Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP019628 | Pseudoalteromonas aliena strain EH1 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DinG,RT,PD-DExK,csa3,DEDDh,cas3 | 0 | 0 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP019628_1 | 2546453-2546557 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP019628_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP019628_1
>1.1|2546478|55|NZ_CP019628|CRISPRCasFinder ATTTAAAGTAGTTTGAAAAGAAAAACTGTAATCAGTAGTCTGTTCAAATTACCCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP019628_1
The CRISPR arrays of NZ_CP019628_1 >merge|NZ_CP019628|1|2546453-2546557|CRISPRCasFinder TCGACTCGGTTAGTCGGCACCATTTATTTAAAGTAGTTTGAAAAGAAAAACTGTAATCAGTAGTCTGTTCAAATTACCCGTCGACTCGGTTAGTCGGCACCATTT >NZ_CP019628|1|1|2546453-2546557|CRISPRCasFinder TCGACTCGGTTAGTCGGCACCATTT ATTTAAAGTAGTTTGAAAAGAAAAACTGTAATCAGTAGTCTGTTCAAATTACCCG TCGACTCGGTTAGTCGGCACCATTT
>NZ_CP019628.1|WP_077537041.1|2542879_2545657_-|hybrid-sensor-histidine-kinase/response-regulator MQNKFSSPVKGLLPLFLIINIVVTTLAIVAYSFYPSNKNHTEEVVSSIDINKLATRLDLPMVDALTMSGQGKVKQLLDLTSLLDNNFQYTLYRFSTSSQTELVYSSVKPAPLPIQLNKHLIDDNILHHVLMLNGQPIGELIIKQDVSGSALSTLDSQIITYVIAFASVIALFLLALLFNRYVNNRVSKSITLLSNELHTITDTGNYNSNVNEQLDIGLGEIAKNINLLLQKTQTAMTSNDDAQVELKKLQNGLDTEVHNRTIALEQASLKAERASETKTTFLATMSHEIRTPMNGVIGTIDLLRQTELDGAQHRLSTIIRESAFSLLSILDDILDFSKIEAGRLNIDPIPFSVTDTIEEVSRVLSSVAKKRELDLELSIAPDIPTNLMGDTVRVRQVLYNLCSNAIKFTSTDDKTQGHVKISVEVAHNTADHFTLRFCVTDNGKGMTQSQLREIFNPFIQAENSITREYGGTGLGLSICKSLTELMLGTIHVTSHIGIGSEFTVELPFSIKGKIQYAHKNALDGKHIVVVSNHLEREKIMYRYLSFMGAKITYAHNEQDIETQLDVRDVIWVVDGIDNMDSINTLLRRLLYSLEDNNQQVVVLSKLDEAAINHNNIFYINASPLCKSNFMLSVLVAAGLHKPKKIKKTKTLKSQLNVEQARQANKLILLVEDNLLNQQVLTDQLHILGYGVEVANDGEEGLNMWRKSNYSLILTDLHMPKMSGYDMVEKIRGEAELLEAIDAQPYIIAVTANALKGEKERCLAVGINDFITKPIELNALEDTLSRWSDKQNQSKNEIIHQNIALPIDMEAVKKYINGDKAKQIRFFKMYLDQSQSLIKSINSGVMMNDLDEIVGSCHQLKSISKTIGAEMVADLTTTFEDKCKAGELTVDELIGLRDQLEIEYSKAAQFLKEQIKTSEQEDELID >NZ_CP019628.1|WP_077537040.1|2542550_2542823_+|oxidative-damage-protection-protein MARTVFCQKLQKEAEGLGFQLYPGEIGEKIFNNISKEAFAQWQHKQTMLINEKHLNMMDPEHRTFLEEQMVGFLFEGKDVEIEGYRPPEK >NZ_CP019628.1|WP_077537039.1|2541455_2542517_+|A/G-specific-adenine-glycosylase MLDLNKEQSHWFSNQVVDWYHLHGRKTLPWQLGKTPYKVWVSEVMLQQTQVITVIPYFEKFMESFPDIIALADADEDHVLHHWTGLGYYARVRNLHKTAKIVRDKYNGEFPQTLEEVIALPGIGRSTAGAVLSLSLGQHHPILDGNVKRVLARYFMIEGWYGVKKVENQLWHLSEQLTPENNVTEFNQAMMDLGSSLCSRSRFDCQACPLNSHCGAFNAGKVKEFPHSKPKKASPKKSCHQLIIKCDDKVLMEKRPSSGIWGGLFGFFEFNERQDLEAFLAQQGFKMELESLDPFVHVFSHFELTINPHVLNIDSILDVVNDRQLVWYPLDQSVEVGLAAPTKKLVKQIAPIG >NZ_CP019628.1|WP_077537038.1|2540568_2541294_-|tRNA-(guanosine(46)-N7)-methyltransferase-TrmB MSESSNSNLEQAKQEGKYIRTIRSFVKREGRLTKGQAAAIEKCWPTMGLEHKNGMLNLSEVFGNNNDVVLEIGFGMGKSLVEMAKNAPHLNFIGIEVHRPGVGACLMDADEAGITNLRIFEHDAIEVLADCIADESLTTLQLFFPDPWHKKRHHKRRIVQAEFVEKLRAQLKVGGVFHMATDWENYAEHMLEVMKVAPGFKNQSETNDYVPRPDLRPLTKFEQRGHRLGHGVWDLMFERTK >NZ_CP019628.1|WP_077537037.1|2539479_2540505_-|methyltransferase MSVLTNPSLLLIRNSEELTGKSILVVNFAQDGFLTELKKLNPQSKITAFSYNHANGEFAKNTKDVDICIDHTISGHSYDLVILYYPKSKPELLMTLDNIRAVITTDAKLLVVGENKSGVKSIEKQLAGKTVYSNKIDSAKHCVLYSFSEIKQHLHFDITQYHKRFLVTVADTEFTAISVPGVFNHGGLDIGTKVLLENAPTIKQGKVLDFGCGAGLIATFLGLKNPALDFVCSDVSALATYATEQTLKLNSIKGEALLSDGLNSITGKFDLIISNPPFHTGISTDYTVAEAFLSNAKQHLTKTGKLNIVANSFLKYTPILETQFDNYQTVFKSNKFAVYSS >NZ_CP019628.1|WP_077537036.1|2537735_2539340_-|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MPKKVHQSSIRKALINLIMLITAICLSLSISISTYLSVKEQKQLIISKLVILSEIVAFDASNSVINDDRQTEEKRLKSFDKIPLIKNIHIYSIEKKSQQPAFFISFNAKKTPPVPLKIDSINELKTPNIINDHIELIRPIYNNKELVGYVYMRGSLESLDDYIKQKIFIDILLTLLILVVVYFIAIKVQKRIAKPIEQLSMLLQDVSKNHNYDARAPATNVKEITALSNSLNIMLTRTQRQLKRHEKDKEEIKQLNQSLEGKVNQRTIALREANQELLATLERMHQYQTQIVENEKMASLGQMVAGVAHEVNTPIGLGITSSTLLRDKLADVRISFDEKKLTSNQLKRFIDEGIENLDLIYRSLNRVADLISNFKKVAVIQDDGAKTHINIHKLISDILISIHSELIVKKPTITINCPTDLIVQSKPEPLQQIFQQLLLNSIIHGFVGIENNKIVIDIEQAQEHIIITYSDNGQGVDKTIQHRIFDPFVTSKRGQGASGLGMHLVYNLVTQALGGRILFDLEEKQGTRFIITIP >NZ_CP019628.1|WP_077537035.1|2536521_2537238_-|two-component-system-response-regulator-ArcA MQTPVILIVEDEDVTRLNLVSLFEAEGYKVIEAIDGDDMHDKLTNNDDVNLVVMDINLPGKNGLILARELRQKRKVGLIFLTGRDNDVDRILGLEIGADDYITKPFNPRELTIRARNLITRTALGGEESTLETNGVITFNGWELDENSRCLTSPSGDAKRLPKGEYRALRLMLDSPGRIFSREQLIKHMTGRELRANDRTVDVTIRRIRKHFESDNSTSELISTIHGEGYRFIGKIDS >NZ_CP019628.1|WP_077537034.1|2534186_2536505_+|aerobic-respiration-two-component-sensor-histidine-kinase-ArcB MTDYSLSPWVRILSSLITRFGEFKAAVACYTLFLTASLILSSMFYYVAVGEIHLVDILAVIFFTAVVSPLVISVLLNSIRQLDASYAYLDSATKQEKLLNQTLKDNISRLNVEIDERKMAFHAKHRAIEELRKEIAERKKTQQELAQQGMLLRSIVDSSPDLFYYRDNNGVFAGCNKMFEEVMGKTSAELIGKTAEQTFPSEFLSEVLETDKQVEQTHQAITIDVGYDVEGEKRWFELRKLPFINDEGDYIGLLGFGRDITSRKEAAQALETAYKDKGKFIATLSHELRTPLNGIVGLTRMLLDTDLDKQQRSWSNTIFSSAETLGNIFNDIIDLDKIDREQLDIATNPINVSDFINDVVNFAGLIAEQKDLEFNIERSGMLDIYALLDPTRLRQVVWNLINNAVKFTQSGEVKLECVRENRIEGPWLIMKISDTGQGIPPEQLPRIFDMYYKAPDLKGTNAIGSGIGLSVTKALVSAMRGVITVESSEGEGSCFTVQIPLNLCIAPTEQSYVGRGLYILLVEDVPLNAEIATNLLEQRGHEVLWAETGEDALSFVETEDDLDLVLLDMQLPDINGDEVARQIRADSHFDKLPIVALTANVRSAEEELKGISIQGALAKPINTVKLDKMLADLFDIKQIESSTPQLKVSDEALIGINAHLLDTETIEDFVNSMGLVVFRRSSQLFEKLNPQYQQELLASLNAGDREEYKSVAHKLKGAAGSVGLNDVQLHAKVMEHGATEETDDVLKEWLNVLADKINEGQQALHLFLQQLE >NZ_CP019628.1|WP_077537033.1|2533032_2533953_-|GTP-cyclohydrolase-I-FolE2 MQTNMPDIADTAPALQTGKLDWVGMAEIELPFIFESRDLAPVTVNAKARAFVNLHKEDAKGIHMSRLYLALDVLSTEQQVNPQTLANTLNTFISSHENLSDKAQIEFKFELPLRRKSLLSGKVGWKSYPVTLISTIEHNIISYELTVDVTYSSTCPCSAALARQLIQNAFNEKFDQDTLSQKDVHEWLGTTQGIVATPHSQRSIANVKVKLNNDINEFDVVNLINTLENELKTPVQAAVKREDEQEFARLNGQNLMFCEDAARKIKASLEASNYADYWLQINHYESLHAHDAVAIAVKGIENGYKA >NZ_CP019628.1|WP_077537032.1|2532325_2532922_-|DUF2726-domain-containing-protein MEFALLSILVLVVGASIFVSKFNDDGGNPYPFTRKQSVFTQVESAFLNLLERAVGDQYKIVSRVKLIDVIDCKEGLSVKSKRAAIAKAKNKQLDFVLIDKEKMTIVAAVDLVNNANKDGHKAQRDWFVNGALEAAGIPHIRMKVKSGYRPSEVRNAIMFKIGKLGSSQTQRPVRNRVSKPAVLSPSQAKAHSTALAEI >NZ_CP019628.1|WP_077537043.1|2547417_2548833_+|TolC-family-protein MIWQCKPTLLAISVMLLCGCASNLNSAQRVQAPTNMPQQWQQKASSSVLKVQEQWLTQLQNPTLDKFVQKALQNNQQLLQTSYDVEIKKQQLIVSGAALWPSLDLSTRTNRSKNNRPVSYNNASSVGLNLTYEVDLWGKLSDSKRQANLAYLAQQARFEQAKQQLVADVVTSWFDVVTAQQLLDLFKRREANAQQNLDIIESGYRQGINEALDVYLARNELNNERSRIATQTASLSASARVLERLLGEYPKGVITTSSDLPVINTDISLGLPSELITRKPTLRASWYELLATDASLAYAHKQRFPSLNLTASLSDSTNRVSDLFSPSSLAWSLLGSISAPIFEGGRLKANEEIARFNTQKQEQLYLQTLYDAFGDVENAISQQQSLSAQYTSTLEAQENALAAEQLSFEQYQSGLVTYTTVLDAQGRSFDAQSSLIDIKNQLITNRINLHIALGGDFAKPSSELKSNNDEN >NZ_CP019628.1|WP_077537044.1|2548822_2550136_+|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MKTKTAKIIIPAAVIIAAVSIVFFIKGNPPEARRFGSPPKASISVAALELKPQSYQIMIDSYGTVKPRTQSLLVAQASGQIIDVSDDFREGGFFEKGDVLLKLDDRDHQAEVKSAQANLLTAEQGLLEEKARGQQAITDWKRLGGAKQASSLVLREPQLAAAEAEVLSAQATLEKAMLDLERTKVTAPYAGRILSRSVDLGQVVSNNTQLATIYAIDSVEIRLPIKNKDLSFVNLPEQYRDGAKNQAGSIVQFTSDLVGEQTWQGQLARTEGAIDENAQQLYVVAKINDPYKATASNQYPIKIGQYIKAQITGKTVPNALIIPNSTIYQGTYVYIVEEGLLKRKDITLAWQNATQAMIKTGLKANDKLVITPLGQVSSGTRVNILGQQSAEQPKNEANRQGKGKRLSPQQLEQKAKELGISVEDLKQRRAAKQGDKP >NZ_CP019628.1|WP_077537045.1|2550132_2553216_+|efflux-RND-transporter-permease-subunit MIAWFTKNHVAANLLLVTLLLSGLFSLSSKIPLEVFPSFETDMISVRVSLRGATPEDVEQGVTIRIEEAVQDLEGIKQIFSRSSEGSGSVTLEVESGYDPRELLADIKSRVDAINTFPGDAEKPIVALAERKREVIAVTVSSDYGEKETREYAEQVRDQILRLPNVTQVELSGVRDYELAIEVSQDILRQYDLSLAQISSAVANSSADISAGNLKTEGGDVLISSKGQAYRKDEFANIVVKNQADGTIIRLGDIAIINDDFEETPVRTRFNGKQAAFIDVYRIGPQSAITVADDVKNYIKEQQSSLPQGFALSYWDDDSELVKSRISTLTTNALQGGILVLALLTLFLRPAIAFWVFIGIPVSFMGAFIAMPIFGVTLNIMSLFGFILVLGIVVDDAIVTGENVYTHLKTAESGEQAAILGTQEVATPVTFGVLTTVAAFLPLAFIEGARGALFAQIPVVVIPVLLFSLIESKFVLPAHLKYIKLRHQKGEPSKFDVIQQRFADGFENAILKYYQPILNTALRHKLATVSLFIGVFFIILTMITSGWTKFVFFPRIPSETVRVNLTLPTGTPFEVTNKYVIDMSQKAQQLQQKYRDPNTGESVILNILATTGGRGGVSNSGSVRFEITPAEKRDSDIGSRELASEWRDLIGVIPGAESLTFRAEIGRSSDPIDVQLSGTSLTILQDVADHIKTRLATYPTVFDIADSMSDGKEELQIELTQQGLALGLNRVNVAGQVRNSFFGSQVQRIQRGRDDVRVMVRLPIDERRSVADLQNILINTPNGGSVPLSHVATLTAGQSPSTINRIDRYRTLNVTADIEKSNTNMTILQADLAQYLDELMQQYPGVDYKLEGEAKEQRESFGSLAWALVFVFFIIYALLAIPFKSYLQPIIVMSVIPFGMIGAVVGHWIMGMDLTIMSLLGMLALIGVVVNDSLVLVDFINKKRSEGGELLEAVKLAGASRFRPVMLTSLTTFIGLMPLLFEKATQAQFLIPMAVSLGFGIIFATFITLLLVPVNYMLMERFQGWFK >NZ_CP019628.1|WP_007378383.1|2553746_2554310_+|UPF0149-family-protein MNDLPDYEKAQLLLEKNEIFVSPAEAHGVISGLLACGLTIDDKEYLGLLSDVFNDGESFSNDLKQFFGTIYKQVVASFNDDEFQFDLFLPSDDETLIDQANGLVSWVAGFMLGFGLKQKDYGKLSSDVKEVITDFSEITRLDTTFEETEEDSQALHEVIEYVRVSALLCFAELGKEQNTQSTKKTLH >NZ_CP019628.1|WP_077537046.1|2554341_2555664_+|Xaa-Pro-aminopeptidase MVEVQKSEFKARRERLLAQMDKNSVAIIPAASEVTRSRDTEYAFRQDSDFFYLTGFNEPDAVLVLCNNSDTPSTLFCLNKDKLAEIWHGRRIGFDKAKSEYLFDETYALSELSEQLLNLVNGQQILFYAQGTYPAFDGKVFSLLNRLRSAPKKGYKAPDTIKDVRSLIHEMRLFKSPSEIEIMREGCEISARGHMRAMRYSHVGATEFQLEAELHHHYAMNGAPHPAYGTIVGSGDNANILHYTQNSDVLKSGDLVLIDSGCELQGYAADITRTFPINGKFSEEQAALYNVVLKAQDVAFGEVKPGGYLSHANKLAMEVMTQGLLDLGILTGNFDELMAKGACKEYYMHGLGHWLGLDVHDVGDYKVNNVERAFEQGMVLTIEPGLYISEDSSAPQKYKGIGIRIEDNLLVTENGHENLTLSVPKKISDIEALMQSAKNV >NZ_CP019628.1|WP_077537047.1|2555679_2556867_+|2-octaprenyl-6-methoxyphenyl-hydroxylase MAKQFDVVVIGGGLAGASCALSVAKTNPALNIAVVEANQVTGEYHPSFDDRSIALAQQSVEYLQSLNLFEQNAPYTAAIKKVSVSDRGYFGKAHINCDEFAKPSLGYVVEVNPFGRALHQRLTQSNITLYCPDSVTAIEQTLHSNSLTLQSGEQLSATLLVIADGAQSPTRNLLGLGFNTQPYEQGAIIANLEVADGHNNHAFERFTQNGPMALLPMSNNRYSLVWCMCQEKIEQHMALGDQSFLSALQSAFGYRGGQFTKVGMRASYPLVYGQVESLIAHRTVVIGNAAHAIHPIAGQGFNLGLRDVQVLSNLIANSQHDLGSYAFTREYSQKRRDDIKTVMTLTDALVRLFSNSSRVFAYGRSIGLFSMDLFPALKAPLAKQLMGQVKQGRCL >NZ_CP019628.1|WP_077537048.1|2556863_2558030_+|monooxygenase MKQAQVCIVGGGCVGLTLALGLAKANISVVVLDGAPTQALPCDEYGLRVSALSIASQTLLEQLNVWPEIIAQRACAYTHMDVRDADSFGKIAFNNEQLELEHLGHIVENDIIRYALIKELEQQSSATLMFDTQYQQIHQSESDVFITLKSGEPIIAKLLVAADGANSAIRKQFNMALSFKDYDHHALVATVKTKESHANTARQVFLPSGPLAFLPLSDANTHSIVWSTSPNHCDELLAMDDNSFNKAVMAAIDGQCGLCEVQSKRAAFPLKMRYAQQWVSGKVVLIGDAAHTIHPLAGLGMNLGLKDAAYLIELLTSNNKEFASTRTLRDYERTRKLDAQKHIAMMQGLKELFEGANPVKKLIRGVGLSLVDNLGPIKHLFAKEAIGK >NZ_CP019628.1|WP_077537049.1|2558561_2558903_+|30S-ribosomal-protein-S6 MRHYEIVFMVHPDQSEQVAGMIERYTGSITEANGVIHRLEDWGRRQLAYPINKLHKAHYVLMNVEAPTEVISELETTFRYNDAVLRNLVIRTKTAVTEASPLAREEKKEAPAA >NZ_CP019628.1|WP_033015549.1|2558947_2559265_+|primosomal-replication-protein-N MVSPFMNQLVISGVVCKTPKFSQSPAGIPHCIFVVEHKSMQTEADLNRNSYVRLQVVASGKQMQQQTQHLHVGQALQVSGFLNRHEGRNGLSQLVLHAQHIERII >NZ_CP019628.1|WP_007378475.1|2559277_2559505_+|30S-ribosomal-protein-S18 MARYFRRRKFCRFKAEGVKQIDYKDLATLRNYVTESGKIVPSRITGTSAKFQRQLATAIKRARYLALLPYTDLHK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
632348 : 771622
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP019628|632348:771622|DBSCAN-SWA 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MSTNIELVIFDCDGVVIDSEILSAQVLINMLVEKGVEIDRAYVQQHFLGCNFKTVSQKIADAFNVTLSESFEGDYREVLLNEFETVLTTTDGIKDVLNNLAVPICIATSSSPARTAKALSVVSLSKYFSDTVFTSCEVKRGKPAPDLFLHAAKHMGVKPEHCLVIEDSKAGVNAGIDANMQVLHYSGGQHMQGSVNHVRSAYPNVDHLTHWQDFFSAYPALKKQ >NZ_CP019628|632348:771622|695994_696471_+|WP_077535591.1|integrase|DBSCAN-SWA MLCICYGCGLRISELLNLRVVDIEFSQDCLWVRAGKGNKDRRVILPKSAARRLNAYIAGFSLGSILFCTNWDKEKAIDAKTFSRGLKRAVARADIAKNVSAHSLRHAYATHQIEAGMPLHQLQKQLGHTSIRTTERYLHWLPEMAHSSHDLMAAWEED |
107 | Pseudomonas_phage(17.65%) | integrase,transposase,protease,plate | attL 694869:694884|attR 757378:757529 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
2170801 : 2217114
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP019628|2170801:2217114|DBSCAN-SWA TATGAAAAAAGCACATTTTACAGACAGTCAGATCCTCGCCATCTTAAAACAAGCAGAAAGTGGCGTGCCTATTCCTGAGCTATGCCGTGAACATGGTATGGGCAACTCAACCTTTTATAAATGGCGCGCTAAATACGGCGGCATGGATGCGTCTTTAATGACACGAATGAAAGAGCTTGAAGATGAAAATCGCCGTTTAAAGAAAATGTATGCTGAAGAGCGGCTGAAATCTGAGGTCATTCAGGAGGCAATGGCAAAAAAGTGGTAAAGGCTTCTGAGCGCAAAGTATTAGCACATGAAGTCGTTAGCACAAATAAAATGAGTATTGCCTTAGCCTGTCGTACTTTCATGATAAGTGAAACATGCTATCGCTATACGCCAAAACTGTCTGATGAAAATGAGAAAATTGCAGCGTTGCTATTGGATTTAAGCCAATGTCAGCGTAATTGGGGATTCGGTTTATGTTTTTTATATTTACGCAATGTTAAAGGCTACACATGGAATCATAAGCGCGTTTATCGTATTTACCGTGAGCTTGAGTTGAATCTGCGAATAAAGCCTAGAAAACGTCTAGCAAGGAAGAAGCCGGAACCATTGACTGTCCCTGATGCCATTAACGAATGTTGGTCAATGGATTTTATGCACGACCAATTATCTGATGGCAGAGGGTGTCGCTTGTTCAATGTAATTGATGATTTCAATCGCGAAGGACTCACAATAGATGCTGACTTATCACTCCCCGCTGAGCGTGTGATCCGCTCGCTCAATCAAATTATAGAATGGCGTGGTAAGCCAAAAGCTATCAGGTGTGACAATGGGCCTGAATATATTAGCCATAAATTAGCGGAGTGGGCGTTAAATAATAATATTGAATTACGATTTATTCAACCAGGTAACCCGCAACAAAATGCTTATGTAGAGCGGTTTAATCGAACGGTTAGGTATGACTGGCTAAGTCATTATATTTACAGTGATATTAGTGAGTTACAAGATAAAGCTACCGATTGGTTATGGACTTATAATAATGAACGCCCTAATATGGGCATAGGTGGCATAACACCCATACAAAAGCTGGAAAAGTTAAACAACGGAAATTCTACAGATAGCCTCCATTAAAAATGGGGGGATTACCTTGGGATAAAACAGGCTTCAAACGAATCGAAAATGTAGTGGTCAATAAAATTTGGCTACAGTTTTAGAGTCTTCGCACTATTTTAGATTAATTTAGCACTAAACCGGCGTTATAATGATTACAACGGAATGCGTTGCAGGTTTTAATTTCGCCATTTTTTCCACCAAATTTGTATGCAGATGGCATAACCTTTCTTTCTTAACGTAATTGGTATTACAGTTTAGATGGGGTTTTAATTCTTCAGTATCTGTTTAAGTATGCATACAGCCCACTAGTGGCTCGTGTAATCGCTTTCCACGCCTTGGCATAGGTACGATTATTAACTCAACGAAATTAGGTAGAGCTTTCATCCAATTACTCAATGGTCTTGCGATCCTATCTGCATAGGGAAAGCTAATTAATTTTATTAATTGGCACCAGATTACCTAGAAACGAATAACACAACATCGCTATAGTTGAGCCTAAGTGATAAAAAACTAACAAAATAAGCACTCCGTAACAATATACTCTGAGGTCACTTGGTAATAGACGTTGAGCTTTGTGCCCGCAGGGACGGCGCTACTTAGAGTATCCATAATCTGAAATGTTAACATATTTTGATTAAAATCTAATAATTTGGCACATTTAAAGCCGAAGAATTCACCAACACTTGCGTATAGCGCTTTATAAATACTCTCTTTTGCTGAAAATATAATGCTCAGTGGAGAGGAGAGTTGTTTACCTAGTCGCTGAAATACCAAGGTTTCATCCTCTCTTAATATTTGATTATTAAGATTATCCTCAAGCTCATCAGGCATCTTCTTTTCAATATCTATACCGATTCCTTTGGCTTGGTTTGCATGCATAACTATCGCTATAGCAAGATCTGTCGTATGTGAAATTGATCCTATTGCTTTTACAGGCCATAAAGGCGCTCTACTTTTTGACGTGCCGATAATCTGATGTTTAAACCCCAATTTATCAAGGGCTCTTGTGGCACAAATTCGACCAGCTAAATATTCAGCTTTTCTTTTTATTACTGCCTTATTTAATTGTTCAGGAAAAGGTTGTCCGTAATATTGAAAACTATTGGGGGTAAAATATTGCTCAGAAAAGTTTATACAATAAAAGGGTACTAGTAATTGAGAGGTGAAATTAAAATTTTCTAGAATTTGCATTTTTTACTCCAATATTGAGCGGCTAAGCGTTTCAGGTCTAGTTTACAAGGTCAAACATGCAATTTAAAATACAATATCAGCTTTAAGGTACTAAAGTTTTGACGTCGAAAGACCAAGCATATGCGTAATGCTGGTCGGTTAAGTGAAAGCCAATAAATGAAAAAGCTACAGGGCGATTCAACTGAATTTTCCTGTAGCCCTCTAATTATGTAACTTGAAGCACCTATATCGAATTTCTATAATCAGTACTAATTTTATGAATAAGAGTGAATATATATTCATAGAATGCTTAACGAGCTGGAATTAGAGTAGATGCTTTTAAATCTAAACTAATACACGTACTAGGAGCTGTTGATCTTTGCTGTATATAAATTGTTCACGCATGCATTGGCAGCCACATCATCAAAAAACTAAGCGTAACCATACTTGAATAATTACGCGATAACTTATCGTATCGTGTTGCTATCGCTCGATAATTTTTAATTCTACCAAATGCATTTTCAACTAAATGCCTGTATCTATATAAGCACCAATCAACATCCTCATTCCCTTTCTTCTGGTGTTTTCTTCTTGGAATTGTTGAATCTGCTCCCATTTTTTCTACTTCCTCACGAAAAGTGTCGCTATCGTAACCCTTATCTGCGACAACATGTTCAGCTTTCGGCGAGTTTTCTACCAAACTTTTTGCATGAACGATATCGTTTACTTGTCCTTGTGAAAGCTCAAAGTAAACAGGTAAGCCGCCGCTATCTACCGCTAAATGGATCTTGGTTGAGTTGCCTCCTCGGCTTTTCCCTATATCTTCGGTCGCTGAAGAAGCTGCCCCTGTTCCATGTTGATGAGCACTGATAATACTCCCATCTATAAAGAGCCATTCGACGTCTTCAGAATCCACTAATGTATTGAAAGCATGAGATAAAACCCCTTTGCTTGACCATAGGTTAAATCGTCGAAAGACCTTGCTCCAGCACCCAAATTCTTTTGGTAAATCACGCCATGGCAAACCTGTTCGCATTCGATAAAGTATTCCTTCCATCGTTATTCGATGTGCTGGCTTATCATAAATTCTCTCCGAACTTAACATTGCTTTGTACAGGATTTCCCAACGTTCATCTGTTAACATTAGCCTTGGCATAGTGAGTCGCTATTTTTTGTTTTTGGCGAAGTAAATTATACCTGCTCACTATGCTGTTTAAAAAGTATACTTGAAAGATCAACAGCCCCTAGGGCCTGTTTATCTTTCGAGGTTAAGTTTGCAGCAGACTGTTTGGTATTTAGGCAAGGCAGAGCCTATGTAGTGTGGTTATTCCCCATAAATAGGCGATAACACAGCATAAATGCCAAACATGCGCTGCCCGAAGGGTTCTACCTAGGGGTAATCAACTCTTTGTTGCTCGGTTTTTACTTATTCTTACAGGGATGTAAGCCATTAGAGTAACGCAGGAGCAGTTACCGAGCCCACTAGGTTACAAATCTCACGCCGCGATTAAATCGCCCCTAGATTAAACAAATTTTAATCCTGAAAGGTCAACAGGCCCTAGATCACATTAATTGGTAGTGTTCATCAACTAGTTCAACATGGTTTCCCATAAGATAATTCAGAACATTGTTATCGTCATAGATTACATCTTTTAACTTAATTTTTTCTGAGTTACTTAGCTCCATGAAATGCTCAATCAATTTTTCATCATGGCTTTAGGTAATCTGTTAAATCTAAATATACTACGTTTACACCTGAATCATGAACCAGTGATCTGCTTCTAATTAAGGGACGTGAGTTTAAGCGTCACTCAATTATCAATATTCTGCTTTAAATTATAAAACGTTATTACATCCATTAAAAAGCATAAATTAATTAGGGTCGCTCGATATACAAAGTAAATGCCAAGTGATTACTGACAAGGCAATAATCGCCATGATTGAATGCTTTGTAGCGGCTTATATTCGATATTTAGCAAAGCGATAAAATACTTAGTCAATAAGCTTTTTATTTGAAATTTAAGTGACAAATGATATTGGGTTGTTTTTTTTGTTACTTAAGTGTATATTTTGTGGGTGATTTTTGTCGATATTTTGTTTTTTAAAGTAACGATACGTATAGGATAGTTTATATACTTAAAGCATTAAGAGTTTAATAGGGTCTGATTTATATTTTAATTAGCATTTTTAAATTTGACCCTAGTTAGGCTTTTAACCGTTTACGTAGTTAAGATTTTAAAAAAGAAACGGTTTCTTATAATTATAAAAGGATATTCTTAATGAAAAAAATATATTCGATTTTACTTGGTGCCTCAATGTTTAGCGGTGCAGCAATGGCGGATACAGTGTCTTGTTATGTTGATACTCAAGCTTATGACCAATATAGCGAAAATCAGTGCTTTGGCGGTGGACCTCTATCTAATCATAGACAAGGCGCGGTTGTATTTAAGGTTAATGCAAGTAAGCCTATACAAAGTGTGACTTGGAATATTTCAGCGTTTGGTGCAATTCCTCGAGCTAACAGTTGTAACGGTAGTACCTGCATTGTTGATGTTGGGCGTGGAGAGCGTAATGTTGAAGGTTGTGTAGACAAAATTTACTATAAAGACTACACATGGGCTGATGTAAATTGGTGTGCAACAGCTAATGCATATTACTGGGCGGACGGTCAAAGCCCTTTATCTGGCTCAGAAAAATAAGAAAAAGCTTAACGCCGTATTACATTTTATAAT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40 | Vibrio_phage(25.0%) | integrase,tRNA,transposase,protease | attL 2189840:2189858|attR 2201095:2201113 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
2652830 : 2660987
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP019628|2652830:2660987|DBSCAN-SWA AATGAAGATACTGTTAAGTAACGATGATGGCGTAAATGCCAAAGGTATTGCGGTTTTATATCAAGCGCTCACTCAAATTGCAGATGTAACGCTTGTTGCGCCAGATCGCAATTGTAGTGGCGCAAGTAATTCTTTAACACTAATGAATCCGCTACGAGCAACTAAGCTCGAAAACGGGTTTATGTCGGTTAATGGTACCCCTACAGATTGTGTACATTTAGGTGTAAATCAGTTGGTTGATGAAAAACCAGATTTGGTTGTTGCAGGTATTAACCATGGTGCCAACTTAGGTGATGACACGCTGTATTCTGGCACCGTTGCAGCTGCAACAGAAGGACGTCATTTGGGCTTACCAGCCATCGCGGTATCACTTTGTTCACACAATGGTGAACACTTTGAAACAGCCGCTGCGGTTACCGTTAATATTATTAAAGGCTTGGCTTCGCATCCGCTGCCTAAAGATCAAATTATAAATATTAACGTGCCAGATATTCCATTAAGTGAATTAAAAGGAGTGCAAGTAACACGCCTCGGTGCGCGCCATAAAGCCGAAACGATGACCAAACAAACCGATCCCTGGGGTCGTGATATTTTTTGGTACGGATCGCTTGGCATAGAAAGTGATGCAGGTGAAGGCACCGACTTTTATGCAATTAATAATGGTTATGCATCGGTGACACCACTAAGTGTTGATATGACGGCTAAAGAAAGCTTAAAAGCGGTAGGAGACTGGTTGGCTGATTTGGAGATTAATCGTGCTCGCTAATTACACGCGCAGTGCTCAAGCGTTATCTGATTTACTTAAACGCGAAGGTGTTGAAGATGCGCAAGTGCTCAATGCGATTGCCCAAATTCCGCGCCATATTTTTATTGATGACGTTTTAAAACATAAAGCGTATGAGAATACGGCACTGCCCATTGGACAAGGGCAGACTATTTCTCAGCCTTATATTGTAGCGCGTATGACTGAGCTACTTCGCCTTGCGGGTGCTTGTAATAAGATACTGGAAATTGGTACTGGCTCTGGATATCAAACGGCGATATTAGCTAAAACTTTTACAAAGGTATATTCAGTTGAGCGTATAAAAGCGTTGCAATGGCAAGCTAAAAGGCGTTTACAGCAGCTCGACCTATATAATGTCACGATGAAACATGGTGACGGTTGGCAAGGCTGGCAATCACAAGCTCCTTTTGATGGCATTATAGTGACAGCAGCGGCGTCTAAAGTTCCACAGGATTTACTCAGCCAATTAACTGAAGGCGGAGTGTTACTTGCGCCAATAGGTGAGAGTGATCAAAAATTAATAATGGTTATTCGCAAAGGCGATAGCTTTACAGAGCATGTGATTGCTCCCGTTAGATTTGTGCCGTTAGTGCCAGGCGATATTGAATAGGAATTTATTTTGAAGTTGTTTACTAAGTTATACGATATGGCTCTTGTATGGGCAAAGCATCGCCATGCCGAACGCTATTTAGCTGCAATGAGCTTTGCCGAGTCTGTTTTTTTCCCGATTCCACCCGATGTAATGCTAGCGCCTATGTCGCTTGCGCAACCTAAAAAAGCATGGCGTTTTGCAAGCTTTGCCACTATCGCATCAGTTATTGGCGGTATAGTTGGTTACTTGCTTGGTTTTTGGTTATTTGAACCCGTTGTTGAGCCACTTATTGCACATATGCACTGGCAAGAAAAATTTGATATTGCACTAAATTGGTTTAAAGACTACGGAGTGTGGGTTGTATTTTTAGCCGGTTTTTCACCTATTCCTTATAAGGTTTTTACTATTGGCGCTGGCGTTTTACAAATGGCATTTTTGCCTTTTTTAATCGCATCAGCAGTAGGGCGCGGTGCGCGATTCTTTTTAGTTTCAGCTTTAATGAAATGGGGCGGAGTTAAAATGGAGCAAAAATTACGTCAATATGTAGAGATACTTGGCTGGGGATTAGTTGCATTAATCGCTATAGCGTACTTTTTATTGCGCTAAGCTTTATAAAATAACTTTTTTAACACAAGGAGCTTAATACGATGAATAAACAAATTAAATGTTATGTTGCTTTATTTATTAGTATTTTGCTCTTTGGTTGCTCATCTCGTCATGTTCCCGCACCCGTTAGCAGTCTAAATAATAATGTTAATAAATATAACCATAAAATTAACATTGCTGGTGATTATTATAAAGTGCAAAAAGGAGACACTTTATATTCTATTGCTTTTAGTGCTGGAAAAGATATTAGAGAAATAGCAAAAAATAATTCAATATCATCACCTTACATCATTTTTCCTGGGCAAAGAATATCCCTGAAACCGGCACCAGCAGAAAAGAAAAAGCGTAAAAAATATACGTATTCAACTAAAAAGTCTACAAAAAAAGCACAAAAAAATAACAATAAATTAAAAAAAGAGCTTGATCGCCCAAAACAACGAGAGTATGTTCAGAAACAAGCCAGTAACAAAGTTAGTAATAATAAGTATTTGTCGAACGGTAAAGTGCAGTGGTTTTGGCCAGCGAAGGGTAAAATTACGAAACGCTTTTCTAATAAGGAAAACGGCTACAAAGGCTTGCAGATTGCTAATAAAAAAGGGGCTTCAGTTTTAGCTGCGGCACAAGGAACGGTGGTGTACGCGGGTAACGCTCTTAGAGGTTATGGTAGTTTAATCATATTGAAACATAATGATGATTATCTAAGCGCTTATGCACATAACTCAAAATTACTTGTTAAAGAAAAGCAGAAAATTAAGGCAGGTCAAAAAATAGCAGAAATTGGTAATTCAGAATCTCCGGTCACCGCACTTCGCTTTGAAATTCGCTACCGAGGGCAAGCTGTCAATCCTGCTAAATACCTTCCCTAATTTTTAGGTATTGATAATTGCTCTGGAGAAGGCTTATGGCTAACACTGCAAAACTTGACACAAACAATACGAATGACGAAAAGTTTGATGACACCGCCGTTGAAGAAACCACACCACTACTTGAAAAGGTAGACGAAGAAGATATTTTTGCCAAAGAAGAAGTCACTAAAAACTTAGATGCCACACAACTTTATTTAGGCGAAATTGGTTTTTCTCCACTATTAAGCGCAGAAGAAGAAGTATTTTTTGCCCGTAAATCCTTAAAAGGCTGTGAAGCCTCACGTAAACGCATGATTGAAAGTAACCTGCGTTTAGTTGTTAAAATTGCACGCCGTTATAATAACCGTGGCCTTGCCTTGCTCGATTTAATTGAAGAAGGGAATTTAGGTTTAATTCGCGCTGTTGAAAAGTTTGATCCAGAGCGTGGTTTTAGATTTTCTACTTACGCTACGTGGTGGATACGTCAAACAATTGAACGTGCCATCATGAACCAAACACGTACCATTCGCTTACCTATTCATGTGGTTAAAGAACTTAACGTATATTTACGTACGGCACGAGAATTAACGCAAAAACTTGATCATGAACCAACCGCCGAAGAAATTGCAGAGAGCTTAGACCGACCTGTTGAAGACGTAACTAAAATGCTACGTTTAAATGAAAAAATAGCCTCTGTTGATATGCCTATTGGCGGCGAAAACGACAGTGTGCTGCTTGATATTATTCCGGATGAAAAAAGTTTTGGTCCTGAAGGCGAAGTACAAAATAACGATATTAATAAACATATTATTGATTGGTTAGGGGAGCTAAACCCAAAACAGCGTGAGGTATTAGCGCGTCGATTTGGATTGCTTGGTTATGAACCTTCGACACTTGAAGATGTAGGTCGCGAAATTGGTTTAACGCGTGAACGAGTAAGACAAATACAAGTTGAGGCATTGCGTCGTTTAAAAGACATTTTGCAACAAGAAGGGTTAAGTACAGATAGTTTGTTTAATCAATTCTCGTAATTATTAAAGCGGTACAAACTAGAAAAGATTATGTGTGTTAAAAAGCCGAAGGATTTATTCTTCGGCTTTTTTATGTTTTATATAAAGTAAATTTAAAGCAATGCTTTTAGTTTATATAATAAATCGTGTGCTTGGCGCGGCGATAAATTATCAGGGTCGATAGCACTTAACTGCTCTTCTATTTCAGAAGGCGTACTTTGTACGGCCTCGTTGTTAAAAGTAAATGCTTGTTGCTCTGTATTTGGCGCCGTTACGCTTTGATGGTTTTCAAGTAATTTAAGTTTTTGTTTTGCTTGCGCAATGACTGCTTTTGGCACCCCCGCGAGAGCTGCTACTTGTAAGCCAAAACTTTTACTTGCTGCGCCATCAAGTACGGTGTGCATAAAGGCGATTGTATCGTTATGCTCTATGGCATCAAGGTGCACGTTTACAAGGCCCGTGGTTTGTTCAGCAAGTTCTGTTAGTTCAAAGTAGTGTGTTGCAAATAATGTTTTTGCAGATATTTTTGATGCTAGATGATCGGCTGTTGCATACGCAAGCGAAAGCCCATCGTAGGTACTTGTCCCGCGACCAATCTCATCCATTAATACCAAAGACTGTGCCGTGGCATTATTCAAAATGGTCGCGGTTTCGGTCATTTCTACCATGAAGGTTGAGCGCCCAGAGGCTAAATCGTCACTTGCGCCAATACGTGTAAATATGCGGTCGATATTGCCAATTTTAGCGCTGTCTGCGGGTACATAACTGCCAATGTGAGCCATTAGTACAATAAGTGCAGTTTGGCGCATATAGGTTGATTTACCGCCCATATTTGGGCCGGTAATAATCAACATTTTACGTTGGCTGTTTAATTCAACAGGGTTAGCAATAAACGGTTCTTTCATTACTTGTTCAACAACAGGGTGGCGACCTTGCTTGATGCTAATGTTGTCGTTATCGCACAGTTCTGGTTTTGCGTAATTTAGCGCAAATGCACGCTCAGCTAAATTATTTAATACGTCTAAATCAGCCAGTGCGGCGGCCATCATTTGCAACTGTTCAATATGTGGAGCAATAAACCTAAATAGCTCTTCGTATAGTTGTTTTTCAAGCGCTAAGGCTTTTGATTGGCTGCCAAGCACTTTATCTTCGTGCTCTTTAAGCTCTGGGATTATATAACGCTCGTTATTTTTAAGCGTTTGGCGACGAATGTAGTCGGCGGGTACTAAATGCGCATTGGCACGGCTTACTTCAATAAAGAAACCATGCACGCGGTTATAACCAATTTTAAGTGTACTAATACCCGTGCGTTCGCGTTCACGCAGTTCTAGTTGATCAAGAACATCAGTAGCGCCTTTGCTTAAGTTGCGCCATTCATCAAGTTCACTGTTATAACCTGGGGCAATAACGCCACCATCACGAATAAGTACAGGCGGGTTTTCTATTACAGCTTGCTCTAACAATGCTTGTAAATCAGGGAGTTCAGGCGAGTGCTTGATAATACCCGCTATACGAGGGTCGTTAGCGTCAGCTAATAAAGTATGTAGCGGCGCAAGCGCTTGTAATGCACTGCGCAGGCGAGTTAAATCGCGTGGACGCGCTGTACATAACGCTAAGCGCGCAATAACACGCTCTACATCACCAATCTCTTTTAATGATTCGTGTAATTCGCCGCACAGTTGTGCATCTAAAATAGCGCTAATTGCATTTAAGCGAGAATTTAGCTCATCTTTATTACGAATAGGTGTATGAATACGGCGCTTAAGTAAACGAGAACCCATTGGGGTTGCTGTTTTATCAAGTACTTGGGCAAGTGTATTTTCAAACCCACCTGATAAATTAACGGTCAGTTCTAAATTTTTACGTGTTGCTGCATCTAAAATAACAGCGTGTTCGTTGTGCTCAAGTGTAATAGCACGAATATGTGGCAGTGCAATACGCTGCGTATCTTTTACGTATTGCATTAAACAACCGGCAGCAACAAGTGCGCTGTGGGCTTTATCAACACCAAATCCTACTAAATCTTTAGTACCAAACTGATCGCATAATAAGTGCTCGGCCGTATCTAAGTCGAATTCCCACTCTGGGCGACGACGAGCCCCTTTTATATGCTCAATTAAATGAAAATTTTCAAAGCTTTCGCTATATAGCAATTCTGCTGGTGATAGGCGCTGAACCGTTGAGCTAAATGCTTCGTCGGTATTAACCTCTACAACGTTAAAGCGACCAGAGTTAATATCTAAGTACGCAATACCGTACAGGCCTTTTTTACTTTGCCAAACACTGGTAAGCAAATTGTCTTGTCGTTCTTGTAAAAGCGCTTCGTCAGAAATTGTACCTGGGGTAACTATACGAACAACTTTGCGATCAACGGGGCCTTTACTGGTAGCTGGATCGCCAACTTGCTCGCAAATAGCAACAGATTCACCCATTTGAACTAGGCGTGCTAAGTAGTTCTCTACTGCATGATAAGGCACGCCCGCCATAGGGATAGGATCGCCACCGGCTTTGCCGCGATGGGTTTGCGAAATATCGAGCAATTGAGCGGCGCGTTTAGCGTCGTCAAAAAAGAGTTCGTAAAAATCGCCCATACGATAAAACAATAAAATATCGCGATGCTCTGATTTTATTTTTAGATACTGCTGCATCATAGGGGTTTGTTGTTTTATAGTGTGTGGTGCATAAAGATCAAACGACATGTATTTACCCAAAGGCTGAATATGGAATTACATCAAGAGATTAAAACACTTGCTGCGCAATTAGGCGCTATTTTAACGGATAAATGCTTATGGATCACTAGTGCTGAGTCATGTACTGGTGGCGGAGTAAGTTATGCGCTTACAGATACGCCAGGAAGCTCTGCTTATATTGACCGTGCATTTGTCACTTACAGTAATCAAGCAAAGCAGGATTTACTGAGTGTAAATAGTAGTACATTAACGCAATACGGTGCTGTGAGCGAGCAAACAGTACAAGAAATGGCATTAGGTGCGATTAAAGCAGCAAACGCTGATATTGCGATAGCTATATCGGGTATTGCTGGACCAGGTGGAGCTAGCGAAGATAAACCTGTTGGGCTTGTGTGGTTTGGCCTGCAGATTAACGGTAAAGCACTTACATTTAAACGAGTATTTACCGGTGATAGAGCTCAGGTTCGTCTGCAAGCTATTGTATTTTCATTAAAAACTATAATAGATGAGATAAAATAAAAAAATTAGCTTGATACTGTGATTTCATACAGTATACTTGGTTCCATTAGCTGGATTTGGAGAACAAAATGAACGATAACAAACAAAAAGCGTTGGACGCTGCACTATCACAAATTGAACGTCAATTTGGTAAAGGCTCAATCATGAAATTGGGTGATAACAAAGCGTTAAACATTGAATCTGTATCTACAGGATCATTAGGCATTGATATTGCCTTAGGCATAGGTGGTTTACCTATGGGACGTATTGTTGAAGTGTATGGCCCTGAATCATCTGGTAAAACAACGCTTACTTTACAAGTTATCGCAGAAGCACAAAAAGAAGGCAAAACATGTGCCTTTATTGATGCTGAGCATGCTCTAGATCCAGTTTATGCACAAAAATTAGGTGTAAATATTGATGAGCTTTTTGTATCGCAACCAGATACCGGTGAGCAAGCATTAGAAATTTGTGACATGTTAGTGCGCTCAAGCGCGGTAGACGTGGTTATTATTGACTCGGTTGCTGCACTTACACCAAAAGCTGAAATTGAAGGCGACATGGGCGACTCGCACATGGGCTTACAAGCACGTTTAATGTCACAAGCATTACGTAAGCTTACTGGTAACATTAAACGCTCTAACACGTTATGTATTTTCATTAACCAAATCCGTATGAAAATTGGTGTTATGTTTGGTAACCCTGAAACAACAACGGGTGGTAATGCACTTAAGTTTTACGCATCTGTTCGTATTGATATTCGTCGTATTGGTTCTGTTAAAGAAGGCGATGAAGTTGTTGGTAACGAAACGCGCGTTAAAATTGTTAAAAACAAAGTTGCGCCGCCGTTTAAACAAGCTGAATTTATCATTATGTATGGTGAAGGTATTTCTAAGCAAGGCGAGTTAATTGACTTAGGTGTTAAGCACAAAATTGTTGAAAAAGCAGGTGCTTGGTACAGTTACTGTGGTAACAAAGTTGGCCAAGGTAAATCTAACTCGATTAAATTCTTGAAAGAAAATCCAGAAATTGCAGATGAGATTGAAGGTAAGTTGCGCGAAATGCTTTTACTAAAAGCAACTATTGAACCAGAAGATGGTGAAGATAAGTTAGGCGATGATCCAGACCTTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP019628|2652830:2660987|2656779_2659365_-|WP_077537133.1|DBSCAN-SWA MSFDLYAPHTIKQQTPMMQQYLKIKSEHRDILLFYRMGDFYELFFDDAKRAAQLLDISQTHRGKAGGDPIPMAGVPYHAVENYLARLVQMGESVAICEQVGDPATSKGPVDRKVVRIVTPGTISDEALLQERQDNLLTSVWQSKKGLYGIAYLDINSGRFNVVEVNTDEAFSSTVQRLSPAELLYSESFENFHLIEHIKGARRRPEWEFDLDTAEHLLCDQFGTKDLVGFGVDKAHSALVAAGCLMQYVKDTQRIALPHIRAITLEHNEHAVILDAATRKNLELTVNLSGGFENTLAQVLDKTATPMGSRLLKRRIHTPIRNKDELNSRLNAISAILDAQLCGELHESLKEIGDVERVIARLALCTARPRDLTRLRSALQALAPLHTLLADANDPRIAGIIKHSPELPDLQALLEQAVIENPPVLIRDGGVIAPGYNSELDEWRNLSKGATDVLDQLELRERERTGISTLKIGYNRVHGFFIEVSRANAHLVPADYIRRQTLKNNERYIIPELKEHEDKVLGSQSKALALEKQLYEELFRFIAPHIEQLQMMAAALADLDVLNNLAERAFALNYAKPELCDNDNISIKQGRHPVVEQVMKEPFIANPVELNSQRKMLIITGPNMGGKSTYMRQTALIVLMAHIGSYVPADSAKIGNIDRIFTRIGASDDLASGRSTFMVEMTETATILNNATAQSLVLMDEIGRGTSTYDGLSLAYATADHLASKISAKTLFATHYFELTELAEQTTGLVNVHLDAIEHNDTIAFMHTVLDGAASKSFGLQVAALAGVPKAVIAQAKQKLKLLENHQSVTAPNTEQQAFTFNNEAVQSTPSEIEEQLSAIDPDNLSPRQAHDLLYKLKALL >NZ_CP019628|2652830:2660987|2659943_2660987_+|WP_008170234.1|DBSCAN-SWA MNDNKQKALDAALSQIERQFGKGSIMKLGDNKALNIESVSTGSLGIDIALGIGGLPMGRIVEVYGPESSGKTTLTLQVIAEAQKEGKTCAFIDAEHALDPVYAQKLGVNIDELFVSQPDTGEQALEICDMLVRSSAVDVVIIDSVAALTPKAEIEGDMGDSHMGLQARLMSQALRKLTGNIKRSNTLCIFINQIRMKIGVMFGNPETTTGGNALKFYASVRIDIRRIGSVKEGDEVVGNETRVKIVKNKVAPPFKQAEFIIMYGEGISKQGELIDLGVKHKIVEKAGAWYSYCGNKVGQGKSNSIKFLKENPEIADEIEGKLREMLLLKATIEPEDGEDKLGDDPDL >NZ_CP019628|2652830:2660987|2652830_2653595_+|WP_077537128.1|DBSCAN-SWA MKILLSNDDGVNAKGIAVLYQALTQIADVTLVAPDRNCSGASNSLTLMNPLRATKLENGFMSVNGTPTDCVHLGVNQLVDEKPDLVVAGINHGANLGDDTLYSGTVAAATEGRHLGLPAIAVSLCSHNGEHFETAAAVTVNIIKGLASHPLPKDQIININVPDIPLSELKGVQVTRLGARHKAETMTKQTDPWGRDIFWYGSLGIESDAGEGTDFYAINNGYASVTPLSVDMTAKESLKAVGDWLADLEINRAR >NZ_CP019628|2652830:2660987|2654852_2655677_+|WP_077537131.1|DBSCAN-SWA MNKQIKCYVALFISILLFGCSSRHVPAPVSSLNNNVNKYNHKINIAGDYYKVQKGDTLYSIAFSAGKDIREIAKNNSISSPYIIFPGQRISLKPAPAEKKKRKKYTYSTKKSTKKAQKNNNKLKKELDRPKQREYVQKQASNKVSNNKYLSNGKVQWFWPAKGKITKRFSNKENGYKGLQIANKKGASVLAAAQGTVVYAGNALRGYGSLIILKHNDDYLSAYAHNSKLLVKEKQKIKAGQKIAEIGNSESPVTALRFEIRYRGQAVNPAKYLP >NZ_CP019628|2652830:2660987|2655712_2656687_+|WP_077537132.1|DBSCAN-SWA MANTAKLDTNNTNDEKFDDTAVEETTPLLEKVDEEDIFAKEEVTKNLDATQLYLGEIGFSPLLSAEEEVFFARKSLKGCEASRKRMIESNLRLVVKIARRYNNRGLALLDLIEEGNLGLIRAVEKFDPERGFRFSTYATWWIRQTIERAIMNQTRTIRLPIHVVKELNVYLRTARELTQKLDHEPTAEEIAESLDRPVEDVTKMLRLNEKIASVDMPIGGENDSVLLDIIPDEKSFGPEGEVQNNDINKHIIDWLGELNPKQREVLARRFGLLGYEPSTLEDVGREIGLTRERVRQIQVEALRRLKDILQQEGLSTDSLFNQFS >NZ_CP019628|2652830:2660987|2659386_2659875_+|WP_077537134.1|DBSCAN-SWA MELHQEIKTLAAQLGAILTDKCLWITSAESCTGGGVSYALTDTPGSSAYIDRAFVTYSNQAKQDLLSVNSSTLTQYGAVSEQTVQEMALGAIKAANADIAIAISGIAGPGGASEDKPVGLVWFGLQINGKALTFKRVFTGDRAQVRLQAIVFSLKTIIDEIK >NZ_CP019628|2652830:2660987|2653584_2654223_+|WP_077537129.1|DBSCAN-SWA MLANYTRSAQALSDLLKREGVEDAQVLNAIAQIPRHIFIDDVLKHKAYENTALPIGQGQTISQPYIVARMTELLRLAGACNKILEIGTGSGYQTAILAKTFTKVYSVERIKALQWQAKRRLQQLDLYNVTMKHGDGWQGWQSQAPFDGIIVTAAASKVPQDLLSQLTEGGVLLAPIGESDQKLIMVIRKGDSFTEHVIAPVRFVPLVPGDIE >NZ_CP019628|2652830:2660987|2654232_2654811_+|WP_077537130.1|DBSCAN-SWA MKLFTKLYDMALVWAKHRHAERYLAAMSFAESVFFPIPPDVMLAPMSLAQPKKAWRFASFATIASVIGGIVGYLLGFWLFEPVVEPLIAHMHWQEKFDIALNWFKDYGVWVVFLAGFSPIPYKVFTIGAGVLQMAFLPFLIASAVGRGARFFLVSALMKWGGVKMEQKLRQYVEILGWGLVALIAIAYFLLR |
8 | uncultured_Mediterranean_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
3507107 : 3515792
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP019628|3507107:3515792|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP019628|3507107:3515792|3507107_3509603_+|WP_077537735.1|DBSCAN-SWA MRLNGVQRLLETGLIISTFTAIFILCALISFDPADAAWSQTSFSEVRNITGAAGAWIADVLLLTFGWLAYLVPAAIQIFGYLLFKQPHRILQLDYTTLALRVIGFALFITSATAISSINFDDIYNFSSGGVVGDVIESAMMPAFNFTGTSILLLCFFFAGLTLLTGVSWVDFVDYLGELIVRFYRFSASYAQGWMHRERIAGNIDNDQMDAQFDDDIEEQIEIPEENNKADKQKAINKPQTPFSEPPMSDDFMPFDELDDILDQEIGFSAIDDEPMDTEAALNALDQSQVVEPEKPVTTVVSPARPMPKPKAAYQPPPTAKEKFEQLLTQEPPPGPLPSLDLLDRPDKAKNPISQEELDTVSRLVETKLLDFNVQATVVAVYPGPVVTRFELDLAPGIKVSKITGLAKDLARSLSAISVRVVEVIPGKTYVGIELPNKHREIVRLSEVINAPKFEQNPSPLTMVLGKDIAGQPVCADLGKMPHLLVAGTTGSGKSVGVNVMIVSLLYKSGPDDVRMIMIDPKMLELSVYEGIPHLLCEVVTDMKEAANALRWCVGEMERRYKLMSALGVRNLKGYNQKVLDANEAGYPILDPLFKDTDGMKEGPDELGKLPSIVVVIDEFADMMMIVGKKVEELIARIAQKARAAGIHLVLATQRPSVDVITGLIKANIPTRMAFQVSSKIDSRTILDQQGAENLLGMGDMLYLPPGTSVPERVHGAFVDDHEVHAVVNDWKARAKPNYIDEILNGDASEDILLPGEASENADEESDPLYDEAVSFVIETGKVSVSSVQRKLRVGYNRAARLVEQMETSGIVSSPGHNGARDVLVPNGANS >NZ_CP019628|3507107:3515792|3511944_3513249_+|WP_077537739.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLDSKFLRQDIEQTAARLAARGYELDVATVTVLEEKRKTLQVKTQELQSQRNASAKAIGQAKAKGEDTQPLLDAVANLGSELDAAKTEQDEVLAAINDIALAIPNLPDESVPEGKDEDDNVEILTWGTPKKFDFEVKDHVDVGQDLNGLDFEMGVKISGARFTVMRGQVARMHRALTQFMLDTHADKNGYTEMYVPYLVNSASLYGTSQLPKFAGDLFHTLGLVNDDGEQQAGFSLIPTAEVPLTNSARDEIYDESDLPIRLVAHTPCFRSEAGSYGRDTRGLIRQHQFDKVELVQLVKPEDSMATLEELTGHAEQILQALELPYRKVILCMGDMGFGSAKTYDLEVWLPAQDTYREISSCSNMADFQARRMQARFRREGVKKPELLHTLNGSGLAVGRTLVAILENYQQADGTVVVPEVLRPYMDGLEVIGKQ >NZ_CP019628|3507107:3515792|3513520_3513817_+|WP_077535063.1|DBSCAN-SWA MRKTRSPEQWRNIIEEQQASDLTITEYCQQNALSKTTFYAAKNKLKVLPDNFVRAKITKQSGIIKPQQPITLVVGKVKVSLPSTTPATYLNQLLHEFA >NZ_CP019628|3507107:3515792|3514310_3515792_+|WP_157604331.1|transposase|DBSCAN-SWA MLLELQQVVAKKDEELAEKDAQIHELLQAYNAKLAKEYAKKSEKMPGAGERFNEAEDILDEHDKALLATSPLVKKEKAKPKRRPLPAQLPRVEVVVDLNEGDKVCDCCQSPLHKMGESSSEALEFVPAHIKVIKTIRPKYTCRHCEREGIESVVKIAPIPATAIPKSIATPSLLSQIIMCKYQFGLPLYRQETLFADIGIELSRQTMSSWMLRCAQLLSPLYQRLKETLLSQAVIHGDETPLNVINADKATSYMWLYCCGDDKPSKGTNIVLFDYHNSRAAHCVVDFLDGYQGYMHVDGYKAYEQTKATLVACLAHIRRKFIEAKGNNKKTVKADVALNLIGKLYGIEQAIKDKPADEKFTVRQQKAKPIVDELYQWLLKHKDKIPPKMALGKAITYAINQFEKFRRYLDDGRLSIDNNRAERAIKPFVIGRKNWLFSNTSKGAHASAVLYSLVETAKANDLVVHDYISICLQHLAEQPDNLEPLLPWNIKQS >NZ_CP019628|3507107:3515792|3513816_3514164_+|WP_077535064.1|DBSCAN-SWA MKMFVEPQSIYLYRDAVDFRKSIDGLVALVEGELERDAYTGALFLFCNKAKDKLKLVYWDKTGFALWYKRLEKQKFKWPNKISLQEYELSAQQLDWLLSGYAVLGHEELQYQSML >NZ_CP019628|3507107:3515792|3510218_3511562_+|WP_077537737.1|DBSCAN-SWA MSNLGFNFGPDVRPLAARMRPTTLDEYIGQQHLLSADKPLHQAIVAGRCHSLILWGPPGVGKTTLAQIIANHADASLIQMSAVTAGVKDIRESVTQARENLESRGQRTLMFVDEVHRFNKSQQDAFLPHIEDGTFIFVGATTENPSFALNNAILSRARVYVLKSLADADLYIVIERALKQDEQLSQKHITIADNAKKALCQASGGDARKVLNLLEQAVDLTTEQNGQYNVDEHVLSQVLPTHLAKYDKGGDEFYDLISAFHKSVRGSSPDGALYWYCRILAGGGDPLYVARRLLAIATEDIGNADPRAMEVALNAWDIFQRVGPGEGERAIAQATLYLASAPKSNAVYMAFNQAKADAQNEPSYPVPEHLRNAPTNLMKDLGYGAEYRYAHNEEGAFAAGEKYLPPEMQGKEYYLPSERGLEQKIKQKLDYLKERDAQSPLKRYEND >NZ_CP019628|3507107:3515792|3511554_3511935_+|WP_077537738.1|DBSCAN-SWA MIKLYLMIALGGASGACLRFFISESMLKLLGRGFPFGTLTVNILGSLLMGILYGLIDKEIITASPAKTLIGIGFLGALTTFSTFSMDSLLLLQQGHFIKMALNVILNVMVCIFMAWLGLQLVMQKG >NZ_CP019628|3507107:3515792|3509599_3510226_+|WP_077537736.1|DBSCAN-SWA MKKFNALLLVLGSVITAPSFADDSQALQDQLATLKSFKAQFAQKVTDKEGQAVMQGEGTIALQQPMMIRWQQTNPDDTLFVSNGDKTYYFDSFAEQVTIMKTSSLIDSTPFVLLTSKDPAQWEKYSVLATNTGFSVTPNKGVESQVEQLDITFADNSKGLAKLVVTDNSGQLSSFTFNDAKVNTPLDKSTFEFTPPEGVEIDDQSNGE |
8 | Leptospira_phage(33.33%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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