Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP019419 | Polaribacter reichenbachii strain 6Alg 8T chromosome, complete genome | 2 crisprs | PD-DExK,cas3,DEDDh,csa3,RT,WYL | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. NZ_CP019419
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP019419_1 | 607776-608137 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019419_1
|
4 spacers
spacers of NZ_CP019419_1
>1.1|607808|55|NZ_CP019419|CRISPRCasFinder TCCGTTATTAGCAGCAGGACCTGCAACATTAGGACATTTATCATTTTCACCTACA >1.2|607895|49|NZ_CP019419|CRISPRCasFinder ATTTGCTTTTGTTCCTTTAGCATTAGGACACATATCATCTTTATCAGCA >1.3|607976|49|NZ_CP019419|CRISPRCasFinder CATTGCAGCTAAACCTGGCGTGTTAGGACAAGCATCATCAGAATCTTTT >1.4|608057|49|NZ_CP019419|CRISPRCasFinder GAATTCTTCTAAACCAGCAACTTCTGGACAAGCATCATTTTTATCATAC >1.5|607895|52|NZ_CP019419|PILER-CR TTTATTTGCTTTTGTTCCTTTAGCATTAGGACACATATCATCTTTATCAGCA >1.6|607979|49|NZ_CP019419|PILER-CR CATTGCAGCTAAACCTGGCGTGTTAGGACAAGCATCATCAGAATCTTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019419_1
The CRISPR arrays of NZ_CP019419_1 >merge|NZ_CP019419|1|607776-608137|CRISPRCasFinder,PILER-CR ACACCATCACCATCAGTATCTGGCCAAGGACATCCGTTATTAGCAGCAGGACCTGCAACATTAGGACATTTATCATTTTCACCTACAACACCATCTCCATCAGCATCAGGACAACCTTTATTTGCTTTTGTTCCTTTAGCATTAGGACACATATCATCTTTATCAGCAACACCATCACCATCAGCATCAGGACAACCATTCATTGCAGCTAAACCTGGCGTGTTAGGACAAGCATCATCAGAATCTTTTACACCATCACCATCAGCATCAGGACAACCATTGAATTCTTCTAAACCAGCAACTTCTGGACAAGCATCATTTTTATCATACACACCATCACCATCAGTATCAGTTCCACCAAA >NZ_CP019419|1|1|607776-608137|CRISPRCasFinder ACACCATCACCATCAGTATCTGGCCAAGGACA TCCGTTATTAGCAGCAGGACCTGCAACATTAGGACATTTATCATTTTCACCTACA ACACCATCTCCATCAGCATCAGGACAACCTTT ATTTGCTTTTGTTCCTTTAGCATTAGGACACATATCATCTTTATCAGCA ACACCATCACCATCAGCATCAGGACAACCATT CATTGCAGCTAAACCTGGCGTGTTAGGACAAGCATCATCAGAATCTTTT ACACCATCACCATCAGCATCAGGACAACCATT GAATTCTTCTAAACCAGCAACTTCTGGACAAGCATCATTTTTATCATAC ACACCATCACCATCAGTATCAGTTCCACCAAA >NZ_CP019419|1|1|607863-608056|PILER-CR ACACCATCTCCATCAGCATCAGGACAACCTTT ATTTGCTTTTGTTCCTTTAGCATTAGGACACATATCATCTTTATCAGCAACA CCATCACCATCAGCATCAGGACAACCATTCAT TGCAGCTAAACCTGGCGTGTTAGGACAAGCATCATCAGAATCTTTTACA CCATCACCATCAGCATCAGGACAACCATT
>NZ_CP019419.1|WP_068362669.1|605679_607191_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-beta MSTTTGKVSQIIGPVIDVEFNTESNELPKIYDSLEIKKADGSILVLEVQQHIGEDTVRTISMDATDGLQRGAEVVATGSPIQMPIGNDIYGRLFNVTGDAIDGLGNLSKDGNNGLPIHRAAPKFEDLSVSTEVLFTGIKVIDLIEPYAKGGKIGLFGGAGVGKTVLIQELINNIAKGHGGLSVFAGVGERTREGNDLLREMLESGIIKYGDDFMHSMEEGGWDLSKVDKSGMKDSKATFVFGQMNEPPGARARVALSGLTIAEYFRDGAGEAQGKDVLFFVDNIFRFTQAGSEVSALLGRMPSAVGYQPTLATEMGAMQERITSTKKGSITSVQAVYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRKIAELGIYPAVDPLDSTSRILTADILGDEHYDCAQRVKEILQRYKELQDIIAILGMEELSEEDKLVVHRARRVQRFLSQPFHVAEQFTGIPGVLVDIKDTIKGFNMIMDGELDKYPEAAFNLRGSIQDAIDAGEKMLAEA >NZ_CP019419.1|WP_068362674.1|605306_605600_-|F0F1-ATP-synthase-subunit-epsilon MFLEIVTPEAILFSSEVDSLSVPGLNGEFQMLNNHAPIVSVLKEGTIYIHIHSQINLELDDLHGKLIPDEADDKILTLAINSGTLELNDNKAIILAD >NZ_CP019419.1|WP_068362679.1|604376_605006_-|hypothetical-protein MKSPIIKLCFLFVFTLLIVSCNAEKSNPDKEDLSCYSNNKRPSQAITYKEMASMFNEYDNGQKILLDKYITQKSKGKDTVATVSEFFSIDELKQYIAYIEKISREKDIKLTGVKIFTAAYPSDYKIEAYQNRVSFILMPTTNIGDDKNVAYEPLKSTKGKPVSMQSVLHKYAGESTKKVNRASILSFRFMQEDDDSSALNRGSIDPKTD >NZ_CP019419.1|WP_068362685.1|603034_603778_-|sensor-histidine-kinase MQEGNIVLIISSLIILFIVVALIILFTVFQKKKTFLLEKQEEDKKRFEREIAETQIEIREETLRNISWELHDNIGQLLTLAKIQLQNATEENIAEVTKTISQGLTEVRSLSKLINPEAIKNIELKEAIQLEINRFNRLNFIASTLEIKGNEKEIDKKSTIIIFRILQEFFSNTIKHSRASELKVTLDYLQSNLLITAKDNGVGFSSEGKKDGIGLINIKNRAHLIGAEAVFKSEKNKGTTLEINYKL >NZ_CP019419.1|WP_068362688.1|602393_603038_-|response-regulator-transcription-factor MTKYSVVVVDDHTLLSQAIQTMVNTFEKFEVLYTCKNGQELVEQFTSSSENIPDIVLMDINMPILNGIETTEWIHKNHSEVNVMALSVEDDDKTVLKMLKAGAIGYLLKDTEKAVLEKALIEIAENGFYHSKNVTNLLMKSISGNAEEEIVLKEKEVIFLKLACTELTYKEIADRMCLSPKTIDGYRNCLFIKLNVKNRVGLVMYAIKNKIYTP >NZ_CP019419.1|WP_068362689.1|601977_602373_-|30S-ribosome-binding-factor-RbfA MEETNRQRKIAGVLQKDLVDVLQKAAQDGMKGVIISVSKVHVTSDLGVAKVYLSIFPSEKRDEIVKGIQSNTFFIRHEMAKRTKNQLRRMPELLFFADDTLDYLEEIDKSLKGEDENPIKNPDVLPRRKKI >NZ_CP019419.1|WP_068362690.1|600759_601962_-|ABC-transporter-permease MNFSLYIAKRYLFTKTSNNAINIITIIASFGVIVGSLALFIILSGFSGLRTFSYSLLDASDPDIKISVVKGKSFFIDDAIQQVLDNNTAIKASSKIIEERVFLEYKDKNEIAYIKGVEENYAQITNIDSSLSVGNWLENEYLKTAVIGRTIAAKLSLGVRSFGEPLSIMIPKPGTGFINPTNAFYKTNVQIVGLYTGTEDFESKFVFVNLEEAKRLLRFKENQVTAIELKLTDNLLADEFAEELQQKLGDSFKVQTKEQLNEVFYKVINTENFVSYLIFTLIVIIALFNVIGAIIMMIIDKKQNLKTLFNLGTTIKEIKRIFVLQGFLLTITGMILGLLIGVIAVFIQLKFGLFMITENLAYPVEFRFSNLLIVIFTITTLGFIAAKIASSRISKEFVEK >NZ_CP019419.1|WP_068362692.1|599756_600758_+|tRNA-dihydrouridine-synthase-DusB MIKIDNIELPDFPLLLAPMEDVSDPPFRALCKENGADVVYTEFISSEGLIRDAAKSVIKLDIYEKERPVGIQIFGANLDSMLKTIEIVEKSNPDIIDINFGCPVKKVVSKGAGAGILKDIDLMVSLTEAMVKHTNLPITVKTRLGWDHDSIRIVEVAERLQDVGCKAISIHGRTRAQMYKGDADWKPIAQVKNNPRMHIPVFGNGDVTSPERAMEMRDKYGLDGCMIGRASIGYPWFFNEIKHFFKTGEYLPKPTIGERTEMARRHLQMAIDWKGERLGVVETRRHYTNYFKGIPHFKEYRTKMVTSDDPRDVFNAFNEVEEKFGNTIIPEIR >NZ_CP019419.1|WP_068362695.1|598509_599733_+|M28-family-peptidase MKNVVFFIFLSILVSCKPEINQQNRIKEDVTFLASDALEGRQTGTEGEKKAAEYISKRFSELGLQEKGTQKYLQPFTFKPKTNPHDEVKFNVNGDGTITGNNVIGFLDNKAENTVIIGAHYDHLGFGGEGSLYRDSIKAIHNGADDNASGIAVLLNLAAKLKAKNTNNNFLFMAFSGEEMGLLGSNYFVKNPTIDTKKVSYMINMDMVGRMKKDSSLAVYGTGTSPIFKQTLKSHNDNFKLIQQESGVGPSDHTSFYLTDIPVLHFFTGQHEDYHKPGDDSEKLNYEGMHLISDYIFNIISDLDDNGKLTFRKTKNESESTPRFKVGLGVIPDYLFDGKGMRIDGVSEDKPAQKAGLKKGDIVIKLGDSTVTNMMSYMRALSIFEKGSTTKVVVKRGDKEVEKIIQF >NZ_CP019419.1|WP_068362702.1|597371_598466_-|PD40-domain-containing-protein MRILSLLVLVSLLFSCKNDKKPNAEKSTKEVVKDSLIYPEETHFKSIRQVTFGGDNAEAYWSFDDKQLVFQSNYKNWNVGCDQMFLMNADENFKDKMPPMISTGKGRTTCAYFLPDNKHIIYASTHLVDDNCPEVPLRKNGKYIWPVYDSFDIFVADLEGNIVKQLTNEKGYDAEPTVSPKGDKIVFTSTRSGDLELYTMNIDGSDVKQITDELGYDGGAFFSPDGTKIIFRSSRPKTQEEIKAYKDLLAEGLVEPTEMELYICNADGSELRQLTDLGNANWSPFFHPSGKKILFSSNFEAEKGFPFNLYLIDIDGKNLERVTHGETFDAFPVFSNDGKKLAFSSNRNNGGGRDTNLFIAEWQD >NZ_CP019419.1|WP_068362667.1|608819_610013_-|glycine-C-acetyltransferase MYGKIKDTLSFELQNIKDEGLYKSERIITSSQDAVIKISTGEEVINFCANNYLGLSNHPEVIQAAKNTMDTHGFGMSSVRFICGTQDIHKQLEQKVADFYTTEDTILYAAAFDANGGVFEPLLTKEDAIISDSLNHASIIDGVRLCKAARYRYNNNDMNSLEEQLIEANKQNHRFKIIVTDGVFSMDGIVAKLDEICDLADKYDALVMVDECHATGFIGKTGRGTVELKNVMDRVDIVTGTLGKALGGAMGGYTTGKKEIIEILRQRSRPYLFSNSLAPAIVGASLKVFDLISNDTSLRDKLEWNTNYFRTEMEKVGFDLVGADSAIVPVMLYDAKLSQVMANKLLKEGIYVIGFFFPVVPKEKARIRVQLSAAHTVHHLNKAISAFTKVGKELKVI >NZ_CP019419.1|WP_068362665.1|610061_613187_-|UvrD-helicase-domain-containing-protein MQQTSTFQVYNASAGSGKTFTLVKEYLKVLLNSEDIFTFQKVLAITFTNKAAGEMKERVLSNLEDFSEGIENDLFKIIIDEVAVDKPTIQARSKKILDVILQNYSAFSITTIDSFTHKIIKSFAYDLGLSLNFEVEMDVVSLLNEAVDVLISKIGTDRKLTKLLIDYSLDKTDDDKSWDISRDLNEFSKVLLNEDDIKHFRGLADKKLEDFTDLKSKLFLHQKEVKAALSKVGQDCLALLDENDLTQKDFLRGTIPKFFADVSLKSVDFNFLSRAETIEKAIENHQYYAKSTSDVIASTIENIVPEIIGFYNQAKEIYSQFLMNKLALKNIIPLAVLNNINQELDSIKEESNIRLNAEFNQLISDNIKEQPAPFIYERIGQRFQHFFIDEMQDTSVLQWSNLIPLIDNALAQEKSNLLLVGDGKQAIYRWRGGKAEQFIELGSDAKNPFHINKEIKSLETNFRSYAEVINFNNSFFQFTSNFLHNESYKKIFVDGNKQLENAKKGGFVSLNFLEKEDHKDDEKIKYPKKVLEKINQLKESFSLDEICVLTRTKKDGIAVANYLSENGVDIVSSETLLLQNSIKVTFIVDVLKLLQNPNDEETRFEILCFLYQHLQIENPKHIFFKEFAKSENLELFEALKKYGISFEISTFNQLPFYEKIEEIIRGFNLVNTSDAYVQFFLDVVLEQQRKSIDVNSFLEFWELKKEKLSIVASESANAVQIMTIHKSKGLEFPIVIFPCDVDVYRQINPKVWLDELPDNYGEFKELLVDFNKSLAEVSEKGEQIYHHQRQELELDNFNLLYVALTRAVEQLHIITERKISAKGEVNTNFYSGVLINYLKEQNLWNDDDLEYSFGNDIRVSSIQKENSVSQIHEKFISTPWQEHNVVLLASSSKLWDTNQGEAIDFGNLFHEILSKIITKNDVEKVVNQYVQQGIIDDFESKSLKLKINEVVYHPEINKYFSEDVVTYNEREIVDVDNQIVIPDRLVFTNDLVSIIDYKTGNKSSEHKQQILKYEQVLKSMNFKVDKKLLIYINKEIDIVEV >NZ_CP019419.1|WP_068362663.1|613337_614174_-|ZIP-family-metal-transporter MNTFEQLVAFGKEHPIQAAFYASLFTWGLTALGAALVFFFKKLNRAVLDGMLGFTGGVMVAASFWSLLSPAIENSPGEGFVKVIPAAIGFALGALSLFGMDKILPHLHINFKENEAEGVKTELHRSTLLVLAITLHNIPEGLAVGVLFGAASTLVGVEQTEMIIAAISLAIGIGIQNFPEGFAVAMPLRRQGVSRFKSFWYGQLSAIVEPMAAVLGALAVSFFTPILPYALAFAAGAMIFVVVEEVIPETQRDKYTDIATLGFIGGFIVMMSLDVGLG >NZ_CP019419.1|WP_068362658.1|614170_614827_-|metal-dependent-transcriptional-regulator MFSQSEENYIKAIYHLETISNKGISTNAIAKKLETKASSVTDMIKKLSEKELVIYKKYQGVKLTSFGKKIAANIVRKHRLWEVFLVDKLNFSWDEVHEVAEQLEHIKSPKLINQLDALLGFPTHDPHGDPIPDKEGNLNVIDKILLSSLLKNDSGVCVGVDDSSSEFLQFLDKKGITLGKQITVLEKEGYDDSLSIKIENKKLTISNKIANNIYIKKL >NZ_CP019419.1|WP_068362651.1|614926_617161_+|TonB-dependent-receptor MKNLIIVLFLIVANNIISQTISGKITATNGDEIPFANIYLKKTKSGTSSNEKGFYELKNIEKGTYILIVSSIGYQSKSLKITIKNNENLVKNITLSDDNSLDEIVISGTLRPVSKTASPVPVEVYSEAFFKKNPTPSVFESLQNVNGVRPQLNCNVCNTGDIHINGLEGPYTFVLIDGMPIVSGLSTVYGLTGIPQALIERVEVVKGPASTLFGSEAVGGIINIITKKPSNSPKLTTDTFVSSWGEVNTDLGLRYQLSEKAQGLLGVNYFNFQNRIDNNDDNFTDLTLQNRISLFNKINIERKSNKVFTIASRYVYEDRWGGELDWEREFRGSDIKYGESIYTNRWELFGTYQLPTTKNINFQFSTNGHYQDSFYGTDAYDAEQFIAFGQLVYNKQIKETHDILLGLAYRYTSYDDNTFATFEDDGITNKPSIIHLPGIFLQDEISLSKRKKLLLGVRWDHNSLHGNIFSPRINYKWNSRNNSNIFRASIGNGFRVANVFTEDHAALTGAREVEFDGDLDPETSWNANLNFVKKINTENSFITLDASAFYTYFDNRILPDYETDVNKIIYANLDGYSVSKGVSLNADVLFTNGLSFNVGTTLMDVSVTENNIKTRQLLTESFSGVWSVSYRFNNDLKLDYTGNLYGPMRLPLLGPNDLRDEYSPWYSIQNIQLSKKFSNSFEVYGGVKNLLNFTPAANSISRAFDPFDKQVDPNDPDALTFDPSYVYASNQGIRAFVGLRYTIF >NZ_CP019419.1|WP_068362647.1|617170_617656_+|DUF255-domain-containing-protein MKINKVLTFILFFGCFAVNAQQTEIKLKEYSFSETERLQENNPRPLFIFIYTDWCKICEGMKKTTFKNNEVISLLNKHFYFIKLNGEEKKDITFLGKTFAYKPTGNKTGTHQLAKELSSIKGKISYPTTTILNSKFEIDIQVDSFINSKKMKKILESYLNH >NZ_CP019419.1|WP_139059125.1|617652_618249_-|hypothetical-protein MKLKILILLIFMLMIKSNIKAQDANNKWAIGVGAAGLLYSAKDGSAVGFRYSDQFPRFTLATYAFTNITLSAAISTSRNEGKQYTTFDGDIRYDFGTSENTLSIYALLGGSLVDTKDYLAPFINIGGGGTLWLTDRFGLNGQAMYKINYYGLQSQGSHIYVGGAIVYRFSFSGSGGGSSGRSRVRRDTGRKRIWEMDH >NZ_CP019419.1|WP_068362640.1|618374_621707_+|transcription-repair-coupling-factor MSKQNIVNQYQKSANVSQVITALQQDKNHFQITNLVGSSLSFVISETFKSADKPYLLIFNDKEEAAYYLNDLEQLLGDKNVLFYPGSYRRPYQIEETDNANVLLRSEVLNRINSRKKPAVIVTYPTALFEKVVTKTELDKNTLKVGISDNLSLDFVNEVLFEYKFKRVDFVTEPGDFSVRGGIIDVFSFSNDEPYRIEFFGDEIDSIRTFDVETQLSKEKLKKVSIMPNVENKALQEKRESFLKYISSKTVIFTKNVDLLSNKLDKFFTKAEDAFKELSKEINHSKPSELFCDGNFIKNQLQDFTLVNFGSSNSDEKSDVVFNTQPQPSFNKQFNLLIDNLEEYHKAGFTNYIFCANEQQAKRFHDIFDDAEQKVHYETVVFPLYQGFVDVDSRLVCYTDHQIFERYHKFRLKNGYAKKQAITLQELNKLEIGDYVTHMDHGIGKFGGLQKIDVQGNKQEAIKLIYGERDILYVSIHSLHKISKFNGKDGKAPKIYKLGSGAWKKIKQKTKARVKHIAFNLIQLYAKRKLQKGFAFGPDTHIQHELEGSFMYEDTPDQFTATQDVKNDMEKEQPMDRLVCGDVGFGKTEVAVRAAFKAVDNGKQVAILVPTTILAFQHYKTFSERLKDFPIKIDYLNRFRSAKQKTTAIDGVNNGEVDIIIGTHQLTNQRIKFKDLGLLIIDEEQKFGVAVKDKLKTLKENVDTLTLTATPIPRTLQFSLMAARDLSVIKTPPPNRHPIESNVIRFSEETIRDAISYEVSRGGQVFFIHNRIENIKEVAGLLQRLVPSAKIGIGHGQMEGKKLEELMLGFMAGDFDVLVSTTIIESGLDVPNANTIFINNANNFGLSDLHQMRGRVGRSNKKAFCYFITPPYHMMTDDARKRIEALVLFSDLGSGINIAMKDLEIRGAGDLLGGEQSGFINDIGFDTYQKILQEAIEELKENEFADLYPTDKLKPKEYVKEVQIDTDFEILFPDDYINSITERLALYNKLGTLKEEKELQVFESEITDRFGEIPTKVEDLLDSVRIKWLAKDLGLEKIILKQKRMIGYFVANQQSDFYQTEAFSRMLKYVQKNPKSCVMKEKQTKNGLRLMITFIKIDTVKTALTILQKI >NZ_CP019419.1|WP_068362638.1|621747_622605_+|DMT-family-transporter MQNTHAKNLSILLLGTLFVSTSGVLGRYIAMPAEAIILCRAFIASILMFVFCKYKKVDFKIKTTKDKISFLIGGFLMGAHWVTYFYALKLSNVALGMLSIYTFPVITAFLEPFFSKQKINVVHIFLAILVLIGVYILVPEFSLENNKLKGILFGILSAFFYALRNLMVKKEVTKYNGSMLMFYQMIVVTVLLLPTLFFSDFSNTVNQLPFLLLVALLTTAIGHTLMVNSLQHFSATTTSIISSVQPIFGIIMAYFFVKEIPSFNTFIGGGLILSTVIIESFRSRK >NZ_CP019419.1|WP_068362635.1|622881_625293_+|TonB-dependent-receptor MPFIRIYIFFFLSFTAFGQTGDFYGKIKFNNNEPAIGAFIMVKGANFYKEISSDIDGGFYLKKVPFGKYSFVIHSLNSVPKTINVTLNSKKKVLNITLDFKDNALDEVKITSKTEETKKETQGFAVNVIKTKEASLRNIQTNELLNTTVGVKIRQNGGLGSDVNYSLNGLSGNAVRIFIDGIPSSMYGSSFNLNSIPASMIKNIEVYKGVVPGHLADDALGGAINIILNNDAKTNLNASVSYGSFNTLQANVNGLYRFKESGFTIKSSIFHNYSDNNYKVSGRSIVTTGLGGVQTPITAKRFNDAYRSTGGMAQIGFTNVKWADQFLIGLTGSDDYKEVQHGAFMTITPYKGRFLESDALVANLIYQKKNFITKGLDVNINGLYGNRNRVVNDTVAAAYSWNGERAIDFRGDIFDYTWGSQQEGGPTLATIERKVASIRTGLSYAINNNHKVLVNHVYSGTDRTDSDVLVSLLENTFKGTRNLYKNIYSLTYELTAFEDKLKANIFGKHYQQETVSIDPEIITNSNGINEIVDDIISSNKKHNGYGFALSYELSPKTTLLASAEKAIRLPDETEVFGNDGDNVVANPTINPEQSNNYNLGFRFGNFNFNNHNFTISTNLFTRNIKDRIGLPIETSFNVDDELIVYVNQGSGTSKGFDAQLNYNYNNNFGLNFNISRFDLKIKNNGVEIDVPNTPFFTMNGSLRYSFKNLIQQNSRLNLFYSIYFTDEFSYLTPQGSNTVGNDFFEVPTQLSQDLGLSYAFPNKKLVASFDIKNIFDKPVYDNLSVQKPGRAFYLKLNYTINKF |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP019419_2 | 3950124-3950211 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019419_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP019419_2
>2.1|3950149|38|NZ_CP019419|CRISPRCasFinder TCTAATCAAGGCACTATAAAAGCTAGCGATTTAAAAAC |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019419_2
The CRISPR arrays of NZ_CP019419_2 >merge|NZ_CP019419|2|3950124-3950211|CRISPRCasFinder TTCTTTAGGTGGTTCTGGTAATATTTCTAATCAAGGCACTATAAAAGCTAGCGATTTAAAAACTTCTTTAGGTGGCTCTGGTAATATT >NZ_CP019419|2|2|3950124-3950211|CRISPRCasFinder TTCTTTAGGTGGTTCTGGTAATATT TCTAATCAAGGCACTATAAAAGCTAGCGATTTAAAAAC TTCTTTAGGTGGCTCTGGTAATATT
>NZ_CP019419.1|WP_068357521.1|3948662_3949751_+|hypothetical-protein MMKFIYKITFLFLLFPLITSANSVGKKQEKSKVITKEYKVNANAKVAIDNRYGNLDITTWDKKQVEIEVTITVKGDNLESLENKLASIDVEFETSSNFISAKTIFEKQQKSGWSFWKKNNNVSYKVNYKVKMPKTNTVDLDNDYGSIFLGDLSGKADINCDYGKIIVGELSASNNNINLDYCSSSTISYMKSGNVNVDYSKITIDEAEDLKVNEDYSTIKFGKVKDINFNADYGSVTIDEAVNVDGNSDYASMRIGTIYKNLTLETDYGSVSVKRLAKGFENVTIDGQYAGIKIGVDEGAIFDFVLDLQYAGFKYDDDQIEFFKKISKSTKKYYEGKFGKGNSSGRIKIRSQYGGVSIKENY >NZ_CP019419.1|WP_068357524.1|3948157_3948682_+|hypothetical-protein MEDKLHNFFTENDFDFQEPHSGHLERFERKLNTPKKINRTSWKWLSVAASVVLVLGFWLGSTHQKRMIDLADVSPKLEEVQDYFVTTINQELKTVEKNRSLETESIIEEALDQLEELEDNYRLFILELNSDVNKTTIINSMIRNYQQRLEILENVLQQIEQIKNPNLLNDEIYI >NZ_CP019419.1|WP_068357527.1|3947601_3948168_+|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MEANQPHITNLLERCKSSDKNAQLKIYNAYYKAMYNSAHRILKDNYEAEDIMQEAFLTAFTKLNSYKGEVAFGAWLKRIVINKSLTQLKKNNRYEEVKLEVVPNDEIEDEAINYTGLNPKLVLTTLQGLKDNYRVVLTLNLIEGFDYEEIAQILNYTNENVRTTVSRAKKKLKQVILAQNIQAQVYGR >NZ_CP019419.1|WP_068357529.1|3946375_3947503_+|hypothetical-protein MSFKKHLIFFLQLFCIAITSAQLKVGDSNISFDKTKFDSNWPQMERWSKAGVLNGIPSINNIELGIKVTAFTASGINDAIKKCPSGKYVFLPNGSYLIDESIQLKSNVFLIGESVDSVICNITMTDKIAFQFYNINNSGIYNLTIQGAWGNPKYNWNISSQLNDEMPNNTNISVKFSGTTKNCWLDNVNIYNSALHPLVVNGTHITIRSCKIIGVHKKAGGYQGYFHVGNSDNLIYDNYVTYLRHISCQNPKSKYNVFYKNKFDQEFSFHTNDGGNNLIEQNKITLPKDMPNKTPNYFALMGPWSVKHKISIKPNYIYKNTIVELNHKNATPWSNNSKIYYGPFEIKPKNPYLNFKAMDSIFIPTGGTLYPVILK >NZ_CP019419.1|WP_068357530.1|3945798_3946314_+|hypothetical-protein MKFKIPFDDKLFLEQTKLTIPFIYANQYKKIKELRLSVSILFGIGIIIQITGSDVSTLFFFLGILLFFVLYSKIENYKELKTNYIRSIKELLFYTPNTFGIFEFNEDRLLLSTDHLCSWYYWSDFSEFKIVKSSLLLFEKECSYNILVISKCELNTGEFERIINFVQKKIN >NZ_CP019419.1|WP_068357535.1|3943137_3945591_-|endopeptidase-La 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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
2303263 : 2316763
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019419|2303263:2316763|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019419|2303263:2316763|2306944_2307895_+|WP_068359431.1|DBSCAN-SWA MNKDSKIYIAGHRGMVGSAVWRVLEKKRYSNLIGRTSSELDLKNQQQVYDFLEKEQPDAIIDAAARVGGILANNDFPYQFLMENMQIQNSLIDGALKIGIEKFIFLGSSCIYPKLAPQPLKEEYLLTDSLEPTNEWYALAKITGVKLCQAIRKQYNKDYVSLMPTNLYGYFDNFDLKTSHVLPAMIRKFHEAKINGNAAVTLWGTGTPMREFLFVDDMAEAVVYALENQLPEYLYNVGAGKDIAIKELAATIQKVTGHQGDIIWDSEKPDGTPRKLMDVSKMTTIGWQYRTELDEGIVKTYNWFLKNIEAVKEVKM >NZ_CP019419|2303263:2316763|2307982_2309110_+|WP_068359558.1|DBSCAN-SWA MKVALITGITGQDGSYLAEFLLEKGYEVHGIKRRSSLFNTDRIDHLYQDPHDPNQRLKLHYGDLTDSMNLTRIIQECQPDEIYNLGAMSHVKVSFEMPEYVGNVDGLGTLRILEAVRILGLENKTRIYQASTSELFGGVPENKNERGFYDENSPLYPRSPYGVAKIYGFWITKNYREAYNMFACNGLLFNHESPRRGETFVTRKITRAVAKIALGLQEKVYLGNLEAKRDWGHAKDYVRMMWMILQAEKAEDWVIATGVTTIVRDFVKMAFSEVGIELEFKGVGVDEKAYVTACHHKDFQVAIGKEVLSIDPTYFRPTEVDLLLGDPTKAKEKLGWVPEYDLAGLVKDMMDGDVALMKKDVDLLKAGHEILKQVE >NZ_CP019419|2303263:2316763|2303263_2304541_+|WP_068359423.1|DBSCAN-SWA 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13 | Synechococcus_phage(40.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DBSCAN-SWA_2 |
2621355 : 2630777
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP019419|2621355:2630777|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP019419|2621355:2630777|2622278_2623694_+|WP_068364951.1|DBSCAN-SWA MKYTEAISSEIFSVISKASKELNVDSYVIGGFVRDFFLKRGTAKDIDVVAVGSGIDLALQVSKLLPNKPKVQVFKTYGTAMLRFKEVEIEFVGARKESYTEDSRNPEVTAGTLKDDQNRRDFTINALALSLNDNNFGELLDPFNGILDLENKIIRTPLDPDITYSDDPLRMMRAIRFATQLNFEIESESLEAIGKNSQRLKIITRERIVDELNRILSSPKPSIGFLLLEKTKLLPQILPEIVALKGVEEVEGQMHKDNFYHTFEVVDNIAEHTEDVWLRWSALLHDIGKAPTKRFSKKVGWTFHSHEFVGSKMVYKIFKRLKMPLNNKMKFVQKMVLLSSRPIVLASDVNDSAVRRLVFDAGDDINSLMTLCEADITTKNPRKFKRYHKNFELVRTKIKEVEERDRVRNFQPPVTGEEIMEAFNLKPCREIGQIKEAIKEAILDGKIPNEHKASYDFMIEKGKSLGLTTFQ >NZ_CP019419|2621355:2630777|2628081_2629038_-|WP_068364938.1|DBSCAN-SWA MEISVVIPLLNEEESLQELHDWIAKVMQSNRYLYEIIFIDDGSTDTSWSVIEQLSEKFKEVKGIRFQKNYGKSQALDAGFELAKGKVVITMDADLQDNPEEIPELYNLIIEENFDLISGWKKKRYDNVITKNIPSKLFNAAARKTSGLKLNDFNCGLKAYKNEVIKTVKVSGEMHRYIPVLAKNEGFNKIGEKVVQHQARKYGETKFGIDRFINGFLDLITISFLSKFGKRPMHFFGLWGTLMFIFGTTSAFYIGAYKLYKVFNGIKTILVTDNPWFYIALTSMIIGTLLFLAGFIGELIIKTKTDEKHYTIKEKLNF >NZ_CP019419|2621355:2630777|2623700_2624468_+|WP_068364949.1|DBSCAN-SWA MKLLSELRTVVLELRLLFFKSEQELVIVTGSDSSHFKSLYQLLVSLNRYEKNTKVLIYDLGITAQESEILKNDFSNFELRKFDYSKYPSYFNIKINAGEYAWKPVIINDVLNEFKTSVCWLDGGNKVTKPLTLLRKVIEFYGFYSPFSKGKISDWTHPKSLEYLDVLNNKNLLKQKNLNGACVSVDYNNIKARQVIKNWSDSAKTKDCIAPQGSNRQNHRQDQAILSVLIYKHMFDIGKKMTYRKFGFKTHQDID >NZ_CP019419|2621355:2630777|2629973_2630777_+|WP_068364931.1|DBSCAN-SWA MSKVVLVTGASSGIGKSIATFLKEKGYTVYGTSRNPKNLENFSFQLITLDVLKVETINKAVDLIIEKEGKLDVLVNNAGMGITGPVEDTPTDEMRAVFNTNLFGAIDVMKAVLPQMRKQKSGTIINVTSIAGYMGLPFRAVYSASKGALELVTEATSMEVKNFGIKVVNVAPGDFATNIAAGRYHTPVFENSAYKENYQASLDLMDAHVDHGMDPIEMAKKVYEIINYKNPKIHYKVGDFMQKFSIVLKRILPDKMYQKLLMNHYKL >NZ_CP019419|2621355:2630777|2626311_2628027_-|WP_068364942.1|DBSCAN-SWA MNEILDKAKQWLTPIFDVETQTEIQELIANNPDDLADRFYKDMAFGTGGMRGLMGAGTNRINKYTLGRATQGLSNYLIENVEKEQLSVVIAYDCRHNSKKFAKVVADVLSANNIKVFLFEDLRPTPELSFAVRHLGCDAGIVLTASHNPPEYNGYKVYWADGGQIVPPNDGGIINEVNSLDFSEIKFDANEDLIEVIGKDVDDVFIKASVKNGSLSENIKRDDLKIVFTSLHGTSIMSVPDALAGAGYNDIHIVEEQRKPDGDFPTVKSPNPEEPEALKMATDLADKIGADIVIGTDPDCDRLGVAVRDLEGNMKLMNGNQTMVVMTDFLLRKWKEEGKLNGKQFVGSTIVSTELVNDVAAKKGVETKVGLTGFKWIAKMVKDFPELDFIGGGEESFGYMVGGFVRDKDAVTATLLACEVAAYAKQNGSSFYEELLNIYVENKYYKEHLISIVKKGMDGAAEIQQILSDMRNNPLTEIDGEKIESLSDYDASTKKNLITGEVTAIDLPKSNVLIYQTASGTRIAARPSGTEPKIKFYFSVNSELDATENADQVEAELDAKIQRIIKEMKLN >NZ_CP019419|2621355:2630777|2624482_2626312_-|WP_068364946.1|DBSCAN-SWA MSHFKDILKYEREYRKFTLLNILFNIFYAIFNVLSVLAFIPVLNILFGVDKAVYKKPNYEGLSNLGSYLEGNFNYFISNKIAQEGEVNVLLFICLLSLSLFFFKNLFRYLASYVITFLRTGIVKDLRDNLYRKIVELPISYFTEKRKGDIIARMTSDVQEVENSILTSIETLVREPLTVIISIGIMLFISLKLTLFVFILLPVSGFIISSISKKLKSQSVKAQKETGTFLSFIEETLTGLRVIKGFNSEKIIERKFNNSTSTFRKLMTSVFHRQTLASPMSEFLGSATIITILWYGGTDVLEKTSPLEAGKFMGYIVLFYTVLNPIKLITTTFYKIKKGEASAERIMQVLNTENSIKDKPNALVKQNFESKIEFKNISFKYKKDYVLKDFSLTIKKGETVALVGQSGSGKSTLANLITRFYDVNKGDVLVDGISIKDVTKKSLRNLMGIVTQESILFNDSIENNIKLGTENATESEINEAAEIANAMEFIKDLPEKFKTNIGDSGNSLSGGQKQRLSIARAVLKNPPIMILDEATSALDTESEQLVQVALEKMMQNRTSLVIAHRLSTIQKADTIVVMKKGKIVEQGKHDDLLTKKGEYYKLVSMQSLS >NZ_CP019419|2621355:2630777|2629114_2629636_-|WP_068364935.1|DBSCAN-SWA MENQVNSKSIILNNGLYLGVLGAIVGLCLWASGQYFELQWVGNLAGFLATVFFIIIGIKKFKSENGGFMTWGQGLKIGMGIVMVSAVITVIYTLLLTNVIDPNLQAEGMAIQEQAWIDQGLSSDQIDSAKEMTEKFQSPFIISGIIFVFAAFVGFVISAITAAIMKKSEEQDY >NZ_CP019419|2621355:2630777|2621355_2622159_-|WP_068364954.1|DBSCAN-SWA MIIVRIVGGLGNQMFQYAYAKSLQQKGFDVKIDISKFKTYKLHGGYQLDKYNIDLKVAGIIPTFLSLVKIKKNVKEKSLLFNNDLINLKGNEFVKGYFQTEKYFKETREILLEQFQKSGKNADSTEVFSKQIKDTTPNCSLHVRRGDYVSNSKNHTIHGVCDLAYYKRAVEFILSKEKQTTFFIFSDDISWTKENLKIENAIYVDHKCTPHEDIYLMSLCDNNITANSSFSWWGAWLNKNPKKIVISPKQWYVSKETNIICDDWIKL |
8 | Bodo_saltans_virus(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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