Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NZ_CP016297 | Acinetobacter baumannii strain CMC-CR-MDR-Ab4 plasmid pCMCVTAb2-Ab4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP016296 | Acinetobacter baumannii strain CMC-CR-MDR-Ab4 plasmid pCMCVTAb1-Ab4, complete sequence | 0 crisprs | DEDDh | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP016295 | Acinetobacter baumannii strain CMC-CR-MDR-Ab4 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,csa3,RT | 0 | 0 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
7911 : 89567
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP016296|7911:89567|DBSCAN-SWA ATCATGCTTCCACCTTATCCGCACGAGCTTGGGCTTGCTCATTTGAATAAGTGCCTTTGCTATAGCGCTTACCCAATTTTGCCATATTCGCCGCAATCGTTTCCTCACGGCTTACCCCGATGATTTGGCGAATACGTTCCATGTAGAACTCTAAATCACCAAGTTCTTCAATCACGTTTTCACGATCTAGCGGTTTGCCGTAAATTGCATGTTTCTTGATTGCGTCAAGAAGTTCACCAGATTCACCTGAAACACCGACACCCATGTGAAGTAAATCGGCTTGCTCTGGTGTCATATCATTCAGGATGTCCTGACCTTTTTTCACCAAAGCCGTGACCATTTCGCTAAAAATGATTTGATCAGCCAACTTTGTTCTCCAAGTTAGTTACACGCGAATTCAAGCTATTGATTGAATTGCCTTGAGTGACATTCACTCCTTCTGCATTATTCATGCGGCTTGTCAAAGTTGAAATTGAGGTGCTTTGACTAGCGTTAGTGTTTTCAACATTTGTAACGCGATTAGCAAGAGTATTAACGGAAGCAACATCAGCCTTTTGAGTCAATTGGCTCTTAAGGTTGTTAATTTCCATTTCGATCTGTTCGTTAGTCATAGTCATGTGCTATCTCCTGTTAATGACATAGACGGTTTAGACTTTTATTTTCTTTTTGACCTCAAGGCCTTCATTACCTGCGGCTTGATAAGCTGCGGTCAAATGCTCAATTGCGGCATCAATGTGGCGATTAAATTCAGGATTGATGCGCTCTAGGTAATACTGATGCCTAGTCAGGTGGTCATTCACCATGCTTAAAAGGACATAAGATGTATGTAATGCCTCATGTCTGAACCACTTAGGATTTACCTTCGTTTTACTCATTACCCGTTCATCTCCTGAAAGACTTCCGTTAATGCTTTTCGTGTTTTGATAGCGCGCGCAATTTCGACATTGTTATCTTCAATGCGAGTTGTAGCGGATCGAATTAATTCATTTTGAACATCGTTGTCCTCTAACAGGCGCTCTTCTAAATCGAAAAGCTCACTCAGCTTTTGCTCAAGATCAGCCGTGATATGGCGAACTGTTTTAGGCTTGACTTGGCCCATGCCAACTTTTTCTTCAAGATGTTCGGTAGCTTTACTTTGTCCGATTCCAAAAATATTCATGACTTACTCCTTGTTTTTCGATAAGAAGATTTCTGCTTCAATGAATTTGCGATGTTGTAACCAGCCTTTTAGATTTCCGTGCATTGTTGGGTTGGCATACTTTTCCGTGCGGTGATCAAAGCTGTCAGGTGTTGCTTGGTGCTCAAAAGGTGAAGCATGCAAAGGTTCAGCTCCGACCAAGCGTTCGCAAAGTTTTAAATCTTCACCAACATTTGATTTATTGCCGTAATGGTTCATGAAAGAGACGCGGCAACAACGGGCACCAGATACCTTTTTTAATACCTCGATTTTGTGCTGCTTCCGTTCCTCGTCTGTGATATATGGCAAGTGCCATTCACCAAATTTGAGCTTTTTAGGTGTTGAAGTACGCATTGCTTTTTCAATGAGATAAGCAACAGCGAAGATTTCGAACTGTGCGTCCTCATGGATACGGAGATCGAAAAAGTTATCCATTTCCGTAGAGCTAAGAACCACATGCATAAATTGCCAAGGCATCAATAAGCGGTTGGCCGTTTGCTTGTGCAGTCCTAATTTCATTAAGGACCATACAACACCGCACATCAGGCGACCTGACCATTTCCATGCAAATCGGCACAAGCGAATCTTGCGTTTTGAAAACTGTTCATTCGCTTGCATGCCAGCCTTGTTTTTGCCCCAAAAGATTGGATATGCCGGATTGTTCCAGACTTGCTGAATGATCTTTGAAATAGGAATGGCGCGGTTAGATGCGGCATTACGGCTGAATACACGATGAGTCATCATTTCGGCATGTATTGGTAACCAATACATAAGCTCAAAGGTGACAAGGCGATCGCCGTATTCATTGATGCTGTCTGCCAAGATTTTTACTTTGATTTGACCTTCCTCAATTGCTTTATCAATGAGGTGTACGAGGTCGAAATTAGTAATTTGCAATTTAGTTCCTCCTTACCAAACCAAAGCACCGCCAACTTTGTAGTCAGTGACGCGGGTTTCGAAGAAGTTCTTTTCTGACGTATTAGGTTTAGAGAACTGCTCAACCCAAGGGAATGGATTTTTTACGCCTGGATATGGCACAAACGGCGCTTGAATTTGTTCAGCACGGAGGTTTGCAAGATGCTTGATGTAATCCTCAATAGCTTTAGGATTCGTTACGCCTTTAGTAATGTATTTCCCCCAACTGATTTCCATTTCTGATGAAGTCAGGAACACTTCAAGAGCTTTATTCCAGAAGGATTGGGTAAAGACGTCTTTATTTTCGTGACGAAGGGTGTCTAGCATATGTGCGAACAAATCTAGGTGCGTTCCTTCTTCATCACGTTGGATATAGCGAATCATGTCGGCTGAACCTAACATTTCACCCTTATCGGCAAGCAGATAGAACGAAAGGAAACCTGAGAAGAAATAAACACCTTCAAGCAAGACGTTTGATACACATGAAAGGGCAAAACCTTCAGCCGAGAATTTTTCACCGAGTAATCGCGACTGTTTGAGAATGAACTGGTTTTTTTGAGCCAATAACCCATCACGTTCAAATGTCATGTAAACGCTCATTGGATCAAGACTGACTGTCTCAATGATCGTGGCGTATGATTTGACGTGTAGCGCTTCTTCCCATGCTTGACGTGACAAACACATGGAAACTTCCGGAGAGGTTACGTGTTTTGCAATATTCTGGTTGATGTTGTTGAATTGAATGCCGTCTAGGTTTGACAAGAAAGCTAATGCTTTATCAAACATGAAACGATCTGCGGCATTTAAGCGGTTATAACTGGCAACATCATCTGCCATATTTACGACATGCGGAAACCACGTATTATTTTCCATGCGGTCGAGAATGCCTTTTGCCCATGTATGCTTCATCGGGCTAATTGCCATTAGGTCATCCTTGGGACCTAAAATTAGACGTCGGTCATTAATACGATTTGCGTAAGTCATAATTTCTTTAATACTCACAAATAAAATAGGGATGAACTTTTCATCCCTATAATTATAGTAAGCGCTTACTAATATTTGCGCCTAAATTAAAAAAGTTTTACTGGCAGCTTTCACAATCTGGATCGAGAATTGAACACATCTTTGGTGCGCTTTCAGTTGGTTCTGAAAGTTTGCCTAAAGCTGCGTTAGCTAATTCCGCAATAACTTTGGTTCGCATTGAAGCGCTCTTCTCTGCATCAGATTGATTGCGTAAGTAGTAAGTGGTTTTCAAGCCAAGTTTTTTAGCTGTTGTATACCACAAATCTAAATCACGACCAGTTGTACCTTGTTTTGCAAAGAGGTTAGTTGATTGAGACTGGTCAATCCACTTTTGACGAACTGCGGCTGCCTTAATGATGTAGAGTTGGTCGACATAATACGATTCTTTGAGCAAGTGATATTTGTCACCGACATGAGCAATTGCAGGATCGACGACTTGGTAAGTACCACCTAGGTTAGACTTGAAGTATTCAAGCAAGAACGGCGGTTCTGTGCATTGAGTTGTTCCTGCAATATTCGAAATCGTTGCAGTCGGCGCAATCGCCATAACGTTCGAGTTACGCATCCCTTTTTTGACTTTTTCACGTAAAGCCTCCCAGTCGAATCGACGAGGTTGATCAAAGAATGGTTTGCCGTCTTCCATCAATTTGGCGTTATCGATTGGCAAGATACCTTTAGACCAGTTAGAACCTTCAAATGATGGATATGAACCGCGTTCTTGAGCCAAGTCTGCTGAAGCCTCGATAGCAAAGTAAGAAATTGCCTCAAACAATGCGTCAGCTTGCTTTAAGTGTTCTTCGCTTTCGAAATCCACACCTTGTTTTACCAGCCATTCGTAATAACCCATCACACCCAAGCCGATAGGGCGGTGTTTGAAGTTAGAGTTGGATGCGCGGTCGCTAGGGTAGTAATTCACGTCAATTACAGAATCCAAATTACGAATAGCCAAGCGGATAACTTCACGTAATCTTTCTAAAGGATTTGGAGCTGACATTACTTGTGAAAGGTTAATAGAACCTAAATTGCATACCGCTGTTTCGTCTTTAGATGTATTTAACGTAATTTCAGTACACAAGTTACTGTGATGAATAACGCCTGCATGTTGTTGAGGATTACGGCGGTTACATTCATCTTTGTAAGTGATCCAAGGATGACCTGTTTCAAATAAATTGGTCAACAAATGGCGCCATACCTGAATAGCCGGAAGTTGGAAATCATATTCACCAGCGGCTTCTAGTTCTTCATAGCGTTTAACGAAATCTTCGCCGTAAAGTTCATGCAATTCAGGGAAGCGTTTAGGCGAGAAGAAAGACCACATGGCATTTGGATCTTCTTTGCGTTCGATCAAGAGATCAGGAACCCAAGCGGCAGGGAATACGTCATGAGCACGGCGGCGGTCGTCACCAGATTCTCTTTTAAGCTCACAAAACGCCATAAAGTCTGGATGCCAAGCTTCTAAGTATGGGGCAACCGAACCCTTACGTTTACCGCCTTGGTTTACGGCAACTGCGGTATTGTTCTGGACCTTGATATATGGAACTACACCACTTGAAATACCATTGGTTCCAAAAATTAATTCATTTTCACCGCGTACTGGCGTCCAGTCTGTACCAATACCGCCCGCAAACTTAGAAAGTAACGCCGTTTCTTCAATTGCTCCAAAAATAGAAGCAAAGCGGTTATCACCTTCATCAGCAGCAATGGTGTCTGAGACTTGGTTCAGGTAACAGCTTGATAACTGAGGATGTAACGTACCAGCATTAAATAGGGTTGGGGTAGAGGAGACGTATTCTAATTTCGAATAAAGCTCATAATAAGCCAGCGCTACAGAAGTACGGATTTCAGGTTTTTCTTTTAAGGCAACACCCATTGCTACACGCATCCA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79 | Pseudomonas_phage(34.09%) | terminase,portal,integrase,tail | attL 32803:32821|attR 72833:72851 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP016295_1 | 2333238-2333323 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016295_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016295_1
>1.1|2333261|40|NZ_CP016295|CRISPRCasFinder GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016295_1
The CRISPR arrays of NZ_CP016295_1 >merge|NZ_CP016295|1|2333238-2333323|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA >NZ_CP016295|1|1|2333238-2333323|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA
>NZ_CP016295.1|WP_000795915.1|2332000_2332237_+|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NZ_CP016295.1|WP_001124846.1|2331106_2331718_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NZ_CP016295.1|WP_000885229.1|2330424_2331036_+|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NZ_CP016295.1|WP_000376215.1|2329812_2330268_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG >NZ_CP016295.1|WP_001990047.1|2328107_2329754_+|allantoin-permease MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA >NZ_CP016295.1|WP_000107128.1|2323520_2324480_-|response-regulator-transcription-factor MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH >NZ_CP016295.1|WP_001025680.1|2323092_2323377_-|N-acetyltransferase MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK >NZ_CP016295.1|WP_002017921.1|2322869_2322983_+|hypothetical-protein MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS >NZ_CP016295.1|WP_000937460.1|2322145_2322781_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT >NZ_CP016295.1|WP_000418064.1|2321490_2322156_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MELDYLFQASHLERLMWGLWATAKIAFISVFFSAIFGTVFGVIMTSKNIVVKALCRLYLEAIRIIPILVLLFVFYFGFATWFNWQFSAMWVCIVVFVLWGTAEMGDLVRAAITSIDQHQRDSAYALGLTHVQALIYVIFPQSLKRVTPGAINLFTRMVKTSSLAVLIGVVEVIKVGQQIIENSLLTVPSASLWIYGFIFILYFLICYPLSRLAAHLEKVWE >NZ_CP016295.1|WP_000983628.1|2333954_2334368_+|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII >NZ_CP016295.1|WP_000432330.1|2334509_2335388_+|glucose-1-dehydrogenase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NZ_CP016295.1|WP_001990041.1|2335444_2337589_-|catalase-HPII MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEHGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLSYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA >NZ_CP016295.1|WP_001145693.1|2337643_2339053_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNQYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NZ_CP016295.1|WP_000482091.1|2339368_2339848_+|CinA-family-protein MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR >NZ_CP016295.1|WP_000108365.1|2340132_2340354_+|hypothetical-protein MSTTNNQANQRNNQQQQQQQNDNRNQQQHGNQQQNDQQQQNNQQQQQNDNRGQQQGSNQKDSGQQNSNNNQQR >NZ_CP016295.1|WP_000132044.1|2340459_2340777_+|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDI >NZ_CP016295.1|WP_000498477.1|2340861_2341083_-|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF >NZ_CP016295.1|WP_001136759.1|2341170_2341599_-|hypothetical-protein MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NZ_CP016295.1|WP_000251637.1|2341868_2342012_-|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSRNDGMHEASDPATSHDMNKNS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1156858 : 1171655
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP016295|1156858:1171655|DBSCAN-SWA 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10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1334616 : 1355461
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP016295|1334616:1355461|DBSCAN-SWA 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19 | Escherichia_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1534107 : 1586356
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP016295|1534107:1586356|DBSCAN-SWA 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75 | Acinetobacter_phage(95.52%) | integrase,transposase | attL 1528130:1528144|attR 1553830:1553844 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2593549 : 2646618
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP016295|2593549:2646618|DBSCAN-SWA 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48 | Escherichia_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2721302 : 2750272
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP016295|2721302:2750272|DBSCAN-SWA 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39 | Acinetobacter_phage(93.55%) | terminase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2754230 : 2766578
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP016295|2754230:2766578|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP016295|2754230:2766578|2754703_2755105_-|WP_000100162.1|DBSCAN-SWA MSSVSIAEYRKLFPIKKNKKRRSAKQVARQPSVGEMVLATHLRACKIGFEQEYKFHPKRKWRADFLIIGTKILIEVEGGIWSGGRHTRGKGYIGDMEKYNSAAMMGFTVLRFSTEQVKAGVAIKQIEQLVGEK >NZ_CP016295|2754230:2766578|2762086_2762530_+|WP_001101038.1|DBSCAN-SWA MNVKATPFNSFAFVSMAALAISGGSLVACQLQPAFQTKDAPTLFTPKTQPSTYSVLTAKITGKHSGVAVIKLDSFRLNVSFDFEAHPDSYGVPGSEFTTVDITQLTVNEITDINGKSYNDFTEFEDIRNINSLLKGFIERNKLVEAA >NZ_CP016295|2754230:2766578|2758462_2758651_-|WP_000703023.1|DBSCAN-SWA MKISDLMTYHGCKNRKELSEKTGYSTVTLWKWENNGIPARTQAVLQVKTKGKLKADLQALTA >NZ_CP016295|2754230:2766578|2765855_2766578_+|WP_000004579.1|DBSCAN-SWA MSESTLWAVAMRPEGYSPFKQTPAASKEIAERAVERYRKMHEKEGNNFFLEIFDDVIKVQKWHGSRKDHIKNLFYVESWFSEPMYQCFDLKTAERVFKFDEIVICYKKGSAPLVTKSFDEAKLFYGSSETGFKYQIQPIEPPENLFNWFHPDIELFDTIEEGAEAYTREQWAQLQMNLRVEIETQLLDYDEIPNIPEDAVVWPNWKPEPPEQGLFLIAAFDSEDGPVLWWANPKAESKEK >NZ_CP016295|2754230:2766578|2763147_2764269_+|WP_001207474.1|DBSCAN-SWA 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24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2985714 : 2993811
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP016295|2985714:2993811|DBSCAN-SWA 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14 | Acinetobacter_phage(57.14%) | integrase | attL 2986559:2986573|attR 2998471:2998485 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3659527 : 3716601
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP016295|3659527:3716601|DBSCAN-SWA 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54 | Staphylococcus_phage(14.29%) | tRNA,transposase,integrase | attL 3692373:3692387|attR 3724644:3724658 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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