Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP016417 | Vibrio scophthalmi strain VS-05 plasmid pVS8, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP016414 | Vibrio scophthalmi strain VS-05 chromosome 1, complete sequence | 1 crisprs | DEDDh,DinG,cas3,RT,csx1,csa3 | 0 | 0 | 2 | 0 |
NZ_CP016416 | Vibrio scophthalmi strain VS-05 plasmid pVS127, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP016415 | Vibrio scophthalmi strain VS-05 chromosome 2, complete sequence | 0 crisprs | DEDDh,WYL,cas3,csa3 | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP016414_1 | 1687669-1687744 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016414_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016414_1
>1.1|1687692|30|NZ_CP016414|CRISPRCasFinder CTTCAAGGGAATGACTATTTAGAGCACACT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016414_1
The CRISPR arrays of NZ_CP016414_1 >merge|NZ_CP016414|1|1687669-1687744|CRISPRCasFinder AAAAGCAAAAGCGAGATTCCCTTCTTCAAGGGAATGACTATTTAGAGCACACTAAAAGCAAAAGCGAGATCCCCTT >NZ_CP016414|1|1|1687669-1687744|CRISPRCasFinder AAAAGCAAAAGCGAGATTCCCTT CTTCAAGGGAATGACTATTTAGAGCACACT AAAAGCAAAAGCGAGATCCCCTT
>NZ_CP016414.1|WP_065545976.1|1687108_1687447_-|cytosolic-protein MFIHHVNGIDWLVITAFEELKTMFIEDAGAIPSCFSSSSELSLIDQAKRSYGYLPTLSGVITDVGTFQSKNNEEDLDPQLACLVEGRGRVFIYHGGFVAFVDDEQTFITRMD >NZ_CP016414.1|WP_005596542.1|1683903_1684398_+|YcxB-family-protein MSKDFDFTTEYTLDKPFFAECYDQTSQPVKFPHAYLKGLLFLIFGVVLLEFELLPNGYVGWFFIVLSVIEAFSVYCKRTWWLWRQTISSSRMRKVQLQVNADGVTYKSGKINRKLGWSEIDQLEQTDLGFILHIGKQRQYVSKSCLNEEVIAFMVEQHAASQSK >NZ_CP016414.1|WP_065545401.1|1683544_1683787_+|hypothetical-protein MNFDIDALKHHQLVEDGQLEGCYIHQPVQGSQPNDEAVVAERQALEKMGHKVMQVQTKGGTTTFAEAMQQFAKKTGHQPR >NZ_CP016414.1|WP_083163398.1|1682332_1683358_+|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MAENNTLANINVGTYSCPPFVIIEGDGSYSGLSLFLWQEIALDLGVSYNITDHGLSELIDDVANGSLNVGVSCLSITPQREEILDFSHSFYETHLAIAVKQQGYLASIGNIFTNTKLLYIIGFVFVLAAIVGVIYYLLEHRINDKLYSMPGKKAQMVEGFILGLLFITKGPFNYFEFKTLPGRILTVFLAIFTTFFIASVTAVLASTFTLGLLNSDIKNVNDLANMSVGAKKSSTSSEYLISQAIVHRTYADIDQLLQALDGNEVDAIVADDAVLKYLIKQAKEQGQYEQLTVLPYRFEKQNYGLAIENNSPYREQINRALLKIRHSPEWRQVLHEYFAEE >NZ_CP016414.1|WP_065545399.1|1681684_1682035_-|hypothetical-protein MNFAHMSDERVWQIADDLMDNLMAGSTMIDHAQHTRDFTQRMRDFVTPEYLQRVCVHYQDEKGFFTQRERVALFRRPDSFALVWKQAFSKVDGEYVAEMVMVERDGRILVDHVMVF >NZ_CP016414.1|WP_065545398.1|1681074_1681659_-|hypothetical-protein MNELKKKSTAEKAITLLLGVTMILGLIGLFSDFVPIKSVQIFGGGVAILLMALTIIYGRKMSILKPHFNNRYLKVVESLFGGGLLLMLYWVSAAYALPSIYTQWVGTEHKKVEIVTPFHLPATKECDYKIESDYIKGTSRGFICITQAWYELDETNYLLYGEQSELGFYIRGVVPLKALRSAIDSRGSESSSSL >NZ_CP016414.1|WP_005596549.1|1679655_1680942_+|DEAD/DEAH-box-helicase MTTATTPANFAELNLIQPLLARLAELEYQQPTPIQAQVIPSVLAGRDLIAGANTGSGKTAAFALPMLQNIFINQHPSLYRKNNSVTGLILVPTRELAKQVADNIKSYATHFNGAMKTVCVFGGVSVNSQMLALRGGADILVATPGRLLDLISSNAVKLDRVKTLVLDEADRMLSLGFTEELSELLALLPKQKQTLLFSATFPEEVQALTQELLNNPVEVQLQSSEASTLVQRVFTVDKGKKTALLAHLIKENDWRQALIFVNSKNGCEHLADKLYKRGISVEVFHGDQSQGARTRVLEDFKAGQLDVLIATDIAARGLDVEKLPVVINYDLPRSPSDYMHRIGRSGRAGEVGLALSLIDYEDYHHFKVIEKKNKIRLEREQVPGFEVDETITAAMLEANKPMAKPAGTGKKKRKKNQAAQGDVWLKNN >NZ_CP016414.1|WP_005596551.1|1679089_1679440_-|MerR-family-transcriptional-regulator MYIGEIAKRSGASPKAIRLYESLGLLVDIKRQGRYRIYDERDVKFVRLIKDAQTLGVSLSDLRSLMVERNELNWHAAIDLLAEKLNRIDHDMQALARQKEKVEQYRSEIEKCLNPT >NZ_CP016414.1|WP_065545397.1|1678445_1679027_-|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MCKKILVVNGNPKPDSFCAELANSYIASSKHNEVKLISLHALEFDCDLTSGYDEIQALEPDLVDFQQAILWAEHVVFVLPVWWGGMPAKLKGLIDRTFLPGFAFKFLENKTIPERLLKGRTADVIVTMDSPPFYYRWFQGNPVVKQLERTILKFSGFKRVSATYIGPVINSTPVQRDKWTKQVVKLASKRAVG >NZ_CP016414.1|WP_065545396.1|1677272_1678271_-|FUSC-family-protein MLTKPSKDDWIRGVLYATAVGLPLLLQPWIESQIVVFITLGALFTLRLDPRSHVKHQAIAMIGGVALVILAGAVGTLLVGHFELAIIVLVVISYLAGQPTIEQKYFSLLGKFVAAAFVLEAVGSPVTLMTGVAFFCGGVLALILTILQARYFATQVNGWSLVDEWQQLRSGKINGPLYGMTLPITVLVSILSAQWLNAQHVSWVGLTVLFVMNVDTVTAWRKIWMRTAGTLLGVISAYIVVVFFPSALLSFIIVLSALFMPMFLRQNYMIFSWLMSMFVLLVVDLAMLQSGGDEFLIQWRFIDTLIGCGWVMVSLSLLHLGRKWWPNQPSKG >NZ_CP016414.1|WP_065545402.1|1688388_1689099_+|hypothetical-protein MAFVIKDTKLNVAEIDIFHDEAGYAAFPTAESVAFDREKLIPIGLLSFNMFAASVDDKILIALPNLQGIPDGDYGPITYSYIGEQQGWCLDDEYANDDTLEEQDEYLDNYQQAQDEFSANQCLMRRGKKLPLITLGGQPRFGQNWASCLYNELAKNPELDHYYEVTCSLNHPEFEHMSTRDIVYVDEKDNKEYTFIGSFKDEAYLVRDSEYLGFAGEFMVFYQPQLKKVMLVAEYD >NZ_CP016414.1|WP_065545403.1|1689224_1690115_-|leucine-rich-repeat-domain-containing-protein MLTGAILATLFGLAIIESSAQQTEFLPSLALKAATNTTTTKRELAVSQPHTLTLDDVSFDKKQGRIDVYKGKHKHIVIPDNFDGIPVTEIWDYAFSEVEDLSEEFEEVPQNPIASVVIPNTVTEIGEGAFQRNALTEIVIPSSVTRIGYKAFAENALTSVDIPDSVTEIAESAFANNALTQLSLPNSLTKINERVFQFNALASITIPDSVTEIGLGAFRGNALQSITIPDSVTDIDSEAFADNAITSVFIPTSVTYMGNGAFTDNPLRGRIIKGFGEKKPPRELTDEEWLEVFGDL >NZ_CP016414.1|WP_032073033.1|1690283_1691492_+|IS4-family-transposase MCELDILHDSLYQFCPELHLKRLNSLTLACHALLECKTLTLTELGRNLPTKARTKHNIKRIDRLLGNRHLHKERLAVYRWHASFICSGNSMPIVLVDWSDIREQKRLMVLRASVALHGRSITLYEKAFPLSEQCSKKAHDQFLADLASILPSNTTPLIVSDAGFKVPWYKSVEKLGWYWLSRVRGKVQYADLGAENWQPISNLHSISSSRSKTLGYKRLTKSNPISCQIALYKSRPKGRKNQRSTRTNCHHPSPKIYSASTKEPWVLATNLPVEIRTPKQLVRLYSKRMQIEETFRDLKSPAYGLGLRHSRTSSSERFDIMLLIALMLQLTFWLAGVHGQKQGWDKHFQANTVKNRNVLSTVRLGMEVLRHSGYTITREDLLAAATLLAQNLFKHGCALGKL >NZ_CP016414.1|WP_065545404.1|1692024_1693203_-|flavohemoglobin-expression-modulating-QEGLA-motif-protein MLKEVSRLNNHEFTAQHNSELRHAKALDKSLFELVNGIEILSAVGPTNYNQQKSEFFKRHFSIEPEFRYKENIHNPFQLKRQLFNLPLESVEDADLHRIYEDVILSYVDKIDQLQTIGTQDFLYNSLRYFGEPTEKDIRNATFILHLPDSDEDDQKLIDAQGIQAIMAEFAKQEDYQYDLVIDDDMIANALVNKTTVKINSAASVPEIEAHALAHHELGVHLATTINAMNQPFHVLSLGCPVNTMTQEGMAILSEYLAGHLTIKRLKILALRVLAVESMIKDKSFRTTFMMLKEQLGVEKNLAFTITARVYRGGGFTKDYLYLRGFHEVLHAYEEQEGFLNLLCGKTALMHLPQINRLVEKGIFNPPIKITPSFVNPTDNDDVRRFITHAIK >NZ_CP016414.1|WP_065545405.1|1693525_1694260_+|RNA-methyltransferase MISKNQLKLLRALGQKKQRKALGLFLVQGEKNVLELASSTLTVKHVFATADFLEQNQATLERFECIEASLDDLTKASTLVSNNAAIAVVEIPTFEAPVAQGMMIALDGVQDPGNLGTIIRVADWYGIKHIVASQDCADPYNPKTISATMGSFGRVQVHQLDLPNYLEQASLPVYGAFLEGESVHKTEFAAEGILLMGSESHGIRAQAAAFVTDKITIPAFGGAESLNVAMATGIILDNMRRQHS >NZ_CP016414.1|WP_005596535.1|1694386_1694710_-|ferredoxin-family-protein MAFVVTDNCIQCKYTDCVAVCPADAFHEGPNFMVINPIECIDCGLCVDECAAQAIFQEDELTDDQQVFIELNAELAEIWPVQTEVKPAMDDAEQWNGVPNKLDKLER >NZ_CP016414.1|WP_009386958.1|1694952_1696569_+|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MIRLTEIKLPLNHEEGAILDAITKKLGIAADQVLSFNLFKRGYDARKKANIQLIYTLDVEVANQAEMLEAFISDPHVKETPDMEYKFVAQAPANQTERPVVIGFGPCGLFAGLVLAQMGFNPIIVERGKEVRERTKDTFGFWRKRALNPESNVQFGEGGAGTFSDGKLYSQIKDPNFYGRKVTTEFVAAGAPEEIMYVSKPHIGTFKLVTMIEKMRAKIIELGGEIRFSTRVDDIHMEDGQITGVTLSNGEEIKSRYVVLSVGHSARDTFEMLNERGVYMEAKPFSVGFRIEHKQSMIDEARFGKNAGHPILGAADYKLVHHCKNGRTVYSFCMCPGGTVVAATSEEGRVVTNGMSQYSRAERNANSAIVVGIDPERDYPGDALAGIRLQRELESGAYVLGGENYDAPAQKIGDFLKGRDPSAIGDVEPSFTPGIKLTDISKALPDFAIEAIREAIPAFDKKIKGFASEDGLLTGVETRTSSPVCIKRGKDYQSINLKGFYPAGEGAGYAGGILSAGIDGIKVAEAVALAMVADAENR >NZ_CP016414.1|WP_065545406.1|1696749_1697250_+|hypothetical-protein MSDIASFMLGEKADSLGRHIEQFLAYNHFWLEHDHKYIQVLFPIDQGTKFNRHAPLVTAADRALFSSDPRLPAAHLNVLDLMLPFWGLTRDGEQIKSDLPLSANNHVWLRHQDHNQLRITRAIRSLALLGNQNIALNLAQFVVEHSQDFDAVSETTRQYWQQAPVV >NZ_CP016414.1|WP_005596531.1|1697485_1698070_+|tetratricopeptide-repeat-protein MIESHPDSASAYYQRGILLAGDYMLPAQVHGRSEQNDVPQAIDDFNTAIDLDPSLVDAYYQLANLYFALSIDDRTAQELLEKALNLAPNNIDCLLLYADLICCEGVNAYAIEILDRVISEDPSAKHFFYKARTLMDNGEIAWNADNFVQGGNLFQAAIEIFQQVTLMEDNDLYFPEAQEYINHCQNVLSSHVCH >NZ_CP016414.1|WP_005596530.1|1698277_1698781_+|peptide-deformylase MAVLDILTAPDPRLKIPATKVSDIESVQTLIDDMLDTLYATDNGIGLASTQVGSKEAIIIIDLSEERNDPLILINPEIVSGSDKAMGQEGCLSVPEYYADVERYTSVVVTGLDRQGNPVTIENDEFLAIALQHEIDHLAGNLFIDYLSPLKRNMALKKVKKHLKQTA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1209943 : 1297505
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP016414|1209943:1297505|DBSCAN-SWA TTTATATGTTTAGATTGGCGATAGGATTGAGCTTTGCGACCGATGATAAGTGGTTAGGGGAAAAGTGCGCGTAAATCATCGTCTGTTCGATATTTGTGTGGCCAAGTGCTTCGCGCAGATCCAGAATGTTGCCACCTTTGCGCATAAACGTAGTGGCGAAAGTGTGGCGCAAAACGTGAGTCGATTGCCCTGCAGGTAGTTCAGGTAAGGCGGTGTTTACCCATTTATGCGCGGTCTTGTAACTGCAGCTAAATAAGTGGCCAGAATCTTGCGGTTTTAACTGTAGGTACAAGGCTTCACTGATTGGCAAAGTGCGGTTGCGTTTACCCTTGGTATTAACAAAAGTGATTTTGTTATCGAAGACGTGTTTGCCTTGCAGTAATAGCGCCTCACTAATTCGCGCGCCGGTTGATAAACAAATCATGTACACCAAACGCAGTTCGTCGGCGAACTCGCTGCCTTTTAGCGTTTCAAATAATCGGATGATTTGCGGCTCGTGTAAAAAGGTAAGTTCAGATTCTGCAACGCGATGGTTTTTCATTCCATCAAGTGGGTTAGGGAAGCGCCATTCTTTTAATTCAATAAGGCGATTGAATACGGCTTTCAAACACGTCATATCACGGTTGCTAGAACTGATTGCCAGTTCGCTACCTTCTTTTCCTTTGCGTTGGTCTTTACGTGCGGCGCGGTAGTGGGCCAGTTTACGAGCATCTAGCTGCGTGGCGATTGGGTTGCCCAAACCACGAATAACATGTTCCATTCGCCCTTTAGTATGCGCCCCAGATTTTAGTTTTTTACCGTGTAATTCATACCACAAATCGACAAGTTCACTTAACCTACGGTGATCTGGTTTATCACCAAGCCAAGGTTTGTCGTCGATCTCTTTCATTAAATAGAGCTCGTAGGCTACTGCTTCACCTTTGGTTGCAAACCGTTTACGGACACGTTTGCCTTCGCGTCCGTTTGGGTAGCATTCGCAAAGCCAATGTTTTTTTGAGTTGTCTTTTAAGTTGCGAACAGCCATATAGCTTTTATCTCAAACCTAAGGTTATTAAGATCATCCATGATATGAGCAATATAGAATTGAATACCAAGGGCAGTGTTAGGTCAAAGCTATACTTTTCTTGCATAAGTGTTCGAAAATAAAATTTAATCTTTAGATGTAATAATTGGAATCTTAGTTTGAATGAATTAATTTGATGAGTTTCATATTGCTCAGTGAAGTAACCATCGTCATCGTAACTGACAGTGTGAATCCCCCAAGCGTTCACTAAACATTCATTTTTAAAGAATGCTTCTTCTACATCAGTATTCTCGTCAGAACCCGATTCTATGTTCTTAAAATTAAATCTATTGTCAAATACGAAATAAAAATAAAACACATCTTCATAACCATACTGATGAGAATGCTCACAGAATGTTGTATGACGACCTCTAATTCCAATTCTGGTGATTGATTCAACAGGATTATCTTTTAATAATGTGTAGGATTCACTTTTTAGCCAGATATTTTCGCTTATAAAATTCCGGCCTTGTGTGCTTAGTAATCCGTTATACAAAGATTCAAACCATAGTTTTCGAAAATTATATGCATTGTGAAGAGTGTATCTATACATAGCATATACATTTAGGGACCAATATAAATAAACAATGTATTCAGGGGACTTAAAATTGATGGTGGGAAACCAAGGAATAGCTACTCTGACATCAGTTAACTCGACTCCCAATACCAAGTGTATTAATCCAATGCAAAACAGGGTCATTAACCCCTTCGATGATTCTGTGAATGAGGGTTCACATGCTTTTTCTATTAGGTTCATGTTATAGCACTGACGTTATATTGATATGGTGGCATCATTAACTTAAGCGAGTGAGTTTTTCTCAATCTCGCTTAAGTTATTTCAAGATCTAAGCCTGATTGTTATTAAATACAGATGAGCTGTATTTACAACGAATCAACCAAATGTCTGACCAAAAAGTGTTTGCGCAGGATCTGCGTCAAATAGCTCAAGAACGGTACCTTTCTTAATCAGCTCTTTCTCGTCGGTTGTTAAGACGGATTCATCGTCCGAATCAACGCCTTCGCTATTTATAATTTGCTCATAAGTGTCTTTGTTTATATTGACAAAGTACTGTAAATCATTTTTCTTAATTACGTCTAAAACCAGTTTGAACATGGTTGCTTTTTGTCTAGGGTCTACACCGGAAAATATACAACTATCATGGGCAAGAAATCCTAAAATAGATGGATTTAAAGAAAACAGCAGTAAGTCATAACAGAATATTTTGACCTCATTTACACCTTGAGAACCATCTTTGTGTATGTGAGGTTCAATATTAAATAAGTACTGGGCGTCTTTACTATTCGTGATAGACAGTCTGCCTCCATGTTCGTGATAAAATCGTTTCACAAAGCTACGGAATATGGTTTCAACTTCTTTTAGTTTTTCTTTGTTATCTTCAAGATATTTGACTGAATCAGCTTTAACTTTAGCTTTATCTAATTCTAGTCTAGCTCTGTCTTTTTCAAATTGGGCTAATACTGTTTGGTAGCTATTGAGCTCTGCAATGTTATTTTCCACCGTACGAATTCGTTCAACGATAGAATTGTATTCTTCCAAAGCACCTTTTGAGTCGAGATCTTTAAGAATCTCATCTCTTTTGGATTCATAGCTAGTAAGATTTGCTTCTAAATATTTGTTGGACTCACGTGCATCTGCGATTTGGTCTCGAAGGCGTTCTTTTCTATTTTTCTGTATTTTAATGTGCCAGTCTTGCGCTTCTTTTAATCGAACGGTCACTCTTTCCGGAAAATGGAATTCAGCTTCATTGTAGATTTCTTCAATCTTAGCTAAATCTACAACTTCATCTCGGCTTGCCATTAATATTTGGTTCTTTTTGCGAATGTTTTGCTCATTCGTGTAAATTTCACTACGGAGTTGCGACATTGTTTGTGTTAACTCATCAGCTCTTCTTTTCAGCTCGTCATAGTTTTTTGCAATTATAAAGTTAGCTTTTGCCTGTAATAAACGTTCTCGCTCTTCTTCCAAATCAAGGAGATCGGATTCGTTGATGGTCACTTTTTGTTTGTTAAGTGACTTTTCAGTTGCTTTCAACTGGTTAAGTTCTTCAGCAATTAGTCTGTTTTTTTTGAGCAATGATGTGTCTATACCGAGTAGGCTAAGATTATACATCATTTGATAGTAGTCGTGAGGTTGTTGGCCTTGTTGGGTCAACGCTCCTGCATAGTAGTTTCTTTCCGGTAAGTATCGGCGAGCAAACATGTTAAAAATAGACTTAAATTTAATATCAAACCTATTGCAAGCAGGGAGTATCTCATAGAGCTTTTTTGGGAAGTTAGTTTTAACTATTTTTTGGTTATTCAAATAGAAATCATTTTCAGCAAAGTTTTTACGGATAGTGTAATTCACAGAACCAATTGTGAAATCAAGATACAGATTTCCATATGTGGATAGGAATGCCTTTAGCTTTTTATCACTAGGTATCTTTTCGTCAAAAGACCCACCAAACATAAGATGTATCAGATTTAGTGAGGTACTCTTGCCAATGCCATTATAACTATCTTTGGCCAACGAGCTGGATTGAAGCCCTGCAACGATATTAAGACCAGGTTCGAAGGGGATTTCTTTGAAACCAGGATTATCAGAATACAGTTTTAAAAGTTTCATTTCTAAACTCCAGTTTGCCAATAATGAACAAAAAATCGAGACATTGTTGTAATCGTTCTATAGATATATTTTTAGGGTACGATTTGTTTACTAAGTCAAGTAAGTCATCGAAATCAACTTCTTCTTGTTTTAGCACATCTACAACGTAAGCAGATATGCAGTATAAAGAATCAATGGGCTTGACAGCTCGAGAAGGCAAAATCATTCTTTTACTCCAACATCACAAATCTCAAAAAAATAGGCGATGATTATCCACGAAACACTCTGACTATTGAAGTTTACTTTAATGATTGCAGATTCTATGCATTCTTGCAGAGAAAAGAGCACTTTGTTGAAGCAAATCTCGCTTTGTTTAGCCAATAGGTGGAGCTCTGGTACGTTCATTGCTTGTAGCTTCGACGGATGTTCATAGCGTTTCAGACTGTTCCGAAGTACATTTGCATAGTAGCCATCAACGACTAAGTTTCGTAGTTCCTGAATTTGGTTATGATCGTCGAAGTTGTAGATAGACTGTGTGTAATCAAGTCCAAGATTGATATGTGCAGCTATACGGACATTTAGATTATTGAGTACAATTTTTTCTGGAGTATCTATTGAACCAAGGTCATCATCATAGTTTGGATTGTAGGTGTGTCGAGCATGTAGCAATAGCTCAAAAATAATTTGAAGTGCTATTTCGTCGGTGTATTTCTCTTCGATTGATGAAAAATGGTTGTTATATAGCTCTAATAAAGGATGGTCATCAAGCTGCTTAATATCATCAAGCAGATCGGTGCTGTCTTTTAAATGAGAGTGTATGTCATTTATGGAATATTTTATTTTATACTCGTCGATAGTCGACTGAGTGAATTTTGTTGGTTTTTCTAGTAGGTAAAGTATGCTTAGCGAATAATTGTTATAAGCTGGATTATCTAGCACTTTCAGAGAGTTATCTATCTTGTGTTTTGTGGTAGTGCTTGTAACTTGAATCGCTTTTCGAGCAGTATGGTCGACTAAGTCTATATATGCTTCATTTTTACCGGATGCGTTTGCATTCGAATAATTAGAACCGTATAAACGGTTAAGAACACCTTTAAAAAAGTCCTCTGCGTGAATGTTTATAGAAAAATCATTCATAGATTGATGCAGCTTAATGTCGCACATCAATATGGATAGCGTTCGTGTGATTTTATTTAGAATATCTATTCTGTCGTAAATCATTTTGGTCAATCCTAGCCAAGAATTTTAATTATTGCTTATTCAGTGAAACCGCCACGCGGCCAATAACTCTGATGTCTTCTTCAGACACTTCTACTGTTGAGTTACCGAATA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86 | Vibrio_phage(42.86%) | portal,lysis,tail,plate,capsid,integrase,terminase | attL 1204807:1204822|attR 1237458:1237473 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
2353681 : 2362088
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP016414|2353681:2362088|DBSCAN-SWA AATGTTGGATATCAAGGCAATTAGAGCGCAGTTTCCCGCGCTCGCTCAGAAGGTGAACCAACAACCATTGGTTTATCTAGACAGTGCTGCAACGACACAAAAACCACAAGTGGTGATCGATGCAATCAGTCGCTACTACAGTCATCAAAATGCCAATGTTCATCGTGGTAGCCACAGTTTAACCGCTCAAGCCACCAGCCAATTTGAAGCGGCCCGCCATTGTGTCGCCAACTTCATTCATGCGGCAAGCGAAAAAGAGATCATCTGGACTCGCGGAGCCACGGAAGCACTCAATCTAATCGCTCAAACTTACGCGCGTAATACTCTCCAAGCGGGAGATGAAATTCTAATTGGTGAAATGGAGCATCACGCCAATATCGTGCCATGGCAGATTGTGGCTGAGCAAACCGGCGCAACCGTAGTGAAATTAGCGATGAACGAACGGTGTCAACTGGATATTGATACTTTTGAGCGCGCATTGAGCAGTAAAACAAAGATTGTGGCACTCGCGCATACCACGAATGTTACCGGTACTCGCCAACCTATCGAGTCGATGATTGAGCTTGCTCATCAACATGGTGCCGTTGTGGTTATTGATGCCGCTCAGGGCATTGTCCATGAAGAGATCAATGTACAATCTTTAGATGCTGACTTCGTGGTCTTCTCCGGTCACAAAATTTTTGCTCCTGCTGGCATTGGCGTGTTGTATGGTAAATTAGCACTGCTCGAAGCGATGCCTCCTTGGCATGGCGGCGGTAAGATGGTTGAGAAGGTCTCATTTTCCGGCACGACCTACAGTCAACTTCCAGGTAAATTTGAAGCCGGCACCCCAAACGTTGCAGGAGCCATCGCGCTTGCAACCGCGATAGAATGGTACGGCCAATTTAGTCGAGAAGAGGTGGAGCAGCACATTCATGCATTAGTCGATAAGGTCTACCAGCGACTTTGCCAACATGCCGATGTTCGCGTGATTGGTTACCAAAGCAATGCGTCGGTGTTGTCTTTTGTTGTTGATGGCGTGCATCATCAAGACGTTGCGACACTGCTCGATCAACAAGGCATTGCAGTTCGTGCAGGCCATCACTGTGCGCATCCATTAATGGATGCTCTGGGCATTGCGGGGACGGTGCGAATCTCTTTTGCCATCTACAATGACCAAGATGATGCAGAGCGAGTTATCACCGCGATAGAGAAAGCACTCGATATGCTCTAGCACTCATTTTTAAATGATTCTGACTAATTTTCAGATAAAAAAAGAGCCTCTGTTGAGGCTCTTGTTCTTTTAACTCTTGCTGATTGAGATTAGCGTGGGCAAATCTCTGACTCAGGAAAGAAGAACGCAATTTCACGCGCAGCAGATTCAGGGCTATCTGAACCATGTACTGAGTTATGACGCATGCTCAATGCGTAATCAGCACGAATAGTGCCACATGCCGCTTCTTCAGGGTTGGTTTTACCCATCAACTCGCGGTAACGAGTGATCGCTTCTTCACCTTCCAGCACTTGAACCATTACCGGGCCCGAGGTCATGAATGCTTTCAAATCATTGAAAAATTCTTTGCCTTCATGCTCTGCATAAAAGCCACTCGCTTGTTCGTCATTAAGATGAACCATCTTTGCTGCAACAATGCTTAAACCTGCTTTTTCAAAGCGATTGTAAATTTCACCAATCAAGTTACGCTTTACCGCGTCAGGCTTTACTATGGAAAACGTTCTTTCTAGAGCCATATGATTTCCTTCTACTTCTCTTCTAATTTTCATTACGCAGTCTAAACGCTGCTCATATTGATCGTGTGTTTATTGAACCAAAATGCGAGCCAAAGAGCGCACACCCACACCGGTTGCACCCGCGCCCCATTTGTCTGACGGAGCTTTACGGTAAGTCGCCGCACAATCAAAATGCAACCAACCTTTTTTGTAATCCTCAACAAAGTAAGAGAGGAATGCTGCTGCCGTACTCGCACCTGGAGAGTAATCACCACTACAGATGTTGGATAGGTCGGCAAAGTTTGAAGGCAACATTGAACGGTGGAACTCTGCAAGAGGTAAAGGCCACAATCCTTCTTGCTCTTCGCGTGCACAAGTCAGCGCTTGATGAGAAAGTGCTTCATCAAAACTCATTAGCGCATGATAGTCGTTACCTAGTGCATTTTTCGCTGCGCCAGTTAAGGTTGCACAGTCGATAATCAGCTCAGGGTTTTGCTCACTGGCATAAATCAAACCATCAGCCAGCACCAAACGGCCTTCGGCATCAGTATTCATGATTTCAACGGTCTTACCATTCTTATAAGTGATGATATCGCCGAGTTTAAGTGCGCGACCTGAAATCATATTTTCCGCGCAGCATAGGATCAGTTTTACACGCTTGTTAAGACCACGCATGATCGCAAGACCTAGACCACCCGTAATCGTACCTGCACCACCCATGTCCGATTTCATTGCCGTCATAAAGTTTGACGGCTTTAGGCTGTAACCACCAGAGTCAAAAGTGATGCCTTTACCGACGAGACACGCATAAACGGGCGCGTTTTCATCTCCAGTCGGGTTGTAATCAAGTTGCAGCATTGCAGATGTGCGCTCAGAACCGCGTCCAACCGCATAAATGCCTTCCCATCCTTCAGTAAGTAAATCCTTATCTTTAACGATACGAACCGTTACTGTGCCTTCTGGCGCAACAGATTTAATAAACTCAGCAGCCATGGTAGCGAGTTGACGAGGCGCGACTTCTTCAGCGGATTTATTGATGATATCGCAAGTAAAAGCGGTCGCTTGAATGCGAGCTTCTAACTCTGCTTGGTGCGCCTCTTCCAGAGGCTGCCAAGTGACATTGGTGTTTTTCTTTGGTTCACGAAAACCTTGGAAAAAGGCCCAAATGGTTTCTACATCCCAACCTTGACCATCGAGCGCAGTATCAGTGATACCTTGTGAGACAATTTTACGTGCCGCTCTTTGAATTGCATCAAGATCATAGCCTTCAGCAAGATGAACCGTTGCGCCTTGCTCAGTGAAAGAAACAAGTGCTTTGTTACCCCAATGTGCCGCAGCTTCAGTTTGGCTTAAATATACCGACATCTGTGTAGACATGGTTTCTCCTTGTCTTAATTATGGCGTTGACTACGCCTTTTGCTCTATACCGAAATCCCCTCGCCTTTGCATAATAAGGCAGACTTTGGTATCGAGTTCGATGTTAGCATTATGTCACGCAAAAATGTCATTTGGATAAAAAAAACGGGCCATAAGGCCCGTTTTTTTTTTATACTTTTTGACGGTGCGTAACATCACGCTTTAATCCGCTTCATCCATCCAGCATAAAATGACCGCTTCAAGAATTTTTTCATTCGAATGATTTGGCTCATCATCAAAATCATCCAACTCTAAAATCCACTGATGCAAGTCGGTAAAACGCACTGTTTTAGGATCAGTCTCTGGAAACTTATCACAAAGCTCAATCGCGATATCACGTGAATCGGTCCATTTCATTCGTCATCTTCCTTAAAGTCAGTATAGTTAACACTCACCTGAGCCTTGTTTATCACAATGTTGTTCAACAACATCGATACATGGGCTCAGCGAATTGATTAATGATCTTCTGATGCGTGGTTCAAAGTATAACGTGGAATTTCTACCACAAGATCTTCTTGTGCAACACGCGCTTGGCAACCAAGACGAGATTCAGGCTCTAAACCCCATGCTTTATCCAGCATGTCATCTTCGAGCTCATCACTTTCTTCTAGTGAATCAAAACCTTCGCGAACAATAACGTGGCAAGTAGTACACGCACATGATTTTTCACACGCGTGCTCGATACCAATACCATTTTTCAGTGCCACATCCAAAACTGTCTCGCCCGCTTGAGCTTCTAATACAGCGCCTTCAGGACACAAGTCTTCATGAGGTAATACGATAATTTTAGGCATAACTTCTACTCTTAAATATCATCGACAGACTGACCAGATAACGCAGCTCGAATCGATTTATCCATACGACGAGATGCAAACTCTTGGCTTGCTTTATCTGTCGCCTTAATTCCTAACTCAATCGCATCGGCATCATCGCCGTTGCGCAGTTCAATAAGGGTTTCAATCACTTTTAGCAGCGCTTGTTCTTCTTCACTTGAAAGTAACTCAGCACCGTCCGCTTGCATCGCTGCAATCAAACCTTCAATAACACGATCCGCTTCAACACGTTGCTCAGCAAGCGCGCGAGCTTGCATGTCTTCTTTGGCATAGGTCATTGAATCACGAAGCATATCAGCAACTTCATTATCACTTAGGCCGTAAGAAGGCTTCACTTGAATCTCAGATTGTACGCCGGTGCTCTTTTCCATCGCGGTAACAGACAATAAACCATCCGCATCGACTTGGTAAGTGACACGAATATGCGCAGCACCCGCCGCCATTGGTGGAATGCCTTTTAACGAGAAACGCGCTAATGAACGACAGTCATCGACCATTTCACGCTCACCCTGCACGGTATGTACCGTCATCGCAGTTTGACCATCTTTGAAGGTGGTGAATTCTTGTGCACGAGCAACTGGAATGGTGGTGTTACGCGGAATGATTTTTTCCACTAGTCCGCCCATGGTTTCGATACCGAGCGAAAGTGGAATAACATCAAGTAACAACATTTCAGAGTCAGGTTTATTACCAACTAGGATATCCGCTTGAATGCCCGCACCGATCGCAACCACTTCGTCTGGGTTGATACTGGTTAACGGGGTACGGCCAAAGAACTCACCGACCATTTCACGAACTAACAAAGTGCGTGTAGAACCGCCAACCATAACCACTTGGTTCACGTCTTCTAGATCCACTTCTGCATCTTTCAATGCACGTCGGCACGACATTAAGGTCTTTTTCACTAAAGGACGAATAAGATCTTCAAACTCTTCACGAGTCACGGTGCCTTGCCAGCCGAGAACATCTACATCAGCGACATCTTGGGTAGAAAACGACTGTTTCACTTTCTGCGCAGCGTTAAGCAATGTGCGGTTTTGTTCAGCAGATAACGAAATTTCTAAACCCATCTTGGCCAATAAACACTCAGCCAAAAGATGGTCAAAGTCATCACCGCCCAGAGCAGAGTCACCGCCCGTCGCTAATACTTCAAATACACCTTTCGATAAACGTAAAATCGAGATATCGAAAGTACCACCACCAAGGTCATAAACTGCAATCACACCTTCTTGGCCAGAATCGAGACCGTATGCAATTGCGGCAGCCGTTGGCTCATTAAGCAGACGCAGTACATGTAAACCGGCCAATTTAGCCGCATCTTTGGTACCTGCGCGCTGTGCATCATCGAAATAGGCTGGAACGGTAATCACGACACCCGCTAACTCTCCACCCAATGTGGTTTCCGCTCGCACTTTCAAAGCGCTTAAAATATCCGCTGAAACCTCAATCGGGTTCTTGTTACCACCCGCGGTTTGTAAAATAGGCAAGCCATTATCACTGGCAGTCAGCTGATAAGGTAAAGAAGGGTAACGCTGATTGATATCTGTCAGTGAACGACCAATCAGGCGTTTGACTGAAATAACAGTGTTGGCAGCATCTTGTTCAGAATGTGCAAGCGCCTCGTGGCCAACCAAAACCGCATCATTAGTGTAATGAACGACAGAAGGCAGAATACGACGACCTTGATCATCTTCTAATGTCGCAGCATCACCGCTACGAACCGTCGAAACCAATGAATTGGTAGTGCCAAGATCAATACCGGCCGCCAATTTATGTTCATGGGGTGCCGAGCTCTGACCCGGTTCTGCAATTTGAAGTAACGCCATTGTTAGTCCTTGCTCTGAGATTAACCGAGTAGTCTTTCTTCCACTAACTCGATTTCATGTTTTAATTTGGCAATAAATTTAAGCTTACGTACGCGATCAGCAGCGAGAGTCCATTGAGCCTCGTTGAGCTCTTTTTCTATCTCGATCAGCTGCTGTTTATACGTTTTAGTCACCTTTTCATCAAACTCAAACAATGCAGCTTCAGGATCCGCTCCACTTGGGATCTCTTCCAACTCTTCACGCAATTCCATTTGTTCCATTAAAAACATTGGATCTTGTAAAGTTTGTTGTTCTCCCTGAAGTTCAATACCGTTTTGGGCAATGAGATATTCAGCACGCGAGAGCGGCTTTTTCAGGATTTGATAAGCATCGTTGATTTGTGCTGCTTTCTGTACCGCCATTAAGCGATCGCGTTCAGAAGCAGTTGCAAAATTGTCAGGATGAAAACGTTTTTGCAGTTCACGGAACTGAGAAGAAAGAAGGCCACCATCCAGACTGAACTGAGTTGGTAGCCCAAATAATTCGAAGTGATTCATTTAAATCTAGCCCTTGGCAATCTCTCCTACTTTCACAAGTAGGAGATCAATCATTAAACGTTGAAGCTTTCACCGCAGCCACATTCACTTTTCGCATTCGGGTTATTGAACTCGAAACCTTCGTTCAATCCCTGCTTTACGTAATCAAGCTCTGTGCCATCAAGATAAGCAAGGCTCTTTTGATCAATGATTACCTTAACGCCTTTGTGCTCAAAGACTTCATCTTCTTCATTTAACTCGTCGACAAACTCAAGTACATAAGCCATACCCGAACAACCTGTCGTTTTTACACCGAGACGCAAACCCACGCCTTTCCCACGATTTTCTAGGAAAGCGCCTACACGGCTAGCGGCTGCATCTGTTAATGTAATGGCCATACTGCACCTTGATTGTTTCTATTACCAATAAAATGGGAGGCTTGCTCCCATCATGACAAAGTCGAGTTTACTGATGTTTTTTCTTATAGTCAGCAACTGCTGCTTTAATTGCGTCTTCCGCTAGGATTGAACAGTGAACTTTCACTGGTGGAAGTTCTAGCTCTTCTGCAATTTCAGAGTTTTTGATTGCTGCCGCTTCGTCGATTGATTTGCCTTTAACCCACTCAGTCACCAGTGAGCTTGACGCAATCGCGCTACCACAACCATAAGTTTTGAACTTCGCGTCTTCAATAATACCTTCCGGCGTTACTTTGATTTGAAGCTTCATAACATCACCACACGCAGGAGCACCAACCATGCCGCTACCTACCGATGGATCTTCTTTATCAAAAGAACCAACGTTACGTGGGTTCTCATAATGATCAATTACTTTTTCGCTGTACGCCATAATATCTACCTCGAATCCTCTACATCTATATCAATTGGGATGCTAACTGATTAGTGGTGCGCCCACTCAACCGTGTTTAAGTCGATCCCTTCCTTGTACATATCCCATAGAGGAGACATGTCGCGTAGCTTATTCACCGCTACACGGATTTGTTCAATTGCATAGTCCACTTCTTCTTCCGTCGTAAAACGACCAAATGAGAATCGAACTGAACTGTGTGCCAACTCATCGTTTAAACCTAGAGCACGCAGAACATATGATGGTTCAAGACTGGCTGATGTACATGCACTGCCTGAAGAAACGGCTAGATCTTTCAGTGACATCAGTAGCGACTCACCTTCAACAAAAGCAAAGCTGATGTTTAAGTTGTGCGGTACACGTTGATCAAAGTCACCATTAACCGTTACGGCTTCAAGATCCTTCACACCATTAAATAAACGATTACGAAGGGCCAATGCATGATCGTAATCTTTTTGTAGCTCTTCTTTCGCAATACGGAAAGCTTCACCCATGCCAACGATTTGGTGTGTTGCTAGCGTGCCTGAACGGAATCCACGTTCATGGCCACCACCGTGCATTTGAGCTTCAAGGCGAATACGTGGCTTACGACGTACATACAGTGCGCCGATGCCTTTCGGGCCATAAACTTTGTGTGCAGATAAGGAGATAAGATCTACTTTCATCTCTTGCACATCAATCGCAACTTTACCTGCAGACTGTGCAGCATCAACATGGAAGATAATTTTACGTTCACGACATAGTTCGCCAATCGCTGCAATATCTTGGATTACGCCGATTTCGTTGTTTACATGCATGATAGAAACCAAGACGGTATCTTCGCGCATCGCCGCTTGAAGTTTGTTTAGGTCGACAAGACCATTAGCTTCCGGCGCCAGGTATGTCACTTCAAAGCCTTCACGCTCAAGTTGGCGACAAGGATCCAGTACCGCTTTGTGTTCGGTTTTGCAGGTAATGACGTGCTTACCTTTCTTCTCGTAAAAATGCGCAGCGCCTTTGATAGCTAAGTTATCAGACTCAGTTGCGCCAGAAGTAAATACGATTTCACGAGGGTCTGCGTTTAGCAGCTCAGCGATTTGTTCGCGAGCGTTATCGACTGCCTCTTCGGCTTGCCAACCGTAACGGTGTGAACGTGACGCAGGATTACCAAACGTACCATCCATCGTCATGCACTGAACCATCTTTTCAGCAACTCGTGGGTCAACTGGACAAGTTGCTGAATAATCGAGATAAATCGGCAGTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP016414|2353681:2362088|2355477_2356764_-|WP_065429872.1|DBSCAN-SWA MSTQMSVYLSQTEAAAHWGNKALVSFTEQGATVHLAEGYDLDAIQRAARKIVSQGITDTALDGQGWDVETIWAFFQGFREPKKNTNVTWQPLEEAHQAELEARIQATAFTCDIINKSAEEVAPRQLATMAAEFIKSVAPEGTVTVRIVKDKDLLTEGWEGIYAVGRGSERTSAMLQLDYNPTGDENAPVYACLVGKGITFDSGGYSLKPSNFMTAMKSDMGGAGTITGGLGLAIMRGLNKRVKLILCCAENMISGRALKLGDIITYKNGKTVEIMNTDAEGRLVLADGLIYASEQNPELIIDCATLTGAAKNALGNDYHALMSFDEALSHQALTCAREEQEGLWPLPLAEFHRSMLPSNFADLSNICSGDYSPGASTAAAFLSYFVEDYKKGWLHFDCAATYRKAPSDKWGAGATGVGVRSLARILVQ >NZ_CP016414|2353681:2362088|2360051_2360375_-|WP_005592828.1|DBSCAN-SWA MAITLTDAAASRVGAFLENRGKGVGLRLGVKTTGCSGMAYVLEFVDELNEEDEVFEHKGVKVIIDQKSLAYLDGTELDYVKQGLNEGFEFNNPNAKSECGCGESFNV >NZ_CP016414|2353681:2362088|2356965_2357160_-|WP_005592824.1|DBSCAN-SWA MKWTDSRDIAIELCDKFPETDPKTVRFTDLHQWILELDDFDDEPNHSNEKILEAVILCWMDEAD >NZ_CP016414|2353681:2362088|2357258_2357597_-|WP_005592825.1|DBSCAN-SWA MPKIIVLPHEDLCPEGAVLEAQAGETVLDVALKNGIGIEHACEKSCACTTCHVIVREGFDSLEESDELEDDMLDKAWGLEPESRLGCQARVAQEDLVVEIPRYTLNHASEDH >NZ_CP016414|2353681:2362088|2360442_2360823_-|WP_005592829.1|DBSCAN-SWA MAYSEKVIDHYENPRNVGSFDKEDPSVGSGMVGAPACGDVMKLQIKVTPEGIIEDAKFKTYGCGSAIASSSLVTEWVKGKSIDEAAAIKNSEIAEELELPPVKVHCSILAEDAIKAAVADYKKKHQ >NZ_CP016414|2353681:2362088|2354982_2355408_-|WP_065545664.1|DBSCAN-SWA MALERTFSIVKPDAVKRNLIGEIYNRFEKAGLSIVAAKMVHLNDEQASGFYAEHEGKEFFNDLKAFMTSGPVMVQVLEGEEAITRYRELMGKTNPEEAACGTIRADYALSMRHNSVHGSDSPESAAREIAFFFPESEICPR >NZ_CP016414|2353681:2362088|2357608_2359462_-|WP_005592826.1|DBSCAN-SWA MALLQIAEPGQSSAPHEHKLAAGIDLGTTNSLVSTVRSGDAATLEDDQGRRILPSVVHYTNDAVLVGHEALAHSEQDAANTVISVKRLIGRSLTDINQRYPSLPYQLTASDNGLPILQTAGGNKNPIEVSADILSALKVRAETTLGGELAGVVITVPAYFDDAQRAGTKDAAKLAGLHVLRLLNEPTAAAIAYGLDSGQEGVIAVYDLGGGTFDISILRLSKGVFEVLATGGDSALGGDDFDHLLAECLLAKMGLEISLSAEQNRTLLNAAQKVKQSFSTQDVADVDVLGWQGTVTREEFEDLIRPLVKKTLMSCRRALKDAEVDLEDVNQVVMVGGSTRTLLVREMVGEFFGRTPLTSINPDEVVAIGAGIQADILVGNKPDSEMLLLDVIPLSLGIETMGGLVEKIIPRNTTIPVARAQEFTTFKDGQTAMTVHTVQGEREMVDDCRSLARFSLKGIPPMAAGAAHIRVTYQVDADGLLSVTAMEKSTGVQSEIQVKPSYGLSDNEVADMLRDSMTYAKEDMQARALAEQRVEADRVIEGLIAAMQADGAELLSSEEEQALLKVIETLIELRNGDDADAIELGIKATDKASQEFASRRMDKSIRAALSGQSVDDI >NZ_CP016414|2353681:2362088|2360873_2362088_-|WP_005592830.1|DBSCAN-SWA MKLPIYLDYSATCPVDPRVAEKMVQCMTMDGTFGNPASRSHRYGWQAEEAVDNAREQIAELLNADPREIVFTSGATESDNLAIKGAAHFYEKKGKHVITCKTEHKAVLDPCRQLEREGFEVTYLAPEANGLVDLNKLQAAMREDTVLVSIMHVNNEIGVIQDIAAIGELCRERKIIFHVDAAQSAGKVAIDVQEMKVDLISLSAHKVYGPKGIGALYVRRKPRIRLEAQMHGGGHERGFRSGTLATHQIVGMGEAFRIAKEELQKDYDHALALRNRLFNGVKDLEAVTVNGDFDQRVPHNLNISFAFVEGESLLMSLKDLAVSSGSACTSASLEPSYVLRALGLNDELAHSSVRFSFGRFTTEEEVDYAIEQIRVAVNKLRDMSPLWDMYKEGIDLNTVEWAHH >NZ_CP016414|2353681:2362088|2353681_2354893_+|WP_065545663.1|DBSCAN-SWA MLDIKAIRAQFPALAQKVNQQPLVYLDSAATTQKPQVVIDAISRYYSHQNANVHRGSHSLTAQATSQFEAARHCVANFIHAASEKEIIWTRGATEALNLIAQTYARNTLQAGDEILIGEMEHHANIVPWQIVAEQTGATVVKLAMNERCQLDIDTFERALSSKTKIVALAHTTNVTGTRQPIESMIELAHQHGAVVVIDAAQGIVHEEINVQSLDADFVVFSGHKIFAPAGIGVLYGKLALLEAMPPWHGGGKMVEKVSFSGTTYSQLPGKFEAGTPNVAGAIALATAIEWYGQFSREEVEQHIHALVDKVYQRLCQHADVRVIGYQSNASVLSFVVDGVHHQDVATLLDQQGIAVRAGHHCAHPLMDALGIAGTVRISFAIYNDQDDAERVITAIEKALDML >NZ_CP016414|2353681:2362088|2359482_2359998_-|WP_005592827.1|DBSCAN-SWA MNHFELFGLPTQFSLDGGLLSSQFRELQKRFHPDNFATASERDRLMAVQKAAQINDAYQILKKPLSRAEYLIAQNGIELQGEQQTLQDPMFLMEQMELREELEEIPSGADPEAALFEFDEKVTKTYKQQLIEIEKELNEAQWTLAADRVRKLKFIAKLKHEIELVEERLLG |
10 | environmental_halophage(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
40140 : 100515
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP016416|40140:100515|DBSCAN-SWA 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59 | Streptococcus_phage(14.29%) | plate,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
285713 : 322730
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP016415|285713:322730|DBSCAN-SWA TCTATAGATGCGCATGAATATACTCCGTAGGAGTTCTATACCCAAGTCTTTTGCGTGGGCGCGTATTTAATTTGTGGGCAATTTCATTGCAGAGCTTCTGTGTTACATGTGACATGGAAGTTCGTTTTGGTAAATACTGACGTATTAATCCATTGGTATTTTCATTGGTGCCTCTTTCCCATGAATGATATGGGTTTGCAAAGTAAAACAAGCAGTTATGAAACCTTTCTAGTTGTGCGTATTGGTGAAATTCAGTGCCGTTATCAGCTGTAATTGTCTTAAAAGGTAAATCGGAACGGGTCATGATTTTGCTCATTCTCACATTAAGTGATCCCGTCGTTCGGTCGTCTAATTGGCCAATAAAAGTGTAGCCTGTCATTCTGTCCACCAAAGTGACAATACAGTGCTTAGTTCCGCGCCCAACAACGGTATCAATTTCCCAGTGCCCAGGTTCTTTTCTTAGCTCAGCCTCAACCGATCTCTCGATGATATGACGTTTATTTGCAAGCCGTCCTCGACTGTCTTTTGAGTTGTAGCGCTTACGCCTTTTCTTAGTCGATTGACGCAGGTGTTTCCATAGCATTCCGCCTTCTGCTTTATCGTTCCAGACGTACTGATAAATGAGTTCGTGACTCATTGTTGGATAGCCTCTTAATCTTAAGTAGCCAACGATCTGATCTGGGCTCCAATCCAGTTTCAATAAGGCTTCAGCCAACCTAAAGTCAGTTTTACAGTAACGCTTATTTCGCCTTGAACGACTAAGTCTACTTCGAGCTTTTTGTTGTGCGCGAGCAGGTTGGTAAGACGGGTTTGGTCGGTATGCGTTGTATCGCGAGTTCCGTTGGAATTCACGATAAATAGTACATCTGTGACGACCTAGTTGTGTGGCGATTTTATCGACACTAATTCCTTGCTTTCTCAGAGCAGAAATCATATACCTTTCTATCTCAGTGAGGTGCGTATATCTCATGGTTTTTCACTTCTTGGCGGGAGCAAATTCATGATTATCGCATCTCACTGTTATATTGTTCAGTGGTGTCGCACTTCGTACTTGAATCCAAGGAACATAACAAGCAATTTAAGAGGGATTCACAACGCTTGGCATTTTTGCTTCTACTTCAAATTTAGTGTTTATGGCACAATGCTTTAGGTCGGGTGGTAGCGTTGTTCACCCCTTAATTGGGCGTTATGTTTTAATGTAATTTCAATGGCTTAAATGCCTTTGAGTCGTTCTTTGCCCCTTTGGCTACTTGTTCGGAATAGACTCAGCAAATCACGATTGTCTGCCCCAATTCTTGAATTACTTCACCCGTAAAACATGCCAAGGTTAGTGGGTTGCTTCATTCGAGTTTTCGGGTGGTTCGGTAGTCAGGTTTCTCTGGCTCAAAGTCGCTTTGGGCATATTTCCCAATCAGCCAATAACCTTGGCAGTTGCCTCGGCAAATCGCCATTGTTTTGCGCTGTTGTTGCTAAGAAAGGGCGCTTGTTGAGACTTGATCGAGTTGTCTCATTATCAGGGAAGTGGGCTTACTCGTTGTTGGTTTGGCGCATCTGTCGGTCAAGTGAACCCGAGATTGTGATTTGGTTCAGAAATCTAGGTTTGTATCTCAGCTCTTTGCCAAGTAAATCAACGAATTGTGCTAAAACATAACAAAGCATTTAAGACGGATTCTCAACGCTTGGCAATTTCAGTTTAGGTCGGCTTTAGTGCTGAATGTGGCAAGGTTTAGGGTTGGGTGGTCGCGTTGTTCACCACTTAATGCGGCGTTATATCTAATTTACATCACACATCCTGACTGTATGTATATACATACTTCGGTGCTGGTATATTATTCTCCGGTTTTTTAGTGATAGAGTTATAAAATGACCAAGTACCTAGAAGCTGGCATCAGAGAGCTAGTCGAGGAATTTCAATCAAATGGCAAACTTTGCCCTTCAGCACAAACAATCGCTGATCGTCGGGCTGGCTATGTCGGTAGTACCATATTAGCTGGTGATAGCCCTAAAATTGCAAGCGAATACTTAGATGTAATTAATAGTATTCCGGTTAAGATTTACAAGCCTACAGATGAAGTGAACTTACCTATAACGGTCTACTTTCATGGAGGTTGTTTCATCAGTGGTGGCTTTGAGACACATGATGCTCAGCTAAGACAAATTGCTCTTCTATCCAACTCGATAGTTATTTGCATTCAATACAGGTTAGCGCCTGAACATGCTTATCCAGCAGCACACGATGATGTCTACCAAGCTGTACTTGGCATTAAGGCGCAAGCGCATAAGTATGGTGGTGATTCAGAGCATTTAGTCTTTATTGGTGATAGCGCTGGAGGGCAGTTGGCTTTGGCGACGACGCTTAGGCTAAAAAAACTAGAACAGTGGTTGCCTCGTCAGCAAATTCTTATTTACCCAATGCTGGATCCAACAGGTAATTCGCAAAGTTACAGAGAAAATGGTTCAGACTATGTTATAACGGCAAATATGCTTCTTTCAGGCTTCGAGTTATACGCGAACTGTAGCTCTAAAGACATTACAGAACCAGAGCTTAACCTTTTAAACAGTGACTTTAGCGGTTTGCCTATCACAACTATTATTACCGCAGAGTTTGACCCACTACGCGATGAGGGTGAGTACTTATACAAGTTGATGCTTTCACAAGGCGTTGACGCTTACTGTGAACGTTATTTGGGTGTAATTCATGGTTTCTTTCAGTTGTCTGGTGTGTGTAATTCGGCAAAGCGTTGTATCGCTGCAATTTCAAACCAAATAAAAAATTAGATATAACAAAGCGTTTAAGCCGGATTCCCAACGCATGGCGTTTTCGGCTTATTTTGGTTTTAGTGTTTATGTCACAATGGTTTAGGTTGGGTGGTTAGCGTTGCTCACCACTTAACGCGGCGTTAGTTTACCAATCAGAATAGCACCCTAACTGAACATGCTAGGGTGTGGTAATTATCGCAAATGGTTTTGCGGTAATTGCGATTGTCCAAGAACTGCAACGACCAAAATAAAGCCGTCTTCTTTGGTAAAGTAAGCCGTGTGCTTACCGATCGGGAAGTAAAAACCGTTTTGATATATATCGTTGCAGCTTCTACCTACTGCCGGGTTTTCAGCAAGCATCTGAAACCCAGTAAGAAGAGTGTCTTTATATGAGTTCCACTGCATCTGGGAAAAGTTTATAACAGTATAATTTTTGATTTTGTGTAAATGAGCCTGTGCTAATTTACTTAGTTTATATTTGCTCTTGTGCATACTCTACTTACAACGCGCTTAAGAAATTTTCACCATCAACGACATTGCCTTGGGCTAAGTCTGCTTTTGCAGTCTCAAAGCAATGTTTTATGTAATCGGCTTTCATCGCTTCAAGTTCTTCATAGTCTCTAATCGACATTACAACAACGGCATCTTTGTTGTTTTTACTAATTTTAACTGGCTCGCGTTGAGCGTTTAGAAGCAGTTCACCGAAATTACGTTTAGCGTCATTTGCTGTTAATGTGTACATGATTAAGCTCCAAGTCTGCAAGTACAGTATCATTATAGGGCATCGCTCTAAATGTGCAATTCAATTAAATCGTGCGATTTGTGTGAAAGGTAAACTAACAAAGCGTTTAAGACGGATTCCCAACGCTTGGCATTTTCGGCTTACTTTGAGTTAAGTGATTATGTCACAATGGTTTAGGTAGGGTGGTAGCGTTGCTCACCACTTAACGCGGCGTTATGTTTTAATGGAATTTCAATGGCTTAAGTGCCTTCGAGTCGTTCTTTGTCCCTCTAACCATTCGTTGGGAGTAGACTCAGCAAATCAGTATTATCGTTCCTTTCTTAAATCACTTAACTCGTAAAACATGCCAAGGTTCGCGGGTTGCTTCATTTAAGTTTTCGGGTGGTTTGGTCGTTTTGTTTCTCTGGCTCAAAGTCGCTTTGGTCATATTTCCCAATCAGCCAATAACCTTGGCAGTTGCCTCGGCAAATCTCCATTGTTTTGCGCTGCTTGTGCTAAGAAAGGGCGCTTGTTGAGCCTTGGTCGAGTTGCCTCATTATCAGGGAAGTGGGCTTACTCGTTTTGGGTTTGGAGCATCTGCCGGTCAAGTGGGTTCTAGCTTGTGACTTGGTTCAGAAATCTAAGTCTGCATCTCAGTTCTTTGCCAAGTAAATCAACGAATTGTGCTAAAACATAACAAAGCATTTAAGACGGATTCTCAACGCTTGGCGGTTTCAGTCTAGGTCGGCTTCAATGCTAAATGTGGCAAGGTTTAAGGCAGGGTGGTCGCGTTGTTCACCACTTAATGCGGCGTTAGCCATCAGTGTGTCAATTATGGAGTTTTAATGAAAGATTATGGTCAAGTTGTAGATATATTAAAAGGTGAAAGCGATCGTGGTGCAGTGCTTATTGCGGCTTCCATGATTGATGTAGCACTCGAAAACCTAATAAAAGAAAAGCTAGTTGATAGCGATAAGAAAAGAGACCCTATTTTTGAGCATAATGGTTCGTTAGGAACATTCTCTTCAAAAATAGAAATGTCGTATAGGTTGGGACTAATTACGAGCAAACAGCAGTTAATGTTCAATACATTTCGAAAGCTGAGAAATGTATTTGCTCATAGCTCAACTCCCTTAAGTCTCGATGATGGACCGATTAGGGATCAGCTAGAAGCTGTGTTTACACATAACCCTGAACTTAGAAATTTATATATCGATGCTGTTCAAGCCACTAATAAGCACCATAACATATCTCAAGAGGACACAAACAATACCCTAAGGTCAGGGCGCTTTCTCCTTAACATGGTTTTTTCTTTGGAAATATTAACGTTAACGAATGCACGTGACAGTGTTGCAAAGATCAAGCGAAATGATGGCTAACAAAGCGTTTAAGACGGATTCCCAACGCTTGGCATTTTTGGTTTACTTTGGGTTAAGTGTTTATGTCACAATGGTTTAGGTTGGGTGGTCTGCGTTGCTCACCACTTAACGCGGCGTTATGTTTTAATGGAATTTCAATG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>NZ_CP016415|285713:322730|291866_292325_+|WP_065546164.1|DBSCAN-SWA MTEIEKIIYTAAATIIGGLLIHSMSQLIQKLFIEPCHQYRQLTSKSISSLSFYSNMLNAKVRVDDGEDYRKRYFDGQDEVRKLMADMKAQYVTIFPLWIAIVFGLVPSKKKHKQIVSNMLTLSFFGSLSTHDDERSPYDLAKETVKLMGGDL >NZ_CP016415|285713:322730|317767_318121_+|WP_065546190.1|DBSCAN-SWA MDYQTKLQFAHKELNDKGVWKSNYNPPIAKLLCKMGLNFPPPYYQTFMNNWVISAIMFAPVWGVLNWFVVWSKADKPVLEAVYMSLIGGVLFGLIMATFYFVRRKQLNLSEWSSLGE >NZ_CP016415|285713:322730|314356_314761_+|WP_065546186.1|DBSCAN-SWA MTITGECFCGEIKYKIDGGLHDARSCHCSRCRKAFSSQASAYALVKEGEFEWVCGEERLTSYIGEHGFGLQFCSKCGSTLVGVYKGHVHGVTLGCINGDPQIQLSRHIYVDSKASWELIADGVPQFDGAPPENA >NZ_CP016415|285713:322730|285713_286682_-|WP_083163595.1|transposase|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP016415|285713:322730|322358_322730_+|WP_156785360.1|transposase|DBSCAN-SWA MTNVADNLLRRDFEADNPNQKWVTDITYIWVKSRWLYLATVMALHSRRIIGWSLDTTMAVQLITNALKMAFKSRKPPKGVIIHSDRGVQYRAYEYQNFMREHGGVPSMSRKGNCWGNAVMESF |
41 | Staphylococcus_phage(44.44%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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