Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019588 | Bacillus anthracis strain SPV842_15 chromosome, complete genome | 5 crisprs | cas3,csa3,WYL,c2c9_V-U4,cas14k,DinG,DEDDh,cas14j | 0 | 1 | 10 | 0 |
NZ_CP019589 | Bacillus anthracis strain SPV842_15 plasmid pX01, complete sequence | 0 crisprs | RT,c2c4_V-U1,csa3 | 0 | 0 | 12 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP019588_1 | 1064106-1064199 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019588_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP019588_1
>1.1|1064131|44|NZ_CP019588|CRISPRCasFinder GCGGTATAGGGAAATTACAAGATGGATCCGGAAAAGTAACAGAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019588_1
The CRISPR arrays of NZ_CP019588_1 >merge|NZ_CP019588|1|1064106-1064199|CRISPRCasFinder GGTTTAAATACGTTAAATAGCAAAAGCGGTATAGGGAAATTACAAGATGGATCCGGAAAAGTAACAGACGGTTTAAATACGTTAAATAGTAAAA >NZ_CP019588|1|1|1064106-1064199|CRISPRCasFinder GGTTTAAATACGTTAAATAGCAAAA GCGGTATAGGGAAATTACAAGATGGATCCGGAAAAGTAACAGAC GGTTTAAATACGTTAAATAGTAAAA
>NZ_CP019588.1|WP_000963385.1|1062589_1063162_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MAIDRKRSIIEAATKYFSAFGYKATTMDQVAKLANVGKGTIYTFFKNKEELFGEIISNLITEMKQVAENAIRSDVSFFENVHRALYSILEFRKEHQLMIKLIQEERDMGTKEVQEVMQQVDVEIVSVIQSYLKIAIDKGEISKCDPEITAFIMLRLYVSLIFDWEKNHEPLEKEKIAELFELYLLKGLSN >NZ_CP019588.1|WP_003170545.1|1060477_1062376_+|M56-family-metallopeptidase MIDMLINVYLPHFFDWLIETSLMASILVGFILCIKILFRNKLTPRWQYMLWIVLMIRLLLPWSPDSSYSIYSLLSYRSSVSEVIPKNMPSTESKMNIESDRKVELESHAETVTKSGKPEVNVSTEQQITLSLYKIAMYVWLVGVFLLAVITFITNRRLYSYIKKQPDITDEQVVTVFNRCKQSMKMKKAVSLRLAGKIASPTVFSFFRPKVLLSKKHMKVLNEQQLQYVFYHELAHIKRNDVAVNWIMYSLILLNWFNPILWYAYFCMREDQELACDAYALTFIDKEEQIAYGHTIITLLEHYSYQAPSLANLSRNKRTMKRRIVMIKKFQKKSYRLSLLGVIVIVAIASLSLFNVRATEGKEKQEDKVEQSKDAFQNAVDMLYGTEENAKKEYHYSARVYEEKTDYLYLAEKALTKDEFQQYIKLSKKIINIQKKGAPRDSDYESTVFREERLSKADRDKLYALYDQAKPFDDKVYESLNYTVKEAQQHVDFQIKKPTYTIEGYNLKDENVGYFIKRRPELIIELEYTNAKGNYTIYQSQVFGESKDPFSHQFVVPENIEQYELEGNQIFYATDHSDSNLQGMKMIVPAKGKNSAYQVVIINHSLERQGEAVFDKNVNKEELEKIMISMLK >NZ_CP019588.1|WP_000184500.1|1060073_1060472_+|BlaI/MecI/CopY-family-transcriptional-regulator MTNQLPKISEAELEIMKVLWLKSPQTANEIIEELEDPMDWKPKTIRTLINRLVQKEAVSYHQDKGRMYAYYPLVSQDNYLQVETKSLLKRFCGAAFKPLLVNFLKEEKLSSEDINELKRLLDEKTEENKRKD >NZ_CP019588.1|WP_000984150.1|1059004_1059844_-|hypothetical-protein MMRALRLNIKQAFCNRVSLIIMFSGFVLICIYHYYYVIRYLGDAASGPISTDIKWIGFRDNEMDVYLLLMPIIASLPFSTSYNSDKSDGFKQFVSKGINLFSYSITKYIVTFFCGGLLYTLPFILSLLFCKLTIPDGEMPAGSGIINVNGMFASLYEASPIIYITVYIEINFLFAGLMALLGLAASAWSQKDYMSLLFPFAATSIPYVLLNTVFPTIGGAPIHLYDPKQPLDGMSPYILTVQCAFFLFVSLLMYIRGVKRDRKKYRRRLQKRDRCRKTF >NZ_CP019588.1|WP_003170543.1|1058654_1059008_+|hypothetical-protein MQAQLNGKLMNQLAIFFSTIVMLQFIADVTGFTQNLDITYNLIHTAASYITFSLAVIFTLIGARRELSKYAIISLCLVVGIKAKGSLFYGDWLARRKRIVNKPLISKIVRKLEVYYT >NZ_CP019588.1|WP_000279249.1|1056136_1058503_+|endonuclease MAVKKLLSVFLSFILLLSFTGTLVQAEETTSMSVEKAIQVFKQQGKTKGTVEGYIVGYTQSPSKYTKDPAKFDDTNVAIADSPNETNPDKIMPVQLPKGDVRAAVNVKDHPENIGKKVSLTGTLELYFSSPGLKSVTAHKFQGEEQNRVSDVVASPNGGEVAKGTAVTLTTNTEGATIYYTLDGSNPTNKSVRYNGQIIVNENSVMKAIAEKEGLTSSPISTFSFVIVNNEPVRIHDIQGKSHLSPYNGKKVYNVEGVVTALDKNGFYIEDNQPDNDPATSEGMYVYKKDANVAVGDLIQVDGVVEEYVGPGYAERFETDLTTTEIKASRVAVIAKDQPLPAPIVLGENGVKIPDQIIDNDAFGLFDPNEDAIDFYESVEGMRVTMPTPKIIAPQKNGNLYVTVKNGGNKVVTKYGTPVLDENQLNPERLSVKVPRDYVAKVGDTFTGDIIGVVGYDYGSFRIAPITELPSVVDGGFKQIGANIQPRLDKLTVATYNIENFSANKKETTDEKVKALAYSIKYNLKMPDIIGVEEMQDNNGTVNDGTTDASLSAKRIIDAVLEIRGPKYEYVEIAPNNNLDGGAPGANIRVGFFYNPSRVKLATVPKLLDKNVVRIGDENPLFESTRKPLAAEFTFQGQNLVVVANHLNSKIGDATPFGKVQPLVLKSEEKRVQLAQEVNNFVQGIQKKNTNAPVVVLGDMNDFEFAKPLKTLEGTILKNMLNTVPKENRYTYIHEGNAQVLDHILVTNNIAPHTIVDPVHLNTNIMKEHGRVSDHDPVLAQIDLKKAS >NZ_CP019588.1|WP_000453710.1|1054543_1055896_-|DUF4026-domain-containing-protein MEVQTETYRAAMNGTLERHFSDMIAVIPTRITIEQLKQRLENIATKVDELKIVYSDETSLIVELHMDNKVIPYELHIDETDDPEEYKLYNRQDSTIVDRSFEDAAYGTEIFTRTLFVGDVLNCFFQQLQFLWNLAPDLLFVIDSSAAMKVISRNYIEYHVENELLPDIPDLYVIHSVYEDDKEGEPTQYWFHTHGLLRAGVTEIELIIPNRISSYYGIGDLFQTFANNAVENGQVPMNEPIVIAHSQQGSIHTVAVPWEKGLSYIGHKTSMDQLSSIEDEEVKLQPISAQNTFLGGMDDRDEYHQSPSVLLFKFDTSEEYIESFFKEHEEATGLMFYKTNSETARMAYNAKNTFGYFSNIFQIEQSNEEFRFLAKFGVSYEEGKSEHMWFEMQHITEEFIQGILINEPYFIEDMSEGNSYHLDFDDLTEWVIYAGDAVIKPNNLYMFIGE >NZ_CP019588.1|WP_001228080.1|1053082_1054504_+|protoporphyrinogen-oxidase MRKKVVIIGGGITGLTTMYHLQKDIRDKNLPIDTLLIEASGKLGGKIQTVRKDGFTIERGPDSFLARKESAARLVKELGLGDELVNNQAGQSFILVNNRLHKMPSGSMMGIPTQITPFLFSGLFSPIGKLRAGFDLLMPRSKPVSDQSLGHFFRHRLGNEVVENLIEPLLSGIYAGDIDEMSLMSTFPQMYQIEQKHRSISLGMRTLAPKAEKAEPKKGIFQTVKTGLESIVESLELKMHEGTIIKGTRIEKVAKQGDGYAITLSNGKEIEADAVVVASSHKVLPSMFAQYKQFRFFRNIPSTSVANVAMAFPKSAIQRDIDGTGFVVSRNSDYTITACTWTHKKWPHTTPEGKTLLRCYVGRPGDEAVVEQTEEELVQLVLEDLRKTMDITEDPEFTVVSRWKEAMPQYTVGHNERMKKLTTFMEKELPGIYLAGSSYAGSGLPDCIDQGEKAAKRVLSHLEKVMNTELIAQ >NZ_CP019588.1|WP_000726793.1|1052127_1053063_+|ferrochelatase MKKKIGLLVMAYGTPYKEEDIERYYTHIRRGRKPSPEMLEDLTERYRAIGGISPLATITLEQAKKLEKRLNEVQDEVEYHMYLGLKHIEPFIEDAVKEMHNDGIQDAIALVLAPHYSTFSVKSYVGRAQEEAEKLGNLTIHGIDSWYKEPKFIQYWVDAVKSIYSGMSDAEREKAVLIVSAHSLPEKIIAMGDPYPDQLNETADYIARGAEVANYAVGWQSAGNTPDPWIGPDVQDLTRELNEKYGYTSFVYAPVGFVAEHLEVLYDNDFECKVVTDEIGAKYYRPEMPNASDAFIDCLTDVVVKKKESVM >NZ_CP019588.1|WP_000252599.1|1051066_1052113_+|uroporphyrinogen-decarboxylase MVRTINETFLKACRGERTDYVPAWYMRQAGRSQPEYRKIKEKYSLFEITHNPELCAYVTKLPVDQYNVDAAILYKDIMSPLPAIGVDVEIKSGIGPVIDNPIRSLQDVEKLGEINPEDDVPYILDTIRLLTTEMLDVPLIGFSGAPFTLASYMIEGGPSRNYHNTKAFMYAEPKAWFALIDKLADMVITYLKAQINAGAKAVQIFDSWVGTVNVADYRVFIKPAMERIFAEVRTMGVPMIMHGVGAAHLVNEWHDLPLDVVGLDWRLPIEEARARGVHKAVQGNMDPSFLLAPWSVIEEHVKGILDQGMKQPGYIFNLGHGVFPEVNPDTLKRLTTFIHEYSKGQLAK >NZ_CP019588.1|WP_003158412.1|1066129_1066345_+|hypothetical-protein MMKGNLTYYFILNPLIIFLVYALSPILFHKEKYINMKDALGILVVYYVLISGYCLMDVVSERMKKDSKDKQ >NZ_CP019588.1|WP_000140275.1|1066381_1066687_+|DUF2087-domain-containing-protein MTESEMKFRDATIRNFFDKEDRLKSIPGQKKKKLVLLEHLISKLNAANQYTEKEMNTFIKQYHDDFCTIRREFIVHGFMDREANMYHINGREVWTKWEELK >NZ_CP019588.1|WP_001068232.1|1066713_1067067_-|PlcR-regulated-protein-PRP2 MNPILTTAKQLLHKEETILSTLNCSLTGYMITYNVPYPGMLLTTNRRLLFFSQYKNTLIAEFDYEKILSIETKRRIFDKKIIFYYEDEYITLGYITSSNIEEFIDLLRRKCKISTNS >NZ_CP019588.1|WP_000620028.1|1067200_1067704_+|GNAT-family-N-acetyltransferase MIRLAKETDAEAIMDIRKEIILSKTTTKFFIVSPKKLPNDTNAEREKIRKSNEKGNLYIVYEIDNKVVGFLLFNRYELDRLRHAGTMGIKEAYCNQGIGTKLIEFLIRWAKEQNGLEKICLGVVSVNDRAIKVYKRMGFVEEGRQRKQIKYEDGSYGDDVLMGFYID >NZ_CP019588.1|WP_000567010.1|1068993_1069122_-|YhfH-family-protein MIDQPMEFFRNLPTKTCAHCGKEIDEQHEAYHNKCDDCVHEE >NZ_CP019588.1|WP_000784654.1|1069301_1070036_+|MBL-fold-metallo-hydrolase MKMTVVGFWGGFPEAGEATSGYLFEHDGFRLLVDCGSGVLAQLQKYITPSDIDAVVLSHYHHDHVADIGVLQYARLITSATKGQLPELPIYGHTFDENGFHSLTHEPHTKGIPYNPEETLQIGPFSISFLKTVHPVTCFAMRITAGNDIVVYSADSSYIPEFIPFTKDADLFICECNMYAHQEAAKAGHMNSTEVASIAKDANVKELLLTHLPHTGNPADLVTEAKQIFSGHITLAHSGYVWNS >NZ_CP019588.1|WP_000897260.1|1070045_1071035_+|lipoate--protein-ligase MLFIDNKGITDPRINLAIEEYCVKNLDINETYLLFYINEPSIIIGKNQNTVEEINADYVKEKGIHVVRRLSGGGAVYHDLGNLNFSFITKDDGDSFSNFKKFTEPVTKALGKLGVNAELSGRNDILAEGRKISGNAQFSTKGRMFSHGTLLFDSEIDHVVSALKVKMDKIQSKGIKSIRSRVANITEFLNEEMTTEEFRQLLLETIFEGETEIPTYELTEEDWKEIHKLSEERYRNWDWNYGKSPKFNLQHSHRFPVGQVDVRLEVKKGTVTECKIYGDFFGSLDVHDIEERLTGVQFDKDAFTTALEGVDIARYFGNITTEDFLHLFF >NZ_CP019588.1|WP_000832626.1|1071289_1071718_+|lipoprotein MKRVMYVVLLLSFVIGMTACNDETSSSRTLLSIGKPAKDNVIYFTHTDNKRKIQEIQDMFQNKKWKRNETFSTVNKTPDVVFSIDEDNTGLPALYVTVYFHEDGADVLNLYGEYTSFNKQELAMLREKMSAYYPKMIFGLVS >NZ_CP019588.1|WP_001055163.1|1071879_1073412_+|fatty-acid--CoA-ligase-family-protein MNLVQSLAETAKKKGDKPAYIFMDQSVSYDQLNKMVTRFSSNLAEMGIGKGDNVALVVGNSPHFLVGLYGTMKAGATVIPVNPIYTADEMHYILQNGDVKTIIVLDVLLPVIQSLTTRLPSLENIIICETSSDFNHTETEKMKTFTRMIGAGDLTYEGPELDEEDVAVILYTSGTTGKPKGAMLTHKNLYSNASDVASYLQYTADDRVVAALPMFHVFCLTVAVNAPIVNGATILMLPKFSPKEVFRICRTYEPTIFAGVPTMYNYLYLFEEASAEDVKTLRLCISGGASMPVALLQNFEKRFDVIVSEGYGLSEASPVTCFNPLDRPRKPGSIGTNIWHVENKIVNELGEEVPVGAVGELIVRGPNVMKGYYNAPEDTAATLKDGWLYTGDLAKMDEEGYFYIVDRKKDIVLVGGYNVYPREVEEVLYMHESVAEVVVIGVPDENLGEAVRAYVVLKQTNVTEEELMHYCTLHLAKYKVPKSIEFLTELPKNTTGKLLRRALREKAMQV >NZ_CP019588.1|WP_000435475.1|1073524_1073776_+|hypothetical-protein MEQKELRLRRVQYLICDIMDEMNAESEKNNLEILQQVIDHLSGAIGDLVDPSSTYSIDYLERKVHTAHYLLFKNERKAYLCRK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP019588_2 | 1176611-1176719 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019588_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP019588_2
>2.1|1176636|59|NZ_CP019588|CRISPRCasFinder GAGAATCCGTTAGCGATAGTCGCGGTTCCTTCTGCATGTGCTGCTTCGCCTAAAGCGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019588_2
The CRISPR arrays of NZ_CP019588_2 >merge|NZ_CP019588|2|1176611-1176719|CRISPRCasFinder TGTATGATTACCTTCCGCATGAGAAGAGAATCCGTTAGCGATAGTCGCGGTTCCTTCTGCATGTGCTGCTTCGCCTAAAGCGATTGTATGTTTACCTTCCGCATGAGAA >NZ_CP019588|2|2|1176611-1176719|CRISPRCasFinder TGTATGATTACCTTCCGCATGAGAA GAGAATCCGTTAGCGATAGTCGCGGTTCCTTCTGCATGTGCTGCTTCGCCTAAAGCGAT TGTATGTTTACCTTCCGCATGAGAA
>NZ_CP019588.1|WP_001079110.1|1175020_1175914_+|RluA-family-pseudouridine-synthase MNRFTLKWDIESAEEGTLVREFLKTKGISKAALTDIKFHGGAIEVNGQHASVRHQLQVGEELRIFFPVEERSEGMIAEDIPLCIVYEDDAVLVINKEANMSTIPSREHPSGSVANALLSHYDKQYLPSTVHIVTRLDRDTSGLMLIAKNRFVHHLLSKQHQQKAVKRTYEAIVHGEMVEREGTIDAPIGRKSDSIIERTVCEEGQRAVTHFRVIDSANHKTHVSLELDTGRTHQIRVHLAHIGHPLLGDNLYGGKRDEMKRQALHSTSLTFYHPILEKEMSFAAMIPSDMQEVLRQT >NZ_CP019588.1|WP_000673194.1|1174207_1175005_+|NAD-kinase MKFTIMSKGDQSSDTLASTMKEYLLDFGFIMDEQEPDIVISVGGDGTLLYAFHRYYNRLDETAFVGVHTGHLGFYADWLPTEVEKLVIAIAKTPFQVVEYPLLEVIIRYMNGSKESQYLAMNEATVKSAEGTLVTEVEIRGEYFETFRGDGLCISTPSGSTAYNKALGGAIIHPSIEAIQIAEMASINNRVFRTVGSPLVLPKHHTCVLKPTAGMNLQITVDHLTMVHQDVKSIQYRVANEKVRFVRFRPFPFWKRVRDSFVADK >NZ_CP019588.1|WP_001081482.1|1173550_1174189_+|GTP-pyrophosphokinase-family-protein MNRNWEEFLAPYHQAVAELKVKLKGMRTQFAMLTEHSPIEFVTGRVKSVASIIDKAEKRNVPLDRLREDMQDIAGLRMMCQFVDEIKPVVEYLRKRNDFEIVEERDYVTQKKDSGYRSYHVVISYPVQTIQGEQKVLVEIQIRTLAMNFWATIEHSLNYKYSGRFPEDIKIRLQRAAEAAFLLDEEMSSIRLEIQEAQKAFSRKQETKDSES >NZ_CP019588.1|WP_001180010.1|1173160_1173520_+|hypothetical-protein MQNKIQVKSVEKRENALIFCAENSEIEVKGLSARNHVLVDSDNLSFLYILENESSFIYVSIPHTCWEAMNNDVVMFVRVNDIEMELEGLKEEVEYLVENIEGNANYGEELVTAVEKVFL >NZ_CP019588.1|WP_000191105.1|1172435_1173014_-|CYTH-domain-containing-protein MTQEIEIEFKNIVTEEEFHALCKSFSIEVFTKQVNHYFETPNFSLKEAGSALRIRHKGETYTLTLKQPAEVGLLETHQVVTENEAKMMMETNVIISGAVMNQLCKLQIPVSALTYMGSLTTERAETLFEGGTLVFDHSFYYNHDDYEIEFEVQDEETGKAAFIHLLKQHNIPIRHTNNKVKRFFLAKQNKAR >NZ_CP019588.1|WP_000043389.1|1171856_1172255_-|hypothetical-protein MSKQPMTPFEAIGGEQCIEILVDTFYSYVSKHPDLSPIFPDDLTETARKQKQFLTQYLGGPNLYTEEHGHPMLRARHLPFEITPKRAEAWLSCMEQAMDDTGVHGHIREFVFERLALTAQHMVNTPNETGEI >NZ_CP019588.1|WP_000360662.1|1170963_1171857_-|DsbA-family-protein MDKQEAKHINMPSPSACEYKSVEAYLFIDPLCKDCWEIEPFIIKLWLEYGKYFSIRHIVTGKVDGTNASSHKWNKPANIRFVWEKTTSLHGFSYDGKVHMQEASSTPYLVSMAIKAAELQGRKAGSKFLRKLQEYIFLENVSNPDCELLLACAKDSDIDVEEFKKDLYSASAKKAFQCDLKFTNEMHITEIPSLVFFHANSDEEGIKIAGTYSYDVYVQLLKELVKCEIEPEPLPSLEVLLEATQFISSKEVAFIYDCSKQEIERELKKLQLKRKVQMIDVKCERYWKWIAKEKDLV >NZ_CP019588.1|WP_000003398.1|1168614_1170441_+|oligoendopeptidase-F MSEQNTAKTLPDRNEIEESSTWRLEDIFQTDTEWEKEFQAIKELLPKLTEFKGKLGDSANNLLEALQYEDEISMRLGKLYTYAHMRYDQDTTNSVYQALNDRATNLYSQVSSSTAYIVPEILSISEDTLQTFLKENRDLSVYEHALEEITRQRPHVLSEAEEALLAEASEVMSTSSNTFGMLNNADLKFPSIKGEDGEEVEITHGRYIQFLESDDRRVREDAFKAVYETYGKYKNTFASTLSGAVKRNNFNARVRKYDSARQAALSNNNIPEAVYDQLIESVNDNLHLLHRYIDIRKRALGLDELHMYDLYTPLVPEVKMNVKYEEAQDMLLKSLHVLGDEYVDILKEAYENRWVDVYENKGKRSGAYSSGAYGTNPYILMNWHDNVNNLFTLAHEFGHSVHSYYTRKTQPHVYGDYSIFVAEVASTCNEALLNDYLLKTTEDKKERLYLLNHYLEGFRGTVFRQTMFAEFEHIIHKKVQEGHAVTPDMLTEIYYDLNKKYFGDALVIDEEIGLEWSRIPHFYYNYYVYQYATGFSAATALSKQILEEGQPAVERYINEFLKAGSSDYPIEVLKKAGVDMASPEPVKEALQVFEEKLNELEALLFEEK >NZ_CP019588.1|WP_000612267.1|1167319_1168564_+|competence-protein MIPIFIAKRENGEKIHLLDHHDEELLHHMRKRESFFCIACGKEVLMRLGKQKRWHFAHKKVDSCLAFYEAESTYHMYGKELLYRWFKRQNVHVEIEHYLPEIQQRPDIFIERAGRKIAIEYQCANLSIEQLCKRTYSYWQAGIQVIWIIGGNQLKKHSAYWMKFSSIMAFSLQSYPQPLLIFFCSKQKSFMKCTFITSFSTSIAFSHIIYLPIETTTFEMLFSPVPFQREVLKREWKRRKDYFRQNALPILNYNHKSLLRLLYQCKCNPANFPSEIGVPLPSSFAFQTNSFIWQAFLYMKCIGELAVGDCISLKYVCGYIKKYTKRRMLPYFSQHIWKVAVTEYMTFLCYAGVLYKVGMYTYRKIRDAVPLKTGGEIIKHDEICLAHALSLFEAKFNMRGGKGDIIKTDREGIT >NZ_CP019588.1|WP_000799204.1|1165693_1167238_+|cardiolipin-synthase MKNTLKLIFFVLLLFALFVSLRMFIDVAFYSDVIGIKDVSILGIISILFTVSAFLIGCVIFLENRHPSKTLTWLIVLGIFPVFGFFAYLLFGQNFRRKRMFQKKALLDEQAFLQYKGHEDYEERILRNHKHQELLFRLADRLGALNISFQTETRTLTNGDETFQAILDGLKRAKHHIHMEYYIVRDDKLGTEIKDILIQKSKEGVVVRFLYDAVGSFKLSKSYIEELNDAGVEMIPFFPVRFPILNDKINYRNHRKIVIIDGNEGFVGGLNIGDEYLGKDKYFGFWRDTHLYLRGEAVQSLQLIFLQDWFYMTGEAVLAPEYLQAKAVEGEHWGGVQLVAGGPDNKWETIKHLYFAMIASARKSIWIATPYFIPDDDILSALKVAALAGIDVRLLMPSKPDKRTVFYASRSYFPELLDAGVKIYEYEKGFLHSKVVIVDSDLASIGTANMDMRSFHLNFEVNAFLYDTDSIRKLVQDFKDDLEESSEIHVDRFHKRRLHRRIVESTYRLLSPLL >NZ_CP019588.1|WP_000872719.1|1177490_1178231_-|bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase-PrpE MKYDIIGDIHGCLQEFQNLTEKLGYNWSSGLPVHPDQRKLAFVGDITDRGPHSLRMIEIVWELVIHKKVAYYAPGNHCNKLYRFFLGRNVTIAHGLETTVAEYEALPSHKQNMIKEKFITLYEQSPLYHILDEKRLLVCHAGIRQDYIGRQDKKVQTFVLYGDITGEKHADGSPVRRDWAKEYKGTTWIVYGHTPVKEPRFVNHTVNIDTGAVFGGRLTALRYPEMETVSVPSSLPFVPEKFRPIS >NZ_CP019588.1|WP_000427734.1|1179607_1180543_-|glycosyltransferase-family-2-protein MENIKNVPLVSILIPTYNRPHYFKIALESALAQTYSNIEIIVGDDSTNNETEKLIYRDYLHKHKHITYIRNPSTLGQFHNALMLLEQSNGEYINFLMDDDIFYNNKIEKMMFYFQKDLDQNLALITSYRTWINDDGDIIEQHPSMKKLYDEDTLLNGKDFGNRMLILGQNIIGEPTTVLFRKRLLTEPFGTLNGRNYNCSVDMASWISLLSKGDAIYITEPLSSFRLHTGQQVHHKYLEGCEDFSHLVLHSKKYGFLQDIDYYKTSLLKACEWYKNATTFYQLYPELIPTTDTHTRLSHCLNIVTKELHAI >NZ_CP019588.1|WP_001012321.1|1180549_1181317_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MNFWNENKKKITLIPPPELVQYVGGHFEEVGKEFMQYFIEIGNLKSNETVLDVGCGIGRMAVPLMNYLSDDGTYYGFDLFNKGITWCKNNISTRRNNFHFEHVDIYNQFYNPDGKEDASQYKFPYEDESFDFIFLTSVFTHLLPKELEHYVREIARVLKKDGRCFITFFLINPESSYYLNAGLSPLGFYHQIDNCYVLNKDIPNFAVAYPEEDIRTLLNKYGLEMQTPPHYGSWCGRTEHTSYQDIILTQKISER >NZ_CP019588.1|WP_000428856.1|1181444_1182290_-|macrocin-O-methyltransferase MENKSAVQLYLELLKKTILFEIWLEYEPYLPASLHISKELSYEPVTVPLPLFLKQYVENHNLKIVNPNVSNNERQGGKDWPRAAHSMVGRKRMNQLQEAMETVVKENIEGDFIETGVWRVGSCIFMNGFLQANNITDRTVWVADSFEGLPAPNLEQYPKDYGDYLHTFDYLRVSLETVQENFRKYDLLNDQVKFLKGWFKDTLPSAPIEKIAIARLDGDMYESTMDSLVNLYDKVSIGGFIIIDDYGLITCAEAVTDFRSERNIKTPMTQIDDFGIFWRKE >NZ_CP019588.1|WP_000069712.1|1182412_1183615_-|hypothetical-protein MSNNNYSNGLNPDESLSASAFDPNLVGPTLPPIPPFTLPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGDTGTTGPTGPTGPTGPTGPTGDTGTTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGDTGTTGPTGPTGPTGPTGPTGDTGTTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGDTGTTGPTGPTGPTGPTGPTGDTGTTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGPTGATGLTGPTGPTGPSGLGLPAGLYAFNSGGISLDLGINDPVPFNTVGSQFGTAISQLDADTFVISETGFYKITVIANTATASVLGGLTIQVNGVPVPGTGSSLISLGAPIVIQAITQITTTPSLVEVIVTGLGLSLALGTSASIIIEKVA >NZ_CP019588.1|WP_000932922.1|1183780_1184893_+|glycosyltransferase-family-2-protein MLNKQGITISLCMIVRDEEKTIARCLDSVEKIVDEIIVVDTGSIDRTKEIVEKYTSNIYDFQWIDDFAAARNFSFSKATQEYILWLDADDVLLEDAQEALKLLKRELDPKIDAVSMPYHLAMDSNGKPLYCTKRNRLVKREKQFQWFGKVHEYLAISGETFSSNVAITHKKEKKVTNRNLKIFQDAVAAGEELSPRDLFYYANECMDNQKYDDAVLLYETFLNQDEGWYEEKIYACGKLGDCYAKLGLWEKAVESCVKSFRYAIPRGENCTRIGYIYMEQQKYNEAIFWFKLATEVPMATESPFHSPASYTWLPYLQMCICYSKLGEQDKAYYYNELAASYVPNNAAIEYNRKYFRSIFDQQKNRYRLFF >NZ_CP019588.1|WP_001087866.1|1185030_1185720_+|class-I-SAM-dependent-methyltransferase MNSPKNSLYEEKSGHYYNAVNPNLLKHIKKEWKEVLDIGCSSGALGAAIKENGTRVSGIEAFPEAAEQAKEKLDHVVLGDIETMEMPYEEEQFDCVIFGDVLEHLFDPWAVIEKVKPYIKHNGVILASIPNVAHISVLAPLLAGNWSYTEYGLLDKTHIRFFTFNEMLRMFLKAGYSISKVDRVYIDHKMYEPLIEELYGVCKKYRLGSGFMAETVVFQYIIEAEKSSL >NZ_CP019588.1|WP_001271203.1|1185716_1186403_+|streptomycin-biosynthesis-protein-StrF MSAAEKTILFVTCINDSKMYAQCVRHILRLAVPPGYVVQFMPIRNAKSMTSGYNQAISHPAKYKVYIHQDVFIMNVAFLHGLLQLFNEHEHLGMIGMIGAQYVPPNGVWNEGKGVVGKVIGYMNDLFYMASQEQPYHESKTFMPVECIDGLLMATQYDIPWREDLFDGFDYYDVSQSFEFRKAGYTVGVPVQRDAWCIHYHIDVNMTNYEKYRKIFVEHYMSDVNQDE >NZ_CP019588.1|WP_000651510.1|1186415_1187096_+|streptomycin-biosynthesis-protein-StrF MKDHTILVVVCINNEELFEQCERQIRNLFVPPGYVVQIFPIRDAKSMASAYNRALSYPAKYKVYIHQDTFLINREMFYTLISLFKDNEKLGLIGVAGAQFLPSNGIWWEGKNLVGKVIEYRRQNYQLLNLDQLFYGNQSFMSVQAIDGLLMATQYDIPWREDLFQGFHFYDVSQSLEFQKAGYLIGIPNQANLWCIHYNGDEFDADTYEKYRKVFVEHYKDILSPS >NZ_CP019588.1|WP_000676166.1|1187110_1187848_+|glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase MKGIILAGGTGSRLYPITKVTNKHLLPVGRYPMIYHAVYKLKQCDITDIMIITGKEHMGDVVSFLGSGQEFGVSFTYRVQDKAGGIAQALGLCEDFVGNDRMVVILGDNIFSDDIRPYVEEFTNQKEGAKVLLQSVDDPERFGVANIQNRKIIEIEEKPKEPKSSYAVTGIYLYDSKVFSYIKELKPSARGELEITDINNWYLKRGVLTYNEMSGWWTDAGTHVSLQRANALARDINFGKQFNGE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP019588_3 | 2720376-2720573 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019588_3
|
3 spacers
spacers of NZ_CP019588_3
>3.1|2720399|18|NZ_CP019588|CRISPRCasFinder ATTATTTTGAAAACACCT >3.2|2720440|42|NZ_CP019588|CRISPRCasFinder CTCGTTCTATTAATTTACTTTTTAGCTCTATTAAACTATGGA >3.3|2720505|46|NZ_CP019588|CRISPRCasFinder TTAATTGTACAGATTGATCATCTCCTACTTTTCTTTTTCACACCCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019588_3
The CRISPR arrays of NZ_CP019588_3 >merge|NZ_CP019588|3|2720376-2720573|CRISPRCasFinder TTACGGAATGAATATTCATTCCTATTATTTTGAAAACACCTTTTCGGAATGAACATTCATTCCTCTCGTTCTATTAATTTACTTTTTAGCTCTATTAAACTATGGATTTCGGAATGAATATTCATTCCTTTAATTGTACAGATTGATCATCTCCTACTTTTCTTTTTCACACCCTCATCGGAATGAATGTTCATTCCT >NZ_CP019588|3|3|2720376-2720573|CRISPRCasFinder TTACGGAATGAATATTCATTCCT ATTATTTTGAAAACACCT TTTCGGAATGAACATTCATTCCT CTCGTTCTATTAATTTACTTTTTAGCTCTATTAAACTATGGA TTTCGGAATGAATATTCATTCCT TTAATTGTACAGATTGATCATCTCCTACTTTTCTTTTTCACACCCT CATCGGAATGAATGTTCATTCCT
>NZ_CP019588.1|WP_000040244.1|2717916_2720340_-|MMPL-family-transporter MSKLKNWRSLSFLLWIVITITMIVTMPNMDKLVKEKGHITIPNTEQSSIADKMIKEMNKDGTEKYDIIAVFNSGSKTALTTEQKEEITKTINALQNEKEQLGIKEVVSHLDNKELEKQLVSKDNTTILTQISIDKKHGEISKVSNNLHNKVKTKGVKTYLTGSDLIAGDFLTSSQEGVKKTEVISIIFILVILIIVFRSPIVPIVSLLTVGVSYLVSMGIIAHLVDQFNFPFSNFTQVFVVVVLFGVGTDYNILLFTRFKEELSKQENAFLATKETFKSAGKTVLYSGIAVLIGFASLALASFKLYQSTSAVAIGVAVLLLVLTTLNPFFMVLLGKGMFYPVKTFKGHEDSRLWGFFAKNSVARPFVALIIVFVISIPIVLKYSNTLNYNDLFEVDNKYESKMGINVIEEHFPPGFSSPSTLVIQSNNKLDEASSLQTLDELTEKILKVKGVSEVYAPTRPTGERIKELYINKQADELNTGLGDANGGIKEINDGLTTAKDKMGSKDSNSLANVQKLIDGTNEAKNGVSALGTALNQLSNGINDGAKGAQQIERGLTSVNENISVLSNATSQLHAGYTQLEKGLSSYDQYFGSISQAIDGAKKGYEQIEMLMTNFIQMKPELANDPNILQTIGIAKEAQKQLGGLSNELNQLATQHNAAMGSFKEANQSLLKVDNGLKEMSNGVTKLQKGAADLKNGLNEGASGSKQIANKSSELQTGLTKINDGQGQVLTGLKDLQEQMGQLQSGLSKSTEGLEKVSNGLGDAQKYLGELNESKSSEKFYIPKEVLEGEDFQKALNTYMSHDRKTA >NZ_CP019588.1|WP_003169883.1|2717763_2717916_-|hypothetical-protein MTIILDVNPYSKEAMPIIQEINKTIDGTLKGTELNNAKKQLEGPQLETLT >NZ_CP019588.1|WP_094770179.1|2717224_2717797_-|MMPL-family-transporter MGGTTARNVDLKEVTGQDFLRTATIMLIGIAIVLIVITRSLLNTIFIIGSLILAYFASLGISEQISTHLLNVDSLSWNVPFFSFIMIVALGVDYSIFVMMRYNELEGEPATKIVTASRHIGGVVLSAALILGGTFAALIPSGVLALIQVASVVGVALLLLAIIVMPILLPALIGLMSKMKDYAKKLSERK >NZ_CP019588.1|WP_001093210.1|2716090_2716939_-|hypothetical-protein MNTKLIIVEGLPGFGKSTTAQLINDILSQNKIEVELFLEGNLNHPADYDGVSCFNKFEFDRLLSNSGDFKEVLLKRVLKKGSNYLLPYRKIKNEFGDQFSDELFNDISRNDIYELPFDKNVELIADKWQDFAEIALEDDKVYIFECCFIQNPLTIGMIKYGEQKEKIINYVMKVAKIIENLNPMLFYVEQDDLEFSFRKALKERNPEWSTGIVDYYTNQGYGKEHNHSGVEGAIKVLEARRNLELEIFDMLKMKKEKINNTKYEIGSYRSMLKDKLTIQMVK >NZ_CP019588.1|WP_000633874.1|2714087_2715713_-|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein MITVSNVSLRFADRKLFEGVNIKFTPGNCYGLIGANGAGKSTFLKILSGEIEPSTGDIHITPGERLAVLKQNHFEYEEFPVLETVIMGHTQLYKVMQEKNAIYMKEDFSDEDGMRAAELEGEFAELNGWEAESEAAILLKGLGIGEDLHDKKLSELTGAEKVKVLLAQALFGKPDILLLDEPTNHLDLKAIQWLENFLMNFENTVIVVSHDRHFLNKVCTHMADLDFGKIQLYVGNYDFWHESSQLALKLTQDANKKKEEKVKELQNFIARFSSNASKAKQATSRKKLLDKITLDDIRPSSRRYPFVGFTPEREVGNDLLTVEGLSKTIDGEKVLDNVYFTLNKGDKVAFIGRNDIAMTTLFKILMGEMEPDSGSFKWGVTTSQSYFPRDNSKYFENSDLNLVEWLRQFSPQDESESFLRGFLGRMLFSGEEVKKNVSVLSGGEKVRCMLSKMMLSGANVITLDDPTNHLDLESITALNNGLIAFKGTMLFTSHDHQFVQTIANRIIEVTPNGVIDKEATYDEFLENEELQKQVDAMYKGQ >NZ_CP019588.1|WP_000808762.1|2711597_2713571_-|LTA-synthase-family-protein MKQFLLKSKSVLSNHFGFFLFAVILFWLKTYAAYVTEFNLGISNTIQKFLLFFNPLSSAVLFLGLALFAKGKRSYIWLIVINLLLSILLYANVVYYRFFSDFITFPTLTQTNNFGDLGGSIVALLHLYDPLYFLDTIILIVLVATKFANPKPIRVAKYKVSLVFVAGILLFSVNLGLAESDRPELLTRTFDRNYIVKYLGAYNYTIYDGIQSAKASTERALADGDNMTEVRNYLTSTYASPNPEYFGKGKGMNVIYIHLESFQNFLIDYKLNGQEVTPFLNSFTKDANTLYFDNFFHQTGQGKTSDAEFMLENSMFGLPQGSVFTTKSHNTYQSAPAILGQQGYTSAVFHGNYKTFWNRDDIYKSFGFNKFFDASYYDMNEKDVVNYGLKDKPFFNESIPLLETLKQPFYTKFITLSNHFPYPIDKEEATIEPANTGDSSVDTYFQTARYLDESVKGFIDYLKQSGLYDNSIIVMYGDHYGISDNHNAAMSKVMGKEINSFENAQLQRVPLIVRVPGVKGGVQHQYGGEIDVLPTLLHLLGTDTKNYVQFGSDLLSPDHKQVVAFRNGNFVSPTVTALNGKYYDTTTGKPVEFTDEIKQNEQMVQNSLKYSDQVVNGDLLRFYTPEGFTPIDRSKYNYNNRDKNKTKVKTAPEGEAK >NZ_CP019588.1|WP_000346934.1|2710866_2711538_+|TerC-family-protein MDFLSAEYLSALLAIIVIDLVLAGDNAIVIGLAARRLPKDQQKKVIIWGTIGAIAIRALATLVVVWLLKIPGLLLIGGVLLIWIAYKLIAEGKDHDIKAEEGFWSAIKTIIIADALMGIDNVLAVAGAAHGNFSLVIIGLLVSIPVVVWGSTLILKWVDRYPIIITIGAAVLAYTAAKMIVDEKWFAAFFESNPFIKWAFIIIIIAGVVFFGKAKQKATDGSI >NZ_CP019588.1|WP_000637714.1|2710093_2710756_+|DUF3841-domain-containing-protein MIVYTVQTEEAWKQFKKLGYLEGNKEFIDSDDIYSYDWMVRVAKTKLPHYEGNYPIWVWEANNYPNRNHKAWGRKNSKMVILTLDVPKKWVLWSYFDYWCCAMTDGSTYLHTKNKCTLDEWYIYMDKKYGIIFNFDYLLSHPDWYLDKEDSLEKQGVIGKIPLSFVKKVRRFRAKEDTSIHTIRSDNWDNRKENRIKKMNRKLRKRNEKQKRVQKRLIRN >NZ_CP019588.1|WP_000551418.1|2709106_2709934_+|polysaccharide-deacetylase MHNGIRMTTLMKRAMLICAGVLFTYEAALGSAHTALASTEDEAKSVQLVSEIQSSLAPKEAPKQYNGQVRKVAYLTFDDGPGKYTAELLDMLKKENAKATFFLIGSNVKAFPDLVKREDAEGHYVGMHSMTHNYKKLYTEGHYVDEMKEDQGLIAGVLGKSPVLTRPSYGSMPGLNEALRNKVVENGLKVWDWTIDSLDWRYNKMPVDAASAKIVENVINGANKPTEVILMHDIHPQSVKAVPGIIKGLKEKGYELEAYSENEHFPLNFWHDNRM >NZ_CP019588.1|WP_001106984.1|2708628_2708889_-|lipoprotein MNYKKMLSIFMTSIFTVGLLIGCNPAPKDEKEPDPTEEPSEQRQEEKNEKQDPAKEQNNELNKKDEQEPDPTEEPSEEQKKKKENE >NZ_CP019588.1|WP_001107293.1|2720593_2721160_-|TetR-family-transcriptional-regulator MAKNKQEDIFDAAIQLFAERGYDGTTIPMIAEKAKVGAGTIYRYFENKEALVNSLFTKSVLQLSELIKTDFPVNANIREQFSHTYNRLFEFARQNADAFLFTNSHCDSYFLDEHSNEIFEDFMGFFMDLIEDGIEKGFLRPLPPIALIIIVYQPIEKLIKVMETGQLEYTEELVKELEESCWNAIRII >NZ_CP019588.1|WP_001100954.1|2721429_2722587_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MNVIRLKEDKFREALRLSEYAFQYKVDEDRLQQQITKMKESHEVYGIMEGENLAAKLHLIPFHIYIGKEKFKMGGVAGVATYPEYRRSGYVKELLQHSLQTMKKDGYTVSMLHPFAVSFYRKYGWELCANLLVCHMTKSDLVMKKQVNGTVKRFNKESHPEEVEKLYETFAELFSGMLVRNEKWWLQAVYDDLTLAIYYDENQTAAGYMLYKIENYKMTVEEFVPLHNEARNGLWNFICQHDSMIKDLEMTVSENEPLLYTLQEPRVKTEIKPYFMGRIVDVEQFLKQYELNWNNVQQEVILHITDSFAQWNNITVRIANHEITIIEEPIDKGIKLDINALSTILFGYRRPLELNELELISGSEEEIRAFESVVPVRKPFIYDFF >NZ_CP019588.1|WP_000664623.1|2722772_2724062_-|3-phosphoshikimate-1-carboxyvinyltransferase MKERTIQPVNNGLNGNITIPGDKSISHRAVMFGAIAEGTTTIKGFLPGADCLSTISCFKEMGVDIVQNGDEVTVVGKGLEGLQEPKAVLDVGNSGTTIRLMSGILANTPFLSCVQGDTSIAKRPMKRVTNPLKQMGANIDGREEGTFTPLTIRGGDLKAIEYTSPVASAQVKSAILLAGLRAEGVTAVTEPHISRDHTERMLEAFGVKVTREGKTVKLAGGQKLTATDVQVPGDVSSAAFFLVAGAIIPNSKLVLENVGMNPTRTGIIDVLEKMGATFTVEPINEGASEPAANITIETSSLKGIEIGGDIIPRLIDEIPVIALAATQAEGITVIKDAHELKVKETNRIDTVVAELTKLGARIEATDDRMIIYGKSALKGNTVNSYGDHRIGMMLAIAGCIAEGKTIIEDAEAVGVSYPTFFEELQKLAK >NZ_CP019588.1|WP_001228120.1|2724078_2725179_-|prephenate-dehydrogenase MRKKVVLIGTGLIGGSLALAIKKDHDVTITGYDIFQEQVERAKELHVVDEIAVDLQHACEEAHLIVFASPVEETKKLLHKLASFHLREDVIVTDVGSTKGSIMNEAEALFSKEISFIGGHPMAGSHKTGVESAKAHLFENAFYILTPMHHVPNEHVEELKDWLKGTGSHFLVLNTEEHDYVTGIVSHFPHLIAAGLVKQVEKHAGDNPLIHQLAAGGFKDITRIASSSPKMWSDIVKQNREHLMVLLKEWISEMEDLYDTVSSGDAGEIQNYFADAKEYRDSLPVRKRGAIPAYHDLYVDVLDKVGALAHVTSILAREEISITNLQILEAREGLLGVLRISFQREEDRMKAKLALGEEKYQTYETI >NZ_CP019588.1|WP_001197243.1|2725171_2726272_-|histidinol-phosphate-transaminase MQVKDQLSSLQPYKPGKSPEQMKEVYGDHSFVKLASNENPFGCSPRVLDELQKSWLDHALYPDGGATTLRQTIANKLHVKMEQVLCGSGLDEVIQMISRAVLKAGDNIVTAGATFPQYRHHAIIEGCEVKEVALNNGVYDLDEISSVVDNDTKIVWICNPNNPTGTYVNDRKLTQFIEGISENTLIVIDEAYYEYVTAKDFPETLPLLEKHKNILVLRTFSKAYGLASFRVGYAVGHEELIEKLNVVRLPFNVSSLAQKAATIAFGDDEFIEEIVRVNTEGLRQYESFCKENEIPFYQSQTNFIFLPVENGGEIYEACAHAGFIIRPFPNGVRITVGTREQNEGVISVLQQHFENKKRKSRDEANA >NZ_CP019588.1|WP_001269395.1|2726290_2727463_-|chorismate-synthase MRYITAGESHGPQLTVILEGVPAGLTLAAEHINKELLRRQKGHGRGRRMQIEMDTVEIVSGVRHGMTLGSPITLIVKNDDFKHWTKVMGAEPISEKESKEMKRTITKPRPGHADLNGAIKYGHRDIRNVLERSSARETTVRVAAGAVAKQILKELGVEIAGHVLEIGGVKAKHISNLSIEEIQIITENSPVRCLDKTVEQEMMDAIDNAKSSGDSIGGIVEVIAEGMPIGVGSYVHYDRKLDAKLAGAIMSINAFKGAEIGVGFEAARQPGSKVHDEILWDEEQGYTRKTNNAGGLEGGMTTGMPIVVRGVMKPIPTLYKPLASVDIDTKEAFQASIERSDSCAVPAAGVVAESVVAWELAHALVEQFGKDRMELIQQNITQHNKYAKEF >NZ_CP019588.1|WP_001273582.1|2727747_2728824_-|3-deoxy-7-phosphoheptulonate-synthase MANHELDQLRKQVDEINLQLLHLLNKRGEIVQKIGEQKQVQGTKRFDPVREREVLDMIAENNEGPFETSTVQHIFKTIFKASLELQEDDNRKALLVSRKKKQENTIVDVKGELIGNGTQTFIMGPCAVESLEQVRQVGQAMKDQGLKLMRGGAFKPRTSPYDFQGLGVEGLQILRQVADEFDLAIISEILNPNDVEMALDYVDVIQVGARNMQNFDLLRAVGKVNKPVLLKRGLAATIDEFINAAEYIIAQGNDQIILCERGIRTYERATRNTLDISAVPILKKETHLPVVVDVTHSTGRRDLLLPTAKAALAIGADAVMAEVHPDPAVALSDSAQQMDIPEFHRFMEELKGFKNKLS >NZ_CP019588.1|WP_000997708.1|2733315_2733753_+|YndM-family-protein MNDFTVVLIKFISCIIAFSIGLALFFPATFVQIISFSLFVTIVSYMFVDKIILNRIGNTGAIMSDFLLTYLSVWIFGNILLDNYMQIAWGSILSAIVFTLSEVIVHRFSSSRTRHHNDNIHINRRFAYGTEFAEEQNILDKDKKK >NZ_CP019588.1|WP_000709765.1|2733901_2734432_-|cysteine-hydrolase MKKALLVIDVQAGMYTAGMPVHNGEKFLETLQELIGECRSNDIPVIYVQHNGPKDHPLEKGTDGWKIHAAIAPLEGECVVEKTTPDSFHKTNLKEVLQDKGIDHVIISGMQTQYCVDTTTRRACSEGYKITLVSDAHSTFDTEVLRAEDIVKHHNVVFGAFADVVTLKDLKVTASK >NZ_CP019588.1|WP_000898754.1|2734448_2734982_-|acetyltransferase MLFQKDNVSVRYVVEEDAPIISKWLTDPEVLQYYEGRDDPQSVEMVLNHFIHNPNSPEKRCLIEFDDVPIGYIQMYPVDSESKTLYGYEESQNVWGMDQFIGEPTYWGKGIGTKFVKAAITYILSEMGAEAIAMDPKVNNERAIKCYEKCGFKKVKILKEHELHEGVLEDCWMMEYK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP019588_4 | 3098899-3099033 | Orphan |
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Consensus repeat of NZ_CP019588_4
|
2 spacers
spacers of NZ_CP019588_4
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019588_4
The CRISPR arrays of NZ_CP019588_4 >merge|NZ_CP019588|4|3098899-3099033|CRISPRCasFinder ATCTGGATTTTCCTGTTTTGGATCATCCGTCTTTGGCTCTTCTGGTTTCTCTTCTTTTGGATCATCCGTTTTTGGTTCTTCCGGTTTCTCTTGCTTTGGATCATCCGTTTTTGGTTCTTCTGGTTTTTCTTGTTT >NZ_CP019588|4|4|3098899-3099033|CRISPRCasFinder ATCTGGATTTTCCTGTTTTGGATCATC CGTCTTTGGCTCTTCTGGTTTCTCTTC TTTTGGATCATCCGTTTTTGGTTCTTC CGGTTTCTCTTGCTTTGGATCATCCGT TTTTGGTTCTTCTGGTTTTTCTTGTTT
>NZ_CP019588.1|WP_000041416.1|3096838_3097675_-|DUF4430-domain-containing-protein MSKMKWFISLLLSLGLLAGCEEAAVKLEKKVEPKQEEVAKQEEKKDEAKPEEKPEEKQAEQEQNKQDEQKEKQEQKVEEKPKEEKPQAQLEVKKEEKQQEQPKEQPAVNKQPEQQKAQEEKQQQPKAQEVKEEAKVVNQPKETPKQEQKKKPEENNSVPTPPTPVPDPVPPVPDPVIPKPKQVTISVKGNEGYLLGAKKVDVQEGDTVYKVLQRTGLDVDAMGSKDGIYVKGINDLYEKDITATSGWKYRVNGAFPNHSAGVVTVKPGDTIEWVFVLK >NZ_CP019588.1|WP_003161810.1|3095937_3096816_-|energy-coupling-factor-transporter-transmembrane-protein-EcfT MKISFSSLHPFVNFFYYIGVMILCMMCLHPLFLIGAILLIVILNVMQGNSEKVRKMLPSTIVFFVMVILFNSLFTHRGRTTLFWVGDSRIKLEAIMFGVVMGLLLVAIMFTFASYNDIISSHKFLYLFSRISPKVALLTMITVRFVPLFMRRLQKITLVQKTKGVQVDAGSIVERVKNGMQLLQVLLICSLEDALQTADSMQARGFGVTKRTTYIRYRMERRDWYTLSYLSILFIIAIICSTYGGGKLIIYPKVESILFQQYDGMMFIVFTMFISLPIIMEGREWIWWRMQK >NZ_CP019588.1|WP_009879384.1|3094303_3095965_-|energy-coupling-factor-ABC-transporter-ATP-binding-protein MDMVAHAEIKNLSFVYADENEKALQHISLSVQKGEFIALAGGSGSGKTTLLKHFKKELLPIGKRTGDTYYDGTLLENVPDLLSAQEIGMVFQNPENQLVMDTVIQELAFSLENIGLPSHIIQKRIAELISFLGFQDLLHQSVHTLSGGQKQLVNLAAVLVMQPKLLLLDEPTAQLDPIAAKEFLGLLKRINEELGITIVLSEHRLDEVIPLATRVICMNNGRIVYDGSPKTVVANMWEVEKFRPFIPQIPRLFLEWNAKDIPFTVREAQMKLNDFLAISYVSEPIVQSEKQEVILSAEHISFQYEKNNPLILRDLTVSIEKGKWVALVGKNGTGKSTLLTILAGLQKARRGKVKWNGKVIHKIDSKERFKSIGYVSQHPYYHFTFDTVWDEVYERARELYGEQGKEIAEHQLKKFWLYGLKERHPHDCSGGEQQLLALCTTLLSKPTLLLLDEPTKGLDPWKKERVGELFRKLQKEGTTIVMATHDIEFAAKYVDQCMMLFDGAVIMNDAPKEFFSGNFFYTTSINRFIRKELPYALTWEDVYEACQNDMLHS >NZ_CP019588.1|WP_000044896.1|3093629_3094331_-|ECF-transporter-S-component MSKRYVAFIICIFAVIIGTLLFTTLIMDGYYMLSSLFLLVVIMLPFYIRFERKAFVSREIVLVAVLAAIAAVSRVPFSILPSVQPTSFVIIVSAIVFGSETGFMIGATAAIVSNIFLGQGPWTPWQMFSWGMIGFIAGLLRNTFLMKKLWGRLLYGLFVGFLFGWIMNFWGLLGFIREATWETVISYYIASFYFDLSHAISNVVFLLLFSTSWITILTRFKKKYGILDEHNMV >NZ_CP019588.1|WP_000779967.1|3092723_3093446_-|YwiC-like-family-protein MKLVIPKQHGAWAMLVIPFLLSVILGKPTIYHIPLFIAWFFIYLATYPFLMYIKQKRKKEYLHAAIVYFIIAFVFGMISLLYEWRILLFVAVMIPFFIVNMYYARQKNERALRNDISAIIVFCIGGLVSYYFSMKLIDKTALFIALISFLYFLGSTFYVKTMIREKNNPKYRFISWGYHILLMIIVFAINPWCSLIFIPSVIRAIILYGKKISIIKVGILEIVNSVYFLIITAIIMKYAI >NZ_CP019588.1|WP_000545001.1|3092499_3092691_+|hypothetical-protein MHENARGYVQDSFQSLQEAKQCLEAALQTVEKDFNRARIEQSLYAIEQAIQRCDYTVHILEQD >NZ_CP019588.1|WP_000171478.1|3091918_3092176_-|hypothetical-protein MTLEKYVKLRSTVYEYMIEQDKPISLLDIQEHIVSHHEGKFTKKMLHQFYLSRLLDELKLDGKITLADEYLYTEKGVFYKARKGS >NZ_CP019588.1|WP_009879381.1|3091277_3091715_-|hypothetical-protein MHRFGSQKGIKGRGVVMYAYLLHDITKWIPKYIMDKGYEYYEEGNVEDVEIQDKKIFAFVTGNAGDYEVIIDLEDFTESSCECPYENYCKHMAAVVYDIQGAGESTVKEKLKDLDKEELLTVLNRLLQSSKNIQIVEKMLKKGKL >NZ_CP019588.1|WP_001101666.1|3090678_3091254_-|NAD(P)H-dependent-oxidoreductase MNVLIVYAHPSPSSFNAAILKHVQKGLQETNHSVTVLDLYKEQFNPVLVFNEEKKRRDLVNEEETARYRALVEEADTLLFIYPIWWWGMPAILKGFIDRIFVAGFAYKYEGALPKGLLKGKKAWGINTLDSPLWYVALLYRSADWIIMKRGVLRFCGIRDIKRSVFQSVKTSKREKREKWLLQIEEKARTL >NZ_CP019588.1|WP_001004518.1|3090328_3090682_-|hypothetical-protein MNEMERIINCCQYDNELFRTYINCLIQLKKCSETFQQIQIQLRNDYLIRGIFEREVDEVVRGSKEYETYFLPKALQWNFLKNNQHLIEKVCGDFFAFEALYLTEIEWKTVINCVGNK >NZ_CP019588.1|WP_000266052.1|3099857_3100337_-|RraA-family-protein MWKTTDLCDEFENELQICRQPFRSFGKKEQFHGKIATVKVKDDNVLVKEGLQTLPEGTVLVVDGGASTNCALLGDNLAAIAEERKLAGIIVNGYVRDSSELKNINIGILALGTMPNRSVKEGKGERNISLQFGQVEWKPDEYVYVDEDGVIISDKSLHR >NZ_CP019588.1|WP_001176953.1|3100537_3101968_+|YfcC-family-protein MQLQTEVKKQPSKRKFKMPDAYVLLFFIALLCAIATYFVPAGEFKRVTNGTVTTTIPGSYHSVPQSPVGFVSFFTAIEKGMTLAAPIIFLILFTGGAIAILEKTGALDGLIYHVINKFRNQQLLFICIVAALFSILGTTGIIVNSVIGFIPIGIIVARTLKWDAIVGVAIIYLGTYAGFNATILSPSPLGISQKIAELPMFSGIGLRTAIYISFLLATILYINWYVKRLKKSNKGSILGDNWFPSNALSSGKEAQKTEVPWTIRHKLILLVSALSLIAFLIGAFRLHWTDAEMTATFSFIAITAGIIGGMKANDIASTFLAGCQNLIYGALIVGMARCISVILEQGKLLDTIVNQLAQSLEGQSPVFGVIGMYVSSAALHFLISSGTGESVIFIPILAPLADFMHITRQVTVQAVMLGEGVVNCLNPTSGVLMGVLAASGISYGKWIRFMAPLAFIWFIIGLIFLIVGVNIEWGPY >NZ_CP019588.1|WP_000672206.1|3102115_3102943_-|ribonuclease MKFRNTKLAMVTLSSFFILGSASLSFTNIIQGEVASASPQEITVKSYDDTYYNNAIGKTGLELKKELHNIIDDHTKLSYSAVWEALRDTDEDPNNKNNVILLYTGRSQGKLTNGSGVDNWNREHVWAKSHGDFGTTAGPGTDLHHLRATDVSVNSSRGNLDFDNGGVNHSEATECKYDSDSWEPRDSVKGDIARMLFYMAVRYEGDNGEIDLELNEKVNNNKDPYMGKLSVLLKWNEQDPVDDLERKRNEVIFTKYQHNRNPFIDHPEWVNKIWN >NZ_CP019588.1|WP_000060302.1|3103370_3103727_-|hypothetical-protein MSLTTGPIENVGNQPANANKVRVKILNRTAGPLTGVARVFRLDGSLVLIEQVNFNVNSNASTFATLSLVHPAFGQAFEYEVQIVPNQPGGLYSVYGLTAESVIITAQRVVNSELTQFL >NZ_CP019588.1|WP_000988166.1|3103928_3104957_-|alpha/beta-hydrolase MMTFDEYEVAIKSEFTLQGTITRPKAEGKYAAVVIIAGSGEIDRDGTIVPLKLEANIYKELAHVMSRLGVVTLRFDKRGVGKSDGEFLKTGMWDLVSDIESTITYLKEQPFVDPENIILAGHSEGCMLATVVNARTPVNGLILLTGAAESLEEAAKRQREIAYKELKEQKGIKGKLMRLLNVEKRGEKQMEKIKEKMMNTEKDTIKVGFKPMNAKWFREHFQHDIYKDLQQVTCPVLAIAGDKDIQADPERAKRIGDYVKGNSEVHVIKDMDHSLKVFKGEFKTLEFKKNYEEGARKPLHPELEEIIVNWLDTHFISQHAGSKIPGSILGESEEVGRKSNCL >NZ_CP019588.1|WP_000659023.1|3104967_3106092_-|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MKEINIHKIIADKRKEKGITQEELAAYIGITKASVSKWETGQSYPDITFLPLLASYFNISIDELISYKPQMEQEDIKNLYHRLAEAFSEKPFDEVMMECRKIIKKYYSCFPLLIQIGILFINHHMLTEDTDRRIEILEEAMNLFSRVQEESDDVSLVKEAVSFQATCYLILNKPNEVLQLLGETIRPNVPEEDLIAQAYQMLGNTKKANEIMQISMYQHLIQLVATIPNYVVVNASSVEKVEVILNRAFMLIDIYEIETLHPNMTLKVYYAAAQVYCMQGNFERALKMLRKYAAVCAASFTVNSLHLHGDSYFDAIDEWFAEFPLGAKTVRNEEIIKRSMLQSIAENPVFAPMKDVREYKNIITSLKFKLDIKE >NZ_CP019588.1|WP_001024063.1|3106432_3107005_-|glycerol-3-phosphate-1-O-acyltransferase-PlsY MNILTLILSYLIGSISFALIVGKMFYKKDIRDYGSGNLGATNAYRVLGIKAGVIVAIADILKGTFACLLPLILSSTINPIVCGLLAILGHIFSVFASFKGGKAVATATGVFLFLSPLGVLVGFVVFVLTLLFTKYVSLSSMLAGIALFIYSLIFEDKVIIALSLLIIVSIIILHRQNIKRILNGTENKIV >NZ_CP019588.1|WP_000710875.1|3107625_3108102_-|Cys-tRNA(Pro)-deacylase MKKDKTNAMRILDKEKIEYSMMSYNPDDGKIDGVSVAEKIGREVREVYKTLIAQGNSKNYHVFIIPVDEELNLKAAAKAVSEKKIEMIPVKDITKVSGYIRGGCSPIGMKKLFSTCIDASAQSLETMIVSGGKIGIQIELKVDDLAKVTRAQFGEITK >NZ_CP019588.1|WP_000405915.1|3108441_3109719_+|histidine--tRNA-ligase MEIRNVKGTKDYLPEEQVLRSKIKRACEDTFERYGCKPLETPTLNMYELMSYKYGGGDEILKEIYTLQDQGKRDLALRYDLTIPFAKVVAMNPNIRLPFKRYEIGKVFRDGPIKQGRFREFIQCDVDIVGVESVMAEAELMSMAFELFQTLNLEVTIQYNNRKLLNGILQAINIPTELTSDVILSLDKIEKIGIDGVRKDVLERGISEEMADTICNTVLSCLQLSIADFKEAFNNPLVADGVNELQQLQQYLIALGINENTIFNPFLARGLTMYTGTVYEIFLKDGSITSSIGSGGRYDNIIGAFRGDDMSYPTVGISFGLDVIYTALSQKETISSTADVFIIPLGTELQCLQIAQQLRSTTSLKIELELAGRKLKRALNYANKENIPYVLIIGEEEICTETVMLRNMKEGSEVKVPLSSLSNYL >NZ_CP019588.1|WP_001100385.1|3109880_3110192_+|hypothetical-protein MNVFIKVLKWTTGISHLILIPCYYLTPGLVDLYGIPPLTVITLHIITILLAKKEDMNTYPHYIGIIVTLVAFFPYIDIVLHMIAAIFLLLDAASTNTKKVYDS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019588_5 | 3267257-3267359 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019588_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP019588_5
>5.1|3267282|53|NZ_CP019588|CRISPRCasFinder GGTATATTTACATGCCCCGAAGTAGCCGTGGATTGTCTCCTTTCCTTCCTTGA |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019588_5
The CRISPR arrays of NZ_CP019588_5 >merge|NZ_CP019588|5|3267257-3267359|CRISPRCasFinder AAGTTTAGGTTTCTTTTGAGAATGTGGTATATTTACATGCCCCGAAGTAGCCGTGGATTGTCTCCTTTCCTTCCTTGACAATTTAGGTTTCTTTTGAGAATGT >NZ_CP019588|5|5|3267257-3267359|CRISPRCasFinder AAGTTTAGGTTTCTTTTGAGAATGT GGTATATTTACATGCCCCGAAGTAGCCGTGGATTGTCTCCTTTCCTTCCTTGA CAATTTAGGTTTCTTTTGAGAATGT
>NZ_CP019588.1|WP_001226321.1|3265749_3266694_-|glycerophosphodiester-phosphodiesterase MRKIISVLVIFFMTGSIFAGGAVHAKAEGKHEWNKNKFLNIAHRGASGHAPEHTFASYDLVKKMKADYLELDIQLTKDGQLIAMHDTAVDRTTNGTGEVRDKTLSEIKSLDAGSWFNKAYPEKAKQEYVGQKVPTLEEIFQKYGRSMKYYIETKSPDVYPGMEEKLLALLEKYNLIGQNMSSSRVMIQSFSKDSLKKIHSINKNIPLVQLLWYYPNENNEIVEWSGITHEPKRVTNDDFQEIKKYAVGIGPNLRNDNGDLIINESYMKMARQNGLLIHPYTINEKPDMRLLMKWGATGMFTNYPDRLHTVLKEK >NZ_CP019588.1|WP_000236552.1|3265022_3265700_+|YdcF-family-protein MVIPKYPDVPTLTKKQIDQITEITFLKEITPQKCDVIFVFGGSHPGNWQAPLETYRQGLGNRIIVTGGTSLHGMKHPSWNYGDLSEAEVIVNKLMENGVPKGAILFEKNSLHSIANVIEAKKIFDFTKINRLLFVCKNLGAGRQYRVLKKHLPKTITCIPYTFDTSFDGEFIMNRYNWMENEKSRSMIFGEYLRNVCYGRKGGIEPPEKEVHGLEEYVSYYYNLA >NZ_CP019588.1|WP_000544597.1|3264419_3264929_+|DUF3916-domain-containing-protein MHEKKIRGMKRKTNAMIKRIEEHTKMFPSTFYNDEYWYMPLPVSQDFIESHKTPRKVKRLCIQTLIDRVNHLIKIQPSDTHTYRVVALISIENLWRSQIIVFKNDDYFHNFFNRNNEFQKWILLSNEIDFWETWGISIFPTPQLLRFQEVIYDEDTIDEKEIWFIGELS >NZ_CP019588.1|WP_000351706.1|3263575_3264427_+|LysR-family-transcriptional-regulator MDIKDLTVFYEVAKENNISHAAKNLNYVQSGVTMRMKQLENELGVPLFYRNGKGVTLTSNGEILLTYAKQIIHLMDQSIKAVQSNGTEPKGTLKIGCTESTTAVRLPSILTTYYEKYPEVELILETNTTEQLIKLVLDRKLDGAFIAGSTQHNELHSNVFHEEELVLISKKTLSSLKDIEDMNLLAFSHGCYYRSLLEDWLQEEDISPKRVLEFGTIEAILACVKSSMGVAIMMKSILKGHEHDVSFNPLPNSFNKVPTTFITRNDIFRSAALQKFMEVTHNA >NZ_CP019588.1|WP_003157243.1|3262245_3263490_-|MFS-transporter MEEDGGIIVLMEERMNSTYKWVMLIVATIAQTTATLITYGVGVFALFWKEEYALTNMESGLLVSVVNVGPLFCMLFIGRLLDQYNEKILISISSFLLGSSLLLTNIVSGFNGLLFVLLLIGMFYSVSQPGGSKVILKWFPKENRGLAMGIRQAGIPIGGALAGVLIPFLTVQYNMTYAINSIACICIIGGVLFFVFYKEPYVQEEARKGHIKISFWMELKVVICKKELYPIYITGICMISLQMVLVGHFMKFLAGEQSITSIVAGTVFSVMFFSGMIGRVALAAISDVFYKGNRRIPLFIAVCASIGLILLLVMSIHTITSGVLYSVSALLGFFSIGWFSLFIAEVAELASEESVGITVSVALTLNQIAIIVAPVLFGYIVDEKGYAYAWLCIVVLLSISAVSLYRRNKKIKES >NZ_CP019588.1|WP_000798801.1|3261915_3262146_+|hypothetical-protein MKNTDKRNRLDDMMFHYRVTKNNIVLIEYYGKQIMILKGTAAEKFLNKINHAHNDTEKQLIMAKVTGNFKRGNERQ >NZ_CP019588.1|WP_000915211.1|3260525_3261659_-|serine-hydrolase MLKKWLIVFFIFAVFSGSVVALIHASKGKKYDIKAFSNLNNKQKHDMQEVDANEKKHYEVVAGKLDQYLKDKGFNGSVLVASKDHVILRKGYGYANMKDKVFTTPRTKYRIGSITKTVVAISIMQLKEKGKLNIEDNVNKYIPSFPADKNITLRNLLTHTSGLPDQGKGRVDAASRLKLVTWIGSQALQFPAGTGWKYTDYNYMVLAYIVEKITNKPLAEYVKENIFTPVEMHESGMGATLPEDIFLAEGYTRKDNELIAAPRLKMNWLYGCGEMYTTVEDMKRLDEAIMNGKLLSKQSVLDMFTASPARKYGFSFYTYPDYYHNHGVLAGWNTFNNFNWDKKTFVILFSNVQNGMNDTFNQEFRKMANDLIEGNGA >NZ_CP019588.1|WP_000137565.1|3258702_3260490_+|oligoendopeptidase-F MTELKDRLQVADKEKWNLTDIYDTIEDWESDFHKIEVLTNELHEFNGNIHDGNSLLAYLTKSEEISSIISLMFAYARLQSDLDTRDTDAQSLVDKVSQLHVKVSAAKSFFSPFLLSVDENTLHTYIEEAEGLQYYKEDLFELYRYKKHVLNKDQEEILSQMGEALSSPQHTYGMLNNADILFGEVTSNDGEKVTLTRGMYAKLIEDESREKRKEAYKAYYKPYVQLKNSIASTLSAAIKNNVTVSKLRKYPSALEKSLFGDMVPKEVYENLIETTKKNIQSLHTYNKLRKEKLNVDELRQYDLSVDLVQGVKQDIPYDNAFDIMIESLAPLGEEYIETLKSFKDKRYIDVRETPGKCSGAYNFGVYGVHPFILLNHHDDLNSLFTLTHECGHGMHTHYSHGYQPRISAHYTIFVAEVASTVNEVLLIHHLLKEAKDANVRNHLVNHFIEKFKGTFFTQIMFAEFEKITHEMAQQGKPLNAQVFSDVYENLFREYNGDSLVFDEEVKYGWARIPHFYRPFYVYKYATGFASAIQIADKLLSGDPNAQKNYLEFLKGGSSDYPLNLLKKAGVDLTTPEPIESALNRFSELVEEFSTL >NZ_CP019588.1|WP_000473536.1|3256038_3257580_-|alpha-amylase MFKKITIVGLSVVLFLPSIYGESKVYADTINNGTLMQYFEWYAPSDRNHWNRLRTDAENLAQKGITSVWIPPAYKGTTQNDVGYGAYDLYDLGEFNQKGTVRTKYGTKAQLKSAIEALHKQNIDVYGDVVMNHKGGADYTETVTAVEVDRNNRNVEVSGDYEISAWTGFNFPGRGDNYSNFKWKWYHFDGTDWDEGRKLNRIYKFRGIGKAWDWEVSSENGNYDYLMYADLDFDHPDVANEMKNWGTWYANELNLDGFRLDAVKHIDHEYLRDWVNHVRQQTGKEMFTVAEYWQNDIQTLNNYLAKVNYNQSVFDAPLHYNFHYASKGNGNYDMRNILNGTVMQNHPALAVTLVENHDSQPGQSLESVVSPWFKPLAYAFILTRAEGYPSVFYGDYYGTSGNSSYEIPALKDKIDPILTARKNFAYGTQRDYLDHPDVIGWTREGDSVHANSGLATLISDGPGGSKWMDVGKNNAGEVWHDMTGNQTNTVTINKDGWGQFHVSGGSVSIYVQQ >NZ_CP019588.1|WP_001291979.1|3255314_3255944_+|exosporium-leader-peptide-containing-protein MSEKYIILHGTALEPNLIGPTLPPIPPFTFPNGPTGITGPTGATGFTGIGITGPTGVTGPTGIGITGPTGATGLGILPVFGTITTDVGIGFSVIVNTNINFTLPGPVSGTTLNPVDNSIIINTTGVYSVSFSIVFVIQAISSSILNLTINDSIQFAIESRIGGGPGVRATSARTDLLSLNQGDVLRVRIREATGDIIYSNASLVVSKVD >NZ_CP019588.1|WP_000417232.1|3267997_3268651_-|hypothetical-protein MEKYHGKSTEQIIQKLMPGSARSSVVMVWVVINFMILTPFLFPPTFTIYLYVILPFLLIANIWGVWVFFYKPNELRLVHILYNGFMGITFSFGSFIVIQKMAYTFIKIETPLFFIVTFVLYIFTIYKLISIGMKSFLRRLNNEENDNIKISPIVYLSGLGYVIGQICIGTLSQNGLATVLILVFSLFAVVLSISGVYIWVYVDLKRKEMDGMHNGQI >NZ_CP019588.1|WP_000933357.1|3268755_3268935_+|hypothetical-protein MLNLIPSVTILDPIETPKPIQAPATVPIGPPKTVPTAAATPSLAPAKALTAVVPTPIAA >NZ_CP019588.1|WP_000445390.1|3269266_3270886_-|FAD-dependent-monooxygenase MESNDVPVLIVGGGLSGLASALFLAKHNIEYLLIERHPSTAIHPKAGGITFRTMELFRELGLEQRIRSAGKTLENCRGRIAVHTIAEANQEELAQMRANQYENDEKLLQKIEEISPSKQTACYQITLEEIMLQEARILGGELSFYHELVSYEQNEQGVIATIRNRETEKESVIHCDYVIAADGAKSKIREQLGISAEGRGTIGGYYMNIYFEADVSEFMQGDAFGFSMVLHPEVLGALIPVDNARRWIYHVSYDPLKGERPEDFTIERCKQIIQTAIGSTNVEPEIVSVLPWKAAESTATKFQDNRIFLVGDSAHIMPPTGGFGSNTGIQDAHNLAWKLAAVIKGKAKPKLLETYHEERYPVAKLTTDYAISLLFRAANREEGSLNKMDGLAVTAGYHYSSDAIIDDAVTLHRMDIVQLNGRPGTRAPHFIGMYEEKEVSVLDLLGNDFVLLTGAENDSWAESAHTVSAKLGVNIKVYRVGLSGDFIAQENIFSELYGLSDGGAVLIRPDAFIGWRSEKEVVNLDVVLEEVMSNLLCDF >NZ_CP019588.1|WP_000571881.1|3271363_3271708_+|winged-helix-turn-helix-transcriptional-regulator MIEMNKQEQLNVIKKDFIDSQKVLLAIGDETRQAILLVLMETECQTGLRVGEITKQTHLSRPAVSHHLRILREAGIILMRKEGTKNFYYIDIRTKLSLLKNLVLDIEKLLHNFY >NZ_CP019588.1|WP_000646397.1|3271726_3272725_+|NADP-dependent-oxidoreductase MKAMIIDKYGKVPMRMAEVPIPEINEHEVLAEIHAASINPIDFKIRDGKVKMLLKYEMPLILGNDFAGVIIKVGSKVTRFKIGDEIYARPRKNKIGTFAEYIAIHEDDIALKPKNLSFEEAASIPLVGLTSYQALHDIMQLQKDQKILIHAGSGGVGTFAIQLAKIMGATVTTTASEAGPDLVKSLGADQIINYKTEKFEEILKDYDAVFDTIGGTTLEKSFDIIKSGGNIVSVSGIPNARFSKEFGSGFFKTFLFSLASKKLTALEKKHNAQYSFLFMKPSGDQLRTIANYIEAGKIKPVIDRVFPFEDAQKAMEYSEAGRAKGKIIVKMK >NZ_CP019588.1|WP_000164886.1|3272903_3274370_+|YdiU-family-protein MTKNNEAGWNLDHSYTTLPQSFYTEIPPTPVSSPELVKLNHSLAISLGFNPEELKKEAEIAIFAGNALPEGAHPLAQAYAGHQFGHFNMLGDGRALLIGEQMTPSGKRFDIQLKGSGPTPYSRRGDGRAALGPMLREYIISEAMYALDIPTTRSLAVVTTGEPTYRETKLPGAILTRVASSHIRVGTFQYAAARGSIEDLQSLADYTIKRHYPEIEAHENRYTALLQEVIKKQASLIAKWQLVGFIHGVMNTDNITISGETIDYGPCAFMDNYDQGTVFSSIDTQGRYAYGNQPYMAAWDLARLAESLIPILHEDEEEVLKIAQDEISKFSVQYEKQWFLGMKKKLGLFSNEEQDQSLIEQLLKMMEKFKADYTNTFRSLTLNTIENTALFESPEFKEWYKLWQSRLERQEESKENAYEMMKNNNPSIIPRNHRVEEALEAAVTNGDYSVMEKLLEALSNPYAYATEQEEYCVPPVPTNRPYRTFCGT >NZ_CP019588.1|WP_000592013.1|3275716_3275908_+|Phr-family-secreted-Rap-phosphatase-inhibitor MIKKISSVFLGLSVFGILATGIHSSFTYQAGHADLPAPQRPDLVQSVDASKDYNSTTTAEKAL >NZ_CP019588.1|WP_000275806.1|3275981_3276581_-|protease-synthase/sporulation-negative-transcriptional-regulator-PaiB MYIPKYFAIQDEKMKYEIMEQNSFATLFSQHNGEPYATHLPLLLNRETLTLHGHFARPNEQWKDIGTQQVLAIFQGPHSYISPSWYETKNAVPTWNYVAVHVYGELELVEDEQELIDSLQDLVDTYEDPQSTYSLNDVDPNYMEGLSKGIVGFKIKISKIEGKAKLSQNHSVARRKLVVEELEKVGSEGSRGIAELMRK >NZ_CP019588.1|WP_000813610.1|3276715_3277243_-|GrpB-family-protein MKQRITIEEYNIKWESEFNKLQTLINDVMEDSILSIEHVGSTSIKGLAAKPVLDIDIVIEDYGFFPKVVTKLGAIGYYHQAEWSYKGREAFGRKDAFVPWDGESTDWMEHHLYVCDKESEELRRHIAFRDYLREYEDVAVEYGHLKEELARETKSRTSYSEGKTAFITNILEKIN >NZ_CP019588.1|WP_001172053.1|3277266_3277614_-|DUF4260-domain-containing-protein MQKRIVHFEGLVVFVATIYMYSLYEFSWIIFLIFLLAPDLSMLAYGINNHIGANIYNLFHTYIISILIVIIGVYFKVDTVIMIGLIWTAHIGMDRMFGYGLKYETEFKGTHIQRL |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019588_4 | 4.1|3098926|27|NZ_CP019588|CRISPRCasFinder | 3098926-3098952 | 27 | KJ094023 | Listeria phage LP-101, complete genome | 3876-3902 | 4 | 0.852 |
NZ_CP019588_4 | 4.1|3098926|27|NZ_CP019588|CRISPRCasFinder | 3098926-3098952 | 27 | NC_022766 | Bacillus phage Glittering, complete genome | 9024-9050 | 5 | 0.815 |
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NZ_CP019588_4 | 4.1|3098926|27|NZ_CP019588|CRISPRCasFinder | 3098926-3098952 | 27 | NZ_CP021809 | Sinorhizobium meliloti strain Rm41 plasmid psymA, complete sequence | 127169-127195 | 6 | 0.778 |
NZ_CP019588_4 | 4.1|3098926|27|NZ_CP019588|CRISPRCasFinder | 3098926-3098952 | 27 | NC_020527 | Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymA, complete sequence | 1227597-1227623 | 6 | 0.778 |
NZ_CP019588_4 | 4.1|3098926|27|NZ_CP019588|CRISPRCasFinder | 3098926-3098952 | 27 | NZ_CP021798 | Sinorhizobium meliloti strain USDA1106 plasmid psymA, complete sequence | 850854-850880 | 6 | 0.778 |
NZ_CP019588_4 | 4.1|3098926|27|NZ_CP019588|CRISPRCasFinder | 3098926-3098952 | 27 | NC_017324 | Sinorhizobium meliloti BL225C plasmid pSINMEB01, complete sequence | 513839-513865 | 6 | 0.778 |
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1. spacer 4.1|3098926|27|NZ_CP019588|CRISPRCasFinder matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
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3. spacer 4.1|3098926|27|NZ_CP019588|CRISPRCasFinder matches to NC_003037 (Sinorhizobium meliloti 1021 plasmid pSymA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
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4. spacer 4.1|3098926|27|NZ_CP019588|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021794 (Sinorhizobium meliloti strain USDA1157 plasmid psymA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
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5. spacer 4.1|3098926|27|NZ_CP019588|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021809 (Sinorhizobium meliloti strain Rm41 plasmid psymA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
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6. spacer 4.1|3098926|27|NZ_CP019588|CRISPRCasFinder matches to NC_020527 (Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer cagggttggctcttctggtttctctat Protospacer *. ******************** .
7. spacer 4.1|3098926|27|NZ_CP019588|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021798 (Sinorhizobium meliloti strain USDA1106 plasmid psymA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
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8. spacer 4.1|3098926|27|NZ_CP019588|CRISPRCasFinder matches to NC_017324 (Sinorhizobium meliloti BL225C plasmid pSINMEB01, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer cagggttggctcttctggtttctctat Protospacer *. ******************** .
9. spacer 4.1|3098926|27|NZ_CP019588|CRISPRCasFinder matches to NC_018683 (Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cgtctttggctcttctggtttctcttc CRISPR spacer cagggttggctcttctggtttctctgt Protospacer *. ******************** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
258555 : 266504
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019588|258555:266504|DBSCAN-SWA 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GCAGCGTTAACGCACTTCGGAGATATTTTCACTGTTCAAATGGGGATTGTTATTATAACGTTCTTCTTTATCGATTTCTTTGATACAGCAGGTACACTTGTAGCGGTTGCGAATCAAGCAGGATTAATGAAGAACAATAAATTACCACGTGCAGGAAAAGCGTTATTCGCAGATGCAATTGCAACTGTAATTGGTGCAATCTTAGGTACATCAACAACAACATCTTACATTGAGTCGTCTGCAGGGGTAGCGGCAGGTGGACGTTCTGGTTTTACAGCAGTTGTAACAGCAGGATTCTTCTTACTGGCACTATTCTTCTCGCCATTATTAAGTGTTGTAACACCAGCTGTAACGGCACCAGCTTTAATTATTGTAGGGATCTTGATGGTTTCATCTTTAGGAGAAATTGATTGGAAGAAATTCGAGATTGCAGTACCGGCGTTCTTTACTATCATTTCAATGCCGCTTACGTATAGTATCGCAACGGGAATTGCGATTGGGTTTATCTTCTATCCAATTACAATGGTAGTAAGTGGTCGACGTAAAGAGATTCATCCAATTATGTATGTTATGGGAGTTTTATTCGTACTATATTTCATTTATGTTCGTAAATAAAAGGGGTTTTTGAAAGGTCTAGACTTAAGGGGAGTCTAGACCTTTTTTGCGTCTTCAGAAAAACTTAAGGATTTCCGAGCGTTTTTCTTCAGAAGTTTTCCTATAATAGAAGTTAGGGATTAAAAAAGTAATGGGGGAGATATTGTGGCACACGAAACAATACTTGTCGTAGATGATGAAAAAGAAATCCGAAATTTAATTACAATCTATTTAAAGAATGAAGGATATAAAGTATTGCAAGCAGGGGACGGAGAAGAAGGATTACGTTTACTAGAAGAAAATGAAGTACATCTAGTCGTATTAGATATTATGATGCCGAAAGTAGACGGCATTCATATGTGTATGAAAATAAGGGAAGAAAAAGAAATGCCAATTATTATGCTTTCAGCGAAAACGCAAGATATGGATAAGATTTTAGGTTTGACAACGGGTGCAGATGATTACGTAACGAAACCGTTTAATCCGTTAGAGTTAATCGCAAGAATTAAATCTCAGTTACGCCGTTATATGAAAATGAATGGTTTCGCTATACAAAATGAGGACGAGCTAGAGATTGGGGAGATGAAAATAAACATCTCAACCCATAAAGTCATTGTAGAGGGAGAAGAAGTGAAACTAACTCCGAGGGAATTTTCAATTTTAGAATTGCTAGCCCGTAATCCGGGGATGGTCTTTAGCGCGGAGCAAATTTATGAAAAGGTGTGGAACGAAAGATCTTTCCAGTCGGATAATACGGTAATGGTGCATATTCGAAAAGTGCGTGAAAAGATTGAGGAGAATCCAAGGAAACCTAGATATATAAAAACAGTATGGGGAGTGGGGTATAAGATTGAAAAAGATATTTAATCCATTTACTTATATAAGGAAAGCAAGACAATTGATTGAGAAATTAGTAAAGGGCGTACGAAAGAGTATAAGAATTCAACTGATTACTACTTTTGCCGCTTGTGCGTTATTAGGAGTTTTTTTTGCAAAGGGAGCTGCACCATTTTTTGAGAATGCGAATCGTCAAGCGACTATTGATTATCGAGCTGGTATGGAACAAATTAATCACGAAGCTCAAAGAGCAGCAAATAGCTCGGTTCATGAAAATAAATTAGAAGCTATATCCAATATGATCGAAATGGAGAATCAAAATTTAGAGCGAGGATCTAGAGCTCTAAAAATATTGGTTACTGATGAAAGTGGTAAAGTTTTATATAAAACGAAGCAGGCGCAAGAAGAGCAAATCGATTTGCATAATACGATTCGTAATGCAGCATCATTTGCGATTAACTATTCAAATGGTCGAGATGTATTTGAAAATACAAGAAAAGAATTTATAGCTTTTTCGCCTATTACAATAGAAGATAAGAACTTATATATGTTCGTTAGTGGAATACCAGATGGTGTAGTGATGTATGATACACAAGAAGGACCATTTCCATTTTTAATTGGTGTACTTGTATTTATTTTCTCTTTCTTCTATATAACAAAGAGAAAGATGAAGCAAATTGAAGCGATGGCAGAAGGTGTAAAGGAAATAGAAAAAGGCAACTTAGCGTACCGTATAGAGAAGAAAGGTGAAGATGAGATTGCATCTTTAACAGAAAATATTAATAATATGGCAGAAGAGCTTATGAATAATATAGAAAAGGAACGTAAGTTAGAGAAGCAAAAGAACGAGCTTATTACAAATGTATCTCACGATTTGCGTACACCACTGACTTCTATTATGGGTTACTTGCGATTACTTCGAGATTCTAAATATGAAAATAAAGAGCAACACGATGAATATACGAGAATTGCTTTTGCGAAGTCAGAGCAGTTAAAGAATTTAATAGAAGATTTATTTGAGTATACGAAGTTAACGAATGAGCAAGTTGTATTAGAAAAACAAGAAGTATGTGTAAATGAGTTATTGGAGCAATTAATAGAAGAGTTAGTACCGCAAGCGGAAGAGCATGGACTTACATTTGTTAAGAAGTTTCCTGAGGAACGTGCCTATGCAGCGATTGATTCGGAAAAGATGGTCCGTGTATTTGATAATCTATTAATGAACGCGATTAAGTATAGTAAAGATGATGGGGAGATAAAAGTTTCCCTTCAAAGGCAGCGCTGGGAGATACAAATTGTAATTGCGAATCATAGTGAAGAGTTTACGAGAGAAGAGTTAGCGAGTTTGTTTGAACGTTTTTATAAGAAAGATCAATCTAGAAGTAGAGTAACAGAAGGGTCAGGCCTTGGATTGGCGATTGCGAAAAGTATTGTTGAATTACAAGGTGGTAGTATTCGAGCTGAATATAAGGATGGTATTATTCAGTTTATCGTCTCGTTACCAATTATAGAAAGATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019588|258555:266504|264313_265015_+|WP_000929883.1|DBSCAN-SWA MAHETILVVDDEKEIRNLITIYLKNEGYKVLQAGDGEEGLRLLEENEVHLVVLDIMMPKVDGIHMCMKIREEKEMPIIMLSAKTQDMDKILGLTTGADDYVTKPFNPLELIARIKSQLRRYMKMNGFAIQNEDELEIGEMKINISTHKVIVEGEEVKLTPREFSILELLARNPGMVFSAEQIYEKVWNERSFQSDNTVMVHIRKVREKIEENPRKPRYIKTVWGVGYKIEKDI >NZ_CP019588|258555:266504|260920_262459_+|WP_000743900.1|DBSCAN-SWA MKKQHDTIIVLDFGSQYNQLIARRIREFGVYSELHPHTITAEEIKAMNPKGIIFSGGPNSVYGEGALHCDEKIFDLGLPIFGICYGMQLMTQQFGGTVERANHREYGKAVLKVENESKLYANLPEEQVVWMSHGDLVTGLPEGFVVDATSESCPIAGMSNEAKNLYGVQFHPEVRHSEHGNDLIKNFVFGVCGCSEGWNMENFIEVELEKIRETVGDKKVLCALSGGVDSSVVAVLIHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEAEGVMKTFSEGFHMNVIKVDAKERFMNKLKGVEDPEQKRKIIGNEFIYVFDDEASKLEGMDFLAQGTLYTDIVESGTATAQTIKSHHNVGGLPEDMQFKLIEPLNTLFKDEVRVLGSELGIPDEIVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEEKLEIVRESDAILREEIIKAGLDREIWQYFTALPGMRSVGVMGDERTYDYTVGIRAVTSIDGMTADWARIPWDVLEKISVRIVNEVKHVNRIVYDVTSKPPATIEWE >NZ_CP019588|258555:266504|264998_266504_+|WP_000719201.1|DBSCAN-SWA MKKIFNPFTYIRKARQLIEKLVKGVRKSIRIQLITTFAACALLGVFFAKGAAPFFENANRQATIDYRAGMEQINHEAQRAANSSVHENKLEAISNMIEMENQNLERGSRALKILVTDESGKVLYKTKQAQEEQIDLHNTIRNAASFAINYSNGRDVFENTRKEFIAFSPITIEDKNLYMFVSGIPDGVVMYDTQEGPFPFLIGVLVFIFSFFYITKRKMKQIEAMAEGVKEIEKGNLAYRIEKKGEDEIASLTENINNMAEELMNNIEKERKLEKQKNELITNVSHDLRTPLTSIMGYLRLLRDSKYENKEQHDEYTRIAFAKSEQLKNLIEDLFEYTKLTNEQVVLEKQEVCVNELLEQLIEELVPQAEEHGLTFVKKFPEERAYAAIDSEKMVRVFDNLLMNAIKYSKDDGEIKVSLQRQRWEIQIVIANHSEEFTREELASLFERFYKKDQSRSRVTEGSGLGLAIAKSIVELQGGSIRAEYKDGIIQFIVSLPIIER >NZ_CP019588|258555:266504|258878_260513_+|WP_001030000.1|DBSCAN-SWA MAKDIKFSEEARRSMLRGVDTLANAVKVTLGPKGRNVVLEKKFGSPLITNDGVTIAKEIELEDAFENMGAKLVAEVASKTNDVAGDGTTTATVLAQAMIREGLKNVTAGANPMGLRKGIEKAVVAAVEELKTISKPIEGKSSIAQVAAISAADEEVGQLIAEAMERVGNDGVITLEESKGFTTELDVVEGMQFDRGYASPYMITDSDKMEAVLDNPYILITDKKISNIQEILPVLEQVVQQGKPLLIIAEDVEGEALATLVVNKLRGTFNVVAVKAPGFGDRRKAMLEDIAILTGGEVITEELGRDLKSATVESLGRAGKVVVTKENTTVVEGVGSTEQIEARIGQIRAQLEETTSEFDREKLQERLAKLVGGVAVIKVGAATETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTSLMNVYTKVASIVAEGDEATGINIVLRALEEPVRQIAINAGLEGSVVVERLKGEKVGVGFNAATGEWVNMLETGIVDPAKVTRSALQNAASVAAMFLTTEAVVADKPEPNAPAMPDMGGMGMGGMGGMM >NZ_CP019588|258555:266504|262843_264169_+|WP_000833093.1|DBSCAN-SWA MKRYFQFDELGTNYKTEFIAGLTTFLSMAYVLFVNPATLSLGNVKGLPAGTGMDPGAVFVATALAAAIGSLIMGIFAKYPIALAPGMGINAFFAYTAVLTMGIPWQTAIAGTLMSGIIFIILTASGIREKIINAIPSELKFAVAAGIGLFIAFLGFQNAGIIVKNDAVLVGLGDLTKGTTLLAIFGVVTTIIFMIKKVNGAVFYGMILTAILGVATGLIDTPKAVVGAIPSLEPTFGAALTHFGDIFTVQMGIVIITFFFIDFFDTAGTLVAVANQAGLMKNNKLPRAGKALFADAIATVIGAILGTSTTTSYIESSAGVAAGGRSGFTAVVTAGFFLLALFFSPLLSVVTPAVTAPALIIVGILMVSSLGEIDWKKFEIAVPAFFTIISMPLTYSIATGIAIGFIFYPITMVVSGRRKEIHPIMYVMGVLFVLYFIYVRK >NZ_CP019588|258555:266504|258555_258840_+|WP_000917306.1|DBSCAN-SWA MLKPLGDRVVIELVQAEEKTASGIVLPDTAKEKPQEGKVIAVGTGRVLENGERVALEVAAGDLIIFSKYAGTEVKYEGTDYLILRESDILAVIG |
6 | uncultured_virus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
297184 : 305561
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP019588|297184:305561|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP019588|297184:305561|297184_298492_+|WP_000625683.1|DBSCAN-SWA MISRYTRPEMGAIWTEENKFKAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVKKIREHASFDIDRIYEIEKETRHDVVAFTRAVSETPALGEERKWVHYGLTSTDVVDTALSYILKQANEIILKDLENFVSILANKAKEHKYTIMMGRTHGVHAEPTTFGLKLGLWYEEMKRNVERFKQAANTVRVGKLSGAVGTYANIDPFVEKYVCENLGLEAAPISTQTLQRDRHAHYMSTLALIATSIEKMAVEIRGLQKSETREVEEAFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENMTGLARVIRGYMMTAYENVPLWHERDISHSSAERVILPDATIALNYMLNRFGNIVKNLTVYPENMKRNMTRTYGLIYSQRVMLTLIDKGMVREEAYDIVQPKAMEAWETQVQFKELVEADERITSKLTQEEINECFNYEHHMQHVDTIFERLGLNEA >NZ_CP019588|297184:305561|299543_300227_+|WP_000666779.1|DBSCAN-SWA MKFAVIVFPGSNCDVDMFHAIKDELGEEVDYVWHDTENLDEYDAILLPGGFSYGDYLRCGAISRFANAMKAVQKAAEQGKPILGVCNGFQILVESGLLPGALMRNENLKFMCRTVQLRVENNETMFTSQYEKDEVINIPIAHGEGNYYCDEETLKQLEENNQIAFRYVENPNGSVSDIAGIVNEKGNVLGMMPHPERAVDELLGGAEGLKVFQSILKQWRETYVVNA >NZ_CP019588|297184:305561|302414_303830_+|WP_000879029.1|DBSCAN-SWA MLAEIKGLNEECGVFGIWGHENAAQVSYYGLHSLQHRGQEGAGIVVNNGEKIVGHKGLGLISEVFSRGELEGLNGKSAIGHVRYATAGGSEVANVQPLLFRFSDHSMALAHNGNLINAKMLRRELEAEGSIFQTSSDTEVLLHLIKRSTKDSLIESVKEALNKVKGAFAYLLLTGNEMIVALDPNGFRPLSIGKMGDAYVVASETCAFDVVGATYIRDVEPGELLIINDEGIHVDRFTNEVDHAICSMEYIYFARPDSNIAGINVHAARKNMGKRLAAEAPIEADVVTGVPDSSISAAIGYAEATGIPYELGLIKNRYVGRTFIQPSQELREQGVKMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVRMLREAGATEVHVRIASPPLKYPCFYGIDIQTRKELIAANHTVEEIREMIGADSLTFLSEDGLVDAIGRPYEGKYGGLCMAYFNGDYPTALYDYEQELLESMK >NZ_CP019588|297184:305561|303936_304977_+|WP_001262436.1|DBSCAN-SWA MANAYKQAGVDIEAGYEAVSRMKKHVQTTMRKEVLGGLGGFGGMFDLSKFALEEPVLVSGTDGVGTKLMLAFMADKHDTIGIDAVAMCVNDIVVQGAEPLFFLDYIACGKAEPSKIENIVKGISEGCRQAGCALIGGETAEMPGMYSTEEYDLAGFTVGIVDKKKIVTGEKIEAGHVLIGLASSGIHSNGYSLVRKVLLEDGELSLDRIYGRLELPLGEELLKPTKIYVKPILELLKNHEVYGMAHITGGGFIENIPRMLPEGIGAEIELGSWKIQPIFSLLQEVGKLEEKEMFNIFNMGIGMVVAVKEEDAKDIVRLLEEQGETARIIGRTVQGAGVTFNGGKAL >NZ_CP019588|297184:305561|304973_305561_+|WP_000088592.1|DBSCAN-SWA MSRLAVFASGSGSNFQSLVNAVEEKRLDAEISLLVCDKPEARAVGRANYHHIPCFAFSAKAYESKEAFEKEILNKLEEYEIDYVILAGYMRLIGPTLLEAYGGRIINIHPSLLPSFPGKDAVGQALEAGVKVTGVTIHYVDAGMDTGPIIAQEAVVVSEGDTRESLQKKIQQVEHKLYVNTVNQIVQSTKEPTVN >NZ_CP019588|297184:305561|298580_299300_+|WP_001170540.1|DBSCAN-SWA MQKLELLYEGKAKRIYRTESADMVWVEYKDSATAFNGEKKETITGKGRLNNEITTLLFRKLQEVGIKTHFVEKLSETEQLVKKVSIIPLEVVTRNVIAGSLSKRLGMEEGTVLAEPIVEFYFKDDDLGDPLVTEDHIRVLNVASPEQVSVLRDMALQINQVLIDHFASCRVRLVDFKLEFGVTDEGAIILADEISPDTCRLWDETSNEKFDKDVFRRDLGNLTDAYEEILKRLGGISHV >NZ_CP019588|297184:305561|299292_299547_+|WP_000278820.1|DBSCAN-SWA MYKVKVYVTLRESVLDPQGTAVKGALHSLSFTEVQDVRIGKYMELTIDKSVSDLDAKVKEMCEKLLANVVMEDFRYEVEEVVAQ >NZ_CP019588|297184:305561|300210_302430_+|WP_000055577.1|DBSCAN-SWA MSLMLEPNPTQIKEERIYAEMGLTDEEFAMVEKILGRLPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTTGERVLQGPGEGAGIVDIGDNQAVVFKMESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPVALLNSLRFGELQSPRVKYLFEEVVAGIAGYGNCIGIPTVGGEVQFDPCYEGNPLVNAMCVGLINHEDIKKGQAHGAGNTVMYVGASTGRDGIHGATFASEELSESSEAKRPAVQVGDPFMEKLLIEACLELIQSDALVGIQDMGAAGLTSSSAEMASKAGMGIEMYLDDVPQRETGMTPYEMMLSESQERMLIVVKKGREQEIVDLFEKYGLAAVTMGKVTEDKMLRLFHKGEMVAEVPADALAEEAPIYHKPSKEAAYFAEFQQMKMETPKVENYKETLFALLQQPTIASKEWVYDQYDYQVRTSTVVTPGSDAAVVRVRGTEKGLAMTTDCNSRYIYLDPEVGGKIAVAEAARNIVCSGGEPLAITDCLNFGNPEKPEIFWQIEKSVDGMSEACRTLQTPVIGGNVSMYNERSGEAVYPTPTVGMVGLVHDLKHVTTQEFKQAGDLVYVIGETKAEFGGSELQKMLHGKIFGQSPSIDLDVELKRQKQVLAAIQAGLVQSAHDVAEGGLAVAISESAIGANGLGATVKLDGEATAALFAESQSRFVITVKRENKEAFEKAVEAIQVGEVTNTNEVTIHNEENEVLLTANVDEMRKAWKGAIPCLLK |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
445989 : 476659
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP019588|445989:476659|DBSCAN-SWA AATGATACAAAAGCAACATGAGAGTAAGTTGGAAGTTGGTCAAACATTTCCTGTGACAATTAAACGTCTTGGGATTAACGGAGAAGGCGTTGGTTATTTTAAGAGACAAGTTGTTTTCATTCCAGGGGCATTACCAGGAGAAGAAGTTGTTGCTGAAACAACGAAAATTCAGCGTGGTTTCGCAGAAGCGAAAGTGAAAAAAGTTCGTAAAGCTTCACCGCATCGTGTGAAAGCACCGTGTCCAGTATATGAGGAGTGTGGCGGTTGTCAGCTGCAACATTTAGATTATAAAGAACAATTGAATCAAAAGCGTGATATCGTTGTACAAGCATTTGAGAAATACATGAAAAACAGTATGGAAGAGAAAATTCGTCCAACGCTTGGCATGGAAAATCCATGGCATTATCGTAATAAGAGTCAATTACAAGTGGGGCGTAAAGACGAAAAGGTTATTACAGGGCTGTATAAACAAAATTCACATCAGTTAATTGATATTGCTCATTGTATGATTCAACATAAAGCAACGAATGAAGCGACAAAAGTTGTAAGACGTATTTTAGAAAAATTAAATGTTTCTATTTACAATGAGAAAAAACAAAAAGGTTTAGTACGTACAATTGTGACACGTACTGCAGTTCAAACAGGGGAAGTACAAGTTACACTTATTACAACAAAAGAAGAGTTGCCAAATAAAGAACAATTTATTGCAGAAGTACAAAAACAGATGCCAGCTGTTAAATCAATTATGCAAAATGTAAACTGGCGTAAAACATCTGTTATTTTCGGAGATAAAACATTTAAATTAGCTGGAAAAGAAGTAATTCAAGAAACACTTGGTGATTTATCATTTGAATTATCAGCACGTGCATTCTTCCAGTTGAATCCAGAACAAACGGTTGTATTATATAATGAAGCGAAAAAAGCCGCTGCTTTAACAGGAAATGAGAAAATTGTAGATGCATATTGTGGTGTTGGTACAATCGGTCTTTGGCTTGCGAATGATGCAGCGGAAGTACGTGGTATGGATGTAATTCCAGAAGCAATTGCAGATGCAAGAAAAAATGCGAAGCGTCACGGATTTACAAATACGAAATATGAAGCAGGTAAAGCTGAACAATGGTTACCTAAATGGGTAAAAGAAGGATGGCGTCCAGATGTAATTGTTGTCGATCCACCACGTACAGGTTGCGACGATAAATTACTGGAAACAATTTTAAAAGTGAAGCCAAAACAAGTTGTTTACGTATCTTGTAACCCTTCTTCATTAGCACGTGATGTACAAGCGTTAATGAAGAGTTATGAAGTGGAATATGTACAACCAGTTGATATGTTCCCGCATACAGCTCATGTTGAGAACGTAGTTAAATTAACGCTGAAATAAAGGGGTTTCAATGAAATTGTTGATGGGTTTGACCACATTCTGACCACATCAACAATTTTTTTATGATTTTAATGCCTCACTTAGCTTTAAAACAGCACTTTCTTGCATATCTATAGTAACATGACTGTAAGTGTCTAATGTGGTCTTAATTGAACTATGTCCTAAACGCTCACTTACGATTTTTGGATTAATACCTAGCTTCAATAAAATTGTTGCATGCGTATGTCGTAAGTCGTGAAACCTAATTTGAGGTACATCGGCTTTTTTTATAAATTGATTAAAAGTAGTTGTCATAGTTCGTGGTAATATTGGCTGTCCAGTTTCTTTAGCAAAAACTAAATCATTATCCTCGTATGACTGCCCAAATAATAATTTGAACTCATTTTGTTTAGCTTTATAAGACTTAAATTCTTTACATAAGTTTTGATCGATAGAAATTAAGCGTTTTGATCCATGTGTTTTGGGTTCTGTAAATCTAAATCCGTTCTCATCATAAATGAGTGTTTCTGTAACGCTTATTTTACCTTCATTCAAATCGAAATTCTTCCACTTTAGACCAAGTATTTCACCACGTCTCATACCTGTATTTAATGCCAATAAGAAAAGATGATAATAGATGACATTTTCAAATTTTGTACGATTTAAGAATTTTTTCGTTTCTTCAATTGACCACGTAGAATTGACCACTTTTCGTGGTCGAGGTATTTCCACATGTTGAAATGGGTTTTTAAACAGGAGCTCCCACCTAACAGCGTCTTCTAATGATCCTTTTAAAACAATGAAAATATATTCAATATACGCAGGTGACAACCCTTCATCAATTAAGGATTTAACGAATCGTTGTCCATGCAAGGGTTTTAAATCCTTTAATTTATGCGAACCAAGCACAGGTATAATTCGACTATTTATAGCTCTTTTATAATTGGTGAATGTAGTTTCTCTTACTCTTTGTTTAGCTGTATTTTCTAGCCATTCTTGTAAATACTCACTAAGAGTAAAATTCTTATCATCAACTAGACTTCCAGTGTTGAATTGATGGATAAGCTCATTGCATGCACGTTCGGCTTCTTTCTTTGTTTTAAAGCCTGATGCTGTTTTTTGTTTTCTTTTTCCAGTGATAGGATCTTTCCCAATATCAATAGTAAATGACCACTTTTCACCACGTTTTCTAAAGTATCCTTTCATTATCCATACCTCCTTGAACTAATAGTATTCTAATAGCACAAATAATTCCAGTATCAGAAAAAGGAAAAAGCAACTCATCTGAGTTACTTTATGGTAAACTATATTCAACTGTATATGTCGGGTGGCTTGGTTGCTATCCTTTCTCTGTATTTTAGAGAGAAAGGAGGTGACCCTTATGATGGAATATTTACTTTCTTTGTTACAGGATTTACTCAAGGTATTCCTTACTATAGTTGTTACAGCTTATGCAAATAAGTTCGCTAACAATTTGTTTAAGAAAAGTAAAAGAGCCACCCCTCGCCGTAGGAAGCAGGGTAGCTCTAAAAGAAAATAAATAGCAACCTTGCCATCTGATGGCGGCAGTTACTGGAAGAGATGTTAACGGCATCTCTTCTTTTATTCTATGCAATTCAGTTAGGTGTCATACTTAATATATAGTAAATATATGTTCACTATACAGTGGTGATTCTAGTGCCAATATTACCACAGTATCATTTTTGGGTCAACGCAAATAGCAGGGATTGATGGTGAATTTATAATGGTCCACAAAATAAAAAATCATGGTAAAATATATATATCCATACTTCTTAGCCCATACATGTTGTGGGCTTTTTTTATTGATACAAAATCAGTATTTTGTCGAAAGAAAAAAAGAGAGCAAAACGCTCTCTTACCACTACCCAATGGAAAACTTTTCTTCTAAAATGAAATTAAATCAGAATATATCTTGATTATCTTCAAGCATATTGATTAATACGGAGACTTGCTTACAAAAACGTTCCCTCTGTTGTTCATTTAACGCCGCATACGTTGTTTGAACATTAGATAATAGTTCTGTTAAGGGTTCTTCATCAAATTCATTCGTGAACCCAATAAGCGCGTCTACCGAAACATTGAAGAAGGAGGCGATGATAACCAACGTATCTATATCTGGCTGATACCGATCAGTTTCCCAGTTTTTGATTTGGCTTCTACTCAAGTTCAGCTTGTGGGAAAGTTGTTCCTGAGTTAAGCCACGCGACTTCCTTAGTTTTTTTAGAATTTGTCCAAAGTGTCTCATAATTTAAAGTATAAATACTAAACAACTATACTACTATATATGGTCGTTTAACTACCTTTAATGTTAAAATGGTAGTTATGGTTTCTGGAAATAAATCAAAAAACAGAACAAAAGTTCGTATTCTTGTGGTAAAATATGCATGTGAGGTATTCGAAAGTTCCATGCATATTTACATATTTTATTTTCGTTACAGCTGATAAACGTTGGTATATAACGGTTTTACAACTTTCTCAATAATTATCAGATAACTGCATGACTGAAATTTGCCAAAAATATGATATTATGAAAACAAATATAATAAACGGAACGAAAAAAAGACTCACAGCGTGTGTAAGAGTGATTTGGCCCACTCTTACACCGTTCGCCCGACTCACAAGGGGAACATCTGCCATAAGTCTCTTTTCGGTCACTACACGAGTAACACTTACATTATAACATGCCGATATTACTAAAGCATTACTATGGTATTAAATTCCTGTTTTAAAAGTTGAGAAAAGAGCGAAGCGTCTTTGTTCCAAAAGGGAGGAACAAGAAGTGTGGAAAGTTTTAAATGTTCTTGAAGGAGAGTTATATGTAGCTGGAATTAAGAAAAACAAGTTAGCTGATTATTGGGGAGTGAAGCCTGCTACAGTTACCAAGGTATTTAAAGGAGCTAACGATATTAGTTTCGGATATCTTTCGAAGACGCTTATTTTATTAAAAAAGAGTTTGATTTCACAGGCGAAAATTGTTAATGACTATGTAACGAACACAGACCCTAAACCTGAAAATTTAAGAGAAGCTATGGAAGATTTGGCTATTAGAGGTAAATTCGAATTATTGAAAGCAATTATAGATCAAGAGATTCATTCTGATGTTGCCGAAAATAGAGAATTTGCAGAAGTATATGAAATAATTTTTCGAAGATATCATGACGGTTTGAATGCTTCGGCTTATTTCAAATTATTAAGACAAAAGAATAAAAATGTTAAAACGATTGAAATGGAAGTTTTGACAGAAATCTTATTATGCCAGGCGCAATATCAGTCTGGGAATTACAAAACGCTATACGAGAGACTGAAGTCAGTTAGTGAAAAAATAAATGAAATAACAAATAAATTTATAAAAGAATGTTTGTTACTAAGATATAAAGAAGCAATAGCAGTAACTTCTTTACAAGGTGGCGAAGTAGTTGAATCTCGTTCCATATGTCGAGATATATTAGATGAATTAGAGTGGGATGACTTTTTCTCACTGCCAAAACTAAATGCATACTTGAAAATAGGCGAGTCATTAATATTCGAACCTGATAATTACGACAGCGCTAAGTTTTATTTAGAGAAAACATTAGAGTTATTAGGTAATCCTAGTTGCAAAGGATTAGAAAAGAAATGG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46 | Bacillus_phage(67.5%) | integrase,terminase,head,capsid,protease,tail | attL 450331:450346|attR 464995:465010 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
480547 : 484415
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP019588|480547:484415|DBSCAN-SWA ATTGAAACACATAAAACTTTACGATAAACAATTACAGTTAAAAGCATATCTCGAAAACGCATTTAAAATAAAGTACAGCCCGCCACTCAATGAACTTTGGACGGCGGGTTTTTCATTACCTTTTACCGATCCTAAGCGAGAGGAAATTGAAACGTTTGATTATGTGGAAATATTTGATAACGGTAAACGTATCGGATTGTTCCGTATTATGGATAGCGAGGAAGAAAGGGAAGTAAGTCAAAAAATAATAACTTATGACTGTGAGCATGTTTTATCTACTTTAATGGATAGCGTGCTTTTTGGTTATCACGAAAGAATTAATTTAACGACAAGGGAGAATATTGAGTATCTCTTAAGCAAACAAAGAATAAAGCATTGGAAACTTGGTCAATGTGATTTTGTAAAATATTTTCAATATAGTTGGGAAAATGAAGATACGATATTAGGACCGATATATAGTATTGCAAAACCGTTTGATGAGAAATTCCAATGGACATGGGACGATACTTCCTATCCTTGGACTTTAAATCTCGTGAAATATTCCGATGAAATTACAGGTGAGCTTCGATATAGAAAGAACATGAAAGGCATTAAGCGAAAGGTAGAAGCTAAGGATGTCATGACTAGAATTTATCCACTAGGTTATGGTGAAGGTGTTAATCAACTTAATATCAAAAGTGTGAACAATGGTCTTCCTTATATAGATGCTCCTGATTTTGTCAGAGAGTTACAGGATGGGTTTGATTATATTTGGGTGGATAGACGATTTGAGGACCCAAAAACGCTTTATGCTTCAGCAAAAGCGATGTTATTAAAAGCGTGTATGCCAAAAGTTACATATGAAATTGATGCAATTGATTATGAATTGATTGACCCATACAAAATAGAAAAATATGAAACAGGCAAGTTAGTACGTCTATATGATGAGGATTTTAATATATCTGTTGATTTACGAGTAATGGACCGTTCAAAAGATGATGTTACTGGTAATCCACTTGATGTAAAGCTTGTATTAGAAAATAAAGTCACTGATATTGGGACAATACAAGCAGATATTGAAAAGCGACAGAAAGTAAACGAAGTGTATTCTCAAGGAACAACTAATATTGATAGTCAACCTTTCCAAGATAATTGCGACCCAGATCATCCAGCCATCATAAGGTTTCAAATACCTAACGATGTTAAGAATGTGAATCAACTGATACTGACATTTGAGACATTACGGTTTAGAGCATATGAGCGGGCTATTAAAGGCGGCGGAGCTGTCGTTGCTTCAACTTCTGCCGGTGGTGCGAATGTATCTTCAACAAGTTCCGGTGGTGGTACGGTTGGTTCGACGTCATCAGGCGGAAGTTCTGTGCAAGCAAGTAGTTCCGGTGGTGGTACGGTTAAAGCTTCAAGTAGTGGAGGAGATCATGTTCATAAAATGTTTCATGGTGGCGGAATTGTTCCTGCTGAACCATCAACAATAGGATTATATACAGCTTTTTCTGATCCAGGAAGAAATACATCAGCTTCATTTTACGCAAAAGGAACGGGATCTAGTTTCTACACATATGGTTCTAGTGGGAATCACACTCATGATATATCAATACCTAACCATACTCACAGTATTAATATAAATCATAAAATATAGAAGGAGATTGATAACATATGCAAACAATTGAAATCCATACACAAGGCGGATTAAAACATAAAGTGCAGACTGAGGTATATAACGCAGAAGCACTGAATACGAAACTAAACGACAACGATTTAATTACAGTATTAATTGGTGATTTTATTATTCAACGTATTGATGTTAAACGTATCATTCCATTAAATATGATTGATGCGGAAGGCGCTAAAAGGGTAGAAGTTCATACAAATGCTGGGAAAGTGATTGAGATTACAACAAACGATTATGATCCAATCTATCTAAACGAGCAATTAAACAATAATAATACAATTACAGTCGTAATTGGTGATTATATTTTCTCTCGAATTGATGTAAAACAAGTAGTTCCTGTGAAAGAAGAACCTAAAGAGCCAGAACAACCACCTGTGACAGAACCTGAGAAACCGACAGAACCAGTTACACCGCCAGGAGAAGGTACAGAAGATGATAGCATTACAACTACAGAGCAGTTATAAACTGGTCTTTTTATTTTGAACAAAATACGGCTTTTACAACAAAACGAAGTGTGCTTATTGCAGGCTTTTTTATTTTGAATAAAGGAGTGAAAAGATGGCTGAATTAAAACACGATGATATGAAGGAATTACTTGTAGGGTTGACCAGAGTAGAAACCAAGCTTGATACACTCGGTAATGTCAAAGAAGTTGCCATTGAAGCCCAACAATCAGCAAAAAGCGCTCATTTGCGTGTGGATAGATTAGATAAATTAGTTTTTTGGTTAGGTACGACAGTTATAGGAGCTGTTATCGTTGGGGCTATTACAGCATTATTCAAATTCGCAGGAAAGTAGGGAGAAGAATGAATAAGGAAAATATCAAAAAAACGATTCCGCAACTGGAAAACATGGGTTGCGGTTTTTTCTTTGCTTGGATTTTTATTTACAAAGTTTGGCGTTCCAGAAGCAAAAAGCTTTTTGGATGAATTAGCACCTTACTTGCTGTCAGTTGGTATCGCATTAGGTATTTGGTCTGATCATGATGTAAATAGCGAAGGAGACGATAAATAATGGGACATATTATTGATATTTCAAAATGGAATGGCGATATTAACTGGTCTATAGCGAAACAACATATAGATTTCATCATTGCTCGCGTACAGGATGGTTCAAATTATGTAGATCCACTATATAAAGGATATGTACAAGCAATGAAGCAGCATGGAATACCATTTGGTAACTACGCATTTTGTCGTTTTGTTTCAATTGCTGATGCAAAGAAAGAAGCACAAGACTTCTGGAATCGCGGCGACAAGAGCGCTACAGTTTGGGTGGCTGATGTAGAAGTAAAAACAATGAATGATATGAGAGCAGGTACACAGGCGTTTATCGATGAGTTATACCGATTAGGGGCTAAGAAAGTTGGTTTATATGTTGGTCATCATATGTATACACCTTTCGGTATGGCGAACGTAAAAAGTGATTTTGTATGGATTCCACGTTATGGTGGTAACAAGCCAGCCTATCCTTGCGATATTTGGCAATATACTGAAACGGGTAATGTACCTGGTATCGGGAAGTGTGACCTTAATTCACTTATAGGCAATAAGTCACTATCTTGGTTTACAGAATCGGCAACCCAGGAATCTGTACAAGCGCCTACACAAAACATCATCCAATCAGGTGCTTTTTCACCTTATGAAACTCCTGACGTTACAGGGGCATTAACATCCTTAAAAATGACTGCTAAATTCATCTTGAAACCTGATGGATTAACATACTTTATTTCTGATCCAACGTCAGATGCTCAATTAAATGCAATGAAAGAATACCTTGACCGTAAAGGTTGGTGGTATGAAGTTAAATAAAACAAAAGAATAGTTTTATAAACAAAAATAAGAGCCGTCAAATGACGGCTTTTTTATTGCAAATCAGATATTTTCTTAACTTCTTTTTCCTTCGCTTTGAATTCCTTCTCGTATTGTTTAAAATCCTCTTTATCAACATGGAACCTTTCACCAGTTGCAACGTTTTTGACTAAATAAGTTTTACGATTGCGTTCCTTAATTAATCCATATAAGACCAAAAACAAAAGGGAGATACCTATCGTCGGAAGAGCTAAAATTATGCATAGTATTAGTACCGTTTTCTCCGATTTGCTATCTTCACGTTTTAAAATAAGTTTCTCTCCTGATGCAGCTTCCGATTGCTTTAATTGTTGCATTCTTTGGAGTGCAGCAACTGTATCAAGACTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP019588|480547:484415|482199_482679_+|WP_001193271.1|DBSCAN-SWA MQTIEIHTQGGLKHKVQTEVYNAEALNTKLNDNDLITVLIGDFIIQRIDVKRIIPLNMIDAEGAKRVEVHTNAGKVIEITTNDYDPIYLNEQLNNNNTITVVIGDYIFSRIDVKQVVPVKEEPKEPEQPPVTEPEKPTEPVTPPGEGTEDDSITTTEQL >NZ_CP019588|480547:484415|484079_484415_-|WP_000050925.1|DBSCAN-SWA MSLDTVAALQRMQQLKQSEAASGEKLILKREDSKSEKTVLILCIILALPTIGISLLFLVLYGLIKERNRKTYLVKNVATGERFHVDKEDFKQYEKEFKAKEKEVKKISDLQ >NZ_CP019588|480547:484415|483025_483229_+|WP_110925518.1|DBSCAN-SWA MRKISKKRFRNWKTWVAVFSLLGFLFTKFGVPEAKSFLDELAPYLLSVGIALGIWSDHDVNSEGDDK >NZ_CP019588|480547:484415|482773_483013_+|WP_000818882.1|DBSCAN-SWA MAELKHDDMKELLVGLTRVETKLDTLGNVKEVAIEAQQSAKSAHLRVDRLDKLVFWLGTTVIGAVIVGAITALFKFAGK >NZ_CP019588|480547:484415|483228_484026_+|WP_000509854.1|DBSCAN-SWA MGHIIDISKWNGDINWSIAKQHIDFIIARVQDGSNYVDPLYKGYVQAMKQHGIPFGNYAFCRFVSIADAKKEAQDFWNRGDKSATVWVADVEVKTMNDMRAGTQAFIDELYRLGAKKVGLYVGHHMYTPFGMANVKSDFVWIPRYGGNKPAYPCDIWQYTETGNVPGIGKCDLNSLIGNKSLSWFTESATQESVQAPTQNIIQSGAFSPYETPDVTGALTSLKMTAKFILKPDGLTYFISDPTSDAQLNAMKEYLDRKGWWYEVK >NZ_CP019588|480547:484415|480547_482182_+|WP_003164347.1|DBSCAN-SWA MKHIKLYDKQLQLKAYLENAFKIKYSPPLNELWTAGFSLPFTDPKREEIETFDYVEIFDNGKRIGLFRIMDSEEEREVSQKIITYDCEHVLSTLMDSVLFGYHERINLTTRENIEYLLSKQRIKHWKLGQCDFVKYFQYSWENEDTILGPIYSIAKPFDEKFQWTWDDTSYPWTLNLVKYSDEITGELRYRKNMKGIKRKVEAKDVMTRIYPLGYGEGVNQLNIKSVNNGLPYIDAPDFVRELQDGFDYIWVDRRFEDPKTLYASAKAMLLKACMPKVTYEIDAIDYELIDPYKIEKYETGKLVRLYDEDFNISVDLRVMDRSKDDVTGNPLDVKLVLENKVTDIGTIQADIEKRQKVNEVYSQGTTNIDSQPFQDNCDPDHPAIIRFQIPNDVKNVNQLILTFETLRFRAYERAIKGGGAVVASTSAGGANVSSTSSGGGTVGSTSSGGSSVQASSSGGGTVKASSSGGDHVHKMFHGGGIVPAEPSTIGLYTAFSDPGRNTSASFYAKGTGSSFYTYGSSGNHTHDISIPNHTHSININHKI |
6 | Bacillus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1838278 : 1847011
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP019588|1838278:1847011|DBSCAN-SWA TATGAAAAAAGTAATTGCAGGTTTAGCAGCAGCTTCTGTAGTAGGTGTTGCAGTTCCAGGTATGGATTCTGCTCAAGCACAAGTTTCAAACGAAGCGCTAAAAGAAATTAATGGACAAGCTCAAACTCAAACGACTGTAACTGAAACAAAAACTGTAGAAACAAAATCTGACTTAAAATACACAGTAACTGCTGATGTATTAAATGTTCGTTCAGGTGCTGGTACAGGACATAGCGTTATTTCTAAAGTAAAACAAGGTCAAGTACTACAAGTAATTGGACAAGAAAACGGTTGGTTCAAAGTAACTGTAAACGGTCAAACTGGTTATGTAAGTGGTGACTTCGTAACAACTGGTGGTAAAACAGGAACTACTGTTCAACAAGGAACTGGTACTTACACAGTAAACGTTTCTTCACTTAACGTACGTACAGGTCCAAGTACATCTCATACAGTATTAGGCTCTGTAAATAAAGGTAAAACAGTACAAGTTGTTAGTGAAGTACAAGATTGGTTTAAAATCAACTTCAATGGTGGAACTGGATATGTAAGCAAAGACTTCGTAACAAAAGGTGGTTCTGCTGTATCTAACCAAACACAACAACCAACTACAAACAACAATACTACAACAGTTCAAACTGGTGGTTCTTATGTTGTTAACACTGGTGCTCTAAAAGTACGTACAGGCCCAGCTACATACAACGCTGTAATCGGTGGTGTAACAAACGGTACAGTATTAAACGTTACTGGCGCTGAAAATGGTTGGTACAAAATTAACCATAACGGCCGCACAGGTCACGTAAGTGCAGACTTCGTTAAGTTTGTAAAAGGCGGAGTAAACAACGTTACGAATAACGTTCAACAACCAGTTAAAGACGTACAAAAACCAACAACAGGTGGAAATACATCTTCAATCGCTGGATTCGCTAGATCTTTAAATGGTTCACCGTACAGAACTGCTGGTACAACACCTGCTGGTTTTGACTGCAGTGGATTCATTCACTACGTATTAAATCAAACTGGTCATAAAGGCGCTCGTCAAACAGTTGCTGGATACTGGAGCTCTAAAACAAAAACTAGCAATCCACAACCAGGTGATTTAGTATACTTCCAAAACACTTATAAATCAGGTCCTTCTCACATGGGTGTTTACTTAGGAAACGGTCAATTCATTAGTGCAGAAACTGATGCAACTGGCGTACGTATTAGTTCAGTAAGCAACTCTTACTGGAGCAAGCACCTTTTAGGTTACACAAAAGCATACTAAGAAAAAGTAGTTTATATACTTTTCGAATAGAGAAAAGGCTTTCCAGGGAAACTTGGGAAGCCTTTTTATAGTTGAATAAATTGGGAGTATAGTAGTTTTTACTTTAACTTCCCGTTTAAAAATCGATCGTATAAGTCATGGAAATAGTTAGGGCGAAATAAATTTGCTGCATGTCCTGCTAACGGTATTTCTTTATATAAAACGTTAGGAAGAATGGACTTTAAATCAAAAAGACAAGATTTATAGAGATGATCATGTTCACCCATTACCCATAGAATAGGGTGGGGAAGTGATTTTAATTTAGATTTTAAATCGAATTCTAACCGATGTCGTAATGATTGGGCAATAATTGATGAATGTAATTGCAATCCGAAACGGTAATAAATATTTCTTGAAATGACTGCAAATGGGTTTGCTTTTAGTATGCCACTTGGAAAAATGGTATTTGCGTATTGAGAGAGCCATTTAGAGTAATCGTCTCCTCGTTTCTCCCAAAATTTTTGAAATACGCTATATAAAAGAGAAGGATTATTATAATGTCCACCAATATGACAAATGCTTAATACTTTTTCTGGGTGCATTTGTGCAAAAATGGTAGAGATATAACAGCCGTAGCTTAAAGCACAAATATGAGCTTTTTGAATGCCTTCTTTTTCGTATAAATTCAATAATTGATCAACGAGGCGCTGTAATGAAAATTCGATAGCTTCACCTTTATCATCGCCGTGACCTAATAAATCATACGTAATAATGTTGTAGGAGGTTGAAAATCGTTTATGCTCTTTTTTGAAGGCACGACGATTACCAACTAATCCATGAATAAAAATGATTGTTTCCTTTTCGGAATGTATATTTGTTTGCAAAAAAGATACTCCTTTCAATAACTGGAGATTTATATAGTATTTTAAATTAGTTATTTATAATTCACATAGAATAATATTAAGTACCAGGTAATAATATCAGATGTTTATATCTGTTGTAAAGATGAGTTTTTATGTATATTTTGTAAAAATACAAAATGTGTGTTTACATTCAGTTTACATTTGTATTGTATTCTATTTTTAGAAAGAACAGTTTTGTTTAACACGAGGAGATGAACATGAATGGAAGTTAGAGATGAAATAAAGAAAAAAGGGAATTGGAGGCAGTTTTTACGCCTTATTCAAGATACAAAGCCTCCGAAAGGGATTCTTGTTTTTGCGTTATTAATGAGTTTGCTTTCTACGGGAGCAAGTTTATTTATTCCGATGTTAACAAAAGGGTTAGTAGATAATTTTTCACTTTCCTCAATTAGTACAGGACAAATTGTTGGATTAGTTGCATTCTTTATTATGCAAACTATAGCTGCAGGATTGTCTATATATTTATTAAATTATATAGGACAGAAGATTGTAGCTGGACTGAGAGAACGTTTGTGGAAAAAGGTACTTATATTGCCAGTATCTTATTATGATCAAAATAGAACAGGCGATACAATTAGCCGCATGACAAATGATACAGGTGTTGTGAAGACATTAATTTCTGAGCATTTGTCAAACTTACTAACAGGTGGTATTTCAATCGTCGGATCATTAATTGTATTATTTGTTTTAGATTGGAAAATGACACTTTTACTTTTAACGGTTATTCCATTATCAGTACTGATTTTAGTTCCACTAGGAAGAAAAATGTATAAGATTTCAAAAGCGCTTCAAGATGAAACAGCTTCTTTTACAAGTGTGCTAACATAAGTATTATCAGAAATTCGTTTAGTGAAATCTTCGAACACAGAAAAAAGAGAATATGAAACTGGAAATAAAGGTATCGAGAAGTTATTGCAATTTGGTTTGAAAGAGGGAAAAGTGCAAGCGTTAATTTCACCAGTTATGTCGTTTGTTTTAATGGCACTGCTTGTTATTATCGTAGGATATGGTGGGATGAGAGTTTCTAGTGGTGCATTAACAACTGGGGAACTAGTAGCGTTTATTTTATATTTAGTTCAAATTATAATGCCGATGAGTCAATTATCTATGTTCTTTACACAATTCCAAAAGGCGATTGGTGCAACGGAAAGAATTAATACCATTTTAGAATATGAAGTAGAAGATCATGAAACTGGTGTGAAAGTCACAAATGCTAAGCAACCAATTGTTCTTGAAAATGTACATTTCGAGTATAACGAAGAAGAGCAAGTGTTAAAGAATATTGATTTCACAATTGAATCTGGAAAAGTAACAGCAATTGTAGGGCCAAGTGGTAGTGGGAAAACGACGTTATTCTCACTATTAGAACGTTTTTATGAGCCAACTAGCGGTGCCATTAAATTAGGAAAAGATGCAATTACGAACTATTCATTACAGTCATGGCGACGTCAAATTGGTTACGTTTCACAAGATAGTCCGTTAATCGATGGAACGATTCGTGATAATATTTGTTACGGTGTTGAGGGGGAAGTAACAGATGAAGAAATTGAAAAAGTAGCAGCGATGGCATATGTTGATGCATTTATTCATGATTTGCCAAACGGATATGCAACAGAAGTGGGAGAACGGGGGGTAAAACTTTCTGGAGGACAAAGGCAGCGAATTGCCATTGCCCGAGCATTACTTCGAAATCCACAAATTCTTATGTTAGATGAGGCAACTTCAAGTTTAGATAGTAAGTCCGAGTCCGTCGTTCAAAAGGCATTAAATAACTTAATGAAAGGCAGAACAACGTTAGTTATTGCACATAGACTGTCTACTGTTGTAGATGCAGATAAAATTATCTTTATTGAAAAAGGGAATCTTACAGGAAGTGGTACACATGATGAATTATTACGTACACATGACATGTATCGTGAATTTGCAACGCAACAATTGAAAATTAAAGAGGCGGCATTATAAAATGAATAATCAGTGGGGATTGTACTCCACTGATTATTCATTTTTAAAAGTTTTGTTAAGGATGCTAATTAGAAAGGAAATGGTTTCTTTGATACCTAACATTTTAATAGTAGACGATGATCCGCATATTAGAGAACTCGTTTCTGTATTTTTAGAGTGTGAAGGTTTTCAAACATATGAGGCAATTGATGGTCTAGATGCACTTCAAAAAATAAATCAAGTGAAAGTTGATATGGTTATTCTTGATATCATGATGCCGAATATGGATGGATTTGATGTATGTTTCGAATTAAGAAAGTACTATGATATTCCGATTTTGATATTAACTGCTAAAGGGGAAACGTCTCAAAAAGTAAAAGGATTTCATCTTGGTACGGATGATTATCTTGTAAAACCATTTGATCCCATAGAACTAGTAGTGAGGGTTAAGGCGTTATTGAAACGTTACCAAATTACAGTGTCGCAATCAATTCAAGTTGGAACTGTACTGTTAAATCGTAAAACATTTGAAGTTACAATTGGAGAACAAACGGTTACGTTACCGTTAAAAGAATTCGAATTGCTCTTTACTTTAGGCTCTAAAGCGGGGAGAACTTGTTCGAGAGAGCAATTAATTGAAGATGTATGGGGATATGATTTTGAAGGGAATGAACGCACACTAGACGTTCATATAAATCGGTTACGTGAGAAGTTTCAAGAAGAGAAGTCGAAATTTAGTATTAAAACAATAAGGGGTTTAGGATATCGCTTAGAGGTAAGTAAATGAGAAAAAGAGGACGAATGAGTAAATTCAAGATGCTGAAAGTAACAGGAGCGATAATAGCACTCTTTTCTTTTCTTACTATTATTTGGTCTACAGCATTTTATGTATCATCTAGTATATTGGATGCCCTTGCAATACATTTATCTCCTTTTGTTACTTACCTCATTAGTGACATACTCAGTTTTATATTTATGATTCTTGTTTGGATATTAATTGCAGTATTAATGAGACCGAAGCGAGAGGCGATGATTTGGACTATTATTGAACCGATACAAAAAATTGCAAAAGGGGACTTTTCGGTAAAAATACGAAATGAAGAGAAATATGATGGGGAAATTGGTGTGCTCGTAAAAAGTATAAACGATATGACAGATGAACTGAATGCGATGGAGAAGATGCGTCAGGAATTTGTTTCGAATGTTTCTCATGAAATACAGTCACCATTAACTTCTATAAAAGGGTTTGCTAGAGCACTACAAGATACTAATCTTCCTGAGGAAAAAAGAAAGCATTATCTTACCATTATTGAAACAGAAACGACGAGATTATCTAAACTAAGTCAAAATTTACTGAAACTCACCCTATTAGAGTCGGAAGAATATACACCAGAAAGAGTTACTTATCGATTAGATCAACAGTTAAAGCAAATTGTGTTAAATAGTGAACCGCTTTGGGCTGAGAAAGAAATTGAATTAGACCTTGATTTAGAAAAAGTGCATATAACTGCTGACCAAGAAAGTATGAGTCAAGTTTGGATTAATTTAATTCATAATAGTATTAAATTTACTCCAAGTAGCGGTACGATTTCAATCAAGCTAAAAGAATATGAGACATTAGTAGAAGTACGTATACGTGATACGGGAAGTGGGATATCCGAAGAACAGAAGCAACATATTTTTGAGCGTTTTTATAAAGCAGACTCTTCACGAAATCGTGCTTATGGAGGAAGTGGTTTAGGTTTAGCGATTGTGAAAAAAGTACTCGATCTTCATCAGGGGGAAATAAAAGTTGAGAGTGAGGAAGGGAATGGGACGGAATGTATTGTTTGTATTCCAAATTATGAAGAGAAATAGTGTTAGGAGGGAATCCTTCTAACACTATTTCTCTTTAAAAATACATTTCCCATTACTGCAGCTATACTGATAAGCTTTTCCTTCGCTATTCATACGGTATGAATAATCAGATTCTTTATCTTTTATAAAGTCAACGTATGCTTCTGCACCGTTTTTATCATCATCTATATCAATGAAATGAACGTGTCGTATAGAATAATCCCTTTTTTCACTTAAACCTCTTTCTTGTAAGTTTGTATGAATCCCTTGTATTAGTTGATCGAACAGTGACCAATTTAAATTAAGATGCTCAAATGATTCAGTATGTCTTCCTAAAATGCCATTGTCTTGTATTATTTTTTTATTATTATCGTATGTATAAGAGTATGTAAAATAAGGTTCGTCTTTATATACGACTTCTGCATAATAGCCGATATTATAAAGGGGAGTATATTTTCCGGCTATACTTTGTATTTCTTTTTGCTTATATCCTTTTATAGTATGGAGATATTCGTTAGTATCTTTTTCTATTACTTTATAATGTAATGGATTACCAAATATAAAGTACATAGCCAAAAATATGCTAAATAGTCCGACTGCAGATAGTGACAAGTACCATTTTTTTCTTTTCATACACAAACACTCTCCTATGTGGAATTTATTTCTATTTTACATGAATTATGGAAAAACATGAGAGTTATAAATAAAAACTTTCTATAGTTACCTACAAGTAACCTACGCACATGAAAGTGCATCATTGCCTTTTTACATAAACATAGATACAATTTTAATATAATACATAACTGAGATGATTAAGGAGTGTTATACTTGGCAGAATTATTACAAGGCAAAAATGCTTTAATTACAGGAGCAGGTAGAGGGATTGGTCGCGCTGTAGCGATCGCATTAGCGAAAGAGGGCGTAAATGTAGGGCTTTTAGCTCGCTCAGAAGAAAACTTAAAAGCTGTAGCGAAAGAAGTAGAAGCAGAAGGCGTAAAAGCTGTTATTGCAACTGCTGATGTTTCTTCATACGAAGAAGTGACTACTGCAATTGAGACATTAAAAAACGGTTTAGGATCTATCGATATTTTAATTAATAACGCTGGTATTTCTAAGTTCGGTAAGTTTTTAGAATTAGACGTTGCTGATTGGGAAAAAATCATTCAAGTAAACTTAATGGGTGTATACTATGCAACTCGTGCAGCGTTACCAAGCATGATTGAACAACAATCTGGTGATATCATTAACATTTCATCTACAGCAGGACAAAAAGGTGCACCTGTAACAAGTGCATATAGTGCTTCTAAATTTGGTGTTCTTGGCTTAACAGAATCGTTAGCGATGGAAGTTCGTAAACATAACATTCGCGTAACTGCTTTAACTCCAAGTACAGTAGCAACTGATATGGCTGTAGATTTAGGACTAACTGATGGAAATCCTGATAAAGTTATGCAAGCAGAAGATATTGCAGAGTTTATCGTAGCGCAGCTGAAATTAAATAAACGTACATTTATTAAATCAGCAGGACTTTGGTCTACTAATCCGTAAGGGATACATGTATAAACAAAAGAAGGGACATCTATTTTGTAATGAAGTAGATGTCCCTTCTTTATTTTTTGTATATGAGACAGAATTTTCGGTATAATTGAAAGCGAATAGTAGAAATGCATTGGAAAATTGAAGGGGATGGTATTTACATGAGTACGATTGAGAAATGGACGGCTGTTGATCAATATGTGAGTGATGTATTAATACCGAAAGATTCTACATTTTCGTAAAAGAATAACGAAAGGAGATAAATAGAATGAAAAAGATGTTTGAAAAATTATAACTTGTATCGTATATAACGCAGTTAGCTCGTGGACCTCCTATATACATATCACTATATTTTATATAAAAAATTGGAGGTTGTGAGTAGATGAGAACGGAAAAAGAAATGATAGACTTAATTATGAATACAGCAAAAGAGGATGAAAGAATCCGAGCGGTTATTATGAACGGATCACGTGTAAATCCGAATGTAAAAAAAGATTGTTTTCAAGACTTTGATATTATTTACGCTGTAAAAGATATACGATCTTTTACGTCTAATCATAATTGGATTCATAGATTTGGAGAAATAATGATTGTACAAATGCCGGAAGAAATGTCATTAATTCCAGCAGATGAAGACGGGAAGTTTCCGTATTTAATGCAGTTCATGGATGGAAATCGGATTGATTTAACACTAGCCCCAGTTGAGTTAATAAATAATTTCGTTAGACAAGATAGTTTAAGTAAATTACTTCTTGATAAAGATAATTGTATGGAAGGATTCCCGCCAGCAAGCGATAAGGATTACTTAATAAAAAAGCCTACAGAAAAAGAGTTTTTGGATTGCTGTAATGAATTTTGGTGGTGTAGTACGAATGTGGCAAAAGGGTTATGGCGAGAGGAACTTTCTTATGTGAAAGGGATGCTTGATGGCCCAGTGCGAGATATGTTAATTGTAATGCTAGAATGGCATATTGGTATGAAAACAGACTTTATAGTTAATGCAGGGAAGTTTGGAAAGCATTTCGAGAAATATATTGAAAAAGATATGTGGGTGCAATTTAAGAGGACATTTTCTAATGCAGAATATGAAAACATATGGGAATCATTCTTTGACATGGGTAATTTATTTAGGGAAGTGGCGAACGAAATTGCTAACGCTTATGGATATCCGTACCCGCAAGGTGATGATGACAGAGTGACAAGTTATTTAAAACATGTGAAAGCTTTACCGAAAGATAGTACATCAATTTATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP019588|1838278:1847011|1843167_1844241_+|WP_001231513.1|DBSCAN-SWA MRKRGRMSKFKMLKVTGAIIALFSFLTIIWSTAFYVSSSILDALAIHLSPFVTYLISDILSFIFMILVWILIAVLMRPKREAMIWTIIEPIQKIAKGDFSVKIRNEEKYDGEIGVLVKSINDMTDELNAMEKMRQEFVSNVSHEIQSPLTSIKGFARALQDTNLPEEKRKHYLTIIETETTRLSKLSQNLLKLTLLESEEYTPERVTYRLDQQLKQIVLNSEPLWAEKEIELDLDLEKVHITADQESMSQVWINLIHNSIKFTPSSGTISIKLKEYETLVEVRIRDTGSGISEEQKQHIFERFYKADSSRNRAYGGSGLGLAIVKKVLDLHQGEIKVESEEGNGTECIVCIPNYEEK >NZ_CP019588|1838278:1847011|1846138_1847011_+|WP_001258491.1|DBSCAN-SWA MRTEKEMIDLIMNTAKEDERIRAVIMNGSRVNPNVKKDCFQDFDIIYAVKDIRSFTSNHNWIHRFGEIMIVQMPEEMSLIPADEDGKFPYLMQFMDGNRIDLTLAPVELINNFVRQDSLSKLLLDKDNCMEGFPPASDKDYLIKKPTEKEFLDCCNEFWWCSTNVAKGLWREELSYVKGMLDGPVRDMLIVMLEWHIGMKTDFIVNAGKFGKHFEKYIEKDMWVQFKRTFSNAEYENIWESFFDMGNLFREVANEIANAYGYPYPQGDDDRVTSYLKHVKALPKDSTSIY >NZ_CP019588|1838278:1847011|1839639_1840404_-|WP_001194297.1|DBSCAN-SWA MQTNIHSEKETIIFIHGLVGNRRAFKKEHKRFSTSYNIITYDLLGHGDDKGEAIEFSLQRLVDQLLNLYEKEGIQKAHICALSYGCYISTIFAQMHPEKVLSICHIGGHYNNPSLLYSVFQKFWEKRGDDYSKWLSQYANTIFPSGILKANPFAVISRNIYYRFGLQLHSSIIAQSLRHRLEFDLKSKLKSLPHPILWVMGEHDHLYKSCLFDLKSILPNVLYKEIPLAGHAANLFRPNYFHDLYDRFLNGKLK >NZ_CP019588|1838278:1847011|1845048_1845768_+|WP_000818985.1|DBSCAN-SWA MAELLQGKNALITGAGRGIGRAVAIALAKEGVNVGLLARSEENLKAVAKEVEAEGVKAVIATADVSSYEEVTTAIETLKNGLGSIDILINNAGISKFGKFLELDVADWEKIIQVNLMGVYYATRAALPSMIEQQSGDIINISSTAGQKGAPVTSAYSASKFGVLGLTESLAMEVRKHNIRVTALTPSTVATDMAVDLGLTDGNPDKVMQAEDIAEFIVAQLKLNKRTFIKSAGLWSTNP >NZ_CP019588|1838278:1847011|1842484_1843171_+|WP_014654523.1|DBSCAN-SWA MVSLIPNILIVDDDPHIRELVSVFLECEGFQTYEAIDGLDALQKINQVKVDMVILDIMMPNMDGFDVCFELRKYYDIPILILTAKGETSQKVKGFHLGTDDYLVKPFDPIELVVRVKALLKRYQITVSQSIQVGTVLLNRKTFEVTIGEQTVTLPLKEFELLFTLGSKAGRTCSREQLIEDVWGYDFEGNERTLDVHINRLREKFQEEKSKFSIKTIRGLGYRLEVSK >NZ_CP019588|1838278:1847011|1838278_1839541_+|WP_000755532.1|DBSCAN-SWA MKKVIAGLAAASVVGVAVPGMDSAQAQVSNEALKEINGQAQTQTTVTETKTVETKSDLKYTVTADVLNVRSGAGTGHSVISKVKQGQVLQVIGQENGWFKVTVNGQTGYVSGDFVTTGGKTGTTVQQGTGTYTVNVSSLNVRTGPSTSHTVLGSVNKGKTVQVVSEVQDWFKINFNGGTGYVSKDFVTKGGSAVSNQTQQPTTNNNTTTVQTGGSYVVNTGALKVRTGPATYNAVIGGVTNGTVLNVTGAENGWYKINHNGRTGHVSADFVKFVKGGVNNVTNNVQQPVKDVQKPTTGGNTSSIAGFARSLNGSPYRTAGTTPAGFDCSGFIHYVLNQTGHKGARQTVAGYWSSKTKTSNPQPGDLVYFQNTYKSGPSHMGVYLGNGQFISAETDATGVRISSVSNSYWSKHLLGYTKAY >NZ_CP019588|1838278:1847011|1845884_1845998_+|WP_003158174.1|DBSCAN-SWA MHWKIEGDGIYMSTIEKWTAVDQYVSDVLIPKDSTFS >NZ_CP019588|1838278:1847011|1844265_1844853_-|WP_000823558.1|DBSCAN-SWA MKRKKWYLSLSAVGLFSIFLAMYFIFGNPLHYKVIEKDTNEYLHTIKGYKQKEIQSIAGKYTPLYNIGYYAEVVYKDEPYFTYSYTYDNNKKIIQDNGILGRHTESFEHLNLNWSLFDQLIQGIHTNLQERGLSEKRDYSIRHVHFIDIDDDKNGAEAYVDFIKDKESDYSYRMNSEGKAYQYSCSNGKCIFKEK |
8 | Bacillus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2156147 : 2163274
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP019588|2156147:2163274|DBSCAN-SWA ATTACTTTTTAAAAATTTCTCTTGAGATACTGTCCTTAGCGTGTATACCACCTTGATGTTCATCAGGGTATTTAGCTGGGTGCATATTCCACCATTCATGTTCTCCGCCATGTGCATTTTCAATAAAATGATGTGCATCAAATGGCTTATCAATTCTCCGTGATACTTTACCTCTTCTAGAAATAACTTCCTCCGTATATGTAGGCCATGTTTGGCCTGTTTCTTTTTCCCATTCAGCTATCAGCTTATTTTTTATAGTATTGAACTCAGCCCTTCTTTGATCTACTTCTTCCTTGCTTAATCGTTCATAAGCATTCTTTTCTAAAGCTTCCTGAAGCAATTCTCTTTGATTTTCAGGGATTTTTCTGTTTGTTATTTCTTCTACTTGGCTAAGATATTCTTGGAATCTAGGTGTATTTAAATTACCAGGGTCAGCAAACATAAATGTATTACGTGCATCTTCTAAAGAATTAAAAGAAGTTTTTGGAATATCTCTAAACTCACTAACGCTAGCATATGCAAAGCGATCTCCCATTTGCAATTTATTCGTAAAATGCGAAATACCTTCTGAGAATTTTGCTACACTCGCACCCTTTGCGAGTGTAGTGACTTTGCTTATTCCTTTATCACCAATAAGTCCTAAACCAACTTGAGTTAAAGCATAACTTCCCCATTTTGCACGACTTTCTGCGTCACCATTTATTACATCATTAATAAATGAATCTGACAATACATTATACATGGTACTAAGGGTATCAATAGGGTGCAGGGCGGCATTCCCCATGTTTTCCCACGTCTCCCATTTACCAAGTGCCTTAAAGCCTTCTACTGTATCTTCAACAGCTTGTCCCGTACCTTCTACAATACCGTCCCACACCTTTTTTATTGTAGATTTTTCAGGGGGTTTACCACACATTGCACCTTCTTCCATTGTAACATCTTGATTATCTGCATTGCGGAATTTTTCAGCAATCCGTTTCAAGTCTTCTTCTACTTTTACAAGTGAATTAATAGATGTAAAAGCTTTTGGTCTCGCATCATTGAACATTTGAATGAACTGTTGATTAGAGGCACCAATCCATTGAAAACACAATTGATCTATTTCGTTACATAAATTATTATGTATAGATTCTAATGCGATTCTGGTATTATTTGCACGATTAGCCACTTCTTCTAGCATTTCAGGTGTTACTTTGATTTGAACCATTTTTTTCCTCCCTTTCCCAATTAAAATTATGAGATAAAAAGAAAAAAATGTAAACATGGAAATTTTAGATTAGTATAATAATATTTATGTGAAGTAAAATCTGTTTAATTATAAATAAACCCTATGTGTACGTGAAGTAAAAAGAGCCGCCCTGTTGGGCAGCTTTTTTAATATCTATCAATTATTTTCTTTTAATACCTATGAATAATGAATCATAGCCTTTTGTTTGAGGACTTGTGCCTAACTCGATTTGGTATTTCCCTTTATCTAAGTAAGTGTGATAATCTCGCCCTCTTGCTTTTTGGGAAGGCATTGCTATAACATCATTAATTTCTTTATCTAGATTAAGATCTGAATTTATTAAAGTAATCCAACTTTTTGCTAATTCAACAGTTGCGTTATCAATTATAAACATAATATAGAAATCATGTTCATTTTCACCTTGTACAAAGAACTGTCCTTGTCCTAAATCATAAACCCTTCCCAAATTAGGGTTAGAAGTACGTAACTGTACACTTTCAGGAAGGCCCATACTACTGACAGATGCGCTTTCGTATTTATAATCTTCATTATATTTCTTGTTTATCTTTGTAATTAGATTTTGCGCTTCATTAGATACAGATTTTTTTAGCACCGGTGAAGCATTTTTCCAATTGTTACTGTTGTAATAAAAATCATTTGTAATCATAGAGCTAGGGATACCGAAAGGTGTTAATTCAGGTTTAACTTCTACTGTATTCATTGCATTATATAGAAATTGTGCATACTGCTCACGAGTTACAATATTTTTAGGTTCAAATAGATTATCTCCTGTGCCAGCAGCAATTTTATTTTCTTGTAATGCACTAATAGCATTTGTCGCCCAGTAATTTTTATCTACATCTTTGAAAGTGGTAGTAGATGTCGCTTTGAAGTTAAAAGCCTTTGTTAATACAACAGCTAATTGTTCACGAGTTAGAATATCATCTGGTCCAAATTTCCCTTCACCATAACCAGCAACAAGACCTTCTTTAGCAAGTGCTAAGATTTCTTTTTCAAACATATGTCCTTTAATATCAGAAAACGGGTTTTTGAAGCTAGCATCTGCATCCGCTGGTTTTACATATGCATAAATCATACGCGCCACTTGCCCACGTGTGATATTATCCCCAAAACCAAACATTCCGTTTCCATAGCCAGCCACAATATTTTTCTCTTTTAAACCCATAATTGCATTATAAGACCAATGATCTGAAGGAACATCGCGAAATCCAGTCTCAGCTTGTGCGTTTGTTAAAGAGGTAAACGTTGATGTAGCAAGAACAGCGCCTGCTAAAATAATTTGTTTGAATTTCATTAGTGAGCTCCTTTTAATTAATTTTTTACAAATTAATTACTTATTTTATTAGTAAATTTAAATATAATAATTAATAGTATATTTGTGTTTGTAAATTAAATCAATATTTAGTTGTAAATGGATATTGAGATAGATGTTATAATTTAAAATAAAGAGATGTAGCGATGTAGCGATGTAGCGATGTAAAGGAGAGGGACAATATGAAACAAAAGATTTCAAATGTCACAGGAGAAATAATTTTATCTTATAAAGAAAATGGCTATCAAGTAGTACTAGATGAATTTAAACATGCAAAATGTATTAATATTGTGACTTATAATATTAATACATATGAATCTAATTCGGTACTAATCAAAGAACTTAGAAAGTTGAATAAAACTACAAAGATAAACATTATCTTGAATATTCCAAACGGTAGTTACGTGAAAAATTTCAAAAATAGGATAGACCAAAAAGAGTTTGATAAGGTTAAATGGAAAATTAAAAACGCTTTGAGTGTTTTGGAACAAGAGAAATTCGGAAATTTAGAAGTGTATATCAATCTTGAGAATCACGCAAAATTAATTATGACTGATCACATCGCCTATATTGGTTCACAGAATTTTTCTGATGCTAGTGAAGGTAATTTTGAATTAGGTTTTTTAGTAAAAGATTCAAAAGTAATCAGAGACATTGAGAGAAATATTTTTGCAGAAATTAAGAACAAATCAATATACTGTATCATTTCTGAATATAGGGCTACAATGGAAGAGATATCTGTAAAATTGGCAAATAAGTTACAAAATATTCGAGAAGATATTTTAACATGGGTTGGAGATCCACCTTTTACTTTTAGGCAAGAGGTCTTTTTTATTGATGACGCATATTTTCATAAAGAAAGATGGGAAGAATTTAAGGAGTTTCACTCTGAATTTGAAGTTATAACCGAAAAACTAATAGATGAGTATCCTTCTGAATTTAATAAAGAAAGCGCAAGGGAAACAGTAAAACATTTAAGAAAACTAGTAAAGCTACTTGTTTCTGAATTGGACGAACTGGCTAAATTTAAAACAAATCAAGAAGAGAGTATGATGTGGGATAAGTTTCATCAACTTGATGTGGGTGAAAATATGGAAGAAGCTTTAGAAGACGCCCGATATTATGTAGAAAATTATAAAGAAAAGAATTACCGAGAAATAGAGTATAAAGGGAAAGAGTTAATTAAAACATTTGATTATATAAAAGAATCTATTCAAGATATTGAAACAATTGTTGATGAAATAAAGGATTCTATGATTAGAAAAGCTCTCAATCAAAATATAGAGAGAATCTTACAAGATATAAAAAAACAATAACAAAAAACGACTGTAAAAACGGTCGTTTTTTTTATGACTTCATCATATGAATGAGCGCTTCACCATCAATGAGCTCAATATTTTTGTTCGCAGCATATTGCCTTGCGTTCTTATTGAAATTACTCAGTGTAACGAAATATCCTCCAACTGCATCACCATCAATAATAGCACTATGTAATTTTTGAATGTATGGCCTTCCGATAGATTCTTTTGTATATCTTTTCACTTCAACAAATTTCACTTCATCGTCTTTCCAAAGGATAATGTCTTTTCCACCATCATTAGAGCCAGGGGTAACTTGTGCTCGATACCCAAGAGAATAAAACAAATCAGCAATTAAGTATTCAAATTTTCGTGGATCCATTTTCTCTAGATATTCACGATTAGCCTGCTCTCTTAAGTGGTTCATACGAATTTCCTCTTCTGAAACTTGTGGTGCTTTAAGGATAATTCCTAATGCAAAAACGACGACCAATGAAAGAATAGCCCAAATCATACAATTCACCTCAGTATGAGTATAACCAGCTTATGGCTATTCTATTTCCTCTTCAATCCAAATGTCTTCTACAGATAAATCAAGTGTTTTTGCAATGCGCATTGCAACTCTCAATGTTGGTTCACTTTTTCCTCTTGCTATTAAGCTAAGTGTTTGGTCTGTAATACCTACGATTTTAGCGATATCGGATTGCTTTATCATTCTCTCAGCCAAGATTACTTTTAATTTGCATTTCATAAATTTATCACCGTCCTAGTTTTATTGTTCAATTTAAATTTTAAAAAACCTTTTTGATTTTTTATGGTGGACAAACAAGATTTTTAATTTTAGGTCATATACCTATATCAAGACCACGAGGAATACCAAGTGGAATCAAGGACAACAAGAGGGGAGAGGGCGCGCATGCGTTGGCAATATTCACATTTAAACGAAACGCCTTACCTGTATCCATCGAAGGAATTAAGAAAAATGTATAGAGATTCTAATGGTAAAAAAGAAACAAATGCGATAGTGGACCACATGGAAAGATATGAGGTTTTTAACAATCGTGAATATAAAGGCTATTACCGTTTATCGAACGATATTATGGATGATTTATATGAAGATGAGGACGAAGTGCTTGATTGG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP019588|2156147:2163274|2161220_2161403_+|WP_000156980.1|DBSCAN-SWA MTIVGEAVIVWTATGLSVITMKVAEKMGLSVPHWLPRMTMYTTLTGSFLYLLRYVLFAFL >NZ_CP019588|2156147:2163274|2157534_2158689_-|WP_077150621.1|DBSCAN-SWA MKFKQIILAGAVLATSTFTSLTNAQAETGFRDVPSDHWSYNAIMGLKEKNIVAGYGNGMFGFGDNITRGQVARMIYAYVKPADADASFKNPFSDIKGHMFEKEILALAKEGLVAGYGEGKFGPDDILTREQLAVVLTKAFNFKATSTTTFKDVDKNYWATNAISALQENKIAAGTGDNLFEPKNIVTREQYAQFLYNAMNTVEVKPELTPFGIPSSMITNDFYYNSNNWKNASPVLKKSVSNEAQNLITKINKKYNEDYKYESASVSSMGLPESVQLRTSNPNLGRVYDLGQGQFFVQGENEHDFYIMFIIDNATVELAKSWITLINSDLNLDKEINDVIAMPSQKARGRDYHTYLDKGKYQIELGTSPQTKGYDSLFIGIKRK >NZ_CP019588|2156147:2163274|2160921_2161224_+|WP_001267637.1|DBSCAN-SWA MRWQYSHLNETPYLYPSKELRKMYRDSNGKKETNAIVDHMERYEVFNNREYKGYYRLSNDIMDDLYEDEDEVLDWGDVINEYQPVMTPKGLQLIRKEGFK >NZ_CP019588|2156147:2163274|2162689_2163274_+|WP_009879021.1|DBSCAN-SWA MAILATIRKLQFATRRHLMSVHNMGGIRNANRILGDLKPYVNKTMQGKEYVYYLNKEGHAMFGDDGKVVSRGKLAHALLRNEAWLHLFCPDDWQIETDIRYIKNKEKMKIVPDVKFRDEENILHAVEVDRSQKMKVNEEKIKKYEEFTQIYKQKHNGKMPVIHFFTVTKYREKKLEELAAKYDVLASVYVIEEI >NZ_CP019588|2156147:2163274|2160054_2160519_-|WP_000637733.1|DBSCAN-SWA MIWAILSLVVVFALGIILKAPQVSEEEIRMNHLREQANREYLEKMDPRKFEYLIADLFYSLGYRAQVTPGSNDGGKDIILWKDDEVKFVEVKRYTKESIGRPYIQKLHSAIIDGDAVGGYFVTLSNFNKNARQYAANKNIELIDGEALIHMMKS >NZ_CP019588|2156147:2163274|2158889_2160023_+|WP_000810464.1|DBSCAN-SWA MKQKISNVTGEIILSYKENGYQVVLDEFKHAKCINIVTYNINTYESNSVLIKELRKLNKTTKINIILNIPNGSYVKNFKNRIDQKEFDKVKWKIKNALSVLEQEKFGNLEVYINLENHAKLIMTDHIAYIGSQNFSDASEGNFELGFLVKDSKVIRDIERNIFAEIKNKSIYCIISEYRATMEEISVKLANKLQNIREDILTWVGDPPFTFRQEVFFIDDAYFHKERWEEFKEFHSEFEVITEKLIDEYPSEFNKESARETVKHLRKLVKLLVSELDELAKFKTNQEESMMWDKFHQLDVGENMEEALEDARYYVENYKEKNYREIEYKGKELIKTFDYIKESIQDIETIVDEIKDSMIRKALNQNIERILQDIKKQ >NZ_CP019588|2156147:2163274|2160555_2160756_-|WP_000649834.1|DBSCAN-SWA MKCKLKVILAERMIKQSDIAKIVGITDQTLSLIARGKSEPTLRVAMRIAKTLDLSVEDIWIEEEIE >NZ_CP019588|2156147:2163274|2161521_2162712_+|WP_000571537.1|DBSCAN-SWA MIELLLVPAAGLTVALFGEKFKSKNDDKRKIQVFFEVAGIAIKRNNEEKLQYPKFQKQIDDDRSTTYVYTLPLGMPSKIIQKVEDVVSEGLNKPVRIQYDNYKLNIRVFRREIPKNWSWSMDLVTKGKWCIPVGQSLETIVYHDFDETPHMAVGGLIRMGKTVFLKNMFASLSLANPDHAHFYLIDLKEEGLEFSEYKKLKQVEQIAETSEQAHGMLLKVMEKMHERGKYMKERGIKNIVHTKEKDRYFIVVDEGAVLAPAKGLPRAHNKMLEECQYMLSHIARVGGALGFRIVFCTQYPTGDTLPRVVKQMANAKLGFRLPTRTASEVVIDQSGLEQLPSIPGRAIYMKERFTVLQVPYIDDVVMWKHLKEYEVEKYEHPEPYENQPSDGDTCDD >NZ_CP019588|2156147:2163274|2156147_2157353_-|WP_000249923.1|DBSCAN-SWA MVQIKVTPEMLEEVANRANNTRIALESIHNNLCNEIDQLCFQWIGASNQQFIQMFNDARPKAFTSINSLVKVEEDLKRIAEKFRNADNQDVTMEEGAMCGKPPEKSTIKKVWDGIVEGTGQAVEDTVEGFKALGKWETWENMGNAALHPIDTLSTMYNVLSDSFINDVINGDAESRAKWGSYALTQVGLGLIGDKGISKVTTLAKGASVAKFSEGISHFTNKLQMGDRFAYASVSEFRDIPKTSFNSLEDARNTFMFADPGNLNTPRFQEYLSQVEEITNRKIPENQRELLQEALEKNAYERLSKEEVDQRRAEFNTIKNKLIAEWEKETGQTWPTYTEEVISRRGKVSRRIDKPFDAHHFIENAHGGEHEWWNMHPAKYPDEHQGGIHAKDSISREIFKK |
9 | Bacillus_phage(71.43%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3446814 : 3483689
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP019588|3446814:3483689|DBSCAN-SWA 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39 | Bacillus_phage(31.03%) | terminase,head,capsid,transposase,protease,tail,portal,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3496027 : 3507581
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP019588|3496027:3507581|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP019588|3496027:3507581|3496706_3497465_-|WP_000382673.1|DBSCAN-SWA MDVKLLAHTQLSEEFVNYLSVVFGIGDEGFDPTHGQVVALSAIRTCYSPNKPSRIVSLEGEKYFKGKATDGKGGKEVDRLIRHIVGSGHASTLEHLTYTFAVEGVSRALLAQLTRHRVGFSYSVQSQRYVRMGSNDKIGGFDYVVPETVKAKGEQVVNAYNEMMYKLQSGYDLLRTLGIPAEDARSVLPNAAATNLVLTVNLRGLLDFYNKRRKGKGAQAEIAELAEQLRQEVVKVEKWVDEFFWKWKVTEV >NZ_CP019588|3496027:3507581|3498490_3499063_-|WP_000615365.1|DBSCAN-SWA MIQLHTITSEEKKQNFDITELFEMQKELDKRIGYKGNDKMDMLFRALLVEISEAWNETRAFKMWSTGFGVPKNGLLEELIDGLHFLMNIVIELDKCTWRHELIPSFSMQSIMRKDTSNVNMLFEWYMQDVLTAKRAWCQYRDLTTTMGHLRRAFGIFFRICYLYGFTYEDVIDSYKEKNAENFERQENGY >NZ_CP019588|3496027:3507581|3499282_3499912_-|WP_000861089.1|DBSCAN-SWA MKTYTGFEAIERMKTNWIKEKNDFFAHTLKKGKHEVFGISSQRIVPSAIGMNFFFENEFVDYEKPLNLEYGEMFVMESSNGKWYGILKEETQTKYYLIMGLKVGEYRFYENGCSFKRYQGRTFRKATDEELEEFERFMVFYKKDRKMDEFKLGDICEREDVLYKVVVQTEDNKFEGVLGCVAINEKDTPVKYFPVKSMELQFCVEDMVG >NZ_CP019588|3496027:3507581|3496027_3496312_-|WP_000520475.1|DBSCAN-SWA MGKSQRNKGMRREREFASLIGGARVPLSGAMDGYSNDVKGLGLEWEVKARKEGFKTLYNWLEDEREQPDALAIKADRKPWLVVMPLDTFLKMVK >NZ_CP019588|3496027:3507581|3501617_3501890_-|WP_000849734.1|DBSCAN-SWA MKTIVRDGSMPIALNRSLGTRYLRDKRLSELLKRCRRLENEGFDYLFPIRKVLETIKHRNDENPHLFKGCLVMDRDRGFYYEVVMRKVKR >NZ_CP019588|3496027:3507581|3504871_3505072_-|WP_000877760.1|DBSCAN-SWA MKYSSFGIEVRKVLLERDLTLTVLASELKISVSYLSDILKGSRKGKKQKKAIVELLGLDMCEEDLK >NZ_CP019588|3496027:3507581|3503771_3504038_-|WP_000483549.1|DBSCAN-SWA MFNVQVDENVVKELCVEEIQKKVKEYDAELAFWDTKELKKRVCMSWNTIQDQFFFDPRFPKFKVGKKWYFPAKQVQAFLVEWAEERMD >NZ_CP019588|3496027:3507581|3503610_3503796_-|WP_011053220.1|DBSCAN-SWA MGRGKDGLMMFTIDYNNVKVSDYLRLLAQYKLPNKKQRRLIENRFVCLNALFKKAGESSGN >NZ_CP019588|3496027:3507581|3503303_3503621_-|WP_000510717.1|DBSCAN-SWA MGIENLVLPEDAELAKSLRNKKENYIKNQFLLTRIASKKNVEGKTKEFYEACKEYEACGEKAKECDKQLKELIFKKKENDRVQHVVERMREVGIKEDVIQKVLYK >NZ_CP019588|3496027:3507581|3501903_3502575_-|WP_001002737.1|DBSCAN-SWA MNEIKNYFAELASIDVSKHVEKKGRFSYLSWSWAVDQLLKKHPDATWQVVRFDGLPYMKTEVGYFVEVEVTVNNITRSQIHPVLDNYNKPIAKPTSFQINTSIQRCLAKAIALHGLGLYIYSGEDIPQDDEPKQAAKQLDNVPQQEQARQTEIANEQRIKAIHVQIRELSEVYNMPFEETKNTVKQSLGIQTFKGMTVQQASQLQKTITSWLNEAKEKQQQAQ >NZ_CP019588|3496027:3507581|3503068_3503332_-|WP_000897921.1|DBSCAN-SWA MLFKRFCINKKKPMAVGSIKKQIQSQYITWGDYVEETIENQLLQKQVEKAVSSLKLISAKEADICRKLDIDYVITVLTNKPYGSMPF >NZ_CP019588|3496027:3507581|3497696_3498476_-|WP_000286272.1|DBSCAN-SWA MYRSKESGLKMLDLCSGIAGISMAADWAGIDTAAFCEIEEFNQKVLRKNYPNIPIFPDLYKLMKQSLIDGGVDVDSIGVISAGYPCQGESLVGKRRGAEDERWLWPEVFRLIKELRPTWFVGENVAGHVTMGLDTVLSDLEEENYSTRTFVFPAVSVGAPHQRYRTFIVGHSNDKSKLQTDPRVVPFRSKWETWENTTGINRGTLSGTYWEENKPAICGMDDGTATRLDEDRLRFLGNAVVPQQIYPIFEAIAKIEGLL >NZ_CP019588|3496027:3507581|3499157_3499280_-|WP_000553935.1|DBSCAN-SWA MHQHIIDQLIDRGIYKSKDGLRDLFECSFEELVEMLEGEE >NZ_CP019588|3496027:3507581|3502571_3503054_-|WP_000780695.1|DBSCAN-SWA MKLYELTSNFNQLQQMIEDGVDPEVINDTLQSISEAIKDKVQGAALLIRNIEAQVEVIKGEENRLAERRKSFENSCKNIKDYLYHQMVAVNKKRIKGALITVGIQKNPASLDIAEDAIIPPEYMIPQNPKVDKKALLLAIKNGMKWDGISLKQGESVRIR >NZ_CP019588|3496027:3507581|3500096_3500927_-|WP_001229822.1|DBSCAN-SWA MALVKVTDIAKTLSKKMIFLSDTCEVCKKERKRTVRFMKINGEVVCPVCKLAEDNHKLEAEMNVFRDEKEQRKRKSMFYDKSLIKDETIKLARFSTFKSDCEEDEKNYTLAKRALEDYLDDVRFNLILVGKVGAGKSHLAYSIAHEMNENSAGTVLYVSVSELFDYISSTFNGQSEESEHSIVNLLISADLLVIDDLGAELGDMDAADPKATAFVNRVLFKVFDGRQGKKTIITTNLTGEAVMKAYDERITSRMFNTYRHIEFKYTRDKRKRKLPF >NZ_CP019588|3496027:3507581|3506436_3506907_+|WP_003169928.1|integrase|DBSCAN-SWA MASFRKFGDVWEFRVRFKDPYTQKYKEKSKRGFKTKKEAQLAAAEEEKKLLNGLEVEITPTSLKHYLRDWLKLFKQDNVRKNTFILHERNIEKHIIPYFQNMNLKELKPMMYQKFINSLTDQGYSKRTVQIIHGTMNNAMKKAVSLKKSKTILVKK >NZ_CP019588|3496027:3507581|3500862_3501621_-|WP_000067428.1|DBSCAN-SWA MSNLLIHEEPLLVLPGLASRIGLNEAIFLQQIHYWLNRSKHFYDERNWVYNSVAEWVKQFPFWSENTIRRIVKNLEDEQLLVIGNYNRAKFDKTKWYSINYEKLRLLESTNDVPNLGRRSTQNGQMDVPNLGKPIPETNTETTSEIKEYIVEIVNYLNDVCGSSYRLTSKKTQTLIKTRLVEGFTVDNFKTVIDTKAKEWLRTEQAKYLRPETLFGTKFEGYLQQGKVEGKHGSSKGNRYSKDPFEEDDLPF >NZ_CP019588|3496027:3507581|3504146_3504875_-|WP_000572505.1|DBSCAN-SWA MIEQIMVVDEKEESFVKGDQESLVFIKDNKVVTDSLTVAEVLKKQHKHVLRDIKVQMEKLESAGEGEFTESNFGLSFYKDVTGRTLQKIDMTEDAFTILMFSYNTIETMKIKVRFIEEFKRMRAFIENQSILPTDTFSQIELLATGTSNLNKRVSSLEQVVEKQLTVDYGQQRVIEKTKAKRIYFLWENGHVDSEVHDSTRKLFGLLGRNLKDAFNVNSYRDILKKDFEEALNFINGWRPMI >NZ_CP019588|3496027:3507581|3506951_3507581_+|WP_003171984.1|integrase|DBSCAN-SWA MRSEDIPLFLKTSYQYNYIYYIFFKALLNTGMRKGEAAALQWKDINLKEHTIIISKTLDFTAKTKEELFGDTKTFTSKRTIMIPKSLVDELLAHKKWQNANKLVLQDAYEHELDLVFSRVDGKFLPKSTLFNAFSRILKKANLPRLEIHSLRHTHAVLLLESGASMKYIQDRLGHKSIEITSNVYSHISDKINKDSISGFEAYMNNVLG >NZ_CP019588|3496027:3507581|3505347_3505761_+|WP_000060654.1|DBSCAN-SWA MSLVNTIKNLCKNHDTSISALEKDLEFGNGTIRKWDKAYPSADRLQKVADHFNVTTDFLLGRTNQMHLTTKDEKDIEKRMEEIKRDLQGEDGLMFSGEPMSEEAVESLLDAMEYIVKQTKVINKKYVPKKYRSTDDN >NZ_CP019588|3496027:3507581|3505783_3506212_+|WP_000673782.1|DBSCAN-SWA MKFVIRDLVQQLCTKYNTTNPYELADYLKINVLTWDLHEEINGFYKYEKRNRFIVINNHLSPSMQRTVCAHELGHAILHTHANTPFLRKNTFFSVDKLEIEANTFAALLLIDKKTIQPGDTKACIAYKNDIPVELLEFYKPY |
21 | Bacillus_phage(66.67%) | integrase | attL 3490120:3490136|attR 3513916:3513932 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3713988 : 3790177
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP019588|3713988:3790177|DBSCAN-SWA 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90 | Bacillus_phage(92.45%) | integrase,head,terminase,capsid,protease,tail,portal,tRNA,holin | attL 3747386:3747402|attR 3791968:3791984 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
4818788 : 4861022
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP019588|4818788:4861022|DBSCAN-SWA 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48 | Staphylococcus_phage(26.67%) | terminase,head,integrase,capsid,protease,portal,tRNA,holin | attL 4809165:4809180|attR 4863473:4863488 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
0 : 8486
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019589|0:8486|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019589|0:8486|3523_4159_-|WP_000817910.1|DBSCAN-SWA MKREKGMIGVLCTLVLMILLLVPLQAAQASVKVDFNKLKGNDVSSSFKDGLNNRTKTTEKDDSFGSSIIQKIEGLYAPAFKVGVNIFSISFVLGVIVMVMALITKNGQWMKWATGSMIFSFISMMSMRLSVYFLFSSDVFSFMNIFTDFLDLFKATALIFTPFMLIAGIRLRRIHESTKQPEYYRWANRVITGSCLLCMLAVLAPWLFANM >NZ_CP019589|0:8486|4158_4788_-|WP_001024816.1|DBSCAN-SWA MNINSISNNVVEKLEQTVRYEKKQVQVLRVSKSSSNIHAYMIFPEFSEVKISNTELDEYIENLSTSVKYVIDRKLSQQEIEKQNHSFIMTCEVEEDGVIDDETIHFNTTYVKPPTIANKVFKLVCGLGNRLDSLKELHITVLNNNINRIEIEFYNENETYVAVEKEEIANAIMGAYTKANIYYAADLYYAAEGNEIKLKSIKPKLAGDV >NZ_CP019589|0:8486|6677_8486_-|WP_001099011.1|DBSCAN-SWA MNTVNMKSAVSPQVTQWNSIQWKEIENYVKKLRQRIYRAEQFGNKRKVRKLQRLMLRSKANLLLSIKRVTQINQGKRTAGIDGITTNTPEDRVKLFHLLKGYSVRNIKAFPVKRAYIPKKNGKKRPLGIPVIKDRIFQNMVKNALEPQWECRFESMSYGFRPKRSAHDAMANLFLKLSRGTNRAWIFEGDFQGCFDNLNHEHILSCIEGFPYSNAINQWLNAGCIDNKTFYKTETGTPQGGIISPLLANIALHGMEKELGVRYHFPKRDGAMLYPDSIGIVRYADDFVIVCNSKEEAESMYAKLQPYLDKRGLKLAEEKTRVVHITDGFDFLGFNFRQYPTKEGSQLFIKPSNQSVKKAKEKISEIFKSHRGRSIGQLIRKLNPVITGIANYWSPVVAKVIYGDIDSYVHKKVMHHLKYKHHRKGARWINKKYFHPDHTGVSQDKWLLTDPDNHKNQLIRMRWTPIVRHVLIKYKNSPDDANLKKYFAKRDEKIFNRFNTNSKRKLAKKTKYKCRVCNNSLVGEEPLESNHIVPKVIGGKDEYDNLELLHCSCHKQHHALLEWYGNGKQLPKVQAYLKSQKIPINSKKAVRTMLNTFKKFKY >NZ_CP019589|0:8486|5853_6561_-|WP_002194485.1|DBSCAN-SWA MIFYQLPYSLFALNQAARRHCRIGQTKQCRTFYLGYRETFQQQMAQLIAQKNKAAEAMNGEATSDGLNAMLGDTGDLQTLLIQNIKSGNQLKGSTEEWTKAASGESKRVLANIGNVITPVFESIEIQFTNWVEKLPGTMDVAFMKEAQFVQKAVECIKKEQVPGVRVKQNVLEVDGEIEDIIRALTTLNTDKRMLVQKQDITFWDSVIVEVDPSKKKGKQKNKIIDGQYEFDLFG >NZ_CP019589|0:8486|1781_2165_-|WP_003159741.1|DBSCAN-SWA MNRNREYIALRNSISIGWLLTCIVIGLSIYFSSVVYLLIGCFILSLKYGLMGTVKNVEKRLPTWANFGVIEKPVNRRVTRPFQFRGGLLVSLALGFVEMVIKGLCISYFILGLETHVFRLMRRNARM >NZ_CP019589|0:8486|2894_3473_+|WP_002194483.1|DBSCAN-SWA MLEHTILFSLVQLVPLIVSTGIIYILLELTDTEWKTWFSYEGIFAIIFLITRFQVFQNKKSIISLNQHEKWFSKLNIFLVSIFLVLFASIPTLLKIAFILQMTVILFLLEYLCLYIDRLPIHNLYRVKEIICDKKQLKIERIIPNNEEHGTHTIKTRDEQYFLYTAVYLSGILSPISEEVFEEYERNNLMGR >NZ_CP019589|0:8486|2290_2875_+|WP_000916417.1|DBSCAN-SWA MLKLVVNNTGTEPEGDSAFSNYFTCKDCVYYLSKSDSCSLQLAADSNNPLVPYECGNFEETYEIGTEDPLNSHIHQQLREEKAQILAESYPAQPSIDPIHKDAIWYGSVNYGCWIINDSKKRFALAEQVPFGDNNMSSKKYASPFPLHDHGAKEGIRHYMCWYVNEKGIGEYHLLIGGVIMKIAEGVKKLGFNY >NZ_CP019589|0:8486|5123_5837_-|WP_000494355.1|DBSCAN-SWA MFTKIFIGLFCYVFIVVCNSKKKFLREEAKKKEMENKPLERPVYWCPRENKPIGREQERITVPTKEITLEKDVASIYDLVATSVHKNLGEVESDRLKHEDIEEVEYAEDFHHTPTPEAVYDIHFPSDEDIPVELLEYEDMYPQQEYVSIPPETEPVFPVQQRVADVKDMDFVRWTTKVLEQEQGLTRVINMSNNKRYWIHTEGEILPENQLLYMKLEVDSPYSYTLVEWSNRQLGNI |
8 | Pseudomonas_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
25257 : 33056
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP019589|25257:33056|DBSCAN-SWA AATGAACGAGACAATTAGCTTAGAAGAAACCTTAGAAGATTTTTCTGCTTATTTGAATGAAAAAGGCCGAAAGTATTCTACGATTCAACGTTATGCATACGATATTAAAGATTTTTATAGATGGTTAGAAATTAATAAGATGCTTTTACATATCAAATCATGGAATGAATTATCTCAAGAAATTTATCAAGCTTATTTCTCTGAGTTAGAACATAAGCGGAAGTATTCCCAGAAAACAAGGCACAGAATATGGGTCGTTTTAAAGAAGTTACATACGTTTTTAGGAATAGTTAGCCCATTAGATGGTATTCACCTTTCCTTAATTCCGGATCAATCACTAAGTGATAGTGATTTTATTACAGAATTAGAAGAAACGCTTTTAAAACAAACGGTTCTATCTACAAAAGGGCTAACAGAAAGACAAGCTAAATATCGGCCTCTAATCATGGATAGAAATGCTTGTATAATTAATTTAATAGTAAACTACGGTTTGTCTCTACAAGAGCTTGTATCGCTTAATATGAGCCATATACAGTTTGCTAGAAACATTTTAATTGTTCCAGGGGAAAATAAATTAACTAGATCTGTTTCTTTAACTATGGAAGATACACAACAGCTTTACAAATATTATACGACTATTCCGGAACCCGTAAGACCTCAACAACACACAAATAATCCCCTATTTGTGGCATTTGATTTCAATCGAGGTACCTTTCGATGGGTTTACGAAAATGATGCGCCTAAGGCTTTGTCTGAGGTTGCTATACAAAAGATGATTCGACTTGAAGTGAAACGAGCAGAATTAGATAGGAGAATTTCTGCACAGCAGATGAGAAACACTTTTATTCTCCGTCTTATTAGGCAAGGAGTAACTGAAAAAGATTTGGTAAGTATGATGGGGTTTAAAACTAAAATATCTTTAAAAAGATATTATCAATATTTACAGTGACCTATATTAACCATACTAAAATAAGAAGACGTGTTCTATAAATAGAATACGTCTTCTTATTAATGTACTTTTCTTTGATTACTTCTTACTTTTCCTCATCTATCTTTTTAATTGCAGCTTCGTTCTGACTGATTATATCTTGAAAATGCTCTTGCTTATTTTCTTCTACAAACTGTATAAGTTCTTCGAATTTCATTATTATCACCTTATTTCATTAACTTTGATTACTTGTTCTAATTCGAATACAGAAAGTACCTGGATGTGTAAAAATGTCTTTAGGGCATTCCCAACCTCGTTATATCCAGGATTTCCTTTTTTAAGGCATGCTTTATGTATAGTAAACGAAACCGGATCAGTTTTTACATCTTGATATAGTACAAGTGTAGGAACCCAATCAATTGGAGTATATAGGTGCATAAGATTCTCCAAACATTTCTTTAGAACGCTATTGTCTCCTATGCAATGTATTTCACAGAACTAAGCTTCATTCCTCCCACTTCTTTAGAGGTGGGAGGAATGAAGTGTTTTTTTCTTTATAGAACATACGTTTATATTGTATAATATAAATAATTAAAAAGAAAGGAGTGACGGGCAATGGCAAAACCAAAGAAAGATTGTTTTATTATAGAACTGAAATTAATTGTGGATACATGGCAAAAGGATATTTTACTCAAACGTTTTGAAATTGCTCGTAAACTCTATAACACTACACTATCTTATGCCATGAAACAATATACACTCATGAAAGAAGCTAAAGCTTATAGAAAACAATTGCATTGCTATCAAAAGGCAAAAAAAGCAAATCATCCAAAAGAATGGAAAGAAATATCAAAAGATTTAGATAGCATCCGTCAATCCTTTGGATTAAGTGAGTATCAACTTCATGCTTATATCAAAAAACACCAACACAATTACAAAAAACATATAGATAGCAATACCTCTCAAAAAATTGCTTCTACGGTTTGGAAAGCTATGCAAGACGTAATATTTAAAGGGACGAAAACCCATTTTAAACCATTCGGAATGCTCCATTCTGTAGAAGGGAAATCCAATAAAGCGGGTATTCGATTCAAAGAAAACAGGGTCTATTGGAATGGATTACACCTTCCTGTTCGCTTTCGCAAGAATGATTTATTTATAGAAGAATCACTCGCTCTTCATAAGATAAAATATTGTCGTCTTGTCAAAAAAGTGATTCGTGGAAAAGATACGTTTTATCTGCAACTTATTATGGGTGGGATGCCTCCTACAAAGAGAATCAATAAAACAGGAGCCTTTCGACATTCCTACCAAAAGAAAAAGCGAGTAGGCATAGATATTGGTCCTTCTACGATTGCCATCGTTTCGGAAGAAACTGTTTCTATTCAACAACTCGCTCCTGATGTTCCGTTATTTGAGAGGGAAAAAAGACGTTTATTACGTAAGTTGGATAGAAGTCGTAGAAGTACAAATCCAAATAACTTTAACACAAATGGCACAATAAAATGTGGCATCAAGCTTCATTGGACATGTAGTAAAAACTATCAAAAAACAAAAAGTCTATTAAACGAGTTGTACCGAAAAAAAGCTGCTTATATCAAAGAAAAACATGGTGCATTGGCAAATAGCATCTTATCCTTAGGTGATGAATTGTATATTGAAACGATGCACTTTAATGGATTAGCAAAACGTACAAAAGAGACAAAAACAAATCAACAAGGCAAGTTCCAATCCAAAAAGCGTTTTGGTAAAAGTATTGGGAATCATGCCCCTGCCATGTTAGTGGAAATTATCAATCAAAAATTGAAGTATGGGAAACAAGAGATACAAAAAGTAAATACGATAACTTTTAGAGCCAGTCAATATAACCATGTAACAAATAGCTATGAAAAGAAAAAACTCCATCAACGATGGAGTCAAATTGGAAATTATCTCGTACAACGAGATTTATATAGTGCCTTTTTATTAATGAATAGTGATGCAACATTAAAACAAACCAATCAAGAACACTGTATCGAAACGTTCGATACCTTTGTAAAGCTACATCATCAACACATAGAATCCTTACAACAAACAAATAAAAAATACCCGCTGAGCATGGGTATCATATAAATAAGGAAGTATTCCTTCGTAGGTAGAGCTACCTGCCTTCGTTAAAGCTTATCGCCAACACAATATTGGTTGTGTAGATAAGAAAGTCTTATGGAACAGAAGATAAATCAAAGATGTTGTACACAGAACATAGCAACACCATCTGTGGAGAGCTTTGTAACGCTTCTATCAAGTACATAAGAACCCCACTGCTTTAGCTGTGGGAGTAGTCAGTCGGATGTATCTCTCTAACGTAAAATGGTACTTGTTCTTCATAATGTTTATATATCCTTTTAAATGCTTCTATGGCCTTTTCTATTGATGTCGCATTAATAAAACTGATTTTATGTTCCGTAGTAATTTCTAATATGTATAGGCGCATAATTATTCATCCCCTATATTTTCTATATATTAATTGATACATTGTATCTTCTTACTTTTAATTTAAAGAAAGTACCTATTTTAATGGTACTCTCTTTAAATATATCTCCTATTTATATATTAATCTATTGGAAATGACTCGTTTCCTAATTCCTTAAGTACTTTTGCAAAGAGATGGTTTGTCTCTTCGGATAGCATTTCCTCTGTTTCTATTAATCTAGAAAGTCTATTTGTAAACTCTGCAGCATACAAAAGCTTCGTACTGGCTTTTTCATCTTCTTTAAACAATTGTTCATTCTTCATGGATTGAATTAAGATCTGAATAAGCATTTGTTTATGTTGTTCGTTTTTCTTTCCTTGGTACATATCCATTCCTAACCAATGACGGACAATTCGTTCAGCGTTTCTTGCTTCTGTTACATCAACTCTAGATACAACAAAGGTTAGCTTGTTCCAAGTTAATTTTGCTACTTCATTTGAATAATTGGAAGGAAAGAAGAAAAAGCTTCGGTGTGTAATTCTTTGCCGTTCTTTAATCCAACGAAATAGTTCCTGCTTTCCTAGATGAATATCTATTTCTACAAAAAATACGGGAAACGGTGACGTTGTTTTTTCCTCATTTATTGTACAATCGGGCTTGAACACCAATTCACCTAGATATGCGTGGTATACAGAATCGTATTCATCTCTTGCTGCGTAAAAAGTAAATACTCTAAAAGCATTCTTCGACCTTTTACAGTAAGTCCTCCTGGTGCATAATCTCCTTTTTCTGTGCGATCAAACATAATATAGTCGTATTCAGCATGATTATGAATTGAAAATAAGTCTGAATCCCTTTTATTTTCGTTTCTAAGGAGTGTTTGTAGACTGCGTCTATTCATTACATTCCGATAACGAATATCGTTTCTAATGGAATGTAAGAAGCTTTTCCATGATTGTAGGTAAGCATAATCTGTATACCCCTCACTTATTAACTGGGTTAGCATTTTATCCTCACCATTCATCATCAGACAAGTCCAACACCCACTACGCGAATTTGCAGCTCCACAAGCATTTCCTTGCTGTTTTCCACCTGTTTTTATGCCACATTCAAACATAGCCTGTCCATACTGTATGCTCATTTCTTCTACATCTACGCCAAAAGGCAATAATCCTCTATCTAAAAGTAACATCCATACTTCATCACCGGTTAAGAATTTGACCGGGTTAAAGCAGAGAATATTCTTCATGTCATTATGACGTGAAAATAAGGAATCATTACTTATTTCGTGCTTTTGGATACTGTGTCTTCTTCGAGCGCTCTCTTCATTACGAACGGCCAGCATTAGCACACCATCATATTCATCAAAGCATTCTATTACATTCGTAGTTTGAGATTCTATTAATATTTCTTTCGTTTTACGCTGCATAGGTTTTACTTTGAGCGAATCAGTACACCATCTCAATCTACTATTACCACTCGGTGGAAGAACACCCCTTCCTAGAACGGAAGATTTTGTTTATCTGCATTCTCTTGAATCTTTCGTAATGTACGTGAGATATAAGCAGTCATAGCTGGTGTTTCTACTCCAACCTCTGATGTTAAGATATGAATTGGTTTCGTACGCTCCTCTATTGGCAATTCTGCAATTGCATCCCATAGTAAGGTCAACATAGCAGAACTATCTTTTCCCCCGCTGTAACCTACAAAACAACAATCACGAGATAAATAGACTTTTTTCATTTCCTTTTTAATTTCTTTATGTATATCCATCATTATATTGTTATCCCCATAGCAAAGTATCATTTCATACTGCCATGGAGCATTCCTCCTCTTTTTTAGATAGAAAAAAAGAGTCCCTATTTAATAGGCACTCTCTTTTATGTATATCCTCTATTTTTAATCAAATGTGATTTCATGTATATTCAACTTGTTTAACTTTTCCTTATAGAAATTCATTACTTTTTGAGCATGTTGTATAGCCATTAATCCATCTTGAACAGTAAATGCTTCAAAATACGGATAACGAATGTCTGTAGCATAACCATTCAGCTGCACGCACTGTTCTAAAATCAATGAGAATTCCTCATCTAATTTCCGACACAATTTGTGCAGCATTAAAAGGTTATGAGTTTTTGGGACTGTTCTACCGTTTAATGCAAGAAATCCTTTTAGAAGTTTTTCCACACATTGTTGACTATGATAACAAATAATTGCAGTAGGGAAAGGGTTCATGTGAGTTAAGTAACTAGCAGAATCTAAATCGGATTTTGCTATAAACACCCACTCTTTAAGATCCTCAGTATTTATTGTCGATAGGTAAGTGTTTGAAGCTATCTCCAACTTTTCCCCCGATCCGCACGGTACGTGCCACTTTCACGGCATACCGCGGTCCATCTATATTGTAGTTTTCTTTTCATCAAAATAATGATAAGTTCTAAGCGAACAACGCTAGTTGTTCATGTTTCATTTCCACTTCATTTTGTGATTAAATACAGATTTCCTCGTTTTTGACTAATTTTCGCAATTTATTGAGTTTGCCTAACTGTTCCTCATTGAATTTGAGTTCATTGAGTAGTTGGTTTATGGTTTCTATCTTGGTTGCGTGTATTAGTCTATGGACACTTGGTTTGATGATGGTAAGATTCTTGTAGCTGTCGTCCTTTGTTTCACTCCATAATCGCTTATGGTGACAATGAATGTCCCAAGGTAAGAGTTTCTCACCTGTTACACTGCATTTGCCTTTTTGTGCGACATAAAGAGAAATTCGGTTGTCATTGTATTCTACGGTTGCCCGTTCATTTATAACTGGATTTTCTCTTAACCATTTCAGTTCCGCTTCGGTTATGTCTGCCAAGTTTTTATGTATCAGGGCTCGTCCTTCTGCGGTGTACTTGTTAATGGCTTGCTTTTTCATCATCGGGTTTTTGTGTTGAATATAGGAGATTGGTAGGATGGGACGTTTCATGAGAAATCTCGTCATTTTTGACTTTAGATATGGTTTAATACCTTTGTCTTTTCCTTTATATTCTCCTATATTCGTGTATCCATTTGTGTTGCTTTTACCTCCAGTTGTTGACTTAGGGAATCTGTTATACATTATGTGGTCAAGATTATGGTTCATTTTACTGAAATCCTGGGAGGCATGCGTAGCTATTTTATAATAGTTGTGCTTACCAATGACCATGCTGTTGTATATGCTGATTCTCTTAATTGTTTCATTAGAGTTTGGGGTTTTCTGTATTCTTCTCACTTGTTTTGCTAAATCTTGTTTTGTTTTTTCCAGTGCTTTTGGGGAAACGTGTGTTACTGCAATGTATCGTGTGTCGCCGTTCTTCTTTTTACCTTTCTTTACAGCTTTGAGGGTGAAACCTAAGAATTCACTTTGTTGCTTTGTCAGATTGGTTACTTTAGACTTTTCGGCTGAGATAGACAGTTTTAGACGTTCTTCTAACCACATTTGAGTCGCTTTGAAAATTTTCTCCGCATTACTACGTGTGTTTGTGAAGATTTTAAAGTCATCTGCGTACCTTACGATGTACATTGGTTTCATCTTGGAAGTTTTGGTGAGTTGTGTCGTTACAACGTCATTGCACCAAATTCCCCTCATGCATCTCGGTTTTACCTTTTTAGCTTTGAATGTCTCCCATTGTCTACTTATCCACCAGTCGAATTCATTAAGATTGACGTTGGCAAGTATAGGACTAAGAATACCGCCTTGTGGGGTGCCCTTAGTCGGGAACATTGTTGTGCCGTCAGGCATTTGCACTGGGGCTTTCAGTATTTTTCGGATAATGACCAGAAGTTGTTTGTCACGGATACCCAATGTCCATAATTGACGCATGAGCTTGACGTGATTTACCTCGTCAAAAAACCCTTTAATGTCTACGTCTACTACATATGTAAGGTTTTGTTTATTTACTCGCACTGATGCATCTGCTAGGGCATGTTCAGCACTTCTGTTTGGGCGAAAACCATAACTTCGGTTACTGAAGTGCGCTTCGCAGATTGGCTCCATGACTTGTAAGATGCACTGTTGGATTATCCTATCCCACATAGCCGGTATTCCCAGGGGTCTGGTTTGTCCGTTGGGCTTCGAAATTTCTTTACGTCTTACTTTCTGCGGTTGGTAGTTTTGAAAGCGTCTTTTAACTTCATTCAAGAAATAGCTTTGTTCCATTCCCTCAATATTCTTTATATTTACATTATCACAAGCTGCAGTTCTACTTCCTTTGTTCCCCTTAATATTGCGGTAGGCGAGAAGTATATTTTCGTCTGATATAATGATAGACATTAGGTTTTTGAAAGAATTTCCCTTTGTTGCTTTTTGGTATAAGTTATCTAGGACAGGTTGAATACCGTAGTATTCGTTGTGTCTTAGTTTCTTCCCCTTTGGCGCGGACTTAGAATTGCCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP019589|25257:33056|31124_33056_-|WP_001014144.1|DBSCAN-SWA MNGNSKSAPKGKKLRHNEYYGIQPVLDNLYQKATKGNSFKNLMSIIISDENILLAYRNIKGNKGSRTAACDNVNIKNIEGMEQSYFLNEVKRRFQNYQPQKVRRKEISKPNGQTRPLGIPAMWDRIIQQCILQVMEPICEAHFSNRSYGFRPNRSAEHALADASVRVNKQNLTYVVDVDIKGFFDEVNHVKLMRQLWTLGIRDKQLLVIIRKILKAPVQMPDGTTMFPTKGTPQGGILSPILANVNLNEFDWWISRQWETFKAKKVKPRCMRGIWCNDVVTTQLTKTSKMKPMYIVRYADDFKIFTNTRSNAEKIFKATQMWLEERLKLSISAEKSKVTNLTKQQSEFLGFTLKAVKKGKKKNGDTRYIAVTHVSPKALEKTKQDLAKQVRRIQKTPNSNETIKRISIYNSMVIGKHNYYKIATHASQDFSKMNHNLDHIMYNRFPKSTTGGKSNTNGYTNIGEYKGKDKGIKPYLKSKMTRFLMKRPILPISYIQHKNPMMKKQAINKYTAEGRALIHKNLADITEAELKWLRENPVINERATVEYNDNRISLYVAQKGKCSVTGEKLLPWDIHCHHKRLWSETKDDSYKNLTIIKPSVHRLIHATKIETINQLLNELKFNEEQLGKLNKLRKLVKNEEICI >NZ_CP019589|25257:33056|30136_30442_-|WP_002194491.1|DBSCAN-SWA MILCYGDNNIMMDIHKEIKKEMKKVYLSRDCCFVGYSGGKDSSAMLTLLWDAIAELPIEERTKPIHILTSEVGVETPAMTAYISRTLRKIQENADKQNLPF >NZ_CP019589|25257:33056|25257_26205_+|WP_001006036.1|integrase|DBSCAN-SWA MNETISLEETLEDFSAYLNEKGRKYSTIQRYAYDIKDFYRWLEINKMLLHIKSWNELSQEIYQAYFSELEHKRKYSQKTRHRIWVVLKKLHTFLGIVSPLDGIHLSLIPDQSLSDSDFITELEETLLKQTVLSTKGLTERQAKYRPLIMDRNACIINLIVNYGLSLQELVSLNMSHIQFARNILIVPGENKLTRSVSLTMEDTQQLYKYYTTIPEPVRPQQHTNNPLFVAFDFNRGTFRWVYENDAPKALSEVAIQKMIRLEVKRAELDRRISAQQMRNTFILRLIRQGVTEKDLVSMMGFKTKISLKRYYQYLQ >NZ_CP019589|25257:33056|30535_30979_-|WP_000401613.1|DBSCAN-SWA MEIASNTYLSTINTEDLKEWVFIAKSDLDSASYLTHMNPFPTAIICYHSQQCVEKLLKGFLALNGRTVPKTHNLLMLHKLCRKLDEEFSLILEQCVQLNGYATDIRYPYFEAFTVQDGLMAIQHAQKVMNFYKEKLNKLNIHEITFD >NZ_CP019589|25257:33056|26799_28296_+|WP_001118290.1|DBSCAN-SWA MAKPKKDCFIIELKLIVDTWQKDILLKRFEIARKLYNTTLSYAMKQYTLMKEAKAYRKQLHCYQKAKKANHPKEWKEISKDLDSIRQSFGLSEYQLHAYIKKHQHNYKKHIDSNTSQKIASTVWKAMQDVIFKGTKTHFKPFGMLHSVEGKSNKAGIRFKENRVYWNGLHLPVRFRKNDLFIEESLALHKIKYCRLVKKVIRGKDTFYLQLIMGGMPPTKRINKTGAFRHSYQKKKRVGIDIGPSTIAIVSEETVSIQQLAPDVPLFEREKRRLLRKLDRSRRSTNPNNFNTNGTIKCGIKLHWTCSKNYQKTKSLLNELYRKKAAYIKEKHGALANSILSLGDELYIETMHFNGLAKRTKETKTNQQGKFQSKKRFGKSIGNHAPAMLVEIINQKLKYGKQEIQKVNTITFRASQYNHVTNSYEKKKLHQRWSQIGNYLVQRDLYSAFLLMNSDATLKQTNQEHCIETFDTFVKLHHQHIESLQQTNKKYPLSMGII |
5 | Bacillus_phage(33.33%) | integrase | attL 21008:21024|attR 41181:41197 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_3 |
99275 : 99563
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP019589|99275:99563|DBSCAN-SWA TATGAAGGGACGTTTTGCAAATGTTAGAACAAAGAAGCAAGTTGAATTCATAAAACGTAGATATAAAGAAGCATATCAAATGGTAATTGGTGTGATGGACGGATTAAAGGTAGGCGACAAGGTAGTAATACACACTTGCTTAGAGTCAAAGCGTTATGACGGAAAAGTATGGACTTGTAGGACAAATCAGTTTACAGCAGAGAGTGGCACGCAAGTGGTTTTTCTAGAAGGGTTTAGAGGGTACTTTGCAGTTAAGTTTTTACAACGAATTAGTTTGTTAGAAAACTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP019589|99275:99563|99275_99563_+|WP_000678362.1|DBSCAN-SWA MKGRFANVRTKKQVEFIKRRYKEAYQMVIGVMDGLKVGDKVVIHTCLESKRYDGKVWTCRTNQFTAESGTQVVFLEGFRGYFAVKFLQRISLLEN |
1 | Bacillus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_4 |
112566 : 114812
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP019589|112566:114812|DBSCAN-SWA AGTGAAGATTAGAAAAGCGATTATCCCAGCAGCGGGATTAGGCACAAGATTTTTACCCGCAACAAAAGCACAACCTAAAGAAATGTTGCCAATTGTAGATAAGCCAACTATTCAATATATTGTTGAAGAAGCTGTTAGCTCAGGAATAGAGGATATTATTATTGTAAGTGGGAGAGGGAAGCATGTTATAGAAGATCATTTTGATAAATCTTATGAGCTAGAACAAACTTTATTTAAGAAAAACAAAATAAAGACTCTTGAAGACATTGAATGCATTTCTAATTTAGCGAATATCCATTATATTCGGCAAAAAGAACCTAAAGGATTAGGACATGCTATATATTGTGCTAGACGTTTTATAGGTGAAGAACCTTTTGCAGTTTTACTTGGTGATGATATTGTTAGCTCTACGTATCCATGTCTCAAGCAATTGATAGATGTTTATGAGGAACATCACTGTTCAGTGGTAGGTGTTCAAAGGGTATTAGAAACAGAAGTGTCTAAATATGGAATAGTTAAATCGGCAAATCAAAATGTTAATCAATCTATTATTCCTATTTCTATGCTAGTTGAAAAACCACCTCTGGAAACTGCACCTTCAAATTTAGCTATAATGGGCAGATATATACTAAAACCAGATATTTTTGAGGTGTTAAAAAATTTACCTGTCGGATCAGGTGGAGAAATTCAGTTAACCGATGCAATCAATGTTTTAAATAAACAACAAAAAGTACTCGCCTTTGAATTTGATGGGAAAAGATATGATGTAGGGGATAAATTTGGCTTTATTAAAGCGACTATAGATTTTGCACTTCAGAGAGAAAGTCTAAAAGAAGATGTTTTGAGTTATTTGAGAAATATCACTCGAGATAAACTTATCAATAAATAAAATATGTAAAAAGTGAGGAAGTCTTAATGAATATATCTATAGTAGGAACAGGCTATGTTGGCTTAGTAACAGGTGTGTGTCTATCAGAAGTAGGTCATAACGTCACTTGTATTGATATAGACGAAGAAAAAGTAAAAAAAATGAAATTGGGTTATTCACCAATATTTGAGCCATGTTTAGAGGAATTAATGAAGAATAATATTATAAAGGGAAGATTACATTTTACAACTAACTATGTTGATGGAGCTGATGGGGCAGAAATTTTTTATATTGCAGTTGGTACACCACAAAAAGAGGACGGTTCAGCCGATTTAAGCTTTATTAAGCAAGCAGCTATTAATATTGCTCGTACAATTAAGAATGATGTTATTATTGTGGTAAAAAGTACCGTGCCTGTAGGCACCAATATATATATTAAGAATCTTATTTTGAAAAATTTAAATTATGATGTAAAAGTAGATATTATTTCAAATCCAGAATTTTTACGTGAAGGTTCAGCTGTAAATGATACTTTTTATGGGGATCGTATTGTAATTGGATCGGAAAATAAAACATCGGCAAATGTTATGGAAGAAGTATATAAACCCTTTGGTACACCAATATTCAAAACAGATATCCAAAGTGCCGAAATGATAAAGTATGCGTCTAATACATTCTTAGCCACAAAAATTAGTTTTATTAATGGGATAGCGAATTTATGTGAAATGGTTGGAGCAGATGTGGAAAAGGTAGCACAAGGGATGGGACAAGATAAAAGAATTGGTTCTCAATTTTTAAATGCAGGAATAGGATACGGTGGATCATGTTTTCCTAAAGATACACATGCGTTGGTTAAAGTTTCTGAAAGTTTACAACATAAATTTCATCTTTTAGAATCTGTTATTAAGCTGAATAAAAATCAACAAACAGTTTTGATAGAAAAAATAAAAAAACGTTTTGGAAGTATTGTTGGCAAAAAAATTGCTTTATTAGGACTTTCTTTTAAACCGAATACGGATGATTTAAGAGAAGCTCCCTCTATTCCCATAGCAAGAAAATTAGTAGAAGAAGGTGCACAGGTGATTGCATATGACCCAGTTGCAATTAAGAACGCGCGAGAAGTGTTGCCTAAAGAGGTACATTATGTATATTCTACTATGGAGGCTCTTACTGAAGCAGACATTGCCTTAGTTCTAACAGAGTGGGATGAAGTGGTCGATTCTTTACTATTAAAAGCAAGTCAATTAATGAAAGAACCCGTAATTTTTGATGGTCGAAATTGTTTCGAACTTAATGAGGCTAAAAATTACGATGTTGAATACCACTCGATTGGAAGACCCTCAGTTTTAAGAGAAGTAAAAGGAGAGATAACAGCTTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP019589|112566:114812|113480_114812_+|WP_001027044.1|DBSCAN-SWA MNISIVGTGYVGLVTGVCLSEVGHNVTCIDIDEEKVKKMKLGYSPIFEPCLEELMKNNIIKGRLHFTTNYVDGADGAEIFYIAVGTPQKEDGSADLSFIKQAAINIARTIKNDVIIVVKSTVPVGTNIYIKNLILKNLNYDVKVDIISNPEFLREGSAVNDTFYGDRIVIGSENKTSANVMEEVYKPFGTPIFKTDIQSAEMIKYASNTFLATKISFINGIANLCEMVGADVEKVAQGMGQDKRIGSQFLNAGIGYGGSCFPKDTHALVKVSESLQHKFHLLESVIKLNKNQQTVLIEKIKKRFGSIVGKKIALLGLSFKPNTDDLREAPSIPIARKLVEEGAQVIAYDPVAIKNAREVLPKEVHYVYSTMEALTEADIALVLTEWDEVVDSLLLKASQLMKEPVIFDGRNCFELNEAKNYDVEYHSIGRPSVLREVKGEITA >NZ_CP019589|112566:114812|112566_113454_+|WP_000702222.1|DBSCAN-SWA MKIRKAIIPAAGLGTRFLPATKAQPKEMLPIVDKPTIQYIVEEAVSSGIEDIIIVSGRGKHVIEDHFDKSYELEQTLFKKNKIKTLEDIECISNLANIHYIRQKEPKGLGHAIYCARRFIGEEPFAVLLGDDIVSSTYPCLKQLIDVYEEHHCSVVGVQRVLETEVSKYGIVKSANQNVNQSIIPISMLVEKPPLETAPSNLAIMGRYILKPDIFEVLKNLPVGSGGEIQLTDAINVLNKQQKVLAFEFDGKRYDVGDKFGFIKATIDFALQRESLKEDVLSYLRNITRDKLINK |
2 | Bacillus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_5 |
125296 : 125629
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP019589|125296:125629|DBSCAN-SWA CATGGAATCTCGAGGGTTTATTTTTGGTTGCCCAGTTTCATATGCTTTGGGAATAGGTTTTATACCGGTTCGTAAATTAGGGACCCTGGTTGGATTTGATAATGAGAACGTAAAAGATATTCTAACAATAAATAATGATGCGATTAAACCAGGGCAACGTGTGTTAATTACTGATGATGTGTTAACTACTGGAAGAACTATTGAAGCAATTATCAAGTTAGTTGAGGAGGCTGGTGGAATTATATCGGGAATCGTATTTCTAGTAGAACTAACAGACTTAGATGGCCGTAAAATGTTAGATGGTTACGATGTATTGGTTTTGGGAATAGATTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP019589|125296:125629|125296_125629_+|WP_001978036.1|DBSCAN-SWA MESRGFIFGCPVSYALGIGFIPVRKLGTLVGFDNENVKDILTINNDAIKPGQRVLITDDVLTTGRTIEAIIKLVEEAGGIISGIVFLVELTDLDGRKMLDGYDVLVLGID |
1 | Klosneuvirus(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_6 |
133123 : 136824
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP019589|133123:136824|DBSCAN-SWA TTTATTTCTGTTTTATTCTATTTTTCCGTAGTGGTCGTAAGTTTTCAAAATTCAATTCTTGATTTAAATTCCAAATATAATCTCCTGTAAGTGCGATATGTTCCCAGCCTAATGGAGAGATGTGCTGAATATATTCCTCTGGAATATGAATACCATTATTCCGTAACGTTTCAATTGCACGAGAGATATAGATAGAATTCCAAGTTACAATCGCAGAAATAATGAGTTGAAGTCCACTTGCACGATGCAATTGATCTTCATAGGATCGGTCACGAATTTCTCCTAATTGATTAAAAAATACAGCTCTAGCCAAAGAATTTTTACTTTCGCCTTTATTTAATTCAACCTGAACTTTTCTTCTGTGCTCAGGATCTTGTATCCACTTTAACATATATAAACTTCTTTCTATTCGGCCGATTTCACGAAGTGCGATACATAAACTATTCTGTCTAGGGTAAGATGATAATTTTTTTAAAATCAGGGAAGCTGTAACTGTTCCTTGTCGTACAGAGCTAACTAAACGTAATATTTCATCCCAATTTTCACGTATTTTCTTTACCTGAATTGTTCCGCCAACCATGAAGTTAATATGGTCATATATTGTTGGAACAGATAATGTATATATTTTATGATTATCAATCGTTTTAATTCGTGGTGAAAAGCGAAACCCTAACATATGGCACATTCCAAATATATGATCAACAAAACCCGCGGCATCTGTATAATGTTCTTCAATTTGCAAATCTGTTTCATGATACAGTAGCCCATCAATAATATGTGGTGCCTCTTCTGAGGAACTAATAACTTGGACATAAAATGGATGATATTGATCTGATATATGTGTATAAAAACTTAATCCTGGGTCATGACCATACTTACCATTTACTTGTGCTAGGGGACTGGAAGTCCCACCGGCACGAAAAAATTGTCCATCTGAAGATGAAGTAGTGCCCTCTCCCCAATAGGAAGAAAAGGGTTGTTTATGATGAAAATTTGCAATATCTCCAAGTGCTTTCGTATAGCTTTCATCTCTTATATACCAATCTGCTATCCAAGCTAGCTGAGAATATGAGATATTTGGACAAGCATCAGCCATTTTACTTAATCCTAAATTAATTCCATCTGATAAGATAGCCGCAAATAAAATTGATTTTTCTTTTGGAGCCTTTTGAGTGTGAAGATGAACAAAGTGTTTGCTAAACTGTGTCCAAGTATCTACTTCTACTAATAAATCTGTTAATTTAATACGCGGCAATAAGTCATACACAAGTCGAGTAATTTCTTCTACATCTTCTGGAACCATCTTTTTTAGAGAAGCGACTTGTATTTTATCTCCATATATCGTTACACCTTGCAAATCTTGATTTGCAATTAAACAATTGACTTTTGAAAGCTCTATATCTAATTGTTCAAAGCGTTTGTTTAAATATTTCTCTACATCCTCTGTAAATTCCAGGGGAATTTGTTGTGTTTGCTTCATGTGCTGCCAAGTATGGGGTGGTAAAAGATACTCTTCAAAATCTTTATATTGCTTGCTGCCTTTTACCCACATATCACCAGAACGAAGGGTATTCAATAACTCTGAAAACACACTAAATTCATAGTAATGTCGATTTATTTTATCGTCTTGGTACACATATTTCATCCATTTAGACTTTATAAAATCAGTCGGTACATTATCAGGTATTTTTCGTTTTCCAGATTGATTGGCTTCTTTTAATAGTTCTAATGCTTGTAATACAGTTTGGCTGGTTGAAGAAGCTTTAAACACATATCTATTGAGTAAACGTGGAGCCATTTTACGAAAATGTCCATAATGATTATCGAGCAAATCTAGATAATCAAATTCTATTGGTCTAGCTAAGCTTTCAGCTTCATGTACAGAGTGAATAAATTTCTCCCAAGATATAATAGATTGTACAGCTTCGAAAGGATCTGTTTCTAATTCTTTTGCTTCAATTAATGCTTTTCCTATTTCGACATAAAGTCTAACTTTTTCATTTATTGATTTCCCATCTTTTTGAAATAGTTTATTATGTTTATTTTCTCCACGGTTAAACATTCGTCCCATTAGTTTTGCAAACATATCTAAACCTTGATCAGTTAAAAAAGCATAGATATGGATAAGGAATGCCATGATCGTTGCATATCGTTTCCTCTCATTAAACCTAGATAAATGTTGTATAGAATAACGAGAGCCCTCACGGGCCATTTGTATTAACCTATTCTGATGAATTTCTTTCCCATTATCTAAAGGTAAATCTAAACTTTGAATAAACTCTAATCGATCCAAAATTTCATGAAAATTTTTAAGCGCTATAACACCCGGTGGTTGACGTAACCATGATAAAAGTGAACTTTTTTTCTCTTCATGAGTATAAAGTAATGTATCTAGTTGTTCGTATTGATAAGAAGAAAGTCCTTTCGTTAAATATTTAAAAATTCTTTTCCTAGCGCGTTCTCTTACAGACCAGGCTAAATGTTCTATAGCGTAAACTGCTGGAAGGATAATTTTCCGTTTTCTCATTTCCTGAATAAGAGCTTCTACCAGTAAATACCCGTTTTCAGTTTTCATTGCTAGAGGGAGAAGCCACCGTGCTAATTCACGGTATTCTCTCAGAGTAAAAGTACGTAAATTGTAAAGATTCCGTATTTTATTTACATGCTCTCGCCGTGTGGTATCTCGAGTACGTGCGTAATTTTGTACCTCCCAAGAGGCTACACCTATTTGTTTGGCAAGAAAATTCACAAGAAATTGTGGAATTTTTTCTTTAGCCAATAAAGGCCTCCCTGGAAAACGAGGATAAGAAATTTGAATAGCAAATCCTAATCGGTTATGATCACCACGCTGTTGATTAACTATTTGTAACTCTTCATCAGATAATGTGTAATAGCGAATTAATTCACGTTCATCCATCTGACTAGGAATTTTATAAAAAAATGTTCGTTGTATATCTGTAAGAAGTTCTCTTGTTTTCAATATTGGATTCCTTTCTTCTAAAAAATCAATTATTATCAATAGAGTATACCCTATTGATAATGTTTTGTCTCCTTGATAATAAAGGGTTCACAGACTATCAATAGCACTTATCAAAAATAAAGAGAAAAAAGGTGAAAAAAATGATATATGGATATGCTCGTGTCAGTGCACAAGATCAAAATTTAGATACACAAATTGAACAACTTCTAAAATATGGAGTTGATAAGATTGTTAAAGAGAAAATTAGCGGTGTAAGTCAAGAAAAAATAGAATTAGATGATTTACTTTCTCAATTACTAAAAGGAGATACGCTCGTGGTAACAAGAATGGACCGGCTAGGACGGAATACAATTCAATTACTACAATTTGTTGAACATCTTCGTGAAAAAGGCGTACACTTTGCAGTGTTAAATTTAGGAATTGACACAAGAACTCCAACAGGAAAGTTCTTTTTAACGGTTATGTCTGCCTTTAGTGAATTAGACCGAGAAATGATTAAGGAAAAACAAATTGCTGGAATCAAACTTGCAAAACAAAAAGGAGTTTACCGGGGGAGAATAAAAAAATATACAGAACAACATGCAGGAATGAACCATGCGATTGAATTACGCCAACAAACGAAGAAAACAATTAAAGAAATTTGTGCTATCACAGATGTAAGTCAAGCTGCGTTATATCGGAAATTAAGAGAATTGAAAAAAGATGAAAAGACGATTCTTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP019589|133123:136824|133123_136102_-|WP_003165373.1|transposase|DBSCAN-SWA MKTRELLTDIQRTFFYKIPSQMDERELIRYYTLSDEELQIVNQQRGDHNRLGFAIQISYPRFPGRPLLAKEKIPQFLVNFLAKQIGVASWEVQNYARTRDTTRREHVNKIRNLYNLRTFTLREYRELARWLLPLAMKTENGYLLVEALIQEMRKRKIILPAVYAIEHLAWSVRERARKRIFKYLTKGLSSYQYEQLDTLLYTHEEKKSSLLSWLRQPPGVIALKNFHEILDRLEFIQSLDLPLDNGKEIHQNRLIQMAREGSRYSIQHLSRFNERKRYATIMAFLIHIYAFLTDQGLDMFAKLMGRMFNRGENKHNKLFQKDGKSINEKVRLYVEIGKALIEAKELETDPFEAVQSIISWEKFIHSVHEAESLARPIEFDYLDLLDNHYGHFRKMAPRLLNRYVFKASSTSQTVLQALELLKEANQSGKRKIPDNVPTDFIKSKWMKYVYQDDKINRHYYEFSVFSELLNTLRSGDMWVKGSKQYKDFEEYLLPPHTWQHMKQTQQIPLEFTEDVEKYLNKRFEQLDIELSKVNCLIANQDLQGVTIYGDKIQVASLKKMVPEDVEEITRLVYDLLPRIKLTDLLVEVDTWTQFSKHFVHLHTQKAPKEKSILFAAILSDGINLGLSKMADACPNISYSQLAWIADWYIRDESYTKALGDIANFHHKQPFSSYWGEGTTSSSDGQFFRAGGTSSPLAQVNGKYGHDPGLSFYTHISDQYHPFYVQVISSSEEAPHIIDGLLYHETDLQIEEHYTDAAGFVDHIFGMCHMLGFRFSPRIKTIDNHKIYTLSVPTIYDHINFMVGGTIQVKKIRENWDEILRLVSSVRQGTVTASLILKKLSSYPRQNSLCIALREIGRIERSLYMLKWIQDPEHRRKVQVELNKGESKNSLARAVFFNQLGEIRDRSYEDQLHRASGLQLIISAIVTWNSIYISRAIETLRNNGIHIPEEYIQHISPLGWEHIALTGDYIWNLNQELNFENLRPLRKNRIKQK >NZ_CP019589|133123:136824|136242_136824_+|WP_000639133.1|DBSCAN-SWA MIYGYARVSAQDQNLDTQIEQLLKYGVDKIVKEKISGVSQEKIELDDLLSQLLKGDTLVVTRMDRLGRNTIQLLQFVEHLREKGVHFAVLNLGIDTRTPTGKFFLTVMSAFSELDREMIKEKQIAGIKLAKQKGVYRGRIKKYTEQHAGMNHAIELRQQTKKTIKEICAITDVSQAALYRKLRELKKDEKTIL |
2 | Salmonella_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_7 |
143778 : 146073
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP019589|143778:146073|DBSCAN-SWA TATGAAAAAACGAAAAGTGTTAATACCATTAATGGCATTGTCTACGATATTAGTTTCAAGCACAGGTAATTTAGAGGTGATTCAGGCAGAAGTTAAACAGGAGAACCGGTTATTAAATGAATCAGAATCAAGTTCCCAGGGGTTACTAGGATACTATTTTAGTGATTTGAATTTTCAAGCACCCATGGTGGTTACCTCTTCTACTACAGGGGATTTATCTATTCCTAGTTCTGAGTTAGAAAATATTCCATCGGAAAACCAATATTTTCAATCTGCTATTTGGTCAGGATTTATCAAAGTTAAGAAGAGTGATGAATATACATTTGCTACTTCCGCTGATAATCATGTAACAATGTGGGTAGATGACCAAGAAGTGATTAATAAAGCTTCTAATTCTAACAAAATCAGATTAGAAAAAGGAAGATTATATCAAATAAAAATTCAATATCAACGAGAAAATCCTACTGAAAAAGGATTGGATTTCAAGTTGTACTGGACCGATTCTCAAAATAAAAAAGAAGTGATTTCTAGTGATAACTTACAATTGCCAGAATTAAAACAAAAATCTTCGAACTCAAGAAAAAAGCGAAGTACAAGTGCTGGACCTACGGTTCCAGACCGTGACAATGATGGAATCCCTGATTCATTAGAGGTAGAAGGATATACGGTTGATGTCAAAAATAAAAGAACTTTTCTTTCACCATGGATTTCTAATATTCATGAAAAGAAAGGATTAACCAAATATAAATCATCTCCTGAAAAATGGAGCACGGCTTCTGATCCGTACAGTGATTTCGAAAAGGTTACAGGACGGATTGATAAGAATGTATCACCAGAGGCAAGACACCCCCTTGTGGCAGCTTATCCGATTGTACATGTAGATATGGAGAATATTATTCTCTCAAAAAATGAGGATCAATCCACACAGAATACTGATAGTCAAACGAGAACAATAAGTAAAAATACTTCTACAAGTAGGACACATACTAGTGAAGTACATGGAAATGCAGAAGTGCATGCGTCGTTCTTTGATATTGGTGGGAGTGTATCTGCAGGATTTAGTAATTCGAATTCAAGTACGGTCGCAATTGATCATTCACTATCTCTAGCAGGGGAAAGAACTTGGGCTGAAACAATGGGTTTAAATACCGCTGATACAGCAAGATTAAATGCCAATATTAGATATGTAAATACTGGGACGGCTCCAATCTACAACGTGTTACCAACGACTTCGTTAGTGTTAGGAAAAAATCAAACACTCGCGACAATTAAAGCTAAGGAAAACCAATTAAGTCAAATACTTGCACCTAATAATTATTATCCTTCTAAAAACTTGGCGCCAATCGCATTAAATGCACAAGACGATTTCAGTTCTACTCCAATTACAATGAATTACAATCAATTTCTTGAGTTAGAAAAAACGAAACAATTAAGATTAGATACGGATCAAGTATATGGGAATATAGCAACATACAATTTTGAAAATGGAAGAGTGAGGGTGGATACAGGCTCGAACTGGAGTGAAGTGTTACCGCAAATTCAAGAAACAACTGCACGTATCATTTTTAATGGAAAAGATTTAAATCTGGTAGAAAGGCGGATAGCGGCGGTTAATCCTAGTGATCCATTAGAAACGACTAAACCGGATATGACATTAAAAGAAGCCCTTAAAATAGCATTTGGATTTAACGAACCGAATGGAAACTTACAATATCAAGGGAAAGACATAACCGAATTTGATTTTAATTTCGATCAACAAACATCTCAAAATATCAAGAATCAGTTAGCGGAATTAAACGCAACTAACATATATACTGTATTAGATAAAATCAAATTAAATGCAAAAATGAATATTTTAATAAGAGATAAACGTTTTCATTATGATAGAAATAACATAGCAGTTGGGGCGGATGAGTCAGTAGTTAAGGAGGCTCATAGAGAAGTAATTAATTCGTCAACAGAGGGATTATTGTTAAATATTGATAAGGATATAAGAAAAATATTATCAGGTTATATTGTAGAAATTGAAGATACTGAAGGGCTTAAAGAAGTTATAAATGACAGATATGATATGTTGAATATTTCTAGTTTACGGCAAGATGGAAAAACATTTATAGATTTTAAAAAATATAATGATAAATTACCGTTATATATAAGTAATCCCAATTATAAGGTAAATGTATATGCTGTTACTAAAGAAAACACTATTATTAATCCTAGTGAGAATGGGGATACTAGTACCAACGGGATCAAGAAAATTTTAATCTTTTCTAAAAAAGGCTATGAGATAGGATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP019589|143778:146073|143778_146073_+|WP_000746486.1|DBSCAN-SWA MKKRKVLIPLMALSTILVSSTGNLEVIQAEVKQENRLLNESESSSQGLLGYYFSDLNFQAPMVVTSSTTGDLSIPSSELENIPSENQYFQSAIWSGFIKVKKSDEYTFATSADNHVTMWVDDQEVINKASNSNKIRLEKGRLYQIKIQYQRENPTEKGLDFKLYWTDSQNKKEVISSDNLQLPELKQKSSNSRKKRSTSAGPTVPDRDNDGIPDSLEVEGYTVDVKNKRTFLSPWISNIHEKKGLTKYKSSPEKWSTASDPYSDFEKVTGRIDKNVSPEARHPLVAAYPIVHVDMENIILSKNEDQSTQNTDSQTRTISKNTSTSRTHTSEVHGNAEVHASFFDIGGSVSAGFSNSNSSTVAIDHSLSLAGERTWAETMGLNTADTARLNANIRYVNTGTAPIYNVLPTTSLVLGKNQTLATIKAKENQLSQILAPNNYYPSKNLAPIALNAQDDFSSTPITMNYNQFLELEKTKQLRLDTDQVYGNIATYNFENGRVRVDTGSNWSEVLPQIQETTARIIFNGKDLNLVERRIAAVNPSDPLETTKPDMTLKEALKIAFGFNEPNGNLQYQGKDITEFDFNFDQQTSQNIKNQLAELNATNIYTVLDKIKLNAKMNILIRDKRFHYDRNNIAVGADESVVKEAHREVINSSTEGLLLNIDKDIRKILSGYIVEIEDTEGLKEVINDRYDMLNISSLRQDGKTFIDFKKYNDKLPLYISNPNYKVNVYAVTKENTIINPSENGDTSTNGIKKILIFSKKGYEIG |
1 | Clostridioides_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_8 |
155262 : 156306
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP019589|155262:156306|DBSCAN-SWA ACTAAAACAATGAATTTCCTATATCTATTGTGGCCAAGTTTTGACGTCTTGTACGTTCTCTTAAATAACGTTCCGTCGTCATAATAGACTCATGTCCTAAATAGTCACGTATTTTCTTAAGTTCGACTCCTTTTCCCATCAAATGATTGGCGAAGAAGTGTCTACAGGTGTGGGGAGTTATTCTATGTTTTCGGTAACGCAGAAATGGTAAATTAGTTTCTTCAATTTTTTCTGCTACATATTTTGATAAGTAGTCGGCTCTATAATGAGAACCGTCCGCTTTAGGTAGAAAGGCAGATGAACTAGAGGCATCTAATTCACTTTTCTGTTTTCGTAATTGACGAAGATGACAGAGATCGTTGAGTACATCTTCAAAGATACGAACTTCTCTCGTTTTATTTCCTTTTCCAACTACACGTAGAAGATAAACATTTAAAGAAGGGTGAAATACAAGGTCAGCCCACTTTGCATTTGCGACTTCCTCAATACGGAGTCCAGTAGTTGTAAGTAGGAAAAACAAGGAATACATAAAGAAATTTGTTTTCTTCAATGTATCTAGAATTTCATTCACTTCTTCTGGAAAGAGATCCCGATTGACTAACTCTTCTTTTTTTACAGATACTTTTTTGAGACGACTACTAAAGTTGTCTGAGAGACCATTGTTATCATACACATATTTTAAAAACTGCTGAACCACTGTTTTCTTTCGACGTAATGTGGTGGCCGCATACTTTTTACTTAGTTGATAGAAGTAGATTTCCATCTCATTATGGGATAACTCCTTAATGATTCCGATTGTTTCTTTTATGTAACGAAGAAAATGAGAAAGATCATGCAGATAAAGTTTTTTTGTTCGCTCACTTCTTTTTTTCGTTAAAGAAGGCTCATCGTGTAAAAATAAATAAACTAATGATCCTTCACTTAATTGGGAATAGTCAATATTTCGAATGCCCATGCCCATAATTTTTTCGAAATGACTGCTATCAAAAAAATCCGATTTGGATTTTACAAGTTGATTATTATGTTCGTAATTTATAATATTCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP019589|155262:156306|155262_156306_-|WP_001021546.1|integrase|DBSCAN-SWA MNIINYEHNNQLVKSKSDFFDSSHFEKIMGMGIRNIDYSQLSEGSLVYLFLHDEPSLTKKRSERTKKLYLHDLSHFLRYIKETIGIIKELSHNEMEIYFYQLSKKYAATTLRRKKTVVQQFLKYVYDNNGLSDNFSSRLKKVSVKKEELVNRDLFPEEVNEILDTLKKTNFFMYSLFFLLTTTGLRIEEVANAKWADLVFHPSLNVYLLRVVGKGNKTREVRIFEDVLNDLCHLRQLRKQKSELDASSSSAFLPKADGSHYRADYLSKYVAEKIEETNLPFLRYRKHRITPHTCRHFFANHLMGKGVELKKIRDYLGHESIMTTERYLRERTRRQNLATIDIGNSLF |
1 | Bacillus_phage(100.0%) | integrase | attL 147601:147615|attR 158214:158228 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_9 |
160283 : 161516
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP019589|160283:161516|DBSCAN-SWA AATGAGCACACAAATTAAGGTAACACCGGAACAATTAGAACAAGCTGCTAAAACCGTAAAAAATACGAGATCATCATTAGAATATATACATCAAGATTTATACTCTCAAACTGAATATATAGCTTCTCAGTGGAGCGGCGCAAGTAGTGATCGTTTCTATCAGATGTTTAATGAAGCGAAGCCAATGATGTTTAACATTTTGCAAGAATTAGATAAAATCGCAGTAGAATTAGAGCGTGCAGCTGTTAAATTCCGAGAAGCAGATGAATTGTATGGCGGAAATTTAGTTGACTCTGATATTCAAGAAGGGGCTATGTGTGGAAAAATCCCTCCAAAATCGGAAGAGTCATTTTTTAATAATAAGGATTTAAATGCTGCGTGGACTGGTATTTCTACTGGGTTTGTAGATGGTGCAGTGGATGCGTGGGAAGGACTGATATCCTTAGGTGATAAAGAAACCTGGTTGAATATGCGAGATGCGATTGTAAATTATGAGGAAACTATTCCTGCTGCATTGAATGCTCTATCAGATTCATTTGTAAACAATCTTTGGCATGGAGATATGGAAAGTAGAGAACATTATGCAGCTTATGGTATAGCAACGTTAGGGCTCGGGCTTCTAGGTGATAAGGGTCTTAGTAAAGCAGGACAAGTAGGGAAGGGAGCTGCCATTACAGGGTTTACTAAAGGGAAATCACTTGTGACTAATTCTCCGGCATACAGAAATGCATTACACATATTAAATAACTATGAATTTAAAGCTGGAAATCACCTTTCATATGCGGGAGTCGGAAGTATTCAAAAGTACTTGCAGAAAGCAGCTCCATATACTTATGAGGGGCCAAATGGTCCGAAAACAATAAGATTAAGGTTGGGTGAGTTAGCAGGGGACAAACATCCTGTTACAGGCATTCGGTATGATTTAGATGGTTTCCCTATTTTTAAAGCTCTTTCTGAAGTTAAATTAAAAGAAGCTGATTTTAAAAAATCTAGACCAACACATGATAGAATATGTAGTAAAGCATTATACGAACAAATAATGAAAGACCCTAAGTTAGCTGCAAAATTCACAGAAGAAGAAATAGAGTTATTTAAGCTAGGCGAGGTACCAGAAAATTATACATGGCATCATCATCAAGAAGCAGGACGAATGCAACTTGTTGATTATGAAACACATAGGAAAACAGGTCACACTGGTGGATATAAAATTTGGGGGAAAGACAGCGATAAGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP019589|160283:161516|160283_161516_+|WP_000107153.1|DBSCAN-SWA MSTQIKVTPEQLEQAAKTVKNTRSSLEYIHQDLYSQTEYIASQWSGASSDRFYQMFNEAKPMMFNILQELDKIAVELERAAVKFREADELYGGNLVDSDIQEGAMCGKIPPKSEESFFNNKDLNAAWTGISTGFVDGAVDAWEGLISLGDKETWLNMRDAIVNYEETIPAALNALSDSFVNNLWHGDMESREHYAAYGIATLGLGLLGDKGLSKAGQVGKGAAITGFTKGKSLVTNSPAYRNALHILNNYEFKAGNHLSYAGVGSIQKYLQKAAPYTYEGPNGPKTIRLRLGELAGDKHPVTGIRYDLDGFPIFKALSEVKLKEADFKKSRPTHDRICSKALYEQIMKDPKLAAKFTEEEIELFKLGEVPENYTWHHHQEAGRMQLVDYETHRKTGHTGGYKIWGKDSDK |
1 | uncultured_Caudovirales_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_10 |
167997 : 169083
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP019589|167997:169083|DBSCAN-SWA CATGAGTAACCAAGAAAAAGAAAAGTTTAAAATACTAATTGATAAGCATAAAAGTAAAATGCCCTGGTATATCATAGAGTATGCAGAAATGAAAACAGCCCTCTCCCCCGCTACATTGTATGCTTATATTACTGAATTTGAAAAGTTTCTAAAATGGCTTATAAGTAATCGATTAGCCGTTGAAAACGGTAAGGTGGTCACTAATATATGTGATGTACCAATTTCAACACTAGAAAATCTACCATTAAATGAAGCTAGAACTTTTCAAAGATATCTACAGGGAGAAGGTATTGAGACAAGAGCTATTAACAGAACTTTCTCCGCTTTAAAATCCCTATTCAAGTACTTAGCTCAAAATACAGAGAACGAACAAGGGGAAAATTACATCTCACGTAATGTAATGGATAAAATTGAACTGCATAAGGAGAAAGTAGATGCAGCAGCAAGAGCAGATGACGTTGCAAACATGATATTTAATGAAAAAGATGATGTAGCTTTTCTTCAATTTCTAGCAAATGATTATGGTGAAATGTTGAAGGATATATCACCCAAAAAATATAGTTTTTTTCAGCGTGATAAAGAAAGAGACATAGCCATCATAAGCCTTATTTTAGGCACTGGCCTTCGAGTTTCTGAGGTAGCTAGTCTTACTATATCTAGTATAAACTTCCGTCAGGGGAAAGTAAAAGTGACGCGTAAAGGTAATAAGAGATCTTCCGTATTAGCTACTCGCTCTTGCTTAGATGATGTTCAGGAGTACATTAAGGTTCGTCCTAGTAAATATAACTGCCCTCAAGATGAAGACTTACTCTTCGTAACAAATTATAAAGGGAAATATACACAGTTAACTGTTAGAGCTATACAGAAGTTATGTGACAAATATTCAAGTGCATTTGATGAAAAGCGTAGCCCTCATAAACTACGACACACATATGCAACAAACCATTATAAAGAAAACAAAGATCTTGTATTGCTGCGAGATCAACTTGGCCACACTTCTGTTGAGGTTACAAGTATTTATACTAATATTAATAACGAGAAAAAACGTGAGGCTGTTGATCGCTTGGAAAGAAGACAATTTGAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP019589|167997:169083|167997_169083_+|WP_000070475.1|DBSCAN-SWA MSNQEKEKFKILIDKHKSKMPWYIIEYAEMKTALSPATLYAYITEFEKFLKWLISNRLAVENGKVVTNICDVPISTLENLPLNEARTFQRYLQGEGIETRAINRTFSALKSLFKYLAQNTENEQGENYISRNVMDKIELHKEKVDAAARADDVANMIFNEKDDVAFLQFLANDYGEMLKDISPKKYSFFQRDKERDIAIISLILGTGLRVSEVASLTISSINFRQGKVKVTRKGNKRSSVLATRSCLDDVQEYIKVRPSKYNCPQDEDLLFVTNYKGKYTQLTVRAIQKLCDKYSSAFDEKRSPHKLRHTYATNHYKENKDLVLLRDQLGHTSVEVTSIYTNINNEKKREAVDRLERRQFE |
1 | Brevibacillus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
172314 : 173409
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP019589|172314:173409|DBSCAN-SWA AATGATTGTTTCAGTAAAGGGGAACGAGCAAATTACTAAAATGTTAAATGACTGGTATATAGAGATACGTGCCAGACATGTAGGAAAGGCACATAATTTAAAACTTGAGATTGATCAAAAGATACATAACATTGAAGAAGACCAAAACCTACTTTTATACTATGCCCTTTTAGATTTTCGTCATCAATATATGCTTGATAGTTTAAGTATTGGAAAAGATAGTTTTGATAAAGTAGATTCACTGGGTGTACCTGCGGATCAGTTTTTACAATACTACTACCACTTCTTTAAAGCTATTCATTCAAATATTACAGGTGATTTTACATCTGCAAAAGAACATTATAATCAAGCTGAATTACTCTTAAAACATATTCCCGATGAAATTGAACATGCTGAATTCCGTTTTAAATTATCAACTTTTCATTATCATATTTATAAACCGCTTGCAGCAATCAAAGAAGCTACCAAAGCAAAGGATATCTTTAAAAAACATGCAGGATATGAAACTAATATTGGATTATGTGATAATTTAATTGGATTAGCTTGTACTCATTTAAAACAATTTGAGGAAGCTGAAGAACATTTCATTACAGCTATTAATACATTCAAAAAATCTGGTAAAGAAAAGAATATCACGTTTGTACGCCATAACTTAGGTTTAATGTATTCAGGTCAAAATTTATCTGAACTAGCAATACGATACCTCTCTGAAGTAACACAAGAACTCCCTAAAGATTATAAAGCAATTTTTATTAAAGCTAGGGAGCATATGAAAATCGGGGAGTCCAAAGAAACTTATAATCTTATAGTGAAAGGCTTAGAAATTTGTAAAGAGCTAAAGAATGAAGAATACGAACATCACTTTTTAATTTTAGAAAAATTAAATCAAAAGGTCTCTGCTGACGAATTAGAGAAGACAATTAAAACAGGAATCTCTTATTTTAAGAGAGAAAACCTACATGAGTACGTACAGGAATACGCTAAAAAATTAGCAGTTTTATTCCACCAAGAAAATAACCGTTCAAAAGCAAGCGATTATTTTTATCTTAGCCATCAAGCAGAAGAACAAAACTTTGAAAAGGAGGCTTTAAAATGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP019589|172314:173409|172314_173409_+|WP_000637338.1|DBSCAN-SWA MIVSVKGNEQITKMLNDWYIEIRARHVGKAHNLKLEIDQKIHNIEEDQNLLLYYALLDFRHQYMLDSLSIGKDSFDKVDSLGVPADQFLQYYYHFFKAIHSNITGDFTSAKEHYNQAELLLKHIPDEIEHAEFRFKLSTFHYHIYKPLAAIKEATKAKDIFKKHAGYETNIGLCDNLIGLACTHLKQFEEAEEHFITAINTFKKSGKEKNITFVRHNLGLMYSGQNLSELAIRYLSEVTQELPKDYKAIFIKAREHMKIGESKETYNLIVKGLEICKELKNEEYEHHFLILEKLNQKVSADELEKTIKTGISYFKRENLHEYVQEYAKKLAVLFHQENNRSKASDYFYLSHQAEEQNFEKEALK |
1 | uncultured_Caudovirales_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_12 |
176765 : 179429
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP019589|176765:179429|DBSCAN-SWA ATTATTTCTTCTTCTCATATATAAACGTGACTCTCTTCTGTGTAGAGTCATATGTTAATTTAGCATCGAATGATTTCCCTGTTTTTTTCGATACAAATCCTTTTACTGTATCCGTCATATTCTTTTCTAATAATTTCTTGATTTGACTGGCTGTAATTCTTTTTTCAAGTATCATTCCTGAAACAATAAAATCACAACCCCTCTTGTATTGTTCGCATAGATAGTTTGTTTTCCCGATTATGACTCTACTCTGGCATAATGGACATTTACCTACCGTACGATCATCTGTAGTTGGAAATTCAAAACAAATACTAAGATCCGTTTTTAATCGAATCGCAGCTGTGAATTCTCCTTTTTCTCCACTAAAACCATTGATGAAGTCTGTCACATGATTATTCACTAGTTTTTTAATCTGGCTATCGGATAATTTCTTACCTTTAATTTTAGCCGGCAACATAAAATCGCATCCGTTTTGATATTCTGAGCACCCAAAAAACGTTTTACGGTTTAGAATTTTTCCTTTTTGACACTTTGGACACTGCCCTAGCGATAATTCTTCAACTGAAGGCAAATTAAAGCTGACTTCACCGTTAACAAATGCTAGATACGCAGAAAATTCTTTACCATTAGATTTAAAACCTTTTATAATGTCCGTTTTATTCTCTTCAAACAGTTTTTTAACTTGTGCTGTGGGAATCGTTTTTTCCTTTACTCTTTTGGGTAATCCCTTGTTACAGTTCGGGTGATTGCTACACCCGAAAAACTTTCCTCTATCTAAGATTATTCCATTTCCACAAGGGCATTGGCATACTTCTATTTGTTTCTTCCAGGTCTCTATTAGATTATACGAAACTGTGTCAGGGATTCTTATAATCTCTTGTGTTATTTTTTGTACAAACGCATTTGTTTGTGCAATAAAGTTCTCATAACTCATTTCATTCTTTTCAATGCGATGTATCATTCCTTCCATTTCTGCTGTGTACAACGGATCTTTAATTTGCTGAACGGGAAATTGTTCAATAAAGGCACGGCCAATTGGAGTTGTTATAATTTTCCCCTTTTCAATGTCTATAAAGTTCTTCTCGTGTAAAACGGGAATAAAAGCCGCTTCCGTTGCTACGGTTCCAATTCGTTTTCCTTTCATCAGCTCTTTTAAATGTTCATCATCAATTTTACGACCAGCCGTTTCCATAAAAGTAAGAATTGAGCTTTCTGTGTGTAGAGCTGGTTTCTTTGTTTTGGATTCCTGTAACTCAAAATCATAGATTTGAAGTTCTTGTCCTTTCTGCAGGATAGGAACTTTAAATGTTTCCACACTTTCTTCCTTTACTTCCTCTTGGAACACTTCTAGGAAACCTTTTTCTCGAAGCACACTTTCTTTTATTTGATAAGTATTTCCCATTGCATCAATAAGGGATACATCTCTTACCAGGTACACTGCAGGACGCATGAAATTGCCCACAAAACGTTTTACCACGAGGCTATATAGTTGTTTTTCAATCTCTGGACGACCTTCCTCTTGATATTGTTTAGTCGTCGGTATAATGGCAAAATGGCTTGATACAAGATCATCATCAAATGTTTTATGTTTTATATCAATGGCGTCAATATCGACGGATTGTACCAGTAAAGAATAACGACTCTTAGCTAGCGCCTGCATAACACCTTTTACCCGATCCACTTGTTCTGTAGGTAAATGCCTAGACGAAGAGCGTGGATAGGTTATGAAACCTTCTTCATACAAGTTCTGAATGTGTTTTTTTGCAGTTTCAGCATTAATTTGTAATTGTGCATGGGCGTCTTTGTACAAGTCCGTTAAGTTGTATAGCAATTTAGGATTTTGTTTCCTAGTGCCCTCTTTAAAATCCTCAACCGTGAGATATTGATCTTTTAGGTTCTCCCCCAAACTTTTTAATGGAGATGGGTTTAACACCTGGTCTTCTGTTTTCATAACTGGTTTAAGTCCTAAATCTGTTATTAGCTGCAGATGATAATAAGATTGCTCCCTATAGTTTTCAATCGCTAACTCCCGCTGGCGTATCTCATGTAGCAAACACATTTGTACACGTCCAGATGACAATAAGAATTTATTTTGTGCTAATTTCGTGGTACATCCCCTGGTTATATTCATACCTAATAGATAATCCAAATACTGCCTTGCTTTAGCAGAATAAGCTAGTCCATCATACTTAGACGCGCTTTCTAATCGATTGAGAGCTGCTTCTAGTTCTGCAGCTTCAAAGGAGGATTTATATACGCGAGATTGCTTTTTATTCACCCCTGCGTATTCGTACACTTCCCTATAGATTAACTCTCCCTCGCGGTCCGCGTCACAAATATTCACGGCATGGTCAACATCAGGTCGCTGTAACAGTTTAACAAGTATTTGTAGTTGCTCTGCATTCTCTTGTATCACCTTATACGATGGCTGAAAAATTAAAGGTAAATGCTCTAACTGAAACAACTTATACTTTGGATCCATCTCTTCCGGATTTTTTAGTTCAAGCAGATGTCCACGGCACCAACTGACAATATAATGATCATTTTCATAATAACCGTAATAAGGTTTGCTACCAATGTACTTTTGTGAATGACGGAAGCGTGGCGATTTCATAATTTCATTGGCCACTTTTGGTTTTTCTGCAATAAATAACGTTTTCCCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP019589|176765:179429|176765_179429_-|WP_000520727.1|DBSCAN-SWA MGKTLFIAEKPKVANEIMKSPRFRHSQKYIGSKPYYGYYENDHYIVSWCRGHLLELKNPEEMDPKYKLFQLEHLPLIFQPSYKVIQENAEQLQILVKLLQRPDVDHAVNICDADREGELIYREVYEYAGVNKKQSRVYKSSFEAAELEAALNRLESASKYDGLAYSAKARQYLDYLLGMNITRGCTTKLAQNKFLLSSGRVQMCLLHEIRQRELAIENYREQSYYHLQLITDLGLKPVMKTEDQVLNPSPLKSLGENLKDQYLTVEDFKEGTRKQNPKLLYNLTDLYKDAHAQLQINAETAKKHIQNLYEEGFITYPRSSSRHLPTEQVDRVKGVMQALAKSRYSLLVQSVDIDAIDIKHKTFDDDLVSSHFAIIPTTKQYQEEGRPEIEKQLYSLVVKRFVGNFMRPAVYLVRDVSLIDAMGNTYQIKESVLREKGFLEVFQEEVKEESVETFKVPILQKGQELQIYDFELQESKTKKPALHTESSILTFMETAGRKIDDEHLKELMKGKRIGTVATEAAFIPVLHEKNFIDIEKGKIITTPIGRAFIEQFPVQQIKDPLYTAEMEGMIHRIEKNEMSYENFIAQTNAFVQKITQEIIRIPDTVSYNLIETWKKQIEVCQCPCGNGIILDRGKFFGCSNHPNCNKGLPKRVKEKTIPTAQVKKLFEENKTDIIKGFKSNGKEFSAYLAFVNGEVSFNLPSVEELSLGQCPKCQKGKILNRKTFFGCSEYQNGCDFMLPAKIKGKKLSDSQIKKLVNNHVTDFINGFSGEKGEFTAAIRLKTDLSICFEFPTTDDRTVGKCPLCQSRVIIGKTNYLCEQYKRGCDFIVSGMILEKRITASQIKKLLEKNMTDTVKGFVSKKTGKSFDAKLTYDSTQKRVTFIYEKKK |
1 | Klosneuvirus(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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