CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP015901	Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM3 chromosome, complete genome	1 crisprs	cas3,DEDDh,WYL,csa3,DinG	0	0	16	0
NZ_CP016737	Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM3 plasmid pJM3A, complete sequence	0 crisprs	RT	0	0	0	0
NZ_CP016741	Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM3 plasmid pJM3E, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP016739	Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM3 plasmid pJM3C, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP016738	Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM3 plasmid pJM3B, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP016740	Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM3 plasmid pJM3D, complete sequence	2 crisprs	NA	0	2	0	0

1. NZ_CP015901

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP015901_1

• CRISPR_ID: NZ_CP015901_1
• CRISPR_location: 2302179-2302274
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP015901_1

Consensus_repeat	Method
TCTTCCTCAATCTTCCCAATTCTT	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP015901_1

>1.1|2302203|48|NZ_CP015901|CRISPRCasFinder
CCCAATTCTTTTAAAATAAACATTTACGCAAGTTATACTTAGTAATAT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015901_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP015901_1

>merge|NZ_CP015901|1|2302179-2302274|CRISPRCasFinder
TTTGCCAGAATCTTCCTCAATCTTCCCAATTCTTTTAAAATAAACATTTACGCAAGTTATACTTAGTAATATTCTTCCTCAATTTTCCCAATTCTT

>NZ_CP015901|1|1|2302179-2302274|CRISPRCasFinder
TTTGCCAGAATCTTCCTCAATCTT	CCCAATTCTTTTAAAATAAACATTTACGCAAGTTATACTTAGTAATAT
TCTTCCTCAATTTTCCCAATTCTT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP015901.1|WP_081175803.1|2308186_2309362_-|IS256-like-element-IS905-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|307151
NZ_CP015901.1|WP_011677109.1|2294328_2296023_-|arginine--tRNA-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|183534
NZ_CP015901.1|WP_011677121.1|2310758_2311541_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease	unknown	unknown	gnl|CDD|376806
NZ_CP015901.1|WP_081175800.1|2292795_2294028_-|arginine-deiminase	unknown	unknown	gnl|CDD|234949
NZ_CP015901.1|WP_011677112.1|2298240_2298840_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP015901.1|WP_152023941.1|2302446_2303459_+|IS3-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|222853
NZ_CP015901.1|WP_011677123.1|2312617_2314909_+|Xaa-Pro-dipeptidyl-peptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|235435
NZ_CP015901.1|WP_011677113.1|2299003_2302108_-|DEAD/DEAH-box-helicase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|350770
NZ_CP015901.1|WP_004254487.1|2296090_2296549_+|arginine-repressor	unknown	unknown	gnl|CDD|130592
NZ_CP015901.1|WP_011677107.1|2289854_2291435_-|amino-acid-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|163522
NZ_CP015901.1|WP_011677119.1|2309519_2309849_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|227933
NZ_CP015901.1|WP_011677117.1|2306957_2307737_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|373100
NZ_CP015901.1|WP_011677124.1|2315771_2316614_+|amino-acid-ABC-transporter-substrate-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|270428
NZ_CP015901.1|WP_011677122.1|2311576_2312446_-|aquaporin-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223653
NZ_CP015901.1|WP_011677116.1|2305928_2306885_-|serine-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|365903
NZ_CP015901.1|WP_011677120.1|2309883_2310390_-|pyridoxamine-5'-phosphate-oxidase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225998
NZ_CP015901.1|WP_011677108.1|2291565_2292630_-|ornithine-carbamoyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|179366
NZ_CP015901.1|WP_011677105.1|2287915_2288860_-|carbamate-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|223623
NZ_CP015901.1|WP_011677106.1|2288892_2289837_-|carbamate-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|223623
NZ_CP015901.1|WP_011677111.1|2296708_2298040_-|UDP-N-acetylmuramate--L-alanine-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|234757

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP015901.1|WP_081175803.1|2308186_2309362_-|IS256-like-element-IS905-family-transposase	gnl|CDD|307151	pfam00872, Transposase_mut, Transposase, Mutator family.	0
NZ_CP015901.1|WP_011677109.1|2294328_2296023_-|arginine--tRNA-ligase	gnl|CDD|183534	PRK12451, PRK12451, arginyl-tRNA synthetase; Reviewed.	0
NZ_CP015901.1|WP_011677120.1|2309883_2310390_-|pyridoxamine-5'-phosphate-oxidase-family-protein	gnl|CDD|225998	COG3467, COG3467, Predicted flavin-nucleotide-binding protein [General function prediction only].	1.22952e-40
NZ_CP015901.1|WP_011677121.1|2310758_2311541_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease	gnl|CDD|376806	pfam02517, Abi, CAAX protease self-immunity. Members of this family are probably proteases (after a isoprenyl group is attached to the Cys residue in the C-terminal CAAX motif of a protein to attach it to the membrane, the AAX tripeptide being removed by one of the CAAX prenyl proteases). The family contains the CAAX prenyl protease. The proteins contain a highly conserved Glu-Glu motif at the amino end of the alignment. The alignment also contains two histidine residues that may be involved in zinc binding. While they are involved in membrane anchoring of proteins in eukaryotes, little is known about their function in prokaryotes. In some known bacteriocin loci, Abi genes have been found downstream of bacteriocin structural genes where they are probably involved in self-immunity. Investigation of the bacteriocin-like loci in the Gram positive bacteria locus from Lactobacillus sakei 23K confirmed that the bacteriocin-like genes (sak23Kalphabeta) exhibited antimicrobial activity when expressed in a heterologous host and that the associated Abi gene (sak23Ki) conferred immunity against the cognate bacteriocin. Interestingly, the immunity genes from three similar systems conferred a high degree of cross-immunity against each other's bacteriocins, suggesting the recognition of a common receptor. Site-directed mutagenesis demonstrated that the conserved motifs constituting the putative proteolytic active site of the Abi proteins are essential for the immunity function of Sak23Ki - thus a new concept in self-immunity.	3.89843e-08
NZ_CP015901.1|WP_081175800.1|2292795_2294028_-|arginine-deiminase	gnl|CDD|234949	PRK01388, PRK01388, arginine deiminase; Provisional.	0
NZ_CP015901.1|WP_004254487.1|2296090_2296549_+|arginine-repressor	gnl|CDD|130592	TIGR01529, Arginine_repressor., arginine repressor. This model includes most members of the arginine-responsive transcriptional regulator family ArgR. This hexameric protein binds DNA at its amino end to repress arginine biosyntheis or activate arginine catabolism. Some species have several ArgR paralogs. In a neighbor-joining tree, some of these paralogous sequences show long branches and differ significantly in an otherwise well-conserved C-terminal region motif GT[VIL][AC]GDDT. These paralogs are excluded from the seed and score in the gray zone of this model, between trusted and noise cutoffs. [Amino acid biosynthesis, Glutamate family, Regulatory functions, DNA interactions].	4.3854e-60
NZ_CP015901.1|WP_152023941.1|2302446_2303459_+|IS3-family-transposase	gnl|CDD|222853	PHA02517, PHA02517, putative transposase OrfB; Reviewed.	3.79622e-57
NZ_CP015901.1|WP_011677113.1|2299003_2302108_-|DEAD/DEAH-box-helicase-family-protein	gnl|CDD|350770	cd18012, DEXQc_arch_SWI2_SNF2, DEAQ-box helicase domain of archaeal and bacterial SNF2-related proteins. Proteins belonging to SNF2 family of DNA dependent ATPases are important members of the chromatin remodeling complexes that are implicated in epigenetic control of gene expression. The Snf2 family comprises a large group of ATP-hydrolyzing proteins that are ubiquitous in eukaryotes, but also present in eubacteria and archaea. Archaeal SWI2 and SNF2 are members of the DEAD-like helicase superfamily, a diverse family of proteins involved in ATP-dependent RNA or DNA unwinding. This domain contains the ATP-binding region.	5.9716e-94
NZ_CP015901.1|WP_011677123.1|2312617_2314909_+|Xaa-Pro-dipeptidyl-peptidase	gnl|CDD|235435	PRK05371, PRK05371, x-prolyl-dipeptidyl aminopeptidase; Provisional.	0
NZ_CP015901.1|WP_011677116.1|2305928_2306885_-|serine-hydrolase	gnl|CDD|365903	pfam00144, Beta-lactamase, Beta-lactamase. This family appears to be distantly related to pfam00905 and PF00768 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase.	5.14839e-51
NZ_CP015901.1|WP_011677119.1|2309519_2309849_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|227933	COG5646, COG5646, Uncharacterized conserved protein [Function unknown].	1.81818e-27
NZ_CP015901.1|WP_011677117.1|2306957_2307737_-|hypothetical-protein	gnl|CDD|373100	pfam14507, CppA_C, CppA C-terminal. This is the C-terminal domain of the CppA protein found in species of Streptococcus. CppA is a putative C3-glycoprotein degrading proteinase, involved in pathogenicity. It is often found associated with pfam14506.	3.1718e-25
NZ_CP015901.1|WP_011677124.1|2315771_2316614_+|amino-acid-ABC-transporter-substrate-binding-protein	gnl|CDD|270428	cd13710, PBP2_TcyK, Substrate binding domain of an ABC transporter TcyJKLMN; the type 2 periplasmic binding protein fold. This group contains periplasmic cystine-binding domain (TcyK) of an ATP-binding cassette transporter from Bacillus subtilus and its closely related proteins. Cystine is an oxidized dimeric form of cysteine that is required for optimal bacterial growth. In Bacillus subtilis, three ABC transporters, TcyJKLMN (YtmJKLMN), TcyABC (YckKJI), and YxeMNO are involved in uptake of cystine. Likewise, three uptake systems were identified in Salmonella enterica serovar Typhimurium, while in Escherichia coli, two transport systems seem to be involved in cystine uptake. Moreover, L-cystine limitation was shown to prevent virulence of Neisseria gonorrhoeae; thus, its L-cystine solute receptor (Ngo0372) may be suited as target for an antimicrobial vaccine. The cystine receptor belongs to the type 2 periplasmic binding fold protein superfamily (PBP2). The PBP2 proteins are typically comprised of two globular subdomains connected by a flexible hinge and bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap. After binding their specific ligand with high affinity, they can interact with a cognate membrane transport complex comprised of two integral membrane domains and two receptor cytoplasmically-located ATPase domains. This interaction triggers the ligand translocation across the cytoplasmic membrane energized by ATP hydrolysis.	6.80736e-84
NZ_CP015901.1|WP_011677122.1|2311576_2312446_-|aquaporin-family-protein	gnl|CDD|223653	COG0580, GlpF, Glycerol uptake facilitator and related permeases (Major Intrinsic Protein Family) [Carbohydrate transport and metabolism].	1.01122e-67
NZ_CP015901.1|WP_011677107.1|2289854_2291435_-|amino-acid-permease	gnl|CDD|163522	TIGR03810, arginine-ornithine_antiporter, arginine-ornithine antiporter. Members of this protein family are the arginine/ornithine antiporter, ArcD. This exchanger of ornithine for arginine occurs in a system with arginine deiminase, ornithine carbamoyltransferase, and carbamate kinase, with together turn arginine to ornithine with the generation of ATP and release of CO2. [Transport and binding proteins, Amino acids, peptides and amines].	1.53686e-156
NZ_CP015901.1|WP_011677108.1|2291565_2292630_-|ornithine-carbamoyltransferase	gnl|CDD|179366	PRK02102, PRK02102, ornithine carbamoyltransferase; Validated.	0
NZ_CP015901.1|WP_011677105.1|2287915_2288860_-|carbamate-kinase	gnl|CDD|223623	COG0549, ArcC, Carbamate kinase [Amino acid transport and metabolism].	5.85545e-175
NZ_CP015901.1|WP_011677106.1|2288892_2289837_-|carbamate-kinase	gnl|CDD|223623	COG0549, ArcC, Carbamate kinase [Amino acid transport and metabolism].	2.05012e-171
NZ_CP015901.1|WP_011677111.1|2296708_2298040_-|UDP-N-acetylmuramate--L-alanine-ligase	gnl|CDD|234757	PRK00421, murC, UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase; Provisional.	0

Protein sequences

>NZ_CP015901.1|WP_011677113.1|2299003_2302108_-|DEAD/DEAH-box-helicase-family-protein
MSRMMPARVRSEGIALYAKGFLNDPIETDFKLTAEIDGEEVSYDLDGAQDSCTCSIFQQNHRYCKHIAAIEEYLKNQDKGSLETKDKETKGAERGLYNENIAFLDAVNGETQLNFSTDQYSIEVQIEDNSQLYDYFSMDYFLYFDLKLKSKNLGRSYVIKDIPYFLRALKNYSQYSLGSLHYIDLFFDNFDEASQEFLSFLLKIDGKSDEALTKSLYIKNGRYLNIPFLFLEEAMDLVSALEVYQLKIIGRTVNYFTFIPLDNDSEIFKFKVESQQDYIELSLFSEDYHNFYDYSLLYDNNVFYKLSQEQRRLLLVLDKQFAQKSKIKFSYSEKDKLAQALQQLSTLGKIEAPEHFVVKPFDAKFTFDLLDEKTLSLAMKFDYGTFSIDSFHDLETLEFSRDLRKEQKIFALMERLQFAKAFNSTLEITEHLSENFFLKILPSFQKLGQIELSPTLRNMRMDEVPEIHIDSQGGLLDISFNIPHVEDGEFANVIAKLQENAEFYISESGKFYHFNEKFDRLKAALHELDDQFVIQGSSLHVNINRSFQISKIFEKISGASFSEKFKSLYQHLTHPEEFPYEKPEHIKASLRSYQETGVRWMSMLSHYNLGGILADDMGLGKTVQAITFILSNLKKDESVLITAPASLTYNWASEFEKFTDEIDFVVIDGNKADRTKEIQENHQIYITSYGSFLKDFEDYQDKKLNYLLLDEAQVVKNYSSKTNKSLSALNVEHTFALSGTPLENRIEEIWAIFQVVMPGFLPKREKFNKMEPSVISRLIQPFIMRRKKEDVLEELPEKMEITVYNQLADDQKVIYLAQLELMQKQVLEMDNAALSRSRIEILAGITRLRQICNTPALFMDDYKGSSGKLERLRELLAQIKDSGHRPLIFSQFTKVFPHIEKLMEEQEMTAYKLTGSTPIKDRLSMVQAFNAGSRDAFLVSLKAGGVGLNLTSADVVILVDLWWNPAVEEQAIARAHRMGQKNTVEVIRLITQGTIEEKIMEIQERKKDLIANVLEGDTVDKVLSEAEIREILGV
>NZ_CP015901.1|WP_011677112.1|2298240_2298840_-|hypothetical-protein
MVERRVVFPVIGDDEVLQKDTRVIFTNQQLLTRNPSLQDEASIETSKSKTDAKRPESFKPYKAKTSFSTQHRPLNSNHAGVSSYDKMPKKTSVDESKERAKRAAATLPKPPKQYVSPLERDKEDLTVRRSTSAILNKRPSTNDNPIRDMKKQGMNVSDAVAKNGSGMKKATPHGGAANDTQKGSYFENKRKNIFDRGIV
>NZ_CP015901.1|WP_011677111.1|2296708_2298040_-|UDP-N-acetylmuramate--L-alanine-ligase
MEKTYHFTGIKGSGMSALALMLHQMGKNVQGSDSTDYFFTQRGLEQVGVPLLPFDEKNIKPEFELIIGNAFRDDNNVEIAFAHKNGFPFKRYHEFLGHFMEDFTSIGVAGAHGKTSTTGMLAHVMSNIVDTSYLIGDGTGRGNAGSEYFVFESDEYERHFMPYHPEYTIMTNIDFDHPDYFEGIEDVTSAFQDYANNIKKGIFAYGEDVNLRKLSAKAPIYYYGFEANDDYRAENLIRNTRGSSFDAYFRGEKIGHFVVPAYGKHNVLNALSVVAVCHNLGLDMTDVADHLLTFRGVKRRFTEKKVGETVIIDDFAHHPTEIEATLDAARQKYPDREIVAVFQPHTFTRTIAFADEFAEVLDHADTVYLAQIYGSAREVDHHEITAQDLADKVRKPAKVIELDNVSPLLDHDRGVYVFMGAGNIQKYEIAFEKLLSQTSTNLQ
>NZ_CP015901.1|WP_004254487.1|2296090_2296549_+|arginine-repressor
MKRDKRLEIIKEIVTNNKISTQEELQSLLLERGVEVTQATLSRDIRKLNIIKKRDKGESFYSFLTSGNSKINSDLQLYFYNFVISAKSVGALVVIRTKLGEADVLANALDDERDSRTDILGTIAGADTLLVICASEKAANILTAEIKYILLG
>NZ_CP015901.1|WP_011677109.1|2294328_2296023_-|arginine--tRNA-ligase
MDEKQLVSQALSAAIDGVLGVEQIAAIIEKPKSSDLGDLAFPAFQLAKTLRKSPQIIAGEIAEKIDTKGFEKVIAVGPYVNFFLDKNATASEVIREVLTEGEHYGDANIGEGGNVPIDMSAPNIAKPFSIGHLRSTVIGDSIAKIYEKLGYQPIKINHLGDWGKQFGLLITAYKKYGDEATITANPIDELLKLYVKINAEAKEDPEVDEEGRQWFLKMEQGDEEALRIWKWFSDVSLIEFNRIYGKLGVTFDHFMGESFYSDKMDAIVEDLENKNLLHESKGALIVDLEKYNLNPALIKKTDGATLYITRDLATAAYRKKTFNFVKSLYVVGGEQTNHFKQLKAVLKEAGYDWSDDMVHVPFGMVTQGGKKFSTRKGHVVKLEMALDEAVDRAEKQIEAKNPNLENKEEVAKQVGVGAVKFYDLKTDRNNGYDFDLDEMVSFEGETGPYVQYAHARIQSILRKANRKVNIDNISLVVSDAEAWEIVKALKEFPNIVKRAADNYEPSIIAKYAISLAQAFNKYYAHVRILEDDAQLDGRLALISATSIVLKEALRLLGVAAPENM
>NZ_CP015901.1|WP_081175800.1|2292795_2294028_-|arginine-deiminase
MNNGINVNSEIGKLKSVLLHRPGAEVENITPDTMKQLLFDDIPYLKIAQKEHDFFAQTLRDNGAETVYIENLATEVFEKSSETKEELLSHLLHEAGYRPGRTYDGLTEYLTSMPTKDMVEKVYAGVRKNELDIKRTALSDMAGSDAENYFYLNPLPNAYFTRDPQASMGVGMTINKMTFPARQPESLITEYVMANHPRFKDTPIWRDRNHTTRIEGGDELILNKTTVAIGVSERTSSKTIQNLAKELFANPLSTFDTVLAVEIPHNHAMMHLDTVFTMINHDQFTVFPGIMDGAGNINVFILRPGQDGEVEIEHLTDLKAALKKVLNLSELDLIECGAGDPIAAPREQWNDGSNTLAIAPGEIVTYDRNYVTVELLKEHGIKVHEILSSELGRGRGGARCMSQPLWREDL
>NZ_CP015901.1|WP_011677108.1|2291565_2292630_-|ornithine-carbamoyltransferase
MTSPLITKAEVNSVFQGRSLLAEKDFTPAEINYLVDFGLHLKALKQQNIPHHYLEGKNIALLFAKTSTRTRAAFTTAAIDLGAHPEYLGANDIQLGIKESTEDTARVLGSMFDAIERRGFSQKEVEDLAKYSGVPVWNGLTDDWHPTQMIADFMTVKENFGYLKGLTLVYVGDGRNNMANSLIVTGSMLGVNVHIVAPDSLHPSKEVMDIANKFAEKSGAKPLATSNIEEGVKGANIIYSDVWVSMGESNWEERVKLLTPYRITMDMLKMTGNADNGKLIFMHCLPAFHDTETEYGKEIKEKYGLTEMEVTDEVFRSKYARQFEEAENRMHSIKAIMAATLGNLFIPAVPEDFK
>NZ_CP015901.1|WP_011677107.1|2289854_2291435_-|amino-acid-permease
MDAENKKGIGLAALVAIIVSGAIGGGVFNLSNDLATNASPGGVVISWIVIGFGILMLVLSLNHLVVNKPELSGVSDYARAGFGNMVGFISGWGYWLSAWAGNIAFAVLMMTAVDYCFPGVFQAKNGSLTILSVIVVSIVSWGLTLLVMRGVEGAAAINAIVLVAKLIPLFVFVIAGIVTFKAGVFSAHFWQNFVANTNADGVIKSLTWSNMTGGDLFSQVKGSLMVMIWVFVGIEGAAMMGDRAKRKSDAGKASIIGLIALLVIYILLSLLPFGFMSQQELANTGQPGLVHILNAMVGGWGGSLMAIGLVISLLGAWLSWTMLPVEATQQLSEQKLLPSWFGKLNDKGAPKNSLLLTQLIVQIFLIVTYFVADAYNVFVYLCTAVIMICYALVGLYLFKLGIQEKKTSNIIIGFIAAAFQILALYYSGWQFVWLSLILYAVGFILYALGKKEYGTKMSTAELIATFILTVLGILAVFGVYGNWLGLQDALGIDGNTLLVAVVPLIVVTFIVYFVVRSDINKKGIKN
>NZ_CP015901.1|WP_011677106.1|2288892_2289837_-|carbamate-kinase
MVSRIVVALGGNAILTKDPSAAAQKKALEVTAEQLMPLIKDNDRQMVVTHGNGPQVGNLLLQQLGSDSEKNPAMPLDTVGAMTQGEIGFWTVQAFTRAMANNGLERYPVISAVTQTLVDENDPAFKNASKPIGPFYTEEQLPEIKKQFPDWELMEDAGRGYRRVVPSPKPLEIIEAKAFGPILESGSLLIASGGGGIPVIKDGNGYKGVEAVIDKDFSAAKLAEMVGADELLILTSGGDVYLNYGKEDQVHLETVKVSEMRKYVDEERFAKGSMGPKVEAAVSFVERTGKVATITSLDNVENFVKSGSGTRIVP
>NZ_CP015901.1|WP_011677105.1|2287915_2288860_-|carbamate-kinase
MVRRMVVALGGNAILTDDPTAKAQERALETTAEQLIPLIRNNDVEMVVTHGNGPQVGNLLLQQLAADSPKNPAMPIDTAVAMTQGQIGFWMGQAFTRALIKNKMERVPVISVVTRTVVDKDDSAFEKPTKPIGPFYDEKGLAEMKAQYPDWTFVEDSGRGYRRVVPSPKPTRIVEAEEIKPLISSSVLVTVSGGGGIPVIETQEGYEGVEAVIDKDFSAAKVAELVEADNLLILTAVDNVFVNFNKPNQKKLETVTMAEMKAYIKEGQFAAGSMLPKVEAAMEFVTRTGRPATITSLENLEDFLNNDSGTKIIP
>NZ_CP015901.1|WP_152023941.1|2302446_2303459_+|IS3-family-transposase
MQKRYSKEFKETLIAFYHSGQSVTQLSKEYDVAPATIYKWIDLYSKSNESSVSKADFLELKRQLAKVKEERDNLKKSIDHIRREKEVSAADMAQTIQPLALNVRLSCQLLDVPESSYYQRINRHPSKTQLRRQYLSLKISQLFNANRGIYGAPKIHHLLLKQGEKVGLKLVQTEPTKKNKVWSTDITYIPTQQGWAYLSTIMDRYTKKVIAWDLGKRMTVELVQRTLNKAIKSQDYPEAVILHSDQGSQYTSLEYEELLKYYGMTHSFSRRGYPYHNASLESWHGHLKREWVYQFKYKNFEEAYQSIFWYIEAFYNSKRIHQSLGYLTPNQFEKVSA
>NZ_CP015901.1|WP_011677116.1|2305928_2306885_-|serine-hydrolase
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>NZ_CP015901.1|WP_011677117.1|2306957_2307737_-|hypothetical-protein
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>NZ_CP015901.1|WP_081175803.1|2308186_2309362_-|IS256-like-element-IS905-family-transposase
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>NZ_CP015901.1|WP_011677119.1|2309519_2309849_-|hypothetical-protein
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>NZ_CP015901.1|WP_011677120.1|2309883_2310390_-|pyridoxamine-5'-phosphate-oxidase-family-protein
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>NZ_CP015901.1|WP_011677121.1|2310758_2311541_+|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease
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>NZ_CP015901.1|WP_011677122.1|2311576_2312446_-|aquaporin-family-protein
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>NZ_CP015901.1|WP_011677123.1|2312617_2314909_+|Xaa-Pro-dipeptidyl-peptidase
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>NZ_CP015901.1|WP_011677124.1|2315771_2316614_+|amino-acid-ABC-transporter-substrate-binding-protein
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Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	87242 : 137754	49	Bacillus_phage(33.33%)	integrase,transposase,protease,tRNA,bacteriocin	attL 88255:88273|attR 141251:141269
DBSCAN-SWA_2	293798 : 303708	14	Lactococcus_phage(90.91%)	integrase	attL 293678:293701|attR 304862:304885
DBSCAN-SWA_3	424228 : 436385	14	uncultured_virus(30.0%)	tRNA	NA
DBSCAN-SWA_4	566885 : 694497	114	Bacillus_phage(27.27%)	integrase,transposase,protease,tRNA,bacteriocin	attL 558407:558421|attR 630190:630204
DBSCAN-SWA_5	877530 : 918584	41	Streptococcus_phage(25.0%)	integrase,transposase	attL 899595:899611|attR 925030:925046
DBSCAN-SWA_6	943041 : 996564	42	Staphylococcus_phage(12.5%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_7	1013573 : 1027202	11	Enterococcus_phage(25.0%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_8	1034774 : 1124185	105	Lactococcus_phage(70.59%)	integrase,transposase,holin,protease,terminase,tRNA,head,plate,portal,capsid,tail	attL 1043210:1043226|attR 1073309:1073325
DBSCAN-SWA_9	1215848 : 1284929	58	Staphylococcus_phage(27.27%)	tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_10	1529943 : 1540256	7	Synechococcus_phage(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_11	1621245 : 1632762	12	Bacillus_phage(25.0%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_12	1641971 : 1710106	72	Lactococcus_phage(88.37%)	transposase,holin,bacteriocin,terminase,plate,head,portal,capsid,tail	NA
DBSCAN-SWA_13	1847361 : 1903379	45	Bacillus_phage(14.29%)	transposase,bacteriocin	NA
DBSCAN-SWA_14	1948007 : 2029334	92	Lactococcus_phage(77.59%)	integrase,transposase,holin,protease,terminase,tRNA,portal,capsid,tail	attL 1989781:1989803|attR 2029354:2029376
DBSCAN-SWA_15	2241861 : 2309362	71	Lactococcus_phage(61.54%)	integrase,terminase,transposase,tRNA	attL 2235023:2235040|attR 2267588:2267605
DBSCAN-SWA_16	2368542 : 2434797	50	uncultured_Mediterranean_phage(25.0%)	protease,tRNA,transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP015901|87242:137754|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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>NZ_CP015901|87242:137754|130633_131830_-|WP_011675183.1|DBSCAN-SWA
MKESWQRNLIVLWFGTFMTGIGSSLISPFISLYIGTLGHYSKTELNIWSGLVFSSTFIVLAIVSPLWGRLADQKGRKLMLLRASLGMAISISLMAFVTAAWQLLILRMLLGAFSGFVSNSMALMASSAPKEKSGSVLSLLTTGSVAGTLIGPIVGGVLVNITGYRRVFSVTGIIMFLVFFLALFLVKETFKPVEKKNMLSYKQVWEVVTHPAIIWGMFFATLITQMTNQSINPVLSLYVQELMHGQGNITFMAGLVAAAPGIVTLVAAPFLGRLGDKVGQRKILGFGLFFSLIVFSITALTTNVWFLIVMRLFVGISDAAILPSVQAILAKESPQAVTGRIFSYNQSAQSIGAFAGPLLGSAIAGFIDYRYVFVGSAILVIFNLINYFTHNNSVTLKK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_011675157.1|87242_87698_+|tRNA	D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase	NA	NA	NA	NA
WP_011675158.1|87690_88695_+	DUF1211 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
88255:88273	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_011675161.1|91021_91663_+	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
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WP_081175717.1|92369_93014_-	FMN-dependent NADH-azoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_011675163.1|93188_95786_+	preprotein translocase subunit SecA	NA	NA	NA	NA
WP_011675164.1|95915_96953_+	3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase	S4W5F1	Pandoravirus	2.7e-46	35.5
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WP_011675168.1|99770_100070_-	YbaB/EbfC family nucleoid-associated protein	NA	NA	NA	NA
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WP_063284018.1|102928_103960_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_063284016.1|104595_104784_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_063284015.1|104776_105394_+	cell filamentation protein Fic	NA	NA	NA	NA
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WP_063284013.1|106463_107150_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_063284012.1|107146_110458_+	DEAD/DEAH box helicase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_011675534.1|120718_121894_+|transposase	IS256-like element IS905 family transposase	A0A0N9STL0	Staphylococcus_phage	2.5e-32	32.3
WP_011675177.1|122933_124169_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_152023924.1|124759_125871_-|transposase	IS3-like element IS981 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	7.2e-50	41.8
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WP_011675182.1|129237_130617_+	argininosuccinate lyase	NA	NA	NA	NA
WP_011675183.1|130633_131830_-	multidrug efflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_011675184.1|132023_132599_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_031286668.1|132740_133109_+	ribonuclease P protein component	NA	NA	NA	NA
WP_011675186.1|133105_133915_+	membrane protein insertase YidC	NA	NA	NA	NA
WP_011675187.1|134002_134917_+	protein jag	NA	NA	NA	NA
WP_003131818.1|135048_135183_+	50S ribosomal protein L34	NA	NA	NA	NA
WP_011675188.1|135360_136272_+	aldo/keto reductase	NA	NA	NA	NA
WP_011675189.1|136341_136656_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_011675190.1|136832_136991_+|bacteriocin	class IIb bacteriocin, lactobin A/cerein 7B family	NA	NA	NA	NA
WP_011675191.1|137073_137754_+|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
141251:141269	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP015901|293798:303708|DBSCAN-SWA
TCTAAAAATTAGCATATTTTGCGAAAAGTTCTACAGCCTCAGATTCCTTTTCTTTTTCCAGATGGCTATAAATATCCATAGTCATTTTTATACTTGCATGTCCTAATCTTGTTTGAATTTCCTTATATGATACTCCAGCATTCAATAATAATGATGCATGAGAATGCCGAAAGCCATGAAATCCAATATCATGAAGTTCAGTAGCTTTAAAAGTAGCCTGTAGTGATTTTCTAAGCCGTTGATAGTCGAGTATTTTACCTTGATTTGTAGGAAAAATAAGTGATTGATTAGGTTGGCCAAGCTTTAAAAAGTATGACTTTTGATATAAATGCCAACGTTGCAAGTGTGATATTGTTTTGCTGTCAATGATAACTACTCGCTTGCTATGCTTTGTTTTCGGTGTATCTTGTATTGTTTGATGTCCAGTAGTAGTTTTACTGACAGAAATTGTCTGCTTTTCGAAGTCAATATCAGACCATGATAAGGCAGTGGCCTCGCCAATCCGCAAACCAGAAGCAGTCAGTAAACGACAAATGGCTCTTAGCTCATTATTTACCCAAGTATTTGGCAAACTCTCCATATAATCAAAATAAGACTGTAGTTGTTCTTTGTTGAAATGCTTTACTTCACGTTCAGTGGTTTCCATTTTAACATTAGGGACAATGACAGTTAGGCATGGGTTAGAGCTTACTAGCCCCATAGAAATCGCATATTTAAATATTCTATTAGTTACATTAAGAAGAAGTTTGTACCCTTTGGCATTCCCTTTATTTCTTCTCATCGCTCCATTAAGTGGTTGACCTGCATTTTTAGCCCAGCGATTGACTTGTAGCTGAATTTGAGAAGTTGTCAGTCTATCAATTTTAGTATTGCCAAAAGCTGGCAAGATATATCTGTTTAGATTGGATCGCATTATCTCTATTGAATGGCTTTTGACTGTATGCTGATACATATCAAACCACGATTCAGCAACCTCAGCAAAAGTCTTTAGCTGCTTTTCTTTTTTCATGCATCCATTTTTAATAAAATCATTCTGTAGACGTTGAAGTTTAGTTTTAACGTCTTTTTTTGTGCGTCCTCTTACATCAGTTCGCACTTGCTTACCTGTCAGCACATCAGTACCTATATAAGCGCCACGGAGAATATAGCGTACTTCTCCGCTTTTTGTTTTGTATTCTTTTATATTTAGTTTGTTCATGTTGACTCTCCTTTTTGCATTTGCCGTGCGCATAATGGAAAATCATGGATATTGTATTGGGATCAAGGAGTTCGTGACAAGCTTTGAACTTTTTAAAACGGCATGATATTGGTACGTAATCGAGATTCAATTTCGGAAACTTTTGATTTTATCTCTTTATCAACTTGGTTTGGTTCAAGAATGCTAACGTAGTTTGTCAAAAAGTCATTAAACTCATCATTGTAATAATCTTTTGTAAACTCTTTTAAAGCTTCTTCAACTTTTTTATATATTTCCGTATTCATCTTCAAAGATAAAGAAGCATCTTCTAAAAGTGGTTGATTGTTTATAAATTTAACAAAGCTAGTTAGTTCATCAGGGAACACTACCTCCAAAATTTCTACTTCCATAAAATTCTCAGGAGTACCATCAGAAGCAAATTCAGTCGGAACGTAATCTTCACTATTTTTATATTTTCCAGTAAATTCAAAAGTACCAATGTAAGAATTGAACTTTTGAACTTGAATAAAGATAGTTAGTTCATCGGATGCTTTTATTTCTTCTTTTGTAGATAATACTACTTCAAAATCAAAAGGGGAATAATCAAAAAAATCGTTTGGAGTTATTTTAAAAAAATTGCAGATACTATTCAAAGTTTCATAATCGATTTGGGAGGACCTATTATTATTAATCCTTGTTAGAGTAGATGGTGCAATGCCCGTTTCAACGGCTAACCTATTCGCTCTTACGTTTCTTTCAGCAAGTAAAACAGATAATCTATTTATAATCATTTTTTCTCCTTTATTTAATATTAGCATATGCGCGAATAAAAAACAATTTAATGAAAATTAAATTTTTATCTTGACTTATATTTTATATTTTGATATTATTTGATTGCGATAAAAAATATTCACATACGCAAATAAAAAACAAAAAGGAGAATTTTATGATTGCGAATAATTTTTCGATACTATTACTTAAGAATAATTTTAAAGCAAAAAGTTTTTCTGCTTACACAGGTATTGCAGAAAGCACACTTTCATCGCTTGTCAATATAGCTGAAAATGGCAAAGATATAAAACTATCAACTCTAATTAAAATATGTAATCATCTTAATTGCACATTATCTGAGCTTATTGAATATTTCCCAGAAGAACAATTAATCAATAACAAGTAATCATCAACCCAAGAACAAACAGCACGGTTTGCACAGCTTTCCGTAATGTGCTTACGCAACTATCCAGCCGTTGCAAGTATTGGTAGATGATTCCACAGCCTAAGCAATGGCTATAAACTGCATGTCCTAACATAAAAATAGCATTTGCCGTGCGCTGTAATAGAGAACCAAGAAAAAGACCGCGATTGTCGATAAACTACGTAGAAATGAGGATAAATGACCCCGTTAGTATTATTTGACAGCCTAGACTTGTCAAAAGCAAACAATGAAAGTTTTTATACGACTACCGAGATTATTGCTGAACGATCAGATAATTCTTACAAAGTTGTATCTGATTTAGTTCGTAAGTATCGTTTTGAACTTGAAAAGATTGCACCTCTAAATAGCTTTTTCAAAAAGCTAAATGTAAATAATGTAGGACGTTCAAGGAAAATATATAAATTGAACGAACAGCAAACTTTATTTTTTATTCCATTATTGGGAAATACTCCAGCAGTTGTGCAATTCAAATTTGATTTAGCTGCTGCATTTGTTGCTATGAGAAATGAGTTGCAAGCACGAAAAATCGAACGTGCTACAGAGAAAGTAACCACTCGTAGCCTAACTGATGCCGTTCATGATTGGGATAATAAATCTAAACATAGTTATATTCACATCAGAAATCTATTAGTGAAAGTTGCTACTGGAGAATCACACACTTATGTTAAGAATCGGGACCCAAGTAATAAAACATCTATGGTTGATTTATTAACTTCTGACGAAATGGAGGAATATAATTATATGAAATCTTTAGTAATTCCAATGCTTTCCAAAAGTGGAGAAAAAGCAATGGATTATCACGACATTAAAGAAAAACTAGAATTTTTGACAACAAAAAAGCCGTGAACGATCCCCATCAATAAACGACTTTTAAACTATTGTAAGGCAAGCTCTTTACGAGTTTTGCTTTACTCAAATTATAACATATTTGAGGAGAAACACAAATGACAGAATTTATAAGTATTGATGAAGCGAAGCTATTATTCACAGAGTGCCTAGCTAGAGCAAGACACCATATTGAAGTGGATGATGTCACTGACAAACTTTTTGATGGTAAAAGCGTAGCCACCTTTACTTTTATGGGGAATGGCTATCAAGTGGAATTGGAGGCTTAAAATGCAATCATCTACTTTTAAAATAGAAGATTTAGAGAAAGCACGAACTTTTGAAAATAAACATTTTCTAATTCTCTCTGTAAAAATGAATTCTGAAATAGGTCATCAAGTTTTTTTAAAAAGCGTAAAAAACAAAAAAACAGTAATTATTTTCAATCAAAATAAAGCTCCTCTTTGTATCAAAGTATCTCATGAGTTTGCACAAAGTTGGAAACTGAAAAAACAAGCCGAAATTAAGAAAAGAGATAAAGTATGAAATTTATAAAAATGGACGTTATAAGCACAGAAATACTACCTACTTGGTGGGTTAAATCTAGTCGTGCTGAAGTAAGAAAAATATTAATTGTCAATGAATCTAAAGCTCCAAAGTTGCATATAAGACTTAAACGAGGAGGGGAATCATGAGTATCTTATCATTTGAAGCAGAGCAGGAACTGACTCAATCAGTATTAAGCCATGTTGATAAATTAGTTGAGGCAAGAATTGAACAAAGTCGCTTGTTCCCATACGTGCAACAAGCTGAATTATTGAAAGAACTGAACATTTCAACCACATATTTAGCTAAACTTCGGGCACACGGATTAAAGCAGGTGATTTTAGAAGATGGAGATCGTACTGTTTGGTATAAAAAAAGTCAATTGGAATCCTTGATGGATTCATTAGCTGAATAGGGGAGAGAAAGTGACAGAAGTTAAAACTGATTATGGAGATTTGGAAAAACAACGCAAAGCGTGGGAACGATTAGAAAACAATCTAAAAAAGGTGATTAATCTTCCCTGGGAAAAATTTGGAAACATTGATGGCGCTAAGATTCCTCAAAGTCTTGATTTAGTCCATATCTTGCATCGTGATATTTATGAATATCCTTATCTGTCAGTAAAATCTACAGGAGAAAATAAAAGAATCAAAAGACCTAGTTTGCATTTAAACAATGGTCAAAATACTGTATCTATTTTCTACGGTGGAGTTAATAAAAAAGCTGAAAAAACTGACGATGGAGAAGATAAAGAAGTAGTTACATTAAAATCAAGTAAAAGTATACCTCGTTTTGTCAATGTGATCCTAGATTATCTATTTGGAAAGCTTGCTTTGCATCATGGATATTTATATGATATTTCAACCTCACAATTCAAACGATTGTCAGAGATGGATATTGCTCATGAATATAAATTAGGGAAACGTTCTGACTTTACAGCTAGTGAGGTTGTAGAAATTATATCTTTTATAGATGAACAGATAAAGCTAAAACCTCTTAAAGAAATAAAAGCATCCATTATTGCTTGTCATGATTTTCAAATGGATTTGCATCAAAAGAAAATTTTAAAAGATTGTTCTATCAAAGACAATGAATGTTACTTTAAAGTGTTTGATTGTCAGCTCTCTGATGTAATTGAAATGTCAATCTTGAACGCTAATTACTTAGGAATGGTGATAGATGATGTAGACAGCTTGCATAATGCGCAACTACAGCCAATCTATCAAATGCTGGTGGCATGTCGTGAGATTACTAAGACAAGGTTCTTTGTCAGTAAATCTGGGACACGTACTGGTAAAGGCTTGCGTCATAAAGTAATTTCATCTATTTTTGATACAAAACATGTCAACCTAGACGAACTCTCAAATAAGGCAACGGCCGCAATGGCTTGGGCTGGATTTGATGGAGGGGAAATGTTACTGGTGACTGAATCAGGAGAAATTGGAAAGAGTTTAGAGCGTTATTTGAAAATACTGGCTACTGAAAGTACATATCGTGGTCGAGGAATTGGCCAAAACTATGCGGATATTAATCTTACTGGGGTGCTGTCTATTGATTCAAATGAAAAAGTCTTATTTTCTTCTGAAATGAATAGCAGGGCTGTGAACATTGCTTTTAAGAATCGTCCTAAAGGGGAGACTGATAGCGAACGTGAATCAATCTTTGCGCCCTATTGGGAAGCATTCACTGAACAGCGAGTATCTGAGACCAGTAGAGAAGCAACGGCGCTTGCAGGAGTGGCTGCTTTATATTCTTCATTTGTCTATTGGAGACAGAATAAATTTAAGTTCAATTTCAAGCAAGTGGAAATGGATAACTTCAGTAGTGATCACTTTGATTTTGACGATGTGCAAATTTATATTATCGAGGAACACATCAAAGGGAACAAGACAATAATCAAAACGGATGAGGTTCAGAAGCTATTGAAAGAAACCTATTACGGTGCTGGAAGTCCTAAACGAAGAAAAGAAGCTCTTGATATTATTGGATATTTTGAAACTACAAGGAAATTACCAACTTTTGAGGGTGAGCGTCGTACTTTTAGAGTAATTGCAATAGGAAATCCACGTCGAGCATCAAAAGCAGTCGCCGCATTTCTTGAATCAATGTATGAGCCACCATAATGACCACACTTTGACCACGATTTTACCACGTTTTATTAATAGCTATAAATAGCGGTATTAAAGGAATGACCACGTAAAATACGCAAAAAACACTTTTTATTTTAAGAAATAATATTTTATTGATTGTATATTAACATTTTAAGTATACCAATTATAGAGCAGTTTATTGTTTTTAATATTATATTATAGAGAATTTATAAAAAAAGCGTATTTTGCGTGTCAATGGCTTAGTAAAGCGAATTATAAGCGTGGTAAAAACGTGGTTGACCACGCAAAAAAAGTGTGGTCTAGAGAACGATTTTAGAAACCTATAGTCATCAAATGAAAAAAGCTATACCAATTTAGAAAAAGAGGTTTGATAATGAGCTTTAATTTTACAAAGACAGTAGTCTTTACAGTCAATGAAAAAATGCCATTTAATATTCCTTATGATGAAGAGGAATTTGAGAAATTTAGTCATGCACTTTTAGTTGATAAAAATGCGGAGTGGCTAGGTGGCTACTTATTTAACATAAAAAATATTGTTTCAATAAAACGAGTTTAAACATAGGGAGATAAAAAAATGAGCGACAAAGTAATTATGGTTTATACAGTCAATGATGCATCAGCATTTGTCTTTAATCAGACACTGGATAATATGAAAGTCATTGGCAAATGGCAAGATGACCCTGACCAGTTATTTAAACTAGGCACTACCGTATTTAATGGAAGTCATGTTGTGGCGATTAAAGTCGCAAAACGTGGGCCACTTGGTACAGTACCAGAATAATAAAGGAGAAATAATGAGGGTAAGACACCCACCAAAATCAGTTGTTTTAACTAACTTATAAAAACAGCTATCAACCCAATAAACATAGGGAATTACAGGGGCTATCAATAGTTCCGATTATAATATATATTTACTAACAAATAAATACAGGAGAAACCACAATGAAAACATTTGAAGAAATTGAATCAGAACTTATCAATCAAAAAGACGGTAATTTATTGGAAATTGATAAGTTTAAAAATAATAAAGAAAAAGCGGAAAGAGCCTTGAAAATCGCTAATGAGGAATTAATCAAAGCCGAGGAGACCGCTGACTTAGTAGCCTATGATAAAGCCAAGGGGGATATATGGACATCACAACACGCTATTGAATTGTATCAAAAACAGTTAGACAAATTGGAAAGCACTCCATTAGTGACCAAAGATGATTATAATCAATTGGTCTCAGATATTGAAAAGGCTGCCGATAAGTTACAAGATGAGTTGAATATTAAGGGCGCTAAGCTAATGGCAGAACTTAAGGCATTGGCTGATGAATCTAATGCGGTCTACCATAAAGCTGACGAGTTGTTACGTATTGCGCAGTATGATGTTTATAAAGACGCTGACTGTTTAGTCGCGTCAAACGGTACCAGAATAACACGAGCGGTAGAGTATAAACGAAACAACTCAGTCCGAAATGTTTATAACTTTAAATATCTTGGCAACACATTTCTTGATGATATGAACGCATAATAAAGGGGGGACACCATGACAGAAACAATCAAAGACAACAGCCAACAACATACAGGTAATTGGGTTGAGGACATCCGAAAAGGCGCAGAGATTGAACGCAAAGAAAGAGAGGAGACGAGCAGACAGCGGAGCAAAGAAGCCTTTGACAAGATGAGAGATAAGGCGAACGCCGAACGTGATGAGATGAATGGATTGATGAAACAAGTTGCTGAAAGAAATTACAATGATAATAAGTTAAAGCGTGACAAAGAAATTAAAGTCGCTAAACAAAAAGCTATGCAACAGATTGAATCTGAATATGAAAGCAAGTACGGAGTCAATACCGACAAGACGGAACGAACTAAGCAAGCATTGAGCAACTTACTAAAAGGTTTATAATTAATAAAAAAATATTTATATTAATTTATTATTTATTAATTTTATTTTTTAAATCTGAAAATATTTTTAAAGAAACTATGGGGGCATATCCCCCTCCCTCTGGGTCAGCTCGTACTTCACGCCGTCACTGTACATATTTTTTCTTGAGTATGTGTTTAACAAGCAGAAAGGAGGAGGAGAAATGAGCGTTATTCGGTGCAAAACTTGCAAAAATTTGTTCAATACAACTAAGCAAGAAAGATATTGTAGCGAAGAATGTAGAAAAGAAGCTCGTAAGAAAGTTCGTAAAAAATGGGAAACAAAGAATCCTGAATATATGAAAAATTATATGCGAGGATATCGTGAAAAATAGCCTTGTAAGTTTAGTTTCATCGCAGTACAAAATATAAAACAAATAAAAAGTCCCCGAAAGGGCTATGATATAATAGTAGTTAAGAAATCTGTTTTAAAGCCCGTTCCCAGCGGGCTTTTTTCGAAAATAATGTTTGATTAATCTTTTCCAATCTTTAGCCGTATGAGATAATAAAATTATCATCATGGAAAGCTGACAATTATGCAAAGAAAAAATCTAAAAAATGATACTGACTATCCGTTAATTATGACTCGAGAATTAGCTGCTGAATTTATTGGTGTAAGTGGTCCTACATTTGATAAGTATTATCGCTATGCACATAATTTCCCAGTTGTGAAAAATGGAGATGTTGAAGAAGCTTTTCCACGAGATCCAATCATTAAATGGGTTGCGGATAATTGGCAATCATTGGAAAAAAGGAGAAAGAAATAGAATATGTTGTGAGGAAGTATCTCTAACGTGGAGGTGCTTTTTTGTATTCCTAAATTTTAGGATTATTGTCAAGGGAAGCAGTTTCAATTACTCCCTCATGGAGGATGTAAATTTATTTGTATTTCTTTATGTTGAGTACATGAAAGATACAATGAATACTTGCAAAAGAATGATCTAGATAGTAGAATGAAAGTAGCAAATAAATATAATAACGAAGGTGTGGTTATGGATGATCAAATAATAATTGAAGAAGAAATTGTACGAAATGAGAATAGAATAGATGATGAGAAGTATGGGGATAACGGACTTTTTCAGATAAACTCATGGGGAGCAGATTTATCGTTTAGGGAACTTATCAATATGTACGCAGAAGATGAGTTACAGAAACCTGAATTACAAAGATATTATGTCTGGGATAAGCGAGAAGCAAGCAGATTTATTGAGTCTATATTATTAGGTTTACCAGTTCCAAGTATCTTTTTAGCACGAACTCAAGAAGAAAATTATTTGATAATTGATGGCTACCAAAGAATAATGACAGTTGTGGATTTTGTGAATGGGGTATTTACTAAAGATGGTAGTAGCTTTAAACTTTCTCCAACTGTGAATGAATTATGGGCAAATAAAACCTTTAGTCAACTTTCATCAGAAGAACAAAAGAGGTTGAGAAGAACTACTATTCACAGTATTATTTTTGAACAAAAAAGACCCACCAATGATGATACGAGCATGTATCAAATTTTTGAGAGGATAAACACAGGAGGCAGAACTCTCTTCCCCCAAGAAATAAGAAACTGTGTTTATCACAATGAAATAAATACTCTATTGATTGAGTTAAATGTAAATCCAGCGTGGCGAACTCTTTTTGGACAAAGTGAAAAAGATAGTCGAATGAGAGATATGGAATTTATTTTAAGATTTTTAATGTTTAGTAATAAAAAATTCTCTGAAACTACTGCGATCTCATTAAAAAAAGAACTTAATCTATTTATGGATATTACCAAAAATAAAGACGGGAAGTATAGGTGTGAAGACTATAAAAAACAATTTTTAGAAACAATGGAGTTGTTGGTAAATACTGATAAAGATGCTTTTCGAAATATAAATGAAGAAGGATCTATTTTAAGTAGATTCCATCCAACAATATTTGATTCTATAGCAGTCGCTACTAAAATGGCTATTGAAAATGGTGTTGATATTTTATGGAAAAACGATAGAGAGGCTTTTTTAAAGGCTAAGAGAAATCTTCTTAAAGATTTTCAATTTATTGAATATACAACTACACGTACTACCAATACAGCGAGTATAAATGGTAGAATTGATCTTGCATATAAATATCTCTTTGAAGAGGTACAGTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

>NZ_CP015901|293798:303708|302574_303708_+|WP_041167514.1|DBSCAN-SWA
MDDQIIIEEEIVRNENRIDDEKYGDNGLFQINSWGADLSFRELINMYAEDELQKPELQRYYVWDKREASRFIESILLGLPVPSIFLARTQEENYLIIDGYQRIMTVVDFVNGVFTKDGSSFKLSPTVNELWANKTFSQLSSEEQKRLRRTTIHSIIFEQKRPTNDDTSMYQIFERINTGGRTLFPQEIRNCVYHNEINTLLIELNVNPAWRTLFGQSEKDSRMRDMEFILRFLMFSNKKFSETTAISLKKELNLFMDITKNKDGKYRCEDYKKQFLETMELLVNTDKDAFRNINEEGSILSRFHPTIFDSIAVATKMAIENGVDILWKNDREAFLKAKRNLLKDFQFIEYTTTRTTNTASINGRIDLAYKYLFEEVQ
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MSFNFTKTVVFTVNEKMPFNIPYDEEEFEKFSHALLVDKNAEWLGGYLFNIKNIVSIKRV
>NZ_CP015901|293798:303708|297986_299684_+|WP_011675328.1|DBSCAN-SWA
MTEVKTDYGDLEKQRKAWERLENNLKKVINLPWEKFGNIDGAKIPQSLDLVHILHRDIYEYPYLSVKSTGENKRIKRPSLHLNNGQNTVSIFYGGVNKKAEKTDDGEDKEVVTLKSSKSIPRFVNVILDYLFGKLALHHGYLYDISTSQFKRLSEMDIAHEYKLGKRSDFTASEVVEIISFIDEQIKLKPLKEIKASIIACHDFQMDLHQKKILKDCSIKDNECYFKVFDCQLSDVIEMSILNANYLGMVIDDVDSLHNAQLQPIYQMLVACREITKTRFFVSKSGTRTGKGLRHKVISSIFDTKHVNLDELSNKATAAMAWAGFDGGEMLLVTESGEIGKSLERYLKILATESTYRGRGIGQNYADINLTGVLSIDSNEKVLFSSEMNSRAVNIAFKNRPKGETDSERESIFAPYWEAFTEQRVSETSREATALAGVAALYSSFVYWRQNKFKFNFKQVEMDNFSSDHFDFDDVQIYIIEEHIKGNKTIIKTDEVQKLLKETYYGAGSPKRRKEALDIIGYFETTRKLPTFEGERRTFRVIAIGNPRRASKAVAAFLESMYEPP
>NZ_CP015901|293798:303708|296367_297036_+|WP_011675323.1|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_011675331.1|301202_301565_+	hypothetical protein	Q9AZG6	Lactococcus_phage	1.0e-53	95.0
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304862:304885	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP015901|424228:436385|DBSCAN-SWA
AATGATTATTCCAGAAAATATTGAAAATTTAGCTGAGCTTGTCAAAGGTCCAGAAAAAACAGTCTTCTTTTTCACAGCTGGTTGGTGTGGAGATTGTAATTTTATCAAACCTAAAATGCCAGAAATTGAAACAGAGAATCCAGAATTTAGATTTGTTGAAGTAGACCGTGATGAGTACATGGATCTTGCTATCGAGTGGGGAATTATGGGAATTCCAAGTTTTGTTGTTATTGAAGATGGACAAGAAAAAGCTCGTCTAGTCAATAAATTACGCAAAACCAAAGAAGAAGTGAATACTTTCTTAGCAAGTGCAAAATAAGACTGATTTCTTGAGGTAAAATGGAGTCAAATACTGACCATTGATAAATCCAGAAATATATTCTATAATAATCACTGTTAAGAAATTAAAAGGGAAAATTTAAAAATGATTGCAACATATAACACAAACGTCGGCGATGTTTTAATGCTTATCACGGCAAATGATAGAGGTGAAAAGGTAAACTTTGAACGTAAGGGAAAAGTAGCACGTATCTTTATCGAAGAAACTGGGGCAACAGTCGCTTGGAATATTTTTGAAGCCAAGTCATTACTGACAGACTTGTCAGGAAATGGACAAGTCAAATTATCATCTGATGATGTTGAAATCTTGAACAAAGAGCTTGGAAAATCAGGATTTAGCGATGTTCTTGTGCATGATTCGCAACCAAAATTTGTTGTCGCTGAGATTGTAGAAATGCAAGACCATCCAGACTCAGATCATCTTCATATCTGTAAAGTTAATGTTGGTTTTGCTGATCCAGTACAAATTGTTTGTGGTGCACCAAACGCGTCACTCGGATTAAAAACAGTCGCAGCACTTCCAGGCGCAATGATGCCTAATGGAGCATTGATTTTTCCAGGAGCTCTTCGAGGTGTTCAATCTTATGGAATGCTTTGTTCAGCGCGTGAACTTGAATTACCCGATGCTCCCGATGTTCGTGGAATCATTGAACTTTCATCAGCTTTGGCTGCGGGTACAGCTTTTGATTCAGAAACTATGTGGCAAGCTTAATAATAAATCTGTCAAAATAATTTATTTTGACAGATTTTTTTATCTAATAATTAAAATAATTATTTCACAATGTTCACAAGCGCTTACAAAAGAAAATAGATTGACTTATGCTAAACTGAATAATGTAAAAAGAATTTTACATTTAAAGGAGATCTATTAGCATGAAAATCGTAGTTATCGGTACAAACCACGCAGGCATTGCTACAGCAAATACATTACTTGAACAATATCCCGGGCATGAAATTGTCATGATTGACCGTAATAGCAACATGAGTTATCTAGGTTGTGGCACAGCAATTTGGGTTGGAAGACAAATTGAAAAACCAGATGAATTATTTTATGCCAAAGCAGAGGATTTTGAGGCAAAAGGGGTAAAAATTTTGACTGAAACAGAAGTTTCAGAAATTGATTTTGCTAATATGAAAGTTTATGCAAAAACTAAATCTGATGATGAAATAATTGAAGCTTACGACAAGCTTGTTTTAGCAACAGGTTCACGTCCAATTATTCCTAATCTACCAGGCAAAGACCTTAAGGGAATTCATTTTCTGAAACTTTTTCAAGAAGGTCAAGCAATTGACGCAGAATTTACCAAAGAAAAAGTAAAGCGTATCGCAGTCATTGGTGCAGGATATATCGGTACAGAGATTGCAGAAGCAGCTAAACGTCGGGGTAAAGAAGTTCTTCTCTTTGACGATGAAAATACTTCGCTTGCTTCATATTATGATGAAGAATTTGCCAAAGGAATGGATGAAAACCTTGCTCAACATGGAATTGAACTTCATTTTGGAGAACTGGCCAAAGAATTTAAAGCGAATGAGGAAGGTTATGTATCACAAATCGTAACCAATAAAGCGACTTATGATGTTGATCTTGTCATCAATTGTATTGGTTTTACTGCCAACAGTGCCTTGGCAAGTGATAAGTTAGCTACCTTCAAAAATGGAGCAATCAAGGTGGATAAACATCAACAAAGTAGTGATCCAGATGTTTACGCGGTAGGTGATGTTGCGACAATTTATTCTAATGCCTTGCAAGATTTTACTTATATCGCTCTTGCCTCAAGCGCTGTTCGGTCAGGAATTGTTGCAGGACACAATATTGGTGGAAAAGAATTAGAATCTGTTGGTGTTCAAGGGTCTAATGGTATTTCAATTTTTGGTTACAATATGACCTCTACAGGACTTTCTGTTAAAGCTGCTAAAAAATTAGGTTTAGAAGTTTCATTTAGTGATTTTGAAGATAAACAAAAAGCTTGGTTTCTTCATGAAAACAACGATATTGTGAAAATTCGTATCGTATATGAGACAAATAGTCGCAGAATTATTGGAGCTCAACTTGCTAGTAAAAGTGAGATAATTGCAGGAAATATAAATATGTTCAGTTTAGCGATTCAAGAGAAAAAAACAATTGATGAACTAGCTTTGCTTGATTTATTCTTTCTCCCCCACTTCAACAGTCCATATAATTATATGACAGTTGCAGCTTTGAATGCCAAATAAAAAATAGAAATCTATCTGCTTGATAGATTTTTTTATTTTTTAGTGACAAATGCTCAAACTTTACGTATAGAAAGTTAGGAGGATTTTATAATGAATAAAACCATGTTGATTGGTCATTTAACAAACGCACCTGAAATTTCGAAAACAACGAACAATAAATCTTATGTCCGTGTGACTCTGGCAGTCAATCGCCGCTTCAAAAATGAAAAAGGAGAGCGAGAAGCAGACTTTATCTCGATAATTTTATGGGGAAAATCAGCAGAAACATTGGTTTCCTATGCTAAAAAAGGAAGTCTTATTTCTGTAGAGGGAGAGATTAGAACTAGAAATTATACTGATAAAAATGAACAGAAACACTGTATTACAGAAATCTTAGGTTTGAGCTATGATTTATTGGAAAGTCGTGCGACTCTTGCCTTGAGAGAAAGCGCTGTAAATTTTGAGGAACTCTTACTTGAAGCTGATGAGCTCCCTTTCTAATTTATTTGATTAAATCTAAATGTTTTCTCTTGACTAAATCTGACCATTGAGATAAAATAAGAATATGTTAGCACACAACTATTAAGAGTGCTAAAAATAAAAAATGGAGTAAAGTATAATGTTGAAACCTTTAGAGAATCGCGTAGTTTTACGTGTAAAAGAAGAAGAGGAAAAATCTATGGGCGGAATCGTATTAACGAGCGCTTCCCAAGAAAAACCTCAAACAGCGGAAGTTATTGCTGTCGGTGAAGGGAAAACAACTAATCATGGGACACTGATTTCTCCACTCGTAAAAGTTGGAGATACAGTAATTTTTGAGAAATTTTCCGGAACGACTGTCAAAATGGACGGTGAAGAATTCTTGATTCTCAAAGACTCAGACCTTCTTGCAATTGTAGAGTAAAAATATAAAAGCAATCAATTTTTGATTGTCTTTTGTATATCTTAAAATCTATTAATTAAAAATATATTCTTAAAAAAGGAGCTAAAATGTCAAAAGAAATTAAATTTTCAAGTGATGCTAGAACAGCGATGATGCGCGGAATTGATATTCTTGCCGATACAGTAAAAACAACCCTTGGGCCAAAAGGGCGTAATGTTGTTCTTGAAAAATCATATGGTTCACCTTTAATTACAAATGATGGTGTTACAATTGCCAAAGAGATTGAACTTGAAGACCATTTTGAAAATATGGGAGCTAAACTTGTTTCGGAAGTTGCTTCAAAAACAAATGATATTGCAGGTGATGGAACAACAACAGCGACAGTTTTGACACAAGCTATTGTTCGTGAAGGATTGAAAAATGTTACTGCAGGTGCAAATCCAGTTGGTATTCGCCGAGGAATTGAACTCGCAGCTGAAACAGCAGTTGCTTCAATTAAAGAAATGGCAATTCCTGTTCATGATAAATCAGCAATCGCTCAAGTTGCTACCGTTTCATCACGTAGTGAAAAAGTTGGGGAATATATTTCTGACGCAATGGAGCGTGTAGGTTCTGACGGAGTTATCACAATCGAAGAATCAAAAGGAATGCAAACAGAGCTTGATGTTGTTGAAGGAATGCAATTTGACCGTGGATACTTGAGTCAATATATGGTTTCTAATACAGAGAAAATGGTTGCTGAGTTAGATAATCCTTATATTCTGATTACGGATAAAAAAATCTCAAATATTCAAGAAATTTTACCGCTTCTTGAACAAATTTTGAAAACAAATCGTCCACTTTTAATTGTTGCTGATGATGTTGATGGAGAAGCATTGCCAACTCTTGTTCTTAATAAGATTAAAGGAGTCTTCAACGTAGTCGCTGTAAAAGCACCGGGATTTGGTGACCGCCGTAAAGCTCAATTGGAAGATTTAGCTATCTTGACAGGTGGTACAGTAATTACTGAAGAACTAGGCCTTGATCTTAAAGATGCTACACTAGAAGCTTTAGGACAAGCTGCTAAAGCAACTGTTGATAAAGACCATACAACAATTGTTGAAGGTGCTGGTTCTGTTGATGCCATTTCTGATCGTGTGGCTATCATCAAAGCACAAATCGAAAAAACAACTTCTGATTTTGACCGTGAAAAATTGCAAGAGCGCTTAGCAAAATTAGCTGGTGGAGTTGCGGTAGTTAAAGTAGGAGCCGCAACAGAAACAGAACTTAAAGCAATGAAACTTTTGATTGAAGACGCACTTAATGCAACACGTGCTGCTGTTGAAGAAGGTATCGTTTCTGGTGGTGGTACAGCTCTTGTTAATGCCATCGCAGCTTTGGATAAACTTTCAGAAGAAGGCGACATTCAAACAGGAATTAACATCGTTCGCCGTGCGCTTGAAGAACCAGTTCGTCAAATCGCGGCCAATGCAGGATATGAAGGTTCAGTTATCATTGATAAACTTCGTTCAGAAAAAGTTGGTACAGGATTTAATGCAGCGACAGGTCAATGGGTAAATATGATTGAAGAAGGAATCGTTGACCC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

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MIATYNTNVGDVLMLITANDRGEKVNFERKGKVARIFIEETGATVAWNIFEAKSLLTDLSGNGQVKLSSDDVEILNKELGKSGFSDVLVHDSQPKFVVAEIVEMQDHPDSDHLHICKVNVGFADPVQIVCGAPNASLGLKTVAALPGAMMPNGALIFPGALRGVQSYGMLCSARELELPDAPDVRGIIELSSALAAGTAFDSETMWQA
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MKIVVIGTNHAGIATANTLLEQYPGHEIVMIDRNSNMSYLGCGTAIWVGRQIEKPDELFYAKAEDFEAKGVKILTETEVSEIDFANMKVYAKTKSDDEIIEAYDKLVLATGSRPIIPNLPGKDLKGIHFLKLFQEGQAIDAEFTKEKVKRIAVIGAGYIGTEIAEAAKRRGKEVLLFDDENTSLASYYDEEFAKGMDENLAQHGIELHFGELAKEFKANEEGYVSQIVTNKATYDVDLVINCIGFTANSALASDKLATFKNGAIKVDKHQQSSDPDVYAVGDVATIYSNALQDFTYIALASSAVRSGIVAGHNIGGKELESVGVQGSNGISIFGYNMTSTGLSVKAAKKLGLEVSFSDFEDKQKAWFLHENNDIVKIRIVYETNSRRIIGAQLASKSEIIAGNINMFSLAIQEKKTIDELALLDLFFLPHFNSPYNYMTVAALNAK
>NZ_CP015901|424228:436385|431851_432553_-|WP_003131580.1|DBSCAN-SWA
MKKILVVDDEKPISDIVKFNLTKEGFEVFTAFDGEEALEAFKEVQPDLILLDLMLPKLDGLDVAREIRKTSDTPIIMVSAKDSEFDKVIGLELGADDYVTKPFSNRELLARIKANLRRINVAPAESTDNVKKELIIGNLRINPAHYAAYKNDKQLDLTHREFELLYYLAQHLGEVITRENLLETVWGYDYFGDVRTVDVTVRRLREKVEDTPSRPQYVSTRRGVGYYMSNPHD

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_011675460.1|424228_424546_+	thioredoxin family protein	A0A0K2FIM3	Achromobacter_phage	9.0e-06	31.9
WP_011675461.1|424651_425278_+|tRNA	DUF4479 and tRNA-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011675462.1|425439_426780_+	FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_011675463.1|426870_427260_+	single-stranded DNA-binding protein	A0A218MNB4	uncultured_virus	2.9e-22	45.7
WP_011675464.1|427378_427663_+	co-chaperone GroES	A0A221S386	uncultured_virus	2.3e-13	43.0
WP_011675465.1|427749_429378_+	chaperonin GroEL	A0A219YK78	uncultured_virus	2.2e-156	56.8
WP_011675466.1|429429_430242_-	MBL fold metallo-hydrolase	A0A0C5AJ83	Bacteriophage	1.5e-33	38.1
WP_011675468.1|430431_431859_-	cell wall metabolism sensor histidine kinase WalK	W8CYF6	Bacillus_phage	3.9e-32	32.9
WP_003131580.1|431851_432553_-	response regulator transcription factor	W8CYM9	Bacillus_phage	1.2e-42	39.7
WP_011675469.1|432730_433366_+	dTMP kinase	M1PSC7	Streptococcus_phage	2.7e-73	66.0
WP_011675470.1|433498_434359_+	DNA polymerase III subunit delta'	M1NSC1	Streptococcus_phage	3.1e-64	44.8
WP_011675471.1|434408_435191_+	stage 0 sporulation family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011675472.1|435183_435510_+	DNA replication initiation control protein YabA	NA	NA	NA	NA
WP_011675473.1|435509_436385_+	16S rRNA (cytidine(1402)-2'-O)-methyltransferase	M1PLC5	Streptococcus_phage	1.6e-100	66.1

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP015901|566885:694497|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>NZ_CP015901|877530:918584|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_081175741.1|877530_878421_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_011675814.1|878609_880652_-	cadmium-translocating P-type ATPase	M1I547	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	4.2e-19	25.4
WP_011835499.1|880840_881698_+	bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase	A0A249XZQ2	Enterococcus_phage	2.6e-39	39.0
WP_031286477.1|881868_883122_+	exodeoxyribonuclease VII large subunit	A0A2H4UVM9	Bodo_saltans_virus	1.2e-45	32.3
WP_011675817.1|883124_883364_+	exodeoxyribonuclease VII small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_011675818.1|883590_884481_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_011675819.1|884539_885685_+	glycerate kinase	W6LM47	Streptococcus_phage	4.5e-47	38.8
WP_014572853.1|885909_886767_+	polyprenyl synthetase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011675821.1|886767_887268_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_011675822.1|887343_888150_+	TlyA family RNA methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_011675823.1|888146_888593_+	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_011675824.1|888772_890440_+	DNA repair protein RecN	NA	NA	NA	NA
WP_011675826.1|891141_891708_+	DUF1211 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011675827.1|891802_892324_+	DUF805 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011675828.1|892345_893272_+	DUF805 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_032940916.1|893515_894457_+	16S rRNA (cytosine(1402)-N(4))-methyltransferase RsmH	NA	NA	NA	NA
WP_011675830.1|894612_894993_+	cell division protein FtsL	NA	NA	NA	NA
WP_011675831.1|894989_897287_+	penicillin-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_011675832.1|897361_898351_+	phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase	NA	NA	NA	NA
WP_011675833.1|898549_898834_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011675834.1|898984_900502_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
899595:899611	attL	NA	NA	NA	NA
WP_011675835.1|900609_901272_+	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	3.2e-21	32.4
WP_011675836.1|901631_902519_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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WP_011675837.1|903754_904429_+	GTP pyrophosphokinase family protein	NA	NA	NA	NA
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WP_011675843.1|908638_909196_+	HdeD family acid-resistance protein	NA	NA	NA	NA
WP_011675844.1|909258_909504_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_011675850.1|913275_914166_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_011675851.1|914300_916172_+	YhgE/Pip domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003131392.1|916360_916693_+	metal-sulfur cluster assembly factor	NA	NA	NA	NA
WP_041167441.1|916828_917803_+|integrase	tyrosine-type recombinase/integrase	A0A142F1N9	Bacillus_phage	8.6e-31	28.6
WP_010890648.1|917903_918584_+|transposase	IS6-like element ISS1S family transposase	A0A1X9I6C6	Streptococcus_phage	8.5e-110	84.5
925030:925046	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>NZ_CP015901|943041:996564|DBSCAN-SWA
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MLANERKKRIVYYLKINRRATIEELLTLMDCSISTLRRDLNELEKEKSLRRVHGGAELTQDLSEELSISEKTSKNIQEKEEIAQIALSKIKDGDIVFLDAGTTTGLLAELINQSHLYLTIVTNSVTHLAKLTDGRLIVYLLGGRVKKVTDAIIGSQALEQLSAYQFNVAFVGANGFDTKHGAMTPDHEEAAIKGLAVKQSQNAYVLADSSKLGQMSFVKFANSEEVELITENN

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_011675878.1|952683_953574_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_011675879.1|953812_954928_+	CDP-glycerol glycerophosphotransferase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011675881.1|956044_957280_+	phosphopentomutase	NA	NA	NA	NA
WP_011675882.1|957337_957607_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011675883.1|957677_958382_+	purine-nucleoside phosphorylase	NA	NA	NA	NA
WP_011675884.1|959639_960086_+	ASCH domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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WP_011675886.1|960656_962324_+	formate--tetrahydrofolate ligase	NA	NA	NA	NA
WP_011675887.1|962432_963026_+	C40 family peptidase	A0A1V0DZX6	Clostridioides_phage	1.4e-15	43.0
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WP_011675889.1|964285_965173_+	amino acid ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
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WP_011675892.1|966363_967290_+	thioredoxin-disulfide reductase	G3MA85	Bacillus_virus	3.4e-85	51.1
WP_011675893.1|967430_967679_+	preprotein translocase subunit SecG	NA	NA	NA	NA
WP_041167444.1|967920_970374_+	ribonuclease R	Q0GXV6	Lactococcus_phage	8.6e-104	44.2
WP_041167547.1|970392_970980_+	isochorismatase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011675896.1|971057_972116_+	endonuclease	NA	NA	NA	NA
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WP_011675899.1|973614_974952_+	PFL family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011675900.1|975047_975527_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011675901.1|975597_976293_+	histidine phosphatase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011675902.1|976289_977036_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011675903.1|977050_977455_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011675904.1|977602_978646_+	heat-inducible transcriptional repressor HrcA	NA	NA	NA	NA
WP_014572780.1|978675_979215_+	nucleotide exchange factor GrpE	NA	NA	NA	NA
WP_011675956.1|979286_981110_+	molecular chaperone DnaK	A0A0N9QXN8	Chrysochromulina_ericina_virus	3.4e-129	45.8
WP_011675957.1|981272_983117_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011675958.1|983286_985050_+	oleate hydratase	NA	NA	NA	NA
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WP_011675960.1|986377_987079_+	DeoR/GlpR transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_011675961.1|987161_988079_+	1-phosphofructokinase	NA	NA	NA	NA
WP_011675962.1|988078_989983_+	PTS transporter subunit EIIA	NA	NA	NA	NA
WP_152023931.1|990067_991442_+|transposase	IS3-like element ISLla3 family transposase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	1.7e-53	43.3
WP_095586744.1|991498_992646_-|transposase	IS3 family transposase	U5P429	Shigella_phage	2.3e-46	41.0
WP_011675964.1|992923_994249_+	DUF805 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011675965.1|994712_995114_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081175751.1|995673_996564_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

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MSLKQLKDVTYFKLNNEINIPVNGSIPLAKDKEAITAFFKENVEPNRYEADTYIDKLNWLVKEEYLEAEFLEKYKPEFITNLRKELSKFEFHFDSFMAAYKFYNQYAMKNNDGSLYLEDFEDRVLMNALYMADGDEKLANNLAFAMINRRYQPATPTFLNAGRKRRGEFVSCFLLQLTDDMNSIGRTINSALQLSKNGGGVGLNLTNLRAAGAPIKGYDGVAAGVVPVMKLFEDAFSYANQLGQRQGAGVVYLSLFHPDIMEFLSTKKENADEKIRVKTLSLGVTVPDKFYELVKKGETMYLFEPYFVEKYYGKPFAEVDITAEYDKMVANPEIRKTPINARELEQELSKLQQESGYPYIVNVDTVNQANPVDGVISMSNLCSEILQVQTPSVLNDDQTYKVVGTDVACNLGSTNVLNMMTSSDEFGTSVESMVRALTFISETSNLDTVPTVRKGNDEMHAIGLGAMGLHSFLAQNQIHYDSKEAVEFTSVYFMLLNYYTLVASNKLAVEKGASFKNFEKSAYADGSYFDKYLTHDYFAAVSPKVQELFKGIAVPTIADWTELRDTVKTSGLYNSYRMAVAPNGSISYINDCSSSIHPIVNRIEERQEKKVGKIYYPAAGLATETIPYYKSAYDTDMRSVIDVYAAATEHVDQGLSLTLFMRSTLPEGLYEWKVANNKMTTRDLSILRNYAYKKGIKTIYYIRTFTDDQEEVGANQCESCVI
>NZ_CP015901|1013573:1027202|1023175_1024009_+|WP_011675992.1|DBSCAN-SWA
MSEKYVVFDFETTGFSAQKNEIIQIGAVKYDENNQELARFNQLVKNQRSYVSTEITQLTGIKPADLLNQPTIEEILPDFLDFIKGHLLVAHNAPFDISFLYQAIIDCAITDVEAFRVYDTLAESKKLLTMSSYALENFKDLLEMNDLRSHDALNDCLITAKLYQYLQKIEEVERSVESEVADELGQLDLFGDSSDEITDSIRRKLNLPITKALVYYQQNLERKWERFEVLGISVEREYSTGSSLKIRLHNSEKVKIHSDFLKEMQKANFVTIMEEEK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_011675982.1|1013573_1014266_+	cell division ATP-binding protein FtsE	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.6e-31	34.8
WP_011675983.1|1014258_1015194_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_011675984.1|1015303_1016281_-	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit beta	A0A096XT60	Enterococcus_phage	6.0e-117	65.7
WP_011675985.1|1016565_1018734_-	class 1b ribonucleoside-diphosphate reductase subunit alpha	A8E2R1	Enterococcus_phage	3.3e-256	60.7
WP_011675986.1|1018870_1019293_-	class Ib ribonucleoside-diphosphate reductase assembly flavoprotein NrdI	A0A142F1R4	Bacillus_phage	1.7e-12	36.4
WP_011675987.1|1019294_1019513_-	redoxin NrdH	C3U2K9	Lactococcus_phage	5.8e-12	47.6
WP_011675988.1|1019686_1020328_-	glycerol-3-phosphate 1-O-acyltransferase PlsY	NA	NA	NA	NA
WP_011675989.1|1020606_1022541_+	DNA topoisomerase IV subunit B	G3M9Z3	Bacillus_virus	1.8e-125	43.4
WP_011675992.1|1023175_1024009_+	3'-5' exonuclease	A0A0K2SUJ2	Clostridium_phage	5.3e-21	40.0
WP_011675993.1|1024005_1024455_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_011675994.1|1024727_1027202_+	DNA topoisomerase IV subunit A	G3M9Z5	Bacillus_virus	1.0e-96	31.9

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>NZ_CP015901|1034774:1124185|DBSCAN-SWA
TATGACTCAGTTTACCACAGAACTACTTAACTTCCTAGCCCAAAAGCAAGATATTGATGAATTTTTCCGTACTTCTCTTGAAACTGCTATGAATGATCTGCTTCAAGCAGAGTTATCAGCCTTTTTAGGGTATGAACCTTACGATAAAGTAGGCTATAATTCTGGGAATAGTCGTAACGGAAGCTATTCACGGCAATTTGAAACCAAATATGGGACTGTTCAGTTGAGCATTCCTAGAGATCGTAATGGGAACTTTATTCCAGCTTTGCTTCCCGCTTATGGACGTCGAGATGACCACTTGGAAGAGATGGTTATCAAACTCTATCAAACCGGTGTAACGACTCGAGAAATTAGTGATATCATCGAGCGAATGTATGGTCATCACTATAGTCCTGCCACAATTTCTAATATCTCAAAAGCAACTCAGGAGAATGTCGCTACTTTTCATGAGCGAAGCTTAGAAGCCAATTACTCTGTTTTATTTCTTGACGGAACCTATCTTCCATTAAGACGTGGAACCGTTAGTAAAGAATGTATTCATATCGCACTTGGCATTACACCAGAAGGACAGAAGGCTGTTCTTGGATATGAAATCGCCCCAAATGAAAACAATGCTTCTTGGTCCACCCTGTTAGACAAGCTTCAAAACCAAGGAATCCAACAGGTTTCTCTTGTAGTGACCGATGGCTTCAAGGGGCTTGAACAGATTATCAGTCAGGCTTACCCATTAGCTAAACAACAACGTTGCTTAATTCATATTAGTCGAAATCTAGCTAGTAAAGTGAAACGAGCAGATAGAGCGGTTATTCTGGAGCAATTTAAAACGATTTATAGTGCTGAAAATTTAGAAATGGCAGTGCAAGCTTTAGAGAACTTTATCGCCGAATGGAAACCAAAGTATAGGAAAGTCATGGAAAGTCTGGAGAATACGGATAATCTTTTAACTTTTTATCAGTTTCCCTACCAGATTTGGCACAGCATTTATTCGACAAACCTCATTGAGTCTCTTAACAAAGAAATCAAACGTCAAACGAAAAAGAAGGTTCTTTTTCCTAACGAGGAGGCTCTGGAACGTTACTTAGTTACTTTGTTTGAAGATTATAATTTCAAGCAAAGTCAACGCATCCATAAAGGGTTTGGCCAATGTGCTGACACACTTGAAAGCTTATTTGATTAATATTCTTCAACTCTACTTGAGTGTTTACACATAATTATTGACAGTATCAAAAAAATAGTTGAATGGCATGATTATATGAATATAAGGGAGTAAACTATCAGATTATGTTATTGAGGAGTTAAGGGAAAGTCTTTCAAAAAAGTTTTAAAAATGATGACAATAAACAGCTAGAGAGACTAATTTAATTAACGACTTGAACTTATAGTGCTAGAAGGCAAAGCATTATAAGTTTTTTTTAGTGCTAAAGAATTCATTGACTGACAGAAAGTATTTTTAAAGGAATTTTCTGATTTTTGGGGGCCTTCTATTTCTGAAAAGGGCTAAAAGTCTATTTTATGATATTTATTGACCCTCGTTGACGCGGTGTGGTATAATTAAAATATGAAAAAATTACTGTCACTTGTAATTATCGTTGTTGGAATTATTGCTGACCAAGTTTTCAAAAATTGGGTTGTTGCTAATATTCAACTTGGAGATACAAAAAAAATTTGGCCAGATGTATTGAGCCTGACTTATATTAAAAATGATGGGGCTGCTTGGTCATCATTTTCTGGTCAACAATGGTTTTTCCTTGTTTTGACACCTATTGTACTCATTGTTGCACTATGGTTTTTGTGGAAAAAAATGGGACAAAATTGGTATTTTGCTGGCTTAACTTTGATTATTGCGGGAGCTTTAGGGAATTTTATGGACCGCGTTCGTCAAGGTTTTGTTGTCGATATGTTTCAAACAGAATTTATGAATTTTCCAATCTTTAATATCGCAGATATCTTACTATCTGTCGGTTTTGTTGTTCTATTTATTGCAATTTTGACGGACAAAGAAACAAAATAAGCTTTTTAAAAAACGAGTGACAGTAAGTAGCATTAAAACCTCTATGAAAAAGGAAAAATCGATTGCCTATAATAAAAATTACTGAAGAAAATAAAGATTTGCGTCTTGATAAAGCACTTGCAAATCAAACAGAGTACTCTCGAAGTTTACTGACAGAGCTTATAAAAAATGACAAAGTTTTTGTCAATAATGAAGCAAAAAAAGCAAAATATAAAGTGAAAACGGGAGATAGAATCGAATTTGAGATTCCGCAAGCCGAGGTCCTTGATGTTGCGGCTGAAGATTTACCCTTGGAAATTATTTATGAAGATTCAGATGTTGCAGTCGTCAATAAGCCACAAGGAATGGTCGTTCATCCTGCGGCAGGACATGCTTCTGGAACCTTAGTGAATGCAATTATGTATCATATAAAAGACCTTTCAAGTATCAATGGAGTCATTCGCCCGGGAATTGTACATCGGATTGATAAAGATACTAGTGGTCTTTTGATGATTGCTAAAAATGATAAAGCACATGAAAGTTTAGCTGCTCAATTAAAAGACAAGACCAGCAAACGTCGCTATTTAGCAATTGTCCATGGAGAACTTGCCAATGATAAAGGGACAATTGAGGCCCCAATCGGTCGTAATCTTAAAGACAGAAAAAAACAAGCGGTTGTGTCTGGTGGGAAACCTGCTGTGACTCATTTCGAGGTTTTAGAACGTTTTGTTGGTTATACTTTAATTGCTTTACGCTTGGAAACTGGACGAACACATCAAATTCGAGTTCATATGCATTATATTGGTCATCCTGTTGCAGGTGACCCGCTCTATGGCCCGAATAAAACTCTAACACCCAATAAGGGGCAGTTTCTTCACGCAGAAACGCTAGGATTTGAACATCCAACAAGTGGAGAGCTTATGGAGTTTCAAGTTGATGCTCCTGACCTCTTCAAGGAACAATTAGAAAAACTCAGAGAACAAGGTTAAACTTGTTCTTTTTGTATGTTTCATTTAAAATTCATGCTAGTTTTATGATAAAATTTCTTTGTTTTGTCAGCAAATAAGTCAAGATTTAAAAGGCTTATATAGTATAATAAGAGTAGTAAGTGAGGGGTTTTAATTTAGGGGAAATTAAGGAGGGGTTATGAATTTTTTTAGTCAGATATTGCATAATCAAATTCTACTGACAGCAATTGTGAGTTGGGCCTTAGCACAACTCATTAAAATAGGGATTGAGCTCATCCGAACTCATCGAATCAATTGGCAATTAGTTTTTGCAACCGGAGGAATGCCTAGTTCTCACAGTTCATTAGTGGTAGCTTTGGCAACCGCAACGGGATTAAGACAAGGTTTTGAGTCTCCTCTTTTTGCGATTGCAACTGTGTTAGCTTTTGTTGTTTTATATGATGCCCAAGGAATTAGACGGCAGGCAGGGAATCAAGCAAGAATTATCAATCGTATGTTGCAAAATGTTGAAAATGCTGGAATTAAAGTGGACAAGAATCTAAAGGAATTATTAGGACACACACCAATTCAAGTCGTTGGTGGAACTATTTTGGGGATAATTGTTGCACTAATAATGAATTAAAAAGAAAGACACAATCATAAAAATAAAATTTAAAATTTGTTTTTATTGTACTTTTTAGATTCAAAGTTAAAAATGAGAATTTATCATTTGAAAATTAAGGTTATTATAAGAAACAAAGGCCAAGCTATGGTAAAATAGTAATATGAATAATATAGTATTTATTAAGTATAAAAAAAGATTCTGTCTTACTTTAATGATGTAGTGACCCCCAAAATATAGACTTTTCAAATCTATATTTCGGAGGTCTTTTCTTATGGTCAAATATTCCATAGAATTAAAACAACGCGTTATTCAAGATTATTTATCTGGCAAGGGAGGCTCTACCTATCTTGCTAAACTGCACAACGTAGGTTCATCTAGTCAGGTTAGACGCTGGATTCGCAATTATCGAGCAGAGGGACTTCCTACAGCTCACTCCAAAGTCAATAAAAATTATTCTATGGAGTTGAAAGAAAATGCGGTACAATGTTATTTAACAACTGATTTAACGTATGAAGCTGTGGCAAGAAAATTCGAAATTACTAATTTTACCTTACTTGCAAGCTGGGTTAATCATTTCAAAATTTATGGAGAAGTCCCAATAAGCAAAAAGAGAGGACGGCGTAAAAAACTAGAAAGCATTGCATCGTCTATGACTCAGAACCCAAATGATTCTCAACGAATTAAAGAACTTGAACAAGAATTACGTTATGCGCAAATTGAGGTAGCTTATTTAAAAGGACTTCGGAGATTGGAGAAAAATGCTCTAATGAACAAAAATCAAGACTCATCTACAGTCTCCGTAAAACCTTCAAACTCAAAGAAATCTTGAAAGTTACAGGATTCCCTAAAGCCACTTATTATTATTGGGTTAACTGTTTTGAACGGGTAAACAAAGATGAGCTTATCGAAAAAGAAATGCTTAAAATACGTCAAGAACATGCCAATGCAGGTTATCGTCCAATGAGTGAATTACTTAAGCAACGTGGCTATCATCACGTCAACCACAAGAAGGTACAGCGCTTAATGAAGAAGCTAGGGCTTCGTGTGACGTCTTATTGGCACAAATCACGTAAATATAATTCATATAAAGGAAAAGTAGGGACGGTAGCTAAAAATAAATTGCACAGACGATTCAGAACTTCCATTCCTCATCAAAAAATCACAACAGATACGACAGAATTCAAATATTATGAAGATGTAATTCAGAAAAAGTGTTATCTCAATCCTTACATTGATTTATTTAATAGCGAGGTGATTAGTTATCATATCTCTAAACAACCCTCTTATCAATCAATTGATATTGCTCTAAATCAAGCCTTAGCTGTGACATCTGATTGTCCTTATCGACGTACTTTCCACTCAGATCAAGGATGGGGATACCAAATGAGAGACTATGTTTCTAAATTAAAATCTCATAGAATTTTTCAGTCTATGAGCC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_011676006.1|1042861_1043818_+	glycosyltransferase family 2 protein	I1TED8	Salmonella_phage	2.4e-49	38.1
1043210:1043226	attL	NA	NA	NA	NA
WP_011676007.1|1043945_1044632_+	response regulator transcription factor	W8CYM9	Bacillus_phage	2.5e-32	34.1
WP_011676008.1|1044652_1045168_+	DUF2127 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676009.1|1045171_1046497_+	HAMP domain-containing protein	W8CYF6	Bacillus_phage	9.6e-25	30.4
WP_011676010.1|1046506_1047163_+	phosphatase PAP2 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676011.1|1047344_1049162_+	glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)	Q76DQ7	Chlorella_virus	6.2e-91	36.3
WP_041167450.1|1049280_1049964_+	JAB domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676013.1|1050263_1051388_-|integrase	site-specific integrase	Q9B016	Lactococcus_phage	3.0e-213	99.7
WP_011676014.1|1051511_1052345_-	DUF4428 domain-containing protein	X5JB37	Clostridium_phage	3.9e-16	36.1
WP_011676015.1|1052363_1052930_-	hypothetical protein	A0A1P8BM30	Lactococcus_phage	2.5e-54	58.8
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WP_011676018.1|1053841_1054564_+	phage antirepressor protein	A0A1P8BLQ9	Lactococcus_phage	9.9e-133	98.8
WP_011676019.1|1054576_1054912_+	DUF771 domain-containing protein	Q38331	Lactococcus_phage	2.2e-58	99.1
WP_010905685.1|1055049_1055244_+	hypothetical protein	Q77JL6	Lactococcus_phage	3.0e-28	100.0
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WP_011676021.1|1055621_1055870_+	hypothetical protein	A0A059NT64	Lactococcus_phage	1.6e-34	96.3
WP_011676022.1|1055972_1056362_+	hypothetical protein	O48508	Lactococcus_phage	6.0e-68	99.2
WP_134794186.1|1056381_1056981_+	ERF family protein	Q6JM07	Lactococcus_phage	2.9e-85	96.5
WP_011676024.1|1056980_1057331_+	single-stranded DNA-binding protein	Q6JM06	Lactococcus_phage	1.2e-56	95.7
WP_011676025.1|1057464_1058274_+	helix-turn-helix domain-containing protein	Q9MCG3	Lactococcus_phage	1.2e-110	83.3
WP_011676026.1|1058254_1058476_+	hypothetical protein	Q94M91	Lactococcus_phage	1.9e-34	100.0
WP_011676027.1|1058465_1058855_+	RusA family crossover junction endodeoxyribonuclease	R9QLL1	Lactococcus_phage	9.2e-69	99.2
WP_011676028.1|1058858_1059098_+	DUF1031 family protein	Q38102	Lactococcus_phage	1.6e-34	92.4
WP_041167451.1|1059202_1059493_+	hypothetical protein	Q9AZU9	Lactococcus_phage	2.7e-49	99.0
WP_011676030.1|1059514_1059694_+	DUF1497 domain-containing protein	Q9MCB5	Lactococcus_phage	3.5e-23	96.6
WP_011676031.1|1059683_1060256_+	DUF658 family protein	Q9AZU8	Lactococcus_phage	1.0e-84	92.1
WP_011676032.1|1060270_1060603_+	hypothetical protein	Q9G0E0	Lactococcus_phage	2.3e-12	94.1
WP_011676033.1|1060626_1060986_+	hypothetical protein	A0A1P8BLI9	Lactococcus_phage	1.5e-60	95.0
WP_139949456.1|1060957_1061644_+	DUF1642 domain-containing protein	A0A1P8BMI6	Lactococcus_phage	1.2e-50	54.5
WP_011676037.1|1061945_1062401_+	dUTP diphosphatase	Q9AYX8	Lactococcus_phage	8.0e-72	99.3
WP_011676038.1|1062419_1062605_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676039.1|1062601_1062745_+	DUF1660 domain-containing protein	O80276	Lactococcus_virus	6.7e-17	74.5
WP_011676040.1|1062752_1062938_+	hypothetical protein	Q8LTR8	Lactococcus_phage	6.2e-15	67.2
WP_011676041.1|1062934_1063153_+	hypothetical protein	A0A1P8BKA1	Lactococcus_phage	1.2e-30	95.6
WP_010905705.1|1063145_1063328_+	hypothetical protein	Q9AZZ4	Lactococcus_phage	4.3e-29	100.0
WP_011676044.1|1063804_1064227_+	RinA family protein	Q9AZM9	Lactococcus_phage	3.2e-51	99.3
WP_011676045.1|1064674_1065142_+|transposase	transposase	A0A1P8BLJ8	Lactococcus_phage	2.2e-77	95.4
WP_011676046.1|1065134_1066523_+|terminase	phage terminase large subunit	Q8LTR4	Lactococcus_phage	2.1e-272	99.4
WP_011676047.1|1066523_1067885_+|portal	phage portal protein	Q9AZ65	Lactococcus_phage	2.1e-245	96.2
WP_011676048.1|1067888_1068932_+|capsid	minor capsid protein	B5SP29	Lactococcus_phage	8.8e-191	98.0
WP_011676049.1|1069046_1069709_+	DUF4355 domain-containing protein	Q9AZ62	Lactococcus_phage	1.8e-72	97.7
WP_011676050.1|1069710_1070529_+|capsid	N4-gp56 family major capsid protein	Q9AZ61	Lactococcus_phage	4.5e-142	99.3
WP_011676051.1|1070528_1070729_+	hypothetical protein	B5SP32	Lactococcus_phage	9.6e-30	100.0
WP_011676052.1|1070712_1071045_+|head,tail	phage head-tail connector protein	B5SP33	Lactococcus_phage	2.1e-53	99.1
WP_011676053.1|1071041_1071353_+	hypothetical protein	A0A1P8BKV3	Lactococcus_phage	6.7e-54	97.1
WP_011676054.1|1071349_1071676_+	HK97 gp10 family phage protein	A0A1L2K255	Streptococcus_phage	4.7e-50	92.6
WP_011676055.1|1071672_1072068_+	hypothetical protein	A0A1P8BM84	Lactococcus_phage	2.2e-65	97.7
WP_011676056.1|1072078_1072588_+|tail	phage major tail protein, TP901-1 family	Q77K19	Lactococcus_phage	1.8e-88	98.8
WP_011676057.1|1072703_1073054_+	hypothetical protein	A0A1P8BLS4	Lactococcus_phage	5.6e-57	98.3
WP_011676058.1|1073137_1073407_+	hypothetical protein	A0A1P8BKT4	Lactococcus_phage	7.3e-41	97.8
1073309:1073325	attR	NA	NA	NA	NA
WP_011676059.1|1073422_1076047_+	tape measure protein	A0A1P8BM12	Lactococcus_phage	1.6e-249	95.8
WP_011676060.1|1076056_1076818_+	hypothetical protein	Q9AZ58	Lactococcus_phage	2.0e-139	97.2
WP_011676061.1|1076817_1079757_+	peptidoglycan DD-metalloendopeptidase family protein	A0A1P8BMB8	Lactococcus_phage	0.0e+00	89.3
WP_011676062.1|1079774_1082219_+|plate	BppU family phage baseplate upper protein	A0A1P8BMJ5	Lactococcus_phage	1.4e-74	89.8
WP_011676064.1|1082615_1082918_+	hypothetical protein	Q8LTP6	Lactococcus_phage	1.7e-49	95.0
WP_011676065.1|1082907_1083132_+|holin	holin	Q9G090	Lactococcus_phage	2.5e-34	98.6
WP_011676066.1|1083128_1084418_+	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	Q9FZS8	Lactococcus_phage	1.4e-246	99.8
WP_011676067.1|1084616_1084916_+	hypothetical protein	Q9AZG1	Lactococcus_phage	5.7e-26	56.1
WP_011676068.1|1084929_1085841_+	DUF4065 domain-containing protein	Q9AZG0	Lactococcus_phage	1.1e-152	89.0
WP_003132737.1|1086196_1086847_-	redox-sensing transcriptional repressor Rex	NA	NA	NA	NA
WP_011676069.1|1087069_1087462_+	Spx/MgsR family RNA polymerase-binding regulatory protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676070.1|1087634_1089542_+	ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	5.2e-48	28.8
WP_014572500.1|1089704_1089845_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676071.1|1089962_1090592_+	orotate phosphoribosyltransferase	Q58MW1	Prochlorococcus_phage	5.2e-05	26.8
WP_011676072.1|1090744_1092016_+	dihydroorotase	NA	NA	NA	NA
WP_080513955.1|1092317_1093340_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_081175754.1|1093530_1094421_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_011675534.1|1094787_1095963_-|transposase	IS256-like element IS905 family transposase	A0A0N9STL0	Staphylococcus_phage	2.5e-32	32.3
WP_011676075.1|1096077_1096674_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_152023927.1|1096886_1097997_+|transposase	IS3-like element IS981 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	7.2e-50	41.8
WP_011676077.1|1098101_1098503_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676079.1|1099033_1101463_+	BspA family leucine-rich repeat surface protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676080.1|1101727_1102396_+	DnaD domain-containing protein	C5J987	Streptococcus_phage	1.1e-05	31.4
WP_011676081.1|1102417_1103074_+	endonuclease III	NA	NA	NA	NA
WP_011676082.1|1103066_1103756_+|tRNA	tRNA (adenine-N(1))-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_011676083.1|1103752_1104526_+	Nif3-like dinuclear metal center hexameric protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676084.1|1104560_1104926_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676085.1|1105064_1105880_-	sugar-phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_011676086.1|1105932_1107276_-	HD domain-containing protein	A0A1B1ISR1	uncultured_Mediterranean_phage	1.2e-27	33.0
WP_011676087.1|1107448_1107847_+	DUF1934 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676088.1|1107839_1109015_+	DUF998 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003130644.1|1109184_1109499_+	50S ribosomal protein L21	NA	NA	NA	NA
WP_011676089.1|1109501_1109837_+|protease	ribosomal-processing cysteine protease Prp	NA	NA	NA	NA
WP_003130646.1|1109838_1110123_+	50S ribosomal protein L27	NA	NA	NA	NA
WP_011676090.1|1110489_1111911_+	divalent metal cation transporter	NA	NA	NA	NA
WP_021212212.1|1111984_1112953_+	phosphate starvation-inducible protein PhoH	H6X2N1	Pseudomonas_phage	2.0e-48	48.4
WP_011676092.1|1113022_1113517_+	NUDIX hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_011676093.1|1113607_1114096_+	rRNA maturation RNase YbeY	NA	NA	NA	NA
WP_011676094.1|1114079_1114535_+	diacylglycerol kinase	NA	NA	NA	NA
WP_011676095.1|1114551_1115130_+	nucleotidyltransferase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676096.1|1115187_1115838_-	ComF family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676097.1|1117188_1117824_+	YigZ family protein	A0A1X9I5T8	Streptococcus_phage	6.6e-56	54.5
WP_011676098.1|1118431_1119451_+	DUF475 domain-containing protein	A0A172Q0Y5	Acinetobacter_phage	5.2e-55	43.4
WP_011676099.1|1119559_1120327_+	5'-nucleotidase	NA	NA	NA	NA
WP_011676100.1|1120563_1121211_+	GIY-YIG nuclease family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676101.1|1121210_1122164_+|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
WP_011676102.1|1122163_1124185_+|tRNA	glycine--tRNA ligase subunit beta	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>NZ_CP015901|1215848:1284929|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_088792927.1|1215848_1216960_-|transposase	IS3-like element IS981 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	1.2e-49	41.4
WP_011676291.1|1217671_1218739_+	DUF475 domain-containing protein	A0A172Q0Y5	Acinetobacter_phage	1.2e-54	41.5
WP_011676292.1|1218901_1219234_+	winged helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_011676294.1|1219909_1220827_+	NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_153927107.1|1222080_1222227_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676296.1|1222405_1223113_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676297.1|1223716_1224787_+	tyrosine recombinase XerS	NA	NA	NA	NA
WP_011676298.1|1224836_1226183_-|tRNA	methylenetetrahydrofolate--tRNA-(uracil(54)- C(5))-methyltransferase (FADH(2)-oxidizing) TrmFO	NA	NA	NA	NA
WP_011676299.1|1226254_1228381_-	type I DNA topoisomerase	E3T4K4	Cafeteria_roenbergensis_virus	1.9e-99	37.6
WP_011676300.1|1228646_1229495_-	DNA-protecting protein DprA	NA	NA	NA	NA
WP_011676301.1|1229643_1230024_-	RidA family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676302.1|1230063_1230774_-	acetolactate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
WP_011676303.1|1232216_1233239_-	ketol-acid reductoisomerase	NA	NA	NA	NA
WP_011676304.1|1233284_1233761_-	acetolactate synthase small subunit	NA	NA	NA	NA
WP_011676305.1|1233753_1235478_-	acetolactate synthase large subunit	A9YVT5	Ostreococcus_tauri_virus	6.6e-42	27.4
WP_011676306.1|1235488_1237201_-	dihydroxy-acid dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_011676307.1|1237320_1238103_-	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	2.9e-13	28.0
WP_011676134.1|1238657_1239548_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_011676135.1|1239740_1240274_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676136.1|1240273_1241650_-	3-isopropylmalate dehydratase large subunit	NA	NA	NA	NA
WP_011676137.1|1241706_1242159_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676138.1|1242201_1242648_-	NUDIX domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676139.1|1242649_1243681_-	3-isopropylmalate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_011676140.1|1243821_1244613_-	DUF805 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676141.1|1244639_1245125_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676142.1|1245160_1246702_-	2-isopropylmalate synthase	E5EQ69	Micromonas_sp._RCC1109_virus	2.3e-06	37.5
WP_011676143.1|1247124_1248084_+	rhodanese-related sulfurtransferase	NA	NA	NA	NA
WP_011676144.1|1248116_1248902_-	histidinol-phosphatase HisJ family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676145.1|1248902_1249541_-	bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP diphosphatase HisIE	NA	NA	NA	NA
WP_011676146.1|1249537_1250317_-	imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF	NA	NA	NA	NA
WP_011676147.1|1250285_1251026_-	1-(5-phosphoribosyl)-5-[(5- phosphoribosylamino)methylideneamino]imidazole-4- carboxamide isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_011676148.1|1251025_1251634_-	imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisH	NA	NA	NA	NA
WP_011676149.1|1251678_1252359_-	phosphotransferase	A0A193CJY5	Infectious_laryngotracheitis_virus	4.9e-09	26.1
WP_011676150.1|1252460_1253069_-	imidazoleglycerol-phosphate dehydratase HisB	NA	NA	NA	NA
WP_011676151.1|1253069_1254377_-	histidinol dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_011676153.1|1255216_1256173_-	ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit	NA	NA	NA	NA
WP_011676154.1|1256172_1257243_-	histidinol-phosphate transaminase	NA	NA	NA	NA
WP_011676155.1|1257772_1258564_-	DUF1295 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_139949461.1|1258560_1260267_-	DegV family EDD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_152023933.1|1260326_1261181_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_011676157.1|1261408_1261771_-	DUF2177 family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676158.1|1261846_1262326_-	tryptophan-rich sensory protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676159.1|1262644_1264648_-	ribonuclease R	Q0GXV6	Lactococcus_phage	3.2e-80	39.6
WP_011676160.1|1264790_1265966_-|transposase	IS256-like element IS905 family transposase	A0A0N9STL0	Staphylococcus_phage	1.4e-32	32.7
WP_011676161.1|1266174_1266507_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_011676162.1|1267087_1267978_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_011676163.1|1268293_1268692_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_011676164.1|1268799_1269945_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_011676165.1|1270051_1271716_-	acetolactate synthase AlsS	NA	NA	NA	NA
WP_011676166.1|1271870_1273127_-	tetratricopeptide repeat protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676167.1|1273154_1274327_-	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
WP_011676168.1|1274392_1275013_-	class I SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_011676169.1|1275014_1276622_-	NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_011676170.1|1276666_1278037_-	23S rRNA (uracil(1939)-C(5))-methyltransferase RlmD	E4ZFI6	Streptococcus_phage	3.8e-141	56.0
WP_011676171.1|1278099_1278921_-	MurR/RpiR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_011676172.1|1279058_1279763_+	N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase	NA	NA	NA	NA
WP_011676174.1|1281240_1283586_-	HAD-IC family P-type ATPase	NA	NA	NA	NA
WP_011676160.1|1283753_1284929_+|transposase	IS256-like element IS905 family transposase	A0A0N9STL0	Staphylococcus_phage	1.4e-32	32.7

Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP015901|1529943:1540256|DBSCAN-SWA
ATTAATGTCTAAAATGGCGGAGTCCAGTAAAGACCATCGCAATACCATATTTATCACAAGCTTCAATCACTTCTTGGTCACGAACAGAGCCACCCGGTTGAACGATTGCTTTAATTCCCGCTTTGGCAATTTCATCAATATTGTCCGCAAATGGGAAAAAGGCATCTGAGCCAAGTACGGCATTTTCTTGAAGAAGGGCGTCCTTATCAGCTGTCGCTTCCAAGGCAATTTTTACCGAGCCGACACGATTAGTTTGCCCAGGGCCAACGCCAAGCGTTTGGTGGTCATTTGTTACAATGATTCCATTTGATTTGACAAATTTTACTGCTTTCCAAGCAAACTTCATGGCTTCCATTTGTCTGTCAGTTGGTTGAACTTTAGTCGCCACTGTCCATTCTTTCGGATTTTCAACAATGACATCTTGATTTTGAACAAGAAGCCCACCAAGTACCCCTGTTACAAGCGCTTCTTTTTCTGATTGCTCTTTTTTAGAAAAATCAACGGTTAAAAGACGAATATTTTTCTTTTTACTCAAAATTTCTAAAGCCTCTTTACTATATGATGGAGCAATAATAATCTCAAGGAAAATCTTGCTCATTTTTTGAGCCGTTTCCTCAGTGACTTCTCTATTTAAAACGATAATCCCACCAAAAATCGAAACAGGGTCCGCTTCATAAGCATAATCCCAAGCTTGTTCAATATTTTTAGCTGTTCCAATCCCACAAGGGTTCATATGTTTGAGGGCCACAACGGTTGGCTCATCAAAATCCCTTGCAATTTGCAAAGCTGCATCAGCATCACGAACATTGTTATAACTTAATTCTTTACCATGAAGTTGATGACTTTGCGCAATAGAGTAAGTTGTTGGTAATCCTGATTCATAAAAATCAGCACTTTGTTGTGGATTTTCACCATAACGCATCCCTTGTTTAAGGTCATAAGTCAAGGTTAATTTTTCGGGTTTTGTATCTTCTACTGGAAATTCTTCTGTCAAATATTGCGCAATGAGGGCATCATAACTTGCAGTATGACGAAAAACTTTTGCTGCAAGTTGCTGACGAAGTTCTAAACTTGTTTCCCCGTCTGCTGAAAGCTCTTTTTCTACTTTTTCATAATCCATCGGGTCACAGACAACTGTGACTGCCGCATGGTTTTTAGCTGCCGAACGTAACATCGACGGCCCACCAATATCAATTTTTTCAATCATTTCTGCTTGGCTACCACCAGCAAGCAAGGTTTCTTTGAAAGGATATAAATTTACAACAACTAAGTCAATCGGAGAAATATGATGTTCAGCCATTGATTTCATGTGACTGTCCAAATCTCTACGTCCAAGGAGTGCACCATGAATCAGCGGATGTAATGTTTTAACTCGACCATCCATCATTTCTGGAAAGCCAGTAACTTCATCAATTGCAATATTCGGAATTTCCTCTTGGTCCAGAACTGCTTTTGTTCCGCCTGTTGAGATAATTTCCCAACCTAACTCCTGAATTTTCTTTGCAAATTCTACAATACCTTCTTTGTCTGAAACACTGATAAGTGCACGTTTTGACATGATTTCCTCCAAGTTTTCTACTTACCGTTCTGTAAGTCAAGATTTTTCTGCTAAAAGTACTGATAAGTCTGTCAGTAACTATTTATCATGTCTTTATTTTACATTTATCGTTTGGAAATAAAAAGCGCTAGTTTAACAACTAGGCTTTTTTTAATTTTATTGTTCGGAAATAACCTTCACTCTTTAATCAAAAATTCTTCATTGAAAACTCCAATATAAGGCAATTGACGATAACGCTCTGCATAATCAATTCCATAACCTACGATAAAAGCATCTGGTACTTCAAAACCGACATAATCAGCGTCAATATCTACTTTACGACCACTTGGTTTGTCTAACAAAGAGATGATTTTTACAGATTTGGCTTGACGTCCTGTCAGTAATTTTTTAAGATAAAGCAAAGTATTTCCAGTATCGATAATATCTTCAACAATCAAAATATCACGTCCATGAGCCACGGTTGATAAATCTTTCAAAATTCGAACTTCACCAGATGATGAGATTCCGTATCCATAACTGGTGACGTCCATAAAATCAACTTCAGCATCAATTGATAATTCCTTGAGCAAGTCAACTGTAAACATGATTGACCCTTTCAAAATCCCGACAACGAGAGGATTCTTTCCCTCATAATCTCGTGAAACAACTTCAGCAAGCTCTTTGACACGTTCAGCAATTTGTTCTCTTGTAAATAAGACTTCTTTTAAATGTGGATGCATTTTTCTCTCCAATTTTTTCACAATATGCTTCCATTTTAGACTTTTTTTCAGAGAATCAAAAGGGTAAAGGCAGAGATTTGGTCTTTTTTAGCTTACAACGTTCGGAAATAGTAAAATTTATAATTCATATTTTCTTAATCAACTTTAATCACAGCCAAATCTAACATCGTTTGCGGTGTTTGAATAATGGCTGCTTCTCCCGAACGGGGTTGCCAACCTAAAAGTCTTGTTGATTTCTCATTTGAACATGCCGTATTTTGCCCCAAAAATGTGGCTGGCATCGCCAAACTTTTATCAAAACGTGCCAAGATCTTCACTAAAAAGTCTGGAATAACTTGAGTAGAAACTTTCTTGGCTTTTGAACCAAATTCTTTTTTCAAAAATTTTGCTTGTTCCTGATAAGTAATATTTTGCCCTGAAGTCGCGATAAAACGCTGACTAATGGCTTCTTCTTTTTCAAGAGCTAACAAATGTAAATCAGCAACATCACGAACATCAACATAGTCAAATGCCAAATTTAAAAGTCTAGGCATTTTTCCTTCAAACATATTTTTAATTGCCGCGCTAGAATGTGAAAAATCATTCCCAAGAATCGGTCCCATGACAGCCGTAGGTAGAACTGAGGCTCCTTCCATACCATAAGATTTGGCAAGTTTCCAAAACTCCAGTTCAGCCATTGTTTTAGAACGTTGATAAGCATTAATTGGAGCATCAAGCTTTGTCCAGTCTTTTTATGTTAAGATTTCTGGATGATGCTTATGCCCCGCTAAAACAGCACCAGATGCTGAGGTCAAAACCACTCGTTTAACTCCTGCTTCCTTGGCTGCTCTCATCACAAACTTCACTCCATCTACAGCCATTATTACCATTAAATCATCAGCGTCAGGACGTTGCAAGGGTGTTGGAGAAGCGACGTGGATGACAGAATCCACTCCAGTCATTGCTTGACTCCATCCTTCTTCTTTAGTTAAATCCGTTTGAACAAAGTCTAGGTCAGTAAAATCAGCAATCCCTCCTTGCTTCATCATTTTCTTCACTTCTTCTTGTCTAGACATCATCCGCAAGGTCGCCCGTACTCGATAGCCTTTTTTTAATAAAGCAATCATGATGAACATAGCAATATAACCCGAACCACCAGTTACTAGTATTAATTTTTTATTTGTATTTGTCATTTTTTTCTCTCAACAACATCCGTTACACTTGAAACTCATGTGGAATTATTGTACGATAGAAGTAGTAAAAATACAAGCTTAAAATCCGCTTGTGTGACAGTCTAAGGAGATGTGTAATGGCAGCGACGAACTATTCCCAAACCATCAAAAATGATACAAAAGATTTTATTACTACAGCTATTCTACAGCTTTCGGGCATTCAAAAAAAATCTGAAAAGCCAAAAACTCTTGATCAACTGACCGTTTCAAACGTTTGTCAGCGGGCAGGAGTCAGTCGAATGGCATTTTATCGTAATTTTGATTCAATCAATCAAGTCATCTATCAATACTATCAACCACGAATTTCCGAAAGCTTTGAAATCATTCGCCAGAATGTGTCGGCAACAATAAAAATTGAGAACCAATTAGAATTTTTTGAAGACTTCAAAAATGACCTCTACCTTTCTGAAAGTCAAGGCTATGAGCCCATCATTCGTCAGATTTATATTGAAGAAATTGAAAAATTTTACGAAGAAACAAATGACGAATATTTCATTACTTTTGTGGCAACTGGAGTTTATGCTGTTTGGCGAAAATGGTTAATGAATGGTCAAGATAAACCAATTGAAGAAATTCATGAACTCATCAGAAAAATTGTCACGATTTAAGTAATAAAAAAAGACACAAAAGGTGTCTTTTTTTGATATAAAATTTATAGTCTAAGCAATTCCCTGACCTAAATGAATGACTTCATCCAAATAATTTTGAGTTTCATCATACAAATGGTGAGTAATCATAATCACAGTCAAATCGGGATTTTCTAAAATATTTTTTTCTACAGCCAGAGCCGTTTTCTTATCAACACTGGCAGTGCTTTCATCCATCACTAAAATCGGTTTTGTCCCCATTAATTCCCGCGCAACAGATAATCTTTCTTGCTGACCTCCTGATAAATTTTTATCATAAATCGTATCAAGTTTATTAAACACAAAATCATCAGCACAGGCAATTCTAATCGACTTATCAAAAATATCTGGCGAAATCTTACGACCCAAAGTCAAATTTTCCTCTACCGTTTCCCTAAAAAGGTAAGGAAATTGCATAATTACGCTCATGACATGTGGTAAAGATTTTCGGTTAATTCCCTTATAATCTTTTCCATCAAGTAAAATTTCTCCTTCATAATCTCGCTTATTGCCGACTAGCAAATTAATTAAGGTTGATTTACCACTACCACTATCCCCGATAATCGCATATTTCTTCCCTTTTTCAATGACAATTTCTGGATATTCAATTTTTTGGCCATCAGGAAAAGCGACAGACAGATTTTTTAACTCCAGTTTACTTTCAAAGTCTGTCACTTCTTCTCCGTCAGTAACTTTTGATTCGTCAGCAATTTTTCCATATTTTTCTAGCAATTTCCCAGTAGCATTGAGCAAAATCAAGCTATTTACTACACTTTTTGAGTAATTAGTAACTGTTCCTGACAGATTCCCCACGCTCATGACAACACCGATTCCAATCTGACCATTCATGATGAGAAAACCAGCAACAGCTAAAATCAAAAATTGTCCCAACATACTGGCCCCTAATAAAGAATATTGCATCCAAGCCCGAGTAAAAATTAATTTTACATTTGCCGTAGCCAATTGATTAAATTTACCCATGGTTCGCTCTTGCATCAGCCCCAGTTGTTTATTGTGATAGAGCACTTCATAGCCACGTAAGTAATCTGTAGATGTCGCTAAAGCATCATTAGCAACATCTGAAACCTGTTCTGTGTCTCGTTCCACTGATTTCTTAAAGACTTTTGGAAAATAGAACAAAATGGCTCCAACTAGAAGTGTTGTCAAAAGCAATACCCAGTGGAAAAAGATGATTGCAATTCCTGAGAATAGCATCGCAACGATTCCCGTATAAACAAAATAAATCTGATGGAAACCATTATCATAAAGTAGTTTTGTACCATTATTTAACCAGGAATTATAATCTTCTTTACTGTTTTTTTCAAAATCAGAATAAGAAATTTCCGTCAGAGGTTCAATGATATCCCGGCGTACAGCATTAAGCTGCTTTTGTATGGCAATTTCTTTCCAAACATCACGCACTCCCTGAACAAAACTATCGACCACCCAGAGGACAATGTCAATAGCTAACCATAAGAAAAATTGATTCATTTCTCTAGCAATCAAAGAATTGAGTACATTGGCCAAAAAGACCGAACTCAAGACCGCAAGAGCAATGTCAATCGTGATAAGTAAGAAAACCATAAAATTTTCAAATTTGAATTCTTTAAGATACTTTACCATTTTTCCTTCTCTTATTTTACTTAAGATTATGTTACCACTACATTGTAGCATTTAAATTTCAAAAGTAAATAGCGCTTACAGAAGTTTTTTAGATGTTTTATTTTCTTAAAAGAACTGAAAATTTTCTCTTATTTTTATCTTTTTTAATCCCTCATTTCTCATTTATTAATGGCCAAATAAAAAAACTTCATCATTGCTGATGAAGAATTATTTGACGAACAACTTTTGGATAGAGCTCATGTTCCGCTTCATGAACTCTCTCTTCATAAACTTCCAAACTTTCGTGATAAGCCACAGGGATTTGCGCGATAATTTCGCCAGTATCCACGCCCTCATCAACATAATGAATTGTAATTCCTAGACCATATTTTGCTTCATGTGACTCCTCAATCGCATGAGGAGAGCCAGCAAAATCAGGCAGAAAAGAAGGATGCACATTGATAATCTTTCCTTTATATCTTGCCAACATCGTCGAACCGATGATTTTCATATAACCAGCCAAGAGAATTAAATCAATTTCTTGTGCTTCTAAAATTTCCACCAAAGCTTTCTCATAGTCAACTTTTGAAGTAAACTCTTTTAACTCCAAACTTGCATTTGCTACCCCTAATTTATCAGCACGTTCAAGTACATAAGCATCATGATGATCTGAAAAAACAAACTTCACTACCTTAGGAAATTGTTCAGCTAGTCTTTGAAAGTTAGAGCCATTTCCTGATGCAAATACTGCAATTTTCATTCTATCCCCTATTCTTAATGAAAAAAGATTATTTTTTAATAACTACTGGTGCCTCTTGTCGATTAACCATTTGACCAATCTCGAAAGCATTCAACTCTTTTTTGAGAGCAGCAGCATTTTCAGGAGCAACAGCGATAACCATTCCAATCCCCATATTGAAAATTTCATACATTTCTTCGTGCTTGATACTTCCATATTTTTCAAGAGCCTTGAAAATTGGTAAAACATCCCAAGAACCTTCGACAATTTCAGCTGACAAGCTATTTCCGAACATTCTTGGCAAATTTTCATGGAATCCTCCACCCGTAATATGAGCAATTCCTTTTATTTTATTTTGCTTAATCAAAGGCAAGAGCTCTTTGACATAGATTTTAGTCGGAGTTAAAAGAGTATCAATCAAAGATTGGTCAAGTTCAGGCAATGATTCATTCAAATCAAAGTCAGCAAAAACTTTCCGAACCAAAGAGTATCCATTAGAATGAATCCCAGATGATGCAAGACCAAGCAAAACATCGCCTGCTTCCACATCTTTTTCGCCATCAATTAATTGTGATTTTTCAGCCACACCCACAGCAAAACCAGCTAAATCATAATCATCTTCATCATACATTCCGGGCATTTCAGCTGTTTCTCCACCAATCAGAGCTGCTCCTGCTTGCAAGCAACCTTCGGCCACTCCAGCCACAACTTGCTCCAATTTTTCAGGAATATTTTTCCCTGTCGCAATATAATCCAAAAAATACAACGGCTCAGCCCCAGCAGCAATAATGTCATTGACACACATGGCTACGCAATCAATCCCAATCGTATCATGCTTGTCTGCTCGAATGGCCAGCATCAACTTGGTCCCTACACCATCTGTCCCTGAAATCAATACAGGTTCTTTGACATCAAGCACAGATAAGTCAAAACCTCCACCAAAACCACCCAGTGCCCCAAGCACCCCTAAACGTTCGGTTTTAGCAACGTGCTTCTTAATACGAGAAACCACCTCATATCCTGCTTCTACATCTACCCCAGATTTTGCATACGCATTCTCAGACACTGTCATTCTCCATTTTCTGATTTATTTTATTCTACTTCCATGATAAATGATTTTCAAACATAAAAAAAGTTCCAGCAGGTAGAACTGAAACTTTTTGATTGGATTGTTCGGAAATAAGGCTTTTGGTTATTTAAATATTCACATATCTACATAAAAAAACCGCCAGCATCAGCCAACGGTTTAATCTATTTATTCAGCAATCGATTGAATATCAAAGTCAACCTTGTTATCTATAAGCCTTACAATAACTTTTGATTTTGGTGGAATTTGTCCTCCGATAATCAGCTTAGCTAATGGATTTTCGATGACTTTTGTCAAGTAACGTTTGAGTGGGCGTGCACCATAAGCAGGTTCATAAGCATTTTCAGCAATCCAAACTTTTACTTCTTCACTCAATTCAAGCTCAACTTCCATTTCTTCAAGACGATGTGCTAGTTGACTGGTCATTTTAAGGATAATGTTCTTGATGTCTTCAAGCGCCAATGGTTTGAAAAGAATGGTATCATCAATCCGGTTTAAAAATTCTGGTTTGAAATGCGCGCGAAGTTGCGACATCACATTTTCTGTTGTTTCTTCAGAAATTTCACCATTTTCTCCAACATTATCGAGCAGATATTGAGAACCGACATTTGAAGTCATAATCAATACTGTATTCTTAAAGTCGACGAGAACACCTTTAGAGTCGGTCAAACGTCCGTCATCTAAAACTTGCAACAAGATATTGAAGACATCTGGATGTGCTTTTTCGATTTCATCAAGCAAGATGATGGTATAAGGATTACGGCGAACGGCTTCGGTCAATTGGCCTCCTTCATCGTAACCGACATATCCTGGAGGAGCTCCGACTAAACGTGACACGCTGTGTTTTTCCATATATTCACTCATGTCAATCCGAACCATATGTTCTTCTGAATCAAAGAGATTTTCAGCCAATGCTTTCGCAAGTTCGGTCTTACCTACCCCAGTTGGTCCAAGGAAGAGGAATGAGCCAAGTGGACGGTTAGGGTCTTGAATTCCTGCACGCGCACGAATAATGGCATCAGATACGGCTTCAACAGCTTCATCTTGTCCGACAACTCTTTGATGAAGTGTTTCTGGCAAATGAAGTAATTTTTCACGTTCACCTTCAACCAATTTGGTAATTGGAATACCAGTCATCCGTCCAACCACTTCGGCGATTTGTTCTTCAGTGACTGATTCTTGAACTAAAGATAAATCATCTGATTTTGCTTTTTCTTCAATGGCTTTGAGTTCTTTTTCAATTTCAGGAATTTTACCATAACGAAGGGCTGCTGCTTTTTCTAAGTTTCCTTCATTTTGGGCTTCTTCCAATTCGTGGCGAGCATGTTCTAATTCATTACGTTTTTCAGAAATATTGCCCACTTCTTTTTTCTCAGCTTCCCATTGGGCTTTGAGTTGATTATTTTCTTCTCGAAGTTCAGCAATTTCACCACGTATAATTTCAAGACGTTTCTTAGAAGCATCATCCCGTTCTTTTTTGAGGGCTGCTTCTTCAATTTCTAATTGCATCAAGCGACGATTGGCTTGGTCAAGTTCAGTTGGGAGTGAATTCATTTCCACCCGAATCGTTGCACTGGCTTCATCAATTAAGTCGATCGCTTTATCTGGTAAGAAACGGTCTGTAATATAACGATTTGACAATGTGGCTGCTGCAACTAAAGCATTATCATGAATGGTCACCCCATGGTGAATTTCAAAACGTTCTTTTAGACCACGCAAGATTGAAATCGTATCTTCAACGGTAGGCTCAGTGACCAATACTTTTTGGAAACGACGTTCAAGTGCTTTATCTGTTTCCATGTATTTACGATATTCATCCAAGGTCGTTGCCCCAATCAAATGGAGTTCACCACGTGCAAGCATTGGTTTCAAAAGGTTACCAGCGTCCATTGAACCTTCTGTTTTACCTGCACCAACAATGGTATGAAGTTCATCAATGAAAAGGATAATTTGTCCATCAGCTTTTTTAACTTCATTAAGGACTGCTTTCAAACGTTCTTCAAATTCACCACGATATTTCGCTCCTGCAATCAAGGCACCCATATCCAGTGAAAAGATTGTTTTATCTTTTAGATTTTCAGGAACGTCTTTTCTGACAATCCTTTGTGCCAATCCTTCGACAATGGCTGTTTTACCAACCCCAGGTTCACCAATAAGAACGGGATTGTTTTTTGTTTTACGAGAAAGCACTCGAATGACATCACGAATTTCTTCATCACGTCCAATGACGGGATCTTGATTGCCTGATTTAACTTGAGCAACGAGATCCACCCCATATTTTTCAAGTGCTTTGTATGTTTCTTCTGCATTTTGACTGGTCACTTTATCACCTCCACGTAATTTTTCAATCGCAGCTTGCGCTTTTGCTTTTGTTAGTCCATGGCTGACCAAATACTCGGTCAATGGATTTTGTTTTAATTCAAAGAGGGCAAGGAGAATAATCTCAGTTGATAGGTATTCATCGCCCATTTTTTGCGCAATTTTGTCTGCTTCAGTAAATACTTGGAACAAATCTGGACTTAGGTTTTGACCATAAGTAATATTTGAACCTTCTACCGAATTAATTTTGTCAATTTCTTTTTCAATTAAATTTGTAAAGTCATCTAGGTCAATCCCTAAATCTTTATAAAAGTTCGCCCCAAAACTATTAGGTTGAACAAAAATTCGCCATAAATGTGGAACTTCAATCACTTGGTGATGACGAACTTGCGCAATTTGTTGCGCTGAACCAAGTGCTTCTTGCATCGTTGTTGTCATTTTTTCGATGTCCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_10

>NZ_CP015901|1529943:1540256|1533507_1534038_+|WP_011676467.1|DBSCAN-SWA
MAATNYSQTIKNDTKDFITTAILQLSGIQKKSEKPKTLDQLTVSNVCQRAGVSRMAFYRNFDSINQVIYQYYQPRISESFEIIRQNVSATIKIENQLEFFEDFKNDLYLSESQGYEPIIRQIYIEEIEKFYEETNDEYFITFVATGVYAVWRKWLMNGQDKPIEEIHELIRKIVTI
>NZ_CP015901|1529943:1540256|1536446_1537463_-|WP_011676470.1|DBSCAN-SWA
MSENAYAKSGVDVEAGYEVVSRIKKHVAKTERLGVLGALGGFGGGFDLSVLDVKEPVLISGTDGVGTKLMLAIRADKHDTIGIDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYIATGKNIPEKLEQVVAGVAEGCLQAGAALIGGETAEMPGMYDEDDYDLAGFAVGVAEKSQLIDGEKDVEAGDVLLGLASSGIHSNGYSLVRKVFADFDLNESLPELDQSLIDTLLTPTKIYVKELLPLIKQNKIKGIAHITGGGFHENLPRMFGNSLSAEIVEGSWDVLPIFKALEKYGSIKHEEMYEIFNMGIGMVIAVAPENAAALKKELNAFEIGQMVNRQEAPVVIKK
>NZ_CP015901|1529943:1540256|1537652_1540256_-|WP_011676471.1|DBSCAN-SWA
MDIEKMTTTMQEALGSAQQIAQVRHHQVIEVPHLWRIFVQPNSFGANFYKDLGIDLDDFTNLIEKEIDKINSVEGSNITYGQNLSPDLFQVFTEADKIAQKMGDEYLSTEIILLALFELKQNPLTEYLVSHGLTKAKAQAAIEKLRGGDKVTSQNAEETYKALEKYGVDLVAQVKSGNQDPVIGRDEEIRDVIRVLSRKTKNNPVLIGEPGVGKTAIVEGLAQRIVRKDVPENLKDKTIFSLDMGALIAGAKYRGEFEERLKAVLNEVKKADGQIILFIDELHTIVGAGKTEGSMDAGNLLKPMLARGELHLIGATTLDEYRKYMETDKALERRFQKVLVTEPTVEDTISILRGLKERFEIHHGVTIHDNALVAAATLSNRYITDRFLPDKAIDLIDEASATIRVEMNSLPTELDQANRRLMQLEIEEAALKKERDDASKKRLEIIRGEIAELREENNQLKAQWEAEKKEVGNISEKRNELEHARHELEEAQNEGNLEKAAALRYGKIPEIEKELKAIEEKAKSDDLSLVQESVTEEQIAEVVGRMTGIPITKLVEGEREKLLHLPETLHQRVVGQDEAVEAVSDAIIRARAGIQDPNRPLGSFLFLGPTGVGKTELAKALAENLFDSEEHMVRIDMSEYMEKHSVSRLVGAPPGYVGYDEGGQLTEAVRRNPYTIILLDEIEKAHPDVFNILLQVLDDGRLTDSKGVLVDFKNTVLIMTSNVGSQYLLDNVGENGEISEETTENVMSQLRAHFKPEFLNRIDDTILFKPLALEDIKNIILKMTSQLAHRLEEMEVELELSEEVKVWIAENAYEPAYGARPLKRYLTKVIENPLAKLIIGGQIPPKSKVIVRLIDNKVDFDIQSIAE
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MSKRALISVSDKEGIVEFAKKIQELGWEIISTGGTKAVLDQEEIPNIAIDEVTGFPEMMDGRVKTLHPLIHGALLGRRDLDSHMKSMAEHHISPIDLVVVNLYPFKETLLAGGSQAEMIEKIDIGGPSMLRSAAKNHAAVTVVCDPMDYEKVEKELSADGETSLELRQQLAAKVFRHTASYDALIAQYLTEEFPVEDTKPEKLTLTYDLKQGMRYGENPQQSADFYESGLPTTYSIAQSHQLHGKELSYNNVRDADAALQIARDFDEPTVVALKHMNPCGIGTAKNIEQAWDYAYEADPVSIFGGIIVLNREVTEETAQKMSKIFLEIIIAPSYSKEALEILSKKKNIRLLTVDFSKKEQSEKEALVTGVLGGLLVQNQDVIVENPKEWTVATKVQPTDRQMEAMKFAWKAVKFVKSNGIIVTNDHQTLGVGPGQTNRVGSVKIALEATADKDALLQENAVLGSDAFFPFADNIDEIAKAGIKAIVQPGGSVRDQEVIEACDKYGIAMVFTGLRHFRH
>NZ_CP015901|1529943:1540256|1534089_1535679_-|WP_011676468.1|DBSCAN-SWA
MVKYLKEFKFENFMVFLLITIDIALAVLSSVFLANVLNSLIAREMNQFFLWLAIDIVLWVVDSFVQGVRDVWKEIAIQKQLNAVRRDIIEPLTEISYSDFEKNSKEDYNSWLNNGTKLLYDNGFHQIYFVYTGIVAMLFSGIAIIFFHWVLLLTTLLVGAILFYFPKVFKKSVERDTEQVSDVANDALATSTDYLRGYEVLYHNKQLGLMQERTMGKFNQLATANVKLIFTRAWMQYSLLGASMLGQFLILAVAGFLIMNGQIGIGVVMSVGNLSGTVTNYSKSVVNSLILLNATGKLLEKYGKIADESKVTDGEEVTDFESKLELKNLSVAFPDGQKIEYPEIVIEKGKKYAIIGDSGSGKSTLINLLVGNKRDYEGEILLDGKDYKGINRKSLPHVMSVIMQFPYLFRETVEENLTLGRKISPDIFDKSIRIACADDFVFNKLDTIYDKNLSGGQQERLSVARELMGTKPILVMDESTASVDKKTALAVEKNILENPDLTVIMITHHLYDETQNYLDEVIHLGQGIA
>NZ_CP015901|1529943:1540256|1531676_1532219_-|WP_011676466.1|DBSCAN-SWA
MHPHLKEVLFTREQIAERVKELAEVVSRDYEGKNPLVVGILKGSIMFTVDLLKELSIDAEVDFMDVTSYGYGISSSGEVRILKDLSTVAHGRDILIVEDIIDTGNTLLYLKKLLTGRQAKSVKIISLLDKPSGRKVDIDADYVGFEVPDAFIVGYGIDYAERYRQLPYIGVFNEEFLIKE
>NZ_CP015901|1529943:1540256|1535869_1536418_-|WP_011676469.1|DBSCAN-SWA
MKIAVFASGNGSNFQRLAEQFPKVVKFVFSDHHDAYVLERADKLGVANASLELKEFTSKVDYEKALVEILEAQEIDLILLAGYMKIIGSTMLARYKGKIINVHPSFLPDFAGSPHAIEESHEAKYGLGITIHYVDEGVDTGEIIAQIPVAYHESLEVYEERVHEAEHELYPKVVRQIILHQQ

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_011834927.1|1529943_1531500_-	bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase	Q58MG4	Prochlorococcus_phage	1.6e-71	46.5
WP_011676466.1|1531676_1532219_-	hypoxanthine phosphoribosyltransferase	A0A218MMB5	uncultured_virus	4.7e-10	30.6
WP_011676467.1|1533507_1534038_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_011676468.1|1534089_1535679_-	ABC transporter ATP-binding protein	F2Y1V6	Organic_Lake_phycodnavirus	5.0e-12	34.1
WP_011676469.1|1535869_1536418_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	1.5e-19	32.0
WP_011676470.1|1536446_1537463_-	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	A0A0E3F760	Synechococcus_phage	5.4e-60	41.5
WP_011676471.1|1537652_1540256_-	ATP-dependent chaperone ClpB	K4FB40	Cronobacter_phage	8.0e-124	32.7

Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>NZ_CP015901|1621245:1632762|DBSCAN-SWA
ATCACATTTTTGGAAATTTTAAGGTAAAAGTTGAACCAATCCCAAGCTCAGAACTAACTTCAATCTCCCCTTGATAATTTTCGGCTAAACGAGCAAGAATTGGTAAACCTAAACCAGTTCCGCCAATCTCACGGTTACGTGCCTTATCCGCTCGAAAGAATCGCTCAAAAAGATGATTAATATCTTCTTCGGCAATTCCGATTCCTTTATCAGAAACACTAGTAATGACAAACTGTTCATCTTCTGAAACAGTAATCACAATCTCCTTTCGATCATCCGGAGAATACTTAACAGCATTATCTAACAAAATGCGTAATCCTTGTTCAAAATGATTTTCAGATATCCGGGCATGGACAGGGTAGATAAGCTGATTATCAAGCACAATCTCAAAATCCTCATGTAGAAGTTGGAAGTTTTTAAGCGCATGATTAGATACTTTCCCAACGTCACAATCCAATTCTTCACTGGACAAATCTACATTTTCAAGCCTAGCTAAAGCAAGCATTTCTTCAAGCATTTTCTTCATTCGGTCTACTTCATCCAAACTCGCCTGCAAAGATTCATCCAAAACTTCTGGATCATTTTTTCCCCAATGATTTAAGAGATTAATATGACCGTCCAAAACTGCTAACGGAGTCCTTAATTCATGTGAAACATCAGAGACAAACCGATTTTGCTGTTCAAGGTATGCTTTCATTTTCAGCATCATATCATTATAAACATGAGCTAATTCTTCAATTTCATCACCACTTTCAATTTCGATAGGTTTGAAATCATTCGTGGGGTCGCTCGCCATTTCCTGCATTCCCTGATAAAGTTTTTCTAAAGGCTTCATAAAATAATTCGCCATAAAATAACCAATCATTTGCGCAACGATTAAAGCGACAATTTCTAAAATTAACAAGACGACTAAAAGGAGATTGGAAATCCGATGATAAGTTGTCGTGTCATAAAATGCCTGTAAATAGCCTACAACCTGTCCCGTCCCTTTAGAAACAATCTTCCTTTGGACTAAATAACCTGGATTCTCACCTTGAATTTCTTTCATCTCATTATTGCCTTGCTTTTGAAATCCAAAATCATGTCGATTAGTTGAATATAGTAATTTATGATTTAAATCATAAATATAAAATGCTTTCCGAGTCCCGATGATACTTCCCAGACTCATTCCTTCCGATTCCCCATTTTGAATCTTTGATGTCGCTTCAATATAAGTATTCAAATTAGTTGAATTTAAAGGAGCATCCGCTTGTTCTAATACCTCTTCAACGCTGTCCATTGAACCTGTCAATAACCTTTGTTCCTCCTTGATGAAAGAACTTATGGTCAGTTGATAAGTTAATGTTGCAAAAAGAGTAAAAGTAATAAAACAAAAAACGGTGTTAGCAAAAGCCCATCTAAGCATAATAGACCGCTTAGCCGAACTTTCTTCTACCGTTTCCTTTTTCTTGTTGAAAGTGAATAATTTTTTCATTTTTTTTATTTGCGTTCACGCATCACATAACCCAAACCACGAACGGTTTGAATATAGCTGTCTTGTCCTTCAACATCAATTTTATTTCTAAGATAGCGGATATATACATCAACAACATTTGTTTCCGTTCCTTCTTCATATCCCCAAACTTGTGAAACTAAATGTTCGCGAGTGACAACATCCCCAACATTTTGCATCAACGTCAAAAGAAGATCGTATTCACGACGCGTCAAATCAATTACTTTTTTACCGCGGTGAACGGTACGATTTGTTTTGTCAATTACAAGATCACGAAAAGAAGTGTTTTCAGCACGTTCTACAGCATGACCATGTTCTTCACGACGGAAGAATGCACGAACACGAGCCAAAAGTTCTTCAATCGCAAAAGGCTTAGTAATATAATCATCTGCTCCAATATCAAGACCGGCAACACGGTCCATTGTTGAATCACGCGCGGTCATCATAATAATTGGAGTATCTTTTTCTTTGCGCAAACGGCGGGCAACTTCAAAACCATCAAGTTCAGGAAGCATCAAATCAAGCAAGATTAAATCATAATCTTTTGAAGTTGCTTCTTCAAGCCCAGAACGTCCGTTATCTTTAATCTCAGTGGCATAGCCTTCATGCTCTAATTCTAATGAGACGAAACGAGCTAAATTCTTTTCATCCTCAATAATCAAAATTTTCTTTGATGCCATATTATTCTCCTTTGTTAAAAAAACTGCATAATTCGATTTCTTATAATACTATTATAAGATAAATTTAATTTATGTACAAACTATTTAACGCTTTTTTTTAAATTGTTTTCGCTTTCTTATGCTTAACAACAGAAATTGTTAAAAAATGAGAGCCATCTAATCAAATAATCCGTTCAAACTATCAAAAGGAGATTTCTTTTCTTCCTTTTTATCTTCTTGTTGCTTGGCATAGTCTTCTTCACTCAAAACAGACCAAAACTTCCCGCTTGGCAATTCTTCTGCTTCTTCATTTTCAGCTAAAATTTGCAACGGAATTTCCAATAGAATATTATCAGTCACTGACTCATCTAAACTAATGATATCTTTATCTAAAACAATAATTAAATCATTATCTAGTAATTCCTGATTTCCTTTTAGCGTTTCCTCGGTTGCAAAAATTTCGTTGACTAGGATATCAATTGGATATTTGACTGGTTTCAAACTTCTTGAAGAAGGTAGGGTTAAAGTCGTTTTTATTTGATAATCCAAATAGAACAACTCATCATCATAAGCAATTTCACCACTAACTTCAATTGGTAGACAATCTAAAATTTCTGCGGAAAGTTTCACAAGTTCCTCGCGAAGGTCTAAATTCTCATTGAAAGCAATCTGTTTTTTTTTTGTTAATTCATTTAAAGACCATTTCATCTTTTAATATTCTCCCACAATTTAATCATTTTTCTTTATTTTATCTTATTTTTACATTTTTTCATAATAAAAAGCTGTCTAAAGACAACTTTGATATTTCTAAAAATAAAAATGGTCGAATGACCATTTTTATTATTGTTTGCCGTATTTCTTTTCGAAACGAGCGATACGTCCGTCCGCTGCTTGGAATTTTTGACGACCTGTGTAGAATGGATGTGAATCTGAAGAGATTTCAACACGAATCAATGGATAAGTGTTTCCGTCTTCCCATTCAACAGTTTCTTTAGAACCTTTAGTTGAACCAGTCAAAAATTTGTAACCAGTTGTTGTGTCCATGAAGACTACTGGTTGGTAATTTGGATGGATATTTTGTTTCATCGTTAGAATTTCCTTTCTGCCTTGGACTGTTTGCCAGACCAAAGTTGTACGAATACTTAAACATTCTATCAAAATTCGAAGTAAATTTCAAGCTAAAATAATCTTTTGTCAAGAAAAAAACTTTACAAATTATTTCTGTCTCTAAGTAAGGTTAAAAACCAAGTATTTTCAGGCTAAAAGTTTCTTGGCAAAAAGTAAATTTACTTTTTAAATCATTTCATAAGCAAGCTTTGACTAGTCTCTTTTAGTCAAATAATTAACCACACGTTCAAACTTCTTGTTTTATATTCATGACTTTTGAAAGTTTTAAAAGTAGTTTTCTCTTAGATTATTATACCTTTTTCCTTTAAATTTTCTCTACAGGATTCAAGATAGGATTCATTATGCTCTGGATATATGGGCAAAGTCTGAGTAATCTTTTTTAATTCTAGATAAGCTTCACATTTTTGACCTCTATACAACGGATCAAACCAGCTTTCATCAGGATGATATCCTCTTATTTTCATCTCATTCATCACTTCCAGATGATATTGAAAAAGTTTATATGGAGAATAATTGAAGACGTAATTTACCATCGAATGTTTTTTCGCCCAGCCCTTTCCACGTAAGGCACAACACTCTCGATGTTGACCCAATAATTGTGCTCTTGGAAGTTTTTCAATTAAAGCTTCATGCCATAATCTCATTGCTTGTCATCCTTTTCTCTTATCTTTTTAGTCCATTAATCACTTTTTAATCAAAAAATTCCCCCGAAGGAGAACTTTCTTTTCTCTATTTACAACAGATATTAACTGCTTCTTCCGATTGTTCAACCGATGAGTTCTAGAATGAAACACTTAATCTCTGAAATATAGATAGTTATATTATACCTTGATAAAATGATGCTCTCAAGTATTTTGACTTCACAACCTTATCCCAAAAATCATTTCCCAATTACATAACGTAAACGACTGGCTTGTTCTTTGCTTAAGACTTGATAAGAGAACAATGTATTATAACCAGTTCCTGATTGCGAAATTAATATAGAGCCATCCGGACGAATTTTTTCTACAAAAGCAACATGACCATAGGTAGGGTCAGCACCATCTTGTCCCGCTTTATAGCTAACTGCACTATGAAGTTGAGGAGTGGATGTAACTTGATAGCCTGATTGATTTTGCCAGTCTTTGCCATTTCCCATGTAAAGACCATAATTTATTCCAAATTCTTTCGCTCGATTATAGACCCACCATGTACATTGCTTATAGGCGTAAGTTTGAGTTGAATAATTTTCAATATCCATCGGTCTATCAATAGTCCAACCCGCTGGAGTGCCTGGTAAACTGTCAGAAGGCATTGTCTTCCACGCAGTAGCTCCATATTTCCAGCCTACTTTTAGCAGACTATTTTGCTCAAAAAAGTTCGTTGTATAATTGTGTGCTCCGGACTTAGTATTTGGGTTGTAAGCAACGTAAAGATTAACCGTTCCTGCTGAATAAAAAACCGGTTTGGCCCCATTATCCCAACGCCAACCTGCTTTTACTAGGCTTTGAGCCTCATAATTACTCAAGGTATAATAGTGGTCTCCCCCTTTAACGTTTGGATTATAAAGGCGATAAACTGGCGCACCTGAATTTGCTGCTTGCCAACCAATTCCCTCATCAAGCCAACCGACATTTTTTAGAGAATTTCCCTCATAAAAATTCGTTGTATAAAAATGTTCCCCACTGTTGGGATTATAAAGCCGATAGACTGGGCTTTTAGAGCTTGCCTTTACTTGGTTT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GTGCTCTCTGTCACAACAGTTTTTTGACAATATATTTATTTCGTCAGTAAACTGACAAAATTTTTATTTACTAACGAAATACTTATCGAGATTTCCATCAGTAATAAGTCCACTTTTTTAATTACTGACAGCTTTGTCAGTAAACTGACGAATCTTTTATTCGCCGATTCAATGCTCATTATTCATCACATTGAACTGGCAGTCCTGTCAGTAATTTTTAGATATTTAAATTTCGCTAGCATCTTTTGGTAAGACAAGATTTAAGACAATTCCGAGAATCGTAGCAATAGCTACTGATGAAATTTGTAAGTTTTGAGTGATGTTGATAATCATTCCACCAATCCCGATAACAAGGACCACTGAGCTAATCAATAAGTTGCGCTTGATATCAAAATCAACTTTGTTTTCAACCAAAATTTTCAGACCTGAGGCTGCAATAACTCCAAAGAGTGCAATTGATGCTCCACCAATAACTGGTGCTGGAATTGATTGTAAAAGAGCTGTGATTTTGCCAACAAATGAGACAACAATGGCAAGAACCGCAGCGCCAGCAATCACATAAATCGAATGAATTTTTGTAATTGCCATGACTCCGATATTTTCACCATAAGAGGTCACCGGTGGCGCACCAATAAAGCCGGCGATGATTTGTGCTAAACCATCCCCTGTCAACGTTTTTTCAAGTCCTGGTTCTTTAAAATAATCTTTTTTTGTTAATGAATTCAAGACCATGATATGACCAAAATGTTCAGTCATTGTAACAAAAGCAATGGGTGCCATTGTCAAGATTGCTGACGGATAGAAAGCCCATTTATAGCTAGCAAATGGAATTTCCATTGGTGGAAGTGTTAACCATTTGGCTTGTGAAATTCCCGTAAAGGAAACGATATTCATGCCAGTGATTTTACCAATAATCATTGCTGCAACATAACCTGTGACGATTCCGAGTAAAATTGGAACGACTGACAGAAATCCTTTTCCATAAATACTGTAAACGACAATTGATAAAACGGTGATGAGGGCAATAATGATATAAGCTAAACTGTATCCTTTTAGATTTGCAACATCGGTATACATGGCATCATTAATTGATGTCGGCGCAAGGGATAAACCAATAACCATAACGATTGGTCCAACAACGATTGGTGGTAAAACTTTGTCAATCCAACCTTTACCCGCAAATTTCACAATCAGAGCGACAATCAGATAAACCAGACCACCTGTCATGGCTCCTTGGGCAATGGCTGGCATTCCGCCATTTTTCATCAGTAAAGTCATCGCACCAATATAAGCAAAGCTTGACCCCATGTAAGCTGGAACCTTAAATTTTGTAACACTCATGTGTGCAAGTGTACCAAGTCCTGAACTCAATAGGGCAATCGCTGGATTAATCCCAACTAAAATCGGAACTAAAACCGTTGAGCCAAACATGGCAAACAAATGTTGAAATGAGAGTCCAAACCACTGACTGGCAGCTGGTTTCTCATCAACTTTTAAGATAATATCATTATCGTGCAC

Protein sequences of DBSCAN-SWA_11

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MRLWHEALIEKLPRAQLLGQHRECCALRGKGWAKKHSMVNYVFNYSPYKLFQYHLEVMNEMKIRGYHPDESWFDPLYRGQKCEAYLELKKITQTLPIYPEHNESYLESCRENLKEKGIII
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MSVKNGLVQLENLTSMENLSVDEVMGLIKRASAFKAGKADFALDEQTFASNLFFENSTRTHHSFHIAERKLGLDVLEFDAQASSISKGETLYDTVLTLDALGVDICVIRSGVEHYYEELVNSDNIHCAIVNGGDGSGQHPSQCLLDLMTIYEEFGKFEGLKIAISGDLTHSRVAKSNMMMLQKLGARLYFTGPAAWYSEEFDDYGHYANLDRILPELDVHMLLRVQHERHDSGESFSKEGYHTHFGLTQERAKMLKPTAIIMHPAPVNRDVEIADSLVESPQSRIVQQMSNGVYTRMAILEAILAGKKAK
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MSKRLLILEDGTIFEGEALGANLDVTGELVFNTGMTGYQESITDQSYNGQILTFTYPIVGNYGVNRDDYESIHPTCKAVVVHEAARRPSNWRMQMSFDEFLKSKNIPGITGVDTRAITKIVREHGTMKASLVQARDEVDHQMSQLQATVLPTNQVETSSTATAYPSPNTGRKVVVVDFGLKHSILRELSKRECNLTVVPYNTSAKEILEMEPDGVMLTNGPGDPTDVPEAIEMIKEVQGKIPIFGICLGHQLFSLANGATTYKMKFGHRGFNHAVREVATGRIDFTSQNHGYAVSSENLPEDLMITHVEINDNSVEGVRHKHFPAFSVQFHPDAAPGPHDASYLFDDFMDLMDNFKK
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MKKLFTFNKKKETVEESSAKRSIMLRWAFANTVFCFITFTLFATLTYQLTISSFIKEEQRLLTGSMDSVEEVLEQADAPLNSTNLNTYIEATSKIQNGESEGMSLGSIIGTRKAFYIYDLNHKLLYSTNRHDFGFQKQGNNEMKEIQGENPGYLVQRKIVSKGTGQVVGYLQAFYDTTTYHRISNLLLVVLLILEIVALIVAQMIGYFMANYFMKPLEKLYQGMQEMASDPTNDFKPIEIESGDEIEELAHVYNDMMLKMKAYLEQQNRFVSDVSHELRTPLAVLDGHINLLNHWGKNDPEVLDESLQASLDEVDRMKKMLEEMLALARLENVDLSSEELDCDVGKVSNHALKNFQLLHEDFEIVLDNQLIYPVHARISENHFEQGLRILLDNAVKYSPDDRKEIVITVSEDEQFVITSVSDKGIGIAEEDINHLFERFFRADKARNREIGGTGLGLPILARLAENYQGEIEVSSELGIGSTFTLKFPKM
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MKQNIHPNYQPVVFMDTTTGYKFLTGSTKGSKETVEWEDGNTYPLIRVEISSDSHPFYTGRQKFQAADGRIARFEKKYGKQ
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MKFNTIQVLIASTLALGTVAVAQEVSAAEQTTSIYRLYNKNTGEHFYTQSRTEQLNAIIAGWNNEGIGWVAPSYSNSPVYRVYNPHAKGGDHYYTRSKYEAQSLVNKGWKWDRNGKPVFYSGGKASVYVAYNPNAQSGSHNYTPNSFEQQSLLNNGWKFGSTAWNAVTKFNWTLAQYRALTVGDSDGKGDVNYNAIIAAHDIPSDVTIYENGSYSSKNVLYSNSDFNSGVYQYVSLTFVKQANGDYLLSNKSYLSL
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MHDNDIILKVDEKPAASQWFGLSFQHLFAMFGSTVLVPILVGINPAIALLSSGLGTLAHMSVTKFKVPAYMGSSFAYIGAMTLLMKNGGMPAIAQGAMTGGLVYLIVALIVKFAGKGWIDKVLPPIVVGPIVMVIGLSLAPTSINDAMYTDVANLKGYSLAYIIIALITVLSIVVYSIYGKGFLSVVPILLGIVTGYVAAMIIGKITGMNIVSFTGISQAKWLTLPPMEIPFASYKWAFYPSAILTMAPIAFVTMTEHFGHIMVLNSLTKKDYFKEPGLEKTLTGDGLAQIIAGFIGAPPVTSYGENIGVMAITKIHSIYVIAGAAVLAIVVSFVGKITALLQSIPAPVIGGASIALFGVIAASGLKILVENKVDFDIKRNLLISSVVLVIGIGGMIINITQNLQISSVAIATILGIVLNLVLPKDASEI
>NZ_CP015901|1621245:1632762|1627355_1627760_-|WP_011676637.1|DBSCAN-SWA
MKKIYFLCTGNSCRSQIAEGYGHVFLKDWEVRSAGIERHGLNPHAVTVMAEDGIDISAQKSELIDMTYFNDCDLIITLCGDALDKCPMIPKSVSHEHWDLQDPARAVGTEADILTEFRKTRDLIKERVQNLSNI
>NZ_CP015901|1621245:1632762|1626407_1627244_-|WP_011834858.1|DBSCAN-SWA
MKIIKIVFSLVILLMLTCLGGLYYAFKIEPYRLVVNQHQLENRSSKEKIKIVQLSDLHIKKDFDAKHLDKVIQKTNEQNPDFIVFSGDLYDNYAHYNENEQVISKLQKMKAKYGKIAIWGNRDYGGGASREYANIMSESGFTLLRNENLLVPMNNGEKILFTGLDDTLLGNPSLPSSYQMEESTYDVLLTHEPDEVSQYQNKGYELILSGHSHGGQVNIPFIPQVQKKAASVMKHSNNYTGGLYQLNTNETLYVNTGIGTTHLSARFGVVPEIAVFNF

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_063284024.1|1621245_1622718_-	HAMP domain-containing histidine kinase	W8CYF6	Bacillus_phage	5.1e-27	33.2
WP_011676631.1|1622723_1623416_-	response regulator transcription factor	W8CYM9	Bacillus_phage	5.3e-35	34.1
WP_011676632.1|1623572_1624103_-	DUF177 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676633.1|1624235_1624481_-	type B 50S ribosomal protein L31	NA	NA	NA	NA
WP_011676634.1|1624804_1625167_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676635.1|1625403_1626315_-	CHAP domain-containing protein	A0A1P8BMN5	Lactococcus_phage	3.4e-05	45.6
WP_011834858.1|1626407_1627244_-	metallophosphoesterase	NA	NA	NA	NA
WP_011676637.1|1627355_1627760_-	arsenate reductase (thioredoxin)	A0A2H4PQT9	Staphylococcus_phage	1.3e-28	47.4
WP_011676638.1|1628196_1628967_+	hypothetical protein	Q38326	Lactococcus_phage	6.3e-69	75.2
WP_011676639.1|1629127_1630201_-	glutamine-hydrolyzing carbamoyl-phosphate synthase small subunit	R4TGJ8	Halovirus	1.5e-60	35.1
WP_011676640.1|1630288_1631221_-	aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit	M1HWF9	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	1.3e-23	30.5
WP_011676641.1|1631469_1632762_-	uracil-xanthine permease	Q9KX94	Enterobacteria_phage	8.1e-61	35.7

Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>NZ_CP015901|1641971:1710106|DBSCAN-SWA
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MEEQAWREVLERLARIETKLDNYETVRDKAERALLIAQSNAKLIEKMEANNKWAWGFMLTLAVTIIGYIITKIL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_011676658.1|1650291_1650963_+	MgtC/SapB family protein	G3MA03	Bacillus_virus	6.1e-20	44.3
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WP_011676660.1|1652224_1652680_-	NUDIX domain-containing protein	D0R7J3	Paenibacillus_phage	1.0e-26	38.9
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WP_011676662.1|1653861_1654725_-	aquaporin family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676663.1|1655073_1655325_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676664.1|1655492_1657469_-	transketolase	NA	NA	NA	NA
WP_011676665.1|1657636_1659037_-	PTS ascorbate transporter subunit IIC	NA	NA	NA	NA
WP_011676666.1|1659089_1659389_-	PTS sugar transporter subunit IIB	NA	NA	NA	NA
WP_139949467.1|1659390_1659954_-	PTS transporter subunit EIIA	NA	NA	NA	NA
WP_011676384.1|1659977_1660868_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_011676669.1|1662511_1663153_-	bifunctional 4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase/2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate aldolase	NA	NA	NA	NA
WP_011676671.1|1664103_1665522_-	glucuronate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_011676672.1|1665534_1666416_-	aldose 1-epimerase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676673.1|1666475_1668002_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_041167593.1|1668187_1669264_-	mannonate dehydratase	NA	NA	NA	NA
WP_011676675.1|1669420_1671055_-	mannitol dehydrogenase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676494.1|1671438_1672119_+	GntR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_011676495.1|1672183_1673614_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_011676496.1|1673972_1674278_-|bacteriocin	bacteriocin immunity protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676497.1|1674282_1674507_-|bacteriocin	garvicin Q family class II bacteriocin	NA	NA	NA	NA
WP_011676498.1|1674721_1675600_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_011676499.1|1675581_1675782_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676500.1|1676793_1678140_-	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	A0A1P8BMS7	Lactococcus_phage	5.9e-248	95.5
WP_011676501.1|1678136_1678403_-|holin	phage holin	Q38613	Lactococcus_phage	9.5e-41	98.9
WP_011676502.1|1678427_1680479_-|plate	BppU family phage baseplate upper protein	A0A1P8BMU0	Lactococcus_phage	2.6e-231	73.2
WP_011676503.1|1680491_1680716_-|holin	holin	A0A1B1IMU8	Lactococcus_phage	6.1e-33	100.0
WP_011676504.1|1680728_1681244_-	hypothetical protein	Q9G096	Lactococcus_phage	1.3e-33	50.6
WP_050748323.1|1681262_1682159_-	hypothetical protein	Q8LTP8	Lactococcus_phage	1.0e-123	77.0
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WP_011676534.1|1702740_1703250_-	DUF658 family protein	A0A1P8BM35	Lactococcus_phage	3.2e-77	94.3
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WP_011676537.1|1703782_1704172_-	RusA family crossover junction endodeoxyribonuclease	R9QLL1	Lactococcus_phage	4.6e-68	98.4
WP_011676538.1|1704168_1704894_-	hypothetical protein	A0A1P8BKN5	Lactococcus_phage	3.4e-133	98.8
WP_139949471.1|1704893_1705265_-	phage replisome organiser protein	A0A1P8BLH6	Lactococcus_phage	3.9e-40	100.0
WP_152023927.1|1705314_1706425_+|transposase	IS3-like element IS981 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	7.2e-50	41.8
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WP_011676541.1|1708627_1710106_-	sugar ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	5.9e-15	30.1

Sequences of DBSCAN-SWA_13

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13

>NZ_CP015901|1847361:1903379|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_13

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>NZ_CP015901|1847361:1903379|1870688_1870979_-|WP_011676794.1|DBSCAN-SWA
MGAISVTPAELKHQAQVYIQSKEQIEQAIQRVNSMNSTIAEEWKGQAFQAYLEQYNQLEQNVRKFEELLESINQQLNKYADTVEERDAQDAQSFGF
>NZ_CP015901|1847361:1903379|1868154_1868817_-|WP_011676791.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA
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>NZ_CP015901|1847361:1903379|1863823_1864669_+|WP_011676788.1|DBSCAN-SWA
MTWYHQLGIKYPLFQGGMAWATNVELVAVVSNNGALGIIGSGGRTASELQEMIRQTKRLTSSPFGVNLMLLDKNIDQLLQVICDEKISVVTTGAGSPKKYIDTIVANHIKLFPVVPSLKIAKKMLELPITGIIAEGTEAGGHVGTQNLSSLLEEIASLCPLPLIAAGGIHDYHSFSSAKNLGASGAQVGTAFLLAKECQISSTYQKLICQSEKNETILISNKKGHLARLLKKPSETSSNQSLKSAVEQGDLLNGAFMAGTSSAYINKIEPAETIIKRLMGK
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>NZ_CP015901|1847361:1903379|1895654_1897106_+|WP_011676813.1|DBSCAN-SWA
MIKLEQVVEILKKDNNFREISSAGEYYFNWPKEVNFDQLSYDSRKSTKDTLFFAKGLNFKKEYLTDLEAAFYVSEFDYEVALPAIIVTDVKRAMALIAANFYKFPQNKLKTLALTGTKGKTTSAYFAKSILDKMNGGKTALLSTAQTTLDGQNYFKSELTTPESLDLLEMMAKALENGMTHLVMEVSSQAYKTERVYGLTFDVGVFLNISPDHIGPVEHPTLEDYFYCKRQLLKNSRYFVANAEMNHFAIIKEELNERKIPHAFYGADSENKIIESKGLHFVTDGSVSGEFDIRLLGRFNQENALATALATKALGASFENIRQGLASAIVPGRMELLTAKNGAHIYIDYAHNGLSLENLVEVVEDHHAGQLFLVLGSTGNKGESRRKDFGQVIENHPRLNVILTTDDSNRENPKTIADEIASFVSRELDFELDREFAIKKAISKTQNSDDAVIIAGKGADMFQLKDGKREPYIGDSPAAQKYL
>NZ_CP015901|1847361:1903379|1890673_1891348_+|WP_011676809.1|DBSCAN-SWA
MFYDRLKTLVIDSQKSFNQVERELRYPINALANYRLGKEPSAKRLTEIADYFNVTTEYLLGKDDKYSYNKAKLLFEYLTLDNKQHLLNYIQNRIDELELLEREPISLSAGQFVFCSDNTWALQDSKKTIKLLTKQLPESYDAVFELIGGPLDDEAPGNGDLLFVKFTDTDYTDSVRNFLLQHDHFAKLLVTENKLVCLSRDGGKLAEVPDLSCKITKIYRFGSS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_011676771.1|1847361_1848252_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_011676773.1|1850945_1852307_-	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_011676774.1|1852303_1853233_-	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	3.1e-22	29.8
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WP_011676776.1|1853853_1854414_-	N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_011676777.1|1854586_1855765_-	cation transporter	NA	NA	NA	NA
WP_011676778.1|1856152_1856809_-	thiaminase II	NA	NA	NA	NA
WP_011676779.1|1857027_1857330_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676780.1|1857350_1858322_-	biotin--[acetyl-CoA-carboxylase] ligase	NA	NA	NA	NA
WP_011676781.1|1858327_1858897_-	biotin transporter BioY	NA	NA	NA	NA
WP_011676782.1|1859097_1859988_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_011676783.1|1860040_1861285_+	AMP-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676784.1|1861274_1862423_+	acetyl-CoA C-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_011676786.1|1862771_1863065_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676788.1|1863823_1864669_+	2-nitropropane dioxygenase	NA	NA	NA	NA
WP_011676789.1|1864815_1867626_-	type VII secretion protein EsaA	NA	NA	NA	NA
WP_162484997.1|1867688_1868045_-	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_011676791.1|1868154_1868817_-|bacteriocin	bacteriocin immunity protein	Q9AZK7	Lactococcus_phage	1.9e-05	37.1
WP_152023938.1|1869023_1870134_+|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	1.6e-49	41.4
WP_011676793.1|1870167_1870581_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676794.1|1870688_1870979_-	WXG100 family type VII secretion target	NA	NA	NA	NA
WP_011676795.1|1871350_1872763_-	Fe-S cluster assembly protein SufB	NA	NA	NA	NA
WP_011676796.1|1872858_1873317_-	SUF system NifU family Fe-S cluster assembly protein	A0A218MM29	uncultured_virus	4.5e-06	32.1
WP_031286519.1|1873450_1873933_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676798.1|1873934_1875152_-	cysteine desulfurase	Q2XUY6	environmental_halophage	1.6e-106	44.6
WP_011676799.1|1875151_1876408_-	Fe-S cluster assembly protein SufD	NA	NA	NA	NA
WP_011676800.1|1876547_1877318_-	Fe-S cluster assembly ATPase SufC	A0A1V0SE00	Indivirus	4.7e-08	25.7
WP_011676801.1|1877493_1878819_-	undecaprenyl/decaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyl 1-phosphate transferase	NA	NA	NA	NA
WP_011676802.1|1878821_1879523_-	adaptor protein MecA	NA	NA	NA	NA
WP_011676803.1|1879650_1880385_-	amino acid ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.8e-36	41.8
WP_011676804.1|1880384_1881071_-	amino acid ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_011676805.1|1881216_1882125_-	diacylglycerol kinase family lipid kinase	NA	NA	NA	NA
WP_011676806.1|1882248_1885872_-	DNA-directed RNA polymerase subunit beta'	R4TQM7	Phaeocystis_globosa_virus	2.0e-72	24.4
WP_011676807.1|1885979_1889570_-	DNA-directed RNA polymerase subunit beta	A0A2P0VMZ3	Tetraselmis_virus	8.3e-39	24.5
WP_011676808.1|1889838_1890438_-	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_011676809.1|1890673_1891348_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	S4TZZ1	uncultured_phage	1.0e-06	43.1
WP_081175788.1|1891462_1893346_+	peptidase M13	E3T4I7	Cafeteria_roenbergensis_virus	6.0e-73	30.5
WP_011676812.1|1893770_1895444_-	polysaccharide biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676813.1|1895654_1897106_+	UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate--2, 6-diaminopimelate ligase	NA	NA	NA	NA
WP_011676814.1|1897187_1897448_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676815.1|1897565_1898456_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_011676816.1|1898475_1899498_-	alcohol dehydrogenase AdhP	A0A2K9L339	Tupanvirus	5.9e-30	27.5
WP_011676817.1|1899717_1901499_+	DNA helicase RecQ	A0A0G2Y8K9	Acanthamoeba_polyphaga_mimivirus	2.8e-72	36.5
WP_011676818.1|1901878_1902061_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_152023939.1|1902267_1903379_-|transposase	IS3 family transposase	A0A1P8CWQ3	Bacillus_phage	1.6e-49	41.4

Sequences of DBSCAN-SWA_14

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14

>NZ_CP015901|1948007:2029334|DBSCAN-SWA
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MAIKINREMAGDLNAPSSELLNHCINQHQSDFWRLEKLSDYYDGKQDILKRTKDNAAIPNNKVVVNHAKYVTDMNVGFMVGNPVAYTSSDDIQSILDAYTKVDIVSHDTELEKDLSVFGIGYELIYMNQEPQTGKVFADIKCIDPRGIFLVTDDTIDTNPLFAVHYQPVYNLQGAVDYYLVKYYNDNRVLTYTAASIGFGDYQLIKALPHYFKAVPVIEYRNNEERQGDFEQAISLIDAYNLLQSDRLNDKEAFVDAILFIRGFTLQDGDGARLAKEKMMQTSFKPGEVDASYLTKQMDENSVAVLRDALLEDIHKVTYVPNMNDKNFSGNVSGEAMKYKLFGLLQLMSVKERYMIKGLRQRLILFANYLEISNNNVDIDGIKINLKPNLPINTTDIINQIVQAHQAGILPLKVLLSWLPDIDNVDEVLEQLQEEKEEAIELNQKAMGVQSEDSHSNLDDPPDENEEENQDNNNNQSGNQTDQKGDQKNGQNKKNKKQNSKN
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MTKATIVKMPNTKQFEFGGLNLQLRLDGNSILSIEKRLDESIVGLFLKGQGEAKIPATNKLLIVLQGANQTSNVSESDIVAAFGRYVDEGHSTLDLFAAINELLEESGFFGNKKTEKEATNGVSLDSEPVEEDSIL
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MTYNSTLPKVFVYLLTTIETLYQTRVPLEVQNRKNVHLATSDCLVIACYLWGVLHFSETLKAKHQLAQSLFPNFLEYYRFVRRCNALLPSIQVIRQALVFKEVEGMSVSIIDSFPIPLCQPIRNFKSKGLGDYANVGYNATKGQYFYGCKCHALVSESGYVIDYTITPASMADSSMTEEVLNQFGTPTVLGDMGYLGQSLHDRLELKGIDLITPVRKNMKQKKILFPNFSKRRKVIERVFSFLTNLGAERCKSRSPQGFQLKLEMILLAYSLLLKSAKSLEPETLRYSIGYQVMAK
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MAWEIPKSAFDKELAEYYLSFVPGVTYQQFVRYVKWAHEKEIVMNPVTFIASVKKISNEAATELMIYGEASEI
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MKLLCKLFGHKWEPVPFTMSEDRCVRCGEILKHNAGCFIYDFNRSDLDESENVFPEKWLDKHMD
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MSAELQFNGVMVKTPKEFSVSISTIDADSSGRNANGEMVRDVIAQKTKLNIKWGPLSDSEVSDILQRINQPFFVVIYPDPQIGRQRSKTFYAGDSTMPSYSWNDKFKAMKWENLSVNLIEK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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WP_011676864.1|1949366_1949960_-	DUF1211 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676865.1|1949973_1950573_-	serine O-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_011676866.1|1950678_1951449_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676867.1|1951717_1954027_-	polyribonucleotide nucleotidyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_041167611.1|1954307_1955453_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676869.1|1955817_1956783_+	ribose-phosphate diphosphokinase	A0A2K9L2G2	Tupanvirus	5.2e-36	32.5
WP_011676870.1|1956887_1957319_-	universal stress protein	NA	NA	NA	NA
WP_041167468.1|1957618_1958743_+	cysteine desulfurase	H7BUW1	unidentified_phage	4.0e-32	37.1
WP_011676872.1|1958768_1959107_+	DUF1831 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_003132374.1|1959201_1960389_-	elongation factor Tu	A0A076FFS6	Aureococcus_anophage	2.0e-34	29.4
WP_011676873.1|1960632_1960815_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011835767.1|1960873_1960990_+	DUF4044 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676874.1|1961049_1963848_-|tRNA	isoleucine--tRNA ligase	A0A1V0SJ93	Klosneuvirus	1.9e-83	26.1
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WP_011676876.1|1965289_1966081_-	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676877.1|1966077_1966353_-	YggT family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676878.1|1966352_1966943_-	cell division protein SepF	NA	NA	NA	NA
WP_011676879.1|1966976_1967654_-	YggS family pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
WP_011676880.1|1967657_1968911_-	cell division protein FtsZ	NA	NA	NA	NA
WP_011676881.1|1968940_1970311_-	cell division protein FtsA	NA	NA	NA	NA
WP_011676882.1|1970473_1971343_-	DegV family protein	A0A0N9SI50	Staphylococcus_phage	2.5e-13	33.8
WP_011676883.1|1971459_1972188_-	23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB	NA	NA	NA	NA
WP_011676884.1|1972380_1973271_-|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_011676885.1|1973347_1974460_-	FAD-binding oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_021211914.1|1974597_1975443_-	aldo/keto reductase	A0A1V0SDE7	Indivirus	1.5e-31	32.9
WP_011676887.1|1975454_1976777_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_011676889.1|1978268_1979579_-	aminopeptidase C	R4TV59	Phaeocystis_globosa_virus	1.5e-62	31.7
WP_011676890.1|1979707_1980382_-	HD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_014572089.1|1980399_1980903_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676892.1|1981039_1981720_-	5'-methylthioadenosine/adenosylhomocysteine nucleosidase	NA	NA	NA	NA
WP_011676893.1|1981747_1982026_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676894.1|1982018_1982603_-	NUDIX hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_011676895.1|1982704_1984081_-	bifunctional UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase GlmU	A0A0G2Y8M0	Acanthamoeba_polyphaga_mimivirus	5.5e-31	35.7
WP_011676896.1|1984303_1985095_+	pyrroline-5-carboxylate reductase	A0A1X9I6T5	Streptococcus_phage	2.4e-31	33.2
WP_010906184.1|1985178_1985448_-	30S ribosomal protein S15	NA	NA	NA	NA
WP_011676897.1|1985618_1987496_-	Stk1 family PASTA domain-containing Ser/Thr kinase	A0A1V0SDC3	Indivirus	9.8e-23	32.4
WP_011676898.1|1987495_1988272_-	Stp1/IreP family PP2C-type Ser/Thr phosphatase	NA	NA	NA	NA
WP_011676899.1|1988394_1989669_-	16S rRNA (cytosine(967)-C(5))-methyltransferase RsmB	NA	NA	NA	NA
1989781:1989803	attL	NA	NA	NA	NA
WP_011676900.1|1989956_1990583_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_041167469.1|1990693_1991632_-	glycosyltransferase family 2 protein	V9QJB1	Oenococcus_phage	7.9e-82	50.6
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WP_063284078.1|1994056_1994359_-|holin	phage holin	Q9AZL0	Lactococcus_phage	9.4e-45	93.6
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WP_063284077.1|1994760_1996218_-	hypothetical protein	A0A059NTA1	Lactococcus_phage	2.4e-93	50.5
WP_041167470.1|1996351_1998853_-	hypothetical protein	A0A059NT86	Lactococcus_phage	0.0e+00	83.2
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WP_011676915.1|2006853_2007972_-	Ig-like domain-containing protein	A0A059NT82	Lactococcus_phage	1.1e-165	98.1
WP_041167616.1|2007983_2008640_-	DUF4355 domain-containing protein	A0A182BQ92	Lactococcus_phage	1.5e-79	89.9
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WP_011676918.1|2009916_2010204_-|protease	ribosomal-processing cysteine protease Prp	A0A059NT85	Lactococcus_phage	5.6e-47	95.8
WP_041167618.1|2010200_2010431_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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WP_011676922.1|2012110_2013346_-|terminase	PBSX family phage terminase large subunit	A0A182BQ98	Lactococcus_phage	2.6e-234	96.4
WP_011676923.1|2013335_2013848_-|terminase	terminase small subunit	A0A059NT97	Lactococcus_phage	2.3e-75	91.2
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WP_011676929.1|2016636_2016948_-	hypothetical protein	Q8H9H2	Lactococcus_phage	2.9e-49	96.9
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WP_011676931.1|2017363_2017720_-	hypothetical protein	A0A1B1IMV9	Lactococcus_phage	9.4e-44	69.5
WP_011676932.1|2017716_2018238_-	DUF1642 domain-containing protein	A0A059NT63	Lactococcus_phage	4.4e-42	59.3
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WP_011676935.1|2019081_2019321_-	DUF1031 domain-containing protein	Q9MBY5	Lactococcus_phage	6.1e-39	100.0
WP_011676937.1|2019731_2019953_-	hypothetical protein	Q94M91	Lactococcus_phage	2.4e-34	98.6
WP_011676939.1|2020878_2021304_-	single-stranded DNA-binding protein	Q9AZV6	Lactococcus_phage	5.7e-72	95.0
WP_011676940.1|2021296_2022055_-	hypothetical protein	Q0ILF6	Lactococcus_phage	7.7e-144	97.6
WP_011676941.1|2022063_2022459_-	hypothetical protein	Q0ILF7	Lactococcus_phage	5.5e-69	98.5
WP_011676942.1|2022557_2022794_-	DUF1408 domain-containing protein	A5GYQ9	Lactococcus_phage	7.1e-40	100.0
WP_063282574.1|2022890_2023256_+	DUF2513 domain-containing protein	A0A1Q1PVT8	Staphylococcus_phage	3.6e-14	37.0
WP_011676945.1|2023771_2024041_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676946.1|2024053_2024836_-	phage repressor protein/antirepressor Ant	A0A1B1IMQ3	Lactococcus_phage	1.9e-89	70.5
WP_011676947.1|2024848_2025088_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	A0A1P8BKU7	Lactococcus_phage	1.4e-35	94.9
WP_011676948.1|2025185_2025695_+	hypothetical protein	A0A1B1IMQ8	Lactococcus_phage	2.8e-89	98.8
WP_011676952.1|2026312_2026507_-	putative transcriptional regulator	A0A1B1IMU6	Lactococcus_phage	1.0e-23	94.8
WP_011676953.1|2026769_2027297_+	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A1B1IMU5	Lactococcus_phage	6.5e-25	52.2
WP_011676954.1|2027302_2027737_+	zinc peptidase	NA	NA	NA	NA
WP_011676955.1|2027750_2028086_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011676956.1|2028152_2029334_+|integrase	site-specific integrase	Q9AZK8	Lactococcus_phage	6.9e-91	47.5
2029354:2029376	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_15

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15

>NZ_CP015901|2241861:2309362|DBSCAN-SWA
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MNIKEYIKKDGTKVYRTNVYLGVDNLTGKQVRTSVSANSRKMCDIKARQAINKFINNGSTIAREKVVFDNFESLALSWFESYKLTVKENSISVADNYLRNYILPPIGSYKLSKITPMLLQELVNKWANNANTAEIINGKRERGKCKDYKLLLNFIKRILDYGMQLGAIEDNSAIKVFPPKLKTRTVKKIKYFDNEELKQFLLYLDTLEPSTDNRKSKTLYKLLLATGLRVGEAMALSWSDIDFNNHYLSVSKTLIQQSNLIQDSAKTKESNRSVFLDNDTLESLKEWRKYQNDGAISLHDSLVFSYHQKMRSYEIERQKLVRHFKNAGVPNIGFHGFRHTHASLLMNNDVNPKEIQRRLGHADYAITMNTYSHLAKSKEKETAEKFSSILKAL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
2235023:2235040	attL	NA	NA	NA	NA
WP_011677045.1|2241861_2242272_-	DUF722 domain-containing protein	Q9AZI2	Lactococcus_phage	3.2e-64	90.4
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WP_011677048.1|2243603_2245232_-	DNA primase	Q9AZI5	Lactococcus_phage	9.2e-296	91.7
WP_011677049.1|2245242_2246037_-	hypothetical protein	Q9AZI6	Lactococcus_phage	6.1e-152	96.2
WP_011677050.1|2246033_2246369_-	hypothetical protein	Q9AZI7	Lactococcus_phage	2.0e-51	90.7
WP_011677052.1|2246616_2246856_-	hypothetical protein	Q9AZJ0	Lactococcus_phage	2.0e-37	93.7
WP_011677053.1|2246898_2247180_-	hypothetical protein	Q9AZJ1	Lactococcus_phage	1.8e-45	94.6
WP_011677054.1|2247176_2247428_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	Q9AZJ2	Lactococcus_phage	5.2e-33	89.0
WP_011677055.1|2247424_2248030_-	hypothetical protein	Q9AZJ3	Lactococcus_phage	4.2e-60	79.5
WP_011677056.1|2248034_2248229_-	DUF1655 domain-containing protein	Q9AZF2	Lactococcus_phage	1.1e-27	95.3
WP_011677057.1|2248347_2248596_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011677058.1|2248599_2248797_-	hypothetical protein	Q9AZJ6	Lactococcus_phage	8.9e-20	79.7
WP_011677059.1|2249055_2249439_+	XRE family transcriptional regulator	Q9AZJ7	Lactococcus_phage	1.4e-45	70.1
WP_011677060.1|2249450_2250002_+	hypothetical protein	Q9AZJ8	Lactococcus_phage	6.2e-87	79.9
WP_011677061.1|2250015_2250210_+	hypothetical protein	Q9AZK1	Lactococcus_phage	3.9e-28	96.9
WP_031286289.1|2250496_2250754_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011677063.1|2250869_2252180_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011677065.1|2252828_2254010_+|integrase	site-specific integrase	Q9AZK8	Lactococcus_phage	4.9e-89	45.2
WP_011677066.1|2254222_2254849_+	copper homeostasis protein CutC	NA	NA	NA	NA
WP_011677067.1|2254881_2255901_-	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_011677068.1|2255893_2256664_-	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	4.9e-29	32.8
WP_011677069.1|2256682_2258461_-	glycerophosphodiester phosphodiesterase	A0A076G4Q2	Staphylococcus_phage	2.0e-09	27.0
WP_011677070.1|2258759_2259158_+	HIT family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011677071.1|2259172_2259394_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014573252.1|2259405_2259750_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011677073.1|2259827_2260517_-	50S ribosomal protein L1	NA	NA	NA	NA
WP_011677074.1|2260903_2261329_-	50S ribosomal protein L11	NA	NA	NA	NA
WP_011677075.1|2261464_2262229_-	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_011677076.1|2262228_2263107_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	A0A2K9L0W2	Tupanvirus	8.6e-06	26.4
WP_011677077.1|2263173_2263383_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011677078.1|2263416_2263938_-	peptide-methionine (S)-S-oxide reductase MsrA	NA	NA	NA	NA
WP_011677079.1|2264112_2264970_-	S1 RNA-binding domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011677080.1|2265014_2265473_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_011677081.1|2265557_2266115_-	ribosome recycling factor	NA	NA	NA	NA
WP_004254608.1|2266270_2266987_-	UMP kinase	NA	NA	NA	NA
WP_011677082.1|2267071_2267524_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011677083.1|2267653_2268841_-	acetate kinase	NA	NA	NA	NA
2267588:2267605	attR	NA	NA	NA	NA
WP_011677084.1|2268999_2270187_-	acetate kinase	NA	NA	NA	NA
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WP_011677086.1|2271404_2271656_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_16

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16

>NZ_CP015901|2368542:2434797|DBSCAN-SWA
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MKIKHIFTDMDGTLLDSHGALSDTNHWSIYYSELPITLVSARSPLEMSDVVEKLQLSTPQIAFNGNLTFTQNQFGLQILDKNTLNSETVFQILNYVSSEFPKVSLNWYSLAHWYTNKQDKGTFIQKALTGLEPRIKTFDGQSEIYKIMMIVFDQNELHQLQNQLNQLEIPNIAIQQSGQWYLEITSDKRTKANAVQSILNDEALDFTQIAAIGDGHNDIPLLKAAGLAIAVDNANPEVKKHVKMVVAKNTEHGVAEAISAINTLNEQVI
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MVNLKEYENKVNDYAIEITKYLISRGSQLIDAEDAVQDTLVKILSLDIFIEPDKLRAFMYRTSIRTYINSYNRSKHYKKIIKNLEKELETAAFLVEYSPLPKIIEQLSPYYNRLLTAYYYENSSTKQLAEYFECSLSKIKIDLYRARKKLKKQLEKAGYDQWLL
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MKILLYLEAEQFLSHSGIGRAMKHQQRALDLMGIDWTKNPEDDYDILHLNTYGFSSWKMLKKAKKAGKKVIFHGHSTKEDFQNSFIGSNIAAPFFKQYLMHYYRAADLVITPTDYSASLLRSYGIKCPILPISNGIDLAKYSRSKAKEQAFRDHFSLKADQKVVVTAALYFKRKGIDDFIKVAERMPDVAFIWFGYQNLWTIPGWIRRIVKKNHPKNVLFPGYIKGDIFEGAMTSADAFFFPSREETEGIVVLEALASHQKTVVRDIPVYHGWLDSNAVSMACDIDGFVSQLQDVLDGKVDKTEAAYQVAESRTIEKVAQQLADAYQQTLEL
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MTSLTDLSKLSGYSKATVSRALSGNGYVSPEARTIIQDLANELDYTPNAIAQELAAGTTKNIGVVLSYVKHPFFSQILEEILDKSFETGYKIVILPSNYDQNLELQYLEQLRKKAFEALIFTSRKISEETVLKYQKYGPIILCHKPKTKTISASYAEREIGYRDAFKWLKKQNCTNIGFLFSRYKSPTTSVTLQTYSEIYK
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>NZ_CP015901|2368542:2434797|2413213_2414239_+|WP_011677208.1|DBSCAN-SWA
MKEKILLGGYTKRVSKGVYSVLLDSKKAELSALTEVAAVQNPTYITLDQKGHLYTCAADGNGGGIATFDFDGQNTTHLGNVTSTGAPLCYVAVDEARQLVYGANYHLGEVRVYKIQADGSLRLTDTVKHNGSGPRPEQASSHVHYSDLTPDGRLVTCDLGTDEVTVYDVIGEGKLNIVTIYRAEKGMGARHISFHPNGKIAYLVGELNSTIEVLSYNEEKGRFARLQTISTLPEDYHGANGVAAIRISSDGKFLYASNRGHDSLAIYKVSPLGTKLEAIGWTKTEGHIPRDFNFNKTEDYIIVAHQESDNLTLFLRDKNTGSLTLEQKDFYAPEITCVLPL
>NZ_CP015901|2368542:2434797|2426975_2428082_+|WP_011677218.1|DBSCAN-SWA
MRTLLIFPYLVLAITFFFGLLRLILFTVKKIQRRNQSTNSHSNLNNDFHNFATKTKLKRWGITSWIAMTIFSAFIVIAWQVNSALMEKNYFKTFDFSTATLTAAAPNIGYNNQIINDYGIFNSNLHSDTYKDIDGYRVPWQAFDFAFGVSNVGTLSLDTLGTMENSNAYFTQTTNQKIASFFSTKTNYKSKEYYGIFPTRDAGKISQLANHVAEAAVTFDKPYSYKEIQKMIPEDLLINWYWIGYNNTKSLAAASQTNWFGLMSNSNHTGNGNNSQLTGKLDNAAYQDFKKSLTAIAKTNQITINDFSPSKDALKQVKKYPTLKSAKFSGVILTGQTKNFANLDKNPWVYASNVGLTVELRPDIQPLK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_152023942.1|2368542_2369936_-|transposase	IS3 family transposase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	2.9e-56	44.6
WP_011677177.1|2370008_2370818_-	metal ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
WP_011677178.1|2370810_2371548_-	metal ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	7.0e-17	25.7
WP_011677179.1|2371726_2372569_-	zinc ABC transporter solute-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_011677180.1|2372565_2373003_-	MarR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_011677181.1|2373082_2373382_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_041167483.1|2373405_2373852_-	competence protein ComGF	NA	NA	NA	NA
WP_011677183.1|2373814_2374111_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011677184.1|2374472_2374850_-	prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011677100.1|2376717_2377608_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_011677185.1|2377895_2382803_-	PolC-type DNA polymerase III	A0A0K2SUJ2	Clostridium_phage	9.1e-20	37.2
WP_011677186.1|2382976_2383279_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011677187.1|2383437_2384769_-	NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_011677188.1|2384784_2386635_-|tRNA	proline--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
WP_011677189.1|2386704_2387991_-|protease	RIP metalloprotease RseP	NA	NA	NA	NA
WP_011677190.1|2388009_2388813_-	phosphatidate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_011677191.1|2388812_2389547_-	isoprenyl transferase	R9W0U9	Flavobacterium_phage	2.6e-16	37.0
WP_011677192.1|2389896_2390229_-	preprotein translocase subunit YajC	NA	NA	NA	NA
WP_011677194.1|2391039_2391519_-	23S rRNA (pseudouridine(1915)-N(3))-methyltransferase RlmH	NA	NA	NA	NA
WP_011677195.1|2391894_2393118_+|protease	serine protease	A0A1B1IRD3	uncultured_Mediterranean_phage	2.4e-06	25.8
WP_011677196.1|2393239_2394238_+	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_011677197.1|2394375_2395716_+	glycosyltransferase family 4 protein	NA	NA	NA	NA
WP_011677198.1|2395823_2396048_+	YkuJ family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011677199.1|2396186_2397191_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_014573352.1|2397247_2398000_-|tRNA	tRNA1(Val) (adenine(37)-N6)-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_011677201.1|2398207_2400841_-	DNA polymerase I	A0A218MKQ4	uncultured_virus	3.8e-57	31.3
WP_011677202.1|2401102_2401912_+	Cof-type HAD-IIB family hydrolase	NA	NA	NA	NA
WP_011677203.1|2401911_2402517_+	LacI family DNA-binding transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_011677205.1|2408966_2410697_-	septation ring formation regulator EzrA	NA	NA	NA	NA
WP_011677206.1|2410901_2411930_-	elongation factor Ts	NA	NA	NA	NA
WP_011677207.1|2412051_2412819_-	30S ribosomal protein S2	NA	NA	NA	NA
WP_011677208.1|2413213_2414239_+	lactonase family protein	NA	NA	NA	NA
WP_011677209.1|2414494_2417206_+	bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
WP_011677211.1|2417669_2418167_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011677212.1|2418153_2418363_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011675620.1|2418650_2419541_+|transposase	IS982 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_014573366.1|2419647_2420967_-	KxxxW cyclic peptide radical SAM maturase	NA	NA	NA	NA
WP_011677213.1|2421466_2422498_-	PDZ domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
WP_011677214.1|2422481_2422982_-	pantetheine-phosphate adenylyltransferase	A0A1B1IVQ3	uncultured_Mediterranean_phage	2.0e-15	32.1
WP_031286167.1|2423029_2423569_-	16S rRNA (guanine(966)-N(2))-methyltransferase RsmD	NA	NA	NA	NA
WP_011677216.1|2423739_2424960_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
WP_050748315.1|2426457_2426952_+	RNA polymerase sigma factor	NA	NA	NA	NA
WP_011677218.1|2426975_2428082_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_011677219.1|2428176_2429523_-	glucose-6-phosphate isomerase	NA	NA	NA	NA
WP_014573374.1|2429866_2430373_+	YkgJ family cysteine cluster protein	NA	NA	NA	NA
WP_011677222.1|2430406_2431147_-	SDR family NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_011677223.1|2431192_2431996_-	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_011677224.1|2432065_2432911_-	NAD(P)H-binding protein	NA	NA	NA	NA
WP_021216380.1|2433083_2433416_+	helix-turn-helix transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_011675534.1|2433621_2434797_+|transposase	IS256-like element IS905 family transposase	A0A0N9STL0	Staphylococcus_phage	2.5e-32	32.3

2. NZ_CP016740

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP016740_1

• CRISPR_ID: NZ_CP016740_1
• CRISPR_location: 4088-4229
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP016740_1

Consensus_repeat	Method
TAGACATAAAAAAGAAAAGCGTTCTAATCGTTTTTCCTTTTTTATC	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP016740_1

>1.1|4134|50|NZ_CP016740|CRISPRCasFinder
AGATGTTCAGAAAATGGTCGTTTTCTGGACATGGACTATTATCAAATAAT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016740_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP016740_1

>merge|NZ_CP016740|1|4088-4229|CRISPRCasFinder
TAGACATAAAAAAGAAAAGCGTTCTAATCGTTTTTCCTTTTTTATCAGATGTTCAGAAAATGGTCGTTTTCTGGACATGGACTATTATCAAATAATTAGACATAAAAAAGAAAAGCGTTCTAATCGTTTTTCCTTTTATATC

>NZ_CP016740|1|1|4088-4229|CRISPRCasFinder
TAGACATAAAAAAGAAAAGCGTTCTAATCGTTTTTCCTTTTTTATC	AGATGTTCAGAAAATGGTCGTTTTCTGGACATGGACTATTATCAAATAAT
TAGACATAAAAAAGAAAAGCGTTCTAATCGTTTTTCCTTTTATATC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP016740.1|WP_011676114.1|3142_3808_+|acetolactate-decarboxylase	unknown	unknown	gnl|CDD|226058
NZ_CP016740.1|WP_001015311.1|4290_4971_-|IS6-like-element-IS1216-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP016740.1|WP_012881352.1|9078_9681_-|replication-associated-protein-RepX	unknown	unknown	unknown
NZ_CP016740.1|WP_011676114.1|5137_5803_+|acetolactate-decarboxylase	unknown	unknown	gnl|CDD|226058
NZ_CP016740.1|WP_012881351.1|9673_10840_-|RepB-family-plasmid-replication-initiator-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|227814
NZ_CP016740.1|WP_011669032.1|0_1161_+|RepB-family-plasmid-replication-initiator-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|227814
NZ_CP016740.1|WP_012881359.1|1710_2262_+|methyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|334588
NZ_CP016740.1|WP_155724485.1|8924_9074_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP016740.1|WP_012881358.1|6239_6803_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP016740.1|WP_001015311.1|2295_2976_-|IS6-like-element-IS1216-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP016740.1|WP_012881357.1|6990_7281_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP016740.1|WP_012881355.1|7753_8122_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP016740.1|WP_011669031.1|1153_1690_+|HTH-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP016740.1|WP_001015311.1|12114_12795_-|IS6-like-element-IS1216-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP016740.1|WP_011676114.1|3142_3808_+|acetolactate-decarboxylase	gnl|CDD|226058	COG3527, AlsD, Alpha-acetolactate decarboxylase [Secondary metabolites biosynthesis, transport, and catabolism].	1.96778e-94
NZ_CP016740.1|WP_001015311.1|4290_4971_-|IS6-like-element-IS1216-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	4.15926e-92
NZ_CP016740.1|WP_001015311.1|2295_2976_-|IS6-like-element-IS1216-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	4.15926e-92
NZ_CP016740.1|WP_011676114.1|5137_5803_+|acetolactate-decarboxylase	gnl|CDD|226058	COG3527, AlsD, Alpha-acetolactate decarboxylase [Secondary metabolites biosynthesis, transport, and catabolism].	1.96778e-94
NZ_CP016740.1|WP_012881351.1|9673_10840_-|RepB-family-plasmid-replication-initiator-protein	gnl|CDD|227814	COG5527, COG5527, Protein involved in initiation of plasmid replication [DNA replication, recombination, and repair].	1.08351e-66
NZ_CP016740.1|WP_011669032.1|0_1161_+|RepB-family-plasmid-replication-initiator-protein	gnl|CDD|227814	COG5527, COG5527, Protein involved in initiation of plasmid replication [DNA replication, recombination, and repair].	2.07707e-80
NZ_CP016740.1|WP_012881359.1|1710_2262_+|methyltransferase	gnl|CDD|334588	pfam01555, N6_N4_Mtase, DNA methylase. Members of this family are DNA methylases. The family contains both N-4 cytosine-specific DNA methylases and N-6 Adenine-specific DNA methylases.	1.41145e-12
NZ_CP016740.1|WP_001015311.1|12114_12795_-|IS6-like-element-IS1216-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	4.15926e-92

Protein sequences

>NZ_CP016740.1|WP_011676114.1|3142_3808_+|acetolactate-decarboxylase
MNSRIFQHNTFTTLSIGFYKGTITLKEALTHGKVGIGTLDTANGEVTIIDGIAYHGDSENQVRLVEENETMPYVAMVEHQPIVKFTDNSVSNSEDFLSALTKRFPTANTAYTIVMTGQFKEVTVSSKPANNTRPYDEIMADQPYFTKENISGTMLGVWAPKHLTDLFGIGFHLHFVSEDKTFTAHVQNFITENLAIELGKITQIEQEFPDEDENFDQHLFQ
>NZ_CP016740.1|WP_001015311.1|2295_2976_-|IS6-like-element-IS1216-family-transposase
MNHFKGKQFQQDVIIVAVGYYLRYNLSYREVQEILYDRGINVSHTTIYRWVQEYGKLLYQIWKKKNKKSFYSWKMDETYIKIKGKWHYLYRAIDADGLTLDIWLRKKRDTQAAYAFLKRLVKQFDEPKVVVTDKAPSITSAFKKLKEYGFYQGTEHRTIKYLNNLIEQDHRPVKRRNKFYRSLRTASTTIKGMEAIRGLYKKTRKEGTLFGFSVCTEIKVLLGIPA
>NZ_CP016740.1|WP_012881359.1|1710_2262_+|methyltransferase
MTFIERPHENEKTRALVYVSKLLEEAINSKENRAEDIKELEDIQKLLSQKKYGLVWEQHAEQFEADMKFNIPVFVENKSKKMHYDKDSNKFNFLLEGDNLHSLHLLEKTHLGKIDIIYIDPPYNTGNKDFVYNDDFVGKDDEFKHSKWLSFMERRLIIAKKLLSPNGVIFVSIDNKEGSVAKF
>NZ_CP016740.1|WP_011669031.1|1153_1690_+|HTH-domain-containing-protein
MSEELKTIKELADEIGVSKQAVWQKIKKESSIDLRQFTSKKGNTVYVDVDGQKVIKNAFFNKTSTKKRQQKLFVDDNVNDSVDGNLEGNEEILFLRNLVSELQSEKKELHKLLDQQQRLALQDKKLLEEYKEEIKELKSLMVPVRKDNKDPMVQKSKDIDNTKEELHTKNKKWWKLWK
>NZ_CP016740.1|WP_011669032.1|0_1161_+|RepB-family-plasmid-replication-initiator-protein
MSSIPEKQENQKQVLTLNELSKRKVVEHNSLITSIAKMDKTPLKMFELAVSCINTEEPPKDNIIYLSKRDLFAFFKVSDNDKHSRFKEAIEKMQKQAFFQIKEEAGKGFKFKSIVPIPYVEWTDYHDEVKIEFHREILPYLINLKKNFTQHALSDIAELNSKYSIILYRWLSMNYNQYEHYSTKGGRRAEQVESYRNPSISIKELRIMTDTVNDYERFQSLETWILKKPLEEINDHTSFTVTYDKVKKGRSIDSIVFHIEKKRQADDNSYKMEDQAYQTDKKIKEETEEKLVYQAMKSKYTQILLENMLLSPYEMTDTALMAGLQKNVYPLYDELKELRGLKGVKDHLSYVASKREDYSKKNICKYLKKAIEQYLPTVKRQDLNHE
>NZ_CP016740.1|WP_001015311.1|4290_4971_-|IS6-like-element-IS1216-family-transposase
MNHFKGKQFQQDVIIVAVGYYLRYNLSYREVQEILYDRGINVSHTTIYRWVQEYGKLLYQIWKKKNKKSFYSWKMDETYIKIKGKWHYLYRAIDADGLTLDIWLRKKRDTQAAYAFLKRLVKQFDEPKVVVTDKAPSITSAFKKLKEYGFYQGTEHRTIKYLNNLIEQDHRPVKRRNKFYRSLRTASTTIKGMEAIRGLYKKTRKEGTLFGFSVCTEIKVLLGIPA
>NZ_CP016740.1|WP_011676114.1|5137_5803_+|acetolactate-decarboxylase
MNSRIFQHNTFTTLSIGFYKGTITLKEALTHGKVGIGTLDTANGEVTIIDGIAYHGDSENQVRLVEENETMPYVAMVEHQPIVKFTDNSVSNSEDFLSALTKRFPTANTAYTIVMTGQFKEVTVSSKPANNTRPYDEIMADQPYFTKENISGTMLGVWAPKHLTDLFGIGFHLHFVSEDKTFTAHVQNFITENLAIELGKITQIEQEFPDEDENFDQHLFQ
>NZ_CP016740.1|WP_012881358.1|6239_6803_-|hypothetical-protein
MPRYTTLTDYVNTQIEKFDIPDTEKNRSKLRIKFTRELKRLGYWDTAEKKVIGRNETRLFSDEQLNHLSIEVEPYLLKQGNVDIEELEEYRQNFENYIEEVRNQTNESYQQQLEAEQYEPPKVTKREAMEVMITALFEKYFEPLDLEQWNKDKATTHFSELSDMTDTDYILACMRLNNPTTSYTKEK
>NZ_CP016740.1|WP_012881357.1|6990_7281_+|hypothetical-protein
MLNGNEYVVTVKDNKTDEAYLSVIVENVSGGKMVKSIVQNSKVSTEVNEDHVKKLLAFVNGTTVDELPVIEDLASKVLVVEATNKIGDDYIVELDF
>NZ_CP016740.1|WP_012881355.1|7753_8122_+|hypothetical-protein
MSQLEKLKALQESKSKTANLSLFNNLVVIDVGIKPTQHFPKLKDEFGNKVKDENGKDKRSETSDGYTYTFTEFGTGKMVKVVLPQEQKIELLGSYVVVGFGYDIKSANMIFIEQKAKIAEYR
>NZ_CP016740.1|WP_155724485.1|8924_9074_+|hypothetical-protein
MKDMILNIKKNAIALDLDADYTTIENQLMDLKKQIKILDEFLDLKILDV
>NZ_CP016740.1|WP_012881352.1|9078_9681_-|replication-associated-protein-RepX
MSENLKTIKELADELGVSKQNLQYHVKFLPTKKRQKNESGIVVLNIEEQMFISGRIKKNKAKDINDETKKGQKNINDETKKRQKNNDVFAFNNHLLKEIIDLKEVNKQLLESQKQTQNLLDQQQRLALLDNKLLEEYKAEINDLKALKMPSQETKEEQANSQPQEELETLKEQIRALNDKIKGQEELNNQSSKKWYQFWK
>NZ_CP016740.1|WP_012881351.1|9673_10840_-|RepB-family-plasmid-replication-initiator-protein
MSIIPINNDFNEKKVVCTLNDLEKRKVVEHNALIQSVAKMQKTALKMFELAVSCIDTDKIPENNTVYLSKKELFSFFEVSSSSKHSQFKEAIEFMQKQAYFKIKSNKALGIEYESIVPIPYVKWNDYNDEVLIRFSPEIMPYLINLKAEFTQYKISELQKLNSKYSIILYRWLAMNYNQYEHYSVKGGRRAEQVEAYRNPSISVKELRAITDTAKEYKDFRNFEKRVLKNAIEEINEHTSFNVTYEKKKAGRSIDSIVFHIEKKRMADDNSYKLGDKDYQDDKKQKSRNEADLLKQAMESKYTRLLSENFLIGMNDIMDTATMVGLQKNVYPLYDELKELRGLNGVKDHLSYVASKKEAYSKRNVAKYLKKAIEQYLPTVKRQDLNHE
>NZ_CP016740.1|WP_001015311.1|12114_12795_-|IS6-like-element-IS1216-family-transposase
MNHFKGKQFQQDVIIVAVGYYLRYNLSYREVQEILYDRGINVSHTTIYRWVQEYGKLLYQIWKKKNKKSFYSWKMDETYIKIKGKWHYLYRAIDADGLTLDIWLRKKRDTQAAYAFLKRLVKQFDEPKVVVTDKAPSITSAFKKLKEYGFYQGTEHRTIKYLNNLIEQDHRPVKRRNKFYRSLRTASTTIKGMEAIRGLYKKTRKEGTLFGFSVCTEIKVLLGIPA

Crispr_ID: NZ_CP016740_2

• CRISPR_ID: NZ_CP016740_2
• CRISPR_location: 6083-6224
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP016740_2

Consensus_repeat	Method
TAGACATAAAAAAGAAAAGCGTTCTAATCGTTTTTCCTTTTTTATC	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP016740_2

>2.1|6129|50|NZ_CP016740|CRISPRCasFinder
AGATGTTCAGAAAATGGTCGTTTTCTGGACATGGACTATTATCAAATAAT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP016740_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP016740_2

>merge|NZ_CP016740|2|6083-6224|CRISPRCasFinder
TAGACATAAAAAAGAAAAGCGTTCTAATCGTTTTTCCTTTTTTATCAGATGTTCAGAAAATGGTCGTTTTCTGGACATGGACTATTATCAAATAATTAGACATAAAAAAGAAAAGCGTTCTAATCGTTTTTCCTTTTATATC

>NZ_CP016740|2|2|6083-6224|CRISPRCasFinder
TAGACATAAAAAAGAAAAGCGTTCTAATCGTTTTTCCTTTTTTATC	AGATGTTCAGAAAATGGTCGTTTTCTGGACATGGACTATTATCAAATAAT
TAGACATAAAAAAGAAAAGCGTTCTAATCGTTTTTCCTTTTATATC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP016740.1|WP_011676114.1|3142_3808_+|acetolactate-decarboxylase	unknown	unknown	gnl|CDD|226058
NZ_CP016740.1|WP_001015311.1|4290_4971_-|IS6-like-element-IS1216-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP016740.1|WP_012881352.1|9078_9681_-|replication-associated-protein-RepX	unknown	unknown	unknown
NZ_CP016740.1|WP_011676114.1|5137_5803_+|acetolactate-decarboxylase	unknown	unknown	gnl|CDD|226058
NZ_CP016740.1|WP_012881351.1|9673_10840_-|RepB-family-plasmid-replication-initiator-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|227814
NZ_CP016740.1|WP_011669032.1|0_1161_+|RepB-family-plasmid-replication-initiator-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|227814
NZ_CP016740.1|WP_012881359.1|1710_2262_+|methyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|334588
NZ_CP016740.1|WP_155724485.1|8924_9074_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP016740.1|WP_012881358.1|6239_6803_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP016740.1|WP_001015311.1|2295_2976_-|IS6-like-element-IS1216-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853
NZ_CP016740.1|WP_012881357.1|6990_7281_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP016740.1|WP_012881355.1|7753_8122_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP016740.1|WP_011669031.1|1153_1690_+|HTH-domain-containing-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP016740.1|WP_001015311.1|12114_12795_-|IS6-like-element-IS1216-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225853

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP016740.1|WP_011676114.1|3142_3808_+|acetolactate-decarboxylase	gnl|CDD|226058	COG3527, AlsD, Alpha-acetolactate decarboxylase [Secondary metabolites biosynthesis, transport, and catabolism].	1.96778e-94
NZ_CP016740.1|WP_001015311.1|4290_4971_-|IS6-like-element-IS1216-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	4.15926e-92
NZ_CP016740.1|WP_001015311.1|2295_2976_-|IS6-like-element-IS1216-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	4.15926e-92
NZ_CP016740.1|WP_011676114.1|5137_5803_+|acetolactate-decarboxylase	gnl|CDD|226058	COG3527, AlsD, Alpha-acetolactate decarboxylase [Secondary metabolites biosynthesis, transport, and catabolism].	1.96778e-94
NZ_CP016740.1|WP_012881351.1|9673_10840_-|RepB-family-plasmid-replication-initiator-protein	gnl|CDD|227814	COG5527, COG5527, Protein involved in initiation of plasmid replication [DNA replication, recombination, and repair].	1.08351e-66
NZ_CP016740.1|WP_011669032.1|0_1161_+|RepB-family-plasmid-replication-initiator-protein	gnl|CDD|227814	COG5527, COG5527, Protein involved in initiation of plasmid replication [DNA replication, recombination, and repair].	2.07707e-80
NZ_CP016740.1|WP_012881359.1|1710_2262_+|methyltransferase	gnl|CDD|334588	pfam01555, N6_N4_Mtase, DNA methylase. Members of this family are DNA methylases. The family contains both N-4 cytosine-specific DNA methylases and N-6 Adenine-specific DNA methylases.	1.41145e-12
NZ_CP016740.1|WP_001015311.1|12114_12795_-|IS6-like-element-IS1216-family-transposase	gnl|CDD|225853	COG3316, COG3316, Transposase and inactivated derivatives [DNA replication, recombination, and repair].	4.15926e-92

Protein sequences

>NZ_CP016740.1|WP_011676114.1|5137_5803_+|acetolactate-decarboxylase
MNSRIFQHNTFTTLSIGFYKGTITLKEALTHGKVGIGTLDTANGEVTIIDGIAYHGDSENQVRLVEENETMPYVAMVEHQPIVKFTDNSVSNSEDFLSALTKRFPTANTAYTIVMTGQFKEVTVSSKPANNTRPYDEIMADQPYFTKENISGTMLGVWAPKHLTDLFGIGFHLHFVSEDKTFTAHVQNFITENLAIELGKITQIEQEFPDEDENFDQHLFQ
>NZ_CP016740.1|WP_001015311.1|4290_4971_-|IS6-like-element-IS1216-family-transposase
MNHFKGKQFQQDVIIVAVGYYLRYNLSYREVQEILYDRGINVSHTTIYRWVQEYGKLLYQIWKKKNKKSFYSWKMDETYIKIKGKWHYLYRAIDADGLTLDIWLRKKRDTQAAYAFLKRLVKQFDEPKVVVTDKAPSITSAFKKLKEYGFYQGTEHRTIKYLNNLIEQDHRPVKRRNKFYRSLRTASTTIKGMEAIRGLYKKTRKEGTLFGFSVCTEIKVLLGIPA
>NZ_CP016740.1|WP_011676114.1|3142_3808_+|acetolactate-decarboxylase
MNSRIFQHNTFTTLSIGFYKGTITLKEALTHGKVGIGTLDTANGEVTIIDGIAYHGDSENQVRLVEENETMPYVAMVEHQPIVKFTDNSVSNSEDFLSALTKRFPTANTAYTIVMTGQFKEVTVSSKPANNTRPYDEIMADQPYFTKENISGTMLGVWAPKHLTDLFGIGFHLHFVSEDKTFTAHVQNFITENLAIELGKITQIEQEFPDEDENFDQHLFQ
>NZ_CP016740.1|WP_001015311.1|2295_2976_-|IS6-like-element-IS1216-family-transposase
MNHFKGKQFQQDVIIVAVGYYLRYNLSYREVQEILYDRGINVSHTTIYRWVQEYGKLLYQIWKKKNKKSFYSWKMDETYIKIKGKWHYLYRAIDADGLTLDIWLRKKRDTQAAYAFLKRLVKQFDEPKVVVTDKAPSITSAFKKLKEYGFYQGTEHRTIKYLNNLIEQDHRPVKRRNKFYRSLRTASTTIKGMEAIRGLYKKTRKEGTLFGFSVCTEIKVLLGIPA
>NZ_CP016740.1|WP_012881359.1|1710_2262_+|methyltransferase
MTFIERPHENEKTRALVYVSKLLEEAINSKENRAEDIKELEDIQKLLSQKKYGLVWEQHAEQFEADMKFNIPVFVENKSKKMHYDKDSNKFNFLLEGDNLHSLHLLEKTHLGKIDIIYIDPPYNTGNKDFVYNDDFVGKDDEFKHSKWLSFMERRLIIAKKLLSPNGVIFVSIDNKEGSVAKF
>NZ_CP016740.1|WP_011669031.1|1153_1690_+|HTH-domain-containing-protein
MSEELKTIKELADEIGVSKQAVWQKIKKESSIDLRQFTSKKGNTVYVDVDGQKVIKNAFFNKTSTKKRQQKLFVDDNVNDSVDGNLEGNEEILFLRNLVSELQSEKKELHKLLDQQQRLALQDKKLLEEYKEEIKELKSLMVPVRKDNKDPMVQKSKDIDNTKEELHTKNKKWWKLWK
>NZ_CP016740.1|WP_011669032.1|0_1161_+|RepB-family-plasmid-replication-initiator-protein
MSSIPEKQENQKQVLTLNELSKRKVVEHNSLITSIAKMDKTPLKMFELAVSCINTEEPPKDNIIYLSKRDLFAFFKVSDNDKHSRFKEAIEKMQKQAFFQIKEEAGKGFKFKSIVPIPYVEWTDYHDEVKIEFHREILPYLINLKKNFTQHALSDIAELNSKYSIILYRWLSMNYNQYEHYSTKGGRRAEQVESYRNPSISIKELRIMTDTVNDYERFQSLETWILKKPLEEINDHTSFTVTYDKVKKGRSIDSIVFHIEKKRQADDNSYKMEDQAYQTDKKIKEETEEKLVYQAMKSKYTQILLENMLLSPYEMTDTALMAGLQKNVYPLYDELKELRGLKGVKDHLSYVASKREDYSKKNICKYLKKAIEQYLPTVKRQDLNHE
>NZ_CP016740.1|WP_012881358.1|6239_6803_-|hypothetical-protein
MPRYTTLTDYVNTQIEKFDIPDTEKNRSKLRIKFTRELKRLGYWDTAEKKVIGRNETRLFSDEQLNHLSIEVEPYLLKQGNVDIEELEEYRQNFENYIEEVRNQTNESYQQQLEAEQYEPPKVTKREAMEVMITALFEKYFEPLDLEQWNKDKATTHFSELSDMTDTDYILACMRLNNPTTSYTKEK
>NZ_CP016740.1|WP_012881357.1|6990_7281_+|hypothetical-protein
MLNGNEYVVTVKDNKTDEAYLSVIVENVSGGKMVKSIVQNSKVSTEVNEDHVKKLLAFVNGTTVDELPVIEDLASKVLVVEATNKIGDDYIVELDF
>NZ_CP016740.1|WP_012881355.1|7753_8122_+|hypothetical-protein
MSQLEKLKALQESKSKTANLSLFNNLVVIDVGIKPTQHFPKLKDEFGNKVKDENGKDKRSETSDGYTYTFTEFGTGKMVKVVLPQEQKIELLGSYVVVGFGYDIKSANMIFIEQKAKIAEYR
>NZ_CP016740.1|WP_155724485.1|8924_9074_+|hypothetical-protein
MKDMILNIKKNAIALDLDADYTTIENQLMDLKKQIKILDEFLDLKILDV
>NZ_CP016740.1|WP_012881352.1|9078_9681_-|replication-associated-protein-RepX
MSENLKTIKELADELGVSKQNLQYHVKFLPTKKRQKNESGIVVLNIEEQMFISGRIKKNKAKDINDETKKGQKNINDETKKRQKNNDVFAFNNHLLKEIIDLKEVNKQLLESQKQTQNLLDQQQRLALLDNKLLEEYKAEINDLKALKMPSQETKEEQANSQPQEELETLKEQIRALNDKIKGQEELNNQSSKKWYQFWK
>NZ_CP016740.1|WP_012881351.1|9673_10840_-|RepB-family-plasmid-replication-initiator-protein
MSIIPINNDFNEKKVVCTLNDLEKRKVVEHNALIQSVAKMQKTALKMFELAVSCIDTDKIPENNTVYLSKKELFSFFEVSSSSKHSQFKEAIEFMQKQAYFKIKSNKALGIEYESIVPIPYVKWNDYNDEVLIRFSPEIMPYLINLKAEFTQYKISELQKLNSKYSIILYRWLAMNYNQYEHYSVKGGRRAEQVEAYRNPSISVKELRAITDTAKEYKDFRNFEKRVLKNAIEEINEHTSFNVTYEKKKAGRSIDSIVFHIEKKRMADDNSYKLGDKDYQDDKKQKSRNEADLLKQAMESKYTRLLSENFLIGMNDIMDTATMVGLQKNVYPLYDELKELRGLNGVKDHLSYVASKKEAYSKRNVAKYLKKAIEQYLPTVKRQDLNHE
>NZ_CP016740.1|WP_001015311.1|12114_12795_-|IS6-like-element-IS1216-family-transposase
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MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
NZ_CP016740_1	1.1|4134|50|NZ_CP016740|CRISPRCasFinder	4134-4183	50	NZ_CP016740	Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM3 plasmid pJM3D, complete sequence	4134-4183	0	1.0
NZ_CP016740_1	1.1|4134|50|NZ_CP016740|CRISPRCasFinder	4134-4183	50	NZ_CP016740	Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM3 plasmid pJM3D, complete sequence	6129-6178	0	1.0
NZ_CP016740_1	1.1|4134|50|NZ_CP016740|CRISPRCasFinder	4134-4183	50	NZ_CP016743	Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM2 plasmid pJM2B, complete sequence	6445-6494	0	1.0
NZ_CP016740_1	1.1|4134|50|NZ_CP016740|CRISPRCasFinder	4134-4183	50	NC_013551	Lactococcus lactis plasmid pSK11B, complete sequence	7664-7713	0	1.0
NZ_CP016740_2	2.1|6129|50|NZ_CP016740|CRISPRCasFinder	6129-6178	50	NZ_CP016740	Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM3 plasmid pJM3D, complete sequence	4134-4183	0	1.0
NZ_CP016740_2	2.1|6129|50|NZ_CP016740|CRISPRCasFinder	6129-6178	50	NZ_CP016740	Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM3 plasmid pJM3D, complete sequence	6129-6178	0	1.0
NZ_CP016740_2	2.1|6129|50|NZ_CP016740|CRISPRCasFinder	6129-6178	50	NZ_CP016743	Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM2 plasmid pJM2B, complete sequence	6445-6494	0	1.0
NZ_CP016740_2	2.1|6129|50|NZ_CP016740|CRISPRCasFinder	6129-6178	50	NC_013551	Lactococcus lactis plasmid pSK11B, complete sequence	7664-7713	0	1.0

1. spacer 1.1|4134|50|NZ_CP016740|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016740 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM3 plasmid pJM3D, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

agatgttcagaaaatggtcgttttctggacatggactattatcaaataat	CRISPR spacer
agatgttcagaaaatggtcgttttctggacatggactattatcaaataat	Protospacer
**************************************************

2. spacer 1.1|4134|50|NZ_CP016740|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016740 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM3 plasmid pJM3D, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

agatgttcagaaaatggtcgttttctggacatggactattatcaaataat	CRISPR spacer
agatgttcagaaaatggtcgttttctggacatggactattatcaaataat	Protospacer
**************************************************

3. spacer 1.1|4134|50|NZ_CP016740|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016743 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM2 plasmid pJM2B, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

agatgttcagaaaatggtcgttttctggacatggactattatcaaataat	CRISPR spacer
agatgttcagaaaatggtcgttttctggacatggactattatcaaataat	Protospacer
**************************************************

4. spacer 1.1|4134|50|NZ_CP016740|CRISPRCasFinder matches to NC_013551 (Lactococcus lactis plasmid pSK11B, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

agatgttcagaaaatggtcgttttctggacatggactattatcaaataat	CRISPR spacer
agatgttcagaaaatggtcgttttctggacatggactattatcaaataat	Protospacer
**************************************************

5. spacer 2.1|6129|50|NZ_CP016740|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016740 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM3 plasmid pJM3D, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

agatgttcagaaaatggtcgttttctggacatggactattatcaaataat	CRISPR spacer
agatgttcagaaaatggtcgttttctggacatggactattatcaaataat	Protospacer
**************************************************

6. spacer 2.1|6129|50|NZ_CP016740|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016740 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM3 plasmid pJM3D, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

agatgttcagaaaatggtcgttttctggacatggactattatcaaataat	CRISPR spacer
agatgttcagaaaatggtcgttttctggacatggactattatcaaataat	Protospacer
**************************************************

7. spacer 2.1|6129|50|NZ_CP016740|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016743 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM2 plasmid pJM2B, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

agatgttcagaaaatggtcgttttctggacatggactattatcaaataat	CRISPR spacer
agatgttcagaaaatggtcgttttctggacatggactattatcaaataat	Protospacer
**************************************************

8. spacer 2.1|6129|50|NZ_CP016740|CRISPRCasFinder matches to NC_013551 (Lactococcus lactis plasmid pSK11B, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

agatgttcagaaaatggtcgttttctggacatggactattatcaaataat	CRISPR spacer
agatgttcagaaaatggtcgttttctggacatggactattatcaaataat	Protospacer
**************************************************