Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019622 | Listeria monocytogenes strain 10-092876-0145 LM9 chromosome, complete genome | 2 crisprs | DinG,cas3,WYL,casR,RT,DEDDh,csa3 | 0 | 0 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP019622_1 | 503320-503904 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019622_1
|
7 spacers
spacers of NZ_CP019622_1
>1.1|503359|39|NZ_CP019622|CRT TGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTG >1.2|503437|39|NZ_CP019622|CRT TCTTACATGTTTTATGATAATAGAAACCTTGAGGTGCTG >1.3|503515|39|NZ_CP019622|CRT TATGCCATGTTTGAAGATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTG >1.4|503593|39|NZ_CP019622|CRT TATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTA >1.5|503671|39|NZ_CP019622|CRT GTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTG >1.6|503749|39|NZ_CP019622|CRT CGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTA >1.7|503827|39|NZ_CP019622|CRT GCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAACTGGAGAAGCTT |
RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019622_1
The CRISPR arrays of NZ_CP019622_1 >merge|NZ_CP019622|1|503320-503904|CRT GATTTGAGTGGTCTTGATACTAGTGCGGTAACTACTATGTGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTGGATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATGTCTTACATGTTTTATGATAATAGAAACCTTGAGGTGCTGGATGTAAGCAACCTTGATACCGGTTCAGTAACTAATATGTATGCCATGTTTGAAGATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTGGATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTGATATGTATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTAGATGTAAGTAATTTCGATACCAGTTCCGCTACTGCAATGGTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTGGATGTAAGTAATTTTAATACGAGCTTAGTAACTGATATGCGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTAGATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATGGCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAACTGGAGAAGCTTGATTTAAGTACCTTTGATACCAGTTCAGTGACTAACATG >NZ_CP019622|1|1|503320-503904|CRT GATTTGAGTGGTCTTGATACTAGTGCGGTAACTACTATG TGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTG GATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATG TCTTACATGTTTTATGATAATAGAAACCTTGAGGTGCTG GATGTAAGCAACCTTGATACCGGTTCAGTAACTAATATG TATGCCATGTTTGAAGATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTG GATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTGATATG TATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTA GATGTAAGTAATTTCGATACCAGTTCCGCTACTGCAATG GTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTG GATGTAAGTAATTTTAATACGAGCTTAGTAACTGATATG CGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTA GATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATG GCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAACTGGAGAAGCTT GATTTAAGTACCTTTGATACCAGTTCAGTGACTAACATG
>NZ_CP019622.1|WP_023550313.1|500445_502527_+|BspA-family-leucine-rich-repeat-surface-protein MKKFSMRVVLIISVLFIALGNANVSIAQERDTTNKLPEEELGSLDTSNLIAEEVAQEKPAEVENLEEIPTTDELMQNPEVREQPVADSDDPDLTAVSSGDYWTIYYNSANDEYSLRMFGNVPSSKPSAWNSYLKYIKHIEIEEATLTGDFSSYFRSNVFTVLESVRIERSNLSGVTSFARAFEGDSESESPLEKVIIRDNYYQETPSLTNISRMFTLCRKLSELDVSGLNTSSVTKMDTIFSNANSLKELDVSHFDTSSVTDMSSMFAACNSLEELDVSNFDTSSVTNMKYMLSGLHLKKLDVSNFDTSSVTNMYGMFAYCYNLEELDVSNFDTSSVNNMLHMFYVCNNLEELDLSNFDTSSVTNMFAMFAYCTSLKEIDVSNFDTSSVTTMSAMFFECSSLEALDLSNFDTSSVTTMASMFENSTALKSLYLDNFTDAASMTDMFKGTTSLTYLFVSHNLSTFNRLENTSWYDEKNWVQFSNLSQLQTYHRKQSEPTGYRKGAFLSLTMDAMGGEFEDAEEQKVQNKVSGEYWEEIVPVKEDYYFDGWYLDQNFTNKFDFSLPAAVSTTIYAKWVENYTVIIPASISLNEATELKVEGINRGSKALSVGLNRLATSVSESNELTLANTADTTVQCSAPLSWDGSENNPEKAILTLAPGSEITEGDAVMAIEAPENIQAGKYTGNLVFSINYE >NZ_CP019622.1|WP_023550311.1|498643_500182_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MREYLDSKSQKKVALLEKIFYAENHTSTQEELLNDLNITYPTLISTIKTINFDIERFGYKAFSIVHSAPNLSYTLKISDNCSIQLIINAYIRESPKFQILETLLLASFPNLQALAKKVHVSYSGIKKEIKELNEELRERNLSISTGNQVEITGDEFSLRIFYAFLFLVAYSGDRWPFSFVQYDEITDILESCPKEIYRANSIDKAMMIHYYVAMHLLRDRMNCQIDTTRQFKVALYKACTEESKKSESAFIKKVAKQLPNRNYKEMTYTTQIILSTIVAFGSYSSIEKMPSFFYMDEQLEEMGFMKLVDFASEQVNDNLSIPFSEKEMELLRYSFASINYRYFLLDNLINKFNNIVPGYTNLDRNIRKIHKVNHLEPLISQLVNLKEMDPLKPFEERLASDYLIILDKRIDFSIHTLPIKVTILSTISNETAVFDFMRYFSSYYNLEIINQVDPVVDLYISDFSVSPEVLTSLRINQPIIYVNTRWLESDYVKINDNLAKIARKKFIANKKN >NZ_CP019622.1|WP_003728092.1|496459_498010_+|hydantoinase/oxoprolinase-family-protein MYKIGIDVGGTNTDAVILDENQQLIHSVKMPTSEDIETGITESLHRVLSETGIDRSKVTHAMLGTTQCTNAIVERKKLAKVGVLRLGYPATASVLPYTAWPEDMVGFLSGKYKLTGGGYEYDGQVLSEINEAEIRETLASWKGEVESVAVVGVFSSLKNDQELAVQKIIEEELGADIPVSISSSVGSVGLIERENATILNAALFKVIAATSDGFEKALEQEGIAHAEIYLCQNDGTLMSLNYARQFPILTIACGPTNSIRGASYLAGLKDAMVLDVGGTTSDIGVLTDGFPRESSLAVDVGGVRTNFRMPDIISIGLGGGSIVREKDGDITIGPDSVGYRISEEALVFGGKTMTTTDIAVRLGRAEIGNPELVAHIPTDFAEKAYKKIAEMTEDAIDKMKTSSGSVSLVLVGGGSVIIPDEISGVAQIFRDKNGPVANAIGASISQISGQYEQIYIYSQIEREEALQDAEQKAREQATLAGAVTDSIEVVEVEEIPLAYHPGNATRLRVKVVGNLV >NZ_CP019622.1|WP_003728093.1|495366_496467_+|DUF917-domain-containing-protein MRYLDEQAIENIAIGAAFLGTGGGGDPYIGKMMALTAIKKHGPIKLLSPEEIADDDYFIPAAMMGAPSVLIEKFPKGDEFVRVFEKLGRYVGKEVKGTFPMEAGGVNSMIPIVVAAQLGLPMVDCDGMGRAFPELQMVTFHLDGISATPMAITDEKGNIGIMETIDNKWTERLARVTTVEMGASSLVSLYPCNGAQIKQSSIKNIVTLSEEIGKVIRETSMDEAEKLQKLLDVTHGYHLFEGKITDVVRETRAGFNFGRVKIDGLNKDTGSEVIVHFQNENLVAEKNGEPIAITPDLICMVDLETLMPVTTEALKYGKRVRVMALPADDAWRTDKGIETVGPRYFGYDVDFEPLEELVKKEERRHV >NZ_CP019622.1|WP_003725189.1|494082_495366_+|cytosine-permease MTEKKSVEQTQSWQSLAFVWTGAMICVPSLLVGGTLISGMPLWEAILIALLGYGVIVLFMIYQGMQSSDLGIPAVSVASQVFGEQGSKKIISILLAIACLGWFGIQANVCGAAFSQFLGIYGINLPVPVSSLIWGVIMLLSAIYGIRILSILNYIAVPVLLFVCIYGLVVSLNDGGLAIVENYKPAGSMSFMTGLAITIGSFALGAVIAGDYSQYTKSRKDVVKAAIVGILPSGVLMITVGAVLALTAGTADISVVFTNLGLPVLGIIGLILAAWTTNAVNAFSGGIAIINVFNISEKYHKVAVAVAGGLGTILAVIGILNHFVPIMSVLSAMVPPVAGVMIASYWIVQKGDKSKWAPVPGVNWLGVSSWLVGAVIAGIPVILTFFPELPQLPNQPLIGIILSLAVYLIGAKVLSGKTNNVENLEGK >NZ_CP019622.1|WP_003740428.1|492352_493948_+|PucR-family-transcriptional-regulator MSVKLADLMKLPSLKEAKVVSGKSGLSKLVSSISVLEYTEVALLEDDLFDNDEFYGSEIVVSAFVNIRDDVEAQCRTIERLHKVGEVALILYYVGIFVPKMDQKLIDFANELDFTIIVMPENEMSLRYSEVIYEVVEAIVKQEMTDTNFVTESLEQISSVRPPQRNIDTTLKILSDRTHTSLVLTDNSFQVINSITWPRTRHWDFERIIEASKQIGEHELVQLTLDERDFYTARKPIFQDGMQAMHLFMMKEKGVLTADVVMQITEVVQVFMNLWGRNYVEISTAELMKAILNDESVKMRRLGKILNVDVSSIKWMWLVKTEEIRDNEQVLAELKSFVASHFQVSLIDLFEDNIVVLLDNSVAQRDRTHTANEFAMMMKEHGIDLKITVCQGMEQTSDVQSAYSLVNEYKNAANAIYANKSIYSLQEIDFAAKCVEIVDRGELAIAEQMRPLKPLEDNDELIETLSVFLLEGESNYNQAAELLFLHKNTIKYRIQRINELLQYPATKIPESYNLYLAVAIRRILGGNNNNK >NZ_CP019622.1|WP_003721242.1|491249_492197_-|MoxR-family-ATPase MSIEPSIKIEEIINEVEKVIVGKRHVVKLSLTALLAGGHVLLEDVPGVGKTMMVRTLSKTIGVSFKRIQFTPDLLPADVTGVSIFNPETRDFEFRPGPVMGNIVLADEINRTAPRTQAALLEGMAENSVTVDGITRKLANPFFVMATQNPIEYEGTYALPEAQLDRFLLKINIGYPTVEEEMQLLTLKQYQDPLDQTQQVVTLSELLDLKNKAKQVFIDDVLKNYIIRLVDATRKHPSVALGISPRGSLAFMQAAQAFALIEGRDYVIPDDIQYLAPYIFTHRLILKSEAYYNEETAESIIASILKNTSVPVEKR >NZ_CP019622.1|WP_009929138.1|490096_491245_-|DUF58-domain-containing-protein MLKKRLLLAFRWIIMLIIYAGLWTYTLFQGDTASWFLTYFFSFILLLLFLSSIYPLKAWKVNRRFVKNTYHDGDLIDMQVSFTRKSRYPVGYLLFQQKIPASFGNVSARQQVVYPLFKKHFTVTLAGFVGVRGIHSFPPVDVETSDAFGLLERSRQLSSEKSLTIYPTYFPDVLEKISEASPENERNAAYWTLKKNSNLHSLREFSSGDRISLIDWKSSAKSDQLMTREFENSATSRLSVIFYGASHPNFELSLRAAYSFIRKISEDNGEIRVTLLGDQTSKFAPAKGTSRLQDISTAFAEIAPVDSLTLQESLDSNLHSGEKILLFTPCIDTMLMQKVTRLTDNKQLQIITFQSEHSKAMDAPAIFLEPASLLSRWEREAK >NZ_CP019622.1|WP_003725186.1|487940_490100_-|transglutaminase MKRYLTLVMLFILSVLLISEWIYPFAELTELSTANWIILFITLSLGSFFLRLKYYWTIPLHIVMIIFVSGIYYAKGGILAGNWFVSFFQITFNGFRDMVQFRSSDISMDFILIVFLIALWLLSYITTYSILRKQRVMSVLVLTVAYLAVINTFTDYNSNWAIVRTVLEGFLLLHLALASRIAAPNRISADSLKRNGLFYHIFVILLLAVFVFSSLMLPKKAPIFPDPVPTIKNALGINTTRTVGYSEDDTTLGGALKKDNATVFTARAEKGHYWRVESKTVYTGTGWANANSADVISFSSGDNFPIQLTEQTTGATNTAEISFASSNDYMPYPYGTQTVNGAVDSFSANLTIERVGPVDTIKNYTVQLKTPVYNIEKMQNADFSTLSNAFVSQYTQTPKDLPDRVTKLANKVTKDADSIYDKTKAIERYLSASGTFTYSTEDAKETPRGADYVDQFLFETQIGYCDNFSTSMVVMLRSLGIPARWAKGYTPGEGEKKENDAKTTYTITNNNAHSWPEVFFPGTGWVPFEPTATFSNPENFQEPTTETANKPETPNDSTSTPETPNTADKTPEQDNGSSSTGETPKKEEPKTETAASNFEIPSWVWWIPAGLVVTLLALAIIFRRRIRRYLLLRSLRNSPEFGKTYHRLMKLLASYGYVRESSETLRHFSTRVDAELTTTEFSRLTKMYEAQIYSNNLTEKVITAEETQLVQQVIARLTK >NZ_CP019622.1|WP_003734632.1|487068_487824_-|DUF4866-family-protein MTTIFPKEQNVAPLFEQILANPTACRRFKDVFLDNLESYQETRGFEKDDTLFAKIILSAYRQSDVSALLLGVCGRTLFELLRQAFLIPKKLTVDNPFFLTDKEGNFIAKKDDISNREQEKFQEIYQSDLHHSETTIFLVDDDDIIHSYEPDFSISTKRINKKRGILVLYSLPDTLKLGMTESEVYAFIWKTFLHIQEIIPSSRIFYGQETSENADELGVFLPIHHFEKKMLQNIEQVNELVDALREQMVNK >NZ_CP019622.1|WP_003721252.1|506690_507164_+|hypothetical-protein MKKKRVVIISLLLLLVSVIGISSYFLFKDKINLLDVDHSAVDWNGKKQKDTSGEENTIAIPGFEKVTLYANETKQAVNFHNPEINDCYFKISLIHPDGSVLWISDLIEPGKGMYSIELEKTLAVGEYENAVLKYECFSLNDQSPLNGSEINLKLVVV >NZ_CP019622.1|WP_003721253.1|507183_507669_+|hypothetical-protein MNKLVLSTLSVAAMGMVFFSGGTAYAADKEGNTVVEYSVEGDYTLVVPEKVNLSNDNATEMSVKTINRNLEPGKEVEVTLSSGLSADGEIELQRVGAISDVITSSFKSNNSVVPMANPVIGSFSGYAMEETEVSKIQIGNPQGDKKAGAYQTTLTFTAAFK >NZ_CP019622.1|WP_003727318.1|507696_508002_+|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein MKRKLVLAMVLISFCGMFFLSPDRVQASQTVVEVLISEDDLDVSEENIQEIPKKELAASSDKDNKQPILPKAGDTVTNYTLLGLVLVLIWLIMQRKRKKKE >NZ_CP019622.1|WP_003725199.1|508077_508344_+|hypothetical-protein MARIEYGEEIQKSLLVLYSRGSTIDSICKEYGIPRYEFHKWMKLHDADKLETKEVKTFLQIRELKQQKNKLEEEILFLNEAINLLESP >NZ_CP019622.1|WP_003733207.1|509456_510017_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MAESLITKKAIAGGLMELCQHKRFEKISIADITNICGLNRQTFYYHFTDKYDLLTWTYENDFFHCLADGITLGNWDKHVLKMLESIKENADFYKNTVSADASILSFCFSKLTNSLFMDLFEKIDTNGAVNEADRVFYAEFFSYGCSGVLIKWITRGFKEAPETIANQLFRLAKDTEFLANSMYREN >NZ_CP019622.1|WP_003728986.1|510126_511827_+|oleate-hydratase MKNKKRTLVALTGAAIGTGIAAKKISEQKAAEKERAVDEAIKARYYGDKQVYFVGGGIASLAGAVYLIRDANFDGKNIHIIEGMHILGGSNDGAGSVEHGFVCRGGRMLNEETYENFWDLFSSIPSLDMPNFSVTEEILNFDHLHPTHAQARLVDKDRNILDAHSMGFNNNDRMLMTKLLATPEEKLDNLTIRDWFDEHFFETNFWYMWQTTFAFQKWSSLFEFRRYMNRMMLEFSRIDTLEGVTRTPLNQYESLILPLKTFLDKHHVDFTINQTVEDIDFKDAPGITATALHLSDGSTIELGPDDDVIMTNACMTDSATLGDMNTPAPKPEEKPISGELWYKVAQKKPNLGNPEPFFGHEEETNWQSFTVTCHGDKLLKRIERFTGNIPGSGALMTFKDSNWLMSTVVAAQPHFKAQDANTTIFWGYGLYPDRVGDFVKKPMKECTGEEILYELMCHLNWQDDFEEIKADIINVIPCYMPYIDAQFEPRAMSDRPAVVPEGSTNFAMISQFVEIPKDMVFTEEYSVRAARIAVYTLLDIDKKICPVTPHNRDPKVLAKATQTMFR >NZ_CP019622.1|WP_070755989.1|511977_513081_+|23S-rRNA-(adenine(2503)-C(2))-methyltransferase-RlmN MEKSSIYGLTWTKLTEWLEAHGQKKFRATQVWDWLYRNRVKTFEEMSNVPKETIELLTANFVMNTLEEQVVQESTDGTTKYLFKLSDGNLIETVMMKQEYGLSVCVTTQVGCNIGCTFCASGLLKKSRDLTAGEIVEQIMNVQHYLDGRNLEERVSHVVVMGIGEPFDNYDNVMDFLRVINHDKGLAIGARHITVSTSGLAPRIIDFANEDFQVNLAISLHAPNNELRTSIMRINKTYSIEKLMEAIHYYVNKTNRRITFEYIMLKGVNDHKKEALELAALLGEHRHLAYVNLIPYNPVDEHIDYERSTKEDVLAFYDTLKKNGINCVIRREHGTDIDAACGQLRSKQIKRVGVRERMKQKQAAAEE >NZ_CP019622.1|WP_003725209.1|513170_513650_+|AraC-family-transcriptional-regulator MEVEIVERNAFTAVGKKRTFSVENDAQKEKISQFWQEANTNGDAERINELAEFATIDGILGVCKMNGDKMDYYIAIESELTPPADMEKLIIPASKWAIFKSVGPLPSAIQKVWEYIYGEWFQTSNYAHGNAPELEVYTEGDTTAADYYSEVWIPVVEKE >NZ_CP019622.1|WP_003721271.1|513807_514173_+|heme-oxygenase-IsdG MIIVTNTIKVEKGAAEHVIRQFTGANGDGHPTKDIAEVEGFLGFELWHSKPEDKDYEEVVVTSKWESEEAQRNWVKSDSFKKAHGRTKDTREQREDRKGIVGNAIARFEVVHVQNPVIVEK >NZ_CP019622.1|WP_003731249.1|514446_516210_+|RNA-directed-DNA-polymerase MRKKVDVLSMDNEKAREFFMKPSSYFSQNLPKYFNLGYLLESAESKLGKKQLKKEMYFENKVYSNFPNVNFLIQTNKTISTYRPITLLHPYIYVDYVNFLTEIKIWEELKERFQNLQEEVKEKIICSSLPFDIETSKEDDSKKEMALNFWKSIEQETIKYSLGYNYLLKLDISNFYGSIYTHTLCWAFHGENYSKEAKNSKNLQNLTGDKCDRKFQWMNYGETVGIPQGNVISDLMSELLLAYIDSELVKKIDDEIDYKIIRYRDDYRIFTKRLEDSTLVKRELVVLLQRFKLNLGESKTSQTTDIISGSLKEDKMYWIEHDPVTKLTSDKFYRSPKILMKKSLEEHKNKKYKTRVFNEFFKKHFHNRTYQATLQKHLLIIKVFSDLYPNSGQLIAALHEFEGRLLDLNYKDFRNIGTEVEVLIAILVDIIKKNPKITEIGVKLLSTLLKKINFEEFEMKYLESNNSNEVQSDFEVKLAYINSVNHKLSNSNYNDYLEIWMQRLVVKNLKESTTLSDLYIEQSKNELVKFCNSIIRGKEMIQIFNEDWLKDEHKIELSKFINLNEIDKLTDIISDDEIYLAEYNQMT |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP019622_2 | 505540-505797 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019622_2
|
3 spacers
spacers of NZ_CP019622_2
>2.1|505564|54|NZ_CP019622|CRISPRCasFinder TATGGCATGTTTCAATTTTGCTCTGGTCTTGAAGAGTTAGATTTAAGTCATTTT >2.2|505642|54|NZ_CP019622|CRISPRCasFinder TATTCCATGTTTTCGGGTTGTGGATCACTGGAGATTTTGGATGTAAGCAATTGG >2.3|505720|54|NZ_CP019622|CRISPRCasFinder AATAGAATGTTTCAAAATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTAGATTTAAGTACCTTT |
RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019622_2
The CRISPR arrays of NZ_CP019622_2 >merge|NZ_CP019622|2|505540-505797|CRISPRCasFinder GATACGAGTGCTATAACTAATATATATGGCATGTTTCAATTTTGCTCTGGTCTTGAAGAGTTAGATTTAAGTCATTTTGATACCAGTTCCGTTACTAATATGTATTCCATGTTTTCGGGTTGTGGATCACTGGAGATTTTGGATGTAAGCAATTGGGATACGAGTTCCGTTACTAATATGAATAGAATGTTTCAAAATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTAGATTTAAGTACCTTTGATACCAGTTCAATGACTGACATG >NZ_CP019622|2|1|505540-505797|CRISPRCasFinder GATACGAGTGCTATAACTAATATA TATGGCATGTTTCAATTTTGCTCTGGTCTTGAAGAGTTAGATTTAAGTCATTTT GATACCAGTTCCGTTACTAATATG TATTCCATGTTTTCGGGTTGTGGATCACTGGAGATTTTGGATGTAAGCAATTGG GATACGAGTTCCGTTACTAATATG AATAGAATGTTTCAAAATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTAGATTTAAGTACCTTT GATACCAGTTCAATGACTGACATG
>NZ_CP019622.1|WP_023550315.1|502662_504732_+|BspA-family-leucine-rich-repeat-surface-protein MKKLSIRVILIVTIIFIACGSANVSIAQERDIINKLPEVELGSLYTSNLITEEVAQDKPAEVENLEQAPTTDDLVQNPDVLEQPIADSDDSDLTVVNSGDFWTIYRNTVNGEYSLHMFGNVPSSKPTAWNSYLNRIKHIEIEEATLTGNFSSYFRNNVFTVLESVRIERSNLSRVTSFALAFYGSGIEKVIIRDNNYPTAPSLLTTEGMFKNCSNLMEVDLSGLDTSAVTTMWDMFNSCRALEELDVSNFDTSSVTNMSYMFYDNRNLEVLDVSNLDTGSVTNMYAMFEDCTSLEELDVSNFDTSSVTDMYRVFNGCEKLKKLDVSNFDTSSATAMVQMFRNCSALEKLDVSNFNTSLVTDMRAMFAGCTSLEALDVSNFDTSSVTNMAAMFSDNEKLEKLDLSTFDTSSVTNMGTMFKNCTALKSLFLDNFTHAASSTDMFTGTTSLSYLFVSHNVSNFNGLENTNWYDEKNWLQFSNLSQLQTYHRKQSEPTGYRKGEFLSLTMDAMGGQFEDAEEQKVQSKISGEYWEEVIPVKEGHYFDGWYLDQNFTNKFDFSLPATVSATLYAKWVENYTVVIPASISLNEATELKVEGINRGSKTLSVGLNYEETTISESNKLTLSNTADTTVQCLAPLSWDGSETNPKNAILTLAPGSEITEGDAVMEIESPENIQAGTYTGNLVFSINYE >NZ_CP019622.1|WP_023550313.1|500445_502527_+|BspA-family-leucine-rich-repeat-surface-protein MKKFSMRVVLIISVLFIALGNANVSIAQERDTTNKLPEEELGSLDTSNLIAEEVAQEKPAEVENLEEIPTTDELMQNPEVREQPVADSDDPDLTAVSSGDYWTIYYNSANDEYSLRMFGNVPSSKPSAWNSYLKYIKHIEIEEATLTGDFSSYFRSNVFTVLESVRIERSNLSGVTSFARAFEGDSESESPLEKVIIRDNYYQETPSLTNISRMFTLCRKLSELDVSGLNTSSVTKMDTIFSNANSLKELDVSHFDTSSVTDMSSMFAACNSLEELDVSNFDTSSVTNMKYMLSGLHLKKLDVSNFDTSSVTNMYGMFAYCYNLEELDVSNFDTSSVNNMLHMFYVCNNLEELDLSNFDTSSVTNMFAMFAYCTSLKEIDVSNFDTSSVTTMSAMFFECSSLEALDLSNFDTSSVTTMASMFENSTALKSLYLDNFTDAASMTDMFKGTTSLTYLFVSHNLSTFNRLENTSWYDEKNWVQFSNLSQLQTYHRKQSEPTGYRKGAFLSLTMDAMGGEFEDAEEQKVQNKVSGEYWEEIVPVKEDYYFDGWYLDQNFTNKFDFSLPAAVSTTIYAKWVENYTVIIPASISLNEATELKVEGINRGSKALSVGLNRLATSVSESNELTLANTADTTVQCSAPLSWDGSENNPEKAILTLAPGSEITEGDAVMAIEAPENIQAGKYTGNLVFSINYE >NZ_CP019622.1|WP_023550311.1|498643_500182_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MREYLDSKSQKKVALLEKIFYAENHTSTQEELLNDLNITYPTLISTIKTINFDIERFGYKAFSIVHSAPNLSYTLKISDNCSIQLIINAYIRESPKFQILETLLLASFPNLQALAKKVHVSYSGIKKEIKELNEELRERNLSISTGNQVEITGDEFSLRIFYAFLFLVAYSGDRWPFSFVQYDEITDILESCPKEIYRANSIDKAMMIHYYVAMHLLRDRMNCQIDTTRQFKVALYKACTEESKKSESAFIKKVAKQLPNRNYKEMTYTTQIILSTIVAFGSYSSIEKMPSFFYMDEQLEEMGFMKLVDFASEQVNDNLSIPFSEKEMELLRYSFASINYRYFLLDNLINKFNNIVPGYTNLDRNIRKIHKVNHLEPLISQLVNLKEMDPLKPFEERLASDYLIILDKRIDFSIHTLPIKVTILSTISNETAVFDFMRYFSSYYNLEIINQVDPVVDLYISDFSVSPEVLTSLRINQPIIYVNTRWLESDYVKINDNLAKIARKKFIANKKN >NZ_CP019622.1|WP_003728092.1|496459_498010_+|hydantoinase/oxoprolinase-family-protein MYKIGIDVGGTNTDAVILDENQQLIHSVKMPTSEDIETGITESLHRVLSETGIDRSKVTHAMLGTTQCTNAIVERKKLAKVGVLRLGYPATASVLPYTAWPEDMVGFLSGKYKLTGGGYEYDGQVLSEINEAEIRETLASWKGEVESVAVVGVFSSLKNDQELAVQKIIEEELGADIPVSISSSVGSVGLIERENATILNAALFKVIAATSDGFEKALEQEGIAHAEIYLCQNDGTLMSLNYARQFPILTIACGPTNSIRGASYLAGLKDAMVLDVGGTTSDIGVLTDGFPRESSLAVDVGGVRTNFRMPDIISIGLGGGSIVREKDGDITIGPDSVGYRISEEALVFGGKTMTTTDIAVRLGRAEIGNPELVAHIPTDFAEKAYKKIAEMTEDAIDKMKTSSGSVSLVLVGGGSVIIPDEISGVAQIFRDKNGPVANAIGASISQISGQYEQIYIYSQIEREEALQDAEQKAREQATLAGAVTDSIEVVEVEEIPLAYHPGNATRLRVKVVGNLV >NZ_CP019622.1|WP_003728093.1|495366_496467_+|DUF917-domain-containing-protein MRYLDEQAIENIAIGAAFLGTGGGGDPYIGKMMALTAIKKHGPIKLLSPEEIADDDYFIPAAMMGAPSVLIEKFPKGDEFVRVFEKLGRYVGKEVKGTFPMEAGGVNSMIPIVVAAQLGLPMVDCDGMGRAFPELQMVTFHLDGISATPMAITDEKGNIGIMETIDNKWTERLARVTTVEMGASSLVSLYPCNGAQIKQSSIKNIVTLSEEIGKVIRETSMDEAEKLQKLLDVTHGYHLFEGKITDVVRETRAGFNFGRVKIDGLNKDTGSEVIVHFQNENLVAEKNGEPIAITPDLICMVDLETLMPVTTEALKYGKRVRVMALPADDAWRTDKGIETVGPRYFGYDVDFEPLEELVKKEERRHV >NZ_CP019622.1|WP_003725189.1|494082_495366_+|cytosine-permease MTEKKSVEQTQSWQSLAFVWTGAMICVPSLLVGGTLISGMPLWEAILIALLGYGVIVLFMIYQGMQSSDLGIPAVSVASQVFGEQGSKKIISILLAIACLGWFGIQANVCGAAFSQFLGIYGINLPVPVSSLIWGVIMLLSAIYGIRILSILNYIAVPVLLFVCIYGLVVSLNDGGLAIVENYKPAGSMSFMTGLAITIGSFALGAVIAGDYSQYTKSRKDVVKAAIVGILPSGVLMITVGAVLALTAGTADISVVFTNLGLPVLGIIGLILAAWTTNAVNAFSGGIAIINVFNISEKYHKVAVAVAGGLGTILAVIGILNHFVPIMSVLSAMVPPVAGVMIASYWIVQKGDKSKWAPVPGVNWLGVSSWLVGAVIAGIPVILTFFPELPQLPNQPLIGIILSLAVYLIGAKVLSGKTNNVENLEGK >NZ_CP019622.1|WP_003740428.1|492352_493948_+|PucR-family-transcriptional-regulator MSVKLADLMKLPSLKEAKVVSGKSGLSKLVSSISVLEYTEVALLEDDLFDNDEFYGSEIVVSAFVNIRDDVEAQCRTIERLHKVGEVALILYYVGIFVPKMDQKLIDFANELDFTIIVMPENEMSLRYSEVIYEVVEAIVKQEMTDTNFVTESLEQISSVRPPQRNIDTTLKILSDRTHTSLVLTDNSFQVINSITWPRTRHWDFERIIEASKQIGEHELVQLTLDERDFYTARKPIFQDGMQAMHLFMMKEKGVLTADVVMQITEVVQVFMNLWGRNYVEISTAELMKAILNDESVKMRRLGKILNVDVSSIKWMWLVKTEEIRDNEQVLAELKSFVASHFQVSLIDLFEDNIVVLLDNSVAQRDRTHTANEFAMMMKEHGIDLKITVCQGMEQTSDVQSAYSLVNEYKNAANAIYANKSIYSLQEIDFAAKCVEIVDRGELAIAEQMRPLKPLEDNDELIETLSVFLLEGESNYNQAAELLFLHKNTIKYRIQRINELLQYPATKIPESYNLYLAVAIRRILGGNNNNK >NZ_CP019622.1|WP_003721242.1|491249_492197_-|MoxR-family-ATPase MSIEPSIKIEEIINEVEKVIVGKRHVVKLSLTALLAGGHVLLEDVPGVGKTMMVRTLSKTIGVSFKRIQFTPDLLPADVTGVSIFNPETRDFEFRPGPVMGNIVLADEINRTAPRTQAALLEGMAENSVTVDGITRKLANPFFVMATQNPIEYEGTYALPEAQLDRFLLKINIGYPTVEEEMQLLTLKQYQDPLDQTQQVVTLSELLDLKNKAKQVFIDDVLKNYIIRLVDATRKHPSVALGISPRGSLAFMQAAQAFALIEGRDYVIPDDIQYLAPYIFTHRLILKSEAYYNEETAESIIASILKNTSVPVEKR >NZ_CP019622.1|WP_009929138.1|490096_491245_-|DUF58-domain-containing-protein MLKKRLLLAFRWIIMLIIYAGLWTYTLFQGDTASWFLTYFFSFILLLLFLSSIYPLKAWKVNRRFVKNTYHDGDLIDMQVSFTRKSRYPVGYLLFQQKIPASFGNVSARQQVVYPLFKKHFTVTLAGFVGVRGIHSFPPVDVETSDAFGLLERSRQLSSEKSLTIYPTYFPDVLEKISEASPENERNAAYWTLKKNSNLHSLREFSSGDRISLIDWKSSAKSDQLMTREFENSATSRLSVIFYGASHPNFELSLRAAYSFIRKISEDNGEIRVTLLGDQTSKFAPAKGTSRLQDISTAFAEIAPVDSLTLQESLDSNLHSGEKILLFTPCIDTMLMQKVTRLTDNKQLQIITFQSEHSKAMDAPAIFLEPASLLSRWEREAK >NZ_CP019622.1|WP_003725186.1|487940_490100_-|transglutaminase MKRYLTLVMLFILSVLLISEWIYPFAELTELSTANWIILFITLSLGSFFLRLKYYWTIPLHIVMIIFVSGIYYAKGGILAGNWFVSFFQITFNGFRDMVQFRSSDISMDFILIVFLIALWLLSYITTYSILRKQRVMSVLVLTVAYLAVINTFTDYNSNWAIVRTVLEGFLLLHLALASRIAAPNRISADSLKRNGLFYHIFVILLLAVFVFSSLMLPKKAPIFPDPVPTIKNALGINTTRTVGYSEDDTTLGGALKKDNATVFTARAEKGHYWRVESKTVYTGTGWANANSADVISFSSGDNFPIQLTEQTTGATNTAEISFASSNDYMPYPYGTQTVNGAVDSFSANLTIERVGPVDTIKNYTVQLKTPVYNIEKMQNADFSTLSNAFVSQYTQTPKDLPDRVTKLANKVTKDADSIYDKTKAIERYLSASGTFTYSTEDAKETPRGADYVDQFLFETQIGYCDNFSTSMVVMLRSLGIPARWAKGYTPGEGEKKENDAKTTYTITNNNAHSWPEVFFPGTGWVPFEPTATFSNPENFQEPTTETANKPETPNDSTSTPETPNTADKTPEQDNGSSSTGETPKKEEPKTETAASNFEIPSWVWWIPAGLVVTLLALAIIFRRRIRRYLLLRSLRNSPEFGKTYHRLMKLLASYGYVRESSETLRHFSTRVDAELTTTEFSRLTKMYEAQIYSNNLTEKVITAEETQLVQQVIARLTK >NZ_CP019622.1|WP_003721252.1|506690_507164_+|hypothetical-protein MKKKRVVIISLLLLLVSVIGISSYFLFKDKINLLDVDHSAVDWNGKKQKDTSGEENTIAIPGFEKVTLYANETKQAVNFHNPEINDCYFKISLIHPDGSVLWISDLIEPGKGMYSIELEKTLAVGEYENAVLKYECFSLNDQSPLNGSEINLKLVVV >NZ_CP019622.1|WP_003721253.1|507183_507669_+|hypothetical-protein MNKLVLSTLSVAAMGMVFFSGGTAYAADKEGNTVVEYSVEGDYTLVVPEKVNLSNDNATEMSVKTINRNLEPGKEVEVTLSSGLSADGEIELQRVGAISDVITSSFKSNNSVVPMANPVIGSFSGYAMEETEVSKIQIGNPQGDKKAGAYQTTLTFTAAFK >NZ_CP019622.1|WP_003727318.1|507696_508002_+|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein MKRKLVLAMVLISFCGMFFLSPDRVQASQTVVEVLISEDDLDVSEENIQEIPKKELAASSDKDNKQPILPKAGDTVTNYTLLGLVLVLIWLIMQRKRKKKE >NZ_CP019622.1|WP_003725199.1|508077_508344_+|hypothetical-protein MARIEYGEEIQKSLLVLYSRGSTIDSICKEYGIPRYEFHKWMKLHDADKLETKEVKTFLQIRELKQQKNKLEEEILFLNEAINLLESP >NZ_CP019622.1|WP_003733207.1|509456_510017_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MAESLITKKAIAGGLMELCQHKRFEKISIADITNICGLNRQTFYYHFTDKYDLLTWTYENDFFHCLADGITLGNWDKHVLKMLESIKENADFYKNTVSADASILSFCFSKLTNSLFMDLFEKIDTNGAVNEADRVFYAEFFSYGCSGVLIKWITRGFKEAPETIANQLFRLAKDTEFLANSMYREN >NZ_CP019622.1|WP_003728986.1|510126_511827_+|oleate-hydratase MKNKKRTLVALTGAAIGTGIAAKKISEQKAAEKERAVDEAIKARYYGDKQVYFVGGGIASLAGAVYLIRDANFDGKNIHIIEGMHILGGSNDGAGSVEHGFVCRGGRMLNEETYENFWDLFSSIPSLDMPNFSVTEEILNFDHLHPTHAQARLVDKDRNILDAHSMGFNNNDRMLMTKLLATPEEKLDNLTIRDWFDEHFFETNFWYMWQTTFAFQKWSSLFEFRRYMNRMMLEFSRIDTLEGVTRTPLNQYESLILPLKTFLDKHHVDFTINQTVEDIDFKDAPGITATALHLSDGSTIELGPDDDVIMTNACMTDSATLGDMNTPAPKPEEKPISGELWYKVAQKKPNLGNPEPFFGHEEETNWQSFTVTCHGDKLLKRIERFTGNIPGSGALMTFKDSNWLMSTVVAAQPHFKAQDANTTIFWGYGLYPDRVGDFVKKPMKECTGEEILYELMCHLNWQDDFEEIKADIINVIPCYMPYIDAQFEPRAMSDRPAVVPEGSTNFAMISQFVEIPKDMVFTEEYSVRAARIAVYTLLDIDKKICPVTPHNRDPKVLAKATQTMFR >NZ_CP019622.1|WP_070755989.1|511977_513081_+|23S-rRNA-(adenine(2503)-C(2))-methyltransferase-RlmN MEKSSIYGLTWTKLTEWLEAHGQKKFRATQVWDWLYRNRVKTFEEMSNVPKETIELLTANFVMNTLEEQVVQESTDGTTKYLFKLSDGNLIETVMMKQEYGLSVCVTTQVGCNIGCTFCASGLLKKSRDLTAGEIVEQIMNVQHYLDGRNLEERVSHVVVMGIGEPFDNYDNVMDFLRVINHDKGLAIGARHITVSTSGLAPRIIDFANEDFQVNLAISLHAPNNELRTSIMRINKTYSIEKLMEAIHYYVNKTNRRITFEYIMLKGVNDHKKEALELAALLGEHRHLAYVNLIPYNPVDEHIDYERSTKEDVLAFYDTLKKNGINCVIRREHGTDIDAACGQLRSKQIKRVGVRERMKQKQAAAEE >NZ_CP019622.1|WP_003725209.1|513170_513650_+|AraC-family-transcriptional-regulator MEVEIVERNAFTAVGKKRTFSVENDAQKEKISQFWQEANTNGDAERINELAEFATIDGILGVCKMNGDKMDYYIAIESELTPPADMEKLIIPASKWAIFKSVGPLPSAIQKVWEYIYGEWFQTSNYAHGNAPELEVYTEGDTTAADYYSEVWIPVVEKE >NZ_CP019622.1|WP_003721271.1|513807_514173_+|heme-oxygenase-IsdG MIIVTNTIKVEKGAAEHVIRQFTGANGDGHPTKDIAEVEGFLGFELWHSKPEDKDYEEVVVTSKWESEEAQRNWVKSDSFKKAHGRTKDTREQREDRKGIVGNAIARFEVVHVQNPVIVEK >NZ_CP019622.1|WP_003731249.1|514446_516210_+|RNA-directed-DNA-polymerase MRKKVDVLSMDNEKAREFFMKPSSYFSQNLPKYFNLGYLLESAESKLGKKQLKKEMYFENKVYSNFPNVNFLIQTNKTISTYRPITLLHPYIYVDYVNFLTEIKIWEELKERFQNLQEEVKEKIICSSLPFDIETSKEDDSKKEMALNFWKSIEQETIKYSLGYNYLLKLDISNFYGSIYTHTLCWAFHGENYSKEAKNSKNLQNLTGDKCDRKFQWMNYGETVGIPQGNVISDLMSELLLAYIDSELVKKIDDEIDYKIIRYRDDYRIFTKRLEDSTLVKRELVVLLQRFKLNLGESKTSQTTDIISGSLKEDKMYWIEHDPVTKLTSDKFYRSPKILMKKSLEEHKNKKYKTRVFNEFFKKHFHNRTYQATLQKHLLIIKVFSDLYPNSGQLIAALHEFEGRLLDLNYKDFRNIGTEVEVLIAILVDIIKKNPKITEIGVKLLSTLLKKINFEEFEMKYLESNNSNEVQSDFEVKLAYINSVNHKLSNSNYNDYLEIWMQRLVVKNLKESTTLSDLYIEQSKNELVKFCNSIIRGKEMIQIFNEDWLKDEHKIELSKFINLNEIDKLTDIISDDEIYLAEYNQMT |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
121081 : 127608
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019622|121081:127608|DBSCAN-SWA TTCAAAACTTCTTGTAAACATCAATGGAATTGCCAAAATTAATGAAATATCCACCATAATCATACATCGGACCATATTTTTCTGCGTAATGAGTAACTGTATGGCGCAAAAATTCTTCTGTTACCTCTAAAAACTCCGCTACTTCAAAATATTCTCGTAAGCCTAGATAAAAACAAGCAATGATGTCATCAAGCGGTATTAGTTCCTCATAACCTTTACGACGAGCAAAAATTTCTTGTTTTTTATCCATAATTGTTTCCTGTTTAGTGATGTTACCTACAGTGTATTTGTAATGCATCAATTCTTCTACTAAAACACAGCCTTTTTCAATGGAAGATTGATCCTTACTAATAAAAATCGTCCCATTTAAATAAAGACCTGGCAATTTGTAAGGCATTTTTTCTTCTCTGATTGTTACCTCATCTTGGTATTTATTTACCAATTTTTCGTACAATAAAATCACATCCCGCGATGGAGTTTTTTCTTCATCTCTATATAAGCTAAAATATCCCGCATTTCTTCCTCGGTTACGTCATCATCAATATGGGCTGCAATTGTTACCAAGCGTTCATCAACAGGTGGTAAATTTCTTTCAGGAAAAAAGTCATCTAATCGTTTGTTGAAAATTTTTGCAAGTTCAAATAAAACGTCTTGATTTGCTTTTCGATCACCATTTTCATAACGGCTAATAGTTTGGCGAGTTGTATGAAGCTTTTCTGCTAATGCTTCTTGATTTAAGCCTCGTTCCTCGCGATATTGTTTTATTTTATTTCCTACAAATTTATTTAACTCCATAATAATTGCCCTCCACATGTTTATGGCTTCAGTATAGCACTTTTAGCACCAAAACGGAACTTTTTCGAACATATTTGTCGGATAAAGTTTACCAGTAACCAAAATGGTGCTATAATATTTGTAGAGCTAGAAAATAAATGCGGCTGATTTCGCGCCAATAGCACCGAATTGGTGACGATGTTACTATATTAATTTATGAGATGGAAGTGGGAATGGATGGATAGAAAACTTTTAAAAGAAAAGCAAATCCAACTAATTTTTCAACTAGAACAAGAAGAAAATCGATTTATTCGAAAGCGTTTAATAGAAGAGTTGGAGTTTTTTGAAGCGCTTGGGGACAGAGAAAAAGGACTGTTAACGGCGGAGCAAAAGTTGCTTATTTTAACACCAAGTGAGTACCGAGAATACAAACGAACTAAATCAGATGTGCAAATTAGTAGGTTAATTGGAGTATCGAGATCGTCTCTTGCGGAATGGAAGCGAAAAAAAGGTTTAAATAGAAAAAAGCCGCAACCGGTTCAGCAGGAAATGATTGATGTATTAGCTTTTCATTTAGATAAAACAAAAGACGAAACTGGCGCTTTACCTGCTTCGGCGATTGAATGTCAGTATGAGGCTTTTGTGATTAATGAAGCGCACAATTAAGGAGTGATAACATGCAGGTTTTAGTTTTACCAGAAAATAAGGATATCAATTATATAAAAACGGTCCAAGAAGTAAAACGATTTTTTGCTGATTTTGAGCGGTTTCGGATGATTACGGGGTTATCAAAAAAGCCACAGTTACTTAGAAATGGTTTTCTGGAAGAGCCGCAGTTTGCGCCGGTAGCATTTTCTGCTAGATATAATAAAGAGGTCATTTTGGAAGCGCGATGGTTGGTAGAGAAATATACTGAAATGTTAAATCAGATGGATGATTTATATCGCACTATTTTGATGGAATGTTACGTGGAACGAAAACAAGATGTGGCGGTAATGATGGATTTACCGTACGAAATTGCCCAGTTTAAACGGATAAAAAAACGAGCAGTATTAGAAATCGCAACGCTAATGGGAATTTTAGTAAGGAAATGATGATACTTTCGTGATATTTTGAAACGTCATTTTACGATTAATATAGAAGTAAGCTAATTGTCCAGTAAGCGGATGACAATAAAAGCTGCATCAGAATGAAGGTGCACCGATTTTCTGATAATACAAGAGGTTGTACAAGAAATTTGTTTTTATGATTGGATTTTTCATCCGTTGACATAAACAAATATTCTATTTTGGAAAGTAAAGTTCGGAGGAATAAATTATCAAATGTGGTCTCGACCGAATTTTACTTTCTGTTTTTAAAGGAGTGAACGCTTGGTGAAGAGTTTAAGCTTCATGAGAGTTTTGGAAGCAGTGAGAACAATGCTCCAGGAAAAAGGCGGACTAGATGTTTCTATTGTAATGCGTGACCAAGTGGAAATGCCTACAACGATGATCGAGATGATTGATCAAGAGGAAGAAGAAAGCCAAACTGCCTGGAAAGAAAAATACCGTTTTGCAATCCATCATTATACAAATGAAACGGACTTAGCGGGAGTCGAAATGATAGATACGCTTATCCAAACAGGGTTCACTTTGCCTGAAGGATACAAATTAATCGCTGTTCGACATTACGGAAAACAAAATTTAGTCAAAGAAAATACGTTAATTCACGCAAAAACCAGTTTTGAAGTAAGTATTTGTCGTGAATTAAAAGTAAAAATTTAGGGGGAAATATTAATGGCATTTGAAGAGAATTTATATTGTGATTATACACCGGGAGCTGCTAAAGCGGTCGCGGGGAAAGATGTAATTTTAGCAGTTTTTAACGCAGCGGGGGATAAGCTATTAGCGGTTGCGGGGCAACAAGGTCTAACTGTAAACCGTTCTAAAGATAGCATTGAAATTACATCTAAAGATACAGTTGGCGGATGGAAATCCAAAATTGGCGGTATGAAAGAATGGTCAATTGAAAATGACGGATTATATGTCGCTGATGCAGAGTCTCACAAAGAATTGGCGAAATATTTCGAAAGTGATAGCCCGGTTTGCGTGAAAATCATTAATCAAGCATCTAAAAAAGGTCTTTTCGGTGGTTTGGCAATTGTAGCTGACTATAGTTTTGAAGCACCTTTTGATGAAGCGATGACTTACTCTGTAAAACTAGACGGAATGGGTGCGCTTGTTGATTTAACGATTACTGAGGGCGGAGATCAAATGCCCGGCGAAACACCTGTAGCACCAGCAGAATAAAATAGAGAGCCACTGAAATAAGTGGCTTTCCCTTAGGAGGAAAATAAATGTTTGAAGTGAATGATACAACTTATATTTTACGATTTAATAAACAAAAAGTTAAAACGGTGGAATTAACATCAGGGATTAGTTTAGTTGCAGCTTTGACTGCGAATAAAGGGATTTTGAGCTACCAAGTGATTGAAACGCTATTTGTTTCAGGACTTGTGGAAGAAAAAGGCTTAGTACCTGTAAAACAAAAAGAAGCTTTGGAGATTTTCGACAAATTAGTAGAAGAACAAGGCTTAATTTCGCTTAATGTAGCTGTTATTGAGAAATTGCAAGAGGATATGGGTTTTTTGTTCCGTTAAAACAGATTGAATTTGAGTATTTTGGTGCTGAGGACGAAGAAGTGGATAGTGAAATGAACCATGATTTTGATTTGGAAAAACAATTCGCTTTTTTTGTAGTTAATTTTCAGATGTCCAAGCATGATTTTGAAGAACTTACTGAAGTGGAGAAAAATTTCATCATGAAAGAATGGGAAAACAAGGTGATTTTTGAATCTACTATGCTTCGAAATGCAGTTTTAAATGCGGAACAAAATCTCAATCGAAAACGAAATTCACGTTTTATCGACTTGCATAAAAAACGTCAGAAGAAAGCCGATGTTAATTATACAGTAAATGCACTTCAAGCAATTTCCGATAATGAAGCGAAGGAAGGTAAAGCGTGGATTGATCGGATTTATGGTGCAAATGGGTTACGAAGACCTAAGAATAAAGAAGAAAGGGGGAAAGTGAATGGCGGATTCTAAAAGTTTTACATTTGAACTGAACGAGAGCGTTTTAACAGCGCAAGTTGGCAGGCTAGATGAGATGGCGATGGTTGTAGAGCGGCGGTTTTCAGAGCTCAAAATGACTATTGAAGATGTTGGAAATGCTGATCCAGGTTCGAAAATTTCCGAATCTTTAGGTGGGCTGCAGTCTGGGCTTGGCACGATTAGTTCGGCGTTTGGACAACTGGGTTCTAGTAGTGAGGCGATTACATCCGGATTCGGTACTGCGGTTGGTTCTGTTGGTGGAATCACGGATGCGTTTAAAAATCTAGGTTCAAGTGTGCAAAATGGTACGTTATTTTCAAGCTTGGCAACCGGGATTGGTGGCATGAGTACAATGCTTGGTGGAGTATCTGGCGGCGTTCAAGGAATTACAAATCTAGCTAGTGGATTTATGGAATTGAAGAAGCATCTAGGCGGTTTGATGTCATCTATTGGTGGCGTTGGTGGAATTATGGGTAAACTGACCTCTCCAATGGGGTTAGTAATTATCGGGATTGTAGCGTTAGTAGCTGCATTTGCGTATTTGATGACGACGAATGAATCATTCCGAAATACGGTGATGTCAGTTGTAACACAGGTTGCGCAACTGTTCGGTCAACTTGTCGCCAGTTTAATGCCGATTATCATGCAAATTGTTACTGCGGTTATGCAAATTGGTGCCGCGTTAATGCCGATGGTTATGCAATTTATTAGCTTTTTTGCGCAATTGTTAGCCCAATTAATGCCGTTTATTAATATGCTGATTTCCATGCTTATGCCTGTTATTATGCAGATTGTTCAAGTTGTTATGTCACTTGTTTCGGCACTATTACCGAGCATCATGACAGTGATTCAAGGCATTATGAGCGTTATTCAATTTTTAATTCCGATAATCATGCAAATTGCGACGGTGGTTGTACAAATTGTTGTAACGATTATTTCTTATATAAGTAAAATTATGCCGATTGTTATGACGATTATTGGCGTTATTGTTTCGATTATCACAACGATTATTAGTTACGTCGTTATTATTGCGACGACGATTGCTAGTGTTATTGGGAAAATTATTAGCTTTATTGCGAGTGTTATTACGGCGGTTATCGGGATTGTGGAACCAATTATTGGCTTTATTACTAATATCTTTACGATTATCGTGACGATTATTGGTGCAGCTTTCCAAATGGTATTTACTGTTGCATCCAAAATCTGGAATGCCATTATGACGACGATTTCCGGAATTATTGAAGGAATCAAAGCAGTCATCACAGGTATTTCTACTACGGTTTCATCAGTGTTTAACGGAGTGAAGCGCATTATTACAGGTGTTTTTGACGGAATCAAAAGTGCTTGGGGTGGTTTAACTGATTTTGTGGGAAATATTTTCGATGGTGTTTCAAGTGCAATTCAAACCGTGGTAGATAATGTCAAAGGTTTTGTAAACGTCGTAATTCGAGGGATTAATGGAGCCATTGGTTTAATTAATAAGATTCCAGGCGTTGAAATCGGCAAAATACCACAATTAATTTCCGGTACAACAAGTTTCCAAGGTGGCTTTGCTCGAATGAATGAAGGCGGCCGAGGCGAAATGGTGGTTTTACCGTCGGGTTCGCAAGTAATTCCGCACGATGCAACGATGAAATACGCAAGGGAAAGTGCGCGCGGAAATAAATCAATGCTTTACACGAGTCAAGGCGCTGATTTGGCTAGAGTTGAAAATCTTCTCGAGCGCTTACTACAAAAAAATCCTGTAATCAAAATGGATGACAAAGTGGTAGCCGAGGTAGTTAGCCGTAACCAAGCTAACTCATTTGATCAGTACAATTACACAATGGGAGGTGCAGCTTATTCATGAGCGACTTGTTTTTAGAATTAAATGGAAAAGTGCATTCGCTTAGTGAGACATTTCCAGGTCTTTCTGTACAAGAAGTTTCCAGACAAAGTCCCCAGTTAAGCATGGAAACTGCTGAAATCGCTGGGACTGATGGGGTTATCCCGGGAATGACCCAATTTAAACCGTTTATCTTTTCAGCAAAATGTAATTTGCAAGCACTTGATATTCCAGATTATCATTTGGCAGTCAGAGAAATTTATGAATTTTTATTCCAGCGCGATAGTTATTATATTTGGAGCGATCAAATGCCAGGAATTCGGTATGAGGTGCATCCTAAACCAGTTGATTTTAGTCGAGAATCGGATCGTGTTGGTTTACTCACTATAGAATTTGATGTATTTAAAGGCTATGCGGAGTCACGTGGCACGAGCCTTGACCCTATGACTTTTGAAGTGGATTTATGGCAAATGGGAATGAATTTATCGAACCGTGATGATTTATTTTATATTTTTAAAGAAAATACATTTCGGGTCTATAATGCGGGGAGCGACCGTGTTAATCCACTGATGCGACATGAATTAGATATTGCGATGACGGCGAATGGGACACCAACGATTCATAATCTTACAACGGGAGAATCCTTCGAGTATCGGAAAGAGCTCCAAAAAACAGATGTTTTACTGTTGAACAATATTTATCCACTTGTTAATAACCGCCGTGTTGGAAAAGATACCAATCATGGGATTATCACCCTTGAAAAAGGCTGGAACGATTTTGAAATCAAAGGTGTAACGGATGTAACGATTGCTTTTAATTTTCCGTTCATTTATCGGTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019622|121081:127608|121539_121875_-|WP_003721740.1|DBSCAN-SWA MELNKFVGNKIKQYREERGLNQEALAEKLHTTRQTISRYENGDRKANQDVLFELAKIFNKRLDDFFPERNLPPVDERLVTIAAHIDDDVTEEEMRDILAYIEMKKKLHRGM >NZ_CP019622|121081:127608|124189_124492_+|WP_003721745.1|DBSCAN-SWA MFEVNDTTYILRFNKQKVKTVELTSGISLVAALTANKGILSYQVIETLFVSGLVEEKGLVPVKQKEALEIFDKLVEEQGLISLNVAVIEKLQEDMGFLFR >NZ_CP019622|121081:127608|123227_123617_+|WP_003728212.1|DBSCAN-SWA MKSLSFMRVLEAVRTMLQEKGGLDVSIVMRDQVEMPTTMIEMIDQEEEESQTAWKEKYRFAIHHYTNETDLAGVEMIDTLIQTGFTLPEGYKLIAVRHYGKQNLVKENTLIHAKTSFEVSICRELKVKI >NZ_CP019622|121081:127608|124533_124938_+|WP_003740367.1|DBSCAN-SWA MDSEMNHDFDLEKQFAFFVVNFQMSKHDFEELTEVEKNFIMKEWENKVIFESTMLRNAVLNAEQNLNRKRNSRFIDLHKKRQKKADVNYTVNALQAISDNEAKEGKAWIDRIYGANGLRRPKNKEERGKVNGGF >NZ_CP019622|121081:127608|126789_127608_+|WP_003734720.1|tail|DBSCAN-SWA MSDLFLELNGKVHSLSETFPGLSVQEVSRQSPQLSMETAEIAGTDGVIPGMTQFKPFIFSAKCNLQALDIPDYHLAVREIYEFLFQRDSYYIWSDQMPGIRYEVHPKPVDFSRESDRVGLLTIEFDVFKGYAESRGTSLDPMTFEVDLWQMGMNLSNRDDLFYIFKENTFRVYNAGSDRVNPLMRHELDIAMTANGTPTIHNLTTGESFEYRKELQKTDVLLLNNIYPLVNNRRVGKDTNHGIITLEKGWNDFEIKGVTDVTIAFNFPFIYR >NZ_CP019622|121081:127608|122091_122520_+|WP_009927883.1|DBSCAN-SWA MDRKLLKEKQIQLIFQLEQEENRFIRKRLIEELEFFEALGDREKGLLTAEQKLLILTPSEYREYKRTKSDVQISRLIGVSRSSLAEWKRKKGLNRKKPQPVQQEMIDVLAFHLDKTKDETGALPASAIECQYEAFVINEAHN >NZ_CP019622|121081:127608|121081_121534_-|WP_003728215.1|DBSCAN-SWA MYEKLVNKYQDEVTIREEKMPYKLPGLYLNGTIFISKDQSSIEKGCVLVEELMHYKYTVGNITKQETIMDKKQEIFARRKGYEELIPLDDIIACFYLGLREYFEVAEFLEVTEEFLRHTVTHYAEKYGPMYDYGGYFINFGNSIDVYKKF >NZ_CP019622|121081:127608|123629_124142_+|WP_003721744.1|tail|DBSCAN-SWA MAFEENLYCDYTPGAAKAVAGKDVILAVFNAAGDKLLAVAGQQGLTVNRSKDSIEITSKDTVGGWKSKIGGMKEWSIENDGLYVADAESHKELAKYFESDSPVCVKIINQASKKGLFGGLAIVADYSFEAPFDEAMTYSVKLDGMGALVDLTITEGGDQMPGETPVAPAE >NZ_CP019622|121081:127608|124924_126793_+|WP_070756022.1|DBSCAN-SWA MADSKSFTFELNESVLTAQVGRLDEMAMVVERRFSELKMTIEDVGNADPGSKISESLGGLQSGLGTISSAFGQLGSSSEAITSGFGTAVGSVGGITDAFKNLGSSVQNGTLFSSLATGIGGMSTMLGGVSGGVQGITNLASGFMELKKHLGGLMSSIGGVGGIMGKLTSPMGLVIIGIVALVAAFAYLMTTNESFRNTVMSVVTQVAQLFGQLVASLMPIIMQIVTAVMQIGAALMPMVMQFISFFAQLLAQLMPFINMLISMLMPVIMQIVQVVMSLVSALLPSIMTVIQGIMSVIQFLIPIIMQIATVVVQIVVTIISYISKIMPIVMTIIGVIVSIITTIISYVVIIATTIASVIGKIISFIASVITAVIGIVEPIIGFITNIFTIIVTIIGAAFQMVFTVASKIWNAIMTTISGIIEGIKAVITGISTTVSSVFNGVKRIITGVFDGIKSAWGGLTDFVGNIFDGVSSAIQTVVDNVKGFVNVVIRGINGAIGLINKIPGVEIGKIPQLISGTTSFQGGFARMNEGGRGEMVVLPSGSQVIPHDATMKYARESARGNKSMLYTSQGADLARVENLLERLLQKNPVIKMDDKVVAEVVSRNQANSFDQYNYTMGGAAYS >NZ_CP019622|121081:127608|122531_122948_+|WP_003731177.1|DBSCAN-SWA MQVLVLPENKDINYIKTVQEVKRFFADFERFRMITGLSKKPQLLRNGFLEEPQFAPVAFSARYNKEVILEARWLVEKYTEMLNQMDDLYRTILMECYVERKQDVAVMMDLPYEIAQFKRIKKRAVLEIATLMGILVRK |
10 | Listeria_phage(33.33%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1113584 : 1121007
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP019622|1113584:1121007|DBSCAN-SWA AATGAAAAAGGTTATTACATATGGAACATTTGACTTGCTTCATTGGGGGCATATTCACTTATTAAAGCGCGCTAAGGCTCTTGGTGATTATTTAATAGTAGCAATTTCTTCTGATGAATTTAATCGAATTAAACATAAAGAAGCTTATCATAGTTACGAACACCGTAAATTAATTATTGAAGCAATACGTTATGTGGATGAGGTGATCCCAGAGAATAACTGGGAACAAAAAAGAGATGATATAGAGAAATACGGAATTGATGTTTTTGTAATGGGGGATGACTGGGAAGGCGAATTTGATTTTCTAAAAGAAGTGTGTGAAGTTGTTTATCTTCCTCGAACAGAAGGGATTTCTACGTCTCAAATTAAAGATGAACTAAAATAAAAATGTGAGAGGAGCATTCTTTTGGAACCTTTAGTAAGTGTAATTATTCCAGTTTATAATGTAGAAGAGTATGTCAAACGATGCTTGGATTCAGTTCTTGAGCAAACATATCATAACCTCGAAGTTATCGTAGTTAATGATGGAGCGACTGATAATTCAGCTAAAGTTATAAAAAGTATCTCAGATAACCGAATTCGTTATTTTGAAAAAGAAAATGGCGGACAAGCTACTGCCCGAAATTTTGGATTAGATGTGGCTACGGGAGATTACATTGTGATGGTAGATAGTGATGATTATATTAGCAAAAACCTAGTAGAAATTTGTTTGGATACTGTACAAAAAACGAATGCTGATTTAGTCTTGTTTACTTCATATAATGTGAATCAGGAAGGAAAAATGCAGTATATAAAGCGTGATAAAGGCATCAAAGTTTTAGACGCAGGTCCAACTCCATGGAACAAATTTTATCAAGCAGATCTATGGAAGGGTTCGCGTTTTCCAGTAGGTTATTGGTATGAAGATCTAGGAATTATTCCAGTCGTCACGCTAAAAGCAAAAAATCCAGTGAAAATCCAGGACGCACTTTATTACTACATAACTGATAGAGCGGATTCACAATCGAATATTCAACAAGTAGATCACTTTTTAGATGTGGTTATTATGTTGGAAAATGTTGAAACAGAATTAAAAAAACTAGGTATTTACGAAGAATCAAAAGATCAACTTGCGTACCTATATATAGAACATCTAATTTATCGTTTAGTTTTACGAAAAGCGATTTACATTACTGATAAGCAAGAACGTAAAAACCTTATTAAGAAAATTAGTACAATTATTCAAGAGAAGTTCCCTAATTGGGGTAGTTATCCTTATCAAGCGGGTGGCAAACTAACAGCAACATTAAAGAAAAAAGCATTATGGCTTTATTTACATCATTTGTACTTGTTGGGTGATTTAGTATGGAAATATCCATTTTCTATCAGAAGTAAGCAAACAGGGTTTTAAAGGAGGTTATCATTTTGCATAAATTAAGTGTGGTCATTGCCGTATATAATGTTTCTGAGTATATAGAAGCATGTTTAACATCAGTCTTAGAACAAAACTACAAGAATGTGGAATTAATTATTGTCAATGACGGTTCAACTGATGATACCTTTCAAAAAGTAGAAAAACTAGTAGACGGACATTCGAACGTTATTTTGATTGATCAAGAAAATCAGGGTGTTTCTGCTGTCCGAAATAATGGTGTAAAAGTCGCTACAGGTGATTATCTAGGCTTTGTCGATGGAGACGATATCATTGCTAAAGATATGTTTCAAAAAATGATGGATTCTTTTGAAATGTCGGATGCAGATATGGTTACAATTGGTGTGGCAAGACTTTCAGGAGATAAAGTATACCCTTCTACATTACACGAAAGATATATGGTAGAAAAAAAAGAAGCCACAACAATTGAAGAAACACCGGCACTTTTATATGATACTACTTCGTGGAATAAAGTATTTAAAAAATCTTTTTGGGATAAACACCATTTGGAATTTCCAGAGGGCCAAATGTATGAAGATATCGCTCTAATGATTCCAGCCTTTTTGTATGCAGAAAAGGTAAATGTTATTCCTGATGTTGGTTATTATTGGCGCAGTCGGGAGGGGGGAGCAAAATCTATCACTCAAAGACGAAATGACATTGCCATGGTGAATGATCGTTTACTTGCTTTGAAAAAAGTAAATCAAGTACTTAATGAGAAAAACATTCAGGGTGATTTAAGATATCAAAATGAATGTAAAAACTTTGAAATTGATTTGTTTTCCATGATTGAATGGGCATTTTTAGCGCCGAAGGATTACTATTTGGCTCTTCAACCACTTATCAAAAATTATGTTGAGCAAGAAATGAAAACAACTGCTTTGAATGATATTCCAGAAGAAAAGAAACAACTTTTCAAAGCTTTGTTAGCAAATAATCGTCCGGCTTTTCTCCTAAATAGTTACATTTATTTCGGTAAGAAAGCTGTGAAAAAAATAACGAAATAAGAGACAAAAGACAAAATACTTCGGATCTTAAGTACACTTGTAAACAATTGATTCAAGTGTGCCATTGCATCATTAGAAGTACTATGTCTTAGGCTCTTTTTTTGTTAGTAACAGTTAATTTAATAGTGAAACTACCTTTTATATGCTATGATAATTGGTATATAATAAGTCAAATTAATGCTTATAAAAAATGATAGGAGCAGAAGAAATGACAAATTTATTTCAAGATGATAGTCTAACGCTGCATACAGACTTATATCAACTAAATATGATGAAAGCGTATTTTGACGATGGACTTCATGAGCGTAGATCGGTATTTGAAGTGTTTTTCCGAGATATGCCATTTGATTCGGGTTTTGTTGTGTTTGCGGGGCTAGAACGAATTATTCATTATATGCAAAATTTACGTTTTACAGAAACGGATATTGCTTATTTACACGACGAACTTGGTTTTGATGGACCTTTTCTAGAATATTTACGTAATTTTAAATTTAAAGGAAATATTCTTGCTGCGAAAGAAGGGGAATTTGTTTTTAAAACAGAGCCAATCCTTCAAGTAGAAGCAAGCTTGGCGGAAGCACAATTAATTGAAACAGCTTTGCTTAATATTGTGAATTTCCAAACGCTGATTGCAACAAAAGCGGCGCGAATCCGTTCTGTTATTGATGACGAAACGTTTGCAGAATTCGGTACAAGACGTGCACAAGAAATGGATGCGGCTATTTGGGGCACACGAGCGGCTTACATCGGCGGTTGTGATTCGACGAGTAATGTTCGCGCTGGAAAAATTTTCGGTATTCCTGTGTCTGGTACGATGGCACATGCGATGGTTCAAGCTTATCGCGACGAACTAGAAGCATTTAGAAGTTACGCAAAAACGCATTTTGATTCGATTTTCTTAGTAGATACATACGATACGCTAAAATCTGGCGTACCAAATGCGATTAAAGTGGCGAAAGAAATGGGCGATAAAATTAACTTTATCGGCATTCGTTTAGATAGCGGGGATATGGCTTTCTTATCTAAAAAAGCACGCCAAATGTTAGATGAGGCTGGTTTTACAGAAGCAAAAATCTTTGCTTCGAGTGACTTAGACGAACATACTATTTTATCGTTAAAAGCGCAAAAAGCAAAAATCGATTCTTGGGGCGTTGGCACAAAACTAATCACCGCTTACGACCAACCAGCATTAGGTGCCGTTTACAAAATGGCGGCAATTGCTGATGAAAATGATATTTTACAAGATTCGATTAAACTTTCGAGTAACACCGAAAAAGTGTCGACTCCTGGTAAAAAGAAAGTTTACCGGATTATTACGAATGAAGATGGCTTGAAAGCGGAAGGCGATTATATTGCTTTAGCGGACGAATCACTCGAAAATGTGGATAAACTAACGATGTTCCACCCAGTTCATACGTATATTATGAAAACAGTCGAGAACTTCACCGCGCGTGAGCTACTTGTACCGATTTTCCAAAACGGAGAACTTGTATATGATATGCCTTCACTAGATGAAATTAAAGCATATAAAGAAGAGAACTTGGCGCTACTTTGGGACGAGTACAAACGAACAGTTCGTCCGGAGCAATACCCAGTTGATTTAAGTGTAAAATGTTGGAAAAATAAGATGCGTAATATCGAAAAGGTACGTAAAAGTGTCCAGCTTCATTCACCAGTTGAACTAGATATGCCGTTTTAGGAGGAATTATAATGGAAATCAGAGAAAGAATTTTAGCAGATATGCAAGTGGCAGAAACGATTGATGCACATGACGAAATCCGAAAAAGTGTCGAGTTTTTAAAAGCATATTTAAAAAAGAATACGTTCTTAAAAAGCTTTGTTCTTGGGATTTCTGGGGGACAAGATTCGACTTTAACAGGAAAACTAGCACAGATGGCGATAAGCGAAATGCGAGCAGAAACGGGCGACGATGAGTACCAATTCTTCGCTGTGAGCTTGCCATACGGAACGCAACTAGATGAATCGGATCGTCAAGATGCACTGAACTTTATGGAACCAGATAATCGTTTAACCGTAAATATTAAAGCTTCAGTGGATGCGAGTGTTGCGGCGCTTGCGGAAGCGGGAGTGGAACTATCTGATTTTGCTAAAGGTAACGAAAAAGCGCGCGAACGGATGAAAGTACAATACGCAATTGCAGCGATGCATAAAGGCGTAGTGGTTGGAACCGATCACTCCGCAGAAGCAGTTACTGGCTTTTATACGAAATACGGCGACGGTGGAACGGATATTAATCCACTGTTCCGCTTGAATAAAAGACAAGGCAAGGCGCTTCTTAAAGAGCTTGGCTGCCCAGAACATTTATATTTGAAAAAACCGACAGCAGATTTAGAAGATAATAAACCGGCACTTCCTGATGAGGTCGCGCTTGGTGTGACTTATGACCAAATTGACGATTACTTGGAAGGCAAAGAAGTTCCAGCAGATGCTGCGGCAAAAATTGAGAACTGGTTTATTAAAACCGAACATAAACGCCATATGGCAATTACTATATTTGACGATTTCTGGAAATAGGAGGCTGTTTAAATGAAAGTTGGTTATGGTTTATTAACTGCATTTTATACACACCCAGGAGAAAAAGACAATTTAGTGAAAATCTTGATTGAAGCAGCAGAGGCTTTGGATGATTACAACACGTGTATCCAATATATCGTCAGTGAATCTGAAACCGAGCCAGACACGGTGTTTGTTTCTGAAATTTGGGTCGATAAAGGGCATCATGCAGCATCACTTGATAACCCAGCAGTACAAGAAACAATTGCACGCGCCAAACCGATGATAAAAGAAATAAAACGAATACAAGAATTAGACATACTCGGTGGAAAAGGCGTATAATTTTAACAACAAGAATGATTCTGGGACTCTCCTGGAATCATTTTTTGGAGGGATGACAAAATGCAAACGTTGATGATTGTTTGTGCTGGCGGTGCGACGTCAAGCCTAATGGCACAAAATGTCGTGAAAAGCGCGATGTCAGAAGGAATGGACGCTGTTTTACTATTTCCAGATGACGTGAAATATAAAGATAGTTTTCTCGAGAAATATAGCGAGCGGGATCTGGTTGTCGTGATGGGGCCAGTCGGCGCGATTACAGCCGGAAAGTTCCGTGATTATAAAGAACAGGTTGACGCGGTTTTAGTAGCACCACAAGTGAAATATATGTACAAAACAGTGGAGGAAGTATTAGGCGAACTAAGTATTCCTTGCGCTAATATTGATTCACTCGATTTCGGTCGGATGCGCGGGGATAAGATTCTCACGCAAGGTCTAGCCTTAATGGATGCGAAAAATTCCAAATAAGGTGTTGCAACTTTAGAGGGGAAACGTTAAAATGAAAGAAGATGAAAAGGACAAGTGATTTGTCCTTTTCTTATATTATTGTGAAGTAACCGCAATTTTGCGGTTTCATTTTATAGATAAGGGTGGTTTTGTTTAAAATTATGAAAGACTTTACCGAGCAAGAGAAAATTATCGTTCTAGATTTTGGTAGTCAGTACAATCAACTAATTACGCGCCGCATTCGTGAATTCGGTGTGTATAGTGAATTACATCCGCATACTATTACAGTTGAAGAAATGAAAGCACTAAATCCAACGGGGATTATTTTTTCAGGAGGACCTAACAGTGTGTATGACGAAGATGCCTTCCGCGCTGACGAAAGAATCTTTGACATGGGAATTCCGATTTTGGGAATTTGTTACGGCATGCAATTAATGACAACGCACTTCGATGGCAAAGTAGAACGTGCGAAAGACCGCGAATATGGGAAAGCGGACATTCACGTCGAAAAACCAAGTCGTTTATTTGCTGGACTACCAACTGATCAAGTTGTTTGGATGAGTCACGGCGATTTAGTTGTCGAGGAACCAGCTGGATTTGAAGTAACAGCTACTAGTAAGTCTTGCCCAATTGCAGCTATTGCAGATGAAGAGCGTTCTCTTTACGGCGTGCAATTCCACCCAGAAGTACGTCACTCAGTTCACGGAAACGAATTACTGAAGAATTTTGCATTAAACGTTTGTGGCTGTAAAGGCGACTGGACAATGGAAAACTTTAGTGAAGTTGAAATCGCTAAAATCCAAGAAATCGTAGGCGACAAAAAAGTCTTGCTTGCACTTTCTGGCGGTGTAGATTCCTCTGTTGTTGGCGTGTTAATTCATAAAGCGATTGGCGACCAACTAACATGTATTTTCGTAGACCATGGCCTTCTTCGTAAAGGGGAAGCTGATCAAGTAATGGCAACGTTACAAGGCGAGTTCAACATGAACATCATCAAAGTAGATGCGAAAAAACGCTTCATGGACAAACTTGCTGGCGTTTCTGACCCAGAGCAAAAACGTAAAATCATCGGTAACGAATTCATTTACGTATTCGACGATGAAGCTAACAAACTAGACGGCGTAGAATTCCTAGCTCAAGGAACACTTTATACAGACATCATCGAAAGTGGTACAGCAACTGCCCAAACAATCAAGTCTCACCACAACGTCGGCGGTCTACCAGAAGATATGCAATTTAAACTAATCGAACCTTTAAATACACTTTTCAAAGATGAAGTTCGCGCACTAGGAACAGAACTTGGCATGCCTGACGCAATCGTTTGGCGCCAACCATTCCCTGGCCCAGGCTTAGGAATCCGCGTTCTTGGCGAAATTACGGAAGAGAAATTAGAGATTGTCCGCGATTCTGATTACATCTTGCGCGAAGAAATCAAAAACGCAGGTCTAGAACGCGAAATCTGGCAATATTTCACAGCACTTCCAAATATCCGTAGCGTTGGTGTTATGGGTGATGGTAGAACGTATGACCATACTGTGGTTGTTCGTGCGGTGACGAGTATTGATGGTATGACAGCCGATTGGGCACGTATTCCGTGGGATGTACTAGAGAAAATTTCGGTACGGATTGTGAATGAAGTGGATCACGTTAATCGTGTTGTTTATGATATTACGAGTAAGCCACCAGCTACGGTTGAGTGGGAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP019622|1113584:1121007|1113584_1113968_+|WP_003730941.1|DBSCAN-SWA MKKVITYGTFDLLHWGHIHLLKRAKALGDYLIVAISSDEFNRIKHKEAYHSYEHRKLIIEAIRYVDEVIPENNWEQKRDDIEKYGIDVFVMGDDWEGEFDFLKEVCEVVYLPRTEGISTSQIKDELK >NZ_CP019622|1113584:1121007|1114987_1116001_+|WP_023550414.1|DBSCAN-SWA MHKLSVVIAVYNVSEYIEACLTSVLEQNYKNVELIIVNDGSTDDTFQKVEKLVDGHSNVILIDQENQGVSAVRNNGVKVATGDYLGFVDGDDIIAKDMFQKMMDSFEMSDADMVTIGVARLSGDKVYPSTLHERYMVEKKEATTIEETPALLYDTTSWNKVFKKSFWDKHHLEFPEGQMYEDIALMIPAFLYAEKVNVIPDVGYYWRSREGGAKSITQRRNDIAMVNDRLLALKKVNQVLNEKNIQGDLRYQNECKNFEIDLFSMIEWAFLAPKDYYLALQPLIKNYVEQEMKTTALNDIPEEKKQLFKALLANNRPAFLLNSYIYFGKKAVKKITK >NZ_CP019622|1113584:1121007|1116209_1117700_+|WP_003721509.1|DBSCAN-SWA MTNLFQDDSLTLHTDLYQLNMMKAYFDDGLHERRSVFEVFFRDMPFDSGFVVFAGLERIIHYMQNLRFTETDIAYLHDELGFDGPFLEYLRNFKFKGNILAAKEGEFVFKTEPILQVEASLAEAQLIETALLNIVNFQTLIATKAARIRSVIDDETFAEFGTRRAQEMDAAIWGTRAAYIGGCDSTSNVRAGKIFGIPVSGTMAHAMVQAYRDELEAFRSYAKTHFDSIFLVDTYDTLKSGVPNAIKVAKEMGDKINFIGIRLDSGDMAFLSKKARQMLDEAGFTEAKIFASSDLDEHTILSLKAQKAKIDSWGVGTKLITAYDQPALGAVYKMAAIADENDILQDSIKLSSNTEKVSTPGKKKVYRIITNEDGLKAEGDYIALADESLENVDKLTMFHPVHTYIMKTVENFTARELLVPIFQNGELVYDMPSLDEIKAYKEENLALLWDEYKRTVRPEQYPVDLSVKCWKNKMRNIEKVRKSVQLHSPVELDMPF >NZ_CP019622|1113584:1121007|1113989_1114973_+|WP_003727002.1|DBSCAN-SWA MEPLVSVIIPVYNVEEYVKRCLDSVLEQTYHNLEVIVVNDGATDNSAKVIKSISDNRIRYFEKENGGQATARNFGLDVATGDYIVMVDSDDYISKNLVEICLDTVQKTNADLVLFTSYNVNQEGKMQYIKRDKGIKVLDAGPTPWNKFYQADLWKGSRFPVGYWYEDLGIIPVVTLKAKNPVKIQDALYYYITDRADSQSNIQQVDHFLDVVIMLENVETELKKLGIYEESKDQLAYLYIEHLIYRLVLRKAIYITDKQERKNLIKKISTIIQEKFPNWGSYPYQAGGKLTATLKKKALWLYLHHLYLLGDLVWKYPFSIRSKQTGF >NZ_CP019622|1113584:1121007|1117711_1118536_+|WP_023550416.1|DBSCAN-SWA MEIRERILADMQVAETIDAHDEIRKSVEFLKAYLKKNTFLKSFVLGISGGQDSTLTGKLAQMAISEMRAETGDDEYQFFAVSLPYGTQLDESDRQDALNFMEPDNRLTVNIKASVDASVAALAEAGVELSDFAKGNEKARERMKVQYAIAAMHKGVVVGTDHSAEAVTGFYTKYGDGGTDINPLFRLNKRQGKALLKELGCPEHLYLKKPTADLEDNKPALPDEVALGVTYDQIDDYLEGKEVPADAAAKIENWFIKTEHKRHMAITIFDDFWK >NZ_CP019622|1113584:1121007|1118548_1118857_+|WP_009929872.1|DBSCAN-SWA MKVGYGLLTAFYTHPGEKDNLVKILIEAAEALDDYNTCIQYIVSESETEPDTVFVSEIWVDKGHHAASLDNPAVQETIARAKPMIKEIKRIQELDILGGKGV >NZ_CP019622|1113584:1121007|1119450_1121007_+|WP_023550418.1|DBSCAN-SWA MFKIMKDFTEQEKIIVLDFGSQYNQLITRRIREFGVYSELHPHTITVEEMKALNPTGIIFSGGPNSVYDEDAFRADERIFDMGIPILGICYGMQLMTTHFDGKVERAKDREYGKADIHVEKPSRLFAGLPTDQVVWMSHGDLVVEEPAGFEVTATSKSCPIAAIADEERSLYGVQFHPEVRHSVHGNELLKNFALNVCGCKGDWTMENFSEVEIAKIQEIVGDKKVLLALSGGVDSSVVGVLIHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEADQVMATLQGEFNMNIIKVDAKKRFMDKLAGVSDPEQKRKIIGNEFIYVFDDEANKLDGVEFLAQGTLYTDIIESGTATAQTIKSHHNVGGLPEDMQFKLIEPLNTLFKDEVRALGTELGMPDAIVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEEKLEIVRDSDYILREEIKNAGLEREIWQYFTALPNIRSVGVMGDGRTYDHTVVVRAVTSIDGMTADWARIPWDVLEKISVRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPATVEWE >NZ_CP019622|1113584:1121007|1118917_1119322_+|WP_009929871.1|DBSCAN-SWA MQTLMIVCAGGATSSLMAQNVVKSAMSEGMDAVLLFPDDVKYKDSFLEKYSERDLVVVMGPVGAITAGKFRDYKEQVDAVLVAPQVKYMYKTVEEVLGELSIPCANIDSLDFGRMRGDKILTQGLALMDAKNSK |
8 | Hokovirus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1217119 : 1324507
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP019622|1217119:1324507|DBSCAN-SWA AATGTTAGTTTCATATAATTGGGTCAAAGAATTTTTCCAAGACTTCCCGTTAACGGCGGAAGAGCTAGGAGAAGCAATTACAAGAACAGGTATTGAAATCGAAGGCGTAGAAGAATTAAGCGCTAGTTTGAAAAATGTCGTAGTCGGCGAAGTTTTATCATGCGAACGCCACCCCGATGCAGAGAAATTGAATAAATGTCTCGTTCAAACAGACGAAACAGAACCTGTTCAAATCATTTGCGGAGCTCCAAACGTTGCCGCTGGTCAAAAAGTAATCGTAGCCAAAGTTGGCGCAAGACTTCCAGGTGGACTTAAAATCAAACGCGCAAAACTACGCGGCGAAGTGTCAGAGGGAATGATTTGCTCCCTGGCTGAACTTGGCTTTGAAAGCAAAGTTGTACCAAAAGCATACGCAGAAGGAATTTATGTATTACCTGCGCACGTGGAAACGGGTGTAAGTGCAATCACTTTACTTGGACTAGATGATGCGATTTTGGATATGGCAATCACACCAAACCGCGCAGATGCATTGAGCATGAATGGTGTAGCTCACGAGGTTGGTGCGATTATTCATCAAAAACCAGCACAACCAACCGAGCCTGACGTATCTGAAAAAGGAAAAGCAGACGATTTCATTTCTGTAGAAGTTGAAAATCCAGCCGAAACACCTTACTATGCTATTAAAATGGTAGAAAACATTGAAATCAAAGAATCGCCACTATGGCTGCAAACAAAACTAATGAAAGCTGGCATTCGTCCACATAATAACGTGGTCGATGTTACCAACTACATCAATTTATTATACGGACAACCTTTGCATTCCTTTGACTATGATAAAATTGGTAGCAAGAAAATCGTTGTACGTTCTGCAAAAGAACAAGAAGAGATTACCACGCTTGATGGCGAGAAAAGAACTTTACAGGCTGGACATACAGTTATTACAAATGGCGTAGAACCAATTGCTATCGCTGGCGTTATGGGTGGAGAATTTTCCGAAGTAACAGAGAACACAACGACAGTAGCGCTAGAAGGTGCTATTTTCAGCAGCTCTTCCATCGGTAAAGCATCTCGCGAATTATACCTACGTACAGAAGCAAGCATCCGTTACGACAAAGGTTCTGACGCTTGGAAAGTAGAAAAAGCACTTGCACATGGCGGAGCGTTAATCGCTGAACTAAGTGGCGGAACACTAGTAGGCGGTGTCGTAGAAGTAGATAACCGTGAAAAAGCTGTAAATAAAATCGAAACAAACCTAACACGCATTAACCGCATTTTAGGAACAGCAATTACGCTTGCGGAAATCGAAACAATTTTTGATCGTTTAGGTTTTGTATTAGAAGTGAAAAATGATGCTCTAATCATTGAAGTGCCGACAAGACGTTGGGACATCACTATTGAAGCAGATATTTTAGAAGAAGTAGCTCGTATTTACGGTTACGATGAAATTCCGGTAACACTTCCTGCGACAAGCACAACAGGCGGCTTATCAGACAGCCAAAAAGCTCGTCGTGTCATGCGCGCTTATTTAGAAGGAGCAGGACTTAACCAAGCATTAACTTACTCTTTAACATCTAAAAAAGATGCAACTCGTCTAGCGCTTTCTGATGAAAAAACAGTTGCATTATCGATGCCAATGAGTGAAGAACATAGCCATTTAAGAACAAGTATCGTTCCACAATTAATTCGTAGCGCAAGTTATAACATCGCTCGTAAAAATATGGACGTGGCACTTTACGAAATGGGTACCGTGTTCTACGCAACAGAAGGGGACAATTTACCAATTGAACAAGAGCATTTGGCAGGTCTAATTACTGGGAACTGGCATACGGTTGATTGGCAAAAAACACCAAAACCAGTAGACTTCTTCGTTTTAAAAGGAATTGTCGAAGGTTTAGTGAACAAATTAGGTATCAAATCCGAACTTCACTGGAAACAAACAGAAAAAGAAGAACTGCATCCGGGAAGAACCGCCAGCCTTATTTTAGAAGGACAAGAAATTGGTTATCTTGGAGCACTTCACCCAGCGGTAGAAGCTAACTATGATTTAAAAGAAACATATGTCTTTGAAATCAATGTAGCTGCTTTACTAGATGCAACCAAAGAAAAAGTTGTGTACCATCCAATCCCACGTTACCCAGAAATGACTCGCGACTTAGCATTGCTTGTGGATAAAAATACCGACCATGCAACAATTTCTCAAGTAATCCAAGAGCACGGCGGAAAGTTACTTGTCGATATCGAGCTATTTGATATTTTCGAAGGGGAGAGTCTTGGCGAAAACAAAAAATCGCTCGCATACACATTGACTTTCCTAGATAGCGAAAGAACACTAGTCGAAGAAGATGTACAAAAAGCAACCAATAAAGTAATAGAAGCATTACAAGAAAAACTACATGCGATTATTCGTTAAATGAAGAAGAACTAGGCTAGCTGGAAAACATTTTCAACTAGTTTGGTTCTTTTTTTGTTTTTTATAAAATAGTGGAAGTCTTTCCTTTTTTAGTACTTCACTTACTTAAATAACACATGTTATAATGATGGCACATGCCAGAGAAAAAAGGACGAGAAAAATGACCTATGTAGAAATGAAAGATGTATCTAAATACTATCAAATGGGCGAGAACGTTGTCACGGCAAATGATAAAATCACTTTCGGGATAAAAAAGGGTGAATTTGTTGTAATAGTCGGACCTTCTGGAGCCGGAAAATCCACTGTACTTAATATACTTGGTGGAATGGATAGTGCAAGTGAAGGCAAAATTATGGTAGATGGGCAGGATATTGCTCAATATAATGCAAAACAATTAACCAAATATCGGCGAACAGATGTCGGCTTTGTATTTCAATTTTACAATTTGGTACCCAATTTGACTGCTAAAGAGAACGTAGAATTAGCTGCCCAAATTGCGCCAAATGCATTAGACGCAGAAACTGTTTTAACTCAAGTTGGATTAAGTCACAGATTAGACAATTTTCCAGCACAACTATCTGGCGGGGAACAACAGCGTGTCGCCATAGCACGTGCGCTTGCTAAAGCACCGAAACTGCTTTTATGCGATGAGCCAACCGGGGCACTTGATTACGATACTGGAAAATCAGTCTTAAAATTATTACAAGAAACTTGCCGTAACACGGGAACAACAGTTATTGTTATTACCCATAACACAGCGATTACGCCAATTGCAGATCGAATTATTGAAATTAATAATGCAAAAGTTCGCAGCATCAAAGAAAATCCAGAACCAATGTCGATTGATGATTTAGAATGGTAGGAAGGAGCAACCAGTGAAACGTTCAGCTTTATGGAAAGATATTTACCGCGAAATATGGCGTTCTAAGAGCCGCTTTATTTCCATTTTTATGCTGATTATGTTGGGTGTTGCTTTTTTCTCCGGACTTAAAGCAACTGGACCCGATATGCTTCTAACAGCCGACAATTATTTTAATAAGTATTAATTAGCTAATTTTAACGTGCAATCTACTTATGGACTAGATGAGACGGACAAGGAAGCACTTGAAGATATATCTGGTGTCGCACAAGTGGAACTCGGATATACAGCAGATACTTTAATGAAAGATAAAAATATCGTAACGAAACTATTTTCCAATTCTGAAAGCGATAATTTAAATCAATACAAGATAGCTAGTGGCCGTTTACCAGAAAAATCAGGGGAAATTGCACTGGATGACAATGACCTTGTTCATAAAAATGTCAAAATCGGCGACGAAGTAACTTTTGTTAAAAGTGATGGAAATAAGTTAACTAACACGCTAAAAAAATCAACTTATAAAGTAGTTGGCTTCGTTAGCTCACCAGCTTACATCCAGAAATCTGAACGTGGCTCGAGCACGGTTGGAAAAGGAAAAACAGATGCCTTTGGTGTGATTCCAGAACAGGATTTTGATTTACCAGAATACACTATTGCTAATCTTACTTTTAACAATTTAGCAGCAAAACAAGCTTTTAGTGACGAATATGTATCCACCGAAGAAAAAGATAAGAAAAGCGTCGAAAAAGCTTTAGCAGACCAACCAGAAAAAAGATTAAATAAAATCAAGACGAAGGAACAAAAGAAATTAGACGATGCAACAGCAGAAATTAACAAAGGAAAAGCAGAACTACAGGAAAATGAAGCTAAACTTGCAAATGCCAAAGCACAATTAGAAGAAGGATTTTCTGAATATAATGCTGCCAAAGCAAGCTATGACGCCAAAATCAAGCATGGCGAAGCAGAGATTGCAAACGGTGAAGCAGAACTAAGAAGCGCAAAAAAACAACTTGATACCGCAAAAACACAGATTGACCAAGGCGAAACAGCTCTTTCACAAGCTGAGATGGAATTAGAAGAAGGTAGAGCGGCTTGGGAAGATGCCAATAATCTTCTTAATACAGCAAATGGTTATTTGCGAAGTGCTAAGTCGACATTAGAAAATGCTTTAAAACAACCAGATTTAACTGATTTTGAGCTAGACCGGAACAGCTTAACAAATTCATTTCAAATGCTTGCATCAGAACTTGATTTATCAAGTGCAGAGCGCGCTGAATATGAAAATGCGATGAATCAGTTACTAGATGATTATGAAAATGGCAATATTAGTGATGCGGAAATTAGGGAAGCCTTAAACGCGGCACTTGCGCAAGTTGGTAACGCTGAAAATGAATACCAATCCGCCAGAGCCACTTTAGACGCTGAAAAACAAAAAATAGAACAAGGCGAACAAACTTTAGCTGCAAAAAAACAAGAACTTCAACAAGCAAAAACTGCCTACCAAGAAGGTCTTGCTAAATATCAAGCAGGTTTAGAAAAAATTTCGCAAGCAAAACAACAACTCGCTGATGGAAAAGAAACAGGTTCCACAGAACTACAAAGCGCACTTGCTAAATTAAACGTAGGTCAAGCGGAATACGAAAAAAATCTCGCTTTGTTTGAAAAAGAGAAAGCAAAAGCAGAAGGCAAGCTAGCTAGCGCCGAAAAAGAGGTTAAAATCGGTCAAGAAAA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119 | Listeria_phage(73.91%) | tRNA,protease,holin,integrase,terminase,capsid,portal,tail | attL 1241818:1241841|attR 1286893:1286916 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1722760 : 1768976
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP019622|1722760:1768976|DBSCAN-SWA 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70 | Listeria_phage(97.01%) | plate,holin,integrase,terminase,capsid | attL 1722472:1722491|attR 1769010:1769029 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1842790 : 1877070
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP019622|1842790:1877070|DBSCAN-SWA 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42 | Erysipelothrix_phage(75.0%) | protease,holin,terminase,head,capsid,portal,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1957865 : 1966151
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP019622|1957865:1966151|DBSCAN-SWA ATTAATCGTTCCCTCCATTTTGAATTAATCCTCGAATCACTTTTGGATAAAAAATATGTTCTACTTGATGAATTTTTCCAGCTAAAGTATCTACAGTTTCCGCATGTTCAATCGGTACTTTCACTTGATCAATAATTGGTCCAGTATCCATTCCCGCATCCACAAAGTGCGCCGTGACACCAGTTTCTGAAACATTGGCTTGAATCGCTTGACCAATTGCATCTTTTCCTTTGAATTCAGGTAATAACGATGGGTGCAGGTTGACAATTTGCTCGGGAAATTCTGCTAATAAAGTCGGCCCAATCAAACGCATATATCCTGCTAGCACTAACAAATCAATTTCCAACCCGCGAAGTTCTAGTAAAATTTCTGTCTCAAAAGCTTCTTTATCCGGATAATTTTTCGCTTCAAAAAGGAACACCGGAATCTGATGTGTGTTTGCGCGTTCTAAAACATAAGCATTTGGTTTATCACATACCAGTAGTTTCACATGAGGCTTAATAAACGCATCATCCACTAAAGCTTGAAAATTCGAACCGTTACCCGAAGCAAAAATGGCTATATTCATCCTTTTGTGCCTCCTGTGAAAATAACCGCATCATTTTCACGTGTCGTAACTTCTCCAATAACATAAGCCGCTTCCCCGTTTTGAACGAGTACTTCTAATGTTCTTTCCACATCCGCTTTCGCAACTGCCAACACCATACCAATGCCCATATTGAAAATTTCATACATTTCAAGTTCGCTCAATTGGCCGTATTTCTTCATAACGTCAAAAATCGGCAACACCGGCCATGAACCTAGCTCCACTTTGACAGCTAAATCATTTGTTAACATCCGCGGTAAATTCTCTACAAATCCGCCACCAGTCACATGCGTAATTCCGTGCACATCTACCTCTTTCAATACTTCTAAAACTGGCTTCACATAAATCCGTGTCGGTTTAAGTAGCTCTTCCACAAGCGGTACATCTAGTTCACTGATTTCCGCATCGAGTGTCAATTCGTTATCTTTAAAGAAAATTTTACGCACAAGGGAGTAACCATTACTATGAATTCCGCTTGATGGAATACCAATGAGTGTATCTCCTTCTTTGACTGCGCCTTCTGTAATTAGCTTCTGTTTCTCTACAGCCCCAACAGTAAAACCAGCTAAATCATAATCTTCCGCGCCGTACATATCAGGCATTTCAGCAGTTTCGCCGCCAATTAAAGCCGCACCAGCTTGTTCACAACCGTCAGCCACGCCTTTAACAATTTGTTCCATTTTCACTGGATCTGTTTTTCCAGTAGCGATATAATCTAAGAAAAATAATGGCTCGGCGCCTTGAGCTAAAATGTCATTCACACACATTGCCACGCAGTCAATCCCGATGGTATCATGCTTATCTGCTTCAATTGCCAAAAGTAATTTTGTCCCAACACCATCCGTACCAGAAACAAGGACAGGTTCTTTTAAATGCAAACTACTTAAGTCAAACATTCCACCAAATGAACCAAGTGCCCCCATCGCGCCTAATCGCTCTGTTCTAGCCACATGTTTTTTGATACGTTCTACAACTTGATAGCCAGCTTCTACGTCCACGCCTGCTTTACTATATGCATTTTCTGCCATTCGATTTGTCACTCCTCATTATTTTTCTGCTTCTAAGCTCGCTAAATATTCCGCTTCATAATCATATAAAGGGGTTGGGTAATCGCCGTTGAAATAAGCCATACAAAGTCCCCCGTAAGGTTCGTTCGGATAAGGTCTGCCAATGGAATCTACTAAACCTTCTTCACTCAAATACTCTAAAGAATCAGCCCCAATAATCCGACAAATTTCATCAACAGAATAATTAGAAGCGATTAATTCATTTCGCGTTTGGATATCAATTCCATAAAAACAAGGATAAGCAAGTGGTGGAGAAGCGATTCTTACATGAACTTCCGCCGCTCCTGCTTCACGTAAAAGCTGGACAATGCGTTTACTTGTCGTCCCGCGAACAATCGAATCATCAATCATGACAACGCGTTTTCCTTCCACAACCCCGCGCACGGCAGAAAGTTTCATTCTAACGCCTTGTTCCCTAAGTTCTTGTGATGGCTGGATAAAAGTTCTTGCCACATATCTATTTTTGATGAGACCAAGTTCGTAAGGAAGACCAGCTTCCTCCGCATAACCAATCGCTGCAGAAATACTGGAATCTGGTACACCTGTAACCACATCTGCATCAATAAAAGCCTCTTTTGCTAATCTTTTCCCAGAACGTTTTCTTGCCGAGTGGACATTAATTCCAGCAATATTAGAGTCAGGTCGCGCAAAATAAATGTATTCCATACTGCAAATCGAATGCGTCACATTTTCCGTGAATTTTTCAATTCGAAGCCCGTCATCATTAATAATAATTAGTTCACCTGGCTCCACATCGCGGACAAACTCAGCGCCAACCGTTTCAAAGGCACATGTTTCCGAAGCAACTACGTAAGAATCACCAATGCGACCTATCGAAAGCGGTCTAAAACCATTCGGGTCAAGCGCCGCATACATCGTGTCTTCCGTCAGAAGCATGTACGCAAAGCCACCCTTAACCTTGTTCAAAGCCACTTTTAAATCTTCCACAAAATCACCTGTATGGCTACGTTTAATTAAATGCGCTAACACTTCTGTATCCGAACTCGTTTGAAAAATAGCGCCTTCTTCTTCTAGTTCACGGCGTAAACTTTTCGCATTAACCAAATTCCCATTATGCGCAAGTGCTAAAGAAGAACTATGAAAGTGAAATAAAAATGGTTGTACGTTTCCTAAGTTTTTTTGACCGGCTGTCGCATATCGAACGTGGCCAATGGCTGCTTTACCTTTTAAATCGTCTAGTTCACCATGTTTAAATACGTCTGCTAAAAGGCCGAGATTTCGGTGACCTTTTAGTGTTTCACCGTCTGTCGAAACAATTCCGGCACCTTCTTGACCGCGATGTTGTAAACTATGCAACCCATAATAGGTGATTTCCGCTGCATTAGGATGATCCCAAATACCAAAAATACCACATTCTTCGTTAAGTCCTTTTACTTCAGCAAGCATGGAATAGCCCCTTCCCAAATGGATCGTAATTCCGTTGTTTTCGCTGTAACTTGATCTTCCTTATGTTTCACACGAATCGTATCATCCTCGGTTACTACACCAAGGCGGTATACTTTTTCCAGTTCCATTAATTGCGCAAAAGCTGCTTCGTTTTCCGGTTTTACCGATACTAAGAAACGTGATTGCGATTCACTGAATAGTTGATTCAACTCAAACGGTACTTCTACATCCGCACCAAGCCCTGCTTTAAAAGTCGCTTCCGCAAGGGCAACACCAAATCCACCTTCTGCCAAATCGTGACTAGAAGCAACTAGACCTTCCTGAATCGCCGTTAGAAGTAATTGTTGGTATTTTTTCTCTGTCGTTAAATCTAATTCCGGCGCACGTCCGCTAATTTTCCCTTGTTGCAATTTTTGCAATTCCGAACCACTATATTCAGCTTTTGTTTCACCAATTAAGAAAATCACATCGCCACTATTTTTAAAATCTTGTGTCGTAATATGTGCCAAATCTTCTACTAAACCAACCATTCCAATGACTGGCGTTGGATAAATTCCGGTACCATCTGTTTCATTATAAAGCGATACATTACCAGAGATAACAGGCGTATCAAGTTCTAAACAAGCCGCACTAATACCATCAGCCGCTTTTTCAATTTCCCAAAAAATTTCTGGTTTTTCAGGATTTCCAAAGTTCAGTCCATCTGTAATCGCTAGTGGTTTCCCGCCAGAACAAACGATATTGCGCGCCGCTTCCGCAACCGCTATCGCTCCGCCTACTTTTGGATCAAGATACAAATAGCGTGAGTTACAATCAGTTGTCATGGCAATTGCCTTCTCGGTCCCACGCACACGAACAATCGCCGCATCTGAACCAGGTACAACAGCTGTATCCGTCCGAACTTGATAATCATATTGCTCATAAATATGGCGCTTACTAGCAATCGTTGGCTGAGCAAGCAGTTCCTTCCAAACACCGACCACATCTTCCATAACTGGCACAAACGATTCCTCTTCTTGGAAAGCTTGATAACGAGCTGGCTCTTTGGAAGGTTTATGATAAACTGGCGCATCTTCTGCAAGCGCATCTACAGGAACGTTCGCAACTACTTCACCATGATGAATAATTTTGTACATTTTATCATCTGTTACTTGACCAATCACAACAGCCTCTAAACCATAACGTTCAAATAACGCTTGGATTTCTTCCACATGCCCTTTTTTCACACATAGAAGCATCCGTTCTTGCGATTCAGAAAGCAACATTTCATAAGGCGTCATATTTAGTTCTCGTTGCGGCACATCATCCATAATTAATTCTAGCCCAGCGCCCGCTTTTGAGGCCATTTCAGAACTTGAACTAACGAGACCAGCTGCTCCCATATCTTGAATTCCCACTAAAATATCCGAATGATCACGAATCACATCTAAACAAGCTTCAAGCAACAATTTCTCCATAAAAGGATCGCCAACCTGTACAGCAGAGCGTTGTTGTTCGCCTTCTTCACTAAACTCTACAGATGCAAAAGTAGCACCATGAATTCCGTCACGACCAGTTTTAGCACCAACATACATCACCGGGTTGCCAATTCCTTTAGCTTGCCCTTTTTGAATATCTTTCGCTTCAATTAAGCCTACACACATTGCATTTACTAGCGGATTTTTTGTATAACAAGGATCAAATTGGATTTCGCCACCAACCGTTGGAATCCCAATGGAGTTACCGTATCCTGCGATTCCCGCAACGACTTCACTAACTAAGTATTTCGCATGGGGTGTATCTAACTCACCAAAACGAAGCGAGTTAAGCATTGCAATCGGTCTAGCTCCCATCGAGAACACATCACGGATAATCCCGCCGACCCCAGTCGCAGCCCCTTGATACGGCTCCACGTAGGATGGATGATTATGACTCTCCACTTTAAAAGCAACACCTAAACC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP019622|1957865:1966151|1957865_1958432_-|WP_003726209.1|DBSCAN-SWA MNIAIFASGNGSNFQALVDDAFIKPHVKLLVCDKPNAYVLERANTHQIPVFLFEAKNYPDKEAFETEILLELRGLEIDLLVLAGYMRLIGPTLLAEFPEQIVNLHPSLLPEFKGKDAIGQAIQANVSETGVTAHFVDAGMDTGPIIDQVKVPIEHAETVDTLAGKIHQVEHIFYPKVIRGLIQNGGND >NZ_CP019622|1957865:1966151|1959496_1960924_-|WP_003722245.1|DBSCAN-SWA MLAEVKGLNEECGIFGIWDHPNAAEITYYGLHSLQHRGQEGAGIVSTDGETLKGHRNLGLLADVFKHGELDDLKGKAAIGHVRYATAGQKNLGNVQPFLFHFHSSSLALAHNGNLVNAKSLRRELEEEGAIFQTSSDTEVLAHLIKRSHTGDFVEDLKVALNKVKGGFAYMLLTEDTMYAALDPNGFRPLSIGRIGDSYVVASETCAFETVGAEFVRDVEPGELIIINDDGLRIEKFTENVTHSICSMEYIYFARPDSNIAGINVHSARKRSGKRLAKEAFIDADVVTGVPDSSISAAIGYAEEAGLPYELGLIKNRYVARTFIQPSQELREQGVRMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVQLLREAGAAEVHVRIASPPLAYPCFYGIDIQTRNELIASNYSVDEICRIIGADSLEYLSEEGLVDSIGRPYPNEPYGGLCMAYFNGDYPTPLYDYEAEYLASLEAEK >NZ_CP019622|1957865:1966151|1964858_1966151_-|WP_003729814.1|DBSCAN-SWA MLERYTRKEMGNIWTEQNRYQAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVAKIRANAKFDVDRIHEIELETRHDVVAFTRSVSESLGAERKWVHYGLTSTDVVDTANSYLLKQANEILRKDLENFIAIIGEKAKEHKYTVTMGRTHGVHAEPTTFGLKLALWYEEMKRNLERFNFAADGVEFGKISGAVGTYANIDPFVEAYVCEKLGTTPAPISTQTLQRDRHAEYLATLALIATSVEKFAVEVRALQKSEVREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENVTGLARVIRGHMVTAYENVPLWHERDISHSSAERIILPDSTILLDYILNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMDRTLGLIYSQRVLLALIDKGLAREAAYDVVQPRAMEAWEKQVPFRELVEQDATITENLSAEEIADCFDYNYHLKNVDLIFDRLGL >NZ_CP019622|1957865:1966151|1963120_1963804_-|WP_003726212.1|DBSCAN-SWA MKFAVIQFPGSNCDLDMLHAIRDSLGEEAEYVWHAETSLAGFDAVLLPGGFSYGDYLRTGAIAKFSSIMPEVLRFAEMGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALIRNNNLHFICKTVPLRVANASTMFTGLYKEGEIIQVPVAHGEGNYYCDDETLLKLKDNNQIVFTYDSVNPNGSRADIAGIVNERGNVLGMMPHPERAVEEIIGGTDGLRLFESVVKAWKEEQVNA >NZ_CP019622|1957865:1966151|1963807_1964053_-|WP_003722248.1|DBSCAN-SWA MYNVKVYVTLKKSVLDPQGVAVKDAAKSMGYEEVEDVRIGKFMELKVAKSDRDIHEVLNEMCDKLLTNPVMEDYRYEIEEA >NZ_CP019622|1957865:1966151|1958428_1959478_-|WP_003726210.1|DBSCAN-SWA MAENAYSKAGVDVEAGYQVVERIKKHVARTERLGAMGALGSFGGMFDLSSLHLKEPVLVSGTDGVGTKLLLAIEADKHDTIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLFFLDYIATGKTDPVKMEQIVKGVADGCEQAGAALIGGETAEMPDMYGAEDYDLAGFTVGAVEKQKLITEGAVKEGDTLIGIPSSGIHSNGYSLVRKIFFKDNELTLDAEISELDVPLVEELLKPTRIYVKPVLEVLKEVDVHGITHVTGGGFVENLPRMLTNDLAVKVELGSWPVLPIFDVMKKYGQLSELEMYEIFNMGIGMVLAVAKADVERTLEVLVQNGEAAYVIGEVTTRENDAVIFTGGTKG >NZ_CP019622|1957865:1966151|1964064_1964778_-|WP_003726214.1|DBSCAN-SWA MTNELVYEGKAKRLFKTEEAGVLRVAYKDDATALNGVRKESFAGKGELNNQITSLIFSHLAGAGIESHFIRAISETEQLVKEVSIIPLEVVVRNVMAGSLAKRLGKEEGELIPNAIVEFYYKDDALDDPFINDDHVLYLELATTSEMDIIRQAARSINKVLQELFNQMNITLIDFKLEFGRDATGNILLADEISPDTCRLWDKETNQKLDKDVFRRNIGNLTDVYTEVLNRLKQVQN >NZ_CP019622|1957865:1966151|1960908_1963128_-|WP_009918191.1|DBSCAN-SWA MPNMEPTTKEIKEQKIYQEMGLTDSEYELVCSILGREPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTEGKQVLQGPGEGAGIVDIGDGLGVAFKVESHNHPSYVEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPIAMLNSLRFGELDTPHAKYLVSEVVAGIAGYGNSIGIPTVGGEIQFDPCYTKNPLVNAMCVGLIEAKDIQKGQAKGIGNPVMYVGAKTGRDGIHGATFASVEFSEEGEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLDVIRDHSDILVGIQDMGAAGLVSSSSEMASKAGAGLELIMDDVPQRELNMTPYEMLLSESQERMLLCVKKGHVEEIQALFERYGLEAVVIGQVTDDKMYKIIHHGEVVANVPVDALAEDAPVYHKPSKEPARYQAFQEEESFVPVMEDVVGVWKELLAQPTIASKRHIYEQYDYQVRTDTAVVPGSDAAIVRVRGTEKAIAMTTDCNSRYLYLDPKVGGAIAVAEAARNIVCSGGKPLAITDGLNFGNPEKPEIFWEIEKAADGISAACLELDTPVISGNVSLYNETDGTGIYPTPVIGMVGLVEDLAHITTQDFKNSGDVIFLIGETKAEYSGSELQKLQQGKISGRAPELDLTTEKKYQQLLLTAIQEGLVASSHDLAEGGFGVALAEATFKAGLGADVEVPFELNQLFSESQSRFLVSVKPENEAAFAQLMELEKVYRLGVVTEDDTIRVKHKEDQVTAKTTELRSIWEGAIPCLLK |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2635634 : 2643476
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP019622|2635634:2643476|DBSCAN-SWA ATTAACTATTACTGATTTTCAGTCCTACTTGTGCTGGTGTTTCCCCGCTTCTAAGGCGCTCTGCAATCTGATCTAGTTTCCGGAGACGATGATTAATACCTGATTTACTTACTTGACCTGTTGTCAGCATTTCGCCTAGCTCTTTTAAGGTAACATCTTCATTAGCTATACGAAGCGCTGCAATCTCACGCAGTCGTTCTGGTAAAGCTTCTAGCCCAACGGTTGATTGGATATACTTGATATTATCGATTTGCCTAACAGCCGCATTAATTGTCTTGTTGAGATTCGCCGTTTCACAGTTCACTAGCCTGTTCACCGAATTCCGCATATCACGCATAATCCGAACATCCTCAAAATGAAGAAGCGCGCTAGTTGCTCCGATAATACTCAAGAATTCCGTGATTTTTTCTGCTTCTTTCAAATAGGTAATAAAACCATTTTTCCGTTCAAGCGTTCGCGCATTGAGATCGAATTGATTCATCAAAGCGCAAATCGCCTCATTGTGCTCCTCATAAACAGAGAAAATTTCTAAATGATAAGAAGAAGTTTCCGGATTATTAACTGACCCACTTGCCAAAAAGGCTCCACGTAAATAAGCACGTTTGGCGCTCCTCTTCTTAACAAATCCCCTATCAATCGATTTCGTAAACGTCATCGGTGGCTCTAGTATCCGTAAATCTTCCAAAATCCCCCGTGTACCTGACTTCAAGCGAACTATATAAACATTATTTTTTTTCAACTTCATTTTGCGACGTACAAGAAGTTCTATTGGCACTTCGTATAAGTCTTTCAGTAATTGATACATTCGTCTAGCTATGGCTGCATTCTCGGTTTGGACATCCATTATCACTAATTGATTCGAAAACGAGATGGCACCATTCATTCGAATAAAAGCTGCGAGTTCCACTTTTGCATCGCTATCACTTACGTCCATATGGGTTAATTCTTTCTTGGTTTCCGATGCAAATGACATGGCTTACTCACTCCTTTTCAATAGTTTGGTTAGGTAACATCGCTAAAAGCGCGTCCGCCACCTTTTCAGCAGCATGGCGCACAAGGCCATCCTCTGTAGAAAGAAAATCTTGATAAATGGCTTCTACGCCAAGCTCTTCCATTCCTTTGGCATTATGCTCTACTTGCGCAACATCCTCTGGGAATAAAAGTTCTTTCGGAACAGTCGTCGTATTAATTAACGTTTTATCTATAAAAGATTTTCCCACATGCTCATGGATAACTTTAATATGATCCGCATCTGAGAAAAAGTCGGTTTCGCCAATTTGCGTTAAAATGTTCGTAATGTATACTTTCGGAGCCTTGCTTGCTATAATTTCATCAGCTAATTCCGTAAGTAATAGATTTGGTAAAATACTTGTGTATAAACTCCCTGGACCAATAACAATCAAATCAGCCTCTTTCACTGCTTCGACTGCTGTCGGATATGGTTTTACATTTTCTGGTTCAATATACACACGATTAATATGCTTTCCTTGTAACGGGATAAGCGATTCACCGTGCACAATAGAACCATCTTCCATTTCGGCATTTAAGATGAGTGGTTGATCCGTTGCTGGAATAACTTTGCCGCGGATTTTCAGCACCGTTGCTAGCACATTAATCGCATCAACATAACTATCATTCAATTGCGATAAAGCCGTTAAAATCAAATTTCCAATAACATGCCCCGATAAATCACCATCTACCGCAAAACGATATTGAAATAAATCGACAACCCGTGGATCAACATTGGATAAAGCTAGCATGACATTGCGTATATCACCTGGGGGAAGCACATCCATTTGCTCGCGAATTTTACCAGAACTACCACCATCGTCCGCTACGGTCACAATGGCCGTTAAATGTATATCCTTCTTTTTAAGCCCTTTTAAAATGACTGGAAGACCGGTCCCGCCACCGATTACTACTACTTTAGGTTTCGTTTCCTTTTTCATATTAACGGCCCTTTCTACGTTTCATATCTCGGTGTGAAATCGTTGTTTCATATTTTTGTTGAATTGCCTTACCAACGAACTCTGTCAAAGCTACTGAACGATGCTGTCCTCCAGTACATCCAATGGCAATAACTAATTGTGTTTTTCCTTCTCGTTTGTAAAAAGGAAGTGTAAACATTAATAGATCTACTAACTTATCTAAAAAGGTCTGCGTTTCTGGCCATTTCATCACATATTCATACACATCTTCATCAAGTCCTGTCAGCGGACGCATTTTGTCAATGTAATGCGGATTCGGTAAAAAGCGCACATCAAACACTAAATCAGCATCAATCGGAATGCCGTATTTGAAACCAAATGACATCAATTGCACATTGAATATATCTTTATCTTCGGTTTGGAATTCATTGTTAATTCGCTCGCGTAACTCACGTGGCGCCATATTCGATGTATTAATAACTAACTGCGAACGGCCTTTTAAATCACTAAGCAGTTCGCGCTCTGCATTAATCCCGTCTAGCACAGACCCATTAGGCTCCAGTGGATGGTGGCGGCGCGTTTCTTTATAACGCGAAACAAGTACCTTATCATCAGCCTCTAAAAAGAGAATTTTCGTTGTTATAAAATTGGTATTATCTAGCTCATCTAGCGCTGGTTCAATGGAATCAAAAAACTCACGGCCGCGAAGATCCATTACGAGCGCGATTTTATCCATTTTATCGCTTTCTTTCATTAGCTCCCAGAACTTTGGAAGTAAACTTGGCGGTAAATTATCTACACAAAAATAACCGAGATCTTCTAAAGACTGCATTGCGACTGTTTTTCCTGCTCCAGACATCCCAGTAATGATTACTAATTTTAATTGTTTAGAAGCCATATCTGCCTCATCCTTTCGCACCAATAATATCTATCTTCCATTTTAGCACACTTCTTACTAGAAAATCCCGGAAAAGTCTCTAAAGCGAGTTTCCGGGATTTTTCTTTTTAAGCTTCGATATGTTGCATCAAATCAGCTTTCACTTTTTCTAATTTTGTTGCACTTTCTTCTTTACTTTCACCACGAATACTAAAGTAGAATTTGATTTTCGGTTCTGTGCCGGATGGACGTAAACAGAACCATGAACCATCTTCAAAATAACATTTAATGACATCTGCTGTTGGCAAATGAATCGCTTCGGTTTTTCCAGTAGCAATCCAAGTTGTTTCGCTTCTTAAATAATCTTCCGCACGTTCCATGGGGAATCCACCCATACTTGTTGGTAGTTGCTCGCGAAAATTACTTGTAATTTCTTTGATGCGCCGAGAACCATCCTTACCGCTTAAAGTTAAGGAAACTAGATCTTCTTTGTAATAGCCAAACTCAGCATAAATTTGCTCTAAATCTTCTAGTAAACTTCCACCTTCTACTTTGCTAACGAGCGCCACTTCCGCAATCGCAAGCACCGCTTGAATCGCATCTTTATCACGCGTAAACGGCTTAACCATATAACCATTACTTTCTTCATAACCAAATTCAAACGTATGCTTGCCAGTTTCTTCAAAGTGCTTAATTTGTTCTGCAATAAATTTGAAACCAGTTAATACTTCAATCATTTCCGCACCGTAATGTTTCGCGATTTCTGTTCCAAGATTACTTGTTACAATAGATTTTAATACCGCTGCATTAGCTGGCAATTCATTTTGCGCTTTCTTTTGTTTTAATAAATAATGTAAAATAATCGCGCCAATCTGGTTTCCAGATAACACTTCATATTCGCCGTCAAGATTACGAACTGCCACGCCTAAACGGTCAGCATCCGGATCTGTTCCGACTAAAATGTCGCCACCAAACTTCTTACCATATTCAATCGCAAGTAAAAAGGCTTCGCGGTTTTCCGGGTTAGGCGATTTTACCGTTCCAAAATCGGGATCATTCACAAATTGCTCGTCAACCTTAACAATATTCGTAAAGCCAACACTTTCAAGCGCAGGAACGCCAAGAATTCCGCCAGTACCATGAAGGGGCGTGAAAACAATTTTCAAATCCTCCCCTCGTTCTTGAACAAGCTCTTTATTGACAATAACCTCTTTTAATTTTTCCAAATATGGACGGTCTACTTTTTCACTGATTACCTCAAGTAAACCATTTTCAATTAATAGCTCTTGGTTCGCTACTTCTACAGAAAAAATATCCTCTACCGCGTTTATGTATTCAATTACAGCACTTGCCCCTGTTGGAGGCATTTGTCCGCCATCTTCACCATAAATCTTGTAGCCATTGTATTCTGGTGGGTTATGGCTAGCTGTAATAACAATCCCACCAAACGCATTTAAATGACGTACTGCAAAGGAAAGTTCCGGTGTTGGTCGAAGCGCATCAAAAACATAGCTTTTCACACCATGATGCCCTAATACCGCCGCCGATTCAAAAGCAAATTCGCGTGACATATGACGAGGGTCATACGCAATTACTATTCCGCGCTTCTTAGCCTCGTCACCGTTCTCCGCCACAAATTGCGCCAAACCTAGAGAAGCCTTACGAATAGTATAGATATTCATGCGGTTTGTTCCAGCGCCTAGTACACCACGCATCCCAGCCGTTCCAAATTCCATATTACGATAAAAACTATCCTCAAGTTCTTTTTCATTTGCTTCCATATTCGTTAATTGTTTTCTTAATGTGCTATCTAATTTGTCATTAGCAACCCATTTTTGATATTCTTCTTGCCAATTCATTCTCTACACTCCTTCATTTAGAACTCTTTAATTAAAATTTATCAGCTCTCCACTGTGAAACGAAAAGCTGTTCTAGATGTAAAAGGTTTTTCTGGTCGAAGTACAATATCACCAAATCCGTCATGGTTAATCGCATCTACTAAACCCTGTGTTTCCATTGTTATGCCAGCATATTTTGGCACAGTTCGCTCGCCAATCTCAAAAGAGCCATCCAAACTATTCGCCGTATAAATTAATACCGAGTCAGCTTTGGTTTCCATTTCCAAGCGCCGTCCTGACTTTGGATCAAACAAAACTGCATCTGGACGACCATTTTCATGTTTTAAAATGAACGTATGATCCAGCCCCGCACCAACTAATTTTACTTGCTGGTCCTGACTTTGTGTAATCTCCGCTACTTCACGACCTGCACGCAAATCAAAGATAGTATTTTCCGCTAACCGCTTTTCCCCAATTGGGAGAAACTCTTCATCAATTGGTAGGAAGCTGTCACTATTAACCCAAAGCTGATGTTGTAAAACCGTTGAACCAGCTTCTCCGCTTAGATTAAAATAAATATGATTGCTCGGGTTATATATAGTCGGCTGATCGCTTTTCGCTTCATAATCAAGCAGCCATTCATTTTTATTATTTAACGTATATGTCATTTTTGCATCAATATTTCCTGGATAGCCATTTTCTCCATCCGCCCAGCAGTATTCAAAAGTCATCACAATTTGATCAAGACTTTTTTCTACTGAAACATCCCAAAGCTTCTTACTAAAATTGAATTTCCCACCGTGACGATGGTTAGCTCCTTCATTTTGAATCAGTTGAAATTGTTTACCGTCCAAACTAAATTGCCCATTTGTAATGCGTCCAGCAACAGGGCCAAGTGTCGCGCCGAAGTATGGGGAGTGTGCCAAATAATCATCTAAATTTGTAAAACCAAGACTAATATTCGCAAAATCACCAAATTTATCTTTTGTTTCAAGGGAAGTAACAATCGCTCCGTAATTTAAAACACTCATGCGCATACCATGATCATTTACCATCGTCCACTTCCAAACAGTTTCTCCCTCAAACTCCCCAAATCGCTCCTTCATTACTTCGATAAAAATCACATTCCTTCATAAGTTATTAATAGCCATTTGGATGAGATACGTGCCATTTCCAAGCAGTGGCGATAATATCTTTTACGTCTGTATAAGTTGGCTCCCAACCAAGAATTTCACGCGCTTTATCACTTGAAGCAATTAACGTTCCTGGATCTCCTGCACGGCGTGGTACAACTTCAGCTGGAATTTCTTTACCTGTTACAGTACGAGCTGCTTCAAGCATTTCTTTCACTGAAAAACCGTTACTGCTACCAAGGTTGAAAATATTACTTTCCCCGCCATTTTTCAAGTATTCTAGCGCTTTAATATGCGCGTCAATTAAATCTTCTACTTGTACATAATCACGAATACAAGTACCATCAGGCGTATTGTAGTCGTCACCGTAAATCGCTAATTTTTCTCGTTGACCAAGCGCAACTTGTAAAATAATTGGGACTAAGTGTGATTCTGGTTTGTGATCTTCCCCAATTGAACCATCCGCTTTGGCGCCAGCAACATTAAAATACCGGAGTGCAACATATTTCATATCATACGCTTTATCGCACCATTTCATCATTTTTTCCATGATTAGCTTCGTTTCGCCGTAAGTACTTTCCGGATTTGTTGGCATATCTTCCGTAATCGGTACTCGTTCTGGCTCACCATATGTTGCAGCGCTAGAAGAAAAGACAATATGTTTCACACCAAATTGCTCCATCACTTCTAAGACAATTTGCGTACCATAAACATTATTATTTAAATAAACAAGCGGTACTTCCATCGATTCTCCTACAAGTGAACTAGCAGCAAAGTGAACCACACCATCTACCTTTTCTTTTTCAAAAACTGAACTTAAAAATGCCTTATCTCGAATATCTCCTTCATAAAATTTTGCCTTTTTATGAATGGATTCCTTGTGCCCTGTTCTTAAATTATCAATAACTACTACTTCATATCCGCGAGTAATTAACTCATCTACTGCATGTGAACCGATATAGCCAGCGCCACCAAGTACAGCAATACCCATTACTTATCTCTCCTAATACTTGTCTTTGTCTTCCATTTTACACTACTCAAGTCTATATAGTCACGCAAAAATGGGTCTAAGATAAATAATCCTAGACCCATTTGCACTTTTTACTATTATTTAGCTGCTTCAGCTTCTAATGACTCTTTTAATTCTTCTACATATTTTTGAGCGTTTTGTCCAGCAAGTCCGCCATCGCCTGTTGCTGTTACAATTTGGCGTAAGCTTTTCGCACGAACATCACCAGCTGCAAAAATACCAGGAAGGTTTGTACGCATTTCCTCATCTGTTACGATATAGCCCTCATCATCTGTAATACCTAAATTTAAGAATGCTTTCGTAAGTGGAACAAGTCCAACATAGATGAAAACACCATCCACTGGCATAATAGATTCGGAACCATCCACTGTGGAAACAAGTTTTGCTCCAGTTACTTTTTTGCCATCGCCAACAATTTCTTCTACTGTACTATTCCAAATGAAATCAACTTTTTCATCTTTGAAAGCACGATCTTGTAAAATTTGTTGTGCTCGCAATTTATCACGACGGTGTACTATCGTTACTTTATCTGCATAACGAGTCAAATAAGTTCCTTCTTCCACTGCAGAGTCTCCGCCGCCAACCACGATTAATTCGCGATTTTTGAAGAACGCTCCATCACAAACAGCACAATAAGAAACGCCGCGTCCACTAAGCTCTTCTTCGCCAGCTGCGCCAAGTTTCCGGTGTTCAGCACCAGTCGCAATAATAATCGCCCGAGCTTTATAGGTTTTCGATCCAGCCGTTACAGTTTTAAATTCTTTGCCATCAACGACTTCTTTAATGTCCCCATAAGCATACTCAGCGCCAAATTGTTTCGCACCGCTAAGCATCTTATCGGATAAATCGGGTCCTAAAATACTATCAAATCCAGGGTAATTTTCAACCTCAGCTGTGTTAACCATTTGTCCACCAGGTACACCGCGTTCAATCATTAACGTATCTAAATCTGCACGGGAAGTATATAAAGCAGCTGTCATTCCAGCTGGTCCCGCTCCAATAATAATCACATCATAAATTTTTTCTTCACTAGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP019622|2635634:2643476|2642516_2643476_-|WP_003722610.1|DBSCAN-SWA MASEEKIYDVIIIGAGPAGMTAALYTSRADLDTLMIERGVPGGQMVNTAEVENYPGFDSILGPDLSDKMLSGAKQFGAEYAYGDIKEVVDGKEFKTVTAGSKTYKARAIIIATGAEHRKLGAAGEEELSGRGVSYCAVCDGAFFKNRELIVVGGGDSAVEEGTYLTRYADKVTIVHRRDKLRAQQILQDRAFKDEKVDFIWNSTVEEIVGDGKKVTGAKLVSTVDGSESIMPVDGVFIYVGLVPLTKAFLNLGITDDEGYIVTDEEMRTNLPGIFAAGDVRAKSLRQIVTATGDGGLAGQNAQKYVEELKESLEAEAAK >NZ_CP019622|2635634:2643476|2640338_2641400_-|WP_009918600.1|DBSCAN-SWA MIFIEVMKERFGEFEGETVWKWTMVNDHGMRMSVLNYGAIVTSLETKDKFGDFANISLGFTNLDDYLAHSPYFGATLGPVAGRITNGQFSLDGKQFQLIQNEGANHRHGGKFNFSKKLWDVSVEKSLDQIVMTFEYCWADGENGYPGNIDAKMTYTLNNKNEWLLDYEAKSDQPTIYNPSNHIYFNLSGEAGSTVLQHQLWVNSDSFLPIDEEFLPIGEKRLAENTIFDLRAGREVAEITQSQDQQVKLVGAGLDHTFILKHENGRPDAVLFDPKSGRRLEMETKADSVLIYTANSLDGSFEIGERTVPKYAGITMETQGLVDAINHDGFGDIVLRPEKPFTSRTAFRFTVES >NZ_CP019622|2635634:2643476|2641416_2642400_-|WP_009918601.1|DBSCAN-SWA MGIAVLGGAGYIGSHAVDELITRGYEVVVIDNLRTGHKESIHKKAKFYEGDIRDKAFLSSVFEKEKVDGVVHFAASSLVGESMEVPLVYLNNNVYGTQIVLEVMEQFGVKHIVFSSSAATYGEPERVPITEDMPTNPESTYGETKLIMEKMMKWCDKAYDMKYVALRYFNVAGAKADGSIGEDHKPESHLVPIILQVALGQREKLAIYGDDYNTPDGTCIRDYVQVEDLIDAHIKALEYLKNGGESNIFNLGSSNGFSVKEMLEAARTVTGKEIPAEVVPRRAGDPGTLIASSDKAREILGWEPTYTDVKDIIATAWKWHVSHPNGY >NZ_CP019622|2635634:2643476|2637583_2638459_-|WP_003722606.1|DBSCAN-SWA MASKQLKLVIITGMSGAGKTVAMQSLEDLGYFCVDNLPPSLLPKFWELMKESDKMDKIALVMDLRGREFFDSIEPALDELDNTNFITTKILFLEADDKVLVSRYKETRRHHPLEPNGSVLDGINAERELLSDLKGRSQLVINTSNMAPRELRERINNEFQTEDKDIFNVQLMSFGFKYGIPIDADLVFDVRFLPNPHYIDKMRPLTGLDEDVYEYVMKWPETQTFLDKLVDLLMFTLPFYKREGKTQLVIAIGCTGGQHRSVALTEFVGKAIQQKYETTISHRDMKRRKGR >NZ_CP019622|2635634:2643476|2635634_2636606_-|WP_003725407.1|DBSCAN-SWA MSFASETKKELTHMDVSDSDAKVELAAFIRMNGAISFSNQLVIMDVQTENAAIARRMYQLLKDLYEVPIELLVRRKMKLKKNNVYIVRLKSGTRGILEDLRILEPPMTFTKSIDRGFVKKRSAKRAYLRGAFLASGSVNNPETSSYHLEIFSVYEEHNEAICALMNQFDLNARTLERKNGFITYLKEAEKITEFLSIIGATSALLHFEDVRIMRDMRNSVNRLVNCETANLNKTINAAVRQIDNIKYIQSTVGLEALPERLREIAALRIANEDVTLKELGEMLTTGQVSKSGINHRLRKLDQIAERLRSGETPAQVGLKISNS >NZ_CP019622|2635634:2643476|2636613_2637582_-|WP_003731212.1|DBSCAN-SWA MKKETKPKVVVIGGGTGLPVILKGLKKKDIHLTAIVTVADDGGSSGKIREQMDVLPPGDIRNVMLALSNVDPRVVDLFQYRFAVDGDLSGHVIGNLILTALSQLNDSYVDAINVLATVLKIRGKVIPATDQPLILNAEMEDGSIVHGESLIPLQGKHINRVYIEPENVKPYPTAVEAVKEADLIVIGPGSLYTSILPNLLLTELADEIIASKAPKVYITNILTQIGETDFFSDADHIKVIHEHVGKSFIDKTLINTTTVPKELLFPEDVAQVEHNAKGMEELGVEAIYQDFLSTEDGLVRHAAEKVADALLAMLPNQTIEKE >NZ_CP019622|2635634:2643476|2638566_2640297_-|WP_009927825.1|DBSCAN-SWA MNWQEEYQKWVANDKLDSTLRKQLTNMEANEKELEDSFYRNMEFGTAGMRGVLGAGTNRMNIYTIRKASLGLAQFVAENGDEAKKRGIVIAYDPRHMSREFAFESAAVLGHHGVKSYVFDALRPTPELSFAVRHLNAFGGIVITASHNPPEYNGYKIYGEDGGQMPPTGASAVIEYINAVEDIFSVEVANQELLIENGLLEVISEKVDRPYLEKLKEVIVNKELVQERGEDLKIVFTPLHGTGGILGVPALESVGFTNIVKVDEQFVNDPDFGTVKSPNPENREAFLLAIEYGKKFGGDILVGTDPDADRLGVAVRNLDGEYEVLSGNQIGAIILHYLLKQKKAQNELPANAAVLKSIVTSNLGTEIAKHYGAEMIEVLTGFKFIAEQIKHFEETGKHTFEFGYEESNGYMVKPFTRDKDAIQAVLAIAEVALVSKVEGGSLLEDLEQIYAEFGYYKEDLVSLTLSGKDGSRRIKEITSNFREQLPTSMGGFPMERAEDYLRSETTWIATGKTEAIHLPTADVIKCYFEDGSWFCLRPSGTEPKIKFYFSIRGESKEESATKLEKVKADLMQHIEA |
7 | Streptococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2757791 : 2792974
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP019622|2757791:2792974|DBSCAN-SWA 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50 | Listeria_phage(95.83%) | tail,integrase,terminase | attL 2757168:2757217|attR 2794216:2794265 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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