CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP020412	Legionella longbeachae strain FDAARGOS_201 chromosome, complete genome	2 crisprs	cas3,DEDDh,csa3,DinG,WYL,RT,PD-DExK	0	0	6	0

1. NZ_CP020412

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP020412_1

• CRISPR_ID: NZ_CP020412_1
• CRISPR_location: 1419610-1419701
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP020412_1

Consensus_repeat	Method
CAGTCTTTTTTTTAGCATTAATA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP020412_1

>1.1|1419633|46|NZ_CP020412|CRISPRCasFinder
ACCTTACATTGGTTACTGGCATTATTTCCGAATACGTTATGGATTT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020412_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP020412_1

>merge|NZ_CP020412|1|1419610-1419701|CRISPRCasFinder
CAGTCTTTTTTTTAGCATTAATAACCTTACATTGGTTACTGGCATTATTTCCGAATACGTTATGGATTTCAGTCTTTTTTTTAGCATTAATA

>NZ_CP020412|1|1|1419610-1419701|CRISPRCasFinder
CAGTCTTTTTTTTAGCATTAATA	ACCTTACATTGGTTACTGGCATTATTTCCGAATACGTTATGGATTT
CAGTCTTTTTTTTAGCATTAATA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP020412.2|WP_003632359.1|1421713_1421938_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020412.2|WP_003632369.1|1428859_1430155_-|LLM-class-flavin-dependent-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|274922
NZ_CP020412.2|WP_003632342.1|1401103_1402330_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020412.2|WP_080619800.1|1412742_1415718_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020412.2|WP_003632366.1|1425977_1427111_-|ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|378925
NZ_CP020412.2|WP_012978948.1|1427111_1428038_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224054
NZ_CP020412.2|WP_003632351.1|1408675_1410691_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|238882
NZ_CP020412.2|WP_003632364.1|1424228_1425251_-|aminoglycoside-phosphotransferase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|366736
NZ_CP020412.2|WP_003632345.1|1403578_1404295_-|alpha/beta-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|366166
NZ_CP020412.2|WP_105166095.1|1422326_1422899_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|213218
NZ_CP020412.2|WP_003632354.1|1416655_1417822_+|GTPase	unknown	unknown	gnl|CDD|238090
NZ_CP020412.2|WP_012978952.1|1410823_1412431_-|murein-biosynthesis-integral-membrane-protein-MurJ	unknown	unknown	gnl|CDD|240528
NZ_CP020412.2|WP_003632349.1|1408152_1408389_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020412.2|WP_003632346.1|1404308_1407710_-|TM0106-family-RecB-like-putative-nuclease	unknown	unknown	gnl|CDD|274603
NZ_CP020412.2|WP_003632353.1|1415915_1416347_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020412.2|WP_080619801.1|1420023_1420257_-|Tn3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|376561
NZ_CP020412.2|WP_003632365.1|1425670_1425949_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|375646
NZ_CP020412.2|WP_003632344.1|1402662_1403565_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|377216
NZ_CP020412.2|WP_125461277.1|1420582_1420801_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020412.2|WP_012978947.1|1428021_1428867_-|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|273776

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP020412.2|WP_003632369.1|1428859_1430155_-|LLM-class-flavin-dependent-oxidoreductase	gnl|CDD|274922	TIGR04020, non-ribosomal_peptide_synthetase, natural product biosynthesis luciferase-like monooxygenase domain. This model describes a subfamily within the bacterial luciferase-like monooxygenase (LLM) family that regularly occurs within large non-ribosomal protein synthases/polyketide synthases, but also as small proteins. The LLM family includes members that bind either FMN or F420, and FMN is more likely in this case because many members are from species that lack F420 biosynthesis capability. An example member is the MupA protein of mupirocin biosynthesis in Pseudomonas fluorescens NCIMB 10586.	3.37361e-170
NZ_CP020412.2|WP_003632366.1|1425977_1427111_-|ABC-transporter-permease	gnl|CDD|378925	pfam12698, ABC2_membrane_3, ABC-2 family transporter protein. This family is related to the ABC-2 membrane transporter family pfam01061.	2.71161e-32
NZ_CP020412.2|WP_012978948.1|1427111_1428038_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|224054	COG1131, CcmA, ABC-type multidrug transport system, ATPase component [Defense mechanisms].	2.98962e-89
NZ_CP020412.2|WP_003632351.1|1408675_1410691_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|238882	cd01846, fatty_acyltransferase_like, Fatty acyltransferase-like subfamily of the SGNH hydrolases, a diverse family of lipases and esterases. The tertiary fold of the enzyme is substantially different from that of the alpha/beta hydrolase family and unique among all known hydrolases; its active site closely resembles the Ser-His-Asp(Glu) triad found in other serine hydrolases. Might catalyze fatty acid transfer between phosphatidylcholine and sterols.	1.79943e-39
NZ_CP020412.2|WP_003632345.1|1403578_1404295_-|alpha/beta-hydrolase	gnl|CDD|366166	pfam00561, Abhydrolase_1, alpha/beta hydrolase fold. This catalytic domain is found in a very wide range of enzymes.	2.13016e-14
NZ_CP020412.2|WP_105166095.1|1422326_1422899_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein	gnl|CDD|213218	cd03251, ABCC_MsbA, ATP-binding cassette domain of the bacterial lipid flippase and related proteins, subfamily C. MsbA is an essential ABC transporter, closely related to eukaryotic MDR proteins. ABC transporters are a large family of proteins involved in the transport of a wide variety of different compounds, like sugars, ions, peptides, and more complex organic molecules. The nucleotide binding domain shows the highest similarity between all members of the family. ABC transporters are a subset of nucleotide hydrolases that contain a signature motif, Q-loop, and H-loop/switch region, in addition to, the Walker A motif/P-loop and Walker B motif commonly found in a number of ATP- and GTP-binding and hydrolyzing proteins.	4.25981e-89
NZ_CP020412.2|WP_003632354.1|1416655_1417822_+|GTPase	gnl|CDD|238090	cd00159, RhoGAP, RhoGAP: GTPase-activator protein (GAP) for Rho-like GTPases; GAPs towards Rho/Rac/Cdc42-like small GTPases. Small GTPases (G proteins) cluster into distinct families, and all act as molecular switches, active in their GTP-bound form but inactive when bound to GDP. The Rho family of small G proteins, which includes Cdc42Hs, activates effectors involved in a wide variety of developmental processes, including regulation of cytoskeleton formation, cell proliferation and the JNK signaling pathway. G proteins generally have a low intrinsic GTPase hydrolytic activity but there are family-specific groups of GAPs that enhance the rate of GTP hydrolysis by several orders of magnitude. The RhoGAPs are one of the major classes of regulators of Rho G proteins.	8.98063e-13
NZ_CP020412.2|WP_012978952.1|1410823_1412431_-|murein-biosynthesis-integral-membrane-protein-MurJ	gnl|CDD|240528	cd13123, MATE_MurJ_like, MurJ/MviN, a subfamily of the multidrug and toxic compound extrusion (MATE)-like proteins. Escherichia coli MurJ (MviN) has been identified as essential for murein biosynthesis. It has been suggested that MurJ functions as the peptidoglycan lipid II flippase which is involved in translocation of lipid-anchored peptidoglycan precursors across the cytoplasmic membrane, though results obtained in Bacillus subtilis seem to indicate that its MurJ homologs are not essential for growth. Some MviN family members (e.g. in Mycobacterium tuberculosis) possess an extended C-terminal region that contains an intracellular pseudo-kinase domain and an extracellular domain resembling carbohydrate-binding proteins. Proteins from the MATE family are involved in exporting metabolites across the cell membrane and are often responsible for multidrug resistance (MDR).	1.29595e-144
NZ_CP020412.2|WP_003632346.1|1404308_1407710_-|TM0106-family-RecB-like-putative-nuclease	gnl|CDD|274603	TIGR03491, TIGR03491, RecB family nuclease, putative, TM0106 family. Members of this uncharacterized protein family are found broadly but sporadically among bacteria. The N-terminal region is homologous to the Cas4 protein of CRISPR systems, although this protein family shows no signs of association with CRISPR repeats.	2.33328e-63
NZ_CP020412.2|WP_003632364.1|1424228_1425251_-|aminoglycoside-phosphotransferase-family-protein	gnl|CDD|366736	pfam01636, APH, Phosphotransferase enzyme family. This family consists of bacterial antibiotic resistance proteins, which confer resistance to various aminoglycosides they include: aminoglycoside 3'-phosphotransferase or kanamycin kinase / neomycin-kanamycin phosphotransferase and streptomycin 3''-kinase or streptomycin 3''-phosphotransferase. The aminoglycoside phosphotransferases inactivate aminoglycoside antibiotics via phosphorylation. This family also includes homoserine kinase. This family is related to fructosamine kinase pfam03881.	6.89234e-12
NZ_CP020412.2|WP_080619801.1|1420023_1420257_-|Tn3-family-transposase	gnl|CDD|376561	pfam01526, DDE_Tnp_Tn3, Tn3 transposase DDE domain. This family includes transposases of Tn3, Tn21, Tn1721, Tn2501, Tn3926 transposons from E-coli. The specific binding of the Tn3 transposase to DNA has been demonstrated. Sequence analysis has suggested that the invariant triad of Asp689, Asp765, Glu895 (numbering as in Tn3) may correspond to the D-D-35-E motif previously implicated in the catalysis of numerous transposases.	2.89105e-17
NZ_CP020412.2|WP_003632365.1|1425670_1425949_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|375646	pfam18219, SidC_N, SidC N-terminal domain. This is the N-terminal domain of SidC present in Legionella pneumophilia. SidC appears to be involved in modulating mammalian trafficking by promoting the communication between ER-derived vesicles and the Legionella containing vacuole. The N-terminal domain (SidC-N) has a novel fold with 4 potential subdomains. SidC-N does not show structural similarity to any known protein domain in the protein data bank.	1.39008e-18
NZ_CP020412.2|WP_003632344.1|1402662_1403565_-|class-I-SAM-dependent-methyltransferase	gnl|CDD|377216	pfam04072, LCM, Leucine carboxyl methyltransferase. Family of leucine carboxyl methyltransferases EC:2.1.1.-. This family may need divides a the full alignment contains a significantly shorter mouse sequence.	1.64366e-30
NZ_CP020412.2|WP_012978947.1|1428021_1428867_-|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit	gnl|CDD|273776	TIGR01730, COG0845:_Membrane-fusion_protein, RND family efflux transporter, MFP subunit. This model represents the MFP (membrane fusion protein) component of the RND family of transporters. RND refers to Resistance, Nodulation, and cell Division. It is, in part, a subfamily of pfam00529 (Pfam release 7.5) but hits substantial numbers of proteins missed by that model. The related HlyD secretion protein, for which pfam00529 is named, is outside the scope of this model. Attributed functions imply outward transport. These functions include nodulation, acriflavin resistance, heavy metal efflux, and multidrug resistance proteins. Most members of this family are found in Gram-negative bacteria. The proposed function of MFP proteins is to bring the inner and outer membranes together and enable transport to the outside of the outer membrane. Note, however, that a few members of this family are found in Gram-positive bacteria, where there is no outer membrane. [Transport and binding proteins, Unknown substrate].	6.08452e-29

Protein sequences

>NZ_CP020412.2|WP_003632354.1|1416655_1417822_+|GTPase
MAGPYNTHTIVNVFRSIVQLISQYQELLHTQGIFRIPGSKEEIERLLEQLIGDHFNVEVLSNYIMNENTVNNEHLHNVLGMISAMLKESQILASTDDLLVSFSKKLKSLLESHQEEDIKNTIAAQLLDNFISDLLLSKRIDHQRAGEILYHYFHLMHQVGKYQEINFMTYNNLAIIIAPGLTNELSLYTGNNLLDLTSYVSQLTPVLENYIAETKWDCDFKKYHADKLDHLENTRYSLREQLEHMKEASRKSVTTPMKSYMLQASMIKAQIDAIKEVQQDHSLKKKAKKKLGKQLDPLQEEQSDLLSKISELAPKIKAMNSGQQQIQKEIDMLTHSGNRVTSCENPSNNSNLVQFSIFEPSSSNACTVLPTIPEEKEEFEDQEEYIHQ
>NZ_CP020412.2|WP_003632353.1|1415915_1416347_-|hypothetical-protein
MDTNIELNAMNPSESRSNEEIGTTDEVVNATSEDVYKYQKISLLIPKLITTIEQIEMLDQNTEMNIELKKSRKRLASIVIDNTSPNAEDIKEFTDSLSSALYGLSTGMSLIDMRGMIPEKKNRAVDLFADISLIQEDIVKLAS
>NZ_CP020412.2|WP_080619800.1|1412742_1415718_-|hypothetical-protein
MPTTRKLDWNKVALAAKKLGKEIGTALMGVITTPLNAIGATAEFAKETGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWLQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWLQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQKTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWLQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWLQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQKTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWLQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWLQNTGWPAVKIGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNGLVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNRLVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWLQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNGLVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPDVKSAAQNAFKAARDFCSSKISQLSDKVAELHDKAVEKIDKYLDDYLADDGGGLLLSSPKSSSSVTNILSDDAYTSPGTSRDNVSEKDNDKGNTIERRLG
>NZ_CP020412.2|WP_012978952.1|1410823_1412431_-|murein-biosynthesis-integral-membrane-protein-MurJ
MSNDKTLNVKATGTVALAIMVSRVLGLIREVLFNALFGSAAMGIFLIAFRAPNLLRDLFAEGALSVSFITVFSKKIETEGDQSAWQLASKMLTLTSIFMSVLCLLGIIFAKYIIFILAPGFSANDIETTVFLTQLMFPFILLVSLAAIVMGMLNSKNVFGVPALASSFFNMGSILGGALCGWLIDPSFGERALIGLSVGTVIGGLLQLGVQFPSLRKVGFRFRPNFHWYDSGIRKTLILTIPAVIAASAVQVNVLINSGFASYLGKEAVTWLNSAFRLMQFPLGMLGVAIATITLPVVSRLAATSNHSQLGPTLARAIRLAIFLTMPAAVGLWFFANPIISFIYGHGKFHASDSLQTAYALQFYALGLVAYSCIKVLSPAFYAIDKKWSPMIVSFATIILNIILNYYLIFKLNMGHCGLALSTTVSATVNFLILYILMSRLHNMQNRYLCSTTLRCILAAATLGFVCQFIFAYGTDFLYHPSFWVRGVSLVISISFAASVYFAICVLLRVDEAKSIFIIIYQRFGSPVDLKSKQV
>NZ_CP020412.2|WP_003632351.1|1408675_1410691_-|hypothetical-protein
MAISKRESKKNLTHFVVFGDSLSDGKNMGEKFSFLGSWVKSLWLKALGLDKSPKERFTNGYTWADSFRATLISKFLNDDKIKNDSDHRFGKYNLNNADISDEVLSQSPFIRKRYTLDDVIAESRKVKRKQRVEDREEGHLFTAKQEGTPEDIINPGHIVDSTDIADAAIAHRYKTNAQRATLRNKMRLLNASTLQESSDDISDQIITDPRYSKYVQEYYSLDDGRTAQYNGQNFFANYSQGGATSYDYSWKGLFLSLFAPFTSIKLFFTRLIVSNLSKQVDQFLVDLEKQEDYEDKERTLITVFSGANDLITVNSEPTKEAANLAVQSNIDNIEKLLQQGFKNIMLCNLPDLSLTPRFQGTSREGQAHEITEYFNTQLEEKYKKLKEKYPSCSIDFFNINSIFTKIYTDVRDNPQSEYAQYFDSKKLKEAYKDSTDYTMTPERTSPGSKHMFWDDVHPTATMHALLMSEFYKNIDALGKYKITAPAEQSPEQLCKKFRQKYHEKLENSWFGFLSSNKELPINYKEPAKALNSILRFALDKNNKKADYIRRAMIDLGWWVNNEPNMCIPALADAMWVLDPTLARKLEAKLDPHLEQPHSNSPRMMMGALNAGVSRHKTVPPELALSPEVEKKLKMMQKLPNKNKESTLSQAKGNTTFETPKLSSKDNVLTFA
>NZ_CP020412.2|WP_003632349.1|1408152_1408389_+|hypothetical-protein
MAAIATFAAWIAGLHIQSIGKVSDFQAHSAKSAFALFIVFLGKHVLKKTLLLTQENFQNLLMMLYQCAIQAQHAAPQM
>NZ_CP020412.2|WP_003632346.1|1404308_1407710_-|TM0106-family-RecB-like-putative-nuclease
MYLESNQIVFSPSDLAQFMDSPFASWMDHLAVTNPEYLPSPDENNELLSVLHDMGNQHESEVLASFEAKGLTIANLRNRTDSYQATIDAMKNGVDVIYQAHLELLPFKGYADFLIKVQGKSIFGDYCYEVWDTKLAKYVKPNFLVQLSCYAEMLDVMQQARADHITIILGNKEQKRFRLNDYFYFYQNLKHQFLLLHQQFEPFKSPDPALSKSWGRWSTHAKNLLLKADHLIQVATITSGQIKKLNQAGIYTMTALANSDYKTVKGIKYELFEQLKAQAKIQKDSIGKDVPAYQLINHENGRKQGLALLPPKSKNDIFFDIEGFPLEDGGLEYLWGVTYFDENDQRRYMDFWAHDKDQEKESFRSFVEWVYKRWQQDLSMHIYHYASYEVTACRKLMSRYGVCEYEIDQLLRNGVFVDLYKIVKSALLIGEPRYSIKNVEHLYRAKRDTEVGSGGDSVVVYERWRENPDGDTWQTSKILNDIRSYNIDDCNSTQELVRWLREKQEACGISFLGQTELIEPEIKEEVNERIKLRDRLLKRALQLHSEGHELLSKLHSVMAWSIEFHRREAKPVFWRLFDRLGLSEEELFEDMDCLAYCQRTEKPPYKSTPKARNLVYEYSFDPDQEFKANAKEYYLLGNETPDGKNIKAICHNEGSDLDHGIIALQIKNEPDSLITLIPNEYIDPDPIPQAITKQAESFANGMLAQTAIVDFLGKSIPRIKDHTSGQAIAPSHDPERRLNEIIKAVVNLDNSYLTIQGPPGAGKTYTGKHLIAELIKKGKKVGVSSNSHKAINNLLINTAKYCQKMGIAGHFSCKSKTDSVIDDLNINVLENKDISSFLQPGCVVGTTAWGFSRDDLEHAFDYLFIDEAGQVSVANLIAMSRSTSNIILMGDQMQLGQPSQGSHPDDSGLSILDYLLHSTPTIPDSMGIFLGTTYRMHSAVNQFISEAIYEGKLETAPENDEQLITVPVGYNGILNKEAGIIPVPVIHEGNTQGSDEEVAQIFSLAHELLGRTFNDKRGRQRTIDWDDILFVAPYNFQVNKFKAALGDKARVGSVDKFQGQEAPIVFLSMCASSANESPRGVNFLFDKNRINVAISRAQCMAVIVYSPALLDSVPNNIEQIAMMNMFCQLVKNR
>NZ_CP020412.2|WP_003632345.1|1403578_1404295_-|alpha/beta-hydrolase
MKKGQTFILIHGAWHASWCWKPIAKELIAKGHKVLMPDLPGHGQKKQISSSIGFTDYVNSVIQLVQHQQEQVILVGHSMAGLIISAVAERIPEAIGELVFVAGYVPHDQKSLFSLALESESNNLTPFLIIDELLQEIRLQISADLINIFFNCCKRADAQKAMSRLQAQPIRPFNEPVQIGEKYTRTPKRSLVCRYDKALLLSDQLRMSREVTDNIIYLDADHAVYYSGAKLIVDELLK
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MREKILKDHNVATTSLLANYWKNEAKSKENWLSLTQMQGTRENDLFKDPLMQNFVNEQVKEEAEQRLDKRMWLPLATRTRFFRQTVSDAVKNKEVKQVIILGSGFDTLPARKIKYTQQFGVRFFEIDQPQILKCKEQIYAEQCIHKNATYIPLDYVNGDLIAALTNNDIDFTKPTLILWEGNTFYLEKEDVLRILRDLSSKFSHMVITFDYMHTLMQTSTQQLDSSAKEKCLEKTLDEFASKKSPFKAFFEPGEIVSLCTKLGIQCVDHKTAAQLAKEYEVDQEPYYTAETYSMVTFEHK
>NZ_CP020412.2|WP_003632342.1|1401103_1402330_-|hypothetical-protein
MGLEIYTWKSSRKGLGFTTPVKSTLLGGNVGHAAVELTFPADEKGDELAKKYQDIRGLAISKRTEIVPEQQADGNYKPKEQINYFVYFSWWPGNSNGHHINSHRDDLEAEWRHEPSHKIKSYTKGYLYGENVPEDNKTNVKGSLVREKTITKVKEFSHAHLKHDIENDPAYKELTARKDALLAENKLLTDKLTNYMQEVKQARIENREPNKALDLTEAENAQCSMIPKEISRISAQIDLCKRDFEERHLSVGEAPAAIVRIPTTYDHNAPDFALDAEKILEEMASLSQSAVAYNYTKFNCSTTATQVVKAGIDDELKMTMEAGGFDVEKASKAYISTPTSFCAFSKKIQSELLHLNTKQDIVEQRQNDAPDRSPAIEIDFKARLRDITQESRKVEERNEVDTGFVRRR
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MGLATNAIVLWNTVYMQAAVDYLRAQGEVINEEDEKRLSPLGLKYVNLLGYFSFMLPKVVAEGQLRPLNVAEKLGLA
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MRRFSEEISTSLWQCIIDDASDELRVSKPISGVTYKVPSDRLCPQVVSCSSYISNQFTELQRCISINMTAIN
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MEELAGCALLVFPALEILAANGSLIHNDDTVLRIIDTIRHNRLNPDKKRTGIYTTVLLAQNSAHKIALFYNSHC
>NZ_CP020412.2|WP_105166095.1|1422326_1422899_+|ATP-binding-cassette-domain-containing-protein
MSKGNVEIDDINLTCFTKDSLRSQIAIVPQHLNLFHRSIFENIAYGCRHVSKEEVIAAAKKAKCHDFITSLEHQYETIIGEQGVKLSGGQRQRIAIARAILKNAPILLFDEATSALDSATEQAIQEALETLLKDKTALIIAHRLSTLKAMDKILVLENGPIVESGSHNELLAVKEAYYNYWTQQSSEFIR
>NZ_CP020412.2|WP_003632364.1|1424228_1425251_-|aminoglycoside-phosphotransferase-family-protein
MLIKPDLKDEEIVRCLRNVYGLDVDKIFFLPLGADLNTAVYRVTTSTERDYFLKLRSGEFNEASVLVPKYLADLGFRQVIPPLTTTDGQFWTSLASFKVVIYPYVKGRNGVEVNLSDKQWIEFGATMKRFHSADIPQTITTGVQTETFSSKWHQTVRVFLGRIDNEVFEEPIATKMALFLKSQKGEILELIRCAEHLASKLQKQPHENILCHADIHGWNLFIDEGGALYVVDWDTLLFAPKERDLMFIGSGLGDSGRTPFEDEALFYNGYGPTNINDDAIAYYRCQRVIEDIGVYCEQIFLSDEGGEDRLQSFKYLQSNFLPNGTIERAFQSCKSRENQK
>NZ_CP020412.2|WP_003632365.1|1425670_1425949_+|hypothetical-protein
MYISSNEPTAPRYIHINPQTNKVHLLVPISYGDEINHADGCDKTTAALQDLFNREALDELDTYQHTLQLDIQLLDEGSEQRIAKEERLIQSI
>NZ_CP020412.2|WP_003632366.1|1425977_1427111_-|ABC-transporter-permease
MARFSLFRLHGLVVKEFVQLKRDRFTMALIIGLPIIQLLLFGLAINVNPKHLPTALMNYDQGPFARTLIHGLENTNYFKFVYFPHTEKEAQYLLSTNQVKFILTIPSDFSRKLIRKEHPAALLEADGTDPVSVVYALSASNNLMSTVFNNDLIGSIHEPIQHQTPAELRTHINYNASAITQYNIVPGLLGLVLSMTFVMVSAMALARERERGNWECLLATSLKPLEVMIGKSLPLIVIGYLQVFIILIIAVSFFRIPFLGSLWLFLLIILPFILANLFVGILFSTFAKNQLEASQLSTLFMMPSLLLSGFAFPFKGMPYWAQFIGNLLPLTHFNNIVRGMMLKGIGFHEVMIDLGPILLFMCVSLFLALRFYKQTLD
>NZ_CP020412.2|WP_012978948.1|1427111_1428038_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein
MQVMNEQWIIDVYGLSKQFNGKMAVNELSLQIKQGEIFGFLGSNGSGKTTTIRMLCGLIQPDKGRGTCLGYDVISQAALIKSSLGYVPQTFSLYQDLTVEENLKFIARANNEKNYLNRINEIIGDLNLHPYRNVLAGNLSGGWKQQVSLAAALIHQPRLLLLDEPTSGVDPKTRQAFWSYISYLTTTGITVLVSTHYMDEAEKCNRLAYIVNGELMIQGTLDQMMQQVKLFAFLVEGSNLAHLANELQNKSQVEQVVHWGNSLRVCDSNAFLLKELIDAYPNYQWNAVTANLEEVFIHLVHSKISKGR
>NZ_CP020412.2|WP_012978947.1|1428021_1428867_-|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit
MLRCVFFLLIISLMNCSCSRQPLKQVNGYVEGRYTYIATSVSGRLIRLNVTRGTPVKRGQLLFNLEVEPELKEEQIAHARVKQAQNARDAIIAKLAYAKVTYERNKKLIEIKAIQQSLLDQEKSKYDVLLAQLAQAEDDLSALSLNLKQAQWRLQQNNSVAPIDGMVFDIYYRIGEYTHANQAVLSLLAPEDVKAIFYVNGLDVSALQLGQQISVFNAGHKESYKAQIDYISPSVEFTPPVIYSDQTHEKLTYRIEAKFRTQDAFHVHPGQPVTINYASHE
>NZ_CP020412.2|WP_003632369.1|1428859_1430155_-|LLM-class-flavin-dependent-oxidoreductase
MYDTPFFEDWLITHIADELEVNPDEILIDVPLAQLGLDSQTAITISGNLEILLETRLEPTLLFEYPTIQDLARYLATIKPITPGKKQALDFTLFFFALQDPVEGKYELIKKAVQFADQHGFKAVWIPERHFNAMGGNFPNPSVISAALATMTKQLSLRAGSVVLPLHDPLRVVEEWSVVDQLSQGRVELSFASGWHVDDFVLAPENYEQRKEYLLSQIPIVRQLWKGDAITRVNGHGNSIQVRSFPRPIQRELPVWLTAIGNPDTFRQAAEIDAHILTCLLTQDLTELASKIKLYRNTLARHHFKPKKVSLFLHTFVGESVVEARTSVLEPFRTYLRGTIELLANYSQHGDVALDVNQFSDEQKEELFDFAFERYLQERSLIGDMEQCQTMLNKVKEADVNEVACIIDFGLSSESVLASLERLNQLREANA

Crispr_ID: NZ_CP020412_2

• CRISPR_ID: NZ_CP020412_2
• CRISPR_location: 3857983-3858081
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP020412_2

Consensus_repeat	Method
AATTTTATTTACAAAAGGGTCAAATAC	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP020412_2

>2.1|3858010|45|NZ_CP020412|CRISPRCasFinder
TTTTTTGTCTTCACCCTTAAATATCAAAGTTGCTTTGTTTTTCAC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020412_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP020412_2

>merge|NZ_CP020412|2|3857983-3858081|CRISPRCasFinder
AATTTTATTTACAAAAGGGTCAAATACTTTTTTGTCTTCACCCTTAAATATCAAAGTTGCTTTGTTTTTCACAATTTTATTTACAAAAGGCTCAAATAC

>NZ_CP020412|2|2|3857983-3858081|CRISPRCasFinder
AATTTTATTTACAAAAGGGTCAAATAC	TTTTTTGTCTTCACCCTTAAATATCAAAGTTGCTTTGTTTTTCAC
AATTTTATTTACAAAAGGCTCAAATAC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP020412.2|WP_003635946.1|3852912_3854148_+|MFS-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|340877
NZ_CP020412.2|WP_003635933.1|3845872_3847195_-|polyhydroxyalkanoate-depolymerase	unknown	unknown	gnl|CDD|130908
NZ_CP020412.2|WP_003635934.1|3847387_3847909_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020412.2|WP_003635967.1|3863126_3864797_-|response-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|236842
NZ_CP020412.2|WP_003635973.1|3868081_3869122_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020412.2|WP_003635971.1|3866766_3867963_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020412.2|WP_003635939.1|3849700_3850729_-|HlyD-family-secretion-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224482
NZ_CP020412.2|WP_003635943.1|3852243_3852711_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224439
NZ_CP020412.2|WP_003635931.1|3844106_3845588_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020412.2|WP_003635957.1|3859458_3860403_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|375831
NZ_CP020412.2|WP_003635963.1|3862639_3862954_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020412.2|WP_003635961.1|3861386_3862547_-|acetylornithine-deacetylase	unknown	unknown	gnl|CDD|236039
NZ_CP020412.2|WP_003635937.1|3848787_3849720_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020412.2|WP_003635959.1|3860530_3861283_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020412.2|WP_003635935.1|3847924_3848809_-|FUSC-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379231
NZ_CP020412.2|WP_003635969.1|3865157_3866543_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020412.2|WP_003635975.1|3869212_3870616_-|YdgA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377603
NZ_CP020412.2|WP_003635954.1|3859039_3859276_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020412.2|WP_003635951.1|3855807_3856794_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020412.2|WP_003635941.1|3850780_3852151_-|TolC-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224455

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP020412.2|WP_003635946.1|3852912_3854148_+|MFS-transporter	gnl|CDD|340877	cd17319, MFS_ExuT_GudP_like, Hexuronate transporter, Glucarate transporter, and similar transporters of the Major Facilitator Superfamily. This family is composed of predominantly bacterial transporters for hexuronate (ExuT), glucarate (GudP), galactarate (GarP), and galactonate (DgoT). They mediate the uptake of these compounds into the cell. They belong to the Major Facilitator Superfamily (MFS) of membrane transport proteins, which are thought to function through a single substrate binding site, alternating-access mechanism involving a rocker-switch type of movement.	3.39758e-20
NZ_CP020412.2|WP_003635933.1|3845872_3847195_-|polyhydroxyalkanoate-depolymerase	gnl|CDD|130908	TIGR01849, unnamed_protein_product, polyhydroxyalkanoate depolymerase, intracellular. This model represents an intracellular depolymerase for polyhydroxyalkanoate (PHA), a carbon and energy storing polyester that accumulates in granules in many bacterial species when carbon sources are abundant but other nutrients are limiting. This family is named for PHAs generally, rather than polyhydroxybutyrate (PHB) specificially as in Ralstonia eutropha H16, to avoid overcalling chemical specificity in other species. Note that this family lacks the classic GXSXG lipase motif and instead shows weak similarity to some [Fatty acid and phospholipid metabolism, Degradation].	6.77267e-163
NZ_CP020412.2|WP_003635961.1|3861386_3862547_-|acetylornithine-deacetylase	gnl|CDD|236039	PRK07522, PRK07522, acetylornithine deacetylase; Provisional.	0
NZ_CP020412.2|WP_003635935.1|3847924_3848809_-|FUSC-family-protein	gnl|CDD|379231	pfam13515, FUSC_2, Fusaric acid resistance protein-like.	7.48193e-16
NZ_CP020412.2|WP_003635939.1|3849700_3850729_-|HlyD-family-secretion-protein	gnl|CDD|224482	COG1566, EmrA, Multidrug resistance efflux pump [Defense mechanisms].	3.63524e-47
NZ_CP020412.2|WP_003635967.1|3863126_3864797_-|response-regulator	gnl|CDD|236842	PRK11091, PRK11091, aerobic respiration control sensor protein ArcB; Provisional.	4.44117e-80
NZ_CP020412.2|WP_003635975.1|3869212_3870616_-|YdgA-family-protein	gnl|CDD|377603	pfam06097, DUF945, Bacterial protein of unknown function (DUF945). This family consists of several hypothetical bacterial proteins of unknown function.	1.22278e-81
NZ_CP020412.2|WP_003635943.1|3852243_3852711_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224439	COG1522, Lrp, Transcriptional regulators [Transcription].	3.85138e-45
NZ_CP020412.2|WP_003635941.1|3850780_3852151_-|TolC-family-protein	gnl|CDD|224455	COG1538, TolC, Outer membrane protein [Cell envelope biogenesis, outer membrane / Intracellular trafficking and secretion].	1.49094e-43
NZ_CP020412.2|WP_003635957.1|3859458_3860403_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|375831	pfam18405, Serine_protease, Gammaproteobacterial serine protease. This family includes serine proteases such as L. pneumophila effector Lpg1137. Lpg1137, is a serine protease that targets the mitochondria-associated ER membrane (MAM) and degrades STX17 (syntaxin 17), a SNARE implicated in macroautophagy/autophagy as well as mitochondria dynamics and membrane trafficking in fed cells. Lpg1137 has a sequence (-Gly-Leu-Ser68-Gly-Gly-) that matches the consensus sequence for the active site of serine proteases (Gly-X-Ser-X-Gly/Ala, where X is any residue). It exhibits proteolytic activity toward STX17 in vitro, whereas an active site mutant in which Ser68 is replaced by Ala does not. Expressed Lpg1137 localizes to the MAM and mitochondria, in addition to the cytosol, and binds to STX17.	5.12006e-164

Protein sequences

>NZ_CP020412.2|WP_003635951.1|3855807_3856794_-|hypothetical-protein
MLSRIEKPINLQKQLIILINPTKNDAMGSKLGLFLNHTLARGKALNATNSAIMIIKKEGTNQVEALDVKNYNFFDSELFSKDSPREKKLLIDFQDKMHPLDETASYDEIVIIGSGVPLKGSNTYASINGLRNNFFPSLVTCIKNIIGTHLKDNGHVRVQICHAATKSPIVTSDEMIQEQRPLSECIQVERKNFTIHAPSSYSVISPNDGRAIDVAFKGTSNQFDEFAKHVKKFLNYKNSNDYIRKMTQIFVLENEDKYHYTKIIKNLSIVNPQQEEFLIETAEDKVSFKKNKFGLFAKSASCKKSIPGEPEDAHSASEEMSLSNFFGN
>NZ_CP020412.2|WP_003635946.1|3852912_3854148_+|MFS-transporter
MSASRVVAWFVWVVASIFYAYQYVLRVMPNIMMDDITSQFHIDATVFGQFSGIYYLGYSLMHLPIGIMLDRFGPRKVMTVCILLPVIGLLPLIFADNWIYPLIGRALIGIGSSAAILGTFKIIRMSFKEQYFSRMLSFSVMIGLIGAVYGGGPVSYLSHTLGYKVVVEIFIILGLILACVTYLIVPEEKPTYHSSVFTNVKTVFSNKKVMLLCFFSGLMLGPLEGFSDVWGSGFLKHVYGLEPSVANYLPSMIFIGMCFGSPVLSLIAEKTGYYLGTIITAGIIMCLVFVALVAGTLTVTTITLSFVLVGMCCAYQILAIYKVSTYVPDNLAGLTTAIANMIIMTFGYGFHTVIGVVVNAYGGIRDANAFIYGIGVIPITLALGVTGILVLAYQDKFGTRRSVIKERLSKA
>NZ_CP020412.2|WP_003635943.1|3852243_3852711_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator
MDRIDKKILDILQANCKINNQELADMVALSPSPCLRRVKLLEDHGYIKKEVALLDPEKIGLKLSVIVLVGLDNHQPTVMSHFEEEIRFLPEVIQCYMITGQSADYLLKVIVPDLNAYQTFLLDKLTRINGVSSVQSSFILRTICETTSLPLNHLE
>NZ_CP020412.2|WP_003635941.1|3850780_3852151_-|TolC-family-protein
MLKRISIFLLLIEIVTGCHRNVEQQVSTPLKKFPSSTKAYKPVNNLPYTAWWKQFHDLELNQLIETGLKNNMDIHIAIGNVQQAQGELQQIKLSWIPTLKLFAGYSTNPALGIPGAFYGVWPYYVLNIMQLYTQQKQATYNLQVYQAAVDGMRLALIGQITTAYFTLIAQMEQLRLLQQLDNDLKSLIALSQQDIKIGLVNEIDLAQLQSDEQIIAAQIKPILHNIVFSENALRFLINEIPGRVKNNNNFATLDFTRFKPGSLPATVLNNRPDMKMAEYALKASRIKISVAYSNFFPALQLDDFLGEVSSPHSTFAQSVDTYVNWTIAPSVLGNVAASKGAYHAKVAEFEKTVKRILKEVDTDYSANKRMNEQFVAYAQAEEDYRRKYKLQQGLLKTGLISYKDLLQSKIYLDNLALTTNQAKLELAMSLVALYQDLAGGYAYHLRPKKLQTDSST
>NZ_CP020412.2|WP_003635939.1|3849700_3850729_-|HlyD-family-secretion-protein
MKNFIQFRTKIKKRYTRLKRSITLVNTIIFIGILTTVIYIFSYLFPFTDNAFVVNNVRPVAALTSGYITDLYVQNGDVVKKGQKLFTVFQKPYIYTVEQLTADLASAQAQLAVLKTTYDRDLKLSENEQRNYIKLYQDDQKYRKGYRIKSVSLMTLQNSQQETQAAKDKWQAALKQLEIDKNQIEVQGNEIKSIYARLKNAKVNLELTNVYAQGNGIIQNLFFTIGTPVNINQPLFSLVDTDNVYIQANFNETDLRDVRKGSKVLIFPRMYLSRKVFHGVVESDYWSANRQLVDNRTQLQNVVNENQWILLPQRLPVIIRITDLDPHYPLRVGTSAYVYIKV
>NZ_CP020412.2|WP_003635937.1|3848787_3849720_-|hypothetical-protein
MSISKFKQWLDEVDPYAIQRITLYKSLFIATVEVYVYWLFQPVSFMAFFMPFLLTSLYEAPVLSTFKEKEQLLIFITIVIILISVTFYLVYPFRVIFFFFSVFVLSVTYFCVLRYFYTLKNLTMLLISSGALVLGIDPPANLEVVYGLISSIALSMTFIFICLRIFPNMYLIVWNRALQKFIQYLEKDIDYTINKNDNKPTWEEIMHLGIVRNYTKMLPKKYMMPAYRISVNIRNIQHSLDNLYYETMNEAFWYGIKNNLLWLRLQMHANSPCGLPQFPIKPNTRLQHHVAMCLDHAFSSWNKLCLLKMH
>NZ_CP020412.2|WP_003635935.1|3847924_3848809_-|FUSC-family-protein
MLTQNALKRKLDYARFVHLAIMFMVAMLIYLFSNIPHKWWVLLTVIVISAGIEPGLIVKRAIYRIGGTFAALLILIPLLYLTQFNYRLIPVIFIVAVIGFSVSSINTNRYDISVFFITLIAFFLLAQTTEINSPEGPFVMMLNRGICTLLGVAIVLIGDYFLFQTFHYSQKLYLFHQMMVYNFFNDVVQQITQTSPHRINSSIFVAKLRTQVIKICSPITVSSQNLKLEAKVSPQTIKRIDVFQETIWEIRRVLFALSVSEFVLHSPTTTQKHLQRFNTLMNKAKNNFIYIAEE
>NZ_CP020412.2|WP_003635934.1|3847387_3847909_+|hypothetical-protein
MSRFPNKTHYELRQYFKKLSLEQLKEQNRSYGPHFENLEEKIDKCSQDLAAESKHWQTLKDQKSTHELSYDSVVLSEQEFRQNIESLNDIMDHSERFLARKSVGVSPSELYYQQLSCLENPIQQSNLMIERLANKLEHLTKKKKEAISELKTLNSIIEEKEQLNNVPQVVHRY
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MFFNPLDNRYLYNIYDFNMRLLQPYSDYCENLARRFRRVSDNINLPYKIPYTSDDTQISFRKILEATSSHYRRVAGYAYVFHMITNVYDKPKFDINQIKIDDEYYDIQEEIIDKQSFCNLIRFKKTYADHLNLPKMLLVAPMSGHYATLLRDTVINLLPLYDVYITDWKNARDVPLTEGSFDLDDYIEYMISYFNLLGPNLNVMAVCQPTVPVLAAVALMSTNHSANLPRTAILLGGPIDTSQSPTTVNDLAASRGDDWFQQNVISIVPSRFPGAMRLVYPGFMQLAGFMSMNLQRHMESLQRAVDRYAENQKEAAFKIIKFYLEYFSTMDLTAEFYMQTINTVFQEKLLTTGRYKSRGHNVRLQDIQKTAILAIEGERDDITGVGQTRSVISLCKNLPDSMKKYFLAEEVGHYGLFNGKKFRNIIIPEIHKFTQTYADS
>NZ_CP020412.2|WP_003635931.1|3844106_3845588_-|hypothetical-protein
MQSKYVSERPLIKTLFKQGLTKNKETPIETVSFTDTLQSADEHALSPEHLAPIGPGTTNTWIKKELILSEKTRLKYNVATCTAVDINDLGAKRLTDAYHQIRGLPGFVHRFLHGRPSLERALFVQAPEMYPIFDTPYDDSKTILMTNPAYLDIKKFLSDCEKVSTGYALKQLKNSENGLALVTWYIHPEALPAKFRNTLPAHKVLEYHRNQLIHEADFACKSKKGKQPFDYYRYGQEMTPLQLCGSFSKLPRTVSQDSITTLESRSESIYLACLFDLDQDKKQSLIYLTSLRDNILANLSTVYGVTPQDKIKIYLHMPYLEATTTLHVHVRVNQADHGLEDAKSFGINEIIDTLEKGGSVTDMILSRGTIYCSEYPIGENIEGVCVKTVPNIQRDWKDIFNLLKADKLTIAYLLQALQENAVKSRMQLLDLDQIGELLKIIEEIDEYPSIEELINILKRMEVNAELKKLGWSLETGTCIKQESHKNPPQALLG
>NZ_CP020412.2|WP_003635954.1|3859039_3859276_-|hypothetical-protein
MISFFLKSGCNVIQTATKRSLIDATRSMSTAGIIFGGYYIYNKAASLFTHHHFFNNNSNKIDVKEISEYNNKSSISGS
>NZ_CP020412.2|WP_003635957.1|3859458_3860403_-|hypothetical-protein
MQAKTENNPGNQGLPFSPTPYFLANLGVKTAAISFSVSTLTQPFQAMLTRLQLNAPSGFNGGLFRSMYRGFVPYAIAGQKRGAVSVTAKQANKEVIEEEEIEIPGRQRWLGTFVFSQADLLISNALGGKSKLENAGIITKTNFKWSFANYWKLTGVNWGSRSFAGFVNFSALGFVGDYISSFYKFDNDFYNKLAGGATAGVIATIFTTIPNSYADRKVLATKVENGRLLTVSPFTMFSQAKSHVNSVGMKQALSHFVKVNFLKEVVVRSPMSALTFGIIFGLDDLMGPEPLKRVWPKFKEIDSEKTENNPAKKM
>NZ_CP020412.2|WP_003635959.1|3860530_3861283_-|hypothetical-protein
MKILYIPFHEENDLCIAAIMWKRTLSEENILIIQHGQPINYNALKNAAGTITLYVLAHGIDSLSQPFHLASHSIITSKTSQLDIEKIADRFNSDFVYLHHKINHIKLFFCNNKGNQELIAKRFNDNLILFNSPIDYYAGNITAPWQNKIKYSFFHGIWYKTSNVRKTLYQKIEPMDSDIKLSVKERSMREFLANAKQKRIDAVFQRQCKARQERIIKNRQKYTDKLRLDLKDTVEEATDELSNPNPQYLG
>NZ_CP020412.2|WP_003635961.1|3861386_3862547_-|acetylornithine-deacetylase
MNTIDWLTKLIAFDTTSRNSNLSLVEFLANALNDYQIKPIIIHDRKEPKANLLATIPAYNARFDGGIILSGHTDVVPVDGQDWDSDPFQATIKDDRIYGRGACDMKGFIAVIMSLIPQLKALKLEFPIHLAFSYDEEIGCRGAPHIIDKINALNYRPKACIVGEPTSMQPVTGHKGIHSYRCQIHGVAAHSSLTSQGCNAIEHAASLIRFLRDLANQFKSEGHKDESYDIPYTTISTNLIQGGNAYNTIPNLCEFVFEIRNLALDDSDRINKKIMNFIENELLPSMHQEQPSAQIILENIANAPGLEIQPSEAIVQGAQSICQSQKQSKVAYATEAGLFQNAHIPTIVCGPGSIEQAHRANEFIDLEQLYRCERFVIEMLKLPFLK
>NZ_CP020412.2|WP_003635963.1|3862639_3862954_+|hypothetical-protein
MKKLLLFAISLFMIFSMASYAGKVVIIGNPVILEKQGSVYYLSNRYTVTTSYYYVILDGQRQVCYMEKQPALSALNTKTIDVNYRGSSMTWICYPYDTNYFETP
>NZ_CP020412.2|WP_003635967.1|3863126_3864797_-|response-regulator
MDSKETNELQKIIDEKNNEIHQLTLSLEEERSKFKNELQAIHEYYDNIIALMPGHVYWLDKNNVFLGCNDLQAKNAQLKSRKDIVGKTNFDMPWRDQAEELNKVNQLVMETGIPHTAEEYAVMANGMGIYYSQKVPLRNQKNEVIGVLGISLDITERKKMEVALRRAKENAEVANQAKNEFIANMSHDIHTPLSGIVGMSKLLEEKEQNPERKQYARWIHESGEQLLELLNGVMDIVATDSLREDDVHEELFELRKNIQDIAHLVQPTLQMKKIKLNIEIDEAVPNTIITDATKIHRVLLNLVGNAIKFTDNGSVTIKVEVLSLENNYTQLRFSVIDTGIGIPAELQSKIFDRFFRAIPSYKSTHSGYGVGLHIAQKYLSLLGGEINLESEIGKGSTFYFTLTLKIGYNDKPTSNPITGSDSQKAASPLSPLVLLVEDNILSLHMIENVVEQAGYEFYSAIDGEHALELIETNDFDLIITDTDLSNLSGKNLVLCIRELENQLQKKPIPIIGLTTNTSIEAEKKYLRSGFNKILSKPIHLKVLQSVVNDLFSPKSK
>NZ_CP020412.2|WP_003635969.1|3865157_3866543_+|hypothetical-protein
MPKVRGPRDGKLITASFDGKEKSLFPSLKTTKDLVLLSIRGNEYCTGEYLGAIVQQAVATHQTPIDHSGAKGKATFLIADEIYWHNIKQMISSESEVEILKQEAIKIGADYFLTNLGAFLTPLDMTIEQFNEKYPEKSVDEIITIINQLADEQGKNFEIVRWKTWVAQNDSQEKINKMMGFYDSVEGLKESVIRTQNNFVKRHGKDGDEELWKLRSHDYLIEESPAVMWLAASLGYNFIVYPGEILPPFEATKEFFVVPNHVPRISQGKNIIEECEHNEYSIHTDNPNRLVNWLEVNFKRSHPPKQAGVSVENEVTSVGKSFASVEQPLVSVEKKMSFFSSSPRKKTKVRVLDKQVEDNVTMDLPLSNPNALMLGSALEGIGKALISKHSNGKIQSKSSSILSEAFAGITHEVLSSDLSPSDQVNFLVSILNGVMKGNGQSCTSESDTSILLENTKASFCK
>NZ_CP020412.2|WP_003635971.1|3866766_3867963_-|hypothetical-protein
MISMTAYWQQFKECIESLQMSTEDIEYARQMSTAKNLIETGLIIEKLGLLEIQQVSEQLHEKAKLFQNEICYTTDNHEHRFYLPKITNTQSFIFAIIYYQHLLNYQNVSYQGTINWFRPKVIDGINQKKITTAIQAQALLQEIRQYCQKISLNVDELLFLKKEEESIIEYTSRLIKTFGCQVKSPKTERKAHLPPLDDITTLEKSLEKLNHKWNQLKIKADLIDQKLSAFKHAKQDYFQLKKEWKNKWFFTKAFYWFISLFIEVSEIKNLKAAHEHLTQTQNDLKQELQNHTSKSYCSKLQKQLRKLEHEQTCLKGEITLKKEIQRQKEHKPKFELLTDKKLEKDIVATSDFKENESSYFETSSSNDYYGFFKNNLPSRYTLQAVAVGVAAIAIQNLL
>NZ_CP020412.2|WP_003635973.1|3868081_3869122_-|hypothetical-protein
MNITRDIINKAVEAKIITQKQSEELIAFIRKQPGQNKGFGLTNVLYYLGGLIAIGAMSLFMTLGWELFGGWGILFLCICYAILGLSLSDIFNKKGFIVPAEICATFVVFLTPLAIYGLQKGMGWWPPDDTVFREYNYYIKWHWIFMELGTLAVGIIMAWIYRYPFMIMPIAVTLWYMSMDFTAMLTGGESDFELSEKVSMYFGLIMLLIGFWVDFRSRQSEDYAYWLYLFGVLTFWCGLSAQHSDYELSKFIYLCINLILILIGIILSRKVFTVFGGIGVCLYLGHLAYDIFKDSYFFPIILTLIGLGIIYLGILWQKHEQKMTIAIRKILPKSLQELLQARDQLI
>NZ_CP020412.2|WP_003635975.1|3869212_3870616_-|YdgA-family-protein
MKKWIGYLLSLVVLVLIIYDLMGLMVQNTLGNIINKIPKNPIMTTKIDKFQHGWFSSKALWIFKMHIPAQTITDKNGVPKTEPPLDFEMTLPITIKHGPIIFTNDGIRFGIGTITTQPETHYGAFINYLNRIIIEYNLPSFGTHVKEVSNNEEFQFNWMGLSALLSISSNIDKLDSYLKLYGIDGSGNNSVFKIGEITYSFNSKRIQEWLWIGKSHFNISSISVTSNNQNILDLQEFDFILSSDIKNEALNFYCKLSLQKLLANNQNYSPAILKLSLKNLDPEIMAKLNKQTFNMLQTSDSHLVGLSLATELPKLLSKGSVLELSEMTINLPEGKIVGNFKISLPKTEINDLSKAMQQAHGQGYFKAPTTIVKELMTSSIKSNLSNVSQQIEQTSPTQDVSAQSPANPTSRTPDLDEEAKKQTNQILKKLVEKGFLKIKDKDYVLQFKLENQQLIVNGKLFTPDMLR

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	178688 : 185505	9	Acinetobacter_phage(42.86%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_2	306050 : 368061	44	Escherichia_phage(33.33%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	2702977 : 2760734	49	Moraxella_phage(16.67%)	transposase,integrase,protease	attL 2725879:2725938|attR 2735965:2736031
DBSCAN-SWA_4	2878579 : 2914990	34	Bacillus_phage(25.0%)	transposase,integrase	attL 2867698:2867714|attR 2920167:2920183
DBSCAN-SWA_5	3502188 : 3557959	50	Alteromonas_phage(11.11%)	transposase,tRNA,protease	NA
DBSCAN-SWA_6	3741652 : 3750902	6	Micromonas_pusilla_virus(16.67%)	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP020412|178688:185505|DBSCAN-SWA
ATTATATTCCCTCGATAAGTTGATCTAATGCTTTACCTATGTCTTTAGCCCTCATTAAGCTTTCTCCAACAAGAAATGTGTTTATGCCATGAGACTGCATCAAACGAATATCTGCATGGGTATTAATCCCGCTTTCAGTAATGGTTATTCTATCTTTGGGAATGTAGTGTTTTAAATCAATACTCAACTGTATATTGGTATGAAACGTATGAAGACTTCGGTTATTGACTCCTATTAATGGAGTAGGTAAACGTAAAGCACGTTCGAGTTCTTCTTGAGTATGGCTTTCTACAAGGACGGCCATACCAAGCTCCTGAGCCAATTGGCAAAACTCAATTAACTGAGCATCATCAAGTAAAGCGACAATAAGTAAAATACAGTCAGCACCCAAAGCTAAGCTTTCATATATTTGATAGGTATCAAGAATAAAATCTTTACGCAATACTGGCAAGTTACAATGCATTTTCGCTTGAGCTAAATAATCTGGATGACCTTGGAAAAAGTCGATATCAGTAAGTACTGAAAGACACCGTGCTCCATGTAGCGCATATATTTTTGTGATTTCTACTACATTAAAATCTTCTCGAATGATCCCTTTACTGGGGGACGCTCGTTTAATTTCTGCGATAATAGCTGGTGATTCTTGAGCTTGTAAAGCACCACAAAAATTTCTTTGCTCCATTAATGGTTGTTGTTTTAATGAATCTAAAGGCCTTTTTTTCTTGGCCAAACTAATTTCTTCTAATTTTTTGTGAGTAATACGCTGTAGTACACTATTCATGATTTGATTCTTTATTTAAAGTTTGAGTTAATTGGCGGAGTCGTGTAAAGCATTGCTTCGCTTTGCCGCTATCTATGGCGAGTTTAGCGTGTTCTAATGCTTGTTCAAAAGATAATTCATTCCCAGCACAATAAATGGCGGCCGCCGAGTTTAAGAGTACTATATCTCGTGGAGCTCCTAATTTTCCGGAAAATACCGCTTGGATATAGTCTAAACTTTGCTCAGGTGAATCAATAATGATTTCATTTAATGAATGATGATTGATCCCATAATCTGTAGGATTAAGAATCCAGTGATTAAATCTTCCTTCTCGATATTCAACGATATTTGTAGGGGCAGCGATACTAATTTCATCCAAGCCATCCTGGGAACTAACTACTAATGCCCTTTCGCTCCCTAAACGAGCAAGAACAGAAGCTAAGGGCTTTTGCCAAAATCCTGAAAAAACCCCTACTACTTGCTTTTTTACTCGAGCAGGGTTAATTAATGGGCCGAGTAAGTTAAATAAAGTTCTAATTCCTAATTGTTGACGTGCTGCTCGAGCATATTGCATCGCAGGATGGTAATGAGGGGCAAATAAAAATGCTAATCCACATTGGTTCATGCACATTTGCATTTGTTCATCTGTAAGATTGAGTTCAAATCCTGCTTTTTCTAATAAATCGGCGCTTCCACTACGACTGGAGACTGAGCGATTACCATGTTTAGCGACAGGAAATCCCGCACTTGCGACGACAAAACTACAAGCAGTGGATACATTAAACGTGTTTTTTCCGTCTCCACCAGTGCCTACTATGTCAATTAAATTTGTACCTAATTCAATATGGTGCGCTAATTGTTGCATTACTTCTGCTGCAGCAATTAACTCATCAGTAGTTTCAACTTTCATACGCATGAGCGCTAAAAAAGTAGCAATCTGGACATCGCTATATTCACCAGACATACAAGCATGAAGAACATCGTGAACTTGTTCAGTGCTTAAATTCTTTTTTGCGATTAGCTGTTCAAATAGAAGATTATGTTTCATATGTTAAAAAATTTTCTAATAGTTTTAGACCATGCTGGCTTAATATTGCTTCTGGATGGAATTGTAGACCAAAAATGGGATATTGACGATGTGAAATTGCCATAATGGTATTATCTGCCCATGCATCAATGGAGAAACAATCTGGCAGACTGTCCTTATCAACCGCTAGGGAATGATAACGAGTTGCTTTGAATTGATTCGGGATATTTGTAAATATCTTTTGTTGATTATGTATAATGGTCGATGTTTTTCCATGCATTATTTCAGGAGCGGATATAATTTTACCGCCAAAAACCTCTGCAATGCATTGATGCCCAAGGCAAATTCCTAATATTGGGATATCTTGATAAAAATTATAAATTACTTCCATTGAAATACCGGCATCCTTGGGGGCTTTGGGTCCAGGAGAAATCACTAAGTAGCCTGGTTTAAGCTTCCTTATTTGCGACAAAGTAATTTGATCATGGGTGAAAACAATCACCTCTTGGTTTAAGCATTGAAAATATTGTACTAGATTGTAAGTAAATGAGTCGTAATTATCGATGATGAGTAACATATTAAATTAAAATTTGGTATAAGAATCGTATTTTAAAGTAGTCGCTTTATATATCCGAATTGTGTTGCGCTACACCCCGAATTTTCTTTCAGTCCGTGAGATCCAACTATAGTATGGAGCAAGAGCATCTTTTGTTTCAATTTTGTGAACAATTCTCGAAAACCAACTGCTGGCCTTTAATGAGCAAGATTTTCTTAGGGTTATTCACCTACATTTCATTTATAGAGTAAAGTCATCACCTAAATAAACAGCCCTTACTTGTTGGTTAGCCAATATAATATCAGGTGTTCCTTCACACAATATTTTTCCTTGGCTAACAATATAGGCGCGTTCACAGATATCTAATGTTTCTCTAACATTATGATCAGTGATGAGTACCCCAATGCCTTTATTACATAAATGTTGAATAATTTTTTTGATATCAATTACTGAAATGGGATCAACTCCAGCAAAAGGCTCATCAAGTAAAATAAAAGAAGGCTCTATGGCTAAAGCTCTAGCAATTTCAACCCGTCGCCGCTCTCCTCCTGATAAAGACATACCTAGACTTTTGTCTAGATGGGAAATATGAAACTCTTGAAGCAAGAGGTCAAGCTTTTCTTGTCGAGCTTGTTCACTTAAATCAGCTCTTAATTCTAATATAGCCATAATATTTTCAGCAACAGTAAGCTTACGGAATACAGAAGCCTCTTGGGGAAGGTAGCTGATTCCTAATCGGGCTCGTTGATGCATGGCACTTGATGTAATATCCTTTTCAGACAAGAAAATTTTCCCTTCATCACATGCTTGTAGTCCTACTATCATATAAAAGCAAGTCGTTTTTCCTGCACCATTGGGTCCTAGCAAACCAACACATTCGCCTTTGTTTATGTGAAGGGTAACTCCATCAACCACTGTGCGTGATTTAAACGATTTTTTGAGGTTTTGTGCTTCTAGAATACTCATGATGGTTTCTTTTCTGGATGATAAATAATCATTATTCTTTTGCTGCCATCGCCCTGAGATAAAACATGTTGCTTTTCAGTATCATAACTTATTTTGGTTGCAGAGAATGAGTTATTCCCTTGTTCAACTCGAGCATTTCCTATTAATTCAATTAAATGACGTAAGGGATAATAACGTATGGTATCAGCATATGCATGCAGTGGGGGTTTCTTTGGATCCGTCGTTGTCCAATAATGAGCTTGTTGTCCAGGAGCCCCACTTGCGATGGCTACAACAAGTTGATTCTTTTCATTACCTAAAGTGATAGCTTTTGTTGCCCGTAGATTCGTTGTCCCTTGTATGAGTTCAACATTACCCGTATAAATACCTTTATGTTGTTGTTGGCTCAAATCTGCTGAGTCGGCCATTACATGCATGACTTTTTCTTTATCTTCTGACAATGCATATGAAGAACAAGCAAATGTTAAAAAAAACCATAAGCAGAACCACAATTTAAAATACTGATGTGACGCACTGTATCTAACCATTTGCTGGAACATAACTTCCTCGGGCTCGATGAAGTAACTCTACTCGTTTTTCATCCAGATAAGCATTCATTCCAGTAGATTGAACGATGTTACCTGATTGTTCATAAGTTACTAAAACATTGGAAATTGCTTTCTTTTCTTTTGGGAAGTAGGTGACTTCCTCTGTTTTTAAGGTACTTTCCTGGGATTTATTACCTTTATTTTGATGTACAATCACGTTACCAAGGAACGTAACTTGTTTCCCTCCATCAATCGATTTGCCTTTTTCTGAACGAATATCCCAAGGTGCTTGTTCGTCCTCGCTTACAATAATATGAGGATTTTCAAATAAATAAACATTACCTTTTTGAATATGTTGCAAGAGGGGTGCGGTTAATAAATTGGCTAGGGTACCTTTTTGATTAAACTGACGCACTGTTACGTGAGAGATTGTCGTATCTACTGAATTTGCCAAAGTTTCATGATCCAGGCGAATTAATGTTGTAGAATGGCTGTAATACCAGCCTGAACAAGCTAGAAGAATTAATGTAAAAAAAAGCCACATAAATTGTTTTGCTGCGTTCATTGTTTTAAATAACCTGATATGGCTAAATCCATTTTGCCCTGTGCATTAAGAATAAAGTCGCATAATTCACGTACAGCCCCACGACCGCCTGGTAAACTAGTTTGCCACATGGCAATTTCTTTAGCTAAATAAGTTGCATCGGCAACAGCAACACTAAGACCTACTTGTTGCATAATTGGTATGTCTGGAATATCGTCACCTATGTAAGCGAATTGTTCATCTTTAAGGCTTAAGGCTATTTTGAGTTGATTGTAAGCTTCTGTTTTATCTATTTTATCTTTGTAATAATGAAAAATACCTAGTTGTTGCATGCGATGATCAACTAACGGATTATGAGAGCCAGTGATAACAGCGACTTCAATGCCGATTGCCATAAGTAATTTTAAGCCAACGCCATCATGAATATGAAATGTTTTCTGCTCATTACAATGAGTATCAATATATAAAAAACCATCGGTGAGTACACCATCGAGATCACAGATGAGGCATTTTATATTTTTCGCTTTTTCTATTAACTGGATCATTAAAAAATACCTGCTTTTAACAAATCATGAAGATGAATCACGGCAGCAGGCCTTGTTTCTTCATCAATTACAATCAGTGATGTTATACTGTATTTTTGCATCATAGCTAAGGCTTCAGCAGCAAGCATTCCCTTGTAAATAGTGCGTGCATTACGCGTCATTACTTCTTTAATTGGAGTAGTGTTAATATCGTATTGATGTGTTAAAGTCCGTCGAATGTCCCCATCCGTATAGATACCAGTAAGGTATCCTTTATTATCAATAACACAAGTCATACCTAGTTTTTTTTCGGTTACTTCGATAAGCGCTTCACTAACAGTTGCATTTTCATGAACAAGCGGCAACTGTTCCCCTTGGTGACAGAGCTCGTCAATACGTAATAAAAGCCGTTTGCCCAAAGAGCCTCCCGGATGAGATAAAGCAAAATCCTCTTCACTGAACCCTCGAGCCTGCAACAGCGCAATAGCTAGTGCATCCCCCATCACCAGTGCCACTGTGGTGCTTGTTGTGGGGGCCAGCCCAAGCGGACATGCCTCTTGTTTAATACCGACATCTAAATTAACGTCTGATGCTTTTGCTAAAGCAGATTCAGGATTACCAGTTAAGGTGATAAGAGGTATTTCCAAGCGCTTTAATAAAGGAAGTAAGGTAACCAACTCTGCGGTATTGCCTGAGTGGGAGATGGCGATTACTGTGTCTTGCCGAGTAATCATTCCCAGATCACCATGGCTTGCCTCACCTGGGTGCATAAAAAAAGAAGGACTGCCTGTACTTGATAAAGTAGCAGCAATTTTATTGGCTATATGTCCTGATTTCCCCATGCCAGTTACAACGATCCGTCCTTTACAGGCAAGCAGTAATTCACAGGCCTTTTCAAATCGGTTATCAATTCTTTGGGTTAATTCAAAGACGGCTTGTGCTTCAGTCTCAATAACGGCAAGCCCTAATTTACAAAAATTCATAAGCTTATTTATTGTTTTTTTGTCTAATTTTGATTCTATCAAAAAAACATTTGAATAAATAGAATTAAATAGCTCATTTTTTTTTGTGATCCAGTATATACTCCTACTTTTGGCTAAACTGGAAAAATAGAGAATGCCTGAAAATTGGGTTGAAATAAAGAATTTAATTTTTACTCGTGAAAAGCGTCGCATCTTCGATGGCATTAATATGAAAGTTAAACGAGGTAATATTACCGCGATTATGGGGCCGAGTGGTTCTGGAAAGACGACCTTATTGCAGCTCATTGGTGCACAGTTGAAGCCCGATAGTGGTGTTATTCATGTAAATGACCAAAATATGCACCAATTGCCTCGCAAAGCTCTATATGAAGCAAGGCGTAATATGGGGCTTCTTTTTCAAAGCTCTGCTTTATTTACCCATCTATCAGTATTTGATAATGTTGCTTTTCCTTTACGGGAACACACGCAATTAAATGCATCCATGTTACGAAATATTGTATTAATGAAACTTGAGGCTGTTGGCCTACGTGGAGCTGTTGATTTAATGCCGGCCCAGTTGTCTGGCGGAATGGCAAGACGTGTTGCTTTAGCACGCACAATTGCTTTGGACCCAGAGCTTATGATGTACGATGAGCCTTTTACTGGACAAGATCCTATTTCACTGGGTGTTCTGGTTCGGCTCATTAAAAGACTAAATGAATTGCTGCATACGACAACCATCATTGTTTCTCATGATGTAGAAGAAACGTGTTCTATTGCTGATTATATCTACCTTATATTTGGTGGAAAAATTATAGGAGAAGGAACCCCACAGGAGTTATTAAAATCTACCGAACCTCAGGTGAAGCAATTTATGCATGGGGAAGCAGATGGAGTAGTGCGTTTTCATTATCCTGCCAGACCTTATACAGAGGAGCTATTAGATGTTTGA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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MLLIIDNYDSFTYNLVQYFQCLNQEVIVFTHDQITLSQIRKLKPGYLVISPGPKAPKDAGISMEVIYNFYQDIPILGICLGHQCIAEVFGGKIISAPEIMHGKTSTIIHNQQKIFTNIPNQFKATRYHSLAVDKDSLPDCFSIDAWADNTIMAISHRQYPIFGLQFHPEAILSQHGLKLLENFLTYET
>NZ_CP020412|178688:185505|183084_183612_-|WP_003636736.1|DBSCAN-SWA
MIQLIEKAKNIKCLICDLDGVLTDGFLYIDTHCNEQKTFHIHDGVGLKLLMAIGIEVAVITGSHNPLVDHRMQQLGIFHYYKDKIDKTEAYNQLKIALSLKDEQFAYIGDDIPDIPIMQQVGLSVAVADATYLAKEIAMWQTSLPGGRGAVRELCDFILNAQGKMDLAISGYLKQ
>NZ_CP020412|178688:185505|179460_180495_-|WP_003636725.1|DBSCAN-SWA
MKHNLLFEQLIAKKNLSTEQVHDVLHACMSGEYSDVQIATFLALMRMKVETTDELIAAAEVMQQLAHHIELGTNLIDIVGTGGDGKNTFNVSTACSFVVASAGFPVAKHGNRSVSSRSGSADLLEKAGFELNLTDEQMQMCMNQCGLAFLFAPHYHPAMQYARAARQQLGIRTLFNLLGPLINPARVKKQVVGVFSGFWQKPLASVLARLGSERALVVSSQDGLDEISIAAPTNIVEYREGRFNHWILNPTDYGINHHSLNEIIIDSPEQSLDYIQAVFSGKLGAPRDIVLLNSAAAIYCAGNELSFEQALEHAKLAIDSGKAKQCFTRLRQLTQTLNKESNHE
>NZ_CP020412|178688:185505|181270_181996_-|WP_003636730.1|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP020412|178688:185505|181992_182535_-|WP_003636733.1|DBSCAN-SWA
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MNSVLQRITHKKLEEISLAKKKRPLDSLKQQPLMEQRNFCGALQAQESPAIIAEIKRASPSKGIIREDFNVVEITKIYALHGARCLSVLTDIDFFQGHPDYLAQAKMHCNLPVLRKDFILDTYQIYESLALGADCILLIVALLDDAQLIEFCQLAQELGMAVLVESHTQEELERALRLPTPLIGVNNRSLHTFHTNIQLSIDLKHYIPKDRITITESGINTHADIRLMQSHGINTFLVGESLMRAKDIGKALDQLIEGI
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MPENWVEIKNLIFTREKRRIFDGINMKVKRGNITAIMGPSGSGKTTLLQLIGAQLKPDSGVIHVNDQNMHQLPRKALYEARRNMGLLFQSSALFTHLSVFDNVAFPLREHTQLNASMLRNIVLMKLEAVGLRGAVDLMPAQLSGGMARRVALARTIALDPELMMYDEPFTGQDPISLGVLVRLIKRLNELLHTTTIIVSHDVEETCSIADYIYLIFGGKIIGEGTPQELLKSTEPQVKQFMHGEADGVVRFHYPARPYTEELLDV
>NZ_CP020412|178688:185505|182515_183088_-|WP_003636734.1|DBSCAN-SWA
MNAAKQFMWLFFTLILLACSGWYYSHSTTLIRLDHETLANSVDTTISHVTVRQFNQKGTLANLLTAPLLQHIQKGNVYLFENPHIIVSEDEQAPWDIRSEKGKSIDGGKQVTFLGNVIVHQNKGNKSQESTLKTEEVTYFPKEKKAISNVLVTYEQSGNIVQSTGMNAYLDEKRVELLHRARGSYVPANG
>NZ_CP020412|178688:185505|183611_184574_-|WP_003636738.1|DBSCAN-SWA
MNFCKLGLAVIETEAQAVFELTQRIDNRFEKACELLLACKGRIVVTGMGKSGHIANKIAATLSSTGSPSFFMHPGEASHGDLGMITRQDTVIAISHSGNTAELVTLLPLLKRLEIPLITLTGNPESALAKASDVNLDVGIKQEACPLGLAPTTSTTVALVMGDALAIALLQARGFSEEDFALSHPGGSLGKRLLLRIDELCHQGEQLPLVHENATVSEALIEVTEKKLGMTCVIDNKGYLTGIYTDGDIRRTLTHQYDINTTPIKEVMTRNARTIYKGMLAAEALAMMQKYSITSLIVIDEETRPAAVIHLHDLLKAGIF

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_003636724.1|178688_179468_-	indole-3-glycerol phosphate synthase TrpC	A0A0P0IR83	Acinetobacter_phage	5.1e-58	52.0
WP_003636725.1|179460_180495_-	anthranilate phosphoribosyltransferase	A0A0N7IRD9	Acinetobacter_phage	4.6e-75	45.9
WP_003636726.1|180484_181051_-	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	1.5e-56	53.2
WP_003636730.1|181270_181996_-	LPS export ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	7.3e-19	26.0
WP_003636733.1|181992_182535_-	lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA	NA	NA	NA	NA
WP_003636734.1|182515_183088_-	LPS export ABC transporter periplasmic protein LptC	NA	NA	NA	NA
WP_003636736.1|183084_183612_-	HAD-IIIA family hydrolase	A0A140XBD6	Dickeya_phage	1.4e-24	47.1
WP_003636738.1|183611_184574_-	KpsF/GutQ family sugar-phosphate isomerase	A0A2P0VNK5	Tetraselmis_virus	4.2e-38	32.1
WP_003636739.1|184707_185505_+	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	7.1e-23	34.2

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP020412|306050:368061|DBSCAN-SWA
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MKMPLKEPLSAKYLHISPANIVHVFMPIVSGTNIGLDNTCKAVYALQEFFGKGSNSNPKASLKVELLAYKEALESDISLLGADSSLLSQQKQERLTQIDGYLDVLASMEKHPELNCLNSGFPRYPRPLEDLMQNRTNSNLYSMVLRPTEEDGFLRSEAANPIFSVAHKSVLRQRETSKSELQQSLIKAYTPLTFEAKDSKSQVMAQVLAQLKQPHVPVQFEHLRELLHHTVQALLNVDVDFSKTQQGKPIHQQEMNEAMEFNSQTTTPNEYMDALFGYCAGNLFDTVIESPFNYLTQVEQWSVATQFLLGITNIYAVSQDIISTSTNFGKILDSRPDLSKSLAETLATAQKEHDCIEAIALSWTNAYATEMQLNTAFTHDDLKAIKEIFAKRYAEIKDSPHFDEFFLLDTKKKGHFVIHQGAICTNFAEFASSPLLGVPKELIQPLDKVQHDAKNLSVNIPHKNYLIKDALVIDTTTLNHTQLQTLYERINTSKDPKLKEELLAQLKHERPDFKTKLDFLQQVAYGEQNEAEQLLQKDVEAAQELLTARNIPFTDYSGRTFTCTAYEYAYWAKDTHMCRMLEKYMNDQTKQIILKQVQNIEELIGDTLFKYPRGLAYTQKEIKYQSAHFDLAPLKKALQTYIDAYNNPQKDWNALDALWIQIGLLQREVPAHIAQEYCHPNRSFDDVVKNNALLDASKPANLVRQLKFYNLVTKENDVWFTPRRSSQDSGLGFSFAILRQAGSVIGLGGQLAWLGEWVRGVDDLAAIKAIDKARTEDLKQSLANLAAPSNLQNSDRFLI
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MEKTAHHSKTRAHHYISQCYLKGFSILDNQFIIPIDIKDQRVSPPSNSKNIGQERDFNRVDFEGIALNYLEDALGHDFEGNVATALRNIENTNRFEGEDRSYIINLMALFAIRNPTRRNHYNNFIEDAGKLGLSMAAQNVGMRVNEHLVTEDLKKAIDEDQYRIILSRNEHIKAELNLFNEILPYFFSRKWILIRAPDDAQFITSDFPVVLFWTNPAKHKHSPGFGLLGTEVHFPLSKKIALIGSFDGINGSQMESRETVALINSNILAHVKRWIFASSQDFYFLNQKGECLYGIQKYWKYLAEL
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MDKSNENKETFSYPLLDCLVILTILSHRPLSADVLRAGLPLENNRLTPALFIRAAERVGFSARVVKRSLSHISKLVLPVVLLLKNDQACILNKIIDSETVELILSDHGGGVQQKSVDDLEENYTGQAIFIAPVFKYETRSEAKPTERIDKLSWFWSTLSRYRYIYIQVILAAFLVNIFNLVMPLFIMNVYNRVIPNNANVTLWVLVIGVLMIHFFDFILRLLRGYLIDVSGKKADVVMASTLFQQAMSIRLMNKPNSVGAFVNNLREFEVLRDFFTSATLTTIIDLPFVILFFVLIAYCLFRKLACTDSTYYSAAYFARCIYS
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MEWNKEKIQILLQQHPLFSELQLDIIEQLAEQAQIRTLEPSQFLFKQGALDEDAFYLILSGETEVLQEKTTSVVLNVLKPGVVLGENAFWGERERLASIRAKTKSEYLVLLCHVVQHLLEKNYSSVTSFIRKLHAQTLKHLVDMNQSYEKSLEDQREAGYFIVSLVSFLSIYSVATPILQELATKIPTTYISTGLIIVGMLFLVTRMTYVGMPLSHIGITRSNLKKSLLQSFFLSLAIIALLIVLKMFLLYIAHLFGDKLSFYKSVQKNQLFYTYPERMFDKYGLVLSNADVIFFAVLYTIHAFFQELLARGSLQGMFTRFLPYKNNTVPSIVLASLIFSAAHVYHSTWAVGAVFVPGLLMGWLYSKQQNIFGVSLFHIMIGLGFFLFIG
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MIEIDYTLLSEEALDNLLIDIITRQGTDYGEYEQNIQVKKKQLLHNLQSGKAIITYSSKENTCDIINQEDFLNFSKKLDNKMCDS
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MSHIWIVIIDLAWPISLFIAWIFGEIGFRCAKIPHISVYAMIGFILAPTQIGLLPKVETSSILFLANIGFGLILFESGYRINLRWFFNNLWILATSFAEATLTFVFIYFVAKYYGLNQSTSLLLAALSTATSPATIIRMIHEQHSSGQVTERILHLSVLNSIFAVFLFKVIIGLVIFRNSGDLWQAMSSSLIVLLLSTGLGMLFGVILPTLLKNFKNTYSDNTLPFTIALILLVAITHYFKLSPLLATLTFGIVSRHGRFVFNSSQRGFGTIGDLLTVLLFVFIAAKIDWHLVKNGWVIGLSIILVRQLAKIVGIGVFAYFSGISLKKGLLTGVAMAPISVFVILILEQSRYIGLNLVETLAPLAMVAISLEVIGPIMVQYSFYFAKEIQ
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MRHSASSVTLSQVQAINLLASKLMQQYSQTKASNIKAWTNNWTQLTDAHLFPEFFLNGVIIMVLFTLFTSATK

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_012979202.1|307581_308034_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003636891.1|308507_308957_-	cupin domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_012979201.1|309536_309821_-	nitrile hydratase subunit beta	NA	NA	NA	NA
WP_003636895.1|310252_313387_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003636897.1|314191_314884_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_012979200.1|314954_316931_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003636900.1|317479_317680_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003636902.1|317713_319483_-	zeta toxin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003636903.1|319816_320989_+	cyclic nucleotide-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003636907.1|321851_325166_-	ankyrin repeat domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_172622908.1|325728_327861_+	S9 family peptidase	A0A1V0SHT0	Klosneuvirus	5.1e-76	33.6
WP_003636911.1|328667_331886_-	chitobiase/beta-hexosaminidase C-terminal domain-containing protein	A0A0N9RV52	Escherichia_phage	6.2e-09	40.2
WP_125461269.1|332950_333313_-	M28 family peptidase	NA	NA	NA	NA
WP_035905115.1|333340_333748_-	M20/M25/M40 family metallo-hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_003636913.1|333791_333986_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003636915.1|334099_334312_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_003636916.1|334324_334489_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
WP_003636918.1|335187_335607_-	TIGR03792 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003636919.1|335997_336936_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080619715.1|337275_338562_+	H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA	NA	NA	NA	NA
WP_080619716.1|338643_339690_+	mechanosensitive ion channel family protein	NA	NA	NA	NA
WP_080619717.1|340378_341551_+	cation:proton antiporter	NA	NA	NA	NA
WP_080619718.1|341569_342682_+	glutamate--cysteine ligase	NA	NA	NA	NA
WP_080619719.1|343122_343983_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_080619720.1|344370_344877_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_125461270.1|345182_345404_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080619721.1|346055_347027_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_165391559.1|346917_348258_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	F2Y1V5	Organic_Lake_phycodnavirus	8.0e-19	28.3
WP_080619723.1|348260_349325_+	HlyD family efflux transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
WP_165391560.1|349333_349504_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_125461271.1|349735_353047_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080619725.1|353900_354620_+	endonuclease	NA	NA	NA	NA
WP_165391561.1|355084_356002_-	DUF4238 domain-containing protein	A0A0F7LBR6	Escherichia_phage	3.7e-44	35.0
WP_080619728.1|356667_357000_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080619729.1|357570_358698_-	DUF4424 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_080619730.1|361034_361952_+	bifunctional helix-turn-helix transcriptional regulator/GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_080619968.1|362069_362327_-	YheU family protein	NA	NA	NA	NA
WP_080619731.1|362390_363296_-	DNA polymerase III subunit epsilon	A0A223W0B0	Agrobacterium_phage	1.4e-30	37.1
WP_080619732.1|364423_366823_-	SidC	NA	NA	NA	NA
WP_105166017.1|367235_367673_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_080619734.1|367743_368061_-|transposase	transposase	A0A218MNC9	uncultured_virus	6.0e-10	39.6

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP020412|2702977:2760734|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

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MKITKSAVDKLPLPVSTTQGRTAQKRYYDEVMKGFGIRVTSGGTKAFFVEKLIKNKLSRITLGRYPELTVEMARKEAQKLLGKIATGIDPVAEKRAEKMRQITLNDVFNDYIQVRKSLKHNTLYKYKKVLATGFAGWVNKPLLAITKDSVAKHHKKLGKEHGEAYANLAMRLLRALFNFAAGQYEDTQGKSLITENPVKRLSQTRAWYRVERRQSFIKAHELAAWYLGVQQLQSEVLRDYLLLIILTGLRRQEGATLRWDQIDLNAKTLTVLDTKNHESHTLSLSSYLYELLLSRSQKRINEYVFPGTGAAGHIIEPRKQMANVTKLSGIHFTVHDLRRTFITIAEGLDISAYALKRLMNHKMNGDITAGYIVTDVERLRKPMQQITDYFLKCMGVQPSAILIAIQPQEVVHE
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MCIVTLLQELASTTHHKINLDKLLKEKNADIQQVFANNDASYLKALFNETEILADRTTIFDL
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MMDEIEKEHFKEQLEQKGLSTVEEGLAQGIYGDAKGKRAIAENWVKTKKQEQNISHKQQALSLQQESNKIARLALWISGVALLVSILVAIFK
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MEHIILILGSYNNDQGELSHIATSRLMKGPIVPCIFYMSANKLLFCLGMIGWFSRLQANGLLAECRPLYLQGT

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_012979546.1|2709166_2709892_-	aspartate/glutamate racemase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_012979545.1|2709897_2710533_-	flavin reductase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_012979544.1|2710501_2711563_-	TauD/TfdA family dioxygenase	NA	NA	NA	NA
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WP_012979542.1|2713233_2714454_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_012979541.1|2714456_2715242_-	uroporphyrinogen III methylase	NA	NA	NA	NA
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WP_012979538.1|2717310_2723376_+	ankyrin repeat domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_080619847.1|2724491_2724650_-	IS66 family insertion sequence element accessory protein TnpB	NA	NA	NA	NA
WP_041819201.1|2724720_2725743_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
2725879:2725938	attL	NA	NA	NA	NA
WP_080619848.1|2726174_2726384_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_105166058.1|2726700_2726961_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_080619852.1|2729318_2729531_+	AlpA family phage regulatory protein	NA	NA	NA	NA
WP_165391546.1|2730705_2732154_+	DNA primase	Q9T217	Streptomyces_phage	9.2e-21	27.1
WP_105166101.1|2733117_2733600_-	hypothetical protein	A0A2K8HN72	Pseudomonas_phage	1.3e-16	36.7
WP_080619856.1|2733841_2734066_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080619857.1|2734085_2734793_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080619858.1|2735022_2735316_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_080619859.1|2735541_2735820_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003634054.1|2736208_2737387_-	pyridoxal phosphate-dependent aminotransferase	NA	NA	NA	NA
2735965:2736031	attR	NA	NA	NA	NA
WP_003634056.1|2737418_2739410_+	excinuclease ABC subunit UvrB	NA	NA	NA	NA
WP_003634060.1|2739714_2740269_+	thioredoxin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003634063.1|2740404_2741373_+	polyprenyl synthetase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003634067.1|2741749_2743870_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_003634071.1|2745548_2746949_+	saccharopine dehydrogenase NADP-binding domain-containing protein	B2ZXX8	Ralstonia_phage	6.0e-94	40.0
WP_003634073.1|2746997_2748569_-	FMN-binding glutamate synthase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003634075.1|2748650_2748974_-	cell division protein ZapA	NA	NA	NA	NA
WP_003634077.1|2749105_2749681_+	UPF0149 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003634079.1|2749697_2751005_+	Xaa-Pro aminopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_003634083.1|2750997_2752227_+	2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase	NA	NA	NA	NA
WP_003634086.1|2752223_2753396_+	FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_003634088.1|2753458_2753623_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003634092.1|2754211_2755822_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_003634105.1|2760227_2760734_-|protease	ATP-dependent zinc protease	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP020412|2878579:2914990|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_165391541.1|2908375_2908648_+|transposase	transposase	A0A0N9SHJ4	Paenibacillus_phage	1.0e-13	41.0
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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

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MAIKLIIGLRNPGPAYEHTRHNAGQWLISALAQRYSIFFKLEKKMQAELVDLELNQHLYKLALPTTFMNHSGQPTRLISQFYRIQPNEILIVHDELDLPAGRIKLKTGGGHGGHNGLRDIIAQLGSAEFHRMRIGIGHPGHKDLVHQFVLSKPTAQERQLTYDAIDRGIAVMPFIFSGDFAKAMNQLNA
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MMQSIKKRMAEVKSIHELNTLLKNYFWSISIKSFAFTYYNQHTKTGSKLVYEWATTPLDAWHKYYLQEGYADIDRTLEATEQSLLPIFWDVKEQLRLAKNKRMRRFKQESLIFGLDKGLCIPLHGPKGEFVILVLHQRINEHGLKNWENHVDTWLGILHTYFHFLRLLLNEKKIGVVPLTKREQECLRLTAEGFRLELIAQLLKISKRTVNFHLQNANKKLGVTNKYLAIMALWNHDPRVNHNKPNKI
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MTKKDKWSQNVTLKSHALDLEKGVFTWKDPKKIANSLILSAENSTRRKGSIYQSAMSMLSFYINRAGKKLHQEQKDILNKAKDELRKLKEMNNL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_003635333.1|3502947_3504345_+	ankyrin repeat domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003635335.1|3504442_3505066_+	LysE family translocator	NA	NA	NA	NA
WP_003635337.1|3505142_3506267_+	DSD1 family PLP-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_003635342.1|3506336_3507473_+|protease	FtsH protease activity modulator HflK	NA	NA	NA	NA
WP_003635344.1|3507475_3508390_+|protease	protease modulator HflC	R4VJU7	Alteromonas_phage	1.5e-05	26.3
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WP_012979356.1|3511950_3512679_+	branched-chain amino acid ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_003635352.1|3512838_3513504_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_012979355.1|3513635_3514211_-	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_003635356.1|3514324_3515167_-|protease	zinc metalloprotease HtpX	NA	NA	NA	NA
WP_003635359.1|3515356_3516709_-	S41 family peptidase	A0A0R6PIZ1	Moraxella_phage	3.6e-19	26.3
WP_012979354.1|3516799_3518023_-	peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003635363.1|3518015_3519557_-	2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase	NA	NA	NA	NA
WP_003635368.1|3519929_3520688_+	isoprenyl transferase	R9W0U9	Flavobacterium_phage	2.0e-22	40.3
WP_003635370.1|3520716_3521499_+	phosphatidate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_003635371.1|3521662_3523015_+|protease	RIP metalloprotease RseP	NA	NA	NA	NA
WP_003635373.1|3523149_3525462_+	outer membrane protein assembly factor BamA	NA	NA	NA	NA
WP_003635375.1|3525629_3526130_+	OmpH family outer membrane protein	NA	NA	NA	NA
WP_003635377.1|3526144_3527188_+	UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)glucosamine N-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_003635379.1|3527343_3527796_+	3-hydroxyacyl-ACP dehydratase FabZ	NA	NA	NA	NA
WP_003635381.1|3527792_3528563_+	acyl-ACP--UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_003635384.1|3528755_3530042_+|tRNA	serine--tRNA ligase	A0A1B1IVT2	uncultured_Mediterranean_phage	1.6e-96	46.2
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WP_012979352.1|3531184_3532789_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003635390.1|3532923_3533421_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_003635391.1|3533719_3534004_+	DUF3175 domain-containing protein	A0A0F6TH17	Sinorhizobium_phage	4.7e-22	66.3
WP_003635393.1|3534181_3534409_+	ChaB family protein	A5IZT6	Spodoptera_litura_granulovirus	1.3e-09	42.7
WP_003635395.1|3534578_3535427_-	GntR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_012979350.1|3535850_3536525_+	M15 family metallopeptidase	NA	NA	NA	NA
WP_003635401.1|3536995_3537619_+	pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003635403.1|3537848_3539018_-	tetracycline destructase Tet(56)	NA	NA	NA	NA
WP_003635408.1|3539263_3539476_-	ORF6N domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_012979349.1|3539818_3540565_-	LuxR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_003635412.1|3540818_3542672_-	peptidase M4 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003635416.1|3543728_3546491_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_012979348.1|3546980_3548612_-	ankyrin repeat domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_080619950.1|3548907_3549177_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_003635421.1|3549285_3550254_-	polyprenyl synthetase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_003635422.1|3550332_3551424_-	redox-regulated ATPase YchF	NA	NA	NA	NA
WP_012979347.1|3551480_3552050_-|tRNA	aminoacyl-tRNA hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_003635425.1|3552208_3552865_-	50S ribosomal protein L25/general stress protein Ctc	NA	NA	NA	NA
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WP_003635429.1|3553381_3553660_+	50S ribosomal protein L27	NA	NA	NA	NA
WP_003635431.1|3553829_3554855_+	GTPase ObgE	NA	NA	NA	NA
WP_003635433.1|3555140_3555647_+	translesion error-prone DNA polymerase V autoproteolytic subunit	A0A2H4J538	uncultured_Caudovirales_phage	3.9e-27	41.9
WP_085956292.1|3555839_3556907_+	DNA polymerase IV	A0A290GHP0	Caldibacillus_phage	1.6e-14	32.2
WP_172622929.1|3557133_3557574_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_003635442.1|3557632_3557959_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP020412|3741652:3750902|DBSCAN-SWA
AATGGCAAAGATTATAGGAATAGACTTGGGTACCACCAACTCATGCGTTGCTGTGATGGAAGGTGATAAACCTAAAGTAATTGAAAATAGTGAAGGTCACCGTACGACCCCTTCCATCGTTGCATTTACAGATGATGGTGAGGTATTAGTTGGGCAATCTGCGAAGCGCCAGGCAGTGACCAATCCAGATAATACTTTGTTTGCAATTAAACGATTAATTGGCCGTCGTTTTGATGATGCGGTTGTTCAAAAAGATATCAAAATGGTTCCTTACAAGATTGTCAAGGCAGATAATGGTGATGCGTGGGTTTGCGTGAAAAATCAAGATAAAGCGCCACCGCAGATTTCTGCTGAAGTATTGAGTAAGATGAAGAAGACAGCAGAAGACTATCTGGGTGAAGAAGTTAAAGAAGCGGTGATTACCGTACCTGCTTACTTTAATGATTCACAACGCCAAGCAACTAAAGATGCTGGTCGTATCGCTGGTCTTGAAGTAAAACGTATCATTAACGAGCCTACTGCTGCAGCTCTTGCTTATGGTATGGACAAAAAGCGTGGCGATTCAGTCATTGCTGTATATGACCTTGGTGGTGGTACTTTTGATGTTTCTATCATTGAAATTGCTGAAGTTGATGGTGAACACCAATTTGAAGTATTAGCTACTAATGGTGATACTTTCTTAGGAGGTGAGGATTTTGATTTGGCATTGATTGATTACCTTGCTTCTGAATTCAAAAAAGATTCAGGCATCGATTTACATAGTGATCCATTAGCATTGCAACGGCTCAAAGATGCTGCTGAAAAGGCTAAAATTGAACTTTCTTCGTCACAGCAAACGGATGTTAACTTGCCTTATATTACGGCAGATGCTTCTGGACCAAAACATTTAAATATTAAGTTGACCCGTGCTAAATTAGAATCTTTAGTCGAAAAACTGGTTGAACGTACCATAGAACCTTGTAAAACTGCACTAAAAGATGCAGGTTTAACCGTGTCACAAATTAATGAAGTTATTTTAGTTGGTGGTCAAACACGTATGCCTTTAGTTCAAAAAACAGTAGAAGAGTTTTTTGGTAAAGAGCCACGTAAAGACGTGAATCCAGATGAAGCTGTTGCTGTAGGTGCTGCGATTCAAGCCGCAGTATTATCTGGTGAAGTGAAAGATATTTTATTGCTTGACGTTACTCCTTTGTCTTTAGGTATTGAAACGATGGGTGGTATTATGACTAAACTCATTGAAAAAAATACTACTATCCCAACCAAAACAGCACAAGTATTCTCTACTGCGGATGACAATCAAACAGCGGTTACTGTACACGTGCTACAAGGGGAAAGAGAGCAAGCGTCAGCGAATAAATCTTTAGGACGATTCGATTTAAGTGATATTCCTGCTGCGCCACGTGGGGTTCCGCAAATTGAGGTTACTTTTGATATCGATGCAAATGGTATTCTTAATGTTTCTGCAAAAGATAAAGCTACAGGTAAGGCTCAATCAATTGTCATTAAAGCATCTAGTGGTTTGAGCGATGAAGAAGTTGATGCCATGATTAAAGATGCTAAATCGCACGCAGAAGAAGATAAAAAATTTAAGGAAATGGCGGATCTTCGTAATCAGGCAGATAGCTTAATCCACAGTTGTGAAAAATCTATGAAAGATCTAGCAACAGAGCTTACTGATGATGAGAAAAAAGGTATAGAAACTGCTATTGCTGAATTAAAAGAAGCAATTCAGGGTACAGATAAAGCAAAAATTGAAGACAAATTAAAAGTGTTAAGTGATGCATCTGCAAAAATGGCTGAACGAGTTTATGCTAAAAAAGCATCTGAAGGACAGGCAGGGCAAGGACAAGCACATCAGGAACAGGCACAAACACAAGCACATGAATCAGCCAAAACGGATGAAAGTGTTGTCGATGCTGAGTTTGAGGAAGTAAAAGACGATAAGAAGTAATTGGTTCTAACGTACTATATGATAGCCTGGGTATTCTATCCTAGTTGAAGCAAAACGTAACTTGAGAAATGAATGCTCATTTCTTGGGTTACGTTACTGTTCGTGGCCATTATGTTAAGAGCAATTTTTTTCCCGTACAGGCGAGATCCCATTTTCTTATAGTACATTGTGCTAACATTTATAAATGGGCTCCCGTTTTGCCGCGGGAACAATTTTAACATAATGATAGAGACTTTATTGTTTCATACTGTTAGAAAAATCTAGACTATGAAGCCTATTAATTTTTAAATTTTGTGAGTGGTTATGGAAAAGCGGGATTATTATGAACTTTTAGAAGTAAGTCGAACTGCCAGTGATGCCGAAATTAAAAAAGCATATCGCAAGTTGGCAATGAAGTATCACCCAGATCGTAATCCTGGCGATTCTGAAGCAGAAGAAAAATTTAAAGAAATTCAAAGCGCTTACAGTGTTTTATCCGATCCACAAAAGCGAGCTGCTTATGACCAGTTCGGTCATGCGGGTGTTGATCCTTCTATGCGAGGTGGTCCTGGCGGCTTTGGAGGATTTGGTGGTTTTGGTGATGTCTTCGAAGATATTTTTGAAAATATTTTTTCAGGTGGACGAGCCTCAGGTCGACAATCACGTGGCCAACGTGGTGCGGATTTGCAATTTAATGTGCAATTAACTTTAGAAGAGGCTGCTTTAGGTAAAGAAGTACAAATTACTGTTCCAAGACATGGTACTTGTACTGTATGCAATGGTTCTGGTGCAAAAGCAGGAACTCAACCAAAGACATGCGAAACATGTAATGGAGTCGGACAGGTAAGAATCCAGCAAGGTTTTTTCTCCATTCAACAAACTTGTCCTCATTGTCATGGAGAAGGAAAAACTATTTCTGATCCATGCTCAAGTTGCCATGGTCAAGGTCGAATCCGTGAAAGTAAAAAACTTACCGTCAAAATTCCACCGGGTGTTGATAATGGTGATAGAGTACGCTTAAGTGGTGAAGGTGAGGCTGGAATGCATGGAGGTGGACCAGGTGATCTTTATGTACAGGTTAGTATAAAAAAACATACCATATTTGAACGACATGAAAATGATTTGCATTGTGAAGTGCCAATAAGTTTCATCACCGCAGCTTTGGGAGGCTCTATAGAAGTTCCTACGCTTGAAGGACGAGTCACGCTAAAGATTCCTCAAGAAACGCAAACGAGTAAGGTATTTCGCTTAAGGGGTAAAGGAATGAAATCTGTACGCGGACATGGCCAAGGCGATTTATTATGTAAAGTAGTTGTAGAAACTCCCGTAAATTTATCCCGTGAGCAAAAAGAATTATTAACAAAATTCCATGAATCACTTGAGAATGCTAAAGGAAATCATTCTCCACGCTCTAATTCCTGGTTTGCTGGTGTGAAAAAGTTCTTTGAAGACATGAAATTTTAAAATAAGTAAGTTACAATTGCTGGCATTTATCTTTATGTGCATTTTTTGAGCTTGAGTGATTAGCATCGATTTGATGATGTAATCTGTCACTCAGGCTGAAATTAAAAGTCATTATAAACAACTTAGAGTAGATCCATGATGAACCAACCAGCAATTTTAGCATTAGCCGATGGCACTATTTATAAAGGTATTTCAATAGGGGCGTCAGGTGATTGTGTTGGCGAGTTGGTTTTTAATACATCGCTAACTGGTTACCAAGAGATGCTTACTGATCCCTCGTATGCACGACAAATCATCACTTTAACTACAGCTCATATCGGAAATACAGGATGCAATCATGAGGATATGGAATCTAATAAGGTTTGGGCCTCAGGTTTAGTCATCCGTAATGCATCTATACTTCACAGCAATTACCGTGCTGAACAATCGCTACAAGATTGGCTCAAAAAAAATGGAGTGGTAGGAATTGCAGATATTGACACCCGTGATTTGACCTTGCGTTTGCGTGAAAAGGGAGCATTGGGGGCTTGTATAAGTACTGATGTCGACAATCCTGAATTGGTTTTGACAAAGGCCAAATCATTTTCTGGTTTACAAGGTGTGGATTTGGCACTTGAAGTTTCCAGAAAAACAATAGAGCGTTGGCATGTTGGTTTGGGTGAATGGGGAAAAAATTCTCAACCACAACAATTTCATGTGGTTGCTTATGATTTTGGCGTCAAGCACAACATTTTACGTATCTTATATGACAAAGGCTGTCATTTGACTTTAGTGCCTGCTAGAACCTCAGCAGCTGAAGTTATGGCAATGGATCCTGATGGTATATTCTTATCGAATGGTCCTGGTGATCCACAAGCTTGTGATTATGCTATTCGTGCAACTCAAGAATTTTTAGAACACAATATACCCTTATTTGGTATCTGTCTTGGTTTTCAAATTTTAGCTTTAGCATGTGGCGGTGTGACTAAAAAAATGAAATTTGGCCATCACGGTGCAAATCATCCTGTTATTGAAACCGAAGGTAAAAAGCGTGTCTTTATAACCAGCCAAAATCATGGTTTTGCAGTGGATGAAGAGAGTTTGCCAGATTGTCTTGCCATAACCCATCGTTCTTTATTTGATAATACATTACAAGGTATTAGACATAAAGAGAAGCCTGCTTTAGGTTTCCAAGGACATCCAGAGGCTAGCCCTGGCCCACATGATATAGAAATAATATTTAATGAATTTATTCAGCTAATGAGCTAAAAGTGGCTGTCCTTTTGTTTCATCACGATTCTAAGTGTGATCTGTGGAAAGTGGATAGGGATCTGGAAAGCCAATGATATACGAATACAAATTTAAAGAGGATTAACAATGAATGAAAGTCATGTCTTTACTTCAGAATCGGTTTCCGAGGGACATCCGGACAAGATAGCTGATCAAATTTCTGATGCAATTCTAGATGCTATTTTAATGCAAGATCCAAATGCACGGGTGGCATGCGAGGTTTTTGTTAAAACAGGTATGGTATTGGTTGGTGGTGAAATCACTACTAAAGCATGGGTAGATGTAGAGGCAGTCACACGACAAGTAGTTAAAGATATAGGTTATAACAGCTCACAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

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>NZ_CP020412|3741652:3750902|3743905_3745045_+|WP_003635761.1|DBSCAN-SWA
MEKRDYYELLEVSRTASDAEIKKAYRKLAMKYHPDRNPGDSEAEEKFKEIQSAYSVLSDPQKRAAYDQFGHAGVDPSMRGGPGGFGGFGGFGDVFEDIFENIFSGGRASGRQSRGQRGADLQFNVQLTLEEAALGKEVQITVPRHGTCTVCNGSGAKAGTQPKTCETCNGVGQVRIQQGFFSIQQTCPHCHGEGKTISDPCSSCHGQGRIRESKKLTVKIPPGVDNGDRVRLSGEGEAGMHGGGPGDLYVQVSIKKHTIFERHENDLHCEVPISFITAALGGSIEVPTLEGRVTLKIPQETQTSKVFRLRGKGMKSVRGHGQGDLLCKVVVETPVNLSREQKELLTKFHESLENAKGNHSPRSNSWFAGVKKFFEDMKF
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MMNQPAILALADGTIYKGISIGASGDCVGELVFNTSLTGYQEMLTDPSYARQIITLTTAHIGNTGCNHEDMESNKVWASGLVIRNASILHSNYRAEQSLQDWLKKNGVVGIADIDTRDLTLRLREKGALGACISTDVDNPELVLTKAKSFSGLQGVDLALEVSRKTIERWHVGLGEWGKNSQPQQFHVVAYDFGVKHNILRILYDKGCHLTLVPARTSAAEVMAMDPDGIFLSNGPGDPQACDYAIRATQEFLEHNIPLFGICLGFQILALACGGVTKKMKFGHHGANHPVIETEGKKRVFITSQNHGFAVDEESLPDCLAITHRSLFDNTLQGIRHKEKPALGFQGHPEASPGPHDIEIIFNEFIQLMS
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MLKLGILSLGLLSIAHNALATSAHDSVRVIIKYKEQITSVSSLKSQIKQSTQLPVKQLNPMANGAYLLILDATNSAFSKEMDNEDTTSLVLERLRKNPQVLYAVKDRVSYFKPVPDPEILDAGNILSHEIQWDEFSRPAGIMLESKPGSRDGAWFYTTGLSKEPVVVAVLDTGIALNENLINNLVKDDAGNIWGWNFAGNNNNLMDETRSYHGTHVAGTIAGYGHVMSGMGEDLKILPLKIPGSNGMFYESSVINAIYWAVGGDVPGVPKNIHPAKILNMSFGVDKGPNEEIDYCDQALQEAVFFARDNGAVLAVAAGNDNVWEHFNAPAICNGTIKVASTGPEGLRSYFSNYGPSVTLAAPGGDKRYGLWGGILSTVNPGGGYGGSGFDFYQGTSMATPHVAGVAGLILAASNKELGSEQIEQLLYMTTHDFGVSSDSNKSCVGKKPCGHGILDAENAVKAAAAGYDLLFSSPKIESLTMQNCGKNSLTPGKSRVVLKGVTWILDNTACESMDSFQKPHIEQTKNGSIIAHYGSVSYRLDQRAYKECHVIGYDGVGCYL
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MNESHVFTSESVSEGHPDKIADQISDAILDAILMQDPNARVACEVFVKTGMVLVGGEITTKAWVDVEAVTRQVVKDIGYNSSQMGFDWESCAVLSAIGKQSPDIAQGVDNKETKILGAGDQGLMFGYASRETDVYMPAPIAYAHRLMEKQSYLRKSGALPWLRPDAKCQLTLKYEHGIPVEVDTVVFSTQHAAEISHNDLIEAVREEIINTTLPVEWLTRRTRYFINPTGRFVIGGPLGDCGLTGRKIIVDTYGGMARHGGGCFSGKDPSKVDRSAAYAARHVAKNIVAAGLADKCELQISYAIGVAEPTSIFVETFGTGRLKDNEIIELVNTHFDLTPQGIIEYHDLLRPIYRQTATYGHYGRETFPWERLDKVAELRKAL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_003635760.1|3741652_3743602_+	molecular chaperone DnaK	G8DDB7	Micromonas_pusilla_virus	1.5e-146	49.4
WP_003635761.1|3743905_3745045_+	molecular chaperone DnaJ	E3T4P7	Cafeteria_roenbergensis_virus	5.7e-26	36.7
WP_003635762.1|3745180_3746293_+	glutamine-hydrolyzing carbamoyl-phosphate synthase small subunit	R4TGJ8	Halovirus	1.7e-51	35.3
WP_003635763.1|3746401_3747550_+	methionine adenosyltransferase	A0A2H4PQS6	Staphylococcus_phage	2.6e-127	59.2
WP_003635764.1|3747560_3748886_+	adenosylhomocysteinase	S4VPF6	Pandoravirus	2.8e-48	31.9
WP_003635765.1|3749219_3750902_+	S8 family serine peptidase	A0A1B0T6A2	Bacillus_phage	1.3e-18	29.1