Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012728 | Bacillus anthracis strain PR10-4 chromosome, complete genome | 5 crisprs | cas3,csa3,WYL,c2c9_V-U4,cas14k,DinG,DEDDh,cas14j | 0 | 1 | 10 | 0 |
1. NZ_CP012728
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012728_1 | 1064104-1064197 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012728_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012728_1
>1.1|1064129|44|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder GCGGTATAGGGAAATTACAAGATGGATCCGGAAAAGTAACAGAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012728_1
The CRISPR arrays of NZ_CP012728_1 >merge|NZ_CP012728|1|1064104-1064197|CRISPRCasFinder GGTTTAAATACGTTAAATAGCAAAAGCGGTATAGGGAAATTACAAGATGGATCCGGAAAAGTAACAGACGGTTTAAATACGTTAAATAGTAAAA >NZ_CP012728|1|1|1064104-1064197|CRISPRCasFinder GGTTTAAATACGTTAAATAGCAAAA GCGGTATAGGGAAATTACAAGATGGATCCGGAAAAGTAACAGAC GGTTTAAATACGTTAAATAGTAAAA
>NZ_CP012728.1|WP_000963385.1|1062587_1063160_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MAIDRKRSIIEAATKYFSAFGYKATTMDQVAKLANVGKGTIYTFFKNKEELFGEIISNLITEMKQVAENAIRSDVSFFENVHRALYSILEFRKEHQLMIKLIQEERDMGTKEVQEVMQQVDVEIVSVIQSYLKIAIDKGEISKCDPEITAFIMLRLYVSLIFDWEKNHEPLEKEKIAELFELYLLKGLSN >NZ_CP012728.1|WP_003170545.1|1060475_1062374_+|M56-family-metallopeptidase MIDMLINVYLPHFFDWLIETSLMASILVGFILCIKILFRNKLTPRWQYMLWIVLMIRLLLPWSPDSSYSIYSLLSYRSSVSEVIPKNMPSTESKMNIESDRKVELESHAETVTKSGKPEVNVSTEQQITLSLYKIAMYVWLVGVFLLAVITFITNRRLYSYIKKQPDITDEQVVTVFNRCKQSMKMKKAVSLRLAGKIASPTVFSFFRPKVLLSKKHMKVLNEQQLQYVFYHELAHIKRNDVAVNWIMYSLILLNWFNPILWYAYFCMREDQELACDAYALTFIDKEEQIAYGHTIITLLEHYSYQAPSLANLSRNKRTMKRRIVMIKKFQKKSYRLSLLGVIVIVAIASLSLFNVRATEGKEKQEDKVEQSKDAFQNAVDMLYGTEENAKKEYHYSARVYEEKTDYLYLAEKALTKDEFQQYIKLSKKIINIQKKGAPRDSDYESTVFREERLSKADRDKLYALYDQAKPFDDKVYESLNYTVKEAQQHVDFQIKKPTYTIEGYNLKDENVGYFIKRRPELIIELEYTNAKGNYTIYQSQVFGESKDPFSHQFVVPENIEQYELEGNQIFYATDHSDSNLQGMKMIVPAKGKNSAYQVVIINHSLERQGEAVFDKNVNKEELEKIMISMLK >NZ_CP012728.1|WP_000184500.1|1060071_1060470_+|BlaI/MecI/CopY-family-transcriptional-regulator MTNQLPKISEAELEIMKVLWLKSPQTANEIIEELEDPMDWKPKTIRTLINRLVQKEAVSYHQDKGRMYAYYPLVSQDNYLQVETKSLLKRFCGAAFKPLLVNFLKEEKLSSEDINELKRLLDEKTEENKRKD >NZ_CP012728.1|WP_000984150.1|1059002_1059842_-|hypothetical-protein MMRALRLNIKQAFCNRVSLIIMFSGFVLICIYHYYYVIRYLGDAASGPISTDIKWIGFRDNEMDVYLLLMPIIASLPFSTSYNSDKSDGFKQFVSKGINLFSYSITKYIVTFFCGGLLYTLPFILSLLFCKLTIPDGEMPAGSGIINVNGMFASLYEASPIIYITVYIEINFLFAGLMALLGLAASAWSQKDYMSLLFPFAATSIPYVLLNTVFPTIGGAPIHLYDPKQPLDGMSPYILTVQCAFFLFVSLLMYIRGVKRDRKKYRRRLQKRDRCRKTF >NZ_CP012728.1|WP_003170543.1|1058652_1059006_+|hypothetical-protein MQAQLNGKLMNQLAIFFSTIVMLQFIADVTGFTQNLDITYNLIHTAASYITFSLAVIFTLIGARRELSKYAIISLCLVVGIKAKGSLFYGDWLARRKRIVNKPLISKIVRKLEVYYT >NZ_CP012728.1|WP_000279249.1|1056134_1058501_+|endonuclease MAVKKLLSVFLSFILLLSFTGTLVQAEETTSMSVEKAIQVFKQQGKTKGTVEGYIVGYTQSPSKYTKDPAKFDDTNVAIADSPNETNPDKIMPVQLPKGDVRAAVNVKDHPENIGKKVSLTGTLELYFSSPGLKSVTAHKFQGEEQNRVSDVVASPNGGEVAKGTAVTLTTNTEGATIYYTLDGSNPTNKSVRYNGQIIVNENSVMKAIAEKEGLTSSPISTFSFVIVNNEPVRIHDIQGKSHLSPYNGKKVYNVEGVVTALDKNGFYIEDNQPDNDPATSEGMYVYKKDANVAVGDLIQVDGVVEEYVGPGYAERFETDLTTTEIKASRVAVIAKDQPLPAPIVLGENGVKIPDQIIDNDAFGLFDPNEDAIDFYESVEGMRVTMPTPKIIAPQKNGNLYVTVKNGGNKVVTKYGTPVLDENQLNPERLSVKVPRDYVAKVGDTFTGDIIGVVGYDYGSFRIAPITELPSVVDGGFKQIGANIQPRLDKLTVATYNIENFSANKKETTDEKVKALAYSIKYNLKMPDIIGVEEMQDNNGTVNDGTTDASLSAKRIIDAVLEIRGPKYEYVEIAPNNNLDGGAPGANIRVGFFYNPSRVKLATVPKLLDKNVVRIGDENPLFESTRKPLAAEFTFQGQNLVVVANHLNSKIGDATPFGKVQPLVLKSEEKRVQLAQEVNNFVQGIQKKNTNAPVVVLGDMNDFEFAKPLKTLEGTILKNMLNTVPKENRYTYIHEGNAQVLDHILVTNNIAPHTIVDPVHLNTNIMKEHGRVSDHDPVLAQIDLKKAS >NZ_CP012728.1|WP_000453710.1|1054541_1055894_-|DUF4026-domain-containing-protein MEVQTETYRAAMNGTLERHFSDMIAVIPTRITIEQLKQRLENIATKVDELKIVYSDETSLIVELHMDNKVIPYELHIDETDDPEEYKLYNRQDSTIVDRSFEDAAYGTEIFTRTLFVGDVLNCFFQQLQFLWNLAPDLLFVIDSSAAMKVISRNYIEYHVENELLPDIPDLYVIHSVYEDDKEGEPTQYWFHTHGLLRAGVTEIELIIPNRISSYYGIGDLFQTFANNAVENGQVPMNEPIVIAHSQQGSIHTVAVPWEKGLSYIGHKTSMDQLSSIEDEEVKLQPISAQNTFLGGMDDRDEYHQSPSVLLFKFDTSEEYIESFFKEHEEATGLMFYKTNSETARMAYNAKNTFGYFSNIFQIEQSNEEFRFLAKFGVSYEEGKSEHMWFEMQHITEEFIQGILINEPYFIEDMSEGNSYHLDFDDLTEWVIYAGDAVIKPNNLYMFIGE >NZ_CP012728.1|WP_001228080.1|1053080_1054502_+|protoporphyrinogen-oxidase MRKKVVIIGGGITGLTTMYHLQKDIRDKNLPIDTLLIEASGKLGGKIQTVRKDGFTIERGPDSFLARKESAARLVKELGLGDELVNNQAGQSFILVNNRLHKMPSGSMMGIPTQITPFLFSGLFSPIGKLRAGFDLLMPRSKPVSDQSLGHFFRHRLGNEVVENLIEPLLSGIYAGDIDEMSLMSTFPQMYQIEQKHRSISLGMRTLAPKAEKAEPKKGIFQTVKTGLESIVESLELKMHEGTIIKGTRIEKVAKQGDGYAITLSNGKEIEADAVVVASSHKVLPSMFAQYKQFRFFRNIPSTSVANVAMAFPKSAIQRDIDGTGFVVSRNSDYTITACTWTHKKWPHTTPEGKTLLRCYVGRPGDEAVVEQTEEELVQLVLEDLRKTMDITEDPEFTVVSRWKEAMPQYTVGHNERMKKLTTFMEKELPGIYLAGSSYAGSGLPDCIDQGEKAAKRVLSHLEKVMNTELIAQ >NZ_CP012728.1|WP_000726793.1|1052125_1053061_+|ferrochelatase MKKKIGLLVMAYGTPYKEEDIERYYTHIRRGRKPSPEMLEDLTERYRAIGGISPLATITLEQAKKLEKRLNEVQDEVEYHMYLGLKHIEPFIEDAVKEMHNDGIQDAIALVLAPHYSTFSVKSYVGRAQEEAEKLGNLTIHGIDSWYKEPKFIQYWVDAVKSIYSGMSDAEREKAVLIVSAHSLPEKIIAMGDPYPDQLNETADYIARGAEVANYAVGWQSAGNTPDPWIGPDVQDLTRELNEKYGYTSFVYAPVGFVAEHLEVLYDNDFECKVVTDEIGAKYYRPEMPNASDAFIDCLTDVVVKKKESVM >NZ_CP012728.1|WP_000252599.1|1051064_1052111_+|uroporphyrinogen-decarboxylase MVRTINETFLKACRGERTDYVPAWYMRQAGRSQPEYRKIKEKYSLFEITHNPELCAYVTKLPVDQYNVDAAILYKDIMSPLPAIGVDVEIKSGIGPVIDNPIRSLQDVEKLGEINPEDDVPYILDTIRLLTTEMLDVPLIGFSGAPFTLASYMIEGGPSRNYHNTKAFMYAEPKAWFALIDKLADMVITYLKAQINAGAKAVQIFDSWVGTVNVADYRVFIKPAMERIFAEVRTMGVPMIMHGVGAAHLVNEWHDLPLDVVGLDWRLPIEEARARGVHKAVQGNMDPSFLLAPWSVIEEHVKGILDQGMKQPGYIFNLGHGVFPEVNPDTLKRLTTFIHEYSKGQLAK >NZ_CP012728.1|WP_003158412.1|1066127_1066343_+|hypothetical-protein MMKGNLTYYFILNPLIIFLVYALSPILFHKEKYINMKDALGILVVYYVLISGYCLMDVVSERMKKDSKDKQ >NZ_CP012728.1|WP_000140275.1|1066379_1066685_+|DUF2087-domain-containing-protein MTESEMKFRDATIRNFFDKEDRLKSIPGQKKKKLVLLEHLISKLNAANQYTEKEMNTFIKQYHDDFCTIRREFIVHGFMDREANMYHINGREVWTKWEELK >NZ_CP012728.1|WP_001068232.1|1066711_1067065_-|PlcR-regulated-protein-PRP2 MNPILTTAKQLLHKEETILSTLNCSLTGYMITYNVPYPGMLLTTNRRLLFFSQYKNTLIAEFDYEKILSIETKRRIFDKKIIFYYEDEYITLGYITSSNIEEFIDLLRRKCKISTNS >NZ_CP012728.1|WP_000620028.1|1067198_1067702_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIRLAKETDAEAIMDIRKEIILSKTTTKFFIVSPKKLPNDTNAEREKIRKSNEKGNLYIVYEIDNKVVGFLLFNRYELDRLRHAGTMGIKEAYCNQGIGTKLIEFLIRWAKEQNGLEKICLGVVSVNDRAIKVYKRMGFVEEGRQRKQIKYEDGSYGDDVLMGFYID >NZ_CP012728.1|WP_000567010.1|1068991_1069120_-|YhfH-family-protein MIDQPMEFFRNLPTKTCAHCGKEIDEQHEAYHNKCDDCVHEE >NZ_CP012728.1|WP_000784654.1|1069299_1070034_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MKMTVVGFWGGFPEAGEATSGYLFEHDGFRLLVDCGSGVLAQLQKYITPSDIDAVVLSHYHHDHVADIGVLQYARLITSATKGQLPELPIYGHTFDENGFHSLTHEPHTKGIPYNPEETLQIGPFSISFLKTVHPVTCFAMRITAGNDIVVYSADSSYIPEFIPFTKDADLFICECNMYAHQEAAKAGHMNSTEVASIAKDANVKELLLTHLPHTGNPADLVTEAKQIFSGHITLAHSGYVWNS >NZ_CP012728.1|WP_000897260.1|1070043_1071033_+|lipoate--protein-ligase MLFIDNKGITDPRINLAIEEYCVKNLDINETYLLFYINEPSIIIGKNQNTVEEINADYVKEKGIHVVRRLSGGGAVYHDLGNLNFSFITKDDGDSFSNFKKFTEPVTKALGKLGVNAELSGRNDILAEGRKISGNAQFSTKGRMFSHGTLLFDSEIDHVVSALKVKMDKIQSKGIKSIRSRVANITEFLNEEMTTEEFRQLLLETIFEGETEIPTYELTEEDWKEIHKLSEERYRNWDWNYGKSPKFNLQHSHRFPVGQVDVRLEVKKGTVTECKIYGDFFGSLDVHDIEERLTGVQFDKDAFTTALEGVDIARYFGNITTEDFLHLFF >NZ_CP012728.1|WP_000832626.1|1071287_1071716_+|lipoprotein MKRVMYVVLLLSFVIGMTACNDETSSSRTLLSIGKPAKDNVIYFTHTDNKRKIQEIQDMFQNKKWKRNETFSTVNKTPDVVFSIDEDNTGLPALYVTVYFHEDGADVLNLYGEYTSFNKQELAMLREKMSAYYPKMIFGLVS >NZ_CP012728.1|WP_001055163.1|1071877_1073410_+|fatty-acid--CoA-ligase-family-protein MNLVQSLAETAKKKGDKPAYIFMDQSVSYDQLNKMVTRFSSNLAEMGIGKGDNVALVVGNSPHFLVGLYGTMKAGATVIPVNPIYTADEMHYILQNGDVKTIIVLDVLLPVIQSLTTRLPSLENIIICETSSDFNHTETEKMKTFTRMIGAGDLTYEGPELDEEDVAVILYTSGTTGKPKGAMLTHKNLYSNASDVASYLQYTADDRVVAALPMFHVFCLTVAVNAPIVNGATILMLPKFSPKEVFRICRTYEPTIFAGVPTMYNYLYLFEEASAEDVKTLRLCISGGASMPVALLQNFEKRFDVIVSEGYGLSEASPVTCFNPLDRPRKPGSIGTNIWHVENKIVNELGEEVPVGAVGELIVRGPNVMKGYYNAPEDTAATLKDGWLYTGDLAKMDEEGYFYIVDRKKDIVLVGGYNVYPREVEEVLYMHESVAEVVVIGVPDENLGEAVRAYVVLKQTNVTEEELMHYCTLHLAKYKVPKSIEFLTELPKNTTGKLLRRALREKAMQV >NZ_CP012728.1|WP_000435475.1|1073522_1073774_+|hypothetical-protein MEQKELRLRRVQYLICDIMDEMNAESEKNNLEILQQVIDHLSGAIGDLVDPSSTYSIDYLERKVHTAHYLLFKNERKAYLCRK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_CP012728_2 | 1176608-1176716 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012728_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012728_2
>2.1|1176633|59|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder GAGAATCCGTTAGCGATAGTCGCGGTTCCTTCTGCATGTGCTGCTTCGCCTAAAGCGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012728_2
The CRISPR arrays of NZ_CP012728_2 >merge|NZ_CP012728|2|1176608-1176716|CRISPRCasFinder TGTATGATTACCTTCCGCATGAGAAGAGAATCCGTTAGCGATAGTCGCGGTTCCTTCTGCATGTGCTGCTTCGCCTAAAGCGATTGTATGTTTACCTTCCGCATGAGAA >NZ_CP012728|2|2|1176608-1176716|CRISPRCasFinder TGTATGATTACCTTCCGCATGAGAA GAGAATCCGTTAGCGATAGTCGCGGTTCCTTCTGCATGTGCTGCTTCGCCTAAAGCGAT TGTATGTTTACCTTCCGCATGAGAA
>NZ_CP012728.1|WP_001079110.1|1175017_1175911_+|RluA-family-pseudouridine-synthase MNRFTLKWDIESAEEGTLVREFLKTKGISKAALTDIKFHGGAIEVNGQHASVRHQLQVGEELRIFFPVEERSEGMIAEDIPLCIVYEDDAVLVINKEANMSTIPSREHPSGSVANALLSHYDKQYLPSTVHIVTRLDRDTSGLMLIAKNRFVHHLLSKQHQQKAVKRTYEAIVHGEMVEREGTIDAPIGRKSDSIIERTVCEEGQRAVTHFRVIDSANHKTHVSLELDTGRTHQIRVHLAHIGHPLLGDNLYGGKRDEMKRQALHSTSLTFYHPILEKEMSFAAMIPSDMQEVLRQT >NZ_CP012728.1|WP_000673194.1|1174204_1175002_+|NAD-kinase MKFTIMSKGDQSSDTLASTMKEYLLDFGFIMDEQEPDIVISVGGDGTLLYAFHRYYNRLDETAFVGVHTGHLGFYADWLPTEVEKLVIAIAKTPFQVVEYPLLEVIIRYMNGSKESQYLAMNEATVKSAEGTLVTEVEIRGEYFETFRGDGLCISTPSGSTAYNKALGGAIIHPSIEAIQIAEMASINNRVFRTVGSPLVLPKHHTCVLKPTAGMNLQITVDHLTMVHQDVKSIQYRVANEKVRFVRFRPFPFWKRVRDSFVADK >NZ_CP012728.1|WP_001081482.1|1173547_1174186_+|GTP-pyrophosphokinase-family-protein MNRNWEEFLAPYHQAVAELKVKLKGMRTQFAMLTEHSPIEFVTGRVKSVASIIDKAEKRNVPLDRLREDMQDIAGLRMMCQFVDEIKPVVEYLRKRNDFEIVEERDYVTQKKDSGYRSYHVVISYPVQTIQGEQKVLVEIQIRTLAMNFWATIEHSLNYKYSGRFPEDIKIRLQRAAEAAFLLDEEMSSIRLEIQEAQKAFSRKQETKDSES >NZ_CP012728.1|WP_001180010.1|1173157_1173517_+|hypothetical-protein MQNKIQVKSVEKRENALIFCAENSEIEVKGLSARNHVLVDSDNLSFLYILENESSFIYVSIPHTCWEAMNNDVVMFVRVNDIEMELEGLKEEVEYLVENIEGNANYGEELVTAVEKVFL >NZ_CP012728.1|WP_000191105.1|1172432_1173011_-|CYTH-domain-containing-protein MTQEIEIEFKNIVTEEEFHALCKSFSIEVFTKQVNHYFETPNFSLKEAGSALRIRHKGETYTLTLKQPAEVGLLETHQVVTENEAKMMMETNVIISGAVMNQLCKLQIPVSALTYMGSLTTERAETLFEGGTLVFDHSFYYNHDDYEIEFEVQDEETGKAAFIHLLKQHNIPIRHTNNKVKRFFLAKQNKAR >NZ_CP012728.1|WP_000043389.1|1171853_1172252_-|hypothetical-protein MSKQPMTPFEAIGGEQCIEILVDTFYSYVSKHPDLSPIFPDDLTETARKQKQFLTQYLGGPNLYTEEHGHPMLRARHLPFEITPKRAEAWLSCMEQAMDDTGVHGHIREFVFERLALTAQHMVNTPNETGEI >NZ_CP012728.1|WP_000360662.1|1170960_1171854_-|DsbA-family-protein MDKQEAKHINMPSPSACEYKSVEAYLFIDPLCKDCWEIEPFIIKLWLEYGKYFSIRHIVTGKVDGTNASSHKWNKPANIRFVWEKTTSLHGFSYDGKVHMQEASSTPYLVSMAIKAAELQGRKAGSKFLRKLQEYIFLENVSNPDCELLLACAKDSDIDVEEFKKDLYSASAKKAFQCDLKFTNEMHITEIPSLVFFHANSDEEGIKIAGTYSYDVYVQLLKELVKCEIEPEPLPSLEVLLEATQFISSKEVAFIYDCSKQEIERELKKLQLKRKVQMIDVKCERYWKWIAKEKDLV >NZ_CP012728.1|WP_000003398.1|1168611_1170438_+|oligoendopeptidase-F MSEQNTAKTLPDRNEIEESSTWRLEDIFQTDTEWEKEFQAIKELLPKLTEFKGKLGDSANNLLEALQYEDEISMRLGKLYTYAHMRYDQDTTNSVYQALNDRATNLYSQVSSSTAYIVPEILSISEDTLQTFLKENRDLSVYEHALEEITRQRPHVLSEAEEALLAEASEVMSTSSNTFGMLNNADLKFPSIKGEDGEEVEITHGRYIQFLESDDRRVREDAFKAVYETYGKYKNTFASTLSGAVKRNNFNARVRKYDSARQAALSNNNIPEAVYDQLIESVNDNLHLLHRYIDIRKRALGLDELHMYDLYTPLVPEVKMNVKYEEAQDMLLKSLHVLGDEYVDILKEAYENRWVDVYENKGKRSGAYSSGAYGTNPYILMNWHDNVNNLFTLAHEFGHSVHSYYTRKTQPHVYGDYSIFVAEVASTCNEALLNDYLLKTTEDKKERLYLLNHYLEGFRGTVFRQTMFAEFEHIIHKKVQEGHAVTPDMLTEIYYDLNKKYFGDALVIDEEIGLEWSRIPHFYYNYYVYQYATGFSAATALSKQILEEGQPAVERYINEFLKAGSSDYPIEVLKKAGVDMASPEPVKEALQVFEEKLNELEALLFEEK >NZ_CP012728.1|WP_000612267.1|1167316_1168561_+|competence-protein MIPIFIAKRENGEKIHLLDHHDEELLHHMRKRESFFCIACGKEVLMRLGKQKRWHFAHKKVDSCLAFYEAESTYHMYGKELLYRWFKRQNVHVEIEHYLPEIQQRPDIFIERAGRKIAIEYQCANLSIEQLCKRTYSYWQAGIQVIWIIGGNQLKKHSAYWMKFSSIMAFSLQSYPQPLLIFFCSKQKSFMKCTFITSFSTSIAFSHIIYLPIETTTFEMLFSPVPFQREVLKREWKRRKDYFRQNALPILNYNHKSLLRLLYQCKCNPANFPSEIGVPLPSSFAFQTNSFIWQAFLYMKCIGELAVGDCISLKYVCGYIKKYTKRRMLPYFSQHIWKVAVTEYMTFLCYAGVLYKVGMYTYRKIRDAVPLKTGGEIIKHDEICLAHALSLFEAKFNMRGGKGDIIKTDREGIT >NZ_CP012728.1|WP_000799204.1|1165690_1167235_+|cardiolipin-synthase MKNTLKLIFFVLLLFALFVSLRMFIDVAFYSDVIGIKDVSILGIISILFTVSAFLIGCVIFLENRHPSKTLTWLIVLGIFPVFGFFAYLLFGQNFRRKRMFQKKALLDEQAFLQYKGHEDYEERILRNHKHQELLFRLADRLGALNISFQTETRTLTNGDETFQAILDGLKRAKHHIHMEYYIVRDDKLGTEIKDILIQKSKEGVVVRFLYDAVGSFKLSKSYIEELNDAGVEMIPFFPVRFPILNDKINYRNHRKIVIIDGNEGFVGGLNIGDEYLGKDKYFGFWRDTHLYLRGEAVQSLQLIFLQDWFYMTGEAVLAPEYLQAKAVEGEHWGGVQLVAGGPDNKWETIKHLYFAMIASARKSIWIATPYFIPDDDILSALKVAALAGIDVRLLMPSKPDKRTVFYASRSYFPELLDAGVKIYEYEKGFLHSKVVIVDSDLASIGTANMDMRSFHLNFEVNAFLYDTDSIRKLVQDFKDDLEESSEIHVDRFHKRRLHRRIVESTYRLLSPLL >NZ_CP012728.1|WP_000872719.1|1177487_1178228_-|bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase-PrpE MKYDIIGDIHGCLQEFQNLTEKLGYNWSSGLPVHPDQRKLAFVGDITDRGPHSLRMIEIVWELVIHKKVAYYAPGNHCNKLYRFFLGRNVTIAHGLETTVAEYEALPSHKQNMIKEKFITLYEQSPLYHILDEKRLLVCHAGIRQDYIGRQDKKVQTFVLYGDITGEKHADGSPVRRDWAKEYKGTTWIVYGHTPVKEPRFVNHTVNIDTGAVFGGRLTALRYPEMETVSVPSSLPFVPEKFRPIS >NZ_CP012728.1|WP_000427734.1|1179604_1180540_-|glycosyltransferase-family-2-protein MENIKNVPLVSILIPTYNRPHYFKIALESALAQTYSNIEIIVGDDSTNNETEKLIYRDYLHKHKHITYIRNPSTLGQFHNALMLLEQSNGEYINFLMDDDIFYNNKIEKMMFYFQKDLDQNLALITSYRTWINDDGDIIEQHPSMKKLYDEDTLLNGKDFGNRMLILGQNIIGEPTTVLFRKRLLTEPFGTLNGRNYNCSVDMASWISLLSKGDAIYITEPLSSFRLHTGQQVHHKYLEGCEDFSHLVLHSKKYGFLQDIDYYKTSLLKACEWYKNATTFYQLYPELIPTTDTHTRLSHCLNIVTKELHAI >NZ_CP012728.1|WP_001012321.1|1180546_1181314_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MNFWNENKKKITLIPPPELVQYVGGHFEEVGKEFMQYFIEIGNLKSNETVLDVGCGIGRMAVPLMNYLSDDGTYYGFDLFNKGITWCKNNISTRRNNFHFEHVDIYNQFYNPDGKEDASQYKFPYEDESFDFIFLTSVFTHLLPKELEHYVREIARVLKKDGRCFITFFLINPESSYYLNAGLSPLGFYHQIDNCYVLNKDIPNFAVAYPEEDIRTLLNKYGLEMQTPPHYGSWCGRTEHTSYQDIILTQKISER >NZ_CP012728.1|WP_000428856.1|1181441_1182287_-|macrocin-O-methyltransferase MENKSAVQLYLELLKKTILFEIWLEYEPYLPASLHISKELSYEPVTVPLPLFLKQYVENHNLKIVNPNVSNNERQGGKDWPRAAHSMVGRKRMNQLQEAMETVVKENIEGDFIETGVWRVGSCIFMNGFLQANNITDRTVWVADSFEGLPAPNLEQYPKDYGDYLHTFDYLRVSLETVQENFRKYDLLNDQVKFLKGWFKDTLPSAPIEKIAIARLDGDMYESTMDSLVNLYDKVSIGGFIIIDDYGLITCAEAVTDFRSERNIKTPMTQIDDFGIFWRKE >NZ_CP012728.1|WP_000069712.1|1182409_1183612_-|hypothetical-protein MSNNNYSNGLNPDESLSASAFDPNLVGPTLPPIPPFTLPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGDTGTTGPTGPTGPTGPTGPTGDTGTTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGDTGTTGPTGPTGPTGPTGPTGDTGTTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGDTGTTGPTGPTGPTGPTGPTGDTGTTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGATGLTGPTGPTGPSGLGLPAGLYAFNSGGISLDLGINDPVPFNTVGSQFGTAISQLDADTFVISETGFYKITVIANTATASVLGGLTIQVNGVPVPGTGSSLISLGAPIVIQAITQITTTPSLVEVIVTGLGLSLALGTSASIIIEKVA >NZ_CP012728.1|WP_000932922.1|1183777_1184890_+|glycosyltransferase-family-2-protein MLNKQGITISLCMIVRDEEKTIARCLDSVEKIVDEIIVVDTGSIDRTKEIVEKYTSNIYDFQWIDDFAAARNFSFSKATQEYILWLDADDVLLEDAQEALKLLKRELDPKIDAVSMPYHLAMDSNGKPLYCTKRNRLVKREKQFQWFGKVHEYLAISGETFSSNVAITHKKEKKVTNRNLKIFQDAVAAGEELSPRDLFYYANECMDNQKYDDAVLLYETFLNQDEGWYEEKIYACGKLGDCYAKLGLWEKAVESCVKSFRYAIPRGENCTRIGYIYMEQQKYNEAIFWFKLATEVPMATESPFHSPASYTWLPYLQMCICYSKLGEQDKAYYYNELAASYVPNNAAIEYNRKYFRSIFDQQKNRYRLFF >NZ_CP012728.1|WP_001087866.1|1185027_1185717_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MNSPKNSLYEEKSGHYYNAVNPNLLKHIKKEWKEVLDIGCSSGALGAAIKENGTRVSGIEAFPEAAEQAKEKLDHVVLGDIETMEMPYEEEQFDCVIFGDVLEHLFDPWAVIEKVKPYIKHNGVILASIPNVAHISVLAPLLAGNWSYTEYGLLDKTHIRFFTFNEMLRMFLKAGYSISKVDRVYIDHKMYEPLIEELYGVCKKYRLGSGFMAETVVFQYIIEAEKSSL >NZ_CP012728.1|WP_001271203.1|1185713_1186400_+|streptomycin-biosynthesis-protein-StrF MSAAEKTILFVTCINDSKMYAQCVRHILRLAVPPGYVVQFMPIRNAKSMTSGYNQAISHPAKYKVYIHQDVFIMNVAFLHGLLQLFNEHEHLGMIGMIGAQYVPPNGVWNEGKGVVGKVIGYMNDLFYMASQEQPYHESKTFMPVECIDGLLMATQYDIPWREDLFDGFDYYDVSQSFEFRKAGYTVGVPVQRDAWCIHYHIDVNMTNYEKYRKIFVEHYMSDVNQDE >NZ_CP012728.1|WP_000651510.1|1186412_1187093_+|streptomycin-biosynthesis-protein-StrF MKDHTILVVVCINNEELFEQCERQIRNLFVPPGYVVQIFPIRDAKSMASAYNRALSYPAKYKVYIHQDTFLINREMFYTLISLFKDNEKLGLIGVAGAQFLPSNGIWWEGKNLVGKVIEYRRQNYQLLNLDQLFYGNQSFMSVQAIDGLLMATQYDIPWREDLFQGFHFYDVSQSLEFQKAGYLIGIPNQANLWCIHYNGDEFDADTYEKYRKVFVEHYKDILSPS >NZ_CP012728.1|WP_000676166.1|1187107_1187845_+|NTP-transferase-domain-containing-protein MKGIILAGGTGSRLYPITKVTNKHLLPVGRYPMIYHAVYKLKQCDITDIMIITGKEHMGDVVSFLGSGQEFGVSFTYRVQDKAGGIAQALGLCEDFVGNDRMVVILGDNIFSDDIRPYVEEFTNQKEGAKVLLQSVDDPERFGVANIQNRKIIEIEEKPKEPKSSYAVTGIYLYDSKVFSYIKELKPSARGELEITDINNWYLKRGVLTYNEMSGWWTDAGTHVSLQRANALARDINFGKQFNGE |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012728_3 | 2720368-2720565 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012728_3
|
3 spacers
spacers of NZ_CP012728_3
>3.1|2720391|18|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder ATTATTTTGAAAACACCT >3.2|2720432|42|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder CTCGTTCTATTAATTTACTTTTTAGCTCTATTAAACTATGGA >3.3|2720497|46|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder TTAATTGTACAGATTGATCATCTCCTACTTTTCTTTTTCACACCCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012728_3
The CRISPR arrays of NZ_CP012728_3 >merge|NZ_CP012728|3|2720368-2720565|CRISPRCasFinder TTACGGAATGAATATTCATTCCTATTATTTTGAAAACACCTTTTCGGAATGAACATTCATTCCTCTCGTTCTATTAATTTACTTTTTAGCTCTATTAAACTATGGATTTCGGAATGAATATTCATTCCTTTAATTGTACAGATTGATCATCTCCTACTTTTCTTTTTCACACCCTCATCGGAATGAATGTTCATTCCT >NZ_CP012728|3|3|2720368-2720565|CRISPRCasFinder TTACGGAATGAATATTCATTCCT ATTATTTTGAAAACACCT TTTCGGAATGAACATTCATTCCT CTCGTTCTATTAATTTACTTTTTAGCTCTATTAAACTATGGA TTTCGGAATGAATATTCATTCCT TTAATTGTACAGATTGATCATCTCCTACTTTTCTTTTTCACACCCT CATCGGAATGAATGTTCATTCCT
>NZ_CP012728.1|WP_000040244.1|2717908_2720332_-|MMPL-family-transporter MSKLKNWRSLSFLLWIVITITMIVTMPNMDKLVKEKGHITIPNTEQSSIADKMIKEMNKDGTEKYDIIAVFNSGSKTALTTEQKEEITKTINALQNEKEQLGIKEVVSHLDNKELEKQLVSKDNTTILTQISIDKKHGEISKVSNNLHNKVKTKGVKTYLTGSDLIAGDFLTSSQEGVKKTEVISIIFILVILIIVFRSPIVPIVSLLTVGVSYLVSMGIIAHLVDQFNFPFSNFTQVFVVVVLFGVGTDYNILLFTRFKEELSKQENAFLATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFASLALASFKLYQSTSAVAIGVAVLLLVLTTLNPFFMVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFFAKNSVARPFVALIIVFVISIPIVLKYSNTLNYNDLFEVDNKYESKMGINVIEEHFPPGFSSPSTLVIQSNNKLDEASSLQTLDELTEKILKVKGVSEVYAPTRPTGERIKELYINKQADELNTGLGDANGGIKEINDGLTTAKDKMGSKDSNSLANVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALNQLSNGINDGAKGAQQIERGLTSVNENISVLSNATSQLHAGYTQLEKGLSSYDQYFGSISQAIDGAKKGYEQIEMLMTNFIQMKPELANDPNILQTIGIAKEAQKQLGGLSNELNQLATQHNAAMGSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVTKLQKGAADLKNGLNEGASGSKQIANKSSELQTGLTKINDGQGQVLTGLKDLQEQMGQLQSGLSKSTEGLEKVSNGLGDAQKYLGELNESKSSEKFYIPKEVLEGEDFQKALNTYMSHDRKTA >NZ_CP012728.1|WP_003169883.1|2717755_2717908_-|hypothetical-protein MTIILDVNPYSKEAMPIIQEINKTIDGTLKGTELNNAKKQLEGPQLETLT >NZ_CP012728.1|WP_094770179.1|2717216_2717789_-|MMPL-family-transporter MGGTTARNVDLKEVTGQDFLRTATIMLIGIAIVLIVITRSLLNTIFIIGSLILAYFASLGISEQISTHLLNVDSLSWNVPFFSFIMIVALGVDYSIFVMMRYNELEGEPATKIVTASRHIGGVVLSAALILGGTFAALIPSGVLALIQVASVVGVALLLLAIIVMPILLPALIGLMSKMKDYAKKLSERK >NZ_CP012728.1|WP_001093210.1|2716082_2716931_-|hypothetical-protein MNTKLIIVEGLPGFGKSTTAQLINDILSQNKIEVELFLEGNLNHPADYDGVSCFNKFEFDRLLSNSGDFKEVLLKRVLKKGSNYLLPYRKIKNEFGDQFSDELFNDISRNDIYELPFDKNVELIADKWQDFAEIALEDDKVYIFECCFIQNPLTIGMIKYGEQKEKIINYVMKVAKIIENLNPMLFYVEQDDLEFSFRKALKERNPEWSTGIVDYYTNQGYGKEHNHSGVEGAIKVLEARRNLELEIFDMLKMKKEKINNTKYEIGSYRSMLKDKLTIQMVK >NZ_CP012728.1|WP_000633874.1|2714079_2715705_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MITVSNVSLRFADRKLFEGVNIKFTPGNCYGLIGANGAGKSTFLKILSGEIEPSTGDIHITPGERLAVLKQNHFEYEEFPVLETVIMGHTQLYKVMQEKNAIYMKEDFSDEDGMRAAELEGEFAELNGWEAESEAAILLKGLGIGEDLHDKKLSELTGAEKVKVLLAQALFGKPDILLLDEPTNHLDLKAIQWLENFLMNFENTVIVVSHDRHFLNKVCTHMADLDFGKIQLYVGNYDFWHESSQLALKLTQDANKKKEEKVKELQNFIARFSSNASKAKQATSRKKLLDKITLDDIRPSSRRYPFVGFTPEREVGNDLLTVEGLSKTIDGEKVLDNVYFTLNKGDKVAFIGRNDIAMTTLFKILMGEMEPDSGSFKWGVTTSQSYFPRDNSKYFENSDLNLVEWLRQFSPQDESESFLRGFLGRMLFSGEEVKKNVSVLSGGEKVRCMLSKMMLSGANVITLDDPTNHLDLESITALNNGLIAFKGTMLFTSHDHQFVQTIANRIIEVTPNGVIDKEATYDEFLENEELQKQVDAMYKGQ >NZ_CP012728.1|WP_000808762.1|2711589_2713563_-|LTA-synthase-family-protein MKQFLLKSKSVLSNHFGFFLFAVILFWLKTYAAYVTEFNLGISNTIQKFLLFFNPLSSAVLFLGLALFAKGKRSYIWLIVINLLLSILLYANVVYYRFFSDFITFPTLTQTNNFGDLGGSIVALLHLYDPLYFLDTIILIVLVATKFANPKPIRVAKYKVSLVFVAGILLFSVNLGLAESDRPELLTRTFDRNYIVKYLGAYNYTIYDGIQSAKASTERALADGDNMTEVRNYLTSTYASPNPEYFGKGKGMNVIYIHLESFQNFLIDYKLNGQEVTPFLNSFTKDANTLYFDNFFHQTGQGKTSDAEFMLENSMFGLPQGSVFTTKSHNTYQSAPAILGQQGYTSAVFHGNYKTFWNRDDIYKSFGFNKFFDASYYDMNEKDVVNYGLKDKPFFNESIPLLETLKQPFYTKFITLSNHFPYPIDKEEATIEPANTGDSSVDTYFQTARYLDESVKGFIDYLKQSGLYDNSIIVMYGDHYGISDNHNAAMSKVMGKEINSFENAQLQRVPLIVRVPGVKGGVQHQYGGEIDVLPTLLHLLGTDTKNYVQFGSDLLSPDHKQVVAFRNGNFVSPTVTALNGKYYDTTTGKPVEFTDEIKQNEQMVQNSLKYSDQVVNGDLLRFYTPEGFTPIDRSKYNYNNRDKNKTKVKTAPEGEAK >NZ_CP012728.1|WP_000346934.1|2710858_2711530_+|TerC-family-protein MDFLSAEYLSALLAIIVIDLVLAGDNAIVIGLAARRLPKDQQKKVIIWGTIGAIAIRALATLVVVWLLKIPGLLLIGGVLLIWIAYKLIAEGKDHDIKAEEGFWSAIKTIIIADALMGIDNVLAVAGAAHGNFSLVIIGLLVSIPVVVWGSTLILKWVDRYPIIITIGAAVLAYTAAKMIVDEKWFAAFFESNPFIKWAFIIIIIAGVVFFGKAKQKATDGSI >NZ_CP012728.1|WP_000637714.1|2710085_2710748_+|DUF3841-domain-containing-protein MIVYTVQTEEAWKQFKKLGYLEGNKEFIDSDDIYSYDWMVRVAKTKLPHYEGNYPIWVWEANNYPNRNHKAWGRKNSKMVILTLDVPKKWVLWSYFDYWCCAMTDGSTYLHTKNKCTLDEWYIYMDKKYGIIFNFDYLLSHPDWYLDKEDSLEKQGVIGKIPLSFVKKVRRFRAKEDTSIHTIRSDNWDNRKENRIKKMNRKLRKRNEKQKRVQKRLIRN >NZ_CP012728.1|WP_000551418.1|2709098_2709926_+|polysaccharide-deacetylase MHNGIRMTTLMKRAMLICAGVLFTYEAALGSAHTALASTEDEAKSVQLVSEIQSSLAPKEAPKQYNGQVRKVAYLTFDDGPGKYTAELLDMLKKENAKATFFLIGSNVKAFPDLVKREDAEGHYVGMHSMTHNYKKLYTEGHYVDEMKEDQGLIAGVLGKSPVLTRPSYGSMPGLNEALRNKVVENGLKVWDWTIDSLDWRYNKMPVDAASAKIVENVINGANKPTEVILMHDIHPQSVKAVPGIIKGLKEKGYELEAYSENEHFPLNFWHDNRM >NZ_CP012728.1|WP_001106984.1|2708620_2708881_-|lipoprotein MNYKKMLSIFMTSIFTVGLLIGCNPAPKDEKEPDPTEEPSEQRQEEKNEKQDPAKEQNNELNKKDEQEPDPTEEPSEEQKKKKENE >NZ_CP012728.1|WP_001107293.1|2720585_2721152_-|TetR-family-transcriptional-regulator MAKNKQEDIFDAAIQLFAERGYDGTTIPMIAEKAKVGAGTIYRYFENKEALVNSLFTKSVLQLSELIKTDFPVNANIREQFSHTYNRLFEFARQNADAFLFTNSHCDSYFLDEHSNEIFEDFMGFFMDLIEDGIEKGFLRPLPPIALIIIVYQPIEKLIKVMETGQLEYTEELVKELEESCWNAIRII >NZ_CP012728.1|WP_001100954.1|2721421_2722579_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MNVIRLKEDKFREALRLSEYAFQYKVDEDRLQQQITKMKESHEVYGIMEGENLAAKLHLIPFHIYIGKEKFKMGGVAGVATYPEYRRSGYVKELLQHSLQTMKKDGYTVSMLHPFAVSFYRKYGWELCANLLVCHMTKSDLVMKKQVNGTVKRFNKESHPEEVEKLYETFAELFSGMLVRNEKWWLQAVYDDLTLAIYYDENQTAAGYMLYKIENYKMTVEEFVPLHNEARNGLWNFICQHDSMIKDLEMTVSENEPLLYTLQEPRVKTEIKPYFMGRIVDVEQFLKQYELNWNNVQQEVILHITDSFAQWNNITVRIANHEITIIEEPIDKGIKLDINALSTILFGYRRPLELNELELISGSEEEIRAFESVVPVRKPFIYDFF >NZ_CP012728.1|WP_000664623.1|2722764_2724054_-|3-phosphoshikimate-1-carboxyvinyltransferase MKERTIQPVNNGLNGNITIPGDKSISHRAVMFGAIAEGTTTIKGFLPGADCLSTISCFKEMGVDIVQNGDEVTVVGKGLEGLQEPKAVLDVGNSGTTIRLMSGILANTPFLSCVQGDTSIAKRPMKRVTNPLKQMGANIDGREEGTFTPLTIRGGDLKAIEYTSPVASAQVKSAILLAGLRAEGVTAVTEPHISRDHTERMLEAFGVKVTREGKTVKLAGGQKLTATDVQVPGDVSSAAFFLVAGAIIPNSKLVLENVGMNPTRTGIIDVLEKMGATFTVEPINEGASEPAANITIETSSLKGIEIGGDIIPRLIDEIPVIALAATQAEGITVIKDAHELKVKETNRIDTVVAELTKLGARIEATDDRMIIYGKSALKGNTVNSYGDHRIGMMLAIAGCIAEGKTIIEDAEAVGVSYPTFFEELQKLAK >NZ_CP012728.1|WP_001228120.1|2724070_2725171_-|prephenate-dehydrogenase MRKKVVLIGTGLIGGSLALAIKKDHDVTITGYDIFQEQVERAKELHVVDEIAVDLQHACEEAHLIVFASPVEETKKLLHKLASFHLREDVIVTDVGSTKGSIMNEAEALFSKEISFIGGHPMAGSHKTGVESAKAHLFENAFYILTPMHHVPNEHVEELKDWLKGTGSHFLVLNTEEHDYVTGIVSHFPHLIAAGLVKQVEKHAGDNPLIHQLAAGGFKDITRIASSSPKMWSDIVKQNREHLMVLLKEWISEMEDLYDTVSSGDAGEIQNYFADAKEYRDSLPVRKRGAIPAYHDLYVDVLDKVGALAHVTSILAREEISITNLQILEAREGLLGVLRISFQREEDRMKAKLALGEEKYQTYETI >NZ_CP012728.1|WP_001197243.1|2725163_2726264_-|histidinol-phosphate-transaminase MQVKDQLSSLQPYKPGKSPEQMKEVYGDHSFVKLASNENPFGCSPRVLDELQKSWLDHALYPDGGATTLRQTIANKLHVKMEQVLCGSGLDEVIQMISRAVLKAGDNIVTAGATFPQYRHHAIIEGCEVKEVALNNGVYDLDEISSVVDNDTKIVWICNPNNPTGTYVNDRKLTQFIEGISENTLIVIDEAYYEYVTAKDFPETLPLLEKHKNILVLRTFSKAYGLASFRVGYAVGHEELIEKLNVVRLPFNVSSLAQKAATIAFGDDEFIEEIVRVNTEGLRQYESFCKENEIPFYQSQTNFIFLPVENGGEIYEACAHAGFIIRPFPNGVRITVGTREQNEGVISVLQQHFENKKRKSRDEANA >NZ_CP012728.1|WP_001269395.1|2726282_2727455_-|chorismate-synthase MRYITAGESHGPQLTVILEGVPAGLTLAAEHINKELLRRQKGHGRGRRMQIEMDTVEIVSGVRHGMTLGSPITLIVKNDDFKHWTKVMGAEPISEKESKEMKRTITKPRPGHADLNGAIKYGHRDIRNVLERSSARETTVRVAAGAVAKQILKELGVEIAGHVLEIGGVKAKHISNLSIEEIQIITENSPVRCLDKTVEQEMMDAIDNAKSSGDSIGGIVEVIAEGMPIGVGSYVHYDRKLDAKLAGAIMSINAFKGAEIGVGFEAARQPGSKVHDEILWDEEQGYTRKTNNAGGLEGGMTTGMPIVVRGVMKPIPTLYKPLASVDIDTKEAFQASIERSDSCAVPAAGVVAESVVAWELAHALVEQFGKDRMELIQQNITQHNKYAKEF >NZ_CP012728.1|WP_001273582.1|2727739_2728816_-|3-deoxy-7-phosphoheptulonate-synthase MANHELDQLRKQVDEINLQLLHLLNKRGEIVQKIGEQKQVQGTKRFDPVREREVLDMIAENNEGPFETSTVQHIFKTIFKASLELQEDDNRKALLVSRKKKQENTIVDVKGELIGNGTQTFIMGPCAVESLEQVRQVGQAMKDQGLKLMRGGAFKPRTSPYDFQGLGVEGLQILRQVADEFDLAIISEILNPNDVEMALDYVDVIQVGARNMQNFDLLRAVGKVNKPVLLKRGLAATIDEFINAAEYIIAQGNDQIILCERGIRTYERATRNTLDISAVPILKKETHLPVVVDVTHSTGRRDLLLPTAKAALAIGADAVMAEVHPDPAVALSDSAQQMDIPEFHRFMEELKGFKNKLS >NZ_CP012728.1|WP_000997708.1|2733307_2733745_+|YndM-family-protein MNDFTVVLIKFISCIIAFSIGLALFFPATFVQIISFSLFVTIVSYMFVDKIILNRIGNTGAIMSDFLLTYLSVWIFGNILLDNYMQIAWGSILSAIVFTLSEVIVHRFSSSRTRHHNDNIHINRRFAYGTEFAEEQNILDKDKKK >NZ_CP012728.1|WP_000709765.1|2733893_2734424_-|cysteine-hydrolase MKKALLVIDVQAGMYTAGMPVHNGEKFLETLQELIGECRSNDIPVIYVQHNGPKDHPLEKGTDGWKIHAAIAPLEGECVVEKTTPDSFHKTNLKEVLQDKGIDHVIISGMQTQYCVDTTTRRACSEGYKITLVSDAHSTFDTEVLRAEDIVKHHNVVFGAFADVVTLKDLKVTASK >NZ_CP012728.1|WP_000898754.1|2734440_2734974_-|acetyltransferase MLFQKDNVSVRYVVEEDAPIISKWLTDPEVLQYYEGRDDPQSVEMVLNHFIHNPNSPEKRCLIEFDDVPIGYIQMYPVDSESKTLYGYEESQNVWGMDQFIGEPTYWGKGIGTKFVKAAITYILSEMGAEAIAMDPKVNNERAIKCYEKCGFKKVKILKEHELHEGVLEDCWMMEYK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012728_4 | 3098878-3099012 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012728_4
|
2 spacers
spacers of NZ_CP012728_4
>4.1|3098905|27|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder CGTCTTTGGCTCTTCTGGTTTCTCTTC >4.2|3098959|27|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder CGGTTTCTCTTGCTTTGGATCATCCGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012728_4
The CRISPR arrays of NZ_CP012728_4 >merge|NZ_CP012728|4|3098878-3099012|CRISPRCasFinder ATCTGGATTTTCCTGTTTTGGATCATCCGTCTTTGGCTCTTCTGGTTTCTCTTCTTTTGGATCATCCGTTTTTGGTTCTTCCGGTTTCTCTTGCTTTGGATCATCCGTTTTTGGTTCTTCTGGTTTTTCTTGTTT >NZ_CP012728|4|4|3098878-3099012|CRISPRCasFinder ATCTGGATTTTCCTGTTTTGGATCATC CGTCTTTGGCTCTTCTGGTTTCTCTTC TTTTGGATCATCCGTTTTTGGTTCTTC CGGTTTCTCTTGCTTTGGATCATCCGT TTTTGGTTCTTCTGGTTTTTCTTGTTT
>NZ_CP012728.1|WP_000041416.1|3096817_3097654_-|DUF4430-domain-containing-protein MSKMKWFISLLLSLGLLAGCEEAAVKLEKKVEPKQEEVAKQEEKKDEAKPEEKPEEKQAEQEQNKQDEQKEKQEQKVEEKPKEEKPQAQLEVKKEEKQQEQPKEQPAVNKQPEQQKAQEEKQQQPKAQEVKEEAKVVNQPKETPKQEQKKKPEENNSVPTPPTPVPDPVPPVPDPVIPKPKQVTISVKGNEGYLLGAKKVDVQEGDTVYKVLQRTGLDVDAMGSKDGIYVKGINDLYEKDITATSGWKYRVNGAFPNHSAGVVTVKPGDTIEWVFVLK >NZ_CP012728.1|WP_003161810.1|3095916_3096795_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MKISFSSLHPFVNFFYYIGVMILCMMCLHPLFLIGAILLIVILNVMQGNSEKVRKMLPSTIVFFVMVILFNSLFTHRGRTTLFWVGDSRIKLEAIMFGVVMGLLLVAIMFTFASYNDIISSHKFLYLFSRISPKVALLTMITVRFVPLFMRRLQKITLVQKTKGVQVDAGSIVERVKNGMQLLQVLLICSLEDALQTADSMQARGFGVTKRTTYIRYRMERRDWYTLSYLSILFIIAIICSTYGGGKLIIYPKVESILFQQYDGMMFIVFTMFISLPIIMEGREWIWWRMQK >NZ_CP012728.1|WP_009879384.1|3094282_3095944_-|energy-coupling-factor-ABC-transporter-ATP-binding-protein MDMVAHAEIKNLSFVYADENEKALQHISLSVQKGEFIALAGGSGSGKTTLLKHFKKELLPIGKRTGDTYYDGTLLENVPDLLSAQEIGMVFQNPENQLVMDTVIQELAFSLENIGLPSHIIQKRIAELISFLGFQDLLHQSVHTLSGGQKQLVNLAAVLVMQPKLLLLDEPTAQLDPIAAKEFLGLLKRINEELGITIVLSEHRLDEVIPLATRVICMNNGRIVYDGSPKTVVANMWEVEKFRPFIPQIPRLFLEWNAKDIPFTVREAQMKLNDFLAISYVSEPIVQSEKQEVILSAEHISFQYEKNNPLILRDLTVSIEKGKWVALVGKNGTGKSTLLTILAGLQKARRGKVKWNGKVIHKIDSKERFKSIGYVSQHPYYHFTFDTVWDEVYERARELYGEQGKEIAEHQLKKFWLYGLKERHPHDCSGGEQQLLALCTTLLSKPTLLLLDEPTKGLDPWKKERVGELFRKLQKEGTTIVMATHDIEFAAKYVDQCMMLFDGAVIMNDAPKEFFSGNFFYTTSINRFIRKELPYALTWEDVYEACQNDMLHS >NZ_CP012728.1|WP_000044896.1|3093608_3094310_-|ECF-transporter-S-component MSKRYVAFIICIFAVIIGTLLFTTLIMDGYYMLSSLFLLVVIMLPFYIRFERKAFVSREIVLVAVLAAIAAVSRVPFSILPSVQPTSFVIIVSAIVFGSETGFMIGATAAIVSNIFLGQGPWTPWQMFSWGMIGFIAGLLRNTFLMKKLWGRLLYGLFVGFLFGWIMNFWGLLGFIREATWETVISYYIASFYFDLSHAISNVVFLLLFSTSWITILTRFKKKYGILDEHNMV >NZ_CP012728.1|WP_000779967.1|3092702_3093425_-|YwiC-like-family-protein MKLVIPKQHGAWAMLVIPFLLSVILGKPTIYHIPLFIAWFFIYLATYPFLMYIKQKRKKEYLHAAIVYFIIAFVFGMISLLYEWRILLFVAVMIPFFIVNMYYARQKNERALRNDISAIIVFCIGGLVSYYFSMKLIDKTALFIALISFLYFLGSTFYVKTMIREKNNPKYRFISWGYHILLMIIVFAINPWCSLIFIPSVIRAIILYGKKISIIKVGILEIVNSVYFLIITAIIMKYAI >NZ_CP012728.1|WP_000545001.1|3092478_3092670_+|hypothetical-protein MHENARGYVQDSFQSLQEAKQCLEAALQTVEKDFNRARIEQSLYAIEQAIQRCDYTVHILEQD >NZ_CP012728.1|WP_000171478.1|3091897_3092155_-|hypothetical-protein MTLEKYVKLRSTVYEYMIEQDKPISLLDIQEHIVSHHEGKFTKKMLHQFYLSRLLDELKLDGKITLADEYLYTEKGVFYKARKGS >NZ_CP012728.1|WP_009879381.1|3091256_3091694_-|hypothetical-protein MHRFGSQKGIKGRGVVMYAYLLHDITKWIPKYIMDKGYEYYEEGNVEDVEIQDKKIFAFVTGNAGDYEVIIDLEDFTESSCECPYENYCKHMAAVVYDIQGAGESTVKEKLKDLDKEELLTVLNRLLQSSKNIQIVEKMLKKGKL >NZ_CP012728.1|WP_001101666.1|3090657_3091233_-|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MNVLIVYAHPSPSSFNAAILKHVQKGLQETNHSVTVLDLYKEQFNPVLVFNEEKKRRDLVNEEETARYRALVEEADTLLFIYPIWWWGMPAILKGFIDRIFVAGFAYKYEGALPKGLLKGKKAWGINTLDSPLWYVALLYRSADWIIMKRGVLRFCGIRDIKRSVFQSVKTSKREKREKWLLQIEEKARTL >NZ_CP012728.1|WP_001004518.1|3090307_3090661_-|hypothetical-protein MNEMERIINCCQYDNELFRTYINCLIQLKKCSETFQQIQIQLRNDYLIRGIFEREVDEVVRGSKEYETYFLPKALQWNFLKNNQHLIEKVCGDFFAFEALYLTEIEWKTVINCVGNK >NZ_CP012728.1|WP_000266052.1|3099836_3100316_-|RraA-family-protein MWKTTDLCDEFENELQICRQPFRSFGKKEQFHGKIATVKVKDDNVLVKEGLQTLPEGTVLVVDGGASTNCALLGDNLAAIAEERKLAGIIVNGYVRDSSELKNINIGILALGTMPNRSVKEGKGERNISLQFGQVEWKPDEYVYVDEDGVIISDKSLHR >NZ_CP012728.1|WP_001176953.1|3100516_3101947_+|YfcC-family-protein MQLQTEVKKQPSKRKFKMPDAYVLLFFIALLCAIATYFVPAGEFKRVTNGTVTTTIPGSYHSVPQSPVGFVSFFTAIEKGMTLAAPIIFLILFTGGAIAILEKTGALDGLIYHVINKFRNQQLLFICIVAALFSILGTTGIIVNSVIGFIPIGIIVARTLKWDAIVGVAIIYLGTYAGFNATILSPSPLGISQKIAELPMFSGIGLRTAIYISFLLATILYINWYVKRLKKSNKGSILGDNWFPSNALSSGKEAQKTEVPWTIRHKLILLVSALSLIAFLIGAFRLHWTDAEMTATFSFIAITAGIIGGMKANDIASTFLAGCQNLIYGALIVGMARCISVILEQGKLLDTIVNQLAQSLEGQSPVFGVIGMYVSSAALHFLISSGTGESVIFIPILAPLADFMHITRQVTVQAVMLGEGVVNCLNPTSGVLMGVLAASGISYGKWIRFMAPLAFIWFIIGLIFLIVGVNIEWGPY >NZ_CP012728.1|WP_000672206.1|3102094_3102922_-|ribonuclease MKFRNTKLAMVTLSSFFILGSASLSFTNIIQGEVASASPQEITVKSYDDTYYNNAIGKTGLELKKELHNIIDDHTKLSYSAVWEALRDTDEDPNNKNNVILLYTGRSQGKLTNGSGVDNWNREHVWAKSHGDFGTTAGPGTDLHHLRATDVSVNSSRGNLDFDNGGVNHSEATECKYDSDSWEPRDSVKGDIARMLFYMAVRYEGDNGEIDLELNEKVNNNKDPYMGKLSVLLKWNEQDPVDDLERKRNEVIFTKYQHNRNPFIDHPEWVNKIWN >NZ_CP012728.1|WP_000060302.1|3103349_3103706_-|hypothetical-protein MSLTTGPIENVGNQPANANKVRVKILNRTAGPLTGVARVFRLDGSLVLIEQVNFNVNSNASTFATLSLVHPAFGQAFEYEVQIVPNQPGGLYSVYGLTAESVIITAQRVVNSELTQFL >NZ_CP012728.1|WP_000988166.1|3103907_3104936_-|alpha/beta-hydrolase MMTFDEYEVAIKSEFTLQGTITRPKAEGKYAAVVIIAGSGEIDRDGTIVPLKLEANIYKELAHVMSRLGVVTLRFDKRGVGKSDGEFLKTGMWDLVSDIESTITYLKEQPFVDPENIILAGHSEGCMLATVVNARTPVNGLILLTGAAESLEEAAKRQREIAYKELKEQKGIKGKLMRLLNVEKRGEKQMEKIKEKMMNTEKDTIKVGFKPMNAKWFREHFQHDIYKDLQQVTCPVLAIAGDKDIQADPERAKRIGDYVKGNSEVHVIKDMDHSLKVFKGEFKTLEFKKNYEEGARKPLHPELEEIIVNWLDTHFISQHAGSKIPGSILGESEEVGRKSNCL >NZ_CP012728.1|WP_000659023.1|3104946_3106071_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKEINIHKIIADKRKEKGITQEELAAYIGITKASVSKWETGQSYPDITFLPLLASYFNISIDELISYKPQMEQEDIKNLYHRLAEAFSEKPFDEVMMECRKIIKKYYSCFPLLIQIGILFINHHMLTEDTDRRIEILEEAMNLFSRVQEESDDVSLVKEAVSFQATCYLILNKPNEVLQLLGETIRPNVPEEDLIAQAYQMLGNTKKANEIMQISMYQHLIQLVATIPNYVVVNASSVEKVEVILNRAFMLIDIYEIETLHPNMTLKVYYAAAQVYCMQGNFERALKMLRKYAAVCAASFTVNSLHLHGDSYFDAIDEWFAEFPLGAKTVRNEEIIKRSMLQSIAENPVFAPMKDVREYKNIITSLKFKLDIKE >NZ_CP012728.1|WP_001024063.1|3106411_3106984_-|glycerol-3-phosphate-1-O-acyltransferase-PlsY MNILTLILSYLIGSISFALIVGKMFYKKDIRDYGSGNLGATNAYRVLGIKAGVIVAIADILKGTFACLLPLILSSTINPIVCGLLAILGHIFSVFASFKGGKAVATATGVFLFLSPLGVLVGFVVFVLTLLFTKYVSLSSMLAGIALFIYSLIFEDKVIIALSLLIIVSIIILHRQNIKRILNGTENKIV >NZ_CP012728.1|WP_000710875.1|3107603_3108080_-|Cys-tRNA(Pro)-deacylase MKKDKTNAMRILDKEKIEYSMMSYNPDDGKIDGVSVAEKIGREVREVYKTLIAQGNSKNYHVFIIPVDEELNLKAAAKAVSEKKIEMIPVKDITKVSGYIRGGCSPIGMKKLFSTCIDASAQSLETMIVSGGKIGIQIELKVDDLAKVTRAQFGEITK >NZ_CP012728.1|WP_000405915.1|3108419_3109697_+|histidine--tRNA-ligase MEIRNVKGTKDYLPEEQVLRSKIKRACEDTFERYGCKPLETPTLNMYELMSYKYGGGDEILKEIYTLQDQGKRDLALRYDLTIPFAKVVAMNPNIRLPFKRYEIGKVFRDGPIKQGRFREFIQCDVDIVGVESVMAEAELMSMAFELFQTLNLEVTIQYNNRKLLNGILQAINIPTELTSDVILSLDKIEKIGIDGVRKDVLERGISEEMADTICNTVLSCLQLSIADFKEAFNNPLVADGVNELQQLQQYLIALGINENTIFNPFLARGLTMYTGTVYEIFLKDGSITSSIGSGGRYDNIIGAFRGDDMSYPTVGISFGLDVIYTALSQKETISSTADVFIIPLGTELQCLQIAQQLRSTTSLKIELELAGRKLKRALNYANKENIPYVLIIGEEEICTETVMLRNMKEGSEVKVPLSSLSNYL >NZ_CP012728.1|WP_001100385.1|3109858_3110170_+|hypothetical-protein MNVFIKVLKWTTGISHLILIPCYYLTPGLVDLYGIPPLTVITLHIITILLAKKEDMNTYPHYIGIIVTLVAFFPYIDIVLHMIAAIFLLLDAASTNTKKVYDS |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012728_5 | 3267235-3267337 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012728_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012728_5
>5.1|3267260|53|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder GGTATATTTACATGCCCCGAAGTAGCCGTGGATTGTCTCCTTTCCTTCCTTGA |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012728_5
The CRISPR arrays of NZ_CP012728_5 >merge|NZ_CP012728|5|3267235-3267337|CRISPRCasFinder AAGTTTAGGTTTCTTTTGAGAATGTGGTATATTTACATGCCCCGAAGTAGCCGTGGATTGTCTCCTTTCCTTCCTTGACAATTTAGGTTTCTTTTGAGAATGT >NZ_CP012728|5|5|3267235-3267337|CRISPRCasFinder AAGTTTAGGTTTCTTTTGAGAATGT GGTATATTTACATGCCCCGAAGTAGCCGTGGATTGTCTCCTTTCCTTCCTTGA CAATTTAGGTTTCTTTTGAGAATGT
>NZ_CP012728.1|WP_001226321.1|3265727_3266672_-|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MRKIISVLVIFFMTGSIFAGGAVHAKAEGKHEWNKNKFLNIAHRGASGHAPEHTFASYDLVKKMKADYLELDIQLTKDGQLIAMHDTAVDRTTNGTGEVRDKTLSEIKSLDAGSWFNKAYPEKAKQEYVGQKVPTLEEIFQKYGRSMKYYIETKSPDVYPGMEEKLLALLEKYNLIGQNMSSSRVMIQSFSKDSLKKIHSINKNIPLVQLLWYYPNENNEIVEWSGITHEPKRVTNDDFQEIKKYAVGIGPNLRNDNGDLIINESYMKMARQNGLLIHPYTINEKPDMRLLMKWGATGMFTNYPDRLHTVLKEK >NZ_CP012728.1|WP_000236552.1|3265000_3265678_+|YdcF-family-protein MVIPKYPDVPTLTKKQIDQITEITFLKEITPQKCDVIFVFGGSHPGNWQAPLETYRQGLGNRIIVTGGTSLHGMKHPSWNYGDLSEAEVIVNKLMENGVPKGAILFEKNSLHSIANVIEAKKIFDFTKINRLLFVCKNLGAGRQYRVLKKHLPKTITCIPYTFDTSFDGEFIMNRYNWMENEKSRSMIFGEYLRNVCYGRKGGIEPPEKEVHGLEEYVSYYYNLA >NZ_CP012728.1|WP_000544597.1|3264397_3264907_+|DUF3916-domain-containing-protein MHEKKIRGMKRKTNAMIKRIEEHTKMFPSTFYNDEYWYMPLPVSQDFIESHKTPRKVKRLCIQTLIDRVNHLIKIQPSDTHTYRVVALISIENLWRSQIIVFKNDDYFHNFFNRNNEFQKWILLSNEIDFWETWGISIFPTPQLLRFQEVIYDEDTIDEKEIWFIGELS >NZ_CP012728.1|WP_000351706.1|3263553_3264405_+|LysR-family-transcriptional-regulator MDIKDLTVFYEVAKENNISHAAKNLNYVQSGVTMRMKQLENELGVPLFYRNGKGVTLTSNGEILLTYAKQIIHLMDQSIKAVQSNGTEPKGTLKIGCTESTTAVRLPSILTTYYEKYPEVELILETNTTEQLIKLVLDRKLDGAFIAGSTQHNELHSNVFHEEELVLISKKTLSSLKDIEDMNLLAFSHGCYYRSLLEDWLQEEDISPKRVLEFGTIEAILACVKSSMGVAIMMKSILKGHEHDVSFNPLPNSFNKVPTTFITRNDIFRSAALQKFMEVTHNA >NZ_CP012728.1|WP_003157243.1|3262223_3263468_-|MFS-transporter MEEDGGIIVLMEERMNSTYKWVMLIVATIAQTTATLITYGVGVFALFWKEEYALTNMESGLLVSVVNVGPLFCMLFIGRLLDQYNEKILISISSFLLGSSLLLTNIVSGFNGLLFVLLLIGMFYSVSQPGGSKVILKWFPKENRGLAMGIRQAGIPIGGALAGVLIPFLTVQYNMTYAINSIACICIIGGVLFFVFYKEPYVQEEARKGHIKISFWMELKVVICKKELYPIYITGICMISLQMVLVGHFMKFLAGEQSITSIVAGTVFSVMFFSGMIGRVALAAISDVFYKGNRRIPLFIAVCASIGLILLLVMSIHTITSGVLYSVSALLGFFSIGWFSLFIAEVAELASEESVGITVSVALTLNQIAIIVAPVLFGYIVDEKGYAYAWLCIVVLLSISAVSLYRRNKKIKES >NZ_CP012728.1|WP_000798801.1|3261893_3262124_+|hypothetical-protein MKNTDKRNRLDDMMFHYRVTKNNIVLIEYYGKQIMILKGTAAEKFLNKINHAHNDTEKQLIMAKVTGNFKRGNERQ >NZ_CP012728.1|WP_000915211.1|3260503_3261637_-|serine-hydrolase MLKKWLIVFFIFAVFSGSVVALIHASKGKKYDIKAFSNLNNKQKHDMQEVDANEKKHYEVVAGKLDQYLKDKGFNGSVLVASKDHVILRKGYGYANMKDKVFTTPRTKYRIGSITKTVVAISIMQLKEKGKLNIEDNVNKYIPSFPADKNITLRNLLTHTSGLPDQGKGRVDAASRLKLVTWIGSQALQFPAGTGWKYTDYNYMVLAYIVEKITNKPLAEYVKENIFTPVEMHESGMGATLPEDIFLAEGYTRKDNELIAAPRLKMNWLYGCGEMYTTVEDMKRLDEAIMNGKLLSKQSVLDMFTASPARKYGFSFYTYPDYYHNHGVLAGWNTFNNFNWDKKTFVILFSNVQNGMNDTFNQEFRKMANDLIEGNGA >NZ_CP012728.1|WP_000137565.1|3258680_3260468_+|oligoendopeptidase-F MTELKDRLQVADKEKWNLTDIYDTIEDWESDFHKIEVLTNELHEFNGNIHDGNSLLAYLTKSEEISSIISLMFAYARLQSDLDTRDTDAQSLVDKVSQLHVKVSAAKSFFSPFLLSVDENTLHTYIEEAEGLQYYKEDLFELYRYKKHVLNKDQEEILSQMGEALSSPQHTYGMLNNADILFGEVTSNDGEKVTLTRGMYAKLIEDESREKRKEAYKAYYKPYVQLKNSIASTLSAAIKNNVTVSKLRKYPSALEKSLFGDMVPKEVYENLIETTKKNIQSLHTYNKLRKEKLNVDELRQYDLSVDLVQGVKQDIPYDNAFDIMIESLAPLGEEYIETLKSFKDKRYIDVRETPGKCSGAYNFGVYGVHPFILLNHHDDLNSLFTLTHECGHGMHTHYSHGYQPRISAHYTIFVAEVASTVNEVLLIHHLLKEAKDANVRNHLVNHFIEKFKGTFFTQIMFAEFEKITHEMAQQGKPLNAQVFSDVYENLFREYNGDSLVFDEEVKYGWARIPHFYRPFYVYKYATGFASAIQIADKLLSGDPNAQKNYLEFLKGGSSDYPLNLLKKAGVDLTTPEPIESALNRFSELVEEFSTL >NZ_CP012728.1|WP_000473536.1|3256016_3257558_-|alpha-amylase MFKKITIVGLSVVLFLPSIYGESKVYADTINNGTLMQYFEWYAPSDRNHWNRLRTDAENLAQKGITSVWIPPAYKGTTQNDVGYGAYDLYDLGEFNQKGTVRTKYGTKAQLKSAIEALHKQNIDVYGDVVMNHKGGADYTETVTAVEVDRNNRNVEVSGDYEISAWTGFNFPGRGDNYSNFKWKWYHFDGTDWDEGRKLNRIYKFRGIGKAWDWEVSSENGNYDYLMYADLDFDHPDVANEMKNWGTWYANELNLDGFRLDAVKHIDHEYLRDWVNHVRQQTGKEMFTVAEYWQNDIQTLNNYLAKVNYNQSVFDAPLHYNFHYASKGNGNYDMRNILNGTVMQNHPALAVTLVENHDSQPGQSLESVVSPWFKPLAYAFILTRAEGYPSVFYGDYYGTSGNSSYEIPALKDKIDPILTARKNFAYGTQRDYLDHPDVIGWTREGDSVHANSGLATLISDGPGGSKWMDVGKNNAGEVWHDMTGNQTNTVTINKDGWGQFHVSGGSVSIYVQQ >NZ_CP012728.1|WP_001291979.1|3255292_3255922_+|exosporium-leader-peptide-containing-protein MSEKYIILHGTALEPNLIGPTLPPIPPFTFPNGPTGITGPTGATGFTGIGITGPTGVTGPTGIGITGPTGATGLGILPVFGTITTDVGIGFSVIVNTNINFTLPGPVSGTTLNPVDNSIIINTTGVYSVSFSIVFVIQAISSSILNLTINDSIQFAIESRIGGGPGVRATSARTDLLSLNQGDVLRVRIREATGDIIYSNASLVVSKVD >NZ_CP012728.1|WP_000417232.1|3267975_3268629_-|hypothetical-protein MEKYHGKSTEQIIQKLMPGSARSSVVMVWVVINFMILTPFLFPPTFTIYLYVILPFLLIANIWGVWVFFYKPNELRLVHILYNGFMGITFSFGSFIVIQKMAYTFIKIETPLFFIVTFVLYIFTIYKLISIGMKSFLRRLNNEENDNIKISPIVYLSGLGYVIGQICIGTLSQNGLATVLILVFSLFAVVLSISGVYIWVYVDLKRKEMDGMHNGQI >NZ_CP012728.1|WP_000933357.1|3268733_3268913_+|hypothetical-protein MLNLIPSVTILDPIETPKPIQAPATVPIGPPKTVPTAAATPSLAPAKALTAVVPTPIAA >NZ_CP012728.1|WP_000445390.1|3269244_3270864_-|FAD-dependent-monooxygenase MESNDVPVLIVGGGLSGLASALFLAKHNIEYLLIERHPSTAIHPKAGGITFRTMELFRELGLEQRIRSAGKTLENCRGRIAVHTIAEANQEELAQMRANQYENDEKLLQKIEEISPSKQTACYQITLEEIMLQEARILGGELSFYHELVSYEQNEQGVIATIRNRETEKESVIHCDYVIAADGAKSKIREQLGISAEGRGTIGGYYMNIYFEADVSEFMQGDAFGFSMVLHPEVLGALIPVDNARRWIYHVSYDPLKGERPEDFTIERCKQIIQTAIGSTNVEPEIVSVLPWKAAESTATKFQDNRIFLVGDSAHIMPPTGGFGSNTGIQDAHNLAWKLAAVIKGKAKPKLLETYHEERYPVAKLTTDYAISLLFRAANREEGSLNKMDGLAVTAGYHYSSDAIIDDAVTLHRMDIVQLNGRPGTRAPHFIGMYEEKEVSVLDLLGNDFVLLTGAENDSWAESAHTVSAKLGVNIKVYRVGLSGDFIAQENIFSELYGLSDGGAVLIRPDAFIGWRSEKEVVNLDVVLEEVMSNLLCDF >NZ_CP012728.1|WP_000571881.1|3271341_3271686_+|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MIEMNKQEQLNVIKKDFIDSQKVLLAIGDETRQAILLVLMETECQTGLRVGEITKQTHLSRPAVSHHLRILREAGIILMRKEGTKNFYYIDIRTKLSLLKNLVLDIEKLLHNFY >NZ_CP012728.1|WP_000646397.1|3271704_3272703_+|NADP-dependent-oxidoreductase MKAMIIDKYGKVPMRMAEVPIPEINEHEVLAEIHAASINPIDFKIRDGKVKMLLKYEMPLILGNDFAGVIIKVGSKVTRFKIGDEIYARPRKNKIGTFAEYIAIHEDDIALKPKNLSFEEAASIPLVGLTSYQALHDIMQLQKDQKILIHAGSGGVGTFAIQLAKIMGATVTTTASEAGPDLVKSLGADQIINYKTEKFEEILKDYDAVFDTIGGTTLEKSFDIIKSGGNIVSVSGIPNARFSKEFGSGFFKTFLFSLASKKLTALEKKHNAQYSFLFMKPSGDQLRTIANYIEAGKIKPVIDRVFPFEDAQKAMEYSEAGRAKGKIIVKMK >NZ_CP012728.1|WP_000164886.1|3272881_3274348_+|YdiU-family-protein MTKNNEAGWNLDHSYTTLPQSFYTEIPPTPVSSPELVKLNHSLAISLGFNPEELKKEAEIAIFAGNALPEGAHPLAQAYAGHQFGHFNMLGDGRALLIGEQMTPSGKRFDIQLKGSGPTPYSRRGDGRAALGPMLREYIISEAMYALDIPTTRSLAVVTTGEPTYRETKLPGAILTRVASSHIRVGTFQYAAARGSIEDLQSLADYTIKRHYPEIEAHENRYTALLQEVIKKQASLIAKWQLVGFIHGVMNTDNITISGETIDYGPCAFMDNYDQGTVFSSIDTQGRYAYGNQPYMAAWDLARLAESLIPILHEDEEEVLKIAQDEISKFSVQYEKQWFLGMKKKLGLFSNEEQDQSLIEQLLKMMEKFKADYTNTFRSLTLNTIENTALFESPEFKEWYKLWQSRLERQEESKENAYEMMKNNNPSIIPRNHRVEEALEAAVTNGDYSVMEKLLEALSNPYAYATEQEEYCVPPVPTNRPYRTFCGT >NZ_CP012728.1|WP_000592013.1|3275694_3275886_+|Phr-family-secreted-Rap-phosphatase-inhibitor MIKKISSVFLGLSVFGILATGIHSSFTYQAGHADLPAPQRPDLVQSVDASKDYNSTTTAEKAL >NZ_CP012728.1|WP_000275806.1|3275959_3276559_-|protease-synthase/sporulation-negative-transcriptional-regulator-PaiB MYIPKYFAIQDEKMKYEIMEQNSFATLFSQHNGEPYATHLPLLLNRETLTLHGHFARPNEQWKDIGTQQVLAIFQGPHSYISPSWYETKNAVPTWNYVAVHVYGELELVEDEQELIDSLQDLVDTYEDPQSTYSLNDVDPNYMEGLSKGIVGFKIKISKIEGKAKLSQNHSVARRKLVVEELEKVGSEGSRGIAELMRK >NZ_CP012728.1|WP_000813610.1|3276693_3277221_-|GrpB-family-protein MKQRITIEEYNIKWESEFNKLQTLINDVMEDSILSIEHVGSTSIKGLAAKPVLDIDIVIEDYGFFPKVVTKLGAIGYYHQAEWSYKGREAFGRKDAFVPWDGESTDWMEHHLYVCDKESEELRRHIAFRDYLREYEDVAVEYGHLKEELARETKSRTSYSEGKTAFITNILEKIN >NZ_CP012728.1|WP_001172053.1|3277244_3277592_-|DUF4260-domain-containing-protein MQKRIVHFEGLVVFVATIYMYSLYEFSWIIFLIFLLAPDLSMLAYGINNHIGANIYNLFHTYIISILIVIIGVYFKVDTVIMIGLIWTAHIGMDRMFGYGLKYETEFKGTHIQRL |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012728_4 | 4.1|3098905|27|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder | 3098905-3098931 | 27 | KJ094023 | Listeria phage LP-101, complete genome | 3876-3902 | 4 | 0.852 |
| NZ_CP012728_4 | 4.1|3098905|27|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder | 3098905-3098931 | 27 | NC_022766 | Bacillus phage Glittering, complete genome | 9024-9050 | 5 | 0.815 |
| NZ_CP012728_4 | 4.1|3098905|27|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder | 3098905-3098931 | 27 | NC_003037 | Sinorhizobium meliloti 1021 plasmid pSymA, complete sequence | 1229260-1229286 | 6 | 0.778 |
| NZ_CP012728_4 | 4.1|3098905|27|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder | 3098905-3098931 | 27 | NZ_CP021794 | Sinorhizobium meliloti strain USDA1157 plasmid psymA, complete sequence | 438058-438084 | 6 | 0.778 |
| NZ_CP012728_4 | 4.1|3098905|27|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder | 3098905-3098931 | 27 | NZ_CP021809 | Sinorhizobium meliloti strain Rm41 plasmid psymA, complete sequence | 127169-127195 | 6 | 0.778 |
| NZ_CP012728_4 | 4.1|3098905|27|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder | 3098905-3098931 | 27 | NC_020527 | Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymA, complete sequence | 1227597-1227623 | 6 | 0.778 |
| NZ_CP012728_4 | 4.1|3098905|27|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder | 3098905-3098931 | 27 | NZ_CP021798 | Sinorhizobium meliloti strain USDA1106 plasmid psymA, complete sequence | 850854-850880 | 6 | 0.778 |
| NZ_CP012728_4 | 4.1|3098905|27|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder | 3098905-3098931 | 27 | NC_017324 | Sinorhizobium meliloti BL225C plasmid pSINMEB01, complete sequence | 513839-513865 | 6 | 0.778 |
| NZ_CP012728_4 | 4.1|3098905|27|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder | 3098905-3098931 | 27 | NC_018683 | Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMA, complete sequence | 498252-498278 | 6 | 0.778 |
1. spacer 4.1|3098905|27|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
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3. spacer 4.1|3098905|27|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder matches to NC_003037 (Sinorhizobium meliloti 1021 plasmid pSymA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
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4. spacer 4.1|3098905|27|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021794 (Sinorhizobium meliloti strain USDA1157 plasmid psymA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer cagggttggctcttctggtttctctat Protospacer *. ******************** .
5. spacer 4.1|3098905|27|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021809 (Sinorhizobium meliloti strain Rm41 plasmid psymA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer cagggttggctcttctggtttctctgt Protospacer *. ******************** .
6. spacer 4.1|3098905|27|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder matches to NC_020527 (Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer cagggttggctcttctggtttctctat Protospacer *. ******************** .
7. spacer 4.1|3098905|27|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021798 (Sinorhizobium meliloti strain USDA1106 plasmid psymA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer cagggttggctcttctggtttctctat Protospacer *. ******************** .
8. spacer 4.1|3098905|27|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder matches to NC_017324 (Sinorhizobium meliloti BL225C plasmid pSINMEB01, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer cagggttggctcttctggtttctctat Protospacer *. ******************** .
9. spacer 4.1|3098905|27|NZ_CP012728|CRISPRCasFinder matches to NC_018683 (Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer cagggttggctcttctggtttctctgt Protospacer *. ******************** .
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
258555 : 266504
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012728|258555:266504|DBSCAN-SWA 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GCAGCGTTAACGCACTTCGGAGATATTTTCACTGTTCAAATGGGGATTGTTATTATAACGTTCTTCTTTATCGATTTCTTTGATACAGCAGGTACACTTGTAGCGGTTGCGAATCAAGCAGGATTAATGAAGAACAATAAATTACCACGTGCAGGAAAAGCGTTATTCGCAGATGCAATTGCAACTGTAATTGGTGCAATCTTAGGTACATCAACAACAACATCTTACATTGAGTCGTCTGCAGGGGTAGCGGCAGGTGGACGTTCTGGTTTTACAGCAGTTGTAACAGCAGGATTCTTCTTACTGGCACTATTCTTCTCGCCATTATTAAGTGTTGTAACACCAGCTGTAACGGCACCAGCTTTAATTATTGTAGGGATCTTGATGGTTTCATCTTTAGGAGAAATTGATTGGAAGAAATTCGAGATTGCAGTACCGGCGTTCTTTACTATCATTTCAATGCCGCTTACGTATAGTATCGCAACGGGAATTGCGATTGGGTTTATCTTCTATCCAATTACAATGGTAGTAAGTGGTCGACGTAAAGAGATTCATCCAATTATGTATGTTATGGGAGTTTTATTCGTACTATATTTCATTTATGTTCGTAAATAAAAGGGGTTTTTGAAAGGTCTAGACTTAAGGGGAGTCTAGACCTTTTTTGCGTCTTCAGAAAAACTTAAGGATTTCCGAGCGTTTTTCTTCAGAAGTTTTCCTATAATAGAAGTTAGGGATTAAAAAAGTAATGGGGGAGATATTGTGGCACACGAAACAATACTTGTCGTAGATGATGAAAAAGAAATCCGAAATTTAATTACAATCTATTTAAAGAATGAAGGATATAAAGTATTGCAAGCAGGGGACGGAGAAGAAGGATTACGTTTACTAGAAGAAAATGAAGTACATCTAGTCGTATTAGATATTATGATGCCGAAAGTAGACGGCATTCATATGTGTATGAAAATAAGGGAAGAAAAAGAAATGCCAATTATTATGCTTTCAGCGAAAACGCAAGATATGGATAAGATTTTAGGTTTGACAACGGGTGCAGATGATTACGTAACGAAACCGTTTAATCCGTTAGAGTTAATCGCAAGAATTAAATCTCAGTTACGCCGTTATATGAAAATGAATGGTTTCGCTATACAAAATGAGGACGAGCTAGAGATTGGGGAGATGAAAATAAACATCTCAACCCATAAAGTCATTGTAGAGGGAGAAGAAGTGAAACTAACTCCGAGGGAATTTTCAATTTTAGAATTGCTAGCCCGTAATCCGGGGATGGTCTTTAGCGCGGAGCAAATTTATGAAAAGGTGTGGAACGAAAGATCTTTCCAGTCGGATAATACGGTAATGGTGCATATTCGAAAAGTGCGTGAAAAGATTGAGGAGAATCCAAGGAAACCTAGATATATAAAAACAGTATGGGGAGTGGGGTATAAGATTGAAAAAGATATTTAATCCATTTACTTATATAAGGAAAGCAAGACAATTGATTGAGAAATTAGTAAAGGGCGTACGAAAGAGTATAAGAATTCAACTGATTACTACTTTTGCCGCTTGTGCGTTATTAGGAGTTTTTTTTGCAAAGGGAGCTGCACCATTTTTTGAGAATGCGAATCGTCAAGCGACTATTGATTATCGAGCTGGTATGGAACAAATTAATCACGAAGCTCAAAGAGCAGCAAATAGCTCGGTTCATGAAAATAAATTAGAAGCTATATCCAATATGATCGAAATGGAGAATCAAAATTTAGAGCGAGGATCTAGAGCTCTAAAAATATTGGTTACTGATGAAAGTGGTAAAGTTTTATATAAAACGAAGCAGGCGCAAGAAGAGCAAATCGATTTGCATAATACGATTCGTAATGCAGCATCATTTGCGATTAACTATTCAAATGGTCGAGATGTATTTGAAAATACAAGAAAAGAATTTATAGCTTTTTCGCCTATTACAATAGAAGATAAGAACTTATATATGTTCGTTAGTGGAATACCAGATGGTGTAGTGATGTATGATACACAAGAAGGACCATTTCCATTTTTAATTGGTGTACTTGTATTTATTTTCTCTTTCTTCTATATAACAAAGAGAAAGATGAAGCAAATTGAAGCGATGGCAGAAGGTGTAAAGGAAATAGAAAAAGGCAACTTAGCGTACCGTATAGAGAAGAAAGGTGAAGATGAGATTGCATCTTTAACAGAAAATATTAATAATATGGCAGAAGAGCTTATGAATAATATAGAAAAGGAACGTAAGTTAGAGAAGCAAAAGAACGAGCTTATTACAAATGTATCTCACGATTTGCGTACACCACTGACTTCTATTATGGGTTACTTGCGATTACTTCGAGATTCTAAATATGAAAATAAAGAGCAACACGATGAATATACGAGAATTGCTTTTGCGAAGTCAGAGCAGTTAAAGAATTTAATAGAAGATTTATTTGAGTATACGAAGTTAACGAATGAGCAAGTTGTATTAGAAAAACAAGAAGTATGTGTAAATGAGTTATTGGAGCAATTAATAGAAGAGTTAGTACCGCAAGCGGAAGAGCATGGACTTACATTTGTTAAGAAGTTTCCTGAGGAACGTGCCTATGCAGCGATTGATTCGGAAAAGATGGTCCGTGTATTTGATAATCTATTAATGAACGCGATTAAGTATAGTAAAGATGATGGGGAGATAAAAGTTTCCCTTCAAAGGCAGCGCTGGGAGATACAAATTGTAATTGCGAATCATAGTGAAGAGTTTACGAGAGAAGAGTTAGCGAGTTTGTTTGAACGTTTTTATAAGAAAGATCAATCTAGAAGTAGAGTAACAGAAGGGTCAGGCCTTGGATTGGCGATTGCGAAAAGTATTGTTGAATTACAAGGTGGTAGTATTCGAGCTGAATATAAGGATGGTATTATTCAGTTTATCGTCTCGTTACCAATTATAGAAAGATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012728|258555:266504|264313_265015_+|WP_000929883.1|DBSCAN-SWA MAHETILVVDDEKEIRNLITIYLKNEGYKVLQAGDGEEGLRLLEENEVHLVVLDIMMPKVDGIHMCMKIREEKEMPIIMLSAKTQDMDKILGLTTGADDYVTKPFNPLELIARIKSQLRRYMKMNGFAIQNEDELEIGEMKINISTHKVIVEGEEVKLTPREFSILELLARNPGMVFSAEQIYEKVWNERSFQSDNTVMVHIRKVREKIEENPRKPRYIKTVWGVGYKIEKDI >NZ_CP012728|258555:266504|260920_262459_+|WP_000743900.1|DBSCAN-SWA MKKQHDTIIVLDFGSQYNQLIARRIREFGVYSELHPHTITAEEIKAMNPKGIIFSGGPNSVYGEGALHCDEKIFDLGLPIFGICYGMQLMTQQFGGTVERANHREYGKAVLKVENESKLYANLPEEQVVWMSHGDLVTGLPEGFVVDATSESCPIAGMSNEAKNLYGVQFHPEVRHSEHGNDLIKNFVFGVCGCSEGWNMENFIEVELEKIRETVGDKKVLCALSGGVDSSVVAVLIHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEAEGVMKTFSEGFHMNVIKVDAKERFMNKLKGVEDPEQKRKIIGNEFIYVFDDEASKLEGMDFLAQGTLYTDIVESGTATAQTIKSHHNVGGLPEDMQFKLIEPLNTLFKDEVRVLGSELGIPDEIVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEEKLEIVRESDAILREEIIKAGLDREIWQYFTALPGMRSVGVMGDERTYDYTVGIRAVTSIDGMTADWARIPWDVLEKISVRIVNEVKHVNRIVYDVTSKPPATIEWE >NZ_CP012728|258555:266504|264998_266504_+|WP_000719201.1|DBSCAN-SWA MKKIFNPFTYIRKARQLIEKLVKGVRKSIRIQLITTFAACALLGVFFAKGAAPFFENANRQATIDYRAGMEQINHEAQRAANSSVHENKLEAISNMIEMENQNLERGSRALKILVTDESGKVLYKTKQAQEEQIDLHNTIRNAASFAINYSNGRDVFENTRKEFIAFSPITIEDKNLYMFVSGIPDGVVMYDTQEGPFPFLIGVLVFIFSFFYITKRKMKQIEAMAEGVKEIEKGNLAYRIEKKGEDEIASLTENINNMAEELMNNIEKERKLEKQKNELITNVSHDLRTPLTSIMGYLRLLRDSKYENKEQHDEYTRIAFAKSEQLKNLIEDLFEYTKLTNEQVVLEKQEVCVNELLEQLIEELVPQAEEHGLTFVKKFPEERAYAAIDSEKMVRVFDNLLMNAIKYSKDDGEIKVSLQRQRWEIQIVIANHSEEFTREELASLFERFYKKDQSRSRVTEGSGLGLAIAKSIVELQGGSIRAEYKDGIIQFIVSLPIIER >NZ_CP012728|258555:266504|258878_260513_+|WP_001030000.1|DBSCAN-SWA MAKDIKFSEEARRSMLRGVDTLANAVKVTLGPKGRNVVLEKKFGSPLITNDGVTIAKEIELEDAFENMGAKLVAEVASKTNDVAGDGTTTATVLAQAMIREGLKNVTAGANPMGLRKGIEKAVVAAVEELKTISKPIEGKSSIAQVAAISAADEEVGQLIAEAMERVGNDGVITLEESKGFTTELDVVEGMQFDRGYASPYMITDSDKMEAVLDNPYILITDKKISNIQEILPVLEQVVQQGKPLLIIAEDVEGEALATLVVNKLRGTFNVVAVKAPGFGDRRKAMLEDIAILTGGEVITEELGRDLKSATVESLGRAGKVVVTKENTTVVEGVGSTEQIEARIGQIRAQLEETTSEFDREKLQERLAKLVGGVAVIKVGAATETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTSLMNVYTKVASIVAEGDEATGINIVLRALEEPVRQIAINAGLEGSVVVERLKGEKVGVGFNAATGEWVNMLETGIVDPAKVTRSALQNAASVAAMFLTTEAVVADKPEPNAPAMPDMGGMGMGGMGGMM >NZ_CP012728|258555:266504|262843_264169_+|WP_000833093.1|DBSCAN-SWA MKRYFQFDELGTNYKTEFIAGLTTFLSMAYVLFVNPATLSLGNVKGLPAGTGMDPGAVFVATALAAAIGSLIMGIFAKYPIALAPGMGINAFFAYTAVLTMGIPWQTAIAGTLMSGIIFIILTASGIREKIINAIPSELKFAVAAGIGLFIAFLGFQNAGIIVKNDAVLVGLGDLTKGTTLLAIFGVVTTIIFMIKKVNGAVFYGMILTAILGVATGLIDTPKAVVGAIPSLEPTFGAALTHFGDIFTVQMGIVIITFFFIDFFDTAGTLVAVANQAGLMKNNKLPRAGKALFADAIATVIGAILGTSTTTSYIESSAGVAAGGRSGFTAVVTAGFFLLALFFSPLLSVVTPAVTAPALIIVGILMVSSLGEIDWKKFEIAVPAFFTIISMPLTYSIATGIAIGFIFYPITMVVSGRRKEIHPIMYVMGVLFVLYFIYVRK >NZ_CP012728|258555:266504|258555_258840_+|WP_000917306.1|DBSCAN-SWA MLKPLGDRVVIELVQAEEKTASGIVLPDTAKEKPQEGKVIAVGTGRVLENGERVALEVAAGDLIIFSKYAGTEVKYEGTDYLILRESDILAVIG |
6 | uncultured_virus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
297184 : 305561
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012728|297184:305561|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012728|297184:305561|297184_298492_+|WP_000625683.1|DBSCAN-SWA MISRYTRPEMGAIWTEENKFKAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVKKIREHASFDIDRIYEIEKETRHDVVAFTRAVSETPALGEERKWVHYGLTSTDVVDTALSYILKQANEIILKDLENFVSILANKAKEHKYTIMMGRTHGVHAEPTTFGLKLGLWYEEMKRNVERFKQAANTVRVGKLSGAVGTYANIDPFVEKYVCENLGLEAAPISTQTLQRDRHAHYMSTLALIATSIEKMAVEIRGLQKSETREVEEAFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMTGLARVIRGYMMTAYENVPLWHERDISHSSAERVILPDATIALNYMLNRFGNIVKNLTVYPENMKRNMTRTYGLIYSQRVMLTLIDKGMVREEAYDIVQPKAMEAWETQVQFKELVEADERITSKLTQEEINECFNYEHHMQHVDTIFERLGLNEA >NZ_CP012728|297184:305561|299543_300227_+|WP_000666779.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDVDMFHAIKDELGEEVDYVWHDTENLDEYDAILLPGGFSYGDYLRCGAISRFANAMKAVQKAAEQGKPILGVCNGFQILVESGLLPGALMRNENLKFMCRTVQLRVENNETMFTSQYEKDEVINIPIAHGEGNYYCDEETLKQLEENNQIAFRYVENPNGSVSDIAGIVNEKGNVLGMMPHPERAVDELLGGAEGLKVFQSILKQWRETYVVNA >NZ_CP012728|297184:305561|302414_303830_+|WP_000879029.1|DBSCAN-SWA MLAEIKGLNEECGVFGIWGHENAAQVSYYGLHSLQHRGQEGAGIVVNNGEKIVGHKGLGLISEVFSRGELEGLNGKSAIGHVRYATAGGSEVANVQPLLFRFSDHSMALAHNGNLINAKMLRRELEAEGSIFQTSSDTEVLLHLIKRSTKDSLIESVKEALNKVKGAFAYLLLTGNEMIVALDPNGFRPLSIGKMGDAYVVASETCAFDVVGATYIRDVEPGELLIINDEGIHVDRFTNEVDHAICSMEYIYFARPDSNIAGINVHAARKNMGKRLAAEAPIEADVVTGVPDSSISAAIGYAEATGIPYELGLIKNRYVGRTFIQPSQELREQGVKMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVRMLREAGATEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANHTVEEIREMIGADSLTFLSEDGLVDAIGRPYEGKYGGLCMAYFNGDYPTALYDYEQELLESMK >NZ_CP012728|297184:305561|303936_304977_+|WP_001262436.1|DBSCAN-SWA MANAYKQAGVDIEAGYEAVSRMKKHVQTTMRKEVLGGLGGFGGMFDLSKFALEEPVLVSGTDGVGTKLMLAFMADKHDTIGIDAVAMCVNDIVVQGAEPLFFLDYIACGKAEPSKIENIVKGISEGCRQAGCALIGGETAEMPGMYSTEEYDLAGFTVGIVDKKKIVTGEKIEAGHVLIGLASSGIHSNGYSLVRKVLLEDGELSLDRIYGRLELPLGEELLKPTKIYVKPILELLKNHEVYGMAHITGGGFIENIPRMLPEGIGAEIELGSWKIQPIFSLLQEVGKLEEKEMFNIFNMGIGMVVAVKEEDAKDIVRLLEEQGETARIIGRTVQGAGVTFNGGKAL >NZ_CP012728|297184:305561|304973_305561_+|WP_000088592.1|DBSCAN-SWA MSRLAVFASGSGSNFQSLVNAVEEKRLDAEISLLVCDKPEARAVGRANYHHIPCFAFSAKAYESKEAFEKEILNKLEEYEIDYVILAGYMRLIGPTLLEAYGGRIINIHPSLLPSFPGKDAVGQALEAGVKVTGVTIHYVDAGMDTGPIIAQEAVVVSEGDTRESLQKKIQQVEHKLYVNTVNQIVQSTKEPTVN >NZ_CP012728|297184:305561|298580_299300_+|WP_001170540.1|DBSCAN-SWA MQKLELLYEGKAKRIYRTESADMVWVEYKDSATAFNGEKKETITGKGRLNNEITTLLFRKLQEVGIKTHFVEKLSETEQLVKKVSIIPLEVVTRNVIAGSLSKRLGMEEGTVLAEPIVEFYFKDDDLGDPLVTEDHIRVLNVASPEQVSVLRDMALQINQVLIDHFASCRVRLVDFKLEFGVTDEGAIILADEISPDTCRLWDETSNEKFDKDVFRRDLGNLTDAYEEILKRLGGISHV >NZ_CP012728|297184:305561|299292_299547_+|WP_000278820.1|DBSCAN-SWA MYKVKVYVTLRESVLDPQGTAVKGALHSLSFTEVQDVRIGKYMELTIDKSVSDLDAKVKEMCEKLLANVVMEDFRYEVEEVVAQ >NZ_CP012728|297184:305561|300210_302430_+|WP_000055577.1|DBSCAN-SWA MSLMLEPNPTQIKEERIYAEMGLTDEEFAMVEKILGRLPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTTGERVLQGPGEGAGIVDIGDNQAVVFKMESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPVALLNSLRFGELQSPRVKYLFEEVVAGIAGYGNCIGIPTVGGEVQFDPCYEGNPLVNAMCVGLINHEDIKKGQAHGAGNTVMYVGASTGRDGIHGATFASEELSESSEAKRPAVQVGDPFMEKLLIEACLELIQSDALVGIQDMGAAGLTSSSAEMASKAGMGIEMYLDDVPQRETGMTPYEMMLSESQERMLIVVKKGREQEIVDLFEKYGLAAVTMGKVTEDKMLRLFHKGEMVAEVPADALAEEAPIYHKPSKEAAYFAEFQQMKMETPKVENYKETLFALLQQPTIASKEWVYDQYDYQVRTSTVVTPGSDAAVVRVRGTEKGLAMTTDCNSRYIYLDPEVGGKIAVAEAARNIVCSGGEPLAITDCLNFGNPEKPEIFWQIEKSVDGMSEACRTLQTPVIGGNVSMYNERSGEAVYPTPTVGMVGLVHDLKHVTTQEFKQAGDLVYVIGETKAEFGGSELQKMLHGKIFGQSPSIDLDVELKRQKQVLAAIQAGLVQSAHDVAEGGLAVAISESAIGANGLGATVKLDGEATAALFAESQSRFVITVKRENKEAFEKAVEAIQVGEVTNTNEVTIHNEENEVLLTANVDEMRKAWKGAIPCLLK |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
445989 : 476659
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP012728|445989:476659|DBSCAN-SWA AATGATACAAAAGCAACATGAGAGTAAGTTGGAAGTTGGTCAAACATTTCCTGTGACAATTAAACGTCTTGGGATTAACGGAGAAGGCGTTGGTTATTTTAAGAGACAAGTTGTTTTCATTCCAGGGGCATTACCAGGAGAAGAAGTTGTTGCTGAAACAACGAAAATTCAGCGTGGTTTCGCAGAAGCGAAAGTGAAAAAAGTTCGTAAAGCTTCACCGCATCGTGTGAAAGCACCGTGTCCAGTATATGAGGAGTGTGGCGGTTGTCAGCTGCAACATTTAGATTATAAAGAACAATTGAATCAAAAGCGTGATATCGTTGTACAAGCATTTGAGAAATACATGAAAAACAGTATGGAAGAGAAAATTCGTCCAACGCTTGGCATGGAAAATCCATGGCATTATCGTAATAAGAGTCAATTACAAGTGGGGCGTAAAGACGAAAAGGTTATTACAGGGCTGTATAAACAAAATTCACATCAGTTAATTGATATTGCTCATTGTATGATTCAACATAAAGCAACGAATGAAGCGACAAAAGTTGTAAGACGTATTTTAGAAAAATTAAATGTTTCTATTTACAATGAGAAAAAACAAAAAGGTTTAGTACGTACAATTGTGACACGTACTGCAGTTCAAACAGGGGAAGTACAAGTTACACTTATTACAACAAAAGAAGAGTTGCCAAATAAAGAACAATTTATTGCAGAAGTACAAAAACAGATGCCAGCTGTTAAATCAATTATGCAAAATGTAAACTGGCGTAAAACATCTGTTATTTTCGGAGATAAAACATTTAAATTAGCTGGAAAAGAAGTAATTCAAGAAACACTTGGTGATTTATCATTTGAATTATCAGCACGTGCATTCTTCCAGTTGAATCCAGAACAAACGGTTGTATTATATAATGAAGCGAAAAAAGCCGCTGCTTTAACAGGAAATGAGAAAATTGTAGATGCATATTGTGGTGTTGGTACAATCGGTCTTTGGCTTGCGAATGATGCAGCGGAAGTACGTGGTATGGATGTAATTCCAGAAGCAATTGCAGATGCAAGAAAAAATGCGAAGCGTCACGGATTTACAAATACGAAATATGAAGCAGGTAAAGCTGAACAATGGTTACCTAAATGGGTAAAAGAAGGATGGCGTCCAGATGTAATTGTTGTCGATCCACCACGTACAGGTTGCGACGATAAATTACTGGAAACAATTTTAAAAGTGAAGCCAAAACAAGTTGTTTACGTATCTTGTAACCCTTCTTCATTAGCACGTGATGTACAAGCGTTAATGAAGAGTTATGAAGTGGAATATGTACAACCAGTTGATATGTTCCCGCATACAGCTCATGTTGAGAACGTAGTTAAATTAACGCTGAAATAAAGGGGTTTCAATGAAATTGTTGATGGGTTTGACCACATTCTGACCACATCAACAATTTTTTTATGATTTTAATGCCTCACTTAGCTTTAAAACAGCACTTTCTTGCATATCTATAGTAACATGACTGTAAGTGTCTAATGTGGTCTTAATTGAACTATGTCCTAAACGCTCACTTACGATTTTTGGATTAATACCTAGCTTCAATAAAATTGTTGCATGCGTATGTCGTAAGTCGTGAAACCTAATTTGAGGTACATCGGCTTTTTTTATAAATTGATTAAAAGTAGTTGTCATAGTTCGTGGTAATATTGGCTGTCCAGTTTCTTTAGCAAAAACTAAATCATTATCCTCGTATGACTGCCCAAATAATAATTTGAACTCATTTTGTTTAGCTTTATAAGACTTAAATTCTTTACATAAGTTTTGATCGATAGAAATTAAGCGTTTTGATCCATGTGTTTTGGGTTCTGTAAATCTAAATCCGTTCTCATCATAAATGAGTGTTTCTGTAACGCTTATTTTACCTTCATTCAAATCGAAATTCTTCCACTTTAGACCAAGTATTTCACCACGTCTCATACCTGTATTTAATGCCAATAAGAAAAGATGATAATAGATGACATTTTCAAATTTTGTACGATTTAAGAATTTTTTCGTTTCTTCAATTGACCACGTAGAATTGACCACTTTTCGTGGTCGAGGTATTTCCACATGTTGAAATGGGTTTTTAAACAGGAGCTCCCACCTAACAGCGTCTTCTAATGATCCTTTTAAAACAATGAAAATATATTCAATATACGCAGGTGACAACCCTTCATCAATTAAGGATTTAACGAATCGTTGTCCATGCAAGGGTTTTAAATCCTTTAATTTATGCGAACCAAGCACAGGTATAATTCGACTATTTATAGCTCTTTTATAATTGGTGAATGTAGTTTCTCTTACTCTTTGTTTAGCTGTATTTTCTAGCCATTCTTGTAAATACTCACTAAGAGTAAAATTCTTATCATCAACTAGACTTCCAGTGTTGAATTGATGGATAAGCTCATTGCATGCACGTTCGGCTTCTTTCTTTGTTTTAAAGCCTGATGCTGTTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGTGATAGGATCTTTCCCAATATCAATAGTAAATGACCACTTTTCACCACGTTTTCTAAAGTATCCTTTCATTATCCATACCTCCTTGAACTAATAGTATTCTAATAGCACAAATAATTCCAGTATCAGAAAAAGGAAAAAGCAACTCATCTGAGTTACTTTATGGTAAACTATATTCAACTGTATATGTCGGGTGGCTTGGTTGCTATCCTTTCTCTGTATTTTAGAGAGAAAGGAGGTGACCCTTATGATGGAATATTTACTTTCTTTGTTACAGGATTTACTCAAGGTATTCCTTACTATAGTTGTTACAGCTTATGCAAATAAGTTCGCTAACAATTTGTTTAAGAAAAGTAAAAGAGCCACCCCTCGCCGTAGGAAGCAGGGTAGCTCTAAAAGAAAATAAATAGCAACCTTGCCATCTGATGGCGGCAGTTACTGGAAGAGATGTTAACGGCATCTCTTCTTTTATTCTATGCAATTCAGTTAGGTGTCATACTTAATATATAGTAAATATATGTTCACTATACAGTGGTGATTCTAGTGCCAATATTACCACAGTATCATTTTTGGGTCAACGCAAATAGCAGGGATTGATGGTGAATTTATAATGGTCCACAAAATAAAAAATCATGGTAAAATATATATATCCATACTTCTTAGCCCATACATGTTGTGGGCTTTTTTTATTGATACAAAATCAGTATTTTGTCGAAAGAAAAAAAGAGAGCAAAACGCTCTCTTACCACTACCCAATGGAAAACTTTTCTTCTAAAATGAAATTAAATCAGAATATATCTTGATTATCTTCAAGCATATTGATTAATACGGAGACTTGCTTACAAAAACGTTCCCTCTGTTGTTCATTTAACGCCGCATACGTTGTTTGAACATTAGATAATAGTTCTGTTAAGGGTTCTTCATCAAATTCATTCGTGAACCCAATAAGCGCGTCTACCGAAACATTGAAGAAGGAGGCGATGATAACCAACGTATCTATATCTGGCTGATACCGATCAGTTTCCCAGTTTTTGATTTGGCTTCTACTCAAGTTCAGCTTGTGGGAAAGTTGTTCCTGAGTTAAGCCACGCGACTTCCTTAGTTTTTTTAGAATTTGTCCAAAGTGTCTCATAATTTAAAGTATAAATACTAAACAACTATACTACTATATATGGTCGTTTAACTACCTTTAATGTTAAAATGGTAGTTATGGTTTCTGGAAATAAATCAAAAAACAGAACAAAAGTTCGTATTCTTGTGGTAAAATATGCATGTGAGGTATTCGAAAGTTCCATGCATATTTACATATTTTATTTTCGTTACAGCTGATAAACGTTGGTATATAACGGTTTTACAACTTTCTCAATAATTATCAGATAACTGCATGACTGAAATTTGCCAAAAATATGATATTATGAAAACAAATATAATAAACGGAACGAAAAAAAGACTCACAGCGTGTGTAAGAGTGATTTGGCCCACTCTTACACCGTTCGCCCGACTCACAAGGGGAACATCTGCCATAAGTCTCTTTTCGGTCACTACACGAGTAACACTTACATTATAACATGCCGATATTACTAAAGCATTACTATGGTATTAAATTCCTGTTTTAAAAGTTGAGAAAAGAGCGAAGCGTCTTTGTTCCAAAAGGGAGGAACAAGAAGTGTGGAAAGTTTTAAATGTTCTTGAAGGAGAGTTATATGTAGCTGGAATTAAGAAAAACAAGTTAGCTGATTATTGGGGAGTGAAGCCTGCTACAGTTACCAAGGTATTTAAAGGAGCTAACGATATTAGTTTCGGATATCTTTCGAAGACGCTTATTTTATTAAAAAAGAGTTTGATTTCACAGGCGAAAATTGTTAATGACTATGTAACGAACACAGACCCTAAACCTGAAAATTTAAGAGAAGCTATGGAAGATTTGGCTATTAGAGGTAAATTCGAATTATTGAAAGCAATTATAGATCAAGAGATTCATTCTGATGTTGCCGAAAATAGAGAATTTGCAGAAGTATATGAAATAATTTTTCGAAGATATCATGACGGTTTGAATGCTTCGGCTTATTTCAAATTATTAAGACAAAAGAATAAAAATGTTAAAACGATTGAAATGGAAGTTTTGACAGAAATCTTATTATGCCAGGCGCAATATCAGTCTGGGAATTACAAAACGCTATACGAGAGACTGAAGTCAGTTAGTGAAAAAATAAATGAAATAACAAATAAATTTATAAAAGAATGTTTGTTACTAAGATATAAAGAAGCAATAGCAGTAACTTCTTTACAAGGTGGCGAAGTAGTTGAATCTCGTTCCATATGTCGAGATATATTAGATGAATTAGAGTGGGATGACTTTTTCTCACTGCCAAAACTAAATGCATACTTGAAAATAGGCGAGTCATTAATATTCGAACCTGATAATTACGACAGCGCTAAGTTTTATTTAGAGAAAACATTAGAGTTATTAGGTAATCCTAGTTGCAAAGGATTAGAAAAGAAATGG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46 | Bacillus_phage(67.5%) | head,terminase,protease,capsid,integrase,tail | attL 450331:450346|attR 464995:465010 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
480547 : 484415
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP012728|480547:484415|DBSCAN-SWA ATTGAAACACATAAAACTTTACGATAAACAATTACAGTTAAAAGCATATCTCGAAAACGCATTTAAAATAAAGTACAGCCCGCCACTCAATGAACTTTGGACGGCGGGTTTTTCATTACCTTTTACCGATCCTAAGCGAGAGGAAATTGAAACGTTTGATTATGTGGAAATATTTGATAACGGTAAACGTATCGGATTGTTCCGTATTATGGATAGCGAGGAAGAAAGGGAAGTAAGTCAAAAAATAATAACTTATGACTGTGAGCATGTTTTATCTACTTTAATGGATAGCGTGCTTTTTGGTTATCACGAAAGAATTAATTTAACGACAAGGGAGAATATTGAGTATCTCTTAAGCAAACAAAGAATAAAGCATTGGAAACTTGGTCAATGTGATTTTGTAAAATATTTTCAATATAGTTGGGAAAATGAAGATACGATATTAGGACCGATATATAGTATTGCAAAACCGTTTGATGAGAAATTCCAATGGACATGGGACGATACTTCCTATCCTTGGACTTTAAATCTCGTGAAATATTCCGATGAAATTACAGGTGAGCTTCGATATAGAAAGAACATGAAAGGCATTAAGCGAAAGGTAGAAGCTAAGGATGTCATGACTAGAATTTATCCACTAGGTTATGGTGAAGGTGTTAATCAACTTAATATCAAAAGTGTGAACAATGGTCTTCCTTATATAGATGCTCCTGATTTTGTCAGAGAGTTACAGGATGGGTTTGATTATATTTGGGTGGATAGACGATTTGAGGACCCAAAAACGCTTTATGCTTCAGCAAAAGCGATGTTATTAAAAGCGTGTATGCCAAAAGTTACATATGAAATTGATGCAATTGATTATGAATTGATTGACCCATACAAAATAGAAAAATATGAAACAGGCAAGTTAGTACGTCTATATGATGAGGATTTTAATATATCTGTTGATTTACGAGTAATGGACCGTTCAAAAGATGATGTTACTGGTAATCCACTTGATGTAAAGCTTGTATTAGAAAATAAAGTCACTGATATTGGGACAATACAAGCAGATATTGAAAAGCGACAGAAAGTAAACGAAGTGTATTCTCAAGGAACAACTAATATTGATAGTCAACCTTTCCAAGATAATTGCGACCCAGATCATCCAGCCATCATAAGGTTTCAAATACCTAACGATGTTAAGAATGTGAATCAACTGATACTGACATTTGAGACATTACGGTTTAGAGCATATGAGCGGGCTATTAAAGGCGGCGGAGCTGTCGTTGCTTCAACTTCTGCCGGTGGTGCGAATGTATCTTCAACAAGTTCCGGTGGTGGTACGGTTGGTTCGACGTCATCAGGCGGAAGTTCTGTGCAAGCAAGTAGTTCCGGTGGTGGTACGGTTAAAGCTTCAAGTAGTGGAGGAGATCATGTTCATAAAATGTTTCATGGTGGCGGAATTGTTCCTGCTGAACCATCAACAATAGGATTATATACAGCTTTTTCTGATCCAGGAAGAAATACATCAGCTTCATTTTACGCAAAAGGAACGGGATCTAGTTTCTACACATATGGTTCTAGTGGGAATCACACTCATGATATATCAATACCTAACCATACTCACAGTATTAATATAAATCATAAAATATAGAAGGAGATTGATAACATATGCAAACAATTGAAATCCATACACAAGGCGGATTAAAACATAAAGTGCAGACTGAGGTATATAACGCAGAAGCACTGAATACGAAACTAAACGACAACGATTTAATTACAGTATTAATTGGTGATTTTATTATTCAACGTATTGATGTTAAACGTATCATTCCATTAAATATGATTGATGCGGAAGGCGCTAAAAGGGTAGAAGTTCATACAAATGCTGGGAAAGTGATTGAGATTACAACAAACGATTATGATCCAATCTATCTAAACGAGCAATTAAACAATAATAATACAATTACAGTCGTAATTGGTGATTATATTTTCTCTCGAATTGATGTAAAACAAGTAGTTCCTGTGAAAGAAGAACCTAAAGAGCCAGAACAACCACCTGTGACAGAACCTGAGAAACCGACAGAACCAGTTACACCGCCAGGAGAAGGTACAGAAGATGATAGCATTACAACTACAGAGCAGTTATAAACTGGTCTTTTTATTTTGAACAAAATACGGCTTTTACAACAAAACGAAGTGTGCTTATTGCAGGCTTTTTTATTTTGAATAAAGGAGTGAAAAGATGGCTGAATTAAAACACGATGATATGAAGGAATTACTTGTAGGGTTGACCAGAGTAGAAACCAAGCTTGATACACTCGGTAATGTCAAAGAAGTTGCCATTGAAGCCCAACAATCAGCAAAAAGCGCTCATTTGCGTGTGGATAGATTAGATAAATTAGTTTTTTGGTTAGGTACGACAGTTATAGGAGCTGTTATCGTTGGGGCTATTACAGCATTATTCAAATTCGCAGGAAAGTAGGGAGAAGAATGAATAAGGAAAATATCAAAAAAACGATTCCGCAACTGGAAAACATGGGTTGCGGTTTTTTCTTTGCTTGGATTTTTATTTACAAAGTTTGGCGTTCCAGAAGCAAAAAGCTTTTTGGATGAATTAGCACCTTACTTGCTGTCAGTTGGTATCGCATTAGGTATTTGGTCTGATCATGATGTAAATAGCGAAGGAGACGATAAATAATGGGACATATTATTGATATTTCAAAATGGAATGGCGATATTAACTGGTCTATAGCGAAACAACATATAGATTTCATCATTGCTCGCGTACAGGATGGTTCAAATTATGTAGATCCACTATATAAAGGATATGTACAAGCAATGAAGCAGCATGGAATACCATTTGGTAACTACGCATTTTGTCGTTTTGTTTCAATTGCTGATGCAAAGAAAGAAGCACAAGACTTCTGGAATCGCGGCGACAAGAGCGCTACAGTTTGGGTGGCTGATGTAGAAGTAAAAACAATGAATGATATGAGAGCAGGTACACAGGCGTTTATCGATGAGTTATACCGATTAGGGGCTAAGAAAGTTGGTTTATATGTTGGTCATCATATGTATACACCTTTCGGTATGGCGAACGTAAAAAGTGATTTTGTATGGATTCCACGTTATGGTGGTAACAAGCCAGCCTATCCTTGCGATATTTGGCAATATACTGAAACGGGTAATGTACCTGGTATCGGGAAGTGTGACCTTAATTCACTTATAGGCAATAAGTCACTATCTTGGTTTACAGAATCGGCAACCCAGGAATCTGTACAAGCGCCTACACAAAACATCATCCAATCAGGTGCTTTTTCACCTTATGAAACTCCTGACGTTACAGGGGCATTAACATCCTTAAAAATGACTGCTAAATTCATCTTGAAACCTGATGGATTAACATACTTTATTTCTGATCCAACGTCAGATGCTCAATTAAATGCAATGAAAGAATACCTTGACCGTAAAGGTTGGTGGTATGAAGTTAAATAAAACAAAAGAATAGTTTTATAAACAAAAATAAGAGCCGTCAAATGACGGCTTTTTTATTGCAAATCAGATATTTTCTTAACTTCTTTTTCCTTCGCTTTGAATTCCTTCTCGTATTGTTTAAAATCCTCTTTATCAACATGGAACCTTTCACCAGTTGCAACGTTTTTGACTAAATAAGTTTTACGATTGCGTTCCTTAATTAATCCATATAAGACCAAAAACAAAAGGGAGATACCTATCGTCGGAAGAGCTAAAATTATGCATAGTATTAGTACCGTTTTCTCCGATTTGCTATCTTCACGTTTTAAAATAAGTTTCTCTCCTGATGCAGCTTCCGATTGCTTTAATTGTTGCATTCTTTGGAGTGCAGCAACTGTATCAAGACTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP012728|480547:484415|482199_482679_+|WP_001193271.1|DBSCAN-SWA MQTIEIHTQGGLKHKVQTEVYNAEALNTKLNDNDLITVLIGDFIIQRIDVKRIIPLNMIDAEGAKRVEVHTNAGKVIEITTNDYDPIYLNEQLNNNNTITVVIGDYIFSRIDVKQVVPVKEEPKEPEQPPVTEPEKPTEPVTPPGEGTEDDSITTTEQL >NZ_CP012728|480547:484415|484079_484415_-|WP_000050925.1|DBSCAN-SWA MSLDTVAALQRMQQLKQSEAASGEKLILKREDSKSEKTVLILCIILALPTIGISLLFLVLYGLIKERNRKTYLVKNVATGERFHVDKEDFKQYEKEFKAKEKEVKKISDLQ >NZ_CP012728|480547:484415|483025_483229_+|WP_110925518.1|DBSCAN-SWA MRKISKKRFRNWKTWVAVFSLLGFLFTKFGVPEAKSFLDELAPYLLSVGIALGIWSDHDVNSEGDDK >NZ_CP012728|480547:484415|482773_483013_+|WP_000818882.1|DBSCAN-SWA MAELKHDDMKELLVGLTRVETKLDTLGNVKEVAIEAQQSAKSAHLRVDRLDKLVFWLGTTVIGAVIVGAITALFKFAGK >NZ_CP012728|480547:484415|483228_484026_+|WP_000509854.1|DBSCAN-SWA MGHIIDISKWNGDINWSIAKQHIDFIIARVQDGSNYVDPLYKGYVQAMKQHGIPFGNYAFCRFVSIADAKKEAQDFWNRGDKSATVWVADVEVKTMNDMRAGTQAFIDELYRLGAKKVGLYVGHHMYTPFGMANVKSDFVWIPRYGGNKPAYPCDIWQYTETGNVPGIGKCDLNSLIGNKSLSWFTESATQESVQAPTQNIIQSGAFSPYETPDVTGALTSLKMTAKFILKPDGLTYFISDPTSDAQLNAMKEYLDRKGWWYEVK >NZ_CP012728|480547:484415|480547_482182_+|WP_003164347.1|DBSCAN-SWA MKHIKLYDKQLQLKAYLENAFKIKYSPPLNELWTAGFSLPFTDPKREEIETFDYVEIFDNGKRIGLFRIMDSEEEREVSQKIITYDCEHVLSTLMDSVLFGYHERINLTTRENIEYLLSKQRIKHWKLGQCDFVKYFQYSWENEDTILGPIYSIAKPFDEKFQWTWDDTSYPWTLNLVKYSDEITGELRYRKNMKGIKRKVEAKDVMTRIYPLGYGEGVNQLNIKSVNNGLPYIDAPDFVRELQDGFDYIWVDRRFEDPKTLYASAKAMLLKACMPKVTYEIDAIDYELIDPYKIEKYETGKLVRLYDEDFNISVDLRVMDRSKDDVTGNPLDVKLVLENKVTDIGTIQADIEKRQKVNEVYSQGTTNIDSQPFQDNCDPDHPAIIRFQIPNDVKNVNQLILTFETLRFRAYERAIKGGGAVVASTSAGGANVSSTSSGGGTVGSTSSGGSSVQASSSGGGTVKASSSGGDHVHKMFHGGGIVPAEPSTIGLYTAFSDPGRNTSASFYAKGTGSSFYTYGSSGNHTHDISIPNHTHSININHKI |
6 | Bacillus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_5 |
1838274 : 1847007
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP012728|1838274:1847007|DBSCAN-SWA TATGAAAAAAGTAATTGCAGGTTTAGCAGCAGCTTCTGTAGTAGGTGTTGCAGTTCCAGGTATGGATTCTGCTCAAGCACAAGTTTCAAACGAAGCGCTAAAAGAAATTAATGGACAAGCTCAAACTCAAACGACTGTAACTGAAACAAAAACTGTAGAAACAAAATCTGACTTAAAATACACAGTAACTGCTGATGTATTAAATGTTCGTTCAGGTGCTGGTACAGGACATAGCGTTATTTCTAAAGTAAAACAAGGTCAAGTACTACAAGTAATTGGACAAGAAAACGGTTGGTTCAAAGTAACTGTAAACGGTCAAACTGGTTATGTAAGTGGTGACTTCGTAACAACTGGTGGTAAAACAGGAACTACTGTTCAACAAGGAACTGGTACTTACACAGTAAACGTTTCTTCACTTAACGTACGTACAGGTCCAAGTACATCTCATACAGTATTAGGCTCTGTAAATAAAGGTAAAACAGTACAAGTTGTTAGTGAAGTACAAGATTGGTTTAAAATCAACTTCAATGGTGGAACTGGATATGTAAGCAAAGACTTCGTAACAAAAGGTGGTTCTGCTGTATCTAACCAAACACAACAACCAACTACAAACAACAATACTACAACAGTTCAAACTGGTGGTTCTTATGTTGTTAACACTGGTGCTCTAAAAGTACGTACAGGCCCAGCTACATACAACGCTGTAATCGGTGGTGTAACAAACGGTACAGTATTAAACGTTACTGGCGCTGAAAATGGTTGGTACAAAATTAACCATAACGGCCGCACAGGTCACGTAAGTGCAGACTTCGTTAAGTTTGTAAAAGGCGGAGTAAACAACGTTACGAATAACGTTCAACAACCAGTTAAAGACGTACAAAAACCAACAACAGGTGGAAATACATCTTCAATCGCTGGATTCGCTAGATCTTTAAATGGTTCACCGTACAGAACTGCTGGTACAACACCTGCTGGTTTTGACTGCAGTGGATTCATTCACTACGTATTAAATCAAACTGGTCATAAAGGCGCTCGTCAAACAGTTGCTGGATACTGGAGCTCTAAAACAAAAACTAGCAATCCACAACCAGGTGATTTAGTATACTTCCAAAACACTTATAAATCAGGTCCTTCTCACATGGGTGTTTACTTAGGAAACGGTCAATTCATTAGTGCAGAAACTGATGCAACTGGCGTACGTATTAGTTCAGTAAGCAACTCTTACTGGAGCAAGCACCTTTTAGGTTACACAAAAGCATACTAAGAAAAAGTAGTTTATATACTTTTCGAATAGAGAAAAGGCTTTCCAGGGAAACTTGGGAAGCCTTTTTATAGTTGAATAAATTGGGAGTATAGTAGTTTTTACTTTAACTTCCCGTTTAAAAATCGATCGTATAAGTCATGGAAATAGTTAGGGCGAAATAAATTTGCTGCATGTCCTGCTAACGGTATTTCTTTATATAAAACGTTAGGAAGAATGGACTTTAAATCAAAAAGACAAGATTTATAGAGATGATCATGTTCACCCATTACCCATAGAATAGGGTGGGGAAGTGATTTTAATTTAGATTTTAAATCGAATTCTAACCGATGTCGTAATGATTGGGCAATAATTGATGAATGTAATTGCAATCCGAAACGGTAATAAATATTTCTTGAAATGACTGCAAATGGGTTTGCTTTTAGTATGCCACTTGGAAAAATGGTATTTGCGTATTGAGAGAGCCATTTAGAGTAATCGTCTCCTCGTTTCTCCCAAAATTTTTGAAATACGCTATATAAAAGAGAAGGATTATTATAATGTCCACCAATATGACAAATGCTTAATACTTTTTCTGGGTGCATTTGTGCAAAAATGGTAGAGATATAACAGCCGTAGCTTAAAGCACAAATATGAGCTTTTTGAATGCCTTCTTTTTCGTATAAATTCAATAATTGATCAACGAGGCGCTGTAATGAAAATTCGATAGCTTCACCTTTATCATCGCCGTGACCTAATAAATCATACGTAATAATGTTGTAGGAGGTTGAAAATCGTTTATGCTCTTTTTTGAAGGCACGACGATTACCAACTAATCCATGAATAAAAATGATTGTTTCCTTTTCGGAATGTATATTTGTTTGCAAAAAAGATACTCCTTTCAATAACTGGAGATTTATATAGTATTTTAAATTAGTTATTTATAATTCACATAGAATAATATTAAGTACCAGGTAATAATATCAGATGTTTATATCTGTTGTAAAGATGAGTTTTTATGTATATTTTGTAAAAATACAAAATGTGTGTTTACATTCAGTTTACATTTGTATTGTATTCTATTTTTAGAAAGAACAGTTTTGTTTAACACGAGGAGATGAACATGAATGGAAGTTAGAGATGAAATAAAGAAAAAAGGGAATTGGAGGCAGTTTTTACGCCTTATTCAAGATACAAAGCCTCCGAAAGGGATTCTTGTTTTTGCGTTATTAATGAGTTTGCTTTCTACGGGAGCAAGTTTATTTATTCCGATGTTAACAAAAGGGTTAGTAGATAATTTTTCACTTTCCTCAATTAGTACAGGACAAATTGTTGGATTAGTTGCATTCTTTATTATGCAAACTATAGCTGCAGGATTGTCTATATATTTATTAAATTATATAGGACAGAAGATTGTAGCTGGACTGAGAGAACGTTTGTGGAAAAAGGTACTTATATTGCCAGTATCTTATTATGATCAAAATAGAACAGGCGATACAATTAGCCGCATGACAAATGATACAGGTGTTGTGAAGACATTAATTTCTGAGCATTTGTCAAACTTACTAACAGGTGGTATTTCAATCGTCGGATCATTAATTGTATTATTTGTTTTAGATTGGAAAATGACACTTTTACTTTTAACGGTTATTCCATTATCAGTACTGATTTTAGTTCCACTAGGAAGAAAAATGTATAAGATTTCAAAAGCGCTTCAAGATGAAACAGCTTCTTTTACAAGTGTGCTAACATAAGTATTATCAGAAATTCGTTTAGTGAAATCTTCGAACACAGAAAAAAGAGAATATGAAACTGGAAATAAAGGTATCGAGAAGTTATTGCAATTTGGTTTGAAAGAGGGAAAAGTGCAAGCGTTAATTTCACCAGTTATGTCGTTTGTTTTAATGGCACTGCTTGTTATTATCGTAGGATATGGTGGGATGAGAGTTTCTAGTGGTGCATTAACAACTGGGGAACTAGTAGCGTTTATTTTATATTTAGTTCAAATTATAATGCCGATGAGTCAATTATCTATGTTCTTTACACAATTCCAAAAGGCGATTGGTGCAACGGAAAGAATTAATACCATTTTAGAATATGAAGTAGAAGATCATGAAACTGGTGTGAAAGTCACAAATGCTAAGCAACCAATTGTTCTTGAAAATGTACATTTCGAGTATAACGAAGAAGAGCAAGTGTTAAAGAATATTGATTTCACAATTGAATCTGGAAAAGTAACAGCAATTGTAGGGCCAAGTGGTAGTGGGAAAACGACGTTATTCTCACTATTAGAACGTTTTTATGAGCCAACTAGCGGTGCCATTAAATTAGGAAAAGATGCAATTACGAACTATTCATTACAGTCATGGCGACGTCAAATTGGTTACGTTTCACAAGATAGTCCGTTAATCGATGGAACGATTCGTGATAATATTTGTTACGGTGTTGAGGGGGAAGTAACAGATGAAGAAATTGAAAAAGTAGCAGCGATGGCATATGTTGATGCATTTATTCATGATTTGCCAAACGGATATGCAACAGAAGTGGGAGAACGGGGGGTAAAACTTTCTGGAGGACAAAGGCAGCGAATTGCCATTGCCCGAGCATTACTTCGAAATCCACAAATTCTTATGTTAGATGAGGCAACTTCAAGTTTAGATAGTAAGTCCGAGTCCGTCGTTCAAAAGGCATTAAATAACTTAATGAAAGGCAGAACAACGTTAGTTATTGCACATAGACTGTCTACTGTTGTAGATGCAGATAAAATTATCTTTATTGAAAAAGGGAATCTTACAGGAAGTGGTACACATGATGAATTATTACGTACACATGACATGTATCGTGAATTTGCAACGCAACAATTGAAAATTAAAGAGGCGGCATTATAAAATGAATAATCAGTGGGGATTGTACTCCACTGATTATTCATTTTTAAAAGTTTTGTTAAGGATGCTAATTAGAAAGGAAATGGTTTCTTTGATACCTAACATTTTAATAGTAGACGATGATCCGCATATTAGAGAACTCGTTTCTGTATTTTTAGAGTGTGAAGGTTTTCAAACATATGAGGCAATTGATGGTCTAGATGCACTTCAAAAAATAAATCAAGTGAAAGTTGATATGGTTATTCTTGATATCATGATGCCGAATATGGATGGATTTGATGTATGTTTCGAATTAAGAAAGTACTATGATATTCCGATTTTGATATTAACTGCTAAAGGGGAAACGTCTCAAAAAGTAAAAGGATTTCATCTTGGTACGGATGATTATCTTGTAAAACCATTTGATCCCATAGAACTAGTAGTGAGGGTTAAGGCGTTATTGAAACGTTACCAAATTACAGTGTCGCAATCAATTCAAGTTGGAACTGTACTGTTAAATCGTAAAACATTTGAAGTTACAATTGGAGAACAAACGGTTACGTTACCGTTAAAAGAATTCGAATTGCTCTTTACTTTAGGCTCTAAAGCGGGGAGAACTTGTTCGAGAGAGCAATTAATTGAAGATGTATGGGGATATGATTTTGAAGGGAATGAACGCACACTAGACGTTCATATAAATCGGTTACGTGAGAAGTTTCAAGAAGAGAAGTCGAAATTTAGTATTAAAACAATAAGGGGTTTAGGATATCGCTTAGAGGTAAGTAAATGAGAAAAAGAGGACGAATGAGTAAATTCAAGATGCTGAAAGTAACAGGAGCGATAATAGCACTCTTTTCTTTTCTTACTATTATTTGGTCTACAGCATTTTATGTATCATCTAGTATATTGGATGCCCTTGCAATACATTTATCTCCTTTTGTTACTTACCTCATTAGTGACATACTCAGTTTTATATTTATGATTCTTGTTTGGATATTAATTGCAGTATTAATGAGACCGAAGCGAGAGGCGATGATTTGGACTATTATTGAACCGATACAAAAAATTGCAAAAGGGGACTTTTCGGTAAAAATACGAAATGAAGAGAAATATGATGGGGAAATTGGTGTGCTCGTAAAAAGTATAAACGATATGACAGATGAACTGAATGCGATGGAGAAGATGCGTCAGGAATTTGTTTCGAATGTTTCTCATGAAATACAGTCACCATTAACTTCTATAAAAGGGTTTGCTAGAGCACTACAAGATACTAATCTTCCTGAGGAAAAAAGAAAGCATTATCTTACCATTATTGAAACAGAAACGACGAGATTATCTAAACTAAGTCAAAATTTACTGAAACTCACCCTATTAGAGTCGGAAGAATATACACCAGAAAGAGTTACTTATCGATTAGATCAACAGTTAAAGCAAATTGTGTTAAATAGTGAACCGCTTTGGGCTGAGAAAGAAATTGAATTAGACCTTGATTTAGAAAAAGTGCATATAACTGCTGACCAAGAAAGTATGAGTCAAGTTTGGATTAATTTAATTCATAATAGTATTAAATTTACTCCAAGTAGCGGTACGATTTCAATCAAGCTAAAAGAATATGAGACATTAGTAGAAGTACGTATACGTGATACGGGAAGTGGGATATCCGAAGAACAGAAGCAACATATTTTTGAGCGTTTTTATAAAGCAGACTCTTCACGAAATCGTGCTTATGGAGGAAGTGGTTTAGGTTTAGCGATTGTGAAAAAAGTACTCGATCTTCATCAGGGGGAAATAAAAGTTGAGAGTGAGGAAGGGAATGGGACGGAATGTATTGTTTGTATTCCAAATTATGAAGAGAAATAGTGTTAGGAGGGAATCCTTCTAACACTATTTCTCTTTAAAAATACATTTCCCATTACTGCAGCTATACTGATAAGCTTTTCCTTCGCTATTCATACGGTATGAATAATCAGATTCTTTATCTTTTATAAAGTCAACGTATGCTTCTGCACCGTTTTTATCATCATCTATATCAATGAAATGAACGTGTCGTATAGAATAATCCCTTTTTTCACTTAAACCTCTTTCTTGTAAGTTTGTATGAATCCCTTGTATTAGTTGATCGAACAGTGACCAATTTAAATTAAGATGCTCAAATGATTCAGTATGTCTTCCTAAAATGCCATTGTCTTGTATTATTTTTTTATTATTATCGTATGTATAAGAGTATGTAAAATAAGGTTCGTCTTTATATACGACTTCTGCATAATAGCCGATATTATAAAGGGGAGTATATTTTCCGGCTATACTTTGTATTTCTTTTTGCTTATATCCTTTTATAGTATGGAGATATTCGTTAGTATCTTTTTCTATTACTTTATAATGTAATGGATTACCAAATATAAAGTACATAGCCAAAAATATGCTAAATAGTCCGACTGCAGATAGTGACAAGTACCATTTTTTTCTTTTCATACACAAACACTCTCCTATGTGGAATTTATTTCTATTTTACATGAATTATGGAAAAACATGAGAGTTATAAATAAAAACTTTCTATAGTTACCTACAAGTAACCTACGCACATGAAAGTGCATCATTGCCTTTTTACATAAACATAGATACAATTTTAATATAATACATAACTGAGATGATTAAGGAGTGTTATACTTGGCAGAATTATTACAAGGCAAAAATGCTTTAATTACAGGAGCAGGTAGAGGGATTGGTCGCGCTGTAGCGATCGCATTAGCGAAAGAGGGCGTAAATGTAGGGCTTTTAGCTCGCTCAGAAGAAAACTTAAAAGCTGTAGCGAAAGAAGTAGAAGCAGAAGGCGTAAAAGCTGTTATTGCAACTGCTGATGTTTCTTCATACGAAGAAGTGACTACTGCAATTGAGACATTAAAAAACGGTTTAGGATCTATCGATATTTTAATTAATAACGCTGGTATTTCTAAGTTCGGTAAGTTTTTAGAATTAGACGTTGCTGATTGGGAAAAAATCATTCAAGTAAACTTAATGGGTGTATACTATGCAACTCGTGCAGCGTTACCAAGCATGATTGAACAACAATCTGGTGATATCATTAACATTTCATCTACAGCAGGACAAAAAGGTGCACCTGTAACAAGTGCATATAGTGCTTCTAAATTTGGTGTTCTTGGCTTAACAGAATCGTTAGCGATGGAAGTTCGTAAACATAACATTCGCGTAACTGCTTTAACTCCAAGTACAGTAGCAACTGATATGGCTGTAGATTTAGGACTAACTGATGGAAATCCTGATAAAGTTATGCAAGCAGAAGATATTGCAGAGTTTATCGTAGCGCAGCTGAAATTAAATAAACGTACATTTATTAAATCAGCAGGACTTTGGTCTACTAATCCGTAAGGGATACATGTATAAACAAAAGAAGGGACATCTATTTTGTAATGAAGTAGATGTCCCTTCTTTATTTTTTGTATATGAGACAGAATTTTCGGTATAATTGAAAGCGAATAGTAGAAATGCATTGGAAAATTGAAGGGGATGGTATTTACATGAGTACGATTGAGAAATGGACGGCTGTTGATCAATATGTGAGTGATGTATTAATACCGAAAGATTCTACATTTTCGTAAAAGAATAACGAAAGGAGATAAATAGAATGAAAAAGATGTTTGAAAAATTATAACTTGTATCGTATATAACGCAGTTAGCTCGTGGACCTCCTATATACATATCACTATATTTTATATAAAAAATTGGAGGTTGTGAGTAGATGAGAACGGAAAAAGAAATGATAGACTTAATTATGAATACAGCAAAAGAGGATGAAAGAATCCGAGCGGTTATTATGAACGGATCACGTGTAAATCCGAATGTAAAAAAAGATTGTTTTCAAGACTTTGATATTATTTACGCTGTAAAAGATATACGATCTTTTACGTCTAATCATAATTGGATTCATAGATTTGGAGAAATAATGATTGTACAAATGCCGGAAGAAATGTCATTAATTCCAGCAGATGAAGACGGGAAGTTTCCGTATTTAATGCAGTTCATGGATGGAAATCGGATTGATTTAACACTAGCCCCAGTTGAGTTAATAAATAATTTCGTTAGACAAGATAGTTTAAGTAAATTACTTCTTGATAAAGATAATTGTATGGAAGGATTCCCGCCAGCAAGCGATAAGGATTACTTAATAAAAAAGCCTACAGAAAAAGAGTTTTTGGATTGCTGTAATGAATTTTGGTGGTGTAGTACGAATGTGGCAAAAGGGTTATGGCGAGAGGAACTTTCTTATGTGAAAGGGATGCTTGATGGCCCAGTGCGAGATATGTTAATTGTAATGCTAGAATGGCATATTGGTATGAAAACAGACTTTATAGTTAATGCAGGGAAGTTTGGAAAGCATTTCGAGAAATATATTGAAAAAGATATGTGGGTGCAATTTAAGAGGACATTTTCTAATGCAGAATATGAAAACATATGGGAATCATTCTTTGACATGGGTAATTTATTTAGGGAAGTGGCGAACGAAATTGCTAACGCTTATGGATATCCGTACCCGCAAGGTGATGATGACAGAGTGACAAGTTATTTAAAACATGTGAAAGCTTTACCGAAAGATAGTACATCAATTTATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP012728|1838274:1847007|1845044_1845764_+|WP_000818985.1|DBSCAN-SWA MAELLQGKNALITGAGRGIGRAVAIALAKEGVNVGLLARSEENLKAVAKEVEAEGVKAVIATADVSSYEEVTTAIETLKNGLGSIDILINNAGISKFGKFLELDVADWEKIIQVNLMGVYYATRAALPSMIEQQSGDIINISSTAGQKGAPVTSAYSASKFGVLGLTESLAMEVRKHNIRVTALTPSTVATDMAVDLGLTDGNPDKVMQAEDIAEFIVAQLKLNKRTFIKSAGLWSTNP >NZ_CP012728|1838274:1847007|1846134_1847007_+|WP_001258491.1|DBSCAN-SWA MRTEKEMIDLIMNTAKEDERIRAVIMNGSRVNPNVKKDCFQDFDIIYAVKDIRSFTSNHNWIHRFGEIMIVQMPEEMSLIPADEDGKFPYLMQFMDGNRIDLTLAPVELINNFVRQDSLSKLLLDKDNCMEGFPPASDKDYLIKKPTEKEFLDCCNEFWWCSTNVAKGLWREELSYVKGMLDGPVRDMLIVMLEWHIGMKTDFIVNAGKFGKHFEKYIEKDMWVQFKRTFSNAEYENIWESFFDMGNLFREVANEIANAYGYPYPQGDDDRVTSYLKHVKALPKDSTSIY >NZ_CP012728|1838274:1847007|1842480_1843167_+|WP_014654523.1|DBSCAN-SWA MVSLIPNILIVDDDPHIRELVSVFLECEGFQTYEAIDGLDALQKINQVKVDMVILDIMMPNMDGFDVCFELRKYYDIPILILTAKGETSQKVKGFHLGTDDYLVKPFDPIELVVRVKALLKRYQITVSQSIQVGTVLLNRKTFEVTIGEQTVTLPLKEFELLFTLGSKAGRTCSREQLIEDVWGYDFEGNERTLDVHINRLREKFQEEKSKFSIKTIRGLGYRLEVSK >NZ_CP012728|1838274:1847007|1844261_1844849_-|WP_000823558.1|DBSCAN-SWA MKRKKWYLSLSAVGLFSIFLAMYFIFGNPLHYKVIEKDTNEYLHTIKGYKQKEIQSIAGKYTPLYNIGYYAEVVYKDEPYFTYSYTYDNNKKIIQDNGILGRHTESFEHLNLNWSLFDQLIQGIHTNLQERGLSEKRDYSIRHVHFIDIDDDKNGAEAYVDFIKDKESDYSYRMNSEGKAYQYSCSNGKCIFKEK >NZ_CP012728|1838274:1847007|1845880_1845994_+|WP_003158174.1|DBSCAN-SWA MHWKIEGDGIYMSTIEKWTAVDQYVSDVLIPKDSTFS >NZ_CP012728|1838274:1847007|1838274_1839537_+|WP_000755532.1|DBSCAN-SWA MKKVIAGLAAASVVGVAVPGMDSAQAQVSNEALKEINGQAQTQTTVTETKTVETKSDLKYTVTADVLNVRSGAGTGHSVISKVKQGQVLQVIGQENGWFKVTVNGQTGYVSGDFVTTGGKTGTTVQQGTGTYTVNVSSLNVRTGPSTSHTVLGSVNKGKTVQVVSEVQDWFKINFNGGTGYVSKDFVTKGGSAVSNQTQQPTTNNNTTTVQTGGSYVVNTGALKVRTGPATYNAVIGGVTNGTVLNVTGAENGWYKINHNGRTGHVSADFVKFVKGGVNNVTNNVQQPVKDVQKPTTGGNTSSIAGFARSLNGSPYRTAGTTPAGFDCSGFIHYVLNQTGHKGARQTVAGYWSSKTKTSNPQPGDLVYFQNTYKSGPSHMGVYLGNGQFISAETDATGVRISSVSNSYWSKHLLGYTKAY >NZ_CP012728|1838274:1847007|1843163_1844237_+|WP_001231513.1|DBSCAN-SWA MRKRGRMSKFKMLKVTGAIIALFSFLTIIWSTAFYVSSSILDALAIHLSPFVTYLISDILSFIFMILVWILIAVLMRPKREAMIWTIIEPIQKIAKGDFSVKIRNEEKYDGEIGVLVKSINDMTDELNAMEKMRQEFVSNVSHEIQSPLTSIKGFARALQDTNLPEEKRKHYLTIIETETTRLSKLSQNLLKLTLLESEEYTPERVTYRLDQQLKQIVLNSEPLWAEKEIELDLDLEKVHITADQESMSQVWINLIHNSIKFTPSSGTISIKLKEYETLVEVRIRDTGSGISEEQKQHIFERFYKADSSRNRAYGGSGLGLAIVKKVLDLHQGEIKVESEEGNGTECIVCIPNYEEK >NZ_CP012728|1838274:1847007|1839635_1840400_-|WP_001194297.1|DBSCAN-SWA MQTNIHSEKETIIFIHGLVGNRRAFKKEHKRFSTSYNIITYDLLGHGDDKGEAIEFSLQRLVDQLLNLYEKEGIQKAHICALSYGCYISTIFAQMHPEKVLSICHIGGHYNNPSLLYSVFQKFWEKRGDDYSKWLSQYANTIFPSGILKANPFAVISRNIYYRFGLQLHSSIIAQSLRHRLEFDLKSKLKSLPHPILWVMGEHDHLYKSCLFDLKSILPNVLYKEIPLAGHAANLFRPNYFHDLYDRFLNGKLK |
8 | Bacillus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
2156143 : 2163267
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP012728|2156143:2163267|DBSCAN-SWA ATTACTTTTTAAAAATTTCTCTTGAGATACTGTCCTTAGCGTGTATACCACCTTGATGTTCATCAGGGTATTTAGCTGGGTGCATATTCCACCATTCATGTTCTCCGCCATGTGCATTTTCAATAAAATGATGTGCATCAAATGGCTTATCAATTCTCCGTGATACTTTACCTCTTCTAGAAATAACTTCCTCCGTATATGTAGGCCATGTTTGGCCTGTTTCTTTTTCCCATTCAGCTATCAGCTTATTTTTTATAGTATTGAACTCAGCCCTTCTTTGATCTACTTCTTCCTTGCTTAATCGTTCATAAGCATTCTTTTCTAAAGCTTCCTGAAGCAATTCTCTTTGATTTTCAGGGATTTTTCTGTTTGTTATTTCTTCTACTTGGCTAAGATATTCTTGGAATCTAGGTGTATTTAAATTACCAGGGTCAGCAAACATAAATGTATTACGTGCATCTTCTAAAGAATTAAAAGAAGTTTTTGGAATATCTCTAAACTCACTAACGCTAGCATATGCAAAGCGATCTCCCATTTGCAATTTATTCGTAAAATGCGAAATACCTTCTGAGAATTTTGCTACACTCGCACCCTTTGCGAGTGTAGTGACTTTGCTTATTCCTTTATCACCAATAAGTCCTAAACCAACTTGAGTTAAAGCATAACTTCCCCATTTTGCACGACTTTCTGCGTCACCATTTATTACATCATTAATAAATGAATCTGACAATACATTATACATGGTACTAAGGGTATCAATAGGGTGCAGGGCGGCATTCCCCATGTTTTCCCACGTCTCCCATTTACCAAGTGCCTTAAAGCCTTCTACTGTATCTTCAACAGCTTGTCCCGTACCTTCTACAATACCGTCCCACACCTTTTTTATTGTAGATTTTTCAGGGGGTTTACCACACATTGCACCTTCTTCCATTGTAACATCTTGATTATCTGCATTGCGGAATTTTTCAGCAATCCGTTTCAAGTCTTCTTCTACTTTTACAAGTGAATTAATAGATGTAAAAGCTTTTGGTCTCGCATCATTGAACATTTGAATGAACTGTTGATTAGAGGCACCAATCCATTGAAAACACAATTGATCTATTTCGTTACATAAATTATTATGTATAGATTCTAATGCGATTCTGGTATTATTTGCACGATTAGCCACTTCTTCTAGCATTTCAGGTGTTACTTTGATTTGAACCATTTTTTTCCTCCCTTTCCCAATTAAAATTATGAGATAAAAAGAAAAAAATGTAAACATGGAAATTTTAGATTAGTATAATAATATTTATGTGAAGTAAAATCTGTTTAATTATAAATAAACCCTATGTGTACGTGAAGTAAAAAGAGCCGCCCTGTTGGGCAGCTTTTTTAATATCTATCAATTATTTTCTTTTAATACCTATGAATAATGAATCATAGCCTTTTGTTTGAGGACTTGTGCCTAACTCGATTTGGTATTTCCCTTTATCTAAGTAAGTGTGATAATCTCGCCCTCTTGCTTTTTGGGAAGGCATTGCTATAACATCATTAATTTCTTTATCTAGATTAAGATCTGAATTTATTAAAGTAATCCAACTTTTTGCTAATTCAACAGTTGCGTTATCAATTATAAACATAATATAGAAATCATGTTCATTTTCACCTTGTACAAAGAACTGTCCTTGTCCTAAATCATAAACCCTTCCCAAATTAGGGTTAGAAGTACGTAACTGTACACTTTCAGGAAGGCCCATACTACTGACAGATGCGCTTTCGTATTTATAATCTTCATTATATTTCTTGTTTATCTTTGTAATTAGATTTTGCGCTTCATTAGATACAGATTTTTTTAGCACCGGTGAAGCATTTTTCCAATTGTTACTGTTGTAATAAAAATCATTTGTAATCATAGAGCTAGGGATACCGAAAGGTGTTAATTCAGGTTTAACTTCTACTGTATTCATTGCATTATATAGAAATTGTGCATACTGCTCACGAGTTACAATATTTTTAGGTTCAAATAGATTATCTCCTGTGCCAGCAGCAATTTTATTTTCTTGTAATGCACTAATAGCATTTGTCGCCCAGTAATTTTTATCTACATCTTTGAAAGTGGTAGTAGATGTCGCTTTGAAGTTAAAAGCCTTTGTTAATACAACAGCTAATTGTTCACGTGTTAAAACATTATCTGGACCAAATTTTCCATCGCCAAAACCGTTCATAATACCTGCTTTACTAAGACTTAAAATTTCTTTTTCAAACATATGTCCTTTGACATCAGTGAAAGGATTTGGTGCATTATGTTCATCTGCTGGTTTCAAGTAGGCATATATCAGTCTAGCTACTTGTCCTCGTGTGATATTATCCCCAAAACCAAACATTCCGTTTCCATAGCCAGCCACAATATTTTTCTCTTTTAAACCCATAATTGCATTATAAGACCAATGATCTGAAGGAACATCGCGAAATCCAGTCTCAGCTTGTGCGTTTGTTAAAGAGGTAAACGTTGATGTAGCAAGAACAGCGCCTGCTAAAATAATTTGTTTGAATTTCATTAGTGAGCTCCTTTTAATTAATTTTTTACAAATTAATTACTTATTTTATTAGTAAATTTAAATATAATAATTAATAGTATATTTGTGTTTGTAAATTAAATCAATATTTAGTTGTAAATGGATATTGAGATAGATGTTATAATTTAAAATAAAGAGATGTAGCGATGTAGCGATGTAGCGATGTAAAGGAGAGGGACAATATGAAACAAAAGATTTCAAATGTCACAGGAGAAATAATTTTATCTTATAAAGAAAATGGCTATCAAGTAGTACTAGATGAATTTAAACATGCAAAATGTATTAATATTGTGACTTATAATATTAATACATATGAATCTAATTCGGTACTAATCAAAGAACTTAGAAAGTTGAATAAAACTACAAAGATAAACATTATCTTGAATATTCCAAACGGTAGTTACGTGAAAAATTTCAAAAATAGGATAGACCAAAAAGAGTTTGATAAGGTTAAATGGAAAATTAAAAACGCTTTGAGTGTTTTGGAACAAGAGAAATTCGGAAATTTAGAAGTGTATATCAATCTTGAGAATCACGCAAAATTAATTATGACTGATCACATCGCCTATATTGGTTCACAGAATTTTTCTGATGCTAGTGAAGGTAATTTTGAATTAGGTTTTTTAGTAAAAGATTCAAAAGTAATCAGAGACATTGAGAGAAATATTTTTGCAGAAATTAAGAACAAATCAATATACTGTATCATTTCTGAATATAGGGCTACAATGGAAGAGATATCTGTAAAATTGGCAAATAAGTTACAAAATATTCGAGAAGATATTTTAACATGGGTTGGAGATCCACCTTTTACTTTTAGGCAAGAGGTCTTTTTTATTGATGACGCATATTTTCATAAAGAAAGATGGGAAGAATTTAAGGAGTTTCACTCTGAATTTGAAGTTATAACCGAAAAACTAATAGATGAGTATCCTTCTGAATTTAATAAAGAAAGCGCAAGGGAAACAGTAAAACATTTAAGAAAACTAGTAAAGCTACTTGTTTCTGAATTGGACGAACTGGCTAAATTTAAAACAAATCAAGAAGAGAGTATGATGTGGGATAAGTTTCATCAACTTGATGTGGGTGAAAATATGGAAGAAGCTTTAGAAGACGCCCGATATTATGTAGAAAATTATAAAGAAAAGAATTACCGAGAAATAGAGTATAAAGGGAAAGAGTTAATTAAAACATTTGATTATATAAAAGAATCTATTCAAGATATTGAAACAATTGTTGATGAAATAAAGGATTCTATGATTAGAAAAGCTCTCAATCAAAATATAGAGAGAATCTTACAAGATATAAAAAAACAATAACAAAAAACGACTGTAAAAACGGTCGTTTTTTTTATGACTTCATCATATGAATGAGCGCTTCACCATCAATGAGCTCAATATTTTTGTTCGCAGCATATTGCCTTGCGTTCTTATTGAAATTACTCAGTGTAACGAAATATCCTCCAACTGCATCACCATCAATAATAGCACTATGTAATTTTTGAATGTATGGCCTTCCGATAGATTCTTTTGTATATCTTTTCACTTCAACAAATTTCACTTCATCGTCTTTCCAAAGGATAATGTCTTTTCCACCATCATTAGAGCCAGGGGTAACTTGTGCTCGATACCCAAGAGAATAAAACAAATCAGCAATTAAGTATTCAAATTTTCGTGGATCCATTTTCTCTAGATATTCACGATTAGCCTGCTCTCTTAAGTGGTTCATACGAATTTCCTCTTCTGAAACTTGTGGTGCTTTAAGGATAATTCCTAATGCAAAAACGACGACCAATGAAAGAATAGCCCAAATCATACAATTCACCTCAGTATGAGTATAACCAGCTTATGGCTATTCTATTTCCTCTTCAATCCAAATGTCTTCTACAGATAAATCAAGTGTTTTTGCAATGCGCATTGCAACTCTCAATGTTGGTTCACTTTTTCCTCTTGCTATTAAGCTAAGTGTTTGGTCTGTAATACCTACGATTTTAGCGATATCGGATTGCTTTATCATTCTCTCAGCCAAGATTACTTTTAATTTGCATTTCATAAATTTATCACCGTCCTAGTTTTATTGTTCAATTTAAATTTTAAAAAACCTTTTTGATTTTTTATGGTGGACAAACAAGATTTTTAATTTTAGGTCATATACCTATATCAAGACCACGAGGAATACCAAGTGGAATCAAGGACAACAAGAGGGGAGAGGGCGCGCATGCGTTGGCAATATTCACATTTAAACGAAACGCCTTACCTGTATCCATCGAAGGAATTAAGAAAAATGTATAGAGATTCTAATGGTAAAAAAGAAACAAATGCGATAGTGGACCACATGGAAAGATATGAGGTTTTTAACAATCGTGAATATAAAGGCTATTACCGTTTATCGAACGATATTATGGATGATTTATATGAAGATGAGGACGAAGTGCTTGATTGGGGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP012728|2156143:2163267|2157530_2158682_-|WP_000669607.1|DBSCAN-SWA MKFKQIILAGAVLATSTFTSLTNAQAETGFRDVPSDHWSYNAIMGLKEKNIVAGYGNGMFGFGDNITRGQVARLIYAYLKPADEHNAPNPFTDVKGHMFEKEILSLSKAGIMNGFGDGKFGPDNVLTREQLAVVLTKAFNFKATSTTTFKDVDKNYWATNAISALQENKIAAGTGDNLFEPKNIVTREQYAQFLYNAMNTVEVKPELTPFGIPSSMITNDFYYNSNNWKNASPVLKKSVSNEAQNLITKINKKYNEDYKYESASVSSMGLPESVQLRTSNPNLGRVYDLGQGQFFVQGENEHDFYIMFIIDNATVELAKSWITLINSDLNLDKEINDVIAMPSQKARGRDYHTYLDKGKYQIELGTSPQTKGYDSLFIGIKRK >NZ_CP012728|2156143:2163267|2160914_2161217_+|WP_001267637.1|DBSCAN-SWA MRWQYSHLNETPYLYPSKELRKMYRDSNGKKETNAIVDHMERYEVFNNREYKGYYRLSNDIMDDLYEDEDEVLDWGDVINEYQPVMTPKGLQLIRKEGFK >NZ_CP012728|2156143:2163267|2160548_2160749_-|WP_000649834.1|DBSCAN-SWA MKCKLKVILAERMIKQSDIAKIVGITDQTLSLIARGKSEPTLRVAMRIAKTLDLSVEDIWIEEEIE >NZ_CP012728|2156143:2163267|2158882_2160016_+|WP_000810464.1|DBSCAN-SWA MKQKISNVTGEIILSYKENGYQVVLDEFKHAKCINIVTYNINTYESNSVLIKELRKLNKTTKINIILNIPNGSYVKNFKNRIDQKEFDKVKWKIKNALSVLEQEKFGNLEVYINLENHAKLIMTDHIAYIGSQNFSDASEGNFELGFLVKDSKVIRDIERNIFAEIKNKSIYCIISEYRATMEEISVKLANKLQNIREDILTWVGDPPFTFRQEVFFIDDAYFHKERWEEFKEFHSEFEVITEKLIDEYPSEFNKESARETVKHLRKLVKLLVSELDELAKFKTNQEESMMWDKFHQLDVGENMEEALEDARYYVENYKEKNYREIEYKGKELIKTFDYIKESIQDIETIVDEIKDSMIRKALNQNIERILQDIKKQ >NZ_CP012728|2156143:2163267|2161213_2161396_+|WP_000156980.1|DBSCAN-SWA MTIVGEAVIVWTATGLSVITMKVAEKMGLSVPHWLPRMTMYTTLTGSFLYLLRYVLFAFL >NZ_CP012728|2156143:2163267|2160047_2160512_-|WP_000637733.1|DBSCAN-SWA MIWAILSLVVVFALGIILKAPQVSEEEIRMNHLREQANREYLEKMDPRKFEYLIADLFYSLGYRAQVTPGSNDGGKDIILWKDDEVKFVEVKRYTKESIGRPYIQKLHSAIIDGDAVGGYFVTLSNFNKNARQYAANKNIELIDGEALIHMMKS >NZ_CP012728|2156143:2163267|2156143_2157349_-|WP_000249923.1|DBSCAN-SWA MVQIKVTPEMLEEVANRANNTRIALESIHNNLCNEIDQLCFQWIGASNQQFIQMFNDARPKAFTSINSLVKVEEDLKRIAEKFRNADNQDVTMEEGAMCGKPPEKSTIKKVWDGIVEGTGQAVEDTVEGFKALGKWETWENMGNAALHPIDTLSTMYNVLSDSFINDVINGDAESRAKWGSYALTQVGLGLIGDKGISKVTTLAKGASVAKFSEGISHFTNKLQMGDRFAYASVSEFRDIPKTSFNSLEDARNTFMFADPGNLNTPRFQEYLSQVEEITNRKIPENQRELLQEALEKNAYERLSKEEVDQRRAEFNTIKNKLIAEWEKETGQTWPTYTEEVISRRGKVSRRIDKPFDAHHFIENAHGGEHEWWNMHPAKYPDEHQGGIHAKDSISREIFKK >NZ_CP012728|2156143:2163267|2161514_2162705_+|WP_000571537.1|DBSCAN-SWA MIELLLVPAAGLTVALFGEKFKSKNDDKRKIQVFFEVAGIAIKRNNEEKLQYPKFQKQIDDDRSTTYVYTLPLGMPSKIIQKVEDVVSEGLNKPVRIQYDNYKLNIRVFRREIPKNWSWSMDLVTKGKWCIPVGQSLETIVYHDFDETPHMAVGGLIRMGKTVFLKNMFASLSLANPDHAHFYLIDLKEEGLEFSEYKKLKQVEQIAETSEQAHGMLLKVMEKMHERGKYMKERGIKNIVHTKEKDRYFIVVDEGAVLAPAKGLPRAHNKMLEECQYMLSHIARVGGALGFRIVFCTQYPTGDTLPRVVKQMANAKLGFRLPTRTASEVVIDQSGLEQLPSIPGRAIYMKERFTVLQVPYIDDVVMWKHLKEYEVEKYEHPEPYENQPSDGDTCDD >NZ_CP012728|2156143:2163267|2162682_2163267_+|WP_009879021.1|DBSCAN-SWA MAILATIRKLQFATRRHLMSVHNMGGIRNANRILGDLKPYVNKTMQGKEYVYYLNKEGHAMFGDDGKVVSRGKLAHALLRNEAWLHLFCPDDWQIETDIRYIKNKEKMKIVPDVKFRDEENILHAVEVDRSQKMKVNEEKIKKYEEFTQIYKQKHNGKMPVIHFFTVTKYREKKLEELAAKYDVLASVYVIEEI |
9 | Bacillus_phage(71.43%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
3432903 : 3483667
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP012728|3432903:3483667|DBSCAN-SWA 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52 | Bacillus_phage(33.33%) | holin,head,terminase,protease,capsid,portal,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
3496005 : 3507559
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP012728|3496005:3507559|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP012728|3496005:3507559|3499260_3499890_-|WP_000861089.1|DBSCAN-SWA MKTYTGFEAIERMKTNWIKEKNDFFAHTLKKGKHEVFGISSQRIVPSAIGMNFFFENEFVDYEKPLNLEYGEMFVMESSNGKWYGILKEETQTKYYLIMGLKVGEYRFYENGCSFKRYQGRTFRKATDEELEEFERFMVFYKKDRKMDEFKLGDICEREDVLYKVVVQTEDNKFEGVLGCVAINEKDTPVKYFPVKSMELQFCVEDMVG >NZ_CP012728|3496005:3507559|3500840_3501599_-|WP_000067428.1|DBSCAN-SWA MSNLLIHEEPLLVLPGLASRIGLNEAIFLQQIHYWLNRSKHFYDERNWVYNSVAEWVKQFPFWSENTIRRIVKNLEDEQLLVIGNYNRAKFDKTKWYSINYEKLRLLESTNDVPNLGRRSTQNGQMDVPNLGKPIPETNTETTSEIKEYIVEIVNYLNDVCGSSYRLTSKKTQTLIKTRLVEGFTVDNFKTVIDTKAKEWLRTEQAKYLRPETLFGTKFEGYLQQGKVEGKHGSSKGNRYSKDPFEEDDLPF >NZ_CP012728|3496005:3507559|3506414_3506885_+|WP_003169928.1|integrase|DBSCAN-SWA MASFRKFGDVWEFRVRFKDPYTQKYKEKSKRGFKTKKEAQLAAAEEEKKLLNGLEVEITPTSLKHYLRDWLKLFKQDNVRKNTFILHERNIEKHIIPYFQNMNLKELKPMMYQKFINSLTDQGYSKRTVQIIHGTMNNAMKKAVSLKKSKTILVKK >NZ_CP012728|3496005:3507559|3501881_3502553_-|WP_001002737.1|DBSCAN-SWA MNEIKNYFAELASIDVSKHVEKKGRFSYLSWSWAVDQLLKKHPDATWQVVRFDGLPYMKTEVGYFVEVEVTVNNITRSQIHPVLDNYNKPIAKPTSFQINTSIQRCLAKAIALHGLGLYIYSGEDIPQDDEPKQAAKQLDNVPQQEQARQTEIANEQRIKAIHVQIRELSEVYNMPFEETKNTVKQSLGIQTFKGMTVQQASQLQKTITSWLNEAKEKQQQAQ >NZ_CP012728|3496005:3507559|3499135_3499258_-|WP_000553935.1|DBSCAN-SWA MHQHIIDQLIDRGIYKSKDGLRDLFECSFEELVEMLEGEE >NZ_CP012728|3496005:3507559|3498468_3499041_-|WP_000615365.1|DBSCAN-SWA MIQLHTITSEEKKQNFDITELFEMQKELDKRIGYKGNDKMDMLFRALLVEISEAWNETRAFKMWSTGFGVPKNGLLEELIDGLHFLMNIVIELDKCTWRHELIPSFSMQSIMRKDTSNVNMLFEWYMQDVLTAKRAWCQYRDLTTTMGHLRRAFGIFFRICYLYGFTYEDVIDSYKEKNAENFERQENGY >NZ_CP012728|3496005:3507559|3500074_3500905_-|WP_001229822.1|DBSCAN-SWA MALVKVTDIAKTLSKKMIFLSDTCEVCKKERKRTVRFMKINGEVVCPVCKLAEDNHKLEAEMNVFRDEKEQRKRKSMFYDKSLIKDETIKLARFSTFKSDCEEDEKNYTLAKRALEDYLDDVRFNLILVGKVGAGKSHLAYSIAHEMNENSAGTVLYVSVSELFDYISSTFNGQSEESEHSIVNLLISADLLVIDDLGAELGDMDAADPKATAFVNRVLFKVFDGRQGKKTIITTNLTGEAVMKAYDERITSRMFNTYRHIEFKYTRDKRKRKLPF >NZ_CP012728|3496005:3507559|3501595_3501868_-|WP_000849734.1|DBSCAN-SWA MKTIVRDGSMPIALNRSLGTRYLRDKRLSELLKRCRRLENEGFDYLFPIRKVLETIKHRNDENPHLFKGCLVMDRDRGFYYEVVMRKVKR >NZ_CP012728|3496005:3507559|3502549_3503032_-|WP_000780695.1|DBSCAN-SWA MKLYELTSNFNQLQQMIEDGVDPEVINDTLQSISEAIKDKVQGAALLIRNIEAQVEVIKGEENRLAERRKSFENSCKNIKDYLYHQMVAVNKKRIKGALITVGIQKNPASLDIAEDAIIPPEYMIPQNPKVDKKALLLAIKNGMKWDGISLKQGESVRIR >NZ_CP012728|3496005:3507559|3503046_3503310_-|WP_000897921.1|DBSCAN-SWA MLFKRFCINKKKPMAVGSIKKQIQSQYITWGDYVEETIENQLLQKQVEKAVSSLKLISAKEADICRKLDIDYVITVLTNKPYGSMPF >NZ_CP012728|3496005:3507559|3496684_3497443_-|WP_000382673.1|DBSCAN-SWA MDVKLLAHTQLSEEFVNYLSVVFGIGDEGFDPTHGQVVALSAIRTCYSPNKPSRIVSLEGEKYFKGKATDGKGGKEVDRLIRHIVGSGHASTLEHLTYTFAVEGVSRALLAQLTRHRVGFSYSVQSQRYVRMGSNDKIGGFDYVVPETVKAKGEQVVNAYNEMMYKLQSGYDLLRTLGIPAEDARSVLPNAAATNLVLTVNLRGLLDFYNKRRKGKGAQAEIAELAEQLRQEVVKVEKWVDEFFWKWKVTEV >NZ_CP012728|3496005:3507559|3505325_3505739_+|WP_000060654.1|DBSCAN-SWA MSLVNTIKNLCKNHDTSISALEKDLEFGNGTIRKWDKAYPSADRLQKVADHFNVTTDFLLGRTNQMHLTTKDEKDIEKRMEEIKRDLQGEDGLMFSGEPMSEEAVESLLDAMEYIVKQTKVINKKYVPKKYRSTDDN >NZ_CP012728|3496005:3507559|3503281_3503599_-|WP_000510717.1|DBSCAN-SWA MGIENLVLPEDAELAKSLRNKKENYIKNQFLLTRIASKKNVEGKTKEFYEACKEYEACGEKAKECDKQLKELIFKKKENDRVQHVVERMREVGIKEDVIQKVLYK >NZ_CP012728|3496005:3507559|3504849_3505050_-|WP_000877760.1|DBSCAN-SWA MKYSSFGIEVRKVLLERDLTLTVLASELKISVSYLSDILKGSRKGKKQKKAIVELLGLDMCEEDLK >NZ_CP012728|3496005:3507559|3505761_3506190_+|WP_000673782.1|DBSCAN-SWA MKFVIRDLVQQLCTKYNTTNPYELADYLKINVLTWDLHEEINGFYKYEKRNRFIVINNHLSPSMQRTVCAHELGHAILHTHANTPFLRKNTFFSVDKLEIEANTFAALLLIDKKTIQPGDTKACIAYKNDIPVELLEFYKPY >NZ_CP012728|3496005:3507559|3496005_3496290_-|WP_000520475.1|DBSCAN-SWA MGKSQRNKGMRREREFASLIGGARVPLSGAMDGYSNDVKGLGLEWEVKARKEGFKTLYNWLEDEREQPDALAIKADRKPWLVVMPLDTFLKMVK >NZ_CP012728|3496005:3507559|3503749_3504016_-|WP_000483549.1|DBSCAN-SWA MFNVQVDENVVKELCVEEIQKKVKEYDAELAFWDTKELKKRVCMSWNTIQDQFFFDPRFPKFKVGKKWYFPAKQVQAFLVEWAEERMD >NZ_CP012728|3496005:3507559|3506929_3507559_+|WP_003171984.1|integrase|DBSCAN-SWA MRSEDIPLFLKTSYQYNYIYYIFFKALLNTGMRKGEAAALQWKDINLKEHTIIISKTLDFTAKTKEELFGDTKTFTSKRTIMIPKSLVDELLAHKKWQNANKLVLQDAYEHELDLVFSRVDGKFLPKSTLFNAFSRILKKANLPRLEIHSLRHTHAVLLLESGASMKYIQDRLGHKSIEITSNVYSHISDKINKDSISGFEAYMNNVLG >NZ_CP012728|3496005:3507559|3504124_3504853_-|WP_000572505.1|DBSCAN-SWA MIEQIMVVDEKEESFVKGDQESLVFIKDNKVVTDSLTVAEVLKKQHKHVLRDIKVQMEKLESAGEGEFTESNFGLSFYKDVTGRTLQKIDMTEDAFTILMFSYNTIETMKIKVRFIEEFKRMRAFIENQSILPTDTFSQIELLATGTSNLNKRVSSLEQVVEKQLTVDYGQQRVIEKTKAKRIYFLWENGHVDSEVHDSTRKLFGLLGRNLKDAFNVNSYRDILKKDFEEALNFINGWRPMI >NZ_CP012728|3496005:3507559|3497674_3498454_-|WP_000286272.1|DBSCAN-SWA MYRSKESGLKMLDLCSGIAGISMAADWAGIDTAAFCEIEEFNQKVLRKNYPNIPIFPDLYKLMKQSLIDGGVDVDSIGVISAGYPCQGESLVGKRRGAEDERWLWPEVFRLIKELRPTWFVGENVAGHVTMGLDTVLSDLEEENYSTRTFVFPAVSVGAPHQRYRTFIVGHSNDKSKLQTDPRVVPFRSKWETWENTTGINRGTLSGTYWEENKPAICGMDDGTATRLDEDRLRFLGNAVVPQQIYPIFEAIAKIEGLL |
20 | Bacillus_phage(66.67%) | integrase | attL 3490098:3490114|attR 3513894:3513910 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
3713964 : 3790153
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP012728|3713964:3790153|DBSCAN-SWA 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90 | Bacillus_phage(92.45%) | holin,head,terminase,protease,capsid,portal,tRNA,integrase,tail | attL 3747362:3747378|attR 3791944:3791960 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
4817198 : 4859432
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP012728|4817198:4859432|DBSCAN-SWA 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47 | Staphylococcus_phage(26.67%) | head,terminase,protease,capsid,portal,tRNA,integrase,holin | attL 4807575:4807590|attR 4861883:4861898 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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