Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013791 | Piscirickettsia salmonis strain AY6297B, complete genome | 2 crisprs | DEDDh,cas3,DinG,csa3 | 0 | 0 | 32 | 0 |
NZ_CP013795 | Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p4PS8, complete sequence | 1 crisprs | NA | 0 | 2 | 2 | 0 |
NZ_CP013792 | Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p1PS8, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 4 | 0 |
NZ_CP013793 | Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p2PS8, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
NZ_CP013794 | Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p3PS8, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013795_1 | 10747-10886 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013795_1
|
2 spacers
spacers of NZ_CP013795_1
>1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR TTTTTAATTTTCGTATTAGCTTACGACGCTACA >1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR CTCTTCCCTAAATAATCCTTAAAAACTCCATTTCCACCCCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013795_1
The CRISPR arrays of NZ_CP013795_1 >merge|NZ_CP013795|1|10747-10886|PILER-CR AGTTCCAAACTATTTTGTCATTTTTAATTTTCGTATTAGCTTACGACGCTACACCCAGTTCCCATCTATTTTGTCACTCTTCCCTAAATAATCCTTAAAAACTCCATTTCCACCCCTCCCAGTTCCCAACTATTTTGTCC >NZ_CP013795|1|1|10747-10886|PILER-CR AGTTCCAAACTATTTTGTCATTT TTAATTTTCGTATTAGCTTACGACGCTACACCC AGTTCCCATCTATTTTGTCACTC TTCCCTAAATAATCCTTAAAAACTCCATTTCCACCCCTCCC AGTTCCCAACTATTTTGTCC
>NZ_CP013795.1|WP_001353740.1|10144_10384_-|DUF1819-family-protein MTPFRYNSDLTSGSLQTRECRIITGLLLQELDEAAWDKAMYKENVLQKRTQSTVRRISSALRKRLEHLSSDFWAFAFLC >NZ_CP013795.1|WP_000497519.1|9630_9957_+|tyrosine-type-recombinase/integrase MFVFPSSTLCNHPYNGKLCRHHLHDSVARKALKAAVQKAGIVSKRVTCHTFRHSFATHLLQAGRDIRTVQELLGHNDVKTTQIYTHVLGQHFAGTTSPADGLMLLINQ >NZ_CP013795.1|WP_000071896.1|8979_9516_+|class-2-integron-integrase-IntI2 MSNSPFLNSIRTDMRQKGYALKTEKTYLHWIKRFILFHKKRHPQTMGSEEVRLFLSSLANSRHVAINTQKIALNALAFLYNRFLQQPLGDIDYIPASKPRRLPSVISANEVQRILQVMDTRNQVIFTLLYGAGLRINECLRLRVKDFDFDNGCITVHDGKGGKSRNSLLPTRLIPAIK >NZ_CP013795.1|WP_000704156.1|8132_8657_-|streptothricin-N-acetyltransferase-Sat2 MKISVIPEQVAETLDAENHFIVREVFDVHLSDQGFELSTRSVSPYRKDYISDDDSDEDSACYGAFIDQELVGKIELNSTWNDLASIEHIVVSHTHRGKGVAHSLIEFAKKWALSRQLLGIRLETQTNNVPACNLYAKCGFTLGGIDLFTYKTRPQVSNETAMYWYWFSGAQDDA >NZ_CP013795.1|WP_001206315.1|7286_8075_-|ANT(3'')-Ia-family-aminoglycoside-nucleotidyltransferase-AadA1 MREAVIAEVSTQLSEVVGVIERHLEPTLLAVHLYGSAVDGGLKPHSDIDLLVTVTVRLDETTRRALINDLLETSASPGESEILRAVEVTIVVHDDIIPWRYPAKRELQFGEWQRNDILAGIFEPATIDIDLAILLTKAREHSVALVGPAAEELFDPVPEQDLFEALNETLTLWNSPPDWAGDERNVVLTLSRIWYSAVTGKIAPKDVAADWAMERLPAQYQPVILEARQAYLGQEDRLASRADQLEEFVHYVKGEITKVVGK >NZ_CP013795.1|WP_001444089.1|6713_7211_-|hypothetical-protein MRDLLKVVLSLVLAMASGQALADLPIVLVDEARLPYDYSPSNYDISPSNYDNSISNYDNSPSNYDNSESNYDNSSSNYDNSRNGNRRLIYSANGSRTFAGYYVIANNGTTNFFSTSGKRMFYTPKGGRGVYGGKDGSFCGALVVINGQFSLALTDNGLKIMYLSN >NZ_CP013795.1|WP_155763435.1|6497_6653_-|hypothetical-protein MSYEPPRDGYTNGYIVDVMYDNRPSKYPAVFRTYVRIPDYVELGKVRFNQS >NZ_CP013795.1|WP_004235553.1|5439_6372_+|IS5-like-element-ISKpn13-family-transposase MPAISSYSSRKSRFLDRMNVLVPWQDIADKLLHVYPSSRRGRRPFPLVLMLRIHCLQLWFDLSDGAAEDALHDVLPFRQFAGICDTVPDRTTIMNFRHFLEKHHAGEQILALINQKLKQAGLMLRQGIIIDATIISAPCSVKNKAGQRDPEMHQTRKGNQWYFGMKAHIAVDAATGLTEKVVTTAANVHDLNAADSLITEPVAIVFADAGYRGAEKRDSLTHRVKEWFIAKGPHAVKKLRQHPRLNKQALHDEYVKAGIRAKVEHPFRILKCQFGFSKTRLRGLMKNHNRLSMLFAMCNLVRAGQLAGMS >NZ_CP013795.1|WP_011751353.1|4124_4766_+|type-A-2-chloramphenicol-O-acetyltransferase-CatII MNFTRIDLNTWNRREHFALYRQQIKCGFSLTTKLDITALRTALAETDYKFYPVMIYLISRVVNQFPEFRMAMKDNALIYWDQTDPVFTVFHKETETFSALFCRYCPDISEFMAGYNAVMAEYQHNTALFPQGALPENHLNISSLPWVSFDGFNLNITGNDDYFAPVFTMAKFQQEDNRVLLPVSVQVHHAVCDGFHAARFINTLQMMCDNILK >NZ_CP013795.1|WP_004235553.1|2990_3923_-|IS5-like-element-ISKpn13-family-transposase MPAISSYSSRKSRFLDRMNVLVPWQDIADKLLHVYPSSRRGRRPFPLVLMLRIHCLQLWFDLSDGAAEDALHDVLPFRQFAGICDTVPDRTTIMNFRHFLEKHHAGEQILALINQKLKQAGLMLRQGIIIDATIISAPCSVKNKAGQRDPEMHQTRKGNQWYFGMKAHIAVDAATGLTEKVVTTAANVHDLNAADSLITEPVAIVFADAGYRGAEKRDSLTHRVKEWFIAKGPHAVKKLRQHPRLNKQALHDEYVKAGIRAKVEHPFRILKCQFGFSKTRLRGLMKNHNRLSMLFAMCNLVRAGQLAGMS >NZ_CP013795.1|WP_012850379.1|11336_12554_-|ParB/RepB/Spo0J-family-partition-protein MTDKTTPKSKGADLSGLDDFNLSSFLEGGKKGKAQEDAGNAAPAGAVSYAPLDHFHEDEDNARQEFDAQRLQELAESMTQVNPKTGEVRGILEPLSVKHHPDKPGHFIINGGARRYRAAKLAGLEQAPYIIKDELDDFDKFVLNDQREQLSPLEIAMFIKARLDEGYSKTEVAKALGRPASYVSDHVIFFDMAGAIRDLYDSERCRSMQALALLHRAHKKNPEPVEAFCQDANENDQELTTSQVRAFLESLKKPEGPKEKDEKPTAPTGDSKDQEPQAPKDEDDNQGDTTPASETQLGEGDTDEEPGDQFPDPSTRNEDQQPLTLDGEPLSGGTLEGQADQMLEQDEKADRIKKAIIQVKHDEREARLLTERRAAYGLAWIKYDDDGQEVEVDLNQVALVAVIEA >NZ_CP013795.1|WP_012850378.1|12553_13306_-|ParA-family-protein MQIITVSNQKGGVGKSTVAVHQAMDIQEKGKRVLFLDLDPQANATKTLERIAPPANVTASQLFTESVEAVEPAEGITLIHADGAMADIERAEPSVLSTFKQNLDNLGEAFDYCVIDTPPTLGLRMTAALLVADHVLAPIELEEYSIDGITKMLQTIFGVKEKWNPDLNFLGMLPNRFNPRSLAQKETLTNLVKNYSHLLIKARIGIRSSIPEALSEGIPVWQLKKTSAREAGREFQEAFAIVYEKMGGLK >NZ_CP013795.1|WP_069971684.1|13309_13624_-|transcriptional-regulator MKRRLTPSEFDQAVKRLPRAMKARNIQIARAILVEGRKQAELVRETGLSRTAIAAVVRKIREAHETYGQPPEGWERIEVCLPSEMVHLVRALEEEARRQHENED >NZ_CP013795.1|WP_041692625.1|13824_14019_-|hypothetical-protein MAEKLVITASAYNAAPSDYRSVWTTERFDLANWSEVRDQYMGKRTLMDRSGLHIEGLTMVILDD >NZ_CP013795.1|WP_012850375.1|14392_15388_-|hypothetical-protein MAQGIPTETYDRIVQVANELYEQNGREKMPTVDDVRRAAKADMNTTSAVMREWRKQQTSQAAPVAVPVPAAVQEAFQGALATAWTEAQALANEALSAAQKGWDEERGEADQLRAEMAEAFESQGLELEAVTQQLADEQKAHQATMESAQAARQQIDNLERETQELKTRLATAERQAADRGERAEELKAELAEARADAKEQRKEADRDRKAVEKQHQEEKRSLESLHRQELEKADAAAGELRQRLDTLTGELAQVKARAEAQETQHQEQRQKAEQEAEQAAERVASAQQDREQTRQELAECRERNATLTGELTAVKAQLAELKQAGKGSAKK >NZ_CP013795.1|WP_041692624.1|15497_15920_-|antirestriction-protein MNNAAQIETAVTANQIPTTSRINALPRHFGRHMMAVETVVFAYMRELVEAYQGGYWEFYDLSNGGFYMAPTGTQELRVSVSGNYFDGDMSPDAAGIVACLFAYGYLANSTGAAALSRHFHWLRDYALDHPEAGKILAAID >NZ_CP013795.1|WP_012850373.1|16456_17821_-|hypothetical-protein MAQQQAAQLALFDQTQEANTYHDAGRRGFFSLLTSKDNGDKRQSSHPLSEMATVLGMVDSTRDTWLSQAEFFRPNRRVVNLLRIGLMFVDLDTYRVPWATGRTPEEQAAGVIYFCQAEGLPLPSLMIYSGRGLQLKWLLDAPIPRQALPRWNACQRHLVDKLAELGADPAAKDASRVLRLVDTVNTKSGNICRVVHVQEEAGEPARYNFEYLCEMLLPVARWDIEAQQKRRRDRQLTLIPGGRQSNLKGFSGRQLAWDRLEDLRRLADLRGGVVEGERMQHLFWRLNFLLLSGATNASLMYHEASALARELDANWNHRSKELMTLYSKAKANEAGETVEFNGRKLPPLYTPRNDTLINLFQITDDEQRQLRTILSKDQALERRRERDRKRDEERRRAAGAIEREAYEANSLSKKKPWEALGMSRAKWYRLGKPMPVESETSPSPITGETAARQA >NZ_CP013795.1|WP_012850372.1|18005_18317_-|HigA-family-addiction-module-antidote-protein MNMKRKPKAPGEVLETQFMQPNHITQKELASHTGWTRKHVNELCKGKARVTIDTALILGKAFGTGPDYWLELQQAVDIWDALHSEKRKERLESIVPLMKMVAA >NZ_CP013795.1|WP_012850370.1|18722_19463_+|hypothetical-protein MNDGLANSGAALSRSTQSNAWVPLAQWFAVLTMTLEHVTKYVWPESAFVPWALAIGRIAFPVFAGMVAWHLLHNTRRPVRYGLRLLLIGAISQVPYAWVVTPDRLNICFTLAFGLLAVVLLDQVKDRRTRMATGVVLFLLAAVVSPFVEYQILGLLLVPAFVYAFRNHQRVAAMLPALALCAVINGGSPLHMAISCAAGCAVLLAPSMSFEGAAVPALPRGLRLSWYPLHLVAITVAIMAINQGAI >NZ_CP013795.1|WP_012850369.1|19462_20110_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MTVSTIKVARIYQRVSTKDQDLTRQAAIVQDAKAAGYHIAGVYREKASGASADRPELLRMIDDLQPGEVVISEKMDRISRLPLPEAEKLIEAIKGKGAKLAVPGVVDLSDLVEDATGVTRIVLESVQEMLLRVALQTARDDYEDRRERQRQGIELAKEAGRFTGRRPDSKMHARIVALRSRGESIADTAHLVGCGEATVKRVWAAHKAAKASEGE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_KX774387 | Providencia rettgeri strain 30905 plasmid pC131, complete sequence | 10387-10419 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP053895 | Proteus mirabilis strain JPM24 plasmid pJPM24, complete sequence | 72648-72680 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_KU963389 | Escherichia coli strain ECO37 plasmid ECO37P1, complete sequence | 15133-15165 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP047288 | Proteus cibarius strain G11 plasmid p152, complete sequence | 62060-62092 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP044485 | Acinetobacter schindleri strain HZE30-1 plasmid pHZE30-1-2, complete sequence | 28402-28434 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP025853 | Escherichia coli strain 510016 plasmid p510016_36, complete sequence | 25816-25848 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_KT754165 | Shigella dysenteriae 1 strain 93-531-1 plasmid p93-531-1, complete sequence | 23240-23272 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP053372 | Proteus cibarius strain G32 plasmid pG32-177, complete sequence | 57315-57347 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP024247 | Escherichia coli O27:H7 strain B4103-1 plasmid unnamed2 | 64739-64771 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP053043 | Proteus cibarius strain HNCF44W plasmid pHNCF44W_NDM-1, complete sequence | 95158-95190 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | JX469830 | Uncultured bacterium plasmid pG527, complete sequence | 41349-41381 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP013819 | Piscirickettsia salmonis strain AY3800B plasmid p3PS10, complete sequence | 10767-10799 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | CP025925 | Escherichia coli strain 520873 plasmid p520873_36, complete sequence | 13633-13665 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | CP025875 | Escherichia coli strain 503458 plasmid p503458_37, complete sequence | 10830-10862 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP013795 | Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p4PS8, complete sequence | 10767-10799 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP023380 | Escherichia coli strain 127 plasmid p43, complete sequence | 15396-15428 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP011314 | Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain 234-12 plasmid pKpn23412-362, complete sequence | 172056-172088 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NC_008357 | Pseudomonas aeruginosa plasmid pBS228, complete sequence | 68063-68095 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP027138 | Escherichia coli strain AR_0369 plasmid unnamed2 | 74789-74821 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP022673 | Shigella sonnei strain 866 plasmid p866, complete sequence | 78315-78347 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP045128 | Acinetobacter indicus strain XG03 plasmid pXG03-X3, complete sequence | 89271-89303 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_LT985250 | Escherichia coli strain 170 plasmid RCS38_p, complete sequence | 152291-152323 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_MK360096 | Salmonella enterica strain 13-SA02717 plasmid pSE13-SA02717, complete sequence | 17850-17882 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP053897 | Providencia rettgeri strain YPR31 plasmid pYPR31, complete sequence | 75880-75912 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_MF150120 | Klebsiella pneumoniae strain A64477 plasmid pKP64477d, complete sequence | 40084-40116 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_KX756453 | Klebsiella pneumoniae strain 1194/11 plasmid pKP1194a, complete sequence | 42453-42485 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NC_015472 | Escherichia coli plasmid pECTm80, complete sequence | 13464-13496 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP013800 | Piscirickettsia salmonis strain AY6532B plasmid p4PS9, complete sequence | 12090-12122 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | MG516911 | Proteus mirabilis plasmid pPm60, complete sequence | 57128-57160 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP003997 | Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae Kp13 plasmid pKP13d, complete sequence | 42619-42651 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | CP054380 | Escherichia coli strain SCU-175 plasmid pSCU-175-1, complete sequence | 38153-38185 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NC_002525 | Escherichia coli K-12 plasmid R721, complete sequence | 10525-10557 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP048015 | Acinetobacter towneri strain 205 plasmid pAT205, complete sequence | 49215-49247 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP034054 | Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2015_112126 plasmid unnamed1, complete sequence | 140941-140973 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP047114 | Proteus mirabilis strain SCBX1.1 plasmid plas1.1.2, complete sequence | 46467-46499 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP034046 | Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2014_104014 plasmid unnamed1, complete sequence | 150963-150995 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP027700 | Klebsiella pneumoniae strain KP30835 plasmid unnamed5, complete sequence | 7471-7503 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP013795_1 | 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR | 10826-10866 | 41 | NZ_CP013819 | Piscirickettsia salmonis strain AY3800B plasmid p3PS10, complete sequence | 10823-10863 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP013795_1 | 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR | 10826-10866 | 41 | NZ_CP023380 | Escherichia coli strain 127 plasmid p43, complete sequence | 15452-15492 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR | 10826-10866 | 41 | NZ_CP011314 | Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain 234-12 plasmid pKpn23412-362, complete sequence | 172112-172152 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR | 10826-10866 | 41 | NC_008357 | Pseudomonas aeruginosa plasmid pBS228, complete sequence | 68119-68159 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR | 10826-10866 | 41 | NZ_CP027138 | Escherichia coli strain AR_0369 plasmid unnamed2 | 74845-74885 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR | 10826-10866 | 41 | NZ_CP022673 | Shigella sonnei strain 866 plasmid p866, complete sequence | 78371-78411 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP013795_1 | 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR | 10826-10866 | 41 | NZ_CP034054 | Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2015_112126 plasmid unnamed1, complete sequence | 140877-140917 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR | 10826-10866 | 41 | NZ_CP047114 | Proteus mirabilis strain SCBX1.1 plasmid plas1.1.2, complete sequence | 46403-46443 | 0 | 1.0 |
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NZ_CP013795_1 | 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR | 10826-10866 | 41 | NZ_CP045128 | Acinetobacter indicus strain XG03 plasmid pXG03-X3, complete sequence | 89327-89367 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR | 10826-10866 | 41 | NZ_CP027700 | Klebsiella pneumoniae strain KP30835 plasmid unnamed5, complete sequence | 7407-7447 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR | 10826-10866 | 41 | NZ_LT985250 | Escherichia coli strain 170 plasmid RCS38_p, complete sequence | 152347-152387 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR | 10826-10866 | 41 | NZ_MK360096 | Salmonella enterica strain 13-SA02717 plasmid pSE13-SA02717, complete sequence | 17906-17946 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR | 10826-10866 | 41 | NZ_CP053899 | Proteus mirabilis strain YPM35 plasmid pJPM35-1, complete sequence | 116635-116675 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR | 10826-10866 | 41 | NZ_MK264770 | Klebsiella pneumoniae strain KP89 plasmid pKP89, complete sequence | 42556-42596 | 0 | 1.0 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | CP052804 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S973 plasmid pN17S0973, complete sequence | 113091-113123 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | CP038508 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FARPER-219 plasmid p-F219, complete sequence | 228634-228666 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | CP052788 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0611 plasmid pN19S0611, complete sequence | 321488-321520 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | CP052786 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0641 plasmid pN19S0641, complete sequence | 10079-10111 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | CP052838 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S097 plasmid pN16S097, complete sequence | 13470-13502 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | CP051676 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1234 plasmid pN16S1234, complete sequence | 201786-201818 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | CP052779 | Salmonella enterica strain 19TN07GT06K-S plasmid pN19S1233, complete sequence | 212524-212556 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | CP052832 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1040 plasmid pN17S1040, complete sequence | 277011-277043 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | MN310378 | Klebsiella pneumoniae strain A2293 plasmid pA2293-Ct2, complete sequence | 73380-73412 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | CP052806 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S816 plasmid pN17S0816, complete sequence | 282696-282728 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | CP052818 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1509 plasmid pN17S1509, complete sequence | 1788-1820 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_MH476540 | Klebsiella pneumoniae strain KP1276 plasmid pIA/C-KLUC, complete sequence | 87104-87136 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | CP052795 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0125 plasmid pN19S0125, complete sequence | 166287-166319 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP047882 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain 119944 plasmid pESI, complete sequence | 264306-264338 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | CP052802 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S976 plasmid pN17S0976, complete sequence | 197576-197608 | 2 | 0.939 |
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NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | CP052836 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S103 plasmid pN16S103, complete sequence | 222743-222775 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | CP052828 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1126 plasmid pN17S1126, complete sequence | 8856-8888 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | CP052826 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1245 plasmid pN17S0637, complete sequence | 292607-292639 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP016409 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FSIS1502916 plasmid pFSIS1502916, complete sequence | 299316-299348 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP016407 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FSIS1502169 plasmid pFSIS1502169, complete sequence | 299920-299952 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP016413 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM44454 plasmid pCVM44454, complete sequence | 295999-296031 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_CP016411 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain N55391 plasmid pN55391, complete sequence | 293612-293644 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | CP052814 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S349 plasmid pN17S0349, complete sequence | 281790-281822 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013795_1 | 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR | 10770-10802 | 33 | NZ_MG764552 | Klebsiella pneumoniae strain A1763 plasmid pA1763-Ct2, complete sequence | 61314-61346 | 2 | 0.939 |
NZ_CP013795_1 | 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR | 10826-10866 | 41 | NZ_CP053897 | Providencia rettgeri strain YPR31 plasmid pYPR31, complete sequence | 75936-75976 | 2 | 0.951 |
NZ_CP013795_1 | 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR | 10826-10866 | 41 | MN310378 | Klebsiella pneumoniae strain A2293 plasmid pA2293-Ct2, complete sequence | 73436-73476 | 2 | 0.951 |
NZ_CP013795_1 | 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR | 10826-10866 | 41 | NZ_MH476540 | Klebsiella pneumoniae strain KP1276 plasmid pIA/C-KLUC, complete sequence | 87160-87200 | 2 | 0.951 |
NZ_CP013795_1 | 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR | 10826-10866 | 41 | NZ_MG764552 | Klebsiella pneumoniae strain A1763 plasmid pA1763-Ct2, complete sequence | 61250-61290 | 2 | 0.951 |
1. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_KX774387 (Providencia rettgeri strain 30905 plasmid pC131, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP053895 (Proteus mirabilis strain JPM24 plasmid pJPM24, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_KU963389 (Escherichia coli strain ECO37 plasmid ECO37P1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP047288 (Proteus cibarius strain G11 plasmid p152, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP044485 (Acinetobacter schindleri strain HZE30-1 plasmid pHZE30-1-2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP025853 (Escherichia coli strain 510016 plasmid p510016_36, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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7. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_KT754165 (Shigella dysenteriae 1 strain 93-531-1 plasmid p93-531-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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8. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP053372 (Proteus cibarius strain G32 plasmid pG32-177, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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9. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP024247 (Escherichia coli O27:H7 strain B4103-1 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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10. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP053043 (Proteus cibarius strain HNCF44W plasmid pHNCF44W_NDM-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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11. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to JX469830 (Uncultured bacterium plasmid pG527, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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12. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP013819 (Piscirickettsia salmonis strain AY3800B plasmid p3PS10, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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13. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to CP025925 (Escherichia coli strain 520873 plasmid p520873_36, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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14. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to CP025875 (Escherichia coli strain 503458 plasmid p503458_37, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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15. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP013795 (Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p4PS8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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16. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP023380 (Escherichia coli strain 127 plasmid p43, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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17. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP011314 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain 234-12 plasmid pKpn23412-362, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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18. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NC_008357 (Pseudomonas aeruginosa plasmid pBS228, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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19. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP027138 (Escherichia coli strain AR_0369 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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20. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP022673 (Shigella sonnei strain 866 plasmid p866, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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21. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP045128 (Acinetobacter indicus strain XG03 plasmid pXG03-X3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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22. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_LT985250 (Escherichia coli strain 170 plasmid RCS38_p, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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23. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_MK360096 (Salmonella enterica strain 13-SA02717 plasmid pSE13-SA02717, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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24. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP053897 (Providencia rettgeri strain YPR31 plasmid pYPR31, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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25. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_MF150120 (Klebsiella pneumoniae strain A64477 plasmid pKP64477d, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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26. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_KX756453 (Klebsiella pneumoniae strain 1194/11 plasmid pKP1194a, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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27. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NC_015472 (Escherichia coli plasmid pECTm80, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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28. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP013800 (Piscirickettsia salmonis strain AY6532B plasmid p4PS9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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29. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to MG516911 (Proteus mirabilis plasmid pPm60, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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30. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP003997 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae Kp13 plasmid pKP13d, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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31. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to CP054380 (Escherichia coli strain SCU-175 plasmid pSCU-175-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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32. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NC_002525 (Escherichia coli K-12 plasmid R721, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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33. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP048015 (Acinetobacter towneri strain 205 plasmid pAT205, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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34. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP034054 (Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2015_112126 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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35. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP047114 (Proteus mirabilis strain SCBX1.1 plasmid plas1.1.2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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36. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP034046 (Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2014_104014 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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37. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP027700 (Klebsiella pneumoniae strain KP30835 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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38. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP053899 (Proteus mirabilis strain YPM35 plasmid pJPM35-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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39. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_MK264770 (Klebsiella pneumoniae strain KP89 plasmid pKP89, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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40. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_KX774387 (Providencia rettgeri strain 30905 plasmid pC131, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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41. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_MF150120 (Klebsiella pneumoniae strain A64477 plasmid pKP64477d, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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42. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP053895 (Proteus mirabilis strain JPM24 plasmid pJPM24, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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43. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_KX756453 (Klebsiella pneumoniae strain 1194/11 plasmid pKP1194a, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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44. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_KU963389 (Escherichia coli strain ECO37 plasmid ECO37P1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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45. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP047288 (Proteus cibarius strain G11 plasmid p152, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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46. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NC_015472 (Escherichia coli plasmid pECTm80, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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47. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP044485 (Acinetobacter schindleri strain HZE30-1 plasmid pHZE30-1-2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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48. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP025853 (Escherichia coli strain 510016 plasmid p510016_36, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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49. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_KT754165 (Shigella dysenteriae 1 strain 93-531-1 plasmid p93-531-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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50. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP013800 (Piscirickettsia salmonis strain AY6532B plasmid p4PS9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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51. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP053372 (Proteus cibarius strain G32 plasmid pG32-177, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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52. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP024247 (Escherichia coli O27:H7 strain B4103-1 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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53. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP053043 (Proteus cibarius strain HNCF44W plasmid pHNCF44W_NDM-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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54. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to MG516911 (Proteus mirabilis plasmid pPm60, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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55. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to JX469830 (Uncultured bacterium plasmid pG527, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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56. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP013819 (Piscirickettsia salmonis strain AY3800B plasmid p3PS10, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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57. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP003997 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae Kp13 plasmid pKP13d, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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58. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to CP025925 (Escherichia coli strain 520873 plasmid p520873_36, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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59. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to CP025875 (Escherichia coli strain 503458 plasmid p503458_37, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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60. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP013795 (Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p4PS8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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61. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to CP054380 (Escherichia coli strain SCU-175 plasmid pSCU-175-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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62. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NC_002525 (Escherichia coli K-12 plasmid R721, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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63. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP023380 (Escherichia coli strain 127 plasmid p43, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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64. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP011314 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain 234-12 plasmid pKpn23412-362, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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65. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NC_008357 (Pseudomonas aeruginosa plasmid pBS228, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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66. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP027138 (Escherichia coli strain AR_0369 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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67. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP022673 (Shigella sonnei strain 866 plasmid p866, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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68. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP048015 (Acinetobacter towneri strain 205 plasmid pAT205, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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69. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP034054 (Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2015_112126 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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70. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP047114 (Proteus mirabilis strain SCBX1.1 plasmid plas1.1.2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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71. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP034046 (Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2014_104014 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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72. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP045128 (Acinetobacter indicus strain XG03 plasmid pXG03-X3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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73. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP027700 (Klebsiella pneumoniae strain KP30835 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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74. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_LT985250 (Escherichia coli strain 170 plasmid RCS38_p, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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75. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_MK360096 (Salmonella enterica strain 13-SA02717 plasmid pSE13-SA02717, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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76. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP053899 (Proteus mirabilis strain YPM35 plasmid pJPM35-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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77. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_MK264770 (Klebsiella pneumoniae strain KP89 plasmid pKP89, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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78. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to CP052804 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S973 plasmid pN17S0973, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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79. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to CP038508 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FARPER-219 plasmid p-F219, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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80. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to CP052788 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0611 plasmid pN19S0611, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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81. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to CP052786 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0641 plasmid pN19S0641, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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82. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to CP052838 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S097 plasmid pN16S097, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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83. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to CP051676 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1234 plasmid pN16S1234, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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84. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to CP052779 (Salmonella enterica strain 19TN07GT06K-S plasmid pN19S1233, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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85. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to CP052832 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1040 plasmid pN17S1040, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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88. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to CP052818 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1509 plasmid pN17S1509, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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89. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_MH476540 (Klebsiella pneumoniae strain KP1276 plasmid pIA/C-KLUC, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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90. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to CP052795 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0125 plasmid pN19S0125, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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91. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_CP047882 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain 119944 plasmid pESI, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
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104. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to MN310378 (Klebsiella pneumoniae strain A2293 plasmid pA2293-Ct2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.951
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105. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013795|PILER-CR matches to NZ_MH476540 (Klebsiella pneumoniae strain KP1276 plasmid pIA/C-KLUC, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.951
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---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
0 : 25688
Sequences of DBSCAN-SWA_1
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31 | Escherichia_phage(27.27%) | integrase,transposase | attL 4548:4563|attR 30340:30355 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_2 |
37244 : 41957
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013795|37244:41957|DBSCAN-SWA CATGGCACAAGAACAGATAGCCGACAAAAACACTTACCTGGTGGTGCCCTTCGAGGAAAAGGACGAGGCGGTAAAAGCGGCCGGTAAGCTGCCGGACGGCTCGAACGCTATCACCTTCGATGGTGACAACAAGCTGTGGTACGCCAAGCCAGGCGCCGACCTGTCCAAGGTGTCGCAGTGGGCACCAGACCCGGCCAAGGCCAATTCCACGTCTGCCGAGAATGACCCCCAGGTGGAGTTTGCCCGGACCCTTGAGGCCGAAGGTTTCGTGCTCGATGGCCTCCCGGAAATGGACGGGCGCCGGCATCGGGTGAAGACCCAGGACGACAAGCGCGGCCAACGCACCGGCGTCTATGTCGGATACCTCGATGGAGTCCCGGCCGGCTGGTATCAAGATCACCGGGTTCATGAAGATCCGGTGAAGTGGAAAGCAACGGGCCAGAAGCTGGACCATGAAGCCCAAGCGCACCTCCGCGCCCAGGCCCTCCAACGAAAGATGGAGCGCCAGGCTAAACAGGAACGCTCCTACGATCACAACGCCCGACGCGCTGGCCAGGTTTACGCGCTCATGCCGGACGCCACGCCAGACCAGGGATATTTGCAGAACAAGGGCGTGAAGCCTTTCCCTGGTGCCAAAATGGACAAGCGCGGCCGCCTGGTGCTGCCGTTGAAAAATGAGAATGACGAGGTTCGGACGCTCCAACGAATCGACCGCACGGGCTTCAAGTCGTTGAAGAAGAACGGCCAGAAAACCGGCAACTACTTCGTGGTAGGCGACCGCGAGCTGCAAAACGGCGAGCCGATCCTATACGCGGAAGGCTATTCGACTTCGGCCAGCATTGCCGAGGCCACCGGCCGTCCCGTGGTCATGACTGTGGACGCCGGCAACTTGCCGCGAGTGGCCGAGAAGCTGAAAGACAAATACCCGGCCAGCTCGCACATCGTGCTAGGCGACGACGACCGGGACAACAAGGTGAACAAGGGCCGCGAGAAAGCGGAAGAAGCGGCGGCGCTGACCAGCGGCGCGTTTCGTGTGCCAGAGTTCAACGACCAGGAAAAACAAGCCGGACTGACCGACTTCAACGACCTGCATCAATCACGCGGCCTCGATGCTGTGCGGGAGCAAGTCGAACAAATCGTGGCGCAGTCCGCAAAGGTGGAAAACATGAGCGAAGAAAAGAACGAGAAGACTAACGACCCGGTAATAAGCGAAAACTTCGAGCGGTACGTAAATCAGGGGCTCAACCGTGAACAGGAGCAGACCCAAGAGGCACCGCGTAGCCGCTTCGAGCTGGTGAACCAGGCTGGTGAGTCTGCCTATCAGACTGACGACATTCGAGACGCTTTCGCCCGTCAGACGCTGGACCAGAACCACAATAAGGAATACTCGATCCGCGATAACCAACGCGGTGAGATTGCATCGAGCTACACCAACCTGGAAGCGGAAGGCGAACAGCCAACCCGTGGCGTCCAGGCTTCGCCGGCTTTCGTGGCCGAGTTCAACGCCGAGGTGAACCAGGAACACCGCATCCGCGAGCAAATGCCCCTCGATGACCGGATGCACGACAGGGCGGCCGCCCTGATCGAGCAAGCAGAAAGCCAGCCTGTCCAGGAACAGGACCAGGAACGCGCTCAACAGCCAGCCCTGGAGCCGGTCGAGCAAGAGGCGGAACCTGTTCAGGAGCAAGCGCCGGAGGTGGACCAGGAGGAAGCCGCGGCCGATCTGCAGGAAGGTGACGGCGAGAACAGTATCGAGCCGCATATCGAGCAAAAGCAGGAATCCGAGGCCGACAACGACGCCCGTCAGTGGCTCCAAAGCAGCAGCCGCCAGTCGCTGAAAGATATGCTGGCCGAAGAAGAAGCAAGGACCGAGGCGCGGCGCGAACAGCAGGACCGTGAAAACCGCCAAGACCCGGCCAGCCTGCAAGTCGGCAAGCCCGCGCCGGCCGCGCCGGCCGCGCAGCAGGATGACCCATTCGCGGACCAGGAGCAGACGACCTTCAAGCCAGTGGTGCCCGAGAAGGTGGCCAAGTCCTACGTGGAGGTGGAAGGCAAGTATTACTTCGCCGGCCGCCCCGACTCGCTGGCGTTCGTGGACAAGGGCGCCCGGCTGCAAACCAAACTGAGCAATGCCCAGGTGGCCGGCTCGATGGTCGATATTGCCGAGTCCCGAGGCTGGACCGAAATCCAAGTGAAGGGAACGCAGGACTTCCGCCGCGAAGCCTGGCTAGAAGCAGCATCCCGAGGCCTTGAGGTGCGCGGCTACAAGCCCCGCGAAGAAGACCTGGCCCGACTCAAGAAGTTGGCCACTGAACGCCAGCCAAACGAGATCGAGGCGCGGGAGCAGGCAGACCAGCCCCGAACCAACCAGGGGCAGCCGAGCCGGCCGCGTCAGCAATCGGAAGCAGCCAAGCCCAGGGAAGCGGCCAGCCAAGCCCAGGAACAGGCTCAGGAGGCCACACAAGCGACCCAGGAGCCCCAGGCCAGCGAGCCGGTCAACCGCCTGGCGGGCAAGGTGGTGGAGCATGGCAAGGCCCCTTACGAGCACAACAAGGACAACCGGGAAAGCTACTACGTCACCCTGGAGAACGCGGACGGCGAGAAAAGCACCACTTGGGGCGTGGACCTAGAACGGGCCATGGAAGAAAGCGGCGCCAAGGAAGGGGATACCGTCGAGCTGGAGAACCAGGGACGCCAGCCGGTGACAGTCAACCGTCCTGTGAAGGATGAACAAGGCAAGGTGGTTCGCACCGAGCAAATCAACACGCACCGCAACAAATGGGACGTGAAGGCCGAAGCACTCCAGGATCGGGAGCGCGATGCTAAAGAGCTGGTCCGGGAGCATCCCGACCTGGTGAACGAGGTTGCCGCTATCAAGGTGGCCGAGAAGTTCAGCCAAAAGCAATTCAGCAACGAGGCCGACCGCGAACGTTTCATGGACAAGGTGCGTACCCAGGTCGCCGGCAACGTATCCAAGGGCCAGCAGGCCCCGGAAGTGAAGCTGCGCGAAGAACGAGTGACCGAGAAGGAGAACGACAATGAGAGATAAAATTCTGGACCTGAACACCCCTGGCCTGGTGGTCGAAGTGAGCAAGGAAGAGGCGGCCGAGCTGGGCGCCTTCGAAGAAGACGCGCTGAGCGAGGAAGACGCCCAGGAGGCGACCGAAGAACAGGAGGACTAGCCATGGCCGGGAGCAAGGACACCAAAAAGCCGTATTACGAGCAAATCAGTGAACGGCTTATCCAACAACTGGAAGCAGGCACGGCCCCATGGCAAAAGCCATGGGAGCCTGGTTCCCATCGAATGCCCCATAACCCGGTCAGCGGCACCAGGTACAAGGGCGCAAACGCTATCTGGCTGGCCATGCAAGGCCGGTCAGACCCTCGCTGGATGACCTACAAGCAGGCCCAAAGCGTCAACGCCCAGGTATCCAAGGGCGAAAAAGGCGTGGCGGTCCAATATTGGAAGTTCCGGGATCGCGTCCCGAAACGGGACGAAAACGGCAAACCCGTCCTAGACGACAAGGGCAAAAAGGTGATGGTCAGCGTCGAGCTGGACAAGCCGAAGGTCTTTAGTTCCGTTGTCTTCAATGCTGAGCAAATCAAGGGGCTTCCGCCCCTTGAAGCTAAGAAGGAACCGGCATGGGATCGCCACGAACGTGCCGAGTCCATCCTAAAGGCATCAGGTGCGGACCTGCACCACGACCAGGGGGACCGGGCCTTTTATCGCCCGTCTACCGACTCAATCCACCTACCTGACCAGGGCCAGTTTGAAAGTGCCGATCGCTACTATTCCACGGCCTTGCATGAGCTGGGGCACTGGACCGGCCACCCTTCCCGCCTGGACCGCGACCTGTCCGGTGGATTCGGCAGCGAATCCTATGCAAAAGAGGAGCTTAGGGCGGAAATTAGCAGCCTTATGATTGGCGAGGAACTGGAAATAGGACACGACCCTGGCCAACACGCGGCCTATGTCAAAAGCTGGGTTCGCGTTCTCAAGGATGACCCTAAAGAGATTCTTAGGGCTGCCCGCGACGCGGACAAAATCCGCGACATGGTGATGGGATACGAGCCAAACCGCGACCAGCACCAGGAGCAAGGCCAGAAAGCGACGATTACGCCGGCCGCCGCCGAGAAGCTGCACAAGCTCGACAAGGACGCAGTGGAAGGCTATTCCCCGATGGAAAGCTGGAAGATGATGCAGGCCGAAGCCGCTCAACACGGTTACACCGCTCGCATTGACGTGAACAAGGACCAGGACGAGTTCGCCAGCCAGTTTGTCATTGGCTACGAGGACCGCAACGGCGACCAGACCGGCATCCGCACCGATATGTATGCCGATAGCAAGCTGGAAACCTCCATCGACGGCCGCCGCCTGTCCACGTTTATTTCCAACGACTCCGAAAGCCAGCCGCGACACCTCCGCGAGGCCATCCAGGAACACGAACAGGGTAAAGCCTCCCAGCCGTCGAGCAGCTACCAGGAAGCGCCTCAGAAGCCCCAGGAAGCCGAAACGGCCCAAGAGCAAGGCGATGGTAGCGCCCTATCCCTCAAGCTCGCTGAGAAGGTCGCCCAGGGCTTCAAGAGTGACGAGGATCGAGCCCGTTTCATGGAGCGGGTCCAAGAACGGCTAGGCCAAGGGGCTGACCAATCTTCTGATATTCGTATCAGGGAATCAGTCCCAGCCAAAGGCGATTCGGACATGGAGCGGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013795|37244:41957|40427_41957_+|WP_012850391.1|DBSCAN-SWA MAGSKDTKKPYYEQISERLIQQLEAGTAPWQKPWEPGSHRMPHNPVSGTRYKGANAIWLAMQGRSDPRWMTYKQAQSVNAQVSKGEKGVAVQYWKFRDRVPKRDENGKPVLDDKGKKVMVSVELDKPKVFSSVVFNAEQIKGLPPLEAKKEPAWDRHERAESILKASGADLHHDQGDRAFYRPSTDSIHLPDQGQFESADRYYSTALHELGHWTGHPSRLDRDLSGGFGSESYAKEELRAEISSLMIGEELEIGHDPGQHAAYVKSWVRVLKDDPKEILRAARDADKIRDMVMGYEPNRDQHQEQGQKATITPAAAEKLHKLDKDAVEGYSPMESWKMMQAEAAQHGYTARIDVNKDQDEFASQFVIGYEDRNGDQTGIRTDMYADSKLETSIDGRRLSTFISNDSESQPRHLREAIQEHEQGKASQPSSSYQEAPQKPQEAETAQEQGDGSALSLKLAEKVAQGFKSDEDRARFMERVQERLGQGADQSSDIRIRESVPAKGDSDMER >NZ_CP013795|37244:41957|40281_40425_+|WP_012850392.1|DBSCAN-SWA MRDKILDLNTPGLVVEVSKEEAAELGAFEEDALSEEDAQEATEEQED >NZ_CP013795|37244:41957|37244_40292_+|WP_012850393.1|DBSCAN-SWA MAQEQIADKNTYLVVPFEEKDEAVKAAGKLPDGSNAITFDGDNKLWYAKPGADLSKVSQWAPDPAKANSTSAENDPQVEFARTLEAEGFVLDGLPEMDGRRHRVKTQDDKRGQRTGVYVGYLDGVPAGWYQDHRVHEDPVKWKATGQKLDHEAQAHLRAQALQRKMERQAKQERSYDHNARRAGQVYALMPDATPDQGYLQNKGVKPFPGAKMDKRGRLVLPLKNENDEVRTLQRIDRTGFKSLKKNGQKTGNYFVVGDRELQNGEPILYAEGYSTSASIAEATGRPVVMTVDAGNLPRVAEKLKDKYPASSHIVLGDDDRDNKVNKGREKAEEAAALTSGAFRVPEFNDQEKQAGLTDFNDLHQSRGLDAVREQVEQIVAQSAKVENMSEEKNEKTNDPVISENFERYVNQGLNREQEQTQEAPRSRFELVNQAGESAYQTDDIRDAFARQTLDQNHNKEYSIRDNQRGEIASSYTNLEAEGEQPTRGVQASPAFVAEFNAEVNQEHRIREQMPLDDRMHDRAAALIEQAESQPVQEQDQERAQQPALEPVEQEAEPVQEQAPEVDQEEAAADLQEGDGENSIEPHIEQKQESEADNDARQWLQSSSRQSLKDMLAEEEARTEARREQQDRENRQDPASLQVGKPAPAAPAAQQDDPFADQEQTTFKPVVPEKVAKSYVEVEGKYYFAGRPDSLAFVDKGARLQTKLSNAQVAGSMVDIAESRGWTEIQVKGTQDFRREAWLEAASRGLEVRGYKPREEDLARLKKLATERQPNEIEAREQADQPRTNQGQPSRPRQQSEAAKPREAASQAQEQAQEATQATQEPQASEPVNRLAGKVVEHGKAPYEHNKDNRESYYVTLENADGEKSTTWGVDLERAMEESGAKEGDTVELENQGRQPVTVNRPVKDEQGKVVRTEQINTHRNKWDVKAEALQDRERDAKELVREHPDLVNEVAAIKVAEKFSQKQFSNEADRERFMDKVRTQVAGNVSKGQQAPEVKLREERVTEKENDNER |
3 | Bdellovibrio_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013791_1 | 544570-544665 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013791_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP013791_1
>1.1|544594|48|NZ_CP013791|CRISPRCasFinder ATTGGGATTGAAAACCACCTACAGTACCAAAAATTTCTTCTTCTTGTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013791_1
The CRISPR arrays of NZ_CP013791_1 >merge|NZ_CP013791|1|544570-544665|CRISPRCasFinder CAGAGTGTCCTGAAGCCCCTTGAGATTGGGATTGAAAACCACCTACAGTACCAAAAATTTCTTCTTCTTGTCCAGAGTGCCCTGAAGCCCCTTGAG >NZ_CP013791|1|1|544570-544665|CRISPRCasFinder CAGAGTGTCCTGAAGCCCCTTGAG ATTGGGATTGAAAACCACCTACAGTACCAAAAATTTCTTCTTCTTGTC CAGAGTGCCCTGAAGCCCCTTGAG
>NZ_CP013791.1|WP_017378009.1|542164_543910_-|hypothetical-protein MPITKQTKATTIQISIRALLSSTMEPCGQTIISSIDSSHQEIIRWLEFVKELPQIKESGGGVSFILESNTPLPEGFQQDLKDQCERLIANSKIFFNISSIAAKHHAAEKNSIEISEEIYEEIDSKHYATSPRQSVTEHSLSNHTDDDKDSSTHAHPIANTTQNNDFPPPPPNAADSSATASNLPFEQIQTQPASETVKNLGGSITYDQLLNLLKQEIQKAVAIIDKKIKNAKLPFSISTPFEDTKGRKKSILVLEEFIKDILTYPDQGNPDQPLTQELGMLVHTRLKDFYEDDGKMKGRRKTKTISMLFSEIKLMFQNITYANTAVSDDNGSPFPPPPPPLLEQDLLSLELTQFNDSELPLPPPPPPSPILLEDQQQLELNAAQPDLSADSHKAHMAVLGAKLRERQLSLGNETQSNSNSQPAPPPLPPKPVFSVGDLAPPNSGNTKPPLPPKPPLVVDDLTSSESTHAQCASDLTADKTVTFLEEIQQRKQQGLRSIKHSHPLQGPAPLDLNAQILKRRQNMQQTGTSDGKPINLAAALLFQCSQMNTQHSQSNNSNATNDNNDNWSDDWSDSASSPPSP >NZ_CP013791.1|WP_036771696.1|540289_541750_-|hypothetical-protein MIKVIKENEGAIVTKGQETILLTGSIYDGSNLGKSPAIIALSELGSGLFCAKATLQSENSCLSWLQELKETLGNEITFHLTGKQSKEDLAELQILCQQAEIEAQFPIPEKQPLLYSLATGVNANGIIEKEDLYEKTGGFSFSLTLTKEIEQAISELEKKIKDSWFTINTKGRTDSIILLKELKQNLEQLGESYIGPVNSESDLKFPKSLKEAIKDYSGSEAKNGRQQTTTVGGLLKTLDFHFTRYTVLTTKFTQVPVLTATWHTSEPSADTDSASATPMPDINESKSTPPPPPPAELKAGAKARREEEAAVTVLTNAMEFADDNAEDLPPPPPPSNPDLQQPLPDFNDSDFPPPPPPPPPSDEEQMPLADFDDIELPPPPPMDFETGPETQVSPIEEVNSGATPTDGTGPDTTEKKDSANITAEMQSIMARRGAIGGPDSETEAGEDDSWSDQEDNSGPNQSPSTLFQRQQSQSQEADNSNPLQYN >NZ_CP013791.1|WP_053093668.1|539507_540107_-|hypothetical-protein MRIITKPTTAKCNIQAYIRYLLSEPVRTSCTGLSDVLLNISHDSVNRFLLRENYRPEDLWTEVSEKIDLNNGVLSVDDMVIDKPYSNAEKTDLIGFFYSGKHHCVVKGVNVITLYYTDQHDVSVPINFRIIDPDEGKTKNEHFREMLQQVLSWGLQPSWVTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP013791.1|WP_144420647.1|539172_539370_+|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVSEDIIRLFSIANSMPRLYFLINFRFSMLEYQQSPAASHGVLSTG >NZ_CP013791.1|WP_155046604.1|538831_538972_-|hypothetical-protein MLSTPWLAAGAVAVRFKQSIVGMKVVYKSNGTTLRARSEQKRTLAQ >NZ_CP013791.1|WP_048875964.1|537984_538764_-|hypothetical-protein MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSHVSVATSVGILHIQ >NZ_CP013791.1|WP_017376708.1|537018_537420_-|transposase MGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKERKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP013791.1|WP_036773793.1|536496_536874_-|hypothetical-protein MLSTPWLAAIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP >NZ_CP013791.1|WP_027242834.1|534729_536037_+|hypothetical-protein MKFIYPGINAPLDTEKSLYAETTQGYFSHKESGKALDFNFIKKQESYFSQWDKRTAFTCEEYKALTHQQRLQLYRLHTTRWNYTLSLLLKDPGAGPDSPLYAEKQFLQNLNENEEMRKLYAGWFIDYVESREGETSKAVEALFKKEMQLKPECDLSKEKQIAVKVRGFRDEITELQAWLMNGSSAERIAIEKYDTKAVNQFIKYQLGQVSKSEFNKTFERAQSKCNKVLKNALHLTTSAASILTEKKIDLNSSVEWERLKNSQHLQKAVLILHKSNINLADSWDTLKDNSHLQKAVLTLHHESSINLTEHWDKVKNNSPLQKALAASYDYLNAERSSWSKMHHNHGIRQTHKFIRHLMASENQTLSGIQAEMQQWLHGYGHFSRASGSASNSRMSFALQSGLCPQADTPPTLLFNTSLQATEVEQEVTNQVTLSS >NZ_CP013791.1|WP_155048058.1|533998_534181_-|hypothetical-protein MLSTPWLAAAVSFLLIVKGAIIVFDRTYALTAGINFDFSSASMPFIIKSLTTPINKSFLS >NZ_CP013791.1|WP_017378007.1|545723_547667_-|hypothetical-protein MKNNIYLNKLPSFLILITGITISLFLFYSLNKSHNLEASSHFEELATDTQQAIQNNINKNIAALNILKSFYESSDFINFNEFTTFTNSLLERDLAIQALEWIPNIPHSKRHDYVKKANQFFKNFNIKEKTAQGKMLIAKTKTNYFPVYYVNPVRGNEKAIGFDISSSPMRNKSLEKAALTGRNVATHKITLIQEEKGNSYGFLLFNPVYHSSSPQDISPKSLKGFVLGVYRINDILGHALNFSAKNNLIIFVKERINNNTLSPIFQNNGKQEINSHLSYQSTFTVADKKWPITIYPSHDFIKEHKNHLPMIILFAGVIISLILAAYLWLLVNREVRVKNLVEERTEQLNELNSKLTVLNEELDQKVMERTQKLKENQEQLIQSEKLASIGQLAAGVAHEINNPIGYIMNNIEIMGEYLDSIKAITQQAEACSKTLTSNDIQIKNDQLQQLKNTLEQEDINYVIDDTEKIIQQSLEGAEKVKNIVLSLKSFAHSDTDNKEEFDLNHCIEQALTITQNELKYKCKIIKNLSPLNPLLGYSSQIGQVIMNLLINAAHAIKESGTITITTQQIAGFNKLTIEDDGYGIHKDHLAKLFDPFFTTKSVGEGTGLGLSISYGIIKKHQGSINVESTVGQGTVFTIQLPNHSHHS >NZ_CP013791.1|WP_048875961.1|547812_549216_-|IS4-family-transposase MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP >NZ_CP013791.1|WP_017378006.1|549335_549965_-|response-regulator MPSLLLVDDEPHIIDALKRLFRREKYTLHCAYSAKEGLDILAQQHIDIILSDQRMPSMLGSEFLAKAQAQSPQTLRIILSGYADTKEIINGILNNHIHQFLEKPWRANELREHLRHLINLMDKNQYTQKNQSDNHYTRTAALSFNKNGAIKSINLYFCALLGQKPEHILSAPLTSVINYNQKQLKEILSYVNNHGHWQGKVTLANSTQD >NZ_CP013791.1|WP_017378005.1|550203_550923_-|sulfate-transporter-CysZ MSGFHYFLNGLNFILTPKMRRYLYLPILLNIILLLVLSYLGVHGIEVITNHVSTSLPHGLHFLRPIATIILSLALITLLVFSFTTLASIIGAPFYSLLCEAVLQKKDHQLPQDNITALIKDMPRLIGRELIKLRYFIIRVMILMILLFIPGINLIVSLLWFIFNCWMQAIQYIDYPMDVLKHPFKQTLKATRQTPLTAMSFGLVCFVCTLIPLLNLIAIPAAVAGGTLLWSERIQPLLK >NZ_CP013791.1|WP_017378004.1|551036_554576_+|chromosome-segregation-protein-SMC MRLKKIKLAGFKSFVDPMTVELPSQLAAIVGPNGCGKSNIIDAVRWVMGESSAKNLRGESITDVIFSGSSARKPVSQATIELIFDNSQGKLVGPYVSYSEISIKRIVNREAQSSYFLNGTKCRKRDIADVFLGTGLGPRSYSIIEQGMISRVIEAKPEELRVHLEEAAGISKYKERRKETERRIRHTRENLERLGDIREELGKQLSRLHQQAQAAEKYQNFKKEEREVKGQLYIQRWKSLQTQHGQEQKKIQEHEVIVEKQRAGQQHIDASLEKERLALSEASEKLHACQADYYQAGNEVSRLEQQIEHATTRIRETGQEMARLNTSLEKARSELAADEQQKVLLSAQEEALEPETELLQNAVDEAALSAEEAEVSYRQLEKERESLLQQVALCRQEAEVEQTRIRHMEEQGQRLQQRLERLRAETHNSDLISLEVGLEDVQGQQRELEEKEQELQLGAEEQQQRLIQQRQLIEQQRKGLEQQRGELHPLKGRLASLEALQQAALFDVNADSASSVKTWLETQGLIASKQLAQSLRVQEGWETAVETVLGDNLQALYTPGYQVNACVAELEMSLICIDQPLALNVNTQVAQGHENQAGILKLTDVIEPGESLPSQLQHVYLAEDLLAALRIRSELKSYESVVTVDGLWLGVNWLKVTKRDDSQSGVIAREKELMTLRQQELALEESICLHEEQLSQSQEVLMQVEAQVKSVQQQAQALQRELAEVKARVSGRLAHIEQVRARLAVVEHELSEALELFNEEQEEIKIARQRLEIAVEKMAELELQRQALESGRVEASRTTQEARQQLESLKSQYQQKQMQLQRVQSEQAGIKAALQRLEELLGRDKVRLVELEQSRIGLEEPLEEQRMLLDEQLERQLSFEDRLKTVKDQAQAHENQVRTFEKQLHEQMNQVAHAREALEQGRMQAQELFIRRQSVEEQLVEAGFQLRGLLEIYQEGCDVKELETALEDIGRRIQRLGVINLAAIDEYAGQSERKVYLDAQHDDLTEALDMLEAAIRKIDKETRTRFKETFDEVNGHFKLLFPKLFGGGSATLELIGEDLLEAGVALMAHPPGKRNSTIHLLSGGEKALTAAALVFAIFQLNPAPFCMLDEVDAPLDDANVGRFCRLVEEMSESVQFIFISHNKIAMEMADQLVGVTMREPGVSRLVAVDIEKALEMAEE >NZ_CP013791.1|WP_017378003.1|554642_555473_+|hypothetical-protein METFLKVLVLLVGILLVWVFIWEGLRRLKVWRIRKWGVKRPLQMRSGDPLAEDDIVDDVTDRQNTEDNQQNQSQHDRQADTVSARAPEPNHIILNIYIESKSTGFLAYALFSLLKRSGLIFNDELQVFEAKNEQGEVDFYITSAVAPGVFDIKNAMVSIPAVSVFARPDLQTNPRMSFFKLLESTHTIASELDGRVLNMRREILSEASVSADYLSVVNTYAVAESTAAALSASNSTSIVVDESMQDDNHVYQENESHVIADTRVDADSNKDQHVAG >NZ_CP013791.1|WP_036773465.1|555459_557499_+|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA MSPAKLKRELVSDARVDELVKQLNLYSEAYYSEDDPLVPDSEYDRLFNELQQLEADYPELKQVDSPTLRVGGTILAEFTEVQHQSPMLSLSNGFNDQDIYDFIKRLKVDEDACFFCEPKLDGLAISLHYQRGRLVLAATRGDGTTGEDVTENVKTIRSIPLRLHSNNPPEFLEVRGEVFMMKSGFNKLNDQLRETNQKTFANPRNAAAGSLRQLNSKVAASRPLSFYAYSLTHMVGIELAQSHHERLALLASWGIPVNGDARCAAGTKGCLVFYQSILKVRDQLNYDIDGVVYKLDDIAAQEKLGFTARAPRWALAHKLPAEEEITIVKAIEFQVGRTGALTPVARLEPVHVGGVVVSNATLHNMDEVERKDVRIGDSVIVRRAGDVIPEIVKTIIENDTQSKAHAARPKLVMPDKCPVCDSAVERLAGEAVSRCMGGWRCKAQRKEALKHFISRKALNVDGLGEKLIEQLVDLELVQDAADLYQLTLEQLAGLERMAEKSANNVLEALEKSKVTTFGRLLYALGIRNVGQATAQVLAQRFGNLAALLAANTEELHAVDDVGPVTSQFILQFFSQQENQQLIERLQALGVCWPEQDKPLLAVRALQGEVIVLTGTLHGFSRDEVKEKLEQLGAKVTSSVSKKTTLLIAGENAGSKLDKAQALGVPVKNENDLKVLLGSN >NZ_CP013791.1|WP_027243145.1|557514_558570_+|protease-SohB MITQLLADYGLFLIKTATLVAAILIVFSGLLALAMKNRLAKQKGSLEVEKLNDHYDDLKETIEIEVLDKKELKALEKERRKEEKQERKDKKKNKSKETETDDEDAASAARIFVLDFDGDIEASAVHALREEVDALLTFINEKDEVVVRLESPGGMVSPYGLAASQLARFRSKGVKLTIAVDQVAASGGYLMACVADRVIAAPFAVLGSIGVVFQMPNFHRVLKKHDVEYEQLTAGDYKRTLTMFGKNTKEGREKLQEELEDIHYLFKNFVGEYRPQLDIDKVATGEHWFGQRALELNLVDELITSDDYLLSRADEHDIYSVNYMEKQTLADRLGIMARALLGKLATAGVKR >NZ_CP013791.1|WP_017377998.1|558580_559111_+|hypothetical-protein MQRKAIVLLSGGGYSSLCLYLARSQGYLPYALSLDIPKRHFQLDSAQQFARDVGVAEHQVIAMNENSLSDSKALTYYSSLLSFAVNWAQELSAQDIFIGLHPSAEHTLEYMVEWLQSYQELINLSSTTAIRIQTPLLFMSDKKREQTAEQFNLKLPEPVSKLKSKKKKFIQRIFSE >NZ_CP013791.1|WP_048875965.1|561268_562189_-|hypothetical-protein MLSTPWLAALDFDGCLYNVNIDNVRRAFHSPGKPKEELTLAHLITINQKLIDHLNNQAEKFSSSTVFLGSDRQDYKKERDNSAGPNREGQYCYPLISDFAKKIGAEFDPLLMADIYNNLPLGESFRQALQDYHTPEKHDQDPHTQPDSSKLTLLYAQMHKAATENPDDIVTYEFYDDRKDILLSLQEIFESDPHMIPKNITLYLNHYDGVNLQNLLIIQGQGNPDSQYQHTLKNPAYRKASANPAEAQTDYSISELIKEKFPKISKSFLEIKQKLQQLNLPKLKKSLIREATSVSVATSVGILHIQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013791_2 | 1102868-1102977 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013791_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP013791_2
>2.1|1102894|58|NZ_CP013791|CRISPRCasFinder CGAGCTAATTTGATATCGGAACGATAAAGGGCGATAATGGCTGTTTGAAGGATAGAGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013791_2
The CRISPR arrays of NZ_CP013791_2 >merge|NZ_CP013791|2|1102868-1102977|CRISPRCasFinder TATCTTTAAGTTGCTCCCAATCTCCTCGAGCTAATTTGATATCGGAACGATAAAGGGCGATAATGGCTGTTTGAAGGATAGAGCTATCTTTAAGTTGCTCCCAATCATCC >NZ_CP013791|2|2|1102868-1102977|CRISPRCasFinder TATCTTTAAGTTGCTCCCAATCTCCT CGAGCTAATTTGATATCGGAACGATAAAGGGCGATAATGGCTGTTTGAAGGATAGAGC TATCTTTAAGTTGCTCCCAATCATCC
>NZ_CP013791.1|WP_017376785.1|1101362_1102268_-|LysR-family-transcriptional-regulator MSVKITLRQLEIFVAISQHGHVTQAANSLYLSQSAVSMALAELERQLGKTLFDRAHKNLQLTNEGRLLLDKAVSLMQQAREVEQLFESDVQGELVVGASSTVGNYMLAGLMSEYLQKYPQLRLRLEISNTRRSQEKLLDYQFDCAFVEGEVTHADIKRQLWCMDEMLLIVAPTHPLAYKGLVEASDLSKAVWVLREQGSGTREFFNRRVLPELTYAQVCLELSDSTAIVQSVETGVGVSCLSRHVVECALREKRLAKLPYERKLERAFYLLIHKKKHIPALVHHFIDFCYQYIGKNNNYSL >NZ_CP013791.1|WP_017376784.1|1100936_1101122_-|hypothetical-protein MEKIERVYARDHGISGNFKDIQFEKYCRDWLEPMRRKVNESTKLDDYVNPRVKSRLGGYLG >NZ_CP013791.1|WP_027242578.1|1100363_1100900_+|DUF2062-domain-containing-protein MFNWFKKKIPTRESLQDHKILAKLYHLLHYHYLWHFNRHSVSKAIAIGSFFAFIPVPFQMIPAALCALVFRANVGISIATVWISNPITIPPMIYAAYKLGSWMIGHPGFIISLEQPHDIIHLLSQSWPPFLLGCITLSITFSLVNYIIARLFYRLWIIHKWHKNREKHKQANTTKKER >NZ_CP013791.1|WP_027242577.1|1099044_1100346_-|ComEC/Rec2-family-competence-protein MLGFIFVIGFLTLFFLGWQGAVLLSLSIGGLCYFIKSKHKAKLLCCLGLGGLWAIIIIFWQDYLHLDDFVLNQVVVITGNVVSIPEHDTRKVCFLFLIESINHQPLWPARQVRLNWYRFKQKKQQVLKAGESWQFQVKLRAPFGLENFIGFNYRRWLYQHSIQATGLVIDRYGKKGINRKLSSSHVFNLQQYRQKIAWFLERIDLHNTALIKALVLGERAEVKRSVRNLLQQTGTAHLLAVSGLHIGLIVTFTFFLIRGVLLWAPGMSRKYKSSGYALFIAAIVSLLVALCYSALAGFSVATLRACLMTVCVLLAFLCRRVVPIWALYQYALVGVVILFPLSVLSIGFWLSFLSVGVLIFVCAGRLTQTKLQKYLKPQWALLIALAPLSLAYFFNMPLIGLLANLVAIPWVGFLVLPLLLFALRHLKCNTTLY >NZ_CP013791.1|WP_048876008.1|1098073_1099048_+|IS30-family-transposase MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKSITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP013791.1|WP_144420681.1|1097844_1098030_-|hypothetical-protein MNMNSLLSVALQMTEGVLGLIFIPLSNELSWVLFHCADLQITWLINRCEPWSAKHGVSRPR >NZ_CP013791.1|WP_155046590.1|1097500_1097665_-|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYGITLFRPLAALYTTLLWCANINFIGFFFFNVSSI >NZ_CP013791.1|WP_036774017.1|1096623_1097499_+|IS982-family-transposase MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMVKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRAFKGLAKKSKSTMRWYYGFKLHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYEKGLQLITKIRKNMKNKLVLMIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSADNFMVNIVAGLAAYCLQEKKPSLGIKYNLLNG >NZ_CP013791.1|WP_155046590.1|1096168_1096333_-|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYGITLFRPLAALYTTLLWCANINFIGFFFFNVSSI >NZ_CP013791.1|WP_036774017.1|1095291_1096167_+|IS982-family-transposase MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMVKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRAFKGLAKKSKSTMRWYYGFKLHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYEKGLQLITKIRKNMKNKLVLMIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSADNFMVNIVAGLAAYCLQEKKPSLGIKYNLLNG >NZ_CP013791.1|WP_144420682.1|1103674_1103836_+|phosphatase MYHFQIDNQINQFLNRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP013791.1|WP_155046588.1|1104370_1104580_-|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYEINNILILFSYLFGAILKLTFPSYYNFLAKLRSHTICQELYGIQKSKEP >NZ_CP013791.1|WP_027243099.1|1105695_1107009_-|DEAD/DEAH-box-helicase MSFSSLGLSAPLLDAITEQNYKEPSAIQAQAIPAVLSGRDVMAAAQTGTGKTASFTLPLLERLSKGEQVRANQARALVLTPTRELAIQVAESVAVYGKNMPLRSTAVFGGVKINPQMMRLRRGVDILVATPGRLLDLYSQNAIKFKQLEVLVLDEADRMLDMGFIHDLRKIMALLPKQRQNLLFSATFSKEIRALAKTFVHQPLEISVTPRNTTAKTVKQWICPVDKKQKSALLMHLISHHQWQQALVFSKTKHGANRLARYLDDQGVTAAAIHGNKSQGARTKALADFKQGEVRILVATDIAARGLDIDQLPQVVNFDLPNVPEDYVHRIGRTGRAGACGQAVSLVSADEIKQLSDIEHLIGQLLARKLVDGFEPVHDVPVSSLDRRSKAPKKPEIEHQGGQRLGGSMQGKRREDHRNSQQQPGRKRRRPQLCRSK >NZ_CP013791.1|WP_027243098.1|1107244_1108390_+|carboxypeptidase-family-protein 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DBSCAN-SWA_1 |
5110 : 54217
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013791|5110:54217|DBSCAN-SWA 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50 | Staphylococcus_phage(21.43%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
64103 : 113172
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013791|64103:113172|DBSCAN-SWA 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53 | Bacillus_phage(35.71%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
124854 : 156531
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013791|124854:156531|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP013791|124854:156531|131177_131381_-|WP_017377709.1|DBSCAN-SWA MKATNYFADSQLSLGALGVMTYIHQHTKNSLSLSVDVEELAKGINTTDKSLIRDALKELTDAGYLPA >NZ_CP013791|124854:156531|138275_139250_+|WP_036771325.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIDHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP013791|124854:156531|133938_134166_+|WP_017377787.1|transposase|DBSCAN-SWA MSSVGACVDNAVVERFFGSLKHEWLLNVIHLTRDTMKEDVEAYIRYYNHDRLHTANGNLSPINFEKSQLKVSNMT >NZ_CP013791|124854:156531|128874_129186_-|WP_017377712.1|DBSCAN-SWA MYDYHIHLYYDMSTRSVAKLLRNNLHTMLEGVAKVSLLHDKPPYPHPQPMFEIAFPKDLLPKLTQWFKTHRNGLSVLLHPVQSNETDAYHSKGLWMGQPLTSG >NZ_CP013791|124854:156531|129315_130098_+|WP_047927332.1|DBSCAN-SWA 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29 | Staphylococcus_phage(50.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
191982 : 333487
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP013791|191982:333487|DBSCAN-SWA 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113 | Staphylococcus_phage(15.38%) | protease,tRNA,integrase,transposase | attL 317106:317165|attR 333263:333759 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
337949 : 477957
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP013791|337949:477957|DBSCAN-SWA 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116 | Staphylococcus_phage(20.0%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
483808 : 537420
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP013791|483808:537420|DBSCAN-SWA 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56 | unidentified_phage(16.67%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
547812 : 599576
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP013791|547812:599576|DBSCAN-SWA 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42 | Burkholderia_virus(28.57%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
639764 : 673746
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP013791|639764:673746|DBSCAN-SWA 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28 | uncultured_Mediterranean_phage(40.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
683492 : 742191
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP013791|683492:742191|DBSCAN-SWA 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49 | Escherichia_phage(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
804326 : 844732
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP013791|804326:844732|DBSCAN-SWA 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38 | Tupanvirus(22.22%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
850398 : 955825
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP013791|850398:955825|DBSCAN-SWA AATGAAAACAGCCATAATTCGTCAAGCGTTTTTAGATTATTTCAAAGGTAAAGGGCACAGTGTTGTGCCCAGCAGTTCTTTAGTGCCTAAAGATGATCCGACATTATTATTTACTAATGCCGGTATGGTGCAGTTTAAGGATGTTTTTTTAGGCCAAGAGCAACGTGATTATACACGAGCGACCTCGTCTCAGCGTTGCGTGCGTGCAGGGGGCAAGCATAATGACTTGGATAATGTTGGCTATACCGCACGCCATCATACGTTTTTTGAGATGTTGGGTAATTTTAGCTTTGGTGATTATTTCAAGCGTGAAGCGATTTTGTTTGCATGGGAGTTTTTAACTGAAGTTATGAAGTTGCCTAAAGAAAAACTATGGGTGACGGTGTATGACAAAGACGAGGAAGCTGCGACGATTTGGACCAATGATATCGGCTTAAGTCAAGAACGAGTGATTCGTATTGCCACTAAAGATAATTTTTGGGAAATGGGTGATACTGGGCCGTGTGGCCCATGCAGTGAAATTTTTTATGATCATGGACCTGAGGTGTTTGGTGGGTTGCCAGGGACTGTCGATGAAGACGGTGATCGCTATATAGAAATCTGGAATATTGTCTTTATGCAATATAACCGGGGGGCTGATGGTGAACTTAACCCGTTGCCTAAGCCATCTGTTGATACGGGGATGGGTCTTGAGCGCTTAGCCGCTATTTTACAAGGAGTGCACAATAACTACGATATTGATCTTTTTCAGGCATTAATTCGTTATGCCGCAGACTTGGCGCATTGTCGTGATTTGGCAAACCCGTCATTGCGGGTCATTGCTGATCATATTCGCTCGTGCAGTTTTTTAATTGTTGATGGAATGGTTCCTTCGAGCGAAAGTCGAGGTTATGTGCTTAGGCGTATTATTCGTCGCGCCATTCGTCATGGTCATAAACTAGGGATTCAAGACGCATTTTTTTACAAGTTAGTTGCCCCGCTGGTACAACAGATGGGAGAGGCTTACCCAGAACTGCTTCAGCAACAGGCGATGATTGAACGTATATTACTGCAAGAAGAAGAGCAGTTTGCAAAAACGCTAGAACAAGGCATGCGTGTTTTTGAGCAAAGTATTGCAGATTTAACCAGCGCTGAGATTCCTGGTGAGACTATCTTTAAACTTTATGATACGTATGGTTTTCCGGTGGATTTGACAGCGGATATTGCTCGTGAACGTAACCTTTCTGTTGATGAGGCGGGTTTTGAGGTGCATATGGAGGCACAGCGTGAGCGTGCCCGCGCTGCAAGTCAGTTCTCTCTGGATTATAATGAGTTAGCTCAGTTAGAAACGTGTTCAACATTTAGTGGTTATGATAAGACGCAAGATCAGGTAAAAGTGACCGATATTATCTTAGGTAGAGTAAGTGTTGAGCAAATTACCTCAGGCCAAGAGGGGGTGCTCGTGCTCGATGCATCACCCTTTTATGCTGAGTCTGGCGGGCAAGTTGGCGATACTGGAATCATTAAAGCAGGAGGAGCTGAGTTTCTAGTCACAGATACGCAAAAGCAGCAAGAGGCGATTTTGCATATTGGTCGAGTGGTTAAAGGTGAGTTTTTTATTGGTGAAGAGGTGCAGGCCTTAGTTGATGATAAGCAACGCCAAGCAACAGCGTTAAATCATTCAGCAACGCATTTATTACATGCAGCGTTAAGAAAAGTGTTGGGTGAGCATGTGATGCAAAAAGGTTCTTTGGTCGATAGTGGGCACTTACGTTTTGATTTCTCGCATTTCGAAGCGATTAATGCAGTACAGTTAGCTGAAATAGAAGGTCTGGTCAATCAGCAGATTCGTTGCAATCATCCTATAGAAACAAACATAATGGCAATAGAGGTCGCGCAAGCACAAGGAGCAATGGCTTTATTTGGCGAAAAATATGCGGATGATGTGCGCGTGCTGTCTATGGGTGATTTTTCTATGGAGCTTTGTGGTGGAATACATACTAAGCGCACCGGTGATATTGGTTTGATGAAAATTACCAGTGAGTCAGGTATTGCTGCAGGTGTGCGTCGTATTGAGGCGGTGACGGGTGAAGACGCCTTGGTTTATGTGACTGTTCATGAGCAAGCGTTGCAGACGTTGGCAGAAAAATTTAAGGGTAATCGCCATACTGTGGTTGAAAAAGCAGACCAGTTATTGTTAAAACTGCGTCATTTAGAGAAAGAAACTGAGCGCTTAAAAGCGCAGTTAGTCCGTTCTCAAGGTGCTGATTTAGCATCCCTAGCTGTAGAGGTTAAAGGCGTTAAAGTTTTGGCTGCGAAAGTTGAGGGCGTTGAAGCGAAAGGCTTGCGTGATTTAGTCGATCAGTTGAAAAATAAACTTGGTTCTGCGGTGATTATTTTGGCCGTTGTAGAGGATAGCCGGGTTCACTTAATTGCAGGCTCTACACATGATTGCAAGAGTAAAGTGCCAGCAGGGCAACTAGTTAACTTTGTCGCAGAGCAAGTTGGCGGTAAAGGCGGTGGTCGACCGGATATGGCCCAAGCCGGTGGCCGCGAGCCTGAAAAACTGGCCCAAGCGCTAGAAAGTGTAACTGTTTGGGTGGCTGAGCGGCTATAAACCCAGCGATAAAATAAAAAAAAATTGATTTAATAAAAGGTCCAGGAAGGGCCTTTTTATGTTAAAGATGTGCTAAATTTGTTGAATTTTTATAAAGAACAGGGTAGTATTCGCAGCTCGTGCTTGATGTTGCACAGCATAAGTCCTAACGGATGTTTTAGGGCGAATGTTTAGACTAAAGTCAGTTGTTATTTTTGACGATATTAGTACTAGGGCATAAAGACTCTAGTGCCTAGCTCGTAGTATAACTGACCAGGTTCTGTGGGACATGAGATGCGAAGGGTTTAAGCAAAGGAGAAAATTTTAATGTTAATTTTAACTCGCCGTATTGGTGAAACATTAATGATTGGTGATGATGTCACTGTGACTGTCCTCGGTATTCGTGGTAATCAAGTTCGTATTGGTGTGAATGCACCTAAAGAGGTCTCTGTTCACCGTGAAGAAATCTATTTACGTATTCAAGAAGAAAAAGATGGTGGTCAAAGTCAAGCAGGCCATTCTTCTGCTTCTGAAATGAACGGTAATCGTGTCCCTTTCCCAGGCAGTGATGATATAGATGGAAATAGATAATTATAGATGGAAATAAGTCCTAAGTATTTGACTTCGCTCGGCAAGTCTGTATAATTTGCCGAGTCGCTGGAGAGGTGGGTGAGTGGCTGAAACCAGTTCCCTGCTAAGGAACCGTATGCTAACGCGTACCGAGGGTTCGAATCCCTCCCTCTCCGCCACGTTAATCGACGCGCCCGTAGCTCAGCTGGATAGAGTACCTGGCTACGAACCAGGCGGTCGGAGGTTCGAATCCTTCCGGGCGCGCCAACTTACCTTGCTTTTCTCCTCACCTTATTGCTTTAAGCCTCGACTGTTTTTTGCTGTGCTAATGTTTCTGTCGTAATATTCATCCACCAGGTATTAAGCCCTAGAATTACGTGAGTTCGATATAACTCAACCATTTAGCAGGTTATATTTTATGCCAAGAGAAGGCTTCTTTTCCTGTAAACAGTAGGCTGCTAAGCCAGCAACAATATTCACCATAAAGTTATCAGCACTACGATGTCGGGAGTGCTCAATTTGAGAAATATTTTTCAATTGGTCAAAAACACTTTCTATAATCCCCCTTTTTCTTAATAGAATTTTATCAATCATTAAAACCAGCTTATTTTTCATGTTTTTACGAATCTTTGTGATAAGTTGAAGTCCTTTTTCATACAATTGATCAAATAATTTTTGTGAAATATAGCCTTTATCACCAATAATTTTACCTGTTAAGTTCTCGGCCATTTTAGGTAATACGACACGGTCATCTGTAGTAGCTTTACTCATTTTAAAGGCCATTAACTCTCCCATATCATTCACAATAATGTGGAGCTTAAAGCCGTAGTACCACCCCATCGTTGACTTAGATTTTTTAGCTAATCCCTTGAAAGCTCTATTTTGAGACGCACGTTTTTCATGACAAACACGGAGTATTGTCGAATCAACAAAATAAATCCCTGTTGCTGTTTTACCTTGGGCCGCAATGAAAAAACACAGAGGCAATAAGATGCTCGGCATGAGTTCAACGAATCTGTTGTAGCTAACGCTGTTTGGAAAGTATTTTACCATGCTACCTTTTATTACATGAAGATAATACATCTTAAAATTTCGGTAATTAGATTTGTGAAAATAAATCATAATTGTCATTATTTCACTTGTTGACATTTGTGAAGGCTTATTAGGTTTTTTATTCGTATCTTCTAGCAAAATAGCATTCCATTGAGGTAATAACTCTTGGCAGAAATCATCTATTACACAAAAGAGAGAAATCAATGTTAAGTCCATTTTATTGCTTCTTTAGAACTAAATTTAGACTCTATTTAGCCGCAAAATCACTGGTTTTTCAAATACTTCTTATGTCGAACTCACGTTAAAATAAATAATCATAAATTAGAATCAATGAATGCAGATTATTTTTCTGATAATTTTAAAGAAAATATAAAAAATTATGCTAAAAATCATGCTGGTCGAGGGGTTTTTAAGAAACGAAATCGAGCAACAATGGTGATGTATGGTTACTTTAACGATGGTGAAAATCAAAAGGTTGATAGAGTATTTTGTAAAAGTCCTGTCTAAGTTAATTTAACAGAGGATTCCACTTATCACTTGTACTATTTTAGGGGAGGGTTACCATCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGTGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCG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95 | Burkholderia_phage(13.04%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1014160 : 1029731
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP013791|1014160:1029731|DBSCAN-SWA 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15 | unidentified_phage(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1044718 : 1150319
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP013791|1044718:1150319|DBSCAN-SWA 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100 | Staphylococcus_phage(24.0%) | protease,tRNA,integrase,transposase | attL 1064901:1064960|attR 1092366:1093360 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1170083 : 1233856
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP013791|1170083:1233856|DBSCAN-SWA 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58 | Acinetobacter_phage(15.38%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1252823 : 1386193
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP013791|1252823:1386193|DBSCAN-SWA 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113 | Staphylococcus_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1395621 : 1455921
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP013791|1395621:1455921|DBSCAN-SWA 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59 | Staphylococcus_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1462822 : 1598939
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP013791|1462822:1598939|DBSCAN-SWA 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115 | Staphylococcus_phage(22.73%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
1607034 : 1658823
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP013791|1607034:1658823|DBSCAN-SWA 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48 | Burkholderia_virus(22.22%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
1683717 : 1728153
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP013791|1683717:1728153|DBSCAN-SWA 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41 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
1783071 : 1829779
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP013791|1783071:1829779|DBSCAN-SWA 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41 | Synechococcus_phage(20.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_21 |
1835474 : 1871753
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_CP013791|1835474:1871753|DBSCAN-SWA 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34 | Acinetobacter_phage(25.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_22 |
1916882 : 1982781
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >NZ_CP013791|1916882:1982781|DBSCAN-SWA 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57 | Staphylococcus_phage(18.18%) | plate,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_23 |
1986782 : 2050554
Sequences of DBSCAN-SWA_23
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23 >NZ_CP013791|1986782:2050554|DBSCAN-SWA 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51 | Planktothrix_phage(10.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_24 |
2082345 : 2125705
Sequences of DBSCAN-SWA_24
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24 >NZ_CP013791|2082345:2125705|DBSCAN-SWA 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42 | Staphylococcus_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_25 |
2178398 : 2214338
Sequences of DBSCAN-SWA_25
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25 >NZ_CP013791|2178398:2214338|DBSCAN-SWA 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MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA |
32 | Staphylococcus_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_26 |
2237547 : 2277763
Sequences of DBSCAN-SWA_26
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26 >NZ_CP013791|2237547:2277763|DBSCAN-SWA 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44 | Staphylococcus_phage(42.86%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_27 |
2365160 : 2477222
Sequences of DBSCAN-SWA_27
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27 >NZ_CP013791|2365160:2477222|DBSCAN-SWA 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102 | Staphylococcus_phage(12.5%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_28 |
2510216 : 2570851
Sequences of DBSCAN-SWA_28
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28 >NZ_CP013791|2510216:2570851|DBSCAN-SWA 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57 | Acinetobacter_phage(33.33%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_29 |
2637243 : 2752760
Sequences of DBSCAN-SWA_29
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29 >NZ_CP013791|2637243:2752760|DBSCAN-SWA 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108 | Escherichia_phage(19.05%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_30 |
2825753 : 2956865
Sequences of DBSCAN-SWA_30
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30 >NZ_CP013791|2825753:2956865|DBSCAN-SWA TATGATTAAAAACATCATGCTATGGCTGGTTATCGCTTTGGTATTGGTGACTGTGTTTAGTAATTTAGGCCCACGTCAGCAGTCGGTGAATCGGCTAGATTATTCAACATTTGTTAAAGATATCAATAATGGTCAAGTAAAAAGCGTTATCATTGATGGTTTGAATATTAAAGGACAAACCTCAAGTGGTACGCCATTTGCCACCTATATTCCGTGGAAGGATCCGTTTTTAATGGATCAAATGCTGTCGAAAAATGTCACAATTGCGGCTAAACCACCTGAGCAGCGTAGCTGGCTATTGTCTGCATTAATTAGCTGGTTCCCTGGTATTTTATTAATTGCAATTTGGATCTTCTTTCTGCGGCAGATGCAAGGCGGAGGCGGGGGCAAGGGCATGATGTCCTTTGGTTCCAGTAAGGCGCGTCTGCTTGGCGAAGATCAAATTAAAGTTAACTTTGCTGATGTTGCTGGCTGTGAAGAGGCTAAAGAAGAAGTAAAAGAACTGGTAGATTTTCTGCGTGACCCAACCAAATTCCAAAAATTAGGCGGCAAAATTCCGCAAGGGGTATTGATGGTTGGCCCACCTGGAACAGGTAAGACGCTATTAGCTAAAGCCATTGCAGGTGAGGCGAAAGTCCCGTTCTTTTCTATTTCAGGTTCTGATTTTGTTGAAATGTTCGTCGGTGTCGGTGCATCACGGGTGCGTGATATGTTTGATCAGGCAAAAAAACGCGCACCGTGTATTATCTTTATCGATGAGATTGATGCAGTGGGCCGTCACCGTGGCTCAGGTATGGGTGGTGGTCATGACGAACGTGAGCAGACCTTAAATCAAATGCTGGTTGAGATGGATGGTTTCGAGGGAACCGAAGGGGTGATTGTCATTGCCGCGACGAATCGTCCGGATGTGTTGGACCCGGCATTATTGCGCCCCGGGCGTTTTGATCGCCAGGTCAGTGTCGGTCTGCCTGATGTCAAAGGCCGTGAGCAGATTCTAAAAGTGCATATGCGTAAAGTGCCTTTGGGAGATGATGTCAAAGCTTCATTGATTGCCCGTGGTACGCCTGGGTTTTCAGGGGCGGATTTGGCTAACTTGGTCAATGAAGCCGCACTCTTTGCCGCGCGTAAAGATAAAACCGTGGTTGCTATGCGTGAGTTTGATGATGCCAAAGATAAAATCTTGATGGGCACTGAGCGGCGCTCAATGGCAATGACCGAAGAGCAAAAACGTTTAACCGCTTTTCATGAGGCAGGGCACGCGATTGTAGGATGTTTGGTACCTGATCATGATCCGGTGTATAAAGTCTCGATTGTGCCGCGGGGTCGTGCCTTAGGTGTGACCATGTATCTGCCTGAAGAGGATAGTTATGGTTATTCGCGCGAGCGCTTGGAGAGTTTAATTTCGAGTATGTACGGCGGTCGTATTGCTGAAGCTTTAGTCTTCGGTGTTGAGAAAGTAACGACTGGGGCATCGAATGACATTGAAAAAGCCTCAGAAGTGGCGCGCAATATGGTGACAAAGTGGGGGCTGTCTGAGCGTTTAGGGCCGATATTATATGGACAAGAAGGCGGTGATCCGTTTGGTTATGGCGCGGGTAAAGGCACGCCGGAATTTTCAGATCAAACCTCTGTTGCTATTGATGAGGAAGTGCGTCAGATCATTGATCGTAATTATACTCGCGCTGAGAGCATTCTAATCGATAATCGGGATATTCTTGATGCGATGGCGGATGCTTTGATGGTCTATGAGACGATTGATCGTGAGCAAGTGGCTGATCTAATGGCGCGTCGTCCGGTGAAAGCGCCGAAAGATTGGGATCAACCCTCTGATGAGAGTGGCTCATCAGCATCTGGTGATGAGTTACAACCTCTTGATGCTAATATCAATACTGATATTAATGATACTAAGAGCGCTGATCAAGAGATAGACCAGGGCGCGCCGTCGCCAGAAATAAAGGGTAAACCAGCGGATGATCCTACCTAATAATTACCCTTCATCTTTTTAATATTATTTAAATTTTTATAGATCTTAAGTAGATAAATGATAAAGGGCACGGGTTGCCCTTTTTTCTTGAGTAACATAAAGAAGATATTAACTAAAAGAAAGATAGATGGCTTGGTATCTGGATCGTATTTTTGATAGCGCTAGAGGGCATTGGCTAGGATAGCGATAGTGAGTGAAGTGAGAAAACAATGAGTATAAAACGTAAATATTTTGGTACGGATGGTGTGCGTGGACGGGTTGGTCAGGCACCGATTACCGCTGATTTTATTTTACAGTTAGGCTGGGCAGTCGGTAGCGTGATTCGTCGTGAAAGCGGTGCGGGTAAGGTTGTGATTGGTAAGGATACACGGATTTCAGGCTATATGTTTGAAGCGGCGCTTGAAGCGGGCTTTTCAGCAGCAGGAGTGGATGTGTACCTACTCGGGCCAATGCCAACACCAGCGATTGCTTATTTGACACGGACTTTTCATGCCGATGCAGGGGTGGTGATCAGTGCCTCACATAATCCTTATTATGATAATGGCATTAAGTTTTTCTCAGCCCAAGGGGTAAAGCTCCCTGATCATATTGAGCTGATGATTGAAGCTGAGCTTGAGAAGCCGATGCAGACAGTGGAGTCATTAGAGTTGGGTAAAGCGTGGCGGATTGATGATGCCCCCGGGCGGTATATTGAATACTGTAAGGCAACGATTCCAAATGATTTGACTTTGTCTGGTTTAAAAATTGTCGTTGATTGTGCGCATGGCGCGACTTATCACGTTGCACCCAGCGTATTTCGAGAGTTGGGTGCTGAGGTGGTAACCATTGGTGTTGAACCAAATGGGACGAATATTAATGATAATGTGGGTGCAACATCACCGCAGGCTTTGTGTAAGAAAGTGCTTAGCGAAGGAGCAGATATTGGTATTGCTCTGGATGGTGATGGTGATCGCTTGATTGTAATTGACCATGCTGGCAGTGTTGTTGATGGTGATGATTTACTGTATATCATGGCCAAAGACTATCAACAGCAAGGGGTATTGCAAGGAGGTGTTGTCGGTACGGTGATGAGTAACTTGGGGCTGGAAAAGGCACTCGATCGTGAAAATATTGCTTTTGTCCGTGCGCAGGTGGGTGATCGTTATGTGGTTGAAGAGATGCACGCGCGTGCTTGGAATTTAGGCGGTGAATCCTCAGGCCATTTAATTTGTAGTGATGTGACGACGACAGGTGATGGTATTGTTGCTGCTTTGCAAGTGCTGGCGAGTATGAAGCGCTTGGGTAAGAATATTCAAGAATTAAAAGCTGGTTTTAAAAAATACCCGCAGAAAATGATTAATGTACCGGTTAAGAAAAGGCTAGGTCATCAGGCATGGGAAAAAGTCAATCAAGAAGTAGTCAAAGCAGAAGCGCAATTGGGTGAGCGCGGTCGAGTTTTGCTGCGACCTTCTGGAACAGAGCCTTTGGTACGGGTGATGGTTGAAGGTGAAAATATGGGGGAAATTACCCGCTGTGCAGAAGATCTCGCTGACGTGGTACGAGAGTATAGTTAAATTTACCGACTCTCTCATTTTTAAAATAATAGTGCAATGGTTGATATGGCCGCCACACGGTGGTTGACTAGGCTTTCGTATTAAAAAAGAGTAGACTATGGTGCGTAAGGAATGCCTGCTGTTTAAGAAACGGTTGTCCGATGCTTAATAAAAAGAGATATTTTCGGCGCTTTATGGACAGATTAATTTAAGGCAAATTTGTGTTTAGTATATGAAATAACCGGCAATAATGCTGAGACTGAATAAATTTAAGGATAAGGGTGGTTATGTCTAGTATCCATGATATTGATCCACAAGAAACAAGCGAATGGCTTGATTCAATCAACTCTGTTGCAAAGGCAGATGGTAGTGAGCGCGTTGGCTTTTTATTAAATAAAGTGAAAGAGCGTGCGCGGGAACTTGGTGTAAATGTTGGTTCAGAACAGATTACGACCCCTTATATCAATACAATTCCCGTTGAAGCAGAGGTGATGATTCCTGCAGATAAAAAGCTTGAAGCACGCCTAGAAGCATTGGTGCGTTGGAATGCTGCAGCGATGATCGTCCATGCCAACCGTCAAGATTCGACTTTAGGTGGCCATATTGGCTCGTATGCATCAAGCTCGACCTTGTATGAAGTGGGTTTTAACCACTTTTTTGCAGGTCCTGATGCTGAACAGGGCAGTGATTATGTTTATTTTCAGGGCCATATTGCCCCAGGAATTTATGCGCGTTCTTATTTGGAAGGACGTCTAACAGAAGAGCAAATTAGAAATTTCCGTCAAGAAACCATGGGCAAGGGTTTATCGTCTTATCCTCATCCATGGCTACAGCCCACCTATTGGCAATTTCCAACCGTGTCTATGGGCTTAGGTCCATTGTCGGCAATTTACCAAGCACGTTTTGCTAAATATTTGCATAATCGTGAGATTATAAAAACCGATCAACGCCATATCTGGTGTTATTGTGGTGATGGTGAGATGGATGAACCAGAATCACTTGGTGCTATTAGTTTGGCTGGCCGTGAAAAACTTGATAATTTAATTTTTGTGATAAATTGTAATTTACAGCGTTTAGATGGTCCTGTGCGTGGTAACTCGAGCATTGTCCAAGAGCTAGAAGGCGTATTCCGCGGTGCCGGCTGGAATGTGATTAAAGTATTATGGAGCACGGATTGGGATGAGCTCTTTGCGAAAGACCATTCTGGCAAATTAATGCAGCGTATGAGCGAAGTCTGTGATGGTGAATATCAAGCTTATAAGGCAAAAGGTGGCGCGTATTTGCGTGAGAATTTCTTTGGCAAATACCCAGAATTAGTTGAGTTGGTTAAAGATAAGAGTGATGATGAGTTAGCCGCTTTACGTCGTGGTGGCCATGATACCCAAAAAGTCTTTAATGCGTATAAGCAAGCGACGGAAACGAAAGACAAGCCAAGCGTTATTTTGGCAAAAACCGTTAAAGGCTATGGCATGGGTGATGCGGGT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112 | Acinetobacter_phage(11.11%) | tail,protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_31 |
2964831 : 3018245
Sequences of DBSCAN-SWA_31
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31 >NZ_CP013791|2964831:3018245|DBSCAN-SWA 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49 | Staphylococcus_phage(57.14%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_32 |
3075254 : 3131247
Sequences of DBSCAN-SWA_32
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32 >NZ_CP013791|3075254:3131247|DBSCAN-SWA 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49 | Acinetobacter_phage(20.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 60025
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013792|0:60025|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013792|0:60025|6773_7880_-|WP_069971688.1|DBSCAN-SWA MVAKVKSTCDFIEDAGTGGLANLCGSIDRLSNTYSNSDENIRRRVLEKTPVLTSIPSNVNTVYLDKVLVAKQNTFRTGSSTSQSGVSTGAKAVDRFSPWIDAYAAHEKKDPVEGYDGYSHSIKGVSFGVDYNAIDKFGLFVSYSENKFSTKITGSSIKSNSYGLTLFLEKPFKTFDYYASLSYFYNDFDNERRDVSKSVNSFKSSFSNHSLLFNSKLLYNIYDQSSYSYDLTLLLDMDYIQIMGYDYQESYLNLGGQTVQSDTWHQLNFGAGFLISKRINLLNGVITPTASVRVQYSVLNDPNSMNVSSVDFPGFIQVQSANTKKIQYDLGIALKYEYKKNMEIDLEYNSIWDNSRKEVVSLVAKYRF >NZ_CP013792|0:60025|35722_36769_-|WP_027243195.1|DBSCAN-SWA MITLEVLRNFLKTGDSSKLLESARSLFDNDDMRERLRLDLPFFEQELSDSQHLGEGIIRADRGVGYNLGNIDLSSLLITEKEELERKLRELIATNQTLKYDRDASSEVNIKKREVVHILNLVVNGISRDLQAQRDEVPRVTQETQADLSVRNFMQGVSKGNVERRSSNEPDFSMHLHEPQNYDKDVMFHPYRKESHEGLALDALVAFDEDEDKYNPLQELKAKLMPIAEGLLDNLKGRYRDIANNVADDTYEAEHRPTENSFEQRVYDKIDRCNEALRSFEAAPDTNAVKKALSDFQKAINTNTAKWSGSGPVTSGVGKKWATTIFDAQLSELPQQDQQALLPGGLEI >NZ_CP013792|0:60025|38861_39260_+|WP_036816769.1|DBSCAN-SWA 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56 | Streptococcus_phage(18.18%) | tail,capsid,portal,transposase,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
64806 : 129214
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013792|64806:129214|DBSCAN-SWA 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60 | Streptococcus_phage(48.15%) | integrase,portal,transposase | attL 72342:72401|attR 111984:112904 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
135453 : 140224
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013792|135453:140224|DBSCAN-SWA TTTATCCGGCAGCATAGAAATCAGCTCGAGTAGCAAATGCTTCTTTTCCACCCTCCATTATCGATTCAATCATATCTCTGATTGCATCATCTTCTATACTCCCCGCATATTTTACAAAACCTTTTTTACCATTTGATTCCAAGCTAACTACTCTATTAGCCTGACCAAGAACCGGAATATTAGCATTATGGCTTGAAACTATAGTTTGAGCTTTATTTGCTCTCTCAGTTAGAGATTTTATGAGAGTGCCTGCTATGTATTCATTATCTAAATGGTCCTCTGGCTGATCCACAACCAATACTCTATTTGGGTTTTCTAAAATAACAGATAATGAAACAGTACATCTCTGCCCAATTGAAAGTTCCTCAACCAGCTTATAGCTTCCGTGATCAAGCAGAGAAAATTGAACACTATCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGCTTCGATTTCCGAGGTGAGAACAGAGCCTAAATCTATATCACTCAAGTACCCCAAAACCCGTGTAGCTCTATCAATAGGTATTCCCAATGCAGCAGAAAAATCATCGTATTTCAAATGGCTAGTGTAGTAAAGCAGCCATTGAGGGTTAACTTTCTGGACCATTTCTGGAACTAGCCCCTTATACTTTAAACTTGATCCTCTAAAAGAGCTTTCCAGGTTCTCCATATAGCTCTGTAAGTCAGTTTGGTGTGTTAGTTCCGTTCGTATGGAGGGAGACAAACTTTGATTCAATTGAGTTACAACCGAATTACGCGATAGAAAAATCTTCTGTCTCAGCTCAGCTAAACTCACCAAGGCTTTTTGGCAAAGCGCATATTGCTCGTTAAGTTGTGATGATTTTTCAGCGCCTATTTGCTCTAAATTCACAAATTGAGCAATGCTTTCTCTAACTCGACCTAATTCACCGAGAACAATACCCGCTCCCTCAGTGAAATTTTCAACTTCAGCCCTGTTTTTTCTAGCCCGCTCTTCCAATAATGAACGGTTGGCACATAACCTTTCAGCCTCTAAATTAATAGATTGAAGCACTTGCTGGTCATTAGTAATAACAGACTGTATATACCCATCATCGTCTGCGATACCCTGCCGAATGATACGATTCATTTCGTTGGAGTTTTCGCCCTTCAATAAAGGCAGCTGCTCTCCATTTAGAAATAAAGATAATTCAGTAACCCGCCTCTCAAAATACTGTTTAATTGTACTCAAATTTTGAGAATTAACAGAAATGATACTTAGTTCATGTTGCACTTTGTTAATGCTCTCTTGATTTACACTAATCACATCATTTTGTTTCTGGAAATCACGTTGTTTCTCTATCAACTCCTTTTCTTTTAGCCTTAGACTTGGCAAATCAGAGGTTTTTTCTACAAGCTCTGCACGCTCTTTTTTTAATGATGCCATTGTTGTGCAAATTGCACTTACCTCACTCATAAGGACTTGCAACAAAGCCTTCTTTTCATTTATATTCGGGATGAAACTGTCGATCAAACGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTATAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTTTAATTTTCCCTCAGCGTTAAGGCTGATCGTTTCTATTTCTTTTTGAGAGAAAATTATTGGCGGAGTAAATTGTTTAACAGGAGCTGTTTCAAATGCAGACCTAGAGATTGTCATATCAACACCATTTTCAACAATATCAATTACCACTCTTCCCGATGATTGTAAAATAGATAAAGCATGCATCATAGACTCTTTGTTGTTGCTTTGGGATAAATTTCCTGCACCAAGACCAAAACGAAGCAACTCAATAATTGATGTTTTTCCGACCCCCCTTCCACCAATTAGTACATTGAGACCAGGTGAAAATTCTAGATCTAGAGCATTAAAGAAACCTTCTTCAACTCGTAATCTTTTAATTAGCAAAACGCCCTCTCCCTAGTCCAAATTTATTAAAATCACTACAAATATTCACAAAAAACATTGAAAGGTTAATAACACTCACACTTCCAGATTAAACCCATAATCGAGCACTATTTCATAGACTTCATATCAATAACAAAACGATATTTCACATCCGACTTCATCACTCTCTCATATGCTGTGTTGATGTCTTCTATATCAATAGTTTCAACATCAGAAACGATATTATGCTCCGCACAGAAATCAAGCATTTCTTGAGTTTCTTTAATGCCACCAATTAGAGATCCTGCAATTATTTTACGGCCAAATACTAGCCCCATTGTATTTAATTCTATTGGCGTGGCTCCTACCACAGCCATTGTTTTTCCCAGCTTTAAAAGCGGCACATAAGGGTCTATATTATGGGCTACAGGAATTGTGTTCAACAAAAAGTCAAAGGTGCCTACGTGTGCTGACATTTGCTCTTCATTTTTGGAAACAAGCACATCACTTGCACCTAATCTTTTAGCATCCTCACCTTTTTCAGGCGAAGTCGTTATCATCACTACATGTGCGCCCATGGCTGAGGCTAGTTTAACCCCCATATGGCCAAGACCACCCAAACCTATAACACCTACCTTATCGCCAGACTTAACATTCCACTGACGTAAGGGGGAATATGTTGTAATACCGGCACATAAAAGAGGTGCAACTGATTTTGAGTCTAGGTTTTCAGACACTTTCAACACAAAATCTTGATCCACAACAATTCGAGTAGAATAGCCACCTTGCGTAATAGCATCTGCATTATGAGAATCAGGGCTGCCATAAGTCATCACCATACCCTTATCACAATGTTGTTCAACATCTTGTTTGCATGGTTCACATTTTCGGCAAGAATCAACCATACAGCCAACGCCAACAAGCTGACCTTCGGAGAAACCTTGCGCATCTGCACCTAATTTTTTCACACGGCCAATGATTTCATGACCAGGTACAAGAGGATAGGCTGACATACCCCAATCATTACGTACCATATGAATATCACTGTGACAGACTCCACAATATAAAATATCAATTTCTATATCTTTTGGGCCAACCTCGCGACGATTGAATTCATAGGACTTTAGCTCGTCTTTATCATTATATGCTGCATAAGATTTTGTGCTGTACATACGTTACTCTTTTGATGTGCCGTTGTTTCCAGATTCAACATACTTTATAACACAGATAGCTACCGCTCTCTTGAAAAACTGTTATTGCTTTACCTGTTTTTGCTAATTTTTCATGATATAAATCTGTTGAGTAAACTGCATCGGCCCTAAAGTTATCTATAGTTGTCACACGAAAACGTAGATACCGCCAGGATTTCTACGTTAATTACTGTCATTAACCTATAATCAAATGATGAGCCTTGTTTACAATATGTAAATGTTTATATATAATAAACGAGTTGTAATAAAGTAGTCTAAACTAATGATTAAGACTTGGAAGCACAAAGGTCTAAAAAAGTTCTTTGAATCAGGCAGTACTGCTGGTATTCAAGCTAGACATAAAACAATTCTAGCTAAGCAATTGGACTTCTTAGATTCTATGAGTGACCCCCAAGAACTTTGGATTTTTGAGAGTTGGGGAGCCCATAAACTTACTGGTAACTATAAAGAGCACTGGGCTATCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGCACCGTAAAAGCGAATTGGCGCTTATTTTTCAAGATAGAAGATGGCGATGTAGTTTTACTTAATTATGGCGACTACCACGGGAAATAATGAGGAGTACATGATGACCACTAAAACACGCAAACCGACACATCCAGGGGCGTATATTGCTGATATATTTGATAACCTGAAAGAGAATGGTGGCATGTCTCGTAATCAAATTGCCAAGCACCTTGGTATATCGCCGTCTACCCTTTGCAATATCATTGCAGAGAAGACACGGGTTAATGCTGATATGGCAGTAGTCTTTGAGAAGGCGTTAGGTGTTAAGGCTGATACCTGGTTAAGGCTACAGATGTCATATGACCTATGGGAAGCGAACAAGAAAAAGAAAAGCTTTTTAGCAAAAGTTAAATCATTGATTAATAATCCTGCCATTAAAATTGCTTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013792|135453:140224|137963_139007_-|WP_017375960.1|DBSCAN-SWA MYSTKSYAAYNDKDELKSYEFNRREVGPKDIEIDILYCGVCHSDIHMVRNDWGMSAYPLVPGHEIIGRVKKLGADAQGFSEGQLVGVGCMVDSCRKCEPCKQDVEQHCDKGMVMTYGSPDSHNADAITQGGYSTRIVVDQDFVLKVSENLDSKSVAPLLCAGITTYSPLRQWNVKSGDKVGVIGLGGLGHMGVKLASAMGAHVVMITTSPEKGEDAKRLGASDVLVSKNEEQMSAHVGTFDFLLNTIPVAHNIDPYVPLLKLGKTMAVVGATPIELNTMGLVFGRKIIAGSLIGGIKETQEMLDFCAEHNIVSDVETIDIEDINTAYERVMKSDVKYRFVIDMKSMK >NZ_CP013792|135453:140224|139679_139832_-|WP_146619517.1|DBSCAN-SWA MLKNKRQFAFTVRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP013792|135453:140224|137448_137856_-|WP_036817201.1|DBSCAN-SWA MLIKRLRVEEGFFNALDLEFSPGLNVLIGGRGVGKTSIIELLRFGLGAGNLSQSNNKESMMHALSILQSSGRVVIDIVENGVDMTISRSAFETAPVKQFTPPIIFSQKEIETISLNAEGKLNVSVATSVGILHIQ >NZ_CP013792|135453:140224|136149_137145_-|WP_036817204.1|DBSCAN-SWA MSEVSAICTTMASLKKERAELVEKTSDLPSLRLKEKELIEKQRDFQKQNDVISVNQESINKVQHELSIISVNSQNLSTIKQYFERRVTELSLFLNGEQLPLLKGENSNEMNRIIRQGIADDDGYIQSVITNDQQVLQSINLEAERLCANRSLLEERARKNRAEVENFTEGAGIVLGELGRVRESIAQFVNLEQIGAEKSSQLNEQYALCQKALVSLAELRQKIFLSRNSVVTQLNQSLSPSIRTELTHQTDLQSYMENLESSFRGSSLKYKGLVPEMVQKVNPQWLLYYTSHLKYDDFSAALGIPIDRATRVLGYLSDIDLGSVLTSEIEA >NZ_CP013792|135453:140224|135453_135879_-|WP_017375964.1|DBSCAN-SWA MARSDSVQFSLLDHGSYKLVEELSIGQRCTVSLSVILENPNRVLVVDQPEDHLDNEYIAGTLIKSLTERANKAQTIVSSHNANIPVLGQANRVVSLESNGKKGFVKYAGSIEDDAIRDMIESIMEGGKEAFATRADFYAAG >NZ_CP013792|135453:140224|139308_139542_+|WP_017375959.1|DBSCAN-SWA MIKTWKHKGLKKFFESGSTAGIQARHKTILAKQLDFLDSMSDPQELWIFESWGAHKLTGNYKEHWAIAASHGVLSTG >NZ_CP013792|135453:140224|139861_140224_+|WP_081078123.1|DBSCAN-SWA MATTTGNNEEYMMTTKTRKPTHPGAYIADIFDNLKENGGMSRNQIAKHLGISPSTLCNIIAEKTRVNADMAVVFEKALGVKADTWLRLQMSYDLWEANKKKKSFLAKVKSLINNPAIKIA |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
144360 : 188041
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP013792|144360:188041|DBSCAN-SWA 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50 | Streptococcus_phage(37.5%) | portal,transposase,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
25804 : 58928
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013793|25804:58928|DBSCAN-SWA ACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATATATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGACCTCATGACCGGCAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCCGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTGCTTAACCGCTGATGAATCAACATTTTTTCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGAGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGAATCAACGCTCATGTCAGCAGCTAAACCCGCTTCCTGACTATTACTACCTGATGGCCACATATAAATAGGATCAACAAAATCAATCGTGTCAAAGTCTATTTGTTGAATTTGGTCAACACTAAATCCATTACACGAAGGCGCTTCAGGTGAACCATAAGACAGATGCAATTGAGGGCGTCCGTAATCTTGAACAATACGTGACATTTTACTATCAAAAACGCAGTAAACTTTTTTATGCGAAAGACAAATTCCAGTAATATCTTCTTTATGCGCACAGTACTCGCCAATATAAGAAGCTAAATACTTTTCTTTTGCTTCACCTAGCTTTTTCTCTTCATCACTACAATGAGCAAGCCCTGTATTCTGTCCCCAACCACTATCATTACAGCAATCACTAAAACCTAAAGTATCTATCGAACAATCCATTGGGGTGCCATTAAAAATACTCACTTGGTCACCGTCGCTATAATCTTCGGCAGCACCTGCGGCGGCGGCTAACTCAGAGACATCTTGACCAAAATTTTCATTTGTTTGAGGGTCTTGACTAGCACAATCACCATCGATACAAAACACATCATTTGCACACACCATTTGAGTAGCACACTGCTTAACAGGACAATTATAAGTGTCGTTGTATTCATCACAGCTTGAACTTGTGCATGCCGAGCTTATTTGTTCACATCCTTGATCTACTAATGACTGGCAACTTGAAGAAAATGGCTGACCACACTGATAATCTGTTTGCTTCTGCCAACAATCTTTAGTGATATCAACGCCATCAATCGTTCGAGTCTCTTCAGGTTCAGTGCAAGTTTGTTTGGTTTCTTTACAGGATGCTGGAAGACTACTACAGTTTGTTGTCCACACCTCCTCCGGTTCTTTCGCTGTGCGTTGTACTTTCATCACGACAGTAAAAGGTGCAGTGCCGCGACTTCCTCCAGAATAACCATCAAACGTTACATTTATCACACCACTACCCGAAACATACACTCCCAAATTATCTGCGGTAATACTAATTGAGCTATTAAAAGGAAACATGCACTGAAAAGTACCGGAACACGGATAAGATCGCGTTCCTATATTGGTTCCATTCAAATAAAAAGTGTAATTTTTATTGTAGTAATAACCATTACCAGCATTAGATTGAAAAGAAATGCTTTCAATAACTCCGCCTTCAGGCAAAGTATAGGTATTGCTATTACTACCAGTATTTTCCATATTTCCAGAATATGTTTTCTCGACATACTCAGTTTTTTCCTTCATTTGAATCGATAATGTACTTGTACACGTCAAATTGTAAGGATGACCGGTTGTGCAACTTTTAGAATCATACGTTGTCGTACAATTCACTGCTTGTTTATCACAATCAACGTATTGGTCAGAAATTCCATGCGTTAAATTGTAGCTATCACTTTCAATCAACTTAGAACCTTGAATGCTCGCCGATTGAGTATTGACCTTGATTTGAGGACGTGTTGTGAAGTTTTGATAAACAGTATTACCAGCAGGGTCATTTGCTAAATTAGTTTGGGCATCTTCAGACAAATTTGAACTATATGACTCTACGCCTTGATAATAACTTGTTTCAGAGGGGTTTGAGGTATAGTTAGGAATCGACTCCTCAGGATTTAAGCTCGTTCCTGTTGAAATCACAGCACTTTCATTGGCCTGAACGATGGATTGATCTTTTTCATAGTCCTCCGATGTTTGATTGGAATAAGTTACATTTAAAATAGAAATAACCAATAAAATTATTAATTTTTTGTTCATTCTACTCACCCATTGGCTAACATGGTCTGTGCCACGCTTTTTGGAATTGAACTACCTCGTTTAGCAATTTCAACGAGTGAATCATGAATGGATTGGTTACCGTAAATCACATCAAAAGGCTGATTCGGACACATTTTTTCTGAGATACATCCTATAGGACGTTGAGTTACGACAAATGCAGGCACCGCAGTAATATGAAACTGATCAAACCAAACAGGGTCAATACTCACCCCACTAAACGGCAACCCCTGTTTTTTTGCCTGTGTTTTAATGTTTAAAATTTCCTGCAATGTCTTTGGCATACTGTTATCGACTAAACCACGCATAATGACCGGAATTTTGTATTTCGCCGCTTGCATCGCCATTGCAATAATAAGCTGGCTAGGCATAGACGTAGAAACAAATAACATCGCACCATTTGCAGCTTTACCACCCTGCTGCAAGTTTTTTTTCGCTGAGTCTTGCGCTGTTCCCATGAGCTGATTAATCATAGCCAAGCTTTTTTTCACATTCTCCTGTGACATATTTGCAAGTGAACTTACTTGTGATGTCTGTCCGGCAACCAATGATTTTTCATGCACTTTATAGTCATTTACTTCATCGTTAAAATTAGCAAAAGCACACTGATTAAAAACAAAAAAACAAAGAAGGTAAGAAATTTTCTTAAGCATTATTTATCTCACACAAAGCAGCAGTTGCGTTTTCTAAAGATTAAAAACCCATAATTATCACCGTCCGCAGGGTTAACATGCCCTGTTTCAAAAGTTGCAACTAAATGACCAAACGGATGGCATTGCAGAGCATCAGGGATGGTATTGACTAATTGATAGCGATAACGACTTTTTGGCATAATTGGGCTGGGATATTCATTGCATACCGCAGGAGAATCCGCGCCCACCGAATCCCAAACCAAACCTTCACGATGCATTTTAAAATCCATCCGTTCAGCAAGCTTAGTCGCTGCTTGCATTGGACTGGCTTGATTAGCAACATTACCCGTTAACGGGTACACTGAGCCCTGTGATCCTAAACACCAGAAGAGACTGTCTATCGATGTTGCAAAATCAGTAGAAGTCACTAATGCATCGGCAACACACGCAGTTTGGGTAATTGGGTTTGAAAGCAAACTCGCTTCAGGATTTAAAACAAACGCCAATTCATCATCATTCCAAGTCGGATCAAGTTCGGTCATATAAGCCAAATCAAACTCACCTGTTTGAACACAGCCAACATTGGTAATGATGTTCAACCAATAAACAAGTGGATATTTATACCAGTGAACATAATAAAAGGCGCCACGTCCATCGGTAGAAGGCATTTCACTACCTCCCATCCCTTGGTCTTTTACATCCAACTCTGTACCCATATTCACCATACAATAGGGTTCACGCGTCACATCTACTAAAGCAAAAGGCTCCCAAAAGCCAATAGTGACACCAATACGTTCAAAAATTGGAGCAGGTGCAGGGCAAAGACAAATAGGGCTGCCAGGATTGGTGGTATCTGGATAAACCCCAGGGGCAATGGGTGCACTGCCAATTGTAATGGGGAAAATACAGTCCCAACACACATCGCTCACAGGGTCAACAAAGTGACCTTTACACGTCGCCGCATAAAGACCACCACTTAAACCAAACACCCCCAAGATGACCAAAAACCATTTACGCATAACGACCTCTAAAAAACGTAACCTAGAGAATAGAAAGTAAAAGACTATTAATAAAAGAACATCAACAAACGTGACTAATTTTTTAAAATATTCCTAACATCTGCTCAAAGCACCTTTGAGCCAATAACAGTAATTTTCCATTTCAAACCATCTTGTTGAGCAATTGCAGGGACGTGCTTAATATGAAGTTTTCGTGTGATATTGCCATATTGGTCATAATAAATCCGACCAAACAATTTTGCTGCCTGACGAATATCACCACCCGTTAAAATAAACTTCACCCATTTATAATCACGATAATGATGTTTTACCCAACTCACCTGCTGTGCGTCATCACCATTAAAGAAAATCAACACTGATCTAAGATGAACAGTATGAAATGGATTGACTATTGTTCCTGCTTTCACCAAAATTCGCCCCATATTATCTGTAATCGGACGAGTTAACTTAATACTTGGGTCAATGGTATAAATCTCACTATCCGACTCTTG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013793|25804:58928|55932_56397_-|WP_036774631.1|DBSCAN-SWA MNIFYLDHNIKKCAQYHCDTHVVKMILESTQILCTVLAKTGVDTPYRPTHKNHPCTLWAEESLDNWLWLLDLTMALNSEYMYRFNRKTPHKSAIVAQSLVFPEITPIGLTERPQAMPEKYRIPDDPVCAYRQYYLAEKNHLFKYTKRNKPIWQL >NZ_CP013793|25804:58928|39524_39779_-|WP_144420828.1|DBSCAN-SWA MSLQKVIQQLDLELGQCSNSEITPDATVQLLNAASKLAVLLVLMESSPLERDHWVKRLSADFKNSLIVSTRSMLMDSSKKNCLH >NZ_CP013793|25804:58928|25804_26779_-|WP_069971648.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEVISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHILNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP013793|25804:58928|52450_53041_-|WP_027242600.1|integrase|DBSCAN-SWA 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35 | unidentified_phage(14.29%) | integrase,transposase | attL 50731:50761|attR 55053:55083 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
4510 : 20533
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013794|4510:20533|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013794|4510:20533|7094_7448_+|WP_016211078.1|DBSCAN-SWA MLKYKGYIGKVEEIHEGDEYIYGIVPNIKDVISFRGKNIKELTKDFKLAIDDYLALCDEREEEPDKPFSGRFMTRLGSDLHEEVFLASMNDSGAKSMNDWVVSACLEKLKHDQTVKR >NZ_CP013794|4510:20533|6841_7102_+|WP_027242955.1|DBSCAN-SWA MNNKHRKTLRDIFHNPIKASIVWADIEKLLLALGAEVIERDGSRVAVILNQVKTTFHRPHPEKTTDKGAVKSIRLFLKNAGVDKNA >NZ_CP013794|4510:20533|13482_13965_+|WP_027242949.1|terminase|DBSCAN-SWA MSRAKGQGRKPKPTKIKKITGNPGCRKLNEHEPKPQDRVAICPDYFDEIAKGAFESAVSDLEYMHIKTASFQKQLEIYASAYSDWRQLSTVIEQKGRTFETTTQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKTSLSELGLTPTAISRLNAQVSNTIESEIDKILD >NZ_CP013794|4510:20533|6020_6611_-|WP_016212329.1|integrase|DBSCAN-SWA MGLNKQAKILSERQEKTVLSSLQSTTYPTRNTAMFLLSIKAGLRAKEIAALTWEMLLTPESELCEAIHLRNTASKGKQGGRVIPLNKQLKQVLSQLLDESKPKHGQRPVILSRRNSHFPAQTVVNWFAELYKNLGFEGCSSHSGRRTFVTRAAKNIIKAGGSLRDVQQLAGHTTLQTTQRYIEGDSEAKKRIVDLI >NZ_CP013794|4510:20533|20116_20533_+|WP_027242943.1|DBSCAN-SWA 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MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEVISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHILNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP013794|4510:20533|15671_16253_-|WP_027242946.1|DBSCAN-SWA MPTQKHMEKITNLIDDLQKRITKLDGQIEAEAKSSFISSGLLEREKSKGSRPVEYYHNVREFSRKLLPKIASWARKALLLCECKNFLEEMTKDDSKALEHATHLNETYLRHSNLAVFEARFRSMTKSLCSKTYKILKSIAKENQQSAVAATNWGGGAYAVADIVNRHQSSGLTSVEEGLQVVELPQTQPAMQG >NZ_CP013794|4510:20533|16633_17608_-|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP013794|4510:20533|13012_13396_+|WP_027242950.1|DBSCAN-SWA MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLKDDKLIPAIEVDHIKPHDGDYELMWNQHNWQALCKPCHSRKTVNEDGGFGRKKSPQGRGV >NZ_CP013794|4510:20533|14172_15147_-|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP013794|4510:20533|4510_5485_-|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP013794|4510:20533|11933_12800_+|WP_027242951.1|DBSCAN-SWA MPKYDQMIQKEIEQSSRRLYKDVDALRSGNTPVEMIPVAHHTVEYSNHKAKLSALSSRMPQSEAERTRDIHDFIAHSSARAALSGLARCEESLTSFMKVHIQSEAAELLPYMTVIFFNVQDPKVPENKNNHCFLMLSANDPSAQLQGFDFKTQVARVNQARQELLSVFERNPGDNYLVDPYLVECVSLKKALKGNNAEFMDAYDERSYLGLASADLGTVDSRDIDIHLITKKERELVTEFKQGNPDFVLNNSIHHTAGPWKDRFQFPFLSAHEEPEPEGEEAALYYCG >NZ_CP013794|4510:20533|9641_9896_+|WP_027242953.1|DBSCAN-SWA MNNKHKKTLREIYTDPIKVNIVWSDVEKMLIAAGATIEERSGSAIAIFLGDEYLGIHRPHPERTAQRYVVKKVRELLKRNGIHA >NZ_CP013794|4510:20533|10333_11308_+|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP013794|4510:20533|18700_19216_-|WP_027242945.1|DBSCAN-SWA MFKTLKRSVLVCVIPVLSSSLLITSAYATCYVDYKNSSENTWNITLKNLEGDTAHIYCPNKTLGYKESCTFPVNPGDSVSVGFSHTAGMIKAYISFSSTINGHSESLNDLLVEAIDDHCPEIYYNDSVPYGITLNKPSIGNVIFAPYSENESTLNKFSKINFEADTNKKFS >NZ_CP013794|4510:20533|9131_9497_+|WP_027242954.1|DBSCAN-SWA MLADWGDYIQRGAEHGSSNSIFGMIQKYGGVVIQNNNSGNDPYIANSDALEVDRIVNELLHSDCKSDQTMARILVIHYGITGSAAKKQAIYHISSPTYDSYLGKGVSYVRGCLNALMCKPA |
20 | unidentified_phage(38.46%) | tail,integrase,transposase,capsid,head,terminase | attL 3840:3899|attR 18013:18304 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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