Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP018143 | Acinetobacter baumannii strain HRAB-85 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,csa3,RT | 0 | 0 | 8 | 0 |
NZ_CP018144 | Acinetobacter baumannii strain HRAB-85 plasmid unnamed, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP018143_1 | 2359106-2359191 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP018143_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP018143_1
>1.1|2359129|40|NZ_CP018143|CRISPRCasFinder GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018143_1
The CRISPR arrays of NZ_CP018143_1 >merge|NZ_CP018143|1|2359106-2359191|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA >NZ_CP018143|1|1|2359106-2359191|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA
>NZ_CP018143.1|WP_000795915.1|2357868_2358105_+|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NZ_CP018143.1|WP_001124846.1|2356974_2357586_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NZ_CP018143.1|WP_000885229.1|2356292_2356904_+|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NZ_CP018143.1|WP_000376215.1|2355680_2356136_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG >NZ_CP018143.1|WP_001990047.1|2353975_2355622_+|allantoin-permease MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA >NZ_CP018143.1|WP_000115408.1|2350345_2353810_-|response-regulator MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVYIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ >NZ_CP018143.1|WP_000107128.1|2349389_2350349_-|response-regulator-transcription-factor MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH >NZ_CP018143.1|WP_001025680.1|2348961_2349246_-|N-acetyltransferase MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK >NZ_CP018143.1|WP_002017921.1|2348738_2348852_+|hypothetical-protein MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS >NZ_CP018143.1|WP_000937460.1|2348014_2348650_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT >NZ_CP018143.1|WP_000983628.1|2359822_2360236_+|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII >NZ_CP018143.1|WP_000432330.1|2360377_2361256_+|glucose-1-dehydrogenase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NZ_CP018143.1|WP_001990041.1|2361312_2363457_-|catalase-HPII MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEHGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLSYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA >NZ_CP018143.1|WP_001145693.1|2363511_2364921_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNQYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NZ_CP018143.1|WP_000482091.1|2365236_2365716_+|CinA-family-protein MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR >NZ_CP018143.1|WP_000108365.1|2366000_2366222_+|hypothetical-protein MSTTNNQANQRNNQQQQQQQNDNRNQQQHGNQQQNDQQQQNNQQQQQNDNRGQQQGSNQKDSGQQNSNNNQQR >NZ_CP018143.1|WP_000132044.1|2366327_2366645_+|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDI >NZ_CP018143.1|WP_000498477.1|2366729_2366951_-|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF >NZ_CP018143.1|WP_001136759.1|2367038_2367467_-|hypothetical-protein MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NZ_CP018143.1|WP_000251637.1|2367736_2367880_-|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSRNDGMHEASDPATSHDMNKNS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1144041 : 1158838
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP018143|1144041:1158838|DBSCAN-SWA 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10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1262364 : 1303148
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP018143|1262364:1303148|DBSCAN-SWA 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61 | Acinetobacter_phage(94.64%) | capsid,integrase,plate | attL 1262346:1262362|attR 1304411:1304427 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1364104 : 1382935
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP018143|1364104:1382935|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP018143|1364104:1382935|1364104_1364809_+|WP_001067858.1|transposase|DBSCAN-SWA MNPFKGRHFQRDIILWAVRWYCKYGISYRELQEMLAERGVNVDHSTIYRWVQRYAPEMEKRLRWYWRNPSDLCPWHMDETYVKVNGRWAYLYRAVDSRGRTVDFYLSSRRNSKAAYRFLGKILNNVKKWQIPRFINTDKAPAYGRALALLKREGRCPSDVEHRQIKYRNNVIECDHGKLKRIINATLGFKSMKTAYATIKGIEVMRALRKGQASAFYYGDPLGEMRLVSRVFEM >NZ_CP018143|1364104:1382935|1377613_1379089_+|WP_000052512.1|DBSCAN-SWA MSLIIKARNIRLDYAGRDVLDIDELEIHSYDRIGLVGDNGAGKSSLLKVLNGEIVLAEATLQRFGDFAHISQLGGIEIETVEDRAMLSRLGVSNVQNDTMSGGEETRAKIAAAFSQQVHGILADEPTSHLDLNGIDLLIGQLKAFDGALLVISHDRYFLDMVVDKIWELKDGKITEYWGGYSDYLRQKEEERQHQAVEYELMMKERERLESAVQEKRQQANRLDNKKKGEKSKNSTESAGRLGHAKMTGTKQRKLYQAAKSMEKRLAALEDIQAPEHLRSIRFRQSSALELHNKFPITADGLSLKFGSRTIFDDANFIIPLGAKVAITGSNGTGKTSLLKMISERADGLTISPKAEIGYFTQTGYKFNTHKSVLSFMQEECEYTVAEIRAVLASMGIGANDIQKNLSDLSGGEIIKLLLSKMLLGKYNILLMDEPGNYLDLKSIAALETMMKSYAGTIIFVSHDKQLVDNIADIIYEIKDHKIIKTFERDC >NZ_CP018143|1364104:1382935|1375295_1375577_-|WP_077252464.1|DBSCAN-SWA 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17 | Escherichia_phage(37.5%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1561544 : 1613796
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP018143|1561544:1613796|DBSCAN-SWA 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MALPIITADQTLLVQAIIVYLYADPGLGKSSMGFTAEKAISFDFDRGAHRTGELRRGAVVQVHQWSDVANLTPQDLAPYKTVVIDTVGAMLECIKTHLLLTANNRQKDGSLKLKAQGLANQTFKQYINTLISLGKDVVFIAHASEDQNGDQIIYRPDLGGKNRNELYRIADVMGYLTTVTTGEGKNARVINFKPSPTHHAKNSGALGGETGEVWVPDLKAHPTFLADLITQAKDHINTLTPAQLAAAKAQEELENWKQSCEEAEHAGDLNQLTESLDKEHMYYQNMRQAMLMRAKALNCTFDKQRGTWISPPEFNGISDQQRDELQNFIAERGLDVKTVCEHLGIDALIQIEAAKLKAVKQDIETLAKTGMTA |
72 | Acinetobacter_phage(96.97%) | terminase,transposase,capsid,integrase | attL 1555653:1555667|attR 1575751:1575765 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2725433 : 2757469
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP018143|2725433:2757469|DBSCAN-SWA 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46 | Acinetobacter_phage(43.33%) | tail,portal,capsid,head,terminase,protease,integrase | attL 2725220:2725273|attR 2761306:2761359 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2768500 : 2797175
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP018143|2768500:2797175|DBSCAN-SWA 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38 | Acinetobacter_phage(93.55%) | terminase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2801133 : 2813481
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP018143|2801133:2813481|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP018143|2801133:2813481|2806425_2806641_+|WP_000370485.1|DBSCAN-SWA MDNSKRPINQIIARINDAAKHGEALVLTAEEVKILSKDIGDKVFIPVLTNEQVVQLVKEGKLGQKINNTKD >NZ_CP018143|2801133:2813481|2808553_2808796_-|WP_000051960.1|DBSCAN-SWA MSLGEEMFEWRKQMVEKLLLQESNIDQLEEKVDRAEKILFGDCTAAFKIECTLRNAYALKAILDDFATKNNCKVSIVECE >NZ_CP018143|2801133:2813481|2804700_2804973_-|WP_001180660.1|DBSCAN-SWA MQNNLSNQTTERNQPEFLVGDVVVLTKECRTFKSNDLFEVKNKTLTRLWTIKSENHLILVSSKEIRTATVAELNAKRRLTSAEQALAEVS >NZ_CP018143|2801133:2813481|2812102_2812354_+|WP_000654846.1|DBSCAN-SWA MKDQYKKVSQKHMLGFMYYLQLLGYVIVRQGMDQAMFLTKHYAVPVAWRRITIDYHNRLNKPAQQLYKEFVEWTKEEYAEMVA >NZ_CP018143|2801133:2813481|2805365_2805554_-|WP_000703023.1|DBSCAN-SWA MKISDLMTYHGCKNRKELSEKTGYSTVTLWKWENNGIPARTQAVLQVKTKGKLKADLQALTA >NZ_CP018143|2801133:2813481|2803530_2804412_-|WP_000064627.1|DBSCAN-SWA 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24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3049820 : 3061157
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP018143|3049820:3061157|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP018143|3049820:3061157|3053786_3054539_-|WP_071916828.1|DBSCAN-SWA MHEITLNEVRQLIASLRTVYAAQFNKQFPATGESAIPLSVVEQIALKTLVGVQQNQFNNALARLLTAGGRFMPSFAEFRTWCIGESWMSPEEAWSRACKFTTDSTVVITQITKYALDEVMYLIEAGQMRAAQDNFFGTYNVMVAKAQLKGRQQEFYAPPLQLEHKEPKHVPVSNDEAQKHLKSLMERLKINGRKPAPVQKLEAKEKEPELIKELGPDPFDNPHEYAEMCRREGMPIPRNILQLIDGRMYE >NZ_CP018143|3049820:3061157|3059700_3060075_-|WP_000818521.1|DBSCAN-SWA MAEKLLANASSKLTLEEKAKMEWIAKLEGKNSLSNLIRSMCKKKISEVEGEMAGKSSLEVIKNICTRKVSEAESEYQFLRNVFCGSKDNGYTRDTFELVPLRAEKSRHTNASDKSVQLDLLSWK >NZ_CP018143|3049820:3061157|3055478_3056525_-|WP_020752534.1|DBSCAN-SWA MNKILFGDCRTLMAQMIQEGLKAQTCVTSPPYFGLRDYGVDGQLGLESTVDEYVQNMVEVFRLVRELLHEDGTLWLNLGDSYAGSGRGITRTGLNDGKNPKTKGLILPKQNAAQSNLKPKDLIGIPWKVAFALQADGWYLRQDIIWHKPNPMPESITDRCTKAHEYIFLFSKSRRYYFDHVAIKEPVAESSIKRLSQNLDDQQGSDRVVNKHNGPMKAVYSRSSRDSFKRSNSKRAAVIPNQAYGTHRSERSESEYDLLTRNKRSVWQVSTKPYKGAHFATFPMDLIEPCVLAGSRVNDVVFDPFMGSGTTAAVALMHNRNYLGCELNPQYYELQQERFEKVLKERAA >NZ_CP018143|3049820:3061157|3059466_3059667_-|WP_000290738.1|DBSCAN-SWA MAVQTLGRMNVSNLANHPCSGKCTDFKEEQCSTCLINQDAPHQIVNTQTDEEKFLDRAFNAQKEIS >NZ_CP018143|3049820:3061157|3059284_3059470_-|WP_000200037.1|DBSCAN-SWA MTSEKKVWPLGTNHTDSEGTPWKRDEQNNWWFWQENFGWSRYVGPVNQAFLDLRFEVGTEQ >NZ_CP018143|3049820:3061157|3053250_3053673_-|WP_000648413.1|DBSCAN-SWA MKATKLIRDKGLQYAKEIVDSAPDNATEWNEGYEFQCGQSVEISPADREKYFVDLVELKRLVESLKIINDLGGVEKLTPAFITTDKHVGYTHVRMVGNGRLSFLDDFCDFIPDGSISIKRVMTAIRDHESIYGGGESHAN >NZ_CP018143|3049820:3061157|3056521_3058192_-|WP_020752533.1|DBSCAN-SWA MNTKFCFDNTRLFKTQYGLNFSEKIIVDFFAGGGGASTGLEMGLNRPVYVAVNHNPKAVAMHEANHPHTIHYVQDVFAVDPVEICDGYQVGWFHASPDCTHHSQAAGGQPRKKEIRDLSWVVIKFAGKMKPDVITLENVKQILNWGPLIAKRDKATGRVITLDKVEVNGKLVNRVAEPGERVPRNNQFLIPNPKKKGKTWRHFVRSLEKLGYVVEWNKRIIAADYGAPTTRERLFLIARCDGQPIVWTNATHFKKAKRGQQKWRSAAECIDFSDLGNSIFERSKPLADATLKRIARGLQKYVIESKKPFFVNSAVPFIGRDFGTSIGHGIEEPLATVTSSFGGHSSLISPILAPFLTEFANSSHQRDWSIEEPLTTICAQVKGGHHGLVAAYMMQANGGFCESDGRSLEEPLSTITNTGSQQQLVSTVLSKENLDGALKVAAFLINFYGNGDARDITAPMDTLTTKDRLALVTVWVKGEPWVIVDIRMRMLLPRELYRGQGFPDTYIIDRGLDNKPLSKKDQVHMCGNSVSPLPMAAIARANDPFFNRVAKVEGAA >NZ_CP018143|3049820:3061157|3054531_3055482_-|WP_001110396.1|DBSCAN-SWA MNYYQHHIGDFNNATRHLSLIERAIYRDLLDMYYDTEKAIDASSIDRLARRLQCTTEEQKEALKYVLDEFFILEEGVYRNNRCEREIAEYHGKKKQASEAGKASAAKRAAKKKGSSNSDSSKDDQASNENSTVVENPLNEEQTDVQPTNNHKPLTINQEPIIDSSSNAREENSQFTPIQFAQYQIDDHKRYSMREFISEYSEFQYDFISLAQQRFVSVPEIDLRTMIQNFGDWYFANESSSLNTPSIWLVKWFSWVQNNEKQVAANRKKQEQINSAGQKPQESGYFANLFEEQSESQIVDVTPAKKFPMIEEVGHA >NZ_CP018143|3049820:3061157|3060107_3060341_-|WP_000335919.1|DBSCAN-SWA MCMNIQDKVIYLSNSRGLTQQQISERTGISQSSVSKIASGEQKEVAYNKGVALDALVASEQKREYEESKTKQLNRSA >NZ_CP018143|3049820:3061157|3053659_3053794_-|WP_001031749.1|DBSCAN-SWA MNKFEILAWGLLISFFTAAISGAVVWWWLARKELDEKGASHESN >NZ_CP018143|3049820:3061157|3060467_3061157_+|WP_000550612.1|DBSCAN-SWA MHLQKNVKYLLKKYSTTTTGLSKKSGVPQPTLFRWENGQYKEPKISTVEKLASWAGYDANTLLNNDLEAIDNINNDLDELVLDNNVNLSNKIKLDGEQIPVISWVAAGSFTDVQTVLKDTEVLEWLPPMKKAGKNGYGLIVTGTSMLPKFEPGDRIYVNPDYPVFDLKTNDLVIVSCAGDTQATFKRLIIEDGEEKYLEPLNTKWPEQIIKLTEECKLVGKVVGMHREF >NZ_CP018143|3049820:3061157|3049820_3050585_-|WP_000994866.1|DBSCAN-SWA MNAVPQKLEYKISHTNQICKIHKEQMINVHGRIVCQSCVEKIMKQSNEKYESDKNNRILNLKMARAGIPKRHVNSGFSNYAVTHKGQDKARKTCEKFTMDFNSGVFRNLLLVGRTGTGKTHLGSSILKNIIIKNWEAIYITSADLAEDIAGAYRRSGDSEDEALKRYVKKDLLIIDEYGLHDRAEKRPQLLESVHKVLLTRYDELKPTVVISNLSLSEVREDLGDRLWSRFQHDGLDIVECDWDDARIGGGKAQ >NZ_CP018143|3049820:3061157|3058197_3058836_-|WP_001205618.1|DBSCAN-SWA MRDRFYIACFRDNVGPNVSFHRHQFAGYHTDIDQAYVCTLDEAQRHFNHAREFECPISADHVDALAVWKVDHQTIPNSTQIIDSVFGYAVFVQGKYSGNDVFWLNISSFDISTDFEKASYFSKDEVSQLDKKYIAIPFHLAEKAKRRTFDFNQYNPRIMTQGAGLKQPEHLKRAKRRVKNPQTRFNCPKCGKIVWQYNPYDFDHCNHCGHMG >NZ_CP018143|3049820:3061157|3058832_3059288_-|WP_000575725.1|DBSCAN-SWA MIFELINPSDKCTFEAPNLKIAALVTCVLGNGQYSAKGIENDLDVPFFIFGGHDEWFVSNFGLNFKETYIQVRNEEKFDLVNSFNSVLLGSYLDRTAFYKAYDLIQDPAEKNKWREQWLDERRSSLNNICKRAWNFAEQVSLYKPAQEGAA |
14 | Acinetobacter_phage(55.56%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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