Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017647 | Acinetobacter baumannii strain KAB03 plasmid unnamed, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP017646 | Acinetobacter baumannii strain KAB03 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,cas3,csa3,WYL | 0 | 0 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
7593 : 15297
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017647|7593:15297|DBSCAN-SWA TTTAAATAAGGTCTTGTTGATTTAAAATAACTTGCATACGAGAGTCTTCAACATTAGAAGATGGAACAAATACATGTAATTGCGCCATAGAATCTAAAATAGTCGCCAACTCATTAACTAGTACTGGATATTGAATTAAGCTTTTCCACGAAAACAAATTAGCTGTATTTTCATCATTAAAGCTTCTTAAAAAGCCACAAGCTACTGATACTAAGTCTTCATCTTCGCTTTCTGTTAAATCTAAAATACTGACGTAACTTTCCAAAATACCATTAAAATAAGCTGTCTCAAGCTCTGAAAATGCCTTTTCATTTGCTTGTTTTACAATCTCTTTTGTTTGCTTTTGAGTAGTAGTCGTAAAAGATTTTTCATCTTTCACTGCTTCAGTATTTTCAACCGATTCTTGAACTTTTGCAGGTTGCTGTAAAGTCTCTTTAGTTTCGGTAATGAGCTCTTGAGTATTGTCCACTTTACTATCTTCATCTTTTTCACCAGCCTTTGGCGAATTCTGAAGTTCTAAAGATGACTGTGTTACCTCTGAAGTGCTTGAGGTAATAATTTCACCCTTCAGCTCTTTAGACCATACACGGGCTAATTTTGATGAAATAGCACCTTCATGATCTGCTACTAACGCTTTTACTTCTTCTGGATACTCAGCTAATAAGTTTTTAATGATCGTGCCAGTTTCAGCATCATTTACCATTTTATTAGCCATAAGGCTTTTTAGATAATCATCTGATTCAAGCAATTGTAATCTTCGAGAAACCCATGTCTTTGACTTATTAATTTCATTAGCTAAATCGTCATAACTATACTTTGGATTCTCTGCCACGCCTTCTTCTAGCATCAATTTTAAATTCGTAGCAACTTCAAGCAAACTCATGTCTTTTCTAAATAAGTTTTCTGACATTTTTACTCGGCGTGAACCAAGTTTGTTATCAATCGTTGCTTCGATAGTATCCAAGTTCAAATGTTTATGAGCTAAATAACGATAATGGCCCATATTAATAATATATTCACCAGGATTATCAGAATCGGCTCTAACTGAAATAGGCTGAAGTAAACCATCTCTCAAAATAGTATTTGCCAGTTCTTTTACATAATCTTGATCATATTCAAGACGTACATTCTGAGGATCCAACTTAACCCGATTAAGCGGCAATTTTAGAATTGTGCGGTCAGAGTTATTGTTAGCATTTAAGTTTGCTGAAGTTAATGAGCTATCAACAGCGTTTAAATCACCTAATAAAGAAGACATAGCTTAAACCCCCATTTTCTCTAAAACTAATTGATTAATTTTTTTGATTTTTCGCCCTACATCTTTTGCTGACGTTTTATCAATTTTCCATACTGGAACTTGTTGTTCACTTGCATCAGCAATTGCAGATCGATTAGGTATGAAAGCAGTCTTATCAAGCATTAAATGACTCAGTTGTTTCTGCAATTCATTTAAAGTTGTTTTTTGAGTAACAGAGTTAGCACTAACCATATTTGGAAGCAGCCCTAGAAACTGAATTTTTGGGTTTACTTCTTTAATTTCTTGTGTGGTATCAATAATACCTCTTAGCCCTAGAATTGAATATTTATCCAATAAAAAAGGAGATAGAGCAAATTCAGAAACTAACAAAGGTAATCGCTGAAACGGGCCGTCTGTAGGAGGTGTATCAAAAATACAGATATCAAAAAATTCGTTAGCCTTAGCAATATTTGATTTGAAATTACGTTGGTATTCTTCAACTTTATCTAGCTTAAACTCTTGTTCTGTAGGATCAAAAAGTGATTTTAAACTCTTATTACCTTTAAAAAGAACAAAATATTTATCTAAAGTTTCAAAGTTTTGGATATCCGCAAATAGACTATGGGTATCTTTAATCTCAACCGCAACTTTACTAAGTGAGAAACCACTATTACCTTGTTTATCCATGTCTACAAATAGAACACGCATACCGCGCTCATAACAGTAATGTGCCAAATGAACAGCAACAGAGGTTTTGCCAATCCCACCCTTTTCGTTAGTGATTACGATTTTTTTCATTGTTCTTTACTCCAAGCATTTCTGCTCAATTTTGAAATCAGCCTATCCGATTTCTGAATAAATTATACTACTAAAACATACTTTTTTGCAAGAAAAAGATTAAATTTTATAGCGCCAATTTGTCTTAAATAGGTTGTTGCGGATCCGCAACAACCTAAGCTTGTGTAAGTTACATCTATGCATATAAAAAAATCAATCATTAATTAAAATGAAATTAGGCACATAATCTTCAGCTTTATGTACAATTTCCTTTAATTTTTGACTATGCAATTTTATGTCCCACCCTTTTACGTAATACATTAAGCTACACCAGCATTCACGATACTTTAACTTGAGGGTATCACCAACAAAAATACGGCAAGGCACTGCCCACAAACTTAGTTGTATATAACACATTAAAGCAACGTTTCTATCAATGTCTGCTGCCTCAATATACAAGTGATCTTGCACTTGTATCTTAGATTCCAAACAGAGTTTTACAGTTGAAAGTAAAGTTGAGCCAGCTCCACAAGCTGGATCGGAAATCGAAATCACCCCCTCTTCCTCAAGTTGTTTTTTAAGGTCGGTCATTACAACTTGAGCACATAAATTTGATACCTCACTTGGTGTAAAATATTGGCCGATATGATCATTCCCAATTTCTAATTCCATGTAAATGCTACCTAACACATCATATGGCTCACCCTTTGCTTCGCATAAATCCACCAACAGATAAAACAATTTTTTTATTTTTAAACGTCCACTAACGTCGTAACGATTGATACGTTGAAGATATTCATTTTCAATATTGTGGTTAAACAAATTTTGATATCTATGACCAATTGAGTTTCTTAATGCTGCTGCTGAACAAAAAACAAAGTCATGAAATATTTCATAAATGTTTTTAGATTGGTCGATACTTTTTAAGGTATGTATAAACTCACTTTTCAAAACACTATAAGTTTTACCAATGTTAACTTTTGAATTCACTTTTTTCTCCGCAAGCTCTTCAGCTCAATCAATTAATAGTTTTCAATGTATTGAATTGTATAAAACCATTTAAACCGGCTTTACGAAAAGTTTCTAAGACTTTGAAATACATTAATTGGAAATTAAGAGACTCTTCTGCTGTTTTAGTGAATTCTCCCAAGTGGTCAGGTCTAAATAATATATCTGCGTTATTATTAAACCAGGTCAAACATTCAAAAATGAAGTCACCATAGAACTCATATGTTTCTTGAATAGCAGTTAAGAAAGGACAAGGAATACCAATCAATTCTTCAAGAACTTTTAATGTTGAAATAAACTTATTAAATGACTCTTTTGTACTTAATGTATAAACATTAAAGTCCTTACAATCATACATTGTAGTAGATAAGGCAACTAAGCCAGTATTGTATTCAAAAGAAGGTTTCTTAATATCGATGTGGCCAACAGCACACGCACAATGTGATGGGGTTTTTAAACGACCAATCTTTAAATCAGTTATGATTAATACATTAAAATAATTATTCATTTTTTCACCATAAGCTTTTCAGCTCAAAATACGAAATCAGCCTATCCAATTTCTAACTAAAATAGTACTACAAGAACATATTTTATTCAAGCTTTCAAAGGTTAAAATTGTTAATAAACATTAATTTAATGACATTCTTTTTTTAAATAATCTGTGCTAACAGAGCAACGTGTCCACGTTGCGAACTGATGAAATTTGCGAGCATCCCCCTCGTTGATTACCGTTTCAAACTTCGAGCGAGTCAGTCAAAATCTGTGATTTTGACTAGACGACCGATGAAGTGAAACTTCTTCCTGTGGACCTTTCCGGGAATAACAAAGCAATCCCGCAGGGTTGCGCCTCTATACCATATGGGAATATTCACCAATCAAATCAACAATAATCATTTTCCCACTTCTAAAAAGGTGAATGGGTGTATTGAGTAGATTTTGTTGGCAATCCAACATAACAATCCATTTATAAGCTGGAGTAGCTGAATAACGATCCTTTTTTTCTATAAGCAAAACCAACAACATGCTCAGAATTTAAGTCCATTTATTTTTTAAGTGTCGGTAGCATGGATTGTATCCCAATGAGTGATGATGATGACCAGTAAAAATTTGGCTGATCTTTCACCCACGTAATGAATTTTGATCCATCATCACTAGTTTTAAGCGTAAGTAAAAAAACTTTCCTCATATCCACACCTAACTTTACAAATGTAATAACAGATGCCTAAGCTGCATTCGCTTGGTTAAACATATTTAAGATATCAATTGCTGAAGTATTTTGACGAAAAAAAACTCTATCAGGCCTGCCTGGTTGATTGTTAGTTTGCCCGTGGATCCTTTCCATTCGTAAATGGAACTCTAAAGCAAACGGATTTGATTCAAGCTGCTTCAATAATTTTGGAAATGATTTCTCAAAACACATATTACAATTACCATCCCATTCATTTAGCTCTAGATCAAACGCTTGCTTTGACCACCAATCTAATATGAATTGCTTATCCACTGGATGTTCTGTGACTAATGGATAAATAAAGTTATTTGCTTCTGCATCCTTAGCACAACGTTTAGATTCATCAGCCCGGATACCGATTGCAGTAGGGATATCTTTAGATTTCATCCCAATACTACGAATATATGAATCCATTGGTCTTATTTTTAATTCACGGGTGCAATGCTTATAAACTTTATTAGGAATTCCATATTTCTCAATCATCTGTTCAAAAAGTACTGGCCCCCTGGTAGCTGTCTTAAAATTGACAACTTTATGCGTCGTACCTACTCTTTTTTTAGGGTGAATAACTGCTTCTAACCAAACTGTATTGAAATTAAAATATTTATCACATTTATCGACAAACTCTAAAGTTTTCTCATGCTCAATGCCTGTATTTGCAAATGTGACTATAAAGTTATAAAGGTGGCTATAGTTATTGAGCATGTACCAGGTTAAATATGCTGAAGTACGTCCACCACTAAAGCTAATTTGATAATATGATTTCATTAATTTCACCTTAAGCTTTTCAGCTCACATATAGAAACCAGCCTACCCGATTTCACCCCTTAATTATACTACATTTTCATGTCTTTTTATTAAGAAAAAACATATATTTAGTGTATTTTTTCGTGTTATAAAAGACATTTGCAGAGCAACGTGTCCACGTTGCGAACTGAAGGAATTTGCAAGCATCCCCCTCCTTGATTACCGTTTCAAACTTCGAGCGAGTCAGTCAAAATCTGTGATTTTGACTAGACGACCGAAGAAGTGAAACTTCTCCCATTGGACCTTATCCGGTAATAACAAAGCAATCCCGCAGGGTTGCGACAAATAGCCCTCTAAATCGCTCTAATTGCCCCTAGATTCAATTTTATAAAAATAAGGCAGTCAAAATACCAACAGGATAAAACATGGCTAGAATTAACAAATATGATCAAAAACAAAATTAAACTTGTAATCTTTTTTGTATATAAATTAAATAAATCACATATAATAAATTACTGATTGGAGGATTTGTTATGGGATCTACAGTACGTCTCCGGGACCCAACAGCTAAACTTGTTATTGATACAGCATTAGATATGCAACAAGAGCAACGTCAAATGGTTAAAACTTCAGATATTGTTGAAACATTAGTTCAAAGGTATATAAATACGATTAGCTTTGAAGATGTTCAACAAACTATTGAAAACCGTAAAAAGAATAAAAAAAGTAAGGACAAATAGAAAACCTATTTGCCCTTATAAATTGTGTCAAACTCTGTCAACCAATCAAGCCTGTTAAAACCAGCTTCAACGTCATTGCCTCTTACTTCTGCGATATAAAACTTCTTCTCGCCATCTTTTAGAAACCATCCAGCCAATATATTTACATAATTACTCTTACAGTTCAGAACTCTAATATAAGCATCTGGTGCAACAGGATGAGCTGGATCAACATGCTCAAGTTGAGGATCAGCATTACTCATTCAATCAGCTCAAGAAAATCTTTTTCGTTTCATTAGGATCAATAGCATGATGTAAGTTCACCTTACTCCCGTCCGAATACCCTTTTACTCGTGCTTGATTAAGCATATCTTTATTATAATGTTTAACACTTTTAACTGGCTTTGTTGCATAAATAAATTTCATCCCCATACATGTTAGATGAATACAGAATCAAAAAGCCGATACAAAACAACGAACTGGTCTGAGTACAATCAGGCTTTACGTCAACGGGGTGCTTTCACCATTTGGTTTGATCCCCAAATGCAATGGTCTGCAACACCTACTGGAAAAAAAGGACGTCAACCTACCTACACTGATATAGCAATTCAATTTGCCCTGACGATACGAAACCTGTTCCAACTGGCTTTACGCCAAACACAAGGTTTCATTCAAAGCTTTTTGCAAATGGCTCACCTCGACTGGAATGTTCCAGACTTCTCAACATTGAGTCGGCGAGCAGATAAGCTCCAGCCACTTCTACATAAATCAGCAAAAAATCCACAGGAAGACTTGCATATTTTAGTTGATAGCACAGGGATCAAAGTTACAGGTGATGGGGAATGGGTGCGTAAAAAACATGGCGTAAACCAACATCGTCAATGGCTGAAATTACATCTTGCGACAGATGCAAACAGTGGAGAAATACAAGCGGTTGAAGTCACGACCTGCCAATATGGTGATGCTGAAATGCTCCAACCTCTTTTAGATCAAATTGATGAACCCATTGCATCTGTCACGGCTGATGGTGCTTATGACACAGTGAATTGTTATGATGCGATTTTGAAACGGCAAGCAAATGTAATTATCCCTCCTCGTTCCAATGCTGCTTTATGGGCAGAAAATGAAATTGGTAAAGCAAGGAATCATGCAGTACAAGGCTGTTGGGACAAGGGTCAAAAGCAGTGGAAACGAGATATTGGTTATCATCGACGATCCCGAATAGAGGCTAAAATGTTTGCCTTGAAACGACTTGGACAAGGTGTATCTAGTCGATGCTTTAATCGTCAGGTGGTTGACTTGCAAATAAGAGTCGATATTTTGAATAAATTTACTCAACTTGGTACAGCTAAAACGGTGGCTGTTGCATAAATATCTGAAGATTAGAACAACTCTACCTTTCGTCTATTTGTGCAACAAAGCCCTTTTAACTTCGCAATATATAAGATTAAGAGTTTTCTCATATTCGCTCAGTTTTTCCTTTAGCTCTTTATCTGGATTTAAGTTCCTACACTTTTTTTCAACTCCAAGAATCCACCCTCTATGATAGCTTATGCCTAAACGTCTCTTAGATTTAAGTTTAGTATTTCCATGTAAAGTGGCTAAATAACTTTGTTTATTTTTAATCAAAATAGGGAGTAAAACATTATATGCATATGTTGCAATAGACACATTTGGTTCAACTCCATAAAAAACATGTTGTTGATATTTCACACCTTCTAAAGTGTAAAAACCTGAGTAACTTCCGCATTCAAAGACATTTGCGATCATTACTTTAAGCCGTCTTTCAATATCTTTAGTTCTTTGAGTTTTTGTCTGAATAATTCGCTCTTTAATATCACTAATTAGTATCTGTTTTTCACTTATTTTGTACTTCTGCATCAATGTCTGTGCTTGCTTAAGTGCAACGGCTGCTTCATGCTCATTGGCACTTTTTGATAATGCTAGACACTTACTAATTTTATCTATGATAGTTTGCATATCTTCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017647|7593:15297|14712_15297_-|WP_070508496.1|DBSCAN-SWA MEDMQTIIDKISKCLALSKSANEHEAAVALKQAQTLMQKYKISEKQILISDIKERIIQTKTQRTKDIERRLKVMIANVFECGSYSGFYTLEGVKYQQHVFYGVEPNVSIATYAYNVLLPILIKNKQSYLATLHGNTKLKSKRRLGISYHRGWILGVEKKCRNLNPDKELKEKLSEYEKTLNLIYCEVKRALLHK >NZ_CP017647|7593:15297|13334_13571_-|WP_000063345.1|DBSCAN-SWA MSNADPQLEHVDPAHPVAPDAYIRVLNCKSNYVNILAGWFLKDGEKKFYIAEVRGNDVEAGFNRLDWLTEFDTIYKGK >NZ_CP017647|7593:15297|13122_13329_+|WP_000535990.1|DBSCAN-SWA MGSTVRLRDPTAKLVIDTALDMQQEQRQMVKTSDIVETLVQRYINTISFEDVQQTIENRKKNKKSKDK >NZ_CP017647|7593:15297|13749_14679_+|WP_001091151.1|transposase|DBSCAN-SWA MNTESKSRYKTTNWSEYNQALRQRGAFTIWFDPQMQWSATPTGKKGRQPTYTDIAIQFALTIRNLFQLALRQTQGFIQSFLQMAHLDWNVPDFSTLSRRADKLQPLLHKSAKNPQEDLHILVDSTGIKVTGDGEWVRKKHGVNQHRQWLKLHLATDANSGEIQAVEVTTCQYGDAEMLQPLLDQIDEPIASVTADGAYDTVNCYDAILKRQANVIIPPRSNAALWAENEIGKARNHAVQGCWDKGQKQWKRDIGYHRRSRIEAKMFALKRLGQGVSSRCFNRQVVDLQIRVDILNKFTQLGTAKTVAVA >NZ_CP017647|7593:15297|9819_10596_-|WP_001086346.1|DBSCAN-SWA MNSKVNIGKTYSVLKSEFIHTLKSIDQSKNIYEIFHDFVFCSAAALRNSIGHRYQNLFNHNIENEYLQRINRYDVSGRLKIKKLFYLLVDLCEAKGEPYDVLGSIYMELEIGNDHIGQYFTPSEVSNLCAQVVMTDLKKQLEEEGVISISDPACGAGSTLLSTVKLCLESKIQVQDHLYIEAADIDRNVALMCYIQLSLWAVPCRIFVGDTLKLKYRECWCSLMYYVKGWDIKLHSQKLKEIVHKAEDYVPNFILIND >NZ_CP017647|7593:15297|7593_8850_-|WP_000096599.1|DBSCAN-SWA MSSLLGDLNAVDSSLTSANLNANNNSDRTILKLPLNRVKLDPQNVRLEYDQDYVKELANTILRDGLLQPISVRADSDNPGEYIINMGHYRYLAHKHLNLDTIEATIDNKLGSRRVKMSENLFRKDMSLLEVATNLKLMLEEGVAENPKYSYDDLANEINKSKTWVSRRLQLLESDDYLKSLMANKMVNDAETGTIIKNLLAEYPEEVKALVADHEGAISSKLARVWSKELKGEIITSSTSEVTQSSLELQNSPKAGEKDEDSKVDNTQELITETKETLQQPAKVQESVENTEAVKDEKSFTTTTQKQTKEIVKQANEKAFSELETAYFNGILESYVSILDLTESEDEDLVSVACGFLRSFNDENTANLFSWKSLIQYPVLVNELATILDSMAQLHVFVPSSNVEDSRMQVILNQQDLI >NZ_CP017647|7593:15297|8853_9627_-|WP_000724905.1|DBSCAN-SWA MKKIVITNEKGGIGKTSVAVHLAHYCYERGMRVLFVDMDKQGNSGFSLSKVAVEIKDTHSLFADIQNFETLDKYFVLFKGNKSLKSLFDPTEQEFKLDKVEEYQRNFKSNIAKANEFFDICIFDTPPTDGPFQRLPLLVSEFALSPFLLDKYSILGLRGIIDTTQEIKEVNPKIQFLGLLPNMVSANSVTQKTTLNELQKQLSHLMLDKTAFIPNRSAIADASEQQVPVWKIDKTSAKDVGRKIKKINQLVLEKMGV >NZ_CP017647|7593:15297|10624_11122_-|WP_001067228.1|DBSCAN-SWA MNNYFNVLIITDLKIGRLKTPSHCACAVGHIDIKKPSFEYNTGLVALSTTMYDCKDFNVYTLSTKESFNKFISTLKVLEELIGIPCPFLTAIQETYEFYGDFIFECLTWFNNNADILFRPDHLGEFTKTAEESLNFQLMYFKVLETFRKAGLNGFIQFNTLKTIN >NZ_CP017647|7593:15297|11836_12610_-|WP_032011455.1|DBSCAN-SWA MKSYYQISFSGGRTSAYLTWYMLNNYSHLYNFIVTFANTGIEHEKTLEFVDKCDKYFNFNTVWLEAVIHPKKRVGTTHKVVNFKTATRGPVLFEQMIEKYGIPNKVYKHCTRELKIRPMDSYIRSIGMKSKDIPTAIGIRADESKRCAKDAEANNFIYPLVTEHPVDKQFILDWWSKQAFDLELNEWDGNCNMCFEKSFPKLLKQLESNPFALEFHLRMERIHGQTNNQPGRPDRVFFRQNTSAIDILNMFNQANAA |
9 | Leptospira_phage(14.29%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017646_1 | 2059245-2059330 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017646_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017646_1
>1.1|2059268|40|NZ_CP017646|CRISPRCasFinder GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017646_1
The CRISPR arrays of NZ_CP017646_1 >merge|NZ_CP017646|1|2059245-2059330|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA >NZ_CP017646|1|1|2059245-2059330|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA
>NZ_CP017646.1|WP_000795915.1|2058007_2058244_+|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NZ_CP017646.1|WP_001124846.1|2057113_2057725_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NZ_CP017646.1|WP_000885229.1|2056431_2057043_+|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NZ_CP017646.1|WP_000376215.1|2055819_2056275_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG >NZ_CP017646.1|WP_001990047.1|2054114_2055761_+|allantoin-permease MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA >NZ_CP017646.1|WP_000115408.1|2050484_2053949_-|response-regulator MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVYIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ >NZ_CP017646.1|WP_000107128.1|2049528_2050488_-|response-regulator-transcription-factor MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH >NZ_CP017646.1|WP_001025680.1|2049100_2049385_-|N-acetyltransferase MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK >NZ_CP017646.1|WP_002017921.1|2048878_2048992_+|hypothetical-protein MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS >NZ_CP017646.1|WP_000937460.1|2048154_2048790_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT >NZ_CP017646.1|WP_001091151.1|2059869_2060799_+|IS5-like-element-ISAba10-family-transposase MNTESKSRYKTTNWSEYNQALRQRGAFTIWFDPQMQWSATPTGKKGRQPTYTDIAIQFALTIRNLFQLALRQTQGFIQSFLQMAHLDWNVPDFSTLSRRADKLQPLLHKSAKNPQEDLHILVDSTGIKVTGDGEWVRKKHGVNQHRQWLKLHLATDANSGEIQAVEVTTCQYGDAEMLQPLLDQIDEPIASVTADGAYDTVNCYDAILKRQANVIIPPRSNAALWAENEIGKARNHAVQGCWDKGQKQWKRDIGYHRRSRIEAKMFALKRLGQGVSSRCFNRQVVDLQIRVDILNKFTQLGTAKTVAVA >NZ_CP017646.1|WP_000983628.1|2060993_2061407_+|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII >NZ_CP017646.1|WP_001091151.1|2061573_2062503_-|IS5-like-element-ISAba10-family-transposase 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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DBSCAN-SWA_1 |
248776 : 333681
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017646|248776:333681|DBSCAN-SWA 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82 | uncultured_Caudovirales_phage(22.22%) | integrase,transposase,tRNA | attL 251399:251458|attR 280238:294273 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1001618 : 1021178
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017646|1001618:1021178|DBSCAN-SWA 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33 | Acinetobacter_phage(40.0%) | integrase | attL 999432:999446|attR 1014458:1014472 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1261764 : 1274112
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017646|1261764:1274112|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017646|1261764:1274112|1262483_1262891_-|WP_000147323.1|DBSCAN-SWA MTGNERIPFESQFKTTEIFKRESAIRKNDILAFSETMNGYFNIVTNDAWQLWNKAKAETVPDTPTPSVTLTCAELKEAFDFGAPDGEKDQFQMETEMTIKWLQDGYDGEGYYCWYADLPEEGCIKLGVSESGAEG >NZ_CP017646|1261764:1274112|1265206_1265530_-|WP_000064463.1|DBSCAN-SWA MSNFKKHPDGYKSFLGRDDKGLYSVRIGWQVYASNANGSVLYKVKDGFKTPLNVFRFQTDYPKVWNELTQEIDFQRRKQLAIKLRETNIPTYDRKAYKTKRGFTGSR >NZ_CP017646|1261764:1274112|1261764_1262487_-|WP_000004579.1|DBSCAN-SWA MSESTLWAVAMRPEGYSPFKQTPAASKEIAERAVERYRKMHEKEGNNFFLEIFDDVIKVQKWHGSRKDHIKNLFYVESWFSEPMYQCFDLKTAERVFKFDEIVICYKKGSAPLVTKSFDEAKLFYGSSETGFKYQIQPIEPPENLFNWFHPDIELFDTIEEGAEAYTREQWAQLQMNLRVEIETQLLDYDEIPNIPEDAVVWPNWKPEPPEQGLFLIAAFDSEDGPVLWWANPKAESKEK >NZ_CP017646|1261764:1274112|1268834_1269587_-|WP_000052252.1|DBSCAN-SWA 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24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1277403 : 1311315
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017646|1277403:1311315|DBSCAN-SWA 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43 | Acinetobacter_phage(91.67%) | capsid,transposase,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2145028 : 2204903
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP017646|2145028:2204903|DBSCAN-SWA 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53 | Enterobacteria_phage(50.0%) | transposase,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2327818 : 2377749
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP017646|2327818:2377749|DBSCAN-SWA 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46 | Escherichia_phage(23.53%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2421584 : 2467542
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP017646|2421584:2467542|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP017646|2421584:2467542|2457866_2458187_-|WP_000049332.1|DBSCAN-SWA MSKVSNELPASASNNESLILQALNASNQRQVAEMINVDASILSRMKTEKKSNGWTEIEFISFLLTAIGLKVVQESDVYCSPEIAEATRVYLAHAFTSPEYMRILFK >NZ_CP017646|2421584:2467542|2466279_2467542_-|WP_000773619.1|integrase|DBSCAN-SWA MKLNKSTVDAIPLTEKGQKIYRDAELIGFAVRVTNKSKTYIVERRHEGELYRVTIGKTTDIPATNARAKAQMILAKISNNEYEKPIKLKKVANPLDITVNEALQIYIDRNDFRPKTIRQYRKYFDLYLGWGNKKLFQISKQEVLDRFIEVSEVSESSANGAVSLLGTLWKYIHVLYSTDENPILKSNPVDIISVTRGWNKIESRDRHLHKDIIHKYYNAVLHYEDELNLENTARSNTHRDIVLMCMYTGCRKQEACCLKWSDVDIKNGTLTFRDTKNGSDHTFPIGDHLHSILRERWLLRENDWVFPATKMPTSWNMHATKVDTLLNRVGKEVDYYVSMHDFRRTFATICNLLRFNIYVTKRLLNHTAKPRIDVTGGYVQIPDEELRASMNMIEAVYQGKIDCFNYQSVWAERLKEIKAV >NZ_CP017646|2421584:2467542|2465004_2465262_+|WP_000654796.1|DBSCAN-SWA MKDQFKKVNNKHLLGFTNYLHLLGFVIVQQGLNQAMLLTKHYAVPVAWRRITIDYNNRLNKPAQQLYKEFVEWTKEEYLRAQKWK >NZ_CP017646|2421584:2467542|2441524_2441893_-|WP_002075957.1|DBSCAN-SWA 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61 | Acinetobacter_phage(98.18%) | capsid,integrase,terminase | attL 2441399:2441413|attR 2469279:2469293 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2817922 : 2832626
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP017646|2817922:2832626|DBSCAN-SWA 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10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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