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Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP016089 | Clostridium saccharobutylicum strain BAS/B3/SW/136, complete genome | 8 crisprs | cas3,cas14j,DEDDh,WYL,c2c9_V-U4,csa3,RT,cas6,cas8b1,cas7b,cas5,cas2,cas1,cas4,DinG | 1 | 14 | 9 | 0 |
1. NZ_CP016089
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP016089_1 | 148425-148574 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016089_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016089_1
>1.1|148480|40|NZ_CP016089|CRISPRCasFinder CAGGTTCAAGTCCTGTCTCCGCAACCATTATATATAAAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016089_1
The CRISPR arrays of NZ_CP016089_1 >merge|NZ_CP016089|1|148425-148574|CRISPRCasFinder AAATATCGCGGGGTGGAGCAGTTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGGTCGCAGGTTCAAGTCCTGTCTCCGCAACCATTATATATAAAATAAATATCGCGGGATGGAGCAGTTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGGTCG >NZ_CP016089|1|1|148425-148574|CRISPRCasFinder AAATATCGCGGGGTGGAGCAGTTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGGTCG CAGGTTCAAGTCCTGTCTCCGCAACCATTATATATAAAAT AAATATCGCGGGATGGAGCAGTTGGTAGCTCGTCGGGCTCATAACCCGAAGGTCG
>NZ_CP016089.1|WP_022743495.1|147417_147822_+|RNA-binding-protein-S1 MTLMAGNIVEGTVINITNFGAFIEVEGKTGLVHISEVADSYVKDIREHLSEQDKVKVKVISIDDNGKISLSIKQANVQKKSVKPAEIDWKSPEKKKAAGNFEDIMSKFLKDSEERMQDVKKHQEFKGKGGKKGV >NZ_CP016089.1|WP_022743494.1|146967_147261_+|septum-formation-initiator-family-protein MKNKLMIKKLIIVGFIIFFAFSYIRQRIEINRIEKEIANKQSQLQDVKEKNERLQDEVEKINSDSLDYLEKLARERLGMIKPGEKVVNSSTTESSSN >NZ_CP016089.1|WP_022743493.1|146495_146888_+|spore-cortex-biosynthesis-protein-YabQ MPLQLSMQFNLVIYSLIAGIITGILFDMYRAIRGFSSIKILTIIEDILFWILAALIVFTFLLYTNYAFLTPYVYIFIVVAILLYLKLISRHFYSSEKIIIKFIAKIIRILLKNICYPLKIIAYKVTDKKK >NZ_CP016089.1|WP_022743492.1|146192_146486_+|sporulation-protein-YabP MEKRLENKIEDNKSNLALENRKKLTLSGVIEVISFDEQKIDLTTNLGNLTIKGEELKMNKLDVQNGDVIIVGNIASMVYNGKIAKKNNESIISRLFK >NZ_CP016089.1|WP_022743491.1|145685_145946_+|RNA-binding-S4-domain-containing-protein MRLDKYLKVSRIIKRRTVAKEVCESGRILINDKVAKPSTKIKEGDIIQITFANRILKAEIINIAEHVRKEDAKQMYIIIEGEEDKE >NZ_CP016089.1|WP_002582985.1|145338_145614_+|HU-family-DNA-binding-protein MNKAELITSMAEKSKLTKKDAELALKSFIESVEEALENGEKVQLVGFGTFETRERAAREGRNPRTKEVINIPATTVPVFKAGKEFKDKVNK >NZ_CP016089.1|WP_022743490.1|143668_145120_+|nucleoside-triphosphate-pyrophosphohydrolase MIKIVGLGPGAKEALTVGTIIELENNKNIFLRTEKHPTVDYLEEKNIKFGTYDNVYESMDSFDEVYLSIANDLIEKHKKLGDLVYAVPGHPLVAEKSVFNLINLCKKNNIEYKVMPAVSFIDAMMEALMIDPIEGLKVIDAFDINNQVLDKRIGTIITQVYNPLIASEVKLKLLEQYNDETEIYFVRAARIQGQESIRVIPLFELDMQEDIDYLTSIYIPKDLNNKRDFNDLLDIIEVLRGENGCPWDREQTHKSLEKALVEESYEVIDAIEKDDDNSLIEELGDVLLQVVFHASIGKEDGYFDIGDIIEGICNKMISRHPHVFRNSNKIDSSEEVIEKWEDLKKKEKGYESLTEEMNGITKGLPSLLRAHKIQQKAKKVGFDFEDLNSVINKVKEELEEVIDVYNTKNMEKIKEEVGDLLFSCVNVARFLNIDEEIALNFTADKFIKRFDYIERMAKEKGIKLVDMKLNEMDKLWVESKKLD >NZ_CP016089.1|WP_022743489.1|142113_143652_+|polysaccharide-biosynthesis-protein MRKQSLMKASIILGISGILTRFLGLFFRWPLIMLIGDEGIGYYQMSYPLYMFFIAIASGVPVAISKMISEKNAINDLNGTFEVVKESAMLMMIIGTGTTLSLFFFAKPIISFLKWDAKAYYSLIGISFAPVMISFMTIFRGFFQGLQNMTPSAISQIIEQMGRVVFGVGLAVFLLPKGIEYSAGGAAFGATAGAVIGSSYLYSKYRKIKKSYGIKKVKSNPEVLNNILKIAIPISLGTTVGSIMNLIDSILVPQKLLQAGFTNTQSTVLYAQLTGKASVIVNVPLTLSMAICTSLIPIIAENFILKKQNELENKIDASMKMAAVIAIPCMFGLFFLTEPIMKFIFPGRFEGIEILKYLSLSIPFIIITQTTTSILQGTGNYIRPVINLLTGCVVKVILTCMLVPMAVFNIYGAVIASVGAYVVTSILNLITMKLMLKVKLNLYQIIIKPAYASTIMMLIVLMSYNIIYRNTISNGISCLISIFLGMIVYMILVVVFKIFKIEEIRDRFRRRM >NZ_CP016089.1|WP_022743488.1|141452_142004_+|stage-V-sporulation-protein-T MKATGIVRRIDDLGRVVIPKEIRRTLRIREGDPLEIFTDRDGGVILKKYSPIEELTDFSKEYCESLQQVIGHIVLIADKDAFVSVSGVPKKEYIERKVSSELEKIMDERKTVLLNKSAGTVIPLHNDDDEASYTSQVIAPIIAEGDEIGAVIILSKEVDVELGDVETKLVETAAAFLGKQMEQ >NZ_CP016089.1|WP_022743487.1|140493_141015_+|hypothetical-protein MKYKIENLEEITDAKDIMNAYLNSCSYKLLKYILYIVMSFLICIMVWSIFAKKTIVISAHGELHPKDNICNIYIKNTSLGTIKEGDRVQLETIPFSKNEYGVITSKLENISDDIVIDEKSGEKYYTADCKLDTNILVDKRGNNVNIRNGMEANVSIVTYETSYFKYILKKLIQ >NZ_CP016089.1|WP_022743496.1|149457_151854_+|stage-II-sporulation-protein-E MQYGLDVDKYEEISSEPRIKRKTWIKTIAIKLTTILVVGILISRVSLLLNQSDSHGIAPFGIAYLMAVVIKGNKRNNLAAAVGCVLGYLTINNLLTDGYVYLVAIIIMTIYYSFVSTARKRKKELIGFITILFSFFIYGLLVNKYELGVNVTLCLIQTLVIVPIYYVINYALDSLSEISTNYFFNSEEIISIGIFLCLLVAGIGDINLMNYSIRNVIALVLVLATAYIGGASYGAMIGVSMGIILGVASNDMMSCVGFFGVGGLIVGIFKDTGKIFSILAGIIIYFALGLYSDSLTLKLAVEVLTSSILFLCVPKSTYKSIEIEINPDRKKQCLSENKINGIKGEFTFKLKELTRVLATVSKYLGSCNENENLLIKAKGSALVENLADRACSKCENKSVCWERDFHQTYNSFQLLIQSYEKGNIEIPKDLEKRCVKNFGLLKSTESIVDNYTVNETVKERLAEGRHLLSEHITNISSTLDNLLNEFKKEVIIDNDLEKIIRRGLNKNSIDYKDVLCYTDIVGRIKIRISMNNCKGADYCGSTVVPLLSETVKMPLCVSDDGCSINPQTNECVITIEEIPKYYMVSYCAVKSKSGESETGDNYSFGKTINGCYMTILSDGMGSGPEAGQESKATVDLVEKFVEAGFNEDVTVNTVNSIMGMRFAEDEKYATLDLTRVNLYNGEANFVKIGAAPSFIKRGREVKAINSKNLPFGLVDEVDVEIVKERLKPGDILISVSDGVLDIDRFNSEGFIWLKEYLKNINSDPKELSELILNKAKELSDEMIKDDMTVLVSKIYLAG >NZ_CP016089.1|WP_022743497.1|152062_153472_+|tRNA-lysidine(34)-synthetase-TilS MYKKVLSYIKDNNLIEFGDKVLVAVSGGPDSICLLNILFKLKEELNIDIGVAHLNHMLRGEDAFGDEEYVINTCEKMNIPCFVKRMDIETYSKEQKLSCEMAGRNARYDFFDEIMKKEGYSKVATAHNANDQAETILFRLMRGTGLEGLGGIKASRDNKIVRPILCLSRKEVEDYIQVNNLNPRIDKTNFEKIYNRNKIRLDILPYMKKNFNDDIIQTLNRMSILIQKDNQFIEKIALSFYNKYCIESKDYFIIKKEMFEEDEVVINRVLRNAITKYSKSNYDFEMKHIYEILQLSKKNSGKIIDLPNKIYAENIYGDIYIKHRKEKNFNSNEKKQEINIDKGNVNNNTIDFNDFKIEFLVIENYNNTKLNLEKNNFIKYFDLDQIIKNISVRNRKDGDKIIPLGMSGSKKLKDIFIDMKIPKEDRDNVPILCFDDKIAWIVGLKVSEQFKITNKTKNILKVVIQRKEY >NZ_CP016089.1|WP_022743498.1|153473_154013_+|hypoxanthine-phosphoribosyltransferase MKEDIQEILFSEEVLTKRIKELADGISKDYKGKDLVVVGILKGSVIFAAELIKNISVHCEIDFMAVSSYGNSAQTSGVVRILKDLDHNIEGKDILLVEDIVDTGVTLSYLLKYLKARKANSIEIVSLLNKQARRVADLDVKYIGFEVPDGFIVGYGIDYAEKYRNLPFVGILKPEVYKK >NZ_CP016089.1|WP_022743499.1|154084_155893_+|ATP-dependent-metallopeptidase-FtsH/Yme1/Tma-family-protein MKKYSSAAVWIVCSVMLVLAAVTMWQTGKGSNDMTYSAFVQKWNANEIESVVIKEDKMTIEGKTTDNKSFVTYIPSQIVNSLIENQPKTDVRIDFEPPSNNATWVATLLPCVLLAVVIFIFLFMFTQQSQGGGGGRGVMNFGKSKAKMVTPESQTVTFDDVAGADEEKAELEEIVDFLKLPSRYVQMGARIPKGVLLVGPPGTGKTLLAKAIAGEAGVPFFSISGSDFVEMFVGVGASRVRSLFEEAKKNAPCIVFIDEIDAVGRQRGAGLGGGHDEREQTLNQLLVEMDGFGINEGIIMIAATNRPDILDPALLRPGRFDRQIVVGAPDVKGREEILKVHTKKKPLGESVNLNVLAKRTPGFSGADLENLANEAALLAVRRDKKEISMEEMEEAITRVIAGPEKKSRVITEHDKKLTAYHEAGHAVVMKLLPNCDPVHEISIIPRGRAGGYTMHLPKEDTSYTSKSKLKDEMVGLLGGRVAEKLIMGDISTGAKNDIDRASHIAKSMVMDYGMSDEIGTISYNTTGHDEVFLGRDLGKSRDFSEEVGAKIDKEIKRFIDEAYDTANKLLKSNTNKLHAVAQALIEKEKLDANEFEDIFANS >NZ_CP016089.1|WP_022743500.1|156370_158041_+|formate--tetrahydrofolate-ligase MKSDIQIAQEAKMEPIKNVAKKLGLCEDDIEYYGKYKCKISLDVYDKVKDNKDGKLILVTAINPTPAGEGKSTVTVGLGQALNKLGKKAVIALREPSLGPVFGIKGGAAGGGYAQVVPMEDINLHFTGDMHAITCANNLLSAAIDNHIHQGNDLRIDSRRIIFKRVIDMNDRALRHIVVGMGGKVNGFVREDGFTITVASEIMAILCLAENLDDLKERMGNILVAYNLDGNPIYAKELEVQGAMALLMKDAIKPNLVQTLENTPALIHGGPFANIAHGCNSVMATKLALKLGDVAITEAGFGADLGAEKFFDIKCRYAGIKPECVVIVATIRALKHHGGVLKTELNVPNVDALAKGITNLEKQIENINKFNVTPVVAINRFVTDSDEEIQFIKDFCDKIGVKVALSDVWAKGGEGGIELGNIVLDVLENNNSSFAPIYDEKATIEEKVLTIAREIYGARGVNYTPAAKKQIAEIEKFGLDKLPICMAKTQYSLSDNASLLGRPEGFDINVNEVRVSNGAGFIVVQNGNIMTMPGLPKVPAANKMDVLKDGKIIGLF >NZ_CP016089.1|WP_022743501.1|158170_158986_+|type-III-pantothenate-kinase MILLVDAGNTNIVLGVHDGERYIASWRISSDGSKTSDEYSIQVMQLFSLSDINPKDIDGVIVSSVVPNIMHSLENMLRKCFSHEPIIVGPGIKTGINIKYDNPREVGADRIVNAVAAYEIYKKPVIIIDFGTATTFCAVRANGNYLGGCICPGIRISADALFERAAKLPRVELEVPKNIICKNTITSMQAGIIFGYIGQVEYIVKKMKEEMKKGNCNEEPFVIATGGLANLIAKETNIIDKVDSDLTLEGLKILYEKNKEQILDENRKFNL >NZ_CP016089.1|WP_022743502.1|158960_159926_+|tRNA-dihydrouridine-synthase-DusB MKIGNLTFDNNVFLAPMAGVTDISFRGLCKEMGCGLVYTEMVSAKALYYGSENTQALLRIADEEKPVAAQIFGRDPEIMASICEEHLNHRDDICIIDINMGCPAPKIVKNGEGSALMNEPELAYEIVKAIKKISTKPVTVKFRKGFDEDNINAVEFAKGMEQAGVDAVAIHGRTRKQMYQGKADWDIIKKIKDSVSIPVIGNGDVFTPEDALRMKELTNCDAIMVARGSQGNPWLFKQIANVLNGETIEEVSNKEKVEMCLRHYQLAIKYDGEYKAIREMRKHASWYIKGLPRCTDIRNSINVLDDSDKVIEILTKYKDEL >NZ_CP016089.1|WP_022743503.1|160376_160859_+|transcription-elongation-factor-GreA MSEAKQYVMTYEGVKKLEGELDYLKTVKRKEITEKIKVALGYGDLSENSEYDEAKNDQAFTEGRIVQLENMLKNAVVVDESEIPKDIVSVGSKVKVKDYEFDEEVEYSIVGSAEADPMNFKISNESPVGKALVGKKVGEIVEVVVPDGMNKFEILGISRS >NZ_CP016089.1|WP_022743504.1|160872_162378_+|lysine--tRNA-ligase MSTEEMSMQELESQYNEQEGLRRDKLAELQKEGKDPFDVYKVERTHTSEQVKEKYDELEGKEVTVAGRIMSKRGQGKVVFSDIYDKDGKIQLFLKIDKVGEENLKQYKTFDLGDWVAATGEVFKTRTGEVTVNVNTFELTCKSLKPLPEKWHGLKDPDLRYRQREVDIITNSEVKDTFIKRSKVVSGIREFLENKGFLAVETPILAPIAGGAAAKPFITHHNTLDMDMYLRIAPELYLKRLIVAGFEKVYEMGRNFRNEGMSVRHNPEFTSIELYEAYSDYNDMMEITENMVAYVCEKINGTTKVTYQGTEIDFKPPWRRITMVDAVKEYGGVDFNEIKTNEEAQAIAKEKHLEFPKPLEKVTKGEVLNALYEEFGEANMIQPTFVMDYPVEISPLTKKKRGNPEFTERFEGFVFGRELCNAYSELNDPIVQRQRFEQQANERELGDDEAYMMDEQFMSALETGMPPTGGMGMGIDRLIMFLTDSASIRDVILFPTMRPQK >NZ_CP016089.1|WP_022743505.1|163758_165150_+|glycine--tRNA-ligase MAVEKTMDKIVALCKNRGFVFPGSDIYGGLANSWDYGPLGVEFKNNVKKAWWKKFVQESPYNVGLDSAILMNREVWVASGHVGGFSDPLMDCKECKARFRADKLVEDHMTANGAEVASADGWTNEELKEYIEKHEIVCPKCGKMNYTEIRKFNLMFKTFQGVTEDAKSEIYLRPETAQGIFVNFKAVQRTSRKKVPFGIAQIGKSFRNEITPGNFTFRTREFEQMELEFFCKPGTDLEWHKYWKDYCWNFLLNLNVKPESLRMRDHGEEELSFYSNATSDIEYLFPFGWGELWGIADRTDYDLNKHQEHSGQDLSYLDQTTNEKYMPYVIEPSLGADRVALAFLVEAYDEEELEGGDVRTVMHLHPALAPFKAAILPLSKKLSERALDIYADLSKKFNLDFDETGSIGKRYRRQDEIGTPYCITIDFDTIEDESVTIRNRDTMEQERVKISELENYIQKSLEF |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP016089_2 | 1658957-1659039 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016089_2
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016089_2
>2.1|1658980|37|NZ_CP016089|CRISPRCasFinder GTTAAAGATGGAGACAAATGGTATTTCTTAAATTCAA |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016089_2
The CRISPR arrays of NZ_CP016089_2 >merge|NZ_CP016089|2|1658957-1659039|CRISPRCasFinder ATGGATATATGAAAACAGGTTGGGTTAAAGATGGAGACAAATGGTATTTCTTAAATTCAAATGGATATATGAAAACGGGTTGG >NZ_CP016089|2|2|1658957-1659039|CRISPRCasFinder ATGGATATATGAAAACAGGTTGG GTTAAAGATGGAGACAAATGGTATTTCTTAAATTCAA ATGGATATATGAAAACGGGTTGG
>NZ_CP016089.1|WP_022744758.1|1657284_1658418_+|hypothetical-protein MKTKVCKICVFFIACFSIFLINGIQAKAADLTPDYGIYWYGKGNVSEKFVPGQSNRYFDPTKPTIIYVHGWQKDSQPNNKRESFNFKDENGNVVNGADAWIDKGWNIGIFYWDMFSDEFSVTDAEAKIWSNNGPQKMRWRDHSGNYHYSDYKNAGELFYDTYVQAMKNYKGNNIRIAGHSLGNQMATYLTKRVYDAADAGQISKNLKPSRLALLDPYWSNGGKSYLNNKWTGEACREYVKDLKSKGTAIELYRSTYIDETPAGDNNKGELDQTAFVHLNAWFKNSFDIAGKHNAAVSIYFTSYSSPAPALYNRDGYKKYSKIAGNGPSAASSDSEIKNFMNSNYRYDQYTGVYTLSSKDNGFAQMDRNTNVYVVPIN >NZ_CP016089.1|WP_022744757.1|1655776_1656952_-|beta-glucanase-Bgc MVITFYNHLLINYYSQTNLNSSLLSFYNDWKFRYLRSIKGSYPLKEYLLYTLDQPTANNAITTSEAMGYGMIIFPIMSKFDPTAKVHFTALYNYMKSYPSIYNNNLMAWQQIKDSNGNIVNSEPEPSSATDGDMTISYGLILAYKLWGENDTINYKAEAIKRINTLMNSCVNKNDYILTLGDWVKAIPYNNFKYVTRSSDFMSYYIRKFIEFDINNSTEWKLVLKRFHSIISKQMRRESKYNGLMPDFFIKHNDEYIAPTFKVLESIHDGDYYYNSCRIPWRYSMDILLNKVPVTLQLHTLNNWIKRETLSNPKNIKSGYYIANGFPGEPFGHTDDLSFIAPFLISSLIEKGNDNWTISLWETLLNKPITKCTFYENTLKLISMIVATGGY >NZ_CP016089.1|WP_041716163.1|1654721_1655519_+|sel1-repeat-family-protein MSGVLVYMDKIVESYQEADINFENMELKKLKKYALRGNLRAQNTIGDRYYIGDGVEKNYEEAFRWYKKAADEGYNVAQYNLGDMYYCGFGIEKNYIKAIELFKKAANKGNIEAACNLGCMYEEGDGTKTDYEEAIKWYVKASEQDDFYAQYNLGNMYMYGKGVAQNYQKAFQLHEKSAKQGYMKAQNTLGYLYEEGKGTLRSYENALKWYEEAAYQEYPYAEYNLGGMYYTGKGVEQNLRIAYAWYERSAEHGLEKAQKALSEKF >NZ_CP016089.1|WP_022744755.1|1651837_1654186_+|bifunctional-glutamate--cysteine-ligase-GshA/glutathione-synthetase-GshB MLNKLKKVFTAYELLRGNYGIERESLRVNKDGEISLNSHPTVFGDKIKNPSITTDFSESQIEVITPPFKKVEEVFSFTNALYDIVSMEIGDEYLWPQSMPSIVPEDSKIPIAEYEDDNQGKDARIYREKLIKKYGGKKQLICGIHYNFSFSEEFIEKLYRNEIFKSEFLHNKCIDQDEKDLEYKTFKNNIYLKVSRNYLRYRWLIIYLMGASGIVHESYKCGCKSSVEEIAKSSFTNEGALSYRNSECGYKNKVDLFPSYNSVEEYVESLKKFINDEVINSHKELYSSVRLKPADVKDFSDSLLKDGIKYLEYRSIDINPFEKGGISLEDLYFLQVFNLFLLIDEESDYERWQEDATENQNIISKFGQKSVMLKKDGKSISKEEWALEILQNIKRINNELNLEKEDIIDTMIKKVNNYKLTYAYRIEKIVKEQGYINAHLNLAKKYKENAYNNRFKLEGYEELELSTQILMKEAIKRGISVEVVDKAENFICLKKDDKVEYVKQATKTSKDNYITILIMENKSVTKKILKDNNIIVPNGIEVNSLYEVSNIIKDFVHKPIVIKPKSTNFGTGISIFSEGADEDSIIQAFKIAFKYDNTVLIEEFIKGKEYRFLVTDDKVAGILCRIPANVKGDGKKTIKELVEIKNQDSLRGYHYVTPLEKINLDENAALFLKQQNKDFNYIPKKDEIVYLRENSNISTGGDSIDYTECIPEKFKEIAVKSARAAGAKICGVDMILENYRDENTNYAIIELNFNPAIHIHCYPFKGTERKIGEDVLRVLGFI >NZ_CP016089.1|WP_022744754.1|1650335_1651409_+|transglutaminase MKKIIKGIVVILILMCTGYVQPVFASDQNLDNYIYNHLKNWDTEFEIPYYNDDVIDVVQNIAKKDDYLSRSISQLCYKKEENKATLIVAYRTTKEQEEYIDEELKKVINSIITPNMNDFDKVKTINKYLVDRYEYDYALQSNNVYSALTTGKTTCQGYAMSAYKMLNLAGIENRIVIGTLSGTPHGWNLVKLGGKWYQLDVTNDDAVSIDKYFLKSDDYLKKDGFSWNCSDYPKCDSNYQETLQSNKVNESANNVTSKEDYDLNNNGQTIYTYRSSVDGKWCLVNGFWYFLKNDGDYAIGWKLIDNNWYYLSDNGIMQNGWIYSDSKWYYCYPTTGAMATNTSINGYVVDTNGVWIA >NZ_CP016089.1|WP_140395263.1|1649464_1650118_+|HAD-IA-family-hydrolase MKKNFEYILFDLDGTLTDSGEGITKAVQYALKYFGIEVSNLDDLRKFVGPPLKESYKNFYGFDDEKADLGLVKFREYYIEKGIYENKMYSGISEVLEKLQKSNKKIIVATSKPEEHAKIVLNHFKIDKYFDFICGADFKETRVKKGDVIKYALEEAKITDLSKAIMVGDREHDIIGAKENNLKSVGVLYGYGDVVELTQARVDYIAKEPKDLLEILL >NZ_CP016089.1|WP_022744752.1|1648756_1649296_+|NADH-dehydrogenase/NAD(P)H-nitroreductase MIEVIKNRRSIRKYMNKEVEEDKLLEILESGRLAPSGSNTQPWQFIVIRPQKNKEKVAKVSHNQKWMTTAPIQIVCVADIRCRIDENIDISLDENSKEEEVKQIIRDTSIAVEHMSLTATELGLGSCWVAWFTQAEFRPVLNIPDDKYVLCVLTIGYPDEVPNPRPRKKLEDIVHYEKW >NZ_CP016089.1|WP_022744751.1|1647944_1648487_-|NADH-peroxidase MKKFICTVCGYIHEGDTPPEVCPICKVGADKFKEMKDDLNFADEHRIGIPDNLDDEILEGLRANFIGECTEVGMYLAMSRQADREGYPEVGEAYKRIAFEEAEHAAKFAEILGEVVVPSTKSNLSARVEAEYGACEGKKKLATLAKQNNLDAIHDTVHEMCKDEARHGKAFKGLLDRYFK >NZ_CP016089.1|WP_022744750.1|1647581_1647908_-|DUF1540-domain-containing-protein MQKINCEVTNCSHNKSGVCYSNRVDIGGINACSESGTCCGSFLNEAHYGDLTSNTNSNSHSHCDCLICKVESCTHNQNTLCDLNSINVCGSSNSQIYYETECGSFEAK >NZ_CP016089.1|WP_022744749.1|1645675_1647250_+|ABC-transporter-permease-subunit MNELFNYLFGAKAQIITLLFEHIRLTALSVGIAILIGMPLGILISYVKKLNKPVLGVASIVQAIPSMALLGFAIPFLGIGTTPAIVMVVLYSLLPIIKNTTTGINGINTQVVEAAKGIGLTRFQILFKIQIPLALPTIMSGIRISAVTAVGLMTMAAFIGGGGLGYLVFSGIRTVNNYQILAGAIPSCILALLVDGIFAIVEMLVTPINLQKNNNKSSLAKIKIRRFQKGILCATACLLMVIFVFTGVSKKINNKKEITIGSKDFTEQEVLGNILSELIERKTDISVNRKFALGGTQVIFSALQRGDVDMYVSYSGTAYGDILKYSPISDVENVYDTVKKDYKDKFNIEVLKQMNFNNTYTLAVTKGTAEKYNLKTISDIAKVGNKLNATTTLEFLNREDGLLGLTNKYNFNFNNTVGIDGTPRYSALMNNESDVIDAFSTDGLLKKYNLTVLKDDKKFFPPYYAIPVVRSEVLEKYPEIKPLVEEAGSLITNDVMIELNYDVDELKKDPKDVAIEFLQKNKLI >NZ_CP016089.1|WP_022744760.1|1659658_1659970_+|hypothetical-protein MEKVNDLISKNPIHLTTNTIILIVVAIVAFYIVMKAIEGIVKIIAILGVCYFALMSIQSTNLINVPVIKETYATIEKIIPSKELWTDALNKADKINKVVNDLK >NZ_CP016089.1|WP_041716167.1|1660108_1661170_+|iron-containing-alcohol-dehydrogenase-family-protein MKTLIHRIAIPSILEVGKGNINNVGNLIKKSNFKKVLICFGEGIKELFGDSIENSLKEAVIEISKTEIIKDINFEEISIKAFEISNDVEALIGVGGGKAIDAVKYMSFLKKLPFISIPTSTSNDGFSSPGASLLVSGRRMSLPAKTPHGIIIDIDVIKGAPEKFIFSGVGDLISNITALHDWNFEEEHGKIIIDDFAKMISKKSVNSFVRTEFKTIKDDLFLKELVDSLTLNGISMEIAGDSSPASGSEHLISHALDKFLEKPELHGIQVGIATYIMSKVQNHRVERISKVLRETGFFEYVKTLKMRKEDFKKAIDIAPSIKPNRYTYIHVEENRILAKKIIDEDEILNYILV >NZ_CP016089.1|WP_022743471.1|1661334_1662573_+|IS256-family-transposase MSKPIDDDFDYKAEVKKCKTIDDVMGKNGLIQRLVKDVLENILEGEMEEHLGRNKYQRAETNDSTKKNYRNGYSTKNLRSSFGDVDLDVPRDRNAEFEPQIIKKYETVCTELDKKVISLYAKGMTTSDIQAEIEDLYGITISPSMVSRITDKVMESAVEWQNRSLDKVYPIVYLDAMYFKVRSNGKIMNKAVYICLGYNMQGYKEILGSWVDEAEGAKFWLKICTDLKNRGVREILIACMDGLKGLPEAIKTVFPSVNIQTCIVHQIRNSVKYIASKDKKEFIKDLKCVYKASTEELALAQLDNLKDKWGDKYAIVIDSWYNNWSHLSTFFTFSPEIRKMIYTTNTLEGFNRQIRKYTKSRTVFPTDESLSKCVYLATMEIIEKWTQPTPNWGRTLAELSIVFEEQLNDELA >NZ_CP016089.1|WP_022744762.1|1662775_1664650_-|anaerobic-carbon-monoxide-dehydrogenase-catalytic-subunit MSMCTSADCKLCEFLSSKEEIETSFNRVDTQKAKCKFGKEGVCCKLCSNGPCKITPKSPRGICGADADTIVSRNFLRAIAAGSACYLHVVENTARNLKNIGEGKGNVKIKSPQTLNQLAEIFDITESDINQKAIKVADAVLADLYKPRFEKMELVKKLAYAPRYKRWEELNILPGGAKSEVFDAIVKTSTNLNSDPVDMLFNALGLGVATGIYGLMLTNLLNDVILGVPTIRQARVGFRVIDEDYINIMITGHQHSHISHLQDRLIDEDVKKKAINAGAKGFRLVGCTCVGQDLQLRGEHYTEVFSGHAGNNYTSEAVLATGGIDLIVSEFNCTIPGLEPIAEQFKVKTICIDDVAKKKNAKYINFDMDNAEEISEKIISEALESYKNRRNDITIDIPKDHGYDDVVTGVSEGSLKEFLGGNWKGLIDLIAQGKIKGIAGVVGCSNLTAKGHDVFTVELTKELIKRNILVLSAGCSSGGLENVGLMSPGAAELAGDNLKEVCKALGIPPVLNFGPCLAIGRLEMVATELAENLGIDIPQLPLVLSAPQWLEEQALADAAFGLSLGLPLHVAISPFIDGSPVVTKVLKEDLVDITGGKLIVEDDVIKAADELEKIIANRRAEMNI >NZ_CP016089.1|WP_022744763.1|1664766_1665180_-|Rrf2-family-transcriptional-regulator MNINQESDYAFRIILMLSKEGLDNKLDAKSLAEQGNIPLRFLLKLTRKLTQAGIVKSYRGVNGGYAITKEPKDITLKDVVEAIQGPIIVNRCIYDKEACSANKASHCSIHKALCNVQNTLLDELKKVTFEQLKNDPW >NZ_CP016089.1|WP_022744765.1|1665641_1666397_-|exonuclease-domain-containing-protein MNYIIYDLEFNQRPSVLTNIDSNNISKLPFEIIQIGALKLNKNLDTISTFNALIKPTLYKTIHPFVEDLTKITTEQVNSCDTFPEVYKNFLNFIGSEEITFCIWGSADIKELIKNIKFHNLSTSSISKKYIDVQNYVSKHFNAPNGTKIGLKNAVELFNIATKTEFHDAFNDAFYTAEVFKKIYNHNIVSKTYESFPSRRLHQPKEKIDTNALIFQFEKMYNRKMTKDEISIIKTAYMMGKTKQFIKNESE >NZ_CP016089.1|WP_022744766.1|1666676_1667207_+|PadR-family-transcriptional-regulator MTQIEIILLALLYDKDCHGYEFEQIIEKEKMRMWTHIGFSSIYNALNKLEHCDYIVSRLEKGNGSSSKRVYSIKDESKKIVKENIKKMISEYKSNPNDFKIGFIFSYLLSKDELTEALTKHKESLIERKENLNNEQLNVVRSEERKALFERTIAFLETDILWLDKCIKQNSNINYK >NZ_CP016089.1|WP_022744768.1|1668207_1669611_+|L,D-transpeptidase-family-protein MEGHKSKRSKVALGIIMFLCCLAAIYLGISAYFIKHFYLGSTINSMNVSGKTVEEVNEKMSSEIQNYSLELQEKGDVKEQIKGSDIDVKYSQDGESKIKSLKDNQNPLGWISGVFGKKNNETTELISYDEQLLNKVLNGLPGINSKNVVESKDASFEYGDGGYKIVNEVYGNKIDKEVLKQKVSDAIVKEDTTLDLDSSDCYKKPKYTADSQEVTDAKNTLDKYTNVTITYASGNNKEVVDGSAIHNWLSVDDDMQVAFDEKKVKKYVSTKLGSTFNTFGKTRDFTTTSGSKVKVSGGDYGWLIDSTKETKDLIETIKSGQSTTKEPIYAQKAVSSDKNDIGNTYVEVNFTKQHVWFYKNGSLVTDGPCVSGNVSLKLATPPGTYALNYKEKNATLKGEDYSSPVTYWMPFNGNVGLHDASWRSPNEFGGSTYLTSGSHGCVNLPVELAHKIFDNIEAGTPVVCYNE >NZ_CP016089.1|WP_022744769.1|1670011_1671397_+|L,D-transpeptidase-family-protein MEISKNQCSKLLVGIIISLCTLIGIYFWISIFFINHFYFGSTINCFNVSGRTVEQADEQISSEIDSYSLKLEERGGEAEQINGNDIDLKYNLDGKIQSFKDKQKPFAWIPGIFTSKDSKSSDIVNYNENLLKKSVDKLSCLDNNTVEPKNVSFKYTDKGYEIVDEVYGNKINKDALYQSIKNAISNGEKAINLESANCYENPKYTSKSKEAIDTKNLLNDYVNTTITYNFGDKTEVLNGATINNWLQVDDDLGVTFDEKEVKKYVDTLASNYNTVGKPRDFVTTAGLKIKVSGGTYGWEINKSEEVKDLISLIKDKKSTTKEPIYSQKGISHDLNDIGNTYVEINMTRQHLWFYKNGSLVTDGPVVTGNVSGGCGTPAGVYKLNYKERNATLKGQGYSSPVSYWMPFNGGIGIHDANWRSVFGGNIYRTSGSHGCVNSPYSLAQSVYQSIDEGTPIVCYYE >NZ_CP016089.1|WP_022744770.1|1671980_1672817_+|deoxyribonuclease-IV MLTIGCHLSSSKGFENMGMDALKIDANTFQFFTRNPRGSKAKDIDKEDVKAFLKLAKQNNFGRILAHAPYTLNACSADEKNRNFAIEIMSDDLNRMEYVPNNLYNFHPGSHVKQGVEIGINYIVEALNTILKPEQTTTVLLETMSGKGTEVGRNFEELAEILRRVDLKEHMGVCLDTCHVYDAGYDIVSNLDGVLEEFDKIIGIEKLRAIHLNDSKNPFESHKDRHETIGEGFIGIEAISRIINHPSLRELPFFIETPNELEGHAKEIELLRTMYQNF |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP016089_3 | 2252452-2253593 | TypeI-B |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016089_3
|
17 spacers
spacers of NZ_CP016089_3
>3.1|2252482|36|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATAGAACTTGCTAAAAGGTTAGGAGTTGCTAAAAG >3.2|2252548|36|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AATTAAGTGATGAAAGAATAGAAGAAAAAGAAGTTG >3.3|2252614|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAGGTAATGAAAGCATTTCACTCAACTGACTAAA >3.4|2252679|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTAGTAATGAAGATGATGATGTAGACACTACTAA >3.5|2252744|36|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATAGGTGATAAGGATTATTCTATTTCTAGCAGTTGG >3.6|2252810|34|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTTTTCCATCCATTTCGTACTCATTCGAATTTA >3.7|2252874|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAACTTTTTCTTTTTTATTTTTAGATTTAACGCT >3.8|2252939|36|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGAAATTTTATACACATAAGTTCATTCACTTCAAAT >3.9|2253005|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATTTAATGGAAATTTAGATGAACTTTCTGTATTA >3.10|2253070|36|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ACTAGTGAAACTGCCATCAATACTTACATTGAATTC >3.11|2253136|36|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAATAATTATTAGAATTAGATATACTACTAGTTG >3.12|2253202|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCAAATGGAACAGATGTACTTGATGAAGAATATGA >3.13|2253267|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCACATTTATTCAAAACCATTTGTATAGCATTTTT >3.14|2253332|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGACCTACTACGTTTTCATGACTCCCCACCATGAT >3.15|2253397|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGTGCTGTAGACATTTCCCCAATTACTAAAAGAAT >3.16|2253462|36|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTGTCTAATTTTTTTATTCCTGGTATTTCAGTTATT >3.17|2253528|36|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AAATTATAAGCATATACAAGTGTATTTGTTTTTCCT |
cas5,cas7b,cas8b1,cas6,RT,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016089_3
The CRISPR arrays of NZ_CP016089_3 >merge|NZ_CP016089|3|2252452-2253593|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAATAATAGAACTTGCTAAAAGGTTAGGAGTTGCTAAAAGGTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAATAATTAAGTGATGAAAGAATAGAAGAAAAAGAAGTTGGTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAATGAAGGTAATGAAAGCATTTCACTCAACTGACTAAAGTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAATGCTAGTAATGAAGATGATGATGTAGACACTACTAAGTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAATATAGGTGATAAGGATTATTCTATTTCTAGCAGTTGGGTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAATTGTTTTCCATCCATTTCGTACTCATTCGAATTTAGTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAATGAAACTTTTTCTTTTTTATTTTTAGATTTAACGCTGTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAATAGAAATTTTATACACATAAGTTCATTCACTTCAAATGTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAATGATTTAATGGAAATTTAGATGAACTTTCTGTATTAGTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAATACTAGTGAAACTGCCATCAATACTTACATTGAATTCGTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAATTTAAATAATTATTAGAATTAGATATACTACTAGTTGGTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAATGCAAATGGAACAGATGTACTTGATGAAGAATATGAGTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAATGCACATTTATTCAAAACCATTTGTATAGCATTTTTGTCGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAATTGACCTACTACGTTTTCATGACTCCCCACCATGATGTTGAAGACTAACATTATATGTTTTGAAATAGTGCTGTAGACATTTCCCCAATTACTAAAAGAATGTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAATTTGTCTAATTTTTTTATTCCTGGTATTTCAGTTATTGTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAATAAATTATAAGCATATACAAGTGTATTTGTTTTTCCTGTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT >NZ_CP016089|3|1|2252452-2253593|PILER-CR GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT AATAGAACTTGCTAAAAGGTTAGGAGTTGCTAAAAG GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT AATTAAGTGATGAAAGAATAGAAGAAAAAGAAGTTG GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT GAAGGTAATGAAAGCATTTCACTCAACTGACTAAA GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT GCTAGTAATGAAGATGATGATGTAGACACTACTAA GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT ATAGGTGATAAGGATTATTCTATTTCTAGCAGTTGG GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT TGTTTTCCATCCATTTCGTACTCATTCGAATTTA GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT GAAACTTTTTCTTTTTTATTTTTAGATTTAACGCT GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT AGAAATTTTATACACATAAGTTCATTCACTTCAAAT GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT GATTTAATGGAAATTTAGATGAACTTTCTGTATTA GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT ACTAGTGAAACTGCCATCAATACTTACATTGAATTC GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT TTAAATAATTATTAGAATTAGATATACTACTAGTTG GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT GCAAATGGAACAGATGTACTTGATGAAGAATATGA GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT GCACATTTATTCAAAACCATTTGTATAGCATTTTT GTCGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT TGACCTACTACGTTTTCATGACTCCCCACCATGAT GTTGAAGACTAACATTATATGTTTTGAAAT AGTGCTGTAGACATTTCCCCAATTACTAAAAGAAT GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT TTGTCTAATTTTTTTATTCCTGGTATTTCAGTTATT GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT AAATTATAAGCATATACAAGTGTATTTGTTTTTCCT GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT >NZ_CP016089|3|3|2252452-2253593|CRISPRCasFinder GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT AATAGAACTTGCTAAAAGGTTAGGAGTTGCTAAAAG GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT AATTAAGTGATGAAAGAATAGAAGAAAAAGAAGTTG GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT GAAGGTAATGAAAGCATTTCACTCAACTGACTAAA GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT GCTAGTAATGAAGATGATGATGTAGACACTACTAA GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT ATAGGTGATAAGGATTATTCTATTTCTAGCAGTTGG GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT TGTTTTCCATCCATTTCGTACTCATTCGAATTTA GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT GAAACTTTTTCTTTTTTATTTTTAGATTTAACGCT GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT AGAAATTTTATACACATAAGTTCATTCACTTCAAAT GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT GATTTAATGGAAATTTAGATGAACTTTCTGTATTA GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT ACTAGTGAAACTGCCATCAATACTTACATTGAATTC GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT TTAAATAATTATTAGAATTAGATATACTACTAGTTG GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT GCAAATGGAACAGATGTACTTGATGAAGAATATGA GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT GCACATTTATTCAAAACCATTTGTATAGCATTTTT GTCGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT TGACCTACTACGTTTTCATGACTCCCCACCATGAT GTTGAAGACTAACATTATATGTTTTGAAAT AGTGCTGTAGACATTTCCCCAATTACTAAAAGAAT GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT TTGTCTAATTTTTTTATTCCTGGTATTTCAGTTATT GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT AAATTATAAGCATATACAAGTGTATTTGTTTTTCCT GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT >NZ_CP016089|3|1|2252452-2253593|CRT GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT AATAGAACTTGCTAAAAGGTTAGGAGTTGCTAAAAG GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT AATTAAGTGATGAAAGAATAGAAGAAAAAGAAGTTG GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT GAAGGTAATGAAAGCATTTCACTCAACTGACTAAA GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT GCTAGTAATGAAGATGATGATGTAGACACTACTAA GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT ATAGGTGATAAGGATTATTCTATTTCTAGCAGTTGG GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT TGTTTTCCATCCATTTCGTACTCATTCGAATTTA GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT GAAACTTTTTCTTTTTTATTTTTAGATTTAACGCT GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT AGAAATTTTATACACATAAGTTCATTCACTTCAAAT GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT GATTTAATGGAAATTTAGATGAACTTTCTGTATTA GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT ACTAGTGAAACTGCCATCAATACTTACATTGAATTC GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT TTAAATAATTATTAGAATTAGATATACTACTAGTTG GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT GCAAATGGAACAGATGTACTTGATGAAGAATATGA GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT GCACATTTATTCAAAACCATTTGTATAGCATTTTT GTCGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT TGACCTACTACGTTTTCATGACTCCCCACCATGAT GTTGAAGACTAACATTATATGTTTTGAAAT AGTGCTGTAGACATTTCCCCAATTACTAAAAGAAT GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT TTGTCTAATTTTTTTATTCCTGGTATTTCAGTTATT GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT AAATTATAAGCATATACAAGTGTATTTGTTTTTCCT GTTGAAGATTAACATTATATGTTTTGAAAT
>NZ_CP016089.1|WP_022745992.1|2251470_2252253_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MDVVKINIYGKTAFFKKPEVNTYRYLTYGQLHKVALMGIFGCILGLNGYGQQGDKVYPEFYEKLKDIKVSIVPISPAKTGGFSKKIQQFNNSVGYASKEEGGNLIVTEQWLENVSWEVYILCNNDISNKLKDALLGKNTVYIPYLGKNDHVANISSIEVYKGVETQDVSYISTLDSLFLKDCVNIKKLIKPNGFRPVKAAPSCGLEKMREYVYQEFLPYALEPKFNTYDTRKFICTNKSIEVNDKESIIYSINDKNLFFY >NZ_CP016089.1|WP_022745991.1|2250484_2251468_+|hypothetical-protein MSNNIKNKLERVYGVLGIKSTMANWNADFTGYPKSLGDGTVYGSDKAYKYPMKVMWDSDPIKRVMYIKSYKVLEKGNDKLLQPRSLKERYEEIYGIEDLKKENDNITVLKNLFQAIDVKNFGATFAESGNNLSIIGAVQITQGLNKYDGHVADYEQILSPFRDGSEKPLKKGEEAKEVMQSTLGNKIFSNEAHYFYSFSINPSVYDKFVKLGVTDGYTREDYEEFKKTALIAASAYDTNAKSGCENEFGLFVETDGDLFLSDLAQYVTFSKSQEGKEVINLVELSKLLNDCMDRIQSVEIYYNPYTTVLEGDIAKARYINIFTRKDV >NZ_CP016089.1|WP_022745989.1|2248713_2250492_+|hypothetical-protein MLDDCLDIFEREYKITGDSIILDKYTPDSGLYLLVDSFGDVIKTAEIDNRGTNRHLYKDFIEIDYLSRLLEMNKPIDNKKTVKSNNYLSFWVKITDLMEDTKTKKIKVDEECIDRYFDTLASIDKKYKDKNSTKLYQTILKDVGDIDLKKLENCRAWIKKNIFNILNNYSVDKKYKYVKVFFKADIELYKSEANRYIYPNLFNSNDYNEYEDGLIYGLPNNNMGMNSKKPYLKRIDRNIKVPFLVSLERAMIMKKFFDYLSCLVDGEDKRLNLYIGDSNGLDPIADSALKDSNFNGIYLRLAKEKNEVEIVDYDVISNYTPILKDFFIKEIISSAKTKIKENDNSLVYKEVTKLDELRTIISNIFFNKFLATNFFTPAKNIRLADMVIKDELIKTRAAYFNWFYKNDKNRIINDFEDSSLRLIKNSVVNGYESRAREQFNLRNCINVYLKGSVVDMSNVVLKSYEELSRKLLCKEFISCETDAEYYFAIGQISYYLLYQSNSSKRNMSEIDFIINCKKNETLIQRLERLFKKYSHNIPANANKFRQLYSIINAYTPINEQVDDKMVLAGYLFSNVLFIKSSNNQNLEVSVDE >NZ_CP016089.1|WP_022745986.1|2248003_2248699_+|hypothetical-protein MIKVYELIVKTYCLKSISDSKALEKISSLIDKAFLNSEDMCKYHNSREYKFYSHDTFDPWTPSGVSVGEIRSFKIRTVDSKLKNYLMTNLLELSTDSLLVLYVTDKVIPKGELSQIESVTPIIIKTEVGYWRNNYDDEFFIDRITANLIKKYNAFTGKNIPLADIELFNKITLKKSHIKRRYKNITLFGDRYVFYLKDDELSQDIGYFALGSGVAEMCPRGFAFMQYQYKK >NZ_CP016089.1|WP_022745983.1|2246849_2247635_+|endo-1,4-beta-xylanase MLRRKVIFTVLATLVMTSLTIVDNTAFAATNLNTTESTFSKEVLSTQKTYSAFNTQAAPKTITSNEIGVNGGYDYELWKDYGNTSMTLKNGGAFSCQWSNIGNALFRKGKKFNDTQTYKQLGNISVNYDCNYQPYGNSYLCVYGWTSSPLVEYYIVDSWGSWRPPGGTSKGTITVDGGIYDIYETTRINQPSIQGNTTFKQYWSVRRTKRTSGTISVSKHFAAWESKGMPLGKMHETAFNIEGYQSSGKADVNSMSINIGK >NZ_CP016089.1|WP_052334828.1|2245574_2246567_+|DUF4179-domain-containing-protein MINEEKEIPSVVRISLDSTYDRIRAMPKKKNRVVGKIAAAVCCVVILGSMVTNESVRAGIKTFFDFNDKGVEKAINEGWISENSSSACDNGVEVTLDSYFADCNKIGLSIMLKFNDSKILKGIDKVSLDYRIKNGDGEYIEEFIPDTKPLKGKKQYISNVNDRNSKIDLENNEVQYDVILESEEGAIPKLENAVVEVESIKFFKNNKKVKDIDGIWNLKLNGGKSNDINAVEYKAVNNTSKIEIISAKSSPTSFNITFSVDGECINEKEFMPKDIKLVDGNGKEYQSNGYSSELKNNKTIISTNFSLSSYEDFDKLKLVVPSMGEAELEK >NZ_CP016089.1|WP_022745975.1|2245024_2245552_+|sigma-70-family-RNA-polymerase-sigma-factor MEINNLVKKAKRGDGEAFISIIKQYEQVLYKVASRMLSNDQDIADALQETIMLGYEKIHTLKNEAYFNTWICRILINKCNCILNKNKNVILVGEILPQKLNNNDFIKIELEDALNSLNKDYKLAMSLYYVVGLSTKEISKLVNEPEGTIKSRLSRAKTILRESYFKNQGGNEYGR >NZ_CP016089.1|WP_022745972.1|2243780_2244806_+|DUF1835-domain-containing-protein MSNIIHICFSQSAGGNLKHAIKKKKLFEGKKIIVFPDDISIGKIGNDMNLDERLEWWDIINKEEATIHSEEINYLKRSYKKFYKEISNINDADIIYLWYGECSNDMCGMMNTLELLKDKIDNIYFVNVSEKIYANDNIIYAYKSVSEIITEKLKEFIPIKRKIGHQEYHDLVSQWNLLKKDNSILRIFKDGKVQSLSEDYFDICILKHTENEFRKSARTVGRVIAYSEMKISDEYIFWRIGELTKSGMLEYKGKFGIMREMEIKITQKGIEYMSTDPEAISFWKNRETEEQFEREKINEAKKQGRMEEKIDIAKKLMDILDVEVIAEKTGLTAMQVKNLIN >NZ_CP016089.1|WP_022745969.1|2241687_2243193_+|RNA-directed-DNA-polymerase MIESQENSKNNRQEYRKQVDELGKKEFTLIKMQEYGFWPKNLPTPYEKQENETKEQYLERKNLTKEYEKIIKAITDLYDEKDEINAKLRDLNKKYNETWDYEKIRQDVSKAIMEESIARRKERKEKRELEKKQKNEAWQKEKADRIVFIGRGYSGLLYDKENNEEKLLNQGLPVIKDDKALADFLGIEYKKLRFLVYHRDVVLVDHYNRYTIPKKKGGERNIAAPKLILKNVQRKILEEILSKIQVSDYTHGFLKGKSVVSGAKSHIADKASGENTALLINMDLEDFFPTITFERVRGMFKAFGYSGYISSLLAMLCTYCERMPIEVKGKVKYVKTSDKILPQGSPASPMITNIICVKLDKRLSGLSSKYNCVYTRYADDMSFSFMEEGSALNLGKFMGFISKIVNEEGFNINKNKTRFLRKNNRQSITGVVINNDEIGVSKKWIKTLRAAIYNANKLKNSGEKISQKTINEISGMISWIRSVNEKRYANIIESGMNLINT >NZ_CP016089.1|WP_022745966.1|2239882_2241691_+|hypothetical-protein MKVDYSYASPSMCLSQGTDTVLGLSPDLSRDEKVSFLGKLKHPLIFRDAMLMLREIVVSDTSNKKKERVEFFEWLDGEIERQILRHEKYLPDVREKLNKDMNELLNKLDEKSMEISKLVDIKNNLKKEIDNHDIWKDYYKLERDFWKFIRDRDYSLWYVLDPVITVHPDQVSFEAFSLDESTYGCLSINMEEFELLQKPVLGTTNIDFSAKLAKEIERFRTYNDVKLSVNPEGFTVDTGVIPEHMEKKIDLPETWIKGFNQVSSAASLGGMDIELSPVDIYDICAFLRRHKAQKSPRYMKWILEPEKPVRIVFEPFGSEITLKAVYNGEKYREEKIWGRRRWLVVEKIIPLAKSFKVRLLGFGMPQFIIADMGTMKMTIGFSSWSSNDWVKGTAFNILGGFIGDGNYDKVYELMKEKRCLSMESIYDNLKDDLRAVSKSGIGMLLKRGESYFDPINDTIRFRKLCNTPIPKELYETTEMEYSVKDHMKESMDNFSVRFTSSNEFIFKHCFKIPNSKYKSWKYHGTEDYNREHDLSETELIIDEDGQICKVKCKCREFNKGPRNISAPCEHILALYLISSKFTRLKLEVDKEYKINDIMEKIL >NZ_CP016089.1|WP_022745994.1|2253645_2256222_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MYFENIKIIDISTLLKEPSDIYSHTKSDILEYETLAEHNERCIKYFYKIVDVKNLDSVFNNFEQRLLKGCSSKCINLWKEIVLNTVFFHDVGKSNPGFQKEKMKNEKYKNIKVNNSNHSRASGIVFFNHYYNEVFAVNNDEAKVLFVFLCLSMYVINKHHSSLEDLAKNLQSINKDLKTPEKNMFANIIKDLNNFDEISDINELHYAFRHELESNTEWISLDMYIYTRFLYSLLVASDFYATSEYMTGAKIEHFGIIDDTKDYRTCLDNSAVGKCIGKYKDFKSGLCTNPYGICKGDMLNQLRTEIYLEADFNIDNNINADIFFLPAPTGAGKTNISINLALKLIENNPLLNKISYNFPFNNLVEQTKNSLYETFNENKKIKESISVINSITPIKEFSSTNDNDEVDFNKSLLSRQFLHYPVIVSTHVGLFDILFGINKENLFPLVHLCNSVIILDEIQAYKNSIWKEIIIFLKTYAKLLNIKFIIMSATLPDLTKLCNTNDGFISLIEDNSKYFTNPLFKDRVDIDYKMLNIDKENLFKALILKVIEVSKLLKKQADKFDNKILVEFITKSAAKDFYENLSTKVKDIHSNEEIILFTGDDSSIERKKIINHIKSSKNIILISTQVIEAGVDIDMDIGFKDISMLDSDEQFVGRINRNCKKENCKVYFFNYDDVTKIYKNDIRNSADYSLLSTKMRELFELKKFDIYYDYIINELNEAADSKNAKNIDFFRKNTLTDLEFYNIKKRMKLIDDQSKITIFLNINVEDENGNIFIGENVWNKYLSLLKNFDITYQEKQVELSKIREKVQYFTYEINDKYKGKFSYDIDKSIGNTFYINNGDDYITNGKFDRDKLINDLFS >NZ_CP016089.1|WP_022745996.1|2256382_2257219_+|AraC-family-transcriptional-regulator MIIKKSLINKSIEYILQHIDEDISIEDVTNHCNFSKYYFSRMFKEETGSSIYSFIKRVKMDQSVVSLKVEKDKTITEIGVDYGYSSSNYSSAFSKQYSICPVEFRKTMNSTEVANPFYPNEYNTFKSFEHYDAKIIIQDLGNFKVIYERYIGNYNEIGSNWYSFMERYKTYIKLDTLLIEKSYDDPSITQLDKCICDLCITVDEHVELENVTMIKGGKFAVYQFDGSIYDIFVTFLGIFNIWLPRSGYKRDKRYVLGIYRNIDRKNNHVTMDLCIPIK >NZ_CP016089.1|WP_022745997.1|2257504_2258053_+|hypothetical-protein MFDIRKIQEHVIYEAVKDERNEDIAREVVYGKDESCKSENNGIWVKSTMKRLESKFDKETTKKIRMKCQCGYGMDKKLELVKELMELSSSLEELGNLQKAKDSGLFYENGDLYLQFNFCPCPMLTNVDKLDSYAWCQCTTGYSKVLFEKAFQCKVDVELLKSIKVGDERCLMKIVPQGIIWK >NZ_CP016089.1|WP_022745999.1|2258145_2258730_+|flavodoxin-family-protein MKVIGINGSARKNGNTSIIIKSIFMELEKKGIETELIQLADKTVKGCMGCFGCKGRKQCVIKDDFFNDCFDKMVNADGIILGSPVYSADITSKMKAFLERAGVVVATNPGMLKHKVGASVAAVRRGGGMTAVDILNHFLLNKEVFVVGSTYWNMVYGKDIGDVINDGEGMRNMKNLGENMAWLMEKLSRAHENK >NZ_CP016089.1|WP_064530724.1|2260105_2260666_+|TetR/AcrR-family-transcriptional-regulator MDLRVLKTRENIKNTFSNLLLEKDFKNITVQDICDRALIGRSTFYDHYCDKYDLLNKMVEEIINQFKPYLKSRFNLNSLDDFTKLGSDMLKLFSKKKNIIKALINVHTESADLYYELKKLLIEGCSYYLNKSNFVSKYNISNEYICGHYASFVLTSFQLWLELGEDENNLQLANRMHSVLFESAGI >NZ_CP016089.1|WP_022746004.1|2261001_2261439_+|MarR-family-transcriptional-regulator MTKSRYSIETPYSQLIRSIAIKMKLSSDEKVKKLGLNSQQGRMIGYIYEHQDSGIIQKDLARVFQRTEASITSMLQGLEKKGYIERRIPKENERQKYIYVLPKGAELIEDFNKLVVEEEENIIANLTEQEKETLLAVLLKVDRNL >NZ_CP016089.1|WP_022746007.1|2261523_2262885_+|MATE-family-efflux-transporter MKQKLSNKYYLESAPITKAIAHLSIPMMIGMSVGTIYNVINAFFIGLLNNTDMLTAITLGLPIFTILMAFGNMLGAGGGTFITRLVAKQNIEKAKKIAGYTFYSSIIIGILLGIIAMIALNPIVNIMGADTSAIINYTKSYSLTMFIGGFAIVMNFALEQVVRAEGASKESMFGMVVSTIFSLIFDTLFILVFKFNVVGVALSMILANIASSIYYVYYLETKSENLKGFIKNFNISLKDKIEIYKIGVSELFLAGFLIITTLLLNNYSIRYGEGVVASFGIALRIVQVPEFLAMGLALGIIPLIAYNFSNENFKRLEDSIKQSALWILGLSGGVVTLVYIFRNVIIHLFSNDSAVLSVGVYIMAAMLISAFFNGFTTLFTGIFQASGQGLPSTIMAITQGILFIPVIIVLNNFFGLHGVIWSMTITEIITFLTGVILYIIFNNKIKKNKVVAN >NZ_CP016089.1|WP_022746010.1|2263460_2264267_+|chemotaxis-protein-CheR MDEFTDIYFKKYCDLLYKRTGIFVRENKKETFKLKIEKSMRKLNIYNHDEYLQYLQKYDCKEHFQQFINDMTTNTTEFFREKQHFDFIENNIQFIMKNNPRIARKNEIRIWSAASSSGQEAVSLAILLKECLDNRINIKILATDIDSEILSKAVKGIYSHSECKDIPQELLYKYFDKVSNGFSIKGEIRSMIQYRHFNLMQDYNFKKGFDIIFCRNVMIYFSNPIQERLINKFYNNIVQGGLLFIGHSESLVSKSHKYQYIGPAIYMK >NZ_CP016089.1|WP_022746013.1|2264286_2266338_+|chemotaxis-protein-CheA MNEILVGYIEDLKYNLINLNEALMEMENGNTNDNVINTVFRVAHTIKGNSAAMEFYNIEKVTHKMEDILQEVRSGKRILTGEIINSLYSFHDFMEDCITFINQDKCDKNIVITEIIQELLKILTGNAPDINESSESNKKHDEELRILKEVKCDTELCNKILENFNRGFMPYWIDVTINERCVMKSLRTWLVFETASAYGSIISSIPECPTEEELGSNKEFIIQNNCVRFLIVIDKDVDLLVSELFNTSEITNVKKQEIDIESIRQKIEDSKKENKIVKDKNIGSSKSQNLKQSSGNEKMADNFIRIPVLKVDGLMDMLGELLILNSQFEQQISEAFGRNSAMMNNLSRSSKLIKEIQASSMSLRMIEIKPTLHRLHRVARDTAAELNKKIFIIIEGEETEIDRSAAEKIFDPLMHLVRNAVSHGIEEEEERIKAGKKAEGTIHIKAYSKRDSVYVEISDDGKGIDTQKILKKALNLNMAEENKVYSEEEIVKFIFKPGFSTQEVVNNISGRGVGMNVVEEVISNLGGKIEVVNVLGQGCAFTIKIPMNLAVMNGTIIEVAGGRYIIPTLFIKEFFIVDKSNLISMQNKTQALRIRNNIIPIVNVSNMFNISENDKLLNLREVVILEMDQRLLAFPVDGIVARQEIVSKPLESEFSSISYASGAAILGDGRVSLILDVEEIFKM >NZ_CP016089.1|WP_022746016.1|2266372_2267419_+|chemotaxis-response-regulator-protein-glutamate-methylesterase MEKIKVLVVDDSAMVRKILSSELSKTKEIQVIDTAPDPYIARDKIVKLKPDIVLLDIEMPRMDGLTFLRKLMKYYPIRVIIVSSVAENGSETALKSLEYGALEVVAKPSVSYSVNDMIEQLIEKILAVSKIPNWKVGIKENKKEVDSYSQKKKLSLIKTTNKIIAIGASTGGTEALREILQKMPPSAPPIIIVQHMPQHFTKSFAQRLNQICAIEVKEAEDKEILSPGKALIAPGNMHMELRRSGAVYYVQLHNGPMVYHQRPSVDILFNSVAKYAGRNAIGVILTGMGKDGAAGLLNMKNEGAYTIAQDEKSCVVFGMPKEAIEMGAANKIVSLNYIVDDIIEYLGT |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP016089_4 | 2818092-2820276 | TypeI-B |
II-B
Consensus repeat of NZ_CP016089_4
|
33 spacers
spacers of NZ_CP016089_4
>4.1|2818122|36|NZ_CP016089|CRT TTTAAATTATACAAAGCACAAGTATGTTTTAGATAA >4.2|2818188|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTACACTTACTCTGTAGCTACCCCATGGCTTACT >4.3|2818252|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTTCTTCCTTTTCTGTTTGCTATATTGGCTAATTT >4.4|2818318|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACTTTGAGCCAGTTATAGATAAGCTTATTAAATA >4.5|2818382|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAGATGAATAATGAAAGGTATAGATATTTCAAATAA >4.6|2818448|35|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AGGTTAAAGTTATTACCAAAGAGTGTAATTACTGC >4.7|2818513|37|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTAAACCGCCTTTTGGATACATAGGTATCTTATGGTT >4.8|2818580|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTGATTTGTTTTAGTCTTCTTTTTTTTATACAA >4.9|2818644|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACATAGTTACTTGGGCTTAAGTTATCTATTGTAGAT >4.10|2818710|35|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCCAGCTAATGCTAGTGTATTACAAATAGATGGAA >4.11|2818775|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTATTCTTTTTGCTCGTACTAAACTATTATCTACA >4.12|2818841|35|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATAGATGGATTTACTCAACTTGGATTCGATGCAAA >4.13|2818906|35|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAAGTATTTAAAATAGAGAGGTGATAAATGATGAG >4.14|2818971|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AACTATATTAATTTCATCATCTTTTAAATCAATGTA >4.15|2819037|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CGAAAACTGATAATCCAAGTGACCCTGCTCCTTC >4.16|2819101|35|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CTTGTGCAACAGACTTAAACTTAACATTATCAGAA >4.17|2819166|35|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CCAACAGTTAATTTTTCCATCTTGACCTTTTATAT >4.18|2819231|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder AAGGTAGGCATATTTAAGTAGATTTTAAGAAGCTTT >4.19|2819297|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTTTACTGATACAAACACTAAAACTGATACTAAAAC >4.20|2819363|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATAATGGTGGTAAATTCTACATGGTAATTCCTAA >4.21|2819427|35|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TATTCCGGAAATGTTGATATTTATTTAAAATTAGC >4.22|2819492|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GCAAATTTAATTTAAGGAGGAAATTATTATTATGTT >4.23|2819558|35|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACTCATGTTACTATATGTTATACAAAAAGTGGTAG >4.24|2819623|35|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TAGTAAAAGTGAGGTTGAACATATGATAAAACATA >4.25|2819688|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TTATGGTTGCTCTGTTAGTGGATTTTCTTTTTCTGT >4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ATTTAGAAATAGATAAAACTCAAGAGAATAGAAT >4.27|2819818|35|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GACTCACTTTTGTAAGGTCAGGTAATTCAGTTCGT >4.28|2819883|37|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TCATAAAGAAAATAAGAATCGCAAATATTAAAATATC >4.29|2819950|35|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder ACGTAACTATTATTAGAATGAAACGTATTTATACT >4.30|2820015|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder GGTTAATCCTAAATCAATTGCCCATTGTTCCATCAA >4.31|2820081|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TGACTTGGGTAAAGAACATCAGACTTTAGTTGTTAT >4.32|2820147|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder TATCAATCAAATCCTCTTAGTGCATATTTCATCA >4.33|2820211|36|NZ_CP016089|CRT,CRISPRCasFinder TTCAAGGTATTCTGATTTTACATTTAGTCAGTTGAG |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7b,cas8b1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016089_4
The CRISPR arrays of NZ_CP016089_4 >merge|NZ_CP016089|4|2818092-2820276|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder CAATTGGTTTCATCATAGTTAATGTTAGTCTTTAAATTATACAAAGCACAAGTATGTTTTAGATAAATTTAAATACATGTCATGTTAATGTTAATCCTACACTTACTCTGTAGCTACCCCATGGCTTACTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCATTTCTTCCTTTTCTGTTTGCTATATTGGCTAATTTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCACTTTGAGCCAGTTATAGATAAGCTTATTAAATAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAAGATGAATAATGAAAGGTATAGATATTTCAAATAAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAGGTTAAAGTTATTACCAAAGAGTGTAATTACTGCATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTAAACCGCCTTTTGGATACATAGGTATCTTATGGTTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTTGATTTGTTTTAGTCTTCTTTTTTTTATACAAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCACATAGTTACTTGGGCTTAAGTTATCTATTGTAGATATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTCCAGCTAATGCTAGTGTATTACAAATAGATGGAAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTTATTCTTTTTGCTCGTACTAAACTATTATCTACAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCATAGATGGATTTACTCAACTTGGATTCGATGCAAAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAAAGTATTTAAAATAGAGAGGTGATAAATGATGAGATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAACTATATTAATTTCATCATCTTTTAAATCAATGTAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCCGAAAACTGATAATCCAAGTGACCCTGCTCCTTCATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCCTTGTGCAACAGACTTAAACTTAACATTATCAGAAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCCCAACAGTTAATTTTTCCATCTTGACCTTTTATATATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCAAGGTAGGCATATTTAAGTAGATTTTAAGAAGCTTTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTTTACTGATACAAACACTAAAACTGATACTAAAACATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCATAATGGTGGTAAATTCTACATGGTAATTCCTAAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTATTCCGGAAATGTTGATATTTATTTAAAATTAGCATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCGCAAATTTAATTTAAGGAGGAAATTATTATTATGTTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCACTCATGTTACTATATGTTATACAAAAAGTGGTAGATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTAGTAAAAGTGAGGTTGAACATATGATAAAACATAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTATGGTTGCTCTGTTAGTGGATTTTCTTTTTCTGTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCATTTAGAAATAGATAAAACTCAAGAGAATAGAATATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCGACTCACTTTTGTAAGGTCAGGTAATTCAGTTCGTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTCATAAAGAAAATAAGAATCGCAAATATTAAAATATCATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCACGTAACTATTATTAGAATGAAACGTATTTATACTATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCGGTTAATCCTAAATCAATTGCCCATTGTTCCATCAAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTGACTTGGGTAAAGAACATCAGACTTTAGTTGTTATATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTATCAATCAAATCCTCTTAGTGCATATTTCATCAATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATCTTCAAGGTATTCTGATTTTACATTTAGTCAGTTGAGATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC >NZ_CP016089|4|2|2818092-2820276|CRT CAATTGGTTTCATCATAGTTAATGTTAGTC TTTAAATTATACAAAGCACAAGTATGTTTTAGATAA ATTTAAATACATGTCATGTTAATGTTAATC CTACACTTACTCTGTAGCTACCCCATGGCTTACT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC ATTTCTTCCTTTTCTGTTTGCTATATTGGCTAATTT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC ACTTTGAGCCAGTTATAGATAAGCTTATTAAATA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC AAGATGAATAATGAAAGGTATAGATATTTCAAATAA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC AGGTTAAAGTTATTACCAAAGAGTGTAATTACTGC ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TTAAACCGCCTTTTGGATACATAGGTATCTTATGGTT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TTTGATTTGTTTTAGTCTTCTTTTTTTTATACAA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC ACATAGTTACTTGGGCTTAAGTTATCTATTGTAGAT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TCCAGCTAATGCTAGTGTATTACAAATAGATGGAA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TTTATTCTTTTTGCTCGTACTAAACTATTATCTACA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC ATAGATGGATTTACTCAACTTGGATTCGATGCAAA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC AAAGTATTTAAAATAGAGAGGTGATAAATGATGAG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC AACTATATTAATTTCATCATCTTTTAAATCAATGTA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC CGAAAACTGATAATCCAAGTGACCCTGCTCCTTC ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC CTTGTGCAACAGACTTAAACTTAACATTATCAGAA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC CCAACAGTTAATTTTTCCATCTTGACCTTTTATAT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC AAGGTAGGCATATTTAAGTAGATTTTAAGAAGCTTT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TTTTACTGATACAAACACTAAAACTGATACTAAAAC ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC ATAATGGTGGTAAATTCTACATGGTAATTCCTAA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TATTCCGGAAATGTTGATATTTATTTAAAATTAGC ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC GCAAATTTAATTTAAGGAGGAAATTATTATTATGTT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC ACTCATGTTACTATATGTTATACAAAAAGTGGTAG ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TAGTAAAAGTGAGGTTGAACATATGATAAAACATA ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TTATGGTTGCTCTGTTAGTGGATTTTCTTTTTCTGT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC ATTTAGAAATAGATAAAACTCAAGAGAATAGAAT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC GACTCACTTTTGTAAGGTCAGGTAATTCAGTTCGT ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC TCATAAAGAAAATAAGAATCGCAAATATTAAAATATC ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTAATC 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>NZ_CP016089.1|WP_077393794.1|2816969_2817698_-|DUF1311-domain-containing-protein MSDYMRRCIMIKNNKRIKLVIAAGVCAFMGLSATIMHLVNTNNNKNEQSAEVSKSEENPQSKDDEKNNEESASKPDVKEDTDKNKSESKSTNNVEKPTENKNKQTTGVKSKSSADSKTFTKVKGGGDYIKTLNAINSILDDPNLLDGSTLEMKSKVNQEYDLWDGYLNEIYKVISCNLPESEKRDLAKKENAWIKEKESKAKLAGDKYKGGTAENLAYSISAAKSTRDRCYELINTYMVTDD >NZ_CP016089.1|WP_022746612.1|2816317_2816839_-|cysteine-hydrolase MVLLVIDTQNLITNEKLYKFDTFVSNVKEIINKARKNNIEVIYVRHDDGEGSELTKGTDGFEIYEEFQPINGEKIFDKNVNSAFKGTGLLEYLRKKDEKEIIIVGLQTDYCFDATIKCGFEHGFHMIVPAYSNTTVNNKFMSAEQSYRYHNEFMWNGRYAECISFDETIKRMK >NZ_CP016089.1|WP_022746611.1|2815774_2816290_-|ClbS/DfsB-family-four-helix-bundle-protein MPDYKSKQELINEISSRAKLFIDEFSDIKETDKDKFIDGIDRTPVQMIAYQLGWLNLILDWEEQEKQGITVITPHANYKWNNLGGLYEDFYKQYENYTLHELCSMFEEAKEKIIHLTEGYTDMELFQSGGRKWASSTPANWALWKWIHTNTVAPFKSFRSKIRKWKKLNQS >NZ_CP016089.1|WP_022746610.1|2813823_2815545_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MITLFKNLKVIHKLILCFGIVITVVIISGIMSYHKMREVNGNLDVIYSESLVKLSTIQDIRAHMADLTSGSLILVNPDKKAVVDKTISDMNGLIEKDNELTKKYEALINNEDDRKIFAEYLENLNSYNNAKDKFFEVAKGGDYDDIKNEFAIFDGYRAKINDLLDEEITYNEKNAKSKYEDSQIKCKNALFITVMFTIVAIGLSIIFSYLLVKNIDDALKKIKQFAGRIAKFDFSSNINIVGKDEFGETSASLNEAQSNIVHLLKNINDNSDDLKSDSEELSLTSNELMSKMEHMNSACKTIRGTIEENSAASEEITASIEEINSAVNELAQRALTARNVASKAKDNAENIQEKGKIAVDTTENLYKGKREAILKAIEEGKIVNKIKHMAEAIESIADQTNLLALNAAIEAARAGENGKGFAVVADEVRKLAEESKSAVNDINENIGKIDEAFDNISSGSNDILVFINEKVIPEFNSFVESGDHYYRDADYINNLSEELASTLEEFSATIGQISEAAQNVALNEQKSSEEVEVVGDIVKDTTKIAVNVSGTSQNQAKLAETLYDQVGKFKIKI >NZ_CP016089.1|WP_077393846.1|2812605_2813214_-|hypothetical-protein MAVLLLAFNPMGASARVSENEAKDLILRYGNDDIFSYDYNYLKTNLVFSEEVSKDKLDDGLLGKGLYKITKSNENLYYFQLETDHYYVGVDSGQIYLYDGGSGCGTFHWIENNKVVKVWYWGRKEIDKDGQFGGWEYSDWQQNNGWVLLSDNTWSYYVDGLQKTGWIYDNGNWYYCYSNGQMAHDTTIAGYYLGSNGAWTNN >NZ_CP016089.1|WP_022746607.1|2810130_2812038_-|sensor-histidine-kinase MKSIKSKLVLYLGVLIVIICIGLSVVSYINSSNALLSNLSKTLPSIAEQTASSVQGRIEGKLNTLESIAERSEIKDINNSWGNKMSILSDEGKRIGSVRLEIVDKNGDIKKADGKTSNVKERSYFKNAICGKSNVSDPLVNNTDKSVVVIYAVPIKDNDNQIIGVLIDTQDGNDLSELTNRVKVGKTGYAFMIKKDGTNIASTDKNKVINMHNPVEEVKTNPSFRAIADIEIKMGNGETGMGEYFSGADKYVGYAPVEGTEWSVGVIVLKSEILSELDTLKSWTVLVSVLFLLIGFLIIYIISSNIVKGIKSASKHLDLLANGNLYKEVSIKYLKQKDEIGAMTSSMKAMQQSLENMIKKIEEDSAKKIKETLKIQDEIFANVSHELKTPLNVIFSANQLTELYVKNSLIEDDKEKILKNINIIKQNCYRFMKLINNIVDISKMNSGFFKVNLSNENIVDVTEEIVQSISQYINAKHINIIFDTNTEEKIIACDPEKIERVILNLISNAIKFTNTDGSIFVNVIDKGDTVEIYVKDTGIGIEEKHLKNIFERFEQVDKSISRNAEGSGIGLSLVKSIVNMHGGKISVESEVGKGSIFKIELPVKIVEEIEVCEQTKACNNKIEMINVEFSDIYSI >NZ_CP016089.1|WP_022746606.1|2808343_2809933_+|asparagine-synthase-B MCTIMCYTGTDMKHEKFAGSLQRTESRGPDMTEILTLPSGILGFQRLAIMDLSYSGMQPFTRKKDASICNGEIYGFRKLKDELMEKGHKFISDSDCEVLLPMYYEYGLDMFAKLDAEFATVIYDGENDTFIAARDPFGIRPLFYGYSESGKIMFASEAKNLVGLTDKIIAFPPGHYYADGKFTCYCDIAATEGEYCKDDLEVICKNIHDKLVTAIEKRMDADAPVGFLLSGGLDSSLVCSVAQKLYPEKKIKTFCIGMTEDAIDLKYAKEAADYIGSDHTAVYMTKEEVIDSLDEVIKLLGTFDITTIRASMGMYLLCKKIHEISDVKVLLTGEISDELFGYKYTDFAPNAGEFQKESQKRVRELYMYDVLRADRCISSNSLEARVPFGDLDFVKYVMAIDPEKKLNTYNMGKYLLRHAFEGDYLPNSILYRDKAAFSDAVGHSMVDYLKEYAEKCYSDDDFEKLCEKYAYHAKPFTKESLLYREIFEKHYPKQAEMIVDYWMPNKEWEGCNVNDPSARVLSNYGDSGK >NZ_CP016089.1|WP_022746605.1|2806824_2807823_+|hypothetical-protein MKKYLQSKVFKMALSATIAITISNYIGLQFGVTSGVIAILTIQDTKKEALLIGGRRIITSTIAILLSFVLYMLLGNNPVVFGLFLLIFIPLTKVLKMEEGMVVGAVLSTHLLTSANINASWIINEAKLTVIGIGVAMFFNFYTASLEDEFEKNKKRIEDCYRALLSDMAVTLVTHAIPVYEQKLLLEVENLVKKSKDIARAINNNKLFKKNDYYVNYIDMRILQLDAMKKMNRHFSRFYMTYEQTKILSEFTNNVAMNLYEDNDCIELIDKLNLLRKDYANMELPKNRNEFENRALLFQFLNDLEDFLVIKRDFKKSVNINNKNTNTNADDK >NZ_CP016089.1|WP_077393793.1|2806004_2806808_+|PucR-family-transcriptional-regulator MYFLQILFIQQPIVNKIDNLEYAEKRLKHGNFILDKNLLILSIPYKQKYEDYRHNFGLKQIINGLKRILGNCISTYHKDMIIFLISNSHQQVISESIKSSLLEFLKLNNLRCGISFVFENLSYIKDYFYQSINTLQLSSYMKINENLNYFEDYVEYYLFHMANNTTNDLHKINLSTLVHPWIKKLIKFDEENKAELFITLKTYLENNRNANNTSSKLNIHRSTFFYRLNKIQNLLDTSFDNGNNLLKLELSFKLLSYKLHNYGKLND >NZ_CP016089.1|WP_022745633.1|2804996_2805935_-|transposase MIISLNIKSENDHYKIFEAVKIAFAKLNSNIQSTKGRPRKYSDEQIVACILYGVKSSIFSLRELEYRIKQDFVFRTIIQLNQVPDYSTFSLRTKILEKHIYYGIYAMFVELINPETRLCAIDGTALRSSKYDSEAKSGKGTRLGYYKGYKLHCIAAVSDIIIPLVFDLTTANVYDNQVSDLLYEAKIYNPFLILADAAYDSAGWFEIASSLEFNLLTDINMRKAKSIESFADKRYENALFLQSPIGLKLYKNRLKIEQLFSVLKGLYNLENPRLYGQARYERHIKWVLLAYLIDEFNKKQQGIKTRKYPWNL >NZ_CP016089.1|WP_022746614.1|2820451_2820742_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MSKVSNYNYAFVFYDVNEKRVQRVFKVCKKYLSHFQKSVFRGEMSPSKLIKFKTDLNKVIDKNEDFICIIKLMNDNVFGEEVLGVTSGANGEDLII >NZ_CP016089.1|WP_022746615.1|2820741_2821740_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGSTRYISSMGELTRKDDSLCFRKEGKNVYIPIENTKEIYCLNEVSINTKLLDFLSQNNVVVHFFNYYEGYSGTFYPKAQYNSGRLLVKQVEKHNNSRMTIAKAIVSGIGINIREVVYHYYKHNKKEVKGTVDWIKKEFFERIEKAQNIKELMSVEGEVWQRFYSEFKNFLPEDFIMNKRVKRPPDNPINALISFGNTLLYTKTISAIYRTHLDQRISYLHEPSEGRFSLSLDISEVFKPVIVYKTIFDLVNNKRLQVNKHFDKKVNYCLLNEEGRNIFITAFEERLESVFLHPKLKRRVSYRTAIKLDCYKLIKYIMEEKEFIPFSLKEGM >NZ_CP016089.1|WP_022746616.1|2821749_2822244_-|Dna2/Cas4-domain-containing-protein MRINGTLINYYFHCRRQCYLHGNRLNLEDNSETVKIGKAIHEEKASGSKNAEISIDNIKLDRLTSEYLTEIKKSDADIEAGKWQLIYYLKVLKSKGIIRKGKLECVEKNKTDKKIMYFELSDELEKELEKYVKEIENLILSEEIPKVLNKSKCKKCAYYEYCYI >NZ_CP016089.1|WP_022746617.1|2822426_2825018_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MYFNENYFINIDNLLSKKYSFYAHLKNDRKETLKEHTELCKNYFNKLVDSKGLDRIFLNFEEIYLKNTSEKGKLLFRELLMNTIVLHDIGKINPFFQSRKMGNNSIEYSEKFCIIDSQHSIISAVLYLDYFMDKVLKLEKDDKKCIRLFMFLNAYIISKHHGNLEEFKKFLSSFDDDEVGFKVMSIFNNTYKDIYLKDFSLSEVKMKKACNNTNNYLKKIDKEKAVYLYTYERLLYSLLVACDFYATTEFMNGVELNEFGEIAEISEFYDIYKSTSVYRNIRKYENEDYYKDRKDLKNEKNINILRNEMFLDAEKELSKKINEDIFYLEAPTGSGKSNVSINLSFKLFEDNPTLKKIFYVYPFNTLVEQNLNTLNETFGENEDVFNRIAVINSISPIKMDENSKKGVDNEDNYEYYAKALLNRQFLNYPIILTTHVSLFNSMFNSLKESAFAFHQLVNSVIVLDEIQSYKNIIWAEIILFLKGFAKILNMKVIIMSATLPNLNILTSSKESTATLIEDRNKYFSNSLFKDRVKVSYELMDEDDTINALLNHVIDNSYKKKKILIEFIKKESAYNFYRKVKESIDMNDRINCSVELMTGDDNSIERQRILKSIKSSNAEKEGIILVATQVIEAGVDIDMDIGYKDISKLDSDEQFLGRINRSCKRRGVVYFFNLDRTDGIYKNDVRVNTELSLLDDDMKRILVEKNFEDYYLPVLNLIQERFNNTFNDSNLEKFLIEDVGQLNTRKVEERMKLIEEDNWNMSIYLARIINKEEENTTVNIDGKEVWESYKDLLANNSMQYAEKQVKLSEVKSKMNYFIYQINKNSDLLYNDKIGELYYIKNGEKYFDGEKLNKDKFKREVGIFV >NZ_CP016089.1|WP_022746618.1|2825096_2825897_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MKILKFTLSGKTAFFKKPDVNTYLYFTYGNIHRVSLLGMFGAILGYGGYNQMKKTDISKKAKKKDDENSIFPEFYEKLRDIKISIAPNNKKGFIPKKVQTFNNSVGYASKEQGGNLIVKEQWLENPSWDIYVLIDSEESEKVSEYILNHKAIYQPYLGKNDHYANITNIVVIENSEIVEINKLNIINSLFPKKLFEVDLEDEDEEEDELADDVYIEAFKYEEQLPIALDKKTNMYISEGFLYTNMKVSSHNNVNVYKVGERNIVFY >NZ_CP016089.1|WP_022746619.1|2825900_2826878_-|type-I-CRISPR-associated-protein-Cas7 MDKRIYGVLGISSIMGNWNADFTGYPKTTSDGIVFGSDKALKYPMKKMWENNGEKVLYIKSMRISNEKKGEIQVVPRNLKERYEYIFNTENLKYCKDTKEILTNLFKTIDVKNFGATFAEEGKNISITGAVQIGQGFNKYIGTYSETQQILSPFRDDSKAQKEAKKKKNENWEEEEDAKNSTLGNKIVSNEAHYFYPFTINPLAYKEFVELGVTDGYTEEDYKKFKKTSLVSATSFATNSKIGCENEFGLFVETDEDLYLPNLSEYISFNKGESKNTIELNCSDLINSVVDKVKAIEIYYNPYTTEIKSDIKGAKIYNIFTQEEV >NZ_CP016089.1|WP_022746620.1|2826877_2828656_-|crispr-associated-protein,-Csh1-family MLKECLEVFKKKLDENGDKFIIDSYVLEQGTYLLIEPKGDSYQIREKIDIIFDKKTKEINGKSNSNFENICNYDYNSRIINTNKPMASGTFVNKRIIHSNNYFSFIVKKESLINGKLTNEIIDNYYETLSDPFIKYSKSQNAMKIYESVEKELGKVDKEIVERIRNWIKENIFNLDIDIKGKDYLKIFFEYPIKDYKREGKRYLVPNIYNSNEFNIIVKDKIYGLPNDNMGLNSKKPYLENKTRKIIVPYLIDNTNILLQKKFFDYLMNFVVIGRTNVYIDNCNNKIYVYENEELPDRNFKGIFLRIKLISNKTGKEVEIQDYDIITGYKPNLTRKFKFKNILNIEQNSKSVSIKEYGDYGKIKEMQQLLNDIFFQNKLIKNYFKESKDLLIDDSSLKSNLLLSRETIFNWIYKGIDNDIFPVLNKISLSLLKGSIKNGYISKAKHQFNLRWSLIYYFKEGKRMAEILNEVNEVLRKKINSKEYDPIENDEQYYFSVGQVVAFLLSKYRGKNKPFSLAKPIVNSKNNEIIKENLRKMYNKYSYDPSINIKRFKNFYVMISGYIPEGKVNQDMIIAGFLSNSLVYEKDKEENK >NZ_CP016089.1|WP_022746621.1|2828671_2829364_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MNVFQIKLKIFVLKDIPIEDSQGTVSAFIDSGLIKDEKLLEFHESNKFKGYCFDAPYPLEDDKIYKKDKIYTITIRTIDKNLAEFFANKLVNEFNENVKGLTSEIRILPKKHIEKLYSITPAVMKNEDGYWKNKIKLDDFERRLKENLIKKYNSTMNLKIDEDFQLYTSIEFKNKKPISTKYKNIKLLGDKISLNIAENENAQKLAYMSLGTGIFEMNARGYGYVNYRWL >NZ_CP016089.1|WP_022746622.1|2830493_2832068_-|MFS-transporter 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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP016089_5 | 4329649-4329749 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016089_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016089_5
>5.1|4329674|51|NZ_CP016089|CRISPRCasFinder AAAAAAAGTGCGCTAGCACATTATAATCTTCTCACATTAAAAAAAGTGCGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016089_5
The CRISPR arrays of NZ_CP016089_5 >merge|NZ_CP016089|5|4329649-4329749|CRISPRCasFinder TAGCACATTATAATCTTCTCACATTAAAAAAAGTGCGCTAGCACATTATAATCTTCTCACATTAAAAAAAGTGCGTTAGCACATTATGATCTTCTCACATT >NZ_CP016089|5|5|4329649-4329749|CRISPRCasFinder TAGCACATTATAATCTTCTCACATT AAAAAAAGTGCGCTAGCACATTATAATCTTCTCACATTAAAAAAAGTGCGT TAGCACATTATGATCTTCTCACATT
>NZ_CP016089.1|WP_022749097.1|4326845_4329398_-|calcium-translocating-P-type-ATPase,-PMCA-type MIQEKELTAGLSTKEAEKRIEKFGFNELQHHKKASAFKIFLSQFNNFIVWVLIAATIISGIIGDRADAITILIIVVINSILGFIQEFKTEKSLEALKDLAAPTCKVLRDSSIQIINSIYLTIGDVVILEAGDRIPADGFFIESSGIVVDESLLTGESVGVNKDSKNKKANSGFMGTTVVKGKGLFKVDCIGMKTEMGKIADLIQNIEEEKSPLNKKLDSLGKILVVICLVICAIVTIMGIMRGNDITEMFLLGVSLAVAAIPEGLAAIVTVALALGVSRMLKRNALVRKLPAVETLGCTSVICSDKTGTLTQNKMTVKEVYLNGRIYELDKEKLNDYTKFMKCLVYCNDCNYDFTKKKMSEALHGDPTETALINMFFKEVPVLESFQSNANRVFDIPFDSTRKMMSVIVNEGGKETCYVKGAPERMIDKCEFILENNKIKPFTYQKKKQVSQFITAMSSRALRCLAAAYKEENLVKSEKLENNLIFLGITGSIDPPRKEAVDAVLKCKLAGIKPVMITGDHQNTALAIAKYLNICSTEDQVMTGQQIEAVSDSELEKRVKKVRVFARVSPSHKLRIVRAFKKTGNIVAMTGDGVNDAPAIKESDIGIAMGISGTDVTKEASSMILMDDNFSTIVAAVEEGRIIYDNIRKFIRYLLSCNLGEVLTMFLATLFYLPNPLSPIQILLVNLATDGLPAIALGVDPAESDIMRQQPREKGESIFARGLVEKIIVRGTLIGLCTLLSFMVGRYYGMNLETCRTLALCTLVMSQLIHVFECRSERHSIFEIKLFTNPWLVGAVLISVILICSVLYVPFLQQVFHTVPLSVKQVLIVMFFSGIIAFINSVYLLIKSKY >NZ_CP016089.1|WP_022749094.1|4325651_4326080_+|hypothetical-protein MSLKDKLSSKFSNYFQNAYMQKYGDRITSVSGTVLSVKFLEKNYFIMKSLVIEMVIKPEVGKKVVKCWYKKNRWFKKPEFILVKQGHKVIIMGVTGEKNSKKENSQEVQIMNVLNLTTKKDLVPVDHSQIRKSRQQAMNMRR >NZ_CP016089.1|WP_022749092.1|4324295_4325249_-|DUF4003-domain-containing-protein MNNRIKEVCDITIKNYKHAMQNLRYDGDYINHFSALLNGYHKNKIPVDKVKEIRTFIKKSTSKMSVFRGDMLYILSFLIANQEKENFEITNSVLDTFNLLVEEGFKECEYLTLVSYSIVKYCDHENRCIIIKRMKNIFNIIKQKYGNLTKEDDYLLCALLAISGAKFDCMTEYMEFIFNYIKDLKLFSNNGVQGLTNSILLNSNENAADKASQLVKALEKNDIKIGNQFLQLLGVLVGEENINESIGLIKQTIEYLCTEESEYNFYIDKDFRNMIAFVIVFMDNRDKEMRYVDELMAFGTYSFLVSKNQGIFNEILA >NZ_CP016089.1|WP_022749088.1|4323012_4324059_-|DNA-polymerase-IV MENKILHVDMDAFFASVEQRDNPELRGKPVIVGGVSERGVVSTCSYEARKYGVHSAMPIFMAREKCPNGIFVSGRYGKYTKVSQEIFKLFNELTPLVEPVSIDEGFLDLSEAKIKDGMEAARYIKNRVYREIGLTLSIGISYNKFLAKLASDWNKPNGIKEITKEMIPDILLPLSISKVHGLGKISVAKLNNMGIYYIKDLYNMPKEFYLEYLGKSGIDIYNRIRGIDNRKVEVVRERKSVGKERTLKFDTKIKEELLEYIKEFSFEIEDILSRKNVMGKTVTLKYKTKDFENHTRSKTLNYYVNTQIEIFEIAKELLEAEQLKDEIRLIGVSVSSFKENELQQITLF >NZ_CP016089.1|WP_022749084.1|4322300_4322732_-|universal-stress-protein MNKRKILIPIDGSERSMHSLEFVKEIFPKGSVDIIIMNVKELVLINEMIVADEIKLAQELGKDILEAAKEKMKDYKTETYFAFGYPADEIIKKAKEENIGIIVMTKSTKKGLTRMIGSVTVNVVKRAKCIVMIVPNDFTISIR >NZ_CP016089.1|WP_022749080.1|4321862_4322105_-|TIGR04540-family-protein MRAVYRNPRELATCLKDIVDTYYDDLISYEKMEEKILKIVEANKDAIYKEKSMSTKIANVLGNKREAIIDEIVEKNKKEA >NZ_CP016089.1|WP_022749076.1|4320291_4321305_-|tryptophan--tRNA-ligase MDKKIILTGDRPTGKLHIGHYIGSLKNRVELQKSGLYESFIMIADQQALTDNARNPEKIRNSLTEVALDYLAVGLDPAKSTIFVQSQIPELNELTMHYLNLVTLSRLERNPTVKQEIKQKNFENSIPAGFLIYPVSQAADITAFKATTVPVGEDQLPMIEQTREIVRSFNSIYGDILVEPEAVLPPSNAGRLPGTDGKAKMSKSIGNCIYLSDDADTIKKKVMSMYTDPNHIRVEDPGQVEGNTVFTYLDVFAKDKEVVEEMKEHYKRGGLGDMKVKRYLNEVLQAELEPIRNRRMEFEKDMDAVYAMLKDGSDKARAVASQTLSEVRNAIGIEYFK >NZ_CP016089.1|WP_022749072.1|4318695_4319760_-|polysaccharide-deacetylase MTLRKKEMNNRKEEGTKRENLNKLESEKETNEYNKEDLKALEERNIKNDDNEKKKLIITNEKSFIRGMIVLMMMIFLGNGAICKACAQAGNNNPISLFQQNDSKESDNKQKDTEEKKDSTMVGTSEEGKKYAYDAVEVERKLKNYDYSNNGKKMVFLTFDDGASTTVTPKILETLDKYDVKATFFVMGKTIEDGGETAKTLIRKEFNSGHAIGNHSYSHDYKVLFPGRSLNFQDFKADFDKNDKILKDILGDNFSTRVIRCPGGHMSWKNMAPLDEYLSDNNMASIDWSAYDSDAEGKKKTANELVNYAIKSAKGKDMVVMLMHDTYGKEETAKALPQIIEYFKQQGYEFRTLA >NZ_CP016089.1|WP_022749069.1|4317779_4317989_-|ferrous-iron-transport-protein-A MPLILANLGSQMNIKKIKGNDETRRFLSSLGFITGEVVTVISEFGGNLIINVKDTRVALDKGMASRIIV >NZ_CP016089.1|WP_022749065.1|4317544_4317766_-|ferrous-iron-transport-protein-A MSTLKEAKCGETVRVKKVDGEGAVRRRIMDMGITRGCEIYVRKVAPLGDPVEVTVRGYELSLRKADAEMIILQ >NZ_CP016089.1|WP_022749100.1|4329847_4331494_-|putative-manganese-dependent-inorganic-diphosphatase MENVVYVTGHKNPDSDSICAAYGYAELKNKTSDLPAVPVRLGNVNAETQFILDYFGVKAPKLLETVKLKVEDLEIDKISPILPSISLKMAWNIMRDNHSKSLPVVDENERLLGILSISNLTSAYMDIWDNNILGKSNTSIENIIDTLAATPIYINENVKTFDGKIAVTAMQPESLREIVDEGDIAIVGDRPDVQQALIDIKTSLIIVTGSHKLDENLLSEAKENGVTVISTPHDSFTASRLIVQSIPVGYVMATENLISFSNDELVEDIKEVMAETRYHSYPVTDADNKVVGTVARYHLISNHKKKVIQVDHNERGQSVDGLEEAEVLEIIDHHRVADIQTNNPIYFRNEPIGSSSSIVAKCYFEHGVTPSKEVAGLLCGAIISDTLLFKSPTCTEQDRTICTKLAEIAGIQSLEDFAKEMFKAGTSLVGKSVAEIFNQDFKPFSMGEAKVGVAQVNTMDIEGFMPLKDEMLSYMASEADNKKYDVVMLLLTDILTEGSQVLVAGNRPDYVEKTFNVTLKDSMAFLPGVLSRKKQVIPPLTNVVNSMK >NZ_CP016089.1|WP_022749104.1|4331720_4332500_-|flagellar-basal-body-rod-protein-FlgG MFNIFATGKSGMSAYQEKLDYLSNDLVNSQTIAYKNTDVGFKDLLVESLDRQGTPLVTKTAVNGTGVKLGTNYAVNKQGNLKNTGIKTDLAIDDGTGQGYFALTQSDGSIAYTRNGNFKIDSNGVLVDATGTKVYINYEAGMSEGSPQLESEKISVDEQGGLYMNSGTDMVKIGTIPVFTAIGDKAFIPQGNSHFVPSADAQITQSTNYDIRQGFLEASTVDPTEVFSDVILTQRAFQLSSKAITAADDIWGMINNMRS >NZ_CP016089.1|WP_022749108.1|4332516_4333293_-|flagellar-basal-body-rod-protein-FlgG MIRGFYTSLSGLITLQNEQETITNNIANVNNTGYKKRELTKQSFEDVMISNRQKLSGDQYVRNDLGTLNLGVKTYDVKTAFTQGTFKSTGNMTDFAISGRGFFVAQSGNKEVYTRDGNFKIDQQGYLITNDGSKVLGVNNTTGAHEPIYVGDKKFSLDADNNINIEGTGATDKLLTADFSGSDYKKLEPMGDNYITDQSPTYNAKVDVTQNTLEGSNVDSASELIKLMEVKRQFETNQKFVKMQDETVQKAATELGRV >NZ_CP016089.1|WP_022749112.1|4333294_4333480_-|hypothetical-protein MSFFIDKRIFLGIGIGLILGVTFMIGYKYTISLSDSQIEQRARDLGMIYENERKSILKGEG >NZ_CP016089.1|WP_041716366.1|4333488_4334016_-|hypothetical-protein MPIVLIIIGVVLIIYNYRAIKREENTSNFSFENILNNNKEDVNDYKIELGIIRRDIAESLTELQQEIIEIKNELNILKNVEEVYENKAEIENNKNEYTESNDDNNVEESNIEINLDIDKEVISEINFSEIKKNIDSSKTESIKKLLLDGLTEEQICRELSISKGEVLLVKGLFKK >NZ_CP016089.1|WP_022749119.1|4334067_4334796_-|FliA/WhiG-family-RNA-polymerase-sigma-factor MNTAREVDGKEQVIQEYIPLVKYIASRVMFSKNKYMEYEDLVSYGMIGLMDALNKFDNTKGMKFSSYASIRIKGAMIDELRKNRPLSKGAMDKLNRYNKAIDDLQGQLLREPTDNEIAKYLNISLNEITEIENYINYISMVSLENVIFSEDEDINFMGIIEDKNSPSPDMYVQDKEQLEILTQAIELLKEKDRTILNLYYYEGLTLKEIGNVLGVSESRVCQLHSRAIRNLRESMKKLHYID >NZ_CP016089.1|WP_022749122.1|4334834_4335476_-|glycosyl-transferase MHSFNLEINDRIEVIVNEKPYKSLVIDIDDDVIKINLPANEGQYLMLHSGEKIEVNAYLENGNCFNFYSKVISKGKDGNILYYELEEPFNITAIQRRNFFRVGMVNSVQYKNITNIHEEDFEDIPFKEALMVDLSGGGIKLKLKEKVSKDDLFFIKMKIKQKEFLLKGDIVRIEETYDNERLCGIRFLDITEAQSDIIIEELFEIMRKQRARS >NZ_CP016089.1|WP_022749126.1|4335487_4336360_-|MinD/ParA-family-protein MLDQAETLRQLITKEEENIKKEQENDYAKIITVTSGKGGVGKSNFVVNLAICLSNRGKKVLIFDADLGMGNDDILMGVYPKYNIFDIIGTDLKLEEIIIEASNGVSLIPAGSGLNKVQELTEAEKKMFIEKLGELGEYDYILMDTGAGVNRDVLSFVSASEELIIITTPEPTALTDAYSLMKATDHFKLKSEAKIVVNKAFTKEEGKETYDKFDKAVKRFLSMKISYLGCILDDRKLVQSVRQQKPFTMLFPNCDASKCVDEIAMKIIGQNINSTGGVRGVFKRLFNIFS >NZ_CP016089.1|WP_022749128.1|4336353_4337646_-|flagellar-biosynthesis-protein-FlhF MVIKRYLVSNMNEALTRIRYELGKDAIIISQRKVKKSGIKGWFSKKVIEVTAAVENFEEEKSTLNSEQEFRNSLENIKKLMESEVRIKKDVENVKDTINNRILEHNANVEKESPKATKYQENYMENINHVNDKTSIIQSENNMEQSGDKRDFESVHKEVSDLKSLLNKVIQNTSVDENPINYLQEKLSQLDIDEKFHDEIIKSIDEEFSKEVDETERLRDIFERNVLVSKKRLNGRVVLVGPTGVGKTTTIAKLAGRLALVEKKKVGLITVDTYRIGAIEQLKTYAEIMNIPFKVVITMKEMEDAIEFMEDCDVVLIDTTGRSSKNTMQISELRAFVQKANPQHISMVISATTKNKDIMSILNGYSELSYDNIIITKLDETTVYGSLYNISKSANKPINFITTGQNVPDDIRTSSKEEIARFILGEETLC >NZ_CP016089.1|WP_022749132.1|4337646_4339713_-|flagellar-biosynthesis-protein-FlhA MVLGGKKLDIKENLDIIVAFGVIGIVLMIIIPLPKILLDLLLALNITISIIIMLITMFTTNVLQLSVFPTLLLVTTLFRLGLNISSTRLILTEGDAGHIITAFGNFVIRGNYVVGIIIFLIIVVIQFMVITNGAGRVAEVSARFTLDAMPGKQMSIDADLNSGMIDEATARKRRQDLQSEADFYGSMDGASKFVKGDAVAAIIITVINILGGIVIGVLQRGLSVGDAAGTYAILSVGDGLVSQVPALLISTASGILVTRSGSADNFGKTMTAQLTAFPIATGVASAIMLFLGLVPNMPKLAFFTASIATGVLTYMLYKEEAAKQVEEYVSEEEEIIQAERKEPENVMNLISVESMEVEIGYGLIPLADEASGGDLLQRIASVRRQCAIEMGIVVQPIRIRDNLQLKTNEYIIKIRGTMVVSSELMPSMLLCMDPTGENSEIPGIKTIEPTFGLPAIWINKDQREEAEIKGLTVVDPTTVMVTHLTETIKTHSYELLGRQEVQLIVENAKEKYSAVVEELIPDLLTIGELQKVLQNLLREKVPIKDIVTIMESLADNARNTRDLEVLTEYVRFALARTICNQVIDEERKITVVTLDPNVEEIIANNIQKSVQGSFPTVDPDTTTKILTSIKETLESVYFYNNQPIILVSPNIRAVFRKLIEMVFPHVMVISLNEVPNDVQINSEGVVRL |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP016089_6 | 4536353-4536526 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016089_6
|
2 spacers
spacers of NZ_CP016089_6
>6.1|4536389|33|NZ_CP016089|PILER-CR GTTAATCCCATACAGTAAGTAAATGCAGAAGCC >6.2|4536458|33|NZ_CP016089|PILER-CR GTTAAACCAACACAACCCAAAAATGCACTATCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016089_6
The CRISPR arrays of NZ_CP016089_6 >merge|NZ_CP016089|6|4536353-4536526|PILER-CR CCTATACTTGTTATACTGTCTGGAATTGTTATTGACGTTAATCCCATACAGTAAGTAAATGCAGAAGCCCCTATACTTGTTACACTGTTTGGGATTGTTATTGACGTTAAACCAACACAACCCAAAAATGCACTATCACCTATACTTGTTATACTGTTTGGGATTGTTATTGAT >NZ_CP016089|6|3|4536353-4536526|PILER-CR CCTATACTTGTTATACTGTCTGGAATTGTTATTGAC GTTAATCCCATACAGTAAGTAAATGCAGAAGCC CCTATACTTGTTACACTGTTTGGGATTGTTATTGAC GTTAAACCAACACAACCCAAAAATGCACTATCA CCTATACTTGTTATACTGTTTGGGATTGTTATTGAT
>NZ_CP016089.1|WP_077395211.1|4532385_4536024_-|hypothetical-protein MNDAFYGSSLDVTTDTAATTAYTVAAAAASSSPTAGVDNVVTLTVKDSTGSTDTTFTGTKPVTVSGYTAAPNGSYGSLNYNQITQASTTRNLNFLNGVATLNLRLTNAAEQNIVFSVEGVNTPDAEAISITPVPAEAEKETLTQDITAPSSNGGRFAQQPIVTITDFYGNICTNDSTTQVYVSKFGEGDWTLTGTTRATVNNGIARFDDLGATNEAAVTGAKLEFGLSDVGISSGSVNLPAPAATPVVNSVTVTPATASVVQGYTKQLAATVDATGGAAQTVTWSSSDTNGKVAVDPTTGLVTVAADAEPGDYTITATSTVDGTKTGAATITVTAAPAAPVAPSITTQPSDKTVTTGNNTSFTVEASGSSLTYQWKVDKGDGNGFVDVVNDSIYSGATTDILNLTNATVEMNNYKYEVVASGITGSPVTSNVAKLTVNPAEPNEVSVTEVSPIDSITVDNGTTRDDLDLPDTVDVTLSDSTTTSAQVRWGDATPEYDGGTAGTYVFTGRLRLPDGITNPTNLKASVAVNVRTAENGTTPAAVTVESVESLDNITVDNGTERSDIDLPDTVDVTLSDSTTTSAQVRWEDATPEYNGDRAGTYIFTGRLRLPDGITNPTNLKASVAVNVRTAENGTTPAAVTVESVESLDNITVDNGTERSDINLPETVTIDLSNNTTTSAAVSWDYDGANYDGDRAGTYRFVGEFELPDGVTNPNNLQASANVIVGAANTNTIGVPSGVRIEGTPKVGDILTSQLIGEDGNAFTTSATVTYKWYRLDNSNSEFSHEIGTGKTYKLTSGDVNKYIGVRAEYEDVSFNNKVGKILRNTSDNNSHSSSHKHSNSSATSNTSSTKQIAVNVTDGTSHNTISQTVIEQTAASNGTKTDKVTYTADKARETISALASQGKDTARIVAADSDSAVLETQVNIPNDTLSALSSGNVNLEIETNGAIVSIPKEGVQDVAASGQLNGDLYFRVVPIKDEVKQAGIKTTADKEAAVKAVAGNDGVQVLGTPMTIETNIGQRPVDITLPLTGINLPTDPAQRQAFLNDLGIFIEHSDGEKVLEKGAVVDYGNGVYGLKFRTPKFSDFTIVKLNENTKVKAGWKFDNGSWYFIKNDGTMEKGWHKSENGEWTYDGQDTVGQWFHLDANGKLTTGWLKDTDGNWYYLCDGSDYGALGVMKTGWQIIDSKWYYFNSNGTMASDTVIDGYALGNDGALI >NZ_CP016089.1|WP_140395238.1|4532073_4532208_+|sensor-histidine-kinase MFERFYKGTKENYGLGLSISKNIIEKLNGQITAINLNSGASFII >NZ_CP016089.1|WP_022749747.1|4529526_4531977_+|leucine--tRNA-ligase MANYGTKIDKKWQKIWGENETYKFNPENLDKKLYTLEMFSYPSGAQLHAGHWFNYGPTDSWARLKRMQGYNVFQPMGFDAFGLPAENYAIKTGIHPQDSTLKNIETMEKQLKSMGAMFNWENEVVTCLPDYYKWTQWLFLKLYEKGLAYRKKAPVNWCPSCNTVLANEQVVDGVCERCSTEVVKKDLTQWFFKITDYADELLDKLDGLDWPEKTKSMQKHWIGRSYGAEVTFKVKDSKLDFNVFTTRVDTLNGVTYVVLAPENKLVDELTLPEYKDAVEEYKEAASKQSEIERQSVSKEKTGIFTGSYAINPINGKEVPIWISDYVLSTYGTGCVMAVPAHDERDFAFATKFNLPIERVITDKDNSDPELPYCEYGVLVNSGKFDGLTTDEAKKKIVEELEKDKLGSMKVNFRLRDWLVSRQRYWGAPIPVIYCDDCGIVPVPEKDLPVKLPYDVEFTPDGKSPLSKSEEFINTTCPICGGHAKREADTLDTFVCSSWYYLRYADNKNEDAPFDPEKINKILPVDKYVGGPEHACMHLLYARFITKALRDMGYLNFGEPFLSLTHQGLILGPDGLKMSKSKGNTISPDDYIKEYGADVFRMYLMFGFGYTEGGAWNDDGIKSVGKFVDRIERTLETCINLFSSNENTKDSIDSAEKELNFWKHTAIKGVTEDGNKMQFNTAIARLMEFVNALNKYLQEDIKNVSFLKETITDFLKLLAPFAPHFAEEQWSLLGNTSTIFNERLPEFDPSALVKDEVEIAIQINGKIKAKINIPSNLDEDGIKKASLENKTVQENTEGKNIIKVIVIKGRLVNIVVK >NZ_CP016089.1|WP_022749743.1|4527828_4528605_-|short-chain-enoyl-CoA-hydratase MENVIFKHENGIAEITINRPKSLNALNTQTLKELGQVINEISERKDIYTVIITGAGEKSFVAGADITEMKDKTAIEGREMAKLAQKVFSNIENMPQIVIAAVNGYALGGGCELSMACDIRLASTKAKFGQPEVGLGIIPGFAGTQRLPRLVGKGRAKELIFTTDMIDANEAYRIGLVNKIYEPNELIDKAKEMANKIMSKGTYAVSLAKSSINNGLNMDTESAYAFEADLFGLCFSTEDQTEGMSAFVGKRKASFKGC >NZ_CP016089.1|WP_022749739.1|4526149_4527718_-|acyl-CoA:acetate/3-ketoacid-CoA-transferase MRKVNVLTSREAAEMVKDEDLLVTGGFVGSSAPETLSSAIEKLFLETGHPKNITLVHAAGQGDGKGKGADHYAHEGMTKRVVAGHWNLAPKLGKMAIENKIEAYNLPQGTISELFRDIAGKRVGTITHVGLNTFVDPRISGGKLNEKTTEDIVKLINIEGEEKLLYKSFPINVCFIRGSFADEYGNISLEREVASLEDTSIAQACKNNGGKVIVQVEKIVESGTLDPRLIKIPGIYVDGIVVSKPEEHEQSFGCEFNPAVTGDIRVPLSTMKKAPLNERKIIAKRCTMELKADTIVNLGIGIPEVISSVANEEGIGEYMTLTVEAGPIGGVPQGGTAFGASINPEAIIDQPYQFDFYDGGGVDIAFLGLAQVDEHGNLNVSKFGPRIAGCGGFINITQNAKKVLFCGTFTAGGLKISTGDGKLKIEQEGRAKKFVKNVEQITFSGDYARKMNQEVMYVTERAVFELRKDGLYLTEIAPGIDLQKDVLDLMEFKPKMDGVPKLMDEKIFYDKLMGLKNKSNES >NZ_CP016089.1|WP_022749734.1|4524923_4526063_-|acyl-CoA-dehydrogenase-short-chain-specific MDFNLTEQQQRIVQVVREFAENEIKPKVIEYDQSGEFPIDTYKKMGQLGLIGVPYPREYGGGNGDYLSYVLAVEEISKVSGSLGISYSVSTSLCAGGIMNAASEEQKKKYLPDVLSGKKFGSFGLTEPNAGSDAGGCITTADKDGDYYILNGAKCFITNGPLSETFLVFALTDKTKGSKGLSAFIVEKGFEGFSIGKVEDKCGIRSAQVSELIFENCKVPAENLVGIEGKGFGIAMKTLDGGRIGVAAQGLGIAEGAFDVAKQYMKDRQQFGKPLWKNQYLAFKMAELELEIEQAKYILYKAAMDKQEGRPYSVSAAKAKLACTDAAMHVTTEAVQMLGGNGYMKEYNVERMMRDAKITQIYEGTNEIQKLIISGSIFR >NZ_CP016089.1|WP_077393859.1|4524294_4524708_-|MarR-family-transcriptional-regulator MMELNECINFLLTKAQQVVFQSLKARLAKFDVTPVQYGILKCLWDEEYQTPKQISEILSLDSSTITGLLDRMENKGLIQRVPNKNDRRTLNVVITEEGLKYRKEIEQIIDDLNKDFLERFSEEDQKQLKNALRTIAR >NZ_CP016089.1|WP_022749724.1|4523812_4524169_-|four-helix-bundle-copper-binding-protein MEEMESLIPEGNPMQSCIDICVKCSQICQECLNLCLQESDVKERMNCIKSLQDCSEICSTSACFMSRSSGNIRELCNVCAIICQNCAAECRAFKDDHCPKCADMCHKCADECEKMINM >NZ_CP016089.1|WP_022749719.1|4523096_4523696_+|tyrosine-type-recombinase/integrase MSKNTEPKIKYLTQKEALSLFNSIENSNSCHSIRDLAIFRLAYRCGLRASEISLLKLQDYNMLKGEIYCKRLKGSSNNTLRLDRKTKIVLDKYINENNITSDSQVIFTSQKNNPISRQTLDYLTKKYCSLARIEDKSKHHFHVLKHTTAVHLAECDMDIKELQWWLGHKSVSNTEIYFQFTTKQQDKMYEKLDGKNEMV >NZ_CP016089.1|WP_022749715.1|4522074_4522890_-|EAL-domain-containing-protein MDRIERLQFSDRKSMIKDELKNVIEKNELYILYQPQINTLSNEITGIEALLRWDNSKLGSVSPVEFIPIAEDLDYIVDLGNWVMDKALRQAWVWKRKGYKFNTISVNVSPIQINKENFKKNLLNIINKYNIPRNFLEIEITEGIIIDINKEKIDMLTEIMNSGISIALDDFGTGYSSLSYLINIPVNTLKIDKIFIDNINSDKSKILIKGIVSLSKSLKYKIIVEGVETKEQLELLTNIGCNTIQGFYFSEPLSENEMENLLKINGGVNNI >NZ_CP016089.1|WP_077867539.1|4538805_4539978_-|response-regulator MMVYQIESGGMYIMKVILVDDDKAMILILKRIMNKIEGVEIVNTFNSSINVLEFIKDNCIDMVFLDISMPGENGMELARNIYHMSPSTDIVFITSHREYALDAFEIYAFDYIIKPVLKERVERTIKRAFEKRSLLIKKIPEKEKNISVYLLGGIDVSSKSLGTVKWMSAKSMELFIYLLLNRGRNISKNVIIEDVFQGMPLKNAENYLKTSVYQIRKAFEPHVSNSILILKNGYYKLECSEFYVDCMDFEKSVGRIKEINEENIKDALDTEKIFIGELLGDRIYYWSISENEKYLNLYLNLAIKLVKYLLNNRDLNNASYILKKIIKLDALNEEANCLLMRLFEAQKDKNSLIKHFQDYERMIKKEFGVNPGCEIINFYEKLLKSFSEHR >NZ_CP016089.1|WP_022749759.1|4540007_4541540_-|ATP-binding-protein MGSSFFGVLWLVFALCFTGKTDKIKKGTLALLYVISITILIVNWTNDFHHLFYKEMYMNNKGIFPILEVIHGPWYWIHIVYNYLVTLIGLIIFILDYINEVSVIRKQLLLIIISCVIPWIADVIYSLGLAPFDLDLCPIALSISGIMYSCAVVKFKLLKLTPIALEKVFSSMLEGVIILDNENNIVNFNNSSKGIIHELNYINQGDKQFEEVFKEYEDIIRAVNSNEYKEGLISLKNKNELKFYKMSINYIYEKNRNILGKILILSDITKEKKQQENLLELNTFKDNLFKVVSHDVKSPLGVLLSLLELLEDENDIYKEENREVLSEIKANVKNTYEMVENVLQWFGSQMDGMVYRNLTWKLFDIMKNSLMLLEKNAQLKGIKVNYEISRDIFVNVDREMFEIVVRNLFSNAVKFTNSGGYIKIWAEEVSGVVTIAVKDSGIGIENEKLDALFDNSNYCSTFGTAGEKGTGIGLMICKQFIEKNNGDIWAESSYGKGSTFYFTILSGKNI >NZ_CP016089.1|WP_022749764.1|4542003_4542750_-|methyltransferase MKPYNKEFVFQVMKKYNELINEGTSGNYRIVKNVVEENLQGYMYENKEQYDISVIQLLKDNVSLMRLSPKEIESSYETIKFAKGKVGIVGLGIGYVVQEIAKKNSVEEVTVYEISEDVIELYNQNFTKNEKIKIIKGDAFKAENQKFDFFYVDIYEYKLTSKVVKDYKIFNELHEIEEYSFWGLEHFLLSCKYEDIVWVYIPENWISMSKKIYESLDSSGYIKTYRPLEENKVREILMQFKEVLNADM >NZ_CP016089.1|WP_022749765.1|4542961_4543294_+|HesB-like-protein MKNITISEEAYNEFKAFLEENNISDFNIRINFAGFACSGPIFNISVSEATDDDEIEKINDISFIVEKTLIDQFGGFIILSTEENEGNGLSLKPVITPEGGCGGSCSGCHH >NZ_CP016089.1|WP_022749769.1|4543738_4545073_-|hypothetical-protein MDFNEKKEQVLKEIYLLDTHNQFNNSHKRQFFDLVEDVILYLLQSEDAFFGQFMLRIKRGIRFDLKVPIATIPQRDGFNMYFNPVLFLNCTKKEMAALFKHEIYHIMSSHFQRERKMKQSLNKEAVSVALDISINQYIKDLPAYSKKLESVNMEYKIILRENRSIEEYAEEIYKSIKSRINKNKISKDNDSKSEIDMTRAHELWEEIDISEEDIENLTKKTALSSYNKSTPEGLQKIIKAYEEKPEIPWQVVLKSILPTMKSGYKKTITRRNRRQPERLDLRGRLPENETEVIVAIDISASMKDDDLHKILVEILSITSNTTNKITIIECDNEIRNIYKLRSERDIKKRSKNNGSTEFTPVFKYIIDNNLRNVVLIYFTDGVGEKELGVKPINKKTLWVISGNEELSLNNSYGEIKRINKERKQIIEGNVGLQMVNEVIHEWAR >NZ_CP016089.1|WP_022749773.1|4545126_4546209_-|AAA-domain-containing-protein MNYSECLSTVDLIIESNDVPLIIGESGVGKTSLVKYIAKNNGYYLVTIDANLLKEGEIGGLPVVENRVTIYATHHKLTEIDRALKNDENANVILFIDELNRCDHAVAQELMNLILNREINGYVLDERVKVIAAMNPSNKNDGFYNSQYEVVDMDPAQEDRFVWVELDSDIKEWIKWAMSDNGNINEHIIEFLSTFPEYLHTPNTDETIKATPRSWERVSKAYNVYLNNKQKYPMNSFLNVVRGNVGANIANDFANFLINLKKPLIKVQDIFTNEILSFELKEKIEKENHSRLYILIKNALKYLEEIPTEKNINLFSELLNLYPRDLRLGIMKEIKRDYKDKIYENLLDNDMFLDAFFNIF >NZ_CP016089.1|WP_022749777.1|4546226_4547006_-|hypothetical-protein MEKENILLKLKSNPEYIKELSEADEELKLFIVKNNGNNIKYIKNPSKEVQKEAIKNTPLSIQYIENVNEEIGILCVRTLWNSLELINNPSETIIEEAVQTKGWAIQFVKNPSEKLQILAVSKDYDAIKYITNPSEIVQLKAIENYYAAIRFIKNPTLKAKIKSIKSNGEAINYISNYDLDELKLFISENINVVKYIYESVDVETVVEVLMEKVKDETIEKKYIEDFLELEILEMDKINFIREYGSKNAKKILVDYKLSM >NZ_CP016089.1|WP_022749782.1|4547096_4547888_-|GTP-pyrophosphokinase-family-protein MAINDWKNFLMPYEQAVDELKVKLRSIRKEYRRKNEYSPIEFVTGRVKEVSSMLEKANKFEIPIDRVKYELEDIAGIRIMCQFVDDIDIVVELLRGRKDMQILYEKDYVRNVKESGYRSYHMIIKYPVNMAEGPVEILAEFQIRTLAMNFWATIEHSLNYKYKRHIPEQIKEKLKRSADAAFRLDEEMLEIKDEIKDAQKLFEVKSHLISNIMNSLLTLISLGKEAEVARYQKTLNKLIEEGEVWELNSLLFSVKREIEKYKE >NZ_CP016089.1|WP_022749786.1|4548054_4548729_+|DUF2225-domain-containing-protein MHDINILDHLFDKHITCPVCNSTFTTKTVKAKSPRIMSKDSDFFIRYKEINPYFYDVCICNSCGYAAMRSDFEKIRSYRKELVFSNITPKWQARQYPDILDEQLAIERYKLALLNAMLTDCPDSTKAMISLRIAWMYRLLNDNSQELSFMKQSLDGFIDAYTKELLPIYGLKRDSLTYLLGELNRKLGKDEEALLWYSKTIVNTNASFRIKEMARVGKSLIKNE >NZ_CP016089.1|WP_022749790.1|4548759_4549701_+|methyl-accepting-chemotaxis-sensory-transducer MSIFKKSNKEIIAPTVSVSTNADQHSINKKDISKEVNILKNQTSNLDSSIKNISSSISSLTKSTQSQCSEIHTAKNILSDFRNNMENLAINITNVHIKVLDTDKLADTGLDSITHLDTSLNDLESAFTVSTSTVNSLVSKLESVNSITDSISQIASQTNLLSLNAAIEAARAGEAGKGFSVVAGEVRKLAENSKLAVQSITSILEEIKQDILKASNAMNSGNSALTIQHNSLEDAKNTFSDIKTSIEDATDEITTCIVNLTTASEAKDNVISSVDNIANLYSEHESVVKEVATSIDTQASEIKQLNKSISNLS |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_CP016089_7 | 4652064-4652156 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016089_7
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016089_7
>7.1|4652091|39|NZ_CP016089|CRISPRCasFinder TGACGTTGCAACTAGTGTAAAAGTCGAATTAATTGCACG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016089_7
The CRISPR arrays of NZ_CP016089_7 >merge|NZ_CP016089|7|4652064-4652156|CRISPRCasFinder TTTATTACATATATAGTTATATATGTATGACGTTGCAACTAGTGTAAAAGTCGAATTAATTGCACGTTTATTACATATATCGTTATATATGTA >NZ_CP016089|7|6|4652064-4652156|CRISPRCasFinder TTTATTACATATATAGTTATATATGTA TGACGTTGCAACTAGTGTAAAAGTCGAATTAATTGCACG TTTATTACATATATCGTTATATATGTA
>NZ_CP016089.1|WP_022750060.1|4650305_4652045_-|FAD-dependent-oxidoreductase MNSYKNTDSPYQIDNPSESERYTMLEYILKIQNRSDDLNNIIDLMSPPKDITNICKAGCAKNIKVAVIGAGEAGLAAAFELRKIGCNIVLFEASQRIGGRVYTHYFDRNRKYYGELGPMSIPISHETTWHYINLFKLETSPFVDYNYNSLFYVKDERAVNDASGISAKNNIYPKFNLSKIEGKKSWRELHERICKKYLSSFSAELRKELIQVKPEYSKNIKEIDKLNYRNAYENVDLSQDSISMLGYLDGKEQFFSLSLIEMLQKYYTADFEYNYRITDGMINLPQSLYEALCDKSEEGYKDINKEQLGKVEIKMGFPVSGIYDSSSKDKVILKYMDCRDNKETSEEFDYVICAIPFSSLRRIQIEPLFTNRKMQAISEMNYEIAHKIYLYLKNRFWEMGNASTKIVGGSSHTDLPLVSIYYPSDHAKAVANKYGKWILKHGASYKEAGALLAGYSWGQDAVRLGNENPELLLDDVMRYVERVHGLSLHYLDDKLIDYKSLIWSDVQYIWTGGALSKPGDKTLFSYNVTVPEMEDKVFFAGEHISQKHVSQQGALQSGMIAANEIAKRINDNAVNIKRS >NZ_CP016089.1|WP_022750055.1|4649324_4649921_+|DUF4489-domain-containing-protein MNSLSHGNCGGTAGTGNICPNPCPPRFAACAAGAEELHPLPCPALLQCGEASNPRITSVFTPSTTTPSISLAEVEIDTTCLCFPNIKIEFSTLINADITGPAGSVTIRLSRSCNSGTNNCNGGTSKTLRSYTINLSGVGGSTITTPFSFVFCSENVPSKDCTYFVDIVSANPGPATGSFIEFTNTDIAALAVGCARIC >NZ_CP016089.1|WP_022750051.1|4648273_4649050_+|hypothetical-protein MSVNLKRFSPRPGLVNKQGRLPDPSELVCIEVPKIFDQCLIKKCLVYGEGPDTNTTDFELRSNPLTDPKRYIGSRDFNLTLLSVDKIPLMGNPNFKKIIISYKISFCADYIDANGVNKSELYEINRTDVIGKFYCPDSIAQISASFVPGNQPQDLDSNIIKLEMVADALAGELLKDEAGKEVLDITLGYYIIVKCELIVQLLIPTYDYCPVPKAPCEEEPEEDPCEIFEKAPIPKFYPDQNLDPLFPDCDDGNRNEEM >NZ_CP016089.1|WP_022750047.1|4646348_4648022_-|hypothetical-protein MNCVCPWIYVDYRNNIWDFFKNGNKELCYKIMYGEGKWSKESLIDKEIRGFAIYIEDDETIHIVYSNIKGELKYCTMKNKRWVGMTLYQIDVDEFEIQSLKIRIIRDEMHIFYLLIGKDGSDHGVLMHCIWNGRETKVNTLSDIILVPNINEHYMLNINENNDIDTFFITDEGDEISLNYCSFQNHIWSSVKRLYGIQGEEIDFEVLVDKEEINILNKSREDAIYFLDHVRIDKGGIIQEFRVYESSKELSEPLVFVKDRKLYSCWLEQGEILYSVFDNEKWRKAYHFDRGNELPVSRYNCFICSDGGSSIKAMKAYATDEPDLYLFVPSQFVINRKESLKDERIKVTEDLSSEGEEVQRLKLKLSRMKLEKKDLENKIDSLNMQLKKRLKSIHEYEEEFVRLVEQKRKADENYKVFLELQQNIQKKLENTNKQLLEERNVKASIENELKEYKEKNILIKQQVEMLSTENERLNKEIELEKENIQEKLEELNTNLLEERNIKASIESELKECKEENSLIKQQVEMMSEENKRLNKELEFERNQSIMERLLKRRSNGI >NZ_CP016089.1|WP_022750045.1|4645988_4646258_-|DUF3343-domain-containing-protein MATEEYDYIMTFTSHNRALYMYQRLTGRNIKVKLVTAPNKINISCTQAVKFKEIDIEIIQTELKRNNIYPTATFKIIKDGKNETYELVN >NZ_CP016089.1|WP_022750041.1|4644308_4645775_-|hypothetical-protein MVDKKEKMIYYVSNLGISTVSIIDGDGYHIIKEVEIGPRPQNIIVDESNNIYIASDRNGKVTVIHDLYDCIKTWDMPNNGNIQVDSIAHKIYVCNTDEVCIYDLRTGEKIGSLRGFIAADSIELNKNKKRLFVLDVLQNEIKVYDTSNLNLIKIYKDIGNSPKYILIEENENYIYIANREKIYILNIENENISFIDLEKRSIITSLEQSGTFLYVANDGLHRIEVIDTLKRKCIANITTTMQKVKRIRLSPDKKILLVIGQNIEGKGVINRIDVSGNVILDTFDLEKKNGIPYDIGVAIQRRLPKKEEALSIIDSEDTLKKENGTTILAKKVLSTYQEKIIFQDVSIKLTSEEEEIINIDEIRFKKCEIINETRNREIIDNRKEYSMLKYNFYIPYYIWYKDEHGRKYIDEGKIEGIQNATLYIPAYAEQQGVEFVVNSFTKLTSNPEIINNDLKFSVSVLISTRAIVDELVFIPFFKNCDVQACENK >NZ_CP016089.1|WP_022750039.1|4641948_4643544_-|peptide-chain-release-factor-3 MADYINEIEKRRTFAIISHPDAGKTTLTEKFLLYGGAIRLAGSVKARKASKHAVSDWMEIEKQRGISVTSSVMQFNYNDHCINILDTPGHQDFSEDTYRTLMAADSAVMVVDAAKGIEDQTRKLFHVASLREMPIFTFINKMDREAKDPFQLLDDIENELGIKTYPMNWPIGSGKEFKGVYERDNNRIIAFNGGNHGQNEVEAIEGSPDDPKFREILGDALHDKLMEDIELLDIAGDELDLDAVRRGELTPVFFGSALTNFGVEPFLEHFLEMTTSPLARNSSAGTIDPFEDKFSAFVFKIQANMNKAHRDRIAFMRICSGKFNKGEDVYHMQGGKKIKLAQPQQFMAQDREIVEEAYAGDIIGVFDPGIFSIGDTLCSPSKKFKFEGIPTFAPEHFARVRPVDTMKRKQFIKGVTQIAQEGAIQVFKETHIGMEEIIVGVVGVLQFEVLEYRLNNEYNVDVKMDRLDYRFVRWIENKDVDMDSLNLTSDTKKVKDLKDRNLLIFQNDWGISWALDHNKGLILSGVGKSED >NZ_CP016089.1|WP_022750037.1|4640705_4641668_+|DNRLRE-domain-containing-protein MKSITIPAIKSLSVTNKYSDKSLNEDKIIVGSDSNYNYYSYLFWDISSIPANAIVHNAKLTLFKTDNFYYDTSKKFSISPLYEYFSTYTTYNNSPNYDHYTVINFYPLTDNISVTIDITTIVSSWVKNSLKNKGIILYGRNEDILTSFGSVKSSDSYLVPFIIVNYEPYSSNKCCKKECNNKCSQDCCCKKNCNGEYFKDDCCEKYIKICKKELEAILFKVCKEACGSNCNPYPPNTSITRTVRVTGTVAPASVYYIVVDLQVTRASSGQINHYYVSDEYDNSLNDTPLPIDKTYNIAVSPPIQSGDTEDVILYGSYKGF >NZ_CP016089.1|WP_022750033.1|4640165_4640450_+|hypothetical-protein MASFDTPQNSTIQTIYATGTIPAHNDAGFIEIQAVASRNGGHETFYKTFQIAASATATTARAWSGAGNYQIVITPKLFGTQSVSSTTVVNSFKH >NZ_CP016089.1|WP_022750028.1|4637366_4639877_-|glycosyltransferase MKDNLGNITKQSKDELINTTENLKEDVSGIVKDKIKLAFFVKMGLDSFLGDIIEGLSQEYEIKKIITIEYKQIEDGMQWADICWFEWCDELIAYGSKLELAKEKKIICRLHSYEAFTDYINNVNWSNVNRLIVVCEHIKSFIIKNFSIDEKIVSIIPNGIDEKRWRFKERENGFNIAYVGYINYKKGPMLLLHTFKAIYETDHRYKLYIAGIFQDNRYVLYYNQMIHEFGLENNVVYEGWQNDLDTWLEDKNAILCTSVLESQNMSVMQAMCKGIKPIIHNFVGARLIYPSQYVWNTITEAVEMISDKNYTSKVYRAFIKERYSLNDQLMKIKDLLISLPEKMSKGNLNYINSNDLKKSSDQVDLMKTKFTVNSDDITNTEALFDYLLSINDEESYMKYLSEWFIRSKYELTFKFNYYYGNMYRRFTSYSRFKYMQKNVYEEMDKIGGKILEENYLTYFNNKKISLKENKRKILFILNGLDIHQSVTQFFINYLQSSENIKHRYSVLSLLNKNEFNNSKESIDYFNKLNVNLFVPISNCIEDKIKEFYIYISEGNFDYVVYQSLYFAPIGVLLYPLLKKVCKIIGKIQFQQPEDYFDEKLDFCYTYIKKDNCCKNIFELISPINTELVDKNLDIRTLFNIDRKKKVVISIGRPIKYKNNEFWNFAIKLINEIHDICLVVFGGDYSEFKQYVPNKLIEEYKVIFAGFNLEASSYLKSCDFYLNSYPGGGYSLEEAYYAELPIITFCKEENDEAFNVMNASYMAPAYLYNNAKTIFPKTGDFDQLLSYSKKLIQDDSFRNTIKINRKIESNNLKFEYFVKEFEKYMDNIANNNGRNNK >NZ_CP016089.1|WP_022750065.1|4652362_4653502_-|aminotransferase-class-V-fold-PLP-dependent-enzyme MIYLDNAATSFPKPSEVYEEVLKCMKNYAANPGRGSYEIAVKAASKIMETREEICNLFNIASLFNLIFTSNATEALNIGIKGILEKGDHVISTVIEHNSVLRPLHSLSEKGVDVTLISSDKAGYVSIKDIKDEIKKNTKMIIISHISNVLGSIQDIKNIGNLSKSNGIIFMVDASQSAGIIPIDVEREHIDLLAFSGHKGLLGPQGTGCLFIREGIKLKNFKEGGTGSNSHFMIQPDFLPDKFESGTLNTPGIAGLGEGVKFIKRIGIDSIQKYEEELTSYLLEEIKRLSYIKIYGSYSGNKRGPVVSFNIEGVDASIVGEELDKEGIAVRTGYHCAALIHDVIGTEYAGTVRVSPGYFNTFDDIEKLIVAIMRIYKVR >NZ_CP016089.1|WP_022750067.1|4654050_4654839_-|hypothetical-protein MSINFKKFSPRPGIVNKQGRLPDPSELVCVEVPKVFDQCLIKRCLVYGEGPDTNTTDCELRSNPLKDPKRYIGSRDFNVKLISVEEIPNNGNPDFKKIILSYMISFYADYIDADGITKSELYEINRTDTIGKFYCPDSIAQISASCIHGNHDKDLDCNILKLEMVADALAGELLTDEGGNDVLDITLGYYIIVKCELVVQLLIPTYDYCPVPGEPCAEEEPEDVCVQFENAPVPKFYPDQNLRPLFSESDDDYEDDDYKDNN >NZ_CP016089.1|WP_144079383.1|4655147_4657400_+|DNRLRE-domain-containing-protein MLLENSIKINCNDATYVCKFHSNTNFSKNNSLLVGGFTNKLSSFNLYRSILNFHIPDLKSDSIKEAYLFLFLEDIKYIHNGPENLILLGNSENIDIPNANWTNFPNNNFTKPVILSMPNTYVGSYLKVDVTSIIKSLVKFNMNYNIILTPPNKNSNAIFKLASSMSYTPPYLNIVTYAEDNIEFSEASEITENIEAIENDTYENTSENVTKNINDKSSVLDENQSDILPSIKNELINILLKKNIALNQSLINYITNEFNKQTSVLASIRSTINDADNFITIKKALDSHTNNLNNQNLILDFIKDKVNNNKSFVVTEDLLNKIVSTLNEQDSTLALIKDNQDSVATQNMLTSISDNLNEKISTLDENQSNILSYIKNDLINNLSEDNNTLNQNLIDDITNKFSDQASLLTSIENKISNYTIVDDLYKKHISLTQNLLQYLTSKFNDQTSILTSIEDEINNPKFINDLSQKHITLNQDLIDYINTKFNDQIPILTSIKDEVSNNESCIKIQNTLDSLSNNLESQSSILDSIKNKVNNNEAYSIAEDLLNKIVNTLTDQESSLTYIKDKVNSDEEFTNIKTILGSFSNNLENQSSILDCIKDKVNNNIPESLSEKLDTQNLKLDSYNDSFNDITKIFSDKLNSIDNKMDSIDNNLIDFKKDNTNNFDSYISPVSNDISELKNAISPLTENINMLKSNIDTLTNAINSKNNTIDENDKINSTNFNSINSQLSELSTNLKTLTETINSIANELLN >NZ_CP016089.1|WP_022750076.1|4657837_4658812_-|glycerophosphoryl-diester-phosphodiesterase MKILNIAHRGYSGKFDENTMIAFRKAIEYKADGIETDVQLSKDGIPVIIHDETLDRTTDGHGFVKDYTLKELKEFRTKSVPRVQALKGEAIEGLQLIKEINSSKLGEYTLDEVEYFKNNNGEEIPTLRDLLELFSASDLKILNLELKNSISEYDELEEKVISMIDEYNLRDRVIISTFNHMSLVKIRELEKQEIEYMANQVETLKDSNSANYKNTNTKLKNDKTKPKSKIILGALTDSTLANVPKYLNDIDVECYHPCFYSILNKSYMKEIKNAGIKVNPYTVNEIEYMKMVIEAGADSIITNEVEKLNDVIKSFPNIDKQLGI >NZ_CP016089.1|WP_022750081.1|4659008_4660157_+|cell-wall-binding-repeat-containing-protein MNKNIKKLISFTIIFTAFSIFTPSTINILEQSAYAYSEYEINALSISSGYSIIPIYDSITYNKDYKIKNGDKIPSIIYSKISSDKASFKLNTLETNAVDIRAFSGNEKLNDIYGEITIPEGESKSIYIRLYNSKNASDNDYDSEYELIVERESSNSTDNDLDNESEDDTITLKDYDDIYLDNLILFDNNDNKIDFTFDKTNPISNINIDKSISCITVKAIPEEQVYNLLINDKHIKTSGNDKDKRLISLDEGKNIIKIRIVDSFNHKRREYFLVVTRGQDNSETYNNNNNNNNANTNLENAQGNYIKTNGNWQYKKADGTIAVGWTFINNEWYYFDSTGAMKTGWLKDTSGKWYYLKESGAMAKNTVIDGYTIVSDGSAINK >NZ_CP016089.1|WP_022750083.1|4660588_4661635_-|hypothetical-protein MKYIYLKRIIASCIISSTLLVMAPLGASAAWIGSYNEGWYYTEGYTYATGWRYINGTWYFFDDTGLMKTGWISSNGLWYYADLSGAMQKGVIQIEGKIYLFTDSGAMETGSAMINTKLYNFNEKGVCTSGEAPMPSRAFDYYGVDVRPYVPSQIVNSSDTKMNNDLPSDDANTVKTYKIQFKDDDGTSLKTKNVEEDKKVTLYEPTKSGYDFVEWNTKKNGDGTSYQYDDQITVKKDLTLYAQWNESTNTDTNNTSSDQNIPVTSIKVVSVGSKTTITLNSTLQMTRTVLPSNATTQNVTWSVEDGTGSATISSTGRLTPSKLGTVIVKATATDGSNVYGEIQITIVD >NZ_CP016089.1|WP_022750087.1|4661731_4664626_-|cell-wall-binding-protein MKRKLISKIIALSIVGTVSATIYPTRAFAAWTKDNQNNYYYTQGNSKLTGWNKINGSTYYFDEDGIMKTGWIKIDSSWYYLDNSGVLKRGWIYYNNNWYYSDASGVMQTGIIKIVGSTYIFTSNGIMQTGHAIINGTFYTLDNSGAVVSNSTPSANKQFDEYGKCVLDSGNSTSNIDAPNESKYNEEIVDQSKSDEDPNEGRKFKVTFKDSINGKDIEDKTVKYGRSIKLDEQDKDGYKFVEWNTMSSGKGKSYDSGDNVKIRSDLTLYAIWKQETDTKSVTSISISGDSQVEVGKKIQLSADILPSDATNTKVKWSVTNNGGSATIDNDGILTGATTGKVTVTATAADGSGLSSSKDVNIVAQKTLVTSITIGGDSVAITQDGGTLDIRTLLSVLPENASDKEVSWSVSKVAENTGDAIGNATISDSGVLTALGNGTVKVIATAKDGSGITGSKFVHISNQTVKLTSMAVRGKDNLKVVNVGDSTHNYSLQMYADLVPTNADISSTEWSVKDSTTSGSTMTGKAMINSSGVLTGTSPGTVTVAAKVTTKSGDVITGSQEINVVQLVTSIDVIGRSVTDQTTSSSITTNGGTLQMEATATPTNANTKDVTWSVVENDAKGTTTDKATISKSGILTATKNGEVLVQATATDGSGVVGSKVITISNQLIKVSKLTIDGLDNVEIGSDTISSPITLKMTAVTTPQVVSDNSVEWSVKEMSSSGPVDTDKATINQNGLLTAKSPGKVVIIVKAKDGSNTIATKEVEIIRKVESLVVLGANSSKKVATNGQLQMNAFVLPSDAKDQTVKWLVVQATTDEINNNSSKLTLNPGLASIEESTGILTGIANGEVKVIAISNYDNSIKGQLLVDVVVPVTSIQVQSSSQVITAGEQLQMSADGLSDATDKVVTWSIQGISGDTGQVSINNNTGELTTTSNITQKTVVTVIATAHDGFGACGTATITINPKKTT >NZ_CP016089.1|WP_022750091.1|4665195_4666824_-|collagenolytic-protease MNKRIRRIIAVVLAVSAFSTIEPTKYMNITGITKAYASSTVIDNFQVNKAATDNELNLYEDEDYEDTTNFKASTDTYYVKTSSSSINFTFDTNSNYVTKVFKDDSKTGTPFDSGEEINLDKGTNTLYVRTYKESKFDKNNVKTNVIEEYKIVVERKTNSTNDVQLSKISLDYGDISFSKSQTSYDVDVNSSVDQIEITAKPSKKSYTVKIAGDEVTEDDDYQETVDLRKGANEIEINVTDDDGNENTYTLNIYRGGKSNTTTDNSDIDTTQDKIYLKDLKLNNGDVELDYNKQVTKYNVNVDSSVNKLTIKAEPQDDNDTVKVNGGKVDSDYEKTVNLDDNSTKEIQVKVKNSDGEQRIYTLNVTRGTVSQNSTTNNTSTDAANNTSTNTTSNTTTNDTNTNNNSTNQTTSNNTVVSKWVKDTVSDKWKYYDDKGDQVKGKWFYYINDNHWYYLDDQGNMKTGWLSKDYKWYYLDENGIMQIGWVNLSGTWYYLNADGSMRTGWLQEGTKKYYLNSNGAMQTGTATINGKSYTFDTAGAMSN >NZ_CP016089.1|WP_022750095.1|4667204_4669322_-|toxin-A MIRRINKIVALVLVSTGISSAIPNNIFSQTANAAESNQSVINIDTQKNTVAMESQDQALKTVVKAMIPSKTGYSTSVISEFKECGSVAYTLDDATALSIGNTLKSNISQMIAGVNKVKNKGTEMKVKGQATSNNDMIQSGTDLESSATTVLEELNQANSMSDSQLVQMIESQAKNVTVYQYRELKSDDGLTASSPTTIQAEGFVVGGILGIALDPQDTYNAETRIATYNSSTLIENLTLNNNGTYGKSIDLNSSTNKVVCDGLHINVIDSQNNALYVINNPAYNMFKQSKSLYTDEDKRLNILNFPSEVNNLKGYATDISFNTGTQSIQTTILGLLLNLKNSSTTDKKTYKYVAPVDSPEAEMLNVVVSKLGLNDLAKQLVENQMKGSTFVMIPDVKTDITNKVNNAIDKINNTVEDITDAMKDLSDAMEDLNDSLNDKNNDVNKAWDKVFDRFDNDPGWAKKDGYWYYYDKDGISSKGAQTIDGKTYYFNRIDGAMETGWQIVNNKKCYFDKDKGYELFTQWVQDGDDWYFVDSSGAVKKSDWITSGGNYYYVKADGKMTKDWLKVDDNWYFFNSDGSMASSTWKWSDNKWYYLKENGAAANDWLQIGDNWYCFKDSSGELQTGWFRNNGNWYCAGDNGVMKTGWAYSSDGWCYLDDSTGKMKKNEWANINGKWYYFNINGTMVTGSRYINGTKYTFNSDGTME >NZ_CP016089.1|WP_022750099.1|4669548_4669956_-|DUF86-domain-containing-protein MGKDVILNKIETIERCVNRINEVYDNNPENLNDYTKQDSIILNIQRACEASIDLAMHIVSEKKLGVPQNSRDSFEALNHNNIIDNELNKKMKSMVGFRNIAVHDYRAINLKVVQIIIESHLKDFEEYIYQINKLL |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NZ_CP016089_8 | 4733444-4733539 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP016089_8
|
1 spacers
spacers of NZ_CP016089_8
>8.1|4733477|30|NZ_CP016089|CRISPRCasFinder GGGCAAACAATAATGGAACTTGGTATTACC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016089_8
The CRISPR arrays of NZ_CP016089_8 >merge|NZ_CP016089|8|4733444-4733539|CRISPRCasFinder TAGATCCTTCTTCAGGTGCTATGAAAACAGGATGGGCAAACAATAATGGAACTTGGTATTACCTAGACCCTTCTTCAGGTGCTATGAAAACAGGAT >NZ_CP016089|8|7|4733444-4733539|CRISPRCasFinder TAGATCCTTCTTCAGGTGCTATGAAAACAGGAT GGGCAAACAATAATGGAACTTGGTATTACC TAGACCCTTCTTCAGGTGCTATGAAAACAGGAT
>NZ_CP016089.1|WP_144079390.1|4732018_4732660_-|exopolysaccharide-biosynthesis-polyprenyl-glycosylphosphotransferase MEETLFKEQIESRKLYCFIKRVMDILGSAMGLVILSPILLVIGIIVKIESKGPLVFAQERVGLNGKRFKMYKFRSMVANAEELKSKLHDQNEMNGPMFKMKEDPRVTKVGKFIRRTSLDELPQLVNVLKGEMSLVGPRPSLPKEVEQFEDWMMTRFSVKPGLTCYWQVSGRNDIEFEDWMKLDAKYVSERSTLVDIKLILKTFGVLFGDEHAS >NZ_CP016089.1|WP_022750249.1|4730901_4731948_-|mannose-1-phosphate-guanylyltransferase MLCALIMAGGKGTRFWPLSTEEKPKQFLNLIGDDTMIQMTVNRIKPIIPMERIFVCTGAMYVDLVKEQLPELPERNIIIEPEGRNTTPCIALSALVIDRYFKDSTMIVLPSDHLIKDEEKFRNIIEESEDFLENNEQAIITLGMKPDRPETGYGYIKYNNETSKNDAFNTFKVDKFVEKPNEEKAKEYLENGSYLWNGGMFLWKTSTIIDEIKKYSPLTYEAIHEIESIKEENLQKLIDEKYNKTESISIDYAVLEKSKNIYVVPSEIGWDDIGTWKSVERYKEKDINNNILDGNARVIESNSNIAINKGKRIVMIGIDDVMTLETEDSIYIVNKDYMDNLRDYKNIV >NZ_CP016089.1|WP_022750245.1|4730133_4730871_-|WecB/TagA/CpsF-family-glycosyltransferase MSRIKFLNTEIDNVTMLEAINKIDEFVSKRKPSYVVTPNVDHIVKLEVDEEFKEVYREADLILTDGMPLIWISNFKSMPIKEKISGSDFFPEVCKLASEKGYKIFLLGAAEGVAAKAAENLKNKFEGLNIVGTYSPSYGFEDKQEEIEKIIDIITKSKPDILAVGLGAPKQEKFIHKFRDRLNIPVSLAIGASIDFEAGNIQRAPIFMQKCGLEWFYRLCKEPKRMFKRYLVDDLKIFKIALKYK >NZ_CP016089.1|WP_022750242.1|4728850_4730089_-|glycosyltransferase MKILFITNLLPYPLDNGGKIKSYNTLEMLSEENDVDIFSFYESRKELDSLKYMKSKFNNVHIIEKPLTTSKNIKKMIFIAFRSLFNKLPFVLLKFKDNNMSQLLKKEISKNKYDLVYIDHLQLGVYWDILKMCNCPIYLDEHNCESQILKRKIKSGENILKNCFIRLEYKKLKNFEDKIVKKCDKVIVLSEEDKKCLMNGVDVNKNKFTVIPIPIQADFMKTIGSRINNKKTLNIMFLGTLTWFPNSQGIEWFVDKVIPKLEQTNSNYKLFIVGKDPSESLMNKCKQNNKIIVTGYVDDVNEYIEKCDIMIVPIFVGSGMRVKILEGLGKRIPIISTQIGAEGIDVENEKDILLAENEQEFINSIVKLTDNELYSSIQKSGRKLFDSKYSIEAVITNYKRLVLNDKELKKNE >NZ_CP016089.1|WP_022750239.1|4727976_4728858_-|glycosyltransferase-family-2-protein MNNTPLVFIILVNYKGVDHTIECIKSLNEITYSNYKIIVVDNDSQDNSVNKLKEYKKNFILIENKINTGFAGGNNLGINYAIKNNADYVLLLNNDTTVEPNFLDELINKTSPEIGINIGKILFYYDKSMLWYAGGRINALKGCTDVNGFEKDNGQYDEEKYVTFASGCCMLISKEVLNKVGMLMEEYFLYFEDTDYCAKVLNNGYKILYCPKSVIYHKESVSTVKESFNFLYYITRNRLYFIKDNIKGINKILSFIYSFIFIFTKAIIKNQDKKPILCAYKDFFRKKKGKLII >NZ_CP016089.1|WP_022750235.1|4726785_4727886_-|glycosyltransferase MRFVTMFPETKNIHLTKDVGMIPFIMYKKFGYDSTIVCYKNGKYDYLRDEVKGLKINFIKKYTGKSIIDGAIYLLGNAKKIDVLHLFHLGKREIVWINLYKILNKNGKVYLKFDADYKIKKAINPSMNTLKSKIKNITLRKCKLTSVETLNIYKFLREEWKINVEHIPNGFYDYGKKEIVQYTNKDNIILTVGRIGSYQKATEILLEGFRLASSGLNNWRLRIVGPIEESFKDYMNKFITKNPNLKEKIEFTGAIYNRKKLEEEYRKAKIFCLTSRYEGFPLVFLEAIKHGCYIISSDFDAAYDITNNEKYGDVFTIDDVNELSICLTKDCNQEQKLRENCYKIQEYNYEEFYWPIICEKIHHLIN >NZ_CP016089.1|WP_022750234.1|4725301_4726546_-|hypothetical-protein MDKKLLKYIIIFNPFLDIIYSVISKTGVTLPINQVVRILIMAYLFFRFTNNKDKIFVILIAILFGIGEVTYIYTNGTSVFTDIQYITKILYFIIVIYAFRSILSKHILTIDEILNYIILSSCIIVASIILSVFGIGFHTYFDGRFGYKGFFTVQNAVTATLIVTTPLNIFLYEKFKYKKYLVSFILSAISLCLIGTKAGIVGGVGSIVVVYLIFLFKMKFTYIKIILGLFSIATIISFSYFKQELFINVYNVMVEKIYSWGENNVYSYIVSNRNLQVSYVEQYISTYYKQNPLLFFGIGFTNCNNILQLHSFDIIEMDFNGILYYSGIWIFIVIFSIITKKILVLLKYFFESKLSIQYYTLLLSIIGGTIHSFWGGHVIYEAMTSLYYGIALIIPAILYQDIKIERTACCKPID >NZ_CP016089.1|WP_022750230.1|4723714_4725151_-|flippase MRNIKLNKVVRNFISLTFANVLGQVLMFISVVYTAKYFGPDNFGIINFSNTIITYFTALASFGLQSLCVLEIAKSKKNNDYKINTILSLKLILATIVYILVIILAIFINKSIVYKLNILFYGLSIFPNAIYVDWIFNANEEMQYNSRSIIIKNLVYSVVVIIALRFFNITNLYYLAVFMFLATLISSLYLLKIAKRHYNMNFKFIINFKEYKRLILNSWPFFFSGIFATINSTIATLMLGFMRTDYEIGIYNSVYKIVNVFIMIAGILFTPVYPSLIRYYNEKQIDKLSTLVNNLRKIVYIISIPILCVAFILNKEIILTLYGDKYKDAYIVLTILFIYVALLYIREIYGYELSAWNLQKKYMKVVLLSSIYNIISNFAFIKYYGIEGAAVNTLISEIINVVLMFKISRNVVKIKYENKFIAKILVSSLGMSVIILICKIVTYNAIILSIIGGGIYFCLLFITNTISISEIKENVLTK >NZ_CP016089.1|WP_022750226.1|4722300_4723515_-|polysaccharide-pyruvyl-transferase-family-protein MKKIILAGASLNSGNRGVNALTRGQIMLICDKYGYDSEIEILSYTVKDEIINKIIYNNKEIIVKETPCSKNELIVAYIESIGFGENYILKKIKLADMVFDISEGDSFSDIYGTKRFIQHSIIKLIAINVKTKIVIMPQTLGPFNRNWVKIIARKILNKADKVFVRDEISKKVATEELQIQRDIKYIPDLAFYMKCDEKTFIDKFISDKKKIKVGINVSALLYNGGYTKNNMFNLKANYKKLVTSLIEKFANMNDVEVILIPHVMTKNFEVEDDFSVCKKIANDISKKIRTDIKTIDKYYREDEIKTIISGCDFFIGSRMHACIAAISTKVPTAPIAYSRKFIGIWEKIELGDCVLDPKNESENEIIEKIIKIYNNRSRIKEVLELQIPLLKSQIENIPYIIEQK >NZ_CP016089.1|WP_022750222.1|4721294_4722200_-|glucose-1-phosphate-thymidylyltransferase-RfbA MKGIILAGGSGTRLYPVTKAMSKQMVPIYDKPMIYYPMSVLMLAGIKDILIISTPRDIVNFKELFKDGQELGLNIEYAIQENPNGLAEAFIIGEKFIGDDNVAMVLGDNIFYGQSFTEHLRKAASLENGAYVFGYYVQNPKAFGVVEFDSNNKVISLEEKPENPKSKYAVPGLYFYDNSVVEKAKSLRPSPRGELEITDLNKSYMQEGSLKVQLLGRGMAWLDTGTHASMLQASNFVEAVQNTQGTYIACLEEIAYRKGWITSKQVIELAKPLMKTGYGKYLMDIVDEVEKSKKEVAVTVK >NZ_CP016089.1|WP_022750262.1|4734776_4735544_-|tyrosine-protein-phosphatase-YwqE MIDIHSHIIPGIDDGSKNMEMTLEMLIAAEKSGTKKIVATPHYLMEYGEAKINEVKDHVEKINSIVNDEGINIEVYAGQEVYFTHNIINDYLEGNIGTINDSRYMLIEFSMRNQEQNLFDTLYELQVRNIVPIIAHPERYKYIINKPSIINDFINEGYLFQMNAGSLEGVFGDSVRKTAEILITNGIYNFIGSDAHNTTTRSVGISEGVDLANAKNKINGELIGESSRRLILNEDIEFCGQKIKEKKSIFSFFGR >NZ_CP016089.1|WP_022750266.1|4735561_4736305_-|CpsD/CapB-family-tyrosine-protein-kinase MFSAKKLENAVANQQYRGFVVEKKPKSIAAEAYRTLRTNIQYSSFDKEIRSIVVTSAEAAEGKSTVSGNLAISFAQNEKKVIIVDCDLRKPSVHKNFKISNLVGLSEVLIGKAKLEEVVQSRNEYLDMLPSGKIPPNPSEMLSSKAMVNLIEKLKETYDIIILDSAPLLAVTDAQILSKDVDGTILVTRAGRTKRESVIEAKNLLTKVGANIIGSVLHAVENTRGKYYYYYGSNEDGDETKTKKKHK >NZ_CP016089.1|WP_022750270.1|4736317_4736998_-|capsular-polysaccharide-biosynthesis-protein-YwqC MNEEIVRLEDIVDILNKRWKMILSITVITTLIAGILSFFIIAPKYEASTKLFIGKENSQTQDKNYNNSDIQMYQQLLKTYAGVITTNDLVENAINNADLNVTSQEVLKNLTVTPSANTQILEIKYISKDKTLSRDLVDSITNQFIKESTELIPNGNVKVIESVKMPENPVSPNKKLNIAIGFLLGLMVSIGLAFLLEFVDNTFKTKEQVEQILGLPVVGAIPDDFN >NZ_CP016089.1|WP_022750272.1|4737611_4738586_-|cell-wall-binding-repeat-containing-protein MNKKLKQLIAIALTVSSVAAFGPTNVFSLITPVSARTSVLDPDELKTLNITTSNGSNLKICSDSYDGKEVDISDIDPDSNKEFYAVLPTGNTKINVSADIKGKNYIAKIFTSKNENAKAYDPARPYDEGNDIYLTDDVTNLYIRIYRSQDDYDEVKDTDVTDCSNTYIVHIKKEEAFSKKYPANSDNDSQTNHEYKQSKDIYNNSNNIEKIIVPGSSQIEIKSSQWVKDALGWQYNGSDGTPVKNAWLLDNQTGKYYYVQTDGYMTTGWKYIDGNWYCFDNSGVMQTGWIQSSDGSWYYLYSSGKMAKDTTIDGYTLSYNGQMM >NZ_CP016089.1|WP_022750276.1|4739190_4740282_+|acyltransferase-family-protein MENLKFTRDDTSIAKGIAIICMFIHHLFTFPNRIKGSSEFISLFQFNGNNIEYWFGQYGRICVAMFLFFSGFGIYKQFAKNNAHVSSNVFKRLKNLYVNYWTVFIIFIPISFFTGYREFNLAEFFDNFVGYRSTYDGEWWFFELYVLVIATFPVTVKLIKNSSVTSFFKIMVLAVLSRTVYVSLKDVPLFNTFARTIFYSELNLLLTWLPCFLMGITFAKFDLFPKISQKFKDNKLDNIFVYLLICLVLMYVRFRNDDVIDFDYLIAPLYILCSVNIVKILKLNKLFVYLGKHSSNMWLVHSFFCYQYFQWWVYLPKISIFVLLWLIIITIATSIAIEFIKKQVTKLCSGEFKLSYMNRALRD >NZ_CP016089.1|WP_022750280.1|4740485_4741094_-|hypothetical-protein MKKIRTRVITLCLSLGILAGTIGMPTAAFAATTDATYKVSNGITTDSPDSIKGTDGTSKDSIYGASLAASGGSSFSGSANFNANVNIDVLGIANRIISAINARNFNGQNAAFCKGLMESAFYAAHGQYNVVVMDLSQNYKHNISGVKYFATYQYGGTTFGVWVFSRQQPKGSYFENDGRRGWDHWACQGWQTQVNNVMWYNR >NZ_CP016089.1|WP_022750283.1|4741703_4742891_-|YibE/F-family-protein MKLKLDRISAIKICSKIIIPIAVLVAYIVIAVNFSSHTPIYNPYSSGAGGEMHYEKGKVISIDEQVINPSGFSGLYIGRQMVNVLIESGQYKGQTFQVNNALNYDTNFILHNGQEIVVSVNTSTGDKSQINVYMFSPYRVVPLLVLIGIFIGAICLVGGWRGFHSVLGIIFTLTTVIFIFVPLLFYGISAVAATIFLVVITSCVTLFLVGGFDRKTLSAVLGTVAGVIVSVIIMLVFSKILGISGYTSSDTDALLNIAGQSKLQVKDLLFTGVIIASLGAVMDIAISIATSINELHKQKQNACFNELFRSGMNIGRDMMGTMSNTLILAFLGESIFSFILMYSYQVQFKQLFNSNGITIDIVNAVCGSLAVIFTVPIVSAIAAKLLQGKQSSDFI >NZ_CP016089.1|WP_022750286.1|4743036_4744695_-|metallophosphoesterase-family-protein MKISKKAKFIIPIAVGTIIATTSCLHFVENVNAEVMDSSGIEGFSLPKVTGGYNINANVGSDPKELDFAWFTQSSGKTQIKIARTSDMNGTQFPNSADIHDATQSTVKVTQSIKQDCTVLPYTNGVGDPSNYRDNVFNGKSVSDTPTGEYSNKVTVKELTPNTKYSYSVSDGQGNWSPVYSISTLSTDKVSFAAFGDPQIGAFDNSKGTAKSSATGGHKNLNDDKTAWQNMLKLVNQNKDLNFLFTMGDQVNDYNYLIQPSNSSDGQWYQYRDFFNPDSAVNYIQSMPLAEFCGNHDHQMGEYYGYHYNQPNISKLGSTKYGNDGDYWFTAGPVLFLVLDANNYGTADHDQFIAQAIKANPNAKWKVATWHQSAYSEANHNTKNEIEDPALTIRNTWTKMMDKYNIDVVLQGHDHYYTRTAQMLNGNVVEPNTGTPETLKNIGNESAPGTTNPNATYARKEYPNSVTNPKGTVYFTLDTGTGSKYYDFNTGSNDTVGGSADHSFSVVGWQGYVPSYSYVSFTDNTFKIKTYATTDFKVENQSLIDSYTITKN >NZ_CP016089.1|WP_022750290.1|4745098_4746814_-|methyl-accepting-chemotaxis-protein MKRSCKRLRNVKITRNIILIWIISLMSTVIIGVEGYSNTNKMYNITNNINSNVIPKLKDWGDVNGYMGVLRNTLTKIIDRPFDPKNEKTMLELNNNITTIMQRQVISSQGDEKEAELVKTAKEAYEHYYSFIPNIIEQRKQGLVPDTKITNEDMGVYGNALAKSITDLVDYQKNTANENSEQSKNVYHDSIIGFGIVFVLSILILTIISLIIIVAIRDLIKEFTNDLQILSEGDFTIEIDDSLTNEFGIMNNALKKTINSISHILKNIETESTSIHSQSSSLSMLAEQMNTSTQDISSAIDGVAKGSSSQASELVTMNELLNNFGVSLDEVGAIINKVNAHTKEVNVKAESSNNELAHIITSINNISNSVNDVGQKISDLTSSVKEINEITNLLNDIAEQTNLLALNAAIEAARAGESGKGFAIVAEEIGKLAEQSKHSSNGINELVKTIQSETDMVTMTANDANSELSKQVSVIDNSIKSFKDIIISIGNILPEMDDINSSISQINKKKENIMDVAENIAAVAEENCASAEEISATTQNMISSADEVEKSSQVLNNKTNSMIEQVNKFSL >NZ_CP016089.1|WP_022750291.1|4747151_4747409_-|hypothetical-protein MNCKTVNKSKFKLMNYFTNKNNDYNKASKNITSIYKYIIGLWQAIFHRIDNDPNNYKKNYNYCDTSYNVTDRIELRLIASKKTFL |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP016089_3 | 3.11|2253136|36|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2253136-2253171 | 36 | NZ_CP016089.1 | 3308495-3308530 | 2 | 0.944 |
1. spacer 3.11|2253136|36|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 3308495-3308530, mismatch: 2, identity: 0.944
ttaaataattattagaattagatatactactagttg CRISPR spacer ttaaataattattagaatcagatatactactggttg Protospacer ******************.************.****
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP016089_4 | 4.14|2818971|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2818971-2819006 | 36 | LC519601 | Cronobacter phage vB_CsaP_009 DNA, complete genome | 75914-75949 | 7 | 0.806 |
| NZ_CP016089_4 | 4.19|2819297|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2819297-2819332 | 36 | NC_008014 | Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3, complete sequence | 156164-156199 | 7 | 0.806 |
| NZ_CP016089_4 | 4.19|2819297|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2819297-2819332 | 36 | NC_020130 | Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3, complete sequence | 156186-156221 | 7 | 0.806 |
| NZ_CP016089_4 | 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2819754-2819787 | 34 | NZ_CP046706 | Nostoc sp. ATCC 53789 plasmid pNsp_c, complete sequence | 151973-152006 | 7 | 0.794 |
| NZ_CP016089_3 | 3.4|2252679|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2252679-2252713 | 35 | NZ_CP040462 | Enterococcus sp. M190262 plasmid pM190262, complete sequence | 10539-10573 | 8 | 0.771 |
| NZ_CP016089_3 | 3.7|2252874|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2252874-2252908 | 35 | NZ_CP019876 | Komagataeibacter nataicola strain RZS01 plasmid pKNA01, complete sequence | 55275-55309 | 8 | 0.771 |
| NZ_CP016089_4 | 4.13|2818906|35|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2818906-2818940 | 35 | NZ_CP033461 | Brevibacillus laterosporus strain 1821L plasmid p1821L01, complete sequence | 20689-20723 | 8 | 0.771 |
| NZ_CP016089_4 | 4.14|2818971|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2818971-2819006 | 36 | NZ_CP022092 | Staphylococcus saprophyticus strain FDAARGOS_355 plasmid unnamed2, complete sequence | 12923-12958 | 8 | 0.778 |
| NZ_CP016089_4 | 4.14|2818971|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2818971-2819006 | 36 | NZ_CP035295 | Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305 = NCTC 7292 strain ATCC 15305 plasmid unnamed1, complete sequence | 36521-36556 | 8 | 0.778 |
| NZ_CP016089_4 | 4.14|2818971|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2818971-2819006 | 36 | NC_013378 | Staphylococcus epidermidis plasmid SAP105B, complete sequence | 5898-5933 | 8 | 0.778 |
| NZ_CP016089_4 | 4.15|2819037|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2819037-2819070 | 34 | AP014229 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C90-MedDCM-OCT-S34-C72, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 5873-5906 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP016089_4 | 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2819754-2819787 | 34 | MK764441 | Flavobacterium phage FPSV-F12, complete genome | 58378-58411 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP016089_4 | 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2819754-2819787 | 34 | KU599886 | Flavobacterium phage Fpv20, complete genome | 47573-47606 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP016089_4 | 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2819754-2819787 | 34 | NC_031931 | Flavobacterium phage Fpv2, complete genome | 47394-47427 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP016089_4 | 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2819754-2819787 | 34 | KT876726 | Flavobacterium phage FpV21, complete genome | 47385-47418 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP016089_4 | 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2819754-2819787 | 34 | KU599877 | Flavobacterium phage Fpv1, complete genome | 47419-47452 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP016089_4 | 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2819754-2819787 | 34 | MK764449 | Flavobacterium phage FPSV-S29, complete genome | 47076-47109 | 8 | 0.765 |
| NZ_CP016089_4 | 4.30|2820015|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2820015-2820050 | 36 | MK268686 | Enterococcus phage vB_EfaH_EF1TV, complete genome | 25894-25929 | 8 | 0.778 |
| NZ_CP016089_4 | 4.30|2820015|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2820015-2820050 | 36 | MK721192 | Enterococcus phage vB_EfaM_Ef2.3, complete genome | 27729-27764 | 8 | 0.778 |
| NZ_CP016089_4 | 4.30|2820015|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2820015-2820050 | 36 | CAJDJZ010000002 | Enterococcus phage vB_EfaH_149 genome assembly, contig: phage149-genome, whole genome shotgun sequence | 130124-130159 | 8 | 0.778 |
| NZ_CP016089_4 | 4.30|2820015|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2820015-2820050 | 36 | AP018714 | Enterococcus phage phiEF17H DNA, complete sequence | 131430-131465 | 8 | 0.778 |
| NZ_CP016089_4 | 4.30|2820015|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2820015-2820050 | 36 | MK693030 | Enterococcus phage vB_EfaM_Ef2.1, complete genome | 25301-25336 | 8 | 0.778 |
| NZ_CP016089_4 | 4.30|2820015|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2820015-2820050 | 36 | CAJDJY010000002 | Enterococcus phage 156 genome assembly, contig: phage156-genome, whole genome shotgun sequence | 128974-129009 | 8 | 0.778 |
| NZ_CP016089_4 | 4.30|2820015|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2820015-2820050 | 36 | MN854830 | Enterococcus phage PBEF129, complete genome | 25198-25233 | 8 | 0.778 |
| NZ_CP016089_4 | 4.30|2820015|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2820015-2820050 | 36 | LR031359 | Enterococcus phage 156, complete genome | 128974-129009 | 8 | 0.778 |
| NZ_CP016089_4 | 4.30|2820015|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2820015-2820050 | 36 | KJ801817 | Enterococcus phage ECP3, complete genome | 109290-109325 | 8 | 0.778 |
| NZ_CP016089_3 | 3.7|2252874|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2252874-2252908 | 35 | NZ_CP041064 | Bacillus megaterium strain KNU-01 plasmid pKNU_01_1, complete sequence | 111993-112027 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP016089_3 | 3.7|2252874|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2252874-2252908 | 35 | NZ_CP032530 | Bacillus megaterium NCT-2 plasmid pNCT2_2, complete sequence | 40546-40580 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP016089_3 | 3.7|2252874|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2252874-2252908 | 35 | CP041518 | Bacillus aryabhattai strain KNU10 plasmid unnamed2, complete sequence | 78660-78694 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP016089_3 | 3.7|2252874|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2252874-2252908 | 35 | NZ_CP018876 | Bacillus megaterium strain JX285 plasmid 3, complete sequence | 25302-25336 | 9 | 0.743 |
| NZ_CP016089_3 | 3.11|2253136|36|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2253136-2253171 | 36 | MT774386 | CrAssphage cr110_1, complete genome | 72552-72587 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP016089_3 | 3.11|2253136|36|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2253136-2253171 | 36 | MT774383 | CrAssphage cr11_1, complete genome | 89075-89110 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP016089_4 | 4.22|2819492|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2819492-2819527 | 36 | NZ_CP014570 | Campylobacter fetus subsp. venerealis strain 01/165 plasmid mp2, complete sequence | 2519-2554 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP016089_4 | 4.22|2819492|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2819492-2819527 | 36 | KU878088 | Bacillus phage AR9, complete genome | 90297-90332 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP016089_4 | 4.22|2819492|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2819492-2819527 | 36 | MF360957 | Bacillus virus PBS1, complete genome | 600-635 | 9 | 0.75 |
| NZ_CP016089_4 | 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2819754-2819787 | 34 | MN693756 | Marine virus AFVG_250M718, complete genome | 30800-30833 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP016089_4 | 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2819754-2819787 | 34 | MN694439 | Marine virus AFVG_250M296, complete genome | 29997-30030 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP016089_4 | 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2819754-2819787 | 34 | MN693803 | Marine virus AFVG_250M716, complete genome | 6799-6832 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP016089_4 | 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2819754-2819787 | 34 | MN694282 | Marine virus AFVG_250M297, complete genome | 30009-30042 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP016089_4 | 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2819754-2819787 | 34 | MT701588 | Klebsiella phage Metamorpho, complete genome | 16877-16910 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP016089_4 | 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2819754-2819787 | 34 | MN694541 | Marine virus AFVG_250M717, complete genome | 30412-30445 | 9 | 0.735 |
| NZ_CP016089_8 | 8.1|4733477|30|NZ_CP016089|CRISPRCasFinder | 4733477-4733506 | 30 | NC_010105 | Enterobacteria phage JS98, complete genome | 97411-97440 | 9 | 0.7 |
| NZ_CP016089_8 | 8.1|4733477|30|NZ_CP016089|CRISPRCasFinder | 4733477-4733506 | 30 | MH791409 | UNVERIFIED: Escherichia phage EcWhh-1, complete genome | 159174-159203 | 9 | 0.7 |
| NZ_CP016089_8 | 8.1|4733477|30|NZ_CP016089|CRISPRCasFinder | 4733477-4733506 | 30 | NC_012741 | Enterobacteria phage JS10, complete genome | 96487-96516 | 9 | 0.7 |
| NZ_CP016089_8 | 8.1|4733477|30|NZ_CP016089|CRISPRCasFinder | 4733477-4733506 | 30 | MK310184 | Phage NC-G, complete genome | 40245-40274 | 9 | 0.7 |
| NZ_CP016089_8 | 8.1|4733477|30|NZ_CP016089|CRISPRCasFinder | 4733477-4733506 | 30 | EU863409 | Enterobacteria phage JS10, complete sequence | 96487-96516 | 9 | 0.7 |
| NZ_CP016089_3 | 3.7|2252874|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2252874-2252908 | 35 | KF751797 | Campylobacter phage CJIE4-5, complete genome | 14225-14259 | 10 | 0.714 |
| NZ_CP016089_3 | 3.7|2252874|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2252874-2252908 | 35 | KF751794 | Campylobacter phage CJIE4-2, complete genome | 13978-14012 | 10 | 0.714 |
| NZ_CP016089_3 | 3.7|2252874|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2252874-2252908 | 35 | KF751795 | Campylobacter phage CJIE4-3, complete genome | 12306-12340 | 10 | 0.714 |
| NZ_CP016089_3 | 3.7|2252874|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2252874-2252908 | 35 | KF751796 | Campylobacter phage CJIE4-4, complete genome | 12344-12378 | 10 | 0.714 |
| NZ_CP016089_3 | 3.7|2252874|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2252874-2252908 | 35 | KF751793 | Campylobacter phage CJIE4-1, complete genome | 15252-15286 | 10 | 0.714 |
| NZ_CP016089_4 | 4.8|2818580|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2818580-2818613 | 34 | AP014235 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C93-MedDCM-OCT-S38-C9, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 7892-7925 | 10 | 0.706 |
| NZ_CP016089_4 | 4.14|2818971|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2818971-2819006 | 36 | EF506570 | Spiroplasma kunkelii virus SkV1_CR2-3x, complete genome | 3059-3094 | 10 | 0.722 |
| NZ_CP016089_4 | 4.17|2819166|35|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2819166-2819200 | 35 | NC_018878 | Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_502p, complete sequence | 129490-129524 | 10 | 0.714 |
| NZ_CP016089_4 | 4.17|2819166|35|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2819166-2819200 | 35 | MN693272 | Marine virus AFVG_25M206, complete genome | 40569-40603 | 10 | 0.714 |
| NZ_CP016089_4 | 4.8|2818580|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2818580-2818613 | 34 | NZ_LR214952 | Mycoplasma neurolyticum strain NCTC10166 plasmid 2 | 13682-13715 | 11 | 0.676 |
| NZ_CP016089_4 | 4.8|2818580|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder | 2818580-2818613 | 34 | NZ_LR214954 | Mycoplasma neurolyticum strain NCTC10166 plasmid 4 | 8556-8589 | 11 | 0.676 |
| NZ_CP016089_1 | 1.1|148480|40|NZ_CP016089|CRISPRCasFinder | 148480-148519 | 40 | NZ_CP035512 | Haematobacter massiliensis strain OT1 plasmid pOT1-2, complete sequence | 14175-14214 | 12 | 0.7 |
| NZ_CP016089_3 | 3.7|2252874|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 2252874-2252908 | 35 | NZ_CP053469 | Fusobacterium nucleatum strain Fn12230 plasmid unnamed, complete sequence | 30024-30058 | 12 | 0.657 |
1. spacer 4.14|2818971|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to LC519601 (Cronobacter phage vB_CsaP_009 DNA, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
aactatattaatttcatcatcttttaaatcaatgta CRISPR spacer atcactatcaatttcatcatcttttaaaacaatatc Protospacer * * ***.******************* ****.*
2. spacer 4.19|2819297|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_008014 (Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
ttttactgatacaaacactaaaactgatactaaaac CRISPR spacer tgatgctggtacaaacactgaaactgatactaaagg Protospacer * *.***.**********.**************.
3. spacer 4.19|2819297|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_020130 (Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
ttttactgatacaaacactaaaactgatactaaaac CRISPR spacer tgatgctggtacaaacactgaaactgatactaaagg Protospacer * *.***.**********.**************.
4. spacer 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP046706 (Nostoc sp. ATCC 53789 plasmid pNsp_c, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
atttagaaatagataaaactcaagagaatagaat-- CRISPR spacer gtttagaaatatataaaattca--agatttgaattt Protospacer .********** ******.*** *** * ****
5. spacer 3.4|2252679|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040462 (Enterococcus sp. M190262 plasmid pM190262, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
gctagt--aatgaagatgatgatgtagacactactaa CRISPR spacer --caattaaatgaagtttatgatgtagacactacaat Protospacer .*.* ******* * **************** *
6. spacer 3.7|2252874|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019876 (Komagataeibacter nataicola strain RZS01 plasmid pKNA01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
gaaactttttcttttttatttttagatttaacgct CRISPR spacer gaacctttttctttattatttttagttcgttggct Protospacer *** ********** ********** *. ***
7. spacer 4.13|2818906|35|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033461 (Brevibacillus laterosporus strain 1821L plasmid p1821L01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
aaagtattt---aaaatagagaggtgataaatgatgag CRISPR spacer
---ctatatcgaaaagtagaaaggtgataaatgatgaa Protospacer
*** * ***.****.****************.
8. spacer 4.14|2818971|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022092 (Staphylococcus saprophyticus strain FDAARGOS_355 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
-aactatattaatttcatcatcttttaaatcaatgta CRISPR spacer taaagat-ttaatttcttcatcatttaaatcaattct Protospacer ** ** ******** ***** *********** .
9. spacer 4.14|2818971|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035295 (Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus ATCC 15305 = NCTC 7292 strain ATCC 15305 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
-aactatattaatttcatcatcttttaaatcaatgta CRISPR spacer taaagat-ttaatttcttcatcatttaaatcaattct Protospacer ** ** ******** ***** *********** .
10. spacer 4.14|2818971|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_013378 (Staphylococcus epidermidis plasmid SAP105B, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
-aactatattaatttcatcatcttttaaatcaatgta CRISPR spacer taaagat-ttaatttcttcatcatttaaatcaattct Protospacer ** ** ******** ***** *********** .
11. spacer 4.15|2819037|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to AP014229 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C90-MedDCM-OCT-S34-C72, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cgaaaactgataatccaagtgaccctgctccttc CRISPR spacer ccgaaactgataattcaagtgaccttggttcagc Protospacer * .***********.*********.** *.* *
12. spacer 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MK764441 (Flavobacterium phage FPSV-F12, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
atttagaaatagataaaactcaagagaatagaat CRISPR spacer atttagaaatggaaaaaactcaagcacaaaacat Protospacer **********.** ********** . * *. **
13. spacer 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to KU599886 (Flavobacterium phage Fpv20, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
atttagaaatagataaaactcaagagaatagaat CRISPR spacer atttagaaatggaaaaaactcaagcacaaaacat Protospacer **********.** ********** . * *. **
14. spacer 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_031931 (Flavobacterium phage Fpv2, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
atttagaaatagataaaactcaagagaatagaat CRISPR spacer atttagaaatggaaaaaactcaagcacaaaacat Protospacer **********.** ********** . * *. **
15. spacer 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to KT876726 (Flavobacterium phage FpV21, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
atttagaaatagataaaactcaagagaatagaat CRISPR spacer atttagaaatggaaaaaactcaagcacaaaacat Protospacer **********.** ********** . * *. **
16. spacer 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to KU599877 (Flavobacterium phage Fpv1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
atttagaaatagataaaactcaagagaatagaat CRISPR spacer atttagaaatggaaaaaactcaagcacaaaacat Protospacer **********.** ********** . * *. **
17. spacer 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MK764449 (Flavobacterium phage FPSV-S29, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
atttagaaatagataaaactcaagagaatagaat CRISPR spacer atttagaaatggaaaaaactcaagcacaaaacat Protospacer **********.** ********** . * *. **
18. spacer 4.30|2820015|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MK268686 (Enterococcus phage vB_EfaH_EF1TV, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
ggttaatcctaaatcaattgcccattgttccatcaa CRISPR spacer tttaaatgctaaatcaattacccattgttccatttc Protospacer * *** ***********.*************.
19. spacer 4.30|2820015|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MK721192 (Enterococcus phage vB_EfaM_Ef2.3, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
ggttaatcctaaatcaattgcccattgttccatcaa CRISPR spacer tttaaatgctaaatcaattacccattgttccatttc Protospacer * *** ***********.*************.
20. spacer 4.30|2820015|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to CAJDJZ010000002 (Enterococcus phage vB_EfaH_149 genome assembly, contig: phage149-genome, whole genome shotgun sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
ggttaatcctaaatcaattgcccattgttccatcaa CRISPR spacer tttaaatgctaaatcaattacccattgttccatttc Protospacer * *** ***********.*************.
21. spacer 4.30|2820015|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to AP018714 (Enterococcus phage phiEF17H DNA, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
ggttaatcctaaatcaattgcccattgttccatcaa CRISPR spacer tttaaatgctaaatcaattacccattgttccatttc Protospacer * *** ***********.*************.
22. spacer 4.30|2820015|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MK693030 (Enterococcus phage vB_EfaM_Ef2.1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
ggttaatcctaaatcaattgcccattgttccatcaa CRISPR spacer tttaaatgctaaatcaattacccattgttccatttc Protospacer * *** ***********.*************.
23. spacer 4.30|2820015|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to CAJDJY010000002 (Enterococcus phage 156 genome assembly, contig: phage156-genome, whole genome shotgun sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
ggttaatcctaaatcaattgcccattgttccatcaa CRISPR spacer tttaaatgctaaatcaattacccattgttccatttc Protospacer * *** ***********.*************.
24. spacer 4.30|2820015|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MN854830 (Enterococcus phage PBEF129, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
ggttaatcctaaatcaattgcccattgttccatcaa CRISPR spacer tttaaatgctaaatcaattacccattgttccatttc Protospacer * *** ***********.*************.
25. spacer 4.30|2820015|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to LR031359 (Enterococcus phage 156, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
ggttaatcctaaatcaattgcccattgttccatcaa CRISPR spacer tttaaatgctaaatcaattacccattgttccatttc Protospacer * *** ***********.*************.
26. spacer 4.30|2820015|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to KJ801817 (Enterococcus phage ECP3, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
ggttaatcctaaatcaattgcccattgttccatcaa CRISPR spacer tttaaatgctaaatcaattacccattgttccatttc Protospacer * *** ***********.*************.
27. spacer 3.7|2252874|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP041064 (Bacillus megaterium strain KNU-01 plasmid pKNU_01_1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
gaaactttttcttttttatttttagatttaacgct CRISPR spacer aatgctttcacttttttatttttagatttcaatcc Protospacer .* .****. ******************* * *.
28. spacer 3.7|2252874|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032530 (Bacillus megaterium NCT-2 plasmid pNCT2_2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
gaaactttttcttttttatttttagatttaacgct CRISPR spacer aatgctttcacttttttatttttagatttcaatcc Protospacer .* .****. ******************* * *.
29. spacer 3.7|2252874|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP041518 (Bacillus aryabhattai strain KNU10 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
gaaactttttcttttttatttttagatttaacgct CRISPR spacer aatgctttcacttttttatttttagatttcaatcc Protospacer .* .****. ******************* * *.
30. spacer 3.7|2252874|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP018876 (Bacillus megaterium strain JX285 plasmid 3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.743
gaaactttttcttttttatttttagatttaacgct CRISPR spacer aatgctttcacttttttatttttagatttcaatcc Protospacer .* .****. ******************* * *.
31. spacer 3.11|2253136|36|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT774386 (CrAssphage cr110_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ttaaataattattagaattagatatactactagttg CRISPR spacer ttaaataattattaaaattagatataagaaagcccg Protospacer **************.*********** * . ..*
32. spacer 3.11|2253136|36|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MT774383 (CrAssphage cr11_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
ttaaataattattagaattagatatactactagttg CRISPR spacer ttaaataattattaaaattagatataagaaagcccg Protospacer **************.*********** * . ..*
33. spacer 4.22|2819492|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014570 (Campylobacter fetus subsp. venerealis strain 01/165 plasmid mp2, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
gcaaatttaatttaaggaggaaattattattatgtt CRISPR spacer tcaaatttaatttaaggagaaaattatgttgaaaag Protospacer ******************.******* * * .
34. spacer 4.22|2819492|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to KU878088 (Bacillus phage AR9, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
gcaaatttaatttaaggaggaaattattattatgtt CRISPR spacer cttcatcttctttaaggaaaaaattattattatgtt Protospacer . **.* ********..****************
35. spacer 4.22|2819492|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MF360957 (Bacillus virus PBS1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
gcaaatttaatttaaggaggaaattattattatgtt CRISPR spacer cttcatcttctttaaggaaaaaattattattatgtt Protospacer . **.* ********..****************
36. spacer 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MN693756 (Marine virus AFVG_250M718, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
atttagaaat---agataaaactcaagagaatagaat CRISPR spacer ---taatgactgaagataaaacaaaagagaatagaat Protospacer **. .*. ********* *************
37. spacer 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MN694439 (Marine virus AFVG_250M296, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
atttagaaat---agataaaactcaagagaatagaat CRISPR spacer ---taatgactgaagataaaacaaaagagaatagaat Protospacer **. .*. ********* *************
38. spacer 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MN693803 (Marine virus AFVG_250M716, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
atttagaaat---agataaaactcaagagaatagaat CRISPR spacer ---taatgactgaagataaaacaaaagagaatagaat Protospacer **. .*. ********* *************
39. spacer 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MN694282 (Marine virus AFVG_250M297, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
atttagaaat---agataaaactcaagagaatagaat CRISPR spacer ---taatgactgaagataaaacaaaagagaatagaat Protospacer **. .*. ********* *************
40. spacer 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MT701588 (Klebsiella phage Metamorpho, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
atttagaaatagataaaactcaagagaatagaat CRISPR spacer attcagaaatagataaacctcaagcagatgataa Protospacer ***.************* ****** ..**.. *
41. spacer 4.26|2819754|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MN694541 (Marine virus AFVG_250M717, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
atttagaaat---agataaaactcaagagaatagaat CRISPR spacer ---taatgactgaagataaaacaaaagagaatagaat Protospacer **. .*. ********* *************
42. spacer 8.1|4733477|30|NZ_CP016089|CRISPRCasFinder matches to NC_010105 (Enterobacteria phage JS98, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gggcaaacaataatggaacttggtattacc CRISPR spacer aagcaaacaataatggaatttcgtaccttt Protospacer ..****************.** ***.. ..
43. spacer 8.1|4733477|30|NZ_CP016089|CRISPRCasFinder matches to MH791409 (UNVERIFIED: Escherichia phage EcWhh-1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gggcaaacaataatggaacttggtattacc CRISPR spacer aagcaaacaataatggaatttcgtaccttt Protospacer ..****************.** ***.. ..
44. spacer 8.1|4733477|30|NZ_CP016089|CRISPRCasFinder matches to NC_012741 (Enterobacteria phage JS10, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gggcaaacaataatggaacttggtattacc CRISPR spacer aagcaaacaataatggaatttcgtaccttt Protospacer ..****************.** ***.. ..
45. spacer 8.1|4733477|30|NZ_CP016089|CRISPRCasFinder matches to MK310184 (Phage NC-G, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gggcaaacaataatggaacttggtattacc CRISPR spacer aagcaaacaataatggaatttcgtaccttt Protospacer ..****************.** ***.. ..
46. spacer 8.1|4733477|30|NZ_CP016089|CRISPRCasFinder matches to EU863409 (Enterobacteria phage JS10, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gggcaaacaataatggaacttggtattacc CRISPR spacer aagcaaacaataatggaatttcgtaccttt Protospacer ..****************.** ***.. ..
47. spacer 3.7|2252874|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KF751797 (Campylobacter phage CJIE4-5, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gaaactttttcttttttatttttagatttaacgct CRISPR spacer tttattttttgtattttatttttagatttaaactc Protospacer *.***** * ****************** ..
48. spacer 3.7|2252874|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KF751794 (Campylobacter phage CJIE4-2, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gaaactttttcttttttatttttagatttaacgct CRISPR spacer tttattttttgtattttatttttagatttaaactc Protospacer *.***** * ****************** ..
49. spacer 3.7|2252874|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KF751795 (Campylobacter phage CJIE4-3, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gaaactttttcttttttatttttagatttaacgct CRISPR spacer tttattttttgtattttatttttagatttaaactc Protospacer *.***** * ****************** ..
50. spacer 3.7|2252874|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KF751796 (Campylobacter phage CJIE4-4, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gaaactttttcttttttatttttagatttaacgct CRISPR spacer tttattttttgtattttatttttagatttaaactc Protospacer *.***** * ****************** ..
51. spacer 3.7|2252874|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KF751793 (Campylobacter phage CJIE4-1, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
gaaactttttcttttttatttttagatttaacgct CRISPR spacer tttattttttgtattttatttttagatttaaactc Protospacer *.***** * ****************** ..
52. spacer 4.8|2818580|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to AP014235 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C93-MedDCM-OCT-S38-C9, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
tttgatttgttttagtcttcttttttttatacaa CRISPR spacer aatgatttctttttgtcttcttttttcttttgtc Protospacer ****** **** ************.* *
53. spacer 4.14|2818971|36|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to EF506570 (Spiroplasma kunkelii virus SkV1_CR2-3x, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
aactatattaatttcatcatcttttaaatcaatgta- CRISPR spacer tttattaataatttcatcattttttaaatc-acgcac Protospacer . ** ************.********* *.*.*
54. spacer 4.17|2819166|35|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NC_018878 (Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_502p, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
ccaacagttaatttttccatcttgaccttttatat CRISPR spacer ctttcctacaatttttccatcttcagcttttatac Protospacer *. * .************** * ********.
55. spacer 4.17|2819166|35|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to MN693272 (Marine virus AFVG_25M206, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714
ccaacagttaatttttccatcttgaccttttatat CRISPR spacer ttgatacagaatttttccaccttgaccttgtataa Protospacer ...*.* **********.********* ****
56. spacer 4.8|2818580|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_LR214952 (Mycoplasma neurolyticum strain NCTC10166 plasmid 2) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
tttgatttgttttagtcttcttttttttatacaa CRISPR spacer acctatttgttttagtcttttttcttttgttttt Protospacer .. ***************.***.****.* .
57. spacer 4.8|2818580|34|NZ_CP016089|CRT,PILER-CR,CRISPRCasFinder matches to NZ_LR214954 (Mycoplasma neurolyticum strain NCTC10166 plasmid 4) position: , mismatch: 11, identity: 0.676
tttgatttgttttagtcttcttttttttatacaa CRISPR spacer acctatttgttttagtcttttttcttttgttttt Protospacer .. ***************.***.****.* .
58. spacer 1.1|148480|40|NZ_CP016089|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035512 (Haematobacter massiliensis strain OT1 plasmid pOT1-2, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.7
caggttcaagtcctgtctccgcaaccattatatataaaat CRISPR spacer caggttcaaatcctgtccccgcaaccatctttacttgctc Protospacer *********.*******.**********. * * . .
59. spacer 3.7|2252874|35|NZ_CP016089|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP053469 (Fusobacterium nucleatum strain Fn12230 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 12, identity: 0.657
gaaactttttcttttttatttttagatttaacgct CRISPR spacer
tcttctttttcttttttattttaatatttcttttc Protospacer
****************** * **** . ..
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
416380 : 497790
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP016089|416380:497790|DBSCAN-SWA AATGGAATTTGAATCAGTCATAGGATTAGAGGTTCATGCAGAGCTTTTAACTAAAACAAAAATATATTGTGGTTGTACAACTGAATTCGGAGGAAAAGCAAATACTCACGTTTGTCCAATATGTTTAGGACTACCAGGATCCCTACCACAATTAAACAAACAAGTAGTTGAACTTGGAATTAAAGCGGGTTTAGCATTAAACTGTGAAATAACTAAAGTAGGAAGAATGGATAGAAAAAATTATTTCTACCCAGATTGTCCTAAGAATTATCAAATAACTCAAGATGAATTACCATTATGCAGAAATGGATATATTGATATTGAGCTTGAAAGTGGAGAAATTAAGAGAATAGGAATCGAAAGAATTCATATAGAAGAAGATGCAGGTAAGTTACTGCATACTAAGAGAGGAACTTTAGTTGACTTTAATAGAGCTGGAGTACCTTTAATAGAAGTAGTATCAAAGCCAGATATAAGAACTTCTGAAGAAGCAACATTATATCTTACAAAGCTTAAGAGTATCTTATCTTCATGTAAAGTATCTGACTGTAAGATGGAAGAGGGATCTTTAAGATGTGATGCCAATATATCAATAAGAGAAAAAGGAACAGAACCTTTTGGTATAAGATCAGAAATTAAGAATATGAATTCATTTAAAGCAGTAGAAAAAGCTTTACACTATGAATTTGAAAGACAAGTTAAAGCTGTAACTGCTGGAGAAAAATTGACTGTTGAAACTAGAAGATGGGATGAAACTAACAATGAAACTACAGTTATGAGAAGCAAAGAAGAAGCAAATGACTATAGATATTTCCCAGAAGGTGATTTAGTTACACTTAATATTTCTGATGAATGGATTGAAAATGTTAGAAAGACAATTCCAGAATTACCACATGAAAAAGAAGCTAGATTTATTAAAGAATATGAATTACCTAAATACGATGCTCATGTTTTAACTTTAACAGATAGCATGGCTGAGTTCTTCGATGAAGCAGCTAAGCTTTCAAAGGATCCAAAAGCAGCTTCAAACTGGATAATGGGAGACTTATCAAGACTTATGAATGTTGAAGGTACATGGGTTGAAGATCTTAAGTTTGCTCCAAATGGTATAGCGGAATTAATAGAAGTAATTAAAGATGGAACTATTTCATCAGCAATAGGAAAACAAGTTCTAGAAGCTATGTTTGAAAGCGGGAAATTACCTAAGGCAATCATAGAAGAAAAAGGTTTAAAGCAAAATAATGATGAAGGTGCTATTCTTGAAATAGTTAATAAAGTTCTTGATGAAAATCCACAAGTTATTGAACAATATAAGAGTGGAAAAACAAGAATTCTTGGATTTGCTGTAGGCCAAGTAATGAAGGCAACAAAAGGTCAAGCAAACCCTGGTATAGTTAATCAGTTAGTTGAACAAGAAGTAGCTAAGAGATAATTAATAATATATAAAAGAGCTATCTAAAATCAATTTTTAAGAATTTAATTTTAGATAGCTCTCTTTTTATTTGAAAATTTCTTTCCTATTAAGACGGTGCAATTAAAAAAATACAAGTTCATTTACCAGCCTGTTTTCAATGAGAGAAAGCTCCACCAGCATACCACTCACAGCGTGCTGTCTGAGTAAGCGACCGTCATCAATCATAGATTTAGACACTTATTTGCTCATAGGCAGATTGATTTAATATATCTGCTATGAGACAAATATATCTTCTTGTCTGATGAAAAATATTTATGACAGATTGGAGTCGTTATTTTCTTTCATGTGCTTAAAGTCAGTAACTTTGTTATCTCTGTTTTCATGATCATTAATATCCAAGATATCTTCTTCACCAGTTAAATAAGCATAATCATTATTTGTATCATCGCAGTTAGAAATATTATCAGAAATTGATGAAAGCTTCTGATGCATTTTTTCTAATATATAATTTTGGTAACGTATTTGACGATAGTTTTTAATATGTACTATAAAGCTCCATATTCCTATAAACATAAATGTGCACATAAATAATATTCCGACTATTAGAAATGCACCAATTAAAAAATTCATCTATAAAACCTCCTTAAAAGATAACTACATTATAGCATAAGAAAAAATATATGATTGTAGTTTGTTTAAATATTAGGCACATTCAAAAAAATAACAAGTCCATCTGTCAAGCCTATTTTGCGTGAGAGGAAGCTCGATTCGCATGCGCTCACTGAGTAAGCGATTTACACCAAATCATTTTTATATGAGGTTAAATCATAAATGAGTTAACTAAGTTGAAGAAACCAAATCATAGATTTGGACTTTCGCTTATCTGCTCATCAGCGGATTTCTCTAATAGCCCGCTATGAGACAAATCCACTTCCTTGCCTGATGCAAAATAATCATGGCATTTTGGACTTGTTATTTTCTTTCATGTGCCTTAATTGATTTGATAGCAATTGAGCTATTAGTATTATTCATAGCTTACCTAAATATTAATTACTTTCATTAACAAATTATGCTCAAGAATTTTAAATTTTATTAATTAAAAATTAAATACTGAGGCACAATCACAAAATAATAAATCTACATATCGGGTTATTTCCCATAGGGGGAAGCTCCACTCAAATGTGCTAATTAAGTAGGCGATTCACACTGAATTATTTTTATATAAGGGCTAGCTCATAAATGAGTTAAATAAGTTCAAGAAACCAAATCATAGATTTATTTCGTTTATCTGATCATCGGTAAAAGACCATGATAGATTGCTATGATGATACTTTGCTTCAGTGGCTGATGCAAAAAAGTTATGGTATTTTGGACTTATTGTTTATTTTTATGTTACTAATGTTTATAAATAGTAATTTTTGTTAATAATTATAACAGAAATTATAGCGAAAGGTGTAATTATGAAAAGATATATTTTTCTTATAGTTATGTTGCTTCTTACAGTCATATTTTGTTTTAGTTTTATAGGCAAAGATACTAGTAAGGCATCTGATATTAACTCTGAGCAATCACTAATTTATGGTGTTGATGATATTTCAACTGATTTGAGAAGTGTAACAAATTTATCTAAGCGACAAGAAGATATTATATGTGCATTAAGTAAAGGATTAGTTAGTAAAAATGCACAGAATAAAATAGTGCCTTCTTTGGCTAGTGATATTAAAGAGGATTCTGAAGGAATACAATATGAATTTAAAATTAGAGATGATGTATTTTGGAGTGATGGGAGCAAAATAACTCCTAATGATATAGTTGAATTTTTTAAAGAATTATTAAAAGAAGAAGATGAAGAAAATATTAAAGCATTACTTGATGTATATGGAGCGAAAGATTTTAAAGCAGGGAAAACAACATTTGAAAAAGGTGTTGCTATAAGTGCTACAAATGATGCTGTGATAATTAGATTAAATACAAAAAATAATAATTTTTTAAGTGAATTAACTAAACCACAATATAGAGTTAGAAAGTACTTGATAATGTGGGGAAACATGAAAAATAATTATAAAAAATTGATTTATTCAGGAGACTTTAGTATTGATTCTATTAATGATGACAGTATGGTGTTAAAGAAAAATCAAAATAGTTCAGATGATATTATATCGAATATAAATATACTTAAAGATGAAAATGTAGAATTATCAATGGCATGTTATGAAGTTAACCAAAGAGACATTGTTATAGATCCTCCTGAAACTGAGCTTAGTAAATTGGATGAGGAAGGTAAATTAATAACAGAACCTAAAATTGATGCAACATATCTATATATTAGTAATAAAGAAAATCTTCCTGTTCAAGCAAGAAGAGAGATATATAATGATGTATGTAAGGCTGTTGCATCATATAAGAATACTAATAATAAAACTTTTGAATTGGCAGAAGGAAGTTATTTTAGAGAGGATAAGGAAAACCTAACCAAGGTGCAGGCTAGAAAAGTTAGTAGTAATAAAATTGGAACTTGGAAAAAGCCTGATATATTAACAATACTAGGTGAAGACAATGATAAAAACAGAAGTATGTGTAGAATTATTCAGGATTGGTTTAAAAATAATACTAATATAACTATTAAGTATAGTCTTGTAAAAGAATCAGAATTTAAGGATGATGAGCTAAGAAATAGATATGATATGGTATTGATAAATAATGATGCCGATATATTAAACAAAGCAACATTTTATTCATCATTTCAAAGTTATTTAACAGGTGATCAAGTTAAGCTATTAAAAAAGGCAGGAGATGACAAAAAAAACGATAGTTATGGAGAATTAGAAGAAAGTTTATTTAATGATTATGATATACTGCCATTGGTTTTTTATAACGAAAATATAGCTATTTCAAGCAAAGTATCTCAGCTTAATCTAGATGGAAATGGCAATATAGATTTTACGACGATTAAATAAAATTTGTATTTGAATATAACTTTAGAGTGTAATGATATCTTTAAAATATAAAATGTTAGATATAAGGTTGTAGCTTTTTAAATTCACTATAACCTTATTTGGGGTTATTTTAAATATATTTAGTAGTAGAAAGTAAGGGTACTCTTTTGCGTAGTAATCGAGCAAAAGAGTACCCTTACTTTTGGTAATTTACCATACGACTTTATTTTTTCTTCTTTTTAGATGGGTGCTGAGCTTTATTTTTTTTGAATTTTTTCTTAGGAATGTTAGTTGTTTTATTATTAGAAACAGTTTTGCATGATTCTTTTAAATTATTTGAATTTGATTTTGTATTTTTTTCTAAATCACAACTAGAATCTGATTTAGATTCTAAATTAGAGACAGAAATTTTAGGTTTATCACATAAATTTTTTTGGGGGGATATAGTATTTATTGATGTACTGGATAATGATGAATTGGATACGATGTTTGCTGAGTTATCTAAATTAGGAAGTTCATTTGGCTCAGGAGATAAATTATCTTCAATTTTAGTATCTTCAATAATTTCTGTATCATTATGCTCTTTTGATAAGTTAGAACATGTAAAATTCATAACTTCTTCAACACTGTCTTTAAAAAGATGAATAATT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60 | Clostridium_phage(13.33%) | tRNA,protease,integrase,coat,transposase | attL 425408:425467|attR 470663:470744 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
685595 : 698862
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP016089|685595:698862|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP016089|685595:698862|688090_688633_+|WP_022743956.1|transposase|DBSCAN-SWA MMKEKITVKDILKDNYNDFKNKYWDKVPKYMRKHIDEAVSKSLKCSDIKYGFAEYKCEICGESTKVPFTCKSKFCNRCGRLYTMKWAEKQRQTMLRVVHGHSVFTLPKELRNYFYSKRELLKELQEGVNEVIKYWYNKKKGSNYEVGVIAVIHTFGGDLKWNPHVHALVTEGAVDKKTKR >NZ_CP016089|685595:698862|697269_698862_+|WP_022743966.1|DBSCAN-SWA MSIILSKSSYVLGIDLGTSTTIASVFTKGKSRIIKIDSNDYIPSVVSFLNDDTKLVGMQAKGRMMIDPVNTVASIKRHMGEDSYKVKINDKEYSPEEISAEILKKIVEAAKEQDNFEPLGEIANAVICIPANFTDNAKQATLKAAELANLNVLYLLEEPVAAAIMYGFNATKSQKILVYDLGGGTFDVCILDANTSESGNANYDILAKEGINQLGGDDFDQKLMEMINTKFLEENNIDILDTTKDQGISKKKIKQAIQKLKEAAEKAKIELSENDATNVLIPNIIQNEEGDLLSVDVEITKEEFNAAIDPLIDKTEETVKCALENAKLTVEDIDKIILVGGSTLVPRIKEKVKDIFGIEPYSNFNPRTIVSEGAAIFGATLSVPSDCVENNEVKPEGDINISQIVTHNLGIMISGMRFSKLIEKGIEIPKGQVISEEKEYSTQSDNQTELTLLIYQCDEDVEFINEKNVEGNDKAICIGEFKLSNIPSKPKGEEKIVVKFDVNEENIVNVTAKCISNGSESNVTLDVKRS >NZ_CP016089|685595:698862|694362_695661_+|WP_022743964.1|DBSCAN-SWA MEFIKGQKTKLEQLVSNMKITIKSDMNFIKDNIDLDMCCFGVDKDEKLSDDRYFIFYNQLTSPEESIKKFQDRNIFEIDIKLIPPTIKKIVLCATIDGQGTVKDVKNGSLRLMDGEREVGQLKIEGKDYTSEKSIILAEIYERDGIWRLGIVASGFNGGLGDILRNYGGEEIEESELTNLDESVHTKQEDLGKNIYLEKKDRVQKLVLEKAPHLIDLTKKVTITLEKKHMEQTTASVVVILDNSGSMDWQYRNGDIQRTMDKLLPVALMFDDNGELDTWAFASKTKHLSPITLDNIKNYLNEESKGWKKWHIGWGNDEPKVMSELINQYMYNHLPVYVIFLSDGGIYETRKIKKLLIESSNYPIFWQFMGVGGSNYGILEELDEMEGRIVDNANFFSIDNINSLSDEALYEKLLNEFPIWLKEASSKGIIKK >NZ_CP016089|685595:698862|691463_692060_+|WP_022743959.1|DBSCAN-SWA MSINLVKGQKIDLTKNNSTLKKLIVGLGWDPVKQEKKGFFNLGSSKPDVDVDASVLMLRNNRFISKEDLIYFGNLKSKCGGVIHAGDNLTGDGDGDDEQILVDLSKIPHDVNKLIFVTNIYQCIERKQSFGMIENAFIRIADYNNNQNIAMFNLTEDYNGKTALIIGEVYRHNNEWKFAAIGEGTQDTCLGDMAEKYR >NZ_CP016089|685595:698862|689323_690691_+|WP_022743957.1|DBSCAN-SWA MTVTLSKGQKVDLTKKNPNLNNVIVGIGWDVNQNSRGYSFDLDASAFLLNSFNKVNNEDDFIFYNNPNGGQGTIIHSGDNKTGVGSGDDEQIKINLGLVPSNIEKIAFTITINDAKERNQNFGQISNSYIRIIDADTSEVILRYDLGRDFSIETAIVVAELYRYNNEWKFNAVGSGFQGGLAALCNMFGIEVEEEQSNNSYPSAPVYSQNPIVHTRYDQNQGYNPQTLDNNQQIYNSQLSNGNQQSEITCPYCHSTQVTAGKKGFGVGKAIVGGLLLGPVGLLGGLIGSKNIEFLCINCNKRWSASNNINSAQWLREQSNNAKNIVNRYLDNDFVEALVAGSALVAMADGVIEYSERERLINYFKTSQEMKHIDTNMVLSKFDCYTQKLQRDFMMGKAELLRIIAKMRTKLDAARFVVRLCCTIGLADGEFSNIEKQVIGEICKELNLNTSEFVY >NZ_CP016089|685595:698862|695719_697264_+|WP_022743965.1|DBSCAN-SWA MGIIVGIDLGTTNSAVACLRRGKVQIVQIDGKNTVPSVVALRNDEIIVGQQAKSRLLIDPKNSVASSKREIGKDVHYNLGGKIFTPEDVAVNILKTIKMKASEALGEEVEEAVVTVPAYFTSEQRQITKSAAERAGLKVLRLMPEPTAAALDYGIDQNKNQTLMVYDLGGGTFDISIMQVKGNNFEILAVDGDSRLGGDDFDQVICNLLYKQINKDLNISITLEKERKYISAVTKVKEAAEKAKIDLSDMDEVEVILPNLIDDYCLEKTITRNEFNELSKPLIDRTIEKMNMAMKSINYTEDDIDRVILVGGSTKMPIIRESVKNRIKEPYMAPNVDEVVARGAALMATSLATPDYQKKSGIDLLKKIVVKEKTVFTYGIDLLDRYNKLVFTPIIKKGSMLPALDGVIGATSRPYQERVLLNVFRGDNPVPNENEYLGELVLDINKPMQQEIPILALFEIDENMIIRFRSVQLPISQEYAELIGSNDIKRLKAYLDMGRLKATEVIIDAKENGR >NZ_CP016089|685595:698862|692090_692669_+|WP_022743960.1|DBSCAN-SWA MGIVLKKGQKVDLTKGNASLKKVIIGLGWDVNKYDGGNDFDLDAVAFCCGEDGKVHNEADMIFYNNLKHSSGAIEHLGDNLTGDGDGDDEQMLIDLSSIPQHINKIDFTVTIHEAEERKQNFGQVSNSYVRVVNSDTKEELIKYDLGEDFSIETAIVVAELYRNGSEWKFNAIGSAFEGGLAALCKNFGLNV >NZ_CP016089|685595:698862|694169_694343_+|WP_022743963.1|DBSCAN-SWA MGLGFRKNVNIIPGVKLNLSRSGHSISLNSKGMKYNISSRGTRITYSIFGTVIKKIF >NZ_CP016089|685595:698862|685595_686951_+|WP_022743953.1|DBSCAN-SWA MKRGSDLTVKIEKLQFPSTGIGYAEDKIIYVKNAFPGQTITGRVKKKREEYAEVKLLSVDEKADYEIEAPCPHFGVCGGCSSQSLPYEKQLEFLSEEVQALFKEADVKAGEYLGILGSPSQWEYRNKMEFTFGDEAKGAPLSLGMHMRGKSFGIKTVDQCKLVDEDYRKIIKLTSDYFGEKDLPYYRIMKAEGYLRHLVIRKAQNTGELLVNLVTTTQIDFDLTEYVKLLREQSYKGNLVSIIHTENDSKSDAVIPEKVNILYGKDYIRETLLGLEFNISPFSFFQTNTKGAESLYSMVREFMGDSENKVVFDLYCGTGTIGQIVAPKAKKVVGIELIEEAVEAAKENAKLNGLNNCEFLAGDVAEIIKQVKDKPDIIILDPPRSGVHPKALDYVIKFKAPEIIYVSCNPKTLVNDLKVLVEKGYKVVQTKVKDMFPNTPHAETVVKLIKK >NZ_CP016089|685595:698862|693563_694160_+|WP_022743962.1|DBSCAN-SWA MSIVLEKGSKINLSKENRQLGKININLNWNSGTQKGIFSSLFGSKAIDLDLGCLYELKDGKIGTVQALGNSFGSFDRAPYIFLDGDDRTGTNADGENLFINGNQIKDIKRILVYTFIYKGAASWKEANGKVCINVPGQEEILINMDEYNNKYIMCALAMIENVNDNNFSVEKLVRFFDGHKSMDKEYNWGLKWVAGRK >NZ_CP016089|685595:698862|690841_691420_+|WP_022743958.1|DBSCAN-SWA MGIVLKKGQKIDLTKGNASLKKILIGLGWDTNKYDGGYDFDLDAAAFCCGEDGMVHNDLDFIFYNNLKHSSGAIEHLGDNLTGDGDGNDEEIIIDLSLIPQNISRINFTVTIHEPEERKQNFGQVSNAYVRVVNSDNSQELLKYDLGEDFSIETAIVVAEIYRYNEEWKFNAIGSGFQGGLAALCRNFGLNV >NZ_CP016089|685595:698862|692731_693454_+|WP_022743961.1|DBSCAN-SWA MLQSIIDNYSQFFSLANFEGVFTVTGISTILLLILLEGLLSADNALVLAMMVKHLPEKQQKKALMYGIWGAYIFRFLVIGVGTYLIKFTWIKAIGALYLLYMAYKGLFGGGEEDPDISKIVKKGLWATVASVELMDIVFSIDSVTAALAVSDKVWVLFLGAIFGILMMRGVAQIFVVLIEKVPELEKTAYILIALIGLKLGVTLVGIEVPDLLFFSVLIIVFLGTFVVSKFNKRNESTTA |
12 | Caulobacter_phage(44.44%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
956776 : 1017681
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP016089|956776:1017681|DBSCAN-SWA 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51 | Erysipelothrix_phage(30.77%) | holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1466870 : 1476876
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP016089|1466870:1476876|DBSCAN-SWA 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ACATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP016089|1466870:1476876|1474747_1475359_+|WP_022744586.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLASGGGTDLQSVIDAVESKYINAKIEMVIGSKEGIYALERAKKHNIDTFVVSRKEYKEKSSDKILELTKGKVDLIVLAGFLSILDGKILKEFEGKIINIHPSLIPSFCGPNMYGLKVHEAVIKSGVKFSGCTVHFVNSEVDGGAIILQEAVPVYFEDDAETLQKRILEKEHIILPKAIKLLSEGKVKVSDGRVKIEE >NZ_CP016089|1466870:1476876|1472318_1473749_+|WP_022744584.1|DBSCAN-SWA MNNSNFELIMDPSNDKFKDECGVFGVYANNTIDVASMTYYGLYALQHRGQESAGIAVANGEKIDIHKGLGLITEAFKQEDLEKLKGRIAVGHVRYSTAGGKGIENAQPILVSSKMGPIAMAHNGTLVNADVIKELLEDGGQIFHTTTDSEVIACLIARSAKKGFAKAVIDAMSAVRGSFALTIMSKDKLIGARDPHGIRPLCLGKIEEGYVLASESCALDAIGAEYVRDIEPGEIVIIDEQGVNSYRYSENTKCQTCAFEYIYFARPDSKIDGLEVHTTRVKAGEQLFKEHPLDADVVIAVPDSGIPAAIGYAKASGIPYDTGFIKNRYVGRTFISPSQEIRERAVAVKLNPLKVNLEGKRVILIDDSIVRGTTSKHLIESLKRAGVKEVSFLIASPSVKYPCYFGIDTPYRSELVAANHTVEEIRDMIGADYLGYLSETGVYKSCEDREGFCMGCFNGVYPVATPIEEISKDLER >NZ_CP016089|1466870:1476876|1471253_1471961_+|WP_022744583.1|DBSCAN-SWA MEKLEMLYEGKAKKIYKTDKADEVIVYYKDDATAFNGEKKGQIEDKGVMNNEITSILFELLEKKGIKTHFIKKLSDREQLCKKVEIVPLEVIVRNVAAGSMAKRLGLEEGYKLKTTVFEFSYKDDELGDPLINSYHAVAIGAATFEEIDTILDMTAKINDVLKEVFAAQNINLIDFKIEFGRCSDGTIVLADEISPDTCRFWDATTGEKLDKDRFRRDLGNVKDAYVEILKRISK >NZ_CP016089|1466870:1476876|1470774_1471254_+|WP_022744582.1|DBSCAN-SWA MEVAIFFGSKSDTEVMKGAANALKEFGVTYKAFVLSAHRVPEKLEETLKEVEEAGCQVIIAGAGLAAHLPGVIASKTILPVIGVPVKAALEGVDALYSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVQMLSVNNKELKNKLKEFRINMKKKFIEDNAEGVEL >NZ_CP016089|1466870:1476876|1466870_1470617_+|WP_022744581.1|DBSCAN-SWA MLDIRSVFVEKKKGFNVEAQSLLNDFKENLGVIGLEDIRIVNKYIISDISEEYYKKALHTIFSEATVDIVYESKLPTNEGEVAFGVEYLPGQYDQRADSASECLALLTAKDKVEIKTAKIVVLKGNISQSDIEKIKSYYINPVDSREVDIDSKDLSSISNMPKDVLILEGFTKKALEELKDFHSEQGLAMSIDDLVMIQDYFKKEERDPSITEIKVIDTYWSDHCRHTTFSTILEDVQIENSVFTEPIKKSYEAYIKSREYVYEDKEKNKTLMDMAVIAMKELRKRGKLEDLDISEEINACSINVKVETNNGIEDYLVMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCLGGAIRDPLSGRTYVYQAMRVTGAADPTVPVKDTLKGKLPQRKITLGAAHGYSSYGNQIGLATGEVREVYHPNYAAKRMEVGAVIAAAPKENVVREEPVLGDVIILLGGRTGRDGVGGATGSSKEHTVDSINECGAEVQKGNAPTERKLQRLFRNSKVAKMIKRCNDFGAGGVSVAIGELCRGLDIDLDKVPKKYEGLDGTELAVSESQERMAVVVTKENADEFIRLSNEENLEANLVAHVTDTDRLRLFWRGKNIVDLKRTFLDTNGATQKTKVVVESPKAYPYTVAEINVKEEWINTLKNLNVSSQQGLSERFDATIGGGTVLMPFGGKYAKTPAEGMAAKIPVLGGESKDATIMTFGFNPNLGMWSPYHMAYYSVVESVTKLTAMGGDYRKARLTFQEYFEKLGVDPKRWGKPFAALLGAYEVQMELGIPAIGGKDSMSGSFGDLDVPPTLVSFAVGVEKAGKIISPEFKKNDSTLVLLQTEKLENGTIDIDKFKNNLETLYRLIQEEKVISASSIKFGGVAEAITKMTLGNRIGAEIENVTKEDLFGLNYGSLVVEVKNAVNVEETFKDCLYKVIGKTTASAQITSKQFDLNLNIEELENVYEEKLNKVFGIKTPDTGKKIETPLTEVKIWKLPKIKASKPKVVIPIFPGNNCEYDCARAFEKEGAEVSQVVFRNITKEALNESIDRLANEINSAQILMIPGGFSAGDEPDGSGKFIANALRNKKISNAVMKLLKNRDGLALGICNGFQALIKLGLVPYGEIVDIKEDMATLTYNNINRHMSSIIRTRVTSNKSPWFSEVKAGDIHSVAISHGEGRFVAPESLIKELIDNGQVATQYVDFDGNVSLDMPFNPNGSMYGIEGITSPDGRVLGKMAHSERIGENVYRNIPGDFDQKIFKAGVEYFK >NZ_CP016089|1466870:1476876|1475373_1476876_+|WP_022744587.1|DBSCAN-SWA MKKRALISVFDKDGVLDFAKFLVSKDVEIVSTGGTYKYLKENGLEVIEINEVTNFPEMLDGRVKTLHPLVHAGILAIRDNEEHMNTLKGRDIHTIDYVVVNLYPFFEKVKEDLEFEEKVEFIDIGGPTMLRAAAKNFQDVVVISDKNDYKVVMDEIESNGETSLKTKKRLAGKVFNLMSAYDGAISNFLLDDEEYPEYLSVSYRKMQGLRYGENSHQSAAVYSSTMRDGAMNTFETLNGKELSYNNFKDVDIAWKCANEFDEPSCCALKHNTPCGVAVGTHSYEAYMKAYEVDPTSIFGGIVAFNRKVDKKTAEEMVKIFLEVIAAPEYDEDALEVLKTKKNLRVLKFNNTPKADKYMVTVDGAMLVQEEDNKLIEEIKVVTESKPTDEEMKDLLFGMKVVKYVKSNAIVVAHNGIALGIGGGQVNRIWPTEDALRRGKGATILASDAFFPFRDVVDQAAQYGIKAIIQPGGSMRDQESIDACNEHGIAMVFTGYRHFKH >NZ_CP016089|1466870:1476876|1473758_1474760_+|WP_022744585.1|DBSCAN-SWA MITYKEAGVNIEEGYRSVKLIKEYAARTMSEYVLNGLGSFAGMVELPEGYKKPVLVSGTDGVGTKLEIAFKNKKYDTVGIDCVAMCVNDILCHGAKPLFFLDYIACGKLEAEVASDLVKGIADGCLDSDCALIGGETAEMPGFYDEGEYDMAGFAVGIVDKDKIINGSNIKEGDKLIGIASSGIHSNGYSLVRKVFPDLNEDFNGEPVWKTLLTPTKIYVKPILKLLENFDIKGMAHVTGGGFIENVPRMFNGADFTAVINKDSYPLPAIFERIVEKGVDKDHMYNTFNMGIGFVLAVEEKDVESIKKALVEMGEKAYEIGYVTSGGEGVCLK |
7 | Prochlorococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
2597580 : 2605099
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP016089|2597580:2605099|DBSCAN-SWA CTTAATTATTTCCTATATAGTCTGCATTTAAGTAAAGATCAGCTTCACTATCTCTTCTCTTTTTTAACCCGTCCCAAACTACCCCATTGCATTTATCCCATGCTTCAAAGTTACTTCTTATAGTTGCTTCATCTGTTACGCCATTTAATATATTTTTAAACAATGTACTGTCAACCAAACCACAAGCTCCGATATTATATGCCATTGAAATTAAGGCGTCTATTTGATTTTGTGCTAAAGTTATATTATTAGCATCTAGTTTCCCCTTTATAGCTTCATAACATGAAGAACATTCTTGCTCTAACCATTTATAAGCTTGTTCTTTCGTACAACTTGTAATTCCACTAGCGTATAATTGTTTGCCTAATGTTCCAGAAGTGGCAGTTCCTATACCTATAGTCCAATATCCATCTCCTACATCTTCCCAAGTACTTGAAAACCCTTCCCAAGAAGAAACAAATTCAGCACCTTTATCAGACAATGCTTTATTCTCAATTAAATGTCCATCTTTATCAAATGCATATGTTTTTCCATCTATTATTGAAGTACAATCTATATAGCAACTCCCCATATAACCATTACTATTTGGTTCTAAGTAATACCAAATTCCTTTTAATTGTATCCATCCTGTTTGCATTGCTCCTGTAGTTTCATCTAAGTAATACCATCTTTTATCTGTATCTTGAATCCACCCTGTTTGCATTATTCCTTGATCATTTAGATAATACCAAGCTCCATTGTCTTCGTACCATCCTTTCATTACTTTTCCATCTAAACCTTCTACACACCATTTCCATTGTGGCATATAATCAACTCCTTTAAATATAAAAAATAAGAGTAACCCTAATAGGCTACTCTAAAATTAAGCTTGTACTGTTTCTCCTTCTGTATTGGCAGCTTCTTGCGTTACTGATACTGTAGTTTGAATTTGCGAGATTTTATTTTTAAGTTCTGCATTTTCTGTTAATAAATTAGCATTAGTATCTTGTAATTGCTTTAATAAATCTGAATTACTTATAAGCGCTTCTTTATCTTTGTTTACTGCTCCTGCAACCGCTTGTCTAAAATACATAACATCTTCTTCAGTTAACTCCGGAAACTTAGTAATTAATAATTTATTAAATTCTTCAGCTTTACTCTTTAATTTATCGTCAGCTTTCTCTGTGATCCTAAACTTCTCATCTACTATGCCCCATACTTCTTTAGCTGCTGCCATATATGTTTTATTCTTTAATATTCTTATTACCAATCCTAAAATTGTTTTTATCATTTTACATCATCCTTTTAATTTTATTTATTGAATATTCCAGTTTGAACTGCATAAAAAAAGAAGCTTATCAAAGCCCCTACCAATGTTGCTATAAACCACTTCATCATACTAGTTAATGATTTTAGATTTTCACATAAGTTCTTAAGTTCTGTCTTTAGTTCTCTTCCATCCTGCTCAAGTTTATCAAGTCTCTCGCTATGATTGTTAAGTCTTCTTTCATGTGTATCTAGTTTATCCTTTACTAATTCATCATTCATATTTCACCTTCCTTATTTCAAATTTTTGTATAACAAAAGACACCTACATTTCTGCAAGTGCCCTAAATAACTATTTATATCGTATTATCTTACTTAAAACCAATTTATTTTATATCTAAAGAACTACATTTACAGGTACTTTAATTGTAACTGTTCCTGAAGGTGGAATATCACCAACATTAACTACAATATTTGAAGGTGTTGAAGTTGAATCAACTGTACCTTGAGTTGTTGTTATTCCACTAGGTATAAATTGAATATGATTTGGAGCGGTATCATTTACAACTACTGCCTTTGCTGTTTTTGAACCAGTGTTAGTAACTACTATAGTATAAATAAACTTATCCCCTACCCATACTTCTTTCACATCTGCTGTTTTTACAACACTTAATGTAGTATCAGCTGTTCCGTGAAATATAATTGAAACCTCGCCACCAGCATTATTGGTATTATCACCTTTTGCATGAGCAATATTAACTATAGTGCTTGTTTCATCTGTTCCTGTAGATGTTCCACCAGTATTATCTGTTGAATTAGTTGGTGTAGTATTTCCACCACTAGTGCCTGATGTGTTCGTTACTGTTGCAGTACATGTTGCAGTTAAACCATCAGCAGTTGTAGCTGTAATTATTGCTTGTCCTTCTTTTACTCCTGTAACTTTACCAGTTGAATCTACTGTTGCTACAGAAGTATCACTTGAAGACCATGTTACTCCTACAGATGCTGGAGTTGTAGTTGCTGTTAATTGTTGTGATTCACCTACATTTAAATTCATTGATAATTTATCTAATGAAATACTAGAATTATTTGTTTTCTCTAATAATTCTAATTCATCTATAGATAAATTAACAGTATACGAGGTAGCTCCGTTATTACTCGCTATATTAATTTGATATTTTGTATATGCAGTAGTATTGTTTATTTCAAAAATTCTTTTATCTATATCTTGCCAATCTGTAACAGTTCTACTATCCAAAACAACCCATTTACTTCCATCCCAACCTTCAAATGTCCATTCTTTTGGTCTTTCAGTTAAAGATGAATGATTATAGTCTAATGCATATGCTGAAATAACTTTCTTTTGTGGAAATTCATAGCTTAGTTTCCCTTTAGTATTGTGAGTTCCCCACGCATGATAAGAACTATTATAATAATAACTATTAACTCCATCAAAAGCTTTATATGCTTGTGTATTATTCCAGTTGTCATCACAACTTGCTATTCCAGAAGGACCTGTATTACTTGTCATTATAGGCACTGCGTTTATATACTTATTTGATATGTCTTCTGCCTTAGCATTAATATTTCCTGAAACTCCAAATATCAAGGCCATGAAAAACACTAATGCAATTTTATGTATATAATATTTTAAATTTTTCATTTATCATTTCTCCCTTATATAATTTTCATAATAAATGAACGCGTTCAATGATTATTATAGCTTCTGTTCCAATGTAATCCAAGAAAAATCATAATACAAATTCTATTAAATATAAGAATTTCAGTAATTTTTTCACAACTAAAGCATAATGTTCTTTAATATATTGTTTTTCATATAAATGAGCAATAAAAAAACACCTCTATTGGTGCTACTTTATTGATTTATTCTATTGTTGAGTTACTTCAGCTGTGTTGATAGTTGATGCTCTAGTAGTAGTTGTATTAGTTTCTGCTGTTTGAGTAGTTGTAGTTACTGGTGTTATCATTTCTGTAAACTCTGCATATTGCTCAGAAGTTATAGTTTCACCTGCCAAAAATATATTAAGTGTATTTGTTACTTCTTCTACATTTAAAGTATTATTAGCTTTCTCTCTTGTAATTCTACTTGTTAATATTTTACCTATTATTTCTTGCATTTTTGTCATTTTTTACATCACTCCTAAAATTTTATTTTGTTCTTTTTGTAATATATAATTTTCAATATCTGAAATATTATTTGAATTTTGATTTAAATATTCTGATATATTGGAAATACTATCATTTAACGCTTGTTCATTTTTAGCTTGCTTTGCATACTCAGTATTTCTCTTATCTATTTCTTCTTGGGTTAAATATTCAATTTCTAATTTTTTAGTTTCCAAATTTACTTTATATGATTTTGCATTGGTGAAAATAGATGCTAGAGTTCCATATTGTAATTCTATAAAATCTACATCATTAATATTTCTTCCTGTTAATTCTTGATATATTTCCATATCTTGTTCTTTTGTAGTTTCTTCTACATTTCCTTGCATTTCTGATGTTATGGTTAATACATCACCAGTTTTAATATCATAATAAATTTTTGCTCCAATATAATAATTCATTTTTAATTCCTCCTTCTATTAATAACCTATAGCATACCAAGTTACTGTTTTAGTTTCACTTCCACTATTTCCGGCATAATAAACATCTCCATATGTTCTATATGTAGCTCCATAAGTACCATGCGTACTGCTCCCATCAGCAACTTCAAACCATGCTCCTGTAGTTAGATTATAATCCCTAATAGAACCGCATCTCCAATAAACTCCACATGTAGCAAACCATGCTAAAACAGTAAAGGATTGATTTGGTAAGATGAATCTAATGCTACCACCACTAGAAGCATATTCTGTTGTAGTCCCAGATGAGTATTTAACGCCAGGTATCGATGTTATAGCACTAGCTAATTGGTCAAACGTCATTCCTCCATTAGCACTTCCACCCTTGCCAGTAATAGCGTTTGCTATGCTATTTTTACCATTACTGGCAGACTGAAAAGCCGAATTCGCTAAATTATTTAATGTATTATAATCGTCCTCATTTAATATTCTTTTCCATGTACCATAAGCACCATCGGTATCATGTCTGCATCTGTAACCTAATTTATTACTTCCATCATATGCTCCTGCGATTTGAAAATTAGAATTATTATCTGAACCTACGTTTAAAACAGTACTATAATTAGATATTGGCGATGGTGTATTAGGGTTGTTACTTCCTGCCCTTGCAGTCCATGTTTTATTAGAATTATATGAATTTAAATCTGTTGAATCTTGATTGAAAGAATCATAAGCAGATGTAAAATCACCAGCATGTTTTCCTCCAACCATTTCAGCATTCAATCCTTTTTGCATCGTACTATCTTTTTGGGCTGAATTTCCTAAGTTATCACTTATTTTCTTAAGCTGTGTATCTATAGTTTGAAAGTTATCTACAAAATCTTGTCTTTTTACATTATCAGTTCCTTCGAATAATTTTAGCCCATAGTTAGCAGATTTTTGCATTATTAATCCTCTCCTTTAATTGTATATTTCTAAGTCATCCCATTTAATATTTTCAGCATTATTATAAGCTAAATTTTTACTATCTAAGTAATCCCAGTTTGTATATGTGTATTTAAAGCTATAAGCAAGATGTGCTGGCTTAATATCTTCCAACATGTTAATAAACGCTTGCATGTTACATGGAATCCCTTTAACCCCTACAAATTGAACTATAAAAGAATAGTTTGCATTCTCTTCTATTATGTTTACTTCACCACCACTAAAAGCTTCTGCTGTAATCTTTAGCATCTTTTTAGTAGTTGTTCCTTGCCCTCTCATTTTAGCTTTAACTATTTCTCTACGCTCTTCATATGAATAATTCAGATTAGTTTCTATTCCATATTCTTCTTCCCAGTAGGTTAATCCCCATGTCGCAGTGTCAATAAAGCATTGATTTATTAAATCATTCATATAATAATAAATGCTACCTAATTGAGCACCTTGTGCATCATAGATAGCTTTCATATTTTTATATATAATTGGTGGTACATATTTATTTAAATCAACAAAATACTTTTCTATGTCTGTTGAATTTGGAGTATTTTCAGCATACTGTGCTAATCCATATTGTGTTGTTGCATAATTCATATGCTATACCCCCTCTAAATCATTCCAGGTCATTCCTTTTTGAACCATATCTTCTGGTGCAGGTGTCCAGTCGGTAGCAATAGTTCCTTTTTCAAATTTAATATTATATATAGTTAAGCTATCCCCAACCGAACTTAACCCACCAACTCCTAAAAAAAACAAAGCATTTGTTGCATTACTTGGTGTAGTAATTTGCTTAGTTATCGTTCCGTTGCTTGCAAAAGATGTATCTGCATAAGATATATTGTAATAACTTCCATCACCATTAATAATATTATTCGATGAATTTAAAAATTTAACATATAATCCTCTTGCATTTGTATTGCTAAATAAAATATTGTTTATTTTAAGAGTATAAGTGGTATTTCCTTGTACTACAGATTGCCAAACTATTCTGCAACCATCTTTATTACTTGTTGTACATTGTAATTTATAAGAATCATTTCCTAATGCAGTTAATGAAAAATAACTATCAGTTGTATTCCAAAGAGTAGAATTTCCTATAGATTGTCTCACTTGACTGCTTATTACTAGATTCCTACCACCAACTTGCAAACTATTAATAGCGCTTGTAACACTTGAAACATTACTATTTATAGTTGTTATATTAGCATTTATTCCACTTACACTTGTTTCTAAAGATGCTGTTCTGTTGCTTATAAATGATACTGTTGTGTTTATAGTTGAAATTTGAGAGTCTGTGTCTTCTGGAGCGGGTGTCCAATCAGTTGCAATATTACCTTTTTCAAGCTTCAAACCACAAATCAAATAAGCATTATTATTATCATTTTCAAATCTACAAGTAGATGTTGTTAAGCTTCCCGAATTAAACACAAAATAATATTTAGTCCATGCTGTAGATATACTTTGACTTTGGGTAAAGTTTTGAGATGTAATAGTTGAACCAGTATTTACATAGCAATTCAGACTAGCTAAAGCTGAAGCACTTTCTGATTTTATCCATGCCGATAAAACATAACTTGTATTTGCATCAATACTAACGTTTTGGCTTAAATCTGTCCATGCATGACATATGCGAATAACTCCAAATCCATTGTATGTCCCTGAAACTGAATAAAAGCTTGTATCTGGTCTAGTAGCATCATTGTTATCTATCCAAATTGTATCATTAACTGCATCATAATCTTTAGTTCTCAACCATAAGTTCCTGCCACCAACTTGTAAATTATTTATAGAATTATTAGCATTATTAGCTATAGATACTCCATTGTTCCATTTATCCCTTTCTGATTGTGTTATATGCTTTACTACATCACTAATATGACTATAAGCACTATTCCAAGTATCTAATAAAGCTTGTGTAATTGTATCTATTATATTTTTATTGGCATGCGTATGCTTTTTTGAATTTACATCTGCAAGTGTAGCTTTTTCTGTATTATCATAGTCGTTTGCGCTTAATTGTTTTCCATCAATCTTATCTACCTTTTTACTTAAAGCATTCATTATAGTAGTTGCAAAGTTAGGATCATCACCCAAAGCATCTGCAATTTCTTTAAAAGTATCTAAAGTTTGAGGAGCGTTTCCAATTAGATCTTTTATTTTCTGTAACACTTCATCTTTTGTGAAAACTTGATCTTTTGTGTATCTATTGTTAAACTCTCCATTTACATATAACAAATCGGATTTTTTATTATCTAAATCAATATCTTTAGCTTTTAGTCCTTGTATTTCTGCATTATTAGTGGTTTTATACAAATTCAAATTATTTTCAATTTGATTTTCTCTATCTATTGCTCTTGCAGTCTCTGAATTTAATGCATTTTGAGTATCAACAATTGCATCTTGTACATTATTTATATCATCTGCTTCAACTGTATCTCCTGTTGTTTCATAACTTATATAAAGTGGTGTCATAGTATAAAAAATCTTAATTATAGTCTTCCATGGAGTTAAACTTGGTGTAGAAGTTAAATAAGTATTGATTTTATCACCAGTAAGTTTGGATCCTGTATATATATTTATGGTCTTAACATTTACATTGTCATGTATAAGTTCAGCTTCATATACTCCATTAATTACTGTAATTTCTTCTTCCACTGTATAGATATTTCCATCTAGTTTGTTGAATTTATCATTAAATTTACTTACATTCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP016089|2597580:2605099|2597580_2598384_-|WP_022746414.1|DBSCAN-SWA MPQWKWCVEGLDGKVMKGWYEDNGAWYYLNDQGIMQTGWIQDTDKRWYYLDETTGAMQTGWIQLKGIWYYLEPNSNGYMGSCYIDCTSIIDGKTYAFDKDGHLIENKALSDKGAEFVSSWEGFSSTWEDVGDGYWTIGIGTATSGTLGKQLYASGITSCTKEQAYKWLEQECSSCYEAIKGKLDANNITLAQNQIDALISMAYNIGACGLVDSTLFKNILNGVTDEATIRSNFEAWDKCNGVVWDGLKKRRDSEADLYLNADYIGNN >NZ_CP016089|2597580:2605099|2598441_2598849_-|WP_022746415.1|DBSCAN-SWA MIKTILGLVIRILKNKTYMAAAKEVWGIVDEKFRITEKADDKLKSKAEEFNKLLITKFPELTEEDVMYFRQAVAGAVNKDKEALISNSDLLKQLQDTNANLLTENAELKNKISQIQTTVSVTQEAANTEGETVQA >NZ_CP016089|2597580:2605099|2602369_2602981_-|WP_022746421.1|DBSCAN-SWA MNYATTQYGLAQYAENTPNSTDIEKYFVDLNKYVPPIIYKNMKAIYDAQGAQLGSIYYYMNDLINQCFIDTATWGLTYWEEEYGIETNLNYSYEERREIVKAKMRGQGTTTKKMLKITAEAFSGGEVNIIEENANYSFIVQFVGVKGIPCNMQAFINMLEDIKPAHLAYSFKYTYTNWDYLDSKNLAYNNAENIKWDDLEIYN >NZ_CP016089|2597580:2605099|2600713_2600971_-|WP_022746418.1|DBSCAN-SWA MTKMQEIIGKILTSRITREKANNTLNVEEVTNTLNIFLAGETITSEQYAEFTEMITPVTTTTQTAETNTTTTRASTINTAEVTQQ >NZ_CP016089|2597580:2605099|2601430_2602354_-|WP_022746420.1|DBSCAN-SWA MQKSANYGLKLFEGTDNVKRQDFVDNFQTIDTQLKKISDNLGNSAQKDSTMQKGLNAEMVGGKHAGDFTSAYDSFNQDSTDLNSYNSNKTWTARAGSNNPNTPSPISNYSTVLNVGSDNNSNFQIAGAYDGSNKLGYRCRHDTDGAYGTWKRILNEDDYNTLNNLANSAFQSASNGKNSIANAITGKGGSANGGMTFDQLASAITSIPGVKYSSGTTTEYASSGGSIRFILPNQSFTVLAWFATCGVYWRCGSIRDYNLTTGAWFEVADGSSTHGTYGATYRTYGDVYYAGNSGSETKTVTWYAIGY >NZ_CP016089|2597580:2605099|2600974_2601412_-|WP_022746419.1|DBSCAN-SWA MNYYIGAKIYYDIKTGDVLTITSEMQGNVEETTKEQDMEIYQELTGRNINDVDFIELQYGTLASIFTNAKSYKVNLETKKLEIEYLTQEEIDKRNTEYAKQAKNEQALNDSISNISEYLNQNSNNISDIENYILQKEQNKILGVM >NZ_CP016089|2597580:2605099|2598869_2599106_-|WP_022746416.1|DBSCAN-SWA MNDELVKDKLDTHERRLNNHSERLDKLEQDGRELKTELKNLCENLKSLTSMMKWFIATLVGALISFFFYAVQTGIFNK >NZ_CP016089|2597580:2605099|2602984_2605099_-|WP_022746422.1|DBSCAN-SWA MNVSKFNDKFNKLDGNIYTVEEEITVINGVYEAELIHDNVNVKTINIYTGSKLTGDKINTYLTSTPSLTPWKTIIKIFYTMTPLYISYETTGDTVEADDINNVQDAIVDTQNALNSETARAIDRENQIENNLNLYKTTNNAEIQGLKAKDIDLDNKKSDLLYVNGEFNNRYTKDQVFTKDEVLQKIKDLIGNAPQTLDTFKEIADALGDDPNFATTIMNALSKKVDKIDGKQLSANDYDNTEKATLADVNSKKHTHANKNIIDTITQALLDTWNSAYSHISDVVKHITQSERDKWNNGVSIANNANNSINNLQVGGRNLWLRTKDYDAVNDTIWIDNNDATRPDTSFYSVSGTYNGFGVIRICHAWTDLSQNVSIDANTSYVLSAWIKSESASALASLNCYVNTGSTITSQNFTQSQSISTAWTKYYFVFNSGSLTTSTCRFENDNNNAYLICGLKLEKGNIATDWTPAPEDTDSQISTINTTVSFISNRTASLETSVSGINANITTINSNVSSVTSAINSLQVGGRNLVISSQVRQSIGNSTLWNTTDSYFSLTALGNDSYKLQCTTSNKDGCRIVWQSVVQGNTTYTLKINNILFSNTNARGLYVKFLNSSNNIINGDGSYYNISYADTSFASNGTITKQITTPSNATNALFFLGVGGLSSVGDSLTIYNIKFEKGTIATDWTPAPEDMVQKGMTWNDLEGV >NZ_CP016089|2597580:2605099|2599221_2600487_-|WP_022746417.1|DBSCAN-SWA MKNLKYYIHKIALVFFMALIFGVSGNINAKAEDISNKYINAVPIMTSNTGPSGIASCDDNWNNTQAYKAFDGVNSYYYNSSYHAWGTHNTKGKLSYEFPQKKVISAYALDYNHSSLTERPKEWTFEGWDGSKWVVLDSRTVTDWQDIDKRIFEINNTTAYTKYQINIASNNGATSYTVNLSIDELELLEKTNNSSISLDKLSMNLNVGESQQLTATTTPASVGVTWSSSDTSVATVDSTGKVTGVKEGQAIITATTADGLTATCTATVTNTSGTSGGNTTPTNSTDNTGGTSTGTDETSTIVNIAHAKGDNTNNAGGEVSIIFHGTADTTLSVVKTADVKEVWVGDKFIYTIVVTNTGSKTAKAVVVNDTAPNHIQFIPSGITTTQGTVDSTSTPSNIVVNVGDIPPSGTVTIKVPVNVVL |
9 | Clostridium_phage(83.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
2900437 : 2909444
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP016089|2900437:2909444|DBSCAN-SWA TATGGAAAATAACTTAGGCATAGTTATCTGTGGAAATTTTATTGAAGAAATTAACTGCATAATAAAAAGAAATAATATAAATAATATAGAGGTTTTTCCTTTCTCTTCTAAATGTAATTTGAGCAAATCTAATCAAAATAACTCTTTAACAGAAACAATTGAAAGATGCCAAAAAAAATGTAGTAAAACAATTATTATAGGTGGGAGTTGTTGTTCTAACATAAAGAATATTGTTACTGATAATGAAAATTGTAAAATACATATATTTGAACATTGTTTCGATATGTTTATTAATAAGGATATAATTTCTAATTTTATAAATGAAAACCTATGTATTATAACATCAGGTATGCTTTCTAACTTAGAAGTGAACGATTATAATCTTAGTTTTCTCAAAACAAGAAAAAAAATTAGACTTTTAGATACTGGGATAAGTAAAGAAAATCTAAATAAACTTGTCCAATTGTCCTCTTATACACATATACCTTATGATTCATTTTTTATAGGATTAGATTACTTTAATATGTTTATAGAAAAAATACTCTTAGAATGGAAATTAGAATGTGAAAGAGCAGAAAGAATGCTTAAACCTGAAGTTTCCATCGACGAAAAATATACAAAACTAGAAACAACAAAAAATTTTATCGAAAATAAAAAAGAACAACTTTTATATATTTTGGATAGTATTTACGAATGTGTATTTATTATGGATCAAAACTACGACATACTGTTTATCAATAGAGGCGTCGAGAAAATGCTTCATCTTAAAAATTTTAAAAATATAATTGGTAAAAATGTATTTGATATTGGTATTATACATGATGACTATAGCAATATTATAGCTAATAGATTTAAAAAAGTGATTACTACTAGAACCTCGGTACCTTTAATTGAAGAAAAACTAATACAATATAACGGTAATGTCATAACAGTTAATATATATTCTGAGCCTATTGAATATAAAGGAAACTTATGCATATTAAGTGTAATCAGGGATATTTCTGAACATAAAAAATCCGAGAATCTAAAAAATAAAATTATAGAGCAAAGCAAATTATTGGACAGAGCTGCAGAATATGATAAACTCAAAACTGAATTTTTTGCAAATTTATCTCATGAATTTAGAACTCCATTAAATGTAATGCTTAGCACTCTTCAATTACTGAATTTAATGGGAGTAAATCACTTTAATGATAATACTAAAGAAAAAGTAACAAAATATTATCATATTATGAAACAGAACTGCTACAGATTGTTAAGACTAGTTAATAATTTAATTGATCTCACAAAAATAGAAACTCAATATTATAAACTTAATTTAAAAAATGAAAATATTATAGAAATTATAGAAGATATAACTTTATCAGTAACTGATTATGCCAAAAACAAAGGTTTAGAGATTATATTTGATACAGATGTTGAAGAAAAAATAATGGCTTGCGATGCCGATAAGATTGAAAGAATTATACTTAATCTTCTTTCCAACGCAATTAAGTTTACCCCATCTGGTGGAAATATACTAATAAATATTCATGATAAAGGTTCCAGTATAATAGTATCTGTAAAAGATAACGGAACTGGTATTCCCCTTGATAAGCAGGAATATATTTTTAAAAGATTTATTCAAGTGGATAAATCACTTTCAAGAAATCGAGAAGGAAGTGGTATAGGTTTATCACTTGTAAAATCTCTTGTTGAACTTCATAAGGGTAATATTAAACTTATTAGTACTTATGGTGAAGGTAGTGAATTTATAATGGAATTCCCAATTAGTGTTTTACCTTCCAATGAAAAAACTATATTAGATGAAAATTTAAACACGCAAACAAGCATAGAAATGATTAATATAGAATTTTCTGATATATATGATTAATTACAAGTAATCAATTATATACCCTTTTATGTTTTTAAACATTAGCTTAATATTTAAAAACATAAAAGGGTATATGATTAGCTCCTATACCCTAAAAACTTAGCTTAATTTAGTTGCAACTCCATTGCTATCAAATCTGTACCCATACATCTCACAATCGTGAATCATAGAACCATTTGAATATAAGCAATAATCTTTACCATTGTCACTTATCCATCCAGTTTGCATAACTCCATTAGAGTCAAAGTAATACCATTTATCATTAATTTTTTGCCACCCTGTTTTGATAGATCCATCATTTAAATCTCCGAGATAATACCATTTATTATCTTGTAATAACCATCCTGATTTCATTGAACCATCATCTGAGCGTCCTAAATAGTACCAATTATTTCCTTCCTTTTTCCAATCATAAAGCATCCATCCTTCATTATCGAATAGATACCATAAACCATCAATCTTTTCCCATCCATTTTTAGTATAACTTCCATTTATATGCTTGTACCACCACTTTCCATTCTGTATAATCCATTGTCCTGCTATAATAGCATTATCTAATAATACACCTTCGGTAAATAAATTAACATCACATCCTTCACTTATTCCACTAATAGAACCATTTTCAGTATATTGATGTCCTACTCTATTTGTAAAGAAATTGGAATGTAAATTCCAAGGATCATCATTATAATTTGCTTCCCAGAAAGGCATATCTTTTATTGTTTCTTCTGCATCTGTTAAATAATCTATAAAGCTAGTATAGCTATAAATCCCCAATTCTAGTGGACTTAATTGTTTAAATGTTGATATAAATCTTCTAACATAATTTGATAAACCTGAAAAATTAGTTTCTACATCCATCATAGGAATCAAATCCCAATCATAATCTTTTATTTTTCCATAAAAATTTTGTGCCTGTGCTTCTGGTGTACTGCTTCCAACTAAAAAATGATATGCTCCTACTTTTAAATTATTTGCTTTACATTGATTATAGAAAGTTTTCATTGCGCTATCTTTAAAAGTAGCACCTTCAGTTGCTTTCACATAAACATATTTCACTCCATCATCTGCAACTCTACTAAAATCTATACTTCCATTATTATTTGATATATCTATTCCCTTTATATATGACATCTGATTCCTTCCTTTCTTATATTATTAAAAAGTAGCCAAAATGGCTACTTAATTACTATTTATCAAACTAACAATCTTAAAATTATTTAGTTTTATTTTCTGTAGAATTTGTTGATGTAGTAGTTTGATCACTTATTCCTGGTGTACTTGTATCTACTATTATTCCAGACATTGTTAAAATTGTTAAAATAGCATTTACGACTGCTGAATAATCACTAGGAAGTTGTAAACCTAATTGTTGAACTAATAATGCTATAGCACTAACCATTGAAACCCAAAATGCTTTATTTTTCAATCTTGCTTTTAAATCAATATTTAACATCTCCATGGTTCACCTTCTTTTCTTTTGTACTACATATTATGCAAAAGTATCCTTAATGGCTACTATAAAAATTATAGTAATATTTATATTTTAACTAATCTTTGCAAAACATCTTGAGTAACATATGTACTGTAAAAAAGAAAAAATAAGGGCAGTAAACAGTATTTCTACTCTCTACTACCCTTATCTATATTATTACCTTTTTCAATTTCTTTTAATATTTTCTTATTTATTTCATTGACTTGATCTACACTCAAACCTTTTTTCTTAATAGCATTAGTAAAAATGTTTTTTACTATATTCCATTCATTAACTTTATTTTGTTCAATTTGCAAATCTATATCTCTTAATAATTCAAAAGTATATTTATCCATGTTTAATTAGCCACTCCATTTACATATAATATTATTTTATAAAACACATATAATAAGGTAATAAAGTTTTTCCTTATTACCTTATCAATTAAGATGTTTATTATATTTTTCTTGGTTGTATTTTGGGGAAGGGGTATAAATCTTTGTAACCCAAGAAATAATATTTTACTAGGTTATACTGGGTATTATGTCTAAATCAATATTAACATATTATTATAAAATATTCAATATCACTTAATAATTTTTATTTATTATATCAAAAAAGAATATAGAAAAATAATCATGTTCATGTAACATTCTTACTTCCCATCATACTTAATAACTATAGACTCTGATATCACTTTTAAAAATATTCTGTTTATGCATGATTTTGTACGTTTAGAAGAAAAAGTATTTATTTAATTTAAGAATTATGAGAATATGTAATTGCAACAAATATATAATATTGTCCATATTTTTGTACCATTTTCAAATGACTTATTACACCACAATAAGTCATTTTTTTATTTTCAAGAGTTAATTCTGAATTCTCAGCAGTGATAAATTTACATTTTTTCATAAAAAATACCATCCTCATCATTTAAAATTTTATTCAAATAATGCGAACAGTATTTTTTATCAATTATCTATTTTAAGAGTCATTTCAACTCTATAAATTCCTAATTTAAAACCCTTCCAAAATATTTCATATTTGAAGTTGAAAGCTTAGAAATTTTAACTACATCTCCTGTATGAGGTGCTTGAATATACATATCATTTCCAATATACATTCCTACATGCGTAGCATCAGTAGGATTATTAAATACTAAATCTCCCGGTTTAATTTCAGCTATCGTTACAGTTGTCGCAAAACTTTGTTGCTCCTGAGATGTTCTTGGTATACTTATTCCTTGAGAATTAAATACATACTGCATAAGTCCAGAACAGTCAAATCCCTGTGGGCTTGTACCGCCCCATAGATAAGGAACTCCTAAATATTTTTCTGATTCCAATATTATCGTCTTAGCCTTATCTGAAATATCAGAAGGTAATGTTACTGGAACTGTATCGCTTGTTTCTGTATTTAATAATTCACTATGATCTTGTACATATTTTAAAAGATCTTGCTTTTGATCCTCTAAATCTTTAATCTCTTTTTCAACCTCATCTTTACTTTTTTGAAGTTCATCATTTTCTTTTTCTATATTAACTTTAATATTTTCAAGATTTTCTTTAGACTTTTTTGCTTGATTTACAAGATTATTATCACTTTCACATATCTTAGAAATTAAATAAACCTTTTGTGTAGCTTGTAAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP016089|2900437:2909444|2904798_2905794_-|WP_140395268.1|DBSCAN-SWA MKKKYITTIVATLLFLTSVTSALPAYAEPSEPTLEQVEQNIQECDSKIEDNMTKLNDYKDQIEKKEKEIKDNEDKLALAQQDIEDKDKQLSDRLKLIQTNGGIAATPMKYIDAVFSSEDVLQATQKVYLISKICESDNNLVNQAKKSKENLENIKVNIEKENDELQKSKDEVEKEIKDLEDQKQDLLKYVQDHSELLNTETSDTVPVTLPSDISDKAKTIILESEKYLGVPYLWGGTSPQGFDCSGLMQYVFNSQGISIPRTSQEQQSFATTVTIAEIKPGDLVFNNPTDATHVGMYIGNDMYIQAPHTGDVVKISKLSTSNMKYFGRVLN >NZ_CP016089|2900437:2909444|2903525_2903765_-|WP_022746694.1|DBSCAN-SWA MLNIDLKARLKNKAFWVSMVSAIALLVQQLGLQLPSDYSAVVNAILTILTMSGIIVDTSTPGISDQTTTSTNSTENKTK >NZ_CP016089|2900437:2909444|2906290_2907382_-|WP_022746698.1|DBSCAN-SWA MNELNHDLGIIALESCATLGNAIDKYIQEQRNTTESFLIPLDEIRFANGEGKVKISETVRGRDIYILCDVGNYSCTYTMFGFEHHKGPDEHFQDIKRTVAAIRGKAARITVIMPLLYESRQHRRKGRESLDCALALQELERLGVDEIITFDVHDPNIQNAIPLLSFENIYPTYDIVKALVCNEKSLELDKEKLLVISPDTGAMDRAIYYSSALGVDVGLFYKRRDHSTIVNGKNPIVQHEYMGRDVEGKDVLIVDDMIASGESVLDIAKELKNRNARNVYVAATFTFFTEGLDKFNKFYEDGIISRIYSTNLTYISQELNDAKWFEAVDMSEFSARIINRLNHGKSIAKYLDATRIIHTLLNK >NZ_CP016089|2900437:2909444|2900437_2902309_+|WP_022746692.1|DBSCAN-SWA MENNLGIVICGNFIEEINCIIKRNNINNIEVFPFSSKCNLSKSNQNNSLTETIERCQKKCSKTIIIGGSCCSNIKNIVTDNENCKIHIFEHCFDMFINKDIISNFINENLCIITSGMLSNLEVNDYNLSFLKTRKKIRLLDTGISKENLNKLVQLSSYTHIPYDSFFIGLDYFNMFIEKILLEWKLECERAERMLKPEVSIDEKYTKLETTKNFIENKKEQLLYILDSIYECVFIMDQNYDILFINRGVEKMLHLKNFKNIIGKNVFDIGIIHDDYSNIIANRFKKVITTRTSVPLIEEKLIQYNGNVITVNIYSEPIEYKGNLCILSVIRDISEHKKSENLKNKIIEQSKLLDRAAEYDKLKTEFFANLSHEFRTPLNVMLSTLQLLNLMGVNHFNDNTKEKVTKYYHIMKQNCYRLLRLVNNLIDLTKIETQYYKLNLKNENIIEIIEDITLSVTDYAKNKGLEIIFDTDVEEKIMACDADKIERIILNLLSNAIKFTPSGGNILINIHDKGSSIIVSVKDNGTGIPLDKQEYIFKRFIQVDKSLSRNREGSGIGLSLVKSLVELHKGNIKLISTYGEGSEFIMEFPISVLPSNEKTILDENLNTQTSIEMINIEFSDIYD >NZ_CP016089|2900437:2909444|2902408_2903443_-|WP_022746693.1|DBSCAN-SWA MSYIKGIDISNNNGSIDFSRVADDGVKYVYVKATEGATFKDSAMKTFYNQCKANNLKVGAYHFLVGSSTPEAQAQNFYGKIKDYDWDLIPMMDVETNFSGLSNYVRRFISTFKQLSPLELGIYSYTSFIDYLTDAEETIKDMPFWEANYNDDPWNLHSNFFTNRVGHQYTENGSISGISEGCDVNLFTEGVLLDNAIIAGQWIIQNGKWWYKHINGSYTKNGWEKIDGLWYLFDNEGWMLYDWKKEGNNWYYLGRSDDGSMKSGWLLQDNKWYYLGDLNDGSIKTGWQKINDKWYYFDSNGVMQTGWISDNGKDYCLYSNGSMIHDCEMYGYRFDSNGVATKLS >NZ_CP016089|2900437:2909444|2904542_2904698_-|WP_155738345.1|DBSCAN-SWA MKKCKFITAENSELTLENKKMTYCGVISHLKMVQKYGQYYIFVAITYSHNS >NZ_CP016089|2900437:2909444|2907686_2909444_-|WP_022746699.1|DBSCAN-SWA MKKNAAQREFKKFKSQINQIEEIVEHSKPGALLEHESAIRKKMIKLKELKNEGLREFNDVCERYEELLEYTSKRILNEYNKKNNTEFDFYDVVRGNYNSFLNQGIMTLLTKHVIPKLIANEFEKNFPENPKDEYIAARRMKRKFYIHLGDTNTGKTYNAIQRLKTARNGVYLSPLRILALENFEKLNNEGIVCNLSTGEEEVIKPGATHTSCTIEKVNLKEHYDIAVIDEIQMISDTFRGMAWSKSVLGLQCNEIHICGALNSKYILEKMISDCNDEYEIKEYKRAIPLEVEDKNFSYNDVQDGDAIVVFSKKRVLEIAQEYSNRGIKTSIIYGDLPPEVRKMQYEQFVKKETKVLVTTDAIGMGVNLPIRRIIFMSIRKFDGEEVRELTSQEIKQVGGRAGRQGIYEVGYIAGVGGSAEFIKSKLEAKDQVIREAVIGPSEAILNIKSLPLNEKLALWSTREEKLDYYTKMDVSEYILILDKIKKYKLSEEDQWDLLKVPFDVSRDELMQTFLDYVDELFINKQEELFIPQCFNGNLDDLEIYYQKINMYYSFSKIFNLKFNVEWVYEERLKVSEAINEILKRI >NZ_CP016089|2900437:2909444|2903932_2904139_-|WP_022746695.1|DBSCAN-SWA MDKYTFELLRDIDLQIEQNKVNEWNIVKNIFTNAIKKKGLSVDQVNEINKKILKEIEKGNNIDKGSRE |
8 | Clostridium_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
3315169 : 3365063
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP016089|3315169:3365063|DBSCAN-SWA TTTAAATTCCCCCTTTCGGTAGTATTGTTATTGTTTCAGCTCCACTTGTTTGTCCAATTGCTACATTTATTTTTCCTGTGCTTTTAATTTGAGTTATTTGATAAGGAAAAACCCTTATTTCTTCGCCACATAACATAAAGGCTCTAACATTAAAAACATCATTAGTTTTTGAAGTCATTTTATAATTTGCCTGTAAATGTGCAGGTTTAATCTCATGTATTGTTTCTTCTAAATCTGTTATTGCATAAGGAAATCCCTTATTGGATACCAAATCTATTAAGAAAGAATAATTTGGGTTATTTTCTATTACATCTGCTGTATCTGCATAAGTTTCAGCAATTGATTTAATAGCCTGTACTGTTGCAGTTCCTTGCCCTCTTAATTTAGAAAGTATTTTATTTCTTCTTTCCTCATAGGTCTTTTGGGTGTTTGTAACTATTCCTAGTTCTTCTTCCCAATATTTAAGACCCCATGTAGCGGTTTGCACATAACATTGATTTAATAAATCTTCAATATCTAAGTTAATATCATCAATTTCATTTTGTTGATTCTCATATAATTTTTTTAATATTGATGATTTTAATAAAAAAGGTGGTACATAATTACTAATCATGCTGCCACCACACTCCCAATTACAGGAATTTCTATATCTCCTAATGGTATATTAATTGTTCCATTATTAACTGTTAAATTACTATAATCTTCGACACCTTCTGTTTCATAAATTAATGCACCAATCTTATTATAAGAAACATAAGTTTTCTTAAAAGCTACACTTTTGAAATAATCCACTAGTTGGTTTTCAATATTTGTTTTTACGTTATCTATTAAATAGCCATCTGATAACACAATAGCTGCATTTACATTAATAGCTTTTTCAGTTGCACTCACAACATATGGAGTACAACCTATTGGTCTATTTTCTTCTATATGAGTTAATACATTACTAACTAATGTTGAATCAGCACCTAGTTTATTTGAATTTACAATTACTACTTTTACACATCCATTCTGATGCTCTCCAGCTAAATTAGTTTCAGAAAATATTTTAACATCTCCAACACCTACAACTTCTAATGCCCAGTTTTTGTAATGATTTTCATTTCCACTTGTTGCAGGAGTCTGAATTTTAACGATATATCTATTACATAAATCTTCATTGCTCTCTACATCATAACCATTTTCAAAGGCTTCCTCATTGGTGATACTAGTAATATTAATTAGCCGAATAGGTAAATATGTAATAGTGTTAGCTATTTTGTTATAAGCGCTACCTATATATTCAGCAGCTACTTTAACTTTTATAGAAGTTGTACCATTCGCTATAACTGCATTATCCATAGTAAAATACCTTAATCCAGTTTGTGTTTGGACTATTGTATTAGCTAAAATAGTTGCACCTGCCTGTCCAATAAATGTTATATAACCTGTTGCCTTATCTCCACTTTTTCTATAAATTCCAAATTCTTCACATCTTTTTTCTAACCATTCAGAATAACCATTTTCTAATGCACTTTTAGCAAATACTTTCTTGAAAATTTCATCAAGCTGTAATTTAGTATTTGCTAATTCAACACTTACTGGTGCTTGTGAATTATGTATATCACTACCTTCTATTGTACTTACATTAGTTATACCCGATTTCATTCTATTTAAAATCGTTTCGCTACTTTCAAAATAAGTATCAGTATCAGACATCTACATTTACCTCCTGTTCAATAGAACCATATATAGTTGTTAAATATATAGTTCCTGTTAATTTTGCATCATCAAATTCAATATTTACAGTATCAATAGATTTAATATATGGATTTACTAATAAACACTGTTCTATAAGTGCTTTTAATTCTATATTTACAATATCACTATCGTAATTTTGACTAATTAATGTTTCAAATTCATTGCCATAATAAAGCGAATAAGCTAAATATCTAAACCGAGGAGTTTTTAAAGCTTTATATATCCAAACTTTAAGAGCTTCATCTTCTTCGATTATTACAAGTTCTGCATCCTGTATAATATAATCATCATTATCAAAGTCCCAAGCATAATCACGATATATTGGTAAATCTGTAGTAGTTATAGTTGAATCTATCGCACTACTAGAACTGTCTGATGGTAAAATACTCATCTACACCACCCCAAACACAATATATTTTTGTCCATTTTCTATAGGATAAAGAAATACAACATCATTAATATCTAATACTGGTTCATGTACAATAGTTGCACTTTTTGTTCCTGTATCATCTTTAATTATTACTGTTTCTGTATATCCTAATAATCTTTTGTCCATATCTAAATTATTTTCAAATAAAGGTAATTCTCCAACTACTATTTGCATTGGATTTACAGATTTAACTGTTCCTTTTTGAATCATAGGAGGATTATATTTACTACCTTCATCTCTAACAATTTTTATAAATTCAGATTTACTATTTTGTTTCATATACAATTCCCCTTTTAATTCAATTTGTAAGCTGTTACTGTTTGTCTCCCTAAATTGTTAGCCTTAGTTACAGAATCTCCCCCAACACCTACATAAATATCTAACCTATTAGCAGAATCAAAATCTGTTCCTCCATGATCTTCAACCGTAAAGACTCCATCATCTAAACCGTCAATACCAGTTATATAAAATTGAGTCCCGAATGAATAAACATTACTTGCACACATACCATATTGCAATGTCTTACCACTAGCAGACTCATTTCCACCTTCACTTGCTGCTCCTGTATAAAAACTTAAATTCATTTGCATCTGAGTAGCGTTGCTTAAATCTACATCTCCACTAGAACTTGAACTATCACTACTGTCTGTTACAATTCTTCTGCCTGCATAGAATCCATACATATCAATTATGCAAACACTTTCTCCTGTATGTGGCGAATGTATAACTTGTCCATTTCCAACATAAATTTGAACATGACCTGTACCTGGGAATACTAAATCTCCTGGTTGTAATTCATCTTGACTTACACTAGAACCACAATCAATTTGTTCATAAGTTGTACGTGGTAGATTGTATCCAAAGTGATTAAATACATATTGTACAAATCCAGAACAATCAAAGCCATCAGGTGTAGTTCCGCCCCATACATAAGGTGTTCCTATAAATGTTTTAGCGTATTCAACAATAGCATTTACATCTGATCTACTATTACTTGAACTATTATTAGAACTTTCTTGATATTCTTTTTCATCCATTACTTTTTCTAAATTTAATGTTAATTCACTTGTATAAGTACCTGTGCCAATATCCCAAGTGTGGCAATCTTCAGTAATATATAAAACCGTATTGGAAACTTTATTAATCCAAGGAATTTGAACTGTTACACCTTTACCTGTAAAATAATCATCATAATTACCTAGAACCTTACATTTAATTGTTATATCTAAATTATGTAACATTTGATTAGCGACTGTTTTATAATCTTTTCCGTCTTCCTGAACATAATTCTTTTGTATAATTCCATATCTATTTTGAACACTAGAATCTGAGTTAACAGTATCAATTTTATTATTATTGTTATCATATACTTCAACTCTATTAACCATATTTGCCATAGTCTCTGTATACTCAAAACTTATTAAATTTCCATCTGCATAACTTAATCCTTGAGTACAAGGTTTAATTATAGTATTTGCAATTTTACCTCCAAATTGAGTAACCATAACTTTATCGCCACTCATCCATAAATAAAACTTTTCTCCTGTTTGCTTTTTAACTTGCGTATACATTTCCATTATTGCATCGTAAGGTGATTGCTTTGCTATTAAATGATTTATAGCTATACCTGTAGGATATATATAATCACTACTAACCCCTACTTTATCTAATATAGATTGAGTTGCATCTTCGGCTGTTGTACCATTGAAATTAAATGTAACTTCATCTTGTTTCAAATACCATGCAAAATCAAAAGCAGTAAATGTCAATGTATCATCTGTTTTTAAAGTATCTTCTATCAACTTTCCCCTAAATATTTCTTCATCATCTAAAGTAACCCAAACTAAAGTTCCAGCACTTAAATCTGTTCTTGAAATATTAGTATTAAACACACCATAACCCATTGTTATATCCAATTCTCTACACACATTTGTCAATGATCCACTTATCTTTATACTTTCACATAGATTTGTTATTTCTACTGTGTTTCCATAATAAATACAAAATACTTTTATCATATTTTTAGAACCTGTCCTACAGAAATATCATTAACATTTTCCAAATTATTTTTTGAAATTAAGTTTGTGTATTTACTAGAATCTCCATATACCTTTTTAGCAATATTAACCAAAGTGTCACCATCTTTAACAGTGTAAGAAGTTGTATAAGCTTGTGCTAAGTTACTATATCCACTAGGTTGTGCTAAATTAGATACCGTATAAGGTGTTGCTAAGTTATGATATCCACTAGGTGTTGCCATTTGGTCAACTCCTGTATAATAAGTTTCAGTACTTGAATTGGTAGTAAGTTTTATTTCTTTGTGTTCTTTAAAAGTAATAGTAAAATAAACATCTCCGCTTCCATCTTCTTCACTATATTCAATATCATCTACAGTACACTGAATATTCACATTTGTTTTAGTTATCACATAAGTACAAACAATATTATTGTCTTTAAGTTTTTCAATCAAGTCACAATAATCAAAGGGGTTTGATTTTGGGGTACAAGTACAAATATTATATTTTTTTGAGGGGAATATAGATGATATAGTCCATGATTTTAATGTTGGTGTACCACCATCACTTATTTCACCGAACCCAAGCAAATTAATACTTGCACTATTTTTACTACTTTTTATTTTGTAGGATGAAGGAGAAATTGGTAATTGTATTGTTTCTATATCATTTTTGATATAATGTATTTTAATATTAATCACATCCTCCAAAAATTAATAAATAAAAAGCCTATAGGTATTAATCTATAAGCTTATGCCATCTTTAGTTGCTCTCTTTTTATAGCAGAAACGAATTTATCTATAAAGTTATCCATA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61 | Clostridium_phage(47.83%) | head,plate,portal,protease,tail,integrase | attL 3317016:3317034|attR 3359889:3359907 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
3851688 : 3910796
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP016089|3851688:3910796|DBSCAN-SWA 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52 | uncultured_Caudovirales_phage(48.28%) | terminase,plate,portal,tail,transposase,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
4713710 : 4722200
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP016089|4713710:4722200|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP016089|4713710:4722200|4718571_4719642_-|WP_022750212.1|DBSCAN-SWA MKTYLVTGGAGFIGSNFVLYMLNKYQHIKIVNLDKLTYAGNLENLKSIQNDERHTFVQGDICDKELVSSLFEKYDVDYVVHFAAESHVDRSIKEPEVFAKTNVLGTVNMLNCAKNAWETKDGFKQGVKFLHVSTDEVYGSLGAEGFFMETTPLDPHSPYSSSKASSDLMVKAYYDTYKMPINITRCSNNYGPFQFPEKLIPLLINNCLKHKDLPVYGDGMNIRDWLFVEDHAKAIDMVINDGRLGEVYNVGGHNERTNIQIVKTVISYINENVDKEVTENLIKYVEDRKGHDKRYGIAPDKIKEELGWYPETVFEVGIKKTIKWYLDNQEWMKNVTSGDYQKYYEKMYTNSTIPEA >NZ_CP016089|4713710:4722200|4713710_4714580_-|WP_022750200.1|DBSCAN-SWA MANKIRKAIIPAAGLGTRFLPATKAQPKEMLPIVDKPTIQYIIEEAIQSGIEEILIITGRNKKCIEDHFDKSVELEMELAKNNKDELLELVQDISDMVDIHYIRQKEPKGLGHAIHCAKSFVGNEPFAILLGDDIVYNEEKPCLKQLIDCYDEYKTTILGVQNVAPQNVSKYGIVDGIEIEDRVCKVKSLVEKPKTEDAPSNIAILGRYIVTPKIFEILEETKPGKGNEIQLTDALLELAKNEAMYAYNFEGRRYDVGDKLGFLEATVEYALRKPELKDDFMEYLKNII >NZ_CP016089|4713710:4722200|4716387_4718115_-|WP_022750206.1|DBSCAN-SWA MNFKEKYNYWLELDIIDENIKSELLSIGDEKEIEDRFYKDLEFGTGGLRGIIGAGSNRLNIYTVGKVTEGLARYLVNKYKENISVTIAYDSRNMSIEFSEYAALVLCANNIKVNLFESLRPTPELSFAVRELKSNAGIVLTASHNPKQYNGYKVYGNDGCQITDEAANAIISEINNVDYIDVKKISKEEAVNKSLLNIIGEEVDRKYIDTLKSYTIRKDLVEKHAKDLKIIYTPIHGTGLMPIKRMLKELGYENLHIVKEQEIPDGNFPTAPYPNPEDSKVFELALKMAEKVNPDIIFGTDPDADRIGVVVKDSNGEYKILTGNQIGVLLTHYILDAYKEEEKLPSNGAIVKTIVTTEMVKDICKECNVELFDVLTGFKYIGETIGRFEKTNSNTFIFGFEESYGCLFGDHARDKDAVVTAEMICEMTLYYKNKGLSLYEGFINLCKKYGYYKETLISIELKGKEGQEKISSCLEYLRNNEIEDVNGVKVENFFDYKLSKAKDMCNEKISTLTLPKSNVLKYVLSDGSWFVIRPSGTEPKMKIYVAVIGKDLEDSDDKLKKFEETIMKKINEILK >NZ_CP016089|4713710:4722200|4720702_4721284_-|WP_022750218.1|DBSCAN-SWA MGNFNFNKTKIDGVYIIEPKVFGDNRGYFMETYNKEHFQEAGLNMTFVQDNESKSSKGVLRGLHFQRKHSQGKLVRVTKGEVFDVAVDLRTGSPTYGEWEGVVLNDENKKQFYIPEGFAHGFLVLSDEAVFNYKCTDLYAPEYDGGVMWNDPDINIKWPVDGIENILLSEKDKVHPSLKQLDLSEYEDFIYKK >NZ_CP016089|4713710:4722200|4719727_4720609_-|WP_022750216.1|DBSCAN-SWA MKILITGCKGQLGNELQEIIKSGKAEIGEVSEIIKNSEVIALDVDKLDITNLTQVKEILNDLRPDVVINCAAATNVDGCESNEDFAFKVNSIGPRNLAMACEKINAKLVQVSTDYVFSGVGNKPLTEYDLTAPYSVYGKTKLLGEQYVQKFCSKSFIVRTAWLYGYVGHNFVYTMMKLGKEKDMLTVVDDQRGNPTHANDLAYHILKLIETQEYGVYHCTGKGECTWYDFAKMIIELSREKCEVKPCTSEEYKTPAKRPEYSSLDNMMLRNTVGDEMREWKEAIKSFIDKLNK >NZ_CP016089|4713710:4722200|4715093_4715903_+|WP_022750204.1|DBSCAN-SWA MRERKYVKFRVDMFDDTKFKIIDMKPERDLIHYVWTRLVILAGKVNLEGDLYLSKNIPYTIETLSIEFNRSIDQIKLALDVLIELEMIEFSENKIYRVKNFAKHQNIKVNDKIKYKVNENDKNNDKTTKNKEVSEIESEKCNIIDNKDNKTENKTNLNKLQTEVNTNIKNYTVNNLGTNYIDDDSGKPHNNVSNIKHKSNSSNNTDSHNDIPITLQRKKTKKSNKNSNINNLINIIDEDSEDNLLCFFSDEVEERSLAEGEQVIGEWSF >NZ_CP016089|4713710:4722200|4721294_4722200_-|WP_022750222.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGSGTRLYPVTKAMSKQMVPIYDKPMIYYPMSVLMLAGIKDILIISTPRDIVNFKELFKDGQELGLNIEYAIQENPNGLAEAFIIGEKFIGDDNVAMVLGDNIFYGQSFTEHLRKAASLENGAYVFGYYVQNPKAFGVVEFDSNNKVISLEEKPENPKSKYAVPGLYFYDNSVVEKAKSLRPSPRGELEITDLNKSYMQEGSLKVQLLGRGMAWLDTGTHASMLQASNFVEAVQNTQGTYIACLEEIAYRKGWITSKQVIELAKPLMKTGYGKYLMDIVDEVEKSKKEVAVTVK |
7 | Enterobacteria_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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