Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017603 | Clostridium formicaceticum strain ATCC 27076 chromosome, complete genome | 5 crisprs | WYL,Cas14u_CAS-V,RT,csa3,cas14k,c2c9_V-U4,PD-DExK,cas3,cas14j,cas6,cas8b1,cas7b,cas5,cas4,cas1,cas2,DinG,DEDDh,cas7,cas8b2 | 0 | 9 | 13 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017603_1 | 219327-219389 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017603_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017603_1
>1.1|219351|15|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder TATCTGTGCATGACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017603_1
The CRISPR arrays of NZ_CP017603_1 >merge|NZ_CP017603|1|219327-219389|CRISPRCasFinder ATCAAAACGTCCCCTTGGCTTATGTATCTGTGCATGACAATCAAAACGTCCCCTTGGCTTTAT >NZ_CP017603|1|1|219327-219389|CRISPRCasFinder ATCAAAACGTCCCCTTGGCTTATG TATCTGTGCATGACA ATCAAAACGTCCCCTTGGCTTTAT
>NZ_CP017603.1|WP_070963504.1|218855_219281_-|transposase MARTARKKTEFTVYGYCLMTNHVHILLKAESEEIGNVVRRITVGYAQYHNIKNGRSGHLFQNRFKSERVNTDDYFLIVLRYIHQNPIKAGVIERIEDYKWSNTLPIMKVRSRRTIIIAFFILYTSLQSIIFKSFKNITLRY >NZ_CP017603.1|WP_070963502.1|218096_218906_+|polysaccharide-deacetylase MRRYLKSSITITLLTIVFTGLLSFEAILPYQTEAIVDAEDFSEKPGSDLAENDLVEDGILTEEEPIVVDEDAKIVYLTFDDGPSPNVTSRILDILNEYDIRATFFVIGNLAERYPDILLRISQEEHLIGNHTYTHNYHHIYSNPQNFIDELKHTDSVLASILGEDYTPKFVRFPGGSFGKKLQPFRQAIEEAGYINIDWNVLSGDAEANRISPQKQLSRLQETLQNKKQAIVLMHDSNTKDTTVEALPSIIDYLISQSYVFKTLEDYGL >NZ_CP017603.1|WP_070963500.1|217190_217898_-|response-regulator-transcription-factor MEKNKKKVLVVEDEASIRKFLAINLNRSGFQVLECESAEEALDLIEEHDPAVAVLDIMLPGMDGFELCQRLREFMPEIIIIMLTAKGQDMDKIMGLELGADDYMVKPFNPLELVARIHANLRKTGIGRKSNNKFIQFQDLRLDLEGQRFYKQNQEIELTPTEFSIIKVLIGKPNKAFSRDEILNKVWGENYFGDMKTVDVHIRRIREKIENNPSEPQWIETVWGLGYRLRGNEKQ >NZ_CP017603.1|WP_070963498.1|214297_215803_-|hypothetical-protein MKYIKLICILVVIIFSSIACTSITNDPSLQVVPPKNIDILIQGTWEVAAVLHQSSANEEEWIGKTIMFSNEYAMIGDYLITDVGYQVKRVIAEEYLLYHYKAFPEGFVFSGEEIEVIMATDQGVFFCEVLKEENAELILKIYNDSFLLKKVSNEVNEELLKQLKEENFWRERVKSFPQDELLRTGVLVGLRQTTEGNESNIQAQSYRTLWIASENKKLHPVLETKDIFFPRRNGFWKMEVKEILEGNKHEDALVAYNILTKGKNQIEEVNQQLSNLGQEEKAIYRTINYISNDYVSIGEKSFRIHEGEKIVEKEGLHILVIDSLPNIKRVNILDLLGAAGIESIENGRMKVLGGKKHNSLLQRIEENENYGLERRLGHWFLKGRVGYFEDNKLIVEDYNINLIPPAELVFYDELAIPWTTVKDKIPTAIDLYTSPNKDIALVVTKNEIIVFGIEEQRLQQEPLGKIPLKKGETVVMAEWATGYYVENWEKALGNYINDSTK >NZ_CP017603.1|WP_070963497.1|213955_214228_+|hypothetical-protein MSEEEYRKAIIANATNKFTGKGRVTFAEFKDASNNVIGHYSQNNGWTMVMSKAEMKQRLPVHPEAHSAYLFDLNQRRERDGRKQLLRSIY >NZ_CP017603.1|WP_070963495.1|210561_213177_-|phosphoenolpyruvate-synthase MSSYMLGFQDIDKTKLMVVGGKGANLGELSKIEEIRVPDGFCISTEAFKRIIGETSSINELLDQLALLKVEDRGKIGELSGEIRRIIEGIAIPEDINEDITRLLSRLGEKNAYAVRSSATAEDLPTASFAGQQDTYLNIIGKKAILKHISKCWASLFTERAVTYRLQKSFDHRKVHLSVIVQKMVSPQAAGILFTADPVTSNRKVLSIDASFGLGEAVVSGLVNADIYKVRNGKVINKKISTKKLAIYALKNGGTEEQEIEPEQQNRQVLTDEQILQLGRIGRKIEEHFGCPQDIEWCLVDDTFYIVQSRPITTLYPIPEANDQENHVYVSVGHQQMMTDPMKPLGMSIFQLTSFGPRFKAGGRLFVDVTHTLASPDNREILLDTMGQHDPLIKDALMTIMERRDFIKSLPNDKKEQSLSKSNKGMSSAGFQEQIEKDPTIVSDLMKRSQTSIEALKQNIQTKSGSDLFDFILEDVQQLKKILFDPQSSGVIKAATDASSWINEKMKKWLGEKNVADTLSQSVPNNITSEMGLELLDVADVIRPYPEVIDYLQHVKDDNFLDELVKFDGGQETQEAILSYLNKYGMRCVGEIDITKTRWSEKPATLAPMLLSNIKNFEPNASNQKFEQGRRVALKKEQELLDRLKQLPDGEQKAKQTKRMIDLIRNFSGFREYPKYGMVNRYFVYKQALLKEAEHLVQANVIHEKEDIHYLTFEELHEAVRTNKLDYQIISKRKDEYKLYEKLTPPRVITSDGEIIAGEYNRENLPTEAIVGLPVSSGVIEGRARVILNMEDADLEDGDILVTSFTDPSWTPLFVSIKGLVTEVGGLMTHGAVIAREYGLPAVVGVDNATKLIKDGEWIRVHGTEGYVEIL >NZ_CP017603.1|WP_081562160.1|209485_209875_-|EcsC-family-protein MQEKIPDKLKLTLENAFSKGFQLVFEKGEVYIEKTYKKDRIKLEYDLNNCAIDKDLSKKYIKRLDKQANYAKMLNTSFTVLEGGVLGFLGIGLPDIPLFIAVIMRTIYEVALSYSMIIKVMKKRNTFSL >NZ_CP017603.1|WP_070963491.1|209237_209489_-|EcsC-family-protein MICGAMSQGEKQKKFNEQINRLGNRMDQQMETEIDLKAQMAETAEVLAEAMLVGKFVQGIPVVGAIGGVVNYTIIKKQGNILV >NZ_CP017603.1|WP_070963489.1|208133_209072_-|hypothetical-protein MKSLIKKIFFVVFCFFILILFVGCTITDVTNEALETTDIYNKSLDAVKAANSYDYEIASKEFIQMVLPPNPSEGGILDEESNSIEKSETETLIRGKLIQKPLSLEMIMKMNVLDQQDALESPATDLDSNSIELKIYMLEGKQYSYFSSWGAWAVQDLREIDIDWENLESINKRSNPMYFLNLLENDLAREAVLETDEQHYILSLQNDEDEFIRRIMEDILGYDTAIYEDIDAALDDIQLSEPNYKIWIDKETYLPTKSYFKYKLTTDIGEYTDIRVHESELSYRNFGAIDKIEIPDEAKNAINMEELLKDNI >NZ_CP017603.1|WP_070963488.1|205813_207088_-|MFS-transporter MKIKGKKKILNTNFVLFLLGRMISDIGNSVQMMIMPLYIIDAGGSAATIGLFSFLSLLPALIIYPFAGVIGDRMNRKMIMVVTDLISAGVILALGLFSYWGFMRISLLLIVQAVISLLNGLFEPATRGMLPQLVDKEELTQSNSTVASMRSISILLGPVIGTVLYANFGITIVFLINGISFLLSGASEMMIQYVHVKRQRTEGMKGIVNDLLEGIQFIMKNKIIRNMCYFFLVIYFVLQPIFSVILPLFFKTNLQYSDTQYGYLQTIIILGALLGSVVVGAWFGKEGQITKPFTIGSGILLGTMLMFSILLFPKSLAALGNDTILYLVLLAGVLSLFSFANIFISVPMQTYIQSETPDEYMSRVFSLVSMISRGGMPLGALVYGIVLEWVEMHWTVLMAVLLMIVICNVFISLLIKDYKMQRSY >NZ_CP017603.1|WP_081562163.1|219414_219639_+|LCP-family-protein MILSIDTVHQRLKLSSIMRDTYVEVEDRGKMKINEAYAYKGNLPTGANNFSAKPLFITNTGGNNNNKSFLHISN >NZ_CP017603.1|WP_070963506.1|219656_221033_+|aspartate-ammonia-lyase MDTLNQYRMENDALGNIMIPSSAYYGPQTQRAVENFPISGIRLPRSFIRTQGIIKASAASANMQLGMLSPEIGKAIIQASEEVIEGKWDMHFVVDVYQAGAGTSQNMNANEVIAKRASEIIGHAQQVHPNDDVNMSQSTNDTFPSALNIATVEAIVQNLLPALLGLYQELQKKADQFMPVLKAGRTHLHDGVPIRLGQEFSGFAATIHAVYLQLEKQLDGLYEIGLGGNAIGTRINLQPEYIPKVIQEVCNRTKLPFRKPANIFAFMQNMNEPIRCMLTLKELAIHLIKITSDLRLLSSGPRTGLAEITLPPVQPGSTIMPGKVNPAILEMTHMVCCQIIGYETAIATAGMASQLEINVMMPVIAHTLLHSIDLLANTIQILITKCISGIQADEEVCKKWMQESLSLITGLSPKLGYDMASQIGLKADEENKTIQQVLQEKGLLTAEISNAIDPNGMV >NZ_CP017603.1|WP_070963508.1|221262_221997_+|VCBS-repeat-containing-protein MLYSPYYSLDQRTLMIVSSAWGDVNGDGIPDHVYLAGVTTTDSPFIQKITLVIQDGRTGMFQYIPLTSNAGYNPTLFLGDFTGDGIKDIMISIASGGSGGMMYYYIYSYVGNIPKLLFDYDVFNEAYQYQVVYKDDYKVDVINTTTGIKYVIDITYKGQDYLNEIYDADGKLKAPLEGFVNPLSGLYPIDFDANGVYELLAYQRISGRFAADALGYLQTTLKWNSRNFVLMNQYVAILGSETLL >NZ_CP017603.1|WP_070963510.1|222640_223870_-|MFS-transporter MKNKNFIIVVIGQIISLLGNAILRFCMSLYILDLTGSAAVFSRILAISTIPYILFAPIAGLLADTINRKKIMLYLDFFSSILMGVYSMILISGRDSTMIVGGVMFILSIIYTLYSPAVTACIPQIVDKEKLASANGIIQQVAAIVNLVGPIIAGILYSFVDIKTIVILNAASFLIAAILEVFLKVPDLELKEKVINPILESLKEMKKSFIYLKEKKKIVLGIIASYGLTNVFVVPILTIVSPYFIKVKLNMSSATYGFVEAIFVLGMIIGGLLVTFRPKLFKMKRIYRTMYPMVIATIMMGIATYLTTENKLGILALYSMGGLAIMLSLALSNVISLTYIQKEVKEEMLGKVSAFSTAVATASVAPGQLIYGHLIDIRLNLYSIMALTFILSIGVVRFIEWNVKELNMD >NZ_CP017603.1|WP_070963513.1|223859_224660_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MEAIRLNNLSVAYEDNLIIDQMNLSIPKGKISIIIGANGCGKSTLLKSIARIIKPQSGEIFINGQNIKNQKEKHIATQIAFLPQGPICPSGMIVKELVAYGRFPHQKMIGGLKAYDKDIIDWAIAETGLKDFADREIENLSGGQRQRAWIAMTLAQETDIIMLDEPTTYLDMSYQLEVLQVLEKLNKEKNITIVMVLHELNNACRFASNIIGLKNGKIVCKGIPKESITKENLKEIYGIDVKLQLSDNKNYPICVDYELIRGQNEK >NZ_CP017603.1|WP_070963514.1|224660_225668_-|iron-ABC-transporter-permease MKKSRFQITVLVLLILLAIAILVYLSWGNYKIAAVEIIKTLLGGGTKLQRAAILHLRLPRMLVGICVGIALSTAGALLQTITKNELADPGIIGINAGAAVAAVIFISLKTANYYNVLGPLSVYVLPFMAILGAGIAAFIIYVLSSRNGVRPKRLLLVGLGMNAGLNAFITFFTFRGGVGDYNRVLIWTSGSLWGAGWNYAQIIIPLTAILFSLVLLNYKKLDVLNLSDEHAIALGLNLNHERRKLLIYAVMLAGGATAFAGNVGFIGLISPNIAKKLVGPYHKNFLVISAMISVVIILIADAVSRNLFSPIEIPVGIVISIFGVPYFIYLMMKEK >NZ_CP017603.1|WP_070963516.1|225669_226656_-|iron-ABC-transporter-permease MKQINTIAFIGGSIVILIIGLFLAISLGATHIGITEMWNSIFNYSETLELMLIRDVRIPRVLSVLFTGGILGVTGAMIQGVTRNPIAEPSLLGISQGATLVIAIFYAVGITINTTNVMIASLIGALLSGVIVVGFLLRKTKSSSITKILLAGTAMSTFFISLTTIIGLLSNQSQFIAFWVSGGFRNATWSDFRLVAAAGIIGLILAMLLSKKINLLSLGDDVAISLGENPERIRLLTFLVMIPMGAAAVAVGKNVGFVGLIVPQLIRKTFGEDYTKNIPFSFLLGAVLLVYSDIAARMIYSPYETPIGIFTALIGVPFFIVVARKERG >NZ_CP017603.1|WP_070963518.1|226642_227596_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKRNAMLKGILFACIAMLVLVGCSRPSTTTDTAKGTSTITITDVRGEVEIPENPERIVDLSGNSDILSILGYKVIGTANSDAYDYTRFPSYLEDILQGATILGYSMQDTMDVEAIMSLNPDLIIISTVQEKMYDQLSNIAPTVMIQLEALDWQEDVKALGQVFNKVEVADAWLANYNIKAKEAGEKLKEIYGENTSYLSFLASGGQFYVFDGAGFGSVLYQDMGLNKPEGMPEQSDISLPVVTYEGLASIRSDYIFVLATEEDLKVLKENTIWNSLPAVKEGRVLQLSASPYFIQGYSSIGREVLLDEIVEMLNETN >NZ_CP017603.1|WP_070963519.1|227900_228902_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTVKSSEEFRNAVLKALSFDKIESEHYTFFTNKKKPDLGYLMNYSREGYYHLGIADYTIPNDFSISFDNPELLIRFGIVYEGVTEFKIENNPVSSFTPSSFFVVEKDLKGHQNWKKGQHFHGTEITIYERYFSEIIEPNFPSVMDFSTFIKNYTYTYLPLEIVEIIRQLQSLNHQNLLTSIYLESKILECIAILINEVTRSSENAFTNQINYGNISIGSHRVIKLTSSDIHAIQKAHDILEKSYSNPPNIEALSKMVFLNEQKLKAGFSKHYHMSIGEYINRLKMTVAANLLSTTDLSIEVIAHKVGYNYTANFCKMFKKTYGKTPLKFRKTK >NZ_CP017603.1|WP_070963521.1|229234_230455_-|hypothetical-protein MIKRKVIFGIIATTIISFSLLGCTNQNSKKAVNDTSTSISNSFETNRAGQTQQTVQTPITSNSIDKKAVEEAYYGQWQIKKVLASAPVSTYSNDDIKIIVGKKLILSKESASCFGDTVDTLNITAANPTYKKSVISKNDFEANYPVTFDKLSIKGDTITQIDVVDTTGNGSTFFIKDNNALILYGGGVYFELGKIVSTSPSSTPLDSNSENTKTQMLSNNSVSEAYKAVLQNKTEFFSTDNKKKLYLNDFLTNKEIYDTIFKVTHFTVLDMDGDKVPEVVLELSVGNEPEFYEVLHYMNDIVYGYLIVYRGLEGLKADGTFHYSSGAADNGFGKLKLESDAFKTDILGYSKSSQGNANLIISYFINNKPVTKESFDSFINEQSGKKDAVWYEFSQKNIETELSINL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017603_2 | 663813-663904 | TypeV |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017603_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017603_2
>2.1|663837|44|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder AAACAGGCTCTTTCATGAGCCTTTTTCCTTGAATCTTGGCTCTA |
cas14k |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017603_2
The CRISPR arrays of NZ_CP017603_2 >merge|NZ_CP017603|2|663813-663904|CRISPRCasFinder AAAATTACAATAAAGTTCACCGAAAAACAGGCTCTTTCATGAGCCTTTTTCCTTGAATCTTGGCTCTAAAAATTACAATAAAGTTGACCGAA >NZ_CP017603|2|2|663813-663904|CRISPRCasFinder AAAATTACAATAAAGTTCACCGAA AAACAGGCTCTTTCATGAGCCTTTTTCCTTGAATCTTGGCTCTA AAAATTACAATAAAGTTGACCGAA
>NZ_CP017603.1|WP_070964130.1|662330_663482_-|SAVED-domain-containing-protein MTITVYKTIVAVLFIGLTIFNIYKGGIRLKEGYFEQIAPFAILETGISLITAGVFSIDSSLIAMYAMSGENQQLSILDYITMAQTEFTLIGLGILMCIISCFVHKALSTDRSIRLLNIQAYDDNRLEYLSTKKCKGKIVEGIYIDLIGLWEELRARKTSSAEFKRIIDKMVGVVDKQVTLFKAGTSKYKRAFTGIAPIPLLIYTGRLIPKLGFSEYLEIQKLENENDLIPLDTTGKIQYSQLQVENNLTTSNEDDEVVVAVSTTQQIDNNDLLQFINKGIEVKHIFLENPNHKSIVSVKQINEYAEVISREILNIKKIKPKLKTIHLVCSSKPSLMFRLGQLIDDTQMPVIISYQYTQQDDNRYPWGIYINHYKKQGELHRWI >NZ_CP017603.1|WP_081562198.1|660888_662313_-|hypothetical-protein MSMYNIDKEMRKFYRTKVVLAQSEQKSLIEKKDLNLDRLKGGLKEYNEENDTNYKIVDSMVQGSVAMQTVVQAEENNYDIDVGIVFNKSNLPAPKSSENNTTTVKNIVHDALLKKSSFFKTPPEKRTNCIRIQYANGYHIDFAIYRREKNEQGEYIYQHCGADWNYRNPRSITKWFKERDRVHSFNLKRIVRLLKAYLKQDSSWSVPGGLIQSVLADECIQISDRLDKMLYDTIIEIINRLDIDTEAYNPVDTDDNGNKITLLTTESHKDKMTKMKNYLDKGIKKLSVLFDESCTKEQAFTAWADFFNHNYWTELAENSVQKSLSETFSKFAGIEDDIYDFDETEEFIEDLYPISSTQYSLKIECKVEQKGYRIDSLQNFLRFNKFLNPHKKLHFKIIENTVPYPYKIFWKVLNRGKDAERRNEIRGQIIKGNSGDDVRIENTKFSGNHIVYCYIVKDGECVAKDSIIVPIEAN >NZ_CP017603.1|WP_070964129.1|658980_660627_-|site-specific-DNA-methyltransferase MPSLNWIGRQAVINHYKEMPYHLLDTKKELSYNIEEAEGNIIVHGDNLVALKSLLPYYSKSAKFCYIDVPYNTGNEEWIYNDNVNDPQIRKWLGQVVGKELDDLSRHDKWLCMMYPRLQLLKKFLRDDGFICVQIDDSEGAHLRVMMDEIFHSSNYLATIYVQVRYADKTLKQDMNFHKQIEQILVYRRTPKAKPYMKSEEYSYDKFTYTIKEKAEGREIELGGKRVVIFNPGEYEIINKEEGFKEGLKEIWASGTILDGNSSGRFFRDYLTGRKEGDGLGVLYKVYGIGEDMYDYRYFTGPKRSNATKGKYYQGVPLDKMSDDAESIKSIPNFYDMAADFGNCRHEGGVEFKSGKKPEKLLATLMEYFTREDDVVIDSFSGSGTTAAVAHKMKRKWIAIEMGDHCYTHVQKRLLSVVKGTDSQFNWNGGGGFRFYELSVPLTDRYGQINKSVSYEHLARHIYFTETGHSVSEDDLLEKPLIAEFRNTFYFLLFENDQETVLDNDILAEIKKYNGTKIVYADRNVISSTHLKAHDIMFKQIPYQVEVK >NZ_CP017603.1|WP_070964127.1|656356_658978_-|DEAD/DEAH-box-helicase-family-protein MLPLKTYQERVLEHLENFCKLCITKGAAETAFLEYTGRSYLGIRQLPGLPYVCLRVPTGGGKTLIASHSVSIVRKEYLRIDNCTVLWIVPTNQIKEQTLKALKDRNHPYRLALESKNDGDIHVLDLQEANFTGAADYEQSTCIIVTTLAALRIEDINGRKIYESNGHLLNHFIGMSEMQKNNLEKGENGEILYSLANVLRLRRPIIIMDEAHNARTELSFDSLARFSPSAIVEFTATPQQIHEPDKGLYASNVLHSVSAAELKAEWMIKMPIYLETNNNWQDILNKAIAKRNDLEKIALNEQKQSKEYIRPILLIQAQPRSQQRENLTVEVVRQSLINDFKIPEDQVKIQTGDIKELEDIDLFNDTCDVRYIITVQALREGWDCSFAYVLCSIPDIGSATAAEQLIGRILRLPNAIKKVNDELNNAYAYVVSNQFHQTLATLGSGLIENGFTEFEAKSIIKSMGEEPNLLNLAVVHTKKVNSVPDLNKLFGNLVEKVAYKPETQEIEVKGFINEEEKEQIQKCFINDKDKTVVETIFADIKKKIGITTKNQENAWMKPTENILVPSLSFKVEGQLQIFEDIHFLNAQWDILKYDAKLDGTSLTQIEDKSRLGKIEVDTKGNIEYRFIEELHEQLSYLVTDKEWAEEELIFWLDRNVEHQDISQAKFVVFVHKIIKDLVENQKMELKKIVYYKFNLRDKIKVLINNYRKKARKENYQTALLSESITVDESKTFTFNPEIYPANWAYTGRYKFNKHYFSEVGELKESGEEFDCAVYLDSLPEVKYWFRNLERQPLYSFWLQTSTDKFYPDFVALLEDGRILVVEYKGEPWSQTLDSDEKNVLGKFWSERSDGNCLFIMATKDNLGKIAELVRKRK >NZ_CP017603.1|WP_156778693.1|654328_655267_-|TniQ-family-protein MMVFYPPVYDDEIIYSIFTRYFELSGLIGVKEALITLFGTSTPCIYTMFPKYLKRFMGKAELFNNQDFNKYMMDNTILPLFKPFICKDSFESIQVLLEEYEEKAINAKLGLTMKDSFIKVDSIKICLECIKMDYQKFGETYLRIEHQIKGNNVCWKHNEVLYEHKIRDYKNDTIIKINEIIRKNLIEDYFRQVFIGDTFYEHLDLAISIADIFKTKDIEINLQLTKDKYKDVLFDKKLITPKGYLKQTKLTEMMYDCYSSEFLVIQNAYIDEKNKDNWLHRMMIKSRNVTNPIKHLLFIRMLFGSYNDFLEY >NZ_CP017603.1|WP_070964123.1|653282_654098_-|heteromeric-transposase-endonuclease-subunit-TnsA MARQKSDKYKLIEGRGVGAYNQYKPWLKVHEFGAHSRVHRIKGWKTGRIHQLMSDLELYYFLIIQWEDKVIDIREQFPLLPIEQTILLANEMGIRHPAEKNKIGKEYVMTTDFLITIQDNNNFKNIVRTVKAKKDFDKQRTREKLLIEKQYFQHKKIDWGIVLDIHIDKIKAQNLYSIYNYYDWNQRNLISDYQLLKYINDFKMILNDNNNIVIESTLQFERMNSLKDGEGLSFLKYLILHKKVQVDMNKLFNYSNMKVFDNDIIETKTNV >NZ_CP017603.1|WP_070964122.1|651465_653268_-|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MMFLVNDLFELYVDNNKRCERILWISPENNFCFTIDMLSESLNINTRQLFDLEELIKNGLAKIIEDDFITRLKPEDIINERNKQIRDKAFNAVKEIINVIGEPDIFDEKKRFKVIKETQRKLNISNATLYKYLKNYWKGGQIKDALLPRYDNCGGKDKEKTFSIKTGRKTYEAQITGQNNGVIIDEEIKKVFTISISRYYHNTKEISLRKTYELMIKDFFTEYIGGSKVVNHYQVIPTYKQFWYWFKKNYSSETTIKSRKGEKKFASDYKGLNSNTKIEAFSPGFRYQVDSTIADVFLVSRIDRTSVIGRPVVYLAVDVFSRLITGVHIALEGPSWEGASSLIYNCYENKVDFCNKYGIQITDDDWPARGLPEVIIADRGELVGPLGEKLVVDLGISLENTPSYRGDAKGIVEQNFRILNSNIRDWSPGAVKKEFRERGERDYRLDAKLDIYQFSKIIIHSILHRNKCLIKDYVLEQEMINDRISAIPVELWSWGLKNKTGSLRSVPLDLLRLKLMKSGRATITERGIKFKNVLYSTSIAEGEGWYTNARINGVSYITIVYDKRDLSIIYIVSENKFIPCKVKNTNDVFENKTYEEIVDL >NZ_CP017603.1|WP_081561990.1|651046_651385_-|hypothetical-protein MTNEALNIDWEDILDKFSSHEGSIKAFCEENSISAHQLYYRRKKLQNNNTPVFHAVSFKDKEADEAVNQNIIPPNPVSASTIKIEIGKAKIYIPSNDKVSLSNVFKEIIALC >NZ_CP017603.1|WP_070963578.1|650702_651053_-|IS66-family-insertion-sequence-element-accessory-protein-TnpB MLNIDKVDKVYLACGVTDLRKNIDGLSMIVQTEFKLDPFEKALFVFCNRQMNKLKILHFDDGFWLYYHRLERNKFRWPMSKEEALKVSIEELRWLLKGYEVRTISKFKPVKERNHF >NZ_CP017603.1|WP_081562101.1|649004_650630_-|IS66-family-transposase MKTGIKMTKINLQNQLDEKTKELILKMEEELEAKDKEIENLKNELAYLKNQVLNKNRKIFGSSSEQANTIQVSFFDEAEKDSNLKAAEPTIEEITYKRTKPTSNTGKKDNLANLEKIVIEHKLDEDQQSCRDCSSDLVVIGKKSKEVLKYIPAKLYVEEHLTYSYACRSCEENNDKANIITTKAPKTLLHKSMASNELLSHVINLKYQHALPLNRQESYFKMMGANLSRQTLANWVIGAAHELDPIYQLMKEELLKRNYIQADETVVKVLDDRGKESNKQKYMWLYKSPDKDQPIVIYDYQKTRSGSCPRNFLSGFSGYMQTDGYAGYNKVENVKRLYCLAHIRRKFHEIIVNLDEEALKSSRALIGFNYCAQLYKIEKDLKEQHSGKEDFYERRYKKRLKASKPIIEAFIAYVDREIKDAVPKSALGKALAYTKPLLPSFKVFLEDGSLEIDNNAAERSIRPFVVGRSNWLFSASTKGAESSALIYSIIETARNNNLVVEKYLLYLMNHFSNVDPQDKESLLKLLPFSKDLPEDLKVQAK >NZ_CP017603.1|WP_070964134.1|664258_666085_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP017603_3 | 2541918-2543001 | TypeI-B |
II-B
Consensus repeat of NZ_CP017603_3
|
16 spacers
spacers of NZ_CP017603_3
>3.1|2541948|35|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT GAAGAACAAAACCTTTTCTTTCTAGTTCTTCCCAT >3.2|2542013|35|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT TAATAAAAAATCTCCAATATAGAAAAATCCAATAT >3.3|2542078|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GATGGCACACGCCACTGACGAAATTAAGGATATGTA >3.4|2542144|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGATTTAGCCACCTGTATAAAGTGCTTAAAGGAATA >3.5|2542210|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TATAATCTTCTAGCATTTCTAAGATTTCATCAAAAT >3.6|2542276|37|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATATAGGATTGACTAGCTACAATTACAAGGAAGCAGG >3.7|2542343|38|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AACTAAAAGAAAATTTTATTACTATTCCCACGATCAAA >3.8|2542411|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATCAAGTTGCAGCATAACAGATCCACAGCTGCTG >3.9|2542477|35|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR AGAGGAATTGGGGAAAAAAGTTGGTGTATCTAGGC >3.10|2542542|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCATATTTTTTTCTGTAAAAAAACATTTCTGAATCA >3.11|2542608|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGCAATTTTTTCATTTTAAAACTCCTCCTTTTCATA >3.12|2542674|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGCAATTTTTTCATTTTAAAACTCCTCCTTTTCATA >3.13|2542740|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATACTTTTGGTACAATTTTATACCAAATTACATTAC >3.14|2542806|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAATTTTAATGATTATGTTAATGTTAACTTTAACTT >3.15|2542872|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CAGTTTCTTCACGAAGAAGGCTTTAAGCATCATGCA >3.16|2542938|34|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT ATCCTTGTTTTTCTAGAACTTCTAATGAAATTTG |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7b,cas8b1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017603_3
The CRISPR arrays of NZ_CP017603_3 >merge|NZ_CP017603|3|2541918-2543001|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATGAAGAACAAAACCTTTTCTTTCTAGTTCTTCCCATATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATTAATAAAAAATCTCCAATATAGAAAAATCCAATATATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATGATGGCACACGCCACTGACGAAATTAAGGATATGTAATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATTGATTTAGCCACCTGTATAAAGTGCTTAAAGGAATAATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATTATAATCTTCTAGCATTTCTAAGATTTCATCAAAATATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATATATAGGATTGACTAGCTACAATTACAAGGAAGCAGGATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATAACTAAAAGAAAATTTTATTACTATTCCCACGATCAAAATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATTAATCAAGTTGCAGCATAACAGATCCACAGCTGCTGATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATAGAGGAATTGGGGAAAAAAGTTGGTGTATCTAGGCATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATCCATATTTTTTTCTGTAAAAAAACATTTCTGAATCAATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATTGCAATTTTTTCATTTTAAAACTCCTCCTTTTCATAATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATTGCAATTTTTTCATTTTAAAACTCCTCCTTTTCATAATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATATACTTTTGGTACAATTTTATACCAAATTACATTACATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATCAATTTTAATGATTATGTTAATGTTAACTTTAACTTATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATCAGTTTCTTCACGAAGAAGGCTTTAAGCATCATGCAATTAAACCTCAACATAAGATGTATTTAAATATCCTTGTTTTTCTAGAACTTCTAATGAAATTTGATTGAACCTCAACATAAGATGTATTATTTA >NZ_CP017603|3|3|2541918-2543001|CRISPRCasFinder ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT GAAGAACAAAACCTTTTCTTTCTAGTTCTTCCCAT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TAATAAAAAATCTCCAATATAGAAAAATCCAATAT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT GATGGCACACGCCACTGACGAAATTAAGGATATGTA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TGATTTAGCCACCTGTATAAAGTGCTTAAAGGAATA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TATAATCTTCTAGCATTTCTAAGATTTCATCAAAAT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT ATATAGGATTGACTAGCTACAATTACAAGGAAGCAGG ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT AACTAAAAGAAAATTTTATTACTATTCCCACGATCAAA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TAATCAAGTTGCAGCATAACAGATCCACAGCTGCTG ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT AGAGGAATTGGGGAAAAAAGTTGGTGTATCTAGGC ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT CCATATTTTTTTCTGTAAAAAAACATTTCTGAATCA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TGCAATTTTTTCATTTTAAAACTCCTCCTTTTCATA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TGCAATTTTTTCATTTTAAAACTCCTCCTTTTCATA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT ATACTTTTGGTACAATTTTATACCAAATTACATTAC ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT CAATTTTAATGATTATGTTAATGTTAACTTTAACTT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT CAGTTTCTTCACGAAGAAGGCTTTAAGCATCATGCA ATTAAACCTCAACATAAGATGTATTTAAAT ATCCTTGTTTTTCTAGAACTTCTAATGAAATTTG ATTGAACCTCAACATAAGATGTATTATTTA >NZ_CP017603|3|1|2541918-2543001|CRT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT GAAGAACAAAACCTTTTCTTTCTAGTTCTTCCCAT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TAATAAAAAATCTCCAATATAGAAAAATCCAATAT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT GATGGCACACGCCACTGACGAAATTAAGGATATGTA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TGATTTAGCCACCTGTATAAAGTGCTTAAAGGAATA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TATAATCTTCTAGCATTTCTAAGATTTCATCAAAAT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT ATATAGGATTGACTAGCTACAATTACAAGGAAGCAGG ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT AACTAAAAGAAAATTTTATTACTATTCCCACGATCAAA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TAATCAAGTTGCAGCATAACAGATCCACAGCTGCTG ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT AGAGGAATTGGGGAAAAAAGTTGGTGTATCTAGGC ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT CCATATTTTTTTCTGTAAAAAAACATTTCTGAATCA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TGCAATTTTTTCATTTTAAAACTCCTCCTTTTCATA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TGCAATTTTTTCATTTTAAAACTCCTCCTTTTCATA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT ATACTTTTGGTACAATTTTATACCAAATTACATTAC ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT CAATTTTAATGATTATGTTAATGTTAACTTTAACTT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT CAGTTTCTTCACGAAGAAGGCTTTAAGCATCATGCA ATTAAACCTCAACATAAGATGTATTTAAAT ATCCTTGTTTTTCTAGAACTTCTAATGAAATTTG ATTGAACCTCAACATAAGATGTATTATTTA >NZ_CP017603|3|1|2542048-2542937|PILER-CR ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT GATGGCACACGCCACTGACGAAATTAAGGATATGTA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TGATTTAGCCACCTGTATAAAGTGCTTAAAGGAATA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TATAATCTTCTAGCATTTCTAAGATTTCATCAAAAT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT ATATAGGATTGACTAGCTACAATTACAAGGAAGCAGG ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT AACTAAAAGAAAATTTTATTACTATTCCCACGATCAAA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TAATCAAGTTGCAGCATAACAGATCCACAGCTGCTG ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT AGAGGAATTGGGGAAAAAAGTTGGTGTATCTAGGC ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT CCATATTTTTTTCTGTAAAAAAACATTTCTGAATCA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TGCAATTTTTTCATTTTAAAACTCCTCCTTTTCATA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TGCAATTTTTTCATTTTAAAACTCCTCCTTTTCATA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT ATACTTTTGGTACAATTTTATACCAAATTACATTAC ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT CAATTTTAATGATTATGTTAATGTTAACTTTAACTT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT CAGTTTCTTCACGAAGAAGGCTTTAAGCATCATGCA ATTAAACCTCAACATAAGATGTATTTAAAT
>NZ_CP017603.1|WP_070967972.1|2541422_2541713_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MKKNYNYNYAFLFYDVNVKRVNKVFKVCKKYLSHFQKSVFRGDITPSKLMLLKEELNRVIDESEDFVCIIKLMNNNVYGEEILGNKQNDTGEDLIL >NZ_CP017603.1|WP_070967969.1|2540423_2541422_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGSTRYITSMGELTRKDNSLCFRKDNKNVYIPVENTKEIYCMSEVSINSKLLDFLSQNNVVIHFFNYYEGYSGTFYPKQQYNSGKILIKQVEAYHTKRLIIAKSIVKAIGDNMYEVLYHYYKHNKKEVKGTIDWIRKDMQGNLEKSKNIQQIMQVEGELWQRFYGEFKHILLEDFVMSRRVKRPPDNPINALVSFGNSLLYTKTITAIYNTHLDQRISFLHAPSEGRFSLSLDISETFKPVLVFKTIFDLVNNKKIQVSKHFDKKVNYCLLNEEGRKIFITAFEERLESVFLHQKLKRKVSYKTAIKLDCYKLIKFILEDVEFKPFDIKEKM >NZ_CP017603.1|WP_070967966.1|2539922_2540414_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MRVNGTLVNYYFHCKRQCWLHGNRINLEDNSEDVRIGKAIHEIKKEKNKSTEISIDNIKIDKLTQEYLTEVKKSDADIEATKWQTLFYLKILREKGIERKGKLEFTEKNKSKSIVIVELDDKKLAELEEITKNIQKLLIEEEAPQVINKPKCKKCSYFEYCYI >NZ_CP017603.1|WP_070967963.1|2537328_2539914_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 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MLAEILSLCIATTMLAPAVTAENYAIEMEEDIVIQEEYDLIPAEEILEEMLEVTEEKAEEPVESVEVEVPEEIEIEEKEEIEEAEVEKIDYPVALKEMGYYKEDYADKEINMRNAVLRFQSEHNLMVDGKFGEISYRALEKRLQDADYQYADVITSPPTEQEWIAINKTKRILTFYKGTQVIKKYPIAQGKDPSYTPEGKYTIVNRIKNPRWGGAGIAAPVAGGSPKNPLGYRWMGLSLKGGGSYGIHGNNQPKSIGTDASMGCVRMINSDVEELFELVKLNTPVWIGTHEKLKEWGVHNKSYLN >NZ_CP017603.1|WP_070967949.1|2526695_2531600_-|cytidyltransferase MNTLEAQKVYSELHMILLEKSFLEEHPLKKNTIKKHLESTYFFHHLHEILEEGDYSCTAVFTLCKDMLEALWEKSMPTNPLHYLYQFSLSLSFPDSVEIQLNPELDLGCYLYLKALRVISQYEKLFHKGTFESDFPLNLLTEEEEHPLMNLQEYRSFLHAFYNEYIYEMMKLNYEVVGHNTLAHICGVHYLAVFIAKQLLEKGTPLDLGRVSGAAAGHDIGKFGCRSLESKRVAYLHYYYTDQWFKRHNIPYIGHIALNHSVWDLELENLSIESLLLIYSDFRVKNITTESGSQEMKMISLKDAFETILEKLDNVDESKEKRYRRVYMKLKDFEDALVDMGIHIDPAAEIKNNLQEEKKYYAIMQGKKITNHLKYIAIRHNINLMYKLRDETSLNEIIEIARAEQDAKIIREYLDIFQEYSTYLTQKQKIIAMKFLYENLVHPEEDIRKQCAYIIGAMIAIFDESYRKEIPEGLSIVEPEITSSEILHQYIKLFLYPDHKVIPLHRSWIRYSISTLLTSLFNKSSYHQVEDYRKVLLKYYENIASLEDEIEIVLMEALKYVPLSPDSSALTTAIDYVMQILKSKHKSIRVSALDTLNHLLQYITKESETYRMIEKFLSEVKYASLPAENFLYYKLAKNLSLDDNIIENIYDFYHQDISKISDMFLNNLKTETDWMIKKFHVELLTEYTLKDAIIDKLYIAMHFCNLLKVSAMETVRCQAGEAVVKIFHHLPIEQRNDIAIELLRTLEIEGARFTKYIPNFLGQIIIYLKPMELDEIIEDVIEKIKHADTQINSLLLKTIGVFIANYPKYKEIFKENKEVYNKRLAKLLGILLNGLVHHNLQIKQVSFSVIGKDVFGADSLTLEEKHHIFQLVAKKILTLLTDAEESELLFLTNSAGLNHIYRFISDYRFLYKDIEVKTGAKVAFFPGSFDPFTLGHKEVAKAIRDLGFEVYLSVDEFSWSKRTQPSMIRKNIIHMSIADEMNVYIYPEDFPVNLANPEDLYHLRSNFYPSEVYIVVGSDVILNASAYKHAKVENSVVTFPHIVFERRSEDFQDEKVLDLEKALENIQQPVIKLNLPPQYEDISSTQIRNYIDENRDISNLIDPLSQKYIYRNNLYRREPQYKSLIQTVSIDIDVRHNFNYELINTLASSFHGNYHQAFSSIEKISQEFNAHIVLIRDVKENGKILGYSLFHWVPSDLIYQEFKDSHISQCIRENYTGRIIRIDGIFVRQDSKQNNLYQIILSETMAYCLKNDYGYGIFANKIETPTSPELLEVLKRSGFQELPFSQGSQPVLAVNMTNPCTLSFDIQTMIKEPFRSNENVKAIIASTRKRLQEALVNLYPGHLVLSLDRDLVEEALVKKICRENEVPPVPLYPRSLGPSMCVPFGNILNRAIVPNTVTKTLHTEKMFNPDMKKFTIGPFPYYLDLVKQARMIHSFKRPVILVDDLLNKGYRMKVLDPILKKENIHVKKIIVGMLSGQGKELMEIQNRSVDSPYFIPKLRLWFNEALFYPFIGGDTLWRGVYPKKNLLPSINFILPYTSLTFIKDVSDTSLYNFSLACINNALDILRVLENTYQKINERKLTLSLLGEVFLYPRSPDLGKNRCYDFNVHPSVHLEKDLELLKRLEYSFTTSYKGR >NZ_CP017603.1|WP_070967974.1|2543185_2545561_+|endonuclease-MutS2 MNEKSLRVLEYTKIIEKLVEGCTSSLGKDLVKNLKPFNQLEKIQQLQKETSEAQSILIKRGNVPLGGIHDILHLVRRTEIGSYLDPGQLLYLRDTLAVARKLKQFLKEDDRQEVEYPIIQGLIQSLNTVREIEEKIEVCVLSETEISDHASSELRNIRRMIASKNDAIRNKLNSIINSASYQKYLQDAIVTIRQDRFVVPVKQEYRSHFPGLVHDQSSSGATVFIEPMAVVELNNQLKELKIKEKKEIERILMEISAMIAERGEEIKGNQSVLQELDFIFAKGKLSLSMKAIEPVLNQEGKVIIKNGRHPLLNPSEVVPTNIWLGEEFHLLVITGPNTGGKTVTLKTVGLLSMMAQSGLHVPADYGTKLAVYDHIYADIGDEQSIEQSLSTFSSHMTNIVKILEEVTPNSLVLLDELGAGTDPTEGAALAMAVLNYLKSLRTSVIATTHYSELKQYALLKDQVENASVEFDVETLRPTYKLLIGVPGKSNAFEISKKLGLSSQLIEEAKTLLTKENIEFEDLLQNIEKNRVEAEKERNIAASLRLQAEATLDNYLEKKDKLEQQREKILKEAKKEAYKIVKEAKQEAEEVVENLRKLKAELEEKEINRKIQEAKAHMDNQLGNLSEGFEEKLFTKTSRKPPENLKAGDPVKVLSLNQVGHVIEPANENGEVFIQIGIMKMNIHVSNLESVNDKKQSKTSGLGKIVKSKATNAKSELDIRGKNLEESFVEVDKYLDDVYLAGLTEVTIIHGIGTGVLKAGIKQMLKKHKHVKSQRDGKYGEGGAGVTIVELK >NZ_CP017603.1|WP_070967977.1|2545581_2546052_+|DUF523-domain-containing-protein MILVSACLLGVNCRYDGTNNKNLELIKLLSEKNIFPVCPEELGELTTPRPPAEIQGREVLEKKGRVMNTDGQDVTEAFIKGAEETLKLAEENGVTTAILKARSPSCGSGKIYDGSFTGTLTEGDGVTAALLKRKNIKVYTEENFLESITEIENLDN >NZ_CP017603.1|WP_070967979.1|2546122_2547214_-|response-regulator MIKMHLTKAEIMVVDDTPEHIELLASILHDENFKVRIATNGHTALELLKQHHPDLILLDVYMPEMDGFELCKNIKNNPALGHIPIIFITASNDEESIKKGFELKAQDYVVKPFNVSELLARIHTHLKLKFQTQALQEAYQELDQFCHSVSHDLKAPLQTIGKLIEHFISDYGDNLDNEKNELIDHISKKSTEVVNMIDRLLEFSRMSKIEMNKEKVDLTQVFHKIYQELIRLQPNRNVVFHVKPLPIIDGDPILLRLLILNILSNALKFTCYQEVGKVEVSCSEETSAYIIATKDNGKGFDMTYVNQLFDVFQRLHSQEEFEGSGVGLSIIQRIVKRHGGKAWITGKINEGATLFFSIPKNNP >NZ_CP017603.1|WP_070973173.1|2547519_2550114_+|response-regulator MDSNIKAEQMAEMRKSQFKQLGLDLANASDYLTDEARKFAVVKDIIHLNQYWEEINVKKTRDHVISQLQELNSPQEEAELLAKAKRNSDALVETERRSMRLVLEALGVSEKDMVFEVATFQLSEEDKNLTSEEKFEKARDIMFDEKYAEDKKLIMEPIDNFQVLMNTRLDAELQIARQFTKRAVILQIILALTSFFALGILLTIFHKQYNLPIKHYTQDLKKFSFENKDFGLMPKGTQELRMFVATFNQLYQSFQEELLKRKQAEETMKVAKEEAEKANRAKSEFLASMSHEIRTPLNAIIGYEYLLESTDLSVKQQEYISKIGISAKNLLALINDILDFSKIEAGRLTMEMISFDLYDLIQDVCQLMSIEVQQKGLKLNKEIEKEVPRYIKGDPTRLKQVLVNLLSNGIKFTEEGYLHIGVKVKKQKRDKVYLLFSIADTGIGISEEQKRYLFESFTQGDASTSRKYGGTGLGLAISRKMVEMMKGKMEVESILGEGSIFYFTAQFQVTDEIIEENKTQEKPRWMDSFMNKKILVVEDHKINRQMIKEVLSHLGFDTDTASGGGQAVEMVRNNRYDLVLMDVRMPEMDGYEATKRIRAFVDADTLPIIALTADAVEEVATAVKEAGMNHYMTKPLNPEKLRNVLRKYAKVNEIKQKEKDSVFPQPKGLISYEEVIQNLGGKKKIYQNILQQFIEEHKKDGEKVKNLLTSEGYEKARFMLHTLKGIAGNIGAMKLKETVEDMEKAIKESNLKQIESTFLLFHRCLKETMMDAEKIIQSISQEEDTNKEKAEYLEEKQKIKKLLYLLQGGEAKAKEFFTLYEEDFIVIWGLVTYQELKKFIVRYEFEKAAAYLIKKIGLEGEKNV >NZ_CP017603.1|WP_070967982.1|2550106_2551156_+|response-regulator MYEVLIVDDDAAIRYLLKRYKKWEIYNFQIKEEARHGKEALEKLKEFSFDLIITDIKMPGMDGLTLLHELKNKQFQGAVILLSTHQEFLYAQEGMRLGALDYVVKPVDDMTLDTALERAKIYLDEKSRQWEKEKSLYDPHHGVKKMEELLMTANEELLKEAEKTIEEIWRFFEKDLLKTGRILEDILLKLWEEFVASYPWIQKVEGMDLEGRFMGTKSFPQMKIKFLSYIESMLHLVEKYELHQKESIIHRTCTYILGHVEEELHLNQIAEEVHVSKDYLGKIFKQKIGYKFNDYVTKIKMEHGKYLLNTSSYKVYEVSEKLGYQNPDYFCRLFKEYTGYTPTQYRKIL >NZ_CP017603.1|WP_070967985.1|2551413_2552664_+|urea-ABC-transporter-substrate-binding-protein MNVKKKTMIRFIAMMMVAFLLMACSSQQSVSEVENNDSETGVSDTDTIKVGILHSLSGTMAISEQSLRDAEMMAIEEINAAGGVLGKQIQPIIEDGASDWPTFAEKAQKLLQQDQVATVFGCWTSASRKAVLPVFEENNGLLWYPVQYEGMESSPNIFYTGAAPNQQIVPAVEWLLENKGKKFFLLGSDYVFPRTANAIIKEQLKAMGGELIEEEYTPLGHTDYSTIINKIQASGADVVFNTLNGDSNVAFFKQLRDAGITSKDLTTLSVSVAEEEIRGIGAENMTGHFVSWNYYQTTDTPENEAFVANYKEKYGASRVTGDPIEAAYIQVYLWAKAVEKAGSTDVDQVKEAAKGLEFQAPGGLVRIEEENQHLWKTVRIGEVREDGLIEEIWSTEGAVRPDPYLRTYDWAATLNQ >NZ_CP017603.1|WP_070967988.1|2552759_2553668_+|urea-ABC-transporter-permease-subunit-UrtB MNTYILQIFNGISVSSILMLAALGLAITFGLMKVINMAHGEFIMIGAYITYVIQNIFISFVNPRYFNYYFVIAIIGAFMITALIGYLLEIAIIKHLYGRPLDSLLATWGLSLFFQQLARSIFGSPNVHVKSPTWLDGGILISTGLQFPYKRLFILLMAFTCMVGTYYFLYQTKRGLKVRAVMQNRSMAESLGINTRKVDGMTFALGSGLAGIAGCGLTLLGSIGPTLGSNYIIDTFMVVVLGGVGRMVGVIAGATVIGVGNTTFEFFTNASMGKVLIFCIVILFLQWKPKGLFTIKSRALDE >NZ_CP017603.1|WP_070967990.1|2553682_2554774_+|urea-ABC-transporter-permease-subunit-UrtC MTCSIGKLRKRYFKNNWMVLLVFILLGIAPLFLSDFRVNMLGKFVAYAILALGIDLIWGYTGILSLGHGVYFGLGAYCMAMYLKLAASGGGLPDFMTWSGQTVLPWFWKPFESIYFAVFMAILIPVLLAALVGFLTFKNRIQGVYFSILTQALSMIFVVLFIGQQKYTGGTNGITNFKTILGFSITSPETRFYLYYISVLLLLLSYLFCKFIIGRRIGKILIAIRDGENRTRFSGYNPTTYKVFVYCISAALAGLAGAIFVPQVGIISPENMGVVPSVEMVIWVAIGGRGTLVGGVLGAILVNIIKSLLSENFPAIWSYFIGITFVVVVIFLPAGLMGTFKQIKEKAREMKVTMKTKPTGSKV >NZ_CP017603.1|WP_070967993.1|2554781_2555537_+|urea-ABC-transporter-ATP-binding-protein-UrtD MDHMEAVLNIKDLTVSFDGFKAVNNLNTSVKNQDIHFFIGPNGAGKTTLLDVICGRVKPFVGNILFEDQKDLTKLSEHEIVELGIGRKFQAPSVFTGITILENMELAVVKKRSLFASLFSKLTKEQTEYILHILQTIGLYEKRYETPISLSHGEKQWLEIGMLLAQQPKLMLLDEPVAGMGRKETEKTGALLKEIAKERSVVVVEHDMEFVRECASTVTVLHEGALLDQGKMEEVQNNPKVIEVYLGRGGE >NZ_CP017603.1|WP_070967996.1|2555539_2556232_+|urea-ABC-transporter-ATP-binding-subunit-UrtE MLNISELEAYYGGSRILNQINMKVKKGQVACILGRNGVGKTTLLKSIMGLVKTPRGSILLEEKEMMKVPTYHRAMEGIGYVPQGREIFPQLTIHENLLLGLERSKNKGELEEDVYELFPVLKSMLKRKGGDLSGGQQQQLAIARALISKPKILLLDEPTEGIQPSIIQDIGKVIQQLKKQGNMTIIIVEQYLEFVLGIADYFFVMDKGKIVMEGNIKEADPKEIQSKMMI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP017603_4 | 3724927-3726743 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017603_4
|
27 spacers
spacers of NZ_CP017603_4
>4.1|3724957|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT CCCGCCTTATGGTCCTTACTGCTTCTTTTTTCTCAT >4.2|3725023|35|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGATATGTCAAAACTGAAATAGATTTACTTATTGG >4.3|3725088|35|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT GCGATAGATGAAGTAGCACTGCTTATAATACATCT >4.4|3725153|35|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT ATGATAGAAGGTTATAATATTTATGTTCGTGATAC >4.5|3725218|37|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT AAATATGCTGTCTCAGCACAATAAGCACCTTCCATCT >4.6|3725285|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT TAACTTTAGATATGCTGCTATAATTTTGGCTACCTT >4.7|3725351|35|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT ATTCCTCCCTTATTTTATTGTATCGAGGGACAAGT >4.8|3725416|35|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT GATACAGATTATCAATATAGGGAAGAATTTCCTGA >4.9|3725481|38|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT GAGATCATATCTTCTGAAAGGTATCTTGAATCTGTTCT >4.10|3725549|37|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT TTAAAATCACTTCAGGTTTCACAATGTTAATAGTTCT >4.11|3725616|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT GCTATACCCCTTGTAAAACACTCTGCTTTTTTATCA >4.12|3725682|37|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT GATTAGCAGCTATTAACGCAAAGACCAATATACAAGC >4.13|3725749|37|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT TTTACCTTTTGCACTCTTTTTTTATTTCTTTAACCAA >4.14|3725816|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT AATTTTCAAACGCAAGTGAACTATAATCATGTTTAA >4.15|3725882|37|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT TGTATTTTTGCAGGCTTTGCCTGCAATATGTAACAAT >4.16|3725949|35|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT ACTATAGTCCGAAAGGGTGGTAGAGATGATCCAAA >4.17|3726014|35|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT GCAGATCTTGCAAAAGAAGATTATTCTTTTCCTGT >4.18|3726079|37|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT GAAGCCAATCAAGTATTTGTTTCACTGTTTTTGGGTT >4.19|3726146|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT GCCGCATGAGCATCTTCAAAATCTACAAACAATTGT >4.20|3726212|35|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT TGTGCCAGTAGAAACCGCAACGGAGATTATTAAGA >4.21|3726277|37|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT CTTCTGTTACGTTAAGTGTTCCAGCTGCTTCTATTAA >4.22|3726344|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT TAGGGCAACATCAGGGGCTTTGTGTGAAGCCTTATG >4.23|3726410|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT CCATATTCATCCCCCTTTTGAATATCTGTCTAATAA >4.24|3726476|37|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT TAGCTTTGTGAACTGAACCCTCTACAATAATATAAGG >4.25|3726543|38|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT CAACTTTTTCGTTTGATATTTTGGGTGTTGCTATTGTT >4.26|3726611|37|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT AAGACAATACAGTATTTTAGACAGCAGGGTTTTAAAA >4.27|3726678|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT TTTTAGAAGGGTGTTTTTTTATGCCTTTTAAAAAGG >4.28|3725088|38|NZ_CP017603|PILER-CR CGGGCGATAGATGAAGTAGCACTGCTTATAATACATCT >4.29|3725156|35|NZ_CP017603|PILER-CR ATGATAGAAGGTTATAATATTTATGTTCGTGATAC >4.30|3725221|37|NZ_CP017603|PILER-CR AAATATGCTGTCTCAGCACAATAAGCACCTTCCATCT >4.31|3725288|36|NZ_CP017603|PILER-CR TAACTTTAGATATGCTGCTATAATTTTGGCTACCTT >4.32|3725354|35|NZ_CP017603|PILER-CR ATTCCTCCCTTATTTTATTGTATCGAGGGACAAGT >4.33|3725419|35|NZ_CP017603|PILER-CR GATACAGATTATCAATATAGGGAAGAATTTCCTGA >4.34|3725484|38|NZ_CP017603|PILER-CR GAGATCATATCTTCTGAAAGGTATCTTGAATCTGTTCT >4.35|3725552|37|NZ_CP017603|PILER-CR TTAAAATCACTTCAGGTTTCACAATGTTAATAGTTCT >4.36|3725619|36|NZ_CP017603|PILER-CR GCTATACCCCTTGTAAAACACTCTGCTTTTTTATCA >4.37|3725685|37|NZ_CP017603|PILER-CR GATTAGCAGCTATTAACGCAAAGACCAATATACAAGC >4.38|3725752|37|NZ_CP017603|PILER-CR TTTACCTTTTGCACTCTTTTTTTATTTCTTTAACCAA >4.39|3725819|36|NZ_CP017603|PILER-CR AATTTTCAAACGCAAGTGAACTATAATCATGTTTAA >4.40|3725885|37|NZ_CP017603|PILER-CR TGTATTTTTGCAGGCTTTGCCTGCAATATGTAACAAT >4.41|3725952|35|NZ_CP017603|PILER-CR ACTATAGTCCGAAAGGGTGGTAGAGATGATCCAAA >4.42|3726017|35|NZ_CP017603|PILER-CR GCAGATCTTGCAAAAGAAGATTATTCTTTTCCTGT >4.43|3726082|37|NZ_CP017603|PILER-CR GAAGCCAATCAAGTATTTGTTTCACTGTTTTTGGGTT >4.44|3726149|36|NZ_CP017603|PILER-CR GCCGCATGAGCATCTTCAAAATCTACAAACAATTGT >4.45|3726215|35|NZ_CP017603|PILER-CR TGTGCCAGTAGAAACCGCAACGGAGATTATTAAGA >4.46|3726280|37|NZ_CP017603|PILER-CR CTTCTGTTACGTTAAGTGTTCCAGCTGCTTCTATTAA >4.47|3726347|36|NZ_CP017603|PILER-CR TAGGGCAACATCAGGGGCTTTGTGTGAAGCCTTATG >4.48|3726413|36|NZ_CP017603|PILER-CR CCATATTCATCCCCCTTTTGAATATCTGTCTAATAA >4.49|3726479|37|NZ_CP017603|PILER-CR TAGCTTTGTGAACTGAACCCTCTACAATAATATAAGG >4.50|3726546|38|NZ_CP017603|PILER-CR CAACTTTTTCGTTTGATATTTTGGGTGTTGCTATTGTT >4.51|3726614|37|NZ_CP017603|PILER-CR AAGACAATACAGTATTTTAGACAGCAGGGTTTTAAAA >4.52|3726681|36|NZ_CP017603|PILER-CR TTTTAGAAGGGTGTTTTTTTATGCCTTTTAAAAAGG |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017603_4
The CRISPR arrays of NZ_CP017603_4 >merge|NZ_CP017603|4|3724927-3726743|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAACGGCCCGCCTTATGGTCCTTACTGCTTCTTTTTTCTCATATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGGGATATGTCAAAACTGAAATAGATTTACTTATTGGATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAACGGGCGATAGATGAAGTAGCACTGCTTATAATACATCTATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGATGATAGAAGGTTATAATATTTATGTTCGTGATACATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGAAATATGCTGTCTCAGCACAATAAGCACCTTCCATCTATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGTAACTTTAGATATGCTGCTATAATTTTGGCTACCTTATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGATTCCTCCCTTATTTTATTGTATCGAGGGACAAGTATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGGATACAGATTATCAATATAGGGAAGAATTTCCTGAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGGAGATCATATCTTCTGAAAGGTATCTTGAATCTGTTCTATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGTTAAAATCACTTCAGGTTTCACAATGTTAATAGTTCTATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGGCTATACCCCTTGTAAAACACTCTGCTTTTTTATCAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGGATTAGCAGCTATTAACGCAAAGACCAATATACAAGCATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGTTTACCTTTTGCACTCTTTTTTTATTTCTTTAACCAAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGAATTTTCAAACGCAAGTGAACTATAATCATGTTTAAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGTGTATTTTTGCAGGCTTTGCCTGCAATATGTAACAATATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGACTATAGTCCGAAAGGGTGGTAGAGATGATCCAAAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGGCAGATCTTGCAAAAGAAGATTATTCTTTTCCTGTATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGGAAGCCAATCAAGTATTTGTTTCACTGTTTTTGGGTTATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGGCCGCATGAGCATCTTCAAAATCTACAAACAATTGTATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGTGTGCCAGTAGAAACCGCAACGGAGATTATTAAGAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGCTTCTGTTACGTTAAGTGTTCCAGCTGCTTCTATTAAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGTAGGGCAACATCAGGGGCTTTGTGTGAAGCCTTATGATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGCCATATTCATCCCCCTTTTGAATATCTGTCTAATAAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGTAGCTTTGTGAACTGAACCCTCTACAATAATATAAGGATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGCAACTTTTTCGTTTGATATTTTGGGTGTTGCTATTGTTATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGAAGACAATACAGTATTTTAGACAGCAGGGTTTTAAAAATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGTTTTAGAAGGGTGTTTTTTTATGCCTTTTAAAAAGGATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG >NZ_CP017603|4|4|3724927-3726743|CRISPRCasFinder ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAACGG CCCGCCTTATGGTCCTTACTGCTTCTTTTTTCTCAT ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG GGATATGTCAAAACTGAAATAGATTTACTTATTGG ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAACGG GCGATAGATGAAGTAGCACTGCTTATAATACATCT ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG ATGATAGAAGGTTATAATATTTATGTTCGTGATAC ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG AAATATGCTGTCTCAGCACAATAAGCACCTTCCATCT ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG TAACTTTAGATATGCTGCTATAATTTTGGCTACCTT ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG ATTCCTCCCTTATTTTATTGTATCGAGGGACAAGT ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG GATACAGATTATCAATATAGGGAAGAATTTCCTGA ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG GAGATCATATCTTCTGAAAGGTATCTTGAATCTGTTCT ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG TTAAAATCACTTCAGGTTTCACAATGTTAATAGTTCT ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG GCTATACCCCTTGTAAAACACTCTGCTTTTTTATCA ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG GATTAGCAGCTATTAACGCAAAGACCAATATACAAGC ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG TTTACCTTTTGCACTCTTTTTTTATTTCTTTAACCAA ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG 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ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAACGG CCCGCCTTATGGTCCTTACTGCTTCTTTTTTCTCAT ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG GGATATGTCAAAACTGAAATAGATTTACTTATTGG ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAACGG GCGATAGATGAAGTAGCACTGCTTATAATACATCT ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG ATGATAGAAGGTTATAATATTTATGTTCGTGATAC ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG AAATATGCTGTCTCAGCACAATAAGCACCTTCCATCT ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG TAACTTTAGATATGCTGCTATAATTTTGGCTACCTT ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG ATTCCTCCCTTATTTTATTGTATCGAGGGACAAGT ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG GATACAGATTATCAATATAGGGAAGAATTTCCTGA ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG GAGATCATATCTTCTGAAAGGTATCTTGAATCTGTTCT ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG TTAAAATCACTTCAGGTTTCACAATGTTAATAGTTCT ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG GCTATACCCCTTGTAAAACACTCTGCTTTTTTATCA ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG GATTAGCAGCTATTAACGCAAAGACCAATATACAAGC ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG TTTACCTTTTGCACTCTTTTTTTATTTCTTTAACCAA ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG AATTTTCAAACGCAAGTGAACTATAATCATGTTTAA ATTTACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG 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>NZ_CP017603.1|WP_070971023.1|3720889_3724453_-|BREX-1-system-adenine-specific-DNA-methyltransferase-PglX 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>NZ_CP017603.1|WP_070971032.1|3728213_3728705_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKKVTGVMIYYYFICDRKLWFFMNDLNMEQGSDLVSMGKLIDETSYKREKKNILIDENINIDFLKDWKVIHEVKKSRKIEEASKWQLKYYIWLLKQKGVDIEKGILDYPLLRKREDVFLDKQDEEELQKVLEEIDKIRSSKLPPAINKKAICKNCAYYELCYI >NZ_CP017603.1|WP_070971035.1|3728735_3730967_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 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MKAIRLKLYQEMTNYKKPTSFQLKESYPLPPYSTVIGMVHTLCDYKEYKEMDISVQGKYFSKVNDLFTRYEFKSGMTFDGARHQIKVEEFGISRGVATTELLVDVELLIHIIPYDQRLIAEIESALLYPREYPSLGRREDLVVIQEVKVVDVLEKELEEDIELEENYTAYIPLKLIDSGAIILSGPDAGIRSRGTKYKLNKNYELVNYGTKKAPKVFRKWNKVDVLYTSNIIASEYETILIDEDENIVFAS >NZ_CP017603.1|WP_070971041.1|3731731_3732616_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas7/Cst2/DevR MKNDMKPKGLTLSMVFEAESANYGESVGNVASLKKVARGKGEQYTYIARQAIRYNIVEQLGEACAEVRAEGSGDKKVIQFHPDATIKDYPEVDFFGYLKTMKGTGGKKRSAKVRLSNAISLETFKGDLDFLTNKGLADRIKENMNIAQAEIHKSYYRYTVTVDLEQIGIDEEYEIEIDNTEKARRVHKLLDTIALLYRDIRGRREDLKPLFAIGGVYDIKNPIFQNVLDVKDQRLIVEQIEGVLFENIKKDTYCGLIEGKFENDKEIKERLNPQSMPKLFETLKGKVKDYYEGY >NZ_CP017603.1|WP_070971043.1|3732615_3734286_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b1/Cst1 MGEKIRLEMSDWLYNAGLVGLYNVLKHSGDKVDYAEQYMELDLSLLENFEEKYFKYFINKYQAYLSYFKIVSYESTIKYHEDKNFETFEEEDLEVLNNYIKNVVKYYLNSNSYRAAYELINDEVDILELAKELQIIKIRKKESIKDKDSEIKNMFQQLKVIISYCNKDNYRKYLAGKNVIYTIIKHSWDGVCFLNPQTKEKDIYLDYKNYFIEPVKEYIDKKATNEKFNCFTCGRNIKDLKNDLSFLNNIGFDVSRKSSHTWNFSNDIAVCPICKLVLSCTPAGITYVYDKGIYINDNNSFQEAVNINNKVKSEILQEHKADKLLTYRALVNSIQDQFQDKVKYELADIQVVRYEEGQYRFNILSKKALCIIRQSQNDLNNIIHSGFKEINTYFNIYELVINRILNNHNLFTLIQKLLVYKLSNPKDCRFNTSQLVSILNINFRCLEGMDYMKNTDKDIIKNANISGYYLREQYKEKGAQDKLNGISYRLLNALKTNNKDMFMDTLLNCYLYSQKTVPSIFLEALKDDEKYKTIGYAFVTGLIEGKESTKKNGGDE >NZ_CP017603.1|WP_070971045.1|3734298_3735027_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRFGVEILLENEMIPKDKNRIILSLLKSCFSSYNEDYYKALYMEEQNKKKDFTFSLYLGNCKFLREEILVPSKKILLNFSSYHHEDGIMFFNSILHNKGKSYPITNNTITLQKINLIREKLVHSYEVTYRPLSPIVVREHSGNNKKTWYHSLSNQEGQAIFIENLKYQIKDALGEKGLLDFEDVKIEIAQTNKEVKVKNYGIEVLSNITNIKMKGQPYILDYLYKAGIGSKRSSGFGMVDIV >NZ_CP017603.1|WP_070971047.1|3735127_3736075_-|transcriptional-regulator MSKISNALNMYFLLQVKDIVKVEEIAEKLEVTPRMVKKYKQDLEMAGIYIGSKLGRDGGYYLENKRSLEGIHLAMEELSTLKMATEAIKSGKYHYSSKFEIMASKILSIHEPTDNIYYHNKVLRKSDETLAKEKIVWIDINLAVNRNKKVKITYKSLKKKGLEIKERLVNPYGIFDYKGATYFFGYCESAKGIRFFKLSRIITYEILKEKFNEKIPFDFEEVLEKSFGIYNDELIELKLKIYYPMSEIVKEKQIAKNQRITVMDENTIYFQAKIKGYTEIKTWIMSMGSSVEVLEPLKLKEDVFEEINKIASLYK >NZ_CP017603.1|WP_070971050.1|3736254_3736875_-|cyclase-family-protein MEIYDVSMDIHQNMMVYKNKEENKPEITVKTDHSNSRTYESSIRMGMHTGTHIDAPLHMLKDGQTMENYSIENFVKKCKVLDLTYVENKITKNILQEKNIEKGDFLLFKTKNSFTEVFDFEFIYLEESGAKHLEEIGIAGVGIDSLGIEREQPQYETHRTLLGKNIMIIEGLQLKEIEEGEYTLIALPLKIKNVEASPARVILIKE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017603_5 | 4200017-4200109 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP017603_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP017603_5
>5.1|4200049|29|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder TTTCACTAATAACGTGATCATCAACGCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017603_5
The CRISPR arrays of NZ_CP017603_5 >merge|NZ_CP017603|5|4200017-4200109|CRISPRCasFinder AAACACATTATCATTTCCTCCTTTCTTGCGTGTTTCACTAATAACGTGATCATCAACGCTTAAACACATTATCACTTCCTCCTTTCTTGCGTG >NZ_CP017603|5|5|4200017-4200109|CRISPRCasFinder AAACACATTATCATTTCCTCCTTTCTTGCGTG TTTCACTAATAACGTGATCATCAACGCTT AAACACATTATCACTTCCTCCTTTCTTGCGTG
>NZ_CP017603.1|WP_070972164.1|4198589_4199705_-|FAD-dependent-oxidoreductase MIKKEVVVIGGGPAGLAAAIEAAKRGVQVLVIDANAEAGGQLIKQIHKFFGSSAHRAGIRGMDIGSQLLQEAKDYGVEIWLNSVVIGLSKEKTMAVETGTDDIDKKVKLIEAEKIVIATGGSENVVRFKGWTLPGVMGAGAAQTMINSNRVKPGKKVVMIGSGNVGLIVSYQLLQGGVDVVALVEAAPNIGGYAVHASKITRAGVPIYTRHTILEAKGKDRVTEAVICEVDDKWQPIEGTEKVVKVDTIAIAAGLKPLAELAIMHDCQTKFDTVLGGWIPLHNTNMESTYPGIYVVGDITGIEEANTALEEGRLAGVAIAEALGKIEPIEAEKLKGEIWERLDGLRSGPDGEVRMKAKSRQMESFKELVNV >NZ_CP017603.1|WP_070972161.1|4198065_4198560_-|4Fe-4S-binding-protein MSLEQNGFLTIEELKAKGHYPSEKRFSEGLIAIIECIHEIPCNPCENSCKFGAINIGEPITNLPRLVEEKCIGCGVCVANCSGLAIFIVNKNYSDTEGTVSFPYEYYPLPEKGQVVEAVNRRGQILCKGTVIKIQNPESYDRTPVVTVAVPMDKVEEVRSIKRL >NZ_CP017603.1|WP_070973430.1|4197707_4197968_-|(2Fe-2S)-binding-protein MLVCRCEEVTVGEIKEAIRQGACDITGIKRRTRAGMGLCQGRTCEKLVQQILRQELGSSPEEISASTPRPPVRPVAFGALGGGGVK >NZ_CP017603.1|WP_070972158.1|4196517_4197711_-|FAD-binding-oxidoreductase MNSFDVVVIGAGAIGSSIAYHLTKKGYDVALVERGDIANGTSSRCDAVALICDKKPGIDTKMGYESIQVFKELAKTFSYDFEFKQPGSLYVCETEQELEVAKEYVAQQQADGYDMRMVDNYEMQEMEPYLAKDLLGGIWTTPDSSMSPYKLCYAFVEEGKKLGLKVFHHHTVMDIKLDEKGAVENVVTDKGEFKTKRVVNCGGAWASELGNMVGIDIPITPRKGIVLISEKSFKVVNQKVHEFGYMLSKFEDINFKRNVSKLVERHNVAFNIEPTRDNNFLLGGNRENKGFDISTELEVMMAVAERGMRFFPILKEINCIRAYSGVRPYCADHLPIVSEVDEVPGYYIAAGHEGDGISLSGITGRMMTQIISGEKTDFDIEKLKFSRYKNKKVVFAD >NZ_CP017603.1|WP_070972155.1|4195585_4196488_-|4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate-synthase MINAPKGIIVPLITPFNDDETIDFQAYKKVIDFQIESGVHGLLVGGTTGEYHVMSLEERKSLIKAGCEYAAGRVPVMAGVGCFTAKETIELANYAAECGAKWGLVLPPYYHHTSEDGILEFFKEIAAKSKVGIVIYNYPEATNVCLSPEMIYELSQEENIVSVKESADFGHLCKVLTLTRDIDNFSVFTGEEHFMLPTFSIGGQGAFGILVNLLPKEVVKLYELAVEEKDIKAARDLNSKLSGFYDLMEAEGNPYPGPVKAGVDMIGLKGGKVRKPLTQTTAELKSKLKEQLIKLGYEVK >NZ_CP017603.1|WP_070972152.1|4194521_4195448_-|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MTPVKIILGILILLSSRFLVIFIKDYVRFYREGKLEKVNIIFTSILAFIVNFLDALGIGSYASSTAVFKFTGMVKDKQIPGTLNVATMMPVLFQALIFITIIQVDIFTMITIIVCTMIGSYIGASIVSKLPERKIQIGMGFGLFAVAITMVLQILNIMPPGGNVTYLSGIKLGIAWVGAFILGITNCIGIGVYAPMMALLLSLGMSPIVIFPIMMGSCAFFQTICGTKFVQEGQYNRQVSMIYSTVGVVGVLVAAYIVKTLPVEILKKLVVAVVIYTSANMFRSAFKSPKHEIEEIENVEPETTHVSR >NZ_CP017603.1|WP_070972149.1|4193360_4194488_-|hypothetical-protein MSFPEAKILKVNLTNREIETIILDSDTYRLYPGGSALGVYLLLSNMTSQVEPLYGGPEYETCSTFGSYCGINDLTTISLANQMCNMYGLDTISCGATIAFAMECYEKGLLSTEDVDGIELRFGNKDVIPMIIEKIVYRQGIGELLSKGSKKAAEVIGKDAIKLSMTVKGQELPAHMPQFKPSLGLVYAVNPFGADHQSSEHDTWLVIPKDSFVRERLSKMGIWKGYEDSFSLDDEKVRFAFDTQCFYSMLDTLCLCQFAWGPSWQLYGPSEFIELCMAGIGWETSILELMRIGERRINMMRYFNKMEGFTKEDDVLPERIFEPFNDGPSKDICLNKIEFEKAKELYYEYAGWDKETGNPTDATLRKLSLGWLLNT >NZ_CP017603.1|WP_070972146.1|4193140_4193338_-|sulfur-carrier-protein-ThiS MEVTLNKDKVSIAENTTILELLHEKGYNDMIAIFINGKQLLQKEYENHVLKENDIIKVIRILGGG >NZ_CP017603.1|WP_070972143.1|4192231_4193023_-|aspartate/glutamate-racemase-family-protein MDKRLNGRQYGYLTSNNDSRFVRAINHQQVAGYSVGIVYIENVNYPMMPGNVVNAYTYDFPVRMRAVPNLTNERLFAADPTIANDIIATAKHMVEKEGVRAICSACGFFGNFHRRVAEALDVPVALSSLVQLPWIKSIIKPGQKVGILTANASAITPELFKNCCVEDFRNIVIKDMMHSENFSAVVDMRGYFDNGKAREEVVQAALELLEGDDDIGAILLECSDMPPYAAAIQEATQLPVFDFITLIKWLHNGTTQRPYSGWI >NZ_CP017603.1|WP_070972140.1|4191584_4192166_-|flavin-reductase-family-protein MKTSIGAKNIIFPTPVFIVGTYGEEGKPNAMNVAWAGICGSSPPSIGIAIREQRCTYKNIMNRKAFTINIPSEIYIKEADYFDLVSGNKTDKFSDTGLTPIQSDKVDASYIEEFPFNAECELIETLQIGEHTLFVGQIIDIKVDADCIDKNDLPDIEKIKPLLFDPAAIRYNTVGKIAGKAFSIGKRILSHDN >NZ_CP017603.1|WP_070972170.1|4200396_4202100_-|sigma-54-interacting-transcriptional-regulator MLEALEKELCIDVKEKRCKKIMEFFELAKAVQLPVVDDRKVVGILDLFVFLNNMNKNTNIVELMEKDIIVAGDSRSVFSFKNSKQHILPFVDENGNYLGFINRLFQKCYLPSKEYMQILEKEIGDAIDCDTKEVDYDKLDRTFDAIFELNYDGIYITVNKGKTLSINNKCIYTKGLMTDDNTVIDKKVNIIQNVQNRNEVSMSSHIISDGGIIRVINNIENFQKLKNELAEAQKLAEKYHNELEFLRWKQSQPEEIIAKSYEMKKIINLAIRIAKVDSTVFIHGQSGVGKGVLSKLIHNNSHRKDGPFIKIDCGSIPEQLLESELFGYEPGSFTGAEKGGKIGLVELANGGTLFLDEIGELPLNLQTKLLSVIQDREIFRVGGIKPIHVDIRIIAATNRDLKKMVENKKFREDLYYRLNVVPIKIPPLQERKEDIKPLIEKCLQNFNKKYKLNKQIEPKALRKLIDYNWPGNIRELNNIIEYLIVTTNSETITKEDLSEIIVDNKSQEVLSVNSILPLKEAVSLVEKKLLIETMQKSKSTEEMAQLLKIDRSTIIRKLQKYNIKTHF >NZ_CP017603.1|WP_070972173.1|4202728_4203799_-|sulfite-oxidase MKSDISYLYKPYLHTRELMPENQETPIHFLNERTTPIEYIYKRNHFLYPALDSAAFFLPVVGEVERPMVFPYNYIKSLPSKTIKMVLECAGNKRAYFDPKTYGEQWKDGAISQVAWKGVSLKDLLYFTGIRSTAIEVAFEGYDYGTRKDIDRVFPYARSLPLEKALHPDTIIAYELNSQPIPYDHGYPLRLVVPQWYGMASVKWLKEIRVIDHKFTGPFQAIDYVYYPNKEDDFGKKPVTEIKVNSIIQQPMNYSVLDTGSHSINGIAWSGHGTIKEVELSFDQGLTWKNVELYQDKNQQHLWTFWKYAWTVEEKGEHTIMCRAKDSYGNIQPLEAEWNRKGYGYNAVYIIKVKIE >NZ_CP017603.1|WP_070972175.1|4204172_4205567_-|peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MKNINIKNLFNCEVTGNIIILIVSILLVYLLIALYFTNHFFFNTVINGVDVSLKAHDDLEDIMRSYIQDYKLQLIERSKEAEEITAQDIGMQYNGKNSISEIYYLQSSFKWISSLLRNQKHYVDDLFIYSKDNLQNRINELNCLNKDLIEPQNVSFKYSNGSYEIIEEVYGNKINKDKLRETIEISILKGETKLDLNENLCYENPRYTLSSGKTFKIRNLLNKYVSTKITYIIGSENEILDGDIINQWLSVDEDLEVVINEKGVLEYVRRLSKKYDTVGAARKFKTSTNKVVEVKGGFYGWKINRAAEVRALLESIKLGEVIKKEPIYTQKALSRGNDDIGDTYVEINITWQHLWFYKDGKLITHGAIVTGNPNRGNATKVGVYMLNYKEKESTLSGANYEVQVTYWMPFNGDIGIHDASWRYSFGGEIYKRNGSHGCVNTPLYLAKIIFDNIEKGTPIICYEE >NZ_CP017603.1|WP_070972178.1|4205898_4206780_+|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MIYIVRPGDSLYLIARRFGVTVQTLLDSNVICNPNLIYPGQVLVIPQASLEIPKAGGTPYYVILPGDTLFCLARQFNTSTQILAQANRIPDPNLIFAGSELLIAYDIPDPRELQILWEQTALNCDILTSLQIYGIYYLGTFQWEAIGQKAIPYLGILAVNPCSIVRYYAIISLGRIALNGESRRILTNALQDPDPIVVQLTRLALSRLDYVRTNRRIHVTISDTQLYSQPFLDTPYITLPPGTAIIVERWYIPSPIGEDFPPAGLAVWDYVRVIATGQTGFLLRVGYNQTLLI >NZ_CP017603.1|WP_070972181.1|4207329_4209126_-|VWA-domain-containing-protein MKWIYGEYDLENRLTNLMWTICGDYDQELDELEKFTKTSKDLAVYYAAKAGARRKYIDWNMIKKYLKHRIQKGADQDLIVPLVEMCADVMVEEKLIKERPGIEDIRKKGLDDLLERYFKIKLNTFMEKVKYALVLEQMGKHASFDLKVKKLLSDIKKCKDVEDTLALLENIDALYLTHFKEMLENQTFLYEMEEENELKEAYKEEESTKEQSFTSFMYEELYEEDTVISEVVDGMQSSLLIESIGDLKQEVPTNPNENRVLSIDQEMVEKIYKKIEHYHGKSCITKEEQKKIEKKVCRNVHEGCRVHFTEGVLRSPCDNAFQIKYVTRQKEKNLSDFRDNIKVHKRNIMKLKEVIIKTLTAEQEKTIVPSDNGVLAVNKLWRVGRSEKPKVFTKVIDNQKGGYVVDILLDASGSQIARQGKVASQGYIISEALTLAGIPNRVMSFCNFLDYTILRRFRDYTSPQSENQNIFEYFSAGNNRDGLAIQAVSQGLLNRSEENKILIVLSDGKPNDVKISKDNIRTIRGEAFYKGMTAIKDTALEVRKARKNGILLFGVFTGKEEELQAEKLIYGKDFVYTRNIEKFSDIVGTYLKRIIENY >NZ_CP017603.1|WP_070972183.1|4209139_4210063_-|MoxR-family-ATPase MNIFDFLRKQEIEEKLIQDVLYFRKYYQIDEAVKDRIPDPRNFFYGKEIWSMCIAAILEGENILLSGPKATGKNVLSDNLCAIFARPQWNVSFHVNTDSSSLIGTDTFIDNEVRLRRGAVYECATYGGFGVFDEINMAKNDAIVVLHSALDYRKIIDVPGYEKIKLHEATRFIGTMNYEYAGTKELNEALVSRFMVIDIPQIEEEKLMTILKLEFKDAHEDKLNQFAGIFLDLQTKAQNSEISTKAVDLRGIIASIKTVKRGLRPRLAINMGVTGKTFDQFEKEIVEDVIRTRIPEKWEAKDIFPSS >NZ_CP017603.1|WP_070972185.1|4210439_4210730_-|hypothetical-protein MDTGIENSVDFITINEKQLEKMADKVYYSYSWAFDQLDQLLSSELWDIPVCIHFKTTIAKKPHFMRLFCMCRFCWVRVASTVIIFGFKSVLVPLCR >NZ_CP017603.1|WP_070972188.1|4210779_4211469_-|radical-SAM-protein MSGFTYKDIYIEDGGRVLEVNILPEKYCNFDCIFCPIGKSQNKVDVQRSFDGYESSLAELDRMIESTKAELVFINSKGEALVNDKIGDIIDFIKGKGLHVRLFSNGYLLGRDEYIRIANKCDEVVGEIKVIKEEDFRKIQRPIEGYTLKEYISNMASFSKQYNGVFIFEITIIKGYNDDEESIQKIKNIIKEISLDKVIIARLEDEVFKKKLGIADERFEEILNELLSL >NZ_CP017603.1|WP_070972190.1|4211487_4212195_-|B3/4-domain-containing-protein MKKFIIEDDFWTLFPKAKIGVVTFHSIDNSIKDKEKYKEMICTSEKEALKYLTNEEFSSNEVIKVWRDAFQKFKTKKGARSSIEALLKRVHKRDPIGTINPLVDIYNSISLKYALPCGGEDIDTFVGNIRLTKAVGGEDFITLGSDESAPPYEGEIIYKDNEGAICRCWNWRESVRTMLTENTKNAFLCIELIDERRLKELEMALNDLAKSVKDHIGGTYKITILDINNKQVSIG >NZ_CP017603.1|WP_070972193.1|4212260_4213589_-|polysaccharide-biosynthesis-C-terminal-domain-containing-protein MKKLRLDFLKYTSLNVLAMVGVSLYILADTYFISKALGAIGLAALNFCIVIFTLIQGVGLMIGIGGAIDFSIGDSERSNLGNKSFVNALFIGSLFSVIFILLGVFFSTQISLFLGADELILSPTKTYLTTILGFSPFFILNNIGLAFVRNDKNPRLTMTAMIVSSFSNIILDYVFMFPLSMGIFGAAFATGLSPIISLCILTFHFRRNSIGFHLCKCRIEIKRLIRIITLGLPSFVTELASSITLFTFNIVILRIAGNVGVAAYSAIANVATIATALFTGLAQGIQPLAGNYFANSDKGGLRTILKYSLITSFFLSITIYFIILVFSDNIILIFNSENNEALARIAGVGLKIYFTGFIFAGINIVIISFLSAISNTVNAMVISILRSSIILIPTILFMSFFFKAYGIWASFMVAELLVTIFTYLTHIYRSRENIQLDTYTGG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP017603_3 | 3.11|2542608|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2542608-2542643 | 36 | NZ_CP013332 | Fusobacterium hwasookii ChDC F174 plasmid unnamed1, complete sequence | 1050-1085 | 7 | 0.806 |
NZ_CP017603_3 | 3.12|2542674|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2542674-2542709 | 36 | NZ_CP013332 | Fusobacterium hwasookii ChDC F174 plasmid unnamed1, complete sequence | 1050-1085 | 7 | 0.806 |
NZ_CP017603_5 | 5.1|4200049|29|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder | 4200049-4200077 | 29 | KY290955 | Aeromonas phage 65.2, complete genome | 192318-192346 | 7 | 0.759 |
NZ_CP017603_5 | 5.1|4200049|29|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder | 4200049-4200077 | 29 | NC_015251 | Aeromonas phage 65, complete genome | 192355-192383 | 7 | 0.759 |
NZ_CP017603_3 | 3.11|2542608|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2542608-2542643 | 36 | CP031730 | Stenotrophomonas rhizophila strain GA1 plasmid unnamed1, complete sequence | 73863-73898 | 8 | 0.778 |
NZ_CP017603_3 | 3.12|2542674|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2542674-2542709 | 36 | CP031730 | Stenotrophomonas rhizophila strain GA1 plasmid unnamed1, complete sequence | 73863-73898 | 8 | 0.778 |
NZ_CP017603_3 | 3.13|2542740|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2542740-2542775 | 36 | NC_018493 | Bacillus cereus FRI-35 plasmid p02, complete sequence | 23134-23169 | 8 | 0.778 |
NZ_CP017603_4 | 4.27|3726678|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT | 3726678-3726713 | 36 | NC_021709 | Alteromonas mediterranea 615 plasmid unnamed, complete sequence | 89284-89319 | 8 | 0.778 |
NZ_CP017603_4 | 4.52|3726681|36|NZ_CP017603|PILER-CR | 3726681-3726716 | 36 | NC_021709 | Alteromonas mediterranea 615 plasmid unnamed, complete sequence | 89284-89319 | 8 | 0.778 |
NZ_CP017603_3 | 3.5|2542210|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2542210-2542245 | 36 | MK017819 | Clostridium phage CPD4, complete genome | 2759-2794 | 9 | 0.75 |
NZ_CP017603_3 | 3.5|2542210|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2542210-2542245 | 36 | MN417334 | Clostridium phage CPAS-15, complete genome | 6638-6673 | 9 | 0.75 |
NZ_CP017603_3 | 3.5|2542210|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2542210-2542245 | 36 | KY206887 | Clostridium phage Clo-PEP-1, complete genome | 44977-45012 | 9 | 0.75 |
NZ_CP017603_3 | 3.5|2542210|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2542210-2542245 | 36 | MF001357 | Clostridium phage CP3, partial genome | 36076-36111 | 9 | 0.75 |
NZ_CP017603_3 | 3.10|2542542|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2542542-2542577 | 36 | NZ_CP019175 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Give strain CFSAN024229 plasmid pCFSAN024229, complete sequence | 47165-47200 | 10 | 0.722 |
NZ_CP017603_3 | 3.16|2542938|34|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT | 2542938-2542971 | 34 | MH622943 | Myoviridae sp. isolate ctbc_4, complete genome | 337301-337334 | 10 | 0.706 |
NZ_CP017603_3 | 3.11|2542608|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2542608-2542643 | 36 | KJ010548 | Bacillus phage Bp8p-T, complete genome | 148296-148331 | 11 | 0.694 |
NZ_CP017603_3 | 3.11|2542608|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2542608-2542643 | 36 | NC_029121 | Bacillus phage Bp8p-C, complete genome | 148294-148329 | 11 | 0.694 |
NZ_CP017603_3 | 3.12|2542674|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2542674-2542709 | 36 | KJ010548 | Bacillus phage Bp8p-T, complete genome | 148296-148331 | 11 | 0.694 |
NZ_CP017603_3 | 3.12|2542674|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 2542674-2542709 | 36 | NC_029121 | Bacillus phage Bp8p-C, complete genome | 148294-148329 | 11 | 0.694 |
1. spacer 3.11|2542608|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013332 (Fusobacterium hwasookii ChDC F174 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
tgcaattttttcattttaaaactcctcct-tttcata CRISPR spacer ttaaattttttcatttaaaaagtcctcctaatttat- Protospacer * ************* **** ******* **.**
2. spacer 3.12|2542674|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP013332 (Fusobacterium hwasookii ChDC F174 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
tgcaattttttcattttaaaactcctcct-tttcata CRISPR spacer ttaaattttttcatttaaaaagtcctcctaatttat- Protospacer * ************* **** ******* **.**
3. spacer 5.1|4200049|29|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder matches to KY290955 (Aeromonas phage 65.2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
tttcactaataacgtgatcatcaacgctt CRISPR spacer tttcactaacaacgtgatcctcaaattcg Protospacer *********.********* **** ..
4. spacer 5.1|4200049|29|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder matches to NC_015251 (Aeromonas phage 65, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
tttcactaataacgtgatcatcaacgctt CRISPR spacer tttcactaacaacgtgatcctcaaattcg Protospacer *********.********* **** ..
5. spacer 3.11|2542608|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP031730 (Stenotrophomonas rhizophila strain GA1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tgcaattttttcattttaaaactcctccttttcata CRISPR spacer ttccattttttcattttaaaaattctcctttaaaat Protospacer * * ***************** *.******* *
6. spacer 3.12|2542674|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to CP031730 (Stenotrophomonas rhizophila strain GA1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tgcaattttttcattttaaaactcctccttttcata CRISPR spacer ttccattttttcattttaaaaattctcctttaaaat Protospacer * * ***************** *.******* *
7. spacer 3.13|2542740|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_018493 (Bacillus cereus FRI-35 plasmid p02, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
-----atacttttggtacaattttataccaaattacattac CRISPR spacer tcaaaaaac-----gtacaatttaatacaaaattacattac Protospacer * ** ********* **** ************
8. spacer 4.27|3726678|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_021709 (Alteromonas mediterranea 615 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
ttttagaagggtgtttttttatgccttttaaaaagg CRISPR spacer aatttctatggtgtttttttatgcgtttaaaaaagg Protospacer ** * *************** *** *******
9. spacer 4.52|3726681|36|NZ_CP017603|PILER-CR matches to NC_021709 (Alteromonas mediterranea 615 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
ttttagaagggtgtttttttatgccttttaaaaagg CRISPR spacer aatttctatggtgtttttttatgcgtttaaaaaagg Protospacer ** * *************** *** *******
10. spacer 3.5|2542210|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK017819 (Clostridium phage CPD4, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tataatcttctagcatttctaagatttcatcaaaat CRISPR spacer catcttcttctagcatttctatgatgtcatccttag Protospacer .** **************** *** ***** *
11. spacer 3.5|2542210|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN417334 (Clostridium phage CPAS-15, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tataatcttctagcatttctaagatttcatcaaaat CRISPR spacer catcttcttctagcatttctatgatgtcatccttag Protospacer .** **************** *** ***** *
12. spacer 3.5|2542210|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KY206887 (Clostridium phage Clo-PEP-1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tataatcttctagcatttctaagatttcatcaaaat CRISPR spacer catcttcttctagcatttctatgatgtcatccttag Protospacer .** **************** *** ***** *
13. spacer 3.5|2542210|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MF001357 (Clostridium phage CP3, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tataatcttctagcatttctaagatttcatcaaaat CRISPR spacer catcttcttctagcatttctatgatgtcatccttag Protospacer .** **************** *** ***** *
14. spacer 3.10|2542542|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019175 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Give strain CFSAN024229 plasmid pCFSAN024229, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
ccatatttttttctgtaaaaaaacatttctgaatca CRISPR spacer cgtctgttttttctgtcaaaaaacatttttgacaaa Protospacer * . ********** ***********.*** *
15. spacer 3.16|2542938|34|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH622943 (Myoviridae sp. isolate ctbc_4, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
-----atccttgtttttctagaacttctaatgaaatttg CRISPR spacer caatgat-----tttttctagttcttctaatgaaataaa Protospacer ** ********* ************* .
16. spacer 3.11|2542608|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ010548 (Bacillus phage Bp8p-T, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
tgcaattttttcattttaaaactcctccttttcata CRISPR spacer tttgttttttccattgtaaaactcctcctttaatcc Protospacer * .. *****.**** *************** .
17. spacer 3.11|2542608|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_029121 (Bacillus phage Bp8p-C, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
tgcaattttttcattttaaaactcctccttttcata CRISPR spacer tttgttttttccattgtaaaactcctcctttaatcc Protospacer * .. *****.**** *************** .
18. spacer 3.12|2542674|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ010548 (Bacillus phage Bp8p-T, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
tgcaattttttcattttaaaactcctccttttcata CRISPR spacer tttgttttttccattgtaaaactcctcctttaatcc Protospacer * .. *****.**** *************** .
19. spacer 3.12|2542674|36|NZ_CP017603|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_029121 (Bacillus phage Bp8p-C, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
tgcaattttttcattttaaaactcctccttttcata CRISPR spacer tttgttttttccattgtaaaactcctcctttaatcc Protospacer * .. *****.**** *************** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
218855 : 267533
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017603|218855:267533|DBSCAN-SWA TCTAATATCTCAAAGTTATGTTTTTAAAACTCTTGAAGATTATGGATTGTAAGGAGGTATAGAGAATGAAAAAAGCTATGATTATTGTCCTTCTGCTCCTTACCTTCATGATAGGCAAAGTGTTACTCCATTTATAATCTTCTATTCTTTCAATCACGCCAGCTTTTATTGGGTTTTGATGAATATATCGTAATACTATGAGAAAATAATCATCTGTATTTACTCGTTCGCTTTTAAATCGATTTTGAAAAAGATGTCCTGACCTTCCATTTTTGATATTATGGTATTGTGCATAGCCCACAGTTATTCTTCTTACGACATTTCCGATCTCCTCTGATTCTGCTTTAAGCAATATATGTACATGATTCGTCATTAAACAATACCCATATACTGTGAATTCTGTCTTTTTTCTTGCTGTTCTGGCCATATTTATCACCCATTTTTATCCTATCATGCCTATCTGTGCATGGCAATCAAAACGTCCCCTTGGCTTATGTATCTGTGCATGACAATCAAAACGTCCCCTTGGCTTTATCAAAACGTCCCCTTGGCTTAGGCTTATGATTTTATCTATTGATACAGTTCATCAAAGGTTAAAGCTTTCCTCTATTATGAGGGATACCTATGTTGAAGTTGAAGATAGGGGGAAAATGAAAATTAATGAGGCTTACGCTTATAAAGGTAACCTACCTACAGGCGCCAATAATTTTTCAGCTAAACCATTGTTTATTACAAATACTGGTGGTAATAATAACAATAAAAGTTTTTTACATATATCTAACTAAAGGATGGGGAGAGTAAAATGGATACTTTGAACCAATATCGAATGGAAAATGATGCATTAGGTAACATAATGATTCCTTCATCAGCCTACTATGGACCTCAAACGCAACGGGCTGTTGAAAATTTTCCCATAAGCGGAATACGGCTTCCTAGGTCCTTTATAAGAACTCAAGGGATTATTAAAGCTTCAGCTGCATCTGCAAACATGCAGTTAGGGATGCTCTCTCCCGAAATTGGAAAAGCCATCATACAAGCATCTGAAGAAGTAATTGAAGGAAAATGGGATATGCACTTTGTTGTTGATGTATACCAAGCAGGAGCAGGTACATCCCAGAATATGAATGCCAATGAAGTGATCGCGAAACGTGCTTCGGAAATAATCGGTCATGCACAACAAGTCCATCCTAATGATGATGTAAATATGTCACAGTCTACAAACGACACATTTCCTTCTGCTCTGAATATTGCAACTGTAGAGGCTATTGTTCAAAACCTACTTCCTGCTTTATTAGGATTGTACCAAGAACTTCAAAAAAAAGCAGATCAGTTTATGCCTGTCTTAAAAGCAGGGCGTACACATTTGCACGATGGCGTTCCAATTCGTTTAGGTCAAGAATTTTCAGGATTTGCTGCAACCATCCATGCTGTTTATCTGCAGCTTGAAAAACAACTTGATGGATTATACGAAATTGGTTTGGGGGGAAATGCAATCGGAACTAGAATAAATTTACAACCCGAGTATATTCCAAAAGTCATTCAGGAAGTTTGTAATCGCACTAAACTGCCTTTTCGTAAGCCTGCAAACATTTTTGCATTTATGCAAAATATGAATGAGCCTATACGCTGTATGCTGACCTTAAAAGAACTTGCAATTCATCTAATTAAAATTACTAGTGACTTGCGTTTACTTAGCTCTGGACCTAGAACAGGATTAGCAGAAATTACCCTTCCCCCTGTTCAGCCGGGTTCCACCATTATGCCGGGAAAAGTAAATCCCGCTATTTTAGAAATGACGCATATGGTATGCTGCCAAATCATTGGCTATGAAACCGCAATTGCCACTGCTGGAATGGCAAGTCAATTGGAAATCAATGTGATGATGCCAGTAATTGCTCATACACTTCTTCATTCTATCGACTTATTGGCAAATACTATTCAGATACTTATAACAAAATGTATTAGCGGTATTCAAGCAGATGAAGAAGTATGTAAAAAATGGATGCAAGAAAGTCTTTCTTTGATTACTGGATTAAGCCCTAAACTAGGTTACGACATGGCTTCACAAATTGGATTGAAAGCAGATGAGGAAAATAAAACCATACAACAAGTACTTCAAGAAAAAGGATTGCTAACAGCAGAAATAAGTAATGCTATAGATCCGAATGGAATGGTGTAACAATTATTCAGTCATCTTTACCATTATTAGCTATGACTATCACGGCCATATCCTTCTCACGAGAAAGAAGTATCTGAATACTTTGACATACCAATGGATCACTATCTACACTCAAGATTTTCATATGCTCAGTCCTCTTTTCTTACAAAACAGAATTATAAAATTCAACACCATCCCTTCTTACTAGCATAGAATAATATAAGTTCAAAAATAGTCTGGAGGGAAAGACATGTTGTATAGCCCGTACTATAGCTTAGACCAAAGAACTCTTATGATCGTCTCCTCGGCTTGGGGTGATGTAAATGGTGATGGAATACCTGATCATGTCTATCTTGCAGGTGTGACAACCACAGATAGTCCATTTATACAAAAGATTACACTTGTTATTCAGGATGGCAGAACTGGTATGTTTCAATATATTCCCCTTACATCTAATGCTGGATACAACCCTACGCTGTTTTTAGGAGATTTTACTGGGGACGGCATTAAAGATATCATGATTAGCATTGCATCTGGGGGAAGCGGAGGAATGATGTACTACTACATTTATTCCTATGTTGGAAATATACCAAAACTATTATTTGACTATGATGTATTCAATGAGGCTTATCAATATCAAGTGGTTTATAAGGATGATTACAAGGTAGACGTGATAAATACTACAACAGGTATAAAATACGTAATTGATATTACCTATAAAGGCCAAGATTACCTAAATGAAATCTATGATGCAGATGGTAAGCTGAAAGCTCCCCTTGAAGGATTTGTAAACCCATTGAGTGGTCTCTATCCTATAGATTTTGACGCTAATGGTGTATATGAGCTACTGGCATATCAAAGAATTTCTGGCCGATTTGCAGCTGATGCTTTGGGATATCTTCAAACAACCTTAAAATGGAATAGCAGAAACTTTGTTTTAATGAATCAATACGTGGCTATTTTGGGATCAGAGACCTTATTATAAAAACTCTTTCAATTTGTCTCTTGTTACATCTAAACTAGATTGTAGCAAAGATATTTAAATGTATTCCTTTTGCGCATAAAACCCTTTGACTCCCCGTTGCTCCACTCAGGATGACAAATTGTAGCTTAAGTTAACGCTATTGAGTTTTAATTAACATTACAATGCCTACTCATAATTGCATTTTTATCTTAGCAAATCTATAATAAAAGCATACGCTTTTTATTTAATCATTTTATAAGTAATGAACAAAATATCAATAAGAAAACTTGGTGTAGGCAGTGAAGAATATTATTGAAACCATCGCAGAATCCAAAATCCGTTGGATGGGTGACATTGTCACCCATCCGTTTGTATAATCCTAAGCTATCTTCACTTTATTATTCTTCCTCCATGTACAACTTTTCCATCTTGGAGCTTTAATTTCCAAATGACTGGAAACCTTTCACTTATCTCTACTTTAATAATTCCATGAGCTGCAAAACATATTAGCTGAAAGTTCAATTTATCTGCTATTTCAAATATAGGGTCCAATACACGTAGTCTGAGGGAATATAAAGCACATTTCAGTTTTTATCTAAAATTATTAATGTAGATATACTCTTTTGCAACAATATGATATTAGTATACAATTTGCGATAGTATACTAATCCATATTAAGTTCTTTTACATTCCATTCTATAAACCTAACTACACCTATACTTAAAATAAAGGTTAATGCCATGATACTGTAGAGGTTTAAACGAATATCTATTAAATGTCCATATATTAATTGGCCAGGTGCAACACTTGCTGTAGCAACAGCAGTAGAAAAGGCACTAACCTTCCCAAGCATCTCTTCTTTAACCTCTTTCTGAATATAAGTTAAAGATATGACGTTTGACAAAGCCAAAGATAACATTATTGCAAGACCACCCATCGAATAAAGTGCTAAAATACCCAATTTGTTTTCCGTAGTTAAATAAGTTGCAATACCCATCATAATAGTAGCTATCACCATAGGATACATGGTTCTATATATTCTCTTCATTTTAAACAATTTAGGTCTAAATGTTACCAATAAACCTCCTATTATCATCCCTAGTACAAATATTGCTTCCACGAAACCATATGTGGCTGAAGACATATTTAGTTTTACTTTGATAAAATAGGGAGATACAATCGTTAGAATTGGCACTACAAATACGTTGGTTAATCCGTAAGAAGCAATAATCCCTAATACAATTTTCTTTTTTTCTTTCAAGTATATAAAACTCTTCTTCATTTCCTTCAGGGATTCTAAAATAGGATTTATCACCTTTTCCTTTAATTCTAAATCTGGTACTTTCAAAAACACTTCCAAAATCGCCGCTATTAAAAAACTAGCCGCATTTAATATTACGATTGTTTTAATATCAACAAAACTGTACAATATTCCAGCAATGATAGGTCCAACTAAATTAACTATAGCTGCAACCTGTTGAATGATGCCATTAGCTGAGGCCAATTTTTCTTTATCAACAATTTGAGGAATACATGCTGTAACGGCAGGACTATACAAAGTATAAATAATCGATAGTATAAACATGACACCCCCCACTATCATGGTACTATCTCTTCCACTTATTAATATCATTGAATATACACCCATTAATATCGAACTAAAAAAATCAAGATAAAGCATTATTTTTTTTCTATTAATCGTATCTGCTAATAAACCTGCAATAGGTGCAAATAATATATATGGAATAGTTGATATTGCTAATATTCTTGAAAAAACAGCGGCACTTCCTGTTAAGTCTAAAATATATAAGGACATACAAAACCTTAGAATTGCATTTCCTAATAACGATATAATCTGACCTATTACTACTATAATAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP017603|218855:267533|244695_245118_+|WP_070963544.1|DBSCAN-SWA MKKINLKDYYSHITVDTYIDIPDEVFSIFEEYLKVEQAYQSRIRYHKAYYSLDRGDGIEHSALFVSLSPDEIYERKLTNEQLHAAIATLPDKQAKRIYAHYFLGMSKTAIAKAEGVSETAIRIGIEKALMNLEKIFKNSF >NZ_CP017603|218855:267533|232733_233606_-|WP_070963527.1|DBSCAN-SWA MIQYAEYKTILSKKNNMNIYRGCTHGCIYCDARSECYGMTYTFENIEVKTNAVELLDQALSKKREKCMITTGAMTDPYIPLEKELKNTRKCLEVMEKYGFGVCLLTKSDLVLRDIDILKRINQKSKCVVQMTLTTYDEELCKILEPNVCGTKRRFEVLIEMHKAGIPTVVWLTPILPFINDNYENISGILDYCKQAKITGLLTFGIGMTLRYGNREYYYQKLDDYFPNLKKEYIRKYGSSYGIKSPNNQKLTRVIKKFCKDNNIIYGEKEVFRFCTLFPEKNQQIALFDV >NZ_CP017603|218855:267533|235205_236330_-|WP_070963531.1|transposase|DBSCAN-SWA 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49 | Leptospira_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
290570 : 301975
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017603|290570:301975|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP017603|290570:301975|301564_301975_-|WP_070963623.1|DBSCAN-SWA MYLGQDDRVTVEHQFDRLCKKVMLGEARSCKKERAKRSQKEISINEVKEIATYDEYEIENTFQWGDEVFTFKNDFLYEAVRLLEKDKRNIILLSYFLEMTDEEIARTLKAIRRTINYKRNRALKELKKRLEDWNEY >NZ_CP017603|290570:301975|294070_294226_-|WP_156778683.1|DBSCAN-SWA MKIGRLIEILKAYDKEYKLYDSENPEFYLSSLEYQEEEDRFYMYFQEEEEK >NZ_CP017603|290570:301975|296439_296655_-|WP_070963613.1|DBSCAN-SWA MHHGDYLYTVEEVAQILKVNKNAVYDLINAKVLRALKLGRLKITRFEVLRFLKEYTGKDLSNLNEIKELNH >NZ_CP017603|290570:301975|298078_299209_+|WP_070963618.1|integrase|DBSCAN-SWA MQGGVRKRGDSWYYFFEAGKVGGKRKKIERKGGNTKKEAQEALRQALNEFEKAGAVITESQLSVADYFDYWYKEYVLINCKYNTQQGYRNIIENHIKPTLGVYKVKSLSPAVLQEFLNKKYRDGFTKNTLAGFYGVLSGALKMAVYPYQFMKENPMQYVSMPKYDNTKKDKEDLKVIALEDFKRIIDRFPEGSSFYIPLQIAFHTGMRATEVCGLTWDCVNLEKRSIKVEKIVIKKDREWVFGTPKTLSSNREIFIGDTLVNILKKHRKAQMENKLEYGKHYIKSHFVCTKENGELVSPDSLKYLSRVVNYELMIPFNFHSLRHTHATMLLEAGANIKEIQERLGHSKLATTMDTYSHITNKLKQDSVDRFESIIK >NZ_CP017603|290570:301975|290570_293279_-|WP_070963608.1|DBSCAN-SWA MNLEGRIDYLKFYQKHIQKGKISGENLVGLCPFHEDTKPSFGANIKTGVYNCLACGEKGNAITFLAKLYRIDNKEAYRLLLQEEGLYEENHQGRKDANNHRNRFINTTDNKESNHSTRKPSDSEGSKHNNQKNNIQDTKTPEYMTTKATTKKEVPKYIVEDYCKEKRLPEDFIRSLGIRDGKTGITIPYKDEAGKILSNRQRYHRDSPTRFSWARGSKINLYGLWQIEKIKSIGRVILVEGESDCHTLWHHGIEEILGVPGATTFHGDWVEMLEGLDVYIHHEGDMGGDTFFNKISKTLKERNFKARIYKIQCSSLGVKDPSDLHIKDPNTFKENWQRVMAEAEEIFLINLQEEEENLIPNAPVKLRQPTGWRITEGGVEMINAKTRLPYLVCRTPILISRRIKALGMEEEKVEIAFFRDKKWHFVREQRSTIFQARTIIKLADVGVTVTSENAKFLVRFLENLEAENFDIIETLQSVNQLGWHGENFLPGREGELVLDMEHGERRWVEAYSKRGELKDWIKMMKPLRQNTIFRFILASSFAAPLLKLLNHRIFFVHNWGDSRGGKTAALKAALSVWGNPEELMTSFNATNVGLERLASFFNDLPLGIDERQVAGGKQEYIETLVYMLSMGYSKVRGTKTGGLENQKSWRSIVLTTGEEPLTTMGSQTGVHTRALEIHGSPFEREEEARSMHNFITMNYGVTGPFFIEKLMEDMKPHELQDRHKEIQETLMGINENHKKIGSHVSSVAVVILADELMNKWLFLEKENISIAMGNEILSNLEDMMHTDIVERAYEFIQGWLISNIEQFRGNPRRESYGVMEDNRFYVFPQILQEALDKQGYSYKKIIQGLGDRGYIDITYEKSGKKRQTVVKKIEGKACRMVSFDLSGIEDLEETPPFKAVTL >NZ_CP017603|290570:301975|299305_301039_-|WP_156778879.1|DBSCAN-SWA MKANKTFVNRKLGQTLEQIRVAPYCRVSTDSEDQAKSYKSQIKYYSDLVKEKKEWVLVDIYADEAITGTRDDKRSDFLRMIEDCKKGLIDMIITKSIARFARNTVDTLRYVRMLKEMGIAVYFEEENINTLTMDGELLLTILASVAQQAVENTSADVKKGLKMKMKRGELVGFNSCLGYDYDKEAQTISINETEAIAVRYIYGRYLEGAGAFTIARELNDLKYKTKNGSTKWHDSSVRKILKNEKYKGDLLQGKTFTIDPITKRRLENFGEEDKFYCEDHHQAIISREDWDEVQRIMQVRGEARKTIKGTVRQKLSRQYAFSSKLECAFCGTNFSRRSWNANTPHQKTTWQCVTSTKKGKKYCEHSKGIPETVVEGAFMKSFALLVRDKSKILDEFLERVEQSFNDNSSEKKVKQIEKRIDVLKKKISKLTDLYLEEAIEKKEYQTKYTELNKELDELVETYEDLNSRMVDEIQMKKRIRKLKNMLEADEIVTEFDRQVFENLIEKVVVGEIDENGSINPYKLTFIYRTGLKDKINPPYDGSKKRKKKSSDVVCSDQANDVKTICSDQGHDTCGNCR >NZ_CP017603|290570:301975|301302_301575_-|WP_070963622.1|DBSCAN-SWA MSINTVSKTISYETIVKATQGDTHSIDQIIGFYTPYMQALATVEYVGDNGKIYFAVDEEMLGRMRAKLMKRVMKFKPVPYQRKEKERCRC >NZ_CP017603|290570:301975|296253_296409_-|WP_156778684.1|DBSCAN-SWA MKSKLAAILWPNSKEVGVKEAIAPMPIKVKAFQHQVQGYNMALRTMGVMEG >NZ_CP017603|290570:301975|297136_297529_+|WP_081562170.1|DBSCAN-SWA MTIGERIRKMRKEKRYSIMDIRDLTGLSKSTISEVENDKSNPTTETLQKIAKALGVSVDTFFKEETDQDEAPALPIEFTTPQKAMEFILKQPAIMGFGGFDVNKLGDEEIVEFANELLRQLELLSYKYKK >NZ_CP017603|290570:301975|294240_294648_-|WP_070963611.1|DBSCAN-SWA MKEIFTLADSLKELKEWKKQLDQERKEVNGKIEALEESLSQAMIQEELENFNRGGMMYYLNTKLYANAIPQRKEALFTALKKEGYGDLVYETVNANSLAAFIKEQVEENDEKLPSWLEGLVNTYEKISVGMRKGK >NZ_CP017603|290570:301975|297546_298011_+|WP_070963617.1|DBSCAN-SWA MMWIDEVVTGLLDLYATKDVYELYEALEISIVYLEEDSILLQGHDALYNRNYLDREVVFLRGGLSLEYERFILAHELGHALLHTHLVSNTFHSLTNLDKLEKQASYFAVRLLDVKLDSIALEGFTIEQIASTLELPMECLEIIREMEEGYGLNP >NZ_CP017603|290570:301975|293328_294069_-|WP_070963610.1|DBSCAN-SWA MSENKGDKKAIEKTGFQLPIAQEEIKEAMLQEMEGLELSFDRAKIPSGGGLAFEVPGEEADRPQLLQELVGVMVDHHPVNGYWQEKYTGGSNPPDCSSMDGKKGEGSPGGDCKTCPLNEFGSDEDRKGKACKNMHRIYLLKSGEMLPLLLTLPPTSLKNFSNYMAKRIITKGHRSYSVVTKITLKRTQSSSGIPYSQAQFTVAEVLEKDIAQQLAEFAEEIKRITREVEVMEDYMPETEEAGELPF >NZ_CP017603|290570:301975|296720_296930_-|WP_070963615.1|DBSCAN-SWA MKNKIKEVLRKRGIKVSYVLSVTGFSKSYFYDVMKGKTVPSLMNARKIAEVIEVPLDELFPVEKLSKQE |
13 | Thermoanaerobacterium_phage(50.0%) | integrase | attL 282590:282604|attR 302982:302996 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
636178 : 654098
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017603|636178:654098|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP017603|636178:654098|645841_648004_-|WP_070964118.1|integrase,transposase|DBSCAN-SWA MIAVNTLIRWKKTDEVEKIERILWIDRKQDIAYVIDIFLNNSPFSRCVSEIEGAISEYTALLYEDDPFTKIIHEEDISELAKERRDKAWQIICELIAQEPMIFVPKARKELIMKYAKFHNVHEKTVYKYLKNYWIRGKTINALLPDYYRCGGPGKEKSSGAAKRGRKRMNKELLGEGINVDEEIKQVFRAAINKFYNTKAQNSLKLAYELMRKEFFVSDYKTENGILIPIIKPDNEVPTYAQFKYWFEKERNIKKEITLRKSAKKYEQQNRAIIGNSTVEALGPGSIYQIDATVGDIYLVSRFNRNWIIGRPVIYVAIDVFSRAIAGLYIGLEGPSWIGAMMALENTASNKVEFCKRFDIEIEENQWPVHHLPEAILADRGELEGKNIENLINGLHIKIQNTPPYRADWKGIVEQHFKITNTRVKPFLPGTIDSNVRERGDKDYRLDAKLDIFQFTQIMIKCALYHNNHHYLKNYCREEMMINDDVKCIPRELWNWGIENRSGKLRQVSEEIVKLNLMPTATATVTGKGIKFKNLYYGSSITLKERWFEKARNKGSWRVNVCYDPRNLDYIYIRNPNEMDFDKCYLLEYQSGYQDKSYEEIEYLIEKEKIDAKIASEKDLQNKIELITEIEHIVKESDKQLKMNKKTEESDRKRLGGIRKNRKIERMLNRESETFELKQEKVNINSQVIDLEIKEKKSNAVNDLELLRKKQKEALSKIHE >NZ_CP017603|636178:654098|638224_638563_-|WP_070964102.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP017603|636178:654098|639489_640368_-|WP_070964106.1|DBSCAN-SWA MNWQDKYLSPFIEREKVSYSKIKKIIKDFTFLFKHSLSFHEQPKEPAEQLPDFISEDTDIIYNVCKEFFDNANSRIDKLEDKAITLLSYVSALFAFISFIFINASNWVTKTMLIFSMGLLILSILISFRCVNVKGRKTFFLPDIFDFNSEVPAENFDRKSISKTLLNSAIYNQNIADNTADILKAARYTLVLAVIIGTTGFLLGVGEYFGTTESIEIVRIDNQIELTDIERQLDNAHKVLNEINHNINTLNNEKKLQEQIDKLMDEMKLIETNYQNLFEKLDRLENDTGANQ >NZ_CP017603|636178:654098|640382_641324_-|WP_070964108.1|DBSCAN-SWA MTVYPKVLFVTNKDDLAIDYLIYKFMDRKIPYLRLNSEDITQIGMTYGFGKSVNLKYQDYEYSFEKLQSAYFRRAPSIFPNTHDLNDMKFINGERKDFFEGLYLSLNCKWVNPIFATYKAERKIYQLSLAKELGFKTPNSIVSNSSKQLLNFIENNGTCIIKPICHGLQVTPQGSYSIYTSEIKDINWLKQDIIFESPVFVQNKIKNYRDIRATVVGKEIFAVEIETNDSEKTDWRKPNIIKEYKLHKLPEPLTNLMFRLHEELNLVYSAFDFVLTPSGEYYFLETNPAGEWVWLERELNLPISDAIIYELLN >NZ_CP017603|636178:654098|650702_651053_-|WP_070963578.1|DBSCAN-SWA MLNIDKVDKVYLACGVTDLRKNIDGLSMIVQTEFKLDPFEKALFVFCNRQMNKLKILHFDDGFWLYYHRLERNKFRWPMSKEEALKVSIEELRWLLKGYEVRTISKFKPVKERNHF >NZ_CP017603|636178:654098|638901_639417_-|WP_156778692.1|DBSCAN-SWA MEVSIGMGIANIVTEPVKGIFSKLNRFTLLQFLWIISLYFFVMNSLYSFLSKIDNESFDLSNIDWILEYNELILKFLKDNERIWEIFTVLLFISSIFVVVVAHTLFENYMFIKSCSRYGGDLSIWSLIIYMTYKLYSFTGQFFIIALLILTSLYYWIKENKSRIYRSFFPT >NZ_CP017603|636178:654098|644169_645849_-|WP_070964116.1|DBSCAN-SWA MNRKIIIPNGGEAIKAEYKEQLIQEYSGNPLIEALPQISSKIEVIDKLSVYPKYDDKERILESHYRVHLVQRLFQCFQPLEIHLDIESRLSRVIRQSYLARNPFRPEFASGLQDGYRMIQNLSLDLTVNSSFRTTAAGFSIVGVSGMGKTTAVNRILSMIPQIIVHSKYKENNFSIYQLVWLKLDCPYDGSIRGLCMEFFNKVDSLLGTKYYQKHINGRHTVDTMLSVMSQIARSIGLGLLIIDEIQHLKQAKSGGSERMLNFFVTLVNTIGVPVVLIGTMKALSLLQGEFRQARRGSGQGDLTYERLKQDDNWELLLSALWDYQWTKTPVFLTSRISNMMYEHSQGIIDIAVKLYAMAQIRAILSGSELVDEALIRQVAEENFKLVKPMIEALKSGDIRRIAQFEDICPINFEEFISLQRPRYDLDINMKELQLLKKRKKEAEENKTSREKAIMKLIELEIDTESAETAIAEVITIDGESIGTGELVIKALQKIADSEKRQKKKQRKKKDVKARGRDDIRAIVEEDKHKQVSAYTMLKEKGYIKHSDVDCCMEGKKIC |
16 | Leptospira_phage(100.0%) | integrase,transposase | attL 648602:648617|attR 653872:653887 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1130780 : 1181019
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP017603|1130780:1181019|DBSCAN-SWA TATGACTGTTGAGCCAATCAGGGATAAAACGAAAATTAAACAAATGTATCAATATTTAAATGGAAAAGATCCAAAATATGGTTTATTATTTAAATTTGGTCTTAATACTGGACTAAGAATTAGCGATATATTACCAATAAAAGTGAAAGACATTCTAAATAATGATGGACAATTTAAAGACTATTTAGTTTTAAGAGAAAAGAAAACTGGAAAAGAAAAAAAAATCAAATTAAATGAGACGCTTCGTAAAACCATCCTTATATACATAAAAAACTATAGTCTTTTGCCTGAAAGTTATTTATTTTCAAGTGTCAAAGGAAACCATATTGGTAGAGTTCAAGCCTATCGTGTGCTTAAGGAAGCAGCAACTGTGCTAGGTATTGAAAACTTTGGTACCCATAGCCTGCGTAAAACCTGGGGCTATTGGACGTATAAGATATCACGTTATAACGTTGGACTCATAATGGATACTTTTAATCATAGTTCACAAAATATCACGCTCCGTTATATTGGTGTTAATCAAGATCAAAAAGACGAACTGTATTCGTTAGTACAATTTTAATTTAATAAAAAAGGCCGGGTATTTTTTCCTACCAGGCCTTTTTATATTTCACAAATATAATATAAAATTTTACATTTTTACTAATTTTGTGCAGGAAATTTACCATTTGTGTCGAATTATTTCAAGATATGTATTAAGTAACATTTTAACCATATTGTTACATTAAAAAACTAAAAAACCTCTATTCCTTGATTTAACTTCATAGTTTCTAATAAATAAGACATGGTTTAAGAAAGGATTTTTGCCTCTCTACAACCATGTCCTATGACAAAACTTTATCCTTCGGTGTATTGCTAAGACGCCCACTTTAGCAAGTGGGAGATCAAGCACTACATCCTCGAAGTAAATTCGGCTACAATTCAGGGGGAGTTTTTACTCCCCCTGAATTGTAGCCGAATTTTATTTTCTTTAATAGAACTTTATTTGATACATACATTTCATGTATACACCAAATAAACATTTTTCACCCTGCAAATAAACATTTATCATAATTCTCCCCACAAGCCCCTACTCAAGCCAATCCCCATTTTTATCCATTTTATCATCCATTCTCAATTCCATTCACTTTTCCCTTAAATCTTAGGCCTTAATCCTGCTGAAATGCAAATAAAGTTGTTTCAGAATTAAGGGTTAAGGATCAAGGGTTAAGAGATGTTTTTATCCATTTTTCTTTTCCATTCTGTTTTCCATTTAGGGGCTTCAGGTCTTTATTTCAGGGCTTTTTAGGGACTAGGTTTAAGGTACAAGGGGGTAAGTCCTAAAAACGAAAAAACATGGTACAGGGAGGTTTTTACGCTTCCTGAAACCATGTTTATGATAGAACTTTCGTGTTGAATTTGATTTTTGATATAAGTTTATTTGGGTAATACATAGTAAGAATTCATGTTTTAAGGGCTATGAATTAAGATTTCATAGAATCTTTTAAATATATGTTTATTTGTGTGATTTAAATAGTAATATTACCTTATTGTTATTTCAATATTGTTCTTTCGTTGAGTTTCTTTTGTGCCTTCAATAGGATACAAAAACCAGCCTAGATTATCAGTATTATCTTGATAATCTTTGCTTAGTAAATATGTAATCTCAATACAATTAGTAATAAAATACGAAAATGATAGATTAGATAATTCATATAAACTCATACAAGGATTTCCATTATTTAGACTTGGATTTCCTTCTTCCCAAAACTTAATAAACTGATTTTCTCCTATAGCAATATGATTAACCTTGCCAACTGTATTTTGCAATACATTTCTGAAGTTTAGATTTATTTCTTCTTCTTCAAAATATACCCCTTGGTTACTCTCATAATAAAAAATTCCATTAAAAATCCTTCTATTTATTAATTGTCCAATTTCTTCTGATTTTTTTATTACACTTTCAAATCTTGAATTATCAAACTTACTTTTAACTTCTATTACTCCAACAACATTTGCTGAATTAACAACTACAAAATCACCTTCTTTAAATAGTATTGGATAGGTATTCTCGTATATTATTATATCTATCTGCGTTGAAATAGATTCATAATCATCATTGTTCATGATAAATCCAGTACCAACTGAAAAATTCTTTGGTAGATACTTCTTCAAAACATTCATTAGTATTATTTCCTTGTATCTTCCATCTTCTCCCCAATGACTGTCTCCGATTAAATATCTAACTCTATCTTTTATAATATTAAACTCAAGAGATATAGATTTATGATAATCTTTTATTCTTAACTCTAATCTATTTCTAGGCATTCACGACCCACTTCCTTAACTAATTTGCTTTTTTAAGATACCTCAATGTTATTAGAACTTGAATTAAAATTCTCTATATCTTATATGGATTACTTGTCCTCTTGATTTCATAACTTAATAAATCTATTTTATAGTTTAAAATCTCGACTCTTTTCCAGCATTCTTCAACTTCATCACTATAATATTCTCGCTTACCTTCTCTAATTATTTCAAATAAATGATTCATCCCATTATTCAATAGTTCAATTAAATGATCTACTGTAATAACAGGATCACATAAATCACATCCATTCCCCGAACCAATAGATTCTTTTATTGCAACTAGATATTCAATATCGCTAGGTTTAACTTGTTTCCATTCTTCTCCAAAATATTCTTGTAAGATTGTATCTAGGTTATGTGCAACATATTTCTTTGCATCACTTAATCTTTCCACCCCTTTTTTAACTTTTTTATCTATCCCTATAACCTCTTTAATATCATAGGGCGGAATATTCCACTTTAACTCAACTACCAATAGTTTCAGACTATGGGTATCAAAAATCAATAGGTCCATACCCGGTCTTACTGACTGTTCCTTTGTTTTTTCTTTGTTATAAATTATGGATCTATTGGTTACAAAATTTTTGATAAGGCTTTCTTGCATATCTTCACAATCATTTGATAGATTATTAAATTTCTTTTCATATAGTTTGGGGATAAGGTTGAGAAAGTTTCTCTCGGGTCTTACCATTAGATTAACAAATCGAGAAGAAAGCATCAGTTTATCCTCAACGGGAATAAAAAACTGAAACGATATTTCCGTATTTTTTATGTCTGGATTATAAGTCAGGTCATCAATTATACTCGTTATAATTTCAATATTTAAACCTGTTTCCTTTAACAACAATGATGTCCACCAATCTTTCTTCTCATTAATAATATACCTTTCTGAATCCTCTCTTTTTAAACTAATCGTTACTAAACCATCTTTTTTAGCCTTTTCAATTTCTTTCATATTTAATCGAGTTAAATAATTGTCTAATGCAGAACTAAATTTCTTGAAGTCACTCCATGTATAACCATTTATTTCCCATTCGTTCATGATTTCAAAATCACTCTCATGTGCCTTTTGCATCGCCTTATAAATATCTTCTCTACAGTCTTTTATATTACCTAATATTTGGTTTTCTCTACATACTTTCCTCCAATTATTATATCCTATAAAGTGTTTCTCATCTGGATTTTTACTTACAAACTTAATATGCTCACCATCAATAATTACATCAGTTAGTTTATTATAGGTAGCATACCAGTTTAAAAAAAATAGTTCATATGCAAATGCATAATTCAAAAATTCAACTACTTCGATTAATTTTGGCACAAAATTCTCACCTTGCTTTTGATTACAATAATCATATATCCACCTAATTCCCCATTTTATTGATTCTTGTAAAACAGTTTCATAAGTGAAATCACTTATATCAAATTTGATAGGGCTATTCTTAAATACCTCTTTTAAATTTAATTGCTTATGCATATAAAGTAATATTAAATCAGAATGTCTCAATAAAGTCTCATGTACAGCGTCTTTAAAGGATAACTTAGTTATAGAAAACTCCTTAATATGATCCTCTATTTCTCCTTTAACTTTATATATATGTTCCATTGCCATTTGTCTTTGACTATCTATTGATGAATCTAAAAGCATTGTATTCCCACCTTAACTTTTCTAATTTTATTCACTAAACCTTTATATCTTATATATCATTTAGAGTTCTGACCTCATTATCCTCTAAAACTCTAATTCCTTATCTCATCAATCAATCCTTGAACCAATTGTATTACCTCATTAAGTTTGCTTTCCTTTAATATATCTAAAGAATGTTTGTTTATTATGTATTTAAAAAAACTGTTTTCTGATATATAAATCCTTTTAACATTTTCAATTATTTCATCTCTCACCTTTAAATAATTATCTATTTTATATTTATTTTCACATTGACAATCATCAGATAACCTTTCCCATCTATCTTTAAATGACTTTTCTTTATACTCTCTATCTCTTTCTTTAGCATCAGGATAGCCCTTTAAAAATCGTTTTGGTTGGAAATACGCCTCAAAATTATTAACTTGGTTATTTCCGTTTAATGCTTCTCTCAACTGCTTTCTATACTGACATTCATAACATTCTATAGCACAGTTAAGTTCTTCTAAATCAGATGCGAATTCATATAAAAATTTATCTTCAATAAAATAATACTCAATAGAATGTTCTAATAAAACATATATACTTGATTTTAATTTATCTTTTTTGTTTGTTAATTCTTCTTCTTCAAAATCCAAAAATTGAGGTTCTTCTAGTAATGTTGCTGCTATCTCCCCATACAAACTTTCTTTTAAAACATTTGGATCTTTTACATCTGAATCTCGTAAAATTAAAACAGGGATATTGAAATTAATATTCATTAACAATTCAGCATTAGCATAAAACTTTAGATTTTGACATGAATGTGCTTGTATTACATTTATTTTATCAATCAAATTGTTGTCAATCTTATTAATTAGCGACACTACTACTTCATAATCATCTTTTCCTTCTACAAAAATAATGCCCTTATAATACAAGATATCATCTGGCTTTATTCCTAACTCATTAATAATTTTTTTGGGACTAATACACAAAATTCTTGCTTCTCCATTTTGTTTCTCAA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44 | Streptococcus_phage(25.0%) | integrase,protease,transposase | attL 1131781:1131840|attR 1174011:1174442 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1628072 : 1634138
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP017603|1628072:1634138|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP017603|1628072:1634138|1630958_1631987_+|WP_070973068.1|DBSCAN-SWA MTYKNAGVDVEEGQRAVQLMKNHVKSTFNQHVLEDIGGFGGLFALDLKDIKEPILVSGTDGVGTKLKLAFLLDKHDTIGQDCVAMCVNDILCQGAKPLFFLDYIATGRLKAEKVADIVKGIAEGCKMAGCALIGGETAEMPGFYQDGEYDVAGFSVGMVDKSKVITGKDIQVGDVIIGIPSSGVHSNGFSLVRKVLLEGDKFDLNAPMEELGNTLGETLITPTKIYVKAVSEVLKAVEVKGIAHITGGGFYENVPRILPEEVDAHIQLDSWSIPEIFKMIQKIGNIQEEEMYKTFNMGIGMMLVVQAKDAESTLKVLQEVGESPYKIGEIRAGNKQVVLWRE >NZ_CP017603|1628072:1634138|1632608_1634138_+|WP_070966109.1|DBSCAN-SWA MIKRALISVSDKTGIVDFAKALSKLGVEILSTGGTAKLLRDGGVNAIDVSDVTGFPECLDGRVKTLHPVIHGGILAIRDNEEHQKTLQQQNITPIDLVVINLYPFKETILKEGVTMEEAIENIDIGGPTMLRSAAKNHKFVTVITDPKDYGKVLEEIKEAGDTCFATRYDLALKVFQHTSHYDTLIAAYLGKDKEGFGDTLTLTYEKVQDLRYGENPHQQAVFYREVGLQPGTLVEGIQLQGKELSFNNINDANGALELLKEFEEPTVVAIKHTNPCGVASGEDIYEAYNKAFEADPLSIFGGIIAANQVIDGRTAEKMKDVFLEVIIAPDFTEEALKIFNDKQNLRLIKLTNITAKKEKAIDMKKVAGGLLIQDVNKELIKEIEIVTEKKPTEKMMEDLVFAFKIVKHVKSNAIVLVKDKQTLAVGPGQTSRIWALQNAIKNSTHDLEGSVMASDAFFPFSDCVDAAFKAGVKAIIQPGGSLNDKLSVEACNEKGIAMVFTGMRHFKH >NZ_CP017603|1628072:1634138|1628769_1629480_+|WP_070973066.1|DBSCAN-SWA MEKLQMLYEGKAKKVYKTKNEDQYIVEYKDDATAFNGEKKGTIINKGIVNNQMAALIFAILKEQGVDNHYIETLSDREMLVKAVKILPVEVIVRNVAAGSMAKRLGMEEGKVLKAPVLEFCYKNDELGDPLINEDHVMALELATEEEIKRIKELTFKINEVLKKFFIEKDLKLIDFKLEFGLYKGQVILADEISPDTCRLWDVHTNEKLDKDRFRRDLGKVEESYQEVLNRLKNSK >NZ_CP017603|1628072:1634138|1631974_1632598_+|WP_070966106.1|DBSCAN-SWA MEGIKIAVLISGGGTNLQALIDAVEAGFIKGSIALVISDRKGAFGLIRAENHGIQTMLLDKNTYGTIEKRDAVLLQALQEKEIDLVVLAGYLAIVPQNIIAEYRNKIINIHPSLIPSFCGNGYYGEKVHQEAFNRGVKVTGATVHFVNEETDGGPIILQEIVAIDFDDDWKDIQLKVLKIEHKILPLAVKLFAEDRLEVIGNRVKIN >NZ_CP017603|1628072:1634138|1629519_1630947_+|WP_070966104.1|DBSCAN-SWA MYHEINLDKLKEECGVLGIYTDSDENTSRLLYYGLYALQHRGQESAGIAVNNGLKSNYHKGMGLVPDVFDEDILKRLLGHIGIGHVRYSTSGESYVENAQPLVARYRGGSISLAHNGNLTNAKIIKERLEDDGVIFQTSIDSEVIVNLIARYSGDGMIDAIERTMDLIKGAYSLVVMTEEELIGVRDPLGLRPLCLGKMGDSYVLASESCAFDVMGATLVRDIEPGEIVTINKEGIQSTFYKNNGTRASCIFEYIYFARPDSVIDGVSVYEARKNAGRILAKEHPVEADLVVAVPDSSVPVAIGYAEASGIPFGEGLIKNRYVGRTFIQPTQSMRELAVRLKLNPLKDNLQGKKIVMIDDSIVRGTTSRRLVERLKSAGAKEVHVRISSPPVAFGCYFGIDTPDRNQLIGAVKTVEQIRKTIGADSLGYISTDGLVKSTGLSKEHFCLACFNGVYPLEVPEVGDKKVFERLSGGE >NZ_CP017603|1628072:1634138|1628072_1628588_+|WP_070966101.1|DBSCAN-SWA MKNTTVSIIMGSDSDLPIMREAADILEDLGVVYECTIVSAHRTPDRMYEFAKTAEKRGIQVIIAGAGGAAHLPGMVASLTNLPVIGVPVKTKILNGIDSLYSIVQMPPGIPVATVAINGAKNAGILAAQIVALQDQGVKESLEKYKKDLKQMVEEKALNLEEVGYESYLSK |
6 | Prochlorococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1938448 : 1987355
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP017603|1938448:1987355|DBSCAN-SWA AATGACAGATAAGAAAGAAAAAGTAATTTTTAGTGGAGCACAGCCTACTGGTAGTTTAACCTTAGGCAATTATATTGGTGCTATTCAAAATTGGAAGGCATTAGAAAATGATTATCAATGTGTGTATTCCATCGTAGATTTACATTCATTGACAATACGCCATGATCCAAAGGTTTTTAAAGCCTCTTGCTTATCCTTTTTAGCACAATATTTAGCATGTGGCTTAGATCCTGAAAAAAATATTATCTTTTTTCAATCTCATGTCATACAGCATGCAGAATTAAACTGGATTTTAAATTGTGTTACTTACATGGGTGAACTTAATAGAATGACACAATTTAAGGAAAAATCTGAAAGACATAAGGATAATATTAATGCTGGTCTATTTACTTATCCAGTACTGCAGGCAGCAGATATTTTATTATATCAAACTGATTTAGTGCCTGTAGGGGAAGACCAAAGGCAACATTTAGAATTAGCTAGAGATATTGCTATTCGATTTAATAACGCCTATGGGGAGACTTTTGCATTACCAGAGATACATCTATCAAAAGTAGGCGCTAGAATAATGAGTCTCCAAGAGCCGGAGAAAAAAATGTCAAAGTCAGATGATAATGTAAATGGAACCATCTTTCTACTGGACAGCAATGATGTTATTCTTAAAAAAATGAAAAGAGCTGTTACAGACAATGAAAACAGTGTTACATACCGAGATGAACAACCTGGTATAAAAAACCTTATAACCATTTACTCTAAGTTAGCCAATTGCAGTGTTCAAGAGGTAGAAGAAAAATATGCGGGGAAAGGTTATGGTGTCTTTAAATCAGATGCGGCAGAATTAGTGGTAGAAAGTTTAAAACCTTTTAAAGAAAAGTATGAAGAGTATATGAAGCATCCTGATTATATTACCAATGTTTATAAACAAGGGGCAGCTAGAGCCACTGAAATTGCAGAAAAAACCATGAAGGATGTAAAGGAAAAGATAGGATTAGTATAAAATCATATCAAAGTCTCTATACTAAGTATAGAGGTGATAGAGATGAAGAAAACAAAAAATCCAGTTATTCCTGAAGCTAGGCAAGCCTTAAATTCTTTTAAAGCAGAAGTTGCTAGGGAATTAGGACTTCAAAATAATACCTCTGCAGGGTACGTTGGAGGTAACATGGTCAAAAAAATGGTAGAAGAAGCAGAAAAGTCATTAACTCATTTAGGAAGGTCTTAAGACCTTCCTAAATTTATTGACTATTTCTATAGGAACAGGTATTATTTTAGTAAGAAGGATTATATAGACTTCTATTTAAAAGAACCGGACTTGTGTAATTTTTCAGCTGATTCTGAGGAAGAGATTGAAGGATTGCACAATTCAAGTAAAGGAAGTGAGATATTGAAGAAAAGCAATATTTCTTTTATTTTATTTTTAGCTTTTGCCATATCAGGAATCATTATAGGTATCCATATAGATGCTCTTGGCGATATCCAAAACGAAATTTCTTTGCCCTTTAGTGGTGAAATAGAAGTCCAGGAAGTAGTAGATCTAAGAAAAGCCAATGAGGATATGAAAATAAAAATTAAAGAGTTAAAAGCACAGGTGGAAGAATATGAAGAAGAAAAAGCTACAGAAAATATCGTGCTAAAAAATCTAAGATCTAGAATCAATGAATATAGAATTTTAGCAGGATATGAGGCGTTAGCAGGTCCTGGCATCAAAATCACATTAGAAAGCAATTTGGAAGAAAATATAGCGATGACTGTAGAACAAAAAAAATATCTCATCAACCTAGTAAACGAGTTAAAGGCAGCTGGAGCTGAGGTAATATCTATTAATAATCACAGAGTTGCTTCTAGAAGTGAAGTGACTTTGGCTGGAAATCATATAAATATTAATATGACAGCCATCGCGCCACCGTATGTTATTAGGGCTATAGGAGATGTGGAAGGTTTTCATCGATATGCTAGCTACAGAACTTTGTTATTTGAGCTTATGGAAGGAGACGGTATCAATACTACCATAGAGTTTGAGGAAGATATTAAAGTGCCTGCTCTATCTAAAGAAAAACCGATGGAATTTTATACAATTGTAGAAGAGGCGAATCCACAATAAAAAAACAACAGAATTTATTGAATTCTGTTGTTTTTTTATTGTGGATGTTTTTTGGCCTGTTAGCAAATTACTTTAAGGGTAATTTCAGGCTTAAAAGAATTAATGGTATCTTCTATTGTCAATACTTTTGTCCCCTCTGTCTTATAAGTATTGATTTCCTGGATATTTACTATCGTTAAGCTTAAAGCAATCAAAGCGACTACGAATACTTTTTTCATGACATTCCCTCCTAATTCAGTGAAATAAATCTATATACAAAAATGAATTATGGTTATATTATGTTTTGTATACTTTATTTTTTGCAAAAATACAGAAATTATATAGGAAGTTAAAGGAAAATTTTTCATAAATATACAGAAACCAATAAGCTTTATAGAATGATATTGCTGTATTGTATAATAATAAATACAATAGTTATTCTCTATAAGTACAGAGATGATGGCTGTTTGATAGAATGAGAGGAAGAAAAAATGAAGAGGAAGGAATACGAAAAAAATATTTTTTTAAATGAAATTTACCCATTGAATACTGCAACTGGCAATTTGATGATAGAAATTCATTTAGAACAATATATTTATCTATTTAACGAATGGGATAATGCTTCATTTAAAAGAAGGGACTTAGACCCTGATTTGATTTATTTCTTAGAGGAATGTTCCCAGGAAATACCTTTGAAATATGATATTGAGTTAAATATAAGTATTACAGAAGAAGAAAGAGATTTACAAAAAGAAAAAAATATTATAAAAGGGTTTAGAACGCAATATATCCATTACCTTCGTGTGGAAAGAAGAAATCTGAAAGAATTATCTATGCGGGCGGTGTTGTATGTAGTAACGGCTTTTGCTCTAATATTCACTGCATCTATGCTTGAAAGCACCTTATCTGCACATCCTATATCTACAACTTTGTTAGAGGGATTTTATGTAGGTGGCTGGGTTTTTGCTTGGGAGGCCATATCGAGTTTTTCTTTTCACAGAGGAGGTATCACCAGAAAAATAAAAGAATATCAAAGGTTTTTAAGGGCCCCTATTCAGTTCATCTATAGCAGCAAAGATCAGTGAAATAAAACAAGAAAAATTGGGCATTGTAAAAGCTATAAGACTATTATAAAATTTAAATTTAAGCAATCGAGAGGAGGAGTAGATGGATGAAATACCGACTACCTTGGGGAGAAATTTATACTGACAAAATAGATGAAGCTGATATCATTGTTTTAGGTATTCCTTTTGATAGTGCCGTCAGTAACAGGAAAGGTGCAGCGGAAGCCCCTGATAAGCTAAGGGAACTTTCAAGAATTTTACCTCCTGTTACAGAAGAAGGATTATTGCTAAGAAACTTTAAAGTATATGACCATGAAAATGTAGAAATCACCTTAGATTGGGAAAAATATTTTAAACAGGTGGAAGAGACAGCCTTTTCCCTAATGAAGACAGGAAAAACCTGTTTGTTTATTGGTGGAGACCATGCAGTTACCATACCGTTAGAAACAGCTTTTGCTAAAATACATAAAGAAGAAAAAATAGGAATTATACATTTTGATTCTCATCCAGATATTATTGATACCTATGATGGACATCCCTGGTCTCATGCCTGCACGCAGCGGAGAGCATTGGAAATAAAAAACATAGCGCCAGAAGATTTAACTTTTGTTGGGTTGCGGTCTTACATGGAGGAGGAACTAGCGTATTTCGAGAAACATCCGGAAATTAAGATTATTGGAGCTAGAGAGGTATATCGTAAAGGAATAGATTATGTAATAGAGGTTTTGAAGGAAAAGTACAAGGATTACACAAAATTATACATTACGCTAGATATTGATGTGTTAGATCCAGCCTTTGCTCCAGGAACTGGAACACCAGAGGCAGGAGGTCTTAGCACCCGTGAGCTTATGGAAGTGGTCAGAGAAATCATCTTGACTTTACCTGTAGCAGTGGTAGATGTTGTAGAAGTTGCTCCTCCCTTAGACACCTCAGACATTACCAGCTGGGCGGCGTTAAAGATTATTTATGAAATTTTTGGTGCTGTCTATAAAAAGAAGATGAACAAAGAATAATTTCCAAAAGTGAGAAGCATATTATATACATATTTCTATGAATATGATATAATTGACCTGTTTTGAAATACTTATGAAAACAATAGCAAAGGAGGAAAAAAATTGCCAATTATTTTAAATGAGAAACATTCCACAGGACTGTCTATGAATTGGACAGTAGACAAGGTTTTATATCATCAAAAGTCAGACTTCCAAGAGGTGGCTATACTAGAATTACAGGAATTGGGGAGGGCTTTGGCGTTAGATGGTGCGATTCAAGTAACTGTTAAGGATGAATTTGTTTATAATGAAATGATCACCCACGTACCTTTATTTACCCATCCTAATCCTGAAAAAGTATTAATTATTGGTGGTGGAGATGGTGGTGCGGCTAGAGAAGCTGCAAAGCATCCTAAAGTAAAGCAAGTGGACATGTGTGAGATTGATCCTGTAGTTATTGAAGCTTGTAGAGAATATCTACCTGAAATGAGTGTTTCTTATGATAATCCTAAAGTAAACGTCATTACTAAGGATGGTATTGCTTTCATAAAAAATAATCCTAATACCTATGATGTAATTATTATAGATTCCTCAGATCCAGTAGGACCTGCTGTAGAACTATTCCAGAAGCAGTTTTATACCGATGTCCGTGGGGCATTGAAGGAAGATGGATTATTTGTATGTCAAAGTGAATCCTTATTTTTACATATGCAATTAATCAAAGATGTTTATGCCAGCATAAGCAGTTTATTCCCTATTGCAAGGGTATACACATCTACCAATGCTACCTATCCAGGCTTCTTATGGAGCTATACAATGGGTTCAAAAAGATATGATCCATTAGCAAAAGAAGAACTCGAGCCA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38 | Bacillus_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2858452 : 2866999
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP017603|2858452:2866999|DBSCAN-SWA TTCAACATAAAAAAACCTTTAAGCTCATATTTAAATATGAGTTTAAAGGTTTTTCTTTTGGTGCCGTGGAAGTGGATGCAGACGTACGCACACAGTTTAATTCTAGCCTTTGAGTAATATAATCCATTAAAAATTCAACAAATACATCATCTTTTGAGACTGTTACCCTCTTAACAAATTTTCTAATGAATTTTGAACACTCTTCTATGTTTCTTTCTTCAATACTGGTTTTGTACCTACCTAGCAGTTCCGTAATCGCATCTTCAGGTATAAGGTATGTGTTTACTGAATGTTCTAATTCTATCAATTCAAAAGACAGATCTCTTTTAACTTGTTCTAAGTCTTTTAGCTTTTCTGTTAAAGCTTCTGATAGTCCAATTGTAGATATAGCATTTACTATGTTAATTATCTCTGTTTCTACTCTTTTTAAGTCTTTTCTAATTAGAACCATATCATTATCTTTACCCTCAAAAGCAGCCCTTGCAAACTCATTAAGTTTTTTAGTTAGTCCTTTGATAGCTTTATCTGTAAAATATGTTTCATAAAGCTGATATAAAACAAAGTCTTCCACTGTGTCTTTCTGAATTGAATTTGGACAACCTTTAGCACATCGGTAATAATGATAATTATGGTAGCCGTTATTCCTTGTATTCCCATGCATCTTACTGTCACATTCACAATAAATAATTCCTGATAATAAATAAGTAACTTTAGCTCGGTACTTAGCTCTACTCTCTCTGTTGCTTTTCATTCTTTCTTGACATAGATTCCAGGTATTTAGATCAATTATTTTAGGCACAGCGTCTGGAATTCTAATTATTTCATCTAAGTCCTTCTGTTTTCTAGAATTACGCTTACCATACAGTCTAGGAGCTGTTTTGTTGTAAGAATAAATACCTATATATTTTTCATTGTTTAGAATAGAATGAAGACTATTCTTGGTAAAGTCTGCTCCCCTTTTAGTTTTATATCCTTTGAACTTCAAACTAGCAAAAATTTCTCCGTAAGTTTTTCCAGAAGCGTGCATATCAAATATTAATTTTACAACTCTTGCCTCAACCTCATTAATTACATATTTTTTATCTAGTACATCATAACCAAGAGGTGGTATGCCACCGTTAAATTCAGCTCTCCTAGCTTTAACTTTTAAACCCTTCATAGTTTCATTTGCTAAGTTTTCGCTGTAATATTGTGCAAAACTCTCTAATATGCCTTCCATAAGCCGACCTTCGGGATTGTCGCTTATAGATTGACCTGCATACTGAATTGATACACCTTGTCTTTTTAACTGTGCTTTATGGATAGCACTATCGTACCGATCACGACCAAAGCGATCTACTTTATGGACTAATACAATATCAAACAGTCCTTTTTTAGCGTCACTTAACATTTGTTGTAGTGCTGGGCGTTTATCAGTTTTCCCAGAAATAGCTTCATCGCTATATATTTTTATAATTTGTATATCGTGAGTATTAGCATATTTTTGAATCTCTTGTAGCTGGGCCTCAGTACTATCTACAGACTGCATATCTGAACTAAATCTAGTGTAGGCAACACCTTTTTTCATATGTATATCACACCCTTTTATTCAAAACTCTTATAAACATATAAAGGACTAAAAAATATCGTATATTCTCCTATAGTATAAGAATGACCATAGATTCCCTTAAAATGGTCTAATGCCGTTTCGATAAAATCTTCTGTTACATCAAGAAACTCTGCTAATTCATGACGATTTCTAACTCCTGCTTTAAAAGCATCTATAAATTGCTCGACTCTGATCAAGCGTTTTACTGCCCATCTACGAGCCTTTAATTCCTGCTTTCTATTTTCCACTTTGGTTTGATCGGTAATATCACCAACAGTGGTATAATGATGACCAAATTCCTCCGCTAAGACACATCGCTTTTCTTTTGTAATTTTAACTTTCTTACTGATAAGAATAACTTTAGCTACAGTTGTTTCCACATAAAAACCTTTTGAATCATCTTCTAAATCAGCTTGATCATAAATAATAATTTCTGGTTCCTCAATAAGTAATTTCTCATAACTATTCATAGATAATCCCCCTGATTATTCCATTACTTTTTAGTATTATTATTAGCCAGTGCGATTCTAATAGCTAGCTTTATTTTTTCTATTTCTTCTTCTGATAAAGGTCCTTCATGTCCGGCTCGGTGTGCTGCTAAGGTTAAAATTTTATCGTCATCAAGCATATTTGCTAGAATATTATCTACACCTTTTAATTCAATGGTTTCATTTACTCCATTGTTATTGTTTTTGTTTTCAGGATCAGGTTGTTCTTGTCTTGCTAGAGCTATCCTTAACGGTTTAGGATGCATCTTCAGAGTTTGAGCTATTAAATTTATAATTTCATAATCCTTATCATCTGGTGTTTTATCATCTAAGGTTTTTAAATACATCAAAGGAAGATTAGTTTTTTCAGCTAGCTCCTCTAATGACATATTTAACTCTTTTAACCTGCTTTCAATTAAACAACTAACTGATTTAGCCAATAGATAATCTACTGAAGTATTTAAAACTTCTGCTATATTTTCTAACATGTTTAAACTTGGGTTATATCTACCGTTTTCTACATCACCTAAATAAGAACGAGATATGTTTGCTCTTGAAGCTAATTGACTTTGTGTCAAACCTAAACTGTTTCTTATTTTTTTAATACGCTGACCTATTTGCATAAAATAAGCTCCCTTCCGTTAAATGACGAACATACCGACTTTTTTCTATTATAGACATTTTTTGCCGGAAATACAATATCAAAATTGACGGAAATACAATTAATCAAAAGCGAATTGACGGATTAACAAGTATTTACTACGTAATTCGCAAATTTAATTTAAAATGCTTATTTTTAAGTTTTTACACAATGACGGAAATACAGTACAATAATTTTAGGAGGTGAATGACATGGATAAACAGGAAAAGAAAAAAATTATAGGTAGAGTGATCAGTGATAAAAGACAATCTAAAAAACTTACACAGTTAGAACTTTCAGAGCTTACAGGTCTATCAAGAAACTATATATGTGATATCGAAAATGGTAGATATATGCCCAGTTTAGATGCCTTAACAAAATTAGCTTTACCTCTAAACATCGATCTTAATTTTTTGCTATCTATGACGGAAATACAATTCAAATACTAGGGTTAAATAAATTGAAGGAGGTGAAAAAATGAAGGGCTTAAAAATTTTTAATAGCCAAGAATTTGGACAGGTAAGAACATTAATTATTCAAAATGAACCTTGGTTTGTAGGTAAAGATGTAGCTGAAGCATTGGGGTACGCAGAACCAAGAAGTGTCATATCAAAGAAGGTGGATGAAGAGGATAAAGGTGTTGCTAGAATGGAAACACCTTCAGGAATGCAAGAAATGACCATCATCAATGAAAGTGGATTATACTCTCTAATATTGTCATCCAAATTAGAATCAGCTAAAAAATTTAAACGTTGGGTTACATCAGAAGTGTTACCTTCAATAAGAAAAACTGGAAGTTATTTGCTTAATTATAAACCAAAAGCCACCAGCGTAGGAGAAGTAGCAAGTCTAATTAAAATTCTTAAAGTTTCGATGAAAGATCAAGGTAGTGCTGCACATGAAATTACTTCTATGGAAAAAATGATCTGTGAACAGTTTAATATCGATTTACCGGAAAACTTTGTAAAGAAACCAGCATACATGCAATTGACTCTTACCTTACCAATTGAATAAAAAAGAGGTGAAATCATGTGTAAAACAACTGAAACTATAACCATTTACACTCAACATAAACTAAATAGGCATACTGGAGAAGTCATAAGGTCAAATCCTGTAGAGCTTACGGAAGAACAGTTTTTAGATTGGGTGGAACCTGCAATACCTCATTTAGTTAGGATTCTACTTGATTCAATGAAAGATAGAAAGGAAGTGAAATAGATGGTAGCACTGACAATTTAAAATGGTCCATTGAAAAAATTACAAGAGAAAATAGAACAGATGAAGGAGCAGTTCATGGAGGAAGGTGCGGAAATTACTTTTTAAGACGATACATTGCTTCAAGTTAAGTTAGGAGATACCGCTATAAGTTACAGGATTAAAAGCGAAGCAGATATTGATCGATGCTTGAGAGAAAATGATGAATATTTATTATTTCAAGAAGTTGCAAAACCTTAACTGCATATGAAGAGGGGGGAAATTAGTTGAAACATGGAAAGAGGCTAACTAAAAAACAGAAGTTGTTTTTAGCATCAAAGGGGCTAAATCCAGAAAATTGGCTATCTGTAAAAAACACTTCTGAGAAAATGGTGTTTGTACATAGGCAGCGTGAAAAAACTAGGACTTTCGATAAAAAAGGGGAGGGACTGTAATGAAATCAACAGGAATTGTAAGGAAAATTGATGATTTAGGTAGATTGGTAATACCTAAGGAAACTAGAAGAAACTTAGGCATAAAAGAGGGGGATCCAGTGGAGTTTTATGTTGAAGATGAAAAGATCATTATTCAAAAGTTTCAAAGGCAATGTATTTTCTGTGGCAATCAGGAAGATCTAAAGTTGGTATTGGATAAGCCAGTATGTGCTAGCTGCCTAGATACTATAGGCAAGGAAAAGGAGTGATAGCATGTTTCAAATGTGGGGACAGGCTAACGCTTATGCAAGATTTTTACTGCTGATATTTTGGACATCCCCAGCATGGTTCAGTGTAGCAACGTGGATTTTTTGCAAGAAAAAAGCCCCTGTCACCGCCAAGCAAACAAGGGCTTTAAAAAACACTATTAATCGTATTTTAACAGATCAGGAGGGATTTATCAATGGATAAACTACAAACGGTTCTAGAAACTCGACAAAAATTTGTTAATGCATATAAAGAAAGTTTGATTATATCAATTGATGGTTCACGCGGTAAAATACATTGTGCCAAAGAATATTTTAAAGAATTGATCTTAGAACATTCTGTGAAATTAGTAAATGATGGCACAAATAAATATCCCATTCGAGCCAGTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP017603|2858452:2866999|2862196_2862385_+|WP_070968610.1|DBSCAN-SWA MCKTTETITIYTQHKLNRHTGEVIRSNPVELTEEQFLDWVEPAIPHLVRILLDSMKDRKEVK >NZ_CP017603|2858452:2866999|2864027_2864780_+|WP_070968626.1|DBSCAN-SWA MPYREKKIYSGEMFEAEMYPISREEKKQPRTKKEKLTVPKQKNLNNKNAVKHLIRLLNKNFTNRDLAVHLTYTEENIPMSEKEARKDVANYIRRINHYRKKNGLPPLKYIAVIEYREKEEEGKTVRLHHHIVMSGDMDRDKVEELWGKGRANVKRLQSDEFGYEGLARYISKDPKGRKRWTQSKNLKQPTVRVNDNKFSRKKIEEIARNPEDKEFFSKLYPGYILNSCKVEVNEITAGIHIHVKMRRLQI >NZ_CP017603|2858452:2866999|2864799_2864964_+|WP_156778779.1|DBSCAN-SWA MSQVSKSCGGCNFFNKGQLVPTIGKCFITGETKKANEYCTKTEYYRPKDQEATH >NZ_CP017603|2858452:2866999|2860532_2861150_-|WP_070968604.1|DBSCAN-SWA MQIGQRIKKIRNSLGLTQSQLASRANISRSYLGDVENGRYNPSLNMLENIAEVLNTSVDYLLAKSVSCLIESRLKELNMSLEELAEKTNLPLMYLKTLDDKTPDDKDYEIINLIAQTLKMHPKPLRIALARQEQPDPENKNNNNGVNETIELKGVDNILANMLDDDKILTLAAHRAGHEGPLSEEEIEKIKLAIRIALANNNTKK >NZ_CP017603|2858452:2866999|2861644_2862181_+|WP_081561980.1|DBSCAN-SWA MKGLKIFNSQEFGQVRTLIIQNEPWFVGKDVAEALGYAEPRSVISKKVDEEDKGVARMETPSGMQEMTIINESGLYSLILSSKLESAKKFKRWVTSEVLPSIRKTGSYLLNYKPKATSVGEVASLIKILKVSMKDQGSAAHEITSMEKMICEQFNIDLPENFVKKPAYMQLTLTLPIE >NZ_CP017603|2858452:2866999|2861379_2861616_+|WP_070968607.1|DBSCAN-SWA MDKQEKKKIIGRVISDKRQSKKLTQLELSELTGLSRNYICDIENGRYMPSLDALTKLALPLNIDLNFLLSMTEIQFKY >NZ_CP017603|2858452:2866999|2864997_2865498_+|WP_070973208.1|DBSCAN-SWA MANKGMFFEREVIMANHQYKERGIALIQKISTPWKVLREGKKIISAFPEGKSTLDFRGTVSGGISISFDCKETTEEKGLPLQNIEAHQIEYMKKAIEVGEITFILCCILPRDKRFYIKGEVVINHWDKWQGNKRKHGYNYIPVEKMLEVRSKQGIVLNYLAVLDKE >NZ_CP017603|2858452:2866999|2863068_2863266_+|WP_070968617.1|DBSCAN-SWA MFQMWGQANAYARFLLLIFWTSPAWFSVATWIFCKKKAPVTAKQTRALKNTINRILTDQEGFING >NZ_CP017603|2858452:2866999|2862648_2862816_+|WP_169824217.1|DBSCAN-SWA MKHGKRLTKKQKLFLASKGLNPENWLSVKNTSEKMVFVHRQREKTRTFDKKGEGL >NZ_CP017603|2858452:2866999|2858452_2860018_-|WP_070968599.1|DBSCAN-SWA MKKGVAYTRFSSDMQSVDSTEAQLQEIQKYANTHDIQIIKIYSDEAISGKTDKRPALQQMLSDAKKGLFDIVLVHKVDRFGRDRYDSAIHKAQLKRQGVSIQYAGQSISDNPEGRLMEGILESFAQYYSENLANETMKGLKVKARRAEFNGGIPPLGYDVLDKKYVINEVEARVVKLIFDMHASGKTYGEIFASLKFKGYKTKRGADFTKNSLHSILNNEKYIGIYSYNKTAPRLYGKRNSRKQKDLDEIIRIPDAVPKIIDLNTWNLCQERMKSNRESRAKYRAKVTYLLSGIIYCECDSKMHGNTRNNGYHNYHYYRCAKGCPNSIQKDTVEDFVLYQLYETYFTDKAIKGLTKKLNEFARAAFEGKDNDMVLIRKDLKRVETEIINIVNAISTIGLSEALTEKLKDLEQVKRDLSFELIELEHSVNTYLIPEDAITELLGRYKTSIEERNIEECSKFIRKFVKRVTVSKDDVFVEFLMDYITQRLELNCVRTSASTSTAPKEKPLNSYLNMSLKVFLC >NZ_CP017603|2858452:2866999|2866108_2866333_+|WP_070968629.1|DBSCAN-SWA MQLFGENATEMGLSPIPKEEIHNLMNRVVELISNQFIRGCTIEINSVTKAKISVSSKGKINIERAQAIKYKLEA >NZ_CP017603|2858452:2866999|2863258_2863555_+|WP_070968620.1|DBSCAN-SWA MDKLQTVLETRQKFVNAYKESLIISIDGSRGKIHCAKEYFKELILEHSVKLVNDGTNKYPIRASIIIQEIEFFTLWEEEEFKETFPKLISQVVRKETV >NZ_CP017603|2858452:2866999|2866372_2866999_+|WP_070968632.1|DBSCAN-SWA MLSIKYPQVLEESELLRLFREYRETRSTSIKARLIKHNLRLASYVGNKYKKDDDDVFQVACIGLTKAVETFDPDKKAKFNTYAIRCMTNEVFMYFRKDKDYGRIQVYLDKEIINPQDGSSTATHEIIPSDMNLEEDYMEKVLLETIIEVSDELILKKNKKHQEIIKLRQNGMSQVEIAKRFNLSQSYISRIEAKHYKELKVKVEAIFK >NZ_CP017603|2858452:2866999|2860035_2860509_-|WP_070968601.1|DBSCAN-SWA MNSYEKLLIEEPEIIIYDQADLEDDSKGFYVETTVAKVILISKKVKITKEKRCVLAEEFGHHYTTVGDITDQTKVENRKQELKARRWAVKRLIRVEQFIDAFKAGVRNRHELAEFLDVTEDFIETALDHFKGIYGHSYTIGEYTIFFSPLYVYKSFE >NZ_CP017603|2858452:2866999|2863600_2863810_+|WP_070968623.1|DBSCAN-SWA MKKLLNKVRIIKSSEATYWYAASIGIVLGVVGIWRGNYMTDHKEKNGLYMVDFKDCEIIEDKSYKQKNI >NZ_CP017603|2858452:2866999|2862815_2863064_+|WP_070968613.1|DBSCAN-SWA MKSTGIVRKIDDLGRLVIPKETRRNLGIKEGDPVEFYVEDEKIIIQKFQRQCIFCGNQEDLKLVLDKPVCASCLDTIGKEKE >NZ_CP017603|2858452:2866999|2865937_2866102_+|WP_156778780.1|DBSCAN-SWA MNDFGHCYYCGEGIMLDYPKEATPEEKNKVATKFCKCPQAKMEADKELEIERAK |
17 | Clostridium_phage(20.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2870344 : 2924324
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP017603|2870344:2924324|DBSCAN-SWA 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64 | Clostridium_phage(22.73%) | integrase,head,plate,capsid,terminase,protease,portal,bacteriocin,tail,transposase | attL 2889761:2889775|attR 2924574:2924588 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2928139 : 2979048
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP017603|2928139:2979048|DBSCAN-SWA 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57 | Leptospira_phage(30.0%) | tRNA,capsid,portal,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3062454 : 3153228
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP017603|3062454:3153228|DBSCAN-SWA 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98 | Clostridium_phage(15.15%) | integrase,head,plate,capsid,terminase,protease,tRNA,portal,bacteriocin,tail,transposase | attL 3085245:3085304|attR 3122709:3122851 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3308183 : 3316799
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP017603|3308183:3316799|DBSCAN-SWA AGTGGAGGGTTTACTACAAAAAGTACAACAAGCCAAGGATTATATTTTAGGTAAAATAAACACTATGCCTCAAATAGGGTTAATTTTAGGATCAGGTTTAGGAAGCTTAGCAGATGAAGTAGAGGATGCTGTAGTGATTGATTATAAAGATATACCTAATTTCCCGGTTTCAACAGTAGAGGGTCATGCAGGAGAACTAGTGATAGGACAGCTACAGGGAAAATCGGTTGTGGTCATGAAGGGGAGATTTCATTACTATGAGGGTTATAGTATGCAACAAGTGACCTTCCCAGTAAGAGTGATGAAGGCTATTGGTATTGAACTACTATTTGTAACAAATGCTTGTGGTGGCTTGAATCCCCAATTATATCCGGGAGCCTTGATGATGATTCAAGACCATATTAACTTTATCGGTGCGAATCCTCTTATTGGTCCCAATTATCATGAACTAGGTCCAAGGTTTCCAGACATGTCCTCTGCCTATGATAAGGATTTGATACAGTTAGCCCATAGGGTAGGAAAAGACTTGTCTATAGAAACCCATGAAGGTGTATATATAGCCATCAGTGGCCCTAATTATTTGACAAAGGCAGAGTTAAAAATGATCATAGCTGTGGGAGCGGATACCGTGGGAATGTCGACGGTGCCTGAGGTGATTGTGGCGAGACATAGTGGATTAAGGGTTTTAGGTATATCCTGTGTGACAGATATGGCGATACCGGATCAGTTGGAATCTATCAGTCATGAAGAAGTAATGGAGGTAGCAAATAAAACAAAGCCTAAATTTATTTCCCTAGTGAAAGAAATTCTGAAGGAGGTGACGCTTTCATGAGAATGTACGATTTAATACTCAAGAAAAGAAAAGGAGAAGCACTTACCAAGGAGGAAATCTACTTCTTTATTGAAGGTTACACCAAGGGTAGTATTCCGGATTATCAAGTTTCAGCACTTTTAATGGCGGTGTACTTTCAAAAAATGAATAAAGAGGAGACTGTGTATCTGACAGAAGCGATGATGCATTCTGGTGAAGTGATTGATTTATCAAGTATAGAGGGTATTAAGGTTGACAAGCACAGCACAGGGGGGGTAGGGGATAAAACCACCATAGCCTTAGCCCCTATTGCGGCGGCCTGTGGCATTCCTGTAGCAAAAATGTCAGGCAGGGGATTAGGGCATACAGGAGGAACCATAGATAAATTAGAGTCTATTCCAGGATTTTGTGTAGAGATGACGAAAGAAACCTTTATCCAGAATGTAAATGTCATGAAACTGGCAATAGCAGGACAGACGGCTAATTTAACACCTGCAGATAAAAAACTCTACGCCCTTAGGGATGTTACTGCTACAGTAGATAATATTTCTTTGATTGCCAGTAGTATTATGTCTAAAAAATTAGCCTCTGGTGCCGATGCGATTGTTTTAGATGTTAAGACCGGTAGTGGGGCTTTTATGCAGGATATTGATGAAGCATTTCTATTAGCAAAGGAAATGGTGGATATTGGTAATCGTGTAGGCAGGGAGACGGTAGCCATTGTCACGGATATGAACCAGCCTTTAGGCTATGCCATAGGCAATAGTTTAGAAGTAAAAGAAGCAGTTCAACTGCTGAAGGGAGAAGGACCAAAAGATTTAGAAAAATTGTGTATTACGCTAGGTGCCCATATGTTGCTGTTGGGTAAAAAAGTTGGTACAGAATATGAGGGAAAAAGAATGGCCAAAGCAGCAATCGATTCCGGTGAAGCCCTCAACGTATTAAAAAACTTTGTTAAACAGCAAAATGGACAGATTGATTGTATAGAGAATCTTGATTTATTGCCAAAGACTAAGGAAGTCTATTCCTTGAAGGCAGATAAGAGGGGTTACATACATAAGATTCAAGGAGACATTGTTGGGGCAAGTGCTCTGACTTTAGGGGCTGGCAGAGATACAAAGGATAGCAAAATTGACTTATCTGTAGGGATTCTTCTCAATAAAAAGATGGGAGATTATGTGGAAACTGGGGAGGTACTGGCTTATATTCATTATAACGATGAAAATAGGAGAGATCTTGCTATAGAGCAATTGCTAAAGGCCTATGAAATAGAAGATGAAGCACCAGAGCATAGACCTTTGATCTTTGGCGTTGTAACAAAAAATGGCATTCAGAGGATATAGTTCATAGACTGTTTAAAAATTTTTAGTCTGTTTTTGGCAAAGGCCTTCTTGTATAAGGAATCATATAGATGGAAAACCTAAGATTAAAAACCTATACAAGGAGGAGAATTATGAAAAGAATTTTTGTGAAAACGATCTTTGTTTTATTCGTCATTACTATGATTTTTAGCAGCTATATCACTGTAGCTGCAGAAACACAACCATTTGATATAAATGCTAAAGCAGCTATATTAATGGATGCATCAACTGGTACAATACTGTATGAGAAAAATATACATGAGGCACTACCTCCTGCCAGTGTAACAAAGATTATGACAATGTTATTAACAATGGAGGCGATAGAAGCCAATAAAATTACCTTAGCAGATAAGGTTGTTGTTAGCGAAAGAGCCTCTTCTATGGGTGGAACACAGCTTTATTTAGAACCAGGGGAAGTAAAAACAGTGGAGGATTTAATCAAGGGCATGGCTATAAGATCTGCCAATGATGCCTGTGTAGCCATTGGCGAACATCTTGCTGGAAGCGAAGAAGGTTTTGTTGAACAGATGAATGCAAGAGCCAAAGAATTAGGCATGAAGAATACACACTTTGTGAATACCAATGGTTTACCAGCAGAAGGACATGTTACCTCTGCCTATGATATCGCTTTAATGTCAAGAGAGCTTTTAAAACATAAAGAGATACATAAGTGGTTAACTACTTGGATGGATACTGTTGATGTAGGAATAAAAAATGTCTCCACACAAGAACTAGTCAATACCAATAAACTCATAAGAACTTATAAGGGGGCCAATGGGATAAAAACAGGTTCTACTTCAGAAGCTAAGTATTGTCTTTCTGCCTCTGCAACAAGAGGAAATACTACTTATATAGCAGTAATTTTAACGGCGCCTACTTCTCCAATTCGTTTTAGCGAAGCAGCTAAGTTGCTGGATTATGGTTTTGCAAATTATAATACTGTAAAGGTAGTTGAAAAAGGTGGTGCTTTAGGTACTGTAGCGGTAGAAAAAGGAAAAAATACTCAAGCCAATCTGGTAGCTAAGGATGATCTAAGTATTTTGGTGAAAAAGGGAGAAGAATCCAAGGTGAAAAAGGAAATGATTATTCCCCAATCAGTAAAGGCACCTATTATGCAAGGAGAAAAAATCGGCGAGGTTATCGTTACTTTAGAAGGAAAAGAAGTTGGAAAAGTGGATATCATAGGTGAAGAAACCATAGAATCTGCTTCCATTATCGATATATTAACGAGAATGTTTCAAAGAATGGTGGGTCACTAAGAGGAAAGGAACCTATAAAAAGATTACCTGGCAAAGTAGTACAGCAATGTACTGCTTTGCTTTTTAATAGGATATATGTGTGTTATAATAAGTGAGTAAATTTTGTGAAGGGGAGATGTTATGAAGGTAATCGTTAGTCATGAAAACTTAGATTTTGATGGAATTGCCAGCATGATAGCATGTTCCAAACTACATCCTGAAGCTATTGTGGTCTTTAGTGGACGCGTGAATAATGATGTTAAAAAGTTCTATAGTTTATATAAAAATATTTTAGCTATAAAGTCTGCCAATGAAATTGATCTTAAAGCAATTAAAGAACTAATGATTGTAGATGTAAATAGCTTTAAGAGGGTAGGAAAATTTAAAGAATTAGCCAATCATAGTATTCCTATCACCATTTATGACCATCATCAAGAGACAGAAGATACCATTGTCAAAGCCCGTAAAATTATGAAGCCCTATGGCTCTTGCACAGCTATTTTGGTGGAGTTAATTAAGGAAAAAGAGGTAACTATTACCTCCTTTGAGGCCACCTTGTTTCTTATGGGCATCTATACCGATACTAACTGTCTAACCTTCTCCAGTACAAAACCACAGGATGCAGCCGCCGCAGCTTATCTATTAGAAAAAGGAGCAGATCTAGAAATTGTTAATACTTTTATTCAAACATCCTTTGGTAATGAGCATGACCAGTTATTTTTAGATCTTTTGTTAAATATGGAGACTATGGAGGTAAATAATTATAGGATTATACTTTCTCTTTATGAAAATGATCGTTTTATTGGAGAACTAGGACATATCGCCAGTAAAATGTTAGAAATCAAAAACTGTGATGCTGTGTTTTTGATTGCAAAAATGGAAAACCGTTGTTATTTGGTGGGTAGGAGTTTAAAGGAGGATATCAATGTTCCTTTTATTTTAAAAGAATTTAATGGGGCAGGACATGATAAAGCTGCATCGGCTGTAGTGAAAAATGGTGAACCACAGGTTTTAAGAGAAGCATTGCTAGAGGCATTACATACAAAGATAAAACCACAAATAACAGCAAGAGATATTATGAATTATCCTGTAAAAATCGTATTTGAGGATATGAACATTGAAGAAGTAAGCAAAATCATGCTCAGATATGGTCATACAGGTATGCCGGTGATTAAAGATAACTACATTATTGGTATTATTTCTAGAACGGATGTTGATAAAGCGATGCAGCATGGGTTAGGACATGCCCCCGTGAAGGGATTTATGACAAGAGAAGTAAAAACCATTAGTCCTACAACCTCTCTTAGTGAGATCAATGATCTGCTTGTTAAAAATAATATTGGTCGATTGCCTGTAGTAGAGGAGGATAAGATCATTGGCATTGTAACAAGAACAGATTTATTGAGAATGTTACATGGTAATAATCATCCTTATTGGTATAAAAAGACCTTTACAGAGAATGAAAAAGCAATAAACTGTTTAAATAAAATAAAACAACTTCCAGAAGAAACCTATAATCTTTTAAAGCTTGTGGGAAAAGTAGGAGATTCATTAGATAAAAAAGTTTATGTGGTAGGGGGATTTGTTAGG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP017603|3308183:3316799|3314347_3314968_+|WP_070969866.1|protease|DBSCAN-SWA MFSLDIVTILLTLPGILLALTIHEFSHAYSAYLLGDDTAKYYGRLTLNPLAHIDLVGFLMLIFFRFGWAKPVPINPKNFSDRRKGYFLVSIAGPLSNIVLAILSTFFFALAIRLALSEFIHTMLYFSIFINLVLAVFNLFPIPPLDGSKILLSILPSSFEETYYRLQKYTYILLFLLVYFRVINRVLFPIVQYLLNLLLGFVMYLV >NZ_CP017603|3308183:3316799|3311733_3314355_+|WP_070969861.1|DBSCAN-SWA MKVIVSHENLDFDGIASMIACSKLHPEAIVVFSGRVNNDVKKFYSLYKNILAIKSANEIDLKAIKELMIVDVNSFKRVGKFKELANHSIPITIYDHHQETEDTIVKARKIMKPYGSCTAILVELIKEKEVTITSFEATLFLMGIYTDTNCLTFSSTKPQDAAAAAYLLEKGADLEIVNTFIQTSFGNEHDQLFLDLLLNMETMEVNNYRIILSLYENDRFIGELGHIASKMLEIKNCDAVFLIAKMENRCYLVGRSLKEDINVPFILKEFNGAGHDKAASAVVKNGEPQVLREALLEALHTKIKPQITARDIMNYPVKIVFEDMNIEEVSKIMLRYGHTGMPVIKDNYIIGIISRTDVDKAMQHGLGHAPVKGFMTREVKTISPTTSLSEINDLLVKNNIGRLPVVEEDKIIGIVTRTDLLRMLHGNNHPYWYKKTFTENEKAINCLNKIKQLPEETYNLLKLVGKVGDSLDKKVYVVGGFVRDLLLKRENYDVDIVVEGDGVLFAEELNQKLQGKLLVHEAFGTASIRLEKNNVIDIVSARREYYEYPAALPKVEKSSIWNDLFRRDFTINCMAIQLNTESFGKLIDYFDGLQDMKHRRIRVLYNLSFIEDPTRIFRAIRFAARMDFTIENETKNFMMEAIRDHMIEKVSDDRIREEISPMLEDENFIKYILSMQAFNLFEAIDPDLVLTKESIKKLSSIQSAIDAFREFFSIIPSVRRIIITGIFRDFPMDRLHDVLTKFVANKQLATNIYHTLENKENIYQLLTKEDVDRFTLYRVLNQHDLEDLIFYYNDCEDGYIKHYIMYYMLHLKNIKLSMSGEDLINLNIKPGPIYKKVLESVLKAKVSGEIYNKDDEINYAYDLYQELKGEENV >NZ_CP017603|3308183:3316799|3314979_3315723_+|WP_070969869.1|DBSCAN-SWA MSCRIKIQAFEGAFDLLFHLIEKNEIDIYDIPINEITEQYLHYLYQMEKLDLEVASEFLVMAATLIEIKSKMLLPKEVVKEDKVEAETVDPRSELVERLLEYKRYKCMAEELKQREDHYNKLYFKQKEEIIMETSEADVALENLKLDDLVKVFEKLLLNYEKHKNDRPYNVRHISRDTYTIEDKITSILTMLQHHKKITFDSIFILAKEKLEVVVTFLALLELIKGKKIKVMQEKSFEGIVIEGISN >NZ_CP017603|3308183:3316799|3309010_3310336_+|WP_070969856.1|DBSCAN-SWA MRMYDLILKKRKGEALTKEEIYFFIEGYTKGSIPDYQVSALLMAVYFQKMNKEETVYLTEAMMHSGEVIDLSSIEGIKVDKHSTGGVGDKTTIALAPIAAACGIPVAKMSGRGLGHTGGTIDKLESIPGFCVEMTKETFIQNVNVMKLAIAGQTANLTPADKKLYALRDVTATVDNISLIASSIMSKKLASGADAIVLDVKTGSGAFMQDIDEAFLLAKEMVDIGNRVGRETVAIVTDMNQPLGYAIGNSLEVKEAVQLLKGEGPKDLEKLCITLGAHMLLLGKKVGTEYEGKRMAKAAIDSGEALNVLKNFVKQQNGQIDCIENLDLLPKTKEVYSLKADKRGYIHKIQGDIVGASALTLGAGRDTKDSKIDLSVGILLNKKMGDYVETGEVLAYIHYNDENRRDLAIEQLLKAYEIEDEAPEHRPLIFGVVTKNGIQRI >NZ_CP017603|3308183:3316799|3316385_3316799_-|WP_070969872.1|DBSCAN-SWA MKMEQLGRHILAEFYNCDSDILNDHKLIEKYMVEAAEAANATVVTSNFHMFNPWGVSGVVVIQESHLTIHTWPEYGYASIDVFTCGGEVNPWASFEYLKEKLKAEVTDTEELPRGIVSRIRKHSKNKYTDIKYKISV >NZ_CP017603|3308183:3316799|3315742_3316309_+|WP_070973305.1|DBSCAN-SWA MNREEIKCIIEAVLFAWSEPISIKELSRVLSIEGKEIKKILEEMIDAFNFHKRGIQIIKMNDYYQLATRQEYYPYIRKLLEPKENKGLTQAALETLAIIAYKQPITKAEIEGIRGVKCDKALSTLQEKSLIEEQGRLEKIGRPIVYGTTMQFLKTFGLKAIDDLPDISGFKLLAENSEMGGEKDIFSK >NZ_CP017603|3308183:3316799|3308183_3309014_+|WP_070969853.1|DBSCAN-SWA MEGLLQKVQQAKDYILGKINTMPQIGLILGSGLGSLADEVEDAVVIDYKDIPNFPVSTVEGHAGELVIGQLQGKSVVVMKGRFHYYEGYSMQQVTFPVRVMKAIGIELLFVTNACGGLNPQLYPGALMMIQDHINFIGANPLIGPNYHELGPRFPDMSSAYDKDLIQLAHRVGKDLSIETHEGVYIAISGPNYLTKAELKMIIAVGADTVGMSTVPEVIVARHSGLRVLGISCVTDMAIPDQLESISHEEVMEVANKTKPKFISLVKEILKEVTLS >NZ_CP017603|3308183:3316799|3310494_3311613_+|WP_156778903.1|DBSCAN-SWA MIFSSYITVAAETQPFDINAKAAILMDASTGTILYEKNIHEALPPASVTKIMTMLLTMEAIEANKITLADKVVVSERASSMGGTQLYLEPGEVKTVEDLIKGMAIRSANDACVAIGEHLAGSEEGFVEQMNARAKELGMKNTHFVNTNGLPAEGHVTSAYDIALMSRELLKHKEIHKWLTTWMDTVDVGIKNVSTQELVNTNKLIRTYKGANGIKTGSTSEAKYCLSASATRGNTTYIAVILTAPTSPIRFSEAAKLLDYGFANYNTVKVVEKGGALGTVAVEKGKNTQANLVAKDDLSILVKKGEESKVKKEMIIPQSVKAPIMQGEKIGEVIVTLEGKEVGKVDIIGEETIESASIIDILTRMFQRMVGH |
8 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
3379943 : 3455386
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP017603|3379943:3455386|DBSCAN-SWA 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95 | Clostridium_phage(23.91%) | integrase,plate,tRNA,portal,tail | attL 3380287:3380303|attR 3422948:3422964 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
4522521 : 4537955
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP017603|4522521:4537955|DBSCAN-SWA 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11 | Bacillus_phage(62.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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