CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP013811	Piscirickettsia salmonis strain AY3864B, complete genome	2 crisprs	DEDDh,cas3,DinG,csa3	0	0	31	0
NZ_CP013814	Piscirickettsia salmonis strain AY3864B plasmid p3PS11, complete sequence	1 crisprs	NA	0	2	2	0
NZ_CP013812	Piscirickettsia salmonis strain AY3864B plasmid p1PS11, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	2	0
NZ_CP013813	Piscirickettsia salmonis strain AY3864B plasmid p2PS11, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP013815	Piscirickettsia salmonis strain AY3864B plasmid p4PS11, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	4	0

1. NZ_CP013811

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP013811_1

• CRISPR_ID: NZ_CP013811_1
• CRISPR_location: 544569-544664
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP013811_1

Consensus_repeat	Method
CAGAGTGTCCTGAAGCCCCTTGAG	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP013811_1

>1.1|544593|48|NZ_CP013811|CRISPRCasFinder
ATTGGGATTGAAAACCACCTACAGTACCAAAAATTTCTTCTTCTTGTC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013811_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP013811_1

>merge|NZ_CP013811|1|544569-544664|CRISPRCasFinder
CAGAGTGTCCTGAAGCCCCTTGAGATTGGGATTGAAAACCACCTACAGTACCAAAAATTTCTTCTTCTTGTCCAGAGTGCCCTGAAGCCCCTTGAG

>NZ_CP013811|1|1|544569-544664|CRISPRCasFinder
CAGAGTGTCCTGAAGCCCCTTGAG	ATTGGGATTGAAAACCACCTACAGTACCAAAAATTTCTTCTTCTTGTC
CAGAGTGCCCTGAAGCCCCTTGAG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP013811.1|WP_144420647.1|539171_539369_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013811.1|WP_017378007.1|545722_547666_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226654
NZ_CP013811.1|WP_155046604.1|538830_538971_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013811.1|WP_048875965.1|561267_562188_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013811.1|WP_048875961.1|547811_549215_-|IS4-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|376573
NZ_CP013811.1|WP_017378006.1|549334_549964_-|response-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|381113
NZ_CP013811.1|WP_036773465.1|555458_557498_+|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA	unknown	unknown	gnl|CDD|236137
NZ_CP013811.1|WP_027243145.1|557513_558569_+|protease-SohB	unknown	unknown	gnl|CDD|236978
NZ_CP013811.1|WP_027242834.1|534728_536036_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013811.1|WP_017378009.1|542163_543909_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223021
NZ_CP013811.1|WP_053093668.1|539506_540106_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379252
NZ_CP013811.1|WP_048875964.1|537983_538763_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|376573
NZ_CP013811.1|WP_017378003.1|554641_555472_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|367907
NZ_CP013811.1|WP_017377998.1|558579_559110_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|284031
NZ_CP013811.1|WP_017376708.1|537017_537419_-|transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|376573
NZ_CP013811.1|WP_017378004.1|551035_554575_+|chromosome-segregation-protein-SMC	unknown	unknown	gnl|CDD|274008
NZ_CP013811.1|WP_036773793.1|536495_536873_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013811.1|WP_144420648.1|540288_541761_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223021
NZ_CP013811.1|WP_155048058.1|533997_534180_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013811.1|WP_017378005.1|550202_550922_-|sulfate-transporter-CysZ	unknown	unknown	gnl|CDD|179898

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP013811.1|WP_017378007.1|545722_547666_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|226654	COG4191, COG4191, Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system [Signal transduction mechanisms].	6.24409e-47
NZ_CP013811.1|WP_017378006.1|549334_549964_-|response-regulator	gnl|CDD|381113	cd17569, REC_HupR-like, phosphoacceptor receiver (REC) domain of hydrogen uptake protein regulator (HupR) and similar domains. This family is composed of mostly uncharacterized response regulators with similarity to the REC domains of response regulator components of two-component systems that regulates hydrogenase activity, including HupR and HoxA. HupR is part of the HupT/HupR system that controls the synthesis of the membrane-bound [NiFe]hydrogenase, HupSL, of the photosynthetic bacterium Rhodobacter capsulatus. It contains an N-terminal REC domain, a central sigma-54 interaction domain that lacks ATPase activity, and a C-terminal DNA-binding domain. Members of this family contain a REC domain and various output domains including the cyclase homology domain (CHD) and the c-di-GMP phosphodiesterase domains, HD-GYP and EAL. REC domains function as phosphorylation-mediated switches within response regulators, but some also transfer phosphoryl groups in multistep phosphorelays.	1.63665e-55
NZ_CP013811.1|WP_036773465.1|555458_557498_+|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA	gnl|CDD|236137	PRK07956, ligA, NAD-dependent DNA ligase LigA; Validated.	0
NZ_CP013811.1|WP_027243145.1|557513_558569_+|protease-SohB	gnl|CDD|236978	PRK11778, PRK11778, putative inner membrane peptidase; Provisional.	0
NZ_CP013811.1|WP_017378009.1|542163_543909_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|223021	PHA03247, PHA03247, large tegument protein UL36; Provisional.	0.000214736
NZ_CP013811.1|WP_053093668.1|539506_540106_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|379252	pfam13546, DDE_5, DDE superfamily endonuclease. This family of proteins are related to pfam00665 and are probably endonucleases of the DDE superfamily. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	0.000376208
NZ_CP013811.1|WP_048875964.1|537983_538763_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|376573	pfam01609, DDE_Tnp_1, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction. This family contains transposases for IS4, IS421, IS5377, IS427, IS402, IS1355, IS5, which was original isolated in bacteriophage lambda.	0.00345182
NZ_CP013811.1|WP_017378003.1|554641_555472_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|367907	pfam04354, ZipA_C, ZipA, C-terminal FtsZ-binding domain. This family represents the ZipA C-terminal domain. ZipA is involved in septum formation in bacterial cell division. Its C-terminal domain binds FtsZ, a major component of the bacterial septal ring. The structure of this domain is an alpha-beta fold with three alpha helices and a beta sheet of six antiparallel beta strands. The major loops protruding from the beta sheet surface are thought to form a binding site for FtsZ.	1.17377e-13
NZ_CP013811.1|WP_017377998.1|558579_559110_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|284031	pfam06508, QueC, Queuosine biosynthesis protein QueC. This family of proteins participate in the biosynthesis of 7-carboxy-7-deazaguanine. They catalyze the conversion of 7-deaza-7-carboxyguanine to preQ0.	1.95217e-24
NZ_CP013811.1|WP_017376708.1|537017_537419_-|transposase	gnl|CDD|376573	pfam01609, DDE_Tnp_1, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction. This family contains transposases for IS4, IS421, IS5377, IS427, IS402, IS1355, IS5, which was original isolated in bacteriophage lambda.	0.00109659
NZ_CP013811.1|WP_017378005.1|550202_550922_-|sulfate-transporter-CysZ	gnl|CDD|179898	PRK04949, PRK04949, putative sulfate transport protein CysZ; Validated.	2.22151e-69
NZ_CP013811.1|WP_144420648.1|540288_541761_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|223021	PHA03247, PHA03247, large tegument protein UL36; Provisional.	9.17808e-06
NZ_CP013811.1|WP_048875961.1|547811_549215_-|IS4-family-transposase	gnl|CDD|376573	pfam01609, DDE_Tnp_1, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contain three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction. This family contains transposases for IS4, IS421, IS5377, IS427, IS402, IS1355, IS5, which was original isolated in bacteriophage lambda.	1.76184e-13
NZ_CP013811.1|WP_017378004.1|551035_554575_+|chromosome-segregation-protein-SMC	gnl|CDD|274008	TIGR02168, Chromosome_partition_protein_Smc, chromosome segregation protein SMC, common bacterial type. SMC (structural maintenance of chromosomes) proteins bind DNA and act in organizing and segregating chromosomes for partition. SMC proteins are found in bacteria, archaea, and eukaryotes. This family represents the SMC protein of most bacteria. The smc gene is often associated with scpB (TIGR00281) and scpA genes, where scp stands for segregation and condensation protein. SMC was shown (in Caulobacter crescentus) to be induced early in S phase but present and bound to DNA throughout the cell cycle. [Cellular processes, Cell division, DNA metabolism, Chromosome-associated proteins].	0

Protein sequences

>NZ_CP013811.1|WP_017378009.1|542163_543909_-|hypothetical-protein
MPITKQTKATTIQISIRALLSSTMEPCGQTIISSIDSSHQEIIRWLEFVKELPQIKESGGGVSFILESNTPLPEGFQQDLKDQCERLIANSKIFFNISSIAAKHHAAEKNSIEISEEIYEEIDSKHYATSPRQSVTEHSLSNHTDDDKDSSTHAHPIANTTQNNDFPPPPPNAADSSATASNLPFEQIQTQPASETVKNLGGSITYDQLLNLLKQEIQKAVAIIDKKIKNAKLPFSISTPFEDTKGRKKSILVLEEFIKDILTYPDQGNPDQPLTQELGMLVHTRLKDFYEDDGKMKGRRKTKTISMLFSEIKLMFQNITYANTAVSDDNGSPFPPPPPPLLEQDLLSLELTQFNDSELPLPPPPPPSPILLEDQQQLELNAAQPDLSADSHKAHMAVLGAKLRERQLSLGNETQSNSNSQPAPPPLPPKPVFSVGDLAPPNSGNTKPPLPPKPPLVVDDLTSSESTHAQCASDLTADKTVTFLEEIQQRKQQGLRSIKHSHPLQGPAPLDLNAQILKRRQNMQQTGTSDGKPINLAAALLFQCSQMNTQHSQSNNSNATNDNNDNWSDDWSDSASSPPSP
>NZ_CP013811.1|WP_144420648.1|540288_541761_-|hypothetical-protein
MPTTMIKVIKENEGAIVTKGQETILLTGSIYDGSNLGKSPAIIALSELGSGLFCAKATLQSENSCLSWLQELKETLGNEITFHLTGKQSKEDLAELQILCQQAEIEAQFPIPEKQPLLYSLATGVNANGIIEKEDLYEKTGGFSFSLTLTKEIEQAISELEKKIKDSWFTINTKGRTDSIILLKELKQNLEQLGESYIGPVNSESDLKFPKSLKEAIKDYSGSEAKNGRQQTTTVGGLLKTLDFHFTRYTVLTTKFTQVPVLTATWHTSEPSADTDSASATPMPDINESKSTPPPPPPAELKAGAKARREEEAAVTVLTNAMEFADDNAEDLPPPPPPSNPDLQQPLPDFNDSDFPPPPPPPPPSDEEQMPLADFDDIELPPPPPMDFETGPETQVSPIEEVNSGATPTDGTGPDTTEKKDSANITAEMQSIMARRGAIGGPDSETEAGEDDSWSDQEDNSGPNQSPSTLFQRQQSQSQEADNSNPLQYN
>NZ_CP013811.1|WP_053093668.1|539506_540106_-|hypothetical-protein
MRIITKPTTAKCNIQAYIRYLLSEPVRTSCTGLSDVLLNISHDSVNRFLLRENYRPEDLWTEVSEKIDLNNGVLSVDDMVIDKPYSNAEKTDLIGFFYSGKHHCVVKGVNVITLYYTDQHDVSVPINFRIIDPDEGKTKNEHFREMLQQVLSWGLQPSWVTRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP013811.1|WP_144420647.1|539171_539369_+|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYVSEDIIRLFSIANSMPRLYFLINFRFSMLEYQQSPAASHGVLSTG
>NZ_CP013811.1|WP_155046604.1|538830_538971_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAAGAVAVRFKQSIVGMKVVYKSNGTTLRARSEQKRTLAQ
>NZ_CP013811.1|WP_048875964.1|537983_538763_-|hypothetical-protein
MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSHVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP013811.1|WP_017376708.1|537017_537419_-|transposase
MGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKERKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP013811.1|WP_036773793.1|536495_536873_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAAIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP
>NZ_CP013811.1|WP_027242834.1|534728_536036_+|hypothetical-protein
MKFIYPGINAPLDTEKSLYAETTQGYFSHKESGKALDFNFIKKQESYFSQWDKRTAFTCEEYKALTHQQRLQLYRLHTTRWNYTLSLLLKDPGAGPDSPLYAEKQFLQNLNENEEMRKLYAGWFIDYVESREGETSKAVEALFKKEMQLKPECDLSKEKQIAVKVRGFRDEITELQAWLMNGSSAERIAIEKYDTKAVNQFIKYQLGQVSKSEFNKTFERAQSKCNKVLKNALHLTTSAASILTEKKIDLNSSVEWERLKNSQHLQKAVLILHKSNINLADSWDTLKDNSHLQKAVLTLHHESSINLTEHWDKVKNNSPLQKALAASYDYLNAERSSWSKMHHNHGIRQTHKFIRHLMASENQTLSGIQAEMQQWLHGYGHFSRASGSASNSRMSFALQSGLCPQADTPPTLLFNTSLQATEVEQEVTNQVTLSS
>NZ_CP013811.1|WP_155048058.1|533997_534180_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAAAVSFLLIVKGAIIVFDRTYALTAGINFDFSSASMPFIIKSLTTPINKSFLS
>NZ_CP013811.1|WP_017378007.1|545722_547666_-|hypothetical-protein
MKNNIYLNKLPSFLILITGITISLFLFYSLNKSHNLEASSHFEELATDTQQAIQNNINKNIAALNILKSFYESSDFINFNEFTTFTNSLLERDLAIQALEWIPNIPHSKRHDYVKKANQFFKNFNIKEKTAQGKMLIAKTKTNYFPVYYVNPVRGNEKAIGFDISSSPMRNKSLEKAALTGRNVATHKITLIQEEKGNSYGFLLFNPVYHSSSPQDISPKSLKGFVLGVYRINDILGHALNFSAKNNLIIFVKERINNNTLSPIFQNNGKQEINSHLSYQSTFTVADKKWPITIYPSHDFIKEHKNHLPMIILFAGVIISLILAAYLWLLVNREVRVKNLVEERTEQLNELNSKLTVLNEELDQKVMERTQKLKENQEQLIQSEKLASIGQLAAGVAHEINNPIGYIMNNIEIMGEYLDSIKAITQQAEACSKTLTSNDIQIKNDQLQQLKNTLEQEDINYVIDDTEKIIQQSLEGAEKVKNIVLSLKSFAHSDTDNKEEFDLNHCIEQALTITQNELKYKCKIIKNLSPLNPLLGYSSQIGQVIMNLLINAAHAIKESGTITITTQQIAGFNKLTIEDDGYGIHKDHLAKLFDPFFTTKSVGEGTGLGLSISYGIIKKHQGSINVESTVGQGTVFTIQLPNHSHHS
>NZ_CP013811.1|WP_048875961.1|547811_549215_-|IS4-family-transposase
MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFKSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP
>NZ_CP013811.1|WP_017378006.1|549334_549964_-|response-regulator
MPSLLLVDDEPHIIDALKRLFRREKYTLHCAYSAKEGLDILAQQHIDIILSDQRMPSMLGSEFLAKAQAQSPQTLRIILSGYADTKEIINGILNNHIHQFLEKPWRANELREHLRHLINLMDKNQYTQKNQSDNHYTRTAALSFNKNGAIKSINLYFCALLGQKPEHILSAPLTSVINYNQKQLKEILSYVNNHGHWQGKVTLANSTQD
>NZ_CP013811.1|WP_017378005.1|550202_550922_-|sulfate-transporter-CysZ
MSGFHYFLNGLNFILTPKMRRYLYLPILLNIILLLVLSYLGVHGIEVITNHVSTSLPHGLHFLRPIATIILSLALITLLVFSFTTLASIIGAPFYSLLCEAVLQKKDHQLPQDNITALIKDMPRLIGRELIKLRYFIIRVMILMILLFIPGINLIVSLLWFIFNCWMQAIQYIDYPMDVLKHPFKQTLKATRQTPLTAMSFGLVCFVCTLIPLLNLIAIPAAVAGGTLLWSERIQPLLK
>NZ_CP013811.1|WP_017378004.1|551035_554575_+|chromosome-segregation-protein-SMC
MRLKKIKLAGFKSFVDPMTVELPSQLAAIVGPNGCGKSNIIDAVRWVMGESSAKNLRGESITDVIFSGSSARKPVSQATIELIFDNSQGKLVGPYVSYSEISIKRIVNREAQSSYFLNGTKCRKRDIADVFLGTGLGPRSYSIIEQGMISRVIEAKPEELRVHLEEAAGISKYKERRKETERRIRHTRENLERLGDIREELGKQLSRLHQQAQAAEKYQNFKKEEREVKGQLYIQRWKSLQTQHGQEQKKIQEHEVIVEKQRAGQQHIDASLEKERLALSEASEKLHACQADYYQAGNEVSRLEQQIEHATTRIRETGQEMARLNTSLEKARSELAADEQQKVLLSAQEEALEPETELLQNAVDEAALSAEEAEVSYRQLEKERESLLQQVALCRQEAEVEQTRIRHMEEQGQRLQQRLERLRAETHNSDLISLEVGLEDVQGQQRELEEKEQELQLGAEEQQQRLIQQRQLIEQQRKGLEQQRGELHPLKGRLASLEALQQAALFDVNADSASSVKTWLETQGLIASKQLAQSLRVQEGWETAVETVLGDNLQALYTPGYQVNACVAELEMSLICIDQPLALNVNTQVAQGHENQAGILKLTDVIEPGESLPSQLQHVYLAEDLLAALRIRSELKSYESVVTVDGLWLGVNWLKVTKRDDSQSGVIAREKELMTLRQQELALEESICLHEEQLSQSQEVLMQVEAQVKSVQQQAQALQRELAEVKARVSGRLAHIEQVRARLAVVEHELSEALELFNEEQEEIKIARQRLEIAVEKMAELELQRQALESGRVEASRTTQEARQQLESLKSQYQQKQMQLQRVQSEQAGIKAALQRLEELLGRDKVRLVELEQSRIGLEEPLEEQRMLLDEQLERQLSFEDRLKTVKDQAQAHENQVRTFEKQLHEQMNQVAHAREALEQGRMQAQELFIRRQSVEEQLVEAGFQLRGLLEIYQEGCDVKELETALEDIGRRIQRLGVINLAAIDEYAGQSERKVYLDAQHDDLTEALDMLEAAIRKIDKETRTRFKETFDEVNGHFKLLFPKLFGGGSATLELIGEDLLEAGVALMAHPPGKRNSTIHLLSGGEKALTAAALVFAIFQLNPAPFCMLDEVDAPLDDANVGRFCRLVEEMSESVQFIFISHNKIAMEMADQLVGVTMREPGVSRLVAVDIEKALEMAEE
>NZ_CP013811.1|WP_017378003.1|554641_555472_+|hypothetical-protein
METFLKVLVLLVGILLVWVFIWEGLRRLKVWRIRKWGVKRPLQMRSGDPLAEDDIVDDVTDRQNTEDNQQNQSQHDRQADTVSARAPEPNHIILNIYIESKSTGFLAYALFSLLKRSGLIFNDELQVFEAKNEQGEVDFYITSAVAPGVFDIKNAMVSIPAVSVFARPDLQTNPRMSFFKLLESTHTIASELDGRVLNMRREILSEASVSADYLSVVNTYAVAESTAAALSASNSTSIVVDESMQDDNHVYQENESHVIADTRVDADSNKDQHVAG
>NZ_CP013811.1|WP_036773465.1|555458_557498_+|NAD-dependent-DNA-ligase-LigA
MSPAKLKRELVSDARVDELVKQLNLYSEAYYSEDDPLVPDSEYDRLFNELQQLEADYPELKQVDSPTLRVGGTILAEFTEVQHQSPMLSLSNGFNDQDIYDFIKRLKVDEDACFFCEPKLDGLAISLHYQRGRLVLAATRGDGTTGEDVTENVKTIRSIPLRLHSNNPPEFLEVRGEVFMMKSGFNKLNDQLRETNQKTFANPRNAAAGSLRQLNSKVAASRPLSFYAYSLTHMVGIELAQSHHERLALLASWGIPVNGDARCAAGTKGCLVFYQSILKVRDQLNYDIDGVVYKLDDIAAQEKLGFTARAPRWALAHKLPAEEEITIVKAIEFQVGRTGALTPVARLEPVHVGGVVVSNATLHNMDEVERKDVRIGDSVIVRRAGDVIPEIVKTIIENDTQSKAHAARPKLVMPDKCPVCDSAVERLAGEAVSRCMGGWRCKAQRKEALKHFISRKALNVDGLGEKLIEQLVDLELVQDAADLYQLTLEQLAGLERMAEKSANNVLEALEKSKVTTFGRLLYALGIRNVGQATAQVLAQRFGNLAALLAANTEELHAVDDVGPVTSQFILQFFSQQENQQLIERLQALGVCWPEQDKPLLAVRALQGEVIVLTGTLHGFSRDEVKEKLEQLGAKVTSSVSKKTTLLIAGENAGSKLDKAQALGVPVKNENDLKVLLGSN
>NZ_CP013811.1|WP_027243145.1|557513_558569_+|protease-SohB
MITQLLADYGLFLIKTATLVAAILIVFSGLLALAMKNRLAKQKGSLEVEKLNDHYDDLKETIEIEVLDKKELKALEKERRKEEKQERKDKKKNKSKETETDDEDAASAARIFVLDFDGDIEASAVHALREEVDALLTFINEKDEVVVRLESPGGMVSPYGLAASQLARFRSKGVKLTIAVDQVAASGGYLMACVADRVIAAPFAVLGSIGVVFQMPNFHRVLKKHDVEYEQLTAGDYKRTLTMFGKNTKEGREKLQEELEDIHYLFKNFVGEYRPQLDIDKVATGEHWFGQRALELNLVDELITSDDYLLSRADEHDIYSVNYMEKQTLADRLGIMARALLGKLATAGVKR
>NZ_CP013811.1|WP_017377998.1|558579_559110_+|hypothetical-protein
MQRKAIVLLSGGGYSSLCLYLARSQGYLPYALSLDIPKRHFQLDSAQQFARDVGVAEHQVIAMNENSLSDSKALTYYSSLLSFAVNWAQELSAQDIFIGLHPSAEHTLEYMVEWLQSYQELINLSSTTAIRIQTPLLFMSDKKREQTAEQFNLKLPEPVSKLKSKKKKFIQRIFSE
>NZ_CP013811.1|WP_048875965.1|561267_562188_-|hypothetical-protein
MLSTPWLAALDFDGCLYNVNIDNVRRAFHSPGKPKEELTLAHLITINQKLIDHLNNQAEKFSSSTVFLGSDRQDYKKERDNSAGPNREGQYCYPLISDFAKKIGAEFDPLLMADIYNNLPLGESFRQALQDYHTPEKHDQDPHTQPDSSKLTLLYAQMHKAATENPDDIVTYEFYDDRKDILLSLQEIFESDPHMIPKNITLYLNHYDGVNLQNLLIIQGQGNPDSQYQHTLKNPAYRKASANPAEAQTDYSISELIKEKFPKISKSFLEIKQKLQQLNLPKLKKSLIREATSVSVATSVGILHIQ

Crispr_ID: NZ_CP013811_2

• CRISPR_ID: NZ_CP013811_2
• CRISPR_location: 1102871-1102980
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP013811_2

Consensus_repeat	Method
TATCTTTAAGTTGCTCCCAATCTCCT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP013811_2

>2.1|1102897|58|NZ_CP013811|CRISPRCasFinder
CGAGCTAATTTGATATCGGAACGATAAAGGGCGATAATGGCTGTTTGAAGGATAGAGC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013811_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP013811_2

>merge|NZ_CP013811|2|1102871-1102980|CRISPRCasFinder
TATCTTTAAGTTGCTCCCAATCTCCTCGAGCTAATTTGATATCGGAACGATAAAGGGCGATAATGGCTGTTTGAAGGATAGAGCTATCTTTAAGTTGCTCCCAATCATCC

>NZ_CP013811|2|2|1102871-1102980|CRISPRCasFinder
TATCTTTAAGTTGCTCCCAATCTCCT	CGAGCTAATTTGATATCGGAACGATAAAGGGCGATAATGGCTGTTTGAAGGATAGAGC
TATCTTTAAGTTGCTCCCAATCATCC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP013811.1|WP_027242577.1|1099047_1100349_-|ComEC/Rec2-family-competence-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|273036
NZ_CP013811.1|WP_144420682.1|1103677_1103839_+|phosphatase	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013811.1|WP_144420680.1|1094058_1094979_-|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2	unknown	unknown	gnl|CDD|225212
NZ_CP013811.1|WP_048876008.1|1098076_1099051_+|IS30-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
NZ_CP013811.1|WP_027243098.1|1107247_1108393_+|carboxypeptidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|349453
NZ_CP013811.1|WP_155046588.1|1104373_1104583_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013811.1|WP_155046590.1|1097503_1097668_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013811.1|WP_155049745.1|1108467_1108644_+|DUF1508-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013811.1|WP_017376785.1|1101365_1102271_-|LysR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|182768
NZ_CP013811.1|WP_144420683.1|1109488_1110145_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013811.1|WP_027243095.1|1110133_1112419_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013811.1|WP_144420681.1|1097847_1098033_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013811.1|WP_036774017.1|1096626_1097502_+|IS982-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|372648
NZ_CP013811.1|WP_017376798.1|1113333_1113969_+|LysE-family-translocator	unknown	unknown	gnl|CDD|224199
NZ_CP013811.1|WP_027243099.1|1105698_1107012_-|DEAD/DEAH-box-helicase	unknown	unknown	gnl|CDD|236722
NZ_CP013811.1|WP_027243096.1|1108679_1109312_-|MarC-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225006
NZ_CP013811.1|WP_027242578.1|1100366_1100903_+|DUF2062-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378263
NZ_CP013811.1|WP_036774017.1|1095294_1096170_+|IS982-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|372648
NZ_CP013811.1|WP_017376797.1|1112692_1113052_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013811.1|WP_155046590.1|1096171_1096336_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP013811.1|WP_027242577.1|1099047_1100349_-|ComEC/Rec2-family-competence-protein	gnl|CDD|273036	TIGR00361, Recombination_protein_2, DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2. Apparant orthologs are found in 5 species so far (Haemophilus influenzae, Escherichia coli, Bacillus subtilis, Neisseria gonorrhoeae, Streptococcus pneumoniae), of which all but E. coli are model systems for the study of competence for natural transformation. This protein is a predicted multiple membrane-spanning protein likely to be involved in DNA internalization. In a large number of bacterial species not known to exhibit competence, this protein is replaced by a half-length N-terminal homolog of unknown function, modelled by the related model ComEC_N-term. The role for this protein in species that are not naturally transformable is unknown. [Cellular processes, DNA transformation].	2.99327e-41
NZ_CP013811.1|WP_036774017.1|1096626_1097502_+|IS982-family-transposase	gnl|CDD|372648	pfam13612, DDE_Tnp_1_3, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contains three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	3.54754e-84
NZ_CP013811.1|WP_144420680.1|1094058_1094979_-|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2	gnl|CDD|225212	COG2333, ComEC, Predicted hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily) [General function prediction only].	1.00534e-72
NZ_CP013811.1|WP_017376798.1|1113333_1113969_+|LysE-family-translocator	gnl|CDD|224199	COG1280, RhtB, Putative threonine efflux protein [Amino acid transport and metabolism].	2.53606e-35
NZ_CP013811.1|WP_048876008.1|1098076_1099051_+|IS30-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	1.65717e-79
NZ_CP013811.1|WP_027243099.1|1105698_1107012_-|DEAD/DEAH-box-helicase	gnl|CDD|236722	PRK10590, PRK10590, ATP-dependent RNA helicase RhlE; Provisional.	0
NZ_CP013811.1|WP_027243096.1|1108679_1109312_-|MarC-family-protein	gnl|CDD|225006	COG2095, MarC, Multiple antibiotic transporter [Intracellular trafficking and secretion].	1.76545e-45
NZ_CP013811.1|WP_027242578.1|1100366_1100903_+|DUF2062-domain-containing-protein	gnl|CDD|378263	pfam09835, DUF2062, Uncharacterized protein conserved in bacteria (DUF2062). This domain, found in various prokaryotic proteins, has no known function.	2.12897e-42
NZ_CP013811.1|WP_036774017.1|1095294_1096170_+|IS982-family-transposase	gnl|CDD|372648	pfam13612, DDE_Tnp_1_3, Transposase DDE domain. Transposase proteins are necessary for efficient DNA transposition. This domain is a member of the DDE superfamily, which contains three carboxylate residues that are believed to be responsible for coordinating metal ions needed for catalysis. The catalytic activity of this enzyme involves DNA cleavage at a specific site followed by a strand transfer reaction.	3.54754e-84
NZ_CP013811.1|WP_027243098.1|1107247_1108393_+|carboxypeptidase-family-protein	gnl|CDD|349453	cd06234, M14_PaCCP-like, Peptidase M14-like domain of ATP/GTP binding proteins and cytosolic carboxypeptidases similar to Pseudomonas aerugnosa CCP (PaCCP). A bacterial subgroup of the Peptidase M14-like domain of Nna-1 (Nervous system Nuclear protein induced by Axotomy), also known as ATP/GTP binding protein (AGTPBP-1) and cytosolic carboxypeptidase (CCP)-like proteins. This subgroup includes PaCCP from Pseudomonas aeruginosa, a carboxypeptidase homologous to M14D subfamily of human CCPs. Structural complexes with well-known inhibitors of metallocarboxypeptidases indicate that PaCCP might only possess C-terminal hydrolase activity against cellular substrates of particular specificity. The Peptidase M14 family of metallocarboxypeptidases are zinc-binding carboxypeptidases (CPs) which hydrolyze single, C-terminal amino acids from polypeptide chains, and have a recognition site for the free C-terminal carboxyl group, which is a key determinant of specificity. Nna1-like proteins are active metallopeptidases that are thought to act on cytosolic proteins (such as alpha-tubulin in eukaryotes) to remove a C-terminal tyrosine. Nna1-like proteins from the different phyla are highly diverse, but they all contain a unique N-terminal conserved domain right before the CP domain. It has been suggested that this N-terminal domain might act as a folding domain.	9.10914e-164
NZ_CP013811.1|WP_017376785.1|1101365_1102271_-|LysR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|182768	PRK10837, PRK10837, putative DNA-binding transcriptional regulator; Provisional.	3.43302e-86

Protein sequences

>NZ_CP013811.1|WP_017376785.1|1101365_1102271_-|LysR-family-transcriptional-regulator
MSVKITLRQLEIFVAISQHGHVTQAANSLYLSQSAVSMALAELERQLGKTLFDRAHKNLQLTNEGRLLLDKAVSLMQQAREVEQLFESDVQGELVVGASSTVGNYMLAGLMSEYLQKYPQLRLRLEISNTRRSQEKLLDYQFDCAFVEGEVTHADIKRQLWCMDEMLLIVAPTHPLAYKGLVEASDLSKAVWVLREQGSGTREFFNRRVLPELTYAQVCLELSDSTAIVQSVETGVGVSCLSRHVVECALREKRLAKLPYERKLERAFYLLIHKKKHIPALVHHFIDFCYQYIGKNNNYSL
>NZ_CP013811.1|WP_027242578.1|1100366_1100903_+|DUF2062-domain-containing-protein
MFNWFKKKIPTRESLQDHKILAKLYHLLHYHYLWHFNRHSVSKAIAIGSFFAFIPVPFQMIPAALCALVFRANVGISIATVWISNPITIPPMIYAAYKLGSWMIGHPGFIISLEQPHDIIHLLSQSWPPFLLGCITLSITFSLVNYIIARLFYRLWIIHKWHKNREKHKQANTTKKER
>NZ_CP013811.1|WP_027242577.1|1099047_1100349_-|ComEC/Rec2-family-competence-protein
MLGFIFVIGFLTLFFLGWQGAVLLSLSIGGLCYFIKSKHKAKLLCCLGLGGLWAIIIIFWQDYLHLDDFVLNQVVVITGNVVSIPEHDTRKVCFLFLIESINHQPLWPARQVRLNWYRFKQKKQQVLKAGESWQFQVKLRAPFGLENFIGFNYRRWLYQHSIQATGLVIDRYGKKGINRKLSSSHVFNLQQYRQKIAWFLERIDLHNTALIKALVLGERAEVKRSVRNLLQQTGTAHLLAVSGLHIGLIVTFTFFLIRGVLLWAPGMSRKYKSSGYALFIAAIVSLLVALCYSALAGFSVATLRACLMTVCVLLAFLCRRVVPIWALYQYALVGVVILFPLSVLSIGFWLSFLSVGVLIFVCAGRLTQTKLQKYLKPQWALLIALAPLSLAYFFNMPLIGLLANLVAIPWVGFLVLPLLLFALRHLKCNTTLY
>NZ_CP013811.1|WP_048876008.1|1098076_1099051_+|IS30-family-transposase
MVYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKSITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP013811.1|WP_144420681.1|1097847_1098033_-|hypothetical-protein
MNMNSLLSVALQMTEGVLGLIFIPLSNELSWVLFHCADLQITWLINRCEPWSAKHGVSRPR
>NZ_CP013811.1|WP_155046590.1|1097503_1097668_-|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYGITLFRPLAALYTTLLWCANINFIGFFFFNVSSI
>NZ_CP013811.1|WP_036774017.1|1096626_1097502_+|IS982-family-transposase
MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMVKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRAFKGLAKKSKSTMRWYYGFKLHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYEKGLQLITKIRKNMKNKLVLMIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSADNFMVNIVAGLAAYCLQEKKPSLGIKYNLLNG
>NZ_CP013811.1|WP_155046590.1|1096171_1096336_-|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYGITLFRPLAALYTTLLWCANINFIGFFFFNVSSI
>NZ_CP013811.1|WP_036774017.1|1095294_1096170_+|IS982-family-transposase
MDLTLISLFCVIDDFCQELLPQWNAILLEDTNKKRNKPSQMSTSEIMTIMIYFHKSNYRNFKMYYLHVIKGSMVKYFPNSVSYNRFVELMPSILLPLCFFIAAQGKTATGIYFVDSTILRVCHEKRASQNRAFKGLAKKSKSTMRWYYGFKLHIIVNDMGELMAFKMSKATTDDRVVLPKMAENLTGKIIGDKGYISQKLFDQLYEKGLQLITKIRKNMKNKLVLMIDKILLRKRGIIESVFDQLKNISQIEHSRHRSADNFMVNIVAGLAAYCLQEKKPSLGIKYNLLNG
>NZ_CP013811.1|WP_144420680.1|1094058_1094979_-|DNA-internalization-related-competence-protein-ComEC/Rec2
MCKIPTEVATLTYFLCRTHVFLGTLILLMPRGFPGRLFGLVTMLVPWVYALRPVTPDHAFVRVLDVGQGLAVIVKTHHHNLVYDVGNKTKSGFDLGQMVVVPNLYALGIQHIDKLVISHIDSDHSAGLASVLAAYPKTPIVSSSPLLPYTKIQACVAGDRWLWDGVTFEFLSPAYPFPYGRNNQSCVLKVSINEEGSSMLLTGDIEKRQEKKLLLQAPLSLKSDILFAPHHGSNSSSTSPFIKAVSPHTVIISAGRYNAYRLPHVKVLHRYQSQHIAILNTGQVGAIDFQLSGNKEPLFTFAGAGV
>NZ_CP013811.1|WP_144420682.1|1103677_1103839_+|phosphatase
MYHFQIDNQINQFLNRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP013811.1|WP_155046588.1|1104373_1104583_-|hypothetical-protein
MLGDFASLDVQNTYRGSDAYEINNILILFSYLFGAILKLTFPSYYNFLAKLRSHTICQELYGIQKSKEP
>NZ_CP013811.1|WP_027243099.1|1105698_1107012_-|DEAD/DEAH-box-helicase
MSFSSLGLSAPLLDAITEQNYKEPSAIQAQAIPAVLSGRDVMAAAQTGTGKTASFTLPLLERLSKGEQVRANQARALVLTPTRELAIQVAESVAVYGKNMPLRSTAVFGGVKINPQMMRLRRGVDILVATPGRLLDLYSQNAIKFKQLEVLVLDEADRMLDMGFIHDLRKIMALLPKQRQNLLFSATFSKEIRALAKTFVHQPLEISVTPRNTTAKTVKQWICPVDKKQKSALLMHLISHHQWQQALVFSKTKHGANRLARYLDDQGVTAAAIHGNKSQGARTKALADFKQGEVRILVATDIAARGLDIDQLPQVVNFDLPNVPEDYVHRIGRTGRAGACGQAVSLVSADEIKQLSDIEHLIGQLLARKLVDGFEPVHDVPVSSLDRRSKAPKKPEIEHQGGQRLGGSMQGKRREDHRNSQQQPGRKRRRPQLCRSK
>NZ_CP013811.1|WP_027243098.1|1107247_1108393_+|carboxypeptidase-family-protein
MRISSQFDAGNIEVISAEAVNNIQLKIRKDNQSDFLQWFHFRLHGAKNQACTLKILNASACSYPQGWQNYNIVASYDKEHWFRIPSHYDGKTLIVEHTPEANSIYYAYFTPYSYERHQELIGHAQQHSQCEVSLLGQTVDGRDLDLLTLGQLDQSNSDHHHKKKIWLIARQHPGETMAEWFIEGFLGALLDESNALARVLLSKAVFYVVPNMNPDGSVRGNLRTNAAGANLNREWQTPSMTKSPEVYYVKEKMQNTGVDLFLDIHGDEALPYNFVVGTEGNPLYSARIHSLEKQFKDAFKQTNPDFQDQYGYDKDQPGQANLTVACNNIGQTFDCLAFTIEMPFKDNADLPCKEFGWSAERSEQLGASVLQPIYNVIDQLR
>NZ_CP013811.1|WP_155049745.1|1108467_1108644_+|DUF1508-domain-containing-protein
MSELSRPENKWDIFKNSKGQWQWSCSDPNGRFLGASTETFDNEESCVANAREQGYSSE
>NZ_CP013811.1|WP_027243096.1|1108679_1109312_-|MarC-family-protein
MHELITFFITLLALTNPFGNLAIFIGLVEGRDVKEQRGIAFKAGIAVAIILMIVTLFGQNILDFFGISIGAFEVAGGLVILLLGLSMLNMKTEHQPHTKSEHTLAEEKPAIAVVPLAMPIIAGPGALAAVIIHTQSHVADRLFAKLPYVGVDIVIAVVVTAVLLFAPFFHKLLGVAGLKIVERIMGLILMAMAVTMMASGVHSLFPVPAA
>NZ_CP013811.1|WP_144420683.1|1109488_1110145_+|hypothetical-protein
MLKACSVPTMQLHADYDTETKKSHYSPLGDLRIQRFFDGRPNIQKTALKRYFKKKLPSGIFSGKTQPELSTYLQTTMRTIGQENGSNAPHSTQHYVITGIIQSIQVSKKPGVAKELMNPNAQYTPYIGASHYHAQVKFKAELRQAGLIILTVPVSINLFEITASHLTVQQDSDKMAYLLKKAINQAIKTMYKKLHQQLPQQSTMTSIKKLSQINRLHP
>NZ_CP013811.1|WP_027243095.1|1110133_1112419_-|hypothetical-protein
MPYTVELEEIYQGKRFESERKRYQECFNAADALADSVYLSESMLGYFEDVSGDELDFNNDATYSSSLSLFVLLGIFGVFKARAHFDKNENIDKYYKKLRTALSGLKNGRHALVNISSLVSILSHHAVASSVVSPVGALGFAIGILLAANNLYKLKLEEKRNSNLKAIEQYFLNFDRPEFDQDFKRIVPPNVKSNRKLIYTNIIDGFTDGLYLVGNAFMLLGLCGATSMVPTVAIGLCVAYGVYTLGSIINKYFKEKEEQLKEEFIYLKFLENLENQGKLVEYHDQFKSDPNYKKYIGDLSESDGAEEIRNKLGVALKIKEKELNAKKETLQSNTFYKVYKMISKSFSTVRSYVNTIKNSLATVTGIDILASQHPLAQAAVSLGCIITGCAVAVPFLVYKTYCSFRPTYQLRCRQGLDYPDLLYFFNEYAKSGFLKKHNHKGLIDRLTDDYQDYRENYLHILCTVNEYIADHYRNMNQKGELFLRYQAAKDYILCKHKYFSSMIKQLYKEYHYYSSLNINSDSDDIFIKNTRCLLKLYPATTKKEVVESLAIFSWDRQIAIITALPEFIDDHQVIMDLKGFLSAIKKPLREKNNFWLDKAHKKAQQDFFNAMLQNYLDNGVVNRSECAALVMNINKLLNSELLYPMPVKTINFYLHKAAVNYLAASASKILKNENLSIQQKIALYQSQHDELLRLLPNMMKSYAQRDSHDSLKVDESQFEEFLARAKNHRSNSNSCFTNMMFYHGQVDTMEPASSHRLVLGV
>NZ_CP013811.1|WP_017376797.1|1112692_1113052_-|hypothetical-protein
MFTRQKKSLAKFAAESAGTVEAVEAFHREPVCELVFSVCDQEISQCIDLLYDAGHNIHNLKKYAPIEFRNYIYEEFLMRLESPAADVQRELAREVFMDYLETRLKFDMDIAREIIKMPG
>NZ_CP013811.1|WP_017376798.1|1113333_1113969_+|LysE-family-translocator
MTFGIWLSLFAVCILGAMSPGPSLAIVTKHSLTNGRWHGIATSWSHALGVGLYATLTLLGLAVLLKRSPILFAIISYAGAGYLIYLGINALRSKGGIDSKLNLGQPAPLKDSCREGFMISLLNPKLALFFLALFSQFISVGHQLSSQVIIVATPTLVDGLWYTLIAFILSNPKVLSILKNKAQLIDRLSGIVLLLLASVFIISTISHSIFN

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	5111 : 54216	51	Staphylococcus_phage(21.43%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_2	64102 : 113171	53	Bacillus_phage(35.71%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	124853 : 156530	29	Staphylococcus_phage(50.0%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_4	191981 : 225430	23	uncultured_Caudovirales_phage(33.33%)	tRNA,transposase	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP013811|5111:54216|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017377817.1|10266_10764_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377818.1|10999_11644_+	porin family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_016210817.1|14435_15068_-	riboflavin synthase	A0A1V0SE20	Indivirus	1.1e-13	32.8
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WP_017377821.1|17964_18495_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_144420615.1|22901_23690_-	FtsX-like permease family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376557.1|23820_24516_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	W5SAS9	Pithovirus	1.2e-10	27.4
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WP_144420763.1|43109_43352_-	BolA/IbaG family iron-sulfur metabolism protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017376579.1|43755_44298_-	septation protein A	NA	NA	NA	NA
WP_016210074.1|44458_45085_+	threonylcarbamoyl-AMP synthase	NA	NA	NA	NA
WP_017376580.1|45090_45930_+	hypothetical protein	A0A1B1IVW1	uncultured_Mediterranean_phage	4.2e-10	24.2
WP_017376581.1|45919_46570_+	SMC-Scp complex subunit ScpB	A0A1B1IVT7	uncultured_Mediterranean_phage	3.9e-19	33.5
WP_026063543.1|46573_47407_+	pseudouridine synthase	NA	NA	NA	NA
WP_017376583.1|47496_48624_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080963588.1|48890_49043_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_047927249.1|49150_49345_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376585.1|49537_50188_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376586.1|50442_51534_-	anhydro-N-acetylmuramic acid kinase	NA	NA	NA	NA
WP_017376587.1|51530_52895_-	peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein	A0A088FRM7	Mycobacterium_phage	2.6e-17	52.2
WP_017376588.1|53019_54216_+|tRNA	tyrosine--tRNA ligase	A0A2I2L594	Orpheovirus	2.8e-07	24.8

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP013811|64102:113171|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_069971647.1|99098_99695_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_155048063.1|102266_103262_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_027243185.1|107432_108389_-	chemotaxis protein CheV	Q56AR1	Bacillus_thuringiensis_phage	6.3e-34	31.6
WP_144420767.1|108667_109345_+	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377787.1|112943_113171_+|transposase	transposase	A4JX31	Burkholderia_virus	8.1e-09	47.0

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP013811|124853:156530|DBSCAN-SWA
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MSSVGACVDNAVVERFFGSLKHEWLLNVIHLTRDTMKEDVEAYIRYYNHDRLHTANGNLSPINFEKSQLKVSNMT

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017377716.1|125215_126679_+	4-hydroxy-3-polyprenylbenzoate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
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WP_017377714.1|127723_128179_+	arginine repressor	NA	NA	NA	NA
WP_027242900.1|128203_128530_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377712.1|128873_129185_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_047927332.1|129314_130097_+	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
WP_144420768.1|130109_131045_-	EamA family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017377709.1|131176_131380_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242901.1|131720_132410_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875919.1|132436_132754_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017377706.1|132771_132984_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377787.1|133937_134165_+|transposase	transposase	A4JX31	Burkholderia_virus	8.1e-09	47.0
WP_144420621.1|135322_136084_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036771325.1|138274_139249_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_027242902.1|139373_140810_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatB	NA	NA	NA	NA
WP_017376308.1|140889_142350_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatA	NA	NA	NA	NA
WP_017376309.1|142470_142758_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatC	NA	NA	NA	NA
WP_016210526.1|142955_143999_+	rod shape-determining protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376311.1|144014_144914_+	rod shape-determining protein MreC	NA	NA	NA	NA
WP_017376312.1|144910_145429_+	rod shape-determining protein MreD	NA	NA	NA	NA
WP_017376313.1|145498_146116_+	septum formation inhibitor Maf	NA	NA	NA	NA
WP_026063524.1|146125_147613_+	ribonuclease G	NA	NA	NA	NA
WP_027242903.1|147622_151303_+	DUF3971 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376318.1|151376_152186_+	3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017376319.1|152185_152866_+	histidine phosphatase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036773116.1|153490_154465_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.6e-29	32.9
WP_048875923.1|154507_155503_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036773116.1|155555_156530_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.6e-29	32.9

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP013811|191981:225430|DBSCAN-SWA
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MLGDFASLDVQNTYRGSDAYDIESIAIARFVVLWFTLVASSLNLYTGVGDGDEAVVIPLPLWSG

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036771330.1|203691_204666_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
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WP_027243146.1|206685_207522_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243147.1|207810_210483_+	DUF4135 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377214.1|212385_214038_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_047927663.1|214638_215865_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
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WP_082300719.1|218761_219187_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_082300723.1|221864_222092_-|transposase	IS3 family transposase	A4JX31	Burkholderia_virus	8.1e-09	47.0
WP_017377224.1|223337_223913_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080999971.1|224026_225430_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP013811|264675:333486|DBSCAN-SWA
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MLSTPWLAAVEFINPQCMYETGWSTEARSINPHSAITMHEEPKNSGWTCFFSTKHYTLKAYVSTAPYLYTSMYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017377295.1|279932_280898_+	aldo/keto reductase	A0A2H4PQR8	Staphylococcus_phage	1.8e-44	38.1
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WP_075275280.1|295286_297185_+	surA N-terminal domain protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377313.1|301047_302397_-	HlyD family type I secretion periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_017377314.1|302393_304514_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	F2Y1V5	Organic_Lake_phycodnavirus	2.0e-16	28.1
WP_017377315.1|304510_306214_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	W8CYL7	Bacillus_phage	3.4e-22	25.0
WP_017377316.1|306348_307491_-	galactokinase	NA	NA	NA	NA
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WP_026063623.1|308702_310217_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_017377319.1|310323_310524_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420630.1|310668_311004_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275281.1|311148_311385_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_080999974.1|314388_315792_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_075275282.1|316972_317815_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
317105:317164	attL	NA	NA	NA	NA
WP_017377467.1|317811_318108_+|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	NA	NA	NA	NA
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WP_017377472.1|320269_321076_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771639.1|321379_322354_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	5.6e-30	33.2
WP_017377475.1|322525_324418_+	DNA topoisomerase IV subunit B	A0A172JHT4	Bacillus_phage	3.6e-81	32.3
WP_144420632.1|324990_327306_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036772665.1|331514_332039_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_017376899.1|332443_332584_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051929562.1|332781_333486_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
333262:333758	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP013811|337948:533383|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017376085.1|487933_488662_+	type IV pilus biogenesis/stability protein PilW	NA	NA	NA	NA
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WP_017377896.1|505761_506718_-	23S rRNA pseudouridine(955/2504/2580) synthase RluC	NA	NA	NA	NA
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WP_017377891.1|513876_514398_+	crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC	G3MA90	Bacillus_virus	2.0e-10	34.2
WP_017377890.1|514394_515000_+	Holliday junction branch migration protein RuvA	NA	NA	NA	NA
WP_017377889.1|515076_516087_+	Holliday junction branch migration DNA helicase RuvB	B3GAM6	uncultured_virus	6.9e-07	30.8
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WP_017377887.1|516938_517370_+	protein TolR	NA	NA	NA	NA
WP_036771700.1|517372_518467_+	cell envelope integrity protein TolA	NA	NA	NA	NA
WP_048875959.1|518526_519879_+	Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB	NA	NA	NA	NA
WP_017377882.1|519914_520556_+	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420778.1|520628_521528_+	tol-pal system protein YbgF	NA	NA	NA	NA
WP_027242836.1|521530_522178_+	7-carboxy-7-deazaguanine synthase QueE	J9PV61	Bacillus_phage	1.6e-36	38.6
WP_027242835.1|522228_523032_-	AAA family ATPase	A0A0E3G5H5	Synechococcus_phage	6.8e-42	43.1
WP_017377879.1|523213_523429_+	SlyX family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377878.1|523432_523666_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377877.1|523727_525320_-	exodeoxyribonuclease VII large subunit	NA	NA	NA	NA
WP_017377875.1|525522_526452_+	ABC transporter ATP-binding protein	W5SAS9	Pithovirus	7.0e-14	31.9
WP_017377874.1|526453_527221_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_047927659.1|527586_528357_+	gamma-glutamylcyclotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|528415_529390_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_017377870.1|529497_529860_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_048875961.1|531979_533383_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>NZ_CP013811|537017:599575|DBSCAN-SWA
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MTKKRFISRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_036771332.1|640718_641693_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	7.3e-30	33.2
WP_017376395.1|642580_645307_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036773116.1|645830_646805_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.6e-29	32.9
WP_017376397.1|647002_648484_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_016209947.1|648943_649606_+	carbonic anhydrase	NA	NA	NA	NA
WP_017376398.1|649847_651080_-	multidrug effflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017376399.1|651236_654008_-|tRNA	valine--tRNA ligase	A0A1V0SK04	Klosneuvirus	6.9e-150	39.4
WP_017376400.1|654076_654520_-	DNA polymerase III subunit chi	NA	NA	NA	NA
WP_017376401.1|654672_656145_-	leucyl aminopeptidase	Q6GYZ8	Mycoplasma_phage	1.8e-43	30.2
WP_017376402.1|656256_657318_+	LPS export ABC transporter permease LptF	NA	NA	NA	NA
WP_027242800.1|657314_658349_+	LPS export ABC transporter permease LptG	NA	NA	NA	NA
WP_017376405.1|658351_659392_+|tRNA	tRNA preQ1(34) S-adenosylmethionine ribosyltransferase-isomerase QueA	NA	NA	NA	NA
WP_026063528.1|659576_660692_+|tRNA	tRNA guanosine(34) transglycosylase Tgt	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	2.2e-94	49.2
WP_017376407.1|660730_661084_+	preprotein translocase subunit YajC	A0A1B1IVR5	uncultured_Mediterranean_phage	1.1e-07	46.5
WP_017376408.1|661104_662973_+	protein translocase subunit SecD	NA	NA	NA	NA
WP_017376409.1|662994_663939_+	protein translocase subunit SecF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	2.4e-38	35.2
WP_017376410.1|664172_664451_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209938.1|664813_665452_-	transglycosylase SLT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376411.1|665426_666851_-	aminodeoxychorismate synthase component I	A0A0B5J984	Pandoravirus	3.9e-40	33.4
WP_017376412.1|667051_667729_+	M15 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_027242801.1|667849_669124_+|tRNA	serine--tRNA ligase	A0A1B1IVT2	uncultured_Mediterranean_phage	1.7e-90	50.9
WP_017376414.1|669191_669947_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

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MPVIGALTRKTRVDIEAELAAERKIAVLESRRPELKNIEVVGEDLSALDLSGVHIYNSRFMGGVRFVKSNLRNVYFNTVDMPHANLAEVCLSGALFIGVDFSYASFNEAELGELGTRIEFRECNLDHSQFKKAVMPGVHFAARTTARGANFSRAEFEDGVIMESTFDHALFKSAELQNMVIAESCLKGVSFFDVRARSIRMINVNCSQSNLIKGDFRFSDISRVIFDGSDCTDSRWNGFLVGDGGVSFKDAKLICARFRGADEDFEAVNMRGVIIDAKSFEKLPLARRREIIMCMNEEARQALQLPDLLPPELKQVVGSFFLFEKAVHEKAQQQASLPPAVTLDF
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MKQKRQLRLLTLITCIIAWLPVIICGAEYFFLTEHALAKKSTIAVSLFITAPNALFSTFLCFVFYLIAAPSNQSTLMHYLILWVPTAVTTVSWLSHTLSTNPSATLTQTLTLYLAITASLLSIALRLIRYMNHDKKQH
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MNFMMYWHPIADIIQKTEELKHSNQLSKEQYMESLVCSRHAIRKTSKKLKEYLDSKFNSRISYLIHFPILAYFDEAVNSANQYKDVQWPLLQQEFYNTTNGGEDFFIALDDALQQNCTPAVYEIFFFLLKSGFKGQLIDDEIKRDDYIKQLEVNLKEQDNYQDTTTKELIDLSSIKASEEIITKMIKHNPLRHIKQYLFFYTGSLILFIYFVYLSILSF
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MARNGISFHDVCEAVDSIVQHGETPTIARIRETLGRGSLTTISRHFNDYKSQNPVESTDASSNSYSDPVSRAVESVWQKMRQEADDEILQIKSNAQAEISNLQQLLNNKELELDTWQQNHQRLITQHESLTTIHQELTAQHQTLITEQQLKTEQLTALEQLHHSSHAQQQQYINELSSQLAEEKEIFKKAIEHIQENYQLHCEQLETHHQQKISELKTNLSSYQANVQELTSDLQHLQQQLNQTKTINNLSEYVFNQLNNQTEHLTQLIKDHQHQQNADLIALQNQQATVNKELTHLALEQQQQIKLKKFIIKRTHKKLKRR
>NZ_CP013811|683491:742191|733347_734751_+|WP_048876031.1|transposase|DBSCAN-SWA
MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFRSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_017375910.1|684622_685351_-|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.1e-43	41.8
WP_075275409.1|685414_686242_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_027242802.1|686423_686792_-	cell division topological specificity factor MinE	NA	NA	NA	NA
WP_017376425.1|686788_687607_-	septum site-determining protein MinD	NA	NA	NA	NA
WP_017376424.1|687707_688523_-	septum site-determining protein MinC	NA	NA	NA	NA
WP_017376423.1|688806_690867_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420655.1|690863_691289_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376421.1|691474_692968_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376420.1|693100_693916_-	exodeoxyribonuclease III	NA	NA	NA	NA
WP_017376419.1|694011_694428_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376418.1|694810_695350_-	DUF2975 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420656.1|696266_696428_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_144420657.1|697139_698201_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036772905.1|699691_700045_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242803.1|700253_701966_+	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	2.5e-25	29.9
WP_027242804.1|702412_704266_+	DNA polymerase III subunit gamma/tau	A0A1L2BWV7	Bacteriophage	2.2e-43	40.5
WP_016209821.1|704368_704701_+	YbaB/EbfC family nucleoid-associated protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377485.1|704731_705328_+	recombination protein RecR	NA	NA	NA	NA
WP_017377486.1|705324_706449_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377487.1|706560_707208_+	hypothetical protein	W8CYT3	Bacillus_phage	1.4e-08	30.8
WP_017377488.1|707259_709173_+	molecular chaperone HtpG	A0A1B1ISV4	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-117	38.6
WP_017377489.1|709377_710415_+	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242805.1|710473_713800_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242806.1|714506_715475_-	DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242807.1|715604_716093_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036777920.1|716534_716768_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036817939.1|717077_717266_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375667.1|717754_718240_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275301.1|718510_718780_+	TSUP family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017377496.1|718814_720140_-	ribonuclease HI	G3MB70	Bacillus_virus	1.3e-37	36.3
WP_144420783.1|720195_720843_-	TetR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_027242809.1|721036_722995_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	2.5e-45	28.2
WP_047927313.1|723138_726069_+	peptidase M16	NA	NA	NA	NA
WP_048875980.1|726874_728278_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017378296.1|729718_730504_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378295.1|730594_732244_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378294.1|732388_733234_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876031.1|733347_734751_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_047927801.1|734747_735194_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_148037443.1|735199_735409_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242792.1|735435_736095_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378290.1|736113_736989_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_075275303.1|737124_738114_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_144420658.1|738090_738852_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	6.9e-44	42.3
WP_144420659.1|738884_739664_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_048875973.1|739940_740576_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_155046582.1|740572_740737_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|740935_741910_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_081329472.1|741945_742191_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP013811|804329:844735|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_155046600.1|809413_809557_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017378221.1|811570_812494_-	phosphatidylserine decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_027242798.1|812517_813567_-	small ribosomal subunit biogenesis GTPase RsgA	NA	NA	NA	NA
WP_047927040.1|813704_814298_+	oligoribonuclease	A0A1B3B0T8	Gordonia_phage	1.2e-14	29.6
WP_017378219.1|814320_814791_+|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex ATPase subunit type 1 TsaE	NA	NA	NA	NA
WP_144420785.1|814900_816151_+	AMIN domain-containing protein	A0A067ZJB6	Vibrio_phage	1.7e-15	27.4
WP_016211840.1|816839_817304_+	DNA starvation/stationary phase protection protein	A0A0A7RTZ1	Clostridium_phage	4.7e-19	32.9
WP_017378214.1|817742_819215_+	catalase	A0A2K9L572	Tupanvirus	3.3e-98	46.5
WP_017378213.1|819331_819784_+	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_048875983.1|821186_821792_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	6.3e-48	49.5
WP_017375549.1|821800_822097_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875984.1|822101_822638_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_048875985.1|822782_823388_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771639.1|823431_824406_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	5.6e-30	33.2
WP_048875986.1|824402_824900_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_087910640.1|825307_825724_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_053856767.1|825791_827195_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275305.1|827191_827812_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036773116.1|828083_829058_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.6e-29	32.9
WP_036773538.1|829222_829846_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_017376442.1|829842_831783_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	1.8e-72	33.0
WP_017376443.1|831938_832592_+	glutaredoxin 2	NA	NA	NA	NA
WP_017376444.1|832760_833936_+	formate-dependent phosphoribosylglycinamide formyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017376445.1|834289_835615_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063532.1|835707_836496_+|tRNA	tRNA pseudouridine(38-40) synthase TruA	NA	NA	NA	NA
WP_017376447.1|836597_837470_+	acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_017376448.1|837656_838919_+	bifunctional tetrahydrofolate synthase/dihydrofolate synthase	NA	NA	NA	NA
WP_017376449.1|838992_839523_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376450.1|839544_841050_+	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	7.7e-87	40.4
WP_017376451.1|841062_841728_+|tRNA	tRNA-(ms[2]io[6]A)-hydroxylase	NA	NA	NA	NA
WP_017376452.1|841821_843582_+	gamma-glutamyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_036773947.1|843859_844735_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_CP013811|850401:955828|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017377583.1|927333_928692_-	replication-associated recombination protein A	G3MBE0	Bacillus_virus	3.1e-71	37.9
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WP_017377576.1|933967_935059_+|tRNA	tRNA pseudouridine(13) synthase TruD	NA	NA	NA	NA
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WP_080999986.1|948908_949106_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771332.1|949309_950284_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	7.3e-30	33.2
WP_017377185.1|950632_951571_+	ubiquinol oxidase subunit II	NA	NA	NA	NA
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WP_036774017.1|954952_955828_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP013811|1014163:1029734|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12

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MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA
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MKNKLVLMIDKILLRKRGIRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRCVP

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_087910642.1|1015946_1017100_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	6.8e-59	44.2
WP_048876004.1|1017221_1017914_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242833.1|1017922_1019110_-	methyl-accepting chemotaxis protein	A0A2H4J162	uncultured_Caudovirales_phage	5.2e-22	34.3
WP_017376484.1|1019259_1019886_+	uridine kinase	A0A1V0SAA3	Catovirus	1.2e-33	41.3
WP_017376485.1|1019931_1021161_+	hypothetical protein	B2YG43	Musca_hytrovirus	2.6e-08	21.9
WP_144420789.1|1021355_1021802_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376487.1|1021993_1023352_+	dNTP triphosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_075275317.1|1024017_1024191_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876005.1|1024320_1025238_+|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	4.6e-26	32.4
WP_053093673.1|1025579_1026239_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_144420674.1|1026319_1026823_-|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	3.0e-19	40.7
WP_017376491.1|1026795_1027083_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036771628.1|1027375_1028497_-	calcium:proton antiporter	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|1028759_1029734_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9

Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP013811|1044721:1233859|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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1092369:1093363	attR	NA	NA	NA	NA
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WP_017377201.1|1161504_1161975_-	DUF1289 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_027243048.1|1163908_1165396_+	type VI secretion system-associated FHA domain protein TagH	NA	NA	NA	NA
WP_017377206.1|1165457_1166915_+	hypothetical protein	A0A1C3NFI8	Phage_NCTB	4.3e-10	24.8
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Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>NZ_CP013811|1252826:1386196|DBSCAN-SWA
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MFSLLLTMLIRLYQLIISPLLGPRCRFYPSCSHYAIEAIQTHGFFRGIALTVKRLLRCHPGCEGGIDPVPEKATKSCEK
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MLNRLLKSNRNQCKRYEKKSAHHAQVDVKLLFFNNENGKKIKHYQYTAIGDAIRIYALKIYSKHTQANAIDFINHLIDKLPF

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_017376700.1|1358698_1359280_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017376683.1|1373550_1374252_-	cyclase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017376680.1|1377306_1378539_+	phosphoglycerate dehydrogenase	A0A1V0SBV6	Catovirus	8.2e-95	47.3
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WP_144420796.1|1381888_1383007_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036774270.1|1383151_1383487_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017375562.1|1385119_1385284_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772169.1|1385320_1386196_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP013811|1395624:1521003|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017375762.1|1430483_1431824_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP013811|1532039:1598942|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_17

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17

>NZ_CP013811|1607037:1658826|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP013811|1607037:1658826|1647751_1648498_-|WP_017376998.1|DBSCAN-SWA
MALYKIIISMSVVVAVVLTGCADRAVVLGSKVQTDQSQGLGLYSCGKKTCYQANLDNRHIEFTVPEVYLANSPKNFTVTNIYFFDVGDYPQLTSGQFDKKRLKNNTQIQGVVVKNSGGTGTYQFKSYIMLIANSDIHVGESLVNRTIYDELEYDFSQRKIKKVTILEKGKNQSNKRCAIDYMKISREFADTRDYMFETESVCPISATSYSLKIASVGRGNSHIKMNNLFNKAVQGESVIRQSIQVVNK
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MMKKILIAASVTAALGLSGTAIAGGGPLSMPAGHSIYVEGALGYVNQQDLPDLAIVSRDDKNIGGRVAVGYMYDIDPMWGIGAELGWGYYGKTEYSFGGNSFNVKSTAWDISAVGTWHINPQFDLFAKAGMAYEDLNGSLTLNGQTINGDNEEWKPLLAIGAGYNFTPNLQVNLTYTHIFGDDLSSNNVGNDDVATINSVLLGLRYTF
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MSQFIDRRLNGKNKSAVNRQRFIRRFKQQIKRAVADAVSGRSITDLESGEKVSIPAKDLSEPHFHHGEGGRREIVHPGNDQFIAGDRVKRPQGSAGGRGSNASDSGEGEDDFGFEISRDEFLELFFEDLELPNLTKQKVGKTEVFDSVRAGFSVTGTPPSISIVRSFRNALARRIALAGPYREEIDLLEEKLQQENQNDNKNTRAEDECIGDDNNNVIQIKQDIQFLKKRIKSIPFIDSFDLRYHSRVKQPKPTTQAVMFCLMDVSGSMDQAKKDIAKRFFILLYLFLNRTYEHIDVVFIRHHTSAKEVDEEEFFYSRETGGTVVSSALELMKDVMAERYPTSEWNIYGAQASDGDNWNSDSPRCRDLLLTHIMPHVQYFAYTEIMSRHHQSLWDAYLEVSDACPHFSMQNIDSVKDIYPVFRKLFKRQAA
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MKFYLMRVCSIIIPLITNLSSYAVSSATPVGYWQTINNNTNRPSSIIEIYTAKNKVNGKTIDVLNGKIYGTYLYGEKRHQPAPRCKKCDGKLANAAIVGLPIITHFRKTADNRWQAGILLSPRTGSTYENATLSLANNNQLLNVHVKVGFFSKTQVWHRILPSLIKEIKQSQQQADFKLLTQ
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MDIFSQFSDRYESQRQEEITIEQYLQLCKEDPLAYANASERMLMAIGEPEFIDTRNDPTLSRIFANKVIKRYPAFKDFYGMEEVIEQIAAYFRHAAQGLEEQKQILYLLGPVGGGKSSLAEKLKSLIEKVPFYAIKDSPINESPLGLFSAEEDGELLEEKYGIPQRYLGKSMSPWASKRLHEYNGDIRKFKVVKIWPSVRDQIAVTKTEPGDENNQDISSLVGKVDIRMLERYSQNDPDAYSYSGGLCLANRGLLEFVEMFKAPIKVLHPLLTATQEGNYNGTEGIAAIPFDGIIMAHSNESEWQSFKGNRNNEAFLDRIFIVKVPYCLRLSEEKQIYEKLVNSSSLRGAQCAPGTLKMMAQFSVLSRLKEPDNSSIYSKMKVYNGENLKDTDPKAKSYQEYRDYAGVDEGMTGLSTRFAFKIISKVFNFDHTEVAANPVHLFYVLETQIEQEQFPSEIAERYLSYIKGYLVPQYIEFIGKEIQTAYLESYSEYGQNIFDRYVTYADYWIQDQEFRDPDTGEILDRQSLNEELEKIEKPAGISNPKDFRNEIVNFVLRARANNKGKNPDWTSYEKLRAVIEKKIFSNTEELLPVISFNAKSSVEDNKKHKDFVNRMTEKGYTEKQVRLLCEWYLRVRKSS
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MSSVGACVDNAVVERFFGSLKHEWLLNVIHLTRDTMKEDVEAYIRYYNHDRLHTANGNLSPINFEKSQLKVSNMT
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MRALKKTAISLLLASSFVLPVASFAANNGNDGIVGPAAVNPPPPGKHKKIKAHGMPLKQFFQKLNLDPTQQKNVISILKDTRQSSQAEMKQLRQSRGQVRQLIMNDTYTPKKAQAILQKRSQLMDKVIENKVNAEARIYGVLTPAQKDKLKSHFEMLERLRAF

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_036771330.1|1607037_1608012_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_080999998.1|1608278_1608548_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_144420803.1|1608692_1609649_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080963583.1|1609809_1610736_-	pentapeptide repeat-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242871.1|1611031_1611793_-	transporter substrate-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211971.1|1611994_1612606_-	trimeric intracellular cation channel family protein	NA	NA	NA	NA
WP_051929560.1|1612626_1613826_-	site-specific DNA-methyltransferase	A0A2L1IZ21	Streptomyces_phage	2.7e-42	33.2
WP_017377024.1|1613920_1614061_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377023.1|1614073_1614478_-	SufE family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377022.1|1614708_1615278_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377021.1|1615344_1616385_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377787.1|1616411_1616639_-|transposase	transposase	A4JX31	Burkholderia_virus	8.1e-09	47.0
WP_027242872.1|1617689_1618547_-	SUMF1/EgtB/PvdO family nonheme iron enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_017377019.1|1618543_1619389_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242873.1|1619389_1622119_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875904.1|1622252_1623128_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_027242874.1|1623392_1624367_-	HAMP domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209885.1|1624795_1625509_-	response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
WP_027242875.1|1625677_1626169_+	Spy/CpxP family protein refolding chaperone	NA	NA	NA	NA
WP_017377014.1|1626308_1626800_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242876.1|1627002_1627893_+	Rossmann-like and DUF2520 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063591.1|1628277_1628862_+	septum formation inhibitor Maf	NA	NA	NA	NA
WP_027242877.1|1628942_1629881_-	signal peptide peptidase SppA	A0A2I6UGK8	Salinibacter_virus	4.9e-15	30.1
WP_036771855.1|1629932_1631027_-	fusaric acid resistance family protein	NA	NA	NA	NA
WP_047927528.1|1631151_1632474_+	Na+/H+ antiporter NhaA	A0A2H4J5W3	uncultured_Caudovirales_phage	7.3e-65	39.9
WP_017377008.1|1632521_1637408_-	NAD-glutamate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_017377007.1|1637502_1637805_-	DUF2835 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242879.1|1637915_1639838_+	PrkA family serine protein kinase	NA	NA	NA	NA
WP_027242880.1|1639859_1641155_+	YeaH/YhbH family protein	A0A219UQP6	Bacillus_phage	1.2e-06	32.8
WP_017377006.1|1641151_1642762_+	SpoVR family protein	NA	NA	NA	NA
WP_052106204.1|1642868_1643762_-	thiol:disulfide interchange protein DsbG	NA	NA	NA	NA
WP_017377003.1|1643871_1644495_+|protease	site-2 protease family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377001.1|1645201_1645900_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit type 1 TsaB	NA	NA	NA	NA
WP_017377000.1|1646043_1646613_-	outer membrane beta-barrel protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063589.1|1646928_1647555_-	porin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376998.1|1647751_1648498_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376997.1|1648593_1649433_-	NADPH-dependent 7-cyano-7-deazaguanine reductase QueF	I6XGV6	Vibriophage	1.0e-32	35.3
WP_016210463.1|1649483_1649831_-	cupin domain-containing protein	A0A1V0SH58	Hokovirus	9.2e-20	42.1
WP_017376996.1|1650021_1650909_+	ROK family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376995.1|1651023_1651626_-	HAD family phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_017376994.1|1651622_1652342_-	TIGR00266 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_080963631.1|1652410_1654123_-	ABC transporter ATP-binding protein/permease	NA	NA	NA	NA
WP_017376991.1|1654270_1656208_+	AsmA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242882.1|1656320_1657370_+	A/G-specific adenine glycosylase	NA	NA	NA	NA
WP_017376990.1|1657369_1657645_+	oxidative damage protection protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376989.1|1657725_1658274_+	DUF2147 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377787.1|1658598_1658826_-|transposase	transposase	A4JX31	Burkholderia_virus	8.1e-09	47.0

Sequences of DBSCAN-SWA_18

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18

>NZ_CP013811|1683720:1728156|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_18

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MGVSWVMSSVKAFLVVWSLLGGSMTETTEASFNQSLVQQVNVNQADADTLAAVLNGCGLKKARAIINYRKQHGPFRSIKDLAKVEGISEQLVLRNKSRLLFIIRY
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MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFRSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_048876031.1|1685168_1686572_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_062365735.1|1687811_1689215_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080963604.1|1690035_1690236_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377826.1|1690476_1691922_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_048875904.1|1693117_1693993_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_027243174.1|1695444_1695726_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046578.1|1695944_1696124_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017376520.1|1697289_1697712_-	transcription antitermination factor NusB	NA	NA	NA	NA
WP_017376521.1|1697713_1698187_-	6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase	A0A2H4PQS3	Staphylococcus_phage	2.4e-26	43.4
WP_017376522.1|1698312_1698969_-	3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate synthase	A0A2H4PQS2	Staphylococcus_phage	6.8e-40	44.2
WP_017376523.1|1698965_1699640_-	riboflavin synthase	A0A2H4PQS5	Staphylococcus_phage	6.0e-31	37.7
WP_017376524.1|1699645_1700794_-	bifunctional diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase/5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase RibD	A0A1V0SE20	Indivirus	4.7e-44	34.8
WP_017376525.1|1700790_1701252_-	transcriptional regulator NrdR	NA	NA	NA	NA
WP_017376526.1|1701327_1702578_-	serine hydroxymethyltransferase	A0A219Y950	Aeromonas_phage	2.4e-102	54.4
WP_017376527.1|1702704_1704384_+	energy-dependent translational throttle protein EttA	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	3.0e-39	26.6
WP_027243172.1|1704495_1705377_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772261.1|1706619_1707213_-	methyltransferase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017375618.1|1709029_1709314_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_036771330.1|1710511_1711486_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_027242983.1|1711642_1712281_-	SGNH/GDSL hydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377748.1|1713716_1715378_-	30S ribosomal protein S1	NA	NA	NA	NA
WP_017377749.1|1715438_1716122_-	(d)CMP kinase	NA	NA	NA	NA
WP_036773645.1|1716121_1717207_-	3-phosphoserine/phosphohydroxythreonine transaminase	M1Q1P2	Streptococcus_phage	9.8e-76	43.3
WP_017377751.1|1717248_1719885_-	DNA gyrase subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	6.9e-99	32.6
WP_155051395.1|1720864_1721008_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377754.1|1721689_1723009_+	TRZ/ATZ family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_017377755.1|1723012_1723729_+	bifunctional 2-polyprenyl-6-hydroxyphenol methylase/3-demethylubiquinol 3-O-methyltransferase UbiG	NA	NA	NA	NA
WP_017377756.1|1723725_1724367_+	HAD-IA family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_144420715.1|1724359_1724494_+	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242981.1|1724742_1725198_-	glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_027242980.1|1725289_1725634_-	winged helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_048876031.1|1726752_1728156_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_19

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19

>NZ_CP013811|1783074:1829782|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_20

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_144420809.1|1841100_1842393_-	3-deoxy-D-manno-octulosonic acid transferase	NA	NA	NA	NA
WP_017377933.1|1842403_1843351_-	ADP-glyceromanno-heptose 6-epimerase	R9S880	Prochlorococcus_phage	3.5e-37	37.6
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WP_087910662.1|1844177_1844957_-	glycosyltransferase family 2 protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377937.1|1850249_1851101_-	4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_144420810.1|1851183_1851729_-	chorismate lyase	NA	NA	NA	NA
WP_027243057.1|1851826_1852687_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_027243058.1|1852778_1853195_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377942.1|1853276_1853783_+|protease	protease inhibitor I42 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377945.1|1856801_1857134_+	GIY-YIG nuclease family protein	D7F5V9	Apocheima_cinerarium_nucleopolyhedrovirus	4.7e-05	34.2
WP_047927125.1|1857251_1857761_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017377687.1|1860835_1861588_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|1861943_1862918_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_016209908.1|1863050_1863761_+	response regulator	W8CYM9	Bacillus_phage	2.2e-31	34.8
WP_017377690.1|1863757_1864792_+	phosphate regulon sensor histidine kinase PhoR	W8CYF6	Bacillus_phage	1.3e-32	34.2
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Sequences of DBSCAN-SWA_21

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21

>NZ_CP013811|1916887:1982786|DBSCAN-SWA
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MIKLIKKILSTFLSRTFITLLLCLALCAVIWFYSPLLAFNNHYYFTDPLPRVIAILVIALLWGISNLRFRIQPWRTHKITSSVHLKKNKNPHDSKIQALCEILKKRNFNKSNIIIVTGDDNSAKRFIFNQVNIIKSSDHTSDNSINWVLTQQQALIYIPHDHLINDNLKKSIYPLIKINSVSPVNSIIIIESCESIFNNNKINNKNIKSINQLNQAIGYSVPVYFYFSNSNEITGYKQYAKLADQSKVSSTIELYSYERNNIIFLTDFNHLIKTKLSYYYQITNNDNKFENILSFRFLLELSKLKDIINKFIKEISHYTTVNPLYIQGLYLSPITEGKPNQGDDTVVFSSNSLIHEIINHSHKISDNFNESRFKRKKFKHAIIASVILFCTITIASIWMVALNKKINYVYDISNDINKNFINSSNITSIDKLANYIQSHSWFSFGLFNINSVPRQTVKLYNYYLSQSFLPYISTIAENQIKSAINHHNTLYLYQWLSSYLMLNDKQYLNKEAIYNTYADYWGERAGYNNTTKQNRLFQLNSLLQLKFQPIDLNTDLVSQARAVLDNKTLAEQAYLNLNNFYHQKNQSLTTSPVDLDSTLSIRKNTTIPYLFTKNGYITEFKSSYTDFLQTVINNQWILGKSFQINDQATLEAQMNNSYWSQYLDVWNNYIANIEVSPFNQLAAATQNLGLLAKDSDSAIVKLLQVISDNTSFTSDKSTLSNNVISNAYSAANSLLIQTDKNTPAPIHNYIQAINNLYRYFVNIQQSAVPDQAAFEQARKLFSDGQTNPIKQLRILALQAPEPLATWLNQIVHSSLITVFNSANKYIETQWDNSIKNQFNTAFKNSYPFTTASSNNASPDDFLNFINQDGEISTFFKKYLNSFIFSDKNYQAKSLYNVKFPINLNISKTLTSVTHLKSMFNLSKESKVSFIIEPRLLSKNIRNINLSYGDNSFAYAYGPIFPYHWNWPLSSLNQDLIIKVQLFSGIVRTYSFSGPWSLFKFLASSKITQRSPTTYTVEYSSDGLILSLTLIANSSSNPFKETLSTALAPLVRYISIS
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MKKLYVGNLPYSADDASLEELFSQFGAITSVKVIQDRETGRSKGFAFVEFDEKDAAEAALKLDGQDNGGRPMKVSMAKPQEKRQPRNHY

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_027242859.1|1918199_1918910_+	DotU family type IV/VI secretion system protein	NA	NA	NA	NA
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WP_027242861.1|1922159_1923296_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376336.1|1924158_1925016_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376335.1|1925157_1925958_-	adenosylmethionine decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_017376334.1|1926056_1926632_-	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	3.2e-57	50.0
WP_027242862.1|1926714_1927386_-	ribulose-phosphate 3-epimerase	NA	NA	NA	NA
WP_027242863.1|1927431_1928331_+	DUF3530 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376331.1|1928365_1928749_-	response regulator	NA	NA	NA	NA
WP_080963653.1|1928898_1929729_-	DnaJ domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376329.1|1929653_1930364_-	nucleotidyltransferase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376328.1|1930360_1931386_-	phosphotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_048876074.1|1931516_1934021_+	LPS-assembly protein LptD	NA	NA	NA	NA
WP_017376325.1|1934027_1935296_+	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA	NA	NA	NA	NA
WP_017376324.1|1935297_1936281_+	4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase PdxA	NA	NA	NA	NA
WP_017376323.1|1936293_1937115_+	16S rRNA (adenine(1518)-N(6)/adenine(1519)-N(6))- dimethyltransferase RsmA	NA	NA	NA	NA
WP_017376322.1|1937159_1937552_+	Co2+/Mg2+ efflux protein ApaG	NA	NA	NA	NA
WP_017376321.1|1937626_1938433_+	symmetrical bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_036774104.1|1938620_1939049_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|1939107_1940082_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
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WP_048876012.1|1940577_1941981_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017376011.1|1942561_1942723_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376015.1|1943943_1944315_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242569.1|1944422_1945973_-	apolipoprotein N-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017376017.1|1946005_1946845_-	CBS domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376018.1|1946841_1947357_-	rRNA maturation RNase YbeY	NA	NA	NA	NA
WP_017376019.1|1947360_1948353_-	PhoH family protein	A0A0S0MVD6	Pseudomonas_phage	9.3e-49	45.1
WP_017376020.1|1948731_1950102_-|tRNA	tRNA (N6-isopentenyl adenosine(37)-C2)-methylthiotransferase MiaB	NA	NA	NA	NA
WP_027242570.1|1950310_1951450_+	hypothetical protein	A0A0F6YPT7	Sinorhizobium_phage	9.3e-61	41.7
WP_062365741.1|1951663_1952266_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.0e-10	35.7
WP_036816881.1|1952949_1953168_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155052676.1|1953206_1953494_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772149.1|1959149_1959830_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376634.1|1959894_1961181_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376633.1|1961782_1962052_-	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420813.1|1962235_1963207_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	3.0e-15	29.3
WP_017376631.1|1963274_1964249_-	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.3e-14	31.3
WP_017376630.1|1964346_1965423_-	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_144420721.1|1965503_1966496_-	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
WP_036772145.1|1966500_1968303_-	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243119.1|1968320_1969622_-	aspartate kinase	NA	NA	NA	NA
WP_027243118.1|1969637_1970921_-	diaminopimelate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_017376625.1|1971053_1971446_+	RidA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376624.1|1971552_1972638_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376623.1|1972853_1973870_-	bifunctional UDP-4-keto-pentose/UDP-xylose synthase	D5GW02	Campylobacter_virus	1.9e-12	28.7
WP_017376622.1|1973872_1974880_-	glycosyltransferase	B9UDL7	Salmonella_phage	2.2e-37	34.4
WP_026063550.1|1974883_1976038_-	DegT/DnrJ/EryC1/StrS family aminotransferase	A0A2K9L0G1	Tupanvirus	3.9e-38	33.0
WP_016209558.1|1976052_1976415_-	small Multidrug Resistance family protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243117.1|1976411_1978127_-	glycosyltransferase family 39 protein	NA	NA	NA	NA
WP_026063546.1|1978226_1978901_+|tRNA	tRNA (guanosine(18)-2'-O)-methyltransferase TrmH	NA	NA	NA	NA
WP_017376619.1|1978929_1979334_+	RidA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243116.1|1979358_1980318_-	response regulator	NA	NA	NA	NA
WP_017376616.1|1980450_1981233_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_075275357.1|1981334_1982294_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0N7C035	Escherichia_phage	1.2e-13	34.3
WP_017376613.1|1982438_1982786_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_22

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22

>NZ_CP013811|1986787:2050559|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036772169.1|2021917_2022793_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_027242610.1|2024936_2025440_-	peptide deformylase	A0A1D8KUY1	Synechococcus_phage	2.1e-09	33.1
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Sequences of DBSCAN-SWA_23

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23

>NZ_CP013811|2082350:2125710|DBSCAN-SWA
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MYEYELSTECCTSDDGGRSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFRSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGTSLTMADSEENQSRYPQHDAQKAGAGFPIMRLVAIMSLTTGGIIDYAVGAYKGKGTGEHALLRQIKDSIHKDDIVMGDRYFPCFFVMGDLQSIGADGIFKAHSQRKYDFRKGRKLGSKNHLVIWKKPHKPDWMTQETYDSYPDQMTVREFKIKGEVYVTTFQDHKKYNKVALANHYKQRWHIEINFNSLKTIMSMDHLRSKTPDMVHKEIAVHFLAYNLIRTLIAEACRNTERLPIQVSFKGVIQLFNSFVSLLSFSADCNKAHAILLHAIIKNKVGNRPGRIEPRAVKKRPKAFRRLNKSRELEKAEITKRMKKNSNKKCSSAP
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MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEAKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017377107.1|2086673_2088044_+	adenylosuccinate lyase	A0A2H4UUU6	Bodo_saltans_virus	1.5e-110	45.1
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WP_017377110.1|2088853_2089864_-	DUF481 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017375809.1|2114605_2115625_-	S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_017375810.1|2115727_2116522_-	thymidylate synthase	A0A2R4A1R4	Microbacterium_phage	1.1e-103	69.0
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WP_026063480.1|2121895_2122294_-	MFS transporter	S4TR35	Salmonella_phage	1.2e-07	31.4
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WP_017375821.1|2124481_2124703_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420724.1|2124699_2125710_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_24

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24

>NZ_CP013811|2178403:2214343|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017377343.1|2199032_2200457_+	bifunctional D-glycero-beta-D-manno-heptose-7-phosphate kinase/D-glycero-beta-D-manno-heptose 1-phosphate adenylyltransferase HldE	M4QSA2	Synechococcus_phage	1.0e-16	42.3
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WP_036818827.1|2201861_2202593_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_048875864.1|2207959_2208985_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_017377694.1|2210395_2211124_+|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	7.8e-45	42.7
WP_048876012.1|2211324_2212728_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017376920.1|2212873_2213371_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875863.1|2213440_2214343_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_25

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25

>NZ_CP013811|2237551:2277767|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_26

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26

>NZ_CP013811|2365164:2477226|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017378122.1|2386649_2387012_-	preprotein translocase subunit SecG	NA	NA	NA	NA
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WP_017378141.1|2405570_2406623_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378142.1|2406941_2407907_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017378145.1|2410396_2411383_+	fumarylacetoacetate hydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_027242684.1|2412057_2413167_+	histidinol-phosphate transaminase	A0A142C026	Faustovirus	1.6e-17	23.5
WP_027242685.1|2413233_2413896_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242686.1|2414155_2416039_-	phosphomethylpyrimidine synthase ThiC	NA	NA	NA	NA
WP_017378149.1|2416352_2417852_+	bifunctional ADP-dependent NAD(P)H-hydrate dehydratase/NAD(P)H-hydrate epimerase	NA	NA	NA	NA
WP_017378150.1|2417942_2418725_+	exodeoxyribonuclease III	E3T4M6	Cafeteria_roenbergensis_virus	1.8e-31	33.0
WP_017378151.1|2418852_2419773_+	SPFH/Band 7/PHB domain protein	J3IZE5	Acanthamoeba_polyphaga_lentillevirus	2.2e-20	27.5
WP_017378152.1|2419796_2420255_+	NfeD family protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875854.1|2420376_2421252_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_036772169.1|2422738_2423614_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_048875853.1|2423812_2424004_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875852.1|2424208_2425504_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275379.1|2425823_2426042_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375941.1|2426078_2427458_-	phosphomannomutase/phosphoglucomutase	A0A127AWJ1	Bacillus_phage	3.0e-53	30.9
WP_017375942.1|2427485_2427944_-	dUTP diphosphatase	G0YQD9	Erwinia_phage	3.5e-51	68.0
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Sequences of DBSCAN-SWA_27

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27

>NZ_CP013811|2510220:2570857|DBSCAN-SWA
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MKLDQSTFVVSNPDKLSLTNEKLNNLRAKQEKTKVGLTQRLKAVRLEILIKGFDKELECEPTEIADKERDHLQTEMIPKI
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MMKSLKIVFAGTPEFAAEILSMVAKTSHQVIAVYSQPDRPQGRGRKLVATPVKQLAETLNIGVFQPESLKTLADQDALRALEPDLMIVAAYGMLLPEAVLKIPVLGCINVHTSLLPRWRGAAPIQRAIEAGDHESGVTIMQMDTGLDTGDSLAQARCAIACTDTSVDLYYKLLNLTADVLPQVINNLAENDVIRTAQGEQGATYARKLSKQEACLDWSDSAVMLDCKIRAFNPWPIAFSVLDGENVRIWQAKVLTVASDRVVSRQYEPEPGTIIQHHAEGIEVMTGAGHLLIQQLQLPGSKVLSAREVLNGKAARFAVGRCFGE
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MIFTARQLTLITRLLKEQLAEDEDYLFHAIQLTVSQSQDEELEVTIQQNKPVTVNITHLSIQNTMGVDLHGYTTSKWDEYNNNYYKKPRKRTFAERCTETIVYTPTYSEKIMAKYHALFLQQDKHIHNLLQATPLPLELDHEIVEFSIGQGPCQQLGKCSDLLYRHATNPESESITTTGCCAVL
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MQIKPLVILDRDGVINEDSEHYIKSAAEWQPIKDSLTAIAKLNTAHIKVAIATNQSGIYRGYFTLATLHDMHKKMAHLLAEQYGHIDHIEYCPHGPTEGCSCRKPAPGMLKTIITHFQLTPEHAYFVGDSFKDIQAAQAIGCTPILVLSGKGGDTLKKHPKLEKQIKIFHTLNHFVNELLANANTTA

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_017377392.1|2512130_2512727_+	biotin/lipoyl-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377391.1|2512997_2513576_+	HlyD family efflux transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_017377386.1|2518098_2519604_-	YifB family Mg chelatase-like AAA ATPase	NA	NA	NA	NA
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WP_047927397.1|2522560_2524132_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051929687.1|2524149_2525349_-	glycosyltransferase family 2 protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036771983.1|2528415_2529087_-	phosphoribosylanthranilate isomerase	NA	NA	NA	NA
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WP_017377373.1|2530888_2531467_-	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	1.1e-44	44.5
WP_017377372.1|2531463_2532933_-	anthranilate synthase component I family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209719.1|2532976_2533264_-	trp operon repressor	NA	NA	NA	NA
WP_026063627.1|2533464_2534385_+	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017377369.1|2534500_2535055_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377368.1|2535170_2535596_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771981.1|2535866_2536217_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242711.1|2536410_2536950_+	peroxiredoxin	NA	NA	NA	NA
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WP_027242708.1|2539619_2539964_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376171.1|2540142_2541117_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
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WP_048875961.1|2541662_2543066_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_048875844.1|2543070_2544090_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_075275373.1|2544706_2545036_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378398.1|2545261_2545660_-	DUF3135 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017378401.1|2549697_2550213_+	acyl-CoA thioesterase	NA	NA	NA	NA
WP_017378402.1|2550221_2550785_+	D-glycero-beta-D-manno-heptose 1,7-bisphosphate 7-phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_017378403.1|2550765_2551512_+	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017378404.1|2551650_2552103_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_047927132.1|2552238_2553075_+	sterol desaturase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242707.1|2553071_2553968_+	DMT family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017378407.1|2554000_2555068_+	4-oxalomesaconate tautomerase	NA	NA	NA	NA
WP_016210352.1|2555086_2555455_-	diacylglycerol kinase	NA	NA	NA	NA
WP_080963575.1|2555480_2556932_-	potassium transporter	NA	NA	NA	NA
WP_017378410.1|2556938_2558318_-	Trk system potassium transporter TrkA	NA	NA	NA	NA
WP_036773239.1|2558358_2559672_-	16S rRNA (cytosine(967)-C(5))-methyltransferase RsmB	NA	NA	NA	NA
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WP_017378413.1|2560729_2561233_-	peptide deformylase	E3SLL2	Synechococcus_phage	5.4e-13	37.1
WP_017378414.1|2561367_2562519_+	DNA-protecting protein DprA	NA	NA	NA	NA
WP_016210342.1|2562515_2562995_+	DUF494 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242705.1|2563141_2565463_+	type I DNA topoisomerase	A0A1V0SCS0	Indivirus	7.9e-99	35.9
WP_080963576.1|2565407_2566034_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378416.1|2566038_2566938_+	oxygen-dependent coproporphyrinogen oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_036773242.1|2567118_2567673_+	DUF4823 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|2567712_2568687_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_069971663.1|2568905_2569148_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|2569882_2570857_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9

Sequences of DBSCAN-SWA_28

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28

>NZ_CP013811|2637249:2752766|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_28

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036772645.1|2693499_2694273_-	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_027243066.1|2694691_2695048_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420745.1|2695079_2695532_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_017376237.1|2721815_2722568_-	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_027242703.1|2728247_2728871_+	phosphatase PAP2 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017376187.1|2734587_2735595_+	dTDP-glucose 4,6-dehydratase	A0A1D7XFE8	Escherichia_phage	3.0e-79	49.7
WP_017376186.1|2735614_2736022_+	adenylyltransferase/cytidyltransferase family protein	A0A1V0SGE7	Hokovirus	1.3e-28	50.4
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WP_027242702.1|2737435_2738608_+	glycerophosphotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017376183.1|2738639_2739491_+	glycosyltransferase family 2 protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242701.1|2739500_2740664_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242700.1|2740660_2741668_+	glycosyltransferase family 4 protein	B6EFC4	Stygiolobus_rod-shaped_virus	3.4e-06	35.1
WP_027242699.1|2741664_2742801_+	glycosyltransferase family 4 protein	NA	NA	NA	NA
WP_017376177.1|2742797_2743724_+	NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein	A0A2K9L4U8	Tupanvirus	3.0e-57	44.2
WP_017376176.1|2743818_2745219_-	mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase	A0A1V0SH58	Hokovirus	4.0e-53	31.1
WP_144420747.1|2745506_2746895_+	undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_036771589.1|2746976_2747804_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771607.1|2748022_2749027_+	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_016209597.1|2749080_2749311_-	cold-shock protein	A0A2H4N7Y6	Lake_Baikal_phage	1.0e-06	40.7
WP_036771588.1|2749318_2750197_-	RNA polymerase sigma factor RpoH	A0A248SJA5	Salicola_phage	2.0e-39	40.9
WP_017376171.1|2750333_2751308_-|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	3.6e-29	32.9
WP_017376170.1|2751665_2752766_+|protease	trypsin-like serine protease	A0A1B1IT49	uncultured_Mediterranean_phage	1.4e-21	28.3

Sequences of DBSCAN-SWA_29

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29

>NZ_CP013811|2825759:2956871|DBSCAN-SWA
TATGATTAAAAACATCATGCTATGGCTGGTTATCGCTTTGGTATTGGTGACTGTGTTTAGTAATTTAGGCCCACGTCAGCAGTCGGTGAATCGGCTAGATTATTCAACATTTGTTAAAGATATCAATAATGGTCAAGTAAAAAGCGTTATCATTGATGGTTTGAATATTAAAGGACAAACCTCAAGTGGTACGCCATTTGCCACCTATATTCCGTGGAAGGATCCGTTTTTAATGGATCAAATGCTGTCGAAAAATGTCACAATTGCGGCTAAACCACCTGAGCAGCGTAGCTGGCTATTGTCTGCATTAATTAGCTGGTTCCCTGGTATTTTATTAATTGCAATTTGGATCTTCTTTCTGCGGCAGATGCAAGGCGGAGGCGGGGGCAAGGGCATGATGTCCTTTGGTTCCAGTAAGGCGCGTCTGCTTGGCGAAGATCAAATTAAAGTTAACTTTGCTGATGTTGCTGGCTGTGAAGAGGCTAAAGAAGAAGTAAAAGAACTGGTAGATTTTCTGCGTGACCCAACCAAATTCCAAAAATTAGGCGGCAAAATTCCGCAAGGGGTATTGATGGTTGGCCCACCTGGAACAGGTAAGACGCTATTAGCTAAAGCCATTGCAGGTGAGGCGAAAGTCCCGTTCTTTTCTATTTCAGGTTCTGATTTTGTTGAAATGTTCGTCGGTGTCGGTGCATCACGGGTGCGTGATATGTTTGATCAGGCAAAAAAACGCGCACCGTGTATTATCTTTATCGATGAGATTGATGCAGTGGGCCGTCACCGTGGCTCAGGTATGGGTGGTGGTCATGACGAACGTGAGCAGACCTTAAATCAAATGCTGGTTGAGATGGATGGTTTCGAGGGAACCGAAGGGGTGATTGTCATTGCCGCGACGAATCGTCCGGATGTGTTGGACCCGGCATTATTGCGCCCCGGGCGTTTTGATCGCCAGGTCAGTGTCGGTCTGCCTGATGTCAAAGGCCGTGAGCAGATTCTAAAAGTGCATATGCGTAAAGTGCCTTTGGGAGATGATGTCAAAGCTTCATTGATTGCCCGTGGTACGCCTGGGTTTTCAGGGGCGGATTTGGCTAACTTGGTCAATGAAGCCGCACTCTTTGCCGCGCGTAAAGATAAAACCGTGGTTGCTATGCGTGAGTTTGATGATGCCAAAGATAAAATCTTGATGGGCACTGAGCGGCGCTCAATGGCAATGACCGAAGAGCAAAAACGTTTAACCGCTTTTCATGAGGCAGGGCACGCGATTGTAGGATGTTTGGTACCTGATCATGATCCGGTGTATAAAGTCTCGATTGTGCCGCGGGGTCGTGCCTTAGGTGTGACCATGTATCTGCCTGAAGAGGATAGTTATGGTTATTCGCGCGAGCGCTTGGAGAGTTTAATTTCGAGTATGTACGGCGGTCGTATTGCTGAAGCTTTAGTCTTCGGTGTTGAGAAAGTAACGACTGGGGCATCGAATGACATTGAAAAAGCCTCAGAAGTGGCGCGCAATATGGTGACAAAGTGGGGGCTGTCTGAGCGTTTAGGGCCGATATTATATGGACAAGAAGGCGGTGATCCGTTTGGTTATGGCGCGGGTAAAGGCACGCCGGAATTTTCAGATCAAACCTCTGTTGCTATTGATGAGGAAGTGCGTCAGATCATTGATCGTAATTATACTCGCGCTGAGAGCATTCTAATCGATAATCGGGATATTCTTGATGCGATGGCGGATGCTTTGATGGTCTATGAGACGATTGATCGTGAGCAAGTGGCTGATCTAATGGCGCGTCGTCCGGTGAAAGCGCCGAAAGATTGGGATCAACCCTCTGATGAGAGTGGCTCATCAGCATCTGGTGATGAGTTACAACCTCTTGATGCTAATATCAATACTGATATTAATGATACTAAGAGCGCTGATCAAGAGATAGACCAGGGCGCGCCGTCGCCAGAAATAAAGGGTAAACCAGCGGATGATCCTACCTAATAATTACCCTTCATCTTTTTAATATTATTTAAATTTTTATAGATCTTAAGTAGATAAATGATAAAGGGCACGGGTTGCCCTTTTTTCTTGAGTAACATAAAGAAGATATTAACTAAAAGAAAGATAGATGGCTTGGTATCTGGATCGTATTTTTGATAGCGCTAGAGGGCATTGGCTAGGATAGCGATAGTGAGTGAAGTGAGAAAACAATGAGTATAAAACGTAAATATTTTGGTACGGATGGTGTGCGTGGACGGGTTGGTCAGGCACCGATTACCGCTGATTTTATTTTACAGTTAGGCTGGGCAGTCGGTAGCGTGATTCGTCGTGAAAGCGGTGCGGGTAAGGTTGTGATTGGTAAGGATACACGGATTTCAGGCTATATGTTTGAAGCGGCGCTTGAAGCGGGCTTTTCAGCAGCAGGAGTGGATGTGTACCTACTCGGGCCAATGCCAACACCAGCGATTGCTTATTTGACACGGACTTTTCATGCCGATGCAGGGGTGGTGATCAGTGCCTCACATAATCCTTATTATGATAATGGCATTAAGTTTTTCTCAGCCCAAGGGGTAAAGCTCCCTGATCATATTGAGCTGATGATTGAAGCTGAGCTTGAGAAGCCGATGCAGACAGTGGAGTCATTAGAGTTGGGTAAAGCGTGGCGGATTGATGATGCCCCCGGGCGGTATATTGAATACTGTAAGGCAACGATTCCAAATGATTTGACTTTGTCTGGTTTAAAAATTGTCGTTGATTGTGCGCATGGCGCGACTTATCACGTTGCACCCAGCGTATTTCGAGAGTTGGGTGCTGAGGTGGTAACCATTGGTGTTGAACCAAATGGGACGAATATTAATGATAATGTGGGTGCAACATCACCGCAGGCTTTGTGTAAGAAAGTGCTTAGCGAAGGAGCAGATATTGGTATTGCTCTGGATGGTGATGGTGATCGCTTGATTGTAATTGACCATGCTGGCAGTGTTGTTGATGGTGATGATTTACTGTATATCATGGCCAAAGACTATCAACAGCAAGGGGTATTGCAAGGAGGTGTTGTCGGTACGGTGATGAGTAACTTGGGGCTGGAAAAGGCACTCGATCGTGAAAATATTGCTTTTGTCCGTGCGCAGGTGGGTGATCGTTATGTGGTTGAAGAGATGCACGCGCGTGCTTGGAATTTAGGCGGTGAATCCTCAGGCCATTTAATTTGTAGTGATGTGACGACGACAGGTGATGGTATTGTTGCTGCTTTGCAAGTGCTGGCGAGTATGAAGCGCTTGGGTAAGAATATTCAAGAATTAAAAGCTGGTTTTAAAAAATACCCGCAGAAAATGATTAATGTACCGGTTAAGAAAAGGCTAGGTCATCAGGCATGGGAAAAAGTCAATCAAGAAGTAGTCAAAGCAGAAGCGCAATTGGGTGAGCGCGGTCGAGTTTTGCTGCGACCTTCTGGAACAGAGCCTTTGGTACGGGTGATGGTTGAAGGTGAAAATATGGGGGAAATTACCCGCTGTGCAGAAGATCTCGCTGACGTGGTACGAGAGTATAGTTAAATTTACCGACTCTCTCATTTTTAAAATAATAGTGCAATGGTTGATATGGCCGCCACACGGTGGTTGACTAGGCTTTCGTATTAAAAAAGAGTAGACTATGGTGCGTAAGGAATGCCTGCTGTTTAAGAAACGGTTGTCCGATGCTTAATAAAAAGAGATATTTTCGGCGCTTTATGGACAGATTAATTTAAGGCAAATTTGTGTTTAGTATATGAAATAACCGGCAATAATGCTGAGACTGAATAAATTTAAGGATAAGGGTGGTTATGTCTAGTATCCATGATATTGATCCACAAGAAACAAGCGAATGGCTTGATTCAATCAACTCTGTTGCAAAGGCAGATGGTAGTGAGCGCGTTGGCTTTTTATTAAATAAAGTGAAAGAGCGTGCGCGGGAACTTGGTGTAAATGTTGGTTCAGAACAGATTACGACCCCTTATATCAATACAATTCCCGTTGAAGCAGAGGTGATGATTCCTGCAGATAAAAAGCTTGAAGCACGCCTAGAAGCATTGGTGCGTTGGAATGCTGCAGCGATGATCGTCCATGCCAACCGTCAAGATTCGACTTTAGGTGGCCATATTGGCTCGTATGCATCAAGCTCGACCTTGTATGAAGTGGGTTTTAACCACTTTTTTGCAGGTCCTGATGCTGAACAGGGCAGTGATTATGTTTATTTTCAGGGCCATATTGCCCCAGGAATTTATGCGCGTTCTTATTTGGAAGGACGTCTAACAGAAGAGCAAATTAGAAATTTCCGTCAAGAAACCATGGGCAAGGGTTTATCGTCTTATCCTCATCCATGGCTACAGCCCACCTATTGGCAATTTCCAACCGTGTCTATGGGCTTAGGTCCATTGTCGGCAATTTACCAAGCACGTTTTGCTAAATATTTGCATAATCGTGAGATTATAAAAACCGATCAACGCCATATCTGGTGTTATTGTGGTGATGGTGAGATGGATGAACCAGAATCACTTGGTGCTATTAGTTTGGCTGGCCGTGAAAAACTTGATAATTTAATTTTTGTGATAAATTGTAATTTACAGCGTTTAGATGGTCCTGTGCGTGGTAACTCGAGCATTGTCCAAGAGCTAGAAGGCGTATTCCGCGGTGCCGGCTGGAATGTGATTAAAGTATTATGGAGCACGGATTGGGATGAGCTCTTTGCGAAAGACCATTCTGGCAAATTAATGCAGCGTATGAGCGAAGTCTGTGATGGTGAATATCAAGCTTATAAGGCAAAAGGTGGCGCGTATTTGCGTGAGAATTTCTTTGGCAAATACCCAGAATTAGTTGAGTTGGTTAAAGATAAGAGTGATGATGAGTTAGCCGCTTTACGTCGTGGTGGCCATGATACCCAAAAAGTCTTTAATGCGTATAAGCAAGCGACGGAAACGAAAGACAAGCCAAGCGTTATTTTGGCAAAAACCGTTAAAGGCTATGGCATGGGTGATGCGGGT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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_017377604.1|2825759_2827742_+|protease	ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH	G9E4U6	Ostreococcus_lucimarinus_virus	1.0e-115	41.1
WP_017377605.1|2827951_2829295_+	phosphoglucosamine mutase	NA	NA	NA	NA
WP_017377606.1|2829561_2832231_+	pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring), homodimeric type	NA	NA	NA	NA
WP_017377607.1|2832254_2834171_+	pyruvate dehydrogenase complex dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_026063653.1|2834340_2835762_+	dihydrolipoyl dehydrogenase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	3.1e-45	28.1
WP_017377609.1|2835906_2836881_+	phospholipase A	NA	NA	NA	NA
WP_027242692.1|2836890_2837190_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377612.1|2837307_2837529_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377613.1|2837692_2839354_-	chaperonin GroEL	A0A2I7SAK5	Vibrio_phage	7.7e-181	64.5
WP_016209850.1|2839426_2839717_-	co-chaperone GroES	A0A221S322	uncultured_virus	3.3e-15	42.6
WP_017377614.1|2839943_2840399_+	type II 3-dehydroquinate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_017377615.1|2840463_2840928_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242691.1|2841019_2842366_+	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit	NA	NA	NA	NA
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WP_017375625.1|2954361_2954589_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_069971669.1|2955632_2956871_-|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_30

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30

>NZ_CP013811|2964837:3018251|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_31

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31

>NZ_CP013811|3075260:3131253|DBSCAN-SWA
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MAVQKFKLELKSAKMITPGIRHMAFTRTDNQPLDYKPGQFISFLFNVDSKTKRRSFSIATIPGQTDEIEIAISYVKGGLASEVLFNLEPGQTLDAMGPAGRLVLQEEPAKRILLTGTGTGIAPYRCMLPQIIEKLATNPTLMITVILGVQYRQDALYAEDFRNFAKQHERLEFRVCYSREDLKQEQPPTTPLITDEYSGYVQHQFDSLNMNPDNDIVYLCGNPNMIDDSFNKLTAMGFVMKQVRREKYISPN
>NZ_CP013811|3075260:3131253|3093810_3094860_+|WP_017378378.1|DBSCAN-SWA
MFKIGNYEISRENKPFIIAEMSGNHNNSLDRALEIVEAAAKAGADAIKLQTYTADTMTLDVDKDDFKIMDKNSLWYGQHLYELYQQANTPWEWHETIFNKAKELGILCFSSPFDSTAVDFLEELNAPAYKIASFENKDVNLIRKVAKTGKPVIISTGMASLADLHLITETLRESGCTNFILLKCTSAYPASPADANLAMMAHMGEMFDCQVGLSDHTMGVGVPVAAVALGATVIEKHFCLSREEGGVDADFSLEPREFSVLVEETKKAWQSIGSISYQLPVAEEKSKQFRRSIYFVKDMQPGEVITEECVRCIRPGYGLEPQYWDKVIGCKVRRKVVTGDRVEWECLEF
>NZ_CP013811|3075260:3131253|3075260_3076424_+|WP_048875895.1|transposase|DBSCAN-SWA
MSQKRKKPSAEFKTKVVLEVIEGDQTLNQICSKYELVPKTVQNWKKVFLANASLAFNIDSAVAEFKDEIKTKEKEVNELHRQLGKRTAELEWAAKKLKSLDYETRKCLIESEPKNIPVTRQCELINFNRSNCYYKSVRCTKDKMELLRAIDRIYTETPFYGYHKVHQQLIEGGYSVGLNRVRNYMNELGLKVIYPTKKVCTTLAHPEHKKYPYLLRDLEVYKPNQVWSTDITYIRLDGGFVYLAAVIDWHSKAILSHKISTTMDSSLVINVLKQALERYGTPEIFNTDQGSQYTSHDHTQLLIDRGIKISMDGKGRATDNIAIERFWRSAKYENIYLSEYTNIKELKAGVTEYIEFYNNKRFHQTLDYKKPMDVYCNLQPQLLLEAA
>NZ_CP013811|3075260:3131253|3087930_3089304_+|WP_144420609.1|DBSCAN-SWA
MPIQAAAVHHVLLECGSNFEAIYHITNKPLIDKTLVNYQSLSFDSVAAMDPDDPSFSEQVKRPVDAQLLEELAAFEPTVLKLVERIFPKKRRYRYFDLRRHLYYSYLSYWSNFLKDNKIDKVIFDDVPHVGFDYVLYILSKHYGIKVIVPFQLQVVDAYLIANDIKTLFLPLKDALDALGSQSVSLNELSPRMQKEYEIRMSENSPFYMLDKRQSSIKSSILRLYRRYISLSEKEQQIRHEIVKPSFKCVHIKEVNFDRPYVYFGLHYQPEMTTNPLGGRYVDQFLAIQLISKVLPDGVKLYIKEHPAIYKERNPSGRFVEFYEKIAQLPGVSFVPQNTRSLELIKNSQAVATITGTTGWEALFMGKPVFVFGNIFYKYCQGVYPIYSYKDMQVAADAVFNRAEKPTESDILRFLKALDQVSGNGIIRDEYFAISCNQDKVYHNKNTSLIVRKMLNM

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_048875895.1|3075260_3076424_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	3.8e-25	32.0
WP_144420756.1|3076477_3077479_-	EF-P beta-lysylation protein EpmB	NA	NA	NA	NA
WP_017378362.1|3077560_3078130_+	elongation factor P	NA	NA	NA	NA
WP_144420608.1|3078343_3079315_+	elongation factor P--(R)-beta-lysine ligase	A0A1V0SAC0	Catovirus	7.3e-22	25.9
WP_017378364.1|3079326_3080922_+	glycosyltransferase family 39 protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772406.1|3080942_3081974_+	glycosyltransferase family 4 protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378367.1|3082305_3083409_-	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017378368.1|3083520_3084705_-	pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_017378369.1|3084782_3086771_+	excinuclease ABC subunit UvrB	NA	NA	NA	NA
WP_144420609.1|3087930_3089304_+	capsule biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378374.1|3089321_3090308_+	UDP-N-acetylglucosamine 4,6-dehydratase (inverting)	K7Y9E1	Megavirus	2.2e-42	34.2
WP_080963622.1|3090310_3091465_+	UDP-4-amino-4, 6-dideoxy-N-acetyl-beta-L-altrosamine transaminase	A0A2D2W2B8	Stenotrophomonas_phage	2.3e-14	28.2
WP_017378376.1|3091461_3092157_+	pseudaminic acid cytidylyltransferase	A0A1B1IVD3	uncultured_Mediterranean_phage	8.6e-09	32.3
WP_017378377.1|3092299_3093790_+	UDP-2,4-diacetamido-2,4, 6-trideoxy-beta-L-altropyranose hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_017378378.1|3093810_3094860_+	pseudaminic acid synthase	NA	NA	NA	NA
WP_027242727.1|3094926_3096321_-	capsule biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378381.1|3097253_3099185_+|tRNA	threonine--tRNA ligase	A0A2K9L297	Tupanvirus	3.1e-117	36.0
WP_075273353.1|3099189_3099720_+	translation initiation factor IF-3	A0A2L0UZ54	Agrobacterium_phage	4.7e-15	33.9
WP_017378382.1|3099754_3099949_+	50S ribosomal protein L35	NA	NA	NA	NA
WP_016210495.1|3099991_3100351_+	50S ribosomal protein L20	NA	NA	NA	NA
WP_017378383.1|3100482_3101478_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit alpha	A0A2I2L4E3	Orpheovirus	3.2e-33	36.5
WP_017378384.1|3101490_3103872_+|tRNA	phenylalanine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_016211707.1|3103877_3104165_+	integration host factor subunit alpha	A0A0H3UZA0	Geobacillus_virus	3.0e-08	33.7
WP_080963621.1|3104431_3104638_-	YbhB/YbcL family Raf kinase inhibitor-like protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378388.1|3106246_3107020_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378389.1|3107021_3107963_-	hypothetical protein	A0A068C8G6	Acinetobacter_phage	1.7e-20	26.5
WP_017378390.1|3108096_3109674_-	FMN-binding glutamate synthase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_036816949.1|3109867_3110266_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017378393.1|3111266_3111473_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048875897.1|3112277_3112922_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	2.7e-09	35.2
WP_069971672.1|3112989_3114246_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_017376600.1|3114501_3114681_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_047927402.1|3114903_3115131_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377704.1|3116406_3117165_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420757.1|3117382_3117946_+	DNA-3-methyladenine glycosylase I	NA	NA	NA	NA
WP_017377702.1|3118049_3118598_+	DUF2058 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_087910634.1|3119194_3120347_+|transposase	IS3 family transposase	A0A0P0I4A4	Acinetobacter_phage	2.3e-59	44.5
WP_017377698.1|3120692_3120989_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420758.1|3121248_3122160_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377696.1|3122394_3122934_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_155046620.1|3124096_3124234_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017377694.1|3124480_3125209_-|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	7.8e-45	42.7
WP_017377686.1|3125255_3125864_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016210764.1|3127138_3127399_-	30S ribosomal protein S20	NA	NA	NA	NA
WP_017377283.1|3127572_3129111_+	murein biosynthesis integral membrane protein MurJ	NA	NA	NA	NA
WP_017377282.1|3129289_3130216_+	bifunctional riboflavin kinase/FAD synthetase	A0A1V0SJE1	Klosneuvirus	1.6e-10	34.5
WP_048875900.1|3130320_3131253_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	9.4e-27	33.8

2. NZ_CP013814

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP013814_1

• CRISPR_ID: NZ_CP013814_1
• CRISPR_location: 10747-10886
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 2 spacers

Consensus repeat of NZ_CP013814_1

Consensus_repeat	Method
CCCAGTTCCCAACTATTTTGTCA	PILER-CR

spacers of NZ_CP013814_1

>1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR
TTTTTAATTTTCGTATTAGCTTACGACGCTACA
>1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR
CTCTTCCCTAAATAATCCTTAAAAACTCCATTTCCACCCCT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP013814_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP013814_1

>merge|NZ_CP013814|1|10747-10886|PILER-CR
AGTTCCAAACTATTTTGTCATTTTTAATTTTCGTATTAGCTTACGACGCTACACCCAGTTCCCATCTATTTTGTCACTCTTCCCTAAATAATCCTTAAAAACTCCATTTCCACCCCTCCCAGTTCCCAACTATTTTGTCC

>NZ_CP013814|1|1|10747-10886|PILER-CR
AGTTCCAAACTATTTTGTCATTT	TTAATTTTCGTATTAGCTTACGACGCTACACCC
AGTTCCCATCTATTTTGTCACTC	TTCCCTAAATAATCCTTAAAAACTCCATTTCCACCCCTCCC
AGTTCCCAACTATTTTGTCC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP013814.1|WP_041692625.1|13824_14019_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013814.1|WP_012850370.1|18722_19463_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|368639
NZ_CP013814.1|WP_012850369.1|19462_20110_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239736
NZ_CP013814.1|WP_041692624.1|15497_15920_-|antirestriction-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377006
NZ_CP013814.1|WP_011751353.1|4124_4766_+|type-A-2-chloramphenicol-O-acetyltransferase-CatII	unknown	unknown	gnl|CDD|366012
NZ_CP013814.1|WP_069971684.1|13309_13624_-|transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|374591
NZ_CP013814.1|WP_001444089.1|6713_7211_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013814.1|WP_004235553.1|2990_3923_-|IS5-like-element-ISKpn13-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225581
NZ_CP013814.1|WP_000071896.1|8979_9516_+|class-2-integron-integrase-IntI2	unknown	unknown	gnl|CDD|131303
NZ_CP013814.1|WP_155763435.1|6497_6653_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP013814.1|WP_012850378.1|12553_13306_-|ParA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224113
NZ_CP013814.1|WP_000497519.1|9630_9957_+|tyrosine-type-recombinase/integrase	unknown	unknown	gnl|CDD|131303
NZ_CP013814.1|WP_001206315.1|7286_8075_-|ANT(3'')-Ia-family-aminoglycoside-nucleotidyltransferase-AadA1	unknown	unknown	gnl|CDD|184296
NZ_CP013814.1|WP_012850379.1|11336_12554_-|ParB/RepB/Spo0J-family-partition-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|319256
NZ_CP013814.1|WP_004235553.1|5439_6372_+|IS5-like-element-ISKpn13-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225581
NZ_CP013814.1|WP_012850372.1|18005_18317_-|HigA-family-addiction-module-antidote-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225635
NZ_CP013814.1|WP_012850373.1|16456_17821_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|374806
NZ_CP013814.1|WP_001353740.1|10144_10384_-|DUF1819-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378066
NZ_CP013814.1|WP_012850375.1|14392_15388_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224117
NZ_CP013814.1|WP_000704156.1|8132_8657_-|streptothricin-N-acetyltransferase-Sat2	unknown	unknown	gnl|CDD|366181

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP013814.1|WP_012850370.1|18722_19463_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|368639	pfam05857, TraX, TraX protein. This family consists of several bacterial TraX proteins. TraX is responsible for the amino-terminal acetylation of F-pilin subunits.	3.15068e-16
NZ_CP013814.1|WP_012850369.1|19462_20110_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein	gnl|CDD|239736	cd03767, SR_Res_par, Serine recombinase (SR) family, Partitioning (par)-Resolvase subfamily, catalytic domain; Serine recombinases catalyze site-specific recombination of DNA molecules by a concerted, four-strand cleavage and rejoining mechanism which involves a transient phosphoserine linkage between DNA and the enzyme. They are functionally versatile and include resolvases, invertases, integrases, and transposases. This subgroup is composed of proteins similar to the E. coli resolvase found in the par region of the RP4 plasmid, which encodes a highly efficient partitioning system. This protein is part of a complex stabilization system involved in the resolution of plasmid dimers during cell division. Similar to Tn3 and other resolvases, members of this family may contain a C-terminal DNA binding domain.	3.10211e-54
NZ_CP013814.1|WP_041692624.1|15497_15920_-|antirestriction-protein	gnl|CDD|377006	pfam03230, Antirestrict, Antirestriction protein. This family includes various protein that are involved in antirestriction. The ArdB protein efficiently inhibits restriction by members of the three known families of type I systems of E. coli.	2.45408e-38
NZ_CP013814.1|WP_011751353.1|4124_4766_+|type-A-2-chloramphenicol-O-acetyltransferase-CatII	gnl|CDD|366012	pfam00302, CAT, Chloramphenicol acetyltransferase.	3.85261e-120
NZ_CP013814.1|WP_012850378.1|12553_13306_-|ParA-family-protein	gnl|CDD|224113	COG1192, Soj, ATPases involved in chromosome partitioning [Cell division and chromosome partitioning].	4.52959e-47
NZ_CP013814.1|WP_004235553.1|2990_3923_-|IS5-like-element-ISKpn13-family-transposase	gnl|CDD|225581	COG3039, COG3039, Transposase and inactivated derivatives, IS5 family [DNA replication, recombination, and repair].	2.46073e-28
NZ_CP013814.1|WP_000071896.1|8979_9516_+|class-2-integron-integrase-IntI2	gnl|CDD|131303	TIGR02249, Integrase/recombinase_E2_protein., integron integrase. Members of this family are integrases associated with integrons (and super-integrons), which are systems for incorporating and expressing cassettes of laterally transferred DNA. Incorporation occurs at an attI site. A super-integron, as in Vibrio sp., may include over 100 cassettes. This family belongs to the phage integrase family (pfam00589) that also includes recombinases XerC (TIGR02224) and XerD (TIGR02225), which are bacterial housekeeping proteins. Within this family of integron integrases, some are designated by class, e.g. IntI4, a class 4 integron integrase from Vibrio cholerae N16961. [DNA metabolism, DNA replication, recombination, and repair, Mobile and extrachromosomal element functions, Other].	3.54716e-72
NZ_CP013814.1|WP_069971684.1|13309_13624_-|transcriptional-regulator	gnl|CDD|374591	pfam16509, KORA, TrfB plasmid transcriptional repressor. KORA is a family of Gram-negative bacterial proteins that act as global repressors of genes involved in plasmid replication, conjugative transfer and stable inheritance in the IncP group of plasmids. KORA operates as a symmetric dimer, and contacts the DNA via the helix-turn-helix region at the N-terminus.	1.4902e-16
NZ_CP013814.1|WP_000497519.1|9630_9957_+|tyrosine-type-recombinase/integrase	gnl|CDD|131303	TIGR02249, Integrase/recombinase_E2_protein., integron integrase. Members of this family are integrases associated with integrons (and super-integrons), which are systems for incorporating and expressing cassettes of laterally transferred DNA. Incorporation occurs at an attI site. A super-integron, as in Vibrio sp., may include over 100 cassettes. This family belongs to the phage integrase family (pfam00589) that also includes recombinases XerC (TIGR02224) and XerD (TIGR02225), which are bacterial housekeeping proteins. Within this family of integron integrases, some are designated by class, e.g. IntI4, a class 4 integron integrase from Vibrio cholerae N16961. [DNA metabolism, DNA replication, recombination, and repair, Mobile and extrachromosomal element functions, Other].	2.82591e-45
NZ_CP013814.1|WP_001206315.1|7286_8075_-|ANT(3'')-Ia-family-aminoglycoside-nucleotidyltransferase-AadA1	gnl|CDD|184296	PRK13746, PRK13746, aminoglycoside resistance protein; Provisional.	1.61477e-174
NZ_CP013814.1|WP_012850379.1|11336_12554_-|ParB/RepB/Spo0J-family-partition-protein	gnl|CDD|319256	cd16398, KorB_N_like, ParB-like partition protein of low copy number plasmid RK2, N-terminal domain and related domains. KorB, a member of the ParB like family, is present on the low copy number, broad host range plasmid RK2. KorB encodes a gene product involved in segregation of RK2 and acts as a transcriptional regulator, down-regulating at least 6 RK2 operons. KorB binds RNA polymerase and acts cooperatively with several co-repressors in modulating transcription. KorB is comprised of 3 domains, including a beta-strand C-terminal domain similar to SH3 domains and an alpha helical central domain that interacts with operator DNA. In ParB of P1 and SopB of F, the N-terminal region is responsible for interaction with the parA component. However, korB interaction with the RK2 parA-equivalent IncC has been mapped to the central HTH motif. This family is related to the N-terminal domain of ParB, a DNA-binding component of the prokaryotic parABS partitioning system. parABS contributes to the efficient segregation of chromosomes and low-copy number plasmids to daughter cells during prokaryotic cell division. The process includes the parA (Walker box) ATPase, the ParB DNA-binding protein and a parS cis-acting DNA sites. Binding of ParB to centromere-like parS sites is followed by non-specific binding to DNA ("spreading", which has been implicated in gene silencing in plasmid P1) and oligomerization of additional ParB molecules near the parS sites. It has been proposed that ParB-ParB cross-linking compacts the DNA, binds to parA via the N-terminal region, and leads to parA separating the ParB-parS complexes and the recruitment of the SMC (structural maintenance of chromosomes) complexes. The ParB N-terminal domain of Bacillus subtilis and other species contains a Arginine-rich ParB Box II with residues essential for bridging of the ParB-parS complexes. The arginine-rich ParB Box II consensus (I[VIL]AGERR[FYW]RA[AS] identified in several species is partially conserved with this family and related families. Mutations within the basic columns particularly debilitate spreading from the parS sites and impair SMC recruitment. The C-terminal domain contains a HTH DNA-binding motif and is the primary homo-dimerization domain, and binds to parS DNA sites. Additional homo-dimerization contacts are found along the N-terminal domain, but dimerization of the N-terminus may only occur after concentration at ParB-parS foci.	6.38404e-38
NZ_CP013814.1|WP_004235553.1|5439_6372_+|IS5-like-element-ISKpn13-family-transposase	gnl|CDD|225581	COG3039, COG3039, Transposase and inactivated derivatives, IS5 family [DNA replication, recombination, and repair].	2.46073e-28
NZ_CP013814.1|WP_012850372.1|18005_18317_-|HigA-family-addiction-module-antidote-protein	gnl|CDD|225635	COG3093, VapI, Plasmid maintenance system antidote protein [General function prediction only].	3.15361e-31
NZ_CP013814.1|WP_012850373.1|16456_17821_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|374806	pfam16793, RepB_primase, RepB DNA-primase from phage plasmid. RepB_primase is a DNA-primase produced by P4-like phages. It is a zinc-independent primase unlike Pri-type primases. It takes up a dumbbell shaped consisting of an N-terminal catalytic domain separated by a long alpha-helix plus tether and a C-terminal helical-bundle domain. Primases are necessary for phage replication. RepBprime primases such as in this family recognize both ssiA and ssiB, ie only 1 single-stranded primase initiation site on each strand, independently of each other and then synthesize primers that are elongated by DNA polymerase III. The phage is thus replicated exclusively in leading strand mode.	0.00477247
NZ_CP013814.1|WP_001353740.1|10144_10384_-|DUF1819-family-protein	gnl|CDD|378066	pfam08849, DUF1819, Putative inner membrane protein (DUF1819). These proteins are functionally uncharacterized. Several are annotated as putative inner membrane proteins.	2.15941e-15
NZ_CP013814.1|WP_012850375.1|14392_15388_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|224117	COG1196, Smc, Chromosome segregation ATPases [Cell division and chromosome partitioning].	1.29338e-09
NZ_CP013814.1|WP_000704156.1|8132_8657_-|streptothricin-N-acetyltransferase-Sat2	gnl|CDD|366181	pfam00583, Acetyltransf_1, Acetyltransferase (GNAT) family. This family contains proteins with N-acetyltransferase functions such as Elp3-related proteins.	4.87486e-19

Protein sequences

>NZ_CP013814.1|WP_001353740.1|10144_10384_-|DUF1819-family-protein
MTPFRYNSDLTSGSLQTRECRIITGLLLQELDEAAWDKAMYKENVLQKRTQSTVRRISSALRKRLEHLSSDFWAFAFLC
>NZ_CP013814.1|WP_000497519.1|9630_9957_+|tyrosine-type-recombinase/integrase
MFVFPSSTLCNHPYNGKLCRHHLHDSVARKALKAAVQKAGIVSKRVTCHTFRHSFATHLLQAGRDIRTVQELLGHNDVKTTQIYTHVLGQHFAGTTSPADGLMLLINQ
>NZ_CP013814.1|WP_000071896.1|8979_9516_+|class-2-integron-integrase-IntI2
MSNSPFLNSIRTDMRQKGYALKTEKTYLHWIKRFILFHKKRHPQTMGSEEVRLFLSSLANSRHVAINTQKIALNALAFLYNRFLQQPLGDIDYIPASKPRRLPSVISANEVQRILQVMDTRNQVIFTLLYGAGLRINECLRLRVKDFDFDNGCITVHDGKGGKSRNSLLPTRLIPAIK
>NZ_CP013814.1|WP_000704156.1|8132_8657_-|streptothricin-N-acetyltransferase-Sat2
MKISVIPEQVAETLDAENHFIVREVFDVHLSDQGFELSTRSVSPYRKDYISDDDSDEDSACYGAFIDQELVGKIELNSTWNDLASIEHIVVSHTHRGKGVAHSLIEFAKKWALSRQLLGIRLETQTNNVPACNLYAKCGFTLGGIDLFTYKTRPQVSNETAMYWYWFSGAQDDA
>NZ_CP013814.1|WP_001206315.1|7286_8075_-|ANT(3'')-Ia-family-aminoglycoside-nucleotidyltransferase-AadA1
MREAVIAEVSTQLSEVVGVIERHLEPTLLAVHLYGSAVDGGLKPHSDIDLLVTVTVRLDETTRRALINDLLETSASPGESEILRAVEVTIVVHDDIIPWRYPAKRELQFGEWQRNDILAGIFEPATIDIDLAILLTKAREHSVALVGPAAEELFDPVPEQDLFEALNETLTLWNSPPDWAGDERNVVLTLSRIWYSAVTGKIAPKDVAADWAMERLPAQYQPVILEARQAYLGQEDRLASRADQLEEFVHYVKGEITKVVGK
>NZ_CP013814.1|WP_001444089.1|6713_7211_-|hypothetical-protein
MRDLLKVVLSLVLAMASGQALADLPIVLVDEARLPYDYSPSNYDISPSNYDNSISNYDNSPSNYDNSESNYDNSSSNYDNSRNGNRRLIYSANGSRTFAGYYVIANNGTTNFFSTSGKRMFYTPKGGRGVYGGKDGSFCGALVVINGQFSLALTDNGLKIMYLSN
>NZ_CP013814.1|WP_155763435.1|6497_6653_-|hypothetical-protein
MSYEPPRDGYTNGYIVDVMYDNRPSKYPAVFRTYVRIPDYVELGKVRFNQS
>NZ_CP013814.1|WP_004235553.1|5439_6372_+|IS5-like-element-ISKpn13-family-transposase
MPAISSYSSRKSRFLDRMNVLVPWQDIADKLLHVYPSSRRGRRPFPLVLMLRIHCLQLWFDLSDGAAEDALHDVLPFRQFAGICDTVPDRTTIMNFRHFLEKHHAGEQILALINQKLKQAGLMLRQGIIIDATIISAPCSVKNKAGQRDPEMHQTRKGNQWYFGMKAHIAVDAATGLTEKVVTTAANVHDLNAADSLITEPVAIVFADAGYRGAEKRDSLTHRVKEWFIAKGPHAVKKLRQHPRLNKQALHDEYVKAGIRAKVEHPFRILKCQFGFSKTRLRGLMKNHNRLSMLFAMCNLVRAGQLAGMS
>NZ_CP013814.1|WP_011751353.1|4124_4766_+|type-A-2-chloramphenicol-O-acetyltransferase-CatII
MNFTRIDLNTWNRREHFALYRQQIKCGFSLTTKLDITALRTALAETDYKFYPVMIYLISRVVNQFPEFRMAMKDNALIYWDQTDPVFTVFHKETETFSALFCRYCPDISEFMAGYNAVMAEYQHNTALFPQGALPENHLNISSLPWVSFDGFNLNITGNDDYFAPVFTMAKFQQEDNRVLLPVSVQVHHAVCDGFHAARFINTLQMMCDNILK
>NZ_CP013814.1|WP_004235553.1|2990_3923_-|IS5-like-element-ISKpn13-family-transposase
MPAISSYSSRKSRFLDRMNVLVPWQDIADKLLHVYPSSRRGRRPFPLVLMLRIHCLQLWFDLSDGAAEDALHDVLPFRQFAGICDTVPDRTTIMNFRHFLEKHHAGEQILALINQKLKQAGLMLRQGIIIDATIISAPCSVKNKAGQRDPEMHQTRKGNQWYFGMKAHIAVDAATGLTEKVVTTAANVHDLNAADSLITEPVAIVFADAGYRGAEKRDSLTHRVKEWFIAKGPHAVKKLRQHPRLNKQALHDEYVKAGIRAKVEHPFRILKCQFGFSKTRLRGLMKNHNRLSMLFAMCNLVRAGQLAGMS
>NZ_CP013814.1|WP_012850379.1|11336_12554_-|ParB/RepB/Spo0J-family-partition-protein
MTDKTTPKSKGADLSGLDDFNLSSFLEGGKKGKAQEDAGNAAPAGAVSYAPLDHFHEDEDNARQEFDAQRLQELAESMTQVNPKTGEVRGILEPLSVKHHPDKPGHFIINGGARRYRAAKLAGLEQAPYIIKDELDDFDKFVLNDQREQLSPLEIAMFIKARLDEGYSKTEVAKALGRPASYVSDHVIFFDMAGAIRDLYDSERCRSMQALALLHRAHKKNPEPVEAFCQDANENDQELTTSQVRAFLESLKKPEGPKEKDEKPTAPTGDSKDQEPQAPKDEDDNQGDTTPASETQLGEGDTDEEPGDQFPDPSTRNEDQQPLTLDGEPLSGGTLEGQADQMLEQDEKADRIKKAIIQVKHDEREARLLTERRAAYGLAWIKYDDDGQEVEVDLNQVALVAVIEA
>NZ_CP013814.1|WP_012850378.1|12553_13306_-|ParA-family-protein
MQIITVSNQKGGVGKSTVAVHQAMDIQEKGKRVLFLDLDPQANATKTLERIAPPANVTASQLFTESVEAVEPAEGITLIHADGAMADIERAEPSVLSTFKQNLDNLGEAFDYCVIDTPPTLGLRMTAALLVADHVLAPIELEEYSIDGITKMLQTIFGVKEKWNPDLNFLGMLPNRFNPRSLAQKETLTNLVKNYSHLLIKARIGIRSSIPEALSEGIPVWQLKKTSAREAGREFQEAFAIVYEKMGGLK
>NZ_CP013814.1|WP_069971684.1|13309_13624_-|transcriptional-regulator
MKRRLTPSEFDQAVKRLPRAMKARNIQIARAILVEGRKQAELVRETGLSRTAIAAVVRKIREAHETYGQPPEGWERIEVCLPSEMVHLVRALEEEARRQHENED
>NZ_CP013814.1|WP_041692625.1|13824_14019_-|hypothetical-protein
MAEKLVITASAYNAAPSDYRSVWTTERFDLANWSEVRDQYMGKRTLMDRSGLHIEGLTMVILDD
>NZ_CP013814.1|WP_012850375.1|14392_15388_-|hypothetical-protein
MAQGIPTETYDRIVQVANELYEQNGREKMPTVDDVRRAAKADMNTTSAVMREWRKQQTSQAAPVAVPVPAAVQEAFQGALATAWTEAQALANEALSAAQKGWDEERGEADQLRAEMAEAFESQGLELEAVTQQLADEQKAHQATMESAQAARQQIDNLERETQELKTRLATAERQAADRGERAEELKAELAEARADAKEQRKEADRDRKAVEKQHQEEKRSLESLHRQELEKADAAAGELRQRLDTLTGELAQVKARAEAQETQHQEQRQKAEQEAEQAAERVASAQQDREQTRQELAECRERNATLTGELTAVKAQLAELKQAGKGSAKK
>NZ_CP013814.1|WP_041692624.1|15497_15920_-|antirestriction-protein
MNNAAQIETAVTANQIPTTSRINALPRHFGRHMMAVETVVFAYMRELVEAYQGGYWEFYDLSNGGFYMAPTGTQELRVSVSGNYFDGDMSPDAAGIVACLFAYGYLANSTGAAALSRHFHWLRDYALDHPEAGKILAAID
>NZ_CP013814.1|WP_012850373.1|16456_17821_-|hypothetical-protein
MAQQQAAQLALFDQTQEANTYHDAGRRGFFSLLTSKDNGDKRQSSHPLSEMATVLGMVDSTRDTWLSQAEFFRPNRRVVNLLRIGLMFVDLDTYRVPWATGRTPEEQAAGVIYFCQAEGLPLPSLMIYSGRGLQLKWLLDAPIPRQALPRWNACQRHLVDKLAELGADPAAKDASRVLRLVDTVNTKSGNICRVVHVQEEAGEPARYNFEYLCEMLLPVARWDIEAQQKRRRDRQLTLIPGGRQSNLKGFSGRQLAWDRLEDLRRLADLRGGVVEGERMQHLFWRLNFLLLSGATNASLMYHEASALARELDANWNHRSKELMTLYSKAKANEAGETVEFNGRKLPPLYTPRNDTLINLFQITDDEQRQLRTILSKDQALERRRERDRKRDEERRRAAGAIEREAYEANSLSKKKPWEALGMSRAKWYRLGKPMPVESETSPSPITGETAARQA
>NZ_CP013814.1|WP_012850372.1|18005_18317_-|HigA-family-addiction-module-antidote-protein
MNMKRKPKAPGEVLETQFMQPNHITQKELASHTGWTRKHVNELCKGKARVTIDTALILGKAFGTGPDYWLELQQAVDIWDALHSEKRKERLESIVPLMKMVAA
>NZ_CP013814.1|WP_012850370.1|18722_19463_+|hypothetical-protein
MNDGLANSGAALSRSTQSNAWVPLAQWFAVLTMTLEHVTKYVWPESAFVPWALAIGRIAFPVFAGMVAWHLLHNTRRPVRYGLRLLLIGAISQVPYAWVVTPDRLNICFTLAFGLLAVVLLDQVKDRRTRMATGVVLFLLAAVVSPFVEYQILGLLLVPAFVYAFRNHQRVAAMLPALALCAVINGGSPLHMAISCAAGCAVLLAPSMSFEGAAVPALPRGLRLSWYPLHLVAITVAIMAINQGAI
>NZ_CP013814.1|WP_012850369.1|19462_20110_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein
MTVSTIKVARIYQRVSTKDQDLTRQAAIVQDAKAAGYHIAGVYREKASGASADRPELLRMIDDLQPGEVVISEKMDRISRLPLPEAEKLIEAIKGKGAKLAVPGVVDLSDLVEDATGVTRIVLESVQEMLLRVALQTARDDYEDRRERQRQGIELAKEAGRFTGRRPDSKMHARIVALRSRGESIADTAHLVGCGEATVKRVWAAHKAAKASEGE

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	NZ_KX774387	Providencia rettgeri strain 30905 plasmid pC131, complete sequence	10387-10419	0	1.0
NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	NZ_CP053895	Proteus mirabilis strain JPM24 plasmid pJPM24, complete sequence	72648-72680	0	1.0
NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	NZ_KU963389	Escherichia coli strain ECO37 plasmid ECO37P1, complete sequence	15133-15165	0	1.0
NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	NZ_CP047288	Proteus cibarius strain G11 plasmid p152, complete sequence	62060-62092	0	1.0
NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	NZ_CP044485	Acinetobacter schindleri strain HZE30-1 plasmid pHZE30-1-2, complete sequence	28402-28434	0	1.0
NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	NZ_CP025853	Escherichia coli strain 510016 plasmid p510016_36, complete sequence	25816-25848	0	1.0
NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	NZ_KT754165	Shigella dysenteriae 1 strain 93-531-1 plasmid p93-531-1, complete sequence	23240-23272	0	1.0
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NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	NZ_CP024247	Escherichia coli O27:H7 strain B4103-1 plasmid unnamed2	64739-64771	0	1.0
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NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	JX469830	Uncultured bacterium plasmid pG527, complete sequence	41349-41381	0	1.0
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NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	CP025925	Escherichia coli strain 520873 plasmid p520873_36, complete sequence	13633-13665	0	1.0
NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	CP025875	Escherichia coli strain 503458 plasmid p503458_37, complete sequence	10830-10862	0	1.0
NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	NZ_CP013795	Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p4PS8, complete sequence	10767-10799	0	1.0
NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	NZ_CP023380	Escherichia coli strain 127 plasmid p43, complete sequence	15396-15428	0	1.0
NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	NZ_CP011314	Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain 234-12 plasmid pKpn23412-362, complete sequence	172056-172088	0	1.0
NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	NC_008357	Pseudomonas aeruginosa plasmid pBS228, complete sequence	68063-68095	0	1.0
NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	NZ_CP027138	Escherichia coli strain AR_0369 plasmid unnamed2	74789-74821	0	1.0
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NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	NZ_CP045128	Acinetobacter indicus strain XG03 plasmid pXG03-X3, complete sequence	89271-89303	0	1.0
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NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	NZ_MK360096	Salmonella enterica strain 13-SA02717 plasmid pSE13-SA02717, complete sequence	17850-17882	0	1.0
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NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	NZ_KX756453	Klebsiella pneumoniae strain 1194/11 plasmid pKP1194a, complete sequence	42453-42485	0	1.0
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NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	NZ_CP034054	Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2015_112126 plasmid unnamed1, complete sequence	140941-140973	0	1.0
NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	NZ_CP047114	Proteus mirabilis strain SCBX1.1 plasmid plas1.1.2, complete sequence	46467-46499	0	1.0
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NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	NZ_CP053899	Proteus mirabilis strain YPM35 plasmid pJPM35-1, complete sequence	116699-116731	0	1.0
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NZ_CP013814_1	1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR	10826-10866	41	NZ_MK264770	Klebsiella pneumoniae strain KP89 plasmid pKP89, complete sequence	42556-42596	0	1.0
NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	CP052804	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S973 plasmid pN17S0973, complete sequence	113091-113123	2	0.939
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NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	CP052788	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0611 plasmid pN19S0611, complete sequence	321488-321520	2	0.939
NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	CP052786	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0641 plasmid pN19S0641, complete sequence	10079-10111	2	0.939
NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	CP052838	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S097 plasmid pN16S097, complete sequence	13470-13502	2	0.939
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NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	MN310378	Klebsiella pneumoniae strain A2293 plasmid pA2293-Ct2, complete sequence	73380-73412	2	0.939
NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	CP052806	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S816 plasmid pN17S0816, complete sequence	282696-282728	2	0.939
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NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	NZ_CP047882	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain 119944 plasmid pESI, complete sequence	264306-264338	2	0.939
NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	CP052802	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S976 plasmid pN17S0976, complete sequence	197576-197608	2	0.939
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NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	CP052836	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S103 plasmid pN16S103, complete sequence	222743-222775	2	0.939
NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	CP052828	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1126 plasmid pN17S1126, complete sequence	8856-8888	2	0.939
NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	CP052826	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1245 plasmid pN17S0637, complete sequence	292607-292639	2	0.939
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NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	NZ_CP016407	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FSIS1502169 plasmid pFSIS1502169, complete sequence	299920-299952	2	0.939
NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	NZ_CP016413	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM44454 plasmid pCVM44454, complete sequence	295999-296031	2	0.939
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NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	CP052814	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S349 plasmid pN17S0349, complete sequence	281790-281822	2	0.939
NZ_CP013814_1	1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR	10770-10802	33	NZ_MG764552	Klebsiella pneumoniae strain A1763 plasmid pA1763-Ct2, complete sequence	61314-61346	2	0.939
NZ_CP013814_1	1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR	10826-10866	41	NZ_CP053897	Providencia rettgeri strain YPR31 plasmid pYPR31, complete sequence	75936-75976	2	0.951
NZ_CP013814_1	1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR	10826-10866	41	MN310378	Klebsiella pneumoniae strain A2293 plasmid pA2293-Ct2, complete sequence	73436-73476	2	0.951
NZ_CP013814_1	1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR	10826-10866	41	NZ_MH476540	Klebsiella pneumoniae strain KP1276 plasmid pIA/C-KLUC, complete sequence	87160-87200	2	0.951
NZ_CP013814_1	1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR	10826-10866	41	NZ_MG764552	Klebsiella pneumoniae strain A1763 plasmid pA1763-Ct2, complete sequence	61250-61290	2	0.951

1. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_KX774387 (Providencia rettgeri strain 30905 plasmid pC131, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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2. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP053895 (Proteus mirabilis strain JPM24 plasmid pJPM24, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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3. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_KU963389 (Escherichia coli strain ECO37 plasmid ECO37P1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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4. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP047288 (Proteus cibarius strain G11 plasmid p152, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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5. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP044485 (Acinetobacter schindleri strain HZE30-1 plasmid pHZE30-1-2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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6. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP025853 (Escherichia coli strain 510016 plasmid p510016_36, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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7. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_KT754165 (Shigella dysenteriae 1 strain 93-531-1 plasmid p93-531-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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8. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP053372 (Proteus cibarius strain G32 plasmid pG32-177, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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9. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP024247 (Escherichia coli O27:H7 strain B4103-1 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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10. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP053043 (Proteus cibarius strain HNCF44W plasmid pHNCF44W_NDM-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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11. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to JX469830 (Uncultured bacterium plasmid pG527, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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12. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP013819 (Piscirickettsia salmonis strain AY3800B plasmid p3PS10, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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13. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to CP025925 (Escherichia coli strain 520873 plasmid p520873_36, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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14. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to CP025875 (Escherichia coli strain 503458 plasmid p503458_37, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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15. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP013795 (Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p4PS8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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16. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP023380 (Escherichia coli strain 127 plasmid p43, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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17. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP011314 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain 234-12 plasmid pKpn23412-362, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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18. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NC_008357 (Pseudomonas aeruginosa plasmid pBS228, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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19. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP027138 (Escherichia coli strain AR_0369 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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20. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP022673 (Shigella sonnei strain 866 plasmid p866, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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21. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP045128 (Acinetobacter indicus strain XG03 plasmid pXG03-X3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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22. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_LT985250 (Escherichia coli strain 170 plasmid RCS38_p, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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23. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_MK360096 (Salmonella enterica strain 13-SA02717 plasmid pSE13-SA02717, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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24. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP053897 (Providencia rettgeri strain YPR31 plasmid pYPR31, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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25. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_MF150120 (Klebsiella pneumoniae strain A64477 plasmid pKP64477d, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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26. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_KX756453 (Klebsiella pneumoniae strain 1194/11 plasmid pKP1194a, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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27. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NC_015472 (Escherichia coli plasmid pECTm80, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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28. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP013800 (Piscirickettsia salmonis strain AY6532B plasmid p4PS9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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29. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to MG516911 (Proteus mirabilis plasmid pPm60, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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30. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP003997 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae Kp13 plasmid pKP13d, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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31. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to CP054380 (Escherichia coli strain SCU-175 plasmid pSCU-175-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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32. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NC_002525 (Escherichia coli K-12 plasmid R721, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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33. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP048015 (Acinetobacter towneri strain 205 plasmid pAT205, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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34. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP034054 (Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2015_112126 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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35. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP047114 (Proteus mirabilis strain SCBX1.1 plasmid plas1.1.2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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36. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP034046 (Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2014_104014 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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37. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP027700 (Klebsiella pneumoniae strain KP30835 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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38. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP053899 (Proteus mirabilis strain YPM35 plasmid pJPM35-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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39. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_MK264770 (Klebsiella pneumoniae strain KP89 plasmid pKP89, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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40. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_KX774387 (Providencia rettgeri strain 30905 plasmid pC131, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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41. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_MF150120 (Klebsiella pneumoniae strain A64477 plasmid pKP64477d, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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42. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP053895 (Proteus mirabilis strain JPM24 plasmid pJPM24, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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43. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_KX756453 (Klebsiella pneumoniae strain 1194/11 plasmid pKP1194a, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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44. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_KU963389 (Escherichia coli strain ECO37 plasmid ECO37P1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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45. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP047288 (Proteus cibarius strain G11 plasmid p152, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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46. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NC_015472 (Escherichia coli plasmid pECTm80, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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47. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP044485 (Acinetobacter schindleri strain HZE30-1 plasmid pHZE30-1-2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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48. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP025853 (Escherichia coli strain 510016 plasmid p510016_36, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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49. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_KT754165 (Shigella dysenteriae 1 strain 93-531-1 plasmid p93-531-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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50. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP013800 (Piscirickettsia salmonis strain AY6532B plasmid p4PS9, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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51. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP053372 (Proteus cibarius strain G32 plasmid pG32-177, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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52. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP024247 (Escherichia coli O27:H7 strain B4103-1 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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53. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP053043 (Proteus cibarius strain HNCF44W plasmid pHNCF44W_NDM-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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54. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to MG516911 (Proteus mirabilis plasmid pPm60, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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55. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to JX469830 (Uncultured bacterium plasmid pG527, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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56. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP013819 (Piscirickettsia salmonis strain AY3800B plasmid p3PS10, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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57. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP003997 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae Kp13 plasmid pKP13d, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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58. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to CP025925 (Escherichia coli strain 520873 plasmid p520873_36, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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59. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to CP025875 (Escherichia coli strain 503458 plasmid p503458_37, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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60. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP013795 (Piscirickettsia salmonis strain AY6297B plasmid p4PS8, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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61. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to CP054380 (Escherichia coli strain SCU-175 plasmid pSCU-175-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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62. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NC_002525 (Escherichia coli K-12 plasmid R721, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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63. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP023380 (Escherichia coli strain 127 plasmid p43, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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64. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP011314 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain 234-12 plasmid pKpn23412-362, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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65. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NC_008357 (Pseudomonas aeruginosa plasmid pBS228, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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66. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP027138 (Escherichia coli strain AR_0369 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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67. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP022673 (Shigella sonnei strain 866 plasmid p866, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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68. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP048015 (Acinetobacter towneri strain 205 plasmid pAT205, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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69. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP034054 (Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2015_112126 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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70. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP047114 (Proteus mirabilis strain SCBX1.1 plasmid plas1.1.2, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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71. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP034046 (Klebsiella pneumoniae strain KP_NORM_BLD_2014_104014 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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72. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP045128 (Acinetobacter indicus strain XG03 plasmid pXG03-X3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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73. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP027700 (Klebsiella pneumoniae strain KP30835 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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74. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_LT985250 (Escherichia coli strain 170 plasmid RCS38_p, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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75. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_MK360096 (Salmonella enterica strain 13-SA02717 plasmid pSE13-SA02717, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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76. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP053899 (Proteus mirabilis strain YPM35 plasmid pJPM35-1, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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77. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_MK264770 (Klebsiella pneumoniae strain KP89 plasmid pKP89, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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78. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to CP052804 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S973 plasmid pN17S0973, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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79. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to CP038508 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FARPER-219 plasmid p-F219, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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80. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to CP052788 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0611 plasmid pN19S0611, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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81. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to CP052786 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0641 plasmid pN19S0641, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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82. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to CP052838 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S097 plasmid pN16S097, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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83. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to CP051676 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1234 plasmid pN16S1234, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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84. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to CP052779 (Salmonella enterica strain 19TN07GT06K-S plasmid pN19S1233, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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85. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to CP052832 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1040 plasmid pN17S1040, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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86. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to MN310378 (Klebsiella pneumoniae strain A2293 plasmid pA2293-Ct2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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87. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to CP052806 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S816 plasmid pN17S0816, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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88. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to CP052818 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1509 plasmid pN17S1509, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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89. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_MH476540 (Klebsiella pneumoniae strain KP1276 plasmid pIA/C-KLUC, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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90. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to CP052795 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N19S0125 plasmid pN19S0125, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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91. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP047882 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain 119944 plasmid pESI, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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92. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to CP052802 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S976 plasmid pN17S0976, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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93. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to CP052840 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S024 plasmid pN16S024, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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94. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to CP052836 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N16S103 plasmid pN16S103, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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95. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to CP052828 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1126 plasmid pN17S1126, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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96. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to CP052826 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S1245 plasmid pN17S0637, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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97. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP016409 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FSIS1502916 plasmid pFSIS1502916, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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98. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP016407 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain FSIS1502169 plasmid pFSIS1502169, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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99. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP016413 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM44454 plasmid pCVM44454, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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100. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP016411 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain N55391 plasmid pN55391, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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101. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to CP052814 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Infantis strain CVM N17S349 plasmid pN17S0349, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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102. spacer 1.1|10770|33|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_MG764552 (Klebsiella pneumoniae strain A1763 plasmid pA1763-Ct2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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103. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_CP053897 (Providencia rettgeri strain YPR31 plasmid pYPR31, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.951

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***************************************..

104. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to MN310378 (Klebsiella pneumoniae strain A2293 plasmid pA2293-Ct2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.951

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105. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_MH476540 (Klebsiella pneumoniae strain KP1276 plasmid pIA/C-KLUC, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.951

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106. spacer 1.2|10826|41|NZ_CP013814|PILER-CR matches to NZ_MG764552 (Klebsiella pneumoniae strain A1763 plasmid pA1763-Ct2, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.951

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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	0 : 25688	31	Escherichia_phage(27.27%)	integrase,transposase	attL 4548:4563|attR 30340:30355
DBSCAN-SWA_2	37244 : 41957	3	Bdellovibrio_phage(50.0%)	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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MVRKYFGTDGIRGKANEGAMTAETALRVGMAAGRVFRRGDHRHRVVIGKDTRLSGYMLEPALTAGFTSMGMDVFLFGPLPTTYNLSIGFFYVY
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MKATEQHKRRVGKPQTVKPEAPNLVSSWRAIVTRTGTLTEALETMNAALGMKLTHSRITEWEREEKAPSTRVVNYMLATVVPALLLDQGLNENKVRELAGKVRVPGL
>NZ_CP013814|0:25688|8132_8657_-|WP_000704156.1|DBSCAN-SWA
MKISVIPEQVAETLDAENHFIVREVFDVHLSDQGFELSTRSVSPYRKDYISDDDSDEDSACYGAFIDQELVGKIELNSTWNDLASIEHIVVSHTHRGKGVAHSLIEFAKKWALSRQLLGIRLETQTNNVPACNLYAKCGFTLGGIDLFTYKTRPQVSNETAMYWYWFSGAQDDA
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MSKQTEQVLSAFQSGQRVKLGSMSGKAFGKLMNELREFRERQEAA
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>NZ_CP013814|0:25688|4124_4766_+|WP_011751353.1|DBSCAN-SWA
MNFTRIDLNTWNRREHFALYRQQIKCGFSLTTKLDITALRTALAETDYKFYPVMIYLISRVVNQFPEFRMAMKDNALIYWDQTDPVFTVFHKETETFSALFCRYCPDISEFMAGYNAVMAEYQHNTALFPQGALPENHLNISSLPWVSFDGFNLNITGNDDYFAPVFTMAKFQQEDNRVLLPVSVQVHHAVCDGFHAARFINTLQMMCDNILK
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MPAISSYSSRKSRFLDRMNVLVPWQDIADKLLHVYPSSRRGRRPFPLVLMLRIHCLQLWFDLSDGAAEDALHDVLPFRQFAGICDTVPDRTTIMNFRHFLEKHHAGEQILALINQKLKQAGLMLRQGIIIDATIISAPCSVKNKAGQRDPEMHQTRKGNQWYFGMKAHIAVDAATGLTEKVVTTAANVHDLNAADSLITEPVAIVFADAGYRGAEKRDSLTHRVKEWFIAKGPHAVKKLRQHPRLNKQALHDEYVKAGIRAKVEHPFRILKCQFGFSKTRLRGLMKNHNRLSMLFAMCNLVRAGQLAGMS
>NZ_CP013814|0:25688|22482_22971_+|WP_012850364.1|DBSCAN-SWA
MNPKKLLATASLVLASFGGYFAPSSALAASQDECAIWICLPGGFPSGCGAAHSAMIDRVKDMKSPLPSFSSCAVQDGSGSQMSYNYNYAALIAEHRVCSSYRYRRDDRECVSWETVPSRYMKGTRCRVDRDGNRTPRYCVGTYRYVDVFIDGAKAGDTYYWR
>NZ_CP013814|0:25688|10829_11276_-|WP_081329474.1|DBSCAN-SWA
MTEFLYDLPLPVLITGLVLLALLSNFGRPLLRLLGWRKPAHRRRERQARQSLAKLAEIPDPGRKFAFLRSINPFTFEEMILETFEQRGYKVKRNTRYTGDGGIDGRVWLDGDLFLIQAKRYAGHISAAVGGQNSWELGGVEMEFLRII
>NZ_CP013814|0:25688|18722_19463_+|WP_012850370.1|DBSCAN-SWA
MNDGLANSGAALSRSTQSNAWVPLAQWFAVLTMTLEHVTKYVWPESAFVPWALAIGRIAFPVFAGMVAWHLLHNTRRPVRYGLRLLLIGAISQVPYAWVVTPDRLNICFTLAFGLLAVVLLDQVKDRRTRMATGVVLFLLAAVVSPFVEYQILGLLLVPAFVYAFRNHQRVAAMLPALALCAVINGGSPLHMAISCAAGCAVLLAPSMSFEGAAVPALPRGLRLSWYPLHLVAITVAIMAINQGAI
>NZ_CP013814|0:25688|6497_6653_-|WP_155763435.1|DBSCAN-SWA
MSYEPPRDGYTNGYIVDVMYDNRPSKYPAVFRTYVRIPDYVELGKVRFNQS
>NZ_CP013814|0:25688|19462_20110_+|WP_012850369.1|DBSCAN-SWA
MTVSTIKVARIYQRVSTKDQDLTRQAAIVQDAKAAGYHIAGVYREKASGASADRPELLRMIDDLQPGEVVISEKMDRISRLPLPEAEKLIEAIKGKGAKLAVPGVVDLSDLVEDATGVTRIVLESVQEMLLRVALQTARDDYEDRRERQRQGIELAKEAGRFTGRRPDSKMHARIVALRSRGESIADTAHLVGCGEATVKRVWAAHKAAKASEGE
>NZ_CP013814|0:25688|13309_13624_-|WP_069971684.1|DBSCAN-SWA
MKRRLTPSEFDQAVKRLPRAMKARNIQIARAILVEGRKQAELVRETGLSRTAIAAVVRKIREAHETYGQPPEGWERIEVCLPSEMVHLVRALEEEARRQHENED
>NZ_CP013814|0:25688|8979_9516_+|WP_000071896.1|integrase|DBSCAN-SWA
MSNSPFLNSIRTDMRQKGYALKTEKTYLHWIKRFILFHKKRHPQTMGSEEVRLFLSSLANSRHVAINTQKIALNALAFLYNRFLQQPLGDIDYIPASKPRRLPSVISANEVQRILQVMDTRNQVIFTLLYGAGLRINECLRLRVKDFDFDNGCITVHDGKGGKSRNSLLPTRLIPAIK
>NZ_CP013814|0:25688|16456_17821_-|WP_012850373.1|DBSCAN-SWA
MAQQQAAQLALFDQTQEANTYHDAGRRGFFSLLTSKDNGDKRQSSHPLSEMATVLGMVDSTRDTWLSQAEFFRPNRRVVNLLRIGLMFVDLDTYRVPWATGRTPEEQAAGVIYFCQAEGLPLPSLMIYSGRGLQLKWLLDAPIPRQALPRWNACQRHLVDKLAELGADPAAKDASRVLRLVDTVNTKSGNICRVVHVQEEAGEPARYNFEYLCEMLLPVARWDIEAQQKRRRDRQLTLIPGGRQSNLKGFSGRQLAWDRLEDLRRLADLRGGVVEGERMQHLFWRLNFLLLSGATNASLMYHEASALARELDANWNHRSKELMTLYSKAKANEAGETVEFNGRKLPPLYTPRNDTLINLFQITDDEQRQLRTILSKDQALERRRERDRKRDEERRRAAGAIEREAYEANSLSKKKPWEALGMSRAKWYRLGKPMPVESETSPSPITGETAARQA
>NZ_CP013814|0:25688|15497_15920_-|WP_041692624.1|DBSCAN-SWA
MNNAAQIETAVTANQIPTTSRINALPRHFGRHMMAVETVVFAYMRELVEAYQGGYWEFYDLSNGGFYMAPTGTQELRVSVSGNYFDGDMSPDAAGIVACLFAYGYLANSTGAAALSRHFHWLRDYALDHPEAGKILAAID
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MREAVIAEVSTQLSEVVGVIERHLEPTLLAVHLYGSAVDGGLKPHSDIDLLVTVTVRLDETTRRALINDLLETSASPGESEILRAVEVTIVVHDDIIPWRYPAKRELQFGEWQRNDILAGIFEPATIDIDLAILLTKAREHSVALVGPAAEELFDPVPEQDLFEALNETLTLWNSPPDWAGDERNVVLTLSRIWYSAVTGKIAPKDVAADWAMERLPAQYQPVILEARQAYLGQEDRLASRADQLEEFVHYVKGEITKVVGK
>NZ_CP013814|0:25688|14392_15388_-|WP_012850375.1|DBSCAN-SWA
MAQGIPTETYDRIVQVANELYEQNGREKMPTVDDVRRAAKADMNTTSAVMREWRKQQTSQAAPVAVPVPAAVQEAFQGALATAWTEAQALANEALSAAQKGWDEERGEADQLRAEMAEAFESQGLELEAVTQQLADEQKAHQATMESAQAARQQIDNLERETQELKTRLATAERQAADRGERAEELKAELAEARADAKEQRKEADRDRKAVEKQHQEEKRSLESLHRQELEKADAAAGELRQRLDTLTGELAQVKARAEAQETQHQEQRQKAEQEAEQAAERVASAQQDREQTRQELAECRERNATLTGELTAVKAQLAELKQAGKGSAKK
>NZ_CP013814|0:25688|2990_3923_-|WP_004235553.1|transposase|DBSCAN-SWA
MPAISSYSSRKSRFLDRMNVLVPWQDIADKLLHVYPSSRRGRRPFPLVLMLRIHCLQLWFDLSDGAAEDALHDVLPFRQFAGICDTVPDRTTIMNFRHFLEKHHAGEQILALINQKLKQAGLMLRQGIIIDATIISAPCSVKNKAGQRDPEMHQTRKGNQWYFGMKAHIAVDAATGLTEKVVTTAANVHDLNAADSLITEPVAIVFADAGYRGAEKRDSLTHRVKEWFIAKGPHAVKKLRQHPRLNKQALHDEYVKAGIRAKVEHPFRILKCQFGFSKTRLRGLMKNHNRLSMLFAMCNLVRAGQLAGMS
>NZ_CP013814|0:25688|21799_22057_-|WP_012850365.1|DBSCAN-SWA
MQTLFYFNNVSQLSDFESFEVKPVSGGHSDAPKQDEEPKFWSVIGTLKEEKAEGLQGRQFPVADLPSELYAGLFANLCEQITGKA
>NZ_CP013814|0:25688|6713_7211_-|WP_001444089.1|DBSCAN-SWA
MRDLLKVVLSLVLAMASGQALADLPIVLVDEARLPYDYSPSNYDISPSNYDNSISNYDNSPSNYDNSESNYDNSSSNYDNSRNGNRRLIYSANGSRTFAGYYVIANNGTTNFFSTSGKRMFYTPKGGRGVYGGKDGSFCGALVVINGQFSLALTDNGLKIMYLSN
>NZ_CP013814|0:25688|23717_25688_+|WP_012850362.1|DBSCAN-SWA
MNLVIVESPGKVKKIREILGQGWDVQASVGHVRDLPEREMGVEAPDFKPKYVPTERGKDVLAKLRKSVERANAVYLATDLDREGEAIAWHLKQALRLDNPQRIRFAEITPKAIKTAIASPSGIDIKMVAAQEGRRVLDRLVGYMVSPKLGDMAGRRGLSAGRVQSPAVRIVLERERAIQAFKPTSHFGAQLGFGDWTADWDTRPFLPEGQKYLLDKSLADRAAALRQVEVLDCEEKEESKAPPAPFITSTLQQAASNKLRMKPKATMEAAQKLYEQGLITYMRTDNPNLSDDALIEIYQVCQAKGLPMVDQPRTWKAKGDAQEAHEAIRPTHFDVEEAGDTPEQQAIYKLIWQRALGCQLAAARYAVRTVRLRAVDGLDGKPVDFIGKGRALVYEGWRAIYEDDTESDDDKKKDKEGANNPVPHLEPGQQLDAETGRVLAKKTRAPSRFTEAELIKELERLGIGRPSTYAAIMQNIISRGYVDYDKAGKYLVPTDTGALVIDALVNSRFSFIEYDFTRDMEARLDQVAEGRSSYREVVSVVHNSLEQELGGMKVDAAPEHPCPNCGKALFRRKGGKGYFWGCSGYPDCDTTLPDAGGKPGKRKPRQVADTPCPKCGKELVRRYKAGAGKKGYDFWSCSGYPSCDAKFDNVGGKPKI
>NZ_CP013814|0:25688|2063_2693_+|WP_021461772.1|DBSCAN-SWA
MARLDKKRVIESALALLDEVGMEGLTTRKLAQKLNIEQPSLYWHVKNKRALLDALSVEILLRHHDHFQPQKGEYWADFLRENAKSFRRALLSHRDAAKIHLGTRPSPEQFETVEAQLAFLCEQGFSLEEALYTLGVVSHFTLGSVLEEREYLEAMRDDDPAIHAAMPPLLTKALEIMEQDTGEKPFLFGLEVIILGLEAKQKQKKGNQE
>NZ_CP013814|0:25688|13824_14019_-|WP_041692625.1|DBSCAN-SWA
MAEKLVITASAYNAAPSDYRSVWTTERFDLANWSEVRDQYMGKRTLMDRSGLHIEGLTMVILDD
>NZ_CP013814|0:25688|11336_12554_-|WP_012850379.1|DBSCAN-SWA
MTDKTTPKSKGADLSGLDDFNLSSFLEGGKKGKAQEDAGNAAPAGAVSYAPLDHFHEDEDNARQEFDAQRLQELAESMTQVNPKTGEVRGILEPLSVKHHPDKPGHFIINGGARRYRAAKLAGLEQAPYIIKDELDDFDKFVLNDQREQLSPLEIAMFIKARLDEGYSKTEVAKALGRPASYVSDHVIFFDMAGAIRDLYDSERCRSMQALALLHRAHKKNPEPVEAFCQDANENDQELTTSQVRAFLESLKKPEGPKEKDEKPTAPTGDSKDQEPQAPKDEDDNQGDTTPASETQLGEGDTDEEPGDQFPDPSTRNEDQQPLTLDGEPLSGGTLEGQADQMLEQDEKADRIKKAIIQVKHDEREARLLTERRAAYGLAWIKYDDDGQEVEVDLNQVALVAVIEA
>NZ_CP013814|0:25688|18005_18317_-|WP_012850372.1|DBSCAN-SWA
MNMKRKPKAPGEVLETQFMQPNHITQKELASHTGWTRKHVNELCKGKARVTIDTALILGKAFGTGPDYWLELQQAVDIWDALHSEKRKERLESIVPLMKMVAA
>NZ_CP013814|0:25688|759_1971_-|WP_069971687.1|DBSCAN-SWA
MNRYITIALFITFLDATGMGLIMPVLPTLLEEFSVKESIATHYGFILAIYALMQVIFAPILGQLSDKFGRKPVLILSLIGAVCDYTLLSFSSALWMLYLGRMIAGISAATGAVAASMVADHTKKAERTKWFGKLGAAFGAGLIAGPAIGGFIGQYSAHFPFIIAAILNAIALIMVIILFPKEQSRPKEIEQDQSKIHEKTTINAPLIHILKPVLLLLMLFFTVQLIGQIPASTWVLFTEYRFEWNTFNIGLSLAGLGLMHIIFQAFVAGYIASRWKNETVFILGFILDASAFLLLAFISQVWLVIPTLILLAGGGIALPALQGLISIKTADEHQGKIQGIIVSLNNITGIIGPPIFAFSFAKTVTNWDGTLWLIGAVLYSILLGLYFLYQKIRAYKQLKSQTA
>NZ_CP013814|0:25688|20110_21175_-|WP_012850368.1|DBSCAN-SWA
MSEGKRPERAPWNDFPPVIRNGDLKELEREPEYQAAKAGDQSAALDMAERLVRPETVEAIREVVGDRPAKIVPVLAREAAGNNKIPLATAEVLGDRLGLEVEYNIVQAEKVGRTNKGADHRLAMNPTFDGAVEPGRPYVLVDDTLSMGGTISSLRGYIENRGGQVLGAAVMTAHPGAVDLAVKPKMLADIERKHGQAMNNYWKEEFGYGIEQLTQGEAGHLRKAPTVDAIRDRITAARNAAGWAMDESRAGQTPATESEGVKRGPHQDKADAFKQLSSKELLEQYPNDPAIEAATAVQAVADKFALEQIPDKDNRDRFLEGVRDRIADNLEHGRENTAPRILDDRSQGHDDQER
>NZ_CP013814|0:25688|10144_10384_-|WP_001353740.1|DBSCAN-SWA
MTPFRYNSDLTSGSLQTRECRIITGLLLQELDEAAWDKAMYKENVLQKRTQSTVRRISSALRKRLEHLSSDFWAFAFLC

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_021461774.1|406_688_+	phosphoglucosamine mutase	NA	NA	NA	NA
WP_069971687.1|759_1971_-	Tet(A)/Tet(B)/Tet(C) family tetracycline efflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_021461772.1|2063_2693_+	TetR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_004235553.1|2990_3923_-|transposase	IS5-like element ISKpn13 family transposase	Q38213	Escherichia_phage	5.2e-94	55.7
WP_011751353.1|4124_4766_+	type A-2 chloramphenicol O-acetyltransferase CatII	G3CFL0	Escherichia_phage	6.6e-56	45.9
4548:4563	attL	NA	NA	NA	NA
WP_004235553.1|5439_6372_+|transposase	IS5-like element ISKpn13 family transposase	Q38213	Escherichia_phage	5.2e-94	55.7
WP_155763435.1|6497_6653_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001444089.1|6713_7211_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001206315.1|7286_8075_-	ANT(3'')-Ia family aminoglycoside nucleotidyltransferase AadA1	NA	NA	NA	NA
WP_000704156.1|8132_8657_-	streptothricin N-acetyltransferase Sat2	NA	NA	NA	NA
WP_000071896.1|8979_9516_+|integrase	class 2 integron integrase IntI2	A0A1P8DJJ6	Virus_Rctr41k	6.9e-14	34.4
WP_000497519.1|9630_9957_+|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	A0A1P8DJJ6	Virus_Rctr41k	2.1e-18	52.0
WP_001353740.1|10144_10384_-	DUF1819 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_081329474.1|10829_11276_-	restriction endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_012850379.1|11336_12554_-	ParB/RepB/Spo0J family partition protein	NA	NA	NA	NA
WP_012850378.1|12553_13306_-	ParA family protein	H7BUL8	unidentified_phage	9.6e-14	29.4
WP_069971684.1|13309_13624_-	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_041692625.1|13824_14019_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_012850375.1|14392_15388_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_041692624.1|15497_15920_-	antirestriction protein	A0A1S5R3R9	Pseudomonas_phage	1.6e-05	33.0
WP_012850373.1|16456_17821_-	hypothetical protein	A0A1B1P892	Bacillus_phage	1.2e-09	25.8
WP_012850372.1|18005_18317_-	HigA family addiction module antidote protein	NA	NA	NA	NA
WP_012850370.1|18722_19463_+	hypothetical protein	A0A1D6ZIU7	Xanthomonas_phage	1.6e-05	33.7
WP_012850369.1|19462_20110_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_012850368.1|20110_21175_-	phosphoribosyltransferase	A0A0R6PHM5	Moraxella_phage	4.1e-34	34.9
WP_012850367.1|21184_21508_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_012850366.1|21614_21752_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_012850365.1|21799_22057_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_012850364.1|22482_22971_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_012850363.1|22980_23721_+	cell wall hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_012850362.1|23717_25688_+	type I DNA topoisomerase	A0A0G2YA05	Acanthamoeba_polyphaga_mimivirus	1.2e-76	34.2
30340:30355	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP013814|37244:41957|DBSCAN-SWA
CATGGCACAAGAACAGATAGCCGACAAAAACACTTACCTGGTGGTGCCCTTCGAGGAAAAGGACGAGGCGGTAAAAGCGGCCGGTAAGCTGCCGGACGGCTCGAACGCTATCACCTTCGATGGTGACAACAAGCTGTGGTACGCCAAGCCAGGCGCCGACCTGTCCAAGGTGTCGCAGTGGGCACCAGACCCGGCCAAGGCCAATTCCACGTCTGCCGAGAATGACCCCCAGGTGGAGTTTGCCCGGACCCTTGAGGCCGAAGGTTTCGTGCTCGATGGCCTCCCGGAAATGGACGGGCGCCGGCATCGGGTGAAGACCCAGGACGACAAGCGCGGCCAACGCACCGGCGTCTATGTCGGATACCTCGATGGAGTCCCGGCCGGCTGGTATCAAGATCACCGGGTTCATGAAGATCCGGTGAAGTGGAAAGCAACGGGCCAGAAGCTGGACCATGAAGCCCAAGCGCACCTCCGCGCCCAGGCCCTCCAACGAAAGATGGAGCGCCAGGCTAAACAGGAACGCTCCTACGATCACAACGCCCGACGCGCTGGCCAGGTTTACGCGCTCATGCCGGACGCCACGCCAGACCAGGGATATTTGCAGAACAAGGGCGTGAAGCCTTTCCCTGGTGCCAAAATGGACAAGCGCGGCCGCCTGGTGCTGCCGTTGAAAAATGAGAATGACGAGGTTCGGACGCTCCAACGAATCGACCGCACGGGCTTCAAGTCGTTGAAGAAGAACGGCCAGAAAACCGGCAACTACTTCGTGGTAGGCGACCGCGAGCTGCAAAACGGCGAGCCGATCCTATACGCGGAAGGCTATTCGACTTCGGCCAGCATTGCCGAGGCCACCGGCCGTCCCGTGGTCATGACTGTGGACGCCGGCAACTTGCCGCGAGTGGCCGAGAAGCTGAAAGACAAATACCCGGCCAGCTCGCACATCGTGCTAGGCGACGACGACCGGGACAACAAGGTGAACAAGGGCCGCGAGAAAGCGGAAGAAGCGGCGGCGCTGACCAGCGGCGCGTTTCGTGTGCCAGAGTTCAACGACCAGGAAAAACAAGCCGGACTGACCGACTTCAACGACCTGCATCAATCACGCGGCCTCGATGCTGTGCGGGAGCAAGTCGAACAAATCGTGGCGCAGTCCGCAAAGGTGGAAAACATGAGCGAAGAAAAGAACGAGAAGACTAACGACCCGGTAATAAGCGAAAACTTCGAGCGGTACGTAAATCAGGGGCTCAACCGTGAACAGGAGCAGACCCAAGAGGCACCGCGTAGCCGCTTCGAGCTGGTGAACCAGGCTGGTGAGTCTGCCTATCAGACTGACGACATTCGAGACGCTTTCGCCCGTCAGACGCTGGACCAGAACCACAATAAGGAATACTCGATCCGCGATAACCAACGCGGTGAGATTGCATCGAGCTACACCAACCTGGAAGCGGAAGGCGAACAGCCAACCCGTGGCGTCCAGGCTTCGCCGGCTTTCGTGGCCGAGTTCAACGCCGAGGTGAACCAGGAACACCGCATCCGCGAGCAAATGCCCCTCGATGACCGGATGCACGACAGGGCGGCCGCCCTGATCGAGCAAGCAGAAAGCCAGCCTGTCCAGGAACAGGACCAGGAACGCGCTCAACAGCCAGCCCTGGAGCCGGTCGAGCAAGAGGCGGAACCTGTTCAGGAGCAAGCGCCGGAGGTGGACCAGGAGGAAGCCGCGGCCGATCTGCAGGAAGGTGACGGCGAGAACAGTATCGAGCCGCATATCGAGCAAAAGCAGGAATCCGAGGCCGACAACGACGCCCGTCAGTGGCTCCAAAGCAGCAGCCGCCAGTCGCTGAAAGATATGCTGGCCGAAGAAGAAGCAAGGACCGAGGCGCGGCGCGAACAGCAGGACCGTGAAAACCGCCAAGACCCGGCCAGCCTGCAAGTCGGCAAGCCCGCGCCGGCCGCGCCGGCCGCGCAGCAGGATGACCCATTCGCGGACCAGGAGCAGACGACCTTCAAGCCAGTGGTGCCCGAGAAGGTGGCCAAGTCCTACGTGGAGGTGGAAGGCAAGTATTACTTCGCCGGCCGCCCCGACTCGCTGGCGTTCGTGGACAAGGGCGCCCGGCTGCAAACCAAACTGAGCAATGCCCAGGTGGCCGGCTCGATGGTCGATATTGCCGAGTCCCGAGGCTGGACCGAAATCCAAGTGAAGGGAACGCAGGACTTCCGCCGCGAAGCCTGGCTAGAAGCAGCATCCCGAGGCCTTGAGGTGCGCGGCTACAAGCCCCGCGAAGAAGACCTGGCCCGACTCAAGAAGTTGGCCACTGAACGCCAGCCAAACGAGATCGAGGCGCGGGAGCAGGCAGACCAGCCCCGAACCAACCAGGGGCAGCCGAGCCGGCCGCGTCAGCAATCGGAAGCAGCCAAGCCCAGGGAAGCGGCCAGCCAAGCCCAGGAACAGGCTCAGGAGGCCACACAAGCGACCCAGGAGCCCCAGGCCAGCGAGCCGGTCAACCGCCTGGCGGGCAAGGTGGTGGAGCATGGCAAGGCCCCTTACGAGCACAACAAGGACAACCGGGAAAGCTACTACGTCACCCTGGAGAACGCGGACGGCGAGAAAAGCACCACTTGGGGCGTGGACCTAGAACGGGCCATGGAAGAAAGCGGCGCCAAGGAAGGGGATACCGTCGAGCTGGAGAACCAGGGACGCCAGCCGGTGACAGTCAACCGTCCTGTGAAGGATGAACAAGGCAAGGTGGTTCGCACCGAGCAAATCAACACGCACCGCAACAAATGGGACGTGAAGGCCGAAGCACTCCAGGATCGGGAGCGCGATGCTAAAGAGCTGGTCCGGGAGCATCCCGACCTGGTGAACGAGGTTGCCGCTATCAAGGTGGCCGAGAAGTTCAGCCAAAAGCAATTCAGCAACGAGGCCGACCGCGAACGTTTCATGGACAAGGTGCGTACCCAGGTCGCCGGCAACGTATCCAAGGGCCAGCAGGCCCCGGAAGTGAAGCTGCGCGAAGAACGAGTGACCGAGAAGGAGAACGACAATGAGAGATAAAATTCTGGACCTGAACACCCCTGGCCTGGTGGTCGAAGTGAGCAAGGAAGAGGCGGCCGAGCTGGGCGCCTTCGAAGAAGACGCGCTGAGCGAGGAAGACGCCCAGGAGGCGACCGAAGAACAGGAGGACTAGCCATGGCCGGGAGCAAGGACACCAAAAAGCCGTATTACGAGCAAATCAGTGAACGGCTTATCCAACAACTGGAAGCAGGCACGGCCCCATGGCAAAAGCCATGGGAGCCTGGTTCCCATCGAATGCCCCATAACCCGGTCAGCGGCACCAGGTACAAGGGCGCAAACGCTATCTGGCTGGCCATGCAAGGCCGGTCAGACCCTCGCTGGATGACCTACAAGCAGGCCCAAAGCGTCAACGCCCAGGTATCCAAGGGCGAAAAAGGCGTGGCGGTCCAATATTGGAAGTTCCGGGATCGCGTCCCGAAACGGGACGAAAACGGCAAACCCGTCCTAGACGACAAGGGCAAAAAGGTGATGGTCAGCGTCGAGCTGGACAAGCCGAAGGTCTTTAGTTCCGTTGTCTTCAATGCTGAGCAAATCAAGGGGCTTCCGCCCCTTGAAGCTAAGAAGGAACCGGCATGGGATCGCCACGAACGTGCCGAGTCCATCCTAAAGGCATCAGGTGCGGACCTGCACCACGACCAGGGGGACCGGGCCTTTTATCGCCCGTCTACCGACTCAATCCACCTACCTGACCAGGGCCAGTTTGAAAGTGCCGATCGCTACTATTCCACGGCCTTGCATGAGCTGGGGCACTGGACCGGCCACCCTTCCCGCCTGGACCGCGACCTGTCCGGTGGATTCGGCAGCGAATCCTATGCAAAAGAGGAGCTTAGGGCGGAAATTAGCAGCCTTATGATTGGCGAGGAACTGGAAATAGGACACGACCCTGGCCAACACGCGGCCTATGTCAAAAGCTGGGTTCGCGTTCTCAAGGATGACCCTAAAGAGATTCTTAGGGCTGCCCGCGACGCGGACAAAATCCGCGACATGGTGATGGGATACGAGCCAAACCGCGACCAGCACCAGGAGCAAGGCCAGAAAGCGACGATTACGCCGGCCGCCGCCGAGAAGCTGCACAAGCTCGACAAGGACGCAGTGGAAGGCTATTCCCCGATGGAAAGCTGGAAGATGATGCAGGCCGAAGCCGCTCAACACGGTTACACCGCTCGCATTGACGTGAACAAGGACCAGGACGAGTTCGCCAGCCAGTTTGTCATTGGCTACGAGGACCGCAACGGCGACCAGACCGGCATCCGCACCGATATGTATGCCGATAGCAAGCTGGAAACCTCCATCGACGGCCGCCGCCTGTCCACGTTTATTTCCAACGACTCCGAAAGCCAGCCGCGACACCTCCGCGAGGCCATCCAGGAACACGAACAGGGTAAAGCCTCCCAGCCGTCGAGCAGCTACCAGGAAGCGCCTCAGAAGCCCCAGGAAGCCGAAACGGCCCAAGAGCAAGGCGATGGTAGCGCCCTATCCCTCAAGCTCGCTGAGAAGGTCGCCCAGGGCTTCAAGAGTGACGAGGATCGAGCCCGTTTCATGGAGCGGGTCCAAGAACGGCTAGGCCAAGGGGCTGACCAATCTTCTGATATTCGTATCAGGGAATCAGTCCCAGCCAAAGGCGATTCGGACATGGAGCGGTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP013814|37244:41957|40427_41957_+|WP_012850391.1|DBSCAN-SWA
MAGSKDTKKPYYEQISERLIQQLEAGTAPWQKPWEPGSHRMPHNPVSGTRYKGANAIWLAMQGRSDPRWMTYKQAQSVNAQVSKGEKGVAVQYWKFRDRVPKRDENGKPVLDDKGKKVMVSVELDKPKVFSSVVFNAEQIKGLPPLEAKKEPAWDRHERAESILKASGADLHHDQGDRAFYRPSTDSIHLPDQGQFESADRYYSTALHELGHWTGHPSRLDRDLSGGFGSESYAKEELRAEISSLMIGEELEIGHDPGQHAAYVKSWVRVLKDDPKEILRAARDADKIRDMVMGYEPNRDQHQEQGQKATITPAAAEKLHKLDKDAVEGYSPMESWKMMQAEAAQHGYTARIDVNKDQDEFASQFVIGYEDRNGDQTGIRTDMYADSKLETSIDGRRLSTFISNDSESQPRHLREAIQEHEQGKASQPSSSYQEAPQKPQEAETAQEQGDGSALSLKLAEKVAQGFKSDEDRARFMERVQERLGQGADQSSDIRIRESVPAKGDSDMER
>NZ_CP013814|37244:41957|40281_40425_+|WP_012850392.1|DBSCAN-SWA
MRDKILDLNTPGLVVEVSKEEAAELGAFEEDALSEEDAQEATEEQED
>NZ_CP013814|37244:41957|37244_40292_+|WP_012850393.1|DBSCAN-SWA
MAQEQIADKNTYLVVPFEEKDEAVKAAGKLPDGSNAITFDGDNKLWYAKPGADLSKVSQWAPDPAKANSTSAENDPQVEFARTLEAEGFVLDGLPEMDGRRHRVKTQDDKRGQRTGVYVGYLDGVPAGWYQDHRVHEDPVKWKATGQKLDHEAQAHLRAQALQRKMERQAKQERSYDHNARRAGQVYALMPDATPDQGYLQNKGVKPFPGAKMDKRGRLVLPLKNENDEVRTLQRIDRTGFKSLKKNGQKTGNYFVVGDRELQNGEPILYAEGYSTSASIAEATGRPVVMTVDAGNLPRVAEKLKDKYPASSHIVLGDDDRDNKVNKGREKAEEAAALTSGAFRVPEFNDQEKQAGLTDFNDLHQSRGLDAVREQVEQIVAQSAKVENMSEEKNEKTNDPVISENFERYVNQGLNREQEQTQEAPRSRFELVNQAGESAYQTDDIRDAFARQTLDQNHNKEYSIRDNQRGEIASSYTNLEAEGEQPTRGVQASPAFVAEFNAEVNQEHRIREQMPLDDRMHDRAAALIEQAESQPVQEQDQERAQQPALEPVEQEAEPVQEQAPEVDQEEAAADLQEGDGENSIEPHIEQKQESEADNDARQWLQSSSRQSLKDMLAEEEARTEARREQQDRENRQDPASLQVGKPAPAAPAAQQDDPFADQEQTTFKPVVPEKVAKSYVEVEGKYYFAGRPDSLAFVDKGARLQTKLSNAQVAGSMVDIAESRGWTEIQVKGTQDFRREAWLEAASRGLEVRGYKPREEDLARLKKLATERQPNEIEAREQADQPRTNQGQPSRPRQQSEAAKPREAASQAQEQAQEATQATQEPQASEPVNRLAGKVVEHGKAPYEHNKDNRESYYVTLENADGEKSTTWGVDLERAMEESGAKEGDTVELENQGRQPVTVNRPVKDEQGKVVRTEQINTHRNKWDVKAEALQDRERDAKELVREHPDLVNEVAAIKVAEKFSQKQFSNEADRERFMDKVRTQVAGNVSKGQQAPEVKLREERVTEKENDNER

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_012850393.1|37244_40292_+	hypothetical protein	H9C0J7	Bdellovibrio_phage	5.4e-23	30.6
WP_012850392.1|40281_40425_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_012850391.1|40427_41957_+	DUF1738 domain-containing protein	A0A1B1IRD0	uncultured_Mediterranean_phage	6.9e-35	33.9

3. NZ_CP013812

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	0 : 5335	6	Pseudomonas_phage(20.0%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_2	25809 : 58933	35	unidentified_phage(14.29%)	transposase,integrase	attL 50736:50766|attR 55058:55088

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP013812|0:5335|DBSCAN-SWA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP013812|0:5335|1167_1662_-|WP_069971678.1|DBSCAN-SWA
MKPTEEQQKIINAVKSGNNLHVAAFAGTGKTTTLELIGRHYSTQKGLYLAYNRAILDDSKGKFPKNIICKTTHSLAYATYGRDYREKLNNRITSMKVADHLAISLLRHHINGKIVQATSRNIAACATRIVAHYCNSADTEIGVQHLSMFHIKMLQTVIKKKKLS
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MKLKPIHTEQDYEEALAEVDKLFDAKPGTAKGDKLEILVTLIEAYEAKEHPISDPSPVDYLVYLMESRGMSRQELGKYIGGKSRVSEILNGKRDLTLNMIRRLHFDLGISADLLISPVAINEVNNAMSCRKPR
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MIDLKNHTIGITHDGYLKLYQLSKPILNQYDFIMLDEAQDANPAILDIFERQTAPTHLCG
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>NZ_CP013812|0:5335|2429_2741_+|WP_027242583.1|DBSCAN-SWA
MRIISNKILRDFYTQPKYFDSKGAITAWYSDTKKAEWNAPQDIKNVYANASFVANNRVVFNLGGNKYRLITAINYDYKIVYVKFIGTHVQYDKVDAATVELRR

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_069971678.1|1167_1662_-	hypothetical protein	A0A0S1WEX5	Vibrio_phage	3.1e-13	43.2
WP_144420830.1|1767_2073_+	WGR domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242583.1|2429_2741_+	type II toxin-antitoxin system HigB family toxin	A0A0P0ZE17	Stx2-converting_phage	2.3e-14	38.7
WP_027242582.1|2737_3139_+	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A222YXG1	Escherichia_phage	6.0e-23	47.9
WP_027242581.1|3148_5335_-	ATP-dependent RecD-like DNA helicase	A0A0K2FLP8	Brevibacillus_phage	1.1e-73	30.3

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP013812|25809:58933|DBSCAN-SWA
ACTAAGCCGCCATCAAATACTCTAAAAAAACATGATTAGGTGAGCGATAATTCAAACTCGCTCTTCTTCTGGTGTTCAATATATGCTCTATTTTTGCTATTTCTTTGTCACTAACTTCATTAAAATCCGTCCCTTTAGGTAGAAAACGCCTTATCAAACCATTTGTGTGCTCATTTAGACCTCTATCACAAGAACGATAAGGTCTAGCAAAGTAAAAGTCTGCTTCAGTGATCTTTGAAATGACCTCATGACCGGCAAACTCTGTTCCGTTGTCAGAAGTGATGGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCCGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTGCTTAACCGCTGATGAATCAACATTTTTTCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCGTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGAGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTGTTGCACTTCAGATGACGGAGGGCGGAATCAACGCTCATGTCAGCAGCTAAACCCGCTTCCTGACTATTACTACCTGATGGCCACATATAAATAGGATCAACAAAATCAATCGTGTCAAAGTCTATTTGTTGAATTTGGTCAACACTAAATCCATTACACGAAGGCGCTTCAGGTGAACCATAAGACAGATGCAATTGAGGGCGTCCGTAATCTTGAACAATACGTGACATTTTACTATCAAAAACGCAGTAAACTTTTTTATGCGAAAGACAAATTCCAGTAATATCTTCTTTATGCGCACAGTACTCGCCAATATAAGAAGCTAAATACTTTTCTTTTGCTTCACCTAGCTTTTTCTCTTCATCACTACAATGAGCAAGCCCTGTATTCTGTCCCCAACCACTATCATTACAGCAATCACTAAAACCTAAAGTATCTATCGAACAATCCATTGGGGTGCCATTAAAAATACTCACTTGGTCACCGTCGCTATAATCTTCGGCAGCACCTGCGGCGGCGGCTAACTCAGAGACATCTTGACCAAAATTTTCATTTGTTTGAGGGTCTTGACTAGCACAATCACCATCGATACAAAACACATCATTTGCACACACCATTTGAGTAGCACACTGCTTAACAGGACAATTATAAGTGTCGTTGTATTCATCACAGCTTGAACTTGTGCATGCCGAGCTTATTTGTTCACATCCTTGATCTACTAATGACTGGCAACTTGAAGAAAATGGCTGACCACACTGATAATCTGTTTGCTTCTGCCAACAATCTTTAGTGATATCAACGCCATCAATCGTTCGAGTCTCTTCAGGTTCAGTGCAAGTTTGTTTGGTTTCTTTACAGGATGCTGGAAGACTACTACAGTTTGTTGTCCACACCTCCTCCGGTTCTTTCGCTGTGCGTTGTACTTTCATCACGACAGTAAAAGGTGCAGTGCCGCGACTTCCTCCAGAATAACCATCAAACGTTACATTTATCACACCACTACCCGAAACATACACTCCCAAATTATCTGCGGTAATACTAATTGAGCTATTAAAAGGAAACATGCACTGAAAAGTACCGGAACACGGATAAGATCGCGTTCCTATATTGGTTCCATTCAAATAAAAAGTGTAATTTTTATTGTAGTAATAACCATTACCAGCATTAGATTGAAAAGAAATGCTTTCAATAACTCCGCCTTCAGGCAAAGTATAGGTATTGCTATTACTACCAGTATTTTCCATATTTCCAGAATATGTTTTCTCGACATACTCAGTTTTTTCCTTCATTTGAATCGATAATGTACTTGTACACGTCAAATTGTAAGGATGACCGGTTGTGCAACTTTTAGAATCATACGTTGTCGTACAATTCACTGCTTGTTTATCACAATCAACGTATTGGTCAGAAATTCCATGCGTTAAATTGTAGCTATCACTTTCAATCAACTTAGAACCTTGAATGCTCGCCGATTGAGTATTGACCTTGATTTGAGGACGTGTTGTGAAGTTTTGATAAACAGTATTACCAGCAGGGTCATTTGCTAAATTAGTTTGGGCATCTTCAGACAAATTTGAACTATATGACTCTACGCCTTGATAATAACTTGTTTCAGAGGGGTTTGAGGTATAGTTAGGAATCGACTCCTCAGGATTTAAGCTCGTTCCTGTTGAAATCACAGCACTTTCATTGGCCTGAACGATGGATTGATCTTTTTCATAGTCCTCCGATGTTTGATTGGAATAAGTTACATTTAAAATAGAAATAACCAATAAAATTATTAATTTTTTGTTCATTCTACTCACCCATTGGCTAACATGGTCTGTGCCACGCTTTTTGGAATTGAACTACCTCGTTTAGCAATTTCAACGAGTGAATCATGAATGGATTGGTTACCGTAAATCACATCAAAAGGCTGATTCGGACACATTTTTTCTGAGATACATCCTATAGGACGTTGAGTTACGACAAATGCAGGCACCGCAGTAATATGAAACTGATCAAACCAAACAGGGTCAATACTCACCCCACTAAACGGCAACCCCTGTTTTTTTGCCTGTGTTTTAATGTTTAAAATTTCCTGCAATGTCTTTGGCATACTGTTATCGACTAAACCACGCATAATGACCGGAATTTTGTATTTCGCCGCTTGCATCGCCATTGCAATAATAAGCTGGCTAGGCATAGACGTAGAAACAAATAACATCGCACCATTTGCAGCTTTACCACCCTGCTGCAAGTTTTTTTTCGCTGAGTCTTGCGCTGTTCCCATGAGCTGATTAATCATAGCCAAGCTTTTTTTCACATTCTCCTGTGACATATTTGCAAGTGAACTTACTTGTGATGTCTGTCCGGCAACCAATGATTTTTCATGCACTTTATAGTCATTTACTTCATCGTTAAAATTAGCAAAAGCACACTGATTAAAAACAAAAAAACAAAGAAGGTAAGAAATTTTCTTAAGCATTATTTATCTCACACAAAGCAGCAGTTGCGTTTTCTAAAGATTAAAAACCCATAATTATCACCGTCCGCAGGGTTAACATGCCCTGTTTCAAAAGTTGCAACTAAATGACCAAACGGATGGCATTGCAGAGCATCAGGGATGGTATTGACTAATTGATAGCGATAACGACTTTTTGGCATAATTGGGCTGGGATATTCATTGCATACCGCAGGAGAATCCGCGCCCACCGAATCCCAAACCAAACCTTCACGATGCATTTTAAAATCCATCCGTTCAGCAAGCTTAGTCGCTGCTTGCATTGGACTGGCTTGATTAGCAACATTACCCGTTAACGGGTACACTGAGCCCTGTGATCCTAAACACCAGAAGAGACTGTCTATCGATGTTGCAAAATCAGTAGAAGTCACTAATGCATCGGCAACACACGCAGTTTGGGTAATTGGGTTTGAAAGCAAACTCGCTTCAGGATTTAAAACAAACGCCAATTCATCATCATTCCAAGTCGGATCAAGTTCGGTCATATAAGCCAAATCAAACTCACCTGTTTGAACACAGCCAACATTGGTAATGATGTTCAACCAATAAACAAGTGGATATTTATACCAGTGAACATAATAAAAGGCGCCACGTCCATCGGTAGAAGGCATTTCACTACCTCCCATCCCTTGGTCTTTTACATCCAACTCTGTACCCATATTCACCATACAATAGGGTTCACGCGTCACATCTACTAAAGCAAAAGGCTCCCAAAAGCCAATAGTGACACCAATACGTTCAAAAATTGGAGCAGGTGCAGGGCAAAGACAAATAGGGCTGCCAGGATTGGTGGTATCTGGATAAACCCCAGGGGCAATGGGTGCACTGCCAATTGTAATGGGGAAAATACAGTCCCAACACACATCGCTCACAGGGTCAACAAAGTGACCTTTACACGTCGCCGCATAAAGACCACCACTTAAACCAAACACCCCCAAGATGACCAAAAACCATTTACGCATAACGACCTCTAAAAAACGTAACCTAGAGAATAGAAAGTAAAAGACTATTAATAAAAGAACATCAACAAACGTGACTAATTTTTTAAAATATTCCTAACATCTGCTCAAAGCACCTTTGAGCCAATAACAGTAATTTTCCATTTCAAACCATCTTGTTGAGCAATTGCAGGGACGTGCTTAATATGAAGTTTTCGTGTGATATTGCCATATTGGTCATAATAAATCCGACCAAACAATTTTGCTGCCTGACGAATATCACCACCCGTTAAAATAAACTTCACCCATTTATAATCACGATAATGATGTTTTACCCAACTCACCTGCTGTGCGTCATCACCATTAAAGAAAATCAACACTGATCTAAGATGAACAGTATGAAATGGATTGACTATTGTTCCTGCTTTCACCAAAATTCGCCCCATATTATCTGTAATCGGACGAGTTAACTTAATACTTGGGTCAATGGTATAAATCTCACTATCCGACTCTTG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MLRDNINATAARDNFKSTCDTVCENNAPVLVKRKGAEDVVIISASDFGGMEETIHLLSSRIMATRLMRSMKQLDEGKGVQRDIIEE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_155074374.1|31031_31409_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036774456.1|31365_33945_-	type IV secretion system protein TraC	NA	NA	NA	NA
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WP_051929537.1|34406_35876_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_051929536.1|35885_36590_-	type-F conjugative transfer system secretin TraK	NA	NA	NA	NA
WP_062365791.1|36582_37092_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036775000.1|38708_38999_-	type IV conjugative transfer system protein TraL	NA	NA	NA	NA
WP_052106244.1|39014_39332_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420828.1|39529_39784_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036774994.1|39989_40268_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_047927058.1|40346_40703_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_053063426.1|40822_41608_+	class I SAM-dependent methyltransferase	R4ZE30	Choristoneura_rosaceana_entomopoxvirus	2.1e-19	27.9
WP_047927059.1|41583_42285_+	HAD family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_036775038.1|42270_43011_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242605.1|43305_44601_-	glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase	A0A1V0SKB7	Klosneuvirus	1.8e-12	26.2
WP_036774869.1|45044_45893_-	ParB/RepB/Spo0J family partition protein	Q331U1	Clostridium_botulinum_C_phage	7.1e-05	25.7
WP_047927060.1|45889_46750_-	ParA family protein	A0A0K2FLP4	Brevibacillus_phage	9.3e-13	25.3
WP_053856777.1|46739_46961_-	type II toxin-antitoxin system Phd/YefM family antitoxin	NA	NA	NA	NA
WP_047927062.1|47477_47804_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_047927063.1|47803_48928_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
50736:50766	attL	NA	NA	NA	NA
WP_048876031.1|51024_52428_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_027242600.1|52455_53046_-|integrase	site-specific integrase	K4K327	Caulobacter_virus	3.9e-18	32.3
WP_032126795.1|53318_53579_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_016211910.1|53582_53855_+	Txe/YoeB family addiction module toxin	NA	NA	NA	NA
WP_155046644.1|54180_54399_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080963647.1|55428_55599_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
55058:55088	attR	NA	NA	NA	NA
WP_036774631.1|55937_56402_-	hypothetical protein	H6WFS7	Cyanophage	2.9e-21	38.2
WP_098082828.1|57668_57926_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_036774189.1|57925_58933_+|transposase	IS3 family transposase	NA	NA	NA	NA

4. NZ_CP013813

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	4509 : 20532	20	unidentified_phage(38.46%)	capsid,head,integrase,terminase,tail,transposase	attL 3839:3898|attR 18012:18303

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP013813|4509:20532|DBSCAN-SWA
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MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA
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MNNKHRKTLRDIFHNPIKASIVWADIEKLLLALGAEVIERDGSRVAVILNQVKTTFHRPHPEKTTDKGAVKSIRLFLKNAGVDKNA
>NZ_CP013813|4509:20532|9878_10235_+|WP_080963620.1|DBSCAN-SWA
MAYMLRYKGYAAVVNFDDHDKILHGEILNIRDMVTFECEDLQGIELAFHNAVDDYVAMCKEKGRTPNKPYSGTTNLRLGTVLHEMCALAAAENDQSLNDWIIQQLNNSLHENNNASKN
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MSRAKGQGRKPKPTKIKKITGNPGCRKLNEHEPKPQDRVAICPDYFDEIAKGAFESAVSDLEYMHIKTASFQKQLEIYASAYSDWRQLSTVIEQKGRTFETTTQAGDTMYRSRPEVAQRNEAWKQVKTSLSELGLTPTAISRLNAQVSNTIESEIDKILD
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MTEGESHLRIDDNNEDEYLEFILAAALQAAEDYRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP013813|4509:20532|11932_12799_+|WP_027242951.1|DBSCAN-SWA
MPKYDQMIQKEIEQSSRRLYKDVDALRSGNTPVEMIPVAHHTVEYSNHKAKLSALSSRMPQSEAERTRDIHDFIAHSSARAALSGLARCEESLTSFMKVHIQSEAAELLPYMTVIFFNVQDPKVPENKNNHCFLMLSANDPSAQLQGFDFKTQVARVNQARQELLSVFERNPGDNYLVDPYLVECVSLKKALKGNNAEFMDAYDERSYLGLASADLGTVDSRDIDIHLITKKERELVTEFKQGNPDFVLNNSIHHTAGPWKDRFQFPFLSAHEEPEPEGEEAALYYCG
>NZ_CP013813|4509:20532|20115_20532_+|WP_027242943.1|DBSCAN-SWA
MKKTIHGTGGGGGKGGGSVHTPTEAPNTLSTNAVVTLVDLLGEGEIEGLVNGAQSVYFDDTPLQNADGSYNFEGVTLKSNNGTPSQDYLPGFAESASEEAFNVKVIHEQPVIRTVGRQETNELRVKIGLDALTEYANT
>NZ_CP013813|4509:20532|14171_15146_-|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA
MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP013813|4509:20532|16632_17607_-|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA
MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP013813|4509:20532|10332_11307_+|WP_036771330.1|transposase|DBSCAN-SWA
MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTFMNVVGSTFFDFKTITSDNGTEFAGHEAISKITEADFYFARPYRSCDRGLNEHTNGLIRRFLPKGTDFNEVSDKEIAKIEHTLNTRRRASLNYRSPNHVFLEYLMAA
>NZ_CP013813|4509:20532|15242_15635_+|WP_075275490.1|capsid|DBSCAN-SWA
MLDLRSSVKAAYRRKASYLMHDSTYGSLLKMKDGNGQYIIQPDFKSGEGDLLRGKRVNTSDFMDTLAAGKCAALFGDFSNFIIADRGGISLRRLNELYAATGEVGYLMWLRVDALLLETDAIKQLKTAAA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
3839:3898	attL	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|4509_5484_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.7e-26	31.8
WP_016212329.1|6019_6610_-|integrase	site-specific integrase	K4K6A1	Caulobacter_phage	3.2e-20	35.3
WP_027242955.1|6840_7101_+	type II toxin-antitoxin system HicA family toxin	NA	NA	NA	NA
WP_016211078.1|7093_7447_+	type II toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	K7PJX6	Enterobacterial_phage	6.5e-13	34.8
WP_069971681.1|7623_8598_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.7e-26	31.2
WP_027242954.1|9130_9496_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242953.1|9640_9895_+	addiction module toxin, HicA family	NA	NA	NA	NA
WP_080963620.1|9878_10235_+	type II toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	K7PJX6	Enterobacterial_phage	1.7e-16	36.4
WP_036771330.1|10332_11307_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.7e-26	31.8
WP_027242951.1|11932_12799_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242950.1|13011_13395_+	HNH endonuclease	A0A2D1GNP5	Pseudomonas_phage	4.3e-26	46.3
WP_027242949.1|13481_13964_+|terminase	P27 family phage terminase small subunit	Q9B019	Phage_GMSE-1	3.6e-14	34.0
WP_027242948.1|13966_14152_+	hypothetical protein	A0A1J0GUY5	Halomonas_phage	9.0e-06	47.3
WP_036771330.1|14171_15146_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.7e-26	31.8
WP_075275490.1|15242_15635_+|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	7.0e-24	45.0
WP_027242946.1|15670_16252_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|16632_17607_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.7e-26	31.8
WP_144420855.1|17680_17896_+|head,tail	phage head-tail connector protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242945.1|18699_19215_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
18012:18303	attR	NA	NA	NA	NA
WP_027242943.1|20115_20532_+	hypothetical protein	A0A2R3UA88	Siphoviridae_environmental_samples	2.2e-20	41.7

5. NZ_CP013815

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	0 : 60056	56	Streptococcus_phage(16.67%)	portal,integrase,capsid,tail,transposase,head	attL 1010:1069|attR 72735:73470
DBSCAN-SWA_2	64837 : 129246	60	Streptococcus_phage(48.15%)	transposase,portal,integrase	attL 72373:72432|attR 112015:112935
DBSCAN-SWA_3	135485 : 140256	7	uncultured_Mediterranean_phage(25.0%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_4	144392 : 188073	49	Streptococcus_phage(37.5%)	transposase,portal,terminase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP013815|0:60056|DBSCAN-SWA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP013815|0:60056|6773_7880_-|WP_069971688.1|DBSCAN-SWA
MVAKVKSTCDFIEDAGTGGLANLCGSIDRLSNTYSNSDENIRRRVLEKTPVLTSIPSNVNTVYLDKVLVAKQNTFRTGSSTSQSGVSTGAKAVDRFSPWIDAYAAHEKKDPVEGYDGYSHSIKGVSFGVDYNAIDKFGLFVSYSENKFSTKITGSSIKSNSYGLTLFLEKPFKTFDYYASLSYFYNDFDNERRDVSKSVNSFKSSFSNHSLLFNSKLLYNIYDQSSYSYDLTLLLDMDYIQIMGYDYQESYLNLGGQTVQSDTWHQLNFGAGFLISKRINLLNGVITPTASVRVQYSVLNDPNSMNVSSVDFPGFIQVQSANTKKIQYDLGIALKYEYKKNMEIDLEYNSIWDNSRKEVVSLVAKYRF
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MKIIIDTNVLASAVFWGGQPLIILEAWFNEEFELLVTEDIFNEYSRVLEILSKKYKKDVSAILRLITVKSQWIVPVKMKTQVCQDIDDDKFIACALAAQGKVIVSGDKLLLECSGYQHIDIIKPKIFIDNYL
>NZ_CP013815|0:60056|24434_24830_-|WP_017375780.1|DBSCAN-SWA
MPKMSFSVEGLRELEKQLKQLAPKKIRNLNRRALRKAAEPVETQMKANAPQKSGALVESIKRRSKKGKGRRTVVNVTVGPARKIQYAIEQEYGSSHQPARPFIRPALNDNAQKSIDIFKNALTLALKKQKL
>NZ_CP013815|0:60056|49410_50343_-|WP_144420837.1|DBSCAN-SWA
MSELKNKEKFEDRGYTHYIQTCSFEGKKCYVKLSYKNDSSTSSLLFEAFNLLSLKVLGLAIPDTIHLVQDQESNKCIGYLTSEVILDKALKFIDFAEDLARISLTRLILGDNAATEDGNILMTKSQLISIDVPFFDLAPEFVPNKYQDHIELFSEVFLDKNSLSHLSKNVINHFYNNIGLISYKLSRLYLDNVISEVEKNDYLKKLIGNISSFYGLISILKEKKNPHDSLTDSEYELYFANRLEHIQQLNTIVVEQDLSAQKDHVSENLFFDANEHLENIDTSELLFFDAKDTLESCSGTVAKNLDLSRV
>NZ_CP013815|0:60056|14492_15470_+|WP_036771347.1|transposase|DBSCAN-SWA
MPYKYPKGKGWDIPKQKYGVTNWAKYTDSLRNRGRIDVWISEKAIEGWYKKDRVYDGTGTPFLYSDLAIITCHEIRKVFKQPLRQTQGLIDSFFESQGLPIKCPDYTVLSKRLAELDIKVPRYRKTDKPDDDIAGIAIDSTGLKRFGRDEWHQEKYKISAKRSWRKLHVAVDDDHYIQAALITDRYEADEEVVDELLEQIDEPFDRFTADGAYDSHDVYDSVLNHSPNADVVIPPPKNAVFDENNHAIRNINFNEIKDHGRMHWQKTRQYGKRNYSELAIQRYKRILGNTMQSREISRQKNEGLIGAGILNKMTSLGMPDSFRRS
>NZ_CP013815|0:60056|15497_15926_-|WP_017375652.1|transposase|DBSCAN-SWA
MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDREQGGELYKNLPHSGVVA
>NZ_CP013815|0:60056|3335_4043_-|WP_027243191.1|DBSCAN-SWA
MPIVQIANSKGGVGKSTIACNLATALVHAGFSVVIADCDPQFSSSSWADERQDNGKLLNVDIVQKTGKIIPALRQLTKKYDFVVVDTAGHDSVEMRAALTVSDLTIVPFKPSQLDIDVLGAMQELIENAQDAGNDKMQVAWIINMAAPNPRSKKLKETQDALNDAEGFNLLKSVLHNRDAYVESMSEGCGVVELKDKKAKTEIEALVKEVLKLTGKKAVRHGIKAKKTVKAKKSA
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MALKLKKQSKQKNQRKANKNDFIYAFKGSEHLKEKFDSGDKWVDTEQCYIAEIKIDRKTKDQDYLNELAASMSGKKQINAAIVRKAKDGRYELINGECRYDAAKINNEPLLVRVVDYDDDEAIGAIIAENDKRKDLCDYDKALAYLEYKSDLSIRAFAEKYNLNRNYVNRLFKVDKIPESVVLALPMIELSASQFEEIAIRIKDNQLYTDVFIELAPLLSQIETPVTWKDFLSRIDRKVNPPEKQPQKKIERYVFSSEKANLRYTDSGFIVKSEKLTRKQKEQIQEALDSIL
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MLVLTRKSGQEIFVGKDITIKVLSVVNGQVRIGIDAPQEVQIQRDDVKKRPELIKAVV
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MIIVYGGRKGGVGKSSGAINFAAGLQEQGKDVLLFDADRTENSSSWNHIRNENKTLKRVNSVQGYGNILTQLADLSERYDDIVIDTAGKDSQEFRYALAVADIALIPFRCSMFDLKTLPQVSDIISTMRPTNPKLQCFCYISMATTNPIMKEVFQTSQRVEKLKRDGLIDELTFLDSIISDRVAFRNVLFEGKSIYENDDKKAIQEIEDIIHEILNLHRTALDKQGSQHAQEA
>NZ_CP013815|0:60056|48392_48650_+|WP_069971691.1|DBSCAN-SWA
MQIIEKAIQKSIETGYAINLYGWNLEGVDLRGLNLDGANLREANLHKANLEGVNLRGADLYHTNLGTVAKNYSELQKGYFLVLSA
>NZ_CP013815|0:60056|7864_10057_-|WP_155763436.1|DBSCAN-SWA
MLISINAAPSNTSVIDATVSDDVTVTESGLFGSTVISRSPIDFDSNSQTSNSAGVTLQAEDTVKITVDTGTQVDPTNINVNVNLATLGVGKTLTGGRGLGPITSPTHGGGGAAVDLRVNADVYTNISIKSNATGGINAFGDDSSTGDGISGSSQSANSAVNLTIFAGSSSSNFTENTVNISGNMIGGSGGNGGNSTFVTGSGGVGTNGNNAIVANLFENTLTHFLVSGNLTGGNGGNGGSTTGSGTSGNAGDGEEAFYLSSPAKNSTVIFDIGKNANGNIIPVTVKGGSGGTSPSNPGGIGSYRAGMILFLGDAGNIGSVTLNVHKGSTIAPGDTGVNAGMRSASLYQVPGSNIISQVNNDGSITNGIDFSSSLQADVITNNESGVISGVSYTGLGDDNLTNSGTIESIDLGFGDDIVTNLTGGEISQNLLTGAGSDIVTNSSELSGTTNLGAGDDLLEIKAGSVGSIEGGTGTDTLNIVNSVSTAYINENCEFASGFATLGSNNCSKEVAIANVETINVNSHRISINGAIENTTTLSVNQGAILYLNAIKNNQLSKAQVTQLNNMGSLYLNSDVDGAINTIGNSSLILNEKDNKARKVTTFTATINSNGIPSIQSGFYNDDGSAKLYALTATSSTINIVNSTGGSEKYINYVIDLRSEDVDQFAKNGTEYPILNGISSSNHDNLEATNFNNNISYINSSGSMVSQLPLVDFFQDLVQGITVVVLYWLLK
>NZ_CP013815|0:60056|23665_24088_-|WP_017375782.1|DBSCAN-SWA
MSESIGALSEIYRDSDNGGNYVKLANITNIGEISSSRDKVDVTEYGSTQKKYKLGLKDHDEIQLDMNVAQDNSELKNLISDHDAGVERQFKIILATQPKRQIYEFTALITNHKIIAPLTEAISMSVSLQPTSVIVQSDEV
>NZ_CP013815|0:60056|43121_44048_-|WP_144420839.1|transposase|DBSCAN-SWA
MKLISEARMSRHKCTKEIYKAFLQASSVRYSGLALSEVSPKPLSHDSVSRWLQSQQYRPRDIWHIVKDLINTEEPCLLVVDDTVLDKHRSKQIDLVHHQYSGNAHDVIAGIGLVNLVWYGLERQHSIPIDYRVYDKDTDGKTKNDHFRDMLKLGKNRGMTPSAVVFDAWYSSLNNLKAARDLHWNWVAGLKKNRKVNRNETLEMLDFPDEGLKLHLRGYGWITVFRFVAKNGRTDYIGTNIEEPSRDQVEVIVKARWSIEVYHRELKQTCGIERCQARTGRAQRNHISLSIAAWVDKYKRKLNEKISL
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MLADWGEYIQRGAEHGSNNSIFGMIQKYGGVVIQNNNSGNDPYIANSDALEVDRIVNELLHSDCKSDQTMARILVIHYGITGSAAKKQATFRISVAVYNSFLSKGVSYVRGCLNVLA
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MVKRKRFKKNQPFKWKHYSGEIILWLVRWYGRYALSYRDLKEIAAERGLEIERSTICRWVHEYGSQIAKRLRPHFRQTCASWRLDETLVKIKGRWYYLYRAIDKYGNTLDWMLSRQQNAKAAMRFFKKAIAQPYVKSPRVVNVDKHASFPPAHQKAKDEGLFSSQCKLRRVKYLNNCIENDHKAVKRKSRFRQWYQSLSTARPTIDIMEAMRMVQKGQLRYIKKQDICAQNQLIDKLFGLAA
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MIEDIYFALLGTGWPVFPMVLPKNQILPAVTYQVIGGDRRYSLDAQAHLQKKTIQISCIAKTYQECKLMQDNITEQLNGYHNENIQLITFESELDQYEQDTKTYRTNLTFHLTGVV
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MIYRHLNEKDRFYIEQRLSEGDSLRSIARALGFSPSTISREIKRHTPIDFKGLYCHRLTSRCAQEKRANAKQGQAFQQISEEEKMLIHQRLSTHTSPDVISQELIREHNIQVSESTIYRYIYDDRERGGELYKNLPHSGKPYKKKVSRGDQTKIPNRVGIEQRPAIADEKTEFGHFEIDTVVGRDHQSYLLTLVDKANKMCCIRKMPNKQAKTVINTALLRKVIVSFRKVIFLC
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MHYVINKLKSQIEKQKATLLDDEGSLSIESLLSSDKFQSIINNCRSFRSRFYTPFVTLILFIRQVLSPDKSCKNTVATFLASVSTEDNNNIPSSNTGPYCKARQKLPIETLESLVKLSGDSLSKSSNARWKIYNREVKLIDGHCCEKFRFE
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MPKKLNLDDIDLSLVQELATQADMTNDEINIRQKKQKESPKVVINGYMNRAKCVTSSSCIKKELVSDIEALCKGNKWAAINYVLKLGLEELKKEKEVVFIEASDL
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MRAGLLRHRVTLQNNLIGANNYGEALDYWQDITTVWARVSPNAGRELFSAQQFYHEVSQTVTLRYRPNVTPSLRLVFDGRYLEILSVINPDERNRELILACRERKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
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MQTHQSRHLYLQITAMLLMWKKATEQWIAAQNKLLPKCEYQHITFTMPKALCPFFLANRELLNHLSRLAADVLLKTAKKKKIKIGIFTALHTFGQSLNWNTHVHLSVTRGGLSKCKTTWKKVYFTKKKTMPMWRFSIVNLLRTAYKTGKLVIPHQYQNHITDLTSFNRFINPEYNKLWHVHFAKAQPSQHQNVDYLGRYLKRPPLSNSRLLHYDGKEVIFRYIDRKTGKQEKHTSTTFEFIERHIPTKSFKMIRYYGFLSFRTRGKLLPTIYKLLDQTVEPVKKITYASLLKGFINTDPFECILCGSKMLLTGGRPKQRLSVIMKHHKALATMQLIKF
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MNLIFIPILLMILIMSPAISSKTENKLFSWKPEQLMNIKQISELDLSSSAPTLAYVVDFYKKDNKNIWTEKSSIKILSLTTKETHKVDYKDEDSWMPKWSPNGHYLAFLSKKVSEKSNDNALSLIKIWSKKTNKIYLLTETKNNIKTLSWSRNGNFIAYVTENKKDFYIDKNKLKIFSSSVRNDEMHIIEIDYKNLKKNKDKIIISKYIQGNKFSYIGNLSWSKDDKDIAFSHDIGDRNDLWNLGIISTINLMTNKINTINIFKQRMIMQQPHYSPDGQYLLFTASPEQVWSPRFCIYMQKIITKSVTKLACSFDQDPKLVGWSKSGKNIIFTENFHTWRNIYSLSTDREDITTKVVKINKSNSLIDTVSINSKGEIAIVQQNSKKAEEIYLTNLIRYQPQIITNINTRYTKFSETLGKTEKINWKSKDGLTISGLLTYPENYNKSKKYPLIIELHGGPADVFQNRFIGRRSVFPIATFSKEGYFYLRPNVRGSSAYGVYFKELNHGDWGGKDYQDIMDGIQYLNDKNIIDSKKISIIGWSYGGYLTAQAITHSPLFKAAIIGGGITDLASYSVTNDLPNYLKLNLGGYLWDKPKFYQKRSPIYAANHVTTPTLLMYGENDIRVPLSQGVEFFNILKLRNIPSMMLIYPKQYHSLSDPNYIIDAGIRNVSWINKYSRAGTVAKNLDLSRV
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Homologous phage analysis in the prophage region

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1010:1069	attL	NA	NA	NA	NA
WP_144420840.1|2041_2473_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_075275473.1|4159_4336_-	carbon storage regulator	A0A2I7RT00	Vibrio_phage	1.7e-06	46.0
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WP_069971688.1|6773_7880_-	autotransporter outer membrane beta-barrel domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_155763436.1|7864_10057_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_036771347.1|14492_15470_+|transposase	IS5 family transposase	A0A1B0VFY5	Salmonella_phage	3.9e-47	35.9
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WP_027242568.1|15984_18675_-	host specificity protein J	A0A0R6PIC9	Moraxella_phage	6.1e-111	32.9
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WP_144420832.1|19218_20004_-	hypothetical protein	A0A0R6PHF9	Moraxella_phage	5.1e-42	41.1
WP_017375787.1|19933_20605_-|tail	phage minor tail protein L	W6EC15	Rhizobium_phage	1.4e-27	33.6
WP_017375786.1|20601_20943_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771950.1|20935_23014_-|tail	phage tail tape measure protein	A0A1J0GWA6	Alteromonas_phage	1.6e-50	31.2
WP_017375784.1|23017_23284_-	DUF4035 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375783.1|23340_23664_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375782.1|23665_24088_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375781.1|24087_24438_-	DUF3168 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375780.1|24434_24830_-	HK97 gp10 family phage protein	Q6UAX1	Klebsiella_phage	4.3e-05	39.6
WP_017375779.1|25007_25433_-|head	phage head closure protein	A0A1W6JP44	Morganella_phage	3.9e-12	37.9
WP_017375778.1|25429_25741_-|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	Q8SBH7	Shigella_phage	5.6e-08	30.8
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WP_075275454.1|26723_27263_-|capsid	phage major capsid protein	A0A2I4R671	Erysipelothrix_phage	9.3e-35	44.2
WP_036771639.1|27312_28287_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	4.9e-26	30.9
WP_036771953.1|28749_31029_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242588.1|31045_31399_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036771330.1|31737_32712_-|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	1.7e-26	31.8
WP_036773107.1|32999_33317_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375691.1|33300_34002_-	AAA family ATPase	A0A222YXS3	Escherichia_phage	9.6e-32	37.6
WP_017375692.1|34025_34259_-	hypothetical protein	Q7Y5W4	Haemophilus_phage	1.3e-06	42.6
WP_036773116.1|34402_35377_+|transposase	IS30 family transposase	H7BWC8	unidentified_phage	3.7e-26	31.2
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Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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MVTLTVTDIHDLTVMLGMLEDIYQYEIPAAQRILKKIADKPESKSYHIVPTGLSSEKSIHYVNKLRD

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_036772541.1|82618_83347_+|transposase	IS6-like element ISPsa2 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	5.4e-38	42.2
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WP_036774378.1|92718_93288_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_144420833.1|93492_93684_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036774385.1|93697_94738_+	DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242592.1|94804_95134_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036774388.1|95157_96120_+|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	NA	NA	NA	NA
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WP_048876191.1|99713_100142_-	DUF86 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_017375910.1|103226_103955_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_146619416.1|104298_104445_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027243206.1|104750_106616_+	AAA family ATPase	V5K3E8	Pseudomonas_phage	7.9e-57	32.7
WP_080963664.1|106688_106955_-|portal	phage portal protein	G0ZT36	Aeromonas_phage	2.5e-09	46.7
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WP_048876194.1|107657_108191_-|portal	phage portal protein	Q8W629	Enterobacteria_phage	1.1e-19	33.3
WP_036774350.1|109430_110159_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	6.4e-39	43.1
WP_027243215.1|110641_111664_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772450.1|113477_114605_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
112015:112935	attR	NA	NA	NA	NA
WP_051929764.1|115276_115768_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	6.9e-21	42.1
WP_032126795.1|117126_117387_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036772441.1|117390_117663_+	Txe/YoeB family addiction module toxin	NA	NA	NA	NA
WP_017375910.1|117738_118467_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	1.4e-38	42.6
WP_048876229.1|119036_120008_-|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_048876208.1|120872_121700_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	1.2e-17	32.1
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WP_155046633.1|123917_124061_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_027242940.1|125267_125867_-	DUF1353 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_017375850.1|126220_126997_-	N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase	NA	NA	NA	NA
WP_036771279.1|127357_128086_+|transposase	IS6 family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	7.1e-38	42.2
WP_155046634.1|128155_128356_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_048876229.1|128274_129246_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP013815|135485:140256|DBSCAN-SWA
TTTATCCGGCAGCATAGAAATCAGCTCGAGTAGCAAATGCTTCTTTTCCACCCTCCATTATCGATTCAATCATATCTCTGATTGCATCATCTTCTATACTCCCCGCATATTTTACAAAACCTTTTTTACCATTTGATTCCAAGCTAACTACTCTATTAGCCTGACCAAGAACCGGAATATTAGCATTATGGCTTGAAACTATAGTTTGAGCTTTATTTGCTCTCTCAGTTAGAGATTTTATGAGAGTGCCTGCTATGTATTCATTATCTAAATGGTCCTCTGGCTGATCCACAACCAATACTCTATTTGGGTTTTCTAAAATAACAGATAATGAAACAGTACATCTCTGCCCAATTGAAAGTTCCTCAACCAGCTTATAGCTTCCGTGATCAAGCAGAGAAAATTGAACACTATCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGCTTCGATTTCCGAGGTGAGAACAGAGCCTAAATCTATATCACTCAAGTACCCCAAAACCCGTGTAGCTCTATCAATAGGTATTCCCAATGCAGCAGAAAAATCATCGTATTTCAAATGGCTAGTGTAGTAAAGCAGCCATTGAGGGTTAACTTTCTGGACCATTTCTGGAACTAGCCCCTTATACTTTAAACTTGATCCTCTAAAAGAGCTTTCCAGGTTCTCCATATAGCTCTGTAAGTCAGTTTGGTGTGTTAGTTCCGTTCGTATGGAGGGAGACAAACTTTGATTCAATTGAGTTACAACCGAATTACGCGATAGAAAAATCTTCTGTCTCAGCTCAGCTAAACTCACCAAGGCTTTTTGGCAAAGCGCATATTGCTCGTTAAGTTGTGATGATTTTTCAGCGCCTATTTGCTCTAAATTCACAAATTGAGCAATGCTTTCTCTAACTCGACCTAATTCACCGAGAACAATACCCGCTCCCTCAGTGAAATTTTCAACTTCAGCCCTGTTTTTTCTAGCCCGCTCTTCCAATAATGAACGGTTGGCACATAACCTTTCAGCCTCTAAATTAATAGATTGAAGCACTTGCTGGTCATTAGTAATAACAGACTGTATATACCCATCATCGTCTGCGATACCCTGCCGAATGATACGATTCATTTCGTTGGAGTTTTCGCCCTTCAATAAAGGCAGCTGCTCTCCATTTAGAAATAAAGATAATTCAGTAACCCGCCTCTCAAAATACTGTTTAATTGTACTCAAATTTTGAGAATTAACAGAAATGATACTTAGTTCATGTTGCACTTTGTTAATGCTCTCTTGATTTACACTAATCACATCATTTTGTTTCTGGAAATCACGTTGTTTCTCTATCAACTCCTTTTCTTTTAGCCTTAGACTTGGCAAATCAGAGGTTTTTTCTACAAGCTCTGCACGCTCTTTTTTTAATGATGCCATTGTTGTGCAAATTGCACTTACCTCACTCATAAGGACTTGCAACAAAGCCTTCTTTTCATTTATATTCGGGATGAAACTGTCGATCAAACGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTATAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGTTTAATTTTCCCTCAGCGTTAAGGCTGATCGTTTCTATTTCTTTTTGAGAGAAAATTATTGGCGGAGTAAATTGTTTAACAGGAGCTGTTTCAAATGCAGACCTAGAGATTGTCATATCAACACCATTTTCAACAATATCAATTACCACTCTTCCCGATGATTGTAAAATAGATAAAGCATGCATCATAGACTCTTTGTTGTTGCTTTGGGATAAATTTCCTGCACCAAGACCAAAACGAAGCAACTCAATAATTGATGTTTTTCCGACCCCCCTTCCACCAATTAGTACATTGAGACCAGGTGAAAATTCTAGATCTAGAGCATTAAAGAAACCTTCTTCAACTCGTAATCTTTTAATTAGCAAAACGCCCTCTCCCTAGTCCAAATTTATTAAAATCACTACAAATATTCACAAAAAACATTGAAAGGTTAATAACACTCACACTTCCAGATTAAACCCATAATCGAGCACTATTTCATAGACTTCATATCAATAACAAAACGATATTTCACATCCGACTTCATCACTCTCTCATATGCTGTGTTGATGTCTTCTATATCAATAGTTTCAACATCAGAAACGATATTATGCTCCGCACAGAAATCAAGCATTTCTTGAGTTTCTTTAATGCCACCAATTAGAGATCCTGCAATTATTTTACGGCCAAATACTAGCCCCATTGTATTTAATTCTATTGGCGTGGCTCCTACCACAGCCATTGTTTTTCCCAGCTTTAAAAGCGGCACATAAGGGTCTATATTATGGGCTACAGGAATTGTGTTCAACAAAAAGTCAAAGGTGCCTACGTGTGCTGACATTTGCTCTTCATTTTTGGAAACAAGCACATCACTTGCACCTAATCTTTTAGCATCCTCACCTTTTTCAGGCGAAGTCGTTATCATCACTACATGTGCGCCCATGGCTGAGGCTAGTTTAACCCCCATATGGCCAAGACCACCCAAACCTATAACACCTACCTTATCGCCAGACTTAACATTCCACTGACGTAAGGGGGAATATGTTGTAATACCGGCACATAAAAGAGGTGCAACTGATTTTGAGTCTAGGTTTTCAGACACTTTCAACACAAAATCTTGATCCACAACAATTCGAGTAGAATAGCCACCTTGCGTAATAGCATCTGCATTATGAGAATCAGGGCTGCCATAAGTCATCACCATACCCTTATCACAATGTTGTTCAACATCTTGTTTGCATGGTTCACATTTTCGGCAAGAATCAACCATACAGCCAACGCCAACAAGCTGACCTTCGGAGAAACCTTGCGCATCTGCACCTAATTTTTTCACACGGCCAATGATTTCATGACCAGGTACAAGAGGATAGGCTGACATACCCCAATCATTACGTACCATATGAATATCACTGTGACAGACTCCACAATATAAAATATCAATTTCTATATCTTTTGGGCCAACCTCGCGACGATTGAATTCATAGGACTTTAGCTCGTCTTTATCATTATATGCTGCATAAGATTTTGTGCTGTACATACGTTACTCTTTTGATGTGCCGTTGTTTCCAGATTCAACATACTTTATAACACAGATAGCTACCGCTCTCTTGAAAAACTGTTATTGCTTTACCTGTTTTTGCTAATTTTTCATGATATAAATCTGTTGAGTAAACTGCATCGGCCCTAAAGTTATCTATAGTTGTCACACGAAAACGTAGATACCGCCAGGATTTCTACGTTAATTACTGTCATTAACCTATAATCAAATGATGAGCCTTGTTTACAATATGTAAATGTTTATATATAATAAACGAGTTGTAATAAAGTAGTCTAAACTAATGATTAAGACTTGGAAGCACAAAGGTCTAAAAAAGTTCTTTGAATCAGGCAGTACTGCTGGTATTCAAGCTAGACATAAAACAATTCTAGCTAAGCAATTGGACTTCTTAGATTCTATGAGTGACCCCCAAGAACTTTGGATTTTTGAGAGTTGGGGAGCCCATAAACTTACTGGTAACTATAAAGAGCACTGGGCTATCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGCTTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACGCACCGTAAAAGCGAATTGGCGCTTATTTTTCAAGATAGAAGATGGCGATGTAGTTTTACTTAATTATGGCGACTACCACGGGAAATAATGAGGAGTACATGATGACCACTAAAACACGCAAACCGACACATCCAGGGGCGTATATTGCTGATATATTTGATAACCTGAAAGAGAATGGTGGCATGTCTCGTAATCAAATTGCCAAGCACCTTGGTATATCGCCGTCTACCCTTTGCAATATCATTGCAGAGAAGACACGGGTTAATGCTGATATGGCAGTAGTCTTTGAGAAGGCGTTAGGTGTTAAGGCTGATACCTGGTTAAGGCTACAGATGTCATATGACCTATGGGAAGCGAACAAGAAAAAGAAAAGCTTTTTAGCAAAAGTTAAATCATTGATTAATAATCCTGCCATTAAAATTGCTTAG

Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP013815|135485:140256|135485_135911_-|WP_017375964.1|DBSCAN-SWA
MARSDSVQFSLLDHGSYKLVEELSIGQRCTVSLSVILENPNRVLVVDQPEDHLDNEYIAGTLIKSLTERANKAQTIVSSHNANIPVLGQANRVVSLESNGKKGFVKYAGSIEDDAIRDMIESIMEGGKEAFATRADFYAAG
>NZ_CP013815|135485:140256|139340_139574_+|WP_017375959.1|DBSCAN-SWA
MIKTWKHKGLKKFFESGSTAGIQARHKTILAKQLDFLDSMSDPQELWIFESWGAHKLTGNYKEHWAIAASHGVLSTG
>NZ_CP013815|135485:140256|139893_140256_+|WP_081078123.1|DBSCAN-SWA
MATTTGNNEEYMMTTKTRKPTHPGAYIADIFDNLKENGGMSRNQIAKHLGISPSTLCNIIAEKTRVNADMAVVFEKALGVKADTWLRLQMSYDLWEANKKKKSFLAKVKSLINNPAIKIA
>NZ_CP013815|135485:140256|136181_137177_-|WP_036817204.1|DBSCAN-SWA
MSEVSAICTTMASLKKERAELVEKTSDLPSLRLKEKELIEKQRDFQKQNDVISVNQESINKVQHELSIISVNSQNLSTIKQYFERRVTELSLFLNGEQLPLLKGENSNEMNRIIRQGIADDDGYIQSVITNDQQVLQSINLEAERLCANRSLLEERARKNRAEVENFTEGAGIVLGELGRVRESIAQFVNLEQIGAEKSSQLNEQYALCQKALVSLAELRQKIFLSRNSVVTQLNQSLSPSIRTELTHQTDLQSYMENLESSFRGSSLKYKGLVPEMVQKVNPQWLLYYTSHLKYDDFSAALGIPIDRATRVLGYLSDIDLGSVLTSEIEA
>NZ_CP013815|135485:140256|139711_139864_-|WP_146619517.1|DBSCAN-SWA
MLKNKRQFAFTVRKRRYLGRYFAHPMMQNRRAKRDDYKPSAVRVTQRYVP
>NZ_CP013815|135485:140256|137480_137888_-|WP_036817201.1|DBSCAN-SWA
MLIKRLRVEEGFFNALDLEFSPGLNVLIGGRGVGKTSIIELLRFGLGAGNLSQSNNKESMMHALSILQSSGRVVIDIVENGVDMTISRSAFETAPVKQFTPPIIFSQKEIETISLNAEGKLNVSVATSVGILHIQ
>NZ_CP013815|135485:140256|137995_139039_-|WP_017375960.1|DBSCAN-SWA
MYSTKSYAAYNDKDELKSYEFNRREVGPKDIEIDILYCGVCHSDIHMVRNDWGMSAYPLVPGHEIIGRVKKLGADAQGFSEGQLVGVGCMVDSCRKCEPCKQDVEQHCDKGMVMTYGSPDSHNADAITQGGYSTRIVVDQDFVLKVSENLDSKSVAPLLCAGITTYSPLRQWNVKSGDKVGVIGLGGLGHMGVKLASAMGAHVVMITTSPEKGEDAKRLGASDVLVSKNEEQMSAHVGTFDFLLNTIPVAHNIDPYVPLLKLGKTMAVVGATPIELNTMGLVFGRKIIAGSLIGGIKETQEMLDFCAEHNIVSDVETIDIEDINTAYERVMKSDVKYRFVIDMKSMK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_017375964.1|135485_135911_-	hypothetical protein	A0A1B1IUG5	uncultured_Mediterranean_phage	5.1e-12	43.9
WP_036817204.1|136181_137177_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_036817201.1|137480_137888_-	AAA family ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_017375960.1|137995_139039_-	NAD(P)-dependent alcohol dehydrogenase	A0A2K9L339	Tupanvirus	2.2e-77	44.0
WP_017375959.1|139340_139574_+	hypothetical protein	A0A0M3LQB1	Mannheimia_phage	5.1e-06	45.2
WP_146619517.1|139711_139864_-	phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_081078123.1|139893_140256_+	HigA family addiction module antidote protein	A0A2I7RIN6	Vibrio_phage	3.5e-06	46.6

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP013815|144392:188073|DBSCAN-SWA
ATTGCCTAGACGTGCGAAACAGATTTGCTGTTATGCCGGATGTCATAACACAACCTATGCACGCTACTGCGAATACCACGAACAACACGGCAATCGATACCATGCCCCACGTAAGACAACAGCCCAGCGTGGCTATGGGGGGCGGTGGCAACGTGAACGTAAGATATTTTTACAAGATCATCCACTGTGCAAGCAGTGCTTACAAGATGACAAATTAATCCCAGTGACTGAAGTGGATCACATTAAACCGCATGATGGTGATCATGATTTAATGTGGAACCAACGCAATTGGCAAGCGCTGTGTAAGCCCTGTCACTCACGTAAAACAGTGAATGATGATGGTGGCTTCGGTCGTAAAAGATCACCCCAGGGGAGGGGTATATAAAATGTCTATGACCTTTATTTCCTGACCACCCGCCTAGTCGAATTTTTACGCATGCGAAATTAGAACTAAAAACTTGGAGGTTTTTGATGTCGAGAATGAGAGGTCAAGGCAGAAAGCCAAAACCAACAAAAATTAAGAAAATTACAGGGAATCCTGGATGTAGAAAACTAAATGAGCATGAGCCAAAACCACAGGATGGGGTTGCCATTTGTCCAGGTTATTTTGATGAAATAGCAAAAGGAGCCTTTGATTCAGCCGTCTCTGATCTTGAATATATGCACATCAAAACAGCCTCTTTTCAAAAACAACTAGAAATTTATGCGAGTGCTTATTCTGACTGGCGGCAGCTATCCGCTGTCATAGAACAAAAGGGCCGTACGTTTGAAACGACGACGCAAGCCGGGGATACCATGTACCGCAGCCGCCCCGAAGTGGCTCAACGCAATGAAGCCTGGAAACAAGTCAAAGCCTCATTAAGTGAGCTTGGATTAACACCAACCGCGATTAGTCGGCTCAATGCTCAAGTATCTAGTGCTATTGAGTCAGAGATAGATAAAATTTTGGATTAACTATGATTAAAAGCGACCCGGTAAAAACCGCCCTCACCTACTGCGATAATGTACTAAGCGGCCGCGTCATTGCCTGTGATTATGTAAAAAAAGCCTGTCAGCGTCATTTAAACGATTTAAAGTATGCTGGTGATCCCGGTTTTTACTTTGATAAAGAAGCGGCCTGTAAAGTCGTTAGATTTTTTAGTTACTGCAAACACAGCAAAGGTGAGTGGTATGGGAAGAAAATTACTTTAGAGCCTTGGCAACTATTTATTATTACTACCGTGTTTGGTTGGAGGCGTGAAGTTGATGGTATGCGGCGTTTTCGTACCGTTTATGAGGAAGTCGCACGTAAAAATGGCAAGAGTACGAAATTATCAGGCACTGGCTTGTATTTATTTTGTGCTGATGAAGAGCCGGGTGCAGAAGTCTATGCCGCGGCAACCAAACGCGATCAAGCAAAAATCGTTTTTGATGATGCGGTCAAAATGGTTAGAGCCTCTAAAGCCTTAGCTTCTCGCATCGGTATTTATAAAAATAATATGCATTATCCCAAGGATTTACCGAATAATAAGTTTGAACCGTTATCGAGCGATAGCCAGACACAAGATGGCTTAAATGTGCATAGTAGTATTGTAGATGAGTTGCATGCCCATAAAACCGGCGATTTGTGGCGGGTATTAGAGACGGGCACCGGCTCCAGGCGTCAACCGTTGCTGTATGCGATTACAACCGCCGGCTTTGATCAGACGGGGATTTGTTATAGTTTGCGTGATTATGCGGTTAAAGTGCTGGAAAATATCATTGAAGATGATACCTTTTTCGGCATTATTTACACCCTCGATAAAGAGGACGATTGGACAGACGAGCGTGTTTGGATCAAAGCCAATCCAAATTTAGGCATTAGTAAAAAGCTTGATGACATGCAACGCCAGTGCGTAAAAGCTCAACAAATGAAGGGTGAACGCAATGGCTTTTTATGTAAGCATTTAAATATCTGGACGAATGCCGAAACCGCTTGGTTAGATTTAGAACGCTGGAAAACTTGCGCTGAATATACCTTTAAACGTGAATCACTGGAAAATCGGCCCTGTTATATAGGTCTGGACTTAGCCAGTACCAACGATATCGCCGCCTTAGTTGCGGCTTTTTTAATGCCAGATGATTCAGTACGTTTATTTTGTCGCTTTTACTTACCTAAAGAAACCGTAATGACTCGAGCCAAGCAATCCCCCGTGCCCTATCAGCTATGGTCAGATGAGGGCTATTTAACCCTCACTGAGGGTAATGTGATCGATTACAACCGCTGCGAGCCATGGAGTGCTAAGCACGGGGTGAGTAGGCCGAGGTAGGTTCGGGTTTTTAGCAGAGCGGAGTTGCGAAAGGCCGTTAGGTCTGTAGCAAGCGTAACGAGTGTCTAAAAATCTATACGAACCGTAGAGTCATGTGAGAGCACAGTAGTGGAGTGTGCCGATTCAAGGCACGTAACGCTGTGTGACGCGGACAGCCGAGGGTTTATAGTCGTCGCGTTTTGCTCGGCGATTTTGCATCATTGGATGTGCAAAATACCTACCGAGGTAGCGACGCTTACATATATCAAAGACGATATTTACCAGCTCAATAAAGAATTTGATGTGAAAGAGATTACTTATGACCCGTGGAATGCCACCCAGCTGGCCAATGATTTACTCGAAGAAGGCGCGAATATGGTGGAGTTTCGCCAAGATTTTAAGTCCATGACCCCAGCATTAAAAGAACTTGAGCGCTTGGTAATTTCAACAAAGCTCCATCATAACAATAACCCCGTGTTGAACTGGATGGCCTCGAATTTAGTCGTTGTTGAAGATGATGCGGGGAATATGAAACCTTCTAAGCGTAAATCCACAGAGAAGATTGACGGTATGGTGGCCATTGCGATGGCCGTCGGGCGTTTAATTGCTGGGGAAGATCATAATTCGATTTATAACGAGAGAGAACTGCTCATTTTATGAAGTTATTTAAACGCTGGTTTGGTGCGGCAACGGAGCTTGAGCCAAGTAGCGAATATGGTGGTTATGAGCTTTTAGATACTGCGCCCATGAGTGCCAGCGGTCAAAGCATCCACCCCGATAATGCCATGCGCTTAGCAACGGTTTATGCCTGCATTCGTGTATTAGCCGAATCGATTGCGGCTTTGCCTTTGCATGTGTATCGCTATGAAACAGATGGTGGTAAAGCCTTGGCTACAGATCACCCGTTATATTCTGTCTTGCATGATCTGCCGAATGGTGAAGTGACTAGTTTTGATTTACGTGAAAACCTCGTCGGCCATTTATGTTTACGTGGTAATGCCTATTGTCAGATTATTCGCGATGGTGCAGGGCGGGTACGTGAATTAATCCAACTGCCCACTGATAACACCAGCGTCCGCCGTGATGAAAAAACTAAAAAGCTCATTTATAGGCACTGTTGCGAAAAGTTATAGGGAGCTTCAGAAAGGTTATTTTCTTGTGTTCGCGGCCTTAGAATGAAGCCGCCAATCCAAATAATTTATCAATGAGCTGGTTTTGGGCACAGATATCCTGTTTTTTAATATAACGTAATTGACCTTTTTGAACCATGCGCATCGCTTCCATCACATCAATGGTAGATCGGGCTGTAGAAAGTGATTGGTACCATTGGCGGAAACGGGATTTGCGCTTTACTGCTTTGTGATCATTTTCAATGCAATTGTTTAAATACTTCACTCGCCTGAGTTTACATCGCCTAGAAAAGACACCTTCATCTTTGGCTTTTTGATGAGCCGGTGGAAATGAAGCATGTTTATCGACATTCACAATACGTGGTGATTTCACATAAGGTTGGGCGATTGCCTTTTTGAAAAAGCGCATCGCCGCTTTGGCATTTTGATGTCGACTGAGCATCCAGTCCAAAGTATTGCCATATTTATCAATGGCTCGATAAAGGTAATACCAGCGCCCTTTAATTTTCACCAACGTTTCATCTAACCGCCAAGAGGCACACGTTTGACGAAAGTGGGGCCTCAGCCGTTTGGCGATCTGCGAGCCATACTCGTGCACCCAACGACAAATGGTTGAACGCTCAATCTCAAGACCTCTTTCAGCTGCTATTTCTTTGAGATCACGGTAAGATAAGGCATAGCGGCCATACCAACGCACCAGCCAAAGAATGATCTCACCGGAATAATGCTTCCATTTAAAGGGTTGATTCTTCTTAAATCGTTTACGTTTTACCACAGCAATTCACTCTTAACTTCCGTTGATTGCTACACCCTACTCAAATCTAAATTTTTTGCAACAGTGCCGTTTTAAAATCAAAGAAAGTTGAGCCAACCACATTCATGAATGTATTGATAACAGTCTTGGCTTGTTTGTTAGGCATTTTCCTTATACAACACATTTTATTCGCCTTATCGACCAGTGTTAATAAATAAGATTGGTGGTCACGACCCACAACCGTATCAATTTCAAAATGACCAAACTCTGTCTTTTCATCAGCAATAGCAGGCCGTTGTTCAATACCAACGCGATTAGGTATTTTTGTTTGATCACCACGACTCACCTTCTTCTTATAAGGTTTTCCTGAATGAGGCAGGTTTTTGTAAAGCTCTCCGCCCTGCTCTCTATCATCATAAATATAACGGTAAATCGTGCTCTCACTCACCTGAATATTATGCTCACGTATAAGTTCTTGACTGATAACATCGGGGGATGTATGAGTCTTTAACCGCTGATGAATTAACATTTTTGCCTCTTCTGAAATTTGTTGAAAAGCTTGTCCTTGCTTAGCCTTAGCTCGTTTTTCTTGTGCGCAGCGAGAAGTAAGCCGGTGACAATAAAGACCTTTAAAATCGATTGGGGTGTGCCGTTTAATCTCACGGCTAATCGTGCTAGGAGAAAAGCCAAGTGCTCTAGCAATTGATCTGAGCGAGTCTCCCTCTGATAACCGTTGTTCGATATAAAAACGATCTTTTTCATTTAAGTGCCGATAAATCATCTCTACCCTCTAAGTCAAAAGGAGAACTAGAGAGTTTATCTGTATGAATATGAACTCTCTACTGAGTG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MPYKYPKGKGWDIPKQKYGVTNWAKYTDSLRNRGRIDVWISEKAIEGWYKKDRVYDGTGTPFLYSDLAIITCHEIRKVFKQPLRQTQGLIDSFFESQGLPIKCPDYTVLSKRLAELDIKVPRYRKTDKPDDDIAGIAIDSTGLKRFGRDEWHQEKYKISAKRSWRKLHVAVDDDHYIQAALITDRYEADEEVVDELLEQIDEPFDRFTADGAYDSHDVYDSVLNHSPNADVVIPPPKNAVFDENNHAIRNINFNEIKDHGRMHWQKTRQYGKRNYSELAIQRYKRILGNTMQSREISRQKNEGLIGAGILNKMTSLGMPDSFRRS
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MVWLCIMSKSKKIVVKSNKLIEAGYKLSLQEQRVLLLCISQINSKNVELSTEYTITAQQYADQYSIALKGAYRELKAVINTLYDRSVSVYDKQNDIEISFRWLSEKVYLNKQGTARVRFSERVEPFLTDLKSKFTSYDLNLIAGIKSSYAIRIYELLKQFGAFGERTVTLDWLKGRLEINDEKSYKMFGSVKQRILEPAKSEINRCTDISMDYKPVKTGRKVTHISFIFESKRKDIVRDIKEERVDEKVSVAGFIKGLNLVIDTLENSENINRDKLSFAYNKFVANGAAIEDYRKLLDYIASHSSSIKDERDIESVIGEQLYLGKKKSKPFPRNGSRVTNPLSQSYYHEHNVNDDPVLEAINGDYEVVGD

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_048876205.1|145347_146679_+|terminase	terminase large subunit	A0A1W6JP18	Morganella_phage	6.1e-112	46.3
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WP_087910668.1|147404_147791_+|portal	phage portal protein	Q6DMU2	Streptococcus_phage	2.1e-25	50.0
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