Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN831034 | Streptococcus pyogenes strain NCTC8198 chromosome 1 | 6 crisprs | DinG,csm6,cas9,cas1,cas2,csn2,cas4,cas7,cas8c,cas5,cas3,DEDDh,csa3 | 6 | 8 | 9 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LN831034_1 | 859996-860093 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN831034_1
|
1 spacers
spacers of NZ_LN831034_1
>1.1|860022|46|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder CAAGGACGGCCAAAACGGTAAAGATGGTAAGGATGGCCAAGATGGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN831034_1
The CRISPR arrays of NZ_LN831034_1 >merge|NZ_LN831034|1|859996-860093|CRISPRCasFinder AAAGATGGTCTTCCAGGTAAAGACGGCAAGGACGGCCAAAACGGTAAAGATGGTAAGGATGGCCAAGATGGCAAAGATGGTCTTCCAGGTAAAGACGG >NZ_LN831034|1|1|859996-860093|CRISPRCasFinder AAAGATGGTCTTCCAGGTAAAGACGG CAAGGACGGCCAAAACGGTAAAGATGGTAAGGATGGCCAAGATGGC AAAGATGGTCTTCCAGGTAAAGACGG
>NZ_LN831034.1|WP_010922253.1|857503_859336_+|elongation-factor-4 MNSQDLKKRQEKIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILEKTETVSSREMQAQLLDSMDLERERGITIKLNAIELNYTAKDGETYIFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNDLEILPVINKIDLPAADPERVRHEVEDVIGLDASEAVLASAKAGIGIEEILEQIVEKVPAPTGDVDAPLQALIFDSVYDAYRGVILQVRIVNGIVKPGDKIQMMSNGKTFDVTEVGIFTPKAVGRDFLATGDVGYVAASIKTVADTRVGDTVTLANNPAKEALHGYKQMNPMVFAGIYPIESNKYNDLREALEKLQLNDASLQFEPETSQALGFGFRCGFLGLLHMDVIQERLEREFNIDLIMTAPSVVYHVHTTDEDMIEVSNPSEFPDPTRVAFIEEPYVKAQIMVPQEFVGAVMELSQRKRGDFVTMDYIDDNRVNVIYQIPLAEIVFDFFDKLKSSTRGYASFDYDMSEYRRSQLVKMDILLNGDKVDALSFIVHKEFAYERGKIIVEKLKKIIPRQQFEVPIQAAIGQKIVARSDIKALRKNVLAKCYGGDVSRKRKLLEKQKAGKKRMKAIGSVEVPQEAFLSVLSMDDDTKK >NZ_LN831034.1|WP_029714017.1|856567_856750_+|hypothetical-protein MLTYDEFKQAIDNGYITADTVAIVRKNGLIFDYVLPHESVRSCEIVIEERVAEVMVELDK >NZ_LN831034.1|WP_011054450.1|856159_856369_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MELYEFVGEQIRHQRKLAKLNQSQLAELLDTNQQTIGMMENGKRRATLQDLVKLRKIFNVSVDDFLPKD >NZ_LN831034.1|WP_011054449.1|855859_856006_-|hypothetical-protein MNKEDYLRLLEKVIDSTPAYITAVASFITALSVSKQTKKRKPKPRKHK >NZ_LN831034.1|WP_011054448.1|855467_855719_-|hypothetical-protein MEYGNKIFEIYNKPFKYRNSSSTNYNKVRASGIEPNTKFVVNKTANINCAVYPRHGSIEKVFYWGDRKITQATAEKRCGYFKG >NZ_LN831034.1|WP_011054447.1|854964_855204_-|hypothetical-protein MKYFVTDIENIDNITVFEEFGFDFTESEEGIWYTEEKAMFDWWNELAQAIEFLNDNEINAETNELADYITIAKENGFEF >NZ_LN831034.1|WP_011054446.1|854550_854907_-|hypothetical-protein MTKTTAQRKKSIYINGALEKIYDECSNALRNRTFSGRVMDIAERYDALMGLTEIPELTPQQQMILGEAVLGAFMDRNKIRYLHDAIADTEIDGCLDLAKMVRDLDYAQRLKLIESINI >NZ_LN831034.1|WP_029714018.1|853229_854435_+|glucosaminidase-domain-containing-protein MAFLDKIKSAVIAEWHTHKILPSLTAAQAILESGCGKHAPHNALFGIKADRSWTGKSFNTKTQEEYQPGVVTDIVDRFRAYDSWEDSIADHGQFLVDNPRYKAVIGEADYKKACHAIKDAGYATASGYADLLIQLIEENNLQEWDAEAIKNKEEQMISSQCREVIEFFINLANAGVGVDKDSFAGWQCADVPCYAAKHWFGVDLWGNAIDLLDSAAAVGWEVHRMPTDANPRTGAFFVQSVPYHQFGHTGIVIEDSDGYTMRTVEQNIDGNPDALYVGAPARFNNRDFTGVIGWFYPPYQGDAVTQTVSTEPQTSDTIVETAKTGTFTLDVAEINIRRWPSLASEVVGIYKQGDTVSFDSEGYANGYYWISYVGDSGKRSYMAIGITDKDGNIISLWGKLV >NZ_LN831034.1|WP_029714020.1|852879_853107_+|phage-holin MINLKLRLQNKVTLMAILGAIFLLAQQLGIKLPSNIADIANTAVTLLVLLGVVADPTTKGLSDSEQALTYHEPKK >NZ_LN831034.1|WP_011017397.1|852610_852883_+|hypothetical-protein MATELIFGLGGFILAIVTTYNIFNAKSIKHATDITLLQSEVEHLKIVTRQNARRLEEHDEQNKTLITMTEQIKNLNREVRELKDIMRGEA >NZ_LN831034.1|WP_010922255.1|860597_861035_+|peptide-methionine-(R)-S-oxide-reductase-MsrB METSDELKQRIGDLSYEVTQHAATESPFTGEYDNFFEKGIYVDIVSGEVLFSSLDKFNSGCGWPAFSKPIENRMVTNHDDSSYGMRRVEVKSREAGSHLGHVFSDGPKEAGGLRYCINSAALKFIPYDQMEKEGYAQWLTLFDET >NZ_LN831034.1|WP_010922256.1|861149_862169_+|YeiH-family-putative-sulfate-export-transporter MSTHLRKLPGLLLCLLLALPAWCLGRLFPIIGAPVFAILLGMLLALFYEHRDKTKEGISFTSKYILQTAVVLLGFGLNLTQVMAVGMQSLPIIISTIATALLVAYGLQKWLRLDVNTATLVGVGSSICGGSAVAATAPVIKAKDDEVAKAISVIFLFNMLAALLFPSLGQLLGLSNEGFAIFAGTAVNDTSSVTATATAWDALHHSNTLDGATIVKLTRTLAILPITLGLSLYRAKKEHDIVTEENFSLRKSFPRFILFFLLASLITTLMTSLGVSADSFHYLKTLSKFFIVMAMAAIGLNTNLVKLIKTGGQAILLGAICWVAITLVSLAMQLSLGIW >NZ_LN831034.1|WP_002989935.1|862375_862801_+|PTS-sugar-transporter-subunit-IIA MKRKFLIGSHGRLASGLQSSIDILAGMGQALETIDAYVDDSDYTSQIDDFIAGVAADEQGLIFTDLLGGSVNQKMVTAVMNSGKDNIFLITNSNLATLLSLVFLKPGEALTKDEIVTVINESQVQLVDLVPETNSEDDFFD >NZ_LN831034.1|WP_002984845.1|862819_863311_+|PTS-system-mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-transporter-subunit-IIB MITQIRVDDRLIHGQVAVVWTKELNAPLLVVANDEAAKNEITQMTLKMAVPNGMKLLIRSVEDSIKLFNDPRAKDKRIFVIVNSVKDACAIAKEVPDLEAVNVANVGRFDKSDPASKVKVTPSLLLNPEEMAAAKELVSLPELDVFNQVLPSNTKVHLSQLVN >NZ_LN831034.1|WP_002984844.1|863327_864137_+|PTS-mannose/fructose/sorbose/N-acetylgalactosamine-transporter-subunit-IIC MLVPATMAALAVLICFGGNYLTGQSMMERPLVVGLVTGLLLGDMKVGILMGASLEALFLGNVNIGGVIAAEPVTATAMATTFTIISHIDQKAAMTLAVPIGMLAAFVVMFLKNVFMNIFAPMVDKAAAANHQGKLVMLHYGTWIIYYLIIASISFIGILVGSGPVNAFVEHIPQNLMNGLSAAGGLLPAVGFAMLMKLLWTNKLAVFYLLGFVLTAYLKLPAVAVAALGAVICVISSQRDLELDAITRGAISKQTTFDSKESEEEDFFA >NZ_LN831034.1|WP_002989931.1|864133_864961_+|PTS-mannose/fructose/sorbose-transporter-family-subunit-IID MTSQDNLTKEDRKMLRSVFWRSWTMNASRTGATQYHAVGVIYTLLPVINRFYKTDKDKAEALVRHTTWFNATMHINNFIMGLVASMEKKNSEDPDFDASAITAVKASLMGPISGVGDSFFWGILRVIAAGIGISLASAGSAMGAVVFLLLYNIPAFIIHYYSLYGGYSVGAGFIKKLYESGGIKIVTKTSSMLGLMMVGSMTASNVKFKTILTVAAKGAKEAASIQDYLDQLFIGIVPLMVTLAAFWLLRKKVNINWIMFGIMFLGIILGLLGIC >NZ_LN831034.1|WP_011285511.1|865096_866746_+|sensor-histidine-kinase MRGEQVEEHFKKQLQDDISRHFSYQSLMLSLLLIGLFIIFSLAPQQLGLYRDINATATRYHRLISKQEALLDDLGKNSLLPFLNKNLSTADLSKHYFHLRHSSQTSPELLLFSPSQDLLFASNPHLGNVFSKSVYIQEVLRATHPPKTLFKVAMDSEDGHYLMIIKPMIDQNQLKGYAFLVMSGKDFLHPTKTLTSELVIADKLDNTFTFSNREFIASSLDKINSQYLHHYFVFQDNRAFITRKVALQGGLWLYMYRPLIPMVSVMLFSLISSAVIFVILQRKSSGLANRIAAKNSRAINQMVRDMSAISRQEKRRIDLESQDEFQYLSDQINQMVERLQQLHDKTLDLETQKLLFEKRMLEAQFNPHFLYNTLETILITSHYDSALTEKIVIQLTKLLRYSLTDSSKPVLLKDDLSVIESYLVINQVRFEELQYSINLSPDLDSLEVPKLFLLPLIENAIKYGLKERHDVKINIACYYQDDHIIFSVRDNGSGIDAHHQKVIREQLEAGESHHGLINSYRRLKYHFSEVSLVFDQGDKQFNVSYHVKE >NZ_LN831034.1|WP_010922260.1|866749_867538_+|response-regulator-transcription-factor MYKLVIIEDEHIIRKWLRYAIDYKALDILVIGEAKDGKEGAVLIKESQPDIVLTDINMPIMTAFDMFEVTKDQTYAKIILSGYADFPNARSAIHYGVLEFLTKPIEKAALWECLQTIIAKIEKQKGSNQKTDACVYIPLPQMTDQIPEVVKDILEWVHAHFQDKISTSRLAHDLGYSESYIYQNIKKHLQMPLSDYINQYRINQAIQLMQQEPDLMVYEIAQAVGIYDYRYFDRVFKKYLGQTVKAFKEEHFMKDTDRSKPC >NZ_LN831034.1|WP_015055942.1|867531_868578_+|extracellular-solute-binding-protein MLKLKRKWLLSFLLVIIILAIVNVAMYIFSSSKKDSAKELVILTPNSQTILTGTIPAFEEKYGVKVRLIQGGTGQLIDQLGRKDKPLNADIFFGGNYTQFESHKDLFESYVSPQVSTVISDYQLPSHRATPYTINGSVLIVNNELARGLHITSYEDLLQPALKGKIAFADPNSSSSAFSQLTNILLAKGGYTNADAWAYMKRLLVNMNSIRATSSSEVYQSVAEGKMIVGLTYEDPCINLQKSGANVSIVYPKEGTVFVPSSVAIIKHAPNMTEAKLFINFMLSRDVQNAFGQSTSNRPIRQDAQTSHDMKALETIATLKEDYAYVTKHKKKIVATYNQLRQRLEKAK >NZ_LN831034.1|WP_010922263.1|869356_869923_+|sugar-O-acetyltransferase MTTEFDKMTRGEWYDANFDSELIQKRMMAQDLCFDLNQLKPSREEERSAVLNQLFGQSFEGLVLLSPFICDYGKNITFGKNCFINSNCYFMDGAKIALGDNVFVGPSTGFYTANHPLDYKRRNEGLEKALPITIGDNVWFGANVNVMPGVTIGSGCVIASGSVVTHDIPVNSLAAGVPCQVVRKIEQE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_LN831034_2 | 1050901-1051002 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN831034_2
|
1 spacers
spacers of NZ_LN831034_2
>2.1|1050925|54|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder CCGATAAAAACATTATGTTTACAGTATATAATATCCACAATGTCTTGTCAAACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN831034_2
The CRISPR arrays of NZ_LN831034_2 >merge|NZ_LN831034|2|1050901-1051002|CRISPRCasFinder AATAATTGGTATAGTCTAATTATACCGATAAAAACATTATGTTTACAGTATATAATATCCACAATGTCTTGTCAAACATAAAATTGGTATAGTCTAATTATA >NZ_LN831034|2|2|1050901-1051002|CRISPRCasFinder AATAATTGGTATAGTCTAATTATA CCGATAAAAACATTATGTTTACAGTATATAATATCCACAATGTCTTGTCAAACA TAAAATTGGTATAGTCTAATTATA
>NZ_LN831034.1|WP_010922374.1|1049035_1050850_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIVGVVGNRNATDILMQGLEKLEYRGYDSAGIFVANANQTNLIKSVGRIADLRAKIGIDVAGSTGIGHTRWATHGQSTEDNAHPHTSQTGRFVLVHNGVIENYLHIKTEFLAGHDFKGQTDTEIAVHLIGKFVEEDKLSVLEAFKKSLSIIEGSYAFALMDSQATDTIYVAKNKSPLLIGLGEGYNMVCSDAMAMIRETSEFMEIHDKELVILTKDKVTVTDYDGKELIRDSYTAELDLSDIGKGTYPFYMLKEIDEQPTVMRQLISTYADETGNVQVDPAIITSIQEADRLYILAAGTSYHAGFATKNMLEQLTDTPVELGVASEWGYHMPLLSKKPMFILLSQSGETADSRQVLVKANAMGIPSLTVTNVPGSTLSREATYTMLIHAGPEIAVASTKAYTAQIAALAFLAKAVGEANGKQEALDFNLVHELSLVAQSIEATLSEKDLVAEKVQALLATTRNAFYIGRGNDYYVAMEAALKLKEISYIQCEGFAAGELKHGTISLIEEDTPVIALISSSQLVASHTRGNIQEVAARGAHVLTVVEEGLDREGDDIIVNKVHPFLAPIAMVIPTQLIAYYASLQRGLDVDKPRNLAKAVTVE >NZ_LN831034.1|WP_002989626.1|1048504_1048840_-|alkylphosphonate-utilization-protein MSLPNCLQCQSEYVYEDGLLLICPMCAFEWTPGEEATEEEGLVVLDSNGVRLSDGDTITVVKDLKVKGAPKDLKQGTRVKNIRLVEGDHNIDCKIDGFGAMKLKSEFVKKI >NZ_LN831034.1|WP_002992417.1|1047757_1048399_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MTYIQQVLPSLLDGALVTLQVFFIVIILSIPLGAILAFLMKIPFKPLQWFLTLYVWMMRGTPLLLQLIFFYYVLPSVGISFDRMPAAILAFTLNYAAYFAEIFRGGIEAIPKGQYEAAKVLKLKPLQTIRYIILPQVFKIVLPSVFNEVINLVKDSSLVYVLGVGDLLLASKTAANRDATLAPMFIAGLIYLLLIGLVTIISKQVEKRFNYYQ >NZ_LN831034.1|WP_002984457.1|1047118_1047748_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MLELKNISKQFGQKTIFDGFNLTVQDGEVLSLVGPSGGGKTTLLRMLAGLESIDSGQVFYNGEDVGIDHLENRNLLGFVFQDFQLFPHLTVLDNLTLSPTITMGKQKADAKEKALDLLARLGLKEHAQVYPYSLSGGQKQRVALARAMMIDPQIIGYDEPTSALDPELRQTVEALIVQNREMGITQIVVTHDLVFAEAISDRIIRVNPK >NZ_LN831034.1|WP_010922372.1|1046266_1047103_-|amino-acid-ABC-transporter-substrate-binding-protein MIIKKRTVAILAIASSFFLVACQATKSLKSGDAWGVYQKQKSITVGFDNTFVPMGYKDESGRCKGFDIDLAKEVFHQYGLKVNFQAINWDMKEAELNNGKIDVIWNGYSITKERQDKVAFTDSYMRNEQIIVVKKRSDIKTISDMKHKVLGAQSASSGYDSLLRTPKLLKDFIKNKDANQYETFTQAFIDLKSDRIDGILIDKVYANYYLAKEGQLENYRMIPTTFENEAFSVGLRKEDKTLQAKINRAFRVLYQNGKFQAISEKWFGDDVATANIKS >NZ_LN831034.1|WP_011285556.1|1045123_1045897_-|CAMP-factor-pore-forming-toxin-Cfa MKPKHLLCLSTVVAGLALFSTMTHSVLADDASNPDTILMNNNQANFQRDALVQKLDEGHQQLEAIKHEAKGTDIETTVNKAIDAVDHMKSSIRFNTETIYDFSSIGARVEALSDAIKAIVFSTTQLTHKVEKAHTDMGFAITKLVIRIIDPFASVDAIKAQVQEIKALEEKVINYPDLQPTDRATIYTKAKLNKAIWNTRLERDKKVLGIKPFDVYNRLNKAITHAVGVQLNPTTTVQQVDDEVIAVQDALETALKS >NZ_LN831034.1|WP_010922370.1|1043519_1044755_+|cation-diffusion-facilitator-family-transporter MTQDPIANLKLARKGPIVSIIVYLSLSVAKLLAGYLLNASSLIADGFNNLSDIVGNVALLIGLHLASQPADANHKFGHWKIEDLSSLVTSFIMFLVGFQVLIHTIKSIFSGQQVDIDPLGAIVGIVSAFVMLGVYVFNKRLSKRVKSSALVAASKDNLADAVTSIGTSIAIIAASLHLPVIDHIAAMIITFFILKTAFDIFMESSFSLSDGFDSRHLKKYEKAILEIPKIVAVKSQRARTYGSNVYLDIVLEMNPDLSVYESHSITEKVEQLLSDQFSIYDIDIHVEPAMIPEEEIFDNVAKKLYRYEKLILSKVPDYDHYIAKSFQLIDANGQTVNYEQFLNQEIYYPSNFNHFQIESISQKTMLVTYQLNGNQRTSIWRRHESWSLLFHQITPIAKKQLHHTHYRIVKM >NZ_LN831034.1|WP_011285555.1|1042077_1043400_+|sodium:alanine-symporter-family-protein MIALVKLIDNLVWGPPLLILLVGTGIYLTSHLGLIQILKLPRAFKLIFSDDEGHGDISSFAALATALAATVGTGNIVGVATAIKSGGPGALFWMWVAAFFGMATKYAEGVLAIKYRTKDANGHISGGPMYYIVNGMGTKWKPLAILFAGSGILVALFGIGTFAQVNSITSSLGHSFGLSPQMVSIVLAIFVAAIIFGGIHSISKVAEKVVPFMAIFYILSSLAVIFSHYQQLLPVIRLVFQSAFTPTAAIGGFAGSLMKDAIQKGIARGVFSNESGLGSAPIAAAAAKTNEPVEQGLISMTGTFIDTIIICTLTGLSILVTGQWTGQLEGAPLTQSAFATVFGNLGTFGLTFSLVLFAFTTILGWSYYGERCFEFLFGITHLTYFRIVFILMVGLGGFLKLELIWVLADIVNGLMALPNLIALLALSPVVILETKHYFIK >NZ_LN831034.1|WP_002989648.1|1039230_1041549_-|DNA-helicase-PcrA MNPLLNGMNDRQAQAVQTTEGPLLIMAGAGSGKTRVLTHRIAYLIDEKFVNPWNILAITFTNKAAREMKERALALNPATKDTLIATFHSMCVRILRREADHIGYNRNFTIVDPGEQRTLMKRILKQLNIDPKKWNERSILGTISNAKNDLLDEKGYEAQAADMYSQIVARCYKAYQEELRRSEALDFDDLIMMTLRLFDANPDVLAYYQQRYQYIHVDEYQDTNHAQYQLIKLLASRFKNICVVGDADQSIYGWRGADMQNILDFEKDYPDAKVVLLEENYRSTKKILQAANDVINNNRNRRPKKLWTQNADGEQLVYYRANDERDEAVFVASTISNMSQELGKNFKDFAVLYRTNAQSRTIEEALLKSNIPYTMVGGTKFYSRKEIRDLIAYLTIVANPADNISFERIVNEPKRGVGPGTLDKLRQFAYESDQSLLEAASNLLMSPLKGKAAQAIMDLANILGQLRQDLDQMSITDLAEALLEKTGYLDSLRLQNTLESQARIENIEEFLSVTKNFDESSASQEEDETGVDRLGRFLNDLALIADTDDSQAEAAEVTLMTLHAAKGLEFPVVFLIGMEEGVFPLSRASEDPDELEEERRLAYVGITRAEEVLFMTNANTRTLFGKSSYNRPTRFLKEISEELLSYKGLARPAQSSFGVRFSTETHTQFGQGMSLSEALQARKAQAQVRQSAQPMQAHTIPSASTSSVLPFGSNSSVEEVTWQIGDIAHHKKWGDGTVLEVSGSGKTMELKIKFPEVGLKKLLASVAPIEKK >NZ_LN831034.1|WP_002984469.1|1038618_1038867_-|GlsB/YeaQ/YmgE-family-stress-response-membrane-protein MGLIWTLIVGALIGVIAGALTKKGGSMGWIANIAAGLVGSSVGQALLGSWGPSLAGMSLIPSVIGAVIVVMITSFVLNKTNN >NZ_LN831034.1|WP_002984449.1|1051025_1051583_-|signal-peptidase-I MVKRDFIRNILLLLIVIIGAILLRIFVFSTFKVSPETANTYLKSGDLVTIKKNIQPKYKDFVVYRVGKKDYVSRVIAVEGDSVTYMDDIFYLNNMVESQAYLEKMKAHYLNHAPFGTLYTDDFTVATITADKYQKVPKGKYLLLNDNRKNTNDSRRFGLINASQIKGLVTFRVLPLSDFGFVEVE >NZ_LN831034.1|WP_002984447.1|1051800_1053303_-|pyruvate-kinase MNKRVKIVATLGPAVEIRGGKKYGEDGYWAGQLDVEESAKKIAELIEAGANVFRFNFSHGDHKEQGDRMATVRLAEEIARQKVGFLLDTKGPEMRTELFADDAKEFSYVTGEKIRVATTQGIQSTRDVIALNVAGSLDIYDEVEVGHTILIDDGKLGLKVIDKDIATRQFIVEVENDGIIAKQKGVNIPNTKIPFPALAERDNADIRFGLEQGLNFIAISFVRTAKDVEEVREICRETGNDHVQLFAKIENQQGIDNLDEIIEAADGIMIARGDMGIEVPFEMVPVFQKMIITKVNAAGKAVITATNMLETMTEKPRATRSEVSDVFNAVIDGTDATMLSGESANGKYPVESVRTMATIDRNAQTLLNEYGRLDSSAFPRTNKTDVIASAVKDATHSMDIKLVVTITETGNTARAISKFRPDADILAVTFDEKVQRALMINWGVIPVLAEKPASTDDMFEVAERVAVEAGLVQSGDNIVIVAGVPVGTGGTNTMRVRTVK >NZ_LN831034.1|WP_010922375.1|1053365_1054379_-|6-phosphofructokinase MKRIAVLTSGGDAPGMNAAIRAVVRKAISEGMEVYGINRGYAGMVDGDIFPLGSKEVGDKISRGGTFLYSARYPEFAQLEGQLAGIEQLKKHGIEGVVVIGGDGSYHGAMRLTEHGFPAVGIPGTIDNDIAGTDYTIGFDTAVNTAVEAIDKLRDTSSSHGRTFVVEVMGRNAGDIALWAGIASGADQIIVPEEEFDIEKVASTIQYDFEHKGKNHHIIVLAEGVMSGEAFAQKLKEAGDKSDLRVTNLGHILRGGSPTARDRVIASWMGSHAVELLKDGKGGLAVGIHNEELVESPILGTAEEGALFSLTEEGKIIVNNPHKARLDFAALNRSLSQ >NZ_LN831034.1|WP_010922376.1|1054458_1057569_-|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MFAQLDTKTVYSFMDSLIDLNHYFERAKQFGYHTIGIMDKDNLYGAYHFIKGCQKNGLQPVLGLEIEILYQERQVLLNLIAQNTQGYHQLLKISTAKMSGKLHMDYFCQHLEGIAVIIPSKGWSDTLVVPFDYYIGVDQYTDLSHMDSKRQLIPLRTVRYFAQDDMETLHMLHAIRDNLSLAETPVVESDQELADCQQLTAFYQTHCPQALQNLEDLVSGIYYDFDTNLKLPHFNRDKSAKQELQDLTEAGLKEKGLWKEPYQSRLLHELVIISDMGFDDYFLIVWDLLRFGRSKGYYMGMGRGSAAGSLVAYALNITGIDPVQHDLLFERFLNKERYSMPDIDIDLPDIYRSEFLRYVRNRYGSDHSAQIVTFSTFGPKQAIRDVFKRFGVPEYELTNLTKKIGFKDSLATVYEKSISFRQVINSRTEFQKAFAIAKRIEGNPRQTSIHAAGIVMSDDALTNHIPLKSGDDMMITQYDAHAVEANGLLKMDFLGLRNLTFVQKMQEKVAKDYGCQIDITAIDLEDPQTLALFAKGDTKGIFQFEQNGAINLLKRIKPQRFEEIVATTSLNRPGASDYTTNFIKRREGQEKIDLIDPVIAPILEPTYGIMLYQEQVMQIAQVYAGFTLGKADLLRRAMSKKNLQEMQKMEEDFIASAKHLGRAEETARGLFKRMEKFAGYGFNRSHAFAYSALAFQLAYFKAHYPAVFYDIMMNYSSSDYITDALESDFQVAQVTINSIPYTDKIEASKIYMGLKNIKGLPRDFAYWIIEQRPFNSVEDFLTRTPEKYQKKVFLEPLIKIGLFDCFEPNRKKILDNLDGLLVFVNELGSLFSDSSFSWVDTKDYSVTEKYSLEQEIVGVGMSKHPLIDIAEKSTQTFTPISQLVKESEAVVLIQIDSIRIIRTKTSGQQMAFLSVNDTKKKLDVTLFPQEYAIYKDQLKEGEFYYLKGRIKERDHRLQMVCQQVQMAISQKYWLLVENHQFDSQISEILGAFPGTTPVVIHYQKNKETIALTKIQVHVTENLKEKLRPFVLKTVFR >NZ_LN831034.1|WP_010922377.1|1057753_1058125_+|GntR-family-transcriptional-regulator MSWKFEEKSPIYAQIAQHVMMQIISQEIKSGDQLPTVREYAEIAGVNPNTMQRAFTELEREGMVYSQRTAGRFVTDDQKLIARKRRELAISELESFITNMTKMGFSHTEIIPVLTSFLKEDSQ >NZ_LN831034.1|WP_002984437.1|1058124_1058823_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MAHLLQLHHVSKSYREKKAIDDLTITIPNGKIIGLLGPNGSGKTTLIKLINGLLQPNKGEIVIDGYRPCVETKKIISYLPDTTYLNENMRIKDMLEFFSDFYSDFDKSKATSLLRDLELDPEDRFKTLSKGNKEKVQLILVMSRKARLYVLDEPIGGVDPAARDYILKTIINSYCENASVIISTHLISDIEPILDEVIFLKQGRLFLSGNADDLRQEYQQSIDSLFRETYKV >NZ_LN831034.1|WP_010922378.1|1058832_1059618_+|hypothetical-protein MFGKLLKYEFRSIGKWYFALNAFVIAIAAILSFTIKLFAQSNSDGLFGVLTNKMLPLTLGLTFGSLIAGSLLSTLLIIIKRFSKSVFGWEGYLTLTLPVNSHQIILSKLLASFICSVFNTIILAFAIAIVIVPMFNINELLEGFFNSFKMDYFINMLTVLAYVLLSTFTSILLIYLSISIGQLFSNRRGLMAFIAYFILVILISVAATYVHSHIFNINTSADSFPFTEQKTIYLLILEQFIEMIMFYLATNFIIKNKLNLQ >NZ_LN831034.1|WP_011285558.1|1059744_1060359_-|TVP38/TMEM64-family-protein MTKRNSKAYILWQKIIKILGIIALIGTFFLAFWLYRLGILNDSNALKDLVQRYRLWGPFVFIVVQIIQIVFPVIPGGLTTVAGFLIFGPVTGFIYNYVGIIIGSIALFLLVKTYGRKFILLFVNDKTFYKYERRLETPGYEKLFIFCMASPVSPADIMVMITGLTDMSLKRFVTILLITKPISIIGYSYLFIFGKDVISWFLQH >NZ_LN831034.1|WP_011285559.1|1060949_1061138_-|hypothetical-protein MLYIDEFKEAIDKGYILGDTVAIVRKNGKIFDYVLPHEKVRDDEVVTVERVEEVMVELDYIK >NZ_LN831034.1|WP_009880239.1|1061358_1062114_+|streptococcal-pyrogenic-exotoxin-SpeA MENNKKVLKKMVFFVLVTFLGLTISQEVFAQQDPDPSQLHRSSLVKNLQNIYFLYEGDPVTHENVKSVDQLLSHDLIYNVSGPNYDKLKTELKNQEMATLFKDKNVDIYGVEYYHLCYLCENAERSACIYGGVTNHEGNHLEIPKKIVVKVSIDGIQSLSFDIETNKKMVTAQELDYKVRKYLTDNKQLYTNGPSKYETGYIKFIPKNKESFWFDFFPEPEFTQSKYLMIYKDNETLDSNTSQIEVYLTTK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN831034_3 | 1157456-1157591 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN831034_3
|
1 spacers
spacers of NZ_LN831034_3
>3.1|1157508|32|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder GTCACTAGCAGCGTTATCCGCTTTAACAACCG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN831034_3
The CRISPR arrays of NZ_LN831034_3 >merge|NZ_LN831034|3|1157456-1157591|CRISPRCasFinder CAGCTTCTTCTGATTGTAAAGCGTCTGTTTGATCCGCCAATGCTTCTAAGGCGTCACTAGCAGCGTTATCCGCTTTAACAACCGCAGCTTCTTCTGATTGTAAAGCGTCTGTTTGATCCGCTAATGCTTCTAAGGC >NZ_LN831034|3|3|1157456-1157591|CRISPRCasFinder CAGCTTCTTCTGATTGTAAAGCGTCTGTTTGATCCGCCAATGCTTCTAAGGC GTCACTAGCAGCGTTATCCGCTTTAACAACCG CAGCTTCTTCTGATTGTAAAGCGTCTGTTTGATCCGCTAATGCTTCTAAGGC
>NZ_LN831034.1|WP_002984095.1|1156436_1156979_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MDIWTKLAVFAFFETPKVILRPFRYEDHWDFYSMVNDTKNLYYVFPEQKTKAASDYLLVHSFIKFPLGQWAIEDKATHQVIGSIRIEHYDAKTRCADIGYFLNYAFWGQGIMTEVVIKLVYLSFHEFGLKTLRIITHLENKASQKVAKKAGFQLKTCFKGSDRNTHKICIYKMYQLTNDR >NZ_LN831034.1|WP_002989302.1|1155144_1156428_-|CBS-domain-containing-protein MSKHQDILDYLEKLAIGKKVSVRSISNHLKVSDGTAYRAIKEAENRGIVETKPRSGTVRIEKKGRVRIDRLTYSEIARISDSEVLAGHAGLGHEFSRFSIGAMTQQNIRRYLVKGGLLIVGDRETIQLLALENHNAILVTGGFPVSKRVIEMANNQRIPVMVTHYDTFTVATMINHALSNIRIKTDLKTVEQVMIPITDYGYLCEDSSVEEFNTLIKKTRQVRFPVLDYKRKVIGVVSMRDVVDQLPTTKLTKVMSKNPITARPNTSLANISQKMIFEDLNMLPVTDEENNLLGMITRRQAMENLPNHQPNNPYTYSEQILSNLEETVDYYQVVVEPTMIDSAGNMSNGVISEFLKEISIRALTKKHQKNIIIEQMMVYFLHAIQIEDELKIYPKIITENRRSSTIDIEIFVDDQVIAKAIITTKIN >NZ_LN831034.1|WP_002984100.1|1154268_1155129_-|methionyl-aminopeptidase MITLKSAREIEAMDRAGDFLAGIHIGLRDIIKPGVDMWEVEAYVRRRCKEDNVLPLQIGVDGHMMDYPYATCCGLNDEVAHAFPRHYILKEGDLLKVDMVLSEPLDKSIVDVAALDFDNVPEMKKWTGSYTGGLADSCWAYAVGTPSDEIKQLMDVTKEAMYRGIEKAVIGNRIGDIGAAVQEYAESFGYGVVRDLVGHGVGPTMHEEPMVPNYGTAGRGLRLKEGMVLTVEPMINTGTWEIDTDIKTGWAHKTLDGGLSCQYEHQFVITKDGPVILTSQGEERTY >NZ_LN831034.1|WP_010922408.1|1153301_1154267_-|YihY/virulence-factor-BrkB-family-protein MAEKKWFDKVLSKWQYEPIQVFMRHLQSAEMDLSAIAVAYYLILTAFPLIVIAANIFPYLNIDIADLLRLMKQNLPKDIFRPASAIVENIFSKPSGSVLGVATLTGLWTMSRSLTSLQKAINKAYGASQHRDFFIGHLVGLLTSLIILFLLAFALIFSIFSKAAIQVLDKHYHLSDNITTIFLLLIQPITVLIIFVGLMLLYFLLPNVKIKKIRYILPGTLFTSFVMTFLSNLVGNYVVYNVERMVDIKMFGSVMIFIIMLWFIFLARILILGAIFNATYQEMSLGKLEGRSGDMIAILKKTLGNDSDLSPSQSIEDSHTD >NZ_LN831034.1|WP_015055964.1|1151907_1153191_-|3-phosphoshikimate-1-carboxyvinyltransferase MKLRTNAGPLQGTIQVPGDKSISHRAVILGAVAKGETRVKGLLKGEDVLSTIQAFRNLGVRIEEKDDQLVIEGQGFQGLNAPCQTLNMGNSGTSMRLIAGLLAGQPFSVKMIGDESLSKRPMDRIVYPLKQMGVEISGETDRQFPPLQLQGNRNLQPITYTLPISSAQVKSAILLAALQAKGTTQVVEKEITRNHTEEMIQQFGGRLIVDGKRITLVGPQQLTAQEITVPGDISSAAFWLVAGLIIPGSELLLKNVGVNPTRTGILEVVEKMGAQIVYEDMNKKEQVTSIRVVYSNMKGTIISGGLIPRLIDELPIIALLATQAQGTTCIKDAQELRVKETDRIQVVTDILNSMGANIKATADGMIIKGPTVLYGANTSTYGDHRIGMMTAIAALLVKQGQVHLDKEEAIMTSYPTFFKDLERLCHD >NZ_LN831034.1|WP_010922406.1|1151423_1151915_-|shikimate-kinase MTKVLLGFMGVGKTTVSKHLSMHCKDMDAIIEAKIGMSIAAFFEQHGEIAFRTIESQVLKDLLFANDNSIIVTGGGVVVLQENRQLLRKNHQHNILLVASFETLYQRLKHDKKSQRPLFLKYSKEAFYEFYQQRMVFYEGLSDLVIRVDHRTPEEVANIIEGY >NZ_LN831034.1|WP_010922405.1|1149764_1151216_-|LCP-family-protein MTKYPMGGLSHHEELRYFYLLRNLSYLSENEKKEFAFLKSKLEIGRAYAPSKQHYRKSKRQEPYFEDDYYNDYSPNDLLEDDDVNHDSSFVPYGLPIYPKEDRYLNKKTKLTARRPIDAPQPIDEDDAFLTESVARCALPRSQKRKHKKKGCMKWFFNILGLLLMTVLMGLGLMFAKGVFDISTNKANYKPAVSQAFDGQETQDGTNILILGSDQRVTQGSTDARTDTIMVVNVGNHAKKIKMVSFMRDTLINIPGYSYNDNSYDLKLNSAFNLGEQEDHHGAEYVRRALKHNFDIDIKYYVMVDFETFAEAIDTLFPNGVKIDAKFATVGGVAVDSVEVPDDLRMKNGVVPNQTIEVGEQRMDGRTLLNYARFRKDDEGDFGRTVRQQQVMSAVMSQIKDPTKLFTGSAAIGKIYALTSTNVSFPFVVKNGVSVLGSGKNGVEHVTIPENGDWVDEYDMYGGQALYIDFDKYQKTLAKLGLR >NZ_LN831034.1|WP_010922404.1|1148327_1149716_-|23S-rRNA-(uracil(1939)-C(5))-methyltransferase-RlmD MVSPRKGKRIRMLKKNDIIQVAISDLSHEGAGVAKHDGFVFFVDNALPEEVIDMRVLKVNKNSGFGKVEAYHYLSSARNADVNLTYLRTGIADLGHLTYEDQLTFKKKQVQDSLYKIAGISDVTVESTIGMTEPLAYRNKAQVPVRRVNGQLETGFFRKHSHDLIPISDYYIQDKEIDRLINFTRDLLRRFDIKPYDETEQTGLLRNIVVRRGHYSGEMMLVLVTTRPKVFRVDQVIEKIVEAFPAVVSIIQNINDKNTNAIFGKDFKTLYGKDTITDSMLGNNYAISAQSFYQVNTVMAEKLYQTAIAFSDLSKDDIVIDAYSGIGTIGLSFAKTVKAVYGVEVIEAAVRDAQQNAALNGITNAYFVADTAEHAMATWAKDGIKPSVILVDPPRKGLTESFIQASVAMGPQKITYVSCNPATMARDIKRYQELGYKLAKVQPVDLFPQTHHVECVVLLIKE >NZ_LN831034.1|WP_002984115.1|1147024_1147426_-|PaaI-family-thioesterase MSDLTQEMTLNVISIFDNYQIELAEKGHLILSTEVTETALNYYGNAHGGYLFTLCDQVGGLVARTTGVESVTLQANANYLKAGHKGDKLMVEGRLVHGGRTTQVVDVTIHNQTGALLTKTSLTMFVTGRRHNG >NZ_LN831034.1|WP_015055963.1|1145433_1146918_+|DUF1846-domain-containing-protein MKTIAFDSNKYLNLQRDHILERISQFDGKLYMEFGGKMLEDYHAARVLPGYEPDNKIKLLKELKEQVEIVIAINANNIEHSKARGDLGISYDQEVFRLIDKFNTLDIYVGSVVITQYNNQPAADAFRKQLEKNGIASYLHYPIKGYPTDINHIISSEGMGKNNYIKTSRNLIVVTAPGPGSGKLATCMSQMYHDQINGVKSGYAKFETFPVWNLPLHHPVNLAYEAATADLDDVNMIDPFHLETYGKTAVNYNRDIEVFPVLNRTFERILSKSPYASPTDMGVNMVGFSIVNEEAAIEASKQEIIRRYYQTLVDFKAERVTESAVKKIELLMNDIGVTPDDRHVTVAAHQKAEQTGQPALALQLPNGQIVTGKTSELFGPTAAVIINAIKTLAKIDKTTHLIEPEYVKPIQGLKVNHLGSHNPRLHSNEILIALAITAMTSEEANLAMKELGNLKGSEAHSTVILTEEDKNVLRKLGVNITFDPVYQHHKLYRK >NZ_LN831034.1|WP_002989295.1|1158227_1159487_-|UDP-N-acetylglucosamine-1-carboxyvinyltransferase MRKIIINGGKALSGEVAVSGAKNSVVALIPAIILADDIVILDGVPAISDVDSLIEIMELMGATVNYHGDTLEIDPRGVQDIPMPYGKINSLRASYYFYGSLLGRFGQAVVGLPGGCDLGPRPIDLHLKAFEAMGVEVSYEGENMNLSTNGQKIHGAHIYMDTVSVGATINTMVAATKAQGKTVIENAAREPEIIDVATLLNNMGAHIRGAGTDIITIQGVQKLHGTRHQVIPDRIEAGTYIALAAAIGKGVKITNVLYEHLESFIAKLEEMGVRMTVEEDAIFVEKQESLKAITIKTSPYPGFATDLQQPLTPLLLKADGRGTIIDTIYEKRINHVPELMRMGADISVIGGQIVYQGPSRLTGAQVKATDLRAGAALVTAGLIAEGKTEITNIEFILRGYASIIAKLTALGADIQLIED >NZ_LN831034.1|WP_010922410.1|1159660_1160857_-|methionine-adenosyltransferase MSERKLFTSESVSEGHPDKIADQISDAILDAILAEDPEAHVAAETCVYTGSVHVFGEISTTAYIDINRVVRDTIAEIGYTEAEYGFSAESVGVHPSLVEQSGDIAQGVNEAFESREGDTDDLSHIGAGDQGLMFGFAINETPELMPLPISLSHQLVRRLAELRKSGEISYLRPDAKSQVTVEYDEHDKPVRVDTVVISTQHDPEATNDQIRQDVIEKVIKAVIPADYLDDDTKFFINPTGRFVIGGPQGDSGLTGRKIIVDTYGGYSRHGGGAFSGKDATKVDRSASYAARYIAKNLVAAGLVTKAEVQLAYAIGVAQPVSVRVDTFGTSTVPEAVLEAAVRQVFDLRPAGIIQMLDLKRPIYKQTAAYGHMGRTDIDLPWERLNKVDALVEAVKTVL >NZ_LN831034.1|WP_010922411.1|1161393_1163772_-|internalin-A MKTKKVIILVGLLLSSQLTLIACQSRGNGTYPIKTKQSRKGMTSNKIKPIKKSKKTNKTHKGVAGVDFPTDDGFILTKDSKILSKTDQGIVVDHDGHSHFIFYADLKGSPFEYLIPKGASLAKPAVAQRAASQGTSKVADPHHHYEFNPADIVAEDALGYTVRHDDHFHYILKSSLSGQTQAQAKQVATRLPQTSSLVSTATANGIPGLHFPTSDGFQFNGQGIVGVTKDSILVDHDGHLHPISFADLRQGGWAHVADQYDPAKKAEKPAETHQTPELSEREKEYQEKLAYLAEKLGIDPSTIKRVETQDGKLGLEYPHHDHAHVLMLSDIEIGKDIPDPHAIEHARELEKHKVGMDTLRALGFDEEVILDIVRTHDAPTPFPSNEKDPNMMKEWLATVIKLDLGSRKDPLQRKGLSLLPNLETLGIGFTPIKDISPVLQFKKLKQLLMTKTGVTDYRFLDNMPQLEGIDISQNNLKDISFLSKYKNLTLVAAADNGIEDIRPLGQLPNLKFLVLSNNKISDLSPLASLHQLQELHIDNNQITDLSPVSHKESLTVVDLSRNADVDLATLQAPKLETLMVNDTKVSHLDFLKNNPNLSSLSINRAQLQSLEGIEASSVIVRVEAEGNQIKSLVLKDKQGSLTFLDVTGNQLTSLEGVNNFTALDILSVSKNQLTNVNLSKPNKTVTNIDISHNNISLADLKLNEQHIPEAIAKNFPAVYEGSMVGNGTAEEKAAMATKAKESAQEASESHDYNHNHTYEDEEGHAHEHRDKDDHDHEHEDENEAKDEQNHAD >NZ_LN831034.1|WP_002984078.1|1163975_1164917_+|bifunctional-biotin--[acetyl-CoA-carboxylase]-synthetase/biotin-operon-repressor MKTSEKIYQLLSQTDDFVSGEYLADQLSISRTSVWKSIKSLENQGIQIDSLKHKGYRMVQGDILLPKTISQGLGMPVTYTPHSQSTQLDAKQGIEAHNSAPRLYLAPSQEAAKGRLDRQFFSASTGGIYMSMYLKPNVPYADMPPYTMMVASSIVKAISRLTGIDTEIKWVNDIYLGNHKVAGILTEAITSVETGLITDVIIGVGLNFFVTDFPEAIAQKAGSLFTEKPTITRNDLIIDIWKLFLSIPVKDHVKVYKEKSLVLNKQVTFIENSQEKRAIAIDLTDQGHLIVQFENGDLQTLRSGEISLSSWEN >NZ_LN831034.1|WP_002992607.1|1164891_1165095_-|DUF3272-domain-containing-protein MTIRQFLFMAFVCAFETYFFNDLLLSGNYLFALFWGLLLFRDLRRVHTINQLTKTILKTANSPKKKD >NZ_LN831034.1|WP_010922413.1|1165189_1166860_-|DNA-polymerase-III-subunit-gamma/tau MYQALYRKYRSQTFDEMVGQSVISTTLKQAVESGKISHAYLFSGPRGTGKTSAAKIFAKAMNCPNQVDGEPCNQCDICRDITNGSLEDVIEIDAASNNGVDEIRDIRDKSTYAPSRATYKVYIIDEVHMLSTGAFNALLKTLEEPTENVVFILATTELHKIPATILSRVQRFEFKAIKQKAIREHLAWVLDKEGIAYEVDALNLIARRAEGGMRDALSILDQALSLSPDNQVAIAIAEEITGSISILALGDYVRYVSQEQATQALAALETIYDSGKSMSRFATDLLTYLRDLLVVKAGGDNQRQSAVFDTNLSLSIDRIFQMITVVTSHLPEIKKGTHPRIYAEMMTIQLAQKEQILSQVNLSGELISEIETLKNELAQLKQQLSQLQSRPDSLARSDKTKPKTTSYRVDRVTILKIMEETVRNSQQSRQYLDALKNAWNEILDNISAQDRALLMGSEPVLANSENAILAFEAAFNAEQVMSRNNLNDMFGNIMSKAAGFSPNILAVPRTDFQHIRKEFAQQMKSQKDSVQEEQEVALDIPEGFDFLLDKINTIDD >NZ_LN831034.1|WP_010922414.1|1166859_1167357_-|GAF-domain-containing-protein MNKSKKIEQYQLMIAQAKELFANESNALANLSNASALLNMTLPNSVFTGFYLFDGQELILGPFQGRVSCVHIKLGKGVCGESAQSRRTIIINDVKQHANYISCDAAAMSEIVVPMVKEGHLIGVLDLDSSLVADYDEVDQEYLEAFVDLFLEKTTFTFNMFGVKN >NZ_LN831034.1|WP_002989260.1|1167501_1168311_+|PrsW-family-intramembrane-metalloprotease MKQITQQKWLRYGLFIALVLNGIELELLGLTANNLSFKEAFALILTISLLGIYLIPFAAAIFYLSKKFHMNLNVIIVSCLSGLYISGFLASCGNHLVGQFWSYIIPSKDALKLWGDALTAPIVEEPIKASSAILVITLFPRLTLKEKLVVALLSGMGFQLTEDIRYLIQAKSIDSLVPTAIERISTAVTSHWVHTAIFTIGAYLLLKGSNLFSKQQQIFWLLSPLVLHFIWNSPLTSIPGMTVLLGTLILLIFGDLFQKINTLDDDVLF >NZ_LN831034.1|WP_010922415.1|1168363_1168627_-|DUF1294-domain-containing-protein MLLIWLGLLFVWNELVFVIYAFDKRKAIKKKRRISERKLLVITVLFGGFGALLAAKKYHHKTRKWYFVITCYTSILLTLLVTYIFMK >NZ_LN831034.1|WP_002984060.1|1168706_1169333_-|uridine-kinase MLKKPIIIGVTGGSGGGKTSVSRAILDSFPNARIAMIQHDSYYKDQSHMSFEERVKTNYDHPLAFDTDFMIQQLKELLAGRPVDIPIYDYKKHTRSNTTFRQDPQDVIIVEGILVLEDERLRDLMDIKLFVDTDDDIRIIRRIKRDMMERGRSLESIIDQYTSVVKPMYHQFIEPSKRYADIVIPEGVSNVVAIDVINSKIASILGEV |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN831034_4 | 1317644-1317938 | TypeI |
I-C
Consensus repeat of NZ_LN831034_4
|
4 spacers
spacers of NZ_LN831034_4
>4.1|1317676|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT GAGTTTACTCGCTCAAATCAAGGTATGCGGACA >4.2|1317741|34|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT GCTGTGACATTGCGGGATGTAATCAAAGTAAAAA >4.3|1317807|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT TAAAGCAAACCTAGCAGAAGCAGAAAATGACTT >4.4|1317872|35|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT CTGATGTAATTGGTGATTTTCGTGATATGCTTTTT >4.5|1317677|33|NZ_LN831034|PILER-CR GAGTTTACTCGCTCAAATCAAGGTATGCGGACA >4.6|1317742|34|NZ_LN831034|PILER-CR GCTGTGACATTGCGGGATGTAATCAAAGTAAAAA >4.7|1317808|33|NZ_LN831034|PILER-CR TAAAGCAAACCTAGCAGAAGCAGAAAATGACTT >4.8|1317873|35|NZ_LN831034|PILER-CR CTGATGTAATTGGTGATTTTCGTGATATGCTTTTT |
cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN831034_4
The CRISPR arrays of NZ_LN831034_4 >merge|NZ_LN831034|4|1317644-1317938|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGACGAGTTTACTCGCTCAAATCAAGGTATGCGGACAATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGACGCTGTGACATTGCGGGATGTAATCAAAGTAAAAAATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGACTAAAGCAAACCTAGCAGAAGCAGAAAATGACTTATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGACCTGATGTAATTGGTGATTTTCGTGATATGCTTTTTATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC >NZ_LN831034|4|4|1317644-1317938|CRISPRCasFinder CTTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC GAGTTTACTCGCTCAAATCAAGGTATGCGGACA ATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC GCTGTGACATTGCGGGATGTAATCAAAGTAAAAA ATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC TAAAGCAAACCTAGCAGAAGCAGAAAATGACTT ATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC CTGATGTAATTGGTGATTTTCGTGATATGCTTTTT ATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC >NZ_LN831034|4|1|1317644-1317938|CRT CTTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC GAGTTTACTCGCTCAAATCAAGGTATGCGGACA ATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC GCTGTGACATTGCGGGATGTAATCAAAGTAAAAA ATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC TAAAGCAAACCTAGCAGAAGCAGAAAATGACTT ATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC CTGATGTAATTGGTGATTTTCGTGATATGCTTTTT ATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC >NZ_LN831034|4|1|1317645-1317938|PILER-CR TTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGACG AGTTTACTCGCTCAAATCAAGGTATGCGGACAA TTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGACG CTGTGACATTGCGGGATGTAATCAAAGTAAAAAA TTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGACT AAAGCAAACCTAGCAGAAGCAGAAAATGACTTA TTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGACC TGATGTAATTGGTGATTTTCGTGATATGCTTTTTA TTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC
>NZ_LN831034.1|WP_002983776.1|1316773_1317484_-|thiol-disulfide-oxidoreductase-associated-membrane-protein-CcdA2 MTLSLVLMVSVFGAGLLSFFSPCIFPVLPVYLGILLDADDSKTITIFGKKLYWYGIVKTLAFIFGLSTIFVILGYGAGFLGNILYAVWFRYLLGALVIILGIHQMGLITIKSLQFQKSLTFHNNKNRNGLFNAFILGLTFSFGWTPCVGPVLSSVLALVASGGNGAWQGGVLMIIYTLGLGIPFLLISFASGIVLKQFNKLKPHILLLKKVGGVLIIVMGILLMTGTLNNLAQLFG >NZ_LN831034.1|WP_002983778.1|1316137_1316761_-|TlpA-family-protein-disulfide-reductase MKKGLLVTTGLACLGLLTACSTQDNMAKKEITQDKMSMAAKKKDKMSTSKDKSMMADKSSDKKMTNDGPMAPDFELKGIDGKTYRLSEFKGKKVYLKFWASWCSICLSTLADTEDLAKMSDKDYVVLTVVSPGHQGEKSEADFKKWFQGTDYKDLPVLLDPDGKLLEAYGVRSYPTEVFIGSDGVLAKKHIGYAKKSDIKKTLKGIH >NZ_LN831034.1|WP_010922508.1|1314988_1316095_-|peptide-methionine-(R)-S-oxide-reductase-MsrB MEHKWKLWLFIVGVVLLIGGASVLIQKGQAKAFSQGKPQLPAKKVKSTKVDPNAPVDQKVIYLAGGCFWGVEEYFSQVDGVLDAVSGYANGRGDTTNYQLIHQTGHAETVEVAYDANRISLKELLLHFFRIIDPTSLNKQGNDRGSQYRTGIYYTDKADLAIIDEVFKEKAKDYKKKIVVEKAPLKHFIKAEDYHQDYLKKNPNGYCHIDINQATYPVIDESKYPKPSATEIKEKLSADEYRVTQKNETEKAFSNRYWDSFDAGIYVDVVTGEPLFSSKDKFESGCGWPSFSRPISPDVVRYKEDKSFNMTRTEVRSRSGNSHLGHVFTDGPKDQGGLRYCINSLSITFIPKADMEAKGYGYLLSSVE >NZ_LN831034.1|WP_010922507.1|1314160_1314901_-|response-regulator MYSLLIVEDEYLVRQGIRSLVDFSQFKIDRVNEAENGQLAWDLFQKEPYDIVLTDINMPKLNGIQLAELIKQESPQTHLVFLTGYDDFNYALSALKLGADDYLLKPFSKADVEDMLGKLRKKLELSKKTETIQELVEQPQKEVSAIAMAIHERLADSDLTLKSLAQQLGFSPNYLSVLIKKELGMPFQDYLVQERLKKAKLLLLTSNLKIYEIAEQVGFEDMNYFSQRFKQLVGVTPSQYKKGGQA >NZ_LN831034.1|WP_011285644.1|1312430_1314164_-|sensor-histidine-kinase MKRYPLLVQLISYVFVIVIALITTLGLLYYQTSSRNIRQLIERDTRQSIRQSSQFIDAYIKPLKETTSVLAKNTEIQAFASQIHQENDKQVLQLMKMVLATNSDLQAAVLVTKDGRTVSTNSQLTMKTSSDMMAEPWYKAAIDRQAMPILTPARQLSLSSKKEWVVSVTQEVVDRAGHNLGVLRLDIAYPTIKASLDQLQLGRQGFAFIVNDKHEFVYHPKKSVYSSSKEMAAMKPYLAIQNGYTKDKTSFVYQKLIPNSQWTLVGVASLDQLHRVQRQIFWSFLGTGLLACLICGFATVLVLRRWIRPIQQLQQVILAIQKGDRQLRAQETGSPELTDLAQQFNALLDQIDSLMVAVADKEKAIGQYRLQALASQINPHFLYNTLDTIIWMAEFNDSKRVVEVTKSLAKYFRLALNQGNEYIRLADELDHVSQYLFIQKQRYGDKLSYEVQGLDVYADFVIPKLILQPLVENAIYHGIKEVDRKGMIKVTVSDTAQHLMLTVWDNGKGIEDSSLTNSQSLLARGGVGLKNVDQRLKLHYGEGYHMTIHSQSDQFTEIQLSLPKMHELMADDTQENE >NZ_LN831034.1|WP_010922506.1|1311278_1312358_-|MmcQ/YjbR-family-DNA-binding-protein MSLATDYFSRQTPIVEKLMAYGFEKRDNGYFYNERFMEGEFEAQLRIDEAGNIWDRVIDCDLEEDYLPLQQAAWQGTYTGQVRAAYLELLERLSVACFEATPFQSMQANRLAKHITKEWSDPMDYPFEKHPDLATYRVGGKWYAMIFSLLADKLDQIPERLVGQTCEVMTVKVNPKAFPQLLQQEGIYPAYHMSKKNWISIILDDKVTDDKLWTLVTQSRQLVNPNGLSNPNGPDYWVIPANLKYYDIDAEFAANDVILWTQKAGIAVGDYVLIYITAPVKSIRYVCQVLETDIPNEGYRKNPNIDKLMRLRKCQQYKDGLLSFDLMKKHGVAAVRGPRRLSPQLIAFLKEKEYFKENN >NZ_LN831034.1|WP_011285642.1|1310548_1311265_-|B3/4-domain-containing-protein MVEFVADQSFWELFPGAKLGVVLLKDVQNQAESPEDVKQLLADSHELAKAYLTADNFSDNQVVQVYRKAYQHFKTKKGARSSIEALLKRVSNGQSIPSINPLVDIYNAASLRFGLPAGAEDSDSFIGDLRLTITDGGDDFYLIGDADNNPTLPNELCYKDDIGAVCRCLNWRDGERTMVTEHTKNAFLIIEALDQEGQNRLQEALKFIEGSAKMYLHAITSVHVLDKDNPHVPLFTEN >NZ_LN831034.1|WP_002989056.1|1309909_1310383_+|arginine-repressor MNKKETRHQLIRSLISETTIHTQQELQERLQKNGITITQATLSRDMKELNLVKVTSGNDTHYEALAISQTRWEHRLRFYMEDALVMLKIVQHQIILKTLPGLAQSFGSILDAMQIPEIVATVCGDDTCLIVCEDNEQAKACYETLSHYTPPFFFSNK >NZ_LN831034.1|WP_002983795.1|1309087_1309768_-|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MIRREDYQYLRKLNDFRYFSIEQFDKIVGQMEFRKAKKDHILFFEGDKRDKLFLVTSGYFKVEQSDQSGTFMYTDFIRHGTIFPYGGLFTDDYYHFSVVAMTDVTYFYFPVDLFEDYSLENRLQMKHLYSKMSKLLELHELRVRNLITSSASSRVIQSLAILLVEMGKDSDTLPFQLTTTDIAQISGTTRETVSHVLRDLKKQELITIKGKYLTYLDKDYFLQYTK >NZ_LN831034.1|WP_002983803.1|1307578_1308814_-|arginine-deiminase MTAQTPIHVYSEIGKLKKVLLHRPGKEIENLMPDYLERLLFDDIPFLEDAQKEHDAFAQALRDEGIEVLYLETLAAESLVTPEIREAFIDEYLSEANIRGRATKKAIRELLMAIEDNQELIEKTMAGVQKSELPEIPASEKGLTDLVESNYPFAIDPMPNLYFTRDPFATIGTGVSLNHMFSETRNRETLYGKYIFTHHPIYGGGKVPMVYDRNETTRIEGGDELVLSKDVLAVGISQRTDAASIEKLLVNIFKQNLGFKKVLAFEFANNRKFMHLDTVFTMVDYDKFTIHPEIEGDLRVYSVTYDNEELHIVEEKGDLAELLAANLGVEKVDLIRCGGDNLVAAGREQWNDGSNTLTIAPGVVVVYNRNTITNAILESKGLKLIKIHGSELVRGRGGPRCMSMPFEREDI >NZ_LN831034.1|WP_002989044.1|1318086_1318380_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MMVLVTYDVNTETPAGRKRLRHVAKLCVDYGQRVQNSVFECSVTPAEFVDIKHRLTQIIDEKTDSIRFYLLGKNWQRRVETLGRSDSYDPDKGVLLL >NZ_LN831034.1|WP_010922509.1|1318390_1319416_-|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKLLNTLYLTQEDFYVTKEGDNIVIKQEGKVLKRFPFRIIDGIVCFSYLGVSSALVKLCTENQINLSFHTPQGRFCGRYIGSTNGNVLLRREHYRLSDREESLEYAKRFILAKISNSRKYLLRFKRDHRQQIDTKLFEAVNDELIWALEMVQAADNKDSLRGIEGQAANQYFRIFNDLVLTDKKTFYFQGRSKRPPLDCVNALLSFGYSLLTFECQSALEAVGLDSYVGFFHTDRPGRASLALDLVEEFRSYIVDRFVFSLINKGQLQKKHFEVKENGSILLTENGRAIFIDLWQKRKHTEVEHPFTKEKVKLMLLPYVQAQLLAKAIRGDLESYPPFMV >NZ_LN831034.1|WP_003060901.1|1319412_1320087_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MVYAEDDYLMLSGIQHFQFCKRQWALIHIEQQWLDNEATAHGQVLHTKADNPYIKEKRKELLVSRAMPISSAELGLSGIMDVVEFYKDDQGVSLRGKRGKWLPKVVEYKRGKPKKDTRDIVQLVAQTMCLEETLDCDINEGCLYYHSVNQRVIVPMTSALRQEVKELAAEMHEVYQSQMLPKAAYFKNCQLCSLVDICKPRLSKKTRSVSRYINEAMTSEEMDL >NZ_LN831034.1|WP_010922510.1|1320088_1320937_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 MLEHKIDFMVTLEVKEANANGDPLNGNMPRTDAKGYGVMSDVSIKRKIRNRLQDMGKSIFVQANERIEDDFRSLEKRFSQHFTAKTPDKEIEEKANALWFDVRAFGQVFTYLKKSIGVRGPVSISMAKSLEPIVISSLQITRSTNGMEAKNNSGRSSDTMGTKHFVDYGVYVLKGSINAYFAEKTGFSQEDAEAIKEVLVSLFENDASSARPEGSMRVCEVFWFTHSSKLGNVSSARVFDLLEYHQSIEEKSTYDAYQIHLNQEKLAKYEAKGLTLEILEGL >NZ_LN831034.1|WP_010922511.1|1320941_1322837_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MDFFTSLLKTYEKAELADLVDHQKRNNEPVLLPIYHTSLKSNGKNIISVKLDKDGQFHKAEFMADKQMIIFPVTADSVARSGSHPAPHPLVDKFAYYSAEMGQIQYDSFHKQLNNWIDYCEEGDVKKFLTFVQQFILKPEFLTLILDSLIGPDYQHNQLKVTFCDATGKEKLIDLSACFLEFSIDQFQGFKNESVSTFKALHQSYISFVEANRENLGICNISGREEQLTDKHRGLMGNAKIISVSNKREAYKGRFREREDVFSVGYETSEKIHLMLKYLLENKNTSTWLGSSQYLINWFSDDLTNDSRLDIVSPIFDDGLEEDDDDDTPPVITLATEDNKRIGKSFIKGQKLFANDATYYVAILNKTSNGRIALKYFRQLQASQLLTNLNKWQETYSWESRSKFGKSRLRTPTFHDILNVSYGVDRDRFLELDNDNFKSDQIQKLVASLIDGKPMPQSIVKKLGNNVKERHRYRKHWYQVEQVCLAILHKQNGEEFSPMLDHTNQNRSYLFGRLLAIFELIETLRYGLDGNNNDRITNAERYWTAYTGQPTKLMMLLENKIKPYEEPLKLNRRGSWMKLEKEKEEILELLNPLLETETMEKPLDYRFIFGYYAEKNYYYTKQNTEVTESEE >NZ_LN831034.1|WP_010922512.1|1322836_1323565_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MYRSRDFYVRVSGQRALFTNPATKGGSERSSYSVPTRQALNGIVDAIYYKPTFTNIVTEVKVINQIQTELQGVRALLHDYSADLSYVSYLSDVVYLIKFHFVWNEDRKDLNSDRLPAKHEAIMERSIRKGGRRDVFLGTRECLGLVDDISQEEYETTVSYYNGVNIDLGIMFHSFAYPKDKKTPLKSYFTKTVMKNGVITFKAQSECDIVNTLSSYAFKAPEEIKSVNDECMEYDAMEKGEN >NZ_LN831034.1|WP_029714133.1|1326258_1328907_-|valine--tRNA-ligase MTELSPKYNPAEVEAGRYQKWLDADVFKPSGDQKAKPYSIVIPPPNVTGKLHLGHAWDTTLQDIIIRQKRMQGFDTLWLPGMDHAGIATQAKVEERLREQGISRYDLGRDKFLDKVWEWKDEYATTIKEQWGKMGLSVDYSRERFTLDEGLSKAVRKVFVDLYKKGWIYRGEFIINWDPAARTALSDIEVIHKDVEGAFYHMNYMLADGSRALQVATTRPETMFGDVAVAVNPEDPRYKDLIGKNVILPIVNKLIPIVGDEHADPEFGTGVVKITPAHDPNDFEVGQRHNLPQVNVMNDDGTMNELAGDFAGMDRFEARQATVAKLEELGALVNIEKRVHSVGHSERSGAVVEPRLSTQWFVKMDELAKQAMDNQETDDRVDFYPPRFNDTFLQWMENVHDWVISRQLWWGHQIPAWYNAEGEIYVGEEAPEGDDWTQDEDVLDTWFSSALWPFSTMGWPDTDVEDFKRYFPTSTLVTGYDIIFFWVSRMIFQSLEFTGRQPFQNVLIHGLIRDEEGRKMSKSLGNGIDPMDVIEKYGADSLRWFLSNGSAPGQDVRFSYEKMDASWNFINKIWNISRYILMNNEGLTLEDAESNVAKVAASEAGNVTDQWILHNLNETIAKVTENFDKFEFGVAGHILYNFIWEEFANWYVELTKEVLYSDNEAEKVITRSVLLYTLDKILRLLHPIMPFVTEEIYAQYAQGSIVTVDYPVVRPAFENEAAHKGVESLKDLIRAVRNARAEVNVAPSKPITILVKTADSELEDFFNSNINYIKCFTNPEKLEISSAIAAPELAMTSIITGAEIYLPLADLLNVEEELARLDKELAKWQKELDMVGKKLGNERFVANAKPEVVQKEKDKQADYQAKYDATQERIAEMKKIKS >NZ_LN831034.1|WP_002989022.1|1328908_1329472_-|AAA-family-ATPase MNLIIIGAQASGKMTIGQEVARQTGMTLFHNHDSIDFVLRFMPWSQESTALIERIRFAFFETFAKTGQDMIFTIVIDFNDPNDVAMLEKIQAVFQSYDQEVLFVELKTDIEERLKRNRTENRLKHKPLKRNIEWSEQDIQSTMAYAVFNPEEPPKTLTHYQKINNTQLTAAETAQLIIQKMTHIKEN >NZ_LN831034.1|WP_002989018.1|1330072_1330468_-|hypothetical-protein MAKQKNRKKALKLEMKRNGLLKKAGQVFDKAVESVETAVDKTISAGKNLVEKGSQTVENLTASKERLTLDEFAGQPVVAGIRSDLVETLYAEGIHSAQAFKEWTEKDLLALKGIGPATVKKLVENGASFKK >NZ_LN831034.1|WP_002983750.1|1330485_1330740_-|DUF1912-family-protein MSYEKEFLKDFEDWVKTQIQVNQLAMATSQEVAQEDGDERAKDAFIRYESKLDAYEFLLGKFDNYKNGKAFHDIPDELFGARHY |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN831034_5 | 1757472-1757589 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN831034_5
|
1 spacers
spacers of NZ_LN831034_5
>5.1|1757503|56|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder TACCGTACCAGGTCCTCCCCAATCATCACGTTTTTCATACCCTGTACCTAATGCTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN831034_5
The CRISPR arrays of NZ_LN831034_5 >merge|NZ_LN831034|5|1757472-1757589|CRISPRCasFinder CTCCATATGGTGGAGTGTAAGGGTCAATTGCTACCGTACCAGGTCCTCCCCAATCATCACGTTTTTCATACCCTGTACCTAATGCTCCTCCATATGGTGGAGTGTAAGGGTCAGTTGC >NZ_LN831034|5|5|1757472-1757589|CRISPRCasFinder CTCCATATGGTGGAGTGTAAGGGTCAATTGC TACCGTACCAGGTCCTCCCCAATCATCACGTTTTTCATACCCTGTACCTAATGCTC CTCCATATGGTGGAGTGTAAGGGTCAGTTGC
>NZ_LN831034.1|WP_011285740.1|1751346_1754841_-|C5a-peptidase-ScpA/B MRKKQKLPFDKLAIALMSTSILLNAQSDIKANTVTEDTPATEQAVETPQPTAVSEEAPSSKETKTPQTPDDAEETIADDANDLAPQAPAKTADTPATSKATIRDLNDPSQVKTLQEKAGKGAGTVVAVIDAGFDKNHEAWRLTDKTKARYQSKEDLEKAKKEHGITYGEWVNDKVAYYHDYSKDGKTAVDQEHGTHVSGILSGNAPSETKEPYRLEGAMPEAQLLLMRVEIVNGLADYARNYAQAIIDAVNLGAKVINMSFGNAALAYANLPDETKKAFDYAKSKGVSIVTSAGNDSSFGGKTRLPLADHPDYGVVGTPAAADSTLTVASYSPDKQLTETATVKTADQQDKEMPVLSTNRFEPNKAYDYAYANRGMKEDDFKDVKGKIALIERGDIDFKDKIANAKKAGAVGVLIYDNQDKGFPIELPNVDQMPAAFISRKDGLLLKENPQKTITFNATPKVLPTASGTKLSRFSSWGLTADGNIKPDIAAPGQDILSSVANNKYAKLSGTSMSAPLVAGIMGLLQKQYETQYPDMTPSERLDLAKKVLMSSATALYDEDEKAYFSPRQQGAGAVDAKKASAATMYVTDKDNTSSKVHLNNVSDKFEVTVTVHNKSDKPQELYYQATVQTDKVDGKLFALAPKALYETSWQKITIPANSSKQVTIPIDVSQFSKDLLAPMKNGYFLEGFVRFKQDPTKEELMSIPYIGFRGDFGNLSALEKPIYDSKDGSSYYHEANSDAKDQLDGDGLQFYALKNNFTALTTESNPWTIIKAVKEGVENIEDIESSEITETIFAGTFAKQDDDSHYYIHRHANGKPYAAISPNGDGNRDYVQFQGTFLRNAKNLVAEVLDKEGNVVWTSEVTEQVVKNYNNDLASTLGSTRFEKTRWDGKDKDGKVVANGTYTYRVRYTPISSGAKEQHTDFDVIVDNTTPEVATSATFSTEDRRLTLASKPKTSQPVYRERIAYTYMDEDLPTTEYISPNEDGTFTLPEEAETMEGATVPLKMSDFTYVVEDMAGNITYTPVTKLLEGHSNKPEQDGSDQAPDKKPETKPEQDGSGQAPDKKPETKPEQDGSGQTPDKKPETKPEKDSSGQTPGKTPQKGQPSRTLEKRSSKRALATKASTKDQLPTTNDKDTNRLHLLKLVMTTFFLGLVAHIFKTKRTED >NZ_LN831034.1|WP_029714149.1|1749966_1751250_-|LPXTG-anchored-fibronectin-binding-protein-FbpA MRRAENNKHSRYSIRKLSVGVTSIAIASLFLGKVAYAVDGIPPISLTQKTTATTSENWHHIDKDGLIPLGISLEAAKEEFKKEVEESRLSEAQKETYKQKIKTAPDKDKLLFTYHSEYMTAVKDLPASTESTTQPVEAPVQETQASASDSMVTGDSTSVTTDSPEETPSSESPVAPALSEAPAQPAESEEPSVAASSEETPSPSTPAAPETPEEPAAPSPSPESEEPSVAAPSEETPSPETPAAPETPEEPATPSPSPESEEPSVAASSEETPSPSTPAAPSTPAAPETPEEPAAPSQPAESEESSVAATTSPSPSTPAESETQTPPAVTKDSDKPSSAAEKPAASSLVSEQTVQQPTSKRSSDKKEEQEQSYSPNRSLSRQVRAHESGKYLPSTGEKAQPLFIATMTLMSLFGSLLVTKRQKETKK >NZ_LN831034.1|WP_002987954.1|1748810_1749731_-|metal-ABC-transporter-substrate-binding-lipoprotein/laminin-binding-adhesin-Lmb MKKGFFLMAMVVSLVMIAGCDKSANPKQPTQGMSVVTSFYPMYAMTKEVSGDLNDVRMIQSGAGIHSFEPSVNDVAAIYDADLFVYHSHTLEAWARDLDPNLKKSKVDVFEASKPLTLDRVKGLEDMEVTQGIDPATLYDPHTWTDPVLAGEEAVNIAKELGRLDPKHKDSYTKNAKAFKKEAEQLTEEYTQKFKKVRSKTFVTQHTAFSYLAKRFGLKQLGISGISPEQEPSPRQLKEIQDFVKEYNVKTIFAEDNVNPKIAHAIAKSTGAKVKTLSPLEAAPSGNKTYLENLRANLEVLYQQLK >NZ_LN831034.1|WP_010922709.1|1746320_1748798_-|pneumococcal-type-histidine-triad-protein MKKTYGYIGSVAAILLATHIGSYQLGKHHMGSATKDNQIAYIDDSKGKAKAPKTNKTMDQISAEEGISAEQIVVKITDQGYVTSHGDHYHFYNGKVPYDAIISEELLMTDPNYRFKQSDVINEILDGYVIKVNGNYYVYLKPGSKRKNIRTKQQIAEQVAKGTKEAKEKGLAQVAHLSKEEVAAVNEAKRQGRYTTDDGYIFSPTDIIDDLGDAYLVPHGNHYHYIPKKDLSPSELAAAQAYWSQKQGRGARPSDYRPTPAPAPGRRKAPIPDVTPNPGQGHQPDNGGYHPAPPRPNDASQNKHQRDEFKGKTFKELLDQLHRLDLKYRHVEEDGLIFEPTQVIKSNAFGYVVPHGDHYHIIPRSQLSPLEMELADRYLAGQTEDDDSGSDHSKPSDKEVTHTFLGHRIKAYGKGLDGKPYDTSDAYVFSKESIHSVDKSGVTAKHGDHFHYIGFGELEQYELDEVANWVKAKGQADELAAALDQEQGKEKPLFDTKKVSRKVTKDGKVGYMMPKDGKDYFYARDQLDLTQIAFAEQELMLKDKKHYRYDIVDTGIEPRLAVDVSSLPMHAGNATYDTGSSFVIPHIDHIHVVPYSWLTRDQIATIKYVMQHPEVRPDIWSKPGHEESGSVIPNVTPLDKRAGMPNWQIIHSAEEVQKALAEGRFATPDGYIFDPRDVLAKETFVWKDGSFSIPRADGSSLRTINKSDLSQAEWQQAQELLAKKNAGDATDTDKPKEKQQADKSNENQQPSEASKEEEKESDDFIDSLPDYGLDRATLEDHINQLAQKANIDPKYLIFQPEGVQFYNKNGELVTYDIKTLQQINP >NZ_LN831034.1|WP_002982507.1|1745951_1746152_-|CsbD-family-protein MSEEKLKSKIEQASGGLKEGAGKLTGDKELEAKGFVEKTIAKGKELADDAKEAVEGAVDAVKEKLK >NZ_LN831034.1|WP_010922708.1|1745244_1745871_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MTLEAKKLGFYHKKDQWLFKEIDLEVAPGQILGIFGQSGCGKTSLSRVLAGFLQPKSGEVLVDGSHLPNKAFRPVQLIQQHPEQTMNPLWPMKKSLEEAYYPSQDLRDAFGIQEKWLKRRPSELSGGELQRFSIVRSLHPETKYLIADEMTTMLDSITQASVWKSLLEIVKDRNLGLIIISHEFDMLEKLCDACYMIEENRTQLFKHT >NZ_LN831034.1|WP_003059481.1|1744457_1745261_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MTETLLSIKDLSITFTQYGRFLKPFQSTPIQALNLEVKKGELLAIIGASGSGKSLLAHAIMDILPKNAAVTGDMIYRGQSLTSKRIKQLRGKEMTLIPQSVNYLDPSMKVKHQVRLGISENAKATQEGLFQQFGLKESDGDLYPFQLSGGMLRRVLFTTCISDTVSLIIADEPTPGLHPDALQMVLDQLRSFADKGISVIFITHDIVAASQIADRITIFKEGKAIETAPASFFSGGGEQLQTEFARRLWRTLPQQDFLKGVTHDLRG >NZ_LN831034.1|WP_029714151.1|1743624_1744446_+|ABC-transporter-permease MILKRRTVVLWQLGIAISLILSILALNLYFYRTPLETNAALRNLAPSLNHLFGTDGLGRDMFVRTIKGLYFSLQVGLLGALMGVFLATVFGVLAGLGNSLIDKIIAWLVDLFIGMPHLIFMILISFVVGKGAQGVIIATAVTHWPSLARLIRNEVYDLKNKAFVQLSKSMGKTPYYIVRHHILPLIASQIFIGFILLFPHVILHEASMTFLGFGLSAEQPSVGIILSEAAKHISLGNWWLVIFPGLYLILVVNAFDTIGESLKKLFYPQTDHF >NZ_LN831034.1|WP_009880585.1|1742650_1743628_+|ABC-transporter-permease MKRTTIIIIWKIIRCVTLIFGVSVLTFVLLKQSPVDPVMASVNYDTSLTPAQYKAIAHHYGLDKPALVQYFIWLKNVIQGDLGTSLVYRQPVSDIIRSRAGASFILMGLSWILSGLIGFILGTLSAFHQGKLLDRVVRWFSYLQISVPTFWIGLIFLLIFSVQLGWFPIGISSPIGTLSQDITLADRVKHLMLPVFTLSILGIANVTLHTRTKMMSVLSSEYVLFARARGETQWQIFKHHCLRNAIVPAITLHFSYFGELFGGSVLAEQVFSYPGLGSTLTEAGLKSDTPLLLAIVMIGTLFVFAGNLIADILNSIINPQLRRKV >NZ_LN831034.1|WP_010922707.1|1740909_1742538_+|ABC-transporter-substrate-binding-protein MSKYLKYFSIITLFLTGLILVACQQQKPQTKERQRKQRPKDELVVSMGAKLPHEFDPKDRYGVHNEGNITHSTLLKRSPELDIKGELAKTYHLSEDGLTWSFDLHDDFKFSNGEPVTADDVKFTYDMLKADGKAWDLTFIKNVEVVGKNQVNIHLTEAHSTFTAQLTEIPIVPKKHYNDKYKSNPIGSGPYMVKEYKAGEQAIFVRNPYWHGKKPYFKKWTWVLLDENTALAALESGDVDMIYATPELADKKVKGTRLLDIPSNDVRGLSLPYVKKGVITDSPDGYPVGNDVTSDPAIRKALTIGLNRQKVLDTVLNGYGKPAYSIIDKTPFWNPKTAIKDNKVAKAKQLLTKAGWKEQADGSRKKGDLDAAFDLYYPTNDQLRANLAVEVAEQAKALGITIKLKASNWDEMATKSHDSALLYAGGRHHAQQFYESHHPSLAGKGWTNITFYNNPTVTKYLDKAMTSSDLDKANEYWKLAQWDGKTGASTLGDLPNVWLVSLNHTYIGDKRINVGKQGVHSHGHDWSLLTNIAEWTWDESTK >NZ_LN831034.1|WP_046735277.1|1758164_1759295_-|YSIRK-type-signal-peptide-containing-protein 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>NZ_LN831034.1|WP_029714100.1|1761104_1762733_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MYVSKLFTSQQWRELKLISYVTENADAIGVKDKELSKALNISMLTLQTCLTNMQFMKEVGGITYKNGYITIWYHQHCGLQEVYQKALRHSQSFKLLETLFFRDFNSLEELAEELFVSLSTLKRLIKKTNAYLMHTFGITILTSPVQVSGDEHQIRLFYLKYFSEAYKISEWPFGEILNLKNCERLLSLMIKEVDVRVNFTLFQHLKILSSVNLIRYYKGHSAVYDNKKTSQRFSQLIQSSLEFQDLSRLFHLKFGLYLDETTIAEMFSNHVNDQLEIGYAFDSIKQDSPTGCRKVTNWVHLLDELEIRLNLSVTNKYEVAVILHNTTVLKEEDITANYLFFDYKKSYLNFYKQEHPHLYKAFVAGVEKLMRSEKEPISTELTNQLIYAFFITWENSFLKVNQKDEKIRLLVIERSFNSVGNFLKKYVGEFFSITNFNELDALTIDLEEIEKQYDVIVTDVMVGKSEELEIFFFHKMIPEAIIDKLNAFLNISFADSLPLDKPINPLDFHRKEVILPTPPNKLHAPLHNLDSLTVATQKQIHH >NZ_LN831034.1|WP_002982472.1|1763408_1763660_-|hypothetical-protein MIKKVTTPSQKTKKRVRNGYLLKLGTACLLLSILSYGIGLLGQPSMENTFMGIASVAMLGSVCFFIIFALNRIFDALEDNLRD >NZ_LN831034.1|WP_010922716.1|1763738_1765364_-|CHAP-domain-containing-protein 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MFQLRKKMTRKQLALLSAGVLTCVVGGSYLIMNHQQQEIVSSVNKVKALTIKEAMEQGKDISLTLAGEVTANNSSKVKIDSSKGEVKEVFVKKGDVVKVGQPLFSYETSQRLTAQSSEFDVQTKANQLQVAKTNAALKWETYNRKVNEINTLKSRYNTAPDESLLEQIRSAEDSVSQALSDAKTADSDVKTAQIELDKANATATTEKGKLEYDTVKSDTAGTIVSLNTDLPNQSKSKKENETFMEIIDKSKMLVKGNISEFDRDKLKIGQKVEVIDRKDNSKKWTGKVTQVGNLKAEEKGQGQGQGGNDQQDNPNQAKFPYVIELDQSDKQPLIGSHTYVNVLNNVPEAGKIVLKETFTMAENGKTYVWKVDKNKVKKQEIKTKPFSKGYVEVTSGLTMQDKIAQPLPGMKDGMEVGSIVKP |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN831034_6 | 1760429-1760562 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_LN831034_6
|
1 spacers
spacers of NZ_LN831034_6
>6.1|1760479|34|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder TAAAGCGGTAGCTCTATGGTAGTCCCGACTTGCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_LN831034_6
The CRISPR arrays of NZ_LN831034_6 >merge|NZ_LN831034|6|1760429-1760562|CRISPRCasFinder TGGTCTATCGCTAATTCAAGAGCTTTCTTTTTCTCTTCTAACTCTTTTTCTAAAGCGGTAGCTCTATGGTAGTCCCGACTTGCCTGGTCTATCGCTAATTCAAGAGCTTCCTTTTTCTCTTCTAACTCTTTTTC >NZ_LN831034|6|6|1760429-1760562|CRISPRCasFinder TGGTCTATCGCTAATTCAAGAGCTTTCTTTTTCTCTTCTAACTCTTTTTC TAAAGCGGTAGCTCTATGGTAGTCCCGACTTGCC TGGTCTATCGCTAATTCAAGAGCTTCCTTTTTCTCTTCTAACTCTTTTTC
>NZ_LN831034.1|WP_046735277.1|1758164_1759295_-|YSIRK-type-signal-peptide-containing-protein MTRQQTKKNYSLRKLKTGTASVAVALTVLGAGFANQTTVKAEGAKIDWQEEYKKLDEDNAKLVEVVETTSLENEKLKSENEENKKNLDKLSKENQGKLEKLELDYLKKLDHEHKEHQKEQQEQEERQKNQEQLERKYQREVEKRYQEQLQKQQQLETEKQISEASRKSLSRDLEASRAAKKDLEAEHQKLEAEHQKLKEDKQISDASRQGLSRDLEASRAAKKELEANHQKLEAEHQKLKEDKQISDASRQGLSRDLEASRAAKKELEANHQKLEAEAKALKEQLAKQAEELAKLRAGKASDSQTPDTKPGNKAVPGKGQAPQAGTKPNQNKAPMKETKRQLPSTGETANPFFTAAALTVMATAGVAAVVKRKEEN >NZ_LN831034.1|WP_046735276.1|1757058_1757976_-|complement-mediated-lysis-inhibitor-Sic MNIRNKIENSKTLLFTSLVAVALLGATQPVSAETYTSRNFDWSGDDWPEDDWSGDGLSKYDRSGVGLSQYGWSQYGWSSDKEEWPEDWPEDDWSSDKKDETEDKTRPPYGEALGTGYEKRDDWGGPGTVATDPYTPPYGGALGTGYEKRDDWGGPGTVAIDPYTPPYGEALGTGYEKRDDWRGPGHIPKPENEQSPNPSHIPEPPQIEWPQWNGFDELSFGPSDWGQSEDAPRFPSEPRVPEKPQHTPQKNPQESDFDRGFSAGLKAKNSGRGIDFEGFQYGGWSDEYKKGYMQAFGTPYTPSAT >NZ_LN831034.1|WP_011285740.1|1751346_1754841_-|C5a-peptidase-ScpA/B 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>NZ_LN831034.1|WP_029714149.1|1749966_1751250_-|LPXTG-anchored-fibronectin-binding-protein-FbpA MRRAENNKHSRYSIRKLSVGVTSIAIASLFLGKVAYAVDGIPPISLTQKTTATTSENWHHIDKDGLIPLGISLEAAKEEFKKEVEESRLSEAQKETYKQKIKTAPDKDKLLFTYHSEYMTAVKDLPASTESTTQPVEAPVQETQASASDSMVTGDSTSVTTDSPEETPSSESPVAPALSEAPAQPAESEEPSVAASSEETPSPSTPAAPETPEEPAAPSPSPESEEPSVAAPSEETPSPETPAAPETPEEPATPSPSPESEEPSVAASSEETPSPSTPAAPSTPAAPETPEEPAAPSQPAESEESSVAATTSPSPSTPAESETQTPPAVTKDSDKPSSAAEKPAASSLVSEQTVQQPTSKRSSDKKEEQEQSYSPNRSLSRQVRAHESGKYLPSTGEKAQPLFIATMTLMSLFGSLLVTKRQKETKK >NZ_LN831034.1|WP_002987954.1|1748810_1749731_-|metal-ABC-transporter-substrate-binding-lipoprotein/laminin-binding-adhesin-Lmb MKKGFFLMAMVVSLVMIAGCDKSANPKQPTQGMSVVTSFYPMYAMTKEVSGDLNDVRMIQSGAGIHSFEPSVNDVAAIYDADLFVYHSHTLEAWARDLDPNLKKSKVDVFEASKPLTLDRVKGLEDMEVTQGIDPATLYDPHTWTDPVLAGEEAVNIAKELGRLDPKHKDSYTKNAKAFKKEAEQLTEEYTQKFKKVRSKTFVTQHTAFSYLAKRFGLKQLGISGISPEQEPSPRQLKEIQDFVKEYNVKTIFAEDNVNPKIAHAIAKSTGAKVKTLSPLEAAPSGNKTYLENLRANLEVLYQQLK >NZ_LN831034.1|WP_010922709.1|1746320_1748798_-|pneumococcal-type-histidine-triad-protein MKKTYGYIGSVAAILLATHIGSYQLGKHHMGSATKDNQIAYIDDSKGKAKAPKTNKTMDQISAEEGISAEQIVVKITDQGYVTSHGDHYHFYNGKVPYDAIISEELLMTDPNYRFKQSDVINEILDGYVIKVNGNYYVYLKPGSKRKNIRTKQQIAEQVAKGTKEAKEKGLAQVAHLSKEEVAAVNEAKRQGRYTTDDGYIFSPTDIIDDLGDAYLVPHGNHYHYIPKKDLSPSELAAAQAYWSQKQGRGARPSDYRPTPAPAPGRRKAPIPDVTPNPGQGHQPDNGGYHPAPPRPNDASQNKHQRDEFKGKTFKELLDQLHRLDLKYRHVEEDGLIFEPTQVIKSNAFGYVVPHGDHYHIIPRSQLSPLEMELADRYLAGQTEDDDSGSDHSKPSDKEVTHTFLGHRIKAYGKGLDGKPYDTSDAYVFSKESIHSVDKSGVTAKHGDHFHYIGFGELEQYELDEVANWVKAKGQADELAAALDQEQGKEKPLFDTKKVSRKVTKDGKVGYMMPKDGKDYFYARDQLDLTQIAFAEQELMLKDKKHYRYDIVDTGIEPRLAVDVSSLPMHAGNATYDTGSSFVIPHIDHIHVVPYSWLTRDQIATIKYVMQHPEVRPDIWSKPGHEESGSVIPNVTPLDKRAGMPNWQIIHSAEEVQKALAEGRFATPDGYIFDPRDVLAKETFVWKDGSFSIPRADGSSLRTINKSDLSQAEWQQAQELLAKKNAGDATDTDKPKEKQQADKSNENQQPSEASKEEEKESDDFIDSLPDYGLDRATLEDHINQLAQKANIDPKYLIFQPEGVQFYNKNGELVTYDIKTLQQINP >NZ_LN831034.1|WP_002982507.1|1745951_1746152_-|CsbD-family-protein MSEEKLKSKIEQASGGLKEGAGKLTGDKELEAKGFVEKTIAKGKELADDAKEAVEGAVDAVKEKLK >NZ_LN831034.1|WP_010922708.1|1745244_1745871_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MTLEAKKLGFYHKKDQWLFKEIDLEVAPGQILGIFGQSGCGKTSLSRVLAGFLQPKSGEVLVDGSHLPNKAFRPVQLIQQHPEQTMNPLWPMKKSLEEAYYPSQDLRDAFGIQEKWLKRRPSELSGGELQRFSIVRSLHPETKYLIADEMTTMLDSITQASVWKSLLEIVKDRNLGLIIISHEFDMLEKLCDACYMIEENRTQLFKHT >NZ_LN831034.1|WP_003059481.1|1744457_1745261_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MTETLLSIKDLSITFTQYGRFLKPFQSTPIQALNLEVKKGELLAIIGASGSGKSLLAHAIMDILPKNAAVTGDMIYRGQSLTSKRIKQLRGKEMTLIPQSVNYLDPSMKVKHQVRLGISENAKATQEGLFQQFGLKESDGDLYPFQLSGGMLRRVLFTTCISDTVSLIIADEPTPGLHPDALQMVLDQLRSFADKGISVIFITHDIVAASQIADRITIFKEGKAIETAPASFFSGGGEQLQTEFARRLWRTLPQQDFLKGVTHDLRG >NZ_LN831034.1|WP_029714151.1|1743624_1744446_+|ABC-transporter-permease 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MIKKVTTPSQKTKKRVRNGYLLKLGTACLLLSILSYGIGLLGQPSMENTFMGIASVAMLGSVCFFIIFALNRIFDALEDNLRD >NZ_LN831034.1|WP_010922716.1|1763738_1765364_-|CHAP-domain-containing-protein MKKRKLLAVTLLSTILLNSAVPLVVADTSLRNSTSSTDQPTTADTDTDDESETPKKDKKSKETASQHDTQKDHKPSHTHPTPPSNDTKQTDQASSEATDKPNKDKNDTKQPDSSDQSTPSPKDQSSQKESQNKDGRPTPSPDQQKDQTPDKTPEKSADKTPEKGPEKATDKTPEPNRDAPKPIQPPLAAAPVFIPWRESDKDLSKLKPSSRSSAAYVRHWTGDSAYTHNLLSRRYGITAEQLDGFLNSLGIHYDKERLNGKRLLEWEKLTGLDVRAIVAIAMAESSLGTQGVAKEKGANMFGYGAFDFNPNNAKKYSDEVAIRHMVEDTIIANKNQTFERQDLKAKKWSLGQLDTLIDGGVYFTDTSGSGQRRADIMTKLDQWIDDHGSTPEIPEHLKITSGTQFSEVPVGYKRSQPQNVLTYKSETYSFGQCTWYAYNRVKELGYQVDRYMGNGGDWQRKPGFVTTHKPKVGYVVSFAPGQAGADATYGHVAVVEQIKEDGSILISESNVMGLGTISYRTFTAEQASLLTYVVGDKLPRP >NZ_LN831034.1|WP_029714102.1|1765465_1766854_-|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MRLIKKTFLVINGLIIVVVTSILLVLYFAMPIYYTKVKDKEVKCEFDQTSKQIKGKTVTEIRDILTKKINKDNIWYSLVDSDNQLLYPSLQLLDGVSESKDSQNVNIVTTFDNSYSNVKVMSQKVTLRDGKKMTLLGQSSLQPVTDASKVLLDLYPSLLIFSVTVGSIVAYLYSRTSSRRILSMSQTAKKMVNLEPNLTCTIHGKDEIAMLASDINRLYASLSTSIKSLQKEYEKASDSEREKSEFLRMTSHELKTPITSIIGMIDGMLYNVGDFADRDKYLRKCRDVLEGQAQLVQSILSLSKIETLASQNQELFSLKSSLEEEMEVFLVLSELKHLKVTINLEEQFVKANKVYLLKAIKNIIDNAFHYTKSGGQVMIQLKDNQLVIKNEAETLLTQQQMKQLFQPFYRPDYSRNRKDGGTGLGLFITHQILDQHHLAYRFVVLDQRWMVFTIDFPSHHDD >NZ_LN831034.1|WP_002991237.1|1766850_1767504_-|response-regulator-transcription-factor MFKILVVEDDDTISQVICEFLKANNYDPDCVFDGQAALDKWQTTSYDLIILDIMLPSLSGLEVLKTIRKTSDVPIIMLTALDDEYTQLVSFNHLISDYVTKPFSPLILIKRIENVLRVSTPDEKRQIGDLLVDETEHSVYWQGTLVKLTKKEYDIIDYLAKRHQKIVTRDQLMDDIWGYSELDTRVLDNHIKNLRKKMTGIPLKTITGMGYLLGERE >NZ_LN831034.1|WP_002993552.1|1767597_1768815_-|ABC-transporter-permease MEDIIAALSSILSHKMRSILTMLGIIIGIGAIIAIFSIIEGNTENTKRQLIGGSNNTINIVFNKKSSIDPKFPDKSNAKKPDYLPFMAEEELSKIQQVKGVKNALISYGIDDKVYHLGQKSSAKISAITKNVAEVRRMTFIKGSDFSDKDFIDQKQVIYLEKSLYESLFPKDDGLGKFVEVMGNPFRVIGVFESKEQSGLTSGTEKIAYIPLHQWYNINGVVDATPEITIQTYRADDLKPVAKRVSDMLNQTIPKSDYMFGVMNLKEFERQLDNLNKSNFVLLAGIASISLIVGGIGVMNIMLVSVTERTREIGIKKALGARRKLILKQFLIEAVILTLLGGVIGVISGMVSGLIITRSLEYPYILSLFSVVLSLAFCCIIGIVFGLLPAIKASKLDPIEALRFE >NZ_LN831034.1|WP_002982458.1|1768827_1769502_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLNLKDIRKSYHLGTEEFAILKGIDLEVNEGDFLAIMGPSGSGKSTLMNIIGCLDKPGSGSYAIEGRDVSSLSDNELADLRNQKIGFVFQNFNLMPKLTACQNVELPLTYMNVPKKERRKRALEMLKLVGLEERSEFKPMELSGGQKQRVAIARALVTNPSFILGDEPTGALDTKTSVQIMDLFKQFNDNGKTIIIITHEPEVAALCKKTVILRDGNIEHSDIE >NZ_LN831034.1|WP_010922718.1|1769488_1770757_-|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MFQLRKKMTRKQLALLSAGVLTCVVGGSYLIMNHQQQEIVSSVNKVKALTIKEAMEQGKDISLTLAGEVTANNSSKVKIDSSKGEVKEVFVKKGDVVKVGQPLFSYETSQRLTAQSSEFDVQTKANQLQVAKTNAALKWETYNRKVNEINTLKSRYNTAPDESLLEQIRSAEDSVSQALSDAKTADSDVKTAQIELDKANATATTEKGKLEYDTVKSDTAGTIVSLNTDLPNQSKSKKENETFMEIIDKSKMLVKGNISEFDRDKLKIGQKVEVIDRKDNSKKWTGKVTQVGNLKAEEKGQGQGQGGNDQQDNPNQAKFPYVIELDQSDKQPLIGSHTYVNVLNNVPEAGKIVLKETFTMAENGKTYVWKVDKNKVKKQEIKTKPFSKGYVEVTSGLTMQDKIAQPLPGMKDGMEVGSIVKP >NZ_LN831034.1|WP_002982442.1|1771179_1771464_-|hypothetical-protein MKFKKVLVIPALALAATCFLTACGTKKDSKKEEVKEIKMSDIKDDAVSKKTKVVDGEEVTEYTTKDGNVIQIPAGNEEGMESKDAGGSGAPAKN >NZ_LN831034.1|WP_002982439.1|1771610_1771907_-|DUF4298-domain-containing-protein MTKQDQLIVEKMEQTYEAFSPKLANLIEALDAFKEHYEEYATLRNFYSSDEWFRLANQPWDDIPCGVLSEDLLFDMIGDHNQLLADILDLAPIMYKHM |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_LN831034_4 | 4.3|1317807|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317807-1317839 | 33 | NZ_LN831034.1 | 551171-551203 | 0 | 1.0 |
NZ_LN831034_4 | 4.7|1317808|33|NZ_LN831034|PILER-CR | 1317808-1317840 | 33 | NZ_LN831034.1 | 551171-551203 | 0 | 1.0 |
NZ_LN831034_4 | 4.1|1317676|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317676-1317708 | 33 | NZ_LN831034.1 | 850316-850348 | 1 | 0.97 |
NZ_LN831034_4 | 4.5|1317677|33|NZ_LN831034|PILER-CR | 1317677-1317709 | 33 | NZ_LN831034.1 | 850316-850348 | 1 | 0.97 |
NZ_LN831034_4 | 4.2|1317741|34|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317741-1317774 | 34 | NZ_LN831034.1 | 1388206-1388239 | 2 | 0.941 |
NZ_LN831034_4 | 4.6|1317742|34|NZ_LN831034|PILER-CR | 1317742-1317775 | 34 | NZ_LN831034.1 | 1388206-1388239 | 2 | 0.941 |
1. spacer 4.3|1317807|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 551171-551203, mismatch: 0, identity: 1.0
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt Protospacer *********************************
2. spacer 4.7|1317808|33|NZ_LN831034|PILER-CR matches to position: 551171-551203, mismatch: 0, identity: 1.0
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt Protospacer *********************************
3. spacer 4.1|1317676|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 850316-850348, mismatch: 1, identity: 0.97
gagtttactcgctcaaatcaaggtatgcggaca CRISPR spacer gagtttactcgctcaaatcaaggcatgcggaca Protospacer ***********************.*********
4. spacer 4.5|1317677|33|NZ_LN831034|PILER-CR matches to position: 850316-850348, mismatch: 1, identity: 0.97
gagtttactcgctcaaatcaaggtatgcggaca CRISPR spacer gagtttactcgctcaaatcaaggcatgcggaca Protospacer ***********************.*********
5. spacer 4.2|1317741|34|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 1388206-1388239, mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
6. spacer 4.6|1317742|34|NZ_LN831034|PILER-CR matches to position: 1388206-1388239, mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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NZ_LN831034_4 | 4.1|1317676|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317676-1317708 | 33 | MK448766 | Streptococcus phage Javan465, complete genome | 34324-34356 | 0 | 1.0 |
NZ_LN831034_4 | 4.3|1317807|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317807-1317839 | 33 | MK448690 | Streptococcus phage Javan169, complete genome | 23669-23701 | 0 | 1.0 |
NZ_LN831034_4 | 4.3|1317807|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317807-1317839 | 33 | MK448694 | Streptococcus phage Javan179, complete genome | 22038-22070 | 0 | 1.0 |
NZ_LN831034_4 | 4.5|1317677|33|NZ_LN831034|PILER-CR | 1317677-1317709 | 33 | MK448961 | Streptococcus phage Javan494, complete genome | 33452-33484 | 0 | 1.0 |
NZ_LN831034_4 | 4.5|1317677|33|NZ_LN831034|PILER-CR | 1317677-1317709 | 33 | MK448766 | Streptococcus phage Javan465, complete genome | 34324-34356 | 0 | 1.0 |
NZ_LN831034_4 | 4.7|1317808|33|NZ_LN831034|PILER-CR | 1317808-1317840 | 33 | MK448690 | Streptococcus phage Javan169, complete genome | 23669-23701 | 0 | 1.0 |
NZ_LN831034_4 | 4.7|1317808|33|NZ_LN831034|PILER-CR | 1317808-1317840 | 33 | MK448694 | Streptococcus phage Javan179, complete genome | 22038-22070 | 0 | 1.0 |
NZ_LN831034_4 | 4.1|1317676|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317676-1317708 | 33 | MK448779 | Streptococcus phage Javan497, complete genome | 33182-33214 | 1 | 0.97 |
NZ_LN831034_4 | 4.1|1317676|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317676-1317708 | 33 | MK448792 | Streptococcus phage Javan521, complete genome | 33433-33465 | 1 | 0.97 |
NZ_LN831034_4 | 4.1|1317676|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317676-1317708 | 33 | NC_004584 | Streptococcus prophage 315.1, complete genome | 33026-33058 | 1 | 0.97 |
NZ_LN831034_4 | 4.1|1317676|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317676-1317708 | 33 | MK448962 | Streptococcus phage Javan496, complete genome | 24582-24614 | 1 | 0.97 |
NZ_LN831034_4 | 4.1|1317676|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317676-1317708 | 33 | MK448770 | Streptococcus phage Javan477, complete genome | 33433-33465 | 1 | 0.97 |
NZ_LN831034_4 | 4.1|1317676|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317676-1317708 | 33 | MK448978 | Streptococcus phage Javan532, complete genome | 32920-32952 | 1 | 0.97 |
NZ_LN831034_4 | 4.1|1317676|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317676-1317708 | 33 | MK448785 | Streptococcus phage Javan507, complete genome | 32921-32953 | 1 | 0.97 |
NZ_LN831034_4 | 4.3|1317807|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317807-1317839 | 33 | MK448955 | Streptococcus phage Javan478, complete genome | 24096-24128 | 1 | 0.97 |
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NZ_LN831034_4 | 4.4|1317872|35|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317872-1317906 | 35 | NC_028700 | Streptococcus phage T12, complete genome | 12019-12053 | 1 | 0.971 |
NZ_LN831034_4 | 4.4|1317872|35|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317872-1317906 | 35 | MK448778 | Streptococcus phage Javan493, complete genome | 12073-12107 | 1 | 0.971 |
NZ_LN831034_4 | 4.4|1317872|35|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317872-1317906 | 35 | MK448686 | Streptococcus phage Javan157, complete genome | 14021-14055 | 1 | 0.971 |
NZ_LN831034_4 | 4.4|1317872|35|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317872-1317906 | 35 | MK448949 | Streptococcus phage Javan460, complete genome | 13943-13977 | 1 | 0.971 |
NZ_LN831034_4 | 4.4|1317872|35|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317872-1317906 | 35 | MK448958 | Streptococcus phage Javan486, complete genome | 11818-11852 | 1 | 0.971 |
NZ_LN831034_4 | 4.4|1317872|35|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317872-1317906 | 35 | MK448950 | Streptococcus phage Javan464, complete genome | 12065-12099 | 1 | 0.971 |
NZ_LN831034_4 | 4.4|1317872|35|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317872-1317906 | 35 | MK448782 | Streptococcus phage Javan501, complete genome | 14704-14738 | 1 | 0.971 |
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NZ_LN831034_4 | 4.5|1317677|33|NZ_LN831034|PILER-CR | 1317677-1317709 | 33 | MK448792 | Streptococcus phage Javan521, complete genome | 33433-33465 | 1 | 0.97 |
NZ_LN831034_4 | 4.5|1317677|33|NZ_LN831034|PILER-CR | 1317677-1317709 | 33 | NC_004584 | Streptococcus prophage 315.1, complete genome | 33026-33058 | 1 | 0.97 |
NZ_LN831034_4 | 4.5|1317677|33|NZ_LN831034|PILER-CR | 1317677-1317709 | 33 | MK448962 | Streptococcus phage Javan496, complete genome | 24582-24614 | 1 | 0.97 |
NZ_LN831034_4 | 4.5|1317677|33|NZ_LN831034|PILER-CR | 1317677-1317709 | 33 | MK448770 | Streptococcus phage Javan477, complete genome | 33433-33465 | 1 | 0.97 |
NZ_LN831034_4 | 4.5|1317677|33|NZ_LN831034|PILER-CR | 1317677-1317709 | 33 | MK448978 | Streptococcus phage Javan532, complete genome | 32920-32952 | 1 | 0.97 |
NZ_LN831034_4 | 4.5|1317677|33|NZ_LN831034|PILER-CR | 1317677-1317709 | 33 | MK448785 | Streptococcus phage Javan507, complete genome | 32921-32953 | 1 | 0.97 |
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NZ_LN831034_4 | 4.8|1317873|35|NZ_LN831034|PILER-CR | 1317873-1317907 | 35 | NC_028700 | Streptococcus phage T12, complete genome | 12019-12053 | 1 | 0.971 |
NZ_LN831034_4 | 4.8|1317873|35|NZ_LN831034|PILER-CR | 1317873-1317907 | 35 | MK448778 | Streptococcus phage Javan493, complete genome | 12073-12107 | 1 | 0.971 |
NZ_LN831034_4 | 4.8|1317873|35|NZ_LN831034|PILER-CR | 1317873-1317907 | 35 | MK448686 | Streptococcus phage Javan157, complete genome | 14021-14055 | 1 | 0.971 |
NZ_LN831034_4 | 4.8|1317873|35|NZ_LN831034|PILER-CR | 1317873-1317907 | 35 | MK448949 | Streptococcus phage Javan460, complete genome | 13943-13977 | 1 | 0.971 |
NZ_LN831034_4 | 4.8|1317873|35|NZ_LN831034|PILER-CR | 1317873-1317907 | 35 | MK448958 | Streptococcus phage Javan486, complete genome | 11818-11852 | 1 | 0.971 |
NZ_LN831034_4 | 4.8|1317873|35|NZ_LN831034|PILER-CR | 1317873-1317907 | 35 | MK448950 | Streptococcus phage Javan464, complete genome | 12065-12099 | 1 | 0.971 |
NZ_LN831034_4 | 4.8|1317873|35|NZ_LN831034|PILER-CR | 1317873-1317907 | 35 | MK448782 | Streptococcus phage Javan501, complete genome | 14704-14738 | 1 | 0.971 |
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NZ_LN831034_4 | 4.2|1317741|34|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317741-1317774 | 34 | MK448762 | Streptococcus phage Javan447, complete genome | 13913-13946 | 2 | 0.941 |
NZ_LN831034_4 | 4.2|1317741|34|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317741-1317774 | 34 | MK448791 | Streptococcus phage Javan517, complete genome | 12700-12733 | 2 | 0.941 |
NZ_LN831034_4 | 4.2|1317741|34|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317741-1317774 | 34 | NC_004587 | Streptococcus prophage 315.4, complete genome | 12795-12828 | 2 | 0.941 |
NZ_LN831034_4 | 4.2|1317741|34|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT | 1317741-1317774 | 34 | NC_003157 | Streptococcus pyogenes strain NIH1 putative methionine sulfoxide reductase gene, complete cds; and integrated temperate phage PhiNIH1.1, complete genome | 14065-14098 | 2 | 0.941 |
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gagtttactcgctcaaatcaaggtatgcggaca CRISPR spacer gagtttactcgctcaaatcaaggcatgcggaca Protospacer ***********************.*********
27. spacer 4.5|1317677|33|NZ_LN831034|PILER-CR matches to NC_004584 (Streptococcus prophage 315.1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gagtttactcgctcaaatcaaggtatgcggaca CRISPR spacer gagtttactcgctcaaatcaaggcatgcggaca Protospacer ***********************.*********
28. spacer 4.5|1317677|33|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448962 (Streptococcus phage Javan496, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gagtttactcgctcaaatcaaggtatgcggaca CRISPR spacer gagtttactcgctcaaatcaaggcatgcggaca Protospacer ***********************.*********
29. spacer 4.5|1317677|33|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448770 (Streptococcus phage Javan477, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gagtttactcgctcaaatcaaggtatgcggaca CRISPR spacer gagtttactcgctcaaatcaaggcatgcggaca Protospacer ***********************.*********
30. spacer 4.5|1317677|33|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448978 (Streptococcus phage Javan532, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gagtttactcgctcaaatcaaggtatgcggaca CRISPR spacer gagtttactcgctcaaatcaaggcatgcggaca Protospacer ***********************.*********
31. spacer 4.5|1317677|33|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448785 (Streptococcus phage Javan507, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gagtttactcgctcaaatcaaggtatgcggaca CRISPR spacer gagtttactcgctcaaatcaaggcatgcggaca Protospacer ***********************.*********
32. spacer 4.7|1317808|33|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448955 (Streptococcus phage Javan478, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcaaacctagcagaagcagaaaacgactt Protospacer ***************************.*****
33. spacer 4.8|1317873|35|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448973 (Streptococcus phage Javan522, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer ******************************.****
34. spacer 4.8|1317873|35|NZ_LN831034|PILER-CR matches to NC_028700 (Streptococcus phage T12, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer ******************************.****
35. spacer 4.8|1317873|35|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448778 (Streptococcus phage Javan493, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer ******************************.****
36. spacer 4.8|1317873|35|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448686 (Streptococcus phage Javan157, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer ******************************.****
37. spacer 4.8|1317873|35|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448949 (Streptococcus phage Javan460, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer ******************************.****
38. spacer 4.8|1317873|35|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448958 (Streptococcus phage Javan486, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer ******************************.****
39. spacer 4.8|1317873|35|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448950 (Streptococcus phage Javan464, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer ******************************.****
40. spacer 4.8|1317873|35|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448782 (Streptococcus phage Javan501, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer ******************************.****
41. spacer 4.2|1317741|34|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448960 (Streptococcus phage Javan492, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
42. spacer 4.2|1317741|34|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448762 (Streptococcus phage Javan447, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
43. spacer 4.2|1317741|34|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448791 (Streptococcus phage Javan517, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
44. spacer 4.2|1317741|34|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004587 (Streptococcus prophage 315.4, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
45. spacer 4.2|1317741|34|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_003157 (Streptococcus pyogenes strain NIH1 putative methionine sulfoxide reductase gene, complete cds; and integrated temperate phage PhiNIH1.1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
46. spacer 4.2|1317741|34|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448977 (Streptococcus phage Javan530, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
47. spacer 4.2|1317741|34|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448783 (Streptococcus phage Javan503, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
48. spacer 4.2|1317741|34|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448788 (Streptococcus phage Javan511, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
49. spacer 4.2|1317741|34|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448954 (Streptococcus phage Javan476, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
50. spacer 4.3|1317807|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448749 (Streptococcus phage Javan39, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcaagcctagcagaagcagaaaacgactt Protospacer ********.******************.*****
51. spacer 4.3|1317807|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448859 (Streptococcus phage Javan170, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcgagcctagcagaagcagaaaatgactt Protospacer ******.*.************************
52. spacer 4.3|1317807|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448962 (Streptococcus phage Javan496, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcgaacctagcagaagcagaaaacgactt Protospacer ******.********************.*****
53. spacer 4.3|1317807|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448850 (Streptococcus phage Javan132, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcgagcctagcagaagcagaaaatgactt Protospacer ******.*.************************
54. spacer 4.3|1317807|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448676 (Streptococcus phage Javan131, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcgagcctagcagaagcagaaaatgactt Protospacer ******.*.************************
55. spacer 4.3|1317807|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448688 (Streptococcus phage Javan161, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcgagcctagcagaagcagaaaatgactt Protospacer ******.*.************************
56. spacer 4.4|1317872|35|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448771 (Streptococcus phage Javan481, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgacatgcctttt Protospacer *************************.****.****
57. spacer 4.4|1317872|35|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK449012 (Streptococcus phage Javan94, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtgattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer *******.**********************.****
58. spacer 4.4|1317872|35|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004585 (Streptococcus prophage 315.2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgacatgcctttt Protospacer *************************.****.****
59. spacer 4.4|1317872|35|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448955 (Streptococcus phage Javan478, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgacatgcctttt Protospacer *************************.****.****
60. spacer 4.4|1317872|35|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448966 (Streptococcus phage Javan508, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgacatgcctttt Protospacer *************************.****.****
61. spacer 4.4|1317872|35|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448795 (Streptococcus phage Javan527, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgacatgcctttt Protospacer *************************.****.****
62. spacer 4.4|1317872|35|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448772 (Streptococcus phage Javan483, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgacatgcctttt Protospacer *************************.****.****
63. spacer 4.4|1317872|35|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448673 (Streptococcus phage Javan119, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgccattt Protospacer ******************************. ***
64. spacer 4.6|1317742|34|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448960 (Streptococcus phage Javan492, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
65. spacer 4.6|1317742|34|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448762 (Streptococcus phage Javan447, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
66. spacer 4.6|1317742|34|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448791 (Streptococcus phage Javan517, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
67. spacer 4.6|1317742|34|NZ_LN831034|PILER-CR matches to NC_004587 (Streptococcus prophage 315.4, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
68. spacer 4.6|1317742|34|NZ_LN831034|PILER-CR matches to NC_003157 (Streptococcus pyogenes strain NIH1 putative methionine sulfoxide reductase gene, complete cds; and integrated temperate phage PhiNIH1.1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
69. spacer 4.6|1317742|34|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448977 (Streptococcus phage Javan530, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
70. spacer 4.6|1317742|34|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448783 (Streptococcus phage Javan503, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
71. spacer 4.6|1317742|34|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448788 (Streptococcus phage Javan511, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
72. spacer 4.6|1317742|34|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448954 (Streptococcus phage Javan476, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
73. spacer 4.7|1317808|33|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448749 (Streptococcus phage Javan39, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcaagcctagcagaagcagaaaacgactt Protospacer ********.******************.*****
74. spacer 4.7|1317808|33|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448859 (Streptococcus phage Javan170, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcgagcctagcagaagcagaaaatgactt Protospacer ******.*.************************
75. spacer 4.7|1317808|33|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448962 (Streptococcus phage Javan496, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcgaacctagcagaagcagaaaacgactt Protospacer ******.********************.*****
76. spacer 4.7|1317808|33|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448850 (Streptococcus phage Javan132, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcgagcctagcagaagcagaaaatgactt Protospacer ******.*.************************
77. spacer 4.7|1317808|33|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448676 (Streptococcus phage Javan131, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcgagcctagcagaagcagaaaatgactt Protospacer ******.*.************************
78. spacer 4.7|1317808|33|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448688 (Streptococcus phage Javan161, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcgagcctagcagaagcagaaaatgactt Protospacer ******.*.************************
79. spacer 4.8|1317873|35|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448771 (Streptococcus phage Javan481, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgacatgcctttt Protospacer *************************.****.****
80. spacer 4.8|1317873|35|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK449012 (Streptococcus phage Javan94, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtgattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer *******.**********************.****
81. spacer 4.8|1317873|35|NZ_LN831034|PILER-CR matches to NC_004585 (Streptococcus prophage 315.2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgacatgcctttt Protospacer *************************.****.****
82. spacer 4.8|1317873|35|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448955 (Streptococcus phage Javan478, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgacatgcctttt Protospacer *************************.****.****
83. spacer 4.8|1317873|35|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448966 (Streptococcus phage Javan508, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgacatgcctttt Protospacer *************************.****.****
84. spacer 4.8|1317873|35|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448795 (Streptococcus phage Javan527, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgacatgcctttt Protospacer *************************.****.****
85. spacer 4.8|1317873|35|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448772 (Streptococcus phage Javan483, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgacatgcctttt Protospacer *************************.****.****
86. spacer 4.8|1317873|35|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448673 (Streptococcus phage Javan119, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgccattt Protospacer ******************************. ***
87. spacer 4.3|1317807|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448675 (Streptococcus phage Javan129, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.909
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer caaagcaaacttagtagaagcagaaaatgactt Protospacer .*********.***.******************
88. spacer 4.7|1317808|33|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MK448675 (Streptococcus phage Javan129, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.909
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer caaagcaaacttagtagaagcagaaaatgactt Protospacer .*********.***.******************
89. spacer 4.3|1317807|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT774411 (CrAssphage cr273_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer tacagcaaacccagcagaagcagatacatatac Protospacer ** ********.************ * *. .
90. spacer 4.3|1317807|33|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT774410 (CrAssphage cr272_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer tacagcaaacccagcagaagcagatacatatac Protospacer ** ********.************ * *. .
91. spacer 4.7|1317808|33|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MT774411 (CrAssphage cr273_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer tacagcaaacccagcagaagcagatacatatac Protospacer ** ********.************ * *. .
92. spacer 4.7|1317808|33|NZ_LN831034|PILER-CR matches to MT774410 (CrAssphage cr272_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer tacagcaaacccagcagaagcagatacatatac Protospacer ** ********.************ * *. .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
36609 : 48922
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN831034|36609:48922|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_LN831034|36609:48922|43905_45453_+|WP_011285343.1|DBSCAN-SWA MTKRALISVSDKSGIVDFAKELKNLGWDIISTGGTKVTLDDAGVETIAIDDVTRFPEMMDGRVKTLHPNIHGGLLARRDADSHLQAAKDNNIELIDLVVVNLYPFKETILRPDITYDLAVENIDIGGPSMLRSAAKNHASVTVVVDPADYATVLGELADAGQTTFETRQRLAAKVFRHTAAYDALIAEYFTTQVGEAKPEKLTITYDLKQAMRYGENPQQDADFYQKALPTDYSIASAKQLNGKELSFNNIRDADAAIRIIRDFKDRPTVVALKHMNPCGIGQADDIETAWDYTYKADPVSIFGGIIVLNREVDAATAKKMHPIFLEIIIAPSYSEEALAILTNKKKNLRILELPFDAQAASEVEAEYTGVVGGLLVQNQDVVAENPSDWQVVTDRQPTEQEATALEFAWKAIKYVKSNGIIITNDHMTLGLGAGQTNRVGSVKIAIEQAKDHLDGAVLASDAFFPFADNIEEIAAAGIKAIIQPGGSVRDQDSIDAANKHGLTMIFTGVRHFRH >NZ_LN831034|36609:48922|36609_40335_+|WP_015055883.1|DBSCAN-SWA MNKRIFVEKKADFGIKSASLVKELTHNLQLTSLKALRIVQVYDVFNLAEDLLARAEKHIFSEQVTDCLLTETEITAELDKVAFFAIEALPGQFDQRAASSQEALLLFGSDSQVKVNTAQLYLVNKDITEAELEAVKNYLLNPVDSRFKDITLPLEEQAFSVSDKTIPNLDFFETYQADDFATYKAEQGLAMEVDDLLFIQNYFKSIGCVPTETELKVLDTYWSDHCRHTTFETELKNIDFSASKFQKQLQTTYDKYIAMRDELGRSEKPQTLMDMATIFGRYERANGRLDDMEVSDEINACSVEIEVDVDGVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRISGAGDITTPIAETRAGKLPQQVISKTAAHGYSSYGNQIGLATTYVREYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKENVVREKPEAGDVVILLGGKTGRDGVGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRDGNVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELADGLEIDLDKVPLKYQGLNGTEIAISESQERMSVVVRPNDVDAFIAACNKENIDAVVVATVTEKPNLVMTWNGEIIVDLERRFLDTNGVRVVVDAKVVDKDLTVPEARTTSAETLEADTLKVLSDLNHASQKGLQTIFDSSVGRSTVNHPIGGRYQITPTESSVQKLPVQHGVTTTASVMAQGYNPYIAEWSPYHGAAYAVIEATARLVATGADWSRARFSYQEYFERMDKQAERFGQPVSALLGSIEAQIQLGLPSIGGKDSMSGTFEDLTVPPTLVAFGVTTADSRKVLSPEFKAAGENIYYIPGQAISEDIDFDLIKDNFSQFEAIQAQHKITAASAAKYGGVLESLALMTFGNRIGASVEIAELDSSLTAQLGGFVFTSAEEIADAVKIGQTQADFTVTVNGNDLAGASLLAAFEGKLEEVYPTEFEQTDVLEEVPAVVSDTVIKAKETIEKPVVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEQVGASVNLVPFVTLNEVAIAESVDTMVANIAKANIIFFAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNEKVRAAIDSFIEKGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGNFEEAGETSPTLFYNDANQHVAKMVETRIANTNSPWLAGVEVGDIHAIPVSHGEGKLVVSASEFAELRDNGQIWSQYVDFDGQPSMDSKYNPNGSVNAIEGITSKNGQIIGKMGHSERWEDGLFQNIPGNKDQILFASAVKYFTGK >NZ_LN831034|36609:48922|43167_43722_+|WP_010921775.1|DBSCAN-SWA MKIAVFASGNGSNFQVIAEQFPVSFVFSDHRDAYVLERAQNLAIPSFAFELKEFENKVAYEQAIVDLLDKHEIDLVCLAGYMKIVGETLLLAYERRIINIHPAYLPEFPGAHGIEDAWEAGVDQSGVTIHWVDSGVDTGQVIQQVRVPRLADDSLESFETRIHETEYQLYPAVLDSLGVERKVI >NZ_LN831034|36609:48922|40495_41950_+|WP_010921773.1|DBSCAN-SWA MTYEVKSLNEECGVFGIWGHPQAAQVTYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDNGKLYGYRNVGLLSEVFKNQSELDNLTGNAAIGHVRYATAGSADIRNIQPFLYKFHDGQFALCHNGNLTNAISLRKELEKQGAIFNASSDTEILMHLIRRSHNSSFMGKVKEALNTVKGGFAYLLMTENKLIAALDPNAFRPLSIGQMQNGAWVISSETCAFEVVGAKWVRDVEPGEVILIDDRGIQCDRYTDETQLAICSMEYVYFARPDSTIHGVNVHTARKNMGKRLAQEFKQDADIVIGVPNSSLSAAMGFAEESGLPNEMGLVKNQYTQRTFIQPTQELREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMIDDSIVRGTTSRRIVGLLREAGASEVHVAIASPELKYPCFYGIDIQTRRELISANHSVDEVCDIIGADSLTYLSLDGLIESIGLETKAPNGGLCVAYFDGHYPTPLYDYEEEYLRSLEEKTSFYIQKVK >NZ_LN831034|36609:48922|46887_48153_+|WP_010921777.1|DBSCAN-SWA MKLLVVGSGGREHAIAKKLLASKGVDQVFVAPGNDGMTLDGLDLVNIVVSEHSRLIAFAKENEISWAFIGPDDALAAGIVDDFNSAGLRAFGPTKAAAELEWSKDFAKEIMVKYNVPTAAYGTFSDFEKAKAYIEEQGAPIVVKADGLALGKGVVVAETVEQAVEAAQEMLLDNKFGDSGARVVIEEFLDGEEFSLFAFANGDKFYIMPTAQDHKRAFDGDKGPNTGGMGAYAPVPHLPQSVVDTAVEMIVRPVLEGMVAEGRPYLGVLYVGLILTADGPKVIEFNSRFGDPETQIILPRLTSDFAQNIDDIMMGIEPYITWQKDGVTLGVVVASEGYPFDYEKGVPLPEKTDGDIITYYAGVKFSENSELLLSNGGRVYMLVTTEDSVKAGQDKIYTQLAQQDTTGLFYRNDIGSKAIRE >NZ_LN831034|36609:48922|41977_43000_+|WP_010921774.1|DBSCAN-SWA MSEKNAYAKSGVDVEAGYEVVERIKKHVARTERAGVMGALGGFGGMFDLSKTGVKEPVLVSGTDGVGTKLMLAIKYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYIATGKNNPVKLEEVVSGVAEGCVQAGAALIGGETAEMPGMYGQDDYDLAGFAVGVAEKSQIIDGSKVKEGDILLGLASSGIHSNGYSLVRRVFADYTGKELLPELEGKQLKDVLLEPTRIYVKAALPLIKEELVKGIGHITGGGFIENIPRMFADDLAAEIDEDKVPVLPIFKALEKYGDIKHEEMFEIFNMGVGLMLAVSPENVNRVKELLDEPVYEIGRIIKKADASVVIK >NZ_LN831034|36609:48922|48430_48922_+|WP_002987716.1|DBSCAN-SWA MKTPIISIIMGSKSDWATMQKTAEVLDNFGIAYEKKVVSAHRTPDLMFKHAEEARGRGIKIIIAGAGGAAHLPGMVAAKTTLPVIGVPVKSRALSGLDSLYSIVQMPGGVPVATMAIGEAGATNAALTALRILSIEDQNLADALAHFHEEQGKIAEESSGELI >NZ_LN831034|36609:48922|45510_46635_-|WP_010921776.1|DBSCAN-SWA MKKFHRFLVSGVILLGFNGLVPTMPSTLISQQENLVHAAVLGDNYPSKWKKGNGIDSWNMYIRQCTSFAAFRLSSANGFQLPKGYGNACTWGHIAKNQGYPVNKTPSIGAIAWFDKNAYQSNAAYGHVAWVADIRGDTVTIEEYNYNAGQGPERYHKRQIPKSQVSGYIHFKDLSSQTSHSYPRQLKHISQASFDPSGTYHFTTRLPVKGQTSIDSPDLAYYEAGQSVYYDKVVTAGGYTWLSYLSFSGNRRYIPIKEPAQSVVQNDNTKPSIKVGDTVTFPGVFRVDQLVNNLIVNKELAGGDPTPLNWIDPTPLDETDNQGKVLGDQILRVGEYFIVTGSYKVLKIDQPSNGIYVQIGSRGTWVNADKANKL |
8 | Synechococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
336789 : 342823
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LN831034|336789:342823|DBSCAN-SWA GATGATCACAGGAAAACTCATAACCGTTGAAGGTCCAGATGGCGCAGGGAAAACGACTGTTTTAGAGCAACTCATTCCACTGTTAAAACAAAAAGTGGCTCAGGATATCTTGACAACAAGAGAGCCTGGAGGTGTTGCCATTTCAGAACACATTAGAGAACTTATTTTAGACATCAACCATACTGCTATGGACCCTAAAACAGAACTCTTACTTTATATTGCGGCTCGAAGGCAGCATTTGGTGGAAAAGGTACTACCAGCTCTTGAAGCAGGCCAGTTGGTTTTTATTGATCGTTTCATCGATAGTTCAGTAGCTTATCAAGGTGCGGGACGCGGTTTGATCAAAGCAGACATTCAGTGGCTCAACGAGTTCGCAACAGATGGTTTAGAGCCTGACTTGACCCTTTATTTTGATGTTCCTTCTGAAATTGGTTTAGCACGGATTAACGCGAACCAACAAAGAGAAGTCAATCGTTTAGATTTGGAAACAATAGAGATACATCAACGAGTACGAAAAGGATACCTAGCCTTAGCTAAGGAGCATCCAAAACGTATTGTCACAATTGATGCGACTAAACCATTGAAAGAAGTTGTCTCTGTCGCTTTGGAACATGTCTTAGCCTTGCTTTTAGCCTAGGATAAGGGAGGGTAGGAATGGATTTAGCGCAAAAAGCTCCTAACGTTTATCAAGCTTTTCAGACAATTTTAAAGAAAGACCGTCTGAATCATGCTTATCTTTTTTCGGGTGATTTTGCTAATGAAGAAATGGCTCTTTTTTTAGCTAAGGTCATCTTTTGTGAACAGAAAAAGGATCAGACGCCCTGCGGGCATTGTCGCTCTTGTCAATTGATTGAACAAGGAGATTTTGCCGATGTGACGGTATTGGAACCAACAGGGCAAGTGATTAAAACGGATGTGGTCAAAGAAATGATGGCTAACTTTTCTCAGACAGGATATGAAAACAAACGACAAGTTTTTATTATCAAAGATTGTGACAAAATGCATATCAATGCCGCTAATAGCTTGCTAAAATACATTGAGGAGCCTCAGGGAGAAGCTTACATATTTTTATTGACCAATGATGATAACAAAGTGCTTCCGACCATTAAAAGTCGGACACAGGTTTTTCAGTTTCCTAAAAACGAAGCCTATCTTTACCAATTGGCACAAGAAAAGGGATTATTAAACCATCAGGCTAAGCTAGTAGCCAAACTTGCCACAAACACCAGTCATCTAGAACGTCTGTTGCAAACGAGCAAGCTTTTAGAACTGATAACTCAAGCAGAGCGTTTTGTATCTATTTGGCTGAAAGATCAGTTGCAGGCATATTTAGCGTTGAACCGTCTGGTACAGTTAGCAACTGAAAAAGAAGAACAAGATTTAGTTTTGACCCTTTTGACCTTGCTCTTGGCAAGAGAGCGTGCGCAAACGCCTTTGACACAATTGGAGGCTGTCTATCAGGCTAGGCTCATGTGGCAGAGCAATGTTAATTTTCAAAACACATTAGAATATATGGTGATGTCAGAATAAGTGCAATTGGAATTCGTTATGGGGAAACGAAGCTTGTCAAAAGACTTGCCCGTAGCGACCAAAGTAGCGGCGCATAAGGGCAAAAAAGCTTTTGAAGAAAATACTGCCTTTGCAACAGATTTGATGAAAGAAGTATCACGATTAATAACACAAAATCAACTTGAAATGACGTTTGTTAATAGTGTCTTTCTCTTAGATCAGCATGTTGTCCTAATTCCCTTTTCAGCAGAAGAGCACATGGATTTTTACAACTGTTAAAAGATTTAGCGGTCGATTTTAGGTCAAGAAGTGAGCTGCCCCAGATTAACAGCCAAGAAGATTTCATTTTCTATGGAGGCTATGGACCGTGTGGCAGGCCACTGTGCTGCTTTCGTTTTTGGGAAAATTTCTGACAGTATCTATTAAAATACTAAAAAGTCAAGGGTTATCATTGACTTTGGGTAAAGCAACAAGCCCTTATGGCCGTTTGCTTTGCTGTCTCTATGATGAAGGTGTCTTTTACCAATAAAGCAAGAAAAAATTCCCTGAATATGGTACCATAGTAGAGACAAGTGATGGCCCTGCAACAGTAGCAGCCGTTGATATATTTACAGATCCCATTAAGGTGCGGTTAAAAGACCAGTTGACCTTAGTCACTTATGCTTTAGAGGAGGTTAAAGTAGGTGAATAAAAAAGAATTATTCGATGCTTTTGATGGATTTTCCCAAAATTTAATGGTTACTTTAGCTGAAATTGAAGCCATGAAAAAACAAGTCCAATCACTAGTAGAAGAAAACACGATTCTTCGCCTAGAAAATACAAAACTACGGGAACGTTTGAGTCACCTAGAACATGAAACGGTAGCTAAAAATCCTTCCAAACAAAGGAAGGATCACTTAGAGGGAATTTATGATGAAGGGTTTCATATCTGCAATTTTTTCTATGGACAACGTCGTGAAAATGATGAAGAATGTATGTTTTGCAGAGAATTATTAGATAGAAAGTAAGGGCATGCAGGTTCAAAAAAGTTTTAAAGACAAAAAAACAAGCGGAACCTTGTATTTGGTTCCAACCCCAATTGGCAATCTGCAGGACATGACCTTTAGAGCAGTGGCAACGTTAAAAGAGGTTGATTTTATTTGTGCAGAAGACACAAGAAACACAGGTCTTTTGCTAAAACACTTTGATATTGCTACCAAGCAAATCAGCTTTCATGAGCACAACGCCTATGAGAAGATTCCTGATTTAATTGATTTATTAATATCAGGACGGTCACTAGCTCAGGTGTCTGATGCAGGAATGCCATCGATTTCTGATCCTGGGCATGATTTGGTCAAGGCTGCTATTGATAGTGATATCGCAGTCGTTGCTTTACCAGGTGCCTCAGCAGGGATTACAGCTTTGATTGCTAGTGGACTGGCTCCTCAACCCCATGTTTTTTATGGGTTTTTACCCAGAAAAGCAGGGCAACAAAAGGCTTTCTTTGAGGACAAACACCATTACCCAGAGACACAAATGTTTTATGAATCACCCTATCGCATCAAAGATACCCTGACCAATATGTTGGCTTGTTATGGTGATCGTCAAGTGGTGCTTGTCAGAGAATTAACCAAGCTTTTTGAGGAGTACCAACGGGGGTCGATTTCAGAAATCTTGTCCTACCTTGAGGAAACACCCCTCAAAGGGGAGTGTCTGCTGATTGTGGCTGGAGCCCAAGCAGACAGTGAGGCTGAGCTGACAGCTGATGTTGACTTAGTGTCTCTAGTGCAAAAAGAAATTCAAGCAGGAGCCAAGCCAAATCAGGCTATTAAAACAATTGCTAAAGCTTACCAGGTAAATCGCCAAGAGCTTTACCAACAATTTCATGACTTATAAGTCATCGTAGATTAGGAGAAAAACAAATGACAGAAGATCAAGCAACTATCCTTATTTTAGGAGTATACGGAATCATATTGGCTGTATTCTTATTATCAGCTTTATTATGCCTTATCGCTAACTGGCGACTCTTTAAAAGAGCAGGTTACAAAGGATGGTATAGTCTCATTCCTTTCTATGCAGGTTTTGTCAAACACAAAATCACTTTTGGAGAAGATAATAAATGGTTTTACTTTATTGGTTGGGTCATTGCTATTTATTATTACTATGTGCACTTTTGCTATGTCCGTGCTTTTGGTGGATCAAAGGGTCTAGCAGTATTTGGCTTGTTTTTCCCAGGCATTGCTTCTTTGATAGTGGCTTTTGGAAAAACTTATACCACACAAGAATGCCACCCTGTGCCACATCTTTTAAACTAAGAGAAAAAAGACCATCAATTGGATTTATTGATGGTCTTTTAGGTGTTTAAATGATTTTAGTCCCGTGAACAATGGCCGTTCCAGTGAGTTGACTCAAGCTTTGGCAATTCTCAGCAGTGATGCCTCCCCCAATCATGATTTCAATGCGTTTATTGGCATAGGTCACAAGACTTTTAAGCTGTTCCACATTGTCTGTAATAGGAGTAGCTTCAGGTGAGCCATGAGTTAGCACACGCACAAAGCCATAATCAATCAGTTGGTCAAGCGCTTGGTGCTGGTGATCAGTCGGAATCCGGTCAAAAGCCATGTGGAAAACCAGTGGCAAGCCTTGTGTAGCAGGCAGTAATTGCTCGATAGCGTCGGTATCCAGTTGATTTTCTGTGGTCAGCAAGCCTAAGACTAGCGCATCTGAGCCAGCTTCAACAGCTTTTAAGATATCTTCTTCCATAGCTTTTAGTTCGAGGTCGTTATAGACAAAATCGCCACCGCGAGGTCGAATCATGGTCGCTACGCTAATCTTTTTATCGTGTAAGAGCTGACAGGCTTCTTTGATGACGCCATAAGATGGCGTGGTCCCTCCGACAGCTAGGTTATCACAGAGTTCCACACGACTGATTTGACCAGCATCAAGGGTTGGCAGTAGTGTGAGGTTCTCAGCACAAAATTCTTTAATCATTTTTAGATCTCCTTTATCAGTAATATTATAGCACGAATGAAGCTAGTCATCAGGAAACATTTTTGTCAAATCATGGACATTATGCTATACTCACTAGTATTAAAAGTAGGCCAAAACAGCAGCAAATACTTTGAAAAAAGATTGCTATGTTCTACGGCAATATCAGTCTTTACCAACGAACTCTCAAGAAGAAAAGAAAGACAAAGCTTAGCATTTTAAAAAAGCCCCCTTTTTTTTGTGAAATGATGACCAAAAACAGGCGCCTCACGCCTAAAACAGTTACACTAAAGGAGAACAAATGATTACGATTTACCAATACCCAAAATGTAGCACCTGCCAAAGAGCCATGGCTGAATTAAAGCAACTGGTTAGTGACTTTGAAGCCATTGACATCAAAGCTAATCCACCCAAAGCTCAGGACCTCAAACATTGGATGGAAACATCTGGTTATACCATCAAAAATTTCTTTAATACCAGTGGTAACAGCTACCGCGAATTGGGACTTAAAGATAAAATAGACC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_LN831034|336789:342823|341995_342823_-|WP_010921936.1|DBSCAN-SWA MKLISWNIDSLNAALTGESPRALLSRAVLDTLVAQDADIIAIQETKLSAKGPTKKHIETLLSYFPNYLHVWRSSVEPARKGYAGTMFLYKNTLNPVITFPEIGAPTTMDAEGRIITLEFEDFFVTQVYTPNAGDGLRRLDDRQIWDHKYADYLTELDAQKPVLATGDYNVAHKEIDLANPNSNRRSPGFTDEERQGFTNLLARGFTDTFRHVHGDIPHVYTWWAQRSKTSKINNTGWRIDYWLASNRLVDKVKRSEMISSGERQDHTPILLDIDL >NZ_LN831034|336789:342823|338980_339304_+|WP_002985838.1|DBSCAN-SWA MNKKELFDAFDGFSQNLMVTLAEIEAMKKQVQSLVEENTILRLENTKLRERLSHLEHETVAKNPSKQRKDHLEGIYDEGFHICNFFYGQRRENDEECMFCRELLDRK >NZ_LN831034|336789:342823|339308_340172_+|WP_029714023.1|DBSCAN-SWA MQVQKSFKDKKTSGTLYLVPTPIGNLQDMTFRAVATLKEVDFICAEDTRNTGLLLKHFDIATKQISFHEHNAYEKIPDLIDLLISGRSLAQVSDAGMPSISDPGHDLVKAAIDSDIAVVALPGASAGITALIASGLAPQPHVFYGFLPRKAGQQKAFFEDKHHYPETQMFYESPYRIKDTLTNMLACYGDRQVVLVRELTKLFEEYQRGSISEILSYLEETPLKGECLLIVAGAQADSEAELTADVDLVSLVQKEIQAGAKPNQAIKTIAKAYQVNRQELYQQFHDL >NZ_LN831034|336789:342823|336789_337425_+|WP_010921930.1|DBSCAN-SWA MITGKLITVEGPDGAGKTTVLEQLIPLLKQKVAQDILTTREPGGVAISEHIRELILDINHTAMDPKTELLLYIAARRQHLVEKVLPALEAGQLVFIDRFIDSSVAYQGAGRGLIKADIQWLNEFATDGLEPDLTLYFDVPSEIGLARINANQQREVNRLDLETIEIHQRVRKGYLALAKEHPKRIVTIDATKPLKEVVSVALEHVLALLLA >NZ_LN831034|336789:342823|337442_338318_+|WP_010921931.1|DBSCAN-SWA MDLAQKAPNVYQAFQTILKKDRLNHAYLFSGDFANEEMALFLAKVIFCEQKKDQTPCGHCRSCQLIEQGDFADVTVLEPTGQVIKTDVVKEMMANFSQTGYENKRQVFIIKDCDKMHINAANSLLKYIEEPQGEAYIFLLTNDDNKVLPTIKSRTQVFQFPKNEAYLYQLAQEKGLLNHQAKLVAKLATNTSHLERLLQTSKLLELITQAERFVSIWLKDQLQAYLALNRLVQLATEKEEQDLVLTLLTLLLARERAQTPLTQLEAVYQARLMWQSNVNFQNTLEYMVMSE >NZ_LN831034|336789:342823|340198_340591_+|WP_002985833.1|DBSCAN-SWA MTEDQATILILGVYGIILAVFLLSALLCLIANWRLFKRAGYKGWYSLIPFYAGFVKHKITFGEDNKWFYFIGWVIAIYYYYVHFCYVRAFGGSKGLAVFGLFFPGIASLIVAFGKTYTTQECHPVPHLLN >NZ_LN831034|336789:342823|341565_341922_+|WP_011284536.1|DBSCAN-SWA MITIYQYPKCSTCQRAMAELKQLVSDFEAIDIKANPPKAQDLKHWMETSGYTIKNFFNTSGNSYRELGLKDKIDQLSLDKAAELLATDGMLIKRPILIKDGNVLQVGYRKPYQELDLG >NZ_LN831034|336789:342823|338336_338576_+|WP_010921932.1|DBSCAN-SWA MGKRSLSKDLPVATKVAAHKGKKAFEENTAFATDLMKEVSRLITQNQLEMTFVNSVFLLDQHVVLIPFSAEEHMDFYNC >NZ_LN831034|336789:342823|340637_341267_-|WP_010921934.1|DBSCAN-SWA MIKEFCAENLTLLPTLDAGQISRVELCDNLAVGGTTPSYGVIKEACQLLHDKKISVATMIRPRGGDFVYNDLELKAMEEDILKAVEAGSDALVLGLLTTENQLDTDAIEQLLPATQGLPLVFHMAFDRIPTDHQHQALDQLIDYGFVRVLTHGSPEATPITDNVEQLKSLVTYANKRIEIMIGGGITAENCQSLSQLTGTAIVHGTKII |
9 | Streptococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
445138 : 451789
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LN831034|445138:451789|DBSCAN-SWA TCTAGATATTATTATCTACAATTTCTACTATATCTTCAATCTTACAATCAAGTGCAATACAAATTTCCAATAAAATATCAGTAGTGATATTTTCCCCTTTTCCCAATTTTGCGATCGTGGAAGAACTAATCCCAGCTTCTTGCCTGAGCTTTGTTTTGGTCCAACCTTTATCAATAAGAAGTTTCCATAATTTATTGTAACTAAATCTCATCTGAGTTTTCTCCTTTGTTCCATGAAATACCGTAGAGTTCATTTCCGTTACTAGAGAGTCTCAATACCGTATTTTCTGACAAGAGTTGATTAGCATCTGGAGAATAAGAGCTGGCTTTATCGAAGACTAAAAAGACTTGTTTGTTCAATGACCTTGACTGGTCATATAGCTTCAAAAGTGCTTCAGTCGCTTGGTAGCTAACATTACTCAAGAGTAATGAATCGTGTGCGAGTGCTGGCAGATTAGTAAGGTAGAGCATTACTAAGTCGAATACAATCATCCCTTTAAACTTAGTTCCTGTACCATCATCATCTGGTGTATAGAAGGAGTAGCTATTGTGAGCATTTAGGTTAATTTGAGGAGCTTTGCGAATATCTGGATATAGAATGTTATTGACTTCACGCATCTTACTGTTGATTTTTACTTCTAGATCTAGAAGGATATCTTCTGTACTGCGTTTCAAGTCAGCGTCCGTTTCTGATTTTTCTTTGGATAGACCAGACTCCTTTAAGTAGGCCTCGTTTTGTTCTTTTAGTGCATTGATTGTAGCTGTTAGTTTAGAGTAGTTTTCTAAGTACTCACTTGAAAGATTTGGGATGTTTCCTAGTTCTTGAAGTTCTTGGTTTAGAGTTGTTAATTGACTCTCTAATTCGTCGATCTCAGCTATTAGGGATTCACGTTCAGTTGAGAATTCGGAATCTAAAATAGTTTCCAATTTTTTGTGGTAAGCTTCAACTTCATATAATTTTTTGAGATTAGTATCTGGGAAGTATTGTTGAAGCTCTGTTAAGTCAGATTCAGTAGGATATAAGCCAAATTCGATACTGATGTCCAATAGCTTAAGACGTCTTTGCTTGTCCCGAAGACTGCTTTCTAACTCCAGCTTAGTATTTCTAAGTTGGAGTTTTTGTTGATTTTTTTAAATATCATCAGAGTCAATTTTATCTTGATGAGTATCTTGGAGATGTGCTAAATCATATTCCAATCTTTTTATTTCTGAGACATTTGCTTCAAATTGCTTTTTACCGCCAACCAGGTTGGAGATGAAGGCATACCTGCGAGCATTACGAAAAGTTGTTAACTGGTCGCTCTTATCTTTCAGACGTTCTTTGTATCGTGCAATGTTATCATACAAATTAAACAGTTGGATGAGAGTAGTAATAGATTCAGAAGATTTTTGGCTCGAATAAACTTGTAAGGGGAAATCGGTATTTTGATTACTTTTTCCTGCAATCCTAAAGAAGCCACTCATAGCTAATCGGAATGATAGCTCTGGAGAATCTAAATGATATCGTTTCTTAAGTTTGTTAAGAAAAATTCCTAGGTCCATTGTTTCACCGGTTGGAGAGTAGCTCTTGTCACACACTAGAATGATATCTGGGTTGGCCGTATCTCTTGAAAAATAAAACTTTTTCTCAAATTGAAAGCAGAAGTAGATAGGATGATCACCTAATTTTTTAACCGCAATTGATTTTAGATAGCTATTACCTCCAAAGATGAAATCAATGGCTAATAGTGAGGAGGATTTGCCGATAGAGTTATCAGCTAAATCCATCCCCATAATCACGTTTAACCCATGGTGGAAGCAGATTGGTTCCCGAATTTCTCCGTGTTTCTTAAATACTGGAGACCACATTTCTATAAGCATAATTTTACTTCTCCTTCATTAGACATTTCAATAGCGTTCAATGCATACAAGCAATCCATTATGGATAGAAAATCTGTAGGATCATCCAACTCTTCTGAGATAGCGTGAAAGATATCTTTGACGTTTGAGTTTCTACTTTTGATTTCATTTAGCACTCTAGGCAAATAAGCAAGGGTGCTTTTTTGATAGGAGTAAAGTTTATTTGGTAATTGCATTATTCAAGTACCTCGCATTTTTGGATAAAGTAAGAGACAATCATCTGACAGAAGTAGATGTCCTGTAGTGTAGCCAGATGGAGTTTTTCCGAAATAGTATTGAAAATAGCCAGATTATTATGCTTGGCTGCTTTTAACTTTTTATACATCGATCGCGTTTGATATTGGATTTTCTCGTAATCAATTTTTCCTTGTTTGTCCAAATTTACGATGATTTTTTGAATGGTTAAGTAGTTATCAATAACTTGGTTTTTAACCAATTGATAAAGCGTACGATTGTTCTCAGGTGATATCTTATCAGTCAATTGCTTCGAGTCATAGGAGATATTATATTCATCACATTTTAGTTTATTGAGACTAGTCAAAACTGAAACAATTCCACTGTCTAACTTCATATCAGAAATCGCTTGTTGGCTGTTATGTGCAGAGACTAGAATCTTTTTAACATTTTTTAGAGTTGTTACAATTTTTTTGCGCCTATCTGCTTGATAGGTTAAAAAACCATCTGGGCAGAGGGCTATCAGATTCAGTGCTTCAGCGTCCTTATCTTTTTCAATGGCTGAAACCTCGTAATTTTCTGCTGCTAAGTTGCCACTGGTTAGAATGAGTGGTCTATCACAGCCTGGGCATGCACAACAGTTATTAGATTCTGTTAACAAGAACTGCCCGTATTGTTTTTTGAGTTGATTCGACTGGGTAGTGAACGCTGTATTTTGCACAGTGGTTAATTTTACAATCCCTGTCTTCTCTCTGATGGTTACCAGAAGATACCTTGGAATTGCGGTGTCGACTTGACCATGGTGCCTTTTGGGCAGGGCTATAAGGATATGAGTCCACCGTCCAAGGAACTCTATAAACTCATGATGGTAGGGAAAATCTAACATGTTGGTCATCCAGTCCTTAAATGGATGGGACAAAACGTGGTGATGCGACAAGCCCCTGGAGGCAACATCAAGCCAGATAAGGAAAAATCTGTTGAGAAGATTGACGGTATTGTAGGTCTTATCCTGGGGCTTGACCGTTGCATTTGCCGCCAAGGTGATGAAGCTAGCGTCTATGATGAGCGAGGGATATTGAGTTTTTAGTTGAGTCAACTCTAAAAACGTGATACAATGTCGTTACAAAAAAGGAGGATAACCATGGCTAAAACGGGAACTTTGAATTTACGAGTTGATGATTCAGTAAAAAGTGCGGCAGATGATATTTTGAAACGCTTAGGTATTCCTATGTCAACTGCGATTGATATGTTTTTGAATCAGATTATTTTGACTGGGGGTATCCCATTTGATGTTTCTCTACCTGAAGCGCCTCAACGAGTTAATGTTGATTACATGAGTCAGGAGAAGTTTTATGATAAGCTTATCACCAGCTTTGAAGATGCGAAAACTGGCAACCGTCAGGATGTCAGAGAATTTCTATTTCAATTGAAGGAAAATGCTTAATGAAAGAATATCAGGTCACCATGTCGGATGATGCTAAAGCAGATTTGCTGAGCATCTATCACTATGTTCGTGATGAACTCTGTGCACCACAGGCAGCGGATGATCTTCTTGAGAGGTTATCCCAAGGAATGTTATCACTATCCATTTTTCCTGAACGTTGTGCCATCATTGAGGATCTGATTGGAAAAGGCTATACCTTCAGACAACTGATTGTCAAAAAATATCGCATTGTATATCATGTTCTGGAAGATGAAGTTATAATTGTTGCGGTCGTCTATGGATCACGTCATATGAATAATTGGTAAAGTAAGGGAGAGTGATGTATGGAACTCGTAAAGACGATACAAATTGGTGATGACATCTATCCTCCGATACCTGACCTATTTGGCATTCAAGAGAATCAGGAGTTTAACCTTTATAAATCAACTGATGGAACTTTGGTGTTAAGTCCATCTGATAGCAAACTATCAGCGGATCACCAAAGTATAAGCAGTGATGAGCAGATGACAACAGCTGTTGAACAAGCAAGGTTAGATGAGATTGCGACTTCAGTATTATCACGACATCTTGACGCATTTAAGGAATTGACAGAATGAGAATACTAGGTTTTGTAAGAAAGACTGTTGATTACTTTGAAAGAAATATACCGAAAGCACTTCAAAGGAGGTGCTTTTTTTGTACCCCAAAATAAGGAGGGCTTATGGGACTACTTGATTTAATTGGAAGAAAAAGGGCTAGAGATAAGCCCCAAAACAGTTATGAAGGTCAGGACTTTTCCTACCTCTTTGGTCGCACGACTAGTGGCGAGAATGTGGATGAGTTTAAGACTATGCAGACGACGGCAGTCTATGCCTGTGTGCGTGTTCTTGCTGAAGCGGTGGCGTCACTTCCTATTCACATCTATGAACGGACAGAAAATGGGAAGGAGAAAAAGCTGGACCACCCACTGTACTTTCTTCTTCATGATGAACCCAATCCAGAGATGTCCTCCTTTATCTTTCGAGAGACAATCATGAGCCATCTTTTGATATGGGGAAATGCCTATGTACAGATTATACGAGATAAAAGTGGTATGGTATCGCTACTGCTAAAGCAGAAGGCGAGCGTTCTGATAAGAAAGCTGCTCTTGATTATCTGGCAACGGATGCCTTAGAAGCACGAATTGCAGCACTTCACAAAGCTAAGATTGATGAGTTGACCGTCTCTAGTTCAGCATGGATGCCAAGGCTTATCTCCCAACAGATTCTATCAGAGTATGTGAAGAGCCTAGAAGTTGAAGCTGATAAGGTCGTTATTCCAGGACAGAATACTCCAGTCTTTAGTTGGGATAGGGATGGGAATGGGAATCTTTCCATTGACACACCGCTCCTAAAGGTGAGAGGGGAAAGTCTAGCGACACAAGCTGACCTTACAACCATCTCTTTAACTCCTGGTCCAAAGGGAGAACTCTGGCAGACAAGTGTTGAAAGGTTGGATATAAAAGTAGACAAGCACATCAGCCTAACCTTCAAAAATGGCGTACGGATTGATTGATAAAAGGCAAGGGCGTATCAATTCGGCACGTCCTTTTTTAGTTTATCTGTGGTATAATGAAAGAAGTTATATTGGGAGTTGAGATGCACGATTCATTTGAATTTTGCACTCCCTAAAAAGGGTAAAGGTTAGATTGTATGATAAAACTAATAGCAACAGAAATAGGAATAAAGTGGATAATACAATAAAAGTTCTAAATAGCTTGAAACAAAGGGACTAGGAGTTTGAGTGGGAATTTTAATACTCTAGGGTAATTTTATGTAGAGTGTTTGAAAATAATAACGTTAAAAAGTTAGTAATCGTTAAAGAATTTAAAATAAATTGTAATAGTTTATCGCTTGTTTTATCGCTTGAAGAACGAGCGATAAATTTATTTTTATGGTATAAATAAGAAAAAAGATTGTAAGGAGAAAATGATGAAACCACCTTTTACAGTTACGAATACCATGTTAAATAAGGTAGTAGAGATTTCTAAAATTATTGGTAATTTAGAATTACAAGTACAGAAAGATTTAAAATTAAGAAAAGAAAATCGTATTCAGTCTATTCACTCATCACTCGCTATTGAACAAAATTCTTTAACAGTAGAACAAATAACAGCCATTATTGATGGGAAAAGAGTGTTAGGGAACCCCCGTGAGATAAGAGAAGTAAAAAACGCTTATGAAGCTTATGAAGAAATTTTAACGCTAACTCCCTATGATGAATCACATTTTTTTAAAATGAAGAAATTTCAACAGTACATTTACCGATAACAACATCGTCAATCACAAGTCCTATGGGGTTGGGGAGTGATTCGCTACCTGTAAAAATTTCCTTATTTGATGTTGATACCTATCTTGCAGATTCGATGCAGTTTCACTTAGAGTATATACTTAGACTTTTTCCAAAGTCAGGAGTTCATTACTTAATGCCTACTTTTAGAGGAGAAGCAGTAGATCATCGACATTTATCGCAATTTTATCATAGTGAGTGTGAGATAGAGGGAGATTTACACTATGTGATGAATTTAGTGGATAGATATATTAAGTTTCTGGTTAGTGAAATTCTTAGAGAGTGTCGAGATAGTATTTTTGCTATAACAAAAGATGTAAGTCATTTGGAAAGTTTTATTGATCGAAAGATACCAATTATTACGTTTGAAGAGGCTTGTACTATATTGGAAAATGAAATAGATTCATTGGAATATAATGATGAACATCATTTTTATGTGTTAACAGATGTTGGGGAAAAGAAATTAATGGAACATTTTGAGGGAGTAGTTTGGGTAAAAAATTATCCCTGTAAAAGTGTCCTTTTTTATCAAAGGTTCTCAACAGATCATCTATTTGCCTATAATGCAGATTTGTTGTTAGGAATAGGCGAAACTGTAGGTTGTGGAGAAAGATGCGAAACATATGAAGAAGTTGTAGAAAATATGAATTATTTACAAGTAGATGCTTCTGAATATAGTTGGTATTTAGAAATGAAAAAAACAAGACCTATGAAATCTTCAGGATTTGGTTTAGGAGTAGAGCGTTTAATAGCGTGGATATTGAAGTGCGATGATGTTCGAAAAGTTCAATTAATCAGTAGAGAAAATGGGATTGATTATTTACCATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_LN831034|445138:451789|445337_446183_-|WP_010921999.1|DBSCAN-SWA MDISIEFGLYPTESDLTELQQYFPDTNLKKLYEVEAYHKKLETILDSEFSTERESLIAEIDELESQLTTLNQELQELGNIPNLSSEYLENYSKLTATINALKEQNEAYLKESGLSKEKSETDADLKRSTEDILLDLEVKINSKMREVNNILYPDIRKAPQINLNAHNSYSFYTPDDDGTGTKFKGMIVFDLVMLYLTNLPALAHDSLLLSNVSYQATEALLKLYDQSRSLNKQVFLVFDKASSYSPDANQLLSENTVLRLSSNGNELYGISWNKGENSDEI >NZ_LN831034|445138:451789|446986_447211_-|WP_010922001.1|DBSCAN-SWA MQLPNKLYSYQKSTLAYLPRVLNEIKSRNSNVKDIFHAISEELDDPTDFLSIMDCLYALNAIEMSNEGEVKLCL >NZ_LN831034|445138:451789|448652_448958_+|WP_011285435.1|DBSCAN-SWA MKEYQVTMSDDAKADLLSIYHYVRDELCAPQAADDLLERLSQGMLSLSIFPERCAIIEDLIGKGYTFRQLIVKKYRIVYHVLEDEVIIVAVVYGSRHMNNW >NZ_LN831034|445138:451789|445138_445348_-|WP_002985621.1|DBSCAN-SWA MRFSYNKLWKLLIDKGWTKTKLRQEAGISSSTIAKLGKGENITTDILLEICIALDCKIEDIVEIVDNNI >NZ_LN831034|445138:451789|449871_450186_+|WP_011285436.1|DBSCAN-SWA MPRLISQQILSEYVKSLEVEADKVVIPGQNTPVFSWDRDGNGNLSIDTPLLKVRGESLATQADLTTISLTPGPKGELWQTSVERLDIKVDKHISLTFKNGVRID >NZ_LN831034|445138:451789|447210_448104_-|WP_160338849.1|DBSCAN-SWA MTNMLDFPYHHEFIEFLGRWTHILIALPKRHHGQVDTAIPRYLLVTIREKTGIVKLTTVQNTAFTTQSNQLKKQYGQFLLTESNNCCACPGCDRPLILTSGNLAAENYEVSAIEKDKDAEALNLIALCPDGFLTYQADRRKKIVTTLKNVKKILVSAHNSQQAISDMKLDSGIVSVLTSLNKLKCDEYNISYDSKQLTDKISPENNRTLYQLVKNQVIDNYLTIQKIIVNLDKQGKIDYEKIQYQTRSMYKKLKAAKHNNLAIFNTISEKLHLATLQDIYFCQMIVSYFIQKCEVLE >NZ_LN831034|445138:451789|448976_449249_+|WP_010922005.1|DBSCAN-SWA MELVKTIQIGDDIYPPIPDLFGIQENQEFNLYKSTDGTLVLSPSDSKLSADHQSISSDEQMTTAVEQARLDEIATSVLSRHLDAFKELTE >NZ_LN831034|445138:451789|450964_451789_+|WP_029714029.1|DBSCAN-SWA MGLGSDSLPVKISLFDVDTYLADSMQFHLEYILRLFPKSGVHYLMPTFRGEAVDHRHLSQFYHSECEIEGDLHYVMNLVDRYIKFLVSEILRECRDSIFAITKDVSHLESFIDRKIPIITFEEACTILENEIDSLEYNDEHHFYVLTDVGEKKLMEHFEGVVWVKNYPCKSVLFYQRFSTDHLFAYNADLLLGIGETVGCGERCETYEEVVENMNYLQVDASEYSWYLEMKKTRPMKSSGFGLGVERLIAWILKCDDVRKVQLISRENGIDYLP >NZ_LN831034|445138:451789|448350_448653_+|WP_002991611.1|DBSCAN-SWA MAKTGTLNLRVDDSVKSAADDILKRLGIPMSTAIDMFLNQIILTGGIPFDVSLPEAPQRVNVDYMSQEKFYDKLITSFEDAKTGNRQDVREFLFQLKENA >NZ_LN831034|445138:451789|448119_448296_+|WP_015055928.1|DBSCAN-SWA MGQNVVMRQAPGGNIKPDKEKSVEKIDGIVGLILGLDRCICRQGDEASVYDERGILSF >NZ_LN831034|445138:451789|450602_450941_+|WP_011285437.1|DBSCAN-SWA MKPPFTVTNTMLNKVVEISKIIGNLELQVQKDLKLRKENRIQSIHSSLAIEQNSLTVEQITAIIDGKRVLGNPREIREVKNAYEAYEEILTLTPYDESHFFKMKKFQQYIYR >NZ_LN831034|445138:451789|449353_449806_+|WP_010922006.1|portal|DBSCAN-SWA MGLLDLIGRKRARDKPQNSYEGQDFSYLFGRTTSGENVDEFKTMQTTAVYACVRVLAEAVASLPIHIYERTENGKEKKLDHPLYFLLHDEPNPEMSSFIFRETIMSHLLIWGNAYVQIIRDKSGMVSLLLKQKASVLIRKLLLIIWQRMP |
12 | Streptococcus_phage(66.67%) | portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
514861 : 603163
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_LN831034|514861:603163|DBSCAN-SWA TATGACTATTAAGGCAGAAATTAAGGCGCTCGCCAAAGAAATTGGTATCTCTAAAATTGGTTTTACGACGGCAGATAACTTTGATTATTTGGAAAAGTCATTGCGTGCTTCTGTGGAAGAGGGGCGCAATTCAGGATTTGAACATAAAGTCATAGAGGATCGTATCTACACTGAAAGGCTTTTAGAATCGGCTAAAACGATTATTTCAATTGGCGTTGCTTATCCTCACAAACTTCCTCAGCAACCTCAAAAAACACCTTATAAACGTGGAAAAATTACACCTAGTTCGTGGGGGCTTGATTATCATTATGTGGTCGGCGAAAAGTTAGACAGACTATCAAAAGGCATTGAAGAGCTGTGTCGAGATTTTCCTTTGCAACAAAAAGCAATGGTCGATACTGGAGCTTTAGTTGATACTGCAGTTGCCCAAAGAGCGGGTATTGGTTTTATAGGAAAAAATGGTCTAGTTATTTCTAAAGAATATGGCTCTTATATGTTTTTGGGAGAATTAATTACCAATTTAGAGATCGAGCCAGACAAGCCTGTCGATTATGATTGTGGTGACTGTCGTCGTTGTCTAGATGCCTGTCCAACTTCTTGTTTAATTGGTGATGGCTCAATGAATGCCAAGCGTTGTCTATCATTTCAAACCCAAGATAAGGGAATGATGGACATAGAGTTTCGAAAAAAGATTAAAACAGTTATCTATGGTTGTGATATTTGCCAAATTTGCTGTCCTTATAACAAGGGTATAAACAATTCACCAGCTACAGAGATTGATCCTGAGTTGGCTCAACCAGAATTAATACCATTTTTGAGTTTATCAAATGGAAAATTTAAAGAAAAATTTGGTATGATTGCTGGAAGTTGGCGAGGTAAAAATATTTTACAGCGTAATGCCATTATTGCGCTAGCAAATGCTCATGATAAAACTGCAGTGGTCAAATTAATAGAGATTATTGATAAAAATAATAACCCTATTCATACTGCAACAGCTATATGGGCATTGGGAGAAATTGTCAAAAAACCAAACGATGAGATACTGGCGTTTATGAGTCATTTAACCTTAAAAGATGAAGATAGCCGAAAAGAGTTGGAATTAATCCGTCATAAATGGCAATTTTAAGCCTTTTATGGTATTTTTAAGAACCTTATGATAAAATAAAACAGATTAACAAAGATTGGAGAAATCTCATGGAAGTGGCTGAAATTCGCCAAAAAATAGTAGAAAATAAAGAGAAGTTGACTAGCTTCAGGAGGTCTCTTTGACTTAGATCGTTTGGAAGAGGAGATTGCTCTTCTTGAAAATCACATGACTGAGCCAGACTTTTGGAATGACAATATTGCAGCGCAAAAGACATCTCAAGAACTAAATGAGTTAAAAGGTAAGTATGATACTTTCCATAATATGCAAGAATTATCTGACGAAACAGAACTCTTACTTGAGATGCTTGACGAAGATGATTCTTTGAAAGAAGAATTAGAAGAAAATCTAATGCAGCTAGATAAGATAATGGGTGCTTATGAAATGACGCTTCTCTTATCTGAACCCTATGACCACAATAATGCTATCTTAGAAATCCATCCTGGTTCAGGAGGAACTGAAGCGCAAGATTGGGGAGATTTACTCTTACGAATGTATACCCGTTTTGGCAATGCTAATGGTTTCAAAATAGAAGTATTGGATTATCAAGCAGGAGATGAAGCTGGTATTAAATCGGTTACCCTCTCTTTTGAAGGCCCCAATGCTTATGGTTTGTTGAAATCAGAAATGGGAGTTCATCGCCTCGTTCGTATATCACCTTTTGATTCGGCTAAACGTCGTCATACCTCATTTGCTTCAGTTGAAGTGATGCCAGAGTTAGATGATACGATTGAAGTAGAAGTACGTGATGATGACATTAAAATGGATACTTTCCGTTCCGGAGGAGCTGGTGGTCAGAATGTCAATAAAGTATCAACAGGTGTTCGTTTGACGCATATTCCAACTGGAATTGTGGTATCGTCTACCGTTGACCGTACTCAATATGGAAACCGCGATCGCGCTATGAAGATGTTGCAGGCTAAGCTATATCAGTTAGAACAAGAAAAGAAAGCACAAGAAGTAGATGCTCTCAAGGGTGATAAAAAAGAAATCACTTGGGGAAGTCAGATTCGTTCTTATGTTTTCACCCCTTATACGATGGTGAAGGATCATCGTACTAACTTTGAGCTTGCTCAGGTAGATAAGGTTATGGATGGAGAGATCAATGGCTTTATTGATGCCTACCTTAAGTGGCGCATTGAAGACTAAAAATAATAAAGGAGAAACATGGCACTAATAGAAATGTCTGGTGTTACTAAAAAATACCGCCGCTCAACGACCGCCCTCAGAGACGTCAATGTTTCTGTTAACCAAGGTGAGTTTGTTTATCTCGTAGGCCCATCAGGTGCTGGTAAATCAACTTTTATCAAACTCCTTTACCGTGAAGAACAACTGACAACTGGTAAGCTATATGTGGGTGAATTCAATTTAACTAAGCTAAAAGCACGTGATGTTCCGATTCTTCGTCGTCACATCGGAGTAGTTTTTCAAGATTACAAACTGCTACCAAGAAAAACAGTCTTTGAAAATGTAGCTTACGCCATGGAAGTTATTGGTGAAAAGCGCCGCCACATTAAAAAACGCGTGCCAGAGGTACTCGATTTAGTTGGCTTGAAACATAAGATGCGTTCTTTTCCAAGTCAGCTATCAGGAGGGGAGCAGCAACGTGTGGCCATTGCGCGTGCGATTGTTAACAACCCTAAATTATTGATTGCAGATGAACCGACAGGGAATTTAGATCCTGAGATTTCATGGGAAATTATGCAGTTACTTGAACGTATTAATGTTCAGGGAACAACTATCTTAATGGCGACACACAACAGTCATATTGTGAATACATTCCGTCATCGTGTTGTTGCTATTGAAGATGGTCGCATAGTACGTGATGAAGAAAAAGGAGATTATGGTTACGATGATTAGATACTTTTTCCGTCATATTTGGGAATCCATTAAAAATCTTAAACGCAACTTTTGGATGACATTTGCTTCAGTTAGTATGGTGGCTGTTACATTGACTTTAGTTGGTGTTTTTGCGGCGACATTGTTGAATATACAGCGTGTTGCTTCGGGTGTTGAAAATAATGTCCATATCAATACCTACTTACAAGTTGATTCAACTGATGCTGCAAAAGTTATTCAAAATACTGCCGGTGAACCTGTTAATAACGATAACTACCACAGTGTTTACGACAAAATTGCTCAGATAAAAGGTGTCAAAAAGATTACATTTTCTAGCAAGGATGAACAATTGAAAAAATTGCAAGAAACCTTAGGTGATGTTTGGAATATGTATGACCAAGACACTAATCCGCTCCAAGATATCTATCTTATTGAGACCCAGACGCCTAAACAAGTTAAGGCGATCACTAAAAAGATCAGAACGATTGAAGGCGTAGAAGCCGCAGATTATGGAGGGATTAACTCCGATAAACTATTTAAGTTTTCAACATTAATTCAAACTTGGGGGCTGATCGGAACAGCAATGCTATTATTTGTAGCTGTCTTTCTCATTTCAAACACTATTCGTATGACTATTATGTCTCGTAAACGTGACATTGAAATTATGCGGTTAGTTGGTGCTAAAAATTCTTATATTCGAGGGCCTTTCTTTTTTGAAGGGGCTTGGGTTGGCTTGTTAGGAGCTGTTTTACCATCTCTTCTGATTTATTATGGATATGATCTTGTTTATAAGCATTTTGCACAAGAATTACAACGTAATAATCTCTCGATGTATCCGCTTGATCCTTATGTATATTACCTGATTGGTGCTTTGTTTGTCATAGGTATTATGATTGGTTCGCTTGGTTCAGTGCTTTCTATGAGACGTTATTTAAAATTCTAAAAAAAGCGCTGCTGACGAAACGTAGCGACCCTCAAAAGTTGGACCTCTTATGTTATTCCAAGGACCTCGTTTTGTATTGCACAGGACTGGTCCTTTTCATTTTGTTTTGATTCATTTGTTTATTTGTAATAGGCAATACAGTTTAAAATAGCAGTTTCTAAGGTTTCAAGAGAAGAAAAGCACCCCAAAAGTTAGATGTTTGATGTATCTAACTTTTGGGGTGTCATTCAAAATTTAGTGGCTCTTTTTTAGTAAAATACTATGATTTCAGTTTTAGGATAACCTCAAACAGTATCTAAAATAGCTATGTCAATGAAAAAAGGGGTTAGCATTTTTTTCGTGACAAATGGTAGTAGAAGGACCATGCCCAGGATAAACTCGGTAATGATTAGGTAAGGTGAATAGTTCTTGGCGAATACCAGTAATGAGGTCCTCAAAGTTACTGGTAGGTAAGTCAGTACGACCGATAGTTTCACGAAATAGAGCATCGCCAGTAACGACTAATTCATCTGAGTGGAAAACAAATGAGACTCCTCCCCAAGAATGACCAGATGTTGGTAAAACTGTGAATTCAAAACCATTTAGTTGATAGGGTTGCTTTAATTTAAAAAAGTTCTCTGCCGGTCTTGCTATAACAGTAATGATATCATCATGACGGCCTAAGCCAGATAAATTATCATCTGGGGAAGATAGCCAAGCGGCTTCTTTTTCTGAAACATAAACAGGTGGATGATCAAAAGCATCTCTGACCAAATCTAAACTAAAAATATGATCATAGTGAGTATGCGTTAAGAGGATAGCCACTAAAGGTTTTTCAAAGGATTTAATTTTAGCAATGATTTCTTGGCCGTTACTTCCTGGATCAATGAGGATAACAGCTTGATCATTAACGAGGTAATAAGTATTTTCACCAGCAATGTGGTTTATTGTTTTATAGATTTTCATAAGGATAGTGTACCAAAAAATCAAGACTTTGTTAAAAAAAGAGTAGCGGAAAATAAATGGCAATTAGTTTCAGAAAATATGAGATCTCACAGCAATTTCTTGACACCGTTTTCATAAAGGTGTATCATA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96 | Streptococcus_phage(58.73%) | terminase,tail,head,capsid,tRNA,protease,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
663085 : 673688
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LN831034|663085:673688|DBSCAN-SWA ATTATTCTTTATTTTTGGGGTTATCCTCTTTTAGTTCAGAAGTTGCCGCGTCAGCTTCTACGGGATTTAGTTCTAAGTAAGATGGTGCTTTAAAAAGTTTCTGAGTTGATTTATGACCATTTTTACTGTATAAACTTGTTGACTCTGATCCGAGTTTTGCTGAAATATCTTTCAGTTGTTTTAACTGCTTAGTGTAGATAAACTGGTTAGGATCAATAGCTTTTAGACCATTTTGAGTATCAAAGCGCAGGAGATCACCCGTTTGAATAGCGTCGCTAGCTGCTAGTTGTTGAGCAACAGCAGAGCGAATTTCCTTAGTTTTGGCTATAGTCATTTCATCGGGATTAGTGATTTCTAAACCTGTTTGCGTGTTGTACAGACGTCCACTATAGTTAGTGTATTCAGGAGTCATATAAGTCCCAGATGTTCGTTGTGCCACAATCTGGCTATTTTGAGGTGATAATAAATCTTGTCCTAATTGAACAAACTGACTAGTGTCAATACCAAGTATGTGGAGTAAAGTAGGAAGAGCATCGATTTCACCGCCAAAGGTTTCTTTGATACTACCATTCGTATAACCTGGAATATGGATCATATACGGGACTCGTTGTAGCATAGCATTATCATATTCAGACCAAGTTTCAGAATCTTTACCAAGAAGTGGAGCAAGACTAGAATTACGAGAATTTGAAATACCATAATGATCACCATATAAAACAAAAATAGAATTGTCGTACAAACCAGTGGCTTTCAAGTAATCAAAAAAAGATTTAAGGGCAGCGTCTAAATAATTGGCAGTAGCAAAGTAACCATTGATCGTTTCATCGTCTGTTTTGGCTAAAGGAAAACCTTCTTCACTACTTTCGCCTTTTAGACTAGTATAAGGATAGTGATTACTCACAGTGATAAACTTGGTATAAAAAGGTTGTTGCATCTGTTCAAGATATTTTATGGAATCCTTAAACATGTACTTATCATTTAACCCATATTGAAAAGAGTTCTTACTATTTTGTTTAGAGAAGTAGCTAGAATCAAAAAAATAATTATAGCCCCATTGTTTATAAGCATTATTGCGATTCCAGAAAGTTCCAACGTTACCATGAAAGACAGCGCTGGTATAGCCACCTTTTTGGGCTAAAATACTTGGAGTAGCAAATTGTGTATTTTCACCACCGTAGTTCACCATAAAAGAACCACTATTTAAACCAAATAAGGAATTCTCCATCATGGTTTCAGCATCAGAAGTTTTACCTGCTTTAACCTGATGAAAAAAGTTAGGGAATGCTAAGGTAGCATTTGAGTGATAAAGTGAGTTGATAAAAGGCGTTACCTCATATTCTTTATCTCCTTCTTTTAGTTTATAATCTATTAAGAATTGTTGAAAGCTTTCTAAATGAAGAACAATAATATTTTTGCCTTTTCCAATTCCAAAATACTGAGGATCAGGTGCTGCATAATGTCCTTTGACATAAGTTTTAACATCAATTAATTCTTCTGCAGTAGCTCCATTTCGTTCTTTTTGAGCTTGATAGGTTTGATTGCCGCTATAGAGGGTAAACGCTGGTAGTCCTAAAGCTCTCACAATATAAGTATTTGAAAAGCCACGTGTTAATAGTTCCGGACGATCAATTTCTGCTAAAAAAAGATTAATAGAAAGCAATAGACTAGATAAAGCGGTGATGGCAAATGCTGCGCGCTTGTTAAAAGGACGTTGATCATTTTTGATTTTTTTAGCGATAGATAAACTAATTAGAATAATAAAATCAAGAATATAGATAATATCCCAGATGCGTAAAAGGTTTAAAGCAGAGTCCCCTAATCCAGCGGAGACTTTACTACTAGCTAGCATGGCACTCACTGTAATAAAGTCTGAAAATTCTCGGTAATATATAGAATTTGATATCAAGAGAATGTTAAGGATAATATAAACCACCCAAGAACAGATATAAAAGGCTCGGGTATTCCTAACGTAAAGAGCAACCCCCAAAAGTAAAAAAGCTAGTGGGATTGGATTGATAATAGTTAGAAAGACTTGGTATATATTTCCCAAATCTAGTGAAAAGTCTGTATGATATGCCCACAGGGTCTTTATCCAGTAACAAAAGAGTAGAGTAATTATAAAACCCAATCTTGTGTTGATAAAACCTGTGATAAGTGTTTTAAATTTCTTCACAGTAGCAACTTCCTTATCGTTTTTTCCTAAAGATGTCATCTCCAAATAAAATCTCAGATTAAATTATACCAAAAATGTGAAGCTAATGCTTGTTGTAAGTTCAAATTTAGTAGGATTTTTTATCAGATTTTGTTATAATAAAAACTATGAATAAACTCTATATTGATTCTTTTGTCGAAAAGAAGCTGACAGCAGGGGTACAATTATTAGATGAAAAAGATTTTTCTAATATAAAGGAAAAAAATCAGTTGGTTCAACTGGTGACCAAGTCCAATCGTCCCATTGGAACAGCATATATCTCTAAGCAAAATAAAGGAATTGGTTGGTATCTAGGACCAGAAAAAATCGACTTGTCTATCTCTTATTTTGTTAGTCTATTTTCAGTTGCTAAGGCCAAAAGACAAGATTTTGCTCAATCGGACGAGACCAATGCTTATCGCCTTTTTAATCAAGAAGGAGACGGTTTTGGTGGAGTAACAATTGATCTTTATAAAGATTTTGCAGTCTTTTCATGGTACAATGCCTTTGTCTATGACAAAAAAGAAATGATTATGGAGGCTTTTCAACAGGTTTTTCCTGAAGTCAAAGGAGCTTATGAAAAGTGTCGCTTTAAAGGTCCAGATACTGAAACTGCTCATCTGTATGGTGAGCTGGCACAAGAAACCTTTTCGATTTTAGAAAATGGCATAGCCTATCAAGTCTTCTTGAATGAGGGCTTAATGACAGGTATTTTTCTAGACCAGCATGATGTTAGAAGAGCACTAGTAGATGGTTTAGCTATGGGCAAGTCCCTTCTTAACCTATTTTCCTATACAGCTGCCTTTTCTGTAGCAGCTGCTATGGGTGGTGCTATCGAGACCACTTCTGTGGACTTGGCTAAACGATCGAGAGAATTATCACTAGCTCATTTTGAGCATAACCAGTTAAACTTAGCCTCACATCATTTTGTGGTGATGGATGTTTTTGAATACTTCAAATATGCCAAACGGAAAAAATTAATCTTTGATGTGATTGTGATTGACCCACCAAGCTTTGCTAGAAATAAAAAACAAACTTTCTCTGTGAGCAGGGACTACCACAAATTAATCACAGAGGCCTTGGACATATTGAGTCCTAAGGGAACTATTATAGCTTCAACAAATGCTGCTAATATGACTGTTAGCCAGTTCAAAAAGCAAATTATCAAAGGATTTGGAAGTCGTCGTCCTGAGTCTATGACTCTCCAGCAGCTTCCGAGTGACTTTACTATCAATAAAGCAGATGAAAGAAGTAACTATTTAAAGGTATTTACTATAAAGGTACGAGAATGAGAATTGTAGCACCAGTCATGCCAAGACATTTTGACGAGGCTCAAGCCATTGATATTTCTAAATATGAAGATGTTAATTTAATTGAATGGCGAGCAGACTTTCTTCCCAAGGATGAGATTGTCGCAGTAGCACCAGCTATTTTTGAAAAATTTGCCGGAAAAGAAATTATCTTTACCCTTCGGACCGTTCAAGAAGGGGGGAATATTACCCTTTCAAGTCAGGAGTATGTTGATATTATCAAAGAAATCAATGCTATTTATAATCCAGACTATATTGACTTTGAGTATTTTACGCACAAGTCAGTATTTCAAGAAATGCTTGATTTTCCAAATCTTATTTTGTCTTATCACAACTTTGAAGAGACTCCTGAAAATTTAATGGAAGCTTTTTCAGAAATGACCAAGTTGGCACCGCGTGTGGTTAAAATTGCTGTGATGCCCCAGAGTGAACAAGATGTTCTAGATTTGATGAACTATACCAGAGGCTTTAAGACGCTCAATCCTGAGCAAGAATTTGCAACTATATCTATGGGGAAATTAGGAAGATTGTCTCGTTTTGCGGGAGATGTCATTGGCTCTTCCTGGACATACGTTTCATTAGATCATGTTAGCGGTCCAGGTCAAGTGACTCTCAATGATATGAAACGTATTATTGAGGTCTTAGAAATGGATATCTCTAACTAGTGAATGGTCTAAAAATATTATTTCTACAATAGTTAAGAAATGATGTTTTTAGATTAATGTTTTTAAAATAAGTGGAACCAAAAAGGAGAAAAATTGCGTTATTTAACAGCAGGAGAATCTCATGGGCCATCCTTAACAGCTATTATTGAAGGTATACCAGCAGGATTAACTCTTCATCCAGCGGATATTGATCACGAATTACAGCGACGTCAAGGAGGTTATGGCCGTGGTGCCAGAATGTCTATTGAGACTGATCGGGTTCAAATATCCTCAGGAGTTCGTCATGGTAAAACAACAGGGGCCCCCATTACCTTAACGGTAATTAATAAGGACCACCAAAAATGGCTAGATGTCATGGCTGTAGGAGACATTGAAGAGACTCTCAAGTTAAAGCGTCGTGTTAAGCATCCTAGACCAGGACATGCGGATTTGGTAGGAGGTATTAAATATCATTTTAACGATTTAAGAGATGCTTTAGAGCGTTCCTCGGCTAGAGAAACAACGATGAGAGTGGCTGTAGGCGCTGTTGCTAAACGTATCTTAGCTGAACTTGGAATTGATATGTTACATCATATCTTAATATTTGGTGGTATAACGATCACAATACCTTCTAAGCTCTCTTTTAGAGAGCTGCAAGAAAGGGCTCTCCATTCAGAATTATCTATTGTTAATCCAAAGCAAGAAGAAGAAATTAAAACGTATATTGATAAGATAAAAAAAGAAGGGGATACCATTGGTGGTATTATCGAAACGATAGTTCAAGGGGTGCCAGCAGGTCTTGGATCTTATGTCCAATGGGATAAAAAATTAGATGCCAAGCTGGCTCAAGCAGTTCTTTCCATTAATGCTTTTAAAGGGGTGGAATTTGGAGCTGGGTTTGATATGGGATTCCAAAAGGGCTCTCAGGTAATGGATGAAATCACCTGGACACCTACCCAGGGCTATGGTCGTCAAACAAACCACTTAGGTGGCTTTGAAGGTGGCATGACCACAGGACAACCTCTTGTTGTTAAAGGGGTTATGAAGCCCATTCCTACTTTGTATAAACCACTCATGTCGGTAGATATTGATAGTCATGAACCTTATAAAGCAACGGTGGAACGCTCTGATCCGACGGCCTTACCAGCTGCAGGGGTTATCATGGAAAATGTGGTGGCGACGGTGCTTGCCAAAGAGATTTTAGAGACTTTTTCTTCTACTACCATGTCTGAATTGCAAAAAGCTTTTTCGGACTATCGTGCCTACGTCAAGCAATTTTAGATAGCGAGATACTGGCTTTTATGGTATCATACAGGTATTAATGAACAAAAGGAGACTGTCATGTCACAAGAAATTTATGACTATGCTAATCAACTTGAAAGAGCAGTTCGTGCTCTGCCAGAATACCAAAAAGTGTTAGAAGTAAAAGAGGCCATTCAAGCAGACGTTAGTGCTAGCGAACTGTTTGATGAGTTTGTCGCTATGCAAGAAAAAATCCAAGGGATGATGCAATCAGGCCAAATGCCAACGGCTGAAGAACAAACAAGCATTCAAGAACTTAGCCAAAAGATTGAAGCTAATGACCAGCTAAAAGCTTATTTTGAAGCGCAGCAGGCCTTATCTGTTTACATGAGTGATATTGAGCGTATTGTATTTGCTCCGTTGAAAGATTTAGTCAAGTAAGCCAATTAAGATAGGAAAAAAACAGATTGCTGGCAGCTCGTCAGGATCTGTTTTTTAGTGTTTATTTTCTTTGTATCAGAAAGTTGAGCCTCTTTCTTATTTGTGATATAGTCAAATAAAGTGACCAAAATAGCAGGCCAGTAGTGGCTTTAATGAAGGCAAGTTGTCTGCTAACTGGCTGTGCTAAAACATCAGTATTAGAAAGTAAAAGGTGATAAAAATGGTTATTCCTTATGATTATATTGTTATTGGTGGAGGGAGTGCAGGTATTGCTTCTGCGAACAGGGCAGCCATGCATGGGGCCAAAGTATTGTTAGCTGAAGGTAAAGAGATTGGGGGAACCTGTGTTAACCTAGGCTGCGTTCCTAAAAAAGTCATGTGGTATGGCGCTCAAGTAGCAGATATTTTAGGGACTTACGCTAAGGATTATGGATTTGACTTTAAAGAGAAAGCATTTGATTTTAAACAATTGAAAGCAAATCGTCAAGCTTATATTGATCGGATTCATGCTTCTTATGAGCGAGGCTTTGAGCAGAATGGTGTTGACCGTATTTATGATTATGCTGTTTTCAAAGATGCTCATACGGTAGAAATTGCAGGGCAGCTTTATACCGCACCGCATATTTTGATTGCCACAGGAGGACATCCTGTTTTTCCAGATATTGAGGGGGCACAATACGGTATCAGCTCGGACGGCTTTTTTGCCTTAGATGAGGTACCAAAACGTACGGCTGTGGTTGGGGCAGGCTATATTGCTGTGGAACTTGCTGGTGTTTTGCATGCTTTGGGATCGAAGACGGATTTGTTTATCCGTCACGATCGACCTTTAAGAAGTTTTGACAAAACCATTGTTGATGTCTTAGTTGATGAAATGGCAGTTAATGGGCCGCGTTTACACACTCATGCAGAAGTGGCAAAGGTTGTCAAAAATACTGATGAGTCCTTGACCCTTTACCTCAAAGATGGCCAAGAAGTTGAGGTTGACCAGCTCATTTGGGCTATCGGTCGCAAGCCTAATCTAGAAGGTTTTAGTCTTGACAAAACTGGAGTGACGTTAAATGATAAAGGTTATATTGAGACAGATGCCTATGAAAACACGTCTGTCAAAGGTATTTATGCCGTGGGAGATGTTAATGGGAAACTGGCTTTAACTCCAGTTGCTGTGGCAGCTGGACGTCGCCTATCAGAGCGTCTTTTCAATGGCAAAACAGACGAGAAATTGGACTACCAAAACGTTGCTACTGTGATTTTTAGTCACCCTGTTATTGGCTCTGTTGGCTTGTCAGAAGAAGCAGCAGTCAAACAGTATGGGCAAGAAGCAGTTAAAACATATCAATCACGTTTTACGTCTATGTTTACTGCTATCACTAACCATCGCCAACCTTGTCTGATGAAGTTGGTAACAGTCGGAGATACCGAAAAAATAGTTGGTCTTCACGGAATCGGATACGGGGTTGACGAAATGATTCAGGGCTTTGCAGTAGCCATCAAAATGGGAGCAACCAAGGCGGATTTTGATAACACCGTTGCTATTCACCCAACTGGCTCAGAAGAATTTGTCACCATGCGCTAAAAAATGTAGCCTAAGGCAATAAAAAATGATGTTAACAGTTTTTGAGGAAAGTCTTCTAAACTGCTAGCATCGTTTTTTGTTAGGTGATTAGGGGAATATGTTTTTAAAGATATTTGCGTTGCTCAGACAATATTGCCTTACCTCGGAGATAAAATAAAGTGACCCTGTAACAACAAAGAGTTCATCAGATGTTACGGAACCTTGTAACCAGTCTCTGTAATCTTTTACCTGTGGGTATTTATCAGGATAATCCTCTAAAAGATTTGCTTCAGGGAAATCAAAAGTCGTGACAGATACTTCAAAAGTATCTAGTTGAGCCAGCAAGTCGGCTAAAGGCTTACGTTTGAGACCTGCAAAGAGAATATGAATAGGACGTTTGGGAAATTCTTCTTGCAGTAGAGACTTTAATTTAGCAATGGAATCTGGATTGTGAGCGCCGTCTAATAGAAGATTAGGTTGAATAAATTCGGACCGGCCAGGCCAAGTTGTTGCCTCAATTCCTTTTTGAATCGTTTTTGGAGATATTTTAGGAAAGGATTTTCTAAGTAATTGAGCTGTCATAATGGCTAAACAGGCATTCGCTTTTTGATGTTGACCTAATAGTTTGAGACGGAGTTTGGTTAAATTCAAGTTATCGTGTTGAAAGGAAAACGTCTTTTCTGAAGGATTGAGCAAAAAATCTTTTCCTAATTGATATAAGCGTGAACCGGCTTTTTGGGTAACTTGTTGAAAGACTTGACTAGCCTCCTGCTCAAGTTGACCGATAATAACGGGTTCTTTAGCTTTGATAACTTCTGCTTTTTGGTGAGCAATTTCTGCTAGGCTATAACCTAAACGTTCTTGGTGATCAAAACTAATAGAAGGGCATACGACGGCCAGAGCATGAAAAACATTGGTTGCGTCGGTTTTCCCACCAATCCCTGCCTCAATAATGGCAATATCAACAGGTTTAAGATTGGCAAAGTAGCAAAACATTATGAGCGTCACTAACTCAAACTCGGTAGGTCTATCCCAATTTGTTTCAAGAGACATTTTAGTGAGAATGGGTCTAATCACGCTCACACATTGCGCCAATTCTAGGTCTGAAATGGGCTGGCCATTAAGGCAAATCCGATCGTGAAAAGAGATAATAAAAGGAGATGTAAAGGTTCCGACCTGATAACCAGAAGTTGACAGGATATGCTGTAAGTAGGCTGTCACAGAGCCCTTGCCGTTAGTTCCAACAACGTGAATAGCAGGGAATTTGTCTTGTGGCCGGCCTAGTGCCTCAAGTAACCAAGCCATTCTGGCCAAATCGGTCTTGCGACCATTAGCCTTAAAGGTATGAATCCAGGAAATGCTATCATAGGTAGTCATTACTATTTCTTGTCCTTCTAACAATGCTTTTAAGGGTTCGTAGGAAGACCAGTATTAGCATCTTCAGCTCCAGTTGCATTAGGAATTTGCGTCCCTTCAGTGGCTGATGGTGTCTCAGGAGCTGTAGGAGTTGTCTCGTTGTGAGAAGGTGTGGTAGAAGATGACGGAAGAGTTGTCTTATTATCATCTGTGGTTTCTGAAGTACCTGTATGGTTTTGATTACCCTGAGAAGACTCTTTTTCAATAATCTTGACAATGGTATTACTCGATTCTTTGGGTGTATCATTAGAGGTCTTATCTGGTACAGGCTGCAGTGCTCTTGAAATGGTAATGGTTGCCACGATGATACTCAAAATACTACCAATAAGTGCAATGGATTTTTGGAAAGCTGTAAAACCTGTTTTAATATGCTCGGTAGGGACACCTCCTGATTTACGAGGTTTTTGTTGACGGGAATAACGTGATGACATATTTTTCTCCTTTAAAATCATCGTAATGCCAAGATTAAGGAGGAGGAAACAGAAGTCCTAGCTCCTCTTTAACACTTCATCTATCAGTATAATCTAGAAAAAAAGTGAAGTCAACGGTTTACCTTATGTCTAGGACAAGGAAGTCCTTTGGGCTTATTGTAATACGAATATTCTTGATTTCATTTTAGCTATTTTGTGATAGAATAAAGTATTGAGTAAAAATGAAGGTGACACATGATTTATTTTGATAATGCAGCCACAACCATACCTTATGGAGAGGCTCTTAAAACTTACCAAGAAGTAGCAACAAAAATATATGGCAATCCCTCAAGTCTGCACCAATTAGGGACAAATGCGTCTCGCATTTTAGAAGCTTCCCGTAAACAGATTGCTGGTTTGTTGGGTGTTAAGTCAGAAGAAATCTTTTTTACGTCTGGTGGGACTGAAAGTGCTAATTGGGCTATTAAGGGAATTGCTTTTGAAAAAAACGCTTTTGGCAAACATATTATTATCTCAGCCATTGAACACCCTGCCGTGAGTGAAAGTGTCAAATGGCTTCTCACACAAGGATTCGAAGTTTCTTATGCTCCAGTGACAACACAGGGAGTTGTTGATGTGAATGCTTTAGCTGAGCTGATTAGACCAGACACCATCTTAATCTCGATTATGGCTGTTAATAATGAAATGGGAGCTATCCAACCGATTAGAGCCATTTCAAACCTATTGGCTAACCAACCAACGATCACCTTTCACGTTGATGCTGTTCAAGCCAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_LN831034|663085:673688|670572_671841_-|WP_002990257.1|DBSCAN-SWA MTTYDSISWIHTFKANGRKTDLARMAWLLEALGRPQDKFPAIHVVGTNGKGSVTAYLQHILSTSGYQVGTFTSPFIISFHDRICLNGQPISDLELAQCVSVIRPILTKMSLETNWDRPTEFELVTLIMFCYFANLKPVDIAIIEAGIGGKTDATNVFHALAVVCPSISFDHQERLGYSLAEIAHQKAEVIKAKEPVIIGQLEQEASQVFQQVTQKAGSRLYQLGKDFLLNPSEKTFSFQHDNLNLTKLRLKLLGQHQKANACLAIMTAQLLRKSFPKISPKTIQKGIEATTWPGRSEFIQPNLLLDGAHNPDSIAKLKSLLQEEFPKRPIHILFAGLKRKPLADLLAQLDTFEVSVTTFDFPEANLLEDYPDKYPQVKDYRDWLQGSVTSDELFVVTGSLYFISEVRQYCLSNANIFKNIFP >NZ_LN831034|663085:673688|667343_668510_+|WP_010922139.1|DBSCAN-SWA MRYLTAGESHGPSLTAIIEGIPAGLTLHPADIDHELQRRQGGYGRGARMSIETDRVQISSGVRHGKTTGAPITLTVINKDHQKWLDVMAVGDIEETLKLKRRVKHPRPGHADLVGGIKYHFNDLRDALERSSARETTMRVAVGAVAKRILAELGIDMLHHILIFGGITITIPSKLSFRELQERALHSELSIVNPKQEEEIKTYIDKIKKEGDTIGGIIETIVQGVPAGLGSYVQWDKKLDAKLAQAVLSINAFKGVEFGAGFDMGFQKGSQVMDEITWTPTQGYGRQTNHLGGFEGGMTTGQPLVVKGVMKPIPTLYKPLMSVDIDSHEPYKATVERSDPTALPAAGVIMENVVATVLAKEILETFSSTTMSELQKAFSDYRAYVKQF >NZ_LN831034|663085:673688|666563_667250_+|WP_002985140.1|DBSCAN-SWA MRIVAPVMPRHFDEAQAIDISKYEDVNLIEWRADFLPKDEIVAVAPAIFEKFAGKEIIFTLRTVQEGGNITLSSQEYVDIIKEINAIYNPDYIDFEYFTHKSVFQEMLDFPNLILSYHNFEETPENLMEAFSEMTKLAPRVVKIAVMPQSEQDVLDLMNYTRGFKTLNPEQEFATISMGKLGRLSRFAGDVIGSSWTYVSLDHVSGPGQVTLNDMKRIIEVLEMDISN >NZ_LN831034|663085:673688|672545_673688_+|WP_011285480.1|DBSCAN-SWA MIYFDNAATTIPYGEALKTYQEVATKIYGNPSSLHQLGTNASRILEASRKQIAGLLGVKSEEIFFTSGGTESANWAIKGIAFEKNAFGKHIIISAIEHPAVSESVKWLLTQGFEVSYAPVTTQGVVDVNALAELIRPDTILISIMAVNNEMGAIQPIRAISNLLANQPTITFHVDAVQAIGKIPLCDYMTNRVDLASFSGHKFHSVRGVGFLYKKAGKRLNPLLSGGGQEQELRSTTENVAGIASMAKALRIVTEKQVSVLPKLTAMRDVIYKSLSAYPDVTVFSAQEGFAPNILTFGIRGVRGEVIVHAFEKYEIYISTTSACSSKAGKPAGSLVAMGIPVKTAQTAVRISLDDDNDMGQVEQFLTIFKQIYDKTQKVR >NZ_LN831034|663085:673688|671870_672311_-|WP_010922142.1|DBSCAN-SWA MSSRYSRQQKPRKSGGVPTEHIKTGFTAFQKSIALIGSILSIIVATITISRALQPVPDKTSNDTPKESSNTIVKIIEKESSQGNQNHTGTSETTDDNKTTLPSSSTTPSHNETTPTAPETPSATEGTQIPNATGAEDANTGLPTNP >NZ_LN831034|663085:673688|669132_670485_+|WP_010922141.1|DBSCAN-SWA MVIPYDYIVIGGGSAGIASANRAAMHGAKVLLAEGKEIGGTCVNLGCVPKKVMWYGAQVADILGTYAKDYGFDFKEKAFDFKQLKANRQAYIDRIHASYERGFEQNGVDRIYDYAVFKDAHTVEIAGQLYTAPHILIATGGHPVFPDIEGAQYGISSDGFFALDEVPKRTAVVGAGYIAVELAGVLHALGSKTDLFIRHDRPLRSFDKTIVDVLVDEMAVNGPRLHTHAEVAKVVKNTDESLTLYLKDGQEVEVDQLIWAIGRKPNLEGFSLDKTGVTLNDKGYIETDAYENTSVKGIYAVGDVNGKLALTPVAVAAGRRLSERLFNGKTDEKLDYQNVATVIFSHPVIGSVGLSEEAAVKQYGQEAVKTYQSRFTSMFTAITNHRQPCLMKLVTVGDTEKIVGLHGIGYGVDEMIQGFAVAIKMGATKADFDNTVAIHPTGSEEFVTMR >NZ_LN831034|663085:673688|663085_665296_-|WP_029713995.1|DBSCAN-SWA MTSLGKNDKEVATVKKFKTLITGFINTRLGFIITLLFCYWIKTLWAYHTDFSLDLGNIYQVFLTIINPIPLAFLLLGVALYVRNTRAFYICSWVVYIILNILLISNSIYYREFSDFITVSAMLASSKVSAGLGDSALNLLRIWDIIYILDFIILISLSIAKKIKNDQRPFNKRAAFAITALSSLLLSINLFLAEIDRPELLTRGFSNTYIVRALGLPAFTLYSGNQTYQAQKERNGATAEELIDVKTYVKGHYAAPDPQYFGIGKGKNIIVLHLESFQQFLIDYKLKEGDKEYEVTPFINSLYHSNATLAFPNFFHQVKAGKTSDAETMMENSLFGLNSGSFMVNYGGENTQFATPSILAQKGGYTSAVFHGNVGTFWNRNNAYKQWGYNYFFDSSYFSKQNSKNSFQYGLNDKYMFKDSIKYLEQMQQPFYTKFITVSNHYPYTSLKGESSEEGFPLAKTDDETINGYFATANYLDAALKSFFDYLKATGLYDNSIFVLYGDHYGISNSRNSSLAPLLGKDSETWSEYDNAMLQRVPYMIHIPGYTNGSIKETFGGEIDALPTLLHILGIDTSQFVQLGQDLLSPQNSQIVAQRTSGTYMTPEYTNYSGRLYNTQTGLEITNPDEMTIAKTKEIRSAVAQQLAASDAIQTGDLLRFDTQNGLKAIDPNQFIYTKQLKQLKDISAKLGSESTSLYSKNGHKSTQKLFKAPSYLELNPVEADAATSELKEDNPKNKE >NZ_LN831034|663085:673688|665403_666567_+|WP_002985142.1|DBSCAN-SWA MNKLYIDSFVEKKLTAGVQLLDEKDFSNIKEKNQLVQLVTKSNRPIGTAYISKQNKGIGWYLGPEKIDLSISYFVSLFSVAKAKRQDFAQSDETNAYRLFNQEGDGFGGVTIDLYKDFAVFSWYNAFVYDKKEMIMEAFQQVFPEVKGAYEKCRFKGPDTETAHLYGELAQETFSILENGIAYQVFLNEGLMTGIFLDQHDVRRALVDGLAMGKSLLNLFSYTAAFSVAAAMGGAIETTSVDLAKRSRELSLAHFEHNQLNLASHHFVVMDVFEYFKYAKRKKLIFDVIVIDPPSFARNKKQTFSVSRDYHKLITEALDILSPKGTIIASTNAANMTVSQFKKQIIKGFGSRRPESMTLQQLPSDFTINKADERSNYLKVFTIKVRE >NZ_LN831034|663085:673688|668570_668912_+|WP_010922140.1|DBSCAN-SWA MSQEIYDYANQLERAVRALPEYQKVLEVKEAIQADVSASELFDEFVAMQEKIQGMMQSGQMPTAEEQTSIQELSQKIEANDQLKAYFEAQQALSVYMSDIERIVFAPLKDLVK |
9 | Streptococcus_phage(57.14%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
798208 : 889357
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_LN831034|798208:889357|DBSCAN-SWA 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105 | Streptococcus_phage(81.48%) | terminase,integrase,transposase,tail,capsid,tRNA,protease,portal,holin | attL 845883:845899|attR 890873:890889 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1027428 : 1103152
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_LN831034|1027428:1103152|DBSCAN-SWA TTTAAATAAGAACTTTTTTGGGTTTGTATTCTTGATCTCTTTTTTCTAAAATAGCAATTACTTTTTCGCCATGAAAAGCAGCTAACAGTGGCTCTTGACTAGGGAGACTAAGACGGCGACCAAATGAAATTTCAGTCAATTCAGTATCATCAATAACCATTTTAGGAAGATCAGCAACGCCATACTCGATCGGTAACAAAAAAGACATCTCTTGTTTAGAAACCATATCAGCAATTTCTCCCAAAGTATAGGCAGTCTCGAGGGTTAATCCTGCTGAAGCTGATCGCTGCAAGAAGGACATATGACTCTCTACCCCTAGAGCTCGACCTAAATCAACTGCTAAGGTCCGCACATAAGTCCCTTTGCTACAAGCAACTTTAAAAGAGAATCGGCAAAGACCGTCTTCAGTAAAATTCAAAGGGCTGGTGCGTTCAAACAGAGAAATAGTCACTTCTCTTCTAGGACGTTCCACACTTTCACCAGCACGCGCATACTCGTATAATTTACGGCCATTAACCTTTACGGCTGAATACATAGGTGGGGTCTGTGTGATTTTCCCAAGGAAAGTCGTCATCGTTTGATCAACGAGTTCTTCTGTTAGCACAGCTGGCAAAGAGGACCTCGCAACTACCTCTCCACTAGCATCCTCAGTCGTTGTTGAGTAACCGAGAGTCACTTGTCCTTCATAAACTTTACCAGCTTCTGTCATGTATTCGATCACACGAGTAGCCTTACCAACTGCAATTGGTAGAACACCGACCACATCAGGATCTAAGGTCCCCCCATGTCCAATCTTTTTTTCTTGTAATAACTTCCGTAATTTAAAAACTGCGTCATGAGAGGTCATGCCGGCTTCTTTTTTTAAATTAATGATTCCATTTATCATGTCTATTTTTCTCTCTAATTAGTAATTGTTACTGATTCTATTCTACCGCTTTATCATCAGTTTTGCCAAAATAAACGCTTAACCAATTTTAGCAGGGAAAGACTCACTTTCAGGCTTACTGGTCCTTGAGGGCTTCAAATTTCTCTCGCATGGTTGGGTTTTGGCGGGTCAGTTTTTTAACTGAAACATCCTCTAATTTATTATTAGCTAAGCGTAACTGATTTTCACTAGTGGTTAAAAAGCGTTTCACTTCCTCCATGCGTTTAATCGATTTATCAATCTCGTCAATAGCCTTTTTAAAGTTGTTGCTGGCAGACTGATAGTTCTTAGCAAAGGCATTCTTAAATTGGTCCAAATCCTCTTCGAAGTGAGTGATGTCAATATTTTGTTCCTTAACCAAGGCCAACTCTTGCTTATAGTGTAAACTATTCAGGGCCGCATTTCGCAGAATCCCTATCAACTGAATAAAGAGTTGAGGACGAACCACATACATCTTTTGATACTCATGACTGACATCAACAATCCCTGTATTGTAGTAATCATTATCAGCTTCTAACATGCTTACCAAAACAGCATACTCACAATCTTTTTCGCGACGGTCTTTATCTAACTCCTTGAAAAAATCACTATTTTTATGTTTTGTTTTGGTGGTGTCTGCCTCGTTCTTCATCTCAAACATGATAGAGAGGATTTCTACACCATTGGCATCAACCTCTCGGTAAATATAGTCCCCTTTTGACCCACGACTAGACAATTGGTTATCTTTGACAAAGCTAGCATTGGGGAAAGCATAGCTTCTTACTTTGTTAAACTCTGTTTCAGCATAGAGTTCTAGACTCTCTCCGATTGCTTTGGTAGATTGCTGCGCTTTGAAATTTTTATAAAATTCAACTTGCTCGTTAGCCGCTTTTAACTGTGCTTCGTAGTCGCTGCGCACCGAAGCCAACGACAATTCACTTTCTTTAGCTTGAAGCGCCAATTGGTTTTTGATTCCATCGCGTTCTTTTTCGATTGTAGCAAGTTTTGACTGGAACGTGGCATCTTTTTCAAGTGCTAATTTGTCCAGCTGATTGGTCAAACTAACCACTTCTTTGTCCTTCTCAGCTAATTGATTGGCCAGTTCCAAAGCATTTTGCGAGGCTAATTTATCAAGTTTCGCTTCTAAAGAAGCAATAAGCTGGTCTTTTTTAGCCAGTTCTTCTTGTCTGAGGTAGGCTTGTTCTTTTTCAATTTGCTCTAATTGGTTTGTCAAGCTGGTAATAGCTGTTTCTTTTTTTGCGACAACCTCATGCAATTGATGCTTCGCTTTTTCTTCCAGCAAGGCTATCTCATTGATTAGCCGTTTTTTCAATTCTTCATCAAAGGCTTGCCCTCTGACTTGTTCCAATAATTGACTATACTCTGACTCATTGATAGTAAATAGGGTATGACAATGAGGGCATTTTATTTCGTTCATCTTGTCTCCATTCTGAGATTCTTCATTTTATTATAGCAAAAAAGCTCAGGAAGTTAAGTCCCAAGCTGTCATAGATAAGAAGTGTGCAATAGAGATTTAGTCATTTTGATAATCCTGATAAAACTCTACCTTTAATAAGATAAAGCGCTCTAAGTCTTGTAAGAGCTGAAATAAAACCGCACGTCGCTCAAATTCCTCCCGAGTTTGAGGAAGATCACCATGACGAAAGGTTTCAAGCAATTGTTCGATGTCATCAATCAAGGTTAAAGCCGGATTTTGTTCGCTTAGCTGACAAGCAGTTTCGTGAAAAAGATGTGACAAAAGAATACTTTCCTTACTTTGTCTCATTAACGTGTTTACGTTGATAGCCATTTGTCCCAATAGTCTATTTTGTTGTCGTCGCATCTCAAAATAATGAACTTGATAATTGGTCTGCTGAAATAGTTGATTATGCCTTTCTCGATAAACTAGTTTTAGAGCTTCATCTAATATTTTATCAAGGTTTTTGATCAAGAGCCCTTCATTTTGACCTTTTCCTTCCAGTAGAAAGCTTTCAAAACGGTATAAGATACCTTTCAGATCCGATTCAACTTTTTGGTGATAGTACCGAATTTGCTGATCTTGTGGACCCATATAAGCATTAAATAGTAAAGCGACACTAGTCCCTACAAAAAAGAGCATAAACTCATTCGATAAAATAGGTAATGCAATACTTTTTTTAGCAATCAAATGTGTCACAAGTACTGTTATAGGAACCAGTCCTGCCTCTATCTGAAAGTGATAGAGCAAAGGAATAATAATTAACAAATAACACATAAAACCTACTGTCGTAAAACCAAACAAGCTAAAGCACATCATCGCAATCCCAAAAGCCAGGAAAAAAGATAGCAAGCGATTCCTAGCGACCACCAAACTGGACTTACGGGTGTCTAAAACACTTAACAGGGCAATGATCCCCGCTGACATTGCATAATCCAGATGAAGTTGGTAAGCAATTAAAATGGCAACAATGGTAGCCAAGGTCATTTTTAATGTACGTTCAACTGAACCCATGACAAGACTCCTAACCTAATCCTTTTTGAATTTCATTCTGAATATATTCCCACTCCTGTTCTGCTCGATTGAGTTTACGATGATAATCTGTTAATCCTCTCAAGTAGTGATTAATCAAATAGTCCTGTTTCACTAAAGGAATAACGGGAATTGGAATATCCAACAATTCTTTCGTTGAGAGATTGATCACATCTTTGCCATGGTCCGCTACATCCAAGAGCGCTTGACCAATAGGTGAGTCCAAAAAGAACTTGATATAGTAGCCCCTTAACAGTTTTTGAGGGCGTAAGACAGTGATATTTGATGATGCCACCACATCTCGATTTTGCTTATGAAAAACACAGACTTTTTTTAGGGTTCCCTTAGAGGCGATTAAGACATCTCCGTCTTCCAAAAGGTAACGCAAGAGCTGCCTACGATCCATCTGGAAAGTTCTTAATTGGTGATATTGAATCCCTAAGGTGCCCATGTCAGATAAATTAATCAATCCCACATCACCTGGCACAACCTTACTTGAGACTGCTTTTCCTTTAAAACAATCAACAACTGTGCCTAATGTTACCTTTTCTCTGCTATCTGCTAGATAGGCCTCAATGCTATTTTCCATACATAGTATCTTTCTATTAAATTATAGTATTTAGATACTATCATAATATGATTAACTTTTCAAGTGCTGTCTATATCTGTCTTTTCACCAATCAATCTATGGATTTCAAAGCTTCTAACATATCAACCTTTTTTAAATGGCGATTAACCCAGATACCTAATACCGCTAACAAGCTAAGGATTACTAGAATTGGCACTAGATAAACATAAGCATCAACCTTTACACCAAATTGAATATCCCCAGTTGAAATCATTGTCATGATATAAGTATGCAGGCCTTTTCCTAAATAGATACCTAAAAGAATGCCTACTAGGGATAGCGAAATAGTTTCTCGATAAATATATAAGGTGACCTCCTGATCGTAAAATCCCAGAACTTTAATAGTGGATAATTCTCGAATACGCTCAGCAATATTAATAGTCGTTAAGTTATAAAGGATAACGATTGCTAATAAAATAGACAAGAAGACAAGGAGGGTCATGACCTGATTAAGAGAGGTGACTACTAGCTGAACAGATTTAATATGATTGACGTTTTGTGAAACTGCTCTAATCGCTTTTAAGGTTAACAAGTCACTGGCTGTCTCCTTTATGTGCTTGCTATCTTTGTCTTTTACCTTAATCAGATAGGCAGGAGCAGCCTCCAATCCTTTAAAATGATTCTTAAAATAGGTATCAGACATTATCAGGTAATGGCCAACTGTCATGTCAATAACCTGTTTAATCGTCACTTTATAAGACTGTCCTTTCCGATCAGTCAATACCAACTGATCACCTGGTTTTACCTTGTAATAGGAGGCTAATTTCTCAGAAATCAAAACACCAGAGGTTGGAATGGGAACCTTCTTTTGCTCCTGACTATCCAGCAGATTAAAATAGGGACTAAGAGAAGTAGCTGAACTTGATAAAATGGAAATACTTTGCTTATCAGGTAATCCCTTTACAGGAAGGGTTAAGCTGGCATAAGATACCTTTTGGTACCCTGTAATAGGTTCTTGT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92 | Streptococcus_pyogenes_phage(64.62%) | terminase,tail,integrase,capsid,tRNA,portal,holin | attL 1060780:1060839|attR 1099691:1099786 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1195696 : 1259402
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_LN831034|1195696:1259402|DBSCAN-SWA 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80 | Streptococcus_phage(66.04%) | terminase,tail,integrase,capsid,tRNA,portal,holin | attL 1223457:1223476|attR 1256787:1256806 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1326258 : 1402151
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_LN831034|1326258:1402151|DBSCAN-SWA 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>NZ_LN831034|1326258:1402151|1350346_1352041_-|WP_010922528.1|DBSCAN-SWA MTIYHALKDYQEVMTRGDYLVFDTPLTCRFIGRFFRFENQKALLAELATSKYFQWIEEGQAEVTMKHFFNRQLAKDAFTLKISEDKEIIIESQNLRGFRYAQEALLKVMTFKGDKLYLPIVSVKHSPSFAMRGIIEGFYGTPWTREERLDCLRFIGNKRMNTYMYAPKDDDYQRKLWRDLYPEDWVTYFKELLAVAKEEGLDFWYMISPGLDFDYTKEADYQLLYQKLQQLLALGVCHFGLLLDDIDYQIVDAVERRFKKTAYAQAHLATEVHHFLNQQHAAPELVICPTEYDNHHDSIYLQELSERIPKEVAFFWTGPSTLASQISQADIETMAAVYQRPIIIWDNIPVNDYQKDPERLFLTPFANRSPFLCQPDYQVKGIVSNPMISWELSKLTLTDMSHYLWDANRYQPSHSWLETLTDYTEDTELALALQAFAWHNGNRHLHRDLPFEVEEALLAKDVSTLSAWVAELVERVNTLRKLDKPAFQQAIAPWFERVAKDQDFWQAMLNQEPQLETLYADLQEDKHRIGSDIPSRYYRIYYQQQDKLTANQGQVTQARPEDYA >NZ_LN831034|1326258:1402151|1363768_1364293_-|WP_011017840.1|DBSCAN-SWA MHALFVANYIIEYSNKKGYKINNLKLQKLLYFVNVRNILENGAPLFEESMEKWKYGPVVPDVYHEYKRFGAFSISTDEMIMEYVEFSVSPFGELSDLEITEYDSQKVENTQLIENTVDALHGFGPFELVDITHDHTPWKKYEDRIMDGVQGIKYTIEEIKDFFGHNPGAKIWVQ >NZ_LN831034|1326258:1402151|1333534_1333840_-|WP_002983743.1|DBSCAN-SWA MIENLSQLVQYHDHQVASRSLSRLLGLSQSIVLYAMAQGESISQETSPRDKVILVLEGQLIFDLEDQKQVLTQESLIAIPAQKVHHLEAKTDCKLLQVLLD >NZ_LN831034|1326258:1402151|1334232_1334988_-|WP_010922518.1|DBSCAN-SWA MVTKEVGHDFLARLGKKRLRPGGVEATNWLIEQGQFSQDCHVLEVACNRCTTAIELAKTFGCQIDAVDLNPKVVKEAQERVAVEGLTRHITVSQASALSLPFPDNHFDIVINEAMLTMLNAQAKEKALNEYWRVLKPGGRLLTHDVAYEDPKTRQVLDELRQTIHVNVAPLSLTGWQALYQEHGFSQVTYHHGKMSLMTPRGMIKDEGLMNTLNIMRRGLKKENRQQFLKMRRFFTRTGKNLCYIAVKSVK |
80 | Temperate_phage(50.91%) | terminase,tail,integrase,capsid,tRNA,portal,holin | attL 1389575:1389592|attR 1416756:1416773 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||
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NZ_LN831034.1|WP_002983750.1|1330485_1330740_-|DUF1912-family-protein |
1330485_1330740_-
Protein sequences of NZ_LN831034.1|WP_002983750.1|1330485_1330740_-|DUF1912-family-protein>NZ_LN831034.1|WP_002983750.1|1330485_1330740_-|DUF1912-family-protein MSYEKEFLKDFEDWVKTQIQVNQLAMATSQEVAQEDGDERAKDAFIRYESKLDAYEFLLGKFDNYKNGKAFHDIPDELFGARHY |
84 aa aa | NA | NA | NA | 1326258-1402151 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 4.2|1317741|34|NZ_LN831034|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LN831034 position: 1388239-1388206, mismatch: 2 gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.***** 2. spacer 4.6|1317742|34|NZ_LN831034|PILER-CR matches to NZ_LN831034 position: 1388239-1388206, mismatch: 2 gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.***** |