CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP001973	Spiroplasma eriocheiris CCTCC M 207170 chromosome, complete genome	0 crisprs	cas1,cas2,cas3,DEDDh	0	0	1	0

1. NZ_CP001973

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	477971 : 484934	9	uncultured_Mediterranean_phage(28.57%)	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP001973|477971:484934|DBSCAN-SWA
AATGAAACAGTATCTAACAATGGCCCAATTTATTTTAGATAATGGTTTAGCCAAGCAAGACCGAACTAATACCGGAACAATTTCTTATTTTGGTTATCAAATGCGCTTTAATTTAGCGGAAGGGTTCCCCTTGTTAACAACGAAAAAAGTTCATTTTAAATCAGTGGTGTATGAATTACTTTGGTTTATTAAGGGTGACACTAATATTAAATATTTAGTTGACCATAATGTCCGAATTTGAAACGAATGACCATATGAAAAATATACAAAGTCACCAGATTATCAAAATGAAACTTTAACTGAATTTGTTGAAAAAATTAAAACAGATGATGAATTCGCAAAGAAATATGGGGATTTAGGTCCAGTTTATGGAAAACAATGGCGTAATTTTGAAGGAGTGAACCAACTAGCAAAGTTAATTGATAATTTAAAAACTAACCCTTATTCACGTCGTCACATTTTAAGTGCTTGAAATCCAAAAGAAGTTGATAATATGGCCTTACCACCTTGTCATACCCTTGTGCAGTTCTATGTTTCTCAAGATAATAAATTAAGTTGTCAATTATATCAACGCAGTGCGGATGTTTTTTTAGGAGTTCCGTTTAATATTGCGAGTTATGCGTTATTAACTTATATGATTGCCCAGGTGTGCGGTTTTGAAGTTGGAGATTTTGTTCATAGTTTTGGTGATTGTCATATTTATCAAAATCACTTAGCCCAAATTAATGAACAATTAACGAGAACGCCCCGCGTATTACCAACCTTAAAATTAAACCCCGGAGTAAAGTCATTATTTGATTTTACTTATGAAGATATTGTTTTAGAAAACTATGATCCATATCCGGCCATTAAAGGTTTGGTGGCAGTGTAATGATTAAGTTATTATGAGCAATGGATCAGCATGGTTTAATTGGAAAGGATAATCACTTACCATGACATATTAAAGCTGAACTTCAACATTTTAAAGCCGAAACTCTTAATAAAACAATTTTATTAGGACGGACTACTTTTGAAGGAATTAATCGGGTGTTACCTAATCGAAAAACAATTGTGGTGACTCATAATCCTAACTATTACTTTAACCATCCGGATGTGCAGGTTGTTCATGATTTACAACCAATCCTCATAGAATATCAACAAAATCCGAATAATGAGTTAATAGTTTGTGGGGGGTCAAAGGTGTATGAGGAAACTTTACCTGTGGCGGATGAGTTAATTATTAGTTATATTAAGGGTGAATATACTGGTGATACTTATTTTCCCCCTTTTAATCTTGATGATTTTGAATTAAAATTTATTCAAGAGTATGATGAATTTACTATTAAAAGATATGTGAGAAGGAGAAGAACTTAATGCCAAATATATGAAAAATTATCTTAACATTGCCCCGTTTTTTACGAATGTTAACAAAATCAAAGAGCATGGCCAGAAAAATTAAACGTGATCCCAATATTGTTTCTGAGGAATACCGTTATCACTGGCTCCAAAAACGAACAAAGTATATGTTATGAATTTTTGATATTAAGTTAATTGTTCATAACGAAGAAAATTGAATTGATAAGGGTTGTTTGATGGTTGCTAACCACCAGTCAAATATTGATCCTGCTATTATTTTTCGGTTAAATGATTTTAATAAAACCGCCCCGTGTGCTTTTATTGCCAAGAAGGAATTAGCAACTGACAAGCGTTTTAAAAATTTTGTGGCTTTAATTGATGTGTTATTCTTAGACCGTAAGAATCCGCGTCAAGCAATTGAAGTTATTAATGAAGCAAACGAATTAATTCGTGTGCCCCGGACAATGGTTGTTTTCCCGGAAGGAACCCGTAGTCATCAACAAGAAATGGGAGAATTCCAAGCGGGAAGTTTTAAAATCGCTCAAAAAGCACATGCGCCAATTATTCCAGTGTCACTTGTTAATTCATACCAAGTTTTAAATAAAAAAGTTAAACAAAAAGGCAAGAAATATATTCATGTTGTGTTTCATAAACCAATTAAACCAGATACTTTTATGACCAAACCAACAGACTTAATTTCGAACAATGTTAAACAAATCATTCAAAAAGGAATTGATCAATATAAAGATGTTGATCATAAGAAAGCCTATGAAAAATATCGTGCCGAATTAAAACAAAAAGCCAAAAATGCTTAAGAAATACATAGGAGATGAAAAAGAATGAGACTTTTAGACTTAATTGAAAAGAAAAAAAATGGTCAAGAACTAACCCAAGAAGAAATTAAATTTATTATTGAAGGATACACTACTGGGGCAATCCCTGATTATCAAATGTCAGCTTTTCTAATGGCAGTTTTTTTCCAATCAATGTCAATTACTGAAATATCATATTTAACTGATGCGATGATTCAATCCGGAGAAGTATATGACTTATCTGGAATCCGGGGGTTTAAGGTTGATAAGCATTCTTCCGGGGGAGTTGGGGATAAAGTTAGTTTAATCTATGCGCCCTTAGTTGCTAGTTTTGGGTTAAAAGTAGCAAAAATGTCTGGACGCGGCCTTGGCCAAACCGGGGGAACAATTGATAAATTAGAAAGTTTTCCGGGGTTCAAAGTCGAAATTTCCTTTGCGGAGTTTGTCCGGATTGTTAATAAAACAAATATTTCAATTATTGCCCAGTCAAGTAATATTGTTCCCGCAGATAAAAAAATTTATGCTCTCCGTGATGTGACAGCCACTGTCAATTCAATTCCCTTAATTGCCGCTAGCATCATGTGTAAAAAAATTGCCACTGGGAGTGATGGGATTGTTTTAGATGTTAAATGTGGGAATGGGGCCTTTATGAAATCAATTTCGGAAGCTAAACAATTAGCTGAAATTATGGTGGGGATTGGCAAACACTTTGATAAAAAAATTGCGGCAGAAATTACCAATATGAACCAACCATTAGGTCGTGCCATTGGAAATGCCATTGAAATTTATGAAGTTGTGAAAACGTTACAAGGCGAAGGTCCCGAAGATTTAAATTATATTGTTTGTGAATCAGCAGCATTGAGTTTATGCCAAGCAAACTTATTCCCTGATTTTGAGAGTGCTTTTAAAGCTTGTCAGGATAAACTCCATAATTCACCAGAACCATTAACTTACTTTAAAAACTTTATCCAAGAACAGGGTGGTGATTTATCTCTAATTAGTGATTTGCATTCGCTGGACCAAATGTTAAAAGTTAAAAATAAAGTTGAAATTAGAGCAAAAGAAACTGGTTTTATTGAAATTGTTGATACTAATGCCTTAGGATTATTATCAGTGCGGTTAGGAGCCGGGCGGAATACCAAAGAAGAAGAAATTGACCATCATGCGGGGATTTACTTAAATAAAAAAACTGGTGAATTTGTTAACGAAGGGGAAACTGTGATGACACTATATACTAATCGTTATGTTACCGATCCAGTTTATGAATGAGCAGAAAGTACTTTTAAAATTACCGACAAAGAACCAAAAGCCTACGAACTAGTATATGAAGTAATTCAATAATTAATCAAGAGAGCTGTGCCCTCTTTTTCTTTCGGATTTTAAAACTCGCGTGCTTATTTCGTAATTTTTTATAATTTTGCTTTGAATTATTATAAAATATCATTATGATATATAAAGAGGAAATAAAGAAGGGAAAGATAATGTTGACAAATAATCCCCGCTATGAAGTAAGTTTAGATAATTTCACTGGTCCGTTGGATTTATTATTGCATCTAATTAAAGAAAAAGAAGTTGATCTTTTTAGTATTAGTTTGTTAGAAGTAACTGATCAGTTTTTAGCGTATTTACATCAATTTGAAAAATTAAACATTGAAATTGCATCCGAATATTTATTAATGGCAAGTTATTTAATTGAAATTAAAACCAAACTAGTTCTCCCCAAAGAAGAAGTTGAAATTGATGAAAACTATGAAAAGGATAGCCGCGAAGAGTTAATTACCCGGTTATTAGAATATAAAAAGATTAAAGAAGTGACCCATTATTTTAAAAACCAACACCAAGAGTCAAGTAAATATTTGTCAAAACCCAAAACTATTATTAAAGGTCAGCGTATTCCCGATGAAGAATTGCCCTTATCCCCTAAAATTAACATTGATAAATTAGCAAATAGTTTTTTAAAAATGTTAGAGCAAATTAATGCTTCCAAACCCTTAAATTCTAATATTATAATTACCGAAGTTTCCCCTGAAGAGGTTGCCATTAAAATTTTAGATATTATTGAAAACACCACTCAGGAATGGTTATTAGAAGATTTATTAGATTATTTTGAACTATCAACCCAGGTGTTTGTTGCTTGTTTTATTGCGATTTTAGACTTAGCTCGTCACCAAAAGATTAGCATTACTCAGCACCAACATTTGGATAACATTTATATTACTTATCTTAACTTAGGAGAGGAGCACCAAAATGAATAATAATGAAAAAATTGCTTTATTAGAAGGATTACTTTTTATTAGTGGCGATGAAGGAATTGGCTTGACTGAAATTAGTGAAGTCTTAGAATTACCAACCTCGGATTGTCAGCAGTTAATTGCAACCTTAGCCAAGGAATACCAAACTAATCCTACTCGGGGGTTAATGATTAATAATTTTGCAAATAAATATCGGTTAACAACCAAAAAAGAATATTATCCGTTTTATTTAAAATTATCCCATCCAAAAGTTGAAGCCCGGCTATCCCAAGCAGCTCTCGAAACATTAGCGATCATTGCCTATCGGGGGCCGATTAGTAAACCAGAAATTGAGGATTTACGAGGTGTTAATTCCGATAATGTTATCTATAAGTTAAAAGCGCGTGAATTAATTGAAGAGGCCGGAAAAAGTGACTTGCCCGGAAAACCACTAAACTATAAAGTTACCGAAGAATTTTTAAAAGCTTTTAACTTAAATTCCCTAGCTGAATTACCACAATTACAAGAAATTACTAGTGATGAAGAAGAGGACTTATTTAAATAATGGAACGGTTACAAAAAGTAATTGCTAATTATGGCTATGCCTCTCGTCGTAAAGCAGAAGAATTAATTACCCAACACCGGGTGAAGGTAAACGGGCAAGTTATTAGCGAAATGGGATTTAAAGTTACGCCCCATGATGTCATTATGATTGATAATAAAATCCTGGAAAATAAAAATCAGCAAAAAGTCTACATAATGTTAAATAAACCGCGTAATACTGTGAGCACTGTTCGTGATCCCCACCACCGGAAAACGGTGCTTTCGTATTTAACCGGGATTTCTCACCGAGTTTATCCAGTAGGGCGATTAGATTATGATACTAGTGGGTTATTATTAATTACAAATGATGGGGATTTTGCTAATATTATTACCCATCCTAAACATATTATTGATAAAACTTATCATGTGCTTGTCAAAGGAGCGGTTACGAAAACGCAACTACGTGATTTAGCTCGGGGCGTAAAAATTGAGGATAATTTTACAACCTCCCCAGCCCAAGCTAGGGTGCTAAAATATTCAGAAAAAGATGATACCACAGTGTTAGAACTAATTATTCACGAGGGTAAAAAACACCAAGTCAAGCGTATGCTTAGTGCGGTTGGCAGTGAAGTTCTAAAGTTAAAAAGAGTGGCGATTGGTTTTTTACAGTTAGATGAAAGTTTAAAGCCAGGAGAATGGCGATACTTAAAACCCAAAGAAATTAAGCGCTTTTTTGGAATTTTTAATAGTATAAAAAAATAAAACTACTTTTAATCATTTTTAAAATACGATAAAATTAAGCAAATGAGAAAAGAGGGAAGTTATGCGAATTACATTAGCGGGAGTAGTTGGGGTTGGAAAATCAACTGTTAGTAAAATGCTTGGCGATAAATATAACTATGTAGTAATGGATGAACCAGTGGAAGAAAACCCATACTTAGATGAATACTATGCTGATCCCAAAAATATGGCGTTTAAAATGCAAGTTTATATGGTGATGGCCCGTAGTAAACAGTTAAAACAAGCTAAAATTGAGCCAAATATTATTTTTGACCGGAGTGTGTTAGAAGATATTATATTTGTCGATGTTCTTCACGAACTAGGGTATATGAATATGACTGATTACAAAGTTTATCGTGAGTTTTATGATATTGTTGTTTTACAAAGTTTATACCTGGATGAAACTATTAAACCGGAGTTAGTAGTTTACTTACGAATTTCACCATTTGGGGCGATGAACCGAATTAAACAACGCGGAAGACCAAGTGAACAAACAGTGAGCCCCGCTTACTGAGAGTTATTAAATAAAAAATATGAAGAATGATACCAACGAAATAAAGATAAGTTTAATTTCTTGGTTATTGATGCGGAAGATAAAACTCCCAATGAAATTGTTGATATAATTTCGGAAAAAATTGATCAGTATCAAAAATAAAAAAGCTGTAAATAATTACAGCTTTTTTATTAATAAATCCTAGTTTACGCTTGACCTAATCCTTTTTCTTTTCAGATTTGCATTACTTTTTCTTTGCCTTCGGTTTCAAGGATTGTTTTATACTCTAAGTAACGATCTTGACACTCTTTAATTTCTTTGAGTGCTTGTTCAACACCACTTCACCCATTAATGCGGACTTCTTTTTTTTGTAATGCTTTATATTGCAAGAAGAAGTTTTCAATTTCATCGCGCAAATGTTGGGGCACATCTGTTAATGTTTGGTAATGTTTAAAACGGGGATCACTATCCACAACCCCAAATATTTTGGTATCAATTTCGCCACTATCAATCATGTTAATTGTTCCCAACACGCGGACATTAATTTGACACCCCGGAACTGTTGGATATGTAATTAATGAAATTACATCTAACGGATCACCATCTCAGTCTAAAGTATTTTCAATAAATCCATATTCACCGGGATAAAAATTAGCACCATATAATACTCGGTCTAAAATAATACGGCCCGTTTGACTATCATATTCATATTTATTGCTTGAACCTTTTGGAATTTCCACAATTATTGGTAGCACATTATTTTTACTCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP001973|477971:484934|482912_483653_+|WP_047791289.1|DBSCAN-SWA
MERLQKVIANYGYASRRKAEELITQHRVKVNGQVISEMGFKVTPHDVIMIDNKILENKNQQKVYIMLNKPRNTVSTVRDPHHRKTVLSYLTGISHRVYPVGRLDYDTSGLLLITNDGDFANIITHPKHIIDKTYHVLVKGAVTKTQLRDLARGVKIEDNFTTSPAQARVLKYSEKDDTTVLELIIHEGKKHQVKRMLSAVGSEVLKLKRVAIGFLQLDESLKPGEWRYLKPKEIKRFFGIFNSIKK
>NZ_CP001973|477971:484934|483714_484326_+|WP_047791290.1|DBSCAN-SWA
MRITLAGVVGVGKSTVSKMLGDKYNYVVMDEPVEENPYLDEYYADPKNMAFKMQVYMVMARSKQLKQAKIEPNIIFDRSVLEDIIFVDVLHELGYMNMTDYKVYREFYDIVVLQSLYLDETIKPELVVYLRISPFGAMNRIKQRGRPSEQTVSPAYWELLNKKYEEWYQRNKDKFNFLVIDAEDKTPNEIVDIISEKIDQYQK
>NZ_CP001973|477971:484934|482364_482913_+|WP_047791288.1|DBSCAN-SWA
MNNNEKIALLEGLLFISGDEGIGLTEISEVLELPTSDCQQLIATLAKEYQTNPTRGLMINNFANKYRLTTKKEYYPFYLKLSHPKVEARLSQAALETLAIIAYRGPISKPEIEDLRGVNSDNVIYKLKARELIEEAGKSDLPGKPLNYKVTEEFLKAFNLNSLAELPQLQEITSDEEEDLFK
>NZ_CP001973|477971:484934|481601_482372_+|WP_047792000.1|DBSCAN-SWA
MTNNPRYEVSLDNFTGPLDLLLHLIKEKEVDLFSISLLEVTDQFLAYLHQFEKLNIEIASEYLLMASYLIEIKTKLVLPKEEVEIDENYEKDSREELITRLLEYKKIKEVTHYFKNQHQESSKYLSKPKTIIKGQRIPDEELPLSPKINIDKLANSFLKMLEQINASKPLNSNIIITEVSPEEVAIKILDIIENTTQEWLLEDLLDYFELSTQVFVACFIAILDLARHQKISITQHQHLDNIYITYLNLGEEHQNE
>NZ_CP001973|477971:484934|480144_481458_+|WP_047791287.1|DBSCAN-SWA
MRLLDLIEKKKNGQELTQEEIKFIIEGYTTGAIPDYQMSAFLMAVFFQSMSITEISYLTDAMIQSGEVYDLSGIRGFKVDKHSSGGVGDKVSLIYAPLVASFGLKVAKMSGRGLGQTGGTIDKLESFPGFKVEISFAEFVRIVNKTNISIIAQSSNIVPADKKIYALRDVTATVNSIPLIAASIMCKKIATGSDGIVLDVKCGNGAFMKSISEAKQLAEIMVGIGKHFDKKIAAEITNMNQPLGRAIGNAIEIYEVVKTLQGEGPEDLNYIVCESAALSLCQANLFPDFESAFKACQDKLHNSPEPLTYFKNFIQEQGGDLSLISDLHSLDQMLKVKNKVEIRAKETGFIEIVDTNALGLLSVRLGAGRNTKEEEIDHHAGIYLNKKTGEFVNEGETVMTLYTNRYVTDPVYEWAESTFKITDKEPKAYELVYEVIQ
>NZ_CP001973|477971:484934|478840_479323_+|WP_047791285.1|DBSCAN-SWA
MIKLLWAMDQHGLIGKDNHLPWHIKAELQHFKAETLNKTILLGRTTFEGINRVLPNRKTIVVTHNPNYYFNHPDVQVVHDLQPILIEYQQNPNNELIVCGGSKVYEETLPVADELIISYIKGEYTGDTYFPPFNLDDFELKFIQEYDEFTIKRYVRRRRT
>NZ_CP001973|477971:484934|484370_484934_-|WP_047791291.1|DBSCAN-SWA
MSKNNVLPIIVEIPKGSSNKYEYDSQTGRIILDRVLYGANFYPGEYGFIENTLDWDGDPLDVISLITYPTVPGCQINVRVLGTINMIDSGEIDTKIFGVVDSDPRFKHYQTLTDVPQHLRDEIENFFLQYKALQKKEVRINGWSGVEQALKEIKECQDRYLEYKTILETEGKEKVMQIWKEKGLGQA
>NZ_CP001973|477971:484934|477971_478841_+|WP_047791284.1|DBSCAN-SWA
MKQYLTMAQFILDNGLAKQDRTNTGTISYFGYQMRFNLAEGFPLLTTKKVHFKSVVYELLWFIKGDTNIKYLVDHNVRIWNEWPYEKYTKSPDYQNETLTEFVEKIKTDDEFAKKYGDLGPVYGKQWRNFEGVNQLAKLIDNLKTNPYSRRHILSAWNPKEVDNMALPPCHTLVQFYVSQDNKLSCQLYQRSADVFLGVPFNIASYALLTYMIAQVCGFEVGDFVHSFGDCHIYQNHLAQINEQLTRTPRVLPTLKLNPGVKSLFDFTYEDIVLENYDPYPAIKGLVAV
>NZ_CP001973|477971:484934|479322_480120_+|WP_047791286.1|DBSCAN-SWA
MPNIWKIILTLPRFLRMLTKSKSMARKIKRDPNIVSEEYRYHWLQKRTKYMLWIFDIKLIVHNEENWIDKGCLMVANHQSNIDPAIIFRLNDFNKTAPCAFIAKKELATDKRFKNFVALIDVLFLDRKNPRQAIEVINEANELIRVPRTMVVFPEGTRSHQQEMGEFQAGSFKIAQKAHAPIIPVSLVNSYQVLNKKVKQKGKKYIHVVFHKPIKPDTFMTKPTDLISNNVKQIIQKGIDQYKDVDHKKAYEKYRAELKQKAKNA

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_047791284.1|477971_478841_+	thymidylate synthase	A0A0N9SH48	Staphylococcus_phage	9.5e-98	56.7
WP_047791285.1|478840_479323_+	dihydrofolate reductase	G3MBI7	Bacillus_virus	2.0e-20	35.7
WP_047791286.1|479322_480120_+	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_047791287.1|480144_481458_+	pyrimidine-nucleoside phosphorylase	A0A0H3UZD4	Geobacillus_virus	7.9e-112	50.9
WP_047792000.1|481601_482372_+	segregation/condensation protein A	A0A1B1IVW1	uncultured_Mediterranean_phage	6.4e-13	36.5
WP_047791288.1|482364_482913_+	SMC-Scp complex subunit ScpB	A0A1B1IVT7	uncultured_Mediterranean_phage	6.3e-15	31.9
WP_047791289.1|482912_483653_+	rRNA pseudouridine synthase	NA	NA	NA	NA
WP_047791290.1|483714_484326_+	deoxynucleoside kinase	A0A0M3UL55	Enterococcus_phage	1.7e-16	32.4
WP_047791291.1|484370_484934_-	inorganic diphosphatase	A0A2H4J8U1	uncultured_Caudovirales_phage	2.7e-21	37.8