Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017259 | Formosa sp. Hel3_A1_48, complete genome | 0 crisprs | cas3,DEDDh,cas3HD | 0 | 0 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
134834 : 143601
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017259|134834:143601|DBSCAN-SWA TTTAATTGGATGTTTTGTTTTTCAGCGCTGCTTTAATAAAGGCCTTAAATAAAGGGTGTGGTTTGGCTACTGTGCTTTTATATTCAGGATGGTATTGAACCCCAACAAACCAACAGTGCTTGGGTATCTCTATAATTTCTACAAGACCAGTTTCGGCATTTATTCCTGTAGCAATCATTCCATTTGCCTCTATTTCGGATTTGTAGAAATTATTAAATTCGTATCGGTGTCTGTGCCGTTCGTTTATAGCATTTGATTTGTAAGCATCGTAAGCAATGGATGGCATTGATATCGTACAGCCCCATGACCCAAGGCGCATTGTACCTCCCATTTCCTCGATTTGCTTTTGGTCTTCCATCAAGTCAATTACAGGGTTTTCCGTAGAATCATTCATCTCAGATGAGTTGGCATCTTTGTGACCTAAAACTGTACGGGCAAATTCAATTACTGCCATTTGCATTCCTAAGCAAATACCGAAAAATGGAATATTATTCTCACGAACATACTTGATGGCTTCAATTTTACCCTCTATTCCACGTTCACCAAAACCTGGAGCTACCAGAACACCGTCTAAGTCTGAAAATAGCGCTGAGATATTTGCTGAGTTAATATGCTCTGAGTGGATGGACTTAACGTTAACTTTAACTTCATTTGCTGCGCCGGCGTGGGTAAATGCTTCAAGGATTGATTTGTACGAATCTTGCAACTCGACATATTTTCCAACTAAGCCAATAGTGATTTCATGTGTAGGATTTTTATGACGATGTAAAAAAGTATTCCAAGACGAAAGATCAGGCTGGTGGCGTTGGAGATTAAGTTGATTTAAAACAACTTTGTCTAAGCCTTCGTCAAGCATTAGATTTGGCACATCATATATCGTAGATGCGTCTATAGACTGAATTACGCATTCTTCTTTGACATTACAAAACCGAGCTAATTTAGTACGAATAGACTGACCAAGTTCATGTTCAGTACGACAAACCAAAATATCAGCTTGCACACCACTTTCCATAAGGGTCTTCACGCTGTGTTGCGTGGGTTTCGTTTTCAATTCTCCAGCTGCGGATAGGTAAGGAATAAGCGTTAAGTGAATGGCCAAAGCATTGTCATTACCCATTTCCCATTTTAGCTGGCGTACTGCTTCAACATAGGGTAGAGATTCTATATCGCCAACAGTTCCCCCAATTTCAGTGATGACTATATCGTAGTCGCCGGAAGATCCTAATAACTTAATTCGCTCTTTGATTTCGTCTGTAATATGCGGGATAACTTGTACTGTTTTACCAAGAAAAACACCCAATCGTTCTTTATCAATAACACTTTGATATATTCGCCCAGTGGTAACGTTGTTGGCTTGTGATGTAGATACATTTAAAAACCGCTCATAATGACCAAGGTCTAAATCTGTTTCTGCACCATCGTCAGTGACATAACATTCACCATGCTCATATGGATTTAATGTACCAGGGTCGATGTTGATGTAAGGATCGAGTTTTTGAATAGTGACACGGTAGCCTTGGGCTTGAAGAAGCTTCGCCAAAGATGCAGCTATTATGCCTTTGCCTAGTGATGAACTCACACCTCCAGTAACAAAGATGTATTTAGTTGTAGTTTGTGTCATTCTGCGCTTGTAAACGCAAACAAATTTACAAATAACTATTTAAATTTTACGAATAAAATTAAGTTGTTTGTGAACAATTTAGTTATTTAATTTTGTTAGCGACAAAAAATTAAAAAACAGAGCGAGTAAGCTATTTGATAGCAACTAACTCAACGTCAAAGATCAAATTAGCATTAGGAGGTATTACACCACCAGCACCTTGGCTTCCATAGGCCAACGCACTTGGAATAACAAACCTAGCTTTTTCGCCAACGTGAAGTAAAGCGATACCTTCATCCCATCCAGCAATTACCTGCCCGACTCCAAGAGTAAATTCAATGGGATCATTTCTTTTGTACGACGAATCAAAAACAGTTCCATCAGCTAATTGCCCTTTGTAATGCACAGATACTATATCGTTTTTATGAGCTTTTTTTCCTTCTCTTTGCTGTAAAATTTGATAGCGGAGACCACTTTCAGTTTTATTAAAACCGTTTGCTAATTTTTCAATTTGAGCCTCAATAGCAGCTTTTTCTTCATCAATCCTTTTAGCACGTGACCCCTCAAAAGTTCTAAAGGCCTCTATGGCGTTAAACGTTTCAGCCTCAGCACCAACTGCTAAAATCTCTAGAGAGTCTAAAGAATCGCCTTGTGCGATGCTGTCCACTACAGACTGGCCCTCAATGGTTTTACCAAAAACAGTATGTTTACCATCTAACCATGGTGTTGGAACGTGAGTAATGAAAAATTGACTACCATTAGTGCCAGGACCTGCATTAGCCATAGATAAAATTCCCGGTTGATTGTGCTTAAGCTCTGGGTGAAACTCATCATCGAATTTATAACCTGGATTACCCGTCCCGGTGCCCTGAGGACATCCACCTTGAATCATAAAGTCTGGAATAACACGGTGAAAATTTAAGCCGTTGTAATAAGGTTGACCTTGTTTTCTAACTGCATTTTCTAAGTTTCCTTGAGCGAGTGCAACAAAGTTACCTACTGTTCCAGGTGTTTTTTGATACTCTAAACTTACTAAGATTTCTCCTTTTGAAGTTGTGAATTTGGCATAAAGACCGTCTTGCATTTGTTTTAGATTTTTTGTTTAATTTTTAAAAAAGCAAATGTAAGGAGGTTTTAAAAAAGAAAGAAATTTATGAAAGATTAGTTGGCTACTTCACTAAAAAATTTGATTCGGTACAGACGGAGTTCCTCATCGTCATAATCCCCATCAAATTCTTCGATGGCAGCTTCAATATCGTCTGTATCAGATTCCATGAAGTACTCATGAATTTCTTCTTGCTGGTCTTCGTCCAATACCTCATCGACCCAATAATTAATATTCAACTTAGTTCCGGAAAAAACAATAGATTCTAATTCCTTTATAAACTCATTCATTTCCATTCCTTTAGCGGTAGAAATGTCTGTAAAAGGCAATTTTCGATCGATATTTTGAATAATATAAAGCTTTAAAGAAGAATTTGATCCCGTAGATTTAATAACCAAATCCTCGACTCTAGTAATGTCATTTTCCTTAACATATGCATCAATTAGGGCAACAAAATCTCGTCCGTAGCGCTTGGCCTTACCCTCACCAACTCCGTGAATATTTTGCAGCTCTTCAATGGATATTGGGTATTTGAGTGCCATATCTTCAAGTGATGGATCTTGAAAAATCGCAAATGGAGGTACTCCTATTATTTTTGCACTTGATTTTCTTAAATCTTTAAGCATGCGAAACAAAGTCTGATCAGTTTGGGTTTTTGGTAACTTACCATAGACCCCCGTCGATTGGTTAGAATAGTTGTGGTCCTCAGTCATTTTAAATGACTTTGGCGCTTTCAGATACTCAAGCCCGCTATTTAAAATTTTAACTACACCATATGATTCAATATCCTTTTTTAGTAGCCCTGATACCAAAACTTGCCTAACAAGAGCCATCCAATAATCAACGTCTTTGGATTTACCACAACCAAAAAAGGCTTGTTCATTAGTTTTATGTGATAAAATTAATGCATTCTCTTCACCAATAATTACCTTGACTAAATCTTTTATCTTGTATTTTTCTTTGGTTTGCTGCACTGTGTTAAGCAACAGAACAACATGATCTTTAGCTTCAACTTGGGGCTTAGGATAACGCGCATTGTCATCCATATCTCCTCCATCTCCGCTATAGTTGTCAAATTCTTCTCCGAAATAATGTAGAATAAATTTTCTTCGAGATATAGAAGTTTCGGCTAATGCCACCACTTCTTGGAGTAAAGCAAAACCAATTTCTTGCTCTGCTACGGGCTTACCCGACATGAATTTTTCTAATTTTTCAATATCTTTATATGCATAGTATGCAAGACAGTGTCCCTCACCCCCATCACGTCCAGCACGGCCCGTTTCTTGATAATAGCTTTCTATACTTTTTGGAATATCATGATGTATGACAAAGCGTACATCGGGTTTATCAATACCCATACCAAATGCAATTGTGGCGACTATAACATCTACATCTTCCATTAAAAACATATCTTGATGTTTTGATCGAGTTTTAGCATCTAGACCAGCATGATAAGGGAGTGCTTTTATTTGGTTGACTTGTAGAATCTGCGCTAATTCTTCAACTCGCTTTCTACTCAAACAATATACTATGCCGGATTTCCCTTCGTTTTGTTTAACAAAACGTATAATATCATTATCCACCTGACTAGTCTTGGGAACAATTTCATAATAAAGATTGGGTCGATTGAAGGAAGCTTTGAATGTCTTAGCGTCTGTAATTGATAAATTTTTAAGAATATCTTCTTGAACCTTGGGGGTTGCAGTTGCTGTCAATCCTATTATGGGAACATCATCGCCAATGTGCTGAACTATCTGTCTTAAATTTCGATATTCTGGCCTGAAGTCGTGCCCCCATTCACTAATGCAATGGGCTTCGTCAACAGCCATGAAGGAGATTTTTTGATTTCTTAAAAACTCCTTGTTGTCCTCCTTAGCTAATGATTCTGGTGCGACGTATAATAATTTTGTTGTACCAGCTTCAATATCGGACTTTACTTGTTTAATCTCGGTTTTGTTAAGCGAGGAATTAAGCACATGAGCAACACCTTGGCTTTCAGAGACCCCTCGAATGGCATCCACTTGATTCTTCATCAGCGCAATAAGAGGTGAAACAACAATGGCTGTACCGTCTTGCATAAGCGCCGGTAGTTGATAACACAACGATTTGCCGCCACCAGTTGGCATAATTGCAAATGTATGTTGGCGAGACATTATACTTTGAATAACTTGTTCTTGAAGCCCTTTAAACTGATTAAAGCCAAAATAATTTTTTAAAGCTTTGTGAAGATGTTCGGAAGATGTATTCATTAAAATATTTAAATCGGTAAATGGATCAACAGTATAATAAAAAGTTAACTTGTATTAAAAATAATGATTATCCACTAATTTTTTGTTTTTTTGCAATCCAATTCTAAGATAACTATATTTACTGTACTACACAATAAATTATGAAAACTTTAATATCTAAAAGCGTGATTATTGAAGCAGCAAAACGGTCTATTTCTGAACAAGGAGATGCAATAAAAAATATCGTTAATTTTCTCGACGATTCATTTGCTGAGGCTGTAGAACTAATTCTTAAATCAAATGGGCGTGTCATAATTACAGGGATTGGTAAAAGTGCAATTATTGCCAACAAAATCGTAGCTACACTAAACTCCACAGGAACACCTTCGATCTTTATGCATGCAGCTGACGCTATTCACGGAGATCTAGGCTTGGTACAAAAAAAGGATATTATTATTTGTATATCCAAAAGTGGAAATACACCTGAAATTAAAGTGCTAGTGCCCTTACTCAAACGAGCAGGAAACCCGCTGATTGCCATCACGGGAAATAAAAATTCATTTCTTGGAGAAGAATCTGATTTTATATTTAATTCCTATGTAGATAAAGAAGTTTGCCCAAATAACTTAGCACCAACAACAAGCACTACCGCTCAATTAGTAATTGGTGATGCTTTAGCGGTTTGTTTGTTACAAATGAGAGATTTTTCGAGCGATGATTTTGCAAAATACCACCCAGGTGGAGCGCTTGGAAAAAAGTTATTTCTTACCGTAAGAGACCTTGCCATGAATAATGAAAAACCAAATGTTGGACTAAATTCAAACATCAAAGACGTTATAATCGAAATTTCCGAGAAGCGACTTGGTGTAAGTGCAGTTGTAGAACAAAATAAAATTAAGGGAATAATTACGGATGGTGATTTAAGAAGAATGTTGGCAAAGACTGAAAACTTTACTAATTTATCCGCCATCGATATTATGACCAAGAACCCCAAGTCAATAGACATCAACGCCATGGCAGTAGATGCCATGCAATTGATGGAAAAACATGAAATCACTCAACTACTTGTTACGGATAACGAAATGTACGCTGGGGTCGTTCACCTTCATGACCTAATGAAAGAAGGAATATTGTAATCATGACACAGGAAAAAGAAATGTCATTCCTTGATCATCTTGAAGAACTAAGATGGCACATTATTCGTTCTACCATTGCTATTATTTCAGCAGCAACACTTGCCTTTTTAGGCAAAAGTTTTTTGTTTGATGTTATCATTTTCGGCCCCACAAAACCAGATTTTTTTACATACGACATGCTTTGCAATGCTTCAAATCTTATTGGCTATGACAGCTTTTGTGATACCGTTTTTGATTTTGAAGTTCAAAGCCGAACAATGGCTGGGCAATTTTCTGCTCACATATGGACGTCTATAACATTTGGTTTTATTTTGGCTTTCCCCTATGTATTGTATGAGTTTTGGAAATTTATAAGCCCAGGGCTTTATACAAAAGAACGCAAACACTCCAGAGGATTTTTATTTTTTTCATCGGTACTATTTTTTATTGGTGTTCTTTTTGGATATTATGTAATATGCCCGTTATCTATTAATTTCTTGGGGACTTACAGTGTAGCAAATCAAGTTCATAATGATTTTGATTTAAATTCTTATATCGGTCTTGTTCGGGCTTCGGTTTTAGCCTCAGGATTTATTTTTGAATTGCCTATCGTCATATACTTTTTAACCAAAATTGGTTTGGTTACACCAGCATTTTTAAAGAAAAACCGAAAATACGCCTTGGTAATTGTTCTCATTCTTGCGGCAATCATCACTCCGCCAGATGTCGCTAGTCAAATTATTGTTGCAATACCGGTTATAATACTTTATCAATTCAGTATTCTTATTTCAAAAATTGTCATTAAAAAACAAAAACGTCAATCATGAGCAATCCTGTAGAAGAATTCAATAGTTACAGAGAGAAAATGAACACTCATATTCTAGCTGACAACAATACTGTTATAAAACGTATTTTTAATTTGGACACAAAAGCCTTTCATGAAGGTGCATTAGATGTTCCTACAAAAGAGCTGTTAGGACTGGTTGCCTCTGCTGTTCTGCGTTGCGATGATTGTATAAAATACCACCTAGAGAAATGCCATAAAGAAGGTTTGTCAAGAGCACAAATAGTTGAAGCCTTGAGTATTTCCACGCTGATCGGGGGCACAATTATGATTCCGCATTTAAGGCGTGCATATGAATTTCTTGAAGCATTAGAAGCTTAAGCTAACAGATTTAATTATATTTACAATCGTAAAAGAAAACAATGAAGCTAAGTGTTCAAAACCTGATGAAATCCTACAGCGGCCGTAAAGTCGTTAAGGATGTTTCATTTGAAGTGAAACAAGGGGAAATTGTTGGCCTTTTAGGGCCTAACGGCGCTGGAAAGACCACTTCATTTTACATGACAGTTGGACTCATAAAGCCCAATGGTGGATCTATTTTTCTAGACAATAAAGAGATTACTAACTACCCAATGTACAAAAGAGCTCAAAGTGGAATTGGTTATCTTGCTCAAGAAGCTTCTGTATTTCGAAAACTAAGTATTGAGGATAATATTTTGAGCGTATTGCAAATGACCAAACTATCCAAAAAAGAGCAGCTTGAAAAAATGGAATCTCTTATTGAAGAATTTGGACTTTCCCATATTCGAAAAAACAGAGGTGATTTGCTTTCTGGCGGGGAACGACGTCGTACAGAAATAGCACGTGCTTTGGCAACAGACCCAAGCTTTATTCTTCTAGACGAGCCTTTTGCTGGGGTTGATCCTGTGGCTGTTGAAGATATCCAACGCATTGTAGCACGACTCACTGAAAAAAATATCGGCATTCTCATAACCGACCATAATGTTCAAGAAACCTTGGCAATTACCGACCGTACGTATCTTATGTTTGAAGGGAGTATTCTCAAAGCAGGGGATCCCGAAACTTTAGCTAGTGATGAAATGGTACGTAAAGTGTATTTAGGGCAAAATTTTGAATTAAGAAAAAAGAAATTAGAGTTTTAACCTTCCTTTTTTTTTCTGCTTTGAGCATTAATTATTTTTTTTTGATATCGCCCTTGTACAATATCTATAAGCACTAAAATAACAATGACAAAATAGAATGTTGTCTTGCTCATTGGTACAATTTCTTCACCGAAAAGCTTGAGGTGAGCCAAGTGACCTCCCTCTGTTAGTAACATAATACCCACTATAAATAGAATAAATAGACCCAAAACCTCATACATTCTATTTTTTGTCAAGAAATCTGTTACCTTTTCAGATAACCAAATCATCAACAACCCCCCAATAACTATAGCTGTAGTCATGATCCACAAAACATCTGTTAGCGCCATTGCACTAAGGATTGAATCAAAAGAAAAAACAACATTCATCACGACGATCATAGTTATGATTTTAGATACAGAGCTTTTAGATTCCGAGGAACTAACTGAGAAATCTTGAAAACTCACCATATGCCATATTTCTTTCATGGCTGTAAACACAATAAAAACACCCCCAATTAATACAATAATACTGTGTATATTAAAATGTCCTTCGATCACATTTTCAAATGGGATATGCAACACTGGATCTTGAAAGTAACCTATGAGTTTAACCAATACAAAAAGCAATACAATTCGAAAGATAATAGCCAATCCAATTCCCATTTTTCGGACATAGGATTGACGCTCAATGGGCGCTTTTTTACTTTCTAATGAGATGTACAATAAGTTGTCAAATCCCAATACAGCTTGAAGCATTACAAGCATCAGTAGGGTTATTATATTGTCAAGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017259|134834:143601|136584_137517_-|WP_069673850.1|DBSCAN-SWA MQDGLYAKFTTSKGEILVSLEYQKTPGTVGNFVALAQGNLENAVRKQGQPYYNGLNFHRVIPDFMIQGGCPQGTGTGNPGYKFDDEFHPELKHNQPGILSMANAGPGTNGSQFFITHVPTPWLDGKHTVFGKTIEGQSVVDSIAQGDSLDSLEILAVGAEAETFNAIEAFRTFEGSRAKRIDEEKAAIEAQIEKLANGFNKTESGLRYQILQQREGKKAHKNDIVSVHYKGQLADGTVFDSSYKRNDPIEFTLGVGQVIAGWDEGIALLHVGEKARFVIPSALAYGSQGAGGVIPPNANLIFDVELVAIK >NZ_CP017259|134834:143601|141704_142046_+|WP_069673854.1|DBSCAN-SWA MSNPVEEFNSYREKMNTHILADNNTVIKRIFNLDTKAFHEGALDVPTKELLGLVASAVLRCDDCIKYHLEKCHKEGLSRAQIVEALSISTLIGGTIMIPHLRRAYEFLEALEA >NZ_CP017259|134834:143601|137594_139787_-|WP_069673851.1|DBSCAN-SWA MNTSSEHLHKALKNYFGFNQFKGLQEQVIQSIMSRQHTFAIMPTGGGKSLCYQLPALMQDGTAIVVSPLIALMKNQVDAIRGVSESQGVAHVLNSSLNKTEIKQVKSDIEAGTTKLLYVAPESLAKEDNKEFLRNQKISFMAVDEAHCISEWGHDFRPEYRNLRQIVQHIGDDVPIIGLTATATPKVQEDILKNLSITDAKTFKASFNRPNLYYEIVPKTSQVDNDIIRFVKQNEGKSGIVYCLSRKRVEELAQILQVNQIKALPYHAGLDAKTRSKHQDMFLMEDVDVIVATIAFGMGIDKPDVRFVIHHDIPKSIESYYQETGRAGRDGGEGHCLAYYAYKDIEKLEKFMSGKPVAEQEIGFALLQEVVALAETSISRRKFILHYFGEEFDNYSGDGGDMDDNARYPKPQVEAKDHVVLLLNTVQQTKEKYKIKDLVKVIIGEENALILSHKTNEQAFFGCGKSKDVDYWMALVRQVLVSGLLKKDIESYGVVKILNSGLEYLKAPKSFKMTEDHNYSNQSTGVYGKLPKTQTDQTLFRMLKDLRKSSAKIIGVPPFAIFQDPSLEDMALKYPISIEELQNIHGVGEGKAKRYGRDFVALIDAYVKENDITRVEDLVIKSTGSNSSLKLYIIQNIDRKLPFTDISTAKGMEMNEFIKELESIVFSGTKLNINYWVDEVLDEDQQEEIHEYFMESDTDDIEAAIEEFDGDYDDEELRLYRIKFFSEVAN >NZ_CP017259|134834:143601|142087_142828_+|WP_069673855.1|DBSCAN-SWA MKLSVQNLMKSYSGRKVVKDVSFEVKQGEIVGLLGPNGAGKTTSFYMTVGLIKPNGGSIFLDNKEITNYPMYKRAQSGIGYLAQEASVFRKLSIEDNILSVLQMTKLSKKEQLEKMESLIEEFGLSHIRKNRGDLLSGGERRRTEIARALATDPSFILLDEPFAGVDPVAVEDIQRIVARLTEKNIGILITDHNVQETLAITDRTYLMFEGSILKAGDPETLASDEMVRKVYLGQNFELRKKKLEF >NZ_CP017259|134834:143601|139927_140902_+|WP_069673852.1|DBSCAN-SWA MKTLISKSVIIEAAKRSISEQGDAIKNIVNFLDDSFAEAVELILKSNGRVIITGIGKSAIIANKIVATLNSTGTPSIFMHAADAIHGDLGLVQKKDIIICISKSGNTPEIKVLVPLLKRAGNPLIAITGNKNSFLGEESDFIFNSYVDKEVCPNNLAPTTSTTAQLVIGDALAVCLLQMRDFSSDDFAKYHPGGALGKKLFLTVRDLAMNNEKPNVGLNSNIKDVIIEISEKRLGVSAVVEQNKIKGIITDGDLRRMLAKTENFTNLSAIDIMTKNPKSIDINAMAVDAMQLMEKHEITQLLVTDNEMYAGVVHLHDLMKEGIL >NZ_CP017259|134834:143601|142824_143601_-|WP_069673856.1|DBSCAN-SWA MLDNIITLLMLVMLQAVLGFDNLLYISLESKKAPIERQSYVRKMGIGLAIIFRIVLLFVLVKLIGYFQDPVLHIPFENVIEGHFNIHSIIVLIGGVFIVFTAMKEIWHMVSFQDFSVSSSESKSSVSKIITMIVVMNVVFSFDSILSAMALTDVLWIMTTAIVIGGLLMIWLSEKVTDFLTKNRMYEVLGLFILFIVGIMLLTEGGHLAHLKLFGEEIVPMSKTTFYFVIVILVLIDIVQGRYQKKIINAQSRKKKEG >NZ_CP017259|134834:143601|140904_141708_+|WP_069673853.1|DBSCAN-SWA MTQEKEMSFLDHLEELRWHIIRSTIAIISAATLAFLGKSFLFDVIIFGPTKPDFFTYDMLCNASNLIGYDSFCDTVFDFEVQSRTMAGQFSAHIWTSITFGFILAFPYVLYEFWKFISPGLYTKERKHSRGFLFFSSVLFFIGVLFGYYVICPLSINFLGTYSVANQVHNDFDLNSYIGLVRASVLASGFIFELPIVIYFLTKIGLVTPAFLKKNRKYALVIVLILAAIITPPDVASQIIVAIPVIILYQFSILISKIVIKKQKRQS >NZ_CP017259|134834:143601|134834_136454_-|WP_069673849.1|DBSCAN-SWA MTQTTTKYIFVTGGVSSSLGKGIIAASLAKLLQAQGYRVTIQKLDPYINIDPGTLNPYEHGECYVTDDGAETDLDLGHYERFLNVSTSQANNVTTGRIYQSVIDKERLGVFLGKTVQVIPHITDEIKERIKLLGSSGDYDIVITEIGGTVGDIESLPYVEAVRQLKWEMGNDNALAIHLTLIPYLSAAGELKTKPTQHSVKTLMESGVQADILVCRTEHELGQSIRTKLARFCNVKEECVIQSIDASTIYDVPNLMLDEGLDKVVLNQLNLQRHQPDLSSWNTFLHRHKNPTHEITIGLVGKYVELQDSYKSILEAFTHAGAANEVKVNVKSIHSEHINSANISALFSDLDGVLVAPGFGERGIEGKIEAIKYVRENNIPFFGICLGMQMAVIEFARTVLGHKDANSSEMNDSTENPVIDLMEDQKQIEEMGGTMRLGSWGCTISMPSIAYDAYKSNAINERHRHRYEFNNFYKSEIEANGMIATGINAETGLVEIIEIPKHCWFVGVQYHPEYKSTVAKPHPLFKAFIKAALKNKTSN |
8 | Only_Syngen_Nebraska_virus(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
1686920 : 1698530
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017259|1686920:1698530|DBSCAN-SWA 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CAGCGTATTGGATATAATTTTATTTACCCAGGTGCGGGCTATGGAGGTTCTTGTTTCCCAAAAGATGTAAAAGCACTGACTAAAATTGCTAAAGAACATAATTATAATGCAAAATTAATAACTTCGGTTGAAGAAGTAAATGATTCCCAGAAATTAGTCATTGCTCAAAAAATAGTGAAACGTTTTGGAGAAGATTTAACCGGCTTTACTTACGGTATTTGGGGATTGGCCTTTAAACCAGGGACTGATGATATGCGTGAAGCACCAGCCATTTATGTAATTAAAGAATTGGTAAGTAGAGGTGCTAAAATAATAGCATACGACCCAAAGGCGATAAATGAGGCAAAAGAGCACTACCTCAAAGGAGTTCAAAACATAACCTATGTAACCTCGAAGTATGATGTTTTAAAAGGCTCAGATGCACTTGTTTTGCTTACTGAGTGGAAAGAGTTTCGTTCTCCCGATTTTGAAGAAATTAAAGCACAATTAAAAACTCCGGTTATTTTTGATGGCAGAAATCAATATAATACATTTAACTTAGAAGAAAAAGGATTTAAATATCATCAAATAGGAAAAAAATAGATGAAAATATTAATTACTGGCGCTGCAGGCTTTATTGGCTATCATCTTTGTGAAGCTATCCTAAAATCAGGTCATAATGTCGTAGGGCTGGATAATATCAATGACTATTATGATGTGAATCTTAAATATGCGCGTTTACAGCTGTTAGGCATAGAGCGTAATGATGCTAAGGTTTTTAATGTTATTTCTAGTAGCACGACATACGGTTCTAAAATGCAGTTTATACGTGTGAATTTAGAAGACCGCGAAGCACTTCCAAAACTATTTAAAGAATTTAAGTTTGATATGGTTTGTAACCTTGCAGCTCAGGCAGGGGTGCGCTACTCATTAGAAAATCCTGAGGCCTATATAGATTCTAATATTAATGGCTTTTTAAATATTTTAGAGTGCTGCAGACATCACAGTGTAAAACGTCTTGTTTATGCTTCGAGTTCTAGTGTTTATGGAAATAGTTATGAGGTTCCTTTTAAAGAATCAGCTAATGTAGACAAGCCCATAAGTTTATATGCAGCAACTAAAAAGTCCAACGAACTAATGGCATATACTTATGCACATTTATATGGTATTGAAACCATAGGTCTACGTTTTTTTACTGTTTATGGCCCTTGGGGACGACCGGACATGGCTATGTTTTTATTTACAGAAGCCATTATCAACAATGAACCTATTAAAGTTTTTAATAATGGCGATTTATCTAGAGATTTCACCTTTATTGATGATATAGTTGCAGGAGTTGTCAACAATTTATTAGAAGATTCGAATAATTTATCTCTATACAAACTATATAATATTGGTAATAGTACTCCAGTGAAGCTTATGGATTTTATTAAATCTATTGAAAGAAAACTTGGATTAGAGGCTCATAAACAATTTCTACCAATGCAAGCTGGGGATGTAAACCAGACATGGGCTGATGTAAGTCAGTTGCAAAAAGATTATGATTATAAACCTCTTACTTCAGTTGATGATGGGGTAGGTGCTTTTGTGGATTGGTACAAATTCTATTATAAACTAGATAAAAGTTTTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017259|1686920:1698530|1695755_1696172_+|WP_069675102.1|DBSCAN-SWA MRVGITFSTFDLLHAGHIKMLEEAKTQCDYLIVGLQLDPSLNRAEKNAPTQTITERYIQLKGCKHVDEIVPYVSEQDLEDILRSFKLDVRIIGEEYRDKPFTGREYCQTKGIELYFNTRDHRFSSSGLRKQVKIAEDK >NZ_CP017259|1686920:1698530|1689250_1690291_+|WP_069675096.1|DBSCAN-SWA MKTNKTILVTGAAGFIGFHLAKALIKQGYTVVGLDNINAYYDVHLKYARLNELGIDRAEAEVFNALCSSRSHGLQMQFIRMNLEDRNALPKLFKELKFDMVCNLAAQPGVRYSLENPEAYIDSNINGFLNILECCRHHNVKRLVYASSSSVYGNSATVPFDESANVDKPISLYAATKKSNELMAHTYAHLYGIETIGLRFFTVYGPWGRPDMAMFLFTDAIINNRPIKVFNKGKLSRDFTYIDDIVSGVVNTLLADAKNSALYKLYNIGNSAPVELMDFIQAIESKLGVEAQKQMLPMQPGDVNQTWADVRALQNDYNYTPNTSVVDGVAAFVEWYQSYYKTKDGV >NZ_CP017259|1686920:1698530|1686920_1687340_+|WP_069675093.1|DBSCAN-SWA MTKKIGITFSTFDLLHAGHVKMLEEAKTQCDYLIVGLQLDPSLDRAEKNAPSQSITERYIQLKGCKFVDEIVPYVSEQDLEDILRAFKLDVRIIGDEYKDKAFTGRDYCETKGIELYFNTRDHRFSSSGLRKQVKTAKN >NZ_CP017259|1686920:1698530|1691374_1692253_+|WP_069675098.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGSGTRLYPITLGTSKQLLPVYDKPMIYYPLSVLMLAGIKEILIISSPEDLPNFERMLGSGAQLGISLSYKEQASPDGIAQAFLLGEEFIAGDDVCLVLGDNVFNGHGFSKLLDKAVANVSNDNMATIFGYYMSDAKRYGVVEFDSEGKAISIEEKPEHPKGNHAVTGLYFYPNSVVEIAKNIKPSKRGELEITTVNQEFLKRGALKVELMGRAFAWLDTGTHESLIEASNYIKAIETRQGLKVACLEVIAFQMGYINKAQLLKLAEPLKKSGYGQYLIQRAKEF >NZ_CP017259|1686920:1698530|1693327_1695175_+|WP_069675100.1|DBSCAN-SWA MCGIVGYIGHRAAQPIILKGLQRLEYRGYDSAGIALFDGARIRLSKTKGKVSDLQEKINSDHNNVGNIGIGHTRWATHGVPNDTNAHPHYSNSGDLVIIHNGIIENYASIKKELSKRGYTFQSDTDTEVLVNLIEDVQKNGGFKLGKAVQIALNQVVGAYAIAVIDIKKPNEIVAARLGSPLAIGVGENEYFIASDASPFIEYTNDAIYLEDEELAIIRLHKETKIRKIKDDSLVSPYIQQLKLNIDQIEKGGYAHFMLKEIFEQPQAIKDTYRGRLLVNQGLIKMAGVEDNLEKFINAQKITIVACGTSWHAGLVAEYIFEDLARIPVEVEYASEFRYRNPVISAKDIVVAISQSGETADTLAAIKLAKAQGAFVFGVCNVVGSSISRETDAGAYTHAGPEIGVASTKAFTTQITVLTMMALRLAKAKGTISNSDYKRHLVELETTPTKVEQALKSDALSKQIAAVYKDVPNALYLGRGFNFPVALEGALKLKEISYIHAEGYPAAEMKHGPIALIDEHMPIVVIATKYGHYEKIVSNIQEIKSRKGKIIGIVTKGDTEVKALADHVIEVPETLELLSPLVTTIPLQLLSYYIAVLLEKNVDQPRNLAKSVTVE >NZ_CP017259|1686920:1698530|1697501_1698530_+|WP_069675104.1|DBSCAN-SWA MKILITGAAGFIGYHLCEAILKSGHNVVGLDNINDYYDVNLKYARLQLLGIERNDAKVFNVISSSTTYGSKMQFIRVNLEDREALPKLFKEFKFDMVCNLAAQAGVRYSLENPEAYIDSNINGFLNILECCRHHSVKRLVYASSSSVYGNSYEVPFKESANVDKPISLYAATKKSNELMAYTYAHLYGIETIGLRFFTVYGPWGRPDMAMFLFTEAIINNEPIKVFNNGDLSRDFTFIDDIVAGVVNNLLEDSNNLSLYKLYNIGNSTPVKLMDFIKSIERKLGLEAHKQFLPMQAGDVNQTWADVSQLQKDYDYKPLTSVDDGVGAFVDWYKFYYKLDKSF >NZ_CP017259|1686920:1698530|1687856_1689251_+|WP_069675095.1|DBSCAN-SWA MNIKSICCIGAGYVGGPTMAVIAQKNPDIKVTVVDLNAQRIADWNHTDLKKLPIYEPGLDEVVAEARGRNLFFSTEVDKAIDAAELIFISVNTPTKNYGAGKGMAADLKYVELCARQIAKVATSDKIVVEKSTLPVKTAEAIQNILDHTGNGVDFQILSNPEFLAEGTAMRDLAVPDRVLIGGDSSSSKGQQAIQALVDIYSSWVPKENILTTNVWSSELSKLTANAFLAQRVSSINALSELCEATGADVQEVAKAIGMDSRIGPKFLQASVGFGGSCFQKDILNLVYIAKSLGLDEVADYWHHVILMNNHQRDRFAKNIIKTLYSTVNGKTIAFLGWAFKKDTNDTRESAAIYVADLLMDEQATIKVFDPKVTATQMQADLNYLNTRPEDENATYLKTERDPYAALEGAHALAVLTEWDEFKTYDWQRIYNKMQKPAFVFDGRNVLDRAALETIGFIYKGIGS >NZ_CP017259|1686920:1698530|1692286_1693288_+|WP_069675099.1|DBSCAN-SWA MKKKILVTGGAGYIGSHTVVELFKSGYLPIIVDNMCNTSERNLSGINKILNTELPFHNVDCTDLKQMERIYALYEDIHACIHFAAYKSVEDSVKYPEKYYKNNIGSLETLLKCFEQAKFKNLIFSSSCTVYGMPDKLPVDERAPFKKAESPYGETKQKCELLIQNNNCNSVSLRYFNPIGSHESGLIGDCSSDNASNLVPIVAEVAAGLRAKLTVNGNDYDTHDGTCVRDYIHVQDLAIAHVKALDYLLEHEVKEVFNVGTGHGLSVLDIVTAFEASNNLKLKYAIGDRRAGDVEKIYADGAKIKKVLGWKAVRTTEEALIAAWNWQKSTQDA >NZ_CP017259|1686920:1698530|1687342_1687828_+|WP_083236583.1|DBSCAN-SWA MDKQFFNGIRVELESLGFKITAADLERPWGAFYYIDERQAQAFADHFFSGLDVEDLRIEGKLSPKILMVKPNVKLSWQYHNRRAEIWQVYKGTVGVVQSETDAENEMQTYRSGAQIKLNQGVRHRLVGLDDFGVVAEIWQHTDAVPSDEEDIIRVQDDFGR >NZ_CP017259|1686920:1698530|1690316_1691378_+|WP_069675097.1|DBSCAN-SWA MTKTKNILITGGAGFIGAHVVRRFVIKYSDYHIYNLDALTYAGNLENLTDIEAKDNYSFLHGDITDQAYINTIFKQYKFDAVIHLAAESHVDRSITDPLAFAKTNILGTMVLLNAFKALHKNNWAGKRFYHISTDEVYGSLGESGLFEESTPYDPNSPYSASKASSDHFVRAYGETYGLPYVITHCSNNYGPYQFPEKLIPLFINNILDDKPLPVYGDGNYTRDWLYVVDHAIAIDLVFHKGENHETYTIGGFNEWKNIDLVKVLCKQMDEKLNRVSGTSEKLITYVKDRPGHDLRYAIDAAKINKELGWNPTVTFEEGLSKTIDWYLNNKQWLSSVSSGNYQDYYKKQYAKL >NZ_CP017259|1686920:1698530|1696175_1697501_+|WP_069675103.1|DBSCAN-SWA MNITVIGSGYVGLVSGTCFSEMGNKVTCVDIDPVKIEKLNQGIIPIFEPGLEKMVLKNVKNKNLFFTTELDKALQNSEIAFIAVGTPMGDDGSADLQYVLAVAKSIGQLMQKRLIVVDKSTVPIGTTDKVKATIQKELDARGVDLEFDVVSNPEFLKEGAAINDFMKPDRVVIGTDSEYAREKMKQLYHPFCMSRDRFISMDIRSAEMTKYAANAMLATKISFMNEIANICEKVGADANQVRIGIGSDQRIGYNFIYPGAGYGGSCFPKDVKALTKIAKEHNYNAKLITSVEEVNDSQKLVIAQKIVKRFGEDLTGFTYGIWGLAFKPGTDDMREAPAIYVIKELVSRGAKIIAYDPKAINEAKEHYLKGVQNITYVTSKYDVLKGSDALVLLTEWKEFRSPDFEEIKAQLKTPVIFDGRNQYNTFNLEEKGFKYHQIGKK >NZ_CP017259|1686920:1698530|1695263_1695752_+|WP_069675101.1|DBSCAN-SWA MSSEVYNTIQNEIESLGFRVVSKDFERPWGAFLVIDEDQAQAFSNQFFEGIDVDHLKIEGKLSPKILIVKPGARLSWQYHHRRAEIWQVYRGEVGIIRSDTDDQGDVVTYSEGDQVKLQQGERHRLIGLKDYGIVAEIWQHTDSVPSDEDDIVRVQDDFKRE |
12 | uncultured_virus(20.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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