Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NZ_CP017033 | Campylobacter jejuni subsp. jejuni strain MTVDSCj16 chromosome, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,cas2,cas1,cas9,csa3 | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
51064 : 102996
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017033|51064:102996|DBSCAN-SWA 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70 | Campylobacter_phage(46.15%) | plate,tRNA,head,integrase,terminase,transposase,tail | attL 50882:50899|attR 62102:62119 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
517569 : 526468
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017033|517569:526468|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017033|517569:526468|518016_519051_+|WP_052805134.1|DBSCAN-SWA MALPSMGHTSPATENVKLKQSIYETIIKIGATETPILNNIGTSKVTNPLTHSWITDTFEEPKKNANLELSKFVGETKNTAQKTTNATQIFITEAMVSKALLKANQYGGNEMEYQIGKKTKEHKMDMEYALFGLGRDSDVKRSVFKDYIQAQEATSGEMAGLFHYIAKGKDSFADGKRGNVLAFDETGDWSGTATELTEDKLNQILQTIWNSGVTPKDVFLGADLKGAINKFATRILGNETKLAGQVVSLETDFGTVNFHMHRLLSPKYGLGDVLIAGDFEYMKHGLYIPTMIEDVPTDITAKAKRFYTQSTLEVRNADAFAIGVGLTSGNNAKAKAVLKAAKGA >NZ_CP017033|517569:526468|522705_523341_+|WP_002874382.1|DBSCAN-SWA MFYDLKNKSLKYDDIFLKDVKIQNEEGEIDAQDTYFLSACDDKLLKELGFAKVKEEEIPSFNEKIEELRQIQTYDEENNLYIISYKIKEKALEELKELKLEELKAIKEEKLLFMPFKNTIFQIDTEAKINISGKVSEIMLANLNNTPLENIAWIDKDNKITTFNKEEFLEFGVGIAKYTESIIFKNDELRNKVKNATSLEELNLIAWESEK >NZ_CP017033|517569:526468|519632_522242_+|WP_069360512.1|DBSCAN-SWA MGTSLNELKTGREKLEIINQVLARINSISEAIDNTRLDEVVGLKQACESLKNECLKFKNDIVDKNDDILSKYDDINKKYSNISEKYNNVNAKFDYIKEAYEDFSLNKQEIQNIKDFLENNTEEFENLKKDIQKYEEIKFNLDNYINEIKQNKDFVKEYFDLNTKIKDEILSELNHALEIVDSLHLNVDELKEIKPELISIKKEVKDLANEAKLVVSKASEIIKNKINTIFFENQRLNQEMIDSVKKLEEIKFDIGVKYKEIASAYELLLESKQNIEDLREVIALYKEFENDITSYSQIIKDFKSKIENLERDLKSQSESIYSSLNDKQNEILKKLNEVKNEALVKFDELTAKCEGYKIHFEQSYDRFNQRALIANEDLGRLAEVAKKELGNDKLIYETELKVLAEETIKQMEEMLKGLSDERNEVTEVFETQKKEFTTLVDTSKVMIDNLNHIFNANYQAKKNEFSIIFNEKLHSLNENKQDFLNELVSAKENGLNKINETKEQGLNELETKKGECIDEIDNQARIYDISGVKANVEYLLSLLNEKDDGKDDGIKDEIANIEQGIKDKEQELEEIKKQIEEALNNNDELKQKNEELKEIKNQIYEALSQEPPADTSEIEERKEELENQIAELEKEIAGELINKKEEIEKELEEANQNLEDKNNELEQNEKDKKLITQKVLDITIKTLEALIDIKVSLNGDEEINGNKTFANPILVKVDPTNDNHLTNKIYVDTALNTKANLNGDNIFNGANTFNQALTSRADPTNDNHLTRKWYVDYGGGIKNLGTTGSINLDLRQAQHFILTANAGTSIGIANFGGVGKSGTITINNCQNVVAFNAPFKFRIAQSGFSGTETFAYFCIASNNVRLVRT >NZ_CP017033|517569:526468|526270_526468_+|WP_002781772.1|DBSCAN-SWA MQTQQVVTKIEIQKVRIPQELLTLSPLEKPIAKNELDILNAYSMLFYKYKQCEIQISKIKELNNE >NZ_CP017033|517569:526468|524084_525365_+|WP_002874386.1|DBSCAN-SWA MSLEQVINTQNESLNQIISSLQELVLSYKNGNLSLEDVKKLINETIENISNDYIKESELKEKLEALLEELGINANINKESLKEVVLKVVLENQESLKGDKGDPFTYEDFTEEQLENLKGQDGAKGADGKSAYELWLENEENTGKSQDEFLESLKAQTPTKEEIKPIIEETLEDMKLNLGINGIKVSNSIPTPKTKANVNDLIITYNENVKQLWLCVASDDKYTSWINLLGNENITAQELIIISFDTNLNSGQYGGCLSDLRFGFENSLASTTQIIKGLNEGSFLITKDGMGLKSKNYTEVSVLSKPSKNQIEGNIKTSGIYNDPAWHNITNALKKYDGNANECCLWASNIKNSVSIELFTNEIPMSLFYRQAGYYGNVNLSNIKMQKALRVQNEIIVERSFIGIKKEIDKTTYGDNAFLFEFEEEK >NZ_CP017033|517569:526468|525413_525872_+|WP_002858146.1|DBSCAN-SWA MKVTINRRYTGKTCVIGKFKVLDDEEKILFECFSLEEDKEGLESGKDLRIPEGNYNLKRHSPSRFENTLRSITKKDDTMINVYNDEVPSSRAILIHWGNTDKDTQGCILLGLTKDNNNESVGQSRQACKEFYDLVYGKNLEDIKLEITNELA >NZ_CP017033|517569:526468|519050_519455_+|WP_002861675.1|DBSCAN-SWA MLCATAKKLIIAKVKNSYKMIEDDEVLKAYFMEAFYYILSKCVPSVLLKNVEQGEKVFRQVRNNHFLIIPDEPDFDNEKEHLMIDETLSFAVINYVCYLITRCEEKDFLALCDKIIYEYIANDGKELDDERTWL >NZ_CP017033|517569:526468|523713_524088_+|WP_004306042.1|DBSCAN-SWA MTKTELKRVCVKPYDKDRFEVIQDYEFILPNYKGIVPQGFKTDGASIPRLFWSLFPPFKSEYFSACVVHDYLCINAKSRDDYRLADLVLKEAMQALEINKFKIFVFYCSCNLFHQIKCLIKGIR >NZ_CP017033|517569:526468|523337_523721_+|WP_002874384.1|DBSCAN-SWA MSTENIIKEGAILGSLSGSALLGLMVFVLAGIAWHLYKTLHKEAGERTKELISETKNTNVLIREQIAVSRVSSDSLVKFIETHCSKTNDKLEAIETDLMRMDERLVKLTQIRNDELRSIFKKKENND >NZ_CP017033|517569:526468|522243_522693_+|WP_002874381.1|DBSCAN-SWA MNCLLLSNNGIALNLPPSLGGSVANYNYMLKLDMIYKQAVVLPSNINNKEVVMLGEVWTTGNMSNKTSGNTLEITWNNFNSKVTLHALSKYYTANAKIKVEKKFNFGNINNLQIMLSSYQSGSANASAGWNLNDGNRLNPRANLTLYWN >NZ_CP017033|517569:526468|525933_526353_+|WP_002857883.1|DBSCAN-SWA MINLLFGNAKLYIALALMAILTGYFYLRLDSTKAKLEKSQSDLALALKINENNQEKLKELNQIHKTELKALNEANNQKNQVQERVQYVKEYIYKSNENNITKLFNDVVDRLWDANSTSSNQNRNSKSKNSARTTNIKSS >NZ_CP017033|517569:526468|517569_517776_-|WP_002801300.1|DBSCAN-SWA MADFFLFPKIKDKELLDFFENLKNNEACFSNTSDIYGKGDICNPNLKSSDEIKVSDEEIEKFIKENNL >NZ_CP017033|517569:526468|519435_519630_+|WP_002874379.1|DBSCAN-SWA MKEHGCNCNFTKKINRALSYKDYVQSINSADFIAYLDDKKWLLAMDDLLFFCEKRIKDSDYYEG |
13 | Campylobacter_phage(90.91%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1511104 : 1520649
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017033|1511104:1520649|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017033|1511104:1520649|1518467_1519526_-|WP_002898760.1|DBSCAN-SWA MLKDSKIYIAGHTGLVGSSILKKLQNDGYENLIFRTRSELDLTNQQAVSEFFAKEKPEYVFFCAAKMGGMMEQLERRADFLYLNLVMQTFVLHEAYKNDCKKLLYLSSLCIYPQHAPLPIKETSMLEGKLQFINEPYAIAKITGNKMCEFYNQQFGTNFITLVPTSIYGPGDNFNLSTAHVFPAIFAKIYLGKLLNEQKHQELFNSLRMDNMQDVLKYLSQFDIDENKVTLLGSGNPRREFIYVDDVADACIFTMDKIDASMLKKYDENFHNTHLNLADGKDYSIKEVAFLIKDIIGYKGDIIFDSSRLDGTMLKTTNTERIRKLGWKAKIKLEDGIKMMHEWYLKEQNIRQ >NZ_CP017033|1511104:1520649|1515150_1515831_-|WP_002898753.1|DBSCAN-SWA MQAIILCGGLGTRLKSVIKDIPKPMAPINDKPFLEFIFEYLKKQGIKEVILAVSYKYEVIKEYFKDEFLGIKIKYSIEKEPLGTGGAIKEALKFIKNEAYVLNGDTFFGIDLSKLKLNGSKICLALKQMNDFDRYGTVNVNEQGFVISFEEKIFKNQGLINGGIYLLTKDIFNEFDLEKKFSFEEFLRENYEKLKAKAHIFDDYFIDIGVPEDYRRFNNDIFTSPE >NZ_CP017033|1511104:1520649|1515818_1516424_-|WP_044258971.1|DBSCAN-SWA MENLNSYIKGHFADSILVKEQILKDENLITLIKNASLEVIKAYKNGNKTLLAGNGGSAADAQHIAGEFVSRFYFDRPGIASIALSTDTSILTAISNDYGYENLFARQVQAQGVKGDVFIGISTSGNSKNILKALELCKQKEIISIGLSGANGGAMNELCDYCIKVPSTCTPRIQEAHILIGHIICAIVEEELFGKGFSCKQ >NZ_CP017033|1511104:1520649|1511104_1512577_-|WP_002898744.1|DBSCAN-SWA MNIIIPATGIGKRFKEAGYKELKPFIKVMKDKVILDYVIECFDTQKDVFYFIIQECEKNKFEDFILSRKINAKIIVYKGQKLGPAGSLYGVVSQLQDILNEEVIISYCDFGQEWNYRDFIQFTQENLDVQAIIPCYTGYHPHLLPLENVYAVCKVYDNTYKVYEVIEKYNSKNKFEEYYSSGIYYFRTLKLAIEAIKKQIEAKDKVFGEYYISMTNNYLENVLCYPFIEKFYQFGTPKDFEYAKKKLNSQDVNNEKIKIQNTIILSAGRGERFLNLNFNQPKPFLPLGKTSIIENIIDTLKDVETKIICVGAQDHKKYWESIKQEVRFVKPNKIGAAYSYKESCGNLSGDVLILPCDLIAKHITKEFIRLQKEYEVIVFVTHASKYNVNNSHYFTWVDGENNKIDNIFVKNRSNDANLVMIGSFYFKANSLLLEYINKIFQEDIKTNGEFYIDNVFELLIKTHKVGYVIVSNYFSYGTPDEYMENKYWRM >NZ_CP017033|1511104:1520649|1514582_1515176_-|WP_002898751.1|DBSCAN-SWA MIFLHRQNNLETSIENYGIEIDLRYNEKLVLNHDLLEKNSLYPFFKEKIQFMKNIPIICNVKESGLEEKIIELLSDDFEYYFLDSQIPDILRLSKNGYQGKFIIRISDVESYNEKLMDISKPKYVWVDYSQFSSFNIKDYQEFIYNIKPKLGQVEPILVSPELYDRSYAELIKPIQSILPKGFSVCTKKPELWSMYV >NZ_CP017033|1511104:1520649|1513291_1514590_-|WP_002898749.1|DBSCAN-SWA MFNFKKIAEKYKLIMVDIDNTLFNYTFAHKNALEVVMKLYSFTLEDYDLAKKMIAKRGLSANHHKKELYFKIICENKNIHFSKASEMFELYVSIFTRNLKVDKTMFEFLCFIKSLNKKVIAITNFYFIEQIHKLNCANLTNMIDYLVCSEEFELEKPNKALVNRALELYGKFIDEEEIVMIGDSIADNFLGGGYRINYYPYNCSKLLISISGKSGSGKTTLSNAINEIYKSFIISTDGYHKYERHSKIWERVTHYNPKANNLIQLAMDIKHIYQDIGNKLHIPIYDHKNGVIVKSDEIEIKDLDIVIIEGLHTLYQEVIGDFVKIKIYIDSDEADRQKIDRDSKERNYSHSKIIDTIQKREEDYKKYLEKQKDNANFLILVRDGIFKIYLKDILLNNYLQKEYTGRYEDLIQTVKDIFDLILKNRWVKENDA >NZ_CP017033|1511104:1520649|1516411_1517431_-|WP_002860370.1|DBSCAN-SWA MKTIRTQTPLRLGLAGGGTDINLYCDKYTGYVLNATISLYIHCTLIEREDGKIIFDSPDTNSYSEYESKEFLGNDGKLDIFKSIYNRIVKDFTKKPLSFSLHTYSDVPSGSGLGGSSTLVVGVIKAFAEWLNLPLGEYEIAKLAYEIEREDLGIVGGAQDQYAATFGGFNFMEFYDNKRVIVNPLRIKNWIASELEARTVLYFTNITREAKDIEEHKKGKLGDEKSLEAMHAIKQDAIKMKEALFKADFDTLAQILGKSWQSKKIISEIVSNDELERIYHLAMQNGAYSGKTSGAGAGGFMFFFVDPTKKYNLIKALSKEQGYVQDFSFTKEGVKSWRI >NZ_CP017033|1511104:1520649|1517427_1518459_-|WP_069360669.1|DBSCAN-SWA MKKTALITGFTGQVGSQMADFLLENTDYGVIGMMRWQEPMDNIYHLSDRINKKDRISIFYADLNDYSSIQKLFESKRPDVIFHLAAQSYPKTSFDIPIETLQTNIIGTANILENIRILKAKEGYDPVVHVCSSSEVYGKAKTGVKLNEETAFHGASPYSISKIGADYLGRFYGEAYNIRTFVTRMGTHSGPRRSDVFFESTVAKQIALIEAGYQEPVIKVGNLSSVRTFQDARDAIRAYYLLSLESQKGNIPCGEAFNIAGEEAFKLPEVIDILLGFSTRKDIKIEQDKERLRPIDADYQMFDNTKIKNYISWKPEIPARQMFEDLLNHWRDEIKKGRIPLNR >NZ_CP017033|1511104:1520649|1512585_1513302_-|WP_032595048.1|DBSCAN-SWA MMHNNEKLNGCIKDYQDLRKIFGNILDAPSKGGNISIKNDEYFIIKASGEDLKKEHKISIFKNNVNSFSYYKDYSVDIVKPSMEIKMHMVFKNKYVVHYHPVYILPYLCTREYKFENYKAIDFVLPGNDLYEALSKSYSYQEKGVVLLRNHGVVIYAEQIQDIIELYNQLKSEFFEQNDFVYTPDDAVDKTNEELWLFRNVVENIAIKKQINLRPLKVSEIDKLLNLPDEQYRKNYRK >NZ_CP017033|1511104:1520649|1519518_1520649_-|WP_002898762.1|DBSCAN-SWA MQTNSKIYIAGHKGTAGTALVENLQKRGFNNLVLKTRKELDLVNQQAVAKFFQEEKPEYVFLTAVLPCGAANVAQRADFIYENLMIQNNIIHHSYLNNVKKLVFFGSGYMYPENVKNPLKEEYLFQGNLEYGAYSFGTAKIAGTIMCESYNLQYGTNFITLVLNNLYGTKANFDFGKSRVLPALLRKFHLAKLLSEGNITQILQDLKMSNFEEAKEYLHNFGISKKSVEIWGAGKVRREFIHSDDLADVAIYTMQNINFKDLVKDGESQNTHINIGTGIDYSIKEVALMVKNIVGFSGGLVFNTSRPDSAMDRLMDCSKIHSLGWKHKIDLEKGIQMMYKWYKNNNGGGELLNFEYFIFANNIRSFANSTQRVCNA |
10 | Bodo_saltans_virus(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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