Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP014614 | Leuconostoc mesenteroides subsp. jonggajibkimchii strain DRC1506 plasmid pDRC3, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP014611 | Leuconostoc mesenteroides subsp. jonggajibkimchii strain DRC1506 chromosome, complete genome | 1 crisprs | csa3,cas3,DEDDh | 0 | 0 | 5 | 0 |
NZ_CP014612 | Leuconostoc mesenteroides subsp. jonggajibkimchii strain DRC1506 plasmid pDRC1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP014613 | Leuconostoc mesenteroides subsp. jonggajibkimchii strain DRC1506 plasmid pDRC2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP014611_1 | 362323-362425 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP014611_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP014611_1
>1.1|362349|51|NZ_CP014611|CRISPRCasFinder CTGACTGTTAATCAGGTTGTCGCCGGTTCGAGCCCGGCAGTCGGAGTTTCG |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP014611_1
The CRISPR arrays of NZ_CP014611_1 >merge|NZ_CP014611|1|362323-362425|CRISPRCasFinder CCGACTTAGCTCAGTTGGTAGAGCACCTGACTGTTAATCAGGTTGTCGCCGGTTCGAGCCCGGCAGTCGGAGTTTCGCCGACGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAC >NZ_CP014611|1|1|362323-362425|CRISPRCasFinder CCGACTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAC CTGACTGTTAATCAGGTTGTCGCCGGTTCGAGCCCGGCAGTCGGAGTTTCG CCGACGTAGCTCAGTTGGTAGAGCAC
>NZ_CP014611.1|WP_025267771.1|360592_362080_+|lysine--tRNA-ligase MAEEKALNDQMLARRQKLATIVSDLHLDPFGKRFERTANAQELHNLYDASSLEELENAKHEVVIAGRMVAKRGAGKVIFADFRDVSGKIQVYARRDDLADNYPIIKRADLGDFLGIKGIMMKTEAGELTVLATELTHLSKALRPMPDKFHGISDVETRYRKRYLDLIANEDSFKKFQERSHIISAIRAYMDRNDFLEVETPILQTEAGGAAARPFITHHNALNIDMYMRIATELYLKRLVVGGMERVYEIGRIFRNEGMDPKHNPEFTTMESYAAYMDFTDVMDETEGIFKAAASVVSDDLKITYQGTEIDLGTKFARKHLVDLIKEQTGIDFWQEMSVEAAQKLADDNHVKYEKYWGVGHIINAFFEEFVEDTLVQPTFVYGHPVEVSPLAKKNTDDPRFTDRFELFIMGSEYANAFTELNDPIDQRARFEAQAAERENGNDEAEGIDEDFIEALEYGMPPTGGLGVGIDRLVMLLTDSDTIRDVVLFPTMRPE >NZ_CP014611.1|WP_061514762.1|359611_360505_+|Hsp33-family-molecular-chaperone-HslO MADQFIKAITKNKYFRTFAVNGTNLVHQAAQIHETSRIAAVVLGRSLLATTLAAQAVLKGEETLSTKINGRGPIGNVVVESDAKGSVRGYVTNPNLETLINEAGQLDVAKAVGKNGFLQVTKFAPYSDPYIGQSQLVSGEIGDDFTYYLAQSEQTPSVIGVSVYMNSDDTVAGAGGFLVQALPDATDEAIDQLEVALKNMKPLSEMIQERYTPLEVLEEIFGKGEVEILQTAGIGLAAEPSKDAYAKMLLTLPASEIQAMIKEDHGAEIVGKFSGKRYFFTEEQLSEILKQIEKNNE >NZ_CP014611.1|WP_011679262.1|357400_359503_+|ATP-dependent-zinc-metalloprotease-FtsH MNNNKGGFLRSSVFYIFIFLAVVGMVYGLFGNDKTTTKTITSSEFIKALNDKELKSVTVQPGNSIYNVTGTYKKAQTATKDKGLSLFQPTQKVTKFTSTLLPNDASLKSVTDAATKTKTELVTKQAENSGFWLNLLVSLVPVLLIVAVFYLMMNQAGGGKGGQGGMMSFGKSKAKPSDPKDNKVRFADVAGAEEEKQELVEVVEFLKAPKKFVNLGARIPKGVLLEGPPGTGKTLLAKAVAGEASVPFFSMSGSDFVEMFVGVGASRVRDLFENAKKSAPAIIFIDEIDAVGRRRGTGMGGGNDEREQTLNQILIEMDGFEGSEGVIILASTNRSDVLDPALLRSGRFDRKILVGAPDVKGREAILNVHAKNKPLADNVDLKAIAQQTPGYVGADLENLLNEAALLAARRNKSKVDAADIDEAEDRIFQGPAKTNHNMSESERRTTAYHEAGHALVGLVRSEASVVRKVTIVPRGRIGGYALMTPKNDRYNLKYSEAKEQLAGLMGGRASEIFMFNEASSGASNDFQQATGLARQMVTAFGMSDKLGMVQLEGNASVGYADQAGNRAYSEETARLIDEEVRRLAREAFDDAIAILRDNKDKLTAIAEALLEVETLDEKQIKDIYLTGTFTRKDIQDDTELAKAKSFEEAKAAADAKDSQAEQRFEKQDEEKSSDDHSESKNEDTDSTDKSETDDNNTENK >NZ_CP014611.1|WP_010277907.1|356833_357373_+|hypoxanthine-phosphoribosyltransferase MDNDIQEVLYDQESIQKAAERLGKQITQDYAGSTPLFLSVLKGAYLWTADLLREVDLYAELEFIKISSYHGGVSSSDEITLVTDVRSDVRGRDVIILEDIVDTGQSLLFLKELLAKRGAKSIKVATLLDKIEGRKVEVDADYAGFNVRNEFVVGYGLDYEEHYRNLPYVGILKKEVYTK >NZ_CP014611.1|WP_025267769.1|355540_356833_+|tRNA-lysidine(34)-synthetase-TilS MTEKILQTIQQYNWPETVIVAVSGGVDSVVLVHALSKTKANLVIAHVNYRLREESDDDADFVRQLATQTGAIFEEQVWQHIPDHAVEKAARQFRYDFFEELAQKYHTNTIAVAHHADDQAETVLLKMIRGGQLQQMGGMQTKNHKVIRPFLSITKQELITYAQDNQLGWRQDKTNFDVDYTPRNLLRNDVLPKLTTINQRAVRHINNMAAQILQQQRLIDNQAKIYANDIQDWQKIPTLWQLPTLKYWLQKNKLFNIKENQLQQMIQLLSNTHKPNGKIALADNFEFIKNYQKISIQKQQNMAQVLTPVMLKLNQWHSFAKTTFMWTDNVPMNGQSFIKFQLTRSLPYLSLRPAKASDKIALINGHKNLRRLAIDEKLTPQERTMMWVLATADDEVIAVHLRSNQWRVNADFAVKENTQPYWLVCQIEET >NZ_CP014611.1|WP_011679260.1|355111_355510_+|septum-formation-initiator-family-protein MAGNFKRRQSNITPLNPAIAREIKKSERANSEAAKHYRKAHARREKKILLFGGLIAIIFVVQLLIGQVKLHAANQELTNTQDRLEKVQKTNTDLTADTKRLKDATYLQQLLRDKYGYSKQGELVYNLPSDNN >NZ_CP014611.1|WP_004164715.1|354748_355030_+|RNA-binding-S4-domain-containing-protein MRLDKYLKISRLIKRRTVAKEIADQGRISINGKVAKSSSDVSTNDELEVRFGNKTLTVKVLKIVETTKKEESADMYEVISEKFQQDFRKIGDE >NZ_CP014611.1|WP_025267768.1|351193_354733_+|transcription-repair-coupling-factor MTLIDFLSDTVTIKKLNEQATVGSAQLLLGVNGTARAASIAALYRKNPRPMLIISDTQVHADQFFDDLSSLLEDLVYNFPAEESIATEMAISSSELRLQRVQTLLALKTEKPIIVVTSLAGAERLVPKKQSLEQAHLHVKVGDAYNLNVIKNTLMMMGYTPTKLVQTPGEFAHRGSIVDVYPITFDDPIRLDFFDDELDQLKSFDVATQKSTTSFDEINIEPATDFIVSEHQYDQAKLAIESAFSDYRTNLSGVDKKHATDGFAPTQYMLNERERGSVLVPYAPFFFDGQTTLLDYFPTDSLIIIDEYTRLMETRLQQMTRDQEWIEQQIEAYQLLPKQTWRTEITDLLASNQHATIYLANFQRGLNRIKFTNVEEVTTRPANQYYGQIPALKNDLIYAQESGITMVLLIPDAKRRANFSRSLSELEVPVTETRDIVKNQVQIMPGELSAGFEWPKLHLTVLTTHELFTQAKHSAPRTRKIANSERLKSYNELNVGDYVVHINHGIGRYEGLQTIEADGGKQDYLTIAYQQNAKIFIPVTQLNLIQKYVGASDVAKKPKLNKLGGSEWAKTKRQVAAKIEDIADDLLELYAKREAQQGYVFPPDDHAQIKFDDSFGYPETPDQIRSIEEIKVDMQKLRPMDRLLVGDVGFGKTEVALRAVFKAAHSGKQVAFLAPTTILVQQHYETMLARFSDFPEIKIGVLSRFQTPTQNKMIIEQLQNHEIDVVVGTHRLLSKDVDFSDLGLLIIDEEQRFGVKHKERLKQLRTSVDVLTLTATPIPRTLNMAMVGARDLSVIETPPANRYPIQTYVLAMDWKIVRDAIEKEIARNGQVFYLHNRVADLDRIVSQIEELIPSARVAAIHGQMSETQLESILYDFLNGQYDVLVTTTIIETGVDIPNANTLIVENADHMGLAQLYQLRGRVGRSTRLAYAYFTYPFTRTPSEEAEKRLEAIRDFTELGSGFRIAMRDLSIRGAGDLLGKQQHGFIDSVGYDMYTQMLKDTVAQKQGKQVTTSQPETDAELILGVLAYLPDEYVSDNAQKIELYSRIRQARTDAEFEDIESDMLDRFGEMPDEVARLLLVGQIKQLADQSQITNIRRQRKQLIMTFNETATKNLAGEAIFETMVDVPLKAAVRTEEGNLQVIFTVNDVAESSIWLNILRNFLLVIINKLSAKTLNELHH >NZ_CP014611.1|WP_010291225.1|350626_351193_+|aminoacyl-tRNA-hydrolase MKFIFGLGNIGAEYDQTRHNIGFMAVDAFATANHMSFSPSKQFALVAKTIIGGESVMLVKPTTYMNDSGKAVRAILDYYDGDVDDVLVLVDDMDLPFGKMRFRAKGSAGGHNGLKSIMTHTGSQTFLRLKFGLGHPVHEQNVVVNYVLGKFTAAEKPDIDAMLDRSTQAIADWIQGATAPELSNRYNG >NZ_CP014611.1|WP_011679258.1|349856_350501_-|CBS-domain-containing-protein MFQKSLVIPKSELTTVTENATIQEVYDIFNDPENAHTRTMPILDESGKLFRGNVYKQHVFEHVAKNGNMNLPATAIMRNSTKFIYTNSKFYEVFFAIRDLPFIAVLDENHQFYGIFTHDALMDLLSQSWSVRSGGVAIAISTHNTQGDLSKISKIITRYSNIESLLTIQSELKPLTVLFTLPLQEDSEQLEKLIKRLEKKGYHVSSVENLNRFR >NZ_CP014611.1|WP_025267772.1|362549_363083_+|rRNA-large-subunit-pseudouridine-synthase-E MIVLFNKPYNVLTKFTDAEGRQTLADYIDIPRVYAAGRLDMDSEGLLLLTDSGKLNHELTDPDNKAYKTYVVQVEGVPTKSQLKQLEQGVALKDGLTLPAKVKRIPYPKWLWEREKPIRIRKNQPTSFIQLKIKEGRNRQVRRMTAAVGIPTLRLIRTHIGEYHIADLKPGQYRIVK >NZ_CP014611.1|WP_025267773.1|363153_363870_+|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MGRKWENIKMKKAQTDGAAAKVNSKYGIEIYAAAKQGGSSDPEANSTLKFVIERAKQAQVPKHVIERAIEKAKGSGDETFIEGRYEGFGPNGSLIIVDTLTSNVNRTATNVRTAFNKNGGTYGAAGSVSYLFDETGVIVFEGEDADATLETLLDAEVDVRDAEQQDDHIVVYTEPTALHQAIAALRESGVSDFSTTEISMLPQSEMTLAGEDLEIFEKLIDVLESDDDVQKVYHNVES >NZ_CP014611.1|WP_025267774.1|363918_364866_-|ferrochelatase MNKKGLLLVNLGTPDSPHPDDVKAYLKEFLSDTNVIQMPRLLWQPILRGKILPKRSFKSAELYQKIWRKDGSPLMVYAKKQVEQVQQLQPNWIVRCAMTYRKPNIAETLKEMRLAGAEDIVVLPLFPQYSVTSTQSVIDQVRKADKNINIVKSFYNDEAYLDLLARDIREAWAKNDYDRLIISYHGVPESYVRRGDPYVDHCTATTQGVLERVGPLTPDNTHQVFQSRFGPTEWVKPYLSDTLRSLPSQGIKRVLVATPAFVADCLETIEEIHVENHDIFKQAGGEVFDVVQPFNEHIDFSKYIASLANRHFAQN >NZ_CP014611.1|WP_071951813.1|365676_367125_+|NCS2-family-permease MEKLFQLKENKTTVRREIIAGITTFVSMAYIFFLNPQILGQAGVPTQAVFLAAILVAVFGTLFMGLFANVPFALAPGIGMQAYFTYTIVFGFGFTWQQALAIVFLVGVVDIVITLTHGRRAIVKGIPTELKAAIGGGIGLFVTYIGLKNAGFINFIVDPSNIMTLNGKPFTGEVHGAVNSILANGGVTPELTKFNNASTLLALIGFVILVVLVMRKVPGAFLISLIVTTLIGIPMGVTNTHIGAGTSVSHAFGELGQVFGQSLGAQGLGSLFNNWHHASLALVTIFAMGLTGLFDAIGTLIGIGNQTGIFSKEDQKSFESSNGFNSKMDRALVVDTFTTAFAGIVGTSNTTTFIESASGVAAGARTGLANVVTAAGFALMILFAPLVGVVPTAATSPLLILVGIMMMGEFKKIPWESLEVALPAFFTSVFMAFSYSISYGIAAGFIFFIIVKFALGKFKEVSPVLLIVSAFFLLNFAVLAFM >NZ_CP014611.1|WP_014324306.1|367244_368045_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLNIKNLSVSYGRKVALTVPKLSINKGEIIGVMGKSGSGKSTLVNSCLGLIPFKGQVRIDTDDVGILMQEQHYVDTMTNQKMIEGMLNTRIKRDKKLTELINFFDFSDQLSLHFKNLSGGQKQRMSLIMVLYQEPELLFLDEMTTGLDFESRQALISQLKIYFKQHQTTVLMVTHYAQEIEALADKLLVIHDGQVKAFDEPKNLFKQYIGYSAFIVDNHTEKSIKVQQPEDEYKVACRLIDDGDDFRRTQSDIELVYTEVMKGQRA >NZ_CP014611.1|WP_071951815.1|368041_368770_+|hypothetical-protein MIKKRKLVFEFQNLLGNIITLFFGFAFAPMMALVFGNSYANVPQALNQLYLGFFCTIPLSMVFVGFSSLFSQEVEQGFTLRAELFGYSRVSQALHKFMALTVFVLLSSIIYSWIFLSHFNLPLPNAVIIGQMAIFQILNTAVYFIIVFILTTILKKFSRIYGISMISYFAIMIISGIMGNMDVGKLGDYLPIKLFVTNYTNHLNDTDYISGKIGLYLLILLGILGVILKVIVRNKNGNKHQY >NZ_CP014611.1|WP_014324308.1|368747_369215_+|LytTR-family-transcriptional-regulator MEININIDDKLKDVQVVISGSDIEQLADIAQYLKSRNTPSRQLAIKTADNIRVVDKEDIILVESYGNDLTFTLKNNHKITTRKTLKRFLEENQKSDFVQISKSEVMNLSYLSKMESAFSGNYYAFLTNQARVTVSRRFIKGILKRLEGSAEDEAF >NZ_CP014611.1|WP_112132932.1|369201_369666_+|DUF3021-family-protein MKHFKEAIVYLLVGIGVGSFISLLSFTLNHATPSMKQFGLLMTMSAIMGLLSLIFEYDKITFITQLISHFILEMLTYGFFIWLTFGSAVITFTNIPTFVITYVIIFIYFRKQGRDNARRINEQLQKISRKKVIQQINEMLNCFLYWLYIHGLIF >NZ_CP014611.1|WP_025267775.1|369744_371835_+|DNA-topoisomerase-III MPNYLILTEKPSAAANFVKALGGKTGVFGDFTYKITNLRGHVMTLKDPEEMVAEDLKKQYKSWLVKHLPWNLEDFSWARTYIRQRNIRTGKIESTKKLIDELKKESKSGYDAIVIATDTDPSGEGELLAWEALDAIGWRGQVLRANFMDESVSGIQKAMHQLRNVSDKMADGEYVKGESRNRWDFASMQLTRIATTAAKKEGFKVVAREGRLKSVIVWRIYQQLAAIKNYIKTPYFEVKFKDPAGHIFGRVTPQGEVIPWRFATKEQAKVDFNNYHETEVINEKHQTRTQAPGKLLDLAGLASILAPRGFSSKEVLSTYQKMYEAQIVSYPRTEDKTVTPEQFNELLPLIDQIAGVVGVDKNLLTHRSPRKTHVKSQGAHGANRPGENVPQTTQSLAKFGSSGPAIYEVLAKNYLAMLAEDYVYDHVTANLKDYPEFKTAFNIPIKLNFKLVYDSQKAIKVEEGEEEESISGQLGPQARPYLHEGANPKPQVPTTKWIMAFLEKHNVGTGATRVSTLSEMSRGTKAMLTEKRGKLGLTETGNVSAIMVKDTWIASPKITKRLFEMMDQVGRFEMTMVQVLDSATKVVEHDMPIMLDNAQTLETLLGKPKPSIKKPRKTSEKMTGIWQGQEITFAREWSGHVFTDEELQKLLTGSEVSFPAKSKRGKSYTAVGKMAKQTFKGNTFYGFKLNPKTKKA >NZ_CP014611.1|WP_011679274.1|373916_374465_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MNNRMSLQTREWVRSAFLELLDEVEDIKSITISDISKRSGISRRTFYRYYASKEDILTEYIDILIEQYGNDLRSKKLANFKEFIVYFFNYWGQYDHELFILQKNGLFTYVLSEFNKMIPELYATISAPWHIQKEVNSREIIYTTRYGVGGLWNVYGEWLEFDREKIEITEVAKILIQSFNSL |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
58096 : 75149
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP014611|58096:75149|DBSCAN-SWA 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17 | Bacillus_virus(50.0%) | protease,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
339929 : 349785
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP014611|339929:349785|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP014611|339929:349785|349182_349785_+|WP_014324297.1|protease|DBSCAN-SWA MWPGVIEQTANGRENYDLPSRLLKDRIILVQGEIEDSMATSIVAQLLFLEAQDPTKEISMYINSPGGSVTAGLSITDTMNFIKAPVTTIVMGLAASMGTIIAASGEKGHRFMLPNAEYLIHQPMGGAAGGTQQTDMAIIAEQLTKTRAKLNKILADASGKDLKTIGRDTERDNWMSAEETLEYGFIDGILTKSGEKPATK >NZ_CP014611|339929:349785|347181_348150_+|WP_011679256.1|DBSCAN-SWA MKPKIVIIGGGSGLPVIIKPLVKQEVDLSAIVTVADDGGSSGLLRNYINIVPPGDIRNILVAMADTDAEFLKVMQYRFDAKDDFFAKHAVGNLIIAAMTEMHGNIFDAVQYLANFMHVQGHIYPVSNEPLVLHAEFKNGNTVAGEAEITHAHQTIDHVWVTGDEPGEEPKAAPEVVEAILSADLIVYGPGSLFTSILPNVVVPEVREALQLTKAKQVYIANIMTQKGETDAYTDAQHLLALNAHIGMQAIDYVISNSEKVPDDFVDFQKWNEVSNQVKLDEQAVVVQGATQISGDFLQLRDAGAFHDGQKITEELLKILEQC >NZ_CP014611|339929:349785|344225_347084_+|WP_025267767.1|DBSCAN-SWA MAKDHIEIRGARAHNLKNIDVNIPKNQLTVVTGLSGSGKSSLAFDTLYAEGQRRYVESLSSYARQFLGQMDKPDVDSIDGLSPAISIDQKTTSNNPRSTVGTVTEINDYFRLLYARVGRPDDPKDGTKIMYTIDQMVEYTLNNLPEGTRLQVFAPIIRGKRGSHETAFDHMRKQGYIRARVDGDIIEIDSQQLSLNKNKPHDIDVMIDRIVLRGNSRSRLFDSIEAAVRLNDGQVELDVVTRDDENPVAPLKFSDHYLGELKDFRAGRLEPRLFSFNAPLGACEFCQGLGVTREVDIDLVIPDDTKTLNEGAILPWNPISSNYYPEMLRQFAEQFAIDMDTPFNKLPKKQQDLILNGSDEKDFHFHYKNDFGGVRDVDIPFEGVINNIARRFTETNSDFTREQMTHYMTELKCKACGGYRLNKAALSVKINGKHIGEVSELPVDQELAFFNSVSLGQQDSEIASPIIKEIKDRLGFLQSVGLKYLTLSRSARTLSGGESQRIRLATQIGSNLSGVLYVLDEPSIGLHQRDNDMLLESMHRMRDLGNTLVVVEHDEDTMRAADYLIDVGPGAGALGGTIVASGTPAEVEANKSSLTGQYLSGKKFIAVPAKRRKGNGNWITVKGAKENNLKNITAKIPLGKFVAVTGVSGSGKSTLVNTVLKRALKQKLNNNSEKPGAYRSIEGTENIEQIVDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDLFSQTNEAKMRGYNKGRFSFNTKGGRCENCRGDGVIKIEMNFLPDVYVACEVCGGTRYNSETLEVTYKGKNISQVLDMTASEALEFFTPIPKIAKKLQTINDVGLGYVKLGQSATTLSGGEAQRMKLASELHRRTNGKTIYILDEPTTGLHTDDIARLLEVLERLVDVGNTIVVIEHNLDVIKSADWIIDMGPEGGAGGGKVLVAGTPEKVMKTAGSYTGKYLKEVIERDLSRA >NZ_CP014611|339929:349785|342199_344194_+|WP_193408639.1|DBSCAN-SWA MEHEFEIKSKYEPTGDQPQAIEKLVGGINNHVKEQILLGATGTGKTFTISNVIKEVKKPTLVLSHNKTLAGQLYGELKEFFPNNAVEYFVSYYDYYQPEAYVPSSDTFIEKDSAVNDEIDKLRNSATSSLLERNDVIVVASVSSIFGLGDPHQYKDHVISLRVGYEYERDQLMRDLIDVQFTRNDIDFHRGTFRVRGDVIEIFPASQDEMALRIEFFGDEIDRIREINSLTGETIAERDHVAIFPAKHFMTDDDQMQVALDGIRQEMNTQVELFKKEGKLLEAQRIKQRTEYDLAMLEEMGFVGGIENYSRWMDGRQAGEPPFTLIDFFPDDFLIVIDESHVTMPQIRGMFNGDKARKETLVNYGFRLPSALDNRPLKLPEFEKHVNQIIYMSATPGNYENERVDSKHVIQQIIRPTGLLDPEVEVRPVMGQIDDLVGEITKRSERDERVFITTLTKRMAEDLTDYLKDLGIKVAYLHADIKTLERTEIIRDLRLGKYDVLIGINLLREGIDVPEVSLVAILDADKEGFLRNPRSLIQTIGRAARNENGHVIMYADKMTRSMLEAIDETARRREIQMQYNTQHGITPKTIKKDIRDLISVTHAATEEKVVDLTKVAFNDLPKDEQQSIVDNMTSQMKAAAKALDFEEAAQLRDTVMELKTRANL >NZ_CP014611|339929:349785|348150_349095_+|WP_011679257.1|DBSCAN-SWA MSYAADVKKELTGLIVHAGNAKAELAALMRMNGVSTLGFDQTIRVQTENAAIARRIYTLLKETYVEVEVEVSVTDHNHLSQHKSYGVLLKTKIDEVLDDLGIDPFGLHPEVPPRMLNQVDKRRSFLRGAFLAAGSVNSPERANYHLEIYTTHEELAEQLMIMMQEFDLPSKISERGNGFIVYLKRAEKIVDFLQTIGATQSMLKFEDIRMMRDMRNSVNRLVNAETANMQKTAIAANKQVSQINLIIDTLGSLDILPKKLRDIAKARLEYPDETLAELGEVLDISKSGANHRMRKLTQLATMIEQGIDYDLTKL >NZ_CP014611|339929:349785|339929_342068_+|WP_025267766.1|DBSCAN-SWA MISLLKRISNPRNLWHQVKRTMDTSAPIVWFFILNVVLVWLKTYAEYHMNFNLGVEGSTQQFLLFLNPIPTAIIFLSISLYFRGVTSYWLAIIFNLIQSIWLFANMLYYREFSDFLSMGILGSGSSTGTNLGKSIAAIIHWTDYLVFIDIVILILLVVFKQLTIDHKGVQKKFAILTTLFGVILMLVDYGIASTDRSGLLTRSFDNNYIVKYLGLNEYAVFNAVQTYNQTESRKRAKPSDLAKVKKFVATQKLPANIQYYGTQKGKNVFMIHLESFQQFLIDYKVDGQEVTPNLNQFYHDQNTLSFDNFYNQVGQGKTSDAEMMQENSLYGLATGSAMVKYGTSNTFESLPAILGQRGYTTAAFHGDVASFWNRDNTYKSFGYNYFFSKAYYANANKANYNIGYGMKDKIFLRDSAKYIEQLPQPFYAKLITVTNHYPYDLDKQNISFPATKTGDKTVDGYVQTAHYLDQAFAELMSYLKKAGLYDNSVFVLYGDHYGISENHQDAIAQLLGKDKITNNDLATFQKVPFMIHATGLKGGIDHTYGGEIDMLPTLMDVLGIPDNNMTMFGQDMLSSKYDGKVVFRDGDWITPTYTKYNNQYFNTKTGDQVTLKSDKKLQKVAKQMSAYATKVLGYSDAVITGDLLRFDTSNSDFNLINKKNYNYKKTEGLASLKKALKSNPSSVLAKNKGKSTLSDYVTDAPELKTDSDDDDK |
6 | Streptococcus_phage(50.0%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
545594 : 558758
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP014611|545594:558758|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP014611|545594:558758|548147_549023_+|WP_014324424.1|DBSCAN-SWA MNETLTNQIGEQLKAARLEKQLSLDDIQEITKIQRRYLSAIEENNLSVLPGDFYVRAFIRQYALAVGLHPDELLGETKPISMSRTSDLSRAHRDNDGIVRAGIDNTPTARSRLANSMPTIGLGLLILVALIVIWFVLTHIGTNSQQTSNGGNISVSTSEVSKSSSKSSASKSSASSSSEESSTLDLGTPETNTSLQTTIYNLSNENTKKHTVVITAKNTGTSVKVNDASSNILLNETLASGSKTVEIPSGTTAFNLQFSNVNNASVTVDGQNVEVSGATTSFWNVLFNLNK >NZ_CP014611|545594:558758|554399_555281_+|WP_014324427.1|DBSCAN-SWA MSKSYRGSIVFTIVAVAVAAALGTAYAMRDKSASNTSITAVGSTALQPLVEAAGEEYAKDNLGTFINVQGGGTGTGLSQVSQGAVDIGNSDVFAEEKDGIDAKELVDHQVAVVGIAPLLNKHNGVKNLTTKQLIAVFTGKVTNWKEVGGNDQKIVIINRAAGSGTRATFEQWGLNGAQSTEAQEQDSSGMVRSIVSTTPGAISYAAFGYIDDSVVAAKVNGVKPTKQNVVSGKYAIWSYEHVYTKGKPSEPVAKFLKYLTSKKVQSTLVSKLGYISIHDMKISRDVNGQVTRK >NZ_CP014611|545594:558758|545594_546860_+|WP_071951845.1|DBSCAN-SWA 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13 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
799981 : 808639
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP014611|799981:808639|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP014611|799981:808639|802247_803282_+|WP_025267984.1|DBSCAN-SWA MNDLTWMKLAADEAIRAMPYQTFENPRVGAVIVKDGQVIATGYHEKFGEAHAEINAFNRVKKKTDILGATLYVTLEPCSTQGKVGSCAVQIQNWGLKRVVVGSIDPNPSTNGKGIKMLRSAGIAVDVLNTVENKEINPAFHYFYTTRLPYVQLKLAMSQNGFVAEKFGKRKKLTDELADADVHRERATRSAIMIGSETMITDQPMLTVRHINISHKQPLRVVIDRRGRLQNTNFDFSNNWLIYTENVLFSKQHSYVKLMSGALKDILIDLAKQNIQSVMVEGGPSLIHSFLKENLWQEMLIYTTDKVLSKDSLKGISVSQKPKNEVQVGNAVKKVYINHQGGTQ >NZ_CP014611|799981:808639|803874_805068_+|WP_014324575.1|DBSCAN-SWA MTSTTEKVKTAVKELKKGKLIILSDDKKREHEGDLVGLASFVTAATVNEALSIARGVLAVPITKSRADELGLDQMTTHNSEKFGTKFTVSVDHIDSTTGVSAYERAATIKNLANLSTTSVDFETPGHIFPLVAEDGGVLTRQGHTEGAVELAKIAGVPPVAYIIEILAQDGTMAREKELKELAKKHDIFQLSMQDLINYREDQKQAGIDEGPTVYLPTQYGDFHLTEFSVNDEEKSDLLIQSSRSFDQIPLVRLHSECLTGEIFGSQRCECGPQLREALKTINKQGGALVYLRQEGRGIGLHEKLKSYVLQENKFDTYDANVHLGHLPDERDYKKAAKILKISGLTKIRLLTNNPDKVQSLIDEGIEVIEQVPLITGINDKNEQYMQTKKEKFNHKL >NZ_CP014611|799981:808639|800906_801866_+|WP_025267983.1|DBSCAN-SWA MKINVYNEYDPLKEVIIGDATKLYFPDTHEIEQEEHTAKWKQFMTKHIYTLLRGKKVPSFLAKKFQRELAEFQRILETHGVKVHHVDSVTPTNLDPYGMGQMYARDSAMSVGEHFIEGNVQIEMRKIERRGYQRIVAAINDKNQVHTLNQKDKIYLEGGDVIVNYPYVFVGIGKYASNEAGAKWLQSILDKDYENEIVDKPWKVVPVYLNDDAILHLDCCMTIIGPKTAIIHKPVLKDLPKELVDYKFIDIDAKTRKEMGGNVLVIGPKKVIVQKRHTALQEALKNEGYTVIPIVFTWHSLLDGALRCASCPLVREKNE >NZ_CP014611|799981:808639|805092_805563_+|WP_011679599.1|DBSCAN-SWA MIYKAKLIDQTNKKIAIVASKFNDLIVKQLISGAQESLEMHGIDESNIDIIWVPGALEIPMVAKRIAQVQKYDGIVTLGAVIKGDTDHYDLVINGVANGISQISLSTDVPIVFGVLTTDTLEQAQQRSGAKSGNKGAEVALSLLELINIFEQIKSI >NZ_CP014611|799981:808639|803281_803872_+|WP_011679597.1|DBSCAN-SWA MFTGITQEVGRLISIYQRNDKEMRLKIAASEDYFSDSRVGDSIMVDGVCLTINQLESNYAEFDIMVPTFETTIVKFYQVGQKVNLEKALLVSNRFDGHFVLGHVDQTAEVVKKEYSEETTLLTFKLADRQQINQIVNKGSVTISGVSLTIVQAREDVFQVGLIPLTLTKTTLGLLHERDLVNVETDILAKYLMKGK >NZ_CP014611|799981:808639|805999_808639_+|WP_025267985.1|DBSCAN-SWA MEAFRRGVKETIASHHVNMGKGLDAEQVSKNREEYGANVFVAEKKVSLLKKILISLNDVATIILLIAAVISFVATYLEDTGNYFESLLIIGIVVINSVLSIVQEGKAEDSLAALQNLNRTQVKVLRDGQIEQIDADDVVLGDVLVVENGSAIAADARLIEAIELQAEESALTGESLPVEKNADATFKPDDEVGLGERITMVYRGTTIVNGHGRAIVTAVGMQTEMGKIASLLSNESKIPLTPLQRRLVQLGKNISWVAIGAAVVVLGLGIYQGMDLKHIFLTAISLAVAVVPETLAVIVTMTLALGVQRIAQKHAIIRRLPAVETLGTTNVIASDKTGTLTQNKMTVRRVWQDEQDHLTNIADGLDDATKEVLSLAAISTNVSVKTVEGQTVYDGLPTEVALVRAIDKEATREELLEKYPLVEQIPFNSTKKRMTTVHKQPEGGYIAITKGAFDVLLPMIKHGNRDKAESVNKTFGGQALRVLTIAKRTFDVMPEAPTQEFYEQDLTLVGLVGIIDPPRPESAPAVEKARLAGVRTIMITGDHVETASAIAREIGILRNGDQTITGSELAKLSDKELDGNVQKYSVYARVTPTDKIRIIKSWQRQDATIAMTGDGVNDAPALKAADVGISMGETGTDVAREASDIILTDDNFATIINAISEGRGVYVKVRKTINFLLSANISELLVILIAMLLGWGSPLLPVHLLFINLVSDGLPGFALSREPMLTNVMNEPPMPKNTKLFAQGLGRQIGLNAALFAIVTLAAIWVGQNVVFGGLQANEQIGQTMAFTILSLTSIFHVFNIRSEKTLFAISYRANPSLVNMAILATVITLVITLIPFTQTLFGLTALSLGHWIVIIVLSLAPTIVIELLKYVRPTLFKV >NZ_CP014611|799981:808639|799981_800887_+|WP_025267982.1|DBSCAN-SWA MTQKKIEQRAFMVGLAMNLLMGSLGIVVYYITQIQALFVDSYFTIMTLVSGIAAITISKYSARTSERFPNGHFMFEPMYAAFKSMMTLILLTTSTIQVSQKAYQYFVYHKGDVLNLTPIIPYEIIMVILCLTISLFYSRQNQKIGRASTMLSAESKSTRIDSIMCGGIGLAAFLVLLIPKNSILGFLLYTGDFFVTVILVLFSIATPVKVLKNAFIEICGGRLIDENIQNEFEACLRKHFGKEVILTGCHIYKTGMYFSVKVMIDVVDDEIGTGLLRDKKVRILEELKACYEFVHLEFVYA |
7 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1632368 : 1643140
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP014611|1632368:1643140|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP014611|1632368:1643140|1638330_1638696_-|WP_002815839.1|DBSCAN-SWA MTEEHQAVMRGDVFYADLKQGIGSEQAGVRPVLIIQNDVGNANSPTTIVAAITSQISKPKLPTHVLLPEHMSGMKRDSVILAEQVRTIDKRRLRDKIAHINASSNEMQLVAHALRISVGLK >NZ_CP014611|1632368:1643140|1635320_1636178_-|WP_025268488.1|DBSCAN-SWA MKKHSLIIVAIVSALVASFVVYSGLQPDSWFQQRTNTTKTSNSAGTTTIAKTAYTSSDTATTAYNKVKNAVVTVQNLQKTSSSSSWSSYFQQNQQDSSSELETASEGSGVVYKISGGYAYIITNNHVVADSDELQLITASGKKIQATIVGTDSSKDLALLKAKTTDIKTSASFDNAKKLQSGQQVLAIGSPLGSDYATSLTSGIVSAPRRTLSAEETGSSATTAIQTDAAINPGNSGGPLINLKGQVVGINSSKIASSTDGTSVEGMGFAIPADIVQTFIKNTEK >NZ_CP014611|1632368:1643140|1633474_1634392_-|WP_025268487.1|DBSCAN-SWA MSVILNNGLLKRESFVIGRFEVLEPTINILLVNLMPNRLQTEKQFTRLLSHLPINVRVTFAVPSEHEIRHDTDAIMTNYVTLNDIWHKKFDGMIVTGAPVDRMKFEQIDYWDEFRHLLEWRKTHVTESLFACWAAYGAGYAERNFPVKALSEKISGVFQASQIFKRHSLLKDLENISMPQSRYFTIPNFGVARRLKVAGDDILGAFILRDEHVNSTYITGHFEYDTETLENEYLRDIAIDPNTIKPKNYFYNNKPTNTWQTYAEKFFVNWGELLMEKMTSSRSTIPTLNQERNKLGLGTSRCKYL >NZ_CP014611|1632368:1643140|1638734_1639856_-|WP_071952332.1|DBSCAN-SWA MTDNDILCLRPTWLDIDLKAIQTNAKLIMRHAGAQRLIAVVKANAYGHGAKQVVGALFEVGVYDFAVATIGEGVDLRKYYPQAEINIFLLGVQDVTQTEVMVENRLSPAVGTTEWLDEAVNYIKDGQKLDVQLAVDTGMGRMGAHSASAVGDMYHLIQGTEKFQLAGVFTHFATADDNNQNYYDEQVQRFYQWVQSAGIPKQYWHLANSGSAIWHHDEIYTDTIRVGSVLYGYNPGAPEKKMSLPLKPALQLKSKLGSVHQLTTGESVSYGATYTAEKPQWIATLPIGYADGYLRRMSGMKVLVDGHIEHVIGRVTMDQIVITLKQKYPVGKTVTLVGLEGENQISVEEIAEYAQTIPHEILTNFGARLPRIY >NZ_CP014611|1632368:1643140|1639852_1640263_-|WP_002815841.1|DBSCAN-SWA MIIGIGNDTEAISRVAEIVERQKSFITLILTPAERAAAAERKGKHQNEYIAGRFSAKEAFSKATGYGIGEKVQWQDIEILNEPNGRPVMKVKNFPYHTYVAITHSGDQVNTVVVIERLTLLEKMSIKLFPKRGVLS >NZ_CP014611|1632368:1643140|1636269_1637568_-|WP_025268489.1|DBSCAN-SWA MPNAINKKQQVRGFIWLLASFFVIFSILASVIFVSYTRTVFNSADSAINQTLSMYDSNGLLSTSDKDVKKPQPLYNNTSTRTETWLFDKNGKLIIDSNTEDTRQAALQKALQQAIKFDKATMTVKPNTYKFYGNYYRIIGFQFKKNAAKGYNQIAVHGMVTVNVTDTMDNLNNFKKVLFWSFGLFGILLVIVSYLIARRNMKPILKSWQQQQDFVNNAAHELRTPMAVIQGKLETMLTKPESTVRDQSNAIILSLSEVRRLNSLTNNMLMLAKTGSNMTTIEKESTDVKQFLENIITPYQEMAEFEEKAVTLEVDVNQAIFIDQKRIHQLLVLLLDNALKYSDAGATIAVKAGIEKKKFVLTIADSGRGISDEAKKHVFDRFYREDKTGNRQTGGTGLGLSIAEWVVHAHGGKITVADNQPQGTVFKVILPL >NZ_CP014611|1632368:1643140|1640333_1641620_-|WP_011680400.1|DBSCAN-SWA MLKKRGLWWIFGPVILAFVMVTALFLAPFSLNYLSNKDIQKASVSFSKNVFKGESVKMAAFSNSKTNYVPFFGSSELLRLDTMHPSVLAAKYKRNYQPFLLGQAGTESLSHYLGMQEMTPALHKKQAVFIISQQWFTKRDSKWAFPQFYSPLQTVNWLRNIKTISATDRFIAKRLLEQKQISDNSFYARLITKIKNNEPLSETDQSLLMLRNRMLLREDQLFSNFAVSNNWDKQVEPALKSLPKTDNVSLLEREAMRVAKKQTGNNKFGIKNSFFRMRVKPSLKKLENSQSHFDYRQSDEYSDFQAVLQEFAKEHTDVLFIIQPVNKRWSKYTGLSTKRYYQSVDKVKKQLKSQGFNQIADFSHDGGHKYFMQDTIHMGWRGWVAADTKIKPFFARGYQEPTYHINDNYLSKKWQNLIPTDKNLKNFK >NZ_CP014611|1632368:1643140|1637548_1638250_-|WP_011680398.1|DBSCAN-SWA MSKAIKILLIEDDVNLADNVVGFLQDFADINAVTDGLDGEFEAQEAPYDLIISDLMLPGETGLELIKNLRANDVETPVLILTAKTSLDDKIEGFNVGADDYLTKPFHREELLVRVKALLRRSGVYSEDNTLAVGDVMINLENRGVQVHGQPVKLVGKEFDILTYLAQNKNIIVTRDQIFDRVWGIDSDTTINVVNIYLNNLRRKLEAVGQNNLIKTLRNIGFILEVEDAERNQ >NZ_CP014611|1632368:1643140|1641624_1641861_-|WP_010292689.1|DBSCAN-SWA MDLKEQIVEILNTIIGEDISDQMDDDFFENGLLDSMATVELLLDLESKFNIQAPVSEFNRDEWNTPNKVVAKVESLIG >NZ_CP014611|1632368:1643140|1632368_1633478_-|WP_025268486.1|DBSCAN-SWA MSIKIDTLLAQGGNGSDDIKTGAVVSPLYFSTAYRHPNLGESSGFDYARLQTPTRQILEEQLADLEQGVQAFATSSGMAAIDLLFASLIKNGDHFVTSDDLYGGTYRYFDAIVEQSGVSYDVWNGVDDISTLINETTRLVWLETPSNPTMKVIDIQKLSAKVKDINPDILIAVDNTFLTPIFQQPLTLGADIVVHSATKYLGGHNDILAGAVIVNSDDLAEKLEISLTTRGQVLDSFSSWLLLRSLKTLHLRMQRHNENGQYLAKKLPCMPGIDKVLYAGVGGMLSFYLSNDYDVDAFLKGLQIGSFAESLGGPETLITIPAVQTHHDMSQEQRDHLGITNQLVRVSAGLEDKEDLLADLRQAVEGAKR >NZ_CP014611|1632368:1643140|1641931_1643140_-|WP_025268491.1|DBSCAN-SWA MLNLQPYADPQYFIILLLALLPLAIGLYFGKRIAWYEVLVSLVFIFLMFDGEKYHEGIALIIYMIWQWLLVWAYTLYRKKYNQTWVFYVTTILAILPLVLIKVAPVANWLQVTTLLGFMGISYLTFRSVGMVMEIRDGSIQEFNPWLFLRFMLFMPTISSGPIDRYRRFVKDVEKAPTHDKYLEMLGKAVKYLFIGFLYKFIVSHALGTVLMPNVERMAIISAHAQGGWSWWIIAYMYIYGLNLFFDFAGYSMFAVATGYVMGIEVPMNFNLPFLSRNLKEFWNRWHMTLSFWFRDFVFMRLVFLMMKKKWFKSRVTTSNVAYIINMLIMGFWHGLKWYYIAYGLFHGVGLVVNDMWLRYKKKHHVPHNKFTNALAIVITFNVIMISFLLFSGLLDKIWFQR >NZ_CP014611|1632368:1643140|1634900_1635227_+|WP_002815833.1|DBSCAN-SWA MYEPTHNSNEAVEEHINKPGRHVMFLSADWCGDCKAIKPFIQTIKDEVTQTAEWFDADRDENIDVATKHNMRGIPSFVLFENGQEISRIGHGERLTPKEIVDWYHSTL |
12 | Pandoravirus(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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