Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019565 | Staphylococcus aureus strain SR434 plasmid pSR02, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP019564 | Staphylococcus aureus strain SR434 plasmid pSR01, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP019567 | Staphylococcus aureus strain SR434 plasmid pSR04, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP019563 | Staphylococcus aureus strain SR434 chromosome, complete genome | 9 crisprs | csa3,cas3,DinG,DEDDh,WYL | 7 | 3 | 13 | 0 |
NZ_CP019566 | Staphylococcus aureus strain SR434 plasmid pSR03, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP019563_1 | 923262-923346 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019563_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP019563_1
>1.1|923291|27|NZ_CP019563|CRISPRCasFinder GCCCCGCCAACTTGCACATTTTTGTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019563_1
The CRISPR arrays of NZ_CP019563_1 >merge|NZ_CP019563|1|923262-923346|CRISPRCasFinder GCTGACTTTTCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTTTTGTATGCTGACTTTTCGCCAGCTTCTGTGTTGGG >NZ_CP019563|1|1|923262-923346|CRISPRCasFinder GCTGACTTTTCGCCAGCTTCTATGTTGGG GCCCCGCCAACTTGCACATTTTTGTAT GCTGACTTTTCGCCAGCTTCTGTGTTGGG
>NZ_CP019563.1|WP_001032816.1|922888_923074_+|hypothetical-protein MNKHINKKASKLLEDYKKVQQRKSEETDKGCLKSVIMLIVLFFLIIFGIVACSTNVNFFFQ >NZ_CP019563.1|WP_000231631.1|922033_922267_+|hypothetical-protein MVFNDWEINVVYSGEHEVVANEKSLFVIDEFYDVAIAIYYLDGKLKVAHVNYGSDFTIDVANKVFELNIQNPNVDEH >NZ_CP019563.1|WP_000857488.1|920597_921557_+|alpha-hemolysin MKTRIVSSVTTTLLLGSILMNPVANAADSDINIKTGTTDIGSNTTVKTGDLVTYDKENGMHKKVFYSFIDDKNHNKKLLVIRTKGTIAGQYRVYSEEGANKSGLAWPSAFKVQLQLPDNEVAQISDYYPRNSIDTKEYMSTLTYGFNGNVTGDDTGKIGGLIGANVSIGHTLKYVQPDFKTILESPTDKKVGWKVIFNNMVNQNWGPYDRDSWNPVYGNQLFMKTRNGSMKAAENFLDPNKASSLLSSGFSPDFATVITMDRKASKQQTNIDVIYERVRDDYQLHWTSTNWKGTNTKDKWTDRSSERYKIDWEKEEMTN >NZ_CP019563.1|WP_000765708.1|919778_919925_-|hypothetical-protein MKLFYIVFLIIIWLNIFLGNEIIHTLTVLITTLYIVNSRKGIKNDRVE >NZ_CP019563.1|WP_001802045.1|919597_919822_-|hypothetical-protein MLIQERGLKMTELNNIINSLQSLFESESGYKISKNSGVPYQTVQDLRNGKTKLEDARFRTIIKLYSYYVSLKEH >NZ_CP019563.1|WP_000041896.1|918379_919096_+|superantigen-like-protein-SSL12 MSKNITKNIILTTTLLLLGTVLPQNQKPVFSFYSEAKAYSIGQDETNINELIKYYTQPHFSFSNKWLYQYDNGNIYVELKRYSWSAHISLWGAESWGNINQLKDRYVDVFGLKDKDTDQLWWSYRETFTGGVTPAAKPSDKTYNLFVQYKDKLQTIIGAHKIYQGNKPVLTLKEIDFRAREALIKNKILYNENRNKGKLKITGGGNNYTIDLSKRLHSDLANVYVKNPNKITVDVLFD >NZ_CP019563.1|WP_001063559.1|917546_918272_+|superantigen-like-protein-SSL13 MNNNITKKIILSTTLLLLGTASTQFPNTPINSSSEAKAYYINQNETNVNELTKYYSQKYLTFSNSTLWQKDNGTIHATLLQFSWYSHIQVYGPESWGNINQLRNKSVDIFGIKDQETIDSFALSQETFTGGVTPAATSNDKHYKLNVTYKDKAETFTGGFPVYEGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKSKKLYNNSYNKGQIKITGADNNYTIDLSKRLPSTDANRYVKKPQNAKIEVILEKSN >NZ_CP019563.1|WP_000739541.1|916726_917452_+|superantigen-like-protein-SSL14 MKKNIMNKLVLSTALLLLGTTSTQLPKTPISFSSEAKAYNISENETNINELIKYYTQPHLSLSNKWLWQKPNGSIHATLQTWVWYSHIQVFGSESWGNINQLRNKYVDIFGTKDEDTVEGYWTYDETFTGGVTPAATSSDKPYRLFLKYSDKQQTIIGGHEFYKGNKPVLTLKELDFRIRQTLIKNKKLYNGEFNKGQIKITADGNNYTIDLSKKLKLTDTNRYVKNPKNAQIEVILEKSN >NZ_CP019563.1|WP_000793615.1|915287_916289_-|ornithine-carbamoyltransferase MKNLRNRSFLTLLDFSRQEVEFLLTLSEDLKRAKYIGTEKPMLKNKNIALLFEKDSTRTRCAFEVAAHDQGANVTYLGPTGSQMGKKETTKDTARVLGGMYDGIEYRGFSQRTVETLAEYSGVPVWNGLTDEDHPTQVLADFLTAKEVLKKDYADINFTYVGDGRNNVANALMQGAAIMGMNFHLVCPKELNPTDELLNRCKNIVAENGGNILITDNIDQGVKGSDVIYTDVWVSMGEPDEVWKERLELLKPYQVNKEMMDKTGNPNVIFEHCLPSFHNADTKIGQQIFEKYGIREMEVTDEVFESKASVVFQEAENRMHTIKAVMVATLGEF >NZ_CP019563.1|WP_001074342.1|914332_915265_-|carbamate-kinase MAKIVVALGGNALGKSPQEQLELVKNTAKSLVGLITKGHEIVISHGNGPQVGSINLGLNYAAEHNQGPAFPFAECGAMSQAYIGYQLQESLQNELHSIGMDKQVVTLVTQVEVDENDPAFNNPSKPIGLFYNKEEAEQIQKEKGFIFVEDAGRGYRRVVPSPQPISIIELESIKTLIKNDTLVIAAGGGGIPVIREQHDGFKGIDAVIDKDKTSALLGANIQCDQLIILTAIDYVYINFNTENQQPLKTTNVDELKRYIDENQFAKGSMLPKIEAAISFIENNPKGSVLITSLNELDAALEGKVGTVIKK >NZ_CP019563.1|WP_000669532.1|923839_924190_-|complement-inhibitor-SCIN-B MKFKKYILTGTLALLLSSTAIATIEGNKADASSLDKYLTESQFHDKRIAEELRTLLNKSNVYALAAGSLNPYYKRTIMMNEYRAKAALKKNDFVSMADAKVALEKIYKEIDEIINR >NZ_CP019563.1|WP_000791581.1|924340_924838_-|complement-convertase-inhibitor-Efb MKNKLIAKSLLTIAAIGITTTTIASTADASEGYGPREKKPVSINHNIVEYNDGTFKYQSRPKFNSTPKYIKFKHDYNILEFNDGTFEYGARPQFNKPAAKTDATIKKEQKLIQAQNLVREFEKTHTVSAHRKAQKAVNLVSFEYKVKKMVLQERIDNVLKQGLVR >NZ_CP019563.1|WP_000584398.1|925096_925603_-|hypothetical-protein MIIKILTILLLLCILSYLVTNRKKPFLFLKTLFMGVVFIFIGYISLAISAVIIYGIIQFITIDFGSFFLMGIILILISSIFQLFIVRLLFRKKNVDLTEVVVLEHLIQWFLVYFAIYQAVNEKMDINDINIDNFQSVFFDVSNLNLVILPTLIISWVTIFNYRMRSYK >NZ_CP019563.1|WP_000739559.1|926272_926668_+|formyl-peptide-receptor-like-1-inhibitory-protein MKKNITKTIIASTVIAAGLLTQTNDAKAFFSYEWKGLEIAKKLADDEKKDEERADRLIKDAEKERTYTGKTVEDLYVIAKKLGKGNTIAVVRIIDGGKNGYYTFDITRPLEEHRKNIKVVAKGEIDSITWY >NZ_CP019563.1|WP_031775077.1|926648_926720_+|hypothetical-protein MRLLGIKKHTELNSCTPNVRKQC >NZ_CP019563.1|WP_000739208.1|927037_927367_-|complement-convertase-inhibitor-Ecb MKKNFIGKSILSIAAISLTVSTFAGESHAQTKNAETVKKYNEYQTNFKKQVNKKVVDAQKAVNLFKRTRTVATHRKAQRAVNLIHFQHSYEKKKLQRQIDLVLKYNTLK >NZ_CP019563.1|WP_001788629.1|927560_927728_-|hypothetical-protein MKRIVILENVIVDDPIWLNHVDYLVKSVLLKSIKLRFQEVRKFEILVKIMNRIHI >NZ_CP019563.1|WP_000049484.1|927855_928359_-|metallophosphoesterase MSKWIIVSDNHTESGVLYQIYEMHPDADVYLHLGDSEFAYDDTELSLFNRVKGNCDFYPEFENEAVAKYNDVKAFYTHGHLYQVNRTRDLLAEKGLELGCLFAFYGHTHVAKYEYINGVHVINPGSISQSRSSMEETYAEVIIDDQTLHGTINFKNRHHETISHTTF >NZ_CP019563.1|WP_000659319.1|928351_928939_-|XTP/dITP-diphosphatase MKEIVIASNNQGKINDFKVIFPDYHVIGISELIPDFDVEETGSTFEENAILKSEAAAKALNKTVIADDSGLEVFALNGEPGIYSARYAGENKSDEANIEKLLNKLGNTTDRRAQFVCVISMSGPDMETKVFKGTVSGEIADGKYGENGFGYDPIFYVPKLDKTMAQLSKEQKGQISHRRNAINLLQAFLEGEKNV >NZ_CP019563.1|WP_001039659.1|928950_929751_-|glutamate-racemase MNKPIGVIDSGVGGLTVAKEIMRQLPNETIYYLGDIGRCPYGPRPGEQVKQYTVEIARKLMEFDIKMLVIACNTATAVALEYLQKTLSIPVIGVIEPGARTAIMTTRNQNVLVLGTEGTIKSEAYRTHIKRINPHVEVHGVACPGFVPLVEQMRYSDPTITSIVIHQTLKRWRNSESDTVILGCTHYPLLYKPIYDYFGGKKTVISSGLETAREVSALLTFSNEHASYTEHPDHRFFATGDPTHITNIIKEWLNLSVNVERISVND |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP019563_2 | 1133398-1133476 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019563_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP019563_2
>2.1|1133421|33|NZ_CP019563|CRISPRCasFinder CCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTCCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019563_2
The CRISPR arrays of NZ_CP019563_2 >merge|NZ_CP019563|2|1133398-1133476|CRISPRCasFinder CCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTCCACCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG >NZ_CP019563|2|2|1133398-1133476|CRISPRCasFinder CCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG CCAACTTGCACACTATTGTAAGCTGACTTTCCA CCAGCCTCTGTGTTGGGGCCCCG
>NZ_CP019563.1|WP_000185316.1|1132135_1133065_+|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MTNSSKSFTKFMAASAVFTMGFLSVPTAGAEQTNQIANKPQAIQWHTNLTNERFTTIAHRGASGYAPEHTFQAYDKSHNELKASYIEIDLQRTKDGHLVAMHDETVNRTTNGHGKVEDYTLDELKQLDAGSWFNKKYPKYARASYKNAKVPTLDEILERYGPNANYYIETKSPDVYPGMEEQLLASLKKHHLLNNNKFKNGHVMIQSFSDESLKKIHRQNKNVPLVKLVDKGELQQFNDQRLKEIRSYAIGLGPDYTDLTEQNTHHLKDLGFIVHPYTVNEQADMLRLNKYGVDGVFTNFADKYKEVIK >NZ_CP019563.1|WP_000066059.1|1130514_1131894_+|argininosuccinate-lyase MSNKAWGGRFEVQPEEWVDDFNASITFDQTLIDQDIEGSIAHATMLANQGIISQQDSEQIIQGLKSIQHDYHQDQIQFSASLEDIHLNIEHELIKRIGDAGGKLHTGRSRNDQVATDMHLYTKKQVQDIIALIKSLQSVIVDIASNNVDTIMPGYTHLQRAQPISFAHHIMTYFWMLQRDQQRFEDSLKRIDINPLGAAALSGTTYPIDRHETTALLNFGSLYENSLDAVSDRDYIIETLHNISLTMVHLSRFAEEIIFWSTDEAKFITLSDAFSTGSSIMPQKKNPDMAELIRGKVGRTTGHLMSMLMTLKGLPLAYNKDMQEDKEGLFDAVHTIKGSLRIFEGMIQTMTVNKERLNQTVKEDFSNATELADYLVTKNIPFRTAHEIVGKIVLECIQQGHYLLDVPLATYQQHHSSIDADIYDYLQPENCLKRRQSYGSTGQSSVKQQLDVAKQLLSQ >NZ_CP019563.1|WP_000660042.1|1129319_1130525_+|argininosuccinate-synthase MKEKIVLAYSGGLDTSVAVQWLIDKGYDVVACCLDVGEGKDLDIVYKKALDMGAVECHIIDATKEFSDEYVSYAIKGNLMYENAYPLVSALSRPLIAKKLVEIAEKTNSVGIAHGCTGKGNDQVRFEVAIKALNPSLKAFAPVREWAWSREEEIDYAIKHNIPVSINHDSPYSIDQNLWGRANECGILEDPYAAPPEDAFDLTNALEETPDDADEIILTFDKGIPVQIDGKTYELDDLILTLNALAGKHGIGRIDHVENRLVGIKSREIYEAPAAEVILKAHKALETITLTKDVAHFKPIIEKQFAEQLYNGLWFSPLTDSLKLFIDSTQQYVSGDVRIKLFKGNAIVNGRKSPYTLYDEKLATYTKEDAFNQDAAVGFIDIYGLPTQVNAMLHGGYSNEQ >NZ_CP019563.1|WP_000148855.1|1127637_1128969_-|glucose-6-phosphate-isomerase MTHIQLDFSKTLEFFGEHELKQQQEIVKSIHKTIHEGTGAGSDFLGWVDLPVDYDKEEFSRIVEASKRIKENSDVLVVIGIGGSYLGARAAIEMLTSSFRNSNEYPEIVFVGNHLSSTYTKELVDYLADKDFSVNVISKSGTTTEPAVAFRLFKQLVEERYGKEEAQKRIFATTDKEKGALKQLATNEGYETFIVPDDVGGRYSVLTAVGLLPIATAGINIEAMMIGAAKAREELSSDKLEENIAYQYATIRNILYAKGYTTEMLINYEPSMQYFNEWWKQLFGESEGKDFKGIYPSSANYTTDLHSLGQYVQEGRRFLFETVVKVNHPKYDITIEKDSDDLDGLNYLAGKTIDEVNTKAFEGTLLAHTDGGVPNMVVNIPQLDEETFGYVVYFFELACAMSGYQLGVNPFNQPGVEAYKQNMFALLGKPGFEDLKKELEERL >NZ_CP019563.1|WP_000007967.1|1126737_1127313_-|TVP38/TMEM64-family-protein MSFHQVEEWFEIFRQFGYLPGFILLYIRAIIPVFPLALYILINIQAYGPILGILISWLGLISGTFTVYLICKRLVNTERMQRIKQRTAVQRLISFIDRQGLIPLFILLCFPFTPNTLINFVASLSHIRPKYYFIVLASSKLVSTIILGYLGKEITTILTHPLRGILMLVVLVVFWIVGKKLEQHFMGSKKE >NZ_CP019563.1|WP_000758209.1|1126208_1126733_-|signal-peptidase-I MKKVVKYLISLILAIIIVLFVQTFVIVGHVIPNNDMSPTLNKGDRVIVNKIKVTFNQLNNGDIITYRRGNEIYTSRIIAKPGQSMAFRQGQLYRDDRPVDASYAKNRKIKDFSLRNFKELDGDIIPPNNFVVLNDHDNNQHDSRQFGLIDKKDIIGNISLRYYPFSKWTIQFKS >NZ_CP019563.1|WP_000711896.1|1125617_1126193_-|signal-peptidase-I MKKELLEWIISIAVAFVILFIVGKFIVTPYTIKGESMDPTLKDGERVAVNIIGYKTGGLEKGNVVVFHANKNDDYVKRVIGVPGDKVEYKNDTLYVNGKKQDEPYLNYNLKHKQGDYITGTFQVKDLPNANPKSNVIPKGKYLVLGDNREVSKDSRAFGLIDEDQIVGKVSFRFWPFSEFKHNFNPENTKN >NZ_CP019563.1|WP_000172377.1|1121981_1125458_-|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddB MTLHAYLGRAGTGKSTKMLTEIKQKMKQDPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDSELNGSLRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFSEKLTEQIQDFKKYAVTPEHLEHFIADKNMQTRTKNKLEDIALIYREFEQRIQNEFITGEDSLQYFIDCMPKSEWLKRADIYIDGFHNFSTIEYLIIKGLIKYAKSVTIILTTDGNHDQFSLFRKPSEVLRHIEEIANELNISIERQYFKHLYRFNNQDLKHLEQEFDALQINRVACQGHINILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYQDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNIDTKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTASYLKSAYLVDLLENFVLERGIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILHFEKQMSQAETVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGNHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVFGDETMSMERFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMPQPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRAKGDVTFSYSLMGSSGDDKEISPFLNQIQSLFNQLEITNIPQYHEVNPLSLMQHAKQTKITLFEALRAWLYDEIVADSWLDAYQVIRDSDHLNQGLDYLMSALTFDNETVKLGETLSKDLYGKEINASVSRFEGYQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLTNEALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRRKPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSATLDLTKVYYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWSDIDEDKLEQDLIKKFKLSGLVNADQTVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFIQHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETINPIEAIQNININDEFGGEQ >NZ_CP019563.1|WP_000154930.1|1118327_1121981_-|helicase-exonuclease-AddAB-subunit-AddA MTIPEKPQGVIWTDAQWQSIYATGQDVLVAAAAGSGKTAVLVERIIQKILRDGIDVDRLLVVTFTNLSAREMKHRVDQRIQEASIADPANAHLKNQRIKIHQAQISTLHSFCLKLIQQHYDVLNIDPNFRTSSEAENILLLEQTIDEVIEQHYDILDPAFIELTEQLSSDRSDDQFRMIIKQLYFFSVANPNPTNWLDQLVTPYEEEAQQAQLIQLLTDLSKVFITAAYDALNKAYDLFSMMDSVDKHLAVIEDERRLMGRVLEGGFIDIPYLTGHEFGARLPNVTAKIKEANEMMVDALEDAKLQYKKYKSLIDKVKSDYFSREADDLKADMQQLAPRVKYLARIVKDVMSEFNRKKRSKNILDFSDYEHFALQILTNEDGSPSEIAESYRQHFQEILVDEYQDTNRVQEKILSCIKTGDEHNGNLFMVGDVKQSIYKFRQADPSLFIEKYQRFTIDGDGTGRRIDLSQNFRSRKEVLSTTNYIFKHMMDEQVGEVKYDEAAQLYYGAPYDESDHPVNLKVLVEADQEHSDLTGSEQEAHFIVEQVKDILEHQKVYDMKTGSYRSATYKDIVILERSFGQARNLQQAFKNEDIPFHVNSREGYFEQTEVRLVLSFLRAIDNPLQDIYLVGLMRSVIYQFKEDELAQIRILSPNDDYFYQSIVNYINDEAADAILVDKLKMFLSDIQSYQQYSKDHPVYQLIDKFYNDHYVIQYFSGLIGGRGRRANLYGLFNKAIEFENSSFRGLYQFIRFIDELIERGKDFGEENVVGPNDNVVRMMTIHSSKGLEFPFVIYSGLSKDFNKRDLKQPVILNQQFGLGMDYFDVDKEMAFPSLASVAYRAVAEKELVSEEMRLVYVALTRAKEQLYLIGRVKNDKSLLELEQLSISGEHIAVNERLTSPNPFHLIYSILSKHQSASIPDDLKFEKDIAQIEDSSRPNVNISIVYFEDVSTETILDNDEYRSVNQLETMQNGNEDVKAQIKHQLDYRYPYVNDTKKPSKQSVSELKRQYETEESGTSYERVRQYRIGFSTYERPKFLSEQGKRKANEIGTLMHTVMQHLPFKKERISEVELHQYIDGLIDKHIIEADAKKDIRMDEIMTFINSELYSIIAEAEQVYRELPFVVNQALVDQLPQGDEDVSIIQGMIDLIFVKDGVHYFVDYKTDAFNRRRGMTDEEIGTQLKNKYKIQMKYYQNTLQTILNKEVKGYLYFFKFGTLQL >NZ_CP019563.1|WP_000670752.1|1117259_1118162_-|fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein MKFLSFKYNDKTSYGVKVKREDAVWDLTQVFADFAEGDFHPKTLLAGLQQNHTLDFQEQVRKAVVAAEDSGKAEDYKISFNDIEFLPPVTPPNNVIAFGRNYKDHANELNHEVEKLYVFTKAASSLTGDNATIPNHKDITDQLDYEGELGIVIGKSGEKIPKALALDYVYGYTIINDITDRKAQSEQDQAFLSKSLTGGCPMGPYIVTKDELPLPENVNIVTKVNNEIRQDGNTGEMILKIDELIEEISKYVALHPGDIIATGTPAGVGAGMQPPKFLQPGDEVKVTIDNIGTLTTYIAK >NZ_CP019563.1|WP_000138487.1|1133600_1134845_-|Glu/Leu/Phe/Val-dehydrogenase MTENNNLVTSTQGIIKEALHKLGFDEGMYDLIKEPLRMLQVRIPVRMDDGTVKTFTGYRAQHNDAVGPTKGGVRFHPDVDEEEVKALSMWMTLKCGIVNLPYGGGKGGIVCDPRQMSIHEVERLSRGYVRAISQFVGPNKDIPAPDVFTNSQIMAWMMDEYSALDKFNSPGFITGKPIVLGGSHGRDRSTALGVVIAIEQAAKRRNMQIEGAKVVIQGFGNAGSFLAKFLYDLGAKIVGISDAYGALHDPNGLDIDYLLDRRDSFGTVTNLFEETISNKELFELDCDILVPAAISNQITEDNAHDIKASIVVEAANGPTTPEATRILTERGILLVPDVLASAGGVTVSYFEWVQNNQGYYWSEEEVNEKLREKLEAAFDTIYELSQNRKIDMRLAAYIIGIKRTAEAARYRGWA >NZ_CP019563.1|WP_000167314.1|1134953_1136144_-|ornithine--oxo-acid-transaminase MTKSEKIIELTNHYGAHNYLPLPIVISEAEGVWVKDPEGNKYMDMLSAYSAVNQGHRHPKIIQALKDQADKVTLVSRAFHSDNLGEWYEKICKLAGKDKALPMNTGAEAVETALKAARRWAYDVKGIEPNKAEIIAFNGNFHGRTMAPVSLSSEAEYQRGYGPLLDGFRKVDFGDVDALKAAINENTAAVLVEPIQGEAGINIPPEGYLKAIRELCDEHNVLFIADEIQAGLGRSGKLFATDWDNVKPDVYILGKALGGGVFPISVVLADKEVLDVFTPGSHGSTFGGNPLACAASIAALDVIVDEDLPGRSLELGDYFKEQLKQIDHPSIKEVRGRGLFIGVELNESARPYCEALKEEGLLCKETHDTVIRFAPPLIITKEELDLALEKIRHVFQ >NZ_CP019563.1|WP_000838029.1|1136451_1137579_-|NADH-dependent-flavin-oxidoreductase MKSKYEPLFDKVELPNGVELRNRFVLAPLTHISSNDDGTISDVELPYIEKRSQDVGITINAASNVSDVGKAFPGQPSIAHDSDIEGLKRLATAMKKNGAKALVQIHHGGAQALPELIPDGDVVAPSPISLKSFGQKQEHSAREMTNEEIEQAIKDFGEATRRAIEAGFDGVEIHGANHYLIHQFVSPYYNRRNDVWANQYKFPVAVIEEVLKAKEAYGNKDFIVGYRLSPEEAESPGITMEITEELVNKISHMPIDYIHVSMMDTHATTREGKYAGQERLPLIHKWINGRMPLIGIGSIFTADEALDAVENVGVDLVAIGRELLLDYQFVEKIKDGREDEIINYFDPEREDNHHLTPNLWHQFNEGFYPLPRKDK >NZ_CP019563.1|WP_001067294.1|1137940_1138318_-|S1-RNA-binding-domain-containing-protein MNNYKIGQHIKVRVTGIQPYGAFVETPNHTEGLIHISEIMDDYVHNLKKFLSEGQIVKAKILSIDDEGKLNLSLKDNDYFKNYERKKEKQSVLDEIRETEKYGFQTLKERLPIWIKQSKRAIRND >NZ_CP019563.1|WP_000035058.1|1138732_1139326_-|peptidylprolyl-isomerase MANYPQLNKEVQQGEIKVVMHTNKGDMTFKLFPNIAPKTVENFVTHAKNGYYDGITFHRVINDFMIQGGDPTATGMGGESIYGGAFEDEFSLNAFNLYGALSMANSGPNTNGSQFFIVQMKEVPQNMLSQLADGGWPQPIVDAYGEKGGTPWLDQKHTVFGQIIDGETTLEDIANTKVGPQDKPLHDVVIESIDVEE >NZ_CP019563.1|WP_000781162.1|1139389_1139773_+|kinase-associated-lipoprotein-B MKLYRFSHKTGSYGVTIVEENGDDVLVKVEQVIKHPKQGDLHNPTETEGVFFHERKALSHFEKRYTKRSQLRDFNVDVLRYEDSLQQAITDLETKLKAQQTKHAEMSLASLARLKEDYSLQYKENFK >NZ_CP019563.1|WP_000054611.1|1139903_1142309_+|Na+/H+-antiporter-subunit-A MSLLHIAVILPLIFALIIPILYRFFKRIHLGWFVLPVPIVIFIYMLTLIKTTMSGNTVMKTLNWMPHFGMNFDLYLDGLGLLFSLLISGIGSLVVLYSIGYLSKSEQLGNFYCYLLLFMGAMLGVVLSDNVIILYLFWELTSFSSFLLISFWRERQASIYGAQKSLIITVFGGLSLLGGIILLAIPTQSFSIQYMIQHASEIQNSPFFIFAMILIMIGAFTKSAQFPFYIWLPDAMEAPTPVSAYLHSATMVKAGLYLIARMTPIFAASQGWVWTVTLVGLITLFWASLNATKQQDLKGILAFSTVSQLGMIMAMLGIGAISYHYQGDDSKIYAAAFTAAIFHLINHATFKGALFMITGAVDHSTGTRDVKKLGGLLTIMPISFTITVITALSMAGVPPFNGFLSKESFLETTFTASQANLFSVDTLGYLFPIIGIVGSVFTFVYSIKFIMHIFFGQYKPEQLPKKAHEVSILMLLSPAILATLVIVFGLFPGILTNSIIEPATSSINHTVIDDVEFHMFHGLTPAFLSTLVIYILGILLIVTFSYWVKLLQRQPGKLTFNYWYNRSANVIPNYSEKMTNSYVTDYSRNNLVIIFGALILLTFVTVFSVPFNINFKDVSPIRIFEVCIVILLLSAAFLILFAKSRLFSIIMLSAVGYAVSVLFIFFKAPDLALTQFVVESISTALFLLCFYHLPNLNRYNEKRSFQLTNALIAGGVGLSVIIIGLIAYGNRHFESISKFYQEHVYDLAHGKNMVNVILVDFRGMDTLFESSVLGIAGLAVYTMIKLRKKRQTQGNEVKNHE >NZ_CP019563.1|WP_001081626.1|1142301_1142730_+|Na(+)/H(+)-antiporter-subunit-B MNRQQNDLILQFAAVIIFFMVMVFGFSLFLAGHYTPGGGFVGGLLFASSLVIITIAFDIETMRKIFPLDFKILIGIGLVFCIATPIASWFLGKNFFTHVTFDIPLFILEPVHMTTAVFFDFGVLCAVVGTVMTIIISIGENE >NZ_CP019563.1|WP_000402803.1|1142729_1143071_+|Na(+)/H(+)-antiporter-subunit-C MEIIMIFVSGILTAISVYLVLSKSLIRIVMGTTLLTHAANLFLITMGGLKHGTVPIYEANVKSYVDPIPQALILTAIVIAFATTAFFLVLAFRTYKELGTDNVESMKGVPEDD >NZ_CP019563.1|WP_000573077.1|1143063_1144560_+|Na+/H+-antiporter-subunit-D MIESNMLVLTLVIPVITAILLVFIGKRPIIKRYVALGGTLLTLVAAIINLANVVKHGPIRVELGSWKAPYSIVFVLDIFSALLIITSIIITAIVILYSYQTIGIERERYYYYFSVLFMLIGIIGAFTTGDIFNLFVFFEVFLMSSYFLLVIGSTKIQLQETIKYVLVNVVSSSFFVMGVAILYSVVGTLNLADISNKLANLSAHDSGLVNIVFILFIFVFATKAGVFPMFVWLPSAYYAPPIPIIAFFGALLTKVGVYAIARTLSLFFSDNVSFSHYVILFLALLTIIFGCVGAVAYANIKKIILYNVMIAVGVILVGVAMMTESGMIGAIYYTLHDMLVKLALFLLIGIMIKITGTADLRQFGGLIKRYPVLGWSFFIAALSLAGIPPLSGFYGKFFIVQSTFERGFYLSGVIVLLSSLVVLYSVIRIFLQGFFGQPKGYDLNNKVDVKYLTTIAIVAVVITVLYGLSADYLYPMVKAGAETFYNPSTYVKAVLGGK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP019563_3 | 1805870-1806060 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019563_3
|
3 spacers
spacers of NZ_CP019563_3
>3.1|1805895|30|NZ_CP019563|CRT ACCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTG >3.2|1805950|31|NZ_CP019563|CRT TTATTGTATGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTA >3.3|1806006|30|NZ_CP019563|CRT GCCTGTAGAATTTCTTTTCGAATTTCTCTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019563_3
The CRISPR arrays of NZ_CP019563_3 >merge|NZ_CP019563|3|1805870-1806060|CRT TTTCTGTCCTTCCCCAACTTGCATTACCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTATGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATT >NZ_CP019563|3|1|1805870-1806060|CRT TTTCTGTCCTTCCCCAACTTGCATT ACCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTG TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACA TTATTGTATGCTGACTTTCCGCCAGCTTCTA TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATT GCCTGTAGAATTTCTTTTCGAATTTCTCTG TGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATT
>NZ_CP019563.1|WP_000031268.1|1804872_1805634_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MSKEAGHTFLAKLGKTRLRPGGKEATDWLIQQGAFSQDKQVLEVACNMCTTSIYLAHTYGCHIQGVDINKKALEKAQENISAAGLESYIQVQQANAVKLPFDDNQFDIVLNEAMLTMLPIAIKEKALREYYRVLKPGGILLTHDIVIVNESHATHVVKSLSAAINVNVSPQTKLGWLDLYNQAGFNHVHYHTGPMSLMTPKGLIYDEGIVGTIKIINNALKKENRPMFCKMFKTMTKLRKDMNYITFVAKKEH >NZ_CP019563.1|WP_001789470.1|1804719_1804854_-|hypothetical-protein MIIIIINIAYLYAIIWKLKRLQKIVTSFITKHESSSIGLVENYF >NZ_CP019563.1|WP_000182746.1|1803707_1804622_+|ribokinase MTNKVVILGSTNVDQFLTVERYAQPGETLHVEEAQKAFGGGKGANQAIATARMQADTTFITKIGTDGVADFILEDFKAAHIDTSYIIKTTEAKTGQAFITVNAEGQNTIYVYGGANMTMTPEDVINAKDAIINADFVVAQLEVPIPAIISAFEIAKAHGVTTVLNPAPAKALPNELLSLIDIIVPNETEAELLSGIKVTNEQSMKDNANYFLSLGIKTVLITLGKQGTYFATKNQSQHIEAYKVNAIDTTAAGDTFIGAFVSRLNKSQDNLADAIDFGNKASSLTVQKHGAQASIPLLEEVNQV >NZ_CP019563.1|WP_000747873.1|1803275_1803680_+|D-ribose-pyranase MKKSAVLNEHISKAIATIGHFDLLTINDAGMPIPNDHRRIDLAVTKNLPRFIDVLATVLEEMEIQKIYLAEEIKEHNPTQLQQIKQLISSEIEIIFIPHEEMKSNLAHPLNKGNIRTGETTPYSNIALESNVTF >NZ_CP019563.1|WP_000029201.1|1802379_1803261_+|ribose-transporter-RbsU MSIVALLIGLGPLIGWGFFPTVASKFGGKPVHQIIGATVGTLIFAIILAVVTSSGFPTGTNLLFALLSGAGWGFGQIITFKAFELVGSSRAMPVTTAFQLLGASLWGVFALGNWPGIGHKIIGFTALVVILIGARMTVWSERKEASNAKNLRRAVVLLLIGEFGYWLYSAAPQATSIDGLTAFLPQAMGMVIVAVIYGFMNMEAENPFRNKITWLQIISGFFFAFGALTYLISAQPNMNGLATGFILSQTSVVLATLTGIYFLKQHKTSKEMVITIIGLVLILVAASVTVFIK >NZ_CP019563.1|WP_000757871.1|1801149_1802148_+|LacI-family-DNA-binding-transcriptional-regulator MKKVSIKDVAREAGVSVTTVSHILNHHDSRFSATTIKNVHAVSERLGYAPNKHAKQLRGSKIQTIGVILPSLTNPFFSALMQSIHDHKPSDVDLCFLTSTATDLYDNIKHLIDRGIDGLIIAQYISSPDALNNYLKKHHVPYVVLDQNDHQGYTDFVRTNEYQGGQLAAQHLIELGHNNMMIVAPYDMMANMSTRVAGFVDTLRANQLPEPQIVHTELSKRGGLTIVDDIMVQSATAIFAINDELAIGILRGLIEHGISIPKDISLIGYDDIDYAAYVSPPLTTVAQPITDIGKTSLTLLLQRLQHLDKSIDMIELPTTLKIRATTGYHLSN >NZ_CP019563.1|WP_001066561.1|1798873_1800250_+|MFS-transporter MNNTQSSPRSNIIIAIMLSALTYWLFAQSFINIGPLVGQTYQTSPAVLNLSISLTSFATGIFMVAAGDIADKIGQLRMTYMGLIISMVASLLLIISDITALLIIGRILQGLSAAILLPSTVGVLNNQFKGEHLRRAISYLMISTVGGIGLAGVIGGLIATNFGWQTNFIISIVIAFIAILLLKGTPEKVSQHSHRHPFDYKGMSIFAVMIGSFTLLLTQGFEQGWFSTFSFICLSIFIITTLIFIIIERRHEVPFIDFSVLRNRPFIGAFLNNFVLNSGLGVTVVFFIFAQTHLGLSAAQSGLVTLPYAIVAVAMIRLGEKATLRFGGKLMLIIGPLFPVIGITIISMTSLQPSQYIIAVVIGFVICAIGNGLVATPGLTIAIFSMPNEKVGLATGLYKMSGTLGGAFGIALSTTVFSMLQLNYAPSVAATVTFIVSIVLMILGSLSAYMIIPKTVKS >NZ_CP019563.1|WP_031865152.1|1797647_1798640_-|linear-amide-C-N-hydrolase MCTGFTIQTLNNQVLLGRTMDYDYPLDGSPAVTPRNYRWTSRTGTTGRTQYGFIGTGTDMEGFIYGDGVNEHGVAISTQYFRGYSSYGSTHKADAMNITQNEIVTWILGYTTSIEDMKQQASQIHVVAVYLNDIGEVPPLHYHVSDATGHSVEVSFKEGEVVIKDNPIGVLTNHPDLDWHYSNLRQYINISPYPATAKLLEGVTIEPLGNEAGTFGLPGGFTSTERFVRMAFMKANIAQNNDKEMDLMNTFYLLDAVNIPIGIVRPHDADNHYTMYQTVINLTTRTLYIKYYGSNELVALKLTDDLINRKDMTIFKPEKHITIRKLNDNQ >NZ_CP019563.1|WP_077156098.1|1796371_1797322_-|glycine-glycine-endopeptidase-LytM MKKLTAAAIATMGFATFTMAHQADAAETTNTQQAHTQMSTQSQDVSYGTYYTIDSNGDYHHTPDGNWNQAMFDNKEYSYTFVDAQGHTHYFYNCYPKNANANGSGQTYVNPATAGDNNDYTASQSQQHINQYGYQSNVGPDASYYSHSNNNQAYNSHDGNGKVNSPNGTSNQNGGSASKATASGHAKDASWLTSRKQLQPYGQYHGGGAHYGVDYAMPENSPVYSLTDGTVVQAGWSNYGGGNQVTIKEANSNNYQWYMHNNRLTVSAGDKVKAGDQIAYLGSTGNSTAPHVHFQRMSGGIGNQYAVDPTSYLQSR >NZ_CP019563.1|WP_000570075.1|1795660_1796320_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MIEINNLSKRYRNKQIFNHLTMSFDSNRLTVLLGDNGAGKSTLLRMIAGIEKANDGTINYFGEKWNQRQIQNHIGYVPQDIALFEHMTVAENINFFKSLCKNPINDTTINEYLQQLNFDDTSAKVSTLSGGNKRKINILVGLLGQPRILILDEPTVGIDLKSRHDIHQLLNIMKSKCLIILTTHHLDEVEALADDIKLIGQDPFYQHVLEDKQWAYTYY >NZ_CP019563.1|WP_000163990.1|1806178_1807615_-|6-phospho-beta-glucosidase MTKLPQNFMWGGALAANQFEGGYDKGGKGLSVIDVMTSGAHGKARQITESIDPNHYYPNHEGIDFYHRYKEDIALFKEMGLKCLRTSIAWTRIFPNGDEDVPNEEGLAFYDRIFDELIAQGIEPVVTLSHFEMPLHLAKHYGGFRNREVVDYFVHFARVVFERYKDKVTYWMTFNEINNQMDTSNPIFLWTNSGVALTENDNPEEVLYQVAHHELLASALAVRLGKEINPKFKIGTMISHVPIYPYSCHPKDMMEAQIANRLRFFFPDVQVRGYYPSYAKKMLARKGYDVGWQEGDDSILQQGTVDYIGFSYYMSTAVKHDVDTTVKNNIVNGGLNHSVENPHIATSDWGWAIDPDGLRYTLNVLYDRYQLPLFIVENGFGAVDEVVDGHIHDDYRIEYLKAHITAAIEAVDQDGVDLIGYTPWGIIDIVSFTTGEMKKRYGLIYVDRDNDGHGTMERLKKDSFYWYQQVIASNGDKL >NZ_CP019563.1|WP_000066935.1|1807630_1808422_-|PTS-glucose-transporter-subunit-IIA MSNKYKEQAQDILTAVGGVENIVDATYDTKCITIHMQHTIPSTANEVKQIVDVTSVAENDAQLVIKLNGNVDEVYQQLQRLIKNANVEESENTDNINSQDTSYTPQVKVTTPILVKAPIAGRRILLKEVRDSIFREKMVGEGLAIKAHEESKVIAPVNGLISMIVPTKHAVGIQSEDGVDIVIHIGVNTVDLEGKGFKCFVKQNDRVEAGQTLLQFDQQYIQQQGYNADVIVVISNSADLGKVELTMNEIITTEDVIFKIFKN >NZ_CP019563.1|WP_000922332.1|1808570_1809275_+|GntR-family-transcriptional-regulator MLKYEHIAKQLNAFIHQSNFKPGDKLPSVTQLKERYQVSKSTIIKALGLLEQDGLIYQAQGSGIYVRNIADANRINVFKTNGFSKSLGEHRMTSKVLVFKEMATPPKSVQDELQLNADDTVYYLERLRFVDDDVLCIEYSYYHKEIVKYLNDDIAKGSIFDYLESNMKLRIGFSDIFFNVDKLTSSEASLLQLSTGEPCLRYHQTFYTMTGKPFDSSDIVFHYRHAQFYIPSKK >NZ_CP019563.1|WP_000607067.1|1809382_1810084_-|antiholin-like-protein-LrgB MINHLALNTPYFGILLSVIPFFLATILFEKTNRFFLFAPLFVSMVFGVAFLYLTGIPYKTYKIGGDIIYFFLEPATICFAIPLYKKREVLVKHWHRIIGGIGIGTVVALLIILTFAKLAQFANDVILSMLPQAATTAIALPVSAGIGGIKELTSLAVILNGVIIYALGNKFLKLFRITNPIARGLALGTSGHTLGVAPAKELGPVEESMASIALVLVGVVVVAVVPVFVAIFF >NZ_CP019563.1|WP_001792906.1|1810076_1810520_-|antiholin-like-murein-hydrolase-modulator-LrgA MVVKQQKDASKPAHFFHQVIVIALVLFVSKIIESFMPIPMPASVIGLVLLFVLLCTGAVKLGEVEKVGTTLTNNIGLLFVPAGISVVNSLGVISQAPFLIIGLIIVSTILLLICTGYVTQIIMKVTSRSKGDKVTKKIKIEEAQAHD >NZ_CP019563.1|WP_000645452.1|1810632_1811373_-|DNA-binding-response-regulator MKALIIDDEPLARNELTYLLNEIGGFEEINEAENVKETLEALLINQYDIIFLDVNLMDENGIELGAKIQKMKEPPAIIFATAHDQYAVQAFELNATDYILKPFGQKRIEQAVNKVRATKAKDDNNASAIANDMSANFDQSLPVEIDDKIHMLKQQNIIGIGTHNGITTIHTTNHKYETTEPLNRYEKRLNPTYFIRIHRSYIINTKHIKEVQQWFNYTYMVILTNGVKMQVGRSFMKDFKASIGLL >NZ_CP019563.1|WP_000950281.1|1811375_1813130_-|sensor-histidine-kinase MLSLTMLLLERVGLIIILAYVLMNIPYFKNLMNRRRTWKARWQLCIIFSLFALMSNLTGIVIDHQHSLSGSVYFRLDDDVSLANTRVLTIGVAGLVGGPFVGLFVGVISGIFRVYMGGADAQVYLISSIFIGIIAGYFGLQAQRRKRYPSIAKSAMIGIVMEMIQMLSILTFSHDKAYAVDLISLIALPMIIVNSVGTAIFMSIIISTLKQEEQMKAVQTHDVLQLMNQTLPYFKEGLNRESAQQIAMIIKNLMKVSAVAITSKNEILSHVGAGSDHHIPTNEILTSLSKDVLKSGKLKEVHTKEEIGCSHPNCPLRAAIVIPLEMHGSIVGTLKMYFTNPNDLTFVERQLAEGLANIFSSQIELGEAETQSKLLKDAEIKSLQAQVSPHFFFNSINTISALVRINSEKARELLLELSYFFRANLQGSKQHTITLDKELSQVRAYLSLEQARYPGRFNININVEDKYRDVLVPPFLIQILVENAIKHAFTNRKQGNDIDVSVIKETATHVRIIVQDNGQGISKDKMHLLGETSVESESGTGSALENLNLRLKGLFGKSAALQFESTSSGTTFWCVLPYERQEEE >NZ_CP019563.1|WP_000608822.1|1813374_1814049_-|iron-sulfur-cluster-repair-di-iron-protein-ScdA MINKNDIVADIVTDYPKAADIFRSVGIDFCCGGQVSIEAASLEKKNVDLNELLQRLNDVEQTNTPGSLNPKFLNVSSLIQYIQAAYHEPLREEFKNLTPYVTKLSKVHGPNHPYLVELKETYDTFKSGMLEHMQKEDDVDFPKLIKYEQGEVVNDINTVIDDLVSDHIATGQLLVKMSDLTSSYEPPIEACGTWRLVYQRLKALEVLTHEHVHLENHVLFKKVS >NZ_CP019563.1|WP_000975363.1|1814192_1815914_-|poly(ribitol-phosphate)-beta-N-acetylglucosaminyltransferase MMKFSVIVPTYNSEKYITELLNSLAKQDFPKTEFEVVVVDDCSTDQTLQIVEKYRNKLNLKVSQLETNSGGPGKPRNVALKQAEGEFVLFVDSDDYINKETLKDAAAFIDEHHSDVLLIKMKGVNGRGVPQSMFKETAPEVTLLNSRIIYTLSPTKIYRTTLLKDNDIYFPEELKSAEDQLFTIKAYLNANRISVLSDKAYYYATKREGEHMSSAYVSPEDFYEVMRLIAVEILNADLEEAHKDQILAEFLNRHFSFSRTNGFSLKVKLEDQPQWINALGDFIQAVPERVDALVMSKLRPLLHYARAKDIDNYRTVEESYRQGQYYRFDIVDGKLNIQFNEGEPYFEGIDIAKPKVKMTAFKFDNHKIVTELTLNEFMIGEGHYDVRLKLHSRNKKHTMYVPLSVNANKQYRFNIMLEDIKAYLPKEKIWDVFLEVQIGTEVFEVRVGNQRNKYAYTAETSALIHLNNDFYRLTPYFTKDFNNISLYFTAITLTDSISMKLKGKNKIILTGLDRGYVFEEGMASVVLKDDMIVGMLSQTSENEVEILLSKDIKKRDFKNIVKLNTAHMTYSLK >NZ_CP019563.1|WP_000240920.1|1815946_1817635_-|CDP-glycerol-glycerophosphotransferase-family-protein MVKSKIYIDKIYWERVQLFVEGHSENLDLEDSNFVLRNLTETRTMKANDVKIDGNQFVCRFNVAILDNGYYLPEDKYLLVNEQELDYIAQLNPDVINDAYQNLKPEQEEEYNELETQNGKINFLLQTYLKEFRKGGISKKTVYTVTPEISSDVNEFVLDVVVTTPEVKSIYIVRKYKELRKYFRKQSFNTRQFIFKAIFNTTKFFHLKKGNTVLFTSDSRPTMSGNFEYIYNEMLRQNLDKKYDIHTVFKANITDRRGIIDKFRLPYLLGKADYIFVDDFHPLIYTVRFRRSQEVIQVWHAVGAFKTVGFSRTGKKGGPFIDSLNHRSYTKAYVSSETDIPFYAEAFGIKEKNVVPTGVPRTDVLFDEAYATQIKQEMEDELPIIKGKKVILFAPTFRGSGHGTAHYPFFKIDFERLARYCEKNNAVVLFKMHPFVKNRLNIADKHKQYFVDVSDFREVNDILFITDLLISDYSSLIYEYAVFKKPMIFYAFDLEDYITTRDFYEPYESFVPGKIVQSFDALMDALDNEDYEGEKVIPFLDKHFKYQDGRSSERLVRNLFGS |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP019563_4 | 2123579-2123752 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019563_4
|
2 spacers
spacers of NZ_CP019563_4
>4.1|2123632|17|NZ_CP019563|PILER-CR AAGAATTTCGAAAAGAA >4.2|2123702|16|NZ_CP019563|PILER-CR TCAGCTTACAATAATG >4.3|2123697|32|NZ_CP019563|CRISPRCasFinder GGCCCCAACATAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019563_4
The CRISPR arrays of NZ_CP019563_4 >merge|NZ_CP019563|4|2123579-2123752|PILER-CR,CRISPRCasFinder TTGGCGAGGCCCCAACATAAAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACAAAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGGTTACAATAATGTGCAAGTTGGGGT >NZ_CP019563|4|1|2123579-2123723|PILER-CR TTGGCGAGGCCCCAACATAAAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCA AGTTGGCGGGGCCCCAA CAAAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCC CAACATAGAAGCTGGC GGAAAG >NZ_CP019563|4|3|2123673-2123752|CRISPRCasFinder TTACAATAATGTGCAAGTTGGCGG GGCCCCAACATAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGG TTACAATAATGTGCAAGTTGGGGT
>NZ_CP019563.1|WP_072398224.1|2121438_2123481_+|YSIRK-domain-containing-triacylglycerol-lipase-Lip1 MKSQNKYSIRKFSVGASSILIATLLFLSGGQAQAAEKQVNMGNSQEDTVTAQSIGDQQTRENANYQRENGVDEQQHTENLTKNLHNDKTISEENHRKTDDLNKDQLKDDKKSSLNNKNIQRDTTKNNNANPSDVNQGLEQAINDGKQSKVASQQQSKEADNSQDSNANNNLPSQSLTKEAPSLNKSDQTSQREIVNETEIEKVQPQQNNQANDKITNHNFNNEQEVKPQKDEKTLSVSDLKNNQKSPVEPTKDNDKKNGLNLLKSSAVATLPNKGTKELTAKAKDDQTNKVAKQGQYKNQDPIVLVHGFNGFTDDINPSVLAHYWGGNKMNIRQDLEENGYKAYEASISAFGSNYDRAVELYYYIKGGRVDYGAAHAAKYGHERYGKTYEGIYKDWKPGQKVHLVGHSMGGQTIRQLEELLRNGNREEIEYQKKHGGEISPLFKGNHDNMISSITTLGTPHNGTHASDLAGNEALVRQIVFDIGKMFGNKNSRVDFGLAQWGLKQKPNESYIDYVKRVKQSNLWKSKDNGFYDLTREGATDLNRKTSLNPNIVYKTYTGEATHKALNSDRQKADLNMFFPFVITGNLIGKATEKEWRENDGLVSVISSQHPFNQAYTKATDKIQKGIWQVTPTKHDWDHVDFVGQDSSDTVRTREELQDFWHHLADDLVKTEKLTDTKQA >NZ_CP019563.1|WP_000834346.1|2120538_2120718_+|hypothetical-protein MKSELSNSGIDVTVKDVEKYMNRYNEVMKGKNGEKAKELCLSLLPINIIVVFTFFVFIL >NZ_CP019563.1|WP_000170492.1|2119713_2120346_+|bifunctional-phosphoribosyl-AMP-cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP-diphosphatase-HisIE MTKYKIDFSKGLVPAILQDNQTKQVLMLGYMNQEAFDKTIEDGVVCFYSRSKQRLWTKGETSGHTQRVKDIHVDCDNDTILIDVIPNGPTCHTGSQSCFNTEVPFSVQTLAQTVQDSAQSNNEKSYTKYLLTEGIEKITKKYGEEAFEVVIEAIKGDKKAFVSEVADELYHLFVLMHALGVDFSEIEAELARRHHKRNNFKGERQNIEQW >NZ_CP019563.1|WP_000592608.1|2118958_2119717_+|imidazole-glycerol-phosphate-synthase-subunit-HisF MIKKRIIPCLDVKDGRVVKGIQFKGLRDIGNPVDLAMYYNEAGADELVFLDISKTEEGHSLMLEVIEQTASRLFIPLTVGGGIQSLDDITQLLNHGADKVSLNSSALKNPQLIKQASDKFGRQCICIAIDSYYDPERKAHYCCTHGGKKMTNIKVYDWVQQVEQLGAGELLVTSMGHDGMKQGFDIEHLVNIKSLVNIPIIASGGGGNAQHFVELFDQTDVSAGLAASILHDRETTVQSIKEVIRQGGIAVR >NZ_CP019563.1|WP_000571735.1|2118257_2118962_+|1-(5-phosphoribosyl)-5-((5--phosphoribosylamino)methylideneamino)imidazole-4--carboxamide-isomerase MIELWPAIDLIGSTSVRLTEGKYDSEEKMSRSAEESIAYYSQFECVNRIHIVDLIGAKAQHAREFDYIKSLRRLTTKDIEVGGGIRTKSQIMDYFAAGINYCIVGTKGIQDTDWLKEMAHTFPGRIYLSVDAYGEDIKVNGWEEDTELNLFSFVRQLSDIPLGGIIYTDIAKDGKMSGPNFELTGQLVKATTIPVIASGGIRHQQDIQRLASLNVHAAIIGKAAHQASFWEGLK >NZ_CP019563.1|WP_000635623.1|2117686_2118265_+|imidazole-glycerol-phosphate-synthase-subunit-HisH MIVIVDYGLGNISNVKRAIEHLGYEVVVSNTSKIIDQAETIILPGVGHFKDAMSEIKRLNLNAILAKNTDKKMIGICLGMQLMYEHSDEGDASGLGFIPGNISRIQTEYPVPHLGWNNLVSKHPMLNQDVYFVHSYQAPMSENVIAYAQYGADIPAIVQFNNYIGIQFHPEKSGTYGLQILRQAIQGGFIND >NZ_CP019563.1|WP_000640266.1|2117111_2117690_+|imidazoleglycerol-phosphate-dehydratase-HisB MIYQKQRNTAETQLNISISDDQSPSHINTGVGFLNHMLTLFTFHSGLSLNIEAQGDIDVDDHHVTEDIGIVIGQLLLEMIKDKKHFVRYGTMYIPMDETLARVVVDISGRPYLSFNASLSKEKVGTFDTELVEEFFRAVVINARLTTHIDLIRGGNTHHEIEAIFKAFSRALGIALTATDDQRVPSSKGVIE >NZ_CP019563.1|WP_000639190.1|2116129_2117143_+|histidinol-phosphate-aminotransferase-family-protein MIYIDKNESPVTPLDEKTMTSIISATPYNLYPDAAYEQFKEAYAKFYGLSPEQIIAGNGSDELIQKLMLIMPKGPALTLNPDFFMYQAYAAQVNREIAFVDAGSDLTFDLETILTKIDEVQPSFFIMSNPHNPSGKQFDTAFLTAIADKMKALNGYFVIDEAYLDYGTAYDVELAPHILRMRTLSKAFGIAGLRLGVLISTAGTIKHIQKIEHPYPLNVFTLNIATYIFRHREETRQFLTMQRQLAEQLKQIFDTHVADKMSVFPSNANFVLTKGSAAQQLGQYVYEQGFKPRFYDEPVMKGYVRYSIATASQLKQLEEIVKEWSAKYDLSKTTKHS >NZ_CP019563.1|WP_000930650.1|2114863_2116114_+|histidinol-dehydrogenase MLNAQQFLNQFSLEAPLDESLYPIIRDICQEVKVHGDKALKMYNLTFDHTKTDHLEISHEQIKAAFDTLDEKTKQALQQSYERIKAYQESIKQTNQQLEESVECYEIYHPLESVGIYVPGGKASYPSTVLMTATLAQVAGVENIVVVTPPQPNGVSQEVLAACYITQVNQVFQVGGAQSIAALTYGTETIPKVDKIVGPGNQFVAYAKKYLFGQVGIDQIAGPTEIALIIDDTADLDAIVYDVFAQAEHDELARTYVISEDAQVLKDLESRIAKALPNVDRYDIVSKSIANQHYLIHASNFDEACHVMNTIAPEHASIQTVNPQPYIEKVKYVGALFIGHYSPEVIGDYVAGPSHVLPTNRTARFTNGLSVNDFLTRNTVIHLSKDTFEQIADSAQHIAHVEALYNHQQSILIRQS >NZ_CP019563.1|WP_000944149.1|2114256_2114871_+|ATP-phosphoribosyltransferase MLRIAIAKGRLMDSLINYLDVIEYTTLSETLKNRERQLLLSVDNIECILVKGSDVPIYVEQGMADIGIVGSDILDERQYNVNNLLNMPFGACHFAVAAKPETTNYRKIATSYVHTAETYFKSKGIDVELIKLNGSVELACVVDMVDGIVDIVQTGTTLKANGLVEKQHISDINARLITNKAAYFKKSQLIEQFIRSLEVSIANA >NZ_CP019563.1|WP_000723836.1|2123927_2124980_-|polysaccharide-intercellular-adhesin-biosynthesis/export-protein-IcaC MKKIRLELVYLRAIICAIIIITHLLTQITLKHENMEGGSLVLQFYIRNIVIFGTPCFIILSQLLTTLNYQKVTYRYLTTRVKYILIPYILMGLFYSYSESLLTDSSFNKQFIENVLLGQWYGYFIVVIMQFFILSYIIFKINYNLFNSKILLLLSFILQQSFLYYFTNNTAFHDTVLHYYPLSENTIIFGWIFYFFLGAYMGYNYERVLNFLERYLVIMIVLAVATYFVFIALANGDYWNVTSFSYSLTPYNSIMFIVILGICTHFKTMLFNTIQMISAFSFFIYLLHPIILDSLFAYTNIFEDNTMVFLAISLLFILGLCIGVGMILREFYIFRFIIGKQPYKLNINAY >NZ_CP019563.1|WP_000877317.1|2124966_2125839_-|intercellular-adhesin-biosynthesis-polysaccharide-N-deacetylase MKYRKFIILVLSILIILPVSTLDGHHIANADDDSPKKLKYKENSALALNYHRVRKANFLNNFIYFFSSSKEIKNYSVSQSQFESQIKWLKSHDAKFLTLKEFLYYKKKGKFPKRSVWINFDDMDETIYENAYPILKKYKIPATGFIITGHVGEENFHNLDMISKKELKEMYKTGLWEFETHTHDLHNLSKNNKSKLMKASEATIIKDLNKSEKYLTKNFKKSQKTIAYPYGLMNDDKLPVIKKAGLKYGFSLEEKAVTPNSNDYYIPRILISDDAFEHLIKRWDGFHEKD >NZ_CP019563.1|WP_000240580.1|2125835_2126141_-|intracellular-adhesion-protein-D MVKPRQREYPTLKSSLNIVRETALIAISCVFWIYCLVVLLVYIGTIFEIHDESINTIRVALNIENTEILDIFETMGIFAIIIFVFFTISILIQKWQRGRES >NZ_CP019563.1|WP_001159430.1|2126104_2127343_-|poly-beta-1,6-N-acetyl-D-glucosamine-synthase MQFFNFLLFYPVFMSIYWIVGSIYFYFTREIRYSLNKKPDINVDELEGITFLLACYNESETIEDTLSNVLALKYEKKEIIIINDGSSDNTAELIYKIKENNDFIFVDLQENRGKANALNQGIKQASYDYVMCLDADTIVDQDAPYYMIENFKHDPKLGAVTGNPRIRNKSSILGKIQTIEYASLIGCIKRSQTLAGAVNTISGVFTLFKKSAVVDVGYWDTDMITEDIAVSWKLHLRGYRIKYEPLAMCWMLVPETLGGLWKQRVRWAQGGHEVLLRDFFSTMKTKRFPLYILMFEQIISILWVYIVLLYLGYLFITANFLDYTFMTYSFSIFLLSSFTMTFINVIQFTVALFIDSRYEKKNMAGLIFVSWYPTVYWIINAAVVLVAFPKALKRKKGGYATWSSPDRGNTQR >NZ_CP019563.1|WP_000653261.1|2127506_2128067_+|ica-operon-transcriptional-regulator-IcaR MKDKIIDNAITLFSEKGYDGTTLDDIAKSVNIKKASLYYHFDSKKSIYEQSVKCCFDYLNNIIMMNQNKSNYSIDALYQFLFEFIFDIEERYIRMYVQLSNTPEEFSGNIYGQIQDLNQSLSKEIAKFYDESKIKMTKEDFQNLILLFLESWYLKASFSQKFGAVEESKSQFKDEVYSLLNIFLKK >NZ_CP019563.1|WP_000659675.1|2128915_2129578_+|capsular-polysaccharide-biosynthesis-protein-CapA MKEKFDLVKLLNILKKNIKLLLILPAICLVVSAALTFFVMPDKYTASTQILVNMKKSSSDLAFQNVQSSLQSVNTYTEIIKSPRILDKVSREFDGQYSTAELNSFLKVTNQTNSQIITVSVTTGNKSESDKIVNKISKVFAHDMPKIMSVDNVTILSSAHDNAVKVSPIVSVNLVISIIVGIVLAILIIFLKELLDKRIKTEEDVESQLGLPILGSIQKF >NZ_CP019563.1|WP_000185863.1|2129594_2130287_+|polysaccharide-biosynthesis-tyrosine-autokinase MTNTRRSTSSLIVHEQPKSPISEKFRGIRSNIMFANPDSAVQSIVITSEAPGAGKSTIAANLAVAYAQAGYKTLIVDGDMRKPTQHYIFNLPNNEGLSSLLLNWSTYQDSIISTEIQDLDVLTSGPIPPNPSELITSRAFANLYDTLLMNYNFVIIDTPPVNTVTDAQLFSKFTGNVVYVVNSENNNKDEVKKGKELIEATGAKLLGVVLNRMPKDKSASYYAYYGTDES >NZ_CP019563.1|WP_000565310.1|2130283_2131051_+|tyrosine-protein-phosphatase MIDIHNHILVDIDDGPKTIEKSIALLKQAKDEGVTSIVATPHHLHPRYDNTFQQVLVKLAELRTHPEVQALDIKLFPGQEIRITDSILKGLDNGSIQGINRSKYLLIEFPTGEVPHYTKQLFFEIQSRGYIPIIAHPERNRSIAKNPEILYELVANGALSQLTSSSLVGGFGKNIQKLSLQFIECNLAHFVASDAHSCDQRPFLMQELFHNHKLKKYSNDIEALLRNASSVINDNFVYLDRPTKPGKVKSFLKWF >NZ_CP019563.1|WP_000244278.1|2131285_2131786_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MVLRKVIMQDLDQIIALENIGFSPEEAATREALKLRIEQIQETFIVAEKNDEVIGYINGPVIKERYISDDLFKNVSTNNSEGGYISVLGLVVAPNYQGQGIAGRLLNYFETLAKNHHRHGVTLTCRESLISFYEKYGYRNEGVSESCHGGIKWYNLVKNIKKDDEV >NZ_CP019563.1|WP_077156114.1|2132343_2132955_+|flavin-reductase-family-protein MYTFDAQSLTARENYKLLIGSIIPRPIAFVTTLNQDASVNAAPFSFFNIVNNHPPMIAIAVQRAGGKRKDTALNIERTGDFVVHITDEDNVQDINETAAPLAYGDSELSRTELSLLTSTTIKTPGIKDAKMRFECKLSQMILLGDVLDGTDLIIGEIVTYHIDDSIYEGDFKINPHALQAVSRLAGNDYAKLGGIFTIKRPEK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019563_5 | 2318038-2318170 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019563_5
|
2 spacers
spacers of NZ_CP019563_5
>5.1|2318054|47|NZ_CP019563|PILER-CR ACAAAGATAAACCAAATTATCAATTCGGTGGACACAACATTGTTGAT >5.2|2318117|38|NZ_CP019563|PILER-CR TTCCGAAAGTAAGCGGTCAAAATGAAGGTCAACAAACG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019563_5
The CRISPR arrays of NZ_CP019563_5 >merge|NZ_CP019563|5|2318038-2318170|PILER-CR ATTGAAGAAGATACAAACAAAGATAAACCAAATTATCAATTCGGTGGACACAACATTGTTGATTTTGAAGAAGATACACTTCCGAAAGTAAGCGGTCAAAATGAAGGTCAACAAACGATTGAAGAAGATACAA >NZ_CP019563|5|2|2318038-2318170|PILER-CR ATTGAAGAAGATACAA ACAAAGATAAACCAAATTATCAATTCGGTGGACACAACATTGTTGAT TTTGAAGAAGATACAC TTCCGAAAGTAAGCGGTCAAAATGAAGGTCAACAAACG ATTGAAGAAGATACAA
>NZ_CP019563.1|WP_001790696.1|2315465_2315567_+|hypothetical-protein MLLKTEQYRLAFIKFKKLMNFAFKGRYYSEKQS >NZ_CP019563.1|WP_000481425.1|2313724_2315083_+|gluconate-permease MFNEIWPLISVVLGIVILLVLIIGFKLNTFISLIITSMITALMLGIPLTKIMETIEKGMGSTLGHIALIFGLGAILGKLLADGGGATRIADTLIQKFGQKHVQWAMLVAAFIVGIALFFEVGLVLLIPLVFTVAKRANVSVLKLGLPMVTALSVTHGFLPPHPGPVVIAKELKANVGDVLLYGMIIAIPVTLIAGPIFNKVAQKMIPSAYTREGDISALGAQKEFTDQEMPGFGMSLLTATLPVILMLVSTITQLVTGHDKPTNLFESIIYMIGTAGTAMLIAVLFAIVTMGLMRKRKMNHIMESVTNAIYPIGMMLLIIGGGGTFKQVLIDGGVGNTIAKMFEGTEMSPILLAWIVAAVLRIALGSATVAAISTTGIVLPLLQSSDVNVALVVLAIGAGSVILSHVNDAGFWMFKEYFGLTVKETFLTWSLLETIISVSGIIFILFISLFV >NZ_CP019563.1|WP_000876661.1|2312054_2313608_+|gluconokinase MKYMIGVDIGTTSTKSVLYDENGTFIMKHQIGYDLHTPNVDVSEENPDELFDAVLMTIKYVMRESKVNKDDIKFVSFSAQMHSLIAMDQKHQRLTNNITWADNRAAKYATVINEVHDGNAIYQRTGTPIHPMSPLVKIFWMKHEWQDVFQRTAKFADIKTYIFYHLFDTYIIDYSMASATGMFNLETLDWDVGALELLGISKEMLPELVPTTYVMKGMKERYATLMGLNEDTPFVIGASDGVLSNLGVNSVGKGEVAVTIGTSGAIRTVIDKPRTDYKGRIFCYVLTEDHYVIGGPVNNGGVVLRWLRDELLASEVETAKRLGVDPYDVLTQIAKRVKPGADGLIFHPYLAGERAPLWNANARGSFFGLTLSHKKEHMIRAALEGVLYNLYTVYLALIEVMNETPKMIKATGGFAKSEVWRQMMSDIFDTELVVPESYESSCLGACVLGLKAVGDIEDFSIVSSMVGATNNHMPFEENVAVYQELVSIFINLSRSLTENYEQIADFQRQHMAENKTQ >NZ_CP019563.1|WP_000990133.1|2311350_2312031_+|GntR-family-transcriptional-regulator MMYGYPEKWLEGMTTGEGIAAELRLGIVNGHIAEGTLLTENQMAKQFNVSRSPIRDAFKLLQQNQLIQLERMGAHVLPFGEQEKKEMYDLRLMLESFAFSRVKNQERLPIVKEMKKQLEMMKVAVKFEDAESFTKHDFEFHETLIKASNHQYLNSFWSHLKPVMMALVLTSMRQRMQQNPQDFERIHHNHQVFIDAVEQYDSQILKEAFHLNFDDVGKDIEGFWLN >NZ_CP019563.1|WP_000074018.1|2310432_2311197_+|MerR-family-transcriptional-regulator MSNYSTGELAKLCNVTTRTIQYYDRKGILKPQGFTEGKRRVYTEQQRQTLELILLLKDLGCALSDIDMLLKGEGTLKTLNTLLTMKQQEINQQVKQQQAVLNKIKNVQYYVNKASTSPITHLKDIEHVMSKSAEMKSIRRNIWISAGIIGIIQYSSIISAILMKNKWPFLIALPFMIGYGIGVTFYYQQKVAYLCPNCQHIFSPSLWQVIKAKHTATTRRFECPNCHETHYCIEVPKAHMSTEQLEISHIQHNN >NZ_CP019563.1|WP_000289136.1|2309575_2310268_+|GTP-pyrophosphokinase-family-protein MYVDRKPSLYLEDLRHDFKNSLSKFENGDEAFDTLLGFVELDHIYSSALKEISTKLSILDDNFNHIYKHNPIHHMERRVKEMRSLIEKLNRKGLQISAETAKEHILDIAGIRVVCNYLDDIYLIEEMLLKQEDVQLIKRKDYIQHPKENGYRSLHIVVSIPVFLAERVEVLPVEIQIRTIGMDMWASLEHKIRYKNNAETEKYRDLLKECATEITEVEDKLQQIHSEITE >NZ_CP019563.1|WP_072519216.1|2308928_2309345_+|DUF2188-domain-containing-protein MPFTMKGYPEKWKEFEVIKRQKAIEIENAMLKEGYLEKDVVPIAAKKAKDWYRALSKEEIKALEEENFVQFHTATMEKAEVDSEYATTDNEEHIQEQSNQDKSYFDSESIGNQSGGVRQREPLMDGAHPKVVESFKDV >NZ_CP019563.1|WP_025175017.1|2306966_2308790_+|FUSC-family-protein MIIPAIIGYLCGNFQFGLLVATGTLAHIYVFKGPSRSKLRTVIICNLAFAICMMLGTLTAKTPLVFGMTLLIVTVIPFYIFTALKIAGPSSTFFIVTFSLPINLPIAPEEALYRGFAILVGGILATMMVLITIVFSKNKAEEQAIQNDFKLISKLLHTYNDKSAFLQVAKTAVDSFKASDKLLITSTSSNDKLSRRFQKLLLLHTSAQGIYSELLELNAKQIRPLPDELIEMMDHIIAQLDNSDENVRYWRKEVTVTEEFQNLFNHILKIDEMVHANEARIAYEADMRKPLYSKRIYQNLTLDSIVFRNTLRYTAIMMIAIFIALMFDFEKAYWIPLSAHTILLGTSTIHAIERGMARGLGTILGVLVLSVILLFSIPTPVAVILMGIAALFTEALVGVNYAIAVVFITIQVILMNGLASQNLTINIAFPRVIDVAMGIVIAIIGLFVLGQRTASALLPNVMAEVVRKEATLFHYLFSENQYKDDVYQKNTAMNLSVKLNNMTQVYNAANGELFSDKTLIQNYYPSLFALEEISFMLNRAMANEDRLTINEQLMGEYLATFENIAKHFELNTGLEIKILPDLPQYNYIQSAMMNIQHNGFRERDKNV >NZ_CP019563.1|WP_000660709.1|2305212_2306490_+|MFS-transporter MKEKRTNVRWMFALAFFFIGVIAYMDRANISYIAKQMMDDLGMTKPQFGLLASFFSLGYALMQVPSGMLAEKFGPRKMITIALVWWSAFTILTGMIKNHGLIYLVRFLFGVGEAPMYPSNAVFNSFWFSKNEKGRASSALLAGSYFGPVLAPIVTIAIVNAFNWQAVFYIFGAVGILMAVLWAIIAKDLPEQHRMVNEAEKRFIMENRDIVATEKSSPPWNDFFKRFSFYAIAIQYFVVQFIITLFLIWLPTYLTEVFHVNFKEMSISSLPWLLMFFLILSAGAISDRVLGLGRSKFVARGVIAIAGFIVFAVSIIFAVRTGNLYVSIFWLSLGLGGIGISMGMSWAAATDLGRNFSGTVSGWMNLWGNIGALISPLLAGLFVEHLGWTMTFQLLIVPAVIAVIMWFYVKPDQPLIVSDDKAIEK >NZ_CP019563.1|WP_000435044.1|2304054_2304666_-|DedA-family-protein MEQIITEFISRFGYAAIFILILLENVLPIVPSEIILTFAGLMSVKSHLSILTLFIIATIASFIGLLILYYICRLISEERLYRFIDRHGKWIKLKSKDLKRANDWFKKYGVWAVFICRFIPVLRVLITIPAGVNRMNVVTFTVISLIGTTIWNFGLILLGRTLSDSFGMLMTGLHTYSRIMYVVIIIAVIYFAIRYIGKRKRVK >NZ_CP019563.1|WP_031865150.1|2319277_2322028_+|fibronectin-binding-protein-FnbB MKSNLRYGIRKHKLGAASVFLGTIIVVGMGQEKEAAASEQNNTTVEESGSSATESKASETQTTTNNVNTIDETQSYSVTSTEQPSQSTQVTTEEAPTTVQAPKVETSRVDLPSEKVADKETTGTQVDTAQPSNFSEIKPRVKRSADVAVVAGEAKATGTDVTNKVTVENGSEIVGHKQDTNVVNPHNAERVTLKYKWKFGEGIKEGDYFDFTLSDNVETHGISTLRKVPEIKSTDGQVMAIGEVVEERKIRYTFKEYVKDKKDLTAELSLNLFIDPTTVTKQGKQKVEVTLGDKTIEKEFDIKYLDGVKDRMGVTVNGRIDTLNKEDGKFSHFAYIKPNNRSLSSVTVTGQVTSGHKQNANNPTVKVYKRIGSDELAESVYAKLDDASKFEDVTEKVNLSYTGEGGYSFTFDSLEDNNNYVVKYEGEYNTKAKDLNFQTRLTGYHNYYPYYPYYPVQLTWNNGVAFYSNNAQGDGKDKPKEPIIEHSTPIELEFKSEQPVKKHELTGTIEESNDSKPIDFEYHTAVEGVEGHAEGIIETEEDSIHVDFEESTHENSKHHADVVEYEEDTNPGGGQVTTESNLVEFDEESTKGIVTGAVSDHTTVEDTKEYTTESNLIELVDELPEEHGQAQGPIEEITENNHYISHSGLGTENGHGNYGVIEEIEENSHVDIKSELGYEGGQNSGDQSFEEDTEKDKPKYEQGGNIIDIDFDSVPHIHGFNKHTEIIEEDTNKDKPNYQFGGHSSVDFEEDTLPQVSGHNEGQQTIEEDTIPPIVPPTPPTPEVPSEPETPTPPTPEVPSEPGEPTPPTPEVPSEPETPVPPTPEVPSEPGKPVPPAKEEPKKPSKPVEQGKVVTPVIEINEKVKAVAPTKQKQSKKSELPETGGEESTNKGMLFGGVFSILGLALLRRNKKNHKA >NZ_CP019563.1|WP_000721336.1|2322207_2323074_+|UTP--glucose-1-phosphate-uridylyltransferase-GalU MKKIKKAIIPAAGLGTRFLPATKAMPKEMLPILDKPTIQYIVEEAARAGIEDIIIVTGRHKRAIEDHFDSQKELEMVLKEKGKSELLEKVQYSTELANIFYVRQKEQKGLGHAISSARQFIGNEPFAVLLGDDIVESEVPAVKQLIDVYEETGHSVIGVQEVPEADTHRYGIIDPLTKNGRQYEVKKFVEKPAQGTAPSNLAIMGRYVLTPEIFDYLKTQKEGAGNEIQLTDAIERMNNDNQVYAYDFEGERYDVGEKLGFVKTTIEYALKDDSMREELTRFIKALGL >NZ_CP019563.1|WP_000386367.1|2323284_2324028_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarU MDYQTFEKVNKFINVEAYIFFLTQELKQQYKLSLKELLILAYFYYKNEHSISLKEIIGDILYKQSDVVKNIKSLSKKGFINKSRNEADERRIFVSVTPIQRKKIACVINELDKIIKGFNKERDYIKYQWAPKYSKEFFILFMNIMYSKDFLKYRFNLTFLDLSILYVISSRKNEILNLKDLFESIRFMYPQIVRSVNRLNNKGMLIKERSLADERIVLIKINKIQYNTIKSIFTDTSKILKPRKFFF >NZ_CP019563.1|WP_000998872.1|2324351_2324708_+|HTH-type-transcriptional-regulator-SarT MNDLKSKSNIKLMKRVLTTYELRKYLKKYFCLTLDNYLVLAYLDVFKNDEGKYFMRDIISYIGIDQSRIVKSVKELSKKGYLNKCRDPHDSRNVIIVVSVKQHNYIKNLLSEININET >NZ_CP019563.1|WP_072528263.1|2325012_2329896_+|E-domain-containing-protein 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>NZ_CP019563.1|WP_077156122.1|2330278_2331472_+|MFS-transporter MLYLEVLKNRNFTYLLIGNFLRRSCFVLFSLQIIWFTVELTNQSSLKLSMMVMSQTLPFIIFGIFGGVYSDKHNKKKILYLSDLILSLIIIIIPLLAITSNLNYLTLLTISTAITIINCYTDPAFRAILPEIIDEEHLATSNALIDSLQRGSNIILPALIGVIVILVGNVGVFFICSILLFLGFIFNALLKYTNNNMIDRHSKEDFSETWEFLKKSKEIPFIIIIQFACILINTGLWRVALPLFISNILKEGVGVYGLATSCLGIASLLMSLIMGLLSEKRLIFKFSIGVLVWGIGLSIINVFPSVAILYIGATLVGLGQSIEGLTRSVAIQIKTPNHLMGKVFSISSTSNYAADTLSLGLISLIIPLLSLSNIFISGGAIISMLSLSGLKFFKKSM >NZ_CP019563.1|WP_072398205.1|2331482_2331686_+|hypothetical-protein MLINAIKVGIEMKYKISLAYNLAIIIGSLIILCILISRGYDIYVILIPILTILASLINLICDIKKHK >NZ_CP019563.1|WP_000217714.1|2331793_2332102_-|hypothetical-protein MTVNIVFSIVFCISMVILGIYVAITKDFTLISYINQTTIADKHKNQIAYIFTLCISLSAVFLMSSILCFEYDFIALSFLFLTIALLLIALFYVCFYKITKYP >NZ_CP019563.1|WP_000678764.1|2332245_2332512_-|hypothetical-protein MKGSKQILLIMGIISLIVLFIFTLFIMAQYAKHYEQKSDSSNAHTLNSSSAIIEQHTMSNLASLDLYAPVRNITSSRDIHPIYFMTKD >NZ_CP019563.1|WP_072398206.1|2332795_2334604_-|phospho-sugar-mutase 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NZ_CP019563_6 | 2321624-2321734 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019563_6
|
1 spacers
spacers of NZ_CP019563_6
>6.1|2321651|57|NZ_CP019563|CRISPRCasFinder ACACCACCAACACCAGAAGTACCGAGTGAGCCAGGCGAACCAACGCCACCAACACCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019563_6
The CRISPR arrays of NZ_CP019563_6 >merge|NZ_CP019563|6|2321624-2321734|CRISPRCasFinder GAAGTACCAAGCGAGCCGGAAACACCAACACCACCAACACCAGAAGTACCGAGTGAGCCAGGCGAACCAACGCCACCAACACCGGAAGTACCAAGTGAGCCGGAAACACCA >NZ_CP019563|6|4|2321624-2321734|CRISPRCasFinder GAAGTACCAAGCGAGCCGGAAACACCA ACACCACCAACACCAGAAGTACCGAGTGAGCCAGGCGAACCAACGCCACCAACACCG GAAGTACCAAGTGAGCCGGAAACACCA
>NZ_CP019563.1|WP_065316043.1|2315550_2318598_+|fibronectin-binding-protein-FnbA 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>NZ_CP019563.1|WP_001790696.1|2315465_2315567_+|hypothetical-protein MLLKTEQYRLAFIKFKKLMNFAFKGRYYSEKQS >NZ_CP019563.1|WP_000481425.1|2313724_2315083_+|gluconate-permease MFNEIWPLISVVLGIVILLVLIIGFKLNTFISLIITSMITALMLGIPLTKIMETIEKGMGSTLGHIALIFGLGAILGKLLADGGGATRIADTLIQKFGQKHVQWAMLVAAFIVGIALFFEVGLVLLIPLVFTVAKRANVSVLKLGLPMVTALSVTHGFLPPHPGPVVIAKELKANVGDVLLYGMIIAIPVTLIAGPIFNKVAQKMIPSAYTREGDISALGAQKEFTDQEMPGFGMSLLTATLPVILMLVSTITQLVTGHDKPTNLFESIIYMIGTAGTAMLIAVLFAIVTMGLMRKRKMNHIMESVTNAIYPIGMMLLIIGGGGTFKQVLIDGGVGNTIAKMFEGTEMSPILLAWIVAAVLRIALGSATVAAISTTGIVLPLLQSSDVNVALVVLAIGAGSVILSHVNDAGFWMFKEYFGLTVKETFLTWSLLETIISVSGIIFILFISLFV >NZ_CP019563.1|WP_000876661.1|2312054_2313608_+|gluconokinase MKYMIGVDIGTTSTKSVLYDENGTFIMKHQIGYDLHTPNVDVSEENPDELFDAVLMTIKYVMRESKVNKDDIKFVSFSAQMHSLIAMDQKHQRLTNNITWADNRAAKYATVINEVHDGNAIYQRTGTPIHPMSPLVKIFWMKHEWQDVFQRTAKFADIKTYIFYHLFDTYIIDYSMASATGMFNLETLDWDVGALELLGISKEMLPELVPTTYVMKGMKERYATLMGLNEDTPFVIGASDGVLSNLGVNSVGKGEVAVTIGTSGAIRTVIDKPRTDYKGRIFCYVLTEDHYVIGGPVNNGGVVLRWLRDELLASEVETAKRLGVDPYDVLTQIAKRVKPGADGLIFHPYLAGERAPLWNANARGSFFGLTLSHKKEHMIRAALEGVLYNLYTVYLALIEVMNETPKMIKATGGFAKSEVWRQMMSDIFDTELVVPESYESSCLGACVLGLKAVGDIEDFSIVSSMVGATNNHMPFEENVAVYQELVSIFINLSRSLTENYEQIADFQRQHMAENKTQ >NZ_CP019563.1|WP_000990133.1|2311350_2312031_+|GntR-family-transcriptional-regulator MMYGYPEKWLEGMTTGEGIAAELRLGIVNGHIAEGTLLTENQMAKQFNVSRSPIRDAFKLLQQNQLIQLERMGAHVLPFGEQEKKEMYDLRLMLESFAFSRVKNQERLPIVKEMKKQLEMMKVAVKFEDAESFTKHDFEFHETLIKASNHQYLNSFWSHLKPVMMALVLTSMRQRMQQNPQDFERIHHNHQVFIDAVEQYDSQILKEAFHLNFDDVGKDIEGFWLN >NZ_CP019563.1|WP_000074018.1|2310432_2311197_+|MerR-family-transcriptional-regulator 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>NZ_CP019563.1|WP_077156122.1|2330278_2331472_+|MFS-transporter MLYLEVLKNRNFTYLLIGNFLRRSCFVLFSLQIIWFTVELTNQSSLKLSMMVMSQTLPFIIFGIFGGVYSDKHNKKKILYLSDLILSLIIIIIPLLAITSNLNYLTLLTISTAITIINCYTDPAFRAILPEIIDEEHLATSNALIDSLQRGSNIILPALIGVIVILVGNVGVFFICSILLFLGFIFNALLKYTNNNMIDRHSKEDFSETWEFLKKSKEIPFIIIIQFACILINTGLWRVALPLFISNILKEGVGVYGLATSCLGIASLLMSLIMGLLSEKRLIFKFSIGVLVWGIGLSIINVFPSVAILYIGATLVGLGQSIEGLTRSVAIQIKTPNHLMGKVFSISSTSNYAADTLSLGLISLIIPLLSLSNIFISGGAIISMLSLSGLKFFKKSM >NZ_CP019563.1|WP_072398205.1|2331482_2331686_+|hypothetical-protein MLINAIKVGIEMKYKISLAYNLAIIIGSLIILCILISRGYDIYVILIPILTILASLINLICDIKKHK >NZ_CP019563.1|WP_000217714.1|2331793_2332102_-|hypothetical-protein MTVNIVFSIVFCISMVILGIYVAITKDFTLISYINQTTIADKHKNQIAYIFTLCISLSAVFLMSSILCFEYDFIALSFLFLTIALLLIALFYVCFYKITKYP >NZ_CP019563.1|WP_000678764.1|2332245_2332512_-|hypothetical-protein MKGSKQILLIMGIISLIVLFIFTLFIMAQYAKHYEQKSDSSNAHTLNSSSAIIEQHTMSNLASLDLYAPVRNITSSRDIHPIYFMTKD >NZ_CP019563.1|WP_072398206.1|2332795_2334604_-|phospho-sugar-mutase 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You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019563_7 | 2374575-2374659 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019563_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP019563_7
>7.1|2374602|31|NZ_CP019563|CRISPRCasFinder CACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAATTTCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019563_7
The CRISPR arrays of NZ_CP019563_7 >merge|NZ_CP019563|7|2374575-2374659|CRISPRCasFinder TTTTGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCCCACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCC >NZ_CP019563|7|5|2374575-2374659|CRISPRCasFinder TTTTGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCC CACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAATTTCT TTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCC
>NZ_CP019563.1|WP_000700929.1|2372872_2374225_-|carboxylesterase/lipase-family-protein MKINTTGGQIHGITQDGLDIFLGIPYAEPPVHDNRFKHSTLKTQWSEPIDATEIQPIPPQPDNKLEDFFSSQSTTFTEHEDCLYLNIWKQHNDQTKKPVIIYFYGGSFENGHGTAELYQPAHLVQNNDIIVITCNYRLGALGYLNWSYFNKDFHSNNGLSDQINVIKWVHQFIESFGGDANNITLMGQSAGSMSILTLLKIPDIEPYFHKVVLLSGALRLDTLESARNKAQHFQKMMLDYLDTDDVTSLSTNDILMLMAKLKQSRGPSKGLDLIYAPIKTDYIQNNYPTTKPIFACYTKDEGDIYITSEQKKLSPQRFIDIMELNDIPLKYEDVQTAKQQSLAITHCYFKQPMKQFLQQLNIQDSNAQLWLAEFAWHDTSNAHYRSAYHILDMVFWFGNLQILAAHQYPTTAHLKFLSRQMQNDLANFAKSGKMPWPMYHNERRYYRTYQ >NZ_CP019563.1|WP_000026189.1|2371623_2372811_+|MFS-transporter MSIMRLFTFILSIFIVGMVEMMVAGIMNLMSQDLHVSEAVVGQLVTMYALTFAICGPILVKLTNRFSSRPVLLWTLLIFIIGNGIIAVAPNFSILVVGRIISSAAAALIIVKVLAITAMLSAPKNRGKMIGLVYTGFSGANVFGVPIGTVIGDLVGWRYTFLFLIIVSIIVGFLMMIYLPKDQEIQRGPVNHEAPSHENHVTSKILRPAEVAKYLIITFLVLIANSVTFVFINPLILSNGHDMSFVSLALLVNGIAGVIGTSLGGIFSDKITSKRWLMISVSIFIVMMLLMNLILPGSGLLLAGLFIWNIMQWSTNPAVQSGVIQHVEGDTSQVMSWNMSSLNAGIGVGGIIGGLVMTHVSVQAITYTSAIIGALGLIVVFTLKNNHYAKTFKSS >NZ_CP019563.1|WP_000072147.1|2370451_2371228_+|iron-export-ABC-transporter-permease-subunit-FetB MSNTALGLTALLLVIPIIISYKEGLHIIKDLIVATLRAVVQLIILGFLLHYIFKINDKWLLILCVLVIIINASWNTISRASPVMHHVFWISFLAIFIGTALPLAGTIATGAIQFTANEVIPIGGMLANNGLIAINLAYQNLDRAFVQDGTNIESKLSLAATPKLASKGAIRESIRLAIVPTIDSVKTYGLVSIPGMMTGLIIGGVPPLQAIKFQLLVVFIHTTATIMSALIATYLSYGQFFNARHQLVARNTDVKSES >NZ_CP019563.1|WP_000923524.1|2369796_2370459_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MLLEIKDLVYKASDRIILDHISLKVDKGESIAIIGPSGSGKSTFQKQICNLISPTSGELYFKGKPYNDYDPEELRQRISYLMQQSDLFGETIEDNMIFPSLARNDKFDRKRAKQLIKDVGLGHYQLSSEVENMSGGERQRIAIARQLMYTPDILLLDESTSALDVHNKEKIENIIFKLVEQDVSIMWITHSDDQSMRHFQKRITIVDGKISKVEELNQHE >NZ_CP019563.1|WP_001076673.1|2368472_2369549_+|M42-family-metallopeptidase MNQSVKLLKHLTDVNGIAGYEMQVKEAMRNYIEPVSDQIIEDNLGGIFGKKNAENGQYSIMISGHMDEVGFMVTKIDKHGFISFTPVGGWWNQVMLSQKVTITTDSGKEIRGIIGSKPPHVLTPEERKKPMEIKNMFIDIGVSSKEEAEEAGVEVGNMVTPYSEFEVLANDKYLTAKAFDNRYGCALAVEVLKRLKDENIGINLYSGATVQEEVGLRGAKVAANTIKPDLAIAVDVGIAYDTPGMSGQTSDSKLGGGPVVIMMDATSIAHQGLRKHIKDVAKEHNIEVQWDTTPGGGTDAGSIHVANEGIPTMTIGVTLRYMHSNVSVLNVDDYENSIRLVTEIVRSLNDESYKNIMW >NZ_CP019563.1|WP_000074049.1|2367851_2368118_+|Txe/YoeB-family-addiction-module-toxin MSNYTVKIKNSAKSDLRKIKHSYLKKSFLEIVETLKNDPYKITQSFEKLEPKYLERYSRRINHQHRVVYTVDDRNKEVLILSAWSHYD >NZ_CP019563.1|WP_000587616.1|2367594_2367852_+|type-II-toxin-antitoxin-system-Phd/YefM-family-antitoxin MIITSPTEARKDFYQLLKNVNNNHEPIYISGNNAENNAVIIGLEDWKSIQETIYLESTGTMDKVREREKDNSGTTNIDDIDWDNL >NZ_CP019563.1|WP_000732076.1|2366780_2367236_-|DUF1307-domain-containing-protein MKKLCSLIVVALICIIALSACGKEQTKTYEGDVSGKHVLTSITYKDDKVLKQSTINTIKYDDLGMDKDEAKKLFAKSESIFKDLKGVKYKVDYKDKKAIEHLDIDYTEVDMKKLNKRLGVSTKENKDISFEKLEKQLKHRGLKEKDKMDDK >NZ_CP019563.1|WP_000143494.1|2365035_2366613_+|FMN-binding-glutamate-synthase-family-protein MTFLTVMQFIVNIIVVGFLLTVIVIGLIWLIKDKRQSQHSVLRNYPLLARIRYISEKMGPELRQYLFSGDNEGKPFSRNDYKNIVLAGKYNSRMTSFGTTKDYQDGFYIQNTMFPMQRNEISVDNTTLLSTFIYKIANERLFSREEYRVPTKIDPYYLSDDHAIKLGEHLKHPFILKRIVGQSGMSYGALGKNAITALSKGLAKAGTWMNTGEGGLSEYHLKGNGDIIFQIGPGLFGVRDKEGNFSEGLFKEVAQLSNVRAFELKLAQGAKTRGGHMEAEKVNEEIAKIRNVEPYKTINSPNRYEFIHNAEDLIRFVDQLQQLGQKPVGFKIVVSKVSEIETLVRTMVELDKYPSFITIDGGEGGTGATFQELQDGVGLPLFTALPIVSGMLEKYGIRDKVKLAASGKLVTPDKIAIALGLGADFVNIARGMMISVGCIMSQQCHMNTCPVGVATTDAKKEKALIVGEKQYRVTNYVTSLHEGLFNIAAAVGVSSPTEITADHIVYRKVDGELQTIHDYKLKLIS >NZ_CP019563.1|WP_000072458.1|2364091_2364841_-|hypothetical-protein MSNTNKHYIEEEYATEQSRFFKRDIGFIFLYIFLVNILPIIIVFLTFGLVAVFTQQAPWGFSFPISMNISYLLAVIISLAIFRRMHEDAFVPMIRTQIIASTKYKWHILISFTLSAVLFLLLNYFDIFALNVDAFTVFDIYPLIRDYGSISLIVMLWLTIILNTLICQLIFRHILIQELSRIMPLKITIVLSIILETLFYYPYIDTWWEFIPALILASSATYLYLKSNRNFMVSYFYQLAVILVLHIFM >NZ_CP019563.1|WP_001030715.1|2374890_2376528_-|APC-family-permease MNKDKQLHNDKINLSQLVLLGLGSLIGSGWLFGAWEASSIAGPAAIISWVLGFLVIGTIAYNYIEIGTMFPQSGGMSNYAQYTHGSLLGFIAAWANWVSLVTIIPIEAVSAVQYMSSWPWHWAKPMRYLMENGSISTYGLLAVYLIIVIFSLLNYWSVKLLTSFTSLISVFKLGVPMLTIIMLMLSGFDTSNYGHSASTFMPYGSAPIFAATTASGIIFSFNSFQTIINMGSEIKNPEKNIARGIAISLSISAVLYIILQSTFITSMPQSMLQHSGWNGINFNSPFADLAILLGINWLAILLYIEAFVSPFGTGVSFVAVTGRVLRAMEKNGHIPKFLGKMNEKYNIPRVAIIFNAIISMIMVTLFRDWGTLAAVISTATLVAYLTGPTTVIALRKMGPTMTRPFRAKILKVMAPLSFVLASLAIYWAMWPTTAEVILIIILGLPIYFFYEYRMNWRNTKKQIGGSLWIIVYLIVLSILSFIGSKEFKGLNMIHYPFDFIVIIIVALIFYYIGTTSSFESVYFRRATRINTKMRESLNNESKSSH >NZ_CP019563.1|WP_001291519.1|2376707_2377307_+|YdeI/OmpD-associated-family-protein MSEKQSNEQVEAFLNKESQWQEEYKYLRALIFNETELEEAYKWMHPCYTLNNKNVVLIHGFKNYVALLFHKGAILEDKYHTLIQQTEKVQAARQLRFENLTEIQARTEEIKYYLAEAIKAEKAGKKVEMKKTEEYVIPKELEAKFEEMPQLESSFYKLTPGRQHQYIYHIGQAKRSETRQKRVEKYINQILEGKGMHDK >NZ_CP019563.1|WP_001791736.1|2377310_2377451_+|hypothetical-protein MSKAYRLYNNIQDDTKQPMAHAVGCFFRCVCHGQHFDVGIPLQAWE >NZ_CP019563.1|WP_102009036.1|2377530_2377614_+|hypothetical-protein MGVCPPVTMDACALLQKFDFCNNISHF >NZ_CP019563.1|WP_000948977.1|2377976_2379203_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLSIKHLTKIYSGNKKAVDDISLDIQSGEFIAFIGTSGSGKTTALRMINRMIEATEGQIEIDGKDVRSMNPVELRRNIGYVIQQIGLMPHMTIKENIVLVPKLLKWTKEEKDKRAKELIKLVDLPESFLERYPAELSGGQQQRIGVVRALAAEQDIILMDEPFGALDPITRDTLQDLVKTLQRKLGKTFIFVTHDMDEAIKLADKICIMSEGKVVQFDTPDNILRHPANDFVRDFIGQNRLIQDRPNDKTVEGVMIKPITIQAEATLNDAVHIMRQKRVDTIFVVDSNNHLLGFLDIEDINQGIRGHKSLRDTMQQHIYTVQIDSKLQDSVRTILKRNVRNVPVVDDKQRLVGLITRANVVDIVYDTIWGDSEDAVQTEHVGEDTASSKMHEQHTTNVKVRDIGDDKS >NZ_CP019563.1|WP_000569114.1|2379199_2379835_+|ABC-transporter-permease MIEFLHEHGGQLMSKTLEHFYISIVALLLAIIVAVPIGILLSKTKRTANIILTVAGVLQTIPTLAVLAIMIPIFGVGKTPAIVALFIYVLLPILNNTVLGVQNIDSNIKEAGKSMGMTQFQLMKDVELPLALPLIIGGIRLSSVYVISWATLASYVGAGGLGDFIFNGLNLYDPLMIVTATVLVTVLALGVDALLALVEKWVVPKGLKVSG >NZ_CP019563.1|WP_000721550.1|2379851_2380793_+|osmoprotectant-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKIKYILVVFVLSLTVLSGCSLPGLGSKSTKNDVKITALSTSESQIISHMLRLLIEHDTHGKIKPTLVNNLGSSTIQHNALINGDANISGVRYNGTDLTGALKEAPIKDPKKAMIATQQGFKKKFDQTFFDSYGFANTYAFMVTKETAKKYHLETVSDLAKHSKDLRLGMDSSWMNRKGDGYEGFKKEYGFDFGTVRPMQIGLVYDALNSEKLDVALGYSTDGRIAAYDLKVLKDDKQFFPPYAASAVATNELLRQHPELKTTINKLTGKISTSEMQRLNYEADGKGKEPAVVAEEFLKKHHYFDKQKGGHK >NZ_CP019563.1|WP_000398941.1|2380792_2381488_+|ABC-transporter-permease MEGNLLQQLFNYYVTNFGYLWDLFFKHLLMSVYGVLFAALIGIPLGILLARYTKLSGFVITIANIIQTVPVIAMLAILMLVMGLGSETVVLTVFLYALLPIIKNTYTGIASVDANIKDAGKGMGMTRNQVLRMIELPLSVSVIIGGIRIALVVAIGVVAVGSFIGAPTLGDIVIRGTNATDGTTFILAGAIPIAIIAIVIDVLLRFLEKRLDPTTRHRKNQSNHRPQSINM >NZ_CP019563.1|WP_000381267.1|2381781_2383182_+|MFS-transporter MDTSKQFRGDNRLLLGIVLGVITFWLFAQSLVNLVVPLQSTYSSDVGTINIAVSLSALFAGLFIVGAGDVADKFGRVKITYVGLILNVVGSLLIIITPLPAFLIIGRIIQGLSAACIMPSTLAIINEYYIGTRRQRALSYWSIGSWGGSGICTLFGGLMATYIGWRSIFVVSILLTLLAMYLIKHAPETKAEPIKGMKAEAKKFDVIGLVILVVTMLSLNVIITQTSHFGLVSPLILGLIVVFICSLVGFVYYENKIKHPLVDFSIFKNRGYSGATISNFLLNGVAGGALIVINTYYQQQLGFNSSQTGYISLTYLIAVLSMIRVGEKILSQHGPKRPLLLGSGFTVIGLILLSLTFLPEMWYIVSSIVGYLLFGTGLGLYATPSTDTAVASAPDDKSGVASGVYKMASSLGNAFGVAVSGTVYTVLAANLNLNLGGFTGMMFNALLAIVAFLVILLLVPKNQTNL >NZ_CP019563.1|WP_000684043.1|2383407_2384343_+|2-dehydropantoate-2-reductase MKIAIAGSGALGSGFGAKLFQAGYDVTLIDGYTSHVDAVKQHGLNITINGEAFELNIPMYHFNDQPDESIYDVVFLFPKSMQLKEVMEDMKPHIDNETIVVCTMNGLKHEEVIAQYVAQSQIVRGVTTWTAGLESPGHSHLLGSGPVEIGELVDEGKENVIKVADLLNEAELNGVISKDLYQSIWKKICVNGTANALSTVLECNMASLNESSYAKCLIYKLTQEIVHVATIDNVHLNVDEVFEYLVDLNEKVGAHYPSMYQDLIVNNRKTEIDYINGAVATLGKQRHIEAPVNRFITDLIHTKESQRHAQD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019563_8 | 2668620-2668705 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019563_8
|
1 spacers
spacers of NZ_CP019563_8
>8.1|2668646|34|NZ_CP019563|CRISPRCasFinder CCCAGTTGCAAACAATAAAGCTAAAGATATGCAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019563_8
The CRISPR arrays of NZ_CP019563_8 >merge|NZ_CP019563|8|2668620-2668705|CRISPRCasFinder ACTAATGATACGCAAACATCAGTTGGCCCAGTTGCAAACAATAAAGCTAAAGATATGCAAACTAATGATACGCAAAAATCAGTTGG >NZ_CP019563|8|6|2668620-2668705|CRISPRCasFinder ACTAATGATACGCAAACATCAGTTGG CCCAGTTGCAAACAATAAAGCTAAAGATATGCAA ACTAATGATACGCAAAAATCAGTTGG
>NZ_CP019563.1|WP_000521495.1|2659892_2661248_+|phosphoglucosamine-mutase MGKYFGTDGVRGVANQELTPELAFKLGRYGGYVLAHNKGEKHPRVLVGRDTRVSGEMLESALIAGLISIGAEVMRLGIISTPGVAYLTRDMGAELGVMISASHNPVADNGIKFFGSDGFKLSDEQENEIEALLDQENPELPRPVGNDIVHYSDYFEGAQKYLSYLKSTVDVNFEGLKIVLDGANGSTSSLAPFLFGDLEADTETIGCSPDGYNINEKCGSTHPEKLAEKVVETESDFGLAFDGDGDRIIAVDENGQIVDGDQIMFIIGQEMHKNQELNNDMIVSTVMSNLGFYKALEQEGIKSNKTKVGDRYVVEEMRRGNYNLGGEQSGHIVMMDYNTTGDGLLTGIQLASVIKMTGKSLSELAGQMKKYPQSLINVRVTDKYRVEENVDVKEVMTKVEVEMNGEGRILVRPSGTEPLVRVMVEAATDEDAERFAQQIADVVQDKMGLDK >NZ_CP019563.1|WP_000894032.1|2658933_2659866_+|YbbR-like-domain-containing-protein MLESKWGLRFIAFLLALFFFLSVNNVFGNIFNTGNLGQKSSKTIQDVPVEILYNTKDLHLTKAPETVNVTISGPQSKIIKIENPEDLRVVIDLSNAKAGKYQEKYQVKGLADDIHYSVKPKLANITLENKVTKKMTVQPDVSQSDIDPLYKITKQEVSPQTVKVTGGEEQLNDIAYLKATFKTNKKINGDTKDVAEVTAFDKKLNKLNVSIQPNEVNLQVKVEPFSKKVKVNVKQKGSLADDKELSSIDLEDKEIEIFGSRDDLQNISEVDAEVDLDGISESTEKTVKINLPEHVTKAQPSETKAYINVK >NZ_CP019563.1|WP_000347896.1|2658122_2658932_+|TIGR00159-family-protein MDFSNFFQNLSTLKIVTSILDLLIVWYVLYLLITVFKGTKAIQLLKGILVIVIGQQISMILNLTATSKLFDIVIQWGVLALIVIFQPEIRRALEQLGRGSFLKRYTSNTYSKDEEKLIQSVSKAVQYMAKRRIGALIVFEKETGLQDYIETGIAMDSNISQELLINVFIPNTPLHDGAMIIQGTKIAAAASYLPLSDSPKISKSLGTRHRAAVGISEVSDAFTVIVSEETGDISVTFDGKLRRDISNEIFEELLAEHWFGTRFQKKGVK >NZ_CP019563.1|WP_000167867.1|2657025_2657934_+|arginase MTKTKAIDIIGAPSTFGQRKLGVDLGPTAIRYAGLISRLKQLDLDVYDKGDIKVPAVNIEKFHSEQKGLRNYDEIIDVNQKLNKEVSASIENNRFPLVLGGDHSIAVGSVSAISKHYNNLGVIWYDAHGDLNIPEESPSGNIHGMPLRILTGEGPKELLELNSNVIKPENIVLIGMRDLDKGERQFIKDHNIKTFTMSDIDKLGIKEVIENTIEYLKSRNVDGVHLSLDVDALDPLETPGTGTRVLGGLSYRESHFALELLHQSHLISSMDLVEVNPLIDSNNHTAEQAVSLVGTFFGETLL >NZ_CP019563.1|WP_001790708.1|2650979_2651165_+|hypothetical-protein MLSNKRVEKEAGCEHKKFLKKLLTLNSKVDNMIKSSKTTQLFLKKNFKSVKLTIEITIKTI >NZ_CP019563.1|WP_000958531.1|2649826_2650891_+|P-loop-NTPase MLTVDQVKELVGEIKDPIIDVPLKETEGIVEVSIKEEKEHVSVKLAMAQLGGAPQLDLQMAVVNALKENGAKTVGIRFETLPEEKVNQFKPKEENKPKTIEGLLSQNNPVEFIAIASGKGGVGKSTVAVNLAVALAREGKKVGLVDADIYGFSVPDMMGIDEKPGIKGKEVIPVERHGVKVISMAFFVEENAPVIWRGPMLGKMLTNFFTEVKWGDIEYLILDLPPGTGDVALDVHTMLPSSKEIIVTTPHPTAAFVAARAGAMAKHTDHSILGVIENMSYFESKETGNKEYVFGKGGGTKLADELNTQLLGELPLEQPSWNPKDFAPSIYQSDDRLGKIYSSIAQKVIAATNK >NZ_CP019563.1|WP_001140999.1|2648236_2649679_+|multidrug-efflux-MFS-transporter-LmrS MAKVELTTRRRNFIVAVMLISAFVAILNQTLLNTALPSIMRELNINESTSQWLVTGFMLVNGVMIPLTAYLMDRIKTRPLYLAAMGTFLLGSIVAALAPNFGVLMLARVIQAMGAGVLMPLMQFTLFTLFSKEHRGFAMGLAGLVIQFAPAIGPTVTGLIIDQASWRVPFIIIVGIAILAFVFGLVSISSYNEVKYTKLDKRSVMYSTIGFGLMLYAFSSAGDLGFTSPIVIGALILSMVIIYLFIRRQFNITNALLNLRVFKNRTFALCTISSMIIMMSMVGPALLIPLYVQNSLSLSALLSGLVIMPGAIINGIMSVFTGKFYDKYGPRPLIYTGFTILTITTIMLCFLHTDTSYTYLIVVYAIRMFSVSLLMMPINTTGINSLRNEEISHGTAIMNFGRVMAGSLGTALMVTLMSFGAKIFLSTSPSHLTATEIKQQSIAIGVDISFAFVAVLVMAAYVIALFIREPKEIESNRRKF >NZ_CP019563.1|WP_000636857.1|2647441_2647915_+|multidrug-efflux-transporter-SepA MIVNYLKHKFYNLLTTMIVLFIFVLSGAIFLTFLGFGLYGLSRILIYFRLGDFTYNRSMYDNLLYYGSYIIFGYFIIFAVEHLMDYFRKMLPENAYFRGATFHLISYTVATTLFYFIIHLNYVYINIDFWVIMVIIGFLYVCKLQFYPESKNLNNRK >NZ_CP019563.1|WP_001237506.1|2645999_2647343_+|MFS-transporter MRLKSIITVIALILIMFMSAIESSIISLALPTIKQDLNAGNLISLIFTAYFIALVIANPIVGELLSRFKIIYVAIAGLLLFSIGSFMCGLSTNFTMLIISRVIQGFGSGVLMSLSQIVPKLAFEIPLRYKIMGIVGSVWGISSIIGPLLGGGILEFATWHWLFYINIPIAIIAIILVIWTFHFPEEETVAKSKFDTKGLTLFYVFIGLIMFALLNQQLLLLNFLSFILAIVVAMCLFKVEKHVSSPFLPVVEFNRSITLVFITDLLTAICLMGFNLYIPVYLQEQLGLSPLQSGLVIFPLSVAWITLNFNLHRIEAKLSRKVIYLLSFTLLLVSSIIISFGIKLPVLIAFVLILAGLSFGYIYTKDSVIVQEETSPLQMKKMMSFYGLTKNLGASIGSTIMGYLYAIQSGIFGPNLHNVLSAVAVISIGLIVLWVVFFKEQSSQSKE >NZ_CP019563.1|WP_000047255.1|2645139_2645823_+|hemolysin-III-family-protein MSKSTKKSNDTIVETFKDIIPLSFGEEIGNAASHGVAALLTLLVLPYAAVHSYIAHGTLASVSMSIYVISIFMMFISSTIYHSMQNETPHKYILRIIDHSMIYVAISGTYTPILLTVVGGWIGWTVFILLWGTTLWGILYKSIAVKVNQKLSLIVYLVMGWVGIILLPIIFIRTSWIFILFIFLGGVSYTIGAWFYAQKNRPYFHMIWHIFIVIASLLHLIAILYFM >NZ_CP019563.1|WP_000648723.1|2669327_2670434_-|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVKDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >NZ_CP019563.1|WP_001292149.1|2670433_2670868_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >NZ_CP019563.1|WP_000927339.1|2670879_2673012_-|BglG-family-transcription-antiterminator MLLSTREKEMIALLIKYHGQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGADSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMIDKDDVHVETKDVDGNTSFENEQTSYLTSVFEKHLSDEKSEQLLHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFISDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI >NZ_CP019563.1|WP_000083807.1|2673046_2674585_-|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPLMKFIMHILSVAVEALVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >NZ_CP019563.1|WP_000334463.1|2675265_2677071_+|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEDGTPVVALATQENVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >NZ_CP019563.1|WP_000908185.1|2677302_2678085_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLIQLDQVGRMKQGKTILKNISWQINEGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATSGTVNLFGKTPGKLGYSADNVRKQIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEVRNEAHHLLKLVGISAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLSILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITANFSKILLLKDGQSIQQGAVEDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >NZ_CP019563.1|WP_000370925.1|2678152_2679010_+|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >NZ_CP019563.1|WP_001792784.1|2679667_2679826_-|hypothetical-protein MSKSSDALFNSLTQSFELIEGVYNELVTDNLKIVMYKPRKESTSGRINRRFK >NZ_CP019563.1|WP_001802298.1|2680505_2680610_+|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >NZ_CP019563.1|WP_000495669.1|2681042_2682134_-|hypothetical-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKDKKVVTEPKNTKVENGKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019563_9 | 2680945-2681026 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019563_9
|
1 spacers
spacers of NZ_CP019563_9
>9.1|2680970|32|NZ_CP019563|CRISPRCasFinder AAAAGTAGGAGCGCCTGCGCTAAGCGCATGCA |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019563_9
The CRISPR arrays of NZ_CP019563_9 >merge|NZ_CP019563|9|2680945-2681026|CRISPRCasFinder AAGAAGCCCCTAACAACTAAAGTTGAAAAGTAGGAGCGCCTGCGCTAAGCGCATGCATAAGAGCCCCTAACAACTAAAGTTG >NZ_CP019563|9|7|2680945-2681026|CRISPRCasFinder AAGAAGCCCCTAACAACTAAAGTTG AAAAGTAGGAGCGCCTGCGCTAAGCGCATGCA TAAGAGCCCCTAACAACTAAAGTTG
>NZ_CP019563.1|WP_001802298.1|2680505_2680610_+|hypothetical-protein MLLLERTSMSDFEMLMVVLTIIGLVLISTQDHKK >NZ_CP019563.1|WP_001792784.1|2679667_2679826_-|hypothetical-protein MSKSSDALFNSLTQSFELIEGVYNELVTDNLKIVMYKPRKESTSGRINRRFK >NZ_CP019563.1|WP_000370925.1|2678152_2679010_+|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINQLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQITNLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >NZ_CP019563.1|WP_000908185.1|2677302_2678085_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLIQLDQVGRMKQGKTILKNISWQINEGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATSGTVNLFGKTPGKLGYSADNVRKQIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEVRNEAHHLLKLVGISAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLSILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITANFSKILLLKDGQSIQQGAVEDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >NZ_CP019563.1|WP_000334463.1|2675265_2677071_+|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEDGTPVVALATQENVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >NZ_CP019563.1|WP_000083807.1|2673046_2674585_-|PTS-mannitol-transporter-subunit-IICB MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPLMKFIMHILSVAVEALVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >NZ_CP019563.1|WP_000927339.1|2670879_2673012_-|BglG-family-transcription-antiterminator MLLSTREKEMIALLIKYHGQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGADSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMIDKDDVHVETKDVDGNTSFENEQTSYLTSVFEKHLSDEKSEQLLHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDVINDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFISDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRNKFLERIKKQFI >NZ_CP019563.1|WP_001292149.1|2670433_2670868_-|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >NZ_CP019563.1|WP_000648723.1|2669327_2670434_-|mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVKDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >NZ_CP019563.1|WP_077156134.1|2661524_2669009_+|DUF1542-domain-containing-protein MNLFRQQKFSIRKFNVGIFSALIATVTFISTNPTTASVAEQNQPAQNQPAQPADANTQPNANAGAQANPTAQPAAPANQGQPAVQPANQGGQANPAGGAAQPNTQPAGQGNQADPNNAAQAQPGNQATPANQAGQGNNQATPNNNATPANQTQPVNAPAAAQPAANAQTQDPNASNTGEGSINTTLTFDDPAISTDENRQDPTVTVTDKVNGYSLINNGKIGFVNSELRRSDMFDKNNPQNYQAKGNVAALGRVNANDSTDHGNFNGISKTVNVKPDSELIINFTTMQTNSKQGATNLVIKDAKKNTELATVNVAKTGTAHLFKVPTDADRLDLQFIPDNTAVADASRITTNKDGYKYYSFIDNVGLFSGSHLYVKNRDLAPKATNNKEYTINTEIGNNGNFGASLKSDQFKYEVTLPQGVTYVNDSLTTTFPNGNEDSTVLKNMTVNYDQNANKVTFTSQGVTTARGTHTKEVLFPDKSLKLSYKVNVANIDTPKNIDFNEKLTYRTASDVVINNAQPEVTLTADPFSVAVEMNKDALQQQVNSQVDNSHYTTASIAEYNKLKQQADTILNEDANHVETANRASQTDIDGLVTKLQAALIDNQAAIAELDAKAQEKVTAAQQSKKVTQDEVAALVTKINNDKNNAIAEINKQTTSQGVTTEKDNGIAVLEQDVITPTVKPQAKQDIIQAVTTRKQQIKKSNASLQDEKDVANDKIGKIETKAIKDIDAATTNAQVEAIKTKAINDINQTTPATTAKAAALEEFDEVVQAQIDQAPLNPDTTNEEVAEAIERINAAKVSGVKAIEATTTAQDLERVKNEEISKIENITDSTQTKMDAYNEVKQAVTARKAQNATVSNATNEEVAEADAAVDAAQKQGLHDIQVVKSKQEVADTKSKVLDKINAIQTQAKVKPAADTEVENAYNTRKQEIQNSNASTTEEKEAAYTELDAKKQEARTNLDAANTNSDVTTAKDNGIAAINQVQAATTKKSDAKAEIAQKASERKTAIEAMNDSTTEEQQAAKDKVDQAVVTANADIDNAAANADVDNAKTTNEATIAAITPDSNVKPAAKQAIADKVQAQETAIDANNGSTTEEKEAAKQQVQTEKTAADAAIDAAHSNAEVEAAKNAEIAKIEAIQPATTTKDNAKEAIATKANERKTAIAQTQDITAEEIAAANADVDNAVTQANSNIEAANSQNDVDQAKTTGETSIDQVTPTVNKKATARNEITTILNNKLQEIQATPDATDEEKQAADAEANTENGKANQAISAATTNAQVDEAKANAEAAINAVTPKVVKKQAAKDEIDQLQAAQTAVINNDQNATNEEKEAAIQQLATAVTDAKNNITAAADNNGVDTAKDAGKNSIQSTQPATAVKSNAKNDVDQAVTTQNQAIDNTTGATTEEKNAAKDLVSKAKEKAYQDILNAQTTNDVTQIKDQAVADIQGITADTTIKDVAKGELAAKANEQKALIAQTVDATTEEKDQANQQVDAQLTQGNQNIENAQSIDDVNTAKDNAIQAIDPIQASTDVKTNARAELLNEMQNKITEILNDNTTTNEEKGKDIGPVRAAYEEGLNNINAATTTGDVTTAKDTAVQKVQQLHANPVKKPAGKTALDQAAADRKTQIEQTPNASQQEINDAKQEVDAALNQAKTNVDQSSTNEYVDNAVKEGKAKINAVKTFSEYKKDALAKIADTYNAKVNEADNSNASTSSEIAEAKQKLAELKQTADQNVNQATSKDDIEVQIHNDLDNINDYTIPTGKKETATTDLYAYADQKKNNISADTNATQDEKQQAIKQVDQNVQTALESINNGVDNGDVDDALTQGKAAIDAIQVDATVKPKANQAIEVKAEDTKESIDQSDQLTAEEKTEALAMIKQITDQAKQGITDATTTAEVEKAKAQGLEAFDNIQIDSTEKQKAIEELETALDQIEAGVNVDADATTEEKEAFTNALEDILSKATEDISDQTTNAEIATVKNSALEQLKAQRINPEVKKNALEAIREVVNKQIEIIKNADADASAKEIARTDLGRYFDRFADKLDKTQTNAEVAELQNVTIPAIEAIVPQNDPDANDTNNGIDNNDATANSNANATPENTGQPNVSETTDNGKADASPTTPNNSDAATGETTATSATDDANDKPQANNNSSVDASTNSPTMDNDVTSKPEVESTNNGTTDKPVTETDNATPAESTTNNNSTTTATNENAPTGSTATAPTTASTEPASSADSKDNASVNDSKQNAEVNNSAESQSTNGKVAQPKSENKAKAEKDGRDSTNQSMVESTTETLPSADITEPNVPSNTSKDKEESTTNQTDAGQLKSETNVASNEADKSPSKADTEVSNKPSTSASSEAKDKMTSTNVSQKDDTATADTNDTQTSVGPVANNKAKDMQTNDTQKSVGSVANNKATQNDGANASPATVSNGSNSANQDMLNVTKPEENKANAKSDQQGKVNKPKQQAKTLPDTGMSHNDDLPYAELALGAGMAFLIRRFTKKDQQTEE >NZ_CP019563.1|WP_000495669.1|2681042_2682134_-|hypothetical-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYAQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAVLLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKDKKVVTEPKNTKVENGKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >NZ_CP019563.1|WP_000019733.1|2682399_2683377_-|CDF-family-zinc-efflux-transporter-CzrB MSHSHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALVAFIYAEKNATTTKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFIPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >NZ_CP019563.1|WP_000003759.1|2683378_2683699_-|Zn(II)-responsive-metalloregulatory-transcriptional-repressor-CzrA MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >NZ_CP019563.1|WP_001024089.1|2683850_2684516_+|SDR-family-oxidoreductase MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIDTLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFDGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGEQDIKDALTQFEIEKD >NZ_CP019563.1|WP_001127960.1|2684951_2685890_+|class-I-mannose-6-phosphate-isomerase MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >NZ_CP019563.1|WP_000808817.1|2685920_2686151_+|hypothetical-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >NZ_CP019563.1|WP_000123395.1|2686822_2688196_+|EVE-domain-containing-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRMSNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFIAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVQKPDMFESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >NZ_CP019563.1|WP_001123303.1|2688652_2689066_+|thiol-disulfide-oxidoreductase-DCC-family-protein MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIKLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >NZ_CP019563.1|WP_000070866.1|2689265_2689709_+|DNA-starvation/stationary-phase-protection-protein MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLENAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >NZ_CP019563.1|WP_000160304.1|2689829_2690540_-|purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019563_4 | 4.1|2123632|17|NZ_CP019563|PILER-CR | 2123632-2123648 | 17 | NZ_CP019563.1 | 1241316-1241332 | 0 | 1.0 |
NZ_CP019563_4 | 4.1|2123632|17|NZ_CP019563|PILER-CR | 2123632-2123648 | 17 | NZ_CP019563.1 | 1806072-1806088 | 0 | 1.0 |
NZ_CP019563_4 | 4.2|2123702|16|NZ_CP019563|PILER-CR | 2123702-2123717 | 16 | NZ_CP019563.1 | 109008-109023 | 0 | 1.0 |
NZ_CP019563_4 | 4.2|2123702|16|NZ_CP019563|PILER-CR | 2123702-2123717 | 16 | NZ_CP019563.1 | 109064-109079 | 0 | 1.0 |
NZ_CP019563_4 | 4.2|2123702|16|NZ_CP019563|PILER-CR | 2123702-2123717 | 16 | NZ_CP019563.1 | 426065-426080 | 0 | 1.0 |
NZ_CP019563_4 | 4.2|2123702|16|NZ_CP019563|PILER-CR | 2123702-2123717 | 16 | NZ_CP019563.1 | 440727-440742 | 0 | 1.0 |
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43. spacer 7.1|2374602|31|NZ_CP019563|CRISPRCasFinder matches to position: 440667-440697, mismatch: 2, identity: 0.935
caccccaacttgcattgtctgtagaatttct CRISPR spacer caccccaacctgcattgcctgtagaatttct Protospacer *********.*******.*************
44. spacer 7.1|2374602|31|NZ_CP019563|CRISPRCasFinder matches to position: 709522-709552, mismatch: 2, identity: 0.935
caccccaacttgcattgtctgtagaatttct CRISPR spacer caccccaactcgcattgcctgtagaatttct Protospacer **********.******.*************
45. spacer 7.1|2374602|31|NZ_CP019563|CRISPRCasFinder matches to position: 835565-835595, mismatch: 2, identity: 0.935
caccccaacttgcattgtctgtagaatttct CRISPR spacer caccccaactcgcattgcctgtagaatttct Protospacer **********.******.*************
46. spacer 7.1|2374602|31|NZ_CP019563|CRISPRCasFinder matches to position: 993810-993840, mismatch: 2, identity: 0.935
caccccaacttgcattgtctgtagaatttct CRISPR spacer caccccaactcgcattgcctgtagaatttct Protospacer **********.******.*************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019563_3 | 3.2|1805950|31|NZ_CP019563|CRT | 1805950-1805980 | 31 | NZ_CP044300 | Escherichia coli strain P59A plasmid pP59A-2, complete sequence | 114278-114308 | 7 | 0.774 |
NZ_CP019563_8 | 8.1|2668646|34|NZ_CP019563|CRISPRCasFinder | 2668646-2668679 | 34 | JN882286 | Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome | 23034-23067 | 8 | 0.765 |
NZ_CP019563_8 | 8.1|2668646|34|NZ_CP019563|CRISPRCasFinder | 2668646-2668679 | 34 | CP030544 | Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence | 7567-7600 | 8 | 0.765 |
NZ_CP019563_9 | 9.1|2680970|32|NZ_CP019563|CRISPRCasFinder | 2680970-2681001 | 32 | NC_016587 | Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p4, complete sequence | 41454-41485 | 9 | 0.719 |
NZ_CP019563_9 | 9.1|2680970|32|NZ_CP019563|CRISPRCasFinder | 2680970-2681001 | 32 | NZ_CP020399 | Burkholderia multivorans strain FDAARGOS_246 plasmid unnamed, complete sequence | 296489-296520 | 10 | 0.688 |
1. spacer 3.2|1805950|31|NZ_CP019563|CRT matches to NZ_CP044300 (Escherichia coli strain P59A plasmid pP59A-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
ttattgtatgctgactttccgccagcttcta CRISPR spacer ttaactaatgctgaagttccgccagcttctt Protospacer *** . ******* **************
2. spacer 8.1|2668646|34|NZ_CP019563|CRISPRCasFinder matches to JN882286 (Cronobacter phage vB_CsaP_GAP52, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cccagttgcaaacaataaagctaaagatatgcaa CRISPR spacer agcatataaaagctataaagctaaagatatgcaa Protospacer ** *. **.* ********************
3. spacer 8.1|2668646|34|NZ_CP019563|CRISPRCasFinder matches to CP030544 (Staphylococcus aureus strain ER04166.3 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cccagttgcaaacaataaagctaaagatatgcaa CRISPR spacer tactgtttataacaataaagctaaagttattcaa Protospacer . * *** **************** *** ***
4. spacer 9.1|2680970|32|NZ_CP019563|CRISPRCasFinder matches to NC_016587 (Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.719
aaaagtaggagcgcctgcgctaagcgcatgca CRISPR spacer tggaggtggagcgcctgcgcaaggcgcatgag Protospacer ..** ************* *.******* .
5. spacer 9.1|2680970|32|NZ_CP019563|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020399 (Burkholderia multivorans strain FDAARGOS_246 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.688
aaaagtaggagcgcctgcgctaagcgcatgca CRISPR spacer tcgaagccgagcgcctgcgcgtagcgcatgcg Protospacer .*. ************ *********.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
33 : 94451
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019563|33:94451|DBSCAN-SWA 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118 | Staphylococcus_phage(89.66%) | tail,coat,holin,integrase,protease,terminase,capsid,portal,head | attL 21006:21023|attR 44552:44569 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
158401 : 203862
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP019563|158401:203862|DBSCAN-SWA 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44 | Staphylococcus_phage(93.33%) | tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
210416 : 242808
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP019563|210416:242808|DBSCAN-SWA AATGTTTACACCTATAGTTATAAATTTATTAAATGATGTAGGTTCGATTTTTTTAGTTAGGGTGGGGAATCAATTGAAAGTTATTGAGAAAGTTCATTATGAAGATATTTTAGAATCAAAAATAGTTCGATTATTTCAGGCATTTATAAAGGACAAAATGGATCAACTTTTTATTACTTCTGAACACTTTGCTATTGACATAGACAAGGTATTATTTCAACTTAATTTAAAAGTTAAATATATTAAAATGGAGAGTAATACTTCGGGTTATTTAAGTGGAAGAACGATTTATATCAATAATAATCTCTCGATTAATAATACAAGATTTGCAATAGCTCGTGAACTCGGCCGTTATTTATACAAAATTAAAGATAACAACGATAATAGTCTAAAGAATTTACATGAAATGATTTATGAAAGCGACGTAAATCAGTTTTCAGTCGACTTACTTATGCCTAAAAAGCAAATAGAGGCATTAGTCTATAATTTTTATGAAGTCAATAATATCAATTTAAGTTCTGGTTTATCTGAAAAAGAACGAAACAAACTATTGAACCTTATATCAACTAAGTTGGAAGTTTCGAAAGTAGCTGCTGGATTAAGGCTGTATAATTTAGGAATACATATTTGATAAATATTGTGAAAATCTAGTCGATTTATTAAAACCAAAAGAAAACTAATACAATTCAAGACCATGCAAACTCATTTATAAACATTGTCCGTTTAAAGATAGGTATGCGTGGTCTATTTTTATAAAATATATTTAATTACAGGTTTAAATATCTATAACAAAATCTCAACAGCAAAAAATAAATCTACATTAATCATTTATCTAGACTCAAGGAAATCATATATTTCTATGCCTTTTAACATATCGTCAATTTTAATGAGTAATTTCTCTACTAATATTCCAGGCAAATAGGCACGTGCTTTGGTGGCTTGCATCCATGCTGGTTTTGGATTATATTCGCCAATGTACCAATCAATGACTGTTGGTTTGATCATTTGACATAATCCAGCCACGCCAAATTGGCCTTTGGATTCTTTTGTAATAATTGCATGTAAAATTAAATGCTCGATTAAATCGCAGTAAACTAAGTTTTCTTTCTTTTGATAGTTGTATGAGTACTTAAATTCGGAAATGAATCTTAGGTCAGATAAGTTTTGGAATTTATCCTCGTTTATGTGATGACAATATAATCCTTCACTAGCTTTAGAGTATTTTCCTTTTGAAATACTCTTGATTTCTCCATTTAAAAATCGCGTGTATGATTTTTCCTTATAATAGTCATCGGTTACAGCGCCATATTTATTTAAAAGGTATGCTACAGCTTGCGAGTAAGTAGCGTCTAATAATTGACTATATTCATTAAATTTAGCTGTATATTCGTTTTTCTCCACTTCAATATACCTCTTTTCAAACTTTATGATATGAAATGCTTGTAATTTACAAAGAATAAAATCAGTACTCACTTAGTTACGTTCGACTTTTATTTGTCTATTACTCTTGCATAATGCGCCAATTGACTAATATTTTGTCATTGAATTCTACATTTTTGTATTGTTTTAATAGTTCTTCAGTTCTTTGTAAACAGACTGTAACTGTATCATCAATTGATAAATTAAATGCTGCAAAGTCTTCTAACTCTGTCCCTTTGTGAATTAAATCGATAATGTCTGGTTTCACCCCTAGGGAAGAGAGTGTTTCCATCATATAAGGTGTAAAGAGCAAATGCTCTGCATTGTCGATTGAAATAATACCGAGTTTAAGTTGATTAAAAAGACCATGCATAGTCATTAAGGTGTATTTTTCAAGTTGTTGTATATTTTCAAATGTTATCATAGCGGTTCTCCTAAAAATTACGATTAATCAAAGTATACCCTTATTTAACTTTAGTTTCTGCTGAATTATTTACACGGTTATCGTGTTTTTCTTCTTTATTAACAGCATTTTTATCACTTTTATCATCGACTTTTTGATCTGGTATGTCATTTTGAATGGCTTTGTTATTATCATTATCATGATGTTGAATGTCTTCTGACTCACCATCTGTTTCATCATGATCACTCATACCTGGGTTGTATTTAGGGCTTCTCTTTTTAAATGCTTCAAATTCTTCTTTATCTTTTTCTGACATATCATCAAAAATATTAATAATCGTACCATTGTGTCGATTAACAATAGCACAACGTTTTAATGGTGTGCCAACTGCATCGCGGACTAGATGTTCAACATAATATTCATGTTCATTACTTCGTTCAAGATTTGTTTTATAATTTAATGTTTGATTTTCGTTAGCACCTCTTGCTTTGTAATCGTTTCGAACGATATCTTCGGCTTCTTGTGGTGTCATTTGCTTTTCTGTATTTGACTGTGTAGTGTTGTCAGTTTGTTGCGTCTTTTTATTAGTGTCATTTGATTTACTATTATTTTCTTTATGTTGATTAGCACCGCAAGCAGTTAATAGTGACAATGATAATGCGATGGCAACGATAGCTTTGAATTTCATTTTTTTATCTCCTTGATTTGATTATGTATAATTAATTTTTCCGTAAAAGAAGGGTAGCCGAGCTACCCTGAAATTTTATTCTGTTGAAGCGTCGTACATGCTATCTTCATTGTGAATATTTTGACTAGGTGGTGCTTCACTAGTGGTAGGTTTGCTCTGGCGCATAGGCTCTACAGGAGCAGTTTCCTCATTAGATTCACTTTTTTCTACACTAGATTTATCACTTTTAGACGCATTCTGCTTATCCTCATCTTTACTAGACTTTTCGCTATCTTCAGAATCAGTATCCGCACTAGAAGTTGTAGCAGGTGTAGTAGCCGAAGCTTCATAACTTATATTATCGCTATTTGACCTCGCAACAGCTACTTCTGTATCTTGCTTGTCTTTTTTAGCTTTTGATGTTTTTTTAGCTTCGGATAAATCAAATGTAATCTTCTTGACGCTAAATAAACTAGAAATAACTTCTAATTTTTTATCTTTTGCGTTGGCTATGTTTTCTGACACATCGAAAACAATTTTACCTTGAGCAGTGCTATCAGGATTTATACGCTGTAAGAAAAATGAATTTTCTATACTACCATTGTCACTTTGATTAGCAGACATTGAACCTGTATTATCTGCTTCAAATGTTTTATCACCGGATTTTAGCTTAAACATTGAACTATCAATTGTTAATGCTTCTTTACCTTTGTTTTTAATCGTCACATCAGCAACGACAAATATACCTTTAGCGTTTGTTGGTGCAAGAGATGGTCCTACAGATTTCATAGTTTCCACTGAATTTACAGTGATTTCAAGGTCGCCATTTTTAACAGTTTCACCGATTTTATGGGTTTTGTTCGTTTCTTTAGAACTATTTCCGCCAAGGTTACCTGTAATACCAGCTGTACAAGCTGAAATACCGATGATAATTAAAATAAATAATAATAGACAACCACCACAGCCCCAGAACCATCCTTTTTTAGATTTCTTTTGTCCGTATTGCTGGTGCTGTTGGTTTTGTTGATTTTGGAAAGCTTGGAATTGTTCCCATTGTCTTCGCTCTTCTTCGCTTTTGAATTGATTGCTCATGCCTAAAAAATCTCCCTCATTATTTACTATGTGATTAGTGCATAAAGCTAAATACAATTTGAATTCAATTCGCTTGTTGTTTAATATTTATCAGGTTCACATGCACGTTTATCTTTATCTCTATCTAAATGTGGTCGATATGCTGGATGATCGGCAGTGACACCATTCGGATATACTTGTCTAAGTTGCTTACAATTAGCAAATGATTGTTGTGTGTTTGTTTCAGTTGATGGTGAGGTCTTAGGTTGCGTGGATTGATGATGGTTACTTGATTGTTGCTTTTCTTTTAAATCATCTTTCAAGTCGTCTTGTGATTTATCTTCTGCAACGTTTGGTGTGTTAATATCATCGTCTGATTGATCTTTTGTTGTTATTTCATCAATTTCATGTTGATTATTTTCAGTATTTTCATTTGCGGGTACTTCTTCGGTTGATTGTAAATCCTCATCTGTTGCTGTTTCTGATTTTTCCTCAGGCTTATCTTCATTTTTATTTTCATCTTTTTGAGTTAATTGCGTTTTTGATGATTGATTACTAGTGGAATTGTCATTATTACTAAACATCATTGAACAGGCTGATAATAAGATTATTAATAAAATAAAAGAAATAAGGCAACCGCCGCATCCTTTTAACATGCCGCGTCTTTCAGAATTTTTAACAGATTGGTTTTGATTCTTGTTGTTCTCTGTATTCAAAGGTAAATCTCCTCTATATTTATATGTTATTTTCATGATTTACTACATAAAACCTGGATGCATTTAAGAGGGAGTTATTAAGTGTAAAACGCTTTCACTATATCACATAATCATATTTTACCAAATTAGTAGTGGAAATACTTTAATTTTTTTCAAAACTTTAAAAATATTTTTGGGTTGTAGAAGTGTTAATTTAATAATTGTAAAGTTGTATTGCAACTCAAAATGACACGAACATGACAACATAATTTAACAAAATAATAATTTCTATTTGTTATAATATATTGTATTTATTTTTAGAGGTGTTGCTTTTGAAAAAGTTTTTAAGATTCAAGTGGATGAAAATATGTTTAATGCTATATCTACTGATTTTTTTAAGTAGTTGTGGCACAAATAATAAAATAGTAGACCAACGATTTGAAATACAACAACATAATGAAACAATAGGTAGTATTTACTTTTCAGCAGACTATGCACATATAAGAGGTATAGAAAAAGGCACTGCAAAATATTTCGTAGACAAAGTAGGCAGCAAACGTTACTTATTTATTGAATATATTCCGGATAATGTATTGAATTGCAAGCCGGACTTTTGGAAAACGTTAAAATATAAAAAGGATAAGATAACATATTATGTATATCTCATTGAAAATTTAGATGATGAAGTATTCCATTTAAGTGCATTACAAGACATGAATCGTATACCAATTGACATTGCAGATGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP019563|210416:242808|214076_214727_-|WP_072398259.1|DBSCAN-SWA MKITYKYRGDLPLNTENNKNQNQSVKNSERRGMLKGCGGCLISFILLIILLSACSMMFSNNDNSTSNQSSKTQLTQKDENKNEDKPEEKSETATDEDLQSTEEVPANENTENNQHEIDEITTKDQSDDDINTPNVAEDKSQDDLKDDLKEKQQSSNHHQSTQPKTSPSTETNTQQSFANCKQLRQVYPNGVTADHPAYRPHLDRDKDKRACEPDKY >NZ_CP019563|210416:242808|230193_230829_-|WP_001168911.1|protease|DBSCAN-SWA MQKFKDFFYDDLSVTRGNYFLTLMAAFFITIILFIGIVVSEVHLLYSMLIVLVGLILLRLFKINLISFKKLTLSQVIYIIGGALLIYGLDNLYLYFHDVPANEQQLEQEIRNTPFYISIFTVTIIPAIVEEIVFRGMIIRVIFRKHLFLGLLVSSLVFASLHESDTWIGYLPYLYSGLIFGLIYIKTKRLEVVIFMHFLNNLLALLFIIWG >NZ_CP019563|210416:242808|227508_227862_-|WP_000623478.1|DBSCAN-SWA MISIILVMIGGGFGAITRSAITDYFNHKFTSKLPIATLIVNLVGSFLIGLTIGLSISISWFPAFFVTGFLGGLTTFSTLAKELTLMMTPKFNINLFLNYSLLQFIIGFIACYIGYHI >NZ_CP019563|210416:242808|211916_212258_-|WP_000627533.1|DBSCAN-SWA MITFENIQQLEKYTLMTMHGLFNQLKLGIISIDNAEHLLFTPYMMETLSSLGVKPDIIDLIHKGTELEDFAAFNLSIDDTVTVCLQRTEELLKQYKNVEFNDKILVNWRIMQE 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34 | Staphylococcus_phage(93.33%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
245969 : 258698
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP019563|245969:258698|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP019563|245969:258698|249061_251479_+|WP_001557386.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLNYNHNQIEKKWQDYWDENKTFKTNDNLGQKKFYALDMFPYPSGAGLHVGHPEGYTATDIISRYKRMQGYNVLHPMGWDAFGLPAEQYALDTGNDPREFTKKNIQTFKRQIKELGFSYDWDREVNTTDPEYYKWTQWIFIQLYNKGLAYVDEVAVNWCPALGTVLSNEEVIDGVSERGGHPVYRKPMKQWVLKITEYADQLLADLDDLDWPESLKDMQRNWIGRSEGAKVSFDVDNTEGKVEVFTTRPDTIYGASFLVLSPEHALVNSITTDEYKEKVKAYQTEASKKSDLERTDLAKDKSGVFTGAYAINPLSGEKVQIWIADYVLSTYGTGAIMAVPAHDDRDYEFAKKFDLPIIEVIEGGNVEEAAYTGEGKHINSGELDGLENEAAITKAIQLLEQKGAGEKKVNYKLRDWLFSRQRYWGEPIPVIHWEDGTMTTVPEEELPLLLPETDEIKPSGTGESPLANIDSFVNVVDEKTGMKGRRETNTMPQWAGSCWYYLRYIDPKNENMLADPEKLKHWLPVDLYIGGVEHAVLHLLYARFWHKVLYDLGIVPTKEPFQKLFNQGMILGEGNEKMSKSKGNVINPDDIVQSHGADTLRLYEMFMGPLDAAIAWSEKGLDGSRRFLDRVWRLMVNEDGTLSSKIVTTNNKSLDKVYNQTVKKVTEDFETLGFNTAISQLMVFINECYKVDEVYKPYIEGFVKMLAPIAPHIGEELWSKLGHEESITYQPWPTYDEALLVDDEVEIVVQVNGKLRAKIKIAKDTSKEEMQEIALSNDNVKASIEGKDIMKVIAVPQKLVNIVAK >NZ_CP019563|245969:258698|247592_248774_+|WP_001025061.1|DBSCAN-SWA MNIPKSVWWLVIGMALNITGSSFLWPLNTIYMKQELGKSLTVAGLVLMINSFGMVIGNLLGGSLFDKLGGYKTILIGTFTCLCSTTLLNFFHGWPWYAVWLVMLGFGGGMIIPAIYAMAGAVWPNGGRQTFNAIYLAQNIGVAVGAAMGGFVAEFSFNYIFLANLIMYVVFALVAVTQFNIEINAKVKYPTHLDITGKKNKARFISLVLICAMFAICWVAYIQWESTIASFTQSINISMAQYSVLWTINGIMILVAQPLIKPILYLLKGNLKKQMFVGIIIFMLSFFVTSFAENFTIFVVGMIILTFGEMFVWPAVPTIANQLAPDGKQGQYQGFVNSAATVGKAFGPFLGGVLVDAFNMRMMFIGMMLLLVFALILLMVFKENNTQPKKIDA >NZ_CP019563|245969:258698|246529_247483_-|WP_000526539.1|DBSCAN-SWA MGNHFQYAFENKRYHTWNYHLKNKFGQKIFKVALDGGFDCPNRDGTVAHGGCTFCSAAGSGDFAGNRADSIAVQFKEIKEKMHEKWHEGKYIAYFQAFTNTHAPVEVLKEKFEPVLKEPGVVGLSIGTRPDCLPDDVVEYLADLNQRTYLWVELGLQTIHQSTSDLINRAHDMKTYYDGVAKLRKHNINVCTHIINGLPGEDYDMMMATAKEVAQMDVQGIKIHLLHLLKGTPMVKQYDKGLLTFMTQEEYTNLVVDQLEVIPPEMIVHRITGDGPIDIMVGPMWSVNKWEVLNGIDAELARRNSYQGLRYKSKVKQ >NZ_CP019563|245969:258698|251500_251812_+|WP_000836465.1|DBSCAN-SWA MKSITTDELKNKLLESKPVQIVDVRTDEETAMGYIPNAKLIPMDTIPDNLNSFNKNEIYYIVCAGGVRSAKVVEYLEANGIDAVNVEGGMHAWGDEGLEIKSI >NZ_CP019563|245969:258698|245969_246533_-|WP_000764419.1|DBSCAN-SWA MKLERILPFSKTLIKQHITPESIVVDATCGNGNDTLFLAEQVPEGHVYGFDIQDLALENTRDKVKDFNHVSLIKDGHENIEHHINDAHKGHIDAAIFNLGYLPKGDKSIVTKPDTTIQAINSLLSLMSIEGIIVLVIYHGHSEGQIEKHALLDYLSTLDQKHAQVLQYQFLNQRNHAPFICAIEKIS >NZ_CP019563|245969:258698|252137_258698_+|WP_072519189.1|DBSCAN-SWA MNLLKKNKYSIRKYKVGIFSTLIGTVLLLSNPNGAQALTTDNNVQSDTNQATPVNSQDKDVANNRGLANSAQNTPNQSATTNQSTNQALVNHNNGSIVNQATPTSVQSSTPSAQNNNHTDGNTTATETVSNANNNDAVSNNTTLNVPNKTNENGSGGHLTLKEIQEDVRHSSDKPELVAIAEPASNRPKKRSRRAAPADPNATPADPGAAAAGNGGAPVAITAPYTPTTDPNANNAGQNAPNEVLSFDDNSIRPSTNRSVPSVTVVDNLPGFTLINGGKVGVLSHAMVRTSMFEAGSNRTYQAQGNVLALGRISGTDASNHGDFNGIEKSLTVNPNSELIFEFNTMTTKNGQGATNVIIKNADTNDTIAEKTVEGGPTLRLFKVPDNVRNLKIQFVPKNDAITDARGIYQLKDGYKYYSFVDSIGLHSGSHVYVERRTMDPTATNNKEFTVTTSLKNNGNSGASLDTNDFVYQVQLPEGVEYVNNSLTKDFPSNNSGVDVNDMNVTYDAANRVITIKSTGGGTANSPARLMPDKILDLRYKLRVNNVPTPRRVTFNETLTYKTYTQDFINSPAESHTVSTNPYTIDIIMNKDALQAEVDRRIQQADYTFASLDIFNDLKKRAQTILAENRNNVPLNKRVSQADIDTLTNQMQHTLIRSVDAENAVNQKADQMEDLVNQNDELTDEEKQAAIQVIEEHKGNIIGDIGDQTTDDGVTRIKDQGIQTLSGDTATPVVKPNAKKAIRDKATKQREIINATPDATEDEIQDAINQLATDETDAIDNVTNATTNADVETAKNNGINTIGAVVPQVTHKKAARDAINQATATKRQQINSNREATQEEKNAALNELTQATNHALEQINQATTNADVDNAKGDGLNAINPIAPVTVVKQAARDAVSHDAQQHIAEINANPDATQEERQAAIDKVNAAVTAANTNILNANTNAEVEQVKTNAIQGIQAITPATKVKTDAKNAIDKSAETQHNTIFNNNDATLEEQQAAQQLLDQAVATAKQNINAADTNQEVAQAKDQGTQNIVVIQPATQVKTDARNVVNDKAREAITNINATPGATREEKQEAINRVNTLKYRALTDIGVTSTTAMVNSIRDDAVNQIGAVQPHVTKKQTATGVLNDLATAKKQEINQNTNATTEEKQVALNQVDQELATAINNINQADTNAEVDQAQQLGTKAINAIQPNIVKKPAALAQINQHYNAKLAEINATPDATNDEKNAAINTLNQDRQQAIESIKQANTNAEVDQAATVAENNIDAVQVDVVKKQAARDKITAEVAKRIEAVKQTPNATDEEKQAAVNQINQLKDQAFNQINQNQTNDQVDATTNQAVNAIDNVEAEVVIKPKAIADIEKAVKEKQQQIDNSLDSTDNEKEVASQALAKEKEKALAAIDQAQTNSQVNQAATNGVSAIKIIQPETKVKPAAREKINQKANELRAKINQDKEATAEERQVALDKINEFVNQAMTDITNNRTNQQVDDTTSQALDSIALVTPDHIVRAAARDAVKQQYEAKKREIEQAEHATDEEKQVALNQLANNEKRALQNIDQAIANNDVKRVETNGIATLKGVQPHIVIKPEAQQAIKASAENQVESIKDTPHATVDELDEANQLISDTLKQAQQEIENTNQDAAVTDVRNQTIKAIEQIKPKVRRKRAALDSIEENNKNQLDAIRNTLDTTQDERDVAIDTLNKIVNTIKNDIAQNKTNAEVDRTETDGNDNIKVILPKGQVKPAARQSVGVKAEAQNALIDQSDLSTEEERLAAKHLVEQALNQAIDQINHADKTAQVNQDSIDAQNIISKIKPATTVKATALQQIQNIATNKINLIKANNEATDEEQNIAIAQVEKELIKAKQQIASAVTNADVAYLLHDEKNEIREIEPVISRKASAREQLTTLFNDKKQAIEANIQATVEERNSILAQLQNIYDTAIGQIDQDRSNAQVDKTASLNLQTIHDLDVHPIKKPDAEKTINDDLARVTALVQNYRKVSDRNKADALKAITALKLQMDEELKTARTNADVDAVLKRFNVALSDIEAVITEKENSLLRIDNIAQQTYAKFKAIATPEQLAKVKVLIDQYVADGNRMIDEDATLNDIKQHTQFIVDEILAIKLPAEAMKVSPKVIQPAPKVCTPIKKEETHESRKVEKELPNTGSEGMDLPLKEFALITGAALLARRRTKNEKES |
6 | Staphylococcus_phage(100.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
382220 : 391263
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP019563|382220:391263|DBSCAN-SWA CATGAATGAGCGTATGGTTGATCAATCAATGCATAGTGAAGAAACTGATTTCGAATTGTCGCTTAGACCTACGAGATTACGACAATATATTGGTCAAAATTCAATAAAAAGTAATTTAGAAGTATTTATTAAAGCGGCTAAACTTCGTCATGAACCATTAGATCATGTATTGCTTTTTGGCCCCCCTGGATTAGGTAAGACAACATTATCTAATATCATTGCCAATGAAATGGAAGTTAATATACGTACAGTATCAGGGCCTTCATTAGAAAGACCTGGTGATTTGGCTGCAATTTTATCAGGACTTCAACCTGGAGATGTTTTGTTTATTGATGAAATACACAGACTGAGTAGTGTTGTTGAAGAAGTGTTATACCCTGCAATGGAAGATTTCTTTTTAGATATTATCATTGGTAAAGGCGATGAGGCTAGAAGTATCCGTATCGACTTACCTCCATTCACTTTGGTAGGTGCAACAACGCGAGCTGGCAGCTTAACAGGTCCACTAAGGGATCGATTTGGTGTGCACTTAAGATTAGAATATTATAATGAATCAGATTTAAAAGAAATCATTATTAGAACAGCTGAGGTTTTAGGCACAGGTATTGATGAAGAAAGTGCCATTGAACTTGCTAAACGTTCTAGAGGGACTCCAAGAGTAGCAAATCGACTATTGAAGCGGGTAAGAGACTTCCAGCAAGTGAATGAAGATGAACAAATATACATTGAAACAACGAAGCACGCATTAGGTTTACTTCAAGTTGATCAACACGGACTAGATTACATTGATCATAAAATGATGAACTGTATTATTAAGCAGTATAATGGTGGACCTGTTGGTTTAGATACGATTGCCGTAACAATTGGTGAAGAACGTATTACAATTGAGGACGTTTATGAGCCATTTCTTATTCAGAAAGGCTTTTTAGAACGTACGCCACGTGGCAGAAAAGCAACACCATTAGCTTATGAACATTTTGCAAAGTCGAATGAGGAGAGAGAATAACGTGAATATTGAAGAATTTGACTATGACTTACCAGAATCATTAATTGCTCAAACGCCTTTAAAAGATCGTGATCATAGTCGTTTATTAGTCATGGATAGAGAAACTGGTGAAATGAAACATTTACATTTCAAAGATATCATTGAGTATTTTAGACCTGGTGATACATTAGTGCTTAACGATACGCGAGTAATGCCAGCTAGACTTTTTGGTTTAAAAGAAGAAACTGGTGCAAAAGTTGAAATGTTAATGTTAACTCAAATTGAAGGTAATGATTGGGAAGTCTTACTGAAACCAGCTAAGCGTATTAAAGTTGGTAATAAATTGAATTTTGGTAATGGCAAAATTATAGCTGAGTGCATAAAAGAAATGGATCAAGGTGGACGCATCATGCGTTTACATTATGAAGGTATTTTACAAGAAAGATTAGATGAATTAGGGGAAATGCCACTGCCACCATACATCAAAGAACGTTTAGATGATCCAGATCGTTATCAAACAGTTTACGCTAAAGAAAGTGGTTCAGCGGCAGCACCAACAGCAGGATTACATTTTACTGATGAGTTATTAACTGAAATTAAAAATAAAGGCGTTAATATCGCATTTGTTACATTACATGTTGGGTTAGGTACGTTTAGACCGGTGAGCGTCGATGATGTGAATGACCACGAAATGCATAGTGAATATTATCAAATGACACAAGAAACAGCTGATTTATTAAATGATACTAAGTCCAAAGGACATCGCATTATATCAGTTGGTACAACTTCAACACGTACACTTGAAACAATTCGACGCGATCATGATAAATTTGTTGAAACGAGTGGCTGGACTAATATATTTATTTATCCAGGATTTGATTTTAAAGCAATTGATGGCCAGATTACTAATTTTCATTTACCAAAATCAACATTAGTTATGCTAGTATCAGCGTTTAGTACTCGTGAAAATGTTCTGAATGCTTATAAAACAGCAGTAAATTTAGAATATAGATTCTTTAGTTTTGGCGATGCAATGTTAATTATATAAAAAGAATGTGAGGATTTTGAATATGCCTGCAGTAACATATGAACACATTAAAACTTGTAAACAATCAGGTGCGCGTTTAGGTATCGTGCACACACCACACGGTTCATTTGAAACACCTATGTTTATGCCAGTTGGTACTAAAGCAACCGTTAAAACAATGAGTCCAGAAGAGTTAAGACAAATTGAAGCAAAAATCATTTTGGGCAACACATATCATTTGTGGTTACAACCCGGAAATGATATTATCAAACACGCTGGGGGATTACATAAATTCATGAATTGGGATGGTCCGATTCTTACAGATTCAGGCGGTTTCCAAGTGTTTAGTTTAAGTAATTTACGTAAAATTACAGAAGAAGGCGTGGAATTTAGACATCATACTAATGGTTCTAAATTATTTTTGAGTCCTGAGAAATCAATGCAAATTCAAAATGATTTAGGTTCTGATATTATGATGGCATTTGATGAATGTCCACCGATGCCGGCTGAATATGATTATGTAAAAAAATCTATTGAACGTACAACACGTTGGGCGAAACGATGTCTAGATGCACACCAAAGACCTGAAGATCAAGCATTGTTCGGCATTATACAAGGTGGCGAATATGAAGATTTAAGAGAACAAAGTGCAAAGGATTTAGTAGAATTAGATTTTCCTGGTTATGCAATCGGCGGTTTGTCAGTTGGTGAACCTAAACCGGTTATGTATAAAATGGTTGAACATACAGAGCAGTTTATGCCTAAAGATAAACCAAGATATTTAATGGGTGTAGGATCTCCAGATGCGTTAATCGAATGTTGTATTCGCGGCATGGATATGTTTGATTGTGTCTTACCGACACGTATTGCCAGAAATGGTACTTGTATGACATCGCAAGGTCGTTTAGTTATTAAAAATGCAAAATTTGCAGATGATTTAAGACCGTTAGATGAGAATTGTGACTGTTATACATGTCAAAACTATTCAAGAGCGTATATACGTCATTTAATCAAGGCAGAGGAAACTTTTGGTATTCGTCTTACTACTATTCATAATTTACATTTTCTGCTAAAATTAATGGAAGATATAAGACAAGCCATTCGAGAAGATCGTCTTTTAGATTTCAAAGAAGAATTCTTCGAGCAATATGGATTAAATGTTGAGAACCCAAAAAACTTTTAAGCAAGAGGAGCGTATAAAATGCAATTTTCATTACTAATATATATAGTCGTAATTTTTGCGGTTATGTATTTCTTGATGATCAGACCACAACAAAAACGTGCGAAACAGCATCGTGAGTTGATTAATAACATTCAATCTGGTCAAAGAATTACAACTATTGGTGGTATTAAAGGTACTGTTAAAGCAGTAGATGAAACAACTGTTGTTATTACAGTTAATGGTCATGGTACTGAATTAACTTTCGAAAAACCTGCTATTAAACAAGTTGACCCTTCATAACGAGAAGTGGTATTAAAAAGGATGAAACGAATAGCGTTTCATCCTTTTTAAGTTATAAGTAGTATGTAGAATAGCTTATTTTTATTCCAAAAAAAGAAATTGTGATACATAATAATTGTTAAATTTAAATTAAATATATCTATGACTATTTTTACTCCCTGCTCTAGTATGTTAATATGTATAAGGCTAATAAATTTTGTAAGAAAGATTTAACTTGCGTTATAAAATAGTATTCAAGTATTCTAAATACATACGTAAATAATGAGGTGTTCATGTGAAGAAAAGTAGTAGAATAATTGCGTTCTTGCTTTTAGTCGTATTGTTGTTTGCCGGAATGGCTGCAACTTATAAAAGTGTTATAAAGAATGTCAATTTAGGACTTGATTTGCAAGGTGGATTTGAGGTGCTTTATCAAGTCGATCCTTTAAATAAAGGCGACAAAATAGATAAAAAAGCCTTACAATCAACAGCGCAAACATTAGAAAATCGTGTTAACGTTTTAGGTGTTTCGGAACCTAAAATTCAAGTTGAAGAACCTAATAGAATTAGAGTTCAACTTGCTGGTGTAACAGACCAGAATGAAGCACGTAAAATTTTATCTTCTCAAGCTAATTTAACAATTCGCGATGCAGAAGATAAAGTAAAATTAAGCGGTTCTGATATTAAACAGGGATCTGCCAAACAAGAATTTAAACAGGAAACAAACCAGCCTACAGTTACTTTTAAAGTAAAAGACAAAAACAAATTTAAAAAAGTAACGGAAGAAATCTCTAAGAAACGTGATAATGTCATGGTTGTTTGGTTAGATTTCAAAAAAGGTGACAGCTATAAAAAAGAAGCACAAAAGAAAAACCCTAAATTTATTTCTGCAGCAAGTGTTGATCAACCAATCAATTCTGATAGCGTAGAAATCTCGGGTGGATTTAAAGGACAAGAAGGCGTTAAAAAAGCAAAACAAATCGCCGAATTGTTAAATGCAGGTTCTTTACCAGTTGACTTGAAAGAAATTTATTCAAACTCAGTAGGTGCCCAATTTGGTCAAGATGCATTAGATAAAACTGTGTTTGCATCGTTTATTGGTGTAGCATTAATTTATTTATTCATGCTTGGATTCTACCGATTACCTGGTTTATTAGCGATTATTGCATTGACAACTTATATCTATCTAACGTTAGTAGCATTTAATTTCATTTCCGGGGTTCTAACTTTACCAGGATTAGCGGCGTTGGTATTAGGTGTAGGTATGGCTGTAGATGCCAATATTATCATGTATGAGCGTATTAAGGATGAACTTCGAATAGGTAGAACGATAAAGCAAGCCTTTTCTAAAGCAAACAAAAGTTCATTCCTAACAATTTTTGATTCTAACTTAACAACAGTTATCGCCGCAGCAGTATTATTCTTCTTCGGTGAAAGTTCAGTTAAAGGTTTCGCTACAATGTTATTATTAGGTATTCTAATGATCTTTGTTACAGCCGTGTTCTTATCAAGATTCTTATTATCATTACTTGTTTCATCAAATATAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP019563|382220:391263|383226_384252_+|WP_001019178.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >NZ_CP019563|382220:391263|385967_388247_+|WP_000749791.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLLAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >NZ_CP019563|382220:391263|384274_385414_+|WP_001112042.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECCIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >NZ_CP019563|382220:391263|382220_383225_+|WP_001005767.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >NZ_CP019563|382220:391263|385432_385693_+|WP_001160682.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >NZ_CP019563|382220:391263|388449_390723_+|WP_000594985.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDFNHDALQLSDMTKAIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKQVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQIIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >NZ_CP019563|382220:391263|390744_391263_+|WP_000364542.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
460810 : 469122
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP019563|460810:469122|DBSCAN-SWA TTTGCGAATAGATCAATCGATCATTAATGAAATAAAAGATAAAACCGACATTTTAGACTTGGTAAGTGAATATGTAAAATTAGAAAAGAGAGGACGCAATTATATAGGTTTGTGTCCTTTTCATGATGAAAAGACACCTTCATTTACAGTTTCTGAAGATAAACAAATTTGCCATTGTTTTGGTTGTAAAAAAGGTGGCAATGTTTTTCAATTTACTCAAGAAATTAAAGACATATCATTTGTTGAAGCGGTTAAAGAATTAGGTGATAGAGTTAATGTTGCTGTAGATATTGAGGCAACACAATCTAACTCAAATGTTCAAATTGCTTCTGATGATTTACAAATGATTGAAATGCATGAGTTAATACAAGAATTTTATTATTACGCTTTAACAAAGACAGTCGAAGGCGAACAAGCATTAACGTACTTACAAGAACGTGGTTTTACAGATGCGCTTATTAAAGAGCGAGGCATTGGCTTTGCACCCGATAGCTCACATTTTTGTCATGATTTTCTTCAAAAAAAGGGTTACGATATTGAATTAGCATATGAAGCCGGATTATTATCACGTAACGAAGAAAATTTCAGTTATTACGATAGATTTCGAAATCGTATTATGTTTCCTTTGAAAAATGCGCAAGGAAGAATTGTTGGATATTCAGGTCGAACATATACCGGTCAAGAACCAAAATACTTAAATAGTCCTGAAACACCTATCTTTCAAAAAAGAAAGTTGTTATACAACTTAGATAAAGCGCGTAAATCAATTAGAAAATTAGATGAAATCGTATTACTAGAAGGTTTTATGGATGTTATAAAATCTGATACTGCTGGCTTGAAAAACGTTGTTGCAACAATGGGTACACAGTTGTCAGATGAACATATTACTTTTATACGAAAGTTAACATCAAATATAACATTAATGTTTGATGGGGATTTTGCGGGTAGTGAAGCAACACTTAAAACAGGTCAAAATTTGTTACAGCAAGGGCTAAATGTATTTGTTATACAATTGCCATCAGGCATGGATCCGGATGAATACATTGGTAAGTATGGCAACGATGCATTTACTGCTTTTGTAAAAAATGACAAAAAGTCATTTGCACATTATAAAGTGAGTATATTAAAAGATGAAATTGCACATAATGACCTTTCATATGAACGTTATTTGAAAGAACTAAGTCATGATATTTCGCTTATGAAATCATCGATTTTGCAACAAAAGGCTTTAAATGATGTTGCACCATTTTTCAATGTTAGTCCTGAGCAATTAGCTAACGAAATACAATTCAATCAAGCACCAGCCAATTATTATCCAGAAGATGAGTATGGCGGTTACATTGAACCTGAGCCAATTGGTATGGCACAATTTGACAATTTGAGCCGTCAAGAAAAAGCGGAGCGAGCATTTTTAAAACATTTAATGAGAGATAAAGATACATTTTTAAATTATTATGAAAGTGTTGATAAGGATAACTTCACAAATCAGCATTTTAAATATGTATTCGAAGTCTTACATGATTTTTATGCGGAAAATGATCAATATAATATCAGTGATGCTGTGCAGTATGTTAATTCAAATGAGTTGAGAGAAACACTAATTAGCTTAGAACAATATAATTTGAATGACGAACCATATGAAAATGAAATTGATGATTATGTCAATGTTATTAATGAAAAAGGACAAGAAACAATTGAGTCATTGAATCATAAATTAAGGGAAGCTACAAGGATTGGCGATGTAGAATTACAAAAATACTATTTACAGCAAATTGTTGCTAAGAATAAAGAACGCATGTAGCATGTGATTTTAAAGAATAATACGAATAATGATTATGTCAAAATGTATAAGGGTAAATGATAGTTACCGCATTTAAACAACACTATTGAAAAATAAATATTGGGATTAGTTCCAATTTGTAAAATAAAATTAAAAATATGGATGAATTAATTAAGAATTTAGTTTAAAATAGCAATATTGAATAAATTTCGAATGTTCATATTTAAAATCGGGAGGCCGTTTCATGTCTGATAACACAGTTAAAATTAAAAAACAAACAATTGATCCGACATTAACATTAGAAGATGTTAAGAAGCAATTAATTGAAAAAGGTAAAAAAGAGGGTCATTTAAGTCATGAAGAAATTGCTGAAAAACTTCAGAATTTTGATATCGACTCTGATCAAATGGATGATTTCTTTGATCAATTAAATGATAATGATATTTCACTAGTTAATGAAAAAGATAGTTCAGATACTGACGAGAAACTGAATCCAAGTGATCTTAGTGCCCCTCCAGGTGTTAAAATAAATGACCCAGTTCGTATGTACCTTAAAGAAATTGGGCGTGTTAACTTATTAAGTGCACAAGAAGAAATCGAATTAGCCAAACGTATTGAACAAGGTGATGAAGTAGCAAAATCAAGACTTGCAGAAGCGAACTTACGTTTAGTTGTAAGTATTGCTAAAAGATACGTAGGTCGTGGTATGTTATTCCTTGATTTAATCCAAGAAGGTAATATGGGTCTTATTAAAGCTGTTGAAAAATTTGACTTTAACAAAGGATTTAAGTTTTCAACATATGCAACATGGTGGATTAGACAAGCAATCACTCGTGCAATTGCTGACCAAGCACGTACGATTCGTATCCCTGTGCATATGGTAGAAACAATTAATAAATTAATTCGTGTTCAACGTCAATTATTACAGGACTTAGGTCGAGATCCAGCACCAGAAGAAATTGGTGAAGAAATGGATTTACCAGCAGAAAAAGTTCGTGAAATTTTAAAAATTGCGCAAGAACCTGTTTCATTAGAAACACCAATTGGTGAAGAAGATGATAGTCATTTAGGAGACTTTATTGAGGATCAGGAAGCACAAAGTCCTTCAGATCATGCTGCTTATGAATTATTAAAAGAGCAATTAGAAGATGTGCTTGATACATTAACTGATAGAGAAGAAAATGTATTACGATTAAGATTTGGTCTTGATGACGGCAGAACAAGAACACTTGAAGAAGTTGGTAAAGTTTTCGGTGTTACACGTGAACGTATTCGACAAATTGAAGCAAAAGCACTTAGAAAATTAAGACATCCAAGTCGTAGTAAACGTTTGAAAGACTTTATGGATTAATTTATATCAATTTTAATGATTGATACCAAGACATGAATAAGCGCTTATTTATTTTTAGATTAAGATTTAACTTGAGTGAGGTTGGTACATTGAATAATGTTCAACCTCTTTTTTCATAAAGGAGAATAAAATGATTTCGTTAAATAACCGATTAACGACGGTAAGTCGATTTTTAAAACAAGGTACAATCGCGGATATTGGCTCAGATCATGCTTATTTGCCAATCTATGCAATTCAAAACCATTTATGCGATTACGGTATTGCAGGAGAAGTTATTCAAGGCCCTTTTCAAGCTGCTGTGAAAAATGTAGCTGCAAACCAATTAGTAGATAGAATTGATGTACGTTTAGGGGATGGCTTAAGTGTTATTCAACCTGAGGACGTAATCGATAATATCACAATTTGTGGTATGGGCGGACCACTTATTGCTAAAATTTTAAAAGATGGGCAAGATAAGTTAAGTCAACATCCAAGGTTGATTTTACAAAGTAATATACAAACTGAAAATTTAAGACAAACATTACAACAATTGAATTATGAAATAATTGATGAAATAATAATGGAAGAAAAAGGCCATATTTATGAAATTGTTGTAGCAGAATATTCTACACAATTAATAGAGCTATCATCTGATGAATTGAAATTCGGACCAAAATTGCTGAACAACAAAAATGAATATTTTATAAAAAAATGGCAAAGAGAGTTAGAAGCACTTTATCATATTAAATCGAAACTCAATACTGAACAACATCATCAACGTTTAGCTCAAATTAATGACGAAATTGCTGTAATTGAAAGGGTGTTATAGTAATGAAAATAGCTGATTTAATGACATTGTTAGATCATCATGTGCCATTTAGTACTGCTGAATCTTGGGATAATGTAGGATTGTTAATAGGTGATGAAGATGTTGAAGTTACTGGTGTTTTAACAGCATTAGACTGTACGTTGGAAGTAGTAAATGAAGCAATCGAAAAAGGTTATAATACTATTATTAGTCATCATCCTCTAATCTTTAAAGGCGTAACATCATTAAAAGCTAATGGTTATGGTTTGATCATTAGAAAACTAATTCAACATGACATTAATTTAATAGCGATGCATACAAATTTAGATGTAAACCCGCATGGTGTCAATATGATGTTGGCGAAAACGATGGGTTTGAAGAACATTTCAATAATAAATAATCAACAAGATGTATACTATAAAGTTCAAACATATATACCTAAGGATAATGTTGAACCATTTAAAGATAAGCTTAGTGAAAATGGATTAGCACAAGAAGGTAATTATGAATATTGTTTCTTTGAAAGTGAAGGAAGAGGGCAATTCAAACCAGTTGGTGAAGCTAATCCAACAATAGGACAAATTGATAAAATTGAATATGTAGATGAAGTTAAAATTGAATTTATGATAGATGCATATCAAAAGTCAAGGGCTGAGCAATTAATTAAACAATACCATCCATATGAAACACCGGTATTTGATTTTATTGAGATAAAACAAACATCCCTTTATGGACTTGGCGTTATGGCAGAAGTGGATAATCAAATGACATTGGAAGATTTCGCAGCCGATATTAAATCTAAATTAAATATCCCAAGTGTCCGTTTTGTTGGTGAGTCTAATCAGAAAATTAAACGTATTGCAATTATTGGTGGTTCAGGTATTGGATATGAATATCAAGCTGTCCAACAAGGCGCAGATGTCTTTGTTACAGGTGATATTAAACATCATGATGCCTTAGATGCTAAAATTCATGGTGTGAACTTAATTGATATTAATCATTACAGCGAATATGTGATGAAAGAAGGTTTAAAAACGTTACTAATGAATTGGTTCAATACAGAAAAAATAAATATAGATGTTGAAGCATCTACAATTAATACAGATCCATTTCAATATATTTAAACTAAAATCTCGGGATTTCTAAATTTTGAAATTTCGAGGTTTTAATATTTTTATTTAAAATAGCACATTTATACTTTATAATAGTAAAGATGAACATATAAGGAGGCCAAATCATGGCAAAACATCCATTCGAACAATTTAATCTAGAATCTAGTTTAATTGACGCTGTGAAAGACCTTAATTTTGAAAAACCAACTGAAATTCAGAATCGAATTATTCCAAGAATACTAAAGAGAACAAATTTAATTGGTCAATCTCAAACGGGTACAGGGAAATCTCATGCATTTTTATTACCATTAATGCAGTTAATTGATAGTGAAATAAAAGAACCACAAGCAATCGTAGTTGCACCAACAAGAGAACTTGCACAACAACTATACGATGCAGCGAACCATTTAAGCCAATTTAAAGCTGGTGTTTCAGTTAAAGTTTTTATTGGTGGTACAGATATAGAGAAAGATAGACAACGTTGTAATGCACAACCACAATTGATTATAGGCACCCCTACTAGAATTAATGACTTAGCTAAAACGGGACATTTACATGTGCACTTAGCATCATATTTAGTTATTGATGAAGCGGATCTTATGATTGACTTAGGATTAATTGAAGATGTAGATTACATTGCTGCAAGATTGGAAGATAATGCAAATATTGCGGTGTTTAGTGCTACAATTCCACAACAGTTACAACCATTTTTAAATAAATATTTAAGTCATCCAGAATATGTAGCTGTCGACAGTAAAAAACAAAATAAAAAGAACATCGAATTCTTTTTAATACCTAATAAAGGTGCAGCTAAAGTTGAAAAAACTTTAAATTTAATTGATATACTAAATCCATACTTATGTATTATTTTCTGTAATAGTAGAGATAATGCAAATGATTTAGCACGTTCACTAAATGAAGCTGGTATTAAAGTTGGTATGATTCATGGTGGTTTAACGCCACGTGAACGTAAACAACAAATGAAACGTATACGTAATTTAGAATTCCAATACGTTATTGCCAGCGATTTAGCATCTCGTGGTATTGATATTGAAGGTGTTAGTCATGTCATCAATTTTGATGTGCCAAATGATATTGACTTCTTTACGCATAGAGTTGGACGAACTGGTCGTGGGAATTATAAAGGTGTAGCAATTACGCTTTATAGTCCTGATGAAGAACACAATATTTCATTAATAGAAGATCGCGGTTTTGTATTCAATACTGTTGATATTAAAGATGGTGAGTTAAAAGAAGTTAAAGCGCACAATCAGCGTCAAGCAAGAATGCGCAAAGATGACCATTTAACTAATCAAGTGAAGAACAAAGTTCGAAGTAAAATTAAAAACAAAGTTAAACCAGGTTATAAGAAGAAATTTAAACAAGAAGTTGAAAAAATGAAACGTCAAGAGCGTAAACAATTTAGTAAGCAGCAAAATAGACAAAAACGTAAGCAAAACAAAAAAGGTTAGGTGTGTTTTATGTTATTAGGATCACATGTTTCAATGAGTGGTAAAAAGATGTTAGAAGGTTCTGCTATAGAAGCGCATGAATATGGTGAAACAACATTTATGATTTATACTGGTGCACCTCAAAACACGCGCCGTAAAAGTATTGAAGATTTAAATATAACTAAAGGTCATGAAGTGATGGAAAAATATGGCTTATCTAATATTGTTGTTCATGCACCATACATCATTAATATTGCAAATACAACCAAACCAGAAACGTTTAATCTTGGTGTAGATTTCTTGCAACAAGAAATTGAAAGAACGCAAGCTATAGGGGCTAAAGATATTGTATTACATCCAGGTGCGCATGTTGGAGCTGGTGTTGATGCCGGAATTAATAAGATTATTGAAGGATTAAATGAAGTTTTAACGAATGACAATAATGTACGTATTGCGCTTGAAACGATGGCAGGTAAAGGTACAGAGATTGGTCGCTCATTTGAAGAGTTAGCACGTATTATTGATGGAGTTCATAATAACGAACGTTTATCAGTATGTTTTGATACATGTCATACGCATGATGCTGGATATAATGTGAAAGAGGACTTTGATGGCGTATTAAATGAATTTGATAAAATCATTGGAGTCGACAGAATCAAAGTTGTTCATGTCAATGATTCTAAAAATGACCGTGGCGCTCAAAAAGACCGACATGAAAATATTGGCTTCGGTTACATTGGTTTTGATGCATTAAATTACATTGTGCATCATGATAGTTTTAAAGATATTCCGAAAATCTTAGAAACACCTTATGTTGGTGAAGATAAGAAAAATAAAAAACCGCCATATAAACTTGAAATTGAAATGTTAAAACAACAGCAATTTGACCCAGAATTAAAAAATAAGGTTATGCAACAATAAAATGATAATGCTCTCTTCAAGAAATGCGATAAATAAAACTTGAAGGGGGCATATCTCTTTATTTTGTCTAATTTTGAGTCGTAAACATTACTGTTTACATATGTTACTAGGAGTTGTATAGTTGAATGCGAGGTGAGAATACGATGACACCAGTCTTTGAATTGAAAAATGTCAATTACTACTATGATCATAAAAAAGTATTAGAAAATATAAACATTAAAATAAATAAAGGTGAATTTTTAGCGATTGTTGGACCAAATGGTGCTGGTAAATCAACATTATTGAAGTTGATTCTAGGGTTATTACCTTTACAAAGTGGTGAGATTTTTGTTGAAGGTATTGATTTTAAAAATAAGAAAACATCAATTAAATTAAGCTATGTATCACAAAAAGCAAATGCCTTTAATTCAGGTTTCCCAGCAAGTGTTAAAGAAGTTGTTTTAAGCGGATTAACAAAGACAAAACGTCTTTTCCAAACATTTAATAGCAAAGATAATGAAAAAGTGATTAAAGTACTAGAAAGACTGAATATAAGTGATTTAATTCATAAAAATATAGCAGAATTATCAGGTGGTCAACAACAACGTGTAATGATTGCTCGAGCATTGATTTCAGAACCTGCAGTATTAGTACTTGATGAACCAACGAATGGTATTGATGCAAAACATGTAAGTGAATTTTATAATACTTTAGATCAATTAAAACAAGAAGGTATCACCATTATCTTAGTTACTCATGATATCGGTGTTGTAGCAGATACTGCTACTGAAGTAGCATGTTTAAATAAGCATTTGCATTTCCATGGTACAACTGATGAGTTTAAATCACTTGATGAAGTTGAAATTTCAAAAATTTATGGACATCCTGTACGTTTTGTCGATCATCAGCATAATCGAGAATGTTGTAATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP019563|460810:469122|468336_469122_+|WP_001213908.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >NZ_CP019563|460810:469122|467320_468211_+|WP_000924214.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >NZ_CP019563|460810:469122|462833_463940_+|WP_001283055.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >NZ_CP019563|460810:469122|460810_462610_+|WP_001217261.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQNLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKALNDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYNLNDEPYENEIDDYVNVINEKGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >NZ_CP019563|460810:469122|464070_464748_+|WP_000624572.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDYGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIQPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL >NZ_CP019563|460810:469122|465964_467311_+|WP_001062174.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPNKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >NZ_CP019563|460810:469122|464750_465851_+|WP_000683928.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFSTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKTMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVEPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDAYQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI |
7 | Caulobacter_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
746382 : 752765
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP019563|746382:752765|DBSCAN-SWA TTTACTTCTCCTTACTTACAAATGGTACTATATGAGAACCAGTTTTGGAATAATGTATTTTACCATATGCAGTATTAATATATTTTCCACATGCATAAGCTTTTCCTATAGTTTTTTCGAAATTAATTATTTCCTTACGATTAAATCCAAATTTATCTACTAATATTTTGCCAGTCATTGAATATTTCTTTAATAAATCATTTAATTCTTCTATAGAGAGTATTGTATAGCAAGGAAACCTCTCATCATTCTGCAATGCATAAATTTTATTTTTTAAATATAATTTATGACCTAAAAAATATCTATTCTGTTTTTCAGGATTTATTTCTATTTTTATTTTACCACTTTCAATCATTTCTTTAACTTTAAATATTTTTCCGTTGAGTGAATGTCATAATTTAGATGTTTTACTATCTATTTTGCCAACGTATTTATATTAGCTATTCTCCATCAAGTACTTTTAGATACTTTATTTTCAATAAAAAAGTATAATAAAATAGCATCTCTCTTTATCTGTGTAGAAAGGATGCTTTAATACCATGCATATATATATTCATTCGGAAATTTATTTTCATCAATAAAATTTAATATTGCATGAAATGATTTATCTCTATAAACTAAAATACATTTTTCATTTTCAACTTTTGATAATTTATAGTCAATTACCTTTGAATCTAATTTATTTACTGTTATTTCGCCTTTCCCTTTTTCTATTTTATCTTGTGGAATATATTCATATACTATAACTTGATTATCTTCTTTTAACTTCCTCATAATAATCAATCAAATCACCCTATTTCTCAATATAATTAGAAAAATTGTATTTTCTTTCTACAATCCCATGTGCTTCTCTATAGTAATAATTATATTTATTCATCAAATAATGTTCAAGTGCCTCTTGACGAAGTAGTATTAAATCTTGTTTTTTATTGTTTTTCCTTCTCTTAAACATTGCCAACTTACTGCAATATTATAATCTGGATAGAAATTATTAATACAGTTATCTAATCATATTTATTCTCAAACAAATGTTCATAAGCTCTTTTAACTAGGTTTTAATTCAAATTGGTATTTTTAGAAATTATATCTACTTCTATATCCTTATTCCTTTGACGTACTGATTTATAATACATTTTTTCTTTTTTAAATTATATAATCATGTCTTAACTCAATCTTCGATTGGAGGTTATTTAATTGAGACATGACATTTATGAAGGAGTGCTATTTTACATTACGAAAGGTATTAAACCAAATTATGCTGAGCTTGGTCTACAATATAATTGTGATCCAAGAACAGTTAAAAAATATTATGAAGCAGGAAAAGAAAATGAATTAGAACGATTGAAGAAAAGACAACAAAATAAGTAAACATCAAAACTAGATCCATTTTAAAGAAATATTGATTAAAAAATTGAATTAGGATGTACAGCTATGGCCATTTTTAAATATATAGAGAAAAAGGGATATGAAGGTAAATATACTATTCTACGAGAATACTGTAAAAATAAAATACAAAATGAGACTAAAAAAATAACATTTTTTTGAAGATAATATAAATATTTGTTTCTTAGATAACCGTGTTGTTGGTAAAACACACCTAACAATCTCATTAGGAATTGAGGCATGTAAACAAAATATAAAGACTAGTTTCTATACTTTCAAAGAATTAATAGACTTATTAACTGTCACAGATTCCAAAGAAATCATTAATAAAACATTAAAACAATTAAGCAGAATAGAGTTACTTATCATTGATGAAATTTGTTATTCTGCCATCACCAAAGAACAAGCTGATTTATTCTACCAGTTAATGTCACTAAAATATGAAATGAAATCAACAATAATTACGACTAATATTACATTTTCGAGTTGGGGAGAGTCATTTAGTAATAAGATTGTATCAGCAGCTATAATTGATCGGTTAGTTCACCATTCAAAAGTATTTAAAATTACTGAGAATCATATCGATTAAAAGATTATAAAACCGAAAAATCATTAAATATACGACAATCTTAAGCTGCTAAAAAACTACATTTTCAAACCGCTATTGACATTAAGATTATACAAAAGGCAAATATTAAAGCTAAAATTCCGATTAGATAATTAATAAAGATTATTATTCTAGTTTTAGTTAAGTTTGTCATTTTCATCACCTCGTAATATAATACGAGGGAGGGGATATCCCCCTCTATAAAAAACATTTTTATTATTGTGGCAAGTGTTGCAAAGCCTAAAGTGTAGTTCCGGAAGATTTCGCTTTTGGCTTTTGCGATATTTGCCATTTTTTCTTCTCTTTCTAATCTGTCCTGTATCCAACACGTTTTTGTATAACTTTTTTCGGTTTTTTACATAAAAAATAACCGCATCAATAAAGATACAGTTATTACTTATTTATATTCAGAACAATATGTTTAACCTTTTTACTTAGCTAGTCAAAAGTTCTTTCTCAGTTTTCTTAAGTCTTTCTTTTTTATCTAAACCAAGATGTAATACAAATTTATATGTTTTTTCAATAAAATTATTAACTTCTTTTAATGAGTCAAACATTTTATATTCAATATTCTCAAAGTAGAAATTATTAACAAACTTTTTCTTATAATTTTTTAATGATTGATTAGTTTGTTCGAATTCACATTTAAGCCCATCCAAAAACATATTAATAAGTTCTAAATTGCCTATTTCATCATCAAATGATAAAATTTTTCTTCTTTGGGTTATAAATTTAATTTCATTCTTATGATAACTTCCCCCTATAATTTCAAATGCCACACCTACAGCTAAATTACAATGGAGATAAATATCTGGATAATAACTTAAAATCGAATAATTCACTTTGAACATAACAAATCACTCCTTGTATAGTGGTGAAGCAAGTATTATTATTAAATTGTAGGAGGGAAAGTCCCTCCTGACTCATTAAAGCTCGAATGTCCATTCAATCTTTATAAAGTAGAGATTTATTAAGATTAACAATTTGGTACATTTGAGCTTTTTTATTTCCTTCACTCGCACCTACTTAAACTTATATGTTCATTATACAAATATAAATAGCTATAATAATTTAATGGAAATGCCCCCTTCGAAGTAGACATTGAAAAAATGAAAACTTTGAAGGGAGCATTTCAAGGCGATCCATTCCAATCTATTTTATCATTTAAAACTTAACTCTTATTTTCCCTTATTCGATGCTAATTTCGTGCAATAAATTCTAAATGAAACGACATACTCCTTTTTCACAAATTGGAATCTACTATTTTTGTATTTTAATTATTATAATATCCATTTACCATATGATTTTTATTAATAGTTAAATCAAATAAACATAGCTTGATTAATTTATACAGTAGTTATATTACAAAACTTTATTGGCATATTCATATAATTTTTCTGTTGTATTCAGGGTTAGATTATCTACTTCGCGTTTGCCCTGTCTTAATTGTGAAAGTACATATTGAGAAACTCCAGTTTTTTTAGAAATTTCATATCCTGTTAAATTACTTTCAATTAATTCAATTATCTTTTTCTTGTATTCTGACATTTTTTCATCTCCATATCTGTACAATTTTTACTGCTTTTTTCGAAATTCTGTGAACTCAATGTATTTTTTATTTATAAATGATTTTATTATTTTTCTATTTATTAATGGCTATCAACACTTCATAATAGTTAAATTTTATATTTTCAATTTTTGTTTCTACATATTAACGACTTTTCATCATCAATTACTTTGTCAAAGATAAACGATTTGTCTTGTATACCTTACGCCTTTTACTAAACTTCAATGTTTAGTATTCATTGAAGTTTACAACCACTTCTAAAGTTTAACCTTTTATGTATTTTTATTAGATTAGTGTCTTTCAATATTCAAACTACTAATTACAGTAGTCTATTAAATTTGAGATATTGAGATATCTTTAGACTTTAATTTTTCCGGAGTCATATAGACTTCTCAAATACTATACATTTATTTCATAATTTTGAACCCTAATATTACTAGAATAATTATAAACGTCCCTATTAAAAATTCTATTTTCTCTTTTTTATTTGTTTTTCGCACTTTAATAGTCATCTTCATTTTACTAATGGTAAGAAAGTAATATTTTATTCAAAGAATATGACTTCGTATTAAATCAAACCTCACATTCTTATTAGTTTGCAAATTCAATAGTCCTATCAGAATTGAAATCAAAACATTCAAACTATTTTATCGTTTTTACTTCCTCGACCATTTTCACCTCCTTATAATCTATATAAATTATGTTTACCACACGATTCTTTACATTCGATGAATTAATTTTGTTAAGAAACATTTAGCCATGTAACTTTGTAATAAAAACATTTTCAAATAAATGTACCAAAAACTTCCATGAAATAAAGTATACTTTTCATATCTATTAATTTTAGAATCATAAAACCAAATGCTATATTATAATATAATTATCACAAATCAACATATATGCCAATTACACAATTTAATATTAAAAATTGTCAATGATAAATAATTCGCACAAACATTATTACAAAATATGTATAGTATAGAATACTGCATTAAAGTTAACTTATTTACTGTGTTCAGCCTTTTATATCATCACTTAAAGATCATTTAAATTTTTATGGAAATGATAATATAATAATGCATACTTTTGATTGTTTAAACATGTACAATTTTAAAAACCTAGAGATAATTTTATTGAGGTGGACAAAACGTGGACAGACAACCATGAAATCATTAGAAATTTAATTTCTTGTCCACCTAACCTAACAAAATATTTTTGTTAACATTCTGTTTTATTTTCTAATGTTCTTTGATATTCATATAACTTGATTATCGTTTTAAATTTAGCTTCTTTTATTTTGGTTTTACCTACCTTTAAATCAGTAACTGTTTGACGTGGTACACCTGAGTTTTTTGAAATACTATATGGTGTATTGTTAGTTAATAACTTTTCTATTTCACTTATAATAGTTTCAATCTCATTCATTTTTAATCACACTCTTTTTCTATTTATAATTATAATAATCCTAATGCAGTAACTACGTTTAGCAATACATTGTTTCTTTGTAGTTGCCAAACTAGTTAATTCATAAACTAATACCTAATAGTATTGGCGTTTTTTATTATATATTGATAAAATTTCTTGTCTTCATATATTCTATATTATTTGATAATTTTTTATTTATATTCACATTAAGCTATCCATATTTAATATACTTTAAAATTAGATGATTTAAAAGGCTCACTCCATGATATTTCAAAAGATATGGTCTTATTTTAATCTTCAATCATTATTTCTGATTGTTTTTGGTAATTATAGAGTTTTTCCGCTGTTTCTAAAGTTAAATTATTCACTTTTCTTTTCCCGCTTCTTAATTCACTTATACCACCATAAGAAACACCAGTGTCTTGATTAATTCTATAATTAGATATTGTTTTATCATTTAGTAATTTTTCTATTGTATTATAAATTTCTTTAAACTGGTTCATTATTTTTGTCAAAATGAAAGAAAAGTTTATTTTTTTCTAGTTAAATTAATAATAAATAATATTAAAGTTGCAATGTTAAGATAGAGAGTTAATTTTTTCCTTAATTCTCTTGTCATAAATACCACCTCCCTATTTAATGTGGTAAAGGTCTTTTGTTCTTTACCTTTTTAAAAGAACGATTTGATAAAATTAAGTACTTGAATTATTTTGCTCGTCACAGCTATTAGAAATTTAATTTTGCTATTCATTCTTTTTCTTTAACCATTCTTATCATTTTTTCTCCTTTCCTCTTTATAGTTATTTAACATTCCACAAATTGTTGTAAGTGATATGTTTGAATTCCCATATCCAATGACAAGATTTATAATTTGCAATTCTAAATTATAATAACCTATATTTTTCAAAATCACTTTGTTTTATGATTAACATCCATCTAAGAGCACCTAAAGGTTTTTATGTAATGTAATAAACATTTCCATTTATACATATACATCTTGTAAAAAAGAAAGAACTCCATATATACTCAAAAGGTATACTGAAGTTCTATATATTATATAAAATTATTATACTATTTCGAAAAACATAAGTAAATCACTAAACATGATTTCTTTCACTTTTAGAAAACTTTTAATACTATAGTAACATCCACTCAGTCACTAGATTGGGCAGTTATTATACGCCTATTGAACTCAATGCTTATATTATAATACCTTTTTCGCATATTCATATAAGATTTTTGAATTCTTTAAGCTTAAATTTTCTATTCTTCTTTCTCCACGGCGCATAGCATTAATATTACCGTAACTTATCCCAGTATCTTTATTAATTTGATAACTCGATATCTCTTTGTTTTCTATCAACTTTTTGATTGTATTGAATATTTCATCATAGCAATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP019563|746382:752765|746382_746736_-|WP_000572946.1|DBSCAN-SWA MIESGKIKIEINPEKQNRYFLGHKLYLKNKIYALQNDERFPCYTILSIEELNDLLKKYSMTGKILVDKFGFNRKEIINFEKTIGKAYACGKYINTAYGKIHYSKTGSHIVPFVSKEK >NZ_CP019563|746382:752765|752567_752765_-|WP_001814546.1|DBSCAN-SWA MNCYDEIFNTIKKLIENKEISSYQINKDTGISYGNINAMRRGERRIENLSLKNSKILYEYAKKVL >NZ_CP019563|746382:752765|749733_749919_-|WP_000006110.1|DBSCAN-SWA MSEYKKKIIELIESNLTGYEISKKTGVSQYVLSQLRQGKREVDNLTLNTTEKLYEYANKVL >NZ_CP019563|746382:752765|751156_751363_-|WP_001002340.1|DBSCAN-SWA MNEIETIISEIEKLLTNNTPYSISKNSGVPRQTVTDLKVGKTKIKEAKFKTIIKLYEYQRTLENKTEC >NZ_CP019563|746382:752765|750345_750456_-|WP_001788716.1|DBSCAN-SWA MKMTIKVRKTNKKEKIEFLIGTFIIILVILGFKIMK >NZ_CP019563|746382:752765|748805_749222_-|WP_000477482.1|DBSCAN-SWA MFKVNYSILSYYPDIYLHCNLAVGVAFEIIGGSYHKNEIKFITQRRKILSFDDEIGNLELINMFLDGLKCEFEQTNQSLKNYKKKFVNNFYFENIEYKMFDSLKEVNNFIEKTYKFVLHLGLDKKERLKKTEKELLTS >NZ_CP019563|746382:752765|747575_747749_+|WP_001215405.1|DBSCAN-SWA MRHDIYEGVLFYITKGIKPNYAELGLQYNCDPRTVKKYYEAGKENELERLKKRQQNK >NZ_CP019563|746382:752765|751653_751878_-|WP_077156057.1|DBSCAN-SWA MTKIMNQFKEIYNTIEKLLNDKTISNYRINQDTGVSYGGISELRSGKRKVNNLTLETAEKLYNYQKQSEIMIED >NZ_CP019563|746382:752765|746912_747164_-|WP_000585093.1|DBSCAN-SWA MIIMRKLKEDNQVIVYEYIPQDKIEKGKGEITVNKLDSKVIDYKLSKVENEKCILVYRDKSFHAILNFIDENKFPNEYIYAWY |
9 | Staphylococcus_phage(83.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1010355 : 1018828
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP019563|1010355:1018828|DBSCAN-SWA CTTATTTTACAATTTTAGCAATAACACTTGGATATAATTCATATTCCAATTTTTTTACTTTCTCTTCTAATTGTTCTTTTGAATCGTCCGGTCTAATATCACATTTTCTCTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATACCACTATCAACATAATGTACTGTCGAACCAGTAATAGTATCGCCACTATGATATGCTTGGCCTATTGCGTCAATCCCCTTATATTTCGGCAATAGAGATGGATGTATATTCAATATTTTACCTTCAAATGATGCTAATAAGTCTGGACCTATTAGACGCATGTAGCCAGCTAAAATAATCCACTCTACCTTATCTTTATTTAATAGTGTTACTAAATGTTGTTCATACGCTGCTTTTGAATCAAATTGTTTTGGTTCATTAATATAAACAGGAATACCGTGCTTTTTTGCTCTATTTATACAAAACGCATTTTGATGATCCGTATATAGCGCCGTAACTTCAATATTTTCAAGTTTTCCTGATTCAATATGCTCAACTATATTTTCAAAGTTACTTCCTGAACCTGATGCAAAAATCGCAATTTTAACCATTGTTATACCCCCAACAATTCAATTGCAGTTGACTCATTTTTCACAATATGACCAATTTGATAAGCTTCCACATTTTGTTCTGCTAAAATCTTCAAAGCGCGTGATGCATCTTTTTCATCAACGATAACCGTATAGCCAATACCCATGTTAAAAATGTTATACATTTCATTTGTGTCTATATTGCCTTGTTGTTGTAACCAATCAAATATTTTTGGCGTTGGAAATGATGTAGTATCAATTCTAGCAGCATATCCGGCTGACAATGCACGTGGAATATTTTCATAAAAGCCTCCACCAGTAATATGATTCATTGCCTTAATAGAAACTTCTTTTTTTAAAGCAAGTACAGGTTTGACATATAATTTAGTTGGTTCTAAAAAGACATCTATAAATGGACGATTATCGAAGTTTGATGCCAAATCAATGCCTGATTCATTAATTAATTTGCGCACTAAACTATATCCATTTGAATGAATGCCACTTGACGCAAGCCCTATAACAACTTGTCCCTCTTTCACTTCTGAACCATCTACATAGTCATCCTTTTCAACTGCTCCAACTGCAAATCCGGCTACATCATATTCACCTTCGTGATACATTTCACCCATTTCAGCAGTCTCTCCACCGATAAGTGCAGTATTCGTTTCAACGCATGCATCACTAATACCTTTAACAATTTGTTCAATAACTTCAGGAACAACTTTGTTTGTAGCGATGTAATCTAAAAAATACAATGGTTCTGCACCTGTCGTTAAAATATCATTAACACACATTGCGACTGCATCGATACCTATCGAATCATGTTTCCCATAGTCGATAGCTAGTTTTAATTTCGTACCTACTCCGTCTGTTCCAGAAACTAAAACTGGTGCTGTCATATTTAATTGTGATAAATCAAATGTAGCACCGAATCCACCTAAACCACCGATAACTTCTTTACGCATCGTACGTTTAACATGACTAGACATTCTTTCTACAGCTTCATAACCAGCATGAATATTTACACCAGATTGTTCATATGCTTTAGACATTTAAATTTCCCTCGCTATCAAAAAAGTGTTTGTTTTTAGAAATATATTGCTTTTGTCGATGACTTAAATGCGCTTTATAATTTGCTTCATAATCATATAACCCTGCAGGATAATCTCCAGTGAAACTTTCTACACATAAGCCACTATATGGCGCGTCATAATCTAAACCAATTGATTCAATTAACCCATCTACAGATAGATATGCTAATGAATCAGCGCCAATATAATCTTTAATTTCTTCAGGTGATTTGCTTGCAGAAATTAATTCTGCCGTAGTTGAAACATCGATTCCATAAAAACTTGGGAACATAAATTCCGGTGATGCTATACGCACATGTACTTTATTTGCACCAGAATCTTTTAACATTTTCACAATGCGTCGAATTGTCGTACCGCGAACAATGGAATCATCAACAAGAATGATATTTTTCCCATCTACTATATCTTTTACCGCAGATAACTTCACTCTCACACCTTGCTCACGTAATTCTTGAGTTGGTTGAATAAATGTTCTTGCAACATATTGATTTTTAACTAGTCCCATTTCATATGGCAAACCTATTTCTTCAGCATAACCACTCGCAGCTGATAGCGATGAATTGGGTACACCGATGACCATATCAGCATTTACAGGGCTTTCTTGGGCTAATTTTTTACCAGAAGCTTTACGTACTGCATGGACATTTTTACCAGCTATTGTTGAGTCTGGTCTAGCAAAATAAATATATTCCATCGCAGAAATTGCAGTTGTCGTATGATGTGTATAAGATTTAACTGTAATACCTTTATCGTTAATCACGACATATTCACCTGCATGAATATCTTGAACAAATTCTGCACCTAACACATCTATTGCACATGTTTCACTTGCAAGGATGTATGTACCATCTTTCATTTTACCTACAACAAGTGGTCTGATAGCATTTGGATCTACTGCGCCATATAACGCATCTTTAGTTAATATCGCAAATGTAAAACCGCCTTTAACTTTTCGCAAACTTTCTTTTAACGCTTCCTCAAAAGTAGGAGCTTTACTTCGACGTATCAAATGCATAATGACTTCAGTATCAGAAGACGAATGGAAGATAGCACCTTGTTTTTCTAAATTCTGACGCAATGATTTAGCATTAATGAGGTTACCATTATGACAAATACCTACACTCATATCATAAAAGTGATACAGAAACGGTTGAATATTTTCAATACCTTTATTACCTGAAGTAGCATAACGGACGTGACCAATTGCATGTTGATATCCTTTTAATCGTTCCATTTGATCATCTTTAATCGCTTCAGTTAGTAAGCCTAATCCTCGCTCGCCTTTTAATTCATTTTGATCAGAAACAACTATACCTGCACCTTCTTGACCACGATGTTGCAAACTATGAAGTCCCATATATGTTAGTTGCGCTGCTTCAGGATGATTCCAAATACCAAACACGCCACATTCTTCGTTTAATCCTGAGTAGTTAAACATTGAGCAATTGCCCCTTCCCATATTTGTTTAATATCTGAAACATTTTCACTAATCTCTGTATATGGTGTTGTTACTTTGAAATTATCACTATCTGTTAAAAGTCCAATTTCTATTGCATTATCAATATTTAAAGTTTTACCTGATTTAACAGAAACAACATATCGGCCTTGCGTCTCACTAAACAATTGTGCATTTGTTATATCTATTGAAGACTTTAATCCTAAACCGTAATGCGCACTTAGTTTAGCTAAAGTTAACAACAAACCACCTTTGCCTACTGTTTGAACATGTGATAATAGTCCTTCACGAATAGCGGTCTTAATTGATTCACCTTTTTCAACTTCTGAACTCAAATCTAATGACTCAAATTCATGATTAACTTTGCCATAAATTAATTTTTCAAGTTGACTACCACCAAAGTCGTCCTTAGTATCACCAATTAAATATAATTTATCTCCAACTTGAGGTTCAAAATCATTTAAATAATTTACATTTTCAATCAAACCTACCATTCCAACAACTGGTGTTGGGAAAATAGAAGTACCTTTCGTTTCGTTATATAAAGATACATTACCAGAAACTACTGGTGTCTTAAGAATGTCGCATGCTTCTGCCATACCTTTCGTTGAATCTATCAACTGTTGATAGATTTCTTTCTTTTCAGGAGAACCATAATTTAAACAATCTGTCATTGCTAATGGTGTTGCACCCACGGCAATTAAATTTCGATAAGCTTCAGCTACTACCATCTTTCCACCTTCATATGGATTGTTATATACATAACGCGCTTCACCATCAATTGTTGAAGCTATTGCCTTATTTGTGCCTTCCACACGTACTACCGATGCTTGAAGTCCTGGCTTAATTATCGTATTGGCACCAACTTGTTGGTCGTATTGATCATATAAATAGTGTTTAGATGCTATAGTCGGATGCTTAAGTAATTTAAAGAAAGTATCTTTAACATCGATGTGTGTATAATCATTTTTAGAAGTATTATAATCTTTTTCTTCTCCTTCTAAAATATATACAGGTGCTTCATCAGCTAGTGGTTCAACTGGAATGTCAGCATAAACTTCGTCATCATATGTTAAAACAAAACGATTTGTATCTGTAACTTCACCTATAACAGCACTATCCAATTCGTGCTTATCAAATAAATCTAAGAATTTTTGTTCAGTACCTTTTTCAACAACTAGTAACATACGTTCTTGAGTTTCTGAAAGCATCATTTCATAAGGAGAAATACCTGGCTCACGTGTTGGCACTTGTTCTAATCTCAAATGTAACCCACTACCACCTTTTGCCGCCATTTCAGACGATGAAGATGTTAAACCAGCAGCACCCATATCTTGAATACCAACTAATTCATCAAATGTAATTGCTTCAAGTGTTGCTTCCATTAATTTTTTACCTACAAATGGATCACCGATTTGTACAGAAGGTCGTTTACTTTCGCTTTCTTCCGTCAATTCTTCAGATGCAAAAGTAGCACCATGAATACCATCTCGACCAGTTTTCAAACCAACATAAATGACCGAATTACCTACACCTTTTGCTGTGCCTTTTTGAATCATGTCGTGATTGATAACACCAACACACATTGCATTAACAAGTGGATTGCCATCATAACGTTCATCAAATTCGATTTCACCAGCAGTTGTTGGAATACCAATGCAGTTACCATAACCTCCGATACCCTTTACAACCCCTTTAAGTAATCTTTGGTTTTGTTTATTATCTAATTCTCCAAATCTAAGACTGTTTAACAAATTAATAGGTCTAGCCCCAATAGAGACAATGTCACGAATGATTCCACCAACGCCTGTAGCAGCCCCTTGATATGGTTCAATTGCTGATGGATGGTTGTGAGACTCTACTTTAAATACTACGGCTTGATTATCACCTATATCGACTACCCCTGCACCTTCACCAGGCCCCATAAGCACATGCTCACCTGACGTAGGAAATTGCTTTAAAAACGGTTTAGAATGTTTATAAGAGCAATGTTCACTCCACATAACAGAAAAGATACCTGTTTCTGTAAAGTTAGGTTGTCTGCCTAAAATATCGCAAACTTTTTCATATTCTTGATCACTTAATCCCATATCTTGATATACTTTTTCAAGTTTAATTTCTTCAACGCTTGGTTCGATAAATTTAGACATGTTGTTCCCTCCAACTTTTTACCATCGCTTCAAATAATTTCACACCACTATCAGTACCTAACAACGTTTCTAAAGCTCTTTCAGGATGTGGCATCATGCCACATACATTGCCTTTTTCGTTAACAATTCCTGCAATATCATCATATGAACCATTCGGATTATTCACATATTTCAGAATAATTTGATTGTTAGCTTTTAATTGTTGATATATTTCATCAGTACAATAATAATGACCTTCACCGTGAGCTACAGGATATATAACTTTTTCACCTTGTTCATAAAGATTTGTAAATGCCGTTTGATTATTCACTATTTCTAACTCTTCATTTCTACTAATAAATAAATGTGAATCGTTATGCAATAATGCACCAGGTAATAAGCCTATTTCAGTTAAAATTTGAAACCCATTACAAACACCTAATACTGGCTTACCTTCAGCTGCAAGACGTTTAACTTCCGAAATAATCGGCGCTACACTAGCCATTGCCCCAGATCTTAAGTAATCCCCGAATGAAAATCCACCAGGAATAAGTACGCCATCAAATCCACTTAGTGATGTTTCTCTATAATCTACATATTCCGCTTCAACACCACTTTTAATAGCAGCATTAAACATGTCTCTATCACAATTCGAACCTGGAAAAACAAGAACCGCAAATTTCATTTTATGCATTCTCCTTTTCATCATCTAACACTTTATAGCTATATTCTTCAATCACTGTATTTGCAAACAATTTTTCACTTAGAGTTGTAATAATGTTGTGTACCTTTTCATCACTAACCTCATCCACTGTCATATATAATACTTTTCCTACACGAATATCATTCACTTGTGCATAACCTAAGTCATGTACAGCTCGAGTAAGCGTTTGTCCTTGCGTATCTAATACTTGTGGTTGTAATGTGATATGTAGTTCAATTGTTTTCATTATTTTAAATCCTCCAATTTGTTTAAAAATATTTGATATGTTTCAATCAGTGATCCAGTGTTATTTCTATATACATCTTTATCAAAGTTTGCATTGGTAGCTTTATCCCAAATTCGACATGTATCTGGAGATATTTCATCCGCTAACAAAATTTGACCAGTCTCAGTCTTTCCAAATTCGATTTTAAAATCTACTAATTTTAAATTCATAGCATCCATTAATTGTTTCAACACATTATTAATCTTTAATGCTTTGGATTTTAGTATTTCAATATCTTCATCTGATGCTATATTGAGCAATTTAACATGGTCATCCGTTATCAACGGATCATTTAACGCATCATTTTTATAGAAAAATTCTACAAGTGGTTCTCTAAAAACTTCACCATTTTCAAAACCTAAACGCTTTGTAATAGATCCACTAGCAATATTACGAACAACTACTTCTAATGGAATTATTTTCACAGGCTTAACTAATTGTTCTGTTTCAGATAATTGTTTAATAAAGTGACTTTCTATTCCATTTTCTTGTAAATATTTAAATATAATAGAAGTAATTTGATTATTTAATCGCCCCTTACCTGCCATTGTGTCTTTCTTAGCCCCGTTTCCAGCAGTAACTTCATCTTTATATTCAACTCTTAATTCATTTTCTTGATTTGTTGAGAAAATGCGCTTCGCTTTTCCTTCATATAATAATGTCATGCTTTAATTACTCCCCTCAAATTTAGCGTACATATCTTGTTCAGTTTGGTTTACATCATTCGTTAGTACAGTCATATGCCCCATTTTTCTGCTATCTTTACGCTCAGACTTACCATAAATATGTAAGTGCCACTCTGGATGTTCATTAAATTCATTTTCCAATAAATCTAAATCTTTACCTAGTAAGTTCATCATGACTGCTGGCTTTAATAATTCAATTGAATTTGGTAATGATTGTCCGGTAACTGCTAAAATATGAGTATCAAATTGTGAATAATCACATGCTTCAATTGAATAATGTCCGGAATTGTGAGGCCTTGGTGCTATCTCGTTCACATACAATTGGTTGTTACTATCTATAAAAAATTCAACTGTAAATGTTCCAATGAAATGAATCGATTGGATAATTTTATTAACTTGCTCTTTCGCCTCAGCTGTTTTATCTATTCTCGCTGGAACAATTGTTTTGAAAAGTATTTGATTTCTATGCTCATTTTCTTGTAATGGGAAAAAAGTGATTTGATTGTTGTTTCCTCTTGTAACAGTAAGAGATACTTCTTTCTTGATATTCAAATATTTTTCAGCTACGCATTCACTAGTTTCAATTAATTTAAAACCTTCTTGTAAGTCTTTTTCGTTGTTAATTAAAACTTGACCTTTGCCATCGTAGCCACCAAATCTAGTTTTTACAATAAAAGGATATCCTAATGTTTCAATTGCTTTGTCAATATCTGTAGATTCTTTTACTGAAATGAACGGGACAACTTTGGTACCAGCACTTTTTAATGTTTCTTTTTCAGTTAAGCGATCTTGTAATAACTGTATAGCTTGGTAACCTTGCGGAATATTGTACTTTTCACATAATAGTTTTAATTGTTGGGCTGAAATGTTTTCAAATTCATAAGTAATCACATCACATTTTTGTCCTAATTGATTGAGTGCCTTTTCATCGTCATACTTGGCTTGTATAAATTCGTGTGCAACGTATCTACATGGACAATCTTCAGAAGGATCCAATACAACCACTTTATAACCCATTTTTTGAGCTGATTGTGCCATCATCTTTCCAAGCTGACCACCACCAATAATGCCAATAGTCGCACCAAACTTTAATTTATTGAAGTTCATTTTGCATGTCCTCCACTTTTTGAATTAACGAAGATTCATACTGATTTAGTTTTTCAACTAAAGAAGGATTTTGAATACTTAACATTCTTGCTGCAAGTATACCTGCGTTTTTAGCACCTGCTGCACCAATTGCAGTCGTTGCAACCGGAATACCTCCTGGCATTTGAACAATTGATAATAAAGAATCTATACCCTTTAAACTTTTTGTTTCAATCGGCACTCCAATAACTGGTAGCGTCGTTAATGATGCAACCATACCTGGTAAATGTGCCGCACCGCCAGCGCCTGCAATGATAATGTTTATACCTCTTTCTCTCGCTTCAGAAGCAAATTGAACCATCATTTTTGGCGTACGATGTGCGGATACTACTTGTTTTTCGTACGGAATTTCAAAATAATCCAACATGTTACAACTCTCTTGCATAATTTTCCAATCGGAAGAACTGCCCATAATGACTGCTACTTTCAC
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP019563|1010355:1018828|1010355_1010922_-|WP_000238660.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHIESGKLENIEVTALYTDHQNAFCINRAKKHGIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRKCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >NZ_CP019563|1010355:1018828|1015590_1016262_-|WP_000666799.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >NZ_CP019563|1010355:1018828|1011945_1013430_-|WP_000483713.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >NZ_CP019563|1010355:1018828|1010924_1011953_-|WP_000030817.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALSAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >NZ_CP019563|1010355:1018828|1016263_1016527_-|WP_000848350.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >NZ_CP019563|1010355:1018828|1016526_1017231_-|WP_000174053.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHVKLLNIASDEDIEILKSKALKINNVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >NZ_CP019563|1010355:1018828|1013408_1015598_-|WP_000032746.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLLTLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >NZ_CP019563|1010355:1018828|1017234_1018359_-|WP_001010412.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVVVLDPSEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITFFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >NZ_CP019563|1010355:1018828|1018345_1018828_-|WP_000861572.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGINIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1206767 : 1211334
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP019563|1206767:1211334|DBSCAN-SWA ATCAACCGAAACATGACGCTGCGGCACCTGTGGCACCACCAGAAACCCCACCAATAATAGCACCTGCAACAGTTCCTAAACCTGGTATAACTGAAGCCGCACTAGCACCGCCTAGCCCACCAGTGCCAGCGCCTCCAACTGTTCCTAGACCACATTTAACCCAGTTAGTTTTTCTCTCTTGACTAGATTTAATTACTTGAACATCAAATCCATCTTTAACCTTTTTATAAACCAAAACAACATCGTTACCTTTTTTATCTTTAGCATTAGTTGGCATCACTTTTGACGTTTTTCCATCAGATAATGTTAACTTACCATTTTTGTCAACAGTCCCTTTAATACCCTTTTCAAATGAAAGATGCAAGGTACTTTCATTTTTTTGATTCAGTTTCCCGATATTATCACTTTTTTGTTCAGCATGAGCGTTGTCATCCATTACAAGAGAAGATCCTGCTATTGATCCCATAACTACGACTGTACTTAATAATACTTTTGATAACATTTGCTGTTTCATAATAAAAACTCCTTTTAAAATTTTTACATTTTAATTTTATCAGTTCTTACTATAACGCTTTACCAAAATTTCTTAAGTGCAATAAAATCATTCCTAATTGTAAAAAATGTCGTGTGTCTAAAATTTTATAGTAAAAATATAATTATTTAACCCATATTTATATTGGTTTCTCTCTATCTCCTCAGAAAGTTGTACTTTTTTCATTTGTGATTGGAGTCGGGCGTTTTCTTCATCTCGTTGTTTGAGTTGTTTCTTTAACTCTCGTAATTCTCGAACCGTCATTTCATCTGGCGTTTTAGTTTCACCATTTGACGTTATGTGTTCTTTCGTGCGTTCTGGTTCAGGGAGAGTTGCTATTTGATAAAGAGCTTCTACTCCTAAAGTGTTCGACGTCGAACGATTTTGAAATTCGTTAAATACTTTTATAAATTTTCTTGCTTGTGAGTCGTTAAAATTCACTGATTTTAACCAATTCGACCATTCCCCATGCGCTAAGTCATTTTCTTTCACATGTTTTAATCTACGACCAATCTCGAAAATCGATTAACTATCTATCCTTTGATGATGTCGAATTTAACAATGTAATATATACATTTTACATACATAGGTTATTAAAACTCATTTCCCACTGCAACACAAGGCGTTTCTCAGCGTATAATTTATATATATTTATCTGTAAAATCATGTTTTTTTACATCTTTTATTTTCAAGGTTTTTATTTCATCTGGGTATTCAGGAAAATACCATTTAAAATATTCTGTGCCAGTAACAAATGTCATTGTTCCATCACCTTCATTTTCCGAGTATAGTATGTTTATTTTATTAACTAACATAGAATCTAATCTATTCATTATTTTCAAAACATCTTCACTAGATAATAGTGCTCTTTGTATATCTTTACTAATCTTTCTATTATTTATTTTTTCTTTTTTATAATGTTTCATTAATTGAACTTCAATAAACTCATTTAAAAAATAAATTTCATTAAAAGTACCACCTACTAATGCAATTTCATTTTTGTCAGATGAATGTAAATACAATTGTGTTGTTTCAGTTTTTAAAATATTAATATCTTTCTTTATATTAAAATGTCTTTGTAATAATTTTTCTAGTTTTTCATGACTTATATATTCGTTATTTTTGGTAAGACTTTTAGTAATAAAATCTAGTGTATATAAAAAACTGATACACGACATTATTGTAGAATAACTTAATTTAACAAAATTATTAATAAATTCTGTCAGTTCTTTTTTATTGTTTAAATTTTTGATATATTTCTGATTTGCTTCTTCGAGTTCATTTTTATAATAATCTATTTGTTTACGATAATTATAATTCCTTCTTCTCCACCTAATTGCAGAAATAGTATTAAACACAGTTAAAATAGTCCCTATTATAGTTATTATTATTCCAACATTATTCATTTATCCCCCACCTTTTTAGTAAAATTTTAACATTATAAATAGAAACTACAAAATAGCCTAATCCAATTTGTTTAGATTCTTTGCTTAAAACTACTAAATATCATAGATTAATCCTATCATTGATTATTTTTACCATCATATTTTTCTTCTAGATTAAATTATGTTCCCAAAACATGAGATATAAACTAATATAATATAGAACTCTGTTTTATACAGAAAAAACGTCACTTTGAAAGTGACGTTTAAAAATAATTTATTTAAATTTTACGCCTACTATTTATTTCGATCTATCACTTAAATAGCAGGATTAATAGACTTTAAAATTTCTTTATCTATAACTTCTTTTGCACAGATACACAAATTGTTAGTTTTATTATTAATTTCGTTAAACAAACTATCTGATACATTTCCATTATTATCATTAGCTCTAAGTTGTATAGGAAATACAACATCATTTATAAAAAAGTACTTGTCTAAATCTATTAATGTACGTCTTCTAAATGGATGGTGATTTATAAATTCATCTGAGTCAATAAAGTTATCAACAACATTTTCCAATAACGGCTTATATGTTTGTGCTTTTATAAGCTTATTGGATTGACCTAATTCATAACAAATATACATATGAGAATATAGAGCTAAATTACTACTTATATTTGGATGAGGCATTTTTAATCTAATAACATCTTTTACCTTAATCAATTAACAACACACCATCCTCTATATCTATATACACTGGATTAATTAAGTTGCTATCATCACTTACCATTTCTAAAGTTTGAAGCATATTATCTTCCAATTTATTTATATCATTATTACTAATTAAAAATATTTTATCTTTAATTTTAATATTTTGATAATCACTTAAATGTTTAGCATACGAATAAAAATTAGAAATAGAATTTCTATCTTTATCGGTAATATCTTTATCTTCTATAGGTATATTTTGTACATTTTGATTTATTAAATCTATTTTACTAGACCATAAATCTAGGTTATGAGTGATTTCAGATAAATCTTCGTTTGTTTGGGTATTAGTAATAAACAACGCTTTGTTTAGATTTTCTTCTTGAGTTGAGTTGTAATTAATTTCAACGGTATCTAATTCTTTTAAAAGTTCTGTTTTTCTATAAGTTATATCTCCATATACATCGCTATATACCGGACCATTTTTATATGCTCTTAATTTGTGAAGTGTGTAGTCTTCATTTGTAACTAAATTAAACATCTCACTAAAAAATAAAAATTTTTGAATTTGCAGTGGGGACATGCTTTCTAAATATCCATTAATTTTTAACCATTTCAACTTTTTTAATTTAATTTCTTCAGAATATATTGTCATTCTACTCCCCCCTTTAATCTTTAAGTACAAAAAATAACAGCGCTTATACGCTGTCACTGTATATATGCTTTCTATAATTCGTACACTAAAACAGTATATATCTTTGTGTGTATTCGCTAAGATGTGTTACGCATTTGCAACTCTTATTTATAATATAAAGCATTTCAACATTTTTTACCATACATTCACTTAAATTTGTCAAGTTAATTTAATATGTCAACATTTTTTTAGACATTTTTCATGTGTAGATTTTTAAATGCCACTGGCGTCAAATACTGTAATGAAGAATGTGGTCTAAAATTGTTGTACCAATTTACATAATCAAATAATTCTGTTTCTAACTGTTCTAAATTTTCAAATTGAGTTTTCATTGCTTTCATCGTTGCTTCCGCAACTGCGTTATCAAAAGGACAACCTTTGGTAATTAATGAACGTTTGATTTTAAAGGTTTCTAGGACTGCATCTATCAAATGATTATCAAATTCTTTGCCTCTATCGGTGTGGAATTGTTCGATTTGTTCAAGATTATGATTTATTTTGCTGATTGCTTTTGATACTAAATTTACGTCCTTATTTTTACCTGCACTGTAACCAACAATTTCTCTATTAAATAGATCTATAAATAAACATATGTAATGCCATGTTTCTGCGCCTTTTACATATGTCAAATCACTTACTAATGTCTCCATTGGTTGTTCTATATTAATAGCGCGATTCAAATGATTTTTAATTAGTTTTTCATTAGTTTCTTTTGGATGATTTTTGTATTTAGCTTTCGTATAAACAGAAACTAGATTTTTTCATGATACGACCTATCTTTCGTCCAGATACTGAAAGACCCTTGTCATTTAAATTATTTTTAATTCGACTTGTAGCAAAGACTTTTCTATTAGAATTAAAAATATTTATGACAGCACGTTCTACGTTTGAATCATCTTTAGTGATTTTATTATCTTTTCTTTTTATAGAATCATAATAGGTACTTCTTAGTATTTTTAAGACTTTACCCATTGCTGATACTGAATATTGATGTACATTCTTTTGAATGACTTCTATTTTCGTCCCATGATCAACGCTGCTTGCTTTAAAATATCGTTCTCCATTTTTAAATGTTGATCTTCTTTACGTAATTTAATCAGCTCTTTTTCTTCATCTGATAAGTTATCTTGATGATTGAATGTCCCGTGTTTTGATGATGCTTTATCCATTTTCCTATCGTCGAAGGTGTTAAATCATACTCGCGTAAAATTTCATTCCTAGGCTTACCATTTTCATATAATCTAACCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP019563|1206767:1211334|1207397_1207811_-|WP_072398063.1|DBSCAN-SWA MGRRLKHVKENDLAHGEWSNWLKSVNFNDSQARKFIKVFNEFQNRSTSNTLGVEALYQIATLPEPERTKEHITSNGETKTPDEMTVRELRELKKQLKQRDEENARLQSQMKKVQLSEEIERNQYKYGLNNYIFTIKF >NZ_CP019563|1206767:1211334|1206767_1207280_-|WP_000813311.1|DBSCAN-SWA MKQQMLSKVLLSTVVVMGSIAGSSLVMDDNAHAEQKSDNIGKLNQKNESTLHLSFEKGIKGTVDKNGKLTLSDGKTSKVMPTNAKDKKGNDVVLVYKKVKDGFDVQVIKSSQERKTNWVKCGLGTVGGAGTGGLGGASAASVIPGLGTVAGAIIGGVSGGATGAAASCFG >NZ_CP019563|1206767:1211334|1211098_1211254_-|WP_001814548.1|transposase|DBSCAN-SWA MDKASSKHGTFNHQDNLSDEEKELIKLRKEDQHLKMENDILKQAALIMGRK >NZ_CP019563|1206767:1211334|1207939_1208704_-|WP_023913543.1|DBSCAN-SWA MNNVGIIITIIGTILTVFNTISAIRWRRRNYNYRKQIDYYKNELEEANQKYIKNLNNKKELTEFINNFVKLSYSTIMSCISFLYTLDFITKSLTKNNEYISHEKLEKLLQRHFNIKKDINILKTETTQLYLHSSDKNEIALVGGTFNEIYFLNEFIEVQLMKHYKKEKINNRKISKDIQRALLSSEDVLKIMNRLDSMLVNKINILYSENEGDGTMTFVTGTEYFKWYFPEYPDEIKTLKIKDVKKHDFTDKYI >NZ_CP019563|1206767:1211334|1211181_1211334_-|WP_072398062.1|DBSCAN-SWA MVRLYENGKPRNEILREYDLTPSTIGKWIKHHQNTGHSIIKITYQMKKKS >NZ_CP019563|1206767:1211334|1209398_1210046_-|WP_000158489.1|DBSCAN-SWA MTIYSEEIKLKKLKWLKINGYLESMSPLQIQKFLFFSEMFNLVTNEDYTLHKLRAYKNGPVYSDVYGDITYRKTELLKELDTVEINYNSTQEENLNKALFITNTQTNEDLSEITHNLDLWSSKIDLINQNVQNIPIEDKDITDKDRNSISNFYSYAKHLSDYQNIKIKDKIFLISNNDINKLEDNMLQTLEMVSDDSNLINPVYIDIEDGVLLID >NZ_CP019563|1206767:1211334|1210273_1210735_-|WP_029727366.1|integrase,transposase|DBSCAN-SWA METLVSDLTYVKGAETWHYICLFIDLFNREIVGYSAGKNKDVNLVSKAISKINHNLEQIEQFHTDRGKEFDNHLIDAVLETFKIKRSLITKGCPFDNAVAEATMKAMKTQFENLEQLETELFDYVNWYNNFRPHSSLQYLTPVAFKNLHMKNV >NZ_CP019563|1206767:1211334|1208998_1209406_-|WP_000598564.1|DBSCAN-SWA MIKVKDVIRLKMPHPNISSNLALYSHMYICYELGQSNKLIKAQTYKPLLENVVDNFIDSDEFINHHPFRRRTLIDLDKYFFINDVVFPIQLRANDNNGNVSDSLFNEINNKTNNLCICAKEVIDKEILKSINPAI >NZ_CP019563|1206767:1211334|1210814_1211057_-|WP_031865111.1|DBSCAN-SWA MGKVLKILRSTYYDSIKRKDNKITKDDSNVERAVINIFNSNRKVFATSRIKNNLNDKGLSVSGRKIGRIMKKSSFCLYES |
9 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase,integrase | attL 1202573:1202589|attR 1212197:1212213 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1269733 : 1284131
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP019563|1269733:1284131|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP019563|1269733:1284131|1278863_1280369_+|WP_000193751.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >NZ_CP019563|1269733:1284131|1273869_1275975_-|WP_000855505.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >NZ_CP019563|1269733:1284131|1269733_1270495_-|WP_000616840.1|DBSCAN-SWA MIQVENLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDNGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMNIQIEHIRNQRICLYFKD >NZ_CP019563|1269733:1284131|1275937_1276336_-|WP_000692521.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >NZ_CP019563|1269733:1284131|1277136_1278003_+|WP_001068495.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMGQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK >NZ_CP019563|1269733:1284131|1280637_1281555_+|WP_000429006.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMSHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >NZ_CP019563|1269733:1284131|1271434_1272406_-|WP_000876318.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >NZ_CP019563|1269733:1284131|1272780_1273752_-|WP_000562498.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >NZ_CP019563|1269733:1284131|1270491_1271448_-|WP_001245577.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISMLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLVITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >NZ_CP019563|1269733:1284131|1283072_1284131_-|WP_000663014.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQLRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVVHKNSVERERFYQLPQSEHFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >NZ_CP019563|1269733:1284131|1280445_1280547_-|WP_031835073.1|DBSCAN-SWA MVITDIDVYRVGREKIVIAVYNEHIKLLFILIS >NZ_CP019563|1269733:1284131|1278022_1278523_+|WP_000930014.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >NZ_CP019563|1269733:1284131|1282235_1282778_-|WP_000197262.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >NZ_CP019563|1269733:1284131|1272444_1272600_-|WP_000499195.1|DBSCAN-SWA MFYFTLSKQNTHSEKLNFSLIANINKIDTKLFERLLKLWSKNATINEKYYQ |
14 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1296104 : 1303924
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP019563|1296104:1303924|DBSCAN-SWA ATTATAACATCTCCAAAATCTTGGTTTTTGCGTAAAATTCATTTACTTCATCTTTTGGCTTAGAATCAATTGTAATACCTGCTCCGACTCCATAAATCGCTTGTCCATATTTATACTCAATAGTACGAATCGGAATATTAAAAATCATTTTATCATCTTCAGTTGGAAGTAATAGTCCAATTGCTCCGCAGTATATACCACGAGGTGAACTTTCTAATTGTTTAATATATTTCATTGTATTCAGTTTCGGTGCACCTGTAATCGAACCACAAGGAAATAACGATGTTAAAATTTGAGTTAAGTCTGTATTAATTTTTAAAGTTCCACTTACCATCGAAGTCATTTGAAATACAGTTTTATATGCCTCAATAAAAAATAGTTTATACACCTTAATTGAGCCACTCTGTGATATTCTCCCTATATCGTTTCTTAGTAAATCAACAATCATGACATTTTCTGCACGATCTTTCGAAGAAGTTTGCAATGTTTTATAATACTGTTGATCTTCAGCTTCCGTTTTACCTCTAGGCATTGTCCCTTTCATCGGTTTGCTTATGATAACGTTATCGACATTGTTAAATTGTCCTTTTTGAAAAAATAATTCTGGTGAGATAGACGCTACTTGGATTTCATCAGTTTGTAATAACGCAGTATAATTACCATTACTAAATTGAGTTAATCGTTCATATAAAGTACTAATAGGATAATAAATGTTATCCGTTAAGCGCGCCGTATAGTTCACTTGATACGTTTCGCCTTCAACAATTGCTTGTTGGACACGTTTAATATTAGTCATCATAACCTCAGAAGATTCAACAAATGAAAAATGATGCTTTGATACATAAGAAGTTTGATGTTCATATGTTGAATTTATGCTTTCCGCTTTTTCAAAACTATAAGCTACTGCATAAATATCATCTTTAGCTAATGAATGTGTACACATAACATGATTAAAATACTTTGCCGCTTCGTAACTTAAATATAACGAGACATATCTACCTTGTCGTTGCTGCGCTTGTGCAAAGTGTATCACTTCTCCCACATCAGCCAACTTAGTAGCAACATACTTCTTTATAAACCCCTTTAATTGAATATGGTATTGCTTATATTCATTTTCAGTTAAATAGTAGCGATAATTATATTCTATTCTCACAGTAATCACCTACCTTCGATAAAAATAATTCAACTTGTCGATAACCGTATTCACTCAAAATAGATTCAGGATGATATTGCACACCAAAAACTGGAAATGTAATATGCTCAAATGCCATAATAATCGCTTCATCGTTTTTGGCTGTAATCTTTAAGCAATTTGGAAAAGTCGCTCCGTCAGCAATTAATGAATGATAACGCATTACATTGAAATTTTGAGGCAGTCCTTGAAAAATACCTTCATTGGTATGGCGTAACTGTGTAGTATGTCCGTGTACAGGATGATAGCCGTGAATGATATTTCCACCAAAATAAGACACGATACATTGAAATCCTAAACATACACCTAGTATAGGTACACGCTGATAAAATTGTTCTAACACTTCATTCAAGATAGGATAATCATCCGGATTACCCGGCCCAGGCGAAATAACAATTGCTTTTGGCTTCATATTAATGACGTCTTCTATCAGCAGATTATCAATACCAACAACTTGAACTGTTAGTTTCGTTTGAGTCTTAATATAGTCTATTAAATTATATGTAAATGAATCATTATTATCTATGACTAGAATCATTGTATACTCCGTTCTAAATGTGTTTTATTTTTATAATATGTATTGGATGTAGCTAAAACTTTAAAAGCATTGTCATTATCCTGACCTTGATTTTAACTAATATATGGTATATTCTATTCATCGTACATAAATGAATATCAGAGGTTCCTAGCTGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACATTGAAATTTCAAACATTCGTTGGTAAACCTTTAATATATATTATAGGAGCAACCCATTTCTTTCGTCTATCTTTTATGGAGATAGGCTTTTTTTATTTTATAAATTAAAAACGGGCTTATCAATGCCATTAACCTCTTTATTAATATTATTAATGATAGGAGCAATTACAAAATGGAAAGTGTATTAAATAATGAAAAAGCCATCGTTGTCTTTAGTGGTGGTCAAGACAGTACAACATGTCTCTTTTATGCAAAAAAACATTTCAAAGAAGTTGAACTCGTAACGTTTAATTATGGCCAAAGACATGATACTGAAATTGAAGTCGCAAAACAAATTGCACAAGATCAAGGAATGAAACATCACGTTTTAGATATGTCATTATTATCACAACTTACTCCAAACGCATTAACACAACATGATATGGAAATTACTAATAATGAAGATGGTATACCTAATACATTTGTTCCAGCTAGAAATTTACTTTTCTTATCGTTTGCAGGCGCTCTAGCTTATCAAATTGGGGCTAAGCATATTATTACAGGCGTATGTGAAACAGACTTTTCAGGCTACCCAGACTGTCGTGATAGTTTTATAAAATCAATGAACGTAACATTAAGCCTAGCTATGGACAAAGATTTTGTCATTCATACTCCTTTAATGTGGTTAAACAAAGCAGAAACGTGGAAATTAAGTGATGAACTCGAAGTTTTAGATTATATTCGTACAAAAACATTAACATGCTATAACGGTATCATTGGGGATGGCTGTGGTGAATGTCCAGCTTGTCATTTACGTCAACGTGGACTAAATCAATATCTTGAAAGTAAAGGAGCGCTTTAAAATGTTACAACAAATCTATCCTAGTACAACGCATCCATATCAATTCGAATTAAATAAAGATTTTAATTTTTCGGCTGCACATCACATTCCGTGTGAAGAAGCAGGTATTTGTCAAAATGTCCATGGTCATACTTACTTTGTTAATTTAACAATTGTCGGTGATAAACTAGATGACACTGGCTTCTTAGTGAACTTTAGCCATTTGAAAAAGATGATACACGGTAAATTTGACCATCAACTGTTAAATAACTTACCTGCTTTTAAAAACAAAATCCCTTCAACTGAAATCGTAGCGGAAACAATTTATCAAATTGTTAAAGAAAATTTGGCATCGCTCGAACACCAACCAAAATGTATTCAAGTATTTGTAAGAGAAACACCAACAAGTTATGTTGTATTTAGACCAAAGGAACAGGTGTAACTAATGGCTAAAATTCCTGTACTCGAAATATTCGGTCCAACCATTCAAGGTGAAGGTCGAGTAATCGGTAGAAAAACGATGTTTGTGAGAACAGCTGGATGTGATTATCGCTGTAGCTGGTGTGATTCTGCATTTACTTGGGATGGTAGTGCTAAAGGCGATATAAAACTCATGACCGCTGAAGAAATTTATGATGAATTAAAACGAATTGGTGGCGATTTATTTAACCACGTTACAATTTCTGGTGGTAACCCAGCATTAATTAAAGGTATCCAAGAGTTAGTTGACTTATTTCAAGATAAAGGTATTTTCAGCGCACTGGAGACACAAGGCAGTAAATTCCAACCTTGGATGACACAAATTGATGATTTAACGATTAGTCCAAAACCACCAAGTTCAACTATGACACCTGATTTAAAAAAGTTAGATGAAGTGATTACACAATGCGTACCTTCCTCATTAAACTTAAAAGTAGTTGTATTCGACGATAAAGATTATGATTTTGCCAAAATGATACACCACCGTTATCCAGATATTCCCTTCTATTTACAAGTTGGTAACCCATATTTATCAGACAGCGTAGATAATCATACCGAAAAGTTGTTAGAACGCTACGAGCAGTTGGTGGATTTAGTTATGCAAAGTAATGATATGAATCACGTTTATGTGTTACCACAACTTCATACATTACTTTGGAGTAATAAAAAAGGTGTATAAAGGATAACTTATTTTACTTTTTACAAGTCATATCTAATGAATAACAATATATTAATTGATATAATAGTTGATTGAAGTATAACGAACAGGAGTCCATCATGATTGTATATATATTAATTAATATTGCTATCGTCGTACTTATAACTGGATTCAATTTATATAGGCATCAAATGCAACATTTATCATTAAGTGCAATGTTGTTATCTATTACGATAAACGCCTTTATAAATACATTCATAATTGATAAATATAACTTTATTACTCTGTGTACTATAACGATGTTTATCATTTGGACGATACTACAGTTTTACATTGATAAAAAATTAAAACCTGTATACATTACAGACCAAAAATTTATTGCTATCATATTAACGATTGTTGTCAGTTTAACGCAACGTGTTACCGACTTTTCAAGTACACAATCAATATATATGTCTATTCCATTTTTAGCCCCTGCCATTTTCATCATTGGTGGTATTATGTTGTTTATTTCAACATTTAATAGCTTAGATGAAACTGCTGAAAATAATAACAAAATAAAGAAACTAATGATTAAAGGACTTATCATTATTAACATTTCATTTATCGTTATGATGGTTTTAACACCATATTGGTACTTGTATTTAATCGTCTATCTTATTTTCTTGTTGTTTTTATTGTGGCAAAAGGTTTATAAATTTTAATACCAAAACTATTAAACACTTCTGATATTCTTAGTTCAAAATATCAGAAGTGTTTTATAGTGTTATCTAGTTCAGATAAATATTTCCTTACTTAAAAAAACGCCCTCCTCTTATTTTGACCCCTATTTATTTAAATCAGACAATTATTTTCATTTTCAAATTATTCTTTCTTCAATATTAGTTAAGCGATATTTAAACGAAGTTAAGAATTAGTTAATGGCATATTATTTGCCTTCATTTTAAACTTAACTTATCAAATTGAAGAAATGAGGAGTTAGCATGAATACAAAATATTTTTTAGCAGTTGGTGCTGTTGCCGCTGTATTAACTTTAGGCGCTTGTGGTAATTCTAATTCACAAGATCAAGGTAACAAAACTGAACAAAAAACAAAGTCAGAAGATAGCAATGTTAAAACTGATAAAACAAAAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP019563|1296104:1303924|1297239_1297833_-|WP_000604515.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >NZ_CP019563|1296104:1303924|1302182_1302869_+|WP_000149344.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >NZ_CP019563|1296104:1303924|1296104_1297256_-|WP_001217794.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKINTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >NZ_CP019563|1296104:1303924|1298183_1298852_+|WP_000446724.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >NZ_CP019563|1296104:1303924|1300088_1300673_+|WP_000637687.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >NZ_CP019563|1296104:1303924|1302868_1303924_+|WP_024273465.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRILEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS >NZ_CP019563|1296104:1303924|1298853_1299273_+|WP_000941336.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >NZ_CP019563|1296104:1303924|1301734_1302208_+|WP_001037807.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >NZ_CP019563|1296104:1303924|1300952_1301393_+|WP_001093556.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVAAVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >NZ_CP019563|1296104:1303924|1299276_1299990_+|WP_001062972.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV |
10 | Pandoravirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1387522 : 1461240
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP019563|1387522:1461240|DBSCAN-SWA 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103 | Staphylococcus_phage(74.29%) | holin,tail,integrase,terminase,capsid,portal,head,plate,tRNA,transposase | attL 1382738:1382754|attR 1416196:1416212 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
2803499 : 2809082
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP019563|2803499:2809082|DBSCAN-SWA CATGCTAAAACCAATTGGAAATCGTGTGATTATTGAGAAAAAAGAACAAGAACAAACAACTAAAAGTGGTATTGTTTTAACTGATAGTGCTAAAGAAAAATCAAACGAAGGCGTTATCGTTGCAGTAGGAACTGGACGTCTATTAAATGATGGTACAAGAGTGACTCCTGAAGTGAAAGAAGGGGACCGTGTCGTGTTCCAACAATATGCTGGTACAGAAGTTAAACGAGATAATGAAACATATCTAGTATTAAATGAAGAAGATATTTTAGCAGTTATTGAATAATACAAAACTAAATTCATAGATAAATTAAAAAGAACGAAAATGAAACACAACTAAACAAATGGAGGTTTATCATTTATGGTTAAACAATTGAAATTCTCTGAAGATGCGCGTCAAGCAATGTTACGTGGTGTTGACCAACTTGCAAATGCAGTTAAAGTAACGATTGGTCCTAAAGGACGTAATGTTGTATTAGATAAAGAGTTTACAGCACCTTTAATTACGAACGATGGTGTAACGATTGCTAAAGAAATCGAATTAGAAGATCCATATGAAAATATGGGGGCTAAACTAGTTCAAGAAGTCGCAAATAAGACAAATGAAATTGCTGGTGACGGTACGACAACTGCAACAGTATTAGCTCAAGCAATGATTCAAGAAGGCTTGAAAAATGTTACAAGTGGTGCGAACCCAGTTGGTTTACGACAAGGTATCGACAAAGCAGTTAAAGTTGCTGTTGAAGCGTTACATGAAAATTCTCAAAAAGTTGAAAATAAAAATGAAATTGCGCAAGTAGGTGCGATTTCAGCAGCAGATGAAGAAATTGGACGTTATATTTCTGAAGCTATGGAAAAAGTAGGTAACGATGGTGTCATTACAATTGAAGAATCAAATGGACTAAACACTGAACTAGAAGTGGTTGAAGGTATGCAATTTGATCGTGGTTATCAATCACCGTATATGGTTACTGATTCAGATAAAATGGTTGCTGAATTAGAACGCCCATACATTTTAGTAACAGATAAGAAAATCTCGTCTTTCCAAGATATCTTACCTTTATTAGAACAAGTGGTTCAATCTAATCGTCCAATCTTAATTGTAGCTGATGAAGTTGAAGGCGATGCATTAACAAATATCGTGCTAAACCGTATGCGTGGCACATTTACAGCTGTTGCAGTAAAGGCGCCTGGTTTCGGTGATCGTCGTAAAGCAATGTTAGAAGATTTAGCTATTTTAACTGGTGCGCAAGTGATTACTGATGATTTAGGCTTAGATTTAAAAGATGCATCAATTGATATGTTAGGTACTGCAAGTAAAGTAGAAGTAACTAAAGATAATACCACTGTTGTTGATGGTGACGGTGACGAAAACAGCATTGATGCACGTGTTAGCCAATTGAAATCTCAAATTGAAGAAACTGAATCTGACTTTGATCGTGAAAAATTACAAGAGCGCTTAGCTAAATTAGCAGGTGGTGTTGCAGTTATCAAAGTAGGTGCAGCAAGTGAAACAGAGCTTAAAGAACGTAAATTACGTATTGAAGATGCATTAAATTCTACACGTGCAGCAGTTGAAGAAGGTATTGTTGCAGGTGGTGGTACTGCATTAGTAAATGTTTACCAAAAAGTAAGTGAAATTGAAGCTGAAGGTGACATTGAAACAGGTGTAAACATTGTACTTAAAGCACTAACTGCACCAGTTCGTCAAATTGCTGAAAATGCAGGATTAGAAGGTTCTGTTATTGTAGAACGTTTGAAAAACGCAGAGCCGGGTGTTGGTTTTAACGCTGCTACAAACGAGTGGGTTAATATGTTAGAAGCAGGTATCGTTGATCCAACTAAAGTAACACGCTCAGCATTACAACATGCTGCAAGTGTTGCAGCAATGTTCTTAACGACTGAAGCGGTTGTGGCATCAATTCCAGAAAAAAATAATGACCAACCTAACATGGGTGGCATGCCAGGAATGATGTAAAAAGACTGTTGGACGCTGATTTTATAACGTTTGTAATATTGGGTGGTCATAATTTGGTCATAGAAATTTTAAAATAAATCTTTTGAGACGTTTTCCATGAGTTTACTAAACTTTTGGGAAGCGTCTTTTTTGTATGAGTTCGTAATCTTAGCGTAGATGTTCATAGTGGTATTTATATCCTTATGGCGCAAGCGTTCTTGTATTTCCTTAATATGAACACCAGCCTCTATAAGTAACGCACAATGAGTATGACGAAATGAATGAGTGCTTATTTGCTTATTAGTTATGTCAGTCTTTTTAAGTATAGCTTTTATCCATAATTGTAGTTTCTTAATTACGAGGGGATAGCCGTTAACATCAGTAAAAACGAAATTATTATCTACATACAATTCGTTTTTCCATGTATCCTGAACATCCACTTTATAGTTTTTAAGTAATTTAATCACATGAGGATCAACTGAAATTTTTCCGATTGAGCTTTCAGTTTTTGGTGTAAGTATTTGAAATTGCTTTTTATTGTTATTCGGATTGTAATAAGTCTTTGTAATATTGATTGTGTTATTCTCAAAGTCTATATCAGACCATTTCAATGCCAATAATTCACCTGCACGCATGCCTGTATATGCTAATGTACAAAACACCTCAAAGCTGTTTTGGGGTGAATGGTGATTTTTAGCAACCTCCAGGAATTGAAATAATTCATCTTTTTCAAGAAACTTTTTATGTATCTCAGTATCTTCTAATTCTTCCACACTAATTTTCTTTTTAGGTCGTTTAATACCCTCGCTAGGCATTATTCTTATTAATTTCATATCGTATGCGTACTTAAATATCATATTTGTAGAGGCTATAATGCTATCAACATAATTCTTGCTATACTGTGCGCTTATATCGTTTACAAAACGTTGATATTCATGTTTATTGATAGTTTGTATTGGTTTATTGTTAAAGCGTTCTATGGCGTGGTTTATGGCTTTCTCGCGTGCTCTGACACTACTTACTTTTACTTCGTTAGCATATTGTGATATCCAATCGTCAGCCACCTGTTTAAATGTAGATGTGGACGGTGCGATATAATCGCCATTTCTTAATTGACGCTCAACCATTTCAGCGTGATGTTTAGCGTCTGATTTGCGTTTAAAACCTGAGTTTGAAATATATTTATATTTGCCCGTTTCTGCGTCTTTTCCTAGTGATATACGATAGCGCCATGTATTTCCGCGTTTTTCATAACTTGCCATTGGATCACCTACTTAATATGGAATTTTTTTAAGGTTTCAAACTCGCTATCTTCAAATAATTTCAAAGCGACATAATCATTTGATTGAAATTGAATAGTTTCATAACCTCCTATAAGTTCAGAAGGTTGTTTGTTTAAAACCAAATCTTTTAATTTTGATTTAACTTTTTCAATTAGTTTATTGATGAAGTCAATTCTGAATGAAATGCTCATGTTAGTAAGAAAATGATAAAATTCATGTTCAGAATAATGATCTGAATCTTGCAACACTAAAGATATATAATAATCAAATTCTCCTTTTTTTAGAGGTATATCATACGAATCTCCACTAAAAACATATATATCTAAGTTAAAATATTTTTCGTAATTTTGTTTTTTAATTCTAATTTCAAAACCTTCTAAGTTTCCTTCGCTAAAATTACTTTTTTTGGTTTCAACTATATATGGGGAATAATCGAAAAATTCGCATGGCGTAACGCCTAAAAAATTACACAATTTATCGACAGTATCAAACTGAACGCCTTTACCAGTATTTTCTGCTACTGCCATCAATGTAGTTTTTGAAATACCAGTTTCTTCATATAAGTCTGAAATTTTCAAACCTCTTTCGGCCATTAATACAGATAATCTACTTTGAATCATGTTTTTACCTCCAAATATTTATATCGATATATTACTATATAACGCTAAAAAATAACAGGTCTCACTAAAATATTTTTGAGTATTGACACTTGGTAGTTTGAATTGTACAATGTCATTATTAACAGACAACGAAAAAATATAACAAAAGTCTGTTATAAAGGAGTGAGTTAAATGAAGAATGATTTTAGAGTTATTCTTGCTATTAAAAAAATTTCAATAGCTGACGTATTTGAAGATACTGGGATAGCAAAAACAACGTTATACGGTTTGTACCATGAAAAAACTAAGAACCCTGATACGTCTACTATTATGAGGCTTTGTAAGTATCTTGAAATTACACCTAATGAATTTTTTGGAATTGATAATAATGAAAAGGAGGCATAACCTATGTTCAAAATCAATATTGATGAAAACGAAGCTCGTGAGATACTCGAACAAGCTATAAATGCACGTGTGGAAGAATTAGCGAAAGAGAAATATTTCATGACTTACAAAGAGTTGTCTAACTATCTGAATTTAAGTAAGCCTACTATTGAAGAATTACTTATTAATAATGGCATGAAATATTATATGGTCGGATCTACATACAGATTCAAAAAGTCTGATGTAGATGAATTCATGGAACAGCTTACTGCTCACATGAATATCCAGAATAACGACTTTAAACAAGTCAATATCAAAAAGTTATTGGAGGCAAGGCAATGAAAATGTACTTAACTTATATTTGCTTAGTTTCATTGTTAACAATTTTATTACTAGCAATATCTAACATGTATGTTGCTTTTAGCGTTTATGCTTGGCTAATAACTTTAGGATTTAATTTAACGGGAGAGATTACAACGTGCAAAAACAAGTGATTATTACAAAAACAGTAGTTGGCTGGTACAACATTAAAGATACTCAACATAATTTAATGTTAAATATACCGCCAAAAGTATTTGAACAGTACTTTCCTGATGTTAGTAAAGATGTTCAAGTTGCGTGTTTAGAAATGGATTTATCAAAAATTACGGAAATTAAAAATAAGAAAAAGGTAGGTAGTAAAGATGGAAATCAAACAAAAATATCAATTATCAAAAGTGGTTAAAATATTAGAAGTAGTATTATACGAGGAAGATAAGTCTCAATCCGATAAGGACT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP019563|2803499:2809082|2808199_2808445_+|WP_001171847.1|DBSCAN-SWA MQKQVIITKTVVGWYNIKDTQHNLMLNIPPKVFEQYFPDVSKDVQVACLEMDLSKITEIKNKKKVGSKDGNQTKISIIKSG >NZ_CP019563|2803499:2809082|2808788_2809082_+|WP_077156138.1|DBSCAN-SWA MNWEIKDLMCDIEVVKEKINDVAIKHGWFVEDKFVKNELETKQEHINFSDSYLEHRIQNEHTVELLQMYLKEFGELIQKFHEIEKASLQADQSESNA >NZ_CP019563|2803499:2809082|2805544_2806717_-|WP_000179346.1|integrase|DBSCAN-SWA MASYEKRGNTWRYRISLGKDAETGKYKYISNSGFKRKSDAKHHAEMVERQLRNGDYIAPSTSTFKQVADDWISQYANEVKVSSVRAREKAINHAIERFNNKPIQTINKHEYQRFVNDISAQYSKNYVDSIIASTNMIFKYAYDMKLIRIMPSEGIKRPKKKISVEELEDTEIHKKFLEKDELFQFLEVAKNHHSPQNSFEVFCTLAYTGMRAGELLALKWSDIDFENNTINITKTYYNPNNNKKQFQILTPKTESSIGKISVDPHVIKLLKNYKVDVQDTWKNELYVDNNFVFTDVNGYPLVIKKLQLWIKAILKKTDITNKQISTHSFRHTHCALLIEAGVHIKEIQERLRHKDINTTMNIYAKITNSYKKDASQKFSKLMENVSKDLF >NZ_CP019563|2803499:2809082|2803859_2805476_+|WP_000240642.1|DBSCAN-SWA MVKQLKFSEDARQAMLRGVDQLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEFTAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVKVAVEALHENSQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGRYISEAMEKVGNDGVITIEESNGLNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMVAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQSNRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLDLKDASIDMLGTASKVEVTKDNTTVVDGDGDENSIDARVSQLKSQIEETESDFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNVYQKVSEIEAEGDIETGVNIVLKALTAPVRQIAENAGLEGSVIVERLKNAEPGVGFNAATNEWVNMLEAGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVASIPEKNNDQPNMGGMPGMM >NZ_CP019563|2803499:2809082|2806725_2807358_-|WP_072526376.1|DBSCAN-SWA MIQSRLSVLMAERGLKISDLYEETGISKTTLMAVAENTGKGVQFDTVDKLCNFLGVTPCEFFDYSPYIVETKKSNFSEGNLEGFEIRIKKQNYEKYFNLDIYVFSGDSYDIPLKKGEFDYYISLVLQDSDHYSEHEFYHFLTNMSISFRIDFINKLIEKVKSKLKDLVLNKQPSELIGGYETIQFQSNDYVALKLFEDSEFETLKKFHIK >NZ_CP019563|2803499:2809082|2807529_2807742_+|WP_061838909.1|DBSCAN-SWA MKNDFRVILAIKKISIADVFEDTGIAKTTLYGLYHEKTKNPDTSTIMRLCKYLEITPNEFFGIDNNEKEA >NZ_CP019563|2803499:2809082|2803499_2803784_+|WP_000917289.1|DBSCAN-SWA MLKPIGNRVIIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVIVAVGTGRLLNDGTRVTPEVKEGDRVVFQQYAGTEVKRDNETYLVLNEEDILAVIE >NZ_CP019563|2803499:2809082|2808059_2808215_+|WP_000784886.1|DBSCAN-SWA MKMYLTYICLVSLLTILLLAISNMYVAFSVYAWLITLGFNLTGEITTCKNK >NZ_CP019563|2803499:2809082|2807745_2808063_+|WP_072526378.1|DBSCAN-SWA MFKINIDENEAREILEQAINARVEELAKEKYFMTYKELSNYLNLSKPTIEELLINNGMKYYMVGSTYRFKKSDVDEFMEQLTAHMNIQNNDFKQVNIKKLLEARQ >NZ_CP019563|2803499:2809082|2808404_2808788_+|WP_000403843.1|DBSCAN-SWA MEIKQKYQLSKVVKILEVVLYEEDKSQSDKDYHYQDKAFYEYALKLVHNGLFNILAELDFEDEAFLILDEVTMTLSDVMKETQHVYRYSVIDEKGEHKHTTDRKGHVIGMLEWALDYIAGNIEVEEL |
10 | Staphylococcus_phage(77.78%) | integrase | attL 2803421:2803435|attR 2806995:2807009 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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