Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP015902 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC06 chromosome, complete genome | 3 crisprs | cas3,DEDDh,csa3,DinG | 0 | 1 | 10 | 0 |
NZ_CP016735 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC06 plasmid pUC06B, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP016734 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC06 plasmid pUC06A, complete sequence | 0 crisprs | RT | 0 | 0 | 0 | 0 |
NZ_CP016736 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC06 plasmid pUC06C, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP015902_1 | 1284658-1284770 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP015902_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP015902_1
>1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder CGTCAGCGCAGCTGACAGTTCTGTCAGTAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015902_1
The CRISPR arrays of NZ_CP015902_1 >merge|NZ_CP015902|1|1284658-1284770|CRISPRCasFinder TGCGATTGAATAGTGAGCATTTTAGTTGTAGATAAAAGAACCGTCAGCGCAGCTGACAGTTCTGTCAGTAATTGCGATTGAATAGTGAGCATTTTAGTTGTAAATAAAAGAAC >NZ_CP015902|1|1|1284658-1284770|CRISPRCasFinder TGCGATTGAATAGTGAGCATTTTAGTTGTAGATAAAAGAAC CGTCAGCGCAGCTGACAGTTCTGTCAGTAAT TGCGATTGAATAGTGAGCATTTTAGTTGTAAATAAAAGAAC
>NZ_CP015902.1|WP_081213511.1|1283617_1284655_+|3-isopropylmalate-dehydrogenase MSKKIVTLAGDGIGPEIMSAGLSVLKAVSKKIAFEYELEAKDFGGIAIDKHGHPLPEETLQAVKNADAILLAAIGHPKYNNAKVRPEQGLLDLRKELGLYANVRPLKIYPALKKLSPIRNVENVDFLVIRELTGGIYFGQHELADDKARDVNDYSADEIRRILHFAFKSAQSRPRKLVTSVDKQNVLATSKLWRKMADEIADEYPDVRLEHQLVDSCAMLLITNPQQFDVIVTENLFGDILSDEASSLAGSLGVMPSSSHGFNGLALYEPIHGSAPDIAGKGIANPVSMILSIAMMLRESFGQEEGAAMIEKAVTQTFTDGILTKDLGGTATTKEMTEAILKNCQ >NZ_CP015902.1|WP_017864488.1|1282064_1283606_+|2-isopropylmalate-synthase MRKIEFFDTSLRDGEQTPGVSFSISEKVTIAKQLEKWGISVIEAGFPAASPDSFEAVKQIADSLNDTAVTALARCVISDIDKAVEAVKGAKYPQIHVFIATSPIHMKYKLKISPEEVLKNIDKCVKYARERVEVVEFSPEDATRTELNFLLEAVQTAVDAGATYINIPDTVGYTTPEEYGKIFKFLIDNTKSEREIIFSPHCHDDLGMAVANSLAAIKAGAGRVEGTVNGIGERAGNAALEEIAVALHIRKDFYQAQSPLKLSETAATAELISQFSGIAIPKNKAIVGANAFAHESGIHQDGVLKNAETYEIITPELVGIKHNSLPLGKLSGRHAFSEKLTELNIAYDDESLAILFEKFKKLADKKKEITDADIHALFTGETVKNLAGFILDNVQIDGHKALVQLKNQEEEIYVSQGEGSGSVDAIFKAIDKVFNHQLKLISYSVDAVTDGIDAQATTLVSVENLSTGTIFNAKGVDYDVLKGSAIAYMNANVLVQKENLQGKVEQISAHDGI >NZ_CP015902.1|WP_081213510.1|1280679_1281639_-|rhodanese-domain-containing-protein MTQDYRVLLYYQYVPIEDGETFAQKHLADCKELGLKGRILVADEGINGTVSGTIEQANAYMELMKNDPRFSSTIFKIDEAEQNAFKKMHVRYRPELVNLSLEDDVNPLELTGAYLDPKEFREAMLDENTVVIDARNDYEFDLGHFRGAIRPEIRSFRELPQWIRDNKEQFMEKRVLTYCTGGIRCEKFSGWLVREGFKDVGQLHGGIATYGKDPEVQGDLWDGQMYVFDSRIAVPINQKEHVIVGRDWFDGSPCERYINCGNPECNRQMLASEENEAKYLGACSHECRVHPNNRYIKAHQLSNQEVQERLALLEKDLAS >NZ_CP015902.1|WP_081213509.1|1279856_1280666_+|PHP-domain-containing-protein MKKLDYHFHSHFSADSEELPRKQVTEAIAHGLEEICFTEHRDFYFPGMDFSLNLLEYFQEINQLQAEFKDKIKIKIGLEMGIDLRFKSEINQFIDSASFDFVIASVHEIGDIEVYDGTEFYLQKTKEEAQREYLLACLDVVQNFETYNSFGHLDYVARYGPYTDKSIKFAENREILFEILRALASKEKALEINTRLFDDPKTEQFYSDLLINFKKFGGKFITLGTDSHIAKRDWLSIHKARTLIKKAGFHELATFSGMKIDKNKKSIKE >NZ_CP015902.1|WP_017864485.1|1279217_1279856_+|bifunctional-phosphoribosyl-AMP-cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP-diphosphatase MRPDFHKQELIPVVVQDYQTNQVLMLAYTNEVAFEKMLETGETWFWSRSRQKLWHKGEESGHFQKIKGMRLDCDQDTLLVFVEQIGNACHTGTYSCFYDEIIPFDDSDIFSELEKQIIDRKLHPVEKSYTNYLLGEGIDKVLKKVGEEASEVIIASKNSDKGELLGEIDDLLYHLFVLMNQQGISLEEVRQKAKERHQLEGNKKEFHTRTAD >NZ_CP015902.1|WP_081213508.1|1278441_1279221_+|imidazole-glycerol-phosphate-synthase-subunit-HisF MLTKRIIPCLDIKNGKVVKGINFVGLREIGDPVELAKIYEEQCADEIVFLDITASFEEREIIGELIGRAARELSIPLTVGGGIRSIDDFRRILARGADKVSVNSAAIENPELIRQAANEFGIQCVVVAIDAKKRADHRGYDVYIKGGREIAGLDLVDWAKKCERLGAGEILLTSMDKDGTKTGYDLEMLNTVCTAVNIPVVASGGCGKISDIVEVFQNTRSDAALVASLFHYGEATVDEVKDELIKNNIPARIIKKETL >NZ_CP015902.1|WP_017864483.1|1277732_1278452_+|1-(5-phosphoribosyl)-5-[(5--phosphoribosylamino)methylideneamino]imidazole-4--carboxamide-isomerase MKIIPAIDLQNGEAVRLYKGDYDKKTVYSKNPLEIAQKFERMGATDLHLVDLDGAKIGQTRNLELVRKIKDETRLKIEIGGGIRDFDTVRMYLEQIGVERVILGTAAVEKPDFLKELLIKYGPSRIVVGVDIREGFVSTSGWLEKTSLPYLSFLKKLERIGVKTTIITDISKDGTLTGPNFKLYDEISKESSLNVIISGGVKDNSDIQRATRSDFYGIIVGKAYYEGKINLEKEFRNAN >NZ_CP015902.1|WP_012897809.1|1277123_1277732_+|imidazole-glycerol-phosphate-synthase-subunit-HisH MKKIVIIDYNIGNLQSVQAAFLRLGQETVISRDLEEIRKADALILPGVGAFPTAMNNLKKFNLIELIQERAAAGIPILGICLGMQVLFEKGYEIEERQGLGLLKGEVIPIKTNEKIPHMGWNQLNLAKTSPTTHYLSGNDEVYFVHSYQATCPDDELIAYTTYGEVKIPAIVGKNNVIGCQFHPEKSGEIGRKILKAFLEEI >NZ_CP015902.1|WP_003131115.1|1276296_1277085_+|aminoglycoside-3'-phosphotransferase MTNLKELRINIEKFPEALHNTLKDAKIYDSSSSPEAQVLFIDKKDGYYLKIASSKTLEREAEMTAYFQKKKLGLGYISYLSDQSQDFLLKKKIQGENYLAKQYLNNPKRLCDNLAENLRFLHEQNFEDCPILDHSERYLKKVEKNASINNSNLDFVNNYNIRTTEEAYDYIENKKLLLRNDTLLHGDYCLPNIILDNWKFKGFIDLDCAGVGDRHIDLFWGAWTLNFNIGTDQYRDRFFDAYGRDRIDVDRLKLVGCCEVFG >NZ_CP015902.1|WP_003131113.1|1275697_1276300_+|imidazoleglycerol-phosphate-dehydratase MTRISHITRNTKETQIELSINLDGTGQADISTGIGFLDHMLTLLTFHSDFDLKIIGHGDHETVGMDPHHLIEDVAIALGKCISEALGNKLGIRRYGSFTIPMDEALVTCDLDISGRPYLVFHADLSGNQKLGGYDTEMTEEFFRALAFNAGITLHLNEHYGQNTHHIIEGMFKSTARALKQAVSIDESKVGEIPSSKGVL >NZ_CP015902.1|WP_039115453.1|1284873_1286256_+|3-isopropylmalate-dehydratase-large-subunit MSGKTIFDKLWDQHVIAGNEGEPQLLYIDLHVIHEVTSPQAFQGLREAGRRVRRKDLTYGTLDHNVPTQDIFNIQDLISKKQIDTFTKNVKEFDVPAETHGGKGQGIVHMVAPESGRTQPGKTIVCGDSHTATNGAFGAIAFGIGTSEVEHVLATQTIWQVKPKRMKIEFQGHPQKGIYSKDFILALIAKYGVDAGVGYAVEYSGDTISDLSMEERMTICNMSIEFGAKIGLMNPDEKTYDYVKGREHEPKNFDEAVSKWEKLVSDSDAQYDKILSLDVSQLKPMVTWGTNPGMGLEFGEKFPEINNDLNYERAYQYMDLKPGQTASDIDLGYIFIGSCTNARLGDLEEAAKIIGDRHIADGLTGIVVPGSRPVKEAAEAQGLDKIFKEAGFEWREPGCSACLGMNPDQIPEYVHCASTSNRNFEGRQGHNARTHLCSPAMAAAAAIAGKFVDVRTLVTD >NZ_CP015902.1|WP_003131129.1|1286275_1286851_+|3-isopropylmalate-dehydratase-small-subunit MEKFTIYKGTSVPVMNDNIDTDQIIPKQFLKAIDKKGFGKNLFYEWRYLKDYDENPDFILNAPKYKKASLLISGDNFGSGSSREHAAWALSDYGFRAIIAGSYSDIFYNNALKNGLLPIKQPREVLNQLTKLSSQEEITIDLPHQLIITSLGDFHFEIDPIWKDKLINGLDDIGITLQYEEAISAYEQKNQ >NZ_CP015902.1|WP_081213512.1|1286864_1287644_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MTIINLKNVNLTRNKKEILKDIIWKVNPGENWVILGLNGSGKSSLLKLILAEEWKTSGEITVLNTQFGNGEIPKLRKRISVVGSFIAERFQPNIKAENLVYTGKFNSSMLYKPYTDQELDEARQLLRQMGAKSLIGRNYASLSQGEKQVLLIARSLILKPELLILDEATNGLDLFAKEKLLKQLQQINQLKTAPTLIYISHHPDEITDIFTHLLLLREGKVVQSGKKENLLNEKILTDFYQEKVEVHRFEQKYFVIPAN >NZ_CP015902.1|WP_058220784.1|1287765_1289478_+|dihydroxy-acid-dehydratase MEFKYNGKVESVELNKYSKTLTQDPTQPATQAMYYGIGFKDEDFKKAQVGIVSMDWDGNPCNMHLGTLGSKIKSSVNQTDGLIGLQFHTIGVSDGIANGKLGMRYSLVSREVIADSIETNAGAEYYDAIVAIPGCDKNMPGSIIGMARLNRPSIMVYGGTIEHGEYKGEKLNIVSAFEALGQKITGNISDEDYHGVICNAIPGQGACGGMYTANTLAAAIETLGMSLPYSSSNSAVSQEKQEECDEIGSAIKNLLEKDIKPSDIMTKEAFENAITIVMVLGGSTNAVLHIIAMANAIGVEITQDDFQRISDITPVLGDFKPSGKYMMEDLHKIGGLPAVLKYLLKEGKLHGDCLTVTGKTLAENVETALDLDFDSQDIMRPLKNPIKATGHLQILYGNLAQGGSVAKISGKEGEFFKGTARVFDGEQHFIDGIESGRLHAGDVAVIRNIGPVGGPGMPEMLKPTSALIGAGLGKSCALITDGRFSGGTHGFVVGHIVPEAVEGGLIGLVEDDDIIEIDAVNNSISLKVSDEEIAKRRANYQKPTPKATRGVLAKFAKLTRPASEGCVTDL >NZ_CP015902.1|WP_058220785.1|1289488_1291216_+|acetolactate-synthase,-large-subunit,-biosynthetic-type MKKIKLEKPTSGSQLVLQTLKELGVEIIFGYPGGAMLPLYDAIHNFEGIQHILARHEQGATHEAEGYAKSSGKVGVVVVTSGPGATNAVTGIADAYLDSVPLLVFTGQVGRQSIGKDAFQEADTVGITAPITKYNYQIRETADIPRIVTEAYYLARTGRPGPVEIDLPKDVSTLDVTEINDPSLNLPHYHESEKATDEQLQELLTELSVSKKPVIIAGGGINYSGSVDIFRAFVEKYQIPVVSTLLGLGTLPISHELQLGMAGMHGSYAANMALVEADYIINLGSRFDDRVVSNPAKFAKNAVVAHIDIDAAELGKIVKTDIPILSDLKVALSRLLQLNNVKTDFNDWIKTVIENKEKAPFTYEPQNHDIRPQETIKLIGEYTQGDAIIVTDVGQHQMWVAQYYPYKNARQLITSAGMGTMGFGIPAAIGAKLAQPNKNVIVFVGDGGFQMTNQELALLNGYGIAIKVVLINNHSLGMVRQWQESFYEERRSQSVFDVEPNFQLLAEAYGIKHVKLDNPKTLADDLKIITEDEPMLIEVLISKSEHVLPMIPAGLHNDEMIGLHFTDENEEVDNA >NZ_CP015902.1|WP_010905839.1|1291208_1291685_+|acetolactate-synthase-small-subunit MRRMIIAKLHNVTGIMNRFTAVLNRRQVNILSITAGVTESQDLTHTTFVIEVDHLDEVEQIIKQLNRLIDVIEVADITDLPHVEREVVLIKVSAPPTIRAEIFTMIEPFRVNVVDVNLENVTIQLTGDSAKIEALIDVVSPYGILNMARTGSAGFERG >NZ_CP015902.1|WP_015426406.1|1291730_1292753_+|ketol-acid-reductoisomerase MAVTMYYEDDVEVSALAGKQIAVIGYGSQGHAHAQNLRDSGHNVIIGVRHGKSFDKAKEDGFETFEVGEAVAKADVIMVLAPDELQQSIYEEDIKPNLKAGSALGFAHGFNIHFGYIKVPEDVDVFMVAPKAPGHLVRRTYTEGFGTPALFVSHQNASGHAREIAMDWAKGIGCARVGIIETTFKEETEEDLFGEQAVLCGGLTALVEAGFETLTEAGYAGELAYFEVLHEMKLIVDLMYEGGFTKMRQSISNTAEFGDYVTGPRIITDEVKKNMKLVLADIQSGKFAQDFVDDFKAGRPKLTAYREAAKNLEIEKIGAELRQAMPFTQSGDDDAFKIYQ >NZ_CP015902.1|WP_017864495.1|1292808_1294059_+|threonine-dehydratase MISAKEVEDAYDLLKAVVTKTPLQLDPYLSNKYQANIYLKEENLQKVRSFKLRGAYYSISKLSDEQRSKGVVCASAGNHAQGVAFAANQLNISATIFMPVTTPNQKISQVKFFGESHVTIRLIGDTFDESARAAKAFSQDNDKPFIDPFDDENVIAGQGTVALEIFAQAKKQAISLDKIFVQIGGGGLIAGITAYSKERYPQTEIIGVEAKGATSMKAAYSAGQPVTLEHIDKFADGIAVATVGQKTYQLINDKVKQLLAVDEGLISQTILELYSKLGIVAEPAGATSVAALELIKDEIKGKNIVCIISGGNNDISRMQEIEERALVYEGLKHYFVINFPQRPGALRTFVSDILGPNDDITRFEYIKRADKGKGPCLVGILLSDASDYDSLIDRIERFDNRYVNLHGNDSLYELLV >NZ_CP015902.1|WP_058220787.1|1294174_1294885_+|alpha-acetolactate-decarboxylase MTEITQLFQYNTLGALMAGLYEGTMTIGELLKHGDLGIGTLDSIDGELIVLDGKAYQAKGDKTIVELTDDIKVPYAAVVPHQAEVVFKQKFTASDKELEDRIESYFDGQNLFRSIKITGEFPKMHVRMIPRAKSGTRFVEVSQNQPEYTEENVKGTIVGIWTPEMFHGVSVAGYHLHFISEDFTFGGHVLDFIIDNGTVEIGAIDQLNQSFPVQDRKFLFADLDIEALKKDIDVAE >NZ_CP015902.1|WP_003131142.1|1294925_1295306_+|RidA-family-protein MKIIATLDAPAAIGPYVQGKIVNGLLYASGQIPLNPLNGEIVGDSIETQTEQVMKNISAILKEAHSDFDLVIKTTCFLKNIEDFSRFNAIYSKFFDKEFPARSAVGVAGLPKNVLIEIEVIAEVKS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP015902_2 | 1753817-1753959 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP015902_2
|
2 spacers
spacers of NZ_CP015902_2
>2.1|1753840|37|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder AACATTTATCTTATTCCCATTTAAGGTTCCAGTTGAT >2.2|1753900|37|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder GATGTTGACATTTGCTGCATTAAGTGTACCTGTCGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015902_2
The CRISPR arrays of NZ_CP015902_2 >merge|NZ_CP015902|2|1753817-1753959|CRISPRCasFinder ATATTTGAAGCATTTAAATTAATAACATTTATCTTATTCCCATTTAAGGTTCCAGTTGATATATTTGAAGCATTTAGATTAATGATGTTGACATTTGCTGCATTAAGTGTACCTGTCGATAGTTTTGAAGCACTTAAATTGCC >NZ_CP015902|2|2|1753817-1753959|CRISPRCasFinder ATATTTGAAGCATTTAAATTAAT AACATTTATCTTATTCCCATTTAAGGTTCCAGTTGAT ATATTTGAAGCATTTAGATTAAT GATGTTGACATTTGCTGCATTAAGTGTACCTGTCGAT AGTTTTGAAGCACTTAAATTGCC
>NZ_CP015902.1|WP_081213599.1|1752068_1752893_-|hypothetical-protein MSYEKQTWNKYDDLKTEEENIENGAVVTDNRMNHIEEGIYSHTIDISNPHKVTAAQVGLDKVDNVKQASKVEFDSHTSDNSNPHKVTAAQIGLDKVDNIQQAAKTDFDSHVNNKANPHSVTASQVGTYTKQEIDTKLSKTVMTDDSGKVTIKDLVVTGTIQQTLSVNQSIAVGWGRTLNFTRIGNVVTVTAEGTFGTTMPQGAWQSAGETLPVGFRPLSRQTTRASAITNVNKFMWTRFNTDGSIQHWQNGSIAVTDTIIMNGTSWVTTDPFPT >NZ_CP015902.1|WP_081213598.1|1751691_1752042_-|hypothetical-protein MELEKIVEQHEDKLKQHDKELARLSDMSVEMQKQMSEGLARVDESNRFLREQNTRQSEQNAQILQAVIKGNESSDERQFQLKLLDKTNFWKLALGIGGSAAAIFAALTEIIKVIFK >NZ_CP015902.1|WP_081213597.1|1751379_1751679_-|phage-holin MKTIDRGTLTRTILLVLALANQLLTASGHSVIPIDDATVTNIISTGFTVATALASWWKNNDFTHAAKKGTELTKSLKNGDSVQVVKASDSDHEFTEGGE >NZ_CP015902.1|WP_081213596.1|1750600_1751380_-|phage-holin MSSIENMIAWMQARKGKVTYSMTSRMGPNSYDCSSSVFFSMIAGGFLSAGSMGNTETLFGMSGTKLKEISRGEVQRGDIFISGTPGGSAGSDGHTGIFLSNGSFIHCSYTHNGIAVDTNDAYMSTRLPHHFYRIVGSGSGNTDNKPQMVILNVDGKFGNATAKRLQEYFDTAGKDGVISHQYKQTFNQNIYAAQFDSSLIGSNVVKALQRFLGVGQDGLFGQGTIKALQKHLGTTQDGTISPVSDSVRELQRRLNANKL >NZ_CP015902.1|WP_081213595.1|1749478_1749691_-|hypothetical-protein MNLKQVLELIADGNIVALKFKDSDEIMVKDYKNSDIFDDFMNCKVIEVNTARVINEFEEEEIEITVELER >NZ_CP015902.1|WP_081213594.1|1748281_1749190_+|hypothetical-protein MKKSIIALSTCTLLTCILFTTLPSPSMADQLDTPSSDISAKAEQEWYGISTIEFFNMGLDSGIVEVTQGDIITGRATFGYYGGDSLTTQDIIVNSNLDYVVISNITIDNNSHTGTFDIMIDTSNISSGSQTFQLNVTDALPENDRHVTPYSITNMIQINEAPRPDPDPNPTPDPEPNPDPEPNPNPEPNPNPEPIPNPEPIPNPEPTPNPEPAPNPEPAPNPEPAPNPEPAPNPEPAPSINKNTLNISKDSIVLDNKITKVSEEGNIKTLPETGVNSKADLSFVLIGIIIISSAVTILYKNR >NZ_CP015902.1|WP_025017008.1|1746758_1747595_-|metallophosphoesterase MKIKKIVFSLIILIICTVIGVFYYAFKVEPYRLVVNEHQVNNTNSKENLKIVQLSDLHIKKDFNADRLDKVIQKTNEQNPDFIIFSGDLYDNYSQYNENEAVISKLKSLKAKYGKIAIWGNRDYGGGSVREYANIMAESDFSLLRNENQVFTLDNGKKILFTGLDEALLGNPQFPSPNQMAETSYDILLTHEPDEVSQYQNKGYELILSGHSHGGQINIPLIPQIQKKATALMSHANNYTGGLYQLGANEKLYVNTGIGTTHLSARFGVAPEIAVLTF >NZ_CP015902.1|WP_023188699.1|1745734_1746646_-|CHAP-domain-containing-protein MQGKKVFLLLGIITAVGAWNIANGTQVKASSKSPVYRLYNPNSGEHFYTTNFYEGNSLKNVGWRDEGIGWQAANSGEPVYRLYNPNVKGGDHYYTLSKYEAQTLVNLGWRWDNNANPVFYSAGTVNLYVSYNPNAQSGAHNYTTNVFEQNSLLSVGWKYGAIAWKTMPSDSLPGTPAGWTIDRPMNIDNYSTQTYAYKQCTWWVYNRAKEFGINYGQYMGNGKDWQNQAGYQVTSTPQLHSAVSFKAGQDGADATYGHVAFVEKIRSDGSILISQSGTGYSTLFSYQVLSKDQASRLRYVIGK >NZ_CP015902.1|WP_023188700.1|1745146_1745509_-|hypothetical-protein MRLWHEALIKKLPRQQLLGQHRECCALRGKGWEKPHSTVNYVFNYSPYKLFQYHLQVMTEMRKRGYHPDEKWLNPLYRGQTSKVYLELEEVIQTFPIYPEHNNDYLEDCKENLREKGIII >NZ_CP015902.1|WP_080668870.1|1744600_1745032_-|hypothetical-protein MSAIGTIAVVIVSLYLARRDYRKKLEVDYWISYKIFSGEKISLWSIDLVNIGSVPVKIYEVGLYQKSWLRKRRKKIIFMMPRDFEYESAKLPILLNPQEDATYFIAKNEWITKIKELGINQRKIGLYARDTTGKYYYRKFLLK >NZ_CP015902.1|WP_081213601.1|1755467_1755833_-|hypothetical-protein MSAELQFNGVTVKTPKEFSVSISTIDADSSGRNANGEMVRDVIAQKTKLDIKWGPLSDSEVSDILQRINQPFFVVIYPDPQIGRQRSKTFYAGDSTMPSYSWNDKFKAMKWENLSVNLIEK >NZ_CP015902.1|WP_081213602.1|1755845_1760627_-|phage-tail-protein MELETLEVLLDVNTARVQASLDKIMPNIESAMSKIQNITGKSMKKTEDNLNIDKGATQFGKQLEKMNQTFEKMMGHLESSSKKSSESIGDNLSTGFKKARPKVSKEIDAMLNEINAKMGQAKAAQEKVAYLKSQRQSSSAKGDGRQTVKYDDQIARAQASMLKYQDQAKSLARSMKTEFDAVPSSLERIAKVMDANEAKYYTMRESVRALQKEYQYQLKPVGSFDKGFKNVDTPDSLKTAQKMQAQSDKMQKLASSNDVLQKEYQRTEERAESLRKAIGRINSVLSQSSMATGTAAAGASMTGSGLKQSERAVSKYGGVFNRMSNSISHGAGGIGNGLKNSFGILDKFGNLFSRNSNKVTQGTRSMSMGNNAFLQSMKYLLPSLIVYQLIGGAISKLAGGMMSALKTNDQFSNSLNQIKVNLMTAFYPIYNAILPAINAMMSAIATLTGQLASFIAGLFGTTYQAAKQGASGLYDNVQAMNDTGSSATKAKDKVDKLQRSLMGFDEINRIGLQDKTDNDTDKGQDTKTPGIDFGAATGNYSTPKWMKDMQALLKDFFKPFQDAWKNQGQKVIDAWKYALGEVIGLAGAIGKSFMEVWTNGTGQKFIENLLILLADVLNIIGDIAKAFKDAWNEDGRGTALIQSLFDGLNRILELLHSIAKSFREAWNDGTGKEIAANLLEIFTNINNTVGNLAEQLKKAWEKGDTGKEIFSIILGIINDLLGHLNNMTKATADWAKTLDFSPLLKGIERLLKNLEPLTDNIGAGLEWLYKNVLLPLAKFTIEDVLPVFLDALAGALKVINGVIEVLKPLFTWFWEKFLQPLGKWVGKNIVDGLQNIADVLNILGDWLAKNKNFLQSAIKMGTDLIDGLLKGIGDSLKNIGAWLQENLVDPIVNGVKSLFGIHSPSTVFAEIGSFLIQGLLNGISSLIGGVSDLIGGIWGDIKKTISDKTQEILDTSKAIWGNISNAIGGAVDGAKKWVSDRWSDISKTTSDTWDNVKKWTSDKWNDAKKSISDTADSIGTKISTKWSEVKKGTSDAWDNVKNWTSSKWNDTKTAVHSAADSIGSKVSSKWNEIKSGTSTAWENVRSSVSNAANNAKDNASNAWSNMKDRMGGYANSIKSTAKSAFDSVASWASDMGKKIGSGLESGVNAVRRGAAAIGNGIAGVIGSAVNGVIDGINWVLGKVGSGNRLGHWSVPRYANGTEGHPGGPALVNDGSGSQWQEMYLTPDGKTGLFPKVRNLMVDLPKGTQVLSGTKTAKAMSGMPAYANGIGDWMGEKWNQAKEMVGDIWDYATHPEKILNIAISKFTNLSQAVEPALSIATGGISTIANGAMGMIEKAFSEGSESPSGTGVERWRPVIKKALSMNGVSTSENYVNAWLRQVQSESGGNEKAVQGGYTDVNTLSGDLAKGLLQTISATFNANKFPGHGNIFNGYDNALAAIHYAMGRYGDPGMLQVIGHGHGYAKGTPYVPEDQLAMIHEGEMVVPAKYNPYNSISDFKSFETLQLPEMFTDKPTDYSNSGSFGGGQDVSNYGLANMNGSLTSAIMLLVQSLGAQTSQTSNGDIVINIGGREFGRIAVSEINKYHQQLGYTELNI >NZ_CP015902.1|WP_014734984.1|1760657_1761029_-|hypothetical-protein MLEDLYPQAVEAGISSTDFWAMTFDEIMVQVEANKKRHENELKEKAMFDYSQQRLAIYAFNDPKNFPKYEDAYPFLNQLKEEVVQAVSEEEEKKQAMLTDQEIMRQNAMLIQETRKRKSQKTN >NZ_CP015902.1|WP_011676909.1|1761052_1761463_-|hypothetical-protein MTKATIVKMPNTKQFEFGGLNLQLRLDGNSILSIEKRLDESIVGLFLKGQGEAKIPATNKLLIVLQGANQTSNVSESDIVAAFGRYVDEGHSTLDLFAAINELLEESGFFGNKKTEKEATNGVSLDSEPVEEDSIL >NZ_CP015902.1|WP_021722205.1|1761536_1761962_-|major-tail-protein MTTVAGLLSKDTVLSYKDGATSKPVAAVKSIPAMGSDPEKVDVTHLGSAKKAYIAGIQDSDNLEFAIIYQGDNFKDVDTLVKAGKSVDWTVTYPDGMKVDFTGQPSYKFDGVEVNQALGFNLVVVVSAGPNFTPAPAGSGQ >NZ_CP015902.1|WP_021722206.1|1761974_1762337_-|hypothetical-protein MEKVNIKVATVSVLSGISEIKKVATDYPSTWNDFPTAIYRTVNTPHFVDGSGEELQTKWSITIELYSKSSLTTIVNNIIEQFGDIGFTGTQRDANTADLKRVIIELSAIVDNKTKYVYSK >NZ_CP015902.1|WP_032946647.1|1762336_1762885_-|hypothetical-protein MTLGVEIKGLDRLKRKINAMPKILNDAVNDATYEITELVRSAAELRLASSMKFSSGELLGSLKTEVVENAEGKIVGRVWSDKAQAIYREFGTGPNGQASSKDLPEGVNPVYTQTRWFIPAEEVGIDLNEIYGMPKITIQGKEFYITSGQPARPFLYPSLKEILPQMPEIYKEHVQKKLRELK >NZ_CP015902.1|WP_081213603.1|1762868_1763222_-|hypothetical-protein MRLMKRDLTTVYLKRIDPNNTQDEEGNDQVNYLAPIALEMNVQSASGAVNATIYGSKLSSMKSCKYQGDELKEGRDENSGICLYVDKDSEPDYKIKSIQHYSTHINVMLERNDDIGS >NZ_CP015902.1|WP_081213604.1|1763202_1763535_-|hypothetical-protein MEESEPKTKAIERLKTDLGIDDNKATGLIEDAVILVLDYTNQEKMLDSMWLYARQLATITFNRESTEGESSRSEGGISQSFVEDIPLNIQRGLNRYRLGKVVSFYAPDET >NZ_CP015902.1|WP_081213605.1|1763554_1764673_-|N4-gp56-family-major-capsid-protein MKNKQLKMNLQRFADGVTFLKTQVDPEVMGQMVAAQLPKAIKFAGIAPIDTTLAGQPGSTITLPKFKYSGDAKVVAEGESIEMDELTTTTQTATIKKVGKGVSITDEAALSGYGDPVGEAQRQIRMAIASAVDNEIVAVAGTAALTVISNVSLDLIDQLEDTFVEAPDALEEQGFTQGVLFVSYKDAATLRKAAGVNWTRASDLGDNILVSGAFGEVLGWTVVRSKKIKTGSPIAVKPGAMKTYLKRDVSVEADRDIKKKITEFTGDEHYVVAIVDDTKIVRVEAADIPVTGVTISQKTASMKVGTTRELKATVDPENATNKSVTYSSDAEAVATVNSDGKVTALTAGTANITVTTTDGSKTDKCVVTVTEA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP015902_3 | 1879522-1879616 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP015902_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP015902_3
>3.1|1879545|49|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder TCAACGCGACCAACGGAAGATGTTGAATCGGCAGATTGAGGAACTGACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP015902_3
The CRISPR arrays of NZ_CP015902_3 >merge|NZ_CP015902|3|1879522-1879616|CRISPRCasFinder GATTTGCTGACAGTTCTGTCAGTTCAACGCGACCAACGGAAGATGTTGAATCGGCAGATTGAGGAACTGACAGCTTTGCTGACAGTTCTGTCAGT >NZ_CP015902|3|3|1879522-1879616|CRISPRCasFinder GATTTGCTGACAGTTCTGTCAGT TCAACGCGACCAACGGAAGATGTTGAATCGGCAGATTGAGGAACTGACA GCTTTGCTGACAGTTCTGTCAGT
>NZ_CP015902.1|WP_081213645.1|1876785_1879041_-|family-65-glycosyl-hydrolase MKQIKRIMGIDPWKITSNQIEKEDRRLQESLTSIGNGYMGMRGNFSETYSGDSHQGTYIAGVWFPDKTRVGWWKNGYPEYFGKAINALNFASVRVFIDDKEVDLAASHVTDFNLSLDMEKGVLTYTYVAYGVRVTAERFFSIAQQELAVFAFMFESLDGEIHQIRTASIIDANVRNEDSNYDEKFWTVKNLDNTATGSFIVTETIPNPFGVEQFTVAAKQSFAGDFTRVKQETRESSVLDVYEAKLIENAPLTFIKNVLVVTSRDIEPSNLTKVLSNLTLEISKKTYHEFYKEQEIAWKKRWEIADVQIDGSAEAQQGIRFNLFQLFSTYYGEDERLNIGPKGFTGEKYGGATYWDTEAYAVPLYLALSDEKVAKNLLKYRHNQLPQAQHNARQQGLKGALYPMVTFTGVECHNEWEITFEEIHRNGAMAYAIYNYSNYTGDETYLAHEGLEVLIEIARFWADRVHYSKRNDKYMIHGVTGPNEYENNINNNWYTNKLAAWVLTYTAESLAKYPRPDLIEGAEIAHWAEIVDKMYYPEDEELGIFVQHDGYLDKDLTPVAQLDPKNLPLNQNWSWDRVLRSPYIKQADVLQGIYFFGNQFSLAEKQRNFDFYEPLTVHESSLSPSIHAILAAELGMEDKAVEMYERTARLDLDNYNNDTEDGLHITSMTGSWLAIVHGFAEMKTWDGQLSFAPFLPQAWTGYAFHINYRGSLLKISVGQEVKLELLRGQSLNLEIYGEKIELKDFYVTKTK >NZ_CP015902.1|WP_058221012.1|1875658_1876633_-|LacI-family-transcriptional-regulator MAVTIKDVAKKAGVNASTVSRVIKDSSEISDKTKVKVRKAMHELGYRRNAAAQILASGKTNTIGVVFPPVADKASQPFFMKILTSINETARDYDVSIAIATGHSAKELKKQIELQYSEKRVDGFIVLYAGKNDEVRDYLLENKVPFVLVGTPAEGKNEITHVDNDNMLLGREAVRHLAQLNHQNISFVTDTKETEVFEERYQGFKDEAEKLGLNHDLLFMDANFSLRNETALVVMDDVLSLKVVERLRSQGLNVPEDVSLITYNNSIFGAMIHPYLTTFDIHIEQLGASAIKKILDLRDKKENLPEKSIIPFELIIRESTKARI >NZ_CP015902.1|WP_003130364.1|1874812_1875490_-|DNA-binding-response-regulator MDSMIKILLVEDDLSLSKSVYDFLKSFAQVKQVYDGVEGLYEAELGIYDLILLDLMLPEKNGFEVLKELREQNVDTPVLIMTAKESLDDKMHGFDIGADDYLTKPFYLDELKARIQALLKRTGKLEDSNGLTYGNIRLNLSNKSTLVDDQPVDLIGKEFDLVVYLMQNQNVILPKEQIFDRIWGYDSDTTVTVVEVYMSKIRKKLKDTEFVNNLSTLRNVGYILR >NZ_CP015902.1|WP_058221011.1|1873352_1874720_-|sensor-histidine-kinase MKKIIKKVKSSAIVKNDGKNFLHFFLAFTVIFVALAVIIIQVMQLGMYRATDQNLHNLAQNRVFLEEAANNQLGTSSSQDSGFGPNNSVIFYDSEGKNFMPSTGSNANISTNFGMSLLQKAMKFNEKHINTIQTVSVKNPYGDNLHYRYYTTSQFIITNSDGTVTPVYMQIFSNVDQIQDAMSRAMWVIVTTMITFWLLSIIISLYLANWTLRPILAAYEKQKEFVENASHELRTPLAILQNRLELLFQKPTATIIDESENISESLSEVRNMRLLTSNLLNLARRDSGIRIEPEATTATYFENIFNSYEMLAENAGKKFSGHLKLDGTINLDQALIKQLLTILFDNALKYTGDEGEISVDVQKNGGFLVFAVADNGEGISDEDKKKIFDRFFRVDKARTRQKGGLGLGLSLAKQIVEAYNGKITVEDNKPKGTKFIVRIRVDSTISNPAKIFQKL >NZ_CP015902.1|WP_058221010.1|1871462_1873205_-|1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate-synthase MSVLEKIDSPADLKKVSNQELEELASEIRTAVLHKVSNIGGHVGPNLGVTELTIALHKVFNSPIDKFIWDVSHQTYPHKILTGRKNGFTDGHFHDITPYTSQRESEHDFFTVGHTSTSIANALGYAKARDLTNDKGNIVAVIGDGSLSGGLAMEALNNAGDFKGNLIILVNDNQMSIAENHGGFYRNLAELRATNGQAENNFFKTFGLDYKYLENGNDIESLIHLFEEVKGIDHPIVLHIHTEKGRGYQPALENKEAFHWHMPFDLETGQSKVIDSGKSYSSVMLDYMDKKVSEGLPLVAINAAIPGIFGLKQFAAKYPDRYIDAGIAEQFTITFGGAMAAAGARPIIFHNSTFVQRAYDQFWHDLAINEEPAIVIVKGGVISGSDETHQGSSAMTWISNIPNIKYLAPTSEEEFISILDWALEQHEEPVVIQMPEHGLESRPTVLTDYSTPSYQMTKSGEKVALLALGGLYSHGEKVAKVLAENGINATLINPLFINDLDQAFLENLVENHQVIATIEDGILDGGFGQKVASFLGKYDVKVLNFGAKREFNDSVPVTELYNRYHLTPELMVADILSLLK >NZ_CP015902.1|WP_012898265.1|1871079_1871346_-|membrane-protein-insertion-efficiency-factor-YidD MKKVLVKAVHGYQRWISPALPPACRYYPTCSNYMIQAIEKHGPAKGLAMGTARILRCHPFCQPGYDLVPDHFSLRRNWAEPEKEEDSN >NZ_CP015902.1|WP_017864852.1|1869523_1870957_-|6-phospho-beta-glucosidase MPFSKDFLWGGATAANQCEGGYNQGGRGLANVDLVPHGKDRFPIITGEMKHLEFDEDHFYPAKEAIDMYHHWKEDLALFAEMGFKTYRMSIAWTRIFPKGDEQEPNEEGLQFYEDIFKECQRLGIEPLVTITHFDCPVHLIKEYGGWRNRKMVGFYENLARAIFTRYKGLVRYWLTFNEINMLLHAPFMGAGLVFEEGENKEQAKYLAAHHELLASALATKIGHEVDPENKIGCMLAAGDYYPFDCNPENVFEAQKQNHDNLFFIDVQSRGKYPNYLLKRLEREEITLPIEKGDLEILAENTVDFISFSYYASRVAKVKDEDADKSAGNIFESVKNPYLEASEWGWQIDPLGLRITMNSIYDRYQKPLFIVENGLGAVDKPDENGFVADDYRIDYMAAHIKEMKKAVELDGVELLGYTSWGCIDLVSAGTGEMSKRYGFIYVDRDDYGKGSLKRTPKKSFNWYKKVIASNGEDLTNE >NZ_CP015902.1|WP_081213644.1|1866559_1869265_-|YhgE/Pip-domain-containing-protein MKSIKNTWKLFALDWKRIFKNPVATFLIVALMIIPSLYAWFNIKALWDPYANTSQLPIAVYSADKSASFQDKTINIGDEVLKNLKKNHQLGWKFVDSKADLDKGVKSGKYYAGIYLPKDFSKDLLSFTTGDIKKPQIVYSINEKINAIAPKITSKGASSLQSQISEEFIKTASSTLLKTFNTIGYDIDKNMVSIQKVKSAILSTNDNLGTIDKYTQQVVDLHGKMPEIKEKLAKANEFITYLPEVDALGQKVIKLNDKMPEIDKSFSLVLTLQEKIPEIQNAGKQISMIDDDFASVESTMTQGIQEAKQGLQIINQVQKSMPDIKKLGQDADSLGTITLDAAKKMQSALPSITNSVQITLQSIQEFSKNTSSVISIIDQAIADNQLTDDEKEQINSLITNFTNNIAKQRETIQNIVEYMKQVQESNGNHDLDSTIEQLTNLDSLLSELSTRMSHLNDLVQEGDVSKIRAYLSQINDVVNNISDLINKIDVSEISSTINKALTTLINTITDAKGLLNQAQQIDFDALLNSTSQTVSNAITILEKYQGEMPAIKQEIHDANVMLNGNMTTIVNAINEGANLYKNEFPTLKTKLGTASDFFKNDYAGVRKDLTDTLTMANEKMPDVESALNQANDLIQNDWPEIKSGIQKAAAAIQKSEKEVDLGEIVKLLKLDATKESDFLTQPVEVQENQIYPIANNGSASTPFYTALCLWVGAVLLSSLATTEVHLSDKDKKRYSKREQFFARMGSFVAIGLAQALIVTLGNYFGLGVDVRDPFYSVLFALLISIAFMIMVYVLVALFGNVGKGIAIIILVLSISGGGGNYPIQVSGKFFQAINPYLPFTHAVNLLRESAGGIYWPNAWFAIIILVAVSIVFVAIGAFLFPHFEDKTKKISEIGSKSHFFH >NZ_CP015902.1|WP_081213806.1|1865721_1866462_-|demethylmenaquinone-methyltransferase MTKVNEERVQEIFNSISSDYDKMNAIISFKQHDLWRVKTMKRMGDLTGLSILDLCCGTGDWTFDLSESVGPSGKVIGLDFSENMLEIAKAKLKEEAKKNIEFLQGNAMALPFENESFDVVTIGYGLRNTPDYLTVLKEIFRVLKPGGRVVCIETSHPTLPIYKQAFELYFKNVMPFFGKVFAKSLKEYQWLQKSAEDFPDAKTLEELFRKAGFVAVEYQKHGGGAIASHFATKSKKPKSNIRIGKK >NZ_CP015902.1|WP_081213643.1|1864852_1865686_-|helix-turn-helix-domain-containing-protein MPYKRYGEIFKKLREQKNFSLSHFSEIGISKASLSRFELGQTMISFERLDSALQEMNVTLAEYEHFINNFSMDYKEEFIEDIIIAHIADDVNKLHSLYLEAMEYDSKMLAYCAKSRYETLTQMEADDVVEYLYDVGEWGYFELSIFYLTLDSFSEREIMYLMKELWGKSKHLYGVFKYRRRVLQSSYRAVVLLSSKGARDSARSILQKSYPKDYFYDLYVENLRNLAHGFYSYCFKDKISGEKQIKNAIEIFGQVGYEDLADYYQKRYQKLLGKLLT >NZ_CP015902.1|WP_058221015.1|1880811_1882389_-|alpha-amylase MKNKLLLLSVTLLATCALSACQKANSKDSSVKKAAVSQKVDRSLYRNFYEIFTSSFADSNHDGEGDLNGVTQHLDYLNTGKSNSTTDLKVQGLWMTPIFASPSYHGYDVTNYEKINPKFGTMADFENLIAQAKKRGIAVILDMPFNHTATDNVWFQKALAGDKKYVAYYNWSDTAKEGYSLASNGKYYESEFDKSMPDLNLANPEVKKEIAKITKFWLDKGVSGFRLDAVGFYFSNDDKKTTAFTKWLTDTVKKQNPKAYLVGEVFSTASAIDDIYPSGIDSLFDFPNALQSSSSPINSALVLGEGSLFGQQIEAWDQEIHADNPKAIDAPFLSNHDTDRSATLLSSLSMQKMAAQTYLLMPGNPFIYYGEELGLTGSGIDQNKRLPMPWNAAGTDSPKADISVPGATEIATTDGGSVAQQEANPNSLLNWYKKILRVKAKYPEIATDRLKNISVSEESLSVINYGKDLTIINNFSDTENVTMKLPKSVVGTKITDQLSVSSSQAKLTDGKLTIPAYSTVILKKK >NZ_CP015902.1|WP_081040701.1|1882378_1882990_-|sugar-O-acetyltransferase MKMSEFKRMVAGELYKASKVEPEYKPDNNRALNQEINQLNLLDTEKIVALEKELFGQTGDELFVNPPLYIDYGKNTRIGQRFYANMDCIFLDVAPITIGDDVMFGPRVSLITASHPIDAGVRQRGLEYGKAITIGNRVWLGAGVIVNPGVTIGKNTIVGSGTVVTKNLPANVIAVGNPARILREITDSDRLYWEEKENEYYEK >NZ_CP015902.1|WP_081040699.1|1883010_1884636_-|alpha-glucosidase MNSHLNGVVNMKENWWQKTVVYQIYPRSFMDANGDGVGDLQGIISKLDYLEKLGIGAIWLSPVYQSPMDDNGYDISDYQAIADVFGTMADMDELLKEAKKRNIQIVMDLVVNHTSDEHKWFVEARKSKDNAYRDYYIWADEPNGLQSTFSGSAWEFDEESGQYFLHLFSKRQPDLNWGNPQVHQEVYDMMNFWIDKGIGGFRMDVIDLIGKEIDQEITGNGPKLHEYLHEMNQATFGQKNLLTVGETWGATPEIAELYSDPKRQELSMVFQFEHITNAYLDEGEKWDKKEFSVSKLKEILAKWQALEKGWNSLFWNNHDLPRIVSNWGNDGKYRLKSAKAFAILLHLMKGTPYIYQGEELGMTNYPFESIEEVNDIESRNMFAERLAAGHSENEIMDSIRRVGRDNARTPMQWTAGENAGFTDGKPWLAVNPNHEEINADQAMSDPDSVFYTYQKLIELRKQHDWVIYGDFKLIDSEADVFAYLRTYKGKKYLVVANLSDEENQFKTGFVCRDLLIHNENFLPELSQIKLKAWEAFACEVE >NZ_CP015902.1|WP_023189702.1|1884842_1886597_-|alpha-glycosidase MNKAAIYHRPESEFAYLYAKNLMHVRLQTQKCDVEKVELFYGDPYSWEGLDNPETQYWASQKVEMKKYLSTNISDYFEAEITVATKRVDYLFVITGLDGEKVVYTDQGMFDYDESLVTKKYGAFRLPYFHESDRFKAPEWVKETVWYQIFPERFANGDTSNDPEGTKAWNPQDVPDRQDFYGGDLQGVIDHLEHLTELGVNGIYFTPIFQAFSNHKYDTEDYMEIDKQFGDKELFKTLVKEAHARGIKVMLDAVFNHIGDTSAQWQDVLKNQEKSKFADWFHVNSWPATYTPTDDFENAENATYDTFAFTPHMPKLNTANPEVEAYLLKVADYWISEFDIDAWRLDVADEVDHTFWKKFRTTCDAAKDDFYILGEVWHSAQPWLVGDEFSAVMNYAYTDAIKDGLITKKISLEQMVSNINTQLTLYRKQVNQMMFNVLDSHDTPRILTVAKNNKNLMKLVETFTFMQPGVPCIYYGDEYAVTGGMDPECRKVMPWEEKDQDLEMFDFFKNLIALRKQYQGILSDSEVEWKIVDSENGIVKFERGSLKAIFNIGEKPAYFSADEVVFSNLVDQNNILQYGFVIYK >NZ_CP015902.1|WP_023189703.1|1888267_1889650_+|sugar-ABC-transporter-permease MTKKKKRKLTESTISPEEKSIKLGEVFSKGDTVTKLTFFVMGLNQIKNKQWVKGFTLLILEIAFIGWLLFSGISAFSLLSSLGPNKIKRTITDASGFPQTLQPDNSVLILLWGLIACLVVILFILLYWFNYRSNKHLYYLKREGKHIPTNKEELASLLDEKLYATLMAVPLIGVLAFTVLPTVYMISMAFTNYDRLHATAFSWTGFQAFANVLTGDLAGTFFPVLGWTLVWAIVATATTFLGGVLLALLIESTGIKFKGFWRTVFVIVFAVPQFVTLLMMAQFLDQQGALNGILMNLHLISNPINFIGAASDPMVARITVIFVNMWIGIPVSMLVSTAIIQNLPQDQIEAARIDGANSLNIFRSITFPQILFVMTPALIQQFIGNINNFNVIYLLTSGWPMNPNYQGAGSTDLLVTWLYNLVFGQTQRYNAAAVLGILIFIVNASISLVAYRRTNAFKEG >NZ_CP015902.1|WP_015426871.1|1889655_1890522_+|maltose-ABC-transporter-permease MKSYKTQRRISLSLRYILLALLAIVWIFPIIWIVLASLTQNNTGFVSTIIPKTFTFENYIQLFQNKSGSFPFVSWIINTFIVAVISATLSTFITIIMSYTLSRLRFAFRKPFLQIALVLGMFPGFMSMIALYYILKAMNMLNLGGLILVYVGGAGLGFYIAKGFFDTIPRSIDEAATIDGANKWQVFTHITLPLSRPIIVYTALMAFIAPWTDFIFSGIILGNNQAHPETFTIAYGLYSMVHSQKGAATAFFTQFIAGCVIIAIPITILFVIMQKFYVNGITAGADKG >NZ_CP015902.1|WP_058221029.1|1890652_1891228_-|CPBP-family-intramembrane-metalloprotease MSSIDLHIGYVQEFTLLIFSIVGVTVIFGNQALIWFSKPQGRYTKIAIACLIINTIWSMLGGTIVALIFGNSGNHANAVFGDYIMIFFVPFMIMGEELFSIGILETLRTKWGLPTMISTLVTSVIFGLIHFNTYNGGNVLRTIIQILLVQGVARLIFNYAYLKTSRIWTSYAVHLVFDLVFLFVLPFVIPK >NZ_CP015902.1|WP_058208139.1|1891453_1892485_-|hypothetical-protein MKNSKILLTTVTLLTLTAIGMQTVDAATVSGAENSTEKSLNNSQNSSTDSTPTQDELRARFNELKAQKEANQEAATYNKNASDEKNAELTSQHKVMDIATNQEAATNNLLATPYKYAEIEAQESAAGNPNSISGTDYKNSELQAQHEEQQTELRAEFNNLKAAKYNQSPSAYKDGEISAQEASIGNPDNIKGSDYKTAVLKRQASEKEAQEHDVSGTDYRKSVTKLEKLNKKDSAKTTETTNKVAGKEAVKVNPIVSSGTVSIHSAQPESAKAVKATATGTKATTTSVTKSANQNEVKTLAASLPTTGDDAGLSLFLTFIGMILFGSVGVILALFQKHGRHSK >NZ_CP015902.1|WP_058208140.1|1892634_1892826_-|hypothetical-protein MRKVGIICLIFLTLIVSLIAFKVYINYELDRRITLEFKKEQQSIERSARNKVGSTFTEQTGCS >NZ_CP015902.1|WP_025016952.1|1892822_1893134_-|hypothetical-protein MKKRKRIKISPIQGAVIVLMCFMVISIVFNIHESQRCEVLIQKYKVEHIARARQYNMIMLLYKSVPIEWENAQNENSKLSDTKLVKTLDDAKEFNEKESKIGQ |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP015902_1 | 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder | 1284699-1284729 | 31 | NZ_CP017782 | Rhodobacter sp. LPB0142 plasmid pEJ01, complete sequence | 19089-19119 | 8 | 0.742 |
NZ_CP015902_1 | 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder | 1284699-1284729 | 31 | NZ_CP017782 | Rhodobacter sp. LPB0142 plasmid pEJ01, complete sequence | 128363-128393 | 8 | 0.742 |
NZ_CP015902_1 | 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder | 1284699-1284729 | 31 | NZ_CP017783 | Rhodobacter sp. LPB0142 plasmid pEJ02, complete sequence | 14971-15001 | 8 | 0.742 |
NZ_CP015902_1 | 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder | 1284699-1284729 | 31 | NZ_CP017783 | Rhodobacter sp. LPB0142 plasmid pEJ02, complete sequence | 24614-24644 | 8 | 0.742 |
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1. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017782 (Rhodobacter sp. LPB0142 plasmid pEJ01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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2. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017782 (Rhodobacter sp. LPB0142 plasmid pEJ01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
cgtcagcgcagctgacagttctgt-cagtaat CRISPR spacer tttcagcgcagcggacagatctgtccagccg- Protospacer . ********** ***** ***** ***. .
3. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017783 (Rhodobacter sp. LPB0142 plasmid pEJ02, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
cgtcagcgcagctgacagttctgt-cagtaat CRISPR spacer tttcagcgcagcggacagatctgtccagccg- Protospacer . ********** ***** ***** ***. .
4. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017783 (Rhodobacter sp. LPB0142 plasmid pEJ02, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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5. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017784 (Rhodobacter sp. LPB0142 plasmid pEJ03, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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6. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP017784 (Rhodobacter sp. LPB0142 plasmid pEJ03, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
cgtcagcgcagctgacagttctgt-cagtaat CRISPR spacer tttcagcgcagcggacagatctgtccagccg- Protospacer . ********** ***** ***** ***. .
7. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP010616 (Phaeobacter inhibens strain P92 plasmid pP92_f, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
cgtcagcgcagctgacagttctgt-cagtaat CRISPR spacer tttcagcgcagcggacagatctgtccagccg- Protospacer . ********** ***** ***** ***. .
8. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP049030 (Fluviibacterium aquatile strain SC52 plasmid pSC52_2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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9. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP049031 (Fluviibacterium aquatile strain SC52 plasmid pSC52_3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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10. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP049031 (Fluviibacterium aquatile strain SC52 plasmid pSC52_3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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11. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028537 (Enterobacter hormaechei strain SCEH020042 plasmid pQnrB4_020042, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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12. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028197 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Concord strain CFSAN018747 plasmid pGMI14-002_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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13. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028197 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Concord strain CFSAN018747 plasmid pGMI14-002_1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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14. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP011601 (Phytobacter ursingii strain CAV1151 plasmid pCAV1151-296, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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15. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019439 (Thioclava nitratireducens strain 25B10_4 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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16. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028975 (Cronobacter sakazakii strain GZcsf-1 plasmid pGW1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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17. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to MT077884 (Escherichia coli plasmid p33, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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18. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to MT077886 (Escherichia coli plasmid p39, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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19. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP048293 (Escherichia coli strain CVM N18EC0432 plasmid pN18EC0432-1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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20. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to MN423361 (Leclercia sp. strain 1106151 plasmid p1106151-mcr, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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21. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP031568 (Enterobacter hormaechei strain 2013_1a plasmid pSHV12-1301491, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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22. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NC_009717 (Xanthobacter autotrophicus Py2 plasmid pXAUT01, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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23. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044215 (Klebsiella aerogenes strain KA_P10_L5_03.19 plasmid pIMPIncH12_334kb, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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24. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020542 (Sphingobium herbicidovorans strain MH plasmid pSHV3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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25. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP030186 (Salmonella enterica strain SA20094620 plasmid pSA20094620.1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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26. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP010635 (Phaeobacter inhibens strain P78 plasmid pP78_f, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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27. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009431 (Sphingopyxis macrogoltabida strain 203 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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28. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009431 (Sphingopyxis macrogoltabida strain 203 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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29. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040696 (Citrobacter freundii strain R47 plasmid pR47-309, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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30. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP042552 (Enterobacter hormaechei strain C45 plasmid pC45_001, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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31. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016526 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg strain 09-036813-1A plasmid p09-036813-1A_261, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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32. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP010718 (Phaeobacter piscinae strain P18 plasmid pP18_c, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
cgtcagcgcagctgacagttctgt-cagtaat CRISPR spacer tttcagcgcagcggacagatctgtccagccg- Protospacer . ********** ***** ***** ***. .
33. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP010722 (Phaeobacter piscinae strain P18 plasmid pP18_g, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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34. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP010723 (Phaeobacter piscinae strain P18 plasmid pP18_h, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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35. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043927 (Klebsiella quasipneumoniae subsp. quasipneumoniae strain M17277 plasmid p17277A_477, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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36. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044075 (Providencia stuartii strain FDAARGOS_645 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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37. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028920 (Gemmobacter sp. HYN0069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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38. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028920 (Gemmobacter sp. HYN0069 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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39. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028921 (Gemmobacter sp. HYN0069 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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40. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012170 (Enterobacter hormaechei subsp. steigerwaltii strain 34977 plasmid p34977-263.138kb, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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41. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP005089 (Sphingobium sp. TKS plasmid pTK5, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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42. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013215 (Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae strain H11 plasmid pH11, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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43. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027144 (Enterobacter hormaechei subsp. hoffmannii strain AR_0365 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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44. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NC_012556 (Enterobacter cloacae plasmid pEC-IMPQ, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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45. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NC_012555 (Enterobacter cloacae plasmid pEC-IMP, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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46. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP010755 (Phaeobacter inhibens strain P70 plasmid pP70_f, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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47. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP049193 (Enterobacter hormaechei strain Y2152 plasmid pIHI2-2152, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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48. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032842 (Enterobacter hormaechei strain C15117 plasmid pSPRC-Echo1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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49. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP010769 (Phaeobacter piscinae strain P13 plasmid pP13_b, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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50. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP010775 (Phaeobacter piscinae strain P13 plasmid pP13_h, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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51. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014775 (Aeromonas veronii strain AVNIH1 plasmid pASP-a58, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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52. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP049189 (Enterobacter hormaechei strain Y323 plasmid pIHI2-323, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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53. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP010713 (Phaeobacter inhibens strain P66 plasmid pP66_h, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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54. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029717 (UNVERIFIED_ORG: Enterobacter cloacae strain AR_0154 plasmid unnamed4, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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55. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to MN937241 (Enterobacter cloacae strain BSI034 plasmid pBSI034-MCR9, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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56. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP033103 (Enterobacter hormaechei strain L51 plasmid pEHZJ1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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57. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_MF344580 (Enterobacter cloacae strain 30860 plasmid p30860-HI2, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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58. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_MH399264 (Enterobacter cloacae strain RJ702 plasmid pIMP26, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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59. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP010740 (Phaeobacter inhibens strain P72 plasmid pP72_e, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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60. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP010740 (Phaeobacter inhibens strain P72 plasmid pP72_e, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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61. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP049047 (Enterobacter hormaechei strain Y233 plasmid pIHI2-233, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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62. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_KY863418 (Enterobacter asburiae strain AMA 497 plasmid pOXA436, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
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63. spacer 1.1|1284699|31|NZ_CP015902|CRISPRCasFinder matches to NZ_KY978628 (Cronobacter sakazakii strain 505108 plasmid p505108-MDR, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
cgtcagcgcagctgacagttctgt-cagtaat CRISPR spacer tttcagcgcagcggacagatctgtccagccg- Protospacer . ********** ***** ***** ***. .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
136636 : 163981
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP015902|136636:163981|DBSCAN-SWA 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31 | Clostridium_phage(25.0%) | transposase,integrase | attL 145042:145101|attR 162889:163022 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
498308 : 510436
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP015902|498308:510436|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP015902|498308:510436|501811_503440_+|WP_003131585.1|DBSCAN-SWA MSKDIKFSSDARTAMMRGIDILADTVKTTLGPKGRNVVLEKSYGSPLITNDGVTIAKEIELEDHFENMGAKLVSEVASKTNDIAGDGTTTATVLTQAIVREGLKNVTAGANPVGIRRGIELAAETAVASIKEMAIPVHDKSAIAQVATVSSRSEKVGEYISDAMERVGSDGVITIEESKGMQTELDVVEGMQFDRGYLSQYMVSNTEKMVAELDNPYILITDKKISNIQEILPLLEQILKTNRPLLIVADDVDGEALPTLVLNKIKGVFNVVAVKAPGFGDRRKAQLEDLAILTGGTVITEELGLDLKDATLEALGQAAKATVDKDHTTIVEGAGSADAISDRVAIIKAQIEKTTSDFDREKLQERLAKLAGGVAVVKVGAATETELKAMKLLIEDALNATRAAVEEGIVSGGGTALVNAIAALDKLSEEGDIQTGINIVRRALEEPVRQIAANAGYEGSVIIDKLRSEEVGTGFNAATGQWVNMIEEGIVDPAKVTRSALQNAASVAGLILTTEAVVANKPEPAAPAMPPMDPSMGMGGMM >NZ_CP015902|498308:510436|507547_508408_+|WP_003131573.1|DBSCAN-SWA MEIKDIQPQLYKQFSTILQHGKLSHAYLFSGGFGSFELAIWLSQALFCENPENALPCGHCRSCRLVAQQEFTDLHIVEPDGQTIKTAQIRELTQVFNESGYEGNQQVLLIKEAEKMHPNAANALLKSIEEPETEIVVFLLTDNENMILQTIKSRTQIINFPKNVQYLQDFLEKNGILKTQAELLAEICNSTDKALELAQQSWFNEGLQRLQQFVKLLKTSADEAFLYLKELVEIFDDKEKQNQAFELLLQLFNQERMSQELLKTFQAIKMWKSNVRFESSLTFLVL >NZ_CP015902|498308:510436|509234_509561_+|WP_011675472.1|DBSCAN-SWA MADKYDVFDQLGELENTLNTTLTQISGIRQVLEASMTENATLRMELEKLRDRLAEFEKKEVKKETPKDQPNPNLIQIFNEGFHVCHLHYAERLAEGESCLDCLELLYR >NZ_CP015902|498308:510436|508459_509242_+|WP_023188991.1|DBSCAN-SWA MIYEIKFAHGESNVFAISDIELAPQTEVILRSDKGNFYGKIVREISEEANLEIHHTIVREVNEDDLQVIAKLEERSKQAKDKVRQLIIEQGLEMKIIDVAYNFDQMQLFISFTAENRVDFRLLLRELATTFRIRIELRQIGPRDAAKIHGGLGPCGRPLCCSEFVYEFPNVSIKMAKNQNLSLKQNKLNGLCGRLMCCLTYEDSFYKEAQQLFPDFGEFVTTSEGKGKVVGLNVLKNRVKIRFGEYSKDFELAEIEVNHG >NZ_CP015902|498308:510436|500929_501319_+|WP_058221224.1|DBSCAN-SWA MNKTMLIGRLTSAPEISKTTNDKSYVRVTLAVNRRFKNEKGEREADFISIIIWGKSAETLVSYAKKGSLISIEGEIRTRNYTDKQNQKHYVTEILGLSYDLLESRATIALRESAIKTGETLLDAEELPF >NZ_CP015902|498308:510436|505901_506603_-|WP_003131580.1|DBSCAN-SWA MKKILVVDDEKPISDIVKFNLTKEGFEVFTAFDGEEALEAFKEVQPDLILLDLMLPKLDGLDVAREIRKTSDTPIIMVSAKDSEFDKVIGLELGADDYVTKPFSNRELLARIKANLRRINVAPAESTDNVKKELIIGNLRINPAHYAAYKNDKQLDLTHREFELLYYLAQHLGEVITRENLLETVWGYDYFGDVRTVDVTVRRLREKVEDTPSRPQYVSTRRGVGYYMSNPHD >NZ_CP015902|498308:510436|504466_505909_-|WP_012897229.1|DBSCAN-SWA MIKFFNSMIFKGVVAHLLLFVILFMSSFDYNFAHLSTFIGYYLFSLVFVLVFLNQQHRMIVNVSKQMNDIKNGYLNRDKIPKGTSEINELYDEILKLGEDIVRTQNNLENQRNQLDSILAYMVDGVIATDRRGNIIMANKSALHYLNTDNDLLMQKNIVEVLKIADQYNFYDLLEKEPEITIETHDAGNESISLHIKFALFRRESGFISGIIAVLHDMTEQDKAERERRLFVSNVSHELRTPLTSVKAYLEALEDGAIEDKETASSFINVSLTETNRMIRMISDLLTLSRMDQDRIVLNKEMINLIAFLDYQINRLDQILETESNDLISSNFTLVRKYSEQPIWVEIDTDKIAQVIDNIIGNAIKYSPKGGTITISVEKRESDVLISISDQGMGIPKSDLLKIFDRFYRVDNASRNSKVGGTGLGLSIVHDIVKIHGGTIFASSEGEGKGTTFSFTLPYSLEAADDWDDGTDEFEFEDNE >NZ_CP015902|498308:510436|503485_504298_-|WP_003131583.1|DBSCAN-SWA MTEQNGFKYSILASGSTGNSFYLETPKKKILVDAGLSGKKIESLLSEIDRDIHDIDALLITHEHSDHIKGIGVLARKYGIDLYANEDTWSELDSKNALGKIPVEQKHLFEMGKTMTFGDIDIESFGVSHDAIAPQFYRFMKDNKSFVMLTDTGYVSDRMRGTIENADAYLMESNHDIEILRMGAYPWRTKQRILSDQGHLSNEDGAEAAFSIHGNKTKRIFLGHLSLNNNIKELAHLTMDGYLQQHDVDTKKDLKILDTSHEHASQLYDI >NZ_CP015902|498308:510436|509560_510436_+|WP_003131568.1|DBSCAN-SWA MENKFNIQRSFKGLKTAGSLYLVPTPIGNMQDMTLRSLETLKTVDLICSEDTRNTLRLLNHFEIKVPQESFHEHNSQEKIPKLIDFLKKGQSIAQVSDAGMPSISDPGHDLVLAAIDEGIDVIALPGASAGITALIASGLVPQPHIFYGFLPRKKGEQQKFLKSKLSYPETQIFYESPFRVGDTLANMQEIYGDREVVLVRELTKIYEEYRRGKISEVLESLTDQPIKGECLIIVSGADEVAQEVQEPELTALEAVKVLVEQSVKPNVAIKQIAKERGLNRQELYAEFHDL >NZ_CP015902|498308:510436|506780_507416_+|WP_012897230.1|DBSCAN-SWA MNGILISLEGPDGAGKTTVLKEILPEIQKMKREIVPTREPGGVRVAEEIRQIILDPKNTEIDSKTELMLFAAARRLHMQEKMLPALQAGKVVIVDRFIDSSVAYQGYGRDLGVEVVDWLNYFATDGLKPDLTLYFDVDTDVALERIMKNRADEVNRLDLERAEMHRKVREGYLEIVVKEPERFVKIDASQPLEKVVADTLSVLKKRFVSEF >NZ_CP015902|498308:510436|498711_499338_+|WP_003131594.1|DBSCAN-SWA MIATYNTNVGDVLMLITANDKGEKVNFERKGKVARVFIEETGATVAWNIFEAKSLLANLSGNGQVVLSSDDIETLNKELGKSGFSDVLVHDAQPKFVVAEIVEMEDHPDSDHLHICKVNVGFADPVQIVCGAPNAALGLKTVAALPGAMMPNGSLIFPGALRGVQSYGMLCSARELELPNAPEVRGIIELSSDLSAGKAFDSETMWQA >NZ_CP015902|498308:510436|499500_500841_+|WP_023188995.1|DBSCAN-SWA MKIVVIGTNHAGIATANTLIDQYPGHEIVMIDRNSNMSYLGCGTAIWVGRQIEKPDELFYAKAEDFEKKGVKILTETEVSEIDFTNKMIYAKSKTGEKITESYDKLVLATGSRPIIPNLPGKDLKGIHFLKLFQEGQAIDEEFAKNDVKRIAVIGAGYIGTEIAEAAKRRGKEVLLFDAESTSLASYYDEEFAKGMDENLAQHGIELHFGELAQEFKANEKGHVSQIVTNKSTYDVDLVINCIGFTANSALAGEHLETFKNGAIKVDKHQQSSDPDVYAVGDVATIYSNALQDFTYIALASNAVRSGIVAGHNIGGKSIESVGVQGSNGISIFGYNMTSTGLSVKAAKKIGLEVSFSDFEDKQKAWFLHENNDSVKIRIVYETKSRRIIGAQLASKSEIIAGNINMFSLAIQEKKTIDELALLDLFFLPHFNSPYNYMTVAALNAK >NZ_CP015902|498308:510436|501438_501723_+|WP_003131589.1|DBSCAN-SWA MLKPLENRVVLRVKEEEEKSMGGIVLTSASQEKPQTAEVVAVGEGKTNHHGTLISPLVKVGDTVIFEKFAGTTVKMDGEEFLILKDSDLLAIVE >NZ_CP015902|498308:510436|498308_498626_+|WP_003131595.1|DBSCAN-SWA MIIPENIENLAELVKGPEKTVFFFTAGWCGDCNFIKPKMPEIEVENPDFKFVEVDRDEYMDLAIEWGIMGIPSFVVIEDGKEKARLVNKLRKTKEEVNTFLASAK |
14 | uncultured_virus(30.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
947873 : 998858
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP015902|947873:998858|DBSCAN-SWA 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56 | Lactococcus_phage(50.0%) | protease,transposase,holin,portal,tail,terminase,capsid,integrase | attL 979556:979572|attR 995141:995157 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1004299 : 1018666
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP015902|1004299:1018666|DBSCAN-SWA 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17 | Lactococcus_phage(82.35%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1092331 : 1115781
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP015902|1092331:1115781|DBSCAN-SWA 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22 | Staphylococcus_phage(21.43%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1320667 : 1326444
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP015902|1320667:1326444|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP015902|1320667:1326444|1323656_1324709_-|WP_023189235.1|DBSCAN-SWA MKKQKIIVSAIALISLFSLTACGYNRENQSGKAKTTLKVALVPGTGGVNDRSFNQSAWEGLQDWGKENNLKKGVGYNYYQSNSDSEYITNYNSAKQAGYKLLFGIGYSLQDATTIAAKNNPDSNFVIIDSVITSQKNVASATFADNEAAYLAGVAAAKASKTNKIGFIGGMESDIVTHFEKGYIAGAESIKPNIQVKVQYSGTFTDAAKTKTIAAAMYASGNDVIFQCAGNAGSGAFNEAKSLNNNRKESDKVWLIGVDQDQKYLGKYTSKDGKKSNFVLVSTIKEVGEVVKDISEKTKNNKFPSEEVIKYDLKNGGVSLGLDNVTSEIKNSIIQAKEKIVSGKIIVPEK >NZ_CP015902|1320667:1326444|1325793_1326444_-|WP_023189232.1|DBSCAN-SWA MSVLVLAGTIGAGKSSLTEMLAKELGTEAFYESVDDNKVLPLFYKDPQKYAFLLQIYFLNKRFDSIKQALSNNNNVLDRSIYEDSLLFHLNADLGRATKTEVEVYDSLLENMMQEINILTFKKKPDLLIHISVSFEKMLERIQKRGRKFEQLEYDPSLFDYYKELNRRYEDWFDNFDICPKIQIDGDKFDFVEEESARKIVLNKINDKLKEIGKDK >NZ_CP015902|1320667:1326444|1322553_1323477_-|WP_023189236.1|DBSCAN-SWA MKLSQQIHMMGTTIDLLIEDDQADLKLEIACQLLDIYNKRFSANDSESELSQINHQAGLKPVQIHPELFELIKIGKKESLSTPSNLNIALGPVTQAWHIGFPDAKLPDSQEIQKLLLLSNPEMIILDEENLTVFLQQKGMIIDLGALAKGYIADQIIKKINASSILINLGGNVLVSGPNSNRESSSWNIGIQSPTKPRGMHVGVVSIENQSVVTSGIYERSFELEGKTYHHIFSSRTGYPIETEMASLTILADKSLTCEIWTTRLFGLPILDVLQIIDDRPEIEGIIITKAGQILYSENIKSHFNLI >NZ_CP015902|1320667:1326444|1321932_1322538_-|WP_011915229.1|DBSCAN-SWA MKLIGLVGSNSKKSTNRILLQYMQKHFTEGVEIKLIEIKEFPMFNKPASMKLPDIVQEISEEIKLSDGVIIATPEYDHAIPATLMNALAWLSYGIDPFLNKPVMIIGASYGTLGSSRAQLQLRQILDAPELKANVMPGSEFLLAHSLQAFNEAGDLSDIEVAKNLEKLFKSFQLFVKMVANFSSAKEFILEDTENKESLNK >NZ_CP015902|1320667:1326444|1320667_1321879_-|WP_081213518.1|DBSCAN-SWA MKFVGIVGSNAEQSYNRKLLKFIRRHFKLKFELELLEITDIPMFNQDIDASDNFNLKLLYNKITRADGVIIATPEHNHTTTPALKSVIEWLSYELHPFEHKPVMIVGASYYDQGSSRAQLQLRQILDAPGVNAYVLPGNEFLLGKAKEAFDNNGNLINSSTIEFLELCLDNFTKYVEVVSHLKKPKPLDPEDLTVGKPISTTIKGIDPDDPHWVEKASEQVGAVSGDTYVKLNHGLLTVDQINMFLDSMPFELTYADDNNQFLYYNNKHQDPETMLAKRIPEQSGNRLSTVHSSLPPQRMKNVEWVIATLRAGNQEYVRTAIPGKNPDLINTHNYQAMYYPNGDYAGINEIVLNFKPWLDWYLNQTGQHLSGGNKVDATSGASSTSNTTIENETDATSGASSH >NZ_CP015902|1320667:1326444|1324773_1325253_-|WP_058223180.1|DBSCAN-SWA MNKLFNKPVKVYLAGPFFSEKQIQKVEQLEKALLDNKTVSSIFSPMRCQRPEELAEEIEDFTPEWAKITMENDVKEVEAADIIIAIVDFDDEDTDSGTAWELGYAIAQEKPTYLIRFEETVPTNIMLTERNRAFFTEINQIRNYDFLASPAIPYSGKYQ >NZ_CP015902|1320667:1326444|1325236_1325791_-|WP_058220898.1|DBSCAN-SWA MNVTVFLSARDGKNPIHRIKSQRLGELLTKSGHTLVYGGSMEGCMGVVSDAVLKNHGKVIAVYPDGILPLEPPRQNATELHLAKTMDERKHKLIDFGDAFVILPGGFGTMEEAFQLLTEMSIGQTLIRPVIFIGINFYKPLFEMVQHQIEEEMLSLEVVKEMYLVDTTEEAMQLIGDQEYEQII |
7 | Lactobacillus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1389327 : 1401073
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP015902|1389327:1401073|DBSCAN-SWA 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GCATTTCTTTCTTGGCTGACTCGTTCATGATTAAATCATCTCCATATTTATCATTTAAGCGTTGCATGGTGGCTTGTAGAGCTTTCTGCTTTTCCAACGGGTCAGTAATCTGCTTAATCGTCCGACGTTTTGAAAGGACAGTTGTCTCGCCTCTCCTTTCACTTTCTGGATTTTCCATTTGAGATTTCTTCCTTTCATTGAATTTCTGAATCTTCCTCTAGGATAATATTCAAAATATGATTCCCAGATAGATCTTGATAGTGTCCGTCTAAGGTTTTTATAATGATTTGATGGTTCTCTCCTAGCCCATAAATACGACCTTTAACCTGTTTTGAGCCAAAACCGTCTTTAAGAAAAACCCGAATCACTTTCCCAGAGCTTAAAGCAAATAATAGCCGAAAACTAATTTAATCTGGTTCCAAGGTAGTCTCAGGTTGCTCTATTTGCGTTGATTAATAGTATTCTCTGTGTGCTGCCGCAAGTTCGGCCGTTGCGAATGGGTTCCACTTCATGACACGTAGGTCTTGATAGTTGCGGATTGCTTCAAATGGGCTATAAGAACGATCCACACGTTTTGTTCCTTCAATAATACTCAATTCAGTCCCTCCAATCCACCAGCCGAATGTACCCCAATCAGCTTACTACGTTCAATCGCCCGCGACCCTCTTTTCAAAATTGAGGCCTTTTGTATGGCTGTAAAGCCTTGCTTTTTTACGAATCCTATCCATCGCTTCTTGAATTTTTTCCTCTTGGTGCTGGCGCGCCATTACCTTATCATCCTCGGCTTCATCAAAGAGGGAAATCAGCCGAAAAGGTGTATCAATCAGGCCATTGGCAGAAATCCCTACTTGACGTACCGCTCCGCCCTCAAAACGTTCCCTGAACAGTTGAAGCACGATTCTCTGAATTTCTACAGTTGAGTTCGTCGGCTCAATCCCTCGTGCAGCGTGAACCGTTTTGCGCGGTTCTTTTGCAGAAAAACCAACAAAGAAACTAATAGAGGTAGCTTCCTTTTTTTCTTTTCTCAGCCGCACCGCCACCTGCTCACACATCTCTTTTAAGACGATTTCGACTTCTCCCTGTCTGGTATAATCTCGCGGTAAGATTGGTGAATTGCCAAAACTGGTAGAAGCCTTTTGATAGTGGTCATGAATACTCGTCTCATCAATGCCATTGGCGTGGAAGAATTGTTGCAAGCCAATCGTCTTCATCTCTCGTTTAATCATGTCTGGGTCCGCATTGGCTAATTCCCGAATGGAGTAAATGCCGATTTTTTCAAAGTTTCGCTTAGTCCGCTTACTAATCCCCCAAAAATCCGTCATTTCTTCTATCGTCCAGACTTTTTCTTCCACATCTTCATAACGAATCAAGGCTCGCATATTCTGGCTATGTTTGGCGTAGTTATCCGTCGCCAATTTGGCTAAAAGCGGATTATCGCCCATGCCAATCGTCACATAAAGTCCTGTTTGATAATAGAGTGTCCGTTGAATTTTCTGTGCCATTAAATCCATTTTCTTGTAGTAATCTGTCTCATCAGGAAAATAATAATCCAGTGATTCGGTCACATCCAAAAAGGACTCATCAATGGAATAAGGGTGGATTTCTGCCCTTGAGGTAAAGGTCGCCAAGATTTTCAAGACTTGGATATTAGACTGAATATAGAGCCCCATACGAGGTGGAACAATATAGGTGTCACGCGCCCAATCCTCGATAAATTTGACGTATTCCTCACTCGGCGGCTCTACATTCCCATAAAAATCACGATGTGTTTTATTCCAGCGGCTATAATTAAATTTACGGGTTTGCGGGTAAAAGGGCAATTCATGACTTCTTCCGACGTTTGACTTGCCAAAAACTTTTTTGAAAGTTGGGCTAGAGGCCAGAATCAGCCCCATCGAGTTGTCGCTGCGGCTCATCACGCAAAGGAAAGTTGTCAACGGGTCTAAGCCTCTTTCTCGGCACTCAATTGACGCGTAGTTAGACTTGACATCTTCAAAGAGTATGGCACGGCGTGGCTCTAACGAATAATCAAAATAGCCCATGATATACACCTCTTAATCCTCAATCAAGTCGGGGTCAATCTCTCGCACACAATCCACAACCGCCCCTAAAATACGCGCGTCTTCCTCTAAAAAAAAGTCCTTATACTGTGGATCAGAATTAAGCGAATGGCAGCGGAAAACGTCTTTCTCCAGAAAAACTTGTTTACAGTAGAGCGTTTCCTCGCCATAGCCTCCCTCGGAGATGACGTAAATGTCTCCATTCACATCAAAGCCGTTATTGACAAAAGTCACGACTGAACCATTCGGAATATCAGGTTCCATGGATTCACCTTTGATTCGTGCAGCACTATCATAGCGTCTGACTGGCGTATCGGTGTAGATAGTATAAGTTTCATAGTTGTCTTTGACACCTGTCCCAAATCCTGCAGAAAGTTCCTCATCTTGGACTTCAACTTCGTAGAGCTCTTTGCGATGATAAGTCTTAATCTCATAGACCACTGATGAATCATGAACCTCTAAGCGACTGGTGTTTCGTTCGACCATGACTTTTGCTAAGTCGCCAAGTGTCTCTTTTTGTTCTTGATATAGATTTTTATAATTATCGACTAAATCAATAACATCTTGTGCCTCTTGCTTCTCCCCTAGGAGATTTTGTAGGGAGACATCATAGATTTTAGTGATTTTTTTGAGTATTTCTAATGTCGGGTTAGTCTCTTTTTGTTCCCAAATTGCATAGGTTCCTTGTGTCATTCCAAGCCTTTTCGCGACTTCTTGCTGCGTCAAATGCTTTTCTTCCCGCAGGGCTTTCAATTTTTTACCGATGTTCATAACGCTCCTCCCAATTATTGAATTTATCAATATTATAATACTGAATATTTCTAAAATCAAGAGATATTATCCAAGAAATCGATAATTAATATTTATCATTTTTCCTCCAAATTTTCTAAAGCAATATTTTCTCCATTATTTTTGCTAATTACCTAGCAATCATCCCCAATAATGAGCCAGATATAGTAAGAAATCCTCTGATTTTCTCCTTCCAAAATCACACAATTAAAAGCTAAGGCTGGATACCTTAGCTTTTAATTGGTGCTTATCATTATATTTCATAAATAATCCGACTACTTCCTCCTGAATTCTAATCCTCCCCATATACGTCACGAGTATAAACTTTTTCTTGGACACTTAGTAGTTGTCTAGAAAATCTGTTAGCAATAATAACGTCCGCCTTGTCTTTAAATTGATCAAAGTCACTATAAACTTGTATATCTTGGAATGTTTTCTCTTTCAATATTGGTTCAAAAATAATGACCCTAACTCCCAATGAAGCTAGCTCAAACATAACATCCTGAATGGATGATTCGCGGAAATTATCGGAGCTTTTCTTCATGACTAATCGATAAACACCAACCACTTTGGGGCGTTTTTTCATAATCATACTTACAATATGGTGCTTTCGAGTTGTATTAGAAGAAACGATAGATTGAATAATATTTTCTGGTATATAATCATAGTCAGCAAGTAATTGCTTTGTATCTTTTGGCAAACAGTACCCTCCATATCCAAAAGAAGGATTATTATAGTTCTTACCAATACGGGGATCTGAACAAATTCCTTCAATTATTTTTTTAGTATCCATTTCCTTAATTTCTGTAAATGTGTCAAGTTCATTGAAGAAAGCAACCCTTAACGCTAAATATGCATTAGCGAAAAGCTTTATTGACTCAGCCTCATTTTGGTTTGTAAGGAACACTGGAATATCTTCCCTAATGGCCCCATTGCACATGAGTTTCGCAAATTTTTCAGCATATAGTGATGTTCCTCCAACGACCACTCTAGTTGGATAAAGATTATCAATTAATCCTTTTCCCTCCCTTAAAAACTCAGGAGAAAATAGTATCTTATCAGTATCGAATTTCTCACACAATAAACTAGTATAACCGACAGGAACAGTTGATTTAATAATAATAACTGCTTCAGGCTTGCTTTGTTGTACATATTCCACGATTTCATCTACTGATGATGTATCAAATTTTTTCTTTTCTACATCGTAGCATGTCGGTGTCGCTATGACAACATATTCTGAAAATCGGATAGCTTCCTCTTTATTTGTAGTTGCTTTCAAATTTAACTTTTTACATTTTAAAAATATCGACACCTCTACGTCGAGAATTGGAGAAATTTTTCTGTTAATCATGTCAATTTTTTTATTGTCTATATCTACTAAAGTCACTTCATTAAATTGCGATAAAAGCACTCCTACCGTCAGCCCTACATATCCAGCACCTATGACAGCTATCTTCATCAACAATCCTCCTTATAATTATCTAAAGCTCCTATCTTCTGTAATAGTTTTTTCCCCTGTACATAGGTTTTCCGATTTGTTTCATATGTAATGAAATTTCTATTGTTTTCAAAGGAACAGATAGCTGTAGTAGCTTGCCCCATAAATGGATCTAAAATCACATCTTTACCAATGGAATAAATTTCAATCAATTTGTTTACTAACTCTTTGGGAAAAGCAGGTGGTCTAGTTGAGTAATCCCACGGGATGTGCCAAATATAATCCAATAATCTCGTCTCAGAAAAAACTTTACTATGCTTTATGAAGCCTTTTCTTTTCTTAAATATCATTACATACTCATAGTTATTCAAAATAAGCGTATTTTCATTAGAGTATATATCGTTAAATTTGTACACTTGGTTTTCAATATACTTAGAATTAATTATATCCCATATAATTGTCCCTTCAATATAAAATCCATGATTAACAAAATATTTCTCTATATCATGCTTTATATCATAATAACAATTTTGATTTTTCCTAGTAATCTCAACAGTACTACAAACATTGATACAAATTGTTCCGTCATCTTTCAAAGAGTCTATACACCTCTTCCAAACCTGATTCAAACTTTGCAAATATCTTTGATATGTTTCTGCAAATCCAATTTGTTTACTGCTTTTATAATCAACTAAGTTAAAATAAGGTGGAGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP015902|1389327:1401073|1391633_1393418_-|WP_081213526.1|DBSCAN-SWA MEKDISFTKYIKKNFLSALFNVVNAHLEKTSHDSLQDLEVRTVYIEDVPLMRLNFDVVVVAKLVMGENLFDFWLRISCTGDLEKRLEDFQVLSVSAYQGKPSYQKPLSDTLLPYLHRKQLDEVASGIIKQYYPEALLTNQVLDAMKFAQNLGLDIKMRKLSKAGTIFGETIFTDTKVEIYDKISDSMVEEEIKGGTILIDPSHYLTRNYGAVNNTIVHECVHWLLHRKAFTLARLFQPKMRFLRSSFSNKTTLDWIEWQANTLTPRLQMPLVPFKDKVIELQGVYHYLSGEQSNLIGEMIYVIDSLANFYHVSKMAAKIRLLDAGFEEARGIYKYVDGHYVQPYVFKRGVLSQTQTFAISLEGAIRQSATNKELQEKLETGNYLYVDSHFCLNDPKYLQTNKFGKLELTEYARHHMEECCLIFELVSQDKKTNTCFDEVLYRDANQEIRFEAHFINKKNVDEKYLIRNRVIELQKLAMSLPGSFSGTVEALIKWSELTLAKVEEQSLISERTLYRMRTDENYNVSLELILQLCIGLHLPPEISDILISRSSKRLGNMELHFLYRFLLNCCYTSTIFECNDILEAQGFSRLGKEN >NZ_CP015902|1389327:1401073|1396380_1397157_-|WP_025016766.1|DBSCAN-SWA MNIGKKLKALREEKHLTQQEVAKRLGMTQGTYAIWEQKETNPTLEILKKITKIYDVSLQNLLGEKQEAQDVIDLVDNYKNLYQEQKETLGDLAKVMVERNTSRLEVHDSSVVYEIKTYHRKELYEVEVQDEELSAGFGTGVKDNYETYTIYTDTPVRRYDSAARIKGESMEPDIPNGSVVTFVNNGFDVNGDIYVISEGGYGEETLYCKQVFLEKDVFRCHSLNSDPQYKDFFLEEDARILGAVVDCVREIDPDLIED >NZ_CP015902|1389327:1401073|1397467_1398634_-|WP_044009673.1|DBSCAN-SWA MKIAVIGAGYVGLTVGVLLSQFNEVTLVDIDNKKIDMINRKISPILDVEVSIFLKCKKLNLKATTNKEEAIRFSEYVVIATPTCYDVEKKKFDTSSVDEIVEYVQQSKPEAVIIIKSTVPVGYTSLLCEKFDTDKILFSPEFLREGKGLIDNLYPTRVVVGGTSLYAEKFAKLMCNGAIREDIPVFLTNQNEAESIKLFANAYLALRVAFFNELDTFTEIKEMDTKKIIEGICSDPRIGKNYNNPSFGYGGYCLPKDTKQLLADYDYIPENIIQSIVSSNTTRKHHIVSMIMKKRPKVVGVYRLVMKKSSDNFRESSIQDVMFELASLGVRVIIFEPILKEKTFQDIQVYSDFDQFKDKADVIIANRFSRQLLSVQEKVYTRDVYGED >NZ_CP015902|1389327:1401073|1390667_1390916_-|WP_025016762.1|DBSCAN-SWA MKINYVPVADSIAEWGNKEAVLKRYEGLNIYTLNRWLAEMRNNKQFRRGVINPTHKLVWINFEIFEEFLYWKQHGYARIKDK >NZ_CP015902|1389327:1401073|1389327_1390590_-|WP_081213525.1|integrase|DBSCAN-SWA MYFEQRKHKNGEIYFKAIERYIDPLTEKYKRASVIFTSDTSRGRAKAVRELDEKIDRLIKERQEQFQGQAMKTFSDLKTSWFETWQTTVKAQTVNREILVISRLSGLISDDILLSKITPLLIQNYLRQYKEKYHSTHSTMQHIKCTLNKIFDYGVLHNAIPFSPSRVVKLNATVDEKRAKKKRLEEKFMNEQEVGALLSELRGRRNQNYYDLALFLIGTGCRIGEASALTAADIDFKNRLVTIDKSLQAHDLRVKDFYLDTTKTEAGDRIEKLPEFVIEAIKRVIQRNNKFEAHCKESPHNAFKKFDFLFRTEYGAPITSHSYREILGRVNKALRENCKEKYGFQWTKNAVPHSFRHIHISVLRDDPSIPLKEVQERVGHIQEETTNGYTHLLSHNQEKSVVAISRFVEKLGVKKQNKAS >NZ_CP015902|1389327:1401073|1398633_1399413_-|WP_032943383.1|DBSCAN-SWA MTNKTNFIYNEDAREMEELKQSIVDLVITSPPYFNLVDYKSSKQIGFAETYQRYLQSLNQVWKRCIDSLKDDGTICINVCSTVEITRKNQNCYYDIKHDIEKYFVNHGFYIEGTIIWDIINSKYIENQVYKFNDIYSNENTLILNNYEYVMIFKKRKGFIKHSKVFSETRLLDYIWHIPWDYSTRPPAFPKELVNKLIEIYSIGKDVILDPFMGQATTAICSFENNRNFITYETNRKTYVQGKKLLQKIGALDNYKEDC >NZ_CP015902|1389327:1401073|1393445_1394504_-|WP_081213527.1|DBSCAN-SWA MENPESERRGETTVLSKRRTIKQITDPLEKQKALQATMQRLNDKYGDDLIMNESAKKEMRVQALPSGILSLDLAMGIGGYPRGRLIEVFGAESSGKTTVALHAVAQAQKLGGIAAYIDVENSLDPDYAESIGVNLDDLIFSQPDSGEKAFDALEELVKTGALDLIVIDSVAALTPQAEIDGVNLQAELAKMMSERLKRIVSLVNKSKTVVLFINQVRSNLSGFLGTGETTPGGKALKFYTSIRIEVKTSEKIKQGELAIGKKTTLTTVKNKVASPFKKAVVENIWGEGFAPTVDIVTCAAKADVVQQSGKWYSFKGQKIGNGIFEVKDYLKTHSQVLYMIEENTRQKLGLTK >NZ_CP015902|1389327:1401073|1399483_1401073_-|WP_081213528.1|DBSCAN-SWA MLIQLTKITKNYDGLPIFDGLDFAVNEGDKMGLIGNNGTGKTSLFKIMIGQISPELGSINKKKKLKIGYVQQELSIGEQSPFQYILESFEEIGYLKKQLQELEEQLSNESSSSDEMLNHYGNVQEKFESLGGFSIEDRIVNILKSFGLEEQMYLPMSFISGGERVRVELARILLSDAELLLLDEPTNHLDMTGIIWLENYLKTTHKAFIVISHDREFLNNTVKKVVQLEDGKANSYKGNYSEYVKQKKEEIERLKKSYELQQREILRLKKLIRQFRQWANEGDNQDFYKKAKEIEHRLERMILIKEPPRNENRLRVEVKSTEKAGKEQIVVEGLVKTIGNRILFENANFTVLRNDRIAILGDNGSGKTCLLKILMGQIKADSGTFKIASSAKIGYVPQIITFSDVNLRLIDVAKTLIGNEQEARRELAKFAFYASDVTKRIKDLSGGEKVRLYLMTIFQKKINLLILDEPTNHLDILAREEIEQVLSKYQGTLIAVSHDRYFLKKIFNQSLIFQNGTIDRYDSLPIDLV >NZ_CP015902|1389327:1401073|1390955_1391249_-|WP_025016763.1|DBSCAN-SWA MNYYEQQLERFRRNFNFSFKIYEGRPLEQKTLCLQMKEKVEHFRIPKNFAMLYREHQQLVNYIQDAYFGVQIQEKAGKYGKPNAKMQHEWLNKALRN |
9 | Streptococcus_phage(25.0%) | integrase | attL 1385005:1385020|attR 1390946:1390961 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1720791 : 1791739
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP015902|1720791:1791739|DBSCAN-SWA 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84 | Lactococcus_phage(82.14%) | head,tRNA,protease,portal,holin,tail,terminase,capsid,integrase | attL 1749285:1749305|attR 1788205:1788225 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1924762 : 1934623
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP015902|1924762:1934623|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP015902|1924762:1934623|1928469_1929321_-|WP_017864882.1|DBSCAN-SWA MKKKIFIALMASVSLFALAACGSGNKQVTAGGSTALQPMVEHASMAYMKQNPDEIIMVQGGGSGVGLAQVAAGSFQIGNSDIFAEEKSGIAVDKIIDHKVAVIGFAPIINKKLKVSNLTQQELIDIFTGKITNWKEVGGQDQKITVIGRTAGSGTRVNFDKYALNGATEVNGPTQDASGSVVQLVGQTPGAISYVAFSYTNKPGVKAVNVDGVAPNYDNVKTNAWKIWSYEHMYTNKSRKNTIENKFIEYVQNDKKTLEQLGYIRVSEMKVDRDAKGNVEKIK >NZ_CP015902|1924762:1934623|1932004_1934623_-|WP_058221023.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKTMTSAEVRQMFLDFFKSKGHTVEPSQSLVPVNDPTLLWINSGVATLKKYFDGSVVPENPRLTNAQKAIRTNDIENVGKTARHHTMFEMLGNFSIGDYFRKEAIAFAWELLTSSEWFEFPAEKLYITYYPADMDTYNRWVEVGVDPTHLVPIEDNFWEIGAGPSGPDTEIFFDRGEVYDPEHVGLKLLAEDIENDRYIEIWNIVLSQFNADPSIPRSEYPELPQKNIDTGMGLERMVCIIQGGKTNFDTDLFLPIIREIEKLSGKTYSPDSENMSFKVIADHIRSLSFAIGDGALPGNEGRGYVLRRLLRRAVMHGKKLGIQGKFLASLVPTVGKIMQSYYPEVLEKEDFIMQIIDREEETFNRTIDAGQKLIDELLVNLKAEGKDRLEGADIFRLYDTYGFPVELTEELAEDEGFKIDHEGFKVAMKAQQERARAAVVKGGSMGAQNETLSSIEVESEFLYEDKTAQGKLLVAIQDDEIVDEVSGKAQLVFDVTPFYAEMGGQVADHGVIKDAEGQVVANVLDVQHAPHGQNLHSVETLSPLKVGESYTLEIDKERRAAVVKNHTATHLLHAALHNIVGNHALQAGSLNEVEFLRFDFTHFAQVTKEELAEIERQVNEVIWQSLKVETVETDIATAKEMGAMALFGEKYGKNVRVVKIGDYSIELCGGTHTQTTSEIGLFKIVKEEGIGSGVRRIIAVTGQKAYEAFKDAENTLNEVATLVKAPQTSQVLAKVTSLQDELKTAQKENDALAGKLAASQSDEIFKNVQTAGSLNFIASEVTVPDANGLRNLADIWKQKELSDVLVLVAKIGEKVSLLVASKSSDVKAGNLVKELAPFVDGRGGGKPDMAMAGGSKAAGIPELLAAVAEKLA >NZ_CP015902|1924762:1934623|1931339_1931918_-|WP_081040700.1|DBSCAN-SWA MKEMPKIMKITIFGDSITNGFGMDEGGSSNIIARLIEKNEPKLKVVLHGINGDDTYGGLLRLKYVLEEEADLNFIFFGANDASPYHLIRPAEFRENLLKMISQLGVERTVLITPPFYNDDEPTHYSKLSEVKLFREVILNLGKEKSLKVIDIFQIMKRSENPKNLLRADGLHFTSRAYELLVREILSVIKNP >NZ_CP015902|1924762:1934623|1925689_1926499_-|WP_003130885.1|DBSCAN-SWA MATTYDWSQRKIMVPEKEEIALSTNDLRVFYNGTKEAIHGVTMSFPKNEITALIGPSGSGKSTYLRALNRMNDTIDGARVTGEINYEGVNINENKVNVFEVRKQIGMVFQRPNPFPKSIYENIAFIHRRDGVRDRKKLDEIVETSLKQAALWDQVKDNLNQSALAMSGGQAQRLCIARALSVKPEIILMDEPASALDPISTMQIEETMMELKENYTIIIVTHNMAQASRASDNTAFFYSGDLIEYDKTSTIFTQPSLQSTEDYVSGHFG >NZ_CP015902|1924762:1934623|1924762_1925524_-|WP_003130886.1|DBSCAN-SWA MEKEAVLTVSDLSLYYSKKKALNTINMTFYKNEITALIGPSGCGKSTLLRSINRMNDLIPTVTITGAIDYKGKNIYSPKVDTVDLRKEIGMVFQQPNPFPFSIYENVVYGLRLKGVKDKALLDEVVENSLKAANIWDEVKDILHSSALGLSGGQQQRVCIARVLAVNPEIILMDEPTSALDPISAARVEETMLELKKDYTIAIVTHSMQQASRISDRTAFMLDGNLIEYNDTKSIFLNPEKQETSDYISGKFG >NZ_CP015902|1924762:1934623|1927425_1928349_-|WP_021722156.1|DBSCAN-SWA MENSKIKEKLLSSNKNSRLEKLGKSLTFLCIALIVFVVGAILVFVAQKGLSTFYSDGVNPFRFLFGTNWSPGNLGPDGKPAVGALPMFTGSLIVTVLSALVATPFAIGAGIYMTEISPKYGKKILQPVIELLVGIPSVVYGFIGLTVVVPAIRNVFGGTGLGLLSGVFVLFVMILPTVTSMTVDAMKAVPSYYKEASLGLGATRWQTIWRVLLRAATPGILTAVIFGMARAFGEALAIQMVVGNAVMMPKDLISPASTLTSILTSGIPNATPGIQLNALWSLALLLLIMSLFFNLAMRAIAKKGSLK >NZ_CP015902|1924762:1934623|1926532_1927426_-|WP_003130884.1|DBSCAN-SWA MNAKRSDKIATGVLYVLSGIIVLILAFLLAYILIKGLPVIFKDPKFIITASNPLTGGGIAVQLFNSVYLLIVTLIISVPLSLGAGIYLSEYANQKHWLTGVVRSAIEVLSSLPSIVVGLFGMLIFVLQFGLGFSVLSGALALTVFNLPLMTRNVEESLRAIPTSQREGGLALGMSRWETATQVILPAAVPGIITGVILSSGRVFGEAAALIYTAGQTNLPINWANWNPMSLTSPLSLFRPAETLAVHIWALNTEGTISTAQQISAGASAVLIIFVLLFNLGARFLGNRIHKKLTSSN >NZ_CP015902|1924762:1934623|1929666_1930563_-|WP_003130880.1|DBSCAN-SWA MKKKILVGLITAGALLTLAACGSSNGSSSSSSSSSDKALSGKIIAGGSTALQPLAQQSSTEFMAKNTGVQVTVQGGGSGVGLTQVAAGSFQIGNSDIFAEEKSGIDASAITDHKVAVVGFAPIVNAKIDVKNLTSQQLQDVFTGKVTNWKDVGGSDQKITVIGRTEGSGTRVNFDKFALGGATEVKGPTQDASGSVVQMVGQTPGAISYVALSYVDTSKDIKDISIDGVEPTEANVVTNDYKVWSYEHMYTNTKKETAADKAFIKYVAENNKDIKKLGYIPISDMKVERDADGNITKK >NZ_CP015902|1924762:1934623|1930840_1931308_-|WP_003130878.1|DBSCAN-SWA MVKNTEDKPLAQNKKARHDYEIYETFEAGIVLTGTEIKSVRQAKIQLKDGFARVRNGEVWLSNVHIAPFEQGNIFNVEELRTRKLLLNKKEIAKIDKELSGTGITFIPLKVYLKNGFAKVLMGLARGKKDYDKRETLKRKEQNRDIARQIKAYNR |
9 | Prochlorococcus_phage(33.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1951106 : 1966041
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP015902|1951106:1966041|DBSCAN-SWA 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21 | Lactococcus_phage(86.67%) | integrase | attL 1956239:1956254|attR 1966429:1966444 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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