACCACAAGGAAATAACGATGTTAAAATTTGAGTTAAGTCTGTATTAATTTTTAAAGTTCCACTTACCATCGAAGTCATTTGAAATACAGTTTTATATGCCTCAATAAAAAATAGTTTATACACCTTAATTGAGCCACTCTGTGATATTCTCCCTATATCGTTTCTTAGTAAATCAACAATCATGACATTTTCTGCACGATCTTTCGAAGAAGTTTGCAATGTTTTATAATACTGTTGATCTTCAGCTTCCGTTTTACCTCTAGGCATTGTCCCTTTCATCGGTTTGCTTATGATAACGTTATCGACATTGTTAAATTGTCCTTTTTGAAAAAATAATTCTGGTGAGATAGACGCTACTTGGATTTCATCAGTTTGTAATAACGCAGTATAATTACCATTACTAAATTGAGTTAATCGTTCATATAAAGTACTAATAGGATAATAAATGTTATCCGTTAAGCGCGCCGTATAGTTCACTTGATACGTTTCGCCTTCAACAATTGCTTGTTGGACACGTTTAATATTAGTCATCATAACCTCAGAAGATTCAACAAATGAAAAATGATGCTTTGATACATAAGAAGTTTGATGTTCATATGTTGAATTTATGCTTTCCGCTTTTTCAAAACTATAAGCTACTGCATAAATATCATCTTTAGCTAATGAATGTGTACACATAACATGATTAAAATACTTTGCCGCTTCGTAACTTAAATATAACGAGACATATCTACCTTGTCGTTGCTGCGCTTGTGCAAAGTGTATCACTTCTCCCACATCAGCCAACTTAGTAGCAACATACTTCTTTATAAACCCCTTTAATTGAATATGGTATTGCTTATATTCATTTTCAGTTAAATAGTAGCGATAATTATATTCTATTCTCACAGTAATCACCTACCTTCGATAAAAATAATTCAACTTGTCGATAACCGTATTCACTCAAAATAGATTCAGGATGATATTGCACACCAAAAACTGGAAATGTAATATGCTCAAATGCCATAATAATCGCTTCATCGTTTTTGGCTGTAATCTTTAAGCAATTTGGAAAAGTCGCTCCGTCAGCAATTAATGAATGATAACGCATTACATTGAAATTTTGAGGCAGTCCTTGAAAAATACCTTCATTGGTATGGCGTAACTGTGTAGTATGTCCGTGTACAGGATGATAGCCGTGAATGATATTTCCACCAAAATAAGACACGATACATTGAAATCCTAAACATACACCTAGTATAGGTACACGCTGATAAAATTGTTCTAACACTTCATTCAAGATAGGATAATCATCCGGATTACCCGGCCCAGGCGAAATAACAATTGCTTTTGGCTTCATATTAATGACGTCTTCTATCAGCAGATTATCAATACCAACAACTTGAACTGTTAGTTTCGTTTGAGTCTTAATATAGTCTATTAAATTATATGTAAATGAATCATTATTATCTATGACTAGAATCATTGTATACTCCGTTCTAAATGTGTTTTATTTTTATAATATGTATTGGATGTAGCTAAAACTTTAAAAGCATTGTCATTATCCTGACCTTGATTTTAACTAATATATGGTATATTCTATTCATCGTACATAAATGAATATCAGAGGTTCCTAGCTGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACATTGAAATTTCAAACATTCGTTGGTAAACCTTTAATATATATTATAGGAGCAACCCATTTCTTTCGTCTATCTTTTATGGAGATAGGCTTTTTTTATTTTATAAATTAAAAACGGGCTTATCAATGCCATTAACCTCTTTATTAATATTATTAATGATAGGAGCAATTACAAAATGGAAAGTGTATTAAATAATGAAAAAGCCATCGTTGTCTTTAGTGGTGGTCAAGACAGTACAACATGTCTCTTTTATGCAAAAAAACATTTCAAAGAAGTTGAACTCGTAACGTTTAATTATGGCCAAAGACATGATACCGAAATTGAAGTCGCAAAACAAATTGCACAAGATCAAGGAATGAAACATCACGTTTTAGATATGTCATTATTATCACAACTTACTCCAAACGCATTAACACAACATGATATGGAAATTACTAATAATGAAGATGGTATACCTAATACATTTGTTCCAGCTAGAAATTTACTTTTCTTGTCGTTTGCAGGCGCTCTAGCTTATCAAATTGGGGCTAAGCATATTATTACAGGCGTATGTGAAACAGACTTTTCAGGCTACCCAGACTGTCGCGATAGTTTTATAAAATCAATGAACGTAACATTAAGCCTAGCTATGGACAAAGATTTTGTCATTCATACTCCTTTAATGTGGTTAAACAAAGCAGAAACGTGGAAATTAAGTGATGAACTCGAAGTTTTAGATTATATTCGTACAAAAACATTAACATGCTATAACGGTATCATTGGGGATGGCTGTGGTGAATGTCCAGCTTGTCATTTACGTCAACGTGGACTAAATCAATATCTTGAAAGTAAAGGAGCGCTTTAAAATGTTACAACAAATCTATCCTAGTACAACGCATCCATATCAATTCGAATTAAATAAAGATTTTAATTTTTCGGCTGCACATCACATTCCTTGTGAAGAAGCAGGTATTTGTCAAAATGTCCATGGTCATACTTACTTTGTTAATTTAACAATTGTCGGTGATAAACTAGATGACACTGGCTTCTTAGTGAACTTTAGCCATTTGAAAAAGATGATACACGGTAAATTTGACCATCAACTGTTAAATAACTTACCTGCTTTTAAAAACAAAATCCCTTCAACTGAAATCGTAGCGGAAACAATTTATCAAATTGTTAAAGAAAATTTGGCATCGCTCGAACACCAACCAAAATGTATTCAAGTATTTGTAAGAGAAACACCAACAAGTTATGTTGTATTTAGACCAAAGGAACAGGTGTAACTAATGGCTAAAATTCCTGTACTCGAAATATTCGGTCCAACCATTCAGGGTGAAGGTCGAGTAATCGGTAGAAAAACGATGTTTGTGAGAACAGCTGGATGTGATTATCGCTGTAGCTGGTGTGATTCTGCATTTACTTGGGATGGTAGTGCTAAAGGCGATATAAAACTCATGACCGCTGAAGAAATTTATGATGAATTAAAACGAATTGGTGGCGATTTATTTAATCACGTTACAATTTCTGGTGGTAACCCAGCATTAATTAAAGGTATCCAAGAGTTAGTTGACTTATTTCAAGATAAAGGTATTTTCAGCGCACTGGAGACACAAGGCAGTAAATTCCAACCTTGGATGACACAAATTGATGATTTAACGATTAGTCCAAAACCACCAAGTTCAACTATGACACCTGATTTAAAAAAGTTAGATGAAGTGATTACACAATGCGTACCTTCCTCATTAAACTTAAAAGTAGTTGTATTCGACGATAAAGATTATGATTTTGCCAAAATGATACACCACCGTTATCCAGATATTCCCTTCTATTTACAAGTTGGTAACCCATATTTATCAGACAGCGTAGATAATCATACCGAAAAGTTGTTAGAACGCTACGAGCAGTTGGTGGATTTAGTTATGCAAAGTAATGATATGAATCACGTTTATGTGTTACCACAACTTCATACATTACTTTGGAGTAATAAAAAAGGTGTATAAAGGATAACTTATTTTACTTTTTACAAGTCATATCTAATGAATAACAATATATTAATTGATATAATAGTTGATTGAAGTATAACGAACAGGAGTCCATCATGATTGTATATATATTAATTAATATTGCTATCGTCGTACTTATAACTGGATTCAATTTATATAGGCATCAAATGCAACATTTATCATTAAGTGCAATGTTGTTATCTATTACGATAAACGCCTTTATAAATACATTCATAATTGATAAATATAACTTTATTACTCTGTGTACTATAACGATGTTTATCATTTGGACGATACTACAGTTTTACATTGATAAAAAATTAAAACCTGTATACATTACAGACCAAAAATTTATTGCTATCATATTAACGATTGTTGTCAGTTTAACGCAACGTGTTACCGACTTTTCAAGTACACAATCAATATATATGTCTATTCCATTTTTAGCCCCTGCCATTTTCATCATTGGTGGTATTATGTTGTTTATTTCAACATTTAATAGCTTAGATGAAACTGCTGAAAATAATAACAAAATAAAGAAACTAATGATTAAAGGACTTATCATTATTAACATTTCATTTATCGTTATGATGGTTTTAACACCATATTGGTACTTGTATTTAATCGTCTATCTTATTTTCTTGTTGTTTTTATTGTGGCAAAAGGTTTATAAATTTTAATACCAAAACTATAAAACACTTCTGATATTCTTAGTTCAAAATATCAGAAGTGTTTTATAGTGTTATCTAGTTCAGATAAATATTTTCTCACCTAAAAAAATGCCCTCCTCTTATTTCGACTCCTATTTATTTAAATCAGACAATTATTTTCATTTTCAAATTATTCTTTCTTCAATATTAGTTAAGCGATATTTAAACGAAGTTAAGAATTAGTTAATGGCATATTATTTACCTTCATTTTAAACTTAACTTATCAAATTGAAGAAATGAGGAGTTAGCATGAATACAAAATATTTTTTAGCAGTTGGTGCTGTTGCCTCTGTATTAACTTTAGGCGCTTGTGGTAATTCTAATTCACAAGATCAAGGTAACAAAACTGAACAAAAAACAAAGTCAGAAGATAGCAATGTTAAAACTGATAAAACAAAACACCTAACAGGTACATTCAGTTCTAAAAACGGTGAAACTGTTGAAGGTAAAGCTGAGATTAAAAATGGTAAATTAATGCTTACTAACTACAAATCATCAAAAGGTCCAGATTTATACGTCTACCTAACAAAAAATGGCGACATTAAAAACGGTAAAGAAATCGCAATGGTTGACTACGATAAAGAAAAACAAACATTTGATCTTAAAAATGTAGATTTAAGCAAATATGATGAAGTAACAATCTATTGTAAAAAAGCTCACGTCATCTTCGGCGACGCTAAATTAAAATAATCAATTTCTGAGTTAAACTTTTATTTACAACATACTATTACTATACATTACAAATTTTAAAAATATACATTACACTCATTACTCAATGGAAAGCGTATGATTTCACAGCCCCCCTAGCTTGTAGAAATCATACTTTCCTTTTTTCAATATATATACAACTATTAAATCCCATAAGATTGCAGAGCACATAAGTAAATTTTTTTAGAGCTTGAGGTTTGTTTAGCTTAAGCAACCCATGAGCTCAAACACTTCCTGTTCACATAACACTACAAATCGCATTATGTTGCTTAATCTTATGTTTATATAAATTACACACAATAAATAGAAAGAATGTGAACATCATGAATAAATTATTGCTACTCGTTACATTTATCATTCGTGTGGGTTCAGGTATTGTTATGTTAATGCAAGGCTACGAAAAATTAACGGGCGGATTTACGCTGAAAGGTTTAGTACCAGTCATCGCTAACAATACTGATTCACCAGAGTGGTATAAGTGGTTTTTCGCAAATATAGTTGCACATACGACGTCATTATTTGATATTGTTGTCCCACTCGGAGAGATTGCAATTGGATTAGGTTTAATTTTTGGAGTTTTTGCATATGCTGCTAGTTTCTTTGGAGCCTTTGTTATGATAAATTATATCTTAGCAGATATGATATTTACGTATCCTCTTCAATTAACTTTCTTTATCCTTTTACTAATGAGTCACTCATTGTTAAAACAGATTTCACTTAAAGAAATCATTAATTACTTTAGAGGTCGTAAGAACAGAGGTGAAAAAATAGATGACCCACTTACTGATCGTGGATGATGAACAAGACATTGTAGACATTTGTCAAACCTATTTTGAATATGAAGGTTACAAAGTAACAACGACAACTAGCGGTAAAGAAGCAATTTCTTTACTATCAAATGATATTGATATCATGGTACTTGATATCATGATGCCAGAAGTTAATGGTTACGACATTGTCAAAGAAATGAAAAGGCAAAAATTAGATATCCCCTTTATCTATTTAACTGCCAAAACACAAGAACATGATACCATTTACGCCTTAACTTTAGGTGCAGATGACTATGTCAAAAAACCATTTAGTCCAAGGGAACTCGTTTTACGTATTAATAATTTACTTACAAGAATGAAGAAATACCATCATCAACCAGTTGAACAACTGTCGTTTGATGAATTAACACTTATTAACTTAAGTAAAGTTGTGACTGTAAATGGTCACGAAGTCCCTATGCGTATTAAGGAATTTGAGTTATTGTGGTATTTAGCTTCTAGAGAAAATGAAGTTATTTCTAAATCAGAATTACTTGAAAAAGTTTGGGGATATGACTATTACGAAGATGCTAATACCGTGAATGTCCATATACACCGTATTAGAGAAAAATTAGAAAAAGAGAGCTTTACAACATATACCATCACAACTGTATGGGGATTAGGATATAAATTTGAAAGGAGCCGATAATGGTGTTATCAATTAGAAGTCAAATCATTATTGGCGTCGTATCGAGTATACTATTAACTTCAACTATTTTAGCAATTGCATATATTTTAATGTGGTTTAACGGCCATATGACACTAACTTTGACCTTAACGACAATAATTACAAGCTGTTTAACCTTATTAATATGTAGTATTTTTATTAATCCACTTATACAAAAAATTAAGCAGTTTAATATAAAAACTAAGCAATTTGCTAACGGAAATTACGCAAGCAATGATAAAACGTTTAATTCACCAAAAGAAATTTATGAATTAAATCAATCTTTTAATAAAATGGCTTCTGAAATTACGCAACAAATGAATCAAATTAAATCCGAACAACAAGAAAAAACAGAACTGATTCAAAACTTAGCCCATGATTTAAAAACACCTTTAGCAAGCATTATTTCATATTCTGAAGGACTACGTGATGGTATAATCACTAAGGATCATGAGATTAAAGAGTCATACGACATATTAATTAAACAAGCAAACAGATTATCAACATTATTTGATGATATGACTCATATTATCACTTTAAATACAGGTAAAACATATCCCCCAGAATTAATACAACTAGACCAATTACTTGTATCAATATTGCAACCATATGAGCAACGTATCAAACATGAAAACCGCACATTAGAAGTGAATTTCTGTAGCGAAATTGATGCATTTTATCAATATCGAACGCCACTTGAGCGTATTTTAACAAACTTACTTGATAATGCGCTAAAATTTTCAAATGTTGGTAGTCGCATTGATATTAATATTAGTGAAAACAAAGATCAAGATACTATCGACATTGCTATTAGCGATGAAGGTATTGGCATTATACCAGAACTACAAGAACGTATATTCGAACGTACATTCAGAGTAGAAAACTCTCGTAATACAAAAACGGGTGGTTCTGGATTAGGCTTATATATAGCTAATGAACTCGCGCAACAAAATAACGCAAAAATCAGTGTAAGCAGTGATATAGATGTAGGAACTACGATGACTGTAACATTACACAAATTAGACATTACGTCATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP015645|1472458:1480278|1473593_1474187_-|WP_000604515.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_CP015645|1472458:1480278|1475630_1476344_+|WP_001062972.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP015645|1472458:1480278|1475207_1475627_+|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_CP015645|1472458:1480278|1479222_1480278_+|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_CP015645|1472458:1480278|1472458_1473610_-|WP_001217794.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKINTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_CP015645|1472458:1480278|1474537_1475206_+|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_CP015645|1472458:1480278|1478088_1478562_+|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_CP015645|1472458:1480278|1476442_1477027_+|WP_000637687.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NZ_CP015645|1472458:1480278|1478536_1479223_+|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_CP015645|1472458:1480278|1477306_1477747_+|WP_001093561.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGDAKLK |
10 | Pandoravirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP015645.1|WP_031835073.1|1456746_1456848_-|hypothetical-protein |
1456746_1456848_-
Protein sequences of NZ_CP015645.1|WP_031835073.1|1456746_1456848_-|hypothetical-protein>NZ_CP015645.1|WP_031835073.1|1456746_1456848_-|hypothetical-protein MVITDIDVYRVGREKIVIAVYNEHIKLLFILIS |
33 aa aa | NA | NA | NA | 1445812-1460487 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.1|1035215|38|NZ_CP015645|CRT matches to NZ_CP015645 position: 1458323-1458360, mismatch: 1 agaaattggggttccaatttctctatgttggggccccg CRISPR spacer agaaattggcgttccaatttctctatgttggggccccg Protospacer ********* **************************** 2. spacer 3.1|1035215|38|NZ_CP015645|CRT matches to NZ_CP015645 position: 1458379-1458416, mismatch: 2 agaaattggggttccaatttctctatgttggggccccg CRISPR spacer agaaattggcgttccaatttctttatgttggggccccg Protospacer ********* ************.*************** |