Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP016856 | Staphylococcus aureus subsp. aureus strain 2148.N chromosome, complete genome | 7 crisprs | cas3,WYL,csa3,DEDDh,DinG | 3 | 3 | 9 | 0 |
NZ_CP025481 | Staphylococcus aureus subsp. aureus strain 2148.N plasmid p2148.N, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP016856_1 | 291598-291689 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016856_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016856_1
>1.1|291622|44|NZ_CP016856|CRISPRCasFinder GGCTTTTATGCAGTGATGCGAAGCATCATCTGTATTCCGCTGTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016856_1
The CRISPR arrays of NZ_CP016856_1 >merge|NZ_CP016856|1|291598-291689|CRISPRCasFinder CCTCTTTGATTTTTAATCATTAGAGGCTTTTATGCAGTGATGCGAAGCATCATCTGTATTCCGCTGTTCCTCTTTGATTTTTAATCATTATG >NZ_CP016856|1|1|291598-291689|CRISPRCasFinder CCTCTTTGATTTTTAATCATTAGA GGCTTTTATGCAGTGATGCGAAGCATCATCTGTATTCCGCTGTT CCTCTTTGATTTTTAATCATTATG
>NZ_CP016856.1|WP_000046704.1|290031_290298_-|cell-division-protein-ZapA MAQFKNKVNVSINDQLFTIVGEDNPEHIRYVAHLVDDKIKELGYKAAGLDTSRKAILTAVNIMHEKVLLEEENRRLKQQIHKLQQREQ >NZ_CP016856.1|WP_000234068.1|289509_290031_-|CvpA-family-protein MVIDFIIIIFFVYFVIVGFRRGFWLSMIHLSATIVSLWIASQFYKSIVERLIVFIPYPKTTAFNTTFAFHFNHLQNRFEAIVAFLMITLFCKFILYLIIVTFDKIIAYQNIHIFSRAMGMIVGVFMTIIVLHFTLYLLALYPNEALQHQLKISIVSHSLIFHIPYLSAFTINL >NZ_CP016856.1|WP_064127985.1|287724_289437_-|DNA-polymerase/3'-5'-exonuclease-PolX MTKKDVIKLLEQIATYMELKEENTFKISAYRKAAQSLELDERPLDEISDVTELKGIGKGVAEVINDYRETGESQYLQQLQEEVPEGLIPLLKIQGLGSKKIAKLYKELNIVDKASLQVACENGKVSELSGFAKKTEQNILEAVKQLGAKKDRYPIDQMRRLNQEIIDYIDTLNYIDQYSSAGSFRRFKEMSKDLDFIISTDNPKAVQQQLLNIPNKVKEVAVGNTKVSLELAYDDETIGVDFRLIEPSAFYHTLQHFTGSKEHNIRIRQLAKARDEKVSEYGIEQADGTLIQYDSEAKIYEHFNVNFIPPAMREDGSEFDKDLSNIITIDDINGDIHMHTTYSDGAFSIRDMVEANIAKGYKFMVITDHSQSLRVANGLQVERLLRQNEEIKALDKEYSEIDIYSGTEMDILPDGSLDYDDEILAQLDYVIGAIHQSFNQSEEQIMERLANACRNPYVRHIAHPTGRIIGRRDGYKPNIEQLMALAEETNTVLEINANPHRLDLNADIVRKYPNVKLTINTDAHHTNHLDFMNYGVATAQKGFVTKDRVINALSREAFKDFIENNIKLKK >NZ_CP016856.1|WP_001249293.1|285366_287715_-|endonuclease-MutS2 MRQKTLDVLEFEKIKSLVANETISDLGLEKVNQMMPATNFETVVFQMEETDEIAQIYNKHRLPSLSGLSKVSAFIHRADIGGVLNVSELNLIKRLIQVQNQFKTFYNQLVEEDEGVKYPILDDKMNQLPVLTDLFQQINETCDTYDLYDNASYELQGIRSKISSTNQRIRQNLDRIVKSQANQKKLSDAIVTVRNERNVIPVKAEYRQDFNGIVHDQSASGQTLYIEPSSVVEMNNQISRLRHDEAIEKERILTQLTGYVAADKDALLVAEQVMGQLDFLIAKARYSRSIKGTKPIFKEERTVYLPKAYHPLLNRETVVANTIEFMEDIETVIITGPNTGGKTVTLKTLGLIIVMAQSGLLIPTLDGSQLSVFKNVYCDIGDEQSIEQSLSTFSSHMTNIVEILKHADKHSLVLFDELGAGTDPSEGAALAMSILDHVRKIGSLVMATTHYPELKAYSYNREGVMNASVEFDVDTLSPTYKLLMGVPGRSNAFDISKKLGLSLNIINKAKTMIGTDEKEINEMIESLERNYKRVETQRLELDRLVKEAEQVHDDLSKQYQQFQNYEKSLIEEAKEKANQKIKAATKEADDIIKDLRQLREQKGADVKEHELIDKKKRLDDHYEAKSIKQNVQKQKYDKIVAGDEVKVLSYGQKGEVLEIVNDEEAIVQMGIIKMKLPIEDLEKKQKEKVKPTKMVTRQNRQTIKTELDLRGYRYEDALIELDQYLDQAVLSNYEQVYIIHGKGTGALQKGVQQHLKKHKSVSDFRGGMPSEGGFGVTVATLK >NZ_CP016856.1|WP_001018928.1|284879_285194_-|thioredoxin MAIVKVTDADFDSKVESGVQLVDFWATWCGPCKMIAPVLEELAADYEGKADILKLDVDENPSTAAKYEVMSIPTLIVFKDGQPVDKVVGFQPKENLAEVLDKHL >NZ_CP016856.1|WP_001788625.1|284721_284817_+|hypothetical-protein MLDYHLTFIDLLIPPFSSRKQYDDLSFNFLY >NZ_CP016856.1|WP_000390524.1|282774_284556_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrC MEDYKQRIKNKLNVVPMEPGCYLMKDRNDQVIYVGKAKKLRNRLRSYFTGAHDAKTTRLVGEIRRFEFIVTSSETESLLLELNLIKQYQPRYNILLKDDKSYPFIKITKEKYPRLLVTRTVKQGTGKYFGPYPNAYSAQETKKLLDRIYPYRKCDKMPDKLCLYYHIGQCLGPCVYDVDLSKYAQMTKEITDFLNGEDKTILKSLEERMLTASESLDFERAKEYRDLIQHIQNLTNKQKIMSSDKTIRDVFGYCVDKGWMCIQVFFIRQGNMIKRDTTMIPLQQTEEEEFYTFIGQFYSLNQHILPKEVHVPRNLDKEMIQSVVDTKIVQPARGPKKDMVDLAAHNAKVSLNNKFELISRDESRTIKAIEELGTQMGIQTPIRIEAFDNSNIQGVDPVSAMVTFVDGKPDKKNYRKYKIKTVKGPDDYKSMREVVRRRYSRVLNEGLPLPDLIIVDGGKGHMNGVIDVLQNELGLDIPVAGLQKNDKHQTSELLYGASAEIVPLKKNSQAFYLLHRIQDEVHRFAITFHRQTRQKTGLKSILDDIDGIGNKRKTLLLRSFGSIKKMKEATLEDFKNIGIPENVAKNLHEQLHK >NZ_CP016856.1|WP_000079317.1|281836_282451_-|succinate-dehydrogenase-cytochrome-b558-subunit MAQSKNEFYLRRIHSLLGIIPIGAFLVVHLLVNHQATQGAEAFNKASNFMESLPFLIIVEFLFIYIPLLYHGLFGIHIAFTAKENVGHYSIFRNWMFFFQRVSGILTFIFIGIHLWQTRLQKAFYGKEVNYDLMHETLQHPGWAIFYIICIIAVVFHFANGLWSFLVTWGGLQSPKSQRVFTWVSLIVFLVISYIGVTAIIAFM >NZ_CP016856.1|WP_000818276.1|280018_281785_-|succinate-dehydrogenase-flavoprotein-subunit MAEKHLIVVGGGLAGLMSTIKAAEKGAHVDLFSVVPVKRSHSVCAQGGINGAVNTKGEGDSPWIHFDDTVYGGDFLANQPPVKAMTEAAPKIIHLLDRMGVMFNRTNEGLLDFRRFGGTLHHRTAYAGATTGQQLLYALDEQVRAFEVDGLVTKYEGWEFLGIVKGDDDSARGIVAQNMTTAEIETFGSDAVIMATGGPGIIFGKTTNSMINTGSAASIVYQQGAIYANGEFIQIHPTAIPGDDKLRLMSESARGEGGRIWTYKDGKPWYFLEEKYPDYGNLVPRDIATREIFDVCINQKLGINGENMVYLDLSHKDPHELDVKLGGIIEIYEKFTGDDPRKVPMKIFPAVHYSMGGLYVDYDQMTNIKGLFAAGECDFSQHGGNRLGANSLLSAIYGGTVAGPNAIDYISNIDRSYTDMDESIFEKRKAEEQERFDKLLAMRGTENAYKLHRELGEIMTANVTVVRENEKLLETDKKIVELMKRYEDIDMEDTQTWSNQAVFFTRQLWNMLVLARVITIGAYNRNESRGAHYKPEFPERNDEEWLKTTMASFQGAFEKPQFTYDDVDVSLIPPRKRDYTSKSKGGKK >NZ_CP016856.1|WP_000139712.1|279203_280019_-|succinate-dehydrogenase-iron-sulfur-subunit MTEQSVKNTPQHETQSKPKQKTVKLIIKRQDTSDSKPYEETFEIPYRENLNVIACLMEIRRNPVNIKGEKTTPVVWDMNCLEEVCGACSMVINGRARQSCSAIVDQLEQPIRLEPMNTFPVIRDLQVDRSRMFDNLKRMKAWIPIDGTYDLGPGPRMPEKKRQTAYELSKCMTCGVCLEVCPNVTENNKFVGAQAISQVRLFNLHPTGSMTKDERLNALMGTGGLQQCGNSQNCVNACPKGIPLTTSIAAMNRETTFHMFKSFFGSDHEVE >NZ_CP016856.1|WP_000908978.1|292040_294443_-|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-beta MLISNEWLKEYVTIDDSVSNLAERITRTGIEVDDLIDYTKDIKNLVVGFVKSKEKHPDADKLNVCQVDIGEDEPVQIVCGAPNVDAGQYVIVAKVGGRLPGGIKIKRAKLRGERSEGMICSLQEIGISSNYIPKSFESGIYVFSEAQVPGTDALQALYLDDQVMEFDLTPNRADALSMIGTAYEVAALYNTKMTKPDTTSNELELSANNELTVTIENEDKVPYYSARVVHDVTIEPSPIWMQARLIKAGIRPINNVVDISNYVLLEYGQPLHMFDQDAIGSQQIVVRQANEGEKMTTLDGTERELLTSDIVITNGQTPIALAGVMGGDFSEVKEQTSNIVIEGAIFDPVSIRHTSRRLNLRSESSSRFEKGIATEFVDEAVDRACYLLQTYANGKVLKDRVSSGELGAFITPIDITADKINRTIGFDLSQNDIVTIFNQLGFDTEINDDVITVQVPSRRKDITIKEDLIEEVARIYGYDDIPSTLPVFEKVTSGQLTDRQYKTRMVKEVLEGAGLDQAITYSLVSKEDATAFSMQQRQTIDLLMPMSEAHASLRQSLLPHLIEAASYNVARKNKDVKLFEIGNVFFANGEGELPDQVEYLSGILTGDYVVNQWQGKKETVDFYLAKGIVDRVSEKLNLEFSYRRADIDGLHPGRTAEILLENKVVGFIGELHPTLAADNDLKRTYVFELNFDALMAVSVGYINYQPIPRFPGMSRDIALEVDQNIPAADLLSTIHAHGGNILKDTLVFDVYQGEHLEKGKKSIAIRLNYLDTEETLTDERVSKVQAEIEAALIEHGAVIR >NZ_CP016856.1|WP_000003566.1|294442_295501_-|phenylalanine--tRNA-ligase-subunit-alpha MSEQQTMSELKQQALVDINEANDERALQEVKVKYLGKKGSVSGLMKLMKDLPNEEKPAFGQKVNELRQTIQNELDERQQMLVKEKLNKQLAEETIDVSLPGRHIEIGSKHPLTRTIEEIEDLFLGLGYEIVNGYEVEQDHYNFEMLNLPKSHPARDMQDSFYITDEILLRTHTSPVQARTMESRHGQGPVKIICPGKVYRRDSDDATHSHQFTQIEGLVVDKNVKMSDLKGTLELLAKKLFGADREIRLRPSYFPFTEPSVEVDVSCFKCKGKGCNVCKHTGWIEILGAGMVHPNVLEMAGFDSSEYSGFAFGMGPDRIAMLKYGIEDIRHFYTNDVRFLDQFKAVEDRGDM >NZ_CP016856.1|WP_000435372.1|295880_296621_-|RNA-methyltransferase MEQITSAQNNRIKQANKLKKKRERDKTGLALIEGVHLIEEAYQSGIVITQLFAIEPARLDQQIIAYAQEVFEINMKVAESLSGTVTPQGFFAIIEKPHYDISKAQQVLLIDRVQDPGNLGTLIRTADAAGMDAVIMEKGTTDPYQDKVLRASQGSVFHLPVMIQDLDTFITQFNGPVYGTALENAVAYKEVTSSDSFALLLGNEGEGVNPELLAHTTQNLIIPIYGKAESLNVAIAGSILLYHLKG >NZ_CP016856.1|WP_001788617.1|296860_296968_-|hypothetical-protein MVLLAFVTTIHDTDDGRFFNEHKHANNKLLKHSLI >NZ_CP016856.1|WP_000670950.1|297004_297328_-|staphylobilin-forming-heme-oxygenase-IsdG MKFMAENRLTLTKGTAKDIIERFYTRHGIETLEGFDGMFVTQTLEQEDFDEVKILTVWKSKQAFTDWLKSDVFKAAHKHVRSKNEDESSPIINNKVITYDIGYSYMK >NZ_CP016856.1|WP_001242420.1|297346_298081_-|class-B-sortase MRMKRFLTIVQILLVVIIIIFGYKIVQTYIEDKQERANYEKLQQKFQMLMSKHQAHVRPQFESLEKINKDIVGWIKLSGTSLNYPVLQGKTNHDYLNLDFEREHRRKGSIFMDFRNELKNLNHNTILYGHHVGDNTMFDVLEDYLKQSFYEKHKIIEFDNKYGKYQLQVFSAYKTTTKDNYIRTDFENDQDYQQFLDETKRKSVINSDVNVTVKDRIMTLSTCEDAYSETTKRIVVVAKIIKVS >NZ_CP016856.1|WP_001792655.1|298142_299111_-|hemin-ABC-transporter-permease-protein-IsdF MMIKNKKKLLFLCLLVILIATAYISFVTGTIKLSFNDLFTKFTTGSNEAVDSIIDLRLPRILIALMVGAMLAVSGALLQAALQNPLAEANIIGVSSGALIMRALCMLFIPQLYFYLPLLSFIGGLIPFLIIILLHSKFRFNAVSMILVGVALFVLLNGVLEILTQNPLMKIPQGLTMKIWSDVYILAVSALLGLILTLLLSPKLNLLNLDDIQARSIGFNIDRYRWLTGLLAVFLASATVAIVGQLAFLGIIVPHVVRKLVGGNYRVLIPFSTVIGAWLLLVADLLGRVIQPPLEIPANAILMIVGGPMLICLICQSQRNRI >NZ_CP016856.1|WP_001220199.1|299120_299999_-|heme-ABC-transporter-substrate-binding-protein-IsdE MRIIKYLTILVISVVILTSCQSSSSQESTKSGEFRIVPTTVALTMTLDKLDLPIVGKPTSYKTLPNRYKDVPEIGQPMEPNVEAVKKLKPTHVLSVSTIKDEMQPFYKQLNMKGYFYDFDSLKGMQKSITQLGDQFNRKAQAKELNDHLNSVKQKIENKAAKQKKHPKVLILMGVPGSYLVATDKSYIGDLVKIAGGENVIKVKDRQYISSNTENLLNINPDIILRLPHGMPEEVKKMFQKEFKQNDIWKHFKAVKNNHVYDLEEVPFGITANVDADKAMTQLYDLFYKDKK >NZ_CP016856.1|WP_001246696.1|299995_301072_-|hypothetical-protein MRNVKQIATKSIIAIISLGILTYTTMIGSVLADEIKYPSAKFNQPEAKDKTELTTSIFDEKIKENKALELLIFNQENKNVTEEQKLVDEKAQLISDMTGKIYLQVKLKGQIDKEQLVFQNDKNEEFPFVIKDEKDDTIVRILIEQHMDKINMHVKTLAEKKNLDNKEMVYSIHFKEKKVQHDDAKEVPSKHQNQENNQDQLKKDIDDKKDSQKSDTKERRTSLFTEKGLNDIPVQKDKVQQDSNKKIENERPKASGTLKVENSPPTIKKVENNHKEQPKHKDEKSKKEKKKVVEKEKALPAFNRDDDSKNSSQLSSDIKELDEPNHKKQYILFAAGIVLATILLISAHLYSRKRGNQV >NZ_CP016856.1|WP_000789821.1|301071_301755_-|heme-uptake-protein-IsdC MKNILKVFNTTILALIIIIATFSNSANAADSGTLNYEVYKYNTNDTSIANDYFNKPAKYIKKNGKLYVQITVNHSHWITGMSIEGHKENIISKNTAKDERTSEFEVSKLNGKIDGKIDVYIDEKVNGKPFKYDHHYNITYKFNGPTDVAGANAPGKDDKNSASGSDKGSDGTTTGQSESNSSNKDKVENPQTNAGTPAYIYAIPVASLALLIAITLFVRKKSKGNVE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP016856_2 | 500113-500191 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016856_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016856_2
>2.1|500136|33|NZ_CP016856|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016856_2
The CRISPR arrays of NZ_CP016856_2 >merge|NZ_CP016856|2|500113-500191|CRISPRCasFinder CCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTCCACCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG >NZ_CP016856|2|2|500113-500191|CRISPRCasFinder CCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTCCA CCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG
>NZ_CP016856.1|WP_000185319.1|498935_499865_+|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MTNSSKSFTKFMAASAVFTMGFLSVPTAGAEQTNQIANKPQAIQWHTNLTNERFTTIAHRGASGYAPEHTFQAYDKSHNELKASYIEIDLQRTKDGHLVAMHDETVNRTTNGHGKVEDYTLDELKQLDAGSWFNKKYPKYARASYKNAKVPTLDEILERYGPNANYYIETKSPDVYPGMEEQLLASLKKHHLLNNNKLKNGHVMIQSFSDESLKKIHRQNKHVPLVKLVDKGELQQFNDQRLKEIRSYAIGLGPDYTDLTEQNTHHLKDLGFIVHPYTVNEKADMLRLNKYGVDGVFTNFADKYKEVIK >NZ_CP016856.1|WP_000066053.1|497314_498694_+|argininosuccinate-lyase MSNKAWGGRFEVQPEEWVDDFNASITFDQTLIDQDIEGSIAHATMLANQGIISQQDSEQIIQGLKSIQHDYHQDQIQFSASLEDIHLNIEHELIKRIGDAGGKLHTGRSRNDQVATDMHLYTKKQVQDIIALIKSLQSVIVDIASNNVDTIMPGYTHLQRAQPISFAHHIMTYFWMLQRDQQRFEDSLKRIDINPLGAAALSGTTYPIDRHETTALLNFGSLYENSLDAVSDRDYIIETLHNISLTMVHLSRFAEEIIFWSTDEAKFITLSDAFSTGSSIMPQKKNPDMAELIRGKVGRTTGHLMSMLMTLKGLPLAYNKDMQEDKEGLFDAVHTIKGSLRIFEGMIQTMTINKERLNQTVKEDFSNATELADYLVTKNIPFRTAHEIVGKIVLECIQQGHYLLDVPLATYQQHHSSIDADIYDYLQPENCLKRRQSYGSTGQSSVKQQLDVAKQLLSQ >NZ_CP016856.1|WP_000660040.1|496119_497325_+|argininosuccinate-synthase MKEKIVLAYSGGLDTSVAVQWLIDKGYDVVACCLDVGEGKDLDIVYKKALDMGAVECHIIDATKEFSDEYVSYAIKGNLMYENAYPLVSALSRPLIAKKLVEIAEKTNSVGIAHGCTGKGNDQVRFEVAIKALNPSLKAFAPVREWAWSREEEIDYAIKHNIPVSINHDSPYSIDQNLWGRANECGILEDPYAAPPEDAFDLTNALEETPDAADEIILTFDKGIPVQIDGKTYELDDLILTLNALAGKHGIGRIDHVENRLVGIKSREIYEAPAAEVILKAHKALETITLTKDVAHFKPIIEKQFAEQLYNGLWFSPLTDSLKLFIDSTQQYVSGDVRIKLFKGNAIVNGRKSPYTLYDEKLATYTKEDAFNQDAAVGFIDIYGLPTQVNAMLHGGYSNEQ >NZ_CP016856.1|WP_000148852.1|494438_495770_-|glucose-6-phosphate-isomerase MTHIQLDFSKTLEFFGEHELKQQQEIVKSIHKTIHEGTGAGSDFLGWVDLPVDYDKEEFSRIVEASKRIKENSDVLVVIGIGGSYLGARAAIEMLTSSFRNSNEYPEIVFVGNHLSSTYTKELVDYLADKDFSVNVISKSGTTTEPAVAFRLFKQLVEERYGKEEAQKRIFATTDKEKGALKQLATNEGYETFIVPDDVGGRYSVLTAVGLLPIATAGINIEAMMIGAAKAREELSSDKLEDNIAYQYATIRNILYAKGYTTEMLINYEPSMQYFNEWWKQLFGESEGKDFKGIYPSSANYTTDLHSLGQYVQEGRRFLFETVVKVNHPKYDITIEKDSDDLDGLNYLAGKTIDEVNTKAFEGTLLAHTDGGVPNMVVNIPQLDEETFGYVVYFFELACAMSGYQLGVNPFNQPGVEAYKQNMFALLGKPGFEDLKKELEERL >NZ_CP016856.1|WP_000007967.1|493538_494114_-|TVP38/TMEM64-family-protein MSFHQVEEWFEIFRQFGYLPGFILLYIRAIIPVFPLALYILINIQAYGPILGILISWLGLISGTFTVYLICKRLVNTERMQRIKQRTAVQRLISFIDRQGLIPLFILLCFPFTPNTLINFVASLSHIRPKYYFIVLASSKLVSTIILGYLGKEITTILTHPLRGILMLVVLVVFWIVGKKLEQHFMGSKKE >NZ_CP016856.1|WP_000758204.1|493009_493534_-|signal-peptidase-I MKKVVKYLISLILAIIIVLFVQTFVIVGHVIPNNDMSPSLNKGDRVIVNKIKVTFNQLNNGDIITYRRGNEIYTSRIIAKPGQSMAFRQGQLYRDDRPVDASYAKNRKIKDFSLRNFKELDGDIIPPNNFVVLNDHDNNQHDSRQFGLIDKKDIIGNISLRYYPFSKWTIQFKS >NZ_CP016856.1|WP_000711893.1|492418_492994_-|signal-peptidase-I MKKELLEWIISIAIALVIFAIIGKFIVTPYTIKGESMDPTLKDGERVAVNIIGYKTGGLEKGNVVVFHANKNDDYVKRVIGVPGDKVEYKNDTLYVNGKKQDEPYLNYNLKHKQGDYITGTFQVKDLPNANPKSNVIPKGKYLVLGDNREVSKDSRAFGLIDEDQIVGKVSFRFWPFSEFKHNFNPENTKN >NZ_CP016856.1|WP_000172378.1|488782_492259_-|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddB MTLHAYLGRAGTGKSTKMLTETKQKMKADPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDPELNGSLRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFSEKLTEQIQDFKKYAVTPEHLEHFIADKNMQTRTKNKIEDIALIYREFEQRIQNEFITGEDSLQYFIDCMPKSEWLKRADIYIDGFHNFSTIEYLIIKGLIKYAKSVTIILTTDGNHDQFSLFRKPSEVLRHIEEIANELNISIERQYFKQLYRFNNQDLKHLEQEFDALQINRVACQGHINILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYQDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNIDTKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTASYLKSAYLVDLLENFVLERGIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILHFEKQMSQAETVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGNHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVFGDETMSMERFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMPQPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRAKGDVTFSYSLMGSSGDDKEISPFLNQIQSLFNQLEITNIPQYHEVNPLSLMQHAKQTKITLFEALRAWLYDEIVADSWLDAYQVIRDSDHLNQGLDYLMSALTFDNETVKLGETLSKDLYGKEINASVSRFEGYQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLTNEALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRRKPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSATLDLTKVYYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWADIDEDKLEQDLIKKFKLSGLVNADQTVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFIQHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETINPIEAIQNININDEFGGEQ >NZ_CP016856.1|WP_000154922.1|485128_488782_-|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA MTIPEKPQGVIWTDAQWQSIYATGQDVLVAAAAGSGKTAVLVERIIQKILRDGIDVDRLLVVTFTNLSAREMKHRVDQRIQEASIADPANAHLKNQRIKIHQAQISTLHSFCLKLIQQHYDVLNIDPNFRTSSEAENILLLEQTIDEVIEQHYDILDPAFIELTEQLSSDRSDDQFRMIIKQLYFFSVANPNPTNWLDQLVTPYEEEAQQAQLIQLLTDLSKVFITAAYDALNKAYDLFSMMDGVDKHLAVIEDERRLMGRVLEGGFIDIPYLTDHEFGARLPNVTAKIKEANEMMVDALEDAKLQYKKYKSLIDKVKSDYFSREADDLKADMQQLAPRVKYLARIVKDVMSEFNRKKRSKNILDFSDYEHFALQILTNEDGSPSEIAESYRQHFQEILVDEYQDTNRVQEKILSCIKTGDEHNGNLFMVGDVKQSIYKFRQADPSLFIEKYQRFTIDGDGTGRRIDLSQNFRSRKEVLSTTNYIFKHMMDEQVGEVKYDEAAQLYYGAPYDESDHPVNLKVLVEADQEHSDLTGSEQEAHFIVEQVKDILEHQKVYDMKTGSYRSATYKDIVILERSFGQAHNLQQAFKNEDIPFHVNSREGYFEQTEVRLVLSFLRAIDNPLQDIYLVGLMRSVIYQFKEDELAQIRILSPNDDYFYQSIVNYINDEAADAILVDKLKMFLSDIQSYQQYSKDHPVYQLIDKFYNDHYVIQYFSGLIGGRGRRANLYGLFNKAIEFENSSFRGLYQFIRFIDELIERGKDFGEENVVGPNDNVVRMMTIHSSKGLEFPFVIYSGLSKDFNKRDLKQPVILNQQFGLGMDYFDVDKEMAFPSLASVAYKAVAEKELVSEEMRLVYVALTRAKEQLYLIGRVKNDKSLLELEQLSISGEHIAVNERLTSPNPFHLIYSILSKHQSASIPDDLKFEKDIAQVEDSSRPNVNISIIYFEDVSTETILDNNEYRSVNQLETMQNGNEDVKAQIKHQLDYQYPYVNDTKKPSKQSVSELKRQYETEESGTSYERVRQYRIGFSTYERPKFLSEQGKRKANEIGTLMHTVMQHLPFKKERISEVELHQYIDGLIDKHIIEADAKKDIRMDEIMTFINSELYSIIAEAEQVYRELPFVVNQALVDQLPQGDEDVSIIQGMIDLIFVKDGVHYFVDYKTDAFNRRRGMTDEEIGTQLKNKYKIQMKYYQNTLQTILNKEVKGYLYFFKFGTLQL >NZ_CP016856.1|WP_000670755.1|484060_484963_-|fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein MKFLSFKYNDKTSYGVKVKREDAVWDLTQVFADFAEGDFHPKTLLAGLQQNHTLDFQEQVRKAVVAAEDSGKAEDYKISFNDIEFLPPVTPPNNVIAFGRNYKDHANELNHEVERLYVFTKAASSLTGDNATIPNHKDITDQLDYEGELGIVIGKSGEKIPKALALDYVYGYTIINDITDRKAQSEQDQAFLSKSLTGGCPMGPYIVTKDELPLPENVNIVTKVNNEIRQDGNTGEMILKIDELIEEISKYVALHPGDIIATGTPAGVGAGMQPPKFLQPGDEVKVTIDNIGTLTTYIAK >NZ_CP016856.1|WP_000138487.1|500315_501560_-|Glu/Leu/Phe/Val-dehydrogenase MTENNNLVTSTQGIIKEALHKLGFDEGMYDLIKEPLRMLQVRIPVRMDDGTVKTFTGYRAQHNDAVGPTKGGVRFHPDVDEEEVKALSMWMTLKCGIVNLPYGGGKGGIVCDPRQMSIHEVERLSRGYVRAISQFVGPNKDIPAPDVFTNSQIMAWMMDEYSALDKFNSPGFITGKPIVLGGSHGRDRSTALGVVIAIEQAAKRRNMQIEGAKVVIQGFGNAGSFLAKFLYDLGAKIVGISDAYGALHDPNGLDIDYLLDRRDSFGTVTNLFEETISNKELFELDCDILVPAAISNQITEDNAHDIKASIVVEAANGPTTPEATRILTERGILLVPDVLASAGGVTVSYFEWVQNNQGYYWSEEEVNEKLREKLEAAFDTIYELSQNRKIDMRLAAYIIGIKRTAEAARYRGWA >NZ_CP016856.1|WP_000167314.1|501668_502859_-|ornithine--oxo-acid-transaminase MTKSEKIIELTNHYGAHNYLPLPIVISEAEGVWVKDPEGNKYMDMLSAYSAVNQGHRHPKIIQALKDQADKVTLVSRAFHSDNLGEWYEKICKLAGKDKALPMNTGAEAVETALKAARRWAYDVKGIEPNKAEIIAFNGNFHGRTMAPVSLSSEAEYQRGYGPLLDGFRKVDFGDVDALKAAINENTAAVLVEPIQGEAGINIPPEGYLKAIRELCDEHNVLFIADEIQAGLGRSGKLFATDWDNVKPDVYILGKALGGGVFPISVVLADKEVLDVFTPGSHGSTFGGNPLACAASIAALDVIVDEDLPGRSLELGDYFKEQLKQIDHPSIKEVRGRGLFIGVELNESARPYCEALKEEGLLCKETHDTVIRFAPPLIITKEELDLALEKIRHVFQ >NZ_CP016856.1|WP_000838035.1|503166_504294_-|NADH-dependent-flavin-oxidoreductase MKSKYEPLFDKVELPNGVELRNRFVLAPLTHISSNDDGTISDVELPYIEKRSQDVGITINAASNVSDVGKAFPGQPSIAHDSDIEGLKRLATAMKKNGAKALVQIHHGGAQALPELTPGGDVVAPSPISLKSFGQKQEHSAREMTNEEIEQAIKDFGEATRRAIEAGFDGVEIHGANHYLIHQFVSPYYNRRNDVWVNQYKFPVAVIEEVLKAKEAYGNKDFIVGYRLSPEEAESPGITMEITEELVNKISHMPIDYIHVSMMDTHATTREGKYAGQERLPLIHKWINGRMPLIGIGSIFTADEALDAVENVGVDLVAIGRELLLDYQFVEKIKDGREDEIINYFDPEREDNHHLTPNLWHQFNEGFYPLPRKDK >NZ_CP016856.1|WP_001067294.1|504655_505033_-|S1-RNA-binding-domain-containing-protein MNNYKIGQHIKVRVTGIQPYGAFVETPNHTEGLIHISEIMDDYVHNLKKFLSEGQIVKAKILSIDDEGKLNLSLKDNDYFKNYERKKEKQSVLDEIRETEKYGFQTLKERLPIWIKQSKRAIRND >NZ_CP016856.1|WP_000035058.1|505447_506041_-|peptidylprolyl-isomerase MANYPQLNKEVQQGEIKVVMHTNKGDMTFKLFPNIAPKTVENFVTHAKNGYYDGITFHRVINDFMIQGGDPTATGMGGESIYGGAFEDEFSLNAFNLYGALSMANSGPNTNGSQFFIVQMKEVPQNMLSQLADGGWPQPIVDAYGEKGGTPWLDQKHTVFGQIIDGETTLEDIANTKVGPQDKPLHDVVIESIDVEE >NZ_CP016856.1|WP_000781162.1|506104_506488_+|kinase-associated-lipoprotein-B MKLYRFSHKTGSYGVTIVEENGDDVLVKVEQVIKHPKQGDLHNPTETEGVFFHERKALSHFEKRYTKRSQLRDFNVDVLRYEDSLQQAITDLETKLKAQQTKHAEMSLASLARLKEDYSLQYKENFK >NZ_CP016856.1|WP_000054608.1|506618_509024_+|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-A MSLLHIAVILPLIFALIIPILYRFFKRIHLGWFVLPVPIVIFIYMLTLIKTTMSGNTVMKTLNWMPHFGMNFDLYLDGLGLLFSLLISGIGSLVVLYSIGYLSKSEQLGNFYCYLLLFMGAMLGVVLSDNVIILYLFWELTSFSSFLLISFWRERQASIYGAQKSLIITVFGGLSLLGGIILLAIPTQSFSIQYMIQHASEIQNSPFFIFAMILIMIGAFTKSAQFPFYIWLPDAMEAPTPVSAYLHSATMVKAGLYLIARMTPIFAASQGWVWTVTLVGLITLFWASLNATKQQDLKGILAFSTVSQLGMIMAMLGIGAISYHYQGDDSKIYAAAFTAAIFHLINHATFKGALFMITGAVDHSTGTRDVKKLGGLLTIMPISFTITVITALSMAGVPPFNGFLSKESFLETTFTASQANLFSVDTLGYLFPIIGIVGSVFTFVYSIKFIMHIFFGQYKPEQLPKKAHEVSILMLLSPAILATLVIVFGLFPGILTNSIIEPATSSINHTVIDDVEFHMFHGLTPAFISTLVIYILGILLIVTFSYWVKLLQRQPGKLTFNYWYNRSANVIPNYSEKMTNSYVTDYSRNNLVIIFGALILLTFVTIFSVPFNINFKDVSPIRIFEVCIVILLLSAAFLILFAKSRLFSIIMLSAVGYAVSVLFIFFKAPDLALTQFVVESISTALFLLCFYHLPNLNRYNEKRSFQLTNALIAGGVGLSVIIIGLIAYGNRHFESISKFYQEHVYDLAHGKNMVNVILVDFRGMDTLFESSVLGIAGLAVYTMIKLRKKRQTQGNEVKNHE >NZ_CP016856.1|WP_001081626.1|509016_509445_+|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-B MNRQQNDLILQFAAVIIFFMVMVFGFSLFLAGHYTPGGGFVGGLLFASSLVIITIAFDIETMRKIFPLDFKILIGIGLVFCIATPIASWFLGKNFFTHVTFDIPLFILEPVHMTTAVFFDFGVLCAVVGTVMTIIISIGENE >NZ_CP016856.1|WP_000402803.1|509444_509786_+|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-C MEIIMIFVSGILTAISVYLVLSKSLIRIVMGTTLLTHAANLFLITMGGLKHGTVPIYEANVKSYVDPIPQALILTAIVIAFATTAFFLVLAFRTYKELGTDNVESMKGVPEDD >NZ_CP016856.1|WP_000573077.1|509778_511275_+|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-D MIESNMLVLTLVIPVITAILLVFIGKRPIIKRYVALGGTLLTLVAAIINLANVVKHGPIRVELGSWKAPYSIVFVLDIFSALLIITSIIITAIVILYSYQTIGIERERYYYYFSVLFMLIGIIGAFTTGDIFNLFVFFEVFLMSSYFLLVIGSTKIQLQETIKYVLVNVVSSSFFVMGVAILYSVVGTLNLADISNKLANLSAHDSGLVNIVFILFIFVFATKAGVFPMFVWLPSAYYAPPIPIIAFFGALLTKVGVYAIARTLSLFFSDNVSFSHYVILFLALLTIIFGCVGAVAYANIKKIILYNVMIAVGVILVGVAMMTESGMIGAIYYTLHDMLVKLALFLLIGIMIKITGTADLRQFGGLIKRYPVLGWSFFIAALSLAGIPPLSGFYGKFFIVQSTFERGFYLSGVIVLLSSLVVLYSVIRIFLQGFFGQPKGYDLNNKVDVKYLTTIAIVAVVITVLYGLSADYLYPMVKAGAETFYNPSTYVKAVLGGK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP016856_3 | 596515-596592 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016856_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016856_3
>3.1|596538|32|NZ_CP016856|CRISPRCasFinder TTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016856_3
The CRISPR arrays of NZ_CP016856_3 >merge|NZ_CP016856|3|596515-596592|CRISPRCasFinder TGGCGGGGCCCCAACATAAAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAAAGAA >NZ_CP016856|3|3|596515-596592|CRISPRCasFinder TGGCGGGGCCCCAACATAAAGAA TTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGT TGGCGGGGCCCCAACATAAAGAA
>NZ_CP016856.1|WP_000958224.1|595342_596275_-|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >NZ_CP016856.1|WP_000513313.1|594497_595337_-|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYVENPSEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >NZ_CP016856.1|WP_001224795.1|594004_594490_-|acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWRVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLVGANSIILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >NZ_CP016856.1|WP_000057543.1|592557_593997_-|tetratricopeptide-repeat-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMAKQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYQNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >NZ_CP016856.1|WP_000134961.1|591555_592491_-|thioredoxin-disulfide-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLKDQA >NZ_CP016856.1|WP_000369722.1|589761_590673_-|RNase-adapter-RapZ MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >NZ_CP016856.1|WP_001248939.1|588769_589765_-|YvcK-family-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTSSNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >NZ_CP016856.1|WP_000006551.1|587714_588659_-|DNA-binding-protein-WhiA MSFASEMKNELTRIDVDEMNAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >NZ_CP016856.1|WP_001049165.1|586563_587151_-|ATP-dependent-Clp-endopeptidase-proteolytic-subunit-ClpP MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKTREKLNRILSERTGQSIEKIQKDTDRDNFLTAEEAKEYGLIDEVMVPETK >NZ_CP016856.1|WP_000816300.1|585418_586321_+|TIGR01777-family-protein MKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGIILSNEGGALQTMKLPYEYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINNESASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQMSTVVLDTQKVLPNKIQALGFQFKYSNLKMALEDLIKE >NZ_CP016856.1|WP_000662681.1|596880_599727_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrA MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNIDLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIEVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGVDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK >NZ_CP016856.1|WP_000229238.1|599734_601720_-|excinuclease-ABC-subunit-UvrB MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIEEIVEGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYRTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQIRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >NZ_CP016856.1|WP_000638419.1|601988_602225_-|CsbA-family-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >NZ_CP016856.1|WP_000538141.1|602221_602872_-|HD-domain-containing-protein MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKRKEENE >NZ_CP016856.1|WP_000753321.1|603045_603885_-|CHAP-domain-containing-protein MKKTLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKAVKTPVRKASQAKKVVKQPVQQASKKVVVKQAPKQAVAKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH >NZ_CP016856.1|WP_072360986.1|604032_604140_-|hypothetical-protein MYLLKQHMQCAFSNITYGDFQGIELIVENVLNYMV >NZ_CP016856.1|WP_010956549.1|604293_605404_-|peptide-chain-release-factor-2 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MGFLSKILDGNNKEIKQLGKLADKVIALEEKTAILTDEEIRNKTKQFQTELADIDNVKKQNDYLDKILPEAYALVREGSKRVFNMTPYKVQIMGGIAIHKGDIAEMRTGEGKTLTATMPTYLNALAGRGVHVITVNEYLSSVQSEEMAELYNFLGLTVGLNLNSKTTEEKREAYAQDITYSTNNELGFDYLRDNMVNYSEDRVMRPLHFAIIDEVDSILIDEARTPLIISGEAEKSTSLYTQANVFAKMLKQDEDYKYDEKTKAVHLTEQGADKAERMFKVENLYDVQNVDVISHINTALRAHVTLQRDVDYMVVDGEVLIVDQFTGRTMPGRRFSEGLHQAIEAKEGVQIQNESKTMASITFQNYFRMYNKLAGMTGTAKTEEEEFRNIYNMTVTQIPTNKPVQRNDKSDLIYISQKGKFDAVVEDVVEKHKAGQPVLLGTVAVETSEYISNLLKKRGIRHDVLNAKNHEREAEIVAGAGQKGAVTIATNMAGRGTDIKLGEGVEELGGLAVIGTERHESRRIDDQLRGRSGRQGDKGDSRFYLSLQDELMIRFGSERLQKMMSRLGLDDSTPIESKMVSRAVESAQKRVEGNNFDARKRILEYDEVLRKQREIIYNERNSIIDEEDSSQVVDAMLRSTLQRSINYYINTADDEPEYQPFIDYINDIFLQEGDITEDDIKGKDAEDIFEVVWAKIEAAYQSQKDILEEQMNEFERMILLRSIDSHWTDHIDTMDQLRQGIHLRSYAQQNPLRDYQNEGHELFDIMMQNIEEDTCKFILKSVVQVEDNIEREKTTEFGEAKHVSAEDGKEKVKPKPIVKGDQVGRNDDCPCGSGKKFKNCHGK >NZ_CP016856.1|WP_000617735.1|608663_609236_-|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA MIRFEIHGDNLTITDAIRNYIEEKIGKLERYFNDVPNAVAHVKVKTYSNSATKIEVTIPLKNVTLRAEERNDDLYAGIDLINNKLERQVRKYKTRINRKSRDRGDQEVFVAELQEMQETQVDNDAYDDNEIEIIRSKEFSLKPMDSEEAVLQMNLLGHDFFVFTDRETDGTSIVYRRKDGKYGLIQTSEQ |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP016856_4 | 1009824-1009926 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016856_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016856_4
>4.1|1009848|55|NZ_CP016856|CRISPRCasFinder TAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016856_4
The CRISPR arrays of NZ_CP016856_4 >merge|NZ_CP016856|4|1009824-1009926|CRISPRCasFinder CAAATTTAATACTCAATTCATATATAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTTCAAATTTAATACTCAATTCATAAA >NZ_CP016856|4|4|1009824-1009926|CRISPRCasFinder CAAATTTAATACTCAATTCATATA TAGCTTTGATTTAAAAACTGATTTTTTATAAACCTATAGAACTGTAATTTACTTT CAAATTTAATACTCAATTCATAAA
>NZ_CP016856.1|WP_020978012.1|1008850_1009807_+|hypothetical-protein MLTKEFAQRVELSEKQVRKIVQHLEERGYQLSKTEYRGREATDFKEEDIELFKDIADKVKQTNSYDLAFDELEKEKDFLQVIVKNDDKNLPTNQNVAQLVEDLRLEIQKMREERHLFGQMMNQVHQQQQELKELQNQLTSKIDSNSESLKAIQTSQEAIQEAQASQAKVLAESTNKVEKNAVTEDKADSKDSKVAGVTTSTDAKTDTKAENAGDGTATKVDKEDQISATEAIEKASVEQSKNENAAETSNKEATVDADAQHDAEQQVAEAHAEASKQATSNDSLEAKAENDSTASQSEMSEPKPQEEKKGFFARLFNL >NZ_CP016856.1|WP_000394698.1|1008070_1008733_+|hypothetical-protein MEFKTIQSVKDPHYNEALKLYDTKLNLSLTEDKRIIKRSLENNKTENDYVFIVGLENDVVVSLATAHYEATTNSAFLIYLFAKDLPNHDELMTQTLHQIEHELNLLSNLVHSRSINFLMMEVPKEPADLTQDNGLIIEHRRQFLYEHQFERQTEIDYIHPTNDGHTKKVDLFLKKNIKLTKDIYGTSVKSNYILKYVFANGIAREIIYALLEEMDLRKPF >NZ_CP016856.1|WP_000763767.1|1007520_1007928_+|general-stress-protein MADITVVNDTGELYNVINQKKSEGYLESELTIISKSKLHLNDLHDSEISLISTSGTFSDRMTKLLTGEDGEHAVLSRYNLAPDELEKYKQLILDDKMLVVAVRDKSSHKEVQEHNSAYEEIDITHFAEASKGPKA >NZ_CP016856.1|WP_000421410.1|1006429_1007008_-|xanthine-phosphoribosyltransferase MELLGQKVKEDGVVIDEKILKVDGFLNHQIDAKLMNEVGRTFYEQFKDKGITKILTIEASGIAPAIMAALHFDVPCLFAKKAKPSTLTDGYYETSIHSFTKNKTSTVIVSKEFLSEEDTVLIIDDFLANGDASLGLYDIAQQANAKTAGIGIVVEKSFQNGHQRLEEAGLTVSSLCKVASLEGNKVTLVGEE >NZ_CP016856.1|WP_000793020.1|1005161_1006430_-|purine-permease MKNLILSVQHLLAMYAGAILVPIIVGTSLKFTPEQIAYLVTVDIFMCGVATFLQANKVTGTGLPIVLGCTFTAVAPMILIGQTKGIDVLYGSLFLSGILVIIIAPFFSHLVKFFPPVVTGSVVTIIGINLMPVAMNYLAGGQGAKDYGDVKNILLGLMTLIIILVLQRFTTGFIKSIAILIGLVLGTIGAGLLGMVDINQVNHAGWLGIPVPFRFSGFSFDVTSTLVFFIVAIVSLIESTGVYHALSEITGKKLERKDFRKGYTAEGLAIVLGSIFNSFPYTAYSQNVGLVSLSGAKKNNVIYGMVVLLIICGCIPKLGALANIIPLPVLGGAMIAMFGMVMAYGVSILGHIDFKNQNNLLIIAVSVGLGTGISAVPQAFKGLGEQFAWLTQNGIVLGAISAIILNFFFNGIKYKQTEENVK >NZ_CP016856.1|WP_000264071.1|1003657_1005124_-|IMP-dehydrogenase MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >NZ_CP016856.1|WP_000424963.1|1002091_1003633_-|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCKGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >NZ_CP016856.1|WP_000361527.1|1000473_1001580_-|Abi-family-protein MDKSLEINLKELESIMYKEKVIDVKEYDNLKVTFETLNDAPKSEIPTPFTIEQMLYKLETKNLYFPEIKSKEKCVELLHSVGYYNLKHFMYNEFGKDEPKNFDEVYILYKFDRYLLKQLFSLVNMLETHIRNIILEVYMLEIEYNNKPSTLFYLDKDLYFEKVNDEYKYSAKKLKEFNRLQNVFWRAIEKKKSNDNVKHNIKKYNIIPAWVLFQNFSFGDLSTFYRTTLPTYRNKVSKRIENLIEKNTGISIKLPEKLLCAWLNSIRFLRNRIAHTDIIYGINFTNTCAKHHSDEEMYVNIEKYKYQQRLVTFLLAMKKIFMSMPENNIIEWNETLTKIENKCSEHNFIKLSRLGVIENNLSYFKITK >NZ_CP016856.1|WP_000888757.1|999286_999679_+|hypothetical-protein MLEDNGDIRLLYQSIEELASVLGQSQFETKTVSLIFVQMDLRYSVFEKVQTDFMKYLAHKNSDEIKYIDLIKIIENALPEDKELSINVINSIIIGFANNYYPILQSLVPEIQSSYGITINKNFNIDSIDF >NZ_CP016856.1|WP_000157765.1|999033_999249_-|hypothetical-protein MASLTTVEIIPASPLLRPAFIAPRLTASPTELAGTSDHFSNGFNSFTIPEYPLSKIVAAVGGGLTGGVTFC >NZ_CP016856.1|WP_001792089.1|1010601_1010700_-|hypothetical-protein MQLNVNMMKFDRWHKGICKQIVLNLVEKGEKG >NZ_CP016856.1|WP_000991021.1|1010784_1012173_+|L-cystine-transporter MNAFLTLINIIVLVIFIVILHMMARKHISFAKRVFTALGIGIVFGVLLHLVYGTHSNVITSTSDWFNIVGQGYVALLQMIVMPLIFISIVAAFTKIQIGEKFAKIGSLIFIFLIGTVTIAAIVGVVYALVFGLDASTINLGNAEQARGSEIAKQAKDLTAHTLPQQILELLPKNPFLDFTGQRATSTIAVVIFASFIGFAYLRVARKQPDHGELLKSAIDAIYSLVMAIVTFVLRLTPYGVLAIMANTLSTSDFGAIWTLGKFLIASYAALITMYIIHLVILSLLGISPIRYVKKTLEVLIFAFTSRSSAGALPLNVQTQTRRLGVPEGIANFAATFGLSIGQNGCAGIYPAMLAIMVAPVANVEIDLQFIVTLIAVVIISSFGVAGVGGGATFASILVLSTLNLPVALAGVLISVEPLIDMGRTALNVNDSMLAGTGTAKLTKHWDKDTFESNDNAALTSH >NZ_CP016856.1|WP_001289311.1|1012252_1013008_-|NADPH-dependent-oxidoreductase MSEHVYNLVKKHHSVRKFKNKPLSEDVVKKLVEAGQSASTSSFLQAYSIIGIDDEKIKENLREVSGQPYVVENGYLFVFVIDYYRHHLVDQHAETDMENAYGSTEGLLVGAIDAALVAENIAVTAEDMGYGIVFLGSLRNDVERVREILDLPDYVFPVFGMAVGEPADDENGAAKPRLPFDHVFHHNKYHADKETQYAQMADYDQTISEYYDQRTNGNRKETWSQQIEMFLGNKARLDMLEQLQKSGLIQR >NZ_CP016856.1|WP_000052781.1|1013499_1014069_+|peroxiredoxin MSLINKEILPFTAQAFDPKKDQFKEVTQEDLKGSWSVVCFYPADFSFVCPTELEDLQNQYEELQKLGVNVFSVSTDTHFVHKAWHDHSDAISKITYTMIGDPSQTITRNFDVLDEATGLAQRGTFIIDPDGVVQASEINADGIGRDASTLAHKIKAAQYVRKNPGEVCPAKWEEGAKTLQPGLDLVGKI >NZ_CP016856.1|WP_000930514.1|1014084_1015608_+|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F MLNADLKQQLKQLLELMEGNVEFVASLGSDEKSKELKELLTEISDMSPRLSLSEKSLKRTPSFSVNRPGEETGVTFAGIPLGHEFNSLVLAILQVSGRAPKEKQSIIDQIKNLEGSFHFETFISLTCQKCPDVVQALNLMSVINPNITHSMIDGAVFREESENIMAVPAVFLNGEEFGNGRMTIQDILSKLGSTADASEFENKEPYDVLIVGGGPASGSAAIYTARKGLRTGIVADRIGGQVNDTAGIENFITVKETTGSEFSSNLAAHIDQYDIDAMTGIRATDIEKTDEAIKVTLENGAVLESKTVIIATGAGWRKLNIPGEEQLINKGVAFCPHCDGPLFENKDVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVNHVTLFEFASELKADNVLQDRLRSLSNVDIKTNAKTTEVVGEDHVTGIRYEDMSTGEEHLLNLDGIFVQIGLLPNTSWLKDAVELNERGEIVIDRNNNTNVPGIFAAGDVTDQKNKQIIISMGAGANAALNAFDYIIRN >NZ_CP016856.1|WP_000887774.1|1015722_1017342_+|hypothetical-protein MLDVHFIYPGKLQNACEYFNLSTSKEGFEVTIHALRPENIHKIYHDMDNSEQRFIETLISKGNPVTIVNSRDVNMLKLTNHLGFVYQLNEDEFFVNNFFLRYINSEVLDNAYGEFESLDTINHMNLNEEVLRVRQHTRLNDVTLEHALLLKTNDELKTICRQYGIKGFSNKNKQNLVELIMTAFFNNNHIIEQVFSNATLFEFDILSSILESDDNYRLNNELTKFEKLQLINFDNFLTIHFYYYYDFEYDCLILPNDVRKHIENFVNQVGNGYFEKAVNQFVDEQTIENSLAEFKNALELSFMEDEVDLDMLLEDDDFEDFGTTDSLRSDAITQLISEIKKGLIDKKDILPLRIILGSVNLYGILSTNHLLYLLQRFYDATFSKEELQYSLDTLAGTELYYVEDDFVFHPVLFDVVESEASGIDISDDGYYVPASVEELIYYDRHHYLKSDQAIKEFTSYLRKQINMKNDIEKEKYVNEIIMLLRTIPTSKLIQPIMQLFIDNAILNNVQNDALLIEKATHARNHLRLWSLQGHRDIPN >NZ_CP016856.1|WP_000746679.1|1017414_1018041_+|NDxxF-motif-lipoprotein MKKRLLLSTFLASALILTGCASDQSDNEDHHTSTGIHAPKSAKKLETKDIFNSDKKNSDISDAEMKQAIEKYLSVNSDILDNKYIMQHKLDKQIDSQTKVTEKQAETLSHLSNLAVKNDLHFKKFVTENNIPKEYKKPVELMMNYFKALNSTIANVDEDIEKLSYQPQNKINVVDVPTKYAGDVNKKQQDKIKDFLKSKGIKSDVIDK >NZ_CP016856.1|WP_000868264.1|1018296_1018680_+|hypothetical-protein MKVRITFIILSILSTIVCLFLAAMHPTGPSTVTFEQPYLFTLNIIIMVLVALPSLVLAIYDYMSFRISSAILQFLGAISWFFLSLILSLTQFTPFTLASFITSIILFTSTIITLAIGGKSVDKNDSH >NZ_CP016856.1|WP_000158377.1|1018745_1019327_-|histidine-phosphatase-family-protein MTIYLVRHGESKSNYDNKHFRSYFCGQLDVPLTDTGTKSADDLCDYFKEKQIKHVYVSDLLRTQQTFEHIFPYDIASTTTPLLRERSLGVFEGEYKDEISANPKYEKYFNDPNFKDFRHSFSQKAPEGESYEDVYQRVEHFMNHVVNEDTQQDDIVIVAHQVVIRCLMVYFNNVSREEAVDLKVENCKPYIIE >NZ_CP016856.1|WP_000211678.1|1019504_1019714_+|hypothetical-protein MTTQSFIFMNIILLDGATQRHPFFICQILAFLFPTSPHVNLLLFNPILPTFLNIIIHIDHFHANKKDDN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP016856_5 | 1616714-1616847 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016856_5
|
2 spacers
spacers of NZ_CP016856_5
>5.1|1616731|46|NZ_CP016856|PILER-CR ATAAAGATAAACCAAATTATCAATTTGGTGGACACAACAGTGTTGA >5.2|1616794|37|NZ_CP016856|PILER-CR TTCCAAAAGTAAGCGGTCAAAATGAAGGTCAACAAAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016856_5
The CRISPR arrays of NZ_CP016856_5 >merge|NZ_CP016856|5|1616714-1616847|PILER-CR TATTGAAGAAGATACAAATAAAGATAAACCAAATTATCAATTTGGTGGACACAACAGTGTTGATTTTGAAGAAGATACACTTCCAAAAGTAAGCGGTCAAAATGAAGGTCAACAAACGATTGAAGAAGATACAA >NZ_CP016856|5|1|1616714-1616847|PILER-CR TATTGAAGAAGATACAA ATAAAGATAAACCAAATTATCAATTTGGTGGACACAACAGTGTTGA TTTTGAAGAAGATACAC TTCCAAAAGTAAGCGGTCAAAATGAAGGTCAACAAAC GATTGAAGAAGATACAA
>NZ_CP016856.1|WP_001790696.1|1614148_1614250_+|hypothetical-protein MLLKTEQYRLAFIKFKKLMNFAFKGRYYSEKQS >NZ_CP016856.1|WP_000481425.1|1612407_1613766_+|gluconate-permease MFNEIWPLISVVLGIVILLVLIIGFKLNTFISLIITSMITALMLGIPLTKIMETIEKGMGSTLGHIALIFGLGAILGKLLADGGGATRIADTLIQKFGQKHVQWAMLVAAFIVGIALFFEVGLVLLIPLVFTVAKRANVSVLKLGLPMVTALSVTHGFLPPHPGPVVIAKELKANVGDVLLYGMIIAIPVTLIAGPIFNKVAQKMIPSAYTREGDISALGAQKEFTDQEMPGFGMSLLTATLPVILMLVSTITQLVTGHDKPTNLFESIIYMIGTAGTAMLIAVLFAIVTMGLMRKRKMNHIMESVTNAIYPIGMMLLIIGGGGTFKQVLIDGGVGNTIAKMFEGTEMSPILLAWIVAAVLRIALGSATVAAISTTGIVLPLLQSSDVNVALVVLAIGAGSVILSHVNDAGFWMFKEYFGLTVKETFLTWSLLETIISVSGIIFILFISLFV >NZ_CP016856.1|WP_000876662.1|1610737_1612291_+|gluconokinase MKYMIGVDIGTTSTKSVLYDENGTFIMKHQIGYDLHTPNVDVSEENPDELFDAVLMTIKYVMRESKVNKDDIKFVSFSAQMHSLIAMDQKHQRLTNNITWADNRAAKYATVINEVHDGNAIYQRTGTPIHPMSPLVKIFWMKHEWQDVFQRTAKFADIKTYIFYHLFDTYIIDYSMASATGMFNLETLDWDVGALELLGISKEMLPELVPTTYVMKGMKERYATLMGLNEDTPFVIGASDGVLSNLGVNSVGKGEVAVTIGTSGAIRTVIDKPRTDYKGRIFCYVLTEDHYVIGGPVNNGGVVLRWLRDELLASEVETAKRLGVDPYDVLTQIAKRVKPGADGLIFHPYLAGERAPLWNANARGSFFGLTLSHKKEHMIRAALEGVLYNLYTVYLALIEVMNETPKMIKATGGFAKSEVWRQMMSDIFDTELVVPESYESSCLGACVLGLKAVGDIEDFSIVSSMVGATNNHTPFEENVAVYQELVSIFINLSRSLTENYEQIADFQRQHMAENKTQ >NZ_CP016856.1|WP_000990133.1|1610033_1610714_+|GntR-family-transcriptional-regulator MMYGYPEKWLEGMTTGEGIAAELRLGIVNGHIAEGTLLTENQMAKQFNVSRSPIRDAFKLLQQNQLIQLERMGAHVLPFGEQEKKEMYDLRLMLESFAFSRVKNQERLPIVKEMKKQLEMMKVAVKFEDAESFTKHDFEFHETLIKASNHQYLNSFWSHLKPVMMALVLTSMRQRMQQNPQDFERIHHNHQVFIDAVEQYDSQILKEAFHLNFDDVGKDIEGFWLN >NZ_CP016856.1|WP_000074005.1|1609115_1609880_+|MerR-family-transcriptional-regulator MSNYSTGELAKLCNVTTRTIQYYDRKGILKPQGFTEGKRRVYTEQQRQTLELILLLKDLGCALSDIDMLLKGEGTLKTLNTLLTMKQQEINQQVKQQQAVLNKIKNVQYYVNEASTSPITHLKDIEHVMSKSAEMKSIRRNIWISAGIIGIIQYSSIISAILMKNKWPFLIALPFMICYGIGVTFYYQQKVAYLCPNCQHIFSPSLWAVIKAKHTATTRRFECPNCHETHYCIEVPKAHMSTEQLEISRIQHNN >NZ_CP016856.1|WP_000289134.1|1608258_1608951_+|GTP-pyrophosphokinase-family-protein MYVDRKPSLYLEDLRHDFKNSLSKFENGDEAFDTLLGFVELDHIYSSALKEISTKLSILDDNFNHIYKHNPIHHMERRVKEMRSLIEKLNRKGLQISAETAKEHILDIAGIRVVCNYLDDIYLIEEMLLKQEDVQLIKRKDYIQHPKENGYRSLHIVVSIPVFLAERVEVLPVEIQIRTIGMDMWASLEHKIRYKNKAETEKYRDLLKECATEITEVENKLQQIHSEITE >NZ_CP016856.1|WP_001117047.1|1607611_1608028_+|DUF2188-domain-containing-protein MPFTMKGYPEKWKDFEVIKRQKAIEIANAMLKEGYLEKDVVPIAAKKAKDWYRALSKEEIKALEEENFVQFHTATMEKTEVDSEYATTDNEEHIQEQSNQDKSYFDSESIGNQSGGVRQREPLMDGPHPKVVESFKDV >NZ_CP016856.1|WP_000586384.1|1605649_1607473_+|FUSC-family-protein MIIPAIIGYLCGNFQFGLLVATGTLAHIYVFKGPSRSKLRTVIICNLAFAICMMLGTLTAKTPLVFGMTLLIVTVIPFYIFTALKIAGPSSTFFIVTFSLPINLPIAPEEALYRGFAILVGGILATMMVLITIVFSKNKAEEQAIQNDFKLISKLLHTYNDKSAFLQVAKTAVDNFKASDKLLITSTSSNDKLSRRFQKLLLLHTSAQGIYSELLELNAKQIRPLPDELIEMMDHIIAQLDNSEENVRYWRKEVTVTEEFQNLFNHILKIDEMVHANEARIAYEADMRKPLYSKRIYQNLTLDSIVFRNTLRYTAIMMIAIFIALMFDFEKAYWIPLSAHTILLGTSTIHAIERGMARGLGTILGVLVLSVILLFSIPTPVAVILMGIAALFTEALVGANYAIAVVFITIQVILMNGLASQNLTINIAFPRVIDVAMGIVIAIIGLFVLGQRTASALLPNVMAEVVRKEATLFHYLFSENQYKDDVYQKNTAMNLSVKLNNMTQVYNAANGELFSDKTLIQNYYPSLFALEEISFMLNRAMANEDRLTINEQLMGEYLATFENIAKHLELNTELEIKILPDLPQYNYIQSAMMNIQHNGFRERDKNV >NZ_CP016856.1|WP_000660709.1|1603462_1604740_+|MFS-transporter MKEKRTNVRWMFALAFFFIGVIAYMDRANISYIAKQMMDDLGMTKPQFGLLASFFSLGYALMQVPSGMLAEKFGPRKMITIALVWWSAFTILTGMIKNHGLIYLVRFLFGVGEAPMYPSNAVFNSFWFSKNEKGRASSALLAGSYFGPVLAPIVTIAIVNAFNWQAVFYIFGAVGILMAVLWAIIAKDLPEQHRMVNEAEKRFIMENRDIVATEKSSPPWNDFFKRFSFYAIAIQYFVVQFIITLFLIWLPTYLTEVFHVNFKEMSISSLPWLLMFFLILSAGAISDRVLGLGRSKFVARGVIAIAGFIVFAVSIIFAVRTGNLYVSIFWLSLGLGGIGISMGMSWAAATDLGRNFSGTVSGWMNLWGNIGALISPLLAGLFVEHLGWTMTFQLLIVPAVIAVIMWFYVKPDQPLIVSDDKAIEK >NZ_CP016856.1|WP_000435044.1|1602304_1602916_-|DedA-family-protein MEQIITEFISRFGYAAIFILILLENVLPIVPSEIILTFAGLMSVKSHLSILTLFIIATIASFIGLLILYYICRLISEERLYRFIDRHGKWIKLKSKDLKRANDWFKKYGVWAVFICRFIPVLRVLITIPAGVNRMNVVTFTVISLIGTTIWNFGLILLGRTLSDSFGMLMTGLHTYSRIMYVVIIIAVIYFAIRYIGKRKRVK >NZ_CP016856.1|WP_000841432.1|1617997_1620787_+|fibronectin-binding-protein-FnbB MKSNLRYGIRKHKLGAASVFLGTMIVVGMGQEKEAAASEQNNTTVEESGSSATESKASETQTTTNNVNTIDETQSYSATSTEQPSQSTQVTTEEAPTTVQAPKVETSRVDLASEKVADKKTTGTQVDTAQPSNVSEIKPRMKRSTDVAEVAEKEVVEEAKATGTDVTSKVTVENGSEIVGHKQDTNVVNPHNAERVTLKYKWKFGEGIKAGDYFDFTLSDNVETHGISTLRKVPEIKSSTEDKVMANGQVIGERKIRYTFTDYIDNKKDLTAELTLNLFIDPTTVTKQGMEKVEVSLGQNKVSKEFDIKYLDGVKDRMGVTVNGRIDTLNKADGKFSHFAYVKPNNQSLSSVTVTGQVTSGYKQNVKNPTVKVYKHIGSDELAESIYAKLDDVSKFEDVTGELTLQYTSNGGYSLNFNNLDQSKNYVIKYEGDYDSNASTLEFQTHLFGYYNYYYYNTSNLTWKNGVAFYSNNAQGDGKDKPNDPIIEKSEPIDLDIKSEPPVEKHELTGTIEESNDSKPIDFEYHTAVEGAEGHAEGIIETEEDSIHVDFEESTHENSKHHADVVEYEEDTNPGGGQVTTESNLVEFDEDSTKGIVTGAVSDHTTVEDTKEYTTESNLIELVDELPEEHGQAQGPIEEITENYQHISHSGLGTENGHGNYGVIEEIEENSHVDIKSELGYEGGQNSGNQSFEEDTEEDKPKYEQGGNIVDIDFDSVPQIQGQNNGDQSFEEDTEEDKPKYEQGGNIIDIDFDSVPHIHGFNKHTEIIEEDTNKDKPNYQFGGHSSVDFEEDTLPQVSGHNEGQQTIEEDTTPPIVPPTPPTPEVPSEPEVPTPPTSEIPSEPGKPVPPAKEEPKKPSKPVEQGKVVTPVIEINEKVKAVAPTKKAQSKKSELPETGGEESTNKGMLFGGLFSILGLALLRRNKKNHKA >NZ_CP016856.1|WP_000721337.1|1620966_1621833_+|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase-GalU MKKIKKAIIPAAGLGTRFLPATKAMPKEMLPILDKPTIQYIVEEAARAGIEDIIIVTGRHKRAIEDHFDSQKELEMVLKEKGKSELLEKVQYSTELANIFYVRQKEQKGLGHAISSARQFIGNEPFAVLLGDDIVESEVPAVKQLIDVYEETGHSVIGVQEVPEADTHRYGIIDPLTKNGRQYEVKKFVEKPAQGTAPSNLAIMGRYVLTPEIFDYLKTQKEGAGNEIQLTDAIERMNNDNQVYAYDFEGERYDVGEKLGFVKTTIEYALKDDSMREELTRFIKELGL >NZ_CP016856.1|WP_000386367.1|1622043_1622787_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarU MDYQTFEKVNKFINVEAYIFFLTQELKQQYKLSLKELLILAYFYYKNEHSISLKEIIGDILYKQSDVVKNIKSLSKKGFINKSRNEADERRIFVSVTPIQRKKIACVINELDKIIKGFNKERDYIKYQWAPKYSKEFFILFMNIMYSKDFLKYRFNLTFLDLSILYVISSRKNEILNLKDLFESIRFMYPQIVRSVNRLNNKGMLIKERSLADERIVLIKINKIQYNTIKSIFTDTSKILKPRKFFF >NZ_CP016856.1|WP_000998872.1|1623112_1623469_+|HTH-type-transcriptional-regulator-SarT MNDLKSKSNIKLMKRVLTTYELRKYLKKYFCLTLDNYLVLAYLDVFKNDEGKYFMRDIISYIGIDQSRIVKSVKELSKKGYLNKCRDPHDSRNVIIVVSVKQHNYIKNLLSEININET >NZ_CP016856.1|WP_103672649.1|1623773_1627505_+|E-domain-containing-protein MRDKKGPVNKRVDFLSNKLNKYSIRKFTVGTASILIGSLMYLGTQQEAEAAENNIENPTTLKDNVQSKEVKIEEVTNKDTAPQGVEAKSEVTSNKDTIEHEPSVKAEDISKKEDTPKEVADVAEVQPKSSVTHNAETPKVRKARSVDEGSFDITRDSKNVVESTPITIQGKEHFEGYGSVDIQSNPEDLKVSEVTRFNNKSIGKNELTGALQLKNKVSFKNDFEFNIRVANNHQSVTTGADGWGFLFSKGDGNEYLQKGGILGPKGMENSAGFKIDTGYNFKDPMDKEEKQAGQGFKGYGTFVKTGADGTTAKVGTNIPTRGKADNSFQYADNSIDTTDGKFHGQLLNNLKLAYNEKSGIMRAEYAGKVWEANISDLGLDKSEAYNFLITSSQRQGTSQGVYANGWMRTDLNNSTFKLTPNLVKKTEIKTVEIPFETKREFNPKLQPGEERVKQEGQPGSKTITTPITVNPLTGEKVGEGQPTEEITKQPVDKIVEFGGEKIPQGHKDIFDPNLPTDQTEKVPGKPGIKNPDTGKVIEEPVDDVIKHGPKTGTPETKTVEIPFETKREFNPKLQPGEERVKQEGQPGSKTITTPITVNPLTGEKVGEGQPTEEITKQPVDKIVEFGGEKIPQGHKDIFDPNLPTDQTEKVPGKPGIKNPDTGKVIEEPVDDVIKHGPKTGTPETKTVEIPFETKREFNPKLQPGEERVKQEGQPGSKTITTPITVNPLTGEKVGEGQPTEEITKQPVDKIVEFGGEKIPQGHKDIFDPNLPTDQTEKVPGKPGIKNPDTGKVIEEPVDDVIKHGPKTGTPETKTVEIPFETKREFNPKLQPGEERVKQEGQPGSKTITTPITVNPLTGEKVGEGQPTEEITKQPVDKIVEFGGEKIPQGHKDIFDPNLPTDQTEKVPGKPGIKNPDTGKVIEEPVDDVIKHGPKTGTPETKTVEIPFETKREFNPKLQPGEERVKQEGQPGSKTITTPITVNPLTGEKVGEGQPTEEITKQPVDKIVEFGGEKIPQGHKDIFDPNLPTDQTEKVPGKPGIKNPDTGKVIEEPVDDVIKHGPKTGTPETKTVEIPFETKREFNPKLQPGEERVKQEGQPGSKTITTPITVNPLTGEKVGEGQPTEEITKQPVDKIVEFGGEKPKDPKGPENPEKPSRPTHPSGPVNPDNPGLSKDRAKPNEPVHSMDKNDKVKKSKIAKKSVANQEKKRAELPKTGAESTQKGLIFSSIIGIAGLMLLARRRKN >NZ_CP016856.1|WP_000966101.1|1627888_1629082_+|MFS-transporter MLYLEVLKNRNFTYLLIGNFLRRSCFVLFSLQIIWFTVELTNQSSLKLSMMVMSQTLPFIIFGIFGGAYSDKHNKKKILYLSDLILSLIIIIIPLLAITSNLNYLTLLTISTAITIINCYTDPAFRAILPEIIDEEHLATSNALIDSLQRGSNIILPALIGVIVILVGNVGVFFICSILLFLGFIFNALLKYTNNNMIDRHSKEDFSETWEFLKQSKEIPFIIIIQFACILINTGLWRVVLPLFISNILKEGVGVYGLATSCLGIASLLMSLIMGLLSEKRLIFKFSIGVLVWGIGLSIINVFPSVAILYIGATLLGLGQSIEGLTRSVAIQIKTPNHLMGKVFSISSTSNYAADTLSLGLISLIIPLLSLSNIFISGGAIISMLSLAGLKFVKKSM >NZ_CP016856.1|WP_010956661.1|1629062_1629296_+|hypothetical-protein MLRSLCKHNRILINAIKVGIEMKYKISLAYNLAIIIGSLIILCILISRGYDIYVILIPILTILASLINLFCDIKKHK >NZ_CP016856.1|WP_000217723.1|1629402_1629711_-|hypothetical-protein MTVNIVVSIVFCISMVILGIYVAITKDFTLISYINQTTIADKHKNQIAYIFALCISLSAVFLMSAILCFEYDFIALAFLFLTIALLLIALFYVCFYKITKYP >NZ_CP016856.1|WP_000678764.1|1629854_1630121_-|hypothetical-protein MKGSKQILLIMGIISLIVLFIFTLFIMAQYAKHYEQKSDSSNAHTLNSSSAIIEQHTMSNLASLDLYAPVRNITSSRDIHPIYFMTKD >NZ_CP016856.1|WP_001792493.1|1630404_1632213_-|phospho-sugar-mutase MHFHTHLLYNTCEKYCLGAVFFYFWDVFLYNSLHKCKGFSFHVLLSLTEILKGCLATMDKELWIERANDSLVKHFYEQQSDIEQREGFESKLTFGTAGIRGKFGLGEGRLNKFTIEKLALGLSRYLNAQTNNPTIVIHYDIRHLSTEFAQIIANVLANHQITVYLPDTYKTTPELSFAVRNLNTTAGIMITASHNPKDYNGIKVYGSDGAQLSTDASELASRYIEEVGDPLQIDIPSSKQNTSYIKPFPKSVTDDYMKHIQNMIGYIPKSDLQVVFTSLHGTSVPIVPELLKSLNFNQFNLVEAQCKPDPNFSSVQSANPEDHRAFDQAVELANKSHADLLISTDPDADRLGIAERDAHGHITYFNGNQIGALLLNYRIQQTSQLRHRLMIQSIVSSELTKSLARYNNVEYKEVLTGFKFIAQEIRQLDDHQNMIFAFEESYGFLSEPFVRDKDAVQIVPLIIKYASELKLYGKTLKDELEQIYQTVGRHEDTLFSHTLEGLEGKKKIESIMTHFRSNPPQEIQGLKVKAIEDYLTSEVYHLDKDTTSQINSPKSNVIRVLFDEGFIALRPSGTEPKIKLYVSLKCPNFDDVAQKINAMIFS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP016856_6 | 1707303-1707400 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016856_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016856_6
>6.1|1707332|40|NZ_CP016856|CRISPRCasFinder ATAAAGGAACGCATTAGATAGCTTCGCTACTAATGCATAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016856_6
The CRISPR arrays of NZ_CP016856_6 >merge|NZ_CP016856|6|1707303-1707400|CRISPRCasFinder GCCTTTCTAGCTCATAAAATTCGCAGAAAATAAAGGAACGCATTAGATAGCTTCGCTACTAATGCATAAGCCTTTCTAGCTCATAAAATTCGCAGAAA >NZ_CP016856|6|5|1707303-1707400|CRISPRCasFinder GCCTTTCTAGCTCATAAAATTCGCAGAAA ATAAAGGAACGCATTAGATAGCTTCGCTACTAATGCATAA GCCTTTCTAGCTCATAAAATTCGCAGAAA
>NZ_CP016856.1|WP_001789935.1|1706881_1706986_+|hypothetical-protein MLTNRLTSVNYVKKRLIQNIQRILSKEVLYGEMQ >NZ_CP016856.1|WP_000792552.1|1705476_1706787_-|B-domain-containing-protein MKNKYISKLLVGAATITLATMISNGEAKASENTQQTSTKHQTTQNNYVTDQQKAFYQVLHLKGITEEQRNQYIKTLREHPERAQEVFSESLKDSKNPDRRVAQQNAFYNVLKNDNLTEQEKNNYIAQIKENPDKSQQVWVESVQSSKAKERQNIENADKAIKDFQDNKAPHDKSAAYEANSKLPKDLRDKNNRFVEKVSIEKAIVRHDERVKSANDAITKLQKNDSIENRRLAQREVNKAPMDVKEHLQKQLDALVAQKDAEKKVAPKVEAPQIQSPQIEKPKAESPKVEVPQIQSPKVEVPQSKLLGYYQSLKDSFNYGYKYLTDTYKSYKEKYDTAKYYTDKYFKYKGTIDKTVLSVFGNGYKSYIQPLKVEDQKNYVSKSYAQVRNYVTETLNTGKVLYAFYQNPKVVKAAITTAETASSIKNTLSNLLSFWK >NZ_CP016856.1|WP_000594519.1|1704012_1704942_-|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB-subunit-A MIKNKILTATLAVGLIAPLANPFIEISKAENKIEDIGQGAEIIKRTQDITSKRLAITQNIQFDFVKDKKYNKDALVVKMQGFISSRTTYSDLKKYPYIKRMIWPFQYNISLKTKDSNVDLINYLPKNKIDSADVSQKLGYNIGGNFQSAPSIGGSGSFNYSKTISYNQKNYVTEVESQNSKGVKWGVKANSFVTPNGQVSAYDQYLFAQDPTGPAARDYFVPDNQLPPLIQSGFNPSFITTLSHERGKGDKSEFEITYGRNMDATYAYVTRHRLAVDRKHDAFKNRNVTVKYEVNWKTHEVKIKSITPK >NZ_CP016856.1|WP_000916704.1|1702498_1703446_-|bi-component-gamma-hemolysin-HlgCB-subunit-C MLKNKILATTLSVSLLAPLANPLLENAKAANDTEDIGKGSDIEIIKRTEDKTSNKWGVTQNIQFDFVKDKKYNKDALILKMQGFISSRTTYYNYKKTNHVKAMRWPFQYNIGLKTNDKYVSLINYLPKNKIESTNVSQTLGYNIGGNFQSAPSLGGNGSFNYSKSISYTQQNYVSEVEQQNSKSVLWGVKANSFATESGQKSAFDSDLFVGYKPHSKDPRDYFVPDSELPPLVQSGFNPSFIATVSHEKGSSDTSEFEITYGRNMDVTHAIKRSTHYGNSYLDGHRVHNAFVNRNYTVKYEVNWKTHEIKVKGQN >NZ_CP016856.1|WP_000783428.1|1701519_1702497_-|bi-component-gamma-hemolysin-HlgAB/HlgCB-subunit-B MKMNKLVKSSVATSMALLLLSGTANAEGKITPVSVKKVDDKVTLYKTTATADSDKFKISQILTFNFIKDKSYDKDTLVLKATGNINSGFVKPNPNDYDFSKLYWGAKYNVSISSQSNDSVNVVDYAPKNQNEEFQVQNTLGYTFGGDISISNGLSGGLNGNTAFSETINYKQESYRTTLSRNTNYKNVGWGVEAHKIMNNGWGPYGRDSFHPTYGNELFLAGRQSSAYAGQNFIAQHQMPLLSRSNFNPEFLSVLSHRQDGAKKSKITVTYQREMDLYQIRWNGFYWAGANYKNFKTRTFKSTYEIDWENHKVKLLDTKETENNK >NZ_CP016856.1|WP_000200946.1|1701000_1701468_+|QueT-transporter-family-protein MTSKDITQISVIAAILTILAVLKIPSIIPGLDFQLSAPAALLILAFFGIKKYFLGGLLSSLLLLIFGVFNPINVIISIIFRVIAIAVVYLLKINVLSLVLASVLGSLVSRLLLSIILNLPVWVVLLNAIPGVIFTLIVAIPLYLTMRKRMAVLLR >NZ_CP016856.1|WP_000286879.1|1700297_1700990_+|6-carboxyhexanoate--CoA-ligase MYSIKMRSSNQDVHISGAETICEFDKIEQTVQRFYNKGFFHENGQPDFLNIKIQKIMEPIQQIKALQIIEDDKANLQHLTQECGVTEQALNQGMTYIKNETVYTGAIILSAISGKRLDSFGQRGIRATHFSFEDINNKGDLNERVTDALAIASCINAHPYVKGELCVSDDLTYTTGYFASAKIGYHRLFDIKPVNTRYGGRIIFVDNRIDLNHYISFLESTPKQVVYETV >NZ_CP016856.1|WP_000971546.1|1699171_1700287_+|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase-family-protein MMFQEQIDLLQQKGLYRSLKSVGYIDRQYIEVENKRCTNYTSNDYLGLGQIAFDKDDFERFMRKYSYHLSSSRLISGSSTAYEEIETMLAGWLGYSACTILNSGYDANLALFNIFKNTNCVVFSDQENHASIIDGIKLSGLEKVIYKHLDIADLEKRLAEYPNQNIQKIIISDSVFSTNGDVVDIGQLVSLKHKYNATLILDVSHSFGIENYSNYQGIDILTSSLSKACGAYGGVILSSNDVKDMLINHGRPLIYSSSLPIYNLYFIKRNIEKLINADDRRTKLNSLSKYFNQKLKALNVNYNSSNSPIKFIEFDDIEAAENIHQTLLKHHVFTSYLRYPTVTKPMLRISLSYFHTEQDIDRLFEILHQED >NZ_CP016856.1|WP_001046645.1|1698186_1699194_+|biotin-synthase-BioB MNLAKRILQGEQLTKETVLKIYEDTNIDTLDLLNEAYILRKHYFGKKVKLNMILNAKSGICPENCGYCGQSRDIKQKQRYALIPEEQIIDGAKVAHDNHIGTYCIVMSGRGPSDKEVDHISNTVRTIKSQHPQLKICACLGLTNDEQAKKLKSAGVDRYNHNINTSENYHDNVVTTHSYKDRTDTIELMKANNISPCSGVICGMGESNQDIVDMAFALKEMDADSIPINFLHPIKGTKFGSMDDLTPMKCLRIVALFRLINPTKEIRIAGGREVNLRSLQPLALKAANSIFVGDYLITGGQPNQLDYDMINDLGFEIDYDTCENKENKNDVSRAN >NZ_CP016856.1|WP_001110069.1|1696826_1698185_+|adenosylmethionine--8-amino-7-oxononanoate-transaminase MNYTQQLKQKDSEYVWHPFTQMGVYSKEEAIIIEKGKGSYLYDTNGNKYLDGYASLWVNVHGHNNKYLNKVIKKQLNKIAHSTLLGSSNIPSIELAEKLIEITPSNLRKVFYSDTGSASVEIAIKMAYQYWKNIDREKYAKKNKFITLNHGYHGDTIGAVSVGGIKTFHKIFKDLIFENIQVESPSFYRSNYDTENEMMTAILTNIEQILIERNDEIAGFILEPLIQGATGLFVHPKGFLKEVEKLCKKYDVLLICDEVAVGFGRTGKMFACNHEDVQPDIMCLGKAITGGYLPLAATLTSQKIYNAFLSDSHGVNTFFHGHTYTGNQIVCTVALENIRLYEKRKLLSHIESTSSTLEKQLHALKRHRNVGDVRGRGLMFGVELVTDKDSKTPLEIEKVERIVRKCKENGLMIRNLENVITFVPVLSMSNKEVKTMVRIFKKAVHNILDRKC >NZ_CP016856.1|WP_000019127.1|1707539_1708406_+|cation-transporter MSHNENLKLAQRGAYLSLIVYIILSIVKYVTGFVFNSAAVRADALNNMTDIIVSLAVIIGLKISIKPADRNHPYGHLKSENISSLLVSFVIMFVGIQVVIQNAPRLFKEDDVVPNAITIIVSLISGLVMLIVFAVNQRLAKRTKSSSLNSAAKDNLSDSLVSIGTAIGLIFTQIGFPIVDIILATLLGLLIVYTGFGIFKEAIFMLSDGFNETELEAYRNDILEVDEVQEVKSIKGRYHGSSVFIDVTIVVDANLSLVEAHQICDNVEHHLHKKGISSVYVHPEPDHL >NZ_CP016856.1|WP_001125208.1|1708732_1709419_+|2,3-diphosphoglycerate-dependent-phosphoglycerate-mutase MPKLILCRHGQSEWNAKNLFTGWEDVNLSEQGINEATRAGEKVRENNIAIDVAFTSLLTRALDTTHYILTESKQQWIPVYKSWRLNERHYGGLQGLNKDDARKEFGEEQVHIWRRSYDVKPPAETEEQREAYLADRRYNHLDKRMMPYSESLKDTLVRVIPFWTDHISQYLLDGQTVLVSAHGNSIRALIKYLEDVSDEDIINYEIKTGAPLVYELTDDLEVIDKYYL >NZ_CP016856.1|WP_000762708.1|1709572_1709677_-|putative-metal-homeostasis-protein MKLDLQTARRNLNSPNIKTRKRALKIIKQHKRAK >NZ_CP016856.1|WP_000038960.1|1709850_1711290_+|multidrug-efflux-MFS-transporter-MdeA MSKKQKLTMIITMLMGGFFGLLNETLLVTALPSIMKDFEISYTQVQWLTTAFLLTNGIVIPLSALVIQRYTTRQVFLVGISIFFLGTLLGGLSPHFATLLVARIIQALGAGIMMPLMMTTILDVFQPHERGKYMGIFGLVIGLAPAIGPTLSGYLVEYFNWRSLFHVVAPIAAVTFLIGFKTIKNVGTTIKVPIDFISVIFSVLGFGGLLYGTSSISEKGFDNPIVLVSMIGGVVLVALFVLRQYRLSTPLLNFAVFKNKQFTVGIIIMGVTMVSMIGSETILPIFVQNLLHRSALDSGLTLLPGAIVMAFMSMTSGALYEKFGPRKLALVGMAIVVITTAYFVVMDEQTSTIMLATVYAIRMVGIALGLIPVMTHTMNQLKPEMNAHGSSMTNTVQQIAGSIGTAALITILSHASKNFSPTMSDYNGMNKIDMMNQIKVDTMLHGYHAGFLFALLITVVSFFCSFMLQGKKKEVDSRQ >NZ_CP016856.1|WP_000825921.1|1711410_1712190_+|transporter-substrate-binding-domain-containing-protein MKRLLFVMIAFVFILAACGNNSSKDKEANKDSKTINVGTEGTYAPFSFHDKDGKLTGYDIDVIKAVAKEEGLKLKFNETSWDSMFAGLDAGRFDVIANQVGINPDREKKYKFSKPYTFSSAVLVIRENEKDIKDFDDVKGKKLAQTFTSNYGKLAKDKGADITKVDGFNQSMDLLLSKRVDGTFNDSLSYLDYKKQKPNAKIKAIKGNAEQSRSAFAFSKKADDETVQKFNDGLKKIEENGELAKIGKKWFGQDVSKSK >NZ_CP016856.1|WP_000479576.1|1712170_1712890_+|amino-acid-ABC-transporter-permease MFLNLNSEQQHALDAAKQAFGPMLEGLVKYSIPITLVTFVLGLIIALFTALMRISTSKILRSISRVYVSIIRGTPMIVQLFIIFYGIPELGRLLTNDADNQWTLAPVVAAIIGLSLNVGAYASEIIRGGIISIPKGQTEAAYSIGMTYGQTIQRIILPQAIRVSIPALGNTFLSLIKDTSLLGFILVAEMFRKAQEVASTTYEYLTIYVLVALMYWVVCFIISIIQGIYESYIERGYRS >NZ_CP016856.1|WP_000615461.1|1712886_1713618_+|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIQLNNIHKSFNDVEVIKGIDLSVEQGEVVTLIGRSGSGKTTLLRMINALEIPTEGTVYVNGKTYTSKDKKSQIEVRKQSGMVFQSYNLFPHKTALENVMEGLITVKKLKKDEARGKSLELLEKVGLTHVKDQRPHALSGGQQQRVAIARALAMNPKVMLFDEPTSALDPELVNDVLKVIKDLANEGMTMVIVTHEMRFAKEVSNNIVFIHEGMIGEQGAPEEMFNRPKTEELRRFLNVINEE >NZ_CP016856.1|WP_001012228.1|1713714_1714965_-|FemA/FemB-family-glycyltransferase-FmhA MNFVTLTSDEFNAFTTKHFSHYTQSAIHYNHRVDLKGDVHLVGVKDDNGQVIAGCLLTEARTLKFFKYFYTHRGPVMDYTNQSLVAFFFKALTSYLKKHNCLYVLVDPYLIENLRNADGEIVKSYDNRAFVRTMDTLGYKHQGFPVGYDSMSQIRWLSVLDLKDKTEDQLLKEMDYQTRRNIKKTYDIGVKTKTLTIDETQTFFDLFHMAEEKHGFKFRELPYFEEMQKLYDDHAMLKLAYIDLNEYLKTLQLKQQQLTAELSGVEEALKESPNSKKNKTKRTQLEQQLNSNKRKIDNTIEQIEQDGAVLNLASALFIYNEHEVYYLSSGSNPKYNAYMGAYHLQWEMIKFAKAHHIDRYNFYGITGDFSESSEDYGVQQFKKGFNAHVEEYIGDFIKPIKPMFYKIQQYLNHKRR >NZ_CP016856.1|WP_000819843.1|1715219_1715582_+|DUF4467-domain-containing-protein MKRFVATVLLLLVFISGCGNDKYVKEIDEAVKIQNQKQEQLAKKGNGDRVDHFERKDANIYVYDKDKIIILAYKPLSNDDEVHYYAYDFSDKRVSYKQDFDSRRYYQQHDADYHEENMTN >NZ_CP016856.1|WP_000162803.1|1715600_1716200_+|DsbA-family-protein MTKKLLTLFIVSMLILTACGKKESATTSSKNGKPLVVIYGDYKCPFCKELDEKVMPKLRKNYIDNHKVEYQFVNLAFLGKDSIVGSRASHAVLMYAPKSFLDFQKQLFAAQQDENKEWLTKELLDKHIKQLHLDKETENKIIKDYKTKDSKSWKAAEKDKKIAKDNHIKTTPTAFINGEKVEDPYDYESYEKLLKDKIK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP016856_7 | 2213853-2213984 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016856_7
|
2 spacers
spacers of NZ_CP016856_7
>7.1|2213881|28|NZ_CP016856|PILER-CR TTTCAAAAAAGAAATTCTACAGGCAATA >7.2|2213937|31|NZ_CP016856|PILER-CR AGCTGACGAAAAGTCAGCTTACGATAATGTG >7.3|2213926|31|NZ_CP016856|CRISPRCasFinder AGCTGACGAAAAGTCAGCTTACGATAATGTG |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016856_7
The CRISPR arrays of NZ_CP016856_7 >merge|NZ_CP016856|7|2213853-2213984|PILER-CR,CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCAAAAAAGAAATTCTACAGGCAATACAGGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACGATAATGTGCAGGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAGAA >NZ_CP016856|7|2|2213853-2213984|PILER-CR CGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCAAAA AAGAAATTCTACAGGCAATACAGGTTGG CGGGGCCCCAACACAGAAGCTGACGAAA AGTCAGCTTACGATAATGTGCAGGTTGGCGG GGCCCCAACATAGAGAA >NZ_CP016856|7|6|2213901-2213981|CRISPRCasFinder CAGGTTGGCGGGGCCCCAACACAGA AGCTGACGAAAAGTCAGCTTACGATAATGTG CAGGTTGGCGGGGCCCCAACATAGA
>NZ_CP016856.1|WP_000999714.1|2212645_2213632_-|aromatic-acid-exporter-family-protein MNDQWYKHLIGARTIKTGIAIFLTAVFCMALDLTPIYAILTAVVTIEPTAKASLIKGYRRLPATVIGAGFAVLFTYLFGDQSPFTYALSATFTILFCTKLKLQVGTNVAVLTSLAMIPGIHDAYIFNFLSRTLTAIIGLVTSGLINFMVFPPKYYGQVEEKLSKTDALMYKLFYNRCQELILSRLQSDKSEKAYKNIFNLNNQVETLISYQRDELSYHKKKECDWKLLNQLTKRAYTNRLFITHLSNIIYLPKNTRVNFSGDEKMALLKISSSIKDIFYDGSFKREDDSVETLRSTIKALEISGENQIKSHLLYEVLMIYRLLDSRYA >NZ_CP016856.1|WP_025173836.1|2211801_2212215_+|hypothetical-protein MKPTKVILRDASYLHSKTSITFILKDVVIEEDNKIYYFDTSATFEDQEVKFEFALFDSDMDNLKHMDYDNPVTEIYFIEPDLHFTIIDFNQELLCIYIDFDSGLRHSNMATESGISLRINVAKSDFTKFINELASLY >NZ_CP016856.1|WP_001790257.1|2211662_2211773_+|hypothetical-protein MDGNNQIDVCFFVLVNNYYTMSIYPRIINSNGDYAT >NZ_CP016856.1|WP_000544965.1|2210845_2211577_+|type-1-glutamine-amidotransferase MHELTIYHFMSDKLNLYSDIGNIIALRQRAKKRNIKVNVVEINETEGITFDECDIFFIGGGSDREQALATKELSKIKTPLKEAIEDGMPGLTICGGYQFLGKKYITPDGTELEGLGILDFYTESKTNRLTGDIIIESDTFGTIVGFENHGGRTFHDFGTLGHVTFGYGNNDEDKKEGIHYKNLLGTYLHGPILPKNYEITDYLLEKACERKGIPFEPKEIDNEAEIQAKQVLIDRANRQKKSR >NZ_CP016856.1|WP_001250329.1|2209530_2210844_+|lipid-II-isoglutaminyl-synthase-subunit-MurT MRQWTAIHLAKLARKASRAVGKRGTDLPGQIARKVDTDILRKLAEQVDDIVFISGTNGKTTTSNLIGHTLKANNIQIIHNNEGANMAAGITSAFIMQSTPKTKIAVIEIDEGSIPRVLKEVTPSMMVFTNFFRDQMDRFGEIDIMVNNIAETISNKGIKLLLNADDPFVSRLKIASDTIVYYGMKAHAHEFEQSTMNESRYCPNCGRLLQYDYIHYNQIGHYHCQCGFKREQAKYEISSFDVAPFLHLNINDEKYDMKIAGDFNAYNALAAYSVLRELGLNEQTIKNGFETYTSDNGRMQYFKKERKEAMINLAKNPAGMNASLSVGEQLEGEKVYVISLNDNAADGRDTSWIYDADFEKLSKQQIEAIIVTGTRAEELQLRLKLAEVEVPIIVERDIYKATAKTMDYKGFTVAIPNYTSLAPMLEQLNRSFEGGQS >NZ_CP016856.1|WP_000949467.1|2208738_2209239_-|H-type-ferritin-FtnA 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>NZ_CP016856.1|WP_000548781.1|2205880_2206411_+|DUF3267-domain-containing-protein MHKIDLTTNNFQMRRFIILQLVIALFVILFTYKWALGVTAVVDQNIIINLVYGFAGFIILLILHELIHRALFLLFKKDSKPMFNIKKDRILFQTADACFNKWQFSIIMLSPLILLSTGLLILIKVFGYSSLIFMFSMHTAYCFIDILLVALTISSSFKYVQQDEDSIYLYHQKPTQ >NZ_CP016856.1|WP_000636142.1|2214159_2214918_+|type-I-methionyl-aminopeptidase MIVKTEEELQALKEIGYICAKVRNTMQAATKPGITTKELDNIAKELFEEYGAISAPIHDENFPGQTCISVNEEVAHGIPSKRVIREGDLVNIDVSALKNGYYADTGISFVVGESDDPMKQKVCDVATMAFENAIAKVKPGTKLSNIGKAVHNTARQNDLKVIKNLTGHGVGLSLHEAPAHVLNYFDPKDKTLLTEGMVLAIEPFISSNASFVTEGKNEWAFETSDKSFVAQIEHTVIVTKDGPILTTKIEEE >NZ_CP016856.1|WP_001110179.1|2215134_2215521_+|hypothetical-protein MNYVERYIEQFLRATVRNNIKHYLLMLDEKMKNLDDYMRYLITKKEQLSKLIDSLMLTLENKYIDIAEAFQIQCAREINNQEIENIKSELNKVEAYYAQIETQIQQTSTEKIATEKTSYLINYMNAVA >NZ_CP016856.1|WP_000149064.1|2215535_2216237_+|cell-wall-active-antibiotics-response-protein 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>NZ_CP016856.1|WP_000037079.1|2218007_2219225_-|YihY/virulence-factor-BrkB-family-protein MSKKDHSSSKYLNSVKEAQEESKKKNKSNPKIDVDRTYIEPQQFQSKKPKKDDQVFFLSRLNKPAKYKKDSNFLSYLIYRIGKDDASGLAAQMTYHFVLAMFPMLLFLLTLLPFFNIKQSQITNMLSNAPAETSTLIKSVIGDITQNSSGGLLSIGLILAIWSASNGMTAIMNSFNVAYDVEDSRNGIVLKLLSVVFTVVMGVVFVVALALPTLGSVISHFLFGPLGFDEQVKWIFNLIRIVLPIIIIFIVFIVLYSVAPNVKTKLKSVLPGAVFTSIIWLAGSFGFGWYISNFGNYSKTYGSIAGIIILLLWLYITSFIIIVGAEINAIIHQRSVIKGKTPEEAALEHDDNNKNHYNENTRYEYDEDSNATHQRTYHVDEHPSDTYPEDDKNIKDKIVDKLKKD >NZ_CP016856.1|WP_000428172.1|2219502_2219778_-|hypothetical-protein MENKFVPGILIGAVIGGAISLADKSTRQALVQSVKDAKNGNRTRKPSKVSKIKDEVLYWKDVVEEIRRNNPELERSLKDAKETFVNRKNQR >NZ_CP016856.1|WP_000228666.1|2219784_2220249_-|low-molecular-weight-phosphotyrosine-protein-phosphatase MVDVAFVCLGNICRSPMAEAIMRQRLKDRNIHDIKVHSRGTGSWNLGEPPHEGTQKILNKHNIPFDGMISELFEATDDFDYIVAMDQSNVDNIKSINPNLKGQLFKLLEFSNMEESDVPDPYYTNNFEGVYDMVLSSCDNLIDYIVKDANLKEG >NZ_CP016856.1|WP_000180460.1|2220395_2220596_+|DUF1128-family-protein 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NZ_CP016856_3 | 3.1|596538|32|NZ_CP016856|CRISPRCasFinder | 596538-596569 | 32 | NZ_CP016856.1 | 2364279-2364310 | 1 | 0.969 |
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18. spacer 7.3|2213926|31|NZ_CP016856|CRISPRCasFinder matches to position: 1868269-1868299, mismatch: 1, identity: 0.968
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19. spacer 7.3|2213926|31|NZ_CP016856|CRISPRCasFinder matches to position: 2540276-2540306, mismatch: 1, identity: 0.968
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20. spacer 3.1|596538|32|NZ_CP016856|CRISPRCasFinder matches to position: 590987-591018, mismatch: 2, identity: 0.938
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21. spacer 3.1|596538|32|NZ_CP016856|CRISPRCasFinder matches to position: 761380-761411, mismatch: 2, identity: 0.938
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26. spacer 7.2|2213937|31|NZ_CP016856|PILER-CR matches to position: 591100-591130, mismatch: 2, identity: 0.935
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27. spacer 7.2|2213937|31|NZ_CP016856|PILER-CR matches to position: 1857352-1857382, mismatch: 2, identity: 0.935
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28. spacer 7.3|2213926|31|NZ_CP016856|CRISPRCasFinder matches to position: 591100-591130, mismatch: 2, identity: 0.935
agctgacgaaaagtcagcttacgataatgtg CRISPR spacer agcttacgaaaagtcagcttacaataatgtg Protospacer **** *****************.********
29. spacer 7.3|2213926|31|NZ_CP016856|CRISPRCasFinder matches to position: 1857352-1857382, mismatch: 2, identity: 0.935
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP016856_7 | 7.2|2213937|31|NZ_CP016856|PILER-CR | 2213937-2213967 | 31 | NC_021536 | Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence | 159749-159779 | 8 | 0.742 |
NZ_CP016856_7 | 7.2|2213937|31|NZ_CP016856|PILER-CR | 2213937-2213967 | 31 | LN846932 | Carnobacterium maltaromaticum strain LMA28 LMA_pa plamid, complete genome | 10622-10652 | 8 | 0.742 |
NZ_CP016856_7 | 7.3|2213926|31|NZ_CP016856|CRISPRCasFinder | 2213926-2213956 | 31 | NC_021536 | Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence | 159749-159779 | 8 | 0.742 |
NZ_CP016856_7 | 7.3|2213926|31|NZ_CP016856|CRISPRCasFinder | 2213926-2213956 | 31 | LN846932 | Carnobacterium maltaromaticum strain LMA28 LMA_pa plamid, complete genome | 10622-10652 | 8 | 0.742 |
NZ_CP016856_3 | 3.1|596538|32|NZ_CP016856|CRISPRCasFinder | 596538-596569 | 32 | MN693281 | Marine virus AFVG_25M371, complete genome | 6448-6479 | 9 | 0.719 |
1. spacer 7.2|2213937|31|NZ_CP016856|PILER-CR matches to NC_021536 (Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
agctgacgaaaagtcagcttacgataatgtg CRISPR spacer gcttgacgaaaactcaccttacgataaaatt Protospacer . .********* *** ********** .*
2. spacer 7.2|2213937|31|NZ_CP016856|PILER-CR matches to LN846932 (Carnobacterium maltaromaticum strain LMA28 LMA_pa plamid, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
agctgacgaaaagtcagcttacgataatgtg CRISPR spacer tgaagacgaaaaatcagattacgataaatta Protospacer * ********.**** ********* *.
3. spacer 7.3|2213926|31|NZ_CP016856|CRISPRCasFinder matches to NC_021536 (Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
agctgacgaaaagtcagcttacgataatgtg CRISPR spacer gcttgacgaaaactcaccttacgataaaatt Protospacer . .********* *** ********** .*
4. spacer 7.3|2213926|31|NZ_CP016856|CRISPRCasFinder matches to LN846932 (Carnobacterium maltaromaticum strain LMA28 LMA_pa plamid, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
agctgacgaaaagtcagcttacgataatgtg CRISPR spacer tgaagacgaaaaatcagattacgataaatta Protospacer * ********.**** ********* *.
5. spacer 3.1|596538|32|NZ_CP016856|CRISPRCasFinder matches to MN693281 (Marine virus AFVG_25M371, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
tttcgaaaagaaattctacaaacaatgcaagt CRISPR spacer cacttagaagaaatcctacaaacaatgcaaaa Protospacer . .. *.*******.***************.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
359419 : 367892
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP016856|359419:367892|DBSCAN-SWA CTTATTTTACAATTTTAGCAATAACACTTGGATATAATTCATATTCCAATTTTTTTACTTTCTCTTCTAATTGTTCTTTTGAATCGTCCGGTCTAATATCACATTGTCTCTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATACCACTATCAACATAATGTACTGTCGAACCAGTAATAGTATCGCCACTATGATATGCTTGGCCTATTGCGTCAATCCCCTTATATTTCGGCAATAGAGATGGATGTATATTCAATATTTTACCTTCAAATGATGCTAATAAGTCTGGACCTATTAGACGCATGTAGCCAGCTAAAATAATCCACTCTACCTTATCTTTATTTAATAGTGTTACTAAATGTTGTTCATACGCTGCTTTTGAATCAAATTGTTTTGGTTCATTAATATAAACAGGAATATCGTGCTTTTTTGCTCTATCTATACAAAACGCATTTTGATGATCCGTATATAGCGCCGTAACTTCAATATTTTCAAGTTTTCCTGATTCAACATGCTCAACTATATTTTCAAAGTTACTTCCTGAACCTGATGCAAAAATCGCAATTTTAACCATTGTTATACCCCCAACAATTCAATTGCAGTTGACTCATTTTTCACAATATGACCAATTTGATAGGCTTCCACATTTTGTTCTGCTAAAATCTTCAAAGCGCGTGATGCATCTTTTTCATCAACGATAACCGTATAGCCAATACCCATGTTAAAAATGTTATACATTTCATTTGTGTCTATATTGCCTTGTTGTTGTAACCAATCAAATATTTTTGGCGTTGGAAATGATGTAGTATCAATTCTAGCAGCATATCCGGCTGGCAATGCACGTGGAATATTTTCATAAAAGCCTCCACCAGTAATATGATTCATTGCCTTAATAGAAACTTCTTTTTTTAAAGCAAGTACAGGTTTGACATATAATTTAGTTGGTTCTAAAAAGACATCTATAAATGGACGATTATCGAAGTTTGATGCCAAATCAATGCCTGATTCATTAATTAATTTGCGCACTAAACTATATCCATTTGAATGAATGCCACTTGACGCAAGCCCTATAACAACTTGTCCCTCTTTCACTTCTGAACCATCTACATAGTCATCCTTTTCAACTGCTCCAACTGCAAATCCGGCTACATCATATTCACCTTCGTGATACATTTCACCCATTTCAGCAGTCTCTCCACCGATAAGTGCAGTATTCGTTTCAACGCATGCATCACTAATACCTTTAACAATTTGTTCAATAACTTCAGGAACAACTTTATTTGTAGCGATGTAATCTAAAAAATACAATGGTTCTGCACCTGTCGTTAAAATATCATTAACACACATTGCGACTGCATCGATACCTATCGAATCATGTTTCCCATAGTCGATAGCTAGTTTTAATTTCGTACCTACTCCGTCTGTTCCAGAAACTAAAACTGGTGCTGTCATATTTAATTGTGATAAATCAAATGTAGCACCGAATCCACCTAAACCACCGATAACTTCTTTACGCATCGTACGTTTAACATGACTAGACATTCTTTCTACAGCTTCATAACCAGCATGAATATTTACACCAGATTGTTCATATGCTTTAGACATTTAAATTTCCCTCGCTATCAAAAAAGTGTTTGTTTTTAGAAATATATTGCTTTTGTCGATGACTTAAACGCGCTTTATAATTTGCTTCATAATCATATAACCCTGCAGGATAATCTCCAGTGAAACTTTCTACACATAAGCCACTATATGGCGCGTCATAATCTAAACCAATTGATTCAATTAACCCATCTACAGATAGATATGCTAATGAATCAGCGCCAATATAATCTTTAATTTCTTCAGGTGATTTGCTTGCAGAAATTAATTCTGCCGTAGTTGAAACATCGATTCCATAAAAACTTGGGAACATAAATTCCGGTGATGCTATACGCACATGTACTTTATTTGCACCAGAATCTTTTAACATTTTCACAATGCGTCGAATTGTCGTACCGCGAACAATGGAATCATCAATAAGAATGATATTTTTCCCATCTACTATATCTTTTACCGCAGATAACTTCACTCTCACACCTTGCTCACGTAATTCTTGAGTTGGTTGAATAAATGTTCTTGCAACATATTGATTTTTAACTAGTCCCATTTCATATGGCAAACCTATTTCTTCAGCATAACCACTCGCAGCTGATAGCGATGAATTGGGTACACCGATGACCATATCAGCATTTACAGGGCTTTCTTGGGCTAATTTTTTACCAGAAGCTTTACGTACTGCATGGACATTTTTACCAGCTATTGTTGAGTCTGGTCTAGCAAAATAAATATATTCCATCGCAGAAATTGCAGTTGTCGTATGATGTGTATAAGATTTAACTGTAATACCTTTATCGTTAATCACGACATATTCACCTGCATGAATATCTTGAACAAATTCTGCACCTAACACATCTATTGCACATGTTTCACTTGCAAGGATGTATGTCCCATCTTTCATTTTACCTACAACAAGTGGTCTGATAGCATTTGGATCTACTGCGCCATATAACGCATCTTTAGTTAAAATCGCAAATGTAAAACCGCCTTTAACTTTTCGCAAACTTTCTTTCAACGCTTCCTCAAAAGTAGGAGCTTTACTTCGACGTATCAAATGCATAATGACTTCAGTATCAGAAGACGAATGGAAGATAGCACCTTGTTTTTCTAAATTCTGACGCAATGATTTAGCATTAATGAGGTTACCATTATGACAAATACCTACACTCATATCATAAAAGTGATACAGAAACGGTTGAATATTTTCAATACCTTTATTACCTGAAGTAGCATAACGGACGTGACCAATTGCATGTTGATATCCTTTTAATCGTTCCATTTGATCATCTTTAATCGCTTCAGTTAGTAAGCCTAATCCTCGCTCGCCTTTTAATTCATTTTGATCAGAAACAACTATACCTGCACCTTCTTGACCACGATGTTGCAAACTATGAAGTCCCATATATGTTAGTTGCGCTGCTTCAGGATGATTCCAAATACCAAACACGCCACATTCTTCGTTTAATCCTGAGTAGTTAAACATTGAGCAATTGCCCCTTCCCATATTTGTTTAATATCTGAAACATTTTCACTAATCTCTGTATATGGTGTTGTTACCTTGAAATTATCACTATCTGTTAAAAGTCCAATTTCTATTGCATTATCAATATTTAAAGTTTTACCTGATTTAACAGAAACAACATATCGGCCTTGCGTCTCACTAAACAATTGTGCATTTGTTATATCTATTGAAGATTTTAATCCTAAACCGTAATGCGCACTTAGTTTAGCTAAGGTAATCAGTAAGCCACCTTTACCAACTGTTTGAACATGTGATAATAGTCCTTCACGAATAGCGGTCTTGATTGATTCACCTTTTTCAACTTCTGAACTCAAATCTAATGACTCAAATTCATGATTAACTTTGCCATAAATTAACTTTTCAAGTTGACTACCACCAAAGTCGTCCTTAGTATCACCGATTAAATATAATTTATCTCCAACTTGAGGTTCAAAATCATTTAAATAATTTACATTTTCAATCAAACCTACCATTCCAACAACTGGTGTTGGGAAAATAGAAGTACCTTTCGTTTCGTTATATAAAGATACATTACCAGAAACTACTGGTGTCTTAAGAATGTCGCATGCTTCTGCCATACCTTTCGTTGAATCTATCAACTGTTGATAGATTTCTTTCTTTTCAGGAGAACCATAATTTAAACAATCTGTCATTGCTAATGGTGTTGCACCCACGGCAATTAAATTTCGATAAGCTTCAGCTACTACCATCTTTCCACCTTCATATGGATTGTTATATACATAACGCGCTTCACCATCAATTGTTGAAGCAATTGCCTTATTTGTGCCTTCCACACGTACTACCGATGCTTGAAGTCCTGGCTTAATTATCGTATTGGCACCAACTTGTTGGTCGTATTGATCATATAAATAGTGTTTAGATGCTATAGTCGGATGCTTAAGTAATTTAAAGAAAGTATCTTTAACATCGATGTGTGTATAATCATTTTTAGAAGTATTATAATCTTTTTCTTCTCCTTCTAAAATATATACAGGTGCTTCATCAGCTAGTGGTTCAACTGGAATGTCAGCATAAACTTCGTCATCATATGTTAAAACAAAACGATTTGTATCTGTAACTTCACCTATAACAGCACTATCCAATTCGTGCTTATCAAATAAATCTAAGAATTTTTGTTCAGTACCTTTTTCAACAACTAGTAACATACGTTCTTGAGTTTCTGAAAGCATCATTTCATAAGGAGAAATACCTGGCTCACGTGTTGGCACTTGTTCTAATCTCAAATGTAACCCACTACCACCTTTTGCCGCCATTTCAGACGATGAAGATGTTAAACCAGCAGCACCCATATCTTGAATACCAACTAATTCATCAAATGTAATTGCTTCAAGTGTTGCTTCCATTAATTTTTTACCTACAAATGGATCACCGATTTGTACAGAAGGTCGTTTACTTTCGCTTTCTTCCGTCAATTCTTCAGATGCAAAAGTAGCACCATGAATACCATCTCGACCAGTTTTCAAACCAACATAAATGACCGAATTACCTACACCTTTTGCTGTGCCTTTTTGAATCATGTCGTGATTGATAACACCAACACACATTGCATTAACAAGTGGATTGCCATCATAACGTTCATCAAATTCGATTTCACCAGCAGTTGTTGGAATACCAATGCAGTTACCATAACCTCCGATACCCTTTATAACACCTTTAAGTAATCTTTGGTTTTGTTTATTATCTAATTCTCCAAATCTAAGACTGTTTAACAAATTAATAGGTCTAGCCCCAATAGAGACAATGTCACGAATGATTCCACCAACGCCTGTAGCAGCCCCTTGATATGGTTCAATTGCTGATGGATGATTGTGAGACTCTACTTTAAATACTACGGCTTGATTATCACCTATATCGACTACCCCTG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP016856|359419:367892|365327_365591_-|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >NZ_CP016856|359419:367892|366298_367423_-|WP_001010412.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPSEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_CP016856|359419:367892|359419_359986_-|WP_000238670.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP016856|359419:367892|362472_364662_-|WP_064127982.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGDHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVIKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP016856|359419:367892|359988_361017_-|WP_000030811.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP016856|359419:367892|364654_365326_-|WP_000666794.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIMNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP016856|359419:367892|367409_367892_-|WP_000861572.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NZ_CP016856|359419:367892|361009_362494_-|WP_031871549.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILIDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKARLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_CP016856|359419:367892|365590_366295_-|WP_000174053.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
383187 : 413782
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP016856|383187:413782|DBSCAN-SWA ATTAGGCGGCCAGTCCATTATTGGGCTTGGTTGTCTTCTTTTTTTCTCCTTTGTACAAGCTGAAAATCATCATTATACGTGCTTTAAAGTTATTGAAATTTCTGTAACCAAAAGAAATTCGCTTGATTAATTTTATCTTATTATTAATTCCTTCTATAGCACCATTATTAAATGCTGGGTAATAAATTGTATTTCTTAACATCCTTTGATGTTTTCTATAATATTTAACCACTTTCCATACACCCTTACTCACAGACTTTTTACTAACTGAATTTAAACGATTAATAAATTTAGGCCAATTACATAACCTTAGGTCTTTTCGTAATCCTTGGACAAGTTCGTAGGAGTGTCGTAGTATATCGTCTTTTGAAAGCATGAATTCTACAATGTCAGATGAGCGTTTATAAGCCTTAAAAGATTTATTCCATCTGTATTTACTAAATATGGTTTTACTAGTATCCATCAATAGAACTTTCCAGTTATTCTTAAAAATTGTATAATTAGGTCCTTTTTTATTACGGTATTCATTCATAACTTGTACACGATACTTATTAAGTTCTCTATTTAAATGTTGAACGATATGGAATCTGTCAAAAATAATAGCTGCATTAGGAAATAGGTCGCGAAATAATCGGACATAGGGTTCATACATGTCAATAGTAACCGTCTTAACTTGTTGTCGATTTTTTAAATCGAATCGCTCGAAATAGGCACGCAAGAATCTTGTAGTTCTATTTTCTAAAATATCTATAACATCATGAGTATCATTATCTATAAAAATGAAACTCATTGATCCAGTTACATTTTTAACGCTTTTAAATTCATCCATAGCGATGTGTTCTGGCAAACAATTAAAGGGTTTAATTCGTAATGAATTAGCCGCTTTAGTTCTAATACGACTTACAGTAGATGGAGAGATACAGTTATCTTCTGCAGTATCAATCTCTGTTTTAACTTTAGTAGCTTCTTCTATAACTTTTTGAGTAACACATCTTGAGATAAAACACGACTCATCAACAATTGACGTTTTAGCAGTAAAAGTGCCATTGCATTCTAAGCATTTAAAACGTTGTTTAGCTAAGTTGAGGTATGTGTTATACCCTTGAGTTTTAAGTAAAGTAATACGAGAAACACGCTTACCATGTTTATGAATTTGTCCTTCATTTTTAACTCCACAACAATAACAGGCCGAAGGCTTATACGTTAGTACAGCATTAACCACTGTTGCTTTTTTTCCTTTGATAATGACGTCAATTTCTTGGTTTATATATTTTATATTTTCATCTTTTATTCTTAGTAATTCTAAGGTATCATTACACATAGGCGCACTTGTCTCCTTTAGTTTGGGTTTGGTCACTTTAAATTATAGAGGCAATTGCGCTTTTTGTGTATTAAAAAAAGCAGGAAGTTTTACCTTCCCACCATAAAAGATGAAGAACCTTTTTATACATACACAAGCAAAAGTAGCGGTGATTGTTTACCATCAATTTTAACAATCACCGCTACTTTTGCTTGTAATTCATGATTCAATTTTTGTTGTGTGCACAACGACACTAAATTATGTGTTTGCTATTGTCGTGTTACAACGATATGCGTCGTTGATTTAACTTATCAAGTAATTGATTTAAATTGTCTAATTCGACTTCCGATAAACATTGACATCTTGCTTCAATCAATTCGCAACGTGCATTATTTATTTGTGAAATTAATGTACGTGCTTGATCAGTCAAAATTAATTCTTTACATCTTAAATCTTCGCTAGATTGTTGACTTGTGATGTACCCTTTCAAAACTAATTTCTTAATCCACCTTGAAACTATAGATTGTTCCCTGCTAATCTTCATCGTCAAATCATACTGTGATAAGCGATCGTAATTAAATAAAATACGGAGAAGTTCTAGCTGTTCAGATGTGATATCCGTGCGTTGTCCAAATCTTCTATTCACTAAGTTTAAGTCATTGTTAGTCAGTGTAATAAGTTTTTCAAGTTGTTTATACATGTTGTTCTACTCCACTACATATTATTTATAATATTATATGATTTTTTTATAATTTTTACAATACTATTCGACACAATAGACAAATTTGTTGCATAACTAATACAAAATATAATAAATTAGTAAGAGTCTTATGGACATAAAGGAGATAAAATATGACTTCATTAAAAGAGAGAGATTATTTTTTTGACAACGCAAGAGCAATTTTAATATTATTAGTCGTATTTGGACATATGTTACAACCCTACACTAGTGGCGATAAATATTTATCAGCATTATACCTAGTTATTTATAGTTTCCATATGCCAACATTTTTGTTTATATCTGGTTATTTCGCGAAAAATATTGATAAACCATACTATTTAGAAAAAATTTCAAAACGTTTGATAGTACCTTATATGATATTTTTTGCATTCTTTTCAATATATTATTTCTTAACAGGTAAAAGTGACGAATTACAACTTGATCCTTTTAACCCAGTATTTGCGTTATGGTTTTTGATCACGCTATTTTTCTTTCATGTCATTTTAGTAATAGTTAGAAGATTTAATCCATATAAAGTGCTATCAGTTTCAATTATTATATCTATTGGAGCAGGTTTTTCAGATAACATCGATAGCTACTTGAGCATTTCAAGGACAATCGTATTTTTCCCAATATTTTACCTAGGTTACATTTTCACCAAAAAACATACGGCTATTTTTAAAAATAAAAAACTAATACCAGTATCTATCATTACCTTTATTTTGTTTTTTATCATTTACGTGATTCATCCTATCAATGCAGATTGGTTATTAGGAAGTTCACCATATACTTCACTTGAAAATGAAGGACAGAGTGTATTCAGTCCTTTTAAACGACTTATATTATATGGAATTATATTAATCGCAATGACTGCGTTTCTAAATTTAATGTCAACAAAGAAAAAATTATATACTTATATTGGTAGTCGTACGCTATACGTATATTTATTACATGGTTTAATTATTGGCATTGTTAGAGGATTTGAATGGTACCCATTCGATAATCCTATATCATTAATGACGTATCTTTATTTAATAAGTATATCTGTAATCATCGTATATGTATTATCTACAAACTTTGTTTGTAAATGGACAAATCCAATAATTAATTTACAAAGACCATCACAGTTTAAAGACTCATAATTTTATAATGTCTAAGTACATTAACTGTAACCACTTCATTCATTTTGAAAAGTAGTTACTACAGTGTATTTAGACATTTTTCGTTTTTCAAATAAAGCTTAAGTAATTTACCCTTTTTTGCTTTAAAAGTATGTTATGATATTATTAATTTCTAAATTTTTAGACAATATTTGATTTATATTTGAGGTGTCACAAATGAAACTTTCTTTAAATTCTAATTCTAAATATTTAAGAGCACCAAGTATTCGCCAATTTTCAAATCGTATGAATAATTTGGATGATTGTGTTAATTTAACTATTGGCCAACCAGACTTCCCGATGCCTGATGTTGTGAAAAAGGCATATATTGATGCTATTAACAATGACAAGACATCATACTCTCACAATAAAGGGTTATTAGAAACTCGCGAAGCAATTAGTCAATACTTCAAAAATCGTTATCATTTTTCCTATGATCCTGAAGAAATTATTGTGACAAATGGAGCAAGTGAAGCAATAGACACAACGTTACGTTCTATCATAGAGCCTGGAGATGAAATTATAATACCGGGACCAATTTATGCAGGCTACATACCACTCATCGAAGTACTAGGTGGTAAACCAATTTATATTGATACAACAGCAACACAATTCAAAATTACACCTGATGCGTTAGAAAGTCATATTTCTCCAAAGACCAAAGCTGTCTTGTTAAATTATCCGACTAATCCAACTGGCGTAGTTTTAAAAAGAAATGAAGTTTTAAATATCGTAAATGTATTAAAAAAATATCCGATATTTATTATTAGCGATGAGATTTATGCTGAAAATACATTTAGTGGTAAACATGTATCCTTCGCTGAATTTGAAGACATTCGTAATCAATTAATATTAATTGGTGGTTTAAGTAAATCACACTCAGCAACCGGAATAAGAATTGGTTTTCTATTAGGACCTCAATATTTGATTGATAAATTAACATTTATGCACGCCTATAATTGTATTTGTGCCAATGTTCCAGCTCAAATAGCATGTATAACAGCACTTAACGAAGGATTAGAAGCTCCTAAATATATGAACGAAGCTTATGTAGAACGAAGAAATTATTTAGTATCTGAATTAACTAAATTAGGTTTTGAGATTACCGCTCAACCTGAAGGCGCGTTTTATATTTTCCCAAGTATTAAACATATCACCGATGACGATTTCGAATTTTGTGTCGATTTACTTGAATCAACACATTTAGCAATCGTTCCAGGCTCATCCTTTACAGAATTCGGTAAAGGATTTGTAAGGATTTCCTATGCTTATGAAATGGATGTTTTAAAAGAAGGTATGAAGAGACTTGCTAAATATTTAAATACTAAATAAAAATGATATGTTGAACTGGACGTCGTGAACTAAATTCATAGTACGTTCAGTTTTTTATATTCTATAAGTTTTAAATAATACTCTATAGAGACTGTAAATACTACCGAGTTATATTCCTCTCCTTTAAACACCTCACTCAAAATGATTCTATCAAAAGCTTTTAATATGCTAACTTATAATTGTTCTTCGAAACTTAAGCACTCAAATAATATATCACCATTCATATTAATCTACCTTTGGCCAAACAATTATTATTCAAAAGTTACTATTTATTATTATAAACAAATACTTTCCATTCGCTCTCAATTCCTTTCTTATTTATTCTTTTAGATAAATGCAAACAATTGAGGATCTTATCAATTTAACTCAATTGAATAAAGTATAATACAATTCAATTTTAATCCCCTTAATGTTTTTGTAAACTCTAATCTTTACAAAAACTTTTTAATTTATTTATATATTCTTATTGACTTAAAAATTTTTAGTG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>NZ_CP016856|383187:413782|399966_400104_-|WP_001792676.1|DBSCAN-SWA MADKILQLVNNDVLAAEFGSKARENIIEKYSTESILEKWLNLFNS |
33 | Staphylococcus_phage(25.0%) | protease,transposase,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
624944 : 639298
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP016856|624944:639298|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP016856|624944:639298|626645_627617_-|WP_000876318.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_CP016856|624944:639298|631148_631547_-|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP016856|624944:639298|625702_626659_-|WP_001245577.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NZ_CP016856|624944:639298|633246_633747_+|WP_000930012.1|DBSCAN-SWA MAHGRQKDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP016856|624944:639298|635670_635772_-|WP_031760357.1|DBSCAN-SWA MVITDIDVYRVGRENIVIAVYNEHIKLLFILIS >NZ_CP016856|624944:639298|624944_625706_-|WP_000616840.1|DBSCAN-SWA MIQVENLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDNGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_CP016856|624944:639298|635861_636779_+|WP_000429008.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGKYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP016856|624944:639298|632360_633227_+|WP_001068487.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNIVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP016856|624944:639298|637402_637945_-|WP_000197271.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPYAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_CP016856|624944:639298|634087_635593_+|WP_000193751.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP016856|624944:639298|627655_627811_-|WP_000499195.1|DBSCAN-SWA MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ >NZ_CP016856|624944:639298|629080_631186_-|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP016856|624944:639298|638239_639298_-|WP_000663030.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP016856|624944:639298|627991_628963_-|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK |
14 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
651269 : 659089
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP016856|651269:659089|DBSCAN-SWA ATTATAACATCTCCAAAATCTTGGTTTTTGCGTAAAATTCATTTACTTCATCTTTTGGCTTAGAATCAATTGTAATACCTGCTCCGACTCCATAAATCGCTTGTCCATATTTATACTCAATAGTGCGAATCGGAATATTAAAAATCATTTTATCATCTTCAGTTGGAAGTAATAGTCCAATTGTTCCGCAGTATATACCACGAGGTGAACTTTCTAATTGTTTAATATATTTCATTGTATTCAGTTTCGGTGCACCTGTAATCGAACCACAAGGAAATAACGATGTTAAAATTTGAGTTAGGTCTGTATTAGTTTTTAAAGTTCCACTTACCATCGAAGTCATTTGAAATACAGTTTTATATGCCTCAATAAAAAATAGTTTATACACCTTAATTGAGCCACTCTGTGATATTCTCCCTATATCGTTTCTTAGTAAATCAACAATCATGACATTTTCTGCACGCTCTTTCGAAGAAGTTTGCAATGTTTTATAATACTGTTGATCTTCAGCTTCCGTTTTACCTCTAGGCATTGTCCCTTTCATCGGTTTGCTTATGATAACGTTATCGACATTGTTAAACTGTCCTTTTTGAAAAAATAATTCTGGTGAGATAGACGCTACTTGGATTTCATCTGTTTGTAATAACGCAGTATAATTACCATTACTAAATTGAGTTAATCGTTCATATAAAGTACTAATAGGATAATAAATGTTATCTGTTAAGCGCGCCGTATAGTTCACTTGATACGTTTCGCCTTCAACAATTGCTTGTTGGACACGTTTAATATTAGTCATCATAACCTCAGAAGATTCAACAAATGAAAAATGATGCTTTGATACATAAGAAGTTTGATGTTCATATGTTGAATTTATGCTTTCCGCTTTTTCAAAACTATAAGCTACTGCATAAATATCATCTTTAGCTAATGAATGTGTACACATGACATGATTAAAATACTTTGCCGCTTCGTAACTTAAATATAACGAGACATATCTACCTTGTCGTTGCTGCGCTTGTGCAAAGTGTATCACTTCTCCCACATCAGCCAACTTAGTAGCAACATACTTCTTTATAAATCCCTTTAATTGAATATGGTATTGCTTATATTCATTTTCAGTTAAATAGTAGCGATAATTATATTCTATTCTCACAGTAATCACCTACCTTCGATAAAAATAATTCAACTTGTCGATAACCGTATTCACTCAAAATAGATTCAGGATGATATTGCACACCAAAAACCGGAAATCTAATATGCTCAAATGCCATAATAATCGCTTCATCGTTTTTCGCTGTAATCTTTAAGCAATTTGGAAAAGTCGCTCCGTCAGCAATTAATGAATGATAACGCATTACATTGAAATTTTGAGGCAGTCCTTGAAAAATACCTTCATTGGTATGGCGTAACTGTGTAGTATGTCCGTGTACAGGATGATAGCCGTGAATGATATTTCCACCAAAATAAGACACGATACATTGAAATCCTAAACATACACCTAGTATAGGTACACGCTGATAAAATTGTTCTAACACTTCATTCAAGATAGGATAATCATCCGGATTACCCGGCCCAGGTGAAATAACAATTGCTTTTGGCTTCATATTAATGACGTCTTCTATCAGCAGATTATCAATACCAACAACTTGAACTGTTAGTTTCGTTTGAGTCTTAATATAGTCTATTAAATTATATGTAAATGAATCATTATTATCTATGACTAGAATCATTGTATACTCCGTTCTAAATGTGTTTTATTTTTATAATATGTATTGGATGTAGCTAAAACTTTAAAAGCATTGTCATTATCCTGACCTTGATTTTAACTAATATATGGTATATTCTATTCATCGTACATAAATGAATATCAGAGGTTCCTAGCTGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACATTGAAATTTCAAACATTCGTTGGTAAACCTTTAATATATATTATAGGAGCAACCCATTTCTTTCGTCTATCTTTTATGGAGATAGGCTTTTTTTATTTTATAAATTAAAAACGGGCTTATCAATGCCATTAACCTCTTTATTAATATTATTAATGATAGGAGCAATTACAAAATGGAAAGTGTATTAAATAATGAAAAAGCCATCGTTGTCTTTAGTGGTGGTCAAGACAGTACAACATGTCTCTTTTATGCAAAAAAACATTTCAAAGAAGTTGAACTCGTAACGTTTAATTATGGCCAAAGACATGATACTGAAATTGAAGTCGCAAAACAAATTGCACAAGATCAAGGAATGAAACATCACGTTTTAGATATGTCATTATTATCACAACTTACTCCAAACGCATTAACACAACATGATATGGAAATTACTAATAATGAAGATGGTATACCTAATACATTTGTTCCAGCTAGAAATTTACTTTTCTTGTCGTTTGCAGGCGCTCTAGCTTATCAAATTGGGGCTAAGCATATTATTACAGGCGTATGTGAAACAGACTTTTCAGGCTACCCAGACTGTCGTGATAGTTTTATAAAATCAATGAACGTAACATTAAGCCTAGCTATGGACAAAGATTTTGTCATTCATACTCCTTTAATGTGGTTAAACAAAGCAGAAACGTGGAAATTAAGTGATGAACTCGAAGTTTTAGATTATATTCGTACAAAAACATTAACATGCTATAACGGTATCATTGGGGATGGCTGTGGTGAATGTCCAGCTTGTCATTTACGTCAACGTGGACTAAATCAATATCTTGAAAGTAAAGGAGCGCTTTAAAATGTTACAACAAATCTATCCTAGTACAACGCATCCATATCAATTCGAATTAAATAAAGATTTTAATTTTTCAGCTGCACATCACATTCCTTGTGAAGAAGCAGGTATTTGTCAAAATGTCCATGGTCATACTTACTTTGTTAATTTAACAATTGTCGGTGATAAACTAGATAACACTGGCTTCTTAGTGAACTTTAGCCATTTGAAAAAGATGATACACGGTAAATTTGACCATCAACTGTTAAATAACTTACCTGCTTTTAAAAACAAAATCCCTTCAACTGAAATCGTAGCGGAAACAATTTATCAAATTGTTAAAGAAAATTTGGCATCGCTCGAACACCAACCAAAATGTATTCAAGTATTTGTAAGAGAAACACCAACAAGTTATGTTGTATTTAGACCAAAGGAACAGGTGTAACTAATGGCTAAAATTCCTGTACTCGAAATATTCGGTCCAACCATTCAGGGTGAAGGTCGAGTAATCGGTAGAAAAACGATGTTTGTGAGAACAGCTGGATGTGATTATCGCTGTAGCTGGTGTGATTCTGCATTTACTTGGGATGGTAGTGCTAAAGGCGATATAAAACTCATGACCGCTGAAGAAATTTATGATGAATTAAAACGAATTGGTGGCGATTTATTTAATCACGTTACAATTTCTGGTGGTAACCCAGCATTAATTAAAGGTATCCAAGAGTTAGTTGACTTATTTCAAGATAAAGGTATTTTCAGCGCACTGGAGACACAAGGCAGTAAATTCCAACCTTGGATGACACAAATTGATGATTTAACGATTAGTCCAAAACCACCAAGTTCAACTATGACACCTGATTTAAAAAAGTTAGATGAAGTGATTACACAATGCGTACCTTCCTCATTAAACTTAAAAGTAGTTGTATTCGACGATAAAGATTATGATTTTGCCAAAATGATACACCACCGTTATCCAGATATTCCCTTCTATTTACAAGTTGGTAACCCATATTTATCAGACAGCGTAGATAATCATACCGAAAAGTTGTTAGAACGCTACGAGCAGTTGGTGGATTTAGTTATGCAAAGTAATGATATGAATCACGTTTATGTGTTACCACAACTTCATACATTACTTTGGAGTAACAAAAAAGGTGTATAAAGGATAACTTATTTTACTTTTTACAAGTCATATCTAATGAATAACAATATATTAATTGATATAATAGTTGATTGAAGTATAACGAACAGGAGTCCATCATGATTGTATATATATTAATTAATATTGCTATCGTCGTACTTATAACTGGATTCAATTTATATAGGCATCAAATGCAACATTTATCATTAAGTGCAATGTTGTTATCTATTACGATAAACGCCTTTATAAATACATTCATAATTGATAAATATAACTTTATTACTCTGTGTACTATAACGATGTTTATCATTTGGACGATACTACAGTTTTACATTGATAAAAAATTAAAACCTGTATACATTACAGACCAAAAATTTATTGCTATCATATTAACGATTGTTGTCAGTTTAACGCAACGTGTTACCGACTTTTCAAGTACACAATCAATATATATGTCTATTCCATTTTTAGCCCCTGCCATTTTCATCATTGGTGGTATTATGTTGTTTATTTCAACATTTAATAGCTTAGATGAAACTGCTGAAAATAATAATAAAATAAAGAAACTAATGATTAAAGGACTTATCATTATTAACATTTCATTTATCGTTATGATGGTTTTAACACCATATTGGTACTTGTATTTAATCGTCTATCTTATTTTCTTGTTGTTTTTATTGTGGCAAAAGGTTTATAAATTTTAATACCAAAACTAAAAAACACTTCTGATATTCTTAGTTCAAAATATCAGAAGTGTTTTTTAGTGATAACTAGTTTAGATAAATATTTCCTTACTTAAAAAACCGCCCTCCTCTTATTTTGACTCCTATTTATTTAAATCAGACAATTATTTTCATTTTCAAATTATTCTTTCTTCAATATTAGTTAAGCGATATTTAAACGAAGTTAAGAATTAGTTAATGGCATATTATTTGCCTTCATTTTAAACTTAACTTATCAAATTGAAGAAATGAGGAGTTAGCATGAATACAAAATATTTTTTAGCAGTTGGTGCTGTTGCCTCTGTATTAATTTTAGGCGCTTGTGGTAATTCTAATTCACAAGATCAAGGTAACAAAACTGAACAAAAAACAAAATCAGAAGATAGCAATGTTAAAACTGATAAAACAAAAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP016856|651269:659089|657347_658034_+|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_CP016856|651269:659089|658033_659089_+|WP_000244415.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_CP016856|651269:659089|656899_657373_+|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_CP016856|651269:659089|654018_654438_+|WP_000941340.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDNTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_CP016856|651269:659089|651269_652421_-|WP_001217801.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKERAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGTIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_CP016856|651269:659089|653348_654017_+|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_CP016856|651269:659089|652404_652998_-|WP_000604514.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHIRFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_CP016856|651269:659089|656117_656558_+|WP_001093557.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLILGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NZ_CP016856|651269:659089|654441_655155_+|WP_001062972.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP016856|651269:659089|655253_655838_+|WP_000637687.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF |
10 | Pandoravirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2097286 : 2169876
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP016856|2097286:2169876|DBSCAN-SWA 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93 | Staphylococcus_phage(92.86%) | holin,protease,integrase,terminase,capsid,transposase,head,portal,tail | attL 2109252:2109269|attR 2176540:2176557 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2252601 : 2306235
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP016856|2252601:2306235|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP016856|2252601:2306235|2273993_2275217_+|WP_000551840.1|DBSCAN-SWA MHNQATTLFNKRLHALRKEKNYYNKFIFNGHFMVFLLILLGAFIFGYGEWLKHIPTNINFSLIAAVIVALTSIFPMRPLLKEADKIFLLPFEKHMSQFMRHAILYSYFARILIQLIIVIVMFPLFYNINQHNVAFYICFGVSALIFPYVGLRLRWQWYQSGLKTWQVNLISFITFALTYYLLLAPKWYIAFVMVALPVLIEFLVKKYKPGFLYPWEKMIAIEHRHHMNYYKFVNMFTDVKHLKESAVRRSYLDILLPVPKGSKFNSNAMYLFLFIRSFIRGRDAFNIIFRLVIIAVLLMVWLSYPLVTAIIGCLFVYIILLQMAQFYSQQAYGLWPQVWPVPEEKVIKGYEQFLYRLMFVICTVFAVTFIIKHMTLFYVVLIFYIVGLLTIRSIIKKLKYQETLLRD >NZ_CP016856|2252601:2306235|2253733_2254204_+|WP_000181394.1|tRNA|DBSCAN-SWA MTNHIVLYQPEIPANTGNIARTCAGTNTHLHLIKPLGFRTDDKMLKRAGLDYWEFVNITYHDSIEAFFEATNGEYYLLTKFGKKTYSDFDFSNHDKDFYFIFGKETTGLPDWVKEKYQDTALRIPMSEHIRSLNLSNTAALLIYEALRQQDFPGLN >NZ_CP016856|2252601:2306235|2272197_2272563_-|WP_000648118.1|DBSCAN-SWA MKASRILFGIGVGVAAGFVVALQGRDDKSVKNNTIDRTAPTGSKSELQREFETIKQSFNDILNYGVQIKNESAEFGSSIGGEIKSLLGNFKSDINPNIERLQSHIENLQNRGEDIGNEISK 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54 | Staphylococcus_phage(90.0%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2311468 : 2343435
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP016856|2311468:2343435|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP016856|2311468:2343435|2322866_2324060_+|WP_000933822.1|DBSCAN-SWA MLNNKRLFTSESVTEGHPDKIADQVSDAILDAILKDDPNARVACETTVTTGMALIAGEISTTTYVDIPKVVRETIKEIGYTRAKYGYDYETMAILTAIDEQSPDIAQGVDKALEYRDKDSEEEIEATGAGDQGLMFGYATNETETYMPLAIYLSHQLAKRLSDVRKDGTLNYLRPDGKVQVTVEYDENDNPVRIDTIVVSTQHAEDVTLEQIQEDIKAHVIYPTVPENLINEQTKFYINPTGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGYARHGGGCFSGKDPTKVDRSAAYAARYVAKNIVAAGLADQCEVQLAYAIGVAEPVSIAIDTFGTGKVSEGQLVEAVRKHFDLRPAGIIKMLDLKQPIYKQTAAYGHFGRTDVLFPWEKLDKVEELKDAVK >NZ_CP016856|2311468:2343435|2332738_2333209_-|WP_000671052.1|DBSCAN-SWA MKFNDVYNKHHKIIHHLLKKYNISYNYDEYYQLLLIKMWQLSQIYKPSSKQSLSSFLFTRLNFYLIDLFRQQNQLKDVILCENNSPTLTEQPTYFNEHDLRLQDIFKLLNQRERLWLKLYLEGYKQFEIAEIMSLSLSTIKLIKMSVKRKCQHNFN >NZ_CP016856|2311468:2343435|2342433_2343435_-|WP_001196354.1|DBSCAN-SWA 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34 | Staphylococcus_phage(93.33%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2483611 : 2492651
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP016856|2483611:2492651|DBSCAN-SWA CATGAATGAGCGTATGGTTGATCAATCAATGCATAGTGAAGAAACTGATTTCGAATTGTCGCTTAGACCTACGAGATTACGACAATATATTGGTCAAAATTCAATAAAAAGTAATTTAGAAGTATTTATTAAAGCGGCTAAACTTCGTCATGAACCATTAGATCATGTATTGCTTTTTGGCCCCCCTGGATTAGGTAAGACAACATTATCTAATATCATTGCCAATGAAATGGAAGTTAATATACGTACAGTATCAGGGCCTTCATTAGAAAGACCTGGTGATTTGGCTGCAATTTTATCAGGACTTCAACCTGGAGATGTTTTGTTTATTGATGAAATACACAGACTGAGTAGTGTTGTTGAAGAAGTGTTATACCCTGCAATGGAAGATTTCTTTTTAGATATTATCATTGGTAAAGGCGATGAGGCTAGAAGTATCCGTATCGACTTACCTCCATTCACTTTGGTAGGTGCAACAACGCGAGCTGGCAGCTTAACAGGTCCACTAAGGGATCGATTTGGTGTGCACTTAAGATTAGAATATTATAATGAATCAGATTTAAAAGAAATCATTATTAGAACAGCTGAGGTTTTAGGCACAGGTATTGATGAAGAAAGTGCCATTGAACTTGCTAAACGTTCTAGAGGGACTCCAAGAGTAGCAAATCGACTATTGAAGCGGGTAAGAGACTTCCAGCAAGTGAATGAAGATGAACAAATATACATTGAAACAACGAAGCACGCATTAGGTTTACTTCAAGTTGATCAACACGGACTAGATTACATTGATCATAAAATGATGAACTGTATTATTAAGCAGTATAATGGTGGACCTGTTGGTTTAGATACGATTGCCGTAACAATTGGTGAAGAGCGTATTACAATTGAGGACGTTTATGAGCCATTTCTTATTCAGAAAGGCTTTTTAGAACGTACGCCACGTGGCAGAAAAGCAACACCATTAGCTTATGAACATTTTGCAAAGTCGAATGAGGAGAGAGAATAACGTGAATATTGAAGAATTTGACTATGACTTACCAGAATCATTAATTGCTCAAACGCCTTTAAAAGATCGTGATCATAGTCGTTTATTAGTCATGGATAGAGAAACTGGTGAAATGAAACATTTACATTTCAAAGATATCATTGAGTATTTTAGACCTGGTGATACATTAGTGCTTAACGATACGCGAGTAATGCCAGCTAGACTTTTTGGTTTAAAAGAAGAAACTGGTGCAAAAGTTGAAATGTTAATGCTAACTCAAATTGAAGGTAATGATTGGGAAGTCTTACTGAAACCAGCTAAGCGTATTAAAGTTGGTAATAAATTGAATTTTGGTAATGGCAAAATTATAGCTGAATGCATAAAAGAAATGGATCAAGGTGGACGCATCATGCGTTTACATTATGAAGGTATTTTACAAGAAAGATTAGATGAATTAGGGGAAATGCCACTGCCACCATACATCAAAGAACGTTTAGATGATCCAGATCGTTATCAAACAGTTTACGCTAAAGAAAGTGGTTCAGCGGCAGCACCAACAGCAGGATTACATTTTACTGATGAGTTATTAACTGAAATTAAAAATAAAGGTGTTAATATCGCATTTGTTACATTACATGTTGGGTTAGGTACGTTTAGACCGGTGAGCGTCGATGATGTGAATGACCACGAAATGCATAGTGAATATTATCAAATGACACAAGAAACAGCTGATTTATTAAATGATACTAAGTCCAAAGGACATCGCATTATATCAGTTGGTACAACTTCAACACGTACACTTGAAACAATTCGACGCGATCATGATAAATTTGTTGAAACGAGTGGCTGGACTAATATATTTATTTATCCAGGATTTGATTTTAAAGCAATTGATGGCCAGATTACTAATTTTCATTTACCAAAATCAACATTAGTTATGCTAGTATCAGCGTTTAGTACTCGTGAAAATGTTCTGAATGCTTATAAAACGGCAGTAAATTTAGAATATAGATTCTTTAGTTTTGGCGATGCAATGTTAATTATATAAAAAGAATGTGAGGATTTTGAATATGCCTGCAGTAACATATGAACACATTAAAACTTGTAAACAATCAGGTGCGCGTTTAGGTATCGTGCACACACCACACGGTTCATTTGAAACACCTATGTTTATGCCAGTTGGTACTAAAGCAACCGTTAAAACAATGAGTCCAGAAGAGTTAAGACAAATTGAAGCAAAAATCATTTTGGGCAACACATATCATTTGTGGTTACAACCCGGAAATGATATTATCAAACACGCTGGGGGATTACATAAATTCATGAATTGGGATGGTCCGATTCTTACAGATTCAGGCGGTTTCCAAGTGTTTAGTTTAAGTAATTTACGTAAAATTACAGAAGAAGGCGTGGAATTTAGACATCATACTAATGGGTCTAAATTATTTTTGAGTCCTGAGAAATCAATGCAAATTCAAAATGATTTAGGATCTGATATTATGATGGCATTTGATGAATGTCCACCGATGCCTGCTGAATATGATTATGTAAAAAAATCTATTGAACGTACAACACGTTGGGCGAAAAGATGTCTAGATGCACAACAAAGACCTGAAGATCAAGCATTGTTCGGCATTATACAAGGTGGCGAATATGAAGATTTAAGAGAACAAAGTGCAAAGGATTTAGTAGAATTAGATTTTCCTGGTTATGCAATCGGCGGTTTGTCAGTTGGTGAACCTAAACCGGTTATGTATAAAATGGTTGAACATACAGAGCAGTTTATGCCTAAAGATAAACCAAGATATTTAATGGGTGTAGGATCTCCAGATGCGTTAATCGAATGTAGTATTCGCGGCATGGATATGTTTGATTGTGTCTTACCGACACGTATTGCCAGAAATGGTACTTGTATGACATCGCAAGGTCGTTTAGTTATTAAAAATGCAAAATTTGCAGATGATTTAAGACCGTTAGATGAGAATTGTGACTGTTATACATGTCAAAACTATTCAAGAGCGTATATACGTCATTTAATCAAGGCAGAGGAAACTTTTGGTATTCGTCTTACTACTATTCATAATTTACATTTTCTGCTAAAATTAATGGAAGATATAAGACAAGCCATTCGAGAAGATCGTCTTTTAGATTTCAAAGAAGAATTCTTCGAGCAATATGGATTAAATGTTGAGAACCCAAAAAACTTTTAAGCAAGAGGAGCGTATAAAATGCAATTTTCATTACTAATATATATAGTCGTAATTTTTGCGGTTATGTATTTCTTGATGATCAGACCACAACAAAAACGTGCGAAACAGCATCGTGAGTTGATTAATAACATTCAATCTGGTCAAAGAATTACAACTATTGGTGGTATTAAAGGTACTGTTAAAGCAGTAGATGAAACAACTGTTGTTATTACAGTTAATGGTCATGGTACTGAATTAACTTTCGAAAAACCTGCTATTAAACAAGTTGACCCTTCATAATGAGAAGTGGTATTAAAAAGGATGAAACGAATAGCGTTTCATCCTTTTTAAGTTATAAGTAGTATGTAGAATAGCTTATTTTTATTCCAGAAAAAGAAATTGTGATACATAATAATTGTTAAATTTAAATTAAATATATCTATGACTATTTTTACTCCCTGCTCTAGTATGTTAATATGTATAAGGCTAATAAATTTTGTAAGAAAGATTTAACTTGCGTTATAAAATAGTATTCAAGTATTCTAAATACATACGTAAATAATGAGGTGTTCATGTGAAGAAAAGTAGTAGAATAATTGCGTTCTTGCTTTTAGTCGTATTGTTGTTTGCCGGAATGGCTGCAACTTATAAAAGTGTTATAAAGAATGTCAATTTAGGACTTGATTTGCAAGGTGGATTTGAGGTGCTTTATCAAGTCGATCCTTTAAATAAAGGCGACAAAATAGATAAAAAAGCCTTACAATCAACAGCGCAAACATTAGAAAATCGTGTTAACGTTTTAGGTGTTTCGGAACCTAAAATTCAAGTTGAAGAACCTAATAGAATTAGAGTACAACTTGCTGGTGTAACAGACCAGAATGAAGCACGTAAAATTTTATCTTCTCAAGCTAATTTAACAATTCGCGATGCAGAAGATAAAGTAAAATTAAGCGGTTCTGATATTAAACAGGGATCTGCCAAACAAGAATTTAAACAGGAAACAAACCAGCCTACAGTTACTTTTAAAGTAAAAGACAAAAACAAATTTAAAAAAGTAACGGAAGAAATCTCTAAGAAACGTGATAATGTCATGGTTGTTTGGTTAGATTTCAAAAAAGGTGACAGCTATAAAAAAGAAGCACAAAAGAAAAACCCTAAATTTATTTCTGCAGCAAGTGTTGATCAACCAATCAATTCTGATAGCGTAGAAATCTCGGGTGGATTTAAAGGACAAGAAGGCGTTAAAAAAGCAAAACAAATCGCCGAATTGTTAAATGCAGGTTCTTTACCAGTTGACTTGAAAGAAATTTATTCAAACTCAGTAGGTGCCCAATTTGGTCAAGATGCATTAGATAAAACTGTGTTTGCATCGTTTATTGGTGTAGCATTAATTTATTTATTCATGCTTGGATTCTACCGATTACCTGGTTTAGTAGCGATTATTGCATTGACAACTTATATCTATCTAACGTTAGTAGCATTTAATTTCATTTCCGGGGTTCTAACTTTACCAGGATTAGCGGCGTTGGTATTAGGTGTAGGTATGGCTGTAGATGCCAATATTATCATGTATGAGCGTATTAAGGATGAACTTCGAATAGGTAGAACGATAAAGCAAGCCTTTTCTAAAGCAAACAAAAGTTCATTCCTAACAATTTTTGATTCTAACTTAACAACAGTTATCGCCGCAGCAGTATTATTCTTCTTCGGTGAAAGTTCAGTTAAAGGTTTCGCGACAATGTTATTATTAGGTATTCTAATGATCTTTGTTACAGCCGTGTTCTTATCAAGATTCTTATTATCATTACTTGTTTCATCAAATATAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP016856|2483611:2492651|2489840_2492111_+|WP_000595005.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKQVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NZ_CP016856|2483611:2492651|2483611_2484616_+|WP_001005767.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >NZ_CP016856|2483611:2492651|2486823_2487084_+|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP016856|2483611:2492651|2492132_2492651_+|WP_000364542.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_CP016856|2483611:2492651|2484617_2485643_+|WP_001019178.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP016856|2483611:2492651|2485665_2486805_+|WP_001112049.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAQQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP016856|2483611:2492651|2487358_2489638_+|WP_000749795.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2560430 : 2568760
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP016856|2560430:2568760|DBSCAN-SWA TTTGCGAATAGATCAATCGATCATTAATGAAATAAAAGATAAAACCGACATTTTAGACTTGGTAAGTGAATATGTAAAACTAGAAAAGAGAGGACGCAATTATATAGGTTTGTGTCCTTTTCATGATGAAAAGACACCTTCATTTACAGTTTCTGAAGATAAACAAATCTGTCATTGTTTTGGTTGTAAAAAAGGTGGCAATGTTTTTCAATTTACTCAAGAAATTAAAGACATATCATTTGTTGAAGCGGTTAAAGAATTAGGTGATAGAGTTAATGTTGCTGTAGATATTGAGGCAACACAATCTAACTCAAATGTTCAAATTGCTTCTGATGATTTACAAATGATTGAAATGCATGAGTTAATACAAGAATTTTATTATTACGCTTTAACAAAGACAGTCGAAGGCGAACAAGCATTAACATACTTACAAGAACGTGGTTTTACAGATGCGCTTATTAAAGAGCGAGGCATTGGCTTTGCACCCGATAGCTCACATTTTTGTCATGATTTTCTTCAAAAAAAGGGTTACGATATTGAATTAGCATATGAAGCCGGATTATTATCACGTAACGAAGAAAATTTCAGTTATTACGATAGATTTCGAAATCGTATTATGTTTCCTTTGAAAAATGCGCAAGGAAGAATTGTTGGATATTCAGGTCGAACATATACCGGTCAAGAACCAAAATACCTAAATAGTCCTGAAACACCTATCTTTCAAAAAAGAAAGTTGTTATACAACTTAGATAAAGCGCGTAAATCAATTAGAAAATTAGATGAAATCGTATTACTAGAAGGTTTTATGGATGTTATAAAATCTGATACTGCTGGCTTGAAAAACGTTGTTGCAACAATGGGGACACAGTTGTCAGATGAACATATTACTTTTATACGAAAGTTAACATCAAATATAACATTAATGTTTGATGGGGATTTTGCGGGTAGTGAAGCAACACTTAAAACAGGTCAACATTTGTTACAGCAAGGGCTAAATGTATTTGTTATACAATTGCCATCAGGCATGGATCCGGATGAATACATTGGTAAGTATGGCAACGATGCATTTACTGCTTTTGTAAAAAATGACAAAAAGTCATTTGCACATTATAAAGTGAGTATATTAAAAGATGAAATTGCACATAATGACCTTTCATATGAACGTTATTTGAAAGAACTGAGTCATGACATTTCACTTATGAAGTCATCAATTCTGCAACAAAAGGCTATAAATGATGTTGCGCCATTTTTCAATGTTAGTCCTGAGCAGTTAGCTAACGAAATACAATTCAATCAAGCACCAGCCAATTATTATCCAGAAGATGAGTATGGCGGTTATGATGAGTATGGCGGTTATATTGAACCTGAGCCAATTGGTATGGCACAATTTGACAATTTGAGCCGTCAAGAAAAAGCGGAGCGAGCATTTTTAAAACATTTAATGAGAGATAAAGATACATTTTTAAATTATTATGAAAGTGTTGATAAGGATAACTTCACAAATCAGCATTTTAAATATGTATTCGAAGTCTTACATGATTTTTATGCGGAAAATGATCAATATAATATCAGTGATGCTGTGCAGTATGTTAATTCAAATGAGTTGAGAGAAACACTAATTAGCTTAGAACAATATAATTTGAATGACGAACCATATGAAAATGAAATTGATGATTATGTCAATGTTATTAATGAAAAAGGACAAGAAACAATTGAGTCATTGAATCATAAATTAAGGGAAGCTACAAGGATTGGCGATGTAGAATTACAAAAATACTATTTACAGCAAATTGTTGCTAAGAATAAAGAACGCATGTAGCATGTGGTTTTAAAGAATAATACGAATAATGATTATGTCAAAATGTATAAGGGTAAATGATAGTTACCGCATTTAAACAACAATATTGAAAAATAAATATTGGGATTAGTTCCAATTTGTAAAATAAAATTAAAAATATGGATGAATTAATTAAGAATTTAGTTTAAAATAGCAATATTGAATAAATTTCGAATGTTCATATTTAAAATCGGGAGGCCGTTTCATGTCTGATAACACAGTTAAAATTAAAAAACAAACAATTGATCCGACATTAACATTAGAAGATGTTAAGAAGCAATTAATTGAAAAAGGTAAAAAAGAGGGTCATTTAAGTCATGAAGAAATTGCTGAAAAACTTCAGAATTTTGATATCGACTCTGATCAAATGGATGATTTCTTTGATCAATTAAATGATAATGATATTTCACTAGTTAATGAAAAAGATAGTTCAGATACTGACGAGAAACTGAATCCAAGTGATCTTAGTGCCCCTCCAGGTGTTAAAATAAATGACCCAGTTCGTATGTACCTTAAAGAAATTGGGCGTGTTAACTTATTAAGTGCACAAGAAGAAATCGAATTAGCCAAACGTATTGAACAAGGTGATGAAGTAGCAAAATCAAGACTTGCAGAAGCGAACTTACGTTTAGTTGTAAGTATTGCTAAAAGATACGTAGGTCGTGGTATGTTATTCCTTGATTTAATCCAAGAAGGTAATATGGGTCTTATTAAAGCTGTTGAAAAATTTGACTTTAACAAAGGATTTAAGTTTTCAACATATGCAACATGGTGGATTAGACAAGCAATCACTCGTGCAATTGCTGACCAAGCACGTACGATTCGTATCCCTGTGCATATGGTAGAAACAATTAATAAATTAATTCGTGTTCAACGTCAATTATTACAGGACTTAGGTCGAGATCCAGCACCAGAAGAAATTGGTGAAGAAATGGATTTACCAGCAGAAAAAGTTCGTGAAATTTTAAAAATTGCGCAAGAACCTGTTTCATTAGAAACACCAATTGGTGAAGAAGATGATAGTCATTTAGGAGACTTTATTGAGGATCAGGAAGCACAAAGTCCTTCAGATCATGCTGCTTATGAATTATTAAAAGAGCAATTAGAAGATGTGCTTGATACATTAACTGATAGAGAAGAAAATGTATTACGATTAAGATTTGGTCTTGATGACGGCAGAACAAGAACACTTGAAGAAGTTGGTAAAGTTTTCGGTGTTACACGTGAACGTATTCGACAAATCGAAGCAAAAGCACTTAGAAAATTAAGACATCCAAGTCGTAGTAAACGTTTGAAAGACTTTATGGATTAATTTATATCAATTTTAATGATTGATACCAAGACATGAATAAGCGCTTATTTATTTTTAGATTAAGATTTAACTTGAGTGAGGTTGGTACATTGAATAATGTTCAACCTCTTTTTTCATAAAGGAGAATAAAATGATTTCGTTAAATAACCGATTAACGACGGTAAGTCGATTTTTAAAACAAGGTACAATCGCGGATATTGGCTCAGATCATGCTTATTTGCCAATCTATGCAATTCAAAACCATTTATGCGATTACGGTATTGCAGGAGAAGTTATTCAAGGCCCTTTTCAAGCTGCTGTGAAAAATGTAGCTGCAAACCAATTAGTAGATAGAATTGATGTACGTTTAGGGGATGGCTTAAGTGTTATTCATCCTGAGGACGTAATCGATAATATCACAATATGTGGTATGGGCGGACCACTTATTGCTAAAATTTTAAAAGATGGGCAAGATAAGTTAAGTCAACATCCAAGGTTGATTTTACAAAGTAATATCCAAACTGAAAATTTAAGACAAACATTACAACAATTGAATTATGAAATAATTGATGAAATAATAATGGAAGAAAAAGGCCATATTTATGAAATTGTTGTAGCAGAATATTCTACACAATTAATAGAGCTATCATCTGATGGATTGAAATTCGGACCAAAATTGCTGAACAACAAAAATGAATATTTTATAAAAAAATGGCAAAGAGAGTTAGAAGCACTTTATCATATTAAATCGAAACTCAATACTGAACAACATCATCAACGTTTAGCTCAAATTAATGACGAAATTGCTGTAATTGAAAGGGTGTTATAGTAATGAAAATAGCTGATTTAATGACATTGTTAGATCATCATGTGCCATTTAGTACTGCTGAATCTTGGGATAATGTAGGATTGTTAATAGGTGATGAAGATGTTGAAGTTACTGGTGTTTTAACAGCATTAGACTGTACGTTGGAAGTAGTAAATGAAGCAATCGAAAAAGGTTATAATACTATTATTAGTCATCATCCTCTAATCTTTAAAGGCGTAACATCATTAAAAGCTAATGGTTATGGTTTGATCATTAGAAAACTAATTCAACATGACATTAATTTAATAGCGATGCATACAAATTTAGATGTAAATCCGTATGGTGTCAATATGATGTTGGCGAAGGCGATGGGTTTGAAGAACATTTCAATAATAAATAATCAACAAGATGTATACTATAAAGTTCAAACATATATACCTAAGGATAATGTTGGACCATTTAAAGATAAGCTTAGTGAAAATGGATTAGCGCAAGAAGGTAATTATGAATATTGTTTCTTTGAAAGTGAAGGAAGAGGGCAATTCAAACCAGTTGGTGAAGCTAATCCAACAATAGGACAAATTGATAAAATTGAATATGTAGATGAAGTTAAAATTGAATTTATGATAGATGCATATCAAAAGTCAAGGGCTGAGCAATTAATTAAACAATACCATCCATATGAAACACCGGTATTTGATTTTATTGAGATAAAACAAACATCCCTTTATGGACTTGGCGTTATGGCAGAAGTGGATAATCAAATGACATTGGAAGATTTCGCAGCTGATATTAAATCTAAATTAAATATCCCAAGTGTCCGTTTTGTTGGTGAGTCTAATCAGAAAATTAAACGTATTGCAATTATTGGTGGTTCAGGTATTGGATATGAATATCAAGCTGTCCAACAAGGCGCAGATGTCTTTGTTACAGGTGATATTAAACATCATGATGCCTTAGATGCTAAAATTCATGGTGTGAATTTAATTGATATTAATCATTACAGCGAATATGTGATGAAAGAAGGTTTAAAAACGTTACTAATGAATTGGTTCAATACAGAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP016856|2560430:2568760|2565602_2566949_+|WP_001062177.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >NZ_CP016856|2560430:2568760|2563708_2564386_+|WP_000624571.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDYGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDGLKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL >NZ_CP016856|2560430:2568760|2564388_2565489_+|WP_000683933.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFSTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPYGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDAYQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >NZ_CP016856|2560430:2568760|2566958_2567849_+|WP_000924220.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAYEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NZ_CP016856|2560430:2568760|2562471_2563578_+|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >NZ_CP016856|2560430:2568760|2560430_2562248_+|WP_001217246.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYNLNDEPYENEIDDYVNVINEKGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NZ_CP016856|2560430:2568760|2567974_2568760_+|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN |
7 | Caulobacter_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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