Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019624 | Listeria monocytogenes strain 10-092876-1016 LM11 chromosome, complete genome | 2 crisprs | DinG,cas3,WYL,casR,RT,DEDDh,csa3 | 0 | 0 | 6 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019624_1 | 507269-507853 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019624_1
|
7 spacers
spacers of NZ_CP019624_1
>1.1|507308|39|NZ_CP019624|CRT TGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTG >1.2|507386|39|NZ_CP019624|CRT TCTTACATGTTTTATGATAATAGAAACCTTGAGGTGCTG >1.3|507464|39|NZ_CP019624|CRT TATGCCATGTTTGAAGATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTG >1.4|507542|39|NZ_CP019624|CRT TATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTA >1.5|507620|39|NZ_CP019624|CRT GTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTG >1.6|507698|39|NZ_CP019624|CRT CGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTA >1.7|507776|39|NZ_CP019624|CRT GCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAACTGGAGAAGCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019624_1
The CRISPR arrays of NZ_CP019624_1 >merge|NZ_CP019624|1|507269-507853|CRT GATTTGAGTGGTCTTGATACTAGTGCGGTAACTACTATGTGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTGGATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATGTCTTACATGTTTTATGATAATAGAAACCTTGAGGTGCTGGATGTAAGCAACCTTGATACCGGTTCAGTAACTAATATGTATGCCATGTTTGAAGATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTGGATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTGATATGTATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTAGATGTAAGTAATTTCGATACCAGTTCCGCTACTGCAATGGTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTGGATGTAAGTAATTTTAATACGAGCTTAGTAACTGATATGCGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTAGATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATGGCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAACTGGAGAAGCTTGATTTAAGTACCTTTGATACCAGTTCAGTGACTAACATG >NZ_CP019624|1|1|507269-507853|CRT GATTTGAGTGGTCTTGATACTAGTGCGGTAACTACTATG TGGGATATGTTTAACAGCTGTAGGGCACTTGAGGAACTG GATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATG TCTTACATGTTTTATGATAATAGAAACCTTGAGGTGCTG GATGTAAGCAACCTTGATACCGGTTCAGTAACTAATATG TATGCCATGTTTGAAGATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTG GATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTGATATG TATAGAGTGTTTAATGGCTGTGAAAAACTGAAGAAACTA GATGTAAGTAATTTCGATACCAGTTCCGCTACTGCAATG GTTCAAATGTTTAGAAATTGTAGCGCCCTTGAGAAGTTG GATGTAAGTAATTTTAATACGAGCTTAGTAACTGATATG CGTGCCATGTTTGCTGGTTGTACTAGTCTTGAAGCGTTA GATGTAAGTAATTTTGATACGAGTTCAGTAACTAATATG GCTGCCATGTTTTCTGATAATGAAAAACTGGAGAAGCTT GATTTAAGTACCTTTGATACCAGTTCAGTGACTAACATG
>NZ_CP019624.1|WP_023550313.1|504394_506476_+|BspA-family-leucine-rich-repeat-surface-protein MKKFSMRVVLIISVLFIALGNANVSIAQERDTTNKLPEEELGSLDTSNLIAEEVAQEKPAEVENLEEIPTTDELMQNPEVREQPVADSDDPDLTAVSSGDYWTIYYNSANDEYSLRMFGNVPSSKPSAWNSYLKYIKHIEIEEATLTGDFSSYFRSNVFTVLESVRIERSNLSGVTSFARAFEGDSESESPLEKVIIRDNYYQETPSLTNISRMFTLCRKLSELDVSGLNTSSVTKMDTIFSNANSLKELDVSHFDTSSVTDMSSMFAACNSLEELDVSNFDTSSVTNMKYMLSGLHLKKLDVSNFDTSSVTNMYGMFAYCYNLEELDVSNFDTSSVNNMLHMFYVCNNLEELDLSNFDTSSVTNMFAMFAYCTSLKEIDVSNFDTSSVTTMSAMFFECSSLEALDLSNFDTSSVTTMASMFENSTALKSLYLDNFTDAASMTDMFKGTTSLTYLFVSHNLSTFNRLENTSWYDEKNWVQFSNLSQLQTYHRKQSEPTGYRKGAFLSLTMDAMGGEFEDAEEQKVQNKVSGEYWEEIVPVKEDYYFDGWYLDQNFTNKFDFSLPAAVSTTIYAKWVENYTVIIPASISLNEATELKVEGINRGSKALSVGLNRLATSVSESNELTLANTADTTVQCSAPLSWDGSENNPEKAILTLAPGSEITEGDAVMAIEAPENIQAGKYTGNLVFSINYE >NZ_CP019624.1|WP_023550311.1|502592_504131_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MREYLDSKSQKKVALLEKIFYAENHTSTQEELLNDLNITYPTLISTIKTINFDIERFGYKAFSIVHSAPNLSYTLKISDNCSIQLIINAYIRESPKFQILETLLLASFPNLQALAKKVHVSYSGIKKEIKELNEELRERNLSISTGNQVEITGDEFSLRIFYAFLFLVAYSGDRWPFSFVQYDEITDILESCPKEIYRANSIDKAMMIHYYVAMHLLRDRMNCQIDTTRQFKVALYKACTEESKKSESAFIKKVAKQLPNRNYKEMTYTTQIILSTIVAFGSYSSIEKMPSFFYMDEQLEEMGFMKLVDFASEQVNDNLSIPFSEKEMELLRYSFASINYRYFLLDNLINKFNNIVPGYTNLDRNIRKIHKVNHLEPLISQLVNLKEMDPLKPFEERLASDYLIILDKRIDFSIHTLPIKVTILSTISNETAVFDFMRYFSSYYNLEIINQVDPVVDLYISDFSVSPEVLTSLRINQPIIYVNTRWLESDYVKINDNLAKIARKKFIANKKN >NZ_CP019624.1|WP_003728092.1|500408_501959_+|hydantoinase/oxoprolinase-family-protein MYKIGIDVGGTNTDAVILDENQQLIHSVKMPTSEDIETGITESLHRVLSETGIDRSKVTHAMLGTTQCTNAIVERKKLAKVGVLRLGYPATASVLPYTAWPEDMVGFLSGKYKLTGGGYEYDGQVLSEINEAEIRETLASWKGEVESVAVVGVFSSLKNDQELAVQKIIEEELGADIPVSISSSVGSVGLIERENATILNAALFKVIAATSDGFEKALEQEGIAHAEIYLCQNDGTLMSLNYARQFPILTIACGPTNSIRGASYLAGLKDAMVLDVGGTTSDIGVLTDGFPRESSLAVDVGGVRTNFRMPDIISIGLGGGSIVREKDGDITIGPDSVGYRISEEALVFGGKTMTTTDIAVRLGRAEIGNPELVAHIPTDFAEKAYKKIAEMTEDAIDKMKTSSGSVSLVLVGGGSVIIPDEISGVAQIFRDKNGPVANAIGASISQISGQYEQIYIYSQIEREEALQDAEQKAREQATLAGAVTDSIEVVEVEEIPLAYHPGNATRLRVKVVGNLV >NZ_CP019624.1|WP_003728093.1|499315_500416_+|DUF917-domain-containing-protein MRYLDEQAIENIAIGAAFLGTGGGGDPYIGKMMALTAIKKHGPIKLLSPEEIADDDYFIPAAMMGAPSVLIEKFPKGDEFVRVFEKLGRYVGKEVKGTFPMEAGGVNSMIPIVVAAQLGLPMVDCDGMGRAFPELQMVTFHLDGISATPMAITDEKGNIGIMETIDNKWTERLARVTTVEMGASSLVSLYPCNGAQIKQSSIKNIVTLSEEIGKVIRETSMDEAEKLQKLLDVTHGYHLFEGKITDVVRETRAGFNFGRVKIDGLNKDTGSEVIVHFQNENLVAEKNGEPIAITPDLICMVDLETLMPVTTEALKYGKRVRVMALPADDAWRTDKGIETVGPRYFGYDVDFEPLEELVKKEERRHV >NZ_CP019624.1|WP_003725189.1|498031_499315_+|cytosine-permease MTEKKSVEQTQSWQSLAFVWTGAMICVPSLLVGGTLISGMPLWEAILIALLGYGVIVLFMIYQGMQSSDLGIPAVSVASQVFGEQGSKKIISILLAIACLGWFGIQANVCGAAFSQFLGIYGINLPVPVSSLIWGVIMLLSAIYGIRILSILNYIAVPVLLFVCIYGLVVSLNDGGLAIVENYKPAGSMSFMTGLAITIGSFALGAVIAGDYSQYTKSRKDVVKAAIVGILPSGVLMITVGAVLALTAGTADISVVFTNLGLPVLGIIGLILAAWTTNAVNAFSGGIAIINVFNISEKYHKVAVAVAGGLGTILAVIGILNHFVPIMSVLSAMVPPVAGVMIASYWIVQKGDKSKWAPVPGVNWLGVSSWLVGAVIAGIPVILTFFPELPQLPNQPLIGIILSLAVYLIGAKVLSGKTNNVENLEGK >NZ_CP019624.1|WP_003740428.1|496301_497897_+|PucR-family-transcriptional-regulator MSVKLADLMKLPSLKEAKVVSGKSGLSKLVSSISVLEYTEVALLEDDLFDNDEFYGSEIVVSAFVNIRDDVEAQCRTIERLHKVGEVALILYYVGIFVPKMDQKLIDFANELDFTIIVMPENEMSLRYSEVIYEVVEAIVKQEMTDTNFVTESLEQISSVRPPQRNIDTTLKILSDRTHTSLVLTDNSFQVINSITWPRTRHWDFERIIEASKQIGEHELVQLTLDERDFYTARKPIFQDGMQAMHLFMMKEKGVLTADVVMQITEVVQVFMNLWGRNYVEISTAELMKAILNDESVKMRRLGKILNVDVSSIKWMWLVKTEEIRDNEQVLAELKSFVASHFQVSLIDLFEDNIVVLLDNSVAQRDRTHTANEFAMMMKEHGIDLKITVCQGMEQTSDVQSAYSLVNEYKNAANAIYANKSIYSLQEIDFAAKCVEIVDRGELAIAEQMRPLKPLEDNDELIETLSVFLLEGESNYNQAAELLFLHKNTIKYRIQRINELLQYPATKIPESYNLYLAVAIRRILGGNNNNK >NZ_CP019624.1|WP_003721242.1|495198_496146_-|MoxR-family-ATPase MSIEPSIKIEEIINEVEKVIVGKRHVVKLSLTALLAGGHVLLEDVPGVGKTMMVRTLSKTIGVSFKRIQFTPDLLPADVTGVSIFNPETRDFEFRPGPVMGNIVLADEINRTAPRTQAALLEGMAENSVTVDGITRKLANPFFVMATQNPIEYEGTYALPEAQLDRFLLKINIGYPTVEEEMQLLTLKQYQDPLDQTQQVVTLSELLDLKNKAKQVFIDDVLKNYIIRLVDATRKHPSVALGISPRGSLAFMQAAQAFALIEGRDYVIPDDIQYLAPYIFTHRLILKSEAYYNEETAESIIASILKNTSVPVEKR >NZ_CP019624.1|WP_009929138.1|494045_495194_-|DUF58-domain-containing-protein MLKKRLLLAFRWIIMLIIYAGLWTYTLFQGDTASWFLTYFFSFILLLLFLSSIYPLKAWKVNRRFVKNTYHDGDLIDMQVSFTRKSRYPVGYLLFQQKIPASFGNVSARQQVVYPLFKKHFTVTLAGFVGVRGIHSFPPVDVETSDAFGLLERSRQLSSEKSLTIYPTYFPDVLEKISEASPENERNAAYWTLKKNSNLHSLREFSSGDRISLIDWKSSAKSDQLMTREFENSATSRLSVIFYGASHPNFELSLRAAYSFIRKISEDNGEIRVTLLGDQTSKFAPAKGTSRLQDISTAFAEIAPVDSLTLQESLDSNLHSGEKILLFTPCIDTMLMQKVTRLTDNKQLQIITFQSEHSKAMDAPAIFLEPASLLSRWEREAK >NZ_CP019624.1|WP_003725186.1|491889_494049_-|transglutaminase MKRYLTLVMLFILSVLLISEWIYPFAELTELSTANWIILFITLSLGSFFLRLKYYWTIPLHIVMIIFVSGIYYAKGGILAGNWFVSFFQITFNGFRDMVQFRSSDISMDFILIVFLIALWLLSYITTYSILRKQRVMSVLVLTVAYLAVINTFTDYNSNWAIVRTVLEGFLLLHLALASRIAAPNRISADSLKRNGLFYHIFVILLLAVFVFSSLMLPKKAPIFPDPVPTIKNALGINTTRTVGYSEDDTTLGGALKKDNATVFTARAEKGHYWRVESKTVYTGTGWANANSADVISFSSGDNFPIQLTEQTTGATNTAEISFASSNDYMPYPYGTQTVNGAVDSFSANLTIERVGPVDTIKNYTVQLKTPVYNIEKMQNADFSTLSNAFVSQYTQTPKDLPDRVTKLANKVTKDADSIYDKTKAIERYLSASGTFTYSTEDAKETPRGADYVDQFLFETQIGYCDNFSTSMVVMLRSLGIPARWAKGYTPGEGEKKENDAKTTYTITNNNAHSWPEVFFPGTGWVPFEPTATFSNPENFQEPTTETANKPETPNDSTSTPETPNTADKTPEQDNGSSSTGETPKKEEPKTETAASNFEIPSWVWWIPAGLVVTLLALAIIFRRRIRRYLLLRSLRNSPEFGKTYHRLMKLLASYGYVRESSETLRHFSTRVDAELTTTEFSRLTKMYEAQIYSNNLTEKVITAEETQLVQQVIARLTK >NZ_CP019624.1|WP_003734632.1|491017_491773_-|DUF4866-family-protein MTTIFPKEQNVAPLFEQILANPTACRRFKDVFLDNLESYQETRGFEKDDTLFAKIILSAYRQSDVSALLLGVCGRTLFELLRQAFLIPKKLTVDNPFFLTDKEGNFIAKKDDISNREQEKFQEIYQSDLHHSETTIFLVDDDDIIHSYEPDFSISTKRINKKRGILVLYSLPDTLKLGMTESEVYAFIWKTFLHIQEIIPSSRIFYGQETSENADELGVFLPIHHFEKKMLQNIEQVNELVDALREQMVNK >NZ_CP019624.1|WP_026747116.1|508816_510574_+|BspA-family-leucine-rich-repeat-surface-protein MKKFSMRVVLIISVLFIALGSANVSTAQERDTTNKLPEVELGSLDTSNIIAEEVAQEKPAEVEQLEEIPTTDELMQNPDVLEQPVADSDDTDLTVVSSGDFWTIYRNTVNNEYSLCMFGNVPSSRPTAWNTYLNRIKHIEIEEATLTGSFASYFSGDYFTVLESVKIEQCNLSGVTSFEKAFYNSGIEKVIIRDNDYPTAPSLLTTQYMFQLCRKLSELDLSGLDTSAITNIYGMFQFCSGLEELDLSHFDTSSVTNMYSMFSGCGSLEILDVSNWDTSSVTNMNRMFQNCTSLEELDLSTFDTSSMTDMGMMFNGCTALKSLYLDNFTDAAIMTDMFTGTTSLTYLFVSHNLSTFNNLENTSWYDEKNWVQFSNLSQLQTYHRNQSEPTGYRKGAFLSLTMDAMGGEFEDAEEQKVQNKISGEYWEEVIPVKEGHYFDGWYLDQNFTNKFDFSLPAAVSTTIYAKWVENYTVVIPASISLNEATELKVEGINRGSKTLSVGLNYGETTISENNKLTLSNTADATVQCLVPLSWDGSENNPENAILTLAPGSEITEGDAVMEIKSPENIQAGKYTGNVVFSIKYE >NZ_CP019624.1|WP_003721252.1|510639_511113_+|hypothetical-protein MKKKRVVIISLLLLLVSVIGISSYFLFKDKINLLDVDHSAVDWNGKKQKDTSGEENTIAIPGFEKVTLYANETKQAVNFHNPEINDCYFKISLIHPDGSVLWISDLIEPGKGMYSIELEKTLAVGEYENAVLKYECFSLNDQSPLNGSEINLKLVVV >NZ_CP019624.1|WP_003721253.1|511132_511618_+|hypothetical-protein MNKLVLSTLSVAAMGMVFFSGGTAYAADKEGNTVVEYSVEGDYTLVVPEKVNLSNDNATEMSVKTINRNLEPGKEVEVTLSSGLSADGEIELQRVGAISDVITSSFKSNNSVVPMANPVIGSFSGYAMEETEVSKIQIGNPQGDKKAGAYQTTLTFTAAFK >NZ_CP019624.1|WP_003727318.1|511645_511951_+|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein MKRKLVLAMVLISFCGMFFLSPDRVQASQTVVEVLISEDDLDVSEENIQEIPKKELAASSDKDNKQPILPKAGDTVTNYTLLGLVLVLIWLIMQRKRKKKE >NZ_CP019624.1|WP_003725199.1|512026_512293_+|hypothetical-protein MARIEYGEEIQKSLLVLYSRGSTIDSICKEYGIPRYEFHKWMKLHDADKLETKEVKTFLQIRELKQQKNKLEEEILFLNEAINLLESP >NZ_CP019624.1|WP_003733207.1|513405_513966_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator 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MEKSSIYGLTWTKLTEWLEAHGQKKFRATQVWDWLYRKRVKTFEEMSNVPKETIELLTANFVMNTLEEQVVQESTDGTTKYLFKLSDGNLIETVMMKQEYGLSVCVTTQVGCNIGCTFCASGLLKKSRDLTAGEIVEQIMNVQHYLDGRNLEERVSHVVVMGIGEPFDNYDNVMDFLRVINHDKGLAIGARHITVSTSGLAPRIIDFANEDFQVNLAISLHAPNNELRTSIMRINKTYSIEKLMEAIHYYVNKTNRRITFEYIMLKGVNDHKKEALELAALLGEHRHLAYVNLIPYNPVDEHIDYERSTKEDVLAFYDTLKKNGINCVIRREHGTDIDAACGQLRSKQIKRVGVRERMKQKQAAAEE >NZ_CP019624.1|WP_003725209.1|517119_517599_+|AraC-family-transcriptional-regulator MEVEIVERNAFTAVGKKRTFSVENDAQKEKISQFWQEANTNGDAERINELAEFATIDGILGVCKMNGDKMDYYIAIESELTPPADMEKLIIPASKWAIFKSVGPLPSAIQKVWEYIYGEWFQTSNYAHGNAPELEVYTEGDTTAADYYSEVWIPVVEKE >NZ_CP019624.1|WP_003721271.1|517756_518122_+|heme-oxygenase-IsdG MIIVTNTIKVEKGAAEHVIRQFTGANGDGHPTKDIAEVEGFLGFELWHSKPEDKDYEEVVVTSKWESEEAQRNWVKSDSFKKAHGRTKDTREQREDRKGIVGNAIARFEVVHVQNPVIVEK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP019624_2 | 509489-509746 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019624_2
|
3 spacers
spacers of NZ_CP019624_2
>2.1|509513|54|NZ_CP019624|CRISPRCasFinder TATGGCATGTTTCAATTTTGCTCTGGTCTTGAAGAGTTAGATTTAAGTCATTTT >2.2|509591|54|NZ_CP019624|CRISPRCasFinder TATTCCATGTTTTCGGGTTGTGGATCACTGGAGATTTTGGATGTAAGCAATTGG >2.3|509669|54|NZ_CP019624|CRISPRCasFinder AATAGAATGTTTCAAAATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTAGATTTAAGTACCTTT |
RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019624_2
The CRISPR arrays of NZ_CP019624_2 >merge|NZ_CP019624|2|509489-509746|CRISPRCasFinder GATACGAGTGCTATAACTAATATATATGGCATGTTTCAATTTTGCTCTGGTCTTGAAGAGTTAGATTTAAGTCATTTTGATACCAGTTCCGTTACTAATATGTATTCCATGTTTTCGGGTTGTGGATCACTGGAGATTTTGGATGTAAGCAATTGGGATACGAGTTCCGTTACTAATATGAATAGAATGTTTCAAAATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTAGATTTAAGTACCTTTGATACCAGTTCAATGACTGACATG >NZ_CP019624|2|1|509489-509746|CRISPRCasFinder GATACGAGTGCTATAACTAATATA TATGGCATGTTTCAATTTTGCTCTGGTCTTGAAGAGTTAGATTTAAGTCATTTT GATACCAGTTCCGTTACTAATATG TATTCCATGTTTTCGGGTTGTGGATCACTGGAGATTTTGGATGTAAGCAATTGG GATACGAGTTCCGTTACTAATATG AATAGAATGTTTCAAAATTGTACTAGTCTTGAAGAGCTAGATTTAAGTACCTTT GATACCAGTTCAATGACTGACATG
>NZ_CP019624.1|WP_026747115.1|506611_508681_+|BspA-family-leucine-rich-repeat-surface-protein MKKLSIRVILIVTIIFIACGSANVSIAQERDIINKLPEVELGSLYTSNLITEEVAQDKPAEVENLEQAPTTDDLVQNPDVLEQPIADSDDSDLTVVNSGDFWTIYRNTVNGEYSLHMFGNVPSSKPTAWNSYLNRIKHIEIEEATLTGNFSSYFRNNVFTVLESVRIERSNLSRVTSFALAFYGSGIEKVIIRDNNYPTAPSLLTTEGMFKNCSNLMEVDLSGLDTSAVTTMWDMFNSCRALEELDVSNFDTSSVTNMSYMFYDNRNLEVLDVSNLDTGSVTNMYAMFEDCTSLEELDVSNFDTSSVTDMYRVFNGCEKLKKLDVSNFDTSSATAMVQMFRNCSALEKLDVSNFNTSLVTDMRAMFAGCTSLEALDVSNFDTSSVTNMAAMFSDNEKLEKLDLSTFDTSSVTNMGTMFKNCTALKSLFLDNFTHAASSTDMFTGTTSLSYLFVSHNVSNFNGLENTNWYDEKNWVQFSNLSQLQTYHRKQSEPTGYRKGEFLSLTMDAMGGQFEDAEEQKVQSKISGEYWEEVIPVKEGHYFDGWYLDQNFTNKFDFSLPATVSATLYAKWVENYTVVIPASISLNEATELKVEGINRGSKTLSVGLNYEETTISESNKLTLSNTADTTVQCLAPLSWDGSETNPKNAILTLAPGSEITEGDAVMEIESPENIQAGTYTGNLVFSINYE >NZ_CP019624.1|WP_023550313.1|504394_506476_+|BspA-family-leucine-rich-repeat-surface-protein MKKFSMRVVLIISVLFIALGNANVSIAQERDTTNKLPEEELGSLDTSNLIAEEVAQEKPAEVENLEEIPTTDELMQNPEVREQPVADSDDPDLTAVSSGDYWTIYYNSANDEYSLRMFGNVPSSKPSAWNSYLKYIKHIEIEEATLTGDFSSYFRSNVFTVLESVRIERSNLSGVTSFARAFEGDSESESPLEKVIIRDNYYQETPSLTNISRMFTLCRKLSELDVSGLNTSSVTKMDTIFSNANSLKELDVSHFDTSSVTDMSSMFAACNSLEELDVSNFDTSSVTNMKYMLSGLHLKKLDVSNFDTSSVTNMYGMFAYCYNLEELDVSNFDTSSVNNMLHMFYVCNNLEELDLSNFDTSSVTNMFAMFAYCTSLKEIDVSNFDTSSVTTMSAMFFECSSLEALDLSNFDTSSVTTMASMFENSTALKSLYLDNFTDAASMTDMFKGTTSLTYLFVSHNLSTFNRLENTSWYDEKNWVQFSNLSQLQTYHRKQSEPTGYRKGAFLSLTMDAMGGEFEDAEEQKVQNKVSGEYWEEIVPVKEDYYFDGWYLDQNFTNKFDFSLPAAVSTTIYAKWVENYTVIIPASISLNEATELKVEGINRGSKALSVGLNRLATSVSESNELTLANTADTTVQCSAPLSWDGSENNPEKAILTLAPGSEITEGDAVMAIEAPENIQAGKYTGNLVFSINYE >NZ_CP019624.1|WP_023550311.1|502592_504131_+|helix-turn-helix-domain-containing-protein MREYLDSKSQKKVALLEKIFYAENHTSTQEELLNDLNITYPTLISTIKTINFDIERFGYKAFSIVHSAPNLSYTLKISDNCSIQLIINAYIRESPKFQILETLLLASFPNLQALAKKVHVSYSGIKKEIKELNEELRERNLSISTGNQVEITGDEFSLRIFYAFLFLVAYSGDRWPFSFVQYDEITDILESCPKEIYRANSIDKAMMIHYYVAMHLLRDRMNCQIDTTRQFKVALYKACTEESKKSESAFIKKVAKQLPNRNYKEMTYTTQIILSTIVAFGSYSSIEKMPSFFYMDEQLEEMGFMKLVDFASEQVNDNLSIPFSEKEMELLRYSFASINYRYFLLDNLINKFNNIVPGYTNLDRNIRKIHKVNHLEPLISQLVNLKEMDPLKPFEERLASDYLIILDKRIDFSIHTLPIKVTILSTISNETAVFDFMRYFSSYYNLEIINQVDPVVDLYISDFSVSPEVLTSLRINQPIIYVNTRWLESDYVKINDNLAKIARKKFIANKKN >NZ_CP019624.1|WP_003728092.1|500408_501959_+|hydantoinase/oxoprolinase-family-protein MYKIGIDVGGTNTDAVILDENQQLIHSVKMPTSEDIETGITESLHRVLSETGIDRSKVTHAMLGTTQCTNAIVERKKLAKVGVLRLGYPATASVLPYTAWPEDMVGFLSGKYKLTGGGYEYDGQVLSEINEAEIRETLASWKGEVESVAVVGVFSSLKNDQELAVQKIIEEELGADIPVSISSSVGSVGLIERENATILNAALFKVIAATSDGFEKALEQEGIAHAEIYLCQNDGTLMSLNYARQFPILTIACGPTNSIRGASYLAGLKDAMVLDVGGTTSDIGVLTDGFPRESSLAVDVGGVRTNFRMPDIISIGLGGGSIVREKDGDITIGPDSVGYRISEEALVFGGKTMTTTDIAVRLGRAEIGNPELVAHIPTDFAEKAYKKIAEMTEDAIDKMKTSSGSVSLVLVGGGSVIIPDEISGVAQIFRDKNGPVANAIGASISQISGQYEQIYIYSQIEREEALQDAEQKAREQATLAGAVTDSIEVVEVEEIPLAYHPGNATRLRVKVVGNLV >NZ_CP019624.1|WP_003728093.1|499315_500416_+|DUF917-domain-containing-protein MRYLDEQAIENIAIGAAFLGTGGGGDPYIGKMMALTAIKKHGPIKLLSPEEIADDDYFIPAAMMGAPSVLIEKFPKGDEFVRVFEKLGRYVGKEVKGTFPMEAGGVNSMIPIVVAAQLGLPMVDCDGMGRAFPELQMVTFHLDGISATPMAITDEKGNIGIMETIDNKWTERLARVTTVEMGASSLVSLYPCNGAQIKQSSIKNIVTLSEEIGKVIRETSMDEAEKLQKLLDVTHGYHLFEGKITDVVRETRAGFNFGRVKIDGLNKDTGSEVIVHFQNENLVAEKNGEPIAITPDLICMVDLETLMPVTTEALKYGKRVRVMALPADDAWRTDKGIETVGPRYFGYDVDFEPLEELVKKEERRHV >NZ_CP019624.1|WP_003725189.1|498031_499315_+|cytosine-permease MTEKKSVEQTQSWQSLAFVWTGAMICVPSLLVGGTLISGMPLWEAILIALLGYGVIVLFMIYQGMQSSDLGIPAVSVASQVFGEQGSKKIISILLAIACLGWFGIQANVCGAAFSQFLGIYGINLPVPVSSLIWGVIMLLSAIYGIRILSILNYIAVPVLLFVCIYGLVVSLNDGGLAIVENYKPAGSMSFMTGLAITIGSFALGAVIAGDYSQYTKSRKDVVKAAIVGILPSGVLMITVGAVLALTAGTADISVVFTNLGLPVLGIIGLILAAWTTNAVNAFSGGIAIINVFNISEKYHKVAVAVAGGLGTILAVIGILNHFVPIMSVLSAMVPPVAGVMIASYWIVQKGDKSKWAPVPGVNWLGVSSWLVGAVIAGIPVILTFFPELPQLPNQPLIGIILSLAVYLIGAKVLSGKTNNVENLEGK >NZ_CP019624.1|WP_003740428.1|496301_497897_+|PucR-family-transcriptional-regulator MSVKLADLMKLPSLKEAKVVSGKSGLSKLVSSISVLEYTEVALLEDDLFDNDEFYGSEIVVSAFVNIRDDVEAQCRTIERLHKVGEVALILYYVGIFVPKMDQKLIDFANELDFTIIVMPENEMSLRYSEVIYEVVEAIVKQEMTDTNFVTESLEQISSVRPPQRNIDTTLKILSDRTHTSLVLTDNSFQVINSITWPRTRHWDFERIIEASKQIGEHELVQLTLDERDFYTARKPIFQDGMQAMHLFMMKEKGVLTADVVMQITEVVQVFMNLWGRNYVEISTAELMKAILNDESVKMRRLGKILNVDVSSIKWMWLVKTEEIRDNEQVLAELKSFVASHFQVSLIDLFEDNIVVLLDNSVAQRDRTHTANEFAMMMKEHGIDLKITVCQGMEQTSDVQSAYSLVNEYKNAANAIYANKSIYSLQEIDFAAKCVEIVDRGELAIAEQMRPLKPLEDNDELIETLSVFLLEGESNYNQAAELLFLHKNTIKYRIQRINELLQYPATKIPESYNLYLAVAIRRILGGNNNNK >NZ_CP019624.1|WP_003721242.1|495198_496146_-|MoxR-family-ATPase MSIEPSIKIEEIINEVEKVIVGKRHVVKLSLTALLAGGHVLLEDVPGVGKTMMVRTLSKTIGVSFKRIQFTPDLLPADVTGVSIFNPETRDFEFRPGPVMGNIVLADEINRTAPRTQAALLEGMAENSVTVDGITRKLANPFFVMATQNPIEYEGTYALPEAQLDRFLLKINIGYPTVEEEMQLLTLKQYQDPLDQTQQVVTLSELLDLKNKAKQVFIDDVLKNYIIRLVDATRKHPSVALGISPRGSLAFMQAAQAFALIEGRDYVIPDDIQYLAPYIFTHRLILKSEAYYNEETAESIIASILKNTSVPVEKR >NZ_CP019624.1|WP_009929138.1|494045_495194_-|DUF58-domain-containing-protein MLKKRLLLAFRWIIMLIIYAGLWTYTLFQGDTASWFLTYFFSFILLLLFLSSIYPLKAWKVNRRFVKNTYHDGDLIDMQVSFTRKSRYPVGYLLFQQKIPASFGNVSARQQVVYPLFKKHFTVTLAGFVGVRGIHSFPPVDVETSDAFGLLERSRQLSSEKSLTIYPTYFPDVLEKISEASPENERNAAYWTLKKNSNLHSLREFSSGDRISLIDWKSSAKSDQLMTREFENSATSRLSVIFYGASHPNFELSLRAAYSFIRKISEDNGEIRVTLLGDQTSKFAPAKGTSRLQDISTAFAEIAPVDSLTLQESLDSNLHSGEKILLFTPCIDTMLMQKVTRLTDNKQLQIITFQSEHSKAMDAPAIFLEPASLLSRWEREAK >NZ_CP019624.1|WP_003725186.1|491889_494049_-|transglutaminase MKRYLTLVMLFILSVLLISEWIYPFAELTELSTANWIILFITLSLGSFFLRLKYYWTIPLHIVMIIFVSGIYYAKGGILAGNWFVSFFQITFNGFRDMVQFRSSDISMDFILIVFLIALWLLSYITTYSILRKQRVMSVLVLTVAYLAVINTFTDYNSNWAIVRTVLEGFLLLHLALASRIAAPNRISADSLKRNGLFYHIFVILLLAVFVFSSLMLPKKAPIFPDPVPTIKNALGINTTRTVGYSEDDTTLGGALKKDNATVFTARAEKGHYWRVESKTVYTGTGWANANSADVISFSSGDNFPIQLTEQTTGATNTAEISFASSNDYMPYPYGTQTVNGAVDSFSANLTIERVGPVDTIKNYTVQLKTPVYNIEKMQNADFSTLSNAFVSQYTQTPKDLPDRVTKLANKVTKDADSIYDKTKAIERYLSASGTFTYSTEDAKETPRGADYVDQFLFETQIGYCDNFSTSMVVMLRSLGIPARWAKGYTPGEGEKKENDAKTTYTITNNNAHSWPEVFFPGTGWVPFEPTATFSNPENFQEPTTETANKPETPNDSTSTPETPNTADKTPEQDNGSSSTGETPKKEEPKTETAASNFEIPSWVWWIPAGLVVTLLALAIIFRRRIRRYLLLRSLRNSPEFGKTYHRLMKLLASYGYVRESSETLRHFSTRVDAELTTTEFSRLTKMYEAQIYSNNLTEKVITAEETQLVQQVIARLTK >NZ_CP019624.1|WP_003721252.1|510639_511113_+|hypothetical-protein MKKKRVVIISLLLLLVSVIGISSYFLFKDKINLLDVDHSAVDWNGKKQKDTSGEENTIAIPGFEKVTLYANETKQAVNFHNPEINDCYFKISLIHPDGSVLWISDLIEPGKGMYSIELEKTLAVGEYENAVLKYECFSLNDQSPLNGSEINLKLVVV >NZ_CP019624.1|WP_003721253.1|511132_511618_+|hypothetical-protein MNKLVLSTLSVAAMGMVFFSGGTAYAADKEGNTVVEYSVEGDYTLVVPEKVNLSNDNATEMSVKTINRNLEPGKEVEVTLSSGLSADGEIELQRVGAISDVITSSFKSNNSVVPMANPVIGSFSGYAMEETEVSKIQIGNPQGDKKAGAYQTTLTFTAAFK >NZ_CP019624.1|WP_003727318.1|511645_511951_+|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein MKRKLVLAMVLISFCGMFFLSPDRVQASQTVVEVLISEDDLDVSEENIQEIPKKELAASSDKDNKQPILPKAGDTVTNYTLLGLVLVLIWLIMQRKRKKKE >NZ_CP019624.1|WP_003725199.1|512026_512293_+|hypothetical-protein MARIEYGEEIQKSLLVLYSRGSTIDSICKEYGIPRYEFHKWMKLHDADKLETKEVKTFLQIRELKQQKNKLEEEILFLNEAINLLESP >NZ_CP019624.1|WP_003733207.1|513405_513966_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MAESLITKKAIAGGLMELCQHKRFEKISIADITNICGLNRQTFYYHFTDKYDLLTWTYENDFFHCLADGITLGNWDKHVLKMLESIKENADFYKNTVSADASILSFCFSKLTNSLFMDLFEKIDTNGAVNEADRVFYAEFFSYGCSGVLIKWITRGFKEAPETIANQLFRLAKDTEFLANSMYREN >NZ_CP019624.1|WP_003728986.1|514075_515776_+|oleate-hydratase MKNKKRTLVALTGAAIGTGIAAKKISEQKAAEKERAVDEAIKARYYGDKQVYFVGGGIASLAGAVYLIRDANFDGKNIHIIEGMHILGGSNDGAGSVEHGFVCRGGRMLNEETYENFWDLFSSIPSLDMPNFSVTEEILNFDHLHPTHAQARLVDKDRNILDAHSMGFNNNDRMLMTKLLATPEEKLDNLTIRDWFDEHFFETNFWYMWQTTFAFQKWSSLFEFRRYMNRMMLEFSRIDTLEGVTRTPLNQYESLILPLKTFLDKHHVDFTINQTVEDIDFKDAPGITATALHLSDGSTIELGPDDDVIMTNACMTDSATLGDMNTPAPKPEEKPISGELWYKVAQKKPNLGNPEPFFGHEEETNWQSFTVTCHGDKLLKRIERFTGNIPGSGALMTFKDSNWLMSTVVAAQPHFKAQDANTTIFWGYGLYPDRVGDFVKKPMKECTGEEILYELMCHLNWQDDFEEIKADIINVIPCYMPYIDAQFEPRAMSDRPAVVPEGSTNFAMISQFVEIPKDMVFTEEYSVRAARIAVYTLLDIDKKICPVTPHNRDPKVLAKATQTMFR >NZ_CP019624.1|WP_003725208.1|515926_517030_+|23S-rRNA-(adenine(2503)-C(2))-methyltransferase-RlmN MEKSSIYGLTWTKLTEWLEAHGQKKFRATQVWDWLYRKRVKTFEEMSNVPKETIELLTANFVMNTLEEQVVQESTDGTTKYLFKLSDGNLIETVMMKQEYGLSVCVTTQVGCNIGCTFCASGLLKKSRDLTAGEIVEQIMNVQHYLDGRNLEERVSHVVVMGIGEPFDNYDNVMDFLRVINHDKGLAIGARHITVSTSGLAPRIIDFANEDFQVNLAISLHAPNNELRTSIMRINKTYSIEKLMEAIHYYVNKTNRRITFEYIMLKGVNDHKKEALELAALLGEHRHLAYVNLIPYNPVDEHIDYERSTKEDVLAFYDTLKKNGINCVIRREHGTDIDAACGQLRSKQIKRVGVRERMKQKQAAAEE >NZ_CP019624.1|WP_003725209.1|517119_517599_+|AraC-family-transcriptional-regulator MEVEIVERNAFTAVGKKRTFSVENDAQKEKISQFWQEANTNGDAERINELAEFATIDGILGVCKMNGDKMDYYIAIESELTPPADMEKLIIPASKWAIFKSVGPLPSAIQKVWEYIYGEWFQTSNYAHGNAPELEVYTEGDTTAADYYSEVWIPVVEKE >NZ_CP019624.1|WP_003721271.1|517756_518122_+|heme-oxygenase-IsdG MIIVTNTIKVEKGAAEHVIRQFTGANGDGHPTKDIAEVEGFLGFELWHSKPEDKDYEEVVVTSKWESEEAQRNWVKSDSFKKAHGRTKDTREQREDRKGIVGNAIARFEVVHVQNPVIVEK >NZ_CP019624.1|WP_003731249.1|518395_520159_+|RNA-directed-DNA-polymerase MRKKVDVLSMDNEKAREFFMKPSSYFSQNLPKYFNLGYLLESAESKLGKKQLKKEMYFENKVYSNFPNVNFLIQTNKTISTYRPITLLHPYIYVDYVNFLTEIKIWEELKERFQNLQEEVKEKIICSSLPFDIETSKEDDSKKEMALNFWKSIEQETIKYSLGYNYLLKLDISNFYGSIYTHTLCWAFHGENYSKEAKNSKNLQNLTGDKCDRKFQWMNYGETVGIPQGNVISDLMSELLLAYIDSELVKKIDDEIDYKIIRYRDDYRIFTKRLEDSTLVKRELVVLLQRFKLNLGESKTSQTTDIISGSLKEDKMYWIEHDPVTKLTSDKFYRSPKILMKKSLEEHKNKKYKTRVFNEFFKKHFHNRTYQATLQKHLLIIKVFSDLYPNSGQLIAALHEFEGRLLDLNYKDFRNIGTEVEVLIAILVDIIKKNPKITEIGVKLLSTLLKKINFEEFEMKYLESNNSNEVQSDFEVKLAYINSVNHKLSNSNYNDYLEIWMQRLVVKNLKESTTLSDLYIEQSKNELVKFCNSIIRGKEMIQIFNEDWLKDEHKIELSKFINLNEIDKLTDIISDDEIYLAEYNQMT |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
125402 : 131929
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019624|125402:131929|DBSCAN-SWA TTCAAAACTTCTTGTAAACATCAATGGAATTGCCAAAATTAATGAAATATCCACCATAATCATACATCGGACCATATTTTTCTGCGTAATGAGTAACTGTATGGCGCAAAAATTCTTCTGTTACCTCTAAAAACTCCGCTACTTCAAAATATTCTCGTAAGCCTAGATAAAAACAAGCAATGATGTCATCAAGCGGTATTAGTTCCTCATAACCTTTACGACGAGCAAAAATTTCTTGTTTTTTATCCATAATTGTTTCCTGTTTAGTGATGTTACCTACAGTGTATTTGTAATGCATCAATTCTTCTACTAAAACACAGCCTTTTTCAATGGAAGATTGATCCTTACTAATAAAAATCGTCCCATTTAAATAAAGACCTGGCAATTTGTAAGGCATTTTTTCTTCTCTGATTGTTACCTCATCTTGGTATTTATTTACCAATTTTTCGTACAATAAAATCACATCCCGCGATGGAGTTTTTTCTTCATCTCTATATAAGCTAAAATATCCCGCATTTCTTCCTCGGTTACGTCATCATCAATATGGGCTGCAATTGTTACCAAGCGTTCATCAACAGGTGGTAAATTTCTTTCAGGAAAAAAGTCATCTAATCGTTTGTTGAAAATTTTTGCAAGTTCAAATAAAACGTCTTGATTTGCTTTTCGATCACCATTTTCATAACGGCTAATAGTTTGGCGAGTTGTATGAAGCTTTTCTGCTAATGCTTCTTGATTTAAGCCTCGTTCCTCGCGATATTGTTTTATTTTATTTCCTACAAATTTATTTAACTCCATAATAATTGCCCTCCACATGTTTATGGCTTCAGTATAGCACTTTTAGCACCAAAACGGAACTTTTTCGAACATATTTGTCGGATAAAGTTTACCAGTAACCAAAATGGTGCTATAATATTTGTAGAGCTAGAAAATAAATGCGGCTGATTTCGCGCCAATAGCACCGAATTGGTGACGATGTTACTATATTAATTTATGAGATGGAAGTGGGAATGGATGGATAGAAAACTTTTAAAAGAAAAGCAAATCCAACTAATTTTTCAACTAGAACAAGAAGAAAATCGATTTATTCGAAAGCGTTTAATAGAAGAGTTGGAGTTTTTTGAAGCGCTTGGGGACAGAGAAAAAGGACTGTTAACGGCGGAGCAAAAGTTGCTTATTTTAACACCAAGTGAGTACCGAGAATACAAACGAACTAAATCAGATGTGCAAATTAGTAGGTTAATTGGAGTATCGAGATCGTCTCTTGCGGAATGGAAGCGAAAAAAAGGTTTAAATAGAAAAAAGCCGCAACCGGTTCAGCAGGAAATGATTGATGTATTAGCTTTTCATTTAGATAAAACAAAAGACGAAACTGGCGCTTTACCTGCTTCGGCGATTGAATGTCAGTATGAGGCTTTTGTGATTAATGAAGCGCACAATTAAGGAGTGATAACATGCAGGTTTTAGTTTTACCAGAAAATAAGGATATCAATTATATAAAAACGGTCCAAGAAGTAAAACGATTTTTTGCTGATTTTGAGCGGTTTCGGATGATTACGGGGTTATCAAAAAAGCCACAGTTACTTAGAAATGGTTTTCTGGAAGAGCCGCAGTTTGCGCCGGTAGCATTTTCTGCTAGATATAATAAAGAGGTCATTTTGGAAGCGCGATGGTTGGTAGAGAAATATACTGAAATGTTAAATCAGATGGATGATTTATATCGCACTATTTTGATGGAATGTTACGTGGAACGAAAACAAGATGTGGCGGTAATGATGGATTTACCGTACGAAATTGCCCAGTTTAAACGGATAAAAAAACGAGCAGTATTAGAAATCGCAACGCTAATGGGAATTTTAGTAAGGAAATGATGATACTTTCGTGATATTTTGAAACGTCATTTTACGATTAATATAGAAGTAAGCTAATTGTCCAGTAAGCGGATGACAATAAAAGCTGCATCAGAATGAAGGTGCACCGATTTTCTGATAATACAAGAGGTTGTACAAGAAATTTGTTTTTATGATTGGATTTTTCATCCGTTGACATAAACAAATATTCTATTTTGGAAAGTAAAGTTCGGAGGAATAAATTATCAAATGTGGTCTCGACCGAATTTTACTTTCTGTTTTTAAAGGAGTGAACGCTTGGTGAAGAGTTTAAGCTTCATGAGAGTTTTGGAAGCAGTGAGAACAATGCTCCAGGAAAAAGGCGGACTAGATGTTTCTATTGTAATGCGTGACCAAGTGGAAATGCCTACAACGATGATCGAGATGATTGATCAAGAGGAAGAAGAAAGCCAAACTGCCTGGAAAGAAAAATACCGTTTTGCAATCCATCATTATACAAATGAAACGGACTTAGCGGGAGTCGAAATGATAGATACGCTTATCCAAACAGGGTTCACTTTGCCTGAAGGATACAAATTAATCGCTGTTCGACATTACGGAAAACAAAATTTAGTCAAAGAAAATACGTTAATTCACGCAAAAACCAGTTTTGAAGTAAGTATTTGTCGTGAATTAAAAGTAAAAATTTAGGGGGAAATATTAATGGCATTTGAAGAGAATTTATATTGTGATTATACACCGGGAGCTGCTAAAGCGGTCGCGGGGAAAGATGTAATTTTAGCAGTTTTTAACGCAGCGGGGGATAAGCTATTAGCGGTTGCGGGGCAACAAGGTCTAACTGTAAACCGTTCTAAAGATAGCATTGAAATTACATCTAAAGATACAGTTGGCGGATGGAAATCCAAAATTGGCGGTATGAAAGAATGGTCAATTGAAAATGACGGATTATATGTCGCTGATGCAGAGTCTCACAAAGAATTGGCGAAATATTTCGAAAGTGATAGCCCGGTTTGCGTGAAAATCATTAATCAAGCATCTAAAAAAGGTCTTTTCGGTGGTTTGGCAATTGTAGCTGACTATAGTTTTGAAGCACCTTTTGATGAAGCGATGACTTACTCTGTAAAACTAGACGGAATGGGTGCGCTTGTTGATTTAACGATTACTGAGGGCGGAGATCAAATGCCCGGCGAAACACCTGTAGCACCAGCAGAATAAAATAGAGAGCCACTGAAATAAGTGGCTTTCCCTTAGGAGGAAAATAAATGTTTGAAGTGAATGATACAACTTATATTTTACGATTTAATAAACAAAAAGTTAAAACGGTGGAATTAACATCAGGGATTAGTTTAGTTGCAGCTTTGACTGCGAATAAAGGGATTTTGAGCTACCAAGTGATTGAAACGCTATTTGTTTCAGGACTTGTGGAAGAAAAAGGCTTAGTACCTGTAAAACAAAAAGAAGCTTTGGAGATTTTCGACAAATTAGTAGAAGAACAAGGCTTAATTTCGCTTAATGTAGCTGTTATTGAGAAATTGCAAGAGGATATGGGTTTTTTGTTCCGTTAAAACAGATTGAATTTGAGTATTTTGGTGCTGAGGACGAAGAAGTGGATAGTGAAATGAACCATGATTTTGATTTGGAAAAACAATTCGCTTTTTTTGTAGTTAATTTTCAGATGTCCAAGCATGATTTTGAAGAACTTACTGAAGTGGAGAAAAATTTCATCATGAAAGAATGGGAAAACAAGGTGATTTTTGAATCTACTATGCTTCGAAATGCAGTTTTAAATGCGGAACAAAATCTCAATCGAAAACGAAATTCACGTTTTATCGACTTGCATAAAAAACGTCAGAAGAAAGCCGATGTTAATTATACAGTAAATGCACTTCAAGCAATTTCCGATAATGAAGCGAAGGAAGGTAAAGCGTGGATTGATCGGATTTATGGTGCAAATGGGTTACGAAGACCTAAGAATAAAGAAGAAAGGGGGAAAGTGAATGGCGGATTCTAAAAGTTTTACATTTGAACTGAACGAGAGCGTTTTAACAGCGCAAGTTGGCAGGCTAGATGAGATGGCGATGGTTGTAGAGCGGCGGTTTTCAGAGCTCAAAATGACTATTGAAGATGTTGGAAATGCTGATCCAGGTTCGAAAATTTCCGAATCTTTAGGTGGGCTGCAGTCTGGGCTTGGCACGATTAGTTCGGCGTTTGGACAACTGGGTTCTAGTAGTGAGGCGATTACATCCGGATTCGGTACTGCGGTTGGTTCTGTTGGTGGAATCACGGATGCGTTTAAAAATCTAGGTTCAAGTGTGCAAAATGGTACGTTATTTTCAAGCTTGGCAACCGGGATTGGTGGCATGAGTACAATGCTTGGTGGAGTATCTGGCGGCGTTCAAGGAATTACAAATCTAGCTAGTGGATTTATGGAATTGAAGAAGCATCTAGGCGGTTTGATGTCATCTATTGGTGGCGTTGGTGGAATTATGGGTAAACTGACCTCTCCAATGGGGTTAGTAATTATCGGGATTGTAGCGTTAGTAGCTGCATTTGCGTATTTGATGACGACGAATGAATCATTCCGAAATACGGTGATGTCAGTTGTAACACAGGTTGCGCAACTGTTCGGTCAACTTGTCGCCAGTTTAATGCCGATTATCATGCAAATTGTTACTGCGGTTATGCAAATTGGTGCCGCGTTAATGCCGATGGTTATGCAATTTATTAGCTTTTTTGCGCAATTGTTAGCCCAATTAATGCCGTTTATTAATATGCTGATTTCCATGCTTATGCCTGTTATTATGCAGATTGTTCAAGTTGTTATGTCACTTGTTTCGGCACTATTACCGAGCATCATGACAGTGATTCAAGGCATTATGAGCGTTATTCAATTTTTAATTCCGATAATCATGCAAATTGCGACGGTGGTTGTACAAATTGTTGTAACGATTATTTCTTATATAAGTAAAATTATGCCGATTGTTATGACGATTATTGGCGTTATTGTTTCGATTATCACAACGATTATTAGTTACGTCGTTATTATTGCGACGACGATTGCTAGTGTTATTGGGAAAATTATTAGCTTTATTGCGAGTGTTATTACGGCGGTTATCGGGATTGTGCAACCAATTATTGGCTTTATTACTAATATCTTTACGATTATCGTGACGATTATTGGTGCAGCTTTCCAAATGGTATTTACTGTTGCATCCAAAATCTGGAATGCCATTATGACGACGATTTCCGGAATTATTGAAGGAATCAAAGCAGTCATCACAGGTATTTCTACTACGGTTTCATCAGTGTTTAACGGAGTGAAGCGCATTATTACAGGTGTTTTTGACGGAATCAAAAGTGCTTGGGGTGGTTTAACTGATTTTGTGGGAAATATTTTCGATGGTGTTTCAAGTGCAATTCAAACCGTGGTAGATAATGTCAAAGGTTTTGTAAACGTCGTAATTCGAGGGATTAATGGAGCCATTGGTTTAATTAATAAGATTCCAGGCGTTGAAATCGGCAAAATACCACAATTAATTTCCGGTACAACAAGTTTCCAAGGTGGCTTTGCTCGAATGAATGAAGGCGGCCGAGGCGAAATGGTGGTTTTACCGTCGGGTTCGCAAGTAATTCCGCACGATGCAACGATGAAATACGCAAGGGAAAGTGCGCGCGGAAATAAATCAATGCTTTACACGAGTCAAGGCGCTGATTTGGCTAGAGTTGAAAATCTTCTCGAGCGCTTACTACAAAAAAATCCTGTAATCAAAATGGATGACAAAGTGGTAGCCGAGGTAGTTAGCCGTAACCAAGCTAACTCATTTGATCAGTACAATTACACAATGGGAGGTGCAGCTTATTCATGAGCGACTTGTTTTTAGAATTAAATGGAAAAGTGCATTCGCTTAGTGAGACATTTCCAGGTCTTTCTGTACAAGAAGTTTCCAGACAAAGTCCCCAGTTAAGCATGGAAACTGCTGAAATCGCTGGGACTGATGGGGTTATCCCGGGAATGACCCAATTTAAACCGTTTATCTTTTCAGCAAAATGTAATTTGCAAGCACTTGATATTCCAGATTATCATTTGGCAGTCAGAGAAATTTATGAATTTTTATTCCAGCGCGATAGTTATTATATTTGGAGCGATCAAATGCCAGGAATTCGGTATGAGGTGCATCCTAAACCAGTTGATTTTAGTCGAGAATCGGATCGTGTTGGTTTACTCACTATAGAATTTGATGTATTTAAAGGCTATGCGGAGTCACGTGGCACGAGCCTTGACCCTATGACTTTTGAAGTGGATTTATGGCAAATGGGAATGAATTTATCGAACCGTGATGATTTATTTTATATTTTTAAAGAAAATACATTTCGGGTCTATAATGCGGGGAGCGACCGTGTTAATCCACTGATGCGACATGAATTAGATATTGCGATGACGGCGAATGGGACACCAACGATTCATAATCTTACAACGGGAGAATCCTTCGAGTATCGGAAAGAGCTCCAAAAAACAGATGTTTTACTGTTGAACAATATTTATCCACTTGTTAATAACCGCCGTGTTGGAAAAGATACCAATCATGGGATTATCACCCTTGAAAAAGGCTGGAACGATTTTGAAATCAAAGGTGTAACGGATGTAACGATTGCTTTTAATTTTCCGTTCATTTATCGGTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019624|125402:131929|128510_128813_+|WP_003721745.1|DBSCAN-SWA MFEVNDTTYILRFNKQKVKTVELTSGISLVAALTANKGILSYQVIETLFVSGLVEEKGLVPVKQKEALEIFDKLVEEQGLISLNVAVIEKLQEDMGFLFR >NZ_CP019624|125402:131929|127548_127938_+|WP_003728212.1|DBSCAN-SWA MKSLSFMRVLEAVRTMLQEKGGLDVSIVMRDQVEMPTTMIEMIDQEEEESQTAWKEKYRFAIHHYTNETDLAGVEMIDTLIQTGFTLPEGYKLIAVRHYGKQNLVKENTLIHAKTSFEVSICRELKVKI >NZ_CP019624|125402:131929|125860_126196_-|WP_003721740.1|DBSCAN-SWA MELNKFVGNKIKQYREERGLNQEALAEKLHTTRQTISRYENGDRKANQDVLFELAKIFNKRLDDFFPERNLPPVDERLVTIAAHIDDDVTEEEMRDILAYIEMKKKLHRGM >NZ_CP019624|125402:131929|125402_125855_-|WP_003728215.1|DBSCAN-SWA MYEKLVNKYQDEVTIREEKMPYKLPGLYLNGTIFISKDQSSIEKGCVLVEELMHYKYTVGNITKQETIMDKKQEIFARRKGYEELIPLDDIIACFYLGLREYFEVAEFLEVTEEFLRHTVTHYAEKYGPMYDYGGYFINFGNSIDVYKKF >NZ_CP019624|125402:131929|126852_127269_+|WP_003731177.1|DBSCAN-SWA MQVLVLPENKDINYIKTVQEVKRFFADFERFRMITGLSKKPQLLRNGFLEEPQFAPVAFSARYNKEVILEARWLVEKYTEMLNQMDDLYRTILMECYVERKQDVAVMMDLPYEIAQFKRIKKRAVLEIATLMGILVRK >NZ_CP019624|125402:131929|128854_129259_+|WP_003740367.1|DBSCAN-SWA MDSEMNHDFDLEKQFAFFVVNFQMSKHDFEELTEVEKNFIMKEWENKVIFESTMLRNAVLNAEQNLNRKRNSRFIDLHKKRQKKADVNYTVNALQAISDNEAKEGKAWIDRIYGANGLRRPKNKEERGKVNGGF >NZ_CP019624|125402:131929|127950_128463_+|WP_003721744.1|tail|DBSCAN-SWA MAFEENLYCDYTPGAAKAVAGKDVILAVFNAAGDKLLAVAGQQGLTVNRSKDSIEITSKDTVGGWKSKIGGMKEWSIENDGLYVADAESHKELAKYFESDSPVCVKIINQASKKGLFGGLAIVADYSFEAPFDEAMTYSVKLDGMGALVDLTITEGGDQMPGETPVAPAE >NZ_CP019624|125402:131929|131110_131929_+|WP_003734720.1|tail|DBSCAN-SWA MSDLFLELNGKVHSLSETFPGLSVQEVSRQSPQLSMETAEIAGTDGVIPGMTQFKPFIFSAKCNLQALDIPDYHLAVREIYEFLFQRDSYYIWSDQMPGIRYEVHPKPVDFSRESDRVGLLTIEFDVFKGYAESRGTSLDPMTFEVDLWQMGMNLSNRDDLFYIFKENTFRVYNAGSDRVNPLMRHELDIAMTANGTPTIHNLTTGESFEYRKELQKTDVLLLNNIYPLVNNRRVGKDTNHGIITLEKGWNDFEIKGVTDVTIAFNFPFIYR >NZ_CP019624|125402:131929|126412_126841_+|WP_009927883.1|DBSCAN-SWA MDRKLLKEKQIQLIFQLEQEENRFIRKRLIEELEFFEALGDREKGLLTAEQKLLILTPSEYREYKRTKSDVQISRLIGVSRSSLAEWKRKKGLNRKKPQPVQQEMIDVLAFHLDKTKDETGALPASAIECQYEAFVINEAHN >NZ_CP019624|125402:131929|129245_131114_+|WP_009928420.1|DBSCAN-SWA MADSKSFTFELNESVLTAQVGRLDEMAMVVERRFSELKMTIEDVGNADPGSKISESLGGLQSGLGTISSAFGQLGSSSEAITSGFGTAVGSVGGITDAFKNLGSSVQNGTLFSSLATGIGGMSTMLGGVSGGVQGITNLASGFMELKKHLGGLMSSIGGVGGIMGKLTSPMGLVIIGIVALVAAFAYLMTTNESFRNTVMSVVTQVAQLFGQLVASLMPIIMQIVTAVMQIGAALMPMVMQFISFFAQLLAQLMPFINMLISMLMPVIMQIVQVVMSLVSALLPSIMTVIQGIMSVIQFLIPIIMQIATVVVQIVVTIISYISKIMPIVMTIIGVIVSIITTIISYVVIIATTIASVIGKIISFIASVITAVIGIVQPIIGFITNIFTIIVTIIGAAFQMVFTVASKIWNAIMTTISGIIEGIKAVITGISTTVSSVFNGVKRIITGVFDGIKSAWGGLTDFVGNIFDGVSSAIQTVVDNVKGFVNVVIRGINGAIGLINKIPGVEIGKIPQLISGTTSFQGGFARMNEGGRGEMVVLPSGSQVIPHDATMKYARESARGNKSMLYTSQGADLARVENLLERLLQKNPVIKMDDKVVAEVVSRNQANSFDQYNYTMGGAAYS |
10 | Listeria_phage(33.33%) | tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1121938 : 1129361
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP019624|1121938:1129361|DBSCAN-SWA AATGAAAAAGGTTATTACATATGGAACATTTGACTTGCTTCATTGGGGGCATATTCACTTATTAAAGCGCGCTAAGGCTCTTGGTGATTATTTAATAGTAGCAATTTCTTCTGATGAATTTAATCGAATTAAACATAAAGAAGCTTATCATAGTTACGAACACCGTAAATTAATTATTGAAGCAATACGTTATGTGGATGAGGTGATCCCAGAGAATAACTGGGAACAAAAAAGAGATGATATAGAGAAATACGGAATTGATGTTTTTGTAATGGGGGATGACTGGGAAGGCGAATTTGATTTTCTAAAAGAAGTGTGTGAAGTTGTTTATCTTCCTCGAACAGAAGGGATTTCTACGTCTCAAATTAAAGATGAACTAAAATAAAAATGTGAGAGGAGCATTCTTTTGGAACCTTTAGTAAGTGTAATTATTCCAGTTTATAATGTAGAAGAGTATGTCAAACGATGCTTGGATTCAGTTCTTGAGCAAACATATCATAACCTCGAAGTTATCGTAGTTAATGATGGAGCGACTGATAATTCAGCTAAAGTTATAAAAAGTATCTCAGATAACCGAATTCGTTATTTTGAAAAAGAAAATGGCGGACAAGCTACTGCCCGAAATTTTGGATTAGATGTGGCTACGGGAGATTACATTGTGATGGTAGATAGTGATGATTATATTAGCAAAAACCTAGTAGAAATTTGTTTGGATACTGTACAAAAAACGAATGCTGATTTAGTCTTGTTTACTTCATATAATGTGAATCAGGAAGGAAAAATGCAGTATATAAAGCGTGATAAAGGCATCAAAGTTTTAGACGCAGGTCCAACTCCATGGAACAAATTTTATCAAGCAGATCTATGGAAGGGTTCGCGTTTTCCAGTAGGTTATTGGTATGAAGATCTAGGAATTATTCCAGTCGTCACGCTAAAAGCAAAAAATCCAGTGAAAATCCAGGACGCACTTTATTACTACATAACTGATAGAGCGGATTCACAATCGAATATTCAACAAGTAGATCACTTTTTAGATGTGGTTATTATGTTGGAAAATGTTGAAACAGAATTAAAAAAACTAGGTATTTACGAAGAATCAAAAGATCAACTTGCGTACCTATATATAGAACATCTAATTTATCGTTTAGTTTTACGAAAAGCGATTTACATTACTGATAAGCAAGAACGTAAAAACCTTATTAAGAAAATTAGTACAATTATTCAAGAGAAGTTCCCTAATTGGGGTAGTTATCCTTATCAAGCGGGTGGCAAACTAACAGCAACATTAAAGAAAAAAGCATTATGGCTTTATTTACATCATTTGTACTTGTTGGGTGATTTAGTATGGAAATATCCATTTTCTATCAGAAGTAAGCAAACAGGGTTTTAAAGGAGGTTATCATTTTGCATAAATTAAGTGTGGTCATTGCCGTATATAATGTTTCTGAGTATATAGAAGCATGTTTAACATCAGTCTTAGAACAAAACTACAAGAATGTGGAATTAATTATTGTCAATGACGGTTCAACTGATGATACCTTTCAAAAAGTAGAAAAACTAGTAGACGGACATTCGAACGTTATTTTGATTGATCAAGAAAATCAGGGTGTTTCTGCTGTCCGAAATAATGGTGTAAAAGTCGCTACAGGTGATTATCTAGGCTTTGTCGATGGAGACGATATCATTGCTAAAGATATGTTTCAAAAAATGATGGATTCTTTTGAAATGTCGGATGCAGATATGGTTACAATTGGTGTGGCAAGACTTTCAGGAGATAAAGTATACCCTTCTACATTACACGAAAGATATATGGTAGAAAAAAAAGAAGCCACAACAATTGAAGAAACACCGGCACTTTTATATGATACTACTTCGTGGAATAAAGTATTTAAAAAATCTTTTTGGGATAAACACCATTTGGAATTTCCAGAGGGCCAAATGTATGAAGATATCGCTCTAATGATTCCAGCCTTTTTGTATGCAGAAAAGGTAAATGTTATTCCTGATGTTGGTTATTATTGGCGCAGTCGGGAGGGGGGAGCAAAATCTATCACTCAAAGACGAAATGACATTGCCATGGTGAATGATCGTTTACTTGCTTTGAAAAAAGTAAATCAAGTACTTAATGAGAAAAACATTCAGGGTGATTTAAGATATCAAAATGAATGTAAAAACTTTGAAATTGATTTGTTTTCCATGATTGAATGGGCATTTTTAGCGCCGAAGGATTACTATTTGGCTCTTCAACCACTTATCAAAAATTATGTTGAGCAAGAAATGAAAACAACTGCTTTGAATGATATTCCAAAAGAAAAGAAACAACTTTTCAAAGCTTTGTTAGCAAATAATCGTCCGGCTTTTCTCCTAAATAGTTACATTTATTTCGGTAAGAAAGCTGTGAAAAAAATAACGAAATAAGAGACAAAAGACAAAATACTTCGGATCTTAAGTACACTTGTAAACAATTGATTCAAGTGTGCCATTGCATCATTAGAAGTACTATGTCTTAGGCTCTTTTTTTGTTAGTAACAGTTAATTTAATAGTGAAACTACCTTTTATATGCTATGATAATTGGTATATAATAAGTCAAATTAATGCTTATAAAAAATGATAGGAGCAGAAGAAATGACAAATTTATTTCAAGATGATAGTCTAACGCTGCATACAGACTTATATCAACTAAATATGATGAAAGCGTATTTTGACGATGGACTTCATGAGCGTAGATCGGTATTTGAAGTGTTTTTCCGAGATATGCCATTTGATTCGGGTTTTGTTGTGTTTGCGGGGCTAGAACGAATTATTCATTATATGCAAAATTTACGTTTTACAGAAACGGATATTGCTTATTTACACGACGAACTTGGTTTTGATGGACCTTTTCTAGAATATTTACGTAATTTTAAATTTAAAGGAAATATTCTTGCTGCGAAAGAAGGGGAATTTGTTTTTAAAACAGAGCCAATCCTTCAAGTAGAAGCAAGCTTGGCGGAAGCACAATTAATTGAAACAGCTTTGCTTAATATTGTGAATTTCCAAACGCTGATTGCAACAAAAGCGGCGCGAATCCGTTCTGTTATTGATGACGAAACGTTTGCAGAATTCGGTACAAGACGTGCACAAGAAATGGATGCGGCTATTTGGGGCACACGAGCGGCTTACATCGGCGGTTGTGATTCGACGAGTAATGTTCGCGCTGGAAAAATTTTCGGTATTCCTGTGTCTGGTACGATGGCACATGCGATGGTTCAAGCTTATCGCGACGAACTAGAAGCATTTAGAAGTTACGCAAAAACGCATTTTGATTCGATTTTCTTAGTAGATACATACGATACGCTAAAATCTGGCGTACCAAATGCGATTAAAGTGGCGAAAGAAATGGGCGATAAAATTAACTTTATCGGCATTCGTTTAGATAGCGGGGATATGGCTTTCTTATCTAAAAAAGCACGCCAAATGTTAGATGAGGCTGGTTTTACAGAAGCAAAAATCTTTGCTTCGAGTGACTTAGACGAACATACTATTTTATCGTTAAAAGCGCAAAAAGCAAAAATCGATTCTTGGGGCGTTGGCACAAAACTAATCACCGCTTACGACCAACCAGCATTAGGTGCCGTTTACAAAATGGCGGCAATTGCTGATGAAAATGATATTTTACAAGATTCGATTAAACTTTCGAGTAACACCGAAAAAGTGTCGACTCCTGGTAAAAAGAAAGTTTACCGGATTATTACGAATGAAGATGGCTTGAAAGCGGAAGGCGATTATATTGCTTTAGCGGACGAATCACTCGAAAATGTGGATAAACTAACGATGTTCCACCCAGTTCATACGTATATTATGAAAACAGTCGAGAACTTCACCGCGCGTGAGCTACTTGTACCGATTTTCCAAAACGGAGAACTTGTATATGATATGCCTTCACTAGATGAAATTAAAGCATATAAAGAAGAGAACTTGGCGCTACTTTGGGACGAGTACAAACGAACAGTTCGTCCGGAGCAATACCCAGTTGATTTAAGTGTAAAATGTTGGAAAAATAAGATGCGTAATATCGAAAAGGTACGTAAAAGTGTCCAGCTTCATTCACCAGTTGAACTAGATATGCCGTTTTAGGAGGAATTATAATGGAAATCAGAGAAAGAATTTTAGCAGATATGCAAGTGGCAGAAACGATTGATGCACATGACGAAATCCGAAAAAGTGTCGAGTTTTTAAAAGCATATTTAAAAAAGAATACGTTCTTAAAAAGCTTTGTTCTTGGGATTTCTGGGGGACAAGATTCGACTTTAACAGGAAAACTAGCACAGATGGCGATAAGCGAAATGCGAGCAGAAACGGGCGACGATGAGTACCAATTCTTCGCTGTGAGCTTGCCATACGGAACGCAACTAGATGAATCGGATCGTCAAGATGCACTGAACTTTATGGAACCAGATAATCGTTTAACCGTAAATATTAAAGCTTCAGTGGATGCGAGTGTTGCGGCGCTTGCGGAAGCGGGAGTGGAACTATCTGATTTTGCTAAAGGTAACGAAAAAGCGCGCGAACGGATGAAAGTACAATACGCAATTGCAGCGATGCATAAAGGCGTAGTGGTTGGAACCGATCACTCCGCAGAAGCAGTTACTGGCTTTTATACGAAATACGGCGACGGTGGAACGGATATTAATCCACTGTTCCGCTTGAATAAAAGACAAGGCAAGGCGCTTCTTAAAGAGCTTGGCTGCCCAGAACATTTATATTTGAAAAAACCGACAGCAGATTTAGAAGATAATAAACCGGCACTTCCTGATGAGGTCGCGCTTGGTGTGACTTATGACCAAATTGACGATTACTTGGAAGGCAAAGAAGTTCCAGCAGATGCTGCGGCAAAAATTGAGAACTGGTTTATTAAAACCGAACATAAACGCCATATGGCAATTACTATATTTGACGATTTCTGGAAATAGGAGGCTGTTTAAATGAAAGTTGGTTATGGTTTATTAACTGCATTTTATACACACCCAGGAGAAAAAGACAATTTAGTGAAAATCTTGATTGAAGCAGCAGAGGCTTTGGATGATTACAACACGTGTATCCAATATATCGTCAGTGAATCTGAAACCGAGCCAGACACGGTGTTTGTTTCTGAAATTTGGGTCGATAAAGGGCATCATGCAGCATCACTTGATAACCCAGCAGTACAAGAAACAATTGCACGCGCCAAACCGATGATAAAAGAAATAAAACGAATACAAGAATTAGACATACTCGGTGGAAAAGGCGTATAATTTTAACAACAAGAATGATTCTGGGACTCTCCTGGAATCATTTTTTGGAGGGATGACAAAATGCAAACGTTGATGATTGTTTGTGCTGGCGGTGCGACGTCAAGCCTAATGGCACAAAATGTCGTGAAAAGCGCGATGTCAGAAGGAATGGACGCTGTTTTACTATTTCCAGATGACGTGAAATATAAAGATAGTTTTCTCGAGAAATATAGCGAGCGGGATCTGGTTGTCGTGATGGGGCCAGTCGGCGCGATTACAGCCGGAAAGTTCCGTGATTATAAAGAACAGGTTGACGCGGTTTTAGTAGCACCACAAGTGAAATATATGTACAAAACAGTGGAGGAAGTATTAGGCGAACTAAGTATTCCTTGCGCTAATATTGATTCACTCGATTTCGGTCGGATGCGCGGGGATAAGATTCTCACGCAAGGTCTAGCCTTAATGGATGCGAAAAATTCCAAATAAGGTGTTGCAACTTTAGAGGGGAAACGTTAAAATGAAAGAAGATGAAAAGGACAAGTGATTTGTCCTTTTCTTATATTATTGTGAAGTAACCGCAATTTTGCGGTTTCATTTTATAGATAAGGGTGGTTTTGTTTAAAATTATGAAAGACTTTACCGAGCAAGAGAAAATTATCGTTCTAGATTTTGGTAGTCAGTACAATCAACTAATTACGCGCCGCATTCGTGAATTCGGTGTGTATAGTGAATTACATCCGCATACTATTACAGTTGAAGAAATGAAAGCACTAAATCCAACGGGGATTATTTTTTCAGGAGGACCTAACAGTGTGTATGACGAAGATGCCTTCCGCGCTGACGAAAGAATCTTTGACATGGGAATTCCGATTTTGGGAATTTGTTACGGCATGCAATTAATGACAACGCACTTCGATGGCAAAGTAGAACGTGCGAAAGACCGCGAATATGGGAAAGCGGACATTCACGTCGAAAAACCAAGTCGTTTATTTGCTGGACTACCAACTGATCAAGTTGTTTGGATGAGTCACGGCGATTTAGTTGTCGAGGAACCAGCTGGATTTGAAGTAACAGCTACTAGTAAGTCTTGCCCAATTGCAGCTATTGCAGATGAAGAGCGTTCTCTTTACGGCGTGCAATTCCACCCAGAAGTACGTCACTCAGTTCACGGAAACGAATTACTGAAGAATTTTGCATTAAACGTTTGTGGCTGTAAAGGCGACTGGACAATGGAAAACTTTAGTGAAGTTGAAATCGCTAAAATCCAAGAAATCGTAGGCGACAAAAAAGTCTTGCTTGCACTTTCTGGCGGTGTAGATTCCTCTGTTGTTGGCGTGTTAATTCATAAAGCGATTGGCGACCAACTAACATGTATTTTCGTAGACCATGGCCTTCTTCGTAAAGGGGAAGCTGATCAAGTAATGGCAACGTTACAAGGCGAGTTCAACATGAACATCATCAAAGTAGATGCGAAAAAACGCTTCATGGACAAACTTGCTGGCGTTTCTGACCCAGAGCAAAAACGTAAAATCATCGGTAACGAATTCATTTACGTATTCGACGATGAAGCTAACAAACTAGACGGCGTAGAATTCCTAGCTCAAGGAACACTTTATACAGACATCATCGAAAGTGGTACAGCAACTGCCCAAACAATCAAGTCTCACCACAACGTCGGCGGTCTACCAGAAGATATGCAATTTAAACTAATCGAACCTTTAAATACACTTTTCAAAGATGAAGTTCGCGCACTAGGAACAGAACTTGGCATGCCTGACGCAATCGTTTGGCGCCAACCATTCCCTGGCCCAGGCTTAGGAATCCGCGTTCTTGGCGAAATTACGGAAGAGAAATTAGAGATTGTCCGCGATTCTGATTACATCTTGCGCGAAGAAATCAAAAACGCAGGTCTAGAACGCGAAATCTGGCAATATTTCACAGCACTTCCAAATATCCGTAGCGTTGGTGTTATGGGTGATGGTAGAACGTATGACCATACTGTGGTTGTTCGTGCGGTGACGAGTATTGATGGTATGACAGCCGATTGGGCACGTATTCCGTGGGATGTACTAGAGAAAATTTCGGTACGGATTGTGAATGAAGTGGATCACGTTAATCGTGTTGTTTATGATATTACGAGTAAGCCACCAGCTACGGTTGAGTGGGAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP019624|1121938:1129361|1124563_1126054_+|WP_003721509.1|DBSCAN-SWA MTNLFQDDSLTLHTDLYQLNMMKAYFDDGLHERRSVFEVFFRDMPFDSGFVVFAGLERIIHYMQNLRFTETDIAYLHDELGFDGPFLEYLRNFKFKGNILAAKEGEFVFKTEPILQVEASLAEAQLIETALLNIVNFQTLIATKAARIRSVIDDETFAEFGTRRAQEMDAAIWGTRAAYIGGCDSTSNVRAGKIFGIPVSGTMAHAMVQAYRDELEAFRSYAKTHFDSIFLVDTYDTLKSGVPNAIKVAKEMGDKINFIGIRLDSGDMAFLSKKARQMLDEAGFTEAKIFASSDLDEHTILSLKAQKAKIDSWGVGTKLITAYDQPALGAVYKMAAIADENDILQDSIKLSSNTEKVSTPGKKKVYRIITNEDGLKAEGDYIALADESLENVDKLTMFHPVHTYIMKTVENFTARELLVPIFQNGELVYDMPSLDEIKAYKEENLALLWDEYKRTVRPEQYPVDLSVKCWKNKMRNIEKVRKSVQLHSPVELDMPF >NZ_CP019624|1121938:1129361|1127804_1129361_+|WP_023550418.1|DBSCAN-SWA MFKIMKDFTEQEKIIVLDFGSQYNQLITRRIREFGVYSELHPHTITVEEMKALNPTGIIFSGGPNSVYDEDAFRADERIFDMGIPILGICYGMQLMTTHFDGKVERAKDREYGKADIHVEKPSRLFAGLPTDQVVWMSHGDLVVEEPAGFEVTATSKSCPIAAIADEERSLYGVQFHPEVRHSVHGNELLKNFALNVCGCKGDWTMENFSEVEIAKIQEIVGDKKVLLALSGGVDSSVVGVLIHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEADQVMATLQGEFNMNIIKVDAKKRFMDKLAGVSDPEQKRKIIGNEFIYVFDDEANKLDGVEFLAQGTLYTDIIESGTATAQTIKSHHNVGGLPEDMQFKLIEPLNTLFKDEVRALGTELGMPDAIVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEEKLEIVRDSDYILREEIKNAGLEREIWQYFTALPNIRSVGVMGDGRTYDHTVVVRAVTSIDGMTADWARIPWDVLEKISVRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPATVEWE >NZ_CP019624|1121938:1129361|1126065_1126890_+|WP_023550416.1|DBSCAN-SWA MEIRERILADMQVAETIDAHDEIRKSVEFLKAYLKKNTFLKSFVLGISGGQDSTLTGKLAQMAISEMRAETGDDEYQFFAVSLPYGTQLDESDRQDALNFMEPDNRLTVNIKASVDASVAALAEAGVELSDFAKGNEKARERMKVQYAIAAMHKGVVVGTDHSAEAVTGFYTKYGDGGTDINPLFRLNKRQGKALLKELGCPEHLYLKKPTADLEDNKPALPDEVALGVTYDQIDDYLEGKEVPADAAAKIENWFIKTEHKRHMAITIFDDFWK >NZ_CP019624|1121938:1129361|1121938_1122322_+|WP_003730941.1|DBSCAN-SWA MKKVITYGTFDLLHWGHIHLLKRAKALGDYLIVAISSDEFNRIKHKEAYHSYEHRKLIIEAIRYVDEVIPENNWEQKRDDIEKYGIDVFVMGDDWEGEFDFLKEVCEVVYLPRTEGISTSQIKDELK >NZ_CP019624|1121938:1129361|1123341_1124355_+|WP_026747136.1|DBSCAN-SWA MHKLSVVIAVYNVSEYIEACLTSVLEQNYKNVELIIVNDGSTDDTFQKVEKLVDGHSNVILIDQENQGVSAVRNNGVKVATGDYLGFVDGDDIIAKDMFQKMMDSFEMSDADMVTIGVARLSGDKVYPSTLHERYMVEKKEATTIEETPALLYDTTSWNKVFKKSFWDKHHLEFPEGQMYEDIALMIPAFLYAEKVNVIPDVGYYWRSREGGAKSITQRRNDIAMVNDRLLALKKVNQVLNEKNIQGDLRYQNECKNFEIDLFSMIEWAFLAPKDYYLALQPLIKNYVEQEMKTTALNDIPKEKKQLFKALLANNRPAFLLNSYIYFGKKAVKKITK >NZ_CP019624|1121938:1129361|1122343_1123327_+|WP_003727002.1|DBSCAN-SWA MEPLVSVIIPVYNVEEYVKRCLDSVLEQTYHNLEVIVVNDGATDNSAKVIKSISDNRIRYFEKENGGQATARNFGLDVATGDYIVMVDSDDYISKNLVEICLDTVQKTNADLVLFTSYNVNQEGKMQYIKRDKGIKVLDAGPTPWNKFYQADLWKGSRFPVGYWYEDLGIIPVVTLKAKNPVKIQDALYYYITDRADSQSNIQQVDHFLDVVIMLENVETELKKLGIYEESKDQLAYLYIEHLIYRLVLRKAIYITDKQERKNLIKKISTIIQEKFPNWGSYPYQAGGKLTATLKKKALWLYLHHLYLLGDLVWKYPFSIRSKQTGF >NZ_CP019624|1121938:1129361|1127271_1127676_+|WP_009929871.1|DBSCAN-SWA MQTLMIVCAGGATSSLMAQNVVKSAMSEGMDAVLLFPDDVKYKDSFLEKYSERDLVVVMGPVGAITAGKFRDYKEQVDAVLVAPQVKYMYKTVEEVLGELSIPCANIDSLDFGRMRGDKILTQGLALMDAKNSK >NZ_CP019624|1121938:1129361|1126902_1127211_+|WP_009929872.1|DBSCAN-SWA MKVGYGLLTAFYTHPGEKDNLVKILIEAAEALDDYNTCIQYIVSESETEPDTVFVSEIWVDKGHHAASLDNPAVQETIARAKPMIKEIKRIQELDILGGKGV |
8 | Hokovirus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1224367 : 1331487
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP019624|1224367:1331487|DBSCAN-SWA TATGTTAGAACAGTTACAGACGCTGAAAAATGAAGCAGAAACGCAAATTAACGAAGCATCAGACTTAAAAACATTAAACGACTTACGGGTAAAATACCTTGGTAAAAAAGGCCCGATGACCGAAATCATGAAACAAATGGGGAAACTTTCCGCAGAAGAACGACCAAAAATGGGTTCACTTGCGAATGAAGTAAGAACCGCATTAACAGAAGCAATTTCAAGCAAACAACAAATTTTAGAAACAGAAGCAATCAATGAAAAACTAAAATCAGAAACCATTGACGTTACATTACCAGGTACTGCTCCAAGTATTGGAACAAAACACTTGCTAACACAAGTAATTGAAGAAATGGAAGATATGTTCATTGGGATGGGTTACGAAATTGCAGAAGGGCCAGAAGTAGAACTAGATTACTACAACTTCGAAGCGTTAAATTTACCAAAAGATCACCCAGCTCGTGATATGCAAGATAGCTTCTATATTACAGAAAATACTTTACTACGTACCCAAACTTCACCTGTACAAGCAAGAACAATGGAAAAACATGACTTCTCTAAAGGACCAATCAAAGTTATCTGTCCAGGGAAAGTGTACCGCCGCGACAATGATGATGCAACTCACTCCCACCAATTTACGCAAATTGAAGGGCTGGTTGTTGGCGAAAACATCACGTTTGCTGACTTAAAAGGAACATTAACTGTTCTCGCAAAAACAATGTTCGGTGAAGAACGTGAAATTCGTCTTCGTCCATCCTTCTTCCCATTCACAGAACCATCCGTTGAAATGGATATCTCTTGTTTCAAATGTGGCGGTAAAGGGTGCCGCGTTTGTAAAGGAACAGGTTGGATTGAAATTTTAGGAAGCGGAATGGTACATCCAAACGTGCTTGAAATGTCGGGAATTGATTCCACGCGTTACAGCGGTTTTGCTTTCGGCTTAGGACCTGAACGGGTTGCGATGTTGAAATATGCGGTGGATGATATTCGCCACCTTTATACAAATGATTTACGCTTTACGAAGCAATTCCAAAGTACAGAAACGGGGGAAATCTAATGTTAGTTTCATATAATTGGGTCAAAGAATTTTTCCAAGACTTCCCGTTAACGGCGGAAGAGCTAGGAGAAGCAATTACAAGAACAGGTATTGAAATCGAAGGCGTAGAAGAATTAAGCGCTAGTTTGAAAAATGTCGTAGTCGGCGAAGTTTTATCATGCGAACGCCACCCCGATGCAGAGAAATTGAATAAATGTCTCGTTCAAACAGACGAAACAGAACCTGTTCAAATCATTTGCGGAGCTCCAAACGTTGCCGCTGGTCAAAAAGTAATCGTAGCCAAAGTTGGCGCAAGACTTCCAGGTGGACTTAAAATCAAACGCGCAAAACTACGCGGCGAAGTGTCAGAGGGAATGATTTGCTCCCTGGCTGAACTTGGCTTTGAAAGCAAAGTTGTACCAAAAGCATACGCAGAAGGAATTTATGTATTACCTGCGCACGTGGAAACGGGTGTAAGTGCAATCACTTTACTTGGACTAGATGATGCGATTTTGGATATGGCAATCACACCAAACCGCGCAGATGCATTGAGCATGAATGGTGTAGCTCACGAGGTTGGTGCGATTATTCATCAAAAACCAGCACAACCAACCGAGCCTGACGTATCTGAAAAAGGAAAAGCAGACGATTTCATTTCTGTAGAAGTTGAAAATCCAGCCGAAACACCTTACTATGCTATTAAAATGGTAGAAAACATTGAAATCAAAGAATCGCCACTATGGCTGCAAACAAAACTAATGAAAGCTGGCATTCGTCCACATAATAACGTGGTCGATGTTACCAACTACATCAATTTATTATACGGACAACCTTTGCATTCCTTTGACTATGATAAAATTGGTAGCAAGAAAATCGTTGTACGTTCTGCAAAAGAACAAGAAGAGATTACCACGCTTGATGGCGAGAAAAGAACTTTACAGGCTGGACATACAGTTATTACAAATGGCGTAGAACCAATTGCTATCGCTGGCGTTATGGGTGGAGAATTTTCCGAAGTAACAGAGAACACAACGACAGTAGCGCTAGAAGGTGCTATTTTCAGCAGCTCTTCCATCGGTAAAGCATCTCGCGAATTATACCTACGTACAGAAGCAAGCATCCGTTACGACAAAGGTTCTGACGCTTGGAAAGTAGAAAAAGCACTTGCACATGGCGGAGCGTTAATCGCTGAACTAAGTGGCGGAACACTAGTAGGCGGTGTCGTAGAAGTAGATAACCGTGAAAAAGCTGTAAATAAAATCGAAACAAACCTAACACGCATTAACCGCATTTTAGGAACAGCAATTACGCTTGCGGAAATCGAAACAATTTTTGATCGTTTAGGTTTTGTATTAGAAGTGAAAAATGATGCTCTAATCATTGAAGTGCCGACAAGACGTTGGGACATCACTATTGAAGCAGATATTTTAGAAGAAGTAGCTCGTATTTACGGTTACGATGAAATTCCGGTAACACTTCCTGCGACAAGCACAACAGGCGGCTTATCAGACAGCCAAAAAGCTCGTCGTGTCATGCGCGCTTATTTAGAAGGAGCAGGACTTAACCAAGCATTAACTTACTCTTTAACATCTAAAAAAGATGCAACTCGTCTAGCGCTTTCTGATGAAAAAACAGTTGCATTATCGATGCCAATGAGTGAAGAACATAGCCATTTAAGAACAAGTATCGTTCCACAATTAATTCGTAGCGCAAGTTATAACATCGCTCGTAAAAATATGGACGTGGCACTTTACGAAATGGGTACCGTGTTCTACGCAACAGAAGGGGACAATTTACCAATTGAACAAGAGCATTTGGCAGGTCTAATTACTGGGAACTGGCATACGGTTGATTGGCAAAAAACACCAAAACCAGTAGACTTCTTCGTTTTAAAAGGAATTGTCGAAGGTTTAGTGAACAAATTAGGTATCAAATCCGAACTTCACTGGAAACAAACAGAAAAAGAAGAACTGCATCCGGGAAGAACCGCCAGCCTTATTTTAGAAGGACAAGAAATTGGTTATCTTGGAGCACTTCACCCAGCGGTAGAAGCTAACTATGATTTAAAAGAAACATATGTCTTTGAAATCAATGTAGCTGCTTTACTAGATGCAACCAAAGAAAAAGTTGTGTACCATCCAATCCCACGTTACCCAGAAATGACTCGCGACTTAGCATTGCTTGTGGATAAAAATACCGACCATGCAACAATTTCTCAAGTAATCCAAGAGCACGGCGGAAAGTTACTTGTCGATATCGAGCTATTTGATATTTTCGAAGGGGAGAGTCTTGGCGAAAACAAAAAATCGCTCGCATACACATTGACTTTCCTAGATAGCGAAAGAACACTAGTCGAAGAAGATGTACAAAAAGCAACCAATAAAGTAATAGAAGCATTACAAGAAAAACTACATGCGATTATTCGTTAAATGAAGAAGAACTAGGCTAGCTGGAAAACATTTTCAACTAGTTTGGTTCTTTTTTTGTTTTTTATAAAATAGTGGAAGTCTTTCCTTTTTTAGTACTTCACTTACTTAAATAACACATGTTATAATGATGGCACATGCCAGAGAAAAAAGGACGAGAAAAATGACCTATGTAGAAATGAAAGATGTATCTAAATACTATCAAATGGGCGAGAACGTTGTCACGGCAAATGATAAAATCACTTTCGGGATAAAAAAGGGTGAATTTGTTGTAATAGTCGGACCTTCTGGAGCCGGAAAATCCACTGTACTTAATATACTTGGTGGAATGGATAGTGCAAGTGAAGGCAAAATTATGGTAGATGGGCAGGATATTGCTCAATATAATGCAAAACAATTAACCAAATATCGGCGAACAGATGTCGGCTTTGTATTTCAATTTTACAATTTGGTACCCAATTTGACTGCTAAAGAGAACGTAGAATTAGCTGCCCAAATTGCGCCAAATGCATTAGACGCAGAAACTGTTTTAACTCAAGTTGGATTAAGTCACAGATTAGACAATTTTCCAGCACAACTATCTGGCGGGGAACAACAGCGTGTCGCCATAGCACGTGCGCTTGCTAAAGCACCGAAACTGCTTTTATGCGATGAGCCAACCGGGGCACTTGATTACGATACTGGAAAATCAGTCTTAAAATTATTACAAGAAACTTGCCGTAACACGGGAACAACAGTTATTGTTATTACCCATAACACAGCGATTACGCCAATTGCAGATCGAATTATTGAAATTAATAATGCAAAAGTTCGCAGCATCAAAGAAAATCCAGAACCAATGTCGATTGATGATTTAGAATGGTAGGAAGGAGCAACCAGTGAAACGTTCAGCTTTATGGAAAGATATTTACCGCGAAATATGGCGTTCTAAGAGCCGCTTTATTTCCATTTTTATGCTGATTATGTTGGGTGTTGCTTTTTTCTCCGGACTTAAAGCAACTGGACCCGATATGCTTCTAACAGCCGACAATTATTTTAATAAGTATGAATTAGCTAATTTTAACGTGCAATCTACTTATGGACTAGATGAGACGGACAAGGAAGCACTTGAAGATATATCTGGTGTCGCACAAGTGGAACTCGGATATACAGCAGATACTTTAATGAAAGATAAAAATATCGTAACGAAACTATTTTCCAATTCTGAAAGCGATAATTTAAATCAATACAAGATAGCTAGTGGCCGTTTACCAGAAAAATCAGGGGAAATTGCACTGGATGACAATGACCTTGTTCATAAAAATGTCAAAATCGGCGACGAAGTAACTTTTGTTAAAAGTGATGGAAATAAGTTAACTAACACGCTAAAAAAATCAACTTATAAAGTAGTTGGCTTCGTTAGCTCACCAGCTTACATCCAGAAATCTGAACGTGGCTCGAGCACGGTTGGAAAAGGAAAAACAGATGCCTTTGGTGTGATTCCAGAACAGGATTTTGATTTACCAGAATACACTATTGCTAATCTTACTTTTAACAATTTA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118 | Listeria_phage(75.0%) | terminase,head,tRNA,integrase,tail,holin,protease,portal | attL 1250116:1250139|attR 1292991:1293014 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1856026 : 1864312
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP019624|1856026:1864312|DBSCAN-SWA ATTAATCGTTCCCTCCATTTTGAATTAATCCTCGAATCACTTTTGGATAAAAAATATGTTCTACTTGATGAATTTTTCCAGCTAAAGTATCTACAGTTTCCGCATGTTCAATCGGTACTTTCACTTGATCAATAATTGGTCCAGTATCCATTCCCGCATCCACAAAGTGCGCCGTGACACCAGTTTCTGAAACATTGGCTTGAATCGCTTGACCAATTGCATCTTTTCCTTTGAATTCAGGTAATAACGATGGGTGCAGGTTGACAATTTGCTCGGGAAATTCTGCTAATAAAGTCGGCCCAATCAAACGCATATATCCTGCTAGCACTAACAAATCAATTTCCAACCCGCGAAGTTCTAGTAAAATTTCTGTCTCAAAAGCTTCTTTATCCGGATAATTTTTCGCTTCAAAAAGGAACACCGGAATCTGATGTGTGTTTGCGCGTTCTAAAACATAAGCATTTGGTTTATCACATACCAGTAGTTTCACATGAGGCTTAATAAACGCATCATCCACTAAAGCTTGAAAATTCGAACCGTTACCCGAAGCAAAAATGGCTATATTCATCCTTTTGTGCCTCCTGTGAAAATAACCGCATCATTTTCACGTGTCGTAACTTCTCCAATAACATAAGCCGCTTCCCCGTTTTGAACGAGTACTTCTAATGTTCTTTCCACATCCGCTTTCGCAACTGCCAACACCATACCAATGCCCATATTGAAAATTTCATACATTTCAAGTTCGCTCAATTGGCCGTATTTCTTCATAACGTCAAAAATCGGCAACACCGGCCATGAACCTAGCTCCACTTTGACAGCTAAATCATTTGTTAACATCCGCGGTAAATTCTCTACAAATCCGCCACCAGTCACATGCGTAATTCCGTGCACATCTACCTCTTTCAATACTTCTAAAACTGGCTTCACATAAATCCGTGTCGGTTTAAGTAGCTCTTCCACAAGCGGTACATCTAGTTCACTGATTTCCGCATCGAGTGTCAATTCGTTATCTTTAAAGAAAATTTTACGCACAAGGGAGTAACCATTACTATGAATTCCGCTTGATGGAATACCAATGAGTGTATCTCCTTCTTTGACTGCGCCTTCTGTAATTAGCTTCTGTTTCTCTACAGCCCCAACAGTAAAACCAGCTAAATCATAATCTTCCGCGCCGTACATATCAGGCATTTCAGCAGTTTCGCCGCCAATTAAAGCCGCACCAGCTTGTTCACAACCGTCAGCCACGCCTTTAACAATTTGTTCCATTTTCACTGGATCTGTTTTTCCAGTAGCGATATAATCTAAGAAAAATAATGGCTCGGCGCCTTGAGCTAAAATGTCATTCACACACATTGCCACGCAGTCAATCCCGATGGTATCATGCTTATCTGCTTCAATTGCCAAAAGTAATTTTGTCCCAACACCATCCGTACCAGAAACAAGGACAGGTTCTTTTAAATGCAAACTACTTAAGTCAAACATTCCACCAAATGAACCAAGTGCCCCCATCGCGCCTAATCGCTCTGTTCTAGCCACATGTTTTTTGATACGTTCTACAACTTGATAGCCAGCTTCTACGTCCACGCCTGCTTTACTATATGCATTTTCTGCCATTCGATTTGTCACTCCTCATTATTTTTCTGCTTCTAAGCTCGCTAAATATTCCGCTTCATAATCATATAAAGGGGTTGGGTAATCGCCGTTGAAATAAGCCATACAAAGTCCCCCGTAAGGTTCGTTCGGATAAGGTCTGCCAATGGAATCTACTAAACCTTCTTCACTCAAATACTCTAAAGAATCAGCCCCAATAATCCGACAAATTTCATCAACAGAATAATTAGAAGCGATTAATTCATTTCGCGTTTGGATATCAATTCCATAAAAACAAGGATAAGCAAGTGGTGGAGAAGCGATTCTTACATGAACTTCCGCCGCTCCTGCTTCACGTAAAAGCTGGACAATGCGTTTACTTGTCGTCCCGCGAACAATCGAATCATCAATCATGACAACGCGTTTTCCTTCCACAACCCCGCGCACGGCAGAAAGTTTCATTCTAACGCCTTGTTCCCTAAGTTCTTGTGATGGCTGGATAAAAGTTCTTGCCACATATCTATTTTTGATGAGACCAAGTTCGTAAGGAAGACCAGCTTCCTCCGCATAACCAATCGCTGCAGAAATACTGGAATCTGGTACACCTGTAACCACATCTGCATCAATAAAAGCCTCTTTTGCTAATCTTTTCCCAGAACGTTTTCTTGCCGAGTGGACATTAATTCCAGCAATATTAGAGTCAGGTCGCGCAAAATAAATGTATTCCATACTGCAAATCGAATGCGTCACATTTTCCGTGAATTTTTCAATTCGAAGCCCGTCATCATTAATAATAATTAGTTCACCTGGCTCCACATCGCGGACAAACTCAGCGCCAACCGTTTCAAAGGCACATGTTTCCGAAGCAACTACGTAAGAATCACCAATGCGACCTATCGAAAGCGGTCTAAAACCATTCGGGTCAAGCGCCGCATACATCGTGTCTTCCGTCAGAAGCATGTACGCAAAGCCACCCTTAACCTTGTTCAAAGCCACTTTTAAATCTTCCACAAAATCACCTGTATGGCTACGTTTAATTAAATGCGCTAACACTTCTGTATCCGAACTCGTTTGAAAAATAGCGCCTTCTTCTTCTAGTTCACGGCGTAAACTTTTCGCATTAACCAAATTCCCATTATGCGCAAGTGCTAAAGAAGAACTATGAAAGTGAAATAAAAATGGTTGTACGTTTCCTAAGTTTTTTTGACCGGCTGTCGCATATCGAACGTGGCCAATGGCTGCTTTACCTTTTAAATCGTCTAGTTCACCATGTTTAAATACGTCTGCTAAAAGGCCGAGATTTCGGTGACCTTTTAGTGTTTCACCGTCTGTCGAAACAATTCCGGCACCTTCTTGACCGCGATGTTGTAAACTATGCAACCCATAATAGGTGATTTCCGCTGCATTAGGATGATCCCAAATACCAAAAATACCACATTCTTCGTTAAGTCCTTTTACTTCAGCAAGCATGGAATAGCCCCTTCCCAAATGGATCGTAATTCCGTTGTTTTCGCTGTAACTTGATCTTCCTTATGTTTCACACGAATCGTATCATCCTCGGTTACTACACCAAGGCGGTATACTTTTTCCAGTTCCATTAATTGCGCAAAAGCTGCTTCGTTTTCCGGTTTTACCGATACTAAGAAACGTGATTGCGATTCACTGAATAGTTGATTCAACTCAAACGGTACTTCTACATCCGCACCAAGCCCTGCTTTAAAAGTCGCTTCCGCAAGGGCAACACCAAATCCACCTTCTGCCAAATCGTGACTAGAAGCAACTAGACCTTCCTGAATCGCCGTTAGAAGTAATTGTTGGTATTTTTTCTCTGTCGTTAAATCTAATTCCGGCGCACGTCCGCTAATTTTCCCTTGTTGCAATTTTTGCAATTCCGAACCACTATATTCAGCTTTTGTTTCACCAATTAAGAAAATCACATCGCCACTATTTTTAAAATCTTGTGTCGTAATATGTGCCAAATCTTCTACTAAACCAACCATTCCAATGACTGGCGTTGGATAAATTCCGGTACCATCTGTTTCATTATAAAGCGATACATTACCAGAGATAACAGGCGTATCAAGTTCTAAACAAGCCGCACTAATACCATCAGCCGCTTTTTCAATTTCCCAAAAAATTTCTGGTTTTTCAGGATTTCCAAAGTTCAGTCCATCTGTAATCGCTAGTGGTTTCCCGCCAGAACAAACGATATTGCGCGCCGCTTCCGCAACCGCTATCGCTCCGCCTACTTTTGGATCAAGATACAAATAGCGTGAGTTACAATCAGTTGTCATGGCAATTGCCTTCTCGGTCCCACGCACACGAACAATCGCCGCATCTGAACCAGGTACAACAGCTGTATCCGTCCGAACTTGATAATCATATTGCTCATAAATATGGCGCTTACTAGCAATCGTTGGCTGAGCAAGCAGTTCCTTCCAAACACCGACCACATCTTCCATAACTGGCACAAACGATTCCTCTTCTTGGAAAGCTTGATAACGAGCTGGCTCTTTGGAAGGTTTATGATAAACTGGCGCATCTTCTGCAAGCGCATCTACAGGAACGTTCGCAACTACTTCACCATGATGAATAATTTTGTACATTTTATCATCTGTTACTTGACCAATCACAACAGCCTCTAAACCATAACGTTCAAATAACGCTTGGATTTCTTCCACATGCCCTTTTTTCACACATAGAAGCATCCGTTCTTGCGATTCAGAAAGCAACATTTCATAAGGCGTCATATTTAGTTCTCGTTGCGGCACATCATCCATAATTAATTCTAGCCCAGCGCCCGCTTTTGAGGCCATTTCAGAACTTGAACTAACGAGACCAGCTGCTCCCATATCTTGAATTCCCACTAAAATATCCGAATGATCACGAATCACATCTAAACAAGCTTCAAGCAACAATTTCTCCATAAAAGGATCGCCAACCTGTACAGCAGAGCGTTGTTGTTCGCCTTCTTCACTAAACTCTACAGATGCAAAAGTAGCACCATGAATTCCGTCACGACCAGTTTTAGCACCAACATACATCACCGGGTTGCCAATTCCTTTAGCTTGCCCTTTTTGAATATCTTTCGCTTCAATTAAGCCTACACACATTGCATTTACTAGCGGATTTTTTGTATAACAAGGATCAAATTGGATTTCGCCACCAACCGTTGGAATCCCAATGGAGTTACCGTATCCTGCGATTCCCGCAACGACTTCACTAACTAAGTATTTCGCATGGGGTGTATCTAACTCACCAAAACGAAGCGAGTTAAGCATTGCAATCGGTCTAGCTCCCATCGAGAACACATCACGGATAATCCCGCCGACCCCAGTCGCAGCCCCTTGATACGGCTCCACGTAGGATGGATGATTATGACTCTCCACTTTAAAAGCAACACCTAAACC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP019624|1856026:1864312|1857657_1859085_-|WP_003722245.1|DBSCAN-SWA MLAEVKGLNEECGIFGIWDHPNAAEITYYGLHSLQHRGQEGAGIVSTDGETLKGHRNLGLLADVFKHGELDDLKGKAAIGHVRYATAGQKNLGNVQPFLFHFHSSSLALAHNGNLVNAKSLRRELEEEGAIFQTSSDTEVLAHLIKRSHTGDFVEDLKVALNKVKGGFAYMLLTEDTMYAALDPNGFRPLSIGRIGDSYVVASETCAFETVGAEFVRDVEPGELIIINDDGLRIEKFTENVTHSICSMEYIYFARPDSNIAGINVHSARKRSGKRLAKEAFIDADVVTGVPDSSISAAIGYAEEAGLPYELGLIKNRYVARTFIQPSQELREQGVRMKLSAVRGVVEGKRVVMIDDSIVRGTTSKRIVQLLREAGAAEVHVRIASPPLAYPCFYGIDIQTRNELIASNYSVDEICRIIGADSLEYLSEEGLVDSIGRPYPNEPYGGLCMAYFNGDYPTPLYDYEAEYLASLEAEK >NZ_CP019624|1856026:1864312|1862225_1862939_-|WP_003726214.1|DBSCAN-SWA MTNELVYEGKAKRLFKTEEAGVLRVAYKDDATALNGVRKESFAGKGELNNQITSLIFSHLAGAGIESHFIRAISETEQLVKEVSIIPLEVVVRNVMAGSLAKRLGKEEGELIPNAIVEFYYKDDALDDPFINDDHVLYLELATTSEMDIIRQAARSINKVLQELFNQMNITLIDFKLEFGRDATGNILLADEISPDTCRLWDKETNQKLDKDVFRRNIGNLTDVYTEVLNRLKQVQN >NZ_CP019624|1856026:1864312|1856589_1857639_-|WP_003726210.1|DBSCAN-SWA MAENAYSKAGVDVEAGYQVVERIKKHVARTERLGAMGALGSFGGMFDLSSLHLKEPVLVSGTDGVGTKLLLAIEADKHDTIGIDCVAMCVNDILAQGAEPLFFLDYIATGKTDPVKMEQIVKGVADGCEQAGAALIGGETAEMPDMYGAEDYDLAGFTVGAVEKQKLITEGAVKEGDTLIGIPSSGIHSNGYSLVRKIFFKDNELTLDAEISELDVPLVEELLKPTRIYVKPVLEVLKEVDVHGITHVTGGGFVENLPRMLTNDLAVKVELGSWPVLPIFDVMKKYGQLSELEMYEIFNMGIGMVLAVAKADVERTLEVLVQNGEAAYVIGEVTTRENDAVIFTGGTKG >NZ_CP019624|1856026:1864312|1859069_1861289_-|WP_009918191.1|DBSCAN-SWA MPNMEPTTKEIKEQKIYQEMGLTDSEYELVCSILGREPNYTETGLFSVMWSEHCSYKNSKPVLRKFPTEGKQVLQGPGEGAGIVDIGDGLGVAFKVESHNHPSYVEPYQGAATGVGGIIRDVFSMGARPIAMLNSLRFGELDTPHAKYLVSEVVAGIAGYGNSIGIPTVGGEIQFDPCYTKNPLVNAMCVGLIEAKDIQKGQAKGIGNPVMYVGAKTGRDGIHGATFASVEFSEEGEQQRSAVQVGDPFMEKLLLEACLDVIRDHSDILVGIQDMGAAGLVSSSSEMASKAGAGLELIMDDVPQRELNMTPYEMLLSESQERMLLCVKKGHVEEIQALFERYGLEAVVIGQVTDDKMYKIIHHGEVVANVPVDALAEDAPVYHKPSKEPARYQAFQEEESFVPVMEDVVGVWKELLAQPTIASKRHIYEQYDYQVRTDTAVVPGSDAAIVRVRGTEKAIAMTTDCNSRYLYLDPKVGGAIAVAEAARNIVCSGGKPLAITDGLNFGNPEKPEIFWEIEKAADGISAACLELDTPVISGNVSLYNETDGTGIYPTPVIGMVGLVEDLAHITTQDFKNSGDVIFLIGETKAEYSGSELQKLQQGKISGRAPELDLTTEKKYQQLLLTAIQEGLVASSHDLAEGGFGVALAEATFKAGLGADVEVPFELNQLFSESQSRFLVSVKPENEAAFAQLMELEKVYRLGVVTEDDTIRVKHKEDQVTAKTTELRSIWEGAIPCLLK >NZ_CP019624|1856026:1864312|1861968_1862214_-|WP_003722248.1|DBSCAN-SWA MYNVKVYVTLKKSVLDPQGVAVKDAAKSMGYEEVEDVRIGKFMELKVAKSDRDIHEVLNEMCDKLLTNPVMEDYRYEIEEA >NZ_CP019624|1856026:1864312|1856026_1856593_-|WP_003726209.1|DBSCAN-SWA MNIAIFASGNGSNFQALVDDAFIKPHVKLLVCDKPNAYVLERANTHQIPVFLFEAKNYPDKEAFETEILLELRGLEIDLLVLAGYMRLIGPTLLAEFPEQIVNLHPSLLPEFKGKDAIGQAIQANVSETGVTAHFVDAGMDTGPIIDQVKVPIEHAETVDTLAGKIHQVEHIFYPKVIRGLIQNGGND >NZ_CP019624|1856026:1864312|1861281_1861965_-|WP_003726212.1|DBSCAN-SWA MKFAVIQFPGSNCDLDMLHAIRDSLGEEAEYVWHAETSLAGFDAVLLPGGFSYGDYLRTGAIAKFSSIMPEVLRFAEMGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALIRNNNLHFICKTVPLRVANASTMFTGLYKEGEIIQVPVAHGEGNYYCDDETLLKLKDNNQIVFTYDSVNPNGSRADIAGIVNERGNVLGMMPHPERAVEEIIGGTDGLRLFESVVKAWKEEQVNA >NZ_CP019624|1856026:1864312|1863019_1864312_-|WP_003729814.1|DBSCAN-SWA MLERYTRKEMGNIWTEQNRYQAWLEVEILACEAWAELGDIPKEDVAKIRANAKFDVDRIHEIELETRHDVVAFTRSVSESLGAERKWVHYGLTSTDVVDTANSYLLKQANEILRKDLENFIAIIGEKAKEHKYTVTMGRTHGVHAEPTTFGLKLALWYEEMKRNLERFNFAADGVEFGKISGAVGTYANIDPFVEAYVCEKLGTTPAPISTQTLQRDRHAEYLATLALIATSVEKFAVEVRALQKSEVREVEEFFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENVTGLARVIRGHMVTAYENVPLWHERDISHSSAERIILPDSTILLDYILNRFGNIVKNLTVFPENMKRNMDRTLGLIYSQRVLLALIDKGLAREAAYDVVQPRAMEAWEKQVPFRELVEQDATITENLSAEEIADCFDYNYHLKNVDLIFDRLGL |
8 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2529476 : 2537318
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP019624|2529476:2537318|DBSCAN-SWA ATTAACTATTACTGATTTTCAGTCCTACTTGTGCTGGTGTTTCCCCGCTTCTAAGGCGCTCTGCAATCTGATCTAGTTTCCGGAGACGATGATTAATACCTGATTTACTTACTTGACCTGTTGTCAGCATTTCGCCTAGCTCTTTTAAGGTAACATCTTCATTAGCTATACGAAGCGCTGCAATCTCACGCAGTCGTTCTGGTAAAGCTTCTAGCCCAACGGTTGATTGGATATACTTGATATTATCGATTTGCCTAACAGCCGCATTAATTGTCTTGTTGAGATTCGCCGTTTCACAGTTCACTAGCCTGTTCACCGAATTCCGCATATCACGCATAATCCGAACATCCTCAAAATGAAGAAGCGCGCTAGTTGCTCCGATAATACTCAAGAATTCCGTGATTTTTTCTGCTTCTTTCAAATAGGTAATAAAACCATTTTTCCGTTCAAGCGTTCGCGCATTGAGATCGAATTGATTCATCAAAGCGCAAATCGCCTCATTGTGCTCCTCATAAACAGAGAAAATTTCTAAATGATAAGAAGAAGTTTCCGGATTATTAACTGACCCACTTGCCAAAAAGGCTCCACGTAAATAAGCACGTTTGGCGCTCCTCTTCTTAACAAATCCCCTATCAATCGATTTCGTAAACGTCATCGGTGGCTCTAGTATCCGTAAATCTTCCAAAATCCCCCGTGTACCTGACTTCAAGCGAACTATATAAACATTATTTTTTTTCAACTTCATTTTGCGACGTACAAGAAGTTCTATTGGCACTTCGTATAAGTCTTTCAGTAATTGATACATTCGTCTAGCTATGGCTGCATTCTCGGTTTGGACATCCATTATCACTAATTGATTCGAAAACGAGATGGCACCATTCATTCGAATAAAAGCTGCGAGTTCCACTTTTGCATCGCTATCACTTACGTCCATATGGGTTAATTCTTTCTTGGTTTCCGATGCAAATGACATGGCTTACTCACTCCTTTTCAATAGTTTGGTTAGGTAACATCGCTAAAAGCGCGTCCGCCACCTTTTCAGCAGCATGGCGCACAAGGCCATCCTCTGTAGAAAGAAAATCTTGATAAATGGCTTCTACGCCAAGCTCTTCCATTCCTTTGGCATTATGCTCTACTTGCGCAACATCCTCTGGGAATAAAAGTTCTTTCGGAACAGTCGTCGTATTAATTAACGTTTTATCTATAAAAGATTTTCCCACATGCTCATGGATAACTTTAATATGATCCGCATCTGAGAAAAAGTCGGTTTCGCCAATTTGCGTTAAAATGTTCGTAATGTATACTTTCGGAGCCTTGCTTGCTATAATTTCATCAGCTAATTCCGTAAGTAATAGATTTGGTAAAATACTTGTGTATAAACTCCCTGGACCAATAACAATCAAATCAGCCTCTTTCACTGCTTCGACTGCTGTCGGATATGGTTTTACATTTTCTGGTTCAATATACACACGATTAATATGCTTTCCTTGTAACGGGATAAGCGATTCACCGTGCACAATAGAACCATCTTCCATTTCGGCATTTAAGATGAGTGGTTGATCCGTTGCTGGAATAACTTTGCCGCGGATTTTCAGCACCGTTGCTAGCACATTAATCGCATCAACATAACTATCATTCAATTGCGATAAAGCCGTTAAAATCAAATTTCCAATAACATGCCCCGATAAATCACCATCTACCGCAAAACGATATTGAAATAAATCGACAACCCGTGGATCAACATTGGATAAAGCTAGCATGACATTGCGTATATCACCTGGGGGAAGCACATCCATTTGCTCGCGAATTTTACCAGAACTACCACCATCGTCCGCTACGGTCACAATGGCCGTTAAATGTATATCCTTCTTTTTAAGCCCTTTTAAAATGACTGGAAGACCGGTCCCGCCACCGATTACTACTACTTTAGGTTTCGTTTCCTTTTTCATATTAACGGCCCTTTCTACGTTTCATATCTCGGTGTGAAATCGTTGTTTCATATTTTTGTTGAATTGCCTTACCAACGAACTCTGTCAAAGCTACTGAACGATGCTGTCCTCCAGTACATCCAATGGCAATAACTAATTGTGTTTTTCCTTCTCGTTTGTAAAAAGGAAGTGTAAACATTAATAGATCTACTAACTTATCTAAAAAGGTCTGCGTTTCTGGCCATTTCATCACATATTCATACACATCTTCATCAAGTCCTGTCAGCGGACGCATTTTGTCAATGTAATGCGGATTCGGTAAAAAGCGCACATCAAACACTAAATCAGCATCAATCGGAATGCCGTATTTGAAACCAAATGACATCAATTGCACATTGAATATATCTTTATCTTCGGTTTGGAATTCATTGTTAATTCGCTCGCGTAACTCACGTGGCGCCATATTCGATGTATTAATAACTAACTGCGAACGGCCTTTTAAATCACTAAGCAGTTCGCGCTCTGCATTAATCCCGTCTAGCACAGACCCATTAGGCTCCAGTGGATGGTGGCGGCGCGTTTCTTTATAACGCGAAACAAGTACCTTATCATCAGCCTCTAAAAAGAGAATTTTCGTTGTTATAAAATTGGTATTATCTAGCTCATCTAGCGCTGGTTCAATGGAATCAAAAAACTCACGGCCGCGAAGATCCATTACGAGCGCGATTTTATCCATTTTATCGCTTTCTTTCATTAGCTCCCAGAACTTTGGAAGTAAACTTGGCGGTAAATTATCTACACAAAAATAACCGAGATCTTCTAAAGACTGCATTGCGACTGTTTTTCCTGCTCCAGACATCCCAGTAATGATTACTAATTTTAATTGTTTAGAAGCCATATCTGCCTCATCCTTTCGCACCAATAATATCTATCTTCCATTTTAGCACACTTCTTACTAGAAAATCCCGGAAAAGTCTCTAAAGCGAGTTTCCGGGATTTTTCTTTTTAAGCTTCGATATGTTGCATCAAATCAGCTTTCACTTTTTCTAATTTTGTTGCACTTTCTTCTTTACTTTCACCACGAATACTAAAGTAGAATTTGATTTTCGGTTCTGTGCCGGATGGACGTAAACAGAACCATGAACCATCTTCAAAATAACATTTAATGACATCTGCTGTTGGCAAATGAATCGCTTCGGTTTTTCCAGTAGCAATCCAAGTTGTTTCGCTTCTTAAATAATCTTCCGCACGTTCCACGGGGAATCCACCCATACTTGTTGGTAGTTGCTCGCGAAAATTACTTGTAATTTCTTTGATGCGCCGAGAACCATCCTTACCGCTTAAAGTTAAGGAAACTAGATCTTCTTTGTAATAGCCAAACTCAGCATAAATTTGCTCTAAATCTTCTAGTAAACTTCCACCTTCTACTTTGCTAACGAGCGCCACTTCCGCAATCGCAAGCACCGCTTGAATCGCATCTTTATCACGCGTAAACGGCTTAACCATATAACCATTACTTTCTTCATAACCAAATTCAAACGTATGCTTGCCAGTTTCTTCAAAGTGCTTAATTTGTTCTGCAATAAATTTGAAACCAGTTAATACTTCAATCATTTCCGCACCGTAATGTTTCGCGATTTCTGTTCCAAGATTACTTGTTACAATAGATTTTAATACCGCTGCATTAGCTGGCAATTCATTTTGCGCTTTCTTTTGTTTTAATAAATAATGTAAAATAATCGCGCCAATCTGGTTTCCAGATAACACTTCATATTCGCCGTCAAGATTACGAACTGCCACGCCTAAACGGTCAGCATCCGGATCTGTTCCGACTAAAATGTCGCCACCAAACTTCTTACCATATTCAATCGCAAGTAAAAAGGCTTCGCGGTTTTCCGGGTTAGGCGATTTTACCGTTCCAAAATCGGGATCATTCACAAATTGCTCGTCAACCTTAACAATATTCGTAAAGCCAACACTTTCAAGCGCAGGAACGCCAAGAATTCCGCCAGTACCATGAAGGGGCGTGAAAACAATTTTCAAATCCTCCCCTCGTTCTTGAACAAGCTCTTTATTGACAATAACCTCTTTTAATTTTTCCAAATATGGACGGTCTACTTTTTCACTGATTACCTCAAGTAAACCATTTTCAATTAATAGCTCTTGGTTCGCTACTTCTACAGAAAAAATATCCTCTACCGCGTTTATGTATTCAATTACAGCACTTGCCCCTGTTGGAGGCATTTGTCCGCCATCTTCACCATAAATCTTGTAGCCATTGTATTCTGGTGGGTTATGGCTAGCTGTAATAACAATCCCACCAAACGCATTTAAATGACGTACTGCAAAGGAAAGTTCCGGTGTTGGTCGAAGCGCATCAAAAACATAGCTTTTCACACCATGATGCCCTAATACCGCCGCCGATTCAAAAGCAAATTCGCGTGACATATGACGAGGGTCATACGCAATTACTATTCCGCGCTTCTTAGCCTCGTCACCGTTCTCCGCCACAAATTGCGCCAAACCTAGAGAAGCCTTACGAATAGTATAGATATTCATGCGGTTTGTTCCAGCGCCTAGTACACCACGCATCCCAGCCGTTCCAAATTCCATATTACGATAAAAACTATCCTCAAGTTCTTTTTCATTTGCTTCCATATTCGTTAATTGTTTTCTTAATGTGCTATCTAATTTGTCATTAGCAACCCATTTTTGATATTCTTCTTGCCAATTCATTCTCTACACTCCTTCATTTAGAACTCTTTAATTAAAATTTATCAGCTCTCCACTGTGAAACGAAAAGCTGTTCTAGATGTAAAAGGTTTTTCTGGTCGAAGTACAATATCACCAAATCCGTCATGGTTAATCGCATCTACTAAACCCTGTGTTTCCATTGTTATGCCAGCATATTTTGGCACAGTTCGCTCGCCAATCTCAAAAGAGCCATCCAAACTATTCGCCGTATAAATTAATACCGAGTCAGCTTTGGTTTCCATTTCCAAGCGCCGTCCTGACTTTGGATCAAACAAAACTGCATCTGGACGACCATTTTCATGTTTTAAAATGAACGTATGATCCAGCCCCGCACCAACTAATTTTACTTGCTGGTCCTGACTTTGTGTAATCTCCGCTACTTCACGACCTGCACGCAAATCAAAGATAGTATTTTCCGCTAACCGCTTTTCCCCAATTGGGAGAAACTCTTCATCAATTGGTAGGAAGCTGTCACTATTAACCCAAAGCTGATGTTGTAAAACCGTTGAACCAGCTTCTCCGCTTAGATTAAAATAAATATGATTGCTCGGGTTATATATAGTCGGCTGATCGCTTTTCGCTTCATAATCAAGCAGCCATTCATTTTTATTATTTAACGTATATGTCATTTTTGCATCAATATTTCCTGGATAGCCATTTTCTCCATCCGCCCAGCAGTATTCAAAAGTCATCACAATTTGATCAAGACTTTTTTCTACTGAAACATCCCAAAGCTTCTTACTAAAATTGAATTTCCCACCGTGACGATGGTTAGCTCCTTCATTTTGAATCAGTTGAAATTGTTTACCGTCCAAACTAAATTGCCCATTTGTAATGCGTCCAGCAACAGGGCCAAGTGTCGCGCCGAAGTATGGGGAGTGTGCCAAATAATCATCTAAATTTGTAAAACCAAGACTAATATTCGCAAAATCACCAAATTTATCTTTTGTTTCAAGGGAAGTAACAATCGCTCCGTAATTTAAAACACTCATGCGCATACCATGATCATTTACCATCGTCCACTTCCAAACAGTTTCTCCCTCAAACTCCCCAAATCGCTCCTTCATTACTTCGATAAAAATCACATTCCTTCATAAGTTATTAATAGCCATTTGGATGAGATACGTGCCATTTCCAAGCAGTGGCGATAATATCTTTTACGTCTGTATAAGTTGGCTCCCAACCAAGAATTTCACGCGCTTTATCACTTGAAGCAATTAACGTTCCTGGATCTCCTGCACGGCGTGGTACAACTTCAGCTGGAATTTCTTTACCTGTTACAGTACGAGCTGCTTCAAGCATTTCTTTCACTGAAAAACCGTTACTGCTACCAAGGTTGAAAATATTACTTTCCCCGCCATTTTTCAAGTATTCTAGCGCTTTAATATGCGCGTCAATTAAATCTTCTACTTGTACATAATCACGAATACAAGTACCATCAGGCGTATTGTAGTCGTCACCGTAAATCGCTAATTTTTCTCGTTGACCAAGCGCAACTTGTAAAATAATTGGGACTAAGTGTGATTCTGGTTTGTGATCTTCCCCAATTGAACCATCCGCTTTGGCGCCAGCAACATTAAAATACCGGAGTGCAACATATTTCATATCATACGCTTTATCGCACCATTTCATCATTTTTTCCATGATTAGCTTCGTTTCGCCGTAAGTACTTTCCGGATTTGTTGGCATATCTTCCGTAATCGGTACTCGTTCTGGCTCACCATATGTTGCAGCGCTAGAAGAAAAGACAATATGTTTCACACCAAATTGCTCCATCACTTCTAAGACAATTTGCGTACCATAAACATTATTATTTAAATAAACAAGCGGTACTTCCATCGATTCTCCTACAAGTGAACTAGCAGCAAAGTGAACCACACCATCTACCTTTTCTTTTTCAAAAACTGAACTTAAAAATGCCTTATCTCGAATATCTCCTTCATAAAATTTTGCCTTTTTATGAATGGATTCCTTGTGCCCTGTTCTTAAATTATCAATAACTACTACTTCATATCCGCGAGTAATTAACTCATCTACTGCATGTGAACCGATATAGCCAGCGCCACCAAGTACAGCAATACCCATTACTTATCTCTCCTAATACTTGTCTTTGTCTTCCATTTTACACTACTCAAGTCTATATAGTCACGCAAAAATGGGTCTAAGATAAATAATCCTAGACCCATTTGCACTTTTTACTATTATTTAGCTGCTTCAGCTTCTAATGACTCTTTTAATTCTTCTACATATTTTTGAGCGTTTTGTCCAGCAAGTCCGCCATCGCCTGTTGCTGTTACAATTTGGCGTAAGCTTTTCGCACGAACATCACCAGCTGCAAAAATACCAGGAAGGTTTGTACGCATTTCCTCATCTGTTACGATATAGCCCTCATCATCTGTAATACCTAAATTTAAGAATGCTTTCGTAAGTGGAACAAGTCCAACATAGATGAAAACACCATCCACTGGCATAATAGATTCGGAACCATCCACTGTGGAAACAAGTTTTGCTCCAGTTACTTTTTTGCCATCGCCAACAATTTCTTCTACTGTACTATTCCAAATGAAATCAACTTTTTCATCTTTGAAAGCACGATCTTGTAAAATTTGTTGTGCTCGCAATTTATCACGACGGTGTACTATCGTTACTTTATCTGCATAACGAGTCAAATAAGTTCCTTCTTCCACTGCAGAGTCTCCGCCGCCAACCACGATTAATTCGCGATTTTTGAAGAACGCTCCATCACAAACAGCACAATAAGAAACGCCGCGTCCACTAAGCTCTTCTTCGCCAGCTGCGCCAAGTTTCCGGTGTTCAGCACCAGTCGCAATAATAATCGCCCGAGCTTTATAGGTTTTCGATCCAGCCGTTACAGTTTTAAATTCTTTGCCATCAACGACTTCTTTAATGTCCCCATAAGCATACTCAGCGCCAAATTGTTTCGCACCGCTAAGCATCTTATCGGATAAATCGGGTCCTAAAATACTATCAAATCCAGGGTAATTTTCAACCTCAGCTGTGTTAACCATTTGTCCACCAGGTACACCGCGTTCAATCATTAACGTATCTAAATCTGCACGGGAAGTATATAAAGCAGCTGTCATTCCAGCTGGTCCCGCTCCAATAATAATCACATCATAAATTTTTTCTTCACTAGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP019624|2529476:2537318|2530455_2531424_-|WP_003731212.1|DBSCAN-SWA MKKETKPKVVVIGGGTGLPVILKGLKKKDIHLTAIVTVADDGGSSGKIREQMDVLPPGDIRNVMLALSNVDPRVVDLFQYRFAVDGDLSGHVIGNLILTALSQLNDSYVDAINVLATVLKIRGKVIPATDQPLILNAEMEDGSIVHGESLIPLQGKHINRVYIEPENVKPYPTAVEAVKEADLIVIGPGSLYTSILPNLLLTELADEIIASKAPKVYITNILTQIGETDFFSDADHIKVIHEHVGKSFIDKTLINTTTVPKELLFPEDVAQVEHNAKGMEELGVEAIYQDFLSTEDGLVRHAAEKVADALLAMLPNQTIEKE >NZ_CP019624|2529476:2537318|2534180_2535242_-|WP_009918600.1|DBSCAN-SWA MIFIEVMKERFGEFEGETVWKWTMVNDHGMRMSVLNYGAIVTSLETKDKFGDFANISLGFTNLDDYLAHSPYFGATLGPVAGRITNGQFSLDGKQFQLIQNEGANHRHGGKFNFSKKLWDVSVEKSLDQIVMTFEYCWADGENGYPGNIDAKMTYTLNNKNEWLLDYEAKSDQPTIYNPSNHIYFNLSGEAGSTVLQHQLWVNSDSFLPIDEEFLPIGEKRLAENTIFDLRAGREVAEITQSQDQQVKLVGAGLDHTFILKHENGRPDAVLFDPKSGRRLEMETKADSVLIYTANSLDGSFEIGERTVPKYAGITMETQGLVDAINHDGFGDIVLRPEKPFTSRTAFRFTVES >NZ_CP019624|2529476:2537318|2535258_2536242_-|WP_009918601.1|DBSCAN-SWA MGIAVLGGAGYIGSHAVDELITRGYEVVVIDNLRTGHKESIHKKAKFYEGDIRDKAFLSSVFEKEKVDGVVHFAASSLVGESMEVPLVYLNNNVYGTQIVLEVMEQFGVKHIVFSSSAATYGEPERVPITEDMPTNPESTYGETKLIMEKMMKWCDKAYDMKYVALRYFNVAGAKADGSIGEDHKPESHLVPIILQVALGQREKLAIYGDDYNTPDGTCIRDYVQVEDLIDAHIKALEYLKNGGESNIFNLGSSNGFSVKEMLEAARTVTGKEIPAEVVPRRAGDPGTLIASSDKAREILGWEPTYTDVKDIIATAWKWHVSHPNGY >NZ_CP019624|2529476:2537318|2536358_2537318_-|WP_003722610.1|DBSCAN-SWA MASEEKIYDVIIIGAGPAGMTAALYTSRADLDTLMIERGVPGGQMVNTAEVENYPGFDSILGPDLSDKMLSGAKQFGAEYAYGDIKEVVDGKEFKTVTAGSKTYKARAIIIATGAEHRKLGAAGEEELSGRGVSYCAVCDGAFFKNRELIVVGGGDSAVEEGTYLTRYADKVTIVHRRDKLRAQQILQDRAFKDEKVDFIWNSTVEEIVGDGKKVTGAKLVSTVDGSESIMPVDGVFIYVGLVPLTKAFLNLGITDDEGYIVTDEEMRTNLPGIFAAGDVRAKSLRQIVTATGDGGLAGQNAQKYVEELKESLEAEAAK >NZ_CP019624|2529476:2537318|2532408_2534139_-|WP_003725409.1|DBSCAN-SWA MNWQEEYQKWVANDKLDSTLRKQLTNMEANEKELEDSFYRNMEFGTAGMRGVLGAGTNRMNIYTIRKASLGLAQFVAENGDEAKKRGIVIAYDPRHMSREFAFESAAVLGHHGVKSYVFDALRPTPELSFAVRHLNAFGGIVITASHNPPEYNGYKIYGEDGGQMPPTGASAVIEYINAVEDIFSVEVANQELLIENGLLEVISEKVDRPYLEKLKEVIVNKELVQERGEDLKIVFTPLHGTGGILGVPALESVGFTNIVKVDEQFVNDPDFGTVKSPNPENREAFLLAIEYGKKFGGDILVGTDPDADRLGVAVRNLDGEYEVLSGNQIGAIILHYLLKQKKAQNELPANAAVLKSIVTSNLGTEIAKHYGAEMIEVLTGFKFIAEQIKHFEETGKHTFEFGYEESNGYMVKPFTRDKDAIQAVLAIAEVALVSKVEGGSLLEDLEQIYAEFGYYKEDLVSLTLSGKDGSRRIKEITSNFREQLPTSMGGFPVERAEDYLRSETTWIATGKTEAIHLPTADVIKCYFEDGSWFCLRPSGTEPKIKFYFSIRGESKEESATKLEKVKADLMQHIEA >NZ_CP019624|2529476:2537318|2529476_2530448_-|WP_003725407.1|DBSCAN-SWA MSFASETKKELTHMDVSDSDAKVELAAFIRMNGAISFSNQLVIMDVQTENAAIARRMYQLLKDLYEVPIELLVRRKMKLKKNNVYIVRLKSGTRGILEDLRILEPPMTFTKSIDRGFVKKRSAKRAYLRGAFLASGSVNNPETSSYHLEIFSVYEEHNEAICALMNQFDLNARTLERKNGFITYLKEAEKITEFLSIIGATSALLHFEDVRIMRDMRNSVNRLVNCETANLNKTINAAVRQIDNIKYIQSTVGLEALPERLREIAALRIANEDVTLKELGEMLTTGQVSKSGINHRLRKLDQIAERLRSGETPAQVGLKISNS >NZ_CP019624|2529476:2537318|2531425_2532301_-|WP_003722606.1|DBSCAN-SWA MASKQLKLVIITGMSGAGKTVAMQSLEDLGYFCVDNLPPSLLPKFWELMKESDKMDKIALVMDLRGREFFDSIEPALDELDNTNFITTKILFLEADDKVLVSRYKETRRHHPLEPNGSVLDGINAERELLSDLKGRSQLVINTSNMAPRELRERINNEFQTEDKDIFNVQLMSFGFKYGIPIDADLVFDVRFLPNPHYIDKMRPLTGLDEDVYEYVMKWPETQTFLDKLVDLLMFTLPFYKREGKTQLVIAIGCTGGQHRSVALTEFVGKAIQQKYETTISHRDMKRRKGR |
7 | Streptococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2622609 : 2703994
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP019624|2622609:2703994|DBSCAN-SWA ATCACATTTTTTCTGGTGCTGATACACCTAAAAGCGTCAAACCATTTCTAAGGGTAATTTGCGCAGTCTTAATAAGTGCTAGTCTTGCTTTTGTTACTTCTAAATTATCCATATCAAGTACTTTATTGCTATTGTAGAAACGGTGGAAGGAAGACGCTAAATCATTTAAGTAGCGAACGATACGGTGTGGCGCTCTTTTTGTAGCAGCTTCCGCAACAACATCCGCGAACTCACCTAACACTTTTAATAAATCATATTCTGCTTCTGTTTGCAGTAAGCTCATGTCTGCGTCTTTTGTTACCTCTAGACCTTGTTCTTTACCAGAACGTAAAATGCTAGAAATTCTGGCGTGCGCATATTGTACATAATAAACTGGATTATCATTAGATGTAGATTTCGCTAAGCTCATATCAAAGTTCATATGTGTATCTGAACTACGCATTGCAAAGAAATATCTTGTTGCATCCAGTCCAACTTCTTCAATTAAGTCACGCATTGTAACTGATTTACCAGTACGTTTACTCATTTTAACTTGAACACCGTCTTCAAATAAGTGAACTAGCTGAATGATTTCTACTTCTAATTGATTTGGTGAGTAGCCAAGCGCTTCAATTGCAGCACGCATACGAGGAATATAGCCGTGGTGATCAGCTCCCCAAATATCAATTAACACATCAAAGCCACGCTCTAATTTGTTTAAGTGGTACGCGATATCTGGTAAGAAATACGTATAACTACCATCTGATTTGATTAAAACGCGGTCTTTGTCATCTTCAAAATCAGTCGTTCTTAACCATGTCGCGCCATCTTGCTCATAAATATAGCCATTTTCGCGTAAACGTTCTAACGCTGGTAATACTTTATTTTCTTCGTATAAAGAAGTTTCTGAGAACCACTCATCAAAGGAAACGCGGAATTCTTCTAAGTCAGCGCGTAATTTTCCTGTTTCAAACGCTAATGCATCTACACGGAAAACGGAACGGCGCTCTTCTTCGCTTGTGTGCACATATTTATCGCCGTATTTAGCAGCTAAATCTTTCCCAAGCGAAATAATATCCGCACCACGGTAGCCATCCTCTGGGAATTCAGAATCTAAACCTAGTGCTTCAAAGTAACGCGCTTCTGCTGAAAGAACTAAATTATTAATTTGATTTCCAGCATCATTAATGTAGTATTCTCTTGAAACATCAAATCCGGCCATTTTCATAATATTTGCTAACGAGTCGCCAATTGCTGCGCCACGAGCATGTCCTAAATGCAAGTCACCAGTTGGGTTCGCGGAAACAAATTCAATTTGGAATTTTTCTCCTTTACCAAAATCAGACTCTCCGTATTGTTTATCTTCGGTTAAAATCACAGGAACTAAATCAGTTAAATAAGCATTATCTAGGTAGAAGTTGATAAAACCCGGCCCAGCGATTTCTACTTCTTTAATTAATTTGTTGTCTTTTTTTAGTTCTGGAACGATACTTTCGGCAATTTGGCGAGGGGCTTTCTTAGCTACTCTAGCAAGTTGCATCGCTATATTAGTCGAATAATCTCCATGCTTTTTATCTTTTGGTACTTCTAGTAAAATTTCTGGTACTTCCGCTTCTTCTAAACCAACCGCTTGAACAACTGCTTGTTTGATATGTTCAATTAATTTGATTTGGTTCTCTTGCATGACATTCATTCTGCGTCCTCCTCTATTTTCATTAAAACAGTATATGAGCCAATGTATTCGCCGTGGCTTAGCAAATCATATTGAAATGCGACTTCACTCAGTACATCAGGCTTATTTTCATATAGTTCTTCCATTGATACTAGTTCTGATTCTAATTGTAATTTCCCTGCTCCGGAATCAACAGACGCAGTACTTCTCCTATTATCTCGGAAAAAGTGCATTCTCATATTTACGGCACCACTTCTCATTAAAAGTAGTTCGTTGTCAGCAATTTTTAGAACCGTACGAATTGTTCCAGCTAATTGTTTTTCCTCATAATGCAGATAACGATTGCCTTTATCGCGGTAAAAAACACCCGAAACAGACATATCGGATTTCTCTTCTGCATCCATCTGACGGATGACATTGGTGATATGAATAGTTACTTTTTTTCGTTCCATTTGGTTGGCAGTCATATCGCTTATTTACCCCTTTCCGGTCAGAAGAATAGACGCATTATATTATAGTGAAAAATAGCATGAAAAGCAACAGGTTAAAATGATGTCAGACCAAATATTGTCAAAATCACATTTAAAACAAATGGAATAACGGTATTAAAAATTGGTTGAATCGTAAATTCTGAAATAGGTGTTAATGCAACTACTAAGAAAATAAGCATCGCATAGCGTTCAAGTGGTTCCAGCTTAGACCTGGTTGACATTGGCAGAAACTCCACTAGTATTTGATACCCATCAAGCGGCGGTAGCGGAATCAAGTTAAACACAAACAAGACTAGATTTAATTGCACAAAAATCATTAAAAAAGTTTCCGCAACGGAGCCATATGTAAAGAAGGAATAATTTAGAAATAAAGCATATAACCCCACACCAACCATCGCAAGTAGTAAATTACTTACTGGTCCTGCAAGCGAAACAAGTATACTTCCAAGGCGGCGTTTTTTTAATTTAAATCGATTTACCGGGGTCGGCTTAGCCCAACCAAAGCCTGCAATTAATATCATTAGCAAACCGAATAAATCAATATGTACAACGGGGTTTAAAGAGAGTCTCCCCTCATTTTTAGCTGTATCATCTCCAAATGCGAGAGCAACCAAGGCGTGTGCCCATTCATGAATAGTAAAAGCAATTAATAATGTAACTAAAACATACGGTATCATTTCGAGTGGATACGCGAGAAAACTAGGCATAGGAGCCTCCTTTATCTTTTATTGAGCAATTTTTATATGCTATAATGAAAAAAACGTTGATCGAGGTGAGAAAATGCCATTTGTTACCATTCAATTTTTAGAAGGTCGTACGGACGATCAAAAGAAAGCTTTAGTTAGCGAAGTGACGGAAGTTGTTGCCAAAAATCTAAAAGCACCAAAAGAAAACATTCATGTGATTTTAGAAGAAATGAAAAAAACGGATTACGGTGTTGGCGGCGTAAGGAAATCTGATATTTAAGTGTGTAAGAAGCAAGGCATTTCGCCTTGCTTTTTTATTTTTCCTTTAACGAATGCGCATGGATGAGGGCGATTATTCTCTCGGTGATTGCTTCTTCCACGTGTCCACTTTCGATAAAATCGAGCGGATAATATAATTTAATATCGGTCCGGCGCTCTCGACCAATCGCCTCAACAACCGGAGACTCGGTCGATAACTCACGCAATTCCCCATTTCCCATCAATAGTTTAATTGGGTCTTTGCCACTTCCCACTCCAGGAAGATAGTAATCATAAGGTAAATCGCTGGAAGAATCAATTACTAAATAATAAGACGGATCAATATCGGCCTTTTCAAGAAGTCCTTTTAGTTCTGCGTAAAGTTCTGCATCTTCTTTCGGATCGTAGTTAATGTATCGTAGCAATCTTCTATTCAAAAAGCGACTACATAAATCACTCAAAATCGGATCTTCTTCCTCTTGCCAAATAGAAAAATAGTACATCAACACAATATCATCAAGCACAATATAATCTTTTAAACTCACTTCATTTAAAAAGAATGGTAGCACTTGAATAGGGGTAGCTTGAAATTCATATCCAGCACAATATAACTTTTTGGCACGCTCAAGGATTTTCCATAATAGCACTTCACCGCTACGACTAACTGGATGAAAATACACTTGTTGATACATTTGATAACGACTCATAATATAATCTTCTACCGCATGCATGCCAGAATATTTTACAATAACACCATTGCCATCTGGGCTTGGGCGTAGAACTCGCAAAATCCGCTCTAAATCAAACTTTCCATAGCTCACTCCAGTATAATAGGCATCTCGCAGCAAATAATCCATTCGGTCAGCATCAATCTGACTCGAAATCAACTTCACCAATGTTTGATTCGGATAATTTTTCTTAATAATAGCAGCAACTTTAAGCGGAAATTCTTCTCCTGCTCTCATCAATATTTTATTAACTTCCGTATCTCCAATAATTATCTCTTGCGTGTATGATTCATGGTCCGTTCCAAATACTTTTTCAAAAGCGTGAGAAAATGGTCCGTGACCTAAATCATGCAAAAGCGCTGCACACAATGCCACCATGCGCTCCTCTGGATCCAGTTGTGGTTCATTCGCAAATGTGACATCGATTATTTGCCGAACAATTTCGTAAACGCCTAACGAATGATTAAAACGGCTATGTTCCGCCCCATGAAAAGTAAGTGAAGTTGTCCCCAATTGATGGATACGCCGCAAACGCTGAAACTCTTTTGTAGCAATCAAATCCCAAATTATCTTATCAGAAACATGTACATATCCATGAACCGGGTCTTTGAATACTTTCTCTTCCCTTAGTTTCTCTGTTAAATAACTCATACAACCTCCTCCTCTCAAGTAAGCACTTTATCATTTCGGGCAATTAAACGTTCATAATAGGCTGGGAAAAGATCTAACTCTTCAGACGTAAGCGTACCAGATACAAGCTCACCTGCGTAATGCCGCAAACTGTTGAAAAGGCGTACTAACGTTCCATTTAAACTTATATCATTTTTCATTAAGTCCGAAAGCGAACCCATAACATTCGGATTCACATCTGGAAAAGTATATTTTGTTTGCTTTGCTTTTCCGCTAATCGTATAGAAATCGCGGATCAGTTCTGAGCGAGTAGTTTGATCCCCATCAATAGCTAAATAAATTTGGACCGCTACCCCTTTTGCCATTCTACGCTGAGAAATACCAGCGAATTTTTTCCCTTGAATACTAAGGTCGTAACTACCAGGACAATAAGAGTCTTCTATTTCTTTTGCTTCAATTACCTCATTACAATCTACGAACATGGCTTTGATAAGCGTAAACATCGTTTCATAACCACGCTCAATCGCAATTCCGCGTTCTGCATCTGGGAGCACCA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|
100 | Listeria_phage(79.69%) | capsid,terminase,plate,tRNA,tail,integrase,holin,protease,portal | attL 2649842:2649891|attR 2690822:2690871 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||
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NZ_CP019624.1|WP_031667946.1|2650323_2650587_+|anti-CRISPR-protein-AcrIIA4 |
2650323_2650587_+
Protein sequences of NZ_CP019624.1|WP_031667946.1|2650323_2650587_+|anti-CRISPR-protein-AcrIIA4>NZ_CP019624.1|WP_031667946.1|2650323_2650587_+|anti-CRISPR-protein-AcrIIA4 MNINELIREIKNKDYTAKLSGTDSNSITQLIIHVNNDGNEYVISESENESIVEKFISAFKNGWNQEYEDEEEFYNDMQTITLKSELN |
87 aa aa |
14
gnl|BL_ORD_ID|14 information
|
NA | NA | 2622609-2703994 | NA |