Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP015935 | Legionella pneumophila strain C4_S chromosome, complete genome | 0 crisprs | RT,PD-DExK,DEDDh,DinG,cas3,WYL,csa3 | 0 | 0 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
914744 : 921584
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP015935|914744:921584|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP015935|914744:921584|915513_916548_-|WP_010946570.1|DBSCAN-SWA MKPKLLFEQLLSRQDLSSDQMQEVIHACMTGEFSDVQIATFLALMRMKGETVNELTAAAQVMRQLAHKIDLGNPLIDIVGTGGDGRNTFNVSTACSFVVAAAGIKVAKHGNRSVSSRSGSADLLEQAGFILNLSDSQVQNCINQCQLAFLFAPHYHPAMQHARAARQQLGIRTLFNLLGPLINPAQVKRQVVGVFSTNWLKTIATVLANLGSERSLVISSQDGLDEISIAAKSEVVEYRDGNFKQWFISPEDYGLKHSSLDAIIVDSPEQSLHLIQSVLSGDSGPARDIVLLNSAAAIYCAKDGISFDAAIEEARIAIDSGKANLCFNKLRLLTQTLNKESNHE >NZ_CP015935|914744:921584|914744_915521_-|WP_010946569.1|DBSCAN-SWA MNSILERIAKHKLEEVAVAKKNKPLHVLSKQQPGEMRDFITALKSNTSPAVIAEIKKASPSKGLIRKDFNVAEIAKIYTQNGARCLSVLTDIEFFQGHPDYLALAKSKTTLPVLRKDFIIDSYQIYESLVLGADCILLIVALLDDVQLMDFCQLAQELKMSVLVESHTQDELERALRLPTPLIGINNRSLHNFKTDIQLSIQLKQFVPKDKIIITESGINTREDIKLMQSHGINAFLIGESLMRADNIGKALQKLMTD >NZ_CP015935|914744:921584|918915_919443_-|WP_011213328.1|DBSCAN-SWA MNELLEKAKKIKCLICDVDGVLSDGLLHIDNHGNELKSFHVQDGMGLKLLMAAGIQVAIITTAQNAVVDHRMEQLGITHYYKGQVDKRSAYQHLKKTLGLNDDEFAYIGDDLPDLPLIQQVGLGVAVSNAVPQVLEFADWRTERTGGRGAVRELCDLILNAQNKAELAITGYLKQ >NZ_CP015935|914744:921584|920786_921584_+|WP_010946577.1|DBSCAN-SWA MPDNWVEIKNLFFSLDDRCIFDGIDMVVKQGKITAIMGPSGSGKTTLLRLIGAQLRPDSGQIYVNGQNIHQLSRKSLYETRRNMGLLFQSSALFTHLSVFENVAFPLREHTELNASMIRNIVLMKLEAVGLRGAAHLMPAQLSGGMCRRVALARTIALDPVLMMYDEPFTGQDPISMGVLVRLIQRLNQLLHTTTIIVSHDVEETCSIADYIYLISGGKIIGQGTPDELKRSIEPQIRQFMHGEADGVVPFHYPAKPYTEELLNA >NZ_CP015935|914744:921584|917859_918369_-|WP_010946573.1|DBSCAN-SWA MTQLKVKYIILLLLMLCSISGNALPFDKEKMVQVVSDSADLNQKNHQGVYIGNVEFVQGSTNLRAEKAITQGDAKNQLTLAVAEGSKDKQAHYWTTTAPDKPPFHAYADTIKYYPLKHLIELIGNARIEQGPNSLSAAKISYDTQEQHVLSHSDEKTRTTIIIYPEKKS >NZ_CP015935|914744:921584|917137_917863_-|WP_010946572.1|DBSCAN-SWA MSLLEAKQLKKSFKGRTVVNGVSIHIKQGECVGLLGPNGAGKTTCFYMIVGLQSCDEGHIILNGTDITQDAMHLRARHGISYLPQEASVFRKLTVAENIMAILELRKDLDDQKREEKLDLLLQEFHISHIENSLGMALSGGERRRVEIARALAIEPSFILLDEPFAGVDPISVIDIKKIILHLCDKGIGVLITDHNVRETLDICERAYIVSQGKILCEGTPKAILANQQVRQVYLGEEFAL >NZ_CP015935|914744:921584|919456_920419_-|WP_010946576.1|DBSCAN-SWA MNFCTLGLAVIETEAQAVFELTQRIDEHFEKACELLLSCKGRIVVTGMGKSGHIANKLASTFSSTGSPAFFMHPGEASHGDLGMITRQDIVVAISNSGNTHEIVTLLPLLKRLEVPLITLTGNKQSTLAKSADVNLDVSIKQEACPLGLAPTTSTTVSLVMGDALAISLLQARGFSAEDFALSHPGGALGKKLLLKIDDLCHTGEQLPLANENATVSDALIEVTNKKLGMTCVVDNHGYLVGVYTDGDIRRTLTRQFNINTTLIKDVMTKNCRTISKGMLAAEALAIMQKYSITSLVVVENDNRPYAVLHLHDLLKAGVF >NZ_CP015935|914744:921584|918349_918919_-|WP_010946574.1|DBSCAN-SWA MNITKQAIWLFLTLLILAGSGWYYAHFNQAIINKKSLSNEVDTTISQLTVKQFNSEGVLINLLTTPQVEYIPNNNLHLLKNPHIIIKQDNQPAWEINSLRAKSFDGGKQITFIEQVVVHQNPGESTRESTLKTEEITYYPKEKKATTSLFVTFEQPGNIIQSTGMNAYLDEKRVELLHKARGSYDPAKG >NZ_CP015935|914744:921584|916525_917104_-|WP_010946571.1|DBSCAN-SWA MLLIIDNYDSFTYNLVQYFQSLNQKVEVFKNDEIQIDTIRQSAPQYLVISPGPNSPDESGISIEVIKEFHKHIPILGICLGHQCIAQAFGGKIIPAPEIMHGKTSEITHHYQGLFTGIPNHFQATRYHSLAVDIMSLPNCFSIDAWADDTIMAISHRQFPLFGLQFHPEAILSQFGLQILENFLRYETQTSI |
9 | Acinetobacter_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1304216 : 1310153
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP015935|1304216:1310153|DBSCAN-SWA TATGCACGAACAGTTTCTGCTTGCAGCACTTGAACAAGCCAAACTGGGGAGAGGCTTTTGTGCCCCCAATCCCAGCGTTGGGGCGGTTGCTGTGCAAAATGGTAATATTATAGCACAGGCATGGCATAGAGGTGCAGGTACACCGCATGCAGAACAATTATTGTTATCACAAATTCCACCCCAAACGCCAGGGGTTACGCTTTATGTCACGCTGGAGCCTTGTAATCATTGGGGCAAAACTCCCCCTTGTGTTGATGCTATTATCAATCATGGTATAGAGGAGGTTGTTTTTTCCTATTTTGATCCAAACCCCATTGTTGCCAAAAGTAACTCCTCAGAAAAATTACGTGAACATGGAATACAAGTCAGGCATATTCCTGTAAAGGCAATTGATGTGTTCTATAAAAGCTATGCTTATTGGACTATGACCCATAAACCAAGAGTCACTGTTAAAATAGCACAAACTTTTGATGGTAAAATTGGAAAGTCTGAGGGAGCTCGAGTGGTTTTGTCCAATGCTTTATGCGAACAGTTCACTCATCAAATGCGTGCTGCCAGTGATGTCATATTAACCAGTGCCAAGACAGTTCAAATGGATAATCCAAGAATGAACGCCAGATTAGATAGTGGATTGGTAGCAAAGCCAGTTGCCATTGTTGACCGCAATTTAAGTTTGTCTGATGACACAATCATTTTTTCGACAGCAAAACATTGCCACATTTATCATCAACCACAAGCAAATCAGGCAAAGACTTATCCTAATAGCACTCATTATGCGATGCCTTTGCAAAATGGGTTGATGGACCTGGAGGCAATAATAACTCATCTTGGTCAACTGGGATATCATGACGTATGGGTTGAGGCGGGCGGAGCTATTTTTTCTGCGTTACATAGTAAGGGATTGGTGCATAGAACCTATTTGTATTTAGTTCCCGGCAGTTTAGGGCATCAAGCGATTTCAGCTTATCAACAACAGGGGATTTTTGAAAAAGCTCATACGGTGAGTTGGCAAGCTATGGGTGACAATATGATAGCATGTTTGGATTGGCAGGAGGATGAGTGTTTACCGGATTGATAGAAAATACAGGCAAAGTATTAATGAATAGGCAAGGAGAAAATTCTAGTCGTTTAGTCGTATCTTCAAGCTATCAGGATTTGAAACCTGGTGAGAGTATCGCTGTAAATGGGGTTTGTTTAACCCTTTTGCCAGCAGATTTTCCTGAACTGTGTTTTGATATTTCACCTGAAACTCTGCATGTTACCACATTGTCAAAATTATCATCTGGCGACATGGTTAATCTTGAAAGAGCTATGCTGGCATCAACCCGCTTTGGTGGTCATTATGTATCGGGTCATGTAGACACCAGGGCCAAAGTGAAATCCATTCGTGCTGTTAATGAATTTATCGCGATGGATTTGGATGGTTTTATCCCAGAACATAATCATTATTTAATACCCAAAGGTAGCATTACAGTAGATGGAGTTAGCTTGACTATTAATACTGTATCAGAACAAACCGTCGGACTCATGCTGGTGCCACATACATTATCAATGACCAATCTCGGTTCATTGAGAGTGGGCCAGCAAGTCAATATTGAATTTGATTATCTTACCCGTATTGTGGCTCATCAGCTTCAAATTATCGGGAAATTGAACCTAGAGGAAGTGTCATGAAACATTCATTAGCAACAATAGAAGAGGCTGTGGCGACACTTAAAGCCGGTAAAATGATTATTCTAATGGATGATGAAGATAGAGAGAATGAAGGTGATTTGGTGATTGCTGCTGAGCACGCTACTCCTGAAGCCATTAATTTTATGTCTCGTCTTGGTTGCGGTTTAATTTGTTTGCCTATGGCTGAAGAATTGATAGACAAACTCCAACTGCCCATGATGGCTCGGCATAACAAATCGCCGTATGGAACGGCGTTTACGGTTTCGATTGAAGCAGCTAACGGTGTCTCCACAGGCATCTCAGCAAGAGACAGAGCTCGAACAATTCAAGTGGCTATTGATCCAAAAAGCGGGCCATCTGATATCATTTCACCTGGACATGTTTTTCCTTTACGGGCTAGAAAGAGAGGAGTTTTAGAAAGACCAGGTCAAACAGAAGGCAGTGTTGACTTGGTAAAACTTGCCGGATTGACCCCGGCCGCAGTGATTTGTGAAATCATTAATGAAGATGGAACAATGAGCAGACGTGATGAATTAGCTCTTTTTTCAAAAAAACATCAAATCCCTTTAGTCACCATTAAAGATTTAATTCAGTACAGAGTACGGCATGAAAATCTGATTCATCCCGTTGCAACCACACAAATTCCTCTGGAGGAGAACGGTGTTTTTACTATGACTGTTTTTGAGAATCAGATAGATTCCTGTGAACATTTTGTCTTGGTTAAACCCCCTTTGTATGGTAATCAAGTGCCTTTGGTTCGAATTCATTCTGAGTGCATAACAGGTGATGTTTTTGGCTCCAGAAAATGTGATTGTGGAAAGCAACTGGAGTTGTCTTTATCCCAGATCGGAGCGGAAGGCGGTATATTAATTTATTTGCGTCAGGAAGGCCGCGGAATAGGTTTGGCAAACAAATTAAAGGCGTATGCTTTGCAAGAGCAGGGGTTTGATACAGTCGATGCTAATCTGGAATTAGGATTGCCCGCTGACGATAGAGATTATGCCGTAGCATACCAAATACTGAAATATTTAGGGGTTGAAGCATTAAGGTTGCTGACAAATAATCCTTTAAAAATCGCTTCTCTTGAGCGTTATGGAATGAAGATTACTCAACGCATTCCTTTGGAAATTGAGCCCTCCAGAGAAAATCACAGTTATTTAAAAACCAAAAAAATAAAACTGGGGCATTTATTAGCCATTGATTAGGATAAACATGAGAGAGATAAAAACAATTGTTAGTGATGGTGTCACGTTTCCAATAGCGCTAGTTGTAAGTACTTTTAATGAACTGATAACCTCTGCATTAAAAAAAGGGGCGTTAGATAGATTGACTGAACTGGGTTTTAAATCGGAGGACATTACCTTAGTTGAGGTTCCTGGCGCAGTAGAGATTCCGTTTGTTGCACAGTTGCTAGCGAAAAAACAAAAAGTAGAAGTCATAGTGGCACTTGGAGCAGTTATCCGTGGTGAAACCTCTCATTATGATTACGTTTGTGATCAGGTCAGCCAGGGATGCCAAAGGGTTATGTTAGATTATAATATTCCGGTTATCTTTGGTGTATTAACTACTGAAAATGATGAGCAGGCTTTGGCAAGAGTGGGAGGAACTCACGGCCATAAAGGGAGAGATGCGATAGATTGTGCGGTTTCCATGCGTTCTATTAAACAACAATTGCAATAGTTCTATTAATTTTGCTCAAATTTCTGTTATTTATATCTTCATTTTGATAGAATTGAATCCCGTTTACATGCAAATTAAATTGAACACCAAATTGGTGGATTCGGCATTTTGAGCGGGGTCAAAAAATGACAAAATATATTTTTATTACTGGCGGGGTTGTGTCTTCTTTAGGAAAAGGCATAGCAGCCGCATCTCTTGCAGCTATTCTTGAAGCTCGTGGTCTTCGCGTTACGTTGATAAAGCTTGATCCCTACATTAACGTTGATCCTGGTACTATGAGTCCCTTTCAGCATGGCGAGGTTTTCGTAACGAATGACGGGGCGGAGACCGATTTGGATTTGGGACATTATGAGCGCTTTGTTAAAACAACAATGACCAAGCGTAATAATTTCACATCGGGAAAAATTTACGAAAATGTAATTAAGAAAGAAAGACGTGGTGATTATTTAGGAGGGACAGTTCAGGTTATTCCTCATATTACTAATGAAATCAAACGCTGTATCAAACTCGGTGCGGATGCATTCGATGTGGCTATGGTTGAAATAGGAGGAACTGTTGGTGATATTGAATCATTACCCTTTCTTGAAGCAATTAGGCAGATGCGTATTGAGTTAGGTTCACAACGAGCGATATTTATTCATCTTACTTTGGTTCCTTATATTGCTACTTCTGGGGAAACCAAAACCAAACCAACTCAACACTCGGTAAAGGAATTGCGTTCTATTGGTATCCAGCCAGATGTATTGATTTGCCGTTCAGAAAAACCATTATCCATGGCAGACAGGGCTAAAATCGCACTATTCACTAATGTTGAAAAAGAAGCTGTGATTTCTCTTGAGGATGCGAATAGTATTTATCAAATACCTATGATTCTACATGCGCAGCATTTAGACGAAATTGTTGTTAAGAAACTAAGCCTGGAAGCTAAGCAGGCTGATTTGAGCGAGTGGCAACGAGTAGTTGATATGCAAGCAGTTCAAACGATGACAGTGAAAATCGCTATGGTAGGTAAATATACGGAGCTGAATGATGCCTACAAGTCGATTAATGAAGCTTTATTGCATGCTGGAATTCATACTGAAACAAAAGTAGAAATTATCTATTTTGATGCTGAGATGATAGAAAAGCATGGCGCTTTATTGCTTGAATCCATTGATGCTATTTTGGTACCTGGTGGTTTTGGTGAGAGAGGAGTCGAAGGCAAAATTAAGGCTATCCAATATGCTCGGGAGCATAAAGTTCCTTTTTTAGGGATATGTTTGGGTATGCAAACAGCTGTTATTGAATTTGCGAGAAATGTAGTCGGTTTGACAGGAGCTAATTCGACCGAGTTCAATAAAGAAACATTGTATCCAGTGCTTGGTTTAATTAGTGAATGGATGGATGCCGATGGCAGCAAGCAGATCAGGGACGAAAATACTGACTTGGGTGGAACCATGCGTTTGGGCGGACAATACTGTCATCTTGCTGAAGGCACTCTGGCAAGAAAAGTTTATGGCAAACCACAAATTATAGAGCGCCATCGCCATCGATATGAAGTCAATAACAAGTATGTGGATAGTTTGGTAAAACATGGCTTAATTATTTCAGGGCGATCAGCAGATAATTCACTGGTTGAGATGATAGAATTAGCGGACCACCCCTGGTTTTTAGCTTGTCAGTTTCATCCTGAATTCACATCAAATCCAAGAGATAGTCATCCTCTATTTAAGGAGTTTGTACTTGCAGCTCGTATTCACCATCAAGAGAAGGACAAAAAATGAGATTATGTGGTTTTGAAGCAGGCTTGGATAAGCCATTGTTTTTGATTGCCGGCCCTTGTGTTATTGAAAGTGAAGAATTGGCTTTAGAGACCGCAGGATATTTAAAGGAAATGTGCAGTCAGTTGAATATCCCTTTCATCTATAAGTCTTCTTTTGATAAAGCAAACCGTTCATCTATTTCCAGTTACAGGGGGCCTGGCTTTGAAAAAGGGTTATCGATTCTGGAAAAGGTTAAATCACAAATAGGTGTTCCTGTTTTGACTGATGTTCATGAAGACACGCCCTTATTTGAAGTCTCCAGTGTGGTAGATGTATTACAAACGCCAGCCTTCCTATGCAGACAAACCAATTTTATCCAAAAAGTTGCTGCCATGAATAAGCCGGTTAATATTAAAAAAGGACAGTTTCTTGCTCCCTGGGAAATGAAACATGTTATTGCGAAGGCAAAGGCGCAAGGTAATGAGCAAATTATGGCTTGTGAGCGAGGAGTGAGCTTCGGCTACAATAATTTGGTTTCTGATATGCGTTCCCTCGTTATCATGCGTGAAACCGGCTGTCCAGTGGTTTATGATGCAACACATTCGGTTCAATTGCCCGGGGGCAATAATGGTGTATCCGGGGGGCAGAGAGAATTTATTCCGGCTCTTGCAAGAGCAGCTGTAGCTGTTGGAATATCAGGGTTATTTATGGAAACTCACCCTGATCCGGATAAGGCACTAAGTGATGGTCCCAATAGTTGGCCTCTAGATAAAATGAAACAACTTTTGGAATCATTGAAAGCAGCGGATGAAGTATATAAAAAGTACAGTACTGATTTCTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP015935|1304216:1310153|1305274_1305889_+|WP_010946912.1|DBSCAN-SWA MFTGLIENTGKVLMNRQGENSSRLVVSSSYQDLKPGESIAVNGVCLTLLPADFPELCFDISPETLHVTTLSKLSSGDMVNLERAMLASTRFGGHYVSGHVDTRAKVKSIRAVNEFIAMDLDGFIPEHNHYLIPKGSITVDGVSLTINTVSEQTVGLMLVPHTLSMTNLGSLRVGQQVNIEFDYLTRIVAHQLQIIGKLNLEEVS >NZ_CP015935|1304216:1310153|1304216_1305290_+|WP_010946911.1|DBSCAN-SWA MHEQFLLAALEQAKLGRGFCAPNPSVGAVAVQNGNIIAQAWHRGAGTPHAEQLLLSQIPPQTPGVTLYVTLEPCNHWGKTPPCVDAIINHGIEEVVFSYFDPNPIVAKSNSSEKLREHGIQVRHIPVKAIDVFYKSYAYWTMTHKPRVTVKIAQTFDGKIGKSEGARVVLSNALCEQFTHQMRAASDVILTSAKTVQMDNPRMNARLDSGLVAKPVAIVDRNLSLSDDTIIFSTAKHCHIYHQPQANQAKTYPNSTHYAMPLQNGLMDLEAIITHLGQLGYHDVWVEAGGAIFSALHSKGLVHRTYLYLVPGSLGHQAISAYQQQGIFEKAHTVSWQAMGDNMIACLDWQEDECLPD >NZ_CP015935|1304216:1310153|1307694_1309332_+|WP_010946915.1|DBSCAN-SWA MTKYIFITGGVVSSLGKGIAAASLAAILEARGLRVTLIKLDPYINVDPGTMSPFQHGEVFVTNDGAETDLDLGHYERFVKTTMTKRNNFTSGKIYENVIKKERRGDYLGGTVQVIPHITNEIKRCIKLGADAFDVAMVEIGGTVGDIESLPFLEAIRQMRIELGSQRAIFIHLTLVPYIATSGETKTKPTQHSVKELRSIGIQPDVLICRSEKPLSMADRAKIALFTNVEKEAVISLEDANSIYQIPMILHAQHLDEIVVKKLSLEAKQADLSEWQRVVDMQAVQTMTVKIAMVGKYTELNDAYKSINEALLHAGIHTETKVEIIYFDAEMIEKHGALLLESIDAILVPGGFGERGVEGKIKAIQYAREHKVPFLGICLGMQTAVIEFARNVVGLTGANSTEFNKETLYPVLGLISEWMDADGSKQIRDENTDLGGTMRLGGQYCHLAEGTLARKVYGKPQIIERHRHRYEVNNKYVDSLVKHGLIISGRSADNSLVEMIELADHPWFLACQFHPEFTSNPRDSHPLFKEFVLAARIHHQEKDKK >NZ_CP015935|1304216:1310153|1305885_1307094_+|WP_010946913.1|DBSCAN-SWA MKHSLATIEEAVATLKAGKMIILMDDEDRENEGDLVIAAEHATPEAINFMSRLGCGLICLPMAEELIDKLQLPMMARHNKSPYGTAFTVSIEAANGVSTGISARDRARTIQVAIDPKSGPSDIISPGHVFPLRARKRGVLERPGQTEGSVDLVKLAGLTPAAVICEIINEDGTMSRRDELALFSKKHQIPLVTIKDLIQYRVRHENLIHPVATTQIPLEENGVFTMTVFENQIDSCEHFVLVKPPLYGNQVPLVRIHSECITGDVFGSRKCDCGKQLELSLSQIGAEGGILIYLRQEGRGIGLANKLKAYALQEQGFDTVDANLELGLPADDRDYAVAYQILKYLGVEALRLLTNNPLKIASLERYGMKITQRIPLEIEPSRENHSYLKTKKIKLGHLLAID >NZ_CP015935|1304216:1310153|1309328_1310153_+|WP_010946916.1|DBSCAN-SWA MRLCGFEAGLDKPLFLIAGPCVIESEELALETAGYLKEMCSQLNIPFIYKSSFDKANRSSISSYRGPGFEKGLSILEKVKSQIGVPVLTDVHEDTPLFEVSSVVDVLQTPAFLCRQTNFIQKVAAMNKPVNIKKGQFLAPWEMKHVIAKAKAQGNEQIMACERGVSFGYNNLVSDMRSLVIMRETGCPVVYDATHSVQLPGGNNGVSGGQREFIPALARAAVAVGISGLFMETHPDPDKALSDGPNSWPLDKMKQLLESLKAADEVYKKYSTDF >NZ_CP015935|1304216:1310153|1307101_1307569_+|WP_010946914.1|DBSCAN-SWA MREIKTIVSDGVTFPIALVVSTFNELITSALKKGALDRLTELGFKSEDITLVEVPGAVEIPFVAQLLAKKQKVEVIVALGAVIRGETSHYDYVCDQVSQGCQRVMLDYNIPVIFGVLTTENDEQALARVGGTHGHKGRDAIDCAVSMRSIKQQLQ |
6 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2213692 : 2223816
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP015935|2213692:2223816|DBSCAN-SWA ATTATAAGTAACAGCCTACGCCATCATATCCAACGACACGACATTCTTTATAAGCCGATTGATCCAATTCATAGCTTACGGAACCATAATAAGCATAAATCTTTCCATCCTTGGCTTTTTCAATACGTGGCTTCTGATAGCTTACACCAGTTTCACAGCTTGACTTAGCTTGAATCCAGGTCGCAGTACTGTCATTAATGATGTTTTTACCAGGTTTTAATCTATTCTCTCCACATTCATGCGTTGCCAGAGCAATCATTTTAGGCGCTGAGAATAAGACATCATAAGCATTTAATGCTGCCTGCACAGCATTATCCGCATCCAATATTCCATGTCCACAAGGTTTTTTGCCGACACAAGATTTATTGGTGTCGTTGCTTTGCCCAAACTCATGCGTAGTAACATATAAAATTTGTTCAACTTGTTCAGGTTTCAAAGCCTTATTACTGACAGCAAAAATTAAACCTGCTACCCCGGCTACATGAGGCGAAGCCATACTCGTCCCTTGATAAAAATCAAAGCCTGATGAATTGTATCCACCTCCCGGGTTTACGGTAGATAAAATACCTCCCGAAGTGCCATAACGCTTATCACCTCCCGGTGCTGCAAGGGTTATACTGGGCCCATAATTTGAAAAGTACGAACGCAATCCTTCTGGTCCGGTGGAAGCAACCTTGATCGTTCCATTGCACACTGCAGGAGCATTATAGTGTTCCCAAACATTATCATTTCCGGCAGCAACCGCGACTACAGCCCCTTTCTTGCGAGCAAAGAATAAAGCCTCTTGTAAAGCTTCGTCGCAATAATCAATTTCTTTTCCAGGCTCTAAATCGACACCAAAACTCATATTTAATACCTTGGCTGGATGTATATTTTTAGGAACTCCCGGAACATCACCTCCAACAGCCCAATAGATACTATTCACCACAGCACTTTCATAAAACATACCATTTTCGGCAGGAATTTTAACAGTCAGAATTTTTAAATCCTCACCAACTCCGTTCATGACATCGCCATAACCGGCAATGGTACCGGCAACATGGGTGCCATGGTAAGATCTGGTTTCATCAGATAAATCATTGTTATTCCCGGCAAAATTCCATCCAAATACATTACCTTCGTTATCTTTTACAAGGTTATTCACCAAACTGTCATTCAATGCAATCCCAGTATCTAAAACCGCAACAACTATCGGCTTCCTAGACTTTCCTGTAGTATATGCCCATGCGCCATCTCTTAAACCAGGCCTGGACTCCAAACGAATTCCCGCTGGCCTTTCGAATTCATCCCATTGACTCTCATGGGATAACAATTGACTTAACTCCTGGTTTATTACTGGATCAGGGAGAGGCTTAAAATGTCCTATTCTGTCTTTAACTGCATAAAGTACATTGGGATTTTTGCGCAAACGTTCTAAAACTTTGGCTGTAACATCTTCTTCTTTAGACTTGACAATAGCATGGGAATTCGATGTATCAAAAATAAGCGAATAAGCGCCATTGGCCATAGGCTTCATTTCTTTAACGGGTATTTGAACAGATTTAATGACTTGTGATTTCAGTGAAGCAATAGTGGCGGGTTGCTGTTTATATTTAATGATAACCCTGATTGTTTCAGTTTCAGTCATAGCAAAACTGCCACAAGCAAGCGATAAAAGACTTAATCCCAATATTCCTGATTTCAAACCCATACTTCAATCTCCTTTTTAAAGTCAATCCGTAGCCTTGACCAATTTTTAAAAATAAAACCACCTCAGTATGCAGGAGAATAAATATCAACTCAAGAATCAATAAGCCATGAGATTAAATTAAAATCGAGCAATCATTGGACTTCATGTTTTTCCCTATATTCTGTGGGAGTGATTCCTGTCCATCGTTTGAATGCTTTTGAAAAATTGGATGTATCTTGAAAACCCAATAAAAAACAGATCTCGGTCATGGAAATATTATTATTGAGCAAAAATGTCTTTGCTTTTTGTTCTCTTACCTCATCAAGCAACTCTTGGTAAGTCACATCCAATCTCTGCAAATGACGTCTTAGAGTACGAGAAGTCATACATAATCGACTGGCTATCTCATCCATGCTGACGTGATTTAAATTCTGATTGATTAAAATAGATTTAATCTTGCTTGCCATATCCTCTTTTAATGACATTTTTTTTTCAAGTTCTTGCAATTGCCTTTTTGCCAGTTGATAACTGACATCGTCAGCAAAATGGATGGGATAATTCAGTTCCTCCGCTTTAAACCAAACGCGAGTAGCCTCTGTATTAAAAATAATTTTAGTCTGAAAAATTGTTTGATAATATTTTGCATAAGGAGGTTCATCGTAATTTAACTCAATCTTGAGCAATGGGTCATTACAACTAATCAAAAAATTTCTCATTTTAATAAGATGAGTAATTGCCAATTCAGTTATAAAACGTGATAAAACCATTTCTTTTGTGTGTGGTAATAACTTGATATAAGCACTGTTTTCAGTATTAAACTGGCGTAACTCCAGAGACAACAAATTGGTTCGTGTATTAAGGTAACTGAGCACAGTTTGTATAGCAGTTCCAAATGTAGGACTGCTCATTGCTGCATACCCAAGAAAACCGTGATTGACTATAGATAAGTTTTGACCAAAAACCAAACCCAATTCCGGACAATTGCTTAATTTATAAGCTTCCAAAATAACCTGGTTAAATTCATCCTGAGTTAAGTAGGCATCAGGATCATGTACTCTTATCAGATCAAAGCCAATTTTTTCTAAAAAATGGTTAATCCCAAATTGTTCAAGACATTTTTCCAGAGTAGAAAGATAATTTGCCGCTATAACCAGATCCATCAACAGGCTTTTCTTTTTTAAGTGATAAGTGAATTAATTCTAATCTATATTAGAGTATAAGATCCAATAATGTATAAAAATTCAAGATTTAGTTATCTTGACTAAATCTTGAATAAAATTAGTTTAATAACGATAATGATCCGGCTTGTAAGGTCCATTTTTATCAACGCCGATATAATCAGCCTGCTCATTACTTAATTGAGTTAATTTTGCACCAATACGTCCCAAATGCAAACGGGCTACTTTTTCATCCAAAACTTTTGGAAGTACATATACTTGATTCTGGTATTGGCTAGAGTTTTGGAACAGCTCAATCTGCGCTAATACTTGATTGGTAAAGGAAGCAGACATGACAAAGCTCGGATGGCCTGTAGCGCAGCCCAAATTCACTAAACGCCCTTCAGCCAGGATAATAATCCGCTTTCCATCAGGAAAAATCACATGATCAACCTGCGGCTTGATATTTTCCCATTGATACTGTTTTAAGCTTTGAATATCAATTTCGGAATCAAAATGGCCTATGTTGCACAATATCGCCTGATTACGCATACGTTTCATGTGATCGTGAGTTACAACATGGTAATTGCCAGTAGCTGTAACTACGATATCCACTTGTTCAGCAACATCATCCAGAGTGACTACTCTGTAGCCTTCCATTGCTGCCTGAAGTGCGCAAATAGGATCAATTTCTGCGACAAGTACAGTGGCTCCCTGTCCGCGCAAGGCCTGAGCGCAACCTTTCCCTACGTCACCATAGCCTAGAATCAAGGCAACCTTACCAGCTATCATAACATCTGTTGCACGTTTTAACCCATCAAGCAGGGATTCCCGACATCCATACAAATTATCAAATTTGGATTTGGTCACCGCATTATTAACATTAATGGCTGGAATTTTTAATTGTCCATGTTTCGCCATTTCGTACAGCCTGGCTACACCTGTAGTGGTTTCCTCAGATACTCCCTTAATTGCAGTCAGTAATTTGGGATGTTTCTGGTGAACAACTTGTGTCAGATCCCCGCCATCATCTAATAATAAATTAGGTGTCCAACCATTGGGGCCACTTAAAGTTTGCTCAACACACCACCAATATTCTTCTTCTGTTTCGCCCTTCCAGGCAAAAACAGGGATTCCTTTTGCAGCAATAGCGGAAGCTGCATGATCCTGAGTAGAAAAAATATTGCAGGAAGACCAGCGTACTTCAGCACCCAATGCAACCAGGGTCTCAATCAATACTGCGGTTTGAATCGTCATATGCAGACAACCTGCAATCCGAGCGCCTTGAAGTGGTTTTTTCGCAGAAAATTCCTCGCGTAAAGCCATTAAACCCGGCATTTCGGTTTCAGCTATCGCTATTTCTTTTCGCCCCCAGTCCGCTAATGAAATCTCTGCTACTTTATAATCTTGTAATGTATTGATTTTCTGTACTCCTTCTTCTACCAGTTCCATTAGAGTATCCTTAAAAAATTATAATGCCTTGCTTAATTCAGCTACTTTGTCCAATCGCTCCCATGGAAAACTCTCCCTGCCATAGTGCCCATAAGTTGCCGTCTGCCTATAAATAGGACGAAGCAAATCGTGTTGGTCGATAATACCTTGCGGTGTTAAATCAAAATGCGTATGAATTAAATCAATTATTTCGCTGTTTTTTAGTCGTCCAGTACCAAAAGTATCAACAAAAATAGATGTAGGTTCAGCAACACCAATAGCATAGGAAATCTGTAACTCGCATTTATCCGCCAAACCAGCCGCCACAATATTCTTGGCAACATGTCTTGCGGCGTATGCTGCGGAGCGATCTACCTTCGAAGGATCTTTACCTGAAAAACAGCCTCCGCCATGTCTTGCCATACCACCATAAGTATCAACAATGATTTTACGGCCGGTTAAGCCACAATCGCCCAAAGGACCACCAATTACGAAGCGTCCTGTCGGATTAATGAAATACCGGGTCTTATCATTGAGCCATTCAGCAGGAAGAACTGATTTAATAATTTCTTCACGGATCGCCTCAACCAAATCTTTATGCTCAATATCAGGTGAATGCTGCGTAGAAAAAACAACAGTATCCACTTCAACCGGCATCCCTTGTTCATATTTCAAAGTAAGTTGACATTTTGCATCAGGTCTTAACCAGGGTAATTGGCCTGATTTACGAGCTTTAGCTAATT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AATGCTACGATAGAAGGAGTTGTTCTGTGACCTTCACTATTTTCAATTACCTTCGGTTTGTCACCTTCCATGACAGCAACACAAGAGTTCGTAGTACCCAGGTCTATACCTATTATTTTAGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP015935|2213692:2223816|2217987_2219136_-|WP_010947738.1|DBSCAN-SWA MNEVYVFTSESVSEGHPDKIADQISDAILDAILAQDPKARVACEVLVKTGMVLVGGEITTKAWVDVEEITRHVIKDIGYNSSQMGFDWESCAVLSAIGKQSPDIAQGVDNQQTKILGAGDQGLMFGYASRETDVFMPAPIAYAHRLMEKLAKARKSGQLPWLRPDAKCQLTLKYEQGMPVEVDTVVFSTQHSPDIEHKDLVEAIREEIIKSVLPAEWLNDKTRYFINPTGRFVIGGPLGDCGLTGRKIIVDTYGGMARHGGGCFSGKDPSKVDRSAAYAARHVAKNIVAAGLADKCELQISYAIGVAEPTSIFVDTFGTGRLKNSEIIDLIHTHFDLTPQGIIDQHDLLRPIYRQTATYGHYGRESFPWERLDKVAELSKAL >NZ_CP015935|2213692:2223816|2221881_2223816_-|WP_015444335.1|DBSCAN-SWA MAKIIGIDLGTTNSCVAVMEGDKPKVIENSEGHRTTPSIVAFTDDNEILVGQSAKRQSVTNPEKTLFAIKRLIGRRFDDPIVQKDIKMVPYKIMKADNGDAWVRVKDQDKAPPQISAEVLRKMKKTAEDYLGEEVKEAVITVPAYFNDSQRQATKDAGRIAGLEVKRIINEPTAAALAYGMDKKRGDSVIAVYDLGGGTFDISIIEIAEVDGEHQFEVLATNGDTFLGGEDFDLALIEYLASEFKKDTGIDLHNDPLALQRLKEAAEKAKIELSSAQQTDVNLPYITADASGPKHLNIKLTRAKLESLVEKLVERTIEPCKTALKDAGLTVSQINEVILVGGQTRMPLVQKTVEEFFGKEPRKDVNPDEAVAVGAAIQAAVLSGEVKDILLLDVTPLSLGIETMGGVMTKLIEKNTTIPTKATQVFSTADDNQTAVTVHVLQGEREQASANKSLGRFDLRDIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAKDKATGKAQSIVIKASSGLSEEEVAAMVKDAQSHAEEDKKFKEMAELRNQADSLIHSCEKSMKDLADELSEDEKRGIETAISELKEAVQGTDKARIEDKLKVLTDASAKMAERIYAKKSSEGQAAQGQTQSQESTKPAEEGVVDAEFEEVKEEDKK >NZ_CP015935|2213692:2223816|2216643_2217969_-|WP_010947737.1|DBSCAN-SWA MELVEEGVQKINTLQDYKVAEISLADWGRKEIAIAETEMPGLMALREEFSAKKPLQGARIAGCLHMTIQTAVLIETLVALGAEVRWSSCNIFSTQDHAASAIAAKGIPVFAWKGETEEEYWWCVEQTLSGPNGWTPNLLLDDGGDLTQVVHQKHPKLLTAIKGVSEETTTGVARLYEMAKHGQLKIPAINVNNAVTKSKFDNLYGCRESLLDGLKRATDVMIAGKVALILGYGDVGKGCAQALRGQGATVLVAEIDPICALQAAMEGYRVVTLDDVAEQVDIVVTATGNYHVVTHDHMKRMRNQAILCNIGHFDSEIDIQSLKQYQWENIKPQVDHVIFPDGKRIIILAEGRLVNLGCATGHPSFVMSASFTNQVLAQIELFQNSSQYQNQVYVLPKVLDEKVARLHLGRIGAKLTQLSNEQADYIGVDKNGPYKPDHYRY >NZ_CP015935|2213692:2223816|2220552_2221692_-|WP_010947740.1|DBSCAN-SWA MEQRDYYELLEVSRNASDAEIKKAYRRLAMKYHPDRNPGDTSAEEKFKEIQKAYNILSDKQKRAAYDQFGHAGVDPSMGGGPGGFGGFGGFGDVFEDIFENIFSGGRGHGRQSRGQRGADLQFNVQLTLEEAAIGKEVEITVPRHGTCTVCEGSGAKKGTSPKTCETCQGMGQVRIQQGFFSIQQTCPTCHGEGKIISDPCASCHGQGRVRESKKINVKIPAGVDNGDRVRLSGEGEAGVHGGGSGDLYVQISLKKHAIFERHENDLHCEVPISFATAALGGSIEVPTLEGRVTLKIPAETQTGKVFRLRSKGMKSVRGYGQGDLLCKVVVETPVNLSREQKELLNKLQDSLENAKGTHSPKTSSWFAGVKKFFEDMKF >NZ_CP015935|2213692:2223816|2215512_2216520_-|WP_015444337.1|DBSCAN-SWA MDLVIAANYLSTLEKCLEQFGINHFLEKIGFDLIRVHDPDAYLTQDEFNQVILEAYKLSNCPELGLVFGQNLSIVNHGFLGYAAMSSPTFGTAIQTVLSYLNTRTNLLSLELRQFNTENSAYIKLLPHTKEMVLSRFITELAITHLIKMRNFLISCNDPLLKIELNYDEPPYAKYYQTIFQTKIIFNTEATRVWFKAEELNYPIHFADDVSYQLAKRQLQELEKKMSLKEDMASKIKSILINQNLNHVSMDEIASRLCMTSRTLRRHLQRLDVTYQELLDEVREQKAKTFLLNNNISMTEICFLLGFQDTSNFSKAFKRWTGITPTEYREKHEVQ >NZ_CP015935|2213692:2223816|2213692_2215381_-|WP_010947735.1|DBSCAN-SWA MGLKSGILGLSLLSLACGSFAMTETETIRVIIKYKQQPATIASLKSQVIKSVQIPVKEMKPMANGAYSLIFDTSNSHAIVKSKEEDVTAKVLERLRKNPNVLYAVKDRIGHFKPLPDPVINQELSQLLSHESQWDEFERPAGIRLESRPGLRDGAWAYTTGKSRKPIVVAVLDTGIALNDSLVNNLVKDNEGNVFGWNFAGNNNDLSDETRSYHGTHVAGTIAGYGDVMNGVGEDLKILTVKIPAENGMFYESAVVNSIYWAVGGDVPGVPKNIHPAKVLNMSFGVDLEPGKEIDYCDEALQEALFFARKKGAVVAVAAGNDNVWEHYNAPAVCNGTIKVASTGPEGLRSYFSNYGPSITLAAPGGDKRYGTSGGILSTVNPGGGYNSSGFDFYQGTSMASPHVAGVAGLIFAVSNKALKPEQVEQILYVTTHEFGQSNDTNKSCVGKKPCGHGILDADNAVQAALNAYDVLFSAPKMIALATHECGENRLKPGKNIINDSTATWIQAKSSCETGVSYQKPRIEKAKDGKIYAYYGSVSYELDQSAYKECRVVGYDGVGCYL >NZ_CP015935|2213692:2223816|2219344_2220457_-|WP_015444336.1|DBSCAN-SWA MINKSAILALADGTVYEGLSVGASGDSVGELVFNTSMTGYQEMLTDPSYARQIITLTTAHVGNTGCNMEDMESTKVWAAGLVMRNCTAIPSNYRAEQSFPDWLSKNGVVAISGIDTRALTLKLREKGSIGACISTNVEKPEIVVAKAKSFAGLQGADLALEVTRQTIERWHEGRGMWSLDKQPQQLHVVAYDFGVKHNILRILHDKGCHITIVPAKTSAEEVLAMNPNGVFLSNGPGDPQACDYAIKATQVFLDNNIPLFGICLGFQILALACGGITKKMKFGHHGSNHPVVETTGKKRVFITSQNHGFAVDEDSLPNCLEVTHRSLFDNSLQGIRHKTKPAFGFQGHPEASPGPHDIDILFNEFLNLMK |
7 | Bacillus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2265644 : 2320669
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP015935|2265644:2320669|DBSCAN-SWA 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53 | Wolbachia_phage(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2617816 : 2681085
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP015935|2617816:2681085|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP015935|2617816:2681085|2676913_2677960_-|WP_052585449.1|protease|DBSCAN-SWA MFLSSVNLNELIQQLNSNNRPINLFEILSLLEAQTNIVLDGEWCLFKENNDKAIFNQIIQDHGPNINLQNALNYLLESESVYSNLISDYLVKYRGSSNRGNNILGQYGYNLLSLKEETCLHREQEQELIKICLTRNYKNNVMLIGSSGVGKTFLISSIARLMNLDIYYVDISSILSGSKYRGEFEKKFHTLLNEALKSKTTLFFDEAHTILNTGNSDGGISGADILKPYLMNSDFRMIGATTIDEAEAFTKDKAFSRRFNFLKLEELPIEKTKDIIKRKYTQTLNWDQKTFNKIFTYLDSVFLNRNYPDKALDFFDFYFSGERLSFFNINNDIEKVLNLFTKMNTIIA >NZ_CP015935|2617816:2681085|2656541_2656706_+|WP_187297749.1|DBSCAN-SWA MSHETELMDVISEKYKDLVIPGFLVEVSPIEAEIMGAFFEDALNEADAMEAIYD >NZ_CP015935|2617816:2681085|2634355_2635018_+|WP_061466985.1|DBSCAN-SWA MLDLMSFPDKAAVNKQITKKKLFEWINANTATKNLFTAQVERMIWAYKLAPETTNLSSKDGIEEIQIFEIFLKASELSNELLKTIDKVIPSPIVFVVYDEDSIQYRAAYKKINNAAPSKWVIGDYFESKWMPKRYIKSNLPPALDLKNLYHSLLQELIPLIKRQDESIEQLLTRYQTLHQLERKSDQLQKKLQQEKQFKNKVEINAQLRDVKKQIEQLRD >NZ_CP015935|2617816:2681085|2655999_2656545_+|WP_061466949.1|DBSCAN-SWA 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57 | Erysipelothrix_phage(18.75%) | tRNA,transposase,integrase,protease | attL 2623724:2623770|attR 2679756:2679802 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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