Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020411 | Haemophilus influenzae strain FDAARGOS_199 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas3,DEDDh,DinG | 0 | 0 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP020411_1 | 329903-329995 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP020411_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP020411_1
>1.1|329933|33|NZ_CP020411|CRISPRCasFinder TCTTTGAGCCTCTTTTTGTCACTTTGTGATACC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020411_1
The CRISPR arrays of NZ_CP020411_1 >merge|NZ_CP020411|1|329903-329995|CRISPRCasFinder TTCCCCCGCAAGCAGGGGAAGGCAAGATTTTCTTTGAGCCTCTTTTTGTCACTTTGTGATACCTTCCCCCGCAAGCAGGGGAAGGCAAGATTT >NZ_CP020411|1|1|329903-329995|CRISPRCasFinder TTCCCCCGCAAGCAGGGGAAGGCAAGATTT TCTTTGAGCCTCTTTTTGTCACTTTGTGATACC TTCCCCCGCAAGCAGGGGAAGGCAAGATTT
>NZ_CP020411.2|WP_005654382.1|329182_329818_-|endonuclease-III MNKTKRIEILTRLREQNPHPTTELQYNSPFELLIAVILSAQATDKGVNKATEKLFPVANTPQAILDLGLDGLKSYIKTIGLFNSKAENIIKTCRDLIEKHNGEVPENREALEALAGVGRKTANVVLNTAFGHPTIAVDTHIFRVCNRTNFAAGKDVVKVEEKLLKVVPNEFKVDVHHWLILHGRYTCIARKPRCGSCIIEDLCEYKEKVEF >NZ_CP020411.2|WP_005694179.1|327751_329125_-|sodium-dependent-transporter MTTNNKQRQTWSSRLTYVMTVAGATVGFGATWRFPYLVGENGGGAYVLLFCIAMIVIGIPMILVENVIGRRLRVNSIDAFGDKILDKGKGISKYWKILGYMGLLGAFGIMAYYMVLGGWVISYIISLISGTLDISTPITKDIAKNFYDLHIGNSPYEIIFYTLLFVIVNYIILAKGIIGGIERSVKYLMPLLFIFLIGMVIRNVTLPGAMEGITFYLKPDFSKITPQLFIFVLGQVFFALSLGFGVLITLSSYLNKEENLIHTAVITGFTNTIIAVLAGFMIFPSLFTFGIEPNAGPTLVFQSLPIVFSHLWAGKFFAIIFFGLLLIAALTTSITIYEVIITALQEKLRMCRGKAIVLTLSGIFLLGNIPAILGDNLWKNVTIFGKSIFDFYDYASGNILFMLTALGCAIFVGFVLKDEAKKELSSTKYSTFIKIWFNYVKFVVPLIILVIFISNLF >NZ_CP020411.2|WP_005694180.1|326672_327728_+|molybdenum-ABC-transporter-ATP-binding-protein-ModC MLQINVKKQLGQLALQANIQVPDQGVTAIFGLSGSGKTSLINLVSGLIQPDEGFICLNDRTLVDMESQESLPTHLRKIGYVFQDARLFPHYTVKGNLRYGMKNVSQDDFNYIVDLLGITHLLKRYPLTLSGGEKQRVAIGRALLTDPDILLMDEPLSALDVPRKRELMQYLERLSKEINIPILYVTHSLDELLRLADRVVLMENGIVKAYDRVEKIWNSPIFAPWKGESEQSSVLALPVHLHNPPYKMTALSLGEQVLWIHQVPANVGERVRVCIYSSDVSITLQKPEQTSIRNILRGKITQIEIQDSRVDLAVLVEGHKIWASISKWAQNELRFAIGQDVYVQIKAVSVM >NZ_CP020411.2|WP_005654374.1|325957_326686_+|molybdate-ABC-transporter-permease-subunit MLTQFFSFFNLTPMEISAINLSLSVAVSSMLWSLPLAIFVAWLLARKNFYGKSLITGVIHLPLVLPPVVIGYLLLVAMGRNGFIGKYLYQWFGLSFGFSWKGAVLSSAVVAFPLVVRAIRLSLENIDIKLEQAAQTLGASAWRVFFTITLPLSLPGVLAGLVLGFARSLGEFGATITFVSNIAGETQTIPLAMYSFIQTPGAEEQTARLCLFAIILSLISLLLSEWLSKRMQKKLGQGNVAD >NZ_CP020411.2|WP_005694182.1|325058_325823_+|molybdate-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLTKISTALLIAGLGFSFAASAKVTVFAAASMTDALQQVAKDYAKQNPKNEVVFSFASSSTLAKQVEEGAPADIFVSASNKWMKYLSEKDLTVKETEKVLVGNDLVLIAPAKSAVNSVDIAKGEWINALKDSYLSVGDPAHVPAGQYAEEALTKLNLWDKVKDRLARGKDVRGALALVERAEAPYGIVYSTDAKVSQQVKTVAVFPADSHKPVVYPVSIVKGHDNADSRDFLKYLESDAAKKVLVGYGFSAK >NZ_CP020411.2|WP_005694183.1|324153_324921_-|TOBE-domain-containing-protein MKNTEILLTIKLQQALFIDPKRVRLLKEIQQCGSINQAAKNAKVSYKSAWDHLEAMNKISPRPLLERNTGGKNGGGTALTTYAERLLQLYDLLERTQEHAFHILQDESVPLDSLLTATARFSLQSSARNQFFGRVAQQRIIDSRCVVDVNVQGLPTPLQVSITTKSSARLKLITEKEVMLMFKAPWVKISEQPLANQPNQFPVNIKSLNEEEAILQFAESNIEFCATVHQPNQWQIEQQVWIHIDQEQIILATLG >NZ_CP020411.2|WP_005694184.1|323241_324045_+|lipooligosaccharide-biosynthesis-galactosyltransferase-LsgF MKFSVLMSLYIKENPQFLRECFESLVAQTRQADEIVLVFDGVVTPELEFVVTEFETKLPLKLVKLPQNRGLGKALNEGLLHCDYDWVFRMDTDDICVPDRFEKQVAFIEQHPESIIFGGQIAEFGKNVNDIVAYRNVPTSAQEIIKFTQKRCPFNHMTVAYQKSAVINCGGYEDLQEDYYLWIKLVAQGLYMANLPDILVYARVGNGMVSRRRGVNQAKAEWRLFKLKYRLGIQGLLSGLFTFALRFGSRLLPTSLLKKLYQTFLRK >NZ_CP020411.2|WP_005694185.1|322355_323240_+|lipooligosaccharide-biosynthesis-N-acetyl-glucosamine-transferase-LsgE MLSIIVPSYNRKAEVPALLESLTQQTSSNFEVIIVDDCSKERVVVEQSYSFPVTVIRNETNQGAAESRNVGARTSKGDWLLFLDDDDCFMPEKCEKVLQVIEQNPNINFIYHPAKCEMVNEGFTYVTQPIEPQEISTERILLANKIGGMPMIAIKKEMFLKIGGLSTALRSLEDYDFLLKLLQEPSFTPYKINEPLTYCTFHTKRSSVSTDTTNTQKAIDYIREHYVKTVEQARNFDINASYILAYPHIMNLSRKAAKYYFDIFKKTKSIKQFIITLVILISPKLAINLKRLGK >NZ_CP020411.2|WP_005694186.1|321570_322344_+|lipooligosaccharide-biosynthesis-galactosyltransferase-LsgD MLKKYLISLDKDIQRRELFFSQKNTEDFQVFSAINTMQKDWDELAAIFNIEQFKAHYFRNVTKGEIGCTLSHLSVYQKIVEDNDIAEDSYALVCEDDALFHSDFQQNLTALLSEKLEAEIILLGQSKINDFNDFDLEINYPTTFSFLCKKTGDVNYAFPYKSYFAGTVGYLIKKSAARRFIQQISQNKPFWLADDFLLFEQNFNIRNKVVRPLIVIENPVLISNLESVRGSLSNNLLKKLMKYPLKKIFAIKKNLAN >NZ_CP020411.2|WP_005694187.1|320497_321559_+|lipooligosaccharide-biosynthesis-family-4-glycosyltransferase-LsgC MKKIGFFIMNIGSAGGTERVSINVANALAKQGYDVSFISIGGNKPFFQVDEKINIYAMNKLPYSLKKDYFSITKKLRELVKELQLDTLIVVDGAIMLFSALALVNLNIKHILWEHYSFNFTGNRLVRTLGKYLAVTTCDKIVTLTEAEKTLWQEKFKTNNIISIANPNTLLPKNKLAKLENKTILSVGHLFSYKGFDYLLKVWQVLAKKYPDWNLKIVGSGEEEENLKNLAKALDIEDSVNFIPRTNDVSFYYESSSIYCLPSQTEGLPLVVIEAMAFGLPIVAFNCSPGVKQLVEHKENGFLCEQNNIEEMVKGLDLLINNPELYLQMSDKSRLMSEDYGIEKIIEEWKGIL >NZ_CP020411.2|WP_005658208.1|330002_330710_-|electron-transport-complex-subunit-E MTDLTEKNTALEEEKIESAVENQQKSIWKEIFAQGIWKNNPAVVQLLGLCPLLAVSSTATNALGLGLATMLVLTCTNTVISLFRQYIPKEIRIPIYVMIIATTVTAVQLLMNAYTYTLYQSLGIFIPLIVTNCIIIGRAEAFASKNSLLHSIWDGFSMGLGMALSLTILGALREIIGQGTIFEGIENLFGEQAKFLTHHIYHTDSSFLLFILPPGAFIGLGLLLAIKNRIDNIKK >NZ_CP020411.2|WP_005694178.1|330711_331335_-|electron-transport-complex-subunit-RsxG MGTVKITSRYGILLGFIALLCTIISAGIFFLTKDKIDAVIAAQQRELLLQVIPQDYFNNNLLESAVIPQDKNFVGIQKIYFAKKDGNVSAYAYETTAPDGYSGDIRLLVGLDPKGEVLGVRVIEHHETPGLGDKIERRISNWILGFTNQSINEHNLSEWAVKKDGGKFDQFSGATITPRAVVNQTKRSALIMLNNQALLQQLSTQVK >NZ_CP020411.2|WP_005694177.1|331334_332411_-|electron-transport-complex-subunit-RsxD MFKMVSSPHTHSGKLTAHIMLWAILAMMPAFFTQIYYFGFGVVLQSALAIGTAIIAEFIAIKLRGKKPLNYLSDFSVALTALILAMAIPPYAPYWIIIIGTLCAVLLGKQVYGGLGQNPFNPAMIGYVILLISFPLQMTTWMPPINLLQEPPTFSDAFSLIFSGLTTDGFTLSQLTHNIDGITQATPLDSAKIFYKSHTQLNDFYELIKLPIFMGNGTDFAQGWWQINVAFLAGGIFLILKRVIHWQIPVAMLVTFFCLATATAFTGFTHLSAISQLVSGAMMFGAFFIATDPVTASITPRGKIIFGALVGLFVYLIRYHGNYPDGVAFAILLSNICVPLIDHYTRPRVSGYPTKGRK >NZ_CP020411.2|WP_010869271.1|332415_334875_-|electron-transport-complex-subunit-RsxC MADVLSRFNSGKLWDFKGGIHPPEMKSQSNSQPLRHLPLGTDFYIPLKQHLGTTGNLLIKEGDYVLKGQALTKGDGLRMLPVHAPTSGTIKSIKPYVATHPSGLDEPTIHLQADGLDQWIERNPIDDFSTLSSEQLIHKIYQAGIAGLGGAVFPTAAKIQSAEQKVKLLIINGAECEPYITCDDRLMRERADEIIKGIRILRYILHPEKVVIAIEDNKPEAISAIRNALQGANDISIRVIPTKYPSGATKQLIYLLTGIEVPSGERSSSIGVLMQNVGTMFAIKRAIINDEPLIERVVTLTGNKIAEKGNYWVRLGTPISQILSDAGYQFDKHFPIFAGGPMMGLELPNLNAPVTKLVNCLLAPDYLEYAEPEAEQACIRCSSCSDACPVNLMPQQLYWFARSEDHKKSEEYALKDCIECGICAYVCPSHIPLIQYFRQEKAKIWQIKEKQKKSDEAKIRFEAKQARMEREEQERKARSQRAAQARREELAQTKGEDPVKAALERLKAKKANETESTQIKTLTSEKGEVLPDNTDLMAQRKARRLARQQAASQVENQEQQTQPTNAKKAAVAAALARAKAKKLAQANSTSEAISNSQTAENQVEKTKSAVEKTQENSTALDPKKAAVAAAIARAKAKKLAQTNSTSEAISNSQTAENEVEKTKSAVEKTEENSTALDAKKAAIAAAIARAKAKKLAQANSASEAISNSQTAENEVEKTKSAVEKTQQNSTALDPKKAAVAAAIARAKAKKLAQANSTSEAISNSQTAENEVEKTKSAVEKTQENSTALDPKKAAVAAAIARAKAKKLAKTQATLENNQE >NZ_CP020411.2|WP_005650033.1|334875_335457_-|electron-transport-complex-subunit-RsxB MTFLFIVITLLALIFGAILGFASIKLKVEADPVVEKIDAILPQSQCGQCGYPGCKPYAEAICNGDEITKCIPGGQTTIVKIAEILGVDVPTMEGIEEPIEKVAFIDENMCIGCTKCIQACPVDAIIGTNKAMHTIIPDLCTGCELCVAPCPTDCILMIPVKKNIDNWDWKFDAKLVIPVMNVDGSEKKLVVGE >NZ_CP020411.2|WP_005694403.1|335544_336123_-|electron-transport-complex-subunit-RsxA MTHYILLIIGTALINNFVLVKFLGLCPFMGVSKKIETAVGMGLATMFVLTVASLCAYLVDHYILIPLNATFLRTLVFILVIAVVVQFTEMAINKTSPTLYRLLGIFLPLITTNCAVLGVALLNVNLAHNLTESVVYGFGASLGFSLVLVLFAALRERLVAADIPATFRGSSIALITAGLMSLAFMGFTGLVK >NZ_CP020411.2|WP_005694402.1|336404_337466_-|protease-SohB MLNDILTGYGIFILEILTILLLILAVVGLIISYRQHNKSKVGELEIKDLSEEFNEQVRLLRDFNLSEEEQKQRTKAEKKAEKQNAKKRKEKLKKGETLEDEKKACVYVLDFCGDISASETTALREEISAILNVAKSEDEVLLRLESPGGIVHNYGFAASQLSRLKQKGIKLTVAVDKVAASGGYMMACVADKIVSAPFAVIGSIGVVAQIPNVHRLLKKHDVDVDVMTAGEFKRTVTVLGENTEKGKQKFQQELEETHKLFKQFVSQNRPCLDIDKIATGEHWFGQQAIALQLVDEISTSDDLILEKMKEKQVLNVKYRLKKSLIKKFGRQAEESAINIIHRYSTKQSRDFMY >NZ_CP020411.2|WP_005654151.1|337663_338329_+|DUF2057-domain-containing-protein 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
438079 : 530339
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP020411|438079:530339|DBSCAN-SWA ATTACATTTTTTCTACGGTTTTAATACCGAGTAACGTTAAACCCTGTTTTAAGGTTTTTTCCGTTAATAATGCTAATTTCAAACGACTTAATTTTATAGATTCATCTTCAGCATTTAAAATTGGACAATGTTCGTAGAATGACGAGAAGATGCCAGCAAGTTCATATAAATAAGCACAAAGCACGTGCGGCGTGCCTTCTTTTCCGACAGTTTGCACGGCTTCTTCAAATTGTAGAAGTTTAATAGCAAGCGTTCTTTCTTTATCATCTTTAATAGTTAAAGGTGCAGCCAAAAGTGCGGTTGAATTTATATCTGTTTTATTAAAGATCGAACGAATACGGGTGTAGGCATATTGCATATAAGGTGCCGTGTTACCTTCGAAACTTAACATATTATCCCAATCAAAAACGTAATCAGTAGTACGGTTTTTGGAGAGATCGGCATATTTCACCGCACCAATACCGACAGCCTCAATCACAGCTTCTTTTTCATCATTAGATAAATTGGTATTTTTTTCATTAATTAATACAGTGGCGCGTTCAATGGCTTCATCTAATAGATCGGCCAATTTCACTGTGCCGCCAGTACGGGTTTTAAATGGTTTGCCATCTTTACCAAGCATCATCCCAAAGTTTTTATGCTCTAACGAGAAACTATCTGGTACATAACCTGCTTTACGAGTAATTAACCAAGCTTGTTGCATATGTTGGCTTTGGCGAGTATCTGAAAAAACAAGGGCGCGATTAGCTTTTAATGTTTCATAACGATATTTTGCTGCAGCAATATCGGTTGTAGTATAAAGGAAACCGCCGTCTTTTTTTTGAACGATTACACCCATTGGGTCGCCATCTTTATTTTTAAATTCATCTAAATAAACAACCAATGCACCATCATTTTCCACAGCCAAACCTTGTTTTTTAAGATCTTTTACAATGCTTGGTAACATAGGATTATAAAGACTTTCGCCCATTACATCTTTTTCGGTTAAAGTCACGTTTAAGCGAGCATAGTTGTGCTGATTTTGTTGCATAGTGATATCGACTAAACGTTTCCACATCGTTCGACAATATTCATCTCCACTTTGTAATTTCACAACATAATTACGCGCTTTTTCTGCGAATACTTCATCTTCATCGTAGTGTTTTTTGGCTTCGCGATAAAAGGCTTCAAGATCTTGTAATTCCATTTCACTCGCATGCTCGTTTTGCATTTTTTCAAGATAAGCAATAAGCATTCCGAATTGCGTTCCCCAGTCGCCTACGTGGTTAGCTCGGATGACATTGTGACCTAAAAACTCAAGGGTTCTGGCTACAGCATCGCCGATTATCGTAGAGCGTAAATGACCTACGTGCATTTCTTTTGCTACGTTTGGAGATGAATAATCAATCACAACTGTTTGTTTATTGGTAGCTTGAATACCTAAATTTTTGTGGGAAAGTGCAGCTGAAATTTCAGTTGTTAGCCAAGTTGGATTTAAGAAAATATTGATAAAACCTGGACCTGCGATTTCTAATTTTTCTGCAATATCAGATAGTTGAAGATTGTCTAAAACTTTTTGAGCAAATTCTCGTGGATTTAAACCTAATTTTTTTGCCGCAGCCATAATGCCATTGGCTTGATAATCGCCAAATTGTGGTTTTCCTGATTGACGAATAAGCGCATCGCAAGATTGATCAGCACCTGCAAGAATCATCGCTTGTTTAATTTTATCGGATAGAATAGATTGAATATTCACGTTTTTTCCTATGTTCAAATTGAATAATAAAAATAATCGGTTATGATACCGTTCTTTGTATATTTCTCAAAGGGACAAAATGACAAATTTACAGGAAAATTTAACCGCACTTTCAGCAGATTTAGCAATATTTGAAAGAAAAATTCAGCATTTAGCCAAAGAAATGACAATAGATCTGTCTCACTATGAAATTGATCATCTTGCATTACGGGTAAATAGTGAGCAAAGTGCTAAAAATTGGCTGATACTTTTATTAAAGTGCGGTAGAATTTTATCTGATAATATTGTTAATGGTCGTAAGATTTATCTTATTGAATTAGAAAAACCAGTTAAATTTGCCAATCAATTTGTGGATATTATTGAACTTCCACTTCCTAAAAATAAAAAATATCCAATTGAGGGCTGGGAACATATTGAGATTGTAATGCCATTTTTACCGAAAGAATCGATAAATGAATGGATTAACCGTGTTAATATGTATTTTTTATGGGACAAATTAACTCAATTAACCATTAAAGTGAGCGAGCCTAAAGTGGATGGGGAAAGATTACCAAATCCATCTATTGCAGTAAGTTTTACGGATAAAACAGTAAATCATACTTGCATTAAGGTTCATCCTTATTCTATAAAAAAATACTTGAGGTTTAGTAAAAATGAATAAATTATCACTTGCATTCGTTGTTTAGCAACAGTAGACTTGAGTGCTTGTTCTGCTTTTCAAAAGGAGGAGGGGACTTATAAAGGTCAAATTATTTTTAGTCAAATGGAAGGCAAAAATCTAAAATTAACTGTTCGTAAAAATGATTGTTCTGGTAACCAGCAGAAAGGATAGGAGGTTGTTATTGTGCATAAGTATGGTTCAACTTTAGTTGTTGGTGCTTGTGTTTTAGTATCTGACAATGGTAATACTAAAAACATTTCAACTTTTTCTCCAAGAAACCCACTTTAATTCCTTCTAATATAGAGAATATTATATGAAAAAAACAAATATGGCATTAGCACTGTTAGTTGCTTTTAGTGTAACTGGTTGTGCAAATACTGATATTTTCAGCGGTGATGTTTATAGCGCATCTCAAGCAAAGGAAGCGCGTTCAATTACTTATGGTACGATTGTTTCTGTACGCCCTGTTAAAATTCAAGCTGATAATCAAGGTGTAGTTGGTACGCTTGGTGGTGGAGCTTTAGGTGGTATTGCTGGTAGTACAATTGGCGGTGGTCGTGGTCAAGCTATTGCAGCAGTAGTTGGTGCAATTGGCGGTGCAATAGCTGGAAGTAAAATCGAAGAAAAAATGAGTCAAGTAAACGGTGCTGAACTTGTAATTAAGAAAGATGATGGTCAAGAGATCGTTGTTGTTCAAAAGGCTGACAGCAGTTTTGTAGCTGGTCGCCGAGTTCGTATTGTTGGTGGCGGCTCAAGCTTAAATGTTTCTGTGCTATAACCAATAGCATTAAAGTCTAATATGATTAATCAGTGTCTTAACTTAGTAAGGCACTGATTTTTTTATAATTAAATTCATTTAAAATATATATTATCGTCTATCTAAGATAAATTTAAAGGACTAAATTAGAATTTAGTCCTTTAGAAAACTTGGAATTTGTTCCCCTTTCTGAACACTCTATCTAAAATATAACATTTATTTTTCTTATGAACTTTTTTATAATCTTTAAATTTTGCTTTAAATCAAATAATTCAAGATGATATTTAATAAAATGTAAGAGTGAAGTTATAGTATATTTATCTAAGCTCATATACATCTCATAAAGTATACTTTTCAACACTTTATTACTTTTATCCACATGATATATTTCTAGCAACGACACACTATTAATTACTTTTATATCTATACCTATCTTATTAAGGTAATATGTAATATTTTCCCTCTTTATCTTTTTAGCTGTCTCATTTTGCTCATGATTATAAACTGATGATGTTTGGTTTCCATGTAGTCTATATTTTACTAATGCTTCAGGATAATTAGCTAAACAACCAAGCCTACTAACCTCTGACCAAAACTTATAATCTTCTGCATACGGATAATCTTTATTAAAGATTAATTTATGCTCTCTATATACATTTGCTCTCATAATCATAGTGTTGTTATGTATCGGATTATAGAAAAGCATAGCTTCACAAATATCATTATGTAGCAATGGATTTTTCCATATATCTCCAGTTTTATATTGAGAACCGATAATTCCACATTCTTTTTCTACAATAATCTCTAAGTATGATCCCATTGCTGTAATATGATCATTTTTCTCCAGATAGGTAACTATTTTCTCAATCCACGATGGTTTAGCTATATCATCAGCATCCATTCTTGCAAAATATTTACCTGAAAAACAACCAAGGCCTATATTCAAAGAATTTATGAACCCTAAATTATATTTATTACTGATAATTTTTATCCTTTTATCTAATTTAGATATTTCTTCTAAATGAGACAAAGTCAAATCTGTTGAACCATCATTGATAACTATAATTTCTAGATTTTCATAAGTCTGATTAATAATGGATGAAATGCTTTCATCTATATATTGCTCAGCGTTATAAGCACAAACAATAACCGATACTAATGGACAATTTTCCATATAAGCTCTAATTTTACACTCTTCTTTAAACTATTTTATACGTTATTTAAATAACAAAAGGAGATGCATAGATAACCAATTAAAACTCTCCTAAATTAATTGTTTTGAAATAGAAATTTGAGTTTTTTTAAATCACTGTGATTAAAACGCCATTCATATTCCTTTAAATATAGCTTAAGAATATCATAACCTCTGTAGAAATTCATATAATAATACTACCTTGTTTATTTTCTCGAATAATCGGTAACAGTGTTGCAGATTGCATATTCATAACCACCACGGTGTTACTTTGCCATTTCGTTTCAAAAAACAAATTACGAAGTTTTTCCAGCTTCTCCTTGACCAAGTTTACCTTTCAGAGCACCACCAAAATAGCTTTCATTCGCTTGAATTTCACTTTCAAACATTTCCATATGTAGGCTGCTTTGAGTGATAAACAATGGTAGACGATGAAAGTAATAAGCTGAAGTTTATTTATATTTACCAACTTAGCTGTGGCTAGAGCTGTCACACTTGCCAGAAATATTTCAATAAGTTTATTTTGTTTATATTGACTTAAGCGACTTTCTCTCATTTGATTATCTTAACCTAAATAGAGTTTTTAGTCGTTATTTGTGACAGCTCTAGAATTATTCAAATCCAAATAATTAACGCCATGCTTTAAATTGATTAA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99 | Shigella_phage(21.43%) | transposase,tRNA,plate,head,tail,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
559385 : 590042
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP020411|559385:590042|DBSCAN-SWA AATGGAATATAAATCTTCTCCTAAACGCCCTTATTTATTACGCGCCTATTATGATTGGCTAGTAGATAATAGTTTTACGCCTTATTTAGTTGTTGATGCGACTTACTTAGGTGTGAATGTTCCTGTCGAATATGTAAAAGATGGACAGATTGTATTAAACTTGTCTGCCAGTGCTACGGGCAATTTACAACTTACAAATGATTTCATCCAGTTTAATGCGCGTTTTAAAGGCGTCTCTCGTGAACTGTATATTCCAATGGGCGCAGCCCTTGCGATCTATGCTCGTGAGAATGGCGATGGCGTGATGTTTGAACCTGAGGAAATTTATGATGAACTTAACATTGAGCCAGATACTGAACAACCAACAGGTTTTTATGAAGCAGTAGATAAGCCTAAAAAACGAGAAGAAAAAAAGAAAACAAAATCAGTTTCCCATTTAAGAATTGTGGATTAAGAAAAAACGCGATGAAATTATCATCGCGTTTATTTTTATAAATTACCTTGTTTTGCAATAAAGTTGAGAATTTTTTCTTCAATGCCTTTTGTATCCAATCCTAAATCTGCCAATGCTTCTTGCTGTGTCGCTTGTGGAATAAAATAATCTGGCAAGCCAAGTTGTAAAAGTGCGGTTGATTTTCCTGATGAATTTAGTACTTCCGCAACAGCAGATCCCGCTCCACCTTGAATTGCATTTTCTTCCAATGTGACCAAATAATCGTGAGTTTGTGCAAGCACATTAATCATTTCAATATCAATCGGTTTCACAAAACGCATATCGACAACCGTTGCATTGAGTTTTTCTGATAACTCTAAAGCGGATGGTAATAGAGTACCAAAATTTAAAATCGCAATTTTTTGACCTTTTCGAATTAAACGTGATTTACCAATAGGAAGCATTTCTAAAGGAGTAAGTTTTACACCAACGGCATTTCCGCGAGGGTAGCGCACTGCCGCAGGTTTTCCACATTGATAACCTGTATAGAGCATTTGACGGCATTCATTTTCATCACTCGGCGTCATAATGATCATATTTGGAATGCAACGCATAAAGCTAATATCGAATGCACCTTGATGTGTAGCCCCATCTGCACCAACTATCCCTGCTCGATCAATTGCAAATAGCACAGGGAGATTTTGAATGGCAACATCGTGAATTAATTGATCGTAAGCACGTTGTAAAAATGTCGAGTAAATTGCGACGACAGGTTTATATCCGCCAATTGCAAGTCCTGTGGCAAACGTGACAGCGTGCTGTTCTGCAATCGCTACGTCAAAATATTGTTTTGGGAAGCGTTGGGAAAATTCTACCATACCTGAACCCTCACGCATTGCAGGTGTGATACCTATAATTTTGGCATCTTTTTCTGCCATTTCACATAGCCAATCGCCAAAAATTTTCGAATAAGTTGGTTTACTATTGTTTTTGGGCAATTCGCCACTGATTGGATCAAATTTAGGTACACCGTGGAAACCAATCGGATCTTTTTCTGCGGGTGCGTATCCTTTACCTTTTTTCGTTTTTATATGCAAAAATTGTGGGCCTTTCAGATTACGCATATTCGTAAGCGTAGCCACTAATTCATCAATGTTATGCCCATCCACTGGGCCAATATAGTTAAAACCGAGTTCTTCAAATAATGTACTTTCTGGCGAAAACATTACACCTTTCATATGTTCTTCGGTTTTTTTCATAAAATTTTTGATTGGAGGAACTTTATCAAGGATTTTTTTACTGCCATCACGAAGCGTAGAGTAAAGAGAGCCAGAGAAAATACGCGCAAGATGATTATTTAATGCACCAACGTTTTCTGAAATAGACATTTCGTTATCATTTAAAATAACTAACATATCTGTATGCAATGCCCCCGCGTGATTTAATGCCTCAAATGCCATTCCCGCAGTAATTGCGCCATCACCGATTACGCATACTGTTTTTCTACCTGCATTTTCTCGTTCTGCGGCAACGGCAATGCCTAATCCCGCACTAATAGACGTAGAGGAGTGACCAACACTTAATACATCAAATTCACTTTCTTCACGCCAAGGAAAAGGATGAATACCGTCTTTTTGGCGAATTGTGGACATTTGCTCTCGGCGACCCGTTAGGATTTTATGTGGATAAGCTTGATGTCCCACATCCCAAATTAACTGATCAAATGGCGTCTTATATACATAATGCAGCGCAACGGTTAGCTCTACAGTGCCTAAACCTGACGCTAAATGTCCGCTAGTTTGACTAACAGATTCTAAAAGATAAGCACGTAATTCTTGACAGAGTTGTGGTAGCTGATCTTTATTTAAAAGACGCAAATCTTCTGGAGAATTAATTAAAGATAAAAGAGGATAATTGTTCATATTGTTAGTCATTTTAAAAACGTGATAAATTTTGACCGCACTTTTGTGGGTATTTAACTTTTTCTGGTAATAATGAATTCAGCTAATGCACGAAGTGCGGTTGTATCAAAAGGAATTTTTTCTAATTCAGACAACGCACTTTGATATAGATCTTGCGCTTTTTGTTTTGCACCACTTAATCCAAGTAATTTTGGATATGTACTTTTATCTAAATCAAGATCGGCACCCACCTGTTTGCCAATTTCTGCACTATCGCCTTCAATATCTAAAATATCGTCTTGAACTTGAAAGGCTAAACCAATGGCTTCCGCATATTGTGTTAAGGATTGTTCTAACCTTTTGTCGGTAAAATGCGGAGAACAAATGAAACCTAATTTCAATGCGGCAATTAGCAATGCACCCGTTTTGTTACGATGAATTAATTCTAATTCACTTAAACTAATCTGTTTATGCTCAGAAATAAGATCTAAACTTTGCCCTAAACACATTCCTTGCACACCAGCGCCTTGCGCTAAAATTTGAATTAAAGCCAGTTTTTGTTCAGTAGAAATATTCGGTGTTTTGGTTAATATTTCAAATGCGAAACTTTGCAGTGCATCGCCCGCAAGAATAGCTGTAGCTTCATCAAATTGGATATGACAAGTAGGATGTCCACGGCGTAAATTGTCATCATCCATTGCAGGTAAATCATCGTGAATTAAGGAATAGGCGTGAATGGCTTCAATGGCAGCAGCAGCGTAATCTAAGGTTTGTTTCTCTGCGCCAAGCATTTGACCTGTTGCGTAAACTAAGAAAGGGCGAACTCGCTTACCGCCAAGTAATAATGCGTATTTCATCGCCTCAAGCAAAGGCGCATTATGACTTTCAATGCCTTCAAATTGAGCTTCTAAAAAGCGATTGATACGAGTTTGAACCTGTTGTAATTCTTCAGAAAAGTGACCCATTAAGCATTCCCTTCATAATCATTCCCTTTATAATCATTCAGTGGCGCGTCTTCTGTTTTTTGCAATAAGATCTGAATACGTTGTTCTGCTTGTTGTAAACGTTCTTGCCCTAACTTAGCTAATTGCACACCTTGTTCAAATTCTTTTAACGCTTCTTCTAACGGTAGATCGCCATTTTCTAAATGTGTAACAATATTTTCTAACTGCACTAACGTTGTTTCAAAATCTTGTGAAGATGCGGGTTTACGCGCCATGGAATTATCCTTTATTCACGGTAAAAATTGTTTGCCATTGTACTGTATTTTACTTGAGTTGTTAAAAAATTATTTCAAGCTAGGACCAGTGGACTTTTCACTATCTTTGCGTAAAATACTCGCCACTTTAAATCCCCAAGAAATACCTAAGCTATTTATATGAAATTTATCGTTAAACTTTTTCCTGAAATCATGATTAAGAGCGAAACTGTGCGTAAACGTTTCGCAAAAATTTTAACCTCTAATATCCGCAATATTTTACAGAAATATGATGAAGAAACCGCAGTTGTACGCCACTGGGATTACATTGAAGTGCGGTCAAAAAATGAAGAAAATCGTGAAGAATTAATCGCCTTGTTACAACGTATTCCTGGTATTCATCATTTTTTAGAAGTTGAAGAAAAACCATTTACCGATTTACATCATATTTTTGAATTGACGCTTGCTGATGTCGCACAACAACTTCAAGACAAAACCTTTTGCGTTCGAGTAAAACGTAAAGGAAAACATAAATTTAGTTCAATTGAAGCAGAACGTTATATCGGCGGTGGATTAAATCAATATATTGAAAGCGCAAAAGTGCGGTTGAAAAATCCAGATGTAACTGTTCGTATTGATATTGAAGATGACAAAATGATGTTAGTTAAAGCACGTCACGCTGGGATTGGCGGTTATCCGATTGGGACTCAAGAGGATGTGCTTTCTTTAATTTCGGGGGGATTTGATTCAGGCGTATCGAGTTATATGTTGATTCGTCGTGGTTCCCGAGTTCATTATTGTTTCTTTAATCTTGGTGGCACAGTCCATGAAATTGGCGTTAAACAAATGGCTTATCATATTTGGCAACGCTATAGCTCTTCACATAAAGTACGCTTTATTGCGATTAACTTTGAGGGAGTTGTTGGTGAGATTTTAGAGAAAGTCGATAACGGCCAAATGGGCGTTGTATTAAAACGGATGATGGTGCGAGCCGCAAGTAAAGTCGCTCAACGTTTCAATATTGAAGCAATTGTGACAGGGGAGGCATTAGGGCAAGTTTCTAGCCAAACTTTAACCAATTTACGCTTGATTGATGAAGCCGCTGATGCCTTAGTATTGCGTCCGTTAATTACCCATGATAAAGAACAAATTATCGCGATGGCGAAAGAAATTGGCACTGATGATATTGCAAAATCTATGCCAGAATTTTGTGGCGTGATTTCAAAAAATCCTACGATTAAAGCGGTTCGTGAAAAGATTCTTAAAGAAGAAGGGCATTTTAATTTTGAGATTCTTGAAAGTGCGGTACAAAATGCAAAATATTTAGATATTCGCCAGATTGCAGAAGAAACAGAAAAAGCAGTCGTGGAAGTCGAGGCAATTTCTGTGTTAGGTGAAAATGAAGTGATTTTGGATATTCGTAGCCCAGAAGAAACGGATGAAAAGCCATTTGAATCAGGTACACATG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP020411|559385:590042|579514_580183_+|WP_005693947.1|DBSCAN-SWA MKNQIQFSTFNFKDLPVRVILDPKGEFWFCGTDVCHILGYTNSRKALQDHCKQGGVTKRYTPTKSADQEMTFINEPNLYRLIIKSRKPEAEPFEAWVFEEVLPQIRKTGKYQLQPQQLALPEPEKKFSFEFTEYELQQLVWLWFAFMRGIVTFQHIEKAFKALGSNMSGDIYGQAYEYLSVLRSTNQILNRITQEFNIDPMTNWRVLKHLRGFNPKAVKIDF >NZ_CP020411|559385:590042|578171_578534_+|WP_050396694.1|DBSCAN-SWA MGFAVPYLEQNGGSFETEFPRVAAGFAEMKCDARYAEKYRMRPISDELGMEIDGYLGVIRKVTPELYDVFVLTYIKRWEKQGIWRYLHISRREYFNRLKTVKTSLLLLLSTEGKQYLFIA >NZ_CP020411|559385:590042|580258_580396_+|WP_165442161.1|DBSCAN-SWA MFRILFAVALLWAAYELNLNQDCDGYICDTSSLISALHKPLDSAH >NZ_CP020411|559385:590042|566276_566753_-|WP_005631703.1|tRNA|DBSCAN-SWA MTPAIDLLKKQKIPFILHTYDHDPNNQHFGDEAAEKLGIDPNRSFKTLLVAENGDQKKLACFVLATANMLNLKKAAKSIGVKKVEMADKDAAQKSTGYLVGGISPLGQKKRVKTVINSTALEFETIYVSGGKRGLSVEIAPQDLAKVLGAEFTDIVDE >NZ_CP020411|559385:590042|562682_562937_-|WP_005693923.1|DBSCAN-SWA 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>NZ_CP020411|559385:590042|589493_590042_+|WP_010869205.1|tail|DBSCAN-SWA MKAFLHHLQNEAKLIISLTYCVDGEFALNEIARATLQQYGIVQLSSATNSDSETEAATSKAVKTAYDKAVEAKTTADGKVGLNGNESINGEKTFENRIVAKRNIRISDSPHYASRGDYLNIGANNGDCWFEYKLSNQEIGTLRMHANGDLTYKRQKIYLKMDCWQAIHKRKLKVFTAKRKKR >NZ_CP020411|559385:590042|587478_587835_+|WP_005693956.1|DBSCAN-SWA MKRNWDLIRSILLKLESQSEARGSLLPDGFTGFDSETVSYHFKLLQSAGLIEAIDYSSLNEMSLIARLLTWQGHELLDKIRNDTVWNSLKTTIKSKSLDLSLDAIKQVAQTIISQMLA >NZ_CP020411|559385:590042|570856_571891_+|WP_005693936.1|DBSCAN-SWA MSNTQLSYKDAGVDIHTGNELVERIKGDVKRTRRSEVMGGLGGFGALCALPTKYKEPILVSGTDGVGTKLRLAIDLKKHDTIGQDLVAMCVNDLIVQGAEPLFFLDYYATGKLDVDVAASVIKGIADGCEMSGCALVGGETAEMPGMYHEGDYDLAGFCVGVVEKSEIIDGTAVKTGDTLIALGSSGAHSNGYSLIRKVLEVSGANPTDLLEGKPLSEHLLAPTKIYVKSILQLIKQTEVHAIAHLTGGGFWENIPRVLPDNTKAVIDESSWQWPAIFNWLQEKGNISRYEMYRTFNCGVGMVIALPEKEVETALALLEQSGEKAWVIGKIEHLGESEAQVEIQ >NZ_CP020411|559385:590042|559873_561751_-|WP_005650455.1|DBSCAN-SWA 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38 | Haemophilus_phage(27.78%) | tRNA,integrase,protease,tail,holin,terminase | attL 560821:560836|attR 577978:577993 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
830856 : 839370
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP020411|830856:839370|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP020411|830856:839370|836494_837382_+|WP_005653671.1|DBSCAN-SWA MSDTPLTFAPKTPLQEFWFYFKQNRGALIGLIFILIVALISILAPYIAPFDPTEQNRTALLLPPAWYEGGNPAYLLGTDDIGRDILSRIIYGTRISVFAGFIIVLLSCAFGTSLGLISGYYGGVLDTIIIRLIDIMLAIPNLLLTIVVVSILEPSLANATLAIAVVSIPSYVRLTRAAMMNEKNRDYVTSSKVAGAGILRLMFIVILPNCLAPLIVQMTMGISNAILELATLGFLGIGAKPPTPELGTMLSEARGFMQAANWLVTIPGLVILSLVLAFNLMGDGLRDALDPKLKQ >NZ_CP020411|830856:839370|838386_839370_+|WP_005691143.1|DBSCAN-SWA MTNEVKENTPLLNAIGLKKYYPVKKGLFAKPQQVKALDGVSFQLERGKTLAVVGESGCGKSTLGRLLTMIEEPTKGELYYKGHNFLENDSETKALRRKKIQIVFQNPYASLNPRKKIGSILEEPLIINTKLSAKERREKVLSMMEKVGLRAEFYDRYPHMFSGGQRQRIAIARGLMLDPDVVVADEPVSALDVSVRAQVLNLMMDLQDELGLSYVFISHDLSVVEHIADEVMVMYLGRCIEKGTTEQIFSNPQHPYTKALLSATPRLSPNLRRERIKLTGELPSPINPPKGCAFNPRCWKATEKCRENQPHLEQHTDGKLIACFHID >NZ_CP020411|830856:839370|831958_832594_+|WP_005686506.1|DBSCAN-SWA MLMEKYHDFEPNFNIVEIFESLQGEGFNTGMPSVFVRFGKCNLDCPWCDTPYNNFKRWSVSQILEKVRSFSSKNIIITGGEPTIVPKIEYLLEQFKSDGYFLAIETNGLKAIPAQIDYIATSPKSLYAHKYEKRCIPFANEVRIVMDSNMPSFCELIEQKIKAKNYYLSPCEIDGKMNLLETITLLGQLNQRSNKPKWQLSLQTHKLIGIE >NZ_CP020411|830856:839370|833208_835389_+|WP_032828438.1|DBSCAN-SWA MDISELLDGLNDKQREAVAAPLGNHLVLAGAGSGKTRVLTHRIAWLIAVENISEGSIMAVTFTNKAAAEMRHRIQSTLAKHAQHQLFGMWIGTFHSIAHRLLRAHHLDVGLPQDFQILDSEDQLRLIKRLLKLHNFDEKAFPPKQACWYINNKKDEGLRPNDIEDFNDRQEREWIKIYQIYQDTCDRAGLVDFAELLIRVYELFEKKPLILQRYQQRFQHILVDEFQDTNKIQYKWIKILAGKTGQVMIVGDDDQSIYGWRGAQIENIQKFLKDFKAETIRLEQNYRSTANILNSANELIANNSDRLGKNLWTEGEKGDPVGIYSAFNELDEAKFVASQIQDWVEHGGKLDDCAVLYRSNSQSRVIEEALIRCQIPYRIYGGMRFFERQEIKDALAYLRLINNRQDDAAFERVINTPTRGIGDRTLDILRNLTRERQITLWQAVQVATQENMLAGRASTALLRFQELINSLQLDTAEMPLFAQTDFVIKHSGLYEMYQQEKGEKGEVRIENLEELVTATREFIKPDNAEEMTELTAFLTHASLEAGEEQASPHQSCVEMMTLHSAKGLEFPRVFMVGVEEGLFPSFRSFEEPGRLEEERRLAYVGITRAKKKLTISYAESRRLYAKEERHLPSRFIAELPRECIQEIRLRGTVTRAMNLAKVGSLSNTSAVENEWKMGQKVKHEKFGFGTVINVEGSENNTRLQIAFQAQGIKWLIAHLAKLEKVR >NZ_CP020411|830856:839370|831532_831958_+|WP_005663812.1|DBSCAN-SWA MFKISKEFSFDMAHLLDGHDGKCQNLHGHTYKLQVEISGDLYKSGAKKAMVIDFSDLKSIVKKVILDPMDHAFIYDQTNERESQIATLLQKLNSKTFGVPFRTTAEEIARFIFNRLKHDEQLSISSIRLWETPTSFCEYQE >NZ_CP020411|830856:839370|837391_838384_+|WP_005694258.1|DBSCAN-SWA MALLDVKELSVHFGDKKTPFKAVDRISYQVAQGEVLGIVGESGSGKSVSSLAIMGLIDHPGRVSAESLQFENTDLLTLESKAKRQLIGADVAMIFQDPMTSLNPAYTVGFQIMEALKTHEGGTKKARKDRTLELLKLVGIPDPESRIDVYPHQLSGGMSQRVMIAMAIACRPKLLIADEPTTALDVTIQAQIMELLLELQKKECMSLILITHDLALVAEAAERIIVMYAGQIVEEGTAKDIFREPKHPYTQALLRSLPEFAEGKSRLESLQGVVPGKYDRPTGCLLNPRCPYATEYCRQVEPQLHHIGSRKVKCHTPLNEQGNPVEYQGA >NZ_CP020411|830856:839370|830856_831540_+|WP_005694253.1|DBSCAN-SWA MNIFNPNHDRKAIVIFSGGQDSTTCLFQAIAEYGKENIEAITFQYGQRHAIELEKARTIAQDLGIKQTLIDTSVMKAITHNALMDEQAHIEQKENELPNTFVDGRNALFLLYAAIYAKGQGIQDIITGVCETDFSGYPDCRDVFIKSMNVTLNLAMDYQFNIKTPLMYLTKAQTWQLADELGVLDYVQKHTHTCYEGIEGGCRKCPSCILRNKGLKKYLTQKGRKNV >NZ_CP020411|830856:839370|835478_836480_+|WP_164927863.1|DBSCAN-SWA MFKFVFKRILMVIPTFIAITLITFALVHFIPGDPVEIMMGERGLTAEVHQQMMHQLGLDLPLYQQYFHYIGNVIQGDFGASFRTQQPVLTEFFTLFPATAELAFFALFWSLLGGIILGTIAAVKKDSWISHTVTAASLTGYSMPIFWWGLILILYVSPQLGLPQGGRLDNEFWIDTPTGFMLIDSWLSGVSGAFENAVKSLILPAIVLGTVPLAIITRMTRSAMLEVLGEDYIRTAKAKGLSYTRIVIVHALRNALIPVVTVVGLIVAQLLSGAVLTETIFSWPGIGKWIIDAIQARDYPVLQGSVLIIATIIIVVNLTVDLLYGVVNPRIRH |
8 | uncultured_Caudovirales_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
971632 : 983720
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP020411|971632:983720|DBSCAN-SWA TATGTTTAACAAAATTTTTTCGTGGTTTGAAAATCGTTTAAATCCCTATCCAGAAAGCAATCCAACAACACCTAAAAAAGGTTTGTTCCGTTTTATTTGGTCTAGTATTACAGGAATGAAAGGCTGGATTTTTTTGCTCGCAATTTTAACCGTAGGTACAGGTGTAATGGAAGCTGTATTATTCCAATTTATGGGAACGCTTGTAGATTGGTTAGGCACATTTACACCTGAAAGATTATGGCAAGAAAAAAGTCATTTATTAATTGGAATGGCTGCTCTATTACTTATTAGTATTGTGTGGGGATTTTTAGCTTCGGCCGTGCATTTACAAACCTTACAAGGCGTATTTCCAATGCGATTACGTTGGAATTTCCATCGTTTAATGCTTGGACAAAGTTTAAGTTTTTATCAAGACGAATTTGCAGGTAGAGTATCCGCAAAAGTAATGCAAACCGCCCTTGCAGTACGTGACACAGTACTTACACTTGCAAATATGTTCGTTTATGTATTGGTATATTTTATTACCTCTGGCGTAGTGCTAGTGGCATTAGATTCTTGGTTCTTATTACCATTTATTACTTGGATTATACTCTTCGGTTTGATCCTACGAACCCTAATTCCTAAACTATCAAAAACCGCACAACGACAAGCTGATGCTCGTTCTTTAATGACAGGACGCATTACAGATGCTTATTCTAATATTGCTACAGTAAAATTATTTTCTCACGGCTCACGCGAAGCTACTTATGCCAAGCGTTCTATGCAAGATTTTATGGTAACAGTACACGCCCAAATGCGCTTAGCAACATCACTAGATACACTCACTTACGCTACAAATATTCTACTTACGTTAAGTACTGCAATACTTGGTATTATTTTATGGAAAAATGGTCAAGTTGGCGTGGGTGCAATAGCAACGGCAACGGCAATGGCATTACGCGTAAATGGGCTTTCTCGCTGGATTATGTGGGAATCTGCCCGTTTGTTTGAGAATATCGGAACCGTAAACGACGGAATGAATACTTTAACCAAACCTCACACTATTGTGGATAAACCACAAGCGTCACCGTTACAAGTGAAACAAGGGGAAATTAAGTTTAACGATATTACCTTTGCTTACGATCCGACAAAACCATTACTCAATCATTTCAATCTCACTATCAAACCAGGGGAAAAGGTTGGGTTAATCGGTCGTTCTGGTGCAGGAAAATCTACGATTGTGAACTTATTGCTTCGCTTTTATGAAGCACAACAAGGCGAAATTACCATTGATGGACAAAATGTACTCAATGTGCAACAAGAAAGCTTACGTCGCCAAATCGGTTTAGTCACTCAAGACACTTCCTTGCTACATCGTTCTGTACGTGACAATATTATTTATGGTCGCCCGAATGCTACTGATGAAGAAATGGTTTTAGCTGCTGAACGAGCGGAAGCCGCTGATTTCATCCCATTTCTCAGTGATTCTCAAGGTAGAAAAGGCTATGATGCCCATGTGGGAGAACGAGGGGTAAAACTTTCTGGTGGTCAGCGTCAGAGAATTGCCATTGCTCGTGTAATGTTAAAAGACGCACCAATTCTATTGTTAGATGAAGCCACAAGTGCATTGGATTCAGAAGTGGAAGTGGCAATACAAGAAAGTCTAGATAAGATGATGGAAAATAAAACTGTGATTGCCATTGCCCATCGTTTATCCACCATCGCAGCGATGGATCGCCTGATTGTGCTTGATAAAGGACAAATTGTCGAACAAGGTACGCACGCCGAATTACTAGAGCTCAATGGTCTGTACGCTAAACTTTGGAATCATCAAAGTGGCGGATTTTTAAGCGAAAGTGCTGAATAATATTGCATTTATCATATTTAATTAATTGTACTGTAATCAAACTAATTAAAAAATTAGTCTAATTTAATAGCTAAAGAAAAGTGCGGTGAATTTTTACCGCACTTTTTTGCTAGATATTTAGCGTTTAATTCACGACTTCAGCAGTATATTTCAGCTTGTGAATTGCATCGAATAATTGTTGGTTTGTGACATTTGGATCTTCCACAACCGTCACTAAACCATCTTTAATAGATGCTTTTGTTGAAATAACGCCATTGATATTACGCAGTTCTTTATTGACTAAGTAAGCACAAAGCTGACAATTCATTTCCTTTACTTTTAGCACAATTTGTTTGGTTTCATTCGCATGAGCGAAAGAGATTGCAAACAGCGAAAGCAAAAGTGCGGTACATAATTTCTTCATTTTTATTCCTAATTAGCTAATTCTAAAATCCAAGGCAAAATTGTTGGATAGGTTAAGAAAAAAATCATCACAATAAATACAATCCAATATAAAACGATGAGTTTTTTACGGGAAATATATTTGCTACAAATGATTTTTTTGGAAAACATCAACAGCCAAAATCCATAGGCAAAGGCGCATAATGAAATAATAAGCATGGGAATACGCAAATAATCATATTCGCCTAAGCCAATCAACCAAGTGGACGACACACCAAATACTAAATAAATTAATGGTGCGATGCAGCACAAGGTTGATGCCACCGCAGCACTTAGTGCGGCGGCTATGGCAACCCAAAAGGATTTATTAGAGTTTTTTAGAGACGTAGTCATATTTAAATTCTTTTGGATCAAAGGAATTTAACGGATCGCCACCTACTTCTGCATATGGATAGCCGAAGTTATTGATTGGAGCCAGTTCTGGTTGTGGATATAAATCAAAGTCACGGGCATGATTAAATCCCACCCAGTTTGCTTCCCAGTTACCAAACAAATATTTTGCTACGGCTTGTGTATCTTTATCTTCAACAGATTTTTTCTCTGCTAAACGCATTTTGGCAACGTCTGCGGAATCAACTGGTACCCATCCAAACCCTGCAAGGTAGAATTCAGCGCGGCAGTGTTGGCCACCACTTACGTTTGCGATGCCTTGTTCATTTGCACTACCGAAGGCACCTTTTGAATATTTGCCCATTTTCTCTGCCGCACCTAAGCGAATACCAAAAATTTCACGAGCAGGGATGCCTGCAGCACGAGCAAGTGCCACAAATACAGAGTTAATATCGGTACATTTACCTTTTAACACGCCAGTGGTAAGAATTTTTTCTACATCGCCGTCACCACAACCTAATACAGAATTATCACGTTCCATATTTTTTACGATCCAGTGGTGAATAAGTTCTGCTTTTTTCAATGGATTAGTTTCTTTACCTAGGATTTTGTCAGCAAATTCTTTCACAATGCCATCAGTTTTAATATGTGGAGTAGCTTTTAAGTATTCTTGTACATCCACGGAATACTGAATATCTTTTGGCGGAGTATAATTCTCTAAAGCACCTTTCACCATCGGTTCACGGTCTTTTGTTTCAATGACCATCATGACTTTTAAATCACGCTTTTGTGCATCTTTATTCCAAGTGGCAAATAAGGTTTTCGCTCCGTATTTATTGTTTTCTGTTACATAGGCATTCATGTAATTACCTTCAAAGTGAATCGATTTCACTTGTTGGTATTCCCCATTAAATGGTAATGGAACCCATAAATTGGTTTGTCCTTGCGAGCCTTTTGGCACAACTAAATCATAGGTTTGCGTGAATTCGTAAAGATGGGCGTCTGTATTGTAGTTTGGAATATTAGTGTTTGCATGAGCTAACGAGCCACATGCAGAAAGCACCGCAACTGCGATAAGTTTCTTCATGAAAAGATCCTCTAGTTAATAATAGTTAAACTTAACATATTAGATAAACTAACACGCCACTATGCTAACGGATTTTTAAATCCATAGTCAATTTGTTATTCCAAAGTTTATTAAAACATCAATCTACTAAAATACCCTATAAATAATATACCTATTAATGATTAATTGATTTGGCTCAAGTAAAACTTCTATACAAAGATTATAATTAACTCGTTTTAGTTATTTTTCAATCTGACTGTGGGGGAACGATATAATGAGTAACTTTAATCAAATAAGTCGCCGAGATTTTGTCAAGGCGTCATCTGCGGGAGCTGCACTGGCAGTTTCAAATCTTACTTTACCTTTCAATGTAATGGCTAAAGAGACACAACGCCTCAATGAAAATAATCAAGAACGTATTGTTTGGAGTGCTTGTACAGTAAACTGTGGTAGCCGTTGTCCATTACGAATGCACGTAAAAGATAACCGAATCACTTATGTGGAAACCGATAATACGGGGACAGAAACATATAATCTTGATCATCAGGTTCGTGCTTGTCTACGTGGACGTTCTATGCGTCGTCGAGTATATAACCCAGACCGTTTAAAATATCCAATGAAACGTATAGGTAAACGCGGAGAAGGCAAATTCAAACGAATCAGTTGGGATGAGGCTTTAACTGAAATTGCAGACGCATTGAAACGCAATATAAAAAAATATGGCAATGAATCAATTTATTTAAACTATGGTACGGGAACACTCGGTGGCACAATGGCTAAATCTTGGCCACCTGCATCCACTATGATCGCTCGTTTTATGAATTGTATTGGTGGATATTTAAACCATTATGGTGATTACAGCACCGCACAAATTGCTGTCGGTTTAGATTATACCTATGGTGGTGGTTGGGCATTGGGAAATGGAATGGCTGACATTGAAAACACCAAATTAATAGTGTTATTCGGTAATAATCCTGCAGAAACTCGTATGAGTGGAGGTGGTTTAACTTATTGTATTGAACAAGCCAAAGCTCGTTCCAATGCCAAAATGATTATTATCGATCCTCGTTATAATGATACTGGTGCAGGGCGTGAAGATGAGTGGATCCCAATTCGTCCAGGTACTGATGCAGCCCTTGTTGCTGCCCTTGCTTATGTAATGATTCAAGAAAATCTCGTGGATCAACCTTTCTTAGATAAATATTGTGTTGGTTATGATGAAAAAACATTACCTACGGATGCCCCTAAAAATGGTCATTATAAAGCCTATATTTTAGGTTATGGTAATGATGGTATCGCTAAAACCCCAGAATGGGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP020411|971632:983720|981220_982660_+|WP_080003770.1|DBSCAN-SWA MVIATVKGDVHDIGKNIVSVVMQCNNFEVIDLGVMVPADKIIQTAINQKTDIIALSGLITPSLDEMEYFLGEMTRLGLNLPVMIGGATTSKEHTAIKLYPKYKQHCVFYTSNASRAVTVCATLMNPEGRAALWEQFKKDYEKIQQSFANSKPLRKQLSIEEARDGFSGEWADYVPPTPKQTGIVEFKNVPIAELRKFIDWSPFFRIWGLMGCYPDAFDYPEGGEEARKVWNDAQVVLDELEQNHKLNPSGILGIFPAERVGDDVVLFSDEERTQTIGTAYGLRQQTERGKNSKSPFNFCLSDFIADRQSGKKNWFGMFAVCVGVEEMELVEGYKAAGDDYNAILLQAVGDRLAEAMAEYLHFELRTRIWGYTQEEFDNQGLINENYVGIRPAPGYPSWPEHTEKALIWDLLEVEQRIGMKLTESYAMWPAASVCGWYFTHPASNYFTLGRIDEDQAQDYAKRKGWDEREMMKWLGVAMK >NZ_CP020411|971632:983720|973888_974251_-|WP_005686315.1|DBSCAN-SWA MTTSLKNSNKSFWVAIAAALSAAVASTLCCIAPLIYLVFGVSSTWLIGLGEYDYLRIPMLIISLCAFAYGFWLLMFSKKIICSKYISRKKLIVLYWIVFIVMIFFLTYPTILPWILELAN >NZ_CP020411|971632:983720|975588_978009_+|WP_005693382.1|DBSCAN-SWA MSNFNQISRRDFVKASSAGAALAVSNLTLPFNVMAKETQRLNENNQERIVWSACTVNCGSRCPLRMHVKDNRITYVETDNTGTETYNLDHQVRACLRGRSMRRRVYNPDRLKYPMKRIGKRGEGKFKRISWDEALTEIADALKRNIKKYGNESIYLNYGTGTLGGTMAKSWPPASTMIARFMNCIGGYLNHYGDYSTAQIAVGLDYTYGGGWALGNGMADIENTKLIVLFGNNPAETRMSGGGLTYCIEQAKARSNAKMIIIDPRYNDTGAGREDEWIPIRPGTDAALVAALAYVMIQENLVDQPFLDKYCVGYDEKTLPTDAPKNGHYKAYILGYGNDGIAKTPEWAAKITGIPAERIIKLAREIGSTKPAFISQGWGPQRRSNGELISRAIAMLPILTGNVGIHGGNTGARESAYSIPFVRMPTLKNPVKASIPMFLWTDAIIRGTEMTALTDGIRGVDKLSSPIKVIWNYASNCLINQHAQINRTHDILQDDTQCEMIITIDNHMTSTAKYSDILLPDCTTSEQMDFALDAFVSNMAYVIFADQVIKPSFECRPIYDMLSDLAEKMGVKEKFTEGRTQEEWLRHIYEQSREKLPELPTFEEFRQQGIFKKVDPNGFKVAYKDFRDNPEAHPLKTPSGKIEIYSSRLAEIAKTWKLAEDDVIHPLPIHAQSFEHYGDPLMEKYPLQLSGFHYKARTHSTYGNVDVLKAANPQEVWMNPIDAEPRNIKNGDMIRIFNDRGEVHINVKITPRIIPGVVALSEGAWYAPDKDRIDHSGCINVLTTQRPSPLAKGNPQHSNLVQVERL >NZ_CP020411|971632:983720|979589_980201_+|WP_005693380.1|DBSCAN-SWA MQNTLQQISIYGRLLGAVFYYEPNDARLTDILTFFRQPNWMQEWEISFDVKTHKKITALIEKGLQQNITEQYQYLFIGPNELPTPPWGSVYLDPECVIFGNSLLALRDFLQQHQIAFQTQQDEPEDHIGLMLMLAAYLAENRPHLLTKFLREHFLTWAYHFLEQLSKIENSDFYQALALLTIKTLQQWQVDLHINVPTVRFYR >NZ_CP020411|971632:983720|980978_981227_+|WP_032828348.1|DBSCAN-SWA MGELLKHALVKGITTCQTLPSPLDVIEGPLMAGMDVVGDLFGDGKMFLPQVVKSARVMKQSVAYLEPFIMQPNKKVQATVKW >NZ_CP020411|971632:983720|973601_973880_-|WP_005662887.1|DBSCAN-SWA MKKLCTALLLSLFAISFAHANETKQIVLKVKEMNCQLCAYLVNKELRNINGVISTKASIKDGLVTVVEDPNVTNQQLFDAIHKLKYTAEVVN >NZ_CP020411|971632:983720|974225_975335_-|WP_005693384.1|DBSCAN-SWA MKKLIAVAVLSACGSLAHANTNIPNYNTDAHLYEFTQTYDLVVPKGSQGQTNLWVPLPFNGEYQQVKSIHFEGNYMNAYVTENNKYGAKTLFATWNKDAQKRDLKVMMVIETKDREPMVKGALENYTPPKDIQYSVDVQEYLKATPHIKTDGIVKEFADKILGKETNPLKKAELIHHWIVKNMERDNSVLGCGDGDVEKILTTGVLKGKCTDINSVFVALARAAGIPAREIFGIRLGAAEKMGKYSKGAFGSANEQGIANVSGGQHCRAEFYLAGFGWVPVDSADVAKMRLAEKKSVEDKDTQAVAKYLFGNWEANWVGFNHARDFDLYPQPELAPINNFGYPYAEVGGDPLNSFDPKEFKYDYVSKKL >NZ_CP020411|971632:983720|982805_983720_-|WP_005693374.1|DBSCAN-SWA MKCVDLFSGCGGLSLGFELAGFEICAAFENWEKAIEIYKNNFSHPIYNIDLRNEKEAVEKIKKYSPDLIMGGPPCQDFSSAGKRDISLGRADLTYSFANIVCNIRPKWFVMENVEQIKKSHILQDIINQFIDFGYGLTSAILDASYCGVPQSRTRFFLIGKLNSEHNFLIPTLSRKLSDKPMTVRDYLGNSLNLEFYYRHPRNYNRRGIFSIDEPSPTIRGVNRPIPKGYNINSCDPKGVELAKVRPLTTIERSYIQTFPKSFLFSGTKTDLEQMIGNAVPVNLAKFVASAIINFEKEPIRSMG >NZ_CP020411|971632:983720|980200_980701_+|WP_005693377.1|DBSCAN-SWA MKNEAYYQAYLSHHHISRRGLLRHVFPATKSTIEKTQSRPPFSAREDLFSAVCNGCGECASACPNGLIQLKQQQATLEIDYAPCDLCGKCAEVCPTNALHPNFPADTLLRPQFSSACLILQNQTCPDCQTACPLQAISSTLEIDNERCNGCGECKITCFVAAITLK >NZ_CP020411|971632:983720|971632_973477_+|WP_005686318.1|DBSCAN-SWA MFNKIFSWFENRLNPYPESNPTTPKKGLFRFIWSSITGMKGWIFLLAILTVGTGVMEAVLFQFMGTLVDWLGTFTPERLWQEKSHLLIGMAALLLISIVWGFLASAVHLQTLQGVFPMRLRWNFHRLMLGQSLSFYQDEFAGRVSAKVMQTALAVRDTVLTLANMFVYVLVYFITSGVVLVALDSWFLLPFITWIILFGLILRTLIPKLSKTAQRQADARSLMTGRITDAYSNIATVKLFSHGSREATYAKRSMQDFMVTVHAQMRLATSLDTLTYATNILLTLSTAILGIILWKNGQVGVGAIATATAMALRVNGLSRWIMWESARLFENIGTVNDGMNTLTKPHTIVDKPQASPLQVKQGEIKFNDITFAYDPTKPLLNHFNLTIKPGEKVGLIGRSGAGKSTIVNLLLRFYEAQQGEITIDGQNVLNVQQESLRRQIGLVTQDTSLLHRSVRDNIIYGRPNATDEEMVLAAERAEAADFIPFLSDSQGRKGYDAHVGERGVKLSGGQRQRIAIARVMLKDAPILLLDEATSALDSEVEVAIQESLDKMMENKTVIAIAHRLSTIAAMDRLIVLDKGQIVEQGTHAELLELNGLYAKLWNHQSGGFLSESAE >NZ_CP020411|971632:983720|978019_978637_+|WP_005656008.1|DBSCAN-SWA MEQYGFYFDSERCTGCKTCELACKDYKDLGTEVNFRRIYEYTGGQWNQQADGCWHQNIFAYYMSISCNHCADPACTKVCPTGAMHKNADGFVIVNEEICIGCRYCHMACPYDAPQYDAQKGHMTKCDGCYSRVKSGQKPICVDACPLRALDFAPIDELRTKYGTQASIAPLPPTDITQPNLVVKPNKYARLSGDTSGFLGNPREV >NZ_CP020411|971632:983720|978638_979478_+|WP_005693381.1|DBSCAN-SWA MNTGLYELPLVFFTVLAQSAVGAWLVFTFVLLNEKNTKSRTYIHKVMFVILALLGIGFIASIMHLGLPIRAFNSLNRVGSSMMSNEIAAGAIFFTLAGFYWLIAILGKMPVSLGNVWRIVTALIGILFMYVMNQVYHITSIPTWNNALTSWSFYLTVVLGGLTLSYALLIPNKQREYQLQHLPSLFAIGVSLVAIVAIYQGFNLHNIHSAIQNAADLVPNYAIMTVTRLCLLSIVAFLLFRVKNIGLLGISVLLTLVAEGIGRVLFYGLHMTYGMTIGG |
12 | Escherichia_phage(71.43%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1761129 : 1764882
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP020411|1761129:1764882|DBSCAN-SWA AATGAAAACTATCACATTAAACATAAAAGGCATACATTGCGGCTGTTGCGTAAAAAGTCTTACTCAAGTTTTAACTGAATTAGATGGTGTACAATCTGCTGATGTGCAATTAGAGGGTAAAGCAAATATTACTTTTGATGAAAATCGAGTCAATGTTGCACAGCTGATTGAGGTCATTGAAGATGCTGGATTTGACGCCACAGAGTAAAAAAATTTCAATTCAGATTGGTGGGATGGCCTGCCAATCGCATTCATCAATAAAACAACTAACAAGGAGTAAAAATGAAAACTATCACATTAAACATAAAAGGCATACATTGCGGCTGTTGCGTAAAAAATCTTACTCAAGTTTTAACTGAATTAGATGGTGTACAATCTGCTGATGTGCAATTAGAGGGTAAAGCAAATATTACTTTTGATGAAAATCGAGTCAATGTTGCACAGTTGATTGAGGTCATTGAAGATGCTGGATTTGACGCCACAGAGTAAAAAATTTCAATTCAGATTGGTGGGATGGCCTGCCAATCGCATTCATCAATAAAACAACTAACAAGGAGTAAAAATGAAAACTATCACATTAAACATAAAAGGCATACATTGCGGCTGTTGCGTAAAAAATCTTACTCAAGTTTTAACTGAATTAGATGGTGTACAATCTGCTGATGTGCAATTAGAGGGTAAAGCAAATATTACTTTTGATGAAAATCGAGTCAATGTTGCACAGTTGATTGAGGTCATTGAAGATGCTGGATTTGACGCCACAGAGTAAAAAAATTTCAATTCAGATTGGTGGGATGGCCTGCCAATCGCATTCATCAATAAAACAACTAACAAGGAGTAAAAATGAAAACTATCACATTAAACATAAAAGGCATACATTGCGGCTGTTGCGTAAAAAATCTTACTCAAGTTTTAACTGAATTAGATGGTGTACAATCTGCTGATGTGCAATTAGAGGGTAAAGCAAATATTACTTTTGATGAAAATCGAGTCAATGTTGCACAGTTGATTGAGGTCATTGAAGATGCTGGATTTGACGCCACAGAGTAAAAAAATTTCAATTCAGATTGGTGGGATGGCCTGCCAATCGCATTCATCAATAAAACAACTAACAAGGAGTAAAAATGAAAACTATCACATTAAACATAAAAGGCATACATTGCGGCTGTTGCGTAAAAAATCTTACTCAAGTTTTAACTGAATTAGATGGTGTACAATCTGCTGATGTGCAATTAGAGGGTAAAGCAAATATTACTTTTGATGAAAATCGAGTCAATGTTGCACAGCTGATTGAGGTCATTGAAGATGCTGGATTTGACGCCACAGAGTAAAAAATTTCAATTCAGATTGGTGGGATGGCCTGCCAATCGCATTCATCAATAAAACAACTAACAAGGAGTAAAAATGAAAACTATCACATTAAACATAAAAGGCATACATTGCGGCTGTTGCGTAAAAAATCTTACTCAAGTTTTAACTGAATTAGATGGTGTACAATCTGCTGATGTGCAATTAGAGGGTAAAGCAAATATTACTTTTGATGAAAATCGAGTCAATGTTGCACAGTTGATTGAGGTCATTGAAGATGCTGGATTTGACGCCACAGAGTAAAAAAATTTCAATTCAGATTGGTGGGATGACCTGCCAATCTTGTGCCAATCGCATTGAAAAAGTTTTAAATAAAAAACCATTTGTGCAACAAGCAGGCGTAAATTTTGCTGCCGAAGAAGCACAAGTTGTATTTGACGCTACGCAAGCAAGCGAAGCTCAAATTATAGAGATTATCCATAAAACAGGTTTCTCTGCCCATATCAAACAAGCCAACGAATTACCAATAGAAGAAAATACATCAATCCCTTGGCGATTAATCGTACTTTGGATAATCAATATTCCATTTCTGATTGGAATGCTTGGTATGATAGGTGGCTCCCATAACTTAATGTTACCGCCGATTTGGCAATTTGCATTAGCGAGCATTGTGCAACTTTGGTTAGCCATTCCATTTTATCGCGGAGCAATCGGTAGTATTCGTGGTGGACTTACCAATATGGATGTACTGGTCAGCACAGGAACGCTCACTATTTATCTTTATTCTGCTTTCATGTTGTTTTACCACGCCAATCATGCAATGGGACATGTGTACTTTGAAGCTTCTGTTATGGTAATTGGTTTTGTCAGTCTTGGAAAATTTCTTGAAGATCGCACTAAAAAGCACAGCCTAAATAGCTTAAGTATGCTCTTGCAACTGACACCGAAAAAAGTCACTGTTTTACGTAATGAAAAATGGATTGAAATTGCTCTTGACCAAGTCAATATCGGCGAAATCATTCGTGCGAATCAAGGCGAGCGTATTGCGGCAGATGGCGTAATTGAAAGTGGAAATGGTTGGTGTGATGAAAGCCATTTAACGGGGGAATCTCGCCCAGAAGAAAAACAGAAAGGTGGAAAAGTATTAGCGGGGGCGATGGTAACAGAAGGTTCTATTATCTATCGAGCAAATCAGCTTGGTAGCCAAACCTTACTTGGCGATATGATGAATGCATTATCAGATGCACAAGGTTCAAAAGCACCCATTGCTCGATTTGCTGACAAAGTTACTTCCGTGTTTGTGCCTGTCGTTTTAGTGATTTCACTTGTTACTTTCGCACTCACTTATATTCTGACGAATGATAGTGTGTCTTCACTAATTCACGCGGTATCCGTGCTTGTGATTGCTTGCCCTTGTGCCTTGGGATTAGCCACACCAGCAGCCATAATGGTTGGTTTAGGTAAAGCAGTCAATGCTGGCGTATGGTTTAAAGATGCGGCTGCAATGGAGGAAACCGCCCACGTGGATACCGTTGTACTTGATAAAACTGGCACATTAACAAAAGGAGAGCTTGAAATCTCTGCTTTATGGCAGCCACAAAGTGCGGTGTATTCTGAAGACGATTTGTATCGTTTTGCAGCAGCAGTTGAACGACAAGCTAACCACCCAATTGCAAAAGCTATTGTGCAAGCAGCAGAACAAAAAATGTTAGAAATTCCCACCGCACTTTTTTCAAAGATGGAAGTGGGTCAAGGCATTCAAGCCGAATTAGAACAAGTGGGAACAATAAAAGTCGGTAAACCTGATTATTGCGGTTTAATCTTGCCTAAAAATTTAGAGGATATTTGGCAAATTGCGAGCATTGTCGCAGTATCCATAAATGATGAACCCATCGGTGCATTTGCACTGACGGATACTTTAAAAAACGATAGCTTGCACGCCATTCAACGCTTACAACAGCAAAATATTGATGTCGTAATTATGAGTGGCGATCAACAATCTGTCGTGGATTACATAGCGAAACAACTCGGCATTAAGAAAGCCTTTGGGAAACTAACTCCAAGAGATAAAGCGGAACAAATCCAAAAGCTGAAAGATCTAGGTCATATTGTCGCAATGGTAGGCGATGGAATAAATGATGCGCCTGCTTTAGCTTCTGCAAACGTCAGTTTTGCGATGAAATCAAGTTCAGATATTGCAGAACAAACAGCCTCTGCAACGCTTATGCAACATTCGGTGAATCAACTTGTGGATGCGCTTTTTATTGCAAGAGCAACCTTGAAAAATATCAAACAAAATCTATTTTTTGCTTTGATTTACAATATTCTCGGCATACCCCTTGCCGCTTTCGGTTTTCTTAGCCCTATAATCGCTGGTGCTGCTATGGCGTTGAGCTCAATTTCCGTATTGATGAACGCCTTAAGATTGAAAAAAGTGCGGTTCTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP020411|1761129:1764882|1761690_1761897_+|WP_005656255.1|DBSCAN-SWA MKTITLNIKGIHCGCCVKNLTQVLTELDGVQSADVQLEGKANITFDENRVNVAQLIEVIEDAGFDATE >NZ_CP020411|1761129:1764882|1761410_1761617_+|WP_005656255.1|DBSCAN-SWA MKTITLNIKGIHCGCCVKNLTQVLTELDGVQSADVQLEGKANITFDENRVNVAQLIEVIEDAGFDATE >NZ_CP020411|1761129:1764882|1761971_1762178_+|WP_005656255.1|DBSCAN-SWA MKTITLNIKGIHCGCCVKNLTQVLTELDGVQSADVQLEGKANITFDENRVNVAQLIEVIEDAGFDATE >NZ_CP020411|1761129:1764882|1762713_1764882_+|WP_005694020.1|DBSCAN-SWA MLDLTPQSKKISIQIGGMTCQSCANRIEKVLNKKPFVQQAGVNFAAEEAQVVFDATQASEAQIIEIIHKTGFSAHIKQANELPIEENTSIPWRLIVLWIINIPFLIGMLGMIGGSHNLMLPPIWQFALASIVQLWLAIPFYRGAIGSIRGGLTNMDVLVSTGTLTIYLYSAFMLFYHANHAMGHVYFEASVMVIGFVSLGKFLEDRTKKHSLNSLSMLLQLTPKKVTVLRNEKWIEIALDQVNIGEIIRANQGERIAADGVIESGNGWCDESHLTGESRPEEKQKGGKVLAGAMVTEGSIIYRANQLGSQTLLGDMMNALSDAQGSKAPIARFADKVTSVFVPVVLVISLVTFALTYILTNDSVSSLIHAVSVLVIACPCALGLATPAAIMVGLGKAVNAGVWFKDAAAMEETAHVDTVVLDKTGTLTKGELEISALWQPQSAVYSEDDLYRFAAAVERQANHPIAKAIVQAAEQKMLEIPTALFSKMEVGQGIQAELEQVGTIKVGKPDYCGLILPKNLEDIWQIASIVAVSINDEPIGAFALTDTLKNDSLHAIQRLQQQNIDVVIMSGDQQSVVDYIAKQLGIKKAFGKLTPRDKAEQIQKLKDLGHIVAMVGDGINDAPALASANVSFAMKSSSDIAEQTASATLMQHSVNQLVDALFIARATLKNIKQNLFFALIYNILGIPLAAFGFLSPIIAGAAMALSSISVLMNALRLKKVRF >NZ_CP020411|1761129:1764882|1762532_1762739_+|WP_005656255.1|DBSCAN-SWA MKTITLNIKGIHCGCCVKNLTQVLTELDGVQSADVQLEGKANITFDENRVNVAQLIEVIEDAGFDATE >NZ_CP020411|1761129:1764882|1761129_1761336_+|WP_005631184.1|DBSCAN-SWA MKTITLNIKGIHCGCCVKSLTQVLTELDGVQSADVQLEGKANITFDENRVNVAQLIEVIEDAGFDATE >NZ_CP020411|1761129:1764882|1762252_1762459_+|WP_005656255.1|DBSCAN-SWA MKTITLNIKGIHCGCCVKNLTQVLTELDGVQSADVQLEGKANITFDENRVNVAQLIEVIEDAGFDATE |
7 | uncultured_virus(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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