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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 60661
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58 | unidentified_phage(16.67%) | head,transposase,integrase,portal,capsid,tail | attL 56346:56405|attR 66858:67146 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
64837 : 129245
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013797|64837:129245|DBSCAN-SWA 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60 | Streptococcus_phage(48.15%) | integrase,transposase,portal | attL 72373:72432|attR 112015:112935 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
135484 : 140255
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013797|135484:140255|DBSCAN-SWA TTTATCCGGCAGCATAGAAATCAGCTCGAGTAGCAAATGCTTCTTTTCCACCCTCCATTATCGATTCAATCATATCTCTGATTGCATCATCTTCTATACTCCCCGCATATTTTACAAAACCTTTTTTACCATTTGATTCCAAGCTAACTACTCTATTAGCCTGACCAAGAACCGGAATATTAGCATTATGGCTTGAAACTATAGTTTGAGCTTTATTTGCTCTCTCAGTTAGAGATTTTATGAGAGTGCCTGCTATGTATTCATTATCTAAATGGTCCTCTGGCTGATCCACAACCAATACTCTATTTGGGTTTTCTAAAATAACAGATAATGAAACAGTACATCTCTGCCCAATTGAAAGTTCCTCAACCAGCTTATAGCTTCCGTGATCAAGCAGAGAAAATTGAACACTATCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGCTTCGATTTCCGAGGTGAGAACAGAGCCTAAATCTATATCACTCAAGTACCCCAAAACCCGTGTAGCTCTATCAATAGGTATTCCCAATGCAGCAGAAAAATCATCGTATTTCAAATGGCTAGTGTAGTAAAGCAGCCATTGAGGGTTAACTTTCTGGACCATTTCTGGAACTAGCCCCTTATACTTTAAACTTGATCCTCTAAAAGAGCTTTCCAGGTTCTCCATATAGCTCTGTAAGTCAGTTTGGTGTGTTAGTTCCGTTCGTATGGAGGGAGACAAACTTTGATTCAATTGAGTTACAACCGAATTACGCGATAGAAAAATCTTCTGTCTCAGCTCAGCTAAACTCACCAAGGCTTTTTGGCAAAGCGCATATTGCTCGTTAAGTTGTGATGATTTTTCAGCGCCTATTTGCTCTAAATTCACAAATTGAGCAATGCTTTCTCTAACTCGACCTAATTCACCGAGAACAATACCCGCTCCCTCAGTGAAATTTTCAACTTCAGCCCTGTTTTTTCTAGCCCGCTCTTCCAATAATGAACGGTTGGCACATAACCTTTCAGCCTCTAAATTAATAGATTGAAGCACTTGCTGGTCATTAGTAATAACAGACTGTATATACCCATCATCGTCTGCGATACCCTGCCGAATGATACGATTCATTTCGTTGGAGTTTTCGCCCTTCAATAAAGGCAGCTGCTCTCCATTTAGAAATAAAGATAATTCAGTAACCCGCCTCTCAAAATACTGTTTAATTGTACTCAAATTTTGAGAATTAACAGAAATGATACTTAGTTCATGTTGCACTTTGTTAATGCTCTCTTGATTTACACTAATCACATCATTTTGTTTCTGGAAATCACGTTGTTTCTCTATCAACTCCTTTTCTTTTAGCCTTAGACTTGGCAAATCAGAGGTTTTTTCTACAAGCTCTGCACGCTCTTTTTTTAATGATGCCATTGTTGTGCAAATTGCACTTACCTCACTCATAAGGACTTGCAACAAAGCCTTCTTTTCATTTATATTCGGGATGAAACTGTCGATCAAACGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTATAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTTTAATTTTCCCTCAGCGTTAAGGCTGATCGTTTCTATTTCTTTTTGAGAGAAAATTATTGGCGGAGTAAATTGTTTAACAGGAGCTGTTTCAAATGCAGACCTAGAGATTGTCATATCAACACCATTTTCAACAATATCAATTACCACTCTTCCCGATGATTGTAAAATAGATAAAGCATGCATCATAGACTCTTTGTTGTTGCTTTGGGATAAATTTCCTGCACCAAGACCAAAACGAAGCAACTCAATAATTGATGTTTTTCCGACCCCCCTTCCACCAATTAGTACATTGAGACCAGGTGAAAATTCTAGATCTAGAGCATTAAAGAAACCTTCTTCAACTCGTAATCTTTTAATTAGCAAAACGCCCTCTCCCTAGTCCAAATTTATTAAAATCACTACAAATATTCACAAAAAACATTGAAAGGTTAATAACACTCACACTTCCAGATTAAACCCATAATCGAGCACTATTTCATAGACTTCATATCAATAACAAAACGATATTTCACATCCGACTTCATCACTCTCTCATATGCTGTGTTGATGTCTTCTATATCAATAGTTTCAACATCAGAAACGATATTATGCTCCGCACAGAAATCAAGCATTTCTTGAGTTTCTTTAATGCCACCAATTAGAGATCCTGCAATTATTTTACGGCCAAATACTAGCCCCATTGTATTTAATTCTATTGGCGTGGCTCCTACCACAGCCATTGTTTTTCCCAGCTTTAAAAGCGGCACATAAGGGTCTATATTATGGGCTACAGGAATTGTGTTCAACAAAAAGTCAAAGGTGCCTACGTGTGCTGACATTTGCTCTTCATTTTTGGAAACAAGCACATCACTTGCACCTAATCTTTTAGCATCCTCACCTTTTTCAGGCGAAGTCGTTATCATCACTACATGTGCGCCCATGGCTGAGGCTAGTTTAACCCCCATATGGCCAAGACCACCCAAACCTATAACACCTACCTTATCGCCAGACTTAACATTCCACTGACGTAAGGGGGAATATGTTGTAATACCGGCACATAAAAGAGGTGCAACTGATTTTGAGTCTAGGTTTTCAGACACTTTCAACACAAAATCTTGATCCACAACAATTCGAGTAGAATAGCCACCTTGCGTAATAGCATCTGCATTATGAGAATCAGGGCTGCCATAAGTCATCACCATACCCTTATCACAATGTTGTTCAACATCTTGTTTGCATGGTTCACATTTTCGGCAAGAATCAACCATACAGCCAACGCCAACAAGCTGACCTTCGGAGAAACCTTGCGCATCTGCACCTAATTTTTTCACACGGCCAATGATTTCATGACCAGGTACAAGAGGATAGGCTGACATACCCCAATCATTACGTACCATATGAATATCACTGTGACAGACTCCACAATATAAAATATCAATTTCTATATCTTTTGGGCCAACCTCGCGACGATTGAATTCATAGGACTTTAGCTCGTCTTTATCATTATATGCTGCATAAGATTTTGTGCTGTACATACGTTACTCTTTTGATGTGCCGTTGTTTCCAGATTCAACATACTTTATAACACAGATAGCTACCGCTCTCTTGAAAAACTGTTATTGCTTTACCTGTTTTTGCTAATTTTTCATGATATAAATCTGTTGAGTAAACTGCATCGGCCCTAAAGTTATCTATAGTTGTCACACGAAAACGTAGATACCGCCAGGATTTCTACGTTAATTACTGTCATTAACCTATAATCAAATGATGAGCCTTGTTTACAATATGTAAATGTTTATATATAATAAACGAGTTGTAATAAAGTAGTCTAAACTAATGATTAAGACTTGGAAGCACAAAGGTCTAAAAAAGTTCTTTGAATCAGGCAGTACTGCTGGTATTCAAGCTAGACATAAAACAATTCTAGCTAAGCAATTGGACTTCTTAGATTCTATGAGTGACCCCCAAGAACTTTGGATTTTTGAGAGTTGGGGAGCCCATAAACTTACTGGTAACTATAAAGAGCACTGGGCTATCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGCACCGTAAAAGCGAATTGGCGCTTATTTTTCAAGATAGAAGATGGCGATGTAGTTTTACTTAATTATGGCGACTACCACGGGAAATAATGAGGAGTACATGATGACCACTAAAACACGCAAACCGACACATCCAGGGGCGTATATTGCTGATATATTTGATAACCTGAAAGAGAATGGTGGCATGTCTCGTAATCAAATTGCCAAGCACCTTGGTATATCGCCGTCTACCCTTTGCAATATCATTGCAGAGAAGACACGGGTTAATGCTGATATGGCAGTAGTCTTTGAGAAGGCGTTAGGTGTTAAGGCTGATACCTGGTTAAGGCTACAGATGTCATATGACCTATGGGAAGCGAACAAGAAAAAGAAAAGCTTTTTAGCAAAAGTTAAATCATTGATTAATAATCCTGCCATTAAAATTGCTTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013797|135484:140255|135484_135910_-|WP_017375964.1|DBSCAN-SWA MARSDSVQFSLLDHGSYKLVEELSIGQRCTVSLSVILENPNRVLVVDQPEDHLDNEYIAGTLIKSLTERANKAQTIVSSHNANIPVLGQANRVVSLESNGKKGFVKYAGSIEDDAIRDMIESIMEGGKEAFATRADFYAAG >NZ_CP013797|135484:140255|137994_139038_-|WP_017375960.1|DBSCAN-SWA MYSTKSYAAYNDKDELKSYEFNRREVGPKDIEIDILYCGVCHSDIHMVRNDWGMSAYPLVPGHEIIGRVKKLGADAQGFSEGQLVGVGCMVDSCRKCEPCKQDVEQHCDKGMVMTYGSPDSHNADAITQGGYSTRIVVDQDFVLKVSENLDSKSVAPLLCAGITTYSPLRQWNVKSGDKVGVIGLGGLGHMGVKLASAMGAHVVMITTSPEKGEDAKRLGASDVLVSKNEEQMSAHVGTFDFLLNTIPVAHNIDPYVPLLKLGKTMAVVGATPIELNTMGLVFGRKIIAGSLIGGIKETQEMLDFCAEHNIVSDVETIDIEDINTAYERVMKSDVKYRFVIDMKSMK >NZ_CP013797|135484:140255|139339_139573_+|WP_017375959.1|DBSCAN-SWA MIKTWKHKGLKKFFESGSTAGIQARHKTILAKQLDFLDSMSDPQELWIFESWGAHKLTGNYKEHWAIAASHGVLSTG >NZ_CP013797|135484:140255|139710_139863_-|WP_146619517.1|DBSCAN-SWA MLKNKRQFAFTVRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP013797|135484:140255|139892_140255_+|WP_081078123.1|DBSCAN-SWA MATTTGNNEEYMMTTKTRKPTHPGAYIADIFDNLKENGGMSRNQIAKHLGISPSTLCNIIAEKTRVNADMAVVFEKALGVKADTWLRLQMSYDLWEANKKKKSFLAKVKSLINNPAIKIA >NZ_CP013797|135484:140255|137479_137887_-|WP_036817201.1|DBSCAN-SWA MLIKRLRVEEGFFNALDLEFSPGLNVLIGGRGVGKTSIIELLRFGLGAGNLSQSNNKESMMHALSILQSSGRVVIDIVENGVDMTISRSAFETAPVKQFTPPIIFSQKEIETISLNAEGKLNVSVATSVGILHIQ >NZ_CP013797|135484:140255|136180_137146_-|WP_036771651.1|DBSCAN-SWA MASLKKERAELVEKTSDLPSLRLKEKELIEKQRDFQKQNDVISVNQESINKVQHELSIISVNSQNLSTIKQYFERRVTELSLFLNGEQLPLLKGENSNEMNRIIRQGIADDDGYIQSVITNDQQVLQSINLEAERLCANRSLLEERARKNRAEVENFTEGAGIVLGELGRVRESIAQFVNLEQIGAEKSSQLNEQYALCQKALVSLAELRQKIFLSRNSVVTQLNQSLSPSIRTELTHQTDLQSYMENLESSFRGSSLKYKGLVPEMVQKVNPQWLLYYTSHLKYDDFSAALGIPIDRATRVLGYLSDIDLGSVLTSEIEA |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
144391 : 188070
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP013797|144391:188070|DBSCAN-SWA ATTGCCTAGACGTGCGAAACAGATTTGCTGTTATGCCGGATGTCATAACACAACCTATGCACGCTACTGCGAATACCACGAACAACACGGCAATCGATACCATGCCCCACGTAAGACAACAGCCCAGCGTGGCTATGGGGGGCGGTGGCAACGTGAACGTAAGATATTTTTACAAGATCATCCACTGTGCAAGCAGTGCTTACAAGATGACAAATTAATCCCAGTGACTGAAGTGGATCACATTAAACCGCATGATGGTGATCATGATTTAATGTGGAACCAACGCAATTGGCAAGCGCTGTGTAAGCCCTGTCACTCACGTAAAACAGTGAATGATGATGGTGGCTTCGGTCGTAAAAGATCACCCCAGGGGAGGGGTATATAAAATGTCTATGACCTTTATTTCCTGACCACCCGCCTAGTCGAATTTTTACGCATGCGAAATTAGAACTAAAAACTTGGAGGTTTTTGATGTCGAGAATGAGAGGTCAAGGCAGAAAGCCAAAACCAACAAAAATTAAGAAAATTACAGGGAATCCTGGATGTAGAAAACTAAATGAGCATGAGCCAAAACCACAGGATGGGGTTGCCATTTGTCCAGGTTATTTTGATGAAATAGCAAAAGGAGCCTTTGATTCAGCCGTCTCTGATCTTGAATATATGCACATCAAAACAGCCTCTTTTCAAAAACAACTAGAAATTTATGCGAGTGCTTATTCTGACTGGCGGCAGCTATCCGCTGTCATAGAACAAAAGGGCCGTACGTTTGAAACGACGACGCAAGCCGGGGATACCATGTACCGCAGCCGCCCCGAAGTGGCTCAACGCAATGAAGCCTGGAAACAAGTCAAAGCCTCATTAAGTGAGCTTGGATTAACACCAACCGCGATTAGTCGGCTCAATGCTCAAGTATCTAGTGCTATTGAGTCAGAGATAGATAAAATTTTGGATTAACTATGATTAAAAGCGACCCGGTAAAAACCGCCCTCACCTACTGCGATAATGTACTAAGCGGCCGCGTCATTGCCTGTGATTATGTAAAAAAAGCCTGTCAGCGTCATTTAAACGATTTAAAGTATGCTGGTGATCCCGGTTTTTACTTTGATAAAGAAGCGGCCTGTAAAGTCGTTAGATTTTTTAGTTACTGCAAACACAGCAAAGGTGAGTGGTATGGGAAGAAAATTACTTTAGAGCCTTGGCAACTATTTATTATTACTACCGTGTTTGGTTGGAGGCGTGAAGTTGATGGTATGCGGCGTTTTCGTACCGTTTATGAGGAAGTCGCACGTAAAAATGGCAAGAGTACGAAATTATCAGGCACTGGCTTGTATTTATTTTGTGCTGATGAAGAGCCGGGTGCAGAAGTCTATGCCGCGGCAACCAAACGCGATCAAGCAAAAATCGTTTTTGATGATGCGGTCAAAATGGTTAGAGCCTCTAAAGCCTTAGCTTCTCGCATCGGTATTTATAAAAATAATATGCATTATCCCAAGGATTTACCGAATAATAAGTTTGAACCGTTATCGAGCGATAGCCAGACACAAGATGGCTTAAATGTGCATAGTAGTATTGTAGATGAGTTGCATGCCCATAAAACCGGCGATTTGTGGCGGGTATTAGAGACGGGCACCGGCTCCAGGCGTCAACCGTTGCTGTATGCGATTACAACCGCCGGCTTTGATCAGACGGGGATTTGTTATAGTTTGCGTGATTATGCGGTTAAAGTGCTGGAAAATATCATTGAAGATGATACCTTTTTCGGCATTATTTACACCCTCGATAAAGAGGACGATTGGACAGACGAGCGTGTTTGGATCAAAGCCAATCCAAATTTAGGCATTAGTAAAAAGCTTGATGACATGCAACGCCAGTGCGTAAAAGCTCAACAAATGAAGGGTGAACGCAATGGCTTTTTATGTAAGCATTTAAATATCTGGACGAATGCCGAAACCGCTTGGTTAGATTTAGAACGCTGGAAAACTTGCGCTGAATATACCTTTAAACGTGAATCACTGGAAAATCGGCCCTGTTATATAGGTCTGGACTTAGCCAGTACCAACGATATCGCCGCCTTAGTTGCGGCTTTTTTAATGCCAGATGATTCAGTACGTTTATTTTGTCGCTTTTACTTACCTAAAGAAACCGTAATGACTCGAGCCAAGCAATCCCCCGTGCCCTATCAGCTATGGTCAGATGAGGGCTATTTAACCCTCACTGAGGGTAATGTGATCGATTACAACCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACATATATCAAAGACGATATTTACCAGCTCAATAAAGAATTTGATGTGAAAGAGATTACTTATGACCCGTGGAATGCCACCCAGCTGGCCAATGATTTACTCGAAGAAGGCGCGAATATGGTGGAGTTTCGCCAAGATTTTAAGTCCATGACCCCAGCATTAAAAGAACTTGAGCGCTTGGTAATTTCAACAAAGCTCCATCATAACAATAACCCCGTGTTGAACTGGATGGCCTCGAATTTAGTCGTTGTTGAAGATGATGCGGGGAATATGAAACCTTCTAAGCGTAAATCCACAGAGAAGATTGACGGTATGGTGGCCATTGCGATGGCCGTCGGGCGTTTAATTGCTGGGGAAGATCATAATTCGATTTATAACGAGAGAGAACTGCTCATTTTATGAAGTTATTTAAACGCTGGTTTGGTGCGGCAACGGAGCTTGAGCCAAGTAGCGAATATGGTGGTTATGAGCTTTTAGATACTGCGCCCATGAGTGCCAGCGGTCAAAGCATCCACCCCGATAATGCCATGCGCTTAGCAACGGTTTATGCCTGCATTCGTGTATTAGCCGAATCGATTGCGGCTTTGCCTTTGCATGTGTATCGCTATGAAACAGATGGTGGTAAAGCCTTGGCTACAGATCACCCGTTATATTCTGTCTTGCATGATCTGCCGAATGGTGAAGTGACTAGTTTTGATTTACGTGAAAACCTCGTCGGCCATTTATGTTTACGTGGTAATGCCTATTGTCAGATTATTCGCGATGGTGCAGGGCGGGTACGTGAATTAATCCAACTGCCCACTGATAACACCAGCGTCCGCCGTGATGAAAAAACTAAAAAGCTCATTTATAGGCACTGTTGCGAAAAGTTATAGGGAGCTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGTTCGCGGCCTTAGAATGAAGCCGCCAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGGTTTTGGGCACAGATATCCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATCACATCAATGGTAGATCGGGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACTGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAATTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACATCGCCTAGAAAAGACACCTTCATCTTTGGCTTTTTGATGAGCCGGTGGAAATGAAGCATGTTTATCGACATTCACAATACGTGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCATCGCCGCTTTGGCATTTTGATGTCGACTGAGCATCCAGTCCAAAGTATTGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAGCGCCCTTTAATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAACGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAGCGGCCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATGATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTTTTACCACAGCAATTCACTCTTAACTTCCGTTGATTGCTACACCCTACTCAAATCTAAATTTTTTGCAACAGTGCCGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTCTTTAACCGCTGATGAATTAACATTTTTGCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCCTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGAGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTG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50 | Streptococcus_phage(37.5%) | transposase,terminase,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP013796_1 | 2279076-2279186 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013796_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP013796_1
>1.1|2279103|57|NZ_CP013796|CRISPRCasFinder GCTCTATCCTTCAAACAGCCATTATCGCCCTTTATCGTTCCGATATCAAATTAGCTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013796_1
The CRISPR arrays of NZ_CP013796_1 >merge|NZ_CP013796|1|2279076-2279186|CRISPRCasFinder AGGATGATTGGGAGCAACTTAAAGATAGCTCTATCCTTCAAACAGCCATTATCGCCCTTTATCGTTCCGATATCAAATTAGCTCGAGGAGATTGGGAGCAACTTAAAGATA >NZ_CP013796|1|1|2279076-2279186|CRISPRCasFinder AGGATGATTGGGAGCAACTTAAAGATA GCTCTATCCTTCAAACAGCCATTATCGCCCTTTATCGTTCCGATATCAAATTAGCTC GAGGAGATTGGGAGCAACTTAAAGATA
>NZ_CP013796.1|WP_144420682.1|2278217_2278379_-|phosphatase MYHFQIDNQINQFLNRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP013796.1|WP_155046588.1|2277473_2277683_+|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYEINNILILFSYLFGAILKLTFPSYYNFLAKLRSHTICQELYGIQKSKEP >NZ_CP013796.1|WP_027243099.1|2275044_2276358_+|DEAD/DEAH-box-helicase MSFSSLGLSAPLLDAITEQNYKEPSAIQAQAIPAVLSGRDVMAAAQTGTGKTASFTLPLLERLSKGEQVRANQARALVLTPTRELAIQVAESVAVYGKNMPLRSTAVFGGVKINPQMMRLRRGVDILVATPGRLLDLYSQNAIKFKQLEVLVLDEADRMLDMGFIHDLRKIMALLPKQRQNLLFSATFSKEIRALAKTFVHQPLEISVTPRNTTAKTVKQWICPVDKKQKSALLMHLISHHQWQQALVFSKTKHGANRLARYLDDQGVTAAAIHGNKSQGARTKALADFKQGEVRILVATDIAARGLDIDQLPQVVNFDLPNVPEDYVHRIGRTGRAGACGQAVSLVSADEIKQLSDIEHLIGQLLARKLVDGFEPVHDVPVSSLDRRSKAPKKPEIEHQGGQRLGGSMQGKRREDHRNSQQQPGRKRRRPQLCRSK >NZ_CP013796.1|WP_027243098.1|2273663_2274809_-|carboxypeptidase-family-protein MRISSQFDAGNIEVISAEAVNNIQLKIRKDNQSDFLQWFHFRLHGAKNQACTLKILNASACSYPQGWQNYNIVASYDKEHWFRIPSHYDGKTLIVEHTPEANSIYYAYFTPYSYERHQELIGHAQQHSQCEVSLLGQTVDGRDLDLLTLGQLDQSNSDHHHKKKIWLIARQHPGETMAEWFIEGFLGALLDESNALARVLLSKAVFYVVPNMNPDGSVRGNLRTNAAGANLNREWQTPSMTKSPEVYYVKEKMQNTGVDLFLDIHGDEALPYNFVVGTEGNPLYSARIHSLEKQFKDAFKQTNPDFQDQYGYDKDQPGQANLTVACNNIGQTFDCLAFTIEMPFKDNADLPCKEFGWSAERSEQLGASVLQPIYNVIDQLR >NZ_CP013796.1|WP_027243097.1|2273412_2273598_-|hypothetical-protein MFDMSELSRPENKWDIFKNSKGQWQWSCSDPNGRFLGASTETFDNEESCVANAREQGYSSE >NZ_CP013796.1|WP_027243096.1|2272744_2273377_+|MarC-family-protein MHELITFFITLLALTNPFGNLAIFIGLVEGRDVKEQRGIAFKAGIAVAIILMIVTLFGQNILDFFGISIGAFEVAGGLVILLLGLSMLNMKTEHQPHTKSEHTLAEEKPAIAVVPLAMPIIAGPGALAAVIIHTQSHVADRLFAKLPYVGVDIVIAVVVTAVLLFAPFFHKLLGVAGLKIVERIMGLILMAMAVTMMASGVHSLFPVPAA >NZ_CP013796.1|WP_144420683.1|2271911_2272568_-|hypothetical-protein MLKACSVPTMQLHADYDTETKKSHYSPLGDLRIQRFFDGRPNIQKTALKRYFKKKLPSGIFSGKTQPELSTYLQTTMRTIGQENGSNAPHSTQHYVITGIIQSIQVSKKPGVAKELMNPNAQYTPYIGASHYHAQVKFKAELRQAGLIILTVPVSINLFEITASHLTVQQDSDKMAYLLKKAINQAIKTMYKKLHQQLPQQSTMTSIKKLSQINRLHP >NZ_CP013796.1|WP_027243095.1|2269637_2271923_+|hypothetical-protein MPYTVELEEIYQGKRFESERKRYQECFNAADALADSVYLSESMLGYFEDVSGDELDFNNDATYSSSLSLFVLLGIFGVFKARAHFDKNENIDKYYKKLRTALSGLKNGRHALVNISSLVSILSHHAVASSVVSPVGALGFAIGILLAANNLYKLKLEEKRNSNLKAIEQYFLNFDRPEFDQDFKRIVPPNVKSNRKLIYTNIIDGFTDGLYLVGNAFMLLGLCGATSMVPTVAIGLCVAYGVYTLGSIINKYFKEKEEQLKEEFIYLKFLENLENQGKLVEYHDQFKSDPNYKKYIGDLSESDGAEEIRNKLGVALKIKEKELNAKKETLQSNTFYKVYKMISKSFSTVRSYVNTIKNSLATVTGIDILASQHPLAQAAVSLGCIITGCAVAVPFLVYKTYCSFRPTYQLRCRQGLDYPDLLYFFNEYAKSGFLKKHNHKGLIDRLTDDYQDYRENYLHILCTVNEYIADHYRNMNQKGELFLRYQAAKDYILCKHKYFSSMIKQLYKEYHYYSSLNINSDSDDIFIKNTRCLLKLYPATTKKEVVESLAIFSWDRQIAIITALPEFIDDHQVIMDLKGFLSAIKKPLREKNNFWLDKAHKKAQQDFFNAMLQNYLDNGVVNRSECAALVMNINKLLNSELLYPMPVKTINFYLHKAAVNYLAASASKILKNENLSIQQKIALYQSQHDELLRLLPNMMKSYAQRDSHDSLKVDESQFEEFLARAKNHRSNSNSCFTNMMFYHGQVDTMEPASSHRLVLGV >NZ_CP013796.1|WP_017376797.1|2269004_2269364_+|hypothetical-protein MFTRQKKSLAKFAAESAGTVEAVEAFHREPVCELVFSVCDQEISQCIDLLYDAGHNIHNLKKYAPIEFRNYIYEEFLMRLESPAADVQRELAREVFMDYLETRLKFDMDIAREIIKMPG >NZ_CP013796.1|WP_017376798.1|2268087_2268723_-|LysE-family-translocator MTFGIWLSLFAVCILGAMSPGPSLAIVTKHSLTNGRWHGIATSWSHALGVGLYATLTLLGLAVLLKRSPILFAIISYAGAGYLIYLGINALRSKGGIDSKLNLGQPAPLKDSCREGFMISLLNPKLALFFLALFSQFISVGHQLSSQVIIVATPTLVDGLWYTLIAFILSNPKVLSILKNKAQLIDRLSGIVLLLLASVFIISTISHSIFN >NZ_CP013796.1|WP_017376785.1|2279785_2280691_+|LysR-family-transcriptional-regulator MSVKITLRQLEIFVAISQHGHVTQAANSLYLSQSAVSMALAELERQLGKTLFDRAHKNLQLTNEGRLLLDKAVSLMQQAREVEQLFESDVQGELVVGASSTVGNYMLAGLMSEYLQKYPQLRLRLEISNTRRSQEKLLDYQFDCAFVEGEVTHADIKRQLWCMDEMLLIVAPTHPLAYKGLVEASDLSKAVWVLREQGSGTREFFNRRVLPELTYAQVCLELSDSTAIVQSVETGVGVSCLSRHVVECALREKRLAKLPYERKLERAFYLLIHKKKHIPALVHHFIDFCYQYIGKNNNYSL >NZ_CP013796.1|WP_017376784.1|2280931_2281117_+|hypothetical-protein MEKIERVYARDHGISGNFKDIQFEKYCRDWLEPMRRKVNESTKLDDYVNPRVKSRLGGYLG >NZ_CP013796.1|WP_027242578.1|2281153_2281690_-|DUF2062-domain-containing-protein MFNWFKKKIPTRESLQDHKILAKLYHLLHYHYLWHFNRHSVSKAIAIGSFFAFIPVPFQMIPAALCALVFRANVGISIATVWISNPITIPPMIYAAYKLGSWMIGHPGFIISLEQPHDIIHLLSQSWPPFLLGCITLSITFSLVNYIIARLFYRLWIIHKWHKNREKHKQANTTKKER >NZ_CP013796.1|WP_027242577.1|2281707_2283009_+|ComEC/Rec2-family-competence-protein MLGFIFVIGFLTLFFLGWQGAVLLSLSIGGLCYFIKSKHKAKLLCCLGLGGLWAIIIIFWQDYLHLDDFVLNQVVVITGNVVSIPEHDTRKVCFLFLIESINHQPLWPARQVRLNWYRFKQKKQQVLKAGESWQFQVKLRAPFGLENFIGFNYRRWLYQHSIQATGLVIDRYGKKGINRKLSSSHVFNLQQYRQKIAWFLERIDLHNTALIKALVLGERAEVKRSVRNLLQQTGTAHLLAVSGLHIGLIVTFTFFLIRGVLLWAPGMSRKYKSSGYALFIAAIVSLLVALCYSALAGFSVATLRACLMTVCVLLAFLCRRVVPIWALYQYALVGVVILFPLSVLSIGFWLSFLSVGVLIFVCAGRLTQTKLQKYLKPQWALLIALAPLSLAYFFNMPLIGLLANLVAIPWVGFLVLPLLLFALRHLKCNTTLY >NZ_CP013796.1|WP_048876008.1|2283005_2283980_-|IS30-family-transposase MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKSITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP013796.1|WP_155046589.1|2284059_2284209_+|hypothetical-protein MTEGVLGLIFIPLSNELSWVLFHCADLQITWLINRCEPWSAKHGVSRPR >NZ_CP013796.1|WP_155046590.1|2284388_2284553_+|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYGITLFRPLAALYTTLLWCANINFIGFFFFNVSSI >NZ_CP013796.1|WP_036774017.1|2284554_2285430_-|IS982-family-transposase MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMVKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRAFKGLAKKSKSTMRWYYGFKLHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYEKGLQLITKIRKNMKNKLVLMIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSADNFMVNIVAGLAAYCLQEKKPSLGIKYNLLNG >NZ_CP013796.1|WP_155046590.1|2285720_2285885_+|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYGITLFRPLAALYTTLLWCANINFIGFFFFNVSSI >NZ_CP013796.1|WP_036774017.1|2285886_2286762_-|IS982-family-transposase MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMVKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRAFKGLAKKSKSTMRWYYGFKLHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYEKGLQLITKIRKNMKNKLVLMIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSADNFMVNIVAGLAAYCLQEKKPSLGIKYNLLNG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP013796_2 | 2835439-2835534 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP013796_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP013796_2
>2.1|2835463|48|NZ_CP013796|CRISPRCasFinder GACAAGAAGAAGAAATTTTTGGTACTGTAGGTGGTTTTCAATCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013796_2
The CRISPR arrays of NZ_CP013796_2 >merge|NZ_CP013796|2|2835439-2835534|CRISPRCasFinder CTCAAGGGGCTTCAGGGCACTCTGGACAAGAAGAAGAAATTTTTGGTACTGTAGGTGGTTTTCAATCCCAATCTCAAGGGGCTTCAGGACACTCTG >NZ_CP013796|2|2|2835439-2835534|CRISPRCasFinder CTCAAGGGGCTTCAGGGCACTCTG GACAAGAAGAAGAAATTTTTGGTACTGTAGGTGGTTTTCAATCCCAAT CTCAAGGGGCTTCAGGACACTCTG
>NZ_CP013796.1|WP_017378007.1|2832436_2834380_+|hypothetical-protein MKNNIYLNKLPSFLILITGITISLFLFYSLNKSHNLEASSHFEELATDTQQAIQNNINKNIAALNILKSFYESSDFINFNEFTTFTNSLLERDLAIQALEWIPNIPHSKRHDYVKKANQFFKNFNIKEKTAQGKMLIAKTKTNYFPVYYVNPVRGNEKAIGFDISSSPMRNKSLEKAALTGRNVATHKITLIQEEKGNSYGFLLFNPVYHSSSPQDISPKSLKGFVLGVYRINDILGHALNFSAKNNLIIFVKERINNNTLSPIFQNNGKQEINSHLSYQSTFTVADKKWPITIYPSHDFIKEHKNHLPMIILFAGVIISLILAAYLWLLVNREVRVKNLVEERTEQLNELNSKLTVLNEELDQKVMERTQKLKENQEQLIQSEKLASIGQLAAGVAHEINNPIGYIMNNIEIMGEYLDSIKAITQQAEACSKTLTSNDIQIKNDQLQQLKNTLEQEDINYVIDDTEKIIQQSLEGAEKVKNIVLSLKSFAHSDTDNKEEFDLNHCIEQALTITQNELKYKCKIIKNLSPLNPLLGYSSQIGQVIMNLLINAAHAIKESGTITITTQQIAGFNKLTIEDDGYGIHKDHLAKLFDPFFTTKSVGEGTGLGLSISYGIIKKHQGSINVESTVGQGTVFTIQLPNHSHHS >NZ_CP013796.1|WP_048875961.1|2830887_2832291_+|IS4-family-transposase MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP >NZ_CP013796.1|WP_017378006.1|2830138_2830768_+|response-regulator MPSLLLVDDEPHIIDALKRLFRREKYTLHCAYSAKEGLDILAQQHIDIILSDQRMPSMLGSEFLAKAQAQSPQTLRIILSGYADTKEIINGILNNHIHQFLEKPWRANELREHLRHLINLMDKNQYTQKNQSDNHYTRTAALSFNKNGAIKSINLYFCALLGQKPEHILSAPLTSVINYNQKQLKEILSYVNNHGHWQGKVTLANSTQD >NZ_CP013796.1|WP_017378005.1|2829180_2829900_+|sulfate-transporter-CysZ MSGFHYFLNGLNFILTPKMRRYLYLPILLNIILLLVLSYLGVHGIEVITNHVSTSLPHGLHFLRPIATIILSLALITLLVFSFTTLASIIGAPFYSLLCEAVLQKKDHQLPQDNITALIKDMPRLIGRELIKLRYFIIRVMILMILLFIPGINLIVSLLWFIFNCWMQAIQYIDYPMDVLKHPFKQTLKATRQTPLTAMSFGLVCFVCTLIPLLNLIAIPAAVAGGTLLWSERIQPLLK >NZ_CP013796.1|WP_017378003.1|2824631_2825462_-|hypothetical-protein METFLKVLVLLVGILLVWVFIWEGLRRLKVWRIRKWGVKRPLQMRSGDPLAEDDIVDDVTDRQNTEDNQQNQSQHDRQADTVSARAPEPNHIILNIYIESKSTGFLAYALFSLLKRSGLIFNDELQVFEAKNEQGEVDFYITSAVAPGVFDIKNAMVSIPAVSVFARPDLQTNPRMSFFKLLESTHTIASELDGRVLNMRREILSEASVSADYLSVVNTYAVAESTAAALSASNSTSIVVDESMQDDNHVYQENESHVIADTRVDADSNKDQHVAG >NZ_CP013796.1|WP_036773465.1|2822605_2824645_-|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA MSPAKLKRELVSDARVDELVKQLNLYSEAYYSEDDPLVPDSEYDRLFNELQQLEADYPELKQVDSPTLRVGGTILAEFTEVQHQSPMLSLSNGFNDQDIYDFIKRLKVDEDACFFCEPKLDGLAISLHYQRGRLVLAATRGDGTTGEDVTENVKTIRSIPLRLHSNNPPEFLEVRGEVFMMKSGFNKLNDQLRETNQKTFANPRNAAAGSLRQLNSKVAASRPLSFYAYSLTHMVGIELAQSHHERLALLASWGIPVNGDARCAAGTKGCLVFYQSILKVRDQLNYDIDGVVYKLDDIAAQEKLGFTARAPRWALAHKLPAEEEITIVKAIEFQVGRTGALTPVARLEPVHVGGVVVSNATLHNMDEVERKDVRIGDSVIVRRAGDVIPEIVKTIIENDTQSKAHAARPKLVMPDKCPVCDSAVERLAGEAVSRCMGGWRCKAQRKEALKHFISRKALNVDGLGEKLIEQLVDLELVQDAADLYQLTLEQLAGLERMAEKSANNVLEALEKSKVTTFGRLLYALGIRNVGQATAQVLAQRFGNLAALLAANTEELHAVDDVGPVTSQFILQFFSQQENQQLIERLQALGVCWPEQDKPLLAVRALQGEVIVLTGTLHGFSRDEVKEKLEQLGAKVTSSVSKKTTLLIAGENAGSKLDKAQALGVPVKNENDLKVLLGSN >NZ_CP013796.1|WP_027243145.1|2821534_2822590_-|protease-SohB MITQLLADYGLFLIKTATLVAAILIVFSGLLALAMKNRLAKQKGSLEVEKLNDHYDDLKETIEIEVLDKKELKALEKERRKEEKQERKDKKKNKSKETETDDEDAASAARIFVLDFDGDIEASAVHALREEVDALLTFINEKDEVVVRLESPGGMVSPYGLAASQLARFRSKGVKLTIAVDQVAASGGYLMACVADRVIAAPFAVLGSIGVVFQMPNFHRVLKKHDVEYEQLTAGDYKRTLTMFGKNTKEGREKLQEELEDIHYLFKNFVGEYRPQLDIDKVATGEHWFGQRALELNLVDELITSDDYLLSRADEHDIYSVNYMEKQTLADRLGIMARALLGKLATAGVKR >NZ_CP013796.1|WP_017377998.1|2820993_2821524_-|hypothetical-protein MQRKAIVLLSGGGYSSLCLYLARSQGYLPYALSLDIPKRHFQLDSAQQFARDVGVAEHQVIAMNENSLSDSKALTYYSSLLSFAVNWAQELSAQDIFIGLHPSAEHTLEYMVEWLQSYQELINLSSTTAIRIQTPLLFMSDKKREQTAEQFNLKLPEPVSKLKSKKKKFIQRIFSE >NZ_CP013796.1|WP_048875965.1|2817915_2818836_+|hypothetical-protein MLSTPWLAALDFDGCLYNVNIDNVRRAFHSPGKPKEELTLAHLITINQKLIDHLNNQAEKFSSSTVFLGSDRQDYKKERDNSAGPNREGQYCYPLISDFAKKIGAEFDPLLMADIYNNLPLGESFRQALQDYHTPEKHDQDPHTQPDSSKLTLLYAQMHKAATENPDDIVTYEFYDDRKDILLSLQEIFESDPHMIPKNITLYLNHYDGVNLQNLLIIQGQGNPDSQYQHTLKNPAYRKASANPAEAQTDYSISELIKEKFPKISKSFLEIKQKLQQLNLPKLKKSLIREATSVSVATSVGILHIQ >NZ_CP013796.1|WP_144420649.1|2817630_2817771_+|phosphatase MTKKRFISRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP013796.1|WP_017378009.1|2836193_2837939_+|hypothetical-protein MPITKQTKATTIQISIRALLSSTMEPCGQTIISSIDSSHQEIIRWLEFVKELPQIKESGGGVSFILESNTPLPEGFQQDLKDQCERLIANSKIFFNISSIAAKHHAAEKNSIEISEEIYEEIDSKHYATSPRQSVTEHSLSNHTDDDKDSSTHAHPIANTTQNNDFPPPPPNAADSSATASNLPFEQIQTQPASETVKNLGGSITYDQLLNLLKQEIQKAVAIIDKKIKNAKLPFSISTPFEDTKGRKKSILVLEEFIKDILTYPDQGNPDQPLTQELGMLVHTRLKDFYEDDGKMKGRRKTKTISMLFSEIKLMFQNITYANTAVSDDNGSPFPPPPPPLLEQDLLSLELTQFNDSELPLPPPPPPSPILLEDQQQLELNAAQPDLSADSHKAHMAVLGAKLRERQLSLGNETQSNSNSQPAPPPLPPKPVFSVGDLAPPNSGNTKPPLPPKPPLVVDDLTSSESTHAQCASDLTADKTVTFLEEIQQRKQQGLRSIKHSHPLQGPAPLDLNAQILKRRQNMQQTGTSDGKPINLAAALLFQCSQMNTQHSQSNNSNATNDNNDNWSDDWSDSASSPPSP >NZ_CP013796.1|WP_144420648.1|2838341_2839814_+|hypothetical-protein MPTTMIKVIKENEGAIVTKGQETILLTGSIYDGSNLGKSPAIIALSELGSGLFCAKATLQSENSCLSWLQELKETLGNEITFHLTGKQSKEDLAELQILCQQAEIEAQFPIPEKQPLLYSLATGVNANGIIEKEDLYEKTGGFSFSLTLTKEIEQAISELEKKIKDSWFTINTKGRTDSIILLKELKQNLEQLGESYIGPVNSESDLKFPKSLKEAIKDYSGSEAKNGRQQTTTVGGLLKTLDFHFTRYTVLTTKFTQVPVLTATWHTSEPSADTDSASATPMPDINESKSTPPPPPPAELKAGAKARREEEAAVTVLTNAMEFADDNAEDLPPPPPPSNPDLQQPLPDFNDSDFPPPPPPPPPSDEEQMPLADFDDIELPPPPPMDFETGPETQVSPIEEVNSGATPTDGTGPDTTEKKDSANITAEMQSIMARRGAIGGPDSETEAGEDDSWSDQEDNSGPNQSPSTLFQRQQSQSQEADNSNPLQYN >NZ_CP013796.1|WP_053093668.1|2839996_2840596_+|hypothetical-protein MRIITKPTTAKCNIQAYIRYLLSEPVRTSCTGLSDVLLNISHDSVNRFLLRENYRPEDLWTEVSEKIDLNNGVLSVDDMVIDKPYSNAEKTDLIGFFYSGKHHCVVKGVNVITLYYTDQHDVSVPINFRIIDPDEGKTKNEHFREMLQQVLSWGLQPSWVTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP013796.1|WP_144420647.1|2840733_2840931_-|hypothetical-protein MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVSEDIIRLFSIANSMPRLYFLINFRFSMLEYQQSPAASHGVLSTG >NZ_CP013796.1|WP_155046604.1|2841131_2841272_+|hypothetical-protein MLSTPWLAAGAVAVRFKQSIVGMKVVYKSNGTTLRARSEQKRTLAQ >NZ_CP013796.1|WP_048875964.1|2841339_2842119_+|hypothetical-protein MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSHVSVATSVGILHIQ >NZ_CP013796.1|WP_017376708.1|2842683_2843085_+|transposase MGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKERKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP013796.1|WP_036773793.1|2843229_2843607_+|hypothetical-protein MLSTPWLAAIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP >NZ_CP013796.1|WP_027242834.1|2844066_2845374_-|hypothetical-protein MKFIYPGINAPLDTEKSLYAETTQGYFSHKESGKALDFNFIKKQESYFSQWDKRTAFTCEEYKALTHQQRLQLYRLHTTRWNYTLSLLLKDPGAGPDSPLYAEKQFLQNLNENEEMRKLYAGWFIDYVESREGETSKAVEALFKKEMQLKPECDLSKEKQIAVKVRGFRDEITELQAWLMNGSSAERIAIEKYDTKAVNQFIKYQLGQVSKSEFNKTFERAQSKCNKVLKNALHLTTSAASILTEKKIDLNSSVEWERLKNSQHLQKAVLILHKSNINLADSWDTLKDNSHLQKAVLTLHHESSINLTEHWDKVKNNSPLQKALAASYDYLNAERSSWSKMHHNHGIRQTHKFIRHLMASENQTLSGIQAEMQQWLHGYGHFSRASGSASNSRMSFALQSGLCPQADTPPTLLFNTSLQATEVEQEVTNQVTLSS >NZ_CP013796.1|WP_155048058.1|2845922_2846105_+|hypothetical-protein MLSTPWLAAAVSFLLIVKGAIIVFDRTYALTAGINFDFSSASMPFIIKSLTTPINKSFLS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
37745 : 69420
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013796|37745:69420|DBSCAN-SWA 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28 | Staphylococcus_phage(50.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
81102 : 130168
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013796|81102:130168|DBSCAN-SWA 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54 | Bacillus_phage(35.71%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
140054 : 189159
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP013796|140054:189159|DBSCAN-SWA 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50 | Staphylococcus_phage(21.43%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
209182 : 257675
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP013796|209182:257675|DBSCAN-SWA 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43 | Staphylococcus_phage(45.45%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
322679 : 375718
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP013796|322679:375718|DBSCAN-SWA 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46 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
390281 : 444542
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP013796|390281:444542|DBSCAN-SWA 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51 | Staphylococcus_phage(37.5%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
452127 : 519070
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP013796|452127:519070|DBSCAN-SWA 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55 | Bodo_saltans_virus(14.29%) | tRNA,tail,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
629268 : 744782
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP013796|629268:744782|DBSCAN-SWA 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106 | Escherichia_phage(19.05%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
779678 : 838960
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP013796|779678:838960|DBSCAN-SWA 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53 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
871068 : 990215
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP013796|871068:990215|DBSCAN-SWA 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104 | Staphylococcus_phage(11.76%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1064009 : 1106368
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP013796|1064009:1106368|DBSCAN-SWA 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54 | Chrysochromulina_ericina_virus(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1115791 : 1170702
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP013796|1115791:1170702|DBSCAN-SWA 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60 | uncultured_Caudovirales_phage(20.0%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1244989 : 1291956
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP013796|1244989:1291956|DBSCAN-SWA 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44 | Streptococcus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1331462 : 1465129
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >NZ_CP013796|1331462:1465129|DBSCAN-SWA 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109 | Staphylococcus_phage(13.64%) | tRNA,plate,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1473771 : 1520070
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >NZ_CP013796|1473771:1520070|DBSCAN-SWA 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50 | Staphylococcus_phage(21.43%) | plate,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1528230 : 1582539
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >NZ_CP013796|1528230:1582539|DBSCAN-SWA 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50 | Prochlorococcus_phage(37.5%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1626219 : 1688954
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >NZ_CP013796|1626219:1688954|DBSCAN-SWA 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54 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
1692856 : 1759817
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >NZ_CP013796|1692856:1759817|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP013796|1692856:1759817|1736170_1736869_+|WP_017377001.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKILALETATEACSVALQIDNEVIVDHRIAPRQHTELVLPMIKEILAQVGIQAKELDAIAFGRGPGAFTGVRIACGLAQGLALGAGVPLISVSTLQILAQGIYRQYGSRKVLTAIDARMGEVYYAGFEIDQKQCAQELIVERVCVPDHIELPIDETRQWYGAGTGFASYSQVLNERLGYILINVVNDALPHAMDILPIASSLWVQGKIIALEDALPVYLRDNIAKKSTKCLF |
56 | Bacillus_phage(22.22%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
1765430 : 1827658
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >NZ_CP013796|1765430:1827658|DBSCAN-SWA 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57 | Staphylococcus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
1836357 : 1897163
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >NZ_CP013796|1836357:1897163|DBSCAN-SWA 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49 | Acinetobacter_phage(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA') |
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DBSCAN-SWA_21 |
1911757 : 1952862
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >NZ_CP013796|1911757:1952862|DBSCAN-SWA 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MQITDITQRLQDAGFSCRPSQQRMIQAIAASIHHRYILLCEGGTGIGKSFGYLLGALSQAQAKKHTLIIATATIQLMEQLANKDIPQVEKLLGLSLNIEIAKGRRRYICHHKFYALDDLLMLERLTPLHNALEKENWSGDRDSLNVKIDDDLWQKISTDRAGCLNHRCHFFKECAFFSARERQKSADIIITNHATLLADIWLGLGKILPEPEKSTYIIDEAHHLPEQSINSLAQELSLHSSKEYIQETKQLLLKCKPLFDDPPKSFFSAFDLSEQIIDRLTSLKKILQLNFKDRATGKEWVFLDDFPKSLAEEFNHLANLTRTCLTQVSLFSEYFESTHIDSLERKQQYQSRLEFIINILETMLTIWQHFPNKEDNQGARQARWITLKQNKEPDDYRFHLSLIDTSHKLAELFWQRAPEAITLCSATLKISGQFQHFARKIGLHLQNSHTVKSISCPSPFAYAQSQLIIPKLKSAPTHTNDQHLQEFQTFLKALLQEFSQGCLVLFTSQKSLENTFGMLPKGLQNKVTCQGDLPKQQLIKKFKHAIDQGKPHALFGLQSLAEGLDLPGHYCKTLIIQKIPFAMPNTPQAQTREHALKLQNKNVFIEHTLPEAHLRLIQWTGRLIRTESDQGKLVLFDDRIIYKAYGKKLLASLPAFEVHHPASWQETVELVI >NZ_CP013796|1911757:1952862|1918602_1919241_-|WP_048876036.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTIVGRDHQSYLLTLVDKANNVSVATSVGILHIQ >NZ_CP013796|1911757:1952862|1911757_1912477_-|WP_053093677.1|transposase|DBSCAN-SWA MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMVKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRAFKGLAKKSKSTMGWYYGFKLHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYEKGLQLITKIRKNMKNKLVLMIDKILLKKRGIIA >NZ_CP013796|1911757:1952862|1919538_1920534_-|WP_036771312.1|DBSCAN-SWA MKKNHHFKKIMSHLVITLSLTTAASYAAIYNPTNSNLSVAYGPCHSGNEKELKKLHQHFNVFRLYKFDQTSLEFAKKHSMQVLLGTTNSLAKSFATSNQNHVTNISDYLQKISNYLSSATVKVIILGNEPLNQPLFANPTGGPDMQSAINNLYSALKKQGYNLPVTINVADDTYWGGAFDPRLNNNILPAINQQTHPIFYVDLYPFFANNNTDAYRLNANKLLNDMYMGGTSNTGWVPAMQNKFPNISVLIAETGWASAGGNPPSGAVASQANESTYINSVATWAKNNHYPTTLFMMYDRPSCKGSNWEGHFGLMKDASTPKQHVTIPSGK >NZ_CP013796|1911757:1952862|1926142_1926370_+|WP_017377787.1|transposase|DBSCAN-SWA MSSVGACVDNAVVERFFGSLKHEWLLNVIHLTRDTMKEDVEAYIRYYNHDRLHTANGNLSPINFEKSQLKVSNMT |
41 | Staphylococcus_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_22 |
1964686 : 2025334
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >NZ_CP013796|1964686:2025334|DBSCAN-SWA 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55 | Staphylococcus_phage(40.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_23 |
2030745 : 2097143
Sequences of DBSCAN-SWA_23
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23 >NZ_CP013796|2030745:2097143|DBSCAN-SWA 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55 | Staphylococcus_phage(20.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_24 |
2128359 : 2176969
Sequences of DBSCAN-SWA_24
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24 >NZ_CP013796|2128359:2176969|DBSCAN-SWA 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38 | Bacillus_thuringiensis_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_25 |
2181266 : 2367891
Sequences of DBSCAN-SWA_25
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25 >NZ_CP013796|2181266:2367891|DBSCAN-SWA 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168 | Staphylococcus_phage(19.51%) | tRNA,protease,integrase,transposase | attL 2288694:2288753|attR 2316158:2317152 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_26 |
2426220 : 2516531
Sequences of DBSCAN-SWA_26
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26 >NZ_CP013796|2426220:2516531|DBSCAN-SWA 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85 | Burkholderia_phage(14.29%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_27 |
2527230 : 2577715
Sequences of DBSCAN-SWA_27
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27 >NZ_CP013796|2527230:2577715|DBSCAN-SWA 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46 | Vibrio_phage(14.29%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_28 |
2637917 : 2646760
Sequences of DBSCAN-SWA_28
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28 >NZ_CP013796|2637917:2646760|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_28 >NZ_CP013796|2637917:2646760|2641255_2642017_+|WP_144420658.1|transposase|DBSCAN-SWA MYNLIRLLTSSDYCAKVRFCSDLALKVVPLAYKLQEEGFQVGRYRARSLMQKLGLKVLQRKAYKVTTKRKHHHAVADNVLNQQFNPVIANHSWAGDITYLRTAEGWLYLAVVIDLYSRKVIGWAMNKRMSENLVCRAMDMAIHLRQPTEHLLFHSDRGSQYTSKKYRKLLKKHKITASMSSVGACVDNAVVERFFGSLKHEWLLNVIHLTRDTMKEDVEAYIRYYNHDRLHTANGNLSPINFEKSQLKVSNMT >NZ_CP013796|2637917:2646760|2641993_2642983_-|WP_075275303.1|transposase|DBSCAN-SWA MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFRSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKLFWSSHIGHF >NZ_CP013796|2637917:2646760|2645356_2646760_-|WP_048876031.1|transposase|DBSCAN-SWA MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFRSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP >NZ_CP013796|2637917:2646760|2644913_2645360_+|WP_047927801.1|DBSCAN-SWA MNNFFTYLNNPIIIGAIGLGIFYLCFQIVRRLYSLLKRFKPKNSKFQLSFNIKRNPYKKIIKQFKSKLPFIIRLSLARRQKYLYLNTANDSLIQELTDYKRYSYHFYDEYKQQPEMGVYLTSKYFITEVKNEPLHNHSKENNRLMALP >NZ_CP013796|2637917:2646760|2637917_2638139_+|WP_017378288.1|transposase|DBSCAN-SWA MKDKKQYKRYSTAFKEEAVALVTEQGYSAQQAADAVGVRTNMIYRWKDQHDKEANSTLTPDENALRHLKCNTQ >NZ_CP013796|2637917:2646760|2639531_2640167_-|WP_048875973.1|transposase|DBSCAN-SWA MGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP >NZ_CP013796|2637917:2646760|2644012_2644672_+|WP_027242792.1|DBSCAN-SWA MNFMMYWHPIADIIQKTEELKHSNQLSKEQYMESLVCSRHAIRKTSKKLKEYLDSKFNSRISYLIHFPILAYFDEAVNSANQYKDVQWPLLQQEFYNTTNGGEDFFIALDDALQQNCTPAVYEIFFFLLKSGFKGQLIDDEIKRDDYIKQLEVNLKEQDNYQDTTTKELIDLSSIKASEEIITKMIKHNPLRHIKQYLFFYTGSLILFIYFVYLSILSF >NZ_CP013796|2637917:2646760|2639370_2639535_+|WP_155046582.1|DBSCAN-SWA MKVSRSAFYAWDKRPAKVISIEELQLYRRCKELFKESRGSLGSRMMAYKLMALP >NZ_CP013796|2637917:2646760|2643118_2643994_+|WP_017378290.1|DBSCAN-SWA MNFPELSNFINIYFNQLPTFEIDRIKINIKLNQQNKNNISSTLSQEFYINTIPFTNTSSEHALPIDVQGFRETYPIIHPNIQGKFQLSAIKKAYYKEHGKTIDLLPKHLTADNLPSYELIQQFTGEGYSELRFHFYENLIQPRTVFIDADWFQLDHFRISDLKLSFYNRSEDYFKIKPVSSQPTILSNERLKVTELIELANIKNHRIIKYDDLKLIISSLVPKHSIFHKAIQHIENISVINNNNFYNYSIETFSLIPEQKVVLQILLSHIQCLLQQLLPVGSQIKLSLKSN >NZ_CP013796|2637917:2646760|2638197_2639172_+|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP013796|2637917:2646760|2644701_2644908_+|WP_017378292.1|DBSCAN-SWA MDSKNFNGISEQFKELSKLSQLNCHSLTTDLRLILLQLERRINEKNITLTEAYTLINQAEYIIEASLR >NZ_CP013796|2637917:2646760|2640443_2641223_-|WP_144420659.1|transposase|DBSCAN-SWA MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEESLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFRSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSHVSVATSVGILHIQ |
12 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_29 |
2651829 : 2728870
Sequences of DBSCAN-SWA_29
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29 >NZ_CP013796|2651829:2728870|DBSCAN-SWA 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60 | uncultured_Mediterranean_phage(29.41%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_30 |
2733301 : 2782166
Sequences of DBSCAN-SWA_30
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30 >NZ_CP013796|2733301:2782166|DBSCAN-SWA 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45 | Staphylococcus_phage(25.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_31 |
2801865 : 2867678
Sequences of DBSCAN-SWA_31
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31 >NZ_CP013796|2801865:2867678|DBSCAN-SWA 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|
59 | Burkholderia_virus(10.0%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_32 |
2876786 : 2925807
Sequences of DBSCAN-SWA_32
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_32 >NZ_CP013796|2876786:2925807|DBSCAN-SWA 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52 | unidentified_phage(15.38%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_33 |
2944868 : 2993091
Sequences of DBSCAN-SWA_33
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_33 >NZ_CP013796|2944868:2993091|DBSCAN-SWA 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41 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_34 |
3005968 : 3066936
Sequences of DBSCAN-SWA_34
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_34 >NZ_CP013796|3005968:3066936|DBSCAN-SWA 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47 | Staphylococcus_phage(30.0%) | integrase,transposase | attL 3013821:3013880|attR 3064242:3065002 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_35 |
3087777 : 3115430
Sequences of DBSCAN-SWA_35
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_35 >NZ_CP013796|3087777:3115430|DBSCAN-SWA 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28 | Staphylococcus_phage(25.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
0 : 52923
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013798|0:52923|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013798|0:52923|38097_38352_+|WP_144420829.1|DBSCAN-SWA MITTGEFMLISYNGHEIDFNQAHSISVEGDEIIFHNDKKRDHVLKLGSEYTEVAEDVTEYIAGCYQKGFKKLNLTAYLASSPIL >NZ_CP013798|0:52923|27973_28180_+|WP_027242547.1|DBSCAN-SWA MKTAMLYAFEQAVHCKKRSVYQKDDDPVLSLNISELHKNLKDVVKLLDRGVFIELQKHNRKIGMIVPY >NZ_CP013798|0:52923|17081_18056_+|WP_069971648.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEVISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHILNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP013798|0:52923|50092_50365_-|WP_016211910.1|DBSCAN-SWA MSKLNLLTWSDDAWDDYLYWQDTDKKVLKKINKLIKECQRTPTEGIGHPEPLKHDFSGYWSRKIKGEHRLVYSFDATSLMIAACRYHYDQ >NZ_CP013798|0:52923|14546_15212_+|WP_036773372.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP013798|0:52923|49494_49767_+|WP_027242602.1|DBSCAN-SWA MASRPLGRHFRPKRDLDNLPETYKVAEKSLKIAARLLDIPIVEITKAITGGKSEEFNTYGDLKKFMEKEQKHLRSQAVQETEMTSMTGPS >NZ_CP013798|0:52923|4867_5158_+|WP_036775000.1|DBSCAN-SWA MSRSYETFILSDEPKLFGIPIVSGLPCIALTIVGLLAGYTFQLFFIGAIASLLLHVKFGADGIRFFLSVIYWFLPSKFTRIFFWHSPNSAYRLYLK >NZ_CP013798|0:52923|1644_2283_-|WP_075286763.1|DBSCAN-SWA MVPQKRSITNMNTKLLLIDFDGTICAVHHSVIHCIFHTYQKFNLPRVPDDETIKIILGSGVVIESMFKKLLSHSDINYSDKDLSEMCQYYRKFYASSSINEIKLYKNFDHILKVIKNKHLTSIIISNKEQERLLSATKYLNINHLVDHIIGTDDTVKAKPHQDMFNRKVQPLCSNLDLDNILIVGDTNSDIQFAKNCGFKSCLQDMGTVTII >NZ_CP013798|0:52923|19511_20894_+|WP_027242553.1|DBSCAN-SWA 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MNKKLIILLVISILNVTYSNQTSEDYEKDQSIVQANESAVISTGTSLNPEESIPNYTSNPSETSYYQGVESYSSNLSEDAQTNLANDPAGNTVYQNFTTRPQIKVNTQSASIQGSKLIESDSYNLTHGISDQYVDCDKQAVNCTTTYDSKSCTTGHPYNLTCTSTLSIQMKEKTEYVEKTYSGNMENTGSNSNTYTLPEGGVIESISFQSNAGNGYYYNKNYTFYLNGTNIGTRSYPCSGTFQCMFPFNSSISITADNLGVYVSGSGVINVTFDGYSGGSRGTAPFTVVMKVQRTAKEPEEVWTTNCSSLPASCKETKQTCTEPEETRTIDGVDITKDCWQKQTDYQCGQPFSSSCQSLVDQGCEQISSACTSSSCDEYNDTYNCPVKQCATQMVCANDVFCIDGDCASQDPQTNENFGQDVSELAAAAGAAEDYSDGDQVSIFNGTPMDCSIDTLGFSDCCNDSGWGQNTGLAHCSDEEKKLGEAKEKYLASYIGEYCAHKEDITGICLSHKKVYCVFDSKMSRIVQDYGRPQLHLSYGSPEAPSCNGFSVDQIQQIDFDTIDFVDPIYMWPSGSNSQEAGLAADMSVDSALRHLKCNTQ >NZ_CP013798|0:52923|40724_41126_-|WP_027242582.1|DBSCAN-SWA MKLKPIHTEQDYEEALAEVDKLFDAKPGTAKGDKLEILVTLIEAYEAKEHPISDPSPVDYLVYLMESRGMSRQELGKYIGGKSRVSEILNGKRDLTLNMIRRLHFDLGISADLLISPVAINEVNNAMSCRKPR |
56 | Choristoneura_rosaceana_entomopoxvirus(12.5%) | integrase,transposase | attL 48860:48890|attR 53182:53212 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_2 |
57197 : 58903
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013798|57197:58903|DBSCAN-SWA TATGTCAAATAAAACAGCAAAAGTTATATCTACAGCAAATCAGAAGGGGGGCGTAGGTAAAACAAATTTAAACTTTAATCTTGGCTGTATATTAGCTGATTATGGTTATAAAATTCTTTTTATAGATAATGATGCTCAAGGAAATTTGACTGAATCAATATTAGGTAGTAAGTCAGGTTTAACAGAAAATACCATGGATTTATACCTAAATAAAAATGTTACGCCATTAAAAGTTAGCAGTAATATAGATTTAATAGGCACTGATTCTAGCTTATCAGAGATTCAAACTTCTGATTTTGAGATTGTATTTTCTATGGATCATAGTATTGGAGGTTTTAAAGAACAATATGATTTTATTTTTATAGACTGTGGTCCTGCTTTAGGACATTCACTTCTTGCTGCATTGATGGCTTCAAGTCATTTATTGGTGCCTGTTGAATTGGATGGTTATAGCGCTTCAGGTATGGAGGAATTATTAAATAATGTAAATATTATAAAGGGAAAGTCACGTTATAACCCAAAGCTTGAAGTGGCTGGAATTATTATAAATAAAAAGCCTTCACCTCCAACAAAATTATCTAAACAAATGGAAAGTATGATGAGGGAATTATATGGTGATTTAATCTTTAAACAAACAATATCAGTTTCAACATCAATGAAAGAATGTGCTATGCCGGGTATCGGCTTGCCAATTACTCAATATGTTTCTTTACATAAAAAAAGAGATAAAGCTGCGAACAAAGTAGTAAAAGAAGTGAGCAACGTTCTCCAAGAACTCATTTTCAGATTAGGGCTTGATAAAAAAAAGAGTATTCGGTCAAGAAAAAATAACAATTCTTGTACTAAAGGAGCTGTAGCATGAGTATAGCTGATTTCACAGTTGGAATTAGAAAAAATATAGGACCTGATAAAGATATAGGTAAGAGTAACGAATATATTTTTGTTGACCCAGTGTTATGCAAGAATTGGAAATATGCCGATAGACAAGCGTTTGAACTAGGTGAAATTGAAGATCTGGCTAGTGATATTAAAGAAAATGGGCAGCATCAACCTATTGTTGTTAGGCCAATCCAAGATAAAAAATACAAGTATGAAGTGATTGCAGGTGAAAGGCGGTGGAGAGCTTGCAGAAACATAAAGATCAAAGTCATAGCAATTTGTAGAGATTTAGATGATATTGCAGCATTTAAAGTGCAGTCTGCTGAAAATGAGAAACATAGTTTATCCGATTACTCTAAAGCTATGCATTACTCAAAAGTTATTGATAATGGAGTGATTTCACAGAATGAGTTAGCAAAATCACTAGGAGTCCATAAATCAACATTAAGCTATTTAATGGCTTTTTCAAAAGTTGATGCTAAAGTATGGGATTCTATTGGTGATATGAGTAATGTTTCAGGTAGAACTGCTGGGGCAATAAGAGCCTTATGTTCTAAGGGAAAAGAATATCAAGATGCAGTAATTCTATTGGCCGAAAAAATCAAAGAAGGACTTGGTGCAAATGCTCTTCAAAAGTATGTTGAAAATTTAGTATCTCCTAAAAAAATTAAACCTAAAAAAATAGTCATTAAGTCCAAAAAAGGTAAAGAGCTATTCACTATATCAGATAAAAATGAAATTAAAATAAGCTCAAAAGTATTGAAAAATAGTGATGTAGATAATATAAAAAAGGAATTGAAAATCTTATTGGAAAAGATGGTAGGTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP013798|57197:58903|58054_58903_+|WP_036774869.1|DBSCAN-SWA MSIADFTVGIRKNIGPDKDIGKSNEYIFVDPVLCKNWKYADRQAFELGEIEDLASDIKENGQHQPIVVRPIQDKKYKYEVIAGERRWRACRNIKIKVIAICRDLDDIAAFKVQSAENEKHSLSDYSKAMHYSKVIDNGVISQNELAKSLGVHKSTLSYLMAFSKVDAKVWDSIGDMSNVSGRTAGAIRALCSKGKEYQDAVILLAEKIKEGLGANALQKYVENLVSPKKIKPKKIVIKSKKGKELFTISDKNEIKISSKVLKNSDVDNIKKELKILLEKMVG >NZ_CP013798|57197:58903|57197_58058_+|WP_047927060.1|DBSCAN-SWA MSNKTAKVISTANQKGGVGKTNLNFNLGCILADYGYKILFIDNDAQGNLTESILGSKSGLTENTMDLYLNKNVTPLKVSSNIDLIGTDSSLSEIQTSDFEIVFSMDHSIGGFKEQYDFIFIDCGPALGHSLLAALMASSHLLVPVELDGYSASGMEELLNNVNIIKGKSRYNPKLEVAGIIINKKPSPPTKLSKQMESMMRELYGDLIFKQTISVSTSMKECAMPGIGLPITQYVSLHKKRDKAANKVVKEVSNVLQELIFRLGLDKKKSIRSRKNNNSCTKGAVA |
2 | Brevibacillus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
211 : 16225
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013799|211:16225|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP013799|211:16225|14780_15137_-|WP_075278739.1|transposase|DBSCAN-SWA MHLRGYGWITVFRFVAKNGRMDYIGTNIEEPSRDQVEVIVKARWSIEVYHRELKQTCGIERCQARTGRAQRNHISLSIAAWVDKYKRKLNEKISLYQQDGDVIKVGISCSIQKILAAT >NZ_CP013799|211:16225|211_517_-|WP_075286767.1|DBSCAN-SWA MDLLGEGEIEGLVNGAQSVYFDDTPLQNADGSYNFEGVTLKSNNGTPSQDYLPGFAESASEEAFNVKVIHEQPVIRTVGRQETNELRVKIGLDALTEYANT >NZ_CP013799|211:16225|15250_16225_+|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP013799|211:16225|4482_5064_+|WP_027242946.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP013799|211:16225|1523_2039_+|WP_027242945.1|DBSCAN-SWA MFKTLKRSVLVCVIPVLSSSLLITSAYATCYVDYKNSSENTWNITLKNLEGDTAHIYCPNKTLGYKESCTFPVNPGDSVSVGFSHTAGMIKAYISFSSTINGHSESLNDLLVEAIDDHCPEIYYNDSVPYGITLNKPSIGNVIFAPYSENESTLNKFSKINFEADTNKKFS >NZ_CP013799|211:16225|6582_6768_-|WP_027242948.1|DBSCAN-SWA MIKSDPVKTALTYCDNVLSGRVIACDYVKKACQRHLNDLKYARDRGFYFDKEAACKAPSVI >NZ_CP013799|211:16225|13287_13641_-|WP_016211078.1|DBSCAN-SWA MLKYKGYIGKVEEIHEGDEYIYGIVPNIKDVISFRGKNIKELTKDFKLAIDDYLALCDEREEEPDKPFSGRFMTRLGSDLHEEVFLASMNDSGAKSMNDWVVSACLEKLKHDQTVKR >NZ_CP013799|211:16225|9427_10402_-|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP013799|211:16225|5588_6563_+|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP013799|211:16225|14124_14715_+|WP_016212329.1|integrase|DBSCAN-SWA MGLNKQAKILSERQEKTVLSSLQSTTYPTRNTAMFLLSIKAGLRAKEIAALTWEMLLTPESELCEAIHLRNTASKGKQGGRVIPLNKQLKQVLSQLLDESKPKHGQRPVILSRRNSHFPAQTVVNWFAELYKNLGFEGCSSHSGRRTFVTRAAKNIIKAGGSLRDVQQLAGHTTLQTTQRYIEGDSEAKKRIVDLI >NZ_CP013799|211:16225|10839_11094_-|WP_027242953.1|DBSCAN-SWA MNNKHKKTLREIYTDPIKVNIVWSDVEKMLIAAGATIEERSGSAIAIFLGDEYLGIHRPHPERTAQRYVVKKVRELLKRNGIHA >NZ_CP013799|211:16225|12136_13111_-|WP_069971681.1|transposase|DBSCAN-SWA MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFRQISEEAKMLIHQRLKTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEVISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHILNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA >NZ_CP013799|211:16225|5099_5492_-|WP_075275490.1|capsid|DBSCAN-SWA MLDLRSSVKAAYRRKASYLMHDSTYGSLLKMKDGNGQYIIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAATGEVGYLMWLRVDALLLETDAIKQLKTAAA >NZ_CP013799|211:16225|2838_3054_-|WP_144420855.1|head,tail|DBSCAN-SWA MTEGESHLRIDDNNEDEYLEFILAAALQAAEDYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP >NZ_CP013799|211:16225|7339_7723_-|WP_027242950.1|DBSCAN-SWA MPRRAKQICCYAGCHNTTYARYCEYHEQHGNRYHAPRKTTAQRGYGGRWQRERKIFLQDHPLCKQCLKDDKLIPAIEVDHIKPHDGDYELMWNQHNWQALCKPCHSRKTVNEDGGFGRKKSPQGRGV >NZ_CP013799|211:16225|7935_8802_-|WP_027242951.1|DBSCAN-SWA 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21 | unidentified_phage(38.46%) | integrase,head,tail,transposase,terminase,capsid | attL 9079:9138|attR 25457:25745 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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