Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017651 | Acinetobacter baumannii strain KAB05 plasmid unnamed, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP017650 | Acinetobacter baumannii strain KAB05 chromosome, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,RT,csa3,cas3,WYL | 0 | 0 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
55526 : 63112
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017651|55526:63112|DBSCAN-SWA AATGGAAGATATGCAAACTATCATAGATAAAATTAGTAAGTGCCTAGCATTATCAAAAAGTGCCAATGAGCATGAAGCAGCCGTTGCACTTAAGCAAGCACAGACATTGATGCAGAAGTACAAAATAAGTGAAAAACAGATACTAATTAGTGATATTAAAGAGCGAATTATTCAGACAAAAACTCAAAGAACTAAAGATATTGAAAGACGGCTTAAAGTAATGATCGCAAATGTCTTTGAATGCGGAAGTTACTCAGGTTTTTACACTTTAGAAGGTGTGAAATATCAACAACATGTTTTTTATGGAGTTGAACCAAATGTGTCTATTGCAACATATGCATATACTGTTTTACTCCCTATTTTGATTAAAAATAAACAAAGTTATTTAGCCACTTTACATGGAAATACTAAACTTAAATCTAAGAGACGTTTAGGCATAAGCTATCATAGAGGGTGGATTCTTGGAGTTGAAAAAAAGTGTAGGAACTTAAATCCAGATAAAGAGCTAAAGGAAAAACTGAGCGAATATGAGAAAACTCTTAATCTTATATATTGCGAAGTTAAAAGTGTTAAACATTATAATAAAGATATGCTTAATCAAGCACGAGTAAAAGGGTATTCGGACGGGAGTAAGGTGAACTTACATCATGCTATTGATCCTAATGAAACGAAAAAGATTTTCTTGAGTTGATTGAATGAGTAACGTTGATCCTCAACTTGAGCATGTTGATCCAGCTCATCCTGCTGCACCGGATGCTTACATGAGAGTTCTGAACTGTAAGAGTAATTATGTAAATATATTAGCTGGATGGTTTCTTAAAGATGGTAAGAAGAAATTTTATATTGCAGATGTAAGAGGCAATGAAGTTGAAGCCGGTTTTAACAGGCTTGATTGGTTGACAGAGTTTGACACAATTTATAAGGGCAAATAGGTTTTCTATTTGTCCTTATTTTTTTTATTCTTTTTGCGATTTTCAATAGTTTGTTGAACATCTTCAAAGCTAATTGTATTTATATATCTTTGAACCAATGTTTCAACAATATCTGAAGTTTTAACCATTTGACGTTGCTCTTGTTGCATATCTAATGCGGTATCCATAACAAGTTGAGCTGTTGGATCCCGGAGACGTACTGTAGATCCCATAACAAATCCTCCTTTCAGTAATTTATTATATGTGATTTATTTAATTTATATACAAAAAATATTACAAGTTTAATTTTGTTTTTGATCATATTTGTTAATTCTAGCCATGTTTTATTTCTTTGGTAGTTAGGCTACCTTGTTTCTATAAAATTGAATCTAGGAGCAAATAGAGCGATTTAGAGGGCTATTTGTCGCAACCCTGCGGGATTGCTTTGTTATTACCGGATAAGGTCCAATGGGAGAAGTTTCACTTCTTCGGTCGTCTAGTCAAAATCACAGATTTTGACTGACTCGCTCGAAGTTTGAAACGGTAATCAAGGAGGGGGATGCTCGCAAATTTCATCAGTTCGCAACGTGGACACGTTGCTCTGCAAAAGTATTTTATAAAACGAAAAATTACACTAAATATATGTTTTTTCTTAATAAAAAGACATGAAAATGTAGTATAATTGAGGGGTGAAATCGGGTAGGCTGGTTTCTATATATGAGCTGAAAAGCTTAAGGTGAATTGAATGAAAAATAATGCTTTATATAAAGAGCTTGATAGACATGATGATGTGAATGTTATTCCTAATGTATTAAAAAATGCTATAGGACAGGCACTTGCATCTGAAGGTAAGTTGTTCTCTGTCTCAGAAATAGATTTAGATATTTATGATTTAATTATCGTCAGTATGAGTGGCGGAAAAGATAGTATTGCTTCTTTGCTCTATTTAATAGAGAAAGGCGTGGACATGTCAAAGGTTGAATTGTGGCATAACCTTGTTGACGGTAAGAGTGAGCCGTTTATGGATTGGCTGTTTATGGATAGCTACAACAAACAGCTTGCCAAAGCATTTAATTTACCAATTTATAATAGCTGGTTAATGCATGGCTTCGAGGGGGAGATGCTAAAAAATAATTCCATAAGCCATGAATATGAGATTGAAACACCGAGTGGGAATATCATTATTCCAAGAAAACGAGCAAAAGCTGGAACGAGATTGCGGTTTCCTCAACAATCAGCAGATCTCCGTATTAGATGGTGTTCTTCAGCTCTGAAGATCGAGGTAGGGCGTAGAGCTTTATCAAACCAGGAGCGTTTTAATAACTCTAAAGTTTTATTTGTTACTGGAGAGCGTCGAGAAGAAAGTCCTAATCGAGCAAAATACTTCCAATTAGAAACACATTTTTGTGATAATCGTAATGGGAAAAAAGGTCGTCTAATTGATGCATATCGACCAGTTCTTGATTTTACAGAACGTCAAGTGTGGGAAATTTTAGAGCGTCATAATGTCGCAGCGCCAGTACCATATCGCTTAGGATGGTCGAGATCAAGCTGTATGAATTGTATCTATAATAGCCCGAAAGTTTGGGCAACCATCAAACATTATTTTCCCAATCGTATTGATCGAATTTTTAAATACGAAGAACAATTTGCAACTACAATTAGTCGAAAAAAAATCAATGTCATAAATATAAGTGAGGGTATTCAGCCTTTTAATATCAATGATTTAGTAGCTTTGGATCAGGCAATGAGAAAAGAATATACCTTGCCTATATTTACAAAAAACTGGGAGCTACCTATGGGGGCCTTTAATAAAGAGGGATGCGGTTCAGATTAAAAATTATAAAAGGCTAAAACAATTGAGATTCGAGCAGAAATGCTTAAGGTGAAATTAATGAAATCATATTATCAAATTAGCTTTAGTGGTGGACGTACTTCAGCATATTTAACCTGGTACTTGCTTAATAACTATAGCCACCTTTATAACTTTATAGTCACATTTGCAAATACAGGCATTGAGCATGAGAAAACTTTAGAGTTTGTCGATAAATGTGATAAATATTTTAATTTCAATACAGTTTGGTTAGAAGCAGTTATTCACCCTAAAAAAAGAGTAGGTACGACGCATAAAGTTGTCAATTTTAAGACAGCTACCAGGGGGCCAGTACTTTTTGAACAGATGATTGAGAAATACGGAATTCCTAATAAAGTTTATAAGCATTGCACCCGTGAATTAAAAATAAGACCAATGGATTCATATATTCGTAGTATTGGGATGAAACCTAAAGATATCCCTACTGCAATCGGTATCCGGGCTGATGAATCTAAACGTTGTGCTAAGGATGCAGAAGCAAATAACTTTATTTATCCATTAGTCACAGAACATCCAGTGGATAAGCAATTCATATTAGATTGGTGGTCAAAGCAAGCGTTTGATCTAGAGCTAAATGAATGGGATGGAAATTGTAATATGTGTTTTGAGAAATCATTTCCAAAATTATTGAAGCAGCTTGAATCAAATCCGTTTGCTTTAGAGTTTCATTTACGAATGGAAAGGATCCACGGGCAAACTAACAATCAACCAGGCAGGCCTGATAGAGTTTTTTTTCGTCAAAATACTTCAGCAATTGATATCTTAAATATGTTTAACCAAGCGAATGTAGCTTAGACATGTGTTATGTGATTTTTAAAGTAGGTGTAGGTAAGTATATCTATCCCTAACACACTAGAATATTAAAAAATGCTGTCAGTTCCATTAATTAACTAGAGTGGATGAACCTAAAATCAATTAGATTCGCAATTTAGAAGCGCAACCCTGCGGGATTGCTTTGTTACTCCCGGATAAGCTCCAATGGGAGAAGTTTCACTTCTTCGGTCGTCTAGTCAAAATCACAGATTTTGACTGACTCGCTCGAAGTTTGAAACGGTAATCAAGTAGGGAGATGCTCGCAAATTCCTTCAGTTCGCAACGTGGACACGTTGCTCTGTTAGTAATGTTTAATTCGAAAATATATTTCATTAAATTAATGTTTTTTAACAATATTAACGTTTAAAGATCTTGATTAAAATACATCATTGTATTACAATTTTGGTTAGAAATCGGATAGGCTGATTTCGTATTTTGAGCTGAAAAGCTTATGGTGAAAAAATGAATAATTATTTTAATGTATTAATCATAACTGATTTAAAAATTGGTCGTTTAAAGACTCCATCACATTGTGCATGTGCTGTTGGCCATATTGATATTATGAAGCCATCTTTTGAATACAATACTGGCTTAGTTGCCTTATCTACTACTATGTATGATTGTAAGGACTTTAATGTTTATACATTAAGTACAAAAGAGTCATTTAATAAGTTTATTTCAACATTAAAAGTTCTTGAAGAATTGATTGGTATTCCTTGTCCTTTCTTAACCGCTATTCAAGAAACATATGAGTTCTATGGTGACTTCATTTTTGAATGTTTGACCTGGTTTAATAATAACGCAGATATATTATTCAGACCTGACCACTTGGGAGAATTCACTAAAACAGCAGATGAGTCTCTTAATTTCCAATTAATGTATTTCAAAGTCTTAGAAACTTTTCGTAAAGCCGGTTTAAATGGTTTTATACAATTCAATACATTGAAAACTATTAATTGATTGAGCTGAAGAGCTTGCGGAGAAAAAAGTGAATTCAAAAGTTAACATTGGTAAAACTTATAGTGTTTTGAAAAGTGAGTTTATACATACCTTAAAAAGTATCGACCAATCTAAAAACATTTATGAAATATTTCATGACTTTGTTTTTTGTTCAGCAGCAGCATTAAGAAACTCAATTGGTCATAGATATCAAAATTTGTTTAACCACAATATTGAAAATGAATATCTTCAACGTATCAATCGTTACGACGTTAGTGGACGTTTAAAAATAAAAAAATTGTTTTATCTGTTGGTGGATTTATGCGAAGCAAAGGGTGAGCCATATGATGTGTTAGGTAGCATTTACATGGAATTAGAAATTGGGAATGATCATATCGGCCAATATTTTACACCAAGTGAGGTATCAAATTTATGTGCTCAAGTTGTAATGACCGACCTTAAAAAACAACTTGAGGAAGAGGGGGTGATTTCGATTTCCGATCCAGCTTGTGGAGCTGGCTCAACTTTACTTTCAACTGTAAAACTCTGTTTGGAATCTAAGATACAAGTGCAAGATCACTTGTATATTGAGGCAGCAGACATTGATAGAAACGTTGCTTTAATGTGTTATATACAACTAAGTTTGTGGGCAGTGCCTTGCCGTATTTTTGTTGGTGATACCCTCAAGTTAAAGTATCGTGAATGCTGGTGTAGCTTAATGTATTACGTAAAAGGGTGGGACATAAAATTGCATAGTCAAAAATTAAAGGAAATTGTACATAAAGCTGAAGATTATGTGCCTAATTTCATTTTAATTAATGATTGATTTTTTTATATGCATAGATGTAACTTACACAAGCTTAGGTTGTTGCGGATCCGCAACAACCTATTTAAGACAAATTGGCGCTATAAAATTTAATCTTTTTCTTGCAAAAAGTATGTTTTAGTAGTATAATTTATTCAGAAATCGGATAGGCTGATTTCAAAATTGAGCAGAAATGCTTGGAGTAAAGAACAATGAAAAAAATCGTAATCACTAACGAAAAGGGTGGGATTGGCAAAACCTCTGTTGCTGTTCATTTGGCACATTACTGTTATGAGCGCGGTATGCGTGTTCTATTTGTAGACATGGATAAACAAGGTAATAGTGGTTTCTCACTTAGTAAAGTTGCGGTTGAGATTAAAGATACCCATAGTCTATTTGCGGATATCCAAAACTTTGAAACTTTAGATAAATATTTTGTTCTTTTTAAAGGTAATAAGAGTTTAAAATCACTTTTTGATCCTACAGAACAAGAGTTTAAACTAGATAAAGTTGAAGAATACCAACGTAATTTCAAATCAAATATTGCTAAGGCTAACGAATTTTTTGATATCTGTATTTTTGATACACCTCCTACAGACGGTCCGTTTCAGCGATTACCTTTGTTAGTTTCTGAATTTGCTCTATCTCCTTTTTTATTAGATAAATATTCAATTCTAGGGCTGAGAGGTATTATTGATACCACACAAGAAATTAAAGAAGTAAACCCAAAAATTCAGTTTCTAGGGCTACTTCCAAATATGGTTAGTGCTAACTCTGTTACTCAAAAAACAACTTTAAATGAATTGCAGAAACAACTGAGTCATTTAATGCTTGATAAGACTGCTTTCATCCCTAATCGATCGGCAATTGCTGATGCAAGTGAACAACAAGTTCCAGTATGGAAAATTGATAAAACGTCAGCAAAAGATGTAGGGCGAAAAATCAAAAAAATTAATCAATTAGTTTTAGAGAAAATGGGGGTTTAAGCTATGTCTTCTTTATTAGGTGATTTAAACGCTGTTGATAGCTCATTAACTTCAGCAAACTTAAATGCTAACAATAACTCTGACCGCACAATTCTTAAATTGCCACTTAATCGGGTTAAGTTGGATCCTCAGAATGTACGTCTTGAATATGATCAAGATTATGTAAAAGAACTGGCAAATACTATTTTGAGAGATGGTTTACTTCAGCCTATTTCAGTTAGAGCCGATTCTGATAGTCCTGGTGAATATATTATTAATATGGGCCATTATCGTTATTTAGCTCATAAACATTTGAACTTGGATACTATCGAAGCAACGATTGATAACAAACTTGGTTCACGCCGAGTAAAAATGTCAGAAAACTTATTTAGAAAAGACATGAGTTTGCTTGAAGTTGCTACGAATTTAAAATTGATGCTAGAAGAAGGCGTGGCCGAGAATCCAAAGTATAGTTATGACGATTTAGCTAATGAAATTAATAAGTCAAAGACATGGGTTTCTCGAAGATTACAATTGCTTGAATCAGATGATTATCTAAAAAGCCTTATGGCTAATAAAATGGTAAATGATGCTGAAACTGGCACGATCATTAAAAACTTATTAGCTGAGTATCCAGAAGAAGTTAAAGCGTTAGTAGCAGATCATGAAGGTGCTATTTCATCAAAATTAGCCCGTGTATGGTCTAAGGAGCTGAAGGGTGAAATTATTACCTCAAGCACTTCAGACGTAACACAGTCATCTTTAGAACTTCAGAATTCGCCAAAGGCTGGTGAAAAAAATGAAGATAGTAAAGTGGACAATACTCAAGAGCTCATTACCGAAACTAAAGAGACTTTACAGCAACCTGCAAAAGTTCAAGAATCGGTTGAAAATACTGAAGCAGTGAAAGATGAAAAATCTTTTACGACTACTACTCAAAAGCAAACAAAAGAGATTGTAAAACAAGCAAATGAAAAGGCATTTTCAGAGCTTGAGACAGCTTATTTTAATGGTGTTTTGGAAAGTTACGTCAGTATTTTAGATTTAACCGAAAGCGAAGATGAAGACTTAGTATCAGTAGCTTGTGGCTTTTTAAGAAGCTTTAATGATGAAAATACAGCTAATTTGTTTTCGTGGAAAAGCTTAATTCAATATCCAGTACTAGTTAATGAGTTGGCGACTATTTTAGATTCTATGGCGCAATTACATGTATTTGTTCCATCTTCTAATGTTGAAGACTCTCGTATGCAAGTTATTTTAAATCAACAAGACCTTATTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017651|55526:63112|56462_56669_-|WP_000535991.1|DBSCAN-SWA MGSTVRLRDPTAQLVMDTALDMQQEQRQMVKTSDIVETLVQRYINTISFEDVQQTIENRKKNKKNKDK >NZ_CP017651|55526:63112|57181_58273_+|WP_057045729.1|DBSCAN-SWA MKNNALYKELDRHDDVNVIPNVLKNAIGQALASEGKLFSVSEIDLDIYDLIIVSMSGGKDSIASLLYLIEKGVDMSKVELWHNLVDGKSEPFMDWLFMDSYNKQLAKAFNLPIYNSWLMHGFEGEMLKNNSISHEYEIETPSGNIIIPRKRAKAGTRLRFPQQSADLRIRWCSSALKIEVGRRALSNQERFNNSKVLFVTGERREESPNRAKYFQLETHFCDNRNGKKGRLIDAYRPVLDFTERQVWEILERHNVAAPVPYRLGWSRSSCMNCIYNSPKVWATIKHYFPNRIDRIFKYEEQFATTISRKKINVINISEGIQPFNINDLVALDQAMRKEYTLPIFTKNWELPMGAFNKEGCGSD >NZ_CP017651|55526:63112|61855_63112_+|WP_070423407.1|DBSCAN-SWA MSSLLGDLNAVDSSLTSANLNANNNSDRTILKLPLNRVKLDPQNVRLEYDQDYVKELANTILRDGLLQPISVRADSDSPGEYIINMGHYRYLAHKHLNLDTIEATIDNKLGSRRVKMSENLFRKDMSLLEVATNLKLMLEEGVAENPKYSYDDLANEINKSKTWVSRRLQLLESDDYLKSLMANKMVNDAETGTIIKNLLAEYPEEVKALVADHEGAISSKLARVWSKELKGEIITSSTSDVTQSSLELQNSPKAGEKNEDSKVDNTQELITETKETLQQPAKVQESVENTEAVKDEKSFTTTTQKQTKEIVKQANEKAFSELETAYFNGVLESYVSILDLTESEDEDLVSVACGFLRSFNDENTANLFSWKSLIQYPVLVNELATILDSMAQLHVFVPSSNVEDSRMQVILNQQDLI >NZ_CP017651|55526:63112|61078_61852_+|WP_000724905.1|DBSCAN-SWA MKKIVITNEKGGIGKTSVAVHLAHYCYERGMRVLFVDMDKQGNSGFSLSKVAVEIKDTHSLFADIQNFETLDKYFVLFKGNKSLKSLFDPTEQEFKLDKVEEYQRNFKSNIAKANEFFDICIFDTPPTDGPFQRLPLLVSEFALSPFLLDKYSILGLRGIIDTTQEIKEVNPKIQFLGLLPNMVSANSVTQKTTLNELQKQLSHLMLDKTAFIPNRSAIADASEQQVPVWKIDKTSAKDVGRKIKKINQLVLEKMGV >NZ_CP017651|55526:63112|59584_60082_+|WP_001067229.1|DBSCAN-SWA MNNYFNVLIITDLKIGRLKTPSHCACAVGHIDIMKPSFEYNTGLVALSTTMYDCKDFNVYTLSTKESFNKFISTLKVLEELIGIPCPFLTAIQETYEFYGDFIFECLTWFNNNADILFRPDHLGEFTKTADESLNFQLMYFKVLETFRKAGLNGFIQFNTLKTIN >NZ_CP017651|55526:63112|58330_59104_+|WP_000844619.1|DBSCAN-SWA MKSYYQISFSGGRTSAYLTWYLLNNYSHLYNFIVTFANTGIEHEKTLEFVDKCDKYFNFNTVWLEAVIHPKKRVGTTHKVVNFKTATRGPVLFEQMIEKYGIPNKVYKHCTRELKIRPMDSYIRSIGMKPKDIPTAIGIRADESKRCAKDAEANNFIYPLVTEHPVDKQFILDWWSKQAFDLELNEWDGNCNMCFEKSFPKLLKQLESNPFALEFHLRMERIHGQTNNQPGRPDRVFFRQNTSAIDILNMFNQANVA >NZ_CP017651|55526:63112|60110_60887_+|WP_001086346.1|DBSCAN-SWA MNSKVNIGKTYSVLKSEFIHTLKSIDQSKNIYEIFHDFVFCSAAALRNSIGHRYQNLFNHNIENEYLQRINRYDVSGRLKIKKLFYLLVDLCEAKGEPYDVLGSIYMELEIGNDHIGQYFTPSEVSNLCAQVVMTDLKKQLEEEGVISISDPACGAGSTLLSTVKLCLESKIQVQDHLYIEAADIDRNVALMCYIQLSLWAVPCRIFVGDTLKLKYRECWCSLMYYVKGWDIKLHSQKLKEIVHKAEDYVPNFILIND >NZ_CP017651|55526:63112|56220_56457_+|WP_000072937.1|DBSCAN-SWA MSNVDPQLEHVDPAHPAAPDAYMRVLNCKSNYVNILAGWFLKDGKKKFYIADVRGNEVEAGFNRLDWLTEFDTIYKGK >NZ_CP017651|55526:63112|55526_56216_+|WP_000389917.1|DBSCAN-SWA MEDMQTIIDKISKCLALSKSANEHEAAVALKQAQTLMQKYKISEKQILISDIKERIIQTKTQRTKDIERRLKVMIANVFECGSYSGFYTLEGVKYQQHVFYGVEPNVSIATYAYTVLLPILIKNKQSYLATLHGNTKLKSKRRLGISYHRGWILGVEKKCRNLNPDKELKEKLSEYEKTLNLIYCEVKSVKHYNKDMLNQARVKGYSDGSKVNLHHAIDPNETKKIFLS |
9 | Alteromonadaceae_phage(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
987743 : 1000527
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017650|987743:1000527|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017650|987743:1000527|992375_993422_+|WP_020752534.1|DBSCAN-SWA MNKILFGDCRTLMAQMIQEGLKAQTCVTSPPYFGLRDYGVDGQLGLESTVDEYVQNMVEVFRLVRELLHEDGTLWLNLGDSYAGSGRGITRTGLNDGKNPKTKGLILPKQNAAQSNLKPKDLIGIPWKVAFALQADGWYLRQDIIWHKPNPMPESITDRCTKAHEYIFLFSKSRRYYFDHVAIKEPVAESSIKRLSQNLDDQQGSDRVVNKHNGPMKAVYSRSSRDSFKRSNSKRAAVIPNQAYGTHRSERSESEYDLLTRNKRSVWQVSTKPYKGAHFATFPMDLIEPCVLAGSRVNDVVFDPFMGSGTTAAVALMHNRNYLGCELNPQYYELQQERFEKVLKERAA >NZ_CP017650|987743:1000527|989612_990068_+|WP_000575725.1|DBSCAN-SWA MIFELINPSDKCTFEAPNLKIAALVTCVLGNGQYSAKGIENDLDVPFFIFGGHDEWFVSNFGLNFKETYIQVRNEEKFDLVNSFNSVLLGSYLDRTAFYKAYDLIQDPAEKNKWREQWLDERRSSLNNICKRAWNFAEQVSLYKPAQEGAA >NZ_CP017650|987743:1000527|995228_995651_+|WP_000648413.1|DBSCAN-SWA MKATKLIRDKGLQYAKEIVDSAPDNATEWNEGYEFQCGQSVEISPADREKYFVDLVELKRLVESLKIINDLGGVEKLTPAFITTDKHVGYTHVRMVGNGRLSFLDDFCDFIPDGSISIKRVMTAIRDHESIYGGGESHAN >NZ_CP017650|987743:1000527|990064_990703_+|WP_001205618.1|DBSCAN-SWA 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19 | Acinetobacter_phage(53.85%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1218503 : 1230851
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017650|1218503:1230851|DBSCAN-SWA 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CGGCTTACAGAACTAAATACGCTGTTCAGTTCAATAAGAATTTTCCAGTAGAGGGGAAAAATGCCGTTCCAATGCAAATCGTTGAACAGCAGCTTGCTAAAGCATTGGTTGGGGTTACACCTAACCAACTTCAAAGAGGCTTAGCGCTATTTTACGCAAGTACAAATACATACATGCCTAACTTCGCTGAATTCCGTGCTATGTGCATGGGTGATGATTGGTGGAGCGCTGAGAAGGCTTGGGTTAAGGCTTGTGAATACACTCAGATCTCTCAACACAAAAAAGTGACATTGCCAGACGGAAGAGAGCAGAACCAAGAAATTACAACCTTGACCAAATTTGTTTTAGACCAAGTTTATTTACTAATCCAAGACGGTGAAATGTACAAAGCCAAAATGGAATTTATCAAGATCTATGATGAATACAAGGCTGAAGCACAACTGAAGGGTAAAACCCAAGCTTGGTACCAAGAACCAATTTTATTAGCTCAGAAAAATGAGCAGAAAGTGCATATACCAGTTTCCAATGAGGAAGCGCAAAAGCATCTCAAATCTTTGATGGAACGGTTAAAGATTAATGGCCGTAAACCAGCACCAGTACAAAAACTTCAGGCAAAAGAAAAAGAGCCTGAACTTGCAAAAGAATTAGGTCCAGATCCTTTTGATAATCCATATGAATATGCAGAGATGTGCCGTCGGGAGGGTATGCCAATACCTAGAAATATTCTTCAGCTAATTGAAGGGGCGAATGTATGAAAGCATCCAAATTAATTAGAGATAAAGGGCTGCAATACGCGAAAGAAATCGTTGATTCAGCACCTTCTAACGCAACTGAGTGGAATGAAGGTTTCGAGTTCCAATGTGGTCAAAGTGTAGAGATTAGCAAGGCTGACCGAGAAAAATATTTTGTAGACCTTTCTGAACTTAAGCGTCTAGTGGAGTCGGTTGATTTGGTCGAATCATGGGGCGGCATTGATGATGTAAAGCTATATGACTTGTCTCATTGCAAAAACAGGCCTGAATCGGCTGGATACAAGTTGCTTCAAGCAATTGCTGATTACGAATCAATATACGGAGGCGGTTATGTTTGAACAAATATTAAAACGCCGCCCTAAAGGTGCGACACATTGGCAGGCTGGATATTACTACAACAGTGATGAATGTGGGATTTGGTCTATTTGGGAAAACGGGAAGTGGCATGGAGATTTTAAATTTCCAGATGGTGTTATGACTAAGTTGCCAGAGGAAAAGGAGCCAGTCATGAGTGAGTTTGAGGGTAAATCTGGAAAGTGGGCTTGGGAGATTCAAAAAGAACAACAAGCGAATTTAGTTGAGCTAAGAAGTTCAATTGAAAACCTAGTTCAAAAGTATAAACACGATGCTCATGCTTCAAGCCTTTTTGGCGATCAAGATAAAGCACGAGTTTATAACTGCTTTGCTAATCAGTTGAAAAATTTGCTGAAAGGTGGTGCTTGATGTCATCAGTCAGCATTGCTGAATACCGCAAGTTATTTCCGATAAAGAAAAATAAAAAGCGGCGTTCAGCAAAGCAAGTTGCCAGACAACCAAGTGTGGGTGAAATGGTTCTGGCAACGCATTTAAGAGCATGCAAGATCGGTTTTGAACAGGAATATAAGTTCCATCCAAAACGCAAATGGAGAGCTGATTTTCTGATTATTGGTACAAAAATTTTGATTGAGGTTGAAGGCGGGATCTGGAGTGGAGGCCGTCATACAAGGGGCAAAGGCTATATAGGGGATATGGAGAAATACAACTCCGCAGCAATGATGGGTTTTACAGTTTTACGGTTCAGCACAGAGCAAGTGAAAGCAGGCGTGGCGATTAAACAAATTGAGCAATTGGTAGGTGAAAAATGAGTGCAGTTTTAAAAACACAACAAATGGATTGGTCTAAATATACTATTGACGGTTGGTTAGAGCAGTTTGGCGCATGGTGTGAAACAGTTAGAATGAAAGGGGGTGATTTGCCAGATGGGCTTCATATCAATCAAATTTACTGGTTGATGCGTGAAGCTGGCAAAGAAGTACAAAAAAGTAAATCTTATATTCGATGTGAGATCAGTGATTATGAGGCGGATCAAATTCAAGCACTTTTACGAAGTCTATTAAATTCTGATAAAACAGATTTTACAACTAAGTTTGCATTAATTTGTTTAATTAAAAATAAGGTTGAAAATAAAGGATTGTTGAAGGTTGCTCAAGAAACAAACCAATCTAAAGCTCAGGTCGCAATTATGGTGAGTTGCGCTAGATTTTATTTATTAGGTCATGATAAAAGATTAAGACAAAATGGAGGTTCAAATGAAAACATACACTGTAAAACTATATGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017650|1218503:1230851|1218503_1219226_-|WP_000004579.1|DBSCAN-SWA MSESTLWAVAMRPEGYSPFKQTPAASKEIAERAVERYRKMHEKEGNNFFLEIFDDVIKVQKWHGSRKDHIKNLFYVESWFSEPMYQCFDLKTAERVFKFDEIVICYKKGSAPLVTKSFDEAKLFYGSSETGFKYQIQPIEPPENLFNWFHPDIELFDTIEEGAEAYTREQWAQLQMNLRVEIETQLLDYDEIPNIPEDAVVWPNWKPEPPEQGLFLIAAFDSEDGPVLWWANPKAESKEK >NZ_CP017650|1218503:1230851|1223779_1224283_-|WP_001129676.1|DBSCAN-SWA MAKRYLPFYNNARFIALVLVGLFAIFSIIFKYLELNITINLVQFSFVLLLPLSQIYLAYKGMLDALKLDGLNQSERDRLTSTVDIRSKSSLYVAMLFIILVFSMYILNLLGLLSAKHLLALILSVGLTSIFSFFLAWSDLREISLLEKTLKDRKESREAKAKVLSNK >NZ_CP017650|1218503:1230851|1229976_1230378_+|WP_000100162.1|DBSCAN-SWA MSSVSIAEYRKLFPIKKNKKRRSAKQVARQPSVGEMVLATHLRACKIGFEQEYKFHPKRKWRADFLIIGTKILIEVEGGIWSGGRHTRGKGYIGDMEKYNSAAMMGFTVLRFSTEQVKAGVAIKQIEQLVGEK >NZ_CP017650|1218503:1230851|1221945_1222269_-|WP_000064463.1|DBSCAN-SWA MSNFKKHPDGYKSFLGRDDKGLYSVRIGWQVYASNANGSVLYKVKDGFKTPLNVFRFQTDYPKVWNELTQEIDFQRRKQLAIKLRETNIPTYDRKAYKTKRGFTGSR 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24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1234808 : 1263480
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017650|1234808:1263480|DBSCAN-SWA 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37 | Acinetobacter_phage(93.33%) | terminase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2680217 : 2686841
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017650|2680217:2686841|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017650|2680217:2686841|2681755_2683558_+|WP_033915478.1|DBSCAN-SWA MNDLTVPEKLAKLRELMTNQSIDALVVMSADPHMSEYLPDYWKARQWLSGFSGSVGTLVVTQNFAGLWADGRYWVQAEQQLAGTGFQLQKLTSDESSTHLAWIEKNLPAGSVISVNGQTLSIQQFKALENTAKQLGFKLETQQDLIGLIWLNRPELPLEQIHLMPEGLNALSRKEKIQAIRETLKTKAIEGHFISSLDDIAWVLNARGQDVEYNPVFLSHLYISAQQAVLFIDSNKVDLTTQQAFKADGIEICDYQDSAQFLANISNASVLLDPAKVSIYHEQAIAKDIQVVYDINPSTLFKSRKHESEIAHIRHAMVKDGVALCHFFHWLEKAFHQSQRISELTIDEKITAFRAQQEGFIGPSFSTIAGFNANGALPHYRATEEHYSFIEGDGLLLIDSGGQYVDGTTDITRVVPVGTPTEQQKRDYTLVLKCHIALAKTIYPEGLAAPLLDSICRHTLWQHGLDYRHGTGHGVGFALNVHEGPQVLSYYAPIHAYSKLREGMILSNEPGLYHEGQYGIRIENLVANRLHSGFEKTYGDFLEFETLTLCPIHLDCIVVDMLTDEEKDWLNSYHQTVQERLAEHLSGDVLDWLIYNTRKI >NZ_CP017650|2680217:2686841|2686451_2686841_-|WP_000433912.1|DBSCAN-SWA MEPVSTSGFTALLKLYGVAIMVTLAVGLVAAVVLMTRMPRSPQEWAVGLICTVVSSLAGGSFIIVKWGLHEWVTDVWGMIALGGFFFVCGLPGWALVRWIFNFIDKQEGKTIVEVIKEFKNARKDIENS >NZ_CP017650|2680217:2686841|2685866_2686409_-|WP_070423365.1|DBSCAN-SWA MNIEKYLDELIKREGGYVNNPADRGGATKYGITEAVARANGFKGNMRDLPLDVAKAIYKKQYWTAPRFDQVNTISSAVAEELLDTGVNCGTGFAKPLLQRALNLLNNQGKAGYADLEVDGVYGSETLRALKTYLAKRGKEGEKVLVRVLNIMQGQRYIEICERNPKQEQFFYGWIANRIG >NZ_CP017650|2680217:2686841|2684045_2685242_+|WP_000947611.1|integrase|DBSCAN-SWA MLSDSKIRSAKPKEKLYRLGDSDGLCVEIKPNGKKYWRYRFQWLKKTQMMSLGEYPIVGLAEARTKRDEAKSLVASGINPVEEKENQKKAKSDEYDNRVLFKHVAAEYKAEKLNNRSERYQEAFQRALDKDILKVIGDKDIKEVTSADVLTIMKKTIARVKRQKNHGTGEVSAIQNRTFIGGVMRYAIATLRADYDPTYAVKNVVERPEIEHARPMEKYEAVQLRNKLNSYGGSTTVKNAGLVMLYSMLRTIEIRRMKWEYVDFEARTITFPKEMMKKKRIHIVPMSDQVFNILQEQRNIVGNREYVFPAIYQDGMLSATTMNKMLDYIGLSDVTAHDFRATASTLLNEKDYDDKWIEKQLAHADGNKTRATYNHAKYLESRRKMLQDWANIVDSWAV >NZ_CP017650|2680217:2686841|2685238_2685433_-|WP_000098296.1|DBSCAN-SWA MSSQLIKIHYHAYSRVADLLADLDKKGEVTKIYDLNGNELKINFLRDEVYYKKVWWHFQKKQGG >NZ_CP017650|2680217:2686841|2680217_2681759_+|WP_000872622.1|DBSCAN-SWA MKYDFEQSDKAFFGHPKPLQTLFFTELWERFSYYGIRPLLVLYMIAMVNDGGLALDRPTAAAIVGLFAGSMYLMTVFGGWVADNWLGQARAVWYGSIIIALGHLSIALTSVFDQSFFYLGLVLIVLGTGLFKTCISVIVGTLYKANDARRDAGFSIFYMGINMGSFIAPLITGLLAKDHGWHLGFGIGGIGMLIALLIFRFMAMPQLQTFNELRQEANSCSKPVVENKNAPKIVFSFLFAVAVVIALTFLGIIHINPVAVATYLTVGISIGIIAYFAYLLLFLNLEQHEKFKIIICFVLLAASALFWSAFEQKPTTFTLFAQDYTDRIVFGFEIPTVWFESINALFIIIFAPVAAWLWAKLGKANKDPSYISKFIIALLFAAGGFLLMSLASHFAIHGGVVSPFWLVGTLFLLTIGELCLSPIGLSTMTKLAPDVIRSQIMGLWFTGTALGNLMAGLIGGQVSADGINHLPSLFMRCVLALVIGAIVLFLLKKPMNKLMDKSTNKVQPDLETI |
6 | Acinetobacter_phage(100.0%) | integrase | attL 2673631:2673644|attR 2691627:2691640 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2690346 : 2798319
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP017650|2690346:2798319|DBSCAN-SWA 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151 | Acinetobacter_phage(93.8%) | terminase,capsid,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
3086611 : 3119789
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP017650|3086611:3119789|DBSCAN-SWA 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42 | Pseudomonas_phage(20.0%) | integrase,head,tail,transposase,plate | attL 3107919:3107932|attR 3118062:3118075 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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