Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP016028 | Lactobacillus curvatus strain FBA2 chromosome, complete genome | 1 crisprs | csa3,DinG,csn2,cas2,cas1,cas9,DEDDh,cas3 | 0 | 7 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP016028_1 | 1130255-1131149 | TypeII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016028_1
|
13 spacers
spacers of NZ_CP016028_1
>1.1|1130291|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT GTTCAACCATCGGACAAGCCGTCCCATAGG >1.2|1130357|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCTGCCACTCCCTAGAATGGTAAGTCGTCG >1.3|1130423|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACTGTTGATGGCGGTTGGTTAGAATGGGTT >1.4|1130489|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTACACGTCCATAAAATGTATCGCGGATAC >1.5|1130555|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACCTACAGCGACACTATTCTTAGAAGTTGT >1.6|1130621|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATGCAATCGGCGTGCCCGAAGGAACACAG >1.7|1130687|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GTATGATTAAGCGCGAGACAATGATTAAAC >1.8|1130753|31|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATTGACTCTCACGCGTTCGTAGGAACTCGT >1.9|1130820|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGCAACATGCATAGCAGGGTGTCATTTGAT >1.10|1130886|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAAAATCGGATATAACTCCCATTTCTGCC >1.11|1130952|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAAGACAGGTTAAAGCCTGAAAACTTTGAA >1.12|1131018|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATGGTGTGTTTATTGAGCACCCTTTTAAGA >1.13|1131084|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACGCAGGTTAAAGGTACATGGACAGGACAT |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016028_1
The CRISPR arrays of NZ_CP016028_1 >merge|NZ_CP016028|1|1130255-1131149|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AAAAAATAACTTATTGATTTGATACTCTTCTAAAACGTTCAACCATCGGACAAGCCGTCCCATAGGGTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAACGCTGCCACTCCCTAGAATGGTAAGTCGTCGGTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAACACTGTTGATGGCGGTTGGTTAGAATGGGTTGTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAACCTACACGTCCATAAAATGTATCGCGGATACGTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAACACCTACAGCGACACTATTCTTAGAAGTTGTGTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAACGATGCAATCGGCGTGCCCGAAGGAACACAGGTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAACGTATGATTAAGCGCGAGACAATGATTAAACGTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAACTATTGACTCTCACGCGTTCGTAGGAACTCGTGTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAACTGCAACATGCATAGCAGGGTGTCATTTGATGTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAACTAAAAATCGGATATAACTCCCATTTCTGCCGTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAACGAAGACAGGTTAAAGCCTGAAAACTTTGAAGTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAACATGGTGTGTTTATTGAGCACCCTTTTAAGAGTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAACACGCAGGTTAAAGGTACATGGACAGGACATGTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC >NZ_CP016028|1|1|1130255-1131149|CRISPRCasFinder AAAAAATAACTTATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC GTTCAACCATCGGACAAGCCGTCCCATAGG GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC GCTGCCACTCCCTAGAATGGTAAGTCGTCG GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC ACTGTTGATGGCGGTTGGTTAGAATGGGTT GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC CTACACGTCCATAAAATGTATCGCGGATAC GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC ACCTACAGCGACACTATTCTTAGAAGTTGT GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC GATGCAATCGGCGTGCCCGAAGGAACACAG GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC GTATGATTAAGCGCGAGACAATGATTAAAC GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC TATTGACTCTCACGCGTTCGTAGGAACTCGT GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC TGCAACATGCATAGCAGGGTGTCATTTGAT GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC TAAAAATCGGATATAACTCCCATTTCTGCC GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC GAAGACAGGTTAAAGCCTGAAAACTTTGAA GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC ATGGTGTGTTTATTGAGCACCCTTTTAAGA GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC ACGCAGGTTAAAGGTACATGGACAGGACAT GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC >NZ_CP016028|1|1|1130255-1131149|CRT AAAAAATAACTTATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC GTTCAACCATCGGACAAGCCGTCCCATAGG GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC GCTGCCACTCCCTAGAATGGTAAGTCGTCG GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC ACTGTTGATGGCGGTTGGTTAGAATGGGTT GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC CTACACGTCCATAAAATGTATCGCGGATAC GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC ACCTACAGCGACACTATTCTTAGAAGTTGT GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC GATGCAATCGGCGTGCCCGAAGGAACACAG GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC GTATGATTAAGCGCGAGACAATGATTAAAC GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC TATTGACTCTCACGCGTTCGTAGGAACTCGT GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC TGCAACATGCATAGCAGGGTGTCATTTGAT GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC TAAAAATCGGATATAACTCCCATTTCTGCC GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC GAAGACAGGTTAAAGCCTGAAAACTTTGAA GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC ATGGTGTGTTTATTGAGCACCCTTTTAAGA GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC ACGCAGGTTAAAGGTACATGGACAGGACAT GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC >NZ_CP016028|1|1|1130321-1131149|PILER-CR GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC GCTGCCACTCCCTAGAATGGTAAGTCGTCG GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC ACTGTTGATGGCGGTTGGTTAGAATGGGTT GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC CTACACGTCCATAAAATGTATCGCGGATAC GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC ACCTACAGCGACACTATTCTTAGAAGTTGT GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC GATGCAATCGGCGTGCCCGAAGGAACACAG GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC GTATGATTAAGCGCGAGACAATGATTAAAC GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC TATTGACTCTCACGCGTTCGTAGGAACTCGT GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC TGCAACATGCATAGCAGGGTGTCATTTGAT GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC TAAAAATCGGATATAACTCCCATTTCTGCC GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC GAAGACAGGTTAAAGCCTGAAAACTTTGAA GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC ATGGTGTGTTTATTGAGCACCCTTTTAAGA GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC ACGCAGGTTAAAGGTACATGGACAGGACAT GTTGAACTACTCATTGATTTGATACTCTTCTAAAAC
>NZ_CP016028.1|WP_064777230.1|1129324_1130107_-|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MSKLEIIDLHVGIDGKEILKGVNLEMNTGEIHAIMGPNGTGKSTLSETIMGNPKYEVLQGQIKLDGQNILEMPVDERARAGLFLAMQYPAEIQGVTNAEFMRAAINARRAEDDQISVMAFLKKLDQRMAFLDMTEEMSERYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMIEPKFAILDEIDSGLDIDALQVVSKGVNEMREADFGSLIITHYQRLLNYIVPDYVHIMMGGKIVTTGDASLAKRLEDEGYVGIRDELGLDIKLTDDESK >NZ_CP016028.1|WP_004271204.1|1128010_1129312_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MKKTLAITPEQIASFSQLHQEPAWFAEMRQAAFAQIEQLELPIFEKINYKHWPVMAANAPTAVKSDLSLMPSAAANLSADQPYAVQIGQTTAKLNLPAELAEQGVIFTDIFTALQEHPDLVQQYYMQVTVKPNEDRLTAFHTALMNSGLFLYVPKNVVIKQPITAYYVQDSTQPADFIHHVLVVAEQNSEFSYLENLQTAGDHKNLANVVVEVIAKDNSHVHFSAVDAFGKSVTTYLNRRGHLMRDARIDWALGSMNDGNIIGDFDSDLVGAGSHAETKVVAISTGKQIQGIDTRVTNIGPRSIGHILQHGVILEDATLTFNGIGHILKGAKGADAQQENRVLMLSRTARGDANPLLLIDENDVQAGHAASVGRVDEQQMYYLMSRGLSKEVAQRLVIRGFLGAVLSEIPDKNVRQQLTDTIERKLIDGQPVK >NZ_CP016028.1|WP_064777229.1|1126791_1128030_-|cysteine-desulfurase MVNQLNDYRCDFPILDQIVNDEPLVYLDNAATTQKPQAVIDRLVAYYQNDNANVHRGVHTLAERATAQYEAARTKVQTFIHAAASAEVIFTKGTTQSLNWVAGSFGPTVVEAGDEIMISVMEHHSNLVPWQQLAQKTGAKLRYIDLLPDGQLDLESARQVIGPKTKIVSLAHASNVLGVVNPIKTIAALVHAQGGYMVVDGAQAVPHMMVDVQALDADFYAFSGHKMLGPTGIGVLYGKQALLEQMPPVEYGGEMIDFVGLQSSTFKELPWRLEGGTPNIAGAIGLGTAIDYLTQIGMDHIQAHEQALVTMALPQLQAIDGLTIYGPQDAAQRTGVIAFNLDNLHPHDLATALDMEGVAVRAGHHCAQPLMQWLNVAATARASFYLYNTEADVKTFVTAIQAAKEFFQNGTL >NZ_CP016028.1|WP_054644705.1|1126313_1126805_-|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MALSKLDNLYRQVILDHSQHPHHHGHLTTADHEIELRNPTCGDVLQLELVLEDGQISQIAFSGEGCTISQASASMMTDAVMHKTPAQAEAMIERFSDMMIGDRDEDWSLLEDAAILQGVQQFPARIKCATLAWKALHKALNSDDRRATTGQMMNHAETEETNE >NZ_CP016028.1|WP_064777228.1|1124913_1126317_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufB MTEETTMPQFEEYDYGFSDDVEPVFSTGRGLTEDVVRAISREKKEPQWMLDFRLKSFHAYEKMPMPDFGPDLSDLDLEHMLYYQKATDKQYRDWEDVPDKIKETFDRLGVPEAERKYLAGSSAQYESEVVYHNMREEFEKLGIIFTDMDTGLREYPEIVKEYFSTLVKPTDNKFSALNSAVWSGGTFIYVPKGVRTDIPIQSYFRINAENSGQFERTLIIVDEGASVNYVEGCTAPSYSSDSLHAAVVEVFVKRDGYCRYTTIQNWSKNVYSLETKRAQAMENATMEWVDGNLGSKMTMKYPSVYLDGEGARGTMLSIAVAGEGVDQDSGARMIHAAPNTSSSIVSKSIAKDGGAVDYRGTVRFERDSDGSFAHVECDTIIMDDRSSSDTIPYNTILNGNVSMEHEAKVSKISEEQLYYLMSRGISEAKATEMIIMGFIEPFTKELPMEYAVELNRLISYEMEGSVG >NZ_CP016028.1|WP_064777227.1|1123664_1124594_-|IS30-like-element-ISLpl1-family-transposase MSSITYSERIKIETFCELGLSNIQMGVRLNRSPSTISYELSRCQPYQAELAQTDAEYKRSRCGRKTKLSDELKQKILNHLRLSWSPGMIAHEFKLATKSIYNWLNQWRIGFSLNDLPEHGVRQRRNVDQRSKYNQSLGRSIEQRPMMINQRKRIGDFELDTVVGPRGHSKAVLLTLIDRKSRFLWAYRLKDRTTATVNEALTKFLTTFNGPVHSFTVDRGTEFSGLVSLESQYGIKTYYCHAYTPAERGSNERFNRNLRYFYPKGTRFEHISAQDLTTTLLQINQRPLKILDWQTPYQVMLTNLSKNSD >NZ_CP016028.1|WP_064777226.1|1122513_1123620_-|hypothetical-protein MPEPLKEIYTPTFLTEFAAQVATVAPDFKQQQFVAQTLADSWVDLTLKQRTRRIATVLGEFLPQSYAEAITILERLAPECQGFAYLFFPDFVVVYGTQPQDWSRSMHALEIFTQSSSAEFAIRTFILQEPDRTMSQMQAWAQSSNAHVRRLASEGCRPRLPWGESLPIFKADPQPVLAILEQLKNDPELYVRRSVANNLNDIAKDHPALVIQTAHRWQGASPEVDWVIRHGCRTLLCKDFVSVRDLFGYAGDRQDQPLVVAATITTRSKEVAIGDRLAFEYRIRFRAEAGLLIRVEYAVDYVKANGQQSRKLFKLVEKKIDGRQGLQGERQINFKDLTTRKHYPGLHQVALIVNGQAVAKTEFEVRRG >NZ_CP016028.1|WP_081272998.1|1122248_1122377_-|MerR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MAEKLLTISKFAQLFNTTQHTIRHYEQQGLLQPATIAANGYR >NZ_CP016028.1|WP_162269983.1|1121663_1122224_-|MerR-family-DNA-binding-protein MSFILFLRQLGLSLAEIKAILTSDYSEQTLLLNKKQALQEEIARLQALEQTIDDQLQQVNQQDTLQVDQPIHLRVLQRLPFAQDFDLSVVETIDWQPDWMLRQLYYVINETDYAICMATPAVSDYQIDAGCYVTTTIEAASGAEFDSALAAITTHQTLPLIGIEMRGTFLSPGKHLAVKILGNPKE >NZ_CP016028.1|WP_064777225.1|1121104_1121659_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MQLETQRLILRPFELTDDQAIYEYAKDPDIGPIAGWPVHTSVAHSRELIQNYLMAKAIFAVNLKTAPNHAIGSVGLELVENGGGQPFMGANDAEIGYWIGVPYWGQGLIPEAAEKILAYGFETLKLDNIWCGYYDGNQQSKRAQEKLGFQPVLTIDEMYNPLLDDTRQEHFTKMTKAQWQARHQ >NZ_CP016028.1|WP_064777231.1|1131175_1131847_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MNITFYPYQPFSVQNKKITVCSTSSPEVYTKLIAGMSGAQETVKFSNDQYELMDYSKAVIWGGDVAAINLNHLFQNRLIKKFAADLTDQQRQKLTQLDSEIRSTILDAAFMYELTLDVNQEWDLQRMIKFYNLQFSTAVQHDPYGIIESIVQTAVELNESKIITLINVSHYLSINQFNELVRLVATLNVKLFLIEFSEEVKSDQYQKCCYYHIDNDYVEWRYE >NZ_CP016028.1|WP_081273026.1|1131843_1132134_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MFDLPVETSEDRKAYRHFRKALLNEGFLMIQYSVYVRVCVSKQSAQFIENRIAGFTPPAGLVQTLMVTEQQYNKMHFLLSESSDDVRNSAERTLIL >NZ_CP016028.1|WP_004270938.1|1132126_1133032_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MSWRTVVISQHAKVSYSGRKIIVQTKDATHQVPIDDIQILLVATTQAVLTASAITELSEAGAKIIFTGKDGNPTCETIADYPGNRSLASIQQQVEWGTGLKETLWTAIIQAKIAMQIQCAQLLGKDIEDLTTEADAMVFADRTNREAVIARKYFQLVFDKDFVRTEYSPINAALNYGYSLLLSAVNREIVCNGYLTQFGIHHHNGVSDFNLGSDLMEPFRPVIDYWVAHQKFNELTPDVKFGLVELLNLELEYNGQITILRNALTKHVQNCLKFMTTPKEEFEVKVVMTHEVPNNALISHV >NZ_CP016028.1|WP_064777233.1|1133258_1137365_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MSRPYNISLDIGTSSIGWSVVDDQSKLVSVRGKYGYGVRLYDEGQTAAERRSFRTTRRRLKRRKWRLGLLREIFEPYITPVDDTFFLRQKQSNLSPKDQRKLYPQTSLFNDRTDRAFYDDYPTIYHLRYKLMTEKRQFDIREIYLAMHHIVKYRGHFLNEAPVSSFKSSEINLVAHFDRLNTIFADLFSESGFQLETDKLAEVKALLLDNQQSASNRQRQALSLIYTPSTNKAVEKQNKAIATELLKAILGLKAKFNVLTGIEAEDVKAWTLTFNAENFDEEMVKLESSLDDNAHQIIESLQELYSGVLLAGIVPENQSLSQAMITKYDDHQKHLKMLKAVREALAPEDRQRLKQAYDQYVDGQENTKAYSKEDFYGDITKALKNNPDHPIVSEIKKLIELDQFMPKQRTKDNGAIPHQLHQQELDRIIENQQQYYPWLAELNPNSKRQTVAKYKLDELVAFRVPYYVGPLITAEQQQQSSDAKFAWMIRKAEGRITPWNFDDKVDRQASANEFIKRMTTTDTYLLAEDVLPKQSLIYQRFEVLNELNGLKIDDQPITTELKQAIFTDLFMQKISVTVKNIQDYLVSEKRYASRPAITGLSDENKFNSRLSTYHDLKAIVGDAVEDVDKQVDLEKCVEWSTIFEDGKIYSAKLNEIDWLTDQQRVQLAAKRYRGWGRLSAKLLTQIVNANGQRIMDLLWDTTDNFMRIVHSEDFDKLITEANQMMLAENDVQDVINDLYTSPQNKKALRQILLVVNDIQKAMKGQAPERILIEFAREDEVNRRLSVQRKRQVEQVYQNISNELLNNTEIRNELKDLSNSALSNTRLFLYFMQGGRDMYTGDSLNIDRLSTYDIDHILPQSFIKDNSLDNRVLVSQKMNRSKADQVPTDFTSVELGKKMQLQWEQMLRAGLITKKKYDNLTLNPDHISKYAMKGFINRQLVETRQVIKLATNLLMEQYGEDNIELITVKSGLTHQMRTEFDFPKNRNLNNHHHAFDAYLTAFVGLYLLKRYPKLKPYFVYGEYQKASQQDKWRNFNFLNGLKKDELVDENTEAVIWDKESGLAYLNKIYQFKKILVTREVHENSGALFNQTLYAAKDDKASGQGSKQLIPAKQNRPTALYGGYSGKTVAYMCIVRIKNKKGDLYKVCGVETSWLAQLKQLTDEDSQKAFLKQKISPQFTKVKKQKGTIVKVVEDFEVIAPHILINQRFFDNGQELTLGSATYKHNEQELILDKTAVKLLNGALPLTQSEELAEQVYDEILDQVMHYFPLYDTNQFRAKLSAGKAAFMKLPWKSQWDGNKMVQVGQQVILDRVLIGLHANAAVSDLGILKLTTPFGKLQKSSGIYLSPDTQIIYQSPTGLFERRVALRDL >NZ_CP016028.1|WP_004270942.1|1137493_1138315_-|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKHSLGLLAAVFLLAGALAACGNKEAKSDSNTIVVGASAIPHAAILKHVQPELKKEGINLKVKVFSDYVLPNKALASGELDANYYQHKPFLKKANKDNGYDLVSVGSIHLEPLGLYSKQVKKLSDVKSGAKVLVSSSQPDWGRVLTILKDGGLITLKSGVNAENATFKDIASNPKHLKFEYTFEPKLMPELLKNDEGTLVAINSNYAVQAGLNPEKDAVALEKQSSPFANIVVTNKKDRNNPAIKKLVKALKSKSTQEWIKNKWHGAVLPVE >NZ_CP016028.1|WP_035186770.1|1138334_1139024_-|ABC-transporter-permease MDNVNGFQSYFQFKQVNWPSMWQATFETVWLTIVSVLLVAVLGFALGLVLYQTNASGGRVNRLLNGIVALLVNVFRSIPFIILIVLLIPLTKGLMGTMIGPKAAIPALIISAAPFYARLVELAFREVDGGVLEATRSMGASKVQIVWQVLLPESMPALVSGLTVTAISLVGYTAMAGVIGAGGLGNLAYQDGFQANQNAITLVATVIILIIVFICQKTGDLVVQHIDHR >NZ_CP016028.1|WP_004270940.1|1139016_1140051_-|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MLTLKQVGKTFEREQKTFAALTDVSLNIEAGEIYGIIGYSGAGKSTLIRLLNGLEKPTTGDVLVEGQSIVGLSEQAMRPIRQKIGMIFQHFNLLWSKTVLENIMLPLKLAGVPKAERQIKARALLKIVELTHLEAAYPSELSGGQKQRVAIARALISDPKILLCDEATSALDPKTTNSILTLLAKINREMGITIVLVTHEMDAVRRICQRIAVMENGRLIEEGTVHEIFEKPQMAATKAFVAESLVVSPSETAASIDQLLERVPNGTIVQLRFNEEQSSQPVIGRLMRQYPAVEISVISGSLQQTINGALGYLYIQIQANPSDLKAVLAELAQQTIEVEVVRHG >NZ_CP016028.1|WP_035186777.1|1140441_1140744_-|glycine-cleavage-system-protein-H MNNNDYFWTEEIAASIRRIGITKAAQNEFGLIKFVDVPIVGQKLTANETLVAIEAEKMVQDLDSPLAGELVNVNTPLADNPELLNADNEKDAWIADIRVD >NZ_CP016028.1|WP_039099358.1|1140763_1141963_-|FtsW/RodA/SpoVE-family-cell-cycle-protein MPKEVETTEDSSRVDYGIVFSVFMLALIGLMSIYVATSHDTSGASSTRAVIMQAAWYVIGGIAIVAIMQFDSEQLWRIAPLAYGLGIFLLIAVLIFYNRAVALQTGAKSWFSLGPISFQPSEVMKPAYILMLGRVVTQHNTAYPEHTIKTDWMLLGRMLLWTLPVMVLLKLQNDFGTLLVFVAILGGIVLVSGVTWKILAPAIAVLVAVGGTALTLAATTPGRVILTHLGFKTYQFNRIDAWLHPFDNTASTSLQLSQSLKAIGSGQLFGKGFNQVQVHVPVRESDMIFSVIGENFGFVGSCFVILLYFLLIYQMIRVTFDTKNEFYAYVSTGIIMMILFHVFENIGMSVGLLPLTGIPLPFISQGGSSLLGNLIGVGFIMSMRYHYKSYMFSEAEDTF >NZ_CP016028.1|WP_004270939.1|1142056_1142287_-|DUF2969-domain-containing-protein MSKKEQKITVTIDDIKRNGQEMTSVMVGKNEIGVIVEDSAKKRFEATVEGTGQSIITKTHDDAVNELLREYHLHQG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP016028_1 | 1.8|1130753|31|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1130753-1130783 | 31 | MN855837 | Bacteriophage sp. isolate 206, complete genome | 1422-1452 | 3 | 0.903 |
NZ_CP016028_1 | 1.2|1130357|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1130357-1130386 | 30 | KY065466 | Streptococcus phage IPP25, complete genome | 10208-10237 | 7 | 0.767 |
NZ_CP016028_1 | 1.2|1130357|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1130357-1130386 | 30 | MK448737 | Streptococcus phage Javan351, complete genome | 9895-9924 | 7 | 0.767 |
NZ_CP016028_1 | 1.2|1130357|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1130357-1130386 | 30 | KY065468 | Streptococcus phage IPP27, complete genome | 10201-10230 | 7 | 0.767 |
NZ_CP016028_1 | 1.6|1130621|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1130621-1130650 | 30 | NC_020062 | Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c, complete sequence | 1880823-1880852 | 7 | 0.767 |
NZ_CP016028_1 | 1.3|1130423|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1130423-1130452 | 30 | NZ_CP013139 | Pseudoalteromonas sp. Bsw20308 plasmid pPBSW1, complete sequence | 239873-239902 | 8 | 0.733 |
NZ_CP016028_1 | 1.6|1130621|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1130621-1130650 | 30 | NC_021289 | Burkholderia insecticola plasmid p1, complete sequence | 249835-249864 | 8 | 0.733 |
NZ_CP016028_1 | 1.7|1130687|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1130687-1130716 | 30 | NZ_CP040459 | Pseudomonas stutzeri strain PheN2 plasmid unnamed, complete sequence | 69675-69704 | 8 | 0.733 |
NZ_CP016028_1 | 1.12|1131018|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1131018-1131047 | 30 | KT852578 | Bacillus phage BMBtp1, complete genome | 3417-3446 | 8 | 0.733 |
NZ_CP016028_1 | 1.1|1130291|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT | 1130291-1130320 | 30 | NZ_CP024892 | Rhodococcus ruber strain YYL plasmid pYYL1.1, complete sequence | 197590-197619 | 9 | 0.7 |
1. spacer 1.8|1130753|31|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN855837 (Bacteriophage sp. isolate 206, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.903
tattgactctcacgcgttcgtaggaactcgt CRISPR spacer cattgactctcacgcgttcgttgggactcgt Protospacer .******************** **.******
2. spacer 1.2|1130357|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY065466 (Streptococcus phage IPP25, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gctgccactccctagaatggtaagtcgtcg CRISPR spacer ttagtaactccttagaatggtaaatcgtcg Protospacer . *. *****.***********.******
3. spacer 1.2|1130357|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448737 (Streptococcus phage Javan351, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gctgccactccctagaatggtaagtcgtcg CRISPR spacer ttagtaactccttagaatggtaaatcgtcg Protospacer . *. *****.***********.******
4. spacer 1.2|1130357|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY065468 (Streptococcus phage IPP27, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gctgccactccctagaatggtaagtcgtcg CRISPR spacer ttagtaactccttagaatggtaaatcgtcg Protospacer . *. *****.***********.******
5. spacer 1.6|1130621|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_020062 (Rhizobium tropici CIAT 899 plasmid pRtrCIAT899c, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gatgcaatcggcgtgcccgaaggaacacag CRISPR spacer cttgcgatcggcctgcccgaaggaaaccaa Protospacer ***.****** ************ **.
6. spacer 1.3|1130423|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013139 (Pseudoalteromonas sp. Bsw20308 plasmid pPBSW1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
actgttgatggcggttggttagaatgggtt CRISPR spacer gctgttgatggcggctggttagcacgataa Protospacer .*************.******* *.*.
7. spacer 1.6|1130621|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_021289 (Burkholderia insecticola plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
gatgcaatcggcgtgcccgaaggaacacag CRISPR spacer aatgcaagcggcgtgcccgaagggcggggg Protospacer .****** ***************. . .*
8. spacer 1.7|1130687|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP040459 (Pseudomonas stutzeri strain PheN2 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
gtatgattaagcgcgagacaatgattaaac CRISPR spacer cgttaattaagggcgacacaatgattaaga Protospacer *.****** **** ***********.
9. spacer 1.12|1131018|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KT852578 (Bacillus phage BMBtp1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
atggtgtgtttattgagcacccttttaaga CRISPR spacer taagtgtgtctattgagtacccttttccaa Protospacer .******.*******.******** .*
10. spacer 1.1|1130291|30|NZ_CP016028|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP024892 (Rhodococcus ruber strain YYL plasmid pYYL1.1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gttcaaccatcggacaagccgtcccatagg CRISPR spacer acaccgagatcggacaagccgtcccagaga Protospacer .. * . ****************** **.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
8199 : 65968
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP016028|8199:65968|DBSCAN-SWA TTTAATCCGAACAAGCCCGGAATCTTTCAATGGCAGTCTGTTGATGATGTATTTTTAATGGTCGTTGATTAATTAGTTCAAGTGCTGCTAGGATCTCATCAGTCGTTACTTGGCTAAAATTGGTCTTTTTCGGGAAGAACCAGCGTAACCGTCTATTAAAATATTCATTGGAACCTCGCTCCCATGGTGAATATGGATGGCAAAAATAAACTTTGATCTGATAATCCTGTTCTAAGGCCTGATAATTGGCAAACTCTTTACCATGATCAACAGTAATGGATTTTACTTGGGGACCGAAGGCCCCCATAAACTTACCAAAAGCGGTGTTTAGAGCCTTAGCCGTTCTATTAGGGGCTTTGATGGCCCATAGAAGTCGGGTCTTACGTTCTACGAATGTAACCAGACATGATCGTGACTCACTTCGACTAGAAAGCACCGTATCTACTTCCCAATGACCAAAAGCTAACCGTTGATTAACAGTTGTTGGCCGTTGTTCGATGGAAGTCCCACTTGTAAATTTCCCACGATTTTCGCTCACTCGGTGCTGGCGGACATTCCGATTGGGTAGATCAGTCAATTTGAAGGGGAGCCAGCCACGATTAAGCCAATTATAAATTGACGCAGTGCTCAAGTTATAAGCGGCCGCAATGGTTTCTGGTGACCAGGTTAATCGTAAGTGATTGGTAATTAAAGTCGCTAATGCTGCCGTCAGCATCGAACGACGACCGCAATTCCGCCTTTTGCGATCTGCATCTTGCTGAGCTAATTCTGGATCATAAGGTTTAACTCGGTCCAACTCATAGCTAATCGTAGCTTTGGCGACGCCTAAGGCGTCAGCCATTACTTGGTAAGATTTATTCCCCTCATTGACCAGTTGTGCTAGTGCGCCACGTTGAAAACGTGATAAAGTAGATGTACCCAAAGTAATCACTCCCTATATTGGTTGGAATTAGCTACTACCATTGTAAGTGATTGCTTTGGGCTTTTTAATTTCTGTTCAGATTAATTATAGAATTTTCCAAAGAGAAAAAGAAGGCTGATTTAGCATTATGAAGTGAACCCCCGATATTGGACCAAAATCCAATATCGGGGGTTTTTATATTGACCAAATATTCTAAAACATTAAAAATAAAAGTTGTTCAGGATTATCTAACGTCACCCTTAGGTTATAAATTAATAGCGAGAAAATATGGTATTAAGAGTAACTCACTAGTTGTCTCGTGGGCTCAACGTTATAAGGCCTTTGGCCCAAAAAGACTGGATGTCCTATCACCCAAAAAAACATTTGATGGCTCATTTAAGATGAATGTTTTAAAATGGATGAAAACGAATAAGGCTTCTTATCCGAAAACCGCACTTCATTTTAATATCTCAAACATCGGGACCATCTGACAATGGCAACATATTTGGGAGACTGAGGGTGCTGATGCCTTAGTTCCAAAGGACGGCAAACAATTATGTCAGCTGATAAACAATCAAAAAAACGGCAACAAACAGAGTTAGAACGTCTTAGAGAAGAAAATGAATTACTACAAATCGAGAATGAATACCTAAAAAAATTAAGAGCCTTAGTCCAGGAAGAAGAAAACAACAAGCGCAAGTCATCCAAGAGCTAAGGCTTAAACACAAACTAGTAAAAATTCTAAAAATAGTTGGTATGGCCAAAAGTACGTATGAATACATTATTAGTCATGAACCGAACGGTTCATCTGACCAATCTGTTAAACAAACCATCCAAATAATCAAGAAGAATCATCCAGCGTACGGTTATCGTCGTGTAACTGGTGAATTACATCGTATGAATATCTTAGTAAATGGTAGATTGCAAATTTAATCCGAATTTTTGGACAAATTTGTCAGCATCACCTGATACGGTGTTTGCCAGTCGAGTATTTTAAGCGGTCGCTGGTTAATTTGGAGTAACGTCGTCGTTAAATCTTGAGCACTAATGTGCTCAAAACGAGTCCCTTTAGGATAAAAATAACGTAAATTCCGATTAAAGCGTTCATTACTACCACGTTCAGCTGGCGTATAAGCATGGCAGTAATAGGTCTTAATACCATATTGTGATTCAAGTGATACTAGCCCACTAAACTCAGTGCCACGGTCCACAGTAAAGCTGTGCACCGGACCATTAAAAGTGGTTAGGAACTTAGTTAGGGCTTCATTAACAGTCGCTGTCGTCCGATTTTTTAACCGGTATGCCCAAAGGAACCGTGATTTGCGATCGATTAAAGTTAATAAAACTGCCTTACTATGCCCACGAGGACCAACGACTGTATCTAGTTCAAAATCGCCGATGCGCTTACGTTGATTAATCATCATGGGACGCTGTTCAATTGATCGCCCCAAAGATTGATTATATTTGGATCGTTGGTCAACGTTACGCCGTTGGCGTACGCCATGTTCAGGTAGATCATTCAAGGAGAAACCAATTCTCCCCTGATTTAGCCAATTATAAATAGATTTAGTAGCTAGTTTAAATTCGTGAGCAATCATTCCTGGTGACCAGCTTAGACGTAAATGGTTGAGAATTTTTTGCTTTAACTCATCGCTCAGCTTAGTTTTCCGACCACATCGTGATCGCTTGTATTCGGCATCTGTTTGTGCTAATTCAGCCTGATAAGGTTGACATCGAGATAATTCATAAGAAATTGTTGACGGTAATCGGTTCAGCCGAACGCCCATTTGGATATTGGACAGCCCTAGTTCACAAAAGGTTTCGATTTTAATTCGTTCGGAATAGGTTATACTAGACAAAAAATCAGCTCCTAAAAGATGGGTTTGTGGTAAACACCATTTTAAAGGAAGCTGATCTTTTTTGTCCGAACAGCGTTCGGATTAATTTTACAATCTACCAAATTATAAAAAAGTACTTGTCTTAATGCGAGAACTGCAATTACTATCAACTGCATTTAACAAACATACTCGTAAATATAATTCATATAGAGGCAATGTTGGCACCGTTGCTAAGAACTTGATCAACCGTCGTTTCTTCACTGATCATCCTTATCAAAAACTAGTAACAGACGTTACTGAAGTTCGCTGGGGAACCAAGACAATTGATGAACGCGCCTATTTCACATGTATTTATGATTTATTCTCAGGTGAAATTCTCAGCCATCAAGTTAGTAAACACCCTACTGTTGAATTTACTACAACTGTTTTGAATCGAGCAGTTAAGAAAATCCCTAAGAATTTAAAATACCGGACAACAGTCCACTCAGATCAAGGATTTCAATACCAGCATCAAGATTGGACTCATATCTTGAAAGAACATCGCATTTTTCAAAGTATGTCTCGCAAAGCAACATGTTTGGATAATGCAGCAATGGAGAGCTTTTTCCATATTATGAAAGCCGAAGCTTTCTACCAAAAAGAAACCGATACTTATGAAACGCTAGTTTCACAAATATCGGTTTGGATTGATGATTATAATTTTTCAAGAATTAAAACAAAACTGGGTTGTAAAAGTCCGATTGAATATCGAATTTTTACAACCCAGAAAGCTGCTTAAAGTTTCGTCCAATATTTGGGGTTCACTTCACCCATGGGGTTTCTTTTTTTATTTTTATTTGTGATACGGACTTCCTTGATTAATCATAAACGCCCGGTAAATCTGTTCGGTCAATACTAAACGCATCAATTGGTGCGGTAACGTGAGCTTGCCAAATGATAGCGCATCGTTGGCGCGTTTATTAACGGCATCGCTCGTTCCAAGCGACCCACCGATGACAAACGTGATATCTGATTTGCCATAGGTTGCTAAATCTTGAATTTCTTGTGCAAATTCTTCTGAAGCGCGTTCCTTGCCTTGAATTGCCAAAACAATCACGTGCTCCTTATCCTTAATCTTATTAAGAATTCGTTCGCCTTCTTTGTCTTTGACATTGGTCATTTCCGCGTTACTCAATGATTCCGGCGCTTTTTCATCCGCGACTTCAATCATTTCGAACTTACAGAACTTACTGAGCCGTTTCGCATATTCCGCGATCCCCGCTTTTAAATACTTTTCCTTTAATTTACCAACTGTGATTACTTTAATGTTCATAAATAGCCTCCTACTGTTACTTACATTTTATGAGAAAACAATGCAGAAAAAAAGCCATTCACAGTAATTCACCGAAAAGTACTGCTTATCCACAAAAGTTGTCCACATATGCACAGGTGTTCGTCCCAAATATGGTATCTCGAATTTTTCTTGATACCAAATAACCGACACCTAAATTTTTTCGTTAAATTTAATAAAAAAGTTATCCACCCTTTTTTGATTGTTCGTTCTTCGAATTATCCGGTTACAAATCCTTTTATATCAGCGTTGTTCTGATGTTATAATAATTTTAAAAAAGTTATCCACCGCCTGTTAATTTTTTTGTGGATAACTAAAAAGACCTTTTAACCGTGTTATACCCACAATCCACAGACTTATCCACAGGCGCTCGGATTTCTTCCCAGGTTACTATCCACATTGACATTTTTAAAACTTAACATTCCTGCCACTTTAGTCTGAATTTAACCAAAATAAAAAGCCGTCACCATCTAATTGATGCTGGCGGCTTTAATTTATTTTGCTGCCGTTGTACTATCTGTTGATGCTGCTTCAGTCAACTTCACTGTTGATTTCTTCAATTCACCATTATGATAATACTGAATTTCAACCGTACTATTCATATCGTAACTGTAAAGTGTCGTGTGTAAATCAGCAACACTTGTGATATCCTTGCCACCTAAACCAACAATGACGTCGTATTTACTAATCCCTGCCTTCTTAGCAACTGAGTTGGCATTGACTGATGCAACAACTACCCCACTCTTCACAGAGGTTGGTAATTTCAAGACTGATGATTGTTGCGTTGATGAAACATTCGTCAAATCGATGACGCTAATCCCAAGCACTGGTCGAACAACTTTCCCATTTGCAACCAATTGGTTAATAATTTTGACCACTTCGTTACTTGGAATGGCAAAGCCCATCCCTTCAACCGTTGTGCTCCCGTTAG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52 | Bacillus_phage(11.11%) | integrase,holin,transposase,tRNA | attL 20069:20097|attR 29784:29812 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
80489 : 89397
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP016028|80489:89397|DBSCAN-SWA TTTAATCGATATTCACATCTAGCAATGCAAGAATCCGGTTTAAATCATCGACTGTGCTGTAATCAATCTCAATCTTTCCGCGACCCTTGCTGTTAATCGCAATATTGACCTTGGTGTCAAATTTATCGACCAATTGATTTTCACTCGCTTGAATATAGGGTGATTTAATCTTGGTCTTCGTCACTTTCGCAGCTTTAATCTGGTTCATCTGGTTAATTAACTGCTCTAGTTGTCGCACCGTTAAGCCTTCATCAATCGTGCGTTTCGCTAATGCACTAATCTGACTTTTTTTCTTCAATGATAATAACGTCCGCGCCTGTCCCATTGAAAGGTCACCATTTTGTAATAACGTCTTCACGTCATTGGGTAAACCCAATAAGCGCAAGTAATTGGCAATGTATGGGCGGCTCTTGCCCAACCGTTCTGATACTTCAGCTTGAGTCAGGTTTAACTTTTTCAAGAGTGTATCGTAAGCTTGGGCTTCTTCTAACGGCGTTAAATCTTCACGTTGCAGGTTTTCCAAGACCGCAATTTCCATCATTGCGGATTCATCAAACTGCCGCGTGATGGCTGGTATCGCTGTTTTACCAGCTAACTTAGACGCACGGAATCGGCGTTCACCCGCAATTAATTCGTAACCATTAATACTTTTGCGAACAATGATTGGTTGGAAAACGCCCGACTTCTTAATTGACGCTGCTAATTCAGCCAAAGCCGCTTCATCAAATGTCTTCCGCGGTTGATAGGGATTTGGACGAATATCATCAAGTGCAATCTCTTCAACTAATTCATCCGCCCGGTTTTTATTAGGGCCTTCGAACGCTGAAAATACAGCATCCAAACCGCGGCCCAATCCTTTTCCATTTCTAGTTGCCATGAGCTGCTAACACTTCCTTTGCCAAATTTTGGTAAACTTCAGCGCCCCGTGATTTTGGATCATAATCAATGATTGATACGCCATGACTAGGTGCTTCTGCTAAGCGCGTATTCCGTGGCACAATCGTGTCGTAAACCCGATCACCAAAATACTTACGCACTTCTTCAATCACTTGAGCCCCTAAATTCGTCCGCGCATCATACATCGTCAACAACACGCCTTCAATCGCTAAGTTTGGGTTAAAATGTTTTTGCACCAAACGAACGGTGTTTAACAATTGGCTCAATCCTTCTAAGGCATAATATTCACTTTGAACTGGAATCATGATTGAATTACTTGCCGTAAAGGCATTGATTGAAAGTTGCCCTAATGAAGGTGGACAGTCAATCAAAACGTAATCATAATCGGCTAAGACTGGTTCTAACCCTAACTTCAAGCGCATTTCACGCGCCATCTGTGATGTTAGCTCGATCTCTGCCCCTGCAAGTTGAATCGTAGCTGGAACAATGTCTAAGTTCTTATGTGATGTTTTAATAATTGTTTCTTTTAGTGGGAATTCATCGACCAACACATCATAGATATCTTTTTCGACTTGGGATTTTTGAACCCCAATCCCGCTTGTCGCATTCCCTTGTGCATCTGAATCAATGATTAACACGTGATTGCCAGCATCCGCCAAACAAGCGCCTAGATTAATCGTGGTCGTTGTTTTACCAACGCCACCTTTTTGATTTGCAATTGAAATAACGTGTGCCATAATGAGCCTCCCTTATTGCTTTGGAATTTCGATCGTAATCCGATAAACATCATCTTGTTCTTCTTCGGTGGCTTTGACGGCAATCCCGCTTTGTTCAACCATTTGAACCGACTTTTTGATGGTGTTGACGGCAATGCGTGTATCATGGGCAATTGCTTTTTTTGCTTTATCGTTCGCTTTTTTAGCCTTCGTGGTAGCTTCTTTTAAACTGTCATCGGTTGCATCAACTGTCTCTTCAGTTGATTCTGGTTCAGGATTCAACGTCTTGTTAACCAGCGCTTCCGTATCCTTAACCGTTAATTGTTCAGCCAAGATTTGGTGTAAAATCATTTGTTGCTTGAATTCATCCAACCGTAAAAGGCTCCGACCGTGTCGTTCAGAAATTTCATGATTCATGATGGCTTCTTGAACGGGTTGTGAGAGTTTCAATAGCCGCAACTTATTAGCAACAAAAGATTGGCTCTTACCCATCTTTTCTGCCAAGCTGGCTTGTGTGAAGTCGTTCAGCTTCATTAAGTCCTTATAAGCTTGTGCTTCTTCAACGGCGGTTAATTCTTCGCGTTGTAAGTTTTCAATCAAGGCCATTGAAGCTGTTTCGTGATCATCCATAGTTTGAACAATCGCTGGTAATTTAGCCCATTTGAGGGTTTGAATCGCTCTAAAACGGCGTTCACCCGCAATAATTTCATATTTTTGATCTTCATATTCACGTAAGATAATCGGTTGCAATAAGCCGTGTTGTTCGATTGTGCTTGCTAATTCGGCGATATTGTCCGCATTAAATACTTTTCGTGGTTGGAACCGGTTAGGCACAATTGCTGAAACCGGCACTTTGATCACTTGATTAATACTTTTATCGTCTTTTTTCTTATTAAAAAATGAGAGTGCCATTATTTTTCCTCCTTAGCCATTAACGGTTTTTTAACTGGCACACCAGCCCGCCGTGGATACTTGGCAGGTGTCGGTGCAACCTTATCAATTACGATTAGATGTCGTTGATCATCTGTTTCTGGTAGCGTCAAAGCAATGTCTTGTGCAAATTGGCCACCAAGTGTTTCGATTGCATAGTTGGCTTCTGCCAATTCCGTTTCACCTTGACTGGCTTTTAATGCGATAAACTGCCCACCAACTTTAACAGTTGGTAAACAGAATTCTGCCAGTACATTTAATGAAGCAACGGCCCGGGCAGTCACAATATCAAACTGTTCACGATATGGACTCTTCGGGTTGCTGAACAGTTCTGCTCGATCATGGACCAACGTCACATCAGACAAACCTAATTCACGGACCAATTCTTCTAAGAAGTGAATCCGCTTGTTTAATGAATCAACAATCGTAATCTTCAATTGCGGGAATAAAATTTTGATCGGTAACGATGGAAAACCCGCGCCCGCACCAATATCACAAATCGTAAGGGGTTCAGTGCGTAGTTTTTCAAGATACAAAGTTGGTGTGACAGAATCGAAGAAGTGCTTGAGATAAACTGCTTCTTGTTCTGTAATGGCTGTCAAATTAACTTGTTGGTTCACTTGTACAAGTCGTTTGAAATACAATTCAAACTGATCCATTTGTGCTTGTGAAACTTGAATATTGTATGTTTTTAACGTTGCTGCAAAAGCCGTTGGTGTCATTATTTCTCCTTAACTATGCTTTAAAGTAGGCGTTTAATTCGTGGAACATTATTGTTTCACATATACCTTTCAGTTTAACGTACTTACCCTAAAAAAACAAGATTCTTCCCAGTTTTCAGATTATTGTTTCATGTGAAACATAATACTCGGTAATTTAAGAACAATTATCGCCTTTTTCAAGCGAATCATTCAGTAAGAAAGCACTTTTGTCATCGAACAGTTGGTGTGCATCATCACAAAGGCGAACTATCGCGATTATTTAAGAATATTATATTCGTTTTTTACTTAATTTCTAATTGAAGTCACTATTGGCGTGTGCTAAACTAAATGTTAACTAAATTTTAACGATTATCTTGGAGGGACACTCGTGGCAGATATACACTCAAATTCAGCACAGCCAACTAATCCAAATGAAAAGCTTCCCCACATTAAAGCAGCGATTCTCGGCTTACAACATCTTCTAGCAATGTATTCTGGCGATGTTTTAATTCCATTACTTGTCGGGGCTGCATTACATTTTAATGCCGCTCAAATGACTTACCTCGTTTCAGTCGATATTTTCATGTGCGGGGTTGCGACCTTATTACAATTAAAACGAACCCCACTGACCGGGATTGCATTACCGGTTGTCCTAGGTTGTGCTGTTGAGTACGTTGGCCCGTTAACCGCCATCGGCACTAACAGCCAACTCGGAATTGACGTTATGTACGGTAGTATTATTGGCGCCGGAATTTTCATCTTGTTAGTTTCTGGCTTGTTTGCACGTTTGCGTTGGCTCTTCCCACCAGTTGTCACAGGGTCTCTCATTACATTAATCGGATTCACATTGATTCCCGTTGCTTTCCAAAACTTAGGCGGTGGCGATGTTGCTGCTAAGTCGTTTGGGAGTACACCAAACCTAATTGCCGGTTTTTCAACGATTGCCCTAATCCTGATTTTTAGTATCTGGGGGCGTGGCTTCATCCAACAAATCGCCATTTTAATTGGGATTATTGCTGGGACCTTAATCGCAGCTGCGATTGGGATTGTGTCCTTAGATCCAGTAGGTCAAGCAAGTTGGTTCAAATTACCTGAATTATTCTACTTCGGAACACCTCGTTTTGAATGGTCATCAATCGTTTCAATGTCATTGGCTGCGTTAACGACCATGATTGAATCAATCGGTGTCTTCTTCGCCCTTGGTGAAATCGTTGGGCGCGACATTACTAGCAATGATCTTAAGCGGGGCTTCCGCGCTGAAGGGATTGCCGCTATCTTAGGGGGATTGTTCAACACCTTCCCTTACTCAACGTTCTCACAAAATGTTGGGATTGTTCAATTATCCGGTATCAAAACGAAAAAACCAGTTTACTACTCAGCATTCTTCTTAATCATCTTAGGATTATTACCTAAGATTGGGGCCGTTGCAACCATTATTCCAAGCGCTGTTTTAGGGGGCGCGATGGTCGTTATGTTCGGCACTGTTGGGATTCAAGGCATTAAGATGTTACACAAAGTCGATCTTGATGATAACCGCAACTTACTAGTCGCTGCCGTTTCAATCGGCTTAGGCTTAGGGGTAGCAATTCATCCAACCTTGCTCCAATCACTACCAACGAGTGTTCGCACAATTCTAGGCAACGGCTTAGTAGTCGGCAGTCTCAGCGCTGTCATCTTAAACTTACTATTCAACTATCGTTCATTAATTGCAGCAAAACATGCTGAACAAAAATAAATCAAAAAAAGTGCCTACAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP016028|80489:89397|81354_82122_-|WP_004265824.1|DBSCAN-SWA MAHVISIANQKGGVGKTTTTINLGACLADAGNHVLIIDSDAQGNATSGIGVQKSQVEKDIYDVLVDEFPLKETIIKTSHKNLDIVPATIQLAGAEIELTSQMAREMRLKLGLEPVLADYDYVLIDCPPSLGQLSINAFTASNSIMIPVQSEYYALEGLSQLLNTVRLVQKHFNPNLAIEGVLLTMYDARTNLGAQVIEEVRKYFGDRVYDTIVPRNTRLAEAPSHGVSIIDYDPKSRGAEVYQNLAKEVLAAHGN >NZ_CP016028|80489:89397|85977_86637_-|WP_158022139.1|DBSCAN-SWA MLSTEWATFYQTLTQTPITIIANAVELPKQYKYHSQSKQIITLGRLGERKGTYDILKLAGVIQSRFPDIQFTLYGDGEQGKVQQEIDRLKLTNVRLGGWLALADRNTVIQESLLHLLPSYQEGLPMAILETMAYGIPNLATNVGDIPQVIENHVSGDLVTPGDDAGLVQQLSDFLGSQMRRETYSRNARQTINDCFSLQQYFSRWHQFYQRIMNETEEE >NZ_CP016028|80489:89397|80489_81365_-|WP_004265828.1|DBSCAN-SWA MATRNGKGLGRGLDAVFSAFEGPNKNRADELVEEIALDDIRPNPYQPRKTFDEAALAELAASIKKSGVFQPIIVRKSINGYELIAGERRFRASKLAGKTAIPAITRQFDESAMMEIAVLENLQREDLTPLEEAQAYDTLLKKLNLTQAEVSERLGKSRPYIANYLRLLGLPNDVKTLLQNGDLSMGQARTLLSLKKKSQISALAKRTIDEGLTVRQLEQLINQMNQIKAAKVTKTKIKSPYIQASENQLVDKFDTKVNIAINSKGRGKIEIDYSTVDDLNRILALLDVNID >NZ_CP016028|80489:89397|83012_83753_-|WP_064776763.1|DBSCAN-SWA MTPTAFAATLKTYNIQVSQAQMDQFELYFKRLVQVNQQVNLTAITEQEAVYLKHFFDSVTPTLYLEKLRTEPLTICDIGAGAGFPSLPIKILFPQLKITIVDSLNKRIHFLEELVRELGLSDVTLVHDRAELFSNPKSPYREQFDIVTARAVASLNVLAEFCLPTVKVGGQFIALKASQGETELAEANYAIETLGGQFAQDIALTLPETDDQRHLIVIDKVAPTPAKYPRRAGVPVKKPLMAKEEK >NZ_CP016028|80489:89397|87990_89397_-|WP_064776767.1|DBSCAN-SWA MVNNELIEQVPPQNNEAEQAVLGAVFISGDALVEAMEYVTADDFYRKAHRLIFETMVELNERGEGIDAVTLKSALDAQNQLEDIGGIGYLAELAEAVPTAANVVYYAKIVSEKAMLRRLIQTAQNIVAKGYAQDEDVTDILDTAEKEIMDVSERQNKAGFKSISDVLTSSIEQIDKLYQNEEDITGLSTGYRDLDKITAGLHEDELIILAARPGVGKTAFVLNIAQNIGTKTNENIAIFSLEMGAEQLVNRMLCAEGSIDANHLRTGQLDELEWQNLIVAMGSLSKANIYIDDTPGVKMAEIRAKCRRLAKEKGGVGLIVIDYLQLIEGSGQENRQQEVSAISRQLKKLAKELRVPVIALSQLSRGVEQRQDKRPVLSDIRESGSIEQDADIVAFLYRDDYYRDEPGEDGDDFGGGNPPAPAPQQSDDADVGEVEVIIEKNRAGARGTVKLLFVKTFNKFSSISYADQ >NZ_CP016028|80489:89397|82134_83013_-|WP_064776762.1|DBSCAN-SWA MALSFFNKKKDDKSINQVIKVPVSAIVPNRFQPRKVFNADNIAELASTIEQHGLLQPIILREYEDQKYEIIAGERRFRAIQTLKWAKLPAIVQTMDDHETASMALIENLQREELTAVEEAQAYKDLMKLNDFTQASLAEKMGKSQSFVANKLRLLKLSQPVQEAIMNHEISERHGRSLLRLDEFKQQMILHQILAEQLTVKDTEALVNKTLNPEPESTEETVDATDDSLKEATTKAKKANDKAKKAIAHDTRIAVNTIKKSVQMVEQSGIAVKATEEEQDDVYRITIEIPKQ >NZ_CP016028|80489:89397|84129_85467_+|WP_107504429.1|DBSCAN-SWA MHSNSAQPTNPNEKLPHIKAAILGLQHLLAMYSGDVLIPLLVGAALHFNAAQMTYLVSVDIFMCGVATLLQLKRTPLTGIALPVVLGCAVEYVGPLTAIGTNSQLGIDVMYGSIIGAGIFILLVSGLFARLRWLFPPVVTGSLITLIGFTLIPVAFQNLGGGDVAAKSFGSTPNLIAGFSTIALILIFSIWGRGFIQQIAILIGIIAGTLIAAAIGIVSLDPVGQASWFKLPELFYFGTPRFEWSSIVSMSLAALTTMIESIGVFFALGEIVGRDITSNDLKRGFRAEGIAAILGGLFNTFPYSTFSQNVGIVQLSGIKTKKPVYYSAFFLIILGLLPKIGAVATIIPSAVLGGAMVVMFGTVGIQGIKMLHKVDLDDNRNLLVAAVSIGLGLGVAIHPTLLQSLPTSVRTILGNGLVVGSLSAVILNLLFNYRSLIAAKHAEQK >NZ_CP016028|80489:89397|85516_85978_-|WP_064776765.1|DBSCAN-SWA MNSIAQSTDKLELINFYHEMAQISANISQILNEDGVTIEQIRILQTLKRYKGINNSKIAQVLKTSTAASSNKLRKLEDQGYISKQYGKQDDRRIVDIAVSPAGESIYRRFEQACETYIKSITESDKKISMPELMQLFEMTNRLARSIRTTEIE >NZ_CP016028|80489:89397|86961_87891_+|WP_003592463.1|transposase|DBSCAN-SWA MSSITYSERIKIETFCELGLSNIQMGVRLNRSPSTISYELSRCQPYQAELAQTDAEYKRSRCGRKTKLSDELKQKILNHLRLSWSPGMIAHEFKLATKSIYNWLNQGRIGFSLNDLPEHGVRQRRNVDQRSKYNQSLGRSIEQRPMMINQRKRIGDFELDTVVGPRGHSKAVLLTLIDRKSRFLWAYRLKDRTTATVNEALTKFLTTFNGPVHSFTVDRGTEFSGLVSLESQYGIKTYYCHAYTPAERGSNERFNRNLRYFYPKGTRFEHISAQDLTTTLLQINQRPLKILDWQTPYQVMLTNLSKNSD |
9 | Leptospira_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
222087 : 271804
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP016028|222087:271804|DBSCAN-SWA TTTAATCCGAACAAGCCCGGAATCTTTCAATGGCAGTCTGTTGATGATGTATTTTTAATGGTCGTTGATTAATTAGTTCAAGTGCTGCTAGGATCTCATCAGTCGTTACTTGGCTAAAATTGGTCTTTTTCGGGAAGAACCAGCGTAACCGTCTATTAAAATATTCATTGGAACCTCGCTCCCATGGTGAATATGTATGGCAAAAATAAACTTTGATCTGATAATCCTGTTCTAAGGCCTGATAATTGGCAAACTCTTTACCATGATCAACAGTAATGGATTTTACTTGGGGACCGAAGGCCCCCATAAACTTGCCAAAGGCGGTGTTTAGAGCCTTAGCCGTTCTATTAGGGGCTTTGATGGCCCATAGAAGTCGGGTCTTACGTTCTACGAATGTAACCAGACATGATCGTGACTCACTTCGACTAGAAAGCACCGTATCTACTTCCCAATGACCAAAAGCTAACCGTTGATTAACAGTTGTTGGCCGTTGTTCGATGGAAGTCCCACTTGTAAATTTCCCACGATTTTCGCTCACTCGGTGCTGGCGGACATTCCGATTGGGTAGATCAGTCAATTTGAAGGGGAGCCAGCCACAATTAAGCCAATTATAAATTGACGCAGTGCTCAAGTTATAAGCGGCCGCAATGGTTTCTGGTGACCAGGTTAATCGTAAGTGATTGGTAATTAAAGTCGCTAATGCTGCCGTCAGCATCGAACGACGACCGCAATTCCGCCTTTTGCGATCTGCATCTTGCTGAGCTAATTCTGGATCATAAGGTTTAACCCGGTCCAACTCATAGCTAATCGTAGCTTTGTCGACGCCTAAGGCGTCAGCCATTACTTGGTAAGATTTATTCCCCTCATTGACTAGTTGTGCTAGTGCGCCACGTTGAAAACGTGATAAAGTAGATGTACCCAAAGTAATCACTCGGTAGATTGTAAAATTAATCCGAACGCTGTTCGGACAAAAAAGATCAGCTTCCTTTAAAATGGTGTTTACCACAAACCCATCTTTTAGGAGCTGATCTTTTGTCTAGTATAACCTATTCCGAACGAATTAAAATCGAAACCTTTTGTGAACTAGGGCTGTCCAATATCCAAATGGGCGTTCGGCTGAACCGATCACCGTCAACAATTTCTTATGAATTATCTCGATGTCAACCTTATCAGGCTGAATTAGCACAAACAGATGCCGAATACAAGCGATCACGATGTGGTCGGAAAACTAAGCTGAGCGATGAGTTAAAGCAAAAAATTCTCAACCATTTACGTCTAAGCTGGTCACCAGGAATGATTGCTCACGAATTTAAACTAGCTACTAAATCTATTTATAATTGGCTAAATCAGGGGAGAATTGGTTTCTCCTTGAATGATCTACCTGAACATGGCGTACGCCAACGGCGTAACGTTGACCAACGATCCAAATATAATCAATCTTTGGGGCGATCAATTGAACAGCGTCCCATGATGATTAATCAACGTAAGCGCATCGGCGATTTTGAACTAGATACAGTCGTTGGTCCTCGTGGGCATAGTAAGGCAGTTTTATTAACTTTAATCGATCGCAAATCACGGTTCCTTTGGGCATACCGGTTAAAAGATCGGACGACAGCGACTGTTAATGAAGCACTAACTAAGTTCCTAACCACTTTTAATGGTCCGGTGCACAGCTTTACTGTGGACCGTGGCACTGAGTTTAGTGGGCTAGTATCACTTGAATCACAATATGGTATTAAGACCTATTACTGCCATGCTTATACGCCAGCTGAACGTGGTAGTAATGAACGCTTTAATCGGAATTTACGTTATTTTTATCCTAAAGGGACTCGTTTTGAGCACATTAGTGCTCAAGATTTAACGACGACGTTACTCCAAATTAACCAGCGACCGCTTAAAATACTCGACTGGCAAACACCGTATCAGGTTATGCTGACAAATTTGTCCAAAAATTCGGATTAAATTTGCAATCTACCACTCCCTATATTGGTTGGAATTAGTTACTACCATTGTAAGTGATTGCTTTGGGCTTTTTAATTTCTGTTCGGATTAATTATAGAATTTGCCAAATCAAAAAAGCTTCAAAACTTAGTTTATCCAAGTTTTGAAGCTTTTTTAGTTTAGTCGTTCAAGTTATAGCGTAATTTCATGTGTTCTGAGCCTGAAATCACCATTTGGCCAAGTAGGGCTGTTTGGCGTTTAAGTGATTCGCTAGCTAGTTTGTTATTAGCGGCTTCCAAGAAGGCTGCAGCGTCTTTTTGATCAGCGAAGGCCTTGTCGGTTTCGTTTTGGATCACGTGATAGGCACTCATTGCTTCGAGTTCGAAGGTGTTACGCATATCAACGTAGAAGTCGTAATCTGTATCGCCAAGTAAGGCGGTTGTACAACTTAACCAGTACATATTGTTCAAGTCAAAAGTACCTGTGGCATTCTTGTATGATTCTGGTGTGTCGTTGATATTCGTGTAGAATGGCACGACGGTGTTAAACGTATTGGCACCATAAGCTAACCATTGAATACCGGCAATTTCAGCAGGCACGTTGTTGCGCACTTGTAAAATATGCACGTTGTGATTCCGGTTAATTCCGATTGGCCGGAAACGAGTTTTAACATCTTCAGGGGCGCTACCGTAAGGATCGTATTCTGTATTTTCAAAGTGAGCGCTCAAGACGAACTTGACGTCTTCGATTGAAATCTTGCGGTTGGCATGGCAGATGAATGGTAAATCTTGGTCCATTGGATCTTGTTTGATTTCTGGATTGAAGTATTGTTGACCGTACCATGTCCGTGGGTTGTTATAAACCGTATCTTTGATTGAAGCACTGCCGAAAATATGACGGAGATTGTAGCCTTCAAAGTCTGGATTCAAGTGGTTATCATCAATTAAAGCTTTTAAATCAGCTGAGCAAAGCGTGTCGGCTGAATCAAAGTCGAAATGATCGATGTTCATCCGGTTAGGGGCAACCACGTATGCATCATCAGGGATACGAACAGCAGCCCAGTGATGACCACCGATTGTTTCAAGCCACCAAACACTGTCTTTGTCAGAAAAAGCAATCCCGTTTGGTTCGTATGTGCCGAATTCTTCAAGGAGGGCGCCTAAACGTTCGACACCTTCTTGAGCACTGTGGATGTAAGGCAAGACTAATGTCACAATATCTTCTTCACCGATGCCACCAGGGACAAAAGGATCAAGCCCTTGAATCCGGGGGTTAGTGGTAATCGTTTCTGTGGCAGACATCGCGATATTTTCACTATTAATCCCAGCAGCTGGCCAAATCCCGTTCGTCAATAATGAGTTAGGAATTGAGGTATAGCGCATTGGGTTGTCAGGTAATTGGATTTGAATGCCGCTAATCACCGCTTGATAATTCCGGGGTTGGTCTTCAGGATTGACCACAACAAAGCGTTGTGGATCCAAAGCTTCGTGGCCATCATCATTTCTAGAAATCATGGTTGAACCGTCGATGGAAGCTTTTTTGCCGACTAAGACCGTGGTACATGACCCTTTAATTGGTTTTTGCATGTCAAAACACTCCTTTTATTTATTATCCATAGTATAACGCTTTTGGCGGGAAAGTGGGGGATTGAGCGATAATCATGTGAAGGAATTGTTTAAATGCAAGTGATTGAGGGTGCCAAGTCAGTTATCATTGGTATTCAATTCGTTGGTATCAATAAAAAGATTCGGATGAGTCGTCAACGTAAAGCACAACATGCAACTAATAGGGCTGAACAACATGCCGAAAAGAAGGCCATACAATACAGCCGTTTTCAGCAACACCAGATTAAGAAGCGGGAAAAACATCGGAGACATTGAAAAAGAAGAGTGAAGCGAACCCCAAATATTGGACGAAACTTTAAGCAGCTTTCTAGGTTGTAAAAATTCGATATTCAATCGGACTTTTACAACCCAGTTTTGTTTTAATTCTTGAAAAATTATAATCATCAATCCAAACCGATATTTGTGAAACTAGCGTTTCATAAGTATCGGTTTCTTTTTGGTAGAAAGCTTCGGCTTTCATAATATGGAAAAAGCTCTCCATTGCTGCATTATCTAAACATGTTGCTTTGCGAGACATACTTTGAAAAATGCGATGTTCTTTCAAGATATGAGTCCAATCTTGATGCTGGTATTGAAATCCTTGATCTGAGTGGACTGTTGTCCGGTATTTTAAATTCTTATGGATTTTCTTAACTGCTCGATTCAAAACAGTTGTAGTAAATTCAACAGTAGGGTGTTTACTAACTTGATGGCTGAGAATTGGCTCCTATGATGGAATTACGGACAAACTGTTTGATATAATACATCATAAAGGAGCTTTTTATTATGGCAATTAAAGGTAGATTGCAAATTTAATCCGAATTTTTAGACAAATTTGTCAGCATAACCTGATACGGTGTTTGCCAGTCGAGTATTTTAAGCGGTCGCTGGTTAATTTGGAGTAACGTCGTCGTTAAATTTTGAGCACTAATGTGCTCAAAACGAGTCCCTTTAGGATAAAAATAACGTAAATTCCGATTAAAGCGTTCATTACTACCACGTTCAGCTGGCGTATAAGCATGGCAGTAATAGGTCTTAATACCATATTGTGATTCAAGTGATACTAGCCTACTAAACTCAGTGCCACGGTCCACAGTAAAGCTGTGCACCAGACCATTAAAAGTGGTTAGGAACTTAGTTAGGGCTTCATTAACAGTCGCTGTCGTCCAATCTTTTAACCGGTATGCCCAAAGGAACCGTGATTTGCGATCGATTAAAGTTAATAAAACTGCCTTACTATGCCCACGAGGACCAACGACTGTATCTAGTTCAAAATCGCCGATGCGATTACGTTGATTAATCATCATGGGACGCTGTTCAATTGATCGCCCCAAAGATTGATTATATTTGGATCGTTGGTCAACGTTACGCCGTTGGCGTACGCCATGTTCAGGTAGATCATTCAAGGAGAAACCAATTCTCCCCTGATTTAGCCAATTATAAATAGATTTAGTA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42 | unidentified_phage(36.36%) | holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
563515 : 623450
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP016028|563515:623450|DBSCAN-SWA 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63 | Streptococcus_phage(25.0%) | integrase,transposase,holin,bacteriocin | attL 610368:610427|attR 618731:620039 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
671030 : 679376
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP016028|671030:679376|DBSCAN-SWA 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TTAGCCGAAATGACTTTTAAAGAACAACTCGGCTGCCGCGTGCAAGTCCCCCTTAATCAACAACAGTTATTTATTGAAACGCAATCCCGCTTTATCATCACGGTTCGGCCAGAAAATCAGACGGCGTTTGAAGCGTTCTGTCAAGATCAGGCGCAATTAATTGGGACGGTCTCGGCCACGCCAATTATGCAAGTGCAAACGACTGAATCAACTGTTGAGTTATCGGTGACTGAAGCAAAGTTAAGTTGGGAGACGGCGATACCATGTCAAATGAAATAAAAAGTTTAAATGAAGAATGTGGTGTTTTTGGGATTTGGGGTAGTCCAGAAGCAAACCAAATGACTTATTTTGGCTTGCATAGTTTGCAACATCGTGGGCAAGAAGGTGCCGGTATTGTCACTAATGATCACGGGCACTTAATGGGTTATCGCAATCGTGGTTTGTTGGCGGATGTTTTCCGCAAACCGGAGCACTTAACCCAACTAACCGGGGACGCGGCAATCGGTCATGTCCGTTATGCGACCGCTGGTAGTCACGGTTTAGAAAATATTCAGCCGTTCCTATTCGATTTTGCAACCGATCAATTCGCACTTGCACACAATGGTAATTTAACCAACGCGGTCACACTGCGCCGCATGCTTGAACAATCGGGGGCCATCTTAAAATCGAGCTCTGATTCTGAAATTCTGATGCATCTGATTCGACGTGCAGAAGGGCCTGATTTGCACGCGCAAATTAAGACGGCCCTTCAACAAATTCGTGGGGGCTTTGCCTACCTATTATTAACGCAAGATTCATTGATTGCGATGCTTGATCCCAACGGCTTTCGACCACTCTCGATTGGACGTTTAGCAAACGGGGGCTACGTTGTGGCCAGTGAAACCTGTGCGCTCAATACCGTTCAAGCAACTTTTATCCGAGATGTGCAGCCAGGCGAAATTGTGACGATTGATGCGGACGGGTTACATTCTGACTTCTTCACAACCGAAACCACGCATTCAATCTGTTCAATGGAATATATCTACTTTGCTCGCCCGGATTCTGATATCTGTGGGATTAACGTCCATGCGGCCCGCAAACGAATGGGGAAACAGTTAGCACGTGAAACCGCAGTTGAGGCGGATATGGTAATTGGGGTGCCGAATTCATCGTTATCGGCCGCTAGTGGCTATGCCGAGGAAAGTGGTTTGCCGTATGAAATGGGCCTCGTTAAAAATCAATACGTGGGGCGGACGTTCATTGAACCAACGCAAGCCCTTCGTGAACAAGGGGTAAACCGCAAACTCGCCGTGGTTAAAAGTGTTGTGGCTGGTAAACGAATCGTTTTAGTGGATGACTCGATTGTGCGTGGGACGACCAGCAAGCACATCGTGAAACGTTTGAAAGAAGCGGGCGCATTATCCGTGCATTTGCGGATTGCGTCCCCACCATTGAAGTACCCTTGTTTTTATGGGATTGATATTCAAACACGTGATGAACTGATTGCCGCGCATCAAAGTATTGCTGAGATGTGTGCCACGATTGGCGCGGATTCACTTGGCTTTTTGAGTGAACAGGGATTAATCGACGCGATTGGGTTACAGCAAGATGCGCCGTATTCCGGATTATGTATGGCGTATTTCAACGGCGACTATCCAACGCCACTTTATGACTATGAAGCTGCCTATCAGGCAAGTTTAAAAGCAGATAAGGAGCAACAATCATGACAAATGCTTACCAAAAAGCCGGGGTGGATGTGACAGCCGGTTACGAAGTGGTTCGTCGGATTCAAAAGCAAGTCGGCGCAACCAATCAAAATATTGGTCGCTTCGGTGGTCAGTTTGCCTTAGCGATGGGGCAGTATGAAAATCCGGTGCTCGTTTCAAGTACCGATGGGGTCGGGACCAAGTTGATGGTTGCTTTTGCAGCTGATGCACACGCGACCATCGGGATTGATTGTGTCGCGATGTGTGTCAATGACATTGTTGCCCAAGGCGCTAAGCCACTTTATTTCTTAGATTACTTAGCGGCTGGTCAAACGCAGCCGGATAAGATCGAACAAATTGTCAGCGGCGTTGTTGCAGGCTGCCAAGCTGCTGACATGCTGTTAATCGGTGGTGAAACGGCCGAGATGCCGGGTATGTATGCTGAAAAACATTATGATTTAGCGGGTTTTGTAGTCGGAATTGCTGATCAAGCTCAATTAATTACTGGTGAAACGATTCAAACAGGGGATGTATTAATCGGAATCGCGTCCAGTGGGATTCATTCGAATGGCTACTCACTTGTGCGCCAAATTTTCTTCGAACAACGTGGGTTGTCCGTCGACAGTCACTTACCCGAATTGCCTGGTCAGACACTCGGTGAATGGCTATTAACACCAACGCGGATTTATACACAAGCATGTCAGCCATTGATCGAACAAGGCTTTATTAAGGGCGCGGCCCACATTACTGGTGGAGGCTTTATTGAAAATATACCGCGGATGTTGCCTGACAACGTGATGACCGAAATTCAATTGGGAACATGGCCAAGCTTACCGATTTTTGCGGCACTTAAACAATATGGGCAATTGGATGCACTCGAGATGTATAACATTTTTAACATGGGGATCGGGATGGTCTTAGCCGTCGCACCAGAAAAAGCGGCACAAGTCCTCGCCCAATTGAACGCTGAACAAGAACAGGCTTACCGAATTGGGTCGGTTAAACCGCGACAAGAAAATGCAATAGAATTGGTGGGTTGATGAGATGAAAGTGGCGATTTTTGCTTCTGGAACGGGTTCTAACTTTGAAGTACTTGCAGATGATGACGCCTTAAAAAAAGCGGGCATGGAGATTATGAATTTAGTGTGTGACCAGCCGGGCGCACCGGTGATTGAAAAAGCGCGCCAACGAAATGTACCGGTGACGGTCATCCGCTTAAGTGATTATGATGATCGACAACACTATGAAGCAGCAATTGTCGCGCTGTTGGCACCGTTACAGTTGGATTATATATTGCTAGCGGGTTATATGCGGGTGATTACCCCAGTATTGTTGCATGCCTACCCACAACGGATTATCAATATTCATCCGTCGTTACTACCGGCCTTTTCTGGGTTACGAAGTATTGAACGGGCCTATGCGGCACAAGTGGCTGAAACGGGCGTTACGATTCACTACATCGATGAAGGTGTCGATAGCGGTCCGATGATTGTCCAAGCAAAAGTACCATTGTTGCCTGGCGATAGTTTAGCCGCATTGGAACAACGCGTGCACGATACAGAGCACGCGATTTATCCGCAAGTTGTTGCTGAATTAATTAAAAACCAAAATAGAAGGAGTAATTCAATCAATGAAAAGAGCGTTGGTCAGTGTTTCAGATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP016028|671030:679376|676292_677735_+|WP_064777020.1|DBSCAN-SWA MSNEIKSLNEECGVFGIWGSPEANQMTYFGLHSLQHRGQEGAGIVTNDHGHLMGYRNRGLLADVFRKPEHLTQLTGDAAIGHVRYATAGSHGLENIQPFLFDFATDQFALAHNGNLTNAVTLRRMLEQSGAILKSSSDSEILMHLIRRAEGPDLHAQIKTALQQIRGGFAYLLLTQDSLIAMLDPNGFRPLSIGRLANGGYVVASETCALNTVQATFIRDVQPGEIVTIDADGLHSDFFTTETTHSICSMEYIYFARPDSDICGINVHAARKRMGKQLARETAVEADMVIGVPNSSLSAASGYAEESGLPYEMGLVKNQYVGRTFIEPTQALREQGVNRKLAVVKSVVAGKRIVLVDDSIVRGTTSKHIVKRLKEAGALSVHLRIASPPLKYPCFYGIDIQTRDELIAAHQSIAEMCATIGADSLGFLSEQGLIDAIGLQQDAPYSGLCMAYFNGDYPTPLYDYEAAYQASLKADKEQQS >NZ_CP016028|671030:679376|673157_673418_+|WP_004265547.1|DBSCAN-SWA MFNVRVQVTYKDSVLDPQGQAVQKAIERLGFDGVSGMRIGKSFEMQVAGDDQAAVEKKVAQICDQLLANPNMEQYHYDIQKVATNQ >NZ_CP016028|671030:679376|678758_679376_+|WP_039098139.1|DBSCAN-SWA MKVAIFASGTGSNFEVLADDDALKKAGMEIMNLVCDQPGAPVIEKARQRNVPVTVIRLSDYDDRQHYEAAIVALLAPLQLDYILLAGYMRVITPVLLHAYPQRIINIHPSLLPAFSGLRSIERAYAAQVAETGVTIHYIDEGVDSGPMIVQAKVPLLPGDSLAALEQRVHDTEHAIYPQVVAELIKNQNRRSNSINEKSVGQCFR >NZ_CP016028|671030:679376|672439_673165_+|WP_064777018.1|DBSCAN-SWA MSETLFYSGKAKDVFTTDDQNVLRMVYKDQATALNGKRKEQITGKGLLNYQISKLIFKYLMANGIETHLIENISATEQLVKKVTIVPLEVVLRNVVAGSFARKFGQAPGKRLATPIIEYYYKNDALDDPAINISQATALGIMTPAEIEVIEKQTKQINQLLIDLFDRADIDLIDFKLEFGRYDGRLILADEFSPDNCRLWDQTTHESLDKDVFRLNKGDLVSVYDVVLRRLEKILGGSTDV >NZ_CP016028|671030:679376|674085_676308_+|WP_107504404.1|DBSCAN-SWA MTVLKQPTAAEIQATKLYQQWGLSDDEYELIRTKILKRLPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLKKFPTSGQHVLQGPGEGAGILDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGATPIALLNSLHFGELTDDHTKYLVQEVVAGIGGYGNCIGIPTVGGEIGFDPCYQTNLLVNAMCVGVIDQKDIQQGKARGAGNSVFYVGAKTGRDGIHGATFASDEFADGKATQRSAVQVGDPFMEKLLMDACLELILKHPDWLVGIQDMGAAGLVSSTAEMAEKAGTGMILNLDLVPQRETEMSAYEIMLSESQERMALCVKAGHETDVVALFERYNLDAVRIGEVTESQQYQLWHGGQLVADLPVAALTSDAPIYHKAQTEPARIAEFKAMAPYQPVINDVKRTWLDLLGQSTIADKRSLYSHYDAQVKTNTVVLPGSDAAVVRIRGTKKALAMTTDCNGRYLYLDPKVGGQVAVAEAARNIVAAGGQPLGITDCLNYGNPEKPEVFWEFDQSAQGIAAACEVFDTPVISGNVSFYNEFNGEVIYPTPMIGMVGLIRDTADITTQDFKSAGDLIYLVGQTDTNLAGSELQKMLTGKVAGRLSGFSLATEKASQDCVLAAIQKGWVTGAHDLSEGGFAVALAEMTFKEQLGCRVQVPLNQQQLFIETQSRFIITVRPENQTAFEAFCQDQAQLIGTVSATPIMQVQTTESTVELSVTEAKLSWETAIPCQMK >NZ_CP016028|671030:679376|677731_678754_+|WP_064777021.1|DBSCAN-SWA MTNAYQKAGVDVTAGYEVVRRIQKQVGATNQNIGRFGGQFALAMGQYENPVLVSSTDGVGTKLMVAFAADAHATIGIDCVAMCVNDIVAQGAKPLYFLDYLAAGQTQPDKIEQIVSGVVAGCQAADMLLIGGETAEMPGMYAEKHYDLAGFVVGIADQAQLITGETIQTGDVLIGIASSGIHSNGYSLVRQIFFEQRGLSVDSHLPELPGQTLGEWLLTPTRIYTQACQPLIEQGFIKGAAHITGGGFIENIPRMLPDNVMTEIQLGTWPSLPIFAALKQYGQLDALEMYNIFNMGIGMVLAVAPEKAAQVLAQLNAEQEQAYRIGSVKPRQENAIELVG >NZ_CP016028|671030:679376|671030_672329_+|WP_064777017.1|DBSCAN-SWA MIERYTNPEMGAIWTDQNKYEAWLVVEILADEAWSELGHILAEDVAKIRANAMFSIPRILEIEQETRHDVVAFTRAVSESLGDERKSVHYGLTSTDVVDTAYGYLLKQANAILRADIDALLAVIAKQAKRYQDTVMMGRTHGVHAEPTTFGLKLALWYSELKRHKARFEEAAKGVEAGKISGAVGTFANIPPFVEAYVCEHLGIRAQEISTQVLPRDLHAAYVAEMALLATSIEKFATEIRGLQKSETREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENITGLARVIRGHMVTAYEDVALWHERDISHSSAERIILPDTTILLDYMLRRFTKIMTDLTVFPENMKRNMGRTFGLIYSQRVLLKLIDHGLSREAAYDLIQPKTAQAWDQQTDFRPLLEADDRIMNVLTPADLDDAFDYHYHIRRVAEIFDRVGLGE >NZ_CP016028|671030:679376|673414_674089_+|WP_039098143.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDADLYHAIEDVCHENAEYVPYTATSLAGFDTVLVPGGFSYGDYLRSGAIAKLAPIMTAVKTFAAAGKPVIGICNGFQILTELGLLPGALLPNRQTHFICDTVALNVTNAGTMFTQHYMPNEQIRLPIAHGEGNYYCDAETLERLKVNHQIAFTYQNDVNGSLANIAGVTNEAGNVLGMMPHPERAVETLLGSDDGQRLFAALITSIRKGGQ |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
915271 : 922789
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP016028|915271:922789|DBSCAN-SWA ATTAGTCGTACGTAAAGCCTTCCCCGAGTGCTTCGTGCACATCAATAATGGAAACGAATGCGTGCGGGTCATGTTGGTTAATCAACCGTTTAAGATAGGCGATTTCACTTGGACTGACGACACAGTACAGCATTGGTCGGTCTTGATGGGCATAAGCGCCTGTGGCCTGTAGAAACGTCACGCCGCGTTCCATATCGGCCAGAATGTCATCGGCAATTGCTTGCGCGTGGTCACTGATTACGAGTAGCCCTTTGGCGGCGTAAGCACCCTCGAGTGTGAAGTTCACAATCCGGGAGAAGACGTAAGACGCAATTAAGGTATACATCATATGTTCGATATCGAGGTAACTGAGTGAGAGTGTTAAGACTACGACGTCAAAAAGAAGGAGGGAGCGGCCCATTGGCATCCCTTTTTCTTTTTCGATAATGCGGGCAATGACGTCGGTGCCACCAGTTGTGCCACCGAAGCGGTAGATAATCCCACTGCCGAAGCCACCACATAAACCGGCTAGAATAGCGGCGATTAAAATATCGTGGTTTAAATCAATTGTGATGGGGACACGTTGCCAAATCCATAGAAAAACGGACATCATCGCCGTTCCGTAAATCGTGTAGGCGAGTGCGCGTTTACCGAGGTAACGATAGCCTAGAATAATTAGCGGGATATTTAACAAAGCCGTTGAATACGCCGGGTCGATATGCAACCAATACCGTAAAATCAAGGTAATCCCGGTTAAGCCACCTTCAGCCAGGTGATTTTGAATGTTGATGGTCACTAGCCCAAACGCGTAGATCGCACAGCCCAGCGCAATCACCGCTAAATCACGACTAGTCGTTTGCCAAGTATGTTGTTTCGTCATGTCAACGCCCCCTTTACATAACTCAAATATAGCACGGAATGGGGGTTAAAAACAGTTGGAACCACTTTGGTGGCTGAAGTGGGGTCCTTGATTGTGGTATGATAAATAGCATCAGAAACAGTTAATTGTTAGATAAGAGGGATAGCCATGAAAGTAACCACCTTTGCGCCGGAATTTGAAGCGGCCCTACCAATCTTAAAACAAATTGAAGCGGCGGGTTTTGAAGCCTATTTCGTCGGCGGCAGTGTCCGCGATTATTTATTAGGCTTGCCGATTCACGACGTTGATATCGCAACGTCGGCGTATCCAGCAGAAGTGAAGCAAATTTTTAAACGAACGGTCGATACCGGAATCCAGCACGGGACTGTGATGATTCTTGATCATGGGACTGGCTATGAAGTGACCACTTTTAGAACGGAAAGTGGCTATCAAGATTTTAGACGGCCTGATTCAGTGACGTTTGTGCGGTCGTTAGCCGAAGATTTACAACGGCGGGATTTCACGATTAATGCGCTTGCGATGCGCGCTGATGGTGAGATTATTGATTTATTCGATGGCCTGACCGATCTAAAAGCGCAACAAATCAGAGCGGTGGGCAAAGCCGACGAACGTTTCCACGAAGATGCACTCCGTATGATGCGTGCCGTCCGTTTTGAAAGTCAACTCGGCTTTGCAGTTACACCAGAAACACAAACTGCGATTGCCAAACATGCTGAACTATTAACGAAAATTGCGGTGGAACGCATTCATGTCGAATTTGTGAAGTTGCTGCAAGGGATTCAGCGGCAAAATGGGTTACAAACCTTTTTAAAAACCGGGTTGTATCGATATTGTCCAGCATTCGCGACTGAAGCAGCGGGACTGACCAAATTAGCGGCATTACCAGCGCAACAGATTCATGATGAAGATACGGCTTGGCTACTAGTCAATGCATTATTGGGTAAAACCCCCGCCGCCGCCGGCAAATTATTGAAACGCTGGAAGAGTGCTAACGATGTGATCGATGCGGTTAAAGCAGGTTTGGGATTATTGCCAGCCATTCTAGACCAATCAGCCGATCAGTGGGCCCTTTATCAAGCGGGGCAACATGTATTAGACATCACGTTAATTGTTGCCCAATTAATGACCAGTGAATCAGTCGCAGTTGATCAGTGGCAAGCAAAGTATGCGGCACTGCAAATCAAGCAAAAGGCGGAACTTGCCATCAATGGACAAGTCTTAATGCAAAATGGGTATCAACCTGGTCCGCAACTAGGAAAAATGTTGGCGCAACTCGAAAAAGCCGTGGTGTTAGATCAATTACCAAACGATCAAGCCCAATTATTGCAATCGGCTGCACAAAACTAAGCCATTCTCTCAGAAGGTGTGTTAAAATAACCATGTAAGCACATTCAGAAAGGGTGACAATTGATGACACAACATGTTTTTAAGGAATTGAAATTTTATTTTAGAAATGGTGACGCTTGGACCGTCAGCCACAAAGAATTAAATGATATTTGGATTAGCCGTGTTACCACCAGTTATGGCCGCATTAATGGTGGCCCAATGCAAGAGATTCACCCTTGCAAGAGTTTCAAAGCCGAAATCTTACCTGAAGCGGATCATGTGAAGTCCGAAGACATCAACACCGGTTCTCTTGAAATGGGGATGTTCGGTCGTGCAACGAAGTATCAAGACATCGAAAAACTCGATTTAATCTTTGAAGATGATCAAGATCGCGCACCAATGCAAATTTATTTCCCATTCAAGAATAAAGATAATAGTGGCTTAGATAATATTTATCAAAGTAGCCAAATCTCACAAAAAAATGGTCGGTTGTACATTGTAATTGATGCAGAACACACAATTGCAGATATGTACCCTGAAATTTAAACGTTAGCCCCTGACAATATTGATCGTTGTCAGGGGCTTTTTTATTTGTTTACAGTTTACGACATTCTTTTTGTCATTTTGATTGTCAGTCGTCTGATTATTCGCTATGATTGATGGTAACGAAAGTAAAAAGGTGACTATATTGCAAACATTGACAGCAACGCATTTAACGAAGACTTACGGCGAAAAAACGCTTTTTGAAGACATTTCATTTTTAATCCGTGAAGGGGACCGCATTGGTTTAGTCGGCATTAATGGGACCGGGAAAACGACGTTACTCAACGCGATTACCGGCACGGATTCATACGATAGCGGGCAGGTTGAAACGCCTAACCAATACGCGATGAGTTATTTAGCCCAGAAACCAAGCTTTGATACGAACTTAAGTATTATGGCGGCGATTTTTGCCGGCGATAATCCGGTTTTCAAGACGATTCAAAACTATGAACGCGTCTTGGCGGCATATACGCAAGATCCCACTAATCCGAAGTTACAGACGCAATACGAACAAGCTGATGCGCAAATGACGCAACAAGATGCTTGGACGGTTGATACGGATATCAAGACGATTTTGACGCAATTACATCTAACGGATTTGGATCAACCGATTAATACATTATCTGGGGGCCAACAAAAACGGGTTGGGTTGGCACAAGCCTTAATTGAAAGCCCAGACTTATTGATTTTGGACGAACCAACGAACCACTTGGATTTTGATTCCATTGAATGGCTTGAAAAACGCTTAGCACAATATCAAGGCGCGCTTTTAATTGTCACGCATGATCGCTACTTCTTGGATCGTGTTGCGAACCAAATTTTTGAACTCGACGGTGGTCAACTCTATTCATATGACGGTAACTATGAACAATTTTTAACCCAAAAAGCTAATCGCTTGGAACGTGAACAACAAGCTGCCCATAAGCAACAACAACTCTACAAGCAAGAATTAACGTGGATGCGCGCGGGTGCTAAGGCACGAACAACCAAGCAACAAGCGCGGATTAATCGCTTCAATGACTTAAAGGCGAATTTAACCACTGGACCAGACGATTCGGAAGTCGATATTCAGATGGGGCAATCGCGGTTAGGTAAAAAAGTACTCGAATTAAAGAACGCCAGTTTAAAACTCGGCGATCGTCAGATTTTGGATGACTTTAGTATTCTAGTTCAAGCGAATGATCGGATTGGGATTAGTGGCGTCAACGGGGCCGGTAAATCATCACTGTTAAACGTGTTGGCTGAACGCCTCCCACTTGATAGTGGCGAGTTAATTGTCGGCGAAACCGTCAACCTCGGCTACTATACGCAACAAAATGAAGACTTAGATCCTAACAAACGAGTGATTGCATACTTGCAAGAAGCCGGCGAAGAAGTCATTGGTAAAAATGGGGACCGGATCAGTGTCACACAATTGTTAGAACAATTCCTATTCAGCCGTCAAATGCACGGCACATTGATTGGCAAACTTTCTGGTGGTGAAAAACGCCGCTTGTACTTGTTGAAAATTTTGATGCAACAACCAAACGTCTTATTACTGGATGAACCAACTAACGATTTAGATATTGGCACGTTGACGATTCTGGAAAATTACTTGGAAAACTTTAACGGGACTGTGATCACAGTTTCGCATGACCGTTACTTCCTCGATCAAGTTGCCGACAAACTCTTGATTTTTGAAGGGGCCGGCAAGATTAGCACCGAAGTTGGCCTGTTCAGCGATTACTTGGCAAAACAAAAAGCAACACCAACTAAGTCAGCGCCTAAAGCAGCGACAGCATCGGTTGAAGAAGCACCAGTTGCAAAGACCAAGCAGAAATTAACATACGCCGAACAAAAGGAATACGAACACATCGAAGCCGACATGGAACAATTGGACGAACAGATTGAAACCATCAAAGCAGAAATGAACGCAAACGGCGCGGACTATGGTAAATTAGCAGAGTGGCAGGCCCAAATGGATCAACTTAACCAACAACTAGACGAAAAAATGACCCGCTGGGAATACTTAAGTGAATACGCAAACTAAATGAGTGCATTCAAACCAGGTATATTCCGAGCACTAGCCTAACAAGGCGAATGATTGCTGAAAGCAATCGTTTGACTTGTGTAGCTAAACGCAAGAACATGGTTTTAAAAGCACGTTAAAAAACTGAGTGCGTTTGAAACGGTTTGACGCTGAGCATTAACTTAATTTGGCGAATTAGCGATGTAATCGCTGATTTGACAAATGTCGTTAAGCGCAAGCGCCAGTTTCAAAAAGCACGTTAAAGAAAGGAATCCACATCATGTCTGAGCAAACCTACTTAGATTTAGCACGTACCATTTTAGAAACGGGTCATTATAAAGAAGATCGTACCAACACTGGCACCTATAGTCTGTTTGGCTATCAAATGCGCTTTGATTTAAACGAAGGGTTTCCTTTATTAACCACCAAAAAAGTGCCATTCGGGTTAATTAAAAGTGAGTTATTGTGGTTTTTAAAAGGTGATTCCAATATTCGTTACTTACTACAACACAATAATCATATTTGGGATGAATGGGCGTTTGAACGTTACGTTCAAAGTGCCGATTACACAGGCCCGGATATGACAGATTTTGGTCATCGTGCCCAAACTGATGCGGCCTTCAATACTGTTTATCGCGACCAAATGCAACAGTTTAACGAACGGATTTTAGACGATGAAGCCTTTGCCAAACAATATGGTGAACTGGGCGATATCTATGGTAAACAATGGCGTGCTTGGCAAACCCGTTCTGGGGACACAATCGATCAGATTAAAAATGTGATTGAACAAATTAAAACCAATCCCGATTCACGGCGCTTAATTGTCTCAGCTTGGAATCCAGAAGACGTGCCAAGTATGGCGTTGCCGCCTTGTCATACGATGTTCCAGTTCTACGTTAATGACGGACGGTTATCGTGCCAATTGTATCAACGCAGCGGGGATGTTTTCCTTGGCGTACCATTTAACATTGCGAGCTACGCATTATTGACACATTTGATTGCGCATGAAACCGGCCTTGAAGTCGGTGAATTCATCCATACGTTGGGTGATGCCCATATTTACAGTAATCATATTGAACAGGTGAAGACACAGCTTGAACGCCCAATTCATGCCGCACCAAAATTGTGGCTCAATCCAGATAAAACAAGCATCTTTGATTTTGATGTCGCCGATATTAAACTTGAAAACTATGAAGCAGAACCCGCAATTAAAGCACCCGTTGCGGTTTAATGAGGAGGAGCGCCAATGTTAGCATTCTTATGGGCTGAAGATCAAAATGGGTTAATCGGTCAAAATGGTCACTTACCATGGTCATTACCCAACGATCTTGCCAATTTTAAACACGAAACGGTTCATGAAGTGGTGGTAATGGGCCGGAAAACGTATGATAGTTTACCCGTCCAACCCTTACCTGGACGCCAAAACATTGTGATTACGCGACAACCGGATTTAGCTGTGGCTGATGGGGTGTTTGTGATGCACACCAAAGCGGAACTGCTTAAATATGAGCAAGCCAACCCGATGAAAAAGATTTTTATCATTGGTGGTGCCGATATTTTTGCAATGTACGCCGATGATGTCGATTATCTGTACGTTACAAAAATTGCTGAATCGTTTGAAGGCAACGTTTATATGCCAAAATTAGCGATGGATCAGTTCGAATTGATCAGTCAAACACCTGGTGTGGTGGACGAACGTAATCGCTATGCGCATACGTTTGAAATCTATCAACGCCGTTAGAAAGATTCAATTAAGGGCGGTCGCAGCGATGTAACCGCCTTTTTGCTTGCTACAAAAGTGACAACTGGCTTTTTTTTAATCAGTAACTTTTGGTGAAAAAAGCGTGATTGTTTGATATACTGTCAATAGACATAATCATAGAAATCACGGGGCCGTTGATTGCCCAGATTTCAAGATAGAAAGCGTGGCTGAAGTAATAGTGGCTAATATTAAAATTGTAACGGATTCATCCATCCAACTCACTCCTGAAGAAATTAAAGAACATCATATTACGGTTATTCCGTTGACGATTATGATCGACAATACGGTGTATATCGATGGTGAAACCATTACCCGCGATCAATTTATGACTGAAATGGCAAGTGCGAGTGCCTTACCTAAGACGAGTCAACCCGCAATCGGGAATTTTGTCGAAACGTATGAACAATTAGCGGCTGATGGCAGCCAGATTTTATCAATTCACATGCTACGAGCAATTAGTGGCACTGTTGATACAGCCCGCCAAGCCGGCGAGATGGCGAAAGCAGATGTAACAGTTGTCGATAGCGACTTTACCGACCGTGCAATGGCATTCCAAGTGTTAAAAGCGGCAGAAGTCATTGAAAACGGCGGTAGCATGGATGATGCTTTAGCAGCCATTCAAAACGTACACGATCATACGAAGTTATACATGGGTGTGACTGATCTAACCAACCTCGTTAAGGGGGGCCGGTTGAGTCATGCGGCTGGTGTGATTTCAAGTTTATTAAATATCAAGGTGATCCTTGAAGTGGCTGATAGCGAATTAAAAGTGTTACGCAAAGGCCGGGGGATGAAGACCATTACGAAATTCATCGATGAAATGGAAGCTGATATGCGCGACTTAAAGATTCGGGCAATCGGGATTTCACATGCGGATGGGCTAGAATTGAGCGAAAAAATTAAAGCACAATTGCAAGTAGTATTCCCAAACATCGAAATTCTTGTTCGGACAACTGATCCAGTGATTGCAACGCATGCGGGTGCAGGCGCATTTGCCGTTATGTACTACACAGAGGAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP016028|915271:922789|921252_921747_+|WP_004270296.1|DBSCAN-SWA MLAFLWAEDQNGLIGQNGHLPWSLPNDLANFKHETVHEVVVMGRKTYDSLPVQPLPGRQNIVITRQPDLAVADGVFVMHTKAELLKYEQANPMKKIFIIGGADIFAMYADDVDYLYVTKIAESFEGNVYMPKLAMDQFELISQTPGVVDERNRYAHTFEIYQRR >NZ_CP016028|915271:922789|917539_918001_+|WP_004270303.1|DBSCAN-SWA MTQHVFKELKFYFRNGDAWTVSHKELNDIWISRVTTSYGRINGGPMQEIHPCKSFKAEILPEADHVKSEDINTGSLEMGMFGRATKYQDIEKLDLIFEDDQDRAPMQIYFPFKNKDNSGLDNIYQSSQISQKNGRLYIVIDAEHTIADMYPEI >NZ_CP016028|915271:922789|918143_920027_+|WP_039099422.1|DBSCAN-SWA MQTLTATHLTKTYGEKTLFEDISFLIREGDRIGLVGINGTGKTTLLNAITGTDSYDSGQVETPNQYAMSYLAQKPSFDTNLSIMAAIFAGDNPVFKTIQNYERVLAAYTQDPTNPKLQTQYEQADAQMTQQDAWTVDTDIKTILTQLHLTDLDQPINTLSGGQQKRVGLAQALIESPDLLILDEPTNHLDFDSIEWLEKRLAQYQGALLIVTHDRYFLDRVANQIFELDGGQLYSYDGNYEQFLTQKANRLEREQQAAHKQQQLYKQELTWMRAGAKARTTKQQARINRFNDLKANLTTGPDDSEVDIQMGQSRLGKKVLELKNASLKLGDRQILDDFSILVQANDRIGISGVNGAGKSSLLNVLAERLPLDSGELIVGETVNLGYYTQQNEDLDPNKRVIAYLQEAGEEVIGKNGDRISVTQLLEQFLFSRQMHGTLIGKLSGGEKRRLYLLKILMQQPNVLLLDEPTNDLDIGTLTILENYLENFNGTVITVSHDRYFLDQVADKLLIFEGAGKISTEVGLFSDYLAKQKATPTKSAPKAATASVEEAPVAKTKQKLTYAEQKEYEHIEADMEQLDEQIETIKAEMNANGADYGKLAEWQAQMDQLNQQLDEKMTRWEYLSEYAN >NZ_CP016028|915271:922789|915271_916129_-|WP_004270306.1|DBSCAN-SWA MTKQHTWQTTSRDLAVIALGCAIYAFGLVTINIQNHLAEGGLTGITLILRYWLHIDPAYSTALLNIPLIILGYRYLGKRALAYTIYGTAMMSVFLWIWQRVPITIDLNHDILIAAILAGLCGGFGSGIIYRFGGTTGGTDVIARIIEKEKGMPMGRSLLLFDVVVLTLSLSYLDIEHMMYTLIASYVFSRIVNFTLEGAYAAKGLLVISDHAQAIADDILADMERGVTFLQATGAYAHQDRPMLYCVVSPSEIAYLKRLINQHDPHAFVSIIDVHEALGEGFTYD >NZ_CP016028|915271:922789|920286_921237_+|WP_039099421.1|DBSCAN-SWA MSEQTYLDLARTILETGHYKEDRTNTGTYSLFGYQMRFDLNEGFPLLTTKKVPFGLIKSELLWFLKGDSNIRYLLQHNNHIWDEWAFERYVQSADYTGPDMTDFGHRAQTDAAFNTVYRDQMQQFNERILDDEAFAKQYGELGDIYGKQWRAWQTRSGDTIDQIKNVIEQIKTNPDSRRLIVSAWNPEDVPSMALPPCHTMFQFYVNDGRLSCQLYQRSGDVFLGVPFNIASYALLTHLIAHETGLEVGEFIHTLGDAHIYSNHIEQVKTQLERPIHAAPKLWLNPDKTSIFDFDVADIKLENYEAEPAIKAPVAV >NZ_CP016028|915271:922789|921946_922789_+|WP_064777125.1|DBSCAN-SWA MANIKIVTDSSIQLTPEEIKEHHITVIPLTIMIDNTVYIDGETITRDQFMTEMASASALPKTSQPAIGNFVETYEQLAADGSQILSIHMLRAISGTVDTARQAGEMAKADVTVVDSDFTDRAMAFQVLKAAEVIENGGSMDDALAAIQNVHDHTKLYMGVTDLTNLVKGGRLSHAAGVISSLLNIKVILEVADSELKVLRKGRGMKTITKFIDEMEADMRDLKIRAIGISHADGLELSEKIKAQLQVVFPNIEILVRTTDPVIATHAGAGAFAVMYYTEE >NZ_CP016028|915271:922789|916276_917476_+|WP_064777124.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKVTTFAPEFEAALPILKQIEAAGFEAYFVGGSVRDYLLGLPIHDVDIATSAYPAEVKQIFKRTVDTGIQHGTVMILDHGTGYEVTTFRTESGYQDFRRPDSVTFVRSLAEDLQRRDFTINALAMRADGEIIDLFDGLTDLKAQQIRAVGKADERFHEDALRMMRAVRFESQLGFAVTPETQTAIAKHAELLTKIAVERIHVEFVKLLQGIQRQNGLQTFLKTGLYRYCPAFATEAAGLTKLAALPAQQIHDEDTAWLLVNALLGKTPAAAGKLLKRWKSANDVIDAVKAGLGLLPAILDQSADQWALYQAGQHVLDITLIVAQLMTSESVAVDQWQAKYAALQIKQKAELAINGQVLMQNGYQPGPQLGKMLAQLEKAVVLDQLPNDQAQLLQSAAQN |
7 | Staphylococcus_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1244670 : 1304564
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP016028|1244670:1304564|DBSCAN-SWA TTTAATCCGAACAAGCCCGGAATCTTTCAATGGCAGTCTGTTGATGATGTATTTTTAATGGTCGTTGATTAATTAGTTCAAGTGCTGCTAGGATCTCATCAGTCGTTACTTGGCTAAAATTGGTCTTTTTCGGGAAGAACCAGCGTAACCGTCTATTAAAATATTCATTGGAACCTCGCTCCCATGGTGAATATGGATGGCAAAAATAAACTTTGATCTGATAATCCTGTTCTAAGGCCTGATAATTGGCAAACTCTTTACCATGATCAACAGTAATGGATTTTACTTGGGGACCGAAGGCCCCCATAAACTTACCAAAGGCGGTATTTAGAGCCTTAGTCGTTCTATTAGGGGCTTTGATGGCCCATAGAAGTCGGGTCTTACGTTCTACGAATGTAACCAGGCATGATCGTGACTCACTTCGACTAGAAAGCACCGTATCTACTTCCCAATGACCAAAAGCTAACCGTTGATTAACAGTTGTTGGCCGTTGTTCGATGGAAGTCCCACTTGTAAATTTCCCACGATTTTCGCTCACTCGGTGCTGGCGGACATTCCGATTGGGTAGATCAGTCAATTTGAAGGGGAGCCAGCCACGATTAAGCCAATTATAAATTGACGCAGTGCTCAAGTTATAAGCGGCCGCAATGGTTTCTGGTGACCAGGTTAATCGTAAGTGATTGGTAATTAAAGTCGCTAATGCTGCCGTCAGCATCGAACGACGACCGCAATTCCGCCTTTTGCGATCTGCATCTTGCTGAGCTAATTCTGGATCATAAGGTTTAACTCGGTCCAACTCATAGCTAATCGTAGCTTTGGCGACGCCTAAGGCGTCAGCCATTACTTGGTAAGATTTATTCCCCTCATTGACCAGTTGTGCTAGTGCGCCACGTTGAAAACGTGATAAAGTAGATGTACCCAAAGTAATCACTTCCTATATTGGTTGGAATTAGCTACTACCATTGTAAGTGATTGCTTTGGGCTTTTTAATTTCTGTTCGGATTAATTATAGAATTTGCCAGATCAAAAAAATATAACACTCATTTTTATGACTCTTTCTTCTCAAAAAGAATGCTACAAATCGTAATAATACTACATAAAAACAGAGCCAATCTGTTTTATATGAATTACTTCAAATAATAGAGTTTACCCTCCTTGGTAATAATCTCTATGTCTTTGTTTAATACTTCATCGGGATACGCCGTTTCTAATCTTTTGTTGAAAGTTTGTGAGATAATTTTTTCCTCTATATTTTCGTCTAAAGGTTTATATTCCAAGTCTTTATTAAATAGCCCCTGCGCTTTACCTAGAGCGCCTTCAAATCCATATTTTTTAATTCGATGATTATCTATGTCTATTCCTAAATATTTTGTTTGGTTATCATGCCATAACTTTAATTTTGCTAAACTGTCATTTGATTGATTCATATATCCATTGAACATTGAATAGCATATTTCGGCTTTAATAGCTCCTCTATTCAATGAATACGTTAACTTGCTGATTTCTTCCAATAAAGAGACAAGTACTTTTTGATAGGTAACTAATTTGTTGAACTCATTTATCTTCTCTGAATATGTTTTGAAGTCAATTTGTTTATTATGTGTGGAAAGATCGTCAATCGTAATATTAACTTGTTGCAGAAGTTGCGTTACTTCGCCTTCTATGGAATCTAATGAATTTAACATTCTATTTCTTAACTCATCATTTTCTAAAATATCAGAACTAAATTTACTTATTTTACCTACTCTAGTGATTAGTGAAAATATTTTTGATTTAAACTCTCTTTGTTGAAAATCTCCTATTTCACTGATGCTTTTATTCATGGTTTGCAGTTTGTCATTTACTTCAGACATATAGTACTGACCAACAACTAAAGAGGCAACATTCATAACACTTGCAACACCATTAGCTACTTTAGATGCTTTACTTAATTTAGAGGGGTTGACTTTAACAAGATTTGCTTGACCAGCAATACCTTTTCCATTGGAATAAAATCCGCGAACAGCACCTTCCATATTTTTTGATTTTGATAAGGTTGCACCACTTGGTATAATGACTCGATATACCTCACCAACAGACTGCAATCCTTTATTCGTAACAGTTCTAGCTACTATGTTAGTTAAAGCTGGTATGGTCTCACTTATTCTTGCTATAACATTTGAATCCTTAATTTCATAAAGCTTTCTTTCATCAAATGTTCTTTCAGAAATTAGATCTAATGTGATAGGAATTTCAAATGGTTTGTCATCTTCCACCGTAAGACTAGGTGAAATCGATATATTTTGTTGTTCATCGTTATTGCAATTCATATTTTTTAATTTTGATTTTTTTAGTACAAGATATATTATGATAATTACAAATAATATAAAAGTAAAAAACAAAAAACTTTTCATTAAACATCCCTCAATTCACTGGGTATCTAAATCATTATACCCTTTTAAATGCTAACAATAATATTTGTAGTTTATTAAATTTATTGTTAGTAGACTATTATCCAAAATCAAATTTGATCGAGCATAGTTTCTCGACTGGCTTGATCTAAACCAAGATAGGTTAAGGTCATGGCTTCGCTTGAATGGTTTAATAAATGCATGACTAACCCAATATTATAGTTTGATTGCGTATAAACACGATACGCACCTGTTTTACGCATGGTATGCGTTCCTAGATAGTTAATTCCTAGAAGATCACCAACTCGTGCCATAATCTTATAAAACTGTTTTTCCGTGATATGGCGCTCGGGGTGTTGAAGGGAAGGAAAGAGCCATTCAGAATCCAGCTAATGATCAAGCAGCCATTGACGGTACAATAAGAGTTCTGTTTGAACTGGTTTAAGGTACAAGGTATTAGTCTTACCGGTTTTTCGATCATGAATGAACGCATTTTGTTTAATAGAACCGTCCAGATTAAAAATATCGGTCTGTTTTAAGTACATGACATCACTGACTCGTAGTAGCGTAGCTTTACCAACTTGAAAAATGGTGTAATTCCGGCGACCAGCACGGAAACTATCGAGAAGTGTATCTTGTACCATCTTTAAGACGTTGGAGTCTTTGATAGGTAATACGATTTGTTGAACCATAGTTAATTTACCACCTTTCAAAGGTCACTTTATTGTTAGTTAAATGAGCTAGTATTTGTATCTTTTTATACAATGCATCTTTAGAAAAATTAACGTAGACATGATATTTACTTGAGTCTATAGCTTTAGTTAATTTAGTACCTTTCCCAGACACGCGCTCTAGCGTCCCTAATATTTGTACAGTATTTGGTTCAGTAGAATTTATTAAATCCGTTAATTTTGATATCTCTGATGACAGAACAAGTGTAGATACTAATTTAGTAAAGACGTCTCTGTAAGAGGTTCCTGTATAATGTTGTCTGCCAAATAAAATCGATATAGTATCGTTGTTTGGAGTAGGGTCAAACCTATCAAATTCGGTATCATCACTAGCAAATAAGTCAATATTTGCGATATCTATCAATACCCTTTCAACTTTCGATAACAATGATAAGGCAGAAAATTGGCTTAATTTATCAATATAGCTCTGATTACCTTGGGTATTATTATCTAGTTCGATTTCTGCTCGTTTCATTTTTTCAATTATTTTTCGTTCTAGCAGATCTAACTGTGCTTTTGATAAATGTCCATCTTCACGTCCAAAAAATATTAACTTGTTCCACCACGGCTTATTAATATAATGTTGCTGCAACCTATTAAAAATAGCATTTGATGCTTGACCGATATATCGTTTATCATCACCTAACAATATATAGATACCAGGTTTTTTAGACTCATCAATCAACTGAATGCTAGTTAGATCATCTTTATTCGCAATGACCACAAATGATGGTTCGTCATAGAATATTGAAATATTATCATTCCCGGACTCTCGATTGATAAATATGTGATTGGGCATGTGATTATCGACCTCGTTTTTTAAGTACTATTATATCACCTAACAAAAAAACAGCCCCCATTATCTACTAGTCAGATAATGGGGGCTGTTTTAATAGTCTTTTCGAGGGGCGATTTGTATATTATAGACCCTACTTTAGTGTTATATTTTGAATTTTGTTTCGTACCTGACGGGCATCACCCGCAACATAGAATTTAACACCATACAACTTTACCTTATCATTTTCACCAATAACATCGACACTCTCAGGAGAAATGCTCGTTAACAAGTCCTCTTTCCATTGGTCTTGATCCAGCAATTGGGTACCCTTTGGTTCAATATAAATCTGATAAATATAAGACTCATTGGCCAAATACAGAACAAAGTCCGGTAAGAAACCAGCATAGTGAGACACATCTCCAGCAAATTCATGCAATTTTAGCTTAGTATTACGCTCATCACTACGAATGAGGTAAACATCTTTATACTTGTTTTGCAGTTCTTCAACATAGCCTTGGATCAGTTCAATTAAACTACGTTCCAATTTATCGACAATAGCCTCGTTATAGACAAACCAAGGTGCCTTTTTATAGTCATAGGTTTGAATTAACTCATGAACCCCAGCATCAGAATAGTTAACTGGGACACGCTTCTGATAATCCTGAACGGCATCTTTAATTGGCAACCCAATAAATTTATTAGTCCCACGTTGACGCTTGTAGTTCATGATTAACATGCGTTGAATATACGCTAGATATTTTTCAACGACTAATAGCTGCGTTTCTCGACTAAGCACTGTATCTGCACCAGTTGATACCGTCGCTTGGATTTCTTTTAGCTGTCCTAGCCACTGCGCATCATACATAAACTCCGAGATAGAATTTAGCGTCGGCATATATTTTTTCATGGTATTGAATCTGAAGAAAGGATTCCGTGCCATTGATTTTTTAACGAGTGCCTCATCAATCTTTACCAGCCGTGTCTCATTCATACCTGCAACATTTTGTGTATCAAAGGCCGTTGCTTCTAGGGTTGCTGTCTCAATGTTAACGGTAGGTAGTTCTGCAACAGGGACTCCATATTTTGCCAAACCATTATATT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59 | Lactobacillus_phage(21.05%) | protease,holin,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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