CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP017688	Flavobacterium crassostreae strain LPB0076 chromosome, complete genome	4 crisprs	DEDDh,cas3,WYL,csa3,cas2,cas1,cas9,PD-DExK	0	24	10	0

1. NZ_CP017688

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP017688_1

• CRISPR_ID: NZ_CP017688_1
• CRISPR_location: 1504420-1504498
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP017688_1

Consensus_repeat	Method
GGATCAATCCCAAAACCTGTGGAGC	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP017688_1

>1.1|1504445|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder
GACAAGAATTAGGGGATCAGTCTCAAAAC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017688_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP017688_1

>merge|NZ_CP017688|1|1504420-1504498|CRISPRCasFinder
GGATCAATCCCAAAACCTGTGGAGCGACAAGAATTAGGGGATCAGTCTCAAAACGGATCAGTCCCAAAACCTGTGGAGC

>NZ_CP017688|1|1|1504420-1504498|CRISPRCasFinder
GGATCAATCCCAAAACCTGTGGAGC	GACAAGAATTAGGGGATCAGTCTCAAAAC
GGATCAGTCCCAAAACCTGTGGAGC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP017688.1|WP_066336663.1|1495431_1497096_+|2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3--cyclohexene-1-carboxylic-acid-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|236020
NZ_CP017688.1|WP_066336639.1|1501020_1502190_+|proline-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|376577
NZ_CP017688.1|WP_066334596.1|1518030_1519665_+|S8-family-serine-peptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|173818
NZ_CP017688.1|WP_157776673.1|1515309_1515462_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP017688.1|WP_066334593.1|1516724_1517912_+|tRNA-2-thiouridine(34)-synthase-MnmA	unknown	unknown	gnl|CDD|234664
NZ_CP017688.1|WP_066336650.1|1497307_1497652_+|DUF2853-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378540
NZ_CP017688.1|WP_070786761.1|1512406_1513390_-|DDE-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|376574
NZ_CP017688.1|WP_066334588.1|1513370_1513736_-|transposase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379669
NZ_CP017688.1|WP_066334592.1|1515943_1516642_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225405
NZ_CP017688.1|WP_070786662.1|1505914_1506277_-|transposase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379669
NZ_CP017688.1|WP_066336642.1|1500282_1500876_+|proline-hydroxylase	unknown	unknown	gnl|CDD|379319
NZ_CP017688.1|WP_066336649.1|1498047_1498278_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP017688.1|WP_066336647.1|1498287_1498662_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|380015
NZ_CP017688.1|WP_066336657.1|1494112_1494709_+|glutathione-peroxidase	unknown	unknown	gnl|CDD|238207
NZ_CP017688.1|WP_070786661.1|1504947_1505931_-|DDE-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|376574
NZ_CP017688.1|WP_066336655.1|1494793_1495291_-|N-acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|224168
NZ_CP017688.1|WP_066336637.1|1502270_1504061_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|131259
NZ_CP017688.1|WP_066334599.1|1519676_1520624_+|2-nitropropane-dioxygenase	unknown	unknown	gnl|CDD|132195
NZ_CP017688.1|WP_066336644.1|1498791_1500027_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|182852
NZ_CP017688.1|WP_066334602.1|1520633_1521047_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP017688.1|WP_066336663.1|1495431_1497096_+|2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3--cyclohexene-1-carboxylic-acid-synthase	gnl|CDD|236020	PRK07449, PRK07449, 2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene-1-carboxylate synthase; Validated.	1.27198e-118
NZ_CP017688.1|WP_066336639.1|1501020_1502190_+|proline-dehydrogenase	gnl|CDD|376577	pfam01619, Pro_dh, Proline dehydrogenase.	2.29051e-97
NZ_CP017688.1|WP_066334596.1|1518030_1519665_+|S8-family-serine-peptidase	gnl|CDD|173818	cd07493, Peptidases_S8_9, Peptidase S8 family domain, uncharacterized subfamily 9. This family is a member of the Peptidases S8 or Subtilases serine endo- and exo-peptidase clan. They have an Asp/His/Ser catalytic triad similar to that found in trypsin-like proteases, but do not share their three-dimensional structure and are not homologous to trypsin. The stability of subtilases may be enhanced by calcium, some members have been shown to bind up to 4 ions via binding sites with different affinity. Some members of this clan contain disulfide bonds. These enzymes can be intra- and extracellular, some function at extreme temperatures and pH values.	3.3801e-134
NZ_CP017688.1|WP_066334593.1|1516724_1517912_+|tRNA-2-thiouridine(34)-synthase-MnmA	gnl|CDD|234664	PRK00143, mnmA, tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA; Reviewed.	0
NZ_CP017688.1|WP_066336650.1|1497307_1497652_+|DUF2853-family-protein	gnl|CDD|378540	pfam11015, DUF2853, Protein of unknown function (DUF2853). This bacterial family of proteins has no known function.	2.63854e-58
NZ_CP017688.1|WP_070786761.1|1512406_1513390_-|DDE-transposase	gnl|CDD|376574	pfam01610, DDE_Tnp_ISL3, Transposase. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. Contains transposases for IS204, IS1001, IS1096 and IS1165.	6.88976e-63
NZ_CP017688.1|WP_066334588.1|1513370_1513736_-|transposase-family-protein	gnl|CDD|379669	pfam14690, zf-ISL3, zinc-finger of transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165.	0.00632677
NZ_CP017688.1|WP_066336644.1|1498791_1500027_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	gnl|CDD|182852	PRK10938, PRK10938, putative molybdenum transport ATP-binding protein ModF; Provisional.	2.20623e-93
NZ_CP017688.1|WP_066336642.1|1500282_1500876_+|proline-hydroxylase	gnl|CDD|379319	pfam13661, 2OG-FeII_Oxy_4, 2OG-Fe(II) oxygenase superfamily. This family contains members of the 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily.	4.93739e-28
NZ_CP017688.1|WP_066334592.1|1515943_1516642_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|225405	COG2849, COG2849, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	7.19352e-15
NZ_CP017688.1|WP_066336647.1|1498287_1498662_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|380015	pfam17775, UPF0225, UPF0225 domain. This entry represents an NTF2-like domain found in bacterial proteins.	1.17008e-39
NZ_CP017688.1|WP_066336657.1|1494112_1494709_+|glutathione-peroxidase	gnl|CDD|238207	cd00340, GSH_Peroxidase, Glutathione (GSH) peroxidase family; tetrameric selenoenzymes that catalyze the reduction of a variety of hydroperoxides including lipid peroxidases, using GSH as a specific electron donor substrate. GSH peroxidase contains one selenocysteine residue per subunit, which is involved in catalysis. Different isoenzymes are known in mammals,which are involved in protection against reactive oxygen species, redox regulation of many metabolic processes, peroxinitrite scavenging, and modulation of inflammatory processes.	1.10572e-74
NZ_CP017688.1|WP_070786661.1|1504947_1505931_-|DDE-transposase	gnl|CDD|376574	pfam01610, DDE_Tnp_ISL3, Transposase. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. Contains transposases for IS204, IS1001, IS1096 and IS1165.	1.22341e-62
NZ_CP017688.1|WP_066336655.1|1494793_1495291_-|N-acetyltransferase	gnl|CDD|224168	COG1247, COG1247, Sortase and related acyltransferases [Cell envelope biogenesis, outer membrane].	1.43911e-55
NZ_CP017688.1|WP_066336637.1|1502270_1504061_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	gnl|CDD|131259	TIGR02204, system_ATPase_and_permease_component, ABC transporter, permease/ATP-binding protein. This protein is related to a Proteobacterial ATP transporter that exports lipid A and to eukaryotic P-glycoproteins.	0
NZ_CP017688.1|WP_066334599.1|1519676_1520624_+|2-nitropropane-dioxygenase	gnl|CDD|132195	TIGR03151, enACPred_II, putative enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase II. This oxidoreductase of the 2-nitropropane dioxygenase family (pfam03060) is commonly found in apparent operons with genes involved in fatty acid biosynthesis. Furthermore, this genomic context generally includes the fabG 3-oxoacyl-[ACP] reductase and lacks the fabI enoyl-[ACP] reductase.	2.65237e-100
NZ_CP017688.1|WP_070786662.1|1505914_1506277_-|transposase-family-protein	gnl|CDD|379669	pfam14690, zf-ISL3, zinc-finger of transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165.	0.00488057

Protein sequences

>NZ_CP017688.1|WP_066336637.1|1502270_1504061_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein
MARIKENDLPKAKLNSNSLQKALRIFKYATNHKWKFFVGLIFLLLTSATALAFPKLMGMLVDCVTNKDLDQANEIALLLMGVLALQAIFSFFRISLFVNFTENSLSNIRFALYENLIKLPMSFFSQKRVGELNSRISADISQLQDTFTTTIAEFLRQFILIVGGFIILGSISPKLTLMMLCIVPLVAVGAVVFGRFIRKYGKKTQDKVAESQVIVEETLQGITNVKAFANEWYELQRYKNKINEIVKIAIKGGQYRGYFASFIILCLFGCVVAVVWYGITLTIKGEVEGVGDLISFILYTTFIGASFGGIAEMYAQIQKAVGATERVFELLDEKPEAISTTIDTANPIKLKGTVNFCNVAFSYPSRKEIEVLKAVSFDVAFGQKIAIVGPSGAGKSTIASLLLRFYDIESGTILIDGKNIYDYDLETLRGNMSIVPQDVILFGGTIKENIAYGKPNATEDEIYMAAKQANALNFIEGFPEKFETIVGERGIKLSGGQRQRIAIARALLKNPSILILDEATSSLDSESEKLVQEALEILMQGRTSIIIAHRLATIRSADQILVLDNGIVSEKGTHQELIALENGKYKNLSTLQFTDF
>NZ_CP017688.1|WP_066336639.1|1501020_1502190_+|proline-dehydrogenase
MEKIFNNTQVAFSLKSDTELDRAYFLFKMIANQPLVRIGTAMTNFALKAKLPVEGLIRATVFDHFCGGINEEDCLSVVDKMYTKGVSSVLDYSVEGKESEDQFDAALKMTLKTIEFAKERMAIPFAVFKPTGLGRFELYEKIGRKEVLSTKDQAEWDRVVARFDLVCSEGHKKDVTLLIDGEESWMQDAADDLVTAMMRKYNKEKAIVFNTLQLYRWDRLDYLKKLAALAKSEGFYIGMKIVRGAYMEKENQRALDKGYPTPICATKQATDTNYDTTVKYMMEHLDQMSIFAGTHNESSTYTLMELMKSKGIASNDTRIWFGQLYGMSDNISYNLAQNGYNVAKYLPFGPVKDVMPYLIRRAEENTSVAGQTSRELEMIKAERKRRKAK
>NZ_CP017688.1|WP_066336642.1|1500282_1500876_+|proline-hydroxylase
MENSFEALIATYIANGVGISEFFLSTTLSTNLRQNLCNLQQKSLLIAAGTGNAAMVSYDTDIRSDSIYWLDKKHNDPFENQFFAQMEAFILYLNESCFAGITGYEFHYALYEKGDFYLQHLDQFKSNPSRKYSIICYLNPDWKEADGGELLIHLLDTNQKIPPTAGKTVFFKSDQLLHEVLLTNTTRMSITGWLKSD
>NZ_CP017688.1|WP_066336644.1|1498791_1500027_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein
MQQLQHLGIFLSNQVDKNKFINTLISNQATGKLSIYNHQKGMVFSDATINAFIQKEHQYNALSSALDTNRKLQTYSSGERKKVFLNYCIHQQPEYLILDNPLDHLDQKSRQTIINTLQQLTQKTQIILLANRMVDLDILEIPKAAVDDNSFDLKLLKSIITPAHHFLATQIPAPLEPIFLDQDILVKMTNLCVHYHQKPILNQINWTIKKGEFWHLLGPNGSGKSTLLSLITGENTKGYGQDLHLFGFQKGSGETIWDIKKNIGYFSTAMIEVFQTNNTLEQMVLSGFFDSIGLYSQASDLQLNIVQQWLELLGLSAHKNTAFKTLSIGQQRLALIVRAVIKHPPLLILDEPLEGLDDTNVSLVAQLINHLSQHTNLSILYVSHRKEPNIHPKTIYQLTPNNKGTTGAIHP
>NZ_CP017688.1|WP_066336647.1|1498287_1498662_+|hypothetical-protein
MVNCYCGALERFENCCKPYILGDLKAPTAVALMRSRYTAFATHNADYLMATTHFSTRKHHNRADILDWATSNQWIKLLVLSATANTVHFKAFYLDSEGNSQLHQEHSIFKLEDGNWFYVDGDLY
>NZ_CP017688.1|WP_066336649.1|1498047_1498278_+|hypothetical-protein
MEENTYALLKQNVQEIIDFIAAKNAIDAKNKLVVVSEQLDDLLDFSEDDADLIEISKYQVLLNQLQQKIVALNGHL
>NZ_CP017688.1|WP_066336650.1|1497307_1497652_+|DUF2853-family-protein
MSKRDELIVKYAADLKDKCGVTPDMDLLTKVTIGCGPSIYNTDSSTVAGSQQSELDTVKNNFLIKKLGLNDGPELDAAIDAVMEKYGRSNKTKHRAVVYYLLAVHFKKEAIYNK
>NZ_CP017688.1|WP_066336663.1|1495431_1497096_+|2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3--cyclohexene-1-carboxylic-acid-synthase
MIYPKIPLAQSVIEICLAKGVTTIVLSPGSRNAPLILGFTTNPNFDCYSIADERCAAFFALGIAQQTNSVVAVVCSSGSALLNYYPAFSEAFYSQIPLLVISADRPQSKIDIGDGQTIRQENVFANHSLYNANLSQEASVENDMHINKAIDAASYKKGPVHINVPFEEPLYQTVTALSVTPVITATAKTTPVIPAKELAGFATIWNNSAKKMVLVGVHPPNTIDAAVLAYLAKDPSVIVMTETTSNLHHSSFVEAIDSVITPFTTQDFEDFKPDILLTFGGMVVSKRIKAFLRSYQPEHHWHLDPLRAYDTFGVLTKHFECSPNAFFALFLPLVATNAKSSYHAKMAAVVALRKQKTAAYLATIPFSDFKVFEIVIASLPVGCQLQISNSSPIRYAQLLAIDPSIEVFCNRGTSGIDGSTSTAIGAAVAQNKPTVFITGDIGFLYDSNALWNMYIPKNFKIILINNGGGGIFRILPGHEETPVFNTFFETTHQLTAVHLAKMYGLNYQLVQDQAELESSLPDFFALQDAPAILEIRTPTLQNDLVLLQFFKELT
>NZ_CP017688.1|WP_066336655.1|1494793_1495291_-|N-acetyltransferase
MEMLLRNYKTQDTQAIVAILNYHILHSTALYDYEPRTYAQQKALLEDKINNNFPVIVAEFAGKVVGFGMYSEFRFKEAYKFTVEHSVYVANEFHGKGLGKQLLEALIVVAKKQGLHTMIAVIDAENQSSIVFHEKYGFKTVGILKETGYKFNRWLDSVFMQLILK
>NZ_CP017688.1|WP_066336657.1|1494112_1494709_+|glutathione-peroxidase
MKKTLVIAGIVALIIGTILYAQNTEPSKQSKTQNTHTMIKPTIYQFKVTDIAGNTFDFASLKGKKILIVNTASECGLTPQYEDLETLYTTYKSQDLVVVGFPSNNFGGQEPGTNKEIASFCQKNYGVSFPMMNKVSVKGDDMCAIYQFLTQKDKNGLQDSDVEWNFQKYLINKNGELEKVLSPRTLPTDPAILNWIKA
>NZ_CP017688.1|WP_070786661.1|1504947_1505931_-|DDE-transposase
MDSKPNDCNAIASFYGVSGKNLQHQYKDFLSDFKIWDQKLHAKQWLIFPENIGKRLSIDETSLSNGELYTILTNKAGKGKKGTIVAMIAGTKAETVIAIIEKIPLKLRNSVTEITLDMAANMGLIAKKCFPNATRVIDRFHVQKLATEALQEIRIKYRWQAIDQENQAIEKAKKNKKRFEPEVLTNGDTIKQLLARSRYFLYKNKSKWTANQLQRALLLFELYPDIKEAYNLSQELRNIFENTTDKIIGFARLAKWHEKVNQSGFKSFNTISRSIMNHYQSILNYFDNRSTNASAESFNAKIKAFRSQFRGVRNVEFFLFRLTTIYA
>NZ_CP017688.1|WP_070786662.1|1505914_1506277_-|transposase-family-protein
MQDSFVDLLKLLLPEIIVEYFELTSYKKEEEILHLYLKEINSIPKEHRQSKLSSKGFFDEITVQDFPIRGHQVYLHITRRRWLNEDTGKVVFRDWNLVADGTRVTQEFASFLKEIHRFQA
>NZ_CP017688.1|WP_070786761.1|1512406_1513390_-|DDE-transposase
MDSSPNDCNAIASFYGVSGKNLQHQYKDFLSDFKIWDQKLHAKQWLIFPENIGKRLSIDETSLSNGELYTILTNKAGKGKKGTIVAMIAGTKAETVISVIEKIPLKQRNLVKEITLDMAANMGLIAKKCFPNATRVTDRFHVQKLALEALQEIRIKYRWQAIDQENQAIEKAKKNKKRFEPEVLTNGDTIKQLLARSRYFLYKNKSKWTANQLQRALLLFELYPDIKEAYNLSQGLRNIFENTTDKIIGFARLAKWHEKVNQSGFKSFNTISRTIINHYQSILNYFDNRSTNASAESFNAKIKAFRSQFRGVRNVEFFLFRLTNIYA
>NZ_CP017688.1|WP_066334588.1|1513370_1513736_-|transposase-family-protein
MQDSFVDLLKLLLPEIIVEYFELTSYKKEEEILHLYLKEINSIPKEHRQSKLSSKGFFDEITVQDFPIRGHQVYLHITRRRWLNEDTGKVVFRDWNLVADGTRVTQEFASFLKEIHRFQPK
>NZ_CP017688.1|WP_157776673.1|1515309_1515462_-|hypothetical-protein
MRNHRHGKQLDTKSENKTHIPKFLNYGKTATIYLSKLIITYINQKKWTDN
>NZ_CP017688.1|WP_066334592.1|1515943_1516642_+|hypothetical-protein
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>NZ_CP017688.1|WP_066334593.1|1516724_1517912_+|tRNA-2-thiouridine(34)-synthase-MnmA
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>NZ_CP017688.1|WP_066334596.1|1518030_1519665_+|S8-family-serine-peptidase
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>NZ_CP017688.1|WP_066334599.1|1519676_1520624_+|2-nitropropane-dioxygenase
MTDKITKLFHIKYPIIQGGMIWVSGYKLASAVSNSGGLGLIGAGSMYPEVLREHIRKCKKATTKPFGVNVPMLYPDLAEIMKIIVDEGVSIVFTSAGNPKTWTAYLQQHNITVVHVVSSAFFALKAQDAGVDAVVAEGFEAGGHNGREETTTLTLLPIVKEKISIPVIAAGGIATGRSMLAAMALGADGVQVGSRFAACLESSAHDNFKQKIIEATEGATQVTLKELAPVRLLKNKFYEDIQELYANNGSKQELQTLLGRARAKLGMFEGNITEGELEIGQVAALIHRIEPAATIIEEMVAEFKKVQQEVAAFDF
>NZ_CP017688.1|WP_066334602.1|1520633_1521047_+|hypothetical-protein
MKKRYLYIVGILLTMAIQPSFAQKYKFKTSGFSVLQKDQRGKWGNWSELDLVAISIHLDTDKNRFVVYLPLIQVYDIVAYQPSSENDTDLVYSFSCKDASSALCTLSIITRKKQDNRKQLYITSEDKIIVYNIVNAM

Crispr_ID: NZ_CP017688_2

• CRISPR_ID: NZ_CP017688_2
• CRISPR_location: 1592602-1592698
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP017688_2

Consensus_repeat	Method
ATCAAGCGCAAAAGTTGGGGACTAT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP017688_2

>2.1|1592627|47|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder
GCAAATAATTTAGTTAATTTAAACAGGAAGAAATCTACTTTTCGTGT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017688_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP017688_2

>merge|NZ_CP017688|2|1592602-1592698|CRISPRCasFinder
ATCAAGCGCAAAAGTTGGGGACTATGCAAATAATTTAGTTAATTTAAACAGGAAGAAATCTACTTTTCGTGTATCAAGCGCAAAAGTTGGGGATTAT

>NZ_CP017688|2|2|1592602-1592698|CRISPRCasFinder
ATCAAGCGCAAAAGTTGGGGACTAT	GCAAATAATTTAGTTAATTTAAACAGGAAGAAATCTACTTTTCGTGT
ATCAAGCGCAAAAGTTGGGGATTAT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP017688.1|WP_066336556.1|1594448_1596413_+|T9SS-type-A-sorting-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|275036
NZ_CP017688.1|WP_066334791.1|1589092_1590175_+|isochorismate-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|273127
NZ_CP017688.1|WP_066334780.1|1582611_1583058_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP017688.1|WP_066334790.1|1588621_1589056_+|PaaI-family-thioesterase	unknown	unknown	gnl|CDD|224961
NZ_CP017688.1|WP_066334779.1|1580743_1582522_-|long-chain-fatty-acid--CoA-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|223953
NZ_CP017688.1|WP_066336607.1|1611427_1611841_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP017688.1|WP_070786762.1|1591196_1592180_-|DDE-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|376574
NZ_CP017688.1|WP_066336554.1|1592970_1593672_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|372635
NZ_CP017688.1|WP_066336561.1|1593686_1594418_+|outer-membrane-beta-barrel-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|372635
NZ_CP017688.1|WP_070786763.1|1592160_1592526_-|transposase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379669
NZ_CP017688.1|WP_157776674.1|1607278_1608181_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|274730
NZ_CP017688.1|WP_066336611.1|1608756_1609206_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP017688.1|WP_066334784.1|1583194_1586881_-|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|235394
NZ_CP017688.1|WP_066334792.1|1590208_1590925_+|bacillithiol-biosynthesis-deacetylase-BshB1	unknown	unknown	gnl|CDD|274915
NZ_CP017688.1|WP_070786764.1|1596559_1606357_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|274730
NZ_CP017688.1|WP_066334787.1|1586987_1588505_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP017688.1|WP_066336614.1|1608177_1608753_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP017688.1|WP_066336605.1|1611874_1612075_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP017688.1|WP_066334778.1|1579928_1580372_-|MarR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|197670
NZ_CP017688.1|WP_066336609.1|1609520_1611416_+|RHS-repeat-associated-core-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|274730

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP017688.1|WP_066336556.1|1594448_1596413_+|T9SS-type-A-sorting-domain-containing-protein	gnl|CDD|275036	TIGR04183, hypothetical_protein, Por secretion system C-terminal sorting domain. Species that include Porphyromonas gingivalis, Fibrobacter succinogenes, Flavobacterium johnsoniae, Cytophaga hutchinsonii, Gramella forsetii, Prevotella intermedia, and Salinibacter ruber average twenty or more copies of a C-terminal domain, represented by this model, associated with sorting to the outer membrane and covalent modification.	1.04005e-06
NZ_CP017688.1|WP_066334791.1|1589092_1590175_+|isochorismate-synthase	gnl|CDD|273127	TIGR00543, Salicylate_biosynthesis_isochorismate_synthase, isochorismate synthases. This enzyme interconverts chorismate and isochorismate. In E. coli, different loci encode isochorismate synthases for the pathways of menaquinone biosynthesis and enterobactin biosynthesis (via salicilate) and fail to complement each other. Among isochorismate synthases, the N-terminal domain is poorly conserved. [Biosynthesis of cofactors, prosthetic groups, and carriers, Menaquinone and ubiquinone].	1.27792e-74
NZ_CP017688.1|WP_066334790.1|1588621_1589056_+|PaaI-family-thioesterase	gnl|CDD|224961	COG2050, PaaI, HGG motif-containing thioesterase, possibly involved in aromatic compounds catabolism [Secondary metabolites biosynthesis, transport, and catabolism].	7.87583e-37
NZ_CP017688.1|WP_066334779.1|1580743_1582522_-|long-chain-fatty-acid--CoA-ligase	gnl|CDD|223953	COG1022, FAA1, Long-chain acyl-CoA synthetases (AMP-forming) [Lipid metabolism].	0
NZ_CP017688.1|WP_070786762.1|1591196_1592180_-|DDE-transposase	gnl|CDD|376574	pfam01610, DDE_Tnp_ISL3, Transposase. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. Contains transposases for IS204, IS1001, IS1096 and IS1165.	5.5821e-61
NZ_CP017688.1|WP_066336554.1|1592970_1593672_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|372635	pfam13568, OMP_b-brl_2, Outer membrane protein beta-barrel domain. This domain is found in a wide range of outer membrane proteins. This domain assumes a membrane bound beta-barrel fold.	0.000147794
NZ_CP017688.1|WP_066336561.1|1593686_1594418_+|outer-membrane-beta-barrel-protein	gnl|CDD|372635	pfam13568, OMP_b-brl_2, Outer membrane protein beta-barrel domain. This domain is found in a wide range of outer membrane proteins. This domain assumes a membrane bound beta-barrel fold.	5.47085e-05
NZ_CP017688.1|WP_070786763.1|1592160_1592526_-|transposase-family-protein	gnl|CDD|379669	pfam14690, zf-ISL3, zinc-finger of transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165.	0.00645529
NZ_CP017688.1|WP_157776674.1|1607278_1608181_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|274730	TIGR03696, tRNA_nuclease_WapA, RHS repeat-associated core domain. This model represents a conserved unique core sequence shared by large numbers of proteins. It is occasional in the Archaea Methanosarcina barkeri) but common in bacteria and eukaryotes. Most fall into two large classes. One class consists of long proteins in which two classes of repeats are abundant: an FG-GAP repeat (pfam01839) class, and an RHS repeat (pfam05593) or YD repeat (TIGR01643). This class includes secreted bacterial insecticidal toxins and intercellular signalling proteins such as the teneurins in animals. The other class consists of uncharacterized proteins shorter than 400 amino acids, where this core domain of about 75 amino acids tends to occur in the N-terminal half. Over twenty such proteins are found in Pseudomonas putida alone; little sequence similarity or repeat structure is found among these proteins outside the region modeled by this domain.	3.27657e-18
NZ_CP017688.1|WP_066334784.1|1583194_1586881_-|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase	gnl|CDD|235394	PRK05297, PRK05297, phosphoribosylformylglycinamidine synthase; Provisional.	0
NZ_CP017688.1|WP_066334792.1|1590208_1590925_+|bacillithiol-biosynthesis-deacetylase-BshB1	gnl|CDD|274915	TIGR04001, thiol_BshB1, bacillithiol biosynthesis deacetylase BshB1. Members of this protein family are BshB1 (YpjG), an enzyme of bacillithiol biosynthesis; either BshB1 or BshB2 (YojG) must be present, and often both are present. Bacillithiol is a low-molecular-weight thiol, an analog of glutathione and mycothiol, and is found largely in the Firmicutes. [Biosynthesis of cofactors, prosthetic groups, and carriers, Glutathione and analogs].	8.6513e-123
NZ_CP017688.1|WP_070786764.1|1596559_1606357_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|274730	TIGR03696, tRNA_nuclease_WapA, RHS repeat-associated core domain. This model represents a conserved unique core sequence shared by large numbers of proteins. It is occasional in the Archaea Methanosarcina barkeri) but common in bacteria and eukaryotes. Most fall into two large classes. One class consists of long proteins in which two classes of repeats are abundant: an FG-GAP repeat (pfam01839) class, and an RHS repeat (pfam05593) or YD repeat (TIGR01643). This class includes secreted bacterial insecticidal toxins and intercellular signalling proteins such as the teneurins in animals. The other class consists of uncharacterized proteins shorter than 400 amino acids, where this core domain of about 75 amino acids tends to occur in the N-terminal half. Over twenty such proteins are found in Pseudomonas putida alone; little sequence similarity or repeat structure is found among these proteins outside the region modeled by this domain.	3.88785e-17
NZ_CP017688.1|WP_066334778.1|1579928_1580372_-|MarR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|197670	smart00347, HTH_MARR, helix_turn_helix multiple antibiotic resistance protein.	1.55854e-15
NZ_CP017688.1|WP_066336609.1|1609520_1611416_+|RHS-repeat-associated-core-domain-containing-protein	gnl|CDD|274730	TIGR03696, tRNA_nuclease_WapA, RHS repeat-associated core domain. This model represents a conserved unique core sequence shared by large numbers of proteins. It is occasional in the Archaea Methanosarcina barkeri) but common in bacteria and eukaryotes. Most fall into two large classes. One class consists of long proteins in which two classes of repeats are abundant: an FG-GAP repeat (pfam01839) class, and an RHS repeat (pfam05593) or YD repeat (TIGR01643). This class includes secreted bacterial insecticidal toxins and intercellular signalling proteins such as the teneurins in animals. The other class consists of uncharacterized proteins shorter than 400 amino acids, where this core domain of about 75 amino acids tends to occur in the N-terminal half. Over twenty such proteins are found in Pseudomonas putida alone; little sequence similarity or repeat structure is found among these proteins outside the region modeled by this domain.	5.56365e-16

Protein sequences

>NZ_CP017688.1|WP_070786763.1|1592160_1592526_-|transposase-family-protein
MQDSFVDLLKLLLPEIIVDYFELTSYKKEEEILHLYLKEINSIPKEHRQSKLSSKGFFDEITVQDFPIRGHQVYLHITRRRWLNEDTGKVVFRDWNLVADGTRVTQEFASFLKEIHRFQPK
>NZ_CP017688.1|WP_070786762.1|1591196_1592180_-|DDE-transposase
MDSSPNDCNAIASFYGVSGKNLQHQYKDFLSDFKIWDQKLHAKQWLIFPENIGKRLSIDETSLSNGELYTILTNKAGKGKKGTIVAMIAGTKAETVISVIEKIPLKLRNSVTEITLDMAANMGLIAKKCFPNTTRVTDRFHVQKLALEALQEIRIKYRWQAIDQENEAIEKAKKNKKRFEPEVLTNGDTIKQLLARSRYFLYKNKSKWTANQLQRALLLFDLYPDIKEAYNLSQGLRNIFENTTDKIIGFARLAKWHEKVNQSGFKSFGTISRSIMNHYQTILNYFDNRSTNASAESFNAKIKAFKSQFRGVRNVEFFLFRLTNIYA
>NZ_CP017688.1|WP_066334792.1|1590208_1590925_+|bacillithiol-biosynthesis-deacetylase-BshB1
MKLDIVAFGAHPDDVELGCAGTLLKEMSLGKKVGIIDLTRGELGTRGSAEIRDQEAHAAAQILGVSVRENLNMRDGFFVNDEKHQLEIVKIIRKYQPEIVLCNAIEDRHIDHGKGSKLVSDACFLSGLVKIETFLEGQKQAAWRPKVVYHYIQWKNIEPDFVVDITGFTDQKIQAILAYGSQFYDKNSKEPESPISSKNFLESLTYRSRDLGRLVGVDHGEGFTTERYLAVNSLGDLV
>NZ_CP017688.1|WP_066334791.1|1589092_1590175_+|isochorismate-synthase
MIDFFIKVKQQEAQNLPFVIYKKPNKDKLVGYFQKNDHLFFAESLEETGFVFAPFENNQMLLLPKEQTVKVESKMSVVKLKTAENAEIPKNNTGKAAFKALVQKALDSIAASEMRKVVVSRKEVVSVPDFELVSVFTKLLQSYPTAFCYCWYHPKIGMWIGATPEHLLFAKKKRFYTMALAGTQKFENTTEVVWNSKEKDEQQFVTDFIIENLSEITTEIAVSSPYTLQAGNLVHIKTDIEGIVNANSNLKQVVSVLHPTPAVCGLPKAIAQKFLLENESYSREYYTGFLGELNKRGIKNEKVQSDLYVNLRCMKIEKDIQLGTTKAHLYMGCGITKDSDPQKEWKESVNKSMTMKKILF
>NZ_CP017688.1|WP_066334790.1|1588621_1589056_+|PaaI-family-thioesterase
MTLDKNKIVAYCNAFSKNTLMETLNIEYIDAGEGFLVAKMPVNPSVHQPMGLLHGGASVALAESVGSAASHFFIDAKEQEVRGIEISANHLKSIREGVVYATARIVHKGKTLHLWEIKITDEEDNLISLCKLTNMVLNKTKPQE
>NZ_CP017688.1|WP_066334787.1|1586987_1588505_-|hypothetical-protein
MRYVTLPFLITILLLTAACRSDFDTVASDGKLAFSRDIIYLDTVFSNIGSSTYRLKVYNRSKKDITIPSIKLERGLLSKYRMTVDGRQDNQGKLFTNVTLLAKDSLYIFIETTASSTDANASDYLYTDKIEFDSGQNLQTIPLVTLVKDAFFLYPQRFADGTTETLPLIDGQKLNGFYLDPKDPINGNELHFTNQKAYVIYGYAAVPKGKTVLFDAGSRVYFHNNSGLVVTENATLQINGTPSTTNALENQVIFEADRLEPEYANLPGQWGTIWLTKGSTNHSITHLTIKNATIGLRIQDNDGTTVSIKNSQIYNCANYGILAQTARIEAQNLAINGAGIAALSCYYGGDYQFTHATFNNNWNNNSHLAVAISNHQDSPATDTKDLTKATFNNCIIYGNNTNELQLSSKPTAAFNYQFNHCLLKFNPKSTQAQYQFQTDPSHYTGIILNQNPNFLNTTKNKLHIDATSGAYAKGNPAYLIPLDILGSSRTLPPDLGAYQSNEFKK
>NZ_CP017688.1|WP_066334784.1|1583194_1586881_-|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase
MIHFFENQSNTIFAVHTSNSKLAEQTQNEISAQDISKLNWLFANAHKIEKSVLTDFFVGPRATMVTPWSTNAVEITQNMGISGIIRIEEFKRVSKDFTDFDPMLSQKYTELNQSLFTVNSTPEAILDIADIAAYNAKEGLSLSPEEVTYLDNLALKLGRKLTDSEIFGFSQANSEHCRHKIFNGTFIIDGEEKPASLFKMIKKTSQENPNDIVSAYKDNVAFVKGPRVAQFAPKSADKPDFYAIKEFDSVISLKAETHNFPTTVEPFNGAATGSGGEIRDRLAGGQGSLPLAGTAVYMTSYSRLENNRPWEQAMDERKWLYQTPMDILIKASNGASDFGNKFGQPLITGSILTFEHQEDARKLGFDKVIMQAGGIGYGKQEQALKKTPQTGDEIVILGGENYRIGMGGAAVSSADTGAFNSGIELNAIQRSNPEMQKRTANAIRGLVESDANPIVSIHDHGAGGHLNCLSELVEDTGGCIDLDQLPVGDPTLSAKEIIGNESQERMGLVIGQKDLATLQRIADRERAPMYQVGTVTGDHRFTFESKTTGAKPMDFALEDFFGSSPKVVMKDTTIDRKYEDLEYSVKNISSYLEQVLQLEAVACKDWLTNKVDRCVGGKVAKQQTAGPLQLPLNNCGVMALDYNGKEGIATAIGHSPVAALIDPVAGSRTAIAEALSNIIWAPIKDGLKGISLSANWMWACKNEGEDARLYAAVESCSDFAIALGVNIPTGKDSLSMKQKYPNEEVIAPGTVIISAAGNCTDIQKVVEPVLQKGGGSIYYINLSQDQFKLGGSSFAQTLNKIGKEAPTIQDAAFFKKAFHAIQELILDNQILAGHDIGSGGLITTLLEMCFADVNLGAKIDFSVFEEKDIIKYLFAENIGLVFQAKEDTVLENKLHTAGVDFYKLGSATSQATLDFGPCQLDIAKYRDIWFQTSFLLDQKQSKNATAQARFDNYKNQALRYQFPTHFTGKKPVIDASKPRPKAAIIREKGSNSEREMANAMYLAGFDVKDVHMTDLISGRETLEDIQFIGAVGGFSNSDVLGSAKGWAGAFKYNEKANTALQNFFKRQDTLSVGICNGCQLFMELEVINPEHKVHGKMLHNDSQKHESIFTSVTVQENKSVMLASLAGSTLGVWVSHGEGKFQLPMGEENYNIVGKYGYDSYPANPNGSDFNTAMLCDTTGRHLVMMPHIERSTFQWNWAHYPKDRNDEVSPWHEAFVNARKWVEKNKF
>NZ_CP017688.1|WP_066334780.1|1582611_1583058_-|hypothetical-protein
MQLKKIMLFLILAATPNLFSQVIVTPIEVKNKTHYITTTIGYPVSGTYLFEGESGPIVSLNDNGSGIYQLHNQPEKRMVWGIECSQKGIPKFREGFDSAVYTLWYKTDAAESQTEQIVEWNEVQFSIHFKKKKMFISGEREKSYKEDE
>NZ_CP017688.1|WP_066334779.1|1580743_1582522_-|long-chain-fatty-acid--CoA-ligase
MVTITRLFDFPYYQKEKYAIEDALVTKKDGVWIKTSTQEYLHKANTISRALLKMGIQKGDKIAIISSNNRTEWNIMDIGILQTAAQTVPIYPTISEQDYEYILNHSEATYCFVSDQEVFAKVNRIREKVPLLKEVYSFDTIEGCKNWEELLQLGQDQSNQGDVEKCKDSIQTDDLATIIYTSGTTGRPKGVMLSHANIVSDVLNSAERIPFEAGNSKALSFLPVCHIFERMILYLYQYYGVSIYFGESIEKISDNLKEVKPTVITAVPRLLEKVYDKIYAKGTELTGIKKSLFFWAIDLGLRYEPYGANGFWYEFQLKIARKLIFSKWKEGLGGNLDLMVSGSAALQTRLTRVFAAAEIPVMEGYGLTETSPVIAVNDLRNRGFKVGTVGKVIRNVTVRIAEDGEILCKGPNVMLGYFKDEKLTNEVIVDGYFHTGDIGELDKEGFLKITDRKKEMFKTSGGKYIAPQIVENTMKQSRFIEQIMVIGEGQKMPAAFIQPNFEFVKEWAVIHKLDIGTTNQEIVCNENVIRRIQEEIDQINTKFGHWEQIKRFELTPDIWSIEGGHLTPTLKLKRKIILQQYDALYQKIYHNL
>NZ_CP017688.1|WP_066334778.1|1579928_1580372_-|MarR-family-transcriptional-regulator
MKDKTIDYILRATWQAVARMYNEEASKYDASMATGFALLSIDKEGGTPSTALGPKMGMEATSLTRTLKSMEDKGLIIRKKNPQDGRGVLIYLTPFGKQKRELSKKTVLQFNDTIRGNISEEKLQHFIEVAETINELIQEKNIFYPTE
>NZ_CP017688.1|WP_066336554.1|1592970_1593672_+|hypothetical-protein
MKVTLYVFIYTFFFTSSFYAQNQTNITYGLKLGGLYSGISNLPENIKGRDNSLDNSTMETQGIYGIEGGFFVNFKLHDTRVAIQPEILFRQSGAKVSYQDTVGKEFDLGFHYSYIQLGALYKVYPYEGLNLGFGAFYGINIAPNAISYTSNQFGGMYDVATRQFYQDGLDGTDDFSTCFALGYELHQSIHFDLRYYLGVKDMVKSNSASFQFIENQNKSTVICFSVGYSFHQW
>NZ_CP017688.1|WP_066336561.1|1593686_1594418_+|outer-membrane-beta-barrel-protein
MKKIILLLLLISSKTIFAQGDREITYGLFVGAIHSTMSNLPDVIVPKGVFKGYTLDTKGKFGTTAGFKINWKYPYAKVSVQTEVLYSNQGTDLNYKDNKGLIYKTNFGYSYLNFGAQFKFYPFEGFYIGLGPYVGFSLNSDNIHYSSNSAVVFGNSEANFEPDATVEKVLKESLTAKNFFYGTFATGYEFSNNLSIGARYNLGLTDGLTTEENGHRYKENANKINSISLVIGYSFNFDDLGNF
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>NZ_CP017688.1|WP_070786764.1|1596559_1606357_+|hypothetical-protein
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>NZ_CP017688.1|WP_066336614.1|1608177_1608753_+|hypothetical-protein
MIKLSKQANRLALCCILGVFFLVFILGSLDSWGIKNNKDLIDILKTILLFSLPFLGYWAAIKLPNPKDVNDVNLLPNTKNIRVRFYKTSGFIDRNNQISFVRFFFNEGVIYMYFSNFLRIYEGPFYIKKKNEADFGMFYIHSLSNYINEELTLEITPKNTLDPHYKLILRNLIKSDYDLMKRYINKIDEIK
>NZ_CP017688.1|WP_066336611.1|1608756_1609206_+|hypothetical-protein
MKLTKKIFIIIIVLISKTSYSQDLPDEMIKSFFTQYSKNPAKAVEKIYQTSIWTSRLKDGIEDMKNEVGKYTIDYMGEYYGSELITKKQLSNTFVLYSYLLKYDRQPIRFIFKLYRPNDKWVLFSLKIDGVIDEEIEQSAKLFNLDLEK
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>NZ_CP017688.1|WP_066336607.1|1611427_1611841_+|hypothetical-protein
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>NZ_CP017688.1|WP_066336605.1|1611874_1612075_-|hypothetical-protein
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Crispr_ID: NZ_CP017688_3

• CRISPR_ID: NZ_CP017688_3
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• CRISPR_type: TypeII
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 48 spacers
• Cas_protein_info: cas2,cas1,cas9

Consensus repeat of NZ_CP017688_3

Consensus_repeat	Method
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GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTTACTTATAATTCCCAAC	PILER-CR

spacers of NZ_CP017688_3

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GCGGAAATAGAGAATTAATGAAGTTTATT
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TGACACCTCGGTTAATGCTTTAATCTTGTT
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AGTTTCTGTTTTGGGGCGAGTACTTACTA
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ATTTGAAACTAAAGAAAAAAGAGCATACCT
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CCCAATTATCGGCTAAACCTACGGCAGATA
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GGCTAACTATTCCGAAATGCTTGCGTACT
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TAAGGGGCTGGCTAATCGTACTAAGTGGC
>3.30|1875505|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder
TACAATTAAAAGCGATGCTACTTAAAAAGA
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TTTTTTCAATTTCCAACTCCATAAATTCGG
>3.32|1875657|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR
GATATGACGGCAGGCAGTATCAAGAGCCG
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ACACCTCAGGCATAATACCGAGAGGTTTAA
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TGTACGCTTCGGTTGCACCCTCTTTTCCTA
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TTAGAAACTTGGCTGAGTTTCCTGAGATGT
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ACACTATTCCACGTGCTACGGAGCTTATAT
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AATATTTATTTCGATGTTAGCGGATTAAT
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GAGGCTAAATATTCCGAAATGCTGGCATAC
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ACAAATCAATTCTCAATTTCTCAGGTAAGC
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AACTTGCGAAAAAAGGCTCTGCTGATGAAG
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CGGAGCAGTTGGTAAACAAGGTATCACTTC
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CTAAGCCTTTCACAAATAATGCCGCCCCCT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017688_3

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP017688_3

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>NZ_CP017688|3|3|1873264-1876946|CRISPRCasFinder
ATTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTTACTTATAATTCCCAAC	TGAGAAGTAAATGGGAAGCGCACAACTCGG
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTTACTTATAATTCCCAAC	TTGCAGCAAGTACTTTTTTAAAGCTGGTAA
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTTACTTATAATTCCCAAC	TTATCTTCGATTAATTCATCGTTTCCGCTA
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTTACTTATAATTCCCAAC	GGAGCAGATAAACAAAGAGCTGGAACAGCA
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTTACTTATAATTCCCAAC	TTTCCATTTTGTTTTGTTTTTTAGTTCAAT
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTTACTTATAATTCCCAAC	AGCAGCTTCCAAAGCTTATTGAGCGGATCA
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTTACTTATAATTCCCAAC	CTTGCTGATAATAACGACATTAGAAGCATC
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTTACTTATAATTCCCAAC	GGTAGTTGAAGCAAGCATCCCGTTGGCTA
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTTACTTATAATTCCCAAC	AAACAATTATGGAAAAATACGTAATGTTTG
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTTACTTATAATTCCCAAC	ACGCTTGTTTGCTGCTGAAGTATTAATGAA
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTTACTTATAATTCCCAAC	ACGACGAGAAAAACGTTTGTACTGTTACTT
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTTACTTATAATTCCCAAC	GCGGAAATAGAGAATTAATGAAGTTTATT
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTTACTTATAATTCCCAAC	TGACACCTCGGTTAATGCTTTAATCTTGTT
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTTACTTATAATTCCCAAC	CGGCTGGTTATTTCGCTACCAACGGAAACG
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTTACTTATAATTCCCAAC	ACGTTAAGAAAACCAAAGGAGATTTTGACA
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTTACTTATAATTCCCAAC	AAAAGTATGATTATAAACGTGAAATATGAT
GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTTACTTATAATTCCCAAC	AAAAACGGCAAAGCTTAGTTCCGAAGATTT
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GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTTACTTATAATTCCCAAC	CACCTCAGGGATTATTCCGAAAGGATTAA
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GTTGTGAATTGCTTTCAAAATTGTATTTTTACTTATAATTCCCAAC	TAGCACTTGTGGCTTCATCGGTCACTTTTT
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Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
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NZ_CP017688.1|WP_066331502.1|1885874_1887056_-|aspartate-aminotransferase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|99735
NZ_CP017688.1|WP_066331519.1|1877062_1877410_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2	cas2	COG3512_cas2_CAS-II-A:CAS-II-B:CAS-II-C	gnl|CDD|226043
NZ_CP017688.1|WP_066331531.1|1866578_1867997_+|cytochrome-c-oxidase-accessory-protein-CcoG	unknown	unknown	gnl|CDD|274278
NZ_CP017688.1|WP_066331496.1|1889746_1890016_-|acyl-CoA-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|376410
NZ_CP017688.1|WP_066331525.1|1869241_1869478_+|DUF465-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225397
NZ_CP017688.1|WP_066331542.1|1863025_1863217_+|cbb3-type-cytochrome-oxidase-assembly-protein-CcoS	unknown	unknown	gnl|CDD|377073
NZ_CP017688.1|WP_066331527.1|1868511_1869213_+|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|372587
NZ_CP017688.1|WP_066331511.1|1883583_1884336_-|shikimate-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|223247
NZ_CP017688.1|WP_066331530.1|1868044_1868494_+|FixH-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377555
NZ_CP017688.1|WP_066331507.1|1884322_1885732_-|tetratricopeptide-repeat-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|276809
NZ_CP017688.1|WP_066331523.1|1869602_1870967_-|oxygen-independent-coproporphyrinogen-III-oxidase	unknown	unknown	gnl|CDD|236430
NZ_CP017688.1|WP_066331514.1|1878612_1883226_-|hypothetical-protein	cas9	cd09643_cas9_CAS-II-A:CAS-II-B:CAS-II-C	gnl|CDD|375967
NZ_CP017688.1|WP_066331536.1|1865413_1865584_+|cbb3-type-cytochrome-c-oxidase-subunit-3	unknown	unknown	gnl|CDD|368492
NZ_CP017688.1|WP_066331491.1|1890015_1890669_-|phosphatidylserine-decarboxylase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|235400
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NZ_CP017688.1|WP_066331539.1|1863219_1865409_+|cytochrome-c-oxidase,-cbb3-type-subunit-I	unknown	unknown	gnl|CDD|184703
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HMMScan for Signature genes

Protein	Cas_name	Cas_description	E-value	Identity	Coverage
NZ_CP017688.1|WP_066331516.1|1877427_1878324_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1	cas1	cd09720_cas1_CAS-II-A:CAS-II-B:CAS-II-C	7e-87	285.8	0.0
NZ_CP017688.1|WP_066331514.1|1878612_1883226_-|hypothetical-protein	cas9	cd09643_cas9_CAS-II-A:CAS-II-B:CAS-II-C	2.5e-64	212.7	78.8
NZ_CP017688.1|WP_066331519.1|1877062_1877410_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2	cas2	COG3512_cas2_CAS-II-A:CAS-II-B:CAS-II-C	2.1e-32	106.5	0.2

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP017688.1|WP_099092431.1|1887121_1888693_-|OstA-like-protein	gnl|CDD|372475	pfam13100, OstA_2, OstA-like protein. This is a family of OstA-like proteins that are related to pfam03968.	8.01973e-52
NZ_CP017688.1|WP_066331502.1|1885874_1887056_-|aspartate-aminotransferase-family-protein	gnl|CDD|99735	cd00610, OAT_like, Acetyl ornithine aminotransferase family. This family belongs to pyridoxal phosphate (PLP)-dependent aspartate aminotransferase superfamily (fold I). The major groups in this CD correspond to ornithine aminotransferase, acetylornithine aminotransferase, alanine-glyoxylate aminotransferase, dialkylglycine decarboxylase, 4-aminobutyrate aminotransferase, beta-alanine-pyruvate aminotransferase, adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase, and glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase. All the enzymes belonging to this family act on basic amino acids and their derivatives are involved in transamination or decarboxylation.	7.46254e-136
NZ_CP017688.1|WP_066331519.1|1877062_1877410_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2	gnl|CDD|226043	COG3512, COG3512, CRISPR-associated protein, Cas2 homolog [Defense mechanisms].	1.53322e-25
NZ_CP017688.1|WP_066331531.1|1866578_1867997_+|cytochrome-c-oxidase-accessory-protein-CcoG	gnl|CDD|274278	TIGR02745, iron-sulfur_cluster-binding_protein, cytochrome c oxidase accessory protein FixG. Member of this ferredoxin-like protein family are found exclusively in species with an operon encoding the cbb3 type of cytochrome c oxidase (cco-cbb3), and near the cco-cbb3 operon in about half the cases. The cco-cbb3 is found in a variety of proteobacteria and almost nowhere else, and is associated with oxygen use under microaerobic conditions. Some (but not all) of these proteobacteria are also nitrogen-fixing, hence the gene symbol fixG. FixG was shown essential for functional cco-cbb3 expression in Bradyrhizobium japonicum.	1.22797e-131
NZ_CP017688.1|WP_066331496.1|1889746_1890016_-|acyl-CoA-binding-protein	gnl|CDD|376410	pfam00887, ACBP, Acyl CoA binding protein.	2.19957e-17
NZ_CP017688.1|WP_066331525.1|1869241_1869478_+|DUF465-domain-containing-protein	gnl|CDD|225397	COG2841, COG2841, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	1.63724e-11
NZ_CP017688.1|WP_066331542.1|1863025_1863217_+|cbb3-type-cytochrome-oxidase-assembly-protein-CcoS	gnl|CDD|377073	pfam03597, FixS, Cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type.	5.95373e-18
NZ_CP017688.1|WP_066331527.1|1868511_1869213_+|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein	gnl|CDD|372587	pfam13386, DsbD_2, Cytochrome C biogenesis protein transmembrane region.	2.44196e-49
NZ_CP017688.1|WP_066331511.1|1883583_1884336_-|shikimate-dehydrogenase	gnl|CDD|223247	COG0169, AroE, Shikimate 5-dehydrogenase [Amino acid transport and metabolism].	2.16471e-72
NZ_CP017688.1|WP_066331530.1|1868044_1868494_+|FixH-family-protein	gnl|CDD|377555	pfam05751, FixH, FixH. This family consists of several Rhizobium FixH like proteins. It has been suggested that suggested that the four proteins FixG, FixH, FixI, and FixS may participate in a membrane-bound complex coupling the FixI cation pump with a redox process catalyzed by FixG.	4.75941e-27
NZ_CP017688.1|WP_066331507.1|1884322_1885732_-|tetratricopeptide-repeat-protein	gnl|CDD|276809	sd00006, TPR, Tetratricopeptide repeat. The Tetratricopeptide repeat (TPR) typically contains 34 amino acids and is found in a variety of organisms including bacteria, cyanobacteria, yeast, fungi, plants, and humans. It is present in a variety of proteins including those involved in chaperone, cell-cycle, transcription, and protein transport complexes. The number of TPR motifs varies among proteins. Those containing 5-6 tandem repeats generate a right-handed helical structure with an amphipathic channel that is thought to accommodate an alpha-helix of a target protein. It has been proposed that TPR proteins preferentially interact with WD-40 repeat proteins, but in many instances several TPR-proteins seem to aggregate to multi-protein complexes.	6.41044e-13
NZ_CP017688.1|WP_066331523.1|1869602_1870967_-|oxygen-independent-coproporphyrinogen-III-oxidase	gnl|CDD|236430	PRK09249, PRK09249, coproporphyrinogen dehydrogenase.	0
NZ_CP017688.1|WP_066331514.1|1878612_1883226_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|375967	pfam18541, RuvC_III, RuvC endonuclease subdomain 3. Cas9 proteins are abundant across the bacterial kingdom, but vary widely in both sequence and size. All known Cas9 enzymes contain an HNH domain that cleaves the DNA strand complementary to the guide RNA sequence (target strand), and a RuvC nuclease domain required for cleaving the noncomplementary strand (non-target strand), yielding double-strand DNA breaks (DSBs). The crystal structures of type II-A and II-C Cas9 proteins highlight the features in Cas9 enzymes that support their function as RNA-guided endonucleases. Cas9 enzymes adopt a bilobed architecture composed of a nuclease lobe containing juxtaposed RuvC and HNH nuclease domains and a variable alpha-helical lobe likely to be involved in nucleic acid binding. The RuvC domain forms the structural core of the nuclease lobe, a six-stranded beta sheet surrounded by four alpha helices, with all three conserved subdomains (I, II, III) contributing catalytic residues to the active site.	6.1445e-50
NZ_CP017688.1|WP_066331536.1|1865413_1865584_+|cbb3-type-cytochrome-c-oxidase-subunit-3	gnl|CDD|368492	pfam05545, FixQ, Cbb3-type cytochrome oxidase component FixQ. This family consists of several Cbb3-type cytochrome oxidase components (FixQ/CcoQ). FixQ is found in nitrogen fixing bacteria. Since nitrogen fixation is an energy-consuming process, effective symbioses depend on operation of a respiratory chain with a high affinity for O2, closely coupled to ATP production. This requirement is fulfilled by a special three-subunit terminal oxidase (cytochrome terminal oxidase cbb3), which was first identified in Bradyrhizobium japonicum as the product of the fixNOQP operon.	0.000151444
NZ_CP017688.1|WP_066331491.1|1890015_1890669_-|phosphatidylserine-decarboxylase-family-protein	gnl|CDD|235400	PRK05305, PRK05305, phosphatidylserine decarboxylase family protein.	4.36792e-96
NZ_CP017688.1|WP_066331534.1|1865605_1866505_+|c-type-cytochrome	gnl|CDD|129864	TIGR00782, di-heme_cytochrome_cp, cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III. This model describes a di-heme subunit of approximately 26 kDa of the cbb3 type copper and heme-containing cytochrome oxidase. [Energy metabolism, Electron transport].	1.55437e-31
NZ_CP017688.1|WP_066331522.1|1871123_1873085_-|DUF349-domain-containing-protein	gnl|CDD|377186	pfam03993, DUF349, Domain of Unknown Function (DUF349). This domain is found singly or as up to five tandem repeats in a small set of bacterial proteins. There are two or three alpha-helices, and possibly a beta-strand.	2.58875e-14
NZ_CP017688.1|WP_066331539.1|1863219_1865409_+|cytochrome-c-oxidase,-cbb3-type-subunit-I	gnl|CDD|184703	PRK14485, PRK14485, putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit I/II; Provisional.	0
NZ_CP017688.1|WP_066331516.1|1877427_1878324_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1	gnl|CDD|274694	TIGR03639, cas1_NMENI, CRISPR-associated endonuclease Cas1, subtype II/NMENI. The CRISPR-associated protein Cas1 is virtually universal to CRISPR systems. CRISPR, an acronym for Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats, is a prokaryotic immunity system for foreign DNA, mostly from phage. CRISPR systems belong to different subtypes, distinguished by both nature of the repeats, the makeup of the cohort of associated Cas proteins, and by molecular phylogeny within the more universal Cas proteins such as this one. This model is of type EXCEPTION and provides more specific information than the EQUIVALOG model TIGR00287. It describes the Cas1 variant of the NMENI subtype of CRISPR/Cas system.	7.51839e-108
NZ_CP017688.1|WP_066331498.1|1888961_1889738_-|superoxide-dismutase	gnl|CDD|223678	COG0605, SodA, Superoxide dismutase [Inorganic ion transport and metabolism].	4.7807e-81

Protein sequences

>NZ_CP017688.1|WP_066331522.1|1871123_1873085_-|DUF349-domain-containing-protein
MLEEKNDNLQNADGKSALESLEKKQTTAPEKDATENTIAGISEQSLEQDSQRALRSIDASNAEESEDQTLKERHEIPMQDYDSLSMVDLVEALNIIAGSDKIMSVKEHVDEIKKSFLAKYTHFIEEKKEEFQAENPDSTEDFEYHLPLKAQFDALYTTFKNKKNTHFKSLQTNLKSNLENRLAIVEELKELINPQENIKDTLKHFNELRERWKNAGSIPKDKYNHVWNNYHFHVENFYDYLHLDREARDLDFKHNLEQKQKIVLRVQELLNEEDVNKAFRELQDLHRMWKEDIGPVSKEHREEIWNLFSDLTKKMHDKRELLFEKQRELELVNLENKKQIIAEIEDLATIKVHAHSQWLLQIEKVEALRTAFFAAGKVPSEVNEATWSSFKTAVRNFNSFKNSFYKEIKKDQNENLNKKNALVAKAQELQDNTDFEATTPIMKNIQEEWKKIGHVPRKFSDKVWTEFKAACNHYFDRLNEQKSENIAEEMESFDKKKTYLESLREFELSGDHKIDLEAIKQHIENWKNLGRVPHARRHIEGKFNKILDALFDKLSLSKKETDMMRFTNRLDNLAENNETRKLENEKIFLIRKIDEVQNEIFQLENNIQFFANTKNAKKENSIVLEVRKNIAIHKESLEVWKEKLNQLRSLNQE
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>NZ_CP017688.1|WP_066331534.1|1865605_1866505_+|c-type-cytochrome
MKKIIPAYVRVLLIFFLVFGAMEYFIDSGDRAAFIKYPMVSLFLAVFLFVLIAIEITVSAIDNISYQMLSAEEKLAFEQESATSYKDKEWFQKLMKKLTKSEPIENEENLLLDHDYDGIKELDNNLPPWWVYLFYGCIVFAVVYLVRFEIMGGDNQEMELQKELAQAKIDVAQYMKTAPDLMDEKTVTLLTDPADLAIGKTIFATNCAACHRADAGGQIGPNLTDDKWILGGGIKNVFHTINNGGRDGKGMISWKGTLKPKEMQKVASYILSLHGSNPKDPKEAEGEVWVEEATVAPAQ
>NZ_CP017688.1|WP_066331536.1|1865413_1865584_+|cbb3-type-cytochrome-c-oxidase-subunit-3
MFEQIKHNMETISGVEIYPILSLLIFFIFFVGLGVWVLSYKKEKIDELSQIPLKDN
>NZ_CP017688.1|WP_066331539.1|1863219_1865409_+|cytochrome-c-oxidase,-cbb3-type-subunit-I
MEMQQFYYDNKIVKKFIYATILFGVVGMLVGLTLAILYLFPNLTDGISWLSYGRLRPLHTNAVIFAFVGNAFFAGMYYSMQRLLKARMYSDFLSGLHFWGWQLIIVAAAITLPLGYSTSKEYAELEWPIDIAITFIWVVMGINMIGTMIKRRERHLYVAIWFYLATFVTVAVLHIFNSLAIPVSLLSMKSYSVYAGVQDALVQWWYGHNAVAFFLTTPFLGLMYYFVPKAANRPVYSYRLSIVHFWSLIFIYIWAGPHHLLYSALPNWAQNLGVVFSIMLIAPSWGGMINGLLTLRGAWDKVRVDPVLKFFVVAITGYGMATFEGPMLSLKNVNAIAHFTDWIIAHVHVGALAWNGFMAFGLIYWLVPRMSKGPLFSAKLANFHFWIGTLGIILYTLPMYVAGFLQASMWKQFNPDGTLTYGNFLETVTQIMPMYWMRAIGGTLYLVGMLVLVYNIYRTIRANAAIEDELAEAPELQKISSSRIKGEKFHPWLERKPIQLTILATIAILIGGVIQIVPTIMVKSNIPTIASVKPYTPLELEGRDLYIREGCVGCHSQMVRPFRSEVERYGPQSKAGEFVYDHPFLWGSKRTGPDLLRVGGKYNDNWHFNHMWNPQSTSSGSIMPGYKWLFDNKALDISDIESKMKVMQTLGVPYTDAEVADARNAMKIQSQKIENNLNADPDFVKSYENSKKKAIAKGEEFVPMHQREIVALIAYIQRLGTDIKVKDKK
>NZ_CP017688.1|WP_066331542.1|1863025_1863217_+|cbb3-type-cytochrome-oxidase-assembly-protein-CcoS
MSVIYLLITISIFVAIGFFIAFVVAVKSGQYDDDYTPSVRMLFDDEIKKTKKQGIQTTEEKQI
>NZ_CP017688.1|WP_066331519.1|1877062_1877410_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2
MFDKQYTRLNQYRSLWILVFFDLPTETRKERKIASGFRKKLLDDGFSMFQFSIYMRFCASKENAEVHTKRIRNSLPEHGKIGVMQITDKQFGMMELFYGKKPVETDKPSQQLELF
>NZ_CP017688.1|WP_066331516.1|1877427_1878324_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1
MIKRTLFFGNPAYLSTKNEQIVISYPDKEQETKTVAIEDVGVLVLENQQITITNGLLEKLTNNNVALINCDQYHLPIGLLMPLNGHTEQSERFRNQINASAPLKKNLWQQTISSKIRNQAGVLKEKGIPCRKMEIWSKEVTSGDALNHESRAAAFYWKNLIPVANFTRGQKGIPPNNLLNYGYAILRAITARAIVSSGMLPTLGIFHRNKYNAYCLADDIMEPYRPYVDLIVCHIMETEDHYDELTIEIKKRLLSIATIDVIIDGKNSPLMVAMSRTTHSLQECFEGTARKIMYPVYG
>NZ_CP017688.1|WP_066331514.1|1878612_1883226_-|hypothetical-protein
MKKILGLDLGTNSIGWALTTNDFDTKKGTIEGLGSRIIPMSQDILGKFDSGVSLSQTAQRTEYRGKRRLVQRFLLRRERLHRVLHILELLPKQYSEAIDFDKKLGQFKPEREQKISFYKNESGKNQFIFTKSHQEMLTEFQTYYPTIKNIPYDWTIYYLRKKALTEKISKEELAWILLNFNQKRGYYQLRGEEKEENKNKKEEFHTLLVTDIIERDKGKSGTWYNVILENGWIYKRESKISLADWIGKTKSFIVTTEYNDDGSVKLTKDNEEKRSFRSPKEDDWGLIKIRTEKTINQSDKSVGAYIYDALLKNPNQKIKGELVRTIERKYYKDELREILKKQLEFHSDVLNDKILYKKCIDELYKNNDSHKNSIKDRGFDYLFLDDIIFYQRPLKSKTSLISDCSLEFRPIKNKNGVLVKDTDGKQIAKALKCIARSNPIFQEFRLLQFVKNLKIYKRGVVDDVEVTNDYLKSENDVEKLFNWLNDKAEINQKQFLVNFKLKEDKHRWNFVEDKGYPCNETRNQFLNAIAKIDVDKSFFNTKNTQDLWHILYSVTDKIEITKAITTFAKRHNLPNEFIINFSKIKPYKKEYGSFSEKAIKKLLPLMRFGSYWDAKNIDIKTLDRIDKIQTGEFDEKIRNRVREKAIDLHKIDDFKDLPLWLASYIVYDKHSEASDVSKWKTPADIEKFLKHEFKQHSLRNPIVEQVITETLRVVKDIWLQYGEGKENFFNEIHIELGREMKNDKATREKISKKVSENENTNLRIKAILTELKNDGVSDIRPYSPSQQEILKIYEEGVYNNESRKEKLEEVDKIRKNAKPTTSEIIKYKLWLEQGYASPYTGKLIPMSELFTTKYQIEHIIPQSRFFDDSLSNKVICESEVNELKSNMTALEFILTNENRIVTLTGGETVKIFTKEAYNQHIISYYSKNKNKQKRLLTEEIPEQFISRQLNDTKYISKIVKNLLSKIVREEDEQEVTSKHVVSLNGSITSRMKQDWGLNDVWNTIVSPRFERLNTLTNSNDFGQFELKKDAYGNEGKRVFQTTVPDAIAKGFTKKRIDHRHHALDALVIACVNRTHINYLNNLNAKDTDDKAVKHELRNKLCFKTKPDSNGNYKWEFHKPWEKFTKEAQDKLNTTIVSFKQNTRVINKTVNKYVSYKDENGNLNVDANGLPQKKVITQTKGDNWAIRKPLHAETVSGKVFLKRIKQSHITIANAIEQVELIVDKEVKKQLKAKIKLYPNNIAGLKKHLKAFPVMINDKAIDKIQIYETLEATATRKILDITFDEKKIQKITDTGIQKILLNHLKQEKYQNTVDENGKKLAPHEIAFSENGLEDLNKNITFLNDGKNHQPIKKVRIFEEGNKFPLGEVGNKINKFVETAKGTNLFFAVYENDDKKRNYKTIPFNEVIERQKQGLNAALEIDENGNRLLFTLSPNDLVYIPLEDEIGYLNGVYFKNLNKEQTVRIYKFVSCTGGEGHFVPNNYSKEIISNENGSNNKNERMLNFNNFNIIFDGKEKPVMIKSICWKLEVDRLGKVIKIIK
>NZ_CP017688.1|WP_066331511.1|1883583_1884336_-|shikimate-dehydrogenase
MTLNNRKRFGLLGKNISYSFSKGYFSAKFEQEAYENYSYENFDIPEISLFNTLIKDNPETLAGINVTIPYKEAVLPFLDQVSKKAKKIGAVNTIKFTKKGKLKGYNTDYYGFKKSLEPMLESHHKKALILGTGGASKGVCYALKELGIAYTLVSRVQTENSIGYAAINSKIMQSHTIIINATPVGTSPNIEAYPALPYADFSSKHIAYDLIYNPAETQFLKRAAAEGAQTKNGYDMLVFQAEKAWEIWNK
>NZ_CP017688.1|WP_066331507.1|1884322_1885732_-|tetratricopeptide-repeat-protein
MQLSNEEDDYNLSISKFESMLKTNKVLFFDSEEFEEIILHYLDMGKATLAKKALKLGLDQHPKSTGLRLVQVEMLVFDNKLDLAEKLLQELYAIEPNNEEIYIQKANIYSKRDQHEKAVEFLKIALQHTEDFADVYNLIGMEYLFMDNLELAKENFIKCLEEDLEDQSALYNVVYCFEFLDQNLEAIAYLNKYINKNPYSEIAWHQMGRLYYDLKDYENAIRAFDYATLIDDEFLGAFMEKAKAYERLKKYDLAIESYNRTIALDDATSYALLRIGKCHERLGNTALALKYYNQTVHEDPLLDKGWIAITDFYLRQKNFQKALFFVNKALAIDNQNRLYWKRYASINKEMNFFEEAEFGFRKAVEFGDTALDTWLFWVDILQFLGEFDSAIQTLLQASEYFPEENEIEYRLAGLYFMIQDNTKAKFHLSNALRLKFDNYILIEDLFPVVWSKKIVQNYIDKHNNTNDTK
>NZ_CP017688.1|WP_066331502.1|1885874_1887056_-|aspartate-aminotransferase-family-protein
MNTDFIKYQAQTSPHPLGLEISYAKGSYIYTTDGQKYLDFVAGVSACTLGHQPQRVNQAIKAQLDKYSHVMVYGEYAQSPAVEYCKLLASLLPDSLNKTYLVNSGTEAIEGALKLARRVTGRSQLISCHNAYHGNTMGSLSLMGYEPRKQAFRPLLPDVDFITFNNEADLEKITTKTAAILVETIQGGAGFIEPKNDFLKKVRARCTAMGALLILDEIQPGFGRTGKLFGFQNYDILPDVVVMGKGMASGMPVGAFTASAARMDLLQDNPKLGHITTFGGHPVIASACLATLQELTQTDLIQKTLEKEKLFRYLLVHPLIKEVRGKGLMLAIMTPSEAVTNEVILKCQDKGLILFWLLFEPCAIRITPPLTISEEEIREGCAIIKQVLDNMVG
>NZ_CP017688.1|WP_099092431.1|1887121_1888693_-|OstA-like-protein
MAQAPKKIIVEHADYADINQAEIPDAFLLTGNVRVNHDGIVLTCNKAYYFQKENYIKAFGNVQLVQGDTLFLNSKYAEYSGNVKKAFAAGEAYMSSPDATLNTDTIHFDRNSQEVYYTTVGNITSKDNNLRSKSGKYFVKQKKFQFLTAVTITNPQCVIQSNHLDYYSNSGHSYLFGPSTITSKNNYIYTEKGFYDTKKNVAHFIRKSYIKYEDRRIQGDSLYYDRNKEFASATRNVKITDSINRGIIKGHYGEIYKKKDSMFVTKRAIASNFVDNDSVYIHGKRLLITGKEGDRIIRAFNNVRFLKKDMSGKCDSIHSSAKTALTKLIGNPIIWNGDNQITGEVIHLIGDNTTRKLDSLKVLNNTFLVSRDTISNGYNQIKGLNLYGKFYQGTLHDVTVVKNAEVIYYMRNENKELIGINKNLSSKIDLVLDNNAVETITFYNQVDGSIYPDKELPENARKLRGLVWRGDERMYTKEALFSAEENAYNTQMLNQAKKENALKNVPMKTRKETVDYDKKKPKK
>NZ_CP017688.1|WP_066331498.1|1888961_1889738_-|superoxide-dismutase
MKNTALLIVSWITTLFLFSCQDKKLTEVVEVPLPTAQEKVAIGHPEDVKAAQGSFQLEKLAYSYDALAPTVSALTLETHYSKHYLSYTNNLNKAISGTPYENQSIENILAKLDLNNPELRNNAGGYYNHTLYWKSMAPDTPDVATDTLAAVINRDFGSFKNFEIAFKNEATNQFGSAWTFLVVDKYGKLKLTSTQNQDNPLMRNAAVPGTPILALDLWEHAYYLGYQYRRKSYIDSFFTVINWAKINENYEAAIRKKY
>NZ_CP017688.1|WP_066331496.1|1889746_1890016_-|acyl-CoA-binding-protein
MRSEDLDTQFQAAVTKALTMTQATLPQDVQLRLYAYYKQATFGNLQTKQTTTYHLRDAFKTNAWMQISHLSAEQAKEEYIKMITDLSKK
>NZ_CP017688.1|WP_066331491.1|1890015_1890669_-|phosphatidylserine-decarboxylase-family-protein
MFHKEGTKTILLGIIFTASVLLISDNLIALFWLKKAIQIAAFLILVIILQFFRNPKRTVAINENHLLAPVDGKVVVIEEVYEPEYFKDKRLQVSIFMSPINVHVTRYALSGIVKFSKYHPGKFLVAWHPKASEENERTTVVVQNNTFGAILYRQIAGALARRIVNYAQEGMQVVQGTDAGFIKFGSRVDLFLPLGTPVNVVLNQKAIGGKTIIATKA

Crispr_ID: NZ_CP017688_4

• CRISPR_ID: NZ_CP017688_4
• CRISPR_location: 2651597-2651901
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 4 spacers

Consensus repeat of NZ_CP017688_4

Consensus_repeat	Method
ACCTGCAACCTATAAAACCGTAGAAGAAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP017688_4

>4.1|2651626|40|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder
CTGTTTTAATAAAAGAAGCTGGTAAAAAAACCACTATACT
>4.2|2651695|40|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder
AAATGCTGGTTAAAGAAGCTAGCAAAACACAATCTATGGT
>4.3|2651764|40|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder
AAATGTTAGTTAAAGAAGCTTCGACAAAATTAGTGGTAAT
>4.4|2651833|40|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder
AAATCATTGCCAAAGAAGCCTACAAAAAAATGGTTTTTAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017688_4

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP017688_4

>merge|NZ_CP017688|4|2651597-2651901|CRISPRCasFinder
ACCTGCAACCTATAAAACCGTAGAAGAAACTGTTTTAATAAAAGAAGCTGGTAAAAAAACCACTATACTACCTGCAACCTACAAAACCGTAGAAGAAAAAATGCTGGTTAAAGAAGCTAGCAAAACACAATCTATGGTAGCGGCCACATTTAAAACCGTTGAAGAAAAAATGTTAGTTAAAGAAGCTTCGACAAAATTAGTGGTAATTCCTGCTACGTACAAAACCGTAGAAGAAAAAATCATTGCCAAAGAAGCCTACAAAAAAATGGTTTTTAAACCCGCTACCTACAAAAGTGAAGAAGAAA

>NZ_CP017688|4|4|2651597-2651901|CRISPRCasFinder
ACCTGCAACCTATAAAACCGTAGAAGAAA	CTGTTTTAATAAAAGAAGCTGGTAAAAAAACCACTATACT
ACCTGCAACCTACAAAACCGTAGAAGAAA	AAATGCTGGTTAAAGAAGCTAGCAAAACACAATCTATGGT
AGCGGCCACATTTAAAACCGTTGAAGAAA	AAATGTTAGTTAAAGAAGCTTCGACAAAATTAGTGGTAAT
TCCTGCTACGTACAAAACCGTAGAAGAAA	AAATCATTGCCAAAGAAGCCTACAAAAAAATGGTTTTTAA
ACCCGCTACCTACAAAAGTGAAGAAGAAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP017688.1|WP_066332028.1|2666423_2667251_-|orotidine-5'-phosphate-decarboxylase	unknown	unknown	gnl|CDD|234651
NZ_CP017688.1|WP_066332036.1|2660494_2661616_+|imelysin-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|271142
NZ_CP017688.1|WP_066332031.1|2665496_2666324_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|238564
NZ_CP017688.1|WP_066332040.1|2657824_2658997_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|271140
NZ_CP017688.1|WP_066332071.1|2634340_2635645_-|restriction-endonuclease-subunit-S	unknown	unknown	gnl|CDD|341186
NZ_CP017688.1|WP_099092438.1|2654411_2655161_+|DUF4197-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379394
NZ_CP017688.1|WP_066332057.1|2645034_2645304_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378935
NZ_CP017688.1|WP_066332038.1|2659229_2660432_+|DUF4856-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|374396
NZ_CP017688.1|WP_066332059.1|2642199_2643282_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP017688.1|WP_066332055.1|2645402_2646308_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP017688.1|WP_066332062.1|2638107_2641185_-|type-I-restriction-endonuclease-subunit-R	unknown	unknown	gnl|CDD|223683
NZ_CP017688.1|WP_066332042.1|2656356_2657760_-|c-type-cytochrome	unknown	unknown	gnl|CDD|226019
NZ_CP017688.1|WP_078055241.1|2662959_2665425_+|TonB-dependent-receptor	unknown	unknown	gnl|CDD|238657
NZ_CP017688.1|WP_078055244.1|2652080_2653094_+|OmpA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|143586
NZ_CP017688.1|WP_078055245.1|2643446_2645030_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|273716
NZ_CP017688.1|WP_066332064.1|2635637_2637263_-|SAM-dependent-DNA-methyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|223363
NZ_CP017688.1|WP_066332051.1|2647762_2651218_-|methylmalonyl-CoA-mutase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239650
NZ_CP017688.1|WP_141672804.1|2653277_2654393_-|redoxin-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239264
NZ_CP017688.1|WP_066332116.1|2637263_2638106_-|Bro-N-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|214989
NZ_CP017688.1|WP_066332054.1|2646341_2647598_-|tyrosine-type-recombinase/integrase	unknown	unknown	gnl|CDD|271185

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP017688.1|WP_066332028.1|2666423_2667251_-|orotidine-5'-phosphate-decarboxylase	gnl|CDD|234651	PRK00125, pyrF, orotidine 5'-phosphate decarboxylase; Reviewed.	1.09512e-92
NZ_CP017688.1|WP_066332036.1|2660494_2661616_+|imelysin-family-protein	gnl|CDD|271142	cd14659, Imelysin-like_IPPA, Imelysin-like protein. This family includes insulin-cleaving membrane protease (imelysin, ICMP)-like protein (IPPA from Psychrobacter arcticus), the Pseudomonas aeruginosa PA4372 and Vibrio cholera VC1266 Fur-regulated imelysin-like protein. They share the overall fold and a similar functional site as the insulin-cleaving membrane protease (ICMP). However, IPPA adopts a structure distinctive from the known HxxE metallopeptidases or iron-binding proteins, suggesting this protein may not be a peptidase; the histidine in the GxHxxE motif region is no longer conserved (GxxxxE), indicating a possible loss of enzymatic function or a change in substrate preference (compared to imelysin and IrpA families). A putative functional site for this non-peptidase homolog is located at the domain interface. The tertiary structure shows a fold consisting of two domains, each of which consists of a bundle of four helices that are similar to each other, implying an ancient gene duplication and fusion event.	3.63901e-82
NZ_CP017688.1|WP_078055241.1|2662959_2665425_+|TonB-dependent-receptor	gnl|CDD|238657	cd01347, ligand_gated_channel, TonB dependent/Ligand-Gated channels are created by a monomeric 22 strand (22,24) anti-parallel beta-barrel. Ligands apparently bind to the large extracellular loops. The N-terminal 150-200 residues form a plug from the periplasmic end of barrel. Energy (proton-motive force) and TonB-dependent conformational alteration of channel (parts of plug, and loops 7 and 8) allow passage of ligand. FepA residues 12-18 form the TonB box, which mediates the interaction with the TonB-containing inner membrane complex. TonB preferentially interacts with ligand-bound receptors. Transport thru the channel may resemble passage thru an air lock. In this model, ligand binding leads to closure of the extracellular end of pore, then a TonB-mediated signal facillitates opening of the interior side of pore, deforming the N-terminal plug and allowing passage of the ligand to the periplasm. Such a mechanism would prevent the free diffusion of small molecules thru the pore.	7.2981e-35
NZ_CP017688.1|WP_066332031.1|2665496_2666324_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|238564	cd01144, BtuF, Cobalamin binding protein BtuF. These proteins have been shown to function as initial receptors in ABC transport of vitamin B12 (cobalamin) in eubacterial and some archaeal species. They belong to the TroA superfamily of helical backbone metal receptor proteins that share a distinct fold and ligand binding mechanism. A typical TroA protein is comprised of two globular subdomains connected by a single helix and can bind the metal ion in the cleft between these domains. In addition, these proteins sometimes have a low complexity region containing a metal-binding histidine-rich motif (repetitive HDH sequence).	9.05017e-47
NZ_CP017688.1|WP_099092438.1|2654411_2655161_+|DUF4197-domain-containing-protein	gnl|CDD|379394	pfam13852, DUF4197, Protein of unknown function (DUF4197). This family of proteins is functionally uncharacterized. This family of proteins is found in bacteria. Proteins in this family are typically between 228 and 249 amino acids in length.	4.36801e-106
NZ_CP017688.1|WP_066332057.1|2645034_2645304_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|378935	pfam12728, HTH_17, Helix-turn-helix domain. This domain is a DNA-binding helix-turn-helix domain.	4.15104e-07
NZ_CP017688.1|WP_066332038.1|2659229_2660432_+|DUF4856-domain-containing-protein	gnl|CDD|374396	pfam16148, DUF4856, Domain of unknown function (DUF4856). This family consists of uncharacterized proteins around 400 residues in length and is mainly found in various Bacteroides and Prevotella species. The function of this family is unknown.	9.72301e-149
NZ_CP017688.1|WP_066332040.1|2657824_2658997_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|271140	cd14657, Imelysin_IrpA-like, Imelysin-like iron-regulated protein A-like. This family includes putative iron-regulated protein A (IrpA) mainly from Bacteriodes, proteobacteria and cyanobacteria, as well as uncharacterized proteins with domains similar to insulin-cleaving membrane protease (imelysin, ICMP) protein. IrpA has been shown to be essential for growth under iron-deficient conditions in the cyanobacteria Synechococcus sp. The conserved GxHxxE motif is similar to other known imelysin-like proteins that are regulated by iron, such as ICMP, IrpA and EfeO. Imelysin is a membrane protein with the active site outside the cell envelope. The tertiary structure shows a fold consisting of two domains, each of which consists of a bundle of four helices that are similar to each other, implying an ancient gene duplication and fusion event.	1.58154e-148
NZ_CP017688.1|WP_066332062.1|2638107_2641185_-|type-I-restriction-endonuclease-subunit-R	gnl|CDD|223683	COG0610, COG0610, Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases [Defense mechanisms].	9.9179e-69
NZ_CP017688.1|WP_066332042.1|2656356_2657760_-|c-type-cytochrome	gnl|CDD|226019	COG3488, COG3488, Predicted thiol oxidoreductase [Energy production and conversion].	0
NZ_CP017688.1|WP_066332054.1|2646341_2647598_-|tyrosine-type-recombinase/integrase	gnl|CDD|271185	cd01185, INTN1_C_like, Integrase IntN1 of Bacteroides mobilizable transposon NBU1 and similar proteins, C-terminal catalytic domain. IntN1 is a tyrosine recombinase for the integration and excision of Bacteroides mobilizable transposon NBU1 from the host chromosome. IntN1 does not require strict homology between the recombining sites seen with other tyrosine recombinases. This family belongs to the superfamily of DNA breaking-rejoining enzymes, which share the same fold in their catalytic domain and the overall reaction mechanism. The catalytic domain contains six conserved active site residues. Their overall reaction mechanism involves cleavage of a single strand of a DNA duplex by nucleophilic attack of a conserved tyrosine to give a 3' phosphotyrosyl protein-DNA adduct. In the second rejoining step, a terminal 5' hydroxyl attacks the covalent adduct to release the enzyme and generate duplex DNA.	7.08575e-20
NZ_CP017688.1|WP_078055244.1|2652080_2653094_+|OmpA-family-protein	gnl|CDD|143586	cd07185, OmpA_C-like, Peptidoglycan binding domains similar to the C-terminal domain of outer-membrane protein OmpA. OmpA-like domains (named after the C-terminal domain of Escherichia coli OmpA protein) have been shown to non-covalently associate with peptidoglycan, a network of glycan chains composed of disaccharides, which are crosslinked via short peptide bridges. Well-studied members of this family include the Escherichia coli outer membrane protein OmpA, the Escherichia coli lipoprotein PAL, Neisseria meningitdis RmpM, which interact with the outer membrane, as well as the Escherichia coli motor protein MotB, and the Vibrio flagellar motor proteins PomB and MotY, which interact with the inner membrane.	4.85852e-33
NZ_CP017688.1|WP_078055245.1|2643446_2645030_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|273716	TIGR01613, putative_primase, phage/plasmid primase, P4 family, C-terminal domain. This model represents a clade within a larger family of proteins from viruses of bacteria and animals. Members of this family are found in phage and plasmids of bacteria and archaea only. The model describes a domain of about 300 residues, found generally toward the protein C-terminus. [DNA metabolism, DNA replication, recombination, and repair, Mobile and extrachromosomal element functions, Prophage functions].	6.54665e-45
NZ_CP017688.1|WP_066332064.1|2635637_2637263_-|SAM-dependent-DNA-methyltransferase	gnl|CDD|223363	COG0286, HsdM, Type I restriction-modification system methyltransferase subunit [Defense mechanisms].	2.03182e-69
NZ_CP017688.1|WP_066332051.1|2647762_2651218_-|methylmalonyl-CoA-mutase-family-protein	gnl|CDD|239650	cd03678, MM_CoA_mutase_1, Coenzyme B12-dependent-methylmalonyl coenzyme A (CoA) mutase (MCM) family, unknown subfamily 1; composed of uncharacterized bacterial proteins containing a C-terminal MCM domain. MCM catalyzes the isomerization of methylmalonyl-CoA to succinyl-CoA. The reaction proceeds via radical intermediates beginning with a substrate-induced homolytic cleavage of the Co-C bond of coenzyme B12 to produce cob(II)alamin and the deoxyadenosyl radical. MCM plays an important role in the conversion of propionyl-CoA to succinyl-CoA during the degradation of propionate for the Krebs cycle. In some bacteria, MCM is involved in the reverse metabolic reaction, the rearrangement of succinyl-CoA to methylmalonyl-CoA. Members of this subfamily also contain an N-terminal coenzyme B12 binding domain followed by a domain similar to the E. coli ArgK membrane ATPase.	0
NZ_CP017688.1|WP_141672804.1|2653277_2654393_-|redoxin-domain-containing-protein	gnl|CDD|239264	cd02966, TlpA_like_family, TlpA-like family; composed of TlpA, ResA, DsbE and similar proteins. TlpA, ResA and DsbE are bacterial protein disulfide reductases with important roles in cytochrome maturation. They are membrane-anchored proteins with a soluble TRX domain containing a CXXC motif located in the periplasm. The TRX domains of this family contain an insert, approximately 25 residues in length, which correspond to an extra alpha helix and a beta strand when compared with TRX. TlpA catalyzes an essential reaction in the biogenesis of cytochrome aa3, while ResA and DsbE are essential proteins in cytochrome c maturation. Also included in this family are proteins containing a TlpA-like TRX domain with domain architectures similar to E. coli DipZ protein, and the N-terminal TRX domain of PilB protein from Neisseria which acts as a disulfide reductase that can recylce methionine sulfoxide reductases.	1.55597e-14
NZ_CP017688.1|WP_066332116.1|2637263_2638106_-|Bro-N-domain-containing-protein	gnl|CDD|214989	smart01040, Bro-N, BRO family, N-terminal domain. This family includes the N-terminus of baculovirus BRO and ALI motif proteins. The function of BRO proteins is unknown. It has been suggested that BRO-A and BRO-C are DNA binding proteins that influence host DNA replication and/or transcription. This Pfam domain does not include the characteristic invariant alanine, leucine, isoleucine motif of the ALI proteins.	7.20624e-17
NZ_CP017688.1|WP_066332071.1|2634340_2635645_-|restriction-endonuclease-subunit-S	gnl|CDD|341186	cd17495, RMtype1_S_Cep9333ORF4827P-TRD2-CR2_like, Type I restriction-modification system specificity (S) subunit Target Recognition Domain-ConseRved domain (TRD-CR), similar to Crinalium epipsammum S subunit (S.Cep9333ORF4827P) TRD2-CR2 and Corynebacterium genitalium sp. nov. S subunit (S.CgeORF10704P) TRD2-CR2. The recognition sequences for Crinalium epipsammum S subunit (S.Cep9333ORF4827P) and Corynebacterium genitalium sp. nov. S subunit (S.CgeORF10704P) are undetermined. The restriction-modification (RM) system S subunit consists of two variable target recognition domains (TRD1 and 2) and two conserved regions (CR1 and CR2) which separate the TRDs. The TRDs each bind to different specific sequences in the DNA. RM systems protect a bacterial cell against invasion of foreign DNA by endonucleolytic cleavage of DNA that lacks a site specific modification. The host genome is protected from cleavage by methylation of specific nucleotides in the target sites. In type I systems, both restriction and modification activities are present in one enzyme complex composed of one DNA specificity (S) subunit (this family), two modification (M) subunits and two restriction (R) subunits. This model contains both TRD1-CR1 and TRD2-CR2. This subfamily of TRD-CR's shows similarity to TRD1-CR1 of Aminobacterium colombiense DSM 12261 S subunit (S.Aco12261I), which recognizes 5'... GCANNNNNNTGT ... 3'. This subfamily may also include TRD-CR-like sequence-recognition domains of various type II restriction enzymes and methyltransferases and type I DNA methyltransferases.	4.88723e-102

Protein sequences

>NZ_CP017688.1|WP_066332051.1|2647762_2651218_-|methylmalonyl-CoA-mutase-family-protein
MNTQTPYLPKHKVRIVTAASLFDGHDAAINIMRRIIQATGVEVIHLGHDRSVEEVVNTAIQEDANAIALTSYQGGHIEYFKYMYDLLQQKGAGHIKLFGGGGGVILPTEIAELQAYGITRIYAPDDGRSMGLQGMINDLVERSDFSPPTPEGTAPEMVNRLQNKQVTTIARLISLAENNPPEFYKLFPESLVAPALKTAETPVLGITGTGGAGKSSLVDEFVRRFLIDFPDKTIGLISVDPSKRKTGGALLGDRIRMNAINSPRVYMRSLATRQSNLALSKYVAGAIQVLKAATFDLIILETSGIGQSDTEIMDHSDVSLYVMTPEFGAATQLEKIDMLDFADVVALNKFDKRGALDAIRDVKKQYQRNHNLWEANPDTMPVFGTIASQFNDPGMNTLYQFILNKIVEKTHSDLKSTFVVSPERSQKIFVIPPQRTRYLSEIAESNRKYDQIVGSQQKVAQKLYGIFKTIESVSGKVPEITKTGIDDSSVYPSAVKEQDENTIFLNLLLNQFDKVKMDLDPYNWEILLTWDQKVNKYKKPIYNFKVRGQNIAIKTHSESLSHSPIPKIALPKYEAWGDILRWCLQENVPGEFPFTSGLYPFKREGEDPSRMFAGEGGPERTNKRFHYVSAGLPAKRLSTAFDSVTLYGNDPDIRPDIYGKIGNAGVSICCLDDAKKLYSGFDLVHAMTSVSMTINGPAPMLLGFFMNAAIDQQCELYIQANGLEKEIATKIDQIYQDKGIARPVYNGDLPEGNNGLGLLLLGVTGDVVLPLEVYREIKAKTLSQVRGTVQADILKEDQAQNTCIFSTEFALRLMGDVQEYFIANKVRNFYSVSISGYHIAEAGANPITQLAFTLSNGFTYVEYYLSRGMDINDFGPNLSFFFSNGVDPEYAVIGRVARKIWAKAMKIKYGANERAQMLKYHIQTSGRSLHAQEIDFNDIRTTLQALYAIYDNCNSLHTNAYDEAITTPTEESVRRAMAIQLIITKELGLAKNENPIQGSFIIEELTDLVETAVLQEFDRITDRGGVLGAMETMYQRSKIQEESLYYETLKHTGAFPIVGVNTFLSSKGSPTVIPTEVIRATEEEKQFQIQTLKNLHKTNAQEVQKQLDKIQEAAIKNENLFEYLMEATKVCSLGQITAALFEVGGQYRRNM
>NZ_CP017688.1|WP_066332054.1|2646341_2647598_-|tyrosine-type-recombinase/integrase
MATLKYIIQSKNENSNIYVRYSIDRKTNLKRKTGFTINPKDWSVDKAQPKQTRDDLKAIKFKLDKLAIFLNEAFNNAVSKGAQFNGDWLQFQIDLFNNKIKIVDFDILTNSIDAYIDNGDNLTKGSIKNLENLKKFIVNYETDALKGNQILIRNIDLNFIDTFKKYHVSKGRSVNYIGTYMSLLKAVVKKASQNGIPIHPQFNQIKMIKEHKNPDEIIILTEEEQELLKNANIILQSHINARKWLLLGCLIGQRAGDLLNITDKNLRDLQGMKIIELKQQKTGKLVAIPLLPEALKIIENGLPYKISLEHFNKYSKDICKIAKINTIIKGKMRIDKKRTLTAGYYEKWQVISSHVCRRSFATNFYGKIPTSVLMNITAHGTETVFLNYIGKTTYDNAYQMLEYFSKLKPIIEKSNSDI
>NZ_CP017688.1|WP_066332055.1|2645402_2646308_-|hypothetical-protein
MDYEEIYEGFYAKYYAKIEILIKNYLIKQRSVNLPFFTAINKVNHYFVNDFINKYHLHNNENLEKLYQIFCNRRFAYSINAIEGILEDQIKKGFDKIDVLELPIDYNYSKLIKEIALLEVEKEISRLLSNNLQLLKMFYELNEFDEFEIRRNGNLSIEDFPIYRKLATKLYPKQFANFIEDVNFNLNEVRDSKDHINSENKNPYPLLFLNLDVYNCFLEYQKHIIDFYIDFSYLKKRMEFEKLIHHHKDNDFMKIVFEEIKLISEKKYNEYYVNGKLKSLTKSFSTQRNNNFNIVFKDLLN
>NZ_CP017688.1|WP_066332057.1|2645034_2645304_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MNNQIFLNGITLEQLAEALTPLIQASQSAQSHQSELIGRKEVCIMLGINLTSLWKHTKSGKLSSYGIGNRVLYKRSEVLNAITPINPKN
>NZ_CP017688.1|WP_078055245.1|2643446_2645030_-|hypothetical-protein
MTTAVNLPHSQSEVKKRLIENIEKCSNELEASENSKSDILTGLLKSISPINFELLAFPDAEKDRKEADRLASIIFDENGDPRSEFKDELKQHKIVLSKLSKNKLTKNHYLIICIEQLMKIAKENNWGLCKKNGYIYLYNGCYWEEIDKERFQFFLGDVAMKMDVEKFKGKVYTFKEDLLKQFLSDAYLPEPDNKKDSILINLQNGTFEISATKQVLRSFDSNDFLTHQLPFEFNPKATAPMFRKYLDEVLPVKEKQSALAEFCGYVFINSSVLKLEKMLTLYGTGANGKSVFFEIINALLGSENISNYSLQSLTDEKGYSRAKIGNKLVNYASEINGKLETDIFKQMASGEPIEARLPYGEPFILNDYAKLIFNCNELPKDVEHTNAYFRRFMIIEFDQTIPEERQDRQLPNKIVENELAGVFNWILSGLDRVLANKGFSKCDAVDNTRINYQKQSDSVLLFIEEHGYKVSATERILISDLYPLYKTFCVDDGYKALGKKNFILRLNHFKMHVNRITIGNVVYLTNH
>NZ_CP017688.1|WP_066332059.1|2642199_2643282_-|hypothetical-protein
MKFSNKLDPSSKKFVCPNCNKKTFVRYLEVETLSYSADEFGRCDRESECSYHKSPVIGIIGYSIPFLSLMSLTDKAYKLTAENGTIHIVPKTVIMEQNENSCFIAGWFLKNSKFSYLTNECKFFEKGGIANVFIPKEQIPKVVPNYHSLELLDKLYCNDLNTDNLTEFLKTKFTNEEVFKMKQDYLITATNTPWNNSTVFWRIDNNETVCGGKIMQYDRYRGKRIKEPHNKTTWIHKYYEKSSFKLSHCLFGLHLIVEDYSKIIAITESEKTAIIMSRFIPEYIWLATGGKGNLKFELLQPIKKRIIVLFPDKSEYNDWLSKATELNSKGFKISVSDILENTDYPKGFDLADLYLSLENG
>NZ_CP017688.1|WP_066332062.1|2638107_2641185_-|type-I-restriction-endonuclease-subunit-R
MTFNEDSRVKIPSLLHLTRLGYTYLSLKNALWDESTNIFTDVFIDSISKINPGIEQSDAKRLLDEVSLLLDNEDLGKAFYERITERSGIRLIDFENFENNTFNVVTELTCKKDDEEFRPDITLLINGMPLVFIEVKKPNNQDGILAEHKRIQSRFENKKFRKFVNITQLMVFSNNMKYDDNSPMPIEGAFYATVSYQKPSFNYFREENKFDLDAVLAPFDDEKENFILKDNNLVGIKNSPEFLTNKNPNSPTNSICTSLFQKERLQFMLQYSIAYVKGSKGLQKHIMRYPQLFATKAIEAKLEEGVKKGIIWHTQGSGKTALAYYNVKYLTDYFQSKKIIPKFYFIVDRLDLLIQAGKEFKSRGLVVHNVNSREEFAKDIKSTSVIHNNSGKAEITVVNIQKFQDDPDVVRNTDYQLNIQRVYFLDEVHRSYNPKGSFLANLNESDPNAIKIGLTGTPLLGTDYNSKALFGGYIHKYYYNSSIADGYTLRLIREEIETNYKLTLKQALEEIEILKGNADKKIVYAHPKFVEPMLDYIVQDFEKARISMNDNSIGGLVVCDSSDQAKMLFEIFESKYATNTTVHSGLLQAAEPSESYGDKKKAESKVTTAAVILHDIGTKQDRKDQVEAFKDGHIDFLFVYNMLLTGFDAPRLKKLYIGRVIKAHNLLQTLTRVNRTYKDFRYGYVVDFADIQKEFDKTNQDYFNELQSELGDEMEHYSNIFKSQEEINTEIKEIKEVLFHFDTMNAEIFSQQISQINDRSEILRITRVLNNAKSLYNLIRLSGNYELLEQLDFHKLTVLSRDANNRLALINAKEALESNIDTSNLLNIALEDVIFAFVKVKEEEMVLADQLKNILQKTRETLGGNFDQKAPEFISLKEELERLFKKKNLNEVTKDEMESNIRELEKIYSKAKELERKNQLLRAKYDNDEKYARLHKRLMEKDPLTDSESKLFEALQGLKTAVDAQIIQNSKMLENESFVERMVMRLVIDQFKNKQHIALDAATTKRINGLIVKEYMNEFYGRTAY
>NZ_CP017688.1|WP_066332116.1|2637263_2638106_-|Bro-N-domain-containing-protein
MKQQEAIQLFEEKKVRTLWNQDEEKWYFSIVDTVSVLTDSPNPRKYWSVLKTRLKKEGSQLTTNCSQLKMQSADGKYYKTDVADTEQLFRLIQSIPSPKAEPFKLWLAQIAAERLDEMQDPELTIDRALEQYMSLGYSENWINQRLKSIEIRKALTDEWKSRGLKEGVQFATLTDIISKAWSGNTTKEYKVLKGLKKENLRDNMTNTELILNMLAEASTKDISTATNPESFEENKKVAEQGGNVAKVAMKELESKTGKKVVTALNAKDSLKQIEDKKKDE
>NZ_CP017688.1|WP_066332064.1|2635637_2637263_-|SAM-dependent-DNA-methyltransferase
MTTTAQFEKQTKNLIDDLKSVCANYGLGNDGNEFKIITQVFLYKFLNDKFVHEVKQLDDKIAKADNWEAVLREYNENDYEMLLMSMSESTARLQPKHFISSLFERQNEANFSDIFDNTLLDIAKENSDLFSVLTEGGEKIVLFENISKYVTDKRDDFCKAIINKLINFSFENIFHEKFDFYATIFEYLISDYNTNSGGKYAEYFTPHAVAKIMARCLVAGEVSNVTCYDPSAGSGTLLMNLAHQIGETKCTVYSQDISQKSSNLLRLNLILNDLVHSIPNIVKGNTILEPYHKDKNGRLQQFDYIVSNPPFKLDFSDYVTDLDSKENHERFFAGMPNVPKAKKDSMAIYPLFVQHIMYSLTAKGKAAIVVPTGFITAQSGIERKIREQMVERKMLRGVVSMPSNIFATTGTNVSILFLDKENTKGDIVLMDASKLGTTVKEGKNQKTLLSPEEEDYIIDTFNKHEAKEDFSVVVSYDDIKAKNYSLSAGQYFEVKIEYTDISPKEFEDKMKSFESNLSALFSESKTLEMEIQNNLKGLRYE
>NZ_CP017688.1|WP_066332071.1|2634340_2635645_-|restriction-endonuclease-subunit-S
MSKVKLIELKNLPIQLIDGDRGINYPSKSEFTNNGYCVFLNTGNVTKNGFDFSNIEYISAERDLLLRKGKLKYNDIVLTTRGTIGNVGYYNDKLQYKHIRINSGMIIMRCDENQINPYYLYLFLRSEIFKKQVLSQGSGSAQPQLPIGSLKNISFPFANVLTQQKIAKVLSDLDAKTEVNNRINSELEAMAKTLYDYWFVQFDFPDVNGTPYKSSGGKMVWNAALKREIPEGWEDGVLSDIANITMGQSPPGESYNEEGNGMIFYQGCTDFGNRFPTIRKYTTSPTRFAKQGDILLSVRAPVGTLNISKEDCCIGRGLACMNSKNDAITYLFGVMVNLKQTFDRRNASGTTFGSITKDDLFSLPVVIPNAKTVRAFQNLVFPSFEKQNKIELENQELASIRDWLLPMLMNGQVSVRDVAEQLGMVAEDSASYGK
>NZ_CP017688.1|WP_078055244.1|2652080_2653094_+|OmpA-family-protein
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MTTTNIPKLTPLFKIKTLLVSTLFLTVTSCAELQQIATQYPGIATAGTVDISGGLKEALNNGITKQVSKLTATDGFYKNEAVKILLPEELRKVDSGLRKMGLNSLADEGLKVLNRAAEDAVKEATPIFVSAIKNMTITDAKGILLGDTSAATTYLQNSTTTALYSKFNPVIKNSFSKVGADKVWTNIITKYNSIPLVNKVNPDLNDYVTNQAMNGVFKMIAVEEQNIRTNIGARTSPLLQTVFAMQDSK
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>NZ_CP017688.1|WP_066332040.1|2657824_2658997_-|hypothetical-protein
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MKPTKLFFASTIIAALSLASCSKDADDQLATYAIPATYTFERNQTTTVDFSGQSSRLLMLEEMGNYIKTAATNGTVVDQTILSNMYSNSNNPFTLAELNTSGKQLKDKTAASKEYFQLLLGGGSSLEKNTVQAFFESQLTLANQASLGATAAAGTAGVYTDGTSKRLFATNGLEPQQVLLKGMMGACFIDQVVNNYLSTYKLDEANNKVNNTNKVLEANKTYTTMEHTWDEAYGYLYGAGGTKFWSSYINQVNADADFNTLKADLDLAFRKGRAAIVANDYATRDAQIAVIKTKLALVPAVRAVYYLQEGKNKLTTDKGAKAFHALSEAYGFILSLRYTNKPGTEAPYFSKTEVDAMLASLISGNNGLWDIDTLGPKLDTLSAQIAAKFGFTVAQAATVN
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MKKKLFIFFSALITLAACSSSDSGEDSTSGSNYDRKLLLTNWADNIIIPSYTNYEAKIATLAQNVAAFTTTANQTNLAAVRTSWLEAYKAYQYVAIYSFGKSEEISFKESANTYPTNLTGIENNILADNYNLALLSQFDKQGFPALDYLLHGLASTDAAIIANYSTDAHASKYQKYLTAVTAQLATNANLVTTDWKSNYRDLYIANSGASVSGSVAITTNNFVKNLEKDIRSGKIGIPCGVFSNATKFPEKVEAYYKNNLSKELLNTALQASQDFFNGKHYGSATTGEGLKTYLDYVNAMRGGQKLSQIILQQYAAAFTAIAGLDPSFSTQITNNNTLMIAAYDVVQQNVIYTKLDMMQALNITIDYVDSDGD
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MKISNTKPGYFLLRTPLKDFRLFLLLLLPLLTFAQNKISGVVTDNKGLKLAGVEIYNRATNTKLLTDKNGFFEIEPKKPASYDLVFFKEGFAIVEQNDISTGSSIKIVLNKINQLTEVIIRKQNDKLQSLYKLNDIEETAIYAGKKTEVINISKLTANKATNNARQIFAQVVGLTINESSDGGLQLSIGGRGLNPNRTANFNTRQNNYDISADVLGYPESYYATPTEALEEIQIIRGAASLQYGTQFGGLINFKLKTPTTKPFEFSTRSTIGSYGLGTNFTSVSGTNKKFSYYSFYNYKQGNGYRPNSDFESKNYFANLNYQFTPQTSVHLDYTYYNYLAQQAGGLTDAQFYKNPKQSNRTRNWFAVNWNLFALRLKHQWNLDTDFSVQLFGLNASRKALGFRDNRITTPDPMQERDLIIGKFVNWGAETRYLKRYPIGQQKSAFLIGAKYYQSNNQQQQGPGSADTNANFNLATTAYPYYQNQSDFRFPNKNLALFGENIFKINANFTVTPGFRIEKIITKADGYYKKINRDFAGNIILNETKNENTVKDRNLLLLGVGLSYKPKKGLEIYGNASQNYRSVTFSDIRTINPSQQIDENITDEKGYTSDIGLRGHIQHIITFDTSIFGLYYNDKIGEYDSTNASNQIVKIRANTGTALTYGFETLVDWNIAKSCFKDTENLSWNVFTNSAITKSSYLKSAIPSIKKGYEVEFVPLFNIKTGTSLGYKNVMSSIQFTHVSSQLSSASSNNSNNVLTGISGTIPAYSVADISCSYKWKNWKLEAGITNFTNNHYFTRRATGYPGPGIIPSDNRTFYTTVEFLF
>NZ_CP017688.1|WP_066332031.1|2665496_2666324_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein
MLKTATDQLGTVHTFKTTPQRIVSLVPSQTELLCDLGLEAKIVGITSFCVHPHHLKTTKKRVGGTKKVHLDKIKALQPDIIICNKEENTLEMVQQLGTICPVWVTNILTIEDNFRMILDFGKIFNSRTEAQKWHDKLVFALSNFKDFIKDVPVQKTAYFIWKNPYMVAGTHTYINELLQLNHFENWYQTKERYPEIILEQMVVDGAPDYIFLSSEPYPFKKNAAYEMRQHIPKAKIVLVDGEMFSWYGSRLLKALDYFRILHQNLQNEAAEAVIE
>NZ_CP017688.1|WP_066332028.1|2666423_2667251_-|orotidine-5'-phosphate-decarboxylase
MTTQHLIDQIKTKKSFLTVGLDVDLNKIPKHLLDLEDPIFEFNKAIIDATHDLCVAYKPNIAFFEAYGIKGWMALQKTMHYLHTTYPEIFTIADAKRGDIGNTSTMYAKAFFEDLEFDSVTVAPYMGKDSVEPFLAFENKHTIMLALTSNEGAFDFQTIKVDGKELYKRVLETAKTWKNSQNLMYVVGATKAEYFTEIRKIVPDSFLLVPGVGAQGGSLSEVCKYGMNAQIGLLINSSRGIIYASNGVDFASRARQEALKMQQEMAQIMALHLIK

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_CP017688_3	3.27|1875280|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1875280-1875308	29	MT234670	Pseudanabaena phage PA-SR01, complete genome	39672-39700	4	0.862
NZ_CP017688_3	3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873614-1873643	30	MH937493	Streptococcus phage CHPC1041, complete genome	24649-24678	5	0.833
NZ_CP017688_3	3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873614-1873643	30	NZ_CP020733	Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides FM06 plasmid pLm2, complete genome	12129-12158	5	0.833
NZ_CP017688_3	3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873614-1873643	30	NZ_CP033610	Weissella hellenica strain 0916-4-2 plasmid pWHSP020, complete sequence	10662-10691	5	0.833
NZ_CP017688_3	3.12|1874145|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874145-1874173	29	KU878088	Bacillus phage AR9, complete genome	20028-20056	5	0.828
NZ_CP017688_3	3.12|1874145|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874145-1874173	29	MF360957	Bacillus virus PBS1, complete genome	180576-180604	5	0.828
NZ_CP017688_3	3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1875355-1875383	29	NC_018276	Croceibacter phage P2559S, complete genome	5441-5469	5	0.828
NZ_CP017688_3	3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1875355-1875383	29	NZ_CP050185	Bacillus thuringiensis strain HER1410 plasmid pLUSID2, complete sequence	30433-30461	5	0.828
NZ_CP017688_3	3.9|1873917|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873917-1873946	30	KY290955	Aeromonas phage 65.2, complete genome	175983-176012	6	0.8
NZ_CP017688_3	3.9|1873917|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873917-1873946	30	NC_015251	Aeromonas phage 65, complete genome	176015-176044	6	0.8
NZ_CP017688_3	3.9|1873917|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873917-1873946	30	NC_013164	Anaerococcus prevotii DSM 20548 plasmid pAPRE01, complete sequence	48646-48675	6	0.8
NZ_CP017688_3	3.9|1873917|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873917-1873946	30	MN693449	Marine virus AFVG_25M25, complete genome	1791-1820	6	0.8
NZ_CP017688_3	3.12|1874145|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874145-1874173	29	NC_020292	Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) plasmid Csp_135p, complete sequence	29096-29124	6	0.793
NZ_CP017688_3	3.20|1874751|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874751-1874780	30	NZ_CP021876	Enterococcus wangshanyuanii strain MN05 plasmid unnamed3	38021-38050	6	0.8
NZ_CP017688_3	3.23|1874978|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874978-1875006	29	NC_010821	Pseudomonas phage 201phi2-1, complete genome	176308-176336	6	0.793
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NZ_CP017688_3	3.24|1875053|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1875053-1875082	30	NZ_CP016085	Brachyspira hyodysenteriae ATCC 27164 strain B-78 plasmid pBhyoB78, complete sequence	8104-8133	6	0.8
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NZ_CP017688_3	3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1875355-1875383	29	NZ_AP019369	Silvanigrellales bacterium RF1110005 plasmid 79K, complete sequence	2067-2095	6	0.793
NZ_CP017688_3	3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1875355-1875383	29	NZ_CP028870	Borreliella garinii strain 20047 plasmid lp28-3, complete sequence	16467-16495	6	0.793
NZ_CP017688_3	3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1875355-1875383	29	NZ_CP028870	Borreliella garinii strain 20047 plasmid lp28-3, complete sequence	7559-7587	6	0.793
NZ_CP017688_3	3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1875355-1875383	29	NZ_CP021678	Bacillus licheniformis strain SRCM100027 plasmid pBL027-1 sequence	7710-7738	6	0.793
NZ_CP017688_3	3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1875355-1875383	29	AP013385	Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G15, isolate: uvMED-CGR-C16-MedDCM-OCT-S39-C44	12473-12501	6	0.793
NZ_CP017688_3	3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1875355-1875383	29	AP013397	Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G15, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S25-C46	4249-4277	6	0.793
NZ_CP017688_3	3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1875581-1875610	30	HQ634190	Cyanophage Syn2 genomic sequence	81578-81607	6	0.8
NZ_CP017688_3	3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1875581-1875610	30	NC_015286	Synechococcus phage Syn19, complete genome	147467-147496	6	0.8
NZ_CP017688_3	3.40|1876263|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1876263-1876292	30	KY296500	Xenohaliotis phage pCXc-HC2016, complete genome	23737-23766	6	0.8
NZ_CP017688_3	3.40|1876263|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1876263-1876292	30	KY296501	Xenohaliotis phage pCXc-HR2015, complete genome	23735-23764	6	0.8
NZ_CP017688_3	3.43|1876491|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1876491-1876520	30	NZ_KP763470	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium strain L946 plasmid pSTM_Phi, complete sequence	38178-38207	6	0.8
NZ_CP017688_3	3.4|1873538|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873538-1873567	30	JN698994	Mycobacterium phage DS6A, complete genome	58059-58088	7	0.767
NZ_CP017688_3	3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873614-1873643	30	MK301443	Lactococcus phage CW09, complete genome	21485-21514	7	0.767
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NZ_CP017688_3	3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873614-1873643	30	NZ_CP035275	Leuconostoc mesenteroides strain SRCM103453 plasmid unnamed4, complete sequence	32142-32171	7	0.767
NZ_CP017688_3	3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873614-1873643	30	MT774382	CrAssphage cr10_1, complete genome	27517-27546	7	0.767
NZ_CP017688_3	3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873614-1873643	30	NZ_CP012031	Leptospira borgpetersenii serovar Ballum strain 56604 plasmid lbp1, complete sequence	44421-44450	7	0.767
NZ_CP017688_3	3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873614-1873643	30	MN732896	Elizabethkingia phage TCUEAP1, complete genome	15813-15842	7	0.767
NZ_CP017688_3	3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873614-1873643	30	MH617339	Microviridae sp. isolate ctjd540, complete genome	74-103	7	0.767
NZ_CP017688_3	3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873614-1873643	30	MN694204	Marine virus AFVG_250M304, complete genome	47289-47318	7	0.767
NZ_CP017688_3	3.7|1873766|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873766-1873795	30	MK448927	Streptococcus phage Javan394, complete genome	16394-16423	7	0.767
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NZ_CP017688_3	3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874372-1874401	30	NC_031070	Bacillus phage Nemo, complete genome	127498-127527	7	0.767
NZ_CP017688_3	3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874372-1874401	30	MF288920	Bacillus phage Zainny, complete genome	126945-126974	7	0.767
NZ_CP017688_3	3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874372-1874401	30	KU737344	Bacillus phage Nigalana, complete genome	127333-127362	7	0.767
NZ_CP017688_3	3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874372-1874401	30	MT584805	Bacillus phage Tomato, complete genome	129582-129611	7	0.767
NZ_CP017688_3	3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874372-1874401	30	KT207918	Bacillus phage Eyuki, complete genome	126548-126577	7	0.767
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NZ_CP017688_3	3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874372-1874401	30	MG763894	Bacillus phage HonestAbe, complete genome	126574-126603	7	0.767
NZ_CP017688_3	3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874372-1874401	30	KJ489401	Bacillus phage Megatron, complete genome	126160-126189	7	0.767
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NZ_CP017688_3	3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874372-1874401	30	MH638311	Bacillus phage OmnioDeoPrimus, complete genome	126410-126439	7	0.767
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NZ_CP017688_3	3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874372-1874401	30	KX961632	Bacillus phage SBP8a, complete genome	126368-126397	7	0.767
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NZ_CP017688_3	3.18|1874600|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874600-1874629	30	CP031026	Lactobacillus phage ViSo-2018a, partial genome	56961-56990	7	0.767
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NZ_CP017688_3	3.22|1874903|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874903-1874931	29	MK249202	Blackfly microvirus SF02 isolate 143, complete genome	4144-4172	7	0.759
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NZ_CP017688_3	3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1875355-1875383	29	MN709127	Escherichia virus Ec_Makalu_002, complete genome	84030-84058	7	0.759
NZ_CP017688_3	3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1875355-1875383	29	MN894885	Escherichia virus Ec_Makalu_001, complete genome	82909-82937	7	0.759
NZ_CP017688_3	3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1875355-1875383	29	NZ_LR135248	Enterococcus faecium isolate E6988 plasmid 6	25599-25627	7	0.759
NZ_CP017688_3	3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1875355-1875383	29	NZ_LR134111	Enterococcus faecium isolate E6043 plasmid 7	18330-18358	7	0.759
NZ_CP017688_3	3.41|1876339|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1876339-1876368	30	NC_022536	Rhizobium sp. IRBG74 plasmid IRBL74_p, complete sequence	402065-402094	7	0.767
NZ_CP017688_3	3.43|1876491|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1876491-1876520	30	MG269973	TM7 phage DolZOral124_53_65, complete genome	736-765	7	0.767
NZ_CP017688_1	1.1|1504445|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1504445-1504473	29	MH319752	Marine virus AG-345-F15 Ga0172271_14 genomic sequence	1303-1331	8	0.724
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NZ_CP017688_3	3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873614-1873643	30	MN812239	Flavobacterium phage vB_FspS_tant8-1, complete genome	24533-24562	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873614-1873643	30	MF443124	Lactococcus phage 50504, complete genome	21493-21522	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.7|1873766|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873766-1873795	30	MH572470	Microviridae sp. isolate SD_MF_53, complete genome	1544-1573	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.9|1873917|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873917-1873946	30	NZ_CP032528	Bacillus megaterium NCT-2 plasmid pNCT2_1, complete sequence	109987-110016	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.10|1873993|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873993-1874022	30	NZ_CP015807	Borrelia mayonii strain MN14-1539 plasmid lp28-4	20578-20607	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.10|1873993|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873993-1874022	30	NZ_CP015792	Borrelia mayonii strain MN14-1420 plasmid lp28-4, complete sequence	20605-20634	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.10|1873993|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873993-1874022	30	MN693756	Marine virus AFVG_250M718, complete genome	8186-8215	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.10|1873993|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873993-1874022	30	MN694439	Marine virus AFVG_250M296, complete genome	8168-8197	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.10|1873993|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873993-1874022	30	MN693803	Marine virus AFVG_250M716, complete genome	29025-29054	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.10|1873993|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873993-1874022	30	MN694282	Marine virus AFVG_250M297, complete genome	8185-8214	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.10|1873993|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873993-1874022	30	MN694541	Marine virus AFVG_250M717, complete genome	8192-8221	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.10|1873993|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873993-1874022	30	MN693256	Marine virus AFVG_25M339, complete genome	12899-12928	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.11|1874069|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874069-1874098	30	MN856033	Myoviridae sp. isolate 312, complete genome	7750-7779	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874372-1874401	30	MN693569	Marine virus AFVG_25M84, complete genome	7347-7376	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874372-1874401	30	NC_012696	Roseophage EE36P1, complete genome	60038-60067	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.20|1874751|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874751-1874780	30	NZ_CP011405	Lactobacillus salivarius str. Ren plasmid pR2, complete sequence	44081-44110	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.20|1874751|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874751-1874780	30	NC_006530	Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pSF118-44, complete sequence	2384-2413	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.20|1874751|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874751-1874780	30	NC_006530	Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pSF118-44, complete sequence	4866-4895	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.20|1874751|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874751-1874780	30	CP002035	Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN1, complete sequence	2675-2704	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.20|1874751|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874751-1874780	30	CP002035	Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN1, complete sequence	5162-5191	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.20|1874751|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1874751-1874780	30	MN693361	Marine virus AFVG_25M120, complete genome	22007-22036	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.24|1875053|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1875053-1875082	30	MN693537	Marine virus AFVG_25M61, complete genome	35471-35500	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1875355-1875383	29	KC465899	Pelagibacter phage HTVC008M, complete genome	24813-24841	8	0.724
NZ_CP017688_3	3.30|1875505|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1875505-1875534	30	NZ_CP018188	Streptococcus salivarius strain ICDC2 plasmid, complete sequence	153817-153846	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1875581-1875610	30	HQ634189	Cyanophage Syn30 genomic sequence	33508-33537	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1875581-1875610	30	KT337342	Streptococcus phage phiARI0131-2, complete genome	23239-23268	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1875581-1875610	30	KY065458	Streptococcus phage IPP17, complete genome	10851-10880	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1875581-1875610	30	MH920640	Synechoccus phage S-E7, complete genome	156686-156715	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1875581-1875610	30	KY065495	Streptococcus phage IPP58, complete genome	10183-10212	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1875581-1875610	30	KY065462	Streptococcus phage IPP21, complete genome	13111-13140	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1875581-1875610	30	KY065454	Streptococcus phage IPP12, complete genome	11891-11920	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1875581-1875610	30	KY065471	Streptococcus phage IPP30, complete genome	13442-13471	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1875581-1875610	30	KY065461	Streptococcus phage IPP20, complete genome	12932-12961	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1875581-1875610	30	KY065463	Streptococcus phage IPP22, complete genome	11917-11946	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1875581-1875610	30	KY065470	Streptococcus phage IPP29, complete genome	12341-12370	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1875581-1875610	30	KY065453	Streptococcus phage IPP11, complete genome	12485-12514	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1875581-1875610	30	KY065469	Streptococcus phage IPP28, complete genome	11237-11266	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1875581-1875610	30	KY065460	Streptococcus phage IPP19, complete genome	9999-10028	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1875581-1875610	30	KY065499	Streptococcus phage IPP63, complete genome	10760-10789	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1875581-1875610	30	KY065494	Streptococcus phage IPP57, complete genome	10183-10212	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1875581-1875610	30	KY065459	Streptococcus phage IPP18, complete genome	12380-12409	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.35|1875884|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1875884-1875913	30	MN694274	Marine virus AFVG_250M1121, complete genome	23513-23542	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.40|1876263|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1876263-1876292	30	MH319749	Marine virus AG-345-F15 Ga0172271_11 genomic sequence	44806-44835	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.41|1876339|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1876339-1876368	30	CP032840	Aeromonas veronii strain FC951 plasmid unnamed	98901-98930	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.46|1876719|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR	1876719-1876748	30	NZ_CP026699	Citrobacter koseri strain AR_0025 plasmid unitig_3_pilon, complete sequence	27451-27480	8	0.733
NZ_CP017688_3	3.7|1873766|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873766-1873795	30	NZ_CP022523	Pseudoalteromonas sp. NC201 plasmid pNC201, complete sequence	927544-927573	9	0.7
NZ_CP017688_3	3.24|1875053|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1875053-1875082	30	MN693459	Marine virus AFVG_25M26, complete genome	38709-38738	9	0.7
NZ_CP017688_3	3.1|1873310|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder	1873310-1873339	30	NZ_CP031474	Vibrio coralliilyticus strain RE22 plasmid p337, complete sequence	47568-47597	10	0.667

1. spacer 3.27|1875280|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MT234670 (Pseudanabaena phage PA-SR01, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.862

tcaatgggctaagacagactcagttttca	CRISPR spacer
tcaatgcgctaacacagactcagttatta	Protospacer
****** ***** ************ *.*

2. spacer 3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MH937493 (Streptococcus phage CHPC1041, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833

tttccattttgttttgttttttagttcaat	CRISPR spacer
ttttcattttgttttgttttttacctcttt	Protospacer
***.******************* .**  *

3. spacer 3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020733 (Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides FM06 plasmid pLm2, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833

tttccattttgttttgttttttagttcaat	CRISPR spacer
tgttctttttgttttgttttttaattgaat	Protospacer
* *.* *****************.** ***

4. spacer 3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033610 (Weissella hellenica strain 0916-4-2 plasmid pWHSP020, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.833

tttccattttgttttgttttttagttcaat	CRISPR spacer
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* *.* *****************.** ***

5. spacer 3.12|1874145|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to KU878088 (Bacillus phage AR9, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828

gcggaaatagagaattaatgaagtttatt	CRISPR spacer
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. *.*****.******** **********

6. spacer 3.12|1874145|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MF360957 (Bacillus virus PBS1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828

gcggaaatagagaattaatgaagtttatt	CRISPR spacer
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. *.*****.******** **********

7. spacer 3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NC_018276 (Croceibacter phage P2559S, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828

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** *.  **********.***********

8. spacer 3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050185 (Bacillus thuringiensis strain HER1410 plasmid pLUSID2, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.828

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*.***.***************** ** .*

9. spacer 3.9|1873917|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to KY290955 (Aeromonas phage 65.2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

aaacaattatggaaaaatacgtaatgtttg	CRISPR spacer
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***  . ****.************ *****

10. spacer 3.9|1873917|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NC_015251 (Aeromonas phage 65, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

aaacaattatggaaaaatacgtaatgtttg	CRISPR spacer
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***  . ****.************ *****

11. spacer 3.9|1873917|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NC_013164 (Anaerococcus prevotii DSM 20548 plasmid pAPRE01, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

-aaacaattatggaaaaatacgtaatgtttg	CRISPR spacer
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  **.**  **************** ****.

12. spacer 3.9|1873917|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MN693449 (Marine virus AFVG_25M25, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

aaacaattatggaaaaatacgtaatgtttg	CRISPR spacer
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** .* *** ************** **** 

13. spacer 3.12|1874145|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NC_020292 (Clostridium saccharoperbutylacetonicum N1-4(HMT) plasmid Csp_135p, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793

gcggaaatagagaattaatgaagtttatt	CRISPR spacer
ggagccataaagaataaatgaagtttatt	Protospacer
* .*  ***.***** *************

14. spacer 3.20|1874751|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021876 (Enterococcus wangshanyuanii strain MN05 plasmid unnamed3) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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******* ********.*********   .

15. spacer 3.23|1874978|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NC_010821 (Pseudomonas phage 201phi2-1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793

taccaa-ataatcggtattgcgattaataa	CRISPR spacer
-acgggcataatcggtactgcgattactaa	Protospacer
 ** .. **********.******** ***

16. spacer 3.24|1875053|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NC_012226 (Brachyspira hyodysenteriae WA1 plasmid pBHWA1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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*************.* ******** * * .

17. spacer 3.24|1875053|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016085 (Brachyspira hyodysenteriae ATCC 27164 strain B-78 plasmid pBhyoB78, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

atttgaaactaaagaaaaaagagcatacct	CRISPR spacer
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*************.* ******** * * .

18. spacer 3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021438 (Bacillus thuringiensis strain C15 plasmid pBMB172, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793

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.***************. ******** . 

19. spacer 3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP019369 (Silvanigrellales bacterium RF1110005 plasmid 79K, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793

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****. ******************..  *

20. spacer 3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028870 (Borreliella garinii strain 20047 plasmid lp28-3, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793

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..* * ********.***** ********

21. spacer 3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028870 (Borreliella garinii strain 20047 plasmid lp28-3, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793

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..* * ********.***** ********

22. spacer 3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021678 (Bacillus licheniformis strain SRCM100027 plasmid pBL027-1 sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793

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 .**************.******   ***

23. spacer 3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to AP013385 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G15, isolate: uvMED-CGR-C16-MedDCM-OCT-S39-C44) position: , mismatch: 6, identity: 0.793

agaagcgaaaaaagaaaagttaaaagcaa	CRISPR spacer
ctaaaagaaaaaagaaaagataaatgcaa	Protospacer
  **. ************* **** ****

24. spacer 3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to AP013397 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G15, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S25-C46) position: , mismatch: 6, identity: 0.793

agaagcgaaaaaagaaaagttaaaagcaa	CRISPR spacer
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  **. ************* **** ****

25. spacer 3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to HQ634190 (Cyanophage Syn2 genomic sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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*  ***** ***************  ***.  

26. spacer 3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_015286 (Synechococcus phage Syn19, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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*  ***** ***************  ***.  

27. spacer 3.40|1876263|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY296500 (Xenohaliotis phage pCXc-HC2016, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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**** ************ *****  ..***  

28. spacer 3.40|1876263|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY296501 (Xenohaliotis phage pCXc-HR2015, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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**** ************ *****  ..***  

29. spacer 3.43|1876491|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_KP763470 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium strain L946 plasmid pSTM_Phi, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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 ************** .********  * *

30. spacer 3.4|1873538|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to JN698994 (Mycobacterium phage DS6A, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 .***.*** ****************..*.

31. spacer 3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MK301443 (Lactococcus phage CW09, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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* ... **************** ****** 

32. spacer 3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MK301442 (Lactococcus phage 20R03M, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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* ... **************** ****** 

33. spacer 3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035275 (Leuconostoc mesenteroides strain SRCM103453 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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  *.. *****************.** ***

34. spacer 3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035275 (Leuconostoc mesenteroides strain SRCM103453 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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  *.. *****************.** ***

35. spacer 3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MT774382 (CrAssphage cr10_1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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********** ***********..* . * 

36. spacer 3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012031 (Leptospira borgpetersenii serovar Ballum strain 56604 plasmid lbp1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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***.*.***************** *..  *

37. spacer 3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MN732896 (Elizabethkingia phage TCUEAP1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 * *  ***** ***************.* 

38. spacer 3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MH617339 (Microviridae sp. isolate ctjd540, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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*** ******* ***********  *. .*

39. spacer 3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MN694204 (Marine virus AFVG_250M304, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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*** .******************. *. .*

40. spacer 3.7|1873766|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MK448927 (Streptococcus phage Javan394, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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*** ***********.*******   . **

41. spacer 3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to KX961629 (Bacillus phage BJ4, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 ******************.**    **.*    

42. spacer 3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NC_031006 (Bacillus phage DIGNKC, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 ******************.**    **.*    

43. spacer 3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NC_031070 (Bacillus phage Nemo, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 ******************.**    **.*    

44. spacer 3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MF288920 (Bacillus phage Zainny, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 ******************.**    **.*    

45. spacer 3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to KU737344 (Bacillus phage Nigalana, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 ******************.**    **.*    

46. spacer 3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MT584805 (Bacillus phage Tomato, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 ******************.**    **.*    

47. spacer 3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to KT207918 (Bacillus phage Eyuki, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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48. spacer 3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to KX349902 (Bacillus phage Kida, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 ******************.**    **.*    

49. spacer 3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to KX156152 (Bacillus phage Smudge, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 ******************.**    **.*    

50. spacer 3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MG763894 (Bacillus phage HonestAbe, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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51. spacer 3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to KJ489401 (Bacillus phage Megatron, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 ******************.**    **.*    

52. spacer 3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MF288917 (Bacillus phage PPIsBest, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 ******************.**    **.*    

53. spacer 3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MH638311 (Bacillus phage OmnioDeoPrimus, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 ******************.**    **.*    

54. spacer 3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NC_031054 (Bacillus phage DirtyBetty, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 ******************.**    **.*    

55. spacer 3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MF288918 (Bacillus phage Bubs, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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56. spacer 3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to KX961632 (Bacillus phage SBP8a, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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57. spacer 3.18|1874600|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to KM514685 (Lactobacillus phage Ldl1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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58. spacer 3.18|1874600|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to CP031026 (Lactobacillus phage ViSo-2018a, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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************* **** ****   **..   

59. spacer 3.20|1874751|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to JN654439 (Bacillus phage BPS13, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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*  *   ****** * **************

60. spacer 3.20|1874751|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NC_031034 (Bacillus phage SalinJah, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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*  *   ****** * **************

61. spacer 3.22|1874903|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MK249202 (Blackfly microvirus SF02 isolate 143, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759

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************* *** *****.  .* 

62. spacer 3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to LT603682 (Enterococcus faecium isolate Ef_DMG1500501 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 7, identity: 0.759

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*  * *************.*******   

63. spacer 3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MH560358 (Escherichia virus KFS-EC, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759

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64. spacer 3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MN709127 (Escherichia virus Ec_Makalu_002, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759

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65. spacer 3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MN894885 (Escherichia virus Ec_Makalu_001, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759

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66. spacer 3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135248 (Enterococcus faecium isolate E6988 plasmid 6) position: , mismatch: 7, identity: 0.759

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67. spacer 3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134111 (Enterococcus faecium isolate E6043 plasmid 7) position: , mismatch: 7, identity: 0.759

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*  * *************.*******   

68. spacer 3.41|1876339|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NC_022536 (Rhizobium sp. IRBG74 plasmid IRBL74_p, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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 ************** *******. * . *

69. spacer 3.43|1876491|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MG269973 (TM7 phage DolZOral124_53_65, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767

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  ********.*******.****** .**.

70. spacer 1.1|1504445|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MH319752 (Marine virus AG-345-F15 Ga0172271_14 genomic sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724

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 . *********.********.****   

71. spacer 3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009639 (Bacillus cereus 03BB108 plasmid pBFI_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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. . *   ***.******************

72. spacer 3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053963 (Bacillus cereus strain FDAARGOS_802 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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. . *   ***.******************

73. spacer 3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MN812239 (Flavobacterium phage vB_FspS_tant8-1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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******* ************* *.* . ..

74. spacer 3.5|1873614|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MF443124 (Lactococcus phage 50504, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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* ... *********.****** ****** 

75. spacer 3.7|1873766|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MH572470 (Microviridae sp. isolate SD_MF_53, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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*.***** ****** **********... .

76. spacer 3.9|1873917|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032528 (Bacillus megaterium NCT-2 plasmid pNCT2_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 *..   *************** ****** 

77. spacer 3.10|1873993|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015807 (Borrelia mayonii strain MN14-1539 plasmid lp28-4) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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78. spacer 3.10|1873993|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015792 (Borrelia mayonii strain MN14-1420 plasmid lp28-4, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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.*.  ********* **** ********  

79. spacer 3.10|1873993|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MN693756 (Marine virus AFVG_250M718, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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   * ******.******** *******  

80. spacer 3.10|1873993|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MN694439 (Marine virus AFVG_250M296, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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   * ******.******** *******  

81. spacer 3.10|1873993|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MN693803 (Marine virus AFVG_250M716, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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   * ******.******** *******  

82. spacer 3.10|1873993|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MN694282 (Marine virus AFVG_250M297, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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   * ******.******** *******  

83. spacer 3.10|1873993|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MN694541 (Marine virus AFVG_250M717, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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   * ******.******** *******  

84. spacer 3.10|1873993|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MN693256 (Marine virus AFVG_25M339, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 .*...* ************ ******** .

85. spacer 3.11|1874069|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MN856033 (Myoviridae sp. isolate 312, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 .*..************ ****** ***. 

86. spacer 3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MN693569 (Marine virus AFVG_25M84, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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 .*.***.********** ********  .

87. spacer 3.15|1874372|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NC_012696 (Roseophage EE36P1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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88. spacer 3.20|1874751|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011405 (Lactobacillus salivarius str. Ren plasmid pR2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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. .*   .******* **************

89. spacer 3.20|1874751|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NC_006530 (Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pSF118-44, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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. .*   .******* **************

90. spacer 3.20|1874751|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NC_006530 (Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pSF118-44, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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. .*   .******* **************

91. spacer 3.20|1874751|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to CP002035 (Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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. .*   .******* **************

92. spacer 3.20|1874751|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to CP002035 (Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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. .*   .******* **************

93. spacer 3.20|1874751|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MN693361 (Marine virus AFVG_25M120, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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   ********.**.************.  

94. spacer 3.24|1875053|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MN693537 (Marine virus AFVG_25M61, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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    ********************* *   

95. spacer 3.28|1875355|29|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to KC465899 (Pelagibacter phage HTVC008M, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.724

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 . .* ..*** *****************

96. spacer 3.30|1875505|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018188 (Streptococcus salivarius strain ICDC2 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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*.. ********** **.*********  .

97. spacer 3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to HQ634189 (Cyanophage Syn30 genomic sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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*  ***** *************** .  * 

98. spacer 3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KT337342 (Streptococcus phage phiARI0131-2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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*************** ***** .  **...

99. spacer 3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY065458 (Streptococcus phage IPP17, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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*************** ***** .  **. .

100. spacer 3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MH920640 (Synechoccus phage S-E7, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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*  ***** *************** .  * 

101. spacer 3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY065495 (Streptococcus phage IPP58, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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*************** ***** .  **. .

102. spacer 3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY065462 (Streptococcus phage IPP21, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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*************** ***** .  **. .

103. spacer 3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY065454 (Streptococcus phage IPP12, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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*************** ***** .  **. .

104. spacer 3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY065471 (Streptococcus phage IPP30, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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*************** ***** .  **. .

105. spacer 3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY065461 (Streptococcus phage IPP20, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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*************** ***** .  **...

106. spacer 3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY065463 (Streptococcus phage IPP22, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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*************** ***** .  **...

107. spacer 3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY065470 (Streptococcus phage IPP29, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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*************** ***** .  **. .

108. spacer 3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY065453 (Streptococcus phage IPP11, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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*************** ***** .  **. .

109. spacer 3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY065469 (Streptococcus phage IPP28, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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*************** ***** .  **...

110. spacer 3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY065460 (Streptococcus phage IPP19, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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*************** ***** .  **. .

111. spacer 3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY065499 (Streptococcus phage IPP63, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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*************** ***** .  **. .

112. spacer 3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY065494 (Streptococcus phage IPP57, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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*************** ***** .  **. .

113. spacer 3.31|1875581|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to KY065459 (Streptococcus phage IPP18, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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ttttttcaatttccacctccaagtttttca	Protospacer
*************** ***** .  **. .

114. spacer 3.35|1875884|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MN694274 (Marine virus AFVG_250M1121, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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**********  ************    ..

115. spacer 3.40|1876263|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to MH319749 (Marine virus AG-345-F15 Ga0172271_11 genomic sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

acaaatcaattctcaatttctcaggtaagc	CRISPR spacer
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 ************** *******  *  . 

116. spacer 3.41|1876339|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to CP032840 (Aeromonas veronii strain FC951 plasmid unnamed) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

aacttgcgaaaaaaggctctgctgatgaag	CRISPR spacer
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 *  ..******* ***** *********.

117. spacer 3.46|1876719|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder,PILER-CR matches to NZ_CP026699 (Citrobacter koseri strain AR_0025 plasmid unitig_3_pilon, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

tgaatcaagttttcacattacccacaggct	CRISPR spacer
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...*.** **************.*****..

118. spacer 3.7|1873766|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022523 (Pseudoalteromonas sp. NC201 plasmid pNC201, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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.****************** **. .*  ..

119. spacer 3.24|1875053|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to MN693459 (Marine virus AFVG_25M26, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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    ***** *************** *   

120. spacer 3.1|1873310|30|NZ_CP017688|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP031474 (Vibrio coralliilyticus strain RE22 plasmid p337, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.667

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  *** *****************..   . 

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	41415 : 85982	43	Brevibacillus_phage(25.0%)	tRNA,transposase,integrase	attL 30571:30586|attR 73556:73571
DBSCAN-SWA_2	507319 : 560878	45	Bacillus_phage(50.0%)	integrase,transposase,tRNA	attL 513928:513962|attR 561299:561333
DBSCAN-SWA_3	915401 : 923329	8	Ralstonia_phage(16.67%)	tRNA	NA
DBSCAN-SWA_4	1216385 : 1228640	12	Escherichia_phage(37.5%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_5	1487422 : 1513736	18	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus(33.33%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_6	1591196 : 1646881	40	Bacillus_phage(42.86%)	transposase,integrase	attL 1622533:1622592|attR 1653645:1654634
DBSCAN-SWA_7	2143184 : 2212907	57	Liberibacter_phage(14.29%)	integrase,transposase,tRNA	attL 2145001:2145016|attR 2199407:2199422
DBSCAN-SWA_8	2247103 : 2280122	32	Bacillus_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_9	2285690 : 2322622	37	Staphylococcus_prophage(50.0%)	transposase,integrase	attL 2278865:2278924|attR 2308810:2310127
DBSCAN-SWA_10	2706186 : 2768831	48	Staphylococcus_prophage(75.0%)	transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP017688|41415:85982|DBSCAN-SWA
ACTATTTATTTCTGGGATGTGCTTCTTTATACACCTTTTGGAGCTCGGACAAGCTACTGTGGGTATAAATTTGTGTAGAAGCCAAACTAGAATGACCTAATAACTCTTTGACAGAATTCAAATCTGCACCATGATTTAGCAAATGAGTCGCAAAGGTATGCCGTAAGACATGCGGACTTGTTTTTACTTTTTCAGACACTCCACTAAAGTAAGAATTAATTAAACGATACACAAAAGAAATACTCAATTTAGATCCTTTTTTGGACAAAAAGAAACATTCTGTATCTTCTATACTTTCTAATTGCGATCTATACGTATTATACAGCACCAACTGATCTTGCACTATAGGCAATATAGGTATAATGCGCTCCTTATTTCGTTTACCTAAAACCTTAATGGTTCGAGCAGACCAATTAACCCCATCCAAACGCAAACCAAGCAACTCTGCCCTACGCATGCCAGTGGTGTAAAACAAATCTACAATCAATTTATTACGAACCGTTTCAAAAGTAACCTCCTCTTGATCCGCTTTCAAAACATGAGTCATTTCTTTTTCCGAAAAAGGAATTTGCAACGTTTTTTTGACTCGCAACGACCTATGCTTAAGTAATGGAGAATCTGTTATTTGCTTGCTTTTTAGCAAAAACCTATAAAAAGCCCGCAAGGATGCAATTTTTCTATTAACGGTAAGATTAGACAAGCCCCCATCTACCAAAACCACAATCCAAGACCTAATCTGGCTATACACCACCCCGAGCAAATCCTGCTGATCAAATGCCAATACTAAAAAGCGCTGGAATTCTTGCACATCTCTACCGTAAGCCTTCACGGTATGCGATGCGTAATTTTTTTCTTTTTCTAAATACTCTTGAAAAGCGTGAAGGATTGTCATATAAAATAAAAAAACCGTTAGCATCAAAGTTATAAAAACTTTAATGACTAACGGTACTTATTGAATAACAAAAACTACTTAGTTCTCTAAGTTGTCTTTCATGTTTTGAATATAAGCTGCTTTCTGCACTTTAATTCTATTTTTTACAGAAGGTTTAATAAAAGCAGTACGTGCTCTTAACTGACGAACAGTTCCTGTTTTATCAAATTTTCTTTTATAGCGCTTTAATGCTCTATCGATATTTTCTCCGTCTTTAATTGGTATAATTAACATAATTTTGACACCCCCTTTCGTTAAGTGTGCAAAAGTAGTCATTATTTTGACTTTACAAGCATAAATTAGTGCTTTTTTTGGGTGTGCCGGCAAAAAGGAGCTCTTGATTCCAGAATAACCTCTTGGTTTGCCGTCAGGCTATTCGTTACAATCTTTTATTCCGCAAGGCTTCATAAAAGGATTTTCACTGCTATCCTTCACACAGAAATCCGGCAAATAGCCATCCAAAATATTTTCATTTTAACCCCGGAACCCCTACGCCTTTAATACATTTCTGGCTATTACTACTTTTTGTATCTCAGTAGTTCCCTCGCCTATAGTACATAATTTTGCATCTCTGTAAAATTTTTCTACCGGATAGTCTTTAGTATAACCATATCCACCATGTATTTGTACGGCTTCGTTAGCAACGCGCACACATACCTCCGAGGCATACATTTTTGCCATAGCTCCTAGAGTGGTAACGGGGCGGTGTTCTTGTTTTAAAAAAGCTGCTTTATGCAATAGCAACTCTGAGGCCTCTATCTCTGTAGCCATATCGGCTAATTTAAAAGAGATCCCTTGAAATTCAGAAATTGGCTTACCAAATTGGTGTCTTTCTTTAGAATATTTTAAAGCTGCTTCATAAGCTCCTTTAGCAATACCCAAAGACAAAGCACCTATAGATATCCTGCCTCCATCTAGTATCTTCATTGCCTGTATAAACCCTTGCCCAACCTCTCCTAGTCTATTGGCATCTGGTATTCTGCAATTATCAAAAATCAATTCTGCGGTTTCACTAGCGCGCATTCCTAATTTGTTTTCTTTCTTGCCTGAGCTAAATCCAGGCATGCCTTTTTCAAACACAAAGGCTGTCATCCCTTTAGAATCTCCTTTTTCGCCCGTACGTACAATTACCACTGCAATATCTCCCGAAATAGCATGCGTAATAAAGTTTTTAGCTCCATTTACGATCCAGTGATCCCCATCTCTTTTTGCCGTAGTATGCATTCCACCTGCATCCGAACCCGTATTGTGCTCCGTTAATCCCCAAGCACCAATATGCTCTGCAGTAGCTAGTTTAGGAACCCAACGTTTCTTTTGTTCTTCGTTTCCAAAAGACAAAATATGGTTAGTACATAACGAATTGTGAGCTGCTACAGACAACCCTATAGAAGGATCCACTTTTGAAATTTCTTCCACAATGGTAATATATTCGTGGTATCCCAAACCAGAACCTCCCAGCTCCTCAGGAACCAAAATGCCCATAAAGCCCATTTCACCTAACTTTTTGAACAAAGGCACCGGAAAAACCTGAGCCTCATCCCATTCCATTATATTGGGTCTTATGTTTATTTCGGCAAAATCACGTATGGACTGCGCAATCATCAATTGTGTTTCGTTTGGGTCAAAATTCATAGTATGGTTTATTGGTTTTAAAAGCTCAAATATAAATCAATTATACCAGTTTTTTCAGTTGGAAAATCCTTAATTTTTGTTAAATCCTGTATGTTTTTAAAATCGCCGTTACTACTGCGATAGATAATAATTTTTCTAGCCAAAGCATATTTAAAATATGGGAACTGTGCTATTTCTTTCAAAGAGGCTGTATTTATGTTTAATTTTGCAATAGATGGGAGCTCCATTACTTTAAAATAGCGGTTAACTCCTTCTATAGCCTGTGGCGAAAGACCCCAAATTTCTTCCATTTGTTCCATAGCCACAAAACAACCCAATTGTTTTTTGCGTTTTAAAATTCTATCCGCAAAAACCGCCCCTACTCCATAAACCTTAATTAAGTCTTCTGGAGTTGCTTTATTGATATCTGTTTTTACAACATCTGTTTTTGTAAAAGATTTTTTAGAATATTGCCGATGCTGGTTAGTGTTTTGAGCCCGTGTTACCCAATCCGGAAATTTAAAATATACGGCCATTTCTTGCAATAAAGAATCCGACACTTGAGTTACAGCCTGAAATTCTTTGGCGCTATTTACAAAGTTATTTTTCTTTCTAAAAGCATGCAATCTATCGATCTCCGGAACAGACATACCCAGTCGATAGCCTTTGTAATCCGTAATAAAATTAGGATTAAAAGGCGCTATTTTTGATTTTACTGGGATTGCTTCTTGTTTTAAAGAGTCTATTTCTGTTTGCAAAGAAAGCCATTTTTGCCCCTGAGGATCCTCTGGACTTGTAGCGGTAACGTTTACACAAAAATAAAGCAACTGCAATCCAATAATTAAACCCAACAATAGCAAAACAGCTCGGGTTTGCTCTTTTGAATAATTAAAATAACTACGGATTTTTGAGAACAACATATTTTTAATACCAAATTTATATTTTGCAACTATCTAGCAACAATGCACTTAATAATGAATTACTGAGACACTTTATAAATGTACCGTTTTGTAGGCAAACCAACAATCCAAAAATTAAAAAATAACAACATGGCACCTAATTACTTAATAAACAAACAAATCTTCAATTTGTTTAGGAAGCTAGTTCGTTATTCGGAGAGTTTACTACCTATTTATAACAATTTTATTTTAAGTTATATTGCATTATTGTTTTTATATTTTATAAAAAATAATACATTTGAGCACTAATAATAATAAACCTAAAAACATATGTCAATTTGGAAAACAAAACCGCTTTCGGTTTTACTAAATGAAGCTTCTGAAGACGAAAAAGGTCTAAAAAGAACATTGTCCTCTAGATCTCTTGTTGCTCTTGGAGTTGGTGCCATAATTGGAGCCGGATTATTCTCTTTAACCGGAATAGCAGCTGCAGAACATGCTGGACCAGCAGTAACTTTATCTTTTATTCTTGCAGCCATTGGATGCGCCTTTGCTGGGCTTTGTTATGCTGAATTTGCTTCTATGATTCCTGTTGCGGGTAGTGCCTACACCTACTCTTATGCCACCATGGGAGAATTTATGGCATGGATTATTGGCTGGGATTTGGTGCTTGAATATGCTTTGGGTGCAGCCACGGTTGGCGTTAGTTGGTCCCGGTATTTATTAGAGCTCCTAAACAAGTATGGGGTGCATCTAAACCCAAAATTAATTTGCTCCCCCTGGGAAACCCTCACTTTGGGTGATGGAACCATTATAGAGGGTGGCTACATCAATCTGCCGGCAATATTAATTGTATCAGCACTTTCTTTATTGTTAATACGAGGAACGCAAGAATCCGCCTCTATAAATAACGCATTAGTAGTACTTAAGGTTATTGTAGTAGTACTATTTATTATATTAGGATGGAGCTATATAGACCCTGCTAATTATATTCCGTATGTACCCGAAAATACTGGTATTAAAGGCCAATTTGGTTGGTCCGGAATAGCTGCTGGTGCCGGAACGGTCTTTTTTGCATTTATTGGTTTTGATGCGGTATCTACAGCGGCTCAAGAGGCCAAAAACCCGCAAAAAGGAATGCCAATCGGTATTTTAGGCTCCTTGGTTATCTGTACTATTTTGTACGTACTCTTTGCTCATGTAATGACTGGACTAGTTCCTTATTATAAATTTGTTGGAGATGCTAAACCTGCAGCAACAGCTTTTGCAGTTACGGGATATAGTTTTTTACAAACGGGTTTAATTGTAGCTATATTGGCTGGATACACCTCTGTAATGTTGGTTATGTTAATGGGACAAAGCCGTGTATTTTATACCATGAGTAAAGATGGACTTTTGCCTCCGTTATTTGGACAAATACACTCTAAATTTCGTACACCTTATAAAACCAATATTTTCTTTATGGTCTTTGTGAGTCTCTTTGCTGGATTTGTACCTGTTAGTGATCTAGGACATATGGTTAGTATTGGTACTCTACTTGCCTTTGTGCTGGTATGCGT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Homologous phage analysis in the prophage region

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30571:30586	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_066332767.1|48942_50304_-	pyridoxal-phosphate dependent enzyme	A0A1X9I5F1	Streptococcus_phage	1.4e-50	38.6
WP_066332646.1|50485_52435_-	putative porin	NA	NA	NA	NA
WP_066332650.1|52613_53282_+	ribonuclease HII	A0A0N9QYD4	Chrysochromulina_ericina_virus	1.0e-27	39.4
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WP_066332669.1|57308_58595_-	glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase	NA	NA	NA	NA
WP_066332671.1|58619_59516_-	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	S5M9Y4	Brevibacillus_phage	2.6e-18	41.3
WP_066332673.1|59508_60405_-	1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase/D-cysteine desulfhydrase	NA	NA	NA	NA
WP_066332771.1|60488_62261_-	T9SS type A sorting domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_066332678.1|63336_65373_+	urocanate hydratase	NA	NA	NA	NA
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WP_066332683.1|66275_67520_+	threonine ammonia-lyase IlvA	NA	NA	NA	NA
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WP_066332691.1|70479_71100_-	DUF4230 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_066332698.1|71102_72050_-	GSCFA domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_066332701.1|72101_74738_-|tRNA	alanine--tRNA ligase	A0A1V0SK38	Klosneuvirus	1.8e-94	40.7
73556:73571	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_066332710.1|77667_78474_+	TPM domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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>NZ_CP017688|507319:560878|526314_527490_-|WP_066331863.1|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_066334588.1|558749_559115_+|transposase	transposase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_070786668.1|559894_560878_+|transposase	DDE transposase	NA	NA	NA	NA
561299:561333	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP017688|915401:923329|DBSCAN-SWA
ATTATTTTTTAGCTTCCTCAATATATGAGATAGCTTGACCTACAGTAGCGATGTTCTCTGCTTGATCGTCTGGAATTTGAATGTCAAATTCTTTTTCGAATTCCATAATAAGCTCAACAGTGTCTAATGAGTCAGCTCCTAAATCATTAGTGAAGCTTGCTTCTGTTACAACTTCGTTTTCGTCAACTCCTAATTTGTCTACGATAATCGCTTTTACTCTTGATGCAATGTCTGACATAATCTTTAATTTTAAAATTTAATTTGTTGGCAAAAATAAAAAACTTTATTTTAAAACAACCAATAAGTTGATAAATGTGACAACTAAATTAAAAAATTTATTTCAACAAAGGCATCTCAATGTTATTTATTTTGGATTTTTATTCCTTTTTTTGCGTAACTTAAAACACGTCAATCATGAAAAAAATTTTGATTTTTGCTTCTGGATCGGGCACTAACGCTGAAAATATTATAAAACATTTTCAGAATAAGGCACTTGCTAATGTGGTTGGTGTTTTTACAAACAATCCTAATGCTGGAGTCATCGAAAAGGCTCAAAATTTAGGAATTTTGGTACAAATTTTTAATAAAATAGATCTAAATGAAGGTAAAGTACTACAAAAAATAGAGCTTATGAAGCCAGATTTAATCGTTTTAGCGGGTTTTTTGTGGAAATTCCCAGAGCAAATTATTGAGATATTTCCTAATAAAGTGATTAATATTCATCCAGCACTACTACCTAAGTATGGTGGTAAAGGCATGTATGGTATGCATATACACCGCGCGGTTGTAGAGAATAAGGAGCTGGAAACGGGGATAACCATTCATTTGGTGAACGAGCATTACGATCAAGGAGCAATTCTTTTTCAGAAAAACATTGCTTTGAGCAAGCAAGAAACTCCCGAAACGGTGGCGCAGAAAATCCATCAGTTGGAGCAAGAATGCTTTCCGGTAGTTTTAGAAGATTTTTTAAAACAATCTTCCTAAAATACGCTTTCAACCCAATTATAACAGATGAATTACGACGTACACATATATACCGATGGCGCAGCAAAAGGCAACCCCGGAAGAGGAGGCTATGGTGTGGTTATGGAAAGCACCCAAATGGGCAAAACGTACCGCAAAGAATTTTATGAAGGCTTTCGGCTAACCACCAACAACAGAATGGAATTGTTGGCTGTAATTGTAGGGTTAGAAAAACTCAAGAACCCCAACACTACCGTATTGGTTGTTTCGGATTCTAAATATGTGGTAGATTCGGTAGTCAAAAAATGGGTTTTTGGTTGGGAGAAAAAAAAATTTCTGGACCGAAAAAATGCAGATTTATGGAAACGTCTTTTGCTAGTTTATAGAAAACATCACGTAGATTTTCAATGGATCAAAGGGCACAACAACCATCCGCAAAACGAACGCTGTGATGCCCTTGCAGTGATGGCATCCATGCAAAAAGAGCTTTCGGTAGATGCTTTTTATGAGCAACAGGAAGCAAAATGAATCTAAAACTTTGCCAGATTGAAACTTTGCAACTATGAAACATATAAACTATCTTTGTGCCTTAATTCGAAACTGATATAAATGAATAAATTATTGATTGTTGGAACTGTTGCTTTTGATGCAATCGAAACTCCTTTTGGTAAAACAGATACAATTTTAGGCGGAGCAGCTACTTACATTGGTTTATCGGCTTCTTTTTTTAACGTACAGTCTGCTATAGTATCCATAGTTGGAGATGATTTTCCGCAAGAATATTTAGATTTGCTTACAGACAGAAATATAGATATTTCTGGGCTTGAGGTAGTTAAAGGAGGTAAAACTTTTTTCTGGAGAGGTCGTTATCACAATGATCTAAACTCCAGAGACACGCTAGAGACCCAGTTGAATGTCTTGGCAGATTTCAAACCCCAAGTTCCTGAAAACTACAAAAATGCCGATGTGGTTATGCTAGGCAACTTGCATCCATTGGTACAAAGTGCTGTTTTGGATCAAATGGAAACCAAACCAAAATTAGTGGTTTTAGACACCATGAATTTTTGGATGGATTGCGCCCTAACGGATTTGTTAGACGTCATAAAACGAGTAGACGTAATTACCATCAATGATGAAGAGGCGAGACAACTCTCTGGAGAATATTCTTTAGTTAAGGCTGCCGCCAAAATTCAAGCCATGGGACCTAAATATGTAGTAATAAAAAAAGGAGAACATGGCGCTTTATTGTTTCATGACCAGGATATTTTCTTTGCGCCCGCTTTGCCATTAGAAGAAGTCTTTGATCCAACAGGAGCAGGAGACACCTTTGCAGGGGGTTTTGCAGGATTTATCACACAGAGTGAAAACATCTCTTTTGAAAACATGAAAAATGCGATTATTTACGGCTCTAATTTAGCTTCTTTTTGTGTAGAGAAATTTGGAACAGAACGAATGGTAGCCCTAGATAAAGAAGCCGTTTTATCACGCTTGATGCAATTTAAGTCTTTGACACAATTTGATATAGAATTATAACGCCTTATTGCCTCGGAAACGAGGCTTTTTTGATTTCTTTTTTGTAAGTAAAGCCTACAGCTGTAGTTTAAAAAAAAGAACCTATTTTAAAATAAACAAACCCCACAAACCCCCACAAAACAATGAGCGACGCTTTAAAACATGAGTGTGGTATAGCTTTAGTTAGACTGCTTAAACCGCTTGAATTTTACAAAGAAAAATACGGTAGTGCTTTTTATGGAATACAAAAAATGTATCTCCTTATGGAAAAGCAACACAATCGCGGACAAGATGGAGCCGGTTTTGCAAGCATAAAATTAGATGTTGCCTCTGGTGAGCGTTACATTAGTAGAGTGCGATCCAACCATTCTCAACCAATACAAGACGTATTTGCACAAATCAATGACAGAATAAATTCAGAAATGGCAGCGCACCCAGAGTATGCTGAGGATGTGCAGTTGCAAAAAACAAAGATTCCCTATATAGGAGAGTTGTTTTTAGGACACGTGCGTTATGGCACCTTTGGGAAAAACAATATTGAGAGTGTACACCCATTTTTGCGTCAAAATAACTGGATGCACCGTAATTTAATTTTGGCAGGAAACTTTAACATGACCAACGTTAAAGAACTTTTTGATAGCCTAGTAGAATTGGGGCAACATCCCAAAGAAATGGCCGATACAGTAACCGTAATGGAAAAGATAGGTCATTTTTTGGATGACGAAGTGACGGATTTGTATCAAGAATGCAAAAATAATGGCTTAACCAAAAGAGAGGCCTCGCCTATTATTGCCGAAAAATTAGATGTAGCTAAAATTTTGTCCAGAGCCTCCAAAAACTTAGATGGTGGTTATGCCATGGCAGGATTATTAGGCCACGGAGATGCCTTTGTATTTAGAGATCCAGCAGGGATACGTCCGGCTTATTTTTATCAAGATGACGAAGTGGTGGTAGTGGCTTCCGAAAGACCTGTGATCCAAACCGTATTTAATGTACCTTTTGAAAAAGTGCACGAGATTGATCCAGGAAGTGCACTGATAATTAAAAAAAACGGAACAGTTTCTATGCAAGAAATTTTGACTCCAACCGTTAAGAAAGCCTGTTCTTTTGAAAGAATATACTTTTCTAGAGGTAGTGATGCCGAAATTTATCAAGAAAGAAAAAACTTAGGTCGATTGATTCTGCCAGCTGTTTTAGATGCCATAGACCAAGATACAGATAACACCGTTTTTTCGTACATTCCAAATACTGCAGAAACCTCCTTTTATGGTTTAGTAGAGGCGGCACAAGATTTTTTAAATCAAAGAAAAAACAACTTTATTTTAAAAAATAGAGATACTCTTACTGCCGAGACGTTGCAAGAATTACTTTCGGTAAAAATACGTACCGAAAAAGTAGCAATAAAAGATGCAAAACTACGCACCTTTATCACCGAAGACAGCAGTAGAGACGATTTAGTAGCGCATGTTTATGATGTAACTTATGGCGTTATCCAACCTACAGATAATTTAGTGATTATTGACGATAGTATTGTAAGAGGGACTACTCTAAAGATGAGTATTATCAAAATGATGGACCGTTTAAACCCAAAACGAATTGTAGTGGTTTCGTCGGCACCGCAAATTAGATTTCCGGATTGTTACGGTATTGATATGGCTAAACTAGAAGGACTTGTTGCCTTTAAAGCTGCTTTAGAATTGTTAAAAGAAAGAAACCTATACCACATTGTGGATGAAGTATATGCTAAATGTAAGGCACAAGAAGGTTTTGTAGACAGCAAAATCATCAACTACGTAACGGCTATCTATGCACCATTTGCACCCCAAGAGGTGTCGGATAAAATTGCCGAAATGTTGAGTTCGCCAGAAATAAAAGCAGAGGTTAAAATTATTTTTCAAACCGTAGAAGATTTGCATATTGCATGCCCTAAAAATTTAGGAGATTGGTATTTCACTGGAGACTATCCTACCCCAGGTGGTAATAGAGTAGTAAACCGTGCTTTTATAAATTTTTACGAAGGCAAAGACGCAAGAGCATATTAATAACTCCCTAAAACAGGGCGTTTATCGGTTTTATAAGTAGTTTGTCTTATAAATTAGGTATCAGAAAGCCTATCCCGTAAATTCGCTGAACCATAAAATTAGTAGGTTAAGTTTATGGTAGATTTGGGGCAAAAGGGGTGGAAGAAATTCCGCCCTTTTTATTTACTTACGGTTTAAGTTCGCTGCAAACAAAAAGTGCCGATTTCAAATTTTGAAATCGGCACTTTTTGTTTATTATACTACAAGAGGAAGAGCCAAAGTTTTTAAATCGGAATCCTCTAAAAAACTATTTTTCAGAAGCAAATCTTCTAGAAACTTCCGTCCAATTAATTACATTAAAGAAAGCTTCAATATAATCGGGTCTTCTGTTTTGGTAGTGCAAGTAGTAAGCATGCTCCCAAACGTCCATTCCAAGAATTGGTGTTCCGCCACATCCTACACCAGGCATTAAAGGATTGTCTTGGTTTGGAGTACCGCATACGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP017688|915401:923329|915401_915638_-|WP_007137004.1|DBSCAN-SWA
MSDIASRVKAIIVDKLGVDENEVVTEASFTNDLGADSLDTVELIMEFEKEFDIQIPDDQAENIATVGQAISYIEEAKK
>NZ_CP017688|915401:923329|921784_923329_+|WP_066333191.1|tRNA|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_066333181.1|916411_916891_+	ribonuclease HI	A0A223LIW7	Erwinia_phage	8.3e-19	39.3
WP_066333183.1|916972_917896_+	sugar kinase	NA	NA	NA	NA
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WP_066333187.1|920203_920812_-	superoxide dismutase	Q56AR7	Bacillus_thuringiensis_phage	8.5e-61	56.0
WP_066333188.1|921008_921692_-	ComF family protein	NA	NA	NA	NA
WP_066333191.1|921784_923329_+|tRNA	glycine--tRNA ligase	A0A1V0SAN4	Catovirus	2.8e-28	23.8

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP017688|1216385:1228640|DBSCAN-SWA
AATGGATAAAATAAATAAACCAATTTTTTTATCAGGATTAAATGGATTAAGGACTATTGCTGCAATAGGAGTTTTACTTTCTCATATTAATTTAAGTTTGCAAAATTTTGGTGTCAAAACAATTTCATTATTTGGTTTTAACGAAAAAGGAATTCAAAAAAGCTGGGTATTAGGAGAACACGGCGTGACAATGTTTTTTGTACTGAGTGGTTTTTTGATCACTTTTTTGTTATTAAAAGAATATGAAAAGACTGGAGCTATAAGAATAAAAGATTTTTATATTAGAAGAGCTTTGCGAATTTGGCCTTTATACTATTTGTATATTTTTTTAGTTTTAATTACAATATTTTCATTTTTTAAATTTGACTTCAATCTACTTTTGTACTTAACTTTTTTTGCAAATATTCCTTTTATAAATAATGCCACTTATCCAGCTATGGGTCATTTATGGTCTATTTCTGTAGAAGAGCAATTTTACTTGTTTTGGCCTTTTTTATTTTTATTTTTAATTAAAAATAAATTTATTAAAAAATTATCTATAGTAATATTTGTATTTGCTTTCTTCAGAATTTTTATTTGGTACATAAAACCTTTTTCTATACCCGCACTTATATCTGTCGTAAATAGGTTTGACTGTATGATGTTTGGCGCTTTAGGAGCTTATTTGTTTTTTAAAGAGAATGTAATTGTTAAATATTTAAACTCTAAAATAGTTCAATTGATTGCATGGGCAATAATGTTCTTGTTAGTTATTAATGTTTTTCAATTTCTGAATTCAATTTCTGAATTCAATTATTGAAATTTTTATTGTTGAGCTAATTACCTTTATTATCATAATAGGTCAAATTAAGGTTGAAAATAGAGTTGTTAATTTAGAAAATAAAGCTATGTCATATTTGGGTAAACTATCATTTGGGATATATGTGTACCATCCATTGATTATTTTAGTATTATCTAGATTTTTAACTATTAATGAAATTTATAGCTCAAACGAATTAATTTATACATTTGGCATTTTTATATTGACTATTTTATTTACACTATTAGTATCACATTTAAGTTATTATAAATTTGAAAAGAATTTTTTAAAACTTAAACATAAGTTTTCGGTTATTAAATCAACAAATGATATATCTGATGTACATTAAATTCTTTAAAAGAATAATCGATCTCTGTGCTGCTTTAATAGGATTGATAGTCTTAAGCCCAGTTTTAGGGATAGTAACTATAGGACTATATTTTGCAAACCAAGGAAAACCATTCTTTTTTCAATTAAGACCTGGATTAAACGGAGTGATCTTTAAAATTATTAAGTTCAAAACCATGAATGACAAAAAAGACCCTGACGGTAATTTATTACCAGATGCAGCACGTCTTACTAAAATTGGTGTTTTTGTTCGCAAAACCTCATTAGACGAAATTCCGCAATTAGTAAATGTGCTAAAAGGAGATATGAGTTTGATAGGTCCAAGGCCGTTATTGCCACAATACGTGCCTTTATATAACGATTTTCAAAAAAAGAGACATGATGTAAAACCCGGAATTACTGGTTGGGCACAAGTCAATGGGCGCAACGCCATATCTTGGGATAAAAAATTTGAATACGATGTATGGTACACCCAACATATAAGTTTAAAATTAGACACAAAAATATTTTTTTTAACCATTAAAAAAGTATTTGTAAGCGAGGGTATAAACATGCAAGGTCAAGTAACCACCGAAGCATTTAAAGGAAATTAAAATGTATTTATTTGGAGCAAGCGGTCATTGTAAAGTAATAATTGATATTATTGAAAATGAAAATAAACAAAAGATAGACGCAATATTAGACGATAATCCAAAAAATAATACATTAGTTAATAGTAATGTAATAAAACCGGACAGTGTTAAATTTAAGGCTACGGATTCTTTATTTATTGCAATTGGGAATAATTATATCAGAAAAAAAATCAGTCAGTTATATAAATTAAAATCTCCTGTTTTAACACATCCCAAAGCAATAGTAGCCTCAAGTGTAAAAATTGGAGAAGGCACAGTTATTATGGCTGGATCTATCATAAACCCGGATGTAATAATAAACAAACATTGTATCATTAATACTGGAGCAATAGTTGAACATGATTCTGTTTTAGAAAGTTTTGTACATATATCTCCAAATGCTTCTATAGCAGGTAATGTTGAAATTAAAGAAGGAACTCATGTTGGAATAGGTTCTTGTGTTATTCAAGGAGTAAAAATCGGTAAGTGGGTAACCATTGGTGCAGGAGCTGTTATAACCAAAAACATTCCAGATTATGCAGTAGTAGTAGGCAATCCAGGTAGAATAATAAAATATAATAAAGAATATGAATAATTCAAAAATATGGCTTTCTTCCCCACACATGGGAGGAAACGAACAAAAATATGTACAAGAAGCTTTTGATACTAATTGGGTAGCACCATTGGGGCCAAATGTGAATGGTTTAGAACAAGATTTAGAATCTTATTTAGGTGCTAACGCCCATGTTGGAGCCTTGAGCTCTGGGACAGCAGCCATACATTTGGGTTTAATTTTATTGGGAGTACAAGCAGGAGATACCGTTATTTGTCAGAGCATGACGTTTTCGGCATCTGCAAATCCTATTTTGTATTTAGGAGCTACGCCAATTTTTATAGACAGCGAGCCCGAAACCTGGAACCTTTGTCCCATAGCTTTAGAACAAGCCATTGTAGCCAGTATTGCAAATGCCCAAAAACCCAAAGCAATTATAGCTGTGCACCTATATGGAGTGCCATATAAGGTAGATGAAATTCATGCCATTGCGGATAAATATCAAATTCCGGTGTTAGAGGATAGTGCCGAGGCATTAGGGAGTAGTTACAAACAACAAAAATGTGGCACCTTTGGGGATATTGGTGTTTTGTCTTTTAATGGCAATAAAATTATAACCACTTCTGGAGGTGGTGCCATAGTTGCCAAAACGAAGGACTTAAAAGAAAAAGCAATTTTTTATGCCACCCAATCTAGAGATGCTGCACCGCATTACCAGCACAGCCACATTGGCTACAACTACAGAATGAGCAATATATGCGCAGGTATCGGTAGAGGTCAAATGGAAGTTATAGACCATCATGTAAATTTGCGCAGACAAATGCACGCATTTTATGTAGATTTATTCCAAAATATTGCTGCGGTCACGGTTTTTACCACACCAGAGAGCAATTCGTTTGCTAATTATTGGTTGAGTGCCATTGTGGTCACTCCAGATGTAGATAAGGGCATCACTGCCGAAGCACTCCGGTTGGCTCTTGAGGCTGCTAATATAGAATCGCGTCCCTTATGGAAGCCCATGCATTTGCAGCCAATTTTTGAGAGTTATCCTTACTACGGAACCACGATCTCCGAGCAGTTGTTTGCAAATGGATTGTGCTTGCCCTCTGGTTCCAACCTTACCGATTTAGAAAGAGAACGAATTAAAAAAGCGGTGTTTGGCTTTTTTGAGCCAAAATAATTATTTAAACAATACGTTAACAATCTTTAGTAATAGTAATAAAATGATACTAGAAAAAACAGAAATACAAGATCTAGTGGTAGTGCAACCTGCCGTTTTTGAAGACGAAAGAGGGTATTTTTTTGAAGCCTATAACAAAGAAAAACTAAGCAATCAAGGAGTTGCAATTACCTTTGTTCAAGACAACCAATCTTTTTCTAAAAAAGGCACCCTTAGAGGATTGCATTACCAAAACCCACCGTATGCACAAACTAAATTAATCCGTGTACTAGATGGAGAAATTATTGATGTAGCCGTAGATTTAAGAAAAGATTCTCCGACCTACGGAAAATCGTTTAGTATTTTATTGTCTTCAGAAAACAAAAAACAATTGTTGGTGCCACAGGGGTTTGCTCACGGATTTTCGGTGCTAAGTGCAACCGCTACAGTGATGTATAAATGTGATAATTATTATAACAAAGAAAGCGAAGGAGGAATTCGTTTTGACGATCCAACCCTAAATATAGACTGGGGGATGGATGCAAAAGATGCGATACTTTCGGACAAAGATTTGATTTTGCCTAGTTTTGAAAACTGTAACAGCCAATTTTAATGAAAAAAATCTTAGTCACAGGCGCAACAGGACAGTTAGGTAGGGAGCTACAGCTTCTATCTGGAGCGTATACACAATACCAATGGGTTTTTGCCGATAGAGCTACAATTACTTTAGATAATTTGCCTCTTTTGGAGCGTCAGTTAGCCACGATCCAGCCAAATATAGTCATAAATTGTGGCGCTTTTACGGCAGTAGACAAAGCAGAATCCCAGCAACAATTGGCAGATACTGTTAACCATCTGGCAGTGGGAGTACTTGCCGCTTGGACCACTACTCATGGAGCGCAAATGCTACATGTTTCTACCGATTATGTTTTTGATGGCAATGCTGCATCTGCTCGTACTGAAGAGGCGCAAACCAATCCGATAAATGTGTATGGAGCCACTAAATTGTTAGGAGAGCAATTGTGCTTGCAAAACAACCCAGAGGCAATAATCCTCAGAACCTCTTGGGTATATTCTAGCTTTGGAAATAATTTTGTCAAAACCATGTCTGCCTTGATGCAAGAAAGAGATAGTCTAAATGTAGTGCAAGACCAAATAGGTTCGCCAACCTATGCAGCCGATTTAGCCCAAGCAATAGTGGATATACTAACGGGTCCTAAATGGGTTGCGGGGATTTATAATTTTTCTAATCAAGGAGAGGTTAGTTGGTATGAATTTGCTTTGGCAATACAACAAATTGGTGGTTTTAGTTGCAAGATAACCGGAATACCATCTTCGGCATATCCCACACCCGCCAAAAGACCTTTTTATTCTCTATTGGATAAAACCAAAATTGCACATACCTTTGGGGTAGCAGTGCCCCATTATAAAGAAAGCCTAAAAAAAGCGATGGCTTTGATTGAAGCAAAAAAATAAAAGCACGTATTTTAAAATAATTTAAAAAAAGCCCCATTCTTTTTTAATAAAGAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

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MNNSKIWLSSPHMGGNEQKYVQEAFDTNWVAPLGPNVNGLEQDLESYLGANAHVGALSSGTAAIHLGLILLGVQAGDTVICQSMTFSASANPILYLGATPIFIDSEPETWNLCPIALEQAIVASIANAQKPKAIIAVHLYGVPYKVDEIHAIADKYQIPVLEDSAEALGSSYKQQKCGTFGDIGVLSFNGNKIITTSGGGAIVAKTKDLKEKAIFYATQSRDAAPHYQHSHIGYNYRMSNICAGIGRGQMEVIDHHVNLRRQMHAFYVDLFQNIAAVTVFTTPESNSFANYWLSAIVVTPDVDKGITAEALRLALEAANIESRPLWKPMHLQPIFESYPYYGTTISEQLFANGLCLPSGSNLTDLERERIKKAVFGFFEPK

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_066333999.1|1217521_1218124_+	sugar transferase	NA	NA	NA	NA
WP_066333994.1|1218125_1218737_+	acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_066333991.1|1218729_1219875_+	pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_066334249.1|1219918_1220467_+	dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase	A0A1D7XFA9	Escherichia_phage	1.4e-38	46.0
WP_066333989.1|1220466_1221330_+	dTDP-4-dehydrorhamnose reductase	I7HXC9	Enterobacteria_phage	3.9e-35	37.4
WP_066333986.1|1221399_1222446_+	dTDP-glucose 4,6-dehydratase	A0A1D7XFE8	Escherichia_phage	6.5e-85	50.3
WP_066333983.1|1222466_1223336_+	glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RfbA	A0A291LA53	Escherichia_phage	3.4e-95	59.0
WP_078055267.1|1223438_1225406_+	polysaccharide biosynthesis protein	L7Y3T9	Megavirus	2.5e-29	32.1
WP_066333980.1|1225538_1226405_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_066333973.1|1226628_1227918_+	ABC transporter ATP-binding protein	W6JKT0	Anomala_cuprea_entomopoxvirus	4.5e-11	23.2
WP_157776668.1|1228004_1228640_+	FkbM family methyltransferase	A0A1V0SAF0	Catovirus	8.7e-08	29.3

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP017688|1487422:1513736|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_070786662.1|1505914_1506277_-|transposase	transposase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_066334588.1|1513370_1513736_-|transposase	transposase family protein	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP017688|1591196:1646881|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP017688|2143184:2212907|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_066330854.1|2148471_2149335_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_066330873.1|2152248_2152839_+	ParA family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_066330879.1|2154322_2157655_+	hypothetical protein	A0A2K5B253	Erysipelothrix_phage	2.7e-44	25.2
WP_066330881.1|2157654_2161311_+	hypothetical protein	A0A2R2ZGH5	Clostridioides_phage	8.9e-12	22.1
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WP_066330908.1|2164676_2165141_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_066330910.1|2165348_2165999_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_066330912.1|2166597_2166795_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_141672796.1|2168186_2168618_+	DUF3987 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP017688|2247103:2280122|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8

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MIDFKKNIHSERVILRPMELNDFEQMKNLTKNSQMWYYFTSDLSNEETLKKWIESAVMDLKEHKSLPFTITNAVNNEIIGTTRIGNLSEVDNRVEIGWTWISEKYQGTGINGHVKNLLFEFLFKETKILRIEFKTDVLNIPAKKGMEKVGLVEEGVLRSHTLMTNNRRRDTVYYSILRNEWKNK

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_070786783.1|2267331_2267709_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_066337192.1|2268619_2268931_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_099092434.1|2278914_2279760_-|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	3.7e-14	25.2
WP_066337192.1|2279810_2280122_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP017688|2285690:2322622|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9

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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

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MKKINILIIILLLSNLCLGQEKWLINNPNSFDYYITTEIKDGEIIGKTRNNALKDIVGGFKFTMAKLATSVKYPEIVYFKGAFEENTFSGNFQMIFSQRHFKGLIKNDTLKITLTNKDRTETKINGIRIKEIKPIRDYKSTFNKIFEITENNIYNQSFLKSKKWRKFKKRMNNISGRINDNLELQIAFSAFAREFPFSHYYLYKSSSTNGIESNNVNFAEIKEINSKTCVLKVKSFSGSRKQMDSLISIIENKKYSNLIIDLRNNPGGNHLSAFPLAEYIIDKPIIAGVFPNKNWYQEFERIPNKKDYSKFIEFSGGTMKEWFVKASQNYGAYFKVNPSENHFKGKVYVLTNNRTGSTCEPFVYGLKNDNYATIIGEHTAGAMLSSNEFNLGNGITLRIPLNDYITYSGERIDKNGIKPNIEVESEKALKYTLDKIMNN
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MKIKVLILNLLFLSLLISCKRADVSFGETQPQNVKEIKAFPNKIIGIYYNSENNAEIQISEYFIFKKIKIEDTLKTSELHNYEVIENNNLINLKTKEKYKIRKINDTLFSGYVYSDTIFEISKKNVLKKFKGYFFLNKLVEETGFWEVEKLYLSNGILRLNGIETENELELLQNITETKKDTLKPFRINPTKKQFKEFIKKNGFTNGEIYLKK
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MKFKIKYILPLFVALLFLSFKNLSNPVFIIGHLKPKNAELKNDIIGLKIFVKADGKILAESYTDQNGDFNLTFTPENEKSFDFFCSGIGIGTILLKSVTNFESENIEMSLDYTAKYKKTILGKVICLKCKKADKVYEILYSDPPIVTRKINKFGDTIYSKIYKNKYREGCIVEPAKYYCERDDVKF

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_066337127.1|2766770_2767739_+	dihydrodipicolinate synthase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_070786672.1|2767847_2768831_-|transposase	DDE transposase	NA	NA	NA	NA