Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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NZ_CP016359 | Gramella flava JLT2011 chromosome, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,c2c10_CAS-V-U3,csa3,cas3 | 0 | 0 | 3 | 0 |
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---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1723440 : 1732141
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP016359|1723440:1732141|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP016359|1723440:1732141|1727754_1729653_-|WP_083644006.1|DBSCAN-SWA MSDALKHECGIALLRLLKPLDYYKEKYGTAFYGVNKMYLMMEKQHNRGQDGAGFASIKLNTLPGERYISRIRSNQAQPIQDIFEQINQRINDEIKANPQYAEDVELQKRHIPYLGELFLGHVRYGTFGKNSIESVHPFLRQNNWMHRNLIVAGNFNMTNVNRLFNNLVELGQHPKERADTVTVMEKIGHFLDSEVRKLYKKLKKEGFSKKEASPHIAQQLNVAKILKKSSKLWDGGYAMAGLMGHGDSFVLRDPAGIRPAYYYKDDEVVVVASERPVIQTVFNVDFEDVQELPPGHAIITKKNGSTKIKEIIEPLERKACSFERIYFSRGSDAEIYEERKKLGRLLMPQVLEAIERDTLNTVFSFIPNTAETSFYGMVEAAQDELNLQKNEAILAEKDKLTNERLQEILSHRLRTEKIAIKDVKLRTFITEDSSRDDLVAHVYDVTYGVVKESDNLVIIDDSIVRGTTLKKSIIKMMDRLNPKKIVVVSSAPQIRYPDCYGIDMARLEDLVAFRAALELLKEAGRYELVEEVYEKCKEQVDLEDQDVQNFVKEIYEPFSDQQISDKISELLCDPEINADVKVIYQTVENLHEACPKNLGDWYFTGDYPTPGGNRVVNRAFMNFFEGKKDRAY >NZ_CP016359|1723440:1732141|1729714_1730638_-|WP_083644007.1|DBSCAN-SWA MSKLLIVGTVAFDAIETPFGKTDKILGGAGTYIGLSASNFDVESAVVSVVGEDFPQEYLDLLTRNNINIDGIEIVEGGKTFFWSGRYHNDLNTRDTLDTQLNVLADFNPKVPDTFKDAEYVMLGNLHPLVQLSVLEQVENPKLVVLDTMNFWMDNTLEDLKKVIARVDVITINDEEARQLSGEHSLVKAARIIANMGPKYIVIKKGEHGALLFHQEQIFFAPALPLEEVFDPTGAGDTFAGGFIGYLARTNDVSFENMKSAIIYGSNLASFCVEKFGTERMESLDRSEVNERLNEFRKLTQYETKMN >NZ_CP016359|1723440:1732141|1723440_1726539_-|WP_083644004.1|DBSCAN-SWA MKNSFTIYDASAGSGKTFTLVKKYLSILLRSKRADTYRNVLAITFTNKAVAEMKRRIIENLSAFTSERTNLANNDMMKILAEETGLFENEIRQKSAEILKSIIHNYAAFEVSTIDGFTHRVLRTFARDLEIPMNFEVELNADDILSEAVDSLINRAGNDEELTKILIEYTLSKTDDDRSWDISRDLFQIARLLTNENNQKAIAILRDKSVEDFKKFRKRLSEEIKKGDQQLQDIGTQFFQLLERNGVDQKSFSRGSVPGYFQKLVNGDKNINFETRWAQHIDSDTLYTKTTPEDQKAQIDARQAEIAELFGHSKKVFFHIQFLEEVQKNIVQLSLLNEINREVEQIKADRNILLISEFNPKISQQVKDQPAPFIYERLGERYRHYFIDEFQDTSVMQWQNLIPLIDHNLSSTEENSSLTLVGDAKQSIYRWRGGKAEQFIELCGEQNPFPVEKEKIQLPDNFRSGSTIVNFNNEFFSFAADSLSFPAYAELFRRGSQQPKKGDYGYVNLRFLENSTKEEELENYPEEVLKIIQELDEAKFQRGDVCILTRTRREGVAVAEFLSENGIPVVSSETLLLSQSSEVLFIIALLKLSLQPENEEIRLEVLDYLMQQKFPESYTYEKLLDSLKHEVSHLFDWLREEQVDFQLEKIQRLSLYEACEYIIRSFELVTESDAHLQFFLDFVYESSQKNLGGIHHFLENWEKNKDRLSIVVPEADDAVKIMTIHKSKGLEFPVVIYPFANSKMQDTRKDNLWIDLEDEDIPVAYVSASKKMMDWNLSASEAYQELLHQNELDTLNVFYVACTRAAERLYILSNKNDKPSGTVADLLFDFAGNQLSANKNEFQIGTAEPAKTQKSEISSSVTARTFYTSSVQNEAVKIVTRAGAMWDSSQQEAIEKGEILHEILAFIHTSEDLEAAMIKAIAIGLISEDAKAEIQQQIEKIIHHPELRLFFSGEMKNINERDIIDSNGERLRPDRLNIDGKTVHIIDYKTGGFTDMHENQLRKYSEVLENMGYTIGERLLIYTHNPIRIEKV >NZ_CP016359|1723440:1732141|1731904_1732141_+|WP_013069791.1|DBSCAN-SWA MSDIASRVKAIIVDKLGVDENEVVNEASFTNDLGADSLDTVELIMEFEKEFDIQIPDDQAENIATVGQAISYIEDAKK >NZ_CP016359|1723440:1732141|1726705_1727317_+|WP_173850086.1|DBSCAN-SWA MMSFELPKLKYAFDALEPHIDARTMEIHHDKHHAGYTSKLNAAIEGTDMEGKNIENILQNLDMSNSAVRNNGGGFYNHSLFWEIMSPEGGGKPEGELAEAIDKKFGSFEAFKEEFSKAAAGQFGSGWAWLCVHKGGEVEVCSSANQDNPIMPGIGCGGQPILGLDVWEHAYYLNYQNKRPEYIDAFFNVIDWQEVSSRYAKAK >NZ_CP016359|1723440:1732141|1730693_1731164_-|WP_083644008.1|DBSCAN-SWA MQQPTVHMYTDGAARGNPGPGGYGVILEWVGKPYKKEFSAGYKHTTNNRMELLAVIEGLKKLKNPGTSVLVFTDSKYVADAVNKGWVFNWEKKAFVNRKNPDLWMEFLKVYRKHQVKFQWIKGHNDHPQNERCDALAVIASKGKKLLDDKGYKPGN >NZ_CP016359|1723440:1732141|1731163_1731757_-|WP_083644009.1|DBSCAN-SWA MSNQQKPPKKIVIFASGNGTNAENIIKHFQKSEKAEVVALFSNRRSAGALKKAHDLNVKALHFDKEAIYHSHEVLNVLRDMKPDLIVLAGFLWLMPKRILQQFSNKVINIHPALLPAYGGKGMYGSRVHEAVIANKEKESGISIHYVNDQYDEGRIIFQARTQLDNTDTPDSLAQKIHELEYRHFPEVIEELLEKQA |
7 | Bacillus_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
2156025 : 2166018
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP016359|2156025:2166018|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP016359|2156025:2166018|2164626_2166018_+|WP_083644395.1|DBSCAN-SWA MKIKNICCIGAGYVGGPTMAVIAQKCPEINVTVVDINEKRIAAWNDENVENIPIYEPGLSKVVEEARDRNLFFSTDVDKAIDQADMIFISVNTPTKTYGMGKGMAADLKFIELCARQIARVSTSDKIVIEKSTLPVRTAEALKNILENTGNGVSFQILSNPEFLAEGTAVEDLMQPDRVLIGGDIDTEKGKEAVQALVDVYAHWVPKEQILTTNVWSSELSKLTANAFLAQRVSSINAMSELCEKTGADVNEVAKAVGMDSRIGPKFLKSSVGFGGSCFQKDILNLVYIAKSFGLNEVADYWEQVITMNDHQKKRFALNIVRTLFNTVSGKKIALLGWAFKKDTNDTRESAAIYVSDYLLNEQADIVIYDPKVTEEQIYADLNYLGTRSEEENIARVTVLSNPYEVCENAHAIAVLTEWDEFKDYDWQRIYDGMLKPAFLFDGRQLLNRKKKEDIGFEFYAIG >NZ_CP016359|2156025:2166018|2159669_2160269_+|WP_086047707.1|DBSCAN-SWA MNYNIVPHTFSVDRAGREKLNGHKALVVWFTGLSGSGKSTIANRVEQALFKEGIHTFSLDGDNIRSGLNKGLTFSQEDRRENLRRIAEVAKLFVDSGMVVIASFISPLKSDRDFLKKIIGKDHFVEVFVNTSLEECEKRDVKGLYAKARAGEITNFTGIDAPYEVPAKPDIKIETEKEELQASVAKVLNYLQAKLKINQ >NZ_CP016359|2156025:2166018|2158216_2159215_+|WP_083644388.1|DBSCAN-SWA MSRFIHVLLTGGVGSRLWPLSRKARPKQYADIFGGDSLFELTVKRNQALTDELCVVGNIENDQLSKGSLSRLGVVTNHHIVETTPRNTAAAIAFAAFSVEKDDMLLITPSDHIIAEGPQYDLAIEKAKELAKKGSIVTFGIQPTKPETGYGYIEYNGTEVKSFREKPNKETAQDFIRSGNFLWNSGMFCFKAGVFLEELKKFEPDVYDQSRNVLENTESDFLDLDLSMKIPSISVDYAVMERSDKIKVVPSSFKWSDMGSFESVYEYLQSQGHPVDENGNMSIGCNKFTSFVGLKNSIFVATEDANLILQKEDSQEVKVVYKNLEKEYSDLT >NZ_CP016359|2156025:2166018|2156897_2157917_+|WP_083644387.1|DBSCAN-SWA MKTEKVILVTGGAGFIGSNFIPFYLERHPQTAIVNLDLLTYAGNLDNLKEVEDHPNYQFIHGDIRNRALIEELFERYQFQGVVHFAAESHVDNSIKNPGVFIETNVNGTYNLVDVAYRSWFDEPFQVKKAFENARFHHISTDEVYGSLGETGKFTEETPYAPNSPYSASKASSDMIVRSYHHTFGLNTIIANCSNNYGPNQHDEKLIPTIIRKALAGEEIPIYGDGKNIRDWLYVLDHCEAIDSVFNYGNAGETYNVGGDCEKSNIELAHLICSLLDELKPKKDGSYSDQISFVKDRAGHDRRYAIDSSKIKKQLQWKPKKDLESTLQNYLRNWLLMFN >NZ_CP016359|2156025:2166018|2156025_2156901_+|WP_083644386.1|DBSCAN-SWA MKGIVLAGGSGTRLYPITKGVSKQLLNIYDKPLIYYPLSVLMLAGIREIMIVSTPEDLPNFKKLLGDGADWGLQFTYAEHPKPEGLAQAFLIAEEWLGNDDVCLVLGDNIFYGNGFTPMLQRSIQNVTNDRKASIFGYYVNDPERYGVAGFDQDGKVTSIEEKPENPKSNYAVVGLYFYPNSVVDVAKNVKPSNRGELEISSINEHFLKNNQLKVELMGRGYAWLDTGTQDSMLEASNYIHTIEKRQGLKIACLEEIAYDRGFIDRQKFEELAKALEKSEYGKYLLKRLKR >NZ_CP016359|2156025:2166018|2163631_2164585_+|WP_083644394.1|DBSCAN-SWA MINKSTKIYIAGHRGMVGSAIWRKLKAEGYINLIGRTSIELDLRNQAAVKKFFETEKPEVVIDAAARVGGILANNDYPYQFLMENLQIQNNLIDFSHKSEVQKFIFLGSSCIYPKHAPQPLKEEYLLTDSLEPTNEWYAIAKIAGVKACEAIREQFEKDYVSLMPTNLYGTHDNFDLETSHVLPAMIRKFHEAKRNDNAPVELWGSGSPRREFLFVDDLADAVCFALENKLPENLYNIGTGKDLTINDLANSIQEIVGHKGQIIWDSSKPDGTPRKLMNVDKIKKAGWEANTDLKEGIHITYNWFLENQSRFKEVKL >NZ_CP016359|2156025:2166018|2161202_2162459_+|WP_083644392.1|DBSCAN-SWA MEINNNQLLRFTTAGSVDDGKSTLIGRLLYDSKSIFEDQLESITSTSEKKGHDGVDLALFTDGLKDEREQGITIDVAYRYFTTPKRKFIIADTPGHIQYTRNMVTGASTANAALILIDARHGVIEQTKRHSFIASLLNIPHLIVCVNKMDLVDFSEDRFNEIISEFEEFSSKLLVKDIRFIPISALLGDNVVNRSENMHWYGGGTLLNILETLHISSDINKIDARFPVQTVLRPQSAEYRDYRGYAGRVASGIYRKGDEVAVLPSGFTSKIKSMNAGDKEIDEAYAPMSISMTLEDDIDVSRGDMIVRKNNQPEGEQEFDVMLCWLNNDSAQPRAKYTIMHTSNEQRAMIKNVVYKIDINSYNRNEEDKDLKMNDIARVTIRTTRRLMLDSYRDNRITGSIILIDENTNETVAAGMIV >NZ_CP016359|2156025:2166018|2160268_2161174_+|WP_083644391.1|DBSCAN-SWA MGKYYLNYLDELESEAIFILREVWAQFENPVILFSGGKDSILVTHLAKKAFYPSKIPFPLMHVDTGHNFPETIKFRDDLIKELGAQLIVGSVQESIDQGRVKEEKGKNATRNALQITTLLDAIELNKVDCAIGGGRRDEEKARAKERFFSHRNDFGEWDPKNQRPELWNLLNGKQFEGEHFRAFPISNWTEMDVWNYIKKENISIPSLYFAHEREVVFRSNSWIPVSEYLKLEEGEKIEKKKIRFRTLGDITITGGIESDADTLEKIAEEVSAMRKTERGDRSDDKRSETAMEDRKRQGYF >NZ_CP016359|2156025:2166018|2159215_2159680_+|WP_083644389.1|DBSCAN-SWA MPKSYKRHIAKSITWRIVGTIDTIVLSWIVTGSPVTGLKIGFSEVATKMVLYYLHERIWFNIKAGVTKNGDSRKRHLAKTVTWRVIGTMDTMVLAWIISGNPLTGLKIGGIELVTKMALYYLHERAWYKFDYGLQQRRKKELKEKKALQYTDEL >NZ_CP016359|2156025:2166018|2162463_2163579_+|WP_083644393.1|DBSCAN-SWA MSKVALITGATGQDGAYLSEFLLKKGYIVHGLKRRASLFNTDRVDHLYQDPHEANLKFILHYGDMTDSTNLIRLIQEIQPDEIYNLAAMSHVAVSFETPEYTGNADGLGTLRILDAVRLLGLEKKTRIYQASTSELYGKVQEVPQSETTPFYPRSPYAVAKMYAYWITVNYREAYGMYACNGILFNHESPIRGETFVTRKITRAASRIALGLQDKFYLGNLDAKRDWGHAKDYVRMMWMILQADEAEDWVIATGKTTTVRDFVKMAFAETGIELEFKGEGVEEKAYVKSCSNPEYQLEEGKELLAVDPKYFRPTEVDLLIGDATKANTKLGWTPEYDLPALVKDMMQSDLKLMKKDQYLKEGGYRIMNYFE |
10 | Hokovirus(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
3123120 : 3160489
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP016359|3123120:3160489|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP016359|3123120:3160489|3137207_3138380_-|WP_083646143.1|DBSCAN-SWA MKQKIIRYFKNVFGTILVLTIIGIIVVISLNGSLEYGNNPLNVNLEKEGPYVFYDSDSSLTVNYIRGNKTDGFYLEQTIHSANATVPLSCKFPLDSSSFSFELTSDFEVPASSYSDNQPILAISDIESGYKTFRDFLITHKVIDHQLNWTFDQGHLVLVGDFVDRGFSTTQVLWFIYKLEQEAKEQGGQVHFIIGNHELYNMQGKYQSASYKYYAVASILEKQHHELYNKRSFIGRWMASKNSMERINGHLFAHGGIHPEMAQYDITLEEVNQINRQNYSKSYYPKPEETVEQLIISNRKGICWYRGYFKDDLSQEDVEKGLKMFDATAIIVGHTIQWRVNKLYDGKVIAIDVKHPKDYNKNWPSKDSEGLLITTENYFRLKGNGERIKL >NZ_CP016359|3123120:3160489|3154974_3157629_-|WP_083645205.1|DBSCAN-SWA 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34 | Thermus_phage(50.0%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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