Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012730 | Bacillus anthracis strain Parent1 chromosome, complete genome | 5 crisprs | cas3,csa3,WYL,c2c9_V-U4,cas14k,DinG,DEDDh,cas14j | 0 | 1 | 10 | 0 |
1. NZ_CP012730
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012730_1 | 1064104-1064197 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012730_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012730_1
>1.1|1064129|44|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder GCGGTATAGGGAAATTACAAGATGGATCCGGAAAAGTAACAGAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012730_1
The CRISPR arrays of NZ_CP012730_1 >merge|NZ_CP012730|1|1064104-1064197|CRISPRCasFinder GGTTTAAATACGTTAAATAGCAAAAGCGGTATAGGGAAATTACAAGATGGATCCGGAAAAGTAACAGACGGTTTAAATACGTTAAATAGTAAAA >NZ_CP012730|1|1|1064104-1064197|CRISPRCasFinder GGTTTAAATACGTTAAATAGCAAAA GCGGTATAGGGAAATTACAAGATGGATCCGGAAAAGTAACAGAC GGTTTAAATACGTTAAATAGTAAAA
>NZ_CP012730.1|WP_000963385.1|1062587_1063160_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MAIDRKRSIIEAATKYFSAFGYKATTMDQVAKLANVGKGTIYTFFKNKEELFGEIISNLITEMKQVAENAIRSDVSFFENVHRALYSILEFRKEHQLMIKLIQEERDMGTKEVQEVMQQVDVEIVSVIQSYLKIAIDKGEISKCDPEITAFIMLRLYVSLIFDWEKNHEPLEKEKIAELFELYLLKGLSN >NZ_CP012730.1|WP_003170545.1|1060475_1062374_+|M56-family-metallopeptidase MIDMLINVYLPHFFDWLIETSLMASILVGFILCIKILFRNKLTPRWQYMLWIVLMIRLLLPWSPDSSYSIYSLLSYRSSVSEVIPKNMPSTESKMNIESDRKVELESHAETVTKSGKPEVNVSTEQQITLSLYKIAMYVWLVGVFLLAVITFITNRRLYSYIKKQPDITDEQVVTVFNRCKQSMKMKKAVSLRLAGKIASPTVFSFFRPKVLLSKKHMKVLNEQQLQYVFYHELAHIKRNDVAVNWIMYSLILLNWFNPILWYAYFCMREDQELACDAYALTFIDKEEQIAYGHTIITLLEHYSYQAPSLANLSRNKRTMKRRIVMIKKFQKKSYRLSLLGVIVIVAIASLSLFNVRATEGKEKQEDKVEQSKDAFQNAVDMLYGTEENAKKEYHYSARVYEEKTDYLYLAEKALTKDEFQQYIKLSKKIINIQKKGAPRDSDYESTVFREERLSKADRDKLYALYDQAKPFDDKVYESLNYTVKEAQQHVDFQIKKPTYTIEGYNLKDENVGYFIKRRPELIIELEYTNAKGNYTIYQSQVFGESKDPFSHQFVVPENIEQYELEGNQIFYATDHSDSNLQGMKMIVPAKGKNSAYQVVIINHSLERQGEAVFDKNVNKEELEKIMISMLK >NZ_CP012730.1|WP_000184500.1|1060071_1060470_+|BlaI/MecI/CopY-family-transcriptional-regulator MTNQLPKISEAELEIMKVLWLKSPQTANEIIEELEDPMDWKPKTIRTLINRLVQKEAVSYHQDKGRMYAYYPLVSQDNYLQVETKSLLKRFCGAAFKPLLVNFLKEEKLSSEDINELKRLLDEKTEENKRKD >NZ_CP012730.1|WP_000984150.1|1059002_1059842_-|hypothetical-protein MMRALRLNIKQAFCNRVSLIIMFSGFVLICIYHYYYVIRYLGDAASGPISTDIKWIGFRDNEMDVYLLLMPIIASLPFSTSYNSDKSDGFKQFVSKGINLFSYSITKYIVTFFCGGLLYTLPFILSLLFCKLTIPDGEMPAGSGIINVNGMFASLYEASPIIYITVYIEINFLFAGLMALLGLAASAWSQKDYMSLLFPFAATSIPYVLLNTVFPTIGGAPIHLYDPKQPLDGMSPYILTVQCAFFLFVSLLMYIRGVKRDRKKYRRRLQKRDRCRKTF >NZ_CP012730.1|WP_003170543.1|1058652_1059006_+|hypothetical-protein MQAQLNGKLMNQLAIFFSTIVMLQFIADVTGFTQNLDITYNLIHTAASYITFSLAVIFTLIGARRELSKYAIISLCLVVGIKAKGSLFYGDWLARRKRIVNKPLISKIVRKLEVYYT >NZ_CP012730.1|WP_000279249.1|1056134_1058501_+|endonuclease MAVKKLLSVFLSFILLLSFTGTLVQAEETTSMSVEKAIQVFKQQGKTKGTVEGYIVGYTQSPSKYTKDPAKFDDTNVAIADSPNETNPDKIMPVQLPKGDVRAAVNVKDHPENIGKKVSLTGTLELYFSSPGLKSVTAHKFQGEEQNRVSDVVASPNGGEVAKGTAVTLTTNTEGATIYYTLDGSNPTNKSVRYNGQIIVNENSVMKAIAEKEGLTSSPISTFSFVIVNNEPVRIHDIQGKSHLSPYNGKKVYNVEGVVTALDKNGFYIEDNQPDNDPATSEGMYVYKKDANVAVGDLIQVDGVVEEYVGPGYAERFETDLTTTEIKASRVAVIAKDQPLPAPIVLGENGVKIPDQIIDNDAFGLFDPNEDAIDFYESVEGMRVTMPTPKIIAPQKNGNLYVTVKNGGNKVVTKYGTPVLDENQLNPERLSVKVPRDYVAKVGDTFTGDIIGVVGYDYGSFRIAPITELPSVVDGGFKQIGANIQPRLDKLTVATYNIENFSANKKETTDEKVKALAYSIKYNLKMPDIIGVEEMQDNNGTVNDGTTDASLSAKRIIDAVLEIRGPKYEYVEIAPNNNLDGGAPGANIRVGFFYNPSRVKLATVPKLLDKNVVRIGDENPLFESTRKPLAAEFTFQGQNLVVVANHLNSKIGDATPFGKVQPLVLKSEEKRVQLAQEVNNFVQGIQKKNTNAPVVVLGDMNDFEFAKPLKTLEGTILKNMLNTVPKENRYTYIHEGNAQVLDHILVTNNIAPHTIVDPVHLNTNIMKEHGRVSDHDPVLAQIDLKKAS >NZ_CP012730.1|WP_000453710.1|1054541_1055894_-|DUF4026-domain-containing-protein MEVQTETYRAAMNGTLERHFSDMIAVIPTRITIEQLKQRLENIATKVDELKIVYSDETSLIVELHMDNKVIPYELHIDETDDPEEYKLYNRQDSTIVDRSFEDAAYGTEIFTRTLFVGDVLNCFFQQLQFLWNLAPDLLFVIDSSAAMKVISRNYIEYHVENELLPDIPDLYVIHSVYEDDKEGEPTQYWFHTHGLLRAGVTEIELIIPNRISSYYGIGDLFQTFANNAVENGQVPMNEPIVIAHSQQGSIHTVAVPWEKGLSYIGHKTSMDQLSSIEDEEVKLQPISAQNTFLGGMDDRDEYHQSPSVLLFKFDTSEEYIESFFKEHEEATGLMFYKTNSETARMAYNAKNTFGYFSNIFQIEQSNEEFRFLAKFGVSYEEGKSEHMWFEMQHITEEFIQGILINEPYFIEDMSEGNSYHLDFDDLTEWVIYAGDAVIKPNNLYMFIGE >NZ_CP012730.1|WP_001228080.1|1053080_1054502_+|protoporphyrinogen-oxidase MRKKVVIIGGGITGLTTMYHLQKDIRDKNLPIDTLLIEASGKLGGKIQTVRKDGFTIERGPDSFLARKESAARLVKELGLGDELVNNQAGQSFILVNNRLHKMPSGSMMGIPTQITPFLFSGLFSPIGKLRAGFDLLMPRSKPVSDQSLGHFFRHRLGNEVVENLIEPLLSGIYAGDIDEMSLMSTFPQMYQIEQKHRSISLGMRTLAPKAEKAEPKKGIFQTVKTGLESIVESLELKMHEGTIIKGTRIEKVAKQGDGYAITLSNGKEIEADAVVVASSHKVLPSMFAQYKQFRFFRNIPSTSVANVAMAFPKSAIQRDIDGTGFVVSRNSDYTITACTWTHKKWPHTTPEGKTLLRCYVGRPGDEAVVEQTEEELVQLVLEDLRKTMDITEDPEFTVVSRWKEAMPQYTVGHNERMKKLTTFMEKELPGIYLAGSSYAGSGLPDCIDQGEKAAKRVLSHLEKVMNTELIAQ >NZ_CP012730.1|WP_000726793.1|1052125_1053061_+|ferrochelatase MKKKIGLLVMAYGTPYKEEDIERYYTHIRRGRKPSPEMLEDLTERYRAIGGISPLATITLEQAKKLEKRLNEVQDEVEYHMYLGLKHIEPFIEDAVKEMHNDGIQDAIALVLAPHYSTFSVKSYVGRAQEEAEKLGNLTIHGIDSWYKEPKFIQYWVDAVKSIYSGMSDAEREKAVLIVSAHSLPEKIIAMGDPYPDQLNETADYIARGAEVANYAVGWQSAGNTPDPWIGPDVQDLTRELNEKYGYTSFVYAPVGFVAEHLEVLYDNDFECKVVTDEIGAKYYRPEMPNASDAFIDCLTDVVVKKKESVM >NZ_CP012730.1|WP_000252599.1|1051064_1052111_+|uroporphyrinogen-decarboxylase MVRTINETFLKACRGERTDYVPAWYMRQAGRSQPEYRKIKEKYSLFEITHNPELCAYVTKLPVDQYNVDAAILYKDIMSPLPAIGVDVEIKSGIGPVIDNPIRSLQDVEKLGEINPEDDVPYILDTIRLLTTEMLDVPLIGFSGAPFTLASYMIEGGPSRNYHNTKAFMYAEPKAWFALIDKLADMVITYLKAQINAGAKAVQIFDSWVGTVNVADYRVFIKPAMERIFAEVRTMGVPMIMHGVGAAHLVNEWHDLPLDVVGLDWRLPIEEARARGVHKAVQGNMDPSFLLAPWSVIEEHVKGILDQGMKQPGYIFNLGHGVFPEVNPDTLKRLTTFIHEYSKGQLAK >NZ_CP012730.1|WP_003158412.1|1066127_1066343_+|hypothetical-protein MMKGNLTYYFILNPLIIFLVYALSPILFHKEKYINMKDALGILVVYYVLISGYCLMDVVSERMKKDSKDKQ >NZ_CP012730.1|WP_000140275.1|1066379_1066685_+|DUF2087-domain-containing-protein MTESEMKFRDATIRNFFDKEDRLKSIPGQKKKKLVLLEHLISKLNAANQYTEKEMNTFIKQYHDDFCTIRREFIVHGFMDREANMYHINGREVWTKWEELK >NZ_CP012730.1|WP_001068232.1|1066711_1067065_-|PlcR-regulated-protein-PRP2 MNPILTTAKQLLHKEETILSTLNCSLTGYMITYNVPYPGMLLTTNRRLLFFSQYKNTLIAEFDYEKILSIETKRRIFDKKIIFYYEDEYITLGYITSSNIEEFIDLLRRKCKISTNS >NZ_CP012730.1|WP_000620028.1|1067198_1067702_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIRLAKETDAEAIMDIRKEIILSKTTTKFFIVSPKKLPNDTNAEREKIRKSNEKGNLYIVYEIDNKVVGFLLFNRYELDRLRHAGTMGIKEAYCNQGIGTKLIEFLIRWAKEQNGLEKICLGVVSVNDRAIKVYKRMGFVEEGRQRKQIKYEDGSYGDDVLMGFYID >NZ_CP012730.1|WP_000567010.1|1068991_1069120_-|YhfH-family-protein MIDQPMEFFRNLPTKTCAHCGKEIDEQHEAYHNKCDDCVHEE >NZ_CP012730.1|WP_000784654.1|1069299_1070034_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MKMTVVGFWGGFPEAGEATSGYLFEHDGFRLLVDCGSGVLAQLQKYITPSDIDAVVLSHYHHDHVADIGVLQYARLITSATKGQLPELPIYGHTFDENGFHSLTHEPHTKGIPYNPEETLQIGPFSISFLKTVHPVTCFAMRITAGNDIVVYSADSSYIPEFIPFTKDADLFICECNMYAHQEAAKAGHMNSTEVASIAKDANVKELLLTHLPHTGNPADLVTEAKQIFSGHITLAHSGYVWNS >NZ_CP012730.1|WP_000897260.1|1070043_1071033_+|lipoate--protein-ligase MLFIDNKGITDPRINLAIEEYCVKNLDINETYLLFYINEPSIIIGKNQNTVEEINADYVKEKGIHVVRRLSGGGAVYHDLGNLNFSFITKDDGDSFSNFKKFTEPVTKALGKLGVNAELSGRNDILAEGRKISGNAQFSTKGRMFSHGTLLFDSEIDHVVSALKVKMDKIQSKGIKSIRSRVANITEFLNEEMTTEEFRQLLLETIFEGETEIPTYELTEEDWKEIHKLSEERYRNWDWNYGKSPKFNLQHSHRFPVGQVDVRLEVKKGTVTECKIYGDFFGSLDVHDIEERLTGVQFDKDAFTTALEGVDIARYFGNITTEDFLHLFF >NZ_CP012730.1|WP_000832626.1|1071287_1071716_+|lipoprotein MKRVMYVVLLLSFVIGMTACNDETSSSRTLLSIGKPAKDNVIYFTHTDNKRKIQEIQDMFQNKKWKRNETFSTVNKTPDVVFSIDEDNTGLPALYVTVYFHEDGADVLNLYGEYTSFNKQELAMLREKMSAYYPKMIFGLVS >NZ_CP012730.1|WP_001055163.1|1071877_1073410_+|fatty-acid--CoA-ligase-family-protein MNLVQSLAETAKKKGDKPAYIFMDQSVSYDQLNKMVTRFSSNLAEMGIGKGDNVALVVGNSPHFLVGLYGTMKAGATVIPVNPIYTADEMHYILQNGDVKTIIVLDVLLPVIQSLTTRLPSLENIIICETSSDFNHTETEKMKTFTRMIGAGDLTYEGPELDEEDVAVILYTSGTTGKPKGAMLTHKNLYSNASDVASYLQYTADDRVVAALPMFHVFCLTVAVNAPIVNGATILMLPKFSPKEVFRICRTYEPTIFAGVPTMYNYLYLFEEASAEDVKTLRLCISGGASMPVALLQNFEKRFDVIVSEGYGLSEASPVTCFNPLDRPRKPGSIGTNIWHVENKIVNELGEEVPVGAVGELIVRGPNVMKGYYNAPEDTAATLKDGWLYTGDLAKMDEEGYFYIVDRKKDIVLVGGYNVYPREVEEVLYMHESVAEVVVIGVPDENLGEAVRAYVVLKQTNVTEEELMHYCTLHLAKYKVPKSIEFLTELPKNTTGKLLRRALREKAMQV >NZ_CP012730.1|WP_000435475.1|1073522_1073774_+|hypothetical-protein MEQKELRLRRVQYLICDIMDEMNAESEKNNLEILQQVIDHLSGAIGDLVDPSSTYSIDYLERKVHTAHYLLFKNERKAYLCRK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012730_2 | 1176608-1176716 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012730_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012730_2
>2.1|1176633|59|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder GAGAATCCGTTAGCGATAGTCGCGGTTCCTTCTGCATGTGCTGCTTCGCCTAAAGCGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012730_2
The CRISPR arrays of NZ_CP012730_2 >merge|NZ_CP012730|2|1176608-1176716|CRISPRCasFinder TGTATGATTACCTTCCGCATGAGAAGAGAATCCGTTAGCGATAGTCGCGGTTCCTTCTGCATGTGCTGCTTCGCCTAAAGCGATTGTATGTTTACCTTCCGCATGAGAA >NZ_CP012730|2|2|1176608-1176716|CRISPRCasFinder TGTATGATTACCTTCCGCATGAGAA GAGAATCCGTTAGCGATAGTCGCGGTTCCTTCTGCATGTGCTGCTTCGCCTAAAGCGAT TGTATGTTTACCTTCCGCATGAGAA
>NZ_CP012730.1|WP_001079110.1|1175017_1175911_+|RluA-family-pseudouridine-synthase MNRFTLKWDIESAEEGTLVREFLKTKGISKAALTDIKFHGGAIEVNGQHASVRHQLQVGEELRIFFPVEERSEGMIAEDIPLCIVYEDDAVLVINKEANMSTIPSREHPSGSVANALLSHYDKQYLPSTVHIVTRLDRDTSGLMLIAKNRFVHHLLSKQHQQKAVKRTYEAIVHGEMVEREGTIDAPIGRKSDSIIERTVCEEGQRAVTHFRVIDSANHKTHVSLELDTGRTHQIRVHLAHIGHPLLGDNLYGGKRDEMKRQALHSTSLTFYHPILEKEMSFAAMIPSDMQEVLRQT >NZ_CP012730.1|WP_000673194.1|1174204_1175002_+|NAD-kinase MKFTIMSKGDQSSDTLASTMKEYLLDFGFIMDEQEPDIVISVGGDGTLLYAFHRYYNRLDETAFVGVHTGHLGFYADWLPTEVEKLVIAIAKTPFQVVEYPLLEVIIRYMNGSKESQYLAMNEATVKSAEGTLVTEVEIRGEYFETFRGDGLCISTPSGSTAYNKALGGAIIHPSIEAIQIAEMASINNRVFRTVGSPLVLPKHHTCVLKPTAGMNLQITVDHLTMVHQDVKSIQYRVANEKVRFVRFRPFPFWKRVRDSFVADK >NZ_CP012730.1|WP_001081482.1|1173547_1174186_+|GTP-pyrophosphokinase-family-protein MNRNWEEFLAPYHQAVAELKVKLKGMRTQFAMLTEHSPIEFVTGRVKSVASIIDKAEKRNVPLDRLREDMQDIAGLRMMCQFVDEIKPVVEYLRKRNDFEIVEERDYVTQKKDSGYRSYHVVISYPVQTIQGEQKVLVEIQIRTLAMNFWATIEHSLNYKYSGRFPEDIKIRLQRAAEAAFLLDEEMSSIRLEIQEAQKAFSRKQETKDSES >NZ_CP012730.1|WP_001180010.1|1173157_1173517_+|hypothetical-protein MQNKIQVKSVEKRENALIFCAENSEIEVKGLSARNHVLVDSDNLSFLYILENESSFIYVSIPHTCWEAMNNDVVMFVRVNDIEMELEGLKEEVEYLVENIEGNANYGEELVTAVEKVFL >NZ_CP012730.1|WP_000191105.1|1172432_1173011_-|CYTH-domain-containing-protein MTQEIEIEFKNIVTEEEFHALCKSFSIEVFTKQVNHYFETPNFSLKEAGSALRIRHKGETYTLTLKQPAEVGLLETHQVVTENEAKMMMETNVIISGAVMNQLCKLQIPVSALTYMGSLTTERAETLFEGGTLVFDHSFYYNHDDYEIEFEVQDEETGKAAFIHLLKQHNIPIRHTNNKVKRFFLAKQNKAR >NZ_CP012730.1|WP_000043389.1|1171853_1172252_-|hypothetical-protein MSKQPMTPFEAIGGEQCIEILVDTFYSYVSKHPDLSPIFPDDLTETARKQKQFLTQYLGGPNLYTEEHGHPMLRARHLPFEITPKRAEAWLSCMEQAMDDTGVHGHIREFVFERLALTAQHMVNTPNETGEI >NZ_CP012730.1|WP_000360662.1|1170960_1171854_-|DsbA-family-protein MDKQEAKHINMPSPSACEYKSVEAYLFIDPLCKDCWEIEPFIIKLWLEYGKYFSIRHIVTGKVDGTNASSHKWNKPANIRFVWEKTTSLHGFSYDGKVHMQEASSTPYLVSMAIKAAELQGRKAGSKFLRKLQEYIFLENVSNPDCELLLACAKDSDIDVEEFKKDLYSASAKKAFQCDLKFTNEMHITEIPSLVFFHANSDEEGIKIAGTYSYDVYVQLLKELVKCEIEPEPLPSLEVLLEATQFISSKEVAFIYDCSKQEIERELKKLQLKRKVQMIDVKCERYWKWIAKEKDLV >NZ_CP012730.1|WP_000003398.1|1168611_1170438_+|oligoendopeptidase-F MSEQNTAKTLPDRNEIEESSTWRLEDIFQTDTEWEKEFQAIKELLPKLTEFKGKLGDSANNLLEALQYEDEISMRLGKLYTYAHMRYDQDTTNSVYQALNDRATNLYSQVSSSTAYIVPEILSISEDTLQTFLKENRDLSVYEHALEEITRQRPHVLSEAEEALLAEASEVMSTSSNTFGMLNNADLKFPSIKGEDGEEVEITHGRYIQFLESDDRRVREDAFKAVYETYGKYKNTFASTLSGAVKRNNFNARVRKYDSARQAALSNNNIPEAVYDQLIESVNDNLHLLHRYIDIRKRALGLDELHMYDLYTPLVPEVKMNVKYEEAQDMLLKSLHVLGDEYVDILKEAYENRWVDVYENKGKRSGAYSSGAYGTNPYILMNWHDNVNNLFTLAHEFGHSVHSYYTRKTQPHVYGDYSIFVAEVASTCNEALLNDYLLKTTEDKKERLYLLNHYLEGFRGTVFRQTMFAEFEHIIHKKVQEGHAVTPDMLTEIYYDLNKKYFGDALVIDEEIGLEWSRIPHFYYNYYVYQYATGFSAATALSKQILEEGQPAVERYINEFLKAGSSDYPIEVLKKAGVDMASPEPVKEALQVFEEKLNELEALLFEEK >NZ_CP012730.1|WP_000612267.1|1167316_1168561_+|competence-protein MIPIFIAKRENGEKIHLLDHHDEELLHHMRKRESFFCIACGKEVLMRLGKQKRWHFAHKKVDSCLAFYEAESTYHMYGKELLYRWFKRQNVHVEIEHYLPEIQQRPDIFIERAGRKIAIEYQCANLSIEQLCKRTYSYWQAGIQVIWIIGGNQLKKHSAYWMKFSSIMAFSLQSYPQPLLIFFCSKQKSFMKCTFITSFSTSIAFSHIIYLPIETTTFEMLFSPVPFQREVLKREWKRRKDYFRQNALPILNYNHKSLLRLLYQCKCNPANFPSEIGVPLPSSFAFQTNSFIWQAFLYMKCIGELAVGDCISLKYVCGYIKKYTKRRMLPYFSQHIWKVAVTEYMTFLCYAGVLYKVGMYTYRKIRDAVPLKTGGEIIKHDEICLAHALSLFEAKFNMRGGKGDIIKTDREGIT >NZ_CP012730.1|WP_000799204.1|1165690_1167235_+|cardiolipin-synthase MKNTLKLIFFVLLLFALFVSLRMFIDVAFYSDVIGIKDVSILGIISILFTVSAFLIGCVIFLENRHPSKTLTWLIVLGIFPVFGFFAYLLFGQNFRRKRMFQKKALLDEQAFLQYKGHEDYEERILRNHKHQELLFRLADRLGALNISFQTETRTLTNGDETFQAILDGLKRAKHHIHMEYYIVRDDKLGTEIKDILIQKSKEGVVVRFLYDAVGSFKLSKSYIEELNDAGVEMIPFFPVRFPILNDKINYRNHRKIVIIDGNEGFVGGLNIGDEYLGKDKYFGFWRDTHLYLRGEAVQSLQLIFLQDWFYMTGEAVLAPEYLQAKAVEGEHWGGVQLVAGGPDNKWETIKHLYFAMIASARKSIWIATPYFIPDDDILSALKVAALAGIDVRLLMPSKPDKRTVFYASRSYFPELLDAGVKIYEYEKGFLHSKVVIVDSDLASIGTANMDMRSFHLNFEVNAFLYDTDSIRKLVQDFKDDLEESSEIHVDRFHKRRLHRRIVESTYRLLSPLL >NZ_CP012730.1|WP_000872719.1|1177487_1178228_-|bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase-PrpE MKYDIIGDIHGCLQEFQNLTEKLGYNWSSGLPVHPDQRKLAFVGDITDRGPHSLRMIEIVWELVIHKKVAYYAPGNHCNKLYRFFLGRNVTIAHGLETTVAEYEALPSHKQNMIKEKFITLYEQSPLYHILDEKRLLVCHAGIRQDYIGRQDKKVQTFVLYGDITGEKHADGSPVRRDWAKEYKGTTWIVYGHTPVKEPRFVNHTVNIDTGAVFGGRLTALRYPEMETVSVPSSLPFVPEKFRPIS >NZ_CP012730.1|WP_000427734.1|1179604_1180540_-|glycosyltransferase-family-2-protein MENIKNVPLVSILIPTYNRPHYFKIALESALAQTYSNIEIIVGDDSTNNETEKLIYRDYLHKHKHITYIRNPSTLGQFHNALMLLEQSNGEYINFLMDDDIFYNNKIEKMMFYFQKDLDQNLALITSYRTWINDDGDIIEQHPSMKKLYDEDTLLNGKDFGNRMLILGQNIIGEPTTVLFRKRLLTEPFGTLNGRNYNCSVDMASWISLLSKGDAIYITEPLSSFRLHTGQQVHHKYLEGCEDFSHLVLHSKKYGFLQDIDYYKTSLLKACEWYKNATTFYQLYPELIPTTDTHTRLSHCLNIVTKELHAI >NZ_CP012730.1|WP_001012321.1|1180546_1181314_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MNFWNENKKKITLIPPPELVQYVGGHFEEVGKEFMQYFIEIGNLKSNETVLDVGCGIGRMAVPLMNYLSDDGTYYGFDLFNKGITWCKNNISTRRNNFHFEHVDIYNQFYNPDGKEDASQYKFPYEDESFDFIFLTSVFTHLLPKELEHYVREIARVLKKDGRCFITFFLINPESSYYLNAGLSPLGFYHQIDNCYVLNKDIPNFAVAYPEEDIRTLLNKYGLEMQTPPHYGSWCGRTEHTSYQDIILTQKISER >NZ_CP012730.1|WP_000428856.1|1181441_1182287_-|macrocin-O-methyltransferase MENKSAVQLYLELLKKTILFEIWLEYEPYLPASLHISKELSYEPVTVPLPLFLKQYVENHNLKIVNPNVSNNERQGGKDWPRAAHSMVGRKRMNQLQEAMETVVKENIEGDFIETGVWRVGSCIFMNGFLQANNITDRTVWVADSFEGLPAPNLEQYPKDYGDYLHTFDYLRVSLETVQENFRKYDLLNDQVKFLKGWFKDTLPSAPIEKIAIARLDGDMYESTMDSLVNLYDKVSIGGFIIIDDYGLITCAEAVTDFRSERNIKTPMTQIDDFGIFWRKE >NZ_CP012730.1|WP_000069712.1|1182409_1183612_-|hypothetical-protein MSNNNYSNGLNPDESLSASAFDPNLVGPTLPPIPPFTLPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGDTGTTGPTGPTGPTGPTGPTGDTGTTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGDTGTTGPTGPTGPTGPTGPTGDTGTTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGDTGTTGPTGPTGPTGPTGPTGDTGTTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGATGLTGPTGPTGPSGLGLPAGLYAFNSGGISLDLGINDPVPFNTVGSQFGTAISQLDADTFVISETGFYKITVIANTATASVLGGLTIQVNGVPVPGTGSSLISLGAPIVIQAITQITTTPSLVEVIVTGLGLSLALGTSASIIIEKVA >NZ_CP012730.1|WP_000932922.1|1183777_1184890_+|glycosyltransferase-family-2-protein MLNKQGITISLCMIVRDEEKTIARCLDSVEKIVDEIIVVDTGSIDRTKEIVEKYTSNIYDFQWIDDFAAARNFSFSKATQEYILWLDADDVLLEDAQEALKLLKRELDPKIDAVSMPYHLAMDSNGKPLYCTKRNRLVKREKQFQWFGKVHEYLAISGETFSSNVAITHKKEKKVTNRNLKIFQDAVAAGEELSPRDLFYYANECMDNQKYDDAVLLYETFLNQDEGWYEEKIYACGKLGDCYAKLGLWEKAVESCVKSFRYAIPRGENCTRIGYIYMEQQKYNEAIFWFKLATEVPMATESPFHSPASYTWLPYLQMCICYSKLGEQDKAYYYNELAASYVPNNAAIEYNRKYFRSIFDQQKNRYRLFF >NZ_CP012730.1|WP_001087866.1|1185027_1185717_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MNSPKNSLYEEKSGHYYNAVNPNLLKHIKKEWKEVLDIGCSSGALGAAIKENGTRVSGIEAFPEAAEQAKEKLDHVVLGDIETMEMPYEEEQFDCVIFGDVLEHLFDPWAVIEKVKPYIKHNGVILASIPNVAHISVLAPLLAGNWSYTEYGLLDKTHIRFFTFNEMLRMFLKAGYSISKVDRVYIDHKMYEPLIEELYGVCKKYRLGSGFMAETVVFQYIIEAEKSSL >NZ_CP012730.1|WP_001271203.1|1185713_1186400_+|streptomycin-biosynthesis-protein-StrF MSAAEKTILFVTCINDSKMYAQCVRHILRLAVPPGYVVQFMPIRNAKSMTSGYNQAISHPAKYKVYIHQDVFIMNVAFLHGLLQLFNEHEHLGMIGMIGAQYVPPNGVWNEGKGVVGKVIGYMNDLFYMASQEQPYHESKTFMPVECIDGLLMATQYDIPWREDLFDGFDYYDVSQSFEFRKAGYTVGVPVQRDAWCIHYHIDVNMTNYEKYRKIFVEHYMSDVNQDE >NZ_CP012730.1|WP_000651510.1|1186412_1187093_+|streptomycin-biosynthesis-protein-StrF MKDHTILVVVCINNEELFEQCERQIRNLFVPPGYVVQIFPIRDAKSMASAYNRALSYPAKYKVYIHQDTFLINREMFYTLISLFKDNEKLGLIGVAGAQFLPSNGIWWEGKNLVGKVIEYRRQNYQLLNLDQLFYGNQSFMSVQAIDGLLMATQYDIPWREDLFQGFHFYDVSQSLEFQKAGYLIGIPNQANLWCIHYNGDEFDADTYEKYRKVFVEHYKDILSPS >NZ_CP012730.1|WP_000676166.1|1187107_1187845_+|NTP-transferase-domain-containing-protein MKGIILAGGTGSRLYPITKVTNKHLLPVGRYPMIYHAVYKLKQCDITDIMIITGKEHMGDVVSFLGSGQEFGVSFTYRVQDKAGGIAQALGLCEDFVGNDRMVVILGDNIFSDDIRPYVEEFTNQKEGAKVLLQSVDDPERFGVANIQNRKIIEIEEKPKEPKSSYAVTGIYLYDSKVFSYIKELKPSARGELEITDINNWYLKRGVLTYNEMSGWWTDAGTHVSLQRANALARDINFGKQFNGE |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012730_3 | 2720370-2720567 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012730_3
|
3 spacers
spacers of NZ_CP012730_3
>3.1|2720393|18|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder ATTATTTTGAAAACACCT >3.2|2720434|42|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder CTCGTTCTATTAATTTACTTTTTAGCTCTATTAAACTATGGA >3.3|2720499|46|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder TTAATTGTACAGATTGATCATCTCCTACTTTTCTTTTTCACACCCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012730_3
The CRISPR arrays of NZ_CP012730_3 >merge|NZ_CP012730|3|2720370-2720567|CRISPRCasFinder TTACGGAATGAATATTCATTCCTATTATTTTGAAAACACCTTTTCGGAATGAACATTCATTCCTCTCGTTCTATTAATTTACTTTTTAGCTCTATTAAACTATGGATTTCGGAATGAATATTCATTCCTTTAATTGTACAGATTGATCATCTCCTACTTTTCTTTTTCACACCCTCATCGGAATGAATGTTCATTCCT >NZ_CP012730|3|3|2720370-2720567|CRISPRCasFinder TTACGGAATGAATATTCATTCCT ATTATTTTGAAAACACCT TTTCGGAATGAACATTCATTCCT CTCGTTCTATTAATTTACTTTTTAGCTCTATTAAACTATGGA TTTCGGAATGAATATTCATTCCT TTAATTGTACAGATTGATCATCTCCTACTTTTCTTTTTCACACCCT CATCGGAATGAATGTTCATTCCT
>NZ_CP012730.1|WP_000040244.1|2717910_2720334_-|MMPL-family-transporter MSKLKNWRSLSFLLWIVITITMIVTMPNMDKLVKEKGHITIPNTEQSSIADKMIKEMNKDGTEKYDIIAVFNSGSKTALTTEQKEEITKTINALQNEKEQLGIKEVVSHLDNKELEKQLVSKDNTTILTQISIDKKHGEISKVSNNLHNKVKTKGVKTYLTGSDLIAGDFLTSSQEGVKKTEVISIIFILVILIIVFRSPIVPIVSLLTVGVSYLVSMGIIAHLVDQFNFPFSNFTQVFVVVVLFGVGTDYNILLFTRFKEELSKQENAFLATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFASLALASFKLYQSTSAVAIGVAVLLLVLTTLNPFFMVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFFAKNSVARPFVALIIVFVISIPIVLKYSNTLNYNDLFEVDNKYESKMGINVIEEHFPPGFSSPSTLVIQSNNKLDEASSLQTLDELTEKILKVKGVSEVYAPTRPTGERIKELYINKQADELNTGLGDANGGIKEINDGLTTAKDKMGSKDSNSLANVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALNQLSNGINDGAKGAQQIERGLTSVNENISVLSNATSQLHAGYTQLEKGLSSYDQYFGSISQAIDGAKKGYEQIEMLMTNFIQMKPELANDPNILQTIGIAKEAQKQLGGLSNELNQLATQHNAAMGSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVTKLQKGAADLKNGLNEGASGSKQIANKSSELQTGLTKINDGQGQVLTGLKDLQEQMGQLQSGLSKSTEGLEKVSNGLGDAQKYLGELNESKSSEKFYIPKEVLEGEDFQKALNTYMSHDRKTA >NZ_CP012730.1|WP_003169883.1|2717757_2717910_-|hypothetical-protein MTIILDVNPYSKEAMPIIQEINKTIDGTLKGTELNNAKKQLEGPQLETLT >NZ_CP012730.1|WP_094770179.1|2717218_2717791_-|MMPL-family-transporter MGGTTARNVDLKEVTGQDFLRTATIMLIGIAIVLIVITRSLLNTIFIIGSLILAYFASLGISEQISTHLLNVDSLSWNVPFFSFIMIVALGVDYSIFVMMRYNELEGEPATKIVTASRHIGGVVLSAALILGGTFAALIPSGVLALIQVASVVGVALLLLAIIVMPILLPALIGLMSKMKDYAKKLSERK >NZ_CP012730.1|WP_001093210.1|2716084_2716933_-|hypothetical-protein MNTKLIIVEGLPGFGKSTTAQLINDILSQNKIEVELFLEGNLNHPADYDGVSCFNKFEFDRLLSNSGDFKEVLLKRVLKKGSNYLLPYRKIKNEFGDQFSDELFNDISRNDIYELPFDKNVELIADKWQDFAEIALEDDKVYIFECCFIQNPLTIGMIKYGEQKEKIINYVMKVAKIIENLNPMLFYVEQDDLEFSFRKALKERNPEWSTGIVDYYTNQGYGKEHNHSGVEGAIKVLEARRNLELEIFDMLKMKKEKINNTKYEIGSYRSMLKDKLTIQMVK >NZ_CP012730.1|WP_000633874.1|2714081_2715707_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MITVSNVSLRFADRKLFEGVNIKFTPGNCYGLIGANGAGKSTFLKILSGEIEPSTGDIHITPGERLAVLKQNHFEYEEFPVLETVIMGHTQLYKVMQEKNAIYMKEDFSDEDGMRAAELEGEFAELNGWEAESEAAILLKGLGIGEDLHDKKLSELTGAEKVKVLLAQALFGKPDILLLDEPTNHLDLKAIQWLENFLMNFENTVIVVSHDRHFLNKVCTHMADLDFGKIQLYVGNYDFWHESSQLALKLTQDANKKKEEKVKELQNFIARFSSNASKAKQATSRKKLLDKITLDDIRPSSRRYPFVGFTPEREVGNDLLTVEGLSKTIDGEKVLDNVYFTLNKGDKVAFIGRNDIAMTTLFKILMGEMEPDSGSFKWGVTTSQSYFPRDNSKYFENSDLNLVEWLRQFSPQDESESFLRGFLGRMLFSGEEVKKNVSVLSGGEKVRCMLSKMMLSGANVITLDDPTNHLDLESITALNNGLIAFKGTMLFTSHDHQFVQTIANRIIEVTPNGVIDKEATYDEFLENEELQKQVDAMYKGQ >NZ_CP012730.1|WP_000808762.1|2711591_2713565_-|LTA-synthase-family-protein MKQFLLKSKSVLSNHFGFFLFAVILFWLKTYAAYVTEFNLGISNTIQKFLLFFNPLSSAVLFLGLALFAKGKRSYIWLIVINLLLSILLYANVVYYRFFSDFITFPTLTQTNNFGDLGGSIVALLHLYDPLYFLDTIILIVLVATKFANPKPIRVAKYKVSLVFVAGILLFSVNLGLAESDRPELLTRTFDRNYIVKYLGAYNYTIYDGIQSAKASTERALADGDNMTEVRNYLTSTYASPNPEYFGKGKGMNVIYIHLESFQNFLIDYKLNGQEVTPFLNSFTKDANTLYFDNFFHQTGQGKTSDAEFMLENSMFGLPQGSVFTTKSHNTYQSAPAILGQQGYTSAVFHGNYKTFWNRDDIYKSFGFNKFFDASYYDMNEKDVVNYGLKDKPFFNESIPLLETLKQPFYTKFITLSNHFPYPIDKEEATIEPANTGDSSVDTYFQTARYLDESVKGFIDYLKQSGLYDNSIIVMYGDHYGISDNHNAAMSKVMGKEINSFENAQLQRVPLIVRVPGVKGGVQHQYGGEIDVLPTLLHLLGTDTKNYVQFGSDLLSPDHKQVVAFRNGNFVSPTVTALNGKYYDTTTGKPVEFTDEIKQNEQMVQNSLKYSDQVVNGDLLRFYTPEGFTPIDRSKYNYNNRDKNKTKVKTAPEGEAK >NZ_CP012730.1|WP_000346934.1|2710860_2711532_+|TerC-family-protein MDFLSAEYLSALLAIIVIDLVLAGDNAIVIGLAARRLPKDQQKKVIIWGTIGAIAIRALATLVVVWLLKIPGLLLIGGVLLIWIAYKLIAEGKDHDIKAEEGFWSAIKTIIIADALMGIDNVLAVAGAAHGNFSLVIIGLLVSIPVVVWGSTLILKWVDRYPIIITIGAAVLAYTAAKMIVDEKWFAAFFESNPFIKWAFIIIIIAGVVFFGKAKQKATDGSI >NZ_CP012730.1|WP_000637714.1|2710087_2710750_+|DUF3841-domain-containing-protein MIVYTVQTEEAWKQFKKLGYLEGNKEFIDSDDIYSYDWMVRVAKTKLPHYEGNYPIWVWEANNYPNRNHKAWGRKNSKMVILTLDVPKKWVLWSYFDYWCCAMTDGSTYLHTKNKCTLDEWYIYMDKKYGIIFNFDYLLSHPDWYLDKEDSLEKQGVIGKIPLSFVKKVRRFRAKEDTSIHTIRSDNWDNRKENRIKKMNRKLRKRNEKQKRVQKRLIRN >NZ_CP012730.1|WP_000551418.1|2709100_2709928_+|polysaccharide-deacetylase MHNGIRMTTLMKRAMLICAGVLFTYEAALGSAHTALASTEDEAKSVQLVSEIQSSLAPKEAPKQYNGQVRKVAYLTFDDGPGKYTAELLDMLKKENAKATFFLIGSNVKAFPDLVKREDAEGHYVGMHSMTHNYKKLYTEGHYVDEMKEDQGLIAGVLGKSPVLTRPSYGSMPGLNEALRNKVVENGLKVWDWTIDSLDWRYNKMPVDAASAKIVENVINGANKPTEVILMHDIHPQSVKAVPGIIKGLKEKGYELEAYSENEHFPLNFWHDNRM >NZ_CP012730.1|WP_001106984.1|2708622_2708883_-|lipoprotein MNYKKMLSIFMTSIFTVGLLIGCNPAPKDEKEPDPTEEPSEQRQEEKNEKQDPAKEQNNELNKKDEQEPDPTEEPSEEQKKKKENE >NZ_CP012730.1|WP_001107293.1|2720587_2721154_-|TetR-family-transcriptional-regulator MAKNKQEDIFDAAIQLFAERGYDGTTIPMIAEKAKVGAGTIYRYFENKEALVNSLFTKSVLQLSELIKTDFPVNANIREQFSHTYNRLFEFARQNADAFLFTNSHCDSYFLDEHSNEIFEDFMGFFMDLIEDGIEKGFLRPLPPIALIIIVYQPIEKLIKVMETGQLEYTEELVKELEESCWNAIRII >NZ_CP012730.1|WP_001100954.1|2721423_2722581_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MNVIRLKEDKFREALRLSEYAFQYKVDEDRLQQQITKMKESHEVYGIMEGENLAAKLHLIPFHIYIGKEKFKMGGVAGVATYPEYRRSGYVKELLQHSLQTMKKDGYTVSMLHPFAVSFYRKYGWELCANLLVCHMTKSDLVMKKQVNGTVKRFNKESHPEEVEKLYETFAELFSGMLVRNEKWWLQAVYDDLTLAIYYDENQTAAGYMLYKIENYKMTVEEFVPLHNEARNGLWNFICQHDSMIKDLEMTVSENEPLLYTLQEPRVKTEIKPYFMGRIVDVEQFLKQYELNWNNVQQEVILHITDSFAQWNNITVRIANHEITIIEEPIDKGIKLDINALSTILFGYRRPLELNELELISGSEEEIRAFESVVPVRKPFIYDFF >NZ_CP012730.1|WP_000664623.1|2722766_2724056_-|3-phosphoshikimate-1-carboxyvinyltransferase MKERTIQPVNNGLNGNITIPGDKSISHRAVMFGAIAEGTTTIKGFLPGADCLSTISCFKEMGVDIVQNGDEVTVVGKGLEGLQEPKAVLDVGNSGTTIRLMSGILANTPFLSCVQGDTSIAKRPMKRVTNPLKQMGANIDGREEGTFTPLTIRGGDLKAIEYTSPVASAQVKSAILLAGLRAEGVTAVTEPHISRDHTERMLEAFGVKVTREGKTVKLAGGQKLTATDVQVPGDVSSAAFFLVAGAIIPNSKLVLENVGMNPTRTGIIDVLEKMGATFTVEPINEGASEPAANITIETSSLKGIEIGGDIIPRLIDEIPVIALAATQAEGITVIKDAHELKVKETNRIDTVVAELTKLGARIEATDDRMIIYGKSALKGNTVNSYGDHRIGMMLAIAGCIAEGKTIIEDAEAVGVSYPTFFEELQKLAK >NZ_CP012730.1|WP_001228120.1|2724072_2725173_-|prephenate-dehydrogenase MRKKVVLIGTGLIGGSLALAIKKDHDVTITGYDIFQEQVERAKELHVVDEIAVDLQHACEEAHLIVFASPVEETKKLLHKLASFHLREDVIVTDVGSTKGSIMNEAEALFSKEISFIGGHPMAGSHKTGVESAKAHLFENAFYILTPMHHVPNEHVEELKDWLKGTGSHFLVLNTEEHDYVTGIVSHFPHLIAAGLVKQVEKHAGDNPLIHQLAAGGFKDITRIASSSPKMWSDIVKQNREHLMVLLKEWISEMEDLYDTVSSGDAGEIQNYFADAKEYRDSLPVRKRGAIPAYHDLYVDVLDKVGALAHVTSILAREEISITNLQILEAREGLLGVLRISFQREEDRMKAKLALGEEKYQTYETI >NZ_CP012730.1|WP_001197243.1|2725165_2726266_-|histidinol-phosphate-transaminase MQVKDQLSSLQPYKPGKSPEQMKEVYGDHSFVKLASNENPFGCSPRVLDELQKSWLDHALYPDGGATTLRQTIANKLHVKMEQVLCGSGLDEVIQMISRAVLKAGDNIVTAGATFPQYRHHAIIEGCEVKEVALNNGVYDLDEISSVVDNDTKIVWICNPNNPTGTYVNDRKLTQFIEGISENTLIVIDEAYYEYVTAKDFPETLPLLEKHKNILVLRTFSKAYGLASFRVGYAVGHEELIEKLNVVRLPFNVSSLAQKAATIAFGDDEFIEEIVRVNTEGLRQYESFCKENEIPFYQSQTNFIFLPVENGGEIYEACAHAGFIIRPFPNGVRITVGTREQNEGVISVLQQHFENKKRKSRDEANA >NZ_CP012730.1|WP_001269395.1|2726284_2727457_-|chorismate-synthase MRYITAGESHGPQLTVILEGVPAGLTLAAEHINKELLRRQKGHGRGRRMQIEMDTVEIVSGVRHGMTLGSPITLIVKNDDFKHWTKVMGAEPISEKESKEMKRTITKPRPGHADLNGAIKYGHRDIRNVLERSSARETTVRVAAGAVAKQILKELGVEIAGHVLEIGGVKAKHISNLSIEEIQIITENSPVRCLDKTVEQEMMDAIDNAKSSGDSIGGIVEVIAEGMPIGVGSYVHYDRKLDAKLAGAIMSINAFKGAEIGVGFEAARQPGSKVHDEILWDEEQGYTRKTNNAGGLEGGMTTGMPIVVRGVMKPIPTLYKPLASVDIDTKEAFQASIERSDSCAVPAAGVVAESVVAWELAHALVEQFGKDRMELIQQNITQHNKYAKEF >NZ_CP012730.1|WP_001273582.1|2727741_2728818_-|3-deoxy-7-phosphoheptulonate-synthase MANHELDQLRKQVDEINLQLLHLLNKRGEIVQKIGEQKQVQGTKRFDPVREREVLDMIAENNEGPFETSTVQHIFKTIFKASLELQEDDNRKALLVSRKKKQENTIVDVKGELIGNGTQTFIMGPCAVESLEQVRQVGQAMKDQGLKLMRGGAFKPRTSPYDFQGLGVEGLQILRQVADEFDLAIISEILNPNDVEMALDYVDVIQVGARNMQNFDLLRAVGKVNKPVLLKRGLAATIDEFINAAEYIIAQGNDQIILCERGIRTYERATRNTLDISAVPILKKETHLPVVVDVTHSTGRRDLLLPTAKAALAIGADAVMAEVHPDPAVALSDSAQQMDIPEFHRFMEELKGFKNKLS >NZ_CP012730.1|WP_000997708.1|2733309_2733747_+|YndM-family-protein MNDFTVVLIKFISCIIAFSIGLALFFPATFVQIISFSLFVTIVSYMFVDKIILNRIGNTGAIMSDFLLTYLSVWIFGNILLDNYMQIAWGSILSAIVFTLSEVIVHRFSSSRTRHHNDNIHINRRFAYGTEFAEEQNILDKDKKK >NZ_CP012730.1|WP_000709765.1|2733895_2734426_-|cysteine-hydrolase MKKALLVIDVQAGMYTAGMPVHNGEKFLETLQELIGECRSNDIPVIYVQHNGPKDHPLEKGTDGWKIHAAIAPLEGECVVEKTTPDSFHKTNLKEVLQDKGIDHVIISGMQTQYCVDTTTRRACSEGYKITLVSDAHSTFDTEVLRAEDIVKHHNVVFGAFADVVTLKDLKVTASK >NZ_CP012730.1|WP_000898754.1|2734442_2734976_-|acetyltransferase MLFQKDNVSVRYVVEEDAPIISKWLTDPEVLQYYEGRDDPQSVEMVLNHFIHNPNSPEKRCLIEFDDVPIGYIQMYPVDSESKTLYGYEESQNVWGMDQFIGEPTYWGKGIGTKFVKAAITYILSEMGAEAIAMDPKVNNERAIKCYEKCGFKKVKILKEHELHEGVLEDCWMMEYK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012730_4 | 3098895-3099029 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012730_4
|
2 spacers
spacers of NZ_CP012730_4
>4.1|3098922|27|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder CGTCTTTGGCTCTTCTGGTTTCTCTTC >4.2|3098976|27|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder CGGTTTCTCTTGCTTTGGATCATCCGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012730_4
The CRISPR arrays of NZ_CP012730_4 >merge|NZ_CP012730|4|3098895-3099029|CRISPRCasFinder ATCTGGATTTTCCTGTTTTGGATCATCCGTCTTTGGCTCTTCTGGTTTCTCTTCTTTTGGATCATCCGTTTTTGGTTCTTCCGGTTTCTCTTGCTTTGGATCATCCGTTTTTGGTTCTTCTGGTTTTTCTTGTTT >NZ_CP012730|4|4|3098895-3099029|CRISPRCasFinder ATCTGGATTTTCCTGTTTTGGATCATC CGTCTTTGGCTCTTCTGGTTTCTCTTC TTTTGGATCATCCGTTTTTGGTTCTTC CGGTTTCTCTTGCTTTGGATCATCCGT TTTTGGTTCTTCTGGTTTTTCTTGTTT
>NZ_CP012730.1|WP_000041416.1|3096834_3097671_-|DUF4430-domain-containing-protein MSKMKWFISLLLSLGLLAGCEEAAVKLEKKVEPKQEEVAKQEEKKDEAKPEEKPEEKQAEQEQNKQDEQKEKQEQKVEEKPKEEKPQAQLEVKKEEKQQEQPKEQPAVNKQPEQQKAQEEKQQQPKAQEVKEEAKVVNQPKETPKQEQKKKPEENNSVPTPPTPVPDPVPPVPDPVIPKPKQVTISVKGNEGYLLGAKKVDVQEGDTVYKVLQRTGLDVDAMGSKDGIYVKGINDLYEKDITATSGWKYRVNGAFPNHSAGVVTVKPGDTIEWVFVLK >NZ_CP012730.1|WP_003161810.1|3095933_3096812_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MKISFSSLHPFVNFFYYIGVMILCMMCLHPLFLIGAILLIVILNVMQGNSEKVRKMLPSTIVFFVMVILFNSLFTHRGRTTLFWVGDSRIKLEAIMFGVVMGLLLVAIMFTFASYNDIISSHKFLYLFSRISPKVALLTMITVRFVPLFMRRLQKITLVQKTKGVQVDAGSIVERVKNGMQLLQVLLICSLEDALQTADSMQARGFGVTKRTTYIRYRMERRDWYTLSYLSILFIIAIICSTYGGGKLIIYPKVESILFQQYDGMMFIVFTMFISLPIIMEGREWIWWRMQK >NZ_CP012730.1|WP_009879384.1|3094299_3095961_-|energy-coupling-factor-ABC-transporter-ATP-binding-protein MDMVAHAEIKNLSFVYADENEKALQHISLSVQKGEFIALAGGSGSGKTTLLKHFKKELLPIGKRTGDTYYDGTLLENVPDLLSAQEIGMVFQNPENQLVMDTVIQELAFSLENIGLPSHIIQKRIAELISFLGFQDLLHQSVHTLSGGQKQLVNLAAVLVMQPKLLLLDEPTAQLDPIAAKEFLGLLKRINEELGITIVLSEHRLDEVIPLATRVICMNNGRIVYDGSPKTVVANMWEVEKFRPFIPQIPRLFLEWNAKDIPFTVREAQMKLNDFLAISYVSEPIVQSEKQEVILSAEHISFQYEKNNPLILRDLTVSIEKGKWVALVGKNGTGKSTLLTILAGLQKARRGKVKWNGKVIHKIDSKERFKSIGYVSQHPYYHFTFDTVWDEVYERARELYGEQGKEIAEHQLKKFWLYGLKERHPHDCSGGEQQLLALCTTLLSKPTLLLLDEPTKGLDPWKKERVGELFRKLQKEGTTIVMATHDIEFAAKYVDQCMMLFDGAVIMNDAPKEFFSGNFFYTTSINRFIRKELPYALTWEDVYEACQNDMLHS >NZ_CP012730.1|WP_000044896.1|3093625_3094327_-|ECF-transporter-S-component MSKRYVAFIICIFAVIIGTLLFTTLIMDGYYMLSSLFLLVVIMLPFYIRFERKAFVSREIVLVAVLAAIAAVSRVPFSILPSVQPTSFVIIVSAIVFGSETGFMIGATAAIVSNIFLGQGPWTPWQMFSWGMIGFIAGLLRNTFLMKKLWGRLLYGLFVGFLFGWIMNFWGLLGFIREATWETVISYYIASFYFDLSHAISNVVFLLLFSTSWITILTRFKKKYGILDEHNMV >NZ_CP012730.1|WP_000779967.1|3092719_3093442_-|YwiC-like-family-protein MKLVIPKQHGAWAMLVIPFLLSVILGKPTIYHIPLFIAWFFIYLATYPFLMYIKQKRKKEYLHAAIVYFIIAFVFGMISLLYEWRILLFVAVMIPFFIVNMYYARQKNERALRNDISAIIVFCIGGLVSYYFSMKLIDKTALFIALISFLYFLGSTFYVKTMIREKNNPKYRFISWGYHILLMIIVFAINPWCSLIFIPSVIRAIILYGKKISIIKVGILEIVNSVYFLIITAIIMKYAI >NZ_CP012730.1|WP_000545001.1|3092495_3092687_+|hypothetical-protein MHENARGYVQDSFQSLQEAKQCLEAALQTVEKDFNRARIEQSLYAIEQAIQRCDYTVHILEQD >NZ_CP012730.1|WP_000171478.1|3091914_3092172_-|hypothetical-protein MTLEKYVKLRSTVYEYMIEQDKPISLLDIQEHIVSHHEGKFTKKMLHQFYLSRLLDELKLDGKITLADEYLYTEKGVFYKARKGS >NZ_CP012730.1|WP_009879381.1|3091273_3091711_-|hypothetical-protein MHRFGSQKGIKGRGVVMYAYLLHDITKWIPKYIMDKGYEYYEEGNVEDVEIQDKKIFAFVTGNAGDYEVIIDLEDFTESSCECPYENYCKHMAAVVYDIQGAGESTVKEKLKDLDKEELLTVLNRLLQSSKNIQIVEKMLKKGKL >NZ_CP012730.1|WP_001101666.1|3090674_3091250_-|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MNVLIVYAHPSPSSFNAAILKHVQKGLQETNHSVTVLDLYKEQFNPVLVFNEEKKRRDLVNEEETARYRALVEEADTLLFIYPIWWWGMPAILKGFIDRIFVAGFAYKYEGALPKGLLKGKKAWGINTLDSPLWYVALLYRSADWIIMKRGVLRFCGIRDIKRSVFQSVKTSKREKREKWLLQIEEKARTL >NZ_CP012730.1|WP_001004518.1|3090324_3090678_-|hypothetical-protein MNEMERIINCCQYDNELFRTYINCLIQLKKCSETFQQIQIQLRNDYLIRGIFEREVDEVVRGSKEYETYFLPKALQWNFLKNNQHLIEKVCGDFFAFEALYLTEIEWKTVINCVGNK >NZ_CP012730.1|WP_000266052.1|3099853_3100333_-|RraA-family-protein MWKTTDLCDEFENELQICRQPFRSFGKKEQFHGKIATVKVKDDNVLVKEGLQTLPEGTVLVVDGGASTNCALLGDNLAAIAEERKLAGIIVNGYVRDSSELKNINIGILALGTMPNRSVKEGKGERNISLQFGQVEWKPDEYVYVDEDGVIISDKSLHR >NZ_CP012730.1|WP_001176953.1|3100533_3101964_+|YfcC-family-protein MQLQTEVKKQPSKRKFKMPDAYVLLFFIALLCAIATYFVPAGEFKRVTNGTVTTTIPGSYHSVPQSPVGFVSFFTAIEKGMTLAAPIIFLILFTGGAIAILEKTGALDGLIYHVINKFRNQQLLFICIVAALFSILGTTGIIVNSVIGFIPIGIIVARTLKWDAIVGVAIIYLGTYAGFNATILSPSPLGISQKIAELPMFSGIGLRTAIYISFLLATILYINWYVKRLKKSNKGSILGDNWFPSNALSSGKEAQKTEVPWTIRHKLILLVSALSLIAFLIGAFRLHWTDAEMTATFSFIAITAGIIGGMKANDIASTFLAGCQNLIYGALIVGMARCISVILEQGKLLDTIVNQLAQSLEGQSPVFGVIGMYVSSAALHFLISSGTGESVIFIPILAPLADFMHITRQVTVQAVMLGEGVVNCLNPTSGVLMGVLAASGISYGKWIRFMAPLAFIWFIIGLIFLIVGVNIEWGPY >NZ_CP012730.1|WP_000672206.1|3102111_3102939_-|ribonuclease MKFRNTKLAMVTLSSFFILGSASLSFTNIIQGEVASASPQEITVKSYDDTYYNNAIGKTGLELKKELHNIIDDHTKLSYSAVWEALRDTDEDPNNKNNVILLYTGRSQGKLTNGSGVDNWNREHVWAKSHGDFGTTAGPGTDLHHLRATDVSVNSSRGNLDFDNGGVNHSEATECKYDSDSWEPRDSVKGDIARMLFYMAVRYEGDNGEIDLELNEKVNNNKDPYMGKLSVLLKWNEQDPVDDLERKRNEVIFTKYQHNRNPFIDHPEWVNKIWN >NZ_CP012730.1|WP_000060302.1|3103366_3103723_-|hypothetical-protein MSLTTGPIENVGNQPANANKVRVKILNRTAGPLTGVARVFRLDGSLVLIEQVNFNVNSNASTFATLSLVHPAFGQAFEYEVQIVPNQPGGLYSVYGLTAESVIITAQRVVNSELTQFL >NZ_CP012730.1|WP_000988166.1|3103924_3104953_-|alpha/beta-hydrolase MMTFDEYEVAIKSEFTLQGTITRPKAEGKYAAVVIIAGSGEIDRDGTIVPLKLEANIYKELAHVMSRLGVVTLRFDKRGVGKSDGEFLKTGMWDLVSDIESTITYLKEQPFVDPENIILAGHSEGCMLATVVNARTPVNGLILLTGAAESLEEAAKRQREIAYKELKEQKGIKGKLMRLLNVEKRGEKQMEKIKEKMMNTEKDTIKVGFKPMNAKWFREHFQHDIYKDLQQVTCPVLAIAGDKDIQADPERAKRIGDYVKGNSEVHVIKDMDHSLKVFKGEFKTLEFKKNYEEGARKPLHPELEEIIVNWLDTHFISQHAGSKIPGSILGESEEVGRKSNCL >NZ_CP012730.1|WP_000659023.1|3104963_3106088_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKEINIHKIIADKRKEKGITQEELAAYIGITKASVSKWETGQSYPDITFLPLLASYFNISIDELISYKPQMEQEDIKNLYHRLAEAFSEKPFDEVMMECRKIIKKYYSCFPLLIQIGILFINHHMLTEDTDRRIEILEEAMNLFSRVQEESDDVSLVKEAVSFQATCYLILNKPNEVLQLLGETIRPNVPEEDLIAQAYQMLGNTKKANEIMQISMYQHLIQLVATIPNYVVVNASSVEKVEVILNRAFMLIDIYEIETLHPNMTLKVYYAAAQVYCMQGNFERALKMLRKYAAVCAASFTVNSLHLHGDSYFDAIDEWFAEFPLGAKTVRNEEIIKRSMLQSIAENPVFAPMKDVREYKNIITSLKFKLDIKE >NZ_CP012730.1|WP_001024063.1|3106428_3107001_-|glycerol-3-phosphate-1-O-acyltransferase-PlsY MNILTLILSYLIGSISFALIVGKMFYKKDIRDYGSGNLGATNAYRVLGIKAGVIVAIADILKGTFACLLPLILSSTINPIVCGLLAILGHIFSVFASFKGGKAVATATGVFLFLSPLGVLVGFVVFVLTLLFTKYVSLSSMLAGIALFIYSLIFEDKVIIALSLLIIVSIIILHRQNIKRILNGTENKIV >NZ_CP012730.1|WP_000710875.1|3107621_3108098_-|Cys-tRNA(Pro)-deacylase MKKDKTNAMRILDKEKIEYSMMSYNPDDGKIDGVSVAEKIGREVREVYKTLIAQGNSKNYHVFIIPVDEELNLKAAAKAVSEKKIEMIPVKDITKVSGYIRGGCSPIGMKKLFSTCIDASAQSLETMIVSGGKIGIQIELKVDDLAKVTRAQFGEITK >NZ_CP012730.1|WP_000405915.1|3108437_3109715_+|histidine--tRNA-ligase MEIRNVKGTKDYLPEEQVLRSKIKRACEDTFERYGCKPLETPTLNMYELMSYKYGGGDEILKEIYTLQDQGKRDLALRYDLTIPFAKVVAMNPNIRLPFKRYEIGKVFRDGPIKQGRFREFIQCDVDIVGVESVMAEAELMSMAFELFQTLNLEVTIQYNNRKLLNGILQAINIPTELTSDVILSLDKIEKIGIDGVRKDVLERGISEEMADTICNTVLSCLQLSIADFKEAFNNPLVADGVNELQQLQQYLIALGINENTIFNPFLARGLTMYTGTVYEIFLKDGSITSSIGSGGRYDNIIGAFRGDDMSYPTVGISFGLDVIYTALSQKETISSTADVFIIPLGTELQCLQIAQQLRSTTSLKIELELAGRKLKRALNYANKENIPYVLIIGEEEICTETVMLRNMKEGSEVKVPLSSLSNYL >NZ_CP012730.1|WP_001100385.1|3109876_3110188_+|hypothetical-protein MNVFIKVLKWTTGISHLILIPCYYLTPGLVDLYGIPPLTVITLHIITILLAKKEDMNTYPHYIGIIVTLVAFFPYIDIVLHMIAAIFLLLDAASTNTKKVYDS |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012730_5 | 3267253-3267355 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012730_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012730_5
>5.1|3267278|53|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder GGTATATTTACATGCCCCGAAGTAGCCGTGGATTGTCTCCTTTCCTTCCTTGA |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012730_5
The CRISPR arrays of NZ_CP012730_5 >merge|NZ_CP012730|5|3267253-3267355|CRISPRCasFinder AAGTTTAGGTTTCTTTTGAGAATGTGGTATATTTACATGCCCCGAAGTAGCCGTGGATTGTCTCCTTTCCTTCCTTGACAATTTAGGTTTCTTTTGAGAATGT >NZ_CP012730|5|5|3267253-3267355|CRISPRCasFinder AAGTTTAGGTTTCTTTTGAGAATGT GGTATATTTACATGCCCCGAAGTAGCCGTGGATTGTCTCCTTTCCTTCCTTGA CAATTTAGGTTTCTTTTGAGAATGT
>NZ_CP012730.1|WP_001226321.1|3265745_3266690_-|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MRKIISVLVIFFMTGSIFAGGAVHAKAEGKHEWNKNKFLNIAHRGASGHAPEHTFASYDLVKKMKADYLELDIQLTKDGQLIAMHDTAVDRTTNGTGEVRDKTLSEIKSLDAGSWFNKAYPEKAKQEYVGQKVPTLEEIFQKYGRSMKYYIETKSPDVYPGMEEKLLALLEKYNLIGQNMSSSRVMIQSFSKDSLKKIHSINKNIPLVQLLWYYPNENNEIVEWSGITHEPKRVTNDDFQEIKKYAVGIGPNLRNDNGDLIINESYMKMARQNGLLIHPYTINEKPDMRLLMKWGATGMFTNYPDRLHTVLKEK >NZ_CP012730.1|WP_000236552.1|3265018_3265696_+|YdcF-family-protein MVIPKYPDVPTLTKKQIDQITEITFLKEITPQKCDVIFVFGGSHPGNWQAPLETYRQGLGNRIIVTGGTSLHGMKHPSWNYGDLSEAEVIVNKLMENGVPKGAILFEKNSLHSIANVIEAKKIFDFTKINRLLFVCKNLGAGRQYRVLKKHLPKTITCIPYTFDTSFDGEFIMNRYNWMENEKSRSMIFGEYLRNVCYGRKGGIEPPEKEVHGLEEYVSYYYNLA >NZ_CP012730.1|WP_000544597.1|3264415_3264925_+|DUF3916-domain-containing-protein MHEKKIRGMKRKTNAMIKRIEEHTKMFPSTFYNDEYWYMPLPVSQDFIESHKTPRKVKRLCIQTLIDRVNHLIKIQPSDTHTYRVVALISIENLWRSQIIVFKNDDYFHNFFNRNNEFQKWILLSNEIDFWETWGISIFPTPQLLRFQEVIYDEDTIDEKEIWFIGELS >NZ_CP012730.1|WP_000351706.1|3263571_3264423_+|LysR-family-transcriptional-regulator MDIKDLTVFYEVAKENNISHAAKNLNYVQSGVTMRMKQLENELGVPLFYRNGKGVTLTSNGEILLTYAKQIIHLMDQSIKAVQSNGTEPKGTLKIGCTESTTAVRLPSILTTYYEKYPEVELILETNTTEQLIKLVLDRKLDGAFIAGSTQHNELHSNVFHEEELVLISKKTLSSLKDIEDMNLLAFSHGCYYRSLLEDWLQEEDISPKRVLEFGTIEAILACVKSSMGVAIMMKSILKGHEHDVSFNPLPNSFNKVPTTFITRNDIFRSAALQKFMEVTHNA >NZ_CP012730.1|WP_003157243.1|3262241_3263486_-|MFS-transporter MEEDGGIIVLMEERMNSTYKWVMLIVATIAQTTATLITYGVGVFALFWKEEYALTNMESGLLVSVVNVGPLFCMLFIGRLLDQYNEKILISISSFLLGSSLLLTNIVSGFNGLLFVLLLIGMFYSVSQPGGSKVILKWFPKENRGLAMGIRQAGIPIGGALAGVLIPFLTVQYNMTYAINSIACICIIGGVLFFVFYKEPYVQEEARKGHIKISFWMELKVVICKKELYPIYITGICMISLQMVLVGHFMKFLAGEQSITSIVAGTVFSVMFFSGMIGRVALAAISDVFYKGNRRIPLFIAVCASIGLILLLVMSIHTITSGVLYSVSALLGFFSIGWFSLFIAEVAELASEESVGITVSVALTLNQIAIIVAPVLFGYIVDEKGYAYAWLCIVVLLSISAVSLYRRNKKIKES >NZ_CP012730.1|WP_000798801.1|3261911_3262142_+|hypothetical-protein MKNTDKRNRLDDMMFHYRVTKNNIVLIEYYGKQIMILKGTAAEKFLNKINHAHNDTEKQLIMAKVTGNFKRGNERQ >NZ_CP012730.1|WP_000915211.1|3260521_3261655_-|serine-hydrolase MLKKWLIVFFIFAVFSGSVVALIHASKGKKYDIKAFSNLNNKQKHDMQEVDANEKKHYEVVAGKLDQYLKDKGFNGSVLVASKDHVILRKGYGYANMKDKVFTTPRTKYRIGSITKTVVAISIMQLKEKGKLNIEDNVNKYIPSFPADKNITLRNLLTHTSGLPDQGKGRVDAASRLKLVTWIGSQALQFPAGTGWKYTDYNYMVLAYIVEKITNKPLAEYVKENIFTPVEMHESGMGATLPEDIFLAEGYTRKDNELIAAPRLKMNWLYGCGEMYTTVEDMKRLDEAIMNGKLLSKQSVLDMFTASPARKYGFSFYTYPDYYHNHGVLAGWNTFNNFNWDKKTFVILFSNVQNGMNDTFNQEFRKMANDLIEGNGA >NZ_CP012730.1|WP_000137565.1|3258698_3260486_+|oligoendopeptidase-F MTELKDRLQVADKEKWNLTDIYDTIEDWESDFHKIEVLTNELHEFNGNIHDGNSLLAYLTKSEEISSIISLMFAYARLQSDLDTRDTDAQSLVDKVSQLHVKVSAAKSFFSPFLLSVDENTLHTYIEEAEGLQYYKEDLFELYRYKKHVLNKDQEEILSQMGEALSSPQHTYGMLNNADILFGEVTSNDGEKVTLTRGMYAKLIEDESREKRKEAYKAYYKPYVQLKNSIASTLSAAIKNNVTVSKLRKYPSALEKSLFGDMVPKEVYENLIETTKKNIQSLHTYNKLRKEKLNVDELRQYDLSVDLVQGVKQDIPYDNAFDIMIESLAPLGEEYIETLKSFKDKRYIDVRETPGKCSGAYNFGVYGVHPFILLNHHDDLNSLFTLTHECGHGMHTHYSHGYQPRISAHYTIFVAEVASTVNEVLLIHHLLKEAKDANVRNHLVNHFIEKFKGTFFTQIMFAEFEKITHEMAQQGKPLNAQVFSDVYENLFREYNGDSLVFDEEVKYGWARIPHFYRPFYVYKYATGFASAIQIADKLLSGDPNAQKNYLEFLKGGSSDYPLNLLKKAGVDLTTPEPIESALNRFSELVEEFSTL >NZ_CP012730.1|WP_000473536.1|3256034_3257576_-|alpha-amylase MFKKITIVGLSVVLFLPSIYGESKVYADTINNGTLMQYFEWYAPSDRNHWNRLRTDAENLAQKGITSVWIPPAYKGTTQNDVGYGAYDLYDLGEFNQKGTVRTKYGTKAQLKSAIEALHKQNIDVYGDVVMNHKGGADYTETVTAVEVDRNNRNVEVSGDYEISAWTGFNFPGRGDNYSNFKWKWYHFDGTDWDEGRKLNRIYKFRGIGKAWDWEVSSENGNYDYLMYADLDFDHPDVANEMKNWGTWYANELNLDGFRLDAVKHIDHEYLRDWVNHVRQQTGKEMFTVAEYWQNDIQTLNNYLAKVNYNQSVFDAPLHYNFHYASKGNGNYDMRNILNGTVMQNHPALAVTLVENHDSQPGQSLESVVSPWFKPLAYAFILTRAEGYPSVFYGDYYGTSGNSSYEIPALKDKIDPILTARKNFAYGTQRDYLDHPDVIGWTREGDSVHANSGLATLISDGPGGSKWMDVGKNNAGEVWHDMTGNQTNTVTINKDGWGQFHVSGGSVSIYVQQ >NZ_CP012730.1|WP_001291979.1|3255310_3255940_+|exosporium-leader-peptide-containing-protein MSEKYIILHGTALEPNLIGPTLPPIPPFTFPNGPTGITGPTGATGFTGIGITGPTGVTGPTGIGITGPTGATGLGILPVFGTITTDVGIGFSVIVNTNINFTLPGPVSGTTLNPVDNSIIINTTGVYSVSFSIVFVIQAISSSILNLTINDSIQFAIESRIGGGPGVRATSARTDLLSLNQGDVLRVRIREATGDIIYSNASLVVSKVD >NZ_CP012730.1|WP_000417232.1|3267993_3268647_-|hypothetical-protein MEKYHGKSTEQIIQKLMPGSARSSVVMVWVVINFMILTPFLFPPTFTIYLYVILPFLLIANIWGVWVFFYKPNELRLVHILYNGFMGITFSFGSFIVIQKMAYTFIKIETPLFFIVTFVLYIFTIYKLISIGMKSFLRRLNNEENDNIKISPIVYLSGLGYVIGQICIGTLSQNGLATVLILVFSLFAVVLSISGVYIWVYVDLKRKEMDGMHNGQI >NZ_CP012730.1|WP_009879430.1|3268760_3268931_+|hypothetical-protein MIPSVTILDPIETPKPIQAPATVPIGPPKTVPTAAATPSLAPAKALTAVVPTPIAA >NZ_CP012730.1|WP_000445390.1|3269262_3270882_-|FAD-dependent-monooxygenase MESNDVPVLIVGGGLSGLASALFLAKHNIEYLLIERHPSTAIHPKAGGITFRTMELFRELGLEQRIRSAGKTLENCRGRIAVHTIAEANQEELAQMRANQYENDEKLLQKIEEISPSKQTACYQITLEEIMLQEARILGGELSFYHELVSYEQNEQGVIATIRNRETEKESVIHCDYVIAADGAKSKIREQLGISAEGRGTIGGYYMNIYFEADVSEFMQGDAFGFSMVLHPEVLGALIPVDNARRWIYHVSYDPLKGERPEDFTIERCKQIIQTAIGSTNVEPEIVSVLPWKAAESTATKFQDNRIFLVGDSAHIMPPTGGFGSNTGIQDAHNLAWKLAAVIKGKAKPKLLETYHEERYPVAKLTTDYAISLLFRAANREEGSLNKMDGLAVTAGYHYSSDAIIDDAVTLHRMDIVQLNGRPGTRAPHFIGMYEEKEVSVLDLLGNDFVLLTGAENDSWAESAHTVSAKLGVNIKVYRVGLSGDFIAQENIFSELYGLSDGGAVLIRPDAFIGWRSEKEVVNLDVVLEEVMSNLLCDF >NZ_CP012730.1|WP_000571881.1|3271359_3271704_+|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MIEMNKQEQLNVIKKDFIDSQKVLLAIGDETRQAILLVLMETECQTGLRVGEITKQTHLSRPAVSHHLRILREAGIILMRKEGTKNFYYIDIRTKLSLLKNLVLDIEKLLHNFY >NZ_CP012730.1|WP_000646397.1|3271722_3272721_+|NADP-dependent-oxidoreductase MKAMIIDKYGKVPMRMAEVPIPEINEHEVLAEIHAASINPIDFKIRDGKVKMLLKYEMPLILGNDFAGVIIKVGSKVTRFKIGDEIYARPRKNKIGTFAEYIAIHEDDIALKPKNLSFEEAASIPLVGLTSYQALHDIMQLQKDQKILIHAGSGGVGTFAIQLAKIMGATVTTTASEAGPDLVKSLGADQIINYKTEKFEEILKDYDAVFDTIGGTTLEKSFDIIKSGGNIVSVSGIPNARFSKEFGSGFFKTFLFSLASKKLTALEKKHNAQYSFLFMKPSGDQLRTIANYIEAGKIKPVIDRVFPFEDAQKAMEYSEAGRAKGKIIVKMK >NZ_CP012730.1|WP_000164886.1|3272899_3274366_+|YdiU-family-protein MTKNNEAGWNLDHSYTTLPQSFYTEIPPTPVSSPELVKLNHSLAISLGFNPEELKKEAEIAIFAGNALPEGAHPLAQAYAGHQFGHFNMLGDGRALLIGEQMTPSGKRFDIQLKGSGPTPYSRRGDGRAALGPMLREYIISEAMYALDIPTTRSLAVVTTGEPTYRETKLPGAILTRVASSHIRVGTFQYAAARGSIEDLQSLADYTIKRHYPEIEAHENRYTALLQEVIKKQASLIAKWQLVGFIHGVMNTDNITISGETIDYGPCAFMDNYDQGTVFSSIDTQGRYAYGNQPYMAAWDLARLAESLIPILHEDEEEVLKIAQDEISKFSVQYEKQWFLGMKKKLGLFSNEEQDQSLIEQLLKMMEKFKADYTNTFRSLTLNTIENTALFESPEFKEWYKLWQSRLERQEESKENAYEMMKNNNPSIIPRNHRVEEALEAAVTNGDYSVMEKLLEALSNPYAYATEQEEYCVPPVPTNRPYRTFCGT >NZ_CP012730.1|WP_000592013.1|3275712_3275904_+|Phr-family-secreted-Rap-phosphatase-inhibitor MIKKISSVFLGLSVFGILATGIHSSFTYQAGHADLPAPQRPDLVQSVDASKDYNSTTTAEKAL >NZ_CP012730.1|WP_000275806.1|3275977_3276577_-|protease-synthase/sporulation-negative-transcriptional-regulator-PaiB MYIPKYFAIQDEKMKYEIMEQNSFATLFSQHNGEPYATHLPLLLNRETLTLHGHFARPNEQWKDIGTQQVLAIFQGPHSYISPSWYETKNAVPTWNYVAVHVYGELELVEDEQELIDSLQDLVDTYEDPQSTYSLNDVDPNYMEGLSKGIVGFKIKISKIEGKAKLSQNHSVARRKLVVEELEKVGSEGSRGIAELMRK >NZ_CP012730.1|WP_000813610.1|3276711_3277239_-|GrpB-family-protein MKQRITIEEYNIKWESEFNKLQTLINDVMEDSILSIEHVGSTSIKGLAAKPVLDIDIVIEDYGFFPKVVTKLGAIGYYHQAEWSYKGREAFGRKDAFVPWDGESTDWMEHHLYVCDKESEELRRHIAFRDYLREYEDVAVEYGHLKEELARETKSRTSYSEGKTAFITNILEKIN >NZ_CP012730.1|WP_001172053.1|3277262_3277610_-|DUF4260-domain-containing-protein MQKRIVHFEGLVVFVATIYMYSLYEFSWIIFLIFLLAPDLSMLAYGINNHIGANIYNLFHTYIISILIVIIGVYFKVDTVIMIGLIWTAHIGMDRMFGYGLKYETEFKGTHIQRL |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012730_4 | 4.1|3098922|27|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder | 3098922-3098948 | 27 | KJ094023 | Listeria phage LP-101, complete genome | 3876-3902 | 4 | 0.852 |
| NZ_CP012730_4 | 4.1|3098922|27|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder | 3098922-3098948 | 27 | NC_022766 | Bacillus phage Glittering, complete genome | 9024-9050 | 5 | 0.815 |
| NZ_CP012730_4 | 4.1|3098922|27|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder | 3098922-3098948 | 27 | NC_003037 | Sinorhizobium meliloti 1021 plasmid pSymA, complete sequence | 1229260-1229286 | 6 | 0.778 |
| NZ_CP012730_4 | 4.1|3098922|27|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder | 3098922-3098948 | 27 | NZ_CP021794 | Sinorhizobium meliloti strain USDA1157 plasmid psymA, complete sequence | 438058-438084 | 6 | 0.778 |
| NZ_CP012730_4 | 4.1|3098922|27|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder | 3098922-3098948 | 27 | NZ_CP021809 | Sinorhizobium meliloti strain Rm41 plasmid psymA, complete sequence | 127169-127195 | 6 | 0.778 |
| NZ_CP012730_4 | 4.1|3098922|27|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder | 3098922-3098948 | 27 | NC_020527 | Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymA, complete sequence | 1227597-1227623 | 6 | 0.778 |
| NZ_CP012730_4 | 4.1|3098922|27|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder | 3098922-3098948 | 27 | NZ_CP021798 | Sinorhizobium meliloti strain USDA1106 plasmid psymA, complete sequence | 850854-850880 | 6 | 0.778 |
| NZ_CP012730_4 | 4.1|3098922|27|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder | 3098922-3098948 | 27 | NC_017324 | Sinorhizobium meliloti BL225C plasmid pSINMEB01, complete sequence | 513839-513865 | 6 | 0.778 |
| NZ_CP012730_4 | 4.1|3098922|27|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder | 3098922-3098948 | 27 | NC_018683 | Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMA, complete sequence | 498252-498278 | 6 | 0.778 |
1. spacer 4.1|3098922|27|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
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3. spacer 4.1|3098922|27|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder matches to NC_003037 (Sinorhizobium meliloti 1021 plasmid pSymA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer cagggttggctcttctggtttctctat Protospacer *. ******************** .
4. spacer 4.1|3098922|27|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021794 (Sinorhizobium meliloti strain USDA1157 plasmid psymA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer cagggttggctcttctggtttctctat Protospacer *. ******************** .
5. spacer 4.1|3098922|27|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021809 (Sinorhizobium meliloti strain Rm41 plasmid psymA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer cagggttggctcttctggtttctctgt Protospacer *. ******************** .
6. spacer 4.1|3098922|27|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder matches to NC_020527 (Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer cagggttggctcttctggtttctctat Protospacer *. ******************** .
7. spacer 4.1|3098922|27|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021798 (Sinorhizobium meliloti strain USDA1106 plasmid psymA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer cagggttggctcttctggtttctctat Protospacer *. ******************** .
8. spacer 4.1|3098922|27|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder matches to NC_017324 (Sinorhizobium meliloti BL225C plasmid pSINMEB01, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer cagggttggctcttctggtttctctat Protospacer *. ******************** .
9. spacer 4.1|3098922|27|NZ_CP012730|CRISPRCasFinder matches to NC_018683 (Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer cagggttggctcttctggtttctctgt Protospacer *. ******************** .
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
258555 : 266504
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012730|258555:266504|DBSCAN-SWA CATGCTAAAGCCATTAGGTGATCGCGTTGTAATTGAGCTTGTTCAAGCGGAAGAAAAAACAGCAAGTGGTATTGTATTACCAGACACAGCAAAAGAAAAACCACAAGAGGGTAAAGTTATTGCAGTAGGTACTGGTCGAGTGCTTGAAAATGGTGAGCGTGTTGCTTTAGAGGTAGCAGCAGGTGATCTTATCATCTTCTCAAAATATGCAGGTACTGAAGTGAAATATGAAGGTACAGACTACTTGATTTTACGTGAAAGTGACATTTTAGCAGTTATCGGTTAATTATATAAATCTTAAAAAATCCAAGGGGGTCAATTATTATGGCAAAAGATATTAAATTTAGTGAAGAAGCACGTCGTTCGATGCTTCGCGGTGTCGACACTCTTGCAAATGCAGTAAAAGTAACGCTTGGACCAAAAGGTCGTAACGTTGTTCTTGAGAAAAAATTCGGTTCACCACTTATTACAAATGACGGTGTAACAATCGCAAAAGAAATTGAATTAGAAGATGCATTCGAAAACATGGGTGCGAAATTAGTAGCAGAAGTTGCTAGCAAAACAAATGATGTAGCTGGTGACGGAACAACAACTGCAACTGTATTAGCACAAGCTATGATTCGTGAAGGTCTTAAAAACGTAACAGCTGGTGCGAACCCAATGGGTCTTCGTAAAGGTATCGAAAAAGCTGTAGTTGCTGCAGTAGAAGAATTAAAAACGATTTCTAAACCAATCGAAGGTAAATCTTCTATCGCACAAGTAGCTGCTATTTCTGCTGCTGACGAAGAAGTAGGTCAATTAATCGCTGAAGCAATGGAGCGCGTTGGTAACGACGGCGTTATTACTTTAGAAGAATCTAAAGGTTTCACAACAGAATTAGACGTAGTAGAAGGTATGCAATTTGATCGTGGATATGCATCTCCTTACATGATTACTGATTCTGACAAAATGGAAGCAGTTCTTGATAACCCATACATCTTAATCACTGACAAAAAGATTTCTAACATTCAAGAAATCTTACCAGTATTAGAGCAAGTGGTACAACAAGGTAAACCGCTTCTTATCATTGCTGAAGATGTAGAAGGCGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTGAACAAACTTCGTGGTACATTCAATGTAGTAGCTGTTAAAGCTCCTGGATTTGGTGACCGTCGTAAAGCAATGCTAGAAGATATCGCAATCTTAACTGGTGGCGAAGTAATCACTGAAGAATTAGGCCGTGACTTAAAATCTGCTACAGTTGAATCTTTAGGACGCGCTGGTAAAGTTGTTGTAACGAAAGAAAACACAACTGTAGTTGAAGGTGTAGGAAGCACAGAACAAATCGAAGCTCGCATCGGTCAAATCCGTGCGCAATTAGAAGAAACAACTTCTGAATTCGATCGTGAAAAATTACAAGAGCGTCTTGCAAAACTTGTAGGTGGCGTAGCAGTAATTAAAGTAGGTGCAGCAACTGAAACTGAGTTGAAAGAGCGCAAACTTCGCATTGAAGATGCACTTAACTCAACTCGTGCAGCAGTAGAAGAAGGTATCGTTGCAGGTGGTGGTACTTCACTTATGAACGTATACACAAAAGTAGCTTCTATCGTAGCTGAAGGTGACGAAGCAACAGGTATCAACATCGTACTTCGTGCACTAGAAGAGCCAGTTCGTCAAATCGCAATCAACGCTGGTCTAGAAGGATCTGTAGTTGTAGAGCGTCTAAAAGGCGAAAAAGTAGGCGTTGGTTTCAACGCAGCTACTGGCGAATGGGTTAACATGCTTGAAACTGGTATCGTAGATCCAGCCAAAGTAACTCGCTCTGCACTTCAAAACGCAGCATCTGTTGCAGCTATGTTCTTAACAACTGAAGCTGTAGTAGCTGACAAGCCAGAACCAAATGCACCAGCAATGCCTGACATGGGCGGCATGGGCATGGGCGGTATGGGCGGAATGATGTAATTCCGTTTGCCCTAAAAAACATCCATTTCTATATAGAAATGGATGTTTTTTTATGTTTTTTAGAAAAGGAAATGAATTTCTGTAGAATTTTGTCGCTTTCTCTCTTGACCATACCGACACTTCATTGTTAGAATCTAGGAAGATAATATAAAACGATCCTTCATATATCCTCAAAGATAAGGTTTGAGAGTCTCTACCGGGTTACCGTAAACAACCTGACTATGAAGGCAGTGTGTCTTATATTTATAAAGAGCGGAAGACTATCTTTCTTTATAAAGCCAGACCCCTGCCTTTTCTTTGTTATGAGACTAGAGGCGGAGGACTGGCTTTTTTTATTATATTGGTAATGCTTTTCGCCAAATTGGTGAAAATATTTATATACGAGAACTAACGTTGGGGTGATTATTTTGAAGAAGCAACACGATACAATTATCGTTTTAGATTTTGGAAGTCAATACAATCAGTTAATAGCACGTCGAATTCGTGAGTTCGGTGTATACAGTGAGCTTCATCCACATACAATTACTGCGGAAGAAATTAAAGCAATGAATCCAAAAGGGATTATCTTCTCTGGTGGACCAAATAGTGTATACGGTGAAGGCGCATTACATTGTGATGAAAAAATCTTTGACCTAGGATTACCGATCTTCGGTATTTGTTACGGTATGCAACTTATGACGCAACAATTCGGTGGTACAGTAGAGCGTGCAAACCACCGTGAGTACGGAAAAGCTGTTCTGAAAGTAGAGAACGAGTCAAAATTATATGCGAACCTTCCAGAAGAGCAAGTTGTATGGATGAGTCATGGCGACTTAGTAACTGGTTTACCTGAAGGATTCGTAGTAGACGCGACAAGTGAGTCTTGCCCAATTGCTGGTATGAGCAATGAAGCGAAAAACTTATACGGTGTACAATTCCACCCAGAAGTACGTCACTCTGAGCACGGTAACGATTTAATTAAAAACTTCGTATTCGGCGTATGTGGCTGTTCTGAAGGATGGAACATGGAGAACTTTATTGAAGTAGAACTAGAGAAAATCCGTGAAACTGTTGGAGACAAAAAAGTACTATGTGCGCTTAGCGGCGGTGTAGATTCTTCTGTTGTAGCAGTATTAATTCATAAAGCAATCGGCGATCAGTTAACATGTATTTTCGTTGACCATGGTTTACTTCGTAAAGGCGAAGCAGAAGGTGTTATGAAAACATTTAGCGAAGGCTTCCACATGAACGTTATTAAAGTGGATGCAAAAGAACGCTTCATGAACAAGTTAAAAGGTGTAGAAGATCCAGAACAAAAACGTAAAATTATCGGTAACGAATTCATTTACGTATTTGATGATGAAGCTTCTAAATTAGAAGGAATGGACTTCTTAGCACAAGGTACACTGTACACAGATATCGTTGAAAGTGGTACAGCAACTGCACAAACAATTAAATCTCACCATAACGTTGGTGGACTTCCAGAAGACATGCAGTTCAAATTAATTGAGCCTTTAAACACGTTATTTAAAGATGAAGTACGTGTATTAGGATCTGAACTAGGAATTCCTGATGAGATCGTATGGCGTCAACCATTCCCAGGTCCTGGTCTTGGTATTCGTGTACTAGGTGAAATCACGGAAGAGAAATTAGAAATCGTTCGTGAATCTGATGCGATTTTACGTGAAGAAATTATTAAAGCAGGCTTAGACCGCGAAATCTGGCAATACTTCACTGCGCTTCCTGGTATGCGTAGCGTAGGTGTTATGGGTGACGAGCGTACTTACGATTACACAGTGGGTATCCGTGCAGTAACATCTATCGACGGTATGACAGCTGACTGGGCACGTATCCCTTGGGACGTATTAGAGAAAATCTCTGTACGTATCGTAAACGAAGTGAAACACGTTAACCGTATCGTGTATGATGTAACGAGTAAGCCACCAGCAACTATTGAGTGGGAATAGTATTATAATAAAAGATCCATCTATTGCTCATGCAATAGATGGATCTTTTTTGATTTGAGTTTAATACGAACGAAATTATAAAAGTTAATAAAAATGTTTGTATTTAAATTGACAAAAATACTTTCAAGAGTTAATATGAGTATGTAATTCAAACGAAAAGTGAATATTATGCCGTCGTATAATATCGGGGATATGGCCCGAAAGTTTCTACCTAGCTACCGTAAATGGCTTGACTACGAGGCGTTTTTATAAAGGTGAGGGGAATCTTATCTTTATTCATAGAACGCTTCCATGTATATGCAATGGAAGCCTTTTTTATTTTTAATAAATAAAAGAGGGCTAGGGGAATTACGGCGAGTAATCATATAACGGGGGAAACGTAAGATGAAACGCTATTTTCAGTTTGATGAACTCGGCACGAATTATAAAACAGAGTTCATAGCAGGCTTAACGACATTTTTATCTATGGCGTATGTGCTATTTGTCAATCCTGCTACGCTGTCACTTGGAAATGTTAAAGGGTTACCGGCAGGCACAGGAATGGATCCAGGTGCAGTATTCGTTGCTACAGCATTAGCAGCAGCGATCGGTTCGTTAATTATGGGTATTTTCGCAAAGTATCCGATTGCTTTAGCGCCAGGTATGGGAATTAACGCATTCTTTGCTTATACGGCAGTGTTAACGATGGGTATTCCGTGGCAAACAGCAATTGCTGGAACGTTAATGTCAGGTATTATCTTTATTATTCTTACTGCTTCAGGTATTCGTGAAAAAATCATTAACGCAATTCCATCAGAGTTAAAGTTCGCAGTAGCGGCAGGTATCGGATTATTCATTGCTTTCCTTGGATTCCAAAATGCCGGAATTATCGTGAAAAATGATGCTGTCCTTGTTGGGTTGGGGGATTTAACAAAGGGCACAACGTTACTAGCAATCTTCGGAGTTGTTACGACAATCATCTTCATGATTAAGAAAGTTAATGGTGCAGTGTTCTACGGTATGATTCTTACAGCAATATTAGGAGTAGCAACAGGATTAATTGATACTCCAAAAGCTGTAGTGGGAGCAATCCCGAGTCTAGAACCAACGTTTGGTGCAGCGTTAACGCACTTCGGAGATATTTTCACTGTTCAAATGGGGATTGTTATTATAACGTTCTTCTTTATCGATTTCTTTGATACAGCAGGTACACTTGTAGCGGTTGCGAATCAAGCAGGATTAATGAAGAACAATAAATTACCACGTGCAGGAAAAGCGTTATTCGCAGATGCAATTGCAACTGTAATTGGTGCAATCTTAGGTACATCAACAACAACATCTTACATTGAGTCGTCTGCAGGGGTAGCGGCAGGTGGACGTTCTGGTTTTACAGCAGTTGTAACAGCAGGATTCTTCTTACTGGCACTATTCTTCTCGCCATTATTAAGTGTTGTAACACCAGCTGTAACGGCACCAGCTTTAATTATTGTAGGGATCTTGATGGTTTCATCTTTAGGAGAAATTGATTGGAAGAAATTCGAGATTGCAGTACCGGCGTTCTTTACTATCATTTCAATGCCGCTTACGTATAGTATCGCAACGGGAATTGCGATTGGGTTTATCTTCTATCCAATTACAATGGTAGTAAGTGGTCGACGTAAAGAGATTCATCCAATTATGTATGTTATGGGAGTTTTATTCGTACTATATTTCATTTATGTTCGTAAATAAAAGGGGTTTTTGAAAGGTCTAGACTTAAGGGGAGTCTAGACCTTTTTTGCGTCTTCAGAAAAACTTAAGGATTTCCGAGCGTTTTTCTTCAGAAGTTTTCCTATAATAGAAGTTAGGGATTAAAAAAGTAATGGGGGAGATATTGTGGCACACGAAACAATACTTGTCGTAGATGATGAAAAAGAAATCCGAAATTTAATTACAATCTATTTAAAGAATGAAGGATATAAAGTATTGCAAGCAGGGGACGGAGAAGAAGGATTACGTTTACTAGAAGAAAATGAAGTACATCTAGTCGTATTAGATATTATGATGCCGAAAGTAGACGGCATTCATATGTGTATGAAAATAAGGGAAGAAAAAGAAATGCCAATTATTATGCTTTCAGCGAAAACGCAAGATATGGATAAGATTTTAGGTTTGACAACGGGTGCAGATGATTACGTAACGAAACCGTTTAATCCGTTAGAGTTAATCGCAAGAATTAAATCTCAGTTACGCCGTTATATGAAAATGAATGGTTTCGCTATACAAAATGAGGACGAGCTAGAGATTGGGGAGATGAAAATAAACATCTCAACCCATAAAGTCATTGTAGAGGGAGAAGAAGTGAAACTAACTCCGAGGGAATTTTCAATTTTAGAATTGCTAGCCCGTAATCCGGGGATGGTCTTTAGCGCGGAGCAAATTTATGAAAAGGTGTGGAACGAAAGATCTTTCCAGTCGGATAATACGGTAATGGTGCATATTCGAAAAGTGCGTGAAAAGATTGAGGAGAATCCAAGGAAACCTAGATATATAAAAACAGTATGGGGAGTGGGGTATAAGATTGAAAAAGATATTTAATCCATTTACTTATATAAGGAAAGCAAGACAATTGATTGAGAAATTAGTAAAGGGCGTACGAAAGAGTATAAGAATTCAACTGATTACTACTTTTGCCGCTTGTGCGTTATTAGGAGTTTTTTTTGCAAAGGGAGCTGCACCATTTTTTGAGAATGCGAATCGTCAAGCGACTATTGATTATCGAGCTGGTATGGAACAAATTAATCACGAAGCTCAAAGAGCAGCAAATAGCTCGGTTCATGAAAATAAATTAGAAGCTATATCCAATATGATCGAAATGGAGAATCAAAATTTAGAGCGAGGATCTAGAGCTCTAAAAATATTGGTTACTGATGAAAGTGGTAAAGTTTTATATAAAACGAAGCAGGCGCAAGAAGAGCAAATCGATTTGCATAATACGATTCGTAATGCAGCATCATTTGCGATTAACTATTCAAATGGTCGAGATGTATTTGAAAATACAAGAAAAGAATTTATAGCTTTTTCGCCTATTACAATAGAAGATAAGAACTTATATATGTTCGTTAGTGGAATACCAGATGGTGTAGTGATGTATGATACACAAGAAGGACCATTTCCATTTTTAATTGGTGTACTTGTATTTATTTTCTCTTTCTTCTATATAACAAAGAGAAAGATGAAGCAAATTGAAGCGATGGCAGAAGGTGTAAAGGAAATAGAAAAAGGCAACTTAGCGTACCGTATAGAGAAGAAAGGTGAAGATGAGATTGCATCTTTAACAGAAAATATTAATAATATGGCAGAAGAGCTTATGAATAATATAGAAAAGGAACGTAAGTTAGAGAAGCAAAAGAACGAGCTTATTACAAATGTATCTCACGATTTGCGTACACCACTGACTTCTATTATGGGTTACTTGCGATTACTTCGAGATTCTAAATATGAAAATAAAGAGCAACACGATGAATATACGAGAATTGCTTTTGCGAAGTCAGAGCAGTTAAAGAATTTAATAGAAGATTTATTTGAGTATACGAAGTTAACGAATGAGCAAGTTGTATTAGAAAAACAAGAAGTATGTGTAAATGAGTTATTGGAGCAATTAATAGAAGAGTTAGTACCGCAAGCGGAAGAGCATGGACTTACATTTGTTAAGAAGTTTCCTGAGGAACGTGCCTATGCAGCGATTGATTCGGAAAAGATGGTCCGTGTATTTGATAATCTATTAATGAACGCGATTAAGTATAGTAAAGATGATGGGGAGATAAAAGTTTCCCTTCAAAGGCAGCGCTGGGAGATACAAATTGTAATTGCGAATCATAGTGAAGAGTTTACGAGAGAAGAGTTAGCGAGTTTGTTTGAACGTTTTTATAAGAAAGATCAATCTAGAAGTAGAGTAACAGAAGGGTCAGGCCTTGGATTGGCGATTGCGAAAAGTATTGTTGAATTACAAGGTGGTAGTATTCGAGCTGAATATAAGGATGGTATTATTCAGTTTATCGTCTCGTTACCAATTATAGAAAGATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012730|258555:266504|262843_264169_+|WP_000833093.1|DBSCAN-SWA MKRYFQFDELGTNYKTEFIAGLTTFLSMAYVLFVNPATLSLGNVKGLPAGTGMDPGAVFVATALAAAIGSLIMGIFAKYPIALAPGMGINAFFAYTAVLTMGIPWQTAIAGTLMSGIIFIILTASGIREKIINAIPSELKFAVAAGIGLFIAFLGFQNAGIIVKNDAVLVGLGDLTKGTTLLAIFGVVTTIIFMIKKVNGAVFYGMILTAILGVATGLIDTPKAVVGAIPSLEPTFGAALTHFGDIFTVQMGIVIITFFFIDFFDTAGTLVAVANQAGLMKNNKLPRAGKALFADAIATVIGAILGTSTTTSYIESSAGVAAGGRSGFTAVVTAGFFLLALFFSPLLSVVTPAVTAPALIIVGILMVSSLGEIDWKKFEIAVPAFFTIISMPLTYSIATGIAIGFIFYPITMVVSGRRKEIHPIMYVMGVLFVLYFIYVRK >NZ_CP012730|258555:266504|260920_262459_+|WP_000743900.1|DBSCAN-SWA MKKQHDTIIVLDFGSQYNQLIARRIREFGVYSELHPHTITAEEIKAMNPKGIIFSGGPNSVYGEGALHCDEKIFDLGLPIFGICYGMQLMTQQFGGTVERANHREYGKAVLKVENESKLYANLPEEQVVWMSHGDLVTGLPEGFVVDATSESCPIAGMSNEAKNLYGVQFHPEVRHSEHGNDLIKNFVFGVCGCSEGWNMENFIEVELEKIRETVGDKKVLCALSGGVDSSVVAVLIHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEAEGVMKTFSEGFHMNVIKVDAKERFMNKLKGVEDPEQKRKIIGNEFIYVFDDEASKLEGMDFLAQGTLYTDIVESGTATAQTIKSHHNVGGLPEDMQFKLIEPLNTLFKDEVRVLGSELGIPDEIVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEEKLEIVRESDAILREEIIKAGLDREIWQYFTALPGMRSVGVMGDERTYDYTVGIRAVTSIDGMTADWARIPWDVLEKISVRIVNEVKHVNRIVYDVTSKPPATIEWE >NZ_CP012730|258555:266504|258555_258840_+|WP_000917306.1|DBSCAN-SWA MLKPLGDRVVIELVQAEEKTASGIVLPDTAKEKPQEGKVIAVGTGRVLENGERVALEVAAGDLIIFSKYAGTEVKYEGTDYLILRESDILAVIG >NZ_CP012730|258555:266504|264313_265015_+|WP_000929883.1|DBSCAN-SWA MAHETILVVDDEKEIRNLITIYLKNEGYKVLQAGDGEEGLRLLEENEVHLVVLDIMMPKVDGIHMCMKIREEKEMPIIMLSAKTQDMDKILGLTTGADDYVTKPFNPLELIARIKSQLRRYMKMNGFAIQNEDELEIGEMKINISTHKVIVEGEEVKLTPREFSILELLARNPGMVFSAEQIYEKVWNERSFQSDNTVMVHIRKVREKIEENPRKPRYIKTVWGVGYKIEKDI >NZ_CP012730|258555:266504|258878_260513_+|WP_001030000.1|DBSCAN-SWA MAKDIKFSEEARRSMLRGVDTLANAVKVTLGPKGRNVVLEKKFGSPLITNDGVTIAKEIELEDAFENMGAKLVAEVASKTNDVAGDGTTTATVLAQAMIREGLKNVTAGANPMGLRKGIEKAVVAAVEELKTISKPIEGKSSIAQVAAISAADEEVGQLIAEAMERVGNDGVITLEESKGFTTELDVVEGMQFDRGYASPYMITDSDKMEAVLDNPYILITDKKISNIQEILPVLEQVVQQGKPLLIIAEDVEGEALATLVVNKLRGTFNVVAVKAPGFGDRRKAMLEDIAILTGGEVITEELGRDLKSATVESLGRAGKVVVTKENTTVVEGVGSTEQIEARIGQIRAQLEETTSEFDREKLQERLAKLVGGVAVIKVGAATETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTSLMNVYTKVASIVAEGDEATGINIVLRALEEPVRQIAINAGLEGSVVVERLKGEKVGVGFNAATGEWVNMLETGIVDPAKVTRSALQNAASVAAMFLTTEAVVADKPEPNAPAMPDMGGMGMGGMGGMM >NZ_CP012730|258555:266504|264998_266504_+|WP_000719201.1|DBSCAN-SWA MKKIFNPFTYIRKARQLIEKLVKGVRKSIRIQLITTFAACALLGVFFAKGAAPFFENANRQATIDYRAGMEQINHEAQRAANSSVHENKLEAISNMIEMENQNLERGSRALKILVTDESGKVLYKTKQAQEEQIDLHNTIRNAASFAINYSNGRDVFENTRKEFIAFSPITIEDKNLYMFVSGIPDGVVMYDTQEGPFPFLIGVLVFIFSFFYITKRKMKQIEAMAEGVKEIEKGNLAYRIEKKGEDEIASLTENINNMAEELMNNIEKERKLEKQKNELITNVSHDLRTPLTSIMGYLRLLRDSKYENKEQHDEYTRIAFAKSEQLKNLIEDLFEYTKLTNEQVVLEKQEVCVNELLEQLIEELVPQAEEHGLTFVKKFPEERAYAAIDSEKMVRVFDNLLMNAIKYSKDDGEIKVSLQRQRWEIQIVIANHSEEFTREELASLFERFYKKDQSRSRVTEGSGLGLAIAKSIVELQGGSIRAEYKDGIIQFIVSLPIIER |
6 | uncultured_virus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
297184 : 305561
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012730|297184:305561|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012730|297184:305561|304973_305561_+|WP_000088592.1|DBSCAN-SWA MSRLAVFASGSGSNFQSLVNAVEEKRLDAEISLLVCDKPEARAVGRANYHHIPCFAFSAKAYESKEAFEKEILNKLEEYEIDYVILAGYMRLIGPTLLEAYGGRIINIHPSLLPSFPGKDAVGQALEAGVKVTGVTIHYVDAGMDTGPIIAQEAVVVSEGDTRESLQKKIQQVEHKLYVNTVNQIVQSTKEPTVN >NZ_CP012730|297184:305561|298580_299300_+|WP_001170540.1|DBSCAN-SWA MQKLELLYEGKAKRIYRTESADMVWVEYKDSATAFNGEKKETITGKGRLNNEITTLLFRKLQEVGIKTHFVEKLSETEQLVKKVSIIPLEVVTRNVIAGSLSKRLGMEEGTVLAEPIVEFYFKDDDLGDPLVTEDHIRVLNVASPEQVSVLRDMALQINQVLIDHFASCRVRLVDFKLEFGVTDEGAIILADEISPDTCRLWDETSNEKFDKDVFRRDLGNLTDAYEEILKRLGGISHV >NZ_CP012730|297184:305561|299543_300227_+|WP_000666779.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDVDMFHAIKDELGEEVDYVWHDTENLDEYDAILLPGGFSYGDYLRCGAISRFANAMKAVQKAAEQGKPILGVCNGFQILVESGLLPGALMRNENLKFMCRTVQLRVENNETMFTSQYEKDEVINIPIAHGEGNYYCDEETLKQLEENNQIAFRYVENPNGSVSDIAGIVNEKGNVLGMMPHPERAVDELLGGAEGLKVFQSILKQWRETYVVNA >NZ_CP012730|297184:305561|300210_302430_+|WP_000055577.1|DBSCAN-SWA MSLMLEPNPTQIKEERIYAEMGLTDEEFAMVEKILGRLPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTTGERVLQGPGEGAGIVDIGDNQAVVFKMESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPVALLNSLRFGELQSPRVKYLFEEVVAGIAGYGNCIGIPTVGGEVQFDPCYEGNPLVNAMCVGLINHEDIKKGQAHGAGNTVMYVGASTGRDGIHGATFASEELSESSEAKRPAVQVGDPFMEKLLIEACLELIQSDALVGIQDMGAAGLTSSSAEMASKAGMGIEMYLDDVPQRETGMTPYEMMLSESQERMLIVVKKGREQEIVDLFEKYGLAAVTMGKVTEDKMLRLFHKGEMVAEVPADALAEEAPIYHKPSKEAAYFAEFQQMKMETPKVENYKETLFALLQQPTIASKEWVYDQYDYQVRTSTVVTPGSDAAVVRVRGTEKGLAMTTDCNSRYIYLDPEVGGKIAVAEAARNIVCSGGEPLAITDCLNFGNPEKPEIFWQIEKSVDGMSEACRTLQTPVIGGNVSMYNERSGEAVYPTPTVGMVGLVHDLKHVTTQEFKQAGDLVYVIGETKAEFGGSELQKMLHGKIFGQSPSIDLDVELKRQKQVLAAIQAGLVQSAHDVAEGGLAVAISESAIGANGLGATVKLDGEATAALFAESQSRFVITVKRENKEAFEKAVEAIQVGEVTNTNEVTIHNEENEVLLTANVDEMRKAWKGAIPCLLK >NZ_CP012730|297184:305561|297184_298492_+|WP_000625683.1|DBSCAN-SWA MISRYTRPEMGAIWTEENKFKAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVKKIREHASFDIDRIYEIEKETRHDVVAFTRAVSETPALGEERKWVHYGLTSTDVVDTALSYILKQANEIILKDLENFVSILANKAKEHKYTIMMGRTHGVHAEPTTFGLKLGLWYEEMKRNVERFKQAANTVRVGKLSGAVGTYANIDPFVEKYVCENLGLEAAPISTQTLQRDRHAHYMSTLALIATSIEKMAVEIRGLQKSETREVEEAFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMTGLARVIRGYMMTAYENVPLWHERDISHSSAERVILPDATIALNYMLNRFGNIVKNLTVYPENMKRNMTRTYGLIYSQRVMLTLIDKGMVREEAYDIVQPKAMEAWETQVQFKELVEADERITSKLTQEEINECFNYEHHMQHVDTIFERLGLNEA >NZ_CP012730|297184:305561|303936_304977_+|WP_001262436.1|DBSCAN-SWA MANAYKQAGVDIEAGYEAVSRMKKHVQTTMRKEVLGGLGGFGGMFDLSKFALEEPVLVSGTDGVGTKLMLAFMADKHDTIGIDAVAMCVNDIVVQGAEPLFFLDYIACGKAEPSKIENIVKGISEGCRQAGCALIGGETAEMPGMYSTEEYDLAGFTVGIVDKKKIVTGEKIEAGHVLIGLASSGIHSNGYSLVRKVLLEDGELSLDRIYGRLELPLGEELLKPTKIYVKPILELLKNHEVYGMAHITGGGFIENIPRMLPEGIGAEIELGSWKIQPIFSLLQEVGKLEEKEMFNIFNMGIGMVVAVKEEDAKDIVRLLEEQGETARIIGRTVQGAGVTFNGGKAL >NZ_CP012730|297184:305561|302414_303830_+|WP_000879029.1|DBSCAN-SWA MLAEIKGLNEECGVFGIWGHENAAQVSYYGLHSLQHRGQEGAGIVVNNGEKIVGHKGLGLISEVFSRGELEGLNGKSAIGHVRYATAGGSEVANVQPLLFRFSDHSMALAHNGNLINAKMLRRELEAEGSIFQTSSDTEVLLHLIKRSTKDSLIESVKEALNKVKGAFAYLLLTGNEMIVALDPNGFRPLSIGKMGDAYVVASETCAFDVVGATYIRDVEPGELLIINDEGIHVDRFTNEVDHAICSMEYIYFARPDSNIAGINVHAARKNMGKRLAAEAPIEADVVTGVPDSSISAAIGYAEATGIPYELGLIKNRYVGRTFIQPSQELREQGVKMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVRMLREAGATEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANHTVEEIREMIGADSLTFLSEDGLVDAIGRPYEGKYGGLCMAYFNGDYPTALYDYEQELLESMK >NZ_CP012730|297184:305561|299292_299547_+|WP_000278820.1|DBSCAN-SWA MYKVKVYVTLRESVLDPQGTAVKGALHSLSFTEVQDVRIGKYMELTIDKSVSDLDAKVKEMCEKLLANVVMEDFRYEVEEVVAQ |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
445989 : 476659
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP012730|445989:476659|DBSCAN-SWA AATGATACAAAAGCAACATGAGAGTAAGTTGGAAGTTGGTCAAACATTTCCTGTGACAATTAAACGTCTTGGGATTAACGGAGAAGGCGTTGGTTATTTTAAGAGACAAGTTGTTTTCATTCCAGGGGCATTACCAGGAGAAGAAGTTGTTGCTGAAACAACGAAAATTCAGCGTGGTTTCGCAGAAGCGAAAGTGAAAAAAGTTCGTAAAGCTTCACCGCATCGTGTGAAAGCACCGTGTCCAGTATATGAGGAGTGTGGCGGTTGTCAGCTGCAACATTTAGATTATAAAGAACAATTGAATCAAAAGCGTGATATCGTTGTACAAGCATTTGAGAAATACATGAAAAACAGTATGGAAGAGAAAATTCGTCCAACGCTTGGCATGGAAAATCCATGGCATTATCGTAATAAGAGTCAATTACAAGTGGGGCGTAAAGACGAAAAGGTTATTACAGGGCTGTATAAACAAAATTCACATCAGTTAATTGATATTGCTCATTGTATGATTCAACATAAAGCAACGAATGAAGCGACAAAAGTTGTAAGACGTATTTTAGAAAAATTAAATGTTTCTATTTACAATGAGAAAAAACAAAAAGGTTTAGTACGTACAATTGTGACACGTACTGCAGTTCAAACAGGGGAAGTACAAGTTACACTTATTACAACAAAAGAAGAGTTGCCAAATAAAGAACAATTTATTGCAGAAGTACAAAAACAGATGCCAGCTGTTAAATCAATTATGCAAAATGTAAACTGGCGTAAAACATCTGTTATTTTCGGAGATAAAACATTTAAATTAGCTGGAAAAGAAGTAATTCAAGAAACACTTGGTGATTTATCATTTGAATTATCAGCACGTGCATTCTTCCAGTTGAATCCAGAACAAACGGTTGTATTATATAATGAAGCGAAAAAAGCCGCTGCTTTAACAGGAAATGAGAAAATTGTAGATGCATATTGTGGTGTTGGTACAATCGGTCTTTGGCTTGCGAATGATGCAGCGGAAGTACGTGGTATGGATGTAATTCCAGAAGCAATTGCAGATGCAAGAAAAAATGCGAAGCGTCACGGATTTACAAATACGAAATATGAAGCAGGTAAAGCTGAACAATGGTTACCTAAATGGGTAAAAGAAGGATGGCGTCCAGATGTAATTGTTGTCGATCCACCACGTACAGGTTGCGACGATAAATTACTGGAAACAATTTTAAAAGTGAAGCCAAAACAAGTTGTTTACGTATCTTGTAACCCTTCTTCATTAGCACGTGATGTACAAGCGTTAATGAAGAGTTATGAAGTGGAATATGTACAACCAGTTGATATGTTCCCGCATACAGCTCATGTTGAGAACGTAGTTAAATTAACGCTGAAATAAAGGGGTTTCAATGAAATTGTTGATGGGTTTGACCACATTCTGACCACATCAACAATTTTTTTATGATTTTAATGCCTCACTTAGCTTTAAAACAGCACTTTCTTGCATATCTATAGTAACATGACTGTAAGTGTCTAATGTGGTCTTAATTGAACTATGTCCTAAACGCTCACTTACGATTTTTGGATTAATACCTAGCTTCAATAAAATTGTTGCATGCGTATGTCGTAAGTCGTGAAACCTAATTTGAGGTACATCGGCTTTTTTTATAAATTGATTAAAAGTAGTTGTCATAGTTCGTGGTAATATTGGCTGTCCAGTTTCTTTAGCAAAAACTAAATCATTATCCTCGTATGACTGCCCAAATAATAATTTGAACTCATTTTGTTTAGCTTTATAAGACTTAAATTCTTTACATAAGTTTTGATCGATAGAAATTAAGCGTTTTGATCCATGTGTTTTGGGTTCTGTAAATCTAAATCCGTTCTCATCATAAATGAGTGTTTCTGTAACGCTTATTTTACCTTCATTCAAATCGAAATTCTTCCACTTTAGACCAAGTATTTCACCACGTCTCATACCTGTATTTAATGCCAATAAGAAAAGATGATAATAGATGACATTTTCAAATTTTGTACGATTTAAGAATTTTTTCGTTTCTTCAATTGACCACGTAGAATTGACCACTTTTCGTGGTCGAGGTATTTCCACATGTTGAAATGGGTTTTTAAACAGGAGCTCCCACCTAACAGCGTCTTCTAATGATCCTTTTAAAACAATGAAAATATATTCAATATACGCAGGTGACAACCCTTCATCAATTAAGGATTTAACGAATCGTTGTCCATGCAAGGGTTTTAAATCCTTTAATTTATGCGAACCAAGCACAGGTATAATTCGACTATTTATAGCTCTTTTATAATTGGTGAATGTAGTTTCTCTTACTCTTTGTTTAGCTGTATTTTCTAGCCATTCTTGTAAATACTCACTAAGAGTAAAATTCTTATCATCAACTAGACTTCCAGTGTTGAATTGATGGATAAGCTCATTGCATGCACGTTCGGCTTCTTTCTTTGTTTTAAAGCCTGATGCTGTTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGTGATAGGATCTTTCCCAATATCAATAGTAAATGACCACTTTTCACCACGTTTTCTAAAGTATCCTTTCATTATCCATACCTCCTTGAACTAATAGTATTCTAATAGCACAAATAATTCCAGTATCAGAAAAAGGAAAAAGCAACTCATCTGAGTTACTTTATGGTAAACTATATTCAACTGTATATGTCGGGTGGCTTGGTTGCTATCCTTTCTCTGTATTTTAGAGAGAAAGGAGGTGACCCTTATGATGGAATATTTACTTTCTTTGTTACAGGATTTACTCAAGGTATTCCTTACTATAGTTGTTACAGCTTATGCAAATAAGTTCGCTAACAATTTGTTTAAGAAAAGTAAAAGAGCCACCCCTCGCCGTAGGAAGCAGGGTAGCTCTAAAAGAAAATAAATAGCAACCTTGCCATCTGATGGCGGCAGTTACTGGAAGAGATGTTAACGGCATCTCTTCTTTTATTCTATGCAATTCAGTTAGGTGTCATACTTAATATATAGTAAATATATGTTCACTATACAGTGGTGATTCTAGTGCCAATATTACCACAGTATCATTTTTGGGTCAACGCAAATAGCAGGGATTGATGGTGAATTTATAATGGTCCACAAAATAAAAAATCATGGTAAAATATATATATCCATACTTCTTAGCCCATACATGTTGTGGGCTTTTTTTATTGATACAAAATCAGTATTTTGTCGAAAGAAAAAAAGAGAGCAAAACGCTCTCTTACCACTACCCAATGGAAAACTTTTCTTCTAAAATGAAATTAAATCAGAATATATCTTGATTATCTTCAAGCATATTGATTAATACGGAGACTTGCTTACAAAAACGTTCCCTCTGTTGTTCATTTAACGCCGCATACGTTGTTTGAACATTAGATAATAGTTCTGTTAAGGGTTCTTCATCAAATTCATTCGTGAACCCAATAAGCGCGTCTACCGAAACATTGAAGAAGGAGGCGATGATAACCAACGTATCTATATCTGGCTGATACCGATCAGTTTCCCAGTTTTTGATTTGGCTTCTACTCAAGTTCAGCTTGTGGGAAAGTTGTTCCTGAGTTAAGCCACGCGACTTCCTTAGTTTTTTTAGAATTTGTCCAAAGTGTCTCATAATTTAAAGTATAAATACTAAACAACTATACTACTATATATGGTCGTTTAACTACCTTTAATGTTAAAATGGTAGTTATGGTTTCTGGAAATAAATCAAAAAACAGAACAAAAGTTCGTATTCTTGTGGTAAAATATGCATGTGAGGTATTCGAAAGTTCCATGCATATTTACATATTTTATTTTCGTTACAGCTGATAAACGTTGGTATATAACGGTTTTACAACTTTCTCAATAATTATCAGATAACTGCATGACTGAAATTTGCCAAAAATATGATATTATGAAAACAAATATAATAAACGGAACGAAAAAAAGACTCACAGCGTGTGTAAGAGTGATTTGGCCCACTCTTACACCGTTCGCCCGACTCACAAGGGGAACATCTGCCATAAGTCTCTTTTCGGTCACTACACGAGTAACACTTACATTATAACATGCCGATATTACTAAAGCATTACTATGGTATTAAATTCCTGTTTTAAAAGTTGAGAAAAGAGCGAAGCGTCTTTGTTCCAAAAGGGAGGAACAAGAAGTGTGGAAAGTTTTAAATGTTCTTGAAGGAGAGTTATATGTAGCTGGAATTAAGAAAAACAAGTTAGCTGATTATTGGGGAGTGAAGCCTGCTACAGTTACCAAGGTATTTAAAGGAGCTAACGATATTAGTTTCGGATATCTTTCGAAGACGCTTATTTTATTAAAAAAGAGTTTGATTTCACAGGCGAAAATTGTTAATGACTATGTAACGAACACAGACCCTAAACCTGAAAATTTAAGAGAAGCTATGGAAGATTTGGCTATTAGAGGTAAATTCGAATTATTGAAAGCAATTATAGATCAAGAGATTCATTCTGATGTTGCCGAAAATAGAGAATTTGCAGAAGTATATGAAATAATTTTTCGAAGATATCATGACGGTTTGAATGCTTCGGCTTATTTCAAATTATTAAGACAAAAGAATAAAAATGTTAAAACGATTGAAATGGAAGTTTTGACAGAAATCTTATTATGCCAGGCGCAATATCAGTCTGGGAATTACAAAACGCTATACGAGAGACTGAAGTCAGTTAGTGAAAAAATAAATGAAATAACAAATAAATTTATAAAAGAATGTTTGTTACTAAGATATAAAGAAGCAATAGCAGTAACTTCTTTACAAGGTGGCGAAGTAGTTGAATCTCGTTCCATATGTCGAGATATATTAGATGAATTAGAGTGGGATGACTTTTTCTCACTGCCAAAACTAAATGCATACTTGAAAATAGGCGAGTCATTAATATTCGAACCTGATAATTACGACAGCGCTAAGTTTTATTTAGAGAAAACATTAGAGTTATTAGGTAATCCTAGTTGCAAAGGATTAGAAAAGAAATGG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46 | Bacillus_phage(67.5%) | tail,integrase,capsid,terminase,head,protease | attL 450331:450346|attR 464995:465010 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
480547 : 484415
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP012730|480547:484415|DBSCAN-SWA ATTGAAACACATAAAACTTTACGATAAACAATTACAGTTAAAAGCATATCTCGAAAACGCATTTAAAATAAAGTACAGCCCGCCACTCAATGAACTTTGGACGGCGGGTTTTTCATTACCTTTTACCGATCCTAAGCGAGAGGAAATTGAAACGTTTGATTATGTGGAAATATTTGATAACGGTAAACGTATCGGATTGTTCCGTATTATGGATAGCGAGGAAGAAAGGGAAGTAAGTCAAAAAATAATAACTTATGACTGTGAGCATGTTTTATCTACTTTAATGGATAGCGTGCTTTTTGGTTATCACGAAAGAATTAATTTAACGACAAGGGAGAATATTGAGTATCTCTTAAGCAAACAAAGAATAAAGCATTGGAAACTTGGTCAATGTGATTTTGTAAAATATTTTCAATATAGTTGGGAAAATGAAGATACGATATTAGGACCGATATATAGTATTGCAAAACCGTTTGATGAGAAATTCCAATGGACATGGGACGATACTTCCTATCCTTGGACTTTAAATCTCGTGAAATATTCCGATGAAATTACAGGTGAGCTTCGATATAGAAAGAACATGAAAGGCATTAAGCGAAAGGTAGAAGCTAAGGATGTCATGACTAGAATTTATCCACTAGGTTATGGTGAAGGTGTTAATCAACTTAATATCAAAAGTGTGAACAATGGTCTTCCTTATATAGATGCTCCTGATTTTGTCAGAGAGTTACAGGATGGGTTTGATTATATTTGGGTGGATAGACGATTTGAGGACCCAAAAACGCTTTATGCTTCAGCAAAAGCGATGTTATTAAAAGCGTGTATGCCAAAAGTTACATATGAAATTGATGCAATTGATTATGAATTGATTGACCCATACAAAATAGAAAAATATGAAACAGGCAAGTTAGTACGTCTATATGATGAGGATTTTAATATATCTGTTGATTTACGAGTAATGGACCGTTCAAAAGATGATGTTACTGGTAATCCACTTGATGTAAAGCTTGTATTAGAAAATAAAGTCACTGATATTGGGACAATACAAGCAGATATTGAAAAGCGACAGAAAGTAAACGAAGTGTATTCTCAAGGAACAACTAATATTGATAGTCAACCTTTCCAAGATAATTGCGACCCAGATCATCCAGCCATCATAAGGTTTCAAATACCTAACGATGTTAAGAATGTGAATCAACTGATACTGACATTTGAGACATTACGGTTTAGAGCATATGAGCGGGCTATTAAAGGCGGCGGAGCTGTCGTTGCTTCAACTTCTGCCGGTGGTGCGAATGTATCTTCAACAAGTTCCGGTGGTGGTACGGTTGGTTCGACGTCATCAGGCGGAAGTTCTGTGCAAGCAAGTAGTTCCGGTGGTGGTACGGTTAAAGCTTCAAGTAGTGGAGGAGATCATGTTCATAAAATGTTTCATGGTGGCGGAATTGTTCCTGCTGAACCATCAACAATAGGATTATATACAGCTTTTTCTGATCCAGGAAGAAATACATCAGCTTCATTTTACGCAAAAGGAACGGGATCTAGTTTCTACACATATGGTTCTAGTGGGAATCACACTCATGATATATCAATACCTAACCATACTCACAGTATTAATATAAATCATAAAATATAGAAGGAGATTGATAACATATGCAAACAATTGAAATCCATACACAAGGCGGATTAAAACATAAAGTGCAGACTGAGGTATATAACGCAGAAGCACTGAATACGAAACTAAACGACAACGATTTAATTACAGTATTAATTGGTGATTTTATTATTCAACGTATTGATGTTAAACGTATCATTCCATTAAATATGATTGATGCGGAAGGCGCTAAAAGGGTAGAAGTTCATACAAATGCTGGGAAAGTGATTGAGATTACAACAAACGATTATGATCCAATCTATCTAAACGAGCAATTAAACAATAATAATACAATTACAGTCGTAATTGGTGATTATATTTTCTCTCGAATTGATGTAAAACAAGTAGTTCCTGTGAAAGAAGAACCTAAAGAGCCAGAACAACCACCTGTGACAGAACCTGAGAAACCGACAGAACCAGTTACACCGCCAGGAGAAGGTACAGAAGATGATAGCATTACAACTACAGAGCAGTTATAAACTGGTCTTTTTATTTTGAACAAAATACGGCTTTTACAACAAAACGAAGTGTGCTTATTGCAGGCTTTTTTATTTTGAATAAAGGAGTGAAAAGATGGCTGAATTAAAACACGATGATATGAAGGAATTACTTGTAGGGTTGACCAGAGTAGAAACCAAGCTTGATACACTCGGTAATGTCAAAGAAGTTGCCATTGAAGCCCAACAATCAGCAAAAAGCGCTCATTTGCGTGTGGATAGATTAGATAAATTAGTTTTTTGGTTAGGTACGACAGTTATAGGAGCTGTTATCGTTGGGGCTATTACAGCATTATTCAAATTCGCAGGAAAGTAGGGAGAAGAATGAATAAGGAAAATATCAAAAAAACGATTCCGCAACTGGAAAACATGGGTTGCGGTTTTTTCTTTGCTTGGATTTTTATTTACAAAGTTTGGCGTTCCAGAAGCAAAAAGCTTTTTGGATGAATTAGCACCTTACTTGCTGTCAGTTGGTATCGCATTAGGTATTTGGTCTGATCATGATGTAAATAGCGAAGGAGACGATAAATAATGGGACATATTATTGATATTTCAAAATGGAATGGCGATATTAACTGGTCTATAGCGAAACAACATATAGATTTCATCATTGCTCGCGTACAGGATGGTTCAAATTATGTAGATCCACTATATAAAGGATATGTACAAGCAATGAAGCAGCATGGAATACCATTTGGTAACTACGCATTTTGTCGTTTTGTTTCAATTGCTGATGCAAAGAAAGAAGCACAAGACTTCTGGAATCGCGGCGACAAGAGCGCTACAGTTTGGGTGGCTGATGTAGAAGTAAAAACAATGAATGATATGAGAGCAGGTACACAGGCGTTTATCGATGAGTTATACCGATTAGGGGCTAAGAAAGTTGGTTTATATGTTGGTCATCATATGTATACACCTTTCGGTATGGCGAACGTAAAAAGTGATTTTGTATGGATTCCACGTTATGGTGGTAACAAGCCAGCCTATCCTTGCGATATTTGGCAATATACTGAAACGGGTAATGTACCTGGTATCGGGAAGTGTGACCTTAATTCACTTATAGGCAATAAGTCACTATCTTGGTTTACAGAATCGGCAACCCAGGAATCTGTACAAGCGCCTACACAAAACATCATCCAATCAGGTGCTTTTTCACCTTATGAAACTCCTGACGTTACAGGGGCATTAACATCCTTAAAAATGACTGCTAAATTCATCTTGAAACCTGATGGATTAACATACTTTATTTCTGATCCAACGTCAGATGCTCAATTAAATGCAATGAAAGAATACCTTGACCGTAAAGGTTGGTGGTATGAAGTTAAATAAAACAAAAGAATAGTTTTATAAACAAAAATAAGAGCCGTCAAATGACGGCTTTTTTATTGCAAATCAGATATTTTCTTAACTTCTTTTTCCTTCGCTTTGAATTCCTTCTCGTATTGTTTAAAATCCTCTTTATCAACATGGAACCTTTCACCAGTTGCAACGTTTTTGACTAAATAAGTTTTACGATTGCGTTCCTTAATTAATCCATATAAGACCAAAAACAAAAGGGAGATACCTATCGTCGGAAGAGCTAAAATTATGCATAGTATTAGTACCGTTTTCTCCGATTTGCTATCTTCACGTTTTAAAATAAGTTTCTCTCCTGATGCAGCTTCCGATTGCTTTAATTGTTGCATTCTTTGGAGTGCAGCAACTGTATCAAGACTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP012730|480547:484415|482773_483013_+|WP_000818882.1|DBSCAN-SWA MAELKHDDMKELLVGLTRVETKLDTLGNVKEVAIEAQQSAKSAHLRVDRLDKLVFWLGTTVIGAVIVGAITALFKFAGK >NZ_CP012730|480547:484415|484079_484415_-|WP_000050925.1|DBSCAN-SWA MSLDTVAALQRMQQLKQSEAASGEKLILKREDSKSEKTVLILCIILALPTIGISLLFLVLYGLIKERNRKTYLVKNVATGERFHVDKEDFKQYEKEFKAKEKEVKKISDLQ >NZ_CP012730|480547:484415|483228_484026_+|WP_000509854.1|DBSCAN-SWA MGHIIDISKWNGDINWSIAKQHIDFIIARVQDGSNYVDPLYKGYVQAMKQHGIPFGNYAFCRFVSIADAKKEAQDFWNRGDKSATVWVADVEVKTMNDMRAGTQAFIDELYRLGAKKVGLYVGHHMYTPFGMANVKSDFVWIPRYGGNKPAYPCDIWQYTETGNVPGIGKCDLNSLIGNKSLSWFTESATQESVQAPTQNIIQSGAFSPYETPDVTGALTSLKMTAKFILKPDGLTYFISDPTSDAQLNAMKEYLDRKGWWYEVK >NZ_CP012730|480547:484415|483025_483229_+|WP_110925518.1|DBSCAN-SWA MRKISKKRFRNWKTWVAVFSLLGFLFTKFGVPEAKSFLDELAPYLLSVGIALGIWSDHDVNSEGDDK >NZ_CP012730|480547:484415|480547_482182_+|WP_003164347.1|DBSCAN-SWA MKHIKLYDKQLQLKAYLENAFKIKYSPPLNELWTAGFSLPFTDPKREEIETFDYVEIFDNGKRIGLFRIMDSEEEREVSQKIITYDCEHVLSTLMDSVLFGYHERINLTTRENIEYLLSKQRIKHWKLGQCDFVKYFQYSWENEDTILGPIYSIAKPFDEKFQWTWDDTSYPWTLNLVKYSDEITGELRYRKNMKGIKRKVEAKDVMTRIYPLGYGEGVNQLNIKSVNNGLPYIDAPDFVRELQDGFDYIWVDRRFEDPKTLYASAKAMLLKACMPKVTYEIDAIDYELIDPYKIEKYETGKLVRLYDEDFNISVDLRVMDRSKDDVTGNPLDVKLVLENKVTDIGTIQADIEKRQKVNEVYSQGTTNIDSQPFQDNCDPDHPAIIRFQIPNDVKNVNQLILTFETLRFRAYERAIKGGGAVVASTSAGGANVSSTSSGGGTVGSTSSGGSSVQASSSGGGTVKASSSGGDHVHKMFHGGGIVPAEPSTIGLYTAFSDPGRNTSASFYAKGTGSSFYTYGSSGNHTHDISIPNHTHSININHKI >NZ_CP012730|480547:484415|482199_482679_+|WP_001193271.1|DBSCAN-SWA MQTIEIHTQGGLKHKVQTEVYNAEALNTKLNDNDLITVLIGDFIIQRIDVKRIIPLNMIDAEGAKRVEVHTNAGKVIEITTNDYDPIYLNEQLNNNNTITVVIGDYIFSRIDVKQVVPVKEEPKEPEQPPVTEPEKPTEPVTPPGEGTEDDSITTTEQL |
6 | Bacillus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_5 |
1838276 : 1847009
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP012730|1838276:1847009|DBSCAN-SWA TATGAAAAAAGTAATTGCAGGTTTAGCAGCAGCTTCTGTAGTAGGTGTTGCAGTTCCAGGTATGGATTCTGCTCAAGCACAAGTTTCAAACGAAGCGCTAAAAGAAATTAATGGACAAGCTCAAACTCAAACGACTGTAACTGAAACAAAAACTGTAGAAACAAAATCTGACTTAAAATACACAGTAACTGCTGATGTATTAAATGTTCGTTCAGGTGCTGGTACAGGACATAGCGTTATTTCTAAAGTAAAACAAGGTCAAGTACTACAAGTAATTGGACAAGAAAACGGTTGGTTCAAAGTAACTGTAAACGGTCAAACTGGTTATGTAAGTGGTGACTTCGTAACAACTGGTGGTAAAACAGGAACTACTGTTCAACAAGGAACTGGTACTTACACAGTAAACGTTTCTTCACTTAACGTACGTACAGGTCCAAGTACATCTCATACAGTATTAGGCTCTGTAAATAAAGGTAAAACAGTACAAGTTGTTAGTGAAGTACAAGATTGGTTTAAAATCAACTTCAATGGTGGAACTGGATATGTAAGCAAAGACTTCGTAACAAAAGGTGGTTCTGCTGTATCTAACCAAACACAACAACCAACTACAAACAACAATACTACAACAGTTCAAACTGGTGGTTCTTATGTTGTTAACACTGGTGCTCTAAAAGTACGTACAGGCCCAGCTACATACAACGCTGTAATCGGTGGTGTAACAAACGGTACAGTATTAAACGTTACTGGCGCTGAAAATGGTTGGTACAAAATTAACCATAACGGCCGCACAGGTCACGTAAGTGCAGACTTCGTTAAGTTTGTAAAAGGCGGAGTAAACAACGTTACGAATAACGTTCAACAACCAGTTAAAGACGTACAAAAACCAACAACAGGTGGAAATACATCTTCAATCGCTGGATTCGCTAGATCTTTAAATGGTTCACCGTACAGAACTGCTGGTACAACACCTGCTGGTTTTGACTGCAGTGGATTCATTCACTACGTATTAAATCAAACTGGTCATAAAGGCGCTCGTCAAACAGTTGCTGGATACTGGAGCTCTAAAACAAAAACTAGCAATCCACAACCAGGTGATTTAGTATACTTCCAAAACACTTATAAATCAGGTCCTTCTCACATGGGTGTTTACTTAGGAAACGGTCAATTCATTAGTGCAGAAACTGATGCAACTGGCGTACGTATTAGTTCAGTAAGCAACTCTTACTGGAGCAAGCACCTTTTAGGTTACACAAAAGCATACTAAGAAAAAGTAGTTTATATACTTTTCGAATAGAGAAAAGGCTTTCCAGGGAAACTTGGGAAGCCTTTTTATAGTTGAATAAATTGGGAGTATAGTAGTTTTTACTTTAACTTCCCGTTTAAAAATCGATCGTATAAGTCATGGAAATAGTTAGGGCGAAATAAATTTGCTGCATGTCCTGCTAACGGTATTTCTTTATATAAAACGTTAGGAAGAATGGACTTTAAATCAAAAAGACAAGATTTATAGAGATGATCATGTTCACCCATTACCCATAGAATAGGGTGGGGAAGTGATTTTAATTTAGATTTTAAATCGAATTCTAACCGATGTCGTAATGATTGGGCAATAATTGATGAATGTAATTGCAATCCGAAACGGTAATAAATATTTCTTGAAATGACTGCAAATGGGTTTGCTTTTAGTATGCCACTTGGAAAAATGGTATTTGCGTATTGAGAGAGCCATTTAGAGTAATCGTCTCCTCGTTTCTCCCAAAATTTTTGAAATACGCTATATAAAAGAGAAGGATTATTATAATGTCCACCAATATGACAAATGCTTAATACTTTTTCTGGGTGCATTTGTGCAAAAATGGTAGAGATATAACAGCCGTAGCTTAAAGCACAAATATGAGCTTTTTGAATGCCTTCTTTTTCGTATAAATTCAATAATTGATCAACGAGGCGCTGTAATGAAAATTCGATAGCTTCACCTTTATCATCGCCGTGACCTAATAAATCATACGTAATAATGTTGTAGGAGGTTGAAAATCGTTTATGCTCTTTTTTGAAGGCACGACGATTACCAACTAATCCATGAATAAAAATGATTGTTTCCTTTTCGGAATGTATATTTGTTTGCAAAAAAGATACTCCTTTCAATAACTGGAGATTTATATAGTATTTTAAATTAGTTATTTATAATTCACATAGAATAATATTAAGTACCAGGTAATAATATCAGATGTTTATATCTGTTGTAAAGATGAGTTTTTATGTATATTTTGTAAAAATACAAAATGTGTGTTTACATTCAGTTTACATTTGTATTGTATTCTATTTTTAGAAAGAACAGTTTTGTTTAACACGAGGAGATGAACATGAATGGAAGTTAGAGATGAAATAAAGAAAAAAGGGAATTGGAGGCAGTTTTTACGCCTTATTCAAGATACAAAGCCTCCGAAAGGGATTCTTGTTTTTGCGTTATTAATGAGTTTGCTTTCTACGGGAGCAAGTTTATTTATTCCGATGTTAACAAAAGGGTTAGTAGATAATTTTTCACTTTCCTCAATTAGTACAGGACAAATTGTTGGATTAGTTGCATTCTTTATTATGCAAACTATAGCTGCAGGATTGTCTATATATTTATTAAATTATATAGGACAGAAGATTGTAGCTGGACTGAGAGAACGTTTGTGGAAAAAGGTACTTATATTGCCAGTATCTTATTATGATCAAAATAGAACAGGCGATACAATTAGCCGCATGACAAATGATACAGGTGTTGTGAAGACATTAATTTCTGAGCATTTGTCAAACTTACTAACAGGTGGTATTTCAATCGTCGGATCATTAATTGTATTATTTGTTTTAGATTGGAAAATGACACTTTTACTTTTAACGGTTATTCCATTATCAGTACTGATTTTAGTTCCACTAGGAAGAAAAATGTATAAGATTTCAAAAGCGCTTCAAGATGAAACAGCTTCTTTTACAAGTGTGCTAACATAAGTATTATCAGAAATTCGTTTAGTGAAATCTTCGAACACAGAAAAAAGAGAATATGAAACTGGAAATAAAGGTATCGAGAAGTTATTGCAATTTGGTTTGAAAGAGGGAAAAGTGCAAGCGTTAATTTCACCAGTTATGTCGTTTGTTTTAATGGCACTGCTTGTTATTATCGTAGGATATGGTGGGATGAGAGTTTCTAGTGGTGCATTAACAACTGGGGAACTAGTAGCGTTTATTTTATATTTAGTTCAAATTATAATGCCGATGAGTCAATTATCTATGTTCTTTACACAATTCCAAAAGGCGATTGGTGCAACGGAAAGAATTAATACCATTTTAGAATATGAAGTAGAAGATCATGAAACTGGTGTGAAAGTCACAAATGCTAAGCAACCAATTGTTCTTGAAAATGTACATTTCGAGTATAACGAAGAAGAGCAAGTGTTAAAGAATATTGATTTCACAATTGAATCTGGAAAAGTAACAGCAATTGTAGGGCCAAGTGGTAGTGGGAAAACGACGTTATTCTCACTATTAGAACGTTTTTATGAGCCAACTAGCGGTGCCATTAAATTAGGAAAAGATGCAATTACGAACTATTCATTACAGTCATGGCGACGTCAAATTGGTTACGTTTCACAAGATAGTCCGTTAATCGATGGAACGATTCGTGATAATATTTGTTACGGTGTTGAGGGGGAAGTAACAGATGAAGAAATTGAAAAAGTAGCAGCGATGGCATATGTTGATGCATTTATTCATGATTTGCCAAACGGATATGCAACAGAAGTGGGAGAACGGGGGGTAAAACTTTCTGGAGGACAAAGGCAGCGAATTGCCATTGCCCGAGCATTACTTCGAAATCCACAAATTCTTATGTTAGATGAGGCAACTTCAAGTTTAGATAGTAAGTCCGAGTCCGTCGTTCAAAAGGCATTAAATAACTTAATGAAAGGCAGAACAACGTTAGTTATTGCACATAGACTGTCTACTGTTGTAGATGCAGATAAAATTATCTTTATTGAAAAAGGGAATCTTACAGGAAGTGGTACACATGATGAATTATTACGTACACATGACATGTATCGTGAATTTGCAACGCAACAATTGAAAATTAAAGAGGCGGCATTATAAAATGAATAATCAGTGGGGATTGTACTCCACTGATTATTCATTTTTAAAAGTTTTGTTAAGGATGCTAATTAGAAAGGAAATGGTTTCTTTGATACCTAACATTTTAATAGTAGACGATGATCCGCATATTAGAGAACTCGTTTCTGTATTTTTAGAGTGTGAAGGTTTTCAAACATATGAGGCAATTGATGGTCTAGATGCACTTCAAAAAATAAATCAAGTGAAAGTTGATATGGTTATTCTTGATATCATGATGCCGAATATGGATGGATTTGATGTATGTTTCGAATTAAGAAAGTACTATGATATTCCGATTTTGATATTAACTGCTAAAGGGGAAACGTCTCAAAAAGTAAAAGGATTTCATCTTGGTACGGATGATTATCTTGTAAAACCATTTGATCCCATAGAACTAGTAGTGAGGGTTAAGGCGTTATTGAAACGTTACCAAATTACAGTGTCGCAATCAATTCAAGTTGGAACTGTACTGTTAAATCGTAAAACATTTGAAGTTACAATTGGAGAACAAACGGTTACGTTACCGTTAAAAGAATTCGAATTGCTCTTTACTTTAGGCTCTAAAGCGGGGAGAACTTGTTCGAGAGAGCAATTAATTGAAGATGTATGGGGATATGATTTTGAAGGGAATGAACGCACACTAGACGTTCATATAAATCGGTTACGTGAGAAGTTTCAAGAAGAGAAGTCGAAATTTAGTATTAAAACAATAAGGGGTTTAGGATATCGCTTAGAGGTAAGTAAATGAGAAAAAGAGGACGAATGAGTAAATTCAAGATGCTGAAAGTAACAGGAGCGATAATAGCACTCTTTTCTTTTCTTACTATTATTTGGTCTACAGCATTTTATGTATCATCTAGTATATTGGATGCCCTTGCAATACATTTATCTCCTTTTGTTACTTACCTCATTAGTGACATACTCAGTTTTATATTTATGATTCTTGTTTGGATATTAATTGCAGTATTAATGAGACCGAAGCGAGAGGCGATGATTTGGACTATTATTGAACCGATACAAAAAATTGCAAAAGGGGACTTTTCGGTAAAAATACGAAATGAAGAGAAATATGATGGGGAAATTGGTGTGCTCGTAAAAAGTATAAACGATATGACAGATGAACTGAATGCGATGGAGAAGATGCGTCAGGAATTTGTTTCGAATGTTTCTCATGAAATACAGTCACCATTAACTTCTATAAAAGGGTTTGCTAGAGCACTACAAGATACTAATCTTCCTGAGGAAAAAAGAAAGCATTATCTTACCATTATTGAAACAGAAACGACGAGATTATCTAAACTAAGTCAAAATTTACTGAAACTCACCCTATTAGAGTCGGAAGAATATACACCAGAAAGAGTTACTTATCGATTAGATCAACAGTTAAAGCAAATTGTGTTAAATAGTGAACCGCTTTGGGCTGAGAAAGAAATTGAATTAGACCTTGATTTAGAAAAAGTGCATATAACTGCTGACCAAGAAAGTATGAGTCAAGTTTGGATTAATTTAATTCATAATAGTATTAAATTTACTCCAAGTAGCGGTACGATTTCAATCAAGCTAAAAGAATATGAGACATTAGTAGAAGTACGTATACGTGATACGGGAAGTGGGATATCCGAAGAACAGAAGCAACATATTTTTGAGCGTTTTTATAAAGCAGACTCTTCACGAAATCGTGCTTATGGAGGAAGTGGTTTAGGTTTAGCGATTGTGAAAAAAGTACTCGATCTTCATCAGGGGGAAATAAAAGTTGAGAGTGAGGAAGGGAATGGGACGGAATGTATTGTTTGTATTCCAAATTATGAAGAGAAATAGTGTTAGGAGGGAATCCTTCTAACACTATTTCTCTTTAAAAATACATTTCCCATTACTGCAGCTATACTGATAAGCTTTTCCTTCGCTATTCATACGGTATGAATAATCAGATTCTTTATCTTTTATAAAGTCAACGTATGCTTCTGCACCGTTTTTATCATCATCTATATCAATGAAATGAACGTGTCGTATAGAATAATCCCTTTTTTCACTTAAACCTCTTTCTTGTAAGTTTGTATGAATCCCTTGTATTAGTTGATCGAACAGTGACCAATTTAAATTAAGATGCTCAAATGATTCAGTATGTCTTCCTAAAATGCCATTGTCTTGTATTATTTTTTTATTATTATCGTATGTATAAGAGTATGTAAAATAAGGTTCGTCTTTATATACGACTTCTGCATAATAGCCGATATTATAAAGGGGAGTATATTTTCCGGCTATACTTTGTATTTCTTTTTGCTTATATCCTTTTATAGTATGGAGATATTCGTTAGTATCTTTTTCTATTACTTTATAATGTAATGGATTACCAAATATAAAGTACATAGCCAAAAATATGCTAAATAGTCCGACTGCAGATAGTGACAAGTACCATTTTTTTCTTTTCATACACAAACACTCTCCTATGTGGAATTTATTTCTATTTTACATGAATTATGGAAAAACATGAGAGTTATAAATAAAAACTTTCTATAGTTACCTACAAGTAACCTACGCACATGAAAGTGCATCATTGCCTTTTTACATAAACATAGATACAATTTTAATATAATACATAACTGAGATGATTAAGGAGTGTTATACTTGGCAGAATTATTACAAGGCAAAAATGCTTTAATTACAGGAGCAGGTAGAGGGATTGGTCGCGCTGTAGCGATCGCATTAGCGAAAGAGGGCGTAAATGTAGGGCTTTTAGCTCGCTCAGAAGAAAACTTAAAAGCTGTAGCGAAAGAAGTAGAAGCAGAAGGCGTAAAAGCTGTTATTGCAACTGCTGATGTTTCTTCATACGAAGAAGTGACTACTGCAATTGAGACATTAAAAAACGGTTTAGGATCTATCGATATTTTAATTAATAACGCTGGTATTTCTAAGTTCGGTAAGTTTTTAGAATTAGACGTTGCTGATTGGGAAAAAATCATTCAAGTAAACTTAATGGGTGTATACTATGCAACTCGTGCAGCGTTACCAAGCATGATTGAACAACAATCTGGTGATATCATTAACATTTCATCTACAGCAGGACAAAAAGGTGCACCTGTAACAAGTGCATATAGTGCTTCTAAATTTGGTGTTCTTGGCTTAACAGAATCGTTAGCGATGGAAGTTCGTAAACATAACATTCGCGTAACTGCTTTAACTCCAAGTACAGTAGCAACTGATATGGCTGTAGATTTAGGACTAACTGATGGAAATCCTGATAAAGTTATGCAAGCAGAAGATATTGCAGAGTTTATCGTAGCGCAGCTGAAATTAAATAAACGTACATTTATTAAATCAGCAGGACTTTGGTCTACTAATCCGTAAGGGATACATGTATAAACAAAAGAAGGGACATCTATTTTGTAATGAAGTAGATGTCCCTTCTTTATTTTTTGTATATGAGACAGAATTTTCGGTATAATTGAAAGCGAATAGTAGAAATGCATTGGAAAATTGAAGGGGATGGTATTTACATGAGTACGATTGAGAAATGGACGGCTGTTGATCAATATGTGAGTGATGTATTAATACCGAAAGATTCTACATTTTCGTAAAAGAATAACGAAAGGAGATAAATAGAATGAAAAAGATGTTTGAAAAATTATAACTTGTATCGTATATAACGCAGTTAGCTCGTGGACCTCCTATATACATATCACTATATTTTATATAAAAAATTGGAGGTTGTGAGTAGATGAGAACGGAAAAAGAAATGATAGACTTAATTATGAATACAGCAAAAGAGGATGAAAGAATCCGAGCGGTTATTATGAACGGATCACGTGTAAATCCGAATGTAAAAAAAGATTGTTTTCAAGACTTTGATATTATTTACGCTGTAAAAGATATACGATCTTTTACGTCTAATCATAATTGGATTCATAGATTTGGAGAAATAATGATTGTACAAATGCCGGAAGAAATGTCATTAATTCCAGCAGATGAAGACGGGAAGTTTCCGTATTTAATGCAGTTCATGGATGGAAATCGGATTGATTTAACACTAGCCCCAGTTGAGTTAATAAATAATTTCGTTAGACAAGATAGTTTAAGTAAATTACTTCTTGATAAAGATAATTGTATGGAAGGATTCCCGCCAGCAAGCGATAAGGATTACTTAATAAAAAAGCCTACAGAAAAAGAGTTTTTGGATTGCTGTAATGAATTTTGGTGGTGTAGTACGAATGTGGCAAAAGGGTTATGGCGAGAGGAACTTTCTTATGTGAAAGGGATGCTTGATGGCCCAGTGCGAGATATGTTAATTGTAATGCTAGAATGGCATATTGGTATGAAAACAGACTTTATAGTTAATGCAGGGAAGTTTGGAAAGCATTTCGAGAAATATATTGAAAAAGATATGTGGGTGCAATTTAAGAGGACATTTTCTAATGCAGAATATGAAAACATATGGGAATCATTCTTTGACATGGGTAATTTATTTAGGGAAGTGGCGAACGAAATTGCTAACGCTTATGGATATCCGTACCCGCAAGGTGATGATGACAGAGTGACAAGTTATTTAAAACATGTGAAAGCTTTACCGAAAGATAGTACATCAATTTATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP012730|1838276:1847009|1844263_1844851_-|WP_000823558.1|DBSCAN-SWA MKRKKWYLSLSAVGLFSIFLAMYFIFGNPLHYKVIEKDTNEYLHTIKGYKQKEIQSIAGKYTPLYNIGYYAEVVYKDEPYFTYSYTYDNNKKIIQDNGILGRHTESFEHLNLNWSLFDQLIQGIHTNLQERGLSEKRDYSIRHVHFIDIDDDKNGAEAYVDFIKDKESDYSYRMNSEGKAYQYSCSNGKCIFKEK >NZ_CP012730|1838276:1847009|1839637_1840402_-|WP_001194297.1|DBSCAN-SWA MQTNIHSEKETIIFIHGLVGNRRAFKKEHKRFSTSYNIITYDLLGHGDDKGEAIEFSLQRLVDQLLNLYEKEGIQKAHICALSYGCYISTIFAQMHPEKVLSICHIGGHYNNPSLLYSVFQKFWEKRGDDYSKWLSQYANTIFPSGILKANPFAVISRNIYYRFGLQLHSSIIAQSLRHRLEFDLKSKLKSLPHPILWVMGEHDHLYKSCLFDLKSILPNVLYKEIPLAGHAANLFRPNYFHDLYDRFLNGKLK >NZ_CP012730|1838276:1847009|1845882_1845996_+|WP_003158174.1|DBSCAN-SWA MHWKIEGDGIYMSTIEKWTAVDQYVSDVLIPKDSTFS >NZ_CP012730|1838276:1847009|1843165_1844239_+|WP_001231513.1|DBSCAN-SWA MRKRGRMSKFKMLKVTGAIIALFSFLTIIWSTAFYVSSSILDALAIHLSPFVTYLISDILSFIFMILVWILIAVLMRPKREAMIWTIIEPIQKIAKGDFSVKIRNEEKYDGEIGVLVKSINDMTDELNAMEKMRQEFVSNVSHEIQSPLTSIKGFARALQDTNLPEEKRKHYLTIIETETTRLSKLSQNLLKLTLLESEEYTPERVTYRLDQQLKQIVLNSEPLWAEKEIELDLDLEKVHITADQESMSQVWINLIHNSIKFTPSSGTISIKLKEYETLVEVRIRDTGSGISEEQKQHIFERFYKADSSRNRAYGGSGLGLAIVKKVLDLHQGEIKVESEEGNGTECIVCIPNYEEK >NZ_CP012730|1838276:1847009|1845046_1845766_+|WP_000818985.1|DBSCAN-SWA MAELLQGKNALITGAGRGIGRAVAIALAKEGVNVGLLARSEENLKAVAKEVEAEGVKAVIATADVSSYEEVTTAIETLKNGLGSIDILINNAGISKFGKFLELDVADWEKIIQVNLMGVYYATRAALPSMIEQQSGDIINISSTAGQKGAPVTSAYSASKFGVLGLTESLAMEVRKHNIRVTALTPSTVATDMAVDLGLTDGNPDKVMQAEDIAEFIVAQLKLNKRTFIKSAGLWSTNP >NZ_CP012730|1838276:1847009|1838276_1839539_+|WP_000755532.1|DBSCAN-SWA MKKVIAGLAAASVVGVAVPGMDSAQAQVSNEALKEINGQAQTQTTVTETKTVETKSDLKYTVTADVLNVRSGAGTGHSVISKVKQGQVLQVIGQENGWFKVTVNGQTGYVSGDFVTTGGKTGTTVQQGTGTYTVNVSSLNVRTGPSTSHTVLGSVNKGKTVQVVSEVQDWFKINFNGGTGYVSKDFVTKGGSAVSNQTQQPTTNNNTTTVQTGGSYVVNTGALKVRTGPATYNAVIGGVTNGTVLNVTGAENGWYKINHNGRTGHVSADFVKFVKGGVNNVTNNVQQPVKDVQKPTTGGNTSSIAGFARSLNGSPYRTAGTTPAGFDCSGFIHYVLNQTGHKGARQTVAGYWSSKTKTSNPQPGDLVYFQNTYKSGPSHMGVYLGNGQFISAETDATGVRISSVSNSYWSKHLLGYTKAY >NZ_CP012730|1838276:1847009|1846136_1847009_+|WP_001258491.1|DBSCAN-SWA MRTEKEMIDLIMNTAKEDERIRAVIMNGSRVNPNVKKDCFQDFDIIYAVKDIRSFTSNHNWIHRFGEIMIVQMPEEMSLIPADEDGKFPYLMQFMDGNRIDLTLAPVELINNFVRQDSLSKLLLDKDNCMEGFPPASDKDYLIKKPTEKEFLDCCNEFWWCSTNVAKGLWREELSYVKGMLDGPVRDMLIVMLEWHIGMKTDFIVNAGKFGKHFEKYIEKDMWVQFKRTFSNAEYENIWESFFDMGNLFREVANEIANAYGYPYPQGDDDRVTSYLKHVKALPKDSTSIY >NZ_CP012730|1838276:1847009|1842482_1843169_+|WP_014654523.1|DBSCAN-SWA MVSLIPNILIVDDDPHIRELVSVFLECEGFQTYEAIDGLDALQKINQVKVDMVILDIMMPNMDGFDVCFELRKYYDIPILILTAKGETSQKVKGFHLGTDDYLVKPFDPIELVVRVKALLKRYQITVSQSIQVGTVLLNRKTFEVTIGEQTVTLPLKEFELLFTLGSKAGRTCSREQLIEDVWGYDFEGNERTLDVHINRLREKFQEEKSKFSIKTIRGLGYRLEVSK |
8 | Bacillus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
2156145 : 2163269
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP012730|2156145:2163269|DBSCAN-SWA ATTACTTTTTAAAAATTTCTCTTGAGATACTGTCCTTAGCGTGTATACCACCTTGATGTTCATCAGGGTATTTAGCTGGGTGCATATTCCACCATTCATGTTCTCCGCCATGTGCATTTTCAATAAAATGATGTGCATCAAATGGCTTATCAATTCTCCGTGATACTTTACCTCTTCTAGAAATAACTTCCTCCGTATATGTAGGCCATGTTTGGCCTGTTTCTTTTTCCCATTCAGCTATCAGCTTATTTTTTATAGTATTGAACTCAGCCCTTCTTTGATCTACTTCTTCCTTGCTTAATCGTTCATAAGCATTCTTTTCTAAAGCTTCCTGAAGCAATTCTCTTTGATTTTCAGGGATTTTTCTGTTTGTTATTTCTTCTACTTGGCTAAGATATTCTTGGAATCTAGGTGTATTTAAATTACCAGGGTCAGCAAACATAAATGTATTACGTGCATCTTCTAAAGAATTAAAAGAAGTTTTTGGAATATCTCTAAACTCACTAACGCTAGCATATGCAAAGCGATCTCCCATTTGCAATTTATTCGTAAAATGCGAAATACCTTCTGAGAATTTTGCTACACTCGCACCCTTTGCGAGTGTAGTGACTTTGCTTATTCCTTTATCACCAATAAGTCCTAAACCAACTTGAGTTAAAGCATAACTTCCCCATTTTGCACGACTTTCTGCGTCACCATTTATTACATCATTAATAAATGAATCTGACAATACATTATACATGGTACTAAGGGTATCAATAGGGTGCAGGGCGGCATTCCCCATGTTTTCCCACGTCTCCCATTTACCAAGTGCCTTAAAGCCTTCTACTGTATCTTCAACAGCTTGTCCCGTACCTTCTACAATACCGTCCCACACCTTTTTTATTGTAGATTTTTCAGGGGGTTTACCACACATTGCACCTTCTTCCATTGTAACATCTTGATTATCTGCATTGCGGAATTTTTCAGCAATCCGTTTCAAGTCTTCTTCTACTTTTACAAGTGAATTAATAGATGTAAAAGCTTTTGGTCTCGCATCATTGAACATTTGAATGAACTGTTGATTAGAGGCACCAATCCATTGAAAACACAATTGATCTATTTCGTTACATAAATTATTATGTATAGATTCTAATGCGATTCTGGTATTATTTGCACGATTAGCCACTTCTTCTAGCATTTCAGGTGTTACTTTGATTTGAACCATTTTTTTCCTCCCTTTCCCAATTAAAATTATGAGATAAAAAGAAAAAAATGTAAACATGGAAATTTTAGATTAGTATAATAATATTTATGTGAAGTAAAATCTGTTTAATTATAAATAAACCCTATGTGTACGTGAAGTAAAAAGAGCCGCCCTGTTGGGCAGCTTTTTTAATATCTATCAATTATTTTCTTTTAATACCTATGAATAATGAATCATAGCCTTTTGTTTGAGGACTTGTGCCTAACTCGATTTGGTATTTCCCTTTATCTAAGTAAGTGTGATAATCTCGCCCTCTTGCTTTTTGGGAAGGCATTGCTATAACATCATTAATTTCTTTATCTAGATTAAGATCTGAATTTATTAAAGTAATCCAACTTTTTGCTAATTCAACAGTTGCGTTATCAATTATAAACATAATATAGAAATCATGTTCATTTTCACCTTGTACAAAGAACTGTCCTTGTCCTAAATCATAAACCCTTCCCAAATTAGGGTTAGAAGTACGTAACTGTACACTTTCAGGAAGGCCCATACTACTGACAGATGCGCTTTCGTATTTATAATCTTCATTATATTTCTTGTTTATCTTTGTAATTAGATTTTGCGCTTCATTAGATACAGATTTTTTTAGCACCGGTGAAGCATTTTTCCAATTGTTACTGTTGTAATAAAAATCATTTGTAATCATAGAGCTAGGGATACCGAAAGGTGTTAATTCAGGTTTAACTTCTACTGTATTCATTGCATTATATAGAAATTGTGCATACTGCTCACGAGTTACAATATTTTTAGGTTCAAATAGATTATCTCCTGTGCCAGCAGCAATTTTATTTTCTTGTAATGCACTAATAGCATTTGTCGCCCAGTAATTTTTATCTACATCTTTGAAAGTGGTAGTAGATGTCGCTTTGAAGTTAAAAGCCTTTGTTAATACAACAGCTAATTGTTCACGTGTTAAAACATTATCTGGACCAAATTTTCCATCGCCAAAACCGTTCATAATACCTGCTTTACTAAGACTTAAAATTTCTTTTTCAAACATATGTCCTTTGACATCAGTGAAAGGATTTGGTGCATTATGTTCATCTGCTGGTTTCAAGTAGGCATATATCAGTCTAGCTACTTGTCCTCGTGTGATATTATCCCCAAAACCAAACATTCCGTTTCCATAGCCAGCCACAATATTTTTCTCTTTTAAACCCATAATTGCATTATAAGACCAATGATCTGAAGGAACATCGCGAAATCCAGTCTCAGCTTGTGCGTTTGTTAAAGAGGTAAACGTTGATGTAGCAAGAACAGCGCCTGCTAAAATAATTTGTTTGAATTTCATTAGTGAGCTCCTTTTAATTAATTTTTTACAAATTAATTACTTATTTTATTAGTAAATTTAAATATAATAATTAATAGTATATTTGTGTTTGTAAATTAAATCAATATTTAGTTGTAAATGGATATTGAGATAGATGTTATAATTTAAAATAAAGAGATGTAGCGATGTAGCGATGTAGCGATGTAAAGGAGAGGGACAATATGAAACAAAAGATTTCAAATGTCACAGGAGAAATAATTTTATCTTATAAAGAAAATGGCTATCAAGTAGTACTAGATGAATTTAAACATGCAAAATGTATTAATATTGTGACTTATAATATTAATACATATGAATCTAATTCGGTACTAATCAAAGAACTTAGAAAGTTGAATAAAACTACAAAGATAAACATTATCTTGAATATTCCAAACGGTAGTTACGTGAAAAATTTCAAAAATAGGATAGACCAAAAAGAGTTTGATAAGGTTAAATGGAAAATTAAAAACGCTTTGAGTGTTTTGGAACAAGAGAAATTCGGAAATTTAGAAGTGTATATCAATCTTGAGAATCACGCAAAATTAATTATGACTGATCACATCGCCTATATTGGTTCACAGAATTTTTCTGATGCTAGTGAAGGTAATTTTGAATTAGGTTTTTTAGTAAAAGATTCAAAAGTAATCAGAGACATTGAGAGAAATATTTTTGCAGAAATTAAGAACAAATCAATATACTGTATCATTTCTGAATATAGGGCTACAATGGAAGAGATATCTGTAAAATTGGCAAATAAGTTACAAAATATTCGAGAAGATATTTTAACATGGGTTGGAGATCCACCTTTTACTTTTAGGCAAGAGGTCTTTTTTATTGATGACGCATATTTTCATAAAGAAAGATGGGAAGAATTTAAGGAGTTTCACTCTGAATTTGAAGTTATAACCGAAAAACTAATAGATGAGTATCCTTCTGAATTTAATAAAGAAAGCGCAAGGGAAACAGTAAAACATTTAAGAAAACTAGTAAAGCTACTTGTTTCTGAATTGGACGAACTGGCTAAATTTAAAACAAATCAAGAAGAGAGTATGATGTGGGATAAGTTTCATCAACTTGATGTGGGTGAAAATATGGAAGAAGCTTTAGAAGACGCCCGATATTATGTAGAAAATTATAAAGAAAAGAATTACCGAGAAATAGAGTATAAAGGGAAAGAGTTAATTAAAACATTTGATTATATAAAAGAATCTATTCAAGATATTGAAACAATTGTTGATGAAATAAAGGATTCTATGATTAGAAAAGCTCTCAATCAAAATATAGAGAGAATCTTACAAGATATAAAAAAACAATAACAAAAAACGACTGTAAAAACGGTCGTTTTTTTTATGACTTCATCATATGAATGAGCGCTTCACCATCAATGAGCTCAATATTTTTGTTCGCAGCATATTGCCTTGCGTTCTTATTGAAATTACTCAGTGTAACGAAATATCCTCCAACTGCATCACCATCAATAATAGCACTATGTAATTTTTGAATGTATGGCCTTCCGATAGATTCTTTTGTATATCTTTTCACTTCAACAAATTTCACTTCATCGTCTTTCCAAAGGATAATGTCTTTTCCACCATCATTAGAGCCAGGGGTAACTTGTGCTCGATACCCAAGAGAATAAAACAAATCAGCAATTAAGTATTCAAATTTTCGTGGATCCATTTTCTCTAGATATTCACGATTAGCCTGCTCTCTTAAGTGGTTCATACGAATTTCCTCTTCTGAAACTTGTGGTGCTTTAAGGATAATTCCTAATGCAAAAACGACGACCAATGAAAGAATAGCCCAAATCATACAATTCACCTCAGTATGAGTATAACCAGCTTATGGCTATTCTATTTCCTCTTCAATCCAAATGTCTTCTACAGATAAATCAAGTGTTTTTGCAATGCGCATTGCAACTCTCAATGTTGGTTCACTTTTTCCTCTTGCTATTAAGCTAAGTGTTTGGTCTGTAATACCTACGATTTTAGCGATATCGGATTGCTTTATCATTCTCTCAGCCAAGATTACTTTTAATTTGCATTTCATAAATTTATCACCGTCCTAGTTTTATTGTTCAATTTAAATTTTAAAAAACCTTTTTGATTTTTTATGGTGGACAAACAAGATTTTTAATTTTAGGTCATATACCTATATCAAGACCACGAGGAATACCAAGTGGAATCAAGGACAACAAGAGGGGAGAGGGCGCGCATGCGTTGGCAATATTCACATTTAAACGAAACGCCTTACCTGTATCCATCGAAGGAATTAAGAAAAATGTATAGAGATTCTAATGGTAAAAAAGAAACAAATGCGATAGTGGACCACATGGAAAGATATGAGGTTTTTAACAATCGTGAATATAAAGGCTATTACCGTTTATCGAACGATATTATGGATGATTTATATGAAGATGAGGACGAAGTGCTTGATTGGGGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP012730|2156145:2163269|2161215_2161398_+|WP_000156980.1|DBSCAN-SWA MTIVGEAVIVWTATGLSVITMKVAEKMGLSVPHWLPRMTMYTTLTGSFLYLLRYVLFAFL >NZ_CP012730|2156145:2163269|2158884_2160018_+|WP_000810464.1|DBSCAN-SWA MKQKISNVTGEIILSYKENGYQVVLDEFKHAKCINIVTYNINTYESNSVLIKELRKLNKTTKINIILNIPNGSYVKNFKNRIDQKEFDKVKWKIKNALSVLEQEKFGNLEVYINLENHAKLIMTDHIAYIGSQNFSDASEGNFELGFLVKDSKVIRDIERNIFAEIKNKSIYCIISEYRATMEEISVKLANKLQNIREDILTWVGDPPFTFRQEVFFIDDAYFHKERWEEFKEFHSEFEVITEKLIDEYPSEFNKESARETVKHLRKLVKLLVSELDELAKFKTNQEESMMWDKFHQLDVGENMEEALEDARYYVENYKEKNYREIEYKGKELIKTFDYIKESIQDIETIVDEIKDSMIRKALNQNIERILQDIKKQ >NZ_CP012730|2156145:2163269|2160916_2161219_+|WP_001267637.1|DBSCAN-SWA MRWQYSHLNETPYLYPSKELRKMYRDSNGKKETNAIVDHMERYEVFNNREYKGYYRLSNDIMDDLYEDEDEVLDWGDVINEYQPVMTPKGLQLIRKEGFK >NZ_CP012730|2156145:2163269|2162684_2163269_+|WP_009879021.1|DBSCAN-SWA MAILATIRKLQFATRRHLMSVHNMGGIRNANRILGDLKPYVNKTMQGKEYVYYLNKEGHAMFGDDGKVVSRGKLAHALLRNEAWLHLFCPDDWQIETDIRYIKNKEKMKIVPDVKFRDEENILHAVEVDRSQKMKVNEEKIKKYEEFTQIYKQKHNGKMPVIHFFTVTKYREKKLEELAAKYDVLASVYVIEEI >NZ_CP012730|2156145:2163269|2160550_2160751_-|WP_000649834.1|DBSCAN-SWA MKCKLKVILAERMIKQSDIAKIVGITDQTLSLIARGKSEPTLRVAMRIAKTLDLSVEDIWIEEEIE >NZ_CP012730|2156145:2163269|2160049_2160514_-|WP_000637733.1|DBSCAN-SWA MIWAILSLVVVFALGIILKAPQVSEEEIRMNHLREQANREYLEKMDPRKFEYLIADLFYSLGYRAQVTPGSNDGGKDIILWKDDEVKFVEVKRYTKESIGRPYIQKLHSAIIDGDAVGGYFVTLSNFNKNARQYAANKNIELIDGEALIHMMKS >NZ_CP012730|2156145:2163269|2156145_2157351_-|WP_000249923.1|DBSCAN-SWA MVQIKVTPEMLEEVANRANNTRIALESIHNNLCNEIDQLCFQWIGASNQQFIQMFNDARPKAFTSINSLVKVEEDLKRIAEKFRNADNQDVTMEEGAMCGKPPEKSTIKKVWDGIVEGTGQAVEDTVEGFKALGKWETWENMGNAALHPIDTLSTMYNVLSDSFINDVINGDAESRAKWGSYALTQVGLGLIGDKGISKVTTLAKGASVAKFSEGISHFTNKLQMGDRFAYASVSEFRDIPKTSFNSLEDARNTFMFADPGNLNTPRFQEYLSQVEEITNRKIPENQRELLQEALEKNAYERLSKEEVDQRRAEFNTIKNKLIAEWEKETGQTWPTYTEEVISRRGKVSRRIDKPFDAHHFIENAHGGEHEWWNMHPAKYPDEHQGGIHAKDSISREIFKK >NZ_CP012730|2156145:2163269|2157532_2158684_-|WP_000669607.1|DBSCAN-SWA MKFKQIILAGAVLATSTFTSLTNAQAETGFRDVPSDHWSYNAIMGLKEKNIVAGYGNGMFGFGDNITRGQVARLIYAYLKPADEHNAPNPFTDVKGHMFEKEILSLSKAGIMNGFGDGKFGPDNVLTREQLAVVLTKAFNFKATSTTTFKDVDKNYWATNAISALQENKIAAGTGDNLFEPKNIVTREQYAQFLYNAMNTVEVKPELTPFGIPSSMITNDFYYNSNNWKNASPVLKKSVSNEAQNLITKINKKYNEDYKYESASVSSMGLPESVQLRTSNPNLGRVYDLGQGQFFVQGENEHDFYIMFIIDNATVELAKSWITLINSDLNLDKEINDVIAMPSQKARGRDYHTYLDKGKYQIELGTSPQTKGYDSLFIGIKRK >NZ_CP012730|2156145:2163269|2161516_2162707_+|WP_000571537.1|DBSCAN-SWA MIELLLVPAAGLTVALFGEKFKSKNDDKRKIQVFFEVAGIAIKRNNEEKLQYPKFQKQIDDDRSTTYVYTLPLGMPSKIIQKVEDVVSEGLNKPVRIQYDNYKLNIRVFRREIPKNWSWSMDLVTKGKWCIPVGQSLETIVYHDFDETPHMAVGGLIRMGKTVFLKNMFASLSLANPDHAHFYLIDLKEEGLEFSEYKKLKQVEQIAETSEQAHGMLLKVMEKMHERGKYMKERGIKNIVHTKEKDRYFIVVDEGAVLAPAKGLPRAHNKMLEECQYMLSHIARVGGALGFRIVFCTQYPTGDTLPRVVKQMANAKLGFRLPTRTASEVVIDQSGLEQLPSIPGRAIYMKERFTVLQVPYIDDVVMWKHLKEYEVEKYEHPEPYENQPSDGDTCDD |
9 | Bacillus_phage(71.43%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
3432921 : 3483685
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP012730|3432921:3483685|DBSCAN-SWA 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53 | Bacillus_phage(33.33%) | tail,portal,holin,capsid,terminase,head,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
3496023 : 3507577
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP012730|3496023:3507577|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP012730|3496023:3507577|3503767_3504034_-|WP_000483549.1|DBSCAN-SWA MFNVQVDENVVKELCVEEIQKKVKEYDAELAFWDTKELKKRVCMSWNTIQDQFFFDPRFPKFKVGKKWYFPAKQVQAFLVEWAEERMD >NZ_CP012730|3496023:3507577|3500858_3501617_-|WP_000067428.1|DBSCAN-SWA MSNLLIHEEPLLVLPGLASRIGLNEAIFLQQIHYWLNRSKHFYDERNWVYNSVAEWVKQFPFWSENTIRRIVKNLEDEQLLVIGNYNRAKFDKTKWYSINYEKLRLLESTNDVPNLGRRSTQNGQMDVPNLGKPIPETNTETTSEIKEYIVEIVNYLNDVCGSSYRLTSKKTQTLIKTRLVEGFTVDNFKTVIDTKAKEWLRTEQAKYLRPETLFGTKFEGYLQQGKVEGKHGSSKGNRYSKDPFEEDDLPF >NZ_CP012730|3496023:3507577|3506947_3507577_+|WP_003171984.1|integrase|DBSCAN-SWA MRSEDIPLFLKTSYQYNYIYYIFFKALLNTGMRKGEAAALQWKDINLKEHTIIISKTLDFTAKTKEELFGDTKTFTSKRTIMIPKSLVDELLAHKKWQNANKLVLQDAYEHELDLVFSRVDGKFLPKSTLFNAFSRILKKANLPRLEIHSLRHTHAVLLLESGASMKYIQDRLGHKSIEITSNVYSHISDKINKDSISGFEAYMNNVLG >NZ_CP012730|3496023:3507577|3498486_3499059_-|WP_000615365.1|DBSCAN-SWA MIQLHTITSEEKKQNFDITELFEMQKELDKRIGYKGNDKMDMLFRALLVEISEAWNETRAFKMWSTGFGVPKNGLLEELIDGLHFLMNIVIELDKCTWRHELIPSFSMQSIMRKDTSNVNMLFEWYMQDVLTAKRAWCQYRDLTTTMGHLRRAFGIFFRICYLYGFTYEDVIDSYKEKNAENFERQENGY >NZ_CP012730|3496023:3507577|3505779_3506208_+|WP_000673782.1|DBSCAN-SWA MKFVIRDLVQQLCTKYNTTNPYELADYLKINVLTWDLHEEINGFYKYEKRNRFIVINNHLSPSMQRTVCAHELGHAILHTHANTPFLRKNTFFSVDKLEIEANTFAALLLIDKKTIQPGDTKACIAYKNDIPVELLEFYKPY >NZ_CP012730|3496023:3507577|3501613_3501886_-|WP_000849734.1|DBSCAN-SWA MKTIVRDGSMPIALNRSLGTRYLRDKRLSELLKRCRRLENEGFDYLFPIRKVLETIKHRNDENPHLFKGCLVMDRDRGFYYEVVMRKVKR >NZ_CP012730|3496023:3507577|3503064_3503328_-|WP_000897921.1|DBSCAN-SWA MLFKRFCINKKKPMAVGSIKKQIQSQYITWGDYVEETIENQLLQKQVEKAVSSLKLISAKEADICRKLDIDYVITVLTNKPYGSMPF >NZ_CP012730|3496023:3507577|3496702_3497461_-|WP_000382673.1|DBSCAN-SWA MDVKLLAHTQLSEEFVNYLSVVFGIGDEGFDPTHGQVVALSAIRTCYSPNKPSRIVSLEGEKYFKGKATDGKGGKEVDRLIRHIVGSGHASTLEHLTYTFAVEGVSRALLAQLTRHRVGFSYSVQSQRYVRMGSNDKIGGFDYVVPETVKAKGEQVVNAYNEMMYKLQSGYDLLRTLGIPAEDARSVLPNAAATNLVLTVNLRGLLDFYNKRRKGKGAQAEIAELAEQLRQEVVKVEKWVDEFFWKWKVTEV >NZ_CP012730|3496023:3507577|3500092_3500923_-|WP_001229822.1|DBSCAN-SWA MALVKVTDIAKTLSKKMIFLSDTCEVCKKERKRTVRFMKINGEVVCPVCKLAEDNHKLEAEMNVFRDEKEQRKRKSMFYDKSLIKDETIKLARFSTFKSDCEEDEKNYTLAKRALEDYLDDVRFNLILVGKVGAGKSHLAYSIAHEMNENSAGTVLYVSVSELFDYISSTFNGQSEESEHSIVNLLISADLLVIDDLGAELGDMDAADPKATAFVNRVLFKVFDGRQGKKTIITTNLTGEAVMKAYDERITSRMFNTYRHIEFKYTRDKRKRKLPF >NZ_CP012730|3496023:3507577|3503299_3503617_-|WP_000510717.1|DBSCAN-SWA MGIENLVLPEDAELAKSLRNKKENYIKNQFLLTRIASKKNVEGKTKEFYEACKEYEACGEKAKECDKQLKELIFKKKENDRVQHVVERMREVGIKEDVIQKVLYK >NZ_CP012730|3496023:3507577|3506432_3506903_+|WP_003169928.1|integrase|DBSCAN-SWA MASFRKFGDVWEFRVRFKDPYTQKYKEKSKRGFKTKKEAQLAAAEEEKKLLNGLEVEITPTSLKHYLRDWLKLFKQDNVRKNTFILHERNIEKHIIPYFQNMNLKELKPMMYQKFINSLTDQGYSKRTVQIIHGTMNNAMKKAVSLKKSKTILVKK >NZ_CP012730|3496023:3507577|3505343_3505757_+|WP_000060654.1|DBSCAN-SWA MSLVNTIKNLCKNHDTSISALEKDLEFGNGTIRKWDKAYPSADRLQKVADHFNVTTDFLLGRTNQMHLTTKDEKDIEKRMEEIKRDLQGEDGLMFSGEPMSEEAVESLLDAMEYIVKQTKVINKKYVPKKYRSTDDN >NZ_CP012730|3496023:3507577|3499278_3499908_-|WP_000861089.1|DBSCAN-SWA MKTYTGFEAIERMKTNWIKEKNDFFAHTLKKGKHEVFGISSQRIVPSAIGMNFFFENEFVDYEKPLNLEYGEMFVMESSNGKWYGILKEETQTKYYLIMGLKVGEYRFYENGCSFKRYQGRTFRKATDEELEEFERFMVFYKKDRKMDEFKLGDICEREDVLYKVVVQTEDNKFEGVLGCVAINEKDTPVKYFPVKSMELQFCVEDMVG >NZ_CP012730|3496023:3507577|3499153_3499276_-|WP_000553935.1|DBSCAN-SWA MHQHIIDQLIDRGIYKSKDGLRDLFECSFEELVEMLEGEE >NZ_CP012730|3496023:3507577|3502567_3503050_-|WP_000780695.1|DBSCAN-SWA MKLYELTSNFNQLQQMIEDGVDPEVINDTLQSISEAIKDKVQGAALLIRNIEAQVEVIKGEENRLAERRKSFENSCKNIKDYLYHQMVAVNKKRIKGALITVGIQKNPASLDIAEDAIIPPEYMIPQNPKVDKKALLLAIKNGMKWDGISLKQGESVRIR >NZ_CP012730|3496023:3507577|3504142_3504871_-|WP_000572505.1|DBSCAN-SWA MIEQIMVVDEKEESFVKGDQESLVFIKDNKVVTDSLTVAEVLKKQHKHVLRDIKVQMEKLESAGEGEFTESNFGLSFYKDVTGRTLQKIDMTEDAFTILMFSYNTIETMKIKVRFIEEFKRMRAFIENQSILPTDTFSQIELLATGTSNLNKRVSSLEQVVEKQLTVDYGQQRVIEKTKAKRIYFLWENGHVDSEVHDSTRKLFGLLGRNLKDAFNVNSYRDILKKDFEEALNFINGWRPMI >NZ_CP012730|3496023:3507577|3497692_3498472_-|WP_000286272.1|DBSCAN-SWA MYRSKESGLKMLDLCSGIAGISMAADWAGIDTAAFCEIEEFNQKVLRKNYPNIPIFPDLYKLMKQSLIDGGVDVDSIGVISAGYPCQGESLVGKRRGAEDERWLWPEVFRLIKELRPTWFVGENVAGHVTMGLDTVLSDLEEENYSTRTFVFPAVSVGAPHQRYRTFIVGHSNDKSKLQTDPRVVPFRSKWETWENTTGINRGTLSGTYWEENKPAICGMDDGTATRLDEDRLRFLGNAVVPQQIYPIFEAIAKIEGLL >NZ_CP012730|3496023:3507577|3496023_3496308_-|WP_000520475.1|DBSCAN-SWA MGKSQRNKGMRREREFASLIGGARVPLSGAMDGYSNDVKGLGLEWEVKARKEGFKTLYNWLEDEREQPDALAIKADRKPWLVVMPLDTFLKMVK >NZ_CP012730|3496023:3507577|3504867_3505068_-|WP_000877760.1|DBSCAN-SWA MKYSSFGIEVRKVLLERDLTLTVLASELKISVSYLSDILKGSRKGKKQKKAIVELLGLDMCEEDLK >NZ_CP012730|3496023:3507577|3503606_3503792_-|WP_011053220.1|DBSCAN-SWA MGRGKDGLMMFTIDYNNVKVSDYLRLLAQYKLPNKKQRRLIENRFVCLNALFKKAGESSGN >NZ_CP012730|3496023:3507577|3501899_3502571_-|WP_001002737.1|DBSCAN-SWA MNEIKNYFAELASIDVSKHVEKKGRFSYLSWSWAVDQLLKKHPDATWQVVRFDGLPYMKTEVGYFVEVEVTVNNITRSQIHPVLDNYNKPIAKPTSFQINTSIQRCLAKAIALHGLGLYIYSGEDIPQDDEPKQAAKQLDNVPQQEQARQTEIANEQRIKAIHVQIRELSEVYNMPFEETKNTVKQSLGIQTFKGMTVQQASQLQKTITSWLNEAKEKQQQAQ |
21 | Bacillus_phage(66.67%) | integrase | attL 3490116:3490132|attR 3513912:3513928 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
3713982 : 3790171
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP012730|3713982:3790171|DBSCAN-SWA 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90 | Bacillus_phage(92.45%) | tRNA,tail,integrase,head,portal,capsid,terminase,holin,protease | attL 3747380:3747396|attR 3791962:3791978 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
4818779 : 4861013
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP012730|4818779:4861013|DBSCAN-SWA 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47 | Staphylococcus_phage(26.67%) | tRNA,integrase,portal,holin,capsid,terminase,head,protease | attL 4809156:4809171|attR 4863464:4863479 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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