Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012047 | Tetragenococcus halophilus strain MJ4, complete genome | 4 crisprs | cas6,cas10,csm2gr11,csm3gr7,csm4gr5,csm5gr7,csm6,cas1,cas2,RT,cas3,cas5,cas8c,cas7,cas4,csa3,DEDDh,DinG,cas14j | 0 | 11 | 9 | 0 |
1. NZ_CP012047
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012047_1 | 421504-422835 | TypeIII |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012047_1
|
18 spacers
spacers of NZ_CP012047_1
>1.1|421540|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTAAGGAAAGTATTCCCTTTCACGTCTAATACACT >1.2|421611|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCACTCACTCCATTCCTCGACCGTGCCATCTACAA >1.3|421682|36|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAGTTCTTCCACTGATTTATCTTTGTACATTTCAT >1.4|421754|40|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCTAGCAACATCAGCACGCTCATCTGTCCCGCTATATAAT >1.5|421830|36|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGGCAGGCGTTTGACCAGCCAAAGCAATAAGTTCCT >1.6|421902|37|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCCTTGAGGAAATTTATTCAAGAGTTGATAGGAAGTT >1.7|421975|33|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTGCTCCACTAAAATTATTCGGTGTGATTTCT >1.8|422044|36|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGTTTGATATCTGTAATAAACGGGCTGTTTTACAG >1.9|422116|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTCATTTTAATTTCTCCTCTCTTTAACTTTCTAA >1.10|422187|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTCATTTTAATTTCTCCTCTCTTTAACTTTCTAA >1.11|422258|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCGAAATCGATGTTTAGGTGCATCTCAGCATTTC >1.12|422329|37|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAAGAAGTTAATTACGATTTGGACTGTGTCAATCT >1.13|422402|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTCGAAATCGATGTTTAGGTGCATCTCAGCATTTC >1.14|422473|37|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAAAAGAAGTTAATTACGATTTGGACTGTGTCAATCT >1.15|422546|38|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATCTTCTTTTATGTTATTCATTCTTTATCTTCCTCTC >1.16|422620|37|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAGTAAATCGTTTATTTCATTTGTTAATACTTTCA >1.17|422693|36|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCCGGGTCTAAGTATTCTATGACCGTGTCTATTAC >1.18|422765|35|NZ_CP012047|CRISPRCasFinder,CRT TAAATTACTTTTTGAAGTAAATCCATATTCACTAG |
csm6,csm5gr7,csm4gr5,csm3gr7,csm2gr11,cas10,cas6,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012047_1
The CRISPR arrays of NZ_CP012047_1 >merge|NZ_CP012047|1|421504-422835|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAACCTAAGGAAAGTATTCCCTTTCACGTCTAATACACTAATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAACTCACTCACTCCATTCCTCGACCGTGCCATCTACAAAATAGATACCTAACCCCATCATTAGGGGACGAGAACTAAGTTCTTCCACTGATTTATCTTTGTACATTTCATAATAGATACCTAACCCCATCATTAGGGGACGAGAACCCTAGCAACATCAGCACGCTCATCTGTCCCGCTATATAATAATAGATACCTAACCCCATCATTAGGGGACGAGAACCGGCAGGCGTTTGACCAGCCAAAGCAATAAGTTCCTAATAGATACCTAACCCCATCATTAGGGGACGAGAACTCCTTGAGGAAATTTATTCAAGAGTTGATAGGAAGTTAATAGATACCTAACCCCATCATTAGGGGACGAGAACTCTGCTCCACTAAAATTATTCGGTGTGATTTCTAATAGATACCTAACCCCATCATTAGGGGACGAGAACCTGTTTGATATCTGTAATAAACGGGCTGTTTTACAGAATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAACATTCATTTTAATTTCTCCTCTCTTTAACTTTCTAAAATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAACATTCATTTTAATTTCTCCTCTCTTTAACTTTCTAAAATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAACTTCGAAATCGATGTTTAGGTGCATCTCAGCATTTCAATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAACAAAAAGAAGTTAATTACGATTTGGACTGTGTCAATCTAATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAACTTCGAAATCGATGTTTAGGTGCATCTCAGCATTTCAATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAACAAAAAGAAGTTAATTACGATTTGGACTGTGTCAATCTAATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAACTATCTTCTTTTATGTTATTCATTCTTTATCTTCCTCTCAATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAACTTTAGTAAATCGTTTATTTCATTTGTTAATACTTTCAAATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAACGTCCGGGTCTAAGTATTCTATGACCGTGTCTATTACAATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAACTAAATTACTTTTTGAAGTAAATCCATATTCACTAGAATAGATACCTAACCTCACGATTAGAGGACTGAGAA >NZ_CP012047|1|1|421504-422764|PILER-CR AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC CTAAGGAAAGTATTCCCTTTCACGTCTAATACACT AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC TCACTCACTCCATTCCTCGACCGTGCCATCTACAA AATAGATACCTAACCCCATCATTAGGGGACGAGAAC TAAGTTCTTCCACTGATTTATCTTTGTACATTTCAT AATAGATACCTAACCCCATCATTAGGGGACGAGAAC CCTAGCAACATCAGCACGCTCATCTGTCCCGCTATATAAT AATAGATACCTAACCCCATCATTAGGGGACGAGAAC CGGCAGGCGTTTGACCAGCCAAAGCAATAAGTTCCT AATAGATACCTAACCCCATCATTAGGGGACGAGAAC TCCTTGAGGAAATTTATTCAAGAGTTGATAGGAAGTT AATAGATACCTAACCCCATCATTAGGGGACGAGAAC TCTGCTCCACTAAAATTATTCGGTGTGATTTCT AATAGATACCTAACCCCATCATTAGGGGACGAGAAC CTGTTTGATATCTGTAATAAACGGGCTGTTTTACAG AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC ATTCATTTTAATTTCTCCTCTCTTTAACTTTCTAA AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC ATTCATTTTAATTTCTCCTCTCTTTAACTTTCTAA AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC TTCGAAATCGATGTTTAGGTGCATCTCAGCATTTC AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC AAAAAGAAGTTAATTACGATTTGGACTGTGTCAATCT AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC TTCGAAATCGATGTTTAGGTGCATCTCAGCATTTC AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC AAAAAGAAGTTAATTACGATTTGGACTGTGTCAATCT AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC TATCTTCTTTTATGTTATTCATTCTTTATCTTCCTCTC AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC TTTAGTAAATCGTTTATTTCATTTGTTAATACTTTCA AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC GTCCGGGTCTAAGTATTCTATGACCGTGTCTATTAC AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC >NZ_CP012047|1|1|421504-422835|CRISPRCasFinder AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC CTAAGGAAAGTATTCCCTTTCACGTCTAATACACT AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC TCACTCACTCCATTCCTCGACCGTGCCATCTACAA AATAGATACCTAACCCCATCATTAGGGGACGAGAAC TAAGTTCTTCCACTGATTTATCTTTGTACATTTCAT AATAGATACCTAACCCCATCATTAGGGGACGAGAAC CCTAGCAACATCAGCACGCTCATCTGTCCCGCTATATAAT AATAGATACCTAACCCCATCATTAGGGGACGAGAAC CGGCAGGCGTTTGACCAGCCAAAGCAATAAGTTCCT AATAGATACCTAACCCCATCATTAGGGGACGAGAAC TCCTTGAGGAAATTTATTCAAGAGTTGATAGGAAGTT AATAGATACCTAACCCCATCATTAGGGGACGAGAAC TCTGCTCCACTAAAATTATTCGGTGTGATTTCT AATAGATACCTAACCCCATCATTAGGGGACGAGAAC CTGTTTGATATCTGTAATAAACGGGCTGTTTTACAG AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC ATTCATTTTAATTTCTCCTCTCTTTAACTTTCTAA AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC ATTCATTTTAATTTCTCCTCTCTTTAACTTTCTAA AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC TTCGAAATCGATGTTTAGGTGCATCTCAGCATTTC AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC AAAAAGAAGTTAATTACGATTTGGACTGTGTCAATCT AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC TTCGAAATCGATGTTTAGGTGCATCTCAGCATTTC AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC AAAAAGAAGTTAATTACGATTTGGACTGTGTCAATCT AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC TATCTTCTTTTATGTTATTCATTCTTTATCTTCCTCTC AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC TTTAGTAAATCGTTTATTTCATTTGTTAATACTTTCA AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC GTCCGGGTCTAAGTATTCTATGACCGTGTCTATTAC AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC TAAATTACTTTTTGAAGTAAATCCATATTCACTAG AATAGATACCTAACCTCACGATTAGAGGACTGAGAA >NZ_CP012047|1|1|421504-422835|CRT AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC CTAAGGAAAGTATTCCCTTTCACGTCTAATACACT AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC TCACTCACTCCATTCCTCGACCGTGCCATCTACAA AATAGATACCTAACCCCATCATTAGGGGACGAGAAC TAAGTTCTTCCACTGATTTATCTTTGTACATTTCAT AATAGATACCTAACCCCATCATTAGGGGACGAGAAC CCTAGCAACATCAGCACGCTCATCTGTCCCGCTATATAAT AATAGATACCTAACCCCATCATTAGGGGACGAGAAC CGGCAGGCGTTTGACCAGCCAAAGCAATAAGTTCCT AATAGATACCTAACCCCATCATTAGGGGACGAGAAC TCCTTGAGGAAATTTATTCAAGAGTTGATAGGAAGTT AATAGATACCTAACCCCATCATTAGGGGACGAGAAC TCTGCTCCACTAAAATTATTCGGTGTGATTTCT AATAGATACCTAACCCCATCATTAGGGGACGAGAAC CTGTTTGATATCTGTAATAAACGGGCTGTTTTACAG AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC ATTCATTTTAATTTCTCCTCTCTTTAACTTTCTAA AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC ATTCATTTTAATTTCTCCTCTCTTTAACTTTCTAA AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC TTCGAAATCGATGTTTAGGTGCATCTCAGCATTTC AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC AAAAAGAAGTTAATTACGATTTGGACTGTGTCAATCT AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC TTCGAAATCGATGTTTAGGTGCATCTCAGCATTTC AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC AAAAAGAAGTTAATTACGATTTGGACTGTGTCAATCT AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC TATCTTCTTTTATGTTATTCATTCTTTATCTTCCTCTC AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC TTTAGTAAATCGTTTATTTCATTTGTTAATACTTTCA AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC GTCCGGGTCTAAGTATTCTATGACCGTGTCTATTAC AATAGATACCTAACCCCATTATTAGGGGACGAGAAC TAAATTACTTTTTGAAGTAAATCCATATTCACTAG AATAGATACCTAACCTCACGATTAGAGGACTGAGAA
>NZ_CP012047.1|WP_083207541.1|420104_421358_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm6 MNLQTLISCVGDTDPIRNFYDGPLLHIARGIRPEKIVIVHSERSQEKHDNIVQALNSIPDYYPEIVTDKRTIKNTDIFLFDKMFEVLSKIIQEYARSEEEIILNLTSATPQIISAMFSINRISGLNVRAYQVATPSNTSNEGIKHNNQQDIQQLIESNKDNRKDYNNRLIEDKAEKFQQLLVRKTFLDLIREYDYEGAVQVISGNDLMLSKKKKGKLHHELDNLIKSIKTQNLLPEVENSEFDVSQKTILNAYLLISLQAKRELNTEVLIRVKNFAEFIVEMYLDKNYNGLIVRYDGKPYLNTEGFEDVILKLQYSLKKAGNELNTDRYLSLPLYAEIIRIIQPDSSLLKLIDKVNGVNTFRNQVAHGFKPINMKNSRVKDLAETCWMLLLIVNDVDEKWRSYFEDKNKVFKEMVGY >NZ_CP012047.1|WP_069028650.1|419095_420109_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm5 MEKRKRYELTLRTMAPLHIGSGTTYTQKEYIYENGYYYFPDMGILYKKLQKQGEKKDRIFEDFLMKNGHTNSRRPRLVQFLNDQQIRERNFSGYQIEETGFELEKKKSARGNLNDISAFVKDAYGYPYIPGSSLKGAIRTILVNEYFRRDDIPWGPKQQDIFHQIRVSDSEPININQLILAQKWDFSPKKLTARSLPIHRESLKPMSVATFIITAVGEQAIELMDQLPQFAKEYYQKYTNQFLSDFPSRYIQKYFWSPLYLGAGSGFWTKTNIDKADNSRHKKGGKMAMKGKGVLKLTKAPITKFRLNGKPRQLIENSENLYEMGKCVFNLKEREEN >NZ_CP012047.1|WP_069028649.1|418181_419078_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm4 MTLKIYKMKFQHAHFGEGILSESASSFDASRLYSALFLEAKKMDVVDEFMKLTQNANFVLSDAFPFIDDQPFLPKPIGYPKVEQDNADDNLKKVRQTAKKLKKIFYLPLNQLELFLKQQANIEELAEYQAQLAEHSYTTQKGVDPFEVGVTVYNSALYVLASQSPLFDQLMDSLQYSGVGGKRSSGLGQYSLEILSLPDELAENLTTNKQQRVMALSTCLPMNQEMLTCLDGANYLLKKSSGFAYSETAGALLRKQDLYKFKAGSTFQTSFTGDIVDVRPDNFPHPVWNFAKGIFYQL >NZ_CP012047.1|WP_069028648.1|417510_418185_+|type-III-A-CRISPR-associated-RAMP-protein-Csm3 MSQFTKIKIEGKIELLSGLHIGGSTAFAAIGAVDSPVIKDPVNNLPMIPGSSIKGKIRFLLAQAMNQKVAEDPNQDDSKITRLFGASMGGGEKGDQIIRGRLLFRDSLLTNKAVLDELGVRTYTETKFENTIDRRTAEASPRQIERAIRGSQFSFELIYELDNQEEAEEDFETILTGLQLLELDYLGGNGSRGYGRVCFKDIAANTVYGKYDATQFNERLKELL >NZ_CP012047.1|WP_069028647.1|417070_417499_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Csm2 MNHGKSRQQTVRWEQPKIHFTDRTYVSDAEAVIKELKDKRFKVGRDTLTTSQIRNLLSLTSTVYDEALSSGVENVMDQVAYLRVQFVYQSGRNEAVKKLVELSRILDILKIIQKHQKKQDLIRFCRYMEALVAYFKYHGGRD >NZ_CP012047.1|WP_069028646.1|414773_417062_+|type-III-A-CRISPR-associated-protein-Cas10/Csm1 MDKQSVDLFYGSLLHDIGKIVQRATQEKKRHTEIGAKFMKDYLSSKNILDQIKFHHYKELSNANIEDQNQAYITYIADNIASGLDRREHNEEVKRKWNSQMNLEDIFSKFGSKPTKRFIQPRILDLDVNNIFPSENYQEFTSGEYAGILQKIKEAFTRIEFTGNYMQSTLNLLEATASFIPSSTNMQEAVDISLYDHLKMTAGFSQATFQYLTDQSRLNFKQELFENSRSFYKEKAFLLVSFDISGIQDFIYTITSKGAHKQLRSRSFYLDMISEWLIDDLLENCSLTRANLLYSGGGHAYLFLPNTKEMLNEIEKIESGFNQFFLKNFGTQLYVIFGHTAFCANEIMEGNSPKDYQAIFHRVSNQISQKKLHRYSADEIKSLNQGGKRSGRECAICHNTSQLVEDDGQDKCELCYRLEHFSRNIQEDDFFEINDQDTQYSLPIGPNAFLHQTSRKNIENHHFSGKVYAKNQLYTGLDQATHLWVADYSDLDRNEFSHYAQREWTQQGAGASIGIKRTAVLRCDVDDLGFGFMAGFSEQDGGRYNTFSRTATFSRNMSIFFKCYINQFAEEKHLTIVYAGGDDVFIIGAWDDIIEFSVQLREYFIRWTNGKLTLSTGIGLFADKTPINIMARQTGELEDVAKDSGKDSIACFSDYFTFGYGTFIQEIYYGKLPIIRDFFAQENERGKSFIYKLLSLIRERDETDRITFARLAYYLARLEDTARNKENFRIFKQKMHDWFEDSEQIRQTELALLLYVYEIRKD >NZ_CP012047.1|WP_083207540.1|414034_414781_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MQQIKLNCSVEGKVENHLGTYFHGWLMQQLQPELVDELHSMKTNPFAIYVERRHDRLQFVVSLLNAEVIEIFSPILLSSKLTVITLEASRQKIFPIHNREISDLSEKDLADIFYRESARNTFDISFITPIAFKSGGDYVFFPDLRLFYQSLMRKYSYTFERDEKVDPEMLERLCESTQIVSYHIMSSYYKVHQSFIPGFKGTIRIRCRGNQTLMNFLEMLLKFGEYSGVGIKTGMGMGALQLKGESHG >NZ_CP012047.1|WP_069028645.1|413420_413738_+|hypothetical-protein MDEFYTEISIGTSVNFDEEIYAIISYEKGKTYTFIIYRDTAKLVELGTEVTAAKFLYHYWEMRLVEYNCVSGEYKSTPFYQLEHLRVKKFEFILSINHSTLSIKR >NZ_CP012047.1|WP_069028643.1|411427_412375_+|FRG-domain-containing-protein MISLEKRFSEWTRRINENWFGSTKENEDGKEQFIWYRGVSKCSYDLTTSFQRNSVVNEMELRQYYEKIRKCINGLDTDDFILTDYENFGFAFLQHRGFPSPLLDWTSYPMVAAQFACHDWIVKEQKTDAAIYALNVKKFMELFDIQYKVSMSFCEDNVYGKKDQKIVENIPPLRVGPGITSLSEMEKPMPFRGFRSPYLSADWEDKMETIIKDPLIARMAPQSGKFIYVPGKESLDAQIKKRCDIEGIDKEDVIQKFSICVSEKDQIKSVLENNVSTGGAFGNYIAYDKLFPEKKASEIDSKLEGLRNLLNNRCF >NZ_CP012047.1|WP_069028642.1|409515_411165_+|ATP-binding-protein MFIDNFYDKIDKSNFYLGMVSQVYRENSVVQVENLSWLSHRKIKSETLIPNTINYFVIVDSIQGLFIGEVYQSKVAASESVHDSMNNGVTEDVYPELSIDVIGVMKSNGNTFELAGFHTVGITDKVYIANERVIEMYLNSIEIKYNSNISESPLSSFANFSKLENQSIYLKPSTLFDRHIMAVGTTNSGKSTSALSILDKLVRDQKKVLIVDPTGEYSNSFTESTQEDLEGEVCKLRLGTDTVLPVGEVSNQQWAMLFETNDATQPAVLADAIKSLRYQKKNKKVGIYEKENQLVTNVKKDMASVGDDNKDFELNDLPKQIAAETNKIGKNGKNTIYQQNDFNFNSNQWLVQKVQYKLANTSLINFFNNDGSKKNLLQQLDAFLQKPNSALYIDTSAIGTDDAIGGVIIDLISNYLINKQRDEISPFVFFVDEVHRYTKAINSESDYYTGLTSIAREGRKKGIFLFLTTQNPQDVPDTLLGQIGTLLIHRLTHVEEIRTIQNHLKANSLGQIKKLDKGEAILTSINLLQDLNLKVVKSGRIHENETPSL >NZ_CP012047.1|WP_069028652.1|422876_423785_+|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MRDCIYVEHQNFVSVVTNSFKFVNVVSKETTYIPFSEIECLIFENELSYFSKKMVTKCMEENIALLFCDKKHSPVTMLTNDFGHSKRLKRLNLQMSLGNKVKKRLWRKIVIGKINNQAVNLQLLTENNDMGKMLVLASKQVDEGDTKNREAYAARRYFTTLFGPNFKRGRYDDVVNASLNYGYALIRAMIRREIAVHGLEASVGIHHQSIENAFNLSDDLIEPFRPFVDSYVYENIFNEGALTLELGEKKALLNILLENCIIDEKVCTVTDAIKVAVTSFVSCLDKNSSSPLKLPSFIEVGK >NZ_CP012047.1|WP_069028653.1|423785_424091_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MMLLVCFDLPRTTRVERKQANKYQKKLVELGFTRKQFSLYEREIKQKKTREKVIEVLRTELPSTGMITLYLLPNEVNDKQITILGENAVKRTIRKPRVVFL >NZ_CP012047.1|WP_069028654.1|424512_424839_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKLSQLDKIGPHVAAYRNKAGLTQQQLATETGLSPQFIGFIENGNRNISLQTLIKITNVFGIDIITFLSPFEQQDENLGQLIQKIEHSSKKDSYIQMFNNILDTADNE >NZ_CP012047.1|WP_069028655.1|425309_425786_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MFDFSFLPELIIPNLAVNSKEEAITYLSKLLEDSRLVERNYKNDVLSREKEFSTGLPVKNGAIAIPHAKSTHVFNNGVAVGTLKKSVYFNSMEDSNLEIPVDLVMLLAISESDKQLKMLQAIMSLLSNEKIIETLKNKKDSEDIAKLLNSYLVTQNNL >NZ_CP012047.1|WP_069028656.1|426012_427461_-|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MSTSLYAELWEIINTQQQFIALLVYQLSSIYANAKAPRPTDIADLDYQKMTVDELPKVVEMEKLNYKKLLQEHLHQTGKPLKPVQRRASSPTLPSTIHCPRCQAPSDYLYLNNGKSDNDQYLCKVCANLFNDKNRYAKEVCFQCPHCEKNLAKIKDRKGFDIYKCLRKDCPYYTKRLKGLSKKELKQFKKHKSLFKMHYIYRSFDLTLSDLEANPDFKTKVHLNKIHSSPYVLGLILTYHVNYGLSAEKTAALMFDVHQLKISGQTIRNYARSVAHRVQAFTDHYPYELSDQFCGDETYIRVQGKWHYIYFFFDAEKKIILSHRYNRHRDTETAIKAIHDVVRRFKQLPDALQLIVDGNPIYKLAQAFYAQNGIDFEVIQVIGLTNADPVSRAYRPLKQIIERLNRTFKGNYKPLGGFHSGAGPLAHVTLFTTYFNFLRPHAKLEKNVPVLLPELNECPDMPQKWIKLLQLSEDFIKGHQAS >NZ_CP012047.1|WP_069028657.1|427798_429460_+|PTS-transporter-subunit-EIIA MYLSWSFLQKLKNPKQNTVIACVCFGFYFVNTLKLMTLHTKLGFHYLIKKVDFGMYAKVCTSFKEVLRVNSVETVPGRLEETEYFLSTILIRMKKSSIKLENEEYIFLINLKTFKITKRFYSYFFEQSINNEEIAYLTIILISTLQGGQYEPSLVFLLSISDQIINEIERLAAIKFADHETLLFKLYRHLVPAYFRIKYDMSSSNIIISEIKKNYRELFQLTKYSLKPLEQNLDKEVPEDEIGYFTIIFGGEIEKQKNREKNDRYRALILCPNGTSASLILRSELTHIFPTIIFKETVSISQFKELNMELDFDMFFSTIDLPYVSDKAVFTVNPIMDKKEKRELVNRVRQKFAIPSMMIPSAKEVITLIEPYIDLKPDVSMKKIQNILEKNLFTRENFSQRRKPMLSELLTTDTVQFSDKNLNWQEAITLAAEPLVKNKQIKDQYIQAMIAKVNEYGTFINIGPGIALPHARPDEGVLKLGMSMLKVSKPVLLLDLPDHPIDTFICLAAVDNEMHLKALSSLTTILSEPESLEALRTAKTKKQIMEIIKEGEK >NZ_CP012047.1|WP_156768856.1|429566_429950_+|hypothetical-protein MCRRFCRKKDSLYTKEEVKQDLIQVGELASCPIIYLSAGVPTDVFRKELDLVNNSGAKYSGVLCGRATWQEGVSIYATEGVAALTEWLQTTGKQNVQELTKLLNQGATPWYDIYEGLDNIEVVEQPY >NZ_CP012047.1|WP_083207594.1|430088_430661_+|SIS-domain-containing-protein METEMTNFIDNIDKKMLIKACNLILESKEKEGRVHITGVGKTSYVAEYIAALNSSIGTPTYFLDTTEAIHGSIGQVKEEDVVVAISNSGQTIELKNTITALQKIGVKVIGVSGGVTSWLKNNVDVFLYAGVAHEGDELNKPPRSSVLVEIIILQCLSILLQQEQKLDLKTYHLYHPGGSLGESVYAQIHE >NZ_CP012047.1|WP_069028659.1|430864_431815_+|acetamidase/formamidase-family-protein MAETHKCTTDTVHYTWHKEHEPILTIDSGDTVVFETREVSDNQFNFHSTTEAISELDWDFVYPLSGPVYINGAEPGDTLAVEILDLKTKHWGWTAVLPGLGLLAEDYPDAYLRTFDLSDGKYIHFSEDIKVPIEPFLVTMGVCPKDGDGTPIMPPGNFGGNLDVRQLTIGTTLYLPVQQAGALFSCGDGHAAQGDGEVCVSALECPMYASLKFTVIKASEKSIPSPQFQTKGGLIQKVNHDDFYGTTGVGPDLMTGAQEALRAMIDYVSETYNIEKIDAYLLASLCVDLKISEVVDAGQYIVSALLPLSIFNDSQE >NZ_CP012047.1|WP_028790515.1|431999_432233_+|toxin-antitoxin-system-antitoxin-component MATITVRVTDEEKDFLDNMAKFEGKSLSELLKTTTLSSLEDAYDAQIGDAAYDEYLKNPQSHPLSESLEEYGLGESE |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012047_2 | 494575-495806 | TypeI |
I-C
Consensus repeat of NZ_CP012047_2
|
18 spacers
spacers of NZ_CP012047_2
>2.1|494607|34|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGAAAGCGATCGTCTGGTACTGTATAAACACAA >2.2|494673|34|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CACTTTTATAAGTGTCGTGAGTGGCTGTATTTTT >2.3|494739|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAGACGCTAGAGATACCGGAGAAGACTATTACCTT >2.4|494806|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTGAACTTGTGTCCATTTAATCATGTTACTTAC >2.5|494873|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTTTTCCAAATACTTTTTTGTTATTTAATTCAAC >2.6|494940|36|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCCATCGAATGGGTAAAACTTAACCACGGCACCCT >2.7|495008|34|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CATAGCGTCAAGATCTGTGTCTGGAAAGACTTCT >2.8|495074|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCTTTATACTTCCAAAATGAGTGGTGGGGCTTAGA >2.9|495141|33|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTTAACTTTAATGTGAGCTAGCCCCAAACCCG >2.10|495206|33|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTGCTGGTTGAATACGAATTCTTTTTGCTCCGA >2.11|495271|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTTGCGTGCTAGCAGATTGGCTACTACCGCTATT >2.12|495338|34|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAACTATTTGAACCAAAAAATACACAAGATATGA >2.13|495404|36|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACATGGAAGAATTTATCGAAGAGAATCTCACAGAG >2.14|495472|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATTTTTTGGAAAATGTCTAATTCTGCTGCTGTTG >2.15|495539|36|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATGGTCATGTTGGAATCACATCGAATTGAGGGGTT >2.16|495607|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCACCCCCTTTCGTTGCTTCCTCGTAGTTTTTGGT >2.17|495674|34|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATAAATTGAATACTGTCATTGATTCCCTCTCCT >2.18|495740|35|NZ_CP012047|CRISPRCasFinder,CRT GTCTTTACCATCTAACTTACAAATGAAAGGAAAGA |
cas3,cas5,cas8c,cas7,cas4,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012047_2
The CRISPR arrays of NZ_CP012047_2 >merge|NZ_CP012047|2|494575-495806|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATTTGAAAGCGATCGTCTGGTACTGTATAAACACAAGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATCACTTTTATAAGTGTCGTGAGTGGCTGTATTTTTGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATAAGACGCTAGAGATACCGGAGAAGACTATTACCTTGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATATTTGAACTTGTGTCCATTTAATCATGTTACTTACGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATACTTTTCCAAATACTTTTTTGTTATTTAATTCAACGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATATCCATCGAATGGGTAAAACTTAACCACGGCACCCTGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATCATAGCGTCAAGATCTGTGTCTGGAAAGACTTCTGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATTCTTTATACTTCCAAAATGAGTGGTGGGGCTTAGAGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATTTTTAACTTTAATGTGAGCTAGCCCCAAACCCGGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATCTGCTGGTTGAATACGAATTCTTTTTGCTCCGAGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATTGTTGCGTGCTAGCAGATTGGCTACTACCGCTATTGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATAAACTATTTGAACCAAAAAATACACAAGATATGAGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATAACATGGAAGAATTTATCGAAGAGAATCTCACAGAGGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATTATTTTTTGGAAAATGTCTAATTCTGCTGCTGTTGGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATAATGGTCATGTTGGAATCACATCGAATTGAGGGGTTGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATTCACCCCCTTTCGTTGCTTCCTCGTAGTTTTTGGTGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATAATAAATTGAATACTGTCATTGATTCCCTCTCCTGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATGTCTTTACCATCTAACTTACAAATGAAAGGAAAGAGTCGCTCTCCTCGTGAAAACGACGGTCGAATC >NZ_CP012047|2|2|494575-495739|PILER-CR GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TTGAAAGCGATCGTCTGGTACTGTATAAACACAA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT CACTTTTATAAGTGTCGTGAGTGGCTGTATTTTT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AAGACGCTAGAGATACCGGAGAAGACTATTACCTT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT ATTTGAACTTGTGTCCATTTAATCATGTTACTTAC GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT ACTTTTCCAAATACTTTTTTGTTATTTAATTCAAC GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT ATCCATCGAATGGGTAAAACTTAACCACGGCACCCT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT CATAGCGTCAAGATCTGTGTCTGGAAAGACTTCT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TCTTTATACTTCCAAAATGAGTGGTGGGGCTTAGA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TTTTAACTTTAATGTGAGCTAGCCCCAAACCCG GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT CTGCTGGTTGAATACGAATTCTTTTTGCTCCGA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TGTTGCGTGCTAGCAGATTGGCTACTACCGCTATT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AAACTATTTGAACCAAAAAATACACAAGATATGA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AACATGGAAGAATTTATCGAAGAGAATCTCACAGAG GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TATTTTTTGGAAAATGTCTAATTCTGCTGCTGTTG GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AATGGTCATGTTGGAATCACATCGAATTGAGGGGTT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TCACCCCCTTTCGTTGCTTCCTCGTAGTTTTTGGT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AATAAATTGAATACTGTCATTGATTCCCTCTCCT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT >NZ_CP012047|2|2|494575-495806|CRISPRCasFinder GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TTGAAAGCGATCGTCTGGTACTGTATAAACACAA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT CACTTTTATAAGTGTCGTGAGTGGCTGTATTTTT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AAGACGCTAGAGATACCGGAGAAGACTATTACCTT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT ATTTGAACTTGTGTCCATTTAATCATGTTACTTAC GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT ACTTTTCCAAATACTTTTTTGTTATTTAATTCAAC GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT ATCCATCGAATGGGTAAAACTTAACCACGGCACCCT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT CATAGCGTCAAGATCTGTGTCTGGAAAGACTTCT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TCTTTATACTTCCAAAATGAGTGGTGGGGCTTAGA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TTTTAACTTTAATGTGAGCTAGCCCCAAACCCG GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT CTGCTGGTTGAATACGAATTCTTTTTGCTCCGA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TGTTGCGTGCTAGCAGATTGGCTACTACCGCTATT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AAACTATTTGAACCAAAAAATACACAAGATATGA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AACATGGAAGAATTTATCGAAGAGAATCTCACAGAG GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TATTTTTTGGAAAATGTCTAATTCTGCTGCTGTTG GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AATGGTCATGTTGGAATCACATCGAATTGAGGGGTT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TCACCCCCTTTCGTTGCTTCCTCGTAGTTTTTGGT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AATAAATTGAATACTGTCATTGATTCCCTCTCCT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT GTCTTTACCATCTAACTTACAAATGAAAGGAAAGA GTCGCTCTCCTCGTGAAAACGACGGTCGAATC >NZ_CP012047|2|2|494575-495806|CRT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TTGAAAGCGATCGTCTGGTACTGTATAAACACAA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT CACTTTTATAAGTGTCGTGAGTGGCTGTATTTTT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AAGACGCTAGAGATACCGGAGAAGACTATTACCTT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT ATTTGAACTTGTGTCCATTTAATCATGTTACTTAC GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT ACTTTTCCAAATACTTTTTTGTTATTTAATTCAAC GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT ATCCATCGAATGGGTAAAACTTAACCACGGCACCCT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT CATAGCGTCAAGATCTGTGTCTGGAAAGACTTCT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TCTTTATACTTCCAAAATGAGTGGTGGGGCTTAGA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TTTTAACTTTAATGTGAGCTAGCCCCAAACCCG GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT CTGCTGGTTGAATACGAATTCTTTTTGCTCCGA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TGTTGCGTGCTAGCAGATTGGCTACTACCGCTATT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AAACTATTTGAACCAAAAAATACACAAGATATGA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AACATGGAAGAATTTATCGAAGAGAATCTCACAGAG GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TATTTTTTGGAAAATGTCTAATTCTGCTGCTGTTG GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AATGGTCATGTTGGAATCACATCGAATTGAGGGGTT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TCACCCCCTTTCGTTGCTTCCTCGTAGTTTTTGGT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AATAAATTGAATACTGTCATTGATTCCCTCTCCT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT GTCTTTACCATCTAACTTACAAATGAAAGGAAAGA GTCGCTCTCCTCGTGAAAACGACGGTCGAATC
>NZ_CP012047.1|WP_014123873.1|493234_493837_+|VanZ-family-protein MSRSIRSILAFIVSTILGFGVIQYLAYPTLLQYERFANVMNRFDYTKETLMVFVILSLWLLYLQVEFRHFSLVYLYLFYSVYLFLLFVVLFTKAPEYHTFNADLFDFLVWDRATLIEAFLNLAYFIPLGGLYGLRVNWVEFILISLLTITGIETIQYVFYIGTFSVSDILLNFLGCLVGYSICLMIRRYMNKKPATERVN >NZ_CP012047.1|WP_069028699.1|489635_491048_+|MFS-transporter MENEIVTKQTKLAILAVALLSFLGILVETSLNVTFPTLTEEFNVSLGTMQWATSGYLLMVTVVMSASGHLIKKFKAQHLFRIAVLFFITGTILCASAVSFPMLMTGRLLQAVSTGLSTPLMFQIILSLVPQSKMGVYMGIGSMVNSFAPALGPTYGGLFTSFLSWRAIFFIAIPIILVSIWLGGRNIQLEAVGTKQRFDWIGLVLLSWVFVSLSVAFANAGNNGFYSLSFFSLLAIFIVGIIALFVHYHFSEKKILNFSLLLRPIIGLRWLNFFILQFINIGISFVLPILAQDYLNTEPFIAGLILLPGSLLGAAIAPLAGRLYDRRGIFLPLTIANVSMFLGCWLFYFGTPILSISSMVLIYVFLRVGFNFGFGNTLSDASRQVTIEEKADINSLFNTFQQYAGSIGTSVLSAIISSVQLQQDAASGLLTAQGSQIDFVLLAILAGIGLLTVFISQRLKRRYTSMKSST >NZ_CP012047.1|WP_069028698.1|488123_489167_+|galactose-mutarotase MEKTIFGNTENGKTVFLYTFKNEQGMEMTVSDFGATLTNLWVTDKDGKARDIVLGFPSLKGYEINNEFFFGATVGRNANRVENAAFELNGVRYKLNKNEGNNNLHSGPDGYQLRIWEVRAVNELEHSITFALDSVDGDQGFSGELNLEVTYQLQEDAISITYRGNADQDTIFNPTNHSYFNLNGHQNGDVLDHVLQLNASKYTPIKAESSIPTGEILTVEDTPMDFRSSKRIGKDIQKNFSQLNYAQGYDHNFVIDQNADITARLEGDQSGILMEVSTQLPGVQVYSGNFLNDTPGKNNAFYPPRGGVCFETQAFSNAVNEPNFATPILKKDEEKILKTTYRFMTVN >NZ_CP012047.1|WP_061840050.1|486866_487772_-|ribokinase MNKATIVGSINLDTNLRVHRMVKPGETIHGKEHYTAAGGKGANQAVATARAGTNTSFIGAVGNDGPGEQMLDLLKEEKIDVSGIEIIQNEPTGQAFIPIDDNGENSIMFYAGANYAFGTEEVAKNSSLIETNDFVIAQLETPIEATIKAFEIARSKNVKTILNPAPGESDLPEKLLKLTDMIIPNETEAETITGIEVNDETSAKKAAAKLHELGVEAVIITFGAKGAFYDFNGYSELVPAFKVKAVDTTAAGDTFIGYMIATLEKDFSNLREAILHGNKASSATVQRFGAQPSIPYKNEII >NZ_CP012047.1|WP_038022287.1|486447_486843_-|D-ribose-pyranase MKKTKVINSNLSRVIAQMGHFDKLAIGDAGTPVPDETEKIDLAVTQDIPKFMDVLNNVLEELEIQKIYLAEEIKTKNPEMLKQIQKQLPDTTIKYISHEELKRELKDCKVFVRTGEMSPFANIMLESNVVF >NZ_CP012047.1|WP_069028697.1|485526_486417_-|ribose-transporter-RbsU MDTVALLVGLGPLIGWGLFPTIASKFGGRPSNQILGTTIGTFILALIFMWVRGLAFPSGSDLLLSIVSGIGWACAQIVTFLSFRLVGSSRAMPITTAFQLLGASLWGVFYLGDWPGVTAKIWGGIALIAIIIGAYFTVWSENKTQENSSLLKKAVIWLLFGEIGYWLYSAAPQATSISGMEAFLPQAIGMLIVGMFYAAIETVGNNTAASPFKETVSYKQIWAGFFFAFGALTYLISAQPDMNGLATGFVLSQTNVALATLTGIWFLGQEKTKKEMTVTVIGLVLIIAGAAVTQFI >NZ_CP012047.1|WP_069028696.1|484842_485394_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIDKTIPYVKLQMEKSTSQALPDRQLPEGYQFCFYTPGDERDWQAIETSAGEFDHLSEAETYFQKNFSPYPDELTKRMTFVTDPSGKKVATCTAWWAKEGGPQFHWLAVMPEAQGQGIATFLAVKVTALLEELYPDQPAMLHTQTWNYPAITIYQKLGYTFVPGTKDFEKGMRILKDLAKRKG >NZ_CP012047.1|WP_014123864.1|484124_484373_-|hypothetical-protein MKEKTHKKIFLTSYFAGTLKQFQLFIKDNVITDKEIAYIHVEEYTDYIDEGKEALKERNFLLDPISNSETIIINDTVYEILK >NZ_CP012047.1|WP_069028695.1|482583_483810_+|MFS-transporter MNQLKANDKKALFASIFASGLDDLNVMFLSFTLGSIMAHLGLSGVEGGWISTITNLGMLAGGLVFGVLADRYNKFTVFKSTILVFSVATGMIFFTESLGYLYLMRFIAGIGVGGEYGVAISIMGGIVPSNKMGRVSSLNGIMGQLGSIGAALLAGLIAPIFGWKGLFLFGLLPVLLVAWMHFAVDEKNVTDRGAKITSDKKEKASIKELFANKKRTHQTLALMLMTTVQIAGYFGLMNWLPTMMQRSLGIEASDNLWMISTILGMCVGMLVFGNILDYFGPRLAYGIFLICSMLSVYAFTYVNSMTTLLLGGAMMGFFVNGMFSGYGAICTKLYPHHIRTIANNTILNVGRAVGGFSSVVIGFILDNAGVSQVMLFIASLYIMSFIAMMSIPALRKEAYTTSDIVEVH >NZ_CP012047.1|WP_014123862.1|480967_482131_+|ImmA/IrrE-family-metallo-endopeptidase MFYGKSLQLARMLHGLSRKELGERLNVTEQSIWQFEKQMTEPSFENVLQLKNILQVKSSFFFEQSTVTQTFPENNIAYRKADVVSRKKTNSEVVYLNFVAEIIHYLEGFLNIPPTTLITLRKKVIEHLPSELTNAAIKKTAVLAREFLNICSDNGNLLLSLEKSGIHVLEKNVGGKADAYSAWSTKDVPVIVLGIKKSAVRRNFDLAHELGHLLLHAHVDFLMLENNERAQVEREADYFASCFLLPAQTVKKEFEGIKKISNPDSYIPLKLKYHVSIQALEMRAYKLGFLTPKQHSYFYRQISLNDYKLEEPLDREIALKRPGKIRSIFHMILNNHITDLQSIEEHFQVERSLLEEMFSIESEFFVPYEKQSNFTDFNNVLRPNFNA >NZ_CP012047.1|WP_069028700.1|496653_499098_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MLLAHYDKKTGSDQSLDVHLFNVANKAAEAAKEIGQQDVAFLCGFYHDLGKVDEKFQDKIIHQRQTHVDHSTAGAKYLKEKIQQVLKKQITDPRQNEYRGSFIETICYVIAAHHGVFDIPLKESADSLSTDILGKLYKRILHGLDETYHYDTQVLNFASELEAELQRENQITLEELILGAFDNYCLLWEKLKPQDKSEKDFYTSLIVRLYLSLLKNADILDTINAYTNIVEPMSSQKYDKLSAHYLDSIEQVYEGYQNPTTKINKIRTSIAKESKRRGSKDSAGVYRLNLPTGAGKTKLSMRYGFHQMNDQGRHRFIYIAPYLSILEQNAAEVKDVIGPEGEEGVLEHHSNVVDTEIKENVDGDERETTYKDYLIDTWDSPIVLSTMVQLFQTFFKVKSGNIRRFANLINSTIILDEVQSLPLEVTTLFNLTMNFLSQIMKVNVVLCTATQPVYDSSGIDHRIQYGGLSGEPADIVNLNDKQRQVFERTEVYKFNEDNEIASIEDVVDEVVEHEDDSILIILNTKAAVKDLYDLIKDRDLRQCYHLSTNMCAKHRLDIIEKIKREIKEEPLICISTQLIEAGVDLDFDRVIRSYAGIDSIVQASGRCNREGGKDKGIVQLVDVDNSQENLSYLKSIKDKKKVTKQIIEDLSSPVDIEQLNDEFFERYFVNSDKKDLDYSLRQEEPTVYDLLSTNEMNNVQHAALKQSFKEAGIKMDLIQDNSKGVIVYYDEEGSQLIKRLIEAIDQFEIEYEMDAVKTIKQLLKKLQPYTVNIRSSNQTQQAVMPYMDGEILILQQSFYDNEVGIIDNMNEFIL >NZ_CP012047.1|WP_069028701.1|499428_500151_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MFKSREFFVSLKGKYALFTNPSTKGGGEKATYTVPTRQALQGCVDSLYFKPTFKNVITEVKMMKPIQTEVIGTRALLGNGKADLNYVSYLTNVEYLVRFYMTWNEARPDLINDRNQKKHEAIMERSIKKGGRRDIFLGTRECVATAEYLTQEEYEQAESCYKEDVLSMGIMFQEFEYPAEDKQPLKSYFADIVMKGGVIRFKNKEDCEIVNTLSTYNFKTQQEIKSVDKEFEEYKQMETR >NZ_CP012047.1|WP_069028702.1|500155_502069_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MSFLTALLRAYDSSLEQGLVDKQEGNNTVLLPLYHTNMKSDGNDIIQVTLTNTGDLFQSEFLPKGETIIFPITEDSVVRTSNKASHPLIDNFSYLSSINEEKNKLYIKEFNKWYSFVQDNQIKQYLSIIKKFMMKSNFLENILDSLYGKGNYSRKELKISYSKEGKTKKTDLSKTFLTFAVNDFIGYKTVKVTDFVKLHENYIQYVEAQDSSRGVCNISGEEQPLTMKHRGFFGNAKLISVSNNKETYKGRFKNKDDIIRVGRRTSEKIHLMLKYLLENQNSRRWLGGQQYLVNWFSDDIANESQLDVSIESIVPFSTDEPTKPEVTSLANKEVGKSFIRGEQLFSNDANYYAAIIDKASNGRISLKFFRDLRASQLLKNLKKWEERYRWERYNAQDGKVYPTTPSLWQFLQVAYGVERNGRLEIDNDNFKKDQFQKLVISLIDGQMIPANIATALNMNIRKPMSYGRTWSQIQFVTLAVFSHENGEEQTPVLDKENTDRSYLFGRLLAVLDRTEAATYNRMGSDGQSRADSDKRRVTNAQKFWTSYTNHPAKTMQTLIEKTKNYEKTLKSNSWGLFLKLDQEKQEIINLLNDYHLDSADLNKPLDYHFIFGYYAETQFLFTKTEKSESEELENVNE >NZ_CP012047.1|WP_069028703.1|502055_502901_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 MLTNKVDFIATIEVNNANPNGDPLAGNMPRTDSNGYGLISDVAIKRKIRNRMQDQGNDIFVKSRDHADDGFNSLQKRFENEFGKESDEEVENKSNENWLDVRSFGQVITYQNRSIGIRGPISVSMAKSLDPIEITSMQITRSANSMEPKGTSSRSSDTMGTKHFVEYGVYVVFGSANVFFSEKTGFSEDDLKVIKESLLTLFANDASSARPEGSMAVKELFWFIHSNKLGNVSSAKIHELLEYDRSTMEHTNYEDYQIKLNQEKLAEYKDKGLQVEIIEGL >NZ_CP012047.1|WP_069028704.1|502903_503569_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MEYIEDEYLMLSGIQHYYFCERQWGLIHIDQQWAENTYTVEGQQLHTKADNPTVKEKRKDMFISRAIRVSSGSLGLSGILDVVEFYKDEKGISFQSKRGKWQPYIVEYKRGKPKKDERDIVQLVAEVMCLEETLACHISSSYLFYHSVNKKIRVEITDRLRDLVSDFCAKMHFYYQHKKVPNAEYFKNCRLCSLYDICMPRMSKKPKNIDNYIENAIHNER >NZ_CP012047.1|WP_069028705.1|503578_504607_+|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MRKLLNTLYLTQEDYYLSRERDNIVIKQEGKIVSRFPYRIIENIICFSYLGTSPSLVQLCNENNIHLTFLTPNGKFCGRFVGMTNGNVLLRREQYRIADDDVRSIEYAKRSLLAKLSNSRKYVLRFRRDHNEKIDGSLFSNVDKELLKSIELVKNAKDKDSLRGIEGNAANTYFRVFNDFVLGNKGDFQFKGRSKRPPLDCVNAMLSFGYSLLTNECQSALETVGLDSYVGFFHTDRPGRASMALDLVEEFRSYIVDRFVFSLINKRQIARKHFDVKENGSVFLNDKGRSAFIKEWQARKQTEVIHPFINEKVKLMLLPYVQAQLMAKAIRDDLPSYPPFMA >NZ_CP012047.1|WP_069028706.1|504745_505996_-|IS110-family-transposase MKCFVGIDVSSEKLDSCFLDDEKNILCQTSYVNDTLGATALKKQILQLHQIYDFDKVVIGMEATSMYSYHPAMNFHQDEQLQEIQAITTIENPHRIKQYAKMFDTDKTDTIDAFMIADYLRNQHYTTSPVKEEKYMALQRLTRARYQTVCQLVEVKQHFIENLSYKCNTLKKELRDAPGSTTVFSAAIMELFTQDLSMDDLAQLPLDDLADWLQKKGRGRFKDPQDLAKTIQKAVRTSYRLDKAVNQSVDIVLSVFVREIRGLEKAIKDLDKAIEDLVQAIPEYQCLTSIPGVGKVYAAGLLAEIGQIERFKDQAHLAKYAGLFWKKHESGKHSRENTPLTKKGNRYFRYYLVEAANSVRHYLPEYQMYYRKKYQETPKHQHKRAIVLTARKFVRLVDTLLRNHQLYTPPRSVIEK >NZ_CP012047.1|WP_068710726.1|506469_506763_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MMVLVTYDVNTETKQGRKRLRHVANLCVDYGQRVQNSVFECSVVPAEFVELKGKLANIINPELDSIRFYLLGKNWQNRVEQIGNNDSYDPDKDVLLL >NZ_CP012047.1|WP_014123593.1|508535_509894_+|transposase MIHLKAIKNQLPNEVKATFSELKVPSFLRQAHIHKQKGYSVAVIFTFLFSLVFKGKSLHQVLSGREADQWMKKDTVYRLMNDPHNNWRTFLLRFSTSVIEKIHRLTDPQTHLRTLILDDSTFYRNRSQKVPGLARLWDHALQKGYKGYRMLTLGFSDGYSFLPIDFSLLSGNKKVQPTISVQDQRTVGARRFKEAQRPMPEVAVEMVARALDQGIYATHVLMDKWFTCPKMIDRLHDLGIHTIGMMKNGKTKYLYQGRFYKLSELYQKSTEEVTAEAILSSIIVQPCAGQHPVKIVFVKNHSKQSAWLAIMTDDLTLSSQEIVKTYSLRWDIETFFKASKSLLHLAQETQTRNYQALLCHTTIVFTRYILLSWQQRCANDERTLGGLFYELADQMKELDWSVALLELVKIIQAVSEKAESTLQDFIESQLQHWIDTLPNYIKGYLPNLVCET >NZ_CP012047.1|WP_061840043.1|510541_511255_-|hypothetical-protein MSSYDFYEYESIAEKRDRATTKRRSYQKKHPNAVPITINGNKIAKSFWGKAWCNHLKYYADHDNRVSRGRSYIKNGFVFDLAIKEGLITGTVSGSGNNLYQVIITIDPIADQRLEEQINGHVESLEDLAYGKFPKALEKVFLTSENGLFPKMNEIQFSCSCPDSAYMCKHVSAILYAVGAKLDSEPLLLFELRGVDTSALVKRSVEEKMSSLLENASSVKSDRIIEDDSIIDLFDLE |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012047_3 | 506911-508281 | TypeI |
I-C
Consensus repeat of NZ_CP012047_3
|
20 spacers
spacers of NZ_CP012047_3
>3.1|506943|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCGTGATAATTTGGATCGCCTGGACGATAGCCTGA >3.2|507010|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACTGTAAAGCCTTGAATTACGCCACCTAAAATCG >3.3|507077|34|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGATTTTTGATATAAAGTAACTAAGGCTGTAATT >3.4|507143|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGGACGTGACAGTAGAAGCTATCATAATGGGAGCA >3.5|507210|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAAATGATGACGGTGGGAAAGAATTTATCCCTAAA >3.6|507277|34|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAAATATGGGCTTTACAGCACAAGAAACAGAAG >3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATAGTGGCCAACGTCGTTATGTCGCTATGACAA >3.8|507410|36|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGTGTAACTCTCGACTATTTACATGGTAGAGAAGCC >3.9|507478|34|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAAAGTTTAGAGATAGATATTTGATAAACTGCT >3.10|507544|36|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCTGTTGCTACGCTTCAAGGATTCTTGGACGACGT >3.11|507612|34|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACAAAGTTTAGAGATAGATATTTGATAAACTGCT >3.12|507678|36|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATCTGTTGCTACGCTTCAAGGATTCTTGGACGACGT >3.13|507746|34|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTTTCGAGCGCGACTTGATACGTGCCACTAGCG >3.14|507812|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATACGAGGGCCATCGGTTTAGATACGAAACAAAA >3.15|507879|36|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CGATGAGAAAATTTACAAAAGCATTGACCAAAAACA >3.16|507947|36|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TCAAAAACCAGATAGTGAGGGAGGTACGCAAGGCAA >3.17|508015|34|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGTTTAATATTAAAGACGGCGTACAATATATC >3.18|508081|36|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACATCTGAACCAGCATTTGATGGAAATACTTGACA >3.19|508149|34|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATCTGAGGCAGAAGCCGAATGGTCGGACTGGAA >3.20|508215|35|NZ_CP012047|CRISPRCasFinder,CRT TACAATAAATGTAGCGGTTTCTTTATTATTTGCCA |
cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012047_3
The CRISPR arrays of NZ_CP012047_3 >merge|NZ_CP012047|3|506911-508281|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATCCGTGATAATTTGGATCGCCTGGACGATAGCCTGAGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATAACTGTAAAGCCTTGAATTACGCCACCTAAAATCGGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATAGATTTTTGATATAAAGTAACTAAGGCTGTAATTGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATAGGACGTGACAGTAGAAGCTATCATAATGGGAGCAGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATTAAATGATGACGGTGGGAAAGAATTTATCCCTAAAGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATGAAAATATGGGCTTTACAGCACAAGAAACAGAAGGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATTTATAGTGGCCAACGTCGTTATGTCGCTATGACAAGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATGGTGTAACTCTCGACTATTTACATGGTAGAGAAGCCGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATACAAAGTTTAGAGATAGATATTTGATAAACTGCTGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATATCTGTTGCTACGCTTCAAGGATTCTTGGACGACGTGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATACAAAGTTTAGAGATAGATATTTGATAAACTGCTGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATATCTGTTGCTACGCTTCAAGGATTCTTGGACGACGTGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATGCTTTCGAGCGCGACTTGATACGTGCCACTAGCGGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATAATACGAGGGCCATCGGTTTAGATACGAAACAAAAGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATCGATGAGAAAATTTACAAAAGCATTGACCAAAAACAGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATTCAAAAACCAGATAGTGAGGGAGGTACGCAAGGCAAGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATATTGTTTAATATTAAAGACGGCGTACAATATATCGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATAACATCTGAACCAGCATTTGATGGAAATACTTGACAGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATAATCTGAGGCAGAAGCCGAATGGTCGGACTGGAAGTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAATTACAATAAATGTAGCGGTTTCTTTATTATTTGCCAGTCGCTCTCTTCATGGGAGCGTGGTATGTGTC >NZ_CP012047|3|3|506911-508214|PILER-CR GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT CCGTGATAATTTGGATCGCCTGGACGATAGCCTGA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AACTGTAAAGCCTTGAATTACGCCACCTAAAATCG GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AGATTTTTGATATAAAGTAACTAAGGCTGTAATT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AGGACGTGACAGTAGAAGCTATCATAATGGGAGCA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TAAATGATGACGGTGGGAAAGAATTTATCCCTAAA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT GAAAATATGGGCTTTACAGCACAAGAAACAGAAG GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TTATAGTGGCCAACGTCGTTATGTCGCTATGACAA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT GGTGTAACTCTCGACTATTTACATGGTAGAGAAGCC GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT ACAAAGTTTAGAGATAGATATTTGATAAACTGCT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT ATCTGTTGCTACGCTTCAAGGATTCTTGGACGACGT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT ACAAAGTTTAGAGATAGATATTTGATAAACTGCT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT ATCTGTTGCTACGCTTCAAGGATTCTTGGACGACGT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT GCTTTCGAGCGCGACTTGATACGTGCCACTAGCG GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AATACGAGGGCCATCGGTTTAGATACGAAACAAAA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT CGATGAGAAAATTTACAAAAGCATTGACCAAAAACA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TCAAAAACCAGATAGTGAGGGAGGTACGCAAGGCAA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT ATTGTTTAATATTAAAGACGGCGTACAATATATC GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AACATCTGAACCAGCATTTGATGGAAATACTTGACA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AATCTGAGGCAGAAGCCGAATGGTCGGACTGGAA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT >NZ_CP012047|3|3|506911-508281|CRISPRCasFinder GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT CCGTGATAATTTGGATCGCCTGGACGATAGCCTGA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AACTGTAAAGCCTTGAATTACGCCACCTAAAATCG GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AGATTTTTGATATAAAGTAACTAAGGCTGTAATT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AGGACGTGACAGTAGAAGCTATCATAATGGGAGCA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TAAATGATGACGGTGGGAAAGAATTTATCCCTAAA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT GAAAATATGGGCTTTACAGCACAAGAAACAGAAG GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TTATAGTGGCCAACGTCGTTATGTCGCTATGACAA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT 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CCGTGATAATTTGGATCGCCTGGACGATAGCCTGA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AACTGTAAAGCCTTGAATTACGCCACCTAAAATCG GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AGATTTTTGATATAAAGTAACTAAGGCTGTAATT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AGGACGTGACAGTAGAAGCTATCATAATGGGAGCA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TAAATGATGACGGTGGGAAAGAATTTATCCCTAAA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT GAAAATATGGGCTTTACAGCACAAGAAACAGAAG GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TTATAGTGGCCAACGTCGTTATGTCGCTATGACAA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT GGTGTAACTCTCGACTATTTACATGGTAGAGAAGCC GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT ACAAAGTTTAGAGATAGATATTTGATAAACTGCT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT ATCTGTTGCTACGCTTCAAGGATTCTTGGACGACGT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT ACAAAGTTTAGAGATAGATATTTGATAAACTGCT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT ATCTGTTGCTACGCTTCAAGGATTCTTGGACGACGT GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT GCTTTCGAGCGCGACTTGATACGTGCCACTAGCG GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AATACGAGGGCCATCGGTTTAGATACGAAACAAAA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT CGATGAGAAAATTTACAAAAGCATTGACCAAAAACA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TCAAAAACCAGATAGTGAGGGAGGTACGCAAGGCAA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT ATTGTTTAATATTAAAGACGGCGTACAATATATC GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AACATCTGAACCAGCATTTGATGGAAATACTTGACA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT AATCTGAGGCAGAAGCCGAATGGTCGGACTGGAA GTCGCTCTCTTCATGAGAGCGTGGATTGAAAT TACAATAAATGTAGCGGTTTCTTTATTATTTGCCA GTCGCTCTCTTCATGGGAGCGTGGTATGTGTC
>NZ_CP012047.1|WP_068710726.1|506469_506763_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MMVLVTYDVNTETKQGRKRLRHVANLCVDYGQRVQNSVFECSVVPAEFVELKGKLANIINPELDSIRFYLLGKNWQNRVEQIGNNDSYDPDKDVLLL >NZ_CP012047.1|WP_069028706.1|504745_505996_-|IS110-family-transposase MKCFVGIDVSSEKLDSCFLDDEKNILCQTSYVNDTLGATALKKQILQLHQIYDFDKVVIGMEATSMYSYHPAMNFHQDEQLQEIQAITTIENPHRIKQYAKMFDTDKTDTIDAFMIADYLRNQHYTTSPVKEEKYMALQRLTRARYQTVCQLVEVKQHFIENLSYKCNTLKKELRDAPGSTTVFSAAIMELFTQDLSMDDLAQLPLDDLADWLQKKGRGRFKDPQDLAKTIQKAVRTSYRLDKAVNQSVDIVLSVFVREIRGLEKAIKDLDKAIEDLVQAIPEYQCLTSIPGVGKVYAAGLLAEIGQIERFKDQAHLAKYAGLFWKKHESGKHSRENTPLTKKGNRYFRYYLVEAANSVRHYLPEYQMYYRKKYQETPKHQHKRAIVLTARKFVRLVDTLLRNHQLYTPPRSVIEK >NZ_CP012047.1|WP_069028705.1|503578_504607_+|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MRKLLNTLYLTQEDYYLSRERDNIVIKQEGKIVSRFPYRIIENIICFSYLGTSPSLVQLCNENNIHLTFLTPNGKFCGRFVGMTNGNVLLRREQYRIADDDVRSIEYAKRSLLAKLSNSRKYVLRFRRDHNEKIDGSLFSNVDKELLKSIELVKNAKDKDSLRGIEGNAANTYFRVFNDFVLGNKGDFQFKGRSKRPPLDCVNAMLSFGYSLLTNECQSALETVGLDSYVGFFHTDRPGRASMALDLVEEFRSYIVDRFVFSLINKRQIARKHFDVKENGSVFLNDKGRSAFIKEWQARKQTEVIHPFINEKVKLMLLPYVQAQLMAKAIRDDLPSYPPFMA >NZ_CP012047.1|WP_069028704.1|502903_503569_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MEYIEDEYLMLSGIQHYYFCERQWGLIHIDQQWAENTYTVEGQQLHTKADNPTVKEKRKDMFISRAIRVSSGSLGLSGILDVVEFYKDEKGISFQSKRGKWQPYIVEYKRGKPKKDERDIVQLVAEVMCLEETLACHISSSYLFYHSVNKKIRVEITDRLRDLVSDFCAKMHFYYQHKKVPNAEYFKNCRLCSLYDICMPRMSKKPKNIDNYIENAIHNER >NZ_CP012047.1|WP_069028703.1|502055_502901_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 MLTNKVDFIATIEVNNANPNGDPLAGNMPRTDSNGYGLISDVAIKRKIRNRMQDQGNDIFVKSRDHADDGFNSLQKRFENEFGKESDEEVENKSNENWLDVRSFGQVITYQNRSIGIRGPISVSMAKSLDPIEITSMQITRSANSMEPKGTSSRSSDTMGTKHFVEYGVYVVFGSANVFFSEKTGFSEDDLKVIKESLLTLFANDASSARPEGSMAVKELFWFIHSNKLGNVSSAKIHELLEYDRSTMEHTNYEDYQIKLNQEKLAEYKDKGLQVEIIEGL >NZ_CP012047.1|WP_069028702.1|500155_502069_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MSFLTALLRAYDSSLEQGLVDKQEGNNTVLLPLYHTNMKSDGNDIIQVTLTNTGDLFQSEFLPKGETIIFPITEDSVVRTSNKASHPLIDNFSYLSSINEEKNKLYIKEFNKWYSFVQDNQIKQYLSIIKKFMMKSNFLENILDSLYGKGNYSRKELKISYSKEGKTKKTDLSKTFLTFAVNDFIGYKTVKVTDFVKLHENYIQYVEAQDSSRGVCNISGEEQPLTMKHRGFFGNAKLISVSNNKETYKGRFKNKDDIIRVGRRTSEKIHLMLKYLLENQNSRRWLGGQQYLVNWFSDDIANESQLDVSIESIVPFSTDEPTKPEVTSLANKEVGKSFIRGEQLFSNDANYYAAIIDKASNGRISLKFFRDLRASQLLKNLKKWEERYRWERYNAQDGKVYPTTPSLWQFLQVAYGVERNGRLEIDNDNFKKDQFQKLVISLIDGQMIPANIATALNMNIRKPMSYGRTWSQIQFVTLAVFSHENGEEQTPVLDKENTDRSYLFGRLLAVLDRTEAATYNRMGSDGQSRADSDKRRVTNAQKFWTSYTNHPAKTMQTLIEKTKNYEKTLKSNSWGLFLKLDQEKQEIINLLNDYHLDSADLNKPLDYHFIFGYYAETQFLFTKTEKSESEELENVNE >NZ_CP012047.1|WP_069028701.1|499428_500151_+|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MFKSREFFVSLKGKYALFTNPSTKGGGEKATYTVPTRQALQGCVDSLYFKPTFKNVITEVKMMKPIQTEVIGTRALLGNGKADLNYVSYLTNVEYLVRFYMTWNEARPDLINDRNQKKHEAIMERSIKKGGRRDIFLGTRECVATAEYLTQEEYEQAESCYKEDVLSMGIMFQEFEYPAEDKQPLKSYFADIVMKGGVIRFKNKEDCEIVNTLSTYNFKTQQEIKSVDKEFEEYKQMETR >NZ_CP012047.1|WP_069028700.1|496653_499098_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MLLAHYDKKTGSDQSLDVHLFNVANKAAEAAKEIGQQDVAFLCGFYHDLGKVDEKFQDKIIHQRQTHVDHSTAGAKYLKEKIQQVLKKQITDPRQNEYRGSFIETICYVIAAHHGVFDIPLKESADSLSTDILGKLYKRILHGLDETYHYDTQVLNFASELEAELQRENQITLEELILGAFDNYCLLWEKLKPQDKSEKDFYTSLIVRLYLSLLKNADILDTINAYTNIVEPMSSQKYDKLSAHYLDSIEQVYEGYQNPTTKINKIRTSIAKESKRRGSKDSAGVYRLNLPTGAGKTKLSMRYGFHQMNDQGRHRFIYIAPYLSILEQNAAEVKDVIGPEGEEGVLEHHSNVVDTEIKENVDGDERETTYKDYLIDTWDSPIVLSTMVQLFQTFFKVKSGNIRRFANLINSTIILDEVQSLPLEVTTLFNLTMNFLSQIMKVNVVLCTATQPVYDSSGIDHRIQYGGLSGEPADIVNLNDKQRQVFERTEVYKFNEDNEIASIEDVVDEVVEHEDDSILIILNTKAAVKDLYDLIKDRDLRQCYHLSTNMCAKHRLDIIEKIKREIKEEPLICISTQLIEAGVDLDFDRVIRSYAGIDSIVQASGRCNREGGKDKGIVQLVDVDNSQENLSYLKSIKDKKKVTKQIIEDLSSPVDIEQLNDEFFERYFVNSDKKDLDYSLRQEEPTVYDLLSTNEMNNVQHAALKQSFKEAGIKMDLIQDNSKGVIVYYDEEGSQLIKRLIEAIDQFEIEYEMDAVKTIKQLLKKLQPYTVNIRSSNQTQQAVMPYMDGEILILQQSFYDNEVGIIDNMNEFIL >NZ_CP012047.1|WP_014123873.1|493234_493837_+|VanZ-family-protein MSRSIRSILAFIVSTILGFGVIQYLAYPTLLQYERFANVMNRFDYTKETLMVFVILSLWLLYLQVEFRHFSLVYLYLFYSVYLFLLFVVLFTKAPEYHTFNADLFDFLVWDRATLIEAFLNLAYFIPLGGLYGLRVNWVEFILISLLTITGIETIQYVFYIGTFSVSDILLNFLGCLVGYSICLMIRRYMNKKPATERVN >NZ_CP012047.1|WP_069028699.1|489635_491048_+|MFS-transporter MENEIVTKQTKLAILAVALLSFLGILVETSLNVTFPTLTEEFNVSLGTMQWATSGYLLMVTVVMSASGHLIKKFKAQHLFRIAVLFFITGTILCASAVSFPMLMTGRLLQAVSTGLSTPLMFQIILSLVPQSKMGVYMGIGSMVNSFAPALGPTYGGLFTSFLSWRAIFFIAIPIILVSIWLGGRNIQLEAVGTKQRFDWIGLVLLSWVFVSLSVAFANAGNNGFYSLSFFSLLAIFIVGIIALFVHYHFSEKKILNFSLLLRPIIGLRWLNFFILQFINIGISFVLPILAQDYLNTEPFIAGLILLPGSLLGAAIAPLAGRLYDRRGIFLPLTIANVSMFLGCWLFYFGTPILSISSMVLIYVFLRVGFNFGFGNTLSDASRQVTIEEKADINSLFNTFQQYAGSIGTSVLSAIISSVQLQQDAASGLLTAQGSQIDFVLLAILAGIGLLTVFISQRLKRRYTSMKSST >NZ_CP012047.1|WP_014123593.1|508535_509894_+|transposase MIHLKAIKNQLPNEVKATFSELKVPSFLRQAHIHKQKGYSVAVIFTFLFSLVFKGKSLHQVLSGREADQWMKKDTVYRLMNDPHNNWRTFLLRFSTSVIEKIHRLTDPQTHLRTLILDDSTFYRNRSQKVPGLARLWDHALQKGYKGYRMLTLGFSDGYSFLPIDFSLLSGNKKVQPTISVQDQRTVGARRFKEAQRPMPEVAVEMVARALDQGIYATHVLMDKWFTCPKMIDRLHDLGIHTIGMMKNGKTKYLYQGRFYKLSELYQKSTEEVTAEAILSSIIVQPCAGQHPVKIVFVKNHSKQSAWLAIMTDDLTLSSQEIVKTYSLRWDIETFFKASKSLLHLAQETQTRNYQALLCHTTIVFTRYILLSWQQRCANDERTLGGLFYELADQMKELDWSVALLELVKIIQAVSEKAESTLQDFIESQLQHWIDTLPNYIKGYLPNLVCET >NZ_CP012047.1|WP_061840043.1|510541_511255_-|hypothetical-protein MSSYDFYEYESIAEKRDRATTKRRSYQKKHPNAVPITINGNKIAKSFWGKAWCNHLKYYADHDNRVSRGRSYIKNGFVFDLAIKEGLITGTVSGSGNNLYQVIITIDPIADQRLEEQINGHVESLEDLAYGKFPKALEKVFLTSENGLFPKMNEIQFSCSCPDSAYMCKHVSAILYAVGAKLDSEPLLLFELRGVDTSALVKRSVEEKMSSLLENASSVKSDRIIEDDSIIDLFDLE >NZ_CP012047.1|WP_014123885.1|511257_513789_-|DEAD/DEAH-box-helicase MAQAIFTKTGFSIEQPTTPFEYRLKNEPFRTLYEQGFAERISKTDPSIDYLLQVAQSFVHQLKKDGEIEITRKFRFPAKHFYQTLVNEVPFVIGYEFVTISWLQAIHQELANIFAEEMKNFQGSVADYVQSKNQNLTTAGRVYFHLIERKQGPTPFAFLATYATLQNGKVNHRPLKNALSEFENSTEIFSLLSAVGRVADESTFISQLVESGELFSPLGFNEQEAYQFLKETPIYEESGVICRIPDFWKKEYQASVKVTLGDQQPSYLGMDSLLSSQPELYLGQDRYSKAEIESLLQQDEGLAFLKGKWIEINHEKLQDLLDTFEEQENTQWTLFEALRNQQINTDSEENQPIEINNGQWLNQVFTQMTMPRKIDQAEPATTFQAELRPYQRVGYNWLKFMQNQSFGALLADDMGLGKTVQILALLDALKNQGTRALLIIPASLIENWRKEAARFAPNLNVQILHGKQTDMQDATADLFITTYGMVSKIAALYEKTFDLLILDEAQAIKNPGTKQTKNVKALHARAKIAMTGTPIENRLSDLWSVFDFLNQGLLGTKKEFSSQIKKGMDYGALRKMISPFILRRLKTDQQIISDLPAKNEQKEYIGLSKKQVALYKGVQREIEKSLEDSEGIQRKGMILSAISKFKQICNHPDQYLGNQEFRPNLSGKFENLRALCETIRDKHEQVLIFTQFKEMCEPLNEFLAEVFGKSGLVLHGSVPAKKRAQYVQEFNSSESYTPYMVLSIKAGGVGVNLTAANHVIHFDRWWNPAVENQATDRAFRIGQEKNVFVYKFVTTGTIEEKIDEMLSEKTQLSNDLISETSGENWLTEMSNQELKQLFTLEAN >NZ_CP012047.1|WP_069028707.1|513979_514954_+|tRNA-dihydrouridine-synthase MTKNFWAELPKPFFILAPMEDVTDVAFRHVIKEAGAPDVYFTEFTNSDSYCHPDGRQSVQGRLTFTEDEKPIVAHIWGDKPEYFREMSLGLAEMGFSGVDINMGCPVRNVVRRGKGSGLILRPEVATELIDAAKAGDLPVSVKTRIGYEQMDEMEEWITHLLEQDIVNLSIHLRTRKEMSKADAHWDMIPQIVAIRDRIAPQTLITINGDIPDRQTGLELVEKYGVDGVMIGRGVFNNPFAFETQPKEHSVQEYIDLLRLQLDLQDYYSETVPRPVAGLRRFFKIYIKGFPGASDLRAELMQTETTDEIRETLANFFQNTSIAS >NZ_CP012047.1|WP_069028708.1|515374_516946_+|PucR-family-transcriptional-regulator MSVEFKSLLNLPSLREAEVVAGVDGLKRQVSSITVLEQSNVAKLREELFNQEDKYGSEIVISGLMTISHDIDAQVEMIQHLQREGEIGLILYYVGVFIPEIDQRLLDTCNKLNFPLIVMPEGEPSLRYSEVIYEVVEAIVKQEMVETSFSNQMVEQISKLPANQRNADTMLKMLTDRTHSSIVLTDMRGQIINAGTWPSISTLDLSYMVKQTTGTNIQSIETVSAVKRTIFHSGMEAIQFYMFKENQPLTENMVEQAAEVVQIFMNLWGQNYEAVNTQELVKAILNDESVKMRRLGAVLHIDVGNISNVWFVHVEEPTLQAIVMRQLKEEMTSHFNVLLVELFEQIIAVFMDEGKTNEGFDMIAFEVSKKLQQEGICHTIVQYLGMGTTSDVQAAYSKMKEYFEQAKFLYPKQRMFTQLHFQFVAECEKRIAEGEKSIHQALGPLQPLIKQPELLDTLAVFLLDAQSHYAKAGKLLYVHMNTIKYRIKRINELVHYSVTKLPESLTYYRAIAIWRLLKNTEKR >NZ_CP012047.1|WP_069028709.1|517080_518349_+|cytosine-permease MQDNKEEQTWQSLAFIWIGSMISVPGLLLGGTLIAGMSFWRAILTALVGYGVIVIGMIFQGIQSSDLRKPTVQVASQVFGEQGAQKIIAIILAISCLGWFGLQANVAGVAFSQFLALYDIGLPVWISSLFWGIVMLLSAIFGIKLLSWLNYIAVPFLLVVILYAIVISVTGGGWTAIVNYQPETHMPFLTGVSVTIGSFALGAIIAGDYSQYVRKRSGVAKASIIGVLPAGILMIAAGAIFGVTSETADIISVFTQLGLPVIGVIAMLLATWTTNAVNAFSGGIAIVNVFNVAKEKQTIAVAAAGGMGTILAAIGILDYFVPIMNVLSAMIPPVAGVMIASYWIIQKGNPASWYEIPKIHWLGVISWFIGAAVAALPVILEFFPNAPQLLNQPLIGVVISFVIYYAGYQFIEKKAVKRNLDD >NZ_CP012047.1|WP_069028710.1|518383_519478_+|DUF917-domain-containing-protein MYKIDAEAIENIAVGAALLGTGGGGDPYIGKMMALSAINEYGPAHLVSPDEIDENAMYAPAAMMGAPSVLVEKFPKGDEFVRVFQKLEKYLGSEIKGVFPMEAGGVNSMIPIIVAAQLGLPLIDCDGMGRAFPELQMVTFHLNGVSSTPMAITDEKGNIGIIETVDNVWAERLARTATVEMGASTLISNYPSSGTELKRSGIANIVSLSEKLGRIIRSKEKDNQVKLQKVLDITGGYDLFTGKIVDVLRGTEGGFNRGKVIIEGLAEYTDEEVNVYIQNENLIALKNGHPLVLTPDLICLVDLETLTPVTTESLKYGKRVRLLALPCNKQWRSAKGIETVGPRYFGYDYDYDPVEELVRKERGQ >NZ_CP012047.1|WP_069028711.1|519477_521043_+|hydantoinase/oxoprolinase-family-protein MEYKIGIDVGGTNTDAVILDENLKLIHSVKYPTTEDIESGIFQALHLVLKESKINKAAVTHAMLGTTQCTNAIVERKKLAKVGVLRLGYPATASVAPFTAWPDTIVQQLSKTYAFAKGGYEFDGRNLSSFDEQEIRDILTSWKGKVESIAVIGVFSSLKNEQEFYVRELAQEILGESIPVSLSSTIGSVGLIERENATILNAALFKVMRTTSDGFEKALLQEGVSDAEVYLCQNDGTLMSIDYAREFPILTIACGPTNSIRGASYLADLENAIVLDVGGTTSDIGVITDGFPRESSVAVDVGGVRTNFRMPDIVSIGLGGGSIVRQTADDDVTVGPDSVGYQLVDKAMVFGGDTLTATDIAVRLGKIEIGEPANVAHIDTVFAEKAYAKIGAMTEEAIDRMKTSAGDVTLILVGGGSVIIPQELNGVKEIIRDEKGAVANAIGASISQIGGQYEQIYIYSQIAREQAMQDAREKADDQAMKAGAIEGTIELVEVEEIPLAYHPDNATRLRVKVVGDLVQNR >NZ_CP012047.1|WP_069028712.1|521265_522498_-|mechanosensitive-ion-channel MDTGITALDNLLASLPAIVAGIVLLIVAWIVASILKNILAKGLKKVGFSRLLTKWGMAKSEENANSAIDSLAKVVYYIVWLVFLPGIFESFGVPAIGRPIQTMLDTALAYLPNIFGAIIILVIGTIVARFVRSVVYNLSVAANIDSYVAKFLGTNEEDQEVEEKKDTLASALGGITYFLIIIPIALIALETLNINTIAEPISSVLNTILAAIPHIVVAAVLLGVGLVLAKFSGQVVGDLLKGTGINKYSKTIEDNTNMSFDLAKLSGQIVSFVVGLLFFVEALNALQLDILNMVGSAIIAYIPNLIIAAIILVAVFVGGDFVGNAISKATKSGLAGAIFKFALIIFGIFMALEQLDFATAIVQQAFVLILGAAAVAFAIAFGIGGRDFAKRQLDKADQKIDSEKDNSDNS >NZ_CP012047.1|WP_014123892.1|522576_524277_+|transketolase MNFSPGHPEVFQTEGVEATTGPLGQGFAMTVGFAIAETHLRERFNRDRFNVVDHYTYTICGDGDLEEGVAMEAAAIAGNLGLGKLIVLYDSNDITSDGPLEESSRENKQEKFSAMNWQTILVEDGNNLEEISRAIKKAQEKENKPTLIEVKTIIGFGSTLQGTEKIHSNPVGAKEAQHIKESFTWDYDDFFVPKEIKTDFNEVIEKGEETEKNWHKLFEEYKEAYPDLGKELEGFISNEISISKEVWKPFEDDKMATRAASGKVLNRLYHEFPKLIGGSADLASSNKTTIDNYPFMNEKEHIGPNLHFGIREFSMAAITNGITLHGGVRGYCGTFLIFSDYMRPAIRLSSVMNIPATYLMTHDSLHVGQDGPTHQPVEHLISLRAMPNLVVYRPADANETLVGWKLAIESKDNPYLLSLGRHDVPVLDNVDFKGAEKGGYVLSKASDKPDVILIATGSEVEMALKAKEKLSDFKVNVVSLPSWELFDKQTKEYKESVVPSSIVNKASIELGSTIGWSQYVGTDGISLGVNKFGKSAPADDLLNDYGFTVDYIVDEVLKMVERNKGK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012047_4 | 1969768-1969892 | TypeV |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012047_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012047_4
>4.1|1969806|49|NZ_CP012047|CRISPRCasFinder GGTTTGGGGAACTACGCTCGTTCCTCTCGCCTAGTACTGTTCATCATCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012047_4
The CRISPR arrays of NZ_CP012047_4 >merge|NZ_CP012047|4|1969768-1969892|CRISPRCasFinder TCTCTTAGCTCCCTTTGGTCGCTAAATCGCAGTGATTCGGTTTGGGGAACTACGCTCGTTCCTCTCGCCTAGTACTGTTCATCATCCTCTCTTAGCTCCCGTTGGTCGCTAAATCGCAGTGATTC >NZ_CP012047|4|4|1969768-1969892|CRISPRCasFinder TCTCTTAGCTCCCTTTGGTCGCTAAATCGCAGTGATTC GGTTTGGGGAACTACGCTCGTTCCTCTCGCCTAGTACTGTTCATCATCC TCTCTTAGCTCCCGTTGGTCGCTAAATCGCAGTGATTC
>NZ_CP012047.1|WP_061840816.1|1967321_1969469_-|polyribonucleotide-nucleotidyltransferase MTKQVFETTWGGRPLQVEVGQLAKQANGAVLVRYGETVVLSAVVASKEAKGTDFFPLTINYEEKMYAVGKIPGGFIKREGRPSTDATLTARLIDRPIRPMFAEGFRNEVQVTNTVMSVEQDCSPAMAAMLGSSLALSISDIPFEGPIAGVEVGRVNGEYILNPTVEQHESSDIDLTVAGTSEAINMVESGAQEVTEADMLGALMFGQEAIQELVAFEEEVAASCGKEKMDISLLQVDEDLQKAIYNNYYETMKTAVLTEEKLAREDEIENVKTIVKEAYEEQITALEEEASDHLAQEVNQIAEDLEKDVVRELITIDKIRPDGRKVDEIRSLSSEVGLLPRAHGSGLFTRGQTQALSACTLAPLGEHQVIDGLGVEESKRFIHHYNFPKYSVGSTGRAGSPGRREIGHGALGERALSQIIPSEAEFPYTIRLVAEVLESNGSSSQASICAGTLALMDAGVPIKAPVAGIAMGLVSDGENYTILTDIQGMEDHLGDMDFKVAGTKDGITALQMDIKIQGITEQILREALAQAKQARMEILQQLTSTIAQPKEELSPYAPKIEMMSIDPEKIKDVIGKGGDVINGIIDETGVKIDIDQEGNVSIASSDAEMIKKASGIIKDLTKEIKPGEVYLGKVVRIEKFGAFVNIAKGKDGLVHISQIAKERINKVEDVLHVGDEVLVKVTEIDKQGRINLSRKAMLKDDEKTDDKKDSKSTKE >NZ_CP012047.1|WP_014123954.1|1966822_1967233_-|hypothetical-protein MRSNWQNKIIQFMRGRYGVFDPLNKRLLILTAVLIIFNVFITIPFVNLLPLLLLVIVYYRFFSKRIYVRSNENQRYLRWENKIKNFFRLRKEAFQNRKTYTYFHCPECKKALRAPKGRGKIKITCSQCRHQFTKKV >NZ_CP012047.1|WP_069029206.1|1966285_1966744_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MRYHLEPVTQKNWHKIIQLSVAPEQEELIEDNAESLLEAAYDSSYDWTPIALCVDSQIVGFAMIGAEDKQNRTILFDRFMIDHNQQKKGYGHALFQAVLTYLEDRFKVNHIYIRVHQKNEQAIPFYESFNFELTGQKDPKTGKKLMWREVQR >NZ_CP012047.1|WP_014123956.1|1965337_1966111_-|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MSVLEIKDLHVSIEDKEILKGVDLRLNTGEVHAIMGPNGTGKSTLSAAIMGSPNYEVTQGEILYDGQNVLEMEVDERARLGLFLAMQYPSEIPGITNAEFMRASINAKRAEEDQIPVMQFIKKLDKTMKLLNMPEEMAERYLNEGFSGGEKKRNEILQLLMLEPTFAVLDEIDSGLDIDALKVVAKGVNAMRGENFGALIITHYQRLLNYITPDVVHIMMDGKIALTGDAELAKRLENEGYSGISKELGIEYQEEEA >NZ_CP012047.1|WP_061840815.1|1964030_1965323_-|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MKKSLMNHLDAIDVFSSRKNEPNWMREMRQAALKKVDELDLRRIERVRYDRWPLFNIDAKSLTTEQPISDSTSGFNEKKEGPVLVQQDDNVIFEQLPQELVDKGVILTDIFTAMQKYPDLVKKYYMTSCVLMDEDKVTAAHAAFMNGGLFLYVPKNVVIEQPVEVIFHHNGDASAHFYKHVLIVAEENSEFSYLERYISEGNDAQKISGNIIVEVIAKNEAKIKFSGIDQLGENLSCYIKRRGYLMRNASIEWAMGIMNEGDVVGDFDSELEGEGSHAEVKAVVISAGDQKQAIDTRVTNKAPHSIGHILQHGVIRDRATLTFNGIGHILKGAKGSDAQQESRVLMLSDKARGDANPILLIDENEVSAGHAASVGRVDPEQMYYLMSRGLAKEEAERLVIRGFLSAVLSSIPVKEVEKELIAVIERKLDA >NZ_CP012047.1|WP_061840814.1|1962798_1964034_-|cysteine-desulfurase MIDAKSLQEEFPILDQKVNDEPLVYLDNAATTQKPKAVLQTIEDYYYKANANVHRGVHTLAERATKKYEAAREKVRQLIHAHEIAEVLFTRGTTTSLNWIAQSFGDAFIHEGDEIVISYMEHHSNVVPWQQLAKKKNAVLKYIPLTKDGFLDIAEARKQITDKTALVAIAHASNVLGVINPIEELTQLAHKHQAVIAVDGAQAVPHMPVDVEKLDVDFYAFSGHKMCGPTGIGVLYGKRYWLEQMEPVEFGGEMIDFVHPYESTWTELPWKFEAGTPNIAGSIALASAIDYLTKIGLAEIYQHEKELVNYVLPRLQAIDGLTIYGPQKPRDHTGVIAFNLDGLHPHDVASALDMEGVAVRAGHHCAQPLLEYLDLVATTRASFYLYNTKEDADRLVEAIKVTKEFFKNGTF >NZ_CP012047.1|WP_061840813.1|1962338_1962812_-|SUF-system-NifU-family-Fe-S-cluster-assembly-protein MALSKLENLYRQVILDHSSHPHNQGTLEDSSHHTELNNPTCGDVIHLELQTEEGVIKDIAFSGHGCSISTASASMMTEIVKGKTIEEAMGLAEDFSLLVQGKDVKDIEMLGDAGMLSGVSKFPARIKCATLSWKALKKAIEESETGVAETGFIKHED >NZ_CP012047.1|WP_069029205.1|1961527_1962232_-|NAD-dependent-protein-deacylase MSELNDLLHAANKVVFLTGAGVSTASGIPDYRSKNGLYATGGSPEYLLSHACLINEPEKHYDFVINNMIHPEAEPNVIHEKMASFTQKGNTDIVTQNVDGLHLAAGTDPQHLVEFHGDISHVYCQKCGRSATMEEYLASMYHKNCGGILRTNIVLYEEAIDTQKVEKAVKAISEADLIVVVGTSFVVFPFASLVQYASPNATMLAVNRDPISLPANGKMITGDAVKAFEQVQVD >NZ_CP012047.1|WP_061840811.1|1959559_1961299_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MVKKLLSCVEEYKKTTALSMFLVIFESFIEILIPTLMAIIIDEGISQGRTSVVWQLGILLILLALLGLFIGALSGRYAAIASAGFAKNLRKTLFFNVQKFSFSNIDKFTAPSLITRMTTDVTNLQNAYQMLVRIMIKSPVQFSFAIIMSALINPNMVLIFIGIAPFLAGTLIFIGRKVHPIFERVFRSYDHLNNIVQENLHGIRVVKSYVRQAFEIQKFQNISQIVYKRFSKAEKLLAFNQPLMQSTAYICILLISWVGAHLIVGQTMSTGELSSLFVYTFQILISLNMFSMVFVMFLISRASAQRVVAVMEEESDLKNNDVALTTVADGRVHFHHVFFQYPTALNHRVLKDISFSAETGETIGIVGGTGSSKTTLVQLIPRLYDVTDGQVELAGRDVGDYDMDALRQNIGVVLQNNILFSGTIMENIRWGNPQASKQEVRNACIMAQADEFIQELPDGYQTYIEQGGSNVSGGQRQRLCIARALLKQPKVLILDDSTSAVDTKTESKILETFRTKLPYTTKFIVAQRITSVQDADKILVLDNGEITDIGAHNQLLQTSAIYQEIYEAQTKGFGEADAK >NZ_CP012047.1|WP_069029204.1|1957707_1959570_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MQNNKILAPLLRILTYIWRDYKLILMLVILFVLLSTGANTLGSLFIQQVVDDYITPLLSQSNPVYTGLLKIILVMASIYLIGVIASLLFNRLMVTVSQGTQKNIRDDMFAKMQSLPIRFFDETPSGDIMSHYTNDIDTLRQMISQSIPQVFQAATQMLGVFIAMLTLNVPLTFVVLFTVILIYLVVKKIAGLSSRYFVYQQRSLGEVDGYIEEMTFGQKVVKVFTHEEASKQGFVRKNNRLFEDASKANQLANILLPIMINLGNLQYVLIALIGGLLSINGMITLSIGTLIAFLQLSRSFSGPLNQISQQVNFIVMALAGAARIFELIDTAPEEDHGKVTLVNVDKQGEQLEESSFRTARWAWKQVRSDGSVQYTEVKGNINFAHVTFGYKENQTILHDISLYAYSGQKVALVGATGAGKTTVTNLLNRFYDIDRGTIFYDGIDITKIKKADLRRSLGIVLQDTNLFSATVRENIRYGNLEATDKQVEEAAKLANAHHFIEELSDGYETLISGQESNLSQGQQQLLSIARAALANNPVLILDEATSSIDTLTEKLVQNGMDSLMKGRTVFVIAHRLSTIQNSDVIVVLDHGQVIERGTHDQLIQNKKTYYQLYTGKLELS >NZ_CP012047.1|WP_014123952.1|1969942_1970212_-|30S-ribosomal-protein-S15 MAISQERKTEIIEKFARHEGDTGSPEVQIAVLTEDINSLNEHLREHKKDHHSRRGLMKKIGHRRNLLAYLRNKDVTRYRELIQALGLRR >NZ_CP012047.1|WP_041591761.1|1970471_1970762_+|rhodanese-like-domain-containing-protein MQSIAIQDFRSLLEESIAILDIRDKGAYKENHLAGAISIPTTSLPNRLSELDKSTTYYVLSHSGRRSEIIAEFLNNNGFQAIHVIGGMKALKKAAA >NZ_CP012047.1|WP_061840817.1|1970806_1971982_-|AI-2E-family-transporter MDKKGKRSFSWFWKWFLNNQFVTGLLIVLLILLIINLFTKVSYLFFPVGQFLAIVALPIIIAGILFYLLNPIVDFFERKGINRYYSIIGLFILVAGLIAWGIIVIIPEIREQTTTFVDRLPGYIDTVQVSLANFFSDPIFDKVQDQIAISGERIMSSITGMVQNISKTTVQSIGNFFGAVASIFIAIVTMPVILFYLLKDGKKIAPYFVQFLPTKMRQPTLRVLKEMNQQVSSYIRGQLAVAFAVAILFMVGFSIIGLDYAITLGVIAGFLNLVPYIGSFLAMIPAIFLGIVGGPVLLVQVIIVFAIEQLIEGRLISPLVLGNQLAVHPVTILFVLLTAGKLFGFFGVVLGVPAYAAIKVVITNIFNWYKTVSGLYTEDEDQKQATEDKNK >NZ_CP012047.1|WP_014123949.1|1971997_1972348_-|PTS-glucitol/sorbitol-transporter-subunit-IIA MQQGKILSIGDQAVDENEKMLIFFGKSVTKGLAPYSIIQEINEPEKVELTVGDKIFFGQQEYQITYVGHLVNQNLQTIQHSSFVFSDDTQDKLSSSVYLTPAKVPDISEGMTITYC >NZ_CP012047.1|WP_069029207.1|1972518_1973538_+|lactonase-family-protein MLEKILLGTYTRGESKGVYSAQLDTENKKLTDLTLAAKETSPTYLALSKAKNLYSVTTVDDKGGVAAYDSSFHYLNAVTEEGAPLCYVAVDNDRQLVYGANYHKGEVNVYQILADGSLKASDAIYHDEPTGPHENQDHAHAHYANLTPDKRLAVCDLGTDRVYTYDVSDEGKLTEIAVFEAPAGTGPRHLVFHPNEKYAYLFGELDSTVTVLTYDASTGKFTQENKISTIPKDYYDFNGGAAIRITSDGKFLYVSNRGHNSITVFAVKDNGENLEFVQNISTEGDFPRDFNLDPTEQFIVCGHQKSDYLSLFERNSQTGELTLISKDFYAPECVCVLFD >NZ_CP012047.1|WP_069029208.1|1973862_1975353_-|ABC-F-type-ribosomal-protection-protein MSKIEIKNLTFGFDTLAEPLFEHTNLTIDTQWKLGLIGRNGRGKTTLLQLLLGEYVYSGAITHQLAFTYFPQKVLDKTQLTYDCLQTLAVFDLWEIERELNLLQTDPEILWRPFASLSGGEQTKVLLALLFIDDRHFPLIDEPTNHLDITARQQVANYLQAKRNGFIVVSHDRSFVNEVVDHVLSIEKSQLVLYQGNFSTYEEQKEQRDHYEQEENRKLKKEIGRLKQTAAEKAEWSRGRERDKQGNPNQKGSGAIYDTGAIGARAARTMKRSKAIVNRMEEKAEEKKGLLHDIEDIDALTMNYQPSYHKQLLKVEELQLSYADVPLFEPLSFEIKQGQRLAVQGANGSGKSSIIQFLLGEFHGQVSGNASLAHGLDISYVRQNYEDNTGTLQEFAQAHHLSYEELLNNLHKLGLERKVFTNRIEDMSLGQRKRVELAKSLATPAELFIWDEPLNYLDVFNHEQLEAVIQSVQPSMLVVEHEVTFLENIATKMIYL >NZ_CP012047.1|WP_069029209.1|1975742_1976165_-|hypothetical-protein MKPNPNFYVQKINQIVKDTEKVGEDMNPNYEEIRGLIDEDNIAELTEERQLEAVEVFKEGTAKYRDLLKTLSSLRAPARVMGAHKKFERSYQNYVDGCQDMIESISNEVDVKAFDAAEQKQDEATDEIASALQKITSFLM >NZ_CP012047.1|WP_061841149.1|1976584_1979230_+|cation-translocating-P-type-ATPase MNYYQQEKKDVLDQLNVDKSGLSQQEVKRRQETEGFNEIEKEKKKSVLALFFNSFKDAMVVILLIAAIIQVLLGDYIETIVIMIVLIMNAIISVVQTKKAESSLDALRQMSAPTATVIRGNEKQTVPARELVPGDIVFLEAGDYIPADGRIIENGSLQVNEGMLTGESEVVDKTEAVIEQEAALGDRTNLVFSSSLVTNGRATFVVTATGTKSEIGKIADMLNTAEQKQTPLQRKLDSFSKKLGIWILLLSIGIFIVQAARIWFGDQPTDLTEELLQALMFAVAIAVAAVPEALQSIVTIVLSVGTNKMARQHAIIRKLPAVETLGSTSIICTDKTGTLTKNKMTVVDYFLPSQKTQNNDNESAEWSFAKERLIDISVLCNDSYVNTEENEIGDPTEIALVNFAQKQGLESKKIRETNQRIDELPFDSDRKLMSTLNDVNDERLMLTKGGPDVMFKRAKYILVDGKEQPLSQYWYDYLINQNESFSSRALRVLAFGYKKMSSSKEKLSFDDESELVLVGLMAMIDPPREVVYGAIKKTKAAGMKTIMITGDHKTTAEAIGKNIGLMEEGDFAVTGQELDEMSDEELNNNLEHISVYARVSPENKIRIVEAWQAKNQISAMTGDGVNDAPALKQADIGIAMGSGTDVSKDASAMILTDDNFVSIVRAVEVGRTVFDNIKKAIAYLFSGNLGAIIAILFAVVLDLPNPFTALQLLFVNLVNDSLPAIALGMENSEPGIMDRKPRSVNEGIFAGETLRSVLTRGSIIGIAVIVSHQIGLQYSNEMGVAMAFTTLILSRTLQTFAARSNQQTILGVGFTTNKYVLAAVAFCLTLYVITILPGLRSIFSIPNEFGMDLWAPAAGLSLAAIFMMEVVKVIYHKFFRK >NZ_CP012047.1|WP_061841148.1|1979435_1981448_-|methionine--tRNA-ligase MGEKETFYITTPIYYPSGKLHIGNSYTTIACDAMARYKRLMGFDVFYLTGVDEHGEKIEQKAEELGVAPQDYVDKMAADVKKLWKTLGISYDKFIRTTDDYHEKAVQKIFQQLLDQGDIYLGEYEGWYSVSDEEFFTEKQLEEVYRDEQGNVIGGKAPSGHEVELIQEESYFFRMSKYADRLVEYYEEHPEFIRPESRKNEMLKNFIEPGLEDLAVSRTTFDWGIPVSSDPKHVVYVWIDALTNYITALGYGSADETNFEKFWPADVHMVGKEIVRFHTIYWPIMLMALGLSLPKQVFAHGWLLMKDGKMSKSKGNVVYPEMLVERYGLDALRYYLLRSVPFGSDGIFTPEDFISRVNYDLANDLGNLLNRTVAMVNKYCEGVVPDYASKVTPYDSELSTTAANVVGRYREAMDDMEFSTALSEVWTLIARSNKYIDETEPWKLAKEEDKKAELNSVMVHLAESLRITAILLQPIMIETSTKIFKQLGLDEEPKGLQELRFGEFPHDTKVVSKGDPIFPRLDAETEVAYIQNKMAEGKQTNDESVKWNPEETELASEKNKQIKYEDFDKVELKVAEVIDCKKVEDADKLLKFRLACGDNQDRQILSGIAEFYPDPNALIGSKLVIVANLKSRKMRGQISQGMILSAEDPETGRLKIVEAPKGMPNGAIIA >NZ_CP012047.1|WP_061841147.1|1981979_1982801_+|NUDIX-hydrolase MEFSSKQEEKHYYQHIASEQEFLEWYKNQEPPMYQKPSVTVDMVLLCYNKSTDQIKVLLIQRRGNPYRNSWALPGGFITPNESTGDSVIRETKEETGVTISEKNIEQLHTFSTPDRDPRGWVITVSYLAFIGEAILSAGDDANQARWFSLERKNNRLHLTSGDTKIILDLKTQASLGEDTLAFDHSQIIIKAFNRIVNKMNHEPQVLQVLGDTFTITEARKVFAKFLGVDYHAIDHSNFKKSLIGFLKEVGERPASIGRPSKLYQLKENFREK |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012047_1 | 1.18|422765|35|NZ_CP012047|CRISPRCasFinder,CRT | 422765-422799 | 35 | NZ_CP031212 | Lactobacillus brevis strain UCCLB521 plasmid pUCCLB521_D, complete sequence | 559-593 | 4 | 0.886 |
| NZ_CP012047_1 | 1.18|422765|35|NZ_CP012047|CRISPRCasFinder,CRT | 422765-422799 | 35 | NZ_CP018213 | Lactobacillus plantarum strain BLS41 plasmid pLPBLS41_4, complete sequence | 7493-7527 | 4 | 0.886 |
| NZ_CP012047_1 | 1.18|422765|35|NZ_CP012047|CRISPRCasFinder,CRT | 422765-422799 | 35 | NZ_CP018213 | Lactobacillus plantarum strain BLS41 plasmid pLPBLS41_4, complete sequence | 39193-39227 | 4 | 0.886 |
| NZ_CP012047_1 | 1.18|422765|35|NZ_CP012047|CRISPRCasFinder,CRT | 422765-422799 | 35 | NZ_CP040375 | Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain BNH17 plasmid unnamed1, complete sequence | 33237-33271 | 4 | 0.886 |
| NZ_CP012047_1 | 1.3|421682|36|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421682-421717 | 36 | NZ_CP026413 | Acinetobacter sp. ACNIH2 plasmid pACI-35f6, complete sequence | 228-263 | 7 | 0.806 |
| NZ_CP012047_2 | 2.5|494873|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 494873-494907 | 35 | HM144387 | Bacillus phage W.Ph., complete genome | 112655-112689 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP012047_2 | 2.12|495338|34|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 495338-495371 | 34 | NZ_CP021643 | Campylobacter concisus strain P2CDO4 plasmid pICON, complete sequence | 5083-5116 | 7 | 0.794 |
| NZ_CP012047_2 | 2.18|495740|35|NZ_CP012047|CRISPRCasFinder,CRT | 495740-495774 | 35 | KY065498 | Streptococcus phage IPP62, complete genome | 15158-15192 | 7 | 0.8 |
| NZ_CP012047_2 | 2.5|494873|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 494873-494907 | 35 | NZ_CP014852 | Bacillus thuringiensis strain HD12 plasmid pHD120161, complete sequence | 17091-17125 | 8 | 0.771 |
| NZ_CP012047_2 | 2.5|494873|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 494873-494907 | 35 | NZ_CP014852 | Bacillus thuringiensis strain HD12 plasmid pHD120161, complete sequence | 85166-85200 | 8 | 0.771 |
| NZ_CP012047_2 | 2.18|495740|35|NZ_CP012047|CRISPRCasFinder,CRT | 495740-495774 | 35 | NZ_CP010090 | Bacillus thuringiensis serovar galleriae strain 4G5 plasmid pBMB426, complete sequence | 209737-209771 | 8 | 0.771 |
| NZ_CP012047_3 | 3.17|508015|34|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 508015-508048 | 34 | MK240351 | Acinetobacter phage Henu6, complete genome | 58300-58333 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP012047_1 | 1.3|421682|36|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 421682-421717 | 36 | MT074137 | Bacteroides phage DAC16, complete genome | 47582-47617 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP012047_2 | 2.12|495338|34|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 495338-495371 | 34 | KJ564036 | Lactobacillus phage Ld25A, complete genome | 1-33 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP012047_2 | 2.14|495472|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 495472-495506 | 35 | MN693170 | Marine virus AFVG_25M480, complete genome | 16362-16396 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP012047_3 | 3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 507343-507377 | 35 | NC_011344 | Staphylococcus phage phi2958PVL, complete genome | 44316-44350 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP012047_3 | 3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 507343-507377 | 35 | NC_048681 | Staphylococcus phage phiSa2wa_st22, complete genome | 36059-36093 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP012047_3 | 3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 507343-507377 | 35 | MG029514 | Staphylococcus phage phiSa2wa_st78, complete genome | 43362-43396 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP012047_3 | 3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 507343-507377 | 35 | MG029512 | Staphylococcus phage phiSa2wa_st59, complete genome | 39616-39650 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP012047_3 | 3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 507343-507377 | 35 | AP011955 | Staphylococcus phage phi5967PVL DNA, complete genome | 39770-39804 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP012047_3 | 3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 507343-507377 | 35 | NC_009762 | Staphylococcus phage tp310-2, complete sequence | 46800-46834 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP012047_3 | 3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 507343-507377 | 35 | MF580410 | Staphylococcus phage phiSa2wa_st1, complete genome | 43068-43102 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP012047_3 | 3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 507343-507377 | 35 | NC_009761 | Staphylococcus phage tp310-1, complete sequence | 39402-39436 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP012047_3 | 3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 507343-507377 | 35 | MG029509 | Staphylococcus phage phiSa2wa_st5, complete genome | 42306-42340 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP012047_3 | 3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 507343-507377 | 35 | AP009363 | Staphylococcus phage phi2958PVL proviral DNA, complete seqeunce | 44316-44350 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP012047_3 | 3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 507343-507377 | 35 | AP011956 | Staphylococcus phage phi7247PVL DNA, complete genome | 39770-39804 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP012047_3 | 3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 507343-507377 | 35 | NC_002321 | Staphylococcus phage PVL proviral DNA, complete sequence | 21563-21597 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP012047_3 | 3.17|508015|34|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 508015-508048 | 34 | HQ698922 | Acinetobacter phage ZZ1, complete genome | 166391-166424 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP012047_1 | 1.9|422116|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 422116-422150 | 35 | NC_019924 | Clostridium phage phi8074-B1, complete genome | 41923-41957 | 10 | 0.714 |
| NZ_CP012047_1 | 1.10|422187|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 422187-422221 | 35 | NC_019924 | Clostridium phage phi8074-B1, complete genome | 41923-41957 | 10 | 0.714 |
| NZ_CP012047_2 | 2.18|495740|35|NZ_CP012047|CRISPRCasFinder,CRT | 495740-495774 | 35 | MK075005 | Staphylococcus phage phiSP119-2, partial genome | 17962-17996 | 10 | 0.714 |
| NZ_CP012047_3 | 3.20|508215|35|NZ_CP012047|CRISPRCasFinder,CRT | 508215-508249 | 35 | MT774398 | CrAssphage cr60_1, complete genome | 39473-39507 | 10 | 0.714 |
1. spacer 1.18|422765|35|NZ_CP012047|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031212 (Lactobacillus brevis strain UCCLB521 plasmid pUCCLB521_D, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.886
taaattactttttgaagtaaatccatattcactag CRISPR spacer caaattactttttgaaataaaaccatattcacttg Protospacer .***************.**** *********** *
2. spacer 1.18|422765|35|NZ_CP012047|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018213 (Lactobacillus plantarum strain BLS41 plasmid pLPBLS41_4, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.886
taaattactttttgaagtaaatccatattcactag CRISPR spacer caaattactttttgaaataaaaccatattcacttg Protospacer .***************.**** *********** *
3. spacer 1.18|422765|35|NZ_CP012047|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018213 (Lactobacillus plantarum strain BLS41 plasmid pLPBLS41_4, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.886
taaattactttttgaagtaaatccatattcactag CRISPR spacer caaattactttttgaaataaaaccatattcacttg Protospacer .***************.**** *********** *
4. spacer 1.18|422765|35|NZ_CP012047|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040375 (Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain BNH17 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.886
taaattactttttgaagtaaatccatattcactag CRISPR spacer caaattactttttgaaataaaaccatattcacttg Protospacer .***************.**** *********** *
5. spacer 1.3|421682|36|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026413 (Acinetobacter sp. ACNIH2 plasmid pACI-35f6, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
taagttcttccactgatttatctttgtacatttcat--- CRISPR spacer tgagttcttccactgttttatcattgta---ttcaggtg Protospacer *.************* ****** ***** ****
6. spacer 2.5|494873|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HM144387 (Bacillus phage W.Ph., complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
acttttccaaatacttttttgttatttaattcaac CRISPR spacer gcatcttcaaatacttttgtgttatttacttcagc Protospacer .* *.*.*********** ********* ****.*
7. spacer 2.12|495338|34|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021643 (Campylobacter concisus strain P2CDO4 plasmid pICON, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
aaactatttgaaccaaaaaatacacaagatatga---- CRISPR spacer aaacaatttgaaccaaaaaagaca----atataacctt Protospacer **** *************** *** ****.*
8. spacer 2.18|495740|35|NZ_CP012047|CRISPRCasFinder,CRT matches to KY065498 (Streptococcus phage IPP62, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.8
gtctttaccatctaacttacaaatgaaaggaaaga CRISPR spacer atccgcactgtctaacttacagatgaaaggaaaga Protospacer .**. .**..***********.*************
9. spacer 2.5|494873|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014852 (Bacillus thuringiensis strain HD12 plasmid pHD120161, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
acttttccaaatacttttttgttatttaattcaac-- CRISPR spacer ttatttccaattacttttttgtttttta--taaaccc Protospacer . ******* ************ **** * ***
10. spacer 2.5|494873|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP014852 (Bacillus thuringiensis strain HD12 plasmid pHD120161, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
acttttccaaatacttttttgttatttaattcaac-- CRISPR spacer ttatttccaattacttttttgtttttta--taaaccc Protospacer . ******* ************ **** * ***
11. spacer 2.18|495740|35|NZ_CP012047|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP010090 (Bacillus thuringiensis serovar galleriae strain 4G5 plasmid pBMB426, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
gtctttaccatctaacttacaaatgaaaggaaaga CRISPR spacer ttcagaatcatccaacttacaaataaaaggaaata Protospacer ** *.****.***********.******** *
12. spacer 3.17|508015|34|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK240351 (Acinetobacter phage Henu6, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
attgtttaatattaaagacggcgtacaatatatc CRISPR spacer attgtttaaaattaaagacggcgtggcacaactt Protospacer ********* **************. *.* *.
13. spacer 1.3|421682|36|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT074137 (Bacteroides phage DAC16, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
taagttcttccactgatttatctttgtacatttcat CRISPR spacer aacattcttccactgatttttctttatacaaagcaa Protospacer * .*************** *****.**** **
14. spacer 2.12|495338|34|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ564036 (Lactobacillus phage Ld25A, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
aaactatttgaaccaaaaaatacacaagatatga CRISPR spacer -aaacacctgaaccaaaaaatacacaatttattt Protospacer ** .*..******************* ***
15. spacer 2.14|495472|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693170 (Marine virus AFVG_25M480, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
tattttttggaaaatgtctaattctgctgctgttg CRISPR spacer tacaccatctaaaatatttaattctgctgctgttg Protospacer **. .. * *****.*.*****************
16. spacer 3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011344 (Staphylococcus phage phi2958PVL, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttatagtggccaacgtcgttatgtcgctatgacaa CRISPR spacer taatagtggacaacgtcgttatatcgcgacaggag Protospacer * ******* ************.**** *... *.
17. spacer 3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048681 (Staphylococcus phage phiSa2wa_st22, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttatagtggccaacgtcgttatgtcgctatgacaa CRISPR spacer taatagtggacaacgtcgttatatcgcgacaggag Protospacer * ******* ************.**** *... *.
18. spacer 3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG029514 (Staphylococcus phage phiSa2wa_st78, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttatagtggccaacgtcgttatgtcgctatgacaa CRISPR spacer taatagtggacaacgtcgttatatcgcgacaggag Protospacer * ******* ************.**** *... *.
19. spacer 3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG029512 (Staphylococcus phage phiSa2wa_st59, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttatagtggccaacgtcgttatgtcgctatgacaa CRISPR spacer taatagtggacaacgtcgttatatcgcgacaggag Protospacer * ******* ************.**** *... *.
20. spacer 3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP011955 (Staphylococcus phage phi5967PVL DNA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttatagtggccaacgtcgttatgtcgctatgacaa CRISPR spacer taatagtggacaacgtcgttatatcgcgacaggag Protospacer * ******* ************.**** *... *.
21. spacer 3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009762 (Staphylococcus phage tp310-2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttatagtggccaacgtcgttatgtcgctatgacaa CRISPR spacer taatagtggacaacgtcgttatatcgcgacaggag Protospacer * ******* ************.**** *... *.
22. spacer 3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF580410 (Staphylococcus phage phiSa2wa_st1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttatagtggccaacgtcgttatgtcgctatgacaa CRISPR spacer taatagtggacaacgtcgttatatcgcgacaggag Protospacer * ******* ************.**** *... *.
23. spacer 3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009761 (Staphylococcus phage tp310-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttatagtggccaacgtcgttatgtcgctatgacaa CRISPR spacer taatagtggacaacgtcgttatatcgcgacaggag Protospacer * ******* ************.**** *... *.
24. spacer 3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MG029509 (Staphylococcus phage phiSa2wa_st5, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttatagtggccaacgtcgttatgtcgctatgacaa CRISPR spacer taatagtggacaacgtcgttatatcgcgacaggag Protospacer * ******* ************.**** *... *.
25. spacer 3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP009363 (Staphylococcus phage phi2958PVL proviral DNA, complete seqeunce) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttatagtggccaacgtcgttatgtcgctatgacaa CRISPR spacer taatagtggacaacgtcgttatatcgcgacaggag Protospacer * ******* ************.**** *... *.
26. spacer 3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to AP011956 (Staphylococcus phage phi7247PVL DNA, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttatagtggccaacgtcgttatgtcgctatgacaa CRISPR spacer taatagtggacaacgtcgttatatcgcgacaggag Protospacer * ******* ************.**** *... *.
27. spacer 3.7|507343|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_002321 (Staphylococcus phage PVL proviral DNA, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
ttatagtggccaacgtcgttatgtcgctatgacaa CRISPR spacer taatagtggacaacgtcgttatatcgcgacaggag Protospacer * ******* ************.**** *... *.
28. spacer 3.17|508015|34|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HQ698922 (Acinetobacter phage ZZ1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
attgtttaatattaaagacggcgtacaatatatc CRISPR spacer attgtttaaaattaaagacggtgtggcacaactt Protospacer ********* ***********.**. *.* *.
29. spacer 1.9|422116|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019924 (Clostridium phage phi8074-B1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
attcattttaatttctcctctctttaactttctaa CRISPR spacer tttcattctaatctctcctctctttattatgtttc Protospacer ******.****.************* . * .*
30. spacer 1.10|422187|35|NZ_CP012047|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019924 (Clostridium phage phi8074-B1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
attcattttaatttctcctctctttaactttctaa CRISPR spacer tttcattctaatctctcctctctttattatgtttc Protospacer ******.****.************* . * .*
31. spacer 2.18|495740|35|NZ_CP012047|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK075005 (Staphylococcus phage phiSP119-2, partial genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gtctttaccatctaacttacaaatgaaaggaaaga CRISPR spacer tgacgcatcatctaacttgcaaatgaatggaaaca Protospacer . .*.**********.******** ***** *
32. spacer 3.20|508215|35|NZ_CP012047|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT774398 (CrAssphage cr60_1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
tacaataaatgtagcggtttctttattatttgcca CRISPR spacer attactttccgtagcagtttctttattatatgcca Protospacer .* * .*****.************* *****
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
15805 : 24295
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012047|15805:24295|DBSCAN-SWA TATGTCTTCAGTAGTAGTTGTAGGAACACAATGGGGCGATGAAGGAAAAGGAAAAATTACTGATTTTTTGAGTGAAAATGCAGAAGTGATCGCACGTTATCAAGGTGGCGACAATGCCGGACATACGATTAAATTCGATGATGTGACTTATAAGTTGCATCTAATTCCTTCTGGTATTTTTTATAAAGAAAAAACAAGCGTTATCGGAAATGGTGTAGTGGTAAATCCCAAATCACTTGTAGAAGAATTGAATTATCTAAAAGAACACGGTGTATCAACAGAAAATTTACGAATCTCTGATCGTGCACACGTAATTTTGCCATATCATATCAAGTTAGATCAATTGCAAGAAGATGCTAAAGGCGCTGATAAAATCGGTACGACAATTAAAGGAATTGGGCCAGCTTATATGGATAAAGCAGCTCGTGTTGGTATAAGGGTCGCTGATTTGCTAGATAAGGATATCTTTAGTGAACGTTTGAAAATTAATTTAGCAGACAAAAATAGACAATTTGAAAAAATGTATGATGACCATGCAATGGCTTTTGAGGATATTTTTGAAGAATTCTATGAGTACGGTCAACAAATCAAGCAATATGTAACAGATACCTCTGTCATTTTAAACGATGCTTTGGACCGTGGAAGACGCGTACTGTTTGAAGGTGCACAAGGCGTTATGTTGGATCTTGATCAAGGAACATATCCTTTTGTTACCTCCTCAAATCCAGTTGCTGGTGGAGTGACAATCGGTAGTGGCGTAGGTCCTTCTAAGATCGATAAAGTTGTGGGTGTATGTAAAGCTTATACTTCGCGTGTAGGTGACGGTCCTTTTCCTACAGAATTATTCGATGAAGTAGGTGATCAAATCAGAAAAGTAGGACATGAATACGGTACAACAACTGGACGTCCTCGTCGTGTTGGTTGGTTTGATTCGGTGGTTATGCGTCATTCGCGTCGAGTTTCTGGTATTACCAATTTATCATTGAACTGTGTGGATGTATTAAGTGGTTTAGATACTGTTAAAATCTGTACGGCTTATGAATTAGATGGGAAGTTAATCTATCATTATCCTGCCAGCCTAAAAGAATTAAACCGGTGTAAGCCTGTGTATGAAGAATTGCCTGGTTGGTCAGAAGATGTTACAAATTGTAAAACATTGGAAGAATTGCCTGAAAATGCACGAAATTATCTTCGTCGAATTTCAGAACTTGTAGGGGTAAGAATTTCTACTTTTTCAGTGGGCCCCGATCGGAATCAAACAAACATTTTAGAAAGTGTTTGGTCACAAATTTAAAATAACTTAAAAAAACATCAGAGAAAATTTCTGATGTTTTTTTATAAACGTAAAAAGCTTAATTTATTTGAGAATATAAGGTATAATAAAGAAAAGTTAACGCTAAAGGAGCGAGAATATGTTTCAAATTATAACAGATGCCTGCTGCGATTTATCGGCGGACTTGTTAGATAAGGATAAAATTGCTTACATACCTATGTTTGTTGAGTTAGAGGGGAAAGAATATACTGATGATCTTGGAAGAACTTTTGATAATTCATGGTTTTTAGATCAATTAAAAGAAAATAAACATCCAAAAACTGCACAAATTAATGTTGGTAGGTATATGGATTTTTTTAGACCCTATGCAAAAAAAGGAATATCTATTTTATACGTTGGCTTTTCATCAGGTTTAAGCGGCTCTTATGAAAGCAGTCTAAATGCAATTGAGTTATTAAAAGAAGAATATCCTGATTTTACGGTTACTAGCTTTGATACCAAAACTGCTAGTTTAGGCTTGGGGATGTTGGTAATGGAAGCAGCTCGTTTACAAAAAGAAGGTAGGACTTTAGAAGAGACCGTTCAATGGCTAGATATATGCAAAGAGCATCTGCGTTCCTGGTTTACTGTTGATGATTTGAAACATTTGGTGCATGGCGGTAGAGTAACCAAAGCACAAGCAGCGATTGGTGGTTTGTTAAATATTAAACCCATTCTTAATGTAGATGAGAAAGGCCAATTACAAAGTGTTGATAAAGTGCATGGACGTAAAAAAGCTTTGCAGAGAATGGTAGATGAAACAATTGAAGACCTGGATTTATCTATAGTTAACCATTTTTATATTGCTTATAGTGGTGATGAAAAAGCTTTAGAAAAAGTTAGTAAACAATTAAAACAACACTACCCAGAAACACCAATTACACGCTTTTCTTTAGGTCCTACGATTGCTAGTCATACAGGCTACGGTTGTGTAGCATTATTTTCAACGGGAAAAACAAAAAGATTTTAAAAAACAAGCCTCTCCAAATTCAATTGAAGGGGCTTGCTTTACTTTTATCGCATAATTAAGCATACAGTTGGTCCACACGTTCTTGTACAGCTTCATTTTCTAAAAATTCATCGTAAGTAGTATCCATGCGGTCAACGACACCTTGGTCTGAAACTACAATGACACGATTGGCTAATGTTTGTATAAATTCATGGTCATGGGAAGTAAAAAGCAATGAACCTTTAAAGTCTATTAGACCGTTGTTTAATGCTGTGATCGATTCTAAGTCTAAATGATTTGTAGGATCGTCTAAAAGTAACACATTAGCTTTAGTCAGCATCAGTTTAGATAATAGACAACGAACCTTTTCACCACCAGAAAGGACATTAACTTTTTTGTTAACTTCTTCACCAGAAAATAACATTCTTCCTAAAAAGCTTCGTAAAAAGGTATTATCATCTTCTTCTTTATCCGCATATTGACGCAACCATTCTAAAATAGTTAGATTGCTATCAAATTCATTACTAGCATCTTTTGGCATATAAGTTTGGCTTGTTGTAACTCCCCAACGCACGGTGCCTGTATCAGGTTTAGTATATCCGGTAATGACGTTTAATAAAGTGGTAGTTGCAATATCATCTTTAGCGATAAAAGCAACTTTATCATTTTTATTTAATGTAAAGGAAATGTTGTCTAAAATTTTCTTGCCATCAATTGTGACACTAACATTTTCTACTTGTAACAAGTCATTACCAATTTCACGTTCGGGTTTAAAACTGATAAAAGGATAACGACGAGAAGAAGGCTGAATATCGTCTAAAGTAATTTTATCCAACATTTTCTTACGCGAAGTTGCTTGTTTTGATTTTGAAGCATTTGCACTAAAACGAGCAATAAATTCTTGTAATTCTTTGATCTGCTCTTCTTTTTTAGCGTTGGCTTGCTGTTGTAATTTTGTAGCTAATTGGCTGGATTCTAACCAAAAATCATAGTTACCAACGTACAATTTAATTTTTCCATAGTCTAAATCAGCCATATGTGTACATACTTTATTTAAAAAGTGACGGTCATGAGATACGACAATTACAGTGTTTTCGAAGTTAATCAAAAATTCTTCTAACCAATTGATTGATGGAATATCCAAACCATTTGTTGGCTCATCAAGCAGCAAGACATCCGGTTTACCAAATAGTGCTTGGGCCAGCAATACTTTTACTTTTTGTCCTTCAGTCAATTCACTCATCTGAACTTGATGCATTGTATCAGGGATATTTAATCCTTGTAAAAGTACAGCTGCTTCTGATTCAGCTTCCCATCCGTTTAATTCGGCAAATTCAGTTTCTAATTCTGCGGCATGTATACCATCTTCATCTGTGAAACCTTCCTTCATATACAGTGCGTCTTTTTCTTTCATTACATCATATAGACGTTTATGTCCCATAATAACAGTTTCGATCACCGGAAACTGTTCGTAATCAAAGTGGTTTTGTTTTAGTACAGCCATCCGTTCATTAGGCCCCATACTAACAGTACCTGTGGATGGTTCGATTTCCCCTGATAAGATCTTTAAGAAAGTAGATTTACCGGCGCCATTAGCACCAATTAAACCGTAGCAGTTTTCAGGAGTAAATTTTAAATTCACGTCATCAAAAAGTTTGCGACCAGAAAAGTGCAAACTCACATTATTTACAGTAATCAATAAATTTCCTCGCTTTTTTCGTATTGGCCATTGTGGCCCTCAAGTTATTATAGCGATGAAACTGAAGTGTTTCAAGTCTGTGAGATAGATATAACGATTTTACAGTTAGTCTTAATATCTTATTAAAAAAGAACGAACAATTTAATTGTCCGTTCCATTTATTATCTTCTTGGTCTTCTACCTCTCTTATTTGTTAACCAGTAAATGACACCGCCAATGATTAATAACGGAATACCAAATTTAAAAACAAGATATAAAACGCCTGTGGCTAGGGATAAGAGTATTTTCAGTACTAAACTGGCTAAGACCAATCCGCCAATGATGATTAGAATATTTAAGAAATTTGAACGGCTTTTCATAATATGTCCCTCCTATTTTTCATACTAAGAATAGCAAAATTTTTCTAGGTTTACATCCGCCTCAAGCAGTAATTTTATTGAAAAACTATCTAAGGAGAAACGATATATGAATAATAATTTAAAAAATATACCTATTCATAAGTTTAATCTATCGTTTTAAACTTGCTGTTTCACGTGAAACTTACGCTCTAGTCTGACCATCGCCATAAATAATATATTTTATACTTGTTAAGGCTTCTAATCCCATAGGGCCTCTTGCATGTAATTTTTGTGTAGAAATACCAATCTCAGCGCCAAAACCAAAAACGAAACCATCAGTAAAACGAGTAGAAGCATTAACATAGACTGCTGCTGCGTCTACTTCATTTAAAAATTTTTGAGCAGTAAAATAATTATCGGTTACGATAGCTTCTGAATGTTTTGTATTGTATCGATTGATATGGGAAATAGCTTCCTCAGCAGAGTCCACTACCTTTATAGCTAAGATATAATCTAGAAATTCAGTGGACCAGTCTTCTTCTGTTGCTAAAGTTGCAGAAGGAAGATAATCACTAGCAATTTCGTCTGCTCGTAGTTCAATACCAAGTTCTATTAAGCGTTCTTCTATTGCTGGTAAAAAGAAAGCGGCCACTTCTTTATGAATCAACAGCGTTTCACATGCATTACAAACAGAAGGACGCTGCGCTTTAGCATTGGCTACGATATCTGTAGCCATATTTACTTGCGCGTCTTTATCAATGTAAATATGATTATTACCTGTACCTGTTTCAATAACAGGCACTTTTGCGTTTTCTTTGACATGCTTGATTAAGCCTTCTCCGCCTCTAGGGATCAAGACATCTAGAAAATCAGTTAATTGCATCATTTCATTAGCCGTTTCATGAGTTGTATCATCAATAAATTGAATTGCGTGAGAAGCAAACTGACTTTCTTCTAATGCTTCTTGTAAGATACTGACTAGTAACTGGTTAGAATGAAAACTTTCCTTACCACCTCTTAAAATAACAGCATTGCCCGATTTAAAACATAAACTGGCTGCATCAGTTGTTACGTTGGGACGTGATTCATAGATAATGCCAATAACGCCAATAGGCACTTGTTTTTGTCCAATTGTCAAACCTTCTTCGTTTTTCCACATATGTTTAATAGTGCCAATCGGATCGTTTAGTTGAACAACCTGACGTATGCCTGCAGCCATCGCTTCAATTCGTTCTTCTGATAGTCGCAGGCGATCTTTCATTACTTCTTTTATTCCATTTTCGTCTGCTTGTTCAAGATCTTTTTGATTGGCTTGTAAAATTTCTTCTGTGTTGTTTTCGATAGCGCAAGCCATATTTTCTAAGAGTTGATTTTTTTCTTTGGTATTCAAAAGAGCTAATTCAGTAGCTGCTTCTTTTGCTTGTTGTCCTAATGTTTGTAAATCTGTCAAAATGATTCCCCCTTAAACAAAGTACCAACCTCTGCACCTTTTAAAATATCAAAAATAATCTTAGGTCTTTTACCATTTGCTAATACCATACTACCATTCACATCTAAAACGCGTTTGGCTGCTTTAAGTTTACTAGACATGCCACCCGTGCCAAACTGATTGTTACTGGCGCCTGCTTGTTTCATTAATTCGTCATCAATTTTTGTAATTCGACGATGAAGTTTTGCTTGTTTATTTTTCAAAGGATTATCAGAATAAAAACCGTCAATATCTGAGAGCATAATGAGTAACTCAGCCCGCGTTAATTCACTAACAATAGTTGAAAGCCGGTCGTTATCTCCAAACTTTGTTAAATGATCCAACTCATCAACTGCTACCGTATCGTTTTCGTTAATAATAGGGATGATTCCCATAGCCAGCAGTTCTTCTAAAGTGTTTATTACATTATTACGGCTTTCAGGGAACTCTATAATATCTCTTGTTAAAAGAATTTGAGCTGTTTGTTGGCTGTACACTTGAAAACGTTGATTATAAATATCCATTAATTCTGCTTGCCCTACAGCTGCTACGGCCTGTTGTTGCGGAATTGAAAAAGGTCGTTGGTTTAACTGCAGTTGGTTTAATCCTACACCGATAGCACCAGAAGAAACCAAAATAACCTCTTTTCCTCGATTCTGCAAATCAGTCAATACAAAAGCTAATTCATCAATACTAGCTAAATTTATATTACCGTTTGGATAAATTAAGGTTGTTGTTCCCACTTTGATTACGATACGCTTTGGGTCTGTAATTTCCTTGTACATAATTTTCTCCATTTTTCTTTGGTTACTATATATTGTACTAACAAATAAGCTTTTCGTCATTTATTATACAAAAAATATTAGAGAAAATTTAGATTCGAAACTTCTTTACTGAATATTCGAAAGATTCAGAAAAACAATTGACATGTAGGTAACGTGGTGTTAGCTTATTGAATAATAAACTAAACAAGCGTTATTTGAGTTTGTATAACTTTAATAATTGGAAAAGTCAGAAAAATCAAATAGCTTTGTTTATTTACAAAAAAGTTATCAGAAAAAAGTATCAGTTGAGCCAACAGAAGAATAATAAAAAAGAAAGCTAGAGACATCTCCAGCTTTCTTTTTTATTATGATTTATATTCTTCTGTATCGTCCCAAGTTTGTACGGTTTCAGCTTTGATTGCATTATGCCAGTCAAACACATCATACCAAATCGTATGTTTCTTTTGGTCCATTTCTTGGATTTTTTGAACATCTTCATCAGATAACTCGAAATCAGCAATTTGGCTATTTTCAATAATACGTTTTTGATGAGTAGATTTTGGAATGGTGATTACATCTTGTTGGTAATTCCAACGTAAAATAATTTGAGCAGCGGTTTTATCGTATTTTTCTGCTAATTGATTTATAATTGGATCATTTAATGCTTCACCGCCACCTAATGGAGACCAGGCTTCTAATTGTATGCCAGTCATTCTTGCCATTTCGTGAATTTCTTTTTCTTGATTTAATGGATTGTATTCCATCTGGTTAATTGCTGGAGTAATGCTAGCATGATCAAGCAAATCTTGTAATCGTTCATTATCAAAATTAGAAATTCCAATAGCACGGATTAAACCGTCTTTGTACAATTTTTCCAAAGCATGCCAAGTGTCAATATAACGACCATCCACTGGCCAATGAATCAAATATAGATCGATATAAGTTAATTGTAATTCATGCAATGTATCATAAAAAGCACGTATCGTGGAATCATAGCCAGCGTCCCCGTTAAATACCTTTGTTGTAATAAATAAATCTTTTCGATTGCCGCCGGTTTCTTTTAAACCTTCACGGATTCCTTTGCCAACGCCAGCTTGATTACCATATTCTTTAGCAGTATCGATCAAACGGTAACCATTTTTGATTGCTTCAGTAACTGAGTTTTGTGCAGTGTGATTGTCTGTTTGCCATACTCCTAAACCAAAGTAGGGCATTTTTACCCCATTATTTAAAGTAGTCGTTTCATCTAAAATGTTTTTTGTCATTGATGTGATACCTGCCTTTCTTTTTTATTTAATTTTATCCTAACGCGTTGACTGAAAACTTGCAAAGATAAGCTTGTTTTATGAAAAAGTAATGCTTTTTTTGCTAATTCTTGAGAAATTTTTAGAAAACAATAAGACATTCAGTTTTTTTATCGAGATATGGTAAAATAGGCATAGTCTTTATGGAGGTTTTTTATGGAAAAAAGAGGATTTAAAGTAGTGACAGATTATAAAGAAAAAGAAATTCATTTACCACAACGAGCGACCCATCATTCTGCAGGATATGACTTTGAAGCTGCAGAAGAAGTGGTAATCCCAAGTATTTGGAAACAGCTTTTAACAAGGAAAATCAATGATAATCCAACAACAGAAAAAAATATTAAACCTGTTTTGGTGCCTACAGGTATCAAGGCGTATATGATGGAAGACGAATTTTTACAACTGGCAAATCGGTCCAGTAATCCATTAAAACGTTTTTTACTTGTGGCAAACGGTGTGGGTATTATTGATAGTGATTATTATAACAATTCAGAAAACGAGGGGCATATTATGTTCCAGTTTTCTAACTTTGGTTTAAAAGACAGGGTAATAAAAAAAGGGGAACGAATTGGCCAAGGGATTTTCTTGCCGTTTTTAAAGGCGGATCAAGATCAAACAACGCATGACCGTACAGGTGGGCTAGGTTCGTCTGACTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012047|15805:24295|18141_19764_-|WP_069028470.1|DBSCAN-SWA MITVNNVSLHFSGRKLFDDVNLKFTPENCYGLIGANGAGKSTFLKILSGEIEPSTGTVSMGPNERMAVLKQNHFDYEQFPVIETVIMGHKRLYDVMKEKDALYMKEGFTDEDGIHAAELETEFAELNGWEAESEAAVLLQGLNIPDTMHQVQMSELTEGQKVKVLLAQALFGKPDVLLLDEPTNGLDIPSINWLEEFLINFENTVIVVSHDRHFLNKVCTHMADLDYGKIKLYVGNYDFWLESSQLATKLQQQANAKKEEQIKELQEFIARFSANASKSKQATSRKKMLDKITLDDIQPSSRRYPFISFKPEREIGNDLLQVENVSVTIDGKKILDNISFTLNKNDKVAFIAKDDIATTTLLNVITGYTKPDTGTVRWGVTTSQTYMPKDASNEFDSNLTILEWLRQYADKEEDDNTFLRSFLGRMLFSGEEVNKKVNVLSGGEKVRCLLSKLMLTKANVLLLDDPTNHLDLESITALNNGLIDFKGSLLFTSHDHEFIQTLANRVIVVSDQGVVDRMDTTYDEFLENEAVQERVDQLYA >NZ_CP012047|15805:24295|21548_22355_-|WP_061840900.1|DBSCAN-SWA MYKEITDPKRIVIKVGTTTLIYPNGNINLASIDELAFVLTDLQNRGKEVILVSSGAIGVGLNQLQLNQRPFSIPQQQAVAAVGQAELMDIYNQRFQVYSQQTAQILLTRDIIEFPESRNNVINTLEELLAMGIIPIINENDTVAVDELDHLTKFGDNDRLSTIVSELTRAELLIMLSDIDGFYSDNPLKNKQAKLHRRITKIDDELMKQAGASNNQFGTGGMSSKLKAAKRVLDVNGSMVLANGKRPKIIFDILKGAEVGTLFKGESF >NZ_CP012047|15805:24295|15805_17098_+|WP_014123411.1|DBSCAN-SWA MSSVVVVGTQWGDEGKGKITDFLSENAEVIARYQGGDNAGHTIKFDDVTYKLHLIPSGIFYKEKTSVIGNGVVVNPKSLVEELNYLKEHGVSTENLRISDRAHVILPYHIKLDQLQEDAKGADKIGTTIKGIGPAYMDKAARVGIRVADLLDKDIFSERLKINLADKNRQFEKMYDDHAMAFEDIFEEFYEYGQQIKQYVTDTSVILNDALDRGRRVLFEGAQGVMLDLDQGTYPFVTSSNPVAGGVTIGSGVGPSKIDKVVGVCKAYTSRVGDGPFPTELFDEVGDQIRKVGHEYGTTTGRPRRVGWFDSVVMRHSRRVSGITNLSLNCVDVLSGLDTVKICTAYELDGKLIYHYPASLKELNRCKPVYEELPGWSEDVTNCKTLEELPENARNYLRRISELVGVRISTFSVGPDRNQTNILESVWSQI >NZ_CP012047|15805:24295|22699_23548_-|WP_050989791.1|DBSCAN-SWA MPYFGLGVWQTDNHTAQNSVTEAIKNGYRLIDTAKEYGNQAGVGKGIREGLKETGGNRKDLFITTKVFNGDAGYDSTIRAFYDTLHELQLTYIDLYLIHWPVDGRYIDTWHALEKLYKDGLIRAIGISNFDNERLQDLLDHASITPAINQMEYNPLNQEKEIHEMARMTGIQLEAWSPLGGGEALNDPIINQLAEKYDKTAAQIILRWNYQQDVITIPKSTHQKRIIENSQIADFELSDEDVQKIQEMDQKKHTIWYDVFDWHNAIKAETVQTWDDTEEYKS >NZ_CP012047|15805:24295|17216_18086_+|WP_014123412.1|DBSCAN-SWA MFQIITDACCDLSADLLDKDKIAYIPMFVELEGKEYTDDLGRTFDNSWFLDQLKENKHPKTAQINVGRYMDFFRPYAKKGISILYVGFSSGLSGSYESSLNAIELLKEEYPDFTVTSFDTKTASLGLGMLVMEAARLQKEGRTLEETVQWLDICKEHLRSWFTVDDLKHLVHGGRVTKAQAAIGGLLNIKPILNVDEKGQLQSVDKVHGRKKALQRMVDETIEDLDLSIVNHFYIAYSGDEKALEKVSKQLKQHYPETPITRFSLGPTIASHTGYGCVALFSTGKTKRF >NZ_CP012047|15805:24295|19925_20123_-|WP_069028471.1|DBSCAN-SWA MKSRSNFLNILIIIGGLVLASLVLKILLSLATGVLYLVFKFGIPLLIIGGVIYWLTNKRGRRPRR >NZ_CP012047|15805:24295|20304_21552_-|WP_069028472.1|DBSCAN-SWA MTDLQTLGQQAKEAATELALLNTKEKNQLLENMACAIENNTEEILQANQKDLEQADENGIKEVMKDRLRLSEERIEAMAAGIRQVVQLNDPIGTIKHMWKNEEGLTIGQKQVPIGVIGIIYESRPNVTTDAASLCFKSGNAVILRGGKESFHSNQLLVSILQEALEESQFASHAIQFIDDTTHETANEMMQLTDFLDVLIPRGGEGLIKHVKENAKVPVIETGTGNNHIYIDKDAQVNMATDIVANAKAQRPSVCNACETLLIHKEVAAFFLPAIEERLIELGIELRADEIASDYLPSATLATEEDWSTEFLDYILAIKVVDSAEEAISHINRYNTKHSEAIVTDNYFTAQKFLNEVDAAAVYVNASTRFTDGFVFGFGAEIGISTQKLHARGPMGLEALTSIKYIIYGDGQTRA >NZ_CP012047|15805:24295|23794_24295_+|WP_014123418.1|DBSCAN-SWA MEKRGFKVVTDYKEKEIHLPQRATHHSAGYDFEAAEEVVIPSIWKQLLTRKINDNPTTEKNIKPVLVPTGIKAYMMEDEFLQLANRSSNPLKRFLLVANGVGIIDSDYYNNSENEGHIMFQFSNFGLKDRVIKKGERIGQGIFLPFLKADQDQTTHDRTGGLGSSD |
8 | Staphylococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
135904 : 195083
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012047|135904:195083|DBSCAN-SWA 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51 | Streptococcus_phage(45.45%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
455511 : 529769
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP012047|455511:529769|DBSCAN-SWA 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58 | Streptococcus_phage(60.0%) | holin,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1285792 : 1353264
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP012047|1285792:1353264|DBSCAN-SWA 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60 | Staphylococcus_phage(17.65%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1551411 : 1613725
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP012047|1551411:1613725|DBSCAN-SWA 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60 | Streptococcus_phage(30.77%) | tRNA,transposase,protease,integrase | attL 1549545:1549561|attR 1598445:1598461 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1805296 : 1818219
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP012047|1805296:1818219|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP012047|1805296:1818219|1810685_1811042_-|WP_061840409.1|DBSCAN-SWA MSMDKRSLYDGLNEFEEDLQKLSQNLMEMKGSLQELVEKNATLELENQRLRERIHELSQQDAKLPEREKQELSRSRLNLEKIYEEGFHVCYDLYGARREHDEPCAFCLEVIYRDSSNK >NZ_CP012047|1805296:1818219|1807516_1808119_+|WP_061840406.1|DBSCAN-SWA MRNPKPKEWQAKDYSKNYIADYKPFNFVDGEGVRNSLYVSGCLFACEGCFNKAVQSFRYGQPFTQELEEQIIKDLAPEYVQGLTLLGGEPFLNTEVCLQVINHTKEVYGNKKDIWSWSGYTFEELLQDTDDKLEMLAKIDILVDGRFELSKKNLNLQFRGSSNQRIIDVAKSLEIGQAVIWEKCHDADTQYEQIKKQDLI >NZ_CP012047|1805296:1818219|1813186_1813840_-|WP_061840412.1|DBSCAN-SWA MDGLFITIEGPDGAGKTSVLNELFPRLQFASEKEMIKTREPGGGKIAEKIRELILDPAYEEMDDRSEVLLYAAARRQHIIDVISPALNNGKIILCDRFVDSSIAYQGAGRRVGIEEVAQINQFATEGLTPDFTLYLDVDSDTGLKRIQRSRGYQVDRLESEGLEFHQRVRHAYLKIVEQNSARVHKIDARTDLQDVVDQSFSAICTAYPDYFKEMVE >NZ_CP012047|1805296:1818219|1813869_1814466_-|WP_069029148.1|DBSCAN-SWA MQYPEPIARLIASYMNLPGIGQKTATRLAFYTIDMKDEAVNDFAKSLLSVKRDLTYCSVCGNITEDDPCELCADTTRDRSCVLVVEEPKDVMALEKMKEYQGLYHVLHGVLSPVEGTGPEDINIPNLIKRLENEEIKEVIIATNASTEGEATAMYLSRLIKPAGITVTRLAHGLSVGSDIEYADEVTLSKAVEGRTEL >NZ_CP012047|1805296:1818219|1814856_1816599_-|WP_069029149.1|DBSCAN-SWA MVYQALYRVWRSQRFDDVIGQEAITQTLKNAITQSQISHAYLFTGPRGTGKTSAAKILAKAVNCPNSVDGEPCNECEICRSITDGTQEDVIEIDAASNNGVEEIRLIRERANYAPTQAQYKVYIIDEVHMLSTGAFNALLKTLEEPKKNVIFILATTEPHKIPATIISRTQRFDFKRIDTKDIVDHLAYILEKNELSFEDEALNVIAQAAEGGMRDALSILDQAISFSDDTITLQDALEVTGSLTYDMMDRFILACKQENTVECLSLLDEMLASGKEARRLLENLLLYCRDLLVYQKAPKLLAEKAQHFTATFKQSAEEIAAQQIYSWIHILNQAQNEIRFTTSPRIYLEVATVKLSEGISTENSSSVDAAAQPADTQELVGLKEQVTALQQEVNQLKNRLEQPQKVQTKTQQHKEKKPASTGYRVPKKRVFKVLKEARKKDLVNVKEIWEDLLASLSVTQKAMLRASQPKAASPNGLVIAFDYEIICKKAANDQEFVLAVQNNISRMISDYVPDLVYITDESWPTLRQEFLSGHKEEADEDELTEQEEAKSTTTDEQKENLAVSKAQDLFGELATIKED >NZ_CP012047|1805296:1818219|1814527_1814839_-|WP_061840413.1|DBSCAN-SWA MKGMGNMQGMMKQVQKMQKDMEKEQEALNKKEFSGKATNGYVKVTATGDRTIKDVQIKEDVIDPEDPEMLQDLIVTAVNDCLENIDKETKQTMGKYTQNIPGM >NZ_CP012047|1805296:1818219|1809753_1810620_-|WP_069029147.1|DBSCAN-SWA MKKQKSYQDELGKLYLVPTPIGNLEDMTVRGVKILKEADLIASEDTRNTQKLLNHFKIEVAQKSLHEHNYKQRIPEILKLLKKGQTIAQVSDAGMPSISDPGQELVAACIQEGIAVISLPGPTAGLTALIASGLNVQPNYFYGFLPRRKKDQKAELKQLATIKATMIFYESPYRLKNTISNMNEVFNPQRNAVICRELTKIHEEYLRGTLAELKEYLTENTLKGECCLLVEGQLEQEVDRSLPQVPLKEQVEQFIATGLSPNDAIKEVAKQNKLKKQKVYNAYHELNK >NZ_CP012047|1805296:1818219|1811028_1811859_-|WP_061840410.1|DBSCAN-SWA MINVAGVRYHKAGPIDYFLAGDEKLLCGDKVLVEKKHLKAIANVVISNKEVTEKDLPGEIGSILHKATKEELSQDMKNRMDAQKALRIGKQKVDEYRIDMRLVDAEYTFERDKIIFRFTADKRIDFRELVKELASVFKTRIELRQIGIRDQAKIIGGIGPCGRQLCCSTFLGEFAPVSIKMAKDQGLSLNPSKISGLCGRLMCCLNYENEEYVQAKKELPDYGKAVMTPEGKGRVVGLNLLSRVVKVRLKSQQVPVEYDYEELKETLKAGDAHVDG >NZ_CP012047|1805296:1818219|1805296_1807492_+|WP_069029146.1|DBSCAN-SWA MTTKRTSEQSISLSSQLSDMKVIKRDGRLVHFNAQKIYDALLKAKKHLEGNLSPLDYEHINRIVEQVISEINYRFQQNVKIYEIQNIVEHTLLENHEYELAQEYINYRTQRDFKRSQATDINFSIDQLMGKEKTVVNENANKDSDVFNTQRDLTAGIVGKSIGLKMLPPHVANAHQKGDIHYHDLDYQPYAPMTNCCLIDFKGMLNNGFKIGNAEVEPPKSIQTATAQISQIIANVASSQYGGCSADRLDETLAPFAKLNYQKHLKEAKIWIEDPTRQKEFAMKKTKKDIFDAMQSLEYEINTLFTSNGQTPFTSVGFGLGTDWFAREIQRAILQNRINGLGSEQRTAIFPKLIFSIKNGTNLHPEDPNYDIKQLALECATKRMYPDILNYDKIVELTGSFKVPMGCRSFLQGWKNEQGEEVNVGRMNLGVVTINLPRIAMQAEGDIENFWKILDERLSIAKDALVYRVERCKQANPANAPILYMYGAFGKRLGREESVNELFKNKRATVSLGYIGLYEVASAFYGQNWESNEKAKNFTLDIVKKLKNNTDQWGDEYGYHFSVYCTPSESLTDRFCRLDTEKFGTVKNITDKEYYTNSFHYDIRKDPTPFEKLDFEKDYPKYCSGGFIHYCEYPVLQQNPKALEAVWDYSYDRVGYLGTNTPIDHCYECGFEGDFKATEKGFECPQCGNHDPKTCDVVKRTCGYLGNPQARPMVHGRHKEIASRVKHMGNE >NZ_CP012047|1805296:1818219|1811882_1812815_-|WP_061840411.1|DBSCAN-SWA MGEENFLAQSQPLVYSQMKKNVEHERLAHAYIFEGVSGSGKHDMALWLAKRLLCLNVNENQPCDQCVNCMRINEGEHPNVQVIEPEGQTIKVNQIRQLQEELSKSSFEKGTQISIVQEADKMNPSAANSLLKLLEEPVGDSIAILETNVLGQVLPTIQSRCQIVHFTPLAKEHLIKRLEEKDLGTNTANLIANLTNSYDKAVEISEDEWFNETRKIIAKWFDYLKKGDPQAFIFVQKKITAQAKEKQQQGMIFAMLLVYFQEERNHSLEDKQKTQRNNKILELILQAQKKLAANVAFQGIAEQLALRIID >NZ_CP012047|1805296:1818219|1816818_1818219_+|WP_061840414.1|DBSCAN-SWA MSHKFPDNFLWGASISAHQTEGAYKSDGKGLTVQDTRIRDNHEIADFTVASDHYHHYKKDIQLLAELGVKVFRFSISWARIFPQGRKEVNQAGIDHYQNVIDECLTHNIKPMITLNHFDLPQVLEDIGGWSNRKTVDAFKEYAQTVFKAYGNKVKYWLTINEPNIMLLVDQKILGKQIPIKEKYQQFHHLMMAEKYAFKFCHELVENGQIGPVPNISLVYPATSKPLDNQAALYFNSVRNWAYLDFSCFGRYNTVFKDYLKQKNISITFSPEDETVMKENFPDFIAMNFYTTMTVEKPMDKNNMSEGISDQQSEDIMDWGFYKGVTNPYLKKNQFNWTIDPDGFKTTLQTLYDRYHLPIIITENGLGAKDDLTEDKKIHDPYRIDYLKQHLEQALEAIEAGVDLFGYSPWSAIDLISVHEGISKRYGFIYVDRTEKELKQLRRYKKDSFYWYQKLIQTNKIPAESR >NZ_CP012047|1805296:1818219|1808572_1809700_-|WP_061840407.1|DBSCAN-SWA MNGLQFPLKNDTSRKVIHIDMDAFFASVEERDNPKLAQYPLVIARHPKDTGGRGVVTTANYKARKYGIHSAMSAQKAYELCPHATFVPGNHQKYREISQKIREIFHCYTDIIEPVSIDEAYLDVTNNKINSSSAIKIAKLIQHDIWQEVHLTCSAGVSYNKFLAKLASDYQKPRGMTVVTPDEAVDFLRGLPIEKFHGVGKKTVPKMHELGIYTGNDLYQKSEMELIQIFGKMGYSLYRKVRGIHNSPVQVTRERKSVGRERTYGKALTSEQECLSQLRIMAEQVTESLKKAQKHGKTVVLKLRYSDFETITKRATVQEYIYQKDDIFSQASLIFEEVAQVEKGVRLLGITMTNLDPLTYENIVLPLWETGDPYK >NZ_CP012047|1805296:1818219|1812857_1813190_-|WP_014124102.1|DBSCAN-SWA MKLVLAIVQDKDSNRLANEFIEANIRATKLSSTGGFLKAGNSTFIIGVEDERVEKTLGLIKKTCQSRKQYVSTPPMTLNVSLEGQVPYPVEVEVGGATVFVLPIEKFQQY |
13 | Streptococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
1938971 : 1947262
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP012047|1938971:1947262|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP012047|1938971:1947262|1938971_1940741_-|WP_061840799.1|DBSCAN-SWA MMANFYESYPTSWQTVKRLFSYLKNYKKILLLSLTMTIISTIMEVAAPIVMGSILNHVQSAMTSQTSLDFNYVLQTALLLTALYIFLALSKIIVERLLVRLSQSLIKIMRTEVSEKIKKVPFSFFDQHSTGDLLSRITNDVEAIGRNVQLSVSQIVNSMLMFAGIIIMMVFISPILFLVFFITVPLNILATKIIMGRSQKYFRAKSERLGAMVGYVEENFTGTDLIKAYNYQDQSNEEFRAFNDRLFDVSYRASFMAGILNPVMTFIGNVAYVLIAIVGGLLVVNGTIMVGDVLAFMQYSQNIRRPIDVIAEMANTLQETIASSNRVFQFLDAPEEVENTSHRIEGPIEEIKLDHIGFEYEQGQPVIRDLTLTVQQGETVAIVGHTGAGKTTLVNLLLRFYDVTRNQILINGIDIRTVPRDNLRSFFGMVLQDTWLTQGTVYDNILYGKVDATEDEVIQASKQAHAHHFIETLPNGYRTVLNEDATNISQGQRQLLTIARAFVSDPDILILDEATSSVDTRTEQLIQQAMANLMKGRTNFVIAHRLSTIVDADKILVMDQGDIVEQGSHKELLAKNGIYTELYNSQFSE >NZ_CP012047|1938971:1947262|1945396_1946005_+|WP_061840803.1|DBSCAN-SWA MNHFIGLVGTNSDNSTNRKLLQFMQKHFSDKATIELMEIKDFPIFNKPVANRLPEVVKKAAEKIEQSDGVIISTPEYDHSIPAALTNALNWLSYDVYPFVDKAVMITGASYGTLGSSRAQSHLRQILDSPELKARIMPSSEFLLGHSLQAFNEQNDLKDFDQVDKLDGLFKDFQVFVELTKQLTHAHEAHKKEAENFDWETI >NZ_CP012047|1938971:1947262|1942679_1944149_-|WP_061840801.1|DBSCAN-SWA MNSNEKDASFLGHPRGLSTLFFTEMWERFSYYGMRAILLYYMYYSVADGGLGFDRSTASAIMSIYGSLVFLLSVVGGYVSDRILGSRRTVFIGGIMIMLGHIALSLPFGKAALFASIILIVLGSGLLKPNISEMVGDLYDKKDLRRDAGFNIFVFSTNLGAFIAPLFVGYLGQEVNFHLGFSLAAIGMFFGLIQYFRGGRKYLPEETLKARDPIKSEEVKPLVRKSLLVIAAVAVLILFMQLAGILDINNVINLITIFAVVIPIYYFVIIIKSKKITTTERSRVWAYIPLFIASILFWSIEEQGSVVLALFAEERTNLSLFGFTIPSSWFQTLNPFFIMIYTPLFVWLWTKLGNKQPSSAKKFTYGLFFAGISFLWMMLPGILFGTDAKVGPQWLLMSWGLVIIGEMLISPIGLSVTTKLAPKAFHSQMMSIWFLSDAVAQAINAQIVRLYSPGTEVLYFGMVGVITVAFGVMLMFMVPRIQRLMNGVN >NZ_CP012047|1938971:1947262|1944492_1945197_+|WP_069029201.1|DBSCAN-SWA MIYIMGTIAAGKTSLAKILAKDLNSAIYYEDIENNGLILNMLEKFYSLGKESRKSNGAILQMAFLTFRYQQLRQAITQQNAVMDSSLASDFVMASQLHEHGEIADEDFNVYVTLSQEMQANVNGIPWNGLPDLVIYLKIDSEHAINEIQKRGREMESIEREPELIDYYHRVHHAYEKWADGYPSAILLTIDREKYDYVNNIENRNEVLNLIETKLKDLGKLSPKTFKKIKQRRE >NZ_CP012047|1938971:1947262|1940737_1942450_-|WP_061840800.1|DBSCAN-SWA MSVFKDFKRYKFLVLIVLILTFANTIGELLLPKMMSQIIDVGVTDQNISYILRLGTLMIGVTLITILVRASAAYFSAKTSMLFSRDLRKRMFNKVNRMTFDETEYFSISSLITRTTNDIAQIEQLVLMGLRPLARAPLTFIGGLFMAFTTSVRLSMIVFVSLPFLAIVLYFVIKVVVPYFPRLQKALDHINLLLRQRLTGLKVIRAFSRDKQEEESFEDANDKYYQIGLKVNKVMQTINPILTLILNLSIVATLLLGVRFVQQGTLSIGALMAFVQYITQVLNAVIMVTRMMTMLPRSVASIDRVKAVLNYPSRSVGGSNVLNEPITSVKAQDLTFYYPDANLPALENLNFSVYKGEVMGIIGGTGSGKSTLLKLFMQFYDPSEGKLLINDQAIDTLNPESVREKISYVPQQNYFFSDSVRGNLFYSNPDASDEKMLDSLETAQAMQFLPKEKPLEKTVARGGRNYSGGQRQRLAISRALTRPASLYVFDDSFSALDYKTDYELRLALQGKLNDAATIIVAQRVATIRHANKILVLENGKVQGLGSHDELMQSNQIYREIAISQGEEEDV >NZ_CP012047|1938971:1947262|1946023_1947262_+|WP_061840804.1|DBSCAN-SWA MKLVGIVGSNADFSYNRLLLQYIKKHFKSLVDIEILEIKDIPLFNQSLDQTDNAPIQKLNRKILNADGVIIATPEHNHTIPAGLKSVLEWLSFKIQPLSNKPVMLVGASYYNQGSSRAQLHLRQILEAPGVNAIVMPGNEFLLGEVKEAFDEQNNLKDQGTVDFLKTCLEKFINFIQVLSSMNEPQKDLSEEEDLEATGKIDTTIEGIDMSAEDWVEQASAKVDAAEGDTYVKLNRGVLTVNQLNALLASMPMELTFADSNNQFLFYNYTEDKAEMFAGRVPGQVGNPLANCHPPATYKNVKWVLSQLRHGKRDVVRIHVPTHGPDKYVVHSYQAMHDDSGNYMGVNEYVLDFQPIIDWYLQQTGQRLAKDETVEVDATSSASTTQSEQADSVSGASEKASVDSVSSASVKA |
6 | Lactobacillus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
1957707 : 1966111
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP012047|1957707:1966111|DBSCAN-SWA 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ATTCCGTATGGTGACTGGAATCTTCTAATGTTCCTTGATTATGGGGATGACTGGAATGATCCAAAATCACTTGACGATATAGATTTTCTAATTTAGAAAGTGCCATTTTTAAAAAACTCCTTTGTCACTTTAATCGCCTCTACTAAACGATCTGCATCTTCCTTTGTATTATATAGATAAAAACTTGCTCTGGTAGTAGCTACAAGGTCTAAGTATTCTAAAAGTGGCTGAGCACAGTGGTGGCCCGCGCGAACGGCCACACCTTCCATATCTAGCGCGGACGCTACATCATGCGGATGTAAACCATCTAAGTTAAAAGCGATCACCCCCGTATGGTCACGTGGCTTCTGTGGTCCATAAATCGTCAAGCCATCAATTGCTTGTAATCGTGGTAAAACATAATTCACCAACTCTTTTTCGTGCTGATAAATTTCTGCTAAGCCAATTTTAGTTAAATAATCAATTGCGCTAGCCAGCGCAATACTTCCCGCAATATTAGGTGTCCCTGCTTCAAATTTCCAAGGTAACTCTGTCCATGTGCTTTCATAAGGATGTACAAAGTCAATCATTTCGCCGCCAAATTCTACTGGTTCCATTTGCTCTAACCAATATCGTTTACCGTACAATACACCAATTCCTGTTGGACCACACATTTTATGACCTGAAAAAGCATAAAAGTCAACGTCAAGTTTTTCTACATCAACCGGCATATGAGGGACAGCTTGTGCCCCATCCACTGCGATTACAGCTTGGTGTTTATGAGCTAATTGTGTCAATTCCTCGATTGGATTGATCACACCTAACACATTAGAAGCGTGAGCGATGGCTACAAGTGCCGTTTTGTCTGTAATTTGTTTTCTAGCTTCAGCAATATCCAAAAAACCATCTTTTGTTAAAGGGATATATTTCAGCACAGCGTTCTTTTTTTTAGCTAACTGCTGCCAAGGGACGACATTGGAATGATGTTCCATATAGGAAATAACAATTTCGTCTCCTTCATGGATAAAAGCATCGCCAAAACTTTGTGCTATCCAATTCAGGCTAGTCGTCGTTCCTCGCGTAAAAAGAACTTCAGCTATCTCATGTGCATGAATCAACTGGCGTACTTTTTCACGTGCTGCTTCATACTTTTTTGTAGCGCGTTCTGCTAAGGTATGCACCCCTCTATGCACGTTTGCATTAGCTTTATAATAGTAGTCTTCAATCGTTTGCAAGACAGCTTTGGGCTTTTGCGTCGTAGCAGCATTATCTAAATATACTAATGGTTCATCATTGACTTTTTGGTCTAAAATTGGAAATTCTTCTTGCAAGCTTTTAGCATCTATCATGCATCTAACTTCCTTTCAATGACAGCAATCAACTCTTTTTCTACCTCTTTTACAGGAATTGAACTTAATACAGCACTTAAAAAGCCGCGAATGACTAATCGTTCTGCTTCTTCTTTTGCTAAACCACGACTCATCAAATAATACATTTGTTCAGGATCCACTCGTCCAACACTAGCAGCATGTCCTGCTGATACCTCATTTTCATCGATCAGTAAGATCGGATTTGCATCACCGCGTGCTTTATCAGAAAGCATCAACACCCGACTTTCCTGTTGCGCATCCGAGCCTTTTGCACCTTTTAAGATATGACCAATACCATTAAAAGTTAAAGTAGCGCGATCGCGGATAACTCCATGTTGTAAGATATGTCCAATCGAGTGGGGCGCTTTATTGGTTACTCGCGTATCGATTGCTTGTTTTTGATCACCTGCACTAATAACAACTGCTTTGACTTCTGCGTGAGAACCTTCTCCTTCCAATTCAGAATCAAAATCCCCAACAACGTCGCCTTCATTCATAATACCCATTGCCCACTCAATCGAAGCATTACGCATTAAATATCCACGTCGTTTGATATAACAAGAAAGATTTTCTCCTAATTGATCAATACCGGAAAACTTAATTTTGGCTTCATTTTTTGCAATCACCTCAACAATAATATTACCAGATATTTTTTGTGCATCATTACCTTCTGATATATACCGCTCAAGATAACTAAATTCGCTATTTTCCTCTGCTACGATTAATACATGTTTGTAAAAATGAGCACTCGCATCTCCATTATGATGGAAAATCACTTCAACTGGTTGTTCAATCACCACATTTTTAGGAACATACAAAAACAAACCACCATTCATAAAAGCTGCATGAGCAGCTGTTACTTTATCTTCATCCATTAATACGCAGCTTGTCATATAATATTTTTTGACTAAGTCAGGATATTTTTGCATAGCTGTAAATATATCAGTTAAAATAACACCCTTATCTACTAATTCTTGGGGTAATTGTTCAAAAATAACGTTATCATCCTGTTGAACTAAAACAGGACCTTCTTTTTTTTCATTAAAACCAGAAGTACTATCACTTATCGGTTGTTCTGTTGTTAAACTTTTTGCATCAATATTAAAAAGTGGCCAACGATCATAACGCACTCGTTCAATCCTTCGCAAATCTAATTCATCTACTTTTTTTAACGCAGCTTGTCGCATTTCGCGCATCCAATTAGGTTCGTTTTTACGGGATGAAAAAACGTCAATCGCATCAAGATGATTCATTAAACTTTTCTTCATGTCACTTGACCTCCTTACGCTTCTTCTTCCTGATATTCAATACCTAATTCCTTACTAATGCCTGAATAGCCTTCATTTTCCAAGCGTTTTGCCAGTTCCGCATCCCCAGTCAAAGCAATTTTGCCATCCATCATAATATGTACGACATCAGGTGTAATATAGTTTAACAGCCTTTGATAGTGAGTAATAATCAAAGCGCCAAAGTTTTCTCCTCGCATAGCATTTACACCTTTAGCAACCACTTTTAACGCATCAATGTCAAGCCCGGAATCGATTTCATCTAGAACCGCAAAAGTTGGTTCTAACATCAAAAGTTGTAAAATCTCATTACGTTTTTTCTCCCCGCCAGAAAAACCTTCATTCAAATAACGTTCAGCCATTTCTTCAGGCATATTCAATAATTTCATCGTCTTATCCAATTTTTTTATAAATTGCATAACTGGGATCTGATCTTCTTCTGCGCGTTTGGCATTAATTGAAGCTCTCATAAATTCGGCATTCGTGATACCAGGAATTTCACTAGGATACTGCATGGCTAAAAATAAGCCTAAACGCGCACGCTCATCTACTTCCATTTCTAAAACGTTTTGACCGTCATATAGGATTTCTCCTTGGGTAACTTCATAATTAGGGCTGCCCATGATGGCAGCTGATAGTGTAGATTTCCCAGTCCCGTTAGGCCCCATAATCGCATGAACTTCGCCTGTATTAAGCCTAAGATCAACCCCTTTTAAAATTTCTTTATCTTCAATGGATACATGTAAATCTTTTATCTCTAAAACGGACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP012047|1957707:1966111|1959559_1961299_-|WP_061840811.1|DBSCAN-SWA MVKKLLSCVEEYKKTTALSMFLVIFESFIEILIPTLMAIIIDEGISQGRTSVVWQLGILLILLALLGLFIGALSGRYAAIASAGFAKNLRKTLFFNVQKFSFSNIDKFTAPSLITRMTTDVTNLQNAYQMLVRIMIKSPVQFSFAIIMSALINPNMVLIFIGIAPFLAGTLIFIGRKVHPIFERVFRSYDHLNNIVQENLHGIRVVKSYVRQAFEIQKFQNISQIVYKRFSKAEKLLAFNQPLMQSTAYICILLISWVGAHLIVGQTMSTGELSSLFVYTFQILISLNMFSMVFVMFLISRASAQRVVAVMEEESDLKNNDVALTTVADGRVHFHHVFFQYPTALNHRVLKDISFSAETGETIGIVGGTGSSKTTLVQLIPRLYDVTDGQVELAGRDVGDYDMDALRQNIGVVLQNNILFSGTIMENIRWGNPQASKQEVRNACIMAQADEFIQELPDGYQTYIEQGGSNVSGGQRQRLCIARALLKQPKVLILDDSTSAVDTKTESKILETFRTKLPYTTKFIVAQRITSVQDADKILVLDNGEITDIGAHNQLLQTSAIYQEIYEAQTKGFGEADAK >NZ_CP012047|1957707:1966111|1961527_1962232_-|WP_069029205.1|DBSCAN-SWA MSELNDLLHAANKVVFLTGAGVSTASGIPDYRSKNGLYATGGSPEYLLSHACLINEPEKHYDFVINNMIHPEAEPNVIHEKMASFTQKGNTDIVTQNVDGLHLAAGTDPQHLVEFHGDISHVYCQKCGRSATMEEYLASMYHKNCGGILRTNIVLYEEAIDTQKVEKAVKAISEADLIVVVGTSFVVFPFASLVQYASPNATMLAVNRDPISLPANGKMITGDAVKAFEQVQVD >NZ_CP012047|1957707:1966111|1962338_1962812_-|WP_061840813.1|DBSCAN-SWA MALSKLENLYRQVILDHSSHPHNQGTLEDSSHHTELNNPTCGDVIHLELQTEEGVIKDIAFSGHGCSISTASASMMTEIVKGKTIEEAMGLAEDFSLLVQGKDVKDIEMLGDAGMLSGVSKFPARIKCATLSWKALKKAIEESETGVAETGFIKHED >NZ_CP012047|1957707:1966111|1957707_1959570_-|WP_069029204.1|DBSCAN-SWA MQNNKILAPLLRILTYIWRDYKLILMLVILFVLLSTGANTLGSLFIQQVVDDYITPLLSQSNPVYTGLLKIILVMASIYLIGVIASLLFNRLMVTVSQGTQKNIRDDMFAKMQSLPIRFFDETPSGDIMSHYTNDIDTLRQMISQSIPQVFQAATQMLGVFIAMLTLNVPLTFVVLFTVILIYLVVKKIAGLSSRYFVYQQRSLGEVDGYIEEMTFGQKVVKVFTHEEASKQGFVRKNNRLFEDASKANQLANILLPIMINLGNLQYVLIALIGGLLSINGMITLSIGTLIAFLQLSRSFSGPLNQISQQVNFIVMALAGAARIFELIDTAPEEDHGKVTLVNVDKQGEQLEESSFRTARWAWKQVRSDGSVQYTEVKGNINFAHVTFGYKENQTILHDISLYAYSGQKVALVGATGAGKTTVTNLLNRFYDIDRGTIFYDGIDITKIKKADLRRSLGIVLQDTNLFSATVRENIRYGNLEATDKQVEEAAKLANAHHFIEELSDGYETLISGQESNLSQGQQQLLSIARAALANNPVLILDEATSSIDTLTEKLVQNGMDSLMKGRTVFVIAHRLSTIQNSDVIVVLDHGQVIERGTHDQLIQNKKTYYQLYTGKLELS >NZ_CP012047|1957707:1966111|1962798_1964034_-|WP_061840814.1|DBSCAN-SWA MIDAKSLQEEFPILDQKVNDEPLVYLDNAATTQKPKAVLQTIEDYYYKANANVHRGVHTLAERATKKYEAAREKVRQLIHAHEIAEVLFTRGTTTSLNWIAQSFGDAFIHEGDEIVISYMEHHSNVVPWQQLAKKKNAVLKYIPLTKDGFLDIAEARKQITDKTALVAIAHASNVLGVINPIEELTQLAHKHQAVIAVDGAQAVPHMPVDVEKLDVDFYAFSGHKMCGPTGIGVLYGKRYWLEQMEPVEFGGEMIDFVHPYESTWTELPWKFEAGTPNIAGSIALASAIDYLTKIGLAEIYQHEKELVNYVLPRLQAIDGLTIYGPQKPRDHTGVIAFNLDGLHPHDVASALDMEGVAVRAGHHCAQPLLEYLDLVATTRASFYLYNTKEDADRLVEAIKVTKEFFKNGTF >NZ_CP012047|1957707:1966111|1964030_1965323_-|WP_061840815.1|DBSCAN-SWA MKKSLMNHLDAIDVFSSRKNEPNWMREMRQAALKKVDELDLRRIERVRYDRWPLFNIDAKSLTTEQPISDSTSGFNEKKEGPVLVQQDDNVIFEQLPQELVDKGVILTDIFTAMQKYPDLVKKYYMTSCVLMDEDKVTAAHAAFMNGGLFLYVPKNVVIEQPVEVIFHHNGDASAHFYKHVLIVAEENSEFSYLERYISEGNDAQKISGNIIVEVIAKNEAKIKFSGIDQLGENLSCYIKRRGYLMRNASIEWAMGIMNEGDVVGDFDSELEGEGSHAEVKAVVISAGDQKQAIDTRVTNKAPHSIGHILQHGVIRDRATLTFNGIGHILKGAKGSDAQQESRVLMLSDKARGDANPILLIDENEVSAGHAASVGRVDPEQMYYLMSRGLAKEEAERLVIRGFLSAVLSSIPVKEVEKELIAVIERKLDA >NZ_CP012047|1957707:1966111|1965337_1966111_-|WP_014123956.1|DBSCAN-SWA MSVLEIKDLHVSIEDKEILKGVDLRLNTGEVHAIMGPNGTGKSTLSAAIMGSPNYEVTQGEILYDGQNVLEMEVDERARLGLFLAMQYPSEIPGITNAEFMRASINAKRAEEDQIPVMQFIKKLDKTMKLLNMPEEMAERYLNEGFSGGEKKRNEILQLLMLEPTFAVLDEIDSGLDIDALKVVAKGVNAMRGENFGALIITHYQRLLNYITPDVVHIMMDGKIALTGDAELAKRLENEGYSGISKELGIEYQEEEA |
7 | Bacillus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
1979435 : 2026880
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP012047|1979435:2026880|DBSCAN-SWA ACTAAGCGATAATCGCGCCATTAGGCATTCCTTTAGGTGCTTCAACAATTTTTAATCTGCCAGTTTCTGGATCTTCTGCTGAAAGAATCATTCCTTGGCTAATTTGACCTCGCATTTTCCGTGATTTTAAGTTAGCAACAATGACTAGCTTACTGCCAATTAACGCATTGGGATCAGGGTAGAATTCAGCAATGCCTGACAAAATTTGCCGATCTTGATTGTCACCACAAGCCAAGCGGAATTTTAATAGTTTATCAGCATCTTCCACTTTTTTACAATCAATGACTTCTGCCACTTTTAATTCAACTTTATCGAAGTCTTCATACTTAATTTGTTTATTTTTTTCTGAGGCAAGTTCAGTTTCTTCTGGATTCCATTTCACAGATTCATCGTTGGTTTGTTTACCTTCTGCCATTTTATTTTGAATATAAGCTACTTCAGTCTCTGCATCTAAACGAGGGAAGATAGGATCCCCTTTACTAACGACCTTCGTGTCATGAGGAAATTCACCAAAACGTAATTCTTGCAAGCCCTTAGGTTCTTCATCTAAACCTAACTGTTTGAAGATTTTCGTTGACGTTTCAATCATAATAGGCTGCAAAAGAATAGCCGTGATTCGAAGGCTTTCAGCCAGATGAACCATCACACTGTTTAATTCTGCTTTTTTATCCTCTTCTTTGGCTAGTTTCCAAGGTTCTGTTTCATCAATATATTTATTCGAACGAGCAATCAGTGTCCATACTTCCGAAAGAGCTGTACTAAATTCCATATCATCCATGGCTTCACGATAACGTCCAACCACGTTAGCAGCAGTAGTCGATAGTTCGCTATCATACGGCGTTACCTTAGAAGCATAGTCTGGCACAACGCCCTCACAGTATTTGTTGACCATAGCTACCGTCCGGTTTAATAAATTACCTAAATCATTCGCTAAATCATAGTTCACTCGTGAAATAAAATCTTCTGGTGTGAAAATACCATCGCTTCCAAAAGGCACAGAACGCAAAAGATAGTAGCGTAAAGCGTCTAGCCCATAACGTTCGACTAACATTTCAGGATAAACAACATTACCTTTTGATTTAGACATTTTACCGTCTTTCATTAACAACCAACCATGAGCGAAAACTTGTTTAGGCAAGGAAAGACCTAGTGCCATCAACATAATTGGCCAATAGATCGTATGGAAACGTACAATTTCCTTTCCTACCATGTGAACATCAGCTGGCCAAAATTTTTCAAAATTTGTTTCGTCTGCTGAACCATAGCCTAAAGCAGTGATATAATTCGTTAAAGCATCGATCCAAACATAAACCACATGTTTAGGATCTGAACTTACTGGAATCCCCCAATCAAATGTGGTCCTTGAAACCGCTAGATCTTCTAATCCTGGCTCAATAAAGTTTTTAAGCATTTCATTTTTTCGTGACTCGGGACGAATAAATTCAGGGTGTTCTTCATAGTATTCCACCAAGCGATCCGCGTATTTACTCATGCGGAAAAAATATGACTCTTCTTGAATCAATTCGACTTCATGACCACTAGGTGCTTTTCCACCAATGACATTTCCTTGTTCGTCACGATAAACTTCTTCTAATTGCTTTTCAGTGAAAAATTCTTCATCTGAAACAGAATACCAACCTTCGTATTCACCTAAATAGATATCGCCTTGATCTAGCAATTGTTGGAAGATTTTTTGAACAGCCTTTTCATGATAATCATCCGTTGTACGGATAAACTTGTCATAACTAATACCTAAAGTCTTCCATAACTTTTTAACATCTGCTGCCATTTTATCAACATAATCTTGGGGCGCTACGCCTAATTCTTCAGCTTTTTGTTCAATTTTTTCTCCATGTTCATCTACACCCGTCAAATAAAATACATCAAACCCCATTAATCGTTTATAACGAGCCATCGCATCACAGGCGATTGTTGTATAAGAATTTCCAATATGTAATTTACCACTAGGATAATAAATCGGTGTAGTAATATAAAATGTTTCTTTTTCCCCCATGGGTAAAAGTTCCTCCTTTAAAAAACACGTTCATACTTTTGATAGTATAACATAATTTTACTTGCTTTGTTTTATTTTTTCTATGCTGACTTCTTATTTTCTTATAATTAAAAAATACTTTTTGAGTTAAAAACAACATTTGCTATAATGTATTTAGTCTAATTTTTAAGGAGCTCTTATGAACACAAAACAAAAAAAATCTGTTATTATCAGTTTTATACTTACTATTTTGCATGCTTTATTTTGTAACTTTTACACGCAAATCTACGCTTTCATGAATGTACAAAATTGGCTTTCACTATTTATAGCCCTTACACTCATTTTACGGTTGTTACTTTTGCTTGCTTTATTTTGGCTAGGTTTGCGCTCAATACAAAAAAATAAAAAAATCGCTTTGTTCTATATACTCTTATTTTTCTTTAACTTAGTCATGTCTTTTATTTTTTATTAAAGTTACTTTTTTATATGCTACAATACAAACGATATTAACGCAAAACATTATAGCTGTATATTTTAAAGTGAGGGAAAGCTATGGAATTCTCTTCTAAACAAGAAGAAAAGCATTATTATCAACATATCGCAAGTGAACAAGAATTTTTAGAATGGTATAAAAACCAAGAACCTCCAATGTATCAAAAGCCTTCTGTTACAGTCGATATGGTTTTACTTTGTTATAACAAAAGTACCGATCAAATTAAGGTCTTATTGATTCAGCGACGCGGAAATCCTTATCGTAATTCATGGGCTTTACCAGGTGGTTTTATAACCCCTAACGAATCAACAGGCGATAGCGTCATTCGCGAAACAAAAGAAGAAACCGGCGTTACGATTTCTGAAAAAAATATCGAACAACTACATACTTTTAGTACACCTGACCGTGACCCACGAGGTTGGGTAATCACCGTTAGCTATTTAGCTTTTATCGGAGAAGCAATACTTTCGGCTGGCGATGATGCAAACCAAGCACGTTGGTTTTCTTTAGAACGTAAGAACAATCGTCTTCACCTTACAAGTGGCGATACAAAAATTATTCTTGATCTAAAAACCCAAGCATCTTTAGGAGAAGATACCTTGGCATTTGACCACAGTCAAATTATCATCAAAGCTTTTAACCGCATTGTAAACAAAATGAACCATGAACCACAAGTGCTGCAAGTTTTGGGGGATACTTTCACAATCACAGAAGCGCGTAAAGTTTTCGCCAAATTTCTAGGCGTAGACTATCACGCCATTGATCATTCAAACTTCAAAAAAAGTTTAATCGGATTTTTAAAGGAAGTTGGAGAACGACCTGCCAGCATAGGCCGTCCTTCAAAACTTTATCAGTTAAAAGAAAATTTTCGTGAAAAATAAAAATGCCTATTCGTTATTGTGTAAACCAAAAATAACGAATAGGCATTTTTACAAACTTATTTAAAAAAATATAGTGTAGAGCAAATCAAAGAACATGTATTAAACTAGTTGCAATACTGAAATAAAGCATTAATCCTAAGGCATCATTGATTGTAGTAATAAAAGGGCCACTAGCTACAGCTGGATCTACATGCAGCTTATCTGCAATCGCAGGAATAACAGCACCTACTACAGTAGAAAACGATATAGTAAATAGCAAAGAGAAGCCCACAATAAATGCTAAAGTTACATTTTGATAAAAAATTGCTATTATTAGGAAGATAACAATCGCCGCGGCAATTCCTATTAATATCCCAGCGCCAAACTCTTTTCTAATCGTCTTCCAAAGGCTTTGTTTTTCATCTTTTTCTACATTTAAATTTCGTACGGAAACAGCTAATGACTGCGTGCCTACATTGCCTGCTGTATCCATCATCACAGGAATAAATGCGGCAAGTAACACAACCGATTCTAATGTCTCTTCAAAAGAACTGATTAACCCGCCATTAAGCATACCAAGAAAAATCAAAATAACAATCCAAGGCGTACGTGCTTTGGCTTTCTGTAATGCACCTTCTTCTTTAGGTTTATTACTACGACGAATGGCGGCAATATCTCTAAAATCTTCTGTAACTTCGTTTTCAAGTATGTCCATGACGTCATCAACTGTAACAATACCTATCATAGTATTATCATCTTCAACCACAGGGGCTGCTAATAAGTCGTAGTCTTGTATGACTCGTGCAACCTCTTCTTGGTCCATATCAACTGGTACAGAAACTATTTGTCTAGACATAGTATTTTGCATAATTTCCTCTTCAGGCGACAGAATCAAATCACGTAAAGACAAAACGCCCACTAAATCAGCTTGATTGTCCAATACATAAATATAGTAGACCGTTTCTGCATGATTACCAACTTGCCGAAGAAAAGCAATCACTTCACTCGCCGTTTGATTTTGGTTCACTGAAACAAATTCTTTAGTCATTATCGATCCAGCAGTTTCAAGCTGATAAGACAACAACTCTTCTACTCTCACACGTTTTTTTTCATTCATCAAACCCAATGGATAACTTTGCTCTATATTGGCAGATTGTTTTAAAAATTTCACTACATCATCTGTGGGCATGGTATTAAATAGTTTTGCTAAAAATGCTTTTGGAAAATAGTTAACAACATACTCTTGATCTTCAATCGTCATCCATTCAAAAAGATCTGAAAATTCTTCTGGGGTCAAAAAATTTGCGATCATTTGTTTTTTTTCAGGATATAATAGATGAAATACCTCATGTTGATCACGATCATGTAAGCGTAAAAACAACTTACGAAATGATTTACGATCATTTTTCTTTGCAGCACGATAAATTGCGTCATAGTATTGGTTTTTATTTAACTTAAGTTTTTCCATTTCTATTCCTCCTCTAAGCTAAGGAGAAGTTACAGTGCTCGTTTTCCAGCTAAAAACTCAATATTATGCTATGCATCCTACAAAAGTATTTACCTCCTTTTCTGTGTCACATAATAAAAAACACGCTACTAAGAGCGTGTTTACCTTACGATATTGGATATATTTGCAAAGCACACCTCTTCGTTG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42 | Enterococcus_phage(17.65%) | head,terminase,transposase,capsid,portal,tRNA,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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