CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP013770	Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p2PS3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP013769	Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence	1 crisprs	RT	0	3	2	7
NZ_CP013772	Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p4PS3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP013768	Piscirickettsia salmonis strain PM23019A, complete genome	3 crisprs	DinG,DEDDh,cas3,RT,csa3	1	2	28	14
NZ_CP013771	Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p3PS3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0

1. NZ_CP013768

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP013768_1

• CRISPR_ID: NZ_CP013768_1
• CRISPR_location: 412002-412108
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP013768_1

Consensus_repeat	Method
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP013768_1

>1.1|412040|31|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder
CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013768_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP013768_1

>merge|NZ_CP013768|1|412002-412108|CRISPRCasFinder
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGACCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAAGCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA

>NZ_CP013768|1|1|412002-412108|CRISPRCasFinder
GCGCTTGATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA	CCTAGGATTAAGTCAGAATCGTATTGAAAAA
GCGCTTAATAATCTCCCTTTGTTTATTAAAATGCAAGA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP013768.1|WP_129556527.1|417862_418123_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013768.1|WP_051307365.1|409670_409931_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013768.1|WP_016210795.1|421158_422130_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270361
NZ_CP013768.1|WP_054300338.1|414101_415667_-|APC-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP013768.1|WP_016210752.1|399853_400651_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|368573
NZ_CP013768.1|WP_036779544.1|413069_414077_+|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|366234
NZ_CP013768.1|WP_016211834.1|409098_409413_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013768.1|WP_016210801.1|422111_423083_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270361
NZ_CP013768.1|WP_054300334.1|409950_410439_+|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270916
NZ_CP013768.1|WP_016210748.1|401580_403536_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|183236
NZ_CP013768.1|WP_016212185.1|404735_405725_+|rhodanese-related-sulfurtransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|223982
NZ_CP013768.1|WP_129556641.1|396214_397477_+|cation:dicarboxylase-symporter-family-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|224736
NZ_CP013768.1|WP_016210751.1|397564_399370_-|DEAD/DEAH-box-helicase	unknown	unknown	gnl|CDD|236941
NZ_CP013768.1|WP_052104738.1|420246_421053_+|methyltransferase-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226472
NZ_CP013768.1|WP_075273540.1|417066_417678_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013768.1|WP_016210800.1|415872_416700_-|DsbA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239321
NZ_CP013768.1|WP_016210749.1|400820_401282_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013768.1|WP_016212182.1|404216_404402_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013768.1|WP_016210799.1|418296_419250_+|chemotaxis-protein-CheV	unknown	unknown	gnl|CDD|223905
NZ_CP013768.1|WP_098082828.1|412812_413070_+|transposase	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP013768.1|WP_036779544.1|413069_414077_+|IS3-family-transposase	gnl|CDD|366234	pfam00665, rve, Integrase core domain. Integrase mediates integration of a DNA copy of the viral genome into the host chromosome. Integrase is composed of three domains. The amino-terminal domain is a zinc binding domain pfam02022. This domain is the central catalytic domain. The carboxyl terminal domain that is a non-specific DNA binding domain pfam00552. The catalytic domain acts as an endonuclease when two nucleotides are removed from the 3' ends of the blunt-ended viral DNA made by reverse transcription. This domain also catalyzes the DNA strand transfer reaction of the 3' ends of the viral DNA to the 5' ends of the integration site.	8.8404e-24
NZ_CP013768.1|WP_054300338.1|414101_415667_-|APC-family-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	2.08501e-34
NZ_CP013768.1|WP_016210752.1|399853_400651_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|368573	pfam05708, Peptidase_C92, Permuted papain-like amidase enzyme, YaeF/YiiX, C92 family. Amidase_YiiX is a family of permuted papain-like amidases. It has amidase specificity for the amide bond between a lipid and an amino acid (or peptide). From the structure, a tetramer, each monomer is made up of a layered alpha-beta fold with a central, 6-stranded, antiparallel beta-sheet that is protected by helices on either side. The catalytic Cys154 in UniProtKB:Q74NK7, Structure 3kw0, is located on the N-terminus of helix alphaF. The two additional helices located above Cys154 contribute to the formation of the active site, where the lysine ligand is bound.	2.13986e-06
NZ_CP013768.1|WP_016210801.1|422111_423083_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|270361	cd13643, PBP2_BCP_2, Substrate-binding domain of osmoregulatory ABC-type glycine betaine/choline/L-proline transport system-like; the type 2 periplasmic-binding protein fold. This subfamily is part of a high affinity multicomponent binding-protein-dependent transport system specific to certain quaternary ammonium compounds for osmoregulation. The periplasmic substrate-binding domain, which is often fused to the permease component of the ATP-binding cassette transporter complex, is involved in uptake of osmoprotectants (also termed compatible solutes) such as glycine betaine, proline betaine, choline, and carnitine. Many microorganisms accumulate these compatible solutes in response to high osmolarity to offset the loss of cell water. This domain belongs to the type 2 periplasmic binding fold protein superfamily (PBP2). The PBP2 proteins are typically comprised of two globular subdomains connected by a flexible hinge and bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap.	7.8235e-122
NZ_CP013768.1|WP_054300334.1|409950_410439_+|protein-kinase	gnl|CDD|270916	cd14014, STKc_PknB_like, Catalytic domain of bacterial Serine/Threonine kinases, PknB and similar proteins. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. This subfamily includes many bacterial eukaryotic-type STKs including Staphylococcus aureus PknB (also called PrkC or Stk1), Bacillus subtilis PrkC, and Mycobacterium tuberculosis Pkn proteins (PknB, PknD, PknE, PknF, PknL, and PknH), among others. S. aureus PknB is the only eukaryotic-type STK present in this species, although many microorganisms encode for several such proteins. It is important for the survival and pathogenesis of S. aureus as it is involved in the regulation of purine and pyrimidine biosynthesis, cell wall metabolism, autolysis, virulence, and antibiotic resistance. M. tuberculosis PknB is essential for growth and it acts on diverse substrates including proteins involved in peptidoglycan synthesis, cell division, transcription, stress responses, and metabolic regulation. B. subtilis PrkC is located at the inner membrane of endospores and functions to trigger spore germination. Bacterial STKs in this subfamily show varied domain architectures. The well-characterized members such as S. aureus and M. tuberculosis PknB, and B. subtilis PrkC, contain an N-terminal cytosolic kinase domain, a transmembrane (TM) segment, and mutliple C-terminal extracellular PASTA domains. The PknB subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	6.10209e-13
NZ_CP013768.1|WP_016210748.1|401580_403536_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein	gnl|CDD|183236	PRK11619, PRK11619, lytic murein transglycosylase; Provisional.	1.01987e-91
NZ_CP013768.1|WP_016212185.1|404735_405725_+|rhodanese-related-sulfurtransferase	gnl|CDD|223982	COG1054, COG1054, Predicted sulfurtransferase [General function prediction only].	3.74089e-160
NZ_CP013768.1|WP_129556641.1|396214_397477_+|cation:dicarboxylase-symporter-family-transporter	gnl|CDD|224736	COG1823, COG1823, Predicted Na+/dicarboxylate symporter [General function prediction only].	2.59319e-84
NZ_CP013768.1|WP_016210751.1|397564_399370_-|DEAD/DEAH-box-helicase	gnl|CDD|236941	PRK11634, PRK11634, ATP-dependent RNA helicase DeaD; Provisional.	0
NZ_CP013768.1|WP_052104738.1|420246_421053_+|methyltransferase-domain-containing-protein	gnl|CDD|226472	COG3963, COG3963, Phospholipid N-methyltransferase [Lipid metabolism].	1.28417e-38
NZ_CP013768.1|WP_016210800.1|415872_416700_-|DsbA-family-protein	gnl|CDD|239321	cd03023, DsbA_Com1_like, DsbA family, Com1-like subfamily; composed of proteins similar to Com1, a 27-kDa outer membrane-associated immunoreactive protein originally found in both acute and chronic disease strains of the pathogenic bacteria Coxiella burnetti. It contains a CXXC motif, assumed to be imbedded in a DsbA-like structure. Its homology to DsbA suggests that the protein is a protein disulfide oxidoreductase. The role of such a protein in pathogenesis is unknown.	1.60773e-43
NZ_CP013768.1|WP_016210795.1|421158_422130_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|270361	cd13643, PBP2_BCP_2, Substrate-binding domain of osmoregulatory ABC-type glycine betaine/choline/L-proline transport system-like; the type 2 periplasmic-binding protein fold. This subfamily is part of a high affinity multicomponent binding-protein-dependent transport system specific to certain quaternary ammonium compounds for osmoregulation. The periplasmic substrate-binding domain, which is often fused to the permease component of the ATP-binding cassette transporter complex, is involved in uptake of osmoprotectants (also termed compatible solutes) such as glycine betaine, proline betaine, choline, and carnitine. Many microorganisms accumulate these compatible solutes in response to high osmolarity to offset the loss of cell water. This domain belongs to the type 2 periplasmic binding fold protein superfamily (PBP2). The PBP2 proteins are typically comprised of two globular subdomains connected by a flexible hinge and bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap.	1.06046e-118
NZ_CP013768.1|WP_016210799.1|418296_419250_+|chemotaxis-protein-CheV	gnl|CDD|223905	COG0835, CheW, Chemotaxis signal transduction protein [Cell motility and secretion / Signal transduction mechanisms].	4.08417e-34

Protein sequences

>NZ_CP013768.1|WP_054300334.1|409950_410439_+|protein-kinase
MPFFPGDSFNAALTKDPDSVDEIILAVALELQRIHQSGVIHGDIRSDNIIIEEKNGIFNAKFIDFGWAYEYPSDDNVIVTKCSYFAPERAKIDLKAHPSQDIYSFGWMLGIAHDLVKEIPEKFYGFLIGANEEDPVLRPELRLLIKANLCPTLGECYTQLVK
>NZ_CP013768.1|WP_051307365.1|409670_409931_+|hypothetical-protein
MPILEYQRPRSGSVIERRLESGVVESYQSIRDLGQGGNGSVRLFASKTALERYAVKRPLEVQRHSLDYLKLEERLSKRRSFIFSNF
>NZ_CP013768.1|WP_016211834.1|409098_409413_-|hypothetical-protein
MNQDTELSLSEEKEQKNFESLCDMLYECTIKTINQHTASFNEDELIFKQPIFMHINAAAQVLNAMINDAGDVLAEQHNEVTPELAVNELKKLTHSILFGDDHSH
>NZ_CP013768.1|WP_016212185.1|404735_405725_+|rhodanese-related-sulfurtransferase
MNQVVVAAMYKFARLPDYKDIQPKLLAFCKAQGIKGTLLLAQEGINGTVSGSRQAIDNLLNFLKSDSRLRALEHKESYLDAAEVPFYRMRVKLKKEIVTLGVDGIDPNEIVGHYVKAQNWNALISDPDVIVVDTRNDYEYDIGTFKRAENPNTETFREFPEYVEKNLDPKKHKKVAMFCTGGIRCEKSTAYMLKQGFEEVYHLEGGILKYLEEVPKEESLWEGECFVFDNRVSVNHDLEKGQYDQCHGCRYPITEQEKASSLYIEGVSCPYCYNNLSDEQKARFSERQRQMALAKHRGHQHIGDSIELAKQVKRQKRKAQVEACQTKQK
>NZ_CP013768.1|WP_016212182.1|404216_404402_+|hypothetical-protein
MKSMKKHSKLEAEIAIEPADVIEMTMTELSTRRAEAMEAIESGKFIQIVKHKKPIGMLVPF
>NZ_CP013768.1|WP_016210748.1|401580_403536_-|transglycosylase-SLT-domain-containing-protein
MPYYTFIYLIALMVSLFITQSFYAANYLNHSLDKQRIFFHQAEQHLKKSRLQSFKKELKKLTHYPLYPYLRYQELIRQLQLGFLPNNKIKHFLNQYQNTIFHDRLHRQWMIHLYNKKWWKTLIKYYQPATKSTAMQCRYLWARYQLNYQQQSLHAFKKVWLQGRSLPKVCDRLISALRKHKQLTNSLAWQRITLAMQKRNYQLAGYLARFLSSQDKKALTLWRILRRHPEKMTKTSLIRAAGNKANYIANDTLLQLAKRKPEYAITIWPRLKSKFSLTKQQKIAITKSIALHLALKKSSKTSHWMEKVPDQDQSLTLTSWNIRTALYQQRWQHALTLINTLPPNEYDSHLWQYWKARALEQLGQITQAKKVYKRLAKHRDYYGFLASNKLQQPYQLNRKAVNISKHILSNVSKKPGIRRAYEFKKTGHPGLARSEWVYAINQFTETEKLAAAKLAHDWGWYNLSVLTTTKTKHRDDLKLRFPMAHYRAILRNAKRYEISPAWVFSVARQESIFHEHAYSPVGARGIMQLMPTTARYIAGKIQIRHYTSKLLDANHNIALGTAYLKRLLERYDNRLILALAAYNAGISRVNQWLPERNPIAADLWIETIPYKETRSYIKNILAYTVVYNARLGHTTKMAQQLVNVPTLKQIS
>NZ_CP013768.1|WP_016210749.1|400820_401282_+|hypothetical-protein
MSKIKSLKPFVHEITVDVHFSKKQAMHIRKLGQNLDLRVITPKAMVRLGEQLFTAKLISAIDLMSLLQPGFNQNYGEVAAQMGVQLKQPPALMNAIQFYYESWQKKIRQKGVNSQQRLLARREYHLMLALQKSLGLPVDGKMIQAKKTVIEDL
>NZ_CP013768.1|WP_016210752.1|399853_400651_-|hypothetical-protein
MQLLNRPLVKWLLKEEPPPSTPLCDYERICYEIRPCDVLLVEGRSRLSDVIQVITRSPWSHSALYIGRSQDIENLHIRQFIEDNYDGSPQDQLVIEGYLGQGTVINLLDDYKYSHIRICRPRGLSRKDVQQVIAYAASKVGSAYNVRQIFDLFRLLLPWTILPRSWRSSLFHHNLGDPTRTVCSTMIAEAFNVVDFPILPDLHTSEDGKMALHIRNPRLFTPRDFDYSPYFEIIKYPFISIDDHMPAYKNLPWQKGRPQDLPTEK
>NZ_CP013768.1|WP_016210751.1|397564_399370_-|DEAD/DEAH-box-helicase
MSSTIGFDKLGINDNILNSISELGYETPSPIQEQSIPVLLNQQDILAQAQTGTGKTAAFALPILTQLSLKHNQPQALVLAPTRELAIQIAEAFQRYAKYLPGFHVLPIYGGQEFRSQLRALKRGVHIVVGTPGRIMDHMRRETLPLESLKTVVLDEADEMLKMGFIDDVKWILQQIPTEHQTALFSATLPPSIKGIASQHLVEPVHIQIKSTTNTVSTIEQSYMITSKHHKLEALTRYLELEEFDAVIVFARTKIATTELAERLEARGYSAAAMNGDMNQASREQVIKRIKNGAIDIVIATDVAARGIDVNRITHVVNFDIPHDPESYVHRIGRTGRAGRDGKALLFVSPRERRLLKDLERVTRQPIKAITPPTANEITEKREESFKKQIINTINETTDLDYYRNLIESLLPLSEKSELDIAAALAYMAQKQKPLQMQKEDPKALSFESPHDRGGRHEPSQRERRTRQAIQTAEHGMSRCRLEVGHRHRIQPSDIVGVLANEGNITHKAIGRIHIFDDYSLVDLTSKVTNQVIELTHQCRVKGHPIKIKPATDKDNQEGQSNNHGRRSHSRDRDSGFKRRRSNSSHNGQSQSQSRTRKKIS
>NZ_CP013768.1|WP_129556641.1|396214_397477_+|cation:dicarboxylase-symporter-family-transporter
MKFNGLVLIALITGVGLGALARFSLVSDHFAMADLNSVFHLVGEGYIDLLKMLVIPLVFTSLVSALLSLSDKGAANFRLSAIRFVVMLLVLTGISAGIGMLMGMAFNLGTGLVIPGVDLQPGHHYTGVVDTILGMLPTNPIAAMASGNAAALALFSIFIGAAALVVKKSKIADIKPFEGFIQSTFEISKQLARFVVALTPYGVLALIANVASATGASSLLSVLSYLVAIYVAMALVFALHLVILAAQGISPTYYLKHAYKALLVAFTTRSSFGTLPVTEETLRQKFKIHPDLATFAPTIGSSIGFNACAGVFPAMLVVMAMTIMHEPVTWQIIVMVMFINAIASLGISGIPGTASIAAAVTLSTLGLPYAVIAIVQGVDPIVDMGRTATNVNGVMASALTVDKYLATEETQARSIKAEAL
>NZ_CP013768.1|WP_098082828.1|412812_413070_+|transposase
MARGELLRKEGLYSSRISTWKKERETGKLGGKYKNKSDKKMKLLSQENIRLKKKLAQAEAIIDLQKKVSDLLGEHILPTELSESN
>NZ_CP013768.1|WP_036779544.1|413069_414077_+|IS3-family-transposase
MDEINKLSKEKNVTAIALCKAVSMPRATYYRQQKKGTLEKKPAFKPSNAIDNQEKDQIIELLHSERFIDSTPYQTFYTLLDEGHYYCSIRTMYRLLTEHSGTKDRRIQRNHRNAIKPELIATTPNQVWSWDITKLLSTKRLVYYHLYVILDIFSRYAVGWLIADRECQDLAYQLIEATALRQGVQKGSLTLHADNGPSMTSGTVGDLLENAGIIKSHNRPYTSNDNPFSESQFKTLKYCPQFPKRFDNIKEAELFSQDFFKWYNSMHYHSGRCFLTPESVHYGLSDGILDKRHDTLMSAYIENPSRFNNKPPVRKILKPAYINPPQTVIIQGVQK
>NZ_CP013768.1|WP_054300338.1|414101_415667_-|APC-family-permease
MIGSGWLFSSYYAAKITGAAACLSWITTSVVILLLGLCLAEIATLYPKRGLMARLLTLSHNKEFAFICTISTWLGLTAVIATEAEGSVQYISSLSDSFGPMIFNNQIHQLTSLGLIIAIVMILSFGLINFWGIKILSKSNVALTTCKIAIPLVTGLSVMFAAFHHQNFHNDHAPLLNYGPSSVFIAMIGAGMIYSFNGFQNILSFSSEARQPTRDIPLAIIFSILITLAIYLVLQIAFIGALSPHILEQGWQSLNFTSPFVQLTALLNLNFITIILYADSVISPSGTGLIYTGSTTRLLTAMSQDGQMPRFFNKIGAYNFSRRSLMFTVGFSIIFLLLFRSWSALVSFLSLFYVISYMSIPLSLSKLHQQNLVGKFRAPLPKLLLPVIFAFLSLLFIFSKFPYTGDVALFTVIAYAAYLLSQFKLATDLNHFKKTVKHSSLMVIYIIILAALSSIGPKEYGGYNLLSKLQFFPSVIFVSFIMYRLSLAWIRDKATETQVIKISPTLQRNVSGEMRQNYRFS
>NZ_CP013768.1|WP_016210800.1|415872_416700_-|DsbA-family-protein
MKKYLFASLSLVTPFVLSNAFAANTTTFTAAQQEKIGEIAAQYIINHPEVLIQAGQKLQQQQMKAQEKQQITAVLHAKKQLLSDPKTPTVGPSNAKVAVVEFFDYQCVFCSKVAPAIEKIMKDNPKVKFVFKDFPIFGQRWPTSTYAAEVGLVAYKQGGAKMYMNYHNGIYATGKDEGKLTNKDVDMVAKKAGVDLTKDKTLLSAGKTPPPSIQANFQLAGEALGLRGTPALVIMPTSGANEKNVTVFAGYPANPQGGTAAAVTAIQQAIDKASQ
>NZ_CP013768.1|WP_075273540.1|417066_417678_+|hypothetical-protein
MSKVIAICPLLVGCTFLCSTSAESESDPSVSQDAQFITEVARSVMQDDISQSIVTECKSMNTESQSALIAEKNHYVPTKKAIQHMETAILEYGSNLADHYEREHPSTMLVTYRGWITSKQCINKLKETVMRAAQALICLGKEQNAVRDSAQLLLIDTVEAVAMKQDYGVSEDQEDQPCAIGWSSTMTYYGLKALDQALVTSKH
>NZ_CP013768.1|WP_129556527.1|417862_418123_+|hypothetical-protein
MSANSNSKIDVIALTVSGQVEKKIRVECNSLATDHVTDDLASKTNRDRAWQIYSSSYERCMAEALDMMRQDLLAVSIQPQLRPEIN
>NZ_CP013768.1|WP_016210799.1|418296_419250_+|chemotaxis-protein-CheV
MRANLLENIDSRTKLVGRNRFEALVFSIHGRQYAINVFKVREVLHLPELTVLPESHPAVLGVVHIRNQSLAVIDTCQAIFAKKTLDPLSGILIVTEYNHSVQGFLVHEIHHIINATWENVIAAPEATGKDKYITSVLKINEEGATSLIQVIDVEKVIYEIHPAQYDIKVSTNTLENVVIEQAPHYTALVVDDSLIARKQVKKALDTIGVKSILMRNGREALDYLINVLPGAGGDITQKYLMVIADVEMPEIDGYAFIKACREHPGLKNLFIILNTSITGVFNENDIQQTGCNEFIGKVNPQKIIECARMQILNRASQ
>NZ_CP013768.1|WP_052104738.1|420246_421053_+|methyltransferase-domain-containing-protein
MKLGEGSLKEKMVFIERATDQSIPTPWQLFSRLIYRYWFLKYPWQMSKFLGRQSKRLWLWFWLSSCNRSSGLKKVDNSIKNTLEKYGLTLGFFKAAIANPRATGAVLPSSRFLVREMVTHVVQMPERYVVELGAGTGVITQELLSSGVSPGQLIAIEYDKNLARKLAARFPDILVICGNAVELERLLGEKNGCVSTVISGLPLRSLPNQAVVHILQQIPSVLVSGGSYIQFTYDFKKKEEYYPGDIELSLSKKIWLNIPPAKVDVFTK
>NZ_CP013768.1|WP_016210795.1|421158_422130_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein
MFKSKLIVLTLSIWATCFYGNVVAQTKTSTNNNTKIARVLVNDWTSQIVLSKITAHILASINYQVTFVQSTSNRQWYKLKSNLADIQVEVWQGTMADKYNQLIKSGDIVDAGNHVAKTREDWWYPEYVEKQCPGLPDWKALRKCYKIFATPKTAPKGMYLGGPWEKPDRARIRALNMNFKVIQVKNGDALWIELEKAVKQKRPIVLFNWTPNWIESKYKGKFIEFPHYSAECENNPKWGLNSKFPWDCGNPKDGWLKKIARSQFQKEQPCAFELLKNINFTNTMIANITAAVDADKMSYDEAAQDWLNQNKALWHSWIPSSCK
>NZ_CP013768.1|WP_016210801.1|422111_423083_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein
MKNTIKNTLVFPALLVFGSSFLQTSIAAKTKEPVRIIVNDWTSQIVLSKITGSILSDMGYQVKYINSKSNGQWFKLKNNQADIQVEVWQGTMAKKYNQLIKTGDIVDAGNHAAKTREDWWYPEYVEKQCPGLPDWKALEKCYKIFATSKTKPKGMYLGGPWEKPDRARIRALKMNFKVIQVKNGDALWVELEKAAKEERPIVLFNWTPNWVEAKYKGKFVEFPKYSPKCISDPKWGKNSKYPWDCGNPKDGWLKKIARTEFSKEQPCAFELLKNISFTNAMISNVAASVDADKMSYDQAAQQWLDSNKKLWHSWIPATCSKVN

Crispr_ID: NZ_CP013768_2

• CRISPR_ID: NZ_CP013768_2
• CRISPR_location: 1603607-1603727
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP013768_2

Consensus_repeat	Method
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP013768_2

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CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013768_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP013768_2

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TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCTCGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGCTTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

>NZ_CP013768|2|2|1603607-1603727|CRISPRCasFinder
TTGATTAAGTCCAAGGGCTGCTAACCATTGATAAGCT	CGCTCAAATCGTTTAGGGTCAGTAAGTACGTGCTGGACATACTTTGC
TTGATTAAGTCCAAGGGCTACTAACCATTGATAAGCT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP013768.1|WP_016210676.1|1597265_1599347_+|kinase-domain-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270918
NZ_CP013768.1|WP_032126312.1|1607065_1607860_-|M48-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|307807
NZ_CP013768.1|WP_016211756.1|1608038_1608764_-|M15-family-metallopeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|350618
NZ_CP013768.1|WP_016210943.1|1611312_1611999_-|acireductone-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|319768
NZ_CP013768.1|WP_098082812.1|1600805_1601321_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013768.1|WP_036778484.1|1612002_1612614_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	unknown	unknown	gnl|CDD|236415
NZ_CP013768.1|WP_036778297.1|1594946_1595420_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013768.1|WP_016210935.1|1610773_1611316_-|acireductone-dioxygenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224704
NZ_CP013768.1|WP_016210671.1|1595552_1596812_+|6-phosphofructokinase	unknown	unknown	gnl|CDD|237600
NZ_CP013768.1|WP_054300492.1|1599650_1600661_+|protein-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|270916
NZ_CP013768.1|WP_016211905.1|1602085_1602496_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013768.1|WP_129556590.1|1606673_1607069_+|nucleic-acid-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|380015
NZ_CP013768.1|WP_016210936.1|1613781_1614576_-|thymidylate-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|234984
NZ_CP013768.1|WP_105962625.1|1605104_1605991_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP013768.1|WP_016210672.1|1593555_1594938_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|130153
NZ_CP013768.1|WP_016211759.1|1609009_1610197_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|236561
NZ_CP013768.1|WP_016210944.1|1612660_1613680_-|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|273112
NZ_CP013768.1|WP_075275117.1|1602739_1603162_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013768.1|WP_155046943.1|1603194_1603335_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013768.1|WP_052047041.1|1601553_1601817_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP013768.1|WP_016210676.1|1597265_1599347_+|kinase-domain-protein	gnl|CDD|270918	cd14016, STKc_CK1, Catalytic domain of the Serine/Threonine protein kinase, Casein Kinase 1. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. CK1 phosphorylates a variety of substrates including enzymes, transcription and splice factors, cytoskeletal proteins, viral oncogenes, receptors, and membrane-associated proteins. There are mutliple isoforms of CK1 and in mammals, seven isoforms (alpha, beta, gamma1-3, delta, and epsilon) have been characterized. These isoforms differ mainly in the length and structure of their C-terminal non-catalytic region. Some isoforms have several splice variants such as the long (L) and short (S) variants of CK1alpha. CK1 proteins are involved in the regulation of many cellular processes including membrane transport processes, circadian rhythm, cell division, apoptosis, and the development of cancer and neurodegenerative diseases. The CK1 subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	1.187e-09
NZ_CP013768.1|WP_032126312.1|1607065_1607860_-|M48-family-metallopeptidase	gnl|CDD|307807	pfam01863, DUF45, Protein of unknown function DUF45. This protein has no known function. Members are found in some archaebacteria, as well as Helicobacter pylori. The proteins are 190-240 amino acids long, with the C-terminus being the most conserved region, containing three conserved histidines. This motif is similar to that found in Zinc proteases, suggesting that this family may also be proteases.	1.59691e-55
NZ_CP013768.1|WP_016210943.1|1611312_1611999_-|acireductone-synthase	gnl|CDD|319768	cd01629, HAD_EP, Enolase-phosphatase similar to human enolase-phosphatase E1 and and Xanthomonas oryzae pv. Oryzae enolase-phosphatase Xep. Enolase-phosphatase E1 (also called MASA) is a bifunctional enolase- phosphatase which promotes the conversion of 2,3-diketo-5-methylthio-1-phosphopentane to 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene anion (an aci-reductone) in the methionine salvage pathway. The catalytic reaction is carried out continuously by enolization and dephosphorylation, and the enolase activity cannot be classified as typical enzymatic enolization. This family belongs to the haloacid dehalogenase-like (HAD) hydrolases, a large superfamily of diverse enzymes that catalyze carbon or phosphoryl group transfer reactions on a range of substrates, using an active site aspartate in nucleophilic catalysis. Members of this superfamily include 2-L-haloalkanoic acid dehalogenase, azetidine hydrolase, phosphonoacetaldehyde hydrolase, phosphoserine phosphatase, phosphomannomutase, P-type ATPases and many others. HAD hydrolases are found in all three kingdoms of life, and most genomes are predicted to contain multiple HAD-like proteins. Members possess a highly conserved alpha/beta core domain, and many also possess a small cap domain, the fold and function of which is variable. HAD hydrolases are sometimes referred to as belonging to the DDDD superfamily of phosphohydrolases.	1.88858e-105
NZ_CP013768.1|WP_036778484.1|1612002_1612614_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase	gnl|CDD|236415	PRK09220, PRK09220, methylthioribulose 1-phosphate dehydratase.	2.90159e-95
NZ_CP013768.1|WP_016210935.1|1610773_1611316_-|acireductone-dioxygenase	gnl|CDD|224704	COG1791, COG1791, Uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain [Function unknown].	2.05718e-61
NZ_CP013768.1|WP_016210671.1|1595552_1596812_+|6-phosphofructokinase	gnl|CDD|237600	PRK14072, PRK14072, diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase.	0
NZ_CP013768.1|WP_054300492.1|1599650_1600661_+|protein-kinase	gnl|CDD|270916	cd14014, STKc_PknB_like, Catalytic domain of bacterial Serine/Threonine kinases, PknB and similar proteins. STKs catalyze the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to serine/threonine residues on protein substrates. This subfamily includes many bacterial eukaryotic-type STKs including Staphylococcus aureus PknB (also called PrkC or Stk1), Bacillus subtilis PrkC, and Mycobacterium tuberculosis Pkn proteins (PknB, PknD, PknE, PknF, PknL, and PknH), among others. S. aureus PknB is the only eukaryotic-type STK present in this species, although many microorganisms encode for several such proteins. It is important for the survival and pathogenesis of S. aureus as it is involved in the regulation of purine and pyrimidine biosynthesis, cell wall metabolism, autolysis, virulence, and antibiotic resistance. M. tuberculosis PknB is essential for growth and it acts on diverse substrates including proteins involved in peptidoglycan synthesis, cell division, transcription, stress responses, and metabolic regulation. B. subtilis PrkC is located at the inner membrane of endospores and functions to trigger spore germination. Bacterial STKs in this subfamily show varied domain architectures. The well-characterized members such as S. aureus and M. tuberculosis PknB, and B. subtilis PrkC, contain an N-terminal cytosolic kinase domain, a transmembrane (TM) segment, and mutliple C-terminal extracellular PASTA domains. The PknB subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other protein STKs, protein tyrosine kinases, RIO kinases, aminoglycoside phosphotransferase, choline kinase, and phosphoinositide 3-kinase.	6.53e-14
NZ_CP013768.1|WP_129556590.1|1606673_1607069_+|nucleic-acid-binding-protein	gnl|CDD|380015	pfam17775, UPF0225, UPF0225 domain. This entry represents an NTF2-like domain found in bacterial proteins.	6.66662e-47
NZ_CP013768.1|WP_016210936.1|1613781_1614576_-|thymidylate-synthase	gnl|CDD|234984	PRK01827, thyA, thymidylate synthase; Reviewed.	0
NZ_CP013768.1|WP_105962625.1|1605104_1605991_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	9.72465e-44
NZ_CP013768.1|WP_016210672.1|1593555_1594938_-|UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl--meso-diaminopimelate-ligase	gnl|CDD|130153	TIGR01081, mpl, UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate ligase. Alternate name: murein tripeptide ligase [Cell envelope, Biosynthesis and degradation of murein sacculus and peptidoglycan].	0
NZ_CP013768.1|WP_016211759.1|1609009_1610197_+|S-methyl-5-thioribose-kinase	gnl|CDD|236561	PRK09550, mtnK, methylthioribose kinase; Reviewed.	0
NZ_CP013768.1|WP_016210944.1|1612660_1613680_-|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase	gnl|CDD|273112	TIGR00512, methylthioribose-1-phosphate_isomerase_predicted, S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase. The delineation of this family was based in part on a discussion and neighbor-joining phylogenetic study, by Kyrpides and Woese, of archaeal and other proteins homologous to the alpha, beta, and delta subunits of eukaryotic initiation factor 2B (eIF-2B), a five-subunit molecule that catalyzes GTP recycling for eIF-2. This clade is now recognized to include the methionine salvage pathway enzyme MtnA. [Amino acid biosynthesis, Aspartate family].	1.29472e-143
NZ_CP013768.1|WP_016211756.1|1608038_1608764_-|M15-family-metallopeptidase	gnl|CDD|350618	cd14843, D-Ala-D-Ala_dipeptidase_like, D-Ala-D-Ala dipeptidase, includes uncharacterized enzymes. This subfamily of D-Ala-D-Ala dipeptidase (also known as D-alanyl-D-alanine dipeptidase vanX; VanX; EC 3.4.13.22) also includes several uncharacterized proteins. This is a Zn2+-dependent enzyme that mediates resistance to the antibiotic vancomycin in Enterococci and other bacteria (both Gram-positive and Gram-negative). It is part of a gene cluster that affects cell-wall biosynthesis. The operon triggers the termination of peptidoglycan precursors by D-Ala-(R)-lactate instead of D-Ala-D-Ala dipeptides. The enzyme is stereospecific, as L-Ala-L-Ala, D-Ala-L-Ala and L-Ala-D-Ala are not substrates. It belongs in the MEROPS peptidase family M15, subfamily D.	1.11944e-66

Protein sequences

>NZ_CP013768.1|WP_155046943.1|1603194_1603335_+|hypothetical-protein
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>NZ_CP013768.1|WP_075275117.1|1602739_1603162_-|hypothetical-protein
MQLSYLELNSVEYIQKVLANITLLDQDACALNKLRVVYSKITQQIESGQLKVHGLGGGSAITFKGERTKVPEGISKIWYEITDMQGNFRWMDNVSAVLNKVKVEANNRSGYRGLTAIGLFFGSYRDAQTKDLYSKISQAL
>NZ_CP013768.1|WP_016211905.1|1602085_1602496_+|hypothetical-protein
MKLNTKETFTRFMGLFIAVDCLYYLIGLTIFSAIPSGNLIAFVNIFTSFCGLVTGILLFIKIYDKWYTPFVAIEFFTCIYWFFLTLGETVSNTQYASLSKVITSLNYDLFSCFMGVIACLLWLKFAFSFKANKLAN
>NZ_CP013768.1|WP_052047041.1|1601553_1601817_+|hypothetical-protein
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MLSTPWLAALDLDLDTDDDIIKTKNLSALDVTCRLIISRYNLYQRENFFQVFNNPKCFYQSYQYLEILGLNQAASIQQLLDGPFEKYKDTWSTLSYLGLDCRENAQRILTNPQSFEQDFDGLIALRSAYESIVKEMEANQLKAHGLAGGNPIKFKGETVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP013768.1|WP_054300492.1|1599650_1600661_+|protein-kinase
MPKIVWESQENRTAAEQQAAEWRIAKKYLAGRAPGTQLNPKHGQHKISFKDPKTNEEVYLTHRYLLGNKGEIFVKSNGYLLGKTPRNLVTFGQTQDGQVWAIKESCEIGKDLKESEIACDLDAAKKMFKSNSKCYQVYRFLGLPLDQYLRQNRLTEEERLDLAIKVSQAVHHLHIGTQSRSHTCYAHLDLKPSNICIDHEGQVHLIDYGFSKSLAGRLTHRKGTSSYLSVDYASASKEALDIFALLRTLYLPKKFKTYTQKAKKSRDHHEYILNDDIISKNGLLYALLDTEDGKIKHTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP013768.1|WP_016210676.1|1597265_1599347_+|kinase-domain-protein
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>NZ_CP013768.1|WP_016210943.1|1611312_1611999_-|acireductone-synthase
MIKAILTDIEGTITRISFVKDVLFPYAEKQLPEFIHCFCETPEVFAQLDAVKNEINNQQATIAQLIDTLLAWIREDKKITALKQLQGMIWEKGYQQGDFTGHLYSDAVEFIREQCKRNIPVYVYSSGSVKAQKLLFSYSDFGDILELFSGFYDTKIGGKKEMKSYQNIIEELNIQAENVLFLSDIAAELDAAKQAGLKTCQLVRDNQKPSKHHPWVNNFNKFIIQDYS
>NZ_CP013768.1|WP_036778484.1|1612002_1612614_-|methylthioribulose-1-phosphate-dehydratase
MQNNNDVVNQLITAGAWISEKGWVPATGGNFSARLADGVVVTASGYDKGCLTEASFCQFDLEGNQFTGTGKPSAETALHLAIYQLDDHAKAVLHTHSIAATTLSRYIAESQLAIHGYEMQKSLAGIQSHLETINIAIFDNDQDIDALVGKVNKAHAKKPLRHGILIRGHGLYAWGDSILEARRHLEGLEFLFMCELERFKLQG
>NZ_CP013768.1|WP_016210944.1|1612660_1613680_-|S-methyl-5-thioribose-1-phosphate-isomerase
MQDLLSTALRYEKNSLYILDQTLLPHKMQWLECCDVDTMTEIIQSLRVRGAPLIGIACSVLVAHLAAQGMEKRELISAIAVLKASRPTAVNLMNNLQQMTLALKVENYRQALIKTAEKLFFEDVLLCQKMAENGAKLLATQQNLLTHCNTGSLATVGMGTALGVIQQAHTNNDNIHIYVDETRPLLQGGRLTAWELSQLNISNTIICDNMAASLMAQGQIDAVLVGADRIAVNGDFANKIGTYNLAVLAHYHDIPFYVVAPYTTVDCDCLHGEDIPVELRDGDEVRGVKGAFGKIVWSPAESQVYNPAFDVTPAQLVTRWILDTGVFGLDDIKAGVLAK
>NZ_CP013768.1|WP_016210936.1|1613781_1614576_-|thymidylate-synthase
MRTYLDLMQRVLETGAEKTDRTGTGTLSVFGHQMRFDLSAGFPLLTTKKLHLRSIIHELLWFLKGETNIAYLNENKVRIWDEWANAEGDLGPIYGAQWRSWAGADGKTIDQMTQVIEQIKINPDSRRLIVSAWNVAEIEKMALPPCHALFQFYVAEGKLSCQLYQRSADIFLGVPFNIASYALLTLMIAQVTGLEPGDFVHTLGDAHLYSNHLEQVKTQLQRDCRGLSMMKINPEVKDIFDFKYEDFILENYDPHPHIKGAVAV

Crispr_ID: NZ_CP013768_3

• CRISPR_ID: NZ_CP013768_3
• CRISPR_location: 2453654-2453783
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP013768_3

Consensus_repeat	Method
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP013768_3

>3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder
CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013768_3

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP013768_3

>merge|NZ_CP013768|3|2453654-2453783|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCTATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

>NZ_CP013768|3|3|2453654-2453783|CRISPRCasFinder
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAA	CCTACTGATATTATGTCAGAAACTGTTAATCCAGCGCT
ATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCTTTATTGTATTTTTTAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP013768.1|WP_155046940.1|2456825_2457209_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013768.1|WP_016212010.1|2455355_2455652_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013768.1|WP_075273619.1|2457481_2458057_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013768.1|WP_075273359.1|2451911_2452487_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP013768.1|WP_016211795.1|2448357_2448552_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013768.1|WP_054300518.1|2455775_2456621_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013768.1|WP_016211797.1|2450457_2451861_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|143424
NZ_CP013768.1|WP_016211271.1|2460266_2461211_-|L,D-transpeptidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|182341
NZ_CP013768.1|WP_054300520.1|2452432_2452747_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013768.1|WP_016212281.1|2442947_2444402_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013768.1|WP_075273371.1|2452787_2453363_-|IS630-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|315923
NZ_CP013768.1|WP_016212044.1|2446256_2446511_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|236153
NZ_CP013768.1|WP_081007059.1|2449234_2450296_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224871
NZ_CP013768.1|WP_016212359.1|2445264_2445483_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013768.1|WP_016211269.1|2461515_2462301_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|274640
NZ_CP013768.1|WP_016211268.1|2459063_2460248_+|fatty-acid-desaturase	unknown	unknown	gnl|CDD|224316
NZ_CP013768.1|WP_032126227.1|2454312_2454603_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013768.1|WP_016212008.1|2454640_2455339_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013768.1|WP_036794771.1|2447233_2448220_+|APC-family-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223605
NZ_CP013768.1|WP_054300516.1|2458114_2458948_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	unknown	unknown	gnl|CDD|234899

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP013768.1|WP_016212044.1|2446256_2446511_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|236153	PRK08116, PRK08116, hypothetical protein; Validated.	0.00575708
NZ_CP013768.1|WP_081007059.1|2449234_2450296_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase	gnl|CDD|224871	COG1960, CaiA, Acyl-CoA dehydrogenases [Lipid metabolism].	5.06874e-09
NZ_CP013768.1|WP_075273359.1|2451911_2452487_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	6.00312e-45
NZ_CP013768.1|WP_016211269.1|2461515_2462301_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|274640	TIGR03545, TIGR03545, TIGR03545 family protein. This model represents a relatively rare but broadly distributed uncharacterized protein family, distributed in 1-2 percent of bacterial genomes, all of which have outer membranes. In many of these genomes, it is part of a two-gene pair.	0.0067305
NZ_CP013768.1|WP_016211271.1|2460266_2461211_-|L,D-transpeptidase-family-protein	gnl|CDD|182341	PRK10260, PRK10260, L,D-transpeptidase; Provisional.	3.41097e-37
NZ_CP013768.1|WP_016211268.1|2459063_2460248_+|fatty-acid-desaturase	gnl|CDD|224316	COG1398, OLE1, Fatty-acid desaturase [Lipid metabolism].	2.7962e-82
NZ_CP013768.1|WP_016211797.1|2450457_2451861_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein	gnl|CDD|143424	cd07106, ALDH_AldA-AAD23400, Streptomyces aureofaciens putative aldehyde dehydrogenase AldA (AAD23400)-like. Putative aldehyde dehydrogenase, AldA, from Streptomyces aureofaciens (locus AAD23400) and other similar sequences are present in this CD.	0
NZ_CP013768.1|WP_036794771.1|2447233_2448220_+|APC-family-permease	gnl|CDD|223605	COG0531, PotE, Amino acid transporters [Amino acid transport and metabolism].	3.69328e-17
NZ_CP013768.1|WP_054300516.1|2458114_2458948_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase	gnl|CDD|234899	PRK01103, PRK01103, bifunctional DNA-formamidopyrimidine glycosylase/DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase.	2.70834e-151
NZ_CP013768.1|WP_075273371.1|2452787_2453363_-|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	2.12687e-44

Protein sequences

>NZ_CP013768.1|WP_075273371.1|2452787_2453363_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLKPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
>NZ_CP013768.1|WP_054300520.1|2452432_2452747_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MKGYLITQISKLLKISRDTLHRWRNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
>NZ_CP013768.1|WP_075273359.1|2451911_2452487_-|IS630-family-transposase
MRLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEGAGCHLLFLPPYSPDLNSIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETVR
>NZ_CP013768.1|WP_016211797.1|2450457_2451861_+|aldehyde-dehydrogenase-family-protein
MSSYAMLINGQLHSGIDSFAVVNPATEAVIAECPIASVELLEQAVNAAKIALIDGTGTLEQRRELLRACADKIEAYQEELSQLLTKEQGKPISQAQNEVSWAIGLLRKQCELDIPKKVLRDDTQAQVTVTRKPLGVVAGITPWNFPFYIAVNKMAEAIYSGNSIIIKPSPYTPLTTLKLGELIQDVIPAGLVNIISGDNEIGALLVKHPKISAISFTGSVATGKHIATAAAADLKRVVLELGGNDAAIVLNDVDVKEVAEKIFWNAFSNCGQVCVAVKRLYVQRAIYHDVLDEMVRIAKTVKVGNGLDSEVTMGPLNNVMQYERIIELLNDAKAQGATVHCGGVAQEGLGYFFPPTIISGIEEGVRLIDEEQFGPLLPVLAFDDVNEVIQRVNNSSMGLSAYVWSKDNDLAVQIANRLEVGIVRVNTSTTEASLTPFGGMKQSGIGREGGVWGIEAMTDAQTLSVKY
>NZ_CP013768.1|WP_081007059.1|2449234_2450296_+|acyl-CoA/acyl-ACP-dehydrogenase
MVLLEQLDTFLISRVDPYANQLDIDSMILKSRFSELGEKKLLAIKVASEFNGIAADRALNHDYFARLARSSYALAFLTAQHESCASLLQKGNNQELKADLLPEMVQGKFRAGVGIYHLRSHTRRAMIMAKKVAGGYRVSGRLDWISGFDIFDYIALGFIIDIGNSQENHEVVGLVPFKVQQYLSGEINIGPKQEVTAISSTNTVAIEFNDWFIRDKDIMIDQPGRAIEQRSILSITHATMLMGIFQAALNIIGNSKSILKKNTVVLSQFNQLNNQCLLLRNQLIHTNTQEEVQKMRAQIHKYTRDCIYLAAALSGGRSVLADHPVQRLNRELLQATIAGVNSLFIHNLCIDIN
>NZ_CP013768.1|WP_016211795.1|2448357_2448552_-|hypothetical-protein
MKLKTKKISNACKGNTFLCVNFAKSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP013768.1|WP_036794771.1|2447233_2448220_+|APC-family-permease
MAMSGNQALQENVGFLGALVFAVSLVLGSGVLVLPGVIYHSIGELAIFTWLADALLMVPLVIIFASFGSKYPGSGGVAGFIEQAFPYLSGGSAYLLLGQCSICFAIVAITGILYSFALLLPNFHASHMLVAGISLALMFIVFFISFLGNHRVIWLQKLIIIPLLLFLLVLIFLSINHPDAATSSVTYWPKHFDTGLITQGMILAFFAFGGWESFASMTGEIKKPARTVPFVIFVGFLLTVGLYVGLSIAIQKIFFEKNMMTGSSFLLDLVQVNHLGQFSVAICFFIVFVVVISNLNGVIWSGSRTLVTLGQKGWAPAFAASHGVLSTG
>NZ_CP013768.1|WP_016212044.1|2446256_2446511_+|hypothetical-protein
MNHIISCPFCGVSTEHEMSYGLQSYVCEACHNLIAAGMDDCCLFFSHDLACLCQRENEKKMEREREEKEEEEALLCPSLRKWSS
>NZ_CP013768.1|WP_016212359.1|2445264_2445483_-|hypothetical-protein
MFKQLQNNRLYFQKERAYLSISKAKKFNGPGNNAQRIIIPLHGDTSGVLKSHLTIASLFDHRPQDKGKPFKP
>NZ_CP013768.1|WP_016212281.1|2442947_2444402_-|hypothetical-protein
MLCRPENSETLKNILISQKDTLISGAKHHKNILVLLIKTAIEFGNVRLLVTLDRLDLNPDRILFENTRQSFMQHLINHVYKYDDEEFAVWLFTVLYKQKIHFPHAKETFKIDFLDTSLRVNALQCLVYSGFFKLALCLSEAGIIDKASSTRYKGERRQVAACGFLITAIVKEGISQEKLDLLVALANGHDIATSQHLISIYRGLYVSAIQNQGGNELEKLIRLIDTLAKLSVINIYKQDSAAILPFYMHPALAYQGIIQEYQQQLSHTRTMRNPHAISQYRVGEALGWLTMLKLAIHCTICHKSVQAGDRARQTRQLLQALSNLKKRNLSLEPLRTSLMLVDGVSMCFQPLRVFHPTHIMEIFAHQLLQLSEKGNCDNFAQIIDLIQQQVLTALKGTEFEALQNAKKHVATIFSLIPPSQPIHANNLPQTPEISATQSTTDEIKPARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
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MGRLFNKENPADLKSSGYFSTEPRGQSHHSVIVIVMAMISIFVMTRVICSIITWMIHSAPLTFIFTMLISFFAAPYVFIVIIIVAFFIGILVKTPS
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MCKIPTEVATLTSNQAYDKPYDLFLTKAAKVFIKYLFIAEHSMANMLPSIQVNQNLAQVKISYSAHETILAMRKCSSLINLHTTERLKGPLVAAHDNVQKYQKKGIYPYNQTNYQALAASHGVLSTG
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MANYSQAYCVAQGFNVNANIHRRFGYINYLRIGDLELSADIDVEVPVEGVKSKHVGVISDLFWQETAKVQPITIDFRLSVSNQQQLAHYIEQNNFNSDVLIEFASYDYDANAQAFYSSFNTDKETIEGDLEILAADSQLAIYVGKEQETDVQSPVNYFVSLSMVSTAKAQQLISATSARIKRVLPWGVTVA
>NZ_CP013768.1|WP_054300516.1|2458114_2458948_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase
MPELPEVETSCRGIAPHIQNQKIQRVTIRQQQLRYPVSVQITTKKLKQQQVTQVSRRGKYILLELDHSAWLMIHLGMSGNLRILEDTTPAGKHDHIEIQFANQKILRLNDPRRFGCFLWTNDLANHKLLKHLGIEPLTRQFNANYLYQAAQSRKIAIKTLLMDSQVVVGVGNIYANEALFQTGIHPSTYCHVLTTNQCAELTRIIKAILKQAIKAGGTSLKDFTNSDGKPGYFKQKLFVYGRSKEPCLTCQEDIQQFRQNQRSSFFCPCCQPEPKTM
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MLSFYGLLNLPWWGYIIAVLLLTHVTIVAVTVFLHRHQAHRALDLHPVVSHFFRLWLWLTTGMVTKEWVAVHRKHHAHCETAEDPHSPKTYGIKTVLWEGADLYRHAIQTQPEMMEKFGHATPNDTLERHLYSRFRYLGIIIMLILDIVLLGVPGIAVWAIQMMWIPFFAAGVINGIGHYVGYRNFEAADASTNVSPWGILIGGEELHNNHHAYASSAKFSVKPWEFDVGWMYIRLLEVCQLAHVKKRIPRGACVAGKSEVDNATLKAVIQNRLQLLSKYQKDVLQPTFKAERARQGESVLNSTASKLLKRDQRFFSHADHQALEQVLISSKALDLVYQFRAKLQAIWTQKASNQKDVLDALKQWCSQAEASGEQRLQEFVSYLRGYVLTTQSH
>NZ_CP013768.1|WP_016211271.1|2460266_2461211_-|L,D-transpeptidase-family-protein
MGIITQRHNTVAGIALFTSSIFCTSAATAFTLPISSHNTNDVVGWQVITYSKAGDTPLKIAQRHSISIQRLQALNSKVRHWQKQRIYLPYQVILPQLIQQQQSKITVNLAEKRLYYFNAKSQVLSVYPVSIGREHWRTPTPTKTTYIIHKKKHPTWNVPASIQRYYRAQGKSLPKQVPPGPENPLGTRALYLGITGILIHGTNQPASIGTASSSGCIRLYTNDIEHLYKQAGVNTPVKLIYQPYKVGFNENVLYIEAHPVISDYDKNNQQRQIIIEKLQNMTNNSKQLQVNWSLVDKAINEAAGIPVPIGKLFY
>NZ_CP013768.1|WP_016211269.1|2461515_2462301_+|hypothetical-protein
MAKKIFYSLIIVILLLVVGSYFLFSHMDSILRSAVEKIGSKTTGTTVTLGSLKTSLKEGQVSLSRLTMSNPAGFSQANAISFKDIMVNLDPSSATQQTIVLNKVIIKDPYLLYEMKEGSSRSNLQQIQKNIQSYFASKQAKNNESNQRNSGVTQQEPSQAKVAAKNQKKFIIKELEILAGQVKVISPLLKSKEKTLSLPNIRLTNIGTGGSGLTPDQVTEQIINVLVANSGQAVAQAGLDRVKTKLKEKASGLLNNLLGNP

Self-targeting detection

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_ID	Protospacer_location	Mismatch	Identity
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NZ_CP013768_3	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	NZ_CP013768.1	502565-502602	0	1.0
NZ_CP013768_3	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	NZ_CP013768.1	553142-553179	0	1.0
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MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
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NZ_CP013768_3	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	NZ_CP039210	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence	166717-166754	0	1.0
NZ_CP013768_3	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	NZ_CP039213	Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed4, complete sequence	30310-30347	0	1.0
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1. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033938 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033940 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033943 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-6, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013780 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p2PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050943 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050946 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050947 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039041 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038912 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-009 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048070 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038925 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038813 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038915 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039207 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038934 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038974 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038888 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039216 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038878 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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112. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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113. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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114. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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115. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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116. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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117. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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118. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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119. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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120. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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121. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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122. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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123. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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124. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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125. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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126. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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127. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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128. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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129. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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130. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.974

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131. spacer 1.1|412040|31|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP054613 (Paenibacillus cellulosilyticus strain KACC 14175 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774

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132. spacer 1.1|412040|31|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016317 (Bacillus cereus strain M3 plasmid pBCM301, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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133. spacer 1.1|412040|31|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to CP020755 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid pLDW-16, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

cctaggattaagtcagaatcgtattgaaaaa	CRISPR spacer
atataaattaagtcagaatcgcaatgaaaaa	Protospacer
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134. spacer 1.1|412040|31|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021062 (Bacillus thuringiensis strain ATCC 10792 plasmid poh1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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atataaattaagtcagaatcgcaatgaaaaa	Protospacer
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135. spacer 1.1|412040|31|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NC_020385 (Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-328, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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atataaattaagtcagaatcgcaatgaaaaa	Protospacer
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136. spacer 1.1|412040|31|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NC_018492 (Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742

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atataaattaagtcagaatcgcaatgaaaaa	Protospacer
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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	8277 : 60915	50	Catovirus(11.11%)	transposase,tRNA,protease	NA
DBSCAN-SWA_2	100271 : 225185	96	Staphylococcus_phage(27.27%)	transposase,integrase,tRNA	attL 211697:211756|attR 217040:218144
DBSCAN-SWA_3	269588 : 439382	143	Escherichia_phage(13.33%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_4	454129 : 504919	50	Staphylococcus_phage(25.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_5	515990 : 636764	103	Staphylococcus_phage(16.0%)	transposase,integrase,tRNA,protease	attL 530745:530804|attR 634391:634680
DBSCAN-SWA_6	668699 : 844380	153	Vibrio_phage(16.0%)	transposase,tRNA,protease	NA
DBSCAN-SWA_7	880947 : 944226	58	uncultured_Mediterranean_phage(36.36%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_8	947276 : 1014376	54	Staphylococcus_phage(20.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_9	1020893 : 1066038	47	Bacillus_phage(20.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_10	1083607 : 1127040	46	Staphylococcus_phage(40.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_11	1148195 : 1203585	49	Vibriophage(16.67%)	transposase,tRNA,protease	NA
DBSCAN-SWA_12	1210886 : 1268172	57	Staphylococcus_phage(35.71%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_13	1335676 : 1383103	43	Acinetobacter_phage(16.67%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_14	1471351 : 1559820	85	Escherichia_phage(39.29%)	transposase,integrase,tRNA	attL 1496659:1496718|attR 1559280:1559888
DBSCAN-SWA_15	1605104 : 1656542	53	Microbacterium_phage(12.5%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_16	1717231 : 1750615	34	Stx2-converting_phage(20.0%)	transposase,tRNA,protease	NA
DBSCAN-SWA_17	1903769 : 1969629	55	Erwinia_phage(18.18%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_18	1979390 : 2033644	52	Acinetobacter_phage(50.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_19	2043756 : 2085738	45	Staphylococcus_phage(30.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_20	2145130 : 2194864	47	Moraxella_phage(20.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_21	2241660 : 2373633	120	Acinetobacter_phage(20.0%)	transposase,tRNA,tail,protease	NA
DBSCAN-SWA_22	2388994 : 2453363	60	Streptococcus_phage(16.67%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_23	2537342 : 2639427	103	Escherichia_phage(39.39%)	transposase,integrase,tRNA	attL 2585842:2585901|attR 2619801:2620089
DBSCAN-SWA_24	2645981 : 2686359	44	Synechococcus_phage(50.0%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_25	2707827 : 2809105	109	Prochlorococcus_phage(16.67%)	transposase,plate,tRNA,protease	NA
DBSCAN-SWA_26	2844467 : 2889905	33	Staphylococcus_phage(33.33%)	transposase,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_27	2906586 : 2969911	52	unidentified_phage(11.11%)	transposase,integrase,protease	attL 2953422:2953481|attR 2981618:2982207
DBSCAN-SWA_28	2977744 : 3036721	58	Staphylococcus_phage(18.18%)	transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP013768|8277:60915|DBSCAN-SWA
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MKRTCLRALLAAASVVLVGCSSLTHHDQQSTQSTSSVDKGHSVQSLQKGSAAATLGKGK
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MVSKSSWQTYLYALTKRRILTVFLLGFSSGLPFALIAGTLQAWFTTAGLDLKTIGAASLIGLPYTLKPFIAPIIDRYRLPLLGRRRGWLLLFQFALLIAILFMSTLKPTHSVLVLGQTVPLLMIIGVCVAFFSTCQDIVINAYQTEVLYENERGLGASLGVTGWRISFILSGSIALILASHLGWHLTYIVMSLCMLIGVFATLFGPNPDNEGQPPMTFVKAIYEPFVDFFSRQKLPTALLVILLILTYKIGDALALALNTTFLIKGVGFSLDAIGVINKNIGIIGSIAGGIIGGLLMLRLSLFRSLMLFGLVQAIANLGYMWLAIVGKNYSVFVITAFSEHFFSGMGTAAFVALLMSQCNLNYTATQYALFTSLSLFGRTWLGPIAASMVDHFGWAQFFFWSFIVSLPCLFFVWLLRHKLEKDHQDRINKQGQEVACS
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_052104774.1|9386_10019_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047009.1|10163_10337_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016211450.1|11112_12135_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211446.1|13430_15158_-	glycoside hydrolase family 32 protein	NA	NA	NA	NA
WP_036776407.1|15341_16478_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|16726_17788_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210569.1|18112_18727_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210561.1|18841_20176_-	dihydroorotase	NA	NA	NA	NA
WP_016210568.1|20303_20945_-	pyridoxamine 5'-phosphate oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_016210566.1|21250_21673_+	universal stress protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210559.1|22028_22991_+	formimidoylglutamase	NA	NA	NA	NA
WP_081007068.1|23029_24205_+	imidazolonepropionase	NA	NA	NA	NA
WP_155046983.1|24293_25994_+	urocanate hydratase	NA	NA	NA	NA
WP_054300273.1|25993_27532_+	histidine ammonia-lyase	A0A1V0S940	Catovirus	5.1e-70	37.2
WP_016210562.1|27560_29213_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210558.1|29286_30042_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556478.1|30322_31209_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211932.1|31619_32909_-	GDA1/CD39 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_148037496.1|33104_33605_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075285912.1|33772_34291_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211476.1|34608_34818_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211473.1|34801_35401_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211474.1|35475_36825_+	23S rRNA (uracil(1939)-C(5))-methyltransferase RlmD	E4ZFI6	Streptococcus_phage	5.7e-33	27.6
WP_032126518.1|36907_39109_+	GTP diphosphokinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211478.1|39125_39941_+	nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126519.1|39920_40640_-	TIGR00730 family Rossman fold protein	A0A1D8KUT5	Synechococcus_phage	1.9e-19	34.8
WP_075273327.1|40807_41383_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|41328_41694_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211265.1|41868_42531_+	adenylate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_016211263.1|42561_42930_+	thioredoxin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126514.1|42940_44257_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_051307354.1|44539_45115_+	DedA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126515.1|45190_45370_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211261.1|45542_45836_-	cold-shock protein	A0A2H4N7Y6	Lake_Baikal_phage	5.8e-15	61.5
WP_075273504.1|46025_46379_+|protease	ATP-dependent Clp protease adapter ClpS	A0A218MMY6	uncultured_virus	6.7e-10	40.0
WP_016211262.1|46433_48707_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA	A0A223W0B1	Agrobacterium_phage	1.0e-167	41.8
WP_016211259.1|48766_49012_-	translation initiation factor IF-1	NA	NA	NA	NA
WP_054300275.1|49136_50012_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211550.1|50089_50851_-|tRNA	leucyl/phenylalanyl-tRNA--protein transferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211548.1|50834_51791_-	thioredoxin-disulfide reductase	A0A2I2L5E1	Orpheovirus	1.6e-61	43.7
WP_016211549.1|52053_54558_+	DNA translocase FtsK	A0A218M9A2	Mycobacterium_phage	4.9e-86	43.1
WP_016211553.1|54561_55302_+	outer membrane lipocarrier LolA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|55641_56007_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|56063_56228_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081007013.1|56217_56517_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126933.1|56520_57822_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300276.1|57989_58964_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	4.0e-28	32.3
WP_016209411.1|59169_59964_-	inositol monophosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_016209421.1|60126_60915_+|tRNA	tRNA (cytosine(32)/uridine(32)-2'-O)-methyltransferase TrmJ	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP013768|100271:225185|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

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MESAIFKVSCFLVIVKKYKQSKIKQAEYRKTIIDKIKSINLFLGKSYGGDIAYLITFALTVYVDEFINLKVGHAEGESWELVQREIFDVDTGGNYFYKALNHIVDNKYYPKIVYQIYYFILKDGFMGEMVNYNNNIARDYLIQLEAKCAQRLKLGLDNTDKTLLFNEQAALVNQKVTKKRWFYLLAKKRYIVVTVILLYIISCLIIYLL

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211347.1|295919_296903_+	UDP-glucose 4-epimerase GalE	A0A2K9L5H6	Tupanvirus	2.1e-53	38.7
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WP_016211346.1|297144_297786_+	RluA family pseudouridine synthase	A0A2H4UV25	Bodo_saltans_virus	7.4e-07	28.8
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WP_016209626.1|321654_323547_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075278617.1|323551_323785_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273639.1|323913_324630_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209627.1|340151_341975_-	BamA/TamA family outer membrane protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209621.1|342533_343538_-|tRNA	tRNA dihydrouridine(20/20a) synthase DusA	NA	NA	NA	NA
WP_016209619.1|343970_345419_+	efflux RND transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_036777066.1|345505_348562_+	efflux RND transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_081007073.1|348544_348715_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046976.1|348780_348918_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274655.1|349214_349748_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126753.1|350744_351209_-	copper chaperone PCu(A)C	NA	NA	NA	NA
WP_016211466.1|351278_352799_-	RsmB/NOP family class I SAM-dependent RNA methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_032126752.1|352886_353489_-	NAD(P)H:quinone oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016211464.1|353485_353833_-	arsenate reductase (glutaredoxin)	NA	NA	NA	NA
WP_016211465.1|353983_354967_+	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	2.9e-34	32.7
WP_054300318.1|355594_356572_+	NAD(P)H-quinone oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_052104629.1|356719_357745_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_052047087.1|358195_358414_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274656.1|358585_359266_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274657.1|359470_359899_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300320.1|361044_361644_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300321.1|361861_362233_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155049135.1|362656_362803_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212346.1|363027_363174_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126540.1|363407_364271_-|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211749.1|364479_365673_+	fatty acid desaturase	NA	NA	NA	NA
WP_016211748.1|365752_367357_+	cytochrome d ubiquinol oxidase subunit 1	NA	NA	NA	NA
WP_016211752.1|367372_368518_+	cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
WP_129556531.1|368722_368920_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273313.1|368882_369221_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081007004.1|369180_369636_+|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP013768|454129:504919|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_129556524.1|482000_482888_+	MinD/ParA family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209791.1|487390_488113_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209778.1|495074_495449_+	iron-sulfur cluster assembly accessory protein	A0A218MM00	uncultured_virus	1.7e-11	38.5
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WP_054300271.1|499987_500962_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_075273327.1|501652_502228_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|502173_502539_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300345.1|502675_503755_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|503836_504919_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP013768|515990:636764|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211733.1|527913_528738_-	DNA/RNA non-specific endonuclease	X2KR27	Campylobacter_phage	2.4e-05	28.3
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530745:530804	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_052104693.1|586686_590553_+	ATP-dependent RNA helicase HrpA	A0A1V0SBU4	Catovirus	1.9e-49	26.2
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WP_129556518.1|591326_592724_+	autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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591078:591366	attR	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

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MKVVVFATFTSAGVVRRALTQAGFVVKKILSFAGKREMMRGWKKI
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MPMTREDWFKKASCPINESNNEKVTLYLDLDENVFSYHKKTKEWTKKLMLDILMF

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126803.1|669697_670930_+	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	7.5e-32	26.6
WP_016211764.1|671130_671952_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016211289.1|674925_675198_-	hypothetical protein	A0A1B0Z0G5	Vibrio_phage	3.2e-12	53.4
WP_016211286.1|675308_675656_-	50S ribosomal protein L19	NA	NA	NA	NA
WP_016211285.1|675673_676453_-|tRNA	tRNA (guanosine(37)-N1)-methyltransferase TrmD	NA	NA	NA	NA
WP_016211280.1|676452_676962_-	ribosome maturation factor RimM	NA	NA	NA	NA
WP_016211283.1|676997_677246_-	30S ribosomal protein S16	NA	NA	NA	NA
WP_016211281.1|677557_677893_+	ferredoxin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211282.1|678187_679438_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_032126762.1|679519_681547_-	NADPH-dependent 2,4-dienoyl-CoA reductase	NA	NA	NA	NA
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WP_016210147.1|683461_684634_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211219.1|836276_837554_-	FAD-dependent 5-carboxymethylaminomethyl-2-thiouridine(34) oxidoreductase MnmC	NA	NA	NA	NA
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WP_032126790.1|843474_844380_-|transposase	IS481 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP013768|880947:944226|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209935.1|917228_918173_-	protein translocase subunit SecF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	3.2e-38	35.2
WP_036777561.1|918194_920063_-	protein translocase subunit SecD	NA	NA	NA	NA
WP_016209930.1|920083_920437_-	preprotein translocase subunit YajC	A0A1B1IVR5	uncultured_Mediterranean_phage	3.1e-07	45.7
WP_036777579.1|920475_921591_-|tRNA	tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	4.8e-94	48.9
WP_016209932.1|921773_922814_-|tRNA	tRNA preQ1(34) S-adenosylmethionine ribosyltransferase-isomerase QueA	NA	NA	NA	NA
WP_016209945.1|922816_923851_-	LPS export ABC transporter permease LptG	NA	NA	NA	NA
WP_016209926.1|923847_924909_-	LPS export ABC transporter permease LptF	NA	NA	NA	NA
WP_016209931.1|925020_926493_+	leucyl aminopeptidase	Q6GYZ8	Mycoplasma_phage	7.9e-44	30.4
WP_052104625.1|926645_927089_+	DNA polymerase III subunit chi	NA	NA	NA	NA
WP_016209940.1|927163_929935_+|tRNA	valine--tRNA ligase	A0A1V0SK04	Klosneuvirus	1.8e-150	39.3
WP_036777555.1|930091_931321_+	multidrug effflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209947.1|931347_932010_-	carbonic anhydrase	NA	NA	NA	NA
WP_054300405.1|932531_933032_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081377365.1|933087_934239_-	group II intron reverse transcriptase/maturase	A0A0N7AE80	Bacillus_phage	7.6e-10	24.8
WP_075274669.1|934443_934746_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075274670.1|941304_942366_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_105962623.1|943072_944226_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP013768|947276:1014376|DBSCAN-SWA
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MKKLLLELQSVVDNKKEFRRKLNELLQDKQSVTQIKEQFNGFQNYRLPTDSQ
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MTLNLSKHGYETFEYLRDDYIPALNVTVTQYRHRQTGAEHYHIDADNAENVFLVGLRTVPTDSTGVAHILEHTALCGSEKYPVRDPFFMMIRRSLNTFMNAFTSSDWTAYPFATQNKKDFNNLLDVYLDAVFFSRLDPLDFAQEGHRLVFSEENNMDSPLMYKGVVYNEMKGALSSPSQQLWYILSSYLFPTSTYHYNSGGDPECITDLSYDELKAFYKKHYHPSNAVFMTYGNISASEHQQNFEEKVLSRFERSDDYVEVKPEKRYHAPVSIARAYPLDTASSGRQSYHVLAWLLGESVDLKSAFKAHLLSSVLLDNSASPLMAALEQTDLGSAPAPICGLEDSNREISFMCGLEGCAPESAEAFKTLVLNVLEKVAKDGIGQEKLAAALHQFELSQREVTGDGYPYGLKLILSMLTASVHRGDAIAAINIEPVLDELREEIKDPNFIKHLVQESLLNNPHQVLFTLNPDEKLTARKAQTEEKYLAELKGRLSTQAKQQMVELANKLKSRQEAADDPGILPKVTLNDVPGDIPKIEGLALNESGKIQRKYYTQGTNGLVYQQIVVDMPELNEAELKVLPLYTACLPELGAGELSYIDVQEAQARCSGGFNAYTTFKGQPDNEQYAKGYFVLSGKALARNYHDFNELMQKLFNQVRFDETSRLRELIAQIRASREQSIVSAGHSFVMGAASSGMSPVAKLHYQLEGLAGVKALKALDESLSDKTKVIALGQTLAAIHSKVMGNAKQLLMIGEENSQPLVENVQWQVEAAESNSKDTQLALASVQETVNCAWLMNTQVNFCSHAYKTVPSGHADAPVLTIIGGILRNGFLHRAVREQGGAYGGGATHDNDNGVLRFYSYRDPRLADTLNDFSASVEWLKKGEFLDEQIEESVLGVIAALDKPSSPAGEARQAFFNDLHGRSYEVRKRFRERALAVTREDIIRVARTYLNGDNVSTAVIASPALKSECENLGLTIFNL
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209803.1|991491_992529_-	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209810.1|992732_994646_-	molecular chaperone HtpG	A0A1B1ISV4	uncultured_Mediterranean_phage	6.9e-117	38.3
WP_036777933.1|995484_996609_-	2-hydroxyacid dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016209800.1|996605_997202_-	recombination protein RecR	NA	NA	NA	NA
WP_016209821.1|997232_997565_-	YbaB/EbfC family nucleoid-associated protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209812.1|997654_999478_-	DNA polymerase III subunit gamma/tau	A0A1L2BWV7	Bacteriophage	9.7e-44	40.5
WP_054300409.1|999924_1001637_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	4.3e-25	30.2
WP_016209815.1|1001954_1002494_+	DUF2975 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209799.1|1002880_1003297_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209805.1|1004340_1005834_+	neurotransmitter symporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126324.1|1006012_1006435_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209801.1|1006434_1008489_-	VWA domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209813.1|1008773_1009589_+	septum site-determining protein MinC	NA	NA	NA	NA
WP_036778458.1|1009689_1010508_+	septum site-determining protein MinD	NA	NA	NA	NA
WP_016209808.1|1010504_1010873_+	cell division topological specificity factor MinE	NA	NA	NA	NA
WP_016209806.1|1011215_1011365_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212343.1|1012177_1012984_+	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	W8CYX9	Bacillus_phage	7.7e-09	42.9
WP_129556499.1|1013222_1014376_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.5e-58	44.2

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP013768|1020893:1066038|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126362.1|1061615_1061981_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016212519.1|1064521_1064902_-	taurine catabolism dioxygenase TauD, TfdA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300423.1|1064976_1066038_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP013768|1083607:1127040|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_CP013768|1148195:1203585|DBSCAN-SWA
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MIKNVVFDLGGVLFDWDPRYLYQELLPTVAEVNYFLENICTNEWNKEQDAGRSLVEGTRVLIEKYPEHAELIRHYYSDWPKSLKGEIAGTVEILSELKQSGFNLYALTNWSAETFVYAKNNYDFLNDFIDIVVSGEEKCVKPDAKLYQILLDRNHINANASLFIDDRQENIDTALTLGMKGILFTSPEQLRDQLEIFALI
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MARVTVEDCLTRVDNRFQLVLVAAKRARQLAYGSEATLTWENDKPTVMALREIAEGKVTRDILNEDEQ
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MSAFNFLNIPGNAASPVDLVGLVQRQLEGEAVDLKSCYLNIQGQAFSESQLNGRKTLVAFDLAELNPAWYEKELEQARIKKIREVQSTKLNDKTYPDANFYILSFLVACLDYYTKISFEEIDRLSGNLLESLNTKLLFLSFLEENFTESFEEIDLKEFYLAHARELAAGEYTKLLDKVKFKETDIIINALASASSSHVICQDANFFSAEQVLKLNEKASRGITALYAQLASTLKSPKQHFDHNFESLIHSNQYFKIKPIYNAMYLHAEYVAHALTKQEGVAQHAVRFAYGYIYPLLNSDIARFLNGDKDVTAEGLNQFIDEQYLKYQTVVESVLMSYLSSFTDVSLRENRAGWLAENTAVNMDLISTCNDNGRLTYVEGSRSLSSLKTSQYALTGKAAGELLSTYPEVGLQQVYAKNLVEGSKIDSRLNKLQKLTEERFARYGEQYREDNLAKLACAVIGDYATGRWRWRSHFKKEGQHFLQEHRDLLGKGQLTSADKWRLLQAVRALHSQIHSSADFSDSSSFSTRLAFLEAKISEQLEFECEAKFKEVEADMQRELVGVTTSKGAKDLLEKVHALEKQVDRSLADMGGPFRMRLVLLESKVFEMLENISLEEALNAAVLAGYDQVVKVESAREALIMQAGLEKLAMQEQCQTLSVMSR
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MSTTKGTLYIFSAPSGAGKTSLVKALTKTLTGINVSVSHTTRPMRHGEVNGSHYHFVSKEQFQSLIQKGQFLEHACVFGNDYGTSHAHIQEQLDQGLDIILEIDWQGGAQVRKLIPESISIFILPPSRQALQERLTGRGQDSTEVINQRLHEAHEEMQHFSEYDYLIINDDFDQALKELTVIVQAKRLKVEKQKITHLLLIEELLA

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016209891.1|1149237_1149936_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit type 1 TsaB	NA	NA	NA	NA
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WP_122940402.1|1150966_1151590_-	porin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126745.1|1151798_1152401_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_105962625.1|1153581_1154468_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_032126686.1|1156712_1157297_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063519.1|1158770_1159187_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210465.1|1159473_1160316_-	NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase QueF	I6XGV6	Vibriophage	5.2e-32	35.3
WP_016210463.1|1160366_1160714_-	cupin domain-containing protein	A0A1V0SH58	Hokovirus	9.2e-20	42.1
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WP_016210468.1|1162505_1163225_-	TIGR00266 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300435.1|1163293_1165006_-	ABC transporter ATP-binding protein/permease	NA	NA	NA	NA
WP_036777098.1|1165153_1167091_+	AsmA family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210458.1|1168606_1169155_+	DUF2147 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300436.1|1169471_1172063_-	bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210459.1|1172227_1172746_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075285947.1|1172950_1174069_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211720.1|1174316_1175240_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211716.1|1175253_1176177_+	PAS and helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126595.1|1176124_1176781_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211719.1|1177083_1177911_+	class II glutamine amidotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_052133280.1|1178351_1178723_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210314.1|1183453_1184503_-	arginine N-succinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_054300438.1|1184626_1186741_-	ATP-dependent DNA helicase RecG	NA	NA	NA	NA
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WP_016210308.1|1187370_1188096_-	ribonuclease PH	NA	NA	NA	NA
WP_016210307.1|1188181_1189072_+	YicC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126592.1|1189112_1189733_+	guanylate kinase	A0A143DIC6	Abalone_herpesvirus	2.5e-20	36.3
WP_016210310.1|1189793_1190000_+	DNA-directed RNA polymerase subunit omega	NA	NA	NA	NA
WP_016210316.1|1190021_1192175_+	bifunctional (p)ppGpp synthetase/guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase	A0A2I2L310	Orpheovirus	1.1e-12	37.1
WP_054300439.1|1192181_1194164_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046953.1|1194435_1194576_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556499.1|1194584_1195738_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	1.5e-58	44.2
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WP_075274682.1|1197390_1197822_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300442.1|1198033_1200130_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211538.1|1200824_1201748_+	GGDEF domain-containing protein	A0A127AWB9	Bacillus_phage	1.1e-24	42.1
WP_054300443.1|1201986_1202265_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081007046.1|1202317_1202566_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300444.1|1202523_1203585_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP013768|1210886:1268172|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210199.1|1256414_1257176_+	orotidine-5'-phosphate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP013768|1335676:1383103|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016212612.1|1337926_1338160_-	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
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WP_129556449.1|1338633_1339140_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212572.1|1339197_1339590_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|1339719_1340085_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274691.1|1340141_1340450_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|1340541_1341117_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_080728364.1|1341580_1341853_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126774.1|1342461_1342797_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307356.1|1342956_1344489_-	apolipoprotein N-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016211407.1|1344521_1345361_-	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211411.1|1345357_1345855_-	rRNA maturation RNase YbeY	NA	NA	NA	NA
WP_016211412.1|1345858_1346851_-	PhoH family protein	A0A0S0MVD6	Pseudomonas_phage	9.3e-49	45.1
WP_016211408.1|1346965_1348312_-|tRNA	tRNA (N6-isopentenyl adenosine(37)-C2)-methylthiotransferase MiaB	NA	NA	NA	NA
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WP_016212287.1|1349674_1350820_+|tRNA	multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'-cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/2'phosphatase	A0A0F6YPT7	Sinorhizobium_phage	2.7e-60	41.7
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WP_016211371.1|1357475_1358399_-	badF/BadG/BcrA/BcrD ATPase	NA	NA	NA	NA
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WP_016211369.1|1360033_1361077_+	SIS domain-containing protein	F2Y1G4	Organic_Lake_phycodnavirus	5.2e-18	28.4
WP_016211370.1|1361119_1361563_-	Rrf2 family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211374.1|1361695_1362886_+	NO-inducible flavohemoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_016211373.1|1362940_1363087_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212140.1|1363637_1364555_-	EamA family transporter RarD	NA	NA	NA	NA
WP_036794860.1|1364822_1365116_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080664878.1|1365192_1365387_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300462.1|1366405_1367323_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210876.1|1367788_1368631_-	isopenicillin N synthase family oxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016210873.1|1368698_1369349_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	4.1e-21	36.6
WP_016210874.1|1369363_1370404_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	Q58MH8	Prochlorococcus_phage	1.5e-68	44.0
WP_016210882.1|1370526_1371612_+	DUF2066 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210872.1|1371638_1372748_+	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_016210879.1|1373078_1373438_-	multidrug efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
WP_080664847.1|1376769_1377723_-	LD-carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|1377795_1378857_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212048.1|1379620_1380178_+	disulfide bond formation protein B	NA	NA	NA	NA
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WP_054300464.1|1382041_1383103_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>NZ_CP013768|1471351:1559820|DBSCAN-SWA
ATTAAGCAGCTAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGATTTTGGGCACAGATATTCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATTATGTCAATGGTAGGCCGTGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACCGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAGTTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACACTGACTAGAAAAGACACCTTCATCTTTGGCTTTTTGGTGAGCGGGTGGAAATGAAGCGTGCTTGTCGACATTCACAACACGCGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCATCGCCGCTTTGGCATTTTGCTGTCGGCTGAGCATCCAGTCCAAAGTATGGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAACGACCTTTGATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAGCGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAGCGGCCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATGATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTCTACCCACAGCAATTCACTCTTAACTTCCGTTGATTGCTACACCCTACTCAAATCTAAATTTTTTGCAACAGTGCCCAAGCATCAACCTTCAAGAGCAAACCATGACAACTAATGCCTTAATCCCAAGTTAAATTCATGGCATACTAGCAAACAATCTTTGATAAATTATATGAATATACTGAGGTGATATAAATTAGGCCATGAAGAGAAAAACGAATGTTGGCACCGTGCGCATTATCAGTGGGAAATATCGCGGTCGTAAAATTACCTTTCCAGCACTTGCCGGAGTGCGTCCAAGTCCGGACCGCATTCGCGAAACGCTCTTCAATTGGCTGATGGATGATATTTACCAACAACGCTGCTTAGATGTCTTTGCCGGTTCTGGAATTTTAGGCTTAGAAGCGTTATCGCGAGGAGCTGCTCACCTTACCGCTTGGGAGCAACAAAAAGACCTGGCCAACCACCTGCAGCAGCAACTTGATGCACTCAACTTTAATGATAACGCGAAGGTTCAATGTGCAGATAGTTTAACCCTTTTAAATCAAACCTGCCCTATCCCTTATAATCTTGTTTTTCTAGACCCACCTTTTTATCAAAACCTCATTCCAATCTGCCTAGAAAGGCTGATATGCAATCATTGGTTACAATCAGAGTCTTATCTATATATAGAGACTGAAGCAAGCTATGTACTGGACTTAAAGCCAAACTTAGATAATAGCTTAACACTGTTGCGCAGTAAAAAAAGTGGTGATGTTGCATATCACCTGCTAAGCTATCAGCCCACTGTATAAGGTGATGCAGATAGTGCAGCGCGACTTGCTTTACAGCAAAGCCAGGCTAACAATAGTGGTATTTTTACTCAGCTTAATTTTACAATAACAATAATTGAAGCAACTACGAATACAGGACAAACAGCTATGCCGGTGAGCTTATTTGATTTATTTTCCATAGGGATAGGGCCATCGAGTTCCCATACCGTTGGACCAATGCGCGCAGCCCACGCTTTTCTAGAAACCCTAAGCGCTGAGCAATTTAACAATATCGCCAGCCTCGAAGCCCATTTATATGGCTCACTCGCCTTAACAGGCAAAGGCCATGCCACCGATAAAGCCACCCTGATGGGGTTAGAAGGCCATCTACCTGAGTCTATCGACCCAGCAATCGTTGAACCTCGCCTCTATGAAATTATTACGCAAAAGACCTTAAATTTAGCTGGGAAAAAAGAAATTTCTTTTGATATCAATGAGCAACTTGTTTTTCACTGTGATGAATTCCTGCCCGAGCATGCCAACGGTATGCGCTTTGATGCCTTTGATGCCCAAGGCAATAAATTAATTGAAAAAACCTACTTTTCAACCGGCGGTGGTTTTATTGCCGATTTAAACAGTTTTCACCAAGAAAACAGTCAATCAAGCAATCAAAATCAGCAAGGCCCTCAACTGCCCTATTTATTTAACTCGGCCGAGCAATTACTCGCCTTGTGCAAACAGCATAATAAAACCATTGCAGAGCTGATGTGGGACAATGAACGTGCTTGGCGTAGCGATGAGCAAATAAAATCCGGCATCCTCGAGCTATGGCAAGTTATGGATGCATCGATAGAGGCTGGCACAAGAACCACAGGCCTTCTTCCTGGTGGGCTGGATGTAAAACGCCGCGCTCCCGAACTCTATAGAAAACTCAAAGAACAACAAGAAAATGGCCGTGGCTATGATGCCATGAGCTGGCTGGCCCAATATTCTATTGCTGTTAATGAAGAAAATGCCGCTGCCGGTCGCGTCGTCACAGCACCAACCAATGGGGCAGCAGGTACTATCCCAGCGACAATAAAATACTATCTTAACTTCGAGCAAGATGCCTCTGAACAAGGCTTGATCAACTTTATGTTAACCGCTGCCGCCATTGGCATTTTATACAAAAAAGGTGCCTCAATTTCAGCCGCTGAAGTCGGTTGCCAAGGCGAGGTTGGTGTCGCTTGCTCAATGGCTGCCGCAGGCTTCGCTGCTGCACTGGGAGCGACTGTTGAGCAAATTGAAAATGCCGCCGAAATTGGCATGGAGCATCATTTAGGCCTTACCTGCGACCCAATAGAGGGCCTGGTACAAATCCCCTGTATCGAACGTAATGTCATGGGGGCAACCCAAGCGATTGCCGCCGCACGCCTAGCGATGCTCGGCGATGGCGAGCATAAGGTCTCACTTGATAAAGTCATCAAGACCATGCTGCAAACCGGTAAAGATATGATGTCCACCTACAAAGAAACCTCTCAGGGGGGACTTGCCGTTAATTTACCGGAATGCTAGCCCTTCCAAGTAACACACACTAAACTAAAAATAATATAAAAATAACATGCAGAAAAATTGCAGATCCACTGAAATTCGCTTACCCTTAGGTCAGTGAATTTCAGTTCAAATACAGGCACAGGTACGGGTAAAACAGCAATGAAAACAAAAGTAAATAATAAAATACAACGCAACTATGTCAGCGATATTAGTAAATTATTAAATACCCTGTCACAAAATCACCCTAAAACAGAATCACAACGCCAAGAAATCGACAAAGCCACGCGCATTACAGCAAAGATGACAAAATAATTACTCAATACCCGCCTTAACAAGCCATCCACAACATGGGCCTGTGCTTATTAAGGCCTTACCTTTAATATTAATAAAATCATTATCATTACATTAGCCTAGTGCAGGTTCGTTGTAACAACCCTCAGCACAATCAAGGCCAGCAAGAAAGTTGTTGGTCGATTCTTTAGTATCACCAATCCCAGTCAAGCGACGAAACCAAGGAAAACTCGGCTGATAAGTAAGAGCAACAGCCTTTATCTTTTTATTGCTTCAAATTTTGCCTCTACAGTGAAATCAGGATTAGGGTCTTTAATAATTTCACAAACCTGAAGTGCTCTTTTTGATACAGAAAAAAACTGACCTTCCACTTCAAGCTTATAGCGAGAACCACCATACCCAAATTTAAACTCACCACTTTTTGCCTGATTTTCAATTGATAAACGTATATCCTGCAGTATTTGTTCCTTACAAGCACTTAGGCACTCAACTAACTCAGCTTTTAAACTCTCATGGCCGTCTCTGTGAAAATAAGCTTTCTGACTGCCTTTTCCCCAAAACGCTTCTTTTTGTTGTAAACCAACTAAAAAAGTGTAACTATCTCTTCCCGATCCAAGCCCATCAACTTGACCTAAGAGCTCCTTAATAACTGCAACTCGACTTCGAGAGTCAATTTGCTCCACATCCTCAGCAGAATCAATACTAGGACTCGGATCAGGCACCGGCTCCGGCTTTACATTCTTCTTGGCCAAAAACTTAGACCCGAGCGCCTTAGCCTTAGCAGCAAACTTATTCGCTATACTAGTAGCATTATCAACAACTTGATTAACATTGCGCTCGACCCCATCTCGACTCACAAACTTACTTTTTTCATGCCTTTTGATATTTAATAACAACTCTTTTATGTTATTTTTTAAATCTTGTAATGCCATACTCATTTCCACCATCAATCAGAGATACACCCATTAAGAACAATTTACATAAAAAACAATAATTTGTATATATTTTACATAAATTTAATGTAAATTTACATTATAGCTAAAACTCTAATCTAACAACTGTACAGTTTAAAGTCATAATTTCCCCTGATTCTCCTTGGCCCATTAAAACTTATTTGTAATCTCGCTTGGTCAATTAAGATGAGAAAAAATCATCGCTTAACTTAAATTTAAAGCCAATAGGCGACTGTCGTTCCCTGGTGAGGATATTAAGTTTTCAATACGGGCTGTATCAATTTAAAATATAAATAATTCAAATAGATAATTATAAAACCCGCTTCTTGCGACTATTTTTCATTATTACATTTAATATAGTTATTAAGGCTTAGTAAAATTTGACAAATTATCCGAGTAGAGTGATAATTTTCCAATTTTGCGTTATGATAAGAAGACTTGGCATTTCCTTAGAGAAGTCAGCAGCGCCACGAGGATTTAACTCTTTGTTAAGACTAACCGTTTTATTTTTGATCATTGCTTTATCCGCGCCTGGTTTTGCCGCAGATTTTATCACGGCCAACCATGAATTTCAGGCAGGCCAATTCAAACAAGCATTTGAAGATAGTATTCCCTTTGCACAAGCTGGGAACCTACAGGCATGTCTTGAAGTCGGATTTATGTATGAATTTGGCAAAGGTGCCAAACAAGATGCAAAAGCAGCAGCACAGTGGTATCTGTCTGCGGTACGCCCTAACGCATTTAACGCTCG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MLSTPWLAALEKEFSELLNQKEVKKNRRVLELAKSVRSEESSFSDDKWSEIEGAFSLDSELKNRCQECFSDAASHGVLSTG
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MNVKNTMKLVFGVIAFGIFISVAMVLELNNLLKKVNEEAKIRYQSYQAADELRQSSDDLTRLARTYVITGDEKYKKMYMDILSIRNGQKARPQNYHSIYWDLVLEYGQKPKPDGEKVALKSTMRKLGFTEHEFQLLKQAQQNSDTLVKMEVRAMNAVKGLYPDSSGNYSQHGIPDLTTAAKILHSKKYHNEKSNIMIPINNFFKELENRTDRQLRIAEQKVENVVLTASISLISVLVISILGYIILNHQVVKPIEQMAHVLRQVDSKSDLTLRVDENSNNELEVIGNSINKVLASYAKTIIKIGEVNSTISSISHSIQSITEENINMAEEQTAEVKMATKAMEEMTVALSDVVRSTNMAEQHADSAEKEASTSKSVFNKTTKEFTELESEFTITARTIQQLAEESNNVGNVLDVIKAIAEQTNLLALNAAIEAARAGEQGRGFAVVADEVRSLAQRTQYSTGEIESIILMLQGKAKESTENIHSSTEKMQSTRSNMGIANEALSTIQGSVIEIHKLNTSIVTATTEQLEVSDEISGNLSNIKQLSLSMNTVVNQLEPFVVDLERNVGDLNKVVSSIRT

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016210945.1|1472273_1472864_+	16S rRNA (guanine(966)-N(2))-methyltransferase RsmD	NA	NA	NA	NA
WP_016210946.1|1472990_1474376_+	L-serine ammonia-lyase	NA	NA	NA	NA
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WP_032126574.1|1476084_1476462_+	sel1 repeat family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210948.1|1476474_1476711_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210951.1|1476710_1476917_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036779389.1|1477099_1477819_+|tRNA	tRNA (guanosine(46)-N7)-methyltransferase TrmB	NA	NA	NA	NA
WP_016210954.1|1477907_1479692_+	SLC13 family permease	NA	NA	NA	NA
WP_036779399.1|1479790_1480045_+	DUF2282 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_144019244.1|1480401_1481013_+	amidohydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|1481500_1482229_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016211812.1|1482310_1483924_-	DEAD/DEAH box helicase	A0A2I7RG64	Vibrio_phage	9.2e-62	32.6
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WP_032126570.1|1484331_1484631_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|1484847_1485576_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016211951.1|1485752_1486850_+	glutamate 5-kinase	A0A1X9I5D0	Streptococcus_phage	3.9e-48	34.3
WP_016211949.1|1486883_1488134_+	glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase	A0A1X9I5D4	Streptococcus_phage	1.6e-93	46.3
WP_054300202.1|1488273_1489002_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_016212193.1|1489124_1489463_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212195.1|1489530_1489917_-	type II toxin-antitoxin system VapC family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016212196.1|1489913_1490159_-	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_054300475.1|1490567_1491296_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	5.6e-43	41.4
WP_016211625.1|1491779_1492649_-	UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase GalU	A0A127AW70	Bacillus_phage	1.2e-68	47.5
WP_036779883.1|1492645_1493995_-	UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase family protein	A0A127AXI2	Bacillus_phage	2.1e-75	37.2
WP_016211623.1|1494107_1495748_+	glucose-6-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_054300477.1|1496470_1497199_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	5.6e-43	41.4
1496659:1496718	attL	NA	NA	NA	NA
WP_054300478.1|1497478_1499215_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	1.3e-24	44.0
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WP_016212213.1|1500916_1501426_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|1502025_1502754_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_054300479.1|1502904_1503945_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211653.1|1504142_1505168_-	L-threonine 3-dehydrogenase	R9TPW0	Vibrio_phage	2.3e-18	78.8
WP_016211652.1|1505275_1506481_-	glycine C-acetyltransferase	V5LQ39	Emiliania_huxleyi_virus	2.5e-35	26.6
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WP_016211051.1|1511103_1511607_+	methylated-DNA--[protein]-cysteine S-methyltransferase	A0A167R6J9	Powai_lake_megavirus	1.1e-13	43.5
WP_016211050.1|1511569_1512277_-	dethiobiotin synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016211044.1|1512345_1513206_-	malonyl-ACP O-methyltransferase BioC	NA	NA	NA	NA
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WP_016211052.1|1513990_1515244_-	8-amino-7-oxononanoate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016211049.1|1515243_1516206_-	biotin synthase BioB	NA	NA	NA	NA
WP_016211056.1|1516249_1517002_+	ComF family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075273327.1|1518848_1519424_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210615.1|1520330_1520801_-	DNA starvation/stationary phase protection protein	A0A0A7RTZ1	Clostridium_phage	2.1e-19	35.7
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WP_016210617.1|1521774_1523199_+	bifunctional D-glycero-beta-D-manno-heptose-7-phosphate kinase/D-glycero-beta-D-manno-heptose 1-phosphate adenylyltransferase HldE	M4QSA2	Synechococcus_phage	1.4e-16	42.3
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WP_016210625.1|1526363_1527110_-	SDR family oxidoreductase	Q06VL0	Trichoplusia_ni_ascovirus	1.3e-18	30.8
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WP_054300201.1|1535618_1536347_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	9.6e-43	41.4
WP_036780093.1|1536450_1537272_-	M48 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016211722.1|1537281_1540584_-	type I restriction endonuclease subunit R	A0A220A398	Liberibacter_phage	1.7e-54	27.1
WP_016211323.1|1542011_1543109_-	Fic family protein	D7RWK9	Brochothrix_phage	1.0e-27	28.3
WP_016211325.1|1543098_1544619_-	type I restriction-modification system subunit M	A0A2H4PQP4	Staphylococcus_phage	7.3e-85	38.9
WP_016211322.1|1544681_1545272_-	restriction endonuclease subunit S	NA	NA	NA	NA
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WP_016212230.1|1554367_1555816_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155046946.1|1558939_1559215_+|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	NA	NA	NA	NA
WP_054300489.1|1559217_1559820_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	6.5e-37	46.2
1559280:1559888	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP013768|1605104:1656542|DBSCAN-SWA
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MKKTSLAVISLGLLSVASLTQAATVAKTVCNINITVPSNPSSQGETQYSDVDFNAIGSDGIVLGTISNLAPGKHKVLPIECSTSEVTGVKLFAEPHYKTNNNESFNASYGSYQYIGNGSESQPGEILLGSTGVSVTFTTRDTSGHPQFVEVSSEAANKKFNDIKF

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_032126310.1|1616729_1617989_+	inorganic phosphate transporter	E5ESL8	Bathycoccus_sp._RCC1105_virus	5.9e-24	34.7
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WP_016210981.1|1639986_1640625_+	ribonuclease T	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP013768|1717231:1750615|DBSCAN-SWA
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MKETGFGIFSTFLIINTVILAVCFSLIFSNVFASQNVKERNWSDIWRELENISYQQYDIFEHDTSDSDAFWQGMEYMDKDSGIVVDLRLSGAKVTH

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016210381.1|1735641_1736112_-	23S rRNA (pseudouridine(1915)-N(3))-methyltransferase RlmH	NA	NA	NA	NA
WP_016210374.1|1736148_1736484_-	ribosome silencing factor	NA	NA	NA	NA
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WP_036777781.1|1745188_1746853_-	ubiquinone biosynthesis regulatory protein kinase UbiB	E5ERK4	Ostreococcus_lucimarinus_virus	5.4e-33	28.5
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Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

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MLENKKVVLGVSGGIAAYKSAELVRRLVEQGAQVQVVITAGAHAFITPLTLQALSGRPVRDSLLDPEAEAGMGHIELARWADVILIAPASANSIAKLAAGMADDLLSTLCLASRVPIAIAPAMNQQMWQAPATIENIRTLQRRSVQIWGPAEGEQACGEIGPGRMLEPLALCQALDQHFTLKSKKADFAGKTVLITAGPTRENIDPVRYLSNYSSGKMGYALAERARDRGARVILVSGPVRLTAPAGVTVLAVESALQMRDAVMAHVSETDIMIGAAAVADFRPEHVETQKIKKGAATSMQLYLVKNPDIIAEASKHLERPFTVGFAAETHNQEEYANKKLVEKELDMIAMNDVSRQDIGFNSDENSLRVLWPEGERVIEKASKFSVADQLLDNIKDHYEAKSKN
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MSDNILDVTDGDFDTEVLQSSTPVLVDFWASWCGPCKALSPVLAEIASQYEGKVKIVKVNVDENTQTPQKYGVRGIPTLLLVKGGAVTATKVGALNKAQLTSFVDSNI
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MQRNMPKSTPKIIKLKNDQYEKIHHFRFLKNDNKARIWTSKYQVRCSTAQKIISDYCKKKKPLYILSGSHDNKSGENAITNKKLKEQSFFLEDKECYETISPRIKIIDITMLTKKEYKSLIRNTARDALLFYCYSRNDTVVKEALRCASPEALYTRETPPPTP
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MIEKLRNIAIIAHVDHGKTTLVDKLLEQSGTLGRNESGERMMDSNDLEKERGITILAKNTAIQWQDYRINIVDTPGHADFGGEVERVLSMVDSVLLLVDAVDGPMPQTRFVTKKAFEQGLNPIVVINKVDRPGARPDWVMDQVFELFDQLGATDEQLDFPVVYASALQGYASLEEGELGGDMTPLFKTIIEKVAAPDVDPEGSFQMQVSSLDYSSYVGAIAIGRISRGKISTNSAIRIIDHQGNERSGRILKIMTHHGLQRVETEQAFAGDIVCVTGIERPFISETFCSPDKVEPLPALTVDEPTVSMMFCVNNSPFAGKEGKYVTSRQIRDRLEQELIYNVALRVENTEDPDKFRVSGRGELHLSILIETMRREGYELGVSRPEVILKEIDGKLQEPFEELMLDIEEQHQGTVMERLGLRRGQLTNMIPDGKGRIRLDYQIPTRGLIGFHNDFLTMTSGSGIMTHVFDHYGDIQEATIITRQNGVLIANATGAAVGFALWNLQERGKLIIGPQTNTYEGMIIGIHSRNNDLVVNVQKAKQLTNVRASGTDENIQLTPPIRFTLEQALEFIEDDELVEVTPEHIRLRKKMLAETDRKRASRAKK
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MSPRQPVGIDHSGIMVGGESLLRKIEQGPRQELFYEVEAAKPEGALEQGLRFIAEELVEQAEFSEPDPFAEQEPELPKEIKVDELEADLGQVLAIDNEVEIHQGPRLEGEEELYSSQKSSLVDAAALEEEKAGDLEDSLGQEVGLSEFHQGGDSAGLLGSAERLQKFAPEEEDDVFKSGWLAGDSFSLSLSSDELELQQTDGSELTEEFLESPESLQGDLATEWSGTFEPGRLDDNPFSLSSLSDEPEQCVTAEVSSECSEQLETLQEYVLEDVAVQEKSALVLMEDLLEEAILKEGAGLSAGEEPIIIKEGHFQPVSLELVEITDSCKLVSALSKLTQNTIAELEATVASASYFFSWNDPDSSKGSIKELKAFQMLLNAEGIDGSLNDKPIELIELAVGDYCANKVGCKDTQIISSFLKKVAKVLGNFRVAPCAGTSSVQDEDGGGWTRVGGISEVESAVDGWTNVDVVSSESEPAATGRAVMDEGDEFELVGQIPQSASLFQERHNAVDQQSSASNMSQSYPQ
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MRDKIKLVSSAGTGHFYTTDKNKRTTTEKLEFKKYDPVVRKHVLYKEAKIK
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MPNHKVNKDKFITLNTHDYHELLMLLAPCPLAFCTLLKCTHSKKSNIILIKKKKLDQLLSHGLSALCCEKSIRLPATLDNKTTHLNLAKANKQSHTTIELIGLY
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MSNLLQHIQNFLHELRKSERKVGEWVLNNSQAVIHLSITDLARYAEVSEPTVLRFCRNIGCQGYQDFKLKLAQSLVSQPKTPITLTEITAHDTSTSLKEKIFQGAAIALQNAQHDIDASILDEAIATILAARRVGIFGFGASGVVAQDALHKIFRLSIPAIACMDSHMQSMTALMLSQGDVMLAISRSGRTKEIIESVNLAKNAGATVIGITSHGTPLANVATLGLTTAATNDTELYTPMTSRLIHLSIIDALAIGIAIKRKHTISEHLSRVKEASAIKKFQQE
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MQNTVTPTHINNNVLLYTKNISQRLVGEDKQTQHILDNINFTLYDNEIVAILGKSGAGKSTFLRTIAGLLPASSGKAYHQDTLIEKPIEEIAMVFQSFALLPWLTVLDNVCFGLDAQGMSKSTSKAKALKAIQLVGLGGYEHAYSKELSGGMRQRVGFARALVVEPKILLMDEPFSALDIGTASTLRKDIIRLWQEHAIQTRSMVIVTHSVEEAVTMADRVIVFDHHPGRIAFETHILTDHPRDIQSANLREKIALISEQLLEGAH

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300168.1|1903769_1904633_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075274701.1|1904929_1905982_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046999.1|1906270_1906678_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211702.1|1907438_1908689_-	malic enzyme, NAD-binding domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_032127042.1|1908791_1909010_-	50S ribosomal protein L31	NA	NA	NA	NA
WP_036777591.1|1909467_1910322_+	SIS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210728.1|1910376_1910847_-	peptide-methionine (S)-S-oxide reductase MsrA	NA	NA	NA	NA
WP_016210732.1|1911153_1912533_-	phosphomannomutase/phosphoglucomutase	A0A127AWJ1	Bacillus_phage	5.1e-53	31.6
WP_016210726.1|1912560_1913019_-	dUTP diphosphatase	G0YQD9	Erwinia_phage	4.2e-52	69.6
WP_032126740.1|1912996_1914214_-	bifunctional phosphopantothenoylcysteine decarboxylase/phosphopantothenate--cysteine ligase CoaBC	Q9HH70	Methanothermobacter_phage	3.7e-39	34.2
WP_017375944.1|1914405_1914642_+	50S ribosomal protein L28	NA	NA	NA	NA
WP_016210730.1|1914655_1914811_+	50S ribosomal protein L33	NA	NA	NA	NA
WP_075274702.1|1914891_1915854_+	alpha/beta fold hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210735.1|1916013_1917330_+	MATE family efflux transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210727.1|1917339_1918008_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210734.1|1918370_1920185_+	translational GTPase TypA	A0A1S5SF82	Streptococcus_phage	3.8e-24	45.1
WP_016211543.1|1921670_1923422_+	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016211544.1|1923432_1924233_+	ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	5.8e-33	38.6
WP_016211545.1|1924335_1924824_-	dihydrofolate reductase	A0A1B2IDT7	Erwinia_phage	2.4e-29	43.7
WP_032126435.1|1924996_1925311_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375799.1|1926331_1926676_+	DMT family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210038.1|1932368_1933331_-	D-2-hydroxyacid dehydrogenase	M1HUT5	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	8.8e-20	27.0
WP_016210039.1|1933517_1934777_-	transcription termination factor Rho	NA	NA	NA	NA
WP_016210045.1|1935000_1935327_-	thioredoxin TrxA	A0A1J0GW78	Streptomyces_phage	1.5e-16	46.2
WP_052104566.1|1935521_1936472_+	Ppx/GppA family phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_032126434.1|1936529_1938596_-	polyphosphate kinase 1	NA	NA	NA	NA
WP_016210049.1|1938601_1939597_-	porphobilinogen synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210042.1|1940182_1941763_+	APC family permease	NA	NA	NA	NA
WP_016210041.1|1941919_1943329_-	glutamate--ammonia ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016210047.1|1943388_1944522_-	cation transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016210033.1|1944661_1945486_-	mechanosensitive ion channel	NA	NA	NA	NA
WP_016210034.1|1945713_1946343_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210044.1|1946679_1947051_-	isochorismatase	NA	NA	NA	NA
WP_016210046.1|1947354_1947642_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126431.1|1947793_1948642_+	pantoate--beta-alanine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_016210037.1|1948769_1949810_+	succinylglutamate desuccinylase	NA	NA	NA	NA
WP_129556667.1|1949882_1951460_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300165.1|1952103_1952763_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|1952917_1953892_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
WP_054300164.1|1953967_1954987_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556602.1|1955385_1955595_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300162.1|1956469_1957552_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
WP_054300161.1|1957599_1958661_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211201.1|1958741_1959050_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_081007001.1|1960942_1962229_-	multidrug effflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211205.1|1962301_1963198_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_016211203.1|1963284_1964283_-	ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126430.1|1964391_1964916_-	shikimate kinase AroK	NA	NA	NA	NA
WP_075285964.1|1965163_1966144_-	type IV pilus secretin PilQ	G4WZN6	Enterobacteria_phage	4.8e-13	24.1
WP_075285965.1|1966155_1966527_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212222.1|1966948_1967422_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

>NZ_CP013768|1979390:2033644|DBSCAN-SWA
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGIPITQISKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
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MDKKQAKTIADVIVNEEVMPFLRSLEPQMISDEVFLSFCQTVILTTTKAMHDFCMSYQEFEHKEIWLEAVKDKIHQGVDKFFNTESGKLDLKTMPKNFFNNL

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_155047002.1|1984364_1984970_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036776867.1|1985340_1986738_-|tRNA	asparagine--tRNA ligase	A0A167RLM0	Powai_lake_megavirus	1.8e-77	34.4
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WP_016209722.1|1991053_1992097_-	TrbG/VirB9 family P-type conjugative transfer protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209715.1|1995537_1995894_-	trbC/VIRB2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_081377360.1|1996673_1997837_+	HlyD family efflux transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
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WP_016209712.1|2003389_2005270_+	biosynthetic arginine decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_075274705.1|2005354_2006953_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016209700.1|2009215_2009974_-	tryptophan synthase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
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WP_016209711.1|2011158_2011830_-	phosphoribosylanthranilate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016209717.1|2012630_2013629_-	anthranilate phosphoribosyltransferase	A0A0N7IRD9	Acinetobacter_phage	5.2e-39	32.7
WP_016209697.1|2013630_2014209_-	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	2.8e-45	45.0
WP_016209713.1|2014205_2015675_-	anthranilate synthase component I family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209719.1|2015718_2016006_-	trp operon repressor	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2016137_2017112_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_054300152.1|2017935_2018301_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046757.1|2018357_2018513_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273401.1|2018657_2019110_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300151.1|2019147_2019480_+	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_155047003.1|2020968_2021854_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212372.1|2022040_2022262_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212371.1|2022377_2023010_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300148.1|2022987_2024049_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036776841.1|2024488_2025028_+	peroxiredoxin	NA	NA	NA	NA
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WP_032126698.1|2027051_2027360_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_129556608.1|2028412_2029123_+	VUT family protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>NZ_CP013768|2043756:2085738|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_032126694.1|2043756_2044716_-|tRNA	methionyl-tRNA formyltransferase	E3SNR5	Prochlorococcus_phage	2.2e-10	35.9
WP_016210340.1|2044808_2045312_-	peptide deformylase	E3SLL2	Synechococcus_phage	1.4e-13	37.1
WP_016210346.1|2045446_2046598_+	DNA-protecting protein DprA	NA	NA	NA	NA
WP_016210342.1|2046594_2047074_+	DUF494 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126693.1|2047220_2049542_+	type I DNA topoisomerase	A0A1V0SCS0	Indivirus	2.3e-98	35.7
WP_080664839.1|2049486_2050113_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210344.1|2050117_2051017_+	oxygen-dependent coproporphyrinogen oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_129556610.1|2051089_2051668_+	DUF4823 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210347.1|2051968_2052226_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_081006998.1|2052810_2053266_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	1.3e-21	41.0
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Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

>NZ_CP013768|2145130:2194864|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

>NZ_CP013768|2241660:2373633|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300271.1|2241660_2242635_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_054300162.1|2369896_2370979_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
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WP_105962623.1|2372480_2373633_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8

Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

>NZ_CP013768|2388994:2453363|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_22

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_016211607.1|2394391_2394616_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155046705.1|2421937_2422105_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_129556442.1|2425317_2427690_+	phosphoenolpyruvate synthase	A0A1V0SGR7	Hokovirus	2.8e-160	35.3
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WP_054300523.1|2429865_2430888_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_032126492.1|2433440_2434415_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210121.1|2434404_2436177_+	single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

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MRVMEVAAGYGYISEKVYPFSKRLTINDLDEKPLISFKSKFSDTSKLCIVSGNILDCSFEENSLDAIFCSRLIHFFNPDEVKVFFENCHKWLSQHGKLFLTCETPYLNNWKSFIPVFELKKNNGIKFPGYVTQISDYESLGHSENLPKYMNFFDDDVLETVVNQFNFKVDECFLFSRKGFLPDEITFDGRESVGLIAEKV
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_129556623.1|2538422_2539982_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	3.0e-09	24.9
WP_051307335.1|2540003_2541038_-	EF-P beta-lysylation protein EpmB	NA	NA	NA	NA
WP_016210643.1|2541086_2541656_+	elongation factor P	NA	NA	NA	NA
WP_122940481.1|2541791_2542763_+	elongation factor P--(R)-beta-lysine ligase	A0A1V0SAC0	Catovirus	2.8e-21	25.3
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WP_016210649.1|2548212_2550201_+	excinuclease ABC subunit UvrB	NA	NA	NA	NA
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WP_054300510.1|2551392_2551575_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126362.1|2551631_2551997_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126128.1|2552913_2554320_+	capsule biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210501.1|2554337_2555324_+	UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting)	K7Y9E1	Megavirus	4.9e-42	34.2
WP_016210490.1|2555326_2556481_+	UDP-4-amino-4, 6-dideoxy-N-acetyl-beta-L-altrosamine transaminase	A0A2D2W2B8	Stenotrophomonas_phage	1.3e-14	28.6
WP_016210502.1|2556477_2557173_+	pseudaminic acid cytidylyltransferase	A0A1B1IVD3	uncultured_Mediterranean_phage	1.5e-08	35.5
WP_016210500.1|2557307_2558798_+	UDP-2,4-diacetamido-2,4, 6-trideoxy-beta-L-altropyranose hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_016210494.1|2558818_2559868_+	pseudaminic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210496.1|2559934_2561329_-	capsule polysaccharide biosynthesis family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210489.1|2562207_2564139_+|tRNA	threonine--tRNA ligase	A0A2K9L297	Tupanvirus	2.3e-120	36.5
WP_075273353.1|2564143_2564674_+	translation initiation factor IF-3	A0A2L0UZ54	Agrobacterium_phage	4.7e-15	33.9
WP_016210493.1|2564708_2564903_+	50S ribosomal protein L35	NA	NA	NA	NA
WP_016210495.1|2564945_2565305_+	50S ribosomal protein L20	NA	NA	NA	NA
WP_016211706.1|2565724_2566720_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit alpha	A0A2K9L3A8	Tupanvirus	2.5e-33	37.4
WP_016211707.1|2569118_2569406_+	integration host factor subunit alpha	A0A0H3UZA0	Geobacillus_virus	3.0e-08	33.7
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WP_075273615.1|2572495_2572594_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300507.1|2573078_2574368_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210485.1|2576113_2577055_-	hypothetical protein	A0A068C8G6	Acinetobacter_phage	2.3e-20	26.5
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WP_032126625.1|2582246_2582819_+	DNA-3-methyladenine glycosylase I	NA	NA	NA	NA
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WP_122941726.1|2584610_2585534_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
2585842:2585901	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_016212146.1|2589582_2591322_-	PLD-like domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046941.1|2591723_2591987_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300502.1|2593416_2594094_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	2.9e-09	30.8
WP_016212477.1|2594266_2594512_+	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_054300501.1|2594723_2595452_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	7.8e-45	42.7
WP_016212066.1|2595811_2596588_+	N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase	NA	NA	NA	NA
WP_016212069.1|2596799_2596967_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212070.1|2596941_2597541_+	DUF1353 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|2598310_2599039_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
WP_075285972.1|2599113_2601480_-	autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155764078.1|2601431_2602394_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|2603073_2603802_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
WP_017375910.1|2604097_2604826_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
WP_016212268.1|2604982_2605567_-	recombinase family protein	W6CWV1	Ralstonia_phage	5.9e-27	38.0
WP_016212269.1|2605570_2606254_-	Fic family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300201.1|2606735_2607464_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	9.6e-43	41.4
WP_155764079.1|2607493_2608168_-|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	A0A2L1IV36	Escherichia_phage	6.8e-27	45.9
WP_054300202.1|2608370_2609099_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_052047116.1|2609401_2609581_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047061.1|2609725_2609992_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273432.1|2610252_2610987_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	5.7e-43	41.8
WP_016212023.1|2610983_2611976_-|transposase	IS3 family transposase	Q6H9S3	Enterobacteria_phage	1.1e-17	33.7
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WP_054300202.1|2613608_2614337_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.5e-43	41.8
WP_051307368.1|2615043_2616324_+	AAA family ATPase	Q7Y3Y6	Yersinia_phage	7.3e-38	33.5
WP_016211918.1|2616323_2617292_+	ParB/RepB/Spo0J family partition protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016211642.1|2617895_2618249_+	toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_129556455.1|2618549_2619152_+	class I SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_054300203.1|2619156_2619615_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081377362.1|2619922_2620525_+	queuosine precursor transporter	A0A2H4J2N7	uncultured_Caudovirales_phage	1.5e-09	30.8
2619801:2620089	attR	NA	NA	NA	NA
WP_036781052.1|2620991_2621594_-	LexA family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

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>NZ_CP013768|2645981:2686359|2663791_2664583_+|WP_054300208.1|DBSCAN-SWA
MRYLAFFLAVILLVSGCASTVPTVAPYSDYPHVYACPNKLSTLCYRTAIAQVGRRFQYSQLSFQLPIALQAPLRQGKLELQEYYVKSLVFPSSLPLSGLGLLTSYLYPFGLYATKIIRLENLTDQRLDIVNVHVVTRLQQSQSLLAVLNQMQAQPAHYFGNSATESVKLLASGTRSLMVSVGVGGQSEPVAIIYMLVDLKLYNGNQGYLLYSLARKSIGPTFVLNVEKKLFSENKNILKKVITSDFFSIKHSPYAQVINILIA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300173.1|2645981_2647043_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016210908.1|2648254_2649070_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126716.1|2649160_2650144_+	transaldolase	V5UTB0	Synechococcus_phage	2.2e-13	32.9
WP_016210913.1|2650314_2650836_+	pantetheine-phosphate adenylyltransferase	A0A1B1IVQ3	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-27	43.8
WP_016210914.1|2650869_2651121_+	YfhL family 4Fe-4S dicluster ferredoxin	A0A1B1IWY9	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-20	58.8
WP_016210909.1|2651126_2652404_-	na+ dependent nucleoside transporter family protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307343.1|2653096_2653624_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210906.1|2653743_2656056_-	RNA-binding transcriptional accessory protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126715.1|2656184_2657000_-	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210915.1|2657197_2657662_+	DUF4402 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|2657791_2658853_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211491.1|2659113_2659410_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211489.1|2661157_2662210_+	2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein	M4QRZ2	Synechococcus_phage	5.3e-10	41.1
WP_036779281.1|2662199_2662655_+	arginine repressor	NA	NA	NA	NA
WP_155046991.1|2662679_2663003_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126199.1|2663350_2663662_-	DOPA 4,5-dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_054300208.1|2663791_2664583_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155764081.1|2664560_2665190_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075285974.1|2665156_2665621_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036779278.1|2665740_2666694_-	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016212075.1|2666807_2667005_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_052047032.1|2667217_2667451_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_142396463.1|2667561_2667678_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212074.1|2667764_2667986_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300209.1|2668012_2668378_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046696.1|2668434_2668599_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_016209523.1|2707827_2709177_-|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssK	NA	NA	NA	NA
WP_016209510.1|2709227_2709665_-	type VI secretion system lipoprotein TssJ	NA	NA	NA	NA
WP_075274721.1|2709926_2711438_+	DUF2169 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036778935.1|2711443_2712670_+	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209528.1|2712663_2713692_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209514.1|2713669_2714362_+	DUF3540 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155049805.1|2714363_2715836_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036778941.1|2715828_2716317_+	type VI secretion system contractile sheath small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_051307310.1|2716322_2717795_+	type VI secretion system contractile sheath large subunit	NA	NA	NA	NA
WP_032126187.1|2717794_2718193_+|plate	type VI secretion system baseplate subunit TssE	NA	NA	NA	NA
WP_016209524.1|2718189_2719878_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209506.1|2719859_2720816_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209515.1|2720858_2721374_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209526.1|2721478_2722411_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	1.2e-21	25.8
WP_016209534.1|2722630_2723017_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209530.1|2723033_2723678_-	2-polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone monooxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_016209504.1|2723858_2724698_+	carbon-nitrogen hydrolase family protein	M1I6H3	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	2.0e-15	28.8
WP_016209502.1|2724773_2725376_+	signal peptidase I	NA	NA	NA	NA
WP_016209512.1|2725376_2726231_-	RNase adapter RapZ	NA	NA	NA	NA
WP_016209537.1|2726587_2726899_-	ribosome-associated translation inhibitor RaiA	NA	NA	NA	NA
WP_016209519.1|2726923_2728315_-	RNA polymerase factor sigma-54	NA	NA	NA	NA
WP_016209538.1|2728470_2729202_-	LPS export ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	1.3e-20	30.7
WP_054300558.1|2729198_2729726_-	lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA	NA	NA	NA	NA
WP_016209499.1|2729757_2730315_-	LPS export ABC transporter periplasmic protein LptC	NA	NA	NA	NA
WP_016209498.1|2730320_2731301_-	KpsF/GutQ family sugar-phosphate isomerase	A0A2P0VNK5	Tetraselmis_virus	6.0e-32	30.4
WP_016209539.1|2731440_2732241_+	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.6e-25	32.7
WP_036780687.1|2732244_2733012_+	lipid asymmetry maintenance ABC transporter permease subunit MlaE	NA	NA	NA	NA
WP_016209535.1|2733008_2733473_+	outer membrane lipid asymmetry maintenance protein MlaD	NA	NA	NA	NA
WP_016209507.1|2733495_2734149_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209517.1|2734152_2734500_+	STAS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209505.1|2734533_2734785_+	BolA/IbaG family iron-sulfur metabolism protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209518.1|2734859_2736128_+	UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016209527.1|2736130_2736889_+	Nif3-like dinuclear metal center hexameric protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209508.1|2736950_2737841_+	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209511.1|2737891_2738575_+	uracil-DNA glycosylase	A0A0R5YU95	Harp_seal_herpesvirus	2.3e-46	49.5
WP_075273445.1|2738660_2738918_-	DUF4286 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274722.1|2739190_2741344_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210408.1|2741335_2742208_-	DNA replication terminus site-binding family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210409.1|2742375_2744205_+	class I poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_016210411.1|2744367_2745009_-	BON domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273448.1|2745250_2745781_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210404.1|2745798_2745972_+	50S ribosomal protein L32	NA	NA	NA	NA
WP_016210402.1|2746030_2747080_+	phosphate acyltransferase PlsX	NA	NA	NA	NA
WP_016210405.1|2747086_2748037_+	ketoacyl-ACP synthase III	NA	NA	NA	NA
WP_016210406.1|2748090_2749035_+	ACP S-malonyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210415.1|2749062_2749800_+	3-oxoacyl-ACP reductase FabG	NA	NA	NA	NA
WP_016210413.1|2749888_2750131_+	acyl carrier protein	A0A1P8VVJ5	Erythrobacter_phage	2.0e-05	39.7
WP_016210403.1|2750205_2751429_+	beta-ketoacyl-ACP synthase II	NA	NA	NA	NA
WP_016210400.1|2751460_2752309_+	aminodeoxychorismate lyase	NA	NA	NA	NA
WP_016210401.1|2752305_2753358_+	endolytic transglycosylase MltG	NA	NA	NA	NA
WP_032126181.1|2753478_2754099_+	dTMP kinase	A0A1L2BX49	Bacteriophage	4.2e-39	44.2
WP_054300218.1|2754114_2755146_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2755189_2756164_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>NZ_CP013768|2844467:2889905|DBSCAN-SWA
TATGGAACCTTTGAAACACGCAGTTAGTCCTGTTGGTGTGACGGGGTTGGGAAGCGATGATAAGGATGCGATTAGCGATGCTTTAACAAGCTGCCTGCCACGCCTGATAGGCGCACGGCAGCTGTATTTAGGTTTCAGTGGTGGTCTTGATTCCCGTGTTCTTTTAGCCGCATTGATGCGGTTAGCAGAGCATTACCCACACTATCAAATTAAAAATAAACTCACTGCAGTCCATGTTCATCATGACTTAAATGCTCAGGCGGATGCTTGGGCTGAGTACTGCCAGTGTGTTTGTCAGTCTTACCAAATTAATTTTATTTGTGAGAAAGTCAGTCTGAATTTAAGTCAATTATCTTCGGGACTTGAAGCGGCTGCTCGCACAGCCCGTTATGGGGTGTTTAAAAAATTCATGCAAGAGAGTGACCTATTATTGTTAGGTCAACATGGCGATGACCAGATTGAGACGGTCTTATTGCAGCTGTTTCGCGGTGCCGGGCCACAGGGTTTGGCAGCGATGGCTAAAGAGTCTCAATTTTCAGCTGACGATGACCGTATAGTCTTGCGGCCATTGTTAGAACTTAAGCAAATTGATTTAGCGCATTATGCGCGCGATCATCAGCTAGACTGGGTGCATGATGATTCAAATGATAATTTAAGGTTTGAGCGCAATTTTTTACGTCATCAAGTGTTACCTAATTTGCATCAACGTTATCCTGGATTAATTGATACAGTTGGTCGTAGTGCACGTTTATGTGCTAAGCATAATGAGTTGCTTAATGCCTATGTACAGGAGGATTTAGTTAAGCACCTTACTCATCAGGGTCAAAGTAACGTGGGTAATAATTATTTAAATTTAAATTTAAATAATAGTCTATGTTCTAAATATTGCTTGAGCTTATTTAAGCTTGCAGGATTTGAGGCTTATTCCTTGGCGCGTCAAAAGGCCTTGATTCGTGCTTGGCTTGCCCACTCTCAGGTGCTGATGCCAAGTGAAGTAAAGCTTACTCACTTAATTCATGATGTCTGTTTGGCTAAAGTTGATGCTCAGCCCATGCTGACATGGGGACATTGGCTATTGCGTCGTTATCATGGCCATTTGTATTTATTTGATCAACAACAAGACGATAGTCATCATTGCTGTGCTTATCATTTACAAGAACAAACCTGGGGTGGTGAAACAGTCACGCTTGAAAATGGCCAGGTCATCTCAAGTCAGCATTTAGTTGACCTGGGTGTAGATTTGGCACACTGGGATTGGCAAGGCGTGACGATTGGCTTGCGACAAGGCGGTGAGCGTTTTCACCCTCAAGGGCATCCGCATTCGCAGCCGTTAAAAAAGTTTTTACATGCACAAAAAATCCCGCCTTGGTTACGTGAGCAGCTAATTTTGGTCAAACGCGATCAAAAAACAGTGGCAATTTTAGGTCTTGCTCTGGCCGCGCAGGGCGAGTAATCAAAAAGAAATAATGGTAGAGGACTTTAATATATATGTTCGGGCTGATTAAGCAAACAACAGCAAGTGTCAAAGATGAGGTTTTATCCGGGGTTACGGTAGCGATGGCGCTGGTTCCTGAGGCGGTTGCGTTTTCCTTGGTTGCACATGTTGCCCCTTTAGTGGGTTTATATGCGGCTTTTATTATGTGTACATTGGCGGCGATTTTAGGTGGGCGACCAGGGATGATCTCTGGGGCGACCGGGGCGATGGCGGTTGTTATCGTTGGTTTGGTCTCGCAATACCCAGGTTGGCAAGGCTTACAATACCTTTTTGTGACGATTATTATGACTGGAATTTTAGAAATTTTAATCGGTGTGCTGCGCTTAGGGCGTGTGGTGCGAATGTTACCACAGCCGGTAATGTTTGGTTTTGTGAATGGCTTGGCGATTGTCATTTTCTTAGCGCAACTCAAGCAGTTTCAGTTTAACGATGCGAATGATGTGATACAGTGGGTCAGTGGCAATTCATTGTATATTATGCTGGGTTTAGTTGCATTAACGATGGTGATTGTCTATGCATTGCCTAAGATTACGCGCTTTCTACCTGCGGCATTAGTAGCGATTTTAGTAGTTACGGCACTTGTGCATATGTTTGGCTTAGAGACGCGCACAGTGGGTGATCTGGCATCAACGGCAGGAGGTTTTCCTAAGTTTCATGTGCCGGATGTTATTTTAAACTGGCAGACGATTAAAATCTGTTTGCCGTATGCGGTGATTTTAACCATTGTTGGCCTGACAGAATCACTCATGACCTTAACGTTGATTGATGAGCTGACCGAAACGCGCGGTCAGGAAAATCGAGAATGCGTAGCCCAAGGAGTTGCTAATATCACCTGTGGGTTTTTCGGTGGTATGGGGGGCTGCGCAATGATTGGTCAAAGTATGATCAATATTAACTCCGGAGCACGTCGACGTTTATCAGGTATTATTGCAGGCTTAGGCTTATTAACGATTATTCTGGTTGCCTCGCCACTCATTGCGCAGATTCCCTTAGCAGCATTAGTTGGCATTATGTTTATGGTGGTGATTGGAACGTTTGAATGGTCTAGTTTTAGAATTTTACACAAGATCCCAAAAGTCGATGCCTTTGTGTTAGTTCTCGTATCGGCAGTGACAGTATTTAGTAATCTGGCAACCGCCGTGATTGTTGGTGTGATCGTCGCAGCTTTAGCCTTCGCTTGGAAAAGTGCCAAGAATACTCACTCTAAAACCTATATTAATGAGGCAGGTAGTAAAGTCTACCAACTGGAAGGGCCATTATTTTTTGCCTCAGTATCTAATTTTAAATCGCTATTTACGCCGTATGACGACCCTGAGGATGTGATCGTTGATTTTGATAACTCGCGTGTGTGTGATCATTCGGCGTTAGAGGCGATTAACCAGCTGGCTGAACGCTATGATGCTGTGAATAAAACGTTGCACCTAAGGCATTTAAGTGCAGATTGTCGAGTCTTATTATCGAAGGCAAAAAATAAAGTTGAGGTGAATATCTTGGAAGATCCCACCTATCGAGTTGCTGAATAAAATACTAGGGAGCTTTAGCTCCCTTTTTTGTTTTTATATCAAAACAGCTGGTGTGGACAATGTGGTGTGGGTATATGAGTAGTAATTTATATGCTGCTGCTAAGAAGTAGAATTTAAGGGAGAAACTTAGATAAATTGACGCGAAACAGGTTGGTTTATCAGAGGCTGGAGACGGCAGTCAATAAGCTATTTTATTTCAAGCCCTTATTATTTAAATTAATTATTGAGTTGTAATTTTACTATCTATTTATTTTAATATGTATTGTTTATCACTTTTAATGAGTCAGAGTATGTTAAAGCAGTTAAATTTAAAGGGGCGATAGCTTCCCTTGCTTAAAATTTACTTTACATGTACAAAAAATTGCTTTAATTTTTAGATTGTAATCTCCCTATTTTAAAAGCATGAGTGCTGTGCAGTTATATTTAGGAGAACAAATCGAATACTTAAAAGCAGGTTATCACAGCAGTATTTTAGATGTAGCATAAAAATATAAAGCCTGATTATTATCCTAAAGTTAGCTTGTTCTTTTTTTAGCTAGCAGAATTATTTTTAACATTATCTGTTGGAGATGACTATGTTATTTGAAGATTTACAGGCGAGTGTGCTGAGGTTATTAGAACATGTTGCTATAAGTTTACCTGTTGCTCAACCAGACGGTAATTTTGAAGAGGAAGTTCATAGAGCTATTAGCTTTCTTAGTAAGCTTGAGAAGCAGGTAGAGAGAGCCAAATCGGCGGAAGTTCTCCTCGATATTTTAGTTTGTCTTCAAGAAAGTCACTTAGTTGGTGCATACGACTCTGTTTTACAAGACAAATTGTTAGCAGAATATATTCTAGCTTGTGAAGAAATGGTGGGGATAGCTGCTAAAGAGATAGGGGTAGCAGCTAAAGAGATTGTTGAGTGGGGACCATCATTGAGGGATGAACTATTAGTTGCTGGGGTGGCGCTAACTAGTGAAAAAGACAGTGAACTAAGCATAACTGCTTTAGAAATGGAATCTTCTAGTGAGCTTAGCCTTAGTGATGAAGAAATAGTATTAGACTCAGAGGTCACTGCACAGGAGGCAGATTCTCCTGATGGACAAGTGGAGGTTATTAGTCAGCACTGGACTGAAGAGAACGCAGCTCTTTTGGCTGTTATTCGCCAGAGATATAATATCCTTAGTCAGAAAGTAGCAGATACCCTGAAGGGAGTAGAAGACTCTCTTGATAGGCTTCCTCCTCGTCATAGCGTAAGGGTTGATGTGCAGCAAAGCGATGATACAGGTACTTTGAATCAAGTATATAATGGGGAGCTAGTCGCAGAGCCAAGTACAAGTGCTTTAGGAGCAGGAACCTCTAATCAGCTAAGTGTAGGTGTTCAAGTTGTAGAACAAAGCGCAAATATTCCAGAGACAGAATCTTCTCATCAATCTAGTACGAGTCTCCAAGTCGCAGGGCCAAGCACTAGTGCTTTAGAGGCCGAGATTTTTCTTCAATCCAGTGTTAGTGATGAAGATGAGTCTATTAGTACAGGTGCTAGCTTGTCATTAGAACAACAAGCACAGAGTGTTGGACAGAGAGCAGAAGTTACAGGCCGGGGATTTGACCTTTGTGAACGGCAATTAGAGAACTTTAAGAAGCAGGAAGCTGCTTGTGAGCAAAGGTTAGATAATTGTGTAGAATCACTCACTACTCTTGAAATACGAATACAGCACCTTCAACAAATGCTGTCTGCTAGGCGGCAAAAGCTAGGGGCTACAAGTACTCAAACTGCAGAGCCAACCCCAAGGACTCCAGAAGCAGGACCTTCGCATCAATCAAGAGCAAATGACCAAACTGTAGAGCCAAGCCCAAGTACTCCAGGAGCTGGAGCTTCTCATCAGTCAAATATGAATATTCAAGGTGGACCCTCCGCACAGCAAAGGCTAGATTTAGTAATGCAGAAGATTGTGAGGGATGCTCAAGCTGGACGTTTTGAGTTGGGGATCGGTGGCAGTACA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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_075274726.1|2871153_2872038_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300240.1|2872294_2872498_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|2872797_2873772_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_054300271.1|2875566_2876541_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.8e-28	32.3
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WP_016210745.1|2877132_2877753_+	DUF2272 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

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TATGGATACCAGCTTAATTGGTTTGTTTTGTATTGTCGATGACTTTTGTCAGGTTTTCTTGCCTCACTGGAAAGCCTCATTACTTGAGCACCAAGATAAGCAGCGCAATAAACCAAGCCGCATGTCAACGAGCGAAATAATGACCATCATGATTTATTTTCATCAATCCCACTATCGTAACTTCAAACATTACTATCAAAGGGAAGTCCAGGGCCATTTGAAAAAATACTTTCCCAAGGTAGTGAGCTATAACCGATTTGTTGAATTAATGCCAACTATATTACTCCCTCTGTGTTTTTTTATTGCCGCTCAAAGAAAAACACCTACGGGAATCTATTTTGTTGATTCAACCGTACTACGAGTCTGTCATCATAAACGCAGTCATCAAAATAGAGTCTTTAAAGGACTGGCTAAAAAATGTGGTTCAACGATGGGCTGGTTCTATGGCTTTAAGCTTCATCTAATTGTAAATGATATGGGGGAGTTGATGGCCTTTAAACTCAGTCAGGCAACAACGGATGATCGCGTTGTATTACCTGAAATTGCTCAAGGTCTGACAGGTAAGATTATTGGTGATAAAGGTTACATTTCACAAGATTTATTTAACAGGCTTTATGAAAAAGGACTGCAATTAATCAATAAAATTCGCAAGAATATGAAAAATAGGCTCATGCCTATCATCGATAAAATTTTACTCAGAAAACGTGGAATTATTGAAAGTGTATTTGATCAACTTAAAAACATCTCACAAATCGAGCACTCTAGGCATCGTAGTGTCAACAACTTTATGGTCAATATTCTTGCTGGATTAGCAGCCTACTGTCTTCAGGAGAAGAAGCCATCGCTTAATATCCAGCGTAATCTATTGACCAGCTGAGTTATATCGAACTCACGTATTTTAGTTAAACATTAATTAAAAATGAGTTGAAAGTCGGCAGATGCCGACTTTTTTATAAAGAATCACCGTGTGAGATGACCCCGTTGATATTCTTCTTGAAAATAGTTAGGTAAATCCTTAGCTTAACTCAGTGGCGAGGCTTGTTTAATAAGACTTTCTGTTTCCGCTGAGGCTATTATAGTGTTATGATTTGTAAACAGTTACACAGTCGCATTGCGTGTAGGAGCCATTCTTTTGATTAAAGTCCTCATTGTTGATGATCATGAATTGATTCGTGTGGGTATTAAGCGTTTATTATCTGATGTACAAGGGATTGAAGTTATCGGTGAGGCAGAAAGTGGTGAAGAAGCATTGCAGTTTATTCGCCAAAGTCGACCGGATGTTGTATTGATGGATGTAAATATGCCGGGCATGGGCGGCTTGGAAGCGACTCGCCGCTTATTACGCATTGATCAGGATATTCAAGTTTTAGCGGTAACAGTTTATGGTGGAGAACCTTATCCTTCACGTGTTTTGCAAGCAGGTGCTGCAGGTTATATCACCAAGGGAACAAATATTGATGAGATGGTGCGAGCGATTCGTAAAGTGCATGTCGGCCAACGTTATATTAGTCCTGATGTTGCGCAGCAGCTTGCTTTAAAGCACTTAACCGATGATGATACACCATTTGATCAACTGTCTGAGCGAGAGATGCAAGTGATGATTATGATTACCAGTGGCCAGAAGGTTCAAGAAATTTCTGATCAGCTCTGCTTAAGTCCAAAAACTGTCAATAGTTATCGCTACCGTTTATTTGAGAAGTTAAATGTAAACAGTGATGTTGAGTTAACACATTTAGCGATTCGTCATGGTATGCTAGATCCATCTGTTCCAGTTTAGCCTCTTAATTGATTATTTTACTACACGTGCATGGGGTTTGATGCAGCAGCATTTTTAATGACCGTTCCTGATTTGCCCGGAGTCTATCAGATGATAGATAGGCAGGCGAACGTTATTTATGTGGGTAAAGCAAAAAGCTTGAAAAAGCGCCTTAGTTCTTATTTTCAAAAAAATCATGCTTCAGTCAAAACAGAGCGTTTAGTAAGCCAAGTTACAAGTGTTGAAATCATTGTGACTGATACTGAAAAAGAAGCGTTGTTGCTTGAATGCTCTTTAATTAAAACCTTAAAGCCTCGTTATAATATTTTATTGCGTGATGATAAAAGTTATCCATATTTGGTACTAAGTGTGGGTGATTTTCCTAGTTTAACCTATCAGCGTGGGGGTAAACGGCAGGCGGGTGAGTATTTTGGTCCTTATCCTGATGCAGGAGCGGCAAAAGCAGCACTTAACCTTTTACAAAAAACGTTTAAACTGCGCTCTTGTGAGGAGTCTGCTTTTAAAAATCGTTCACGGCCTTGTTTACAACATCAAATTGGTCGTTGTACTGCGCCTTGTGTGGGCTGGGTGAGTGTGGAAGATTACCAGCTTAATGTGAGTCATACTCGATTGTTTTTGCAGGGGAAAAGCCAGGCTTTAATCGATCGGCTGGCGAGTGAGATGGACAGTGCTTCAGAGCAATTAGCCTTTGAAAAGGCTGCACAATTGCGCGATCAAATTACCCATTTGCGTAGAACAATGCAGCAACAGGCGGTGGTTTTTGAACAGGCTAAAAGTGTTGATGTTATTGTTTTATTATTAGATCAGGGTGTGTTGTGTATTCAGTTGATGATGTTGCGTGAGGGCTGTTTACTAGGCCATAAAAGTATATTTTCAAAGTTTGACTTGGACTTTGAACGTCATGAATTATTAGAGTTATTTTTAGTGCAGTGGTATCTCGGATCTGCTCGAGAGTTGCCTGCGCAAATTTGTATAGAGCAGCCTTTAGCGAATCAACAACATATTGAGACAATTTTAACTGAACAGCGCGGACGTCAGGTAAAAATTCGTGCGCAAGGGCGTGGACTTGCGAAAAAGTGGTTGGCTTTAGCAAGCCACAATGGCCTACAGGCGCTTAAAACACATCTAGCAAAAAATACGCATTATCAGCATGGATTTACTGAATGTTTGGCTGAGCTGGGCTTGTCTGAAGCAATTAGTCGGATTGAGTGTTTCGATGTGAGCCATACCATGGGGCAGGCGACGGTGGCATCATGTGTGGTATTTAATTGTGATGGGCCATTGAAGAAAGAGTATCGGCGTTTTAATATAGCAGGAGTAAAGCCAGGTGATGATTATGCTGCGCTTGCTAATAGTATATTGAGGCGCTACCAAAAAATAACTCAGTATGAGCTTGATACATGCTTATTATTGATTGATGGCGGGCGTGGGCAGTTTAATGCAGTTGTGACAGCACTGAACGCATTAAATTTGACTGCGCAGGTGCTTGCTATCAGTAAAGGTCCTGGACGTCGCCCGGGACTTGAAGTATTGCACTTATATGGGGGTGAAGCACGTGTTTTATCAGCAGATAGTGCAGCATTGCATTTCTTACAACGGGTGCGCGATGAGGCGCATCGATTTGCAATTGAAGGACATCGTGCAAAACGTGGTAAGATCACCTCTGTAATAGAAAGTATTGCCGGGGTCGGGCCAAAGCGCCGCAAGACATTACTGCATAGTTTTGGTGGTTTACAAGAGTTAAAACAAGCACGGGTTGAAGACATTGCGCGAATTGATGGCATAGGCGATGCTTTGGCACAACGTATTGTCCAAGCACTAAAAGATAAGGTTTAGGAGTGAGTAAGAAGGTGAGAATGATGCGGATGCGACTGCCAAATATTTTAACATTATTACGTATGGTGTTAATCCCTGTTTTCATACTGATTTATTATTTGCCTTTTACCTGGGCACCATTAGCGACGGCGATTATTTTTGCGGTTGCTGCGGTGACAGATTGGTTGGATGGCTTTTTAGCCAGGCGTTGGAATCAAACCTCAGCTTTTGGTGCATTTTTAGATCCAGTGGCAGACAAGCTGATTGTTGCCGTGGCCTTGGTACTCTTAGTCAGTACGTTTGCGTCAGCATGGTTTGCACTGCCTGCAGCGGTGATTATGTGTCGAGAGATTTTAGTGTCCGCTTTGCGTGAATGGATGGCAGAACTTGGTAAGCGTGCAGCAGTGAAAGTCTCTCATATAGGTAAAGTCAAAACAGTCGCTCAAATGATTGCATTATTGGTATTGCTCGTTCAAAAAGCACCGGCTCAAGGTTGGCAAGTGTGGGATTGGCCGATTTGGTTTGGTGTGGCATTAATGTATGTTGCAGCCGCGCTGACGTTATATTCAATGGTTATCTATATAAAATCCGCCTGGTCGGACTTGACTTATTCCATGTAGTCTATATAATTCATTCCAGATTTGTTGAGGCATATCAAAGTGGTATGACTTAAGTGTAGGTAAGCAATCCTGCGTTGATGGCCGGATGGCAGAGTGGCTATGCAGCGGATTGCAAATCCGTGTACCTCGGTTCGACTCCGGGTCCGGCCTCCATAGTACAGATCATTGCCCGGGTGGCGAAATTGGTAGACGCAAGGGACTTAAAATCCCTCGGTGGAAACACCGTGCCGGTTCGAGTCCGGCCCCGGGCACCATTGCTTGAATTAGTTCGTATTTTGGCCGGATGGCAGAGTGGCTATGCAGCGGATTGCAAATCCGTGTACCTCGGTTCGACTCCGGGTCTGGCCTCCATAATACAGATCATTGCCCGGGTGGCGAAATTGGTAGACGCAAGGGACTTAAAATCCCTCGGTGGAAACACCGTGCCGGTTCGAGTCCGGCCCCGGGCACCATTCTTTACTTCTTTTCTATATCAGATATTTTAAGAGCAAATTTAGCTTTATTTTCCTAGCCCATGTGACCGACTTTATATTTATAGTGAACACTATTTTGGCAAAGGGATATAGGTTTTGCGTTCTGCTATTGCAAAGTCAGGAGTTTCTGCTTGCTGCTGATAAGTAAACAGTAATTGAGAGCTGGGAGATTGATTGGCTTGAATATTTATCTTGCTGAGTAATCGAGCACAAGGGCTTTGAAAGTCAGGATAATTAATTTTTAAGTTAGAAGTAGACAAGAGCTCAATCTCATGCTGAGAGAGCTGACTTTCCAACTGCTCTATGCTTTGCTCT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MKENKTNIYIACALTNMKKSVFANYSNHIKQLALWLKQKNIQLNTP
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MSLSVNYQQEIEVRAPIGTPWQEINAFIQDRAAWIKQRQTEFADLYTKVDYQYITNEVHYFLGRSYQLRVYSSRRNDLIINKNNKSQSRDDKRVLYLGVHALSNPESALYQWYRQQATRVFSARYDYWLKQAQEKLIIDWELSLNVVIKRLKSRWGSYSTRGRINLNLELIRYPQRCLDMIICHELCHVRELRHNKRFFNFLTKLYPDWQEQSQLLSRLSMKY
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MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVIALNE
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MPLSTLNEVQNQYALYFKQACLNTSQSFITRGSIKNGGASVGIENIEGHFTDQEIESKFKVLKESLRGCSPSERSDLLNNFSLFINNKTNHDVDTVRVLAFFKDKDITDLTFLEILYLEAINFEASAALQIAFYKTNQTKTDTEEGVLATQAQKSLFTSVADLFLSQLNLSYHPNIFANLDKIGLGNQPEYIQGALKCSQQLNDEDYQLLKEMSEDLKEMYQAIKNHVALSSEPSSNNNSDSFLSSLFSCFATQKLDLEARFKQYQSRTIETFFDFFTPDNKNQSQEALKAQLSQLKADFLSSSDSSFQSSLSSPLNRAETQNNQPSPSSPLLFSQQQAAAAHSTAPTPEPSPY
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MRNLSNTSKAHSPVLISLIAGVEYYDFAILAILAPSLSRVFFPNLHLSIDPLFAIYAIGALFRPVGSIMWGHFADRYGRKKTLITTSFIMIFSTLCISILPNGHQAPIFSPIALLTLRCLQGVSLGGDASSAAVLIAETVSNKKRGFYVSFVFAMNSLGSLLAAAMAYLLLKITPANVMLEWGWRIPFVFGAFLLIICLIFRSGVLESTIFEKNPQRYRLPVSALFKHHSPQVFIGICLGFLGNSLVGLSFSFPTLATNQGFPTSQSSLAYTIATLYLTVLYPIAGYFSDIIGRQRLLTIISILTLISSIFIFQLMNIQTTLAITLFMIIIDTFMAITISSAQCAYSELFPTPVRVTGVGIVDSMSSSIGGMMPLLCNIAISLFHNNSAPAYILTIAASATCLAALMLHDQTGRPLTFDEHSTV
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MSDEKNGRDESSKLLYCSFCGKSQHEVRKLIAGPSVYICDECVSLCGDIVREELKEGETSEEPSQLPTPREIKQVLDEYVIGQKQAKKVLAVAVYNHYKRLMPGGGEVKADDVELSKSNILLVGPTGCGKTLLAQTLARLLDVPFTIADATTLTEAGYVGEDVENIIQKLLQKCDYDVEKAQKGIVYIDEIDKISRKSDNPSITRDVSGEGVQQALLKLIEGTVASVPPQGGRKHPQQEFLQVDTANILFICGGAFDGLEKVIRERSEKGGIGFSAEVRGKDETKNTSDVLQSVEPEDLMKFGLIPEFIGRLPVTAVLRELDEDALVRVLKEPKNSLVKQYKRLFEMEGVELDLRDDALRAIARKSIERKAGARGLRSVLEQVLLNTMYEIPSQEEAKTIVVDQSVIEGQSEPLIVYEESNDNDQQQQRAGQQ
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MYKTYNELKCLREQVIIDVDKPEFSGDTQIKVCSYDLRLGNIFWKSKRKGKIDLSFTKIYQLSPRRLWKKITLKKEGKITIKSGEMLLGRTHEKIAIPPELVGKITVRSSYARLGLWTACNCDLVNPGYEGHIPLELINTSKHDLTLKPYLPICQLFLMKLDGEIDSCYQSEIFQSNYIDDDGGPSKWWRDLLNKKIESDGCLNSYALDEIKLEIKDLDDDILNRFEDFIDKRKFDNSQDLLEQFSKSEKKAKRRNRILYLICGAVEVVLLGLIANSLFAKSILSFLIFLVIFLVILIPIIMYFDTIKDNNFYERK
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MAFKRLLWRVGLNCARLFARLPYDVQMDVGRWLGRASLSFFKRRRQITEANLRYCFPELNEEELQHRLVLAFESAGMGVAETIIAWFRPQLDASLCQIEGLEYLEAALNQNKGALILGAHMTCLEIIGRFFAKAQAYRLLYRKHENSSFEDLMSQARGEYVDELIDRIDVRKVVRSLKNNWPIWYAPDQDFGIGNALFTPFFGVQTATTVATSRLVKMSGCQIVPVSFYRLPHAQGYKIKFYPAWQSFPGDSDEKDCLRINQFIESVILNAPEQYLWQHRRFKTRPQGEGSLYD
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MIKKSIILFILVFSSLFSIKNFSYNGRSVTIRNDTPLPLTVEFINPQCMYGTGWSTEARSINPHSAITMHEEPKNSGWTCFFSTKHYTLKAYVSTAPYLYTSMYVEFVANDATSCVHNVQFIPGSLDNHFAIANPDGPTPVSGYRENNPGAVFYIKHVQET
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MHIEWSEEKNKKLKAERGFSFEDVVAAISLGKLLDNRAHPNPEYQHQNIAVVNIEGYAVMVPYVTKEDGTLFLKTAYPSRKATKHYLGEGDD
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKNHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKRASDTKNVMH
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MKKSKSFKQLQQISTATLLEESNHLRLATLAIICSTIILITLLIWASLSKITETAVTSGEIVPQGKIQVIQHLEGGTVLQIFVKDGDHVRKNQLLAQLDPTTMLADVDKLKSQFTTLTLKSKRLRAYINKLDHKILKPNKINKVKISSKYTENLNEIIADNQSLLSSQNKKRRAQRAVLTAQLAQSEEKIHQLQQEMKTLDKNVELMTQEFEMYKKLTKTNILSRKDFLVMLRGVNKAQGEKTSLLSMQQQAKQALVEAQNRLYQLDSESYETALQELNDINEQRLQISHTLEKAQKRLQDTNINAPVTGIIKDITIAPSSVVAPGGVLMEIVPMEDPLVVSTRIDPRDIGHIHTGAKATIKIMTYDFTRYGSISGTIQTISASTSLTPEGNPFYKAIIKLDQQSLGPQQLPLLPGMTVQADIITGKKSLLQYLLKPIHRSIESAFRER

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_016211687.1|2907717_2908362_+	UvrY/SirA/GacA family response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
WP_016211685.1|2908392_2910198_+	excinuclease ABC subunit UvrC	NA	NA	NA	NA
WP_016211684.1|2910221_2910797_+	CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_129556476.1|2911341_2912352_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273474.1|2912649_2913624_-|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	4.0e-28	31.9
WP_155046989.1|2913856_2914921_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274727.1|2915013_2915976_-|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	2.6e-27	32.0
WP_155046989.1|2916208_2917273_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300249.1|2917763_2918129_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300250.1|2918639_2919299_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.3e-09	31.0
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WP_016209646.1|2922205_2922781_-	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209651.1|2922811_2924086_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_032126159.1|2924730_2925444_+	aldolase	NA	NA	NA	NA
WP_016209641.1|2925523_2926261_+	SDR family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_016209658.1|2926381_2927737_+	aminotransferase class I/II-fold pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_075273478.1|2927913_2928585_+	M48 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_016209661.1|2928700_2929576_-	bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase FolD	A0A249XZQ2	Enterococcus_phage	1.5e-34	39.7
WP_016209645.1|2930179_2931484_+	trigger factor	NA	NA	NA	NA
WP_016209647.1|2931596_2932202_+	ATP-dependent Clp endopeptidase proteolytic subunit ClpP	A0A223W000	Agrobacterium_phage	8.4e-61	59.8
WP_016209663.1|2932283_2933585_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX	G3M9Z9	Bacillus_virus	1.5e-134	57.3
WP_032126161.1|2933652_2936085_+	endopeptidase La	A0A0R6PGP8	Moraxella_phage	9.5e-220	52.7
WP_016209655.1|2936188_2936461_+	HU family DNA-binding protein	A4JWM7	Burkholderia_virus	2.0e-22	62.9
WP_075273480.1|2936543_2938442_+	surA N-terminal domain protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209643.1|2938473_2939358_+	lipid A biosynthesis acyltransferase	A0A1W6JP29	Morganella_phage	2.4e-40	35.3
WP_016209657.1|2939366_2939762_-	CrcB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209662.1|2940189_2942337_+	EAL domain-containing protein	G3MA91	Bacillus_virus	1.8e-25	36.7
WP_016209652.1|2942308_2943658_-	HlyD family type I secretion periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_016209642.1|2943654_2945775_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	F2Y1V5	Organic_Lake_phycodnavirus	2.0e-16	28.1
WP_016209656.1|2945771_2947475_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	W8CYL7	Bacillus_phage	2.8e-21	24.8
WP_016209654.1|2947593_2948736_-	galactokinase	NA	NA	NA	NA
WP_016209659.1|2948800_2949829_-	UDP-glucose--hexose-1-phosphate uridylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_075274728.1|2949955_2951470_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_059372266.1|2951559_2952045_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274729.1|2952377_2953445_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
2953422:2953481	attL	NA	NA	NA	NA
WP_051307360.1|2954500_2955430_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211514.1|2957669_2959562_+	DNA topoisomerase IV subunit B	A0A172JHT4	Bacillus_phage	1.4e-80	32.9
WP_032126157.1|2959848_2960253_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081377777.1|2961139_2961814_+	P-loop NTPase	NA	NA	NA	NA
WP_016211528.1|2961794_2962100_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300253.1|2963954_2964905_+	dCTP deaminase	I4AZP2	Saccharomonospora_phage	6.9e-09	34.7
WP_155764084.1|2964891_2965032_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274730.1|2965106_2965400_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211530.1|2965405_2966302_-	Abi family protein	A3QSC6	Clostridium_virus	5.3e-35	32.0
WP_016211531.1|2966655_2967336_-	MBL fold metallo-hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_032126152.1|2967399_2967990_-|integrase	site-specific integrase	A0A1B0V4T7	Roseobacter_phage	1.1e-15	32.7
WP_016212424.1|2968192_2968471_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036781387.1|2968463_2968736_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273820.1|2968828_2969911_-|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	1.2e-142	71.8
2981618:2982207	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_28

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28

>NZ_CP013768|2977744:3036721|DBSCAN-SWA
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MPSPYSYDLRIRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFMAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
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MKTTFSFKHANAKKNRDVNIDGAISLSDGAEIFRKAFSIEKKNFSVLNRVSFILANIDAMNSQKEDYLYHLAANNSLTIFKDFEVIYRGFVWDFVGEYTNEMPAALASLKEGLGVAF

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_054300162.1|2980560_2981643_+|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	8.4e-144	72.1
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WP_155046716.1|2992537_2992684_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017376905.1|2994619_2994847_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556629.1|2995077_2995824_+	DNA/RNA non-specific endonuclease	A0A2H4N7Z3	Lake_Baikal_phage	3.6e-29	33.0
WP_026063577.1|2996050_2996344_+	HU family DNA-binding protein	A3E2K9	Sodalis_phage	4.7e-17	52.8
WP_129556482.1|2996415_2997021_-	NUDIX domain-containing protein	A0A1S6L1P8	Vibrio_phage	1.2e-17	30.9
WP_016210545.1|2997169_2998147_-	malate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_075285981.1|2998254_2999685_-	TolC family outer membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210553.1|2999711_3000365_-	protein-L-isoaspartate O-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_016210552.1|3000489_3001056_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_052104721.1|3003260_3004967_+	thiol reductant ABC exporter subunit CydC	W8CYL7	Bacillus_phage	7.3e-25	26.7
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WP_051307332.1|3005296_3005503_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_054300264.1|3008825_3009164_-|transposase	IS5/IS1182 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300265.1|3009308_3009569_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273313.1|3009528_3009867_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_129556484.1|3010339_3011800_-	sodium:proton antiporter	NA	NA	NA	NA
WP_016211426.1|3012143_3013586_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_075273490.1|3014567_3015860_+	outer membrane transport family protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300560.1|3016333_3019006_+	HAD-IC family P-type ATPase	M1HX51	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	4.1e-75	30.2
WP_032126554.1|3019025_3020111_-	competence/damage-inducible protein A	NA	NA	NA	NA
WP_016210417.1|3020552_3020990_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210423.1|3020986_3021871_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210416.1|3021960_3022491_+	prokaryotic cytochrome b561 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210420.1|3022561_3023740_-	mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein	Q6A202	Oenococcus_phage	2.0e-50	32.1
WP_054300267.1|3023888_3027737_-	bifunctional proline dehydrogenase/L-glutamate gamma-semialdehyde dehydrogenase PutA	NA	NA	NA	NA
WP_016210422.1|3027723_3029226_-	sodium/proline symporter PutP	NA	NA	NA	NA
WP_016210418.1|3029776_3030412_+	peroxiredoxin C	NA	NA	NA	NA
WP_054300173.1|3030724_3031786_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211781.1|3032002_3033250_+	LbtU family siderophore porin	NA	NA	NA	NA
WP_129556486.1|3034993_3035341_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273492.1|3035431_3035551_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300268.1|3035659_3036721_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
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NZ_CP013768.1|WP_016212218.1|1096595_1096946_+|hypothetical-protein	1096595_1096946_+	116 aa aa	NA	NA	NA	1083607-1127040	yes
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NZ_CP013768.1|WP_129556569.1|1246122_1246332_+|hypothetical-protein	1246122_1246332_+	69 aa aa	NA	NA	NA	1210886-1268172	yes
NZ_CP013768.1|WP_017375841.1|1550636_1550846_-|hypothetical-protein	1550636_1550846_-	69 aa aa	NA	NA	NA	1471351-1559820	yes
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NZ_CP013768.1|WP_016212022.1|2612462_2612681_+|hypothetical-protein	2612462_2612681_+	72 aa aa	NA	NA	NA	2537342-2639427	yes
NZ_CP013768.1|WP_016212024.1|2613276_2613525_+|hypothetical-protein	2613276_2613525_+	82 aa aa	NA	NA	NA	2537342-2639427	yes
NZ_CP013768.1|WP_054300218.1|2754114_2755146_-|hypothetical-protein	2754114_2755146_-	343 aa aa	NA	NA	NA	2707827-2809105	yes
NZ_CP013768.1|WP_054300240.1|2872294_2872498_-|hypothetical-protein	2872294_2872498_-	67 aa aa	NA	NA	NA	2844467-2889905	yes
NZ_CP013768.1|WP_016210742.1|2876691_2876967_+|hypothetical-protein	2876691_2876967_+	91 aa aa	NA	NA	NA	2844467-2889905	yes
NZ_CP013768.1|WP_155046985.1|2986202_2986985_+|hypothetical-protein	2986202_2986985_+	260 aa aa	NA	NA	NA	2977744-3036721	yes
NZ_CP013768.1|WP_016211584.1|2987082_2987436_+|hypothetical-protein	2987082_2987436_+	117 aa aa	NA	NA	NA	2977744-3036721	yes
NZ_CP013768.1|WP_016212461.1|3006601_3006976_-|hypothetical-protein	3006601_3006976_-	124 aa aa	NA	NA	NA	2977744-3036721	yes

Protein sequences of NZ_CP013768.1|WP_016211126.1|1057551_1057941_+|lipoprotein

>NZ_CP013768.1|WP_016211126.1|1057551_1057941_+|lipoprotein
MKIFVVLFTLILLSGCATTAKYRAQVERWKGHDVNDLIQAWGPPDTTFKMPNGNLYYSYRVNNINRLPSYYVPGNTTVSDRDGKTYITTSGGYQTGGGTIKSNCTTSFQVNKKDIIIGTHFQGNACVSN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	1062007-1062044	0

1. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013768 position: 1062007-1062044, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013768.1|WP_016212218.1|1096595_1096946_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013768.1|WP_016212218.1|1096595_1096946_+|hypothetical-protein
MPIPTLKEIQGQYLIFLAEACSKAEDCVYDRQSIKNKEGKYVNLSEVKHFFLNEDKDKKNNEIEDAYQSLKEKLKLSKRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	1088651-1088688	0

1. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013768 position: 1088651-1088688, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013768.1|WP_155764071.1|1117249_1117408_-|hypothetical-protein

>NZ_CP013768.1|WP_155764071.1|1117249_1117408_-|hypothetical-protein
MEEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLGYTRKKELQIPRT

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	1088651-1088688	0

1. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013768 position: 1088651-1088688, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013768.1|WP_129556569.1|1246122_1246332_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013768.1|WP_129556569.1|1246122_1246332_+|hypothetical-protein
MTNFVHASEFTFQQDDGLINDDWVRLVQPSLPLGTQINSLALTQAGDTLYINTQSVGSFLCQGDIALNE

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	1247234-1247271	0

1. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013768 position: 1247234-1247271, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013768.1|WP_017375841.1|1550636_1550846_-|hypothetical-protein

>NZ_CP013768.1|WP_017375841.1|1550636_1550846_-|hypothetical-protein
MCREGFIFYKPATLETILTKDREYNPQHVITELEMESSFQRISTTTGMPLEEVKEKGLQAFDLEKTFIN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	1518512-1518475	0

1. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013768 position: 1518512-1518475, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013768.1|WP_155046757.1|2018357_2018513_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013768.1|WP_155046757.1|2018357_2018513_+|hypothetical-protein
MDEAGMDDTERYARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	1979353-1979390	0
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	1982790-1982753	0

1. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013768 position: 1979353-1979390, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013768 position: 1982790-1982753, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013768.1|WP_016212022.1|2612462_2612681_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013768.1|WP_016212022.1|2612462_2612681_+|hypothetical-protein
MSPQQEKLFWKKFERELGFDSGEAALSHLSAGRPIYYGDDRYSDAVIKEYPDGTKQLVRFDDNDNEIIIEEL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	2552023-2552060	0

1. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013768 position: 2552023-2552060, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013768.1|WP_016212024.1|2613276_2613525_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013768.1|WP_016212024.1|2613276_2613525_+|hypothetical-protein
MSVEVEHSLACDGHERDRDFLTTPEIQQLLEGSKKGRYPIRDQARKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	2552023-2552060	0

1. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013768 position: 2552023-2552060, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013768.1|WP_054300218.1|2754114_2755146_-|hypothetical-protein

>NZ_CP013768.1|WP_054300218.1|2754114_2755146_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGEFKCPVTLEYLDETKIQIYAVKDNSKYAIHAIEKNSFSNLDKCPLTRSQLYISLTFEEYLIFNKNRHHASEFEVKVLPKAEFEEKLPNKVLLPFKTSHLASAIRRLRSDLITSENIQFIAQHANNALNLTIAINRLRTNLAIAENIQLLAQNIEDAYELASAMSELRENLAIPENLQLLTQHSRHALQLVLAINNLKENLATSTTLQLLAQNLASAAHLTAAINELKENLATAENIQLLAQHPSHALQLALAMNYLNEGLATAENLQLLAQHAENAFDLTLSINQKSAANLNVSLSAEQTEHTSLIFQNHLQDSNNEELSFASSLSN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	2762733-2762770	0
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	2808193-2808156	0

1. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013768 position: 2762733-2762770, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013768 position: 2808193-2808156, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013768.1|WP_054300240.1|2872294_2872498_-|hypothetical-protein

>NZ_CP013768.1|WP_054300240.1|2872294_2872498_-|hypothetical-protein
MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEA

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	2865000-2864963	0

1. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013768 position: 2865000-2864963, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013768.1|WP_016210742.1|2876691_2876967_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013768.1|WP_016210742.1|2876691_2876967_+|hypothetical-protein
MNIILKNTVNILSHRSGLLKSKSYEVAMPYLLECKKLLEISEQDWEVMLAIQYGFGKFHPEHEHQTFKFYEQYMDKHDGRLDGLNLTVQPQ

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	2865000-2864963	0

1. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013768 position: 2865000-2864963, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013768.1|WP_155046985.1|2986202_2986985_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013768.1|WP_155046985.1|2986202_2986985_+|hypothetical-protein
MMTIKQIQLSEENRGNPKRGRKANLLSNMWQDIEASEVERLIDLNRDRHQENKDTEATITLSKYIPHKSYSAKELLHYPELTMLLRKEKQYLVKDYLLTGPLFELRTPLFMIEAGKQLLQIENDFRESLASEQKRLNNLMFLAKNKVKNIRVTGGKPSCQWSAGTIELNGVSWRVNKDSPAYLGPTGGIEALSFSYCEEIGQMDSFKIETAHIGTSIVELKVRNKGHNKGRRAFLNIEKLGLVPTAEAKALIKKQRGQAN

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	2989039-2989076	0
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	3005686-3005649	0

1. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013768 position: 2989039-2989076, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013768 position: 3005686-3005649, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013768.1|WP_016211584.1|2987082_2987436_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013768.1|WP_016211584.1|2987082_2987436_+|hypothetical-protein
MKTTFSFKHANAKKNRDVNIDGAISLSDGAEIFRKAFSIEKKNFSVLNRVSFILANIDAMNSQKEDYLYHLAANNSLTIFKDFEVIYRGFVWDFVGEYTNEMPAALASLKEGLGVAF

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	2989039-2989076	0
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	3005686-3005649	0

1. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013768 position: 2989039-2989076, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013768 position: 3005686-3005649, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013768.1|WP_016212461.1|3006601_3006976_-|hypothetical-protein

>NZ_CP013768.1|WP_016212461.1|3006601_3006976_-|hypothetical-protein
MPKNIFVFNINKTLLWAEEHPRTINQVPTQSTWPFYGCDNIHIINQEKIAKIMQAILANGDQIVFLQERAKTTKNNTREEKEKEQTEKAEFLRLCTDKYGISLQPNNIYFHHGSDGKIARLLSI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	2989039-2989076	0
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	3005686-3005649	0

1. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013768 position: 2989039-2989076, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013768 position: 3005686-3005649, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. NZ_CP013769

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP013769_1

• CRISPR_ID: NZ_CP013769_1
• CRISPR_location: 106938-107161
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 3 spacers
• Cas_protein_info: RT

Consensus repeat of NZ_CP013769_1

Consensus_repeat	Method
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	CRT

spacers of NZ_CP013769_1

>1.1|106963|42|NZ_CP013769|CRT
ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
>1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT
TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
>1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT
ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013769_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP013769_1

>merge|NZ_CP013769|1|106938-107161|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAGAAATGGAACACAAACGGAATACAAGTTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATAAAACGGAACACAAACGGAACACAAAATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAAAAACGGAACACAAACGGAACACAAA

>NZ_CP013769|1|1|106938-107161|CRT
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGCTTTAACTCCGAAAATAAACAGACGATAAAAAATAG
AAATGGAACACAAACGGAATACAAG	TTAAATAAAGAAAAAGTAATTAAATCAAATTCTAAAGATA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA	ATTAGGTTTTATCTCCGAAAATAAACAGACGCTAAAAAATAA
AAACGGAACACAAACGGAACACAAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP013769.1|WP_075273826.1|101276_102404_-|hypothetical-protein	RT	pfam00078_RT_CAS-I:CAS-III	gnl|CDD|275209
NZ_CP013769.1|WP_155046765.1|117070_117265_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013769.1|WP_032126362.1|100172_100538_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379154
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HMMScan for Signature genes

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NZ_CP013769.1|WP_075273826.1|101276_102404_-|hypothetical-protein	RT	pfam00078_RT_CAS-I:CAS-III	2e-50	166.1	0.1

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP013769.1|WP_075273826.1|101276_102404_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|275209	TIGR04416, hypothetical_protein, group II intron reverse transcriptase/maturase. Members of this protein family are multifunctional proteins encoded in most examples of bacterial group II introns. These group II introns are mobile selfish genetic elements, often with multiple highly identical copies per genome. Member proteins have an N-terminal reverse transcriptase (RNA-directed DNA polymerase) domain (pfam00078) followed by an RNA-binding maturase domain (pfam08388). Some members of this family may have an additional C-terminal DNA endonuclease domain that this model does not cover. A region of the group II intron ribozyme structure should be detectable nearby on the genome by Rfam model RF00029. [Mobile and extrachromosomal element functions, Other].	4.35291e-98
NZ_CP013769.1|WP_032126362.1|100172_100538_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|379154	pfam13384, HTH_23, Homeodomain-like domain.	9.56809e-08
NZ_CP013769.1|WP_155047021.1|111451_111607_-|IS3-family-transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	0.000140996
NZ_CP013769.1|WP_054300202.1|113288_114017_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP013769.1|WP_036780064.1|104161_104752_+|site-specific-integrase	gnl|CDD|271175	cd00397, DNA_BRE_C, DNA breaking-rejoining enzymes, C-terminal catalytic domain. The DNA breaking-rejoining enzyme superfamily includes type IB topoisomerases and tyrosine based site-specific recombinases (integrases) that share the same fold in their catalytic domain containing conserved active site residues. The best-studied members of this diverse superfamily include Human topoisomerase I, the bacteriophage lambda integrase, the bacteriophage P1 Cre recombinase, the yeast Flp recombinase, and the bacterial XerD/C recombinases. Their overall reaction mechanism is essentially identical and involves cleavage of a single strand of a DNA duplex by nucleophilic attack of a conserved tyrosine to give a 3' phosphotyrosyl protein-DNA adduct. In the second rejoining step, a terminal 5' hydroxyl attacks the covalent adduct to release the enzyme and generate duplex DNA. The enzymes differ in that topoisomerases cleave and then rejoin the same 5' and 3' termini, whereas a site-specific recombinase transfers a 5' hydroxyl generated by recombinase cleavage to a new 3' phosphate partner located in a different duplex region. Many DNA breaking-rejoining enzymes also have N-terminal domains, which show little sequence or structure similarity.	2.06134e-23
NZ_CP013769.1|WP_054300202.1|107649_108378_+|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP013769.1|WP_054300202.1|111630_112359_-|IS6-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	1.84991e-51
NZ_CP013769.1|WP_075274743.1|108580_111157_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|273167	TIGR00601, UV_excision_repair_protein_RAD23_homolog_A, UV excision repair protein Rad23. All proteins in this family for which functions are known are components of a multiprotein complex used for targeting nucleotide excision repair to specific parts of the genome. In humans, Rad23 complexes with the XPC protein. This family is based on the phylogenomic analysis of JA Eisen (1999, Ph.D. Thesis, Stanford University). [DNA metabolism, DNA replication, recombination, and repair].	0.00878524
NZ_CP013769.1|WP_155047012.1|99204_100212_-|IS3-family-transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	1.10856e-86
NZ_CP013769.1|WP_081377350.1|103100_103916_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|377437	pfam04986, Y2_Tnp, Putative transposase. Transposases are needed for efficient transposition of the insertion sequence or transposon DNA. This family includes transposases IS1294 and IS801. This is a rolling-circle transposase.	2.93086e-44
NZ_CP013769.1|WP_075273327.1|100483_101059_+|IS630-family-transposase	gnl|CDD|315923	pfam13358, DDE_3, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	2.58738e-46
NZ_CP013769.1|WP_075273824.1|101062_101317_-|transposase	gnl|CDD|366690	pfam01527, HTH_Tnp_1, Transposase. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This family consists of various E. coli insertion elements and other bacterial transposases some of which are members of the IS3 family.	4.34134e-11
NZ_CP013769.1|WP_155047014.1|112791_113133_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|227633	COG5323, COG5323, Uncharacterized conserved protein [Function unknown].	1.27873e-32
NZ_CP013769.1|WP_016211879.1|105706_106726_+|ParA-family-protein	gnl|CDD|224113	COG1192, Soj, ATPases involved in chromosome partitioning [Cell division and chromosome partitioning].	2.24633e-33

Protein sequences

>NZ_CP013769.1|WP_016211879.1|105706_106726_+|ParA-family-protein
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>NZ_CP013769.1|WP_036780064.1|104161_104752_+|site-specific-integrase
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>NZ_CP013769.1|WP_075273826.1|101276_102404_-|hypothetical-protein
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>NZ_CP013769.1|WP_075273824.1|101062_101317_-|transposase
MGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGIHSSTLHGWVNKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREI
>NZ_CP013769.1|WP_075273327.1|100483_101059_+|IS630-family-transposase
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>NZ_CP013769.1|WP_155047012.1|99204_100212_-|IS3-family-transposase
MLEFLSHNCKEKASFFLIVFFNLLILCQKLLIQRYTKKSGGVLCKRNTVKYAWIKENKCVFPVDRVCSILGVSRSGYYSWLKVQPSKRMIENQKLARRIKEIFIESRATYGTRRIRKQLATQEISVSRKRVGRLMKQNQLCCKIKRKFKVTTDSKHRLPIAKNVLDRNFSATGPNQKYVGDITYIRTQQGWLYLAVVIDLFSRKVVGWAMEDHMEASLVNDALLMALWKRKPKAGLIWHSDRGSQYASESHREILKDHQIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS
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>NZ_CP013769.1|WP_054300202.1|107649_108378_+|IS6-family-transposase
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MGE targeting detection<

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25. spacer 1.1|106963|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|106963|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|106963|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|106963|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|106963|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|106963|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|106963|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|106963|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|106963|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|106963|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|106963|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|106963|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|106963|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|106963|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.1|106963|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.1|106963|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.1|106963|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.1|106963|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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79. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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80. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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81. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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82. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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83. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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84. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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85. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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86. spacer 1.2|107030|40|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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87. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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88. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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89. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP013763 (Piscirickettsia salmonis strain PM21567A plasmid p1PS2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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90. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP013779 (Piscirickettsia salmonis strain PM51819A plasmid p1PS5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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91. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP050945 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-2192A plasmid Ps2192A-p7, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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92. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039210 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-103 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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93. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP048067 (Piscirickettsia salmonis strain Ps-8079A plasmid Ps8079A-p1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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94. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039033 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-070 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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95. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038894 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-006a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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96. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038924 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-011 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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97. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038953 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-040 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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98. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038958 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-041 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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99. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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100. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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101. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039196 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-161 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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102. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038812 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-001 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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103. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP013769 (Piscirickettsia salmonis strain PM23019A plasmid p1PS3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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104. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP033942 (Piscirickettsia salmonis strain EM-90 plasmid pPSEM90-5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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105. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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106. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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107. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP013761 (Piscirickettsia salmonis strain AY6492A plasmid p4PS1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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108. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP013774 (Piscirickettsia salmonis strain PM37984A plasmid p1PS4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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109. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038892 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-005 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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110. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038914 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-010a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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111. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038968 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-068 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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112. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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113. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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114. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039202 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-163 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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115. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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116. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039205 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-182 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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117. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039042 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-072 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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118. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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119. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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120. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039182 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-158 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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121. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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122. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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123. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039187 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-159 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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124. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038948 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-028 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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125. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038933 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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126. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038973 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-069 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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127. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039036 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-071 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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128. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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129. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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130. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039066 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-107 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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131. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038887 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-004 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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132. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP039215 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-104a plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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133. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038938 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-026 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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134. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038963 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-051 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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135. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038877 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-002 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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136. spacer 1.3|107095|42|NZ_CP013769|CRT matches to NZ_CP038882 (Piscirickettsia salmonis strain Psal-003 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	9030 : 48668	42	Streptococcus_phage(21.43%)	head,transposase,tail,capsid,integrase	attL 1377:1436|attR 42500:42810
DBSCAN-SWA_2	56298 : 108378	60	Acinetobacter_phage(20.0%)	integrase,protease,transposase	attL 94457:94516|attR 116194:117148

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP013769|9030:48668|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_129556716.1|42801_43092_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	2.7e-12	42.7
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WP_075273766.1|44152_45214_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075273768.1|45217_45487_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	Q8SBH7	Shigella_phage	2.2e-05	31.3
WP_016210667.1|45483_45807_+|head	phage head closure protein	A0A1W6JP44	Morganella_phage	1.0e-12	39.0
WP_016210658.1|45799_46195_+	hypothetical protein	Q7Y404	Yersinia_phage	1.6e-07	40.0
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Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP013769|56298:108378|DBSCAN-SWA
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MVIQRQKGETYQIQFTLKHVLQYRSAWWNYRAKHADSIRPAVDENVLKVLGCRTKLMGCDVYGCSNPNCEHTKVVCFTCKSRFCSTCGKKATEQWIEEQNATLPQCKWQHITFTMPRKFWAFFLFNRELLNIIFRTAANTLLETAKKKGLVIGIFAALHTFGRDLK
>NZ_CP013769|56298:108378|102624_102771_+|WP_155047013.1|DBSCAN-SWA
MSNISSLNVLRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP
>NZ_CP013769|56298:108378|66247_67401_-|WP_105962623.1|transposase|DBSCAN-SWA
MGKRHVTKYTEEFKKSSAKLAVDSNQAISHTAQELGIHSSTLHGWVNKYHPNSPNTVKDEVSDMAAEIKQLKKELARVTQEREILKKAAALLCKRNTVKYAWIKENKCVFPVDRVCSILGVSRSGYYSWLKVQPSKRMIENQKLARRIKEIFIESRATYGTRRIRKQLATQEISVSRKRVGRLMKQNQLCCKIKRKFKVTTDSKHRLPIAKNVLDRNFSATGPNQKYVGDITYIRTQQGWLYLAVVIDLFSRKVVGWAMEDHMEASLVNDALLMALWKRKPKAGLIWHSDRGSQYASESHREILKDHQIKQSMSRKGDCWDNAVSESFFHTLKTELVHHMNFKNRQEAKSAIFEYIEVFYNRKRIHSANDYLSPEEYEHNQKIS
>NZ_CP013769|56298:108378|60310_61018_-|WP_075273780.1|transposase|DBSCAN-SWA
MYYLSAKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGHTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGVFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQNIDLATFF
>NZ_CP013769|56298:108378|63688_63961_+|WP_016211910.1|DBSCAN-SWA
MSKLNLLTWSDDAWDDYLYWQDTDKKVLKKINKLIKECQRTPTEGIGHPEPLKHDFSGYWSRKIKGEHRLVYSFDATSLMIAACRYHYDQ

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_052104629.1|56298_57324_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016212298.1|57990_58317_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051307374.1|58557_59034_+|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	3.2e-15	39.2
WP_155047011.1|59148_60301_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	9.8e-58	43.8
WP_075273780.1|60310_61018_-|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.8e-38	43.1
WP_052104629.1|61156_62182_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_016211912.1|62561_63152_-|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	2.1e-19	33.3
WP_032126795.1|63424_63685_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211910.1|63688_63961_+	Txe/YoeB family addiction module toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016211913.1|64286_65408_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273786.1|65840_66239_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_105962623.1|66247_67401_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.5e-58	43.8
WP_016212499.1|68399_68774_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212410.1|68978_69152_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212408.1|69399_69849_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212412.1|69841_70006_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_059372613.1|70306_70933_+	hypothetical protein	A0A222ZGQ4	Arthrobacter_phage	1.8e-21	33.7
WP_075273790.1|70922_71225_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_052104629.1|71769_72795_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_054300590.1|73411_73636_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211873.1|73886_74144_+	AbrB/MazE/SpoVT family DNA-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211871.1|74137_74473_+	type II toxin-antitoxin system PemK/MazF family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_032126138.1|75038_75302_+	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273796.1|75856_76660_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273798.1|77414_77639_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033923775.1|78039_78780_-	SDR family oxidoreductase	F2NZ40	Diadromus_pulchellus_ascovirus	4.6e-08	28.0
WP_016212413.1|78827_79256_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273802.1|79589_80318_+|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	3.5e-37	42.2
WP_075273804.1|80402_80741_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081007004.1|80700_81156_+|transposase	IS5 family transposase	A0A0N9SJT9	Paenibacillus_phage	6.2e-16	36.7
WP_075273806.1|81261_81825_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273808.1|82086_82611_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080728342.1|82650_83154_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_081377348.1|83468_84218_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273810.1|84525_85233_+	hypothetical protein	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	1.4e-11	34.2
WP_129556718.1|85219_86405_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	7.7e-58	43.8
WP_054300276.1|87542_88517_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	2.4e-25	30.8
WP_075273812.1|88513_89071_-|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.6e-08	26.6
WP_032126362.1|89016_89382_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273814.1|90729_91191_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_129556717.1|92614_93841_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
94457:94516	attL	NA	NA	NA	NA
WP_054300271.1|94495_95470_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.1e-25	30.7
WP_016212260.1|95627_95900_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212257.1|95919_96144_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_032126838.1|96480_96684_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016212255.1|96680_96851_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273820.1|97037_98120_-|transposase	IS481 family transposase	E9P643	Wolbachia_endosymbiont_wVitB_of_Nasonia_vitripennis_phage	1.2e-142	71.8
WP_075273822.1|98276_98777_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274741.1|98878_99136_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155047012.1|99204_100212_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	6.5e-58	43.8
WP_032126362.1|100172_100538_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_075273327.1|100483_101059_+|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.7e-08	26.6
WP_075273824.1|101062_101317_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075273826.1|101276_102404_-	hypothetical protein	A0A0U4J920	Pseudomonas_phage	1.9e-18	30.3
WP_155047013.1|102624_102771_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081377350.1|103100_103916_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036780064.1|104161_104752_+|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	2.0e-22	38.3
WP_016211879.1|105706_106726_+	ParA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_075274742.1|106738_107620_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300202.1|107649_108378_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.9e-38	43.1
116194:117148	attR	NA	NA	NA	NA

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
NZ_CP013769.1|WP_016212298.1|57990_58317_-|hypothetical-protein	57990_58317_-	108 aa aa	NA	NA	NA	56298-108378	yes
NZ_CP013769.1|WP_016211913.1|64286_65408_-|hypothetical-protein	64286_65408_-	373 aa aa	NA	NA	NA	56298-108378	yes
NZ_CP013769.1|WP_016212499.1|68399_68774_+|hypothetical-protein	68399_68774_+	124 aa aa	NA	NA	NA	56298-108378	yes
NZ_CP013769.1|WP_016212408.1|69399_69849_+|hypothetical-protein	69399_69849_+	149 aa aa	NA	NA	NA	56298-108378	yes
NZ_CP013769.1|WP_016212260.1|95627_95900_+|hypothetical-protein	95627_95900_+	90 aa aa	NA	NA	NA	56298-108378	yes
NZ_CP013769.1|WP_016212257.1|95919_96144_+|hypothetical-protein	95919_96144_+	74 aa aa	NA	NA	NA	56298-108378	yes
NZ_CP013769.1|WP_032126838.1|96480_96684_+|hypothetical-protein	96480_96684_+	67 aa aa	NA	NA	NA	56298-108378	yes

Protein sequences of NZ_CP013769.1|WP_016212298.1|57990_58317_-|hypothetical-protein

>NZ_CP013769.1|WP_016212298.1|57990_58317_-|hypothetical-protein
MKLITIEDYAKINEMRIQDAYELVNNEKLRKFNQPHIGMKRLTLVYVDSAPDFISYLDVNTVYFSQSEAARTMGVSLEKMRKKVVSGEVKSTRMKKFCFIPSEQFKDL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	89408-89445	0
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	100147-100110	0

1. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 position: 89408-89445, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 position: 100147-100110, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013769.1|WP_016211913.1|64286_65408_-|hypothetical-protein

>NZ_CP013769.1|WP_016211913.1|64286_65408_-|hypothetical-protein
MSFEQACAALERAGVDFQNRETELKENEKLQQVVCALAQVRLLNPETWGKIQIRNSEAQQIIIDIIDSLPLQSKDGPTGEDEQTPIEKTASAIAYRAINYFIACDWAKHISDDRYMGQAYRRFQNDKPFQQVATHLHKKIAGDFDSRTIADIQGFYQEELAALSAVWKPSFLSHHQEHERGFQAATELHQRDCLSLGDCERYQAIFSLGAGQILSQKTFDQVCSSDDPKVEAAKILILDAQSKVAEKAKDLDKGTREKISNHLQTRLKNNTDTPKKSLLSTVRMASRPLGRHFRPKRDLDNLPETYKVAEKSLKIAARLLDIPIVEITKAITGGKSEEFNTYGDLKKFMEKEQKHLRSQAVQETEMTSMTGPS

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	89408-89445	0
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	100147-100110	0

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**************************************

2. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 position: 100147-100110, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP013769.1|WP_016212499.1|68399_68774_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013769.1|WP_016212499.1|68399_68774_+|hypothetical-protein
MSENEKSKKTLGSPAEQTTHPLGSPLISYSIDLIEFRGKLNLTNFTVRSIQSADVSGSASLEYARDAILFALEGSEEDTAIESHILSEIQTASNLVVYAWGCKSCGEWWYRKTVNGHTYCPRCR

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	89408-89445	0
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	100147-100110	0

1. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 position: 89408-89445, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 position: 100147-100110, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP013769.1|WP_016212408.1|69399_69849_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013769.1|WP_016212408.1|69399_69849_+|hypothetical-protein
MFIKRYSLLFLLVFNLNLHALSGRTIMINNQTSQDIILHFFDVNCMYTNLSDSDGIDIDSINNRIIKANNFIKVHEESKASGICFFIRSNSSEYKLKASLVVAPYIYTVMKAEAHGSAISRYMKYNTEGGSIQKFKFNFDDNKIYINHE

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	89408-89445	0
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	100147-100110	0

1. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 position: 89408-89445, mismatch: 0

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**************************************

2. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 position: 100147-100110, mismatch: 0

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**************************************

Protein sequences of NZ_CP013769.1|WP_016212260.1|95627_95900_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013769.1|WP_016212260.1|95627_95900_+|hypothetical-protein
MIIPEKSKLTAWPSPVLYAAAKATAWGGCYGVSSHQSFKENYNRSIKKYLAGQKFEVPPEVCRSIEHKGPRNSEAALSQLEKMRRNLRVH

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	89408-89445	0
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	100147-100110	0

1. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 position: 89408-89445, mismatch: 0

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cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 position: 100147-100110, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013769.1|WP_016212257.1|95919_96144_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013769.1|WP_016212257.1|95919_96144_+|hypothetical-protein
MLGVAIDSTESLNDRCKQIVKAVDSFLKGYKLATNKKLSELGINIKDHHDLTKCLGLEPYTEISRNGVVLYGIK

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	89408-89445	0
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	100147-100110	0

1. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 position: 89408-89445, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 position: 100147-100110, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

Protein sequences of NZ_CP013769.1|WP_032126838.1|96480_96684_+|hypothetical-protein

>NZ_CP013769.1|WP_032126838.1|96480_96684_+|hypothetical-protein
MQKAVKCEAEEIQERMRFVKNNYKSLTVKRLKILWGVNSLNVYQFLRQYDLPWLPIDELTIKQRGRI

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	89408-89445	0
NZ_CP013768_3	Orphan	3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder	2453700-2453737	38	100147-100110	0

1. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 position: 89408-89445, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

2. spacer 3.1|2453700|38|NZ_CP013768|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013769 position: 100147-100110, mismatch: 0

cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	CRISPR spacer
cctactgatattatgtcagaaactgttaatccagcgct	Protospacer
**************************************

3. NZ_CP013770

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	18666 : 26339	9	Enterobacteria_phage(28.57%)	terminase,portal,tail,head,protease,capsid,transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP013770|18666:26339|DBSCAN-SWA
ATCATAGTTTTTGCTTTTTAATCGCCAGCGTTAAGGTGCTTTTAAAAATATCGATGGATGTTTGCGCATTATCATTCAGCGCGGGGCGAATAAACGGCCGTGCCGGTTGGTGGCTACTGCCATATTCTTGCTCGATGGCATAGTCTATTTTACGTGTTGGCCCCACCGTCACATTAACAATGGTTCGGCGGCCTTTGCCTTTTTTAGAGCGCCGTTTAATCGACTCAACTAAAGCGCCTGATTTTTGCGGTGCATTCGCTTTCATTTGCTGCTCAAGCGGTTCGGCGGCTTTACGCAGGGCGCGGCGGTTTAAGGTTCTTATCTTTTTTGGTGCTAACTGTTTTAATTGTTTTTCTAAATCACGTAAGCCCTCAACAGAGAAACTTATTTTAGGCATGCACCCACTCCCGACACGCTAAAATGAGCTCACGATTACGCTCATCTGGATTAATCACACTTAAAATCTCCAAATAACGACCATCAAAAACAAGGCGCAATAAAGGGGTGACATCAGACCGATAACGCAGGGTGACGGTTTGGCTAATTTCATGATAAAACTGCTGCGCGCTAAAAAGTTCCCGGCCTGCACTCGGGCTGACCCGTGCCCAGACGGTAGCAATATCCTGCCAATACTCCACCGCTTCACCATAATTATTGGTACCAACTAAATTATTCTGTAAAGTCACGCGATGGCGTAACAAGCCGGCTCTCATGCGCTTAAATACCGATGCGGATTAAGTAAAAAGTGGGTACTCATCGGCACCTCTTTCACCGTTAAAGTACTCGTTGATTCACGGTTTTCATAAAAGTGACCGGCAGACATTAAGATGGTGATTTCTATCGATTTATTGATTAACACACTGTTTGCAATCGCTTCTAAATCATCCGTGTTATTTACAATCACCCGATCTAGATAATCTTCGGCAGCTTGCAGGGCAGCGGCAAGAATAAATTCTAAATACTCATCTTCGTTATTATCGTCGATGCGCAAATGGCTTTTTAAGCGTGTTAAATCGATCATTTTGATTTTTTCTTCGACGTTTTAATGTTAACCGCTTCAGCATCACCGTGCTTAATCATGGCTTTTGCAGTTTTATCGGGTAAATCAACAATATCGCCGATATTATAAGCAATATTAATCCCAGCCCTTGGCACTAAGATTTTAACTTTCATAAAGTCCCTTTTCGGTTTGATTTAAATGTGAATTAAGGTGATTTACACAAAAATAACATTAATTTTTGATTCCGCATATTCATGCTTATGATATTTTATTTTTTTATCTGGTATTTTACTCTCTAAATTAAATGAAAGTTCAATACAACGTTAAAGGTTTAAATATAATGCCTACACAGAAACATATGGAAAAAATAACGAACCTTATTGATGATCTCCAGAAGAGAATTACTAAGTTGGACGGTCAGATAGAAGCAGAGGCTAAAAGCTCATTTATTTCTTCTGGGCTATTAGAAAGAGAAAAGAGCAAAGGCTCACGACCTGTCGAATATTACCATAATGTAAGAGAGTTTAGTCGGAAACTTTTACCTAAAATCGCATCATGGGCTCGTAAGGCTCTTCTATTATGTGAATGCAAAAACTTTTTAGAAGAAATGACAAAAGATGACTCTAAAGCTCTAGAGCACGCAACTCATTTAAATGAAACCTATCTTAGACATTCCAATCTTGCAGTGTTTGAGGCTAGGTTTAGAAGCATGACAAAAAGCTTATGTTCAAAGACTTACAAGATTTTAAAAAGTATCGCGAAAGAAAATCAACAATCTGCCGTTGCAGCGACTAACTGCGGTGGAGGCGCATATGCAGTAGCTGATATTGTAAATCGACACCAGTCAAGCGGACTTACCTCAGTTGAAGAAGGTTTACAAGTAGTAGAGTTACCTCAAACGCAGCCAGCCATGCAGGGTTAAGCACAGAGTGAATAGTTTGCTGCTGAGAATTATTATTAAGCGGCAGCGGTTTTAAGTTGCTTAATGGCATCTGTCTCAAGCAATAAAGCATCCACACGCAACCACATTAAATAACCGACTTCACCAGTTTCAGCATAAAGCTCATTCAATCGACGCAGCGAGATACCCCCACGATCAGCAATAATAAAATTAGAAAAATCACCAAACAAGGCGGCGCATTTTCCGGCGGCGAGGGTGTCCATAAAATCCGAGGTATTCACACGCTTACCGCGCAATAAATCCCCTTCACCGCTTTTAAAATCAGGCTGAATAATATACTGGCCGTTACCATCTTTCATTTTTAATAATGAGCCATAGGTAGAGTCGTGCATAAGGTAGGAGGCTTTACGACGATAAGCGGCTTTGACCGAACTACGTAAGTCTAAAATATCATCTAAAGTAATACTGGTCGGTGCGGCAGCGGTAACCCCAATCGGCGCGACATTTAATAAGCCATTGGGTTTGCCGGTGCCGTCCCCGGTTAAAAAGGCTTTTTCTTGGGCTTCGCCAAAGCTGCGACCAAAGGAGTAAGCAATATGGGCACCAATATTAATCGCACTATCGGCCAGTAATTCATCCGATATTTTTAACATCCGTGATAGCTTATAGGCTTTGATGGATTTTTTCTTAAAGGTATCATCGGTGGCGGTATGGGCGGCAGTTTCACCGGTCCAGGTCGCGGCTCCATAGCTGTCGGCCATCGGTAATTCCGTGGTTGAGTCGGTTTGAATAATACGACACATTTGACGCATCACCGTCTGCTCTTCCAGAGCTTCGATTAAGGTGGTTTGTAGTTTCGTCGGCACTAAATAGCCGCCCTTATTATCCGTCCCTTCAACTTGCCCGGCACGAATATCAACCCCTGAATTTTGCCCACGCATATAGGCAAAAAAGTTCTTTTCATATTCTTCCGTCGCGAGTGGGTTGATCGGTGTATTATCAGTCGGTGATTGTACACCGGCACGTAACGGCTCAGAACTTAATGAATTAATTTCACGTTCCTGGGCTTCAACCTCTTCAATTTTAGCAATACGGTTTTTAATGTTTAATTGCTGGGTGTTTAAATCCTTATATTGCCCGTCTTCCTCATCGGTAAAGCCACGGCTTTCGCTTTCTGCATGGTCCAGCATGGCGCGTTGCTTGTTAATGACTTCAGCGCGTTGTTGGGCAAGTTCATAAATATCAGGCATAAGTCTATTCCTCCTAGAATATTAAGAGCCTTAAAAATTAAGTGTTAGAGAAAATTATAAAAGGGAGCGTTTAAGTGCGAGTTTATGGCGTTGCAGTGCTTTTGCTGCGTTATTTTCAGAATGTTTAATTAATGTTTGAGGGGTGTTTTTATATTGATTAGGTTTAACGCAAGCGGCGATATTCACCGCCTCGGTGATTTCATCAATAAAGCCATACTCTTTTGCTTCTGCTGCGGTCAACCAAGAGGTTTCATACATCATTGCTTTAATTTTATCGTCGGCTAAATTAGATTTTTGGTGATAAATGTTTACTATTTTTGCTTCATTTTTATCTAAAATCTCAATGATTTTACTCAACTCTTCAGCATCACCCACCGCATAGGCCCAAGGGCGGTGGATCATATAAAAAGCATTATCGGCCATATGCACGGTGTCACCGGTAAGTGCAATAATGCTTGCCATAGAGGCCGCGAGGCTATCAATATGAGTGATAATTTTTGCCGGATGACGATGCAGGGCATTATAAATAGCAAAGCCATCCGTGACAGAGCCGCCGGGCGAATTAATTCTAAGATTAATTTGCTCTACATCAAGCGCCTGTAATTCCATCACAAAACTTTTAGCTTCAACACCGTAATCACCGATGTAATCGTAAATATACACATCGGCAGACTTATTTGCTTGTGCTTTGATCTGATACCAGTTGTTCATTATTTTGCTCTTCATCCTCACCAATCGGGGTCATATTCAACGGACGGTAATAACGGTCCCCGTCTTCTATTGGGTTCATGTTCTCTAGTTTACGAATATCGTTTTGACTCATTACACCGATGCTAAACATGCGATTATAAAAAGACGCTCGAGCGGCCGTATCGCCACGCAATAAGCCCTCGATATTAAATTTTATAAAATATTTTTTGCGCTCATGGGCAAGTAATAAATCACGGCTAATACTCTGCTCAATCTTCACCAGCCACGGCACCAGGCTATGACGAACAAAGGCTAAATCTTGATGCTCAATATTTGAAAAAGTGGCGCGCTCTAAATCAGCAATCATATGCGGCGGCACCCGGAAAATGCCACAGATTTCATTGCGCTGGTATTTGCGTGTTTCTAAAAACTGACTGTCTTCACTACTCATCGTCAAGGTTTGCCATTTCAAGCCATTTTCTAACACAGCGACCCCATTCGAATTTTTACCGCCGTGGGATTTTTTCCAAGACTCCGCTAAGTTTTCACGGCCTTCTTTTTTTAACGCGCCGTCTGTGGTTAAGATGCCGCTGGGGCGTGCACCATTGCCAAATAACTGCGCGCCATGCGCTTGAGTTGCCGCAGATAAACCCAAAGACTCACGCTGTAAGGTAATCGGACTGCTGCCGATAATGCCATCACTGCCCATGGCATTCAGCCGCCATACTTGATCATCACGTAGCTCATAGCTTTGACCGTTTAAGATCGTGCTATAAACCAGTTTTTTAGTCTTTTCATCACGGCGTACTGTGGTGCTATCAGTGGGCAGTTGGATTAATTCACGCACTCGCCCTGCACCATCGCGAATAATCTGACAATAGGCATTACCACGCAAACATAAATGGCCCACAAGGTTTTCACGTAAATCAAAACTGGTGACTTCAGCATTGGGAAGATCATGCAAAACAGAATATAACGGGTGATCTGTAGCCAAGGCTTTACCGCCACCTGTTTCATAGCGATACACATGCAAAGGCAAGGCGGCAATAGATTCAGCTAATACACGAATACAGGCATAAACGGTTGCTAAATGCATAGCATTATCCGGGTGGATGCTTTGACCGCTGGCACTCATGGGGTTATATCTAAAAGCTCATAGCCACCATATTCGGTGCTCGGTTCAAGTTCCGTTGCCGCACCGAACCAGCGCTTAAATAACTTCATAACTCACCTTACGCACTGACATGATAAACGATGTATAATGAAATCTGATAGATACAGGGATTTCATCAGGAATGAATAAAGAGCTACTGGATATTTATAGCGACTATTTAATTAGCCAGAACCATTATGCAACGGCAACAGGACTTTCAGATTTACTGGAAGGAAGTATCAGCCATGATAAAGTCACACGCTTTTTAAATAAAAACCACTTTGGATCAAAAGAGCTCTGGAGCTATGTTAAAAAGCATGTTCGTCAGTATGAAGAAGAAGTTGGAGGCGTTTTAAGTCTGGATGATACCGTGGAAGAAAAGCCTTATACAGATGAGAATGATGTGGTTTGTTGGCATTATTCACACAGCAAAAGCGCTCATGTAAAGGGAATTAATATTTTGACAAGTATGGTGACTTACAAGAAAACGTCCGTACCTATTGGTTATGAAACTGTATTAAAAGACATCAAGTTTACTGATTTAAAGGACCGAAAAGAAAAGAGAAAATCTAATATATCGAAGAATGAGTACTTTCGTAACCTTATAAATCGTGCAATTAATAACCAGGTTAAATTTGATTATGCTGTTGCAGATAACTGGTTCAGTTCAAAAGAAAACATGAATTATATTCATGCCAAGTTAAATAAGTTGTTTATTTTAGGAATAAAATCTAATCGAACAGTTGCTTGCAGTTTAGATGATAAAGTCAATAGAAATTACCAGCCAGTCAAATCTCTTGATTTAAAAGATGGTGAGGCCATAGATGTATATCTTCAGGGAATTAATTTCCCAGTGCGATTAATGAAAAAGATCTTCACAAACGAAGACGGGTCAACAGGTCACCTCTATTTAATAACAAATGATTTAGAGACGGATGGTGATGGGCTTTACAAAATCTATCAAAAACGATGGAAAATTGAAGAATATCATAAGTCGATTAAACAAAATGCAAGTTTAGCAAAATCACCAACTAAAACTGTTCGGTCACAATGCAATCATATTTTTGCATCAATCGTGGCATTTTGTAAACTAGAAACATTGAGTGTAAAAGCACAACTTAACCACTTTGCACTCAAATATAAATTACTTGTGCGGTCAAATCAAATAGCTTTTGAAGAGCTTAGGCGATTAAAATGTTTATGACCTGTGCGTAAGGTGAGTTCATAAGATGAGTAGCTCTCTCTCGTTATAAATCGAGTTGTGATCTTCCCCCGCAATTAAACGCCCGACGGCCATTGCCGTGGCCACCATGCCGTCAATCTTCTCTGTCGATTTACGCTTAGAAGGTTTCATATTGCCCGCATCATCTTCAACAACCACTAAATTCGAGGCCATCCAATTTAAGACCGGGTTGTTGTTGTGATGGAGTTTTGTTGAAATCACCAAGCGCTCAAGTTCTTTTAAGGCTGGGGTCATGGACTTAAAACCTTGGCGAAACTCGACCATATTCGCCCCTTCTTCAAGTAAATCATTGGCGAGCTGGGTGGCATTCCACGGGTCATAAGTAATCTCTTTAACATCAAATTCTTTATTCAACTGGTAAATATCATCTTTGATGTAGTTGTAATCGATCACATTACCCTCTGTTAGGGTTAAATAACCTTCATCGGCCCATAGCTGATAGGGCACGGGCGATTGCTTGGCTCGAGTCATTACCGTCTCTTTCGGTAAGTAAAAGCGACAAAATAGGCGCACAGAATCATCTGGCATTAAAAAAGCCGCAACTAAGGCGGCTATATCGTTGGTACTGGCCAAATCCAAGCCAATATAACAGGGCCTGTTTTCCAATGATTCACGTTTAAAGGTATATTCAGCGCAGGCTTTCCAGCGTTCTAAATCTAACCAAGCGGTTTCGGCATTCGTCCAGATATTTAAGTGCTTACATAAAAAACCATTGCGTTCGCCCTTCATTTGTTGGGCTTTTACGCACTGGCGTTGCATATCATCGAGCTTTTTACTGACGCCTAAATTCGGGTTGGCTTTGATCCAATTGCGCTCATCCGTCCAATCGTCATCCTTATCCAACGTGTAAATAATGCCGAAAAAGGTATCATCTACAATGATATTTTCCAGCACTTTAACCGCATAATCACGCAAACTATAACAAATCCCCGTTTGATCAAAGCCGGCGGTTGTAATCGCATACAGCAATGGTTGACGCCTAGAGCCGGTGCCCGTCTCTAATACGCGCCATAAATCGCCGGTTTTATGGGCATGCAACTCATCAACAATACTAGAATGCACATTTAAACCGTCCTGAGTTTGGCTATCACTGGATAACGGTTCAAATTTATTATTGGGTAAATCCTTGGGATAATGCATATTATTTTTATAAATGCCAATACGACCGGCTAAGGCTTTTGACGCCCTAACCATTTTCACCGCATCATCAAAAACGATCTTCGCTTGATCGCGTTTTGTTGCCGCAGCATACACTTCAGCGCCTGGCTCTTCATCGGCACAAAATAAATACAAGCCAGTGCCTGATAATTTCGTACTTTTGCCATTTTTACGCGCGACTTCTTCATAAACGGTACGAAAGCGCCGCATACCATCAACTTCACGCCTCCAACCAAACACGGTAGTAATAATAAACAACTGCCACGGCTCTAAAGTAAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP013770|18666:26339|20622_21816_-|WP_054300591.1|capsid|DBSCAN-SWA
MPDIYELAQQRAEVINKQRAMLDHAESESRGFTDEEDGQYKDLNTQQLNIKNRIAKIEEVEAQEREINSLSSEPLRAGVQSPTDNTPINPLATEEYEKNFFAYMRGQNSGVDIRAGQVEGTDNKGGYLVPTKLQTTLIEALEEQTVMRQMCRIIQTDSTTELPMADSYGAATWTGETAAHTATDDTFKKKSIKAYKLSRMLKISDELLADSAINIGAHIAYSFGRSFGEAQEKAFLTGDGTGKPNGLLNVAPIGVTAAAPTSITLDDILDLRSSVKAAYRRKASYLMHDSTYGSLLKMKDGNGQYIIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAETGEVGYLMWLRVDALLLETDAIKQLKTAAA
>NZ_CP013770|18666:26339|21870_22542_-|WP_081007077.1|protease|DBSCAN-SWA
MKSKIMNNWYQIKAQANKSADVYIYDYIGDYGVEAKSFVMELQALDVEQINLRINSPGGSVTDGFAIYNALHRHPAKIITHIDSLAASMASIIALTGDTVHMADNAFYMIHRPWAYAVGDAEELSKIIEILDKNEAKIVNIYHQKSNLADDKIKAMMYETSWLTAAEAKEYGFIDEITEAVNIAACVKPNQYKNTPQTLIKHSENNAAKALQRHKLALKRSLL
>NZ_CP013770|18666:26339|22489_23641_-|WP_075286005.1|portal|DBSCAN-SWA
MSASGQSIHPDNAMHLATVYACIRVLAESIAALPLHVYRYETGGGKALATDHPLYSVLHDLPNAEVTSFDLRENLVGHLCLRGNAYCQIIRDGAGRVRELIQLPTDSTTVRRDEKTKKLVYSTILNGQSYELRDDQVWRLNAMGSDGIIGSSPITLQRESLGLSAATQAHGAQLFGNGARPSGILTTDGALKKEGRENLAESWKKSHGGKNSNGVAVLENGLKWQTLTMSSEDSQFLETRKYQRNEICGIFRVPPHMIADLERATFSNIEHQDLAFVRHSLVPWLVKIEQSISRDLLLAHERKKYFIKFNIEGLLRGDTAARASFYNRMFSIGVMSQNDIRKLENMNPIEDGDRYYRPLNMTPIGEDEEQNNEQLVSDQSTSK
>NZ_CP013770|18666:26339|23801_24863_+|WP_054300392.1|transposase|DBSCAN-SWA
MNKELLDIYSDYLISQNHYATATGLSDLLEGSISHDKVTRFLNKNHFGSKELWSYVKKHVRQYEEEVGGVLSLDDTVEEKPYTDENDVVCWHYSHSKSAHVKGINILTSMVTYKKTSVPIGYETVLKDIKFTDLKDRKEKRKSNISKNEYFRNLINRAINNQVKFDYAVADNWFSSKENMNYIHAKLNKLFILGIKSNRTVACSLDDKVNRNYQPVKSLDLKDGEAIDVYLQGINFPVRLMKKIFTNEDGSTGHLYLITNDLETDGDGLYKIYQKRWKIEEYHKSIKQNASLAKSPTKTVRSQCNHIFASIVAFCKLETLSVKAQLNHFALKYKLLVRSNQIAFEELRRLKCL
>NZ_CP013770|18666:26339|19054_19378_-|WP_075274764.1|head|DBSCAN-SWA
MRAGLLRHRVTLQNNLVGTNNYGEAVEYWQDIATVWARVSPSAGRELFSAQQFYHEISQTVTLRYRSDVTPLLRLVFDGRYLEILSVINPDERNRELILACREWVHA
>NZ_CP013770|18666:26339|20005_20587_+|WP_036778347.1|DBSCAN-SWA
MPTQKHMEKITNLIDDLQKRITKLDGQIEAEAKSSFISSGLLEREKSKGSRPVEYYHNVREFSRKLLPKIASWARKALLLCECKNFLEEMTKDDSKALEHATHLNETYLRHSNLAVFEARFRSMTKSLCSKTYKILKSIAKENQQSAVAATNCGGGAYAVADIVNRHQSSGLTSVEEGLQVVELPQTQPAMQG
>NZ_CP013770|18666:26339|19374_19686_-|WP_075274765.1|head,tail|DBSCAN-SWA
MIDLTRLKSHLRIDDNNEDEYLEFILAAALQAAEDYLDRVIVNNTDDLEAIANSVLINKSIEITILMSAGHFYENRESTSTLTVKEVPMSTHFLLNPHRYLSA
>NZ_CP013770|18666:26339|18666_19062_-|WP_075274763.1|DBSCAN-SWA
MPKISFSVEGLRDLEKQLKQLAPKKIRTLNRRALRKAAEPLEQQMKANAPQKSGALVESIKRRSKKGKGRRTIVNVTVGPTRKIDYAIEQEYGSSHQPARPFIRPALNDNAQTSIDIFKSTLTLAIKKQKL
>NZ_CP013770|18666:26339|24881_26339_-|WP_081377785.1|terminase|DBSCAN-SWA
MTLEPWQLFIITTVFGWRREVDGMRRFRTVYEEVARKNGKSTKLSGTGLYLFCADEEPGAEVYAAATKRDQAKIVFDDAVKMVRASKALAGRIGIYKNNMHYPKDLPNNKFEPLSSDSQTQDGLNVHSSIVDELHAHKTGDLWRVLETGTGSRRQPLLYAITTAGFDQTGICYSLRDYAVKVLENIIVDDTFFGIIYTLDKDDDWTDERNWIKANPNLGVSKKLDDMQRQCVKAQQMKGERNGFLCKHLNIWTNAETAWLDLERWKACAEYTFKRESLENRPCYIGLDLASTNDIAALVAAFLMPDDSVRLFCRFYLPKETVMTRAKQSPVPYQLWADEGYLTLTEGNVIDYNYIKDDIYQLNKEFDVKEITYDPWNATQLANDLLEEGANMVEFRQGFKSMTPALKELERLVISTKLHHNNNPVLNWMASNLVVVEDDAGNMKPSKRKSTEKIDGMVATAMAVGRLIAGEDHNSIYNERELLIL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_075274763.1|18666_19062_-	HK97 gp10 family phage protein	Q7Y404	Yersinia_phage	6.0e-07	39.1
WP_075274764.1|19054_19378_-|head	phage head closure protein	K7PH08	Enterobacteria_phage	5.4e-14	41.7
WP_075274765.1|19374_19686_-|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	Q8SBH7	Shigella_phage	2.5e-08	31.7
WP_036778347.1|20005_20587_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_054300591.1|20622_21816_-|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	2.6e-69	39.5
WP_081007077.1|21870_22542_-|protease	Clp protease ClpP	Q8VNN5	Enterobacteria_phage	5.5e-45	45.8
WP_075286005.1|22489_23641_-|portal	phage portal protein	A0A2K5B287	Erysipelothrix_phage	7.2e-85	45.8
WP_054300392.1|23801_24863_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_081377785.1|24881_26339_-|terminase	terminase large subunit	A0A1W6JP18	Morganella_phage	2.4e-122	46.6

4. NZ_CP013771

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	17781 : 23202	7	Staphylococcus_phage(33.33%)	transposase,tail,head	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP013771|17781:23202|DBSCAN-SWA
CATGTCCATTGTTCGAATTCATAGAAAAGAGAAAGATTTTGTTGTACTTGATAAACAGTTTTTAAATGACGAAGGTTTATCTTTTCGTGCTAAAGGGGTGTTGTCTTATTTGTTGTCTTTGCCTGACGATTGGAAAGTGTCGAGATCACATCTTGCAAAAATATCTCAGGATGGGCCGACCTCAGTTAATTCTACTCTGAAGGAGTTAAAAGAGGCGGGATATATTTTACTTATTTCAGAGCGCGAAAATGGAAAAATATCGGGCTATGATTACCTTGTCTTTGAGACGAAAGCGCTTGCAGATGCTTATTTGTCCTCTTCTACCCATACAGATGTTAGTCAACCAACTAAAACGGCCCAAGGTGCTGAGCAAGAAGGAGATGAGCTGCGAGTGGGCAAGCTGTTAGCAGTAAAGCAGCTAGCGGTAAAAAGCCCCCTACTAAATAATAAGGGTACTAAGAACGCCCTCCGTCATCTGAAGTGCAACACTACTCTATACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCAATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATGTATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAATTTCATTAAAATCTGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGGCCTCATGACCCGCAAACTCTGTTCCATTGTCAGAGGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATATAGCGCTCAACGAATAGTTTCTGACATTGACTTCATTACTTGACTAAGCGCTGTCTCTAAATTTATTTCATCTTGATCAAGCTTCATGCGAACCCTATTTTTAAGCGGTGACCATACATGCTCGATCGGGTTTAAATCAGGAGAATAAGGGGGTAAAAATAATAAGTGACAACCCGCATCTTCAATCGCTTCCTTAACCCCTTTTGATTTGTGAAAAGAGGCATTATCCATGATTACAGTCTCTCCAGGAGATAAACAGGGAATTAAGCACTGATCGATATAAGCCTGACAAACGTTAGCATTGCAATAACCTTCAACCATCATTGGTGCGATAAATTGCTTGCCGCGCAAACCACCTATAAAGTTAATTCGTATTGATTTTTTACCTGGCTTCTCTGCATAGCACCGTTTACCTTTAGCAGAGTGGCCATAAGCGTAACGCTCAGTATCATCCATACCCGCTTCGTCCATATAAACAATTTTGTCGTTATCGATTTTCTCGACTTTTTCCAGGAAAGCTTTCCGCTTTAATGCATCACGTTCTTGGTATCTGAAGCTCTTTTTTTTCTGGTATAGCCTAATTTTTTAATCCACACTCCCATGGTTTTTGCACTCATTTCTACAGGGTAAAGATCAGCGAGTTGTTGATGAGTTTTACCCGGATTCTGATCAATAAATTTTTGAAATTCTTTCATATCACTGATTTTATGGTTATAGCCCGTTTGGTAGCCAAACCTTGCTTTGACGTCTCCTGTATGATCACGCCTATTTTTCCAACGATGCAGGGTATCTCGACTGATTTTTAAGAGCTTGGAAACTTGTGTAATAAGTATCCCTTCATCAATCATTTTTAGTGCTCGAATTCTTAAGTCATAACTGTAAGGAGAAGGCATCGTTTTTCCTTATTGTATTTTTTAACCTACTGATAGTATGTCAGAAACTGTTGATCGAGCGCTATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGATCGCGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGGTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTATTTGATCACCACGATTCACCTTTTTCTTATAAGGTTTTCCCGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTTTCACTCACCTGGATATCATGCTCTCGTATAAGTTCCTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGGGTGCTTAACCGTTGATGGATCAACATTTTTGCCTCCTCTGAAATTTGTCGAAAAGCTTGACCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCACAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAACCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGCGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGTAAACGTGTGAATACCTCGGACTTTATGGACACCCTCGCCGCCGGGAAATGTGCCGCCTTGTTCGGTGATTTTTCTAATTTTATTATTGCTGATCGTGGGGGTATTTCGCTGCGTCGATTGAACGAGCTTTATGCTGAAACCGGTGAAGTTGGTTATTTAATGTGGTTGCGTGTGGATGCCTTATTGCTTGAGACAGAGGCAATTAAACAACTTAAAACAGCTGTATCTTAAAAAATTAATAAAAATTAGATGCTTTATTTATTAATAAATAAACTTTATATAATTAATTAATATACTATTTTTATTTATAAAATATTACCATGGCATTAATACATTTAAGGTATTATTGCCATGAATGCAAATCAGTTACTCGCAATTGGTGCTGCCTTAGTCACAGCAGTTCGCCGAAATATTAAATATTCAGAAAACCTTTATTTGTTGACAGGAAATTCTTTTTTTGATGAAAGATATAAAAAAGTATACTCGATTAGAGAAGGGATTAATGCTACTAGTGGTAAAATTGATGAGCAAGCTCCCTCAGCATACGCAAAAAGAGCATTAGATCATAGAGTTGGTTTTTGTAGTGAACTAAGTGAAGTTAGTACTTTCTTAGGCTCAATGTTAAATAAATTTGAAGCACCTGTTTATATATCAGTAATTAAAACTCCTCTTCATGCCTTTTGCTTAATTCATCAATCATCAAGTTTGCACCAACAAACAAAATCAAATGTTTATATTTCTGATAATATAAAAGAGCTTAGTGAGAAAACAGAACTAGAAAATGCAATTATCGTTGATACCTGGATTTATAAGGCAACCAAACTTTCCAATTATAAAAGCCATATAAACTATGCAAAAGAATTTGGAAAACAGTTTGATCTTGAAGAGTGTTTTGATGGTGAAATTAAAACAGAAGGCTATTCTGAAGCGTTTGGTACAACTCAACCTATAAAAATCGCAGAAAAAAGACTGTTAAGGGATTTTAATCTAGCTTACCAAGAAGAGAGCAGAAAGCTCTTTACTAAAGAGACATATTCTACCCAAGGTCGTAGACGTAACTCTATCGATACTAATCTAATTTGTGATAGCAAACGATGGGGGCAGTTGAAAGACCTTAAGCTATTTATTGAAAGAATAGCTTCAAAATCGAGTGATTGGTATTCTAGCTCTAGTAATCGAAAAGGTAAGAGCTATCAAGCACTAATAGATAGTTTGGACTTTGCTATCCAAAAATATATGGACATTAGTAATACCGATTTACAAGAAATTTTTAATCGAGCATTGCAGTTAGCACCTATAGTTCGAGGAACGTCTTCCTTTAAAAATCTTTGGGGTTATAGAAATCATATTACAAAAACAACTGAAGGGTTACTCAGTACAGATGTTGTACCAGAAGAATATTATAAATTTGAAACTCTACCACAGATGAATCTTTTTGAAATAAGGAACATTAGGTCTCGCCCAATATCTCAAAATGAAAAATGTACAGCCTTAATCCAATGGATAAAAAAAGAAGGTGCGGATCCTTCTTTTTATAGTGATGCGCAAAAAGCGGCTGCTTATAAAGCAGTCGATGATTTTGTCAGTCGCAGCCAAGGAGAAGCAAGCTTGTTATTTTATGACAGAGCGGAGGAAGCACCCCCTCTGGCAGCAGAAGCTTCAGCAGCATCATTTAAATCGTTTTAATTCACATTTAAATCAAATTTAAAAGTAAAAGGGACTTTATGAAAGTTAAAATCTTAGTGCCTCGGGCCGGGATAAATATTTCTTATAATATCGGCGATATTATTGATTTACCCGACAAAACCGCAAAAGCCATGATGAAGCACGGTGATGCTGAGGCAGTTAACGTTAAAACATCGAAGAAAAAACCAAAATGATCGATTTAGCACGCCTAAAAAGCCATCTACGCATCGAAGATAATAACGAAGATGATTATTTAGCGTTTATTCTTGCCGCTGCCCTACAAGCCGCCGAGGACTATCTAGACCGTGCAATTGTAAATAATACAAATGACTTAGAAACGATTGAAAACAGTGTGTTAATTAATAAATCGATAGAAATTGCCATCTTAATGTCTGCCGGTCACTTTTATGAAAACCGTGAATCAACGAGTACTTTAACGGTGAAAGAGGTGCCGATGAGTACCCATTTTTTACTCAATCCACATCGGCATTTAAGCGCATGAGAGCGAGTTTGTTACGCCATCGCGTGACTTTACAAAATAATTTAATCGGTGCCAATAATTATGGTGAAGCCGTCGATTATTGGCAGGATATTACTACCGTCTGGGCACGGGTCAGTCCGAGTGCAGGCCGGGAACTCTTTAGCGCCCAACAGTTTTATCATGAAATTACTCAAACGGTGACCCTGCGTTATCGATCTGATATTACCCCGTCGTTGCGCCTTGTTTTTGATGGTCGTTATTTGGAGATTTTAAGTGTGATTAATCCAGATGAGCGTAATCGTGAGCTTATTTTAGCCTGTCGGGAGTGGCTGCATGCCTAAAATGAGTTTTTCTGTTGAGGGTTTACGTGAATTAGAGCAGAAACTTAAAACCTTAGAACCGAAAAAAATAAGAAACCTAAACCGTCGCGCCCTGCGTAAAGCCGCGGAACCGGTTGAGGCACAAATGAAAGCGAATGCACCGCAAAAGTCAGGCGCTTTAGCTGAGTCAATTAAACGGCGTTCTAAAAAAGGCAAAGGCCGCCGAACCATTGTTAATGTGACGGTGGGGCCTGCACGTAAAATTCAATACGCTATCGAGCAAGAATATGGCAGCAGTCACCAACCGGCACGGCCGTTTATTCGCCCGGCGCTGAATGATAACGCGCAAACATCCATCGATATTTTTAAAAATGCATTAACCCTCGCGCTGAAAAAACAAAAACTATGA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP013771|17781:23202|18618_19505_-|WP_155046942.1|transposase|DBSCAN-SWA
MPSPYSYDLRIRALKMIDEGILITQVSKLLKISRDTLHRWKNRRDHTGDVKARFGYQTGYNHKISDMKEFQKFIDQNPGKTHQQLADLYPVEMSAKTMGVWIKKLLYQKKKSFRYQERDALKRKAFLEKVEKIDNDKIVYMDEAGMDDTERYAYGHSAKGKRCYAEKPGKKSIRINFIGGLRGKQFIAPMMVEGYCNANVCQAYIDQCLIPCLSPGETVIMDNASFHKSKGVKEAIEDAGCHLLFLPPYSPDLNPIEHVWSPLKNRVRMKLDQDEINLETALSQVMKSMSETIR
>NZ_CP013771|17781:23202|22182_22494_+|WP_016211137.1|head,tail|DBSCAN-SWA
MIDLARLKSHLRIEDNNEDDYLAFILAAALQAAEDYLDRAIVNNTNDLETIENSVLINKSIEIAILMSAGHFYENRESTSTLTVKEVPMSTHFLLNPHRHLSA
>NZ_CP013771|17781:23202|22806_23202_+|WP_016211139.1|DBSCAN-SWA
MPKMSFSVEGLRELEQKLKTLEPKKIRNLNRRALRKAAEPVEAQMKANAPQKSGALAESIKRRSKKGKGRRTIVNVTVGPARKIQYAIEQEYGSSHQPARPFIRPALNDNAQTSIDIFKNALTLALKKQKL
>NZ_CP013771|17781:23202|19531_20212_-|WP_054300680.1|transposase|DBSCAN-SWA
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHDIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGKPYKKKVNRGDQIKIPNRVGIEHRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVIALDQQFLTYYQ
>NZ_CP013771|17781:23202|22490_22814_+|WP_016211132.1|head|DBSCAN-SWA
MRASLLRHRVTLQNNLIGANNYGEAVDYWQDITTVWARVSPSAGRELFSAQQFYHEITQTVTLRYRSDITPSLRLVFDGRYLEILSVINPDERNRELILACREWLHA
>NZ_CP013771|17781:23202|20657_21992_+|WP_016211133.1|DBSCAN-SWA
MNANQLLAIGAALVTAVRRNIKYSENLYLLTGNSFFDERYKKVYSIREGINATSGKIDEQAPSAYAKRALDHRVGFCSELSEVSTFLGSMLNKFEAPVYISVIKTPLHAFCLIHQSSSLHQQTKSNVYISDNIKELSEKTELENAIIVDTWIYKATKLSNYKSHINYAKEFGKQFDLEECFDGEIKTEGYSEAFGTTQPIKIAEKRLLRDFNLAYQEESRKLFTKETYSTQGRRRNSIDTNLICDSKRWGQLKDLKLFIERIASKSSDWYSSSSNRKGKSYQALIDSLDFAIQKYMDISNTDLQEIFNRALQLAPIVRGTSSFKNLWGYRNHITKTTEGLLSTDVVPEEYYKFETLPQMNLFEIRNIRSRPISQNEKCTALIQWIKKEGADPSFYSDAQKAAAYKAVDDFVSRSQGEASLLFYDRAEEAPPLAAEASAASFKSF
>NZ_CP013771|17781:23202|17781_18282_+|WP_054300681.1|DBSCAN-SWA
MSIVRIHRKEKDFVVLDKQFLNDEGLSFRAKGVLSYLLSLPDDWKVSRSHLAKISQDGPTSVNSTLKELKEAGYILLISERENGKISGYDYLVFETKALADAYLSSSTHTDVSQPTKTAQGAEQEGDELRVGKLLAVKQLAVKSPLLNNKGTKNALRHLKCNTTLY

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_054300681.1|17781_18282_+	hypothetical protein	A0A1W6JQ30	Staphylococcus_phage	8.1e-17	42.7
WP_155046942.1|18618_19505_-|transposase	IS630 family transposase	A0A1V0SDF3	Indivirus	2.6e-10	22.8
WP_054300680.1|19531_20212_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.0e-09	31.0
WP_016211133.1|20657_21992_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211137.1|22182_22494_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	A0A2H4J711	uncultured_Caudovirales_phage	1.1e-08	34.7
WP_016211132.1|22490_22814_+|head	phage head closure protein	A0A1W6JP44	Morganella_phage	5.0e-12	39.8
WP_016211139.1|22806_23202_+	HK97 gp10 family phage protein	Q7Y404	Yersinia_phage	2.1e-07	40.7