Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020029 | Lactobacillus helveticus strain D75, complete genome | 5 crisprs | cas14k,csa3,Cas14u_CAS-V,cas14j,DEDDh,cas3,DinG,cas2,cas1,cas4,cas5,cas7,cas8b2,cas6 | 4 | 7 | 12 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020029_1 | 457964-458146 | TypeV |
NA
Consensus repeat of NZ_CP020029_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP020029_1
>1.1|457988|60|NZ_CP020029|PILER-CR CCTCCTCTGATTGGTCCATTGGAGCAGTGGTTTATCTCGCCTCCCTGTCACGGAGGAGAT >1.2|458072|55|NZ_CP020029|PILER-CR GGACCGTTTATGGCGGAATTGGTGAAGGGGTTAACACACTGGTTTGTGGATCCAG |
cas14k |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020029_1
The CRISPR arrays of NZ_CP020029_1 >merge|NZ_CP020029|1|457964-458146|PILER-CR CGCGCGTGGGTTCAAATCCCACATCCTCCTCTGATTGGTCCATTGGAGCAGTGGTTTATCTCGCCTCCCTGTCACGGAGGAGATCGTGGGTTCAAATCCCACATGGACCGTTTATGGCGGAATTGGTGAAGGGGTTAACACACTGGTTTGTGGATCCAGCATGCGTGGGTTCGAATCCCACAT >NZ_CP020029|1|1|457964-458146|PILER-CR CGCGCGTGGGTTCAAATCCCACAT CCTCCTCTGATTGGTCCATTGGAGCAGTGGTTTATCTCGCCTCCCTGTCACGGAGGAGAT CGTGGGTTCAAATCCCACATGGAC CGTTTATGGCGGAATTGGTGAAGGGGTTAACACACTGGTTTGTGGATCCAGCATG CGTGGGTTCGAATCCCACAT
>NZ_CP020029.1|WP_065866835.1|456239_457565_+|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MRKKIVPRNKAKYEHLASEYLVAGNSKLDQCSHASHDLYNRALYDLRQGFFKRNYVKGYCDLDQRFKKRYSARESMLYHSLFYVQSAQQTLKEVNTIWSAWLKALKAYQANPGKFTGRPRMPKYLAKGQRHVFFVTNQNAKVKDDYLIIPKLGFKLKITPQVKAIQRVAFKPVYGGYKAIVQYKTNRDIDYLPDNGRYMGIDPGVDNAFACVANIQKAPLLVNGRAIKSVNQYYNKERSRLKALQARYHQLESIVDTQQGKKPVYRETKAMRRITAWRNRKIRQFAHKASKRIVDYALSCGANTIVIGNNKSWKRSSDMGRKNNQNFIGIPHKVMIDMIQYKANLAGISVIRTNESYTSQTSALDHEKPCWENGSQSRKRQGKTPINRRIHRGLFQSNNGRLVNADINGALQIIRKVFPKFSSDEGIEDAVLHPVKWSPLI >NZ_CP020029.1|WP_003627960.1|455601_456210_+|IS607-family-transposase MKAGKVMDLLQISRSTLKRYREKGILEAKKLPTGQYDFDDDSVFLLKNKHSKRLTVLYGRVSTYKQKADLANQMQELSDFAQSKGFQANDSFQDIASGISFKNRKQFFKMLDLILAGKVKRVIITRKDRLSRVGFELFEYLFQNYGTEIDVISDEMNPKTDEQELFEEIISLLHCFSMREYSHRRAERKLFEATLNQKEKTK >NZ_CP020029.1|WP_065866858.1|454998_455499_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIIKPLISEDEAKETSRLFQKCWQNTYKDILPDVFLDNIPENAWGKRLNESGRHNLIFIDDDNKIRAAVSYGRPRDTRMLGCGELMALYVEPDFQGFNIGKTLLNAAENELKKMGYGKIYLWCIDGDENARQFFEHFGWVNNATEKFVEIAGKEYKYLLYSHKLLV >NZ_CP020029.1|WP_023190958.1|453243_453633_+|hypothetical-protein MLTVNYRSVIENDLVNYTQGIESYFRNERLTLRDKINKFIEELPESYRELLSEHVGNTDDWIGKLVSTRVFLTHGDRENMAVSNPYKLVQMTKIFGFMVRIFILQKLGITIDKPKILNKFKNVLTTHYY >NZ_CP020029.1|WP_012211526.1|452780_452981_-|cold-shock-protein MQTGTVKWFNADKGFGFITGSDNKDVFVHFSAIKTDGFKSLEEGQKVSYDVEQGSRGPQATNVVPQ >NZ_CP020029.1|WP_065866930.1|449930_450716_-|carbon-nitrogen-family-hydrolase MKIKVALAQFNIQFADPDKNQQRVAELTSIAAKAGADVIVFPEMWNIGYALNQLDRLADDGGRTTTKLFYRLARQYQISIVGGSVAVKEGGQFYNRTLIVDPLGQVVGKYDKVHLFRLMNEHRYLTAGNQENYFRLAGVPSASFICYDLRFPEWIRTVARHGSAVLYFPAEWPAVRIPQWTTMLKARAIENQAFVVAVNRVGDDPDNHYNGHSLAIDPLGNVIADAGENDGITYAELDLTQLATVRGAIPVFVDRRPDLYK >NZ_CP020029.1|WP_065866857.1|448731_449910_-|pyridoxal-phosphate-dependent-aminotransferase MEFQQSKLLGRLPKQFFASLVAKVNHKIESGVDVINLGQGNPDKPTPEYIVKATQKWVADPATHKYSPFQGLPEFKQAAADFYAEKYGAHFDPEKEVAILGGSKIGLVELPWALMNPGDTYLLPDPGYPDYFSGAALGGVKFETVPLLAKNNFLPDLKAIPEAVAQRAKFFYLNYPNNPTGAVATKKFYEELVSWAKKYHVGIISDFAYGALGFDGQAPRSFMQTPGAKDVGIEFYTFSKTFNMAGWRIAFAVGNQDIIGALNLIQDHLFVSLFPALQRAAIDALQGSQRDAEIAKIVGRYEERRNAFVDAAEKIGWHAFVPKGTFYAWMPVPAGYTSESFADLLLDKAGVAVAPGNGFGKHGEGYVRIGLLIEQARLKEAVARIAKLHLFD >NZ_CP020029.1|WP_065866856.1|447750_448713_-|ketopantoate-reductase-family-protein MTLKYTVLGAGAMGLRFGVLLQELAGAKVDFVDNWAPEVKTIQQQGGVYVSRDHEDRHLVPIKIYSPEDYQGDPDVFIVFAKQMTLADLLKRSAHFFHPDHQYVFSGMNGMGHIEKINQYFPKEHVVAGTCLIGTVLNKAGDVDFIGKSGAGSINMAAQAEKADDRVKQIVADFTAANINPHLNNNFLGTLLTKVVFNSVINTICTLFEIQMGQFIDYDGSEKLGKQLINEAYDVAERAGIQLLSTREEEWQTIKYVSSVTNPLHYPSMYQDMSKDRPTEVDYINGYIYQLGKKYNYEASTHDFLRNLVHLAENTRKFRK >NZ_CP020029.1|WP_003626890.1|444911_446264_+|23S-rRNA-(uracil(1939)-C(5))-methyltransferase-RlmD MEKNQIIDLEITDLSYEAMGVAHYNGMTVFVTNALPGEVVSAKILKVKKNFAFAKIEKIKKESPDRVNVKLNQGVQSGLASLAHIKYDKQLDFKRNQVVNLLKKAHLENIEVGETLASPEEVGYRNKAQVPVREVNGQLEIGFFRRHSHDLMPLTHFFTTDPEIDRVLVAVRDILRKYKVPAYDEINNNGEVRYLEVRRSKSTGEMMVILVCLHKDFMQLPNVAAEVSQIPGVSGLILNHNPKKTNVILGPKDYLVFGNDQITDQIGDLKFRISPQSFFQINSLQTPRLYNLAIKQADLKPDDVVIDAYSGIGTIGLSVAKHVKAVRGIEVVRDAIKDAKDNAKLNDITNAKYYLGKAEEIMPRWAKSGLKTDVVFVDPPRKGLTPEFINAAVKTGPKKIVYISCNPATLVRDLQLFQEKSYEFNRIDPVDMFPQTPHVESVTVLERTEK >NZ_CP020029.1|WP_046813923.1|443170_444547_-|Na+/H+-antiporter-NhaC MKKEKVSFTESIIILIALLAILGISVIKFGLSPEVPVLFTVLLLTFWARFRGFTWKDVQDGIKEGIGVAIIPIFIFILIGALIGLWIKAGIIPSIMVLGFHLISGSFFVPSVFIACAIVGVAIGSGFTTISTVGIALFGIGASMNANLALVAGAIISGAVFGDKMSPLSDSTNLSSAVAESELFAHIKNMMWSTIPSFIVSLILFWILGNSGHMDPTKIERTSHVLQTNFSISWWAVVPIVFMLLCAWRKVPAIPTLFINIAATVIMIFVQNPHESVQSLNNLIMNGFVAKTSDASVNALLTRGGISSMMATVALIISTLSLGGMLMKFNVVQSAMEPLVKHLRKPGRLITVTILSGICINLFVGEQYLSVILPGRAFKPAFDKIKLSPLALSRVLEDGGSVINYLIPWGVAGSFAATTLGVPVLQFLPFVFFSLLSPVFSIISGFTGIGLKWAKDKK >NZ_CP020029.1|WP_060471716.1|462056_462293_-|hypothetical-protein MENIEPMDILREPTPEEETLATILRWVKDSHDNKENKTTTIVFKKNTPQKILKSFQRNTDLFVAITDYTINKQYEIEN >NZ_CP020029.1|WP_079227754.1|462458_462995_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MILDSKPARWGTKAYRDAKDLYMKAFPAWERFSMFSLLAMSLHRNVKFHAIYNEDQFCGITYYAENDKTVYLTYLAINEELRGQGYGSKILTMLEDRFPDKQIVIDIEPVTSKAKNYKQRVSRLKFYERNGFHRTDQKLKDPDGKFEALTTGKKLDKESFMDTLRQMSFGFYQAKVEK >NZ_CP020029.1|WP_012211430.1|463183_464461_+|ISL3-family-transposase MSSLNHCIKFELDVKDENIVFKDYFYKSIKLQKHKIYEAELIQPACPFCGSLDLLHNGHLITNIHYPTANASLPVIIRLAKQRVKCRDCERWSMAQSELVNKYCSISNASKLKVLSALTEDRSMTSIARENNVSINTVQRVLGNCSHRFIDSCEYLPAHLAFDEFKGVDRQLHFICLDGDSHQVVQILRTRYKKNLLKYFGRFSPQARANVRTVTMDLNFYYQDIVRACFPNAQIVIDRFHMIQMLTRSFNSLRVKVMKTFDKRSRQYQLLKSPWKLYLKKFDELEKVHPRYNWHYKDCLTQAQVVTEGINANTALENSYNLMQDFIQAIETGNTQKLKSLINCKDQIGTLMHKTLLTFKYNLTAVLNGAELPYSNGCLEGFNRKIKQIERTAFGYSSFTNLLTRIRLEENLYKEKEPNSLLMVA >NZ_CP020029.1|WP_012211358.1|466499_467678_+|IS256-family-transposase MNDFTKNMAQALFNQDKINDLLRKELQQAVNDLLEAELTAFLGYDPYARTGWNTGNSRNGAYFRKVDTQFGEIEIQVPRDRNGMFHQHTLPDYKQHSDVLESMIIKLYSKGVTTREIADLIEKMYGSHYSPAQVSNISKQMIPKVEAYHQRKLSDKFFCVYLDATYIPLRRITFDREAVYIAIGIKPNGHKEVIDYRIAPSENVENWTEMLQDMKSRGLEQVELFLSDGVVGMKTALEQTYPKAHFQRCLVHVMRNICAKVRVDDRETIMNEFKQIHQQPNKEAAIKVLHAFYDKWNRAYNHVIRNLKEIEPDLLVFYDYPKQIRASIYSTNMIESFNNVIKRKAKPKAEFPTEQSLDTFIGIQAMSYNERYFNRIHKGFGQVQDTLESYFD >NZ_CP020029.1|WP_065866861.1|468320_469397_+|cell-surface-protein MKKRVISLTAITLLAVSPIIATAIPVLAVDVTSQITTNTIASSESPVLTYNGKTFDHDQDITDIMANTKFSQVIPADNIKFTQNLKSAFSAVASSKDSTKVNVSVYTGGINWNIAGKYPVEVSATNKAGKMTKLTFTVIVGNQGKDAQYAVAQPQIKGNVTLYTIRDNKVVHDSYGAFVLHGGTTVATFGTVEINGISYTRLNGPDSDLFIETKSVDGTYPESATNEDGQAKTVTKTLMHTAIAYNSDGHSTGKKYYAYRQLTLSAVKKNIKGSMYYNVQGTGDYIKVGNIDGTMRTLTRNSYIYATSKRRADRTLLRKGDTITTYGGSYKFKNGKRYYRIEGATSTNKRYVKVVNFE >NZ_CP020029.1|WP_012211358.1|469635_470814_+|IS256-family-transposase MNDFTKNMAQALFNQDKINDLLRKELQQAVNDLLEAELTAFLGYDPYARTGWNTGNSRNGAYFRKVDTQFGEIEIQVPRDRNGMFHQHTLPDYKQHSDVLESMIIKLYSKGVTTREIADLIEKMYGSHYSPAQVSNISKQMIPKVEAYHQRKLSDKFFCVYLDATYIPLRRITFDREAVYIAIGIKPNGHKEVIDYRIAPSENVENWTEMLQDMKSRGLEQVELFLSDGVVGMKTALEQTYPKAHFQRCLVHVMRNICAKVRVDDRETIMNEFKQIHQQPNKEAAIKVLHAFYDKWNRAYNHVIRNLKEIEPDLLVFYDYPKQIRASIYSTNMIESFNNVIKRKAKPKAEFPTEQSLDTFIGIQAMSYNERYFNRIHKGFGQVQDTLESYFD >NZ_CP020029.1|WP_065866862.1|473220_474549_-|uracil-permease MSKKENFRNPDAILDVYEKPEFGQGVLLSLQHTFAMFGSTVLVPILIGINPSIALLSSGIGTLVHMILTHFKIPAYLGSSFAFIATMQALMKADGYPAVAQGAIASGLVYVMVALIIAKVGSGWVNKVLPPIVVGPIIIVIGLSLATTAANDAMMNNQKYDLTYFGVAIFTLVMTLVFQMCFKGFTSLVSIMLGIICGYVLACFLGIVDFSGVEKAAWFSIPSLDVMGISYHFKWYPAAILAMAPIAFVTMTEHMGHIMVLNSLTKRNFFKNPGLHRTMMGDGISTIIAGFIGGPPTTSYGENIGVLAMTKVHSVWVLAGAAVCAIIFSFVGKLAALIESIPMPVIGGISFLLFGTIASNGLKILVDDNVDFGEKRNMLIASVILVIGIGGAYLQLGNFQLTSVALSTIIGMILNWVLPKKAASEKALEEKNKQKQDGKIYQ >NZ_CP020029.1|WP_020829065.1|474561_475092_-|bifunctional-pyr-operon-transcriptional-regulator/uracil-phosphoribosyltransferase-PyrR MAKEIIDAIGMKRALMRMTYEIVERNKGTENLVLVGIKTRGLYLAQRIAANLKKLEDVEISVGAIDVLQYRDDLPESKKEKMIHNQQLDFDITDKNVVLVDDVLFTGRTIRAALDALMDQGRPAKINLAVLVDRGHRELPIRPDFIGKNIPTAMNEEVKVSMTEVDDKDSIELINK >NZ_CP020029.1|WP_065866863.1|475377_476847_+|MFS-transporter MNKKQLFMVTLALLLANIMSGLDATIINTAIPAIVSDLHGIQYMGWIVACFLLGMSVSVPIWGKLGERMGNKFAFELSLALFILGSLLEGIALDIYFFLIARILMGVGAGGMGSLPYVIVGYIYPNIKRRTVILGYIAASFSAASIAGPLVGGWIVDTLSWHWVFYINVPLGLIAIILSFVYYKGIRKPNKNTQFDKLGAFTLIAGLTSFLIGIQLLGMVSLPVVLGFIILSILLLVVFIRAERKAKSPVVPLSVFTNKALVGDFLIFALAWGSSIAVNTYLPMWAQTILGASALVGGMTLIPNSIVDIVGSQTASYFLRHVNNYRLLIANLTIMAITAVGLILAPISTPYQILALIAAFSGFGVGSIFVILQIKVQVDASEKDMAPATSLSFLIRILALTIMAAIYGVIMNLALGRGIAGHPGITMTMMNKLIDAESAKSLPVQLLPTMRKIFYGGIREIMIVSLVLLVAAYVVNYLYNRHEEKIMAE >NZ_CP020029.1|WP_012211531.1|476870_478076_-|multidrug-efflux-MFS-transporter MKEKPIWKKNLFVLSIAVFIAGIAFSEVMPFLPLYIDTLGKFSHQQLNFWSGFIYSGTYLVSALISPCWGKLADKKGRKPMTLRASLGMAIVIGCMGLVTNVYQLFILRMLQGVFAGFVSNSNALIATETPKEKSGQALGTMASSFTAGNLLGPFIGGALASIFSYRVTFFITGGLLLISFFLSLFFVHETDFKPVTEKKLDKASGIIKELRSPQLIFGLLLTTLIIQAANNSINPIVSLYVKQLMANHGNVVFISGVIAALPGIATFLAASRFGALGDRIGTHKIIVGGFIGATILFFLTAFVQNTVELGILRFLVGFTDACLFPQVQTLLTKNTPAKITGRIFSWNQSAMYVGNIFGPLLGSTISGLTSYSMVFIVTAIIVVFNLILFKFNVINNLRQK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP020029_2 | 1360958-1361169 | Orphan |
I-B,III-A,III-B
Consensus repeat of NZ_CP020029_2
|
3 spacers
spacers of NZ_CP020029_2
>2.1|1360986|33|NZ_CP020029|CRISPRCasFinder,CRT AGCCACGGAGGCGCAAAAAGAAAAAATAGACAA >2.2|1361047|33|NZ_CP020029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAAATGCCTCCAGTAGTGCATAATTTTAAGTAA >2.3|1361108|33|NZ_CP020029|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTCGTATCTTCTATTCGGGAAAGCTCCTAATG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020029_2
The CRISPR arrays of NZ_CP020029_2 >merge|NZ_CP020029|2|1360958-1361169|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTGGTTGCTCCACATACGTGGAGAATACAGCCACGGAGGCGCAAAAAGAAAAAATAGACAAGGATCACCTCCACATACGTGGAGAATACTAAATGCCTCCAGTAGTGCATAATTTTAAGTAAGGATCACCTCCACATACGTGGAGAATACCTTCGTATCTTCTATTCGGGAAAGCTCCTAATGGGATCACCTCCACATACGTGGAGAATACT >NZ_CP020029|2|1|1360958-1361169|CRISPRCasFinder TTGGTTGCTCCACATACGTGGAGAATAC AGCCACGGAGGCGCAAAAAGAAAAAATAGACAA GGATCACCTCCACATACGTGGAGAATAC TAAATGCCTCCAGTAGTGCATAATTTTAAGTAA GGATCACCTCCACATACGTGGAGAATAC CTTCGTATCTTCTATTCGGGAAAGCTCCTAATG GGATCACCTCCACATACGTGGAGAATACT >NZ_CP020029|2|1|1360958-1361168|CRT TTGGTTGCTCCACATACGTGGAGAATAC AGCCACGGAGGCGCAAAAAGAAAAAATAGACAA GGATCACCTCCACATACGTGGAGAATAC TAAATGCCTCCAGTAGTGCATAATTTTAAGTAA GGATCACCTCCACATACGTGGAGAATAC CTTCGTATCTTCTATTCGGGAAAGCTCCTAATG GGATCACCTCCACATACGTGGAGAATAC >NZ_CP020029|2|2|1361019-1361168|PILER-CR GGATCACCTCCACATACGTGGAGAATAC TAAATGCCTCCAGTAGTGCATAATTTTAAGTAA GGATCACCTCCACATACGTGGAGAATAC CTTCGTATCTTCTATTCGGGAAAGCTCCTAATG GGATCACCTCCACATACGTGGAGAATAC
>NZ_CP020029.1|WP_065866517.1|1360608_1360935_+|metal-sulfur-cluster-assembly-factor MRDGETIKNDIINQLATVIDPELNVDVVNLGLIYEIDLDKDGICLINVTLTTPTCPLTGYLIDSITQAVKKVLEVKNVDVEFVWYPVWTPDRMSDAAKKYFNIDEKQD >NZ_CP020029.1|WP_023191365.1|1359722_1360604_+|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-alpha MYNHIKEIVADSEKQQKPISELIIEQECKLSGLPRQKVWNRMKHNLATMRAAVERGKSGAGIFSKTGLTGGEAVKIKKYRQTHHTLSGDTIIAAVQNAVATNEVNASMGVICATPTAGSSGTLPGVLFLLEKRMDLSEEQMIRSLFTAGGFGLVIANNAEIAGATGGCQAEVGSASAMGAAAAVEAAGGSAEQSAQAMSIAMSNLLGLVCDPIAGLVEVPCVKRNAIGAGNALISADIALAGCTSVIPADECIDAMKKVGHQMPASLRETGIGGLAGTPTGQAIKAKIFGKDA >NZ_CP020029.1|WP_012212055.1|1359045_1359708_+|serine-dehydratase MTNRYKSVFDIIGPVMVGPSSSHTAGAVAIGRAGNKLFGGVPRKLTVHYYGSFAQTHRGHGTDYAIAAGILGFDTDDLRVPNAPEIAKKRGIDIRFVEEDGPSPIDHPNTAILDMSSGTKKAQISGCSIGGGSIEIRHLVIHDTEITPTGSLPIIIWLDYEKEILNEQNLTSLLQEKAPFSKKRIFHTKDCNIYEYDVENYLKPALVKELKEKFENIICL >NZ_CP020029.1|WP_023192717.1|1358650_1358944_-|hypothetical-protein MNKEKDELKRNLEKVAEEQGGQQAVSYQDLFNPRFMQKNTHFTTIDVFVRELGAKSFPDIEQLGQKVVDNFVKKETNFNSWEEMQQRAVSEYMSSLF >NZ_CP020029.1|WP_065866516.1|1358206_1358503_-|hypothetical-protein MTDKEILQKIEQSVKDSENWEVYHHLTDSLGSPALILRKTNTNADRLGVNIDVFKGYAYLFLDNGTPAEPYQAILSMHSNYLTFEQKMAYLVKPYIKR >NZ_CP020029.1|WP_065866515.1|1356836_1358072_-|MFS-transporter MTHKKSFFSWWIFIVCCFISMIGFGLLVNTIGLFFGPISQEFNVGRANVALMTTFQNAAAAIALLFAGKIMEKVNLRWLLTACFALITVSMLSLTFANSLVHFYLAWTIIGICQPIAITLSIPVLLSKWFNQKLGTVMGISLGLSALGGTIFNPIIAEVIKQFGWRGGFVGEAMLIGLILVPLAISIKPEPTTQYPAYGKAMRSSKKVALTGLSLKQALKMPVFYAVAFAMLALQFVSGSVQHISGHITNIGISPITAATVVSGVMIGAAIGKISIGYFLDKFNAKLVLAVYSLFGVIGWGGQAMLRESNLLILAAVILGLGQGVCLVALPYLIRQIFGEKDYSNILSVINMIGAFAMSASVYLIGLFFDQTGSYNLGWMINVSAFALSFIVIMITLGKKESANSDLERVE >NZ_CP020029.1|WP_147628268.1|1354155_1356780_+|HAD-IC-family-P-type-ATPase MLKQYYLQTKAKVLEELKTSSGGLSSQQAKDNLAKYGKNALIEGKKKTTLQVFLEQFKDLMVIILIIAAVISAFTGELESTLVIIAVLILNAILGTVQHIKAEKSLESLKSLSSPSAKVWRDGKKIEIDSKDVVPGDIMLLEAGDMVTADGRILDNFSLQVNESSLTGESTNIDKADVEFDHEMPLGDRINMVYSSSLVTYGRANVVVTATGMNTEIGKIASLMNETKERRTPLQISLDKFSSKLATAILIICAIVLGLQIWRGQPIMDALLFAVALAVAAIPEALSSIVTIVQAMGTQKMAKENAIIKNLAAVESLGSVSVICSDKTGTLTQNKMTVQDIYIGGKTLKPNQLNLDNQLHRYLLYDAVLNNDSSLVDGKGIGDPTEYALLEMYRQVPGIDLGDKGLGISEEDLRGLLTRKQEVPFDSDRKLMSTKHLIHTVPTIFVKGAIDVLLDRCVNIRLDDEVRPITEEDKKQILAQNQHFSENGLRVLTFAYKESDEDLTPETENGFTFIGLVSEMDPPREESIEAVARAKKAGIRTVMITGDHKVTAVAIAKKIGIFNDGDMAVTGLELDKMSDEELEQKIEKIAVYARVSPENKIRIVNAWQKKDHIVSMTGDGVNDAPALKKADIGVAMGITGTEVSKDAASMILADDNFATIIKAVANGRTVFENIKNAIMYLLSGNLSAIITVLFASIGGFSVPFVAVQLLFINLVTDSLPALAIGVEPGAPDILDRKPRDPKVGILNKSLVTEVGLQGLIIAVGVITAFMIGRQTSPAVACTMAFSTLTFARLLHGFNCRSQHSIFKIGFKKNWYSLAAFAVGTLLLALILFVPALHGLFAVTPLTGNQLLWIIGLAVIPTVIIQIVKVVNENR >NZ_CP020029.1|WP_079227810.1|1352608_1352992_+|ABC-transporter-permease MLLSGGFAGIGGVVQGLGTYQNYFTQTSSINIGWDGLSVALLGNSTAIGILIAYLLFSILKIGGLGMQTVAGVPYEIVSIVIAAIIFFIAIKYVFDLLFAVKKGTEIGPNNGVDGPNIKLQKEGPVL >NZ_CP020029.1|WP_023190998.1|1351858_1352053_+|hypothetical-protein MKKLSKLTAQAAVVVSPLVAFAGAFLASIIFPNQFSLNKSTWIGLGIFTFCYWIVTLFSYLKHH >NZ_CP020029.1|WP_003627631.1|1349461_1350085_+|orotate-phosphoribosyltransferase MHQDQIISQLIQEKIISISPDKPFTYASGMLSPIYTDLRLMVSYPDLRDMIASDLANLIAKEFPEATIIGGVATAGIPHAALVAEKLHLPMIYVRPKPKDHGKGRQIEGRFSSSDKIVLIDDLITTGGSVLNAVKATEKDGGNVIGVSSIFTYYLPDAKENFAKANVKYAPLLSYPELLKKENESGHITREQYQTLKTWHEDPWAWK >NZ_CP020029.1|WP_052747907.1|1361284_1361824_-|hypothetical-protein MNKIIKKLALVGACSMLMSSVVATVPSQTVDAVSSKTFSKYSKKFNRVIVTDPIWVYKIYPRYPMYKTKYVKAYKLKPGDTPIVRHRGVDWGWTVGKSYRYCILKDSFSWFDGYSKYKWVDQGLLDGSMKDEHFAYKFTWKQYCQLIKAGIYTTVHPKKLWNSKIKKMIERWKPETDNS >NZ_CP020029.1|WP_046814366.1|1361835_1362198_-|hypothetical-protein MSHLFRRRSITKSITARTSAKYKRQIKKKILPGYGKKGAGVIKDPKKSMYNAIYNRTTIDTRKIGKSKQAKNDESDNKLGCGCATTLIFFGAIVGQMIGGNIGGTIGVILMLIIAIFGMI 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NZ_CP020029_3 | 1362306-1362394 | Orphan |
I-B,III-A,III-B
Consensus repeat of NZ_CP020029_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP020029_3
>3.1|1362334|33|NZ_CP020029|CRISPRCasFinder TTTACTTTAGTTTTATCTGTAACTCCTGTGTAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020029_3
The CRISPR arrays of NZ_CP020029_3 >merge|NZ_CP020029|3|1362306-1362394|CRISPRCasFinder GGATCACCTCCACATACGTGGAGAATACTTTACTTTAGTTTTATCTGTAACTCCTGTGTAAGGATCACCTCCACATACGTGGAGAATAC >NZ_CP020029|3|2|1362306-1362394|CRISPRCasFinder GGATCACCTCCACATACGTGGAGAATAC TTTACTTTAGTTTTATCTGTAACTCCTGTGTAA GGATCACCTCCACATACGTGGAGAATAC
>NZ_CP020029.1|WP_046814366.1|1361835_1362198_-|hypothetical-protein MSHLFRRRSITKSITARTSAKYKRQIKKKILPGYGKKGAGVIKDPKKSMYNAIYNRTTIDTRKIGKSKQAKNDESDNKLGCGCATTLIFFGAIVGQMIGGNIGGTIGVILMLIIAIFGMI >NZ_CP020029.1|WP_052747907.1|1361284_1361824_-|hypothetical-protein MNKIIKKLALVGACSMLMSSVVATVPSQTVDAVSSKTFSKYSKKFNRVIVTDPIWVYKIYPRYPMYKTKYVKAYKLKPGDTPIVRHRGVDWGWTVGKSYRYCILKDSFSWFDGYSKYKWVDQGLLDGSMKDEHFAYKFTWKQYCQLIKAGIYTTVHPKKLWNSKIKKMIERWKPETDNS >NZ_CP020029.1|WP_065866517.1|1360608_1360935_+|metal-sulfur-cluster-assembly-factor MRDGETIKNDIINQLATVIDPELNVDVVNLGLIYEIDLDKDGICLINVTLTTPTCPLTGYLIDSITQAVKKVLEVKNVDVEFVWYPVWTPDRMSDAAKKYFNIDEKQD >NZ_CP020029.1|WP_023191365.1|1359722_1360604_+|L-serine-ammonia-lyase,-iron-sulfur-dependent,-subunit-alpha MYNHIKEIVADSEKQQKPISELIIEQECKLSGLPRQKVWNRMKHNLATMRAAVERGKSGAGIFSKTGLTGGEAVKIKKYRQTHHTLSGDTIIAAVQNAVATNEVNASMGVICATPTAGSSGTLPGVLFLLEKRMDLSEEQMIRSLFTAGGFGLVIANNAEIAGATGGCQAEVGSASAMGAAAAVEAAGGSAEQSAQAMSIAMSNLLGLVCDPIAGLVEVPCVKRNAIGAGNALISADIALAGCTSVIPADECIDAMKKVGHQMPASLRETGIGGLAGTPTGQAIKAKIFGKDA >NZ_CP020029.1|WP_012212055.1|1359045_1359708_+|serine-dehydratase MTNRYKSVFDIIGPVMVGPSSSHTAGAVAIGRAGNKLFGGVPRKLTVHYYGSFAQTHRGHGTDYAIAAGILGFDTDDLRVPNAPEIAKKRGIDIRFVEEDGPSPIDHPNTAILDMSSGTKKAQISGCSIGGGSIEIRHLVIHDTEITPTGSLPIIIWLDYEKEILNEQNLTSLLQEKAPFSKKRIFHTKDCNIYEYDVENYLKPALVKELKEKFENIICL >NZ_CP020029.1|WP_023192717.1|1358650_1358944_-|hypothetical-protein MNKEKDELKRNLEKVAEEQGGQQAVSYQDLFNPRFMQKNTHFTTIDVFVRELGAKSFPDIEQLGQKVVDNFVKKETNFNSWEEMQQRAVSEYMSSLF >NZ_CP020029.1|WP_065866516.1|1358206_1358503_-|hypothetical-protein MTDKEILQKIEQSVKDSENWEVYHHLTDSLGSPALILRKTNTNADRLGVNIDVFKGYAYLFLDNGTPAEPYQAILSMHSNYLTFEQKMAYLVKPYIKR >NZ_CP020029.1|WP_065866515.1|1356836_1358072_-|MFS-transporter 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MLKQYYLQTKAKVLEELKTSSGGLSSQQAKDNLAKYGKNALIEGKKKTTLQVFLEQFKDLMVIILIIAAVISAFTGELESTLVIIAVLILNAILGTVQHIKAEKSLESLKSLSSPSAKVWRDGKKIEIDSKDVVPGDIMLLEAGDMVTADGRILDNFSLQVNESSLTGESTNIDKADVEFDHEMPLGDRINMVYSSSLVTYGRANVVVTATGMNTEIGKIASLMNETKERRTPLQISLDKFSSKLATAILIICAIVLGLQIWRGQPIMDALLFAVALAVAAIPEALSSIVTIVQAMGTQKMAKENAIIKNLAAVESLGSVSVICSDKTGTLTQNKMTVQDIYIGGKTLKPNQLNLDNQLHRYLLYDAVLNNDSSLVDGKGIGDPTEYALLEMYRQVPGIDLGDKGLGISEEDLRGLLTRKQEVPFDSDRKLMSTKHLIHTVPTIFVKGAIDVLLDRCVNIRLDDEVRPITEEDKKQILAQNQHFSENGLRVLTFAYKESDEDLTPETENGFTFIGLVSEMDPPREESIEAVARAKKAGIRTVMITGDHKVTAVAIAKKIGIFNDGDMAVTGLELDKMSDEELEQKIEKIAVYARVSPENKIRIVNAWQKKDHIVSMTGDGVNDAPALKKADIGVAMGITGTEVSKDAASMILADDNFATIIKAVANGRTVFENIKNAIMYLLSGNLSAIITVLFASIGGFSVPFVAVQLLFINLVTDSLPALAIGVEPGAPDILDRKPRDPKVGILNKSLVTEVGLQGLIIAVGVITAFMIGRQTSPAVACTMAFSTLTFARLLHGFNCRSQHSIFKIGFKKNWYSLAAFAVGTLLLALILFVPALHGLFAVTPLTGNQLLWIIGLAVIPTVIIQIVKVVNENR >NZ_CP020029.1|WP_079227810.1|1352608_1352992_+|ABC-transporter-permease MLLSGGFAGIGGVVQGLGTYQNYFTQTSSINIGWDGLSVALLGNSTAIGILIAYLLFSILKIGGLGMQTVAGVPYEIVSIVIAAIIFFIAIKYVFDLLFAVKKGTEIGPNNGVDGPNIKLQKEGPVL >NZ_CP020029.1|WP_153245682.1|1362587_1362725_+|hypothetical-protein MLKKTKWNTAIVAVLLGAGIISTNHVQADAVSNAQSNTQVVQNSN >NZ_CP020029.1|WP_079227812.1|1363728_1364697_+|hypothetical-protein MKGKILFISIISCFLLTGFSTTVKADETDQSQTSQINSQTGSYTQQDNTQINKSDSTQDSGNKQNQTNQNSNNTPVKNNNGWKTVNGNTYYLKNGSATKGFKKINGYWYLFNKNGIMLKDVRKIPHTKHYSYFDQLGRRRMKNTSTKKAYYWINKKGQITGIKNNAKVICQRPQMPTGCEITAVTMMLNFAGKKVSKYQAAKVMPRSSNPNKGFVGSPYKKFPLGFWVAPGGVKPVVQHYLGKSKIMTNCSINAIKQKLLRSHLVVVWVGMFDGISNHAITLTGYHGNTLYYNDPWTGTKRKISVAKFKIHWALDGHRAISY >NZ_CP020029.1|WP_060471342.1|1366071_1366491_+|hypothetical-protein MWIILIINTIITISAIIVSFKNRSEVFSLFNAGIIFIIWSIIFLLGAISIYRNFDTSSLMMFIAGILLILGIIMLMFSFINKKVKKIRLQDIAITMMVASVALVGLMQGLNLNFLNLIVPEVSLIIGLICFVVNTINNR >NZ_CP020029.1|WP_065866519.1|1367990_1369442_-|zinc-ribbon-domain-containing-protein MKKICPNCGKEVDPEEKYCPFCHFNLVNNDETMVTVNIGLLGLKNNESTKKDEEKIQSEKKESDAKPEKKKQPEKAVSKSNEDKKQKIEKNEIIPSPLPPKKKPTPLPKSKKKKFHFKWSILIEIVVAVIAILVMVGMNYYSCKAQIGRIETGLKNGEVNNVVTNGKVPLTAKNLTPLKEYYKNNPAAYKKLKKSLMGKNNLPIKLIKQGHYFLFFPRYVVQLPTYELNVVNDYHHSTVTVNGMKFVKKQKVFPGAYNIEAKSSYLGQTAKFKKTVNVWKDQTAEVNLNAKTIKVQGMPNGKLYLNNHNIGKLDKKGNLVLEDVPLTKPFSMYVAKKQKGKLVKTKQVRDVPAVIKGSKNVAVLKLDWQQSKNVGKLLEDNFNYPNSKDFVGGSKNKSYVELRTLVSNWRNSPNITKYHANITVNNKSLNDIRYSVEFNFAFNKNGKRYKRVQVMKFRSASARSTSKGLKIKTIGGGRIVSSK >NZ_CP020029.1|WP_012212067.1|1369623_1370130_+|hypothetical-protein MKNYTIDHDIYLMNHKNGDVLKVTVNKEDSVKILQLYRQDGLGNYYLDKNSRLKKQDNLTTKEDIVKASKKIGGHNTHHIDKWHHQVVPIYNAQHQITGFKPKLALEHHTRIQNAKRYLRHLDHHHAIYLSTTSRNTLLKPINHLKDAIYADRNKEMVLAHKIHKLSR >NZ_CP020029.1|WP_065866520.1|1371003_1371264_-|hypothetical-protein MKKLKIFIIISLMMLFWVWPKSVSAKSFSSFQTKMINGNSNYRIYQGMTHRGPVGSVGLARTFKYGNFQASAVKKSGKVEILFRLD >NZ_CP020029.1|WP_065866521.1|1371380_1372166_-|hypothetical-protein MKTKKLFTSIAAAVMLSTSLAGSGAVLSQTAHAANTTQTTTKNSNDKKGTVSVKRRSVTVTINSDKPTLLAVGEDGKSVKPVASTYTKGQTIQVYYSVAFTATAQGSEGQQLPAYYVENKAIDGKESMIFIPAGVVTAATAVPSQADWVKQAESDAKAIQEAYQNRDLKYIVVTPKSKKGAKIYYAYKKTRKSKKVYFKATKKKIKKGKKYKSSMIVKHGKTRYVYIGKKRYVKLSALKMVSAKYAPVKLSDDLKSLIIEN >NZ_CP020029.1|WP_065866522.1|1372229_1372934_-|oxidoreductase MELLDEAVVLNDGSLMPKTGIIVKNDDDVTKATKLGYRLLDCAVDDNLKIKDVNPQLYVEVRISKLAKGKELHDNLKSIRANLIADQPDLCLLNLSDDNERNNQIWQKLEQLKITGWVKTLGIETDEADALEALLKNIKFKPNVLRLKCEDTDLLTIAKNNKLQVEIPVKGDIAALAEIADKYHTFPMELVLCYFNQKGIIPLVEASEMIENPQVNFNIKSADMATISQLFVKD >NZ_CP020029.1|WP_003629414.1|1372953_1373361_-|OsmC-family-protein MGDYLVKTKLENTEWQIANQARDHVFICDADKRSKEDAGPNPVEYLCGSINSCITMSAGMITKVHRLDVKNFHVENYAKTENLGHGKSVVTGMKIKVSFDSSMNREEKEKFIAHALHVSTVYQTLKEAIKIYVEF >NZ_CP020029.1|WP_025283748.1|1373379_1374552_-|MFS-transporter MTEKESIYTKDVILVMAASFFFMFSTMFVNPLINGYAKNLGASRVFAGIIVGIMSIAAMFLRSVAGNLTDKFSKYRLSFIGGILILIGVVGYVLTPSSGWLLLFRLINGTGYVLCTVCMTTWLAFLVPREHVGEAMGFYGLMNALAMALAPALSINIYQKIGYRESLIAAAIAALLMVISIQFVGNHAEPIVKKNQPEKHFKIIQMNVLPVAILTTLFAIPYFITQADIVTYVEQKHLSVAVGSYFLIYAVVLLIIRIGLKRYFDTVRFGVWFWISLISTAAYICLLAIMQNNGEMALAAAGMAMGYGIIYSVLQSTALLLAPVEEQGLASSTFYLGLDIAMSFGPMISGVIDSILPVKWFYVVDLVLLPVMLLVYFVWRKRLNGAIDHH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP020029_4 | 1490702-1491326 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP020029_4
|
9 spacers
spacers of NZ_CP020029_4
>4.1|1490732|36|NZ_CP020029|CRISPRCasFinder AGCATATTTAGTAAAGTTGGTGTAAAATTCGGCTTT >4.2|1490798|38|NZ_CP020029|CRISPRCasFinder,CRT CTACCAACTACTAAAACTTTTAGATTAAACTTTCAAAA >4.3|1490866|36|NZ_CP020029|CRISPRCasFinder,CRT TCACTCAAAAAGAGGTACTATAGATCATTCAAGTTT >4.4|1490932|35|NZ_CP020029|CRISPRCasFinder,CRT CAATGGGTTCAAGCATTCCGTTACCACCTGAATTA >4.5|1490997|36|NZ_CP020029|CRISPRCasFinder,CRT AATGAAAAGGTGGCGCAAGATATGAGTTTTTACGAT >4.6|1491063|35|NZ_CP020029|CRISPRCasFinder,CRT TAGTAAGCGTAAGGTTTAAAGTTAGTAAGAATTAA >4.7|1491128|35|NZ_CP020029|CRISPRCasFinder,CRT AAGTTTAAAGCTGGCACGTTAATAATTGCTTGTGT >4.8|1491193|37|NZ_CP020029|CRISPRCasFinder,CRT TAAAAACGATTTTTTGAGACCTAGCAAGCCGGATCAA >4.9|1491260|36|NZ_CP020029|CRISPRCasFinder,CRT TTAGGTACTGACATAAGTCTTCTTTCTAAAATACTA >4.10|1490867|36|NZ_CP020029|PILER-CR TCACTCAAAAAGAGGTACTATAGATCATTCAAGTTT >4.11|1490933|35|NZ_CP020029|PILER-CR CAATGGGTTCAAGCATTCCGTTACCACCTGAATTA >4.12|1490998|36|NZ_CP020029|PILER-CR AATGAAAAGGTGGCGCAAGATATGAGTTTTTACGAT >4.13|1491064|35|NZ_CP020029|PILER-CR TAGTAAGCGTAAGGTTTAAAGTTAGTAAGAATTAA >4.14|1491129|35|NZ_CP020029|PILER-CR AAGTTTAAAGCTGGCACGTTAATAATTGCTTGTGT >4.15|1491194|37|NZ_CP020029|PILER-CR TAAAAACGATTTTTTGAGACCTAGCAAGCCGGATCAA >4.16|1491261|36|NZ_CP020029|PILER-CR TTAGGTACTGACATAAGTCTTCTTTCTAAAATACTA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020029_4
The CRISPR arrays of NZ_CP020029_4 >merge|NZ_CP020029|4|1490702-1491326|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AATTATTTTCATCTTAAGTTAGATAAAATCAGCATATTTAGTAAAGTTGGTGTAAAATTCGGCTTTATTTACATTTCCCTTAGATTAAATAAAGACCTACCAACTACTAAAACTTTTAGATTAAACTTTCAAAAATTCACATTTCTCTTAAATTAAATAAAAACTCACTCAAAAAGAGGTACTATAGATCATTCAAGTTTCTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACCAATGGGTTCAAGCATTCCGTTACCACCTGAATTACTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACAATGAAAAGGTGGCGCAAGATATGAGTTTTTACGATCTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACTAGTAAGCGTAAGGTTTAAAGTTAGTAAGAATTAACTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACAAGTTTAAAGCTGGCACGTTAATAATTGCTTGTGTCTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACTAAAAACGATTTTTTGAGACCTAGCAAGCCGGATCAACTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACTTAGGTACTGACATAAGTCTTCTTTCTAAAATACTACTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACA >NZ_CP020029|4|3|1490702-1491326|CRISPRCasFinder AATTATTTTCATCTTAAGTTAGATAAAATC AGCATATTTAGTAAAGTTGGTGTAAAATTCGGCTTT ATTTACATTTCCCTTAGATTAAATAAAGAC CTACCAACTACTAAAACTTTTAGATTAAACTTTCAAAA ATTCACATTTCTCTTAAATTAAATAAAAAC TCACTCAAAAAGAGGTACTATAGATCATTCAAGTTT CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC CAATGGGTTCAAGCATTCCGTTACCACCTGAATTA CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC AATGAAAAGGTGGCGCAAGATATGAGTTTTTACGAT CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC TAGTAAGCGTAAGGTTTAAAGTTAGTAAGAATTAA CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC AAGTTTAAAGCTGGCACGTTAATAATTGCTTGTGT CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC TAAAAACGATTTTTTGAGACCTAGCAAGCCGGATCAA CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC TTAGGTACTGACATAAGTCTTCTTTCTAAAATACTA CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACA >NZ_CP020029|4|2|1490768-1491325|CRT ATTTACATTTCCCTTAGATTAAATAAAGAC CTACCAACTACTAAAACTTTTAGATTAAACTTTCAAAA ATTCACATTTCTCTTAAATTAAATAAAAAC TCACTCAAAAAGAGGTACTATAGATCATTCAAGTTT CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC CAATGGGTTCAAGCATTCCGTTACCACCTGAATTA CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC AATGAAAAGGTGGCGCAAGATATGAGTTTTTACGAT CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC TAGTAAGCGTAAGGTTTAAAGTTAGTAAGAATTAA CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC AAGTTTAAAGCTGGCACGTTAATAATTGCTTGTGT CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC TAAAAACGATTTTTTGAGACCTAGCAAGCCGGATCAA CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC TTAGGTACTGACATAAGTCTTCTTTCTAAAATACTA CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC >NZ_CP020029|4|3|1490837-1491325|PILER-CR TTCACATTTCTCTTAAATTAAATAAAAACT CACTCAAAAAGAGGTACTATAGATCATTCAAGTTTC TTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACC AATGGGTTCAAGCATTCCGTTACCACCTGAATTAC TTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACA ATGAAAAGGTGGCGCAAGATATGAGTTTTTACGATC TTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACT AGTAAGCGTAAGGTTTAAAGTTAGTAAGAATTAAC TTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACA AGTTTAAAGCTGGCACGTTAATAATTGCTTGTGTC TTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACT AAAAACGATTTTTTGAGACCTAGCAAGCCGGATCAAC TTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACT TAGGTACTGACATAAGTCTTCTTTCTAAAATACTAC TTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC
>NZ_CP020029.1|WP_065866562.1|1487883_1490547_-|DNA-polymerase-I MADEKLLLIDGNSVAFRAFYALYRQLESFKSPDGLHTNAIYAFKNMLDVLLKDVDPTHVLVAFDAGKVTFRTKMYGEYKGGRAKTPEELLEQMPYIQEMLHDLGIKTYELKNYEADDIIGTFAAKGEKAGFTTTIVTGDRDLTQLASDKTTVEVTKSGVSQLEAYTPEHMKEVNGVTPTEFIDMKALMGDNSDNYPGVEGIGPKTASNLIQEYGSVENLYDHIDEMKKSKRKERLIRDKDKAFLAKKLATIDRDSPVTIDIDDVKREPVDYEKLRQFYEKMNFRKFLAELNASGAGQDGAEVEKVEYTVLNDDNVKDVKATEKDTVEFYLEMLGANYHLADFVGFSLKINDKIYVSRDVDLLEEDNIKHILEDEKIKKNVFDLKRSMVGAHRLGIHTHGLDYDMLLASYLVNNENNSNDLGEIAHLYGDYSVKTDLEVYGKGKSEHIPDDDDELFNHLASKVNAIESLKKTLLEKLKDHEQDALFDTIEIPTARVLARMEMNGMRVETSTLIQLQNEFAVKLKKLEDKIYGQAGEKFNLNSPKQLGHILFEKLGLPVIKKTKTGYSTSVEVLDQLKTQSPIVSKILDYRQIAKIQSTYVKGLLDVIQPDGRVHTRYLQTLTATGRLSSVDPNLQNIPTRTEEGKQIRKAFVPSEPDGYIFSCDYSQVELRVLAHVSGDQNMQEAFKTGYDIHSHTAMKIFHLESPDEVTPLMRRHAKAVNFGIVYGISDYGLSKNLGISRKRAQEFIDNYFEQYPQIKDYMNKAVQEARDKGYAETIMHRRRYLPDIHAKKYTVRAFAERTAINSPIQGSAADIIKIAMINMQKKLDELHLKTKMVVQVHDELIFDVPKDELETIKKIVPEVMQSAVKLDVPLIADSGWGHNWYDAK >NZ_CP020029.1|WP_003627142.1|1487044_1487875_-|DNA-formamidopyrimidine-glycosylase MPEMPEVETVRRTLIPLIKGKTIEKVILWYPKIVATDHEKFLSELPGKKIIDIDRYAKYLLIRLSDNLTIVSHLRMEGKYHLTTSDAPKDKHDHVEFIFTDGTALRYNDVRKFGRMQLILTGTERQTTGIGKLGYEPNSSEFTSEYLVNGLKRKKKNIKNTLLDQSVVAGLGNIYVDEVLWRTKIHPLSQANKIPAEKVMELHDQINQIITEAIKLQGTTVHSFLNANGQVGGFQSKLQVYGHVGEPCPVCGTKFEKIKVNGRGTTFCPHCQVIYK >NZ_CP020029.1|WP_065866561.1|1486445_1487048_-|dephospho-CoA-kinase MSYVLALTGGIATGKSTADDFFRKKNIPIIDCDQIARELMEPGNASWQAIKDHFGMEYLNSDQTINRKKLGQLVFSNKQALSELNQVTHPLIFDKTVAKIKEYRDFALVILDAPVYFEAGLDNKHVANGVLVITLPEQLQIERLKKRNNLTDQEAINRINSQMPLVEKEKMADFVVANTGTIKELENKLKQVLIKIREEE >NZ_CP020029.1|WP_003627138.1|1485975_1486443_-|transcriptional-repressor-NrdR MECPNCHQNASRVIDSRPSDENRAIRRRRECENCGFRFTTFERIETAPLLVIKNDGTREPFNRKKILHGVMAAGQKRPISSDQFEQLVDHVENKVRKQGISEISSKKIGQYVMDELADLDDVAYIRFASIYREFKDMSSFMKTMEDMMAKKGKGN >NZ_CP020029.1|WP_065866560.1|1484641_1485973_-|chromosome-replication-initiation-protein MFETADPKHLYYVANRIRLFPEDEKVLIKLYQPLVGAVAVALYQTLIQNYDPYGIISDSKGIYSLQEQLDCSLKQLFNSLHKLEAVGLVQTFLSDNVFNNVLVFKLLQVPAADKFFATPLLASLLKEKVGVPTFHDLSHAFAQEAKLKEKPIKNAKDVSANFFDVFRLPGDEAITPSSDVVQAAQENKVHEVETAKVNDHDSIDWDFIKQEYSRYQIPASEIDLNKEQIRGLIQTYGLSEKEFVDESLPCLHGSYSLNMRDISNTLAENYKRTNTRENVQTQLNEGRKKALATIKDMDDNDKKLLKAANESSPAEFLYKLKTQKGGITSANEKQIINNLHTQYGLPEDLINILTYTCLTYDTVVSSNLAYKIANDWLQHGVATAVQALQYVKKRRNSFGKKRPVRTYQKRVEKGTDWSKKKADRDAGISTEQLKNLFKDLNNK >NZ_CP020029.1|WP_012212130.1|1483700_1484609_-|primosomal-protein-DnaI MEPIDKVIKKIVKERNLGDAQSLISQALHDPDVQAFLTANANKIDQKMVQNSMSNLYEYYSQKHTANKVMAGYAPQLFLNGKVIDIRYVPTKAKLAQDRKQAAERRLQLIDVPTRLHDVSLSEIDVNDDRKQVLTLIYDFLRKYKQDPHVQGLYLSGDYGVGKTYILAGLANYVVTNMNKNVVFLHVPTFIAGLASHFDDNSLQSEIRRLSECDLLILDDIGAESLSQWSRDDVLGVILQARMDNVLPTFFSSNLDMEALESHFEETRNATDPVKARRLMQRVRFLAKEVVVSGPDRRNSLH >NZ_CP020029.1|WP_065866559.1|1481475_1483410_-|threonine--tRNA-ligase MSFSITLPDGSKKDFEESLTIADLAQNIATSLGKAAVAGKVNGELKPLDYKLDSDSEVAIITNKDEEGLDVLRATAAFVFEAVAKCEYPELRLGEHVADEGGFYVDTDKDDQIKVGELPKLEKAMQKVIKNGEKIEHVQIAKSELEDLYKNDKFKSELLAKVEGDTVDAYKLGDFVDFGFDALLPNTGKIKQFKLLSVAGAYWLGKSSNPMLQRIFGTAFFKEADLKADLKRRQEIKERDHRTIGRDLDLFFVDPKVGAGLPYWMPKGATIRRAVERYIIDREVADGYQHVYTPVLMNLDAYKTSGHWAHYRDDMFPPMDMGDGEMLELRPMNCPSHIQIFKHHIRSYRDLPLRVAELGMMHRYEKSGALSGLQRVREMTLNDGHTFVALDQVQTEFAKILKLIMEVYKDFDITDYYFRLSYRDPKNTDKYFANDEMWEKSQKMLKGAMDDLGLDYVEAEGEAAFYGPKLDIQTKTALGNDETMSTIQLDFMLPDRFGLTYVGKDGEEHRPVMIHRGIVGTMERFIAYLTEIYKGAFPTWLAPVQAEIIPVNNEAHGEYAEKVRAELAKRGFRVEVDDRNEKMGYKIRESQTQKVPYTLVLGDEEMKSGKVNLRRYGTDEEISKSLDDFINEIDADVKSYSREN >NZ_CP020029.1|WP_065866558.1|1480112_1480643_-|hypothetical-protein MKKKLLLFLGAILLILGFAKLSSVNADAATIKATDWGAKKVFTTPKKTRGVWYYKEGKKVKKFKITAHTIDGVKLYKELNGKTSDRWVNKLIKADKKSVYKLADKVGESAWACHTIKYHKIIGFNADGWLAGSGDGFYYVPVKKNVKGKKVNALRVGEGAGNYLSYYAYKSRKLVK >NZ_CP020029.1|WP_147628274.1|1478741_1479059_-|ACT-domain-containing-protein MYYCNLRKNDFYFFAKTDEELSLVCETKNAPSKTINREDGWRAFKIEGQLDFSLIGILAKIAQLLANNGISIFAVSTFNTDYILVKDNNFDSAIKILSENNYEIK >NZ_CP020029.1|WP_012212123.1|1477484_1478735_-|DUF389-domain-containing-protein MSRKNYLSPQFLTKISEDGTLNIESLIILTCAIFIASIGLNVNSTATIIGAMLISPLMGPLLAIGTGLALYNTNILRKGAISLLAEIVISLVASTIYFHFSPLTYASQEIIARTSPTIWDVMIAFFGGSAGIIGARKKDANNIVPGVAIATALMPPLCTVGYSIAAGNLKYFLGSGYLFLINCVFITLTAFLGVKIMKWLSHSAGQPGLSFFRKPTLKETGIVLVVIILIIPSILSAGHMVNKTLVDQNVQNLVAHELGDVDLIKENVDLQEKTINLTVSGKKINTKKIQAAKANLAEYNLKGYSLNIVQVAQVNPNAENQLDRQVNNILNQRQREQEQANEERQQEQEKHNQEIEKLSPAISSVTAVSDNKNKQITLIELKKNISAKKKKALVKQIKEKYPNINLVEFVQESEKE >NZ_CP020029.1|WP_023192833.1|1493734_1494016_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYVILVYDIVMDKQGAKVSRHVFKICKKYLTHVQNSVFEGELTKSQLESLKNELDRWIRQNVDSVIIFKNRNKDWLDKEFMGQDLTDLTSDIF >NZ_CP020029.1|WP_065866563.1|1494021_1495011_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MEDYYLFSSGELERKDNTVRLTRSDGKYKDLKIEVTRDIYLFGEVSTNTKCLNYLAQMKIPVHFFNYYGFYTGSFYPKEQNVSGTLLIQQVQAYTDPKRRLYYAKKFVLGAAKNLLRNLKYYQRRGRNLDDSIKEITSLIRQIDQVHDVEELMGVEGTIHRRYYASWQSVFIPDVDFSKRVRRPPDNMVNTLISFLNGLMYTTCLSEIYVTQLNPAISYLHSPMDRRFSLCLDISEIFKPMIVDRLIFSLINKNMISEEDFNKESNYCYLSEKSKRIIVSEYDKYMKQKVRYKTLHRDVSYRHLIRLECYKLVRSLVEGETYEPYVMGW >NZ_CP020029.1|WP_065866564.1|1495020_1495512_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MRVTGNMVNYFFVCKRKLWLFQHQIGFEQTSERVQLGSLLDRTSYQGHGTHHLMIDNLINIDMVENWQLIHEVKRSDAIEPAAIWQLKYYIYYLRKKGVNISKGLLDYPRLKKCVKVDYTDEDEKQMEKYISEIEQICEQVTPPKPQFKPICKSCAFYEYCFS >NZ_CP020029.1|WP_065866565.1|1495527_1497957_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MNEYLAKSLDQSEGNHCETIVEHTNNLLKQYSLLKQAYPDIFQNFWLSQDRFNDMTKQVDIRSKDDWRLLEIACSYHDLGKMNLRFQKKVKAGQSFCKGEIPHALLSITMLPIDELQKHYTKDQIIALIFAIKWHHERNFSEIYEKHYEDEIEALKKEFASFDYSKSSFPIPPQEPAKVDSKYLTGNLSHRLSPNYEPKIYDEFVILKGLLNRIDYAASGHYEIESKSRVCLSQNILQEWHKKNPVADWNELQKYTYDHRNESIVVVGQTGLGKTESALRWLDNSKSFFVLPLKSAINSIYDRISGIVFQNKSHENLALLHSDMMAKALSEKFDDEDNFEEFVNEERSWSKQLSVATLDQIFNFVYHYKNYEPKLATLAYAKVVIDEIQMYSPDLLGYLIYGLGEIQKFGGKFEIMTATLPPFLIDLLESNGLEFKQAPHPFLDPKVNHRHKVKVLHKQINSDDIINLDRHQKTLVVCNTVKSATELYSELKQKGVSDVHLIHSRFIRKDRNEREKEILEFGQKENHSSGIWIGTQVVEASLDIDFDMLITELSELCGLFQRMGRCYRKRNYEGKEPNVYVFDGGDKLTSGIHESKQEYDDKRYHSVVDYHLFEISKRALAQVDGYLTESDKLKLIDENYTTDKLLDENCQLIDKVNDCIDYLNDLTFLDNLKTKEEVVNTFRNINTIDIIPEQVFLENKDKLEAAAKALNNYIRREDFLDQTEYKKQHQILVKEKIKAREVINNYLVGIPLYIISKVSKQDRWIKDKALNEVGYNILPADFNYDSMTGLSYNDSKNKNAEIDDDDNIF >NZ_CP020029.1|WP_065866566.1|1498099_1498813_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKVIRVKLHQETANYRVPASHGFRESYPLPPISTVIGMVHYLCDFHEYHPMKVSVQGSYVSTTSDFFTRYEFKNGLKFDPGRHQLNAEGYGISRGIGHVQLLYDVNLILHIKPDDENELEDIYNALKYPREFPNLGRREDLVNFEEVKIVDVEKKDEDLTVNRGAYIPVEMSENIGLENEGIGYKGTHYYLNKDYKLVTIKKGQTQRRWNKVEVIYASGFTVYKSYVDEDNNVVFLV >NZ_CP020029.1|WP_023192831.1|1498799_1499702_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MTQDKMGLTATIVFQASSANYGESLGNVASLKKLTRGDGQQYSYISRQAIRYDIVQQLGEKETNLEAEGSGDKKVIQFAKDASIKDFPEIDFFGYMKTEKGNNSSIRSAKVRLSNAISQEPYEGDTDFLTNMSLAQRIRKATGDNKIRNSIAQSEIQQSYYVYTLTVDLDQIGVDDNDGTNLNANEKNRRVAKLLDTIQYLYRDIRGRREDLKPLFAIGGVYDIKNPIFENAVKVRNSNIDIESIQSILDDPRVKENTSVGFVDGAFNNSQEIKDKLDAVTVAKFMTDLKKKVADYYEGN >NZ_CP020029.1|WP_065866567.1|1499720_1501478_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MGETSTVTIDFRINSWLENAGIVGLTRILKANPRYRGSYKEKENTLEVDPKVFDNFSDLYFNFFIKNYGQATRYWRIVSEENFLKSLKENGFKDFDNKKLKELTDWFDNVLKYSVNSASYKKVIKFINSDYDIKAEVKDCNKKIRTLNKKNFLTESPEEAKEILQELINQLLKAIEYFSTDQARKYFPAKTLSYTVINKAWNGVSFLNPQAKNLDFYDDYQNYFVAPVQKYLQEDHSKDKYICSTCGRPIKRLEYSYGFLNDMGYDLNRKTSNAWNFKNDLYICPVCQFLYSLVPAGFTYNMASQGIFINENSSIRNLQGKNDATFNSMMRDIRSNTQTSPYRAFSAAFRDAEASGQNAVLANIQLITYNNDHYNFQIIPIVASKVLIKAVEKKYTVKQTGEVKSYLANLYNAGISNFRGAGYYSILDNVLNCLFNNTNLFSIIQELELLKVGNTAGCYYNTFQIMTVIRMNGWFLNELHKYRRSENPMKVEEDKLTKARGCGMHVRMGYDNENKAKTLAYKMLEAIRANSTDRFMELLLNAYLYLDKTVPKIFIETQSNTEVFKEYAFAFIAGLIGSSNAEQDK >NZ_CP020029.1|WP_003627162.1|1501495_1502251_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRFGIPIHLLPKNSEEKEIKINIDYDAYILSLIKTGLSTENPALFKELFGKPTQKNYSTSVFFPNATFTKDNIVLDKNGEMKLYFSTANTNLAINFYNSFVYLDHLDAEKLPFGHSYLADVKKLYTIELPKITKDRVIFKTMSTIVIRNDEGRFISCPNDSTEEGLAEFNDALRRNTFNKLRDNESLASTVKGLKFKPIKMRKTVRKSFGLNIECTKGIFELEGNPTLLNFIQESGLGEKTGTFSGMISLA >NZ_CP020029.1|WP_003629695.1|1504740_1505394_-|flavodoxin MFGRTYSDLGPVVGQINGEDIRANQLERRGYDWENGYGTPSDGQDTNRDGQPVRKLTKDAKSIIIFWSCSGSTKLLASKIARETGADILEITLRNPYPANYRKTLNRANCERIQNDPPELEMLSQYDTIYLGYQTWAMTLSQPMRAFLLEYGGEFSNKKIAPFLSEGGYGSGDSTELIREFIARDGGKNNTYTSALVVDGNRVDESDVEVKRWLKTI >NZ_CP020029.1|WP_003629702.1|1505538_1506420_-|SPFH-domain-containing-protein MMARIIIGIIVVLVIVYVCCGFKIVPQNNEGLVETLGKYSKTVKAGFIFVWPLFQRIRKVPLALQPLEISKYSIITKDNAEISTSLTLNYLVTDSYRYFYNNTDSVESMVQLIRGHLRDIIGRMDLNAALGSTKEINDQLFTATGDLTDIYGIKVVRVNVDELLPSAEIQHAMDKQLTADREKTAAIAKAEGEARTIGMTTKAKNDALVATAKANAEAVKTQADADAYRVQKMQEALSKAGEGYFRNQSLDSFNQLAQGPNNLIVVGKDEMTDLGKVPTLRKVWDASDDKKDK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020029_5 | 1492138-1493550 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP020029_5
|
21 spacers
spacers of NZ_CP020029_5
>5.1|1492168|36|NZ_CP020029|CRT TCAAATCTAATTATTGATGATATTGAAAATAGAAGA >5.2|1492234|36|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAGCACAAATTAAATCTGCAAAGGCTCATGGTCTTA >5.3|1492300|35|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTAGTAGTGGCAGCTTTCCAGTTGTCATTCATTC >5.4|1492365|35|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GGTGAGAGTGCTGCTAACATCCAATCACTAAATGA >5.5|1492430|36|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGATGCCATAAAAATTGACTATTTGTGCGGTAGCGA >5.6|1492496|36|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TACTTCTCAATCAGCTTTTCAGCATCTTTTTTATCT >5.7|1492562|37|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCGATCACTGGACTAAGCACAAAACCACTTCAGTTGA >5.8|1492629|35|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACTTCCGAAGTACCATTGCCACCAGCCACTGCATG >5.9|1492694|36|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AACGGCATAAACCATTGAGTCGACATTGTCATCGTG >5.10|1492760|36|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAGCTCCATTAATGCTGACTTAATCCCCCATGCAGT >5.11|1492826|37|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTATCGGCTTACTGGCTGGCGTAGATTTGATTCTGTG >5.12|1492893|36|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TACTTTCACCCATTGTTTTAGCAACGGCAGAAATAC >5.13|1492959|36|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAGTGCCCCTGCGCGCTTATATGCACTCATGCTAGT >5.14|1493025|35|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTGCTCACAGCCAGGGCTATGCGATTGATTTTTC >5.15|1493090|35|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCCGTCGAAGTATTTCATAGCATCGTCTTTCCAGA >5.16|1493155|37|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCTCACCGTCAACCACAGCAGAAGTCGGGCCATTGTC >5.17|1493222|37|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GATCAGTAAACTTAATTCCGTCTAATCGATAGTAGAA >5.18|1493289|35|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAGAAGTTGTTGTTGAAGACTTTTCATTTTTAGGT >5.19|1493354|37|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GAAGAAAGTTAAAGAAATATCGAAAAATGGTAAATCA >5.20|1493421|35|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTTTTAGTAGTAACCACAGAAGTTAAATAATTAGA >5.21|1493486|35|NZ_CP020029|CRT,CRISPRCasFinder CTTTTAGTAGTAACCACAGAAGTTAAATAATTAGA |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020029_5
The CRISPR arrays of NZ_CP020029_5 >merge|NZ_CP020029|5|1492138-1493550|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGCACCACGCGTATTAAGTTAAATAAAAACTCAAATCTAATTATTGATGATATTGAAAATAGAAGACTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACCAGCACAAATTAAATCTGCAAAGGCTCATGGTCTTACTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACATTAGTAGTGGCAGCTTTCCAGTTGTCATTCATTCCTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACGGTGAGAGTGCTGCTAACATCCAATCACTAAATGACTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACTGATGCCATAAAAATTGACTATTTGTGCGGTAGCGACTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACTACTTCTCAATCAGCTTTTCAGCATCTTTTTTATCTCTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACGCGATCACTGGACTAAGCACAAAACCACTTCAGTTGACTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACACTTCCGAAGTACCATTGCCACCAGCCACTGCATGCTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACAACGGCATAAACCATTGAGTCGACATTGTCATCGTGCTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACAAGCTCCATTAATGCTGACTTAATCCCCCATGCAGTCTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACTTATCGGCTTACTGGCTGGCGTAGATTTGATTCTGTGCTTTACATTTCTCTTCAGTTAAATAAAAACTACTTTCACCCATTGTTTTAGCAACGGCAGAAATACCTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACAAGTGCCCCTGCGCGCTTATATGCACTCATGCTAGTCTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACTTTGCTCACAGCCAGGGCTATGCGATTGATTTTTCCTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACTCCGTCGAAGTATTTCATAGCATCGTCTTTCCAGACTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACTCTCACCGTCAACCACAGCAGAAGTCGGGCCATTGTCCTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACGATCAGTAAACTTAATTCCGTCTAATCGATAGTAGAACTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACCAGAAGTTGTTGTTGAAGACTTTTCATTTTTAGGTCTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACGAAGAAAGTTAAAGAAATATCGAAAAATGGTAAATCACTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACCTTTTAGTAGTAACCACAGAAGTTAAATAATTAGACTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAACCTTTTAGTAGTAACCACAGAAGTTAAATAATTAGACTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC >NZ_CP020029|5|3|1492138-1493550|CRT AGCACCACGCGTATTAAGTTAAATAAAAAC TCAAATCTAATTATTGATGATATTGAAAATAGAAGA CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC CAGCACAAATTAAATCTGCAAAGGCTCATGGTCTTA CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC ATTAGTAGTGGCAGCTTTCCAGTTGTCATTCATTC CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC GGTGAGAGTGCTGCTAACATCCAATCACTAAATGA CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC TGATGCCATAAAAATTGACTATTTGTGCGGTAGCGA CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC TACTTCTCAATCAGCTTTTCAGCATCTTTTTTATCT CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC GCGATCACTGGACTAAGCACAAAACCACTTCAGTTGA CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC ACTTCCGAAGTACCATTGCCACCAGCCACTGCATG CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC AACGGCATAAACCATTGAGTCGACATTGTCATCGTG CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC AAGCTCCATTAATGCTGACTTAATCCCCCATGCAGT CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC TTATCGGCTTACTGGCTGGCGTAGATTTGATTCTGTG CTTTACATTTCTCTTCAGTTAAATAAAAAC TACTTTCACCCATTGTTTTAGCAACGGCAGAAATAC CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC AAGTGCCCCTGCGCGCTTATATGCACTCATGCTAGT CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC TTTGCTCACAGCCAGGGCTATGCGATTGATTTTTC 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CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC ATTAGTAGTGGCAGCTTTCCAGTTGTCATTCATTC CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC GGTGAGAGTGCTGCTAACATCCAATCACTAAATGA CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC TGATGCCATAAAAATTGACTATTTGTGCGGTAGCGA CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC TACTTCTCAATCAGCTTTTCAGCATCTTTTTTATCT CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC GCGATCACTGGACTAAGCACAAAACCACTTCAGTTGA CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC ACTTCCGAAGTACCATTGCCACCAGCCACTGCATG CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC AACGGCATAAACCATTGAGTCGACATTGTCATCGTG CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC AAGCTCCATTAATGCTGACTTAATCCCCCATGCAGT CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC TTATCGGCTTACTGGCTGGCGTAGATTTGATTCTGTG CTTTACATTTCTCTTCAGTTAAATAAAAAC TACTTTCACCCATTGTTTTAGCAACGGCAGAAATAC CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC AAGTGCCCCTGCGCGCTTATATGCACTCATGCTAGT CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC TTTGCTCACAGCCAGGGCTATGCGATTGATTTTTC CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC TCCGTCGAAGTATTTCATAGCATCGTCTTTCCAGA CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC TCTCACCGTCAACCACAGCAGAAGTCGGGCCATTGTC CTTTACATTTCTCTTAAGTTAAATAAAAAC 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>NZ_CP020029.1|WP_065866562.1|1487883_1490547_-|DNA-polymerase-I MADEKLLLIDGNSVAFRAFYALYRQLESFKSPDGLHTNAIYAFKNMLDVLLKDVDPTHVLVAFDAGKVTFRTKMYGEYKGGRAKTPEELLEQMPYIQEMLHDLGIKTYELKNYEADDIIGTFAAKGEKAGFTTTIVTGDRDLTQLASDKTTVEVTKSGVSQLEAYTPEHMKEVNGVTPTEFIDMKALMGDNSDNYPGVEGIGPKTASNLIQEYGSVENLYDHIDEMKKSKRKERLIRDKDKAFLAKKLATIDRDSPVTIDIDDVKREPVDYEKLRQFYEKMNFRKFLAELNASGAGQDGAEVEKVEYTVLNDDNVKDVKATEKDTVEFYLEMLGANYHLADFVGFSLKINDKIYVSRDVDLLEEDNIKHILEDEKIKKNVFDLKRSMVGAHRLGIHTHGLDYDMLLASYLVNNENNSNDLGEIAHLYGDYSVKTDLEVYGKGKSEHIPDDDDELFNHLASKVNAIESLKKTLLEKLKDHEQDALFDTIEIPTARVLARMEMNGMRVETSTLIQLQNEFAVKLKKLEDKIYGQAGEKFNLNSPKQLGHILFEKLGLPVIKKTKTGYSTSVEVLDQLKTQSPIVSKILDYRQIAKIQSTYVKGLLDVIQPDGRVHTRYLQTLTATGRLSSVDPNLQNIPTRTEEGKQIRKAFVPSEPDGYIFSCDYSQVELRVLAHVSGDQNMQEAFKTGYDIHSHTAMKIFHLESPDEVTPLMRRHAKAVNFGIVYGISDYGLSKNLGISRKRAQEFIDNYFEQYPQIKDYMNKAVQEARDKGYAETIMHRRRYLPDIHAKKYTVRAFAERTAINSPIQGSAADIIKIAMINMQKKLDELHLKTKMVVQVHDELIFDVPKDELETIKKIVPEVMQSAVKLDVPLIADSGWGHNWYDAK >NZ_CP020029.1|WP_003627142.1|1487044_1487875_-|DNA-formamidopyrimidine-glycosylase MPEMPEVETVRRTLIPLIKGKTIEKVILWYPKIVATDHEKFLSELPGKKIIDIDRYAKYLLIRLSDNLTIVSHLRMEGKYHLTTSDAPKDKHDHVEFIFTDGTALRYNDVRKFGRMQLILTGTERQTTGIGKLGYEPNSSEFTSEYLVNGLKRKKKNIKNTLLDQSVVAGLGNIYVDEVLWRTKIHPLSQANKIPAEKVMELHDQINQIITEAIKLQGTTVHSFLNANGQVGGFQSKLQVYGHVGEPCPVCGTKFEKIKVNGRGTTFCPHCQVIYK >NZ_CP020029.1|WP_065866561.1|1486445_1487048_-|dephospho-CoA-kinase MSYVLALTGGIATGKSTADDFFRKKNIPIIDCDQIARELMEPGNASWQAIKDHFGMEYLNSDQTINRKKLGQLVFSNKQALSELNQVTHPLIFDKTVAKIKEYRDFALVILDAPVYFEAGLDNKHVANGVLVITLPEQLQIERLKKRNNLTDQEAINRINSQMPLVEKEKMADFVVANTGTIKELENKLKQVLIKIREEE >NZ_CP020029.1|WP_003627138.1|1485975_1486443_-|transcriptional-repressor-NrdR MECPNCHQNASRVIDSRPSDENRAIRRRRECENCGFRFTTFERIETAPLLVIKNDGTREPFNRKKILHGVMAAGQKRPISSDQFEQLVDHVENKVRKQGISEISSKKIGQYVMDELADLDDVAYIRFASIYREFKDMSSFMKTMEDMMAKKGKGN >NZ_CP020029.1|WP_065866560.1|1484641_1485973_-|chromosome-replication-initiation-protein MFETADPKHLYYVANRIRLFPEDEKVLIKLYQPLVGAVAVALYQTLIQNYDPYGIISDSKGIYSLQEQLDCSLKQLFNSLHKLEAVGLVQTFLSDNVFNNVLVFKLLQVPAADKFFATPLLASLLKEKVGVPTFHDLSHAFAQEAKLKEKPIKNAKDVSANFFDVFRLPGDEAITPSSDVVQAAQENKVHEVETAKVNDHDSIDWDFIKQEYSRYQIPASEIDLNKEQIRGLIQTYGLSEKEFVDESLPCLHGSYSLNMRDISNTLAENYKRTNTRENVQTQLNEGRKKALATIKDMDDNDKKLLKAANESSPAEFLYKLKTQKGGITSANEKQIINNLHTQYGLPEDLINILTYTCLTYDTVVSSNLAYKIANDWLQHGVATAVQALQYVKKRRNSFGKKRPVRTYQKRVEKGTDWSKKKADRDAGISTEQLKNLFKDLNNK >NZ_CP020029.1|WP_012212130.1|1483700_1484609_-|primosomal-protein-DnaI MEPIDKVIKKIVKERNLGDAQSLISQALHDPDVQAFLTANANKIDQKMVQNSMSNLYEYYSQKHTANKVMAGYAPQLFLNGKVIDIRYVPTKAKLAQDRKQAAERRLQLIDVPTRLHDVSLSEIDVNDDRKQVLTLIYDFLRKYKQDPHVQGLYLSGDYGVGKTYILAGLANYVVTNMNKNVVFLHVPTFIAGLASHFDDNSLQSEIRRLSECDLLILDDIGAESLSQWSRDDVLGVILQARMDNVLPTFFSSNLDMEALESHFEETRNATDPVKARRLMQRVRFLAKEVVVSGPDRRNSLH >NZ_CP020029.1|WP_065866559.1|1481475_1483410_-|threonine--tRNA-ligase MSFSITLPDGSKKDFEESLTIADLAQNIATSLGKAAVAGKVNGELKPLDYKLDSDSEVAIITNKDEEGLDVLRATAAFVFEAVAKCEYPELRLGEHVADEGGFYVDTDKDDQIKVGELPKLEKAMQKVIKNGEKIEHVQIAKSELEDLYKNDKFKSELLAKVEGDTVDAYKLGDFVDFGFDALLPNTGKIKQFKLLSVAGAYWLGKSSNPMLQRIFGTAFFKEADLKADLKRRQEIKERDHRTIGRDLDLFFVDPKVGAGLPYWMPKGATIRRAVERYIIDREVADGYQHVYTPVLMNLDAYKTSGHWAHYRDDMFPPMDMGDGEMLELRPMNCPSHIQIFKHHIRSYRDLPLRVAELGMMHRYEKSGALSGLQRVREMTLNDGHTFVALDQVQTEFAKILKLIMEVYKDFDITDYYFRLSYRDPKNTDKYFANDEMWEKSQKMLKGAMDDLGLDYVEAEGEAAFYGPKLDIQTKTALGNDETMSTIQLDFMLPDRFGLTYVGKDGEEHRPVMIHRGIVGTMERFIAYLTEIYKGAFPTWLAPVQAEIIPVNNEAHGEYAEKVRAELAKRGFRVEVDDRNEKMGYKIRESQTQKVPYTLVLGDEEMKSGKVNLRRYGTDEEISKSLDDFINEIDADVKSYSREN >NZ_CP020029.1|WP_065866558.1|1480112_1480643_-|hypothetical-protein MKKKLLLFLGAILLILGFAKLSSVNADAATIKATDWGAKKVFTTPKKTRGVWYYKEGKKVKKFKITAHTIDGVKLYKELNGKTSDRWVNKLIKADKKSVYKLADKVGESAWACHTIKYHKIIGFNADGWLAGSGDGFYYVPVKKNVKGKKVNALRVGEGAGNYLSYYAYKSRKLVK >NZ_CP020029.1|WP_147628274.1|1478741_1479059_-|ACT-domain-containing-protein MYYCNLRKNDFYFFAKTDEELSLVCETKNAPSKTINREDGWRAFKIEGQLDFSLIGILAKIAQLLANNGISIFAVSTFNTDYILVKDNNFDSAIKILSENNYEIK >NZ_CP020029.1|WP_012212123.1|1477484_1478735_-|DUF389-domain-containing-protein MSRKNYLSPQFLTKISEDGTLNIESLIILTCAIFIASIGLNVNSTATIIGAMLISPLMGPLLAIGTGLALYNTNILRKGAISLLAEIVISLVASTIYFHFSPLTYASQEIIARTSPTIWDVMIAFFGGSAGIIGARKKDANNIVPGVAIATALMPPLCTVGYSIAAGNLKYFLGSGYLFLINCVFITLTAFLGVKIMKWLSHSAGQPGLSFFRKPTLKETGIVLVVIILIIPSILSAGHMVNKTLVDQNVQNLVAHELGDVDLIKENVDLQEKTINLTVSGKKINTKKIQAAKANLAEYNLKGYSLNIVQVAQVNPNAENQLDRQVNNILNQRQREQEQANEERQQEQEKHNQEIEKLSPAISSVTAVSDNKNKQITLIELKKNISAKKKKALVKQIKEKYPNINLVEFVQESEKE >NZ_CP020029.1|WP_023192833.1|1493734_1494016_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYVILVYDIVMDKQGAKVSRHVFKICKKYLTHVQNSVFEGELTKSQLESLKNELDRWIRQNVDSVIIFKNRNKDWLDKEFMGQDLTDLTSDIF >NZ_CP020029.1|WP_065866563.1|1494021_1495011_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MEDYYLFSSGELERKDNTVRLTRSDGKYKDLKIEVTRDIYLFGEVSTNTKCLNYLAQMKIPVHFFNYYGFYTGSFYPKEQNVSGTLLIQQVQAYTDPKRRLYYAKKFVLGAAKNLLRNLKYYQRRGRNLDDSIKEITSLIRQIDQVHDVEELMGVEGTIHRRYYASWQSVFIPDVDFSKRVRRPPDNMVNTLISFLNGLMYTTCLSEIYVTQLNPAISYLHSPMDRRFSLCLDISEIFKPMIVDRLIFSLINKNMISEEDFNKESNYCYLSEKSKRIIVSEYDKYMKQKVRYKTLHRDVSYRHLIRLECYKLVRSLVEGETYEPYVMGW >NZ_CP020029.1|WP_065866564.1|1495020_1495512_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MRVTGNMVNYFFVCKRKLWLFQHQIGFEQTSERVQLGSLLDRTSYQGHGTHHLMIDNLINIDMVENWQLIHEVKRSDAIEPAAIWQLKYYIYYLRKKGVNISKGLLDYPRLKKCVKVDYTDEDEKQMEKYISEIEQICEQVTPPKPQFKPICKSCAFYEYCFS >NZ_CP020029.1|WP_065866565.1|1495527_1497957_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MNEYLAKSLDQSEGNHCETIVEHTNNLLKQYSLLKQAYPDIFQNFWLSQDRFNDMTKQVDIRSKDDWRLLEIACSYHDLGKMNLRFQKKVKAGQSFCKGEIPHALLSITMLPIDELQKHYTKDQIIALIFAIKWHHERNFSEIYEKHYEDEIEALKKEFASFDYSKSSFPIPPQEPAKVDSKYLTGNLSHRLSPNYEPKIYDEFVILKGLLNRIDYAASGHYEIESKSRVCLSQNILQEWHKKNPVADWNELQKYTYDHRNESIVVVGQTGLGKTESALRWLDNSKSFFVLPLKSAINSIYDRISGIVFQNKSHENLALLHSDMMAKALSEKFDDEDNFEEFVNEERSWSKQLSVATLDQIFNFVYHYKNYEPKLATLAYAKVVIDEIQMYSPDLLGYLIYGLGEIQKFGGKFEIMTATLPPFLIDLLESNGLEFKQAPHPFLDPKVNHRHKVKVLHKQINSDDIINLDRHQKTLVVCNTVKSATELYSELKQKGVSDVHLIHSRFIRKDRNEREKEILEFGQKENHSSGIWIGTQVVEASLDIDFDMLITELSELCGLFQRMGRCYRKRNYEGKEPNVYVFDGGDKLTSGIHESKQEYDDKRYHSVVDYHLFEISKRALAQVDGYLTESDKLKLIDENYTTDKLLDENCQLIDKVNDCIDYLNDLTFLDNLKTKEEVVNTFRNINTIDIIPEQVFLENKDKLEAAAKALNNYIRREDFLDQTEYKKQHQILVKEKIKAREVINNYLVGIPLYIISKVSKQDRWIKDKALNEVGYNILPADFNYDSMTGLSYNDSKNKNAEIDDDDNIF >NZ_CP020029.1|WP_065866566.1|1498099_1498813_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 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MGETSTVTIDFRINSWLENAGIVGLTRILKANPRYRGSYKEKENTLEVDPKVFDNFSDLYFNFFIKNYGQATRYWRIVSEENFLKSLKENGFKDFDNKKLKELTDWFDNVLKYSVNSASYKKVIKFINSDYDIKAEVKDCNKKIRTLNKKNFLTESPEEAKEILQELINQLLKAIEYFSTDQARKYFPAKTLSYTVINKAWNGVSFLNPQAKNLDFYDDYQNYFVAPVQKYLQEDHSKDKYICSTCGRPIKRLEYSYGFLNDMGYDLNRKTSNAWNFKNDLYICPVCQFLYSLVPAGFTYNMASQGIFINENSSIRNLQGKNDATFNSMMRDIRSNTQTSPYRAFSAAFRDAEASGQNAVLANIQLITYNNDHYNFQIIPIVASKVLIKAVEKKYTVKQTGEVKSYLANLYNAGISNFRGAGYYSILDNVLNCLFNNTNLFSIIQELELLKVGNTAGCYYNTFQIMTVIRMNGWFLNELHKYRRSENPMKVEEDKLTKARGCGMHVRMGYDNENKAKTLAYKMLEAIRANSTDRFMELLLNAYLYLDKTVPKIFIETQSNTEVFKEYAFAFIAGLIGSSNAEQDK >NZ_CP020029.1|WP_003627162.1|1501495_1502251_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRFGIPIHLLPKNSEEKEIKINIDYDAYILSLIKTGLSTENPALFKELFGKPTQKNYSTSVFFPNATFTKDNIVLDKNGEMKLYFSTANTNLAINFYNSFVYLDHLDAEKLPFGHSYLADVKKLYTIELPKITKDRVIFKTMSTIVIRNDEGRFISCPNDSTEEGLAEFNDALRRNTFNKLRDNESLASTVKGLKFKPIKMRKTVRKSFGLNIECTKGIFELEGNPTLLNFIQESGLGEKTGTFSGMISLA >NZ_CP020029.1|WP_003629695.1|1504740_1505394_-|flavodoxin MFGRTYSDLGPVVGQINGEDIRANQLERRGYDWENGYGTPSDGQDTNRDGQPVRKLTKDAKSIIIFWSCSGSTKLLASKIARETGADILEITLRNPYPANYRKTLNRANCERIQNDPPELEMLSQYDTIYLGYQTWAMTLSQPMRAFLLEYGGEFSNKKIAPFLSEGGYGSGDSTELIREFIARDGGKNNTYTSALVVDGNRVDESDVEVKRWLKTI >NZ_CP020029.1|WP_003629702.1|1505538_1506420_-|SPFH-domain-containing-protein MMARIIIGIIVVLVIVYVCCGFKIVPQNNEGLVETLGKYSKTVKAGFIFVWPLFQRIRKVPLALQPLEISKYSIITKDNAEISTSLTLNYLVTDSYRYFYNNTDSVESMVQLIRGHLRDIIGRMDLNAALGSTKEINDQLFTATGDLTDIYGIKVVRVNVDELLPSAEIQHAMDKQLTADREKTAAIAKAEGEARTIGMTTKAKNDALVATAKANAEAVKTQADADAYRVQKMQEALSKAGEGYFRNQSLDSFNQLAQGPNNLIVVGKDEMTDLGKVPTLRKVWDASDDKKDK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020029_4 | 4.5|1490997|36|NZ_CP020029|CRISPRCasFinder,CRT | 1490997-1491032 | 36 | NZ_CP020029.1 | 985890-985925 | 0 | 1.0 |
NZ_CP020029_4 | 4.12|1490998|36|NZ_CP020029|PILER-CR | 1490998-1491033 | 36 | NZ_CP020029.1 | 985890-985925 | 0 | 1.0 |
NZ_CP020029_5 | 5.20|1493421|35|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1493421-1493455 | 35 | NZ_CP020029.1 | 1661027-1661061 | 0 | 1.0 |
NZ_CP020029_5 | 5.21|1493486|35|NZ_CP020029|CRT,CRISPRCasFinder | 1493486-1493520 | 35 | NZ_CP020029.1 | 1661027-1661061 | 0 | 1.0 |
1. spacer 4.5|1490997|36|NZ_CP020029|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 985890-985925, mismatch: 0, identity: 1.0
aatgaaaaggtggcgcaagatatgagtttttacgat CRISPR spacer aatgaaaaggtggcgcaagatatgagtttttacgat Protospacer ************************************
2. spacer 4.12|1490998|36|NZ_CP020029|PILER-CR matches to position: 985890-985925, mismatch: 0, identity: 1.0
aatgaaaaggtggcgcaagatatgagtttttacgat CRISPR spacer aatgaaaaggtggcgcaagatatgagtttttacgat Protospacer ************************************
3. spacer 5.20|1493421|35|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to position: 1661027-1661061, mismatch: 0, identity: 1.0
cttttagtagtaaccacagaagttaaataattaga CRISPR spacer cttttagtagtaaccacagaagttaaataattaga Protospacer ***********************************
4. spacer 5.21|1493486|35|NZ_CP020029|CRT,CRISPRCasFinder matches to position: 1661027-1661061, mismatch: 0, identity: 1.0
cttttagtagtaaccacagaagttaaataattaga CRISPR spacer cttttagtagtaaccacagaagttaaataattaga Protospacer ***********************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020029_5 | 5.7|1492562|37|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1492562-1492598 | 37 | NC_019782 | Lactobacillus phage AQ113, complete genome | 9068-9104 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP020029_5 | 5.12|1492893|36|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1492893-1492928 | 36 | NC_024206 | Lactobacillus phage phi jlb1, complete genome | 25770-25805 | 2 | 0.944 |
NZ_CP020029_5 | 5.12|1492893|36|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1492893-1492928 | 36 | DQ320509 | Lactobacillus phage KC5a, complete genome | 25750-25785 | 2 | 0.944 |
NZ_CP020029_5 | 5.18|1493289|35|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 1493289-1493323 | 35 | NC_019782 | Lactobacillus phage AQ113, complete genome | 33793-33827 | 4 | 0.886 |
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1. spacer 5.7|1492562|37|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_019782 (Lactobacillus phage AQ113, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcgatcactggactaagcacaaaaccacttcagttga CRISPR spacer gcgatcactggactaagcacaaaaccacttcagttga Protospacer *************************************
2. spacer 5.4|1492365|35|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_019782 (Lactobacillus phage AQ113, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ggtgagagtgctgctaacatccaatcactaaatga CRISPR spacer agtgagagtgctgctaacatccaatcactaaatga Protospacer .**********************************
3. spacer 5.12|1492893|36|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_019782 (Lactobacillus phage AQ113, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.972
tactttcacccattgttttagcaacggcagaaatac CRISPR spacer tactttcacccattgttttagcaactgcagaaatac Protospacer ************************* **********
4. spacer 5.12|1492893|36|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_024206 (Lactobacillus phage phi jlb1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
tactttcacccattgttttagcaacggcagaaatac CRISPR spacer tacttacacccattgtcttagcaacggcagaaatac Protospacer ***** **********.*******************
5. spacer 5.12|1492893|36|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to DQ320509 (Lactobacillus phage KC5a, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.944
tactttcacccattgttttagcaacggcagaaatac CRISPR spacer tacttacacccattgtcttagcaacggcagaaatac Protospacer ***** **********.*******************
6. spacer 5.18|1493289|35|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_019782 (Lactobacillus phage AQ113, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.886
cagaagttgttgttgaagacttttcatttttaggt CRISPR spacer ctgaagttgttgttgaaaacttttcatttttatct Protospacer * ***************.************** *
7. spacer 3.1|1362334|33|NZ_CP020029|CRISPRCasFinder matches to MN694486 (Marine virus AFVG_250M318, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
tttactttagttttatctgtaactcctgtgtaa CRISPR spacer tttacttttgttttatctttaactgttttttta Protospacer ******** ********* ***** .* * * *
8. spacer 5.1|1492168|36|NZ_CP020029|CRT matches to NZ_AP019369 (Silvanigrellales bacterium RF1110005 plasmid 79K, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tcaaatctaattattgatgatattgaaaatagaaga CRISPR spacer tttcctataaatattaatgatattgaaaatagaatt Protospacer *. * *** ****.******************
9. spacer 5.11|1492826|37|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_022882 (Bacillus thuringiensis YBT-1518 plasmid pBMB0233, complete sequence) position: , mismatch: 11, identity: 0.703
ttatcggcttactggctggcgtagatttgattctgtg CRISPR spacer ctcccattttactagcttgcgtagatttgattctaat Protospacer .* .*. .*****.*** ****************.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
183924 : 242020
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP020029|183924:242020|DBSCAN-SWA 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52 | Bacillus_phage(20.0%) | bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
255039 : 308679
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP020029|255039:308679|DBSCAN-SWA 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46 | Bacillus_phage(20.0%) | transposase,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
317460 : 470814
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP020029|317460:470814|DBSCAN-SWA 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108 | Bacillus_virus(14.71%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
490685 : 555606
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP020029|490685:555606|DBSCAN-SWA 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53 | Bacillus_phage(23.08%) | bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
771905 : 838776
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP020029|771905:838776|DBSCAN-SWA 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53 | Staphylococcus_virus(25.0%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
842212 : 910213
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP020029|842212:910213|DBSCAN-SWA 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58 | Lactobacillus_phage(16.67%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
949429 : 1014662
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP020029|949429:1014662|DBSCAN-SWA 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56 | Staphylococcus_phage(13.33%) | integrase,transposase,protease,tRNA | attL 946616:946634|attR 973656:973674 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1044020 : 1113414
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP020029|1044020:1113414|DBSCAN-SWA 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43 | Bacillus_phage(20.0%) | integrase,transposase | attL 1086096:1086121|attR 1118889:1118914 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1207856 : 1275849
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP020029|1207856:1275849|DBSCAN-SWA 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53 | Lactobacillus_virus(10.0%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1481475 : 1549190
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP020029|1481475:1549190|DBSCAN-SWA 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54 | Bacillus_phage(23.08%) | transposase,bacteriocin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1615774 : 1676371
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP020029|1615774:1676371|DBSCAN-SWA 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48 | uncultured_virus(14.29%) | holin,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1762744 : 1799930
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP020029|1762744:1799930|DBSCAN-SWA 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27 | Lactobacillus_virus(25.0%) | bacteriocin,transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020029.1|WP_012211463.1|1633478_1633850_-|hypothetical-protein |
1633478_1633850_-
Protein sequences of NZ_CP020029.1|WP_012211463.1|1633478_1633850_-|hypothetical-protein>NZ_CP020029.1|WP_012211463.1|1633478_1633850_-|hypothetical-protein MKKFASFVLGAVAGCAAGFIAGSLLVSDEQVDDVKNKIKDNDKLQDLKKKYDNGTEIVKNQLASFPKNVEDDSELKDFDDIVIDDSNKDNDVADGDNAEKSVDDLNNAENDDTASTPDNSSEE |
123 aa aa | NA | NA | NA | 1615774-1676371 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 5.20|1493421|35|NZ_CP020029|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020029 position: 1661027-1661061, mismatch: 0 cttttagtagtaaccacagaagttaaataattaga CRISPR spacer cttttagtagtaaccacagaagttaaataattaga Protospacer *********************************** 2. spacer 5.21|1493486|35|NZ_CP020029|CRT,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020029 position: 1661027-1661061, mismatch: 0 cttttagtagtaaccacagaagttaaataattaga CRISPR spacer cttttagtagtaaccacagaagttaaataattaga Protospacer *********************************** |