Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NZ_CP017657 | Acinetobacter baumannii strain KAB08 plasmid unnamed, complete sequence | 0 crisprs | TnsE_C | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP017656 | Acinetobacter baumannii strain KAB08 chromosome, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,RT,csa3,cas3,WYL | 0 | 0 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
978535 : 989987
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017656|978535:989987|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017656|978535:989987|978535_979174_+|WP_001205618.1|DBSCAN-SWA MRDRFYIACFRDNVGPNVSFHRHQFAGYHTDIDQAYVCTLDEAQRHFNHAREFECPISADHVDALAVWKVDHQTIPNSTQIIDSVFGYAVFVQGKYSGNDVFWLNISSFDISTDFEKASYFSKDEVSQLDKKYIAIPFHLAEKAKRRTFDFNQYNPRIMTQGAGLKQPEHLKRAKRRVKNPQTRFNCPKCGKIVWQYNPYDFDHCNHCGHMG >NZ_CP017656|978535:989987|985744_986788_+|WP_000124473.1|DBSCAN-SWA MARSRNIKPSFFMNEDIIELPYEARLLFIGLWTLADREGRLENRPKKIKMSLFPADDINVAEQLENISKFGFIELYNADGIDVIHIVNFVKHQNPHGLEKDSELPDRNGIYTVYERNPKNKTIVGKPIQLNKADLKHFYDKTGPFAPQNTGSAVENSYQDNESNQANSSGNKQEQLDNGSKTVSISDQNALNPESFNLNPDSLNPETFNQNPEGNNNSAVGEVDSSTQTKFSFKSALKKNGVPEKDAAEFLQVRKAKKAQNTENAFEALLNEAQKAGITLQQAVEYCLKRQNPWGAFKASWYLNEKPEMTTGQQSNHQSLPRNVNDQWGAPKKYEPVAHTAVKGELI >NZ_CP017656|978535:989987|983779_983998_+|WP_171259514.1|DBSCAN-SWA MNEGYEFQCGQSVEISPADREKYFVDLVELKRLVESLKIINDLGGVEKLTPAFITTDSMLVTRMFAWWEMGD >NZ_CP017656|978535:989987|981888_982839_+|WP_001110396.1|DBSCAN-SWA MNYYQHHIGDFNNATRHLSLIERAIYRDLLDMYYDTEKAIDASSIDRLARRLQCTTEEQKEALKYVLDEFFILEEGVYRNNRCEREIAEYHGKKKQASEAGKASAAKRAAKKKGSSNSDSSKDDQASNENSTVVENPLNEEQTDVQPTNNHKPLTINQEPIIDSSSNAREENSQFTPIQFAQYQIDDHKRYSMREFISEYSEFQYDFISLAQQRFVSVPEIDLRTMIQNFGDWYFANESSSLNTPSIWLVKWFSWVQNNEKQVAANRKKQEQINSAGQKPQESGYFANLFEEQSESQIVDVTPAKKFPMIEEVGHA >NZ_CP017656|978535:989987|988764_989694_+|WP_001091151.1|transposase|DBSCAN-SWA MNTESKSRYKTTNWSEYNQALRQRGAFTIWFDPQMQWSATPTGKKGRQPTYTDIAIQFALTIRNLFQLALRQTQGFIQSFLQMAHLDWNVPDFSTLSRRADKLQPLLHKSAKNPQEDLHILVDSTGIKVTGDGEWVRKKHGVNQHRQWLKLHLATDANSGEIQAVEVTTCQYGDAEMLQPLLDQIDEPIASVTADGAYDTVNCYDAILKRQANVIIPPRSNAALWAENEIGKARNHAVQGCWDKGQKQWKRDIGYHRRSRIEAKMFALKRLGQGVSSRCFNRQVVDLQIRVDILNKFTQLGTAKTVAVA >NZ_CP017656|978535:989987|984175_984526_+|WP_151276084.1|DBSCAN-SWA MEMLRARLIELLTPHLSGRYVKWREAYFTRFTKCGGDSGWMFCVGPHEFHIDGALRRYYSGSIDITYNQKDRYFLVGEKKKVKCKACKGFGFIRDDGWGHIDKCEMCDAEKGASHE >NZ_CP017656|978535:989987|987545_988079_+|WP_070469493.1|DBSCAN-SWA MNAFIDMKKSEYALVAYSNVAAKSDERKALEKAVKKWLKHPGNKIRQVESLGRDLNMPHGTGPMYKRLCCRCETCVEWALSTGLIKSKPKPVVKRGPDARQLRIWAQKNQLTPYATAFNEDWDLLALEVDYSVTAFQLECIYQGRSEIDHNFVWNRVKRVADRLVAEKLRAKGGGCK >NZ_CP017656|978535:989987|980845_981892_+|WP_020752534.1|DBSCAN-SWA MNKILFGDCRTLMAQMIQEGLKAQTCVTSPPYFGLRDYGVDGQLGLESTVDEYVQNMVEVFRLVRELLHEDGTLWLNLGDSYAGSGRGITRTGLNDGKNPKTKGLILPKQNAAQSNLKPKDLIGIPWKVAFALQADGWYLRQDIIWHKPNPMPESITDRCTKAHEYIFLFSKSRRYYFDHVAIKEPVAESSIKRLSQNLDDQQGSDRVVNKHNGPMKAVYSRSSRDSFKRSNSKRAAVIPNQAYGTHRSERSESEYDLLTRNKRSVWQVSTKPYKGAHFATFPMDLIEPCVLAGSRVNDVVFDPFMGSGTTAAVALMHNRNYLGCELNPQYYELQQERFEKVLKERAA >NZ_CP017656|978535:989987|986784_987549_+|WP_000994866.1|DBSCAN-SWA MNAVPQKLEYKISHTNQICKIHKEQMINVHGRIVCQSCVEKIMKQSNEKYESDKNNRILNLKMARAGIPKRHVNSGFSNYAVTHKGQDKARKTCEKFTMDFNSGVFRNLLLVGRTGTGKTHLGSSILKNIIIKNWEAIYITSADLAEDIAGAYRRSGDSEDEALKRYVKKDLLIIDEYGLHDRAEKRPQLLESVHKVLLTRYDELKPTVVISNLSLSEVREDLGDRLWSRFQHDGLDIVECDWDDARIGGGKAQ >NZ_CP017656|978535:989987|989735_989987_+|WP_151276085.1|DBSCAN-SWA MDVSLIPSYNLREEYILWLAGFIQKITEGGPKPPPPIKEYIPEFINLESELDFLTLNLEKNQNNGEEIVNYFNSKHYKATFKK >NZ_CP017656|978535:989987|984597_985668_+|WP_002052057.1|DBSCAN-SWA MNKILFGDCRTLMAQMIQEGLKAQTCVTSPPYFGLRDYGVDGQLGLESTVDEYVQNMVEVFRLVRELLHEDGTLWLNLGDSYAGSGRGITRTGLNDGKNPKTKGLILPKQNAAQSNLKPKDLIGIPWKVAFALQADGWYLRQDIIWHKPNPMPESITDRCTKAHEYIFLFSKSRRYYFDHVAIKEPVAESSIKRLSQNLDDQQGSDRVVNKHNGPMKAVYSRSSRDSFKRSNSKRAVAHPNQSMGTHRADRKESNYDLLTRNKRSVWQVSTKPYKGAHFATFPMDLIEPCILAGSRVNDVVFDPFMGSGTTAAVAKKLKRQYLGCELNPKYEHLQKERLSQIHTNMELQFEGGCHV |
11 | Acinetobacter_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1208331 : 1220679
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017656|1208331:1220679|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017656|1208331:1220679|1208331_1209054_-|WP_000004579.1|DBSCAN-SWA MSESTLWAVAMRPEGYSPFKQTPAASKEIAERAVERYRKMHEKEGNNFFLEIFDDVIKVQKWHGSRKDHIKNLFYVESWFSEPMYQCFDLKTAERVFKFDEIVICYKKGSAPLVTKSFDEAKLFYGSSETGFKYQIQPIEPPENLFNWFHPDIELFDTIEEGAEAYTREQWAQLQMNLRVEIETQLLDYDEIPNIPEDAVVWPNWKPEPPEQGLFLIAAFDSEDGPVLWWANPKAESKEK >NZ_CP017656|1208331:1220679|1209050_1209458_-|WP_000147323.1|DBSCAN-SWA MTGNERIPFESQFKTTEIFKRESAIRKNDILAFSETMNGYFNIVTNDAWQLWNKAKAETVPDTPTPSVTLTCAELKEAFDFGAPDGEKDQFQMETEMTIKWLQDGYDGEGYYCWYADLPEEGCIKLGVSESGAEG >NZ_CP017656|1208331:1220679|1216457_1216778_+|WP_000048916.1|DBSCAN-SWA MSKVLNELPASASNNESLILQALNASNQRQVAEMINVDASILSRMKTEKKSNGWTEIEFISFLLTAIGLKVVQESDVYCSPEIAEATRVYLAHAFTSPEYMRILFK >NZ_CP017656|1208331:1220679|1213265_1213469_-|WP_000845537.1|DBSCAN-SWA MKTEIIEALALELTKATIADTDPSTINIKSADLWVKTYQESLKAVEEALKELKPKPKATSKPISGMS >NZ_CP017656|1208331:1220679|1209711_1210644_-|WP_000698529.1|DBSCAN-SWA 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24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1225865 : 1254980
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017656|1225865:1254980|DBSCAN-SWA 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37 | Acinetobacter_phage(93.55%) | terminase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2328667 : 2376484
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017656|2328667:2376484|DBSCAN-SWA 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59 | Acinetobacter_phage(100.0%) | transposase,terminase,integrase,tail | attL 2328143:2328160|attR 2376645:2376662 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2734814 : 2800398
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP017656|2734814:2800398|DBSCAN-SWA 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71 | Acinetobacter_phage(93.75%) | terminase,integrase,tail | attL 2738452:2738468|attR 2785592:2785608 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
3087656 : 3120835
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP017656|3087656:3120835|DBSCAN-SWA 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43 | Pseudomonas_phage(19.23%) | transposase,head,tail,integrase,plate | attL 3108965:3108978|attR 3119108:3119121 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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