CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP016298	Acinetobacter baumannii strain CMC-MDR-Ab59 chromosome, complete genome	1 crisprs	cas3,DEDDh,WYL,csa3,RT	0	0	7	0
NZ_CP016299	Acinetobacter baumannii strain CMC-MDR-Ab59 plasmid pCMCVTAb1-Ab59, complete sequence	0 crisprs	DEDDh	0	0	1	0

1. NZ_CP016298

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP016298_1

• CRISPR_ID: NZ_CP016298_1
• CRISPR_location: 2333372-2333457
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP016298_1

Consensus_repeat	Method
CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP016298_1

>1.1|2333395|40|NZ_CP016298|CRISPRCasFinder
GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016298_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP016298_1

>merge|NZ_CP016298|1|2333372-2333457|CRISPRCasFinder
CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA

>NZ_CP016298|1|1|2333372-2333457|CRISPRCasFinder
CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA	GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG
CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP016298.1|WP_001145693.1|2337777_2339187_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379634
NZ_CP016298.1|WP_001124846.1|2331240_2331852_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|182350
NZ_CP016298.1|WP_000937460.1|2322280_2322916_-|amino-acid-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223836
NZ_CP016298.1|WP_000498477.1|2340995_2341217_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP016298.1|WP_001136759.1|2341304_2341733_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP016298.1|WP_000795915.1|2332134_2332371_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP016298.1|WP_000432330.1|2334643_2335522_+|glucose-1-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|187613
NZ_CP016298.1|WP_000482091.1|2339502_2339982_+|CinA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224463
NZ_CP016298.1|WP_001990047.1|2328241_2329888_+|allantoin-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|224374
NZ_CP016298.1|WP_000108365.1|2340266_2340488_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|237171
NZ_CP016298.1|WP_000885229.1|2330558_2331170_+|LysE-family-translocator	unknown	unknown	gnl|CDD|224199
NZ_CP016298.1|WP_002017921.1|2323004_2323118_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP016298.1|WP_000107128.1|2323655_2324615_-|response-regulator-transcription-factor	unknown	unknown	gnl|CDD|381147
NZ_CP016298.1|WP_000132044.1|2340593_2340911_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP016298.1|WP_001990041.1|2335578_2337723_-|catalase-HPII	unknown	unknown	gnl|CDD|236886
NZ_CP016298.1|WP_000115408.1|2324611_2328076_-|response-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|274362
NZ_CP016298.1|WP_000251637.1|2342002_2342146_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP016298.1|WP_000376215.1|2329946_2330402_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224439
NZ_CP016298.1|WP_000983628.1|2334088_2334502_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP016298.1|WP_001025680.1|2323227_2323512_-|N-acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|379642

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP016298.1|WP_001145693.1|2337777_2339187_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein	gnl|CDD|379634	pfam14518, Haem_oxygenas_2, Iron-containing redox enzyme. The CADD, Chlamydia protein associating with death domains, crystal structure reveals a dimer of seven-helical bundles. Each bundle contains a di-iron centre adjacent to an internal cavity that forms an active site similar to that of methane mono-oxygenase hydrolase.	1.51279e-18
NZ_CP016298.1|WP_001124846.1|2331240_2331852_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit	gnl|CDD|182350	PRK10276, PRK10276, translesion error-prone DNA polymerase V autoproteolytic subunit.	2.36027e-39
NZ_CP016298.1|WP_000937460.1|2322280_2322916_-|amino-acid-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|223836	COG0765, HisM, ABC-type amino acid transport system, permease component [Amino acid transport and metabolism].	2.9036e-64
NZ_CP016298.1|WP_000432330.1|2334643_2335522_+|glucose-1-dehydrogenase	gnl|CDD|187613	cd05355, SDR_c1, classical (c) SDR, subgroup 1. These proteins are members of the classical SDR family, with a canonical active site tetrad and a typical Gly-rich NAD-binding motif. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold (alpha/beta folding pattern with a central beta-sheet), an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Classical SDRs are typically about 250 residues long, while extended SDRs are approximately 350 residues. Sequence identity between different SDR enzymes are typically in the 15-30% range, but the enzymes share the Rossmann fold NAD-binding motif and characteristic NAD-binding and catalytic sequence patterns. These enzymes catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase (15-PGDH) numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser (Ser-138, 15-PGDH numbering) and/or an Asn (Asn-107, 15-PGDH numbering) contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. Extended SDRs have additional elements in the C-terminal region, and typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif. Some atypical SDRs have lost catalytic activity and/or have an unusual NAD(P)-binding motif and missing or unusual active site residues. Reactions catalyzed within the SDR family include isomerization, decarboxylation, epimerization, C=N bond reduction, dehydratase activity, dehalogenation, Enoyl-CoA reduction, and carbonyl-alcohol oxidoreduction.	1.69173e-160
NZ_CP016298.1|WP_000482091.1|2339502_2339982_+|CinA-family-protein	gnl|CDD|224463	COG1546, CinA, Uncharacterized protein (competence- and mitomycin-induced) [General function prediction only].	5.88094e-21
NZ_CP016298.1|WP_001990047.1|2328241_2329888_+|allantoin-permease	gnl|CDD|224374	COG1457, CodB, Purine-cytosine permease and related proteins [Nucleotide transport and metabolism].	9.5172e-23
NZ_CP016298.1|WP_000108365.1|2340266_2340488_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|237171	PRK12678, PRK12678, transcription termination factor Rho; Provisional.	5.30417e-06
NZ_CP016298.1|WP_000885229.1|2330558_2331170_+|LysE-family-translocator	gnl|CDD|224199	COG1280, RhtB, Putative threonine efflux protein [Amino acid transport and metabolism].	2.70108e-23
NZ_CP016298.1|WP_000107128.1|2323655_2324615_-|response-regulator-transcription-factor	gnl|CDD|381147	cd19920, REC_PA4781-like, phosphoacceptor receiver (REC) domain of cyclic di-GMP phosphodiesterase PA4781 and similar domains. Pseudomonas aeruginosa cyclic di-GMP phosphodiesterase PA4781 contains an N-terminal REC domain and a C-terminal catalytic HD-GYP domain, characteristics of RpfG family response regulators. PA4781 is involved in cyclic di-3',5'-GMP (c-di-GMP) hydrolysis/degradation in a two-step reaction via the linear intermediate pGpG to produce GMP. Its unphosphorylated REC domain prevents accessibility of c-di-GMP to the active site. REC domains function as phosphorylation-mediated switches within response regulators, but some also transfer phosphoryl groups in multistep phosphorelays.	6.21476e-55
NZ_CP016298.1|WP_001990041.1|2335578_2337723_-|catalase-HPII	gnl|CDD|236886	PRK11249, katE, hydroperoxidase II; Provisional.	0
NZ_CP016298.1|WP_000115408.1|2324611_2328076_-|response-regulator	gnl|CDD|274362	TIGR02956, sensor_protein_TorS, TMAO reductase sytem sensor TorS. This protein, TorS, is part of a regulatory system for the torCAD operon that encodes the pterin molybdenum cofactor-containing enzyme trimethylamine-N-oxide (TMAO) reductase (TorA), a cognate chaperone (TorD), and a penta-haem cytochrome (TorC). TorS works together with the inducer-binding protein TorT and the response regulator TorR. TorS contains histidine kinase ATPase (pfam02518), HAMP (pfam00672), phosphoacceptor (pfam00512), and phosphotransfer (pfam01627) domains and a response regulator receiver domain (pfam00072). [Signal transduction, Two-component systems].	3.64852e-57
NZ_CP016298.1|WP_000376215.1|2329946_2330402_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224439	COG1522, Lrp, Transcriptional regulators [Transcription].	8.76675e-40
NZ_CP016298.1|WP_001025680.1|2323227_2323512_-|N-acetyltransferase	gnl|CDD|379642	pfam14542, Acetyltransf_CG, GCN5-related N-acetyl-transferase. This family of GCN5-related N-acetyl-transferases bind both CoA and acetyl-CoA. They are characterized by highly conserved glycine, a cysteine residue in the acetyl-CoA binding site near the acetyl group, their small size compared with other GNATs and a lack of of an obvious substrate-binding site. It is proposed that they transfer an acetyl group from acetyl-CoA to one or more unidentified aliphatic amines via an acetyl (cysteine) enzyme intermediate. The substrate might be another macromolecule.	1.0722e-24

Protein sequences

>NZ_CP016298.1|WP_000795915.1|2332134_2332371_+|hypothetical-protein
MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS
>NZ_CP016298.1|WP_001124846.1|2331240_2331852_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit
MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR
>NZ_CP016298.1|WP_000885229.1|2330558_2331170_+|LysE-family-translocator
MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI
>NZ_CP016298.1|WP_000376215.1|2329946_2330402_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator
MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG
>NZ_CP016298.1|WP_001990047.1|2328241_2329888_+|allantoin-permease
MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA
>NZ_CP016298.1|WP_000115408.1|2324611_2328076_-|response-regulator
MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVYIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ
>NZ_CP016298.1|WP_000107128.1|2323655_2324615_-|response-regulator-transcription-factor
MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH
>NZ_CP016298.1|WP_001025680.1|2323227_2323512_-|N-acetyltransferase
MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK
>NZ_CP016298.1|WP_002017921.1|2323004_2323118_+|hypothetical-protein
MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS
>NZ_CP016298.1|WP_000937460.1|2322280_2322916_-|amino-acid-ABC-transporter-permease
MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT
>NZ_CP016298.1|WP_000983628.1|2334088_2334502_+|hypothetical-protein
MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII
>NZ_CP016298.1|WP_000432330.1|2334643_2335522_+|glucose-1-dehydrogenase
MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG
>NZ_CP016298.1|WP_001990041.1|2335578_2337723_-|catalase-HPII
MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEHGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLSYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA
>NZ_CP016298.1|WP_001145693.1|2337777_2339187_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein
MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNQYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN
>NZ_CP016298.1|WP_000482091.1|2339502_2339982_+|CinA-family-protein
MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR
>NZ_CP016298.1|WP_000108365.1|2340266_2340488_+|hypothetical-protein
MSTTNNQANQRNNQQQQQQQNDNRNQQQHGNQQQNDQQQQNNQQQQQNDNRGQQQGSNQKDSGQQNSNNNQQR
>NZ_CP016298.1|WP_000132044.1|2340593_2340911_+|hypothetical-protein
MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDI
>NZ_CP016298.1|WP_000498477.1|2340995_2341217_-|hypothetical-protein
MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF
>NZ_CP016298.1|WP_001136759.1|2341304_2341733_-|hypothetical-protein
MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS
>NZ_CP016298.1|WP_000251637.1|2342002_2342146_-|hypothetical-protein
MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSRNDGMHEASDPATSHDMNKNS

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	1153278 : 1168075	10	Acinetobacter_phage(100.0%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_2	1331037 : 1351052	18	Escherichia_phage(33.33%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	1532420 : 1585372	79	Acinetobacter_phage(95.59%)	transposase,integrase,capsid	attL 1526443:1526457|attR 1551383:1551397
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Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

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MINIQNTILGKIVDRKHEELAARLKQRNLQDVEELAKAATPVRGFANALQHKRPGVIAEIKKASPSKGIIRADFNPAEIAEQYEQAGAACLSVLTDVDFFQGADENIAIARNHCALPALRKDFLVDPYNVVEARALHADCILLIVACLSDQQLEEMSKTAFEHQLDVLVEVHDEEELERALKLSEQCLLGVNNRNLKTFDVDLNTTIRLKKLLPASRLLITESGIATPDDVRMMQEHDIHSFLVGESFMKQPRPDQAFTALFGQPQTV
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MQQSYANILTAVGEDLNRPGLKDTPVRAAKAFSYLTSGYSKTLEEVTNNAVFPSDNHEMVLVKNIEFYSLCEHHLLPFYGRVHVAYLPEGKVLGLSKFARITEMFARRLQIQENLTQQIAEAVAEVTGARGVAVVIDSAHMCMMMRGVGKQESTTRTVSFVGDFKTDKEARREFLSAVPESY

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_001187844.1|1153278_1153827_-	GTP cyclohydrolase I FolE	A0A0P0HSD2	Acinetobacter_phage	1.7e-97	100.0
WP_000893683.1|1154089_1155589_+	xanthine dehydrogenase small subunit	A0A0P0IVM8	Acinetobacter_phage	6.1e-286	100.0
WP_001076817.1|1155590_1157966_+	xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit	A0A0P0I429	Acinetobacter_phage	0.0e+00	100.0
WP_001164226.1|1157972_1158956_+	xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC	A0A0P0IKN7	Acinetobacter_phage	2.0e-189	100.0
WP_000066126.1|1158966_1159662_-	Smr/MutS family protein	A0A0P0IDT4	Acinetobacter_phage	5.8e-122	100.0
WP_000608304.1|1159671_1160478_-	indole-3-glycerol phosphate synthase TrpC	A0A0P0IR83	Acinetobacter_phage	7.9e-147	100.0
WP_001982145.1|1160487_1161537_-	anthranilate phosphoribosyltransferase	A0A0N7IRD9	Acinetobacter_phage	9.8e-190	100.0
WP_000281127.1|1161892_1164625_+	TonB-dependent receptor	A0A0P0I887	Acinetobacter_phage	0.0e+00	99.9
WP_000960548.1|1164704_1167404_+	M1 family metallopeptidase	A0A0P0IY26	Acinetobacter_phage	0.0e+00	100.0
WP_000566784.1|1167499_1168075_-	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	3.2e-110	100.0

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP016298|1331037:1351052|DBSCAN-SWA
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MNPFKGRHFQRDIILWAVRWYCKYGISYRELQEMLAERGVNVDHSTIYRWVQRYAPEMEKRLRWYWRNPSDLCPWHMDETYVKVNGRWAYLYRAVDSRGRTVDFYLSSRRNSKAAYRFLGKILNNVKKWQIPRFINTDKAPAYGRALALLKREGRCPSDVEHRQIKYRNNVIECDHGKLKRIINATLGFKSMKTAYATIKGIEVMRALRKGQASAFYYGDPLGEMRLVSRVFEM

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_001067858.1|1331037_1331742_+|transposase	IS6-like element IS26 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.2e-138	99.6
WP_000018326.1|1331995_1332811_+	aminoglycoside O-phosphotransferase APH(3')-Ia	A0A193DTG4	Autographa_californica_nuclear_polyhedrosis_virus	4.3e-161	98.5
WP_001067858.1|1332923_1333628_+|transposase	IS6-like element IS26 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.2e-138	99.6
WP_000018326.1|1333881_1334697_+	aminoglycoside O-phosphotransferase APH(3')-Ia	A0A193DTG4	Autographa_californica_nuclear_polyhedrosis_virus	4.3e-161	98.5
WP_001067858.1|1334809_1335514_+|transposase	IS6-like element IS26 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.2e-138	99.6
WP_014454105.1|1336543_1337098_+	aminoglycoside N-acetyltransferase AAC(6')-Ib'	NA	NA	NA	NA
WP_002075262.1|1337190_1337823_+	type B-3 chloramphenicol O-acetyltransferase CatB8	A0A2R8FE91	Brazilian_cedratvirus	3.5e-25	40.1
WP_001206316.1|1337880_1338672_+	ANT(3'')-Ia family aminoglycoside nucleotidyltransferase AadA1	NA	NA	NA	NA
WP_000679427.1|1338835_1339183_+	quaternary ammonium compound efflux SMR transporter QacE delta 1	NA	NA	NA	NA
WP_000259031.1|1339176_1340016_+	sulfonamide-resistant dihydropteroate synthase Sul1	NA	NA	NA	NA
WP_000050481.1|1340420_1341962_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_000359986.1|1343361_1344135_+	ArmA family 16S rRNA (guanine(1405)-N(7))-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_077252464.1|1344115_1344397_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_002026779.1|1344616_1344802_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_002001451.1|1344850_1346035_+|transposase	IS4-like element ISEc29 family transposase	A0A0F7LAS3	uncultured_marine_virus	4.5e-50	35.4
WP_000052512.1|1346433_1347909_+	ABC-F type ribosomal protection protein Msr(E)	A0A1B0RXA0	Streptococcus_phage	2.3e-160	59.0
WP_000155092.1|1347964_1348849_+	Mph(E) family macrolide 2'-phosphotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_000753551.1|1349492_1351052_-|transposase	IS66-like element ISAba24 family transposase	S5VTD3	Leptospira_phage	4.0e-70	34.2

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP016298|1532420:1585372|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP016298|2712400:2741074|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_000462878.1|2745906_2746299_-	hypothetical protein	J7HXM5	Acinetobacter_phage	1.2e-07	57.8
WP_000647826.1|2746291_2746630_-	hypothetical protein	A0A0P0IKW4	Acinetobacter_phage	1.1e-30	56.3
WP_001003671.1|2746626_2747427_-	hypothetical protein	A0A0P0IDV1	Acinetobacter_phage	2.8e-144	95.5
WP_000064627.1|2747429_2748311_-	replication protein	A0A0P0IKQ2	Acinetobacter_phage	3.3e-138	95.2
WP_000602535.1|2748303_2748528_-	hypothetical protein	A0A0P0I444	Acinetobacter_phage	3.2e-34	97.3
WP_001180660.1|2748599_2748872_-	hypothetical protein	J7I0V3	Acinetobacter_phage	7.2e-36	90.0
WP_000048916.1|2748933_2749254_-	hypothetical protein	A0A0P0HSE9	Acinetobacter_phage	1.2e-42	87.7
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WP_000370485.1|2750324_2750540_+	hypothetical protein	A0A0P0IKK4	Acinetobacter_phage	9.4e-31	98.6
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WP_000051960.1|2752452_2752695_-	hypothetical protein	A0A0P0I4B0	Acinetobacter_phage	5.2e-38	100.0
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WP_000698529.1|2755067_2756000_+	hypothetical protein	A0A0P0I438	Acinetobacter_phage	2.2e-137	80.0
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WP_000004579.1|2756657_2757380_+	hypothetical protein	A0A0P0HSE1	Acinetobacter_phage	1.7e-55	88.2

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP016298|2977704:2985801|DBSCAN-SWA
AATGAGAACAAACTATTTACGAGGATCTAAACGTTACGAAAATAATCTGAATGGTCAAGTAAACCAAAAATCAACTTTCCGTGAATTCGTAGGGAAGGATGAAGAACATGGTTTATACAAAGTCCGTCTTGGCTATACAGTTTATGCTGCAAATCACACTTTAACTCGTGTTTATACGGTTAATGAAAACAATGAATTAACTCCTGTTTCACAATATACGTTAAATACAAAAGAGTGGATTTTACGAAATCTAGAAACCGAAATTAAATATCGTAGAGGACGTGAATTAGGTCAAATTCTTCAAAAAACGCACATACCTTCCCCTGACCGGAAAGCTTACAAAATTCGTCGTGGTTTTCTTGGTACACGCTAGTTGGGGATATTTATGTTAGTTATTAAATCTTTTCGTGTGATTTATGGTACTTGTCCAAGATGTACTAATGACAAATGCACTTTAGGTGTTAGTCATTCTGGCTCTGGTGCTCAATGGGAATGTCACAACTGCGGCTTTTGTTGGCCTAACAGTTAAATGGTGCATGATCAATGAAAGCAATTATTTTAGATACTGAAACCAACAAATTAAATGGTTATCCAATTGAAATCGCTTATGCGCCTTTTAGCTTAGAGAATGGTCAATTGTTAGTTCATAAAGATGAAGTTTTTAACCGTTTCTATTCTTGTCCTGAACCGATTGATTTAGAAGCAATGGCTGTACACAACATCATTGAAGCGGATATTGAAGGTCAACCAAGTTGCGAATCGTTCCGGTTACCTGAAGGGGTTGAATTCATTGTCGGTCACAATATTGATTACGACATCAAAGCTCTAAATAAATGTGGACCAGCAATTAAGGCAAAGGCTATTTGTACTTTAGCTTTAGCAAGGGACGTATGGCCTGATTTAACAAGTCATAAATTGGCTGTTCTGTACTATTTCGTAATGAGTAACCGTGAAGAAGCACGTAAGCATTTAAGACATGCACATTCAGCACGGGCGGATGTTTATTTTACTGGGATTATCCTAATAGCTCTAATTGAACGACTGGGAATTAAAGATTTGAACTCCTTATTTCTCATGTCTGAAGCTGTACGTTTACCCAAAATAATGACATGGGGTAAACACAAAGGAACGCCTCTTAAAGAATTACCGCGCCCATATATCTCATGGCTCCTGAATAAAGAAGACCTTGACCCACATTTGCGTAAAGCGCTTCAAAATATTTAAAGGTTAGCAACTATGAAACCTACTCTATTTACGCCTGAAACATGGGCGGAGTTTACCCAACAACTCAAAAATTCTTGGGAAAAAGATAACGCTGGTACTGATTCACCAATTTTTGTTGTTCAAGAAAAAAAGATTGTTTGGGGTTTAGATCCGGCTAGTGATTCTGTAGAAATCACTAATATTGTAGATGCCGATGATGAATCAACATATAAATCAATTGATGATTTTTTTGAATCTCTTAAAGCTACAGATAAGCATGCTTTAAATGGTTTAGCAATTGAAGAGGAAGATGAACTTTTCCTCGATGTAAAAGCTTCTACTCAAATAAACATTTTATCTGATTGGAATGAACGCAATATTCATATCTGCCATGGTAAATATTTTTGGGAAGATGTTAATTGCCATCTAACTCGTTCAGCTGCAGATGCATTTATTAAACGTAAATCGCATGATTTCGGTGAGTTGCGGGTATTTGTTAAGTCACTTTATTGGTGTGAGGAGTTTAAGAATTTACTTAACGCTATTATTAGCGGTGAAGTAGGTTTGACAAGTATAGATGACGACAACATCCTAAACGTTTTGGGACCAATTGAACCCAAAGCAGATAAAGAAATTAACTCAACTCAAGCAAAAAAATCTGCGAAGAAGGCCAATAACAAAGAGGAAAATTGGACTCGTTATCATAATGACAAACCTGTTGAGTCTCCGTTAGCTGGCCTTATTGAAAAGCTAAAGAAAACTAAAACTGCAGATGCAGCTAATAGTCTCATTGAGGAAACGAAAGACTGGGCTTCTGAAGATCAAAAATCTTTTTTAACTGAGTTAAATAAACACTTAGTCATCATTGCTGGTCAATCGAAAGAAAATATTTCAATTTCTGAACGAGTCAAACGAGCTACAGACCTGACTACGTTGGATGCGATTGAAATTGATATTTCAGAAGCAGATGAACGTATTCAAGAACCCCTAATGGAGCTGGTTATAAAAAGAAGAAAAGAACTAGAAGTTGAAAATAACTTCTTATTGGAGTCACCACAATGATCCAAATATACAACAGCAAAACCAGAACTTTCACTGTGGTTGGTAAAAACAGAACTCATGTGTTCTCAAATGTTTCGCTTCATGAAACAGATGCCCTGCTCTACAAGGCAAAAGTTAAAGATTCCATTTGGAGATTTTAAATGATGAGAAACATCCCTGATTCTATGTCGTTTCCTTTCACTGTTTGGATGTGTGAAAACGGGTATTACCCATCTCATAAAAATGGATTCATTATTTTAAAGCGTGGCAAAGAAGTTGCAAAGATATCAATGAATGAAACAAAAGATGGTTATCCAATGAATGATATTTGCCAAAAGAAATTTGCCTCGTTCTGCAGAGCATGGATGAACAGAGATAAACACTTTATTGAGCAATTACGTTTGCGTGGATTAGCAAGATTAAATCAAAAAAGTTATCAGATGGTGGCCTAAATGTTTGAAGTTAAGACTGCAGTGCAATTTGATGACGATGATGTTTGGATTGGAAGTGTTCTTATCTCGAAATGTGGCGGTAATGACGAATGGACGGCATATCTCGACAATGATGTGGAAAAGGAATTTGAAACTTTAGAGCAAGCTGTCACTTATTGTTTGGAGCAAGCGAATGATTAATTTAGCGAACCAAAGAGAAGCTTTAATTGCAGAAGTAGAAGTTTTTAAAAAAGACAGTATGGAGCTATGGTTTGTTCCTGATCTCGCAGCTTCTTATACAAATCGGGACTTTTTTTCTTATTCCATAATAGAAGATAACCAAGTCTTTTTTATGATCGAACAAACTCGACAACTGTGGGAATTCTGGAATAAAGCCAAGGATCATAATTTGCCTAAAGGTTCAGTTCTAATTGTTGAAGACCAAATTAAAACTATGTGGCAAGACAATGAAGAGCCTGAAAATTGCGTAAATAAAGAAAAAGACTTTAATTGTTTGGGTGATTGTTTAGACATTGAAGATATCATTTCAATCACAAAGCAACGCTATGCATATATCTCAGCCGAAAAGGTCTACGGTACTTGGGTAGCTAAATTTGAGGCTGGTGAACTGAAAAAAGATTATTTCTTCGTTGGTAGTCAAAAAGAATGTGAAGAAATTGTCGAAAGTAATAAAGCTCTTTATTCAAGCAGAATGGGAGCTAATTCATGATTTTTTATGACCGTGCTTTTTTTGAAGAAAATTTCAAAAAAACTGAAACTTTCAAGCAAGAAAGCAATATTCGAAAAAATGACATTCTTGTATTTAGTGAAACCATGAATGGCTATTTTAATATAGTGACAAATAAAGCTTGGTTACTTTGGAAAAAGGAAATGCAAGCTCATGCTGATTGGTATAAAAATGATGACCCAATTGCATATAAATGGGCCAAAGATGGAAGCCCTGAATATGAAGCTGACTTTTATACAAGTGCAAAAGCTTGGGCTGCAGCAAAAGCCCAAGCTGGGCCCACTTGGATCAGCGTAAAAGATGAAGAGCCACCTACAGACATAATGGTACTTATTTGTTGGGATGATGCGCCAGATGTTACTCCAGAACAAGACTATATAACTATTGATGAAGATCTAAATAGTGTATGGGCAAATTATTATAATGACCCACCTTCTCACTGGATGCATTTTCATAGTGTGCCAAACGTATCGGGAGCTGAACAATGAGCATAACACTTAGCGGTCATCAACTAAAAAGCCTTCTCGAATTTGTAAATCCAGATGGTGAGAAAGATTTAGATCAACTTGATACTGAACTAACAATTAAATTCTTTGAAGATGGCCACAGTGGAAAAGGCTATTACTTTTGGATGACCGAATATCCAGAAGAAGGTGCAATGAAGTTGGATATTGAATCGGGAGCTGAGGGATGAGTGAATTAGAAATACTTGAATCAGCACCCAAAGATGCTACCCATTATTTTCTTGTGCCTAATGGATCTGGTGAACCTTATTACGTTCTTGAAAAAGAAAAAAAGTTCTACTGGTTTCACGGTCAGGATGAAATAACTAAGCCACACATTTTAAGTTGGATTAAGTCAATTGAATCACTGAAAGAAGTTAAAGCGGAAAGTCAGGAGATTTAAATGTCTTGGTATTCTTTAAGACAATTAGCTAAAGAACTCGGAATGGCTCCAAATACTTTTAAAAAATATTATTTGGAGAAATTCCCGCCTGATCGAGAATCCAAAACTTATAAGGGTTGGACATCTCAATCAGTAGCAAAGATTAAAGTTGAGATTCAAGGCGCTAAATAAGCGCCTTTAATCTTCTATAGGATATTTATAGTCATCAAAATTTAATAAATCAGTGGTGTGCATTGCAGCACCGTTGGCACCACGAAATAAGTGACATGCATTGAAATTATGAATATTACAATAATTAAATAATTCAACGATTAATTCATATCCTAAAGTTATTTTTAATAACCTGTAACCACTTTCATAATACTTTAGAATATCTTTTAAGCATGGTCGAGTTCCAAATTTATTAAAGATTTTGATGTGATTTTTTGTGTAAGTTAAGACACCTTGTTGATGAGAAATATGCTGATTAAGGCCTTTAGGTGGATCTAGCACTTCGAGTACTTGATTCAATTCATTTGTAATACTTTCAGAATTTAATACCCAAATGCAAAATTTTGAATTTGGATCATAATTCATTTTGAGTGCATGAGAACAAGCGAAATAACTAGCTACAAACGGATTTTTGGTCCAATCCAGCAATCTAGTTTCAACTCCATAATGTTGTGCATATACAGCTAACTCAAAAAAATCATCATCAAACCAATCTAGCTGATCTCTTCCAAACGATTTCCTATATTTACTTAACTTATTTTTTTGTCTTCTTCTCAATTGATCATTATCTGATGGTAATTGAACACCAGCTAAATCACAGGAATCTTGGAATTTCAATAAAATTTCTGACTCATAATTTTGATCTACACTCCAATTTGTCTTAACCCACCCAATATTTTTTTTATTACGATAAAAGGTTGGTTTTAAATCCCAATCACTTTCTCCATGTCCCCGATAAATGATCGATTTGTCTAATGTACTATACCCTTTAAAATCTTTTATCTTAAAAAAAGGAAAATTAACAGCTGATGGGTTAAATTCCAATCTTAATTGAGTCATAAGATCTTTTACATGTAATTTATCTGGACGAATAAAAGTTATAAACTCCTCAAAATCATTAAACGTAATTTCAAAATGAGAATCATTATTTACTAATTGATCGTAGTATTTATTACCCATTTTGATTTACCCATTTATCAATTTTATACATTAGAAATTCGTTCAATTTAAAACCTACAAAAAATTGCTTTCATAATTACTTGCTATGATTAGATTCAAAATTTAAGGCGCTAATTAAGCGCCTTTTTTCATTAATTTTCTTATTTTATCTCCAACAAAAGCACTAGAAAGTAAGGGTTTAAATTGCTCTAATAAGGATTCAGCATCATGTGATATAAGCTTGTTGCCGTTAACATTCATTTCACATGGGAAGCCATCAGGACTTATCACTAATATTGTTATATCAAATCTTTGTGTTTTGTCATCTGTTGCAGAAACATAGAGAACACGCGACTCAGGCTCTTGAGATTCAATTTTTACATCTGTAATTGGAAGTGAAGTAAGACCCGTTAATAAACCTAACGTATTAAACCCTTTTTTTCTCCAACCAAATTCAACTTTATTATTTGTTGCTTTCTTAACTGCTTGGTCTACTTCAAATAATACATTATCAATTTCTTCAATACTTTTGTCTCTGGTTACAGAGGATTGCATACCCTCTTCAACTGCTAAACTTAAATCTAAATGCATTTTGTTTTCTCCAACTTTAGACAGATAGGCAAATGATCTGAAGGGTTACTAAATGAATCATTATGTAAAGAACTAATCATCTTATCATCAAAGACAAGAACTAGATTATCATCCAAATTCCATCCATCACGGAAAAAGTTTCCTGAAACTAAGATTTGATCATAAATGTGCCAGTGATGGAACTCATTTTTAGTACAGTGATGGGTACCTGAGGGTTGATCTTCCTTAATTTGTAAAAATTTCCAAAAAGGATTGTAAAACAGTGAAGAATTATTAGAGATAACTTTTTGATCCCTAGTACTTCTTAACCCCTCTAATATTGCCGAATCATAAGGTTCAACATTAAAATCCCCTAAAACAACAAACTTCGTTTTATTGAAAAATTTTTTTTCATCATTAGTATCTTTTTTAATAAATGATGCGACTGTTCTTCTTTTTTCCTTATTATCATTTAATTGAGATAACCAATGAGTAACATAAAATATAATTCTTTCTTCTAAGTGCCCACTTAGAAATTCATATTTTTGAAAGACTTTAAGCTTATTCTTTTCTTCACCATCGACTTCTACTTTTGATTGAACAAAATCAAAAGTATTTTTAAATATTACACATGTATCAAAATATAAGCCTCCATAATTTTTTCGATAAATATTGTAATCATAGCCCATCCCAATAAGTTGAATACTATTATCTATAAACTCCATATCCTCAGGTGAAACCTCACAAAGACATAAAAAATCAAAATCGAGTTTCAAGAGCCCTTGAATTACCCTAGAAACTTTTATTTTTTTATCAACTTTTGATTTATTCCATCTATTTCCTATAGGAGGAGATAAATTTATATTCCAAAAACCGACAAATAAACTTTGGTTCATGAGTTAGTACCAATCCAATTTTCTACTTCATTCGCATACCAAGTCATAAGCTCTACTCGCTCATCCCAATATTCGGCACGGTTATAAATTTTACTTGTCTTATCTGCTTTTGTTGTTTTGTTCACGTGGGCAATTTGATAATCGATAACCTCACCACGGAACAATTTACTTTCATTAGCATGAGTCGAAAACAATGAACGAAAACCATGAGTAACCATTTTATCTGTGTAGCCCATTCTTTTTATCATTGTGAGAACCGACTCAGATGTCATGTGCTCATAAGGTTTTCCACGTTTTTTAAATATGTACCCATCATCTGTTTTGACGCTTTCGAGTTCCTTAAACAAAGCATAGATTTGCGGTACCAGTGGGACCATTAATTCTTTTCTTTTTTTCATTCGCTCTGCAGGAATTATCCAGACTTTGTTTTCAAAATCTATCTCTCCAGTATCCCACCTAGCTTTTAACAATTCTGTTATTCGGGTTCCGGTATAACAAACTAAAAGCATGGCCATTTTTACTATTGAGCTAGAATGACTCGCTTTCATGCGTTTAAAGAATTCTGGCATTTCACTCACAGGTAAACAAGGATGGCTGTCAGATTCATATTCAGGTATTACATCCTCTACTAATGTACATGGATTACGATCTGTATAATCTGAGGCAATTGCAAAATCAAATACTTGCTTTCCAAGTCTTAATGCTCGGCTTGCTGTTTCTAAAGTACCCTTTGCAACAATTTCTTTAATTTTCTTCGAGATGTGCTTTCTTTCAACTTCATTAATTGGAAGATTTTTAAAATCCTCGGTTAGATATGCAAGTCGATATTCGACTGTGTCATAGTATTTTTTGCTGGTCCATTGTGATTTCATGATACTCAACCATTCCTCAACCACCTTATGGACTGGTGGAGAATTGGCGACCTTGCCCTGATATTCTAATTTTAATTGTCTTGCTAGTTGGCGTGCTTCTTTACATCCCATAATAGGATATTCACCCAACATCTTTTGATTTTGCTTTCCATTTTGGCGATAAGACAAAACCCATTTCTTTTTTCCATTAGGAAAAACGGAAATGTTTAATCCTTCCCCATCTGCTACTGAATATCTAGATTCTTTAGGTTTTAATGACTTTACTTGGGCATCCGATAGCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

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MKAIILDTETNKLNGYPIEIAYAPFSLENGQLLVHKDEVFNRFYSCPEPIDLEAMAVHNIIEADIEGQPSCESFRLPEGVEFIVGHNIDYDIKALNKCGPAIKAKAICTLALARDVWPDLTSHKLAVLYYFVMSNREEARKHLRHAHSARADVYFTGIILIALIERLGIKDLNSLFLMSEAVRLPKIMTWGKHKGTPLKELPRPYISWLLNKEDLDPHLRKALQNI
>NZ_CP016298|2977704:2985801|2983316_2983772_-|WP_000549863.1|DBSCAN-SWA
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MSELEILESAPKDATHYFLVPNGSGEPYYVLEKEKKFYWFHGQDEITKPHILSWIKSIESLKEVKAESQEI
>NZ_CP016298|2977704:2985801|2984643_2985801_-|WP_000947475.1|integrase|DBSCAN-SWA
MLSDAQVKSLKPKESRYSVADGEGLNISVFPNGKKKWVLSYRQNGKQNQKMLGEYPIMGCKEARQLARQLKLEYQGKVANSPPVHKVVEEWLSIMKSQWTSKKYYDTVEYRLAYLTEDFKNLPINEVERKHISKKIKEIVAKGTLETASRALRLGKQVFDFAIASDYTDRNPCTLVEDVIPEYESDSHPCLPVSEMPEFFKRMKASHSSSIVKMAMLLVCYTGTRITELLKARWDTGEIDFENKVWIIPAERMKKRKELMVPLVPQIYALFKELESVKTDDGYIFKKRGKPYEHMTSESVLTMIKRMGYTDKMVTHGFRSLFSTHANESKLFRGEVIDYQIAHVNKTTKADKTSKIYNRAEYWDERVELMTWYANEVENWIGTNS
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MSITLSGHQLKSLLEFVNPDGEKDLDQLDTELTIKFFEDGHSGKGYYFWMTEYPEEGAMKLDIESGAEG
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MSWYSLRQLAKELGMAPNTFKKYYLEKFPPDRESKTYKGWTSQSVAKIKVEIQGAK
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MFEVKTAVQFDDDDVWIGSVLISKCGGNDEWTAYLDNDVEKEFETLEQAVTYCLEQAND
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MINLANQREALIAEVEVFKKDSMELWFVPDLAASYTNRDFFSYSIIEDNQVFFMIEQTRQLWEFWNKAKDHNLPKGSVLIVEDQIKTMWQDNEEPENCVNKEKDFNCLGDCLDIEDIISITKQRYAYISAEKVYGTWVAKFEAGELKKDYFFVGSQKECEEIVESNKALYSSRMGANS
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MRTNYLRGSKRYENNLNGQVNQKSTFREFVGKDEEHGLYKVRLGYTVYAANHTLTRVYTVNENNELTPVSQYTLNTKEWILRNLETEIKYRRGRELGQILQKTHIPSPDRKAYKIRRGFLGTR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_001260065.1|2977704_2978076_+	hypothetical protein	A0A0D4DCB5	Acinetobacter_phage	1.4e-10	40.6
WP_000643997.1|2978246_2978927_+	DNA polymerase III subunit epsilon	NA	NA	NA	NA
2978549:2978563	attL	NA	NA	NA	NA
WP_000805204.1|2978939_2979968_+	ead/Ea22-like family protein	A0A2I7QY11	Vibrio_phage	3.8e-13	29.0
WP_000986115.1|2980108_2980399_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000464381.1|2980399_2980579_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000609004.1|2980571_2981108_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000578497.1|2981104_2981614_+	phage protein	A0A0P0I8H3	Acinetobacter_phage	1.6e-33	87.8
WP_000028957.1|2981610_2981820_+	hypothetical protein	A0A0P0IRG7	Acinetobacter_phage	6.3e-32	94.2
WP_001292077.1|2981816_2982032_+	hypothetical protein	I2GUB6	Acinetobacter_phage	8.5e-32	92.9
WP_000119264.1|2982032_2982203_+	hypothetical protein	A0A2H4JBW6	uncultured_Caudovirales_phage	2.4e-13	69.2
WP_000527288.1|2982209_2983202_-	FRG domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_000549863.1|2983316_2983772_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001076477.1|2983762_2984647_-	endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_000947475.1|2984643_2985801_-|integrase	site-specific integrase	A0A2H4J339	uncultured_Caudovirales_phage	4.9e-134	63.0
2990461:2990475	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP016298|3652780:3709854|DBSCAN-SWA
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MKLVTAIVKPFKLDDVREALSDIGVQGITVTEVKGFGRQKGHTELYRGAEYVVDFLPKVKIEIAISDEMVDAVIESITRVASTGKIGDGKIFVTNLEQVIRIRTGETGPDAV
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MVALNVGQDFKKRWLNAPEAVRHAYQQDLARICDLLEPQTPIQLWVLNDEKAQLESQQNIEKAYADLKAELIEQARIRRQLALEKALADKRAKEAAYAAELQADEVRKFSEQTEALQALRSHLEQEVAEHTARYQKNPETPAIDYSSGAKLSITDDQILSELESVRVRLELEAESLIEQAVTVFRAKLHAAAQEEIEYILKNSNFSDEKIEK

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_000354154.1|3676515_3676734_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_001144971.1|3683807_3685595_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
3685626:3685640	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_001120888.1|3688171_3689665_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_000088605.1|3690284_3690908_-	tetracycline resistance transcriptional repressor TetR(B)	NA	NA	NA	NA
WP_001089073.1|3690989_3692207_+	tetracycline efflux MFS transporter Tet(B)	A0A2H4UVM2	Bodo_saltans_virus	3.0e-09	24.4
WP_001144965.1|3692289_3694086_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000953322.1|3694380_3695868_+	SulP family inorganic anion transporter	A0A2H4J153	uncultured_Caudovirales_phage	8.3e-219	79.4
WP_000034564.1|3695880_3696732_+	universal stress protein	A0A2H4J154	uncultured_Caudovirales_phage	8.2e-70	45.9
WP_001095006.1|3696799_3697099_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000529372.1|3697171_3697543_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_000081835.1|3699340_3700456_-	TniQ family protein	NA	NA	NA	NA
WP_000417085.1|3700485_3701406_-	TniB family NTP-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_000573060.1|3701410_3703321_-|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	NA	NA	NA	NA
WP_000736396.1|3703321_3704032_-|transposase	heteromeric transposase endonuclease subunit TnsA	I6WI48	Vibriophage	4.1e-06	29.3
WP_071543477.1|3704236_3704530_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000251875.1|3704423_3704726_-	phosphoglucosamine mutase	NA	NA	NA	NA
WP_001043260.1|3704812_3705628_-	sulfonamide-resistant dihydropteroate synthase Sul2	NA	NA	NA	NA
WP_085940413.1|3705720_3706810_+|transposase	IS4 family transposase ISAba1	NA	NA	NA	NA
WP_000573066.1|3707232_3709143_-|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	NA	NA	NA	NA
WP_000736393.1|3709143_3709854_-|transposase	heteromeric transposase endonuclease subunit TnsA	I6WI48	Vibriophage	5.3e-06	29.3
3717897:3717911	attR	NA	NA	NA	NA

2. NZ_CP016299

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	7911 : 89566	80	Pseudomonas_phage(33.33%)	terminase,portal,tail,integrase	attL 32803:32821|attR 72832:72850

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP016299|7911:89566|DBSCAN-SWA
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MSKSVEVITPETVADFLAEQGSELIFEGNQINVIKGKNEECGDFLVINNALGENLFIKLSYIVL

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_001103335.1|11083_13456_-	ribonucleoside-diphosphate reductase subunit alpha	A0A2H4P767	Pseudomonas_phage	3.1e-207	50.7
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32803:32821	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_000521251.1|87856_89566_+	DEAD/DEAH box helicase	L7TNS5	Rhizobium_phage	3.4e-131	46.2