Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP012872 | Salegentibacter sp. T436, complete genome | 1 crisprs | RT,csa3,cas3,DEDDh | 0 | 0 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP012872_1 | 1854887-1855017 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP012872_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP012872_1
>1.1|1854930|45|NZ_CP012872|CRISPRCasFinder GGCGAAGTAATCTTTTAGATTAACATTTTTGCGAAAATTCTACTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP012872_1
The CRISPR arrays of NZ_CP012872_1 >merge|NZ_CP012872|1|1854887-1855017|CRISPRCasFinder TTATCGCTAAAATGGTGATCGATAAAAAAGAATACAAGCCAGCGGCGAAGTAATCTTTTAGATTAACATTTTTGCGAAAATTCTACTTTTATCGCTAAAATGGTGATCGATAAAAAAGAATACAAACCAGC >NZ_CP012872|1|1|1854887-1855017|CRISPRCasFinder TTATCGCTAAAATGGTGATCGATAAAAAAGAATACAAGCCAGC GGCGAAGTAATCTTTTAGATTAACATTTTTGCGAAAATTCTACTT TTATCGCTAAAATGGTGATCGATAAAAAAGAATACAAACCAGC
>NZ_CP012872.1|WP_075325990.1|1850688_1852767_+|amino-acid-carrier-protein MRKYLLSMFFLFSILAINAQELDVQAKVGNPSNIINNGFIDLEVEGGVPPYKYQWSDPETSLESSRAEGLTEGVPYEVTVTDSEGNSVTKSFEIKADAITEHFNGTFVPIVEGMTAILFWDPFTAVGIYDPKVYAERSFVPTPDWSADTEDKFILKEWQVEEGAHVDEGDLIAIVGSQNSGDLEVMANATGTVEYLVGEGETIWDYQNSSDLIETNAHMLAQIQYDEPQILTNPNGTPQKHNIPFIVVWLIFGAAFFTVKMGFINFKGFKHSIDLARGKYDEPNAPGSITHFQALATAVSATVGLGNIAGVAVAISLGGAGATFWMIIAGLLGMASKFVECTLGVKYRFINSEGRIFGGPMNYLRYGLEKRNMRGLGKFLAAFFAILGIGASFGGGNMFQANQSFEILSGQFTFLIGNGFWFGIGVAVLVGIVIIGGIQSIAKVTGKVVPFMAAVYVLGALTVIFINIENIVPAFGAIYDGAFNATAMKGGIIGVLIVGFQRAAFSNEAGVGSAAIAHSAAKTNHPPSEGFVALLEPFIDTVVVCTLTALVLIFTGMHEVEGVGGVQLTSDAFASVVSWFPYVLAMAVFLFAFSTMISWSYYGMRSWTYLFGKSKKTELAYKILFLVFVVVGASISLGAVLDFSDMMILAMSFPNIIGLYIMSSEVRKDLNEYSRKLKAGELFKKQREAKAS >NZ_CP012872.1|WP_075325989.1|1850287_1850518_+|PspC-family-transcriptional-regulator MTKMVHNIRYFFERHGFYVSSRVADKMGMRAKSVRLFFIYASFVTLGSWFVVYLVLAFWLKLKDLVYTKRTSVFDL >NZ_CP012872.1|WP_075325988.1|1848988_1850269_+|DUF2851-family-protein MREDFLHYLWKYKKFDFTNAKTTQGEKILLIDSGTHNFNSGPDFFNARLKIGDQLWAGNVELHIKASDWYFHQHEKDTNYDNVILHVVWEDDVDVQRHNKTSIPALSLKSLVDQDLLMGYRQLFASPENWINCEKNFKEVDDFTLRHWQERLYLKRLEEKSILILDLLGKSGNNWEAVLFQMLAKNFGLNLNGDAFLSMAQSLDFSVVQKSSQNNLQLEALFIGQAGLLSKQLNIPYYKKLQQEYAYLKHKYKLSNSGVIPPKYFRLRPDNFPNIRLSQLASLYFKQKNLFSELIASKSLEPIYKILDVETSEFWRQHYSFPKKHREREKRLSPSFKDLVLINTIIPLRFCYSQSRGNDEIEILLELIEKIPAENNKIVQNFNKIKNGSTQNALHSQAMINLKKNYCEANKCLDCAISVKLLQRKT >NZ_CP012872.1|WP_075325987.1|1848240_1848945_+|SGNH/GDSL-hydrolase-family-protein MKNFYFIILAFLVIGCNTSNSVTQNTETDNSSGMDYSYLALGDSYTIGESVPEKERWPVQLVAQLNERGYKVAPPKIIAKTGWTSGNLLAAMRSELNYTREFDLVSILIGVNNQYQGQGIEDYEEELREIFKLALNHSKRREKGVFALSIPDYGVTPFGAENAETIGEEIDEFNAVFRRIAAEFEVDFYNITPISREAERDAALIAEDNLHPSGLMYRFWVEEIIDEIPQMFPQ >NZ_CP012872.1|WP_075325986.1|1847617_1848172_-|hypothetical-protein MKLYFILFFLSSAVFAQETPAKSFWNQLQQHCGKSYEGTITQGIGNADFDGKKLIMHVRSCEENEIKIPFFVGENKSRTWILRLKDNKIELKHDHRKPDGSEDKITQYGGTASNNGLANIQVFPADDETAELLPAAATNVWWISLDDEIFSYNLKRIGAKTNFSVEFDLSNPIKTPDAPWGWEE >NZ_CP012872.1|WP_075325985.1|1847320_1847503_-|hypothetical-protein MEPNQENKTTTSNITSEPTQEKEEPKTGFGRFFSKVGYSIWIAVMIVGGIIAFLVSLLVL >NZ_CP012872.1|WP_143083627.1|1846976_1847201_-|hypothetical-protein MPIVLSICLYTVQLLKKDKTLRLNLITVLSVFVMYAIYFEVILPPLHWRYTADIIDVLLYLIGSFLFYFLQKLT >NZ_CP012872.1|WP_075325983.1|1844766_1846869_+|amino-acid-carrier-protein MRNLWLFTSIFLMLTAITGAQENTQNNSDLQVEVTLSNPSREINDGIAEVIVTGGEKPYQYKWTNQSTALDARKSTGLIEGMEHTIKVTDANNKSVSKSFTIPAESITEIFNSNVQPAVDFLGGILFWDPFASLGIFDPVVYTPTKQIPIPEWDALSNNSYTLKEWLITKNAEVNEGDKIAIIQTNTGEEIEVFSPVKGRLNYLVKEGHVIFDPNSTSDVVEQDAHVFAEVVYAEPQPLLHPNGDVKMNAIPFIVMWLIIGSIFFTIRLGFINIRGFRHSIDLARGKYDDPNAPGTITHFQAMATAVSATVGLGNIAGVAVAISLGGAGATFWMFLAGFFAMSLKFVECTLGVKYRFINSEGRIFGGPMNYLRYGLEKRNMRGLGKFLAGLFAVLGVGASFGGGNMLQSNQAFKIVSEQLPFLQGHGFWFGVGFAILVGVVIIGGINSIAKVTGKVVPFMAMVYILGCAIVIGTHIENIGGAFSAIFNGALSADALKGGFIGVLIIGLQRAAFSSEAGVGSAAIAHSASKTNNPIADGFTSLVEPFIDTMVVCTMTALVLIFTGMHEVNGLGGVELTSDAFGSVISWFPAVLAFAVFLFAFSTMVSWSYYGMRSWTYLFGKSVKSETVYKIMFLLFVVLGASTSLGAVLSFSDMMILAMSFPNIIGLYIMSSEVREDMKIYLKRLKAGEIYISEKFRKAA >NZ_CP012872.1|WP_075325982.1|1843642_1844623_+|cysteine-synthase-family-protein MDYVENILGTIGNTPMVKMNKITKDIDALVLAKYETFNPGNSVKDRMAVKMVEEAEANGLLKPGGTIIEGTSGNTGMGLALAAIVKGYKMVCVLSDKQSKEKIDILKAVGCEVVVCPTDVAPEDPQSYYSTSKRMAEETPNSWYVNQYDNLANTKAHYESTGPEIWEQTDGKVTHFVVGVGTGGTISGVGKYLKEKNPNIKVWGIDTYGSIFKKYHETGEFDEKEIYPYITEGIGEDILPKNVDFSVIDGFTKVTDKDAAVYTRKLAEEEGFFLGNSAGAAAKGLLQLKEHFTKDDVVVVLFHDHGSRYVGKIFNDEWMKKQGFID >NZ_CP012872.1|WP_075325981.1|1842329_1843562_+|ABC-transporter-permease MNFEFFVVKRLIGGKSHKSSISAPIIKIAIAAIAIGVVMMLVSFATGLGLQEKIRDKIAAFNGHINISNYDNNSSQVTLTPVDKNQDFYPEFNTVDGIAYVQAVATKFGIIRTETDFEGVVVKGVGTDYNWSYFEDFLVKGKLPEVDNKLNDEVLVSAYLANRLQLNVGDKIPTYFLRDGSDRPLTRGFVVTGIYDSGFMDFDKLYVLADIRHIQRLNRWGENEVGNFEVFLNDFDEIDEKGQEVYENTGSFLDTQTINQKYYSIFEWLALFDFNIALIIGIMILVAGINMITALLVLILERTQMIGILKALGGNDWSIRKIFLYNAGYLIIKGLFWGNLIGIGILLLQKYFKLVPLNPETYYVTEVPVYLSWDYILAVNLGTLILCMLMLIIPSVIISKISPSRAIKFE >NZ_CP012872.1|WP_037316435.1|1855115_1855310_+|30S-ribosomal-protein-S21 MLIIPVKDGENIDRALKRFKRKFDKTGTMRQLRSRQHFTKPSVAKRAQVQKAEYIQHLRDQEDI >NZ_CP012872.1|WP_075325994.1|1855409_1856303_+|tyrosine-type-recombinase/integrase MPFSQFLDYLQLEKKYSPNTLTAYKTDLESFSEFILFEFEEKDLRNVHYSQIRNWIVSLVDQGVSNRSINRKISSLKAYYRFLQKTGDIEFSPLAKHKALKTASKIQVPFSEAEISQVLEQIDISDFEGLRDRLIVELFYTTGMRRIELIEIKLQDVDLSGKYVKVLGKRQKERIIPLLPGVISNLENYISKRSDLVKGQEPSYLFVTQKGIKLYESLVYRIINNYFSKVSGKIKRSPHILRHSFATHLLNQGANLNAVKELLGHSSLAATQVYTHNSISELSKVHQMAHPRNKKTN >NZ_CP012872.1|WP_075325995.1|1856331_1856634_+|ribosome-associated-translation-inhibitor-RaiA MKVNVQSVNFNADQKLIDFIQRKLDRLENYYDKIIYADVFLKVQNTSGKDNKITEVLLSIPGGDIMVKKTCKKFEECVDECASSLQRQLIKRKEKLSAHV >NZ_CP012872.1|WP_075325996.1|1857512_1858700_+|elongation-factor-Tu MAKETYDRSKPHLNIGTIGHVDHGKTTLTAAITKVMADAGYSEASAFDQIDNAPEEKERGITINSSHVEYQTANRHYAHVDCPGHADYVKNMVTGAAQMDGAILVVAATDGPMPQTREHILLGRQVGIPRIVVFLNKVDLVDDEELLELVEMEVRDLLSFYEYDGDNGPVISGSALGALEGDEKWSKTVLDLMEAVDSWIELPERDVDKPFLMPIEDVFSITGRGTVATGRIETGVANTGDPVEIIGMGAEKLTSTITGVEMFRKILDRGEAGDNVGILLRGIEKSQISRGMVITKPGSVTPHAKFKAEVYILKKEEGGRHTPFHNNYRPQFYVRTTDVTGTINLPDGVEMVMPGDNLTITVELIQTIAMNVGLRFAIREGGRTVGAGQVTEILD >NZ_CP012872.1|WP_075325997.1|1858854_1859052_+|preprotein-translocase-subunit-SecE MAGIGNYISESYNELKNHVTWTSWPEAQRLTILVAVFSIIFSLAIWGVDTVFSSAIEEYFKWIKS >NZ_CP012872.1|WP_075325998.1|1859062_1859614_+|transcription-termination/antitermination-factor-NusG MAEGKEKKWYVVRAVSGQENKVKDYIEKEVNHLGMEDYLDQVLVPTEKVIQIRNGKKVNKERVYFPGYVMIQASLEGEMPHVIKNINGVIGFLGETKGGDPVPLRKSEVNRMLGKVDELSVKTDNVAIPFTIGETIKVIDGPFNGFNGTVEKINEEKRKLEVMVKIFGRKTPLELSYMQVEKV >NZ_CP012872.1|WP_057482053.1|1859690_1860128_+|50S-ribosomal-protein-L11 MAKEVSKVVKLQVRGGAANPSPPVGPALGAAGVNIMEFCKQFNGRTQDKQGKVLPVAITVYSDKSFDFVIKTPPAAVQLLEASKNKKGSGEPNRKKIASVSWDQVRTIAEDKMQDLNAFTVESAMKMVAGTARSMGITVKGDAPF >NZ_CP012872.1|WP_075325999.1|1860146_1860845_+|50S-ribosomal-protein-L1 MAKLTKKQKEAQSKIESNKAYSVAEASALIKEVANENFDASVDLAVRLNVDPRKANQMVRGVVTLPHGTGKDVKVLALVTPDKEEEAKEAGADYVGLDEYLDKIKGGWTDVDVIITMPSVMGKLGPLGRVLGPRGLMPNPKTGTVTMDVAKAVSDVKAGKIDFKVDKTGIVHAGIGKASFEAEKIAGNARELLTTLVKLKPQASKGVYIKSIHMSSTMSPSVQVDTKRFTEQ >NZ_CP012872.1|WP_075326000.1|1860856_1861378_+|50S-ribosomal-protein-L10 MTREEKSIVIEDLTAQLTDNSVVYLADISGLDAGTTSNLRRACFKANVKLAVVKNTLLAKAMEASDKEFGDLPSVLKGNTSIMFSETGNAPAKVIKEFRKKNEKPLLKGAFVEEAVYVGDEYLDALVNIKSKEEVIGDIVGLLQSPAKNVISALKSGGGKISGILKTLSEKEG >NZ_CP012872.1|WP_075326001.1|1861435_1861813_+|50S-ribosomal-protein-L7/L12 MADLKEFAEQLVNLTVKEVNELADILKEEYGIEPAAAAVAVAGGGAAGGGEEAEEQSEFDVILKAPGGSKLAVVKLVKELTGLGLKDAKALVDGAPAPVKEGVAKDEAEALKAQLEEAGAEVELK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
865421 : 873145
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012872|865421:873145|DBSCAN-SWA TTTATTTTTTTGCGTCTTCAATATAAGAAATTGCCTGACCTACTGTGGCAATGTTCTCAGCCTGGTCATCAGGAATCTGGATATCGAATTCTTTTTCGAATTCCATGATCAATTCCACAGTGTCCAATGAATCAGCACCCAGATCGTTTGTGAAGCTTGCTTCGTTTACAACCTCGTTCTCGTCAACACCTAACTTGTCAACGATAATCGCTTTTACTCTTGATGCAATGTCTGACATAATACTTTTATTTTAATTTTGATTAGGTGGCAAAAATAAAAAACTTTATTTTAAAACCGATTTTTACTTTAAAAATGTGATCGTAATTTACATAAATTTAGTTGAAAGGACTTAATTTTACATTCTAATAATTGTTAACAAGCTTATTTTGAGCAATCCAACCCATACCCTACAAAAAAAAATAGTTGTCTTTGCTTCCGGCTCGGGAACCAACGCCGAAAATATCATTAAATTTTTTCAGAAACAGCCCAATGCCAGTGTGGTAGCGGTTTTCTCGAACAAAAGATCGGCTAAAGTGCTAAAAAGAGCACACGATCTCAATGTTAAAGCGCTTCATTTTGACCGGGATGCACTCTATAATAGTTACGATGTTCTGCATATTTTAGAAGATATAAATCCAGATTTAATTGTTTTAGCAGGATTTATGTGGATTTTCCCCGAAGACATTTTAAAACGTTTTCCTAATAAGATTGTAAACATACATCCGGCACTACTTCCAAAATATGGCGGTAAAGGAATGTATGGAATGCATGTGCACGAAGCTATAATTCAAAATAAGGAAAAAGAAAGCGGGATTAGCATTCATTATGTAAATGAAAATTATGATGAAGGCGAAATAATCTTTCAGGCGAAAACAGATATTTCAGAAGAAGACACTCCCGAAAGTCTTGCAGAAAAAATTCATAAGCTGGAGTACAAACATTTTCCAGAAATCCTTCAGCAATTACTTCAAAAGAAATCACAATAGTGCAAACAACCCAGGTACACATTTATACCGATGGCGCCGCGAGAGGAAACCCCGGCCCCGGCGGTTACGGCATTGTAATGGAATGGGTAGGAAAAGCCTACCGCAAAGAATTTTCAAAAGGTTTTAAACACACCACTAATAACAGGATGGAATTGCTGGCAGTAATTGAAGCTTTAAAAAAGCTGAAAAAGCCCGGAGTTTCTGCTATAGTTTTTACCGATTCAAAATATGTTGCAGATGCGGTTAATAAAAAATGGGTGTTTGGCTGGGAAAAGAAAAATTTTAAAGATCGAAAGAATGGGGATCTCTGGATAGAATTTCTAAAAGAAATACGCAAACATAATGTAAGCTTTAGGTGGATAAAGGGACATAATGAGCATCCGCAAAACGAACGCTGCGACGCTTTGGCGGTAGCCGCCTCAAAAGAAAAAAGACTTCTAATTGATGAAGGTTTTCAACAAAATTGAACGGAATTAATCTTTAAGTAGTGTATTCGAGATGAACCATAAAGGCATTATTACTATTATATCCTGGTTTCGAGACAAAACGTACAATATTTAAATCTCGATTATCGAGTAATTTTGATTGAGCCCTTGAAAAACAAACTGTATATTTGCAGCACAATTTTTAAACCATTTTATGAGTAAATTACTGATTGTAGGCACTGTAGCCTTTGATGCTATTGAAACCCCTTTTGGGAAAACCGATAAAATTCTTGGAGGTGCAGGCACCTATATTGGGCTTTCAGCTTCGCAGTTTAATGTAGACAGCGCCGTGGTATCTATTGTTGGAGACGATTTTCCACAAAAATACCTGGACCTGCTTACCAGAAACAATATAAATATAGATGGAATTGAAGTGGTTTCCGGCGGAAAAACCTTCTTTTGGAGCGGCCGTTACCATAACGATTTAAATTCCAGAGATACCTTAGACACCCAATTAAACGTACTGGCCGATTTTAATCCGGTAGTACCAAATGCTTATAAAGATGCTGAAATTGTGATGTTGGGCAACCTGCATCCTTTGGTGCAACTTAGCGTTTTAGAACAAATTGAATCTCCAAAACTCGCCATTTTAGATACTATGAACTTCTGGATGGATAACGCCCTGGAAGATTTAATGAAAGTAATTGCCAAAGTAGATGTGATCACCATTAACGATGAAGAGGCAAGGCAACTTTCTGGCGAATATTCTTTAGCCAAAGCTGCTAAAAAGATTGCTACAATGGGCCCAAAATATGTAGTGATTAAAAAAGGAGAACACGGCGCTTTATTATTTCACGAAGAGCAGGTGTTCTTTGCGCCCGCCCTTCCATTAGAAGAAGTTTTTGATCCAACCGGTGCCGGCGATACTTTTGCAGGTGGTTTTGCAGGTTATCTTGCAAAAACCGGAGATATTAGCTTTGAAAATATGAAAAACGCCATTATATACGGCTCTAATCTCGCATCTTTTTGCGTAGAAAAATTTGGAACCGAGAGGATGGAGGAACTTTCAGGCGAGGAAGTAAATTCGCGCCTCGCAGAGTTTAAGAAATTAACTCAATTTGAAATAGCATTAACCTAAACTTATGCCCTGAATTTTCAGGGCATTTTTTATATAAAGCAGGAATAAAATCTGCCACGAATTATGAGTGACGCCTTAAAACACGAATGTGGAATTGCCCAAATACGATTGTTAAAACCACTGGAGTACTATAAAGAAAAATATGGTACTGCCTTTTATGGGATTAACAAAATGTATTTAATGATGGAAAAACAGCATAACCGCGGCCAGGACGGTGCCGGTTTTGCCAACATTAAATTAAATACTGCTCCCGGAGATCGCTATATAAGCCGAATTAGATCTAATGCGGCACAACCCATCCAGGATATTTTTGAGCAGATAAATGGTAGAATTAACGACGAAATTAAAGCAAACCCTGAGTATTCTGAAGATGTTGCGCTGCAAAAGAAAAACCTTCCATATGTGGGAGAAGTTTATCTTGGACACGTGCGCTACGGTACTTTTGGAAAAAATAGTATAGAAAGTGTACACCCATTTCTTAGGCAAAACAACTGGATGCACCGTAATCTTATTGTGGCCGGGAATTTTAATATGACCAACGTAAACCAGCTTTTTAATAACCTGGTAGAGCTTGGGCAGCATCCCAAAGAAAAAGCCGATACCGTTACGGTAATGGAAAAAATTGGACACTTTTTAGATTCTGAAGTTCAAAAACTTTATAAAAAATTAAAAAAACAAGGCTATTCTAAAGTTTCAGCTTCTCCTATTATTGCCGAAAAATTAAACGTTGCTAAAATACTAAGAAAATCGTCTAAAAACTGGGATGGTGGTTACGCTATGGCCGGTTTACTTGGCCACGGTGATTCTTTTGTTTTACGTGACCCTGCAGGAATTCGTCCCGCATATTATTATAAAGATGACGAAGTGGTAGTTGTTGCTTCAGAAAGACCGGTGATTCAAACCGCTTTCAACGTAGATTTTAATGATGTACATGAGCTTCCGCCGGGACACGCCATTATCACTAAAAAAAGTGGAGAAGTAAATATCACCCAAATTCTGGAGCCTCTGGAACGAAAAGCCTGTTCTTTTGAACGTATTTATTTTTCCCGCGGAAGCGATGCCGAAATCTATAAAGAACGTAAAATGCTTGGGCGTTTATTAATGCCCGAAGTATTAAAATCCATAGATCACGATACCATAAATACGGTTTTCTCTTTTATTCCAAATACTGCTGAAACCAGTTTCTACGGAATGGTTGAAGCGGCACAGGATGAATTGAATAAACAGAAAAACGATGCAATTCTAGCTGAAAAAGATACTTTAACTGATGCCAGACTTCAGGAAATTTTAGCACACCGTTTACGCACCGAAAAAATTGCGATCAAAGATGTAAAGCTTAGAACCTTTATTACCGAAGACAGCAGCCGTGATGATCTCGTAGCCCACGTTTATGATGTAACCTACGGCGTGGTTAAACCAGAAGACAGCCTGGTAATCATAGACGATAGTATTGTAAGGGGAACAACTTTAAAGAAGAGCATCATTAAAATGATGGACAGGTTAAACCCCCGGCAAATTGTAGTAGTTTCTTCGGCGCCACAAATTCGTTATCCAGATTGTTACGGTATAGATATGGCGCGACTGGAAGGTCTTGTTGCTTTTAGGGCAGCCCTAGAGCTTTTAAAAGATAATAACCAATACGATATAGTGGAAAAGGTTTACGAAAAGTGTAAACTCCAGGTAGATCTTGCCGATGAAGAAGTGAAGAATTTCGTTAAGGAAATCTACGAACCTTTTACCGATGAGCAAATTTCAGATAAAATCTCAGAGCTACTTTGTGATACAGATGTAAAGGCAGAGGTAAAAGTGATTTACCAAACAGTAGACAATTTACATAAAGCCTGCCCTAAAAACCTGGGTGACTGGTATTTCACGGGGAACTATCCAACTTTTGGTGGTAACCGGGTAGTGAATAGAGCTTTTATTAATTTTTACGAAGGAAACGAAGGGAGAGCCTACTAAGTGCAGTTTAACAAGTTTTTCTGCCTTTCGTCTAAAATGATTTTTTACAGGAATAAGAATCTATACATTAGCAGAACCATAAACATAAGTAGGTTAAGTTCATGGTAGATTTGGGGCAAAAAAAGGTGGATATAAAAATCCGCCTTTTTTTATTTTTACCCAAATTTAAAACGCTTCAGAAAATAAAACTTCCCACAACTAACTTACACAAAAACCCAAATTTTCTTACATTAAATATTGAATTTCAATACTTTAACAGATATTTACGCCTTTAATCTAAAAAATTTGCACGCAACATTTATTCAGTATACTTTAGACTCACCATAACATAAGTAGGTTAAGTTCATGGTAGATTTGGGGCAAAGAAAGGTGGATTTAAAAAATCCGCCTTTTTTTATTTAACATTCTGGCAATCAAGTAGGGTGAAGATAATAAATATTTGAGCATTTATTATCTTCATCCCTCTTCCAGAACCGTGCATACGGGTCTCGTACACGGCTCATGTTAAATCTTATTCAGTACTGTTTGATAGTACTGATGCAAAGTATTCCCTTCAACTGTGTCCATTGCGTACAACCCTAATTCTGAGAAGTACTTATTGGGCAGGGCATAGTGTATTAAATTGGTGGAGGAGTTTCTCCATCGGGTTACCGATATCTTAAGAAAATTCCCCTTATAGCCCATACGCCTTAGTTGTCGGTGAAGAGGTTTCCAGCTTTTCCAGCTTTTCATCACCATCATTCGTAACCTTCTCCTGATCCAGCTTAAAAGATCCTGGAACAGCTTTTTGGTCAAGCCTATTCGGAAGTAATTGGCAAAACCCCTTAATAGCGGGTTCAGTTCTTTAATATAGAAAGCTATACTTTGCCCTTTAGTTCGAGGGGTTAGTAATTTTACTTTCTTTTTGAACCTCTTGATGCTTTTGTGGGATACCACTACTCCATAGGGCTTTATCACCACACCTAAATAGTGGATGCCTTCTTCAAGGTTTGTCAGACTGCTCTTGTTTTTATTCACTTCTAACCGAAGCTCTTTTTCCAGATAACTCGTGGCTTTAGCCATGTATTTTCCAGCTTGAGCTTTGGTTGGTGCAAACAACAGCACGTCATCAGCAAACCTCACCATTCGTATGCCTGAATTTTTCATATGCTGGTCGAATGCGTCCAGATAGATATTCATCAGAAGCGGTGAGATAATTCCCCCTTGTGGGCTCCCCTTCTTTGTAGGTGTGAAGCGCGCTCCATCAAGTGCGCCGGATTCTAAAAAGCTCCCTATCAGTTTAAGTATCTTTCCATCGCTTACCCGTTTGCCCACGCTTTGCACTATCAGCCGATGGTCTAGAGTATCAAAACATTTGGATAAATCCATGTCTGCTACATGATCCAGACCATAGTACCGACTAAAGCGCTCTGCTTTGGCAATGGCATGATGAGCACTTCGTTTAGGACGATACCCATAACTGGAGGGATGGAATTCGGGATCGAAGATAGGTTGCAACACATTAAGCAGCGATTGTTGTACAATGCGGTCTTTGATGGTTGGGATACCCAATCCTCTCTTGCTCCCGTCTGGTTTATCGATATAGACCCGCCTTACCGGCTGTGGCCTATATCTCCCCTCTTTCAGTTCCCTGGAGAGTTGGCACAAATTCTCCTCTAAAGCTGAACTAAAATCAGCTATACTTTGGTTATCCACTCCCTTGGCTCTGGAACCTTTGTTTTTCCTTACCTCACGGTAGGCTTGTTCCAGCCTCGGTAATGCATATACCTTGTCTATAAGACTGTACCATTTTCGCATAATGAAACTTTCTCTTCTTTGCAGTACGGTTTATTTCTTTAGGCAGAATTAGACAGATTGTTTGTTCATAAGGTATACTGTTGTCTTTAGCACTGTGGCAATCTATAACAGTAAAAGAAAATCTTACTACTCAATACTCGCGCGGATTAACAGCCAGAGTTAGCTCGTCACTCCTCTTTGCTGCAATTCCTCAGAATGTTTCAATTCCGATTGTCTTCGCTTATGGCTAATTCCTTTAAAGAACTTCCTGTACTTAATTTAACTTCGTCCCTTCGCATCCGCCACAGTTAATCTGTGACAGTCATTGCAACCGATTATGCGATTCTTGTGCAATGTCATTTGGGTTTTCTCCTCCACACTGTCACCAGTGCTTCTCAGGCCTAAATTTTCTCACTACTACGGACTCATCTGCCACCTGATTTTCCATAACAAATCCTTGTCTCTCGACTTGTTTCTGCTTAGCCTGGAAAGGCGAATAATCAGGCTTCCCCCGTTAAGCAAACATTCCTGTTAGTGAAGCCATCCGTTTTAACATATATTGCTATTCGGATTTTGGGCATCGGCACTTTTTGCAACCTTACCCCCAATATATGCCAGAATCGGTTCGATTTCTCTATGTTCCACTAACTTGCTAGGTCTTCCTTCACACCCCACCGTTGCCAGTGACGCACTTGACTTTACATTGCTCTTCCCTCCGATCAGGTGAGCGGGCTTTCTTTCAAGTCCCGGAATTGTTTGCATGCAGGGCAAACAAAAAAAGACCGCCAAACAGCGGTCTTTTTAATATATATGAAAAATAACTTAGTTATTATTTCTGCTTTGCATATCTGCTTCCCACTTCTTTCCAGTCTATTACATTAAAAAATGCATCAATATAGTCTGGACGACGGTTTTGATAGTTTAGGTAATAAGCATGTTCCCAAACATCAAGACCTAAAATAGGAGTTCCGCCACAGCCAATTCCTGGCATTAATGGATTGTCCTGATTTGCAGTAGAGCAAATTTCTACTTTTCCGCCTTCGTGAACACAAAGCCAGGCCCATCCAGAACCAAACTGTCCTGCAGCTGCCTTGGCAAATTCGTCTTTAAAAGCTTCAAAAGAACCATATGCAGCATCTATTGCTTTTGCAAGTTCACCTTCTGGCTTTCCACCACCATCTGGAGACATTACTTCCCAAAACAGGTTATGGTTATAAAATCCGCCTCCGTTATTTCTTACAGCGGTATTTTCTTTATCAAGATTTTCAAGAATATTCTCTATAGTTTTTCCTTCAAGATCGGTGCCTTCTATTGCAGCGTTTAATTTCTTAGTGTAACCTGCGTGGTGTTTTCCATGGTGAATTTCCATGGTCTTCGCATCTATATGTGGTTCTAATGCATCAAATGCATATTTTAACTTTGGTAACTCAAAAGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012872|865421:873145|867045_867969_+|WP_075325315.1|DBSCAN-SWA MSKLLIVGTVAFDAIETPFGKTDKILGGAGTYIGLSASQFNVDSAVVSIVGDDFPQKYLDLLTRNNINIDGIEVVSGGKTFFWSGRYHNDLNSRDTLDTQLNVLADFNPVVPNAYKDAEIVMLGNLHPLVQLSVLEQIESPKLAILDTMNFWMDNALEDLMKVIAKVDVITINDEEARQLSGEYSLAKAAKKIATMGPKYVVIKKGEHGALLFHEEQVFFAPALPLEEVFDPTGAGDTFAGGFAGYLAKTGDISFENMKNAIIYGSNLASFCVEKFGTERMEELSGEEVNSRLAEFKKLTQFEIALT >NZ_CP012872|865421:873145|872536_873145_-|WP_075325317.1|DBSCAN-SWA MAFELPKLKYAFDALEPHIDAKTMEIHHGKHHAGYTKKLNAAIEGTDLEGKTIENILENLDKENTAVRNNGGGFYNHNLFWEVMSPDGGGKPEGELAKAIDAAYGSFEAFKDEFAKAAAGQFGSGWAWLCVHEGGKVEICSTANQDNPLMPGIGCGGTPILGLDVWEHAYYLNYQNRRPDYIDAFFNVIDWKEVGSRYAKQK >NZ_CP012872|865421:873145|866405_866873_+|WP_075325314.1|DBSCAN-SWA MQTTQVHIYTDGAARGNPGPGGYGIVMEWVGKAYRKEFSKGFKHTTNNRMELLAVIEALKKLKKPGVSAIVFTDSKYVADAVNKKWVFGWEKKNFKDRKNGDLWIEFLKEIRKHNVSFRWIKGHNEHPQNERCDALAVAASKEKRLLIDEGFQQN >NZ_CP012872|865421:873145|865421_865658_-|WP_013069791.1|DBSCAN-SWA MSDIASRVKAIIVDKLGVDENEVVNEASFTNDLGADSLDTVELIMEFEKEFDIQIPDDQAENIATVGQAISYIEDAKK >NZ_CP012872|865421:873145|868032_869931_+|WP_075325316.1|DBSCAN-SWA MSDALKHECGIAQIRLLKPLEYYKEKYGTAFYGINKMYLMMEKQHNRGQDGAGFANIKLNTAPGDRYISRIRSNAAQPIQDIFEQINGRINDEIKANPEYSEDVALQKKNLPYVGEVYLGHVRYGTFGKNSIESVHPFLRQNNWMHRNLIVAGNFNMTNVNQLFNNLVELGQHPKEKADTVTVMEKIGHFLDSEVQKLYKKLKKQGYSKVSASPIIAEKLNVAKILRKSSKNWDGGYAMAGLLGHGDSFVLRDPAGIRPAYYYKDDEVVVVASERPVIQTAFNVDFNDVHELPPGHAIITKKSGEVNITQILEPLERKACSFERIYFSRGSDAEIYKERKMLGRLLMPEVLKSIDHDTINTVFSFIPNTAETSFYGMVEAAQDELNKQKNDAILAEKDTLTDARLQEILAHRLRTEKIAIKDVKLRTFITEDSSRDDLVAHVYDVTYGVVKPEDSLVIIDDSIVRGTTLKKSIIKMMDRLNPRQIVVVSSAPQIRYPDCYGIDMARLEGLVAFRAALELLKDNNQYDIVEKVYEKCKLQVDLADEEVKNFVKEIYEPFTDEQISDKISELLCDTDVKAEVKVIYQTVDNLHKACPKNLGDWYFTGNYPTFGGNRVVNRAFINFYEGNEGRAY >NZ_CP012872|865421:873145|870435_871728_-|WP_075325137.1|DBSCAN-SWA MRKWYSLIDKVYALPRLEQAYREVRKNKGSRAKGVDNQSIADFSSALEENLCQLSRELKEGRYRPQPVRRVYIDKPDGSKRGLGIPTIKDRIVQQSLLNVLQPIFDPEFHPSSYGYRPKRSAHHAIAKAERFSRYYGLDHVADMDLSKCFDTLDHRLIVQSVGKRVSDGKILKLIGSFLESGALDGARFTPTKKGSPQGGIISPLLMNIYLDAFDQHMKNSGIRMVRFADDVLLFAPTKAQAGKYMAKATSYLEKELRLEVNKNKSSLTNLEEGIHYLGVVIKPYGVVVSHKSIKRFKKKVKLLTPRTKGQSIAFYIKELNPLLRGFANYFRIGLTKKLFQDLLSWIRRRLRMMVMKSWKSWKPLHRQLRRMGYKGNFLKISVTRWRNSSTNLIHYALPNKYFSELGLYAMDTVEGNTLHQYYQTVLNKI >NZ_CP012872|865421:873145|865806_866406_+|WP_075325313.1|DBSCAN-SWA MSNPTHTLQKKIVVFASGSGTNAENIIKFFQKQPNASVVAVFSNKRSAKVLKRAHDLNVKALHFDRDALYNSYDVLHILEDINPDLIVLAGFMWIFPEDILKRFPNKIVNIHPALLPKYGGKGMYGMHVHEAIIQNKEKESGISIHYVNENYDEGEIIFQAKTDISEEDTPESLAEKIHKLEYKHFPEILQQLLQKKSQ |
7 | Ralstonia_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
3437244 : 3475031
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012872|3437244:3475031|DBSCAN-SWA AATGAAAAATAATTACTTGCTTAATGTAGTTGGGCCTACCGCTATCGGTAAAACTTCCCTGGCCATCAATCTCGCTAAAAAGTTTAATACTGAAATAATTTCAGCAGATTCCCGGCAGTTTTATAAGGAAATGCGAATTGGCACCGCCGTCCCTTCAACCGAAGAACTGGAGGCTGCTAAACATCATTTTATTCAACATATTTCTATTGAAGATGCTTATAATGTGGGCGATTTTGAAGCTGAGGCGATTCAGAAATTAGAAGAAATTTTCCAGGATCACGATATTGTGATAATGGTAGGCGGCAGTGGTTTATACACCAAAAGCGTTCTGCAAGGCCTGGATTATTTTCCCGAAGTTCCTGCAGAAATTAGGGAAAATTTGAACTTAAAGTATGAAGAAAATGGATTGGTTCCTTTGCAAAAGGAACTTCAAAAATACGACCCTGAATATTATTATGTAGCCGATGTTGAAAATCCGCAGCGAGTTATAAGAGCGCTTGAAGTTTGCATAACTTCAGGCAAACCATATTCCTCTTATTTAAATCAGCCTAAAAAACAGCGTGATTTTATCCCGATAAGTATAGGTCTTACTGCCGATCGTGAAATAATCTATGAACGTATAAACCGGCGTGTAGATTTGATGATGAATGAAGGATTACTGGAAGAAGTAGAAAAACTTTTTGCTCACAAACATTTAAATGCTTTGAACACCGTAGGCTATAAAGAACTTTTCAGTTATTTAGAAGGAAAAATTCCCCTTGAAACAGCAGTTTCAGAAAATAAGAAAAACACCCGAAGATTCGCAAAAAGGCAGCTTACCTGGTTTAGAAAAGACCCCGATATTCAATGGTTTGATTTTAAAACCCCTTCGGAAGAAGTTCAGGAATTTATTGAGGGAAAAATCACTGAATTTGAAAAGTGATAGATAAAAAAGCTCCCCTCCTTTTCAAGGAGGGGAATGAATTCAGCGCAACTGAAGAAAGGGGTGGTTAAGCCCCAATCTTAAATCTCAATTTTTGCCCCGAGTAATTTTACAAATTCTCTAATAAATGCGGCGTGACCCGGCCAGGCTGGTGATGTTACCAGGTTGCCATCTACCACTGCTTCAGTAGGCTCAACTTCTTTATAATTCCCTCCTACCAGTTCTATTTCTGGACCAATTGTGGGGTATGCGGTAAGTGTTCTTCCTTTTAAAACTTTTGCTACAGTAAGAATTTGGATAGCGTGGCAAATAGAAGCCACCGGTTTATCTTTTTCAAAGAAATGCTTAGTGATTTCAATTACTTTTTTATTCAGCCTAAGATATTCTGGTGCCCGGCCGCCGGCCATTACAAATCCGTCATAATCGTCTGCAAATACCTCATCAAAAGAATAGTTGAGTTCAAATAAATGACCTGGTTTTTCAGTATATGTTTGGTCTCCTTCAAAATCGTGAATTGCAGTTTTTATCTTGTCGCCTTTCTTTTTTCCCGGGCATACCGTATGCACGGTGTAGCCTAACATTTCCAACATCTGGAAAGGAACCATAGTTTCATAATCTTCAGCGAAATCACCGGTTAAAAAAAGTATTTTTTTCATAATTAATCAGGTTTTGATTTGACTTTTAAGTTAAGAAAATTCATACTAAGCACTGGTAATCAGTTTTTAAAAAATAGTTAAATATAATTTTTGACTGCAAATTTTAAAAAAGCTTGAGTAACTTTTAGGCTCAGCCAAAAAACATAATTATGCAAGATCGCAGGACATTTATTAAAAAATCAGGGCTATTTGTGGCCGCTACTACACTTCCAATTCCCAATTTTCTACTTCATAAAAATAAAGAAAAATTAGGCGTAGCCTTGTTAGGACTTGGAAACTACAGTACCGGGCAACTTGCACCGGCGCTTCAGGAAACTGATTATTGCGAATTACGAGGTATTGTAACCGGAAGTCCTGAGAAAATACCGGTATGGCAAAAAAAATACGGGATTAAAGATCAAAACGTGTATAATTATGAAAATATGGATGAGATTGCCAATAACGATGATATAGATGTAATCTATATTGTGGTACCCACGGGGCTTCACGCAAAATATGCAATTAAGGCCGCTAATGCAGGGAAACACGTTTGGTGTGAAAAGCCTATGGCAAAAACCTCGGAAGAATGCCGACAAATAATTGAGGCCTGTAACAAAAATGGGGTAAAACTTTCTATTGGTTATAGAATGCAGCACGAGAAAAATACGCAAACCTTAATGAAATGGGCTGAAACCAAACCTTTTGGTAAGATGAAAAACCTAAAAGCCGAAGCCGGTTATTATGGAGACCCTATGAATCCTTGGAAACTGGAAAAAGAAATGGGTGGCGGTGCTATGTATGATATGGGCGTTTACCCGTTAAACGCAGCCCGCTATACCACCGGCTTAGAACCAATTTCGGTTAGCGCAAAGCATATTATTAACAGACCAGAGATTTTTGATGAAGTTGATGAAACTACGGTTTTTGATCTTGAATTTCCTAACGGAATTACTGCCAATTGCAGAACCAGTTTTGGAGAAAGTATGAATAATCTTGAAGTAGATTGCAAAGATGGCTGGTATTATTTAAGACCTTTCCAATCATACTCCGGAGTGAAAGGAAAAGCCAGCGATGGGACTGTTTTAGCTCCATTCGGGAAAAATCAGCAAGCTGTACAAATGGATGATGATGCCCTGGCAATTATCAATGATAAAAAAGTAATGGTTCCCGGGGAAGATGGATTGAAGGATATTATAATTCTGGAAAAAATATATGAATCTTCCAGTAAAAACGGGGAACGTTTAAGCCTATAATCAGGTTTTGGAAAAGGGAATTTTTATTAGGGTTTCTACTCCAGCTTCTTTATTGCGTATTTTAAAACTGGCTCTTTTTCCGTAAAGCGTAAGTAAACGATCCCTGGTATTAGAAATCCCCACTCCTTTTTCTAATAAAGCTTCTTGTTTTTCGGTAAGTGTTTTTCCATTATTGTAGACGCTAAGCACCAGGTAACCTCTGGATTTAAAAATATTGATCACAATTTTTAGATGTATATTATGGTAAGAATAACCGTGTTTAACCGAATTTTCTATAATGGGTTGTAATAGCAACGAGGGCACTAAATGATCTAACAGGCTCTCGTCTATATTCTTCTCGATTATCAAATGATCTGAAAACCTAAGAGTGAGAATATTTAAATAATAGTCCAGCATTCGTAATTCCTTTCTCAATGTAACCTTATAATTCTCACTACTGTACAAAATTTCCCGAAGCAGGTCGCTTAGATCTGCAATGGTATCCTGGGCTTTTTTAGCATCTATTTCTACTAAAACCGAAATAGAGTTTAAGGTATTGAATAAAAAATGCGGCTGTAGCTGAGAAGATAACATCTTCATACGCGTATTGGTAAGTTGGGATTCCAGTAGTGTCTTTTGCTTCTCGGTCTCTTTTACCTGTTTTAAATAATAATAGGTGTAGATGATAAAAATCATCGCAAAGTAGATGAGAAAATTAAGATCTATTACGAATATCATTCGGTCTATACTGGCCTTTAAACTATAATCGGCAAAAGTCATGAGACCGAGTAAAATTCCATAAAGATCAAAGAAAAAACGAATTACAAACCCTATTAATATTGAAAATAAGGTATGCAGTAAAAAAATTTTTATCCACGAATAATTTTTATTTAAAAGGCGCTTAGTACTTATCGCAATCAGGCTCATATAAACCACTACAATAATCCAGTCTATAAGCAAGTTATGGAAAATAATGTCGTGCCAGGATTCTACGGTTTCCCGGGAAATGAAGGCTCGCATATATGCCAGTTTGCCTAAATATACCAGGTTGAATAACGTGTAGAAGGCCGCCAAAAGCAAAATAAGCTTTACGTCTATATATTTATTTTTTAAGGCTGAAAAGCTCATCTTGAGGTTCTTTAAATTCCGAGTTTATCAAATAATTCCTTTTTATTGGATTTGCTGATGCGTAATAATTTTTTGTCTCTCATTTTTACATCTACTTCAGAGAAATCTGAATGCACAATTTCTTTAATATGATTCAGATTAATAATGGCCGATCTATGAATTCTAAAAAAGGCGTGGTCTTTGAAAAATTCTTCCAGGTTATTTAGAGATTCCCTGAGTAAATACTTGCTATTTTCAGTATAAATTTCAGCATAATAGCCAGAAGCACAGATATAACTAATCTCGTTGGGTGTTAATAAAACGGTTTTATTACCCTGCCTAACCGGAAGTTTTAAGGGAATTTTGGAAGTTTTCCTGTCTTTGCTATAAACTTCAAATAAAGTTTGCAGGCGTTTTTCAAAATTTTCCTGAACTTCATTATTTGAGATATTAAGTACTTTTTTTATAGTTTTAAAAAACCGCTCGTCGCGAAAGGGTTTCAGAAGAAAATCGAACGCATCTACATCAAAAGCTTTTGTGGCATAATTATCATAAGCAGTTACAAATACAACTATCGGTTTTGGGTTCACATGAAGCTTCTGCAGCACTTCAAATCCACTCATATCTTTCATACTAATATCAAGAAAAACAAGTCCCGGCTTAAGCTTATTAATTTGAGTAATCGCCGATTTCCCATTGGAGCATTCTCCCAAAACTTCAATTTCCTTTACTTCAGCAAGCAGGTTAAGCACTCTTCTTCTTGCCAGTTCTTCGTCATCTACAACAAGTGCTTTCATAATTTTACATTTGAGATACACCCATGTAATTTAAAACTATTTTTTCTTGTTGAATATTTTTTTTTGAATCTAAGTAATTGATATCAAATAATTTAGTGAATGAATCAGCCTAATTCTGCTACCAGGGATATATTTTATGCTGTGAATAGGCTCCTATTTGATATAAAGCATAAAAAAGCCTGTAAAGTTTTTTAAAAGCTTCATTTAGATTGAAGTTATACTTTACAGGCATTAGTTAAAGTTCTGGAGAGATTACATACCGGCCACACGCTCTTCATTTATATTTTTAGGATCAATTTTAATAATC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38 | Enterobacteria_phage(33.33%) | integrase,transposase,tRNA | attL 3464169:3464184|attR 3483634:3483649 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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