CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP017406	Lactiplantibacillus plantarum strain RI-113 chromosome, complete genome	1 crisprs	csa3,cas3,DEDDh,DinG,WYL	0	0	6	0
NZ_CP017409	Lactiplantibacillus plantarum strain RI-113 plasmid pRI113_3, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP017408	Lactiplantibacillus plantarum strain RI-113 plasmid pRI113_2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP017412	Lactiplantibacillus plantarum strain RI-113 plasmid pRI113_6, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP017411	Lactiplantibacillus plantarum strain RI-113 plasmid pRI113_5, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP017407	Lactiplantibacillus plantarum strain RI-113 plasmid pRI113_1, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0
NZ_CP017410	Lactiplantibacillus plantarum strain RI-113 plasmid pRI113_4, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0

1. NZ_CP017406

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP017406_1

• CRISPR_ID: NZ_CP017406_1
• CRISPR_location: 275149-275346
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP017406_1

Consensus_repeat	Method
GGCCGACGTTGCACTCTGGCTCGTCGTGCTAGTGACTGAACTAGCACT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP017406_1

>1.1|275197|102|NZ_CP017406|CRISPRCasFinder
GGCTTGACTAGTACTGCTTTGGCTAGCGGCCGACGTTGCACTCTGGCTCGTCGTGCTAGTGACTGAACTAGCACTGGCTTGACTAGTACTACTTTGGCTAGT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP017406_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP017406_1

>merge|NZ_CP017406|1|275149-275346|CRISPRCasFinder
GGTTACCGTTGTACTTTGACTAGCCGCACTTTTTACTGAACTAGCACTGGCTTGACTAGTACTGCTTTGGCTAGCGGCCGACGTTGCACTCTGGCTCGTCGTGCTAGTGACTGAACTAGCACTGGCTTGACTAGTACTACTTTGGCTAGTGGCCGACGTTGCACTCTGGCTCGTCGTACTAGTGACTGAACTAGCACT

>NZ_CP017406|1|1|275149-275346|CRISPRCasFinder
GGTTACCGTTGTACTTTGACTAGCCGCACTTTTTACTGAACTAGCACT	GGCTTGACTAGTACTGCTTTGGCTAGCGGCCGACGTTGCACTCTGGCTCGTCGTGCTAGTGACTGAACTAGCACTGGCTTGACTAGTACTACTTTGGCTAGT
GGCCGACGTTGCACTCTGGCTCGTCGTACTAGTGACTGAACTAGCACT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP017406.1|WP_003642130.1|269424_269823_+|cupin-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|380361
NZ_CP017406.1|WP_003642128.1|270190_270934_+|SDR-family-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|226674
NZ_CP017406.1|WP_003642134.1|264015_264717_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224059
NZ_CP017406.1|WP_003642121.1|277579_279124_+|glycosyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|340855
NZ_CP017406.1|WP_003644753.1|285569_286232_+|HAD-family-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|319787
NZ_CP017406.1|WP_003642118.1|281657_282668_+|putative-sulfate-exporter-family-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|225411
NZ_CP017406.1|WP_003642115.1|283871_285356_-|multidrug-efflux-MFS-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|129794
NZ_CP017406.1|WP_003642120.1|279120_280629_+|accessory-Sec-system-glycosyltransferase-Asp1	unknown	unknown	gnl|CDD|340855
NZ_CP017406.1|WP_003644752.1|286350_287538_+|MFS-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|340882
NZ_CP017406.1|WP_003642133.1|264710_267302_+|ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223650
NZ_CP017406.1|WP_003642119.1|280713_281541_-|LysR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|223656
NZ_CP017406.1|WP_003642126.1|272291_273191_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226631
NZ_CP017406.1|WP_003642124.1|274112_274613_-|methylated-DNA--[protein]-cysteine-S-methyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|223427
NZ_CP017406.1|WP_003642132.1|267382_268645_+|ArgE/DapE-family-deacylase	unknown	unknown	gnl|CDD|181490
NZ_CP017406.1|WP_003642122.1|276326_277271_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP017406.1|WP_003642116.1|283374_283875_-|DUF4811-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|374344
NZ_CP017406.1|WP_077143251.1|268808_269252_-|MerR-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|133384
NZ_CP017406.1|WP_003642129.1|269856_270177_+|carboxymuconolactone-decarboxylase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223672
NZ_CP017406.1|WP_003642127.1|271081_272299_-|ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|224582
NZ_CP017406.1|WP_003644754.1|282751_283315_+|GNAT-family-N-acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|379112

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP017406.1|WP_003642130.1|269424_269823_+|cupin-domain-containing-protein	gnl|CDD|380361	cd02233, cupin_HNL-like, Granulicella tundricola hydroxynitrile lyase (GtHNL) and related proteins, cupin domain. This family includes archaeal, eukaryotic, and bacterial proteins homologous to hydroxynitrile lyase from Granulicella tundricola (GtHNL), a novel class of HNLs that does not show any sequence or structural similarity to any other HNL and does not contain conserved motifs typical of HNLs. HNLs comprise a diverse group of enzymes that vary in terms of their substrate specificity, enantioselectivity and the need for a co-factor. In plants, they catalyze the reversible cleavage of cyanohydrins, yielding HCN and aldehydes or ketones. Also included in this family is TM1010 from Thermotoga maritima, a protein of unknown function. Some but not all members of this family have N- or C-terminal carboxymuconolactone decarboxylase domains in addition to the cupin domain. Members of this family belong to the cupin superfamily with a conserved "jelly roll-like" beta-barrel fold capable of homodimerization.	9.00976e-52
NZ_CP017406.1|WP_003642128.1|270190_270934_+|SDR-family-oxidoreductase	gnl|CDD|226674	COG4221, COG4221, Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity [General function prediction only].	3.11403e-96
NZ_CP017406.1|WP_003642134.1|264015_264717_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|224059	COG1136, SalX, ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component [Defense mechanisms].	4.59578e-102
NZ_CP017406.1|WP_003644753.1|285569_286232_+|HAD-family-hydrolase	gnl|CDD|319787	cd02588, HAD_L2-DEX, L-2-haloacid dehalogenase. L-2-Haloacid dehalogenase catalyzes the hydrolytic dehalogenation of L-2-haloacids to produce the corresponding D-2-hydroxyacids with an inversion of the C2-configuration. 2-haloacid dehalogenases are of interest for their potential to degrade recalcitrant halogenated environmental pollutants and their use in the synthesis of industrial chemicals. This family belongs to the haloacid dehalogenase-like (HAD) hydrolases, a large superfamily of diverse enzymes that catalyze carbon or phosphoryl group transfer reactions on a range of substrates, using an active site aspartate in nucleophilic catalysis. Members of this superfamily include 2-L-haloalkanoic acid dehalogenase, azetidine hydrolase, phosphonoacetaldehyde hydrolase, phosphoserine phosphatase, phosphomannomutase, P-type ATPases and many others. HAD hydrolases are found in all three kingdoms of life, and most genomes are predicted to contain multiple HAD-like proteins. Members possess a highly conserved alpha/beta core domain, and many also possess a small cap domain, the fold and function of which is variable. HAD hydrolases are sometimes referred to as belonging to the DDDD superfamily of phosphohydrolases.	5.30751e-60
NZ_CP017406.1|WP_077143251.1|268808_269252_-|MerR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|133384	cd01109, HTH_YyaN, Helix-Turn-Helix DNA binding domain of the MerR-like transcription regulators YyaN and YraB. Putative helix-turn-helix (HTH) MerR-like transcription regulators of Bacillus subtilis, YyaN and YraB, and related proteins; N-terminal domain. Based on sequence similarity, these proteins are predicted to function as transcription regulators that mediate responses to stress in eubacteria. They belong to the MerR superfamily of transcription regulators that promote transcription of various stress regulons by reconfiguring the operator sequence located between the -35 and -10 promoter elements. A typical MerR regulator is comprised of distinct domains that harbor the regulatory (effector-binding) site and the active (DNA-binding) site. Their N-terminal domains are homologous and contain a DNA-binding winged HTH motif, while the C-terminal domains are often dissimilar and bind specific coactivator molecules such as metal ions, drugs, and organic substrates.	2.00784e-48
NZ_CP017406.1|WP_003642118.1|281657_282668_+|putative-sulfate-exporter-family-transporter	gnl|CDD|225411	COG2855, COG2855, Predicted membrane protein [Function unknown].	3.10527e-67
NZ_CP017406.1|WP_003642115.1|283871_285356_-|multidrug-efflux-MFS-transporter	gnl|CDD|129794	TIGR00711, Uncharacterized_MFS-type_transporter_YhcA, drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily. This subfamily of drug efflux proteins, a part of the major faciliator family, is predicted to have 14 potential membrane-spanning regions. Members with known activities include EmrB (multiple drug resistance efflux pump) in E. coli, FarB (antibacterial fatty acid resistance) in Neisseria gonorrhoeae, TcmA (tetracenomycin C resistance) in Streptomyces glaucescens, etc. In most cases, the efflux pump is described as having a second component encoded in the same operon, such as EmrA of E. coli. [Cellular processes, Toxin production and resistance, Transport and binding proteins, Other].	6.00245e-95
NZ_CP017406.1|WP_003642120.1|279120_280629_+|accessory-Sec-system-glycosyltransferase-Asp1	gnl|CDD|340855	cd04949, GT4_GtfA-like, accessory Sec system glycosyltransferase GtfA and similar proteins. This family is most closely related to the GT4 family of glycosyltransferases and is named after gtfA in Streptococcus gordonii, where it plays a role in the O-linked glycosylation of GspB, a cell surface glycoprotein involved in platelet binding. In general glycosyltransferases catalyze the transfer of sugar moieties from activated donor molecules to specific acceptor molecules, forming glycosidic bonds. The acceptor molecule can be a lipid, a protein, a heterocyclic compound, or another carbohydrate residue. This group of glycosyltransferases is most closely related to the previously defined glycosyltransferase family 1 (GT1). The members of this family may transfer UDP, ADP, GDP, or CMP linked sugars. The diverse enzymatic activities among members of this family reflect a wide range of biological functions. The protein structure available for this family has the GTB topology, one of the two protein topologies observed for nucleotide-sugar-dependent glycosyltransferases. GTB proteins have distinct N- and C- terminal domains each containing a typical Rossmann fold. The two domains have high structural homology despite minimal sequence homology. The large cleft that separates the two domains includes the catalytic center and permits a high degree of flexibility. The members of this family are found in bacteria.	1.93235e-80
NZ_CP017406.1|WP_003644752.1|286350_287538_+|MFS-transporter	gnl|CDD|340882	cd17324, MFS_NepI_like, Purine ribonucleoside efflux pump NepI and similar transporters of the Major Facilitator Superfamily. This family is composed of purine efflux pumps such as Escherichia coli NepI and Bacillus subtilis PbuE, sugar efflux transporters such as Corynebacterium glutamicum arabinose efflux permease, multidrug resistance (MDR) transporters such as Streptomyces lividans chloramphenicol resistance protein (CmlR), and similar proteins. NepI and PbuE are involved in the efflux of purine ribonucleosides such as guanosine, adenosine and inosine, as well as purine bases like guanine, adenine, and hypoxanthine, and purine base analogs. They play a role in the maintenance of cellular purine base pools, as well as in protecting the cells and conferring resistance against toxic purine base analogs such as 6-mercaptopurine. MDR transporters are drug/H+ antiporters (DHA) that mediate the efflux of a variety of drugs and toxic compounds, and confer resistance to these compounds. The NepI-like family belongs to the Major Facilitator Superfamily (MFS) of membrane transport proteins, which are thought to function through a single substrate binding site, alternating-access mechanism involving a rocker-switch type of movement.	5.54209e-66
NZ_CP017406.1|WP_003642133.1|264710_267302_+|ABC-transporter-permease	gnl|CDD|223650	COG0577, SalY, ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component [Defense mechanisms].	3.85225e-14
NZ_CP017406.1|WP_003642119.1|280713_281541_-|LysR-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|223656	COG0583, LysR, Transcriptional regulator [Transcription].	6.66516e-33
NZ_CP017406.1|WP_003642126.1|272291_273191_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|226631	COG4152, COG4152, ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component [General function prediction only].	1.14298e-136
NZ_CP017406.1|WP_003642121.1|277579_279124_+|glycosyltransferase	gnl|CDD|340855	cd04949, GT4_GtfA-like, accessory Sec system glycosyltransferase GtfA and similar proteins. This family is most closely related to the GT4 family of glycosyltransferases and is named after gtfA in Streptococcus gordonii, where it plays a role in the O-linked glycosylation of GspB, a cell surface glycoprotein involved in platelet binding. In general glycosyltransferases catalyze the transfer of sugar moieties from activated donor molecules to specific acceptor molecules, forming glycosidic bonds. The acceptor molecule can be a lipid, a protein, a heterocyclic compound, or another carbohydrate residue. This group of glycosyltransferases is most closely related to the previously defined glycosyltransferase family 1 (GT1). The members of this family may transfer UDP, ADP, GDP, or CMP linked sugars. The diverse enzymatic activities among members of this family reflect a wide range of biological functions. The protein structure available for this family has the GTB topology, one of the two protein topologies observed for nucleotide-sugar-dependent glycosyltransferases. GTB proteins have distinct N- and C- terminal domains each containing a typical Rossmann fold. The two domains have high structural homology despite minimal sequence homology. The large cleft that separates the two domains includes the catalytic center and permits a high degree of flexibility. The members of this family are found in bacteria.	1.01133e-92
NZ_CP017406.1|WP_003642132.1|267382_268645_+|ArgE/DapE-family-deacylase	gnl|CDD|181490	PRK08588, PRK08588, succinyl-diaminopimelate desuccinylase; Reviewed.	0
NZ_CP017406.1|WP_003642116.1|283374_283875_-|DUF4811-domain-containing-protein	gnl|CDD|374344	pfam16069, DUF4811, Domain of unknown function (DUF4811). This family of proteins is found in bacteria. Proteins in this family are typically between 188 and 241 amino acids in length. There is a single completely conserved residue Y that may be functionally important.	4.84282e-43
NZ_CP017406.1|WP_003642124.1|274112_274613_-|methylated-DNA--[protein]-cysteine-S-methyltransferase	gnl|CDD|223427	COG0350, Ada, Methylated DNA-protein cysteine methyltransferase [DNA replication, recombination, and repair].	1.17829e-47
NZ_CP017406.1|WP_003642129.1|269856_270177_+|carboxymuconolactone-decarboxylase-family-protein	gnl|CDD|223672	COG0599, COG0599, Uncharacterized homolog of gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit [Function unknown].	7.7214e-25
NZ_CP017406.1|WP_003642127.1|271081_272299_-|ABC-transporter-permease	gnl|CDD|224582	COG1668, NatB, ABC-type Na+ efflux pump, permease component [Energy production and conversion / Inorganic ion transport and metabolism].	8.34886e-34
NZ_CP017406.1|WP_003644754.1|282751_283315_+|GNAT-family-N-acetyltransferase	gnl|CDD|379112	pfam13302, Acetyltransf_3, Acetyltransferase (GNAT) domain. This domain catalyzes N-acetyltransferase reactions.	2.10921e-26

Protein sequences

>NZ_CP017406.1|WP_003642124.1|274112_274613_-|methylated-DNA--[protein]-cysteine-S-methyltransferase
MHLTLTQTTINQQTYWLGTTPTGLAFVGRANGPRDEWQAFFKSANIHYDQQANQQACQELHDYLTGQRQHFDIPLDQTTGTPLQHQVWQALTRIPYGQTATYSQLATMINHPTAVRAVASAVGKNPLLIVIPCHRIRRKDGQLGGYRGGLPMKRALLALENARLPK
>NZ_CP017406.1|WP_003642126.1|272291_273191_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein
MLSIAHIQKRFGTVQALNDVSFDVHDGEIMGLIGQNGAGKSTTFHSILNFLSFDGQITWNGQPLTADDYDQIGYLPEERSLMSKLTITQQIVYLARLKNQPARVTKGKIAAWMKRFAVKGQPTDKIDKLSKGNQQKVQLICTLIHDPKLIILDEPFSGLDPVNADLLKQAILDAKQRGAAIIFSSHDMSNVEAICDSLVMLRNGEAVLKGTVEDVRAQFGRTRLFLTTDWSQAQLADLPGVTTVTQQGARRFRLELADASVGPAIFDQVTAGHYIEEFSQQPPTLDEIFRTEAGGVNHE
>NZ_CP017406.1|WP_003642127.1|271081_272299_-|ABC-transporter-permease
MNKTWIVTFETYLRQIKSWSFLSLVFMPFLFFGFVAAFSYFAAPSASKNDIAVVSTSPQLRTSFIKQSHVATANKYQTLASAKAATKRNDIAGYLVLTTKNQQLQAQFTGPNAVSSGDKAKIQQFLATAQSQRNVQRAQLSAKQTQALAVQPKFTEQLQKHAASDKTAKTVSFYIVVFFVYLILTTYSAITAQEIAADKGTKIMEVIFSSTTPRKYFNGKIYGVLLVIVTQLLVYLVGGFAVMQFVKRSSLTIDFWQQNTDLINQVIHNLVSINLLFALLAVLLYTVASAFCGALVTRVADASKAAQPVIYLSMLAFFMALAFQNTPTNLFVKIFSYIPFFSSYFMPLRLINGMATMPAAIVSLLILIATIIGSMIYIGRIYGGLMLQTDELGFWGNLKRGLRLK
>NZ_CP017406.1|WP_003642128.1|270190_270934_+|SDR-family-oxidoreductase
MTVKNKVVVITGASSGIGATTAKQLASNGAKVVLGARREERLAALVDEIKAAGGQAAYQVTDVTKSADVQALVKLAQTQFGGLDVILNNAGIMPTSPISALHTDEWDQMVDINIKGVLNGVAAVMPIFTAQKSGQIITTSSVAGIKSFAGSGVYGATKFAVRNLMEVIRMESAQEGTNIRTVSLYPAAINTELLHTITDKTAKQNMTDFYQQVGISPAAVANVVNFAIDQPEDVNVNEFTIYPTKQA
>NZ_CP017406.1|WP_003642129.1|269856_270177_+|carboxymuconolactone-decarboxylase-family-protein
MTVKQTAGRDNLGKLAPQFAALNDDVLFGEVWARESALSLHDRSMITIACLMTSGDFPQLKAHFKMGKDHGISKDEAVEIVTHLAFYAGWPKAWSAMALIKEVYGE
>NZ_CP017406.1|WP_003642130.1|269424_269823_+|cupin-domain-containing-protein
MTTTNNSGLFGLGVKNEAYQQYFIGQSYLNALAGDEQVDVNVSNVTFEPGCRNNWHIHHNGYQILLVTSGEGWYQEAGKPVQLLHPGDVVTIHPGVKHWHGATKDSWFAHIAITKGTSEWLEPVDDEAYAKL
>NZ_CP017406.1|WP_077143251.1|268808_269252_-|MerR-family-transcriptional-regulator
MVRTTTERYSIGDFAKAVGLSAPTLRYYEKAGLIEPHRLDNGRRYYETADINWVKFLLHLKGTGMSISELQQYVTWRAAGDNTIPQRLALLKHVKEDFLVQFNEVQHHLQILNDKINWYEEKEAGITQDHEDFSSYLQRFGHHEQPE
>NZ_CP017406.1|WP_003642132.1|267382_268645_+|ArgE/DapE-family-deacylase
MNGMAETAQLEAAVQALSDIVKMNTVNNHEQLVADYLVTLLKQHGIEAQSIEYAPGRVNLVAEIGDGHGPVVALDGHEDTVALGDADKWHTDPLAATIKDNRLYGRGVTDMKAGLMAEVFAMIALHDQDAPLHGTVRLLATVGEEVDHLGAEQLTELGYADDIQTLICAEPSGADKQLLLTKSIQAMLGVDGDTAQRMADANPTTEQHFIELAHKGSLTYTIKAQGVAAHSSMPAIGQNAIDMLMTYYQKQTAYFDSFKTIVNPVLGPTVPVVTLISGGEQVNTVPASAEMSVKIRTIPELRNDRLIKDLEAIIAECNADGANLTMDIASSFYPVHTPEDSQLVQLAKKVGEQVLQQRLPYFGAPGGTDASSYIVKSPDMQVIVFGPGNITAHQVNEYVDLDMYGRFIEIYQKMITELLA
>NZ_CP017406.1|WP_003642133.1|264710_267302_+|ABC-transporter-permease
MVGAAMTAAYFKTIMREIWSSKARFASILLIIFLGVAFYTGIRATGPDMSQAANDYYAKQKLATNSVQSTMGLTKADTRVLNQHRSQLTYQATRYADVNQLNNSQVVRVMALPTTQRLNRLRIVKGRLPRHANEIVLDAQAQRLQPKLKVGSTYRISSTAKRNAQFTRRTFKVVGFVNSPTYVENTNRGVTNVGKGTLDYLVYVRPQVIKSSVITRIDVQFKNLRGVTPYTAKYRRLNRENTAQLKRWLKPQARKRQQALQAQAQAKLKPLQQATQQLASQVPAGTAQLVKLQSQLKRAQAQVAAITMPTYLYTDRTDNPGYTEYHENTQRVVALSTVFPLFFIAIAALICLTTMTRMVEELRLQMGTLKALGYTNTAVGSEFMIYGGLAALIGTALGVLFGVNFFPRFIAQAYGSMYNLPAINVQYIWMDIGIALAIALLCTLGTALVVLRVDLNSLPAQLLQPRSPKAGKTLLLERWQWLWHRLSFNHKITLRNLFRYKQRLLMTVLGIAGCMAMMITGFGLKDSIGDISVKQFNELWHYDAVVTRSGNETDQQRQALSRGQLYQASLKLQAKQVTVKQSGVAEQTATLGIPAPHQSLSKFVVLRHRQSHQAIHIGDRGAVIDEKLAKLYGVQAGDDLTIKLAGQTTKRIHISAVAENYVNHFIYMSPTYYRRVFKQAPVYNTNYVRFKQATKKQENAYADRLLKQAGVQNVTLMSTEKATNFKMLDSMNLVVLIFVISAGALALVVLYNLTNINVSERIRELSTIKVLGFYDGEVTMYIFRENLILTVLGIIAGCFLGNWLHAYILQTAETNALMFSPTIHPLSYVYAALLTLAFSLLVMGMMHRKLKRVNMLDALKSVD
>NZ_CP017406.1|WP_003642134.1|264015_264717_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein
MAYIEVQQATRQFKNGEQVTVANRDISFEVDQGAVVVILGPSGAGKSTLLNILGGMDSPTSGRVLVDGVDIAQFNSRQLTTYRRQAVGFVFQFYNLVPNLTARENVELASQITKDARDVDETLTLVGLTHRSDNFPAQLSGGEQQRVAIARAVAKNPKLLLCDEPTGALDYQTGKQVLQVIQDAAKQTQTTVIIVTHNSAIAQLGDQVIRINDAQVQSVEHNAHPTPLAEIEW
>NZ_CP017406.1|WP_003642122.1|276326_277271_-|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein
MKIKNALLTSLAATGLLALGTTVANADTVVVKAGDTVSEIALTHKTTIKAIQKANHLKNVNLIYIGDKLEVNGKHHATTVTTQVPTSAASSTASSTSTASSTANSTSTQSASSASVSSSTSTSAASTATSSSTTSVASSSAASSSSTSAASSSVTSTSTASAASSSAASSSTSSATSSSATSQASTASSSTATSASMTKLSNTTASSAASTSTAASSSATTSSSTTTSTSSSSSTTSTSSSAEAAAKAWIANKESGGSYTASNGNYYGKYQLSKSLLNGDYSASNQETVADEYVASRYGSWVAAKAFWEANGYY
>NZ_CP017406.1|WP_003642121.1|277579_279124_+|glycosyltransferase
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>NZ_CP017406.1|WP_003642120.1|279120_280629_+|accessory-Sec-system-glycosyltransferase-Asp1
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>NZ_CP017406.1|WP_003642119.1|280713_281541_-|LysR-family-transcriptional-regulator
MFKQLETFCAVYETRNFSHAAEQLFISQPTVSTQIKQLEADLQTTLLTRNGRQEIVPTASGQLLYQQAQKLLTTWAATKTAVQSPRHLVKVPCRIGASHTTGRLILPTLLANLSAVSDRFDFQVTLANSAEILTAMSQHKLDFGLVEKPLVTDQLNRLPFGHDELVHAGDFASPLWLLREPNSGVRHYTNAFLKARNIQPAQVMVIHSNQIIADLLAHGIGQTIISRHVLSNEIPIEQLSAHYQRQFFLLTNTQPAAALRPVQTAITQYLTTWSD
>NZ_CP017406.1|WP_003642118.1|281657_282668_+|putative-sulfate-exporter-family-transporter
MKVKGILPGLVTSLVIAIISQGLAQFVPALGAATIAILLGIIGGNTFLKQPQLGRGTKFAESKLLEYSVMLLGATMTVQTIGKIGGFGVLFILCQMTITIVGALWLGRKLGFSQSVRMLMAGGNAVCGSSAIASIAPVIDADEDDKGTVITLVNLMGTVLMLTLPVLGMAVFGGSVILKGALIGGTLQSVGQVVAAASMINQTTVQFATIFKIMRIMMLVVVVLIFGRLHQRTIENELAEDAVVSGNGNGHWLPWYVAGFLILCALNSLISLPAIIGATAHTISSWFEIIALAAIGLRLNLVNFMKAGKRLALYGLGVGTIQVVSALILITLLLQH
>NZ_CP017406.1|WP_003644754.1|282751_283315_+|GNAT-family-N-acetyltransferase
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>NZ_CP017406.1|WP_003642116.1|283374_283875_-|DUF4811-domain-containing-protein
MIIVLLILATLVFAGTMIFSPAGRNRLIAIIISGLIIAASLIALVLNDNYHWGMHEVTRTQIQDLAPLKSKQAALRVQQLGTGSERVISYRVAAATKVSHTVTATTTTTKLTSGSPAQVQLKTTTWQFKNHLTHVLFSLGNTKTKIVQRQYLFTIPKTWQVVTVKN
>NZ_CP017406.1|WP_003642115.1|283871_285356_-|multidrug-efflux-MFS-transporter
MPTQNSTLPLDANGQPYHRTWLVLTLLVGTFTTFITQTLLTTAFPTLMADFHISATAVQWLTTGFMLIMGIMIPVSAWLLTRINSKYLYLTAMLIFGLGTTLAYFAVNFQMLLIARMIQAMGVGISAPVFQTIMSSVYPPEKRGSAMGTAGIVIGLAPAIGPTLSGWIIDNYSWRALFLFILPINILVIIVSFFTLRKVLPTSKQPIDWWSVLISTIGFGSMLYGFSSVGNAGWGDPVVLTTLVIGLIFIGLFVWRQLHMDQPLLELRVFKIPAFTLSAILTALAYMAMMGVEMILPMYIQTVLGRSAMDSGLILLPGAIMMGIMSPITGRIFDHIGARRLAMTGMLLLTLGTAFFLSISATTPILWIIVVYAIRMFGLTMVTMPVTTTGINALPFRLISHGTAANNTLRQVAASMGTAVLISVYSSVAKWQMPGHQLLTQAPLKYRQDGITATLTGYHMAFVVSLIFCAIGFGITFFLKTNHSKTISQEDDAA
>NZ_CP017406.1|WP_003644753.1|285569_286232_+|HAD-family-hydrolase
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>NZ_CP017406.1|WP_003644752.1|286350_287538_+|MFS-transporter
MNSKSLNKSTVLLMAISAAIVVANINYIQPIEADIAQQFNLPNAVIGAVAMLTQLGYAFGLLLIVPMGDIMNRRMLIMRLLVLAIISALLAFVAPNIWVYALASLLIGITSVAPQVIIPYAGFLAPRNQRGQVLGNVLSGLLVGVLLSRTVSGVLASYLSWQMVYLIAAILIAGLWLVLWRKLPHDPVTTHTTNYKAMIQTVPQLVKRYPVLRASAVNGFVLFGVSNIFWATLVFYLQHQYGWGSREAGLLALLGVTGVLAAPLIGRLADRFRPRTIIGLGLVLSTLAYVVFWLSGTHLVGLIIGIVILDLGTQFGQVANQTRIQSIDVHASSRFNSVFMFGYFMGGALGSFCGNVLWYLAGWNGVCGLAVVVLMIGFYAHFVHYPRVVTRQVQH

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	381750 : 390261	9	Synechococcus_phage(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_2	1428645 : 1439285	10	Lactobacillus_phage(90.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	1596292 : 1697799	110	Lactobacillus_phage(67.92%)	terminase,tail,capsid,transposase,protease,head,integrase,tRNA,portal,holin	attL 1619175:1619190|attR 1683013:1683028
DBSCAN-SWA_4	2122156 : 2238966	148	Lactobacillus_phage(80.72%)	terminase,lysis,tail,capsid,protease,integrase,head,tRNA,portal,holin	attL 2199369:2199384|attR 2239117:2239132
DBSCAN-SWA_5	2324437 : 2385307	55	uncultured_Mediterranean_phage(22.22%)	protease,bacteriocin,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_6	2388736 : 2434160	44	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus(50.0%)	protease,bacteriocin	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP017406|381750:390261|DBSCAN-SWA
GATGGCGAAAGTTGGTTTGATTATGGGGTCAATTTCTGATTGGCCAACCATGCAATTAGCGGCAGAACAGTTAACGGCACTGGGAGTCTCTTATGAGCGTCACGTTATTTCGGCCCACCGAATGCCCCAGACATTACAATCCTATGGTGAAGAAGCAGCGTCACGGGGAATTCAAGTTATTATTGCGGGTGCGGGGGGCGCTGCCCATTTACCCGGGATGCTAGCTGCCAATACACTACTCCCGGTAATTGGGGTGCCCATTAAGACCCATACGTTGAACGGAGTTGATTCGTTATTGTCAATCGTACAGATGCCAGCTGGCGTACCCGTGGCGACGATGGCGATTGGTGATGCGGGGGCTAAGAATGGTGCGCTAATGGCCGCCCAAATTATCGGTTTACGGGAACCACAAGTACAACATGCAATTGGAGAATTTCGTGCTCGTCAACGTCAGGAGGCTGAACAAAGTGAACGCCAATTTTAAGGAAGCACTCTTACCACCCGCAACGATCGGAATCGTTGGTGGCGGTCAACTCGGTCAGATGATGACGCTTAGCGCGAAGGCGATGGGCTATCGGGTAGGTGTCCTTGACCCGACACCCAAAGCACCGGCAGCCCAGGTCGCAGATTTTCAGATTGTTGCGGCTTATGATGATCAGGCGGCTTTACTTGATCTAGCGCGCCGTAGTGATGTCTTGACCTACGAGTTTGAAAACGTTGATGAGAATGCTTTGATTGCTGCGCAAGCCTATGCAAAGTTACCGCAGGGCACTGCACTCCTGCATATTACTGGAGATCGTCTTAATGAGAAGCAATTTCTTCATGATCATGGCATCCCAGTCACATCTTTCGCACCGGTGACGGATTTACAGTCATTAAATTACGCCCTCAACCGTGTTGGTACGCCGGCAATTCTCAAAACGGCGGCAGGTGGCTACGATGGTCACGGACAAACGGATTTAGACACAGCAGTGGTGACAAAAGCCGCTAGTGTCTTATTGACACAGCCGTGCATTCTAGAGGCGCGGCAGAAATTTCGAACAGAAGTTTCCATGATGGTGACGCGTAGTGCTGCTGGTGTTGTTACGACTTTTCCGTTAGTTGAAAATCAGCATCAACATCATATCTTACACACAACGATTGCCCCAGCTAATGTTCAGCCCAGTGTTCATAGTGCGGCCCGCAAAATTGCGGTTTCGATTGCTGAATCTCTGGAACTACGCGGCGTGCTAGGAATCGAATTCTTTGTTTTACCGGATGATACTTTATTAGTCAATGAACTGGCACCACGCCCACATAATTCTGGTCACTATACGATTGAGGCCTGCAACATCTCGCAGTTTGAGGCCCATATTCGAAGTATCTGTGGCTTACCGATTCCGGCCATTACGCAGACCAGTCCGGCAGTGATGCGTAATCTGCTAGGTGATGACTTAACAGTGGCACGTCAACAGTTGGTTGAACACCCAGAATGGCATTTTCACGACTACGGTAAGGCGGCCATTAAGCCCCAGCGCAAGATGGGTCATGTCACCGTATTAAATCACGATATTGACGCAGCATTAGCGTCGGTGGCAAATTTGAAAGGGGAACAATAATAATGACGGCAGCGATTGAGAAACAAGCTTTGCTTTACACGGGTAAAGCGAAAGCGATGTATGCCACTAATGATCCTGAAATTCTATGGGTCGAATACTTAGATCAAGCAACAGCGCTAAATGGTAAGCGGAAGGTTCCCATTGACCAGAAAGGCCGATTGAATAATCGCATCGCGAGTTTGATTTTCAAAGACTTAGCCAATCACGGCATTGCCAACCATTTTATTGAGCAACCTTCAGACTATGTGCAACTTGTCCGTCGCGTGACCATGATTCCCTTGGAGACAGTTGTTCGGAATGCGGCTTCGGGTAGTTTTGAGCGTAAATTTGCCGTGCCACACTTAACCAAATTTGCAGAACCAGTACTGGAATTTTTCTATAAGAGTGATCAGCTGGATGATCCATTTATCAATGATTCACAAATCCACGCGCTAAATGTTGCAACACCGGCAATCGTGGCGGAAATTAAACGGCAGGCCTTACAGGTTAACCAGCGTTTGACGGCAATTTTTGCGGCGATGGGGGTACAGCTCGTTGATTTTAAAATCGAATTTGGGTTGACGACCACCGGTAAAGTCTTGCTGGCTGATGAAATCTCACCAGATAGTTGTCGGTTAGTCGACCTAAAGACCGGTGCATCGCTTGATAAGGATGTCTTCCGCAAGGATCTAGGCGACTTGACTAGTGTTTATCAGGAAGTATTGACGCGGCTAGCAACCGTTGAGGAGGCCTAACATGTACTTAGTTAAAATCTATGTGACTTATAAGCAATCAATTCTAGACCCCAAGGGTGAGGCGATTCATGATGCCTTACACCGACTTGGATATACGAATGTCGATGCCGTTGAATTAGGTAAGTATTTTGAGGTGAAAATTCACGCGGATGATCGGCCAGTTGCCGCTGAAATCGACGAGATGTGTGATCGCTTGTTAGCCAACGTTAATATGGAAACTTATCGTTACGAAATTACTGAGATGGAGGCTTTGTAATGATGAAATTTGCCGTACCAGTCTTTCCTGGTTCTAATTGTGATCATGACATGGTGAATGCCTTGCGCGATATTTTACACGTTACGGCTGATTTGATTCCGGCGACAGCGACCTCATTAGCAGGTTATGACGCGGTGGTGTTACCTGGTGGCTTTTCGTACGGTGATTATTTACGGAGTGGTGCGATTGCCCGCTTTGCGCCCATCATGCCGGCCGTTATTGCATTTGCTAACGCTGGTAAACCAGTCATCGGAATCTGCAATGGCTTTCAAGTCTTGACCGAAGCCGGATTATTACCTGGTGCATTGCAGGCCAATCGCTCAGCGAAGTTTATTTGTCAGGACAGCCCATTACGAATTGCCAATCATGAGACGATTTTTACCACCGCATACGGATCGACAGATCAAATTAGTTTACCGATTGCCCACGGCGAAGGCAATTATTATTGTGATGAGGCCACCTTGGCGCAATTACGTGCTAATCATCAAATCATCTTCGAATACGTCGAGAATCCAAATGGCAGCACGGCTAATATTGCTGGCATTACAAATGAAGCGGGAAATGTGCTTGGGATGATGCCCCATCCGGAACGGGCCGTGGAGATGATCTTAGGTTCCACGGACGGTCTCGGAATTTTTCAATCGGTCATTGCGAGTCAAGAGGAGGTCACCCATGCTTAAAAAGCAACCATTATCACCTACAGATGTTCGCGATTCTAAGGTCTATCGGGATTGGGGCTTAACCGATGCTGAGTATCAATTATTAACGGATAAGGTCCTTCAACGCTTACCTAACGAGACTGAAACCGGGTTGTTTTCCGGCATGTGGAGCGAACATTGCTCCTACAAGAATTCAAAACCAGTCTTGAAAAAATTTTGGACGCAGGGTGAACAGGTACTTGAAGGGCCTGGTGAAGGCGCCGGTATTATCGACATCGGTGATGGTCAGGCCGTGGTCTTTAAAGCTGAAAGTCATAATCATCCGTCTGCAGTTGAACCTTATGAGGGTGCGGCAACGGGTGTGGGTGGTATCATTCGGGACATCTTTTCGATGGGGGCCCGGCCGATTGCGCTGCTGGACAGTCTTCGCTTTGGGGAACCGACTGATGCTCATACGAAATACTTGATTTCGCAAGTAGTCGCCGGCATTGGCGGTTATGGCAACTGTATTGGAATTCCGACAATCGGTGGTGATACGGTATTTGATGCGAGTTATCAGAAGAACCCGTTGGTGAACGCCATGTGTGTTGGAATCTTGGATCAAGCTGATATTCAGAAGGGCCAAGCAACAGGAATTGGCAACGCCGTTATTTATGTCGGCGCAAAAACGGGGCGTGACGGCATTAACGGTGCGTCCTTTGCCTCTGCTGAATTTAATGACGCCAATGAAACCCAGCGTTCCGCGGTTCAAGTTGGTGATCCCTTTATGGAAAAATTATTGATGGAGGCGTGTCTCGAGGTTATTCATGAACATCGTGATGTTTTAATCGGGATTCAAGATATGGGCGCGGCGGGCCTAGTTTCCTCCTCAGCCGAAATGGCGTCCAAAGCAGGCAGTGGGTTGTCACTGAATCTTGACTTGGTACCACAACGTGAAACTGGCATGACGCCGTTTGAACTGATGCTCTCTGAATCACAGGAGCGGATGTTACTATGTGTCAAAGCTGGTGCCGAAGCAGAAATTTATCAAGTCTTTGAAAAGTACGGTCTTGATGCTGTCACAATTGGTAAAGTGACAGCCGGCCACCAGTATCAATTATTCCATCATGGTAAGTTAGTTGCAGATGTTCCCGTCGATGCACTTGCGACCAAAGCGCCGGTCTATGAACGCGAAAAGAAACGACCAACGCGCTTGAACCATCAGAGCCATCATCAATTTATGCCACGACTAGTTGATGCAACTGGCACATTGAAGAAGATGCTCCAACAGCCAACGATTGCTTCCAAAGCGTCGTTATATGGAACGTATGACTCGCAGGTCCAAACGAATACGGTCGTCAAGCCGGGTTCCGATGCGGGGGTCATACGGATTCGACATACGGATAAGGCGTTGGCGGTCACCACCGATGTTAACGGGCGATACTTATACTTAAACCCCCGTGTCGGTGGAGAAATCGCCGTTGCGGAAGCTGCTCGAAACATTGTCGCTTCCGGTGGGCAACCTTTAGGCATCACTGATTGCTTGAACTATGGTAATCCAGAGAAACCTGAACAATTTTACGATTTGGACGAATCGGCGATGGGCATCGCTCGTGCCTGCCAATTATTCAATACGCCCGTGATTTCTGGCAATGTCTCGTTGAACAATGAATCGAACGGGGAAGCCATCTATCCCACCCCAATGATTGGGATGGTCGGGTTAATTAAGCATCAGAAAGATATTACGACTAGCGATTTTAAACACGCTGGCGATGCAGTCTACGTGTTAGGTACCACAGAAGCCAATTTCAATGGTAGTGAGCTGCAAAAGATGTTGACGGGAACAATCAGTGGCGAGCTGTTTGATTTTGACCTTGTGACTGAAAATCGTAATCAGCGTCTATTGTTAACTGCGATTCAAAAAGGACTAGTTGCTAGTGCCCACGACGTTTCTGAAGGTGGCTTGATTACGACGATTGCCGAATCATGTTTTCCACAAAATATCGGGGTGGAACTGGCCAGTGACTTGCCCGCTGCCAACTTCTTTGCGGAAACGCAGTCACGATTTGTTATCTCGGTGACACCAGCACAGCAAGCCGCGTTTGAAAGTTTAATGGAACCATATGTGACCTATTTAGGACGAACAACTGCAACGGATCGGCTACACGTTCAAACTGCTGATCAGGCGTTTGATATTAAGGTTAGTTTCGCCAAACAGTTGTGGGAAGGGGCCTTACCATGCCTACTGAAGTAAGAAGTCTGAATGAAGAATGTGGCGTCTTTGGGGTTTGGGGCTCGCCGGACGCCGCCCAATTAACGTACTTTGGGCTCCATGCGTTACAACACCGGGGGCAAGAAGGAGCCGGTATCACGGCGAATGATCACGGCAAACTGCAGACGGAACGCGGACTAGGGTTGTTGGCTGATGTCTTTCGGGACCCACGGCGGTTGGCACGTTTGACGGGTCAAGCTGCAGTCGGCCATGTACGTTATGCCACGGCTGGTAATCATGGATTGGAAAACATTCAACCCTTGAGTTTTAATTTTAGCGACTCACAGTTTGCACTCGCACATAACGGCAATTTGACGAACGCGGTGACACTGCGGCGACGGTTGGAACAGCATGGTGCCATTTTTCATGCTAGTTCTGATAGTGAGATTTTAATGCATCTGATTCGACGCAGCCCCGCAGCAACGTTAACGGAACAGGTTAAGGATGCTTTACGTCAAGTCCACGGAGGCTTTGCTTACTTACTACTAACGAATGATTGTTTGATTGCCGCTTTGGATCCTAACGGGTTACGACCATTAGTCGTCGGTCAGTTACCCACGGGCGGGTACGTCGTTTGTAGTGAAACTTGCGCGCTTGATACGATTGGTGCGACGTTTGTTCAAGATGTTCAGCCGGGAGAATTGTTAACGATCGATGATCATGGTTTGACGATCGACCATTATACGACTGATACACAGTTGGCGATTTGTTCAATGGAGTTTATCTACTTTGCACGTCCAGATTCTGATATTCACGGCGTCAACGTCCATTCTGCACGTAAACGAATGGGTGCTCAGCTCGCTGTTGAACAGCCCGTGGACGCCGACATTGTTGTCGGGGTACCCAATTCATCTTTATCAGCGGCGACCGGCTATGCGGAAGCGAGTGGCCTGCCTTACGAGATGGGATTAATTAAAAATCAATATTCGTCACGGACCTTTATTCAGCCGACCCAAGCATTGCGAGAACAGGGGGTTCGGATGAAGCTTTCAGCGGTCAAAGGTGTTGTCGCTGGTAAACGAGTCGTCTTAATCGATGATTCGATTGTACGTGGTACCACCAGTCGGCGGATCGTCAAATTATTGAAAGATGCGGGTGCAAAGTCAGTTCATTTACGAATTGCATCGCCACCATTACGCTATCCATGTTTTTACGGTATCGATATTCAATCGACTAATGAATTGATTGCGGCTCAGCAAACGATTCGGGAGATGTGTCAGACGTTTGGTGCGGACTCACTTGGTTTTCTCAGTGAACAGGGCGTCGTTGATGCAGTTGGCTTGTCGACCACCGAACCGTATGGTGGACTATGCATGGCCTATTTTAATGGGGATTATCCAACGGCCCTGTATGATTACCAAGCCGAGTATGATGCGGAAATTGCGCAATTACAAGCCAATCATGAAGGGGTGATCAAGTGAGCGATGCGTATAAGCGGGCTGGCGTTGATATCAACGCTGGTTACGACGTCTTAAAGACGGTCAAACAAATGAGTGGCAATCAGCAATTAGGCGCGTTTGGGGGGGCGTTTCCACTTAGTTCGGATGCAACTGCCAACGATCCCGTGTTAGTAGCGGGGACGGATGGTGTGGGGACTAAGCTCTTAGTCGCAATCGCTGCTGATCAACATACCACGATTGGAATTGACTTGGTCGCAATGTGTGTGAATGATATTTTGGCACAAGGCGCGACCCCCCAGTTCTTTTTAGATTACTTAGGTCTTGGACATACGGATCAGAAGCGGGTCAAAGCCATTTTGACTGGCGTCGTCACGGGCTGTCAGCAGGCCCATACAGCGTTGATTGGTGGCGAGACTGCGGAGATGCCCGATATGTATGGTCAGGACCATTACGACCTCGCTGGTTTTGCGGTCGGAATTGCGAACCGCGCGGACCTGTTATCACCAGCAAATGTTCGGGCTGGGGACGTCTTGATTGGGTTGCCGTCTAATGGCCTCCACTCGAATGGGTTTAGTCTAGTTCGTGATATTTTATTCAAACAACACGACTACCAATTGACCACGGTTTTTGACGAACTTGGTCATGATTTACAAACGGAACTTTTACGACCAACGACCATTTACGTTGATGCAGTTCAACCATTATTACAGCAGAAATTAGTGACGAGTATCGCCCACATTACTGGGGGCGGCTTGATTGAGAACGTCGCCAGAGCGTTACCGGCGGGCTTGAGTGCGCACCTTGAATTGGGTCAATGGCCGGTGCCGCCAATTATGACGTTATTGGCCGAACTCGGTGGGCTGACTGCCACGGATCTTCGGTCGACCTTTAACTTAGGCCTGGGAATGGTTTTGGTCGTTCACCCCGACCAAGTGGCGGCTGTGACGGCTAATTTGACGGCCAACGCGCAGTCCTATTATCGCGTCGGAACAGTCCAAACTGGGACGGCCCCCGTCGTTTTCGAGGAGGCTGAACATGCCTAATAAGATTGCGGTATTTGCTTCGGGGAACGGCACCAACTTTGTTGCACTCCACCAAGCGATTATTGAACGGCAGTTACCGGTGGTGATTGGGTTACTCGTCTGTGATCAACCCACGGCGCCGGTCATTGATAAAGCCCGGGCAGCTAACATACCGATATTGATTGTTGATTTTCATGATTATGCGAATAAAGCGGCCGCGGAAGCCATCATTTTGACGGCCTTGCAAGCGCGACAAATTAAACTGGTCTTATTGGCCGGGTACATGCGTATTATCGGTCCGACCCTCTTGAATGCGTATTCGCATAAAATTATCAACATCCACCCAGCATTGTTACCGAAATTTCCAGGTCGTCACGGTATCGAGGATGCTTTTGACGCTGGTGTGACTGAGACGGGCGTTACCATTCACTATATCGATGCCGGAATCGATACCGGGCAAATTATTGCCCAGCGGGTCGTTCCGGTTGCACCAGACGATACGCTAGCCAGCCTGGCGACCCGGATTCATGATTGTGAACACCAATTTTATCCAGATGTATTACAGACACTCATTAATGAAGGAGCAATTTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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MYLVKIYVTYKQSILDPKGEAIHDALHRLGYTNVDAVELGKYFEVKIHADDRPVAAEIDEMCDRLLANVNMETYRYEITEMEAL
>NZ_CP017406|381750:390261|389682_390261_+|WP_003642593.1|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP017406|381750:390261|387213_388668_+|WP_003642591.1|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP017406|381750:390261|388664_389690_+|WP_003642592.1|DBSCAN-SWA
MSDAYKRAGVDINAGYDVLKTVKQMSGNQQLGAFGGAFPLSSDATANDPVLVAGTDGVGTKLLVAIAADQHTTIGIDLVAMCVNDILAQGATPQFFLDYLGLGHTDQKRVKAILTGVVTGCQQAHTALIGGETAEMPDMYGQDHYDLAGFAVGIANRADLLSPANVRAGDVLIGLPSNGLHSNGFSLVRDILFKQHDYQLTTVFDELGHDLQTELLRPTTIYVDAVQPLLQQKLVTSIAHITGGGLIENVARALPAGLSAHLELGQWPVPPIMTLLAELGGLTATDLRSTFNLGLGMVLVVHPDQVAAVTANLTANAQSYYRVGTVQTGTAPVVFEEAEHA
>NZ_CP017406|381750:390261|385009_387229_+|WP_003642590.1|DBSCAN-SWA
MLKKQPLSPTDVRDSKVYRDWGLTDAEYQLLTDKVLQRLPNETETGLFSGMWSEHCSYKNSKPVLKKFWTQGEQVLEGPGEGAGIIDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGEPTDAHTKYLISQVVAGIGGYGNCIGIPTIGGDTVFDASYQKNPLVNAMCVGILDQADIQKGQATGIGNAVIYVGAKTGRDGINGASFASAEFNDANETQRSAVQVGDPFMEKLLMEACLEVIHEHRDVLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLSLNLDLVPQRETGMTPFELMLSESQERMLLCVKAGAEAEIYQVFEKYGLDAVTIGKVTAGHQYQLFHHGKLVADVPVDALATKAPVYEREKKRPTRLNHQSHHQFMPRLVDATGTLKKMLQQPTIASKASLYGTYDSQVQTNTVVKPGSDAGVIRIRHTDKALAVTTDVNGRYLYLNPRVGGEIAVAEAARNIVASGGQPLGITDCLNYGNPEKPEQFYDLDESAMGIARACQLFNTPVISGNVSLNNESNGEAIYPTPMIGMVGLIKHQKDITTSDFKHAGDAVYVLGTTEANFNGSELQKMLTGTISGELFDFDLVTENRNQRLLLTAIQKGLVASAHDVSEGGLITTIAESCFPQNIGVELASDLPAANFFAETQSRFVISVTPAQQAAFESLMEPYVTYLGRTTATDRLHVQTADQAFDIKVSFAKQLWEGALPCLLK
>NZ_CP017406|381750:390261|382216_383347_+|WP_003642586.1|DBSCAN-SWA
MNANFKEALLPPATIGIVGGGQLGQMMTLSAKAMGYRVGVLDPTPKAPAAQVADFQIVAAYDDQAALLDLARRSDVLTYEFENVDENALIAAQAYAKLPQGTALLHITGDRLNEKQFLHDHGIPVTSFAPVTDLQSLNYALNRVGTPAILKTAAGGYDGHGQTDLDTAVVTKAASVLLTQPCILEARQKFRTEVSMMVTRSAAGVVTTFPLVENQHQHHILHTTIAPANVQPSVHSAARKIAVSIAESLELRGVLGIEFFVLPDDTLLVNELAPRPHNSGHYTIEACNISQFEAHIRSICGLPIPAITQTSPAVMRNLLGDDLTVARQQLVEHPEWHFHDYGKAAIKPQRKMGHVTVLNHDIDAALASVANLKGEQ
>NZ_CP017406|381750:390261|384336_385017_+|WP_011101895.1|DBSCAN-SWA
MMKFAVPVFPGSNCDHDMVNALRDILHVTADLIPATATSLAGYDAVVLPGGFSYGDYLRSGAIARFAPIMPAVIAFANAGKPVIGICNGFQVLTEAGLLPGALQANRSAKFICQDSPLRIANHETIFTTAYGSTDQISLPIAHGEGNYYCDEATLAQLRANHQIIFEYVENPNGSTANIAGITNEAGNVLGMMPHPERAVEMILGSTDGLGIFQSVIASQEEVTHA
>NZ_CP017406|381750:390261|383349_384081_+|WP_003642587.1|DBSCAN-SWA
MTAAIEKQALLYTGKAKAMYATNDPEILWVEYLDQATALNGKRKVPIDQKGRLNNRIASLIFKDLANHGIANHFIEQPSDYVQLVRRVTMIPLETVVRNAASGSFERKFAVPHLTKFAEPVLEFFYKSDQLDDPFINDSQIHALNVATPAIVAEIKRQALQVNQRLTAIFAAMGVQLVDFKIEFGLTTTGKVLLADEISPDSCRLVDLKTGASLDKDVFRKDLGDLTSVYQEVLTRLATVEEA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_003642590.1|385009_387229_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurL	A6N228	Microbacterium_phage	7.7e-144	39.3
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WP_003642592.1|388664_389690_+	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	A0A0E3F760	Synechococcus_phage	8.4e-61	41.7
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Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP017406|1428645:1439285|DBSCAN-SWA
TATGCAAGATTATTATAACATGAATCAAACCACTTTGAGTATTGCCTTGGATTACCAACCAGAAGATCATCATTCTGCTCGTTACATCAACCAGCTTGTTGAGAGTTTAAAACTAAAATATGATTACCAGTTTGGCCGTCCGCGGGAATATAACCTCGGTGCCATGTTAAAACTGGTCCTTTTAGCGTACAGCTATGGCATTTTCAGCAGTCGTAAAATTGAACGGTTTGCCCGTGAAAACAAGCCAGCTGGGTGGTTAATTGCCGACCAAATTCCGTCCTACCGGACGATTTGTCGCTTTAGAATTTCTGATGAACTGGCCACTTTGACAACCGATAGCTTATCACAGCTAACCCAATATCTTCGTCAAAATGGCATGATTGATGATGTTTCATTTATTGATGGAACTAAGATCCTAGCCGACGCCAACAAGTATAGCTTTGTTTGGAAGAAGAATACGATACGATTTGACAAGATGAATCGCGAAAAACTCGTTGACCTGTTAGGCGAGCTTCATGAAGCTAAAATTGTCGGTGAAATTCCGGCAGGATCAGAGCTGACTCCCGAACTATTGGATATCATGATTAGCAAGGTTGAGGATCACTTAGTGGTCCTTAATGAAACCGTGGAAGCAACTAAGCAGGTTTCCCCGAACCCAGCCAAACAGCAACGCCGGACTGTTAAATCACAAAAACGTAAGTTGGATAAACGACGTGATAAAATGCGTGAACACCAAGCACAGCAAGCAATCTATGGTCAGCGTAACAGCTACTCTAAGACGGATCACGATGCCACCTTTATGCGGGTCAAGGAAGATCCGATGCAAAACGGTCAATTAAAACCTGCCTACAACGTTCAAATCGCCACGAGTAATCAGTTCATTACGGGATATCGGCTTTTCCAAAATCCAACCGACACACGAACCTTACAACCGTTTATTGAACATTTAAAGGCCAACAATGTGTTAGGTCACACCATCGTTACCGATGCCGGATACGGTTCCGAAAGTAATTATCGGTACTTGGAAGATGAATTCGGTCAGCATACCGTTTTGATTCCCTACGGCACAATGCTTAAAGAGAATAGTCGAAAATGGCAAAGTGATGACCGTAAGGTTATGAACTGGGACTATCATGAAAAAGATGATTATTTTATCAATCCGCAAAACGTCCGGTTTAATTTTAATGCTTATCGTCGACGGACTGATAAGTATGGTTTTACCCGTGACTTTAAAGAATACATTGCCGAAAAGTATGATGAAAATCATCAACTAATTGCCGCGGCACTAACACCAAAAGGATATCTTAAAAGGATTTCCGTGAACGAAAATTGGGAATATTTCAAATCGAAACAACGAGAATTACTTTCAGCTCCAGAAACTGGTCAGATTTACGCTCAACGTAAGATCGATGTTGAGCCAGTTTTTGGCAAGATGAAGGCTTCTTTACATTTCAATCGATTCTCGGTGCGAGGTTTCGACAAGGTCACCAAGGAAGCCGGAATCGTAATACTGGCGTTAAACATTATGAAACTGGTCACGGTAGGGACCAACTTTAAAAATCAAAGGCGTAAGCAAATGGGACGAGAAACCAAAATTCGGTTTCTCGTCCCATTTGCTTATACAGAGGCTAGTTATGTCACAGCCTCCTTGTGGCACAATCGTCCCGACTGCACAAAATTACCGGCATCGTTGTAGGCGCCCGTTTGCGCAATTACTGAATCGGAGAGGTAACTTTGATTGGAACCCAATGTGTCATTGACAACAACTGTTCCAAGCTTCTTACCGCTTGGATTGAATGCAATATTCCATGTTAAAGTTGCAGGCAGGCCATGCTCATCATAGCTTCCAATCAAAATATACATCAGAATCAGCCGTGCCTTTCACGTAAAACTGGAGGGTACTCGCGCGATTCGTCCCCATTTGTGATAAGGCATCGTTGAAAGTAATCAGTCCAGCGGTTTCACCCGCTTTAATTTTAAAATGACCAGCAACTCGACCATTATCGTCTTTCAATGGAAACCCCAAATCAACGGGTGCAACCGTCCCATTCGGCAATTCTGTATCACCGGCCGCAATTGGTTGACCATTGCGAATAGCCCAGTCATACTCGACTGTAAAATCCTCCCATTTGCTTAATTGACTTGTATCTGTGATGACATTGCCATACCGATCAGTCACTCTGGCCTCATTCCCCGTTAGGCCAGCCGTCGACACATCATCCGCTTGTCCAATCCGTCCTAATACTATGACTGTCACTAAAACTGTTAACAGACCTAGTAGGACTGAAAACAATTTATTTCGCATAAAACTGCCCCCATTCTCTGCCAAACACAACCAACTTTGATACTTAGAATATCCATTGGAATTACCAATAGTTCTACGATCACTTTATAATAAGCCCATCTTTTTCATCAGTGTTATTAATAAGTTGTCATTGGTAGATTTACAAACAAGTTGATGATTAATCAATCGCTACCCACGTTACTTATTTAGCCTTCCAATGGCCAACGTCACCGTATTTTTTACCAACCTGACATGACACGTCTCCACTCAGACCATCCATTAAAAACTGTTTGACGTTAGCGCCTAAAATCTCTAAAATGAACCCATTGGTCTTTATTATCAAATTAATTTTAAGGAGTGTCTTCATGGCGCAAATCTATATTGCTAGTCCGTTTTTCAGTCCCGAACAAGTGACGCGGGTCACACAACTTGAGGAAGCTTTAGCAAAAAATCCAACGGTCACGGATTTTTATTCACCACGTCTACACCAGGACGCTCAAGCCGAACAGTTCACCAAAACTTGGGCGACCGAAATTTTCCACCGTGACATGGCCCAAATTGCGGCCGCGCAAGTCATCGTGACTGTCTTAGACTTTGAAGCCAAAAACTTAGATTCTGGTACCGCCTACGAGCTAGGTGTGGCTACCATGCGCGACTTGCCCATCATCGCCTTGCAGGAAAAAGATGAGGCCGTCAACCTGATGATTACCGAAAGCTTACACTGGTATACCAAACAAGTGAGTGATTTTGAAACTTACGACTTCCAACAATTACCTAAAGGCGACTTTATCGGTGAAATTTTATAATAAAAAACGAAGCCAGACTTTCGACTATTATCGAAAGTCTGGCTTCATATTTTGTAGTTCTTAATTTTACTTACCAGTGGGCCCCAATCGTCTGTTGCCAAGCAAAGTACGGGGTGCCCTTTGTCAATGCTTCAAATTGATCAGCCGTCAAATTGGGCCAGTCGATGTCACTGGTTGCCAATTGTAACGAATCGGTTAAGTGAAGATGAAAGTCGGTGATCCAAGCCAACAGCGGTTTCAACACTGACAAATCGGTATTTAACATCTGATAAGTAGCGGTATCGCTGGTCAACGTCACCGCCAATGTGTAACGGGCCTTCATTCGTACGCCATTACCAAGTTGCCGCACGATTGAGCGATACAATCCCAGCTCGACGTCCGTGATGACTGTGGGTATTGGCGCCAAGGTTTGAAAGACTGTGCCGCGCTCATCGGCCAAACTCAGCCGACTAGGCGTGATCGTCAAACGCCCATGAGCAGCCGCGCCCTCATTCAACGCTTTCAAGATAAACGGCGTCTTTTTGCGCGCGGTCGAATACTTGTGATCATTTAAAACAATCGTCATATAAGCTGGTTGGTGCGTAATATTGTCCGCAATGTTCGTCACCGCGACTGGCATTGGTTTTTGCATGTGATAATCTCCCTTGTCGATCTGCTTCTCTCTACGGTCGATTATACACTAACACGACTCAACCAACGTAGCGACTTAATAATTGCCTTAGGCCGTCACCGGATCAACGTGCTCAGCAACAGCATGAGCCGCCGCGATTCGACCGAACGTAAAGATATCACTAAGCGAGTTACCACCCAGCCGGTTACCCGCGTGAATTCCACCGGCTACTTCTCCCGCCGCGTATAGCCCGTCGATAATCTGACCGTCCGTATTTAAAACGTGAGCATCCGGATCAATCTTCAAGCCCCCCATCGTGTGGTGGGTTGCTGGTTTACGCGGCGTTGCGTAAAATGGTGCCACGGCAACTTTCAAATCAAAGGCCGTCTTATGAAATTCAGGATCCTCGCCAGCATCAACGTAACGATTGTAGTCCGCAATCGTCTTGGTCAGGGCTGCCGGGTCCATGCCAATTTGGTGCGCTAAATCTGTCAAAGTATCAGCACGGAACAAGGTCCCATTCGCCACCTGCTGGTCAATTTTAGCTTGTGTCGTGTTGTAAGCCGTCTTTTTAATTTCATCATCGGCAATTAGATAGAAGAGACTCCCATTATCAATGGCCGCCTGAGTTAACTCATCACGACTGCCGTACTCATTGACGAACCGTTTTCCTTGCTGGTTTACCATCACAAAGTTTGCCGGTGGCACTTGGAGCCCACTGAATAATTCGCCGGTCTCCGGATCAGATACCGGCATCATTTGTGAGAAGCCCATCCCAACTAATGCTGCACCAACACTAGTCCCTAGCCGAATTCCATCACCAGTCATTGCGGGTGAATTAGTCGTCTTGACATCATCGTCGATGGCCGTCCAGTACGTATTGTACTTTTGTAACATTTTAGTATTCGCTGCGAAACCACCAGAAGCTAAAATCACCGCATCAGCATGGACAATAACTTTCTCATGAGCCGCATTAGTCGCAATGACGCCACGAACTTGCCCATCCGTCACCAGTAATTCTTTTACCGGCGTTTCCGTCATAATCGTACCACCCTGTTGTTCAACAAAGGCCCGTAAAGTCTTGATGTAAGCAAACCCTAGATCGCCCATTGGCTTATGCCCGCGCCGCCAGATGGCTCCAACTGGCATTGTCACTTGGCTTTCATCAAATTTCACACCAATCGATTGTAACCACTTGACTGAATCCAGGGCGTTATCCGTCAATTCTTTTACCAAATCATACTGACCGTGAATCTCTTGACCGTTCAAATCAGTCCGTTGACCACCTAAATAAGTTTGA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TGGCTAACCAATTCAAAAATCTCAAAAGAGTCCTCAGTATCCTGGTACTTATCGAAAAAGGCCCACATCACGGCTGGTAATTGCTCAGCAGTCAACGTCAGCGGGGCGGCAGACTCCGGATGCATGCTCTGGCGATGTGCACGCCACACTTGCCACCCGGCACCACTGACCTGAGTGGCCGCCCGTTTACCAATTTCTTGCAGATATTCCTGATCTTGTGCCTGCAAAAACGCGTTCATCGCTGCATAGGCTTGAACTTCTTCTAATTGACGTTCTGGTCGTACCCCAGCTGGCAGCACTAATTCATCCTCTCCGTCGGTCTCATCAACTTCATGTTCAGCATGATCATTGGGCGTAAGCACGGCCCTAACTGCCCGCTTCCATGCTTGCCACATTGGATCATCCGCCGTTACCTCATAAATTGCCCCGGCTTGCATCCGATTTAGTAGTGACTTGACGGCGTCATCGATTTCATCGTCGTCAAATTCATCCTCAAGTCCCAGATAGCTAGTTTCCAACCAACAATCCGCGAGCCAATAAAATGTCGTTACATATGCTTCTTGTTCGTTCATCCCGATAATCTCCCCTAATGCGTGCAATTTTAAATCATTTGTCTCTGTGACGGTCCCGTCACGTGCCAC

Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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>NZ_CP017406|1428645:1439285|1431804_1432365_-|WP_003643095.1|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

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MHIWMNTHVLLTVTDSNQRQFHQHWLADRELTDSDFTTLITILTPLFAEKIISITVRTITEFAD

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_077143321.1|1610639_1613633_-	MucBP domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_013355381.1|1617052_1617448_-	glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase	A0A1V0SGE7	Hokovirus	1.7e-17	42.2
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WP_013355379.1|1618952_1619837_-	glycosyltransferase family 2 protein	NA	NA	NA	NA
1619175:1619190	attL	NA	NA	NA	NA
WP_063846044.1|1619854_1620979_-	CDP-glycerol glycerophosphotransferase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_015380056.1|1620968_1622033_-	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_047674633.1|1622564_1623740_+|transposase	IS256 family transposase	NA	NA	NA	NA
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WP_077143325.1|1626653_1627256_-	AAA family ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_077143326.1|1627279_1627915_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_013355372.1|1628038_1629157_-	UDP-galactopyranose mutase	E4ZFQ1	Streptococcus_phage	4.0e-173	79.8
WP_003643315.1|1629306_1630023_-	aquaporin family protein	A0A1J0F964	Only_Syngen_Nebraska_virus	5.6e-19	32.7
WP_003643314.1|1630212_1631142_-	YihY/virulence factor BrkB family protein	NA	NA	NA	NA
WP_045352549.1|1631527_1632646_-	UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase (non-hydrolyzing)	A0A0N9R0B2	Chrysochromulina_ericina_virus	7.1e-21	31.3
WP_077143327.1|1632835_1634011_-	serine hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_187326544.1|1634267_1635623_+	NADP-specific glutamate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_003646269.1|1635705_1636269_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_077143328.1|1636701_1637142_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_045352541.1|1637341_1637542_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_045352539.1|1637692_1638559_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_045352535.1|1638551_1639859_-	PTS sugar transporter subunit IIC	NA	NA	NA	NA
WP_003643301.1|1639992_1640433_+	universal stress protein	NA	NA	NA	NA
WP_154566808.1|1640850_1641021_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_187338203.1|1641253_1641634_-|holin	holin	A0A2P0ZLG6	Lactobacillus_phage	3.1e-13	81.2
WP_077143329.1|1641644_1641908_-	hemolysin XhlA family protein	E9LUR9	Lactobacillus_phage	2.2e-34	88.5
WP_077143330.1|1641907_1643080_-	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	E9LUR8	Lactobacillus_phage	3.1e-200	89.2
WP_013355620.1|1643091_1643451_-	hypothetical protein	A0A2P0ZLF6	Lactobacillus_phage	5.9e-46	80.7
WP_003644513.1|1643434_1643596_-	hypothetical protein	A0A2P0ZLG1	Lactobacillus_phage	9.5e-20	100.0
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WP_077143352.1|1674228_1674489_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_155295629.1|1674779_1674935_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_003641362.1|1675765_1675981_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_003641360.1|1676594_1676984_+	ImmA/IrrE family metallo-endopeptidase	D6PSS8	Lactobacillus_phage	4.6e-36	54.3
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WP_003641358.1|1677836_1678037_+	hypothetical protein	E9LUS6	Lactobacillus_phage	4.9e-26	100.0
WP_003641356.1|1678370_1678685_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_077143354.1|1678852_1680034_+|integrase	site-specific integrase	B4XYR4	Lactobacillus_phage	1.2e-58	37.6
WP_077143355.1|1680275_1681610_-	DEAD/DEAH box helicase	Q5GF26	Diachasmimorpha_longicaudata_entomopoxvirus	1.3e-37	31.5
WP_045352531.1|1681622_1682630_-	Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_003638174.1|1682816_1683017_-	cold-shock protein	Q9AZD3	Lactococcus_phage	3.1e-20	71.4
WP_003641352.1|1683360_1683726_+	DUF4828 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
1683013:1683028	attR	NA	NA	NA	NA
WP_045352529.1|1683881_1684658_-	lysozyme	A0A141HSE6	Bacillus_phage	2.6e-06	31.1
WP_003644133.1|1684682_1685561_-	MurR/RpiR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_003641349.1|1685685_1686570_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_003644132.1|1686562_1687879_-	PTS sugar transporter subunit IIC	NA	NA	NA	NA
WP_003646275.1|1688119_1690459_-	cation-translocating P-type ATPase	M1HI01	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	7.1e-39	24.8
WP_003641346.1|1690725_1691304_-	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_045352524.1|1691757_1693131_-	23S rRNA (uracil(1939)-C(5))-methyltransferase RlmD	A0A2K5B251	Erysipelothrix_phage	2.5e-124	50.0
WP_003641344.1|1693464_1694487_-	diacylglycerol kinase	A0A1V0SBJ0	Catovirus	2.6e-17	26.5
WP_003641343.1|1694591_1696016_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatB	NA	NA	NA	NA
WP_077143356.1|1696015_1697479_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatA	NA	NA	NA	NA
WP_003641341.1|1697478_1697799_-|tRNA	Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatC	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP017406|2122156:2238966|DBSCAN-SWA
TATGGGAACATACAATAGAACAGCCACTACAGTTAACCAGCAAATTGACATTCTGTTTTCTAGAGACTTGAATATTGTCAACTCACCAGAAACAGCACAAAAAATTGAAAATATCGGTTATTTTAAATTTAAGGGCTATTGTGTACCCTTTTATGATTCAAAGGATCACTTTAGACCGAATACTTCATTTGATGATATATATGACTCCTATATGTTTGATCAAAAACTACACATGCTCCTTTTATCACTCATAATGCGTGTTGAAACTCAAATAAAATCAAAACTAGGAAGCTATATTGCTTTAAGTTATGGTCCTTTAGCGTATATCGATGATGATTTTTTTAAATCGACGGAATACAGAACCGATTTTTTAAATAAAATTAAAGACGATGAGAACCAGGCAAATACCAGAAATGAATTATATGCTAAACACTACCAAGAAGTATATGACGATACATTTCCGATTTGGGTTACATTTGAAATGTGCTCATTAGGCACATTATCAAAATTTTTTTCTGATATGAAAACTTTTGATCAAAAAGAATTTTCACGTAAAACATTTAACAATCCAAACAACAATCGTATGGAAAACTGGCTCCATTATCTCACTCTTGTCAGGAACTGTTGCGCACATAATAGTCGCACGTTTAGCCGTAGATATTCTACTCATCCAACCTTTCAATTAAGTGATATCCGCTCCTGCCCAAATTTACGAGAAAACACAACTTTCCCAATCTTATATATTTTAAAGGAATTGTGTTCTAGTTCAAATTATTTTTCATCGTGCATGTTGGACTTGAAACATTATTCAGAAACATACCCAAACGCTAACTTAGTAAATTGGGGATTTCCAGATAACTGGTTCGAATTTTTATATTAGCAATTAACAATCCCCACACCAGCCAATTGCGGTTGATGTGGGGATTGTTTGTTAGTTAATTTGTAACTGGTTGCCAGGGTAAATCGTGCTGTAAATTGCCTTACCATTCTGGCTAGTTAGTGTATACATGCTTAGCCCGTTCCGTTGGGCAATCAACCAACATGAATCACCAGACTTGACCTTATAATAAGTGTGAGAATAACCAGCTTTAGAATACCACCTGCCAATTGCCAGTAATGTAGTTTCACAGTAGTGAGTATTAAAGTTGAACGATTTCTCATGTATTCCTATGATAATAATGGAACCTAGTAATAATCTGGTTTCCTCTTTCGCTAAGATACTTTCTCTTATGTATTAGCCGTCTGCCTTTACAGCAGGCGGCTTTTTACGCAAAAAATCCCCCACGCCGAAGCGCATGGGATTAATTATGCTACTTTTGGTTTGCTTGTGACGCTGCTTCAGTGTCAGATGATGCAGAACTATTCATTGCAGCGACTGTGGACGTTGGTGTTTGCGCTTCGTCAGCAGCCTTAATCAATCTTATTCCATCAGCAACCTTGTTAGCTGCCGCTTCAACTTGGCTTTCCTCGTCACTTTTAACTGTTGGTGCTGTCACTGTTTGAACGTCAGTAATAACGCCCAGCATACCAAGGATCGTTAATACAGTGTTGATAACGGCTACAATACTCGTCCAGTCACCAGTAAACTTAATGCCAAACATGGCCAAGATTTGTTGAACCAAAACGATCAGTAAGGAAATGATCCCAGCGATTAATTTACCATTCAAGCTACCGTCAGCATTCTTGAAGCTAATTTTTTTAATCATGTTTTCCCTCCTAAAGGAACTTTTCTGCGATGTAAATAACTAACGTGACAAGCACACCACTAACTAAGACACCAATCAACCAATTTTGAATAGTTGTCACGCGGTCAATTTGATGGTTAGCTTCAATAGACTTTGCCAGTGCCTTGTCCGCTTTTTCGCCAATATTGTCAACTTGATTCAGTTTTTCTTCGATGTTCTCAACTTTCGCTTTGGTAGCGGCCACATCCTTTTGAATATCCATTAATAGCTTAGTTGTATCATCATATTGTGACATTACCGCACCACCAATCGCTGGCCAGGATAGATAGTGGTGTAAATCGTCTTGCCATTCTGACTAGCTAACGTAGTCATGCTCAGGCCGTTGCGTTGTGCGATTGCCCACCAGCTGTCGCCGGACTTAACTGTGTAATACGTATGAGTTGTACCACTCTTGACATATTCTAACGTATTGCTTGCCGGGCCGGTTGCTAGATAGCCATAACCATAAAAACGTGGCTGACGTACCCAGCGATAACCACCTTGAATAATAGCTTGGTCGGTCTTAATCGTAGTTCCAGCTGGCAAAATCGTGATAACGCTTGATGACGTTGACGCACCTGTATGCAACTTAACCGCAGTCTTTAGTGTGTAGGTCTTTGCTTCCTTGACCCACTTGGCTGACGTAGATGGCTTGGAAGTGTTTTTGTTGGCTCCCTGGTTGTTGGCCTTAACCGCATCCTTATTGGTCGGTTTGACCGTTGATTTTTGACCAGCTGTGTAGTAATCAGTATAAAGTTGACTAACGTCAAACCCGCCGTAACTAATCCGAAAATGGGCTGACCCGGACCATTGCCAAGCATTGTTATTCGTATACCACTTCTGACCAGACATGACATAGGGGTAACCAGCAACCCAACCTGTTTTGCTCTTGATGGTCATCTTGTTGTTAGCCCATGATCCAGACGTATAAATGTCGGCCCGATAACCAAACTTCTGAATCTCTTTCATGAAGGCGGCATTGTTGCGGTCATTGGTTGCTTGTGACAAGATTCCTTGTTCTTCAGCCGATTCTACGTCAGTCGCTAGTACCGCACCAACTGGCAGTCCTGCAGCTTTAGCCGTTCGGCCAGCAAAGTCAGCTTCGGCAATTGCTTGTGCCTTAGTGGCGTAGCGTGCAAAGTGGTAACCGTTGATATACAATCCGGCTGCTTGGACATTTGCAATGTTGCTGGCAGCATCCGGGTCTTTATACGTACCACCTTCGCTAATCTTTACCGTAACAGCCTTAACGCCGAACTCATTGCGCATGGAAACATACTCTGCAGTTGACATGTAGCCGTTATTATTCGACACGTCGACCATATCCATGCGAGCAGCCTGACTGTTTAAATTGACCATTAAAAAGGCCATAAAAATGGCGCCCACCATTAAGATGAGTGCCTTTAACTTGTGCTTATTCAATTGTCTACCTCCTATTGTACGCTGTTATTATCTGCGGTAGCTGCTGCCTGTGCTGCTTTGTAGGCTGTAATTGCATCGGATACTTGAGTAACCTGGGCTTGGGTAATCAGTGATTTTGCTAGATAATTGCCAGCATATACAGTTGCTAAATCCGATGGAATCAGTCCATTGTTAACACTGCTAATTAATCCTTCTGTTAAAAATTCGCTTAAATCAAAACTCATGACAAAGATCCTCCTAGTGCTACAATAGCTGCTTTTATTTTTGCGTAATCTGATTGTGTCAAAACTTCTGATGGATTAGGTGACCAGTCAGTTGCTACGATACCCTTTTCTAGTTTTGGCAAAGCAATATAAACATTTCCTTTATTTCCATCAGGAACCCCAAAGACGCACGAAGCGTGTGAAATATCGGTGTTAGCATCGGAATAGCTGGTTAATACCGTGGTATAGCGTACCCAATTCGTGGTTAATACAAAATCGGTATTGTCGATAGACCCCCATAATTCTGTATGTGCTTTATCTCCTACATTATCGGCTTTAGCCCAGAAACTACTAGTATACTGGAATGAATTTTCTAGTTCTTCTAAACCCAAGGATTGTCCTGCTAATTGTCGATTACTTGAGGTAAACACCATACTAGGATGTCCATTGTATTCTGTAGTTGTGGAGACCGAGGACTGCCCAACCCAATTAGAACTAAAATCTGAAGTATCTGTTAATAGGTTGGTACCCACAGCGCTATTAGTAACCTGCGTTTGGAGCTCAACAAAAGCTGGTGCTGTGGTCAAGCCAGCATTATCAACCGTACCAGTGTCACCTTTGTCGCCTTTATCTCCTTTTGCACCTTGCAGTCCTATTGGGCCTTGTTCGCCTTGCGGCCCAGTGTCACCTTTATCACCCTTATCGCCTTTGTCACCCTTAGCGATTGTACTTGCAGCCTTATTCATTGCTTTAACAAAATCATCAAAAGCGATCGTTGTAATACTCGCACCCGATTCGCTCTCAATGTTGTTTGTAATGGTAAAACCTAGTGGCTTATCACTAGGATAAATACTTGTGCCTGCCTGGTCAGTCACCCAAATTTCTAACTGATAATCTCCAGCCGGCAGTCCTGCAATCAAATTAGGCATAGGCTGTAAATTAAGCCAGCCTGGTTTTAGACCAGTCAAACTAGTAATCGTGATAGGCTGACTTCTTAAATAACCACTGGCATTGCCAATCTTGGCGATAATGCTGGTGGCCTGGGTTAAATCGACAACTGATCCGGCGTTTTTGCAAATGAAGGTAAACATCGTCTCGGTGTCGCCTTGCTTTATTTGCCGAGGTGATTTAGTTGTAAACTCTAACGTTTTATCCATCGTATAGCCTCCTTCAATCACAATGCGGGAGATGGCGCTACGTAGTCCTCACCAGTAATTTCTTTGTACTGATCCGTTGTTAGACCGACCCCAACAAATACCTTATAATAATTAGCATCATTTTGACCCCAGGACTTAAATAATTTGCACTCTTCATAAATCGTCATTACTTAGCACTTCCTTTACTTAAAGTTGCCATTTGACTAGCTTGAGCCATTACTAACTGACGCAATTGCATAATATCAGCTGCTTGCTGCATTAATGTTTGTTGCTCAGTCGTTGGCGCTGGCGTCGGTGGCTGTTCACTTTGCTTAGCGTACTCATCAGCGGAGATGCCAGTCCAAGCTTGCCCATCAAAAGTCGGTTGATACAAGCCGTCTGGAACGGCCACGGTAGTGGCATTCTCCGGTTGTGTCACCGCTGATACCGCACCGGCAAAGATCTTCGTCTCTGGATCATATAAATAATAAGTTGTCATTGTTATCCCTCCTACC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_187338206.1|2123465_2123861_-|holin	holin	A0A2K9VCG4	Lactobacillus_phage	3.1e-19	72.5
WP_077143380.1|2123871_2124135_-	hemolysin XhlA family protein	E9LUR9	Lactobacillus_phage	3.1e-36	94.3
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WP_134901158.1|2126678_2126828_-	XkdX family protein	U5U4L4	Lactobacillus_phage	3.6e-05	56.8
WP_077143382.1|2126827_2127139_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_077143383.1|2127150_2129310_-	hypothetical protein	M4ZSB3	Bacillus_phage	3.3e-38	31.1
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WP_015380605.1|2129597_2129819_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_077143384.1|2129811_2130939_-|tail	phage tail protein	O03938	Lactobacillus_phage	7.5e-71	41.8
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WP_077143386.1|2131769_2137400_-|tail	phage tail tape measure protein	A0A1S5SFC1	Streptococcus_phage	7.2e-21	24.8
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WP_063208226.1|2141302_2142250_-|capsid	N4-gp56 family major capsid protein	A8ASJ6	Listeria_phage	2.7e-90	60.2
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WP_077143394.1|2142938_2144024_-	hypothetical protein	A0A059T7W2	Listeria_phage	3.6e-38	31.0
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WP_187338208.1|2150180_2150339_-	hypothetical protein	O03920	Lactobacillus_phage	8.4e-13	73.1
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WP_077143400.1|2150869_2151235_-	hypothetical protein	O03915	Lactobacillus_phage	1.8e-21	39.5
WP_077143401.1|2151239_2151962_-	phage antirepressor KilAC domain-containing protein	Q8SDM9	Staphylococcus_phage	1.6e-50	45.6
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WP_187331638.1|2156960_2157122_+	hypothetical protein	A0A141VTQ7	Staphylococcus_phage	4.6e-06	51.9
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WP_077143410.1|2160238_2160460_-	hypothetical protein	U5U783	Lactobacillus_phage	2.8e-06	41.5
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WP_077143412.1|2161362_2162565_+|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	A0A126GGK4	Streptococcus_phage	4.5e-37	29.5
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WP_003640934.1|2169554_2169965_-	Mini-ribonuclease 3	NA	NA	NA	NA
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WP_021356507.1|2191554_2194404_-	sigma-54-dependent transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_003640911.1|2194709_2195096_-	DUF956 family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_003643922.1|2198282_2199137_-	C39 family peptidase	NA	NA	NA	NA
2199369:2199384	attL	NA	NA	NA	NA
WP_077143414.1|2199562_2200495_-	lysin	A0A2P0ZLG2	Lactobacillus_phage	1.9e-176	96.5
WP_077143415.1|2200494_2200779_-|lysis	lysis protein	A0A2P0ZLE8	Lactobacillus_phage	4.5e-41	95.7
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WP_077143417.1|2201363_2201810_-	hypothetical protein	A0A2P0ZLE9	Lactobacillus_phage	1.3e-50	75.2
WP_077143418.1|2201812_2202262_-	DUF1617 family protein	A0A2P0ZLE0	Lactobacillus_phage	2.0e-22	40.0
WP_187338216.1|2202264_2205342_-	hypothetical protein	A0A0A1ELH9	Lactobacillus_phage	1.7e-72	47.8
WP_077143420.1|2207926_2208748_-|tail	phage tail protein	A0A2P0ZLE2	Lactobacillus_phage	1.5e-148	96.0
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WP_003643912.1|2213365_2213587_-	hypothetical protein	A0A2P0ZLD9	Lactobacillus_phage	3.9e-32	98.6
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2239117:2239132	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP017406|2324437:2385307|DBSCAN-SWA
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MKQSTKFGLKLAGVIGAATYAGTLLGGLAAYQVAMHVSDAQKQQGRERSRAENTEIENFWYFKQPKQQWMIQSFDGLNLVATYIPNPKTIGRLAILAHGLGHSREQMIPYARIFMSLGYDVLMPDARSFGDSQGHTIGYGWLDRLDYERWITMALSQLGLDIDIVLMGISMGAATVMATSGEPLPENVKAIVEDSGYADLYDEAKFRLTHKFHLPAYPIMPVANRLAHVRAGYGFKDGRILQRVIDGGLPILMIHGSKDQTVPVRNAHTLYDQLPQQKGLYIDPDAGHVEAIRTHPDRYQEVLDEFLHEQAGLA
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MQTKKWIRGLVCGLALLGGWSWALPVHATSVKSEQTAVKKIAQRDLKSLGGRWSVKVTRLGRRKLTVQTGNQRMTRQRSASTIKVYVMLTIYRRVQQRKLRLTQQDQNDLKLMIHNSDNNAANRLIKRAGGFRGVNAAIKHYRFKQTVLQRYMLDTNALRWGRDNYTSVADLTRFLTLTYQHKLLGKTYDKKMLTLLKGCRNHSKLPYLVKHATVYNKTGEYPDKGVQNDAAIFKTKQGTYSIVVMAQNGKQYQQYQGMNRLGRDVVTYLNQHH
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MVARLIRVFGYVLAGLGLFIFIQLPVLADGYWNWWGERPQQINIGYHWVALVVLTVGVAVVLVRCYHHYFEMPVLLGPFSWSMMGLTALVAVVVVVIQMGISGLLVSPTETQNDEIMALIHSPLGLLTLVCTNIVSPVLEELLFRGIVQNTLRRYLPVLGAIILTNAVFALGHGYQLASTVGIFITGCGFSWLVLKTKQLSTAMGCHILVNWLVTLINMMWG
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MKSLKQCLLIGMNLGLLAVILSPLAGTTGQWVTLGLGLAVSAALFVVYRRVGQIERSHQNAD
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MRIFDSHTHLNSEEFIQEVPRYLQQAADLDVTRMAIVGSNTQLNADAIKLAETYPQLVAIVGWHPEDAKNYDQAAEKLLIEQVQHPKVVALGEIGLDYHWDTSPQDVQRQVFARQVAIAKEMQLPISVHNRDAFEDTYKILKAADIRDTGGVMHSFNGDPEWLKRFLDLGMHISYSGVASFKNAREVHESVKQTPLTQMLVETDAPYLTPEPYRGKQNEPGYTRYVVEAIAQLRETTPEIIAAQTYQNAEEFFKIEKD
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MDEIISFEFSNGSKILDSNIYEYKVGKESVTKIDLPDSNGFVAVHKDNNKTEYIKALYMKFCTDSHV
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MPISLAAIKDKLDSRIGQRMKVVAQAGRKKTTERHGILKETYRSVFVVDLDQQENAFERVSYSYTDVLTKNVQIAFDDETTEA
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MSDITAAQTTLQQAQHIVFMTGAGVSTPSGIPDYRSKNGLYTEHHNAEYYLSHAFLAEHPLEFYQYLQSNLYYPDAQPNVIHQKMAALTRQGRASVITQNIDNLYGVAKTAQLVEFHGNLYQVYCTKCGQHVDWHEYLKSPYHQTDHGYLRPNVVLYDEGIASANIERAVQYLQQADLVVICGTSFRVYPFAGLIDYRNPKAQVLAINAEPLQLPFAFTMVQQDAVDFFEGVQV
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MAFFGYKDIDKLSGVDLAIYRFIVEHDEQIPYMRVRELARGAHVSNSSVMRFIRKIGYDSFPEFKVSLRSETPIQKPDAPGIQFVQPSAFPADITKIIRLAAQLMVNADNIVFVGIGASAALGEYASRQTSSLGFNSYVVKDPFYPLLPQLRNTSNNVLVAVSVSGQTSELVEMLNDFVNNPEVNIISITSNLESTIARMSRYALTYRATEERIHQYYDLTSQVPCLYIIEALLRELRHQEVVQHRFE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_003642042.1|2326175_2327789_-	CTP synthase	A0A1J0FA14	Only_Syngen_Nebraska_virus	1.2e-143	49.9
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WP_003642040.1|2328614_2329055_-	DUF1934 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_024971479.1|2329417_2330350_+	lipoate--protein ligase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_171786060.1|2330358_2331717_+	HD domain-containing protein	A0A1B1ISR1	uncultured_Mediterranean_phage	5.2e-26	32.9
WP_003642037.1|2331736_2332546_+	sugar-phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_024971609.1|2332714_2333701_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642034.1|2333783_2334806_-	YdcF family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003643830.1|2335094_2336075_-	ribose-phosphate diphosphokinase	A0A2K9L8D8	Tupanvirus	4.9e-42	36.3
WP_003642032.1|2336440_2337265_-	serine hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_003642031.1|2337500_2338883_-	bifunctional UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase GlmU	A0A2K9L140	Tupanvirus	5.7e-28	33.2
WP_003642030.1|2338951_2339788_-	pur operon repressor	NA	NA	NA	NA
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WP_077143456.1|2340558_2341101_-	ankyrin repeat domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642026.1|2341649_2341811_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003646500.1|2343955_2344753_-	metal ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_003642023.1|2344745_2345444_-	ABC transporter ATP-binding protein	A0A1V0SGN0	Hokovirus	1.2e-15	27.8
WP_003642022.1|2345712_2346657_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_003642021.1|2346966_2347833_-	4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol kinase	NA	NA	NA	NA
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WP_003642019.1|2348321_2349212_-	16S rRNA (adenine(1518)-N(6)/adenine(1519)-N(6))- dimethyltransferase RsmA	NA	NA	NA	NA
WP_011101014.1|2349208_2349772_-	ribonuclease M5	NA	NA	NA	NA
WP_003642017.1|2349758_2350535_-	TatD family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_003642016.1|2350657_2351842_-	multidrug effflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_003643823.1|2352074_2354126_-|tRNA	methionine--tRNA ligase	A0A1V0SHR2	Klosneuvirus	2.7e-90	35.8
WP_024971611.1|2354447_2354837_-	NUDIX domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642012.1|2355433_2356276_-	DUF72 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642011.1|2356275_2356980_-	NAD-dependent protein deacylase	NA	NA	NA	NA
WP_003642010.1|2357001_2357961_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642009.1|2357953_2359228_-	hydroxymethylglutaryl-CoA reductase, degradative	NA	NA	NA	NA
WP_003642008.1|2359273_2360191_-	Ppx/GppA family phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_003643820.1|2360359_2361154_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642006.1|2361158_2362292_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003643818.1|2362745_2363759_-|tRNA	tRNA-dihydrouridine synthase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642004.1|2363871_2364618_-	MurR/RpiR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_003642003.1|2364767_2365664_-	ROK family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003642002.1|2365784_2367221_-	6-phospho-beta-glucosidase	A0A0B5JD41	Pandoravirus	9.7e-31	25.5
WP_003643816.1|2367238_2368594_-	PTS sugar transporter subunit IIC	NA	NA	NA	NA
WP_003642000.1|2368816_2369239_-	DUF3284 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641999.1|2369228_2369417_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641998.1|2369423_2370785_-	PTS sugar transporter subunit IIC	NA	NA	NA	NA
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WP_003643815.1|2371975_2372992_-|tRNA	tryptophan--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_003643814.1|2373430_2374207_-	carbon-nitrogen family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_003641994.1|2374465_2376775_+	ATP-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641993.1|2376869_2377073_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_077143457.1|2377210_2377897_-|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
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WP_003641990.1|2378757_2379426_-|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
WP_003641987.1|2380272_2381649_-	HlyD family secretion protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641986.1|2381664_2383815_-	peptide cleavage/export ABC transporter	W8CYL7	Bacillus_phage	6.1e-45	27.9
WP_003641985.1|2384081_2384252_+|bacteriocin	two-peptide bacteriocin plantaricin EF subunit PlnE	NA	NA	NA	NA
WP_003643811.1|2384276_2384435_+|bacteriocin	two-peptide bacteriocin plantaricin EF subunit PlnF	NA	NA	NA	NA
WP_003646470.1|2384533_2385307_+|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP017406|2388736:2434160|DBSCAN-SWA
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MKIKLTVLNEFEELTADAEKNISGGRRSRKNGIGYAIGYAFGAVERAVLGGSRDYNK

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_003641972.1|2393409_2393583_+|bacteriocin	two-peptide bacteriocin plantaricin JK subunit PlnK	NA	NA	NA	NA
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WP_003641969.1|2394659_2394863_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_003641965.1|2399353_2400226_+	AraC family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_003641962.1|2402249_2402867_+	sugar O-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_003641960.1|2403248_2403524_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641956.1|2404794_2405202_-	immunity 63 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_114071742.1|2405278_2405425_-	glycohydrolase toxin TNT-related protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641954.1|2405627_2405819_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641952.1|2406268_2406655_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641950.1|2407034_2407313_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641949.1|2407424_2407688_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641948.1|2407731_2408649_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_033607791.1|2408645_2408921_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641946.1|2410410_2414094_-	MucBP domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641945.1|2414680_2415403_-	aquaporin family protein	M1HWZ0	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	3.2e-30	31.9
WP_003641944.1|2415417_2417247_-	type 1 glycerol-3-phosphate oxidase	NA	NA	NA	NA
WP_003641943.1|2417261_2418779_-	glycerol kinase GlpK	NA	NA	NA	NA
WP_024971425.1|2419244_2420576_-	NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_003641941.1|2420653_2421625_-	ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	1.7e-23	31.7
WP_003641940.1|2421625_2423152_-	ABC transporter permease/substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641939.1|2423389_2423836_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_024971424.1|2424725_2425637_-	oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_077143458.1|2425773_2426694_+	ribonucleoside hydrolase RihC	NA	NA	NA	NA
WP_003641936.1|2426859_2427432_-	acetyl-CoA carboxylase biotin carboxyl carrier protein subunit	NA	NA	NA	NA
WP_003641935.1|2427535_2427991_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641934.1|2428009_2428480_-	Rrf2 family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_003641933.1|2428589_2429786_+	DUF2075 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641932.1|2429816_2430326_+	YbhB/YbcL family Raf kinase inhibitor-like protein	NA	NA	NA	NA
WP_003643763.1|2430438_2430807_-	DUF1304 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641930.1|2431071_2432577_-	multicopper oxidase domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003641929.1|2432734_2433403_-	ribose 5-phosphate isomerase A	NA	NA	NA	NA
WP_003643762.1|2433596_2434160_+|protease	matrixin family metalloprotease	NA	NA	NA	NA

2. NZ_CP017407

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	17566 : 25016	8	Lactobacillus_phage(33.33%)	transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP017407|17566:25016|DBSCAN-SWA
TTTGTCTAGTATAACCTATTCCGAACGAATTAAAATCGAAACCTTTTGTGAACTAGGGCTGTCCAATATCCAAATGGGCGTTCGGCTGAACCGATCACCGTCAACAATTTCTTATGAATTAGCTCGATGTCAACCTTATCAGGCTGAATTAGCACAAACAGATGCCGAATACAAGCGATCACGATGTGGTCGGAAAACTAAGCTGAGCGATGAGTTAAAGCAAAAAATTCTCAACCATTTACGTCTAAGCTGGTCACCAGGAATGATTGCTCACGAATTTAAACTAGCTACTAAATCTATTTATAATTGGCTAAATCAGGGGAGAATTGGTTTCTCCTTGAATGATCTACCTGAACATGGCGTACGCCAACGGCGTAACGTTGACCAACGATCCAAATATAATCAATCTTTGGGGCGATCAATTGAACAGCGTCCCATGATGATTAATCAACGTAATCGCATCGGCGATTTTGAACTAGATACAGTCGTTGGTCCTCGTGGGCATAGTAAGGCAGTTTTATTAACTTTAATCGATCGAAAATCACGGTTCTTTTGGGCATACCGGTTAAAAGATCGGACGACAGCGACTGTTAATGAAGCACTAACTAAGTTCCTAACCACTTTTAATGGTCCGGTGCACAGCTTTACTGTGGACCGTGGCACTGAGTTTAGTGGGCTAGTATCACTTGAATCACAATATGGTATTAAGACCTATTACTGCCATGCTTATACGCCAGCTGAACGTGGTAGTAATGAACGCTTTAATCGGAATTTACGTTATTTTTATCCTAAAGGGACTCGTTTTGAGCACATTAGTGCTCAAGATTTAACGACGACGTTACTCCAAATTAACCAGCGACCGCTTAAAATACTCGACTGGCAAACACCGTATCAGGTTATGCTGACAAATTTGTCCAAAAATTCGGATTAAATTTGCAATCTACCCTTAACACGGTTCTGATCATTTTAGGTATGCTAGGTGTAATTACAGACGTACAAACTGTAAACGTCTCACAGGACACGACAGGCACCTTAGAACATGTTACAAACGAGGTGGACTCCGCTAGCCAAGCTGATAAAAGCACCAACTAGTGCGAACGTTTCTAATGTGACCTCAACTAGTGCTGAGATTAAAGTAGATGACAAAGCTGAATAAAGTAAAAAGGTCTATCCTCAATTGGGTAGGCCTTTTTATTGTGCAGTTAAGTAAATGAAAGTAGTGTGCAACGTCATGTCATATAGCACAAGCATAGTATAGCATTATTAAAGCTAGCTGCAACCACTAAAAAAGTGGGCACCCGGGTAAGTGCTCACTAAGAAGTTGTCACATTATGAAGCTAAATACCATGAGTCCCGACTAATAGGGACAACTTAATCTTAACTCATTATCATTAAATTGCAATAAAAAAGTGACTACCCTAAAAAGATAGTCATTTTCCCTATAAATGGCACACAGATTATTATAATAACATTAAAATCAATAAAATAAAAAGGTCTATCCAATTAAGGGTAGGCCTTTTTATTGTGCAATTAAGTAAATAAGAGTAGTGTGTCATGTCAACAGCACAAGCTTAATTATAACACTATTTTAAGCTAGTTAACATAATGTGGCTTATCCCAAGTAACCCTCTCACTCCCTGATAAAACAACGATCCGTTATTTGGCCTTTGTGAAATTTGACGGGAGAGGAGTGGTCTAGATGAAAAATCCCCAAAAAATCAGTAAACTCACTTTGTGAATTTAACCGCCTAAATTCCTAGACCATTGCGCCAATCGTGCCTGACACCAGTCCAAAAAATCCCGTTCTGAAATCGTTGGTGTTCCCGTCAATAACTTTTTTGTGATGGGCTCCTCACCTAAAGCCGTCTCAATTAACCCAACCACTAAATAATCTGTCTGTTTCGTAACCCAATTTTGTGGTTTCGCCCCAAAGACTTTCGCCAAACTAAAAGCTTGTTCCCGATTCATGGTAGTTAGACGTCCGGTAAAAGCAATCTCACAATCTCTTAAATCAAGCATTTTAAATCATCAACTTTCTTGATTCTAATGTTGGTTTTGACTTGACGGGTTATGGTTTTCCATTCAGTTTAGAGGGAGTGACGTTTTGAGCGCAGAATTGTTCCCTGGAAACAGCTATTTGGAATAACTGAACCAGAGTGCAATTCTACGCTAAGGTTTCCCCCTAGTTCGTCGGTCGTTAACGCCCGTCGCTTGTCTGTACAATTGCGGTATTGCTACCACCACTCATTATAAACCTACGTTTTCGGTTTAACCTACTAAAAAACGCCCTAGTAGGCGTTGGCAATACGTATTTATGTTTGTTCGATCACCAACTAATCAGTGGCACCAAGCCGAAGCTTCGTTTTACCACCCGCGCCGTTAATGGTCGCGCTCACCATTCACCACCCAGCCGTACAGATGACCTTGTTGTGGTATAGCCAGACTTATTGAAGTCGCCCTGGCAAACGTGTCCCCTTAGATTTAGACCCCAGCTTGTCCCCTAGGGCTTTAAAAATCGCACCGGCCATGATATAATAGTCATTAAACAAGTTGACTTTTATGTGGCGCTCACCGATGCCAGTCGGTGGGTGTTTTTTTTTATGCAGTTTTTTAGGTATTACTTCTTTTGAACTACTGACAGTGTCCCCCATGATTCACAGTTAGTACAGCAAACGGTGGAAATAATGTTAAAAGCACATCATATAATAGGACTGTCAATACCAATGATTATAGCCCTTTCATAGGATATCTGTCAACAATTATATTTAATTTCCCTTTTTCCCTTTATCTATTTTTCCCTAAATAGAATTATCTCTAAATAGAATTATCCCTATATCCCTTTTTCTATTTAGGGATATTTTTAATTCCCATTCTAACAGTGTTCTCAGTCGATAAGTATCCCTTTTTCCCTTTATCCCAATTTCTATATATCCCTAATTCTATATATCTAAATAACTATTTAGGGAAATTTCCCTTTTGCTATTAAATTGTGGTATACTAATTAAAAATCAATTGGAGGTCGTTGTTATGGATATTCCAGACGTAGTAAAGGCTATACAGTCTCGTGATGAGGCATTAACCATTGTGATTGGTAATCAAAAGGGTGGCGTGGGAAAAACAACTAACACGTATCTCATCGCTTATACCTTAGCTAAAATGGGAATACATACGTTGGTTGCAGACTTAGACCCACAAGCCAACGCCACTAAAACACTAATGTTAACGAAAAGTCAGCAGGAAGATACCGTGTACTCAATTAAAAAAACTCTGATGGTAGGCGTACAGGAGAAAGATCTAACAGACTTACCAGTTAAGATAATGGATAACCTTGACCTAATTCCTTCATATATTGATTTCCAAGATTTCACGAAATATTTATATCAGAATACGAATAATGAGTACGAAGAAACACATCTGTTGGAACCCTTGTTTAATCCATTGAAGAAGAAATATGATGTAATTCTGTTGGATGTGCCACCATTTAGTATTGAGATTACCCGTAATGCTGTTATCTTCTCAGACTTTGCACTTATCAGCTTGCAAACACACGATGATAGTCTATCCGGTGCAGAAGAGTATGTGAATACCCTTTCCAAACTTCAGCAAGAGTATCAGCTAGATATAGAGGTAATTGGTATCTTGCCAATGCTTCACGATGCCCGTAACGGTGTCGATCAGACAATCATACAATCTGCTAAGGATGAGTTTGGAGAAGAAAATGTATTCACAAATATTGTTACTCAAATGGCCCGGATTAAACGATTCCCAATTAATGGAATTACCGATAAGGACCGCTTCGATAAGCGAGTGTTAGACAAGTACCAGCAAGTTACCGATGAGTTATTAAGCCGGATTGGCTTATTTATAGATGATAAGGAGGCCAAGTAAGATGCCAAGTAAAAAGCCTAATATTCTTCAACGAAGGGTTACCGGAGCGGTAAAGCCATCAGAAGAGTACCATGCAACAGATAATGCTACGAAAAAAGAGAATAAATCTTCCTCTATACCAAAAAATCAGAAAAAATCCCTTAAGGTATCCGCAGAGACTTACAAGGATATGAAAGTCCTGAAGACAATTGAACATGTTAGCTTCGACTACGAGATTATCCAGCTTCTTATTGACCAGTATTACAAGGATATGACCGAGGAACAACAGCGCAGGTATACCGTATTGCGGGAGAATATGTAAGCAGTGCTACATTAAAATAAAAGAAAGAAGTAATGGTAGATTGCAAATTTAATCCGAATTTTTGGACAAATTTGTCAGCATAACCTGATACGGTGTTTGCCAGTCGAGTATTTTAAGCGGTCGCTGGTTAATTTGGAGTAACGTCGTCGTTAAATCTTGAGCACTAATGTGCTCAAAACGAGTCCCTTTAGGATAAAAATAACGTAAATTCCGATTAAAGCGTTCATTACTACCACGTGGATGTAAGCTGATTCCTGAGACAACTTTTAAGAGAGCGTATAATGAATAAATCGTCTCTCAAAAGGAAGGAATTTTTACATGCCAACTCGTTACGACAAAGAATTCAAACAAAACATCATCAACCTATATAAACAAGGCGAATCAGCCGCCCAACTGGCCAGAGAATATGGCATTGGCTATTCAACCGTTCATAAGTGGATCCAGGGCCAAGCCAAAACTCAATCCGGTAAATCGCCAGACGAAATTAAAGCGATGGAAAAGCGGCTGGCTTCCCTGTCTGAGGAGAACGAAATCCTAAAAAAAGCCCTGGGCTTCCTTGCGCAGAAGTAACCAATATTTTTGATTACATTCACCAAGAAAGCCATAACCACCAGGTAACTAAGATGTGCCGAATCCTCGGTGTTTCCAGAGCTCAGTATTATCGTTATCGATCCCCCAAGCCTTCAAAACACCGGGCCGAAGATGAGGACTTAAAACAACGGATTCTGCGGATCTTTGCGGAATTCAAGCAGCGATACGGCGTTATGAAGATCCACCATGAATTGAATCTGGAACTTCAACCACTGCAGCGTCGGTGCAGCCCAAGACGGATTTCCCGGCTCATGAAGGAACTGGATATCCACTCCGTTACCGTCAATAAATGGAAAGCGGCTTCGGCTTCCAAAACCAAGGTTGAACAGCGTCCCAACTTGCTTAAGCAGGATTTCTCGACCACTGGTTTAAATCAAAAATGGACCGCTGATATGACCTATATTCAAACGAAGCGTAATGGCTGGTGTTACTTATCAACCATCATGGACCTGCACTCACGACGGATTATCGGCTATTCGTTCTCAAAAAAGATGGCTACTGATTTAGTCTTAAAGACCCTTGAAAGCGCGGTTAAAAATCGAACCATTACTGGGGACCTGATTATCCATACGGATTTAGGATCACAGTATACCAGTGATGATTACAATCAACGTTTAACTGAACTATATATCCGCCACTCATACAGCCGTAAGGGTTGTCCGTATGATAATGCGCCAATGGAATCCTTTCACGCTTCCCTCAAAAAGGAATGTGTTTATCCAGTGCCGGTCTTTGAAGATTATGAAACTGCCGCTGCCGTCCTTTTTGAATATGTGCATGCTTTCTACAACTAGGAAGAGAATTCATAGTTCACTGGGCTACCAGACCCCCTTACAAGTTGAAATTGCAACACTTACGAGCCAAATGGCCGTCTGATTTAATGCTTTCCAGGGTTCAAATAAGTTATTAATCGCGATTAATGATTTATTTGAGCTGTGGAAGGTAAACGCGGTTCTGAATGTCTCTTAAAATCTGTCTCAAATATTGACTTCAATCCACAAATTATGGAAACACAATATACATATTTTTGTCAAAAGTCAGGCGAGATTTTCAGGGAGCAGTAGATTAAGTAGTACAATGTAGATATCGAGTTAAATGGAGGGAATTCAATGTATAAAGCGGTTGTTTTTTTTGATCTAGATGGCACACTATTTGATAATCAAAAGAATGTTTCTGATAACAACATTGCAGCAATTAATCAGTTACGAGAGAACAATATTCTCCCTGTAATTTCAACTGGCCGAAATATTTTTGAAATTCAATATGTGATTGACGCTACCGGTATCAATTCATTAGTCAGTGCGAACGGTAGTTACGTTCAATATCAAGGGAAAAAGCTAAAGGCTGAGCAAATTAGTGATGAGGTGATTGAAGAGATTTTAGCATTTGCCAAAAAGCAGGGCGATGTGATTTCATTCTATAACAATGAAGAATTTGCCTTAACAGCTGAAAATGACTTAACTAAAGTTAACTATCGGCTGTTAAGATTGACGCCGCACGTTGAGCCGGACTTTTACAAGACTCATGAAGTCAATTTCTTGAACGTTTTTAATTATGATAAAGATAAACTGTATCAGGATGAATTCAAGGGTGAATTGTCATTGGTTAGAAATAATCCTCGCTGTTTAGATACGATGAAGTGGGGGGTATCGAAGCAAACCGGCATTCAAGCACTCTTGAAGAAAGCGCAATTAGGGGACATTCCGTCCTATGCTTTCGGAGATCAGCTGAATGATTTGCAAATGTTTGCTGAAGTGGATTACCCAGTCGCAATGGGTAATGGTCACCCAGATGTGAAAGCCAAAGCATCATTCGTCACTACTTCAAATGTGAATGGCGGAATTGTGAATGGGCTGAAGCATTACGGGTTAATCAAATAACTTACGACATGCAATCATTTAAGGGCTTCACCCTGAAATCCTCGTTTTGGATTTTGGGATGAAGCCCTTAAATGATGGGATTAAAGCATCAATTGTCCCAGTTTTCCAAATGGATTGAATTAGTCCATCTGTTTTTTAATGTTAGCCAAGGTCATTTCACTGGTATCAGTAAAGTTCACATCTGCATCCTTCAAAATTGTCTTGTCACCAATTCCAATGGAGGTTTCCCCAGCGGCGTTAATTGATTCAACTCCAGCGGCAGCATCTTCGACTCCAATGCATTGTTCTGGTTTCAAATTGATCAGTTCGGCACCTTTGAGGTAAATTTCTGGATCTGGTTTGCCTTTGCTCAAAGTTTTTGGATCCACAATCTTTGGAAAATAATCAGTCAATTGTAGCTTCTTCAAAACAGTAGGAGCATTTTTTGATGCAGAAGCTAATGATAACAGATAACCACCATCTTTAATTTCATCCAGGAATTCTTTAATCCCCGGAAGAATATTAGCTGGAGTCATTTTGTCAACCAACTTCAAGTAGTTTGTATTTTTTTCCGTTGCAAGATCAACCTTCTGATCGTCAGTATAGTGGTCTTGTAGATTACCTGCTTTTAAAATCATTTCAAGAGAATCCATCCGGCTGATTCCCTTTAATCCGTCTTCAAGTTCTTTGGACCATGGGGCACCCACCTTGTCAGCAACTTGATGCCAAGCTTGGCTGTGGAAAACCGAAGTATCCGTAATTACACCGTCGAGATCGAAGACAAAACCTTTAATATCTGAAAACTTTGCCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP017407|17566:25016|22377_23139_+|WP_077143518.1|transposase|DBSCAN-SWA
MCRILGVSRAQYYRYRSPKPSKHRAEDEDLKQRILRIFAEFKQRYGVMKIHHELNLELQPLQRRCSPRRISRLMKELDIHSVTVNKWKAASASKTKVEQRPNLLKQDFSTTGLNQKWTADMTYIQTKRNGWCYLSTIMDLHSRRIIGYSFSKKMATDLVLKTLESAVKNRTITGDLIIHTDLGSQYTSDDYNQRLTELYIRHSYSRKGCPYDNAPMESFHASLKKECVYPVPVFEDYETAAAVLFEYVHAFYN
>NZ_CP017407|17566:25016|20592_21453_+|WP_013356270.1|DBSCAN-SWA
MDIPDVVKAIQSRDEALTIVIGNQKGGVGKTTNTYLIAYTLAKMGIHTLVADLDPQANATKTLMLTKSQQEDTVYSIKKTLMVGVQEKDLTDLPVKIMDNLDLIPSYIDFQDFTKYLYQNTNNEYEETHLLEPLFNPLKKKYDVILLDVPPFSIEITRNAVIFSDFALISLQTHDDSLSGAEEYVNTLSKLQQEYQLDIEVIGILPMLHDARNGVDQTIIQSAKDEFGEENVFTNIVTQMARIKRFPINGITDKDRFDKRVLDKYQQVTDELLSRIGLFIDDKEAK
>NZ_CP017407|17566:25016|22072_22324_+|WP_002816285.1|transposase|DBSCAN-SWA
MPTRYDKEFKQNIINLYKQGESAAQLAREYGIGYSTVHKWIQGQAKTQSGKSPDEIKAMEKRLASLSEENEILKKALGFLAQK
>NZ_CP017407|17566:25016|24344_25016_-|WP_039098360.1|DBSCAN-SWA
MAKFSDIKGFVFDLDGVITDTSVFHSQAWHQVADKVGAPWSKELEDGLKGISRMDSLEMILKAGNLQDHYTDDQKVDLATEKNTNYLKLVDKMTPANILPGIKEFLDEIKDGGYLLSLASASKNAPTVLKKLQLTDYFPKIVDPKTLSKGKPDPEIYLKGAELINLKPEQCIGVEDAAAGVESINAAGETSIGIGDKTILKDADVNFTDTSEMTLANIKKQMD
>NZ_CP017407|17566:25016|23454_24225_+|WP_045353665.1|DBSCAN-SWA
MYKAVVFFDLDGTLFDNQKNVSDNNIAAINQLRENNILPVISTGRNIFEIQYVIDATGINSLVSANGSYVQYQGKKLKAEQISDEVIEEILAFAKKQGDVISFYNNEEFALTAENDLTKVNYRLLRLTPHVEPDFYKTHEVNFLNVFNYDKDKLYQDEFKGELSLVRNNPRCLDTMKWGVSKQTGIQALLKKAQLGDIPSYAFGDQLNDLQMFAEVDYPVAMGNGHPDVKAKASFVTTSNVNGGIVNGLKHYGLIK
>NZ_CP017407|17566:25016|17566_18496_+|WP_077143517.1|transposase|DBSCAN-SWA
MSSITYSERIKIETFCELGLSNIQMGVRLNRSPSTISYELARCQPYQAELAQTDAEYKRSRCGRKTKLSDELKQKILNHLRLSWSPGMIAHEFKLATKSIYNWLNQGRIGFSLNDLPEHGVRQRRNVDQRSKYNQSLGRSIEQRPMMINQRNRIGDFELDTVVGPRGHSKAVLLTLIDRKSRFFWAYRLKDRTTATVNEALTKFLTTFNGPVHSFTVDRGTEFSGLVSLESQYGIKTYYCHAYTPAERGSNERFNRNLRYFYPKGTRFEHISAQDLTTTLLQINQRPLKILDWQTPYQVMLTNLSKNSD
>NZ_CP017407|17566:25016|21454_21754_+|WP_048481076.1|DBSCAN-SWA
MPSKKPNILQRRVTGAVKPSEEYHATDNATKKENKSSSIPKNQKKSLKVSAETYKDMKVLKTIEHVSFDYEIIQLLIDQYYKDMTEEQQRRYTVLRENM
>NZ_CP017407|17566:25016|19305_19584_-|WP_076632997.1|DBSCAN-SWA
MLDLRDCEIAFTGRLTTMNREQAFSLAKVFGAKPQNWVTKQTDYLVVGLIETALGEEPITKKLLTGTPTISERDFLDWCQARLAQWSRNLGG

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_077143517.1|17566_18496_+|transposase	IS30-like element ISLpl1 family transposase	H7BW47	unidentified_phage	2.3e-25	34.4
WP_076632997.1|19305_19584_-	BRCT domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_013356270.1|20592_21453_+	ParA family protein	F0PIG8	Enterococcus_phage	1.7e-43	40.2
WP_048481076.1|21454_21754_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_002816285.1|22072_22324_+|transposase	IS3 family transposase	Q6J1X3	Lactobacillus_phage	9.2e-38	96.4
WP_077143518.1|22377_23139_+|transposase	IS3 family transposase	Q6J1X2	Lactobacillus_phage	6.7e-140	98.0
WP_045353665.1|23454_24225_+	Cof-type HAD-IIB family hydrolase	Q0GXW5	Lactococcus_phage	6.4e-05	24.4
WP_039098360.1|24344_25016_-	beta-phosphoglucomutase	A0A1D8KNV9	Synechococcus_phage	6.0e-07	22.7

3. NZ_CP017408

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	20897 : 34181	15	Bacillus_virus(20.0%)	transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP017408|20897:34181|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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>NZ_CP017408|20897:34181|26569_28009_-|WP_045353556.1|DBSCAN-SWA
MNLQLLTDLYEFSMANGYYATLPHDRQARFDVFYRRIPDNGSFVIVAGLQQVVEQVQNWHFTKENIEYLTSLNEFTPEFLDYLSKIKNHCSIKALPEGTPVFPREPIISISGPLIEAQLLETFILNIINHQSLIATKSWQINHAAQGRPIMEFGARRAQGPDAATYGARAAVIGGCTSTSNLQAASKFNIPAAGTMAHAWVESFSDELSAFQAWAKVYPDKVSLLVDTYDVLQSGVPNAIRVFKQVSAQGHQPVGIRIDSGDISQLAIKARKMLDDAGFPKAKITASNALDAHVVKSLLDEGAPIDNFGIGERLITSSSSPVLSGVYKLAEEKINDQWIPKIKVSDSREKITLPGNKQVYRIYRQDNLHQAIADVIALADEHITAPLKVVNANSAATHASQVLTNFNAKPLMQEYLGSNASPIENDLFKIQQFSMDQVAELPEATKRLVNPDRYPVYLTATLAELQEQLITKAQFTEEH

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_077143525.1|20897_21827_+|transposase	IS30 family transposase	H7BVY4	unidentified_phage	9.1e-22	29.7
WP_063725122.1|22036_22627_+	recombinase family protein	M9Q1K0	Clostridium_phage	8.3e-21	35.9
WP_171032675.1|23282_24539_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_128384001.1|24656_25319_-|transposase	IS3 family transposase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	8.7e-35	38.5
WP_045353553.1|25413_25902_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_045353555.1|26019_26568_-	cysteine hydrolase	G3MA16	Bacillus_virus	1.0e-28	41.9
WP_045353556.1|26569_28009_-	nicotinate phosphoribosyltransferase	G3MA18	Bacillus_virus	5.8e-100	43.1
WP_035426685.1|28123_28828_-	NUDIX hydrolase	A0A0E3JJF3	Streptomyces_phage	5.3e-06	31.1
WP_063488830.1|29050_29392_-	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_076612162.1|29363_30138_-|transposase	IS5-like element ISLpl3 family transposase	A0A0N9SHJ4	Paenibacillus_phage	7.1e-28	54.1
WP_128384000.1|30142_30415_+	DUF536 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_061468183.1|30522_31698_+|transposase	IS256 family transposase	A0A0N9STL0	Staphylococcus_phage	1.8e-27	29.2
WP_011373852.1|31898_32819_-|transposase	IS30-like element ISLsa1 family transposase	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	9.2e-51	38.2
WP_011669001.1|33152_33392_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_077143526.1|33395_34181_-	ParA family protein	A0A1X9I765	Streptococcus_phage	1.0e-37	37.2