Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017649 | Acinetobacter baumannii strain KAB04 plasmid unnamed, complete sequence | 0 crisprs | TnsE_C | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP017648 | Acinetobacter baumannii strain KAB04 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,csa3,RT | 0 | 0 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP017648_1 | 2423748-2423833 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017648_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017648_1
>1.1|2423771|40|NZ_CP017648|CRISPRCasFinder GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017648_1
The CRISPR arrays of NZ_CP017648_1 >merge|NZ_CP017648|1|2423748-2423833|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA >NZ_CP017648|1|1|2423748-2423833|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA
>NZ_CP017648.1|WP_000795915.1|2422510_2422747_+|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NZ_CP017648.1|WP_001124846.1|2421616_2422228_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NZ_CP017648.1|WP_000885229.1|2420934_2421546_+|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NZ_CP017648.1|WP_000376215.1|2420322_2420778_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG >NZ_CP017648.1|WP_001990047.1|2418617_2420264_+|allantoin-permease MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA >NZ_CP017648.1|WP_000115408.1|2414987_2418452_-|response-regulator MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVYIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ >NZ_CP017648.1|WP_000107128.1|2414031_2414991_-|response-regulator-transcription-factor MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH >NZ_CP017648.1|WP_001025680.1|2413603_2413888_-|N-acetyltransferase MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK >NZ_CP017648.1|WP_002017921.1|2413380_2413494_+|hypothetical-protein MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS >NZ_CP017648.1|WP_000937460.1|2412656_2413292_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT >NZ_CP017648.1|WP_000983628.1|2424464_2424878_+|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII >NZ_CP017648.1|WP_000432330.1|2425019_2425898_+|glucose-1-dehydrogenase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NZ_CP017648.1|WP_001990041.1|2425954_2428099_-|catalase-HPII MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEHGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLSYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA >NZ_CP017648.1|WP_001145693.1|2428153_2429563_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNQYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NZ_CP017648.1|WP_000482091.1|2429878_2430358_+|CinA-family-protein MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR >NZ_CP017648.1|WP_000108365.1|2430642_2430864_+|hypothetical-protein MSTTNNQANQRNNQQQQQQQNDNRNQQQHGNQQQNDQQQQNNQQQQQNDNRGQQQGSNQKDSGQQNSNNNQQR >NZ_CP017648.1|WP_000132044.1|2430969_2431287_+|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDI >NZ_CP017648.1|WP_000498477.1|2431371_2431593_-|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF >NZ_CP017648.1|WP_001136759.1|2431680_2432109_-|hypothetical-protein MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NZ_CP017648.1|WP_000251637.1|2432378_2432522_-|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSRNDGMHEASDPATSHDMNKNS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
816789 : 914822
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017648|816789:914822|DBSCAN-SWA TTTAAGGATATTGGTTGTAAGTCGATAAAATGGTTTGCAGTTGTACTGGAGTAAACCCTAAATTTCTTAAGCCACCACTGCCTAATTTACATTCGGCACTTGTCATAATATTGGTTGGAGTACGTTTTGTAGCCTTCGGTGCACAAACATGTTTTAGACCAAATACATGCCCCATCTCATGCACACTACCAGCCTGAATATTATAATTTAGACGGTTCCAATCTAATAAAATAAAAGGTTTGCCATTATTACGAAATGCTCTGCTTGTTACATCTTCAAATTTCCATTTTGTTGAGTAGGCATCATAAATAAAGACAATGACTTCTTTACTTGCAGTGCGCTTAGGAAAACATGTATTTACACTGGCAGGAATAGTTTCAGTAGAAATGGGATAAGGCTGATTAATTTGCTGTTTCAAATCACAATGTAACTTTGAGAACTCTTCATAAGGGATATAACGGTGTAATTTAAATTTGAAAATCTTATTATTTTTATCATCTACATAATATTTATTTAAAATCTTAATTTCCTTACGCATTTGTTGATAATTATCAAATTTTGTAGCCTGAGGAGTATTGGTAGTAAAAACAAAAGTGACGGGAACAATAGGCCGACCATCTGCAGATATACTTGGACCTCTTTCTGAAAGCAGAGGGGGACGAGTAGTACAAGAAACACACAGTAAAGTTCCACTGATCAACAGCAATATTTTTTTCATGCGATTTTCCCTTGAGCTCATCTTAGAGTAGGTTTAATTTTATTCAAAAATTTTTATATGATATGAATAATGTCAACGTTTATGGATTCCATTTTGACAACTCAGTATGAACTACATCGACAAATTTTAGAAGTCATCGCTTTGATTCCATATGGAAAAGTTGCAACTTATGGCCAAGTTGCTCGTATGGCAGGTTTACCTAAACATGCCAGATTAGTTGGGTATGTGCTTAAACATCTTGAGGCAGATCATCAGGTCCCTTGGCACCGTGTTATTAATTCGCAAGGTAAAATTAGCCTAAGTAAGTTTAATGAAAAGGGCGAAAATATTCAGCAGTTAAAGCTTGAAACAGAGGGAATCTATTTATTAAATGGCAAAGTAAACTTAAAGCAATTTGCTTGGCAGCCTTAAAAGTATTTTAATAATTGCCTGCCTTGCTGTATTAAGCTAGACAGGCTTTTTAGTTTTAACGAACTATTAAAACCGGGATATGACTTTCACCTAAGACCTTTTGCGCAACACTTCCTAATACAAGTTTTCGTACACCTGTGCGGCCATGAGAACCCATCACAATCAGATCAGCATTAAGCTCTTGTGCAGCTTGAATAATTTCTTCGTGAACAACAAAACCTTCAAGTAATTTGGTTTCTACACTAAGTCCTTCTTGCAAAAATTGTTGCTTAGCTTGCTCTAAAATATCTAGCAAATATGTTCTAGTACGCTCAATCAATTCATTGGTTTGCCCCGTCTTAACGTAAAGGTCAGCAATAATCGGGTCAAGTGCCATAACTTGTACAACCGTAATTTTACTGTTTAATGCTTTCCCAATTTTGATTGCTTCCTTCATAGCAACCATAGAAGTTTCAGAACCGTCAATTGGTACAAGAATATGTTGATATAACATGAGTTTATTCCTTATTGTAATGATGGTTATTTATTCAATACTTTATACTTCTTTTCTTACGATTTAAATTCGAGCACGTAATCATTTGTGTTTTTTAAGCAAGAAATTCTTGCAAATATATTTTATTCGCTCTGTAATTTTTTAAGATGTGCTGTTAATGCATCTATATCATCCGTTTGTAAATATTCCCGCATTTTTAAAACTTGTTTTTCATCTAAATCATAAATTTTTAAAGCAAGTAGTTTTTCTATTTGCTCCTGAGGAAAACGGTATTTAATAATTTTTGCAGGTACGCCACCAACAATTGTATAAGGGGGGACATCTTTAGTGACCACAGCTCCAGTTGCAACAACAGCACCTTCACCGATTTTTACACCTTGCATAATCATTGCACGACTTCCAATCCAGCAGCCATCTGCAATTATAGTGTCACCAGCGGCTAAAAAACTTCGGGTGTCAAAGGGGAATGTCGATATCCAGTCTGGCCGATGAAGTTGGTTACCACCCATCATAATCACGCATTCAGCGCCAAAACAAACAAAATTACCAATATAGAGCTGATCAATTGGCTTGTCTGGAGTAGAAGGCTTGTCATGTAGATATCGCACTACACAGCGTTCAAAACCTTGATCCCAATATGCCGAGTAGTAAGAGTAATTCCCTTTAATATGGATATTTGGATTTTTCACAGTTTTGGAAATAAACTCAAATTCACACCAATGGCGGACTGGTGTGTTAATTAGAGGAGTATCCATAATTTATTATCCAAACAAAAATGAGCCAAACCATATTAAATAAAAACCCCTCATAAAGAGGGGTTCAAGTGTATTACCTTAGAGGTATTCTACACTTACAACTTCGTATTCCACTTCGCCTTGAGGAGTGGTAATTTTTACTTCATCACCTTCATTTTTACCCAAAAGGCCACGTGCAATTGGCGAATTTACTGAAATTTTATTGATTTTAAAATCAGCTTCATCATCACCAACAATCTTATAAGTCTTGCGTTCTTCAGTATCAAGGTTTTCAATCGTTACCGTAACACCGAATACAACACGACCGTTTTGTTCTAAGTCTTTAACATCGATGACTTGTGCAGCACCCAATTTCCCTTCGATATCTTGGATACGGCCTTCACAGAAACCTTGCTGTTCACGAGCAGCATGATATTCTGCATTTTCTTTTAAGTCCCCATGTTCACGTGCTTCAGCAATCGCTTGAGTAATACGTGGACGTTCAACAGTTTTCAGATGTTGTAATTCTTTCTCTAAGGCGATTTTACCTTCAGGGGTCATTGGATAACGTTGCATTTCGGTCCCTCTTAAGTTGAGAAAACACAGTTAAAAAAATGAAAAAATCCCGCCACCGATAAGGTGGCGGGACTTATCGGAAAAAAATTAACCTACAGTTAAATCTTGCAAGCGGTATACATCCATTGGCAATTTCACAGCAAAGGCTTGGCAAACCGCTTCTGCGCCATTGATAGTCGTTGTGTAATACACTTTGCCTTGTAGGGCAGCACGACGAATCATTGCAGAGTCATATTGAGCTTGTTTGCCTTCAGTAGTATTGACAATAAGGTGTATTTCACCATTTTTCAAGCGGTCAACAATATGTGGACGGCCTTCAGTTACTTTATTTACAGATTCACATTCTAAACCTGCTTCTTTAAGTACCTGATATGTTCCACCTGTTGCTACAAGTTTGAAGCCATATTCAACTAATTTCTTAGCAATATCAGCGATGTATTTCTTGTCTGACTCACGAACAGATAAGAAAGCATGCTTTACTTCACCTTCAGTTGGCAAGCCTGGTAAGCGGTCATTTGAGCCTAAAACAGCCTTATAGAATGCTTCACCAAAGGTTTGACCAACACCCATTACTTCACCTGTAGATTTCATCTCAGGGCCAAGCATTGGGTCTACGCCAGGGAATTTTGCAAATGGGAATACTGCTTCTTTTACTGCGAAACGATTTGGAATAATTTCTTTAGTAAAACCTTGAGACTCAAGTGATTGACCCGCCATACAACGAGCAGCTACTTTTGCTAAAGATTCACCAATACATTTCGATACGAATGGAACAGTACGTGATGCACGTGGGTTTACTTCAAGAACGTAAATATCGTTGCCTTTCACTGCGAACTGAACGTTCATTAAACCAACTACACCAAGTTCTTTTGCCATCGCAATTGTTTGACGACGCATCTCATCCTGAATCTCTTTAGAAAGAGAGTAAGGAGGGATAGAACATGCAGAGTCACCTGAGTGAATACCTGCTTGTTCGATGTGTTGCATAATACCGCCAATCACGACATCTTTACCGTCAGATACGCAGTCAACATCAACTTCAGTTGCGTCATCAAGGAAGTGGTCAAGAAGAACAGGTGCTTCATTAGAAGCCTGTACTGCTTCACGAAGATAACGTTTAAGCTCATCTTCGTTATAGACGATTTCCATTGCACGGCCACCTAATACATAAGATGGGCGAACAACTAATGGATAGCCAACTTTCGCAGCTTCAGAAATACCTTCTTCAGCAGATTTTACAATGCTGTTGTTTGGTTGACGAAGCTGTAAACGTTGAATCATTTGTTGGAAACGTTCACGGTCTTCTGCACGGTCAATTGCATCTGGAGATGTACCGATAATTGGAGTACCAGCTTCTTCTAAAGCACGTGCCAATTTAAGTGGAGTTTGACCACCATACTGTACGATTACGCCTTTAGGCTTCTCTGTACGTACGATTTCAAGTACATCTTCAAGTGTTACAGGTTCGAAGTATAGACGATCAGATGTGTCATAGTCGGTAGAAACAGTTTCAGGGTTACAGTTCACCATGATTGTTTCATAACCGTCTTCACGCATTGCTAAAGCAGCGTGTACACAGCAGTAGTCAAATTCGATACCTTGACCAATACGGTTTGGACCACCACCAATAACCATGATCTTGTCACGATTTGATGGGTTAGCTTCACACTCTTCATCGTAAGTCGAGTACATATATGCTGTACCAGATTCAAACTCGGCAGCACATGTATCAACACGTTTGTAAACAGGGTAAACACCCAAGTTCCAACGTTGCTTACGGAATTGCTTTTGAGAAATACCCATGAGGTTCGCAATACGAAGGTCAGATAAACCTTTACGTTTGAACGAACGGATATTTTCAGCAGTGAGATCACCAAAACCTAAAGTTTTTACTTGAGCTTCTGTGTTGACAATATCTTGAATTTGGATCAAGAACCAACGGTCAATTTTAGTTGCTTCAAATACATCATCTAAAGAGAAGCCGTGACGGAATGCATCTGCTACGTACCAAATACGTTCAGGTCCCGGAACTTTAAGCTCTTTTAGAATAGTTTCTTTTACATTTGTT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91 | Pseudomonas_phage(12.5%) | plate,head,integrase,tRNA,transposase,tail,protease | attL 822700:822715|attR 919223:919238 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1204155 : 1269952
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017648|1204155:1269952|DBSCAN-SWA 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83 | Acinetobacter_phage(94.44%) | capsid,terminase,tail,integrase | attL 1218945:1218961|attR 1266299:1266315 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1375611 : 1468884
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017648|1375611:1468884|DBSCAN-SWA 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85 | Enterobacteria_phage(21.05%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1632162 : 1678659
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017648|1632162:1678659|DBSCAN-SWA 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63 | Acinetobacter_phage(98.41%) | capsid,terminase,transposase,integrase | attL 1631985:1632002|attR 1679167:1679184 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2747232 : 2786549
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP017648|2747232:2786549|DBSCAN-SWA 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46 | Acinetobacter_phage(85.71%) | transposase,capsid,terminase,integrase | attL 2743414:2743429|attR 2782084:2782099 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2790107 : 2802455
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP017648|2790107:2802455|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP017648|2790107:2802455|2793378_2793603_-|WP_000602535.1|DBSCAN-SWA MILNELHDRNRKNLRAKGYDENNAAITREEFSQTMAQRFRTNQWLAGQIVNSLANADLVQKFGGYVKPKVGVHE >NZ_CP017648|2790107:2802455|2795666_2796674_+|WP_000048052.1|DBSCAN-SWA MSKTVVKDKTVHYKKVDFLKGANLGQLLKAQLLDKDSFYYKAINRQQFVSATKDDFILINHASSHQSMFFGELIIVESGKAQAVLKIDSDDATEFPIKTYLTDDLPDDEDGVDATEVVRKEFIDSVLYFGVIDNHVAIIQSRSLTARTLESYLGWLLGEAAKALPENSALILKDAPNPTVKQKLESTPAKTISISSGIGSTELQPVHTVESSIPAKIDYKIEDNVVDVLKSAFGVDLENLKLEDGLDDANLKLKLTLTYNRKTSKSGQKVIDTVASSMRHNDDYVITLEDGTKVTADNLKMSGKISVETINNKVYNDGLKVQLYNWMTTNINFGD >NZ_CP017648|2790107:2802455|2798689_2799013_+|WP_000064463.1|DBSCAN-SWA MSNFKKHPDGYKSFLGRDDKGLYSVRIGWQVYASNANGSVLYKVKDGFKTPLNVFRFQTDYPKVWNELTQEIDFQRRKQLAIKLRETNIPTYDRKAYKTKRGFTGSR >NZ_CP017648|2790107:2802455|2800142_2801075_+|WP_000698529.1|DBSCAN-SWA 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24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3021469 : 3035285
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP017648|3021469:3035285|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP017648|3021469:3035285|3032960_3033416_-|WP_000575725.1|DBSCAN-SWA MIFELINPSDKCTFEAPNLKIAALVTCVLGNGQYSAKGIENDLDVPFFIFGGHDEWFVSNFGLNFKETYIQVRNEEKFDLVNSFNSVLLGSYLDRTAFYKAYDLIQDPAEKNKWREQWLDERRSSLNNICKRAWNFAEQVSLYKPAQEGAA >NZ_CP017648|3021469:3035285|3033412_3033598_-|WP_000200037.1|DBSCAN-SWA MTSEKKVWPLGTNHTDSEGTPWKRDEQNNWWFWQENFGWSRYVGPVNQAFLDLRFEVGTEQ >NZ_CP017648|3021469:3035285|3023942_3024707_-|WP_000994866.1|DBSCAN-SWA MNAVPQKLEYKISHTNQICKIHKEQMINVHGRIVCQSCVEKIMKQSNEKYESDKNNRILNLKMARAGIPKRHVNSGFSNYAVTHKGQDKARKTCEKFTMDFNSGVFRNLLLVGRTGTGKTHLGSSILKNIIIKNWEAIYITSADLAEDIAGAYRRSGDSEDEALKRYVKKDLLIIDEYGLHDRAEKRPQLLESVHKVLLTRYDELKPTVVISNLSLSEVREDLGDRLWSRFQHDGLDIVECDWDDARIGGGKAQ >NZ_CP017648|3021469:3035285|3027917_3028667_-|WP_000544506.1|DBSCAN-SWA 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20 | Acinetobacter_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
64159 : 94489
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017649|64159:94489|DBSCAN-SWA 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36 | Vibrio_phage(40.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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