Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017116 | Erysipelothrix rhusiopathiae strain WH13013 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,cas3,WYL | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP017116_1 | 1248896-1248972 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017116_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017116_1
>1.1|1248925|19|NZ_CP017116|CRISPRCasFinder TTCTTCCGGTTTCACTTCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017116_1
The CRISPR arrays of NZ_CP017116_1 >merge|NZ_CP017116|1|1248896-1248972|CRISPRCasFinder GGATTTGTTTCAGGTTTCACTTCTGGTTTTTCTTCCGGTTTCACTTCTGGTTTTTCTTCCGGTTTCACTTCCGGTTT >NZ_CP017116|1|1|1248896-1248972|CRISPRCasFinder GGATTTGTTTCAGGTTTCACTTCTGGTTT TTCTTCCGGTTTCACTTCT GGTTTTTCTTCCGGTTTCACTTCCGGTTT
>NZ_CP017116.1|WP_013852751.1|1247962_1248478_-|NUDIX-hydrolase MIIKYFDDDQFKAANICNVRNTVRCFVLNEFGQCAMILIKGQDLFGKRNHYESPGGGIEVGESMIQAVHREIQEELGYEVDSISYLASVVDAYHRLELTTVHNYFVCKLAKKTCYARTCLELQLFDSIEWKLPNVWLDILDKPQDGVNELVHARERFMMRYFVDKQETLRD >NZ_CP017116.1|WP_013852752.1|1247484_1248009_+|methyltransferase-domain-containing-protein MNHKERSHKWMKQFLNKDSIVVDMTCGNGYDTHFLANHAGHVYAIDIQEEAILSSKQLNQNFSNITYIHSDHSRVNFEEKAPFTGAIYNLGYLPRSDKSIITTSHTTVSSLKNIFPLLTDFLVIACYLKHEGGYEEYEAVRDYIISTNMPYETLEYETPLSPVTFLVYLRNNAS >NZ_CP017116.1|WP_013852753.1|1246645_1247464_+|metallophosphoesterase MSKKKLAVLLGLIAIVSSLIYFEMTHFAPQRVKLRIETVESTRIPASFNNLSIGFLSDVYSHEENLDKALIELDSFKPDMIIFGGNLFKAAPSEKEQAAMIEKLSKVNAKLGKYAVLGENDIRKANEVTQEVLTQSGFKLISNTKIDVHNFTTESIQLVGIDANNDINKETEFPYPTTSEDLFNITIANNPDNVKEFDDTEVDLMLSGKTMGGYIRLPLIGSITESSDYINKRQTVDETTLIISSGIGLKEPEMRLLSNPDVMIVILKSPEA >NZ_CP017116.1|WP_013852754.1|1244780_1246649_+|ribonuclease-J MDEKNMKLRKTDTLVYALGGLGEVGKNMYCIEHDDEIIIIDCGVMFPEENLLGVDYVIQDYAHLIRNQKKVKALVITHGHEDHIGGIPFLLQKVNVPQIYAPQFAKAQIERKLEERKIRTKHKIQEIDSKSTIKTKHFVIGFFNVVHSIPDALGVLVNTPNGRIVSTGDFKFDLTPVGNNPDYQIMSYMGEIGVTLLMSDSTNAEVSGFSISEKEVGREIKRIFNKTEGRIIIATFASNVYRVQQIIEAAIADGRKIAIFGRSMDNVVNIARKLGHIDAADKHFVNAHQLNKLPADQSCIICTGSQGEPLAALSRIANGTHRQISIMPGDTVVFSSSPIPGNATSVSHVVNQLTRAGANVLTNSPLNSIHTTGHASKEEQTLMLQLIKPKFFMPMHGEYKMLKAHRQTAIETGVDPDNIFICSNGDVVALRDGVAFMSDTRIQADDIYVDGNDSSGLSTAVLKDRKILSDSGLVSVVVTIDSRQNKILCKPTIVTRGFVFIKENQTLLKEAELVVYEALKKRMTKKVTFGEIKNTIRGSLEPFLYKHTQRNPLVIPVILNQKTAMTPVKVENKKENSGQETKPVKKQKKNNNKQNNEPKQQQKDAKKPKTPKATKPQQAREA >NZ_CP017116.1|WP_013852755.1|1244199_1244772_+|peptide-deformylase MHDINMDTIVLDPNPVLREKCEPVSFPLSEEDRNTLENMLQYVRDSRDPELAEKYNLQPANGIAAPQIGVAKQMTALVVDLEDKHGNIKTVEYALVNPKIVSNSVKQCALSYGEGCLSIRKDYPGLVRRSQRIKVLAYDMITDQRIEIVAKDILAIVLQHEIDHLNGVLFYDHIDSKDPWMAEKGLKIIE >NZ_CP017116.1|WP_013852756.1|1242767_1244024_-|FtsW/RodA/SpoVE-family-cell-cycle-protein MKKRKISLKMPMGYNRPIHAAALILNIFGVLMVISGSMTSGSTPKSLVLVGVKELVFVIVSYIMMVMVARRFSLNYFRKNYAKILLLMVGMLGITLVFPAVNGAKAWINLKVMTIQPSEFAKIFGILTIATFLADRNKRTSASTFDMVKKPFFIILAIFVFVVKAQHDLGSAVVIIGVAYICVLIPSHDKLTRLQKVMFILAGVGIIGLIFLDSSFGISLIEKLNIPPYMIGRFKTSSNPFLDRYGSGYQIFNGMVAMFKGGLFGMGYGNSLIKYGYLPEAHTDFILAVTIEELGMIGFSVILIGYGTMLFQLVKYSFKVKKESDKVILMGTVAYIMIHFIFNIGGITALIPLTGVPLLFISKGGSSRMAIMIAIGLTQNVISRYEMGIINVKRKDQLRIKQEETKRKENLKRLTEVV >NZ_CP017116.1|WP_013852757.1|1242222_1242768_-|16S-rRNA-(guanine(966)-N(2))-methyltransferase-RsmD MRVVAGRFGSRPIKTLKGDTTRPTTDKVRAAIFNRIGPFFNEGAMLDVFGGSGAMAIESISRGIERAVVFEKDVRAFSVIQDNIKTFGLESRIQLKKGDSMKLLETVSGSFEFVFLDPPYRYAQTLKIIKLIIKRDLVVDGGLIICETDKNYDLPDEIDGYSLDCVKDYGISKVRYYKKDK >NZ_CP017116.1|WP_013852758.1|1241088_1242120_-|heat-inducible-transcription-repressor-HrcA MLTPRKIEIFKAIVKEFINTAEPVGSKTLIDKYNLSYSSATIRNEMSDLEKIGLLEKTHTSSGRIPSTKGYRFYVEHLMDEEENYGIETAIAQIFSDRRLGIDEAIRQSCDILSQMTNLTTVVLGPSAMNETLKSVQLIPLSEFNAMAVFVTESGHAEHRIFNFDSKVDVNDLEACTSILNERLKGTELSEVVDKMESLRPILSKRIEKYEVLFEAFVGAFVKFAQDEVYLSGERNMLYQPEFSNIEKLREMMDMLENSEMWRNLSTGQNHLSLKKGDQSEIVWVDDMAVVSSSFNLLDNHEHKLMIVGPSRMEYSRVVSLMDYVSEMIETVYGKGGNDEQDE >NZ_CP017116.1|WP_043892556.1|1240532_1241108_-|nucleotide-exchange-factor-GrpE MMSKTNKTAEEFNEEVQLEQEVEATDSEELETSNSENEASETDEAIDENEALRKEIETLKNDYFKMLADTENLKKRLQREHDQLRKYRIQGFAADVLPVLDNLERALKQETTDEALREGVQMIYDQLMASLKAEGVEPINALNQPFDPNIHQAMMTEEKEGVESNIVIEEFQKGYMLKDRILRASLVKVSQ >NZ_CP017116.1|WP_013852760.1|1238716_1240519_-|molecular-chaperone-DnaK MSKVIGIDLGTTNSAVSVMDGGEAKVITNPEGNRTTPSVVSFKNGERIVGDAAKRQVVTNPNSAVSVKRLIGTGEKVTLEGKDYTPEEISAMILGYMKSYAEDYLGEKVTKAVITVPAYFNDAQRQATKDAGKIAGLEVERIINEPTAAALAFGIDKTDKEEKVLVFDLGGGTFDVSILELADGTFEVLSTAGDNKLGGDDFDNIVVDYLVDIFKKENGIDLSSDKMAMQRLKEAAEKAKKDLSSTVNASISLPFISAGENGPLHLETTLSRAKFEEMTKSLVERTMVPVRQALKDAGLTKNDIHQVLLVGGSTRIPAVVEAVKNELGKEPNKSVNPDEVVAMGAAIQGGVISGDVKDVLLLDVTPLSLGIETMGGVMTVLIERNTTIPTSKSQVFSTAADNQPAVDINVLQGERPMAKDNKSLGLFKLDGIAPAKRGIPQIEVTFDIDVNGIVNVSAMDKGTNKKQSITISNSSGLSDEEIERMVREAEENASEDLRLKEEAELKNRAEQFIHQIDESLASEDSPVDDAQKEEVTKLRDELQAAMDNNDFETLKEKLDQLEQAAQAMSQAMYEQQAGQAEVDASSSDETVVDAEFEEKN >NZ_CP017116.1|WP_013852749.1|1253513_1254509_-|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MKRVTIYDVAKEAGVSLATVSRVINGLEIVREETRVKVETAIDKLGYKPNAIAQGLALQKTTTIALLVPEASFGYTGQIINGLIDVAKIYKYNIMLHTMTEGIVDIKDVIDDIIKSRVDGVIIYNDKLMENELAELNKYQFPIVIIGNKMSDKQISSVYVDIEKAVYELTMQKIQMDPKNRVAVIQDRKNDFTTNQMVSGVQRAYQELGIDDEGYIEIPVDYRRSYDYFLDHIESMNYNFLIANRDSQAISAMNAAHECNMNIPEDLEIVCLIDTKYNSMVRPRLSSFAIPSYDLGAVAMRVLTKMLNEDEVEDKEIELSYLYTPRQSTKN >NZ_CP017116.1|WP_013852748.1|1254505_1255387_-|hypothetical-protein MSKYDEILNELVYQIDDVVYNFYSESNEIIAAKNGQERLLTFRDKTLNTINDMNVRSLEIISGFKDSDLIQERAEHLLEKNKDIVNSALEVLRAAPERNEFFDDLGNLATGIFESAKTTFQKVEESETFDRFKEGALLGLKKMQKGLDDLAKHPGVVKSTEIVKEKTKEAVDAGTQIVKDTSKNVADWVSEQELRAKAEKVSKEVHAGAETVKVKVHDGAEKVSEFVEDTVETKAHEFEEDAFSFLDTLEEELDQVSRDAESNLEPSNIVEAAEKQVRELDKKLDEVKEDEEV >NZ_CP017116.1|WP_003773209.1|1255379_1255796_-|hypothetical-protein MDALIQNLREVSILIAPIVGVVCLIILAMILYRIYVVVRDLPKTIDRVNGVIDSTQSSVDQLQAPLNTLNNVTNTVDLVNQSAVSAVSSVASYGAKHSDAIVNWTKDLLDKRRNGRNPESSDVQETGDEKEEDFGIYE >NZ_CP017116.1|WP_003773207.1|1255841_1257167_-|UDP-N-acetylmuramate--L-alanine-ligase MSMKNKPIYFIGIKGTGMAALARICYKMGYEVMGSDIDRHFFTEDALRALNIPIVPFNKNNIKDNTVVIIGNAFLDDHEEVQAAKANPTVETYRYHEYLGKMMDSYRTIAVSGSHGKTTTTTLLRDMLSYSKETGYLIGDGRGDLQRDDEYFAVEACEFRRHFLAYKPKIAIMTNFEIDHVDYFKSVEDYLSAFKEFAKNVESLIVVWGDDPHYQDLSFDVETWSYGFGEGNKIRATELEKTTTHSIFDVEVDGKRIHRFNLPIVGDHMILDALAVIAVGLYEGIEPNDIEAGLQTFTGAKRRFVIETGKDNVYIDDYAHHPTEVRVTLEAARTRYPDRKIVGIFKPHRVGRVYYFADEFADALSLADEVCLCPFTSIDDAEEGIDIDITYLQDRIEDSHVVDLNDHDLDLLESFGPAVYVFMSSKDIYDLKDALKIRFND >NZ_CP017116.1|WP_003773206.1|1257150_1257786_-|hypothetical-protein MFRRLASVLFKEEEIVIEEEISDHVGEVEIPELKPILPKEKKIVEKPKTVTEHVDITEPVISEKPITDMTPDEAVKAASELNRKSRMITADDDLAKRKMERAKAARTSELEVKKFEYQRKDIISPMYGGPSQPSEPLDIPKKNKASKHVPVAEVISPMYGKVQEESKAEARKIDESLMDLRVDDIISNEGKGETVQVSLYDYLEGIDEHEE >NZ_CP017116.1|WP_003773205.1|1257809_1258514_-|hypothetical-protein MSLRKLMTALLLLLLVSGCTPAAINYDDLVKSALSRPMPEATNHNKKYYRYYLLPDVGIKQSTQISTLYEIDRKPIMLDLDVANIVAKRYTEITENNEGKEKGDQKEDSKIQFSSLIKEEAVSYRTTGTYVDGSDKEQHFIFSIVDLEKHKAVVLENGQVDMMAIVNDANMDMIVQSMFTTMRSITVNEDLVVQDFSKKDIITYHERYEEFFEHAIPESGAISDIIDKTAPKTE >NZ_CP017116.1|WP_013852747.1|1258500_1259565_-|M42-family-metallopeptidase MLNEKQLNWFETLTQLDGVSGHEHQVAQYLFNEYSNYTDEILRDNLGSILAVRRSNKKNAPKVLVLGHMDEVGFLVREVTETGVLKIHPVGGWFSQVLLGHRVRVTTRHGEVYDGAIGATPPHMLSAEERLKPIQIPQMTVDVGATTPEEVHAMGIQIGDMVVVDGEFNVLNKGKRLLAKAFDNRYGCVMGLDLLEALKDQELDYDLYVGCSVQEEVGLRGAQTVANLVKPDLAIILDCSPANDALDSKAIGKLGGGVLVRVMDGNMIATKDLIYKFVDICNEHDIKHQYYFSPGGTDAGAVHKSNSGVKTLTCCLCARNIHTSSSILDTDDYLAAREALLHFIDKKTWGDVIA >NZ_CP017116.1|WP_013852746.1|1259564_1260197_-|tRNA-(guanosine(46)-N7)-methyltransferase-TrmB MRLRKKEWSSEVFETFADYTVTEFETIKGNWKEALGSELLHLEIGSGKGDYWHQLSALYPDRGIVAMERDFTASSIALKKLEKNPGDHKRFIYGDAENLNDMFAPGEVDVVHLNFSDPWPKKRHTKRRLTYKDKLDEYYSVLSDKGEIWMKTDNVGLFNYSLVSVGQHKFELVEVDVDFRSHEHEDPFTEYERKFHEMGQPIFRAIWRKK >NZ_CP017116.1|WP_013852745.1|1260295_1261363_+|hypothetical-protein MKNKLTATGIIVEYNPLHNGHCYHIKKTREITRCDVLIAVMSPNFVQRGEPAYLDKWVRTEAALESGVDLVLELPTIYTLQSADVFAFKAVEILNHVGIQSLVFGSESNVLPVKPQFDKGLLKQGHSFAHASNTSNHQSNDILGVYYVQACQTYGITPLTILRTNNYHDQSISTSIASASAIRKAHQEGISVSHTTPLNLNTLTSYQLKEYEPFIHYLLSVHPSKTLSQNSLVSEGIQNLFIKHRHLPLDVLIETCTSKRYTRSRVQRTLMNLLLNFTKDLEQPLEHVRVLGMNTKGKAYLRQLSDDEIPYTTQFKHYQFKELELRATEVYTLPKDETIKKRLLKQEVSELIIKT >NZ_CP017116.1|WP_013852744.1|1261352_1262447_-|methionine-adenosyltransferase MNLVFFTSESVTDGHPDKMCDQIADAILDQALKQDPNSKMAVEATIKDNFVLIYGEANTKAVIDYTQVAKDVIADIGYPEDYEVMVKVNKQSSQINNAVISQENVGAGDQGIMFGFACNETENYMPLPIHLAHALSKRLSDAKSEIDWLYPDGKTQVTVAYEGNEPKFVHTVLVSASHKAGIDHATIEKTVMESIIKPVIDSKWITEETRFIVNPSGEFSIAGPFSDSGTTGRKIVVDSYGGFGRIGGGCFSSKDPSKVDRSAAYFSRYVAKSVVAAGLCDKIELQLSYAIGLSDPLSIHIDTFGTHKRPESEILDIIKANFDFKVGNIISELDLLRPIYRDTANFGHFGRDGFPWEVIKPLKF |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
526115 : 534963
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017116|526115:534963|DBSCAN-SWA TTTAATCGAGTTGCGCTCTTTCATTAATATCTTTTTTTAGTGCTTCAAATTTTAAGAGTGATTCTTCAATTGTTTTACCTACAACGCAATAGTAAAACTTGCATTTTGGTTCCGTACCAGATGGTCGAATTGCAATCCAAGATCCATCTTCAAGGCTATACTTAATAACATTCGATTTTGGTAATGTTAATCTTTCACCGTTTGAACGTGATGATGTTAAATAATCATCTCGGTAAAGAACCTTAATTCCCGCAAACGCTTCGATATTTGATTCTCTAAATGTTGTTAGGATTTCTTGAATACGATTTAAACCCTCTTGTCCGGATAACGTAATTGCTACTTGTGTTTCATGATACGCACCATGTCTGTCATAAAGACCGTTTAAAACATCAACGAGTGTTAAGCCATGATTTTTGTAATAGTTTGCCGCTTCCGCAACCATCATACATGCTTGCAAAGCATCTTTATCACGCACAAAATCTGCGAGAAGATAACCGTAGCTTTCTTCATAACCAAATACAAAATTAAAATCACCCACTTTATTGTGATTTTCGATGCTATCACCGATGTATTTAAAACCCGTTAATGTCTTCTCTACATTCACACCGTAAGATTGCGCAATCTTTTCTCCTAAGTCAGAAGTAACGACGGTATTAAACATAATTGGATTTTCAGGCATGGTTTCTTTTTCAATTCGTGTTGCATAGATATATTCTTGAAGTATGGATCCACCTTGGTTTCCGGTAAGGTAAACATACTCGTCATGGTGTTTAACCACAATACCCATACGGTCTGCATCCGGATCACAACTGAGTACAAGATCAGCATCGTGTTTTACCGCATATTCCACGGCTAAATCATAGGACGCTTTTTCTTCGGGATTCGGAGTTTTTGTATTACTAAAATTAGGGTCATAATTACTTTGTTCCATGACAGGAATAACATTGTATCCTGCATTCGTTAAGATATCCGGTACAAGTGGATAGGATGTTCCATGTTGCGATGTAAACACAACGGATAAGGTTTTTACTTCCTCTGGACGTAGTTGAATTGAATGGATTGCATCTTTATAGGTTTCATCAAAATCAGCTTCCATATAAGTAATCATTGAACGATTACCCTGATTGATATCCACCTTCGTTTCATCCGGTTCTTCATTGATGAGAGAAATAACACGAGCAATCTTGTGATCCACCAATTGACATCCATTTTCATCGTATACTTTGTAACCATTGTATTCTTTCGGGTTATGACTTGCTGTAATAACAATTCCACCAACACAGTTTAACGTTCTAACTGCAAATGATAACTCGGGGGTTGGACGAGGTTGTGAAAAGATGTAACTTTTAATCCCGTAAGTTGATAATACCATCGCACTCACGTCCGCAAATTCTTTAGACATATGACGGTTGTCATATGCAATCGCTATTTTTAATTCTTGATCTTTAAATGTCTCAACTAAGTATTTCGCAAATCCCACACTTGCTTTCGCTACCGTATAAACATTCATGCGGTTAGGTCCGATTCCTAATAATCCGCGCATACCTGCAGTACCAAATTCTAATGACTTATAAAAAGCGTCATGTTTTGTGCTTTCATCCATAGTTTGCATTGCTTCCTCAATCCATGAATAATCGCGAGCCAACTCATTCCATCTATCTAATGACATAATTCCCTCCTGCATAAAAAAAATAGAAGATTCTCATCTTCTATTTTATTCTAATTATAAAATTAAGCAATTACTTTTTGTGCTTTTAGTACTTCTTCAATTGTAGCGATTGCATCATCTTGATCTTCGCCTTCAGCAGAAATAACGATTTCTGACTGAGTTGGAATTCCTAATGACATAACGCCCATGATTGACTTCATGTTTACAGCTTTACCTTTGTAGCTGATTTTGATTTCGCTCTTGAATTTGCTTGCTGCATTTACTGCTACGGTTGCAGGACGCGCATGCAATCCAACAGGATCAATAACTGTTACTGTAATCTCTTTCATAAGTATAACCTCCTACTTTTCATTTCAATTTTATACTATTTTAAAGATTAATACAATGATTAGTCTTTTTTTACTTGTGATATGGATGATTTTTTGAAATCATAAAAAACCGATACACTTGTTCATACAACATAAGGCGGACAAGTTGATGTGGAAAAGTAAGGTTTGAAATCTTCCAACGATAGTTAGAACGTTCTCTTATTGATTGGTTTACACCGTGAGAACCACCAATAATAAATGTGATTGGCTTTCCCATATCGATGAGATCCATTATTTTTTCACTCATCGAAACCGAGTCCAAATCTTTTCCACTTAAGTCCATCAATACCACATAGTCGCGATCATCAATTTTCTCAAGTATTCTTTGACATTCATCTTCAATGATACTCGTAACATCGCTTTTATTTGAGTTTGTTAGTTCAATCATTTCGACAGAATGAATGGGTTTAAGGCGTTTCTCATATTCTTGAATCAGTGCTTGCATTGGTTTTTCTTTAATTTTTCCAATTGCGATAATTTTTATCACTGCAATGTTACCTCTACCTCGTGAATTTCTCCATTACGATTTATCGTTAGTTTAACGGTATCACCGACTTTATGTGCATATAGTTCACGTCTAAACTCGCGATAACTCGAAATGGCTTTGTCATTAATATGGGTTAGAATGTCACCCTCTTTAATATCTGCTTTACGTGCTGGTCCATTTTGAGTTAACTCAGCAATAAATACTCCCGCATTTACATCTGAAGGAACTTTATAGTAATTTTTAAGGAATGGGTTCATTTCAGAAACCGAAACACCTGAAATCCCTATAACTGGATATTGTACTTTTCCAGTTTCTTCAATTTGTTTAATGATTGGAACCACTTCATTGATAGGAATTGAGAATCCCATTCCTTCAACTTGAGCTGAAGAGAGTTTCATGGAATTAATACCAATTAATTCTCCATTCATGTTTACAAGTGCTCCACCACTATTTCCCGGGTTAATTGCAGCATCTGTTTGCATTACAACCATATCCCAATCCGGATTACGGTCTCCATTTAAATCAACTGGAACTTTACGATCTTTTCCAGAAATAACTCCAAATGTTACGGAGTTTGCGAATTCTAAATCTACTGGACTTCCAATAGCGAGGACAAATTCCCCCACCTTAACAACAGAAGAATCCCCCAGTTTCATTGGCTTCACATCCGAATCAGTTTCTACTTGAAGTAGTGCTAAATCTGTAAAAGGATCCGCGCCTAAAAGTTTCGCTTCTACTTTTTCGCCATTTGAGAATTGAACATAGTATTGTTCACCTTTTTCAGTTACGTGATTATTGGTGATAATGTGAATCTTACCACCTTCATTTTTGTACACTACACCTGATCCACTACCCGCAAGTTGTCCACTTTGGACATTTAATACACTCACAACTTGGTCGCGAACATTTTCAACGACTTTCGTTGGATCTGTTTCAAATTCTGTAACAACTTTTTCTACAGTTTTACCATCTTCGGTCTTCTCAGTGACTGTTGGACGATTGTTTAGGTCGTAGACTTGATAGGTTAGAAATCCATTCCATGCAAGTAAAATAACTAAAATTCCAATAAATGTATTTTTAAATCCTTGATCTTTTCTCATATTTGATATCCTCCAATTACAATTTCAAATTGTTTAGCGACATTGAATTCAATCCCCTCATTATCAACTAATTCACGTACCGTTGACAAGGCTAAATATTCATCATTAGCTTCCGAACTAAGATGGGCTAGTAAAATTTCCTTTGTTTTTTCCGAAACAACTTTAGATAACAGAACACCCGCTTCTTCATTAGACAAGTGACCTGTATCCGATAATATACGACGCTTAATGGCATAAGGACGATTGGTTTGCATCAGTAATTCAGGATCGTGATTGCTTTCCAAGATGTAGTAATCGGCATCTTTGATCAATTCAAAATCCTGCTCACGAATGTAACCCGTATCGGTAATATACACAAGTTTACGACTCCCGTCATCAACAATATATCCTACTGAATCATCCGCGTCGTGAGATGTTTTCACTGCCGTGATTATAAACGGTCCAACGTGAAATGGGGTATACGGTTCTACCTTTGTATGGTTAAACATAATCTCCGAAGGACAGTAGATTTGATGGTGAGCAAAATGCTTCAACTGACTGGTATGATCACCATGATCGTGTGTAATCAAAACACAATCCACATCATCAAATGTTAGCGCTAGCGATTCAAAACTTTGTTTGAGATAACGCTTTGTGGTTCCACAATCAATCATAATTCGAACCCCTTGCGATTCTACTAGACAACAGTTCCCTTTAGAACCGCTCGCAAGCATTGAATATTTCATAAACATCTTCCTTTACCTAACATCCCATTACGGTGCATGGGTCTACCCGCACGCCGTGATAGCGGAACTCTAAATGAACATGAGGACCATAAGTTGTACCTGTCATACCCATATATCCAATATTATCACCACGTTTTACAAGATCACCAACATTGAAGTAAGGACCTGTAGCCATATGTGCATAAAGCGTTGTATAACCATTACCATGATCAATCACAATATGATTACCCCAACCACTTCCACATCCATAATTTCCTTCAAAACAACCACTTACAGTTTCCGATACAACACCTCGGTCAACTGCATATATTGGACCAAAACCACCACCATTGAGAACAAAATCAGTTCCATTATGGTTGTAGTAACATGAATTTCCATAGACACATGAAATATTCGCGTTATCTAACGGCCAACGATAGTTACCCGACCCAATCCGTGGTTCAACCTTCGTACCATAACGAACTTTTCCACGAATTGGCTCTTTCGTTACTTGTGTTCGAATTTCCTCCGAAGACTTTGGAGCACCATTCACAATAACATCTTCATAAACCACATCTCGCTTACCATTTTGTTCCACAACATCCACAACTTCCTTCCCTTCAGATAATTCTGGGTCAGATTCGTAGATTGTTGACTCGGGATAAACAACTTCTGAGGTCATTCGTTCTCGAGTGATTTTAACGGTAAAAGGAGAATTAAACTTACTGACTCGAAGTTTCGATCCAACCTCAAGCACCTGGTTTACATCTTTAATTATATCACTATTTATATATTTTATTTGATTTGCATCCATACCTTTATGCCAAGCAATCCCTGCGATTGTGTCATACGGTTGGACTTCATAAATTTCAACTTTTGGATTATATCCATAACTTAGAAAGGTTAAAACATCACTTTCATTCATAAGAATATTTTCTTTGGATGTCAATCCTTTGCTAATTTGAACTGTTTCTTCTACTTCCACATTAACATCATGTGTCCCATAATCTTTGATGCTTTCAATTTTTCGATTGTTTTTCATCGCATCAAATGTTTTGTCATCTGTAAAGTTCCGAATAAATGTATCACGTGCTTTGTTGAAGTCATCGATATTCTTAACATAAATGATCGCACCATTAGAAAATGTAACTTGATTTACTTCAATCGCAAAGAGTTTTTCATCATAGAGATATTGAAATATTTCATCATCACGATCTTCATAGTGATTAAAGCTCAATTCTTTAACGAGAATTAAGTCATCGATAAAACCTAGCTTTGAATCTGGGAATTCAGCTTTATATTCTTCTTCGTAAACCTTATCAAACATCTTATTTAATTTCGAACCGTCGCTGATAATGCCCACTAGTTTTTCGTCACGATAAAGTTTTGTGACTTCAATGGGTTTATCAGACTTTCCTTCAGACTCTTGTGGAAAGATTGATGTAGATGTGTCGGTTAATTTGTATAAATCCACAACACTCGTATTCGCACTCACTGTTTCGATTGCATACGTAATAAGTACTGAGACTATAAAAGTTATCAGGATTAATTTCAGTTCTTTATGTTGCTTCATTAGACCAACTCCTTTTGGAAAGCACAAACGAGACCGTAATCTCGTTTATACTTCGATTTGATAAAAACTAACAGCCAATAACACCACATGCATCAACACGTGTTCCACCACCCACAATAATTTCAAGATGGACGTGTGGATAACTTGTTCGACCCGTCATACCAACATAACCAATGTTTTCACCCTTTGCGACAGTTTGTCCTGCTTGGAAATAACCTGGACTTGCCATATGGGCATAAAGGGATCTGTATCCATTACCATGGTCAATAACGATATAGTTACCCCATCCTCCTGGATCGTATGAGTTTGTTGTGACAACACCACGGTCAATTGCGTAGATTGGTCCATAGCCACTACCGTGTGTTGAAAAGTCTGTACCCGAGTGATTTGGATAACAACCATAACCACAAAGAACATAGGCATTATCTAAAGGCCAACGCCATGCACCACTACCAACTTTAGGTTCAACTTTTGTACCATATCGAATAACACCACGTACTGGTTTCTTAGTTTCTTTACTTGATATTTCTTTCGTTGAGATGGATGCACCATTCTCATAAACATCTTCATAAATAACATCACGAGCACCATTTTGTTCCACGACATCCACAACTTCTTTACCTTCCGCAAGTTCTGGATCGGATTGATATACTGTTTTTTCAGGATATACTGGTTCCGTCGTCATACGTTGCTTGGTTACAGTAACTGTGAATGGTGAATCAAACTTACTTACTCGAAGCTCTGATCCAACTTCAAGCACCTGATTCACATCTTTGATTTTATCCGCATTAATGGATTGAATCTGATTAACGTTCATACCACTGTGATATGCAATACCTTCTAATGTATCAAATGGTTTAATTTTATAAGTTTCAACTTTTGGATTATACCCATAACTTAAGAATGTCAGAATTTCTGTTTCATCTTTTAGGATTTTATCCTTCGTCGCAAGTCCCCGCGTTACTTTAACGGTTTCTTTAACTTTTACATCAATATCCTTAGTTCCATAGTCCGTAATTGCAGGAATTTTTTTATTATTTTTGATTGCATCAAATGTGCTCTCACTGGTAAAGTTTTGTATGAATTTATCACGCGCTGAATCAAAATCTTCAGAATTCTTTACATAGATGATGGCTCCATTTGAGAATGTGACTTTATTTGCCTCAATCGCAAATAAGTTTTCTTTATAGAGATAGTCAAAAATATCATTATCACGATCTTCATAAACATTGAAACTCATTTCATCTACTTGAATAAGGTCATCAATGAATCCCAACTTAGAATCTGGGAATTCTTCTTTATATTCATTTTCATACACTTCATCAAACATCTTCTGTAGACGTGTCGAATCTTTCAAGACCCCTACTAGTTTTTGTTCGCGATAAAGCTTTGTAATCACTACAGGTTTATCATTTACAGTTACAACTTCTTGTGGAAATATAGCAGATGATGAATCGATTGCTTCATACGCTGTTTTAATTTCTGATGCTGAAGTTGGTGACTTATAAAGGTACCCTAACCCAATCGCAAAAAGAAATACGACAGATATCATAATGAGGTTTTTATGTTTTTTCATATTACATTCTACCTCCGTCTCCGGCAACACCATAGAACTTACTAATGGAAGCATTGAACATGAGTGTAATGTCTGCCAATGCACCATTACGGTGTTTCGCCATTTTTAGTAATACTTCTTGTTGTTCTGGTTTCGGCATTTGAGGACCATCATCCTCTTCACCTTCGCGGTCTTTATAATAATCTTCACGGTACAAGAACATTACAATATCCGCATCTTGCTCAATCGAACCAGATTCACGTAAATCACTCAATTGAGGAATTTTACTGTCTCGACGTTCCACTAAACGTGATAATTGCGAGAGCGCAATAACCGGGCAATCCATTTCACGGGCCAACTGTTTGAGTCCACGTGAGATTTCCGAAACTTCTTGTTGACGTGATTCTGTTTTCCCACGTCCTGAAATCAACTGAATATAGTCAATCACAATCATATCTAAATTACCTTCGGATTTTAGTTTTCGGCATTTCGAAAAAATTTCAGGAACTGTAATTGTTGAACTATCATCAATAAAGATATTGAGTTTCGATAAAACATTGGCGCCTGCATAGACGTTGTTTAATTGTTCATCGTTTAGATTACCCGTTCGTAAATACTCACTCTTAACAGAAGATTGCGCACTTAACATACGTGAAATCAAATGTGTTGCAGGCATTTCAAGGGAGAAGATCGCCATTCCTGCTTTTTCATCTTTATTGTGACGTGCTGCATTCAATGCAAGGTTTAAGGCAAAAGCCGTCTTACCTACAGATGGACGCGCCGCTAAGATAATTAAATCGCCACGTTGCAAACCGTTTGTGACATTATCTAAATGACTGTAATTGGTCTTTAAACCAGTAATGCGATCGTGGTTATCACGAATTCGGTTTAAATTCTCCATTACTTCATTTACGACCTCACGACTGCGTTGCATTTCAGTTGTTCGACGAACTCGTGTTACTTCTAAAATTCTCTGTTCTGCCTCATCAAGCAGTGCTGTAAGTTCAGTAGTAGAGTCAAAACCCTTTTCAGCAATAGACTGCCCAACATCAATGAGTCGGCGCATTTGAGCTTTTTCTTGAACAACTTCAATATAATGTTTCACACTTGCTGGTGTTGCACTGTTTTCTGTAAGTGCAAACAAGTATTCCACACCACCCACACTATCAATTTCGTGTTGATCTTTTAATCGGGTTATTAAAGTCGTTGCATCTAAAACACGACCACGTTCAATAATTTCTAACATATGAGAAAATATTTTTTGGTGCTCGGTATTATAAAAGTCATCGACTTGCATATCATATTCTTCAACAACTGCAACTGACTCTGGGAACACCAATAGCGTTCCTAAAAGAGCCATCTCAGCGTCTTGACTGTAAGGCAATTTACGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017116|526115:534963|530479_532015_-|WP_003774364.1|DBSCAN-SWA MKQHKELKLILITFIVSVLITYAIETVSANTSVVDLYKLTDTSTSIFPQESEGKSDKPIEVTKLYRDEKLVGIISDGSKLNKMFDKVYEEEYKAEFPDSKLGFIDDLILVKELSFNHYEDRDDEIFQYLYDEKLFAIEVNQVTFSNGAIIYVKNIDDFNKARDTFIRNFTDDKTFDAMKNNRKIESIKDYGTHDVNVEVEETVQISKGLTSKENILMNESDVLTFLSYGYNPKVEIYEVQPYDTIAGIAWHKGMDANQIKYINSDIIKDVNQVLEVGSKLRVSKFNSPFTVKITRERMTSEVVYPESTIYESDPELSEGKEVVDVVEQNGKRDVVYEDVIVNGAPKSSEEIRTQVTKEPIRGKVRYGTKVEPRIGSGNYRWPLDNANISCVYGNSCYYNHNGTDFVLNGGGFGPIYAVDRGVVSETVSGCFEGNYGCGSGWGNHIVIDHGNGYTTLYAHMATGPYFNVGDLVKRGDNIGYMGMTGTTYGPHVHLEFRYHGVRVDPCTVMGC >NZ_CP017116|526115:534963|526115_527783_-|WP_013853426.1|DBSCAN-SWA MSLDRWNELARDYSWIEEAMQTMDESTKHDAFYKSLEFGTAGMRGLLGIGPNRMNVYTVAKASVGFAKYLVETFKDQELKIAIAYDNRHMSKEFADVSAMVLSTYGIKSYIFSQPRPTPELSFAVRTLNCVGGIVITASHNPKEYNGYKVYDENGCQLVDHKIARVISLINEEPDETKVDINQGNRSMITYMEADFDETYKDAIHSIQLRPEEVKTLSVVFTSQHGTSYPLVPDILTNAGYNVIPVMEQSNYDPNFSNTKTPNPEEKASYDLAVEYAVKHDADLVLSCDPDADRMGIVVKHHDEYVYLTGNQGGSILQEYIYATRIEKETMPENPIMFNTVVTSDLGEKIAQSYGVNVEKTLTGFKYIGDSIENHNKVGDFNFVFGYEESYGYLLADFVRDKDALQACMMVAEAANYYKNHGLTLVDVLNGLYDRHGAYHETQVAITLSGQEGLNRIQEILTTFRESNIEAFAGIKVLYRDDYLTSSRSNGERLTLPKSNVIKYSLEDGSWIAIRPSGTEPKCKFYYCVVGKTIEESLLKFEALKKDINERAQLD >NZ_CP017116|526115:534963|532082_533591_-|WP_003774363.1|DBSCAN-SWA MKKHKNLIMISVVFLFAIGLGYLYKSPTSASEIKTAYEAIDSSSAIFPQEVVTVNDKPVVITKLYREQKLVGVLKDSTRLQKMFDEVYENEYKEEFPDSKLGFIDDLIQVDEMSFNVYEDRDNDIFDYLYKENLFAIEANKVTFSNGAIIYVKNSEDFDSARDKFIQNFTSESTFDAIKNNKKIPAITDYGTKDIDVKVKETVKVTRGLATKDKILKDETEILTFLSYGYNPKVETYKIKPFDTLEGIAYHSGMNVNQIQSINADKIKDVNQVLEVGSELRVSKFDSPFTVTVTKQRMTTEPVYPEKTVYQSDPELAEGKEVVDVVEQNGARDVIYEDVYENGASISTKEISSKETKKPVRGVIRYGTKVEPKVGSGAWRWPLDNAYVLCGYGCYPNHSGTDFSTHGSGYGPIYAIDRGVVTTNSYDPGGWGNYIVIDHGNGYRSLYAHMASPGYFQAGQTVAKGENIGYVGMTGRTSYPHVHLEIIVGGGTRVDACGVIGC >NZ_CP017116|526115:534963|527845_528112_-|WP_003774368.1|DBSCAN-SWA MKEITVTVIDPVGLHARPATVAVNAASKFKSEIKISYKGKAVNMKSIMGVMSLGIPTQSEIVISAEGEDQDDAIATIEEVLKAQKVIA >NZ_CP017116|526115:534963|533592_534963_-|WP_003774361.1|DBSCAN-SWA MRKLPYSQDAEMALLGTLLVFPESVAVVEEYDMQVDDFYNTEHQKIFSHMLEIIERGRVLDATTLITRLKDQHEIDSVGGVEYLFALTENSATPASVKHYIEVVQEKAQMRRLIDVGQSIAEKGFDSTTELTALLDEAEQRILEVTRVRRTTEMQRSREVVNEVMENLNRIRDNHDRITGLKTNYSHLDNVTNGLQRGDLIILAARPSVGKTAFALNLALNAARHNKDEKAGMAIFSLEMPATHLISRMLSAQSSVKSEYLRTGNLNDEQLNNVYAGANVLSKLNIFIDDSSTITVPEIFSKCRKLKSEGNLDMIVIDYIQLISGRGKTESRQQEVSEISRGLKQLAREMDCPVIALSQLSRLVERRDSKIPQLSDLRESGSIEQDADIVMFLYREDYYKDREGEEDDGPQMPKPEQQEVLLKMAKHRNGALADITLMFNASISKFYGVAGDGGRM >NZ_CP017116|526115:534963|528634_529738_-|WP_016357484.1|DBSCAN-SWA MRKDQGFKNTFIGILVILLAWNGFLTYQVYDLNNRPTVTEKTEDGKTVEKVVTEFETDPTKVVENVRDQVVSVLNVQSGQLAGSGSGVVYKNEGGKIHIITNNHVTEKGEQYYVQFSNGEKVEAKLLGADPFTDLALLQVETDSDVKPMKLGDSSVVKVGEFVLAIGSPVDLEFANSVTFGVISGKDRKVPVDLNGDRNPDWDMVVMQTDAAINPGNSGGALVNMNGELIGINSMKLSSAQVEGMGFSIPINEVVPIIKQIEETGKVQYPVIGISGVSVSEMNPFLKNYYKVPSDVNAGVFIAELTQNGPARKADIKEGDILTHINDKAISSYREFRRELYAHKVGDTVKLTINRNGEIHEVEVTLQ >NZ_CP017116|526115:534963|529734_530463_-|WP_013853428.1|DBSCAN-SWA MKYSMLASGSKGNCCLVESQGVRIMIDCGTTKRYLKQSFESLALTFDDVDCVLITHDHGDHTSQLKHFAHHQIYCPSEIMFNHTKVEPYTPFHVGPFIITAVKTSHDADDSVGYIVDDGSRKLVYITDTGYIREQDFELIKDADYYILESNHDPELLMQTNRPYAIKRRILSDTGHLSNEEAGVLLSKVVSEKTKEILLAHLSSEANDEYLALSTVRELVDNEGIEFNVAKQFEIVIGGYQI >NZ_CP017116|526115:534963|528182_528638_-|WP_003774367.1|DBSCAN-SWA MIKIIAIGKIKEKPMQALIQEYEKRLKPIHSVEMIELTNSNKSDVTSIIEDECQRILEKIDDRDYVVLMDLSGKDLDSVSMSEKIMDLIDMGKPITFIIGGSHGVNQSIRERSNYRWKISNLTFPHQLVRLMLYEQVYRFFMISKNHPYHK |
8 | Streptococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1177840 : 1211994
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017116|1177840:1211994|DBSCAN-SWA ATTAGCCAATTAGTTTTCGAATATCATTAAACATGATAAATACAAAGAGTGCCATAATCATTGCAACTCCAATTGACATAATTCCGTTTTCAATTTTTTCTGGAATCGGTCTTCGAATAATCATCTCAATAAGTGTTAGCAGTGCACGTCCACCATCCATTACTGGAATCGGAACAAGATTAATCACCGCTAAACTCACAGACAATTGCGCAATCAAACTCAAGAAGAATATAAATCCTTGGCTCGAAATCTGTGATGTGACTTGATAGATACCAATTGGTCCACCCACAGAATTAAGACCAACACCATGCACAAGACGACTTAAAACAAAACCAAGTTGTTGGATTATCGTGCCCAGCATCGTAAATCCCATGCCAAGTGATTCAAAGAAATTCAAATCACGATGTTCACCACTGATTGCCTGCACACCAATGAGATAACGTTCTTCTTCTTTATTAAACTCTGGTTTAAGTTTTGTATCTACTTCATTACCATCACGCATCACCGTAACAGTCACTTCGTGATCTTCATAGACCATGATGCTTGTAACCAATTGATTAAAATCATGAGGCTTCACAACTTTACCATCATCAAAAGTAAGTTTGATAATTTCATCGTTGATGCGCAATCCTGCTTTTTCTGCTGGAGAATCTTCTGCGATCCCAGCTACAATTGGTTTGGGTGCATCAACTGTACCAAGATGCATCGAAAGTCCTGTGAAAATCACAAAAGCTAAGACTAAATTCATAAAAATACCTGCAAGCATAACAATAAGACGCTTCCAAGGTTTGATACCAACAATGGTACGTTCACGATCGACACCAAAATCACCTTCACCAGGCTCTCCTGCCATCGACACAAATCCTCCTAAAGGTAATGCTCGAATTGAGAAACTTGTCTCCCAACCTTCTTTTTTATATTCGAAAATTTTAGGTCCCATGCCAATTGCAAACTCGTTACAATAAACACCAAAAACCTTTGCAGCCATAAGATGACCTAATTCATGAATGAATACAATCAATCCCATAACTAAAACAAAATAAAATATATTGAGTAATATTTGCATGCAAACCTCCTATATAAAGATTGTAAGTATAATATTAAATGTTAAGAGTGCAAAAATAACACTATCAACACGGTCTAACACCCCACCATGACCCGGGAATATATAACCAAAATCTTTCACATCAAAATGACGTTTGATTGAACTGAATGCTAAATCACCAATTTGCCCGATAAAAGGAATAATAAGTGAACCCACAATGATTACGTTAAGTGGTACATAATTAATGATGAACATTGATCCAAAGATAAAGGATAGAAGTGCTGACATCGTATAACCAATGACTGCACCCTCAATTGTTTTCTTAGGCGAAATACGTTCAATCAGCTTATGTTTCCCAAACATCATTCCTCCAAAATACGCAAAGGTATCCGTTAAGTAGGTTGCAAGGAGAACATAAATAAACACAAGTTTGTCATACTCTAAAACGACCGTCACCGCTTGTACTGCAAGCACTAACATCATAATTAAGATAAACATATACGAAACATTATCGAAAGTATACCAGTCAAAGAATACGGTCAATGCAAAGAGTGTCATGATCAATACTGCTGTAAATGAAGGTATATACTCAGGTAGAATTGATCCACCTGTAATGGTAAATGCAATGATGACTGGGACTATAATCGGTTTTAAACGCTCTTTATTGAGAAGATATATTTCATAAGCTCCCAACAGGATTAAACCCATTATTAAAGTAAAAAGAGCCCCGTTCCCTGCAAATAAAGCTGCACTAAAAACAGCGACTAATACAATGGCAGTGGTTATGCGCTCTTTCATACTAAAGTCCTCCAAATCTACGATTTCGTTGATTGAAATCCTCTACACACGACTTAAACATTGGACGATCAAACTCTGGCCATTGAACATCTACAAAGAGAAGTTCCGCATACGCTAATTGCCACAATAAGTAATTCGAAAGTCGGCGATCGCCGCCTGTGCGAATTAAAAGATCAACAGGTGGTAATCCAAATGTATCTAAATACGATTCAAAAACTGTTTCCGTTACAGTCTCGATTCCATCATCCACTATTGATTGCGCAGCACGTACGATTTCATCCCGTGAGCCATAATTCAATGCGAAATTAAGAATGAGTTTATTGTTATCTTTTGTGCGTTCAACCGCATTATCCATTACCTTGCGCGTGCGTGCTGGAATTTTCGTTAAATCACCAATGGTTCGGATTTGAATACCTTTTTCCATCAATTCATTTAAGAACTTTTCAAAAAACACAGCAGGTAATTTCATGAGATAATCAATCTCTTTTTGAGGACGTTTCCAGTTTTCAGTCGAAAATGCATACAATGTAATGACCTCAACACCCAAATCTAAGGCTTCCAAAGCAATATCACGTACATTCTCACTACCGTAGTAGTGACCGAATGTACGTTCTTTCTTTTGCTTTGTTGCCCAACGTCCGTTACCATCCATAATGATGGCCACATGTTTTAGGCTATTCATAATTAAATTGTCATGATTTCCTTAACTTTGTCTTTAGAAATCGCATCAATTTTCTTTGTAATATCGTCTGTAAGTTTTTGTACATCATCAAGAAGACGTTTCTCTTGATCTTCTGGAAGATCTTCAAGATTCTTGATTTCATCATTTAAATCACGGCGAACATTACGTGCAGCTACTTTAGCATCTTCCGCTAAAGATCCTACTTGTTTTGAAACTTCTTTACGTGTTTCTTCTGTTAATTGAGGCACATTGATACGTACTACCGTACCATCATTTTGTGCTAATAACCCGAGGTTACCGTTGTTGATTGTATGTTCAATTTCTTTAAGTGCAGATGGATCAAATGGCTTGATTACCAATTGACGTCCTTCTACTACAGAAATTTGAGCAATTTGTTCAATGGGTGTTGCTGAACCATAATAGTCAATTGACACTCCATATAACATTGACACATTGGCACGTCCTGAACGTAAACCACCTAAGCGTGTCTCAAAGTTTTCAATTACTTCGTCCATTAAAAGACGACCATCGTTAATGATTGATTGCATCTTTATTTTCCTCCCTTAGATACGCGTGTTGCTACTGCTTCACCTTTTACTGCTTTTATTATATTATTTTTTTCATTCATATTAAATACAATTAAATCAATATCGTTATCCATACACATTGACGTTGCAGTTGTATCCATAACGGCAAGTTCTTCTTGAATAACATCCATATAGGATAAACTATCATATTTTAAGGCATCCGGATTAATTCTTGGATCAGAATTATAAACACCATCGACACCATTTTTAGCCATTAAGATTACATCGGCTTTAATTTCTGATGCGCGAAGTGCTGCAGTAGTATCCGTTGAAAAATATGCAGATCCTGTACCCGCACCAAATACAACAACACGTCCTTTTTCTAAGTGACGGATTGCACGACGTGGAATAAAGGGTTCTGCAACCTTAGTCATATCAATCGCTGTTTGAACGCGTGTTTCAACACCGTTACGTTCTAAAGCTCCTTGGATTGCTAAAGCGTTAATTACTGTGCCCAACATTCCCATGTAGTCAACTTGCATGCGATCGATGCCTAATTCTTCAGCCATTCGACCTCTAACAAAGTTTCCTCCTCCGACAACGATAGCAACTTCGACACCATCATTGACAATTGTTTTAATTTGTTCTGATAAATCATCGAGAACGACCGGATCAAAAATTTCTCCATCTGTTGATAGAGCTTCACCGCTTAATTTTAACAATACGCGTTTATACATGTTGCACGTCCTTTCAAAAAGGACACAGTGACTGTGTCCTTATATCATAAATTAAACTTGAGCTGCTTTTGCAACTTCAGCTGCGAAATCTTCTTCGCGTTTTTCAATACCTTCACCAACTGCGAAACGAATGAATGATTCAACGTTTGCATTTGCTGATTTAAGTACTTGTGAAACCTTAGCTTTACCATCTTTAAAGAAAATTTGGTCAACTAAAGAGATGTCTTGCATAGATTTGCTTACACGTCCCTTAATGATTCCTTCAACTACTTGTTCTGGTTTGTTTGAAAGTGATTCGTCATTTTTAACGATTTCAACTTGAATGTTTGTTTCGTGATCAATGATTTCTGAAGGAATTTCAGCTTGTGACACATATTGTGGTGACATTGAAGCAATTTGCATTGCCATGTCTTTTGCTAATTCTTCATCAGCGTTCTTAAGAACTGCTAATGCTGAAATTTTTCCACCCATATGCATGTATTCACCGAATACTTCATCATCTGATTTTTCAACGATTGCAAATCGACGTAATGTAATTTTTTCTCCGATTGTAGCTGTTGCAGCAACAACTAAGTCAGATACTGTTTGTCCATTAACATCAACTGCTAAAGCTGCATCTAAATCTGCAGGATTAGCTTCAAGAAGTACGTTGCTTAATGTATCAACGAGTTCTACGAATTGAACATTCTTAGCAACAAAGTCTGTTTCTGAGTTTACTTCGATAACAATACCGCGGTTTCCCTTAACAGTAACCTTTGTTGTTCCTTCAGCAGCAATACGACCTGATTTCTTCTGAGCATTTGAAATACCTTTTTCTCGTAACCAGTCAACTGAAGCTTGGATATCGCCTTCAGTAGCTTCAAGAGCTTTCTTACAGTCCATCATTCCAGCTCCAGTAAGATCACGAAGTTCTTTAACTAACTTTGCACTAATCATCTTTACGCCTCACTTTTTTCTGTTTTTGTTTCTGTTTTTGCTTCTACTTTTTCATCACGATTGTTTGTTGGACGGTCAGTACGTGTATAACGTTGTTGACGACGACGATCATCGCGTTTACGACGTTCTTCAAAACGTTGACGACGACGACGGTCATTTTCAGCAGCTTGTTGTTCTACATTAACGATAACGTCTTCCATTGTGATGTCTTCTACATCTTGATCTTGGTAAGCAACTTGTAATACGCCACCTTTTGGTTCGATCATTGCATCTGC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41 | Erysipelothrix_phage(33.33%) | portal,tRNA,transposase,holin,terminase,protease,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1219935 : 1228380
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017116|1219935:1228380|DBSCAN-SWA TCTAAAATTCCGGCTTATACGTTCTCGGCTCAATCCCTGGAGGTACTTGTCGCCACCCTTGAGCAGCAATTCTACTGATCATTTTATTTGCTGCTTCAAAGGACCAACTTCCTACATGTTGGAAATCAAATCGTTCCAATAGTCTTATCTGTTTTGGTGTGGCAAGGCCTGCATCACGACGTTTATTGATTCTGTCAATAAGTAACGACGCTTTACCTGCATTATCTATTTCATCAGGTAATATCCCTGCTTTCTCTAATTGCTGAAGTTGCTTACTTGTAGGTGGCCCCATTTCCCATCCAAAACTTGGTACATAATTAGACAAGTCTTCTGCTTGAATACTTAATTCGAATTGTAAAGGATCTACAAGTGCTCGCTTTCGCTTACGCATCTGCGCTAGTTGTTCTGCAAGAGCTTCTTCCCTTTGTGATACAACATCTTCTTTTGCTTTTTCTTCAAGTAGCTCTATATCTAGAGCAATACCCGCATTATCTTCAGATATCTTGGTAATTGCTTTTGCAACCTCTTCATTTTCTGCTATTAAATGAGCCGGATGTACTAAGTCATGGCGTTCTGTATGCCATAAGAAATCCAAGAGTAATAGCTCTTCTTTCCCTGGATAAAGTCTCGTCCCACGACCAACCATTTGAGAATATAAACTTCTGACTTTTGTTGGTCTAAGTACGACGATACAATCCACGGCAGGACTATCCCACCCTTCTGTAAGTAGCATAGAATTGCAAAGCACGTTGTATCTGTTATTTTCAAAGTCTTCCAAGATTTCAGTCCTATCGGGACTACTTCCATTTACTTCCGCTGCCCTAAATCCTTTTTCATTTAAAATATCTCTAAACTTTTGTGATGTGACAACTAACGGTAGAAACACTACCGTTTTTCTATTCTGGCAGTGCTTAGCCATCTCATTGGCGATTTGATACAAATACGGGTCTAATGCAGTTCCAATATCGCTTGCTTTAAAATCTCCTGCTTGTTGTGAGACACTGGATAAATCTAATTGCAGCGGAATTGTGAGAGCCTTAATCGGACTCAAATAACCTTCTTTAATCGCTTGTGGTAAAGAATACTGATAGGCTAACGTTTCAAAGTATTTACCTAGATTTTTCATATCACCACGATCAGGAGTTGCAGTAACTCCAAGTACATCCGCATTTTCGAAATAACTTAACACTGTCTGATAACTCTCAGATATACAATGATGTGCTTCATCAACAACTATAAAATCGAAGTGTTCTTTGCTAAATTGATGTAAACGTTTTTCACGCATCAATGTCTGAACACTTCCTACAACCACACGTTCCCAACTATTGAGACTCGTAGACTCTGCTTTTTCAAGAGCAGTACGGAGTCCTGATGCCTTATACAGTTTATCGGACGCCTGTTCAAGTAATTCTCCTCGATGTGCGAGGACAAGCCCACGCTTGCCCTCCCTAACTTTTTCTTCTATCACTTTAGAGAAAACTATTGTTTTTCCACAGCCTGTTGGAAGTACTAACAACGTTCGTTTAATACCTTTGTCCCATTCATTAAGAATCGCATTCTTAGCGGATTCTTGATATGGTCTTAATTCCATGGTTTAAAATCCCCAGGATGCTTGTTGATTTACGACTTCCTCTTCTTTTCGATAGAACTTGTCAACTTCGTTGTATAAGTTTCCATTATATTCTCGGTTCTTAATTTTACACTTACCGACTTTAGCAACAATCATGTTCCATTGTGGTTTAATTTTCTCGCCTTTTTTCTTCATGCCAAGTGATGCAAAAAATGCACTGATAGTCCATTCTGTTTTTCTATGTAGTAAAATTCGATTTTGAACATCAACTTGTCGACCGGTATCAGGGTCTTCTACAGTAATTGTTACCAAAGCCATATTGCAAGCCGGCATTTTTTCACTTCCGTCGAAACGACCTCGTTCAAATTTCTTAACTACAAAATCATAGTTTCCAGGTTTTAAAATAATAAAATCTTCCCCATCATCTTGAATTTCATCGTCCCATCCTAATTCACGTTCAAATTGATTATTATTTAATGTCATTATTTTATCCTCCTACTTTAAAATGGTAAATCATCACTGTTTATATCTAAAACAGGCTCTCTCATATTTCGAATTTCTTGAATTACTTTTGGCCAATTAGCCACAAGTGCTCCATCAGTATATTCTCGAGGGAGATTTTCTAATGGTGTTCCTTTTGGGAAATGCCCCTTTATATCGATTATGTAGTGCATCAACTCAGATTTAGTCACCTTATCAGTTTTCAGTAAATCTTGAAGTGCTTGACTTAAACATCCAAACTCATTTTCAGTATCAGTTAAAATATTTTCCTTTGTTGCTTCTTGGTGCACTTCTTTTTGATGTGTATTAACTTCGTTCACAACTTGTTTGGTTTCAATAATTTGATCTACAAGACTATCAGGAATATGTAATGCAATTTCTTTAAATTCGAATGAAAGTTTATCAGCAAGGCCCCAACGATTTTTAGCATCCCATGCTGGATTGTGAGAAGTAAACATTACACGTGCGCCGCCTTGTGCTTTATTCTTACCCTTTACAGCACCTTGATTATCGACATTGACTACATGAATTTCATAAGTTGCAAATAAAACTGCATCCGCCCATTCTTTAGTTAGAGGCGACGTTTTCTTTTCAAGTTTAAGTTCCCATCTATCATAAGAACCTAATTCTTGAGGTTGTTCAAATTTACGCATCATAGCATGTGCCAGGATTACGACATTGATTCCAACGTCAACAACTTCCTGTAATTTATTAAGGAATCGCCCCCACTCTTCTGCAAGCATCGTATACCCTTTTCCATAACCAAAATCTTCAATGGACTTAATCTTTGGATATTGGCCTATAAGATATTCTTTCGCTAATTTTTCTGCCCAATCAGCAGTGTCAATAATGTATGTTAGACAAGGCTTGTTTTGTTTAACATATTCGATTTGGGATAATAACATCGGCCACGAAGTTGGTTTATCGAATCGTGCTACATCAAGATGCATCGTAGATCCTTCTGTATCACTGAACAATGGATTTGGAAACATTGAAGCAAAGGTTGATTTTCCAATTCCCTCAGGTCCATATAAAATAACTTTTTGAGCATTTATCACTTTTCCTTTCGTTATATTCATGACTAAAATTCCCATCCTTTCTCTTCAACTTTCAAGTCGTTTTCTTTTGGTAGTGACTCCTGTCCCACGACATATCCATCTTCAATAATAATCTGACACTCATCTCCGCTTGAGACACGTGTTGCAATTGCTTGTAAATCTTCTTGCTCTAACCATTTACCAAATTCTTTCATAGTATCAACATCCATTTGTTCTAATTTATCGATTAAAACAAAGCCACATTCAGGTTTAAGTTTTCGTACAATTGCTGTTGCAACGCGTAATTGTTCAGAGCCTGACATGTTGTCCCAATGCTGATCATTGAATGTTAATTCCCCATCAACAACACTTAGCCCTGGTAGCGGTAAATCTGCTCCTTTCAATAAATCGAGACGTTCCTTACGAATTGCATCGATTTCTTCATTTAAATCTTTATATTGTTGACCGTAATACTCTGCTTCTTGCTCTGCTTGGTCTTTCTCTAAATTGATACGAATTTTTGCATTAATTTCATCAATCTTAGCAATATTAGCTTCGAGTTCTGCTGTTGATTCATCATGAAGGTCTATTGCTGACTTTCGAGCTTCTGCAAGATCGTTTTCGTTGGCTTCTAGCTTAGTTTGGTAATCTTGAAGTATTTCTTTCAGACGTTTATTTTCGTCCTCTAAATGGGCTAAATTGCGTCGTTTACGTTCTTTTTCTGCATTTCGTGCTAGAATATCCTGTTGCTGTTTAATTAAATCTGATGCACTAATCAGTTCTTCAGGTACACCTTCATGACGCGGCATTTCTTGAGCATGTTTCTTTTTAGTATCAGCAATTTTACCGATTGCTAGACGTTCTTGATATAGTTTATTTTCTAAGGTATCAAGTTCAAATAACTTATCGCCTACACCGATAATTTCTAAAAGTGTTCGTGCCTTTTCTTTGCTTGTAGCTTCCATAAATTTTGGTAAGTCTAGTGCAAGCTCTTCTATAAAAGAATCTAGCAAAGTCTGTCCTGCTTTATTCCCTGATGGATCAATTACTTTTAAATCGCTATTTTTTCCTTTGCGTTCTACGATTAAGCCATTACTTAACTCAACTCTAAGTGATGGTGGTGTTACGGAACCTTCTCTTCTTGGATTTGATGGTTGATATTTTTTACCACCTAGTGCCCAAGCAATAGAGTCTAGTACCGATGTCTTCCCTTGATTATTTTTTCCACCAAGTACTGTTAGACCTTTTTCAGATGGTACAACATGTACCGCACGTACACGTTTAACATTTTCAATTTCCAATTTGTTTATTTTAATGGAATTCATTCACTCTTCCCTCTCTTTCTAATTTTTCGGTAAATTCACAAGAACCCAGGATTGTTAAAATTTGTAATTCAGTTGGAATTCCTGCTTCATGGATTGCTTTACATAAACCTACTAATGCATTTAATAGAAAATTTTGTGTTCCATTACATTTGATTTCAATTCCATCTTTTTCTTTCTTAATTGTCACGCTGTTTTTATCATTCATATATTTTCCCTTCTTTCTTCCCTATGACTGGGCTTTCTGTAAATACATCAATCCTTTGCAGTTCTTCACCTTCAATCCCATGACATGCGCCACACACATCTAAAACAATTCCTGTTCTTAAAACCCCATTTAATTCATAACTAACAGTTTCATACAGATCGTATGACTTAAATCCTTCCTTCAGTCGTTCTAGCCATCGAGTTGTGTTCGCAGTTGCCAGTACATCTTTACCTTGATACTGATAAATTCCGTCTGATACCGTAAAATCTTCTATCGTTAGTCCTGACGCAGTATTGTTTGTTGATTCCCCATCCCAAGTTCCATATTCAGTTATATATACTTTTACGGAAGATACCTCTGCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017116|1219935:1228380|1224353_1224572_-|WP_013852777.1|DBSCAN-SWA MNDKNSVTIKKEKDGIEIKCNGTQNFLLNALVGLCKAIHEAGIPTELQILTILGSCEFTEKLEREGRVNEFH >NZ_CP017116|1219935:1228380|1226878_1227241_+|WP_013852770.1|DBSCAN-SWA MEKLKEYYIVEILDEKTVIVNFGINDGAKSKSLLKVYDARKEVIDPIAGISLGYRKITKTILRIQDTYEYFSICSIDNFKNEGSFILGSKPFSGTIFQDGFYDKDLSNNELRIGDQIEVI >NZ_CP017116|1219935:1228380|1221528_1221987_-|WP_062810477.1|DBSCAN-SWA MTLNNNQFERELGWDDEIQDDGEDFIILKPGNYDFVVKKFERGRFDGSEKMPACNMALVTITVEDPDTGRQVDVQNRILLHRKTEWTISAFFASLGMKKKGEKIKPQWNMIVAKVGKCKIKNREYNGNLYNEVDKFYRKEEEVVNQQASWGF >NZ_CP017116|1219935:1228380|1223086_1224367_-|WP_013852778.1|DBSCAN-SWA MNSIKINKLEIENVKRVRAVHVVPSEKGLTVLGGKNNQGKTSVLDSIAWALGGKKYQPSNPRREGSVTPPSLRVELSNGLIVERKGKNSDLKVIDPSGNKAGQTLLDSFIEELALDLPKFMEATSKEKARTLLEIIGVGDKLFELDTLENKLYQERLAIGKIADTKKKHAQEMPRHEGVPEELISASDLIKQQQDILARNAEKERKRRNLAHLEDENKRLKEILQDYQTKLEANENDLAEARKSAIDLHDESTAELEANIAKIDEINAKIRINLEKDQAEQEAEYYGQQYKDLNEEIDAIRKERLDLLKGADLPLPGLSVVDGELTFNDQHWDNMSGSEQLRVATAIVRKLKPECGFVLIDKLEQMDVDTMKEFGKWLEQEDLQAIATRVSSGDECQIIIEDGYVVGQESLPKENDLKVEEKGWEF >NZ_CP017116|1219935:1228380|1226335_1226752_+|WP_013852771.1|DBSCAN-SWA MATFSNRFKELRLSKKLTQKQIAQIFGLAESTISMYESGKREPNFDQLDEFADYFNVDLNYLLGQSNVTTNIEKGIHGKLQDDLEYFASKPELLELCKEINEKEQLHQLFNISKDLSPSDLETVLMIVKGIKKERGQD >NZ_CP017116|1219935:1228380|1219935_1221525_-|WP_013852781.1|DBSCAN-SWA MELRPYQESAKNAILNEWDKGIKRTLLVLPTGCGKTIVFSKVIEEKVREGKRGLVLAHRGELLEQASDKLYKASGLRTALEKAESTSLNSWERVVVGSVQTLMREKRLHQFSKEHFDFIVVDEAHHCISESYQTVLSYFENADVLGVTATPDRGDMKNLGKYFETLAYQYSLPQAIKEGYLSPIKALTIPLQLDLSSVSQQAGDFKASDIGTALDPYLYQIANEMAKHCQNRKTVVFLPLVVTSQKFRDILNEKGFRAAEVNGSSPDRTEILEDFENNRYNVLCNSMLLTEGWDSPAVDCIVVLRPTKVRSLYSQMVGRGTRLYPGKEELLLLDFLWHTERHDLVHPAHLIAENEEVAKAITKISEDNAGIALDIELLEEKAKEDVVSQREEALAEQLAQMRKRKRALVDPLQFELSIQAEDLSNYVPSFGWEMGPPTSKQLQQLEKAGILPDEIDNAGKASLLIDRINKRRDAGLATPKQIRLLERFDFQHVGSWSFEAANKMISRIAAQGWRQVPPGIEPRTYKPEF >NZ_CP017116|1219935:1228380|1224564_1225167_-|WP_062810478.1|DBSCAN-SWA MKKQNKKRTLTLAGKVILYGFILTLTYLTVQSLELAKKERKVLESKIQLINQEMGRLDKQQIENKTKIETIKHISNVGAEVSSVKVYITEYGTWDGESTNNTASGLTIEDFTVSDGIYQYQGKDVLATANTTRWLERLKEGFKSYDLYETVSYELNGVLRTGIVLDVCGACHGIEGEELQRIDVFTESPVIGKKEGKIYE >NZ_CP017116|1219935:1228380|1222004_1223084_-|WP_050921055.1|DBSCAN-SWA MNITKGKVINAQKVILYGPEGIGKSTFASMFPNPLFSDTEGSTMHLDVARFDKPTSWPMLLSQIEYVKQNKPCLTYIIDTADWAEKLAKEYLIGQYPKIKSIEDFGYGKGYTMLAEEWGRFLNKLQEVVDVGINVVILAHAMMRKFEQPQELGSYDRWELKLEKKTSPLTKEWADAVLFATYEIHVVNVDNQGAVKGKNKAQGGARVMFTSHNPAWDAKNRWGLADKLSFEFKEIALHIPDSLVDQIIETKQVVNEVNTHQKEVHQEATKENILTDTENEFGCLSQALQDLLKTDKVTKSELMHYIIDIKGHFPKGTPLENLPREYTDGALVANWPKVIQEIRNMREPVLDINSDDLPF >NZ_CP017116|1219935:1228380|1225708_1225963_-|WP_013852773.1|DBSCAN-SWA MPKRTDEEKMLFDDYIAVTTIQRYFSLSKIDAHDIFIKAKSWDEDNGYLDIFPERVRKGAVLQVLGLNLESMLMCYQIKKGEKS >NZ_CP017116|1219935:1228380|1227351_1228380_+|WP_062810479.1|DBSCAN-SWA MTNTQNEDLIIEECDIYDKPYKSFDEQIQHLEECYGLSMDGLSKKESLDLLRSISYYDLVNRTKDLFMENDHYRDEVNFSDLVLLSIFDKSFQNILFKYSLYAERKFKNILANVIASHKSFGVDHYSYLDASKYNPYRGKSITKTIEEITECINCGNNNYPTTHYVGNKNHIPPWILFKNVSFSTLIDLVHFLPDGMKTEVAKLLFPNTISTKDKVELLIPTLTIIRRFRNVIAHNYKFVTYKSGNYFLNHRIANQEFRGSMITPLESRKNIKKNNAYSMLLSLLLIVNESPIQMQMKIDFSTLFAQYSLKPKDMKIMKLYLSQINFPLNLIERFEKYCDKI >NZ_CP017116|1219935:1228380|1226000_1226207_-|WP_013852772.1|DBSCAN-SWA MKKELIGFRLRELRNEKGITREEVSIATGITLRAIEGYERGERVPRDEVKLKLADFYQKSVQEIFFDK >NZ_CP017116|1219935:1228380|1225214_1225595_+|WP_013852775.1|DBSCAN-SWA MKIIKVNSKFENLMALRLVIDTSNDIDGVLLLVSGIIIVGELNIQTEEILEPTSLYETAEYLKNHIDMENENVEWVGDGAIIGISNATIRYPDGQILKANDFVVLVSEIDAFTGVNIQEFLKQPSM |
12 | Paenibacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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