Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017653 | Acinetobacter baumannii strain KAB06 plasmid unnamed, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP017652 | Acinetobacter baumannii strain KAB06 chromosome, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,RT,csa3,cas3,WYL | 0 | 0 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
5028 : 12613
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017653|5028:12613|DBSCAN-SWA AATGGAAGATATGCAAACTATCATAGATAAAATTAGTAAGTGCCTAGCATTATCAAAAAGTGCCAATGAGCATGAAGCAGCCGTTGCACTTAAGCAAGCACAGACATTGATGCAGAAGTACAAAATAAGTGAAAAACAGATACTAATTAGTGATATTAAAGAGCGAATTATTCAGACAAAAACTCAAAGAACTAAAGATATTGAAAGACGGCTTAAAGTAATGATCGCAAATGTCTTTGAATGCGGAAGTTACTCAGGTTTTTACACTTTAGAAGGTGTGAAATATCAACAACATGTTTTTTATGGAGTTGAACCAAATGTGTCTATTGCAACATATGCATATACTGTTTTACTCCCTATTTTGATTAAAAATAAACAAAGTTATTTAGCCACTTTACATGGAAATACTAAACTTAAATCTAAGAGACGTTTAGGCATAAGCTATCATAGAGGGTGGATTCTTGGAGTTGAAAAAAAGTGTAGGAACTTAAATCCAGATAAAGAGCTAAAGGAAAAACTGAGCGAATATGAGAAAACTCTTAATCTTATATATTGCGAAGTTAAAAGTGTTAAACATTATAATAAAGATATGCTTAATCAAGCACGAGTAAAAGGGTATTCGGACGGGAGTAAGGTGAACTTACATCATGCTATTGATCCTAATGAAACGAAAAAGATTTTCTTGAGTTGATTGAATGAGTAACGTTGATCCTCAACTTGAGCATGTTGATCCAGCTCATCCTGCTGCACCGGATGCTTACATGAGAGTTCTGAACTGTAAGAGTAATTATGTAAATATATTAGCTGGATGGTTTCTTAAAGATGGTAAGAAGAAATTTTATATTGCAGATGTAAGAGGCAATGAAGTTGAAGCCGGTTTTAACAGGCTTGATTGGTTGACAGAGTTTGACACAATTTATAAGGGCAAATAGGTTTTCTATTTGTCCTTATTTTTTTTATTCTTTTTGCGATTTTCAATAGTTTGTTGAACATCTTCAAAGCTAATTGTATTTATATATCTTTGAACCAATGTTTCAACAATATCTGAAGTTTTAACCATTTGACGTTGCTCTTGTTGCATATCTAATGCGGTATCCATAACAAGTTGAGCTGTTGGATCCCGGAGACGTACTGTAGATCCCATAACAAATCCTCCTTTCAGTAATTTATTATATGTGATTTATTTAATTTATATACAAAAAATATTACAAGTTTAATTTTGTTTTTGATCATATTTGTTAATTCTAGCCATGTTTTATTTCTTTGGTAGTTAGGCTACCTTGTTTCTATAAAATTGAATCTAGGAGCAAATAGAGCGATTTAGAGGGCTATTTGTCGCAACCCTGCGGGATTGCTTTGTTATTACCGGATAAGGTCCAATGGGAGAAGTTTCACTTCTTCGGTCGTCTAGTCAAAATCACAGATTTTGACTGACTCGCTCGAAGTTTGAAACGGTAATCAAGGAGGGGGATGCTCGCAAATTTCATCAGTTCGCAACGTGGACACGTTGCTCTGCAAAAGTATTTTATAAAACGAAAAATTACACTAAATATATGTTTTTTCTTAATAAAAAGACATGAAAATGTAGTATAATTGAGGGGTGAAATCGGGTAGGCTGGTTTCTATATATGAGCTGAAAAGCTTAAGGTGAATTGAATGAAAAATAATGCTTTATATAAAGAGCTTGATAGACATGATGATGTGAATGTTATTCCTAATGTATTAAAAAATGCTATAGGACAGGCACTTGCATCTGAAGGTAAGTTGTTCTCTGTCTCAGAAATAGATTTAGATATTTATGATTTAATTATCGTCAGTATGAGTGGCGGAAAAGATAGTATTGCTTCTTTGCTCTATTTAATAGAGAAAGGCGTGGACATGTCAAAGGTTGAATTGTGGCATAACCTTGTTGACGGTAAGAGTGAGCCGTTTATGGATTGGCTGTTTATGGATAGCTACAACAAACAGCTTGCCAAAGCATTTAATTTACCAATTTATAATAGCTGGTTAATGCATGGCTTCGAGGGGAGATGCTAAAAAATAATTCCATAAGCCATGAATATGAGATTGAAACACCGAGTGGGAATATCATTATTCCAAGAAAACGAGCAAAAGCTGGAACGAGATTGCGGTTTCCTCAACAATCAGCAGATCTCCGTATTAGATGGTGTTCTTCAGCTCTGAAGATCGAGGTAGGGCGTAGAGCTTTATCAAACCAGGAGCGTTTTAATAACTCTAAAGTTTTATTTGTTACTGGAGAGCGTCGAGAAGAAAGTCCTAATCGAGCAAAATACTTCCAATTAGAAACACATTTTTGTGATAATCGTAATGGGAAAAAAGGTCGTCTAATTGATGCATATCGACCAGTTCTTGATTTTACAGAACGTCAAGTGTGGGAAATTTTAGAGCGTCATAATGTCGCAGCGCCAGTACCATATCGCTTAGGATGGTCGAGATCAAGCTGTATGAATTGTATCTATAATAGCCCGAAAGTTTGGGCAACCATCAAACATTATTTTCCCAATCGTATTGATCGAATTTTTAAATACGAAGAACAATTTGCAACTACAATTAGTCGAAAAAAAATCAATGTCATAAATATAAGTGAGGGTATTCAGCCTTTTAATATCAATGATTTAGTAGCTTTGGATCAGGCAATGAGAAAAGAATATACCTTGCCTATATTTACAAAAAACTGGGAGCTACCTATGGGGGCCTTTAATAAAGAGGGATGCGGTTCAGATTAAAAATTATAAAAGGCTAAAACAATTGAGATTCGAGCAGAAATGCTTAAGGTGAAATTAATGAAATCATATTATCAAATTAGCTTTAGTGGTGGACGTACTTCAGCATATTTAACCTGGTACTTGCTTAATAACTATAGCCACCTTTATAACTTTATAGTCACATTTGCAAATACAGGCATTGAGCATGAGAAAACTTTAGAGTTTGTCGATAAATGTGATAAATATTTTAATTTCAATACAGTTTGGTTAGAAGCAGTTATTCACCCTAAAAAAAGAGTAGGTACGACGCATAAAGTTGTCAATTTTAAGACAGCTACCAGGGGGCCAGTACTTTTTGAACAGATGATTGAGAAATACGGAATTCCTAATAAAGTTTATAAGCATTGCACCCGTGAATTAAAAATAAGACCAATGGATTCATATATTCGTAGTATTGGGATGAAACCTAAAGATATCCCTACTGCAATCGGTATCCGGGCTGATGAATCTAAACGTTGTGCTAAGGATGCAGAAGCAAATAACTTTATTTATCCATTAGTCACAGAACATCCAGTGGATAAGCAATTCATATTAGATTGGTGGTCAAAGCAAGCGTTTGATCTAGAGCTAAATGAATGGGATGGAAATTGTAATATGTGTTTTGAGAAATCATTTCCAAAATTATTGAAGCAGCTTGAATCAAATCCGTTTGCTTTAGAGTTTCATTTACGAATGGAAAGGATCCACGGGCAAACTAACAATCAACCAGGCAGGCCTGATAGAGTTTTTTTTCGTCAAAATACTTCAGCAATTGATATCTTAAATATGTTTAACCAAGCGAATGTAGCTTAGACATGTGTTATGTGATTTTTAAAGTAGGTGTAGGTAAGTATATCTATCCCTAACACACTAGAATATTAAAAAATGCTGTCAGTTCCATTAATTAACTAGAGTGGATGAACCTAAAATCAATTAGATTCGCAATTTAGAAGCGCAACCCTGCGGGATTGCTTTGTTACTCCCGGATAAGCTCCAATGGGAGAAGTTTCACTTCTTCGGTCGTCTAGTCAAAATCACAGATTTTGACTGACTCGCTCGAAGTTTGAAACGGTAATCAAGTAGGGAGATGCTCGCAAATTCCTTCAGTTCGCAACGTGGACACGTTGCTCTGTTAGTAATGTTTAATTCGAAAATATATTTCATTAAATTAATGTTTTTTAACAATATTAACGTTTAAAGATCTTGATTAAAATACATCATTGTATTACAATTTTGGTTAGAAATCGGATAGGCTGATTTCGTATTTTGAGCTGAAAAGCTTATGGTGAAAAAATGAATAATTATTTTAATGTATTAATCATAACTGATTTAAAAATTGGTCGTTTAAAGACTCCATCACATTGTGCATGTGCTGTTGGCCATATTGATATTATGAAGCCATCTTTTGAATACAATACTGGCTTAGTTGCCTTATCTACTACTATGTATGATTGTAAGGACTTTAATGTTTATACATTAAGTACAAAAGAGTCATTTAATAAGTTTATTTCAACATTAAAAGTTCTTGAAGAATTGATTGGTATTCCTTGTCCTTTCTTAACCGCTATTCAAGAAACATATGAGTTCTATGGTGACTTCATTTTTGAATGTTTGACCTGGTTTAATAATAACGCAGATATATTATTCAGACCTGACCACTTGGGAGAATTCACTAAAACAGCAGATGAGTCTCTTAATTTCCAATTAATGTATTTCAAAGTCTTAGAAACTTTTCGTAAAGCCGGTTTAAATGGTTTTATACAATTCAATACATTGAAAACTATTAATTGATTGAGCTGAAGAGCTTGCGGAGAAAAAAGTGAATTCAAAAGTTAACATTGGTAAAACTTATAGTGTTTTGAAAAGTGAGTTTATACATACCTTAAAAAGTATCGACCAATCTAAAAACATTTATGAAATATTTCATGACTTTGTTTTTTGTTCAGCAGCAGCATTAAGAAACTCAATTGGTCATAGATATCAAAATTTGTTTAACCACAATATTGAAAATGAATATCTTCAACGTATCAATCGTTACGACGTTAGTGGACGTTTAAAAATAAAAAAATTGTTTTATCTGTTGGTGGATTTATGCGAAGCAAAGGGTGAGCCATATGATGTGTTAGGTAGCATTTACATGGAATTAGAAATTGGGAATGATCATATCGGCCAATATTTTACACCAAGTGAGGTATCAAATTTATGTGCTCAAGTTGTAATGACCGACCTTAAAAAACAACTTGAGGAAGAGGGGGTGATTTCGATTTCCGATCCAGCTTGTGGAGCTGGCTCAACTTTACTTTCAACTGTAAAACTCTGTTTGGAATCTAAGATACAAGTGCAAGATCACTTGTATATTGAGGCAGCAGACATTGATAGAAACGTTGCTTTAATGTGTTATATACAACTAAGTTTGTGGGCAGTGCCTTGCCGTATTTTTGTTGGTGATACCCTCAAGTTAAAGTATCGTGAATGCTGGTGTAGCTTAATGTATTACGTAAAAGGGTGGGACATAAAATTGCATAGTCAAAAATTAAAGGAAATTGTACATAAAGCTGAAGATTATGTGCCTAATTTCATTTTAATTAATGATTGATTTTTTTATATGCATAGATGTAACTTACACAAGCTTAGGTTGTTGCGGATCCGCAACAACCTATTTAAGACAAATTGGCGCTATAAAATTTAATCTTTTTCTTGCAAAAAGTATGTTTTAGTAGTATAATTTATTCAGAAATCGGATAGGCTGATTTCAAAATTGAGCAGAAATGCTTGGAGTAAAGAACAATGAAAAAAATCGTAATCACTAACGAAAAGGGTGGGATTGGCAAAACCTCTGTTGCTGTTCATTTGGCACATTACTGTTATGAGCGCGGTATGCGTGTTCTATTTGTAGACATGGATAAACAAGGTAATAGTGGTTTCTCACTTAGTAAAGTTGCGGTTGAGATTAAAGATACCCATAGTCTATTTGCGGATATCCAAAACTTTGAAACTTTAGATAAATATTTTGTTCTTTTTAAAGGTAATAAGAGTTTAAAATCACTTTTTGATCCTACAGAACAAGAGTTTAAACTAGATAAAGTTGAAGAATACCAACGTAATTTCAAATCAAATATTGCTAAGGCTAACGAATTTTTTGATATCTGTATTTTTGATACACCTCCTACAGACGGTCCGTTTCAGCGATTACCTTTGTTAGTTTCTGAATTTGCTCTATCTCCTTTTTTATTAGATAAATATTCAATTCTAGGGCTGAGAGGTATTATTGATACCACACAAGAAATTAAAGAAGTAAACCCAAAAATTCAGTTTCTAGGGCTACTTCCAAATATGGTTAGTGCTAACTCTGTTACTCAAAAAACAACTTTAAATGAATTGCAGAAACAACTGAGTCATTTAATGCTTGATAAGACTGCTTTCATCCCTAATCGATCGGCAATTGCTGATGCAAGTGAACAACAAGTTCCAGTATGGAAAATTGATAAAACGTCAGCAAAAGATGTAGGGCGAAAAATCAAAAAAATTAATCAATTAGTTTTAGAGAAAATGGGGGTTTAAGCTATGTCTTCTTTATTAGGTGATTTAAACGCTGTTGATAGCTCATTAACTTCAGCAAACTTAAATGCTAACAATAACTCTGACCGCACAATTCTTAAATTGCCACTTAATCGGGTTAAGTTGGATCCTCAGAATGTACGTCTTGAATATGATCAAGATTATGTAAAAGAACTGGCAAATACTATTTTGAGAGATGGTTTACTTCAGCCTATTTCAGTTAGAGCCGATTCTGATAGTCCTGGTGAATATATTATTAATATGGGCCATTATCGTTATTTAGCTCATAAACATTTGAACTTGGATACTATCGAAGCAACGATTGATAACAAACTTGGTTCACGCCGAGTAAAAATGTCAGAAAACTTATTTAGAAAAGACATGAGTTTGCTTGAAGTTGCTACGAATTTAAAATTGATGCTAGAAGAAGGCGTGGCCGAGAATCCAAAGTATAGTTATGACGATTTAGCTAATGAAATTAATAAGTCAAAGACATGGGTTTCTCGAAGATTACAATTGCTTGAATCAGATGATTATCTAAAAAGCCTTATGGCTAATAAAATGGTAAATGATGCTGAAACTGGCACGATCATTAAAAACTTATTAGCTGAGTATCCAGAAGAAGTTAAAGCGTTAGTAGCAGATCATGAAGGTGCTATTTCATCAAAATTAGCCCGTGTATGGTCTAAGGAGCTGAAGGGTGAAATTATTACCTCAAGCACTTCAGACGTAACACAGTCATCTTTAGAACTTCAGAATTCGCCAAAGGCTGGTGAAAAAAATGAAGATAGTAAAGTGGACAATACTCAAGAGCTCATTACCGAAACTAAAGAGACTTTACAGCAACCTGCAAAAGTTCAAGAATCGGTTGAAAATACTGAAGCAGTGAAAGATGAAAAATCTTTTACGACTACTACTCAAAAGCAAACAAAAGAGATTGTAAAACAAGCAAATGAAAAGGCATTTTCAGAGCTTGAGACAGCTTATTTTAATGGTGTTTTGGAAAGTTACGTCAGTATTTTAGATTTAACCGAAAGCGAAGATGAAGACTTAGTATCAGTAGCTTGTGGCTTTTTAAGAAGCTTTAATGATGAAAATACAGCTAATTTGTTTTCGTGGAAAAGCTTAATTCAATATCCAGTACTAGTTAATGAGTTGGCGACTATTTTAGATTCTATGGCGCAATTACATGTATTTGTTCCATCTTCTAATGTTGAAGACTCTCGTATGCAAGTTATTTTAAATCAACAAGACCTTATTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017653|5028:12613|10579_11353_+|WP_000724905.1|DBSCAN-SWA MKKIVITNEKGGIGKTSVAVHLAHYCYERGMRVLFVDMDKQGNSGFSLSKVAVEIKDTHSLFADIQNFETLDKYFVLFKGNKSLKSLFDPTEQEFKLDKVEEYQRNFKSNIAKANEFFDICIFDTPPTDGPFQRLPLLVSEFALSPFLLDKYSILGLRGIIDTTQEIKEVNPKIQFLGLLPNMVSANSVTQKTTLNELQKQLSHLMLDKTAFIPNRSAIADASEQQVPVWKIDKTSAKDVGRKIKKINQLVLEKMGV >NZ_CP017653|5028:12613|5964_6171_-|WP_000535991.1|DBSCAN-SWA MGSTVRLRDPTAQLVMDTALDMQQEQRQMVKTSDIVETLVQRYINTISFEDVQQTIENRKKNKKNKDK >NZ_CP017653|5028:12613|7831_8605_+|WP_000844619.1|DBSCAN-SWA MKSYYQISFSGGRTSAYLTWYLLNNYSHLYNFIVTFANTGIEHEKTLEFVDKCDKYFNFNTVWLEAVIHPKKRVGTTHKVVNFKTATRGPVLFEQMIEKYGIPNKVYKHCTRELKIRPMDSYIRSIGMKPKDIPTAIGIRADESKRCAKDAEANNFIYPLVTEHPVDKQFILDWWSKQAFDLELNEWDGNCNMCFEKSFPKLLKQLESNPFALEFHLRMERIHGQTNNQPGRPDRVFFRQNTSAIDILNMFNQANVA >NZ_CP017653|5028:12613|11356_12613_+|WP_070423407.1|DBSCAN-SWA MSSLLGDLNAVDSSLTSANLNANNNSDRTILKLPLNRVKLDPQNVRLEYDQDYVKELANTILRDGLLQPISVRADSDSPGEYIINMGHYRYLAHKHLNLDTIEATIDNKLGSRRVKMSENLFRKDMSLLEVATNLKLMLEEGVAENPKYSYDDLANEINKSKTWVSRRLQLLESDDYLKSLMANKMVNDAETGTIIKNLLAEYPEEVKALVADHEGAISSKLARVWSKELKGEIITSSTSDVTQSSLELQNSPKAGEKNEDSKVDNTQELITETKETLQQPAKVQESVENTEAVKDEKSFTTTTQKQTKEIVKQANEKAFSELETAYFNGVLESYVSILDLTESEDEDLVSVACGFLRSFNDENTANLFSWKSLIQYPVLVNELATILDSMAQLHVFVPSSNVEDSRMQVILNQQDLI >NZ_CP017653|5028:12613|5028_5718_+|WP_000389917.1|DBSCAN-SWA MEDMQTIIDKISKCLALSKSANEHEAAVALKQAQTLMQKYKISEKQILISDIKERIIQTKTQRTKDIERRLKVMIANVFECGSYSGFYTLEGVKYQQHVFYGVEPNVSIATYAYTVLLPILIKNKQSYLATLHGNTKLKSKRRLGISYHRGWILGVEKKCRNLNPDKELKEKLSEYEKTLNLIYCEVKSVKHYNKDMLNQARVKGYSDGSKVNLHHAIDPNETKKIFLS >NZ_CP017653|5028:12613|5722_5959_+|WP_000072937.1|DBSCAN-SWA MSNVDPQLEHVDPAHPAAPDAYMRVLNCKSNYVNILAGWFLKDGKKKFYIADVRGNEVEAGFNRLDWLTEFDTIYKGK >NZ_CP017653|5028:12613|9085_9583_+|WP_001067229.1|DBSCAN-SWA MNNYFNVLIITDLKIGRLKTPSHCACAVGHIDIMKPSFEYNTGLVALSTTMYDCKDFNVYTLSTKESFNKFISTLKVLEELIGIPCPFLTAIQETYEFYGDFIFECLTWFNNNADILFRPDHLGEFTKTADESLNFQLMYFKVLETFRKAGLNGFIQFNTLKTIN >NZ_CP017653|5028:12613|9611_10388_+|WP_001086346.1|DBSCAN-SWA MNSKVNIGKTYSVLKSEFIHTLKSIDQSKNIYEIFHDFVFCSAAALRNSIGHRYQNLFNHNIENEYLQRINRYDVSGRLKIKKLFYLLVDLCEAKGEPYDVLGSIYMELEIGNDHIGQYFTPSEVSNLCAQVVMTDLKKQLEEEGVISISDPACGAGSTLLSTVKLCLESKIQVQDHLYIEAADIDRNVALMCYIQLSLWAVPCRIFVGDTLKLKYRECWCSLMYYVKGWDIKLHSQKLKEIVHKAEDYVPNFILIND |
8 | Alteromonadaceae_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
979832 : 992616
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017652|979832:992616|DBSCAN-SWA 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19 | Acinetobacter_phage(53.85%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1210596 : 1222944
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017652|1210596:1222944|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017652|1210596:1222944|1211723_1211975_-|WP_000654846.1|DBSCAN-SWA MKDQYKKVSQKHMLGFMYYLQLLGYVIVRQGMDQAMFLTKHYAVPVAWRRITIDYHNRLNKPAQQLYKEFVEWTKEEYAEMVA >NZ_CP017652|1210596:1222944|1218722_1219043_+|WP_000048916.1|DBSCAN-SWA MSKVLNELPASASNNESLILQALNASNQRQVAEMINVDASILSRMKTEKKSNGWTEIEFISFLLTAIGLKVVQESDVYCSPEIAEATRVYLAHAFTSPEYMRILFK >NZ_CP017652|1210596:1222944|1218523_1218712_+|WP_000703023.1|DBSCAN-SWA MKISDLMTYHGCKNRKELSEKTGYSTVTLWKWENNGIPARTQAVLQVKTKGKLKADLQALTA >NZ_CP017652|1210596:1222944|1220549_1221350_+|WP_001003671.1|DBSCAN-SWA MNELAPFESFLKELIAAYRTKYAVQFNKNFPVEGKNAVPMQIVEQQLAKALVGVTPNQLQRGLALFYASTNTYMPNFAEFRAMCMGDDWWSAEKAWVKACEYTQISQHKKVTLPDGREQNQEITTLTKFVLDQVYLLIQDGEMYKAKMEFIKIYDEYKAEAQLKGKTQAWYQEPILLAQKNEQKVHIPVSNEEAQKHLKSLMERLKINGRKPAPVQKLQAKEKEPELAKELGPDPFDNPYEYAEMCRREGMPIPRNILQLIEGANV >NZ_CP017652|1210596:1222944|1221346_1221685_+|WP_000647826.1|DBSCAN-SWA 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24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1226902 : 1255576
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017652|1226902:1255576|DBSCAN-SWA AATGCCACAGTATCTCATGTTTGCGGAAAATATTTATAACAAAATTAAAGATGAGGAATTGTTTTCACATGACTGTATTGAAAATATGAACTTACTTATGACATGTATACGCAGAGAAATTGAGGGAACAGAATTTAAATTAAAATATAATTTTATTGATTTTGTTGAATTGTTTAGTAAACAATTAGATGAATGTAAAGTAAAAATAGATGTGAGTTTGATTCCTCCTCATAATTCAGAAGGTGAGTATATTTTATGGTTAGCTGGATTTATCGAAAAAATTACAGAAGGTGGACCTAAACCACCTCCGCCTATAAAGAAATTTATTCCAGAGTATATGAGCTTGAAATATGAATTAGATTTTTTACCTTTAAATGAGGAAAAAATTCAAACCGAAGGTAAAGAAATTACGGATTACTTTAATTCAAAGCTTTATAAGGCAACTTTTAAGAAATAATAGTTAGTTGTCTCTATTTTTAGCCACCGCCTTAGGGCGGTTTTTTTATGGGTAAGAATAATGGATTCTACAGAATACTTTTGGCTTACTCGGAAAAAAGAACCTAAAACTAAACCTAAAAGCCGGCCACTGCCAAAGCCTACACAAAAATATCTCGAGGCTGAGGCAACACTTAAGGAAGAGCTTGAGGATTTGTCGATTGGATTTGAACAGAAGTTTCAGCCGATCCATACCAAACACTGGCGCTTTGACTTTCATATTGTGAAATTGCGTTTGCTCATTGAAATTGAGGGCGGTTCCTGGTCTGGTGGGCGTAGTGGAAAACTGTCAAATAAAGCATGGAGTCTTGATCGATATGATCATGCTGAAGAGATGGGTTACAAAATAGAGCGCTTTCATCCAGACTCTGTTTTGTCGGGATATGTCATTAACTGGATAAAAGACGAATTAGCGAGAATTGAAGATGGAGCAGATCAGACCATTTCCACCGACTGATTTTATTGATCAAGCAGATGAAGAAGAAGCAATAAGACTAACACCAGCACCAGATCTAAAAAAATGGGTTGTTGCTAATTACTTAACTATTGGTGGACCTCTTTATAATCCCGATCATGATCACATAGCTGAGCTGCTTCACGATAATGAAGAATTTTTAGCATGTGCTTGGGCCTCTTCTGCATATAAAAGCAAGCAAGCTATGGTGTTAGGTCAGTGCGAAAAAGTCATGTTCAATGTTGGTGGATGGCGTAAGGCCAGACAAGAGCAACAGATGCGAGACTGGTTCGGCTTTGTGCCAACATACTTGATCACCATTGATGCTACATTTTGCGACAAAGCAAATGATCGTGAGTTTTGTGCTTTGCTTGAGCATGAACTCTACCATATAGGCGTAGAACGTGATGAAGACGGTGAAATGATCTTTAGTAGCTCAACAGGTTTACCTAAACATTATTTAGCTGGTCACGATGTCGAAGAGTTTGTTGGTGTAACCAAACGGTGGGGGGCGAGTCAAAGCGTTAAACGTATCGTTGAAGCTGCAAAGAATCCGCCGTTTGTTTCGAAACTTGATATTTCAAAATGCTGCGGAAACTGCGTAATCAACTGAGCCGAATGGCTCTTTTTTTTGCCTTCTTTGCTAGACGTAGCTAGACAAAGGTGGGGGTATGGCTGCACTTAAAGAACAGGTAAAAATATTTATTGTTCAAGCGCTTGCCTGCATGGATACCCCTCAACAGGTAGCTAATGCTGTCAAGCAAGAATTTAACATTGAGATTGATCGAAAACAGGTACAACTTTATGACCCGACAAAAGCGGCAGGAAAGAATTTAAGTAAGAAATATAAAGACCTTTTTCATAAAACCCGAGAGGACTTTAAAAAGAATGTTTATGACATCCCTTTAGCTAATAAAGCCTATCGGCTTAAAGAACTTCAGAAGATCTATGAAGACTGGAAGAACAACAGGCTTATGAAGCAAGGGGTTATTAAACAGGTTAGGGAAGAAATGCAGGGTTATGACCTCATGCTTTTAAATCTTGAGTTAAAGCAACTTGAGATTGAAAAGTTAAGAGAGGGTGAAGGTGATGAAGATCCAACACCAGTCAAGGTAACTATTCAAGTTGTAGATGCGAGTAAAAAAGATGCCGAACATCAATCCGACACTGAATGTACCTCAGGCTAATTTTTTGCAGATGGAAAAGAAGTTCCGCGCATTTGTCGCTGGCTTTGGATCGGGAAAGACTTGGGTTGGATGCTCCAGTTTATGCAACAAAGCTTGGGAATTCCCAAAAGTACCTTTGGGTTATTTTGCTCCAACTTACCCGCAGATTCGCGACATTTTCTTTCCAACTATTGAAGAGGTTGCTTTCGATTGGGGGCTTAAAACTAAGGTTTATGAAACCAATAAAGAGGTGGATATCTATTATGGTCGGCAATATCGAACTACAATCATTTGCCGGTCTATGGAGAAACCAGCAACCATTGTAGGTTTTAAAATTGGCCACGCCTTGATTGATGAGCTTGATGTTATGGCCAAGGTCAAAGCTCAACAGGCTTGGCGTAAGATCATCGCTCGTATGCGTTATAAGCAAGCTGGTTTGCTCAACGGTATTGATGTGGCCACAACACCAGAAGGTTTTAAGTTTACATACGAGCAATTTGTTAAAGAGGCAAATAAATCAGAGGCTAAGCGTAAGCTCTATGGAATGATTCAAGCTTCAACTTATGACAATGAAGCTAATCTTCCAGATGACTACATATCATCACTTTATGAGTCTTATCCGCCGCAATTAATTTCAGCTTATTTAAGAGGGCAGTTTGTCAATTTAACCAGTGGTGCTGTTTACCCCGACTTTGATCGAGTTCTAAACCACACGGATGAAGAAATTAAGAAAGGTGAGCCTTTACTCATTGGTATGGATTTTAACGTGCTTAAAATGGCTGCTGTGGTTTATGTCATTAGAGAAGGGAAGCCAAGAGCTTTAGATGAACTGGTTGGCGTGAGAGATACACCGACGATGTGTCAACTGATTAATGAGCGCTTTCCAGATCACGATATTACTGTGATTCCAGATGCTTCAGGTCAGGCAACATCATCAAAGAACTTCAGTGAATCTGATCATGCAATCTTAAAGAAAAATGGATTCAAAGTTGAAGTTAATGGTGTGAATCCCGGTATTAAAGATCGTATCACTGCAGTTAATGCACAAATTCTGAATGCTGAGGGTGAACGACACTTAAAAGTGAACACAAACAAGTGTCCTAACTTTACGGCTACTTTAGAACAGCAAGTCTATGATGATTTTGGAATGCCAGATAAAAGCGCTGGTTTGGACCACGTTGGGGACGCTGGTGGATATCCAATAGCTAAGAGATTCCCAGTCATCATTCAGAAAATATTTAAACGGCGCGCAATCGCTGGTTTTTCTCGTTAATCAATGCACCTTCTCAGGTGCTTTTTTATTGGTGTTTTTATGGCAGTTACTGATAAACATCCGCAGTATATTGCTGCACAAAAAAGCTGGGAGATTATGCGGGACGCCGTTGCTGGTGAAGAGCAGATCAAACAGGCACAAACAAAGTACCTAGCTAAATCGGCCGGAATGATTGAGGCTGAAAAGCAAGGTGATACGACTGGAGAGATTTATAAGGCCTATCTAAGTCGAGCTCAGTATCCGCTATGGGTTCAGGACGCATTACGCACGATGATTGGTTTAGTTTCAAAGCTGGAACCTAACATCGTAATTGAAAGTTCTCTGTTAAAGGGTTTGATAGAGAATGCAACCAATGATGGTTTTGGGCTTAAACAGCTCTTTATTCGCATTTGTTCAGAGTTGCTAGAGTTTGGGCGCTGTGGTTTGCTTGTCGATGTTGATGGGGCTGGTGTGCCATATTTCGCTCTATATGATGCGCTATCAATCATTAACTGGAAGGAAAACAGCATTGGTGGCCGTAAGGATCTAAAGCTGTTAGTGCTCGAGGAACAATTCGAAAATAGTGAAGATGAGTTTGGGCATGATACAAAGACGGTTCACCGTGTTTTATCTATGGTTGATGGTGCGCTAACTGTACGGTTATTTGATGGCTCTGTTGAAGAAGATAAAACGCCAGATCTCGGCGGTAATCAGCTATCTTTCACGCCGTTTGTTTTCTGTGGAACGACCGATAATTCTCCACAAGTTGGAACGGTACCATTGCTTACCATGGCCAAGGCAGCACTCAAGTATTACCAGCTAAGTGCGGATTATTACCAGTCACTTCACCATACAGCTCATCCGCAGCCTTGGATTAATGGACTTGAGGGTGATGAAGATATTAGCGTTACTGGTGTGATGGCTGTCTGGAGCCTTCCTAGTGAATCTCAGTGTGGTTATCTCGAAATTTCAGGTAGTGGCATTGAACTCACTAAAAAGGAAATGGATGCTCAAAAGAATTCGGCATTAGAAGCTGGAGCAAAGGTGATTGATACCAACTCACAAGAATCAGGTGAAGCACGACGTGCGCGTCAGGATGACCAACAAGCAAGCCTACATAGCATTGTCACTTGTGCTGCTGCAGCTATTGAACAAGCTATCAAATATGCAGCTCAGTGGTTAAAGCTGGATTCAACAAAATATGCATTTACGGTTGAACCTGAATTTATCGTTCAGCAATACGATATCAATCTGGCCAAACAACTTTATGAAGGTGCTATTGCCGGAAAGAACTCTTTCCGCACATATTGGGAATACCTGATGACAGGTAAATTACCAGCTCACGACTATCAGGAAGAAGTGAAGCGGGTTGAAGGTGAACGGGACAGTATGCCGTTGTAGAGGTGACGTATGGCTTCAAAAGAAGATAAATCATTGATTGAAGTACTTACCCAACATCAGGCGTACTTATATCGGGTGTCTTCTCAATCTGTTAATGAGCTACTAAAAATCTTTAATGATGAGTCAATATTAATGTTGGCAAAGCTTCGGGATTTGCTTGATGAATTAAATGATTCTGAAAAGATGGCTCTAGCAAGTGGACAGTACACTACAACTAATCTTAAAGAAATTC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38 | Acinetobacter_phage(93.55%) | capsid,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2672344 : 2790450
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017652|2672344:2790450|DBSCAN-SWA 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160 | Acinetobacter_phage(94.16%) | integrase,capsid,tail,terminase | attL 2675982:2675998|attR 2775645:2775661 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
3078750 : 3111930
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP017652|3078750:3111930|DBSCAN-SWA 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44 | Pseudomonas_phage(18.52%) | head,tail,transposase,integrase,plate | attL 3100060:3100073|attR 3110203:3110216 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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