Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NZ_CP012547 | Campylobacter pinnipediorum subsp. pinnipediorum strain RM17261, complete genome | 0 crisprs | DEDDh | 0 | 0 | 4 | 0 |
1. NZ_CP012547
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
869233 : 874546
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012547|869233:874546|DBSCAN-SWA GTTACCTTTTTTTTATTGTGTTTTGCTTTTTTTGTAAGTCTTCTGCCAGCCTTTTAAAAATATGCGCTATAACATCAACAGTCCAGGCGTTGCCTATGCTTTTATATCTTTGTGTATTTGATACACCTACTGTATAGTCAATAGGCAATGTTTGCAATTTTTCATACTCATTTACGCTTAGATTTCTCATCTTGTTTTTTTCTTTATTGAGATAGTATTGTTTCGTATGTGTTTTGTTTGTTGTTAAACAGTTTGCTTTTTCATCACACACTGTTTTTAAAATATCTTTAATCGCTACCCCATTATGCAATTTAAAACAAAAAGGCTTAAGCTCTCTAAATTCGTGTGTGTCTAGCACATCGTTTAGTTTTATGTTTTTATCTTGTGGTTGTGTTATGTTTGGTATATTCGTCCAATATAAGCGGTTTCTGTTTTGTGCTGATACAAGTGCCGAATTAATTTTTACAGGCTGAACTTTTAAAATATCGCTTATGATATCTTGGCACTCTTTTTTCATCACTACATTTTCAAGCAAAAAGTATTTAGGTTTAACCTCTCTTAAAAGTCGTACAAACTCAAAAAACAAATCACTTCTTTCGTCTTTGAAATTTAACCTTTTACCAGCCACAGAAAAGCCTTGACAAGGACTACACGCTATTAATAAATCGATTTGTGGCAAGTCTCTGCCTTTTATATTCCTAACATCTCCTAATCGATATTCTTTATCTTGTGGATAGTTATTATTAGCAATCTTGATTGCATACTCATTTGTCTCGATGCTATAATATTTATCAATCGCAACATTAGCTCTTTGCAACGCTAATCTACCACAAGAGATTCCATCAAAAAGGCTTAAAACATTTACATCACCACTCATTCATAAGCCTTTATCAAAAAATCAATATACCATTTGGCTTTTTTTAAATCCTCACCCCCATTTTTATCTTTATACCTACAAATATATTTAATAATATTACCTTCGCAAAATCCTATATTGTTAGAAGTTATAAAGTCTATGGGTTCAATCGTCATCTTTTCGTAATGACTGCCACCAATTTGTTTTCTGTTGTTTGTGTTTGCTACCTCCATTATTAACTCACTTTTAAAAAATTAGGTATTTGGGTTTCAACTTTAGGGTTGTATTCTGTTTTAATTGTTTTTGTTTGTCGTATCTCTTCTTGCACGATGTCTTTTGTTTGGCTAATAACACCGTCAATCATTTTTAAAAAATCTTTTTCTTTGCGGTTTATATTAGACAATACGTTTGCCTCTGCCTCACTTGTAACGATACAACAATCAACATCATTCTTTTGCCCGTATCTATAAACCCGCATTAAGCTCTGAAAAAAACCTTCAAAGCTATCGGACAAGCTAGCGTATACGACATTTTTACAATGCTTTTGCCAGTTCATCCCAAAACCTGCGATTTTTGGCTTTGTTATCAGTACTCTTATTTTGCCTTTTGCGAAGTCTTGCATAGCTTTGGCTTTAAACTCATCACTATCACTTCCTTTTATCTCCACAGCATCATTTATAAGCTCTTTTAATTTCTTACCTTCATCATTTAATTCACACCAAACCAAATAATTATCATCGTTAGAGTTGCATATATCAGCTACTGCTTTACATCTATCATCTAAGCTATCTTTTTTTGCTTGTCTTCGCTCTGATAGCGTTTGTGCCACATCTGCAAATAATGAAGTAGTGCTCGCATGCTCTACTTCTATATGATGCATATTTAGTTTTGGGAGTTTAAATTTATCATCTTCCGCGTTAGCATAACCAAGATCGCTAGGTTTTGTAAAAAATGCCACCCAAGTGCTTATAAACTCCCAAAACGGCTTAGCAGCATGCCCTTTTAAAATCCAATTTGATGTATTGCTCCCATCATGTATAAAATACATCGATAACATTTCGCTTAAGCTCATTATGTTTAAAAATTCGGTATGATTGCCTAGCTCGGTGTAGTCATTTGGCGATGGTGTCGCCGAGCAAGCGAGTTTATAAGCAGTTGATTTAAAGCTTACTATTATCAAAGCTCGACCCTTTGAAGTATAGCTTTTTATGTGACTGCTTTCATCTAATACCACAGCTACAAACTCACTAGCATTAAATTTATCTAGCTTTTCATAGCTTGTTATATTTATGCCGTTTATAACATCTTTTACACTTTCACAGTATTTAACATTATATCCCAAAATGTGTTTTATTTCTTCTACACTTTGATGAGCGACTGCAAGCGGTGCTATTATTAATACCGGTTTTTGTTCTTTCTTCCACACTTGATAAGCCCACTCGCCCTGCATGGCTGTTTTACCACTCCCCGTCATTGCAAAGATAGCAAAATGCCCTTTTTTTAGCGCAAGTTGCACTAGGTCTTTTTGATATTCAAACAAAGTTTTATTCAATTCATCTCTTTTTATATCAACACTTTTAAAAACCGCCATTTTTTTCTTTGACCCTAAAAATTCATCATATGTCATATTGTTATCCTTAATCAAATAAACTTTTTTGTTGTCGTTGGTTTATTGCTAGCTTGCAATTTTTAGCAGCAACTTTAAAATAAGAGCTTTTAAGCTCTACGCCTACGCCCCTGCGTTTCATTTTTAAAGATTGATAAACTTCGCTTCCTATACCTAAAAAGGGAGTTAAGACAATATCGCCCTCGTTAGTCCAAAGTTGCAAAGCTCTTTCTATCACGTCAAGTTGTAAAGGGCATATGTGCTTTTCATCTTCATCGTCTTTACTCCCCTTTAAAGCAAGTGTGTTGCTTTGTCTTATATCCATCCAAACGGGGCTAGCATACCTTTGCCATACCTCTATGCTCCCACGATTTAAACTGCCCTTCTCCTCGTTAAACTCTGCTGTTATAGGTTCGCCATCGCCCGAATAGTATTCAAACCCACCGGATATAGGTTCTTTGTTCTCGCCTGGTTTTCTCATGGTTACCAGATAATCAGGTATGCCCTGACGGCTCATAGCGCTATCTTTAACCAATTGCTTATGTAAAAGCCCTAGTGCTTTTGTGCGTTGTTGCGCGATTACTGGGTCTTTCCAAATGCAAACCTCACTATGAAAGATAAAACCAACTTCTTGAAAAAGTCTTATAAGCTCACCCCTAAAATCCCTAATCCCTATAAACCCATCTTTAACTTTTGAAGTAGGTAAATTCATACAATGAAAACTCATAAGCCTACCGCTTTTTAACACCCTAAACAAATCTTTGGCTAAAAACTCAAAATGCTTTATAAACTCACCTTTGTCGGAGTTCCCCATATCTCTATCAGAGTTTGAATAAGTATAAAGGCTATCAAAAGGTGTATAATCTATGCTCTCGTCATCAAAACTTTTTATAACCTCACAACTATCGCCATTGTAGATAGCGTATTCATCTGTCACAACTTGATCTATAACATCCATATTTTTAACCTCTATCTATTGTATTATCGCCAAGCATTTGCATGTTTTCAACCACTACAACATGCTTGCTTCTGTTTTGACCGGTAGTAGACTGCCAAGTCTCCTGCACCAATCTGCCTTCTATTAAAATTTTTACACCTTTGCGAATGTATTCATTTGCTATTTCTGCAAGCCTTGCAAAAAACACAATATCAATAAACATAGTTTTTTCCATTTTTTCGTTGTTTATTGTGTATTTGCGATTTACTGCGACTGATGTTTTACCTATCGCGGTATTTGACTGCATAAACCTAAGCTCTATATCTTTTGTTAAATGTCCTACTAAAATAACTTTATTAAACATATCTAGCTCTTTACGCCTTCGCAAAGCTGATTAATTTTGTCGAACAAAACTATCACTTTTTTCATAGTCTCTTTTATATTCTCATCTTGCCTTTTTATAGAGTCTCTTAAATCTTGTAAACAATAATCTTCTGCTAAATCCTGATCGAAAATTTCCTGAAAAATATGATTTTCAAACACAATTTTTTTATTGTTATTTGTTGCGAATTTATACTCTTGCCTTATCTCTTCGCTTGATAATGTATAACTTAAATTTGGTATAAACAAAGCATCGCACCCATTAAGCCTATCAAGACAAATCCTCATCATCTCATCCCTGCTTTTATTGTTAAATATATTTTGCATATCTAGCGTCATCGCTACAGGCGAAAACAAAGAACAATTTTCTGGAAAATGATTAACCGCTTGTATCATTGCTTGAAATGCTAGCTCTCTCACATATCTTTTACTTTTACCGGCTTTTAAAGCTGTATCGTAAGCACTTGCTACATAAACCTTCATCTTTTACCCTTTAATTTTAATTCAAGTGCTATCTCTAAATGTTTCAAATTTGGATTTATAAGCATTAAATGCTTAATACCTTTTTTACGAAAATAACGACATACTCTAATCGCTCTTATATACTCATCTAAATCGTAATTCATTGTTTACCCTTTTAAAAAATCATTCTTTTTAAGCTTAATCGCTTTCGCATATCTTTAAAAAATGCTATTTGCTCGTTAAGTTTTGCAAGATCAACCCCAAACGGAAAATCATCACTAATATTAGAAATGATCTCATCCATCACCGCTATACTCTCTTGGTAGCTTTTGTTTTCTACCTCATCTAAAAATTTTTTATTTAGTTTAAATGTTAGCTCTAGCCTTTGCCAACCATCAAAACTATTATCTATTTTTTGTTTATGATAGTTTGTTTGCTTTTTATACTTATCATAAAGCAAAATACGACTAAGCCCATAAAACTTATCATCGCAGTTATTAGCATATAGTGATGTGCTTTTACTTGTCACATTACCATCCGTATATTTTTCGGTAGCTTTTTTAAAAAACTCTTTCATCTTATAGCTTATCTCGCCACCACCTTTAAAATCCGCCGCAAAATCATAACTGTAAGTTTTAAATCTTCTCAAAAACTTACCCAAAATTTTATATGTCTCTTTATGCACCTCCCTGCTCGGTTGATAAAGCCCTGCAAAGACAACAGATACATAATACCCATCTCGCTTTTTTCTCTTTTTACAAAGTTTTTTAAGCTCATCCGTATACTCTATAACAAGCATTGAGTTTGTTAAACTCTTAATACCACGCTTAAAGCTTATATATCGTATCTTCATAGGCGTTTTATCTTCGTCTTTTTTGGCTTGTCTGCTTTCATCTTTTTTTGCTTCTTTACTTTTATATTTATAGTCCGCGTATTCTTTTACGCTCTTATTCCTGCTTACAAGCCTAAGCTTTTTAATTAGTTCAAGTTTTTTTAAAAAAGACATCAAAGTCTTTTTTGGTAGTATGAATTCATAACTATCAATCCCACTACTAAACTCGTAATCAATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP012547|869233:874546|869233_870109_-|WP_078387684.1|DBSCAN-SWA MSGDVNVLSLFDGISCGRLALQRANVAIDKYYSIETNEYAIKIANNNYPQDKEYRLGDVRNIKGRDLPQIDLLIACSPCQGFSVAGKRLNFKDERSDLFFEFVRLLREVKPKYFLLENVVMKKECQDIISDILKVQPVKINSALVSAQNRNRLYWTNIPNITQPQDKNIKLNDVLDTHEFRELKPFCFKLHNGVAIKDILKTVCDEKANCLTTNKTHTKQYYLNKEKNKMRNLSVNEYEKLQTLPIDYTVGVSNTQRYKSIGNAWTVDVIAHIFKRLAEDLQKKQNTIKKR >NZ_CP012547|869233:874546|870105_870321_-|WP_078387685.1|DBSCAN-SWA MEVANTNNRKQIGGSHYEKMTIEPIDFITSNNIGFCEGNIIKYICRYKDKNGGEDLKKAKWYIDFLIKAYE >NZ_CP012547|869233:874546|872997_873495_-|WP_078387689.1|DBSCAN-SWA MKVYVASAYDTALKAGKSKRYVRELAFQAMIQAVNHFPENCSLFSPVAMTLDMQNIFNNKSRDEMMRICLDRLNGCDALFIPNLSYTLSSEEIRQEYKFATNNNKKIVFENHIFQEIFDQDLAEDYCLQDLRDSIKRQDENIKETMKKVIVLFDKINQLCEGVKS >NZ_CP012547|869233:874546|870323_871715_-|WP_078387686.1|DBSCAN-SWA MTYDEFLGSKKKMAVFKSVDIKRDELNKTLFEYQKDLVQLALKKGHFAIFAMTGSGKTAMQGEWAYQVWKKEQKPVLIIAPLAVAHQSVEEIKHILGYNVKYCESVKDVINGINITSYEKLDKFNASEFVAVVLDESSHIKSYTSKGRALIIVSFKSTAYKLACSATPSPNDYTELGNHTEFLNIMSLSEMLSMYFIHDGSNTSNWILKGHAAKPFWEFISTWVAFFTKPSDLGYANAEDDKFKLPKLNMHHIEVEHASTTSLFADVAQTLSERRQAKKDSLDDRCKAVADICNSNDDNYLVWCELNDEGKKLKELINDAVEIKGSDSDEFKAKAMQDFAKGKIRVLITKPKIAGFGMNWQKHCKNVVYASLSDSFEGFFQSLMRVYRYGQKNDVDCCIVTSEAEANVLSNINRKEKDFLKMIDGVISQTKDIVQEEIRQTKTIKTEYNPKVETQIPNFLKVS >NZ_CP012547|869233:874546|873491_873638_-|WP_153300935.1|DBSCAN-SWA MNYDLDEYIRAIRVCRYFRKKGIKHLMLINPNLKHLEIALELKLKGKR >NZ_CP012547|869233:874546|873649_874546_-|WP_078387690.1|DBSCAN-SWA MIDYEFSSGIDSYEFILPKKTLMSFLKKLELIKKLRLVSRNKSVKEYADYKYKSKEAKKDESRQAKKDEDKTPMKIRYISFKRGIKSLTNSMLVIEYTDELKKLCKKRKKRDGYYVSVVFAGLYQPSREVHKETYKILGKFLRRFKTYSYDFAADFKGGGEISYKMKEFFKKATEKYTDGNVTSKSTSLYANNCDDKFYGLSRILLYDKYKKQTNYHKQKIDNSFDGWQRLELTFKLNKKFLDEVENKSYQESIAVMDEIISNISDDFPFGVDLAKLNEQIAFFKDMRKRLSLKRMIF >NZ_CP012547|869233:874546|872656_872995_-|WP_078387688.1|DBSCAN-SWA MFNKVILVGHLTKDIELRFMQSNTAIGKTSVAVNRKYTINNEKMEKTMFIDIVFFARLAEIANEYIRKGVKILIEGRLVQETWQSTTGQNRSKHVVVVENMQMLGDNTIDRG >NZ_CP012547|869233:874546|871725_872652_-|WP_078387687.1|DBSCAN-SWA MDVIDQVVTDEYAIYNGDSCEVIKSFDDESIDYTPFDSLYTYSNSDRDMGNSDKGEFIKHFEFLAKDLFRVLKSGRLMSFHCMNLPTSKVKDGFIGIRDFRGELIRLFQEVGFIFHSEVCIWKDPVIAQQRTKALGLLHKQLVKDSAMSRQGIPDYLVTMRKPGENKEPISGGFEYYSGDGEPITAEFNEEKGSLNRGSIEVWQRYASPVWMDIRQSNTLALKGSKDDEDEKHICPLQLDVIERALQLWTNEGDIVLTPFLGIGSEVYQSLKMKRRGVGVELKSSYFKVAAKNCKLAINQRQQKSLFD |
8 | Synechococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
883699 : 896674
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012547|883699:896674|DBSCAN-SWA TTTATATATCTATACCACTTATAAGAGTAGCAATGTCGCTATCATAATTTAAGCCCATTATAGAAGTTAAGAGTGTTCCTCTTTTTTGTGGTTCTACCTTTTGCAAAGCACTAAGAAATTTAAGTATAGTCCCTTGCGCGTCTTTTTTCATAGCGTTTGAAAAGTCGTTTATATCTATCCCCATATCGCTAAACGCTTTTTGTGCTTTTGGTGTGGCTGATTTTATATTGTTTAGCTTTTTAAGTAGTGCTTCGCTTGCAGTTGCTGCTGTTTCTGGCGCCTTACCAAGTGCGATAAAAGAAGTAGCAAGTGCGGCGGTTTGTTCTTTGCTTATGCCTACTTGTTTACCTATGCCTGATATACGCTTCATTACTTCCACTATCTCGGAGGCTTTGGCGGCGTTTTTGTTTGATATGTGGTTTATCGCATCCATCATCTCGCCCGTTTCGTCTATGCTAAGAGATGGGATGTTTTTTATCTTCCCTATGCTGTCCCCTGCTTGTTCGGCGGTTATGTCAAAGGCTACTGCTGTTTTTGATGCAAGTTCAGTAAATTTAAATAACTCATCTTTTGCTATACCCATTTGAGCGCCTGCAGCGGTTACTTGTGATAAGCCTTCTGCGGTCATTGGTATAATTTGACTCATTTTTAAAAGCTTATTTAAAAATAGCTTTACTTCTTCGGGAGTGTCAAAATCAACTACCTTTTTAACATCAGCCATAGCACTTTCAAAATCTATAGCTGTTTTTATAGGGGCTTTTACTGCACTTATAGATGCAAAGGCTGCCAATGCTTCGCCTTTAAGGTTCATTATTTTCTTTGTTGCTTCATCTATATTGAGGCGTATTTTTGTAGATGTGGCTTTGATTAGGTCTTGCTTTAATTTGTCTAGCTTTTCTTTTACTTTTTGATCTGCTAGTGGGTTGGCTTTTAATTCTTGTAGCCCTTTTTTGTAAGCCGTCATTGCATCTTTTGTTACTTTGTTTAATTGATTGCTAAAACTTCTTGTTTCACGATTTACAACACTCATCGCCTTGTTAAAATCGCTTAAATCCATTCCAAAGGTTAATATAGGTTTTGCCATAAAAAAGCCTTATAATTATTTATTATGATACAATAACAAATAGTTAAGCTTAAAAAATACAAGGGAGCTAATAGCAATGGATGATATTGTCGTAGCGTTTGCGAATCTTTTTGGTTGGGTTATGATGATTATTTTTATTATTCTTGTTTATATAGCGGCAGAGTGGATGGTAGCAACTTATGCATGGGTATGGATTATCCCCTTAGCAATTTTATATTTTATATTTAAGAAAAGAAAGGCCAATTCAAATTTGGATTAGCCTTGTTGATATATTGTAATATTCTACAAACTCATTAAAATCTAAGTTCATAATATCACTATATGTAAAATGTAGGCAATGCCCTATAAGAGCAATGCCCTCTGTTAGTTTTTTATGTCTATGCCTATAAACTCGTTTGCATTCTTAGCAAGGTTTATCCACTCATTAAGCGGTAAGCTTCCTAAAAATTCCTTGTCAAGTTCTCCATCACTCATTTCTATAAGCATAAGTTTTATTTGTTCTATGTCATCACTTGTTCTTTTTTGGATGTTTTGCATTTGTGCTAAAGTTGGCGATTTTAAAATTACTGTTTGGCCGTCTGAAAAAGTATACTCTTTTTGTGGTAATTCTATTTTTTTAAGTCCCATTTTTTTACTCCTTGATTTTTTATATTTTTAAAGCGTCTTGTTTATAAGACGCTATAACCTCATCACTAATTTATGATATGTTTTTTCTTATAGTGGCGTATAAATCATCACCATTTACAGAATATACTTTGTTTTCTATATCATAAACTAATACAGCTTTTTTATCTACTTCGTATTTGACTGTATAGCAATTCATCTCAATTACCATATTTGCCTCTTTATTCATTTCAAATTTTGGCGTTTCTAGTATTTTTATGCTACCAGTAAAAGTAGCCACTATCGCTACTTCTGCCCCTTCGCTTCCTGTGTTGTTTGTTTTAACATAAACCTTCTGATGTTGTTTTGTGTTAAGCAGTGAAAAATATACATCGCTTACGTTATTTACAGTAAATTTAGCTGATAGCGGTTTTAGCGTTGGTAATACTAGCTCATATTTGCCAACTTCTGAATTCGCTTCTAGTGTCTCGTGTTCGAATTTTGGCGGTTCAAAATCTACCAACTCGCCAAAACAACCTACCCCATCAATAAAAAGGTTTCCGCCTGTTATTGCTTGTGCTTTTAACATTTTCTTACTCCTTTATGTTTTCATTACCAAGTGTTTTTAGCTCATCTTCATACTCTTTTATTTTTAAAAAAGTATTACTTAACAATATACTTTTATTTTTATAGTTTTTAGTTAGTTCATCCCATACGCTAGGTAAAAATTCTCTATTGAAAGATGACACTATAGCCTCTTTTAGTTCGGCTAAGGCTTCTTTTGTTTTGGCGGCTATCTCTTTTTGTTCTACTATTCGCCCCATTAGTTCATATTTATTCATTTTTAAAGCTCCTCGGTATCGTTTAATTGTTCTTGCAAAACTTGTATCTCTTTTTGTTTTGATTTGATTGTTTCATCTGCTGTCTTTAAACTTTCTAAATATCCAAAAAGCAAATTAAAATTTAAAGGCTCATTCAAAGAGCCTACAATATCATTTTTCATTTTGTTTTTTAAATTTTGTGCTTTTGTTACCTCTTCTCTTGCTTCGTATATGCTGCCTTTAAGTTCAAGTCTATTCATTTTTAAAGCTCCTCAATTAGCACTTGTGAGTATTCTGCAACTCTGTAAATTCTATTTGTTATATTTTTAATTAATGGCATTTCTTGTACTTTATGCTGTATGTAGATTTTGCCTTCACTTATGGTTTTGTTTGTGTTTAGCTCAAGCGGGATAGTTACTTCAAAACCAACAGCAACGTTATTAGCCACAAGTCTGCGATAAAAAGCTTCTAAGCTATCAACTACATTTTTAAGTACGTCACGCATTCTTTTATCAATAGCTCTTTTTTGTGCCTCGAAGATTGTTTCTATGGCAGTGTAAAATATAACATATGTATGTAAGCTAGAAAAGTCTTCATCTCTTGTTTCGCCTCCCCACGCGCGAATTCCATCATCTACAAAAGCTACAGTAATGCCCTCACCTCTTAGTCTATCAGCCTCACAATCAACGCCTTGGATATATTCAACTGTATCAACTAATCCTGTAATATCTGGTATTACTCTGTTTGAGTATGTTTGTGAAAACCCATACTCGGTTTTAGCCATCACTTTGGCGTAAAGAGCTAGTAAAAACATACTCATTAGGTCTTACTGTTTTATCTACTCTAGCTACTTTTTGATAAGTGATTATCGCCATTTTTGTTTGTAGTGTTGTTACTGCAGATTTTGCGGTGGTTTCGTTTGTTGCATTTATTTCAATAGTATATACCGCCCTCAGATACTCGGCTACTTGTTTAAGTTTTTCATATACTCCGTTATCGTTATATTCAGGGGCAGCTATAAATTTCGGTTTTGTCATTACTATGCTTTGAGCTTTTTTAAGCTCATCTACTGCGTTTATGCAAGATGTTAAATTTGCTTGTTTTTTTGTTTCTTCGTCCTCTTCTGTGCTTGGTGCAAAAACATTTAATACCACTTGTGTGTGTATCCCACACGCCTTTAAATCATCAAGTGCATTTTTTACACTTCCGCGCTCTACTTTAGCAATCGCATCATTAACTGAACTATATACATATAACCCCGCTGCTAATGTGCTATCATCACCAACTATCGCTATTGGTCTTTGATTGTTGATCTCGTATGGGTTTAGTGAGCCGTTATAAAGCTCTACATTAACGCCGTATTTGCTAGGCATTATATCTCCTTTTTTTAAAATTGATTTATTATCTTTACTTCAAAATTATCGTAATTTATAAGTTCAAGCAATTTACTTAAAGTTGCCACAGAATTATAAATTCCTTTGTTGTCGCTTCTATTCCCCACTAAAAACACCCCTCAGCGTCTTGCGGGAAGTTGCCGTTATGGATCAAAATGTATCTAACTTTTTTAACTTTATCGTTAAACAAAAGCGGTAATCTTCTTTTAAAACGCGGGCTTCTGTAAAATATCGCTTTATAGTCTCCTGCTGGTATTCTTTTGTCTTGATTTGGAGTTTCGCAGTCCTCGCCTTTTGGTTCTAATGTTACGCCTTACAAAAGCGATAGGTTTGCGTCTTTTAACTCAAATCTTCCGATTGTTCCATCATGAATATTTTTAAATCTATGTATGTATAATGTTTTCATTCACTCCCTTTATTCGTTGTTTTTGTCTCTATGAATTTATCAACTATGCTATTTATCCACTCAGCACCTCTCCATGCGACAAACCCACCAACGGCCAAAGATAATCTTTCATGGTCTGTAAAATAGTATGATATTTCATAAGCAATCCAACAAAAAAACATACTAGATATTGCACCTGTAAAGAAGTTGGCTATCTTTCTTGTATTTGTCTTATCTTCACTATACTTATCATTTAAAAATCCAGCCACAAGACCAATAATTGCTATCCAAAGCAAATAACTATTTTTTTCAAAAAATATTAAGATATCATTCATCTATACATTCCTTTAAAAGTATTTCTATTTGTTTATAGTATTTAGATAGCTCTTTTGCTGTCTGTGGATTTTTTTCATCAAACGCTGGTTTATTTGGTAGCTCTACTTTACATTTCACTGGCACGTATACATCTTTATATTCTGTTTTTACTATCACTTGCTTATCAGCACAACCTGCTAAGATAATCAAAAAAACAACTACAAAGATATAAAATACAAACTTACAATTTCTGTTTTTAGTTTCTGTTTTCATCACGAAAGCTCCTTAAAAAGTTGCTCATAGTATTTTAGTTTTACATTACACTTGCTATTTGCTTTTGGTGTTGTTATCTTTTTAAATTTATCATCAAGTTTTATAAGCTCATTATTTAGTTTTTC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP012547|883699:896674|884858_885041_+|WP_078387711.1|DBSCAN-SWA MDDIVVAFANLFGWVMMIIFIILVYIAAEWMVATYAWVWIIPLAILYFIFKKRKANSNLD >NZ_CP012547|883699:896674|894922_896674_-|WP_078387729.1|capsid|DBSCAN-SWA MDKEFLKELQNFSISFAKDAAFDDENKTISFVALSKDNLHKRTSFWGDEYYLSVDTSNVKFNAKTLYKDHNPTFENAIGKIVDTKFENGTIKAKVQFNDEVRESKEAYAKYKAGFSNSVSVGFGEYKVKEMDKIDGIDHYQIYEGEIIELSAVWQGTDKNAVVSKFNKSIKEGGQMPEAIKKLQEEAAPDTQKLQAEQEVQTFNKAQQTQSEERANIIELAKIMGREKEGLDAISEGKTYAQFSKEMAALNSQSEVKKVNIITNKTDDANFSLAKIIRSAVDRNIDLSREMQNSGKEIGRFALPDEFVAQFNDTITKTSNTGDIVNQSYRSDLLVDQLKQESKLLGLCTWLTGLHAAVTIPRDTSNITADFVEEGGTRDAEKLAFDNIKLAPHTLNANIVITRTMLNMAAIDLESFAFKKLKEAIRKKLELTMLYGGSVVKGLFDTSGIPTVQNYMKAPTLDLTLKFGDLLDASGANTDHAKFFLNGTDISKLRATKRGESLDRMLIDVGDTDLQGYQYFKNNNLKSGDVIFGNFEDIYVGAFGSLEVLPLMQRGGDVLLQAFYDIDIKFAREKSFAVSKTSD >NZ_CP012547|883699:896674|883699_884782_-|WP_078387710.1|tail|DBSCAN-SWA 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21 | Campylobacter_phage(28.57%) | capsid,tail,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1001622 : 1010720
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP012547|1001622:1010720|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP012547|1001622:1010720|1006061_1006334_-|WP_069637524.1|DBSCAN-SWA MQKLLICYDLYKQGQNYKGIDNLIQTLGDCRRILNTTWILKTKYSYDRVFDKLQNECLDSNDKCLVFELPDELNGIISNLGKDVTEWINS >NZ_CP012547|1001622:1010720|1003803_1004034_+|WP_078387807.1|DBSCAN-SWA MSSLKISKEIVSDFIKFGKEMTATDFKRSNANQYLAPLAKQGILQSRWHTNDKGTKCKMYRINDMKKALKFLGRTA >NZ_CP012547|1001622:1010720|1009526_1010720_-|WP_078387814.1|integrase|DBSCAN-SWA MPKIANSLTAIAIKNLKPKDKPYFVSDGFNMLLKVSVNGNKSFILTYKSPKTNKQRRYTIGTYPTMSLSEAREKRIELQKQIANGIDILEQENYKDFQTIYQEYIKTRTEITPKHLQRISSIFNRFILPKFANANIKNITRKEIVDALTPLQDKQETIRKSLTFLNHFYKYALLHEYTNHNIITDINKKTLIGKMEVRHYVFLKDDQDISKLLRNIREYSGDDRIKVCALLQLYTAVRGANARFAEWSEFDFDKSLWSISAEKMKAGKAHEVHLTNSIKNILLDYRQKYSFNSKYLFPSLRTTLKPISDNTVRTMLRNLGYSNEQITPHGFRATFSTICHENIDIHKHSSDVIELCLAHIETNKVKDAYNHAKNLKQRASLLKWWSDYLDNLYSPDM >NZ_CP012547|1001622:1010720|1004034_1004553_+|WP_078387808.1|DBSCAN-SWA MFKDLTLDDITFLENLGNEMSTQDTRSTAQPCGLVLLSKKYKTVDSRFGYDNYCLSSDGLCLAEGLEDSKKYLIDLAQEMNKKFIPLINDIKEDDELEEFLDSHNYEFDSIHYNAVKTSWECDPNDFFFTFSNEEAKQHENKHTKSYMVYLGASPKTKRLVEILLKIGAKDV >NZ_CP012547|1001622:1010720|1006420_1006660_+|WP_078387810.1|DBSCAN-SWA MIISSDDVNLNPITLIIKYKQSTYEKLSEHLGYSIEELKEFEKLNHKELPLPFVKALKLYIELIRIKLSLKDIDSELYV >NZ_CP012547|1001622:1010720|1008597_1008861_+|WP_078387812.1|DBSCAN-SWA MIEDILKERQKTHGDFGLQSFYAQNIKKYIKSEKYKLTVGQIEALEMIAHKIARILAGNPNYKDHWDDIAGYATLVSKELENDKRTI >NZ_CP012547|1001622:1010720|1001622_1001865_+|WP_078388208.1|DBSCAN-SWA MYYGNENIVKHTCRILGITQKELAEMIGVADNTPAQWATQKEPPEMAIKFMNLLLAHNKVKKQLDKFKQAFKLLDEAKQS >NZ_CP012547|1001622:1010720|1003589_1003823_+|WP_078387806.1|DBSCAN-SWA MNIMTPTKYLYDKEPSELLDLTPIGNERIKLARELLTKLQEVPFEARDDQRISKVYKAINFWQDLLIERYNDELLKN >NZ_CP012547|1001622:1010720|1005745_1005991_+|WP_069637523.1|DBSCAN-SWA MSDEKIPIKDIKGLDFKCNACGLSLSYPLATQQTFINECPNCGIEWIPSQLNIESVRNLKNIFKILSNAQGANISLSFTKE >NZ_CP012547|1001622:1010720|1002037_1002769_+|WP_078387804.1|DBSCAN-SWA MKNLFTATNKAHTFQTFTTEQVANGYGVALTTIRNHKAEHSDEIAENIHFVYEVISTNGGKQEMLKWTLRGIVKLGMFIRSKEAKKFRLWAEQELEKSILAELEKANEIREKNITYVNEISNLKAYQMAQGKHHNYQVLGYKSQISQKNKEIVALKQELVKAQKIYTAQVDDDSYKAMYKNAILERNYYYQKCQKLKECFFTKEQKTFQILNDIRTQLDKTYTDVGALIAYVWEDNDYFIENR >NZ_CP012547|1001622:1010720|1005355_1005733_+|WP_069637522.1|DBSCAN-SWA MNYFTIADAIELHDQIISNMGGANGYNEVSIGYLDSALEQIQNDEYYPTFIDKLTHLVFSCVKFHPFLDGNKRTSIYLGIFFLELNDLEGYFVYFADKMEDVVVDLASGKVSKEELKEIITNIIY >NZ_CP012547|1001622:1010720|1008841_1009381_+|WP_078387813.1|DBSCAN-SWA MTKEQFNDIQERLKVYRKERGLTYENQSNGLMANILEELAEYLRAGDDNERIDALCDMAVFILNSFELKKYEIEEILYFLCDEDECFINSTFVNDIFELVDNYITFGKRDNKYLGRSLFILFLGIKDKNYDIYKCMLETIKEISSRTGYYDEIQKKFIKDKNQLNEYKADYESCKKEIR >NZ_CP012547|1001622:1010720|1009377_1009560_+|WP_069637531.1|DBSCAN-SWA MNDTFIPAKQAKEMLGVGDTTLWRLARDKILDKRKAGHKTVYYSLESINRYMSGEYRLSK >NZ_CP012547|1001622:1010720|1007518_1007749_+|WP_069637527.1|DBSCAN-SWA MADEKENIVKKVCKELGITQAELGRQLDVPPSTVGTWASGKTPKMAEVALTLMLENKEQKEILEAIKKARDFIGKI >NZ_CP012547|1001622:1010720|1002778_1003579_+|WP_078387805.1|DBSCAN-SWA MSTEITEIQTQMQRFELEQRQAKAFSMSVFFPQHLKGQGPNAQLISTSNAVVVYDLAYRMNVSPLEIAQSIFIIYGKPSFETKFLVARLNMSGKIKGRLKTIISDDKKSAYCEAIDAETGETYRGSTITLDMAAAEGWLSKSGSKWKTMPELMLRYRAQSFFINEYYPEVKLGIKSKEELQDSDEITIQPKKPNLNEIVSEKEKKELLEVEIEPQTLPHDELEKELVARGIDEDLAEDVVSRFSKEQVLQLLSDPNAIDNLIEQSA >NZ_CP012547|1001622:1010720|1004545_1005055_+|WP_078387809.1|DBSCAN-SWA MFNKIVLVGNLTRDIELRYTESGLALGNSAIAVTRKFTTNGEKREETCFVDITFFGKGAEIANQYLSKGSKLLIEGRLKQDVWQDQQGNNKSKHSVIVENMEMLGNTNNNANNTYNTNGNCNTNAKNSHQSYQMNNYQRPSQKQTIQENQQIDEEYNDRYEQSDNTIPF >NZ_CP012547|1001622:1010720|1007875_1008601_+|WP_078387811.1|DBSCAN-SWA MNDLVINHNGTLTTTQDKVSILTDNNELSVQKLIRTYKQDLEEFGNLEFEDELICNSKNKMNSKKVYYLNEQQATLLLTYMKNTKQVREAKKILVKAFYELKSENQRLKHEKYINEISSLNATLISKAKRHQRVVNAYKSNLSQKNNKIVALKQELKNANSSLNYEARYKNAMLERDYYFKKYKDLEEKHKFKEEVTFKVLDKIRSQLDDAYGDISALIPYVWEDNAYFLKQRLDKKRIER |
17 | Vibrio_phage(33.33%) | integrase | attL 998317:998341|attR 1011105:1011129 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1617093 : 1626232
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP012547|1617093:1626232|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP012547|1617093:1626232|1617093_1618176_+|WP_078388088.1|DBSCAN-SWA MLSQKIIDRKISQNKYKSVEYIYKFIINILLVGHIISFVLLLIFDLGLSIYSLIVLIFSFYIKYKYNEKFQNLVSLWFHLNTLILSAIFTYKFGWNSGFWYFVFGLIFISYFCAFDNLIFTYSLSAFETIFIVSLYFFTKDKINPNIDATTYQIMYITCFTITFFIVFRMYLFASIITSQDYKSLIKEQLELEKISQYDQLTGILNRRSMQKLVEKDEEFIKKNKIKTNSVLLLGDIDDFKHINDTFGHIYGDKIIKDVSNTLKNTFRKNDLVCRWGGEEFLIVLNDVNVEFIYDLSDRLLKNISLIKLPNNNPITMTFGMVVNLNSNSNSFEDNIKKADELLYKGKRDGKDKVEIEIIR >NZ_CP012547|1617093:1626232|1624513_1626232_+|WP_069632750.1|DBSCAN-SWA MQYLIDFLNSNEKDIGISKILNTSEEQTKILRHLSKSYVDGVFSLSVFDILSSVFTIENFSHIEHLKDIKSLIENGWIVQNFGVFRTEQKISQSLLPLLNCEVSLSLNFLKILEDGDLNLELPNAVAYDENLQYLKDQFLRIELYEKKSLLSAKSEVKLKINNQISKLEDYIKQRIELSKIDIVTEQIFKDNTLNEKEELIFLTLLRQEYSNDFENQRELDNLISLVSEDEFECVKNRSLLDDNSKLLDSGLIEYDEILNSYSTISKNFFINEDVLQSIMHPKNSKKEKKIKVDSIIKDYQIFELIEPTTNINDVVLNEKTKELLDTILKQVDKKVLNRLNTWGIKNRKSIDAKIIFYGEAGTGKTMSAVSLAKSLKKQVLSFDCSKILSKYVGESEQNVRKIFDSYNEICKKTKTEPVLLLNEADQFLSTRIESSSGAEKMHNQMQNIFLEQIERFNGVLIATTNFLQTLDSAFSRRFDYKIEFKKPDFDSRLTIWRKVLPQNADFEDNFDIKNLAKYNLSGAQIVLVMKNTALKVAVKDEPIFLFDDFKSTIERELSSAFGEDKKVGFGS >NZ_CP012547|1617093:1626232|1620473_1620782_+|WP_141071288.1|DBSCAN-SWA MQIYNTALNIANIKIYNKICINRACFEKSEFNKRFFLDSYYDEMFEDILLQKPIYNRKNLQKTECGFNQNINNNLIQYEVCDNNVKFIDTKNKIKIILRENK >NZ_CP012547|1617093:1626232|1622897_1624514_+|WP_078388095.1|DBSCAN-SWA MIYKYQNLYENLEAVVKANPKSVAIFEDNKKISYKELKNKIDKVGAYLENVGIRHGDKVGILITNSQEFIISYYAITAIGAVAVPLNTFLKSDEIKYILKDCEAKALFLSTSFQKELQKVDDTYISNFIWAGGVPKTFTKTDILYTQSCNETVESLHFDNKPDESIKHICFEELYTFPKKLDFVKKPMLDDLCHIIYTSGTTGKPKGAMITYKNIFSNVVKTSERFKASKKDRFVVFLPMFHSFTLTLMVILPLCYGSSIILVKSVFPFSNVLKQTLLKRATIFLGVPAIYTAIGKAKIPWYFKWFNNVRLFVCGAAPLAKQTIDDFSAKFPRASLVEGYGLSECSPVVASNLYEKQKPLSVGIPLDGYKVKIVNDEMVELPIGQVGEIIVKGDCVMKGYYGMDNSDVIINGWLRTGDLGKIDEDGFIYIVDRKKDLIISKGINIYPREIEEVIYQLEEVEAAAVIGVSDEHADEEVVAFVQLKEGMNIDEKEIKKYLKKYLANFKIPKNIYFSDELPRNATGKVLKRVLKEQVKDKI >NZ_CP012547|1617093:1626232|1618172_1619234_+|WP_078388089.1|DBSCAN-SWA MSRSLTLTKDLYSKIEYILRITNILAFAAHASYFVIFLIMEQYILVTVNSFSIIIYLFIQAAYTNPPNNSKILLTLFQFEIMIHALICIMVLGWGYGFEMIFITFIITIFFVETSYKKVTYFLTFIQFALFVICCLKFYDIAAKNTFWKDFCFIYNFIIMSFLAMVLSYMLEISNQVAYLNAQREKENIKNISNQDPLTKLSNRHSLQDFIKKYLSKNKQFILVLSDIDDFKKANDFYGHNVGDSILVHISSLLKNILREDDFLCRWGGEEFLIIMLDIDKNSALNVIKRAKNILNTTFVKHGDYEIKTTMTFGAVYHDKDEEFDIETMIKKADDLMYKGKKTGKNKIIYDFK >NZ_CP012547|1617093:1626232|1620778_1621633_+|WP_078388092.1|DBSCAN-SWA MKYIGAHVSASGGVENAPLNAAKIGADAFALFVKNQRQWTAADLSEKSIAAFKQNCEKANIKPEHILPHDSYLINLGHFDDEKREKSFNAFLDEIRRVHLLGLKLLNFHPGSHLKEISEKECLDNIVKCLNLALQETENVRLIIENTAGQGSNLGYKFEHLAYLIENVIDKTRIGVCIDTCHLFAAGYDIRDEKSYNKTMKEFDDIIGYEFLSAMHINDSKFDINSRKDRHESLGKGFLGLNAFKNIMNDEKIDDIPLILETIDDSIWDKEIEILRNFTRRNNV >NZ_CP012547|1617093:1626232|1621625_1622888_+|WP_078388093.1|DBSCAN-SWA MFKKVVFGTVAVASLLNAAGYKVPEQSSDAVSLLSSNIATSFGADVAYYNPANMMFLPENRHYFEANLAWFHINSVKFNSNNSKSYKSNKFDSLASTMHSVSPEYYENFRFGMSLAVPAGVGISWDDPDTAFTAKRFKLKVIELNPSVAYKVSDNFAVATGLRVVYTKGMLANELYGLGDRALHGDGVDFGYNLALTYKPTPNWSLAATYRSKIDLDIKGNSKINVKQFGINYNGKVEVNIPLPAQLALATSYKIQDTTLMFSYERTYWSKFTGYDFEYPGRNPMQNKLAEGFFQLAFDNKVIRDYRDTNTYRFGVAHDATDRLRLMAGFVYDQKAAKNKHSVSLELPDTTSLAYSLGLNYKINHDLELSLGGLYQDRKKNDSSIKMAKLNNGMPMPFNQDGEISKAAIWIINSGIKYKF >NZ_CP012547|1617093:1626232|1619316_1619934_+|WP_078388090.1|DBSCAN-SWA MFKLRNLPFDSKSNLVVSEKTCEYHHGKHHATYVANLNNLIKDTEFANSSFYEILVGAKGGLYNNVAQVYNHDFYWDCIAKKSEMSDEFKKALQAEFPNFKEDFIKAATTLFGSGWAWLVLDPKTSKLEIVQTSNAATPVNDGKVPVLVVDVWEHAYYIDNFNARPKYLETFFENINWEFVSEAYEWAKKEGLGSVQHYTQKIHG |
8 | Bacillus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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