Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP018205 | Staphylococcus aureus subsp. aureus strain HG001 isolate RN1 chromosome, complete genome | 10 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,csa3,WYL | 10 | 3 | 10 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP018205_1 | 375412-375512 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP018205_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP018205_1
>1.1|375435|55|NZ_CP018205|CRISPRCasFinder AAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018205_1
The CRISPR arrays of NZ_CP018205_1 >merge|NZ_CP018205|1|375412-375512|CRISPRCasFinder TTATGAATTGAGTATTAAATTTGAAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTATATATGAATTGAGTATTAAATTTG >NZ_CP018205|1|1|375412-375512|CRISPRCasFinder TTATGAATTGAGTATTAAATTTG AAAGTAAATTACAGTTCTATAGGTTTATAAAAATCAGTTTTTAAATCAAAGCTAT ATATGAATTGAGTATTAAATTTG
>NZ_CP018205.1|WP_001789518.1|374636_374738_+|hypothetical-protein MQLNVNMMKFDRWHKGICKQIVLNSVVIGGKGK >NZ_CP018205.1|WP_000991007.1|373163_374552_-|L-cystine-transporter MNAFLTLINIIVLVIFIVILHMMARKHISFAKRVFTALGIGIVFGVLLHLIYGTHSNVITSTSDWFNIVGQGYVALLQMIVMPLIFISIVAAFTKIQIGEKFAKIGSLIFIFLIGTVTIAAIVGVVYALVFGLDASTINLGNAEQARGSEIAKQAKDLTAHTLPQQILELLPKNPFLDFTGQRATSTIAVVIFASFIGFAYLRVARKQPDHGELLKRAIDAIYSLVMAIVTFVLRLTPYGVLAIMANTLSTSDFGAIWTLGKFLIASYAALITMYIIHLIILSLLGISPIRYVKKTLEVLIFAFTSRSSAGALPLNVQTQTRRLGVPEGIANFAATFGLSIGQNGCAGIYPAMLAIMVAPVANVEIDLQFIVTLIAVVIISSFGVAGVGGGATFASILVLSTLNLPVALAGVLISVEPLIDMGRTALNVNDSMLAGTGTAKLTKHWDKDTFDSNDNAALTSH >NZ_CP018205.1|WP_001289311.1|372327_373083_+|NADPH-dependent-oxidoreductase MSEHVYNLVKKHHSVRKFKNKPLSEDVVKKLVEAGQSASTSSFLQAYSIIGIDDEKIKENLREVSGQPYVVENGYLFVFVIDYYRHHLVDQHAETDMENAYGSTEGLLVGAIDAALVAENIAVTAEDMGYGIVFLGSLRNDVERVREILDLPDYVFPVFGMAVGEPADDENGAAKPRLPFDHVFHHNKYHADKETQYAQMADYDQTISEYYDQRTNGNRKETWSQQIEMFLGNKARLDMLEQLQKSGLIQR >NZ_CP018205.1|WP_000052781.1|371266_371836_-|peroxiredoxin MSLINKEILPFTAQAFDPKKDQFKEVTQEDLKGSWSVVCFYPADFSFVCPTELEDLQNQYEELQKLGVNVFSVSTDTHFVHKAWHDHSDAISKITYTMIGDPSQTITRNFDVLDEATGLAQRGTFIIDPDGVVQASEINADGIGRDASTLAHKIKAAQYVRKNPGEVCPAKWEEGAKTLQPGLDLVGKI >NZ_CP018205.1|WP_000930486.1|369727_371251_-|alkyl-hydroperoxide-reductase-subunit-F MLNADLKQQLKQLLELMEGNVEFVASLGSDDKSKELKDLLTEITDMSPRLSLSEKSLKRTPSFSVNRPGEETGVTFAGIPLGHEFNSLVLAILQVSGRAPKEKQSIIDQIKKLEGSFHFETFISLTCQKCPDVVQALNLMSVINPNITHSMIDGAVFREESENIMAVPAVFLNGEEFGNGRMTIQDILSKLGSTADASEFENKEPYDVLIVGGGPASGSAAIYTARKGLRTGIVADRIGGQVNDTAGIENFITVKETTGSEFSSNLAAHIDQYDIDAMTGIRATDIEKTDEAIKVTLENGAVLESKTVIIATGAGWRKLNIPGEEQLINKGVAFCPHCDGPLFENKDVAVIGGGNSGVEAAIDLAGIVNHVTLFEFASELKADNVLQDRLRSLSNVDIKTNAKTTEVVGEDHVTGIRYEDMNTGEEHLLNLDGIFVQIGLLPNTSWLNDAVELNERGEIVIDRNNNTNVPGIFAAGDVTDQKNKQIIISMGAGANAALNAFDYIIRN >NZ_CP018205.1|WP_000746687.1|368656_369283_-|NDxxF-motif-lipoprotein MKKRLLLSTFLASTLILTGCASDQSDNEDHHTSTGIHAPKSAKKLETKDIFNSDKKNSDISDAEMKQAIEKYLSVNSDILDNKYIMQHKLDKQIDSQTKVTEKQAETLSHLSNLAVKNDLHFKKFVTENNIPKEYKKPVELMMNYFKALNSTIANVDEDIEKLSYQPQNKINVVDVPTKYAGDVNKKQQDKIKDFLKSKGIKSDVIDK >NZ_CP018205.1|WP_000868248.1|368018_368402_-|hypothetical-protein MKVRITFIILAILSTIVCLFLAAMHPTGPNTVTFEQPYLFTLNIIIMVLVALPSLVLAIYDYMSFRISSAILQFLGAISWFFLSLILSLTQFTPFTLASFITSIILFTSTIITLAIGGKSVEKNDSP >NZ_CP018205.1|WP_000158374.1|367371_367953_+|histidine-phosphatase-family-protein MTIYLVRHGESKSNYDNKHFRSYFCGQLDVPLTDTGTKSADDLCDYFKEKQIKHVYVSDLLRTQQTFEHIFPYDIASTTTPLLRERSLGVFEGEYKDEISANPKYEKYFNDPNFKDFRHSFSQKAPEGESYEDVYQRVEHFMNHVVNEDTQKDDIVIVAHQVVIRCLMVYFNKVSRAEAVDLKVENCKPYIIE >NZ_CP018205.1|WP_000211676.1|366984_367194_-|hypothetical-protein MTTQSFIFMNIILLDGATQRHPFFICQILAFLFPKFPHINLLLFNPILSTFSNIIIHIDHFHANKKDDN >NZ_CP018205.1|WP_000466748.1|366694_366946_+|GlsB/YeaQ/YmgE-family-stress-response-membrane-protein MFGFIGMLIVGGLIGWAAGAIMGKDIPGGILGNIIAGIIGSWVGGKLFGQWGPELGSIYILPALIGSIILIAIVTLILRAMRK >NZ_CP018205.1|WP_000956132.1|375528_376485_-|hypothetical-protein MLTKEFAQRVELSEKQVRKIVQHLEERGYQLSKTEYRGREATDFKEEDIELFKDIADKVKQTNSYDLAFDELEKEKDFLQVIVKNDDKNLPTNQNVAQLVEDLRLEIQKMREERHLLGQMMNQVHQQQQELKELQNQLTSKIDSNSESLKAIQTSQEAIQEAQASQAKALAESTNKVEKNAVTEDKADSKDSKVAGVNTSTDAKTDTKAENAGDGTATKVDKEDQISATEAIEKASVEQSKNDNAAETSNKEATVDAEAQHDAEQQVAEAHAEASKQATSNDSLEAKAENDSTASQSEMSEPKPQEEKKGFFARLFNL >NZ_CP018205.1|WP_000394698.1|376602_377265_-|hypothetical-protein MEFKTIQSVKDPHYNEALKLYDTKLNLSLTEDKRIIKRSLENNKTENDYVFIVGLENDVVVSLATAHYEATTNSAFLIYLFAKDLPNHDELMTQTLHQIEHELNLLSNLVHSRSINFLMMEVPKEPADLTQDNGLIIEHRRQFLYEHQFERQTEIDYIHPTNDGHTKKVDLFLKKNIKLTKDIYGTSVKSNYILKYVFANGIAREIIYALLEEMDLRKPF >NZ_CP018205.1|WP_000763768.1|377407_377815_-|general-stress-protein MADITVVNDTGELYNVINQKKSEGYLESELTIISKSKLHLNDLHDSEISLISTSGTFSDRMTKLLTGEDGEHAVLSRYNLAPDELEKYKQLILDDKMLVVAVRDKSSHQEVHENNSAYEEIDITHFAEASKGPKA >NZ_CP018205.1|WP_000421410.1|378327_378906_+|xanthine-phosphoribosyltransferase MELLGQKVKEDGVVIDEKILKVDGFLNHQIDAKLMNEVGRTFYEQFKDKGITKILTIEASGIAPAIMAALHFDVPCLFAKKAKPSTLTDGYYETSIHSFTKNKTSTVIVSKEFLSEEDTVLIIDDFLANGDASLGLYDIAQQANAKTAGIGIVVEKSFQNGHQRLEEAGLTVSSLCKVASLEGNKVTLVGEE >NZ_CP018205.1|WP_000793009.1|378905_380174_+|purine-permease MKNLILSVQHLLAMYAGAILVPIIVGTSLKFTPEQIAYLVTVDIFMCGVATFLQANKVTGTGLPIVLGCTFTAVAPMILIGQTKGIDVLYGSLFLSGILVIIIAPFFSHLVKFFPPVVTGSVVTIIGINLMPVAMNYLAGGQGAKDYGDVKNILLGLMTLIIILLLQRFTTGFIKSIAILIGLVLGTIGAGLLGMVDINQVNHAGWLGIPVPFRFSGFSFDVTSTLVFFIVAIVSLIESTGVYHALSEITGKKLERKDFRKGYTAEGLAIVLGSIFNSFPYTAYSQNVGLVSLSGAKKNNVIYGMVVLLLICGCIPKLGALANIIPLPVLGGAMIAMFGMVMAYGVSILGHIDFKNQNNLLIIAVSVGLGTGISAVPQAFKGLGEQFAWLTQNGIVLGAISAIILNFFFNGIKYKQTEENVK >NZ_CP018205.1|WP_000264071.1|380211_381678_+|IMP-dehydrogenase MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >NZ_CP018205.1|WP_000424966.1|381702_383244_+|glutamine-hydrolyzing-GMP-synthase MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFAGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSPSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCRGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >NZ_CP018205.1|WP_000551776.1|383356_383893_-|hypothetical-protein MHNNNEFNKKLKDFIGSDKRMALVKGYVNEYKLTTVLRALNNSDYTKGTIHTRSIGNLKQIVDNRIIPKNITQNTIFKLSNLTLEVNLYERNTIYHGDFAIYYPVESALIIETDTPRLINHINNNPVQKIFIITTNDWSFNTLELEKIVDETIIYDLKQEDPKQYEILYKNKHGKLPY >NZ_CP018205.1|WP_000041883.1|384285_384990_-|type-II-toxin-antitoxin-system-PemK/MazF-family-toxin MSKNINQANSKLNTSNKKLKQAYSKSDSKNMKVIYMPHWLEFYSIAIHSDVTSNKKRYYKSYSRGTVVYVKLGSNIGSEFSGNHFCVILDNKDNKGKETVTIVPLSSKGNKNYLKLNESVLNLTATDLKKQIIDISSKVQALAQKYREIDIKLSTEDKKLLSNLNQKANELYRVIGVYSKHKGKDTYVNISAITTISKRRISKINDSDPTGTIIISEDDMNEIEKQLKIKFFSN >NZ_CP018205.1|WP_000159787.1|385388_385661_-|transposase MTKERRTFSSEFKLQMVRLYKNGKLKNEIIRKYDLKPSIISNSIKQHQNTGPFNHQDNLKSDEKELIKLRKEVQHLKMEHDVLKQILKLI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP018205_2 | 604868-604960 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP018205_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP018205_2
>2.1|604900|29|NZ_CP018205|CRISPRCasFinder AGGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018205_2
The CRISPR arrays of NZ_CP018205_2 >merge|NZ_CP018205|2|604868-604960|CRISPRCasFinder CTAAAGGTGAAGAGGAACGCAGTTGGATGCTAAGGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATCGCTAAAGATGAAGAGGAACGCAGTTGGATGCTA >NZ_CP018205|2|2|604868-604960|CRISPRCasFinder CTAAAGGTGAAGAGGAACGCAGTTGGATGCTA AGGCACAACTGCATAAAAGCCTCTAATCG CTAAAGATGAAGAGGAACGCAGTTGGATGCTA
>NZ_CP018205.1|WP_000901764.1|604014_604650_+|endonuclease-III-domain-containing-protein MLGTDELYKVLYEHLGPQFWWPADNDIEMMLGAILVQNTRWRNAEIALNQIKEHTHFNPNHILELPIETLQSLIHSSGFYKSKSLTIKTLLTWLARHHFNYQEINERYKGGLRKELLSLKGIGSETADVLLVYIFGRIEFIPDSYTRKIYDKLGYENTKNYDQLKKVVTLPNHFTNQDANEFHALLDVFGKHYFRDKDIKNYDFLEPYFKK >NZ_CP018205.1|WP_001021145.1|601964_603626_+|arginine--tRNA-ligase MNIIDQVKQTLVEEIAASINKAGLADEIPDIKIEVPKDTKNGDYATNIAMVLTKIAKRNPREIAQAIVDNLDTEKAHVKQIDIAGPGFINFYLDNQYLTAIIPEAIEKGDQFGHVNESKGQNVLLEYVSANPTGDLHIGHARNAAVGDALANILTAAGYNVTREYYINDAGNQITNLARSIETRFFEALGDNSYSMPEDGYNGKDIIEIGKDLAEKHPEIKDYSEEARLKEFRKLGVEYEMAKLKNDLAEFNTHFDNWFSETSLYEKGEILEVLAKMKELGYTYEADGATWLRTTDFKDDKDRVLIKNDGTYTYFLPDIAYHFDKVKRGNDILIDLFGADHHGYINRLKASLETFGVDSNRLEIQIMQMVRLMENGKEVKMSKRTGNAITLREIMDEVGVDAARYFLTMRSPDSHFDFDMELAKEQSQDNPVYYAQYAHARICSILKQAKEQGIEVTAANDFTTITNEKAIELLKKVADFEPTIESAAEHRSAHRITNYIQDLASHFHKFYNAEKVLTDDIEKTKAHVAMIEAVRITLKNALAMVGVSAPESM >NZ_CP018205.1|WP_000359086.1|601551_601968_+|DUF1934-domain-containing-protein MDKKVSIQTKQVLKQHNEKEKFEFTTEGTWQQRQSNFIRYVEQIEDATVNVTIKVDDDSVKLIRKGDINMNLHFVEGQTTTTFYDISAGRIPLEVKTLRILHFVSGDGGKLKIHYELYQDNEKMGSYQYEINYKEIGE >NZ_CP018205.1|WP_000655099.1|601351_601459_+|hypothetical-protein MKDSENLVFFGFEVLFVFYKMAYIYEALIKYGIVN >NZ_CP018205.1|WP_001200748.1|600266_601277_+|alcohol-dehydrogenase-AdhP MRAAVVTKDHKVSIEDKKLRALKPGEALVQTEYCGVCHTDLHVKNADFGDVTGVTLGHEGIGKVIEVAEDVESLKIGDRVSIAWMFESCGRCEYCTTGRETLCRSVKNAGYTVDGAMAEQVIVTADYAVKVPEKLDPAAASSITCAGVTTYKAVKVSNVKPGQWLGVFGIGGLGNLALQYAKNVMGAKIVAFDINDDKLAFAKELGADAIINSKDVDPVAEVMKLTDNKGLDATVVTSVAKTPFNQAVDVVKAGARVVAVGLPVDKMNLDIPRLVLDGIEVVGSLVGTRQDLREAFEFAAENKVTPKVQLRKLEEINDIFEEMENGTITGRMVIKF >NZ_CP018205.1|WP_001788287.1|599246_599768_+|YwhD-family-protein MEVISLSEKKGFNFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANKEAFIDIGGMHARAKVEKGVKWITDKAAVEGDEAKEYWLCWVTTERNEQGPYYAGLTACYLLVNKAIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHIIIDQIGDENKAILKDFLMNHDEGMWKHSSDALHQAFN >NZ_CP018205.1|WP_000180230.1|597923_599219_+|HD-domain-containing-protein MTNAYVDLKLVEEKVFKDPIHRYIHVEDQLIWDLIKTKEFQRLRRIRQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRLIDESFIGHDAWDNKDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAYTQAIITGDTEVNAVLRKVAPEFPREVAEVINKTHHNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVSYGAFDMERILRLMRPSKDEVLIKESGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKLHPHDFIPFFEETVTIEQYVELDEAVVTYYLEKWTKEDDAILSDLASRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAGGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLRQDGTIREISNQSLVIHSITGINRQDYKLYYPREMVAKIKDKTIREAIENLINELN >NZ_CP018205.1|WP_000477504.1|597407_597884_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MFKVRQATEKDVVQIRDVATKAWFNTYLNIYAATTVNHLLEASYNEHHLKKRLQEQLFLVVEEGNDIVGFANFIYGEELYLSAHYVKPESQHTGYGTALLNEGLSRFEDKFEGVYLEVDNKNEEAVAYYKEQGFTILRSYEPEMYGEKLDLALMYKAF >NZ_CP018205.1|WP_000633782.1|596702_597239_+|flavodoxin-family-protein MITVLFGGSRPNGNTAQLTKFALQDLEYQWIDVTQHQFKPIRDVRHTAETITSYDDDYLPILDKILASDTIIFASPVYWYSISAPLKAFIEHWSETLQDKRYPNFKAQMAEKDFRVILVGGDCPKIKAKPAITQMKYSLDFLGATLNGYIIGTAEKPGDIMKDNYALARATEWNSILQ >NZ_CP018205.1|WP_000808902.1|595553_596492_+|aldo/keto-reductase MKQFVNLGKSDVEVFPIALGTNAVGGHNLYPNLDEEQGKDVVRQAINHGINLLDTAYIYGPERSEELVGEVVKEYPREQIKIATKGSHEFDENQEVHQNNQPEYLKQQVENSLKRLQTDYIDLYYIHFPDNNTPKDQAVAALQELKEQGKIKAIGVSNFTLDQLKEANKDGYVDVVQLEYNLLHRENEAVLQYCVDHQITFIPYFPLASGILAGKYDENTKFSDHRTTRRDFKPGVFEENVRRVKALESIAAAHQTSIANIVLAFYLTRPAIDVIIPGAKRAEQVVENIKAADIVLSDDEIQYIDELFPIED >NZ_CP018205.1|WP_000749059.1|605028_605916_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKSLIAFILIFMLVLSGCGMKDNDKQGSNDNGSSKSPYHRIVSLMPSNTEILYELGLGKYIVGVSTVDDYPKDVKKGKKQFDALNLNKEELLKAKPDLILAHESQKATANKVLSSLEKQGIKVVYVKDAQSIDETYNTFKQIGKLTHHDKQAEQLVEETKDNIDKVIDSIPAHHKKSKVFIEVSSKPEIYTAGKHTFFNDMLEKLEAQNVYSDINGWNPVTKESIIKKNPDILISTEAKTRSDYMDIIKKRGGFNKINAVKNTRIEVVNGDEVSRPGPRIDEGLKELRDAIYRK >NZ_CP018205.1|WP_001790232.1|606063_607014_+|iron-ABC-transporter-permease MTFNKVLLSWIVILIITTSIYLFWQLGDINDVFNQSILINVRLPRLLEALLTGMILTVAGLIFQTVLNNALADSFTLGLASGATFGSGLALFLGLTTLWIPVFSITFSLITLITVLVITSVLSQGYPVRILILSGLMIGALFNSLLYFLILLKPRKLNTIANYLFGGFGDAEYSNVSIIAITFIIALFGIFIILNQLKLLQLGELKSQSLGLNVQLITYIALCIASMITAINVAYVGIIGFIGMVIPQLIRKWQWKQSLGRQLALNIVTGGQIMVMADFIGSHILSPVQIPASIIIALIGIPVLFYMLISQSKRLH >NZ_CP018205.1|WP_000365354.1|607068_607788_+|HAD-family-hydrolase MDLNQIKAVVFDLEGTLLDRVKSREKFIEEQYERFHDYLIHVQLADFKKAFIELDDDEDNDKPDLYKEIIKRFHVDRLTWKDLFNDFEMHFYRYVFPYYDTLYTLEKLSQKGFQIGVIANGKSKIKQFRLHSLGLMHVINYLSTSETVGFRKPHPKIFEDMIDQLGVLPEQIMYVGDDALNDVAPARAMGMVSVWYKQEDAEIEPLEEEVDFTITTVEELLTILPIKNDNKGENYGSIY >NZ_CP018205.1|WP_000362967.1|607771_608572_+|alpha/beta-hydrolase MDLFTRKDGTSIHYSTLGEGYPIVLIHTVLDNYSVFNKLAAELAKSFQVVLIDLRGHGYSDKPRHIEIKDFSDDIVELLKYLYIEEVAFVCHEMGGIIGADISVRYPEFTSSLTLVNPTSIEGELPEERLFRKYAHIIRNWDPEKQDKFLNKRKYYRPRKMNRFLKHVVDTNEISTKEEIQAVKEVFKNADISQTYRNVVVPTKIIAGEFGERTTRLEAKEVADLIQNADFEVYQESSAFPFVEEQERFVEDTAAFINKHHDEKHV >NZ_CP018205.1|WP_000735558.1|608707_609214_+|hypothetical-protein MKKLLTASIIACSVVMGVGLVNTSAEAASGNSIDTVKQLIKGDQSLENVKIGESIKDVLTKYKNPMYSYNEDGTEHYYEFHTKKGMLLVTTDGKKNNGKVTHISMMYNDANGPTYQAVKNYVGKAVTHTEYSKVAGNFGYIEKGKTTYQFASAPKDKNIKLYRIDLEK >NZ_CP018205.1|WP_001222133.1|609375_610092_+|hypothetical-protein MRINDKILLENIEDYFNHKGLSPHLIDDIKEKVITDIKNSEKKDQDYIEYKRKSPAQIILMIQRNLFALQMNPVIFFIINFILISYLYDKQYVQFQAITGMSLFYCLVIFPMTIVVYLRVSQKNYLRSNKIEMIMGTIIAIISLLLIILQAFNITWGVIPITNFGHQFFFFIGIILVIAGIFYKRLEFSGIGLLFCQKTVDAMIHNPQSAQIFSLIIWILLVVLVIYFTIRLSSRTRL >NZ_CP018205.1|WP_001045421.1|610260_611049_+|alpha/beta-hydrolase MNKVTINPQIQLTYQIEGKGDPIILLHGLDGNLAGFEDLQHQLASSYKVLTYDLRGHGKSSKSESYDLNDHVEDLKILMEKLNIHEAHILGHDLGGVVAKLFTDKYAYRVKSLTTIASKKDDLIHSFTQLLIQYQDDIAGFNKSEAYILLFSKLFRNQEKTMKWYQKQRIYSIKSEDDSAVAIRSLILHKDEPMYLKKRTCVPTLLINGEHDPLIKDKNHFKLEAHFLNVTKKIFEHSGHAPHIEEPEAFMNYYLKFLKSVS >NZ_CP018205.1|WP_001018677.1|611299_611674_-|transcriptional-regulator MAITKINDCFELLSMVTYADKLKSLIKKEFSISFEEFAVLTYISENKEKEYYLKDIINHLNYKQPQVVKAVKILSQEDYFDKKRNEHDERTVLILVNAQQRKKIESLLSRVNKRITEANNEIEL >NZ_CP018205.1|WP_001553862.1|612621_613551_-|DMT-family-transporter MLLFYIIGVLVGMLIPIQTSVNSRLSLYTKSPFYTSFISFSVGTICLIILNIIINPEVFTIHFYNNQSFNYTWVVGGLLGVSFLTGNLLLLPKLGATLTVIATVAGQIIMGVIIDTFGLFGATIHDFNLIKAIGVLLLIVGIVIMNQFNKNNLLLTDQKYLLFWLLLGFIFGFFPPIQTTINSALASHTHSPAFASLVSFTIGSIALLILTAIFNRSLKLKTSHLKFGKLKPIYFTGGILGMAFVTANIILMPHMGAALTTLIGMFGQILMGILIDHFGLFGSPKIAMTSRKTIGLLCILTGIILLRLF >NZ_CP018205.1|WP_000169042.1|613745_613970_-|DUF2922-domain-containing-protein MTKTLELSFKSSLDKPVKLQLPQLNNVVTEQVARDSMNALVDLNIIKSNSGTITKVHSAQIIDKTTTVLFEDKK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP018205_3 | 668128-668226 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP018205_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP018205_3
>3.1|668158|39|NZ_CP018205|CRISPRCasFinder ACAAAGGAATACAGTTGGTTGCTAATGCACCAACTGCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018205_3
The CRISPR arrays of NZ_CP018205_3 >merge|NZ_CP018205|3|668128-668226|CRISPRCasFinder AAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGGACAAAGGAATACAGTTGGTTGCTAATGCACCAACTGCATAAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGG >NZ_CP018205|3|3|668128-668226|CRISPRCasFinder AAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGG ACAAAGGAATACAGTTGGTTGCTAATGCACCAACTGCAT AAGAGCCCCTAATTAATAAATTAAAAGGGG
>NZ_CP018205.1|WP_000687411.1|667176_668043_+|LysR-family-transcriptional-regulator MKIEDYRLLITLDETKTLRKAAEILYISQPAVTQRLKAIENAFGVDIFIRTKKQLITTTEGTMIIEHARDMLKRERLFFDKMQAHIGEVNGTISIGCSSLIGQTLLPEVLSLYNAQFPNVEIQVQVGSTEQIKANHRDYHVMITRGNKVMNLANTHLFNDDHYFIFPKNRRDDVTKLPFIEFQADPIYINQIKEWYNDNLEQDYHATITVDQVATCKEMLISGVGVTILPEIMMKNISKEQFEFEKVEIDNEPLIRSTFMSYDPSMLQLPQVDSFVNLMASFVEQPKA >NZ_CP018205.1|WP_000865624.1|666416_667061_+|DUF402-domain-containing-protein MKVKYIDKRHWRRLIDREYTEVKVNNNRFKGIIGLVTMKKVRDPLEVTVVGQNIIVADDNYKWLQILPEKKRYSITVMFDNKGNPLEYYFDINIKNITQKGNARTVDLCLDVLALPSGEYELVDEDDLMFALESEQITKKQFHEAYMIAHQIMAELENDFKGFQKKIMYCFNKINAKAQKNHQKPQNKTNIEKSKQIKPKQYNQTKNHQQQKKN >NZ_CP018205.1|WP_001789973.1|666155_666272_+|hypothetical-protein MLQLFLMKIALNDFENDKSVLFIFLKNHFYEEMCVLSN >NZ_CP018205.1|WP_000833483.1|665590_666064_+|cupin-domain-containing-protein MKSAEQWIDELQLESHPEGGFYRETIREVLKDGRRAPFSSIYFLLTDDNISHFHRIDADEVWYYHAGDSLTIHMINPDGEYTTATLGTDIQNGDVLQYVVPKGTIFASSIEISNTFSLVGCMCQPAFEFKQFELFKQSELITQYPHLKSVIEKYALK >NZ_CP018205.1|WP_000532966.1|664874_665591_+|YebC/PmpR-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MGRKWNNIKEKKAQKDKNTSRIYAKFGKEIYVAAKSGEPNPESNQALRLVLERAKTYSVPNHIIEKAIDKAKGAGDENFDHLRYEGFGPSGSMLIVDALTNNVNRTASDVRAAFGKNGGNMGVSGSVAYMFDHVATFGIEGKSVDEILETLMEQDVDVNDVIDDNGLTIVYAEPDQFAVVQDALRAAGVEEFKVAEFEMLPQTDIELSEADQVTFEKLIDALEDLEDVQNVFHNVDLK >NZ_CP018205.1|WP_001090985.1|664325_664685_+|HTH-type-transcriptional-regulator-SarX MNTEKLETLLGFYKQYKALSEYIDKKYKLSLNDLAVLDLTMKHCKDEKVLMQSFLKTAMDELDLSRTKLLVSIRRLIEKERLSKVRSSKDERKIYIYLNNDDISKFNALFEDVEQFLNI >NZ_CP018205.1|WP_001129754.1|662029_664180_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MAKSCLHILTNNEYATTRCQDGIVLFWPIDGEIELQKFRKSKIIEDDIYIINHLDVFSIKNNKKTIMLYLSSDWFAELGFTFFNYHYTAKLIKSSYNLKCLLLKLTYRYLDNQPLNDADIRKLQDIIKIIAKEASMDKKIAQNQYRYAYYGDLRDELEYIYQNVNQRLTLKSVADKLFVSKSNLSSQFHLLMGMGFKKYIDTLKIGKSIEILLTTDSTISNISEHLGFSSSSTYSKMFKSYMDITPNEYRNLSKYNKCLMLKPEPLVGKMVQEVKEIILNYIEHYKNHLTDVIHIDEDKFETPKLFQTVIQINTYTEMKLVFLEGIFKTLLNKNSQVVFFIMPSILKSKNTMSEEEKFTIIKTIIESDLKIAFNINNIETTYFVEEAFMSVFRQISPNELSNHNNYEVHFVFDLSLMEIRTIYRMILKLHNIMLNVKLGLNITCLFEKPSVFKSLVSQIKRLKFDSLIIDNANLSSPYLMGESDELLLKNILHFKNLKQVINELDIEQEKLIFLNVENHKLLNNKERDLSNSAPLIYKTLSALYHNFDGFGLNIFDNHQAFNAMHLYDKNGFKTTLGLILEKFIEYVSKPKYENSYYSIFDIENYYCLVIYDWRVIESETIMSNFEDSQVYINFKNNVLNDKYLIVIETLDENSGNINHLISKELRDKYEWNPSLLSKIDNYLKPAIEIKEHNFSDNSLNINVTFNALYIIKIGKK >NZ_CP018205.1|WP_000081602.1|660688_661333_+|Bax-inhibitor-1-family-protein MSQNTNHSYYHQNQHAQSISKVWLYFMYYWIIFGIGCYLGQFLPLSWRQPLSFGLLIIILATLVFERARRFGLIISHIYAVVIGLLSYATFTTYLQNLGPDIFYKNIALAIFAFIAFGIIGYFFVGDASSIGKYLFVTLITLIIASLIGIFLQNPIFYTIITVVSLLLFLLYTLYDFNRLKRGDYSPREMGFNLFINLLNIIKDILYLANMFRR >NZ_CP018205.1|WP_000731644.1|659530_660328_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MKKLAFAITATSGAAAFLTHHDAQASTQHTVQSGESLWSIAQKYNTSVESIKQNNQLDNNLVFPGQVISVGGSDAQNTSNTSPQAGSASSHTVQAGESLNIIASRYGVSVDQLMAANNLRGYLIMPNQTLQIPNGGSGGTTPTATTGSNGNASSFNHQNLYTAGQCTWYVFDRRAQAGSPISTYWSDAKYWAGNAANDGYQVNNTPSVGSIMQSTPGPYGHVAYVERVNGDGSILISEMNYTYGPYNMNYRTIPASEVSSYAFIH >NZ_CP018205.1|WP_000120368.1|657935_658943_+|inorganic-phosphate-transporter MSYIIIVTIAVVIFSLIFDFINGFHDTANAVATAVSTRALTPKTAILMAAVMNFIGALTFTGVAGTITKDIVDPFKLENGLVVVLAAILAAIIWNLATWFYGIPSSSSHALIGSIAGAAIASEGSFGVLHYQGFTKIIIVLIVSPIIAFCVGFLMYSIFKVIFKNANLTRANRNFRFFQIFTAALQSFSHGTNDAQKSMGIITLALIVANVQNDGSVEPQLWVKFACATAMGLGTAIGGWKIIKTVGGNIMKIRPANGAAADLSSALTIFVASSLHFPLSTTHVVSSSILGVGASNRAKGVKWSTAQRMIITWVITLPISALLAGLLFYILNLFF >NZ_CP018205.1|WP_000367064.1|668243_669464_+|sugar-efflux-transporter MDMFAALLQIKNYKLFVANMFLLGMGIAVTVPYLVLFATKDLGMTTNQYGLLLASAAISQFTVNSIIARFSDTHHFNRKIIIILALLMGALGFSIYFFVDTIWLFILLYAIFQGLFAPAMPQLYASARESINVSSSKDRAQFANTVLRSMFSLGFLFGPFIGAQLIGLKGYAGLFGGTISIILFTLVLQVFFYKDLNIKHPISTQQHVEKIAPNMFKDKTLLLPFIAFILLHIGQWMYTMNMPLFVTDYLKENEQHVGYLASLCAGLEVPFMIILGVLSSRLQTRTLLIYGAIFGGLFYFSIGVFKNFYMMLAGQVFLAIFLAVLLGIGISYFQDILPDFPGYASTLFSNAMVIGQLGGNLLGGAMSHWVGLENVFFVSAASIMLGMILIFFTKNQKITKEDVIST >NZ_CP018205.1|WP_000152582.1|669460_669949_+|DUF456-domain-containing-protein MTIILWLLIIAAFMLAFVGLIKPIIPSVLVLWVGFLIYQFGFHNQHLSWVFYVSMALLTILILCADFLANKYFVNRFGGSKFGEYAALIGVVIGCFVLPPFGIIIIPFILVFIVELIQGYSFERAVKVSIGSIVAFLTSSIAQAIIMFIMIVWFFIDALLIN >NZ_CP018205.1|WP_000842860.1|670047_670737_-|DUF1129-family-protein MKSTAQLTKENNVKSLRLSNTDREIFENYMTYMRSDFRVNPHDTELIINRILKQLLSAEQHGLLALDFFNHDPKAHAIKELKAMPNETFKNIFKYIYQHIVLLIGIVSFLKGFLGFFMEKNGSNLYFVSFPFSVVVGFFIVFLFIWFSFKTIQLQCFNNSNWIWIFTYLAIILLIVGFFYVFFIPQSLLAFGPYIQVSNWVFIIFSFIVMPIGLRIERNISKKHSHTFL >NZ_CP018205.1|WP_001259678.1|670863_671307_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MRTLNKDEHNYIKQIANIHETLLSQVESNYKCTKLSIALRYEMICSRLEHTNDKIYIYENEGQLIAFIWGHFSNEKSMVNIELLYVEPQFRKLGIATQLKIALEKWAKTMNAKRISNTIHKNNLPMISLNKDLGYQVSHVKMYKDID >NZ_CP018205.1|WP_000733431.1|671373_671769_+|hypothetical-protein MKKLIISIMAVMLFLTGCGKSQEKATLEKDIDNLQKENKELKDKKEKLQQEKEKLADKQKDLEKEVKDLKPSKEDNKDDKKDEDKNKDKDKDKEASQDKQSKDQTKSSDKDNHKKPTSADKDQKANDKHQS >NZ_CP018205.1|WP_000545115.1|671906_672206_+|hypothetical-protein MHEQDFRILEGQDITLPELGRELENITGHTIADSTGEIKRVIAHLPNFESDTDTFVATYRLNHQQDFIDATFTALKSDRARLKEVPVHVELISYISKSK >NZ_CP018205.1|WP_000638613.1|672285_672828_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIYCETERLILRDWHEDDLLPFQKMNANYDVRKYFPSLLSYRRSELDMRTMDAVIKDYGIGLFAVEDKESHQWIGFIGLNYIPETSDYPFKELPLYEIGWRLLPEFWGKGLATEGAKATLKLAEEHQIYDVYSFTAEANKASQRVMEKIGMTVYDHFELPNLSKYHLLKRQVRYYINLRK >NZ_CP018205.1|WP_000820892.1|672923_673490_-|TIGR00730-family-Rossman-fold-protein MKRIAVYCGASKGHDPSYVQKAYDLGKYFAEQGYELVFGAGSIGIMGAIQDGVLDHGGKAIGVMPKMLDEHEITSQRLTELILVDSMHERKNKMAELADAFVMAPGGAGSLEEFFEMYSWAQIGIHEKPIAIYNINGFFNPLQTMIDHMIEEGFIDPKYRALAPLCDTKESLIESILNFKPLGTRSYD >NZ_CP018205.1|WP_000148828.1|673491_673950_-|YaiI/YqxD-family-protein MTHIIIDGDACPVVDSIIDLTTETGIFVTIIRSFSHFSNQLYPPHVSTLYVDDGPDAVDYKIVQLSTKDDIVVTQDYGLASLLVDKVLIVMHHNGKIYNSKNIQQLLDKRYMNAQIRKQGGRHKGPPPFTKQDQKVFEQSLLKVIHRIKELD >NZ_CP018205.1|WP_000358498.1|673952_674636_-|hypothetical-protein MDKKKVIKFMINVLPIVLVPLIVERKRIKQHPDVQKVTDATSKVASKTSAAISNTASDVKEYVGDKKQDFENKRELKKFAREHDPAYIEKKGEKLAKQNRKDADKMNKILQKNIEKRHKEEQKAREKNEIQRIKDMKKSQKYEEKAGLTPNKLDEKTEKKGDKLAEKNRKEIAKMNKKLQKNIEKRHKEEQKRQQEADKARIKSFKKYKDYVAKSASQQNKENNTEA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP018205_4 | 810357-810438 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP018205_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP018205_4
>4.1|810381|34|NZ_CP018205|CRISPRCasFinder ATTGGGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018205_4
The CRISPR arrays of NZ_CP018205_4 >merge|NZ_CP018205|4|810357-810438|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCATCCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA >NZ_CP018205|4|4|810357-810438|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAA ATTGGGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCAT CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA
>NZ_CP018205.1|WP_000932216.1|809374_810253_+|DUF1963-domain-containing-protein MLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPVLPCIEMDLKEMQEETLNQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLDDLPEQQELFPVKEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPITDLSLENIQAHLKSLDADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQELKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >NZ_CP018205.1|WP_000290485.1|808815_809196_+|glycine-cleavage-system-protein-GcvH MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVAIIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEISDESQIEALLTAEKYSEMIGE >NZ_CP018205.1|WP_000589549.1|808301_808658_+|arsenate-reductase-family-protein MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >NZ_CP018205.1|WP_001190695.1|807837_808158_-|thioredoxin-family-protein MQSIKSNESFKSVINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK >NZ_CP018205.1|WP_000422908.1|807148_807688_+|nitroreductase MELQQAIANRRSVKKFKRDMHIDDALLYQAIEKAADAPNHGMREPWRVVHVPKDRLGDMSKDISKFAFPNELDKQQCHYDAVTKLGGMLLLILKTDPRQRQNDENYFAFGAYAQNLMLLLYEAGIGTCWKSPLYIYDPKVRKTLGIKKDEVLAGFLYLTDLEEDMPKAPRKNRNLITLY >NZ_CP018205.1|WP_000150017.1|806349_807066_+|type-I-3-dehydroquinate-dehydratase MTHVEVVATIAPQLSIEETLIQKINHRIDAIDVLELRIDQIENVTVDQVAEMITKLKVMQDSFKLLVTYRTKLQGGYGQFTNDSYLNLISDLANINGIDMIDIEWQADIDIEKHQRIITHLQQYNKEVVISHHNFESTPPLDELQFIFFKMQKFNPEYVKLAVMPHNKNDVLNLLQAMSTFSDTMDCKVVGISMSKLGLISRTAQGVFGGALTYGCIGVPQAPGQIDVTDLKAQVTLY >NZ_CP018205.1|WP_000974460.1|805779_806202_-|organic-hydroperoxide-resistance-protein MAIHYETKATNVGGRKGHVYTDDRALDIDIVPPAQADGKATNPEQLFAAGYASCFNGAFDLILKQNKVRDAHPEVTLTVRLEDDSDSESPKLSVSIDATIKNVISQEEAEKYLQMAHEFCPYSKATQGNINVDLNVNVVD >NZ_CP018205.1|WP_000569884.1|804886_805381_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MIEIKTLTNNDFNEYKRLVSTVNEEFTQDSHYSQTMTDTLIHDILNQGSPKCIVFGCYENETLIATAALEQIRYVGKEHKSLIKYNFVTNNDKSINSELINFIINYARQNNYESLLTSIVSNNIGAKVFYSALGFDILGFEKNAIKIGNTYFDEHWLFYDLINK >NZ_CP018205.1|WP_000255561.1|804114_804732_-|amino-acid-transporter MVTAIIHGFILAIGLILPLGAQNVFIFNQGANQPKYRYVLPAIITAGLSDSLLIIIAVVGVSIIIMSLPVLQAIIYIVGLIFLMYMAWTIWHDKPSTDGETQIMSPMKQVSFALSVSLLNPHAILDTIGVIGSSAALYSGSNKIAFTIACISVSWLWFFLLAILGKMVGSIDKTGKLLTIINKISSIIIIIVALMILQKLIQLLF >NZ_CP018205.1|WP_001140693.1|803460_804042_+|histidine-phosphatase-family-protein MAKTLYLMRHGQTLFNFKGLIQGFGDSPLTELGIAQAQKARSYYETKGINFDLYASSTQERASDTLENVAPNQSYQRFKGLKEWHFGIFEGESVYLFDNLYKPEDLFGDRIVPFKGEARQQVEERIVKTLHDIMSQTKNNALVVSHGTIMGVFLRYCLKLDEALKHNIGNCNILKFEYDNGTFKFVELIDPNL >NZ_CP018205.1|WP_001018962.1|810994_811381_+|topiosmerase MAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKLDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPLLPNINNERLVLVNE >NZ_CP018205.1|WP_001065801.1|811373_811670_+|thioredoxin-family-protein MNNSLDIKDVTTFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKVSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFKSVTDLLENLK >NZ_CP018205.1|WP_000571218.1|811919_812945_+|methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEQGPVTQVFENPQHTVTKRFVKDDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >NZ_CP018205.1|WP_000520233.1|812937_813633_+|ABC-transporter-permease MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWTVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >NZ_CP018205.1|WP_000732326.1|813650_814472_+|MetQ/NlpA-family-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGNKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYELDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >NZ_CP018205.1|WP_000752917.1|814825_815020_+|CsbD-family-protein MADESKFEQAKGNVKETVGNVTDNKNLENEGKEDKASGKAKEFVENAKEKATDFIDKVKGNKGE >NZ_CP018205.1|WP_001183858.1|815252_816104_-|DUF368-domain-containing-protein MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTSLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEVVKLNFAGLPILLAVGFGVLAGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE >NZ_CP018205.1|WP_000168845.1|816431_817193_+|Fe-S-cluster-assembly-ATPase-SufC MASTLEIKDLHVSIEDKEILKGVNLTINTDEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPSYEVTKGEVLLDGVNILELEVDERAKAGLFLAMQYPSEITGVTNADFMRSAINAKREEGQEINLMQFIKKLDKNMDFLDIDKDMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMLEPKFAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGENFGALMITHYQRLLNYITPDKVHVMYAGKVVKSGGPELAKRLEEEGYEWVKEEFGSAE >NZ_CP018205.1|WP_000205572.1|817290_818598_+|Fe-S-cluster-assembly-protein-SufD MTTDILNISEEQLVDYSKAHNEPSWMTELRKKALKLTETLEMPKPDKTKLRKWDFDSFKQHDVKGDVYQSLSQLPESVREIIDVDHSKNLVIQHNNTIAYTQVDDNASKDGVIVEGLADALMNHSDLVQKYFMKDAVTVDEHRITALHTALVNGGVFVYVPKNVVVEHPVQYVVLHDDENASFYNHVIIVTEESAEVTYVENYLSNASGEGNQLNIISEVIAGANSNITYGSVDYMDKGFTGHIIRRGITEADASINWALGLMNEGSQIIDNTTNLFGDRSTSSLKSVVVGTGEQKINLTSKIVQYGKETDGYILKHGVMKEHASSVFNGIGYIKHGGTKSIANQESRVLMLSEHARGDANPILLIDEDDVQAGHAASVGRVDPDQLYYLMSRGISQREAERLVIHGFLDPVVRELPIEDVKRQLREVIERKVSK >NZ_CP018205.1|WP_001006454.1|818703_819954_+|cysteine-desulfurase MNEVAEHSFDVNEVIKDFPILDQKVNGKRLAYLDSTATSQTPVQVLNVLEDYYKRYNSNVHRGVHTLGSLATDGYENARETVRRFINAKYFEEIIFTRGTTASINLVAHSYGDANVEEGDEIVVTEMEHHANIVPWQQLAKRKNATLKFIPMTADGELNIEDIKQTINDKTKIVAIAHISNVLGTINDVKTIAEIAHQHGAIISVDGAQAAPHMKLDMQEMNADFYSFSGHKMLGPTGIGVLFGKRELLQKMEPIEFGGDMIDFVSKYDATWADLPTKFEAGTPLIAQAIGLAEAIRYLERIGFDAIHKYEQELTIYAYEQMSAIEGIEIYGPPKDRRAGVITFNLQDVHPHDVATAVDTEGVAVRAGHHCAQPLMKWLNVSSTARASFYIYNTKEDVDQLINALKQTKEFFSYEF |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP018205_5 | 859212-859494 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP018205_5
|
4 spacers
spacers of NZ_CP018205_5
>5.1|859242|26|NZ_CP018205|CRT CGGGGCCCCAACACAGAGGCTGGCGG >5.2|859298|28|NZ_CP018205|CRT GGTGGAGCCCCGACACAGAGAAATTAGC >5.3|859356|26|NZ_CP018205|CRT CGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGA >5.4|859412|53|NZ_CP018205|CRT GGTGGGACGACGAAATAAATTTTGCGAAAATATCATTTCTGTCCCACTCCCAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018205_5
The CRISPR arrays of NZ_CP018205_5 >merge|NZ_CP018205|5|859212-859494|CRT AAAGTCAGCTTACAATAGTGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAGGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAGTGTGCAAGTTGGGGTGGAGCCCCGACACAGAGAAATTAGCTCCTCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGAAAAGTCAGCTTACAATAGTGTGCAAGTTGGGGTGGGACGACGAAATAAATTTTGCGAAAATATCATTTCTGTCCCACTCCCAAAAAGACAGCAGTAGGATAATTTCAATTTGG >NZ_CP018205|5|1|859212-859494|CRT AAAGTCAGCTTACAATAGTGTGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACACAGAGGCTGGCGG AAAGTCAGCTTACAATAGTGTGCAAGTTGG GGTGGAGCCCCGACACAGAGAAATTAGC TCCTCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCGA AAAGTCAGCTTACAATAGTGTGCAAGTTGG GGTGGGACGACGAAATAAATTTTGCGAAAATATCATTTCTGTCCCACTCCCAA AAAGACAGCAGTAGGATAATTTCAATTTGG
>NZ_CP018205.1|WP_000138487.1|857816_859061_+|Glu/Leu/Phe/Val-dehydrogenase MTENNNLVTSTQGIIKEALHKLGFDEGMYDLIKEPLRMLQVRIPVRMDDGTVKTFTGYRAQHNDAVGPTKGGVRFHPDVDEEEVKALSMWMTLKCGIVNLPYGGGKGGIVCDPRQMSIHEVERLSRGYVRAISQFVGPNKDIPAPDVFTNSQIMAWMMDEYSALDKFNSPGFITGKPIVLGGSHGRDRSTALGVVIAIEQAAKRRNMQIEGAKVVIQGFGNAGSFLAKFLYDLGAKIVGISDAYGALHDPNGLDIDYLLDRRDSFGTVTNLFEETISNKELFELDCDILVPAAISNQITEDNAHDIKASIVVEAANGPTTPEATRILTERGILLVPDVLASAGGVTVSYFEWVQNNQGYYWSEEEVNEKLREKLEAAFDTIYELSQNRKIDMRLAAYIIGIKRTAEAARYRGWA >NZ_CP018205.1|WP_000167314.1|856517_857708_+|ornithine--oxo-acid-transaminase MTKSEKIIELTNHYGAHNYLPLPIVISEAEGVWVKDPEGNKYMDMLSAYSAVNQGHRHPKIIQALKDQADKVTLVSRAFHSDNLGEWYEKICKLAGKDKALPMNTGAEAVETALKAARRWAYDVKGIEPNKAEIIAFNGNFHGRTMAPVSLSSEAEYQRGYGPLLDGFRKVDFGDVDALKAAINENTAAVLVEPIQGEAGINIPPEGYLKAIRELCDEHNVLFIADEIQAGLGRSGKLFATDWDNVKPDVYILGKALGGGVFPISVVLADKEVLDVFTPGSHGSTFGGNPLACAASIAALDVIVDEDLPGRSLELGDYFKEQLKQIDHPSIKEVRGRGLFIGVELNESARPYCEALKEEGLLCKETHDTVIRFAPPLIITKEELDLALEKIRHVFQ >NZ_CP018205.1|WP_000838037.1|855082_856210_+|NADH-dependent-flavin-oxidoreductase MKSKYEPLFDKVELPNGVELRNRFVLAPLTHISSNDDGTISDVELPYIEKRSQDVGITINAASNVSDVGKAFPGQPSIAHDSNIEGLKRLATAMKKNGAKALVQIHHGGAQALPELTPDGDVVAPSPISLKSFGQKQEHSAREMTNEEIEQAIKDFGEATRRAIEAGFDGVEIHGANHYLIHQFVSPYYNRRNDVWANQYKFPVAVIEEVLKAKEAYGNKDFIVGYRLSPEEAESPGITMEITEELVNKISHMPIDYIHVSMMDTHATTREGKYAGQERLPLIHKWINGRMPLIGIGSIFTADEALDAVENVGVDLVAIGRELLLDYQFVEKIKDGREDEIINYFDPEREDNHHLTPNLWHQFNEGFYPLPRKDK >NZ_CP018205.1|WP_001067294.1|854343_854721_+|S1-RNA-binding-domain-containing-protein MNNYKIGQHIKVRVTGIQPYGAFVETPNHTEGLIHISEIMDDYVHNLKKFLSEGQIVKAKILSIDDEGKLNLSLKDNDYFKNYERKKEKQSVLDEIRETEKYGFQTLKERLPIWIKQSKRAIRND >NZ_CP018205.1|WP_000035058.1|853334_853928_+|peptidylprolyl-isomerase MANYPQLNKEVQQGEIKVVMHTNKGDMTFKLFPNIAPKTVENFVTHAKNGYYDGITFHRVINDFMIQGGDPTATGMGGESIYGGAFEDEFSLNAFNLYGALSMANSGPNTNGSQFFIVQMKEVPQNMLSQLADGGWPQPIVDAYGEKGGTPWLDQKHTVFGQIIDGETTLEDIANTKVGPQDKPLHDVVIESIDVEE >NZ_CP018205.1|WP_000781156.1|852887_853271_-|kinase-associated-lipoprotein-B MKLYRFSHKTGSYGVTIVEENGDDVLVKVEQVIKHPKQGDLHNPTETEGVFFHDRKALSHFEKRYTKRSQLRDFNVDVLRYEDSLQQAITDLETKLKAQQTKHAEMSLASLARLKEDYSLQYKENFK >NZ_CP018205.1|WP_000054609.1|850351_852757_-|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-A MSLLHIAVILPLIFALIIPILYRFFKRIHLGWFVLPVPIVIFIYMLTLIKTTMSGNTVMKTLNWMPHFGMNFDLYLDGLGLLFSLLISGIGSLVVLYSIGYLSKSEQLGNFYCYLLLFMGAMLGVVLSDNVIILYLFWELTSFSSFLLISFWRERQASIYGAQKSLIITVFGGLSLLGGIILLAIPTQSFSIQYMIQHASEIQNSPFFIFAMILIMIGAFTKSAQFPFYIWLPDAMEAPTPVSAYLHSATMVKAGLYLIARMTPIFAASQGWVWTVTLVGLITLFWASLNATKQQDLKGILAFSTVSQLGMIMAMLGIGAISYHYQGDDSKIYAAAFTAAIFHLINHATFKGALFMITGAVDHSTGTRDVKKLGGLLTIMPISFTITVITALSMAGVPPFNGFLSKESFLETTFTASQANLFSVDTLGYLFPIIGIVGSVFTFVYSIKFIMHIFFGQYKPEQLPKKAHEVSILMLLSPAILATLVIVFGLFPGILTNSIIEPATSSINHTVIDDVEFHMFHGLTPAFLSTLVIYILGILLIVTFSYWVKLLQRQPGKLTFNYWYNRSANVIPNYSEKMTNSYVTDYSRNNLVIIFGALILLTFVTIFSVPFNINFKDVSPIRIFEVCIVILLLSAAFLILFAKSRLFSIIMLSAVGYAVSVLFIFFKAPDLALTQFVVESISTALFLLCFYHLPNLNRYNEKRSFQLTNALIAGGVGLSVIIIGLIAYGNRHFESISKFYQEHVYDLAHGKNMVNVILVDFRGMDTLFESSVLGIAGLAVYTMIKLRKKRQTQGNEVKNHE >NZ_CP018205.1|WP_001081626.1|849930_850359_-|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-B MNRQQNDLILQFAAVIIFFMVMVFGFSLFLAGHYTPGGGFVGGLLFASSLVIITIAFDIETMRKIFPLDFKILIGIGLVFCIATPIASWFLGKNFFTHVTFDIPLFILEPVHMTTAVFFDFGVLCAVVGTVMTIIISIGENE >NZ_CP018205.1|WP_000402803.1|849589_849931_-|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-C MEIIMIFVSGILTAISVYLVLSKSLIRIVMGTTLLTHAANLFLITMGGLKHGTVPIYEANVKSYVDPIPQALILTAIVIAFATTAFFLVLAFRTYKELGTDNVESMKGVPEDD >NZ_CP018205.1|WP_000573077.1|848100_849597_-|Na+/H+-antiporter-Mnh1-subunit-D MIESNMLVLTLVIPVITAILLVFIGKRPIIKRYVALGGTLLTLVAAIINLANVVKHGPIRVELGSWKAPYSIVFVLDIFSALLIITSIIITAIVILYSYQTIGIERERYYYYFSVLFMLIGIIGAFTTGDIFNLFVFFEVFLMSSYFLLVIGSTKIQLQETIKYVLVNVVSSSFFVMGVAILYSVVGTLNLADISNKLANLSAHDSGLVNIVFILFIFVFATKAGVFPMFVWLPSAYYAPPIPIIAFFGALLTKVGVYAIARTLSLFFSDNVSFSHYVILFLALLTIIFGCVGAVAYANIKKIILYNVMIAVGVILVGVAMMTESGMIGAIYYTLHDMLVKLALFLLIGIMIKITGTADLRQFGGLIKRYPVLGWSFFIAALSLAGIPPLSGFYGKFFIVQSTFERGFYLSGVIVLLSSLVVLYSVIRIFLQGFFGQPKGYDLNNKVDVKYLTTIAIVAVVITVLYGLSADYLYPMVKAGAETFYNPSTYVKAVLGGK >NZ_CP018205.1|WP_000185319.1|859563_860493_-|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MTNSSKSFTKFMAASAVFTMGFLSVPTAGAEQTNQIANKPQAIQWHTNLTNERFTTIAHRGASGYAPEHTFQAYDKSHNELKASYIEIDLQRTKDGHLVAMHDETVNRTTNGHGKVEDYTLDELKQLDAGSWFNKKYPKYARASYKNAKVPTLDEILERYGPNANYYIETKSPDVYPGMEEQLLASLKKHHLLNNNKLKNGHVMIQSFSDESLKKIHRQNKHVPLVKLVDKGELQQFNDQRLKEIRSYAIGLGPDYTDLTEQNTHHLKDLGFIVHPYTVNEKADMLRLNKYGVDGVFTNFADKYKEVIK >NZ_CP018205.1|WP_000066053.1|860734_862114_-|argininosuccinate-lyase MSNKAWGGRFEVQPEEWVDDFNASITFDQTLIDQDIEGSIAHATMLANQGIISQQDSEQIIQGLKSIQHDYHQDQIQFSASLEDIHLNIEHELIKRIGDAGGKLHTGRSRNDQVATDMHLYTKKQVQDIIALIKSLQSVIVDIASNNVDTIMPGYTHLQRAQPISFAHHIMTYFWMLQRDQQRFEDSLKRIDINPLGAAALSGTTYPIDRHETTALLNFGSLYENSLDAVSDRDYIIETLHNISLTMVHLSRFAEEIIFWSTDEAKFITLSDAFSTGSSIMPQKKNPDMAELIRGKVGRTTGHLMSMLMTLKGLPLAYNKDMQEDKEGLFDAVHTIKGSLRIFEGMIQTMTINKERLNQTVKEDFSNATELADYLVTKNIPFRTAHEIVGKIVLECIQQGHYLLDVPLATYQQHHSSIDADIYDYLQPENCLKRRQSYGSTGQSSVKQQLDVAKQLLSQ >NZ_CP018205.1|WP_000660045.1|862103_863309_-|argininosuccinate-synthase MKEKIVLAYSGGLDTSVAVQWLIDKGYDVVACCLDVGEGKDLDIVYKKALDMGAVECHIIDATKEFSDEYVSYAIKGNLMYENAYPLVSALSRPLIAKKLVEIAEKTNSVGIAHGCTGKGNDQVRFEVAIKALNPSLKAFAPVREWAWSREEEIDYAIKHNIPVSINHDSPYSIDQNLWGRANECGILEDPYAAPPEDAFDLTNALEETPDTADEIILTFDKGIPVQIDGKTYELDDLILTLNALAGKHGIGRIDHVENRLVGIKSREIYEAPAAEVILKAHKALETITLTKDVAHFKPIIEKQFAEQLYNGLWFSPLTDSLKLFIDSTQQYVSGDVRIKLFKGNAIVNGRKSPYTLYDEKLATYTKEDAFNQDAAVGFIDIYGLPTQVNAMLHGGYSNEQ >NZ_CP018205.1|WP_000148849.1|863659_864991_+|glucose-6-phosphate-isomerase MTHIQLDFSKTLEFFGEHELKQQQEIVKSIHKTIHEGTGAGSDFLGWIDLPVDYDKEEFSRIVEASKRIKENSDVLVVIGIGGSYLGARAAIEMLTSSFRNSNEYPEIVFVGNHLSSTYTKELVDYLADKDFSVNVISKSGTTTEPAVAFRLFKQLVEERYGKEEAQKRIFATTDKEKGALKQLATNEGYETFIVPDDVGGRYSVLTAVGLLPIATAGINIEAMMIGAAKAREELSSDKLEENIAYQYATIRNILYAKGYTTEMLINYEPSMQYFNEWWKQLFGESEGKDFKGIYPSSANYTTDLHSLGQYVQEGRRFLFETVVKVNHPKYDITIEKDSDDLDGLNYLAGKTIDEVNTKAFEGTLLAHTDGGVPNMVVNIPQLDEETFGYVVYFFELACAMSGYQLGVNPFNQPGVEAYKQNMFALLGKPGFEDLKKELEERL >NZ_CP018205.1|WP_000007967.1|865315_865891_+|TVP38/TMEM64-family-protein MSFHQVEEWFEIFRQFGYLPGFILLYIRAIIPVFPLALYILINIQAYGPILGILISWLGLISGTFTVYLICKRLVNTERMQRIKQRTAVQRLISFIDRQGLIPLFILLCFPFTPNTLINFVASLSHIRPKYYFIVLASSKLVSTIILGYLGKEITTILTHPLRGILMLVVLVVFWIVGKKLEQHFMGSKKE >NZ_CP018205.1|WP_000758215.1|865895_866420_+|signal-peptidase-I MKKVVKYLISLILAIIIVLFVQTFVIVGHVIPNNDMSPTLNKGDRVIVNKIKVTFNQLNNGDIITYRRGNEIYTSRIIAKPGQSMAFRQGQLYRDDRPVDASYAKNRKIKDFSLRNFKELDGDIIPPNNFVVLNDQDNNKHDSRQFGLIDKKDIIGNVSLRYYPFSKWTVQFKS >NZ_CP018205.1|WP_000711486.1|866435_867011_+|signal-peptidase-I MKKEILEWIISIAVAFVILFIVGKFIVTPYTIKGESMDPTLKDGERVAVNIVGYKTGGLEKGNVVVFHANKNDDYVKRVIGVPGDKVEYKNDTLYVNGKKQDEPYLNYNLKHKQGDYITGTFQVKDLPNANPKSNVIPKGKYLVLGDNREVSKDSRAFGLIDEDQIVGKVSFRFWPFSEFKHNFNPENTKN >NZ_CP018205.1|WP_000172342.1|867170_870647_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddB MTLHAYLGRAGTGKSTKMLTEIKQKMKADPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDPELNGSLRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFSEKLTEQIQDFKKYAVTPEHLEHFIADKNMQTRTKNKLEDIALIYREFEQRIQNEFITGEDSLQYFIDCMPKSEWLKRADIYIDGFHNFSTIEYLIIKGLIKYAKSVTIILTTDGNHDQFSLFRKPSEVLRHIEEIANELNISIERQYFNQLYRFNNQDLKHLEQEFDALQINRVACQGHINILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYQDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNIDTKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTASYLKSAYLVDLLENFVLERGIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILHFEKQMSQAETVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGNHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVFGDEPMSMERFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMPQPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRAKGDVTFSYSLMGSSGDDKEISPFLNQIQSLFNQLEITNIPQYHEVNPLSLMQHAKQTKITLFEALRAWLYDEIVADSWLDAYQVIRDSDHLNQGLDYLMSALTFDNETVKLGETLSKDLYGKEINASVSRFEGYQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLTNEALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRRKPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSATLDLTKVYYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWSDIDEDKLEQDLIKKFKLSGLVNADQTVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFIQHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETINPIEAIQNININDEFGGEQ >NZ_CP018205.1|WP_000154930.1|870647_874301_+|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA MTIPEKPQGVIWTDAQWQSIYATGQDVLVAAAAGSGKTAVLVERIIQKILRDGIDVDRLLVVTFTNLSAREMKHRVDQRIQEASIADPANAHLKNQRIKIHQAQISTLHSFCLKLIQQHYDVLNIDPNFRTSSEAENILLLEQTIDEVIEQHYDILDPAFIELTEQLSSDRSDDQFRMIIKQLYFFSVANPNPTNWLDQLVTPYEEEAQQAQLIQLLTDLSKVFITAAYDALNKAYDLFSMMDSVDKHLAVIEDERRLMGRVLEGGFIDIPYLTGHEFGARLPNVTAKIKEANEMMVDALEDAKLQYKKYKSLIDKVKSDYFSREADDLKADMQQLAPRVKYLARIVKDVMSEFNRKKRSKNILDFSDYEHFALQILTNEDGSPSEIAESYRQHFQEILVDEYQDTNRVQEKILSCIKTGDEHNGNLFMVGDVKQSIYKFRQADPSLFIEKYQRFTIDGDGTGRRIDLSQNFRSRKEVLSTTNYIFKHMMDEQVGEVKYDEAAQLYYGAPYDESDHPVNLKVLVEADQEHSDLTGSEQEAHFIVEQVKDILEHQKVYDMKTGSYRSATYKDIVILERSFGQARNLQQAFKNEDIPFHVNSREGYFEQTEVRLVLSFLRAIDNPLQDIYLVGLMRSVIYQFKEDELAQIRILSPNDDYFYQSIVNYINDEAADAILVDKLKMFLSDIQSYQQYSKDHPVYQLIDKFYNDHYVIQYFSGLIGGRGRRANLYGLFNKAIEFENSSFRGLYQFIRFIDELIERGKDFGEENVVGPNDNVVRMMTIHSSKGLEFPFVIYSGLSKDFNKRDLKQPVILNQQFGLGMDYFDVDKEMAFPSLASVAYRAVAEKELVSEEMRLVYVALTRAKEQLYLIGRVKNDKSLLELEQLSISGEHIAVNERLTSPNPFHLIYSILSKHQSASIPDDLKFEKDIAQIEDSSRPNVNISIVYFEDVSTETILDNDEYRSVNQLETMQNGNEDVKAQIKHQLDYRYPYVNDTKKPSKQSVSELKRQYETEESGTSYERVRQYRIGFSTYERPKFLSEQGKRKANEIGTLMHTVMQHLPFKKERISEVELHQYIDGLIDKHIIEADAKKDIRMDEIMTFINSELYSIIAEAEQVYRELPFVVNQALVDQLPQGDEDVSIIQGMIDLIFVKDGVHYFVDYKTDAFNRRRGMTDEEIGTQLKNKYKIQMKYYQNTLQTILNKEVKGYLYFFKFGTLQL >NZ_CP018205.1|WP_000670752.1|874466_875369_+|fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein MKFLSFKYNDKTSYGVKVKREDAVWDLTQVFADFAEGDFHPKTLLAGLQQNHTLDFQEQVRKAVVAAEDSGKAEDYKISFNDIEFLPPVTPPNNVIAFGRNYKDHANELNHEVEKLYVFTKAASSLTGDNATIPNHKDITDQLDYEGELGIVIGKSGEKIPKALALDYVYGYTIINDITDRKAQSEQDQAFLSKSLTGGCPMGPYIVTKDELPLPENVNIVTKVNNEIRQDGNTGEMILKIDELIEEISKYVALHPGDIIATGTPAGVGAGMQPPKFLQPGDEVKVTIDNIGTLTTYIAK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP018205_6 | 992896-992983 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP018205_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP018205_6
>6.1|992921|38|NZ_CP018205|CRISPRCasFinder AAGGAGAGGGATACATGCGCCGAGCACATGCATAAAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018205_6
The CRISPR arrays of NZ_CP018205_6 >merge|NZ_CP018205|6|992896-992983|CRISPRCasFinder CCCCTAACAACTAAAAGTTGTAAGGAAGGAGAGGGATACATGCGCCGAGCACATGCATAAAATCCCCTAACAACTAAAAGTTGTAAGG >NZ_CP018205|6|5|992896-992983|CRISPRCasFinder CCCCTAACAACTAAAAGTTGTAAGG AAGGAGAGGGATACATGCGCCGAGCACATGCATAAAAT CCCCTAACAACTAAAAGTTGTAAGG
>NZ_CP018205.1|WP_000033477.1|991833_992409_-|ECF-transporter-S-component MSKGLKLSEILVTVLISVVFAVIYNLWWFVYNGVQATGLHLEQLTNGVWFMAAIVCYLIIPKPGIALLAEFAAGAGETIIMGRFDIPTIVYAFIQGLACELVFAIFKYQSRSVMVAMLAGFCTAIAAFPIDYFYGYLNEVAGWNLTLFIVFRLISGAVVAGVLSYLLVKALDKTGVTKLFRPAAKEDYDNL >NZ_CP018205.1|WP_000921968.1|990418_991819_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLKVSDLRLKYPSGQRKIFDHLNITIQDKEKVLLLGPSGCGKSTLLNVLSGIVPNLIELPMKYDELIVDPLSGVIFQDPDSQFCMPKVYEELAFVLENRQLPREDMDALIINALNMVNLNVTPETYIKDLSGGMKQKLAIVETILQQSKTLFLDEPTAMLDVQATEDLWTKLIELWEDQTVVIVEHKVKHIWNHVDRVILMDYNGNIIADECPEIILQKYVHLLSEYGVWHPRAWEFAPSRVDFPTTNSHLLQFKNGRIIRGKSTLLSFSDLEIGLGEWITITGANGSGKTTLLESIMQLIKYQGDVYFENQRLTKIKHAAKHMYLVYQNPELQFITNSVYDEINIHFNHLSKDQSDDETIQLLKLLDLQNVKDQHPYELSIGQKRRLSVATALSSKADIIFLDEPTFGLDSHNTFQLIKLFQKRINLGQSIVMVTHDDEIIERYPSRRLKISDGALLDCDGDTNV >NZ_CP018205.1|WP_000273253.1|989619_990426_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MYEQWKVRQSFVDDVNIITKLFLGIILFFFIIFVHNFDFMLYITILMLVFLLMFNGTQFKITAIFITISIGFALLSSLFMILYGNGSHTILKFGFIHITTESLVRGLHVSLRTIAISFFGILIALTSQVVMIFYSLMQHLKVKSKVAYAFMAAIRMIPLMISSLIQLRRSLKMRYQMIDAANYRGLKRFKHLIIPLLSQNIRKAHQLSVAMESKGFRDGPRTYYYNVPFSYKDIIFIIVLIAIITMAYYCSITLPITGIDDVRLGRVG >NZ_CP018205.1|WP_001101908.1|988107_989355_+|phosphoribosylamine--glycine-ligase MNVLVIGAGGREHALAYKLNQSNLVKQVFVIPGNEAMTPIAEVHTEISESDHQAILDFAKRQNVDWVVIGPEQPLIDGLADILRANGFKVFGPNKQAAQIEGSKLFAKKIMEKYNIPTADYKEVERKKDALTYIENCELPVVVKKDGLAAGKGVIIADTIEAARSAIEIMYGDEEEGTVVFETFLEGEEFSLMTFVNGDLAVPFDCIAQDHKRAFDHDEGPNTGGMGAYCPVPHISDDVLKLTNETIAQPIAKAMLNEGYQFFGVLYIGAILTKDGPKVIEFNARFGDPEAQVLLSRMESDLMQHIIDLDEGKRTEFKWKNESIVGVMLASKGYPDAYEKGHKVSGFDLNENYFVSGLKKQGDTFVTSGGRVILAIGKGDNVQDAQRDAYKKVSQIQSDHLFYRHDIANKALQLK >NZ_CP018205.1|WP_000709290.1|986607_988086_+|bifunctional-phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide-formyltransferase/IMP-cyclohydrolase MKKAILSVSNKTGIVEFAKALTQLNYELYSTGGTKRILDEANVPVRSVSDLTHFPEIMDGRVKTLHPAVHGGILADRNKPQHLNELSEQHIDLIDMVVVNLYPFQQTVANPDVTMDEAIENIDIGGPTMLRAAAKNYKHVTTIVHPADYQEVLTRLRNDSLDESYRQSLMIKVFEHTAEYDEAIVRFFKGDKETLRYGENPQQSAYFVRTSNAKHTIAGAKQLHGKQLSYNNIKDADATLALVKKFDTPATVAVKHMNPCGVGIGDTIEQAFQHAYEADSQSIFGGIVALNRAVTPELAEQLHSIFLEVIIAPKFTDEALDILKQKKNVRLLEIDMTIDSNEEEFVSVSGGYLVQDKDNYVVPKEEMKVVTEVAPTDEQWEAMLLGWKVVPSVKSNAIILSNNKQTVGIGAGQMNRVGAAKIALERAIEINDHVALVSDGFFPMGDTVELAAQHGIKAIIQPGGSIKDQDSIDMANKHGIAMVVTGTRHFKH >NZ_CP018205.1|WP_000238664.1|986026_986593_+|phosphoribosylglycinamide-formyltransferase MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRKCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP018205.1|WP_000030812.1|984995_986024_+|phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP018205.1|WP_000483713.1|983518_985003_+|amidophosphoribosyltransferase MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_CP018205.1|WP_000032727.1|981350_983540_+|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-subunit-PurL MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGDHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP018205.1|WP_000666799.1|980686_981358_+|phosphoribosylformylglycinamidine-synthase-I MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP018205.1|WP_000064214.1|992992_993127_-|hypothetical-protein MSNENQNKKAAEKAKEVEEKLKDKKEEKTEDINQTKQDIQDTLN >NZ_CP018205.1|WP_000009069.1|993278_994574_+|hypothetical-protein MSFLRKHAEIIFSYLIGIVSLFTGLIILINLPLIKQLNGGKKVDTHVHNVWEFLNAFFSEIIKVMSRFIGNFPIVSAIVIIIFGILVMLIGHTLLRTIKYDYDISIFFLVIGIMYFIITLILMTQVYGFFAVIFIIPFTIHIGYIVYKDELNQENVKNHFMWIIVSYGISYLITQIALYGRIDANEIESIDILSVNAFFIIMWLLGQMAIWNFLFLRRALPLTKQELGEEEPELSRTSKGNVTNQTKIHLKQLQDKTTEYARKTRRSVDLDKIRAKRDKFKKKVNDIIDIQEDDIPDWMRKPKWVKPMYVELFCGVVIFLFTFLEFNNRNALFVSGDWKLSQTQYVIEWVTLLILLFIIIAYIATTLTFHLKGKFYYLQLFMGSILFFKLLTEFINIMIHGLLLSVFITPTLLLMLLAIIISYSLQLRERP >NZ_CP018205.1|WP_000685079.1|994998_996171_+|class-I-SAM-dependent-rRNA-methyltransferase MKIATLNKGKETKYFNGYPLIEEEDIYSQDHLKEGDIFQIVTDKSQYVATAYVGRQHKGLGWVLTYDKAQQINTAFFVKLFNTALAERDYYFNIDGTNAFRLFNAEGDGVGGLTIDNYDGHLLIQWYSKGIYKFKYAILEAVRKVFDYKSIYEKVRFKDSEYSGGFVEGDAPEFPIVIEENFTFYNVDLEDGLMTGIFLDQKEVRKKLRDQYAKERHVLNLFSYTGAFSAIAASEASSTTSVDLANRSRSLTEENFGLNAIDPKSQYIYVMDTFDFYKYAARHGHSYDTIVIDPPSFARNKKRTFSVQKDYDKLINGALNILSSEGTLLLCTNASVYPLKQFKNTIKKTLEESGVDYELTEVMGLPKDFKTHPHYKPSKYLKAVFVNIRH >NZ_CP018205.1|WP_000505965.1|996224_996767_+|hypothetical-protein MGFKNNLTSNLTNKIGNSVFKIENVDGKGAMPTTIQELRERRQRAEAIVKRKSLMSSTMSVVPIPGLDFGVDLKLMKDIIEDVNKIYGLDHKQVNSLGDDVKERIMSAAAIQGSQFIGKRISNAFLKIVIRDVAKRTAAKQTKWFPVVGQAVSASISYYFMNKIGKDHIQKCENVIKNVM >NZ_CP018205.1|WP_000437472.1|996920_997187_+|phosphocarrier-protein-HPr MEQNSYVIIDETGIHARPATMLVQTASKFDSDIQLEYNGKKVNLKSIMGVMSLGVGKDAEITIYADGSDESDAIQAISDVLSKEGLTK >NZ_CP018205.1|WP_000040054.1|997189_998908_+|phosphoenolpyruvate--protein-phosphotransferase MSKLIKGIAASDGVAIAKAYLLVEPDLTFDKNEKVTDVEGEVAKFNSAIEASKVELTKIRNNAEVQLGADKAAIFDAHLLVLDDPELIQPIQDKIKNENANAATALTDVTTQFVTIFESMDNEYMKERAADIRDVSKRVLSHILGVELPNPSMIDESVVIVGNDLTPSDTAQLNKEFVQGFATNIGGRTSHSAIMSRSLEIPAIVGTKSITQEVKQGDMIIVDGLNGDVIVNPTEDELIAYQDKRERYFADKKELQKLRDADTVTVDGVHAELAANIGTPNDLPGVIENGAQGIGLYRTEFLYMGRDQMPTEEEQFEAYKEVLEAMGGKRVVVRTLDIGGDKELSYLNLPEEMNPFLGYRAIRLCLAQQDIFRPQLRALLRASVYGKLNIMFPMVATINEFREAKAILLEEKENLKNEGHDISDDIELGIMVEIPATAALADVFAKEVDFFSIGTNDLIQYTLAADRMSERVSYLYQPYNPSILRLVKQVIEASHKEGKWTGMCGEMAGDETAIPLLLGLGLDEFSMSATSILKARRQINGLSKNEMTELANRAVDCATQEEVIELVNNYVK >NZ_CP018205.1|WP_001289614.1|999144_999378_-|glutaredoxin-like-protein-NrdH MSEIIVYTQNDCPPCTFVKNYLNEHHIDFEERNINNQQYRNEMIDFDAFSTPFILLNGNPMYHVDLDEINKVLNIQD >NZ_CP018205.1|WP_000381849.1|999575_1000937_+|cytochrome-ubiquinol-oxidase-subunit-I MDTVEISRFLTAMTLAVHIIFATIGVGMPLMFAIAEFLGIRKNDLQYIAMAKRWAKAYTITVAVGVVTGTIIGLQLSLIWPTFMEMGGHVIALPLFMETFAFFFEAIFLSIYLYTWDRFKNKWTHFLISIPVIIGGSFSAFFITSVNSFMNTPAGFELKNGKMVNVQPIEAMFNPSFIVRSFHVITTAGMTMAFVIASIAAFKLLRNRQPKDTVYHKKALKMSMIVGFFSTLLSMLAGDLSAKFLHKFQPEKLAAYEWHFDTSSHAKLLLFGVLDEKTQQVKGAIELPGLLSFLADNSVKTKVQGLNDFPKSLHPPMIVHYFFDLMVTMGILCFVISGVYVLTLMFKKLRKFSTHKWMLYGILLTGPASMLAIEFGWFLTEMGRQPWIVRGYMRVAEAATQAGGITFVTILFGILYIILMYTCAYVLIRMFKNKPAYEDVNRLAKKQGGEIEK >NZ_CP018205.1|WP_000638456.1|1000933_1001953_+|cytochrome-d-ubiquinol-oxidase-subunit-II MIYAFIGITVLWLFLFCYIIIASIDFGAGFFALHSKLTGDEKKINHLISRYLNPVWEVTNVFFVFFFVGFVGFFPESIKYLGTVLLIPGSIALIMISLRNSFYAFENYGQDTKLAWMIMYGVSGLLIPASLSTALTITEGGYINVRNNVIDLDWVQLLLSPFAWSVVFLAIISVLYISSGFLTYYAKKANDEPAYNLTRQWHIFLGPPMIIICLFVFLSLRIQNSEHFYSAVFDYWWMFGISFLFFALASLLTFFKKKHGLAFVFVILQMMFAFFGYGISKLPYLLYPFVKITDAYVNPEMGWTLVIVFILGLLLLLPSLILLLRLFVFDKEYVEGKKS >NZ_CP018205.1|WP_000514290.1|1002085_1002748_+|TrkA-family-potassium-uptake-protein MGKEYVVIGLGRFGGSIVRELNALDMDVMAIDHDENRVNEYSDIATHAVVADTTDEAVMKSLGIRNFDHVIVAIGENIQSSTLTTLILKELGVKKVTAKAQNDYHAKILNKIGADTVVHPERDMGRRIAHNVASASVLDYLELADEHSIVELKATEKMAGQSIIDLDIRAQYGINIIAIKRGKEFIISPNPNINLEIGDILIMIGHDNDLNRFEKNIATR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP018205_7 | 1775278-1775488 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP018205_7
|
3 spacers
spacers of NZ_CP018205_7
>7.1|1775316|21|NZ_CP018205|CRT AGCTGGCCAATAGTCAGCTTT >7.2|1775375|20|NZ_CP018205|CRT GAATTTCGAAAAGAAATTCT >7.3|1775433|18|NZ_CP018205|CRT TGGCCAATAGTCAGCTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018205_7
The CRISPR arrays of NZ_CP018205_7 >merge|NZ_CP018205|7|1775278-1775488|CRT CAATAATGTGCAAGTTGGGGTAAGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCCAATAGTCAGCTTTCAATAATGTGCAAGTTGGGGTAAGGGCCCCAACACAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGCCAATAGTCAGCTTTCAATAATGTGCAAGTTGGGGTAAGGGCCCCAACACAGA >NZ_CP018205|7|2|1775278-1775488|CRT CAATAATGTGCAAGTTGGGGTAAGGGCCCCAACACAGA AGCTGGCCAATAGTCAGCTTT CAATAATGTGCAAGTTGGGGTAAGGGCCCCAACACAGA GAATTTCGAAAAGAAATTCT ACAGACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGC TGGCCAATAGTCAGCTTT CAATAATGTGCAAGTTGGGGTAAGGGCCCCAACACAGA
>NZ_CP018205.1|WP_000265417.1|1773518_1774928_-|Mn(2+)-dependent-dipeptidase-Sapep MWKEKVQQYEDQIINDLKGLLAIESVRDDAKASEDAPVGPGPRKALDYMYEIAHRDGFTTHDVDHIAGRIEAGKGNDVLGILCHVDVVPAGDGWDSNPFEPVVTEDAIIARGTLDDKGPTIAAYYAIKILEDMNVDWKKRIHMIIGTDEESDWKCTDRYFKTEEMPTLGFAPDAEFPCIHGEKGITTFDLVQNKLTEDQDEPDYELITFKSGERYNMVPDHAEARVLVKENMTDVIQDFEYFLEQNHLQGDSTVDSGILVLTVEGKAVHGMDPSIGVNAGLYLLKFLASLNLDNNAQAFVAFSNRYLFNSDFGEKMGMKFHTDVMGDVTTNIGVITYDNENAGLFGINLRYPEGFEFEKAMDRFANEIQQYGFEVKLGKVQPPHYVDKNDPFVQKLVTAYRNQTNDMTEPYTIGGGTYARNLDKGVAFGAMFSDSEDLMHQKNEYITKKQLFNATSIYLEAIYSLCVEE >NZ_CP018205.1|WP_000411085.1|1772666_1773515_-|D-amino-acid-transaminase MEKIFLNGEFVSPSEAKVSYNDRGYVFGDGIYEYIRVYNGKLFTVTEHYERFLRSANEIGLDLNYSVEELIELSRKLVDMNQIETGAIYIQATRGVAERNHSFPTPEVEPAIVAYTKSYDRPYDHLENGVNGVTVEDIRWLRCDIKSLNLLGNVLAKEYAVKYNAVEAIQHRGETVTEGSSSNAYAIKDGVIYTHPINNYILNGITRIVIKKIAEDYNIPFKEETFTVDFLKNADEVIVSSTSAEVTPVIKLDGEPVNDGKVGPITRQLQEGFEKYIESHSI >NZ_CP018205.1|WP_000434765.1|1771325_1772117_-|phosphotransferase-family-protein MEQFYQLGWTLDSAGGASGEAYMAEQDGQKLFLKRNSNPFIAALSAEGIVPKLVWTKRIETGEVVTAQHWKNGRELSSNEMKQTRVAHLLKKIHNSRPLLSMLKRMEMEPITPEIMLNKINASLSREVLTHHIVRKSLTYLEEHIPSLDSRFFTVVHGDVNHNNWLLSDRDELFLVDWEGAMIADPAIDIGMLLYNYVPQQQWSEWLETYGVQESLNLNKRMKWYTVIQSIGLVQWYEEQKRYKDMNTWLKFLNEVMNSNMFI >NZ_CP018205.1|WP_001266157.1|1770666_1771311_-|tRNA-(guanosine(46)-N7)-methyltransferase-TrmB MRVRYKPWAEDYLKDHPELVDMDGQHAGKMTEWFDKTQPIHIEIGSGMGQFITTLAAQNPHINYISMEREKSIVYKVLDKVKEMGLTNLKIICNDAIELNEYFKDGEVSRIYLNFSDPWPKNRHAKRRLTYHTFLALYQQILNDEGDLHFKTDNRGLFAYSLESMSQFGMYFTKINLNLHQEDDGSNILTEYEKKFSDKGSRIYRMEAKFHSQK >NZ_CP018205.1|WP_000689580.1|1769354_1770197_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MKIGDISIHYLNGGNTKMDGGAMFGVVPKPLWSKQYNANERNQINLPTHPILIQTAQYNLIIDAGIGNGKLSEKQLRNFGVDEESHIIADLANYNLTPKDIDYVLMTHMHFDHAAGLTDQAGHAIFENAIHVVQQDEWHEFIAPNIRSKSTYWDKNKGDYSNKLILFEKHFEPVLGIKMQHSGGHSFGHTIITIESQGDKAVHMGDIFPTTAHKNPLWVTAYDDYPMQSIREKERMIPYFIQQQYWFLFYHDENYFAVKYSDNGENIDAYILRETLVDNN >NZ_CP018205.1|WP_000163826.1|1768918_1769230_+|PepSY-domain-containing-protein MTKLKYIIPTIIAVAIVIISTISIIQFINRKRYNPVKVLNEVKSYFMNVKGSYIVYEPFVHPETDKYRLVYQGGITTIKNGQNIHYDFYADAYTGEVINIVER >NZ_CP018205.1|WP_001024576.1|1767755_1768832_-|M42-family-metallopeptidase MNINKKVTLQRIQTLTELHGAPGFEEEVKNYMTQQMAPYVDEFIENRMGGFFGVKKSKNPNAKRVMIAAHMDEIGFMITNITKNGMIQFTNLGGVANDIWQGQRLVIKNRNGDKIIGVVSNIPKHFRTGSEGAPEIKDLTLDIGAQNEDEVRERGIDIGDTIVPHTPFTQLSEHRYSAKAWDNRYGCVLAIEILELLKDIELDVDLYVGANVQEEVGLRGAKASAEMIDPDVAFVVDCSPANDVKGNQPLSGELGKGTLIRIKDGTMILKPVFRDYLLKLVEAHDIEHQYYMSPGGTDGGEIHKANIGIPTAVIGVCARYIHSTDSVFDIRDYFAARSLLSEAICNLDNNQIETLQYK >NZ_CP018205.1|WP_000811163.1|1767379_1767691_-|thioredoxin-family-protein MKQLESEQQFESLKQGATVFEFTAGWCPDCRVIEPDLPELEARYPMFDFVSVDRDKFMDICIENGIMGIPSFLVYKNGELLGSYIGKERKSIEQIDAFLAQYV >NZ_CP018205.1|WP_001091387.1|1766422_1767280_-|DUF1444-domain-containing-protein MNTFQMRDKLKERLSHLDVDFKFNREEETLRIYRTDNNKGITIKLNAIVAKYEDKKEKIVDEIVYYVDEAIAQMADKTLESISSSQIMPVIRATSFDKKTKQGVPFIYDEHTAETAVYYAVDLGKSYRLIDESMLEDLKLTEQQIREMSLFNVRKLSNSYTTDEVKGNIFYFINSNDGYDASRILNTAFLNEIEAQCQGEMLVAVPHQDVLIIADIRNKTGYDVMAHLTMEFFTKGLVPITSLSFGYKQGHLEPIFILGKNNKQKRDPNVIQRLEANRRKFNKDK >NZ_CP018205.1|WP_001048368.1|1765797_1766394_-|DUF4479-domain-containing-protein MNLFYNPKYVGDVAFLQIEPVEGELNYNKKGNVVEITNEGNVVGYNIFEISKDITIEEKGHIKLTDELVNVFQKRISEAGFDYKLNADLSPKFVVGYVETKDKHPDADKLSVLNVNVGNDTLQIVCGAPNVEAGQKVVVAKVGAVMPSGMVIKDAELRGVASSGMICSMKELNLPNAPEEKGIMVLNDSYEIGQAFFE >NZ_CP018205.1|WP_001051860.1|1775791_1776214_-|YtxH-domain-containing-protein MAKGNLFKAILGIGGAVAAVLVTRKDSRDKLKAEYNKYKQDPQSYKDNAKDKATQLGTIANETIKEVKTNPKEYANRLKNNPKAFFKEEKSKFTEYDNKTDESIEKGKFDDEGGAAPNNNLRIVTEEDLKKNKNALSDKE >NZ_CP018205.1|WP_001217125.1|1776230_1776926_-|rRNA-pseudouridine-synthase MRIDKFLANMGVGTRNEVKQLLKKGLVNVNEQVIKSPKTHIEPENDKITVRGELIEYIENVYIMLNKPKGYISATEDHHSKTVIDLIPEYQHLNIFPVGRLDKDTEGLLLITNDGDFNHELMSPNKHVSKKYEVISANPITEDDIQAFKEGVTLTDGKVKPAILTYIDNQTSHVTIYEGKYHQVKRMFHSIQNEVLHLRRIKIADLELDSNLDSGEYRLLTENDFDKLNYK >NZ_CP018205.1|WP_000004335.1|1776922_1778584_-|polysaccharide-biosynthesis-protein MSESKEMVRGTFLITISILITKVLGVLFIIPFNYLIGGQENMAPFTYAYAPYNIAIAVATAGVPLAASKYVAKYNAIGAYKVSQKFYKSSFIVMSITGVLGFLVLYFLAPYISELTLARNIHDKNGWSVDDITWIIRIISMVVIFIPVLATWRGIFQGYKSMGPTAVSEVTEQIARVIFILIGSYLVLNVFDGSILLANGIATFAAAVGAIIGIFTLWYYWRKRKHNIDRMVESDYTDIDVSYGKMYKEIIAYSIPFVIVSLNYPLFNLVDQFTHNGALSLVGIPSQLQDIFFNMLNMSTNKIVMIPTSLSAGFAVSLIPYITKTFAEGRLHEMHHQIRTSIGVLMFITVPASIGIMALAQPLFTVFYGYDPIVLGHDPNHDGSRLLFYYAPVAILISLLSVTASMLQGIDKQKLTVYVILASVVIKLALNYPLIMLFHTPGAILSTSIALLFAIGCNFYILKKYAKFKFSYSWIHFAKIFLYSFIMMLGVELVFFLANLFLEPTKLGYLIIIILGVTVGILIYGTITIKTRLADEFLGEIPEKLRRRVRFLR >NZ_CP018205.1|WP_000285019.1|1778990_1780259_+|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MYQTIIIGGGPSGLMAAVAASEQSSSVLLIEKKKGLGRKLKISGGGRCNVTNRLPYAEIIKNIPGNGKFLYSPFSIFDNESIIDFFESRGVKLKEEDHGRMFPVSNKAQDVVDTLVTTIERQHVTIKEEEAVSRIEVNTDQTFTVHTQNNSYESHSLVIATGGTSVPQTGSTGDGYKFAQDLGHTITELFPTEVPITSAEPFIKSNRLKGLSLKDVELSVLKKNGKKRISHQMDMLFTHFGISGPAALRCSQFVYKEQKNQKTQHISMAIDAFPELNHEQLKQHITSLLSDTPDKIIKNSLHGLIEERYLLFMLEQAGIDENTTSHHLSNQQLNDLVNMFKGFVFKVNGTLPIDKAFVTGGGVSLKEIQPKTMMSKLVPGLFLCGEVLDIHGYTGGYNITSALVTGHVAGLYAGHYSHASME >NZ_CP018205.1|WP_001050546.1|1780375_1786936_-|LPXTG-anchored-repetitive-surface-protein-SasC MNLLKKNKYSIRKYKVGIFSTLIGTVLLLSNPNGAQALTTDNNVQSDTNQATPVNSQDKDVANNRGLANSAQNTPNQSATTNQATNQALVNHNNGSIVNQATPTSVQSSTPSAQNNNHTDGNTTATETVSNANNNDVVSNNTALNVPTKTNENGSGGHLTLKEIQEDVRHSSNKPELVAIAEPASNRPKKRSRRAAPADPNATPADPAAAAVGNGGAPVAITAPYTPTTDPNANNAGQNAPNEVLSFDDNGIRPSTNRSVPTVNVVNNLPGFTLINGGKVGVFSHAMVRTSMFDSGDNKNYQAQGNVIALGRIHGTDTNDHGDFNGIEKALTVNPNSELIFEFNTMTTKNGQGATNVIIKNADTNDTIAEKTVEGGPTLRLFKVPDNVRNLKIQFVPKNDAITDARGIYQLKDGYKYYSFVDSIGLHSGSHVFVERRTMDPTATNNKEFTVTTSLKNNGNSGASLDTNDFVYQVQLPEGVEYVNNSLTKDFPSNNSGVDVNDMNVTYDAANRVITIKSTGGGTANSPARLMPDKILDLRYKLRVNNVPTPRTVTFNETLTYKTYTQDFINSAAESHTVSTNPYTIDIIMNKDALQAEVDRRIQQADYTFASLDIFNGLKRRAQTILDENRNNVPLNKRVSQAYIDSLTNQMQHTLIRSVDAENAVNKKVDQMEDLVNQNDELTDEEKQAAIQVIEEHKNEIIGNIGDQTTDDGVTRIKDQGIQTLSGDTATPVVKPNAKKAIRDKATKQREIINATPDATEDEIQDALNQLATDETDAIDNVTNATTNADVETAKNNGINTIGAVVPQVTHKKAARDAINQATATKRQQINSNREATQEEKNAALNELTQATNHALEQINQATTNANVDNAKGDGLNAINPIAPVTVVKQAARDAVSHDAQQHIAEINANPDATQEERQAAIDKVNAAVTAANTNILNANTNADVEQVKTNAIQGIQAITPATKVKTDAKNAIDKSAETQHNTIFNNNDATLEEQQAAQQLLDQAVATAKQNINAADTNQEVAQAKDQGTQNIVVIQPATQVKTDTRNVVNDKAREAITNINATTGATREEKQEAINRVNTLKNRALTDIGVTSTTAMVNSIRDDAVNQIGAVQPHVTKKQTATGVLNDLATAKKQEINQNTNATTEEKQVALNQVDQELATAINNINQADTNAEVDQAQQLGTKAINAIQPNIVKKPAALAQINQHYNAKLAEINATPDATNDEKNAAINTLNQDRQQAIESIKQANTNAEVDQAATVAENNIDAVQVDVVKKQAARDKITAEVAKRIEAVKQTPNATDEEKQAAVNQINQLKDQAINQINQNQTNDQVDTTTNQAVNAIDNVEAEVVIKTKAIADIEKAVKEKQQQIDNSLDSTDNEKEVASQALAKEKEKALAAIDQAQTNSQVNQAATNGVSAIKIIQPETKVKPAAREKINQKANELRAKINQDKEATAEERQVALDKINEFVNQAMTDITNNRTNQQVDDTTSQALDSIALVTPDHIVRAAARDAVKQQYEAKKREIEQAEHATDEEKQVALNQLANNEKRALQNIDQAIANNDVKRVETNGIATLKGVQPHIVIKPEAQQAIKASAENQVESIKDTPHATVDELDEANQLISDTLKQAQQEIENTNQDAAVTDVRNQTIKAIEQIKPKVRRKRAALDSIEENNKNQLDAIRNTLDTTQDERDVAIDTLNKIVNTIKNDIAQNKTNAEVDRTETDGNDNIKVILPKVQVKPAARQSVGVKAEAQNALIDQSDLSTEEERLAAKHLVEQALNQAIDQINHADKTAQVNQDSINAQNIISKIKPATTVKATALQQIQNIATNKINLIKANNEATDEEQNIAIAQVEKELIKAKQQIASAVTNADVAYLLHDEKNEIREIEPVINRKASAREQLTTLFNDKKQAIEANIQATVEERNSILAQLQNIYDTAIGQIDQDRSNAQVDKTASLNLQTIHDLDVHPIKKPDAEKTINDDLARVTALVQNYRKVSNRNKADALKAITALKLQMDEELKTARTNADVDAVLKRFNVALSDIEAVITEKENSLLRIDNIAQQTYAKFKAIATPEQLAKVKVLIDQYVADGNRMIDEDATLNDIKQHTQFIVDEILAIKLPAEATKVSPKEIQPAPKVCTPIKKEETHESRKVEKELPNTGSEGMDLPLKEFALITGAALLARRRTKNEKES >NZ_CP018205.1|WP_000836465.1|1787278_1787590_-|rhodanese-like-domain-containing-protein MKSITTDELKNKLLESKPVQIVDVRTDEETAMGYIPNAKLIPMDTIPDNLNSFNKNEIYYIVCAGGVRSAKVVEYLEANGIDAVNVEGGMHAWGDEGLEIKSI >NZ_CP018205.1|WP_001549041.1|1787611_1790029_-|leucine--tRNA-ligase MLNYNHNQIEKKWQDYWDENKTFKTNDNLGQKKFYALDMFPYPSGAGLHVGHPEGYTATDIISRYKRMQGYNVLHPMGWDAFGLPAEQYALDTGNDPREFTKKNIQTFKRQIKELGFSYDWDREVNTTDPEYYKWTQWIFIQLYNKGLAYVDEVAVNWCPALGTVLSNEEVIDGVSERGGHPVYRKPMKQWVLKITEYADQLLADLDDLDWPESLKDMQRNWIGRSEGAKVSFDVDNTEGKVEVFTTRPDTIYGASFLVLSPEHALVNSITTDEYKEKVKAYQTEASKKSDLERTDLAKDKSGVFTGAYATNPLSGEKVQIWIADYVLSTYGTGAIMAVPAHDDRDYEFAKKFDLPIIEVIEGGNVEEAAYTGEGKHINSGELDGLENEAAITKAIQLLEQKGAGEKKVNYKLRDWLFSRQRYWGEPIPVIHWEDGTMTTVPEEELPLLLPETDEIKPSGTGESPLANIDSFVNVVDEKTGMKGRRETNTMPQWAGSCWYYLRYIDPKNENMLADPEKLKHWLPVDLYIGGVEHAVLHLLYARFWHKVLYDLAIVPTKEPFQKLFNQGMILGEGNEKMSKSKGNVINPDDIVQSHGADTLRLYEMFMGPLDAAIAWSEKGLDGSRRFLDRVWRLMVNEDGTLSSKIVTTNNKSLDKVYNQTVKKVTEDFETLGFNTAISQLMVFINECYKVDEVYKPYIEGFVKMLAPIAPHIGEELWSKLGHEESITYQPWPTYDEALLVDDEVEIVVQVNGKLRAKIKIAKDTSKEEMQEIALSNDNVKASIEGKDIMKVIAVPQKLVNIVAK >NZ_CP018205.1|WP_001025061.1|1790316_1791498_-|MFS-transporter MNIPKSVWWLVIGMALNITGSSFLWPLNTIYMKQELGKSLTVAGLVLMINSFGMVIGNLLGGSLFDKLGGYKTILIGTFTCLCSTTLLNFFHGWPWYAVWLVMLGFGGGMIIPAIYAMAGAVWPNGGRQTFNAIYLAQNIGVAVGAAMGGFVAEFSFNYIFLANLIMYVVFALVAVTQFNIEINAKVKYPTHLDITGKKNKARFISLVLICAMFAICWVAYIQWESTIASFTQSINISMAQYSVLWTINGIMILVAQPLIKPILYLLKGNLKKQMFVGIIIFMLSFFVTSFAENFTIFVVGMIILTFGEMFVWPAVPTIANQLAPDGKQGQYQGFVNSAATVGKAFGPFLGGVLVDAFNMRMMFIGMMLLLVFALILLMVFKENNTQPKKIDA >NZ_CP018205.1|WP_000526539.1|1791607_1792561_+|TIGR01212-family-radical-SAM-protein MGNHFQYAFENKRYHTWNYHLKNKFGQKIFKVALDGGFDCPNRDGTVAHGGCTFCSAAGSGDFAGNRADSIAVQFKEIKEKMHEKWHEGKYIAYFQAFTNTHAPVEVLKEKFEPVLKEPGVVGLSIGTRPDCLPDDVVEYLADLNQRTYLWVELGLQTIHQSTSDLINRAHDMKTYYDGVAKLRKHNINVCTHIINGLPGEDYDMMMATAKEVAQMDVQGIKIHLLHLLKGTPMVKQYDKGLLTFMTQEEYTNLVVDQLEVIPPEMIVHRITGDGPIDIMVGPMWSVNKWEVLNGIDAELARRNSYQGLRYKSKVKQ >NZ_CP018205.1|WP_000764419.1|1792557_1793121_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MKLERILPFSKTLIKQHITPESIVVDATCGNGNDTLFLAEQVPEGHVYGFDIQDLALENTRDKVKDFNHVSLIKDGHENIEHHINDAHKGHIDAAIFNLGYLPKGDKSIVTKPDTTIQAINSLLSLMSIEGIIVLVIYHGHSEGQIEKHALLDYLSTLDQKHAQVLQYQFLNQRNHAPFICAIEKIS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP018205_8 | 1975677-1975755 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP018205_8
|
1 spacers
spacers of NZ_CP018205_8
>8.1|1975700|33|NZ_CP018205|CRISPRCasFinder CATTATCGTAAGCTGACTTTTCGTCAGCTTCTG |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018205_8
The CRISPR arrays of NZ_CP018205_8 >merge|NZ_CP018205|8|1975677-1975755|CRISPRCasFinder TGTTGGGGCCCCGCCAACCTGCACATTATCGTAAGCTGACTTTTCGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACCTGCA >NZ_CP018205|8|6|1975677-1975755|CRISPRCasFinder TGTTGGGGCCCCGCCAACCTGCA CATTATCGTAAGCTGACTTTTCGTCAGCTTCTG TGTTGGGGCCCCGCCAACCTGCA
>NZ_CP018205.1|WP_000636142.1|1974735_1975494_-|type-I-methionyl-aminopeptidase MIVKTEEELQALKEIGYICAKVRNTMQAATKPGITTKELDNIAKELFEEYGAISAPIHDENFPGQTCISVNEEVAHGIPSKRVIREGDLVNIDVSALKNGYYADTGISFVVGESDDPMKQKVCDVATMAFENAIAKVKPGTKLSNIGKAVHNTARQNDLKVIKNLTGHGVGLSLHEAPAHVLNYFDPKDKTLLTEGMVLAIEPFISSNASFVTEGKNEWAFETSDKSFVAQIEHTVIVTKDGPILTTKIEEE >NZ_CP018205.1|WP_001110179.1|1974132_1974519_-|hypothetical-protein MNYVERYIEQFLRATVRNNIKHYLLMLDEKMKNLDDYMRYLITKKEQLSKLIDSLMLTLENKYIDIAEAFQIQCAREINNQEIENIKSELNKVEAYYAQIETQIQQTSTEKIATEKTSYLINYMNAVA >NZ_CP018205.1|WP_000149064.1|1973416_1974118_-|cell-wall-active-antibiotics-response-protein MTHKYISTQMLIIFTALMIIANFYYIFFEKIGFLLVLLLGCVLVYVGYLYFHKIRGLLAFWIGALLIAFTLLSNKYTIIILFVFLLLLIVRYLIHKFKPKKVVATDEVMTSPSFIKQKWFGEQRTPVYVYKWEDVQIQHGIGDLHIDLTKAANIKENNTIVVRHILGKVQVILPVNYNINLHVAAFYGSTYVNEKSYKVENNNIHIEEMMKPDNYTVNIYVSTFIGDVEVIYR >NZ_CP018205.1|WP_001017131.1|1972376_1973420_-|sensor-histidine-kinase MNHYIRTIGSMLILVYSMLAAFLFIDKVFVNIIYFQGMFYTQIFGIPVFLFLNLIIILLCIIVGSVLAYKINQQNDWIKTQIERSMEGETVGINDQNIEIYSETLDLYHTLVPLNQELHKLRLKTQNLTNENYNINDVKVKKIIEDERQRLARELHDSVSQQLFAASMMLSAIKETKLEPPLDQQIPILEKMVQDSQLEMRALLLHLRPLGLKDKSLGEGIKDLVIDLQKKVPMKVVHEIQDFKVPKGIEDHLFRITQEAISNTLRHSNGTKVTVELFNKDDYLLLRIQDNGKGFNVDEKLEQSYGLKNMRERALEIGATFHIVSLPDSGTRIEVKAPLNKEDSYDD >NZ_CP018205.1|WP_000153530.1|1971757_1972387_-|two-component-system-response-regulator-VraR MTIKVLFVDDHEMVRIGISSYLSTQSDIEVVGEGASGKEAIAKAHELKPDLILMDLLMDDMDGVEATTQIKKDLPQIKVLMLTSFIEDKEVYRALDAGVDSYILKTTSAKDIADAVRKTSRGESVFEPEVLVKMRNRMKKRAELYEMLTEREMEILLLIAKGYSNQEIASASHITIKTVKTHVSNILSKLEVQDRTQAVIYAFQHNLIQ >NZ_CP018205.1|WP_000037075.1|1970424_1971642_+|YihY/virulence-factor-BrkB-family-protein MSKKDHSSSKYLNSVKEAQEESKKKNKSNPKIDVDRTYIEPQQFQSKKPKKDDQVFFLSRLNKPAKYKKDSNFLSYLIYRIGKDDASGLAAQMTYHFVLAMFPMLLFLLTLLPFFNIKQSQITNMLSNAPAETSTLIKSVIGDITQNSSGGLLSIGLILAIWSASNGMTAIMNSFNVAYDVEDSRNGIVLKLLSVVFTVVMGVVFVVALALPTLGSVISHFLFGPLGFDEQVKWIFNLIRIVLPIIIIFIIFIVLYSVAPNVKTKLKSVLPGAVFTSIIWLAGSFGFGWYISNFGNYSKTYGSIAGIIILLLWLYITSFIIIVGAEINAIIHQRSVIKGKTPEEAALEHDDNNKNHYNENTRYEYDEDSNATHQRTYHVDEHPSDTYPEDDKNIKDKIVDKLKKD >NZ_CP018205.1|WP_000428172.1|1969871_1970147_+|hypothetical-protein MENKFVPGILIGAVIGGAISLADKSTRQALVQSVKDAKNGNRTRKPSKVSKIKDEVLYWKDVVEEIRRNNPELERSLKDAKETFVNRKNQR >NZ_CP018205.1|WP_000228666.1|1969400_1969865_+|low-molecular-weight-phosphotyrosine-protein-phosphatase MVDVAFVCLGNICRSPMAEAIMRQRLKDRNIHDIKVHSRGTGSWNLGEPPHEGTQKILNKHNIPFDGMISELFEATDDFDYIVAMDQSNVDNIKSINPNLKGQLFKLLEFSNMEESDVPDPYYTNNFEGVYDMVLSSCDNLIDYIVKDANLKEG >NZ_CP018205.1|WP_000180461.1|1969053_1969254_-|DUF1128-family-protein MTNEEKVLAIREKLNIVNQGLLDPEKYKNANEEELTDIYDFVQSRERLSPSEVTAIADALGQLRHE >NZ_CP018205.1|WP_001795438.1|1967794_1969051_-|aminopeptidase MGILTNYKEKLQQYAELLVKVGMNVQPKQPVFIRSSVETLELTHLIVEEAYHCGASDVRVVYSDPTLKRLKFENESVEHFANHEIKSYDVEARMDYVKRGAANLALISEDPDLMDGIDSQKLQAFQQQNARAFKGYMESVQKNQFPWVVAAFPSKAWAKRVYPELSVEEAYIKFIDEVFDIVRIDGNDPVENWRQHIANLSVYAQKLQQKNYHALHYVSEGTDLTVGLAKNHIWEDATSYVNGKEQAFIANIPTEEVFTAPDRNRVDGYVTNKLPLSYNGTIIDQFKLMFKDGEIIDFSAGKGEAVLKDLINTDEGSRRLGEVALVPDDSPISNRNTIFYNTLFDENAACHLAIGSAYAFNIQGGTEMTVEEKIASGLNDSNVHVDFMIGSSDLTIYGIFEDGSKELVFENGNWASTF >NZ_CP018205.1|WP_000999713.1|1976021_1977008_+|aromatic-acid-exporter-family-protein MNDQWYKHLIGARTIKTGIAIFLTAVFCMALDLTPIYAILTAVVTIEPTAKASLIKGYRRLPATVIGAGFAVLFTYLFGDQSPFTYALSATFTILFCTKLKLQVGTNVAVLTSLAMIPGIHDAYIFNFLSRTLTAIIGLVTSGLINFMVFPPKYYGQVEEKLSKTDALMYKLFYNRCQELILSRLQSDKSEKAYKNIFNLNNQVETLISYQRDELSYHKKKECDWKLLNQLTKRAYTNRLFITHLSNIIYLPKNTRVNFSGDEKMALLKISSSIKDIFYDGSFKREDDSVETLRSTIKALEISGENQIKSHILYEVLMIYRLLDSRYA >NZ_CP018205.1|WP_001549145.1|1977438_1977852_-|hypothetical-protein MKPTKVILKDASYLHSKTSITFILKDVVIEEDNKIYYFDTSATFEDQEVKFEFALFDSDMDNLKHMDCDNPVTEIYFIEPDLHFTIIDFNQELLCIYIDFDSGLRHSNMATESGISLRINVAKSDFTKFINELASLH >NZ_CP018205.1|WP_001790257.1|1977880_1977991_-|hypothetical-protein MDGNNQIDVCFFVLVNNYYTMSIYPRIINSNGDYAT >NZ_CP018205.1|WP_000544969.1|1978076_1978808_-|type-1-glutamine-amidotransferase MHELTIYHFMSDKLNLYSDIGNIIALRQRAKKRNIKVNVVEINETEGITFDECDIFFIGGGSDREQALATKELSKIKTPLKEAIEDGMPGLTICGGYQFLGKKYITPDGTELEGLGILDFYTESKTNRLTGDIVIESDTFGTIVGFENHGGRTYHDFGTLGHVTFGYGNNDEDKKEGIHYKNLLGTYLHGPILPKNYEITDYLLEKACERKGIPFEPKEIDNEAEIQAKQVLIDRANRQKKSR >NZ_CP018205.1|WP_001250336.1|1978809_1980123_-|lipid-II-isoglutaminyl-synthase-subunit-MurT MRQWTAIHLAKLARKASRAVGKRGTDLPGQIARKVDTDILRKLAEQVDDIVFISGTNGKTTTSNLIGHTLKANNIQIIHNNEGANMAAGITSAFIMQSTPKTKIAVIEIDEGSIPRVLKEVTPSMMVFTNFFRDQMDRFGEIDIMVNNIAETISNKGIKLLLNADDPFVSRLKIASDTIVYYGMKAHAHEFEQSTMNESRYCPNCGRLLQYDYIHYNQIGHYHCQCGFKREQAKYEISSFDVAPFLYLNINDEKYDMKIAGDFNAYNALAAYTVLRELGLNEQTIKNGFETYTSDNGRMQYFKKERKEAMINLAKNPAGMNASLSVGEQLEGEKVYVISLNDNAADGRDTSWIYDADFEKLSKQQIEAIIVTGTRAEELQLRLKLAEVEVPIIVERDIYKATAKTMDYKGFTVAIPNYTSLAPMLEQLNRSFEGGQS >NZ_CP018205.1|WP_000949467.1|1980414_1980915_+|H-type-ferritin-FtnA MLSKNLLEALNDQMNHEYFAAHAYMAMAAYCDKESYEGFANFFIQQAKEERFHGQKIYNYINDRGAHAEFRAVSAPKIDFSSILETFKDSLSQEQEVTRRFYNLSEIARQDKDYATISFLNWFLDEQVEEESMFETHINYLTRIGDDSNALYLYEKELGARTFDEE >NZ_CP018205.1|WP_001790679.1|1980996_1981089_-|hypothetical-protein MTKNTIISLENEKTQINDSENESSDLRKAK >NZ_CP018205.1|WP_000613733.1|1981303_1981858_+|3'-5'-exonuclease MIQDAFVALDFETANGKRTSICSVGMVKVIDSQITETFHTLVNPQDYFSQQNIKIHGIQPEDVENAPTFDYVFPYMMQFIADLPVVAHNAAFDMNVLHQSIQNIGLPTPNLTYFCSYQLAKRTVDSYRYGLKHMMEFYQLDFHGHHDALNDAKACAMITFRLLKNYENLTYVTNIYGKNLKDKG >NZ_CP018205.1|WP_000140176.1|1981925_1982996_-|DNA-polymerase-IV MTERRIIHIDMDYFFAQVEMRDNPKLKGKPVIVGGKASSRGVVSTASYEARKYGVHSAMPMSQAHKLCPNGYFVTSNFGAYRETSAQIMSIFRSYTDKVEPMSLDEAYLDITELVRPDLPASKIAQYIRKDILEQTHLTASAGVSYNKFLAKLASGMNKPDGMTVIDYQNVHDILMTLDIGDFPGVGKASKKVMHDNGIFNGRDLYEKTEFELIRLFGKRGRGLYNKARGIDHSEVKSSRVRKSVGTERTFATDVNDDEEILRKVWELSGKTAERLNKLQKSAKTVTVKIKTYQFETLSKQMSLRDSVSSEEDIYNIAYLLYNDLKDPDVPIRLIGVTVGNLEQSTYKNMTIYDFI >NZ_CP018205.1|WP_000548781.1|1983242_1983773_-|DUF3267-domain-containing-protein MHKIDLTTNNFQMRRFIILQLVIALFVILFTYKWALGVTAVVDQNIIINLVYGFAGFIILLILHELIHRALFLLFKKDSKPMFNIKKDRILFQTADACFNKWQFSIIMLSPLILLSTGLLILIKVFGYSSLIFMFSMHTAYCFIDILLVALTISSSFKYVQQDEDSIYLYHQKPTQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP018205_9 | 2210491-2210580 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP018205_9
|
1 spacers
spacers of NZ_CP018205_9
>9.1|2210515|42|NZ_CP018205|CRISPRCasFinder ATGCAGTTGATGCGTAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTT |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018205_9
The CRISPR arrays of NZ_CP018205_9 >merge|NZ_CP018205|9|2210491-2210580|CRISPRCasFinder CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCAGTTGATGCGTAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTCAACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCT >NZ_CP018205|9|7|2210491-2210580|CRISPRCasFinder CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTT ATGCAGTTGATGCGTAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTT CAACTTTAGTTGTTAGGGGCTTCT
>NZ_CP018205.1|WP_000495671.1|2209382_2210474_+|lytic-regulatory-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKNKKVVTEPKNTKVENDKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >NZ_CP018205.1|WP_000019744.1|2208136_2209117_+|CDF-family-zinc-efflux-transporter-CzrB MSHSHHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALVAFIYAEKNATTTKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >NZ_CP018205.1|WP_000003759.1|2207814_2208135_+|Zn(II)-responsive-metalloregulatory-transcriptional-repressor-CzrA MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >NZ_CP018205.1|WP_001024094.1|2206997_2207663_-|SDR-family-oxidoreductase MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFDGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGDQDIKDALTQFENETD >NZ_CP018205.1|WP_000808817.1|2205362_2205593_-|hypothetical-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >NZ_CP018205.1|WP_000123393.1|2203317_2204691_-|EVE-domain-containing-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRISNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVQKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >NZ_CP018205.1|WP_001123303.1|2202446_2202860_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIKLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >NZ_CP018205.1|WP_000070866.1|2201803_2202247_-|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLENAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >NZ_CP018205.1|WP_000160304.1|2200972_2201683_+|purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE >NZ_CP018205.1|WP_001083311.1|2199995_2200658_-|deoxyribose-phosphate-aldolase MNSAKLIDHTLLKPESTRTQIDQIIDEAKAYHFKSVCVNPTHVKYAAERLADSEVLVCTVIGFPLGASTTATKAFETEDAIQNGADEIDMVINIGALKDGRFDDVQQDIEAVVKAAKGHTVKVIIETVLLDHDEIVKASELTKAAGADFVKTSTGFAGGGATAEDVKLMKDTVGADIEVKASGGVRNLEDFNKMVEAGATRIGASAGVQIMQGLEADSDY >NZ_CP018205.1|WP_001802298.1|2210916_2211021_-|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >NZ_CP018205.1|WP_000115562.1|2211707_2212844_-|SAP-domain-containing-protein MSVNARDLLVLHTNVNRLVGEEIFANKCLANNDVQIMNSIKKLIEAELLTTTNDFEVSIYKKTRPELQSILKSFGIKTTGNKPDLIKRIDDNFHIINNLDLPYVYIPIKKGEEILKKTEYLTSFIQSYGEISLERAYYLVENYIDENCDDKVAEIYKFEFQRKYDNGEFDFNHGYNFELNMLIDHYKRDVKDYDNARKYSNIYLYFGLRDFLKKLMSNYSYYDSKGNIDLNEIQNDLNRFINSSASGMYERLIYNENLSNNIMFELFKKDTQDYSDLEEQLIEKFINYVVSNVKKESRSNTLIELSKILENGYTIDKEEFKKEDDYLSKYIFTDIDYLKKLESKINVAIDIRSGEIHLVLDDDSLDILIQNQKYGNEF >NZ_CP018205.1|WP_001790138.1|2213132_2213225_+|hypothetical-protein MFIFKTTSKSHFHNNVKSLECIKIPINKNR >NZ_CP018205.1|WP_000370924.1|2213929_2214787_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAEHFLAE >NZ_CP018205.1|WP_000908177.1|2214854_2215637_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLIQLDQIGRMKQGKTILKKISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATSGTVNLFGKMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEIRNEAHQLLKLVGMSAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLSILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITANFSKILLLKDGQSIQQGAVEDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >NZ_CP018205.1|WP_000334465.1|2215868_2217674_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEEGTPVVGLATQEKVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >NZ_CP018205.1|WP_000083807.1|2218354_2219893_+|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPLMKFIMHILSVAVEALVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >NZ_CP018205.1|WP_000927363.1|2219927_2222060_+|BglG-family-transcription-antiterminator MLLSTREKEMIALLIKYHGQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGTDSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMIDKDDVHVETKDVDGNTSFENEQTSYLTSVFEKHLSDEKSEQLLHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFISDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI >NZ_CP018205.1|WP_001292149.1|2222071_2222506_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >NZ_CP018205.1|WP_000648719.1|2222505_2223612_+|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVEDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP018205_10 | 2334515-2334708 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP018205_10
|
3 spacers
spacers of NZ_CP018205_10
>10.1|2334538|33|NZ_CP018205|CRT CATTATTGTATGCTGACTTTTCGTCACCTTCTG >10.2|2334594|36|NZ_CP018205|CRT TGCATTGTCTGTAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTA >10.3|2334653|33|NZ_CP018205|CRT CATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCTTCTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP018205_10
The CRISPR arrays of NZ_CP018205_10 >merge|NZ_CP018205|10|2334515-2334708|CRT TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTATGCTGACTTTTCGTCACCTTCTGTGTTGGGGCCCCGTTCCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGTA >NZ_CP018205|10|3|2334515-2334708|CRT TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCA CATTATTGTATGCTGACTTTTCGTCACCTTCTG TGTTGGGGCCCCGTTCCCCAACT TGCATTGTCTGTAGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTA TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCA CATTATTGTAAGCTGACTTTCTGTCAGCTTCTG TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGTA
>NZ_CP018205.1|WP_001790034.1|2334284_2334455_+|hypothetical-protein MFRFISFGQLVVYSTTFIPKKDILQLNGMECDINVKEPLKIYYVVILKSGIEMIFS >NZ_CP018205.1|WP_000066900.1|2333808_2334159_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >NZ_CP018205.1|WP_000184419.1|2332493_2333705_+|MFS-transporter MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFLVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDGSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAIDLLFIICVILGILGLIISLFIKVDFEVTNNKTETNVIDKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFALERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >NZ_CP018205.1|WP_000951058.1|2332060_2332501_+|winged-helix-DNA-binding-protein MLSQEFFNSFITIYRPYLKLAEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKHQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND >NZ_CP018205.1|WP_000600967.1|2331134_2331899_-|VOC-family-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIEAVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKVKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >NZ_CP018205.1|WP_001549681.1|2330891_2331143_+|hypothetical-protein MRTIILSLFIIMNIVAIIMTLSQPLTVNYFSLRVILIFFTFILSIFFILIKSSRLNNILTILSIVLVIIHMGILAHSTYVYLY >NZ_CP018205.1|WP_000413865.1|2329237_2330503_-|lipid-II:glycine-glycyltransferase-FemX MEKMHITNQEHDAFVKSHPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEVQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMKTSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYVLNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >NZ_CP018205.1|WP_000592303.1|2325953_2329121_-|efflux-RND-transporter-permease-subunit MIKKLLQFSLGNKFAIFLMVVLVVLGGVYASAKLKLELLPNVQNPVISVTTTMPGATPQSTQDEISSKIDNQVRSLAYVKNVKTQSIQNASIVTVEYENNTDMDKAEEQLKKEIDKIKFKDEVGQPELRRNSMDAFPVLAYSFSNKENDLKKVTKVLNEQLIPKLQTVDGVQNAQLNGQTNREITLKFKQNELEKYGLTADDVENYLKTATRTTPLGLFQFGDKDKSIVVDGQYQSVDAFKNINIPLTLAGGQGQSQSQSDNKQNSAMSDVNQASPQQNSKASAPNNISGMPTAKLGDLADITVGDVRTSISKTNGKDAVNLQITKAQDANTVQVAKDVQRKIDTFVDENKDFNVTKTMDTAKPVEKSLYTMVEKASLGTIVAIIVILLFLRNIRTTAISIISIPLSLLMALIALKLSDVSLNILTLGALTVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLTDSEEQLKGENLIISATTEVFKPIMSSTLVTIIVFLPLVFVSGSVGEMFRPFALAIAFSLLASLLVSITLVPALAATLFKKGVKRRNKQHQEGLGVVSTTYKKVLHWSLNHKWIVIILSTLILVATIVFGGPRLGTSFISAGDDKFLAITYTPKPGETEQAVLNHAKDVEKYLKQKKHVKTIQYSVGGSSPVDPTGSTNSMAIMVEYDNDTPNFDVEADKVIKHADGFKHPGEWKNQDLGTGAGNKSVEVTVKGPSMDAIKSTVKDIEQKMKQVKGLANVKSDLSQTYDQYEIKVDQNKAAENGISASQLAMHLNENLPEKTVTTVKENGKTVDVKVKQNKQTDWSEDKLNNITLKKPTGGTIKLGDIATLVKTTTPSKLTQEQGDYATTVSAKVTNKDVGGTTRQVMSKINNLDKPNNVKVNIGGASDDINNAMTQLAFAMLAAIIIVYLILVITFKGGLAPFTILFSLPFTVIGVIIALLITGETISVPSLIGMLMLIGIVVTNAIVLIDRVINNEQQGMEMKEALIEAGGTRIRPILMTAIATIGALVPLLFGQDSSILISKGLAATVIGGLISSTLLTLVVVPVIYEILFTLKKRFTKR >NZ_CP018205.1|WP_001161085.1|2325449_2325767_+|hypothetical-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVVFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKENWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >NZ_CP018205.1|WP_000051206.1|2325040_2325205_+|hypothetical-protein MSLENQLAELKYDYVRLQGDIEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD >NZ_CP018205.1|WP_000230173.1|2334849_2335872_-|GTP-3',8-cyclase-MoaA MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLDVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEQHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATVDGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >NZ_CP018205.1|WP_000643988.1|2335891_2336491_-|molybdenum-cofactor-guanylyltransferase-MobA MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNVYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL >NZ_CP018205.1|WP_000866971.1|2336497_2336731_-|molybdopterin-converting-factor-subunit-1 MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQALTVQQFEDLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >NZ_CP018205.1|WP_000808500.1|2336736_2337183_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaE MKQFEIVTEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >NZ_CP018205.1|WP_000602937.1|2337196_2337682_-|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B MILQIVGYKKSGKTTLMRHIVSFLKSHGYTVATIKHHGHGKEDIQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVDNQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRNEEELQVLQQLSNVCYSINVREHEDFTAFEQWLLNKIKNDCDTQLT >NZ_CP018205.1|WP_000259718.1|2337678_2338938_-|molybdopterin-molybdotransferase-MoeA MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSSMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETKTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYAEVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAEKLGLEVGIYKTQKDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKAVKAEVLFNKVAMRPGSVTTVAFVDGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >NZ_CP018205.1|WP_000134528.1|2339000_2339495_+|cyclic-pyranopterin-monophosphate-synthase-MoaC MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIFKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTLIPMCHPLPLTGIDVHFSWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQSNQ >NZ_CP018205.1|WP_000503820.1|2339496_2340003_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-MoaB MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRDFDTDKGGQCVRQLLQADDVEVSDAHYTIVKDEKVAITTQVKKWLEEDIDVIITTGGTGIAQRDVTIEAVKPLLTKEIEGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNNKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >NZ_CP018205.1|WP_000076929.1|2340033_2341038_-|ThiF-family-adenylyltransferase MSQERYSRQILFKQIGEIGQSKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDDYIAHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKYRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRSDCTTCGDVPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENASITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >NZ_CP018205.1|WP_000913019.1|2341207_2341813_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLKINVKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTAKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSEHIDQLIQTLNIDHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP018205_4 | 4.1|810381|34|NZ_CP018205|CRISPRCasFinder | 810381-810414 | 34 | NZ_CP018205.1 | 1285549-1285582 | 0 | 1.0 |
NZ_CP018205_4 | 4.1|810381|34|NZ_CP018205|CRISPRCasFinder | 810381-810414 | 34 | NZ_CP018205.1 | 1373991-1374024 | 0 | 1.0 |
NZ_CP018205_7 | 7.2|1775375|20|NZ_CP018205|CRT | 1775375-1775394 | 20 | NZ_CP018205.1 | 115357-115376 | 0 | 1.0 |
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29. spacer 7.2|1775375|20|NZ_CP018205|CRT matches to position: 1077345-1077364, mismatch: 1, identity: 0.95
gaatttcgaaaagaaattct CRISPR spacer gaatttcaaaaagaaattct Protospacer *******.************
30. spacer 7.2|1775375|20|NZ_CP018205|CRT matches to position: 1334776-1334795, mismatch: 1, identity: 0.95
gaatttcgaaaagaaattct CRISPR spacer gattttcgaaaagaaattct Protospacer ** *****************
31. spacer 7.2|1775375|20|NZ_CP018205|CRT matches to position: 1630465-1630484, mismatch: 1, identity: 0.95
gaatttcgaaaagaaattct CRISPR spacer gaatttcgtaaagaaattct Protospacer ******** ***********
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35. spacer 8.1|1975700|33|NZ_CP018205|CRISPRCasFinder matches to position: 767173-767205, mismatch: 1, identity: 0.97
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36. spacer 8.1|1975700|33|NZ_CP018205|CRISPRCasFinder matches to position: 1285504-1285536, mismatch: 1, identity: 0.97
cattatcgtaagctgacttttcgtcagcttctg CRISPR spacer cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg Protospacer ******.**************************
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cattatcgtaagctgacttttcgtcagcttctg CRISPR spacer cattatagtaagctgacttttcgtcagcttctg Protospacer ****** **************************
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tgcattgtctgtagaatttctttttgaaattctcta CRISPR spacer tgcattgtctgtagaatttcttttcgaaattctcta Protospacer ************************.***********
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41. spacer 5.1|859242|26|NZ_CP018205|CRT matches to position: 1077383-1077408, mismatch: 2, identity: 0.923
cggggccccaacacagaggctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacatagaagctggcgg Protospacer *************.***.********
42. spacer 5.1|859242|26|NZ_CP018205|CRT matches to position: 2777205-2777230, mismatch: 2, identity: 0.923
cggggccccaacacagaggctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacatagaagctggcgg Protospacer *************.***.********
43. spacer 5.1|859242|26|NZ_CP018205|CRT matches to position: 2777261-2777286, mismatch: 2, identity: 0.923
cggggccccaacacagaggctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacaaagaagctggcgg Protospacer ************* ***.********
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cggggccccaacacagaagctggcga CRISPR spacer cggggccccaacaaagaagctgacga Protospacer ************* ********.***
45. spacer 7.2|1775375|20|NZ_CP018205|CRT matches to position: 735101-735120, mismatch: 2, identity: 0.9
gaatttcgaaaagaaattct CRISPR spacer gaatttcaaaaaggaattct Protospacer *******.*****.******
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cattatcgtaagctgacttttcgtcagcttctg CRISPR spacer cattattgtaagctgacttttcgtcatcttctg Protospacer ******.******************* ******
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cattattgtatgctgacttttcgtcaccttctg CRISPR spacer cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg Protospacer ********** *************** ******
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cattattgtatgctgacttttcgtcaccttctg CRISPR spacer cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg Protospacer ********** *************** ******
49. spacer 10.1|2334538|33|NZ_CP018205|CRT matches to position: 1285504-1285536, mismatch: 2, identity: 0.939
cattattgtatgctgacttttcgtcaccttctg CRISPR spacer cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg Protospacer ********** *************** ******
50. spacer 10.1|2334538|33|NZ_CP018205|CRT matches to position: 1374037-1374069, mismatch: 2, identity: 0.939
cattattgtatgctgacttttcgtcaccttctg CRISPR spacer cattattgtaagctgacttttcgtcatcttctg Protospacer ********** ***************.******
51. spacer 10.1|2334538|33|NZ_CP018205|CRT matches to position: 2611930-2611962, mismatch: 2, identity: 0.939
cattattgtatgctgacttttcgtcaccttctg CRISPR spacer cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg Protospacer ********** *************** ******
52. spacer 10.2|2334594|36|NZ_CP018205|CRT matches to position: 1596487-1596522, mismatch: 2, identity: 0.944
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53. spacer 10.2|2334594|36|NZ_CP018205|CRT matches to position: 1986444-1986479, mismatch: 2, identity: 0.944
tgcattgtctgtagaatttctttttgaaattctcta CRISPR spacer tgcattgtctgtagaatttcctttcgaaattctcta Protospacer ********************.***.***********
54. spacer 10.3|2334653|33|NZ_CP018205|CRT matches to position: 767061-767093, mismatch: 2, identity: 0.939
cattattgtaagctgactttctgtcagcttctg CRISPR spacer cattattgtaagctgactttccgccagcttctg Protospacer *********************.*.*********
55. spacer 10.3|2334653|33|NZ_CP018205|CRT matches to position: 767117-767149, mismatch: 2, identity: 0.939
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56. spacer 10.3|2334653|33|NZ_CP018205|CRT matches to position: 767173-767205, mismatch: 2, identity: 0.939
cattattgtaagctgactttctgtcagcttctg CRISPR spacer cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg Protospacer ********************..***********
57. spacer 10.3|2334653|33|NZ_CP018205|CRT matches to position: 1285504-1285536, mismatch: 2, identity: 0.939
cattattgtaagctgactttctgtcagcttctg CRISPR spacer cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg Protospacer ********************..***********
58. spacer 10.3|2334653|33|NZ_CP018205|CRT matches to position: 2611930-2611962, mismatch: 2, identity: 0.939
cattattgtaagctgactttctgtcagcttctg CRISPR spacer cattattgtaagctgacttttcgtcagcttctg Protospacer ********************..***********
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP018205_5 | 5.4|859412|53|NZ_CP018205|CRT | 859412-859464 | 53 | MG543995 | Staphylococcus phage UPMK_1, partial genome | 76246-76298 | 4 | 0.925 |
NZ_CP018205_5 | 5.3|859356|26|NZ_CP018205|CRT | 859356-859381 | 26 | NZ_CP022541 | Antarctobacter heliothermus strain SMS3 plasmid pSMS3-1, complete sequence | 333735-333760 | 5 | 0.808 |
NZ_CP018205_8 | 8.1|1975700|33|NZ_CP018205|CRISPRCasFinder | 1975700-1975732 | 33 | NC_021536 | Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence | 159745-159777 | 10 | 0.697 |
1. spacer 5.4|859412|53|NZ_CP018205|CRT matches to MG543995 (Staphylococcus phage UPMK_1, partial genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.925
ggtgggacgacgaaataaattttgcgaaaatatcatttctgtcccactcccaa CRISPR spacer ggtgggacgacgaaataaattttgagaaactatcatttctgtcccactccctt Protospacer ************************ **** *********************
2. spacer 5.3|859356|26|NZ_CP018205|CRT matches to NZ_CP022541 (Antarctobacter heliothermus strain SMS3 plasmid pSMS3-1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.808
cggggccccaacacagaagctggcga CRISPR spacer taaggcctcaacacagaagctggcgt Protospacer ...****.*****************
3. spacer 8.1|1975700|33|NZ_CP018205|CRISPRCasFinder matches to NC_021536 (Synechococcus phage S-IOM18 genomic sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
cattatcgtaagctgacttttcgtcagcttctg CRISPR spacer ttttatcgtaaggtgagttttcgtcaagcacct Protospacer . ********** *** *********. . *.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
699192 : 707012
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP018205|699192:707012|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTACGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTCGTTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGTTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTAGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAGCCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTGCAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCTGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCACCTAAAGCTAATGTTGTGATAACAGCACCAGCTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGGGTCAAAATAAGAGGAGGGCGTTTTTTTAAGTAAGGAAATATTTATCTGAACTAGATAACACTATAAAACACTTCTGATATTTTGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTAATAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGCTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGCAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTGCTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCCACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGATGAAGGTACGCATTGTGTAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGTGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAGAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACATGGAATGTGATGTGCAGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP018205|699192:707012|702443_703028_-|WP_000637687.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NZ_CP018205|699192:707012|700908_701382_-|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_CP018205|699192:707012|704264_704933_-|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_CP018205|699192:707012|701723_702164_-|WP_001093553.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAAGAVITTLALGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NZ_CP018205|699192:707012|700247_700934_-|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_CP018205|699192:707012|703126_703840_-|WP_001062972.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >NZ_CP018205|699192:707012|699192_700248_-|WP_000244412.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCNEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENEDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_CP018205|699192:707012|705283_705877_+|WP_000604514.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHIRFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_CP018205|699192:707012|703843_704263_-|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_CP018205|699192:707012|705860_707012_+|WP_001217785.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHAMCTHSLAKDDIYAAAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKYHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKNNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
718984 : 733715
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP018205|718984:733715|DBSCAN-SWA TATGAAAGAACAACTTAATCAACTATCAGCATATCAGCCTGGTTTATCTCCAAGGGCATTGAAAGAAAAGTATGGCATTGAAGGAGATTTATATAAACTTGCATCAAATGAAAATTTGTATGGACCATCGCCTAAAGTTAAAGAAGCGATATCAGCACACTTAGATGAGTTATATTATTATCCTGAAACAGGATCACCGACATTAAAAGCGGCGATTAGTAAACATTTAAATGTAGATCAATCACGCATTTTATTTGGTGCGGGATTAGATGAAGTTATATTAATGATTTCTAGAGCTGTATTAACGCCAGGGGATACTATTGTTACAAGTGAAGCGACATTCGGTCAATATTATCACAATGCGATTGTTGAATCAGCTAATGTGATACAAGTACCTTTAAAAGATGGTGGCTTCGATTTAGAAGGTATTTTAAAAGAAGTTAATGAAGATACGTCATTGGTATGGTTATGTAATCCAAATAATCCTACAGGTACATATTTTAATCATGAGAGCTTAGATTCGTTTTTATCTCAAGTACCTCCACATGTACCAGTAATTATAGATGAAGCTTATTTTGAATTTGTGACAGCAGAGGACTACCCGGATACACTTGCTTTGCAACAAAAATATGACAATGCTTTCTTATTACGTACATTTTCAAAGGCGTATGGATTAGCGGGTTTACGTGTAGGATATGTGGTAGCAAGTGAACATGCGATTGAAAAATGGAACATCATTAGACCACCATTTAATGTGACACGTATATCTGAATACGCAGCAGTTGCAGCACTTGAAGATCAACAATATTTAAAAGAGGTAACACATAAAAATAGTGTTGAACGCGAAAGATTTTATCAATTACCTCAAAGTGAGTATTTCTTGCCAAGTCAAACGAATTTTATATTTGTAAAAACAAAGCGGGTAAATGAACTTTATGAAGCACTTTTAAATGTAGGGTGTATTACGCGACCATTTCCAACTGGTGTTAGAATTACAATTGGTTTTAAAGAACAAAATGATAAAATGTTAGAAGTTTTATCAAACTTTAAATACGAATAGTAAGTGGGGAGTGGGACAGAAATGATATTTTCGCAAAATTTATTTCGTCGTCCCACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCCGCCGGCAAGGTTGACTAGAATTGAAAAAAGCTTGTTACAAGCGCATTTTCGTTCAGTCAACTACTGCCAATATAACTTTGTAGAGCATTGAACATTGATTTATGTCTCAAGCTCAATGCAGTGTGAATGATGAGGTGAGAGTATTCAGTGTAAAAAGCAACAATAGATGATATTGTTTTGTATCAATTGCTTTTTTGCTATACTGAATCAATACTGATATTTTCAGGAGAAGATTAAAATGACCCGTAAATCAATCGCGATTGATATGGATGAAGTATTGGCAGATACATTAGGAGAAATCATTGATGCTGTCAATTTTAGAGCGGATTTAGGTATTAAAATGGAAGCTTTGAATGGTCAAAAACTTAAACATGTTATTCCTGAACATGATGGATTAATTACAGAAGTATTGAGAGAACCAGGCTTCTTCAGACATCTTAAAGTGATGCCGTATGCACAAGAAGTTGTGAAAAAATTAACTGAACATTATGATGTATATATTGCTACAGCAGCAATGGATGTACCAACATCATTTAGTGATAAATATGAATGGTTACTAGAGTTCTTTCCATTTTTAGATCCTCAGCATTTTGTTTTTTGTGGTAGAAAAAACATCGTTAAAGCTGATTATTTAATAGATGACAATCCTAGACAGCTTGAAATTTTTACTGGTACACCGATTATGTTTACAGCAGTGCATAATATTAATGATGATCGATTTGAACGCGTAAATAGCTGGAAAGATGTAGAACAGTATTTTTTAGATAATATTGAGAAATAAAATATATCACTTGAAAAATTTCATGTAGAAAAGATGATGGATAGGCTATAAAGTAATTGTGACTGAGATGAACTTTTATGTCTTAGACACTACAACACTATATTGGCAGTAGTTGACTGCGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACATAAAGAAATACTTTTTCTTTAGAAATTAGTATTTCTTATGCATGAGTGTAACTCATGCATTCATATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTCTATCTTATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAATTATATGTCTGTTTTTGAAACAGGGTAATAGCTTAAAGCTAATAAAAACGAATATAAGGTGCGTTGAATCTTATGATTACACTCCAAACCTAATATAATATCGGGTTAAGATCATTCCGGATGCTTACAAATCATTGACAGTAAGTAACTGAATGGCATTTGGTATAACCTCAATATCAATAGGTGTTTCTAATGAAATTTCGCCATCAATATCAACTTTCATTGCTGGATCTGTTGTAAGTGAAATCTTTTTACCAGGTATATGCTCAATACCTTGAGTAATTTCATTCCAATTCATGCTATCACGCTTTTTAAAAATATCATTTAAAATACTGAAACTTTGTTCATTAAAAATGAAAGTGTTCAGTTCACCATCTTGAGGAGACAAATCAGTCAATGGTATACGACTACCACCAATGAATGGACCATTTGCTGTTAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCTATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATGAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCGTATGTACCAACTTGTGCAGAAATCATTTGTTCACTAGCTTGTTTATGATTAGGTGCTATATTTAGCGTTTTTGTAAAATCATTAAAAGTACCGCCTGGTAAAATGCCAATAGGGAGTTGAAGGTCATGTGTCATAACACCGTTTATAAGTTCGTTAACCGTGCCATCACCGCCAAGAATAAATAATATATCTACATCTTTTGCATAGTTTTTAGTTTTGATTTCTTGGCAATATTTAATAATGTCACCTTCGTTTTCACTCAATTGAATAGAAAGATGCTTACAAATTGAACTTAATGCTGTTGTAACTTCCCCAATACCTTGATTAATATTTTTTAATCCACTGTGTTCATGGTAAAAGAGGACACCATGTGTATATTTATTTTCCATAGTTTAGCCTACTTTCTAAAAATTGGTTCATTAAATATATATACCCACTTTTAATTGTTAATACCAAAAATATGTTTTTAAATAGAGAAAATGGTAATAAATGAAATTGATTTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGAATGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAATTTGTTTGACCTAGTGGTTCTATTAACTTAACTAAAGTACCATTGATTGCTTGTGCAGAAGCGTTAGTTAAGTACCAAATACTCATCATTTGGGCATTAAATGCTTTAGGTGCTAACTTAACAGCAGCACTATTACCCGTTGGTGATAAGCATAGCTCACCGATAACACAAATAATGTACGATAAAATAACCCAGTTAACTGAAAAGTTTGATGAACCTGATGCATAACCTACAATACCAATTAGTATGTATGACGCACCTGCTAAGAACGTACCAATTGCAAATTTTACTGGCAGGCTAGGTTGTTTAGTTCCAAGCTTTTGCCATAAAAGTGAAATAATTGGAGCTAGTAATAAAATAAATAATGGGTTAATTGATTGGAAGATCGCTTCACCAAAGTTTGTTTTCCAACCAAATAAGTTTAATTTCATATCTGAATGTTCAATTCCATATATGTTTAATACATTAGACCCTTGTTCTTGAATAGCCCAGAACACCATTCCAAGAATAAATAATGGAATAAATGCTTTAACACGAGAACGTTCAGTATCAGTGACATCTTTACTTCTAATAATTAAAGTGAAGTAAATGATTGGTAATGCAATACCTAATACTAAAACAGTATTACTAACTAAGTTAAATGATAATGAGTTAGTTAATGCACCAATAACGATAATTAATACAATTGCTAAAACAACACTTCCGATAATAAGACCATACTTTTTCTTTTCAGCTGGTGTCAATGGGTTAGTAGGTTTCATACCAACGCTACCTAAGTTTTTGCGGTTGAAAAGTACATACCATACTAAACCTAATGCCATACCAACTGCTGCAATCAAGAATCCGCCGTGGAAGTTTTTAACATTAACAAAGTGTTGCAAAATAATAGGTGATAATAATGCACCCATATTAACTGACATATAGAAAATAACAAAACCTGCATCCATACGTCTATCATTTTCAGGATATAAACGGCCAACGATATTTGAAATGTTTGGCTTCATTAAACCTGAACCAATAATGATGAAGAACATTGATGTGAATAAGCCGATTAATGCAAATGGTAAGCTTAAACAAATATGTCCGATAATAATAAAGACTGCACCTAATAAAGTAGCGCCTCTAGTGCCTGTAATTCTG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP018205|718984:733715|726779_727178_+|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP018205|718984:733715|724592_725093_-|WP_000930014.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP018205|718984:733715|720393_720936_+|WP_000197271.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPYAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_CP018205|718984:733715|730848_731004_+|WP_000499195.1|DBSCAN-SWA MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ >NZ_CP018205|718984:733715|725112_725979_-|WP_001068497.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP018205|718984:733715|731042_732014_+|WP_000876318.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_CP018205|718984:733715|732953_733715_+|WP_000616842.1|DBSCAN-SWA MIQVENLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFENGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_CP018205|718984:733715|721559_722477_-|WP_000429014.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP018205|718984:733715|727140_729246_+|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP018205|718984:733715|722746_724252_-|WP_000193751.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP018205|718984:733715|718984_720043_+|WP_000663030.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEYFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP018205|718984:733715|722567_722669_+|WP_001790641.1|DBSCAN-SWA MVINEIDFYRVGRENIVIAVYNEHIKFLFILIS >NZ_CP018205|718984:733715|732000_732957_+|WP_001245578.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVESVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NZ_CP018205|718984:733715|729363_730335_+|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK |
14 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
904347 : 958133
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP018205|904347:958133|DBSCAN-SWA 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53 | Streptococcus_phage(33.33%) | tRNA,protease,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
978120 : 986593
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP018205|978120:986593|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP018205|978120:986593|984995_986024_+|WP_000030812.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP018205|978120:986593|981350_983540_+|WP_000032727.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGDHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP018205|978120:986593|980686_981358_+|WP_000666799.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP018205|978120:986593|978120_978603_+|WP_000861572.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >NZ_CP018205|978120:986593|983518_985003_+|WP_000483713.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_CP018205|978120:986593|986026_986593_+|WP_000238664.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRKCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP018205|978120:986593|978589_979714_+|WP_001010412.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPSEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_CP018205|978120:986593|979717_980422_+|WP_000174053.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_CP018205|978120:986593|980421_980685_+|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1425105 : 1512985
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP018205|1425105:1512985|DBSCAN-SWA 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108 | Staphylococcus_phage(56.41%) | protease,plate,tail,head,capsid,portal,terminase,holin,tRNA,integrase | attL 1461346:1461370|attR 1507378:1507402 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1568109 : 1576421
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP018205|1568109:1576421|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCGATATCATGAGTAACTAAGATAATGGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTTGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAACCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATTAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGTTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTGATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTAACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAACATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAATGAGCGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGCGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCCCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAACCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGCTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAATACAAAACCGCGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGACCAGTTCGTCCGACTCTATGCGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAGCCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAATAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGGATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAGTCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACACCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTAAATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAACGCTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAATTCACACCATGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGGACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTCACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGGGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGACTTTTGATATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGCGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAAACCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATACGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATGATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAACCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTACTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCGTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTCTGTAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAATTTTCAGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCAGGTTGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTATCTACTAATTGGTTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGGCCTTGAATAACTTCTCCAGCAATACCGCATTCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTACCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCAATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTGCCGTCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGCACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCAGCATGATCTGAAGGACTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGTGTTTCTAATGAAACAGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATTTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAATAATTGACGTTGAACACGAATTAATTTATTAATTGTTTCTACCATATGCACAGGGATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAACTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCACGACCTACGTATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTTGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCGATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGGTACATACGAACTGGGTCATTTATTTTAACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGATTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCAAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATTGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAATAGTGTTGTTTAAATGCGGTAACTATCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGTATTATTCTTTAAAATCACATGCTACATGCGTTCTTTATTCTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTTTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTAGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATTGTTTCTTGTCCTTTTTCATTAATAACATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCGTCATTCAAATTATATTGTTCTAAGCTAATTAGTGTTTCTCTCAACTCATTTGAATTAACATACTGCACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGCATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAAATGCTGATTTGTGAAGTTATCCTTATCAACACTTTCATAATAATTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGCTCGCTCCGCTTTTTCTTGACGGCTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATGTAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAATTGGCTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAATTGCTCAGGACTAACATTGAAAAATGGTGCAACATCATTTAAAGCCTTTTGTTGCAAAATCGATGATTTCATAAGCGAAATATCATGACTTAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTATGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTCACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTGTCATTTTTTACAAAAGCAGTAAATGCATCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCCGGATCCATGCCTGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAGCCCTTGCTGTAACAAATTTTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAAGTAATATGTTCATCTGACAACTGTGTACCCATTGTTGCAACAACGTTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACGATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGCGCTTTATCTAAGTTGTATAACAACTTTCTTTTTTGAAAGATAGGTGTTTCAGGACTATTTAAGTATTTTGGTTCTTGACCGGTATATGTTCGACCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGCGCATTTTTCAAAGGAAACATAATACGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAATTTTCTTCGTTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTATCGGGTGCAAAGCCAATGCCTCGCTCTTTAATAAGCGCATCTGTAAAACCACGTTCTTGTAAGTACGTTAATGCTTGTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAATAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCAATCATTTGTAAATCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGCCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATGTCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCACCTTTTTTACAACCAAAACAATGACAAATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGTGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTGCGTCCTCTCTTTTCTAATTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATTTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP018205|1568109:1576421|1568109_1568895_-|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NZ_CP018205|1568109:1576421|1569920_1571267_-|WP_001062180.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFYLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >NZ_CP018205|1568109:1576421|1574621_1576421_-|WP_001217261.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQNLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKALNDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYNLNDEPYENEIDDYVNVINEKGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NZ_CP018205|1568109:1576421|1569020_1569911_-|WP_000924214.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NZ_CP018205|1568109:1576421|1572483_1573161_-|WP_000624584.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCECGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIQPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTELIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL >NZ_CP018205|1568109:1576421|1573291_1574398_-|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >NZ_CP018205|1568109:1576421|1571380_1572481_-|WP_000683931.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFSTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPYGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDAYQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKALLMNWFNTEKINLDVEASTINTDPFQYI |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1645559 : 1654602
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP018205|1645559:1654602|DBSCAN-SWA ATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCGCCTAATTTTTCAACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATATACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAATTTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTGACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAATATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAAGGAATTAGACAAGTCTTCCATTGACGTTGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCGCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCATTCATCGCAATATCTTGAATAATTATTTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGATCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGTAACTCAGGTTCTAAGTGTCCATTTTGCCAAAATAGCGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCTATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGAATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACATCTACTTGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGATGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAGCCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCCTTTTTAACTTTCGTTTCTGCCATAGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGACGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATCATTTAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAATCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTATGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAATGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCTAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTATCACTAAAATTGTAGTTGCGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTTTCAATAGTCTTAGTCATATCGCTCAATTGCAGTGCATCATGATTGATATCTGTATCTGAAATGATGGATTCTATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGCTGGTTTAGTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATATTTTGTTAAATTTAAATAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTATTGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTGTTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTGTCTTTACCATTGATCTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCTACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACGCGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAAGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAAAATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCGGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAGGAATGAACTTTTGTTTGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAACGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAATCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCCGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTAGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGTACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCCGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGATCGACTTGATAAAGCACCTCAAATCCACCTTGCAAATCAAGTCCTAAATTGACATTCTTTATAACACTTTTATAAGTTGCAGCCATTCCGGCAAACAACAATACGACTAAAAGCAAGAACGCAATTATTCTACTACTTTTCTTCACATGAACACCTCATTATTTACGTATGTATTTAGAATACTTGAATACTATTTTATAACGCAAGTTAAATCTTTCTTACAAAATTTATTAGCCTTATACATATTAACATACTAGAGCAGGGAGTAAAAATAGTCATAGATATATTTAATTTAAATTTAACAATTATTATGTATCACAATTTCTTTTTTTGGAATAAAAATAAGCTATTCTACATACTACTTATAACTTAAAAAGGATGAAACGCTATTCGTTTCATCCTTTTTAATACCACTTCTCATTATGAAGGGTCAACTTGTTTAATAGCAGGTTTTTCGAAAGTTAATTCAGTACCATGACCATTAACTGTAATAACAACAGTTGTTTCATCTACTGCTTTAACAGTACCTTTAATACCACCAATAGTTGTAATTCTTTGACCAGATTGAATGTTATTAATCAACTCACGATGCTGTTTCGCACGTTTTTGTTGTGGTCTGATCATCAAGAAATACATAACCGCAAAAATTACGACTATATATATTAGTAATGAAAATTGCATTTTATACGCTCCTCTTGCTTAAAAGTTTTTTGGGTTCTCAACATTTAATCCATATTGCTCGAAGAATTCTTCTTTGAAATCTAAAAGACGATCTTCTCGAATGGCTTGTCTTATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGTAAATTATGAATAGTAGTAAGACGAATACCAAAAGTTTCCTCTGCCTTGATTAAATGACGTATATACGCTCTTGAATAGTTTTGACATGTATAACAGTCACAATTCTCATCTAACGGTCTTAAATCATCTGCAAATTTTGCATTTTTAATAACTAAACGACCTTGCGATGTCATACAAGTACCATTTCTGGCAATACGTGTCGGTAAGACACAATCAAACATATCCATGCCGCGAATACTACATTCGATTAACGCATCTGGAGATCCTACACCCATTAAATATCTTGGTTTATCTTTAGGCATAAACTGCTCTGTATGTTCAACCATTTTATACATAACCGGTTTAGGTTCACCAACTGACAAACCGCCGATTGCATAACCAGGAAAATCTAATTCTACTAAATCCTTTGCACTTTGTTCTCTTAAATCTTCATATTCGCCACCTTGTATAATGCCGAACAATGCTTGATCTTCAGGTCTTTGGTGTGCATCTAGACATCTTTTCGCCCAACGTGTTGTACGTTCAATAGATTTTTTTACATAATCATATTCAGCAGGCATCGGTGGACATTCATCAAATGCCATCATAATATCAGATCCTAAATCATTTTGAATTTGCATTGATTTCTCAGGACTCAAAAATAATTTAGACCCATTAGTATGATGTCTAAATTCCACGCCTTCTTCTGTAATTTTACGTAAATTACTTAAACTAAACACTTGGAAACCGCCTGAATCTGTAAGAATCGGACCATCCCAATTCATGAATTTATGTAATCCCCCAGCGTGTTTGATAATATCATTTCCGGGTTGTAACCACAAATGATATGTGTTGCCCAAAATGATTTTTGCTTCAATTTGTCTTAACTCTTCTGGACTCATTGTTTTAACGGTTGCTTTAGTACCAACTGGCATAAACATAGGTGTTTCAAATGAACCGTGTGGTGTGTGCACGATACCTAAACGCGCACCTGATTGTTTACAAGTTTTAATGTGTTCGTATGTTACTGCAGGCATATTCAAAATCCTCACATTCTTTTTATATAATTAACATTGCATCGCCAAAACTAAAGAATCTATATTCTAAATTTACTGCCGTTTTATAAGCATTCAGAACATTTTCACGACTACTAAACGCTGATACTAGCATAACTAATGTTGATTTTGGTAAATGAAAATTAGTAATCTGGCCATCAATTGCTTTAAAATCAAATCCTGGATAAATAAATATATTAGTCCAGCCACTCGTTTCAACAAATTTATCATGATCGCGTCGAATTGTTTCAAGTGTACGTGTTGAAGTTGTACCAACTGATATAATGCGATGTCCTTTGGACTTAGTATCATTTAATAAATCAGCTGTTTCTTGTGTCATTTGATAATATTCACTATGCATTTCGTGGTCATTCACATCGTCTACGCTCACCGGTCTAAACGTACCTAACCCAACATGTAATGTAACAAATGCGATATTAACACCTTTATTTTTAATTTCAATTAATAACTCATCAGTAAAATGTAATCCTGCTGTTGGTGCTGCCGCTGAACCACTTTCTTTAGCGTAAACTGTTTGATAACGATCTGGATCATCTAAACGTTCTTTGATGTATGGTGGCAGTGGCATTTCCCCTAATTCATCTAATCTTTCTTGTAAAATACCTTCATAATGTAAACGCATGATGCGTCCACCTTGATCCATTTCTTTTATGCATTCAGCTATAATTTTGCCATTACCAAAATTCAATTTATTACCAACTTTAATACGCTTAGCTGGTTTCAGTAAGACTTCCCAATCATTACCTTCAATTTGAGTTAACATTAACATTTCAACTTTTGCACCAGTTTCTTCTTTTAAACCAAAAAGTCTAGCTGGCATTACTCGCGTATCGTTAAGCACTAATGTATCACCAGGTCTAAAATACTCAATGATATCTTTGAAATGTAAATGTTTCATTTCACCAGTTTCTCTATCCATGACTAATAAACGACTATGATCACGATCTTTTAAAGGCGTTTGAGCAATTAATGATTCTGGTAAGTCATAGTCAAATTCTTCAATATTCACGTTATTCTCTCTCCTCATTCGACTTTGCAAAATGTTCATAAGCTAATGGTGTTGCTTTTCTGCCACGTGGCGTACGTTCTAAAAAGCCTTTCTGAATAAGAAATGGCTCATAAACGTCCTCAATTGTAATACGTTCTTCACCAATTGTTACGGCAATCGTATCTAAACCAACAGGTCCGCCATTATACTGCTTAATAATACAGTTCATCATTTTATGATCAATGTAATCTAGTCCGTGTTGATCAACTTGAAGTAAACCTAATGCGTGCTTCGTTGTTTCAATGTATATTTGTTCATCTTCATTCACTTGCTGGAAGTCTCTTACCCGCTTCAATAGTCGATTTGCTACTCTTGGAGTCCCTCTAGAACGTTTAGCAAGTTCAATGGCACTTTCTTCATCAATACCTGTGCCTAAAACCTCAGCTGTTCTAATAATGATTTCTTTTAAATCTGATTCGTTATAATATTCTAATCTTAAGTGCACACCAAATCGATCCCTTAGTGGACCTGTTAAGCTGCCAGCTCGCGTTGTTGCACCTACCAAAGTGAATGGAGGTAAGTCGATACGGATACTTCTAGCCTCATCGCCTTTACCAATGATAATATCTAAAAAGAAATCTTCCATTGCAGGGTATAACACTTCTTCAACAACACTACTCAGTCTGTGTATTTCATCAATAAACAAAACATCTCCAGGTTGAAGTCCTGATAAAATTGCAGCCAAATCACCAGGTCTTTCTAATGAAGGCCCTGATACTGTACGTATATTAACTTCCATTTCATTGGCAATGATATTAGATAATGTTGTCTTACCTAATCCAGGGGGGCCAAAAAGCAATACATGATCTAATGGTTCATGACGAAGTTTAGCCGCTTTAATAAATACTTCTAAATTACTTTTTATTGAATTTTGACCAATATATTGTCGTAATCTCGTAGGTCTAAGCGACAATTCGAAATCAGTTTCTTCACTATGCATTGATTGATCAACCATACGCTCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP018205|1645559:1654602|1645559_1646078_-|WP_000364542.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >NZ_CP018205|1645559:1654602|1652570_1653596_-|WP_001019172.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLIEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSSRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP018205|1645559:1654602|1651408_1652548_-|WP_001112045.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP018205|1645559:1654602|1651129_1651390_-|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP018205|1645559:1654602|1653597_1654602_-|WP_001005767.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >NZ_CP018205|1645559:1654602|1646099_1648373_-|WP_000594993.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTATTILVITLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDVEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKQVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQIIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NZ_CP018205|1645559:1654602|1648575_1650855_-|WP_000749795.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1787611 : 1861863
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP018205|1787611:1861863|DBSCAN-SWA ATTATTTAGCTACAATATTGACTAATTTTTGAGGAACAGCGATGACTTTCATGATGTCTTTACCTTCAATACTCGCTTTAACATTGTCATTAGATAAGGCAATTTCTTGCATTTCTTCTTTTGATGTATCTTTAGCAATTTTAATTTTAGCTCTCAATTTACCATTCACTTGAACAACGATTTCTACTTCATCATCTACAAGTAGTGCTTCGTCATAAGTTGGCCAAGGTTGGTACGTAATAGACTCTTCATGTCCTAATTTTGACCATAATTCTTCACCGATATGTGGTGCAATAGGTGCTAACATTTTAACGAAGCCTTCAATGTAAGGTTTATAAACTTCATCAACTTTATAACACTCATTAATAAATACCATTAATTGACTAATAGCAGTATTAAATCCTAATGTTTCAAAGTCTTCTGTTACCTTTTTAACAGTTTGGTTATAAACTTTATCTAAAGATTTATTATTTGTAGTTACAATTTTTGAACTCAATGTCCCATCTTCATTTACCATTAAACGCCATACGCGATCTAAGAATCGACGAGACCCATCTAATCCTTTTTCACTCCATGCAATTGCAGCATCTAAAGGTCCCATAAACATTTCGTAAAGACGCAAAGTATCTGCACCATGAGACTGTACTATATCATCAGGATTGATTACATTTCCTTTAGATTTACTCATCTTCTCATTACCTTCTCCTAAAATCATACCTTGGTTAAATAATTTTTGGAAAGGTTCTTTAGTAGGTACGATAGCCAAATCATAAAGGACTTTATGCCAAAATCTTGCATATAATAAGTGAAGAACCGCATGTTCTACTCCACCGATATATAAATCAACAGGTAACCAATGTTTTAATTTTTCAGGATCTGCTAACATATTTTCATTTTTAGGATCGATGTAACGTAAATAATACCAACAACTACCTGCCCATTGTGGCATTGTATTTGTTTCACGACGTCCTTTCATACCTGTTTTTTCATCTACAACATTTACAAATGAATCAATATTAGCTAGTGGAGACTCACCAGTCCCTGATGGCTTGATTTCATCTGTTTCAGGTAACAACAATGGTAGCTCTTCTTCAGGAACAGTTGTCATTGTTCCATCTTCCCAATGAATGACAGGAATTGGTTCGCCCCAATAACGCTGACGACTGAATAACCAATCTCTTAATTTGTAATTAACTTTCTTTTCGCCAGCACCTTTTTGCTCTAATAATTGAATAGCTTTAGTAATTGCCGCTTCATTTTCTAAACCATCAAGTTCACCAGAATTAATATGTTTACCTTCACCAGTGTATGCTGCTTCTTCAACATTTCCACCTTCGATGACTTCAATGATTGGCAAATCAAACTTTTTAGCAAATTCATAATCTCTGTCATCATGCGCTGGTACTGCCATAATTGCTCCAGTACCATATGTTGATAATACATAATCAGCAATCCAAATTTGTACTTTTTCACCAGATAAAGGATTAGTTGCATATGCACCAGTAAATACACCTGATTTATCTTTTGCTAAATCTGTACGTTCTAAATCTGACTTTTTAGAAGCTTCTGTTTGATAAGCTTTTACTTTTTCTTTATATTCATCTGTTGTAATTGAATTAACTAATGCATGTTCAGGACTTAAGACTAAGAATGATGCACCATAGATTGTATCTGGTCTAGTCGTAAATACTTCTACTTTTCCTTCCGTATTATCTACATCAAATGAAACTTTGGCCCCTTCAGAACGTCCAATCCAATTGCGCTGCATATCTTTTAAAGACTCAGGCCAATCTAAATCATCTAAATCTGCTAATAATTGATCTGCATATTCTGTGATTTTAAGTACCCATTGTTTCATCGGCTTACGATAAACTGGATGTCCACCACGTTCAGAGACACCATCAATCACTTCTTCGTTAGATAAAACAGTGCCTAATGCTGGACACCAGTTAACTGCAACTTCATCAACGTATGCTAAACCTTTGTTATATAACTGTATGAAAATCCACTGTGTCCATTTATAGTATTCTGGATCTGTTGTATTAACTTCACGATCCCAATCATAACTGAACCCTAATTCTTTAATTTGTCGTTTAAAAGTTTGGATATTTTTCTTTGTAAATTCACGTGGGTCGTTGCCAGTGTCTAAAGCATATTGCTCTGCTGGTAATCCGAATGCATCCCACCCCATCGGATGTAATACATTATATCCTTGCATTCTTTTATATCTTGAAATGATATCTGTTGCTGTATAGCCCTCAGGATGTCCAACATGTAAACCAGCACCTGATGGATATGGAAACATGTCTAAAGCATAAAATTTCTTTTGACCTAAGTTATCATTTGTTTTAAATGTTTTATTTTCGTCCCAATAGTCTTGCCATTTCTTTTCAATTTGATTGTGGTTGTAATTCAACACATTTCCTCCTATTCAATAAAAAAGACACCTCTAACTATTCTATTTACATAGGGACGACATTTGCCGCGTTACCACCCTATTTCACAAAAATTGTGCACTCATTTTAATAGTAAGAGATGTCATTCATTCAATTTAAAATTAATACGATTTACATTTAGTCCTTAACACTAGCTCTCAGCATCACTAGCTTTCTGTAGAAAAGCTCCAAACGAAATTAAATTATACAAATTAATATTATGTTATAACGACATTTATTTCAAGTCTATAACGTTAATTCTATTTACTCATTATGCATCTATTTTTTTAGGTTGCGTATTATTCTCCTTGAAAACCATTAATAATATTAATGCAAATACAAGTAGTAGCATCATACCGATAAACATCATGCGCATATTAAACGCATCAACTAATACACCACCAAGAAATGGACCAAATGCTTTTCCTACTGTAGCAGCTGAATTCACAAAACCTTGGTACTGTCCTTGCTTACCATCTGGCGCTAACTGATTGGCTATAGTTGGAACTGCTGGCCATACAAACATTTCTCCAAAAGTTAAAATAATCATACCGACAACAAATATTGTAAAGTTTTCGGCAAAACTCGTGACAAAGAACGACAACATAAAAATGATGATGCCGACAAACATTTGCTTCTTTAAGTTTCCTTTTAACAGATAGAGAATCGGTTTAATTAATGGTTGTGCTACTAAAATCATTATTCCGTTAATTGTCCATAAAACACTATATTGTGCCATTGAAATATTAATAGATTGTGTAAATGAAGCGATTGTAGACTCCCATTGAATATATGCAACCCAACAAATTGCAAACATTGCACAAATTAGTACTAATGAAATAAATCTTGCTTTATTCTTTTTACCAGTAATATCTAAATGAGTTGGATATTTAACTTTCGCATTAATTTCAATATTAAATTGCGTTACCGCGACAAGCGCAAACACAACATACATAATAAGATTGGCTAAAAAGATATAGTTAAAGCTAAATTCTGCGACAAAGCCGCCCATTGCAGCACCGACAGCCACACCAATATTTTGCGCTAAGTATATCGCATTAAACGTTTGTCTTCCGCCATTTGGCCACACTGCTCCAGCCATAGCGTATATCGCAGGAATAATCATTCCGCCACCAAACCCTAACATTACAAGCCATACAGCATACCAAGGCCACCCGTGAAAGAAATTAAGTAGCGTTGTACTACAAAGACAAGTGAAAGTTCCAATTAAAATCGTCTTGTATCCACCTAATTTATCAAATAGTGAACCACCTAATAAGTTTCCAATAACCATGCCAAATGAATTTATCATTAGCACTAAACCAGCAACAGTTAAACTTTTTCCAAGTTCTTGTTTCATATAAATTGTATTTAAAGGCCACAAAAAACTGGAACCAGTAATATTTAACGCCATGCCAATTACTAGCCACCAGACTGATTTAGGTATATTCATATTTCATAGTTCCTCTCTCTTTTTTGTCAAACTATAATAAACACTATAACATTAAAATATGTTAAAATCTGTACTTAGAACTCTTTTTTTATAGAAAGGAAAATGACATATGGGCAATCATTTCCAATACGCTTTTGAAAACAAACGTTATCACACATGGAATTACCATTTAAAAAATAAATTTGGACAAAAAATATTTAAAGTTGCATTGGATGGCGGGTTTGACTGTCCTAACCGCGATGGCACTGTAGCACATGGTGGATGTACATTTTGTTCTGCTGCAGGTAGCGGAGACTTTGCAGGTAATCGTGCAGATTCAATCGCAGTACAATTTAAAGAAATTAAAGAAAAGATGCATGAGAAATGGCACGAAGGAAAATATATTGCTTATTTTCAGGCATTTACAAATACACATGCACCGGTTGAAGTATTAAAAGAAAAATTCGAACCTGTACTTAAAGAACCGGGTGTTGTGGGATTATCTATTGGTACGCGTCCTGACTGTCTACCAGACGATGTTGTCGAATATTTAGCAGATTTGAATCAACGAACATACTTATGGGTTGAATTAGGACTACAAACAATCCATCAGTCAACATCTGATTTAATCAATCGTGCCCATGATATGAAAACTTATTATGATGGTGTGGCAAAATTACGTAAGCATAATATCAATGTATGTACACACATCATTAATGGCTTACCTGGCGAAGACTATGACATGATGATGGCTACTGCCAAAGAAGTTGCACAAATGGATGTACAAGGTATTAAAATTCATTTACTTCATTTGTTAAAAGGTACACCGATGGTAAAACAATACGATAAAGGTTTATTAACTTTTATGACTCAAGAAGAGTACACAAACCTAGTTGTGGACCAATTAGAAGTGATTCCCCCTGAAATGATCGTTCACCGAATTACCGGTGATGGTCCAATAGATATCATGGTAGGTCCAATGTGGAGTGTTAATAAATGGGAAGTATTAAATGGCATCGATGCTGAATTAGCACGTAGAAATTCTTATCAAGGCTTGCGTTACAAGTCTAAGGTGAAGCAATGAAATTAGAACGTATACTCCCTTTTTCAAAAACACTTATTAAACAACATAT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75 | Staphylococcus_phage(93.22%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1890385 : 1965725
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP018205|1890385:1965725|DBSCAN-SWA 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93 | Staphylococcus_phage(85.92%) | plate,tail,head,capsid,portal,terminase,holin,transposase,tRNA,integrase | attL 1917330:1917344|attR 1966067:1966081 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2001134 : 2088450
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP018205|2001134:2088450|DBSCAN-SWA 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113 | Staphylococcus_phage(91.25%) | protease,portal,tail,head,capsid,terminase,holin,integrase | attL 2064912:2064928|attR 2091106:2091122 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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