CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP016630	Lactobacillus johnsonii strain BS15 plasmid LJBSp1, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP016400	Lactobacillus johnsonii strain BS15 chromosome, complete genome	1 crisprs	DinG,RT,c2c9_V-U4,csn2,cas2,cas1,cas9,DEDDh,cas14j,cas3	0	23	8	0

1. NZ_CP016400

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP016400_1

• CRISPR_ID: NZ_CP016400_1
• CRISPR_location: 503558-505706
• CRISPR_type: TypeII
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 32 spacers
• Cas_protein_info: csn2,cas2,cas1,cas9

Consensus repeat of NZ_CP016400_1

Consensus_repeat	Method
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CRT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CRISPRCasFinder
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	PILER-CR

spacers of NZ_CP016400_1

>1.1|503594|30|NZ_CP016400|CRT
AATGGGACACACCGTCATTGGCGATGTAGT
>1.2|503660|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder
TTATCGATTGGAGAACTATAAGTAGCAACT
>1.3|503726|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder
CTTTATTGAACCTTATGTGTATCATCAGTT
>1.4|503792|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder
TTGAGGATTGTCGTACTTATTGGAAACAAA
>1.5|503858|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder
TCTTACTCGCTCTAAGGTTGTGACGATTGT
>1.6|503924|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder
TACCTACTGGTTCTCCTCAATTAATTTCTT
>1.7|503990|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder
TGTCGATAAATATCGACTTAGCATATCCAG
>1.8|504056|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder
AAGATGATGTCTAAATAGCTAGCCTTCTTA
>1.9|504122|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder
CATAATGAGTAAATCTAACTGAAGATACAG
>1.10|504188|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder
CCTTGTGCGGAGTTCTAGCGAGAGTTGCAT
>1.11|504254|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder
TGTTAGCAAGGCATAATGCCCTACGTTTCC
>1.12|504320|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder
CTTTGACGAATTTCCTGAAATCGACTTTGA
>1.13|504386|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder
CAAAAGCACCTTGCGGTTTCCAATCTGGGC
>1.14|504452|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder
AGGTCGAAGTAATGTTGTCAAATTTTATCT
>1.15|504518|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder
CCAAAGTGGAGCATCAACATTATCTGAATA
>1.16|504584|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR
TTATCACTACATCAAAGATAAGATTGGTGT
>1.17|504650|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR
AACTCAAGACACTAAACACTTATATACATA
>1.18|504716|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR
TTTCTTTGACCTCTTTTCTTAACTAACTCA
>1.19|504782|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR
CTCTAATCCGCCAAAATAATCTAGAACCTG
>1.20|504848|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR
AAAATAGTAACTCAACATGCTTACGACTAA
>1.21|504914|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR
CATGGGCTACGTTTGCAGGTATGTTAAGGA
>1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR
CTCTATTTGTAATCTTTTAAATGTTCTTGG
>1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR
GCTTGGAACAGAACTTTTTAAGCTCTTCAA
>1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR
GCATTAATTTGAAAAGATTAAGTATTTTTT
>1.25|505178|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR
TGTCAAAATTATCAACGCCAATTTCGTTAA
>1.26|505244|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR
CAAATTGTCAGATATTAAATCAGTCTCTGC
>1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR
AATCTCTTAACCTTATATATACATTATATC
>1.28|505376|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR
CTGATTCGTTGCTTGACCTATCTATGCCTT
>1.29|505442|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR
GGTTGGATTTACTATTTAAAGAATTAGATG
>1.30|505508|31|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR
GCTTAAACTCTTTGGAACTTCAAAATATGCT
>1.31|505575|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR
GAAAGATCGAACTGCATATAATGAGTTAAG
>1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR
AAAGAATTGGATTAATTTTTCCATTTGTGT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016400_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP016400_1

>merge|NZ_CP016400|1|503558-505706|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR
AGAAGTAAAATATTTGATCTGACAATCATCTAAAACAATGGGACACACCGTCATTGGCGATGTAGTGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTTATCGATTGGAGAACTATAAGTAGCAACTGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACCTTTATTGAACCTTATGTGTATCATCAGTTGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTTGAGGATTGTCGTACTTATTGGAAACAAAGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTCTTACTCGCTCTAAGGTTGTGACGATTGTGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTACCTACTGGTTCTCCTCAATTAATTTCTTGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTGTCGATAAATATCGACTTAGCATATCCAGGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACAAGATGATGTCTAAATAGCTAGCCTTCTTAGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACCATAATGAGTAAATCTAACTGAAGATACAGGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACCCTTGTGCGGAGTTCTAGCGAGAGTTGCATGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTGTTAGCAAGGCATAATGCCCTACGTTTCCGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACCTTTGACGAATTTCCTGAAATCGACTTTGAGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACCAAAAGCACCTTGCGGTTTCCAATCTGGGCGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACAGGTCGAAGTAATGTTGTCAAATTTTATCTGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACCCAAAGTGGAGCATCAACATTATCTGAATAGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTTATCACTACATCAAAGATAAGATTGGTGTGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACAACTCAAGACACTAAACACTTATATACATAGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTTTCTTTGACCTCTTTTCTTAACTAACTCAGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACCTCTAATCCGCCAAAATAATCTAGAACCTGGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACAAAATAGTAACTCAACATGCTTACGACTAAGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACCATGGGCTACGTTTGCAGGTATGTTAAGGAGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACCTCTATTTGTAATCTTTTAAATGTTCTTGGGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACGCTTGGAACAGAACTTTTTAAGCTCTTCAAGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACGCATTAATTTGAAAAGATTAAGTATTTTTTGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACTGTCAAAATTATCAACGCCAATTTCGTTAAGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACCAAATTGTCAGATATTAAATCAGTCTCTGCGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACAATCTCTTAACCTTATATATACATTATATCGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACCTGATTCGTTGCTTGACCTATCTATGCCTTGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACGGTTGGATTTACTATTTAAAGAATTAGATGGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACGCTTAAACTCTTTGGAACTTCAAAATATGCTGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACGAAAGATCGAACTGCATATAATGAGTTAAGGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAACAAAGAATTGGATTAATTTTTCCATTTGTGTGATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC

>NZ_CP016400|1|1|503558-505706|CRT
AGAAGTAAAATATTTGATCTGACAATCATCTAAAAC	AATGGGACACACCGTCATTGGCGATGTAGT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTATCGATTGGAGAACTATAAGTAGCAACT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CTTTATTGAACCTTATGTGTATCATCAGTT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTGAGGATTGTCGTACTTATTGGAAACAAA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TCTTACTCGCTCTAAGGTTGTGACGATTGT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TACCTACTGGTTCTCCTCAATTAATTTCTT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TGTCGATAAATATCGACTTAGCATATCCAG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	AAGATGATGTCTAAATAGCTAGCCTTCTTA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CATAATGAGTAAATCTAACTGAAGATACAG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CCTTGTGCGGAGTTCTAGCGAGAGTTGCAT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TGTTAGCAAGGCATAATGCCCTACGTTTCC
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CTTTGACGAATTTCCTGAAATCGACTTTGA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CAAAAGCACCTTGCGGTTTCCAATCTGGGC
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	AGGTCGAAGTAATGTTGTCAAATTTTATCT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CCAAAGTGGAGCATCAACATTATCTGAATA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTATCACTACATCAAAGATAAGATTGGTGT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	AACTCAAGACACTAAACACTTATATACATA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTTCTTTGACCTCTTTTCTTAACTAACTCA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CTCTAATCCGCCAAAATAATCTAGAACCTG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	AAAATAGTAACTCAACATGCTTACGACTAA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CATGGGCTACGTTTGCAGGTATGTTAAGGA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CTCTATTTGTAATCTTTTAAATGTTCTTGG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GCTTGGAACAGAACTTTTTAAGCTCTTCAA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GCATTAATTTGAAAAGATTAAGTATTTTTT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TGTCAAAATTATCAACGCCAATTTCGTTAA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CAAATTGTCAGATATTAAATCAGTCTCTGC
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	AATCTCTTAACCTTATATATACATTATATC
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CTGATTCGTTGCTTGACCTATCTATGCCTT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GGTTGGATTTACTATTTAAAGAATTAGATG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GCTTAAACTCTTTGGAACTTCAAAATATGCT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GAAAGATCGAACTGCATATAATGAGTTAAG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	AAAGAATTGGATTAATTTTTCCATTTGTGT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC

>NZ_CP016400|1|1|503624-505706|CRISPRCasFinder
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTATCGATTGGAGAACTATAAGTAGCAACT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CTTTATTGAACCTTATGTGTATCATCAGTT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTGAGGATTGTCGTACTTATTGGAAACAAA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TCTTACTCGCTCTAAGGTTGTGACGATTGT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TACCTACTGGTTCTCCTCAATTAATTTCTT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TGTCGATAAATATCGACTTAGCATATCCAG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	AAGATGATGTCTAAATAGCTAGCCTTCTTA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CATAATGAGTAAATCTAACTGAAGATACAG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CCTTGTGCGGAGTTCTAGCGAGAGTTGCAT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TGTTAGCAAGGCATAATGCCCTACGTTTCC
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CTTTGACGAATTTCCTGAAATCGACTTTGA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CAAAAGCACCTTGCGGTTTCCAATCTGGGC
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	AGGTCGAAGTAATGTTGTCAAATTTTATCT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CCAAAGTGGAGCATCAACATTATCTGAATA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTATCACTACATCAAAGATAAGATTGGTGT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	AACTCAAGACACTAAACACTTATATACATA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTTCTTTGACCTCTTTTCTTAACTAACTCA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CTCTAATCCGCCAAAATAATCTAGAACCTG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	AAAATAGTAACTCAACATGCTTACGACTAA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CATGGGCTACGTTTGCAGGTATGTTAAGGA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CTCTATTTGTAATCTTTTAAATGTTCTTGG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GCTTGGAACAGAACTTTTTAAGCTCTTCAA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GCATTAATTTGAAAAGATTAAGTATTTTTT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TGTCAAAATTATCAACGCCAATTTCGTTAA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CAAATTGTCAGATATTAAATCAGTCTCTGC
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	AATCTCTTAACCTTATATATACATTATATC
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CTGATTCGTTGCTTGACCTATCTATGCCTT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GGTTGGATTTACTATTTAAAGAATTAGATG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GCTTAAACTCTTTGGAACTTCAAAATATGCT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GAAAGATCGAACTGCATATAATGAGTTAAG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	AAAGAATTGGATTAATTTTTCCATTTGTGT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC

>NZ_CP016400|1|1|504548-505706|PILER-CR
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTATCACTACATCAAAGATAAGATTGGTGT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	AACTCAAGACACTAAACACTTATATACATA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TTTCTTTGACCTCTTTTCTTAACTAACTCA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CTCTAATCCGCCAAAATAATCTAGAACCTG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	AAAATAGTAACTCAACATGCTTACGACTAA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CATGGGCTACGTTTGCAGGTATGTTAAGGA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CTCTATTTGTAATCTTTTAAATGTTCTTGG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GCTTGGAACAGAACTTTTTAAGCTCTTCAA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GCATTAATTTGAAAAGATTAAGTATTTTTT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	TGTCAAAATTATCAACGCCAATTTCGTTAA
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CAAATTGTCAGATATTAAATCAGTCTCTGC
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	AATCTCTTAACCTTATATATACATTATATC
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	CTGATTCGTTGCTTGACCTATCTATGCCTT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GGTTGGATTTACTATTTAAAGAATTAGATG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GCTTAAACTCTTTGGAACTTCAAAATATGCT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	GAAAGATCGAACTGCATATAATGAGTTAAG
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC	AAAGAATTGGATTAATTTTTCCATTTGTGT
GATCTAAACCTTATTGATCTAACAACCATCTAAAAC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP016400.1|WP_069168521.1|516416_517589_-|methyltransferase-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|133381
NZ_CP016400.1|WP_069168516.1|506687_507596_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1	cas1	cd09720_cas1_CAS-II-A:CAS-II-B:CAS-II-C	gnl|CDD|187851
NZ_CP016400.1|WP_069168512.1|502534_502720_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP016400.1|WP_004897486.1|496330_496732_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP016400.1|WP_061399971.1|500571_501489_-|M48-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|320699
NZ_CP016400.1|WP_069168520.1|514342_515227_-|glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase-RfbA	unknown	unknown	gnl|CDD|130274
NZ_CP016400.1|WP_069168519.1|513703_514312_-|dTDP-4-dehydrorhamnose-3,5-epimerase	unknown	unknown	gnl|CDD|376414
NZ_CP016400.1|WP_155762239.1|503123_503300_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP016400.1|WP_061399972.1|501702_502128_-|restriction-endonuclease	unknown	unknown	gnl|CDD|214906
NZ_CP016400.1|WP_069168517.1|507802_511915_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9	cas9	mkCas0193_cas9_CAS-II-A:CAS-II-B:CAS-II-C	gnl|CDD|374653
NZ_CP016400.1|WP_069168518.1|512700_513687_-|dTDP-4-dehydrorhamnose-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|367904
NZ_CP016400.1|WP_069168513.1|502722_502947_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP016400.1|WP_014567556.1|498218_499061_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|275056
NZ_CP016400.1|WP_014567555.1|497626_498067_-|8-oxo-dGTP-diphosphatase	unknown	unknown	gnl|CDD|239519
NZ_CP016400.1|WP_069168515.1|506404_506710_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2	cas2	mkCas0206_cas2_CAS-I:CAS-II:CAS-III	gnl|CDD|226043
NZ_CP016400.1|WP_014567554.1|496936_497596_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|374106
NZ_CP016400.1|WP_014567557.1|499126_499855_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP016400.1|WP_023599693.1|515233_516271_-|dTDP-glucose-4,6-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|224013
NZ_CP016400.1|WP_069168514.1|505739_506408_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2	csn2	cd12218_csn2_CAS-II-A	gnl|CDD|213411
NZ_CP016400.1|WP_069168522.1|518923_520153_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379523

HMMScan for Signature genes

Protein	Cas_name	Cas_description	E-value	Identity	Coverage
NZ_CP016400.1|WP_069168516.1|506687_507596_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1	cas1	cd09720_cas1_CAS-II-A:CAS-II-B:CAS-II-C	2.3e-89	293.9	3.8
NZ_CP016400.1|WP_069168515.1|506404_506710_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2	cas2	mkCas0206_cas2_CAS-I:CAS-II:CAS-III	2.7e-56	182.8	0.8
NZ_CP016400.1|WP_069168514.1|505739_506408_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2	csn2	cd12218_csn2_CAS-II-A	1.1e-70	232.4	14.9
NZ_CP016400.1|WP_069168517.1|507802_511915_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9	cas9	mkCas0193_cas9_CAS-II-A:CAS-II-B:CAS-II-C	0	1993.8	78.6

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP016400.1|WP_014567555.1|497626_498067_-|8-oxo-dGTP-diphosphatase	gnl|CDD|239519	cd03427, MTH1, MutT homolog-1 (MTH1) is a member of the Nudix hydrolase superfamily. MTH1, the mammalian counterpart of MutT, hydrolyzes oxidized purine nucleoside triphosphates, such as 8-oxo-dGTP and 2-hydroxy-ATP, to monophosphates, thereby preventing the incorporation of such oxygen radicals during replication. This is an important step in the repair mechanism in genomic and mitochondrial DNA. Like other members of the Nudix family, it requires a divalent cation, such as Mg2+ or Mn2+, for activity, and contain the Nudix motif, a highly conserved 23-residue block (GX5EX7REUXEEXGU, where U = I, L or V), that functions as a metal binding and catalytic site. MTH1 is predominantly localized in the cytoplasm and mitochondria. Structurally, this enzyme adopts a similar fold to MutT despite low sequence similarity outside the conserved nudix motif. The most distinctive structural difference between MutT and MTH1 is the presence of a beta-hairpin, which is absent in MutT. This results in a much deeper and narrower substrate binding pocket. Mechanistically, MTH1 contains dual specificity for nucleotides that contain 2-OH-adenine bases and those that contain 8-oxo-guanine bases.	7.74293e-48
NZ_CP016400.1|WP_069168521.1|516416_517589_-|methyltransferase-domain-containing-protein	gnl|CDD|133381	cd01106, HTH_TipAL-Mta, Helix-Turn-Helix DNA binding domain of the transcription regulators TipAL, Mta, and SkgA. Helix-turn-helix (HTH) TipAL, Mta, and SkgA transcription regulators, and related proteins, N-terminal domain. TipAL regulates resistance to and activation by numerous cyclic thiopeptide antibiotics, such as thiostrepton. Mta is a global transcriptional regulator; the N-terminal DNA-binding domain of Mta interacts directly with the promoters of mta, bmr, blt, and ydfK, and induces transcription of these multidrug-efflux transport genes. SkgA has been shown to control stationary-phase expression of catalase-peroxidase in Caulobacter crescentus. These proteins are comprised of distinct domains that harbor an N-terminal active (DNA-binding) site and a regulatory (effector-binding) site. The conserved N-terminal domain of these transcription regulators contains winged HTH motifs that mediate DNA binding. These proteins share the N-terminal DNA binding domain with other transcription regulators of the MerR superfamily that promote transcription by reconfiguring the spacer between the -35 and -10 promoter elements. Unique to this family, is a TipAL-like, lineage specific Bacilli subgroup, which has five conserved cysteines in the C-terminus of the protein.	3.77887e-40
NZ_CP016400.1|WP_061399971.1|500571_501489_-|M48-family-metallopeptidase	gnl|CDD|320699	cd07340, M48B_Htpx_like, Peptidase M48 subfamily B HtpX-like membrane-bound metallopeptidase. This HtpX family of peptidase M48 subfamily B includes uncharacterized HtpX homologs and consists of proteins smaller than Ste24p, with homology restricted to the C-terminal half of Ste24p. HtpX expression is controlled by the Cpx stress response system, which senses abnormal membrane proteins. HtpX participates in the proteolytic quality control of these misfolded proteins by undergoing self-degradation and collaborating with FtsH, a membrane-bound and ATP-dependent protease, to eliminate them. HtpX, a zinc metalloprotease with an active site motif HEXXH, has an FtsH-like topology, and is capable of introducing endoproteolytic cleavages into SecY (also an FtsH substrate). However, HtpX does not have an ATPase activity and will only act against cytoplasmic regions of a target membrane protein. Thus, HtpX and FtsH have overlapping and/or complementary functions, which are especially important at high temperature; in E. coli and Xylella fastidiosa, HtpX is heat-inducible, while in Streptococcus gordonii it is not.	6.50011e-101
NZ_CP016400.1|WP_069168520.1|514342_515227_-|glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase-RfbA	gnl|CDD|130274	TIGR01207, Glucose-1-phosphate_thymidylyltransferase_1, glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form. Alternate name: dTDP-D-glucose synthase homotetramer This model describes a tightly conserved but broadly distributed subfamily (here designated as short form) of known and putative bacterial glucose-1-phosphate thymidylyltransferases. It is well characterized in several species as the first of four enzymes involved in the biosynthesis of dTDP-L-rhamnose, a cell wall constituent and a feedback inhibitor of the enzyme. [Cell envelope, Biosynthesis and degradation of surface polysaccharides and lipopolysaccharides].	3.09595e-173
NZ_CP016400.1|WP_069168519.1|513703_514312_-|dTDP-4-dehydrorhamnose-3,5-epimerase	gnl|CDD|376414	pfam00908, dTDP_sugar_isom, dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase. This family catalyze the isomerisation of dTDP-4-dehydro-6-deoxy -D-glucose with dTDP-4-dehydro-6-deoxy-L-mannose. The EC number of this enzyme is 5.1.3.13.	7.98881e-101
NZ_CP016400.1|WP_061399972.1|501702_502128_-|restriction-endonuclease	gnl|CDD|214906	smart00910, HIRAN, The HIRAN protein (HIP116, Rad5p N-terminal) is found in the N-terminal regions of the SWI2/SNF2 proteins typified by HIP116 and Rad5p. HIRAN is found as a standalone protein in several bacteria and prophages, or fused to other catalytic domains, such as a nuclease of the restriction endonuclease fold and TDP1-like DNA phosphoesterases, in the eukaryotes. It has been predicted that this protein functions as a DNA-binding domain that probably recognises features associated with damaged DNA or stalled replication forks.	6.62436e-20
NZ_CP016400.1|WP_069168517.1|507802_511915_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9	gnl|CDD|374653	pfam16592, Cas9_REC, REC lobe of CRISPR-associated endonuclease Cas9. The REC lobe of Cas9 - the CRISPR-associated endonuclease Cas9 - includes the REC1 and REC2 domains. REC1 forms an elongated, alpha-helical structure consisting of 25 alpha helices and two beta-sheets, whereas REC2 inserted within REC1 adopts a six-helix bundle structure. The REC lobe and the NUC lobe of Cas9 fold to present a positively charged groove at their interface which accommodates the negatively charged sgRNA:target DNA heteroduplex. CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeat)-Cas system occurs naturally in bacteria as a defense against invasion by phages or other mobile genetic elements. Cas9 is targeted to specific genomic locations by sgRNAs or single guide RNAs, in order to complex with invading DNA in order to cleave it and render it inactive.	1.08245e-134
NZ_CP016400.1|WP_069168518.1|512700_513687_-|dTDP-4-dehydrorhamnose-reductase	gnl|CDD|367904	pfam04321, RmlD_sub_bind, RmlD substrate binding domain. L-rhamnose is a saccharide required for the virulence of some bacteria. Its precursor, dTDP-L-rhamnose, is synthesized by four different enzymes the final one of which is RmlD. The RmlD substrate binding domain is responsible for binding a sugar nucleotide.	2.00057e-97
NZ_CP016400.1|WP_069168516.1|506687_507596_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1	gnl|CDD|187851	cd09720, Cas1_II, CRISPR/Cas system-associated protein Cas1. CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) and associated Cas proteins comprise a system for heritable host defense by prokaryotic cells against phage and other foreign DNA; Cas1 is the most universal CRISPR system protein thought to be involved in spacer intergration. Cas1 is metal-dependent deoxyribonuclease, also binds RNA; Shown to possess a unique fold consisting of a N-terminal beta-strand domain and a C-terminal alpha-helical domain.	1.7932e-99
NZ_CP016400.1|WP_014567556.1|498218_499061_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|275056	TIGR04211, hypothetical_protein, SH3 domain protein. Members of this protein family have a signal peptide, a strongly conserved SH3 domain, a variable region, and then a C-terminal hydrophobic transmembrane alpha helix region.	5.28791e-07
NZ_CP016400.1|WP_014567554.1|496936_497596_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|374106	pfam15782, GREB1, Gene regulated by oestrogen in breast cancer. GREB1 (gene regulated by estrogen in breast cancer 1) was first identified as an oestrogen-regulated gene expressed in breast cancer. Its exact function is not known but its expression is regulated by the coordinated binding of oestrogen-receptors to distal sites interacting with Pol II to activate gene transcription from core promoters located at a considerable distance from the greb1 gene.	0.000456572
NZ_CP016400.1|WP_069168515.1|506404_506710_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2	gnl|CDD|226043	COG3512, COG3512, CRISPR-associated protein, Cas2 homolog [Defense mechanisms].	2.67203e-26
NZ_CP016400.1|WP_023599693.1|515233_516271_-|dTDP-glucose-4,6-dehydratase	gnl|CDD|224013	COG1088, RfbB, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase [Cell envelope biogenesis, outer membrane].	0
NZ_CP016400.1|WP_069168514.1|505739_506408_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2	gnl|CDD|213411	cd12218, Csn2, CRISPR/Cas system-associated protein Csn2. Csn2 is a Nmeni subtype-specific Cas protein, which may function in the adaptation process which mediates the incorporation of foreign nucleic acids into the microbial host genome. Csn 2 may interact directly with double-stranded DNA. CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) and associated Cas proteins comprise a system for heritable host defense by prokaryotic cells against phage and other foreign DNA. Csn2 has been predicted to be a functional analog of Cas4 based on anti-correlated phyletic patterns; also known as SPy1049 family.	3.09611e-71
NZ_CP016400.1|WP_069168522.1|518923_520153_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|379523	pfam14253, AbiH, Bacteriophage abortive infection AbiH. This family of proteins confers resistance to bacteriophage.	1.13073e-05

Protein sequences

>NZ_CP016400.1|WP_155762239.1|503123_503300_-|hypothetical-protein
MRNLRFKKADFLFIRTTYPSLFIKFKNSYEENGIVNVPMQNERDYDYYFDVVYSYLIE
>NZ_CP016400.1|WP_069168513.1|502722_502947_+|hypothetical-protein
MVTIILVSNSNKEVIYKFLNGNDNYKGQITVNKADLSYKLKDKEKFTNSYETQAYRLVQRCIELNKYPPIASKG
>NZ_CP016400.1|WP_069168512.1|502534_502720_+|hypothetical-protein
MIAIPKELNNMLTFPKDKPVPILKKGANNNQKIIYADFITALLSDKTCCRYEDDFFQPHKA
>NZ_CP016400.1|WP_061399972.1|501702_502128_-|restriction-endonuclease
MSMYRNDDVLITDLMDRISNLENQMTELKKIYYKQSGESHSTFLYGCEVRGSDYLHLEDKIVPRLKENDPVLLVREADNKYDKNAISVTTPSGLKLGYIPHEHNLIFSRLIDAGNLLFGRVKTFHWDGKNLELVIKIYLAG
>NZ_CP016400.1|WP_061399971.1|500571_501489_-|M48-family-metallopeptidase
MLYKQIEQNKRNTWIILGLYTLLILIISIFLGMLFTVYIGGAFFVIGLIYIAHVYFDATRHLMKVTNAVEITKETEPQIYELVEELCLAGGLPVPKLYITPDQAPNAFATGRDPQHASLALTQGLLNMMNKKEVQGVIGHELSHIRNYDTRITVLASALTSLITMTGVGIVVFGWGVLTSENKGLLGLFIKFFALFLIIVGGIISIIGIPIAKLLFLLVSRQREYLADIGSVDLTREPSGLISALSKLERLEEGEGTPQIGSQDLALQHLYFNFPSAHNWISRLFSDHPPLDKRIERLENSNQIK
>NZ_CP016400.1|WP_014567557.1|499126_499855_-|hypothetical-protein
MGLGTSACSSQTNNSSSKQTTTSRSKKSVEKTDENSSESTKRSKKDLSTAADNQANNSNSNDGKAYGGNFQDSKGYIAINNVTNVTVKNSNDDEHYALVQGTFTNNAKESVDPTSFFSDHLKVMEKVGKATYDLVLVTTDIENELTPWGNQIKEGRKKVEPNMTGNFVIVYKLDPANGAKTNATHYVFEPYDSKFGKSLTVKVYESKTIKKSSDNAGSNSHSDESTDTNSSADTSSDVDTDD
>NZ_CP016400.1|WP_014567556.1|498218_499061_+|hypothetical-protein
MTLQINTRVDSITWPLNQNLTNQEIISQLELTVTENGHLISNDNLSINKKAVNRSEAGVYPVIITAIGTNNEYATKKIQAWVTDKNNVVDSSPTPQPAPAKPAQYTSSNKPASPKKKGKKKIVYIVLGVLVLLIAIIFGISACQAHNDTVQNEQAQSNALNNTNSKLDNLSEQNKQLMQQNKELQSAINTYKQDQNKEELQNQLNQIKTENEQLKNNAANNQALQNQINQLGSTIDQIKQNPNQADSLLDQMKNNQNEFMQNLNATFQKLVSDFQQLIGQ
>NZ_CP016400.1|WP_014567555.1|497626_498067_-|8-oxo-dGTP-diphosphatase
MKRSEAVTLTNMCMIKNKDKILVLNRTDPVWPGLTFPGGHVESHEAFHDSVVREIKEETGLEIKDPRLVGVKQFFDHNDERYLVFFYVATKFTGTLKASDEGDLTWMTREEIEKSKLAYNFDHDLPIFFDEKLSEHILDGDRDQTY
>NZ_CP016400.1|WP_014567554.1|496936_497596_+|hypothetical-protein
MEEINLKKLIVGALSCSLLLLAGCRNNLVEPKHKSSAADYAIIQSSHKQSHKKVEKEKPKNKDDKKEKSEKTDQKKDEDIKMDDQLDSLQNKEEQSSSESQSSSSSSTPTPIQRSEHKASSTLPKSNFGTSFYTVPRRNYSYYNPQPNYYFDNNWTTNSNANATTQSSATSSSNSENSTTSSSSTASSESSSSSSKETETPASQNNESESTSSTENTQD
>NZ_CP016400.1|WP_004897486.1|496330_496732_-|hypothetical-protein
MYDLEDVLMKSFREDNGISSAFSIEPIDDNEYRVSTNVVDGLNDTIHFYLVVYPNGTYALNDRVFTAQMIDNNIGSFASIASDVARLASEFGVLLDDRGELTRDYINARDLRDEVNNFTQLLNRVVEFAQIHR
>NZ_CP016400.1|WP_069168514.1|505739_506408_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2
MIFSYLSHKKMILNGYGIKIIATSSPIAYRDITQSFQNEKQMILISDDEYNQLDINKNFDFIGDLLLTKNNLDKYMPLIIKKYIENLDEDNRNKIIKAYYNLESLVQDSLFLEDLPLEIDFSEDLKKFLKLENLHLDSKFLKGPYAIIESILRIHQTCNLKTVPVVCNVAHYLDSTQLNMLNNLLKSMKLKMILIEFTSKEGLVYPKDADYFYIDGDLVDWY
>NZ_CP016400.1|WP_069168515.1|506404_506710_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2
MRLMIMFDLPVDTADERREYRQFRKRLINEGFLMIQYSVYERVCVSRKTATFLENRIKSFLPTSGVVQSLMVTEKQYNDMHFLVGDPVRDVRNSSDRTVIL
>NZ_CP016400.1|WP_069168516.1|506687_507596_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1
MGWRSVIITQHAKLTYSMNMMIVQTRDGVNQIPIDDINLVLISTSQAVITSALISKLAEKQSKVIFVDDKYQPISETVDYYPGSRNLAKLENQFRWDEKRKELLWTKIVTRKIQNQIAVLQNYKLDGEDIQEELDRIEINDSTNREALAARKYFMKMFGKDFIRRNSDVINAALDYGYAILLSTFDREIAVNGYLSYLGIHHHSQENQFNLGSDLMEPFRPIVDYWVKAHENISEFTPDIKFGLVELLSLEIKFNGRSTILSNAITVYVRDCLRFLSGEIDKVKIEMELIHEVPNDAINDNV
>NZ_CP016400.1|WP_069168517.1|507802_511915_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9
MTKIKDDYIVGLDIGTDSCGWVAMNSNNDILKLQGKTAIGSRLFEGGKSAAERRLFRTTHRRIKRRRWRLKLLEEFFDPYMAEVDPYFFARLKESGLSPLDKRKTVSSIVFPTSAEDKKFYDDYPTIYHLRYKLMTEDEKFDLREVYLAIHHIIKYRGNFLYNTSVKDFKASKIDVKSSIEKLNELYENLGLDLNVEFNISNTAEIEKVLKDKQIFKRDKVKKIAELFAIKTDNKEQSKRIKDISKQVANAVLGYKTRFDTIALKEISKDELSDWNFKLSDIDADSKFEALMGNLDENEQAILLTIKELFNEVTLNGIVEDGNTLSESMINKYNDHRDDLKLLKEVIENHIDRKKAKELALAYDLYVNNRHGRLLQAKKKLGKIKPRSKEDFYKVVNKNLDDSRASKEIKKKIELDSFMPKQRTNANGVIPYQLQQLELDKIIENQSKYYPFLKEINPVSSHLKEAPYKLDELIRFRVPYYVGPLISPNESTKDIQTKKNQNFAWMIRKEEGRITPWNFDQKVDRIESANKFIKRMTTKDTYLFGEDVLPANSLLYQKFTVLNELNNIRINGKRISVDLKQEIYENLFKKHTTVTVKKLENYLKENHNLVKVEIKGLADEKKFNSGLTTYNRFKNLNIFDNQIDDLKYRNDFEKIIEWSTIFEDKSIYKEKLRSIDWLNEKQINALSNIRLQGWGRLSKKLLAQLHDHNGQTIIEQLWDSQNNFMQIVTQADFKDAIAKANQNLLVATSVEDILNNAYTSPANKKAIRQVIKVVDDIVKAASGKVPKQIAIEFTRDADENPKRSQTRGSKLQKVYKDLSTELASKTIAEELNEAIKDKKLVQDKYYLYFMQLGRDAYTGEPINIDEIQKYDIDHILPQSFIKDDALDNRVLVSRAVNNGKSDNVPVKLFGNEMAANLGMTIRKMWEEWKNIGLISKTKYNNLLTDPDHINKYKSAGFIRRQLVETSQIIKLVSTILQSRYPNTEIITVKAKYNHYLREKFDLYKSREVNDYHHAIDAYLSAICGNLLYQNYPNLRPFFVYGQYKKFSSDPDKEKEIFNKTRKFSFISQILKNKSENSKEIAEKLKRAYQFKYMLVSRETETKDQEMFKMTVFPRETPGNLIPKKKGMAPEIYGGYTKNSDAYMVIVKIDKKKETEYRILGIPTRELVNLKKAEKEDHYESYLKEILAPRILYNKNGKRDKKITSFEIVKSKIPYKQVIQDGDKKFMLGSSTYVYNAKQLTLSTESMKAITNNFDKDSDENDALIKAYDEILDKVDKYLPLFDINAFRKKLHSGREKFVELSLEDKKDIILKVLIGLHDNPATSDLKTLGFSSTELGKMQKNSGIVLSGNAKLIYQSPTGLFKKSVKISDL
>NZ_CP016400.1|WP_069168518.1|512700_513687_-|dTDP-4-dehydrorhamnose-reductase
MKVFVTGVNGQLGHDVMNELAKRGYGGVGSDLAPEYAGVADSTVVTKAPYVSLDITDAAAVDKVITEVNPDVIVHCAAWTAVDMAEDDDKVAAVRKVNVDGTQNIANVAKKLDAPMVYLSTDYVFDGQGTTPWEPDFKGYKPLNVYGETKLGGEEAVANTLDKYFIVRIAWVFGVNGSNFIKTMLKVGLNHDEVKVVSDQVGTPTYTFDLARLLVDMIETDKYGYYHATNAELPAREGDHDENGTKTGYISWYDFTKEIYRQAGYKTKVTPVTTEEYGLSKAVRPFNSRLDKSKLEENGFKPLPTWPDAISRYLDILKADGFFDELGK
>NZ_CP016400.1|WP_069168519.1|513703_514312_-|dTDP-4-dehydrorhamnose-3,5-epimerase
MGQIKVEKNVGGIEDLAVITPTVHGDDRGYFMETFNQRDMMDAGFSINFVQDNQSSSTKGVLRGLHFQKKYPQIKLVRAVRGSVFDVAVDLRSDSKTYGKWYGVELTAENKKQFLIPQGFAHGFLVLSDEAEFCYKVNDFWHPNDEGGMAWNDPEIGIEWPHLKGDYPGSPDASGYTLDDGTKLTLSDRDQEWKGLKDTFKF
>NZ_CP016400.1|WP_069168520.1|514342_515227_-|glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase-RfbA
MKGIILAGGSGTRLYPLTLVTSKQLLPVYDKPMIYYPLSTLMLAGIKDILVISTPADTPRFKELLGDGSQFGVSLSYKVQPSPDGLAQAFTLGEDFINGEACAMVLGDNIFYGNGFTDLLKNAAEDAQKGKATVFGYYVNDPERFGVVDFDENGNAVSIEEKPEQPKSNYAVTGLYFYPAGVSEKAAQVKPSARGEVEITSLNDMYLQDDNLGVQLLGRGYAWLDTGTMQSLVDASNYVKMIEERQGVSVSAPEEIAYVHGWINKDQLLEAAKHYGKSPYGKHLKSVAEGKVRY
>NZ_CP016400.1|WP_023599693.1|515233_516271_-|dTDP-glucose-4,6-dehydratase
MKVIVTGGAGFIGSNFVFYMLKKHPDYEIICLDSLTYAGNLSTLKDVMDNPNFKFVKLDIRDREGVYKLFEEEKPDVVVNFAAESHVDRSIENPEIFLETNIIGTSVLMDACRKYGIKRFHQVSTDEVYGDLPLDRPDLFFHEDTPLHTSSPYSSSKASADLLVGAYGRTFNLPVTISRCSNNYGPYQFPEKLIPLMIQRALNNEKLPVYGDGKNVRDWLYVEDHCKAIDLILENGKPGEVYNIGGHNEMANIDIVKLICDYLDKPYSLIEHVTDRKGHDRRYAIDPEKIHNELGWLPETMFKDGIKKTIQWYLDNKDWWENIISGDYQNYYDEMYGKKQVLDKD
>NZ_CP016400.1|WP_069168521.1|516416_517589_-|methyltransferase-domain-containing-protein
MKTYYTSGEFAKKAHVSIRTIRYYDQKNLLKPSTHTASGARRYTDADFAKLQQILLLKYLGFSLTDIREMTLGSGDRQLLLDSLQIQKRLVEERRKEMQNVATAIDSTSSTLKAGHEVDWSKMLDLIHLTSMNQSLSTQYQNASNISARIKLHRDYSLNKEGWFHWLFRQLDLKPGMKILELGAGNGTLWAQNLDRIPKGLTIVLSDISEGILADAKNEIGDRAEFQYAVFDAQKIPFADNTFDLVIANHMLFYCDNIPKTLKEVKRVMKRGASFACSTYSKRHMHEITDLVQEFNPEIVLSSTNLYDRFGLDNGVEILSHDFTDVICHKYEDAIELSESTPVISYILSCHGNQNSILLDHYNEFKNYVDDKVSDGFHITKDVGCFICKK
>NZ_CP016400.1|WP_069168522.1|518923_520153_-|hypothetical-protein
MEENKTKQLIVLGNGFDIACGLDSHYDTFFKKRFAKANSGYIIDTLLKYRPNNHGSILNFNVYGLGDQQLNTFTNRFEAKFNYFDLLFMATEQYMDQRDKSWSNIEQILQEILNFVYVQCKEAEFTNNCEIDNAAEKFKYKIFNNYKFKSDNDKLKFIKFILHVFNKTVQNNDIRKALKQYEKIFGHFITEEINDNYIAYITQVKNKLSKLVVKKADILSFNYSASLLLDNLQDNNLLENWYNIHGLSRWDAPARTKAVRKFNDNSIVIPRPIFGISNYDQNRDEFLSNTSPIYQFTKSNRRKEKKDGIKEIHDLLEYNISPNINLVTIFGHSLGLADYAYFKDIFQQLNFAKGKVRFEIFYYDDLQSIKSNMKLMLKEYSHDVSMHPKDLYSKICSENRLIFKSSSEF

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_CP016400_1	1.7|503990|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder	503990-504019	30	NC_024206	Lactobacillus phage phi jlb1, complete genome	7785-7814	0	1.0
NZ_CP016400_1	1.8|504056|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder	504056-504085	30	NC_005355	Lactobacillus prophage Lj965, complete genome	5613-5642	0	1.0
NZ_CP016400_1	1.8|504056|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder	504056-504085	30	AY459535	Lactobacillus johnsonii prophage Lj965, complete genome	5613-5642	0	1.0
NZ_CP016400_1	1.28|505376|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505376-505405	30	NC_005355	Lactobacillus prophage Lj965, complete genome	4567-4596	0	1.0
NZ_CP016400_1	1.28|505376|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505376-505405	30	AY459535	Lactobacillus johnsonii prophage Lj965, complete genome	4567-4596	0	1.0
NZ_CP016400_1	1.1|503594|30|NZ_CP016400|CRT	503594-503623	30	AJ131519	Lactobacillus bacteriophage phi adh complete genome	41321-41350	1	0.967
NZ_CP016400_1	1.1|503594|30|NZ_CP016400|CRT	503594-503623	30	NC_000896	Lactobacillus prophage phiadh, complete genome	41321-41350	1	0.967
NZ_CP016400_1	1.16|504584|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	504584-504613	30	MN830256	Lactobacillus phage JNU_P7, complete genome	14240-14269	1	0.967
NZ_CP016400_1	1.30|505508|31|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505508-505538	31	NC_010179	Lactobacillus johnsonii prophage Lj771, complete genome	10675-10705	1	0.968
NZ_CP016400_1	1.30|505508|31|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505508-505538	31	NC_024206	Lactobacillus phage phi jlb1, complete genome	9728-9758	1	0.968
NZ_CP016400_1	1.14|504452|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder	504452-504481	30	MN830256	Lactobacillus phage JNU_P7, complete genome	20572-20601	2	0.933
NZ_CP016400_1	1.18|504716|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	504716-504745	30	MN694392	Marine virus AFVG_250M8, complete genome	38998-39027	3	0.9
NZ_CP016400_1	1.30|505508|31|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505508-505538	31	MN830257	Lactobacillus phage JNU_P11, complete genome	13098-13128	3	0.903
NZ_CP016400_1	1.30|505508|31|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505508-505538	31	DQ320509	Lactobacillus phage KC5a, complete genome	9765-9795	3	0.903
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	JN638751	Bacillus phage G, complete genome	461135-461164	5	0.833
NZ_CP016400_1	1.6|503924|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder	503924-503953	30	MN693069	Marine virus AFVG_25M392, complete genome	2474-2503	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.6|503924|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder	503924-503953	30	MN693225	Marine virus AFVG_25M249, complete genome	2547-2576	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	504980-505009	30	NC_015715	Zymomonas mobilis subsp. pomaceae ATCC 29192 plasmid pZYMOP01, complete sequence	2838-2867	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	NZ_AP019825	Leptotrichia hofstadii strain JCM16775 plasmid pJCM16775-2, complete sequence	10475-10504	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	NZ_CP025224	Enterococcus sp. CR-Ec1 plasmid pCREc1, complete sequence	9044-9073	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	MT080590	UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW27, complete genome	106950-106979	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	KX532239	Staphylococcus phage StAP1, complete genome	15780-15809	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	MT080584	UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW15, complete genome	28922-28951	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	MT080587	UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW20, complete genome	34912-34941	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	NC_022090	Staphylococcus phage vB_SauM_Remus, complete genome	2202-2231	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	MT080588	UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW22, complete genome	11099-11128	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	MT080595	UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW41, partial genome	127896-127925	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	NC_020877	Staphylococcus phage vB_SauM_Romulus, complete genome	2202-2231	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	NZ_CP013684	Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence	101911-101940	6	0.8
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NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	LC492752	Staphylococcus phage KSAP11 genomic DNA, compelete genome	2389-2418	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	JN638751	Bacillus phage G, complete genome	137555-137584	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	JN638751	Bacillus phage G, complete genome	418799-418828	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	JN638751	Bacillus phage G, complete genome	471127-471156	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	JN638751	Bacillus phage G, complete genome	476393-476422	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505641-505670	30	NC_011738	Gloeothece citriformis PCC 7424 plasmid pP742401, complete sequence	113380-113409	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505641-505670	30	NC_014757	Bacillus cereus VPC1401 plasmid pLVP1401 complete sequence	10306-10335	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505641-505670	30	NC_007105	Bacillus cereus E33L plasmid pE33L54, complete sequence	47155-47184	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505641-505670	30	NZ_CP040339	Bacillus luti strain FJ plasmid unnamed3, complete sequence	38657-38686	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505641-505670	30	NZ_CP007625	Bacillus pseudomycoides strain 219298 plasmid unnamed, complete sequence	162817-162846	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505641-505670	30	NZ_CP009966	Bacillus cereus E33L plasmid pBCO_2, complete sequence	47724-47753	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505641-505670	30	NZ_CP009650	Bacillus pseudomycoides strain BTZ plasmid pBTZ_1, complete sequence	64625-64654	6	0.8
NZ_CP016400_1	1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505641-505670	30	NZ_CP021438	Bacillus thuringiensis strain C15 plasmid pBMB172, complete sequence	1781-1810	6	0.8
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NZ_CP016400_1	1.6|503924|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder	503924-503953	30	MN694532	Marine virus AFVG_250M629, complete genome	10035-10064	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.9|504122|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder	504122-504151	30	KM236242	Escherichia phage Pollock, complete genome	36447-36476	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.16|504584|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	504584-504613	30	NZ_LR215032	Mycoplasma gallopavonis strain NCTC10186 plasmid 2	149914-149943	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	504980-505009	30	AP014381	Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S43-C84, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***	29690-29719	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	504980-505009	30	MN694515	Marine virus AFVG_250M511, complete genome	20632-20661	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505046-505075	30	NZ_CP039706	Clostridium butyricum strain 4-1 plasmid p-butyl_plas_4-1, complete sequence	529962-529991	7	0.767
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NZ_CP016400_1	1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505046-505075	30	NZ_CP033248	Clostridium butyricum strain CFSA3989 plasmid pCFSA3989, complete sequence	293283-293312	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505046-505075	30	NZ_AP019717	Clostridium butyricum strain NBRC 13949 plasmid pCBU1, complete sequence	571525-571554	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505046-505075	30	NZ_CP039703	Clostridium butyricum strain 29-1 plasmid p-butyl_plas_29-1, complete sequence	160815-160844	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505046-505075	30	NZ_CP013238	Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence	268554-268583	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505046-505075	30	DQ222855	Bacillus anthracis phage Gamma isolate 53, complete genome	10442-10471	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505046-505075	30	DQ289555	Bacillus anthracis phage W Beta, complete genome	10442-10471	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505046-505075	30	NC_007814	Bacillus phage Fah, complete genome	10433-10462	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505046-505075	30	DQ150593	Bacillus anthracis bacteriophage Fah, complete sequence	10433-10462	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505046-505075	30	DQ222853	Bacillus anthracis phage Gamma isolate 51, complete genome	10442-10471	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505046-505075	30	MK085976	Bacillus phage AP631, complete genome	10423-10452	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505046-505075	30	DQ221100	Bacteriophage gamma putative terminase small subunit, putative terminase large subunit, putative portal protein, putative prohead protease, putative phage structural protein, putative DNA packaging protein, putative head-tail adaptor, phage related proteins, putative major tail protein, phage related protein, putative tail tape measure protein, phage related protein, putative minor structural protein, putative holin, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase (PlyG), putative lipoprotein, putative transcriptional regulator, conserved hypothetical proteins, FtsK/SpoIIIE family protein, phage related protein, conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator, putative site-specific recombinase, conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulators, putative antirepressor, conserved hypothetical protein, putative DNA replication proteins, conserved hypothetical protein, phage related proteins, conserved hypothetical protein, putative transglycosylase, and putative endonuclease genes, complete cds	10442-10471	7	0.767
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NZ_CP016400_1	1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505046-505075	30	DQ289556	Bacillus anthracis phage Gamma isolate d'Herelle, complete genome	10442-10471	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505046-505075	30	NC_007734	Bacillus phage WBeta, complete genome	10442-10471	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505046-505075	30	KY963369	Bacillus phage Tavor_SA, complete genome	10653-10682	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505046-505075	30	NC_007458	Bacillus phage Gamma, complete genome	10442-10471	7	0.767
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NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	KJ019114	Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803US60, complete genome	118134-118163	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	KJ019138	Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C107, complete genome	118133-118162	7	0.767
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NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	KJ019038	Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C59, complete genome	118006-118035	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	KJ019068	Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803US102, complete genome	118130-118159	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	KJ019137	Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C104, complete genome	118222-118251	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	KJ019157	Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C31, complete genome	118225-118254	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	KJ019087	Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803US19, complete genome	118126-118155	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	KJ019076	Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803US112, complete genome	118130-118159	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	KJ019065	Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C99, complete genome	118121-118150	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	KJ019026	Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C42, complete genome	118135-118164	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	KJ019081	Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803US117, complete genome	118134-118163	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	KJ019033	Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C53, complete genome	117977-118006	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	NC_023584	Synechococcus phage S-MbCM100, complete genome	118410-118439	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	KJ019153	Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C26, complete genome	118129-118158	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	KJ019158	Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C33, complete genome	118225-118254	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	KJ019067	Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803US101, complete genome	118134-118163	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	KJ019039	Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C60, complete genome	118137-118166	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	KJ019030	Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C47, complete genome	118226-118255	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	KJ019163	Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C38, complete genome	118121-118150	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	KJ019116	Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803US62, complete genome	117629-117658	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	KJ019088	Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803US1, complete genome	118209-118238	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	KJ019084	Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803US123, complete genome	118131-118160	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	NZ_CP045341	Vibrio sp. THAF190c plasmid pTHAF190c_c, complete sequence	28501-28530	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	MT080590	UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW27, complete genome	34602-34631	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	KX532239	Staphylococcus phage StAP1, complete genome	78604-78633	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	MT080584	UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW15, complete genome	101270-101299	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	MT080587	UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW20, complete genome	98237-98266	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	MT080588	UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW22, complete genome	74460-74489	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	AP013666	Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C10-MedDCM-OCT-S37-C126, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***	11423-11452	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	LC492751	Staphylococcus phage KSAP7 genomic DNA, compelete genome	64563-64592	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	LC492752	Staphylococcus phage KSAP11 genomic DNA, compelete genome	64383-64412	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	AP013407	Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G16, isolate: uvMED-CGR-C10-MedDCM-OCT-S30-C55	27838-27867	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	MF001361	Enterococcus phage EF5, partial genome	109197-109226	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	JN638751	Bacillus phage G, complete genome	392621-392650	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	JN638751	Bacillus phage G, complete genome	394054-394083	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	MF001358	Enterococcus phage EF1, partial genome	8120-8149	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	AP013412	Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G16, isolate: uvMED-CGR-C10A-MedDCM-OCT-S46-C61	5894-5923	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	NZ_CP013332	Fusobacterium hwasookii ChDC F174 plasmid unnamed1, complete sequence	51010-51039	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	KY779848	Staphylococcus phage qdsa001, complete genome	98135-98164	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.29|505442|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505442-505471	30	MN693025	Marine virus AFVG_117M63, complete genome	9791-9820	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.29|505442|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505442-505471	30	LT603682	Enterococcus faecium isolate Ef_DMG1500501 genome assembly, plasmid: 5	14238-14267	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.29|505442|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505442-505471	30	NC_013384	Staphylococcus epidermidis plasmid SAP110B, complete sequence	3532-3561	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.29|505442|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505442-505471	30	MG366114	UNVERIFIED: Acinetobacter phage PBAB08, complete genome	24070-24099	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505641-505670	30	NZ_CP012102	Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-3, complete sequence	91771-91800	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505641-505670	30	NC_018687	Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC189, complete sequence	47789-47818	7	0.767
NZ_CP016400_1	1.13|504386|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder	504386-504415	30	NZ_LR594691	Variovorax sp. WDL1 plasmid 3	411336-411365	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.15|504518|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder	504518-504547	30	NC_031109	Gordonia phage Jumbo, complete genome	18261-18290	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.18|504716|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	504716-504745	30	MN694758	Marine virus AFVG_250M853, complete genome	13148-13177	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.18|504716|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	504716-504745	30	MN694077	Marine virus AFVG_250M852, complete genome	13152-13181	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.20|504848|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	504848-504877	30	MH638312	Bacillus phage Kioshi, complete genome	33921-33950	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	504980-505009	30	NZ_CP015353	Bacillus thuringiensis strain MYBT18246 plasmid p120510, complete sequence	39619-39648	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	504980-505009	30	MN693005	Marine virus AFVG_117M50, complete genome	50503-50532	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	504980-505009	30	MN698240	Pelagibacter phage HTVC026P, complete genome	15934-15963	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	504980-505009	30	MN694372	Marine virus AFVG_250M1157, complete genome	29151-29180	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	MN693584	Marine virus AFVG_25M163, complete genome	13405-13434	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	NC_013164	Anaerococcus prevotii DSM 20548 plasmid pAPRE01, complete sequence	12051-12080	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505112-505141	30	NC_030904	Bacillus phage vB_BhaS-171, complete genome	29008-29037	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.25|505178|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505178-505207	30	NZ_CP031175	Lactobacillus brevis strain UCCLB556 plasmid pUCCLB556_A, complete sequence	3273-3302	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.25|505178|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505178-505207	30	NC_013783	Lactococcus lactis subsp. lactis plasmid pAR141, complete sequence	1329-1358	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.26|505244|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505244-505273	30	MN693694	Marine virus AFVG_250M548, complete genome	12922-12951	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	KT339177	Lactococcus phage GE1, complete genome	23722-23751	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	MT080601	UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW72, complete genome	12445-12474	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	MT080585	UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW18, complete genome	15781-15810	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	MT080591	UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW29, complete genome	12317-12346	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	NC_025416	Staphylococcus phage MCE-2014, complete genome	19152-19181	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	NC_028765	Staphylococcus phage phiIPLA-RODI, complete genome	11258-11287	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	MT080589	UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW26, complete genome	24555-24584	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.29|505442|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505442-505471	30	MK504446	Lactobacillus phage SAC12B, complete genome	26437-26466	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.30|505508|31|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505508-505538	31	MK448700	Streptococcus phage Javan191, complete genome	22175-22205	8	0.742
NZ_CP016400_1	1.31|505575|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505575-505604	30	KY945241	Synechococcus phage S-H35, complete genome	154546-154575	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.31|505575|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505575-505604	30	KU594605	Cyanophage S-RIM50 isolate RW_29_0704, complete genome	81239-81268	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.31|505575|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505575-505604	30	MH107246	Synechococcus phage S-B64, complete genome	20569-20598	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.31|505575|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505575-505604	30	MW117966	Synechococcus phage S-H9-1, complete genome	135056-135085	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505641-505670	30	MN693101	Marine virus AFVG_25M559, complete genome	49390-49419	8	0.733
NZ_CP016400_1	1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505641-505670	30	MN698247	Pelagibacter phage HTVC115P, complete genome	50231-50260	8	0.733
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NZ_CP016400_1	1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505641-505670	30	MN693957	Marine virus AFVG_250M449, complete genome	7856-7885	8	0.733
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NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	LR215721	Staphylococcus phage Stab22 genome assembly, chromosome: I	151449-151478	9	0.7
NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	NC_028765	Staphylococcus phage phiIPLA-RODI, complete genome	140983-141012	9	0.7
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NZ_CP016400_1	1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	505310-505339	30	KY794642	Staphylococcus phage vB_Sau_Clo6, complete genome	110436-110465	9	0.7
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NZ_CP016400_1	1.21|504914|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	504914-504943	30	AP014170	Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C61B-MedDCM-OCT-S25-C16, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***	24405-24434	10	0.667
NZ_CP016400_1	1.21|504914|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	504914-504943	30	AP014169	Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C61B-MedDCM-OCT-S24-C48, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***	18470-18499	10	0.667
NZ_CP016400_1	1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR	504980-505009	30	NZ_CP014325	Borrelia anserina Es isolate UTHSCSA plasmid lpA89, complete sequence	59108-59137	10	0.667

1. spacer 1.7|503990|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder matches to NC_024206 (Lactobacillus phage phi jlb1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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2. spacer 1.8|504056|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder matches to NC_005355 (Lactobacillus prophage Lj965, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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******************************

3. spacer 1.8|504056|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder matches to AY459535 (Lactobacillus johnsonii prophage Lj965, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

aagatgatgtctaaatagctagccttctta	CRISPR spacer
aagatgatgtctaaatagctagccttctta	Protospacer
******************************

4. spacer 1.28|505376|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_005355 (Lactobacillus prophage Lj965, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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******************************

5. spacer 1.28|505376|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to AY459535 (Lactobacillus johnsonii prophage Lj965, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

ctgattcgttgcttgacctatctatgcctt	CRISPR spacer
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******************************

6. spacer 1.1|503594|30|NZ_CP016400|CRT matches to AJ131519 (Lactobacillus bacteriophage phi adh complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

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7. spacer 1.1|503594|30|NZ_CP016400|CRT matches to NC_000896 (Lactobacillus prophage phiadh, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

aatgggacacaccgtcattggcgatgtagt	CRISPR spacer
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**************.***************

8. spacer 1.16|504584|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN830256 (Lactobacillus phage JNU_P7, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

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9. spacer 1.30|505508|31|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_010179 (Lactobacillus johnsonii prophage Lj771, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.968

gcttaaactctttggaacttcaaaatatgct	CRISPR spacer
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*****************.*************

10. spacer 1.30|505508|31|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_024206 (Lactobacillus phage phi jlb1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.968

gcttaaactctttggaacttcaaaatatgct	CRISPR spacer
gcttaaactctttggaatttcaaaatatgct	Protospacer
*****************.*************

11. spacer 1.14|504452|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder matches to MN830256 (Lactobacillus phage JNU_P7, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

aggtcgaagtaatgttgtcaaattttatct	CRISPR spacer
aagtcgaagtgatgttgtcaaattttatct	Protospacer
*.********.*******************

12. spacer 1.18|504716|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN694392 (Marine virus AFVG_250M8, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

tttctttgacctcttttcttaactaactca-	CRISPR spacer
tttttttgacctcttttctt-attaactcat	Protospacer
***.**************** *.******* 

13. spacer 1.30|505508|31|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN830257 (Lactobacillus phage JNU_P11, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.903

gcttaaactctttggaacttcaaaatatgct	CRISPR spacer
gcttaaactcttcgggacttcaaaatatgcc	Protospacer
************.**.**************.

14. spacer 1.30|505508|31|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to DQ320509 (Lactobacillus phage KC5a, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.903

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************.** **************.

15. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to JN638751 (Bacillus phage G, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833

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 ** *.* * ************.********

16. spacer 1.6|503924|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder matches to MN693069 (Marine virus AFVG_25M392, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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********** ****** *******   *.

17. spacer 1.6|503924|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder matches to MN693225 (Marine virus AFVG_25M249, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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********** ****** *******   * 

18. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_015715 (Zymomonas mobilis subsp. pomaceae ATCC 29192 plasmid pZYMOP01, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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.* * ***  *******************.

19. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_AP019825 (Leptotrichia hofstadii strain JCM16775 plasmid pJCM16775-2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 .*  ********** *****.********

20. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP025224 (Enterococcus sp. CR-Ec1 plasmid pCREc1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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*.** *. ************* ******* 

21. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MT080590 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW27, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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* *.  .********** ************

22. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KX532239 (Staphylococcus phage StAP1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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* *.  .********** ************

23. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MT080584 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW15, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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* *.  .********** ************

24. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MT080587 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW20, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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* *.  .********** ************

25. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_022090 (Staphylococcus phage vB_SauM_Remus, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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* *.  .********** ************

26. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MT080588 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW22, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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* *.  .********** ************

27. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MT080595 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW41, partial genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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* *.  .********** ************

28. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_020877 (Staphylococcus phage vB_SauM_Romulus, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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* *.  .********** ************

29. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP013684 (Clostridium botulinum strain AM282 plasmid pRSJ10_1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 **   ************ **.********

30. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to LC492751 (Staphylococcus phage KSAP7 genomic DNA, compelete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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* *.  *********.* ************

31. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to LC492752 (Staphylococcus phage KSAP11 genomic DNA, compelete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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* *.  *********.* ************

32. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to JN638751 (Bacillus phage G, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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33. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to JN638751 (Bacillus phage G, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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  *.* *********** ***.********

34. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to JN638751 (Bacillus phage G, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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* *.*. * ************.********

35. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to JN638751 (Bacillus phage G, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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* * *. * ************ ********

36. spacer 1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_011738 (Gloeothece citriformis PCC 7424 plasmid pP742401, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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.* ***** *****************  .*

37. spacer 1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_014757 (Bacillus cereus VPC1401 plasmid pLVP1401 complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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38. spacer 1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_007105 (Bacillus cereus E33L plasmid pE33L54, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 ** .**** ************ ***** *

39. spacer 1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP040339 (Bacillus luti strain FJ plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 ** .**** ************ ***** *

40. spacer 1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP007625 (Bacillus pseudomycoides strain 219298 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 **  * * *****************.***

41. spacer 1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP009966 (Bacillus cereus E33L plasmid pBCO_2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 ** .**** ************ ***** *

42. spacer 1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP009650 (Bacillus pseudomycoides strain BTZ plasmid pBTZ_1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 **  * * *****************.***

43. spacer 1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP021438 (Bacillus thuringiensis strain C15 plasmid pBMB172, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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44. spacer 1.6|503924|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder matches to NC_019429 (Anabaena sp. 90 plasmid pANA02, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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45. spacer 1.6|503924|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder matches to MN694532 (Marine virus AFVG_250M629, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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*    *********.********* *** *

46. spacer 1.9|504122|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder matches to KM236242 (Escherichia phage Pollock, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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47. spacer 1.16|504584|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_LR215032 (Mycoplasma gallopavonis strain NCTC10186 plasmid 2) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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48. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to AP014381 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S43-C84, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.*.* .*******.********* *****.

49. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN694515 (Marine virus AFVG_250M511, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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50. spacer 1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP039706 (Clostridium butyricum strain 4-1 plasmid p-butyl_plas_4-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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51. spacer 1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP033246 (Clostridium butyricum strain CFSA3987 plasmid pCFSA3987, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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52. spacer 1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP033248 (Clostridium butyricum strain CFSA3989 plasmid pCFSA3989, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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53. spacer 1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_AP019717 (Clostridium butyricum strain NBRC 13949 plasmid pCBU1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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54. spacer 1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP039703 (Clostridium butyricum strain 29-1 plasmid p-butyl_plas_29-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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55. spacer 1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP013238 (Clostridium butyricum strain CDC_51208 plasmid pNPD4_2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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56. spacer 1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to DQ222855 (Bacillus anthracis phage Gamma isolate 53, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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57. spacer 1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to DQ289555 (Bacillus anthracis phage W Beta, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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58. spacer 1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_007814 (Bacillus phage Fah, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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59. spacer 1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to DQ150593 (Bacillus anthracis bacteriophage Fah, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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60. spacer 1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to DQ222853 (Bacillus anthracis phage Gamma isolate 51, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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61. spacer 1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MK085976 (Bacillus phage AP631, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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62. spacer 1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to DQ221100 (Bacteriophage gamma putative terminase small subunit, putative terminase large subunit, putative portal protein, putative prohead protease, putative phage structural protein, putative DNA packaging protein, putative head-tail adaptor, phage related proteins, putative major tail protein, phage related protein, putative tail tape measure protein, phage related protein, putative minor structural protein, putative holin, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase (PlyG), putative lipoprotein, putative transcriptional regulator, conserved hypothetical proteins, FtsK/SpoIIIE family protein, phage related protein, conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator, putative site-specific recombinase, conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulators, putative antirepressor, conserved hypothetical protein, putative DNA replication proteins, conserved hypothetical protein, phage related proteins, conserved hypothetical protein, putative transglycosylase, and putative endonuclease genes, complete cds) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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63. spacer 1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to DQ222851 (Bacillus anthracis phage Cherry, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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64. spacer 1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to DQ289556 (Bacillus anthracis phage Gamma isolate d'Herelle, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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65. spacer 1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_007734 (Bacillus phage WBeta, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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66. spacer 1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY963369 (Bacillus phage Tavor_SA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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67. spacer 1.23|505046|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_007458 (Bacillus phage Gamma, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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68. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019135 (Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C101, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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69. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019114 (Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803US60, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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70. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019138 (Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C107, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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71. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019122 (Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803US79, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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72. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019055 (Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C86, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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73. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019038 (Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C59, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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74. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019068 (Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803US102, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.  * ****************  ******.

75. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019137 (Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C104, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.  * ****************  ******.

76. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019157 (Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C31, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.  * ****************  ******.

77. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019087 (Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803US19, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.  * ****************  ******.

78. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019076 (Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803US112, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.  * ****************  ******.

79. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019065 (Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C99, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.  * ****************  ******.

80. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019026 (Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C42, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.  * ****************  ******.

81. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019081 (Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803US117, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.  * ****************  ******.

82. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019033 (Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C53, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.  * ****************  ******.

83. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_023584 (Synechococcus phage S-MbCM100, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.  * ****************  ******.

84. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019153 (Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C26, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.  * ****************  ******.

85. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019158 (Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C33, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.  * ****************  ******.

86. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019067 (Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803US101, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.  * ****************  ******.

87. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019039 (Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C60, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.  * ****************  ******.

88. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019030 (Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C47, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.  * ****************  ******.

89. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019163 (Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803C38, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.  * ****************  ******.

90. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019116 (Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803US62, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.  * ****************  ******.

91. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019088 (Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803US1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.  * ****************  ******.

92. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KJ019084 (Synechococcus phage ACG-2014a isolate Syn7803US123, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.  * ****************  ******.

93. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP045341 (Vibrio sp. THAF190c plasmid pTHAF190c_c, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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.  .*.*** * ******************

94. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MT080590 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW27, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 **********.***.********. * * 

95. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KX532239 (Staphylococcus phage StAP1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 **********.***.********. * * 

96. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MT080584 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW15, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 **********.***.********. * * 

97. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MT080587 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW20, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 **********.***.********. * * 

98. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MT080588 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW22, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 **********.***.********. * * 

99. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to AP013666 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C10-MedDCM-OCT-S37-C126, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 * *******.*** ************   

100. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to LC492751 (Staphylococcus phage KSAP7 genomic DNA, compelete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 **********.***.********. * * 

101. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to LC492752 (Staphylococcus phage KSAP11 genomic DNA, compelete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 **********.***.********. * * 

102. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to AP013407 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G16, isolate: uvMED-CGR-C10-MedDCM-OCT-S30-C55) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 * *******.*** ************   

103. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MF001361 (Enterococcus phage EF5, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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  *...************** .********

104. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to JN638751 (Bacillus phage G, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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  ..* ************ **.********

105. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to JN638751 (Bacillus phage G, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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  *. .************** .********

106. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MF001358 (Enterococcus phage EF1, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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  *...************** .********

107. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to AP013412 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G16, isolate: uvMED-CGR-C10A-MedDCM-OCT-S46-C61) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 * *******.*** ************   

108. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP013332 (Fusobacterium hwasookii ChDC F174 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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. ** .************ * ********.

109. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY779848 (Staphylococcus phage qdsa001, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 **********.***.********. * * 

110. spacer 1.29|505442|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN693025 (Marine virus AFVG_117M63, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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*  ****************** ****.  .

111. spacer 1.29|505442|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to LT603682 (Enterococcus faecium isolate Ef_DMG1500501 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 * * ****** ***** **********  

112. spacer 1.29|505442|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_013384 (Staphylococcus epidermidis plasmid SAP110B, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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..* ******* *************..* *

113. spacer 1.29|505442|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MG366114 (UNVERIFIED: Acinetobacter phage PBAB08, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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* *********** ******* *** . * 

114. spacer 1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP012102 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 ** .**** ************ *****  

115. spacer 1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_018687 (Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC189, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 *  ****** **********.***** .*

116. spacer 1.13|504386|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder matches to NZ_LR594691 (Variovorax sp. WDL1 plasmid 3) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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*  .   ************* ** ******

117. spacer 1.15|504518|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder matches to NC_031109 (Gordonia phage Jumbo, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 * ************.****** ***  . 

118. spacer 1.18|504716|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN694758 (Marine virus AFVG_250M853, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 .***************  ****** .*  

119. spacer 1.18|504716|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN694077 (Marine virus AFVG_250M852, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 .***************  ****** .*  

120. spacer 1.20|504848|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MH638312 (Bacillus phage Kioshi, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 ***************** *** . * ..*

121. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP015353 (Bacillus thuringiensis strain MYBT18246 plasmid p120510, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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  *************.** ******    *

122. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN693005 (Marine virus AFVG_117M50, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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. .* *******.******* ******* .

123. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN698240 (Pelagibacter phage HTVC026P, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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.*.  ***************** **.**  

124. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN694372 (Marine virus AFVG_250M1157, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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...*.************** * ******  

125. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN693584 (Marine virus AFVG_25M163, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 ***************** ** **     *

126. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_013164 (Anaerococcus prevotii DSM 20548 plasmid pAPRE01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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   ************* ****.**** .* 

127. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_030904 (Bacillus phage vB_BhaS-171, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 . ..* ****************.***.**

128. spacer 1.25|505178|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP031175 (Lactobacillus brevis strain UCCLB556 plasmid pUCCLB556_A, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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****** **************  * .*...

129. spacer 1.25|505178|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_013783 (Lactococcus lactis subsp. lactis plasmid pAR141, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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..  * ************** ****** .*

130. spacer 1.26|505244|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN693694 (Marine virus AFVG_250M548, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 . .*************** **** ** *.

131. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KT339177 (Lactococcus phage GE1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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.   *.*****.****************. 

132. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MT080601 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW72, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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133. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MT080585 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW18, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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.*   ********** ***** ******  

134. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MT080591 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW29, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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.*   ********** ***** ******  

135. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_025416 (Staphylococcus phage MCE-2014, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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.*   ********** ***** ******  

136. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_028765 (Staphylococcus phage phiIPLA-RODI, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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.*   ********** ***** ******  

137. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MT080589 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW26, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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.*   ********** ***** ******  

138. spacer 1.29|505442|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MK504446 (Lactobacillus phage SAC12B, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 ... *************** ***** **.

139. spacer 1.30|505508|31|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MK448700 (Streptococcus phage Javan191, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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 *..*  .*********.***** *******

140. spacer 1.31|505575|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY945241 (Synechococcus phage S-H35, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 .  ***** *********.********..

141. spacer 1.31|505575|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KU594605 (Cyanophage S-RIM50 isolate RW_29_0704, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 .  *** *** ****************..

142. spacer 1.31|505575|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MH107246 (Synechococcus phage S-B64, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 .  ***** *********.********..

143. spacer 1.31|505575|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MW117966 (Synechococcus phage S-H9-1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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..**. **.******************   

144. spacer 1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN693101 (Marine virus AFVG_25M559, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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   *   ******************.** *

145. spacer 1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN698247 (Pelagibacter phage HTVC115P, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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   *   ******************.** *

146. spacer 1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN693185 (Marine virus AFVG_25M398, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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   *   ******************.** *

147. spacer 1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN693957 (Marine virus AFVG_250M449, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 *** **** ************** *..  

148. spacer 1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN693267 (Marine virus AFVG_25M289, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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   *   ******************.** *

149. spacer 1.15|504518|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder matches to AP014311 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S30-C44, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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    .** ************** *****. 

150. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP011284 (Enterococcus faecium strain E39 plasmid p4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

151. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP018831 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_9 plasmid p2_ISMMS_VRE9, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

152. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP013996 (Enterococcus faecium strain 6E6 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

153. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_LR135335 (Enterococcus faecium isolate E7471 plasmid 5) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

154. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP025755 (Enterococcus faecium strain AALTL plasmid pEFA-790c, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

155. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_LR135281 (Enterococcus faecium isolate E6975 plasmid 4) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

156. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_LR135477 (Enterococcus faecium isolate E8423 plasmid 3) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

157. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP040708 (Enterococcus faecium strain HOU503 plasmid p2) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

158. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP035650 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_08 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

159. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP035644 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_01 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

160. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_LR135310 (Enterococcus faecium isolate E7240 plasmid 4) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

161. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP016166 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_11 plasmid ISMMS_VRE11_p3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

162. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP018825 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_12 plasmid p2_ISMMS_VRE12, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

163. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP023796 (Enterococcus faecium strain Efaecium_ER04484.3A plasmid pER04484.3A.2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

164. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_KX810025 (Enterococcus faecium strain Efm008 plasmid pJEG040, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

165. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_KX574671 (Enterococcus faecium strain V24 plasmid pHvH-V24, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

166. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_KY554216 (Enterococcus faecium strain Efa-125 plasmid pEfa-125gr, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

167. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_KY595962 (Enterococcus faecium strain VREfm1 plasmid pPEC286, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

168. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_KY595966 (Enterococcus faecium strain VREfm81 plasmid pBUD102, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

169. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_021170 (Enterococcus faecium plasmid pF856, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

170. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP014452 (Enterococcus faecium strain ATCC 700221 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

171. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP044266 (Enterococcus faecium strain V1836 plasmid pHVH-V1836-2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

172. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_014959 (Enterococcus faecium plasmid pS177, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

173. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP035661 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_09 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

174. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP035667 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_20 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

175. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP033209 (Enterococcus faecium strain RBWH1 plasmid pRBWH1.3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

176. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP012464 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_7 plasmid ISMMS_VRE7_p4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

177. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP012431 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_1 plasmid ISMMS_VRE_p2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .  ***************** **** . 

178. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to AP013758 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C27-MedDCM-OCT-S40-C101, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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...  ***************** **.**  

179. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP012104 (Bacillus thuringiensis strain HS18-1 plasmid pHS18-5, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .. ****** ******** ******* .

180. spacer 1.24|505112|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MG945533 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 2359-1801, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  .   ****** *.************** 

181. spacer 1.26|505244|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP032411 (Brevibacillus laterosporus strain E7593-50 plasmid pAZOBL1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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  ******** ************ .*. ..

182. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MT080592 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW3, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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183. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MT080603 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW9, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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184. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MT787017 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage WV, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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185. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MT080596 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW42, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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186. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MT080593 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW36, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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187. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MT080597 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW5, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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188. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MT080598 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW6, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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189. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to LR215721 (Staphylococcus phage Stab22 genome assembly, chromosome: I) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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190. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to LR215721 (Staphylococcus phage Stab22 genome assembly, chromosome: I) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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191. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_028765 (Staphylococcus phage phiIPLA-RODI, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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192. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MT080599 (UNVERIFIED: Staphylococcus phage vB_SauM_EW7, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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ggctccttaaccttatatctatattatact	Protospacer
.....************* **.******..

193. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MK417515 (Staphylococcus virus Sa87, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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.....************* **.******..

194. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MK417515 (Staphylococcus virus Sa87, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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.....************* **.******..

195. spacer 1.27|505310|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY794642 (Staphylococcus phage vB_Sau_Clo6, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

aatctcttaaccttatatatacattatatc	CRISPR spacer
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.....************* **.******..

196. spacer 1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP046704 (Nostoc sp. ATCC 53789 plasmid pNsp_a, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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***************  ******.. ..  

197. spacer 1.32|505641|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to AP014382 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-U-MedDCM-OCT-S43-C95, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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   .   ******************.** *

198. spacer 1.21|504914|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to AP014171 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C61B-MedDCM-OCT-S44-C38, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 10, identity: 0.667

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.  .. ****************.**** . 

199. spacer 1.21|504914|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to AP014170 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C61B-MedDCM-OCT-S25-C16, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 10, identity: 0.667

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.  .. ****************.**** . 

200. spacer 1.21|504914|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to AP014169 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C61B-MedDCM-OCT-S24-C48, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 10, identity: 0.667

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ttaaacctacgtttgcaggtatattaacat	Protospacer
.  .. ****************.**** . 

201. spacer 1.22|504980|30|NZ_CP016400|CRT,CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP014325 (Borrelia anserina Es isolate UTHSCSA plasmid lpA89, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.667

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    ** ******************    .

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	21972 : 39629	17	Streptococcus_phage(91.67%)	tRNA	NA
DBSCAN-SWA_2	43302 : 52659	12	Streptococcus_phage(88.89%)	integrase,transposase	attL 43067:43082|attR 55223:55238
DBSCAN-SWA_3	77739 : 183463	108	Lactobacillus_prophage(42.19%)	capsid,integrase,head,terminase,tRNA,protease,tail,portal,transposase	attL 100966:100983|attR 155082:155099
DBSCAN-SWA_4	1381736 : 1426213	47	Bacillus_phage(27.27%)	protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_5	1517063 : 1525789	8	Phaeocystis_globosa_virus(33.33%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_6	1584873 : 1644939	50	Bacillus_phage(16.67%)	holin,tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_7	1681368 : 1741894	39	Staphylococcus_virus(40.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_8	1802945 : 1855126	44	uncultured_virus(25.0%)	tRNA,transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP016400|21972:39629|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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MILKYPENICMLCIPMVMHKNPSDKSIYHWDFYALLGF
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MELKFVIPNMEKTFGNLEFAGEDKVVQRRINGRLTVLSRSYNLYSDVQRADDIVVVLPAEAGEKHFGFEERVKLVNPRITAEGYKIGTRGFTNYLLHADDMIKE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_004897108.1|23489_23762_+	30S ribosomal protein S16	NA	NA	NA	NA
WP_004895297.1|23830_24352_+	ribosome maturation factor RimM	NA	NA	NA	NA
WP_004895296.1|24341_25064_+|tRNA	tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD	NA	NA	NA	NA
WP_003647502.1|25177_25528_+	50S ribosomal protein L19	NA	NA	NA	NA
WP_000420682.1|25924_26239_+	YdcP family protein	A0A1S5SF38	Streptococcus_phage	5.2e-54	100.0
WP_000985015.1|26254_26641_+	YdcP family protein	A0A1S5SF96	Streptococcus_phage	3.0e-64	100.0
WP_000813488.1|26669_28055_+	DNA translocase FtsK	A0A1S5SFB5	Streptococcus_phage	1.1e-265	100.0
WP_000398284.1|28231_29437_+	replication initiation factor domain-containing protein	A0A1S5SEX3	Streptococcus_phage	2.8e-233	100.0
WP_001009056.1|29479_29701_+	hypothetical protein	A0A1S5SEY0	Streptococcus_phage	4.3e-31	100.0
WP_000342539.1|29817_30315_+	antirestriction protein ArdA	A0A1S5SF25	Streptococcus_phage	1.7e-91	100.0
WP_000331160.1|30778_33226_+	ATP-binding protein	A0A1S5SF64	Streptococcus_phage	0.0e+00	100.0
WP_001574271.1|33228_35406_+	YtxH domain-containing protein	A0A1S5SF30	Streptococcus_phage	2.4e-307	85.6
WP_001574272.1|35402_36404_+	lysozyme family protein	A0A1S5SEZ8	Streptococcus_phage	2.5e-190	99.7
WP_001224318.1|36400_37333_+	conjugal transfer protein	A0A1S5SF22	Streptococcus_phage	3.1e-171	99.4
WP_001791010.1|37577_37694_+	tetracycline resistance determinant leader peptide	NA	NA	NA	NA
WP_069168329.1|37709_39629_+	tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(M)	A0A1S5SF82	Streptococcus_phage	0.0e+00	99.4

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP016400|43302:52659|DBSCAN-SWA
TATGTGTCCTAATAGTAGCATTTATTCAGATGAAAAATCAAGGGTTTTAGTGGACAAGACAAAAAGTGGAAAAGTGAGACCATGGAGAGAAAAGAAAATCGCTAATGTTGATTACTTTGAACTTCTGCATATTCTTGAATTTAAAAAGGCTGAAAGAGTAAAAGATTGTGCTGAAATATTAGAGTATAAACAAAATCGTGAAACAGGCGAAAGAAAGTTGTATCGAGTGTGGTTTTGTAAATCCAGGCTTTGTCCAATGTGCAACTGGAGGAGAGCAATGAAACATGGCATTCAGTCACAAAAGGTTGTTGCTGAAGTTATTAAACAAAAGCCAACAGTTCGTTGGTTGTTTCTCACATTAACAGTTAAAAATGTTTATGATGGCGAAGAATTAAATAAGAGTTTGTCAGATATGGCTCAAGGATTTCGCCGAATGATGCAATATAAAAAAATTAATAAAAATCTTGTTGGTTTTATGCGTGCAACGGAAGTGACAATAAATAATAAAGATAATTCTTATAATCAGCACATGCATGTATTGGTATGTGTGGAACCAACTTATTTTAAGAATACAGAAAACTACGTGAATCAAAAACAATGGATTCAATTTTGGAAAAAGGCAATGAAATTAGACTATGATCCAAATGTAAAAGTTCAAATGATTCGACCGAAAAATAAATATAAATCGGATATACAATCGGCAATTGACGAAACTGCAAAATATCCTGTAAAGGATACGGATTTTATGACCGATGATGAAGAAAAGAATTTGAAACGTTTGTCTGATTTGGAGGAAGGTTTACACCGTAAAAGGTTAATCTCCTATGGTGGTTTGTTAAAAGAAATACATAAAAAATTAAACCTTGATGACACAGAAGAAGGCGATTTGATTCATACAGATGATGACGAAAAAGCCGATGAAGATGGATTTTCTATTATTGCAATGTGGAATTGGGAACGGAAAAATTATTTTATTAAAGAGTAGTTCAACAAACGGGCCATATTGTTGTATAAGTGATGAAATACTGAATTTAAAACTTAGTTTATATGTGGTAAAATGTTTTAATCAAGTTTAGTATAGTGGTATAAAGTCAAGAAACTTTTTCAATAAATTTTCTTGACCAACCTACATTGAAGACGCACTCAAATAAGCCTAGCTAATTGAAGCGTTTTCGCTAGGTGCTCACCAAGAAAATTGCATCTAGAATCATGTTATTCTAACTCTCCACGCTCCTTGGGGACGTATAGAGTTGATGGTTACGTAGCAGCGTATCCACCAGACGCACAAATTTTCTTGCAGTTAAGACGATAGCACGTTTATGTTGGTGTTTTGGCGTTTCTTGGTACTTCTTACGATAAAATTCATTATATTCAGGGAGATGTCTTCTTACAGAATTGGCGGCTTCAATTAAGTAATACCGAAGATATCTGTTCCCACGCTTCGTAAGAGGGGTATTTTCCGATTTATAGTTACCAGATTCGCTCTTTTTCCAATGTAAACCGGCATATTTAGCCAACTTTGCTTGATTTTCAAAGCGTTCTATTTGACCCACTTCAGCGATAATGCCAGCAGCGTAGACAAGTCCCACTCCCGGAATACTCGTTAAACATTGGTATTCAGGCATAGCTTTCACAATGCGTTCAATTCCTTTTTCTAGTTGTTTAATTGAAGCTTCCAATGAACGCATTTGTCCAACTAGCGTCGCCAAAACGATATCAATGGATGTCTCAAACGTTGGACTTAATCGATAGGAAGAACGAATGGCTTTTTGGATAGTTTTAGCCAATTTCTCAGGATGCTTAAAGCGCCCACGACCGAGTGTCTGAAGTGTTTCAGCTAGCTTGTTCAAAGGTAGCTGGGCAATTTCATCCAACCCCATATCTGAAGTTATTAATTCAATGATAGATGTGCTAAACACCGTAGTGGATAGACTTTCTTCATCACGAAGTTCTCTTGATAAGGTATTACATTTATAATAGAGATTTTCAATGAAATGTTGTTTGGTCTCCACTAACATATTTACCAATTGCATTCTTGATCGTGTTAATCGCTGAAGCGATAGGAATTGTTCTTCTTTTAATGGAGAATGGCTATAGCGTTCAGAACGAAGAAAATCTGCGATAAAAAAGGCATCGTTGGTATCTGTTTTATCTGCATTGAATACTTTGGCGTAGTTGTGAATTTTGAATGGATCTTCAATAGTCACCACACAATGCATATTTTTTAAGTCCTCATCTTCATGAAAGAAAATCAATGGATGGGCACTATACATGGAAGTAGATTCCATTCCTATGACCACTTTATCGAAGGCAAACTGCTCAAACATATTGACAATCGTTTCTTTGATTTGAGTTGCGCCTTCTATATCGTTGGCATAGCTTCCTTGATGAAGGATAGTTAATGTATCCGTAAGGAAGCAAGCATCTAATTTATCAGAACTAACATCTAAACCTACAAATAATTTCATGGAAGGGACCTCCTTTCTTGATTGAATTAGGAAAGACTACGATACTGCGGGCATCCCAAGATACACGTTGTATAACCAAAACCTCGCCTACTAGAATACTAATGTTTATCAAAAACAAGCCGCACTTCTATCTACTACTAGAAGCTGTTTCAGATAAACCAAACAGATAGTGTGTTGGTAGTTATATCAACGGTCTGGGGAGCATACTTTTAAACGAAGACTAGTATATTACCAGCGACAGGAGGAAATAGTACAATCCCATGCGGATCCTTTCCGCTGACTATTGTATCTTGAAATCCACGCAATATCGAGTCATTAAACCTAATTTTGTTATTTCTGTATAAATATATTTTTTAACGAACGGGAGAGATTGATGTCTCCTAAAACTTATTTTACGAGGAGGAGATAGTTATTATAAACTACAAGTGGATATTGTGTCCTGTATGTGGAAATAAAACACGATTAAAGATAAGGGAAGATACTGAATTAAAAAAATTCCCCCTCTATTGTCCGAAATGCAGACAAGAAAATTTAATTGAAATAAAGCAGTTCAAAGTAACTGTGATTACAGAGCCAGACGCAAAGACGCAGAGCCGATAAAATGAGATTAATACAATCTCATTTTATCGGCTCTTTCCGTTATGTATGGATTCTTTTAATTAGTCTTCGATGTTTCTTGCTTCGTTGATACCGCTGGCTAAAGATTCCATTAAGGATAGTTCTTTGTCTGTAAAGCTATCCATGTATTTCTCTATCTGTAATCGTCGGGTGCTTTTTACCAAGTTATTAGCAGGTAAGAAAAATTCATCAACGGAAACATGAAGTAACGATACAAGGTCATAAAGAACTTGTATGCTGGGGTGTTGCCCTTTATTTTCAATATTAGTTAAGTACCGTGGGTCAATTTCAATCAATGCTCCCACTTGTTCACGAGTTAAACCTCGTTTCAATCGAGCTTCTTTAATGGCTAAACCAAAGGCTCTAAAATCATATTTATCTTCTTTTTTACGCATAGTAGACCACCTCTATACATTTTATTGTTCCTACTGAATTAAAAACAGGTATAGAAAAACGTGTTATATGGTTTATAGGTTTATATTTAATAAAAAGCACTACTAAACGCCAATAAAAAAAACCGTTATATGGTAGTGCTATTTACGCTGTTAAAATATTGTATATTACTTCCAAATGGCGGTTTGTTGGAGGTCAACGTCGCCATGAAGTACATCATATACAATAAATTTCCTTACATTGGGTTCTTGTCAAAAAAAGTCGTCTATCTGCAATAGATAAGTACGTCCACCAATGTGGTTTTATAAATCATATAGATAGAATAACAGAAGCATGTAAACAGAGAAATAAATCTGTTTATATGCTTTTTTGGCTATTCAGAACTTTTTTACAAAGTTTATTTATCAGTAATGCAACAAATCCCCCTTTCACATTGGGACTAAGAGTGAAAGGAGATAAACGAGCAAGGCTCACTTCCTTTCCTAGACAGAAAGGGGGTGAGAAACATGAAACCATCTTCTTTTCAGACCACAATAGAAAATCAGTTTGACTATATCTGTAAACGTGCTATGGAAGACGAGCGAAAGAATTATATGCTTTATCTTTCAAGGATTGCAAAGCGTGAGGTGTCCTTTTCGGATGTTGGCGATTATCTTGTTAGCCAGTTTGCGACAACAGATAACTATTCAACTGACTTTCAGATTTTTACACTCAATGGGTTATCAGTAGGCGTTGAAAATGATTTGTTGAGTGAAGCATTACGTGAGTTGCCAGACAAGAAACGTGAAATTCTACTGCTGTTTTACTTTATGGACATGAGCGATTCAGAAATTGCAGACCTGTTGAAATTGAACCGTTCTACTGTCTATCGGCATAGAACCAGTGGACTAGCCTTAATTAAAAAGTTTATGGAGGAATTTGAAGAATGAAAACACAATATCCTATGATTCCCTTTCCTCTCATTGTAAAGGCAACAGATGGCGATACCGAAGCGATTAACCAGATTCTACATCATTACAGAGGGTACATAACGAAGCGTTCCCTACGACTTATGAAAGATGAATATGGCAATCAAAGTATGGTCGTTGATGAAGTCTTACGTGGAAGAATGGAAACCAGACTGATTACAAAGATTTTGTCATTTGAAATTAAGTAATATCCTCTCTCCTTTCGTGGAAGCGTGCTAAACCATTCCACGCTTCCCGAACAGGGAGGTTTGTTATTCCACCAAAGCATATTGAGCTTTCAATGTGTTTTGATAGGCTAACGAGCCATTGTTCTTTGAAAACTGAATAAAAGTAATCGAATACGTTTCGATAAGAAAAGAGCCAACGGAACTAACCGCCATGACCTATCTTATAAAGATAGCGAGCGATTCATGTTAGTGATCCGAGAAGCAATCTTTAGCAGGATTGCCTGCAACGACATTCTTATCGTGATAATGATACTCCCATACAGTCAATAGTCCGAGCGTGATAAAACCGTCGCAGGCAATGAGTATGGCTACATGAGAACCATGCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP016400|43302:52659|46201_46369_+|WP_000336323.1|DBSCAN-SWA
MCPVCGNKTRLKIREDTELKKFPLYCPKCRQENLIEIKQFKVTVITEPDAKTQSR
>NZ_CP016400|43302:52659|52035_52659_-|WP_011162245.1|DBSCAN-SWA
MTEPHANKQLEILRFIYDTVEERAFPPTVREICSAVDLSSTSTVHGHLARLEKKGYILKDATKPRAIEVTEKGREALGIKPKDIPVVGVVTAGQPILAVQDIDEYFPLPPDLENDAGELFMLRVHGESMINAGILNGDHVIVRKQSSANNGEIVVAMTEDNEATVKRFFKEDGYYRLQPENDTMDPIILPVVQILGKVVGLYRNNID
>NZ_CP016400|43302:52659|47286_47709_+|WP_000804885.1|DBSCAN-SWA
MKPSSFQTTIENQFDYICKRAMEDERKNYMLYLSRIAKREVSFSDVGDYLVSQFATTDNYSTDFQIFTLNGLSVGVENDLLSEALRELPDKKREILLLFYFMDMSDSEIADLLKLNRSTVYRHRTSGLALIKKFMEEFEE
>NZ_CP016400|43302:52659|50114_50756_-|WP_004897109.1|DBSCAN-SWA
MKKQEQSESWGQWILQVLILVAIFFGIFFVLNKYVFANLTVSGISMQPTFENNDRVIALRHAKIKEGDIVIVDAPDEPGALYIKRVIGLPGDTIVSKNNQIYINGKKLNQPWLKAGQKLIDNGEDGISGTKYTNTQNFTLSSLAKTQNYRQFYTSKQLKEMQKTNKVPANTYFVMGDHRSVSKDSRYIGTIPRSKIVGVVKMRYWPLNHITFY
>NZ_CP016400|43302:52659|48681_49899_+|WP_001291561.1|integrase|DBSCAN-SWA
MSEKRRDNKGRILKTGESQRKDGRYLYKYIDSFGEPQFVYSWKLVATDRVPAGKRDCISLREKIAELQKDIHDGIDVVGKKMTLCQLYAKQNAQRPKVRKNTETGRKYLMDILKKDKLGVRSIDSIKPSDAKEWAIRMSENGYAYQTINNYKRSLKASFYIAIQDDCVRKNPFDFQLKAVLDDDTVPKTVLTEEQEEKLLAFAKADKTYSKNYDEILILLKTGLRISEFGGLTLPDLDFENRLVNIDHQLLRDTEIGYYIETPKTKSGERQVPMVEEAYQAFKRVLANRKNDKRVEIDGYSDFLFLNRKNYPKVASDYNGMMKGLVKKYNKYNEDKLPHITPHSLRHTFCTNYANAGMNPKALQYIMGHANIAMTLNYYAHATFDSAMAEMKRLNKEKQQERLVA
>NZ_CP016400|43302:52659|47705_47936_+|WP_000857133.1|DBSCAN-SWA
MKTQYPMIPFPLIVKATDGDTEAINQILHHYRGYITKRSLRLMKDEYGNQSMVVDEVLRGRMETRLITKILSFEIK
>NZ_CP016400|43302:52659|48396_48600_+|WP_000814511.1|DBSCAN-SWA
MKQTDIPIWERYTLTIEEASKYFRIGENKLRRLAEENKNANWLIMNGNRIQIKRKQFEKIIDTLDAI
>NZ_CP016400|43302:52659|44518_45769_-|WP_001573639.1|transposase|DBSCAN-SWA
MKLFVGLDVSSDKLDACFLTDTLTILHQGSYANDIEGATQIKETIVNMFEQFAFDKVVIGMESTSMYSAHPLIFFHEDEDLKNMHCVVTIEDPFKIHNYAKVFNADKTDTNDAFFIADFLRSERYSHSPLKEEQFLSLQRLTRSRMQLVNMLVETKQHFIENLYYKCNTLSRELRDEESLSTTVFSTSIIELITSDMGLDEIAQLPLNKLAETLQTLGRGRFKHPEKLAKTIQKAIRSSYRLSPTFETSIDIVLATLVGQMRSLEASIKQLEKGIERIVKAMPEYQCLTSIPGVGLVYAAGIIAEVGQIERFENQAKLAKYAGLHWKKSESGNYKSENTPLTKRGNRYLRYYLIEAANSVRRHLPEYNEFYRKKYQETPKHQHKRAIVLTARKFVRLVDTLLRNHQLYTSPRSVES
>NZ_CP016400|43302:52659|43302_44286_+|WP_000336291.1|DBSCAN-SWA
MCPNSSIYSDEKSRVLVDKTKSGKVRPWREKKIANVDYFELLHILEFKKAERVKDCAEILEYKQNRETGERKLYRVWFCKSRLCPMCNWRRAMKHGIQSQKVVAEVIKQKPTVRWLFLTLTVKNVYDGEELNKSLSDMAQGFRRMMQYKKINKNLVGFMRATEVTINNKDNSYNQHMHVLVCVEPTYFKNTENYVNQKQWIQFWKKAMKLDYDPNVKVQMIRPKNKYKSDIQSAIDETAKYPVKDTDFMTDDEEKNLKRLSDLEEGLHRKRLISYGGLLKEIHKKLNLDDTEEGDLIHTDDDEKADEDGFSIIAMWNWERKNYFIKE
>NZ_CP016400|43302:52659|50957_51377_+|WP_069168331.1|DBSCAN-SWA
MHEYSAGSIVYRIKNNKIEFLLVQSRLNRTWGFPKGHLEKDENNVQAAQREVYEEVGLKPDYDFDFEESITYKIARDRLKTVTLFLSRFNPDQKIELQKSEIRDYKWAALAEANSCLNYEELKELLKKAQEYIENEISR
>NZ_CP016400|43302:52659|51360_51999_+|WP_069169036.1|DBSCAN-SWA
MKYPDKLLAEVKERSKGMKLEGINFGAGPVHPKLMIVGEAPGREEIESLIPFHGASGKELMKSLASIGLKREDVYITSAVRSRPYSIKHTFSKKENKEVINYPNRKPTKKEILAHAPFLDYEIKFVKPKIIVTVGTTALTRLLDDKYEISNVHGKIIENTPILELNDKKDGYIWSKEKYIVVPQYHPAAVFYNRKLAEVIAQDWLNVKPLIK
>NZ_CP016400|43302:52659|46428_46782_-|WP_001227347.1|DBSCAN-SWA
MRKKEDKYDFRAFGLAIKEARLKRGLTREQVGALIEIDPRYLTNIENKGQHPSIQVLYDLVSLLHVSVDEFFLPANNLVKSTRRLQIEKYMDSFTDKELSLMESLASGINEARNIED

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
43067:43082	attL	NA	NA	NA	NA
WP_000336291.1|43302_44286_+	protein rep	A0A286QS97	Streptococcus_phage	6.1e-08	62.0
WP_001573639.1|44518_45769_-|transposase	IS110 family transposase	M1NSC9	Streptococcus_phage	2.0e-109	59.4
WP_000336323.1|46201_46369_+	cysteine-rich KTR domain-containing protein	D0R0F6	Streptococcus_phage	1.6e-14	68.0
WP_001227347.1|46428_46782_-	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A1S5SFA6	Streptococcus_phage	1.3e-58	100.0
WP_000804885.1|47286_47709_+	sigma-70 family RNA polymerase sigma factor	A0A1S5SEW0	Streptococcus_phage	2.5e-72	100.0
WP_000857133.1|47705_47936_+	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A1S5SEX1	Streptococcus_phage	2.7e-36	100.0
WP_000814511.1|48396_48600_+	excisionase	A0A1S5SF07	Streptococcus_phage	4.0e-31	100.0
WP_001291561.1|48681_49899_+|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	A0A1S5SEW7	Streptococcus_phage	3.7e-233	100.0
WP_004897109.1|50114_50756_-	signal peptidase I	NA	NA	NA	NA
WP_069168331.1|50957_51377_+	NUDIX domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_069169036.1|51360_51999_+	uracil-DNA glycosylase	NA	NA	NA	NA
WP_011162245.1|52035_52659_-	transcriptional repressor LexA	A0A1B2APZ1	Phage_Wrath	3.2e-15	56.3
55223:55238	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP016400|77739:183463|DBSCAN-SWA
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MKGIVIEVIDNLGAAIKKRRRSLRMTQEDLAEFSSLSVNFISKIERTGNQNISIQKLDAIAKALQTSVITLIDESSKTPEPQAFASKLSNDRVFLDKLTNDMKKLPVEQEEALAKSFITIINTFAKEDK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_069168337.1|78645_79584_+	riboflavin biosynthesis protein RibF	NA	NA	NA	NA
WP_069168338.1|79842_81354_+	ABC-F family ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2I4R674	Erysipelothrix_phage	4.9e-25	24.9
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WP_012845970.1|82137_83196_+	heat-inducible transcriptional repressor HrcA	NA	NA	NA	NA
WP_004897146.1|83207_83786_+	nucleotide exchange factor GrpE	NA	NA	NA	NA
WP_004897147.1|83803_85678_+	molecular chaperone DnaK	G8DDB7	Micromonas_pusilla_virus	1.1e-135	46.3
WP_004897148.1|85757_86924_+	molecular chaperone DnaJ	A0A1V0SBY2	Catovirus	4.4e-13	21.6
WP_014567315.1|87069_88908_+	elongation factor 4	E4ZFJ7	Streptococcus_phage	2.4e-21	25.1
WP_069168340.1|89075_89765_+	class A sortase	NA	NA	NA	NA
WP_004897151.1|89864_92135_+	single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ	A7KV88	Bacillus_phage	1.9e-81	34.1
WP_004897152.1|92269_92797_+	adenine phosphoribosyltransferase	A0A1V0SKE5	Klosneuvirus	1.4e-24	39.3
WP_069168341.1|92921_94430_+	glutamate/gamma-aminobutyrate family transporter YjeM	NA	NA	NA	NA
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WP_069168344.1|97074_97578_+	dihydrofolate reductase	G3MBI7	Bacillus_virus	5.3e-24	39.2
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WP_069168346.1|99171_101439_-	HAD-IC family P-type ATPase	M1I547	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	8.4e-45	26.0
100966:100983	attL	NA	NA	NA	NA
WP_004897158.1|101562_102411_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_069168347.1|102870_104046_-|integrase	site-specific integrase	Q6SEG4	Lactobacillus_prophage	1.1e-221	99.0
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WP_069169037.1|104463_104691_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_069169039.1|106920_107343_-	hypothetical protein	Q6SEF7	Lactobacillus_prophage	5.3e-46	69.3
WP_069168350.1|107332_107773_-	helix-turn-helix domain-containing protein	Q6SEF6	Lactobacillus_prophage	1.0e-71	93.8
WP_069168351.1|107947_108169_+	DUF739 family protein	Q6SEF5	Lactobacillus_prophage	5.1e-32	90.4
WP_069168352.1|108198_108996_+	ORF6N domain-containing protein	Q9T1J2	Lactobacillus_phage	7.2e-52	69.8
WP_069168353.1|108998_109211_+	hypothetical protein	Q9T1J1	Lactobacillus_phage	1.1e-28	88.6
WP_069168354.1|109613_109823_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168355.1|109879_110107_+	zinc ribbon domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168356.1|110201_110411_+	helix-turn-helix domain-containing protein	Q6SE97	Lactobacillus_prophage	2.8e-32	98.6
WP_172821770.1|110570_110744_+	hypothetical protein	Q20DG5	Lactobacillus_phage	1.2e-15	82.0
WP_069168357.1|110767_111109_+	hypothetical protein	L0P7D6	Lactobacillus_phage	5.0e-26	58.3
WP_082224949.1|111124_111610_+	siphovirus Gp157 family protein	A0A0A1EL06	Lactobacillus_phage	8.3e-27	42.1
WP_069168358.1|111623_112487_+	ERF family protein	A0A2D1GPH8	Lactobacillus_phage	3.8e-22	43.0
WP_069168359.1|112495_113284_+	conserved phage C-terminal domain-containing protein	X2CYF1	Lactobacillus_phage	5.7e-41	42.2
WP_069168360.1|113296_114097_+	ATP-binding protein	B8R682	Lactobacillus_phage	9.8e-65	49.4
WP_069168361.1|114121_114472_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_082224951.1|114479_115628_+|integrase	site-specific integrase	A8ATM2	Listeria_phage	5.2e-59	38.5
WP_069168362.1|115629_116271_+	methylase	L0P368	Streptococcus_phage	7.6e-52	46.4
WP_155762253.1|116254_116440_+	sporulation protein Cse60	NA	NA	NA	NA
WP_069168363.1|116474_116753_+	hypothetical protein	Q9T1H3	Lactobacillus_phage	1.6e-19	73.4
WP_069168364.1|116755_117022_+	hypothetical protein	X2CYF2	Lactobacillus_phage	4.3e-09	46.1
WP_069169042.1|117021_117219_+	hypothetical protein	Q9T1H0	Lactobacillus_phage	1.6e-29	87.7
WP_069168365.1|117215_117422_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155762235.1|117415_117589_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155762236.1|117601_117955_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168367.1|118028_118328_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168368.1|118529_118751_+	hypothetical protein	A9D9P7	Lactobacillus_prophage	8.7e-24	80.8
WP_069168369.1|118938_119256_+	hypothetical protein	A9D9Q0	Lactobacillus_prophage	1.6e-26	60.9
WP_069168370.1|119258_119483_+	hypothetical protein	Q20DE8	Lactobacillus_phage	3.4e-23	77.8
WP_167739989.1|119463_119631_+	hypothetical protein	Q20DE7	Lactobacillus_phage	1.7e-19	80.0
WP_069168371.1|119652_120156_+	hypothetical protein	A9D9Q7	Lactobacillus_prophage	7.2e-90	95.8
WP_155762237.1|121409_121574_+	transmembrane Fragile-X-F protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168372.1|121653_122508_+|terminase	terminase small subunit	Q6SE85	Lactobacillus_prophage	1.7e-131	84.9
WP_069168373.1|122494_123769_+|terminase	PBSX family phage terminase large subunit	Q6SE84	Lactobacillus_prophage	1.6e-247	94.8
WP_069168374.1|123784_125284_+|portal	phage portal protein	Q6SE83	Lactobacillus_prophage	7.5e-252	87.2
WP_082224953.1|125213_125501_+|protease	ribosomal-processing cysteine protease Prp	Q6SE82	Lactobacillus_prophage	6.0e-33	74.7
WP_069168375.1|125507_126611_+|capsid	minor capsid protein	Q6SE81	Lactobacillus_prophage	1.7e-155	77.3
WP_069168376.1|126603_126795_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168377.1|126923_127574_+	DUF4355 domain-containing protein	Q6SE80	Lactobacillus_prophage	1.0e-75	73.1
WP_069168378.1|127576_127945_+	hypothetical protein	Q6SE79	Lactobacillus_prophage	9.1e-58	93.4
WP_069168379.1|127962_129012_+|capsid	major capsid protein	Q6SE78	Lactobacillus_prophage	4.4e-190	96.6
WP_069169043.1|129039_129339_+|head,tail	phage head-tail connector protein	Q6SE77	Lactobacillus_prophage	2.5e-37	78.8
WP_069168380.1|129335_129689_+	hypothetical protein	Q6SE76	Lactobacillus_prophage	9.3e-52	81.2
WP_069168381.1|129681_130230_+	HK97 gp10 family phage protein	Q6SE75	Lactobacillus_prophage	1.1e-83	84.0
WP_069168382.1|130230_130599_+	hypothetical protein	Q6SE74	Lactobacillus_prophage	5.5e-55	88.5
WP_069168383.1|130602_131094_+|tail	phage tail protein	Q6SE73	Lactobacillus_prophage	4.6e-73	88.0
WP_069168384.1|131159_131570_+	hypothetical protein	Q6SE72	Lactobacillus_prophage	3.1e-67	96.3
WP_069168385.1|131662_131956_+	hypothetical protein	Q6SE71	Lactobacillus_prophage	6.8e-48	99.0
WP_069168386.1|131955_138021_+	lytic transglycosylase	Q6SE70	Lactobacillus_prophage	0.0e+00	97.3
WP_004897007.1|138038_138395_+	hypothetical protein	Q6SE69	Lactobacillus_prophage	1.3e-61	100.0
WP_004897009.1|144226_144379_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168387.1|144362_144623_+	hypothetical protein	Q6SE67	Lactobacillus_prophage	1.6e-37	95.3
WP_069168388.1|144622_145021_+	hypothetical protein	B8R662	Lactobacillus_phage	3.3e-13	30.3
WP_004897012.1|145034_145253_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004897013.1|145249_145594_+	hypothetical protein	Q38316	Lactobacillus_phage	7.2e-49	90.4
WP_069168389.1|145597_146551_+	SH3 domain-containing protein	Q6SE63	Lactobacillus_prophage	1.3e-108	60.6
WP_004897159.1|147121_147706_+	phosphatase PAP2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_004897160.1|147883_149170_+	phosphopyruvate hydratase	A0A1X9I5Z8	Streptococcus_phage	2.6e-107	51.7
WP_172821771.1|149283_149565_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168390.1|149631_151254_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	2.2e-47	26.6
WP_069168391.1|151451_152729_+|transposase	ISL3 family transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	1.1e-49	33.3
WP_004897162.1|152819_153800_+	choloylglycine hydrolase family protein	M1HS66	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	1.2e-24	29.5
WP_011162169.1|153849_154239_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_004897164.1|154468_155320_-	DNA/RNA non-specific endonuclease	NA	NA	NA	NA
155082:155099	attR	NA	NA	NA	NA
WP_004897165.1|155319_156024_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168392.1|156441_157296_+	MetQ/NlpA family ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168393.1|157312_158362_+	methionine ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.1e-31	37.4
WP_004897168.1|158354_159056_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_053107141.1|159192_160599_+	class II fumarate hydratase	NA	NA	NA	NA
WP_069168394.1|160613_161987_+	flavocytochrome c	M1HTN0	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	2.1e-46	30.8
WP_069168395.1|163100_164483_+	threonine/serine exporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011162159.1|164576_165602_+	asparaginase	NA	NA	NA	NA
WP_069168396.1|168126_169818_+	cell division protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168397.1|169882_170386_-|tRNA	Cys-tRNA(Pro) deacylase	NA	NA	NA	NA
WP_069168398.1|170447_171395_+	50S ribosomal protein L11 methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_004895134.1|171427_171808_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168399.1|171825_174075_+	bifunctional (p)ppGpp synthetase/guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase	A0A1X9SH80	Bradyrhizobium_phage	5.6e-09	41.4
WP_061399931.1|174074_174512_+|tRNA	D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase	NA	NA	NA	NA
WP_069168400.1|174794_176081_+|tRNA	histidine--tRNA ligase	A0A1V0S921	Catovirus	1.4e-28	27.2
WP_012846053.1|176082_177936_+|tRNA	aspartate--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_069168401.1|178051_179329_-|transposase	ISL3-like element ISLjo2 family transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	1.1e-49	33.6
WP_069168402.1|179481_180666_-	aminotransferase class I/II-fold pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_069168403.1|180772_181201_+	peptide-methionine (R)-S-oxide reductase MsrB	NA	NA	NA	NA
WP_069168404.1|181205_181967_+	SGNH/GDSL hydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168405.1|182413_183463_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	2.6e-49	35.9

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP016400|1381736:1426213|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

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MRKGENYNTGVTPNLRPKNKKNSKARVKRAAEVVAFLNKAAKDENK
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MKVKVNGVKIYYQKLGKGHPLILLHGHHQDGGIFDKLVAPLSLYYTVVVPDMRGHGLSEGEASEHYQTEVEDLRAFINALKLDKPYILGFGSGGLVALSLAAQAPELVSKVIVAGTYVNGNGVNAKHIAANTIRGFFKGDRDSKVALRESHIPVETLKRIKTPTLCVVGERDWVKVEHVRWYSQLLPNCRLVLMPRQTHYSYVVHSLKLLDLIKDFCKED
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MKKFFKVVGIGAAICTGIGAAVAVTKKLIDKNNNSGEDVVKDEEPEFEDGESDDSTENSTETTDSTETN
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MKVSVLSSGSTGNSTLIETEQHKILMDAGLSGKKTKDLLAQVGVDIKDIDMIFISHDHTDHSGGLGVLMRRYPQISAYANSGTWNYLIESKKIGNLPVEQINTFESGVTKTFGDLDVTSFATSHDAAEPQYYVFSSGGKRFACLTDTGYVSSNVKGEIKDADGYLMEFNYDDMMLRNGPYSWSLKHRIMSDVGHLSNDQAADTLLDVVSPKTKNIFLAHRSQHNNTQYLAHETAHDLLVAGDANLPVDVKIIDTNPLEAGSLTEI
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MSLLYISFDILLIGYIFYSWYWQANIDYKARFRSSSVIWALIFLLIGFYLDYFTDPTVLMNVFIATFLLMSIIDGVSGLAKKRLVVSGYFKRTVKYSDIAHVTLITVPNPKKPTVMAIFQTNNRQAYYLRFSQQVSDVIVNIRKYLGSNVGIEVQSMV
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MSSKQIKINQLSFQYQDKLIFKNLDFTINQGDFALLTGPSGCGKSTLLKLIAGLEPTSTSKITTGSLTQPFTNWGMVFQDPNRQFTMATPREELIFALENKLIDRVTAQKIIDEVSHKTNISLLLDRPFLHLSGGEKQRVALAVLIAMQSDLFLLDEPFANCDSHNRNFLLNCLDSLHQDGKTILISDHNFANYEKIDPKVFAIKNQRIKTSPLPSQEVVVTNFSLPHTNQESVYSFNSFSLSFPEKELLSSTNLKIYSGKATLLTGENGSGKTSLFKALSKVITYQGELLFKDKEVKNWRRRPYLSKVGQIFQNPDDQFLNVTVKEELDFSLKYNQNPSLNESKLQSILTKLNLENMDEQVIYSLSGGQKKKLQILVMLMAYPDVLLLDEPFSGLDQKSVSEVIFLLKNYFLDANHSLIVISHQLDQIQNLCDYHLVLKGQQLFYAK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_069168741.1|1381736_1383014_+|transposase	ISL3-like element ISLjo2 family transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	2.7e-48	33.1
WP_004896231.1|1383317_1384025_+	response regulator transcription factor	W8CYM9	Bacillus_phage	3.0e-41	39.7
WP_011161302.1|1384071_1385922_+	cell wall metabolism sensor histidine kinase WalK	W8CYF6	Bacillus_phage	3.5e-33	32.4
WP_069168798.1|1385911_1387240_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011161304.1|1387229_1388051_+	two-component system regulatory protein YycI	NA	NA	NA	NA
WP_069168799.1|1388056_1388854_+	MBL fold metallo-hydrolase	A0A0B5A2C7	Paenibacillus_phage	1.6e-27	33.7
WP_053106806.1|1388937_1390158_+	trypsin-like peptidase domain-containing protein	A0A1B1IT49	uncultured_Mediterranean_phage	2.0e-21	29.1
WP_069168800.1|1391147_1391801_-	energy-coupling factor transporter transmembrane protein EcfT	NA	NA	NA	NA
WP_069168801.1|1391812_1393159_-	ABC transporter ATP-binding protein	A0A1V0SI78	Klosneuvirus	2.3e-13	20.7
WP_061400884.1|1393133_1393697_-	ECF transporter S component	NA	NA	NA	NA
WP_069168802.1|1393933_1394860_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_069168803.1|1395083_1395374_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168804.1|1395498_1396683_+|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_069168805.1|1396772_1397663_-|protease	zinc metalloprotease HtpX	NA	NA	NA	NA
WP_004896202.1|1397671_1398229_-	LemA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168806.1|1398344_1399451_-	cation transporter	NA	NA	NA	NA
WP_004898492.1|1399625_1400036_+	iron-sulfur cluster biosynthesis family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003649666.1|1400114_1400255_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168807.1|1400430_1401291_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168808.1|1401423_1402731_+	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_069168809.1|1402740_1403865_+	beta-glucanase	NA	NA	NA	NA
WP_004896187.1|1403979_1404624_+	HD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168810.1|1404625_1405555_+	HNH endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_004898506.1|1405636_1405903_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014566955.1|1406156_1406915_-	amino acid ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.4e-28	38.4
WP_069168811.1|1406904_1408518_-	ABC transporter substrate-binding protein/permease	NA	NA	NA	NA
WP_069168812.1|1408853_1409480_-	DNA-3-methyladenine glycosylase	NA	NA	NA	NA
WP_069168813.1|1409555_1409918_+	DUF488 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168814.1|1409914_1410697_-	TerC family protein	A0A068EP98	Bacillus_phage	1.1e-41	41.2
WP_061400873.1|1410683_1411214_-	methylated-DNA--[protein]-cysteine S-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_069168815.1|1411330_1412044_-	NAD-dependent protein deacylase	NA	NA	NA	NA
WP_014566959.1|1412169_1412646_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168816.1|1412713_1414183_-	cardiolipin synthase	NA	NA	NA	NA
WP_004898528.1|1414187_1414895_-	zinc metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_014566961.1|1414918_1415845_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_014566962.1|1415933_1416665_+	viroplasmin family protein	C1KFJ1	Lactobacillus_virus	2.2e-31	34.5
WP_044025895.1|1416748_1416958_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_023599067.1|1417126_1418095_-	DUF1002 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168817.1|1418217_1419048_+	glycosyltransferase family 2 protein	NA	NA	NA	NA
WP_014566964.1|1419072_1419735_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_004896146.1|1419821_1420184_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014566965.1|1420266_1421256_+	ribose-phosphate diphosphokinase	A0A2H4UV84	Bodo_saltans_virus	1.9e-30	27.2
WP_069168818.1|1421423_1421708_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168405.1|1421766_1422816_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	2.6e-49	35.9
WP_069169066.1|1423007_1424201_+|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_069168819.1|1424555_1424843_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168820.1|1424998_1426213_+|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP016400|1517063:1525789|DBSCAN-SWA
TATGGCGAAATTTGATATTTTAGAAGATTTAAAATGGCGTGGAGCTATTAATCAAGAAACTGATGAAGAAGGTTTGCGCAAGTACTTAGCAGAACATGATGATTTAGCGCTTTACTGCGGAACTGACCCAACCGGAGATTCTCTTCATATTGGGCACCTAATTCCCTTCATGATTATGAAGAGATTCCAAATGGCTGGTTACCACCCAGTAATTTTAATTGGTGGTGGTACTGGTTCAATCGGTGATCCATCAGGTAGAAAGACTGAGCGTGTTCTTCAAACTGCTGAACAAGTTAAACATAATGAAGAAAAATTAACTGCTCAAATGAAGAAACTATTCGGTACAGAAAACTTTGAAATTAAGAATAATGCGGAATGGTTAGGTAAGTTAAATTTAATCGATTTCTTACGTGATTATGGTAAGTTCTTCCAAGTTAATAACATGATTAATAAGGATGTTGTTGCTAGTCGTTTAGAAAATGGTATTTCATTTACTGAATTTACATACCAAATTTTGCAAGCAATTGACTTCTACCATTTGAATAAAGATAATGGCGTACAACTCCAAATTGGTGGTAGTGATCAATGGGGTAATATTACTGCAGGTATTGACTTGATTCACAAACTTGAAGGTGCAGATCGGCCAGCATTTGGTTTAACTATTCCATTAATGCTTAAGGCTGATGGTACTAAGTTTGGTAAGTCTGCTGGTGGAGCTGTGTGGCTTGATCCAGAAAAGACTAGTCCTTACGAATTCTATCAATTCTGGATCAATCAAGATGACCGAGATGTTATTAAGTATCTCAAGTACTTTACTTTCTTATCTCGTGAAGAAATTGAAGATTTAGCTGAAAAGACTGAAAAGGAACCTTGGAAGCGAGCAGCTCAAAAGAAATTAGCTGAAGAAGTTACTAAGTTTGTTCATGGTGAAGAAGGCTTGAAAGAAGCTCAAATGATTACTGAAGCATTATTCTCAGGTAATATTAAGAGTCTATCAGTTCCTCAAATTGAGCAAGCTTTGAAGAACGCTCCAAGTGCTGAAGCAACTCATGAGGCTAAGAATATCGTAGAATTTTTGATTGAAACTAAGATTGAACCATCTAAGCGTCAAGCACGTGAAGACGTTAAGAATGGTGCGATTTACGTAAACGGCGAACGTCAAGATGATATTGACTTTATCATCGAACCAGATAGTGATTTTGATGGAAAATATGTAATTATCCGTAAGGGTAAGAGAAAGTATACTCTAGTTAAAATTAAATAATAAACGTAAATTGCAATAATAAATTGAACATTTAGGCTGTTTGATAGATTTTATCTAATTCTCTTTCGAAGATTTCATCTGGTGTGTGATATGCCAGGATCTTTCTGGGTAAAGAGTTGCACCAGGTTTCAATATCAATGATTTGTTGGAGAGAATAGTTATTGATGCAGTCTCCTTTAGGAATGAATCTGCGAATAAGACCATTATGTCTTTCAACAGTTCCTTTATCACAAGAAGTATAAGGATGAGCATAATAAACAAGAGTCTTAGAAACTTCTTCTAAATTAGCTAAATCCGCAAACTCTGAACCATTGTCAGTAGTAATCGTCTTGAAGATGTCATTCCAGTGCTCGCTGTATTGTTTTTGAAGCATTTTAAAAGCCTGCATGACACTGACAGATGTCTTGTCAGGTATGCGAATAATCAAGAATTCACGGCTCATGCGCTCAGAAAGCGTTAATAGAACCTGATCATCTTTGGTTTTATGCCCTAGAACAAGATCACATTCCCAATGACCAAATTCATTGCGCTGGTCAATCTCTTTAGGCCGCTCTTCGATGCTTCGTCCCAGCTTTTTCTTATTTTTGCGAACATGATGGAGCTTGGTATTACGTTTAATTTTTTCAGGCAAATCATAGTTCTTAATTGCAATTAGGCCTTGTTCTACATAGTTGTACAAAGTTCTGGTGCAGACTGCTTGATGATGTGAGAATTCACCGATAGCTAAACTACGATTGGCACAAACGTCAAGTGACCAGCCGTCCTCAAAAAAATGCTTAATGACGTAGCTAATAAAGTTTGCTTTCTTCAAGAAGTCCGATTTACGACCACAGTGACGACGATTAATCTGATAAACACCTTGACCATGTTCAGCCTTATAGCGCTGCTGCTTGCCATGATAGAGAGAAACAGTACCACGTTTGACCTCATAGCTAATTGTAGAAGGAGAGCAGCCCAATTCGCGAGCAATCGCTCTAATAGAATAACCATCTTTTAAACGTGTTTGGATAACAACCCGCTCTTCAAATGATAAGTGCTTGCCTTTAACGTGCTGATTCATGGTAAAATGTAAAGAGTCCATTTGTGACCTCCAATAGATGTTTTTGTGGATATTAACATTCTATCAAACAGGTCCAGATGGACTTTTATTTTTATAAAGTGTTCAACTTGATTTTACAATCGGCGATTAAATAATAAATAAAAATTAAGGACTAGGAATGTAAAAACGTTCCTGGTCCTTTTTGCTATAATTAAATTGATATCTGCCGTTTTAGCTCAGGAGGTAGAGCACCGCCGTGGTAAGGAGGAGGTCCCCAGTTCAAATCTGGGAAACGGCTTAGTGAATAATTTAGTAACAAAAAAATTCTAGGGATGGTCAAAAAGGCGATCCCTTTTTATAATTGTTATAAATAGTATAAATAATTTATGAAAGAAGAATTAATATGACTCATGAACTTACGCTAGATGAAATTGCAAAATTTCAACAAGATTATCAACAAAATAAGCAAAATAAAATTGCTGAATTGGCTGTTGTGAATAACGGTGTGCAAAAAGCAAGTTTCAACGGTGAGGGTATCCGTGATTTAAATCGAACTTTCTCAATTGAAATTCCAACTGATAATGTGACCGACCAAAAGCAATCAGGTCGTTGTTGGTTGTTTGCGGCTTTGAATGTTTTACGTCATAAGTTTGCCAAGCAATATCATACAAAGAACTTTACTTTTTCACAAAGCTATCTTTTCTTCTGGGATCGAATTGAAAGAGCAAATATTTTCTTTAATCATATTCTAGAAACTGCGGATAAACCTGTGGATGATCGTACTGTACATTTTTACTTACAAGCACCTGATACCGATGGTGGACAATGGCACATGGCTATTTCATTAATTAGAAAATATGGCTTGGTACCAACTTATGCACAAGACGAAAGTTTTACAGCTAATAATACGGCGGCTTTTAATCAAGCATTGAATATGAAATTACGTGAAGATGGATTAGTTTTACGCAAACTTGCTCAAGCCGGTAAAAATGATGAAATTGAACAAAAACGTCAAGAATATTTAAGTGAAATTTACCGTATGGCTGTAATTGCTTTTGGACAACCTGTGCAAAAGTTTGATCTAGAATTTAAAGATGACGATGGAAATTACAAGTTAGACCAAAATATTACCCCATTAGACTTTTTCCACAATTATTTTGAAGATGACTTAGATGATTACGTAGTACTTTTTAATGCTCCAGATCATGAGTATGATAAGCTTTACGCTTTTCCATTTGAAGATAATGTTGAAGGCGGTAGCCCAGTTAGATTTTTGAATACAAAGATTGAAAATCTTAAGGAAGCCGCAATTAAGCAGTTAAAAGATGGAGAGACAATCTGGTTTGGCTGTGATGTAGGCAAGCAAAGTGATCGTCAAAAGGGAATTCTAGCTGCTAATTTATATGAAACTGATACGATTTTTGGTATTGAAACTAAGTTAAATAAAAAAGAACGTCTTCAAACTGGTGCTAGTGGTTCAACTCATGCAATGACCTTTGTGGGTGTGGATGTAGTTGATGGTAAACCTCGTCAGTGGAAAGTAGAAAATTCCTGGGGAACAAAAGTCGGCGATAAAGGCTACTTTGTCATGGATGATAAATGGTTTGACGAATACTTATTTAAAGTTGTAGTTAAGAAGCAATACTTACCAGAGAAACTAGTAAAAATTGCTGAAGGCGAAGCAACTCCTGTTCCTTGCTGGGATTCAATGGCTTAGTCTAGGGGATCGACTATGAACATCGAATTAGTTAAAAAATTTACTAAGGATCATCTAAAAGGTGAAAAAACAGGTCATGATTACTACCATGGACAAAGAGTGGCAAATTTAGCCACAAAAATGTATCTAAGTGATTATCCAGATGCACATAAAGACAGCAGAATAGTAGCTATTATTCAGACAGAAAGTTATTTACATGATACAATCGATGAAAAAATTTGTGACAATCCTGATGAAGTTATAGACGAAATCAAAGAATTATTGCCTAAGGGTGGCTTTACTTCTTTAGAAATAGAAGATATTTTGTTTATTATTCAACACATGTCTTTTTCAGCTAATATTGAGCACCACTATCAACTTCCTTTGAGTGGACAATATGTGCAAGATACTGATCGGATTGAAAGTTTAGGTGCAATTGGAATTGCTAGAGCATTTACTTATGGCGGAAAACACGGAAATAAGATTTATGACCCCGAAATTAAGCCTGAGAAGCTAATAAGTCATGATCAATATCGCAACCATGTAGAAACCACAATTAACCATTTCTATGAAAAATTATTTGATCTAGAAGACCTAATGAATACGCCTGCTGCTAAAAAAGAAGCACACCGGAGAACTGAATATATGCGTGAGTTTGTTCAAGAATTTATGGATGAATGGAATGTATAATTGAAGAAAAAGAGATTTGTACCTGTATTGATACAAATCTCTTTTTGATATATATTTTATTTTTACTAAGCTAGTGAATCCCAAGCAGGAAGTGGAGTTGGCTTGCTTTCTGCAAGTTTCTTTTGATCTTCAGTTAAGAACTCTTTTCTAACAACCACTTCATAAACAAATTCGTCAAACCACTTATCGCTCATTGTGAAGTAACCTTTACGACCAGATTTTTCACTCCATGAGTTTTCAACTTTCCACTTACGGATTTCACCCTTATCTAAGTCAACACCAACTAAAGTCATAGCGTGGCTAACTTCGCCTTCACCAGTAGCCAATCTTTCTGCCTTAGTCATATAAGTATCAACATCAAATAATTCATCGGTCTTGTATAATTCAGTATCTAGGTAACCAGTCTTACGATCCATTTCTTTCAAGACATCATTACCAAACCAAACACTTTCACCATCTTTTAATTGCTTAATAGCAGCGTCTTTTAAGTATTCGATTGGAACATTTAAGAAAGTAATAGGGATACCACCATTAACATTGTCTTCAAATGGAAGAGAGTAAAGTTTGCCGTATTCATGATCTGGAGCATTAGTTAAGCAAACATAATCATTGAAATTAATATCCCAGTACTTATTGAAAAATTCAACTGGAGTCAAATTTTTATCCAAGTGAAGTTTTTTCTCATCATCGCGGTACTCTAAGTCAAAAGTTTTAGGAGGTTCGCCCACAGCAATTGCAGTCATGCGATAGATTTCACTTAAAAATTCTTTGCGTTTCTTTTCAACTTCTTCAGTTTTACCTTCTTGAACTAATTTGCGTAAAACTAAAGCATCTTTTCTTTCTTTACGAGCTAACGCATCAGATAAACCGGCTGTATGATTAGTATTAAAACTTTCAGGCATTGCATTGGTTGGGACAACACCGTACTTCTTTACTAAGGAAGCAGCCATTGCCCATTGACCACCATCTGCACCAGCAAAATTCATATATGCCTTAACTGTGCGATCATCTAAGGGCTTATCTGCAGAATCAATAATTGCATCATAGAAAATATTAGCACGTTCAATCTTATCCCAGAAGAAGTTGTATGCTTGAGATAAGGTGAAGTTTTTAGCCTTATATTTTTTACCAAAATCATGGCGTAAAGTATTTAAGGTTGCAAATAACCAGCAACGACCTGACTGCATTTGGTTAGTAACATTATCAGTTTCTACTTCGACAGAGAATACATCGTTTAGACGGTTAGTAACTGCTGGATTAAATGAAGCTTCTAACACACCGGACCGCATTGCTGCGCGAGAAACTACTTGATTACGTGAATTATCAAAGTCACTACGGAATTGATCAATTTCTTGTAGGGTTAATTCGTGAGACATAGATTACACTCCTTTAATTTTTTTATCATGTTTTTCATTATATTTACTATACAGCAAATCACAACTTAATACACTAATTTTATTGAATGAAAGTGGCTTTCATAAGGATTTAAAGTATGATTCTGAAGTATAATATTGATAACAATATCGGAGGTAAGAACTATGAAAAAGAATATTTTTGTATCAGGAATTACCCTAATGACAATGCTTTTAGCTGTAGGTTGCAGTAATAATGCAAGCCAATCTAACAATAATAATGAAGCTAAAAGTACTAAGACAAGCCATAAAAAGAGCCACAAAGCTAAAAAACATACAACTAAGAAAGATAAGACTGATATAGATACTGATAATTCAGAAACTACTAACTCAGATAAAAAAACTGATAAGAGGAGCAGCGAAAGTTCCAAGAGTAGTACTAGTGAAAAAGCTAGCCAGAATGGATCAGCAAACTCAAATGCTTCTTCTAATTCAAATGAATCAAAAAATACAAATAATTCAAATGGCTCATCCAATTCTTCAGCATCTAATACTCAAAATAATGGCGGTCAAAGTGCTGCGTCAGCTAATAGCTCTTCAGATGCTATGTTTAATAAGATGGTTTCTAATACTATCAAAGAAAATGGCTACTCAAGTAGCTATGGCCCAGACAACTTTACGTTAATTGATGGTGGTAATGGACAATATTCTTTAGCTGAGAAGTCAACTGGAACAATTGTTGGTCATTATTCTGTAAAGAATGGTGATCTTTACAAGCAAGATGTGATTACTGGAAACGATGTTAAGGTTAAATAATGGTTTATTATCAAAAAATGACGCCTGAAGGCTATCAGGAAATTAAAGACGAGATAGCCCGCTTAAAGAAAGATCGGCCACGAAGAATTAAAATCTTACAAGAAGCTCGTAGTATGGGAGACTTATCAGAAAACTCTGAATATACTACAGCTAAGATGGAATTAGGGCATTTACAAAGTCGCTTACGCTATTTAGATAAGCAATTAAGATATTCAGAAATTATTCAAAAAGATGAAAGTGGAACTATTGATTTAGGATCAAATGTTACTTTACTTTTTGATGGTGACGATGAAGCTGAAAAGTATCGGATTGTTGGTAGGATGGAAGCAGATTTAGCTAAGGGAAAAATTTCCTTTGATTCACCTTTAGGACAAGCTTTGATGAAACAAAACATACTAATCTAGTGTTGGATGATTACTCGACGGAGTAGTCGTTCAACACTTTTTCTTTTACTATGTAAAGTGGAGATGAAGCCAATGCCGTGACTGCTTTGGACACATGATGTCGTAAACAAAACTGGCAGCTTCACCATTCAATTATGAATCTCGTCTAAGTATGTTGGCTGTTAAAGTCCTGTTGAGAAAATTAGATCTGATTGGATTAGATGGAGGCAGCTCATCTCCAAGTAAAGCGGAGGTTTATTCTTATGGATTTATTGAAAACTGTTTTTGGTATTGATGTTAGCAGCCGGAAGTCTAACGTATGCATTATGGTCAATGGCCAAAAAGTTGATGACTATGCCATCTCCAACGATATGGTAGGCTTCAATCAGTTGCTAGATGACCTTAAGCAGGTTACTAAACCGCAGATTATCTTTGAAGCAACTGGTGTCTATTCCAGAAGACTCCAGGCGTTTTTGGACATGCACGAATTGCGCTATGTCATGATGAACCCGCTGGAAGCCAAAAGAAAGACAAAGGATGACCTGCACCAGAACAAGACCGATAAGCTTGATGCCTTGTACCTTGCCAAGCTGCAGTCTGAGCACCCGCAACGGCTGGCCTACGTTCAAAGCAAAGAATATCAAGAATTGATGGCCAATAACCGCATCTATGAGCAGGCTTCGCACGATCTGATAACCAACAGGAATAGACTGCACAAAGCCATTCAGCTCACTTTCCCAGAGATTGAGCACTTAATGGTTAACCCGAGAGGGAAAAACTACTGGAGTATTGTTCTCAGATTCCCACACCCTGATATCGTATTAGAAACAAAAGAAGCCGATATCATCGACTTCTTAAAAGGCTTATCTGGTATTGGTAAAAAGCGCGCTAACGACATAATGCAAAGTCTTATTCGTTTGGCTAAAGTCGCATGCCCAGCTGTCAAAAAGGACAGTGCACATATTCGTGGCCTCGAAATGGCCATTAACAATATTCTGAGCGCTGAAGAGGCGTGCCAGACAGCTTTAAAGGAGATGACCAAGCTCGCTCCCAAGCGGGATCTGGAGATCCTCACAAGCATTCCAGGCATCGGCGAAAATACCGCTCTAAGAATCATTAGTGAGCTTGGGGATATCAGACGTTTTAACAACCCTAGCCAATTAAATGCCTTCGTTGGCGTTGACCCTCAAGTTTATGAATCTGGCAACCTCACGGCCCATCTGTCTATTTCAAAGCGCGGGACAGCTATTGGCAGAAAGGTGCTGTACTTGGCCATAAACCAAATTCAGTCGGCTAAGAAAGCGGGAAACCCTTGTCATATTGCGGATTATTACGAGAAACGAAAACGGTCTTCTGAGACTGTAAGTCACAAGAAGGCCGCTATCGCATCGATCCATAAATTATTACGGACGATCTTCGCTTTAATTAAGAATGATCAATTGTATAACTATGACGTAGCCAAACATAACCAAAGACTTTTGTCATAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP016400|1517063:1525789|1517063_1518326_+|WP_014567013.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MAKFDILEDLKWRGAINQETDEEGLRKYLAEHDDLALYCGTDPTGDSLHIGHLIPFMIMKRFQMAGYHPVILIGGGTGSIGDPSGRKTERVLQTAEQVKHNEEKLTAQMKKLFGTENFEIKNNAEWLGKLNLIDFLRDYGKFFQVNNMINKDVVASRLENGISFTEFTYQILQAIDFYHLNKDNGVQLQIGGSDQWGNITAGIDLIHKLEGADRPAFGLTIPLMLKADGTKFGKSAGGAVWLDPEKTSPYEFYQFWINQDDRDVIKYLKYFTFLSREEIEDLAEKTEKEPWKRAAQKKLAEEVTKFVHGEEGLKEAQMITEALFSGNIKSLSVPQIEQALKNAPSAEATHEAKNIVEFLIETKIEPSKRQAREDVKNGAIYVNGERQDDIDFIIEPDSDFDGKYVIIRKGKRKYTLVKIK
>NZ_CP016400|1517063:1525789|1523289_1523919_+|WP_004898665.1|DBSCAN-SWA
MKKNIFVSGITLMTMLLAVGCSNNASQSNNNNEAKSTKTSHKKSHKAKKHTTKKDKTDIDTDNSETTNSDKKTDKRSSESSKSSTSEKASQNGSANSNASSNSNESKNTNNSNGSSNSSASNTQNNGGQSAASANSSSDAMFNKMVSNTIKENGYSSSYGPDNFTLIDGGNGQYSLAEKSTGTIVGHYSVKNGDLYKQDVITGNDVKVK
>NZ_CP016400|1517063:1525789|1519768_1521082_+|WP_014567014.1|DBSCAN-SWA
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MDLLKTVFGIDVSSRKSNVCIMVNGQKVDDYAISNDMVGFNQLLDDLKQVTKPQIIFEATGVYSRRLQAFLDMHELRYVMMNPLEAKRKTKDDLHQNKTDKLDALYLAKLQSEHPQRLAYVQSKEYQELMANNRIYEQASHDLITNRNRLHKAIQLTFPEIEHLMVNPRGKNYWSIVLRFPHPDIVLETKEADIIDFLKGLSGIGKKRANDIMQSLIRLAKVACPAVKKDSAHIRGLEMAINNILSAEEACQTALKEMTKLAPKRDLEILTSIPGIGENTALRIISELGDIRRFNNPSQLNAFVGVDPQVYESGNLTAHLSISKRGTAIGRKVLYLAINQIQSAKKAGNPCHIADYYEKRKRSSETVSHKKAAIASIHKLLRTIFALIKNDQLYNYDVAKHNQRLLS
>NZ_CP016400|1517063:1525789|1518357_1519407_-|WP_069168405.1|transposase|DBSCAN-SWA
MDSLHFTMNQHVKGKHLSFEERVVIQTRLKDGYSIRAIARELGCSPSTISYEVKRGTVSLYHGKQQRYKAEHGQGVYQINRRHCGRKSDFLKKANFISYVIKHFFEDGWSLDVCANRSLAIGEFSHHQAVCTRTLYNYVEQGLIAIKNYDLPEKIKRNTKLHHVRKNKKKLGRSIEERPKEIDQRNEFGHWECDLVLGHKTKDDQVLLTLSERMSREFLIIRIPDKTSVSVMQAFKMLQKQYSEHWNDIFKTITTDNGSEFADLANLEEVSKTLVYYAHPYTSCDKGTVERHNGLIRRFIPKGDCINNYSLQQIIDIETWCNSLPRKILAYHTPDEIFERELDKIYQTA
>NZ_CP016400|1517063:1525789|1521816_1523127_-|WP_004898664.1|DBSCAN-SWA
MSHELTLQEIDQFRSDFDNSRNQVVSRAAMRSGVLEASFNPAVTNRLNDVFSVEVETDNVTNQMQSGRCWLFATLNTLRHDFGKKYKAKNFTLSQAYNFFWDKIERANIFYDAIIDSADKPLDDRTVKAYMNFAGADGGQWAMAASLVKKYGVVPTNAMPESFNTNHTAGLSDALARKERKDALVLRKLVQEGKTEEVEKKRKEFLSEIYRMTAIAVGEPPKTFDLEYRDDEKKLHLDKNLTPVEFFNKYWDINFNDYVCLTNAPDHEYGKLYSLPFEDNVNGGIPITFLNVPIEYLKDAAIKQLKDGESVWFGNDVLKEMDRKTGYLDTELYKTDELFDVDTYMTKAERLATGEGEVSHAMTLVGVDLDKGEIRKWKVENSWSEKSGRKGYFTMSDKWFDEFVYEVVVRKEFLTEDQKKLAESKPTPLPAWDSLA
>NZ_CP016400|1517063:1525789|1523918_1524323_+|WP_069168845.1|DBSCAN-SWA
MVYYQKMTPEGYQEIKDEIARLKKDRPRRIKILQEARSMGDLSENSEYTTAKMELGHLQSRLRYLDKQLRYSEIIQKDESGTIDLGSNVTLLFDGDDEAEKYRIVGRMEADLAKGKISFDSPLGQALMKQNILI
>NZ_CP016400|1517063:1525789|1521097_1521751_+|WP_014567015.1|DBSCAN-SWA
MNIELVKKFTKDHLKGEKTGHDYYHGQRVANLATKMYLSDYPDAHKDSRIVAIIQTESYLHDTIDEKICDNPDEVIDEIKELLPKGGFTSLEIEDILFIIQHMSFSANIEHHYQLPLSGQYVQDTDRIESLGAIGIARAFTYGGKHGNKIYDPEIKPEKLISHDQYRNHVETTINHFYEKLFDLEDLMNTPAAKKEAHRRTEYMREFVQEFMDEWNV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_014567013.1|1517063_1518326_+|tRNA	tyrosine--tRNA ligase	K4F5T3	Cronobacter_phage	1.6e-85	42.6
WP_069168405.1|1518357_1519407_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	2.6e-49	35.9
WP_014567014.1|1519768_1521082_+	C1 family peptidase	R4TV59	Phaeocystis_globosa_virus	6.1e-64	31.9
WP_014567015.1|1521097_1521751_+	hypothetical protein	S4W232	Pandoravirus	5.4e-05	26.1
WP_004898664.1|1521816_1523127_-	aminopeptidase	R4TV59	Phaeocystis_globosa_virus	1.2e-64	34.2
WP_004898665.1|1523289_1523919_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168845.1|1523918_1524323_+	transcription elongation factor GreA	NA	NA	NA	NA
WP_069168846.1|1524565_1525789_+|transposase	IS110 family transposase	A0A1X9I619	Streptococcus_phage	8.1e-95	48.0

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP016400|1584873:1644939|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

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MNYGEKSPALWDAIKSEEKRQEDTIELIASENIVSDAVREAQGSVLTNKYAEGYPGKRYYGGCQYIDKVEQLAIDYAKKLFDADYANVQPHSGSQANMTVYNALLKPGDTILGMGMDAGGHLTHGSKVNFSGKIFNSISYDLNPETEELDFDRIRQIAIEKKPKLIIAGASAYSRIIDWQRFREIADEVGAYLMVDMAHIAGLVATGAHTSPIPIADVVTTTTHKTLRGPRGGMILSNNKELGKKIDSALFPGTQGGPLEHVIAAKAQAFYEDLQPEFTQYINQVIKNSKAMAEEFKNSKNIRVVSDGTDNHLMIIDITKTGVTGKDAQNLLDSVNITTNKESIPGDKRSPFITSGLRIGTPAITSRGFKESDAKEVAKIIIEVLDTPEDAGVLAQAKERVNNLVTKYPIK
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MTKPILELKDVKTTVKTADGEIVPILKGINLEIRPGDFITIIGTNGAGKSTLFNTIAGSLKPDSGILRHNGQDITKMSEEKRTQFIGRVFQDPKMGTAPRMTVAENLLLATKRGKRRFLKIRRLKQNLPRFKKLAAVMNNGLESRLNTFVEGLSGGQRQALSFLMATIEKPDILLLDEHTAALDPHTSENLLAVTDKQIKENKLTALMITHHMEDALKYGNRLLVLKDGKVKADISEEEKKSLKVSDLYSFFED

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_069168865.1|1586203_1586800_-	NAD(P)H-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_014567043.1|1586801_1587335_-	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_004045666.1|1587545_1587959_+	YjdF family protein	NA	NA	NA	NA
WP_080502236.1|1588143_1588236_-|holin	putative holin-like toxin	NA	NA	NA	NA
WP_069168866.1|1588471_1589254_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_069168867.1|1589274_1590141_-	zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_080558334.1|1590412_1590505_-|holin	putative holin-like toxin	NA	NA	NA	NA
WP_044025905.1|1590788_1591943_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168868.1|1592125_1592971_+	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	2.4e-21	31.9
WP_014567049.1|1592970_1593837_+	multidrug ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_043921362.1|1593826_1594276_+	LytTR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_004898815.1|1594277_1594667_+	DUF3021 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_004898818.1|1594691_1595195_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_155762244.1|1596564_1597967_-|transposase	IS3 family transposase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	8.6e-40	39.6
WP_014567056.1|1598042_1598558_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004898834.1|1598752_1600111_-	formyl-CoA transferase	NA	NA	NA	NA
WP_004898837.1|1600116_1601853_-	oxalyl-CoA decarboxylase	E5ERI2	Ostreococcus_lucimarinus_virus	1.3e-18	23.3
WP_014567057.1|1602204_1603386_+	AEC family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_014567058.1|1603455_1603671_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014567059.1|1603762_1604386_-	DUF4097 family beta strand repeat protein	NA	NA	NA	NA
WP_014567060.1|1604509_1604962_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014567061.1|1607774_1609190_-	C69 family dipeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_069168870.1|1609267_1610095_-	AraC family ligand binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168871.1|1610315_1612277_+	PTS sugar transporter subunit IIA	NA	NA	NA	NA
WP_069168872.1|1612260_1614459_+	alpha-galactosidase	NA	NA	NA	NA
WP_014567065.1|1614469_1615912_+	sucrose phosphorylase	NA	NA	NA	NA
WP_014567066.1|1616065_1617301_+	serine hydroxymethyltransferase	A0A219Y950	Aeromonas_phage	2.8e-95	51.1
WP_069168873.1|1617588_1618581_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168874.1|1618577_1619477_+	branched-chain amino acid ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_069168875.1|1619469_1620234_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	W6JKT0	Anomala_cuprea_entomopoxvirus	4.9e-05	26.2
WP_082225001.1|1620338_1621937_+	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_004898881.1|1622053_1622305_+	type B 50S ribosomal protein L31	NA	NA	NA	NA
WP_069168876.1|1622467_1623835_+	UDP-N-acetylmuramoyl-tripeptide--D-alanyl-D- alanine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_069168877.1|1623850_1625305_+	DEAD/DEAH box helicase	A0A0N9Q9J4	Chrysochromulina_ericina_virus	4.1e-69	39.4
WP_069168878.1|1625380_1625740_+	holo-ACP synthase	NA	NA	NA	NA
WP_069168879.1|1625739_1626870_+	alanine racemase	NA	NA	NA	NA
WP_069168880.1|1626932_1627613_-	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_004898900.1|1627758_1628730_-	L-lactate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_014567075.1|1628914_1629472_+|tRNA	aminoacyl-tRNA hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_069168881.1|1629473_1632971_+	transcription-repair coupling factor	S6B678	Bacillus_phage	2.8e-07	34.3
WP_004898904.1|1632987_1633230_+	RNA-binding S4 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_004895915.1|1633318_1633696_+	septum formation initiator family protein	NA	NA	NA	NA
WP_004898907.1|1633695_1634052_+	S1 RNA-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168882.1|1634074_1635370_+|tRNA	tRNA lysidine(34) synthetase TilS	A0A0N7G7K4	Chrysochromulina_ericina_virus	8.0e-08	22.9
WP_014567079.1|1635453_1637580_+	ATP-dependent metallopeptidase FtsH/Yme1/Tma family protein	A0A0P0CCN8	Ostreococcus_mediterraneus_virus	4.1e-110	42.2
WP_069168883.1|1640399_1643042_+	YfhO family protein	NA	NA	NA	NA
WP_069169068.1|1643183_1643816_+|transposase	IS607 family transposase	Q331V0	Clostridium_botulinum_C_phage	9.8e-60	52.1
WP_069168884.1|1643778_1644939_+|transposase	IS200/IS605 family element transposase accessory protein TnpB	C1KFS0	Lactobacillus_virus	2.2e-81	43.9

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP016400|1681368:1741894|DBSCAN-SWA
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MNKEKTKNTLAERHALKRLDKVEENQRKAYEKKQNDFPWKQLVMGMLFGIILLLMLIQMIVK
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MIEKQQPIVALGHSTKPKKARPPRNNLLLNLKKDDLELNFYSSLDTEIMNKLLEKVLS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_004895822.1|1682719_1683115_+	30S ribosomal protein S9	NA	NA	NA	NA
WP_014567093.1|1683480_1684176_-	NAD-dependent protein deacetylase	NA	NA	NA	NA
WP_155762245.1|1684187_1684829_-	NAD(P)H-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168890.1|1686050_1686641_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_044025910.1|1686784_1687651_+	NmrA family NAD(P)-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168891.1|1687884_1688469_-	DJ-1/PfpI family protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168892.1|1688731_1689421_+	histidine phosphatase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168893.1|1689447_1689774_-	winged helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_014567101.1|1689868_1690753_+	cation transporter	NA	NA	NA	NA
WP_069168894.1|1690816_1691074_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_053107057.1|1691075_1691318_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_172821779.1|1691327_1692017_+	2,3-bisphosphoglycerate-dependent phosphoglycerate mutase	NA	NA	NA	NA
WP_014567106.1|1692125_1693061_+	AAA family ATPase	I7CCW4	Staphylococcus_virus	2.0e-13	29.0
WP_069168895.1|1693296_1704165_+	YSIRK-type signal peptide-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_082225003.1|1704562_1704913_+	IS66 family insertion sequence element accessory protein TnpB	NA	NA	NA	NA
WP_014567110.1|1704978_1705206_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_069168897.1|1705123_1706488_+|transposase	IS66 family transposase	A0A218MNE7	uncultured_virus	3.2e-39	27.4
WP_014567112.1|1706632_1708294_-	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
WP_069168898.1|1708773_1709961_+	accessory Sec system protein translocase subunit SecY2	NA	NA	NA	NA
WP_069168899.1|1709963_1711472_+	accessory Sec system protein Asp1	NA	NA	NA	NA
WP_069168900.1|1713000_1713861_+	accessory Sec system protein Asp3	NA	NA	NA	NA
WP_014567118.1|1716243_1717773_+	accessory Sec system glycosyltransferase GtfA	NA	NA	NA	NA
WP_069168901.1|1717765_1719094_+	accessory Sec system glycosylation chaperone GtfB	NA	NA	NA	NA
WP_044025913.1|1719086_1719275_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155762246.1|1719698_1719971_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155762247.1|1721732_1723988_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168902.1|1723977_1730247_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_044025916.1|1730245_1730548_+	LPXTG cell wall anchor domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_004897518.1|1730721_1730898_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080558344.1|1730891_1731242_+	IS66 family insertion sequence element accessory protein TnpB	NA	NA	NA	NA
WP_069168903.1|1731306_1731537_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_172821784.1|1731490_1732819_+|transposase	IS66 family transposase	A0A0P0ZEB3	Stx2-converting_phage	1.1e-41	28.0
WP_172821780.1|1732932_1733118_+	SLAP domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168905.1|1733135_1734842_-|transposase	IS1182 family transposase	A0ZS58	Staphylococcus_virus	2.3e-95	38.5
WP_069168906.1|1735457_1739780_+	MucBP domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155762259.1|1740413_1740476_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_172821784.1|1740565_1741894_-|transposase	IS66 family transposase	A0A0P0ZEB3	Stx2-converting_phage	1.1e-41	28.0

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP016400|1802945:1855126|DBSCAN-SWA
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MAKKDTTPMMKQYYEIKEQYPDAFLFYRVGDFYELFEDDAIKGAQILELTLTHRSNKTKNPIPMAGVPHLAVDTYVNTLVEKGYKVALCEQLEDPKKAKGMVKRGIIQLITPGTMMQERPDQAKDSNYLTSVISTNSGFGLAYSDLSTGETFSTHLTDFEGVANELLSLQTREVVYNGHLTDLNKDFLKKANITVSEPVEVEGEHAEISYVAQNLTNDAEIKATKQLVAYLLSTQKRSLAHLQVAQSYEPTQYLQMSHTVQTNLELIKSAKTSKKMGSLFWLLDKTSTAMGGRLLKSWIERPLLSVTEITRRQEMVQALLDDYFTREKVIDSLKGVYDLERLTGRIAFGSVNAREMLQLAHSLGAIPEILNALLETSNPHLQNYAKQIDPLKGIHDLIVNTIVDNPPLPTTEGGLIREGVSEQLDRYRDAMNNGKKWLSEMESHEREVTGINNLKVGYNKVFGYYIEVTNSNKSKVPTDRYTRKQTLTNAERYITPDLKEHEALILEAEAKSTGLEYDLFVKLREDVKKYIPALQKLAKQIASLDVLTNFATVSEQNNYVRPNFVTDKQEINVVNGRHPVVEQVMTAGSYIPNDVKMDQDTNIFLITGPNMSGKSTYMRQMALIAIMAQIGSFVPADSATLPIFDQIFTRIGAADDLISGQSTFMVEMSEANDALQHATKRSLVLFDEIGRGTATYDGMALAGAIVKYLHDKVGAKTLFATHYHELTDLDQTLKHLKNIHVGATEENGKLIFLHKILPGPADQSYGIHVAQLAGLPHKVLREATTMLKRLEKQGASELQPASEQLDLFVPEEASAPAISDDEKDVLDEIQNVYLADKTPLQVMELVAQWQQELKDKD
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MKEIPKYLLIADKIKHEIKTGEYNPNDQLPKEFDLANAYNVSRITIRNALSELERQDLIYRIQGAGTFVKDTEISSAVNSDRLELINLKKYKLKVTDFEVGQVDEKITKALELQPYDIVYTVRRAALSKQDVVAFQKICIPAKVIQGMNMEMLESSIYPLISQKIGLKPKKAVRDISLVHAISELVQKNKVQGKVEDNEPLLKWLQKSYLENGKPFEWNETYYRISKFSIKEAIIL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_014567158.1|1802945_1804280_-|transposase	IS200/IS605 family element transposase accessory protein TnpB	A0A286QQE5	Streptococcus_phage	3.8e-61	36.4
WP_014567159.1|1804380_1804845_+|transposase	IS200/IS605 family transposase	A0A0P0IQC6	Lactobacillus_phage	6.5e-29	42.3
WP_003647732.1|1804996_1805641_+	redox-sensing transcriptional repressor Rex	NA	NA	NA	NA
WP_069168926.1|1805781_1806348_+	TIGR00730 family Rossman fold protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168927.1|1806425_1807136_+	GntR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_061400204.1|1807250_1808651_+	PTS sugar transporter subunit IIC	NA	NA	NA	NA
WP_069168928.1|1808660_1810202_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_009559328.1|1810593_1811796_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_082225007.1|1811819_1812125_+	PTS sugar transporter subunit IIB	NA	NA	NA	NA
WP_004895701.1|1812284_1812743_+	LytTR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_004896777.1|1812739_1813498_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003647727.1|1814425_1814710_+	co-chaperone GroES	A0A221S3C8	uncultured_virus	5.6e-15	39.8
WP_004896780.1|1814740_1816372_+	chaperonin GroEL	A0A219YK78	uncultured_virus	3.9e-161	56.4
WP_082225008.1|1816511_1817345_+	Rgg/GadR/MutR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_050756193.1|1817926_1818172_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168931.1|1818204_1819968_+	ABC transporter ATP-binding protein	F2Y302	Organic_Lake_phycodnavirus	2.3e-18	26.5
WP_004896783.1|1820084_1822658_+	DNA mismatch repair protein MutS	A0A1V0SDQ0	Indivirus	2.4e-40	24.7
WP_069168932.1|1822663_1824556_+	DNA mismatch repair endonuclease MutL	A0A1B2LRQ5	Wolbachia_phage	2.1e-57	31.9
WP_069168933.1|1824561_1825137_+	Holliday junction branch migration protein RuvA	NA	NA	NA	NA
WP_004895679.1|1825165_1826185_+	Holliday junction branch migration DNA helicase RuvB	A0A127AWE7	Bacillus_phage	8.5e-13	25.2
WP_014567170.1|1826245_1826701_+	preprotein translocase subunit YajC	NA	NA	NA	NA
WP_004896789.1|1828244_1829366_+	DNA polymerase IV	NA	NA	NA	NA
WP_004896790.1|1829403_1830369_+	bifunctional oligoribonuclease/PAP phosphatase NrnA	NA	NA	NA	NA
WP_069168934.1|1830352_1831738_+	DEAD/DEAH box helicase	E3T5E1	Cafeteria_roenbergensis_virus	1.0e-48	30.3
WP_069168935.1|1831969_1834618_+|tRNA	alanine--tRNA ligase	A0A1V0SK38	Klosneuvirus	8.0e-63	33.4
WP_003647717.1|1834672_1834930_+	IreB family regulatory phosphoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_069168936.1|1834929_1835361_+	Holliday junction resolvase RuvX	NA	NA	NA	NA
WP_004895671.1|1835362_1835677_+	DUF1292 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_004896794.1|1835734_1836277_+	CvpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168937.1|1836319_1838686_+	endonuclease MutS2	Q94M10	Lactobacillus_phage	2.1e-22	52.6
WP_004895668.1|1838764_1839076_+	thioredoxin	A0A1X9I9P5	Staphylococcus_phage	7.0e-19	38.4
WP_004896796.1|1839158_1839554_-	YslB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168938.1|1839650_1840451_+	glutamate racemase	NA	NA	NA	NA
WP_014567176.1|1840453_1841077_+	XTP/dITP diphosphatase	Q66YC8	Euphorbia_ringspot_virus	8.5e-08	29.3
WP_069168939.1|1841229_1842408_+	acetate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_004896804.1|1842453_1843350_-	mechanosensitive ion channel family protein	NA	NA	NA	NA
WP_004895662.1|1843472_1843904_+	DUF948 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_004895661.1|1843926_1844259_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_008459757.1|1844616_1844964_+	IS66 family insertion sequence element accessory protein TnpB	NA	NA	NA	NA
WP_004896819.1|1845019_1845253_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014567179.1|1845209_1846553_+|transposase	IS66 family transposase	A0A218MNE7	uncultured_virus	1.1e-47	30.3
WP_069168940.1|1847003_1852049_+	MucBP domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_069168941.1|1852355_1853633_+|transposase	ISL3-like element ISLjo2 family transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	5.4e-49	33.3
WP_014567179.1|1853782_1855126_-|transposase	IS66 family transposase	A0A218MNE7	uncultured_virus	1.1e-47	30.3