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NZ_CP016311 | Vibrio scophthalmi strain VS-12 plasmid pVS14, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP016307 | Vibrio scophthalmi strain VS-12 chromosome 1, complete sequence | 1 crisprs | cas3,csa3,DEDDh,WYL,DinG,csx1 | 0 | 0 | 4 | 0 |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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DBSCAN-SWA_1 |
231038 : 245156
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP016308|231038:245156|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP016308|231038:245156|233683_234097_+|WP_065431280.1|DBSCAN-SWA MKKLKLITKGLPTGTFGELFMNGSALCYTVEREWNNNLPSLSCVPAGTYRLKRHKSPKYGLCFALECPSVGVTIYGPSQRTHCLIHAANFPHQLEGCIAPGIEMHSNKWGVANSRTAMNKLLEILVDDEYELEIVRL >NZ_CP016308|231038:245156|240156_240345_-|WP_065431291.1|DBSCAN-SWA MSSIILMFFIGVLLGFGAAVMMMNSAVKHINRQTKMNKVRLKRAKAALDDALLLVNQYEQGK >NZ_CP016308|231038:245156|239123_239354_-|WP_065431290.1|DBSCAN-SWA MARKYSAYQKYIELAEQAALLERQNEYSEASIYWAEAVVCLLDTRSANLDWAVCRAEFCQHWATRLNVKKEQTYEA >NZ_CP016308|231038:245156|235848_236373_-|WP_156773177.1|DBSCAN-SWA MNTLFNRDGAIVPPRPDADDSDIKLSIIKQAVEDLFVEKHCEFEKSEKEDLIQSLHRHWEENCDEYELAKNFESDNWLVNYDFVSKLENVCGYVDSALKATIDEWANSYDIIPPFEIGTKLEEGVIAGISEYDPATYRVLVYGQKEDSTMRRLIKFEDAKAKVESTNGMSTCQK >NZ_CP016308|231038:245156|232027_233158_+|WP_065431279.1|DBSCAN-SWA 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24 | Vibrio_phage(41.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
747275 : 807744
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP016308|747275:807744|DBSCAN-SWA 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|
37 | Planktothrix_phage(22.22%) | integrase,transposase | attL 746456:746501|attR 790287:790332 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1086810 : 1118814
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP016308|1086810:1118814|DBSCAN-SWA 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28 | Bluetongue_virus(50.0%) | integrase,transposase | attL 1086703:1086762|attR 1113097:1114427 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1155070 : 1180399
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP016308|1155070:1180399|DBSCAN-SWA 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26 | Bluetongue_virus(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1268365 : 1295489
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP016308|1268365:1295489|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP016308|1268365:1295489|1294193_1295489_-|WP_065431935.1|integrase|DBSCAN-SWA MYLIKLASGVYYTRIATPVFLQNSHDYPKEVRFSLLTKTRREAIKRNTRLASAICSLFDRALNQYMPYKTFKAILLVLIKRVREEFKTSSKIEPHAPVTVETPPPAPVEALPEQSSKDSKFFATELDDFIHSKSLENITHLSSVQLKQRCTDFIFFVRKRKLPVTPKTAMVYRDSLLARGLGAKTIKDYLAALRQFFTWCVQRETIASNPFQLVKAPKSKASKASEERSRWTLDELTKLVSSSEYLSRDKQFDWVTRLQIYHGLRPAEACQLSTTDVKKVGGIYCITCSDSNERQRLKTKNAYRLVPVHRALLDSGFIEYVEERNRKRLKQLFDYKPHGKNHDWSFRYRTHLGKVQTAIGMKPKERPTAYSFRHTFIDELKMADIPEHVVSEIVGHAHPNITYGRYGKKTDLLKLQEAVDVFPILEGDSHA >NZ_CP016308|1268365:1295489|1281844_1282822_+|WP_065431923.1|DBSCAN-SWA MARPKSYSEEELINVANELLNKGIEPRGWRIREILGRGKTTSFDSDIKRLTESGKLPVYVKPSIATEVLPTRSETEHAQLPLEIQDAYKITEAELSESIYALIVRLNDITACHYEQLTKTRLQSALSEKESALEEKRLAEEQVIKTEERVRAQVANNEELELKHEELEHRYSELEQAQSNISSELMQLKRDNLKLREDIKATEITIRDLEEQILSLSTANTVLDTQLKERNLQSAKLNERYSDLENQLDTTKQQLTVANTRSDSIQMDLAKTDEIISSLRSELSESITRANVAERTALILERDKANLTALNNQLITDKTSNFQTV 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MCELDILHDSLYQFCPELHLKRLNSLTLACHALLECKTLTLTELGRNLPTKARTKHNIKRIDRLLGNRHLHKERLAVYRWHASFICSGNSMPIVLVDWSDIREQKRLMVLRASVALHGRSITLYEKAFPLSEQCSKKAHDQFLADLASILPSNTTPLIVSDAGFKVPWYKSVEKLGWYWLSRVRGKVQYADLGAENWQPISNLHSISSSRSKTLGYKRLTKSNPISCQIALYKSRPKGRKNQRSTRTNCHHPSPKIYSASTKEPWVLATNLPVEIRTPKQLVRLYSKRMQIEETFRDLKSPAYGLGLRHSRTSSSERFDIMLLIALMLQLTFWLAGVHGQKQGWDKHFQANTVKNRNVLSTVRLGMEVLRHSGYTITREDLLAAATLLAQNLFKHGCALGKL >NZ_CP016308|1268365:1295489|1275362_1275677_-|WP_065431919.1|DBSCAN-SWA MTWDLFLLDKFFENWVRKPDDQEFIYASNDKPLQEVLKTAIKIQKEGAVVSLTQDLSPSLIPSFTATFDQVASEHGRRISSVKDFQSFHDGMIIHYENALEVLA >NZ_CP016308|1268365:1295489|1288089_1289502_+|WP_065431929.1|DBSCAN-SWA MAKTISDLLDVSSKTLMDLGAFDPILDLDTRLFIDPHLLKHCDIPEFEASYDKFTSHFKSIVKLLDASEKKGDVFWNKADRLLSGKEVKGLCIGYASKGTSGSGVGPALRKRLLETAKNIIAKGKDDPELFELVGMFEGDFGPDRISDMTANIIRDDITEYTKRVVSQVELGAKATVTFDDKSGLPMNPFTGDIILLVPYSILRDLPVALDWSNMDVIAQQNQELRDKVNGIIGNSWREAMKTVSKDKLKKLILEHPDLLDDLVKQYAAKPPLPYDFIEDRAGEYIWYPVTRELVKDNPIPLTLSESPTIDEVESLVVTICEKFKELVEYNGLNQLLYNKDGSLKHESAAQLLFYGVAESYCTSNNIMIARECDSGRGPVDFKFGTNSENSVLVELKKSTNTSGLKKGIEKQLPEYMKSEKSRRAIYLVIDVGYTKAAINNLESINKKINGTNVQIIHVDGSQKVSASKM >NZ_CP016308|1268365:1295489|1289514_1289622_+|WP_083181565.1|DBSCAN-SWA MTICLRVIRNAWHFCYALRFVFKVVCGSIGIALLT >NZ_CP016308|1268365:1295489|1287110_1287551_+|WP_065431928.1|DBSCAN-SWA MGIDENIRQQKVAERRKESGFQTKKYHLFERDIRRLNTLGKNMGYDTSKPLSNEEYSSIIRTCIAERYAKVFPKKNVKVPDAQIGQREYELKQIISYRVSKGESNSDIAAFLEKNGYKIPSSDGAQQKSEESWTAKQVGQLKPKKK >NZ_CP016308|1268365:1295489|1271634_1272024_+|WP_065431917.1|DBSCAN-SWA MDMKKTIKIKGLEKALELVQSKASVRTLTANEVYDHLNYVQTKLDQILYKKDQVGIKVCITVKTEVAASYQGIPQSTLVELERGKTVWKLLSVSRDKGIPSDARIHNIKEFKEQIAEKLHDRMQRILID >NZ_CP016308|1268365:1295489|1290947_1291649_+|WP_065431931.1|DBSCAN-SWA MKNESLLAFRERLDSNTGLVSKRRMLVTLSLLLLAIQFTGAVFKEANTFIFKIEFTNQGGLSVFLLLAVIILMIRYYSYAHEYHQELFKLMAERMMSDYKIFRFNHHTEEISGLLGDGIDLFGGDEPGLQDAKYETDGFLKRKIVYKKEYHDEEGSELLDEDVSLNRYNEKWTRWDFLVLYSYELRYRLEALLKYRENLDLWGPYFLGSTAVVLTLIKLDTATILNLWLAITT >NZ_CP016308|1268365:1295489|1283370_1284600_+|WP_065431924.1|integrase|DBSCAN-SWA MARIAKQLTDKQLKNAKSKISEYVLSDGAGLQCRIMPSGAKTWRLVYKNPEIGKQSRITLGHYPALSIANARKLADEQRTLIALGIDPKSHKQKIQNEYIAINQNTLFNVSRDWFEIKATEVTPDYANDIWRSLELHIFPELQDHPISTLTAPIVINVLKPIEAKGTLETVKRLSQRLNEIMTYAVNCGLAPANPLRGIKAAFRKPTIENMKSLKPEELPELMSSIAHASIKRTTRCLIEFQLHTMTRPNEAAGARWDEFDFENKIWIIPAHRMKKRIEHRIPLTNEVLNILEKMALISRQREYVFPADRNPKKATNSQTANAALKRMGFSGRLVSHGLRALASTVINEQKLHDSDLIEAALAHIGGDEIRRTYNRTDYLEPRREMMSWWSKWIVDASHGSFSITKATE >NZ_CP016308|1268365:1295489|1280035_1281244_-|WP_032073033.1|transposase|DBSCAN-SWA MCELDILHDSLYQFCPELHLKRLNSLTLACHALLECKTLTLTELGRNLPTKARTKHNIKRIDRLLGNRHLHKERLAVYRWHASFICSGNSMPIVLVDWSDIREQKRLMVLRASVALHGRSITLYEKAFPLSEQCSKKAHDQFLADLASILPSNTTPLIVSDAGFKVPWYKSVEKLGWYWLSRVRGKVQYADLGAENWQPISNLHSISSSRSKTLGYKRLTKSNPISCQIALYKSRPKGRKNQRSTRTNCHHPSPKIYSASTKEPWVLATNLPVEIRTPKQLVRLYSKRMQIEETFRDLKSPAYGLGLRHSRTSSSERFDIMLLIALMLQLTFWLAGVHGQKQGWDKHFQANTVKNRNVLSTVRLGMEVLRHSGYTITREDLLAAATLLAQNLFKHGCALGKL >NZ_CP016308|1268365:1295489|1272818_1274027_-|WP_032073033.1|transposase|DBSCAN-SWA MCELDILHDSLYQFCPELHLKRLNSLTLACHALLECKTLTLTELGRNLPTKARTKHNIKRIDRLLGNRHLHKERLAVYRWHASFICSGNSMPIVLVDWSDIREQKRLMVLRASVALHGRSITLYEKAFPLSEQCSKKAHDQFLADLASILPSNTTPLIVSDAGFKVPWYKSVEKLGWYWLSRVRGKVQYADLGAENWQPISNLHSISSSRSKTLGYKRLTKSNPISCQIALYKSRPKGRKNQRSTRTNCHHPSPKIYSASTKEPWVLATNLPVEIRTPKQLVRLYSKRMQIEETFRDLKSPAYGLGLRHSRTSSSERFDIMLLIALMLQLTFWLAGVHGQKQGWDKHFQANTVKNRNVLSTVRLGMEVLRHSGYTITREDLLAAATLLAQNLFKHGCALGKL >NZ_CP016308|1268365:1295489|1271230_1271635_+|WP_065431916.1|DBSCAN-SWA MKTQKLTLLRGLPGSGKTTYASNMKAVLIEADQFFIDQFGEYKFNPKLIKDARAWCQLETKRNLNAGRDVVVANTFIKLWETKFYQELARTMTITFEIIELNGRYPNVHGVPPATIERMASQFEPFHAATKLEG >NZ_CP016308|1268365:1295489|1279549_1280014_-|WP_065431922.1|DBSCAN-SWA MFQHRDLKKIFHEDTERNLNETLKRLVKNQILERVARGIYLYTLSKDRFSASTLEFIVKTLRRGEYSYVSLESALSEYGVISQIPVDRLTVMTTGRKGEYKTRYGVIEFTHTKKSVPDIVDSIRSVGRPLRVATEETAIRDLKRVGRNVHLIID >NZ_CP016308|1268365:1295489|1277033_1277759_-|WP_065431920.1|DBSCAN-SWA MEYVVYKFPDYAEQVIALLLEENWLVHSFPLSDDADIFNPSAYLYNADTSGIEYTIHLDLNIYQYILNAFKKEKKNSLHRSAIALVVFAKFTNVKFDPTIAIYEKLNYRNQCPDELIDDLTLFRQIDNAEMEALAEFALGFTDSIVLPEPAYIDRSQLKTKLTEFRRLKKWDTLYVLVMKLTELYFFENRLSNEDKLEAFWRWCHEEFLFSLVATCLAIKMFGTEGSPHNFPKAQPCLNRF >NZ_CP016308|1268365:1295489|1275867_1277076_+|WP_032073033.1|transposase|DBSCAN-SWA MCELDILHDSLYQFCPELHLKRLNSLTLACHALLECKTLTLTELGRNLPTKARTKHNIKRIDRLLGNRHLHKERLAVYRWHASFICSGNSMPIVLVDWSDIREQKRLMVLRASVALHGRSITLYEKAFPLSEQCSKKAHDQFLADLASILPSNTTPLIVSDAGFKVPWYKSVEKLGWYWLSRVRGKVQYADLGAENWQPISNLHSISSSRSKTLGYKRLTKSNPISCQIALYKSRPKGRKNQRSTRTNCHHPSPKIYSASTKEPWVLATNLPVEIRTPKQLVRLYSKRMQIEETFRDLKSPAYGLGLRHSRTSSSERFDIMLLIALMLQLTFWLAGVHGQKQGWDKHFQANTVKNRNVLSTVRLGMEVLRHSGYTITREDLLAAATLLAQNLFKHGCALGKL >NZ_CP016308|1268365:1295489|1293817_1294201_-|WP_065431934.1|DBSCAN-SWA MRKLAHFELKSVLSALDHAEFTQVYDFSNLVACGISLEAIRLVYRLKTALKRNSDLTIANYIQHVNQLYAVVDSFYGFKEMLGYGVLSQEIEREEKLLQLIDFVQSHDMDISITTQGIAWAISVRLE >NZ_CP016308|1268365:1295489|1289662_1290820_+|WP_083181568.1|DBSCAN-SWA MKIVLNHSSNEESNLYLRGLYANIRKVFGKCAWHFNPYKRGEHQLIKIGSIDLGKEYPTQVLSIKYAQKGVIKELYISNISEPNNEELEQKLYEIASTVSIDAVEDFVVSTELDTIKVPAANCSTELFSLITDGNGKNVLFVKVSAFDSSDAAVLAGKFINRICDFLSISFNTYVKSTNLMLCKELPIIENDPVFCGELDWIDDNPCVNGKLTLAQYQVQMIDDILQELVKPTFVNACSHFNNAADLLKNYSLKNGSLVDTATVLYVSALEVCATLFPYDNASCAECSQKVFSIRRRVLELVRRYHPEHLIKFFDKYYQERSKYLHAGSFSSSSNYYGVKIPQLDPNSESGCHMQTSDFPMNLRDFTSFIFRQVSQDRELTNNSI >NZ_CP016308|1268365:1295489|1285271_1285676_+|WP_065431925.1|DBSCAN-SWA MTEFYSSSLATTMPNTSRIGLSLAHVSEKTLDTYSLWWRKRKGGKLAKAALVLRAIAQNQGIKTDEIRNLADACSNPAHSIRDINKKLMNKGLMIIRMDPVGVAPNESCHHWFLVEAPIEQIKVHMASNDPLFV >NZ_CP016308|1268365:1295489|1274277_1275072_+|WP_065431918.1|DBSCAN-SWA MFGDRNFSWVTIAFWGIIETTGVGDFDVTKCIELVNEIMTVAKLSDESLRVFMLDEHNLYEFRMTQYSPDGNIIRVHQPVSQLTTLFGLANDDESVHTRQEAKDSSQIISQLKNNTLQIYDRLYASALIDKGNNNYTSSFYQLNSSIESLITHSLREVYLHINKIREFEVFMYGDNDRVPSNYAQLKELRKQVNLISQGVISNKDRNQLEEYLNIVKGKNGTGVLRNRLVHGSEHTVNKETLFRSFDAYKSFKVTLESKLRQVI >NZ_CP016308|1268365:1295489|1277900_1279010_-|WP_065431921.1|DBSCAN-SWA MFDLQEYCSQQFSAGRGVVIMPALGIFSVDGVLTQSGVTFAHSSCISGVSSIIEQAHLIEFQEGFTPQDIGYQLNGGSIREVATTFTGIKKSVFTNSDLAILSFDPLHFQGFKDHASGLLFLKSLSDQAFNALNVIRFMHCDLFVPDKLPMIPGYWQGSDGFMGACISLPNQLPEIVAGSQMGGAVSSGLGIGLESSDTIGMEGHPFVTTIEPDEPSRNEVGQIIEHALKLYNRAMYANSDTLKFINVMALFEYLGTGDKYTNFKQVRPKLQSHIAQSREQYKDLSEVFQMLTSLKIGGVNVGYRTRIIHEGALLEDLIPSVTEREKLFRDLTQYIQFIIRGMYQFTDHTLESLQEQRKLKLQAIGIST >NZ_CP016308|1268365:1295489|1285874_1286642_-|WP_065431926.1|DBSCAN-SWA MARYTSLAQLPRFESVNDAQEENENRINTLRRVGGTEYNRIADLLSDCLKGERTCNSLACKLCNRTFRLRRVDDLVAKIRSEKGSWWIVTIIDYSSAFTSEELNSFDVSKSKDCLRKRLKRAGFEGVIVGSFEVDFHDICGLWLPHYHLLCRNTKQNRQAKNELQAMLARQQPSHIKAGRTPKPLMFQRLKQRYTQVSYIYKLVFNRVCDYDDSITKKAKTKKRRLNDVMFCQSLLWMDRIGRRRVLFSFGERGW >NZ_CP016308|1268365:1295489|1292748_1293504_-|WP_065431933.1|DBSCAN-SWA MYSFINRVDGVVVTKEDEYAAIDFLFQPIYCSRRRRAIYYEVLSRVTSQSGEVYNSQDFFENIDDDFIKNICLSQIKAAKTLKIKSMISTNVNMSCLDDDDFVQDLLSFKGVKFSLEINELNCYTSSVRTLNNIKTLQANGVMIWLDDYHSNNEQANLSLGNIHWDYIKIDKSFLYYNSEDFMPVKALSYVLSPFTKKGLIFEGVETYEQSLIVKSTRSLAQGYFYSMPKRWSEILQEVKSEHQNKNAIEI |
26 | Bluetongue_virus(66.67%) | integrase,transposase | attL 1287044:1287059|attR 1298534:1298549 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1344750 : 1405628
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP016308|1344750:1405628|DBSCAN-SWA GATGTGCGAACTCGATATTTTACACGACTCTCTTTACCAATTCTGCCCTGAATTGCACTTAAAACGACTCAACAGTTTAACGCTGGCTTGCCACGCATTACTTGAATGTAAAACGCTCACTCTTACCGAACTTGGTCGTAACCTGCCAACGAAAGCCAGAACAAAACATAACATCAAACGAATCGACAGATTGTTAGGTAATCGTCACTTGCACAAAGAGCGACTCGCTGTATACCGTTGGCATGCCAGCTTTATCTGTTCAGGTAATTCGATGCCCATTGTTCTTGTTGACTGGTCTGATATTCGTGAGCAAAAACGGCTTATGGTATTGCGGGCTTCGGTGGCACTACATGGTCGTTCTATTACTCTTTATGAGAAAGCCTTTCCGCTTTCAGAGCAATGTTCAAAGAAGGCTCATGACCAATTTCTAGCCGACCTTGCAAGCATTCTACCGAGTAACACTACACCGCTCATTGTCAGTGATGCTGGCTTTAAAGTGCCATGGTATAAATCCGTTGAAAAGCTAGGTTGGTACTGGTTAAGTCGAGTCAGAGGGAAAGTGCAATATGCAGATTTAGGTGCGGAAAACTGGCAACCTATCAGCAACTTACATAGCATATCCTCAAGTCGCTCAAAGACTTTAGGCTATAAGAGGTTGACTAAGAGCAACCCAATTTCATGTCAAATTGCACTGTATAAATCACGTCCTAAAGGCCGAAAAAATCAGCGTTCGACACGGACTAATTGTCATCATCCGTCACCTAAAATCTACTCCGCTTCGACAAAAGAACCATGGGTTTTAGCGACTAACTTGCCCGTTGAAATCCGAACACCAAAGCAACTTGTTAGGCTCTACTCGAAGCGTATGCAAATTGAAGAAACCTTCCGAGACTTGAAAAGCCCAGCCTACGGTTTAGGCCTCCGTCATAGCCGAACTAGCAGCTCAGAGCGCTTTGATATCATGCTGCTAATCGCCCTAATGCTTCAACTGACATTTTGGCTTGCTGGAGTTCATGGTCAGAAACAAGGTTGGGATAAGCACTTCCAAGCTAACACTGTCAAAAATCGAAATGTACTCTCAACAGTGCGCTTAGGGATGGAAGTTTTGCGGCATTCTGGCTACACAATAACGAGGGAAGACTTGCTCGCGGCTGCAACCCTGCTTGCTCAAAATCTATTCAAACATGGTTGTGCTTTGGGGAAATTATGAGGGGATCCCTCAGCATTAGACATGATATTGGCATCTAAATCCTGGGTATTATTGGTTTCCTTGAGCAAGCAATTAGTTTGATCTAGCTGAGCGGTTAAATCTTCTATTTCTTCTTTATACTGTTTCTTTAACTGTTCGATTTCTTGTCTCAGCTGGTGATTTTCTTGTTTTAATTTTTTGTAGAACCACACTTAAATGTAACTCCTTATCTTTAATAGACAGTAGGCTGTCACCAATAAGTTACAATTTGTATTGATTTATATCAAAAAATGATCAGCAAGTTTTCTCACCTACCGAGAATATCATTTCGACATGGTATAAATCTGAGTGGTCAGTGATATTTTGCCCATCACATTAGTGTCTTTACTCTAACAATAAGCAACGCTCTCATTAGATAATAATTATTCCGTATCCATTTTATTTATCAAAAGGCGGACAGTAAAATTGCCTCGCGCAATTTCTATTTTATAGCAACAAAAAAGCCCAGACACTGTCTGAGCTTTTTCATCTTACGGTCTATTTACACTTTCTAATTTACAACGCCGTCGAATCACACTTCTCAAGCTCAGTGTTAATTCGAGCAATAAACTTACCTGTTTCAGCATATTTGGTGAAAACCATATATTCGTCACCAATATAGAACTCTAAAGCGTTACCCTTGATGTTTAGCGGTAAATCACTATTTAATGACGCATCTAGCAGCACACCATAAAGTACTGTCGATGGTGTCATATTAAGTAGGTTATCTTTTTTCTGTGGGTTTAACGCATTCTCGTAGGCTAATTGAAGCGCTGCGGAATCCACGCCTTTTTCGACATATAATACCCGTAAGCCATCTTTCTCTTTTAACACCATCGATGGCGTGCCAAATTGCTGGGTAATCGCATCCAGTGTTTTACGTTTATCACCCTGTTTTAAAGGCTCCAATCCAGAAAAGTTCATCACAGACTGGTCTTTATATAAACGAAAACCAATACGTTGAATGCCATCTTTATCTGCAGAGTCAGTTTTGTTATAAGAAACTAAACCAAAGGTAGGAAAAGGGTTTTCACTTTGAGGAAAAGCCGAAAAATCCGCTAGAGAAGTAATCCGAGTCGCCGGTTCTGAACACGTCACAATACTTTGAGACTGAAAGTACCCAGCAGGCCCGACGTAACCATCATCGTACCCGCGCTCAAAAACAAATCCGGCTTGAGTTAATTCGCCTGCTTTTGTCGCTTGAGAAAAATCCGCAATCTTAAAGCTTAGATTGTTAATCGTTGCGGATTGCAGGTCACTCCCCATTAAATCAATCTCACCACTCGGCATTTGTGTCGCATAAATTTGGCTTGACGCGAGTCCCGCCATCAAACCCATAATCAGCGTTATTTTTTTCATCACTTAATTCCTTTCTTGTTATGCGGAACACTAACAAGATAGTAAGTAAGTCAGGTAATTACTATATAGCATATGCTCAAACTAACTTTGTGCAATGAAAGCTATTGATTTAAAAGAAATTATGATTTAGTCAAACAGGCCTCAGCAAACCGCTCATTCACATCTTACTGAGCAATAGTAGAAATGTCCCTATCTTTTAAACGACCACTGCCAACGAATTTACAAAGCATCGACAATTCTAAGATTGCTCGACACCTCAATATCGCTCTTTCCTTTATTATGTCTGTCCTCGATAAAAAGTGCCAATAAGAAGGACACACACCATAACGTAACCAAAGTATGGTTTGGTGATAAGCTCGTTATAACTAGGAGTATTTAATATGGCGACTGTCTTTCAGCATTTTATTCTTGAGAGGTGAAACACTACTCGAGACCAACAATGACCACAGCTAGAAGACAACAGATATCCGTCGATGCGACACCTTATTATCACTGCGTTTCTCGCTGCGTTAGGCGCAGTTTATTGTGTGGTATTGACCCACTAACAAAGCAAAACTTTGAGCATCGCCGCGAGTGGATCAAAAACAAAATATATGCGCTCTCACAAGTGTACTGTGTCGACATTTGCGCCTATGCAATTATGAGTAACCATTATCATCTAGTTGTGCATATCAATCGAGACAAGGCAACTACGCTTTCTAACCATGAAGTAGTCGAGCGCTGGCAGCAAGAGCACAAACTCCCAAGTCTTGTTTCACGCTGGTTATTAGGGCAACTAGCCAGTGATGCGGAAACAGAAGCTTGCCTGTTAATCATTGACACTTGGCGCTCTCGCTTATGGAGTCTTAGCTGGTTTATGAAAGAGCTCAATTTTGATATTGCTTGCCAAGCAAATAGAGAAGAAGATTGTAAGGGGCATTTTTGGGAAAGCCGCTTTAAAAGTCAGGCTTTGCTCGATGAGCAAGCTCTCGCTGCAGCGATGGCTTATGTCGATTTAAACCCATTAAGAGCAGGCATTGCCAATACACCAGAAACCTCAGAATTCACTTCGATACAAGCCAGGTTGAAAGCGTTAAATAATCAACAAGAAACCGCTCCTTGCTTACACCCATTTATCGGCAATCCCACTAATGAAAAACTCGATGGTATTCCCTTTCGGCTAATGGATTATATTGAACTGGTGGATTGGAGTGCGCGCCAATTTCGAGAGGATAAAGCTTGTTTAGAGGCCAATGTTCCGCCGATACTGCAACGGCTCAACCTAAACCAGCGCACTTGGCTCAAAGCCTGCACTGAACTAGAGCGTCATAGTAGTACCGCCGTCGGTTGTCTCTGCACTATCGAGCCAGCCAGAAGTCACTTAAACAAAAAACGGATACATCTGTTTCGCTTAGATGGTTGAATATCGCCGATTTACTCTCTTCATAAAACGACCACAGCCAACGAATGACCATCTTCGTTTACCTCCGTTCGCGCCAACCCAACTCCATTTAACCAATACCGTATTTTTCCACCAGATAAACGCTAAATGAGCAGTAATTTAAAGAGTATCGATGACCTTGATACTGCTCGACATCTCAGCATCATGATTTCTCTATATAGTGTCTGTCCTGTTTGTAACCTTTTTGTATCGGTGCCTGTCCTTTGTATAGAAGGCCATTAAAAAGTTACCGAACAATCAATTCAATTCCTTACGGTGATCAATAGCGTGGATAATCGTCATATTTCAAAGGTTGTACCACACTATCTAGACCTTCAACCTTGAGGGCTAAACACAGTTGCATCAGGCTACCCAACTCCCCTTCAGGAAACCCCTTTTTATCGAACCAAAGCAAATATTCCTCTGGTAAATCAATCAACACTCGCCCTGCATATTTACCAAAAGGCATCTGCATACGAGCTAATTTGATGAGGTTTTGTTTTTCGAGCATTAGATCTTCTAACGGTAGTGTTATATTGAGTTAAGATTAACAGACAAAGAACTCTTTCGGCAGAGGTATTCTAGCCCAAATAACGCGAAGATATATTTTCTCTCTTGAACATAAACATAGCGGTTACGGCTGCTGCCACCCTTGCATAGTGATACCTAATCGATCTACCCAGTAGTCGATCGCGTCTTTGGCATCATCAAGAGAATCAATCATGGTCGAAATATCTTTATTTCCCGTTTGTCGGTCAATGGCGGCGAACAAGGGTTTACCGGACATAGCATCACTGACCAACAACTCAATACTCGCACTACCGACGTTGGTGTGTTCACCAGTTGTGACTTTTGAAATGGTTGAGATCGCTAAACCAAATGGCAGCACACTGCTTGTGACCGCTAAGATTGGATTAGGGGTTTCGACATTACTCAGTGCGATACTGAGTCGTAAAGAGTGCTTGGTGGGTTGATCAACCACTGACTTGTAAG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58 | Bluetongue_virus(14.29%) | tRNA,integrase,protease,transposase | attL 1344641:1344700|attR 1404310:1405641 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP016307_1 | 247116-247248 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016307_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP016307_1
>1.1|247141|46|NZ_CP016307|PILER-CR CTAATTAATATTTTAAGTGTTAGTTAAAATTACATAAAATAAAACC >1.2|247212|19|NZ_CP016307|PILER-CR ACTACAGTAGTTAATACAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016307_1
The CRISPR arrays of NZ_CP016307_1 >merge|NZ_CP016307|1|247116-247248|PILER-CR CTAACTACTGTAGTTAGACTAATTAATATTTTAAGTGTTAGTTAAAATTACATAAAATAAAACCCTAACTACTGTAGTTAGGATTTATAACTACAGTAGTTAATACATATAACTACTGTAGTTAGATTTAATA >NZ_CP016307|1|1|247116-247248|PILER-CR CTAACTACTGTAGTTAGACTAATTA ATATTTTAAGTGTTAGTTAAAATTACATAAAATAAAACCCTAACTA CTGTAGTTAGGATTTATAACTACAG TAGTTAATACATATAACTA CTGTAGTTAGATTTAATA
>NZ_CP016307.1|WP_065429606.1|246311_247001_-|hypothetical-protein MTEINRGKKDQEVNKHLNSLFDDRYTEELKHQKTKKEFFQKVSLDEFGDTINSTETATSSIPSEPDFIKLYLKDVVTLKGIQSANKDILYCLLKLMRYENYVISITKYDKTIICKELGLKRVQQVDNAITKLKKAGILFSIVDENGKKEQGAFEVNPYLFGKGKWVENYNKRDIHKLTVLYRKNSKEVINVDALVEYIKTETNEEKRNEAINKLNEIRGFTNEDEKDSV >NZ_CP016307.1|WP_156773127.1|246175_246331_-|hypothetical-protein MKKTAYDRFLEERQEMLEEITILVNSDNPEKEIQELKQNRKNKNRQENNNG >NZ_CP016307.1|WP_065429605.1|245955_246183_-|hypothetical-protein MDKKEIIKHIDKINFQVYLAQTNVIKSYRNYKYNLDNKNGKTAIAACEDMIKSTEEELEVLMTKKRELEKKLMEK >NZ_CP016307.1|WP_065429604.1|245750_245954_-|hypothetical-protein MREEDLRTCNGCGNDYSIRSGCNYCVEEPSLETIDADIKEWEKQLKEQGLSDEEVQKKLYKWISETF >NZ_CP016307.1|WP_065429603.1|244545_245721_+|hypothetical-protein MKKYCAVNTKYYQDSNDGEIDHVLRNMLDNVNAFDALTPNNFGFCFGDNDIKSYYKEKLEDAKQDNNLALQKNSNTFVDSVLVFNSELFLKCMEDGKQEEIKKATKNFMLEFQKEYGFEPIGFEFHLDEGTKISTEDLEKLEPEEKSKYVPFDDPDEPFTTEYIKHNIHAHAIFLNYDFDKHKSCLRNMRKKDWSNSQDLLYKHFKDFGFERGEPKQTNKADHKNKEDYVRELELKTIELVKATSDHLDEKNELLDEILDHQEKLDRFENLSNYAQKIKDFFDTKPKLIKQLEKTFGEKFEQVKEMAIEIYQALTERSEPVKQEIVIEQGIEQTTPETDLAEVPQTVEEQKIDNEVKAEQVAEKEKKIKSIKNKRKYKKKSNSSTPRPKNS >NZ_CP016307.1|WP_005597334.1|241481_243128_-|acetolactate-synthase-2-catalytic-subunit MTGAELVVAALAQQGIKTVFGYPGGAIMPIYDALYDGGVEHILCRHEQGAAMAAIGMARATQDVAVCMATSGPGATNLVTGLADAFMDSIPLVAITGQVASSHIGTDAFQEMDVIGMSLSCTKHSYLVTDIQELAPTLAEAFEVAKTGRPGPVIVDIAKDVQLAQAPTSILPPCTPPDHPVVSSEALSHAQQLLSSSSRPVLYVGGGVQLSNATDTVREFLRINPMPSVSTLKGLGTIERHDSHYLGMLGMHGTKAANLIVQECDLLLAVGARFDDRVTGKLDTFAPNAKVIHIDVDAAEINKLRTANAPLRGDVKAVLPLLELTHDITPWLSHSESLRTGFTWRYDHPGELIFAPGLLKQLSDMMPDSSIVSTDVGQHQMWAAQHIQPREPQNFITSAGLGTMGFGLPAAMGASVGRPDDQSILITGDGSFMMNVQELGTLKRRQIPVKIVLLNNQRLGMVRQWQSLFFDGRHSETILDDNPDFVMLAKAFDIPGKTITKKEEVEPALKEMLASKTAYLLHVLIDEEENVWPLVPPGASNSEMLENT >NZ_CP016307.1|WP_005597332.1|241195_241480_-|acetolactate-synthase-2-small-subunit MERYLLDIKADDKPVLLERVLRVIRHRGFIIKQVAATQNHESHVASVEIIVDSDRPITFITNQIEKLWDVRTVDVTKIARDQLPNNNLQQKVCA >NZ_CP016307.1|WP_065429601.1|240237_241182_-|branched-chain-amino-acid-transaminase MATNTADYIWFNGEMVPWAEANVHVLTHAMHYGTSVFEGVRCYNTPKGPIVFRHREHAQRLKDSAKIYRFPIPYTVDEIMEATRETLRQNKLESAYIRPLGFVGNVGLGVCPPADTAMELIIAAFPWGSYLGEEALEKGVDAMISSWNRAAPNTIPTAAKAGGNYLSSLLVGGEARRHGYDEGIALSVDGYLSEGAGENIFVIKDGIILTPPTTSAILPGITRDSIMTLARDMGYEVREANIAREALYLADEVFMTGTAAEVVPVSTVDKIEVGCGKRGPITKALQAAYFGLFNGTTEDKWGWLDYVYSQEAAK >NZ_CP016307.1|WP_005597330.1|238380_240222_-|dihydroxy-acid-dehydratase MPKYRSATTTHGRNMAGARALWRATGVKEEDFGKPIIAVVNSFTQFVPGHVHLKDMGQLVAGEIEKAGGIAKEFNTIAVDDGIAMGHGGMLYSLPSRELIADSVEYMVNAHCADAMVCISNCDKITPGMMMAAMRLNIPVIFVSGGPMEAGKTKLSDQIIKLDLVDAMIQGADPTISDEQSEQVERSACPTCGSCSGMFTANSMNCLTEALGLSQPGNGSMLATHADREQLFINAGKRIVELTRRYYEQDDASALPRNIADRAAFENAMALDIAMGGSSNTVLHLLASAQEGEIDFDMNDIDQMSRRVPHLCKVAPSTPKYHMEDVHRAGGVMAILGELDRAGLLNNQTRTVLGLTMQEQLAQYDIMQTEDEAVLKFFRAGPAGIRTTKAFSQDCRWDRLDDDRVEGCIRTKENAFSQEGGLAVLSGNIALDGCIVKTAGVDEGSLVFQGPAVVFESQDTAVDGILGGKVKAGDVVVIRYEGPKGGPGMQEMLYPTTYLKSMGLGKSCALLTDGRFSGGTSGLSIGHVSPEAASGGTIGLVNDGDIIAIDIPSRSISLQVSESELAERRAKQDTFGWKPVDRQRTVSLALKAYASLATSADKGAVRDKSKLEG >NZ_CP016307.1|WP_065429600.1|236814_238377_-|threonine-ammonia-lyase,-biosynthetic MVNHGLVEDLSPDQALPSGADYLRQVLRAPVYEVATVTPLQAMPRLSARLNNQVQLKREDRQPVHSFKLRGAYNMVASLTEEQKIAGVIAASAGNHAQGMALSGTKLGIKTTIVMPKTTPDIKVDAVRSFGGKVVLHGNNFDEAKAEAERLSAKHGYTFVPPFDHPLVIAGQGTIGMEMLQQNGHLDYIFVPVGGGGLAAGVAVLVKQLMPEIKVIAVEPEDSACLKAALDAGEPVVLDQVSMFADGVAVKRIGDETFRLCQKYIDGHVTVSSDEICSAVKDIFEDTRAIAEPSGALALAGLKKYVDKQQLTGKRLGTILSGANTNFHGLRYVSERCELGEKREGLLAVTIPERQGAFFEFCNLIGGRAVTEFNYRYNDDSLANIFVGVRLNDGQSELDNIIQDLRSGGYPVVDLSDDEMAKLHVRYMIGGKPSKQLKERLYSFEFPEYPGALLKFLSTLGTHWNISLFNYRNHGADYGRVLCGFELDEQDLARFSLHLRELGYQCKDETNNPSYQFFLS >NZ_CP016307.1|WP_065429607.1|247458_249159_-|recombinase-family-protein MSKIIYPYIRFSSDKQAAGSSFQRQMERITDYANENGYIVNNSLKLQDLGLSAFTAKHIEKGALGAFLDGVKAGKIEQDGSAYLCIEQLDRLSRENVDDAYQVFRKILKSNVNIITLMDNKIYTKESLTDLMSIMYSLMLMAQANQESAKKSYRVLRAFDKKLDKLNDGKTVQYVGMFPGWIDNKGTKEETNFVINKKSEIVQRAFSLYINGTSMGDIARIFNDERVPQVAKKRQKNYTNSWSSAKINHLLKNRCVLGELLIRKTGDSFENYYPAIISVDDWDVVQSMMKTKKIAKSSGRRSINIFTGKMFCACCGQKYYFETDDKNTKTGKKLYYMLKCSGRRSLGCKSKSIKYDDFLDSTPNLFGMITQSKKDNSKEIDKIKLKIKEINEITKKLRDKLITLENLNDSNKLDFTIYLKESSKIQKQVRENDARVASFKLKISRLSSDNKLDYFDKTDPNSVVKAKKFISDNFAAFVISSDSRFCIALYNDGQVLQFKIKNSKIEKKESQVKNIDNFESFNEFYKLKEQVLETYKNGTMDGRFIEILSATNFWGVETSEKDYSLD >NZ_CP016307.1|WP_065429608.1|250091_252431_+|hypothetical-protein MNVKTLNELSLLKKALSVGYSNYLKFAAESSVTPTFIQPVLNLYAAYCYLVKQGSYSALEILNDSSSINAHFQSLIGFVYSRDDITIRHRYLLGNQLRVLFRYIAQDKNLTLNEVKLSNVKITEDASSCLAQFRTLNIDKTKADYLDGWQVVSKEGKEHEVYLDMLYVSFGEAFTNKVHLALKNYAFTQKSSSLTHVLINLRKLFVGFSTIYNERDGLSIEAFLSRNHVQLFFHKVFKVLFVRSQAALKCPKNFHAKWRSTIYYYTECFINTGVFAEPHKPFIVPDWKDPKDAAPTFSIGGNATQTENLRWFANIPLKIKDEEAVSIIKQRIDRDMAHIKHVCLLKFEELLGREARNKVFQSKGLVKPLSGTLGYTQYKNFVGADKLDNTVATFYAHGIAGKDTSYLSFLGFSGNSNQLNTELNLPTKSTLNVLLTLLVIEHPLITPSWLAKWDLFDVNGCMVGYKQVGNKHIAVSYKSRKGSTNAQQEVVLNEFSKSIVEFLIQHTRMSREYLKQKGNVNWRKMILTATAINVIRPSCLNTTLSSANDFYDWLQDKTLFDKSSDITLKDAKAISDIHSLRSVRRHRGFQIYLETRSMDAVAEALGHETKDVKLLTSYLPKSLMDFFNARWIRQFQNAILLEAMKDSVYRLDAVNMSAEDIEEFLNNHGISNIPEHFDHGFTQQTTDNQVSESLGFDQLTYTISTSLLQLLMAIRFVVESSDDGEIFLDIVAHWYQSAVFVLDTLSSSKHSADDDLMGMLDLASNNKLDTESIKGALLC >NZ_CP016307.1|WP_065429609.1|252424_254836_+|integrase 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
848959 : 902624
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP016307|848959:902624|DBSCAN-SWA 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48 | Burkholderia_virus(15.38%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
909558 : 919511
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP016307|909558:919511|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP016307|909558:919511|912126_912576_+|WP_005592773.1|DBSCAN-SWA MHCPFCTETDTKVIDSRLVADGHQVRRRRQCLACSERFTTFETAELVMPRVIKSNGNREPFNEDKMIGGLQRALEKRPVSADAVELAISMIKSKLRATGEREVPSDMVGNLVMEQLKELDKVAYIRFASVYRSFEDIREFGEEIAKLED >NZ_CP016307|909558:919511|916154_916622_+|WP_005592767.1|DBSCAN-SWA MGASVKPAARRNARRFALQAIYSWQITKENVATIEEQFLSGGKYDEEEHHAAEPALTAPDTDVAYFRDLLAGVVLSHTELDCKIRPYTSRPMQDLDLMELALLRLAMYEMTRREDVPYKVVINEAIELAKVFAAEDSHKFVNGVLDKAAPHVRKK >NZ_CP016307|909558:919511|913697_914351_+|WP_005592771.1|DBSCAN-SWA MFTGIVEAVGTLTAITPKGEDISVTVSSNKLDMSDVKLGDSIATNGVCLTVVAFNDHSYTADLSLETLNKTGFTHYQAGDKVNLEKAMLPTTRFGGHIVSGHVDGVGEIVERNQVGRSIEFWVAMPEELNKYVAEKGSITVDGISLTVNALRKNAFKLTIVPHTGEETTIADFHVGRKVNLEVDVLARYMERLLTSQQAAQPESRITMEFLQQNGFA >NZ_CP016307|909558:919511|914425_915535_+|WP_005592770.1|DBSCAN-SWA MPISTPQEIIEDIRLGKMVILMDDEDRENEGDLIMAAEHVTPEAINFMATYGRGLICLTMTKSRCERLGLPPMVQDNNAQYTTNFTVSIEAAEGVTTGISAADRSRTVQAAVATDAKAADLVQPGHIFPLAAQEGGVLTRAGHTEAGCDLARLAGLEPASVIVEILNDDGTMARRPDLEIFAEKHDIKLGTIADLIEYRNNTETTIERVAECKLPTEFGEFNLVTYRDTIDNQVHYAMCKQGAADTSPLVRVHLQDTFTDLLRSDRNAERSWTLDKAMKRIGEEGGVLVILGNEEPSDLLIHRVKMFQAQDNGSAPTLAKKQGTSRRVGVGSQILADLGIHDMRLLSSSNKRYHALGGFGLNVVEYICE >NZ_CP016307|909558:919511|910718_911969_+|WP_009384644.1|DBSCAN-SWA MDLTNMGKAAKEAAFVLATASTAQKNQALALIADELEANAADILAANEKDIELGRQAGLTEALLDRLLLNAERLTGIANDVRNVISLNDPVGSEIDSKVLENGMSLARRRVPLGVVGVIYEARPNVTIDIAALCLKTGNASILRGGKETFFSNMELVKVIQSALGKVGLPAASVQYIEKPDRELVSQLLKLDDYVDMIIPRGGAGLHKMCKENSTIPVIIGGFGISHIFVDDSADLAKSLNVVENSKVQRPSACNSLDTLLVHEKVAGEFLPMLAERLNGKVTLVVEPKAKALLGNAQEMRDAVDGDFDTEWLSYTLGVKVVADVAEAVDHMRVHNASHSDAIMTNSLENAERFINSVGSAAVYVNASTRFTDGAQFGLGAEVAVSTQKLHARGPMGLEELTSYKWVGKANYLVRS >NZ_CP016307|909558:919511|916713_917685_+|WP_065429894.1|DBSCAN-SWA MPGEFNLIDKYFVGRQAQREDVLLAAGDDCALVQAPVNQAIAISTDTLVAGTHFLASANPAWVAHKALASNISDLAAMGASPAWVSFALTMPEVDEAWLKPFCDSFFALANEYGIQLIGGDTTKGPLSLTLTVQGFVAADKALRRDGAKVGDWVYVSGNLGDAKAGLDVLLGNAPLNAPYAAELEKRHYLSTPRVLLGQRLQGVASAAIDISDGVISDLPHILKRSGVGAQLQVDELPISAELLAFTRDREQALQYALTSGEEYELCFTISPQHRDALESMLLESNTKVTCIGQIVAQAGLSLTLQGKPLEWQLSGYDHFNNN >NZ_CP016307|909558:919511|917694_918198_+|WP_009384650.1|DBSCAN-SWA MANPLSLISLKNPWHFLATGFGSGLSPIVPGTMGTLASIPLYLLLVQLPLPAYIIAVLLACVIGVKICQVTSDDMGVHDHGSIVWDEFAGFWITMAIVPLFQLSPTDWKWLLSGFILFRFFDMVKPWPIGWLDKRVHGGLGIMIDDIVAGVMAGVALYLVGKYAGWL >NZ_CP016307|909558:919511|915684_916155_+|WP_005592769.1|DBSCAN-SWA MKVIEGGFPAPNAKIAIVISRFNSFINESLLSGAIDTLKRHGQVSEDNITVVRCPGAVELPLVAQRVAKTGKYDAIVSLGTVIRGGTPHFDYVCSECNKGLAQVSLEFSLPVAFGVLTVDTIDQAIERAGTKAGNKGAEAALSALEMINVLSEIDS >NZ_CP016307|909558:919511|918340_919511_+|WP_156773136.1|transposase|DBSCAN-SWA MKVKTVRKHSDDFKKQAVQQSLDSPDTVISVAKSLGISPGLLSKWRTEMTSQKNTSPPLPNIGPEKSVVQLEKEIRRLKKRLEMAEMENEFLKEGESLLRQPKRIRFEYILKYTSIQRPVIRLCQWLGVSSAGYYKWLHRKPSVREQGNDSLLDFLKEESDRQHCIPGYRKLWEAAVAYGFICNKKRVQRLLQSLGYRSKASKKRHGRAPRQKTLMPAYNLLNRQFDVSKPNQVWASDITQVRCKEGWNYLCVILDLYSRKVVGWSTSRINSACLVLKTLNKAWKSRRPDGRKLMFHSDQGVQYRAIETLRWHRKKAITVSMSRKGNCWDNACSESFFAQYKKEWISNLGGMSRQEMTMQSRLYIDTYYNPVRRHGTLGGVSPIDFELMN >NZ_CP016307|909558:919511|912588_913695_+|WP_065429893.1|DBSCAN-SWA MATFTPQDYLMMSRAIKLAQGGIYTTAPNPNVGCVITRDDQIVGEGFHYRAGEPHAEVHALRMAGKLAEGATAYVTLEPCSHYGRTPPCAEGLIKAKVAKVICAMQDPNPQVSGRGINMLREAGIEVQVGLLEADAQALNLAFIKRMQTGMPFVQLKMAASLDGQTALANGQSQWITSAQARQDVQAFRAQSGAILSTSQTVIEDNASLNVRWDDLPLSIQAHYPAEELRQPVRVILDRQNQLSADLKLFQTAGERLIVAPGGDVECLLNDDQQIDLRATFEMLAKQHNINHIWVEAGATLARSLMQLQLVDEVVLYQAPKLMGSDGRGLFGALGFQEMSQVIELDITELKQVGRDIRILAKPIYKEQ >NZ_CP016307|909558:919511|909558_910698_+|WP_065429892.1|DBSCAN-SWA MTTNQQCGTVTQPQTVVVKLGTSVLTGGTLQLNRAHMVELVRQCAELKKIGHSVVIVSSGAIAAGREHLGYPALPNSMASKQLLAAVGQSQLIQTWEALFAIYGMKIGQMLLTRADLDDRERFLNARNTINALVEHDIIPVVNENDAVATTEIKVGDNDNLSALVGILCGADKLLLLTDQKGLFTADPRKDPNAELIKEVKTIDDTLRKIAGGSGTNLGTGGMATKLQAADIARRAGIEVIIAAGSAPDVIFDSLGDDPQGTRFLPCEEALENRKRWILAGPAAAGDLVIDDGAVNAVLAKGSSLLAKGVVSLSGEFARGDVVRVTDQAGKLIARGISAYSSADMAKIRGTHSKDIHSVLGYDYGSEVVHRDDMVVIQE |
11 | Staphylococcus_phage(42.86%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1527100 : 1566205
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP016307|1527100:1566205|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP016307|1527100:1566205|1533470_1534679_-|WP_032073033.1|transposase|DBSCAN-SWA MCELDILHDSLYQFCPELHLKRLNSLTLACHALLECKTLTLTELGRNLPTKARTKHNIKRIDRLLGNRHLHKERLAVYRWHASFICSGNSMPIVLVDWSDIREQKRLMVLRASVALHGRSITLYEKAFPLSEQCSKKAHDQFLADLASILPSNTTPLIVSDAGFKVPWYKSVEKLGWYWLSRVRGKVQYADLGAENWQPISNLHSISSSRSKTLGYKRLTKSNPISCQIALYKSRPKGRKNQRSTRTNCHHPSPKIYSASTKEPWVLATNLPVEIRTPKQLVRLYSKRMQIEETFRDLKSPAYGLGLRHSRTSSSERFDIMLLIALMLQLTFWLAGVHGQKQGWDKHFQANTVKNRNVLSTVRLGMEVLRHSGYTITREDLLAAATLLAQNLFKHGCALGKL >NZ_CP016307|1527100:1566205|1551395_1552340_-|WP_065430224.1|DBSCAN-SWA MPNQAHTSIDIPFNCRHICWFCGEPSSRSLLFPRHASKKSQHTALSVPACSECDSIKYPSKIDSIWVLRAYLKQALLTKYTKHLAIGENWTEQELLESNFSGAILGGFGQSAWQMYEIAKQRIAFEGWPLSIDELPFYTLDDTSGFEFNGTRYSSLNACIDFFVDATGIDKDLLTELVDIVTAKQFAYALKIAKLNKRISPARRHQIIEEISLQETEKREAEFERLALTTINDAIEEVEVAGTLAPIFAIQWAMEKGAHTLANLCALEDEYFDEFEHLGGAAAFASYNGLQLYLNAREDADWVEANDPNKDLWR >NZ_CP016307|1527100:1566205|1564996_1566205_+|WP_032073033.1|transposase|DBSCAN-SWA 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34 | Bluetongue_virus(50.0%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2928595 : 2993134
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP016307|2928595:2993134|DBSCAN-SWA 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52 | Bluetongue_virus(30.0%) | transposase,integrase,tRNA | attL 2950541:2950556|attR 2999732:2999747 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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