Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020559 | Clostridium formicaceticum strain DSM 92 chromosome, complete genome | 5 crisprs | csa3,WYL,cas14j,cas6,cas8b1,cas7b,cas5,cas3,cas4,cas1,cas2,RT,DinG,DEDDh,cas7,cas8b2,cas14k,Cas14u_CAS-V,c2c9_V-U4,PD-DExK | 0 | 9 | 13 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP020559_1 | 1347744-1348827 | TypeI-B |
II-B
Consensus repeat of NZ_CP020559_1
|
16 spacers
spacers of NZ_CP020559_1
>1.1|1347774|35|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAGAACAAAACCTTTTCTTTCTAGTTCTTCCCAT >1.2|1347839|35|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATAAAAAATCTCCAATATAGAAAAATCCAATAT >1.3|1347904|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GATGGCACACGCCACTGACGAAATTAAGGATATGTA >1.4|1347970|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGATTTAGCCACCTGTATAAAGTGCTTAAAGGAATA >1.5|1348036|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TATAATCTTCTAGCATTTCTAAGATTTCATCAAAAT >1.6|1348102|37|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATATAGGATTGACTAGCTACAATTACAAGGAAGCAGG >1.7|1348169|38|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AACTAAAAGAAAATTTTATTACTATTCCCACGATCAAA >1.8|1348237|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAATCAAGTTGCAGCATAACAGATCCACAGCTGCTG >1.9|1348303|35|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGAGGAATTGGGGAAAAAAGTTGGTGTATCTAGGC >1.10|1348368|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCATATTTTTTTCTGTAAAAAAACATTTCTGAATCA >1.11|1348434|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCAATTTTTTCATTTTAAAACTCCTCCTTTTCATA >1.12|1348500|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGCAATTTTTTCATTTTAAAACTCCTCCTTTTCATA >1.13|1348566|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATACTTTTGGTACAATTTTATACCAAATTACATTAC >1.14|1348632|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAATTTTAATGATTATGTTAATGTTAACTTTAACTT >1.15|1348698|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CAGTTTCTTCACGAAGAAGGCTTTAAGCATCATGCA >1.16|1348764|34|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT ATCCTTGTTTTTCTAGAACTTCTAATGAAATTTG |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7b,cas8b1,cas6 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020559_1
The CRISPR arrays of NZ_CP020559_1 >merge|NZ_CP020559|1|1347744-1348827|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATGAAGAACAAAACCTTTTCTTTCTAGTTCTTCCCATATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATTAATAAAAAATCTCCAATATAGAAAAATCCAATATATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATGATGGCACACGCCACTGACGAAATTAAGGATATGTAATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATTGATTTAGCCACCTGTATAAAGTGCTTAAAGGAATAATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATTATAATCTTCTAGCATTTCTAAGATTTCATCAAAATATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATATATAGGATTGACTAGCTACAATTACAAGGAAGCAGGATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATAACTAAAAGAAAATTTTATTACTATTCCCACGATCAAAATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATTAATCAAGTTGCAGCATAACAGATCCACAGCTGCTGATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATAGAGGAATTGGGGAAAAAAGTTGGTGTATCTAGGCATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATCCATATTTTTTTCTGTAAAAAAACATTTCTGAATCAATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATTGCAATTTTTTCATTTTAAAACTCCTCCTTTTCATAATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATTGCAATTTTTTCATTTTAAAACTCCTCCTTTTCATAATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATATACTTTTGGTACAATTTTATACCAAATTACATTACATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATCAATTTTAATGATTATGTTAATGTTAACTTTAACTTATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAATCAGTTTCTTCACGAAGAAGGCTTTAAGCATCATGCAATTAAACCTCAACATAAGATGTATTTAAATATCCTTGTTTTTCTAGAACTTCTAATGAAATTTGATTGAACCTCAACATAAGATGTATTATTTA >NZ_CP020559|1|1|1347744-1348763|PILER-CR ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT GAAGAACAAAACCTTTTCTTTCTAGTTCTTCCCAT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TAATAAAAAATCTCCAATATAGAAAAATCCAATAT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT GATGGCACACGCCACTGACGAAATTAAGGATATGTA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TGATTTAGCCACCTGTATAAAGTGCTTAAAGGAATA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TATAATCTTCTAGCATTTCTAAGATTTCATCAAAAT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT ATATAGGATTGACTAGCTACAATTACAAGGAAGCAGG ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT AACTAAAAGAAAATTTTATTACTATTCCCACGATCAAA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TAATCAAGTTGCAGCATAACAGATCCACAGCTGCTG ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT AGAGGAATTGGGGAAAAAAGTTGGTGTATCTAGGC ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT CCATATTTTTTTCTGTAAAAAAACATTTCTGAATCA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TGCAATTTTTTCATTTTAAAACTCCTCCTTTTCATA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TGCAATTTTTTCATTTTAAAACTCCTCCTTTTCATA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT ATACTTTTGGTACAATTTTATACCAAATTACATTAC ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT CAATTTTAATGATTATGTTAATGTTAACTTTAACTT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT CAGTTTCTTCACGAAGAAGGCTTTAAGCATCATGCA ATTAAACCTCAACATAAGATGTATTTAAAT >NZ_CP020559|1|1|1347744-1348827|CRISPRCasFinder ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT GAAGAACAAAACCTTTTCTTTCTAGTTCTTCCCAT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TAATAAAAAATCTCCAATATAGAAAAATCCAATAT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT GATGGCACACGCCACTGACGAAATTAAGGATATGTA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TGATTTAGCCACCTGTATAAAGTGCTTAAAGGAATA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TATAATCTTCTAGCATTTCTAAGATTTCATCAAAAT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT ATATAGGATTGACTAGCTACAATTACAAGGAAGCAGG ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT AACTAAAAGAAAATTTTATTACTATTCCCACGATCAAA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TAATCAAGTTGCAGCATAACAGATCCACAGCTGCTG ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT AGAGGAATTGGGGAAAAAAGTTGGTGTATCTAGGC ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT CCATATTTTTTTCTGTAAAAAAACATTTCTGAATCA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TGCAATTTTTTCATTTTAAAACTCCTCCTTTTCATA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TGCAATTTTTTCATTTTAAAACTCCTCCTTTTCATA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT ATACTTTTGGTACAATTTTATACCAAATTACATTAC ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT CAATTTTAATGATTATGTTAATGTTAACTTTAACTT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT CAGTTTCTTCACGAAGAAGGCTTTAAGCATCATGCA ATTAAACCTCAACATAAGATGTATTTAAAT ATCCTTGTTTTTCTAGAACTTCTAATGAAATTTG ATTGAACCTCAACATAAGATGTATTATTTA >NZ_CP020559|1|1|1347744-1348827|CRT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT GAAGAACAAAACCTTTTCTTTCTAGTTCTTCCCAT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TAATAAAAAATCTCCAATATAGAAAAATCCAATAT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT GATGGCACACGCCACTGACGAAATTAAGGATATGTA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TGATTTAGCCACCTGTATAAAGTGCTTAAAGGAATA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TATAATCTTCTAGCATTTCTAAGATTTCATCAAAAT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT ATATAGGATTGACTAGCTACAATTACAAGGAAGCAGG ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT AACTAAAAGAAAATTTTATTACTATTCCCACGATCAAA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TAATCAAGTTGCAGCATAACAGATCCACAGCTGCTG ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT AGAGGAATTGGGGAAAAAAGTTGGTGTATCTAGGC ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT CCATATTTTTTTCTGTAAAAAAACATTTCTGAATCA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TGCAATTTTTTCATTTTAAAACTCCTCCTTTTCATA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT TGCAATTTTTTCATTTTAAAACTCCTCCTTTTCATA ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT ATACTTTTGGTACAATTTTATACCAAATTACATTAC ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT CAATTTTAATGATTATGTTAATGTTAACTTTAACTT ATTGAACCTCAACATAGGATGTATTTAAAT CAGTTTCTTCACGAAGAAGGCTTTAAGCATCATGCA ATTAAACCTCAACATAAGATGTATTTAAAT ATCCTTGTTTTTCTAGAACTTCTAATGAAATTTG ATTGAACCTCAACATAAGATGTATTATTTA
>NZ_CP020559.1|WP_070967972.1|1347248_1347539_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MKKNYNYNYAFLFYDVNVKRVNKVFKVCKKYLSHFQKSVFRGDITPSKLMLLKEELNRVIDESEDFVCIIKLMNNNVYGEEILGNKQNDTGEDLIL >NZ_CP020559.1|WP_070967969.1|1346249_1347248_+|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGSTRYITSMGELTRKDNSLCFRKDNKNVYIPVENTKEIYCMSEVSINSKLLDFLSQNNVVIHFFNYYEGYSGTFYPKQQYNSGKILIKQVEAYHTKRLIIAKSIVKAIGDNMYEVLYHYYKHNKKEVKGTIDWIRKDMQGNLEKSKNIQQIMQVEGELWQRFYGEFKHILLEDFVMSRRVKRPPDNPINALVSFGNSLLYTKTITAIYNTHLDQRISFLHAPSEGRFSLSLDISETFKPVLVFKTIFDLVNNKKIQVSKHFDKKVNYCLLNEEGRKIFITAFEERLESVFLHQKLKRKVSYKTAIKLDCYKLIKFILEDVEFKPFDIKEKM >NZ_CP020559.1|WP_070967966.1|1345748_1346240_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MRVNGTLVNYYFHCKRQCWLHGNRINLEDNSEDVRIGKAIHEIKKEKNKSTEISIDNIKIDKLTQEYLTEVKKSDADIEATKWQTLFYLKILREKGIERKGKLEFTEKNKSKSIVIVELDDKKLAELEEITKNIQKLLIEEEAPQVINKPKCKKCSYFEYCYI >NZ_CP020559.1|WP_070967963.1|1343154_1345740_+|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MYFNDVEKFQLEELIVNNEKIYAHVMKERKEILKEHVELAIKYLYKIIEVKQLHSVLLNFEKNICKEMSTQGKLLYREMLFNTIYMHDLGKINCNFQYNRMNNKEFKGKKGLDFNNSNHSMLSSIIYLNHYFNRIKEQENKDDRSILAIVMLLNAYAISKHHGGFDSFGEFKSKLLEKDGEGWRLYTEELSMFNEIYQVPIIFNHNKNLLNRIFSNVEKSLKDKEKKQRGISIYFYIYQRFVASLLLACDYYATSEFKNQREIKDFGEIENINHFYQVYKNTEICKGIRTYEKESYGKTNDFNGIQDINILRNELFLEAEKNLLKNIEKNIFYLEAPTGSGKSNVGFNLSFKLIENLSDINKIFYVYPFNTLVEQNMNTLKKTFEDSAAMKDIAIINSVVPIKTKNRTENEDSDVMKDDYEISFLDRQFLHYPMILTTHISIFNYLFGTSKDNLFPLYQLANSIIILDEIQSYKNRIWKEIITFLKYYSEALNIKFIIMSATLPDLNKLIDEETETINLVENRDKYFSNSIFKDRVKLDFSLLELQENTMEGLLKHVLETGKKTEGNILIEFITKKSAMKFFKKLKEENELSEDADKKEIELITGDDNSIDRNAIIAKVKANKNIILVATQVIEAGVDIDMDVGYKDISMLDAEEQFLGRINRSCMKKNCKVYFFDLDDASKIYKNDVRKEKSINLTAEKIRNILIDKNFGVFYKDVLQKLEKEANKLNDNNFYSFIEDNIKGLNFKKIEERMKLIDEHYRYSVFLSRRIELENNKILNGEEVWKEYITLLKNNDLEYAEKKIKLSRVTASLNHFIYKVQKNDFTYQERIGDLYYITDGERYFVDGKFDRENFDKGIGDFI >NZ_CP020559.1|WP_070967961.1|1342354_1343107_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 MRALKFTLSGKTAFFKKPDVNTYYYFTYGNIHKVALLGILGAILGYKGYNQQKHEEKSVYPEFYEKLKAIKIGVVPRNNKGYIQKKIQSFNNSVGYASREQGGNLIVKEQWLEEPKWDIYILIEEEVENELADRIMKRRFQYIPYLGKNDHIANITDVQIIDNIELITNTNKIDSLFLKDFFELQPFEDDPFDTDTVYVPIYKYEEMLPVMLEETTNKYEVQSFIYTNSPLVPIKNSLVYECDGNIIFFF >NZ_CP020559.1|WP_070967958.1|1341377_1342352_+|type-I-CRISPR-associated-protein-Cas7 MNKRVYGVLGIVSRMSNWNADFTGYPKTTSSGDVFGSDKAFKYPLKKMWEQQGEKVLYIKSLRLSENKKGETELIPRSLKERYEFLFDTKDLKEEIDNGKILKNLFCCIDVKNYGATFTPSNSDKNISITGAVQVGQGFNKYDGSQAEEQQILSPFRDDKKKEINSGAKKEEDQEEAKASTLGTKIVSNEAHYFYPFTINPAAYDEFKVLGVTDGYTEEDYKKFKKASLVAATSFSTNAKIGCENEFALFVETERDLYLPDLSQYVGFEKGEEKNTIILKCDELLNELQDKINNIEIYYNPYTTQLEEKIEGAKKFNIFTQKEV >NZ_CP020559.1|WP_070967955.1|1339653_1341375_+|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas8b/Csh1 MLSDVIQIFKKKYKDQGDQIITDAYTPADGEYIIIDTNQDKFHILDKVYIKQDKKTREVDSSNPHFDFICKADYMSRYLESNKAISDKNIHSNNYLTFFVKKENIHNGKITNEVIEKYYDILKNPLIKYTKSKSKKLYESLEKKYGKPNKAQVERIEDWIKNNIFNLIDPDSKDKSYLKIFFKFDLAIYKNESERYILANIYNSTDYNETIDNKIYGLPNDNMGLNSKKPYLENKSRKATVPYLISEEEVLIQKKFFDYLANQAALNKTNIYIGANQIESYKNDETPEEDFCGYYLRIKKGKEIEIHDFDTIGLYEAQISPLSLENTLQLEKPKLEYSTIHKLSTLKNIINDVFFNKCLTTNYFTDAKDIRIHDSALKRNLLISRTTLFTWFYKGNDSNAWKILKQSSLDLIKGSIYKGYLTKAGEQFNLRCGLKKYFEGGDNMADILVDVKDTLRAKITNKSGTETIASDTEYYFAVGQLTSYFISLSKTKTKMHSLANPMINAKTNEKIKEELRKLYKKYNYTINTATNRFNNLFAMVSSYVPEGKIMEDLIIAGYLHSNLLYEKSDKGGK >NZ_CP020559.1|WP_070967952.1|1338946_1339642_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MKVYELRLKIFLLKSIDKKEALERIGEMIDKCLTATDEFRNFHNSNTFKNYTFNSLYKLERDGIYKVGNIYSIKIRTVDEMLAKYFKKNLANEYTEHMKGLTLECNILRKKPIEKIYSITPVIIKTDEGYWKGRLSLESFEKRLRENIIKKYNDYFDTEISEDFELFSRIEFNNQKPIASSYKNVNFLGDKLTLYIAENEIAQNLAYLALGTGVGEINGRGYGFMNYQSFK >NZ_CP020559.1|WP_156778765.1|1337588_1338506_+|L,D-transpeptidase MLAEILSLCIATTMLAPAVTAENYAIEMEEDIVIQEEYDLIPAEEILEEMLEVTEEKAEEPVESVEVEVPEEIEIEEKEEIEEAEVEKIDYPVALKEMGYYKEDYADKEINMRNAVLRFQSEHNLMVDGKFGEISYRALEKRLQDADYQYADVITSPPTEQEWIAINKTKRILTFYKGTQVIKKYPIAQGKDPSYTPEGKYTIVNRIKNPRWGGAGIAAPVAGGSPKNPLGYRWMGLSLKGGGSYGIHGNNQPKSIGTDASMGCVRMINSDVEELFELVKLNTPVWIGTHEKLKEWGVHNKSYLN >NZ_CP020559.1|WP_070967949.1|1332521_1337426_-|cytidyltransferase MNTLEAQKVYSELHMILLEKSFLEEHPLKKNTIKKHLESTYFFHHLHEILEEGDYSCTAVFTLCKDMLEALWEKSMPTNPLHYLYQFSLSLSFPDSVEIQLNPELDLGCYLYLKALRVISQYEKLFHKGTFESDFPLNLLTEEEEHPLMNLQEYRSFLHAFYNEYIYEMMKLNYEVVGHNTLAHICGVHYLAVFIAKQLLEKGTPLDLGRVSGAAAGHDIGKFGCRSLESKRVAYLHYYYTDQWFKRHNIPYIGHIALNHSVWDLELENLSIESLLLIYSDFRVKNITTESGSQEMKMISLKDAFETILEKLDNVDESKEKRYRRVYMKLKDFEDALVDMGIHIDPAAEIKNNLQEEKKYYAIMQGKKITNHLKYIAIRHNINLMYKLRDETSLNEIIEIARAEQDAKIIREYLDIFQEYSTYLTQKQKIIAMKFLYENLVHPEEDIRKQCAYIIGAMIAIFDESYRKEIPEGLSIVEPEITSSEILHQYIKLFLYPDHKVIPLHRSWIRYSISTLLTSLFNKSSYHQVEDYRKVLLKYYENIASLEDEIEIVLMEALKYVPLSPDSSALTTAIDYVMQILKSKHKSIRVSALDTLNHLLQYITKESETYRMIEKFLSEVKYASLPAENFLYYKLAKNLSLDDNIIENIYDFYHQDISKISDMFLNNLKTETDWMIKKFHVELLTEYTLKDAIIDKLYIAMHFCNLLKVSAMETVRCQAGEAVVKIFHHLPIEQRNDIAIELLRTLEIEGARFTKYIPNFLGQIIIYLKPMELDEIIEDVIEKIKHADTQINSLLLKTIGVFIANYPKYKEIFKENKEVYNKRLAKLLGILLNGLVHHNLQIKQVSFSVIGKDVFGADSLTLEEKHHIFQLVAKKILTLLTDAEESELLFLTNSAGLNHIYRFISDYRFLYKDIEVKTGAKVAFFPGSFDPFTLGHKEVAKAIRDLGFEVYLSVDEFSWSKRTQPSMIRKNIIHMSIADEMNVYIYPEDFPVNLANPEDLYHLRSNFYPSEVYIVVGSDVILNASAYKHAKVENSVVTFPHIVFERRSEDFQDEKVLDLEKALENIQQPVIKLNLPPQYEDISSTQIRNYIDENRDISNLIDPLSQKYIYRNNLYRREPQYKSLIQTVSIDIDVRHNFNYELINTLASSFHGNYHQAFSSIEKISQEFNAHIVLIRDVKENGKILGYSLFHWVPSDLIYQEFKDSHISQCIRENYTGRIIRIDGIFVRQDSKQNNLYQIILSETMAYCLKNDYGYGIFANKIETPTSPELLEVLKRSGFQELPFSQGSQPVLAVNMTNPCTLSFDIQTMIKEPFRSNENVKAIIASTRKRLQEALVNLYPGHLVLSLDRDLVEEALVKKICRENEVPPVPLYPRSLGPSMCVPFGNILNRAIVPNTVTKTLHTEKMFNPDMKKFTIGPFPYYLDLVKQARMIHSFKRPVILVDDLLNKGYRMKVLDPILKKENIHVKKIIVGMLSGQGKELMEIQNRSVDSPYFIPKLRLWFNEALFYPFIGGDTLWRGVYPKKNLLPSINFILPYTSLTFIKDVSDTSLYNFSLACINNALDILRVLENTYQKINERKLTLSLLGEVFLYPRSPDLGKNRCYDFNVHPSVHLEKDLELLKRLEYSFTTSYKGR >NZ_CP020559.1|WP_070967974.1|1349011_1351387_+|endonuclease-MutS2 MNEKSLRVLEYTKIIEKLVEGCTSSLGKDLVKNLKPFNQLEKIQQLQKETSEAQSILIKRGNVPLGGIHDILHLVRRTEIGSYLDPGQLLYLRDTLAVARKLKQFLKEDDRQEVEYPIIQGLIQSLNTVREIEEKIEVCVLSETEISDHASSELRNIRRMIASKNDAIRNKLNSIINSASYQKYLQDAIVTIRQDRFVVPVKQEYRSHFPGLVHDQSSSGATVFIEPMAVVELNNQLKELKIKEKKEIERILMEISAMIAERGEEIKGNQSVLQELDFIFAKGKLSLSMKAIEPVLNQEGKVIIKNGRHPLLNPSEVVPTNIWLGEEFHLLVITGPNTGGKTVTLKTVGLLSMMAQSGLHVPADYGTKLAVYDHIYADIGDEQSIEQSLSTFSSHMTNIVKILEEVTPNSLVLLDELGAGTDPTEGAALAMAVLNYLKSLRTSVIATTHYSELKQYALLKDQVENASVEFDVETLRPTYKLLIGVPGKSNAFEISKKLGLSSQLIEEAKTLLTKENIEFEDLLQNIEKNRVEAEKERNIAASLRLQAEATLDNYLEKKDKLEQQREKILKEAKKEAYKIVKEAKQEAEEVVENLRKLKAELEEKEINRKIQEAKAHMDNQLGNLSEGFEEKLFTKTSRKPPENLKAGDPVKVLSLNQVGHVIEPANENGEVFIQIGIMKMNIHVSNLESVNDKKQSKTSGLGKIVKSKATNAKSELDIRGKNLEESFVEVDKYLDDVYLAGLTEVTIIHGIGTGVLKAGIKQMLKKHKHVKSQRDGKYGEGGAGVTIVELK >NZ_CP020559.1|WP_070967977.1|1351407_1351878_+|DUF523-domain-containing-protein 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MDSNIKAEQMAEMRKSQFKQLGLDLANASDYLTDEARKFAVVKDIIHLNQYWEEINVKKTRDHVISQLQELNSPQEEAELLAKAKRNSDALVETERRSMRLVLEALGVSEKDMVFEVATFQLSEEDKNLTSEEKFEKARDIMFDEKYAEDKKLIMEPIDNFQVLMNTRLDAELQIARQFTKRAVILQIILALTSFFALGILLTIFHKQYNLPIKHYTQDLKKFSFENKDFGLMPKGTQELRMFVATFNQLYQSFQEELLKRKQAEETMKVAKEEAEKANRAKSEFLASMSHEIRTPLNAIIGYEYLLESTDLSVKQQEYISKIGISAKNLLALINDILDFSKIEAGRLTMEMISFDLYDLIQDVCQLMSIEVQQKGLKLNKEIEKEVPRYIKGDPTRLKQVLVNLLSNGIKFTEEGYLHIGVKVKKQKRDKVYLLFSIADTGIGISEEQKRYLFESFTQGDASTSRKYGGTGLGLAISRKMVEMMKGKMEVESILGEGSIFYFTAQFQVTDEIIEENKTQEKPRWMDSFMNKKILVVEDHKINRQMIKEVLSHLGFDTDTASGGGQAVEMVRNNRYDLVLMDVRMPEMDGYEATKRIRAFVDADTLPIIALTADAVEEVATAVKEAGMNHYMTKPLNPEKLRNVLRKYAKVNEIKQKEKDSVFPQPKGLISYEEVIQNLGGKKKIYQNILQQFIEEHKKDGEKVKNLLTSEGYEKARFMLHTLKGIAGNIGAMKLKETVEDMEKAIKESNLKQIESTFLLFHRCLKETMMDAEKIIQSISQEEDTNKEKAEYLEEKQKIKKLLYLLQGGEAKAKEFFTLYEEDFIVIWGLVTYQELKKFIVRYEFEKAAAYLIKKIGLEGEKNV >NZ_CP020559.1|WP_070967982.1|1355932_1356982_+|response-regulator 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020559_2 | 2530794-2532610 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP020559_2
|
27 spacers
spacers of NZ_CP020559_2
>2.1|2530824|36|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT CCCGCCTTATGGTCCTTACTGCTTCTTTTTTCTCAT >2.2|2530890|35|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GGATATGTCAAAACTGAAATAGATTTACTTATTGG >2.3|2530955|35|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT GCGATAGATGAAGTAGCACTGCTTATAATACATCT >2.4|2531020|35|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT ATGATAGAAGGTTATAATATTTATGTTCGTGATAC >2.5|2531085|37|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT AAATATGCTGTCTCAGCACAATAAGCACCTTCCATCT >2.6|2531152|36|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT TAACTTTAGATATGCTGCTATAATTTTGGCTACCTT >2.7|2531218|35|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT ATTCCTCCCTTATTTTATTGTATCGAGGGACAAGT >2.8|2531283|35|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT GATACAGATTATCAATATAGGGAAGAATTTCCTGA >2.9|2531348|38|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT GAGATCATATCTTCTGAAAGGTATCTTGAATCTGTTCT >2.10|2531416|37|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT TTAAAATCACTTCAGGTTTCACAATGTTAATAGTTCT >2.11|2531483|36|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT GCTATACCCCTTGTAAAACACTCTGCTTTTTTATCA >2.12|2531549|37|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT GATTAGCAGCTATTAACGCAAAGACCAATATACAAGC >2.13|2531616|37|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT TTTACCTTTTGCACTCTTTTTTTATTTCTTTAACCAA >2.14|2531683|36|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT AATTTTCAAACGCAAGTGAACTATAATCATGTTTAA >2.15|2531749|37|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT TGTATTTTTGCAGGCTTTGCCTGCAATATGTAACAAT >2.16|2531816|35|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT ACTATAGTCCGAAAGGGTGGTAGAGATGATCCAAA >2.17|2531881|35|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT GCAGATCTTGCAAAAGAAGATTATTCTTTTCCTGT >2.18|2531946|37|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT GAAGCCAATCAAGTATTTGTTTCACTGTTTTTGGGTT >2.19|2532013|36|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT GCCGCATGAGCATCTTCAAAATCTACAAACAATTGT >2.20|2532079|35|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT TGTGCCAGTAGAAACCGCAACGGAGATTATTAAGA >2.21|2532144|37|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT CTTCTGTTACGTTAAGTGTTCCAGCTGCTTCTATTAA >2.22|2532211|36|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT TAGGGCAACATCAGGGGCTTTGTGTGAAGCCTTATG >2.23|2532277|36|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT CCATATTCATCCCCCTTTTGAATATCTGTCTAATAA >2.24|2532343|37|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT TAGCTTTGTGAACTGAACCCTCTACAATAATATAAGG >2.25|2532410|38|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT CAACTTTTTCGTTTGATATTTTGGGTGTTGCTATTGTT >2.26|2532478|37|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT AAGACAATACAGTATTTTAGACAGCAGGGTTTTAAAA >2.27|2532545|36|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT TTTTAGAAGGGTGTTTTTTTATGCCTTTTAAAAAGG >2.28|2530955|38|NZ_CP020559|PILER-CR CGGGCGATAGATGAAGTAGCACTGCTTATAATACATCT >2.29|2531023|35|NZ_CP020559|PILER-CR ATGATAGAAGGTTATAATATTTATGTTCGTGATAC >2.30|2531088|37|NZ_CP020559|PILER-CR AAATATGCTGTCTCAGCACAATAAGCACCTTCCATCT >2.31|2531155|36|NZ_CP020559|PILER-CR TAACTTTAGATATGCTGCTATAATTTTGGCTACCTT >2.32|2531221|35|NZ_CP020559|PILER-CR ATTCCTCCCTTATTTTATTGTATCGAGGGACAAGT >2.33|2531286|35|NZ_CP020559|PILER-CR GATACAGATTATCAATATAGGGAAGAATTTCCTGA >2.34|2531351|38|NZ_CP020559|PILER-CR GAGATCATATCTTCTGAAAGGTATCTTGAATCTGTTCT >2.35|2531419|37|NZ_CP020559|PILER-CR TTAAAATCACTTCAGGTTTCACAATGTTAATAGTTCT >2.36|2531486|36|NZ_CP020559|PILER-CR GCTATACCCCTTGTAAAACACTCTGCTTTTTTATCA >2.37|2531552|37|NZ_CP020559|PILER-CR GATTAGCAGCTATTAACGCAAAGACCAATATACAAGC >2.38|2531619|37|NZ_CP020559|PILER-CR TTTACCTTTTGCACTCTTTTTTTATTTCTTTAACCAA >2.39|2531686|36|NZ_CP020559|PILER-CR AATTTTCAAACGCAAGTGAACTATAATCATGTTTAA >2.40|2531752|37|NZ_CP020559|PILER-CR TGTATTTTTGCAGGCTTTGCCTGCAATATGTAACAAT >2.41|2531819|35|NZ_CP020559|PILER-CR ACTATAGTCCGAAAGGGTGGTAGAGATGATCCAAA >2.42|2531884|35|NZ_CP020559|PILER-CR GCAGATCTTGCAAAAGAAGATTATTCTTTTCCTGT >2.43|2531949|37|NZ_CP020559|PILER-CR GAAGCCAATCAAGTATTTGTTTCACTGTTTTTGGGTT >2.44|2532016|36|NZ_CP020559|PILER-CR GCCGCATGAGCATCTTCAAAATCTACAAACAATTGT >2.45|2532082|35|NZ_CP020559|PILER-CR TGTGCCAGTAGAAACCGCAACGGAGATTATTAAGA >2.46|2532147|37|NZ_CP020559|PILER-CR CTTCTGTTACGTTAAGTGTTCCAGCTGCTTCTATTAA >2.47|2532214|36|NZ_CP020559|PILER-CR TAGGGCAACATCAGGGGCTTTGTGTGAAGCCTTATG >2.48|2532280|36|NZ_CP020559|PILER-CR CCATATTCATCCCCCTTTTGAATATCTGTCTAATAA >2.49|2532346|37|NZ_CP020559|PILER-CR TAGCTTTGTGAACTGAACCCTCTACAATAATATAAGG >2.50|2532413|38|NZ_CP020559|PILER-CR CAACTTTTTCGTTTGATATTTTGGGTGTTGCTATTGTT >2.51|2532481|37|NZ_CP020559|PILER-CR AAGACAATACAGTATTTTAGACAGCAGGGTTTTAAAA >2.52|2532548|36|NZ_CP020559|PILER-CR TTTTAGAAGGGTGTTTTTTTATGCCTTTTAAAAAGG |
cas2,cas1,cas4,cas3,cas5,cas7,cas8b2,cas6,WYL |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020559_2
The CRISPR arrays of NZ_CP020559_2 >merge|NZ_CP020559|2|2530794-2532610|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR 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GATCTTGCAAAAGAAGATTATTCTTTTCCTGTATT TACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGGAA GCCAATCAAGTATTTGTTTCACTGTTTTTGGGTTATT TACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGGCC GCATGAGCATCTTCAAAATCTACAAACAATTGTATT TACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGTGT GCCAGTAGAAACCGCAACGGAGATTATTAAGAATT TACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGCTT CTGTTACGTTAAGTGTTCCAGCTGCTTCTATTAAATT TACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGTAG GGCAACATCAGGGGCTTTGTGTGAAGCCTTATGATT TACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGCCA TATTCATCCCCCTTTTGAATATCTGTCTAATAAATT TACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGTAG CTTTGTGAACTGAACCCTCTACAATAATATAAGGATT TACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGCAA CTTTTTCGTTTGATATTTTGGGTGTTGCTATTGTTATT TACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGAAG ACAATACAGTATTTTAGACAGCAGGGTTTTAAAAATT TACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGGTTT TAGAAGGGTGTTTTTTTATGCCTTTTAAAAAGGATT TACATTCTACTGTAGTTCTATTAAAGG
>NZ_CP020559.1|WP_070971023.1|2526756_2530320_-|BREX-1-system-adenine-specific-DNA-methyltransferase-PglX MNKTAIKSFAIRARKKLIEGITQKAHGLGIMKNERKDIEILENGFKIKGVENRRIYKKYEKKQREKLISEIREKGFEQVIEEVAYTWFNRFIALRFMEVNGYLPIGVRVLSSVEEGRTEPDIIKKALNVDLDIDRNLVCKLIDANDMEDLYKYLIIKQCNQLGHIMPTVFEEIADYTELLLPEGLLSKTSVIRDLVVSIQEDDYKDQVEIIGWLYQYYSSEKKDKIFADLKKNKKIAKEDIPAATQLFTPKWIVRYMVENTLGRLWLTSHPDEGLKAQWKYYLEEAEQDSEVQKKLDELKNPNLSPEEIRVLDPAMGSGHILVYAFDVLYSIYLKANYQEKDIPQLILEKNLYGLDIDDRAGQLTVFALMMKARSKNKRIFKEKIDLNVCAIQESNEIPKEAIEYLINSKGADIVKTVSKEDVEYLLAVFQDAKEYGAILDVKKINYAVIEHRLEELKKEEILDLFQLHYTQIILEKLPSLIKQAKIMSQKYDAVIANPPYSGLRKLNDQLKKYIEDNFQACKYDLFSVFFAKNIDYTKKSGFIGLMTPNVWQYISSYRNLRELIINNYQLMSLIQLADNGFKDASVSISTFVMRKEAGKYHTTFIKLDNDFDEAEEQEKVDAIAKLFSKNTHVLNTELFKSIPDNKIAFWATEQTIRTFLKGKRLEAIAKPRQGMATSDNNKFLRLWHEVDICKIQFFSKTSEDFHLKWAPYNKGGGYRKWYGNNEFIINWQNNGEEVKEYAKKLYGSYSRTIKNEKFYFQSGITYTFIGKDVGPRFTPNGFIFDVAGSMIFIEDEKLLYILGLMASKLSKYYMDILNPTINIQVGDIKNIPVILDKEKEENIKALVSRCIRKAQKDWDSFETSWNFKQHPLLRGSAIKNDFNASKIETAFKEWEDVIHKEFYQMKAYEEELNKTFIEIYGLENELTPEVKEITMRRRGDIQSFISYAVGCMFGRYSLDEEGLIYAGGEFKIDRYKTFIPAKDNIIPIVEDDYFEDDIVNRFVTFVKITFGEKMLEENLDYIARLLSKKTNETSRQTIRRYFLEDFYSDHLKIYSKRPIYWLFDSGKENGFKALIYMHRYDVSTVDRIRTDYLHKLQKRYEDEVKNLNILIKSELPEKQKTAAMKRKEYIERQIAQCAIYDQIIAHIANQKIEIDLDDGVQVNYSKFQNVKISQGKELTLNLLARI >NZ_CP020559.1|WP_070971020.1|2525215_2526508_+|EAL-domain-containing-protein MAIAMIKNNLKQEYFNILKKQEITTYFQPIISLKDGGVLGYEALSRGPANSHFHYPDELFHYAKKVNKVWELDLLCRLKAIEKAKETISDKLLFINIDSDIIKDIKFKKGFTKEFLRHHNIDTNHIIFELTEHTAVSDYKTFNQIIENYRHQGYRIAIDDAGDGYSGLRLMTEIRPNFIKIDMALIRDIDKDMMKKELLKSFQQFSHITNIQVIAEGIETSEELKTLIEIGIPYGQGYYIQRPSEGFVAISPKLMEEIQRLNQQNKKIQRLPTTLTIGMLQRRDSPLQQDDTCDKANNIFSESYNLQGIVVLKEKKVIGLIMRHKFYYQMRKEGNQNNFLLRPLSSIMNHAPLVLDHSINIREASNIAMSREESTVYDYIIVTKGEEYSGVVPIAYLLNAFAQAGVIHEAEVSKNQNLLHLMEKPVYLDA >NZ_CP020559.1|WP_070971017.1|2524460_2525054_+|hypothetical-protein MKHLNLCIDIDGTITEAYDWIPRANDYFSRKIAPKDVKVYEIHEVLGVSRKAYDEFYTLYGEVLHEEAKIREGVKTIVNELYKQHKIHFVTAREEKMKDVTNRWFIHHQISSHSLSLLGSHNKVTKAQELACDIFIEDRYENAMQLSLAGFEVLLMDCHYNQGILPPKVTRVNNWYEISDIIEKRLHKLYPLFKIAT >NZ_CP020559.1|WP_070971014.1|2521943_2524082_-|catalase MDKKQQSHTSIQKNTKNHQLEDYRKSHGEQLLTTNQGVRVSNTDDSLKAGDRGPTLMEDFHFREKLTHFDHERIPERVVHARGFGVHGYFQVYESMAEFTKAKFLQDPSVKTPVFVRFSTVVGSRGSADTVRDVRGFATKFYTEEGNYDLVANNIPVFFIQDAIKFPDVVHAIKPEPNNEIPQASAAHDTFWDFVVNTPETAHMIMWLLSDRAIPRSFRMMEGFGVNTFRFINHQGKARFVKFHWKPLLGVHSLVWDEAQKLAGKDPDYHRRDLWDAINMGAYPEYELGVQMLEEEEEFNFDFDILDPTKIWPEEIIPVRRIGKMTLDGNVDNFFAETEQVAFHPGHVVPGIDFSNDPLLQGRLFSYLDTQLIRLGGPNFHEIPINRPVAPIHNNQRDGYHRMTIDRSSVSYSPNSLQGNAPMPASETEGGYVHYEEKVEGKKVRQRSQSFQDHYSQATLFWNSMSTAEKQHIIEAFHFEVGSVMDKQIKQRVVDMFNNVDGQLAAQIAAGVGATPPANPGNAGITASSPAVSQENTVKDAKTRKVAILLENGFNHQEVSQVMEALTAAGVHSEIISKNLGMLTSVDGQQLEVGKNYVTTGSIKYDAVYIAGGQQSINTLMMQGDALHFINEAFKHAKTIGATNEGIDLLMASAIQGVAMAGADTQAQVITEMGVITVRNVTDMKNFTKEFINGMAQHRHWIRQNKKQMIPA >NZ_CP020559.1|WP_070971011.1|2520988_2521819_+|c-type-cytochrome-biogenesis-protein-CcsB MELQNLLQLENSFFNVAISTYIISMVLYFLFFVMKHEKAGMYATFLIKIAFILHTLAIIVRGIGAERIPLTNQYEFATSFAWGISLCFIIFEHKYHFRAMGTFVTPIIFIIIGYAAMQSKDVRPLMPALQSYWLALHVATAVIGYGSFGVACGVSCMYLLKDKFKEDQFIHKHIPTLEKLDAISYRATALGFLFLTLVIVTGAIWAEQAWGRYWAWDPKETWSFITWIIYSVYLHLRLTKRWRGKKAALFSIIGFICVLFTYIGVNTLLPSIHSYA >NZ_CP020559.1|WP_070971008.1|2519681_2520971_+|cytochrome-c-biogenesis-protein-ResB MKQDSVLKESWQALHSMKFGIILLLLIGISSIAGTIIPQKNPLLFYQREYSSLVYTLITTLSLHNVYNSWWFITMTVVLSINLTLCSIIRLPILIKQMTKTPELYKELKRENYLIKKELNKEINVEKFFKKARFFKIKKLETEEGMYYWSCKNRFGILGSWLTHIGLLFILVSYMFGQIAGFETYLYGVPGIKEKIDNTPYEIQIDAFEIQFREDHSVRQYISEITVLDAATGNQLTKGELSVNHPFRMDNFSIYQNGTGWAVDMTLERDDQVIAERILYQNEIHVDDNQKIALQFVNFYPDYHVSMGRPFTISPYPNNPQLLYTVFYEGQRADMNVVAMGETVTWEEYTFTIKNPRQFTFLQITKDPGISGAKLGGFLLLLGILFAFYFQPRQLQILKRKDGKVLLWADTIKDQENYKHQIEQLLQKI >NZ_CP020559.1|WP_070971005.1|2518412_2519627_+|ammonia-forming-cytochrome-c-nitrite-reductase-subunit-c552 MKIQPRKNQWFSAVTIVALSLVAILVFQLTIDNSPEGIIYAEDWAQQYPLQYETYLKNAEMEKTTFGGSEPYDYLEKYPNLLVLYDGVGFSKEYLRARGHVYALEDVIHTARPKPGASCLSCKTPDYVAMINELGSEVHAMNFDEVAAQAISPISCYDCHQNAPGEPVITRNHLKVALEKVDMDFKQGDLACAQCHVEYYLHPESKEVILPWENGITVAGIEKTFDDMGYSDWIHPTTGTPLLKVQHPEFETYQGSLHSNIGLSCIDCHMPNMSTDNGDLFSSHHWTSPLKTIEASCMGCHSETPDALIARVETIQAEIESTTNEVSDLIVELIDELTKAVEAGEHTEEFLDLARDYHRKAQWRWDFVFVENATGFHNPQLARDTLTEARMYAEKGLELFRQEL >NZ_CP020559.1|WP_070971001.1|2517227_2517809_-|DUF2318-domain-containing-protein MSKKLPSKKEQFMQAPKSRLPLMIAACCAVLAVVVLFVVLGASKQEEEKYFGDTVAASRSYVGEFISMTPIAPIVEDGQIKIALQDVDQNNIVFFEVENNEGDLVPLMAYITPSGRIFVGSSMCEPCRGRTFSLAGDTLVCDTCRTTYNIENHEFISGSSACGSYPPVNMNPEIQDEIIMIDLEEVLNWRVRG >NZ_CP020559.1|WP_070970998.1|2516881_2517193_-|hypothetical-protein MDRYKQDGKKLSDVGKYIQTGLVVLIILIGMKFVFARSADVFGPRDGRLSQIALEYYVENYGDDGQEVRAVVRNFGCHQEIHIYKDGELVMKVTYANGQVYEL >NZ_CP020559.1|WP_070973371.1|2515647_2516841_-|ABC-transporter-permease MNIFQIALNNLKRRKIKMLFLMLGLVVGVATVVGILNIIEAMHVDLGDRIDEFGANAILLPRSEEIHYGNTVISDLAFDVQKLTMEDVPKIYSSSVAEYINIVSPKLVGAVEIGDQKALMVGVETRQEFTQKPWFSLQQQMGIGPGEKVGDLALMDIPEDGLIVGSSAAEALGVKTGDLLMINEQTFKVFGLLNKLGSEEDGLVYGNLAVVQDLLNRPQELSMIEISAYCNSCPIEEIAMGLEDALPNSRAIPMRQAALFREETIQQFSVFGFALAGTVLLVAALVVFITMLSSVNERKREIGIFRAIGFRRIHIMQVIFLEAGIVSFLGGLTGYFLGSFIAIYAGPYLVQIQGGFSLQLQLLLPAVVLSVGLALLSSVYPALKAVKLDPAEALRFI >NZ_CP020559.1|WP_070971026.1|2532795_2533074_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MYVVLMYDIMMDKDGAKVQRNTFKICKRYLTHIQKSVFEGNLTELNLMKLKKELGQYIRDHKDSLVIFKSRDEKWLAKEFLGLKDDKTSNFF >NZ_CP020559.1|WP_070971029.1|2533078_2534071_-|type-I-B-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGETFYIFKDGDLKRKDNNIIITTLEGEKKNLKAEVTEEIYLFGEVQMNTKLLNFLSQQKITMHIFNYYGFYSGSFYPRESNISGYLLVNQVKKYDDQEERVRIAKEILKSASYNIYRNLRYYNRRGIDLDNPVKEIESLMNKLDFGTDIHQLMGIEGNIRKIYYATWNSIIKQDICFEKRVKRPPDNMINSLISFVNSLIYTTVLSEIYKTQLNPTISFLHEPGSKRFSLSLDISEIFKPLIGERMIFSLLNKNQITEEDFEKESNFLYLKESGKKKILLEYDRRLKQTISHRDLGRQVSYRYLIRLECYKLIKDIIEEKKYSGFKIWW >NZ_CP020559.1|WP_070971032.1|2534080_2534572_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MKKVTGVMIYYYFICDRKLWFFMNDLNMEQGSDLVSMGKLIDETSYKREKKNILIDENINIDFLKDWKVIHEVKKSRKIEEASKWQLKYYIWLLKQKGVDIEKGILDYPLLRKREDVFLDKQDEEELQKVLEEIDKIRSSKLPPAINKKAICKNCAYYELCYI >NZ_CP020559.1|WP_070971035.1|2534602_2536834_-|CRISPR-associated-helicase/endonuclease-Cas3 MNRYLAKSNPQETIQQHTDHLLKNYNILKSIYPNLEINWDILYLACLYHDLGKMNIKFQQKIESQEKIEGEIPHGILSLAFINAKALKDRGFNDDEIKILAHAVAYHHEREFNFDNHQLKEEIKLIEKEAENFMYEKIKDIQVKKLGAKYFAKDRIYQKDNEKMFFNYILVKGLLNRIDYAASGDIDVEKPNDFLMKSLSNLMEEWQEKDIHATWNDLQKHMLSHKEDNIIAIAETGMGKTEAGLQWIGDQKGFFTLPLKTAINAMYDRVAGKIIKEGYEDKVGLLHSDTYSEYLNKDLEEVDIDEYYNKTKQLSLPLTICTLDQVFDFVYRYRGFESKLATLAYSKTVIDEVQMYSSDLLAYLIIGLSYITKIGGKFAILTATLPNLVIDLLKEEGIDFIPPKTFTNNDRVRHSVKIIREQMNTDYIINLYNKNKVLVICNTVKEAQRVYKNLKIQHKVECVNLFHSNFIKKDRKEKEHNILSIGNKDSSEYGIWVTTQVVEASLDIDFDILITELSDLNGLFQRMGRCYRSRQFNESGYNCYVFDGGDKECSGVGYVIDKDIFQLSKEALRNIDGQLKEEDKMKLVSNLYTTENLKNTKYYKLIKANIDYVKSIEDHEKCKNEVKKIFRNINSMTVIPKEVYNKNLEVISSYIDILSKEYDKAMSKKERGELKGKKVIARSKLMDFTLSVPYHKTKENLIKSIKLNRYETIPILNCKYSSRIGVEYIEKDRFKEDSIDYFI >NZ_CP020559.1|WP_070971038.1|2536856_2537612_-|type-I-B-CRISPR-associated-protein-Cas5 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MGEKIRLEMSDWLYNAGLVGLYNVLKHSGDKVDYAEQYMELDLSLLENFEEKYFKYFINKYQAYLSYFKIVSYESTIKYHEDKNFETFEEEDLEVLNNYIKNVVKYYLNSNSYRAAYELINDEVDILELAKELQIIKIRKKESIKDKDSEIKNMFQQLKVIISYCNKDNYRKYLAGKNVIYTIIKHSWDGVCFLNPQTKEKDIYLDYKNYFIEPVKEYIDKKATNEKFNCFTCGRNIKDLKNDLSFLNNIGFDVSRKSSHTWNFSNDIAVCPICKLVLSCTPAGITYVYDKGIYINDNNSFQEAVNINNKVKSEILQEHKADKLLTYRALVNSIQDQFQDKVKYELADIQVVRYEEGQYRFNILSKKALCIIRQSQNDLNNIIHSGFKEINTYFNIYELVINRILNNHNLFTLIQKLLVYKLSNPKDCRFNTSQLVSILNINFRCLEGMDYMKNTDKDIIKNANISGYYLREQYKEKGAQDKLNGISYRLLNALKTNNKDMFMDTLLNCYLYSQKTVPSIFLEALKDDEKYKTIGYAFVTGLIEGKESTKKNGGDE >NZ_CP020559.1|WP_070971045.1|2540165_2540894_-|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas6 MRFGVEILLENEMIPKDKNRIILSLLKSCFSSYNEDYYKALYMEEQNKKKDFTFSLYLGNCKFLREEILVPSKKILLNFSSYHHEDGIMFFNSILHNKGKSYPITNNTITLQKINLIREKLVHSYEVTYRPLSPIVVREHSGNNKKTWYHSLSNQEGQAIFIENLKYQIKDALGEKGLLDFEDVKIEIAQTNKEVKVKNYGIEVLSNITNIKMKGQPYILDYLYKAGIGSKRSSGFGMVDIV >NZ_CP020559.1|WP_070971047.1|2540994_2541942_-|transcriptional-regulator MSKISNALNMYFLLQVKDIVKVEEIAEKLEVTPRMVKKYKQDLEMAGIYIGSKLGRDGGYYLENKRSLEGIHLAMEELSTLKMATEAIKSGKYHYSSKFEIMASKILSIHEPTDNIYYHNKVLRKSDETLAKEKIVWIDINLAVNRNKKVKITYKSLKKKGLEIKERLVNPYGIFDYKGATYFFGYCESAKGIRFFKLSRIITYEILKEKFNEKIPFDFEEVLEKSFGIYNDELIELKLKIYYPMSEIVKEKQIAKNQRITVMDENTIYFQAKIKGYTEIKTWIMSMGSSVEVLEPLKLKEDVFEEINKIASLYK >NZ_CP020559.1|WP_070971050.1|2542121_2542742_-|cyclase-family-protein MEIYDVSMDIHQNMMVYKNKEENKPEITVKTDHSNSRTYESSIRMGMHTGTHIDAPLHMLKDGQTMENYSIENFVKKCKVLDLTYVENKITKNILQEKNIEKGDFLLFKTKNSFTEVFDFEFIYLEESGAKHLEEIGIAGVGIDSLGIEREQPQYETHRTLLGKNIMIIEGLQLKEIEEGEYTLIALPLKIKNVEASPARVILIKE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020559_3 | 3005799-3005891 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP020559_3
|
1 spacers
spacers of NZ_CP020559_3
>3.1|3005831|29|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder TTTCACTAATAACGTGATCATCAACGCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020559_3
The CRISPR arrays of NZ_CP020559_3 >merge|NZ_CP020559|3|3005799-3005891|CRISPRCasFinder AAACACATTATCATTTCCTCCTTTCTTGCGTGTTTCACTAATAACGTGATCATCAACGCTTAAACACATTATCACTTCCTCCTTTCTTGCGTG >NZ_CP020559|3|3|3005799-3005891|CRISPRCasFinder AAACACATTATCATTTCCTCCTTTCTTGCGTG TTTCACTAATAACGTGATCATCAACGCTT AAACACATTATCACTTCCTCCTTTCTTGCGTG
>NZ_CP020559.1|WP_070972164.1|3004371_3005487_-|FAD-dependent-oxidoreductase MIKKEVVVIGGGPAGLAAAIEAAKRGVQVLVIDANAEAGGQLIKQIHKFFGSSAHRAGIRGMDIGSQLLQEAKDYGVEIWLNSVVIGLSKEKTMAVETGTDDIDKKVKLIEAEKIVIATGGSENVVRFKGWTLPGVMGAGAAQTMINSNRVKPGKKVVMIGSGNVGLIVSYQLLQGGVDVVALVEAAPNIGGYAVHASKITRAGVPIYTRHTILEAKGKDRVTEAVICEVDDKWQPIEGTEKVVKVDTIAIAAGLKPLAELAIMHDCQTKFDTVLGGWIPLHNTNMESTYPGIYVVGDITGIEEANTALEEGRLAGVAIAEALGKIEPIEAEKLKGEIWERLDGLRSGPDGEVRMKAKSRQMESFKELVNV >NZ_CP020559.1|WP_070972161.1|3003847_3004342_-|4Fe-4S-binding-protein MSLEQNGFLTIEELKAKGHYPSEKRFSEGLIAIIECIHEIPCNPCENSCKFGAINIGEPITNLPRLVEEKCIGCGVCVANCSGLAIFIVNKNYSDTEGTVSFPYEYYPLPEKGQVVEAVNRRGQILCKGTVIKIQNPESYDRTPVVTVAVPMDKVEEVRSIKRL >NZ_CP020559.1|WP_070973430.1|3003489_3003750_-|(2Fe-2S)-binding-protein MLVCRCEEVTVGEIKEAIRQGACDITGIKRRTRAGMGLCQGRTCEKLVQQILRQELGSSPEEISASTPRPPVRPVAFGALGGGGVK >NZ_CP020559.1|WP_070972158.1|3002299_3003493_-|FAD-binding-oxidoreductase MNSFDVVVIGAGAIGSSIAYHLTKKGYDVALVERGDIANGTSSRCDAVALICDKKPGIDTKMGYESIQVFKELAKTFSYDFEFKQPGSLYVCETEQELEVAKEYVAQQQADGYDMRMVDNYEMQEMEPYLAKDLLGGIWTTPDSSMSPYKLCYAFVEEGKKLGLKVFHHHTVMDIKLDEKGAVENVVTDKGEFKTKRVVNCGGAWASELGNMVGIDIPITPRKGIVLISEKSFKVVNQKVHEFGYMLSKFEDINFKRNVSKLVERHNVAFNIEPTRDNNFLLGGNRENKGFDISTELEVMMAVAERGMRFFPILKEINCIRAYSGVRPYCADHLPIVSEVDEVPGYYIAAGHEGDGISLSGITGRMMTQIISGEKTDFDIEKLKFSRYKNKKVVFAD >NZ_CP020559.1|WP_070972155.1|3001367_3002270_-|4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate-synthase MINAPKGIIVPLITPFNDDETIDFQAYKKVIDFQIESGVHGLLVGGTTGEYHVMSLEERKSLIKAGCEYAAGRVPVMAGVGCFTAKETIELANYAAECGAKWGLVLPPYYHHTSEDGILEFFKEIAAKSKVGIVIYNYPEATNVCLSPEMIYELSQEENIVSVKESADFGHLCKVLTLTRDIDNFSVFTGEEHFMLPTFSIGGQGAFGILVNLLPKEVVKLYELAVEEKDIKAARDLNSKLSGFYDLMEAEGNPYPGPVKAGVDMIGLKGGKVRKPLTQTTAELKSKLKEQLIKLGYEVK >NZ_CP020559.1|WP_070972152.1|3000303_3001230_-|sulfite-exporter-TauE/SafE-family-protein MTPVKIILGILILLSSRFLVIFIKDYVRFYREGKLEKVNIIFTSILAFIVNFLDALGIGSYASSTAVFKFTGMVKDKQIPGTLNVATMMPVLFQALIFITIIQVDIFTMITIIVCTMIGSYIGASIVSKLPERKIQIGMGFGLFAVAITMVLQILNIMPPGGNVTYLSGIKLGIAWVGAFILGITNCIGIGVYAPMMALLLSLGMSPIVIFPIMMGSCAFFQTICGTKFVQEGQYNRQVSMIYSTVGVVGVLVAAYIVKTLPVEILKKLVVAVVIYTSANMFRSAFKSPKHEIEEIENVEPETTHVSR >NZ_CP020559.1|WP_070972149.1|2999142_3000270_-|hypothetical-protein MSFPEAKILKVNLTNREIETIILDSDTYRLYPGGSALGVYLLLSNMTSQVEPLYGGPEYETCSTFGSYCGINDLTTISLANQMCNMYGLDTISCGATIAFAMECYEKGLLSTEDVDGIELRFGNKDVIPMIIEKIVYRQGIGELLSKGSKKAAEVIGKDAIKLSMTVKGQELPAHMPQFKPSLGLVYAVNPFGADHQSSEHDTWLVIPKDSFVRERLSKMGIWKGYEDSFSLDDEKVRFAFDTQCFYSMLDTLCLCQFAWGPSWQLYGPSEFIELCMAGIGWETSILELMRIGERRINMMRYFNKMEGFTKEDDVLPERIFEPFNDGPSKDICLNKIEFEKAKELYYEYAGWDKETGNPTDATLRKLSLGWLLNT >NZ_CP020559.1|WP_070972146.1|2998922_2999120_-|sulfur-carrier-protein-ThiS MEVTLNKDKVSIAENTTILELLHEKGYNDMIAIFINGKQLLQKEYENHVLKENDIIKVIRILGGG >NZ_CP020559.1|WP_070972143.1|2998013_2998805_-|aspartate/glutamate-racemase-family-protein MDKRLNGRQYGYLTSNNDSRFVRAINHQQVAGYSVGIVYIENVNYPMMPGNVVNAYTYDFPVRMRAVPNLTNERLFAADPTIANDIIATAKHMVEKEGVRAICSACGFFGNFHRRVAEALDVPVALSSLVQLPWIKSIIKPGQKVGILTANASAITPELFKNCCVEDFRNIVIKDMMHSENFSAVVDMRGYFDNGKAREEVVQAALELLEGDDDIGAILLECSDMPPYAAAIQEATQLPVFDFITLIKWLHNGTTQRPYSGWI >NZ_CP020559.1|WP_070972140.1|2997366_2997948_-|flavin-reductase-family-protein MKTSIGAKNIIFPTPVFIVGTYGEEGKPNAMNVAWAGICGSSPPSIGIAIREQRCTYKNIMNRKAFTINIPSEIYIKEADYFDLVSGNKTDKFSDTGLTPIQSDKVDASYIEEFPFNAECELIETLQIGEHTLFVGQIIDIKVDADCIDKNDLPDIEKIKPLLFDPAAIRYNTVGKIAGKAFSIGKRILSHDN >NZ_CP020559.1|WP_070972170.1|3006178_3007882_-|sigma-54-interacting-transcriptional-regulator MLEALEKELCIDVKEKRCKKIMEFFELAKAVQLPVVDDRKVVGILDLFVFLNNMNKNTNIVELMEKDIIVAGDSRSVFSFKNSKQHILPFVDENGNYLGFINRLFQKCYLPSKEYMQILEKEIGDAIDCDTKEVDYDKLDRTFDAIFELNYDGIYITVNKGKTLSINNKCIYTKGLMTDDNTVIDKKVNIIQNVQNRNEVSMSSHIISDGGIIRVINNIENFQKLKNELAEAQKLAEKYHNELEFLRWKQSQPEEIIAKSYEMKKIINLAIRIAKVDSTVFIHGQSGVGKGVLSKLIHNNSHRKDGPFIKIDCGSIPEQLLESELFGYEPGSFTGAEKGGKIGLVELANGGTLFLDEIGELPLNLQTKLLSVIQDREIFRVGGIKPIHVDIRIIAATNRDLKKMVENKKFREDLYYRLNVVPIKIPPLQERKEDIKPLIEKCLQNFNKKYKLNKQIEPKALRKLIDYNWPGNIRELNNIIEYLIVTTNSETITKEDLSEIIVDNKSQEVLSVNSILPLKEAVSLVEKKLLIETMQKSKSTEEMAQLLKIDRSTIIRKLQKYNIKTHF >NZ_CP020559.1|WP_070972173.1|3008510_3009581_-|sulfite-oxidase MKSDISYLYKPYLHTRELMPENQETPIHFLNERTTPIEYIYKRNHFLYPALDSAAFFLPVVGEVERPMVFPYNYIKSLPSKTIKMVLECAGNKRAYFDPKTYGEQWKDGAISQVAWKGVSLKDLLYFTGIRSTAIEVAFEGYDYGTRKDIDRVFPYARSLPLEKALHPDTIIAYELNSQPIPYDHGYPLRLVVPQWYGMASVKWLKEIRVIDHKFTGPFQAIDYVYYPNKEDDFGKKPVTEIKVNSIIQQPMNYSVLDTGSHSINGIAWSGHGTIKEVELSFDQGLTWKNVELYQDKNQQHLWTFWKYAWTVEEKGEHTIMCRAKDSYGNIQPLEAEWNRKGYGYNAVYIIKVKIE >NZ_CP020559.1|WP_070972175.1|3009954_3011349_-|peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MKNINIKNLFNCEVTGNIIILIVSILLVYLLIALYFTNHFFFNTVINGVDVSLKAHDDLEDIMRSYIQDYKLQLIERSKEAEEITAQDIGMQYNGKNSISEIYYLQSSFKWISSLLRNQKHYVDDLFIYSKDNLQNRINELNCLNKDLIEPQNVSFKYSNGSYEIIEEVYGNKINKDKLRETIEISILKGETKLDLNENLCYENPRYTLSSGKTFKIRNLLNKYVSTKITYIIGSENEILDGDIINQWLSVDEDLEVVINEKGVLEYVRRLSKKYDTVGAARKFKTSTNKVVEVKGGFYGWKINRAAEVRALLESIKLGEVIKKEPIYTQKALSRGNDDIGDTYVEINITWQHLWFYKDGKLITHGAIVTGNPNRGNATKVGVYMLNYKEKESTLSGANYEVQVTYWMPFNGDIGIHDASWRYSFGGEIYKRNGSHGCVNTPLYLAKIIFDNIEKGTPIICYEE >NZ_CP020559.1|WP_070972178.1|3011680_3012562_+|LysM-peptidoglycan-binding-domain-containing-protein MIYIVRPGDSLYLIARRFGVTVQTLLDSNVICNPNLIYPGQVLVIPQASLEIPKAGGTPYYVILPGDTLFCLARQFNTSTQILAQANRIPDPNLIFAGSELLIAYDIPDPRELQILWEQTALNCDILTSLQIYGIYYLGTFQWEAIGQKAIPYLGILAVNPCSIVRYYAIISLGRIALNGESRRILTNALQDPDPIVVQLTRLALSRLDYVRTNRRIHVTISDTQLYSQPFLDTPYITLPPGTAIIVERWYIPSPIGEDFPPAGLAVWDYVRVIATGQTGFLLRVGYNQTLLI >NZ_CP020559.1|WP_070972181.1|3013111_3014908_-|VWA-domain-containing-protein MKWIYGEYDLENRLTNLMWTICGDYDQELDELEKFTKTSKDLAVYYAAKAGARRKYIDWNMIKKYLKHRIQKGADQDLIVPLVEMCADVMVEEKLIKERPGIEDIRKKGLDDLLERYFKIKLNTFMEKVKYALVLEQMGKHASFDLKVKKLLSDIKKCKDVEDTLALLENIDALYLTHFKEMLENQTFLYEMEEENELKEAYKEEESTKEQSFTSFMYEELYEEDTVISEVVDGMQSSLLIESIGDLKQEVPTNPNENRVLSIDQEMVEKIYKKIEHYHGKSCITKEEQKKIEKKVCRNVHEGCRVHFTEGVLRSPCDNAFQIKYVTRQKEKNLSDFRDNIKVHKRNIMKLKEVIIKTLTAEQEKTIVPSDNGVLAVNKLWRVGRSEKPKVFTKVIDNQKGGYVVDILLDASGSQIARQGKVASQGYIISEALTLAGIPNRVMSFCNFLDYTILRRFRDYTSPQSENQNIFEYFSAGNNRDGLAIQAVSQGLLNRSEENKILIVLSDGKPNDVKISKDNIRTIRGEAFYKGMTAIKDTALEVRKARKNGILLFGVFTGKEEELQAEKLIYGKDFVYTRNIEKFSDIVGTYLKRIIENY >NZ_CP020559.1|WP_070972183.1|3014921_3015845_-|MoxR-family-ATPase MNIFDFLRKQEIEEKLIQDVLYFRKYYQIDEAVKDRIPDPRNFFYGKEIWSMCIAAILEGENILLSGPKATGKNVLSDNLCAIFARPQWNVSFHVNTDSSSLIGTDTFIDNEVRLRRGAVYECATYGGFGVFDEINMAKNDAIVVLHSALDYRKIIDVPGYEKIKLHEATRFIGTMNYEYAGTKELNEALVSRFMVIDIPQIEEEKLMTILKLEFKDAHEDKLNQFAGIFLDLQTKAQNSEISTKAVDLRGIIASIKTVKRGLRPRLAINMGVTGKTFDQFEKEIVEDVIRTRIPEKWEAKDIFPSS >NZ_CP020559.1|WP_070972185.1|3016221_3016512_-|hypothetical-protein MDTGIENSVDFITINEKQLEKMADKVYYSYSWAFDQLDQLLSSELWDIPVCIHFKTTIAKKPHFMRLFCMCRFCWVRVASTVIIFGFKSVLVPLCR >NZ_CP020559.1|WP_070972188.1|3016561_3017251_-|radical-SAM-protein MSGFTYKDIYIEDGGRVLEVNILPEKYCNFDCIFCPIGKSQNKVDVQRSFDGYESSLAELDRMIESTKAELVFINSKGEALVNDKIGDIIDFIKGKGLHVRLFSNGYLLGRDEYIRIANKCDEVVGEIKVIKEEDFRKIQRPIEGYTLKEYISNMASFSKQYNGVFIFEITIIKGYNDDEESIQKIKNIIKEISLDKVIIARLEDEVFKKKLGIADERFEEILNELLSL >NZ_CP020559.1|WP_070972190.1|3017269_3017977_-|B3/4-domain-containing-protein MKKFIIEDDFWTLFPKAKIGVVTFHSIDNSIKDKEKYKEMICTSEKEALKYLTNEEFSSNEVIKVWRDAFQKFKTKKGARSSIEALLKRVHKRDPIGTINPLVDIYNSISLKYALPCGGEDIDTFVGNIRLTKAVGGEDFITLGSDESAPPYEGEIIYKDNEGAICRCWNWRESVRTMLTENTKNAFLCIELIDERRLKELEMALNDLAKSVKDHIGGTYKITILDINNKQVSIG >NZ_CP020559.1|WP_070972193.1|3018042_3019371_-|polysaccharide-biosynthesis-C-terminal-domain-containing-protein MKKLRLDFLKYTSLNVLAMVGVSLYILADTYFISKALGAIGLAALNFCIVIFTLIQGVGLMIGIGGAIDFSIGDSERSNLGNKSFVNALFIGSLFSVIFILLGVFFSTQISLFLGADELILSPTKTYLTTILGFSPFFILNNIGLAFVRNDKNPRLTMTAMIVSSFSNIILDYVFMFPLSMGIFGAAFATGLSPIISLCILTFHFRRNSIGFHLCKCRIEIKRLIRIITLGLPSFVTELASSITLFTFNIVILRIAGNVGVAAYSAIANVATIATALFTGLAQGIQPLAGNYFANSDKGGLRTILKYSLITSFFLSITIYFIILVFSDNIILIFNSENNEALARIAGVGLKIYFTGFIFAGINIVIISFLSAISNTVNAMVISILRSSIILIPTILFMSFFFKAYGIWASFMVAELLVTIFTYLTHIYRSRENIQLDTYTGG |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020559_4 | 3611877-3611939 | Unclear |
NA
Consensus repeat of NZ_CP020559_4
|
1 spacers
spacers of NZ_CP020559_4
>4.1|3611901|15|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder TATCTGTGCATGACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020559_4
The CRISPR arrays of NZ_CP020559_4 >merge|NZ_CP020559|4|3611877-3611939|CRISPRCasFinder ATCAAAACGTCCCCTTGGCTTATGTATCTGTGCATGACAATCAAAACGTCCCCTTGGCTTTAT >NZ_CP020559|4|4|3611877-3611939|CRISPRCasFinder ATCAAAACGTCCCCTTGGCTTATG TATCTGTGCATGACA ATCAAAACGTCCCCTTGGCTTTAT
>NZ_CP020559.1|WP_070963504.1|3611405_3611831_-|transposase MARTARKKTEFTVYGYCLMTNHVHILLKAESEEIGNVVRRITVGYAQYHNIKNGRSGHLFQNRFKSERVNTDDYFLIVLRYIHQNPIKAGVIERIEDYKWSNTLPIMKVRSRRTIIIAFFILYTSLQSIIFKSFKNITLRY >NZ_CP020559.1|WP_070963502.1|3610646_3611456_+|polysaccharide-deacetylase MRRYLKSSITITLLTIVFTGLLSFEAILPYQTEAIVDAEDFSEKPGSDLAENDLVEDGILTEEEPIVVDEDAKIVYLTFDDGPSPNVTSRILDILNEYDIRATFFVIGNLAERYPDILLRISQEEHLIGNHTYTHNYHHIYSNPQNFIDELKHTDSVLASILGEDYTPKFVRFPGGSFGKKLQPFRQAIEEAGYINIDWNVLSGDAEANRISPQKQLSRLQETLQNKKQAIVLMHDSNTKDTTVEALPSIIDYLISQSYVFKTLEDYGL >NZ_CP020559.1|WP_070963500.1|3609739_3610447_-|response-regulator-transcription-factor MEKNKKKVLVVEDEASIRKFLAINLNRSGFQVLECESAEEALDLIEEHDPAVAVLDIMLPGMDGFELCQRLREFMPEIIIIMLTAKGQDMDKIMGLELGADDYMVKPFNPLELVARIHANLRKTGIGRKSNNKFIQFQDLRLDLEGQRFYKQNQEIELTPTEFSIIKVLIGKPNKAFSRDEILNKVWGENYFGDMKTVDVHIRRIREKIENNPSEPQWIETVWGLGYRLRGNEKQ >NZ_CP020559.1|WP_081562161.1|3608351_3609743_-|HAMP-domain-containing-histidine-kinase MKSIKKRLVFNFVFIIIITVVILEIFLISSIRQYYYKNLDSTLLNQIQISANLYEKYFSDASLQENVLNNVDTFWKQTSAQVEIIDMDGKVLMDSIGIISKTTKEMEDVKRAMEGEVGKWIGSVDYDTEKVMAISYPLHSGGQLVGVLRFIASLREINKDIRKIAYVFIAFGGLVILITGFVSIFLANTITGPLEEVTFVAEKMAMGDYHIENKKKTDDEIGKLSDTLNYMAKEIIKKEQIKNDFISSVSHELRTPLTSIKGWAITLKQDYEDKQILSDGLEIIEKESDRLTLMVEELLDFSKFISGKITLNVKPVHLPEVLEHIKKQLMPRAVREQISFEVTYPDELPLIYFDENRLKQVLINLLDNAFKFTPSNGKISLLTKLEANNIIIIISDTGLGIPPQELPKIKEKFYKGKSSKSQNGIGLSISDEIIKMMGGRLDIESQLDEGTYITITLPIQEVV >NZ_CP020559.1|WP_070963498.1|3606845_3608351_-|hypothetical-protein MKYIKLICILVVIIFSSIACTSITNDPSLQVVPPKNIDILIQGTWEVAAVLHQSSANEEEWIGKTIMFSNEYAMIGDYLITDVGYQVKRVIAEEYLLYHYKAFPEGFVFSGEEIEVIMATDQGVFFCEVLKEENAELILKIYNDSFLLKKVSNEVNEELLKQLKEENFWRERVKSFPQDELLRTGVLVGLRQTTEGNESNIQAQSYRTLWIASENKKLHPVLETKDIFFPRRNGFWKMEVKEILEGNKHEDALVAYNILTKGKNQIEEVNQQLSNLGQEEKAIYRTINYISNDYVSIGEKSFRIHEGEKIVEKEGLHILVIDSLPNIKRVNILDLLGAAGIESIENGRMKVLGGKKHNSLLQRIEENENYGLERRLGHWFLKGRVGYFEDNKLIVEDYNINLIPPAELVFYDELAIPWTTVKDKIPTAIDLYTSPNKDIALVVTKNEIIVFGIEEQRLQQEPLGKIPLKKGETVVMAEWATGYYVENWEKALGNYINDSTK >NZ_CP020559.1|WP_070963497.1|3606503_3606776_+|hypothetical-protein MSEEEYRKAIIANATNKFTGKGRVTFAEFKDASNNVIGHYSQNNGWTMVMSKAEMKQRLPVHPEAHSAYLFDLNQRRERDGRKQLLRSIY >NZ_CP020559.1|WP_070963495.1|3603109_3605725_-|phosphoenolpyruvate-synthase MSSYMLGFQDIDKTKLMVVGGKGANLGELSKIEEIRVPDGFCISTEAFKRIIGETSSINELLDQLALLKVEDRGKIGELSGEIRRIIEGIAIPEDINEDITRLLSRLGEKNAYAVRSSATAEDLPTASFAGQQDTYLNIIGKKAILKHISKCWASLFTERAVTYRLQKSFDHRKVHLSVIVQKMVSPQAAGILFTADPVTSNRKVLSIDASFGLGEAVVSGLVNADIYKVRNGKVINKKISTKKLAIYALKNGGTEEQEIEPEQQNRQVLTDEQILQLGRIGRKIEEHFGCPQDIEWCLVDDTFYIVQSRPITTLYPIPEANDQENHVYVSVGHQQMMTDPMKPLGMSIFQLTSFGPRFKAGGRLFVDVTHTLASPDNREILLDTMGQHDPLIKDALMTIMERRDFIKSLPNDKKEQSLSKSNKGMSSAGFQEQIEKDPTIVSDLMKRSQTSIEALKQNIQTKSGSDLFDFILEDVQQLKKILFDPQSSGVIKAATDASSWINEKMKKWLGEKNVADTLSQSVPNNITSEMGLELLDVADVIRPYPEVIDYLQHVKDDNFLDELVKFDGGQETQEAILSYLNKYGMRCVGEIDITKTRWSEKPATLAPMLLSNIKNFEPNASNQKFEQGRRVALKKEQELLDRLKQLPDGEQKAKQTKRMIDLIRNFSGFREYPKYGMVNRYFVYKQALLKEAEHLVQANVIHEKEDIHYLTFEELHEAVRTNKLDYQIISKRKDEYKLYEKLTPPRVITSDGEIIAGEYNRENLPTEAIVGLPVSSGVIEGRARVILNMEDADLEDGDILVTSFTDPSWTPLFVSIKGLVTEVGGLMTHGAVIAREYGLPAVVGVDNATKLIKDGEWIRVHGTEGYVEIL >NZ_CP020559.1|WP_081562160.1|3602033_3602423_-|EcsC-family-protein MQEKIPDKLKLTLENAFSKGFQLVFEKGEVYIEKTYKKDRIKLEYDLNNCAIDKDLSKKYIKRLDKQANYAKMLNTSFTVLEGGVLGFLGIGLPDIPLFIAVIMRTIYEVALSYSMIIKVMKKRNTFSL >NZ_CP020559.1|WP_070963491.1|3601785_3602037_-|EcsC-family-protein MICGAMSQGEKQKKFNEQINRLGNRMDQQMETEIDLKAQMAETAEVLAEAMLVGKFVQGIPVVGAIGGVVNYTIIKKQGNILV >NZ_CP020559.1|WP_070963489.1|3600681_3601620_-|hypothetical-protein MKSLIKKIFFVVFCFFILILFVGCTITDVTNEALETTDIYNKSLDAVKAANSYDYEIASKEFIQMVLPPNPSEGGILDEESNSIEKSETETLIRGKLIQKPLSLEMIMKMNVLDQQDALESPATDLDSNSIELKIYMLEGKQYSYFSSWGAWAVQDLREIDIDWENLESINKRSNPMYFLNLLENDLAREAVLETDEQHYILSLQNDEDEFIRRIMEDILGYDTAIYEDIDAALDDIQLSEPNYKIWIDKETYLPTKSYFKYKLTTDIGEYTDIRVHESELSYRNFGAIDKIEIPDEAKNAINMEELLKDNI >NZ_CP020559.1|WP_081562163.1|3611964_3612189_+|LCP-family-protein MILSIDTVHQRLKLSSIMRDTYVEVEDRGKMKINEAYAYKGNLPTGANNFSAKPLFITNTGGNNNNKSFLHISN >NZ_CP020559.1|WP_070963506.1|3612206_3613583_+|aspartate-ammonia-lyase MDTLNQYRMENDALGNIMIPSSAYYGPQTQRAVENFPISGIRLPRSFIRTQGIIKASAASANMQLGMLSPEIGKAIIQASEEVIEGKWDMHFVVDVYQAGAGTSQNMNANEVIAKRASEIIGHAQQVHPNDDVNMSQSTNDTFPSALNIATVEAIVQNLLPALLGLYQELQKKADQFMPVLKAGRTHLHDGVPIRLGQEFSGFAATIHAVYLQLEKQLDGLYEIGLGGNAIGTRINLQPEYIPKVIQEVCNRTKLPFRKPANIFAFMQNMNEPIRCMLTLKELAIHLIKITSDLRLLSSGPRTGLAEITLPPVQPGSTIMPGKVNPAILEMTHMVCCQIIGYETAIATAGMASQLEINVMMPVIAHTLLHSIDLLANTIQILITKCISGIQADEEVCKKWMQESLSLITGLSPKLGYDMASQIGLKADEENKTIQQVLQEKGLLTAEISNAIDPNGMV >NZ_CP020559.1|WP_070963508.1|3613812_3614547_+|VCBS-repeat-containing-protein MLYSPYYSLDQRTLMIVSSAWGDVNGDGIPDHVYLAGVTTTDSPFIQKITLVIQDGRTGMFQYIPLTSNAGYNPTLFLGDFTGDGIKDIMISIASGGSGGMMYYYIYSYVGNIPKLLFDYDVFNEAYQYQVVYKDDYKVDVINTTTGIKYVIDITYKGQDYLNEIYDADGKLKAPLEGFVNPLSGLYPIDFDANGVYELLAYQRISGRFAADALGYLQTTLKWNSRNFVLMNQYVAILGSETLL >NZ_CP020559.1|WP_070963510.1|3615190_3616420_-|MFS-transporter MKNKNFIIVVIGQIISLLGNAILRFCMSLYILDLTGSAAVFSRILAISTIPYILFAPIAGLLADTINRKKIMLYLDFFSSILMGVYSMILISGRDSTMIVGGVMFILSIIYTLYSPAVTACIPQIVDKEKLASANGIIQQVAAIVNLVGPIIAGILYSFVDIKTIVILNAASFLIAAILEVFLKVPDLELKEKVINPILESLKEMKKSFIYLKEKKKIVLGIIASYGLTNVFVVPILTIVSPYFIKVKLNMSSATYGFVEAIFVLGMIIGGLLVTFRPKLFKMKRIYRTMYPMVIATIMMGIATYLTTENKLGILALYSMGGLAIMLSLALSNVISLTYIQKEVKEEMLGKVSAFSTAVATASVAPGQLIYGHLIDIRLNLYSIMALTFILSIGVVRFIEWNVKELNMD >NZ_CP020559.1|WP_070963513.1|3616409_3617210_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MEAIRLNNLSVAYEDNLIIDQMNLSIPKGKISIIIGANGCGKSTLLKSIARIIKPQSGEIFINGQNIKNQKEKHIATQIAFLPQGPICPSGMIVKELVAYGRFPHQKMIGGLKAYDKDIIDWAIAETGLKDFADREIENLSGGQRQRAWIAMTLAQETDIIMLDEPTTYLDMSYQLEVLQVLEKLNKEKNITIVMVLHELNNACRFASNIIGLKNGKIVCKGIPKESITKENLKEIYGIDVKLQLSDNKNYPICVDYELIRGQNEK >NZ_CP020559.1|WP_070963514.1|3617210_3618218_-|iron-ABC-transporter-permease MKKSRFQITVLVLLILLAIAILVYLSWGNYKIAAVEIIKTLLGGGTKLQRAAILHLRLPRMLVGICVGIALSTAGALLQTITKNELADPGIIGINAGAAVAAVIFISLKTANYYNVLGPLSVYVLPFMAILGAGIAAFIIYVLSSRNGVRPKRLLLVGLGMNAGLNAFITFFTFRGGVGDYNRVLIWTSGSLWGAGWNYAQIIIPLTAILFSLVLLNYKKLDVLNLSDEHAIALGLNLNHERRKLLIYAVMLAGGATAFAGNVGFIGLISPNIAKKLVGPYHKNFLVISAMISVVIILIADAVSRNLFSPIEIPVGIVISIFGVPYFIYLMMKEK >NZ_CP020559.1|WP_070963516.1|3618219_3619206_-|iron-ABC-transporter-permease MKQINTIAFIGGSIVILIIGLFLAISLGATHIGITEMWNSIFNYSETLELMLIRDVRIPRVLSVLFTGGILGVTGAMIQGVTRNPIAEPSLLGISQGATLVIAIFYAVGITINTTNVMIASLIGALLSGVIVVGFLLRKTKSSSITKILLAGTAMSTFFISLTTIIGLLSNQSQFIAFWVSGGFRNATWSDFRLVAAAGIIGLILAMLLSKKINLLSLGDDVAISLGENPERIRLLTFLVMIPMGAAAVAVGKNVGFVGLIVPQLIRKTFGEDYTKNIPFSFLLGAVLLVYSDIAARMIYSPYETPIGIFTALIGVPFFIVVARKERG >NZ_CP020559.1|WP_070963518.1|3619192_3620146_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKRNAMLKGILFACIAMLVLVGCSRPSTTTDTAKGTSTITITDVRGEVEIPENPERIVDLSGNSDILSILGYKVIGTANSDAYDYTRFPSYLEDILQGATILGYSMQDTMDVEAIMSLNPDLIIISTVQEKMYDQLSNIAPTVMIQLEALDWQEDVKALGQVFNKVEVADAWLANYNIKAKEAGEKLKEIYGENTSYLSFLASGGQFYVFDGAGFGSVLYQDMGLNKPEGMPEQSDISLPVVTYEGLASIRSDYIFVLATEEDLKVLKENTIWNSLPAVKEGRVLQLSASPYFIQGYSSIGREVLLDEIVEMLNETN >NZ_CP020559.1|WP_070963519.1|3620450_3621452_+|helix-turn-helix-transcriptional-regulator MTVKSSEEFRNAVLKALSFDKIESEHYTFFTNKKKPDLGYLMNYSREGYYHLGIADYTIPNDFSISFDNPELLIRFGIVYEGVTEFKIENNPVSSFTPSSFFVVEKDLKGHQNWKKGQHFHGTEITIYERYFSEIIEPNFPSVMDFSTFIKNYTYTYLPLEIVEIIRQLQSLNHQNLLTSIYLESKILECIAILINEVTRSSENAFTNQINYGNISIGSHRVIKLTSSDIHAIQKAHDILEKSYSNPPNIEALSKMVFLNEQKLKAGFSKHYHMSIGEYINRLKMTVAANLLSTTDLSIEVIAHKVGYNYTANFCKMFKKTYGKTPLKFRKTK >NZ_CP020559.1|WP_070963521.1|3621785_3623006_-|hypothetical-protein MIKRKVIFGIIATTIISFSLLGCTNQNSKKAVNDTSTSISNSFETNRAGQTQQTVQTPITSNSIDKKAVEEAYYGQWQIKKVLASAPVSTYSNDDIKIIVGKKLILSKESASCFGDTVDTLNITAANPTYKKSVISKNDFEANYPVTFDKLSIKGDTITQIDVVDTTGNGSTFFIKDNNALILYGGGVYFELGKIVSTSPSSTPLDSNSENTKTQMLSNNSVSEAYKAVLQNKTEFFSTDNKKKLYLNDFLTNKEIYDTIFKVTHFTVLDMDGDKVPEVVLELSVGNEPEFYEVLHYMNDIVYGYLIVYRGLEGLKADGTFHYSSGAADNGFGKLKLESDAFKTDILGYSKSSQGNANLIISYFINNKPVTKESFDSFINEQSGKKDAVWYEFSQKNIETELSINL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP020559_5 | 4056365-4056456 | TypeV |
NA
Consensus repeat of NZ_CP020559_5
|
1 spacers
spacers of NZ_CP020559_5
>5.1|4056389|44|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder AAACAGGCTCTTTCATGAGCCTTTTTCCTTGAATCTTGGCTCTA |
cas14k |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020559_5
The CRISPR arrays of NZ_CP020559_5 >merge|NZ_CP020559|5|4056365-4056456|CRISPRCasFinder AAAATTACAATAAAGTTCACCGAAAAACAGGCTCTTTCATGAGCCTTTTTCCTTGAATCTTGGCTCTAAAAATTACAATAAAGTTGACCGAA >NZ_CP020559|5|5|4056365-4056456|CRISPRCasFinder AAAATTACAATAAAGTTCACCGAA AAACAGGCTCTTTCATGAGCCTTTTTCCTTGAATCTTGGCTCTA AAAATTACAATAAAGTTGACCGAA
>NZ_CP020559.1|WP_070964130.1|4054882_4056034_-|SAVED-domain-containing-protein MTITVYKTIVAVLFIGLTIFNIYKGGIRLKEGYFEQIAPFAILETGISLITAGVFSIDSSLIAMYAMSGENQQLSILDYITMAQTEFTLIGLGILMCIISCFVHKALSTDRSIRLLNIQAYDDNRLEYLSTKKCKGKIVEGIYIDLIGLWEELRARKTSSAEFKRIIDKMVGVVDKQVTLFKAGTSKYKRAFTGIAPIPLLIYTGRLIPKLGFSEYLEIQKLENENDLIPLDTTGKIQYSQLQVENNLTTSNEDDEVVVAVSTTQQIDNNDLLQFINKGIEVKHIFLENPNHKSIVSVKQINEYAEVISREILNIKKIKPKLKTIHLVCSSKPSLMFRLGQLIDDTQMPVIISYQYTQQDDNRYPWGIYINHYKKQGELHRWI >NZ_CP020559.1|WP_081562198.1|4053440_4054865_-|hypothetical-protein MSMYNIDKEMRKFYRTKVVLAQSEQKSLIEKKDLNLDRLKGGLKEYNEENDTNYKIVDSMVQGSVAMQTVVQAEENNYDIDVGIVFNKSNLPAPKSSENNTTTVKNIVHDALLKKSSFFKTPPEKRTNCIRIQYANGYHIDFAIYRREKNEQGEYIYQHCGADWNYRNPRSITKWFKERDRVHSFNLKRIVRLLKAYLKQDSSWSVPGGLIQSVLADECIQISDRLDKMLYDTIIEIINRLDIDTEAYNPVDTDDNGNKITLLTTESHKDKMTKMKNYLDKGIKKLSVLFDESCTKEQAFTAWADFFNHNYWTELAENSVQKSLSETFSKFAGIEDDIYDFDETEEFIEDLYPISSTQYSLKIECKVEQKGYRIDSLQNFLRFNKFLNPHKKLHFKIIENTVPYPYKIFWKVLNRGKDAERRNEIRGQIIKGNSGDDVRIENTKFSGNHIVYCYIVKDGECVAKDSIIVPIEAN >NZ_CP020559.1|WP_070964129.1|4051532_4053179_-|site-specific-DNA-methyltransferase MPSLNWIGRQAVINHYKEMPYHLLDTKKELSYNIEEAEGNIIVHGDNLVALKSLLPYYSKSAKFCYIDVPYNTGNEEWIYNDNVNDPQIRKWLGQVVGKELDDLSRHDKWLCMMYPRLQLLKKFLRDDGFICVQIDDSEGAHLRVMMDEIFHSSNYLATIYVQVRYADKTLKQDMNFHKQIEQILVYRRTPKAKPYMKSEEYSYDKFTYTIKEKAEGREIELGGKRVVIFNPGEYEIINKEEGFKEGLKEIWASGTILDGNSSGRFFRDYLTGRKEGDGLGVLYKVYGIGEDMYDYRYFTGPKRSNATKGKYYQGVPLDKMSDDAESIKSIPNFYDMAADFGNCRHEGGVEFKSGKKPEKLLATLMEYFTREDDVVIDSFSGSGTTAAVAHKMKRKWIAIEMGDHCYTHVQKRLLSVVKGTDSQFNWNGGGGFRFYELSVPLTDRYGQINKSVSYEHLARHIYFTETGHSVSEDDLLEKPLIAEFRNTFYFLLFENDQETVLDNDILAEIKKYNGTKIVYADRNVISSTHLKAHDIMFKQIPYQVEVK >NZ_CP020559.1|WP_070964127.1|4048908_4051530_-|DEAD/DEAH-box-helicase-family-protein MLPLKTYQERVLEHLENFCKLCITKGAAETAFLEYTGRSYLGIRQLPGLPYVCLRVPTGGGKTLIASHSVSIVRKEYLRIDNCTVLWIVPTNQIKEQTLKALKDRNHPYRLALESKNDGDIHVLDLQEANFTGAADYEQSTCIIVTTLAALRIEDINGRKIYESNGHLLNHFIGMSEMQKNNLEKGENGEILYSLANVLRLRRPIIIMDEAHNARTELSFDSLARFSPSAIVEFTATPQQIHEPDKGLYASNVLHSVSAAELKAEWMIKMPIYLETNNNWQDILNKAIAKRNDLEKIALNEQKQSKEYIRPILLIQAQPRSQQRENLTVEVVRQSLINDFKIPEDQVKIQTGDIKELEDIDLFNDTCDVRYIITVQALREGWDCSFAYVLCSIPDIGSATAAEQLIGRILRLPNAIKKVNDELNNAYAYVVSNQFHQTLATLGSGLIENGFTEFEAKSIIKSMGEEPNLLNLAVVHTKKVNSVPDLNKLFGNLVEKVAYKPETQEIEVKGFINEEEKEQIQKCFINDKDKTVVETIFADIKKKIGITTKNQENAWMKPTENILVPSLSFKVEGQLQIFEDIHFLNAQWDILKYDAKLDGTSLTQIEDKSRLGKIEVDTKGNIEYRFIEELHEQLSYLVTDKEWAEEELIFWLDRNVEHQDISQAKFVVFVHKIIKDLVENQKMELKKIVYYKFNLRDKIKVLINNYRKKARKENYQTALLSESITVDESKTFTFNPEIYPANWAYTGRYKFNKHYFSEVGELKESGEEFDCAVYLDSLPEVKYWFRNLERQPLYSFWLQTSTDKFYPDFVALLEDGRILVVEYKGEPWSQTLDSDEKNVLGKFWSERSDGNCLFIMATKDNLGKIAELVRKRK >NZ_CP020559.1|WP_156778693.1|4046880_4047819_-|TniQ-family-protein MMVFYPPVYDDEIIYSIFTRYFELSGLIGVKEALITLFGTSTPCIYTMFPKYLKRFMGKAELFNNQDFNKYMMDNTILPLFKPFICKDSFESIQVLLEEYEEKAINAKLGLTMKDSFIKVDSIKICLECIKMDYQKFGETYLRIEHQIKGNNVCWKHNEVLYEHKIRDYKNDTIIKINEIIRKNLIEDYFRQVFIGDTFYEHLDLAISIADIFKTKDIEINLQLTKDKYKDVLFDKKLITPKGYLKQTKLTEMMYDCYSSEFLVIQNAYIDEKNKDNWLHRMMIKSRNVTNPIKHLLFIRMLFGSYNDFLEY >NZ_CP020559.1|WP_070964123.1|4045834_4046650_-|heteromeric-transposase-endonuclease-subunit-TnsA MARQKSDKYKLIEGRGVGAYNQYKPWLKVHEFGAHSRVHRIKGWKTGRIHQLMSDLELYYFLIIQWEDKVIDIREQFPLLPIEQTILLANEMGIRHPAEKNKIGKEYVMTTDFLITIQDNNNFKNIVRTVKAKKDFDKQRTREKLLIEKQYFQHKKIDWGIVLDIHIDKIKAQNLYSIYNYYDWNQRNLISDYQLLKYINDFKMILNDNNNIVIESTLQFERMNSLKDGEGLSFLKYLILHKKVQVDMNKLFNYSNMKVFDNDIIETKTNV >NZ_CP020559.1|WP_070964122.1|4044017_4045820_-|DDE-type-integrase/transposase/recombinase MMFLVNDLFELYVDNNKRCERILWISPENNFCFTIDMLSESLNINTRQLFDLEELIKNGLAKIIEDDFITRLKPEDIINERNKQIRDKAFNAVKEIINVIGEPDIFDEKKRFKVIKETQRKLNISNATLYKYLKNYWKGGQIKDALLPRYDNCGGKDKEKTFSIKTGRKTYEAQITGQNNGVIIDEEIKKVFTISISRYYHNTKEISLRKTYELMIKDFFTEYIGGSKVVNHYQVIPTYKQFWYWFKKNYSSETTIKSRKGEKKFASDYKGLNSNTKIEAFSPGFRYQVDSTIADVFLVSRIDRTSVIGRPVVYLAVDVFSRLITGVHIALEGPSWEGASSLIYNCYENKVDFCNKYGIQITDDDWPARGLPEVIIADRGELVGPLGEKLVVDLGISLENTPSYRGDAKGIVEQNFRILNSNIRDWSPGAVKKEFRERGERDYRLDAKLDIYQFSKIIIHSILHRNKCLIKDYVLEQEMINDRISAIPVELWSWGLKNKTGSLRSVPLDLLRLKLMKSGRATITERGIKFKNVLYSTSIAEGEGWYTNARINGVSYITIVYDKRDLSIIYIVSENKFIPCKVKNTNDVFENKTYEEIVDL >NZ_CP020559.1|WP_081561990.1|4043598_4043937_-|hypothetical-protein MTNEALNIDWEDILDKFSSHEGSIKAFCEENSISAHQLYYRRKKLQNNNTPVFHAVSFKDKEADEAVNQNIIPPNPVSASTIKIEIGKAKIYIPSNDKVSLSNVFKEIIALC >NZ_CP020559.1|WP_070963578.1|4043254_4043605_-|IS66-family-insertion-sequence-element-accessory-protein-TnpB MLNIDKVDKVYLACGVTDLRKNIDGLSMIVQTEFKLDPFEKALFVFCNRQMNKLKILHFDDGFWLYYHRLERNKFRWPMSKEEALKVSIEELRWLLKGYEVRTISKFKPVKERNHF >NZ_CP020559.1|WP_169904452.1|4041556_4043164_-|IS66-family-transposase MTKINLQNQLDEKTKELILKMEEELEAKDKEIENLKNELAYLKNQVLNKNRKIFGSSSEQANTIQVSFFDEAEKDSNLKAAEPTIEEITYKRTKPTSNTGKKDNLANLEKIVIEHKLDEDQQSCRDCSSDLVVIGKKSKEVLKYIPAKLYVEEHLTYSYACRSCEENNDKANIITTKAPKTLLHKSMASNELLSHVINLKYQHALPLNRQESYFKMMGANLSRQTLANWVIGAAHELDPIYQLMKEELLKRNYIQADETVVKVLDDRGKESNKQKYMWLYKSPDKDQPIVIYDYQKTRSGSCPRNFLSGFSGYMQTDGYAGYNKVENVKRLYCLAHIRRKFHEIIVNLDEEALKSSRALIGFNYCAQLYKIEKDLKEQHSGKEDFYERRYKKRLKASKPIIEAFIAYVDREIKDAVPKSALGKALAYTKPLLPSFKVFLEDGSLEIDNNAAERSIRPFVVGRSNWLFSASTKGAESSALIYSIIETARNNNLVVEKYLLYLMNHFSNVDPQDKESLLKLLPFSKDLPEDLKVQAK >NZ_CP020559.1|WP_070964134.1|4056810_4058637_-|glutamine--fructose-6-phosphate-transaminase-(isomerizing) MCGIVGYIGKKEAAPILVDGLEKLEYRGYDSAGIAVYTDQDIVVRKYKGRLSVLEEHLNNESIPGTLGIGHTRWATHGEPNDVNAHPHTNYAGDIAVVHNGIIENYMKLKEWLTAQGKIFVSETDTEVIAHLVDYYYKEDLVEAVQKAISRMEGAYAIGVISRKNPEKLVAVRKDSPLVVGIGEGENFIASDIPALLKYTRNVYFLNDGEMAVLDENNITMLNEFGEKVEKEVFEVTWDVEAAEKGGYQHFMIKEIYEQPKALKETISPRVNNKNEIVLDDIKLTKEDLEKINKVVIVACGTAYHAGLVGRYAIEKFAKIPVETDVASEFRYRDPFVDDRTLFIAVSQSGETADTLAALREAKEKGARVLAVTNVVGSRISREADDVFYTWAGPEIAVASTKAYTTQLVAMYLIALDMGLKKGTITKGKYDAVLNELKTFPEKAEKLLQDKQLLQELADKQFNNQNVFYIGRGIDDHVGREGSLKLKEISYIHSEAIAAGELKHGTIALIEEGTLVVALATQDHLYDKMLSNIKEVKARGAYVVAVAKEGNTEIEKSADIAIYIPNTLDELTPVLSVIPLQILAYYIAVARGCDVDKPKNLAKSVTVE >NZ_CP020559.1|WP_070964136.1|4059050_4060397_-|phosphoglucosamine-mutase MGKLFGTDGVRGIANKELTPELAYQLGRVGAYILLREKTQGKVVIGKDTRKSGDLLEAAMTAGFLSMGIDVITLGVLPTPAVAYLTRHLQADCGVVISASHNPAEYNGIKFFNHQGYKLPDEVEEEIEDYILNHKEILLRPEGSAIGKYITLENPIGLYTDYLKTTVKQDFKGFKIAIDAANGAAYQAAPKILQELGAEVYVINDVPDGMNINLNCGSTHPEVLQQLVKETKADIGVAFDGDADRLIAVDEACQIIDGDHIMNICGYNLKKHDKLSKNTIVATVMSNIGLDIALQQQGCQIVKTKVGDRYVLEEMIGKGYSLGGEQSGHIIFLEYNTTGDGLLTALQLIASMKEEGKKISELSAMMTSYPQVLINAKVKNENKEAYMQDEVIMTEIRKIEEVMNGQGRVLIRPSGTEPLVRVMLEGKNQEELNRLATALAKLIEERLN >NZ_CP020559.1|WP_070964137.1|4060587_4062207_-|carbon-starvation-protein-A MNALVLVLISIAIFFIAYVSYGAWLAKQWGVDDGRKTPAHTKGDGVDYVPAKSPVLLGHHFASIAGAGPIVGPITAAIFGWVPVLLWIIIGSIFFGGVQDFGSLFASIRHNGKSIGEVIEINMGKKGKKLFAIFAWLTLLLVVAAFANIVANTFVSVPEAATASVLFILLAIVFGFAVYRQGVSLGIGSVIGVILLFVCIALGNMFPLELSRNAWIVILLGYIFIASVTPVWILLQPRDYLNSYLLYIMMAGAVIGLIITRPALELAPVTGFNVGGQWMFPMLFVTVACGAISGFHSLVGSGTSAKQLDKESDAKIVGYGGMLIEGVLAVIAIITAAYIGHDKLAALLNNGGPVNVFSDGIGTFMTSFGISFTVGKSFVALAVSAFALTSLDTGTRLGRFILQEFFYEEGAASQHPLTNMYTATALTVVVGGLLAITSWAKIWPVFGSANQLLAALALMAVAVWLKKTGKNYKMFIIPMVFMFAATLLALILLIKTNLGPEGSLILVVFPVLLFILAIILAYQGYHIMKEIDTKKITKV >NZ_CP020559.1|WP_070964139.1|4062241_4062739_-|hypothetical-protein MKAQNYIKNMGERLWKYFDVEKAYSYKEIEFDLFAKSLVRNERYIASKKIAIYGFENHEYHFIKHYQVLKEESISRFLSVLSSAAEELVNPHPEHMSTIITGIIVVEKEISEELRRTIKKFKFMCSFAFGFKGWTYIRLVVVDLSKGEVITNKRGREVKKFYQIP >NZ_CP020559.1|WP_070964141.1|4062862_4064125_-|IS200/IS605-family-element-transposase-accessory-protein-TnpB MKLSFKFKPSFTVEQLSIIQELSFHTTKLYNIVNYDLREKGFKSYVDIENIYKTNWHSDFLHSHTRQHCFKMVEQNWKSYFASIKDYKENPHKYKGLPKPPKFKNMEDKKNEIVFTNLAIRFRENTFMLSLSKAIQKTFEVESLNFEVSNKLQSLINWNELQQVRIKWDHSLKQWYLIIIYNKQELEPVNNINIMAIDLGLDNLATITFKEGNETYLFCGKKLKGINAFVNKKIAYYQSIEMKKIGSDKFKNTKMIHSLRRYRNNYVNDYLHKTSKNIIDKAIEHKVKKIVIGKIKGIKQDMNYNKSFVQIPIQRLTELIKYKAELQGIEVKFKEESYTSGCSALDLEPIDKNHYNKRRRVVRGLFKSSFGLVNSDVNGSLNILRKEEKCIPEIVQAMRDKGSVSSPLRVRVACLGGSSR >NZ_CP020559.1|WP_070964143.1|4065064_4065610_-|2-oxoacid:acceptor-oxidoreductase-family-protein MTTEKIIMAGFGGQGVMSMGQLLTYSGMIEDKQVSWLPSYGPEMRGGTANCSVIVSDSLIGSPIITEDATAVIAMNLPSLVKFEKNLRTGGRLLINSSLIEKKAEREDVEVYYIPANEIANEIGNLRVANMVMLGAYLALTNVVSVESIVEAFKKVYGPSKEHLITLNKQALERGASVVNV >NZ_CP020559.1|WP_070964145.1|4065611_4066358_-|2-oxoglutarate-oxidoreductase MSIVFEKTKGLTDKQFHYCPGCTHGIIHRLVAEVLEELDVVGKTIGVAPVGCSVLAYDYFNCDMHEASHGRAPAVATGIKRVLPDHVVFTYQGDGDLASIGTAEIIHAAHRSEKFTTIFVNNAIYGMTGGQMAPTTLIGQRTTTSPEGRKQELTGMPLKMSEMFATIEGAVFVERVSVHNVANIRKAKKAIKKAFEIQLEGKGFGIVEVLSTCPTNWGITPVESLKWLEENMIPYYPLGNFRTPEEGK >NZ_CP020559.1|WP_070964147.1|4066357_4067422_-|3-methyl-2-oxobutanoate-dehydrogenase-subunit-VorB MTRILMKGNEAIGAAAIKAGCRYFFGYPITPQNELPEFMSRELPKVDGVYVQAESEVAAINMVYGAAGTGARVMTSSSSPGIALKQEGITYIAGAELPCVIVNISRGGPGLGGIQPSQADYFQSTRGGGNGDYRLLVYAPASLQEAVDLVIEAFDAADYYRNPVMVIGDGMIGQMMEPVEFKESTNKRELPPKDWATTGTKGKRQPNIINSLALEPESLEKHNIKLNKKYKEMEEKEVKYEMYKMEEAELVMVAYGTTARIAKNAIDALEEEGIKVGLIRPITLWPFPYKAFKDIPATTKALLSVEMSMGQMIDDVKIANEGRLPVEFYGRSGGMIPTPEAIAAKVKDILGGGK >NZ_CP020559.1|WP_070964149.1|4067449_4067674_-|4Fe-4S-dicluster-domain-containing-protein MAKAKGKVKFNEDRCKGCELCTTACPVKIIKMDKKRINVKGYHPATVEEMDKCIGCANCASICPDLVIQVEKED >NZ_CP020559.1|WP_081562199.1|4067702_4068374_-|ATP-binding-protein MLNDHRIRIVIGHYGSGKTEFAVNYAMNLAKANKKVALADLDIVNPYFRSREKERMLQEYGIKVIASYIKGSGSDLPAVTGDVLGPLQDKSYDVVLDVGGDAVGARALGRYKEYWKTEDYDMFCVVNANRPQTSELEGVLEHIYAIEKTSGAKVTGLVNNTHLLRHTTVEEVLKGQELCRKVSEVLRIPIKYITALREVGEKLSPTLEGEIMPIDMIMREDWM |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020559_1 | 1.11|1348434|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1348434-1348469 | 36 | NZ_CP013332 | Fusobacterium hwasookii ChDC F174 plasmid unnamed1, complete sequence | 1050-1085 | 7 | 0.806 |
NZ_CP020559_1 | 1.12|1348500|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1348500-1348535 | 36 | NZ_CP013332 | Fusobacterium hwasookii ChDC F174 plasmid unnamed1, complete sequence | 1050-1085 | 7 | 0.806 |
NZ_CP020559_3 | 3.1|3005831|29|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder | 3005831-3005859 | 29 | KY290955 | Aeromonas phage 65.2, complete genome | 192318-192346 | 7 | 0.759 |
NZ_CP020559_3 | 3.1|3005831|29|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder | 3005831-3005859 | 29 | NC_015251 | Aeromonas phage 65, complete genome | 192355-192383 | 7 | 0.759 |
NZ_CP020559_1 | 1.11|1348434|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1348434-1348469 | 36 | CP031730 | Stenotrophomonas rhizophila strain GA1 plasmid unnamed1, complete sequence | 73863-73898 | 8 | 0.778 |
NZ_CP020559_1 | 1.12|1348500|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1348500-1348535 | 36 | CP031730 | Stenotrophomonas rhizophila strain GA1 plasmid unnamed1, complete sequence | 73863-73898 | 8 | 0.778 |
NZ_CP020559_1 | 1.13|1348566|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1348566-1348601 | 36 | NC_018493 | Bacillus cereus FRI-35 plasmid p02, complete sequence | 23134-23169 | 8 | 0.778 |
NZ_CP020559_2 | 2.27|2532545|36|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT | 2532545-2532580 | 36 | NC_021709 | Alteromonas mediterranea 615 plasmid unnamed, complete sequence | 89284-89319 | 8 | 0.778 |
NZ_CP020559_2 | 2.52|2532548|36|NZ_CP020559|PILER-CR | 2532548-2532583 | 36 | NC_021709 | Alteromonas mediterranea 615 plasmid unnamed, complete sequence | 89284-89319 | 8 | 0.778 |
NZ_CP020559_1 | 1.5|1348036|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1348036-1348071 | 36 | MK017819 | Clostridium phage CPD4, complete genome | 2759-2794 | 9 | 0.75 |
NZ_CP020559_1 | 1.5|1348036|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1348036-1348071 | 36 | MN417334 | Clostridium phage CPAS-15, complete genome | 6638-6673 | 9 | 0.75 |
NZ_CP020559_1 | 1.5|1348036|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1348036-1348071 | 36 | KY206887 | Clostridium phage Clo-PEP-1, complete genome | 44977-45012 | 9 | 0.75 |
NZ_CP020559_1 | 1.5|1348036|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1348036-1348071 | 36 | MF001357 | Clostridium phage CP3, partial genome | 36076-36111 | 9 | 0.75 |
NZ_CP020559_1 | 1.10|1348368|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1348368-1348403 | 36 | NZ_CP019175 | Salmonella enterica subsp. enterica serovar Give strain CFSAN024229 plasmid pCFSAN024229, complete sequence | 47165-47200 | 10 | 0.722 |
NZ_CP020559_1 | 1.16|1348764|34|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT | 1348764-1348797 | 34 | MH622943 | Myoviridae sp. isolate ctbc_4, complete genome | 337301-337334 | 10 | 0.706 |
NZ_CP020559_1 | 1.11|1348434|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1348434-1348469 | 36 | KJ010548 | Bacillus phage Bp8p-T, complete genome | 148296-148331 | 11 | 0.694 |
NZ_CP020559_1 | 1.11|1348434|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1348434-1348469 | 36 | NC_029121 | Bacillus phage Bp8p-C, complete genome | 148294-148329 | 11 | 0.694 |
NZ_CP020559_1 | 1.12|1348500|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1348500-1348535 | 36 | KJ010548 | Bacillus phage Bp8p-T, complete genome | 148296-148331 | 11 | 0.694 |
NZ_CP020559_1 | 1.12|1348500|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 1348500-1348535 | 36 | NC_029121 | Bacillus phage Bp8p-C, complete genome | 148294-148329 | 11 | 0.694 |
1. spacer 1.11|1348434|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013332 (Fusobacterium hwasookii ChDC F174 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
tgcaattttttcattttaaaactcctcct-tttcata CRISPR spacer ttaaattttttcatttaaaaagtcctcctaatttat- Protospacer * ************* **** ******* **.**
2. spacer 1.12|1348500|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP013332 (Fusobacterium hwasookii ChDC F174 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.806
tgcaattttttcattttaaaactcctcct-tttcata CRISPR spacer ttaaattttttcatttaaaaagtcctcctaatttat- Protospacer * ************* **** ******* **.**
3. spacer 3.1|3005831|29|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder matches to KY290955 (Aeromonas phage 65.2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
tttcactaataacgtgatcatcaacgctt CRISPR spacer tttcactaacaacgtgatcctcaaattcg Protospacer *********.********* **** ..
4. spacer 3.1|3005831|29|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder matches to NC_015251 (Aeromonas phage 65, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
tttcactaataacgtgatcatcaacgctt CRISPR spacer tttcactaacaacgtgatcctcaaattcg Protospacer *********.********* **** ..
5. spacer 1.11|1348434|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP031730 (Stenotrophomonas rhizophila strain GA1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tgcaattttttcattttaaaactcctccttttcata CRISPR spacer ttccattttttcattttaaaaattctcctttaaaat Protospacer * * ***************** *.******* *
6. spacer 1.12|1348500|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP031730 (Stenotrophomonas rhizophila strain GA1 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
tgcaattttttcattttaaaactcctccttttcata CRISPR spacer ttccattttttcattttaaaaattctcctttaaaat Protospacer * * ***************** *.******* *
7. spacer 1.13|1348566|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_018493 (Bacillus cereus FRI-35 plasmid p02, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
-----atacttttggtacaattttataccaaattacattac CRISPR spacer tcaaaaaac-----gtacaatttaatacaaaattacattac Protospacer * ** ********* **** ************
8. spacer 2.27|2532545|36|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_021709 (Alteromonas mediterranea 615 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
ttttagaagggtgtttttttatgccttttaaaaagg CRISPR spacer aatttctatggtgtttttttatgcgtttaaaaaagg Protospacer ** * *************** *** *******
9. spacer 2.52|2532548|36|NZ_CP020559|PILER-CR matches to NC_021709 (Alteromonas mediterranea 615 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.778
ttttagaagggtgtttttttatgccttttaaaaagg CRISPR spacer aatttctatggtgtttttttatgcgtttaaaaaagg Protospacer ** * *************** *** *******
10. spacer 1.5|1348036|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK017819 (Clostridium phage CPD4, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tataatcttctagcatttctaagatttcatcaaaat CRISPR spacer catcttcttctagcatttctatgatgtcatccttag Protospacer .** **************** *** ***** *
11. spacer 1.5|1348036|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN417334 (Clostridium phage CPAS-15, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tataatcttctagcatttctaagatttcatcaaaat CRISPR spacer catcttcttctagcatttctatgatgtcatccttag Protospacer .** **************** *** ***** *
12. spacer 1.5|1348036|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KY206887 (Clostridium phage Clo-PEP-1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tataatcttctagcatttctaagatttcatcaaaat CRISPR spacer catcttcttctagcatttctatgatgtcatccttag Protospacer .** **************** *** ***** *
13. spacer 1.5|1348036|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MF001357 (Clostridium phage CP3, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
tataatcttctagcatttctaagatttcatcaaaat CRISPR spacer catcttcttctagcatttctatgatgtcatccttag Protospacer .** **************** *** ***** *
14. spacer 1.10|1348368|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP019175 (Salmonella enterica subsp. enterica serovar Give strain CFSAN024229 plasmid pCFSAN024229, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
ccatatttttttctgtaaaaaaacatttctgaatca CRISPR spacer cgtctgttttttctgtcaaaaaacatttttgacaaa Protospacer * . ********** ***********.*** *
15. spacer 1.16|1348764|34|NZ_CP020559|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH622943 (Myoviridae sp. isolate ctbc_4, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
-----atccttgtttttctagaacttctaatgaaatttg CRISPR spacer caatgat-----tttttctagttcttctaatgaaataaa Protospacer ** ********* ************* .
16. spacer 1.11|1348434|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ010548 (Bacillus phage Bp8p-T, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
tgcaattttttcattttaaaactcctccttttcata CRISPR spacer tttgttttttccattgtaaaactcctcctttaatcc Protospacer * .. *****.**** *************** .
17. spacer 1.11|1348434|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_029121 (Bacillus phage Bp8p-C, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
tgcaattttttcattttaaaactcctccttttcata CRISPR spacer tttgttttttccattgtaaaactcctcctttaatcc Protospacer * .. *****.**** *************** .
18. spacer 1.12|1348500|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KJ010548 (Bacillus phage Bp8p-T, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
tgcaattttttcattttaaaactcctccttttcata CRISPR spacer tttgttttttccattgtaaaactcctcctttaatcc Protospacer * .. *****.**** *************** .
19. spacer 1.12|1348500|36|NZ_CP020559|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_029121 (Bacillus phage Bp8p-C, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.694
tgcaattttttcattttaaaactcctccttttcata CRISPR spacer tttgttttttccattgtaaaactcctcctttaatcc Protospacer * .. *****.**** *************** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
431312 : 439964
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP020559|431312:439964|DBSCAN-SWA TATGAGTACAAAAGGTTTAGACAGAATGTTTAAGCTTACGGAAAATAAAACTGATGTAAAAACAGAAATTATTGCAGGGATTACTACTTTTATTACAATGGCGTATATTTTATTTGTTAATCCAGATCTTTTATCTGCTGCTGGCATGGACTTTAATGCCGTTTTTATGGCAACTTGTCTTTCAGCAGCGATTGGTACGTTGATTATGGGTTTTTATGCAAATTTACCCTTTGCGCAAGCACCGGGAATGGGTTTAAATGCATTCTTTACCTTTGGTGTTGTATTTGGTTTAGGTTACACATGGGAGCAGGCTTTAGCAGCAATTTTTATTTCAGGAATTGTTTTTATTATTTTAACTGTAACAGGTCTTAGAACTGCTATTGTGGAAGCTATACCTACATCACTAAAACACGCTATCGGTGGAGGTATTGGCTTATTTATTGCATTGCTTGGATTTAAAAATTCAGGAATTGTTGTGCCTTATGAAGCTACTTTAGTAGAATTAGGAAATTTTCAAGATCCAAAGGTATTATTGGCGGTGATCGGCTTAGTGATTACTTCTGTACTTATGGTAAAGAGAGTGAGAGGTGCTATTTTAATAGGAATTATTGCAACCATGGCTATAGGGGTTCCTATGGGTGTAACTGATTTATCTGCTGGAATGAATTTTTCCTTTGATATTCGTCCTACACTATTTAAGTTGGATTTACTTGGATTATTAAATATTGGAGAAGCTGGTGTTGTAGGAGCCATAACAAGTGTATTGACAGTCGTTATCTCCTTCAGTTTAGTAGATATGTTTGATACTATTGGCACATTAATTGGTACAGGTGCAAAAGCAAAAATGCTGGATGAAAAAGGTAATTTACCTAACATGAGCAAGGCATTGATGGCGGATGCTGTAGCAACCTCTGCAGGTGCATTATTAGGAACATCTACAGTAACGACTTATGTTGAGTCTGCTGCTGGTGTGGCTGAAGGTGGAAAAACCGGGCTGACTGCTGTAACAACAGGTGTGTTGTTTATTTTCTCTATACTTTTAGCACCTTTTGCCTTGATGGTACCGGCACAAGCAACAGCACCTGCGTTGATTATTGTTGGTGTGTTAATGATGAGTACATTAAAAGAAATTAATTTTGAAGACTTTGGTGAAGCGTTGCCGGCCTTTTTAACCATTGCCGTTATGCCTTTTTCCTTTAGCATAGCAAATGGTATTGCAGCAGGACTTGTGTTCCTTCCAATCGTTAAGATTGCTACAGGAAAGGCAAAGGAAGTACATCCGACTGTATATGTGTTAGCGTTGCTCTTCATCTTAAGGTTTACGATATTACCGCATTAATTGAAAATAGCAGCTAAGAAAACCTTAGCTGCTTTTCTAAACTAAAATTTAGTTAGAAAGGGAGGGACTAGGTTGAATTTTAAAAAAATTGGCATAATTGGCGGCGGTCAACTGGGAAAAATGATGGTTTTAGAGGGGAAGAAATTAGGGCTTCACTTTACTGTCTTAGATCCTAGTATGGATTGTCCAGCCTTCTCCATCGTAGATGAATATATTGAAGGAGACTTTTATGATAAGGATAAAATTCGAAAATTAGCGGAGGCAACAGACCTTATTACCTATGAATTTGAACATATTGATGCAGATATATTGATGGAACTTAAGGAAGAGGGCTATAAAATTTATCCTACGCCATCGACACTAAAAATCATTCAAGATAAATTTCAACAAAAAAACTTTTTAAGACAATGTAATGTTCCTGTGCCGGATTTTGATGCAGTAGATTCAGTGGAGGCGCTTGATGCGGCGGTTGATAAATATGGTTTGCCTTTGCTTTTAAAGAGTTGTAGAGGAGGTTATGATGGTAAAGGGAATTATCTTATAAGACATAGAGAAGAAATTCCAAAAGCTTATCATACTTTAGGTGGGGATGCTACGCAGCTTATGGTGGAGGCATTTGTTCCCTTTATCAAGGAAGTTTCAGTGGTAGTAGCAAGAGGGGTAGATGGAGAAATAAAGGTATATCCACTGGCAGAGAATATTCATGAAAACAACATTTTAAAAACTACCATTGTTCCAGCTAGAGTAAATAAGGTAGTAGCACATAAGGCACAGGCTCTGGCCTTAAAGACGATGGAACTACTGAAAGGGGTTGGGATATTTTGTGTAGAGATGTTTGTGGATGCCGATGATGATGTACTGGTGAATGAAATTGCTCCTCGAACCCATAACTCTGGCCATTATACCATAGAAGCCTGTAGCACTTCTCAATTTGCTCAACATATTCGAGCTATTTTAGGATTGCCCCTTGGAGAAACAAAGCTTTTGAAGCCAGCAGTCATGATCAATCTTCTAGGAGGGGATGGGTATGATGGAAGGGCAAAGTTGGTAGGTGCAGAGGAAATACTGGCTATCCCTGAAGTATATCTTCATTTCTACGGAAAAACCTATACACAGCCGGAACGTAAGATGGGGCATGTAACTGTGTTAGCAGAGGATGTAGATTCTGCTTTAAGCAAAGGGGATAAAGTAAAGGAATTAATGCGAATTATCGCTGAAGAATAAGTTTGGTGTAGTAGGAGGAAAAATATGAAAAATACAACTGTTAGTATTATTATGGGAAGTGATTCGGATTTACCTATTATGAGGGAAGCGGCAGATATATTAGAGGATTTAGGCGTTGTTTACGAGTGCACCATCGTATCCGCTCATCGTACGCCAGATAGAATGTATGAATTTGCAAAAACAGCAGAAAAAAGAGGTATTCAAGTGATCATAGCAGGAGCAGGAGGTGCAGCTCACTTGCCCGGGATGGTGGCTTCTCTTACGAATTTGCCTGTGATAGGGGTACCGGTAAAGACGAAAATCTTAAACGGCATAGACTCTCTCTATTCTATTGTACAAATGCCTCCGGGAATTCCTGTGGCTACAGTAGCCATCAATGGTGCAAAAAATGCGGGAATATTGGCAGCTCAAATCGTAGCTTTGCAGGACCAAGGGGTAAAGGAGAGCTTAGAGAAATACAAGAAAGACCTTAAACAAATGGTAGAAGAAAAGGCTTTGAATCTAGAAGAAGTGGGCTATGAAAGTTATTTATCAAAATAATCATTTTATGATGGCAGTATGATCTGTCATTCTGAAGATAATGGAAAGTCTAGGTTTTGGGAGTTTTTTTCAGACAAACAGGATGATAGAAATACTTCTTTCATGTTTCATGTTTATTTTAATATTGGATATTTTTTATTTAATCCACGAGAAGGGTATAGGAGGAGTTATCATGTGTAAAATCGAAAAATTACAGATGCTGTATGAGGGAAAGGCAAAAAAGGTTTATAAGACAAAGAATGAGGATCAGTATATCGTAGAGTACAAGGATGATGCTACTGCCTTCAATGGAGAGAAGAAGGGGACAATCATCAATAAAGGTATTGTTAATAACCAGATGGCAGCACTGATTTTTGCTATCTTAAAGGAACAGGGTGTTGATAATCATTATATTGAAACTCTAAGTGACAGAGAGATGTTGGTAAAGGCAGTAAAGATTTTGCCGGTTGAGGTTATTGTGAGGAATGTGGCGGCGGGGTCTATGGCAAAACGACTAGGTATGGAGGAAGGTAAAGTATTGAAAGCCCCTGTGCTAGAGTTTTGCTATAAAAATGATGAACTAGGGGATCCTCTAATTAATGAAGATCATGTGATGGCCTTAGAACTTGCAACGGAGGAAGAAATTAAGCGCATCAAAGAGCTAACCTTTAAAATTAATGAAGTATTAAAGAAGTTTTTTATAGAAAAAGATCTAAAACTTATTGATTTTAAACTAGAATTTGGTTTGTATAAAGGGCAGGTAATTTTAGCAGATGAAATATCCCCAGATACTTGCAGACTTTGGGATGTTCATACAAATGAAAAGTTAGATAAGGATCGTTTTAGAAGGGATTTAGGTAAGGTTGAAGAATCTTATCAGGAAGTATTAAATAGATTGAAAAATAGTAAATGATTGAAAAAATTTTAAGGAAGATGAGAGAGGGGCATTAAAATGTATCATGAAATAAATCTCGATAAACTAAAAGAAGAATGTGGCGTATTGGGGATTTATACAGATAGCGATGAAAATACCTCTAGGCTTTTATATTACGGACTATATGCATTGCAACACAGAGGTCAAGAAAGTGCTGGGATTGCTGTGAATAACGGCTTAAAAAGCAATTATCATAAAGGTATGGGTTTGGTGCCAGATGTATTTGATGAAGATATTTTAAAAAGATTGTTGGGCCATATCGGCATAGGTCACGTAAGATACTCCACTTCCGGCGAGAGCTATGTGGAAAATGCCCAACCCCTTGTGGCCAGATATAGAGGCGGCAGCATCTCTCTAGCCCACAATGGCAATTTAACTAATGCAAAGATTATTAAAGAGCGTCTAGAGGATGATGGGGTTATTTTTCAAACCTCTATTGATAGTGAAGTAATTGTTAATTTAATTGCCCGATACAGCGGGGATGGCATGATTGATGCTATTGAAAGAACGATGGATTTAATCAAAGGCGCTTATTCATTAGTAGTAATGACGGAGGAAGAACTGATTGGTGTGAGGGACCCATTGGGCTTAAGACCTCTTTGTTTAGGTAAAATGGGAGATAGTTATGTGTTAGCATCAGAAAGTTGTGCCTTTGATGTGATGGGAGCAACCTTGGTAAGAGATATTGAGCCAGGGGAGATTGTTACCATTAATAAAGAAGGTATTCAATCTACCTTCTATAAAAACAATGGTACACGAGCTTCTTGTATTTTTGAGTACATTTATTTTGCTCGTCCTGATAGTGTAATCGATGGCGTAAGTGTTTATGAGGCTAGAAAAAATGCTGGTAGAATATTAGCGAAAGAGCATCCAGTAGAAGCAGATTTAGTGGTTGCTGTGCCGGATTCTTCTGTTCCAGTAGCAATAGGATATGCAGAGGCTTCTGGCATACCCTTTGGAGAAGGTTTGATAAAAAACAGATATGTAGGCAGAACGTTTATTCAACCGACACAATCTATGCGGGAGTTAGCAGTAAGATTAAAGCTAAATCCTCTTAAGGACAATTTACAGGGGAAAAAAATAGTTATGATTGATGATTCTATTGTAAGGGGAACCACCAGCAGACGTTTGGTGGAGAGACTTAAAAGTGCTGGTGCCAAGGAGGTTCATGTGCGAATCAGTTCTCCTCCAGTGGCTTTTGGTTGCTATTTTGGTATTGATACCCCAGATCGAAACCAATTGATTGGTGCGGTAAAAACCGTAGAACAGATTAGAAAAACCATTGGTGCAGATAGCTTGGGTTATATCAGTACTGATGGGTTGGTGAAATCTACCGGGCTATCTAAAGAACATTTTTGCCTAGCTTGTTTTAATGGCGTGTATCCTTTGGAAGTGCCGGAAGTAGGGGATAAAAAGGTGTTTGAGAGATTATCAGGAGGTGAATAGCATTGGAAAATATGACCTATAAAAATGCTGGTGTAGATGTGGAAGAAGGCCAAAGGGCAGTACAGCTAATGAAAAATCATGTAAAGAGCACTTTTAATCAACATGTGCTAGAGGATATTGGTGGGTTTGGAGGATTGTTTGCTTTAGATCTTAAAGACATCAAGGAGCCTATTTTGGTTTCTGGAACGGATGGTGTAGGAACGAAACTGAAGCTGGCTTTCTTGTTAGATAAACATGATACCATAGGCCAGGATTGCGTTGCTATGTGTGTCAATGATATATTATGCCAAGGAGCAAAGCCTCTATTCTTTTTAGATTATATTGCTACTGGCAGACTTAAAGCTGAAAAGGTAGCAGACATTGTAAAAGGTATTGCTGAAGGATGTAAAATGGCAGGCTGTGCTTTAATCGGTGGAGAAACTGCAGAAATGCCAGGATTTTATCAAGATGGAGAGTATGATGTTGCCGGCTTTTCTGTAGGAATGGTGGACAAATCTAAGGTAATCACAGGCAAAGATATCCAGGTGGGAGATGTAATCATAGGTATTCCCTCCAGCGGTGTCCATAGCAATGGTTTTTCACTGGTGAGAAAGGTTCTTTTAGAAGGAGACAAATTTGACCTAAATGCGCCTATGGAGGAATTGGGAAATACCCTGGGAGAAACCTTAATTACCCCTACAAAAATTTATGTGAAGGCTGTGTCAGAGGTGCTAAAGGCGGTAGAAGTAAAGGGCATAGCACATATCACTGGTGGAGGATTTTATGAGAATGTTCCAAGAATTTTGCCTGAAGAGGTGGATGCGCATATCCAATTAGATAGCTGGTCAATACCTGAGATATTTAAAATGATTCAAAAGATAGGTAATATCCAAGAAGAAGAAATGTACAAAACTTTTAATATGGGTATCGGTATGATGTTGGTGGTCCAGGCGAAGGATGCTGAAAGCACTTTAAAGGTATTACAGGAGGTAGGAGAATCCCCTTATAAAATAGGAGAAATTCGTGCGGGGAATAAACAGGTGGTATTATGGAGGGAATAAAGATTGCTGTCCTTATATCCGGTGGAGGTACGAATCTTCAAGCATTAATAGATGCGGTGGAAGCGGGATTCATCAAAGGAAGCATTGCTTTGGTGATCTCTGATAGAAAAGGGGCTTTTGGTCTTATACGAGCAGAGAATCATGGAATACAAACCATGCTTTTGGATAAGAACACTTATGGTACTATAGAAAAAAGAGATGCTGTTTTATTGCAAGCATTACAGGAGAAGGAAATAGATTTAGTAGTTTTAGCTGGATATTTAGCGATCGTGCCCCAAAATATCATTGCTGAATATCGGAATAAGATCATAAATATTCACCCCTCTTTAATACCAAGCTTTTGCGGCAATGGATATTATGGAGAAAAGGTTCATCAGGAGGCATTCAACAGAGGTGTAAAGGTTACTGGAGCTACAGTGCATTTTGTTAATGAGGAAACCGATGGGGGACCGATTATCCTACAAGAGATAGTAGCCATAGATTTTGACGATGATTGGAAGGATATACAGCTAAAGGTGCTAAAGATAGAGCATAAAATCCTTCCCCTTGCAGTAAAATTATTTGCAGAGGATAGGCTAGAGGTTATAGGAAATAGAGTAAAAATAAACTGAGGTGATAAAAATGATAAAAAGAGCATTGATTAGTGTTTCTGACAAAACTGGGATTGTAGATTTTGCGAAGGCGTTATCTAAGCTGGGGGTAGAAATATTATCTACTGGAGGAACTGCAAAGCTTTTAAGAGATGGTGGTGTAAATGCCATCGATGTATCGGATGTAACCGGTTTTCCAGAATGTTTAGATGGAAGAGTAAAGACGCTGCATCCAGTAATCCATGGCGGCATTTTAGCTATACGGGATAATGAAGAACATCAAAAAACCTTACAACAACAAAATATTACTCCGATTGATTTAGTTGTTATCAATCTATATCCCTTCAAGGAGACGATTTTGAAAGAAGGGGTAACGATGGAGGAAGCCATAGAAAACATTGACATTGGTGGACCGACGATGCTACGTTCAGCTGCAAAAAATCACAAATTTGTAACAGTTATAACGGACCCTAAAGACTATGGAAAAGTCCTTGAAGAAATAAAAGAAGCAGGCGATACGTGTTTTGCAACAAGATATGACTTGGCGTTAAAGGTATTTCAACATACAAGTCATTATGACACATTGATTGCTGCTTATTTAGGGAAAGACAAGGAAGGCTTTGGCGATACTTTAACATTAACTTATGAAAAGGTACAGGACTTAAGATACGGAGAAAACCCTCATCAACAGGCAGTCTTTTATAGAGAGGTAGGTCTTCAGCCTGGCACATTGGTAGAAGGCATTCAGTTGCAGGGAAAAGAGTTGTCCTTTAATAACATTAATGATGCAAATGGGGCATTAGAACTGTTGAAAGAATTTGAAGAACCTACAGTGGTGGCGATTAAACACACCAATCCTTGTGGTGTAGCCTCTGGTGAAGATATCTACGAAGCTTATAATAAAGCCTTTGAGGCAGACCCCCTATCTATCTTTGGAGGTATTATTGCTGCCAACCAAGTCATTGATGGAAGAACAGCAGAAAAAATGAAGGATGTCTTTTTGGAAGTAATTATTGCTCCTGATTTTACAGAGGAGGCTTTGAAGATATTTAACGATAAGCAAAACCTGCGATTGATCAAGTTGACGAATATTACAGCAAAAAAAGAAAAAGCCATAGATATGAAAAAGGTAGCCGGTGGCCTTTTGATTCAAGATGTAAACAAAGAGCTAATCAAGGAAATAGAAATAGTGACAGAGAAAAAACCTACGGAAAAGATGATGGAGGACTTAGTTTTTGCCTTTAAAATTGTTAAACATGTAAAGTCCAATGCTATTGTGTTGGTGAAGGATAAGCAAACTTTAGCAGTAGGACCAGGACAAACCAGTAGAATATGGGCATTACAAAATGCTATTAAAAATAGCACCCATGACCTTGAAGGCAGCGTTATGGCATCAGACGCTTTCTTCCCTTTTAGTGATTGTGTAGACGCGGCTTTTAAGGCTGGAGTAAAAGCTATTATTCAGCCAGGGGGATCTTTAAATGATAAACTATCCGTTGAAGCTTGTAACGAGAAGGGAATTGCTATGGTGTTTACAGGAATGAGACATTTTAAGCATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP020559|431312:439964|437800_438424_+|WP_070966106.1|DBSCAN-SWA MEGIKIAVLISGGGTNLQALIDAVEAGFIKGSIALVISDRKGAFGLIRAENHGIQTMLLDKNTYGTIEKRDAVLLQALQEKEIDLVVLAGYLAIVPQNIIAEYRNKIINIHPSLIPSFCGNGYYGEKVHQEAFNRGVKVTGATVHFVNEETDGGPIILQEIVAIDFDDDWKDIQLKVLKIEHKILPLAVKLFAEDRLEVIGNRVKIN >NZ_CP020559|431312:439964|431312_432650_+|WP_070966097.1|DBSCAN-SWA MSTKGLDRMFKLTENKTDVKTEIIAGITTFITMAYILFVNPDLLSAAGMDFNAVFMATCLSAAIGTLIMGFYANLPFAQAPGMGLNAFFTFGVVFGLGYTWEQALAAIFISGIVFIILTVTGLRTAIVEAIPTSLKHAIGGGIGLFIALLGFKNSGIVVPYEATLVELGNFQDPKVLLAVIGLVITSVLMVKRVRGAILIGIIATMAIGVPMGVTDLSAGMNFSFDIRPTLFKLDLLGLLNIGEAGVVGAITSVLTVVISFSLVDMFDTIGTLIGTGAKAKMLDEKGNLPNMSKALMADAVATSAGALLGTSTVTTYVESAAGVAEGGKTGLTAVTTGVLFIFSILLAPFALMVPAQATAPALIIVGVLMMSTLKEINFEDFGEALPAFLTIAVMPFSFSIANGIAAGLVFLPIVKIATGKAKEVHPTVYVLALLFILRFTILPH >NZ_CP020559|431312:439964|433898_434414_+|WP_070966101.1|DBSCAN-SWA MKNTTVSIIMGSDSDLPIMREAADILEDLGVVYECTIVSAHRTPDRMYEFAKTAEKRGIQVIIAGAGGAAHLPGMVASLTNLPVIGVPVKTKILNGIDSLYSIVQMPPGIPVATVAINGAKNAGILAAQIVALQDQGVKESLEKYKKDLKQMVEEKALNLEEVGYESYLSK >NZ_CP020559|431312:439964|435345_436773_+|WP_070966104.1|DBSCAN-SWA MYHEINLDKLKEECGVLGIYTDSDENTSRLLYYGLYALQHRGQESAGIAVNNGLKSNYHKGMGLVPDVFDEDILKRLLGHIGIGHVRYSTSGESYVENAQPLVARYRGGSISLAHNGNLTNAKIIKERLEDDGVIFQTSIDSEVIVNLIARYSGDGMIDAIERTMDLIKGAYSLVVMTEEELIGVRDPLGLRPLCLGKMGDSYVLASESCAFDVMGATLVRDIEPGEIVTINKEGIQSTFYKNNGTRASCIFEYIYFARPDSVIDGVSVYEARKNAGRILAKEHPVEADLVVAVPDSSVPVAIGYAEASGIPFGEGLIKNRYVGRTFIQPTQSMRELAVRLKLNPLKDNLQGKKIVMIDDSIVRGTTSRRLVERLKSAGAKEVHVRISSPPVAFGCYFGIDTPDRNQLIGAVKTVEQIRKTIGADSLGYISTDGLVKSTGLSKEHFCLACFNGVYPLEVPEVGDKKVFERLSGGE >NZ_CP020559|431312:439964|434595_435306_+|WP_070973066.1|DBSCAN-SWA MEKLQMLYEGKAKKVYKTKNEDQYIVEYKDDATAFNGEKKGTIINKGIVNNQMAALIFAILKEQGVDNHYIETLSDREMLVKAVKILPVEVIVRNVAAGSMAKRLGMEEGKVLKAPVLEFCYKNDELGDPLINEDHVMALELATEEEIKRIKELTFKINEVLKKFFIEKDLKLIDFKLEFGLYKGQVILADEISPDTCRLWDVHTNEKLDKDRFRRDLGKVEESYQEVLNRLKNSK >NZ_CP020559|431312:439964|432770_433874_+|WP_081562239.1|DBSCAN-SWA MMVLEGKKLGLHFTVLDPSMDCPAFSIVDEYIEGDFYDKDKIRKLAEATDLITYEFEHIDADILMELKEEGYKIYPTPSTLKIIQDKFQQKNFLRQCNVPVPDFDAVDSVEALDAAVDKYGLPLLLKSCRGGYDGKGNYLIRHREEIPKAYHTLGGDATQLMVEAFVPFIKEVSVVVARGVDGEIKVYPLAENIHENNILKTTIVPARVNKVVAHKAQALALKTMELLKGVGIFCVEMFVDADDDVLVNEIAPRTHNSGHYTIEACSTSQFAQHIRAILGLPLGETKLLKPAVMINLLGGDGYDGRAKLVGAEEILAIPEVYLHFYGKTYTQPERKMGHVTVLAEDVDSALSKGDKVKELMRIIAEE >NZ_CP020559|431312:439964|436784_437813_+|WP_070973068.1|DBSCAN-SWA MTYKNAGVDVEEGQRAVQLMKNHVKSTFNQHVLEDIGGFGGLFALDLKDIKEPILVSGTDGVGTKLKLAFLLDKHDTIGQDCVAMCVNDILCQGAKPLFFLDYIATGRLKAEKVADIVKGIAEGCKMAGCALIGGETAEMPGFYQDGEYDVAGFSVGMVDKSKVITGKDIQVGDVIIGIPSSGVHSNGFSLVRKVLLEGDKFDLNAPMEELGNTLGETLITPTKIYVKAVSEVLKAVEVKGIAHITGGGFYENVPRILPEEVDAHIQLDSWSIPEIFKMIQKIGNIQEEEMYKTFNMGIGMMLVVQAKDAESTLKVLQEVGESPYKIGEIRAGNKQVVLWRE >NZ_CP020559|431312:439964|438434_439964_+|WP_070966109.1|DBSCAN-SWA MIKRALISVSDKTGIVDFAKALSKLGVEILSTGGTAKLLRDGGVNAIDVSDVTGFPECLDGRVKTLHPVIHGGILAIRDNEEHQKTLQQQNITPIDLVVINLYPFKETILKEGVTMEEAIENIDIGGPTMLRSAAKNHKFVTVITDPKDYGKVLEEIKEAGDTCFATRYDLALKVFQHTSHYDTLIAAYLGKDKEGFGDTLTLTYEKVQDLRYGENPHQQAVFYREVGLQPGTLVEGIQLQGKELSFNNINDANGALELLKEFEEPTVVAIKHTNPCGVASGEDIYEAYNKAFEADPLSIFGGIIAANQVIDGRTAEKMKDVFLEVIIAPDFTEEALKIFNDKQNLRLIKLTNITAKKEKAIDMKKVAGGLLIQDVNKELIKEIEIVTEKKPTEKMMEDLVFAFKIVKHVKSNAIVLVKDKQTLAVGPGQTSRIWALQNAIKNSTHDLEGSVMASDAFFPFSDCVDAAFKAGVKAIIQPGGSLNDKLSVEACNEKGIAMVFTGMRHFKH |
8 | Prochlorococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
744274 : 793181
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP020559|744274:793181|DBSCAN-SWA AATGACAGATAAGAAAGAAAAAGTAATTTTTAGTGGAGCACAGCCTACTGGTAGTTTAACCTTAGGCAATTATATTGGTGCTATTCAAAATTGGAAGGCATTAGAAAATGATTATCAATGTGTGTATTCCATCGTAGATTTACATTCATTGACAATACGCCATGATCCAAAGGTTTTTAAAGCCTCTTGCTTATCCTTTTTAGCACAATATTTAGCATGTGGCTTAGATCCTGAAAAAAATATTATCTTTTTTCAATCTCATGTCATACAGCATGCAGAATTAAACTGGATTTTAAATTGTGTTACTTACATGGGTGAACTTAATAGAATGACACAATTTAAGGAAAAATCTGAAAGACATAAGGATAATATTAATGCTGGTCTATTTACTTATCCAGTACTGCAGGCAGCAGATATTTTATTATATCAAACTGATTTAGTGCCTGTAGGGGAAGACCAAAGGCAACATTTAGAATTAGCTAGAGATATTGCTATTCGATTTAATAACGCCTATGGGGAGACTTTTGCATTACCAGAGATACATCTATCAAAAGTAGGCGCTAGAATAATGAGTCTCCAAGAGCCGGAGAAAAAAATGTCAAAGTCAGATGATAATGTAAATGGAACCATCTTTCTACTGGACAGCAATGATGTTATTCTTAAAAAAATGAAAAGAGCTGTTACAGACAATGAAAACAGTGTTACATACCGAGATGAACAACCTGGTATAAAAAACCTTATAACCATTTACTCTAAGTTAGCCAATTGCAGTGTTCAAGAGGTAGAAGAAAAATATGCGGGGAAAGGTTATGGTGTCTTTAAATCAGATGCGGCAGAATTAGTGGTAGAAAGTTTAAAACCTTTTAAAGAAAAGTATGAAGAGTATATGAAGCATCCTGATTATATTACCAATGTTTATAAACAAGGGGCAGCTAGAGCCACTGAAATTGCAGAAAAAACCATGAAGGATGTAAAGGAAAAGATAGGATTAGTATAAAATCATATCAAAGTCTCTATACTAAGTATAGAGGTGATAGAGATGAAGAAAACAAAAAATCCAGTTATTCCTGAAGCTAGGCAAGCCTTAAATTCTTTTAAAGCAGAAGTTGCTAGGGAATTAGGACTTCAAAATAATACCTCTGCAGGGTACGTTGGAGGTAACATGGTCAAAAAAATGGTAGAAGAAGCAGAAAAGTCATTAACTCATTTAGGAAGGTCTTAAGACCTTCCTAAATTTATTGACTATTTCTATAGGAACAGGTATTATTTTAGTAAGAAGGATTATATAGACTTCTATTTAAAAGAACCGGACTTGTGTAATTTTTCAGCTGATTCTGAGGAAGAGATTGAAGGATTGCACAATTCAAGTAAAGGAAGTGAGATATTGAAGAAAAGCAATATTTCTTTTATTTTATTTTTAGCTTTTGCCATATCAGGAATCATTATAGGTATCCATATAGATGCTCTTGGCGATATCCAAAACGAAATTTCTTTGCCCTTTAGTGGTGAAATAGAAGTCCAGGAAGTAGTAGATCTAAGAAAAGCCAATGAGGATATGAAAATAAAAATTAAAGAGTTAAAAGCACAGGTGGAAGAATATGAAGAAGAAAAAGCTACAGAAAATATCGTGCTAAAAAATCTAAGATCTAGAATCAATGAATATAGAATTTTAGCAGGATATGAGGCGTTAGCAGGTCCTGGCATCAAAATCACATTAGAAAGCAATTTGGAAGAAAATATAGCGATGACTGTAGAACAAAAAAAATATCTCATCAACCTAGTAAACGAGTTAAAGGCAGCTGGAGCTGAGGTAATATCTATTAATAATCACAGAGTTGCTTCTAGAAGTGAAGTGACTTTGGCTGGAAATCATATAAATATTAATATGACAGCCATCGCGCCACCGTATGTTATTAGGGCTATAGGAGATGTGGAAGGTTTTCATCGATATGCTAGCTACAGAACTTTGTTATTTGAGCTTATGGAAGGAGACGGTATCAATACTACCATAGAGTTTGAGGAAGATATTAAAGTGCCTGCTCTATCTAAAGAAAAACCGATGGAATTTTATACAATTGTAGAAGAGGCGAATCCACAATAAAAAAACAACAGAATTTATTGAATTCTGTTGTTTTTTTATTGTGGATGTTTTTTGGCCTGTTAGCAAATTACTTTAAGGGTAATTTCAGGCTTAAAAGAATTAATGGTATCTTCTATTGTCAATACTTTTGTCCCCTCTGTCTTATAAGTATTGATTTCCTGGATATTTACTATCGTTAAGCTTAAAGCAATCAAAGCGACTACGAATACTTTTTTCATGACATTCCCTCCTAATTCAGTGAAATAAATCTATATACAAAAATGAATTATGGTTATATTATGTTTTGTATACTTTATTTTTTGCAAAAATACAGAAATTATATAGGAAGTTAAAGGAAAATTTTTCATAAATATACAGAAACCAATAAGCTTTATAGAATGATATTGCTGTATTGTATAATAATAAATACAATAGTTATTCTCTATAAGTACAGAGATGATGGCTGTTTGATAGAATGAGAGGAAGAAAAAATGAAGAGGAAGGAATACGAAAAAAATATTTTTTTAAATGAAATTTACCCATTGAATACTGCAACTGGCAATTTGATGATAGAAATTCATTTAGAACAATATATTTATCTATTTAACGAATGGGATAATGCTTCATTTAAAAGAAGGGACTTAGACCCTGATTTGATTTATTTCTTAGAGGAATGTTCCCAGGAAATACCTTTGAAATATGATATTGAGTTAAATATAAGTATTACAGAAGAAGAAAGAGATTTACAAAAAGAAAAAAATATTATAAAAGGGTTTAGAACGCAATATATCCATTACCTTCGTGTGGAAAGAAGAAATCTGAAAGAATTATCTATGCGGGCGGTGTTGTATGTAGTAACGGCTTTTGCTCTAATATTCACTGCATCTATGCTTGAAAGCACCTTATCTGCACATCCTATATCTACAACTTTGTTAGAGGGATTTTATGTAGGTGGCTGGGTTTTTGCTTGGGAGGCCATATCGAGTTTTTCTTTTCACAGAGGAGGTATCACCAGAAAAATAAAAGAATATCAAAGGTTTTTAAGGGCCCCTATTCAGTTCATCTATAGCAGCAAAGATCAGTGAAATAAAACAAGAAAAATTGGGCATTGTAAAAGCTATAAGACTATTATAAAATTTAAATTTAAGCAATCGAGAGGAGGAGTAGATGGATGAAATACCGACTACCTTGGGGAGAAATTTATACTGACAAAATAGATGAAGCTGATATCATTGTTTTAGGTATTCCTTTTGATAGTGCCGTCAGTAACAGGAAAGGTGCAGCGGAAGCCCCTGATAAGCTAAGGGAACTTTCAAGAATTTTACCTCCTGTTACAGAAGAAGGATTATTGCTAAGAAACTTTAAAGTATATGACCATGAAAATGTAGAAATCACCTTAGATTGGGAAAAATATTTTAAACAGGTGGAAGAGACAGCCTTTTCCCTAATGAAGACAGGAAAAACCTGTTTGTTTATTGGTGGAGACCATGCAGTTACCATACCGTTAGAAACAGCTTTTGCTAAAATACATAAAGAAGAAAAAATAGGAATTATACATTTTGATTCTCATCCAGATATTATTGATACCTATGATGGACATCCCTGGTCTCATGCCTGCACGCAGCGGAGAGCATTGGAAATAAAAAACATAGCGCCAGAAGATTTAACTTTTGTTGGGTTGCGGTCTTACATGGAGGAGGAACTAGCGTATTTCGAGAAACATCCGGAAATTAAGATTATTGGAGCTAGAGAGGTATATCGTAAAGGAATAGATTATGTAATAGAGGTTTTGAAGGAAAAGTACAAGGATTACACAAAATTATACATTACGCTAGATATTGATGTGTTAGATCCAGCCTTTGCTCCAGGAACTGGAACACCAGAGGCAGGAGGTCTTAGCACCCGTGAGCTTATGGAAGTGGTCAGAGAAATCATCTTGACTTTACCTGTAGCAGTGGTAGATGTTGTAGAAGTTGCTCCTCCCTTAGACACCTCAGACATTACCAGCTGGGCGGCGTTAAAGATTATTTATGAAATTTTTGGTGCTGTCTATAAAAAGAAGATGAACAAAGAATAATTTCCAAAAGTGAGAAGCATATTATATACATATTTCTATGAATATGATATAATTGACCTGTTTTGAAATACTTATGAAAACAATAGCAAAGGAGGAAAAAAATTGCCAATTATTTTAAATGAGAAACATTCCACAGGACTGTCTATGAATTGGACAGTAGACAAGGTTTTATATCATCAAAAGTCAGACTTCCAAGAGGTGGCTATACTAGAATTACAGGAATTGGGGAGGGCTTTGGCGTTAGATGGTGCGATTCAAGTAACTGTTAAGGATGAATTTGTTTATAATGAAATGATCACCCACGTACCTTTATTTACCCATCCTAATCCTGAAAAAGTATTAATTATTGGTGGTGGAGATGGTGGTGCGGCTAGAGAAGCTGCAAAGCATCCTAAAGTAAAGCAAGTGGACATGTGTGAGATTGATCCTGTAGTTATTGAAGCTTGTAGAGAATATCTACCTGAAATGAGTGTTTCTTATGATAATCCTAAAGTAAACGTCATTACTAAGGATGGTATTGCTTTCATAAAAAATAATCCTAATACCTATGATGTAATTATTATAGATTCCTCAGATCCAGTAGGACCTGCTGTAGAACTATTCCAGAAGCAGTTTTATACCGATGTCCGTGGGGCATTGAAGGAAGATGGATTATTTGTATGTCAAAGTGAATCCTTATTTTTACATATGCAATTAATCAAAGATGTTTATGCCAGCATAAGCAGTTTATTCCCTATTGCAAGGGTATACACATCTACCAATGCTACCTATCCAGGCTTCTTATGGAGCTATACAATGGGTTCAAAAAGATATGATCCATTAGCAAAAGAAGAACTCGAGCCA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37 | Bacillus_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1664277 : 1672824
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP020559|1664277:1672824|DBSCAN-SWA 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TTATAATCCAAGAAATTGAGTTCTTTACTTTATGGGAGGAAGAAGAATTCAAAGAAACCTTCCCAAAGTTGATTTCACAAGTGGTTAGAAAAGAAACGGTATGATGCGTCTATCAGAAATGGAACAAAATCAAAAGGGTTAATGATAATATGAAAAAATTACTAAATAAAGTCAGGATTATTAAATCCTCAGAAGCAACCTACTGGTATGCAGCTTCCATAGGAATTGTTCTCGGAGTAGTTGGAATTTGGAGAGGAAATTATATGACGGACCATAAGGAAAAGAACGGCCTATACATGGTGGACTTTAAGGATTGTGAAATCATTGAAGATAAAAGTTATAAGCAAAAAAACATATAAAAGCACATTACACTCTCAGACCAAATAAGCGTAATGTGCTTTTTAATAAAAAACATGCAGGTCCTTTCGTCCTCGTAATAGGTATTATCTTATCAACGATAATAAAAAAACAAAGGAGAGATTAACAATTAAGAAATAAATTCAATAAACAATAAATTCTATTTTTCCTATATCCATAAAGGGATTATGGGGGGACCAAAAGGGGACGGGAAAAGAGATGCCATACAGAGAGAAAAAAATATATTCTGGAGAAATGTTTGAAGCAGAAATGTATCCTATTTCAAGAGAAGAAAAAAAACAGCCAAGGACAAAAAAAGAAAAACTAACAGTACCAAAGCAAAAAAACCTGAATAACAAAAATGCTGTGAAACATTTAATTAGATTATTGAATAAAAATTTTACAAATAGAGATCTAGCAGTCCATCTTACATATACAGAAGAAAACATACCTATGAGTGAAAAAGAGGCAAGAAAAGATGTAGCAAATTATATCAGAAGAATAAATCATTACAGGAAGAAAAATGGATTACCTCCATTAAAATACATAGCAGTAATTGAGTACAGAGAAAAAGAGGAAGAAGGAAAAACAGTTAGACTTCATCATCATATTGTAATGAGCGGTGACATGGATAGAGATAAAGTAGAGGAGCTTTGGGGAAAAGGAAGAGCCAATGTAAAAAGATTACAATCTGATGAATTTGGATATGAAGGACTAGCCAGATATATATCCAAGGATCCTAAAGGAAGAAAAAGATGGACCCAATCAAAAAACTTGAAACAGCCAACAGTGAGGGTGAATGATAATAAATTCAGTAGAAAAAAGATAGAAGAAATAGCAAGAAACCCAGAGGATAAAGAATTTTTCTCTAAGCTATATCCAGGATATATTTTGAACTCTTGCAAGGTAGAGGTAAATGAAATCACAGCTGGGATTCATATACACGTGAAAATGAGAAGGCTGCAAATATAAAAAAAGGGAGGTAAAAGTAATGAGTCAAGTCAGTAAAAGTTGTGGAGGTTGTAATTTTTTCAACAAAGGTCAGCTGGTACCAACGATAGGAAAATGCTTTATTACTGGTGAGACCAAGAAAGCTAATGAATACTGCACAAAAACAGAATATTACAGACCAAAGGATCAAGAGGCAACTCATTAGCCAGAGGAGGGCATAAGGTTGAAAAATTATTGTATGGCCAATAAGGGAATGTTCTTTGAAAGAGAAGTTATAATGGCAAATCATCAATACAAAGAAAGAGGAATTGCTTTAATACAAAAGATCAGTACTCCGTGGAAAGTACTTAGAGAAGGCAAGAAAATAATATCAGCATTTCCTGAGGGAAAAAGCACATTAGACTTCAGAGGTACCGTATCAGGAGGAATTTCCATCTCGTTTGATTGTAAAGAGACAACGGAAGAAAAGGGGCTACCTTTACAAAACATAGAAGCTCATCAAATAGAGTACATGAAAAAAGCCATAGAGGTAGGAGAAATCACATTTATATTATGCTGCATCCTACCACGTGATAAGCGGTTTTACATAAAAGGTGAAGTTGTCATAAATCATTGGGATAAGTGGCAGGGAAATAAAAGAAAGCATGGATATAATTATATTCCAGTAGAAAAAATGCTAGAGGTTAGATCTAAGCAAGGGATCGTGTTAAATTATTTAGCTGTATTGGATAAAGAGTAGTTTTTAGATTATGTGACATTATGTACCTTAGTGGGGTTCTCTAGGAGTAATTGCTAGATACATATAAGAAAAAAGAATTGTGTTAATTATCGTAGATAAAGATGTTGTCTTATCATAAGTAAAACGCAAGAAAAATATAACAGATAACACTATTACTACAAGTGCTATTTTATATTTGGTAGTTGAGCCAAAAAAATTCACTAACTTGGTTTTATATGAGTATTTTCTTTCAAGCATATAGAGGAGTGATATGGAGAGGCTTGGATAAAAAAATAGTGATAGAAGATTCATAACAAACACAACCCTTCAAACAAAATGTAAGTTAATTATAGCATAGCAATTTTAAATACACTATGCATTAAAATAAGATTTAATGTCGCACTTCAAGATTTACTTGAAATAGAATTTTGAAATTATTAAAGAAAGAGAGGTCTTAACAATGAACGATTTCGGACACTGTTATTATTGCGGTGAAGGAATTATGTTAGATTACCCCAAAGAGGCTACACCAGAAGAAAAAAATAAAGTGGCAACCAAATTCTGCAAATGCCCACAAGCAAAGATGGAAGCAGATAAAGAACTTGAAATAGAGAGGGCAAAATAGAGGATCGTGCAGCTCTTCGGAGAAAATGCAACAGAAATGGGTCTTAGTCCTATTCCAAAAGAAGAAATTCACAATCTGATGAATAGAGTTGTTGAGTTAATATCTAATCAATTCATTAGAGGATGTACCATTGAAATTAACAGTGTAACCAAGGCTAAAATCTCAGTCTCATCAAAAGGCAAAATTAACATTGAACGGGCACAGGCCATAAAATATAAGCTTGAAGCTTAGTGATTAATTGAAACAACAGAAAAAAGGGGGTATAGGGAAATGTTATCGATAAAGTATCCTCAAGTATTAGAAGAAAGTGAACTTTTAAGATTATTCCGGGAGTATAGAGAAACAAGAAGTACATCCATAAAAGCCAGGTTGATTAAACATAATCTTAGATTAGCTTCATATGTGGGAAACAAGTATAAAAAAGATGATGATGATGTATTTCAAGTAGCTTGTATCGGTTTAACTAAAGCAGTAGAAACCTTTGATCCAGATAAAAAAGCAAAATTTAATACTTATGCCATTAGATGCATGACCAATGAAGTATTCATGTATTTCAGAAAAGACAAAGATTATGGTAGAATTCAAGTTTATTTAGACAAAGAGATCATCAATCCTCAAGATGGTAGTAGCACAGCAACTCATGAAATTATACCCAGTGATATGAACTTAGAGGAAGACTACATGGAAAAAGTTCTACTAGAAACAATCATAGAGGTATCAGATGAACTAATTTTAAAGAAAAATAAAAAACATCAAGAAATTATAAAGCTTAGGCAAAATGGAATGAGTCAAGTAGAGATAGCCAAAAGATTTAATTTATCTCAATCCTATATATCTCGAATAGAAGCAAAGCACTACAAGGAGTTAAAAGTGAAAGTAGAAGCTATTTTTAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP020559|1664277:1672824|1669083_1669380_+|WP_070968620.1|DBSCAN-SWA MDKLQTVLETRQKFVNAYKESLIISIDGSRGKIHCAKEYFKELILEHSVKLVNDGTNKYPIRASIIIQEIEFFTLWEEEEFKETFPKLISQVVRKETV >NZ_CP020559|1664277:1672824|1670822_1671323_+|WP_070973208.1|DBSCAN-SWA MANKGMFFEREVIMANHQYKERGIALIQKISTPWKVLREGKKIISAFPEGKSTLDFRGTVSGGISISFDCKETTEEKGLPLQNIEAHQIEYMKKAIEVGEITFILCCILPRDKRFYIKGEVVINHWDKWQGNKRKHGYNYIPVEKMLEVRSKQGIVLNYLAVLDKE >NZ_CP020559|1664277:1672824|1671933_1672158_+|WP_070968629.1|DBSCAN-SWA MQLFGENATEMGLSPIPKEEIHNLMNRVVELISNQFIRGCTIEINSVTKAKISVSSKGKINIERAQAIKYKLEA >NZ_CP020559|1664277:1672824|1665860_1666334_-|WP_070968601.1|DBSCAN-SWA MNSYEKLLIEEPEIIIYDQADLEDDSKGFYVETTVAKVILISKKVKITKEKRCVLAEEFGHHYTTVGDITDQTKVENRKQELKARRWAVKRLIRVEQFIDAFKAGVRNRHELAEFLDVTEDFIETALDHFKGIYGHSYTIGEYTIFFSPLYVYKSFE >NZ_CP020559|1664277:1672824|1664277_1665843_-|WP_070968599.1|DBSCAN-SWA MKKGVAYTRFSSDMQSVDSTEAQLQEIQKYANTHDIQIIKIYSDEAISGKTDKRPALQQMLSDAKKGLFDIVLVHKVDRFGRDRYDSAIHKAQLKRQGVSIQYAGQSISDNPEGRLMEGILESFAQYYSENLANETMKGLKVKARRAEFNGGIPPLGYDVLDKKYVINEVEARVVKLIFDMHASGKTYGEIFASLKFKGYKTKRGADFTKNSLHSILNNEKYIGIYSYNKTAPRLYGKRNSRKQKDLDEIIRIPDAVPKIIDLNTWNLCQERMKSNRESRAKYRAKVTYLLSGIIYCECDSKMHGNTRNNGYHNYHYYRCAKGCPNSIQKDTVEDFVLYQLYETYFTDKAIKGLTKKLNEFARAAFEGKDNDMVLIRKDLKRVETEIINIVNAISTIGLSEALTEKLKDLEQVKRDLSFELIELEHSVNTYLIPEDAITELLGRYKTSIEERNIEECSKFIRKFVKRVTVSKDDVFVEFLMDYITQRLELNCVRTSASTSTAPKEKPLNSYLNMSLKVFLC >NZ_CP020559|1664277:1672824|1668640_1668889_+|WP_070968613.1|DBSCAN-SWA MKSTGIVRKIDDLGRLVIPKETRRNLGIKEGDPVEFYVEDEKIIIQKFQRQCIFCGNQEDLKLVLDKPVCASCLDTIGKEKE >NZ_CP020559|1664277:1672824|1668893_1669091_+|WP_070968617.1|DBSCAN-SWA MFQMWGQANAYARFLLLIFWTSPAWFSVATWIFCKKKAPVTAKQTRALKNTINRILTDQEGFING >NZ_CP020559|1664277:1672824|1669425_1669635_+|WP_070968623.1|DBSCAN-SWA MKKLLNKVRIIKSSEATYWYAASIGIVLGVVGIWRGNYMTDHKEKNGLYMVDFKDCEIIEDKSYKQKNI >NZ_CP020559|1664277:1672824|1667204_1667441_+|WP_070968607.1|DBSCAN-SWA MDKQEKKKIIGRVISDKRQSKKLTQLELSELTGLSRNYICDIENGRYMPSLDALTKLALPLNIDLNFLLSMTEIQFKY >NZ_CP020559|1664277:1672824|1668473_1668641_+|WP_169824217.1|DBSCAN-SWA MKHGKRLTKKQKLFLASKGLNPENWLSVKNTSEKMVFVHRQREKTRTFDKKGEGL >NZ_CP020559|1664277:1672824|1672197_1672824_+|WP_070968632.1|DBSCAN-SWA MLSIKYPQVLEESELLRLFREYRETRSTSIKARLIKHNLRLASYVGNKYKKDDDDVFQVACIGLTKAVETFDPDKKAKFNTYAIRCMTNEVFMYFRKDKDYGRIQVYLDKEIINPQDGSSTATHEIIPSDMNLEEDYMEKVLLETIIEVSDELILKKNKKHQEIIKLRQNGMSQVEIAKRFNLSQSYISRIEAKHYKELKVKVEAIFK >NZ_CP020559|1664277:1672824|1666357_1666975_-|WP_070968604.1|DBSCAN-SWA MQIGQRIKKIRNSLGLTQSQLASRANISRSYLGDVENGRYNPSLNMLENIAEVLNTSVDYLLAKSVSCLIESRLKELNMSLEELAEKTNLPLMYLKTLDDKTPDDKDYEIINLIAQTLKMHPKPLRIALARQEQPDPENKNNNNGVNETIELKGVDNILANMLDDDKILTLAAHRAGHEGPLSEEEIEKIKLAIRIALANNNTKK >NZ_CP020559|1664277:1672824|1668021_1668210_+|WP_070968610.1|DBSCAN-SWA MCKTTETITIYTQHKLNRHTGEVIRSNPVELTEEQFLDWVEPAIPHLVRILLDSMKDRKEVK >NZ_CP020559|1664277:1672824|1667469_1668006_+|WP_081561980.1|DBSCAN-SWA MKGLKIFNSQEFGQVRTLIIQNEPWFVGKDVAEALGYAEPRSVISKKVDEEDKGVARMETPSGMQEMTIINESGLYSLILSSKLESAKKFKRWVTSEVLPSIRKTGSYLLNYKPKATSVGEVASLIKILKVSMKDQGSAAHEITSMEKMICEQFNIDLPENFVKKPAYMQLTLTLPIE >NZ_CP020559|1664277:1672824|1669852_1670605_+|WP_070968626.1|DBSCAN-SWA MPYREKKIYSGEMFEAEMYPISREEKKQPRTKKEKLTVPKQKNLNNKNAVKHLIRLLNKNFTNRDLAVHLTYTEENIPMSEKEARKDVANYIRRINHYRKKNGLPPLKYIAVIEYREKEEEGKTVRLHHHIVMSGDMDRDKVEELWGKGRANVKRLQSDEFGYEGLARYISKDPKGRKRWTQSKNLKQPTVRVNDNKFSRKKIEEIARNPEDKEFFSKLYPGYILNSCKVEVNEITAGIHIHVKMRRLQI >NZ_CP020559|1664277:1672824|1670624_1670789_+|WP_156778779.1|DBSCAN-SWA MSQVSKSCGGCNFFNKGQLVPTIGKCFITGETKKANEYCTKTEYYRPKDQEATH >NZ_CP020559|1664277:1672824|1671762_1671927_+|WP_156778780.1|DBSCAN-SWA MNDFGHCYYCGEGIMLDYPKEATPEEKNKVATKFCKCPQAKMEADKELEIERAK |
17 | Clostridium_phage(20.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1676169 : 1730149
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP020559|1676169:1730149|DBSCAN-SWA TATGCCACAAAAACCATTAAGACCTTGCAAAAAGGCGGGATGTAGAAATCTAACAAGAGAAGGCTATTGCAAAGAACATAAGCAGCTTGAATTACTTGATAAGCAAGAAAGAAATAAATATTACGATCAACAGGTCAGGCATAAAAGAGATAAAAAATATACGGAGTTTTATCATAGTAAAGCGTGGGGAATAGTAAGACAGCAAGCATTAATAAGAGATAATGGATTATGCCAACACTGTTTAAAAGAAAATAGAATTACCCTAGCGGATATGGTACATCATATTAAATCGATTAAGGCTGCATGGCATTTAAGATTAGTGCTGAGCAACCTTATTTCTTTATGTAATAGCTGCCATAACAAGATAGAACGGAGGGAGGGGGCACCTGAAAAGTTTTAGAGAAGTTTCCAGAAACCGATTGGCCTCCTTCGTGTGAGATTTTTTCCCAAAATGAAAATCGTTTTAGGCTAGGAGGTGAAAATCATGGCGGGAAGATTAAGTAAACCTGTACAGCTTCTAAAGGTGGAAGGGAAAAGCCACAGGACAAAAGAAGAATTAGAGCATAGAGAGAAGATGGAAAAGTCACTTTACACAGGAACAACATTTAAGGAATCCCCCGTTGTGAAGGAGGATCCTATAGCCCATAAAGAATTTCTTCGATTAAAAAAATTGTACAAAAGTATTCAGTATGTAGACGGGTTAGATGAGCAGGTGATTAATCGATACTGTATGATGATAAGTCAGGAAAAAGCTATGCAGAAGTTCATAGAGAAGATGAATGAGGATATCGACAAATGTGAGGATTTTTCAGATCGATTAGATCTATATAAAACAATCTCAGGTGCTACTGCTAAACTTGTTCAAATTAGAAATATGCTTATTAAACTGGAGGATCGGCTTTTTCTGAACCCCACAGCCAGAATGAAGTCTATACCAAAGACACCACTGGAAAAAAATAAAGAATCACCCATGGCAGAATTTTTAAAGAGAAGAAATAACAATGGTTCATGATAAGAGTAGAGCTTTAGAACCGATAGAATTCATACAAATGCTAAAAGCGGTGGATGACTTTTATGGACAGCCTTTTATACTATTAGATTGGCAATATAATATATTGTGGGATGTATATGGAACGGTAAAAGAAAATGGGTTGAGACAATATCGATATGCCTACCTAGAAGTTCCAAAGAAAAACGGAAAAACATCTTTAATTGCAGGTATTGCCCTGTATCATCTTGTATGTGACGGACCTGGGGGACAAATATACTGCTGTGCTGCAGATAAAATTCAAGCAGGATTAGTCTATAAAGCAGCTCTTGGAATGATTGAACAGGAACCAGAGCTAGAAGCAACCTTGAAGGTTGTAGATTCTAAAAAAGAGATCACAAACAAATACACTGGTACTATATTGAAAGTCCTTTCAGCAGAAGCCTATACAAAGCATGGACTAAATCCAACAGTAGTTATTTTTGATGAACTTCATGCCCAGCCTAATAGAGATTTGTGGGATGTCATGACTTTTGGTGCTGGTGCGGCTAGAAAAGAACCACTTTGGTGGGTGATAACAACTGCAGGAGATGATCCAGATAGAAAATCAATAGGTTGGGAAATACATGAACAAGCCACCAAAATAGTTGCTGGTGAAATAGTAGATTCCACATGGTATGCAAAGATATACGGGGCACCAGAAGATGCTGATATTTGGGACGAAAATACCTGGTATACGGCTAACCCAAGTTTAGGACATACAATTAATATAGAAACTGTACGACAAGAAGCAGTAGCAGCACGGAATAGTGAAGCAGCTGAAAAGTTATTCCGTTGGCTCAGATTAAATCAATGGGTATCGATAAAAAGGCATGGATGGCTACCGTTAACCTTATGGGATGCTACCACCGGGAAATGGGATCTATCAGAATTGACAGGAAAAAAATGTTACCCAGGCATGGACCTTTCTAGTACAACTGATATAACTGCAGTTTGCTACTTATTTCCACCTCAAGAGGGTATACCTGATTGGAGGGCGATATTTGAGGCATGGATCCCAGAAGACAATATGAAAGAAAGAACTCAACGTGACCATGTTCCCTACGATCAATGGGTTAACGCTAAATTTTTATATGCTACTCCAGGAAATGTAGTGGATTACAACTTTGTAGAAGCTCGTATACTTGCTGCTAATCAACAGTATGATATACAAATGCTGGGTACTGACCCATGGAACAGCAGGATGTTAACACAACGTCTGATGAAGGAAGAAATTAATGTTGTAGAGATTCCCCAGAATATGAAACATATGAGCCCATCAATGAAAACAATAGAGCGATTGATAAAATCAGGAGGTTTAACACATGAAAAAAACCCAGTGGCTAGATGGTGTTGGGGGAATGTAGTGGTAGCTGTTGATGGAAATGAAAATATTAAGCCAATGAAAAATTTATCTCGTGATCGCATTGATTTAACAGTAGCAATGATAAATGCTATGGCTACAGCTATGCTGTTTGAAAGCGTAGAATTTGATGTAGATAAAAGTACAGAAGATTATCTAAAGATGATGGGTTGGAGTTAAAACTTGTAGGAGGTGAAAAATTGAATGTGTTGAAAAAGACCTATTTTAAGATAAAGAACATGATTATGCCATCTAAAACAGTGGACATGAAAAGCGAAGAACTATTGGAGTGGCTTGGAATAAGTACTACTCCTAAAAAATTAATCAGTGAAGTGACCTATTTCACATGTCTTAAAATGCTTTCTGAAACTTTGGGAAAAATGCCACTGAAGTTCTACCAGGAAACCGACAAAGGAATCTTAAAAGCAAATTCTAATGAAGCACATAAGCTTTTAAAAGTGCGACCTAACCCCTTGATGACACCATCAACCTTTTGGGCAACCATTGAACAAAACAGAAATCATTATGGAAACGCTTATGTATGGATTCGAAGGACATTTAAGAAAGCACGCTATGGAGGAAGTTATAAAGTCCAAGATATGTGGATCATGCCTTCGGATAGTGTACAGGTGCTTATCGATGATGCTGGATATTTTGGCAACAAAGGTCGCATATGGTACTCTTATGTGGATAAATTTTCAGGGCAGCACTATGCTTTTAATAGTGATGATGTCTTACATTTTAAAACATCTCATTCCTTTGATGGTATAGTAGGAACACCTGTCAAAGATATCCTTAAAAGTATGGTAGAAGGAGGTTTAGAGAGCCAAAATTTCATGAACAACCTGTATAAAAGCGGCTTGACAGCAAAGGCTGTGCTGGAATATACAGGGGATTTGAACGAAGAAGCAAGGAAAAAGCTTGTAGCAGGATTCGAAGCCTTTGCAAATGGATCTAAAAATACAGGTAAAATTATCCCTGTTCCATTGGGGATGAAACTGGTTCCGTTGGACATAAAACTTACTGATAGCCAATTCTTTGAGTTGAAAAAATTCAGTGCCCTTCAAATAGCTGGAGCCTTTGGAATTAAACCTAATCAAATAAATGATTATGAAAAAAGTTCCTATGCAAATTCAGAAATGCAACAGCTCAGTTTTTATGTGGATACAGAACTTTTTATCTTAAAGCAATATGAGGAAGAACTTAATTACAAGCTCCTTAACGAGGAAGAAGTGGATCAAGGATATTTTTTTAAGTTCAATGAAAAAGTTATTTTAAGAACTGATAGTAAAACCCAAATGGAGGCATTATCAAAGGCAGTTAATAACGGAATTTATACACCAAATGAAGCAAGGGAGTTTTTAGATAAACCGGCAAAAGAAGGGGGAGATCAACTGGTGATGAATGGGAACTACATTCCTATTACTAAGGTTGGAAAACAATATGACTAAGGAGGTGGTGGTAGTGCCTGAGAATAAAAAGTATTGGGAATTTAAGAATAAATCAGCCGATGAAGCAGATTTGTATTTGTATATTGAAGTAGCTTCATGGGGAGGAGGTTATTACGCACATTCAGCTAAAAGTTTTAAAAGAGACCTAGATGCTTTAGGTGATATAAAGACCTTAAATATCTACATCAACAGTCCTGGCGGGGATGTGTTTGAAGGAAATGCTATTTATAATATGCTAAAGCGTAAAGCTAAGAATTGTCAAATTAATGTCTACATTGATGGGTTGGCTGCAAGTATAGCATCTGTAATTGCCATGGCAGGAAATGTTTTTATGCCAAGTAATGCTATGATGATGGTCCATAATGCATGGTGCCTTACTTGGGGAAACGCTAAAGAATTAAGAGACACAGCAAATGCTCTTGAAAAAATCGATACCTCCATTAAGCAAACTTATCTCAACAAAGCAGGTGATAAGCTTGACGAGGAAACCTTGACGGATTTATTAGACAATGAAACATGGTTAACTGCCCAAGAATGTCTAGATTATGGCCTGTGCGATGAAATTATTGGAGAAAAACAGGTGGCGGCTAAATTTGACAACTCAATTTTTAAAAATTATAGAAATGTCCCTAAGATTTATAAGATTGATGATGAGAACTTGAAAGAACCCCTGAATAATCTCCCAGATGAGTCATTAGAATCGCCAAAACAAGATATTGAAGCTGAAAAAGCTAAGCTATTAATGGAATTAGAGTTAATCTAGTTCTTTTTTGATGCTTTAAAATAAAAACCTAAGGAGGATAAAACAATTATGAATAAGGAATTACGAGAGTTATTAAACAAAATTAATGCAAAAAAGGTAGAGGCTAAAAACCTACTGGCTGAGAATAAGATTGAAGAAGCAAAAGCAGCAAAAGAAGAGTTGGAGCAACTACAGGCTAAGTTTAACATCATGAAGGATCTGTACGATGAAGAGGAGGGTGAAATTCAGAATCAAATTGAAGATGGTACAGCGAAGGCAGCAACAGATAAAAAAGTTGATGCAACAAAAGCTTTTGTAAATGTTTTTATAGCAGCTGCACAGAAAAAGTCTATCAATCCAGAAGATATGGAAGTTTTAAATATGATGACTCAAGCAGATCCAGTGGAGGGGATATCC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63 | Bacillus_phage(19.05%) | portal,head,transposase,plate,capsid,integrase,terminase,bacteriocin,tail,protease | attL 1695586:1695600|attR 1730399:1730413 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1733964 : 1784855
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP020559|1733964:1784855|DBSCAN-SWA 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56 | Leptospira_phage(30.0%) | portal,tRNA,capsid,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1868279 : 1959053
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP020559|1868279:1959053|DBSCAN-SWA 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98 | Clostridium_phage(15.15%) | portal,head,transposase,plate,integrase,capsid,terminase,tRNA,bacteriocin,tail,protease | attL 1891070:1891129|attR 1928534:1928676 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2114008 : 2122624
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP020559|2114008:2122624|DBSCAN-SWA AGTGGAGGGTTTACTACAAAAAGTACAACAAGCCAAGGATTATATTTTAGGTAAAATAAACACTATGCCTCAAATAGGGTTAATTTTAGGATCAGGTTTAGGAAGCTTAGCAGATGAAGTAGAGGATGCTGTAGTGATTGATTATAAAGATATACCTAATTTCCCGGTTTCAACAGTAGAGGGTCATGCAGGAGAACTAGTGATAGGACAGCTACAGGGAAAATCGGTTGTGGTCATGAAGGGGAGATTTCATTACTATGAGGGTTATAGTATGCAACAAGTGACCTTCCCAGTAAGAGTGATGAAGGCTATTGGTATTGAACTACTATTTGTAACAAATGCTTGTGGTGGCTTGAATCCCCAATTATATCCGGGAGCCTTGATGATGATTCAAGACCATATTAACTTTATCGGTGCGAATCCTCTTATTGGTCCCAATTATCATGAACTAGGTCCAAGGTTTCCAGACATGTCCTCTGCCTATGATAAGGATTTGATACAGTTAGCCCATAGGGTAGGAAAAGACTTGTCTATAGAAACCCATGAAGGTGTATATATAGCCATCAGTGGCCCTAATTATTTGACAAAGGCAGAGTTAAAAATGATCATAGCTGTGGGAGCGGATACCGTGGGAATGTCGACGGTGCCTGAGGTGATTGTGGCGAGACATAGTGGATTAAGGGTTTTAGGTATATCCTGTGTGACAGATATGGCGATACCGGATCAGTTGGAATCTATCAGTCATGAAGAAGTAATGGAGGTAGCAAATAAAACAAAGCCTAAATTTATTTCCCTAGTGAAAGAAATTCTGAAGGAGGTGACGCTTTCATGAGAATGTACGATTTAATACTCAAGAAAAGAAAAGGAGAAGCACTTACCAAGGAGGAAATCTACTTCTTTATTGAAGGTTACACCAAGGGTAGTATTCCGGATTATCAAGTTTCAGCACTTTTAATGGCGGTGTACTTTCAAAAAATGAATAAAGAGGAGACTGTGTATCTGACAGAAGCGATGATGCATTCTGGTGAAGTGATTGATTTATCAAGTATAGAGGGTATTAAGGTTGACAAGCACAGCACAGGGGGGGTAGGGGATAAAACCACCATAGCCTTAGCCCCTATTGCGGCGGCCTGTGGCATTCCTGTAGCAAAAATGTCAGGCAGGGGATTAGGGCATACAGGAGGAACCATAGATAAATTAGAGTCTATTCCAGGATTTTGTGTAGAGATGACGAAAGAAACCTTTATCCAGAATGTAAATGTCATGAAACTGGCAATAGCAGGACAGACGGCTAATTTAACACCTGCAGATAAAAAACTCTACGCCCTTAGGGATGTTACTGCTACAGTAGATAATATTTCTTTGATTGCCAGTAGTATTATGTCTAAAAAATTAGCCTCTGGTGCCGATGCGATTGTTTTAGATGTTAAGACCGGTAGTGGGGCTTTTATGCAGGATATTGATGAAGCATTTCTATTAGCAAAGGAAATGGTGGATATTGGTAATCGTGTAGGCAGGGAGACGGTAGCCATTGTCACGGATATGAACCAGCCTTTAGGCTATGCCATAGGCAATAGTTTAGAAGTAAAAGAAGCAGTTCAACTGCTGAAGGGAGAAGGACCAAAAGATTTAGAAAAATTGTGTATTACGCTAGGTGCCCATATGTTGCTGTTGGGTAAAAAAGTTGGTACAGAATATGAGGGAAAAAGAATGGCCAAAGCAGCAATCGATTCCGGTGAAGCCCTCAACGTATTAAAAAACTTTGTTAAACAGCAAAATGGACAGATTGATTGTATAGAGAATCTTGATTTATTGCCAAAGACTAAGGAAGTCTATTCCTTGAAGGCAGATAAGAGGGGTTACATACATAAGATTCAAGGAGACATTGTTGGGGCAAGTGCTCTGACTTTAGGGGCTGGCAGAGATACAAAGGATAGCAAAATTGACTTATCTGTAGGGATTCTTCTCAATAAAAAGATGGGAGATTATGTGGAAACTGGGGAGGTACTGGCTTATATTCATTATAACGATGAAAATAGGAGAGATCTTGCTATAGAGCAATTGCTAAAGGCCTATGAAATAGAAGATGAAGCACCAGAGCATAGACCTTTGATCTTTGGCGTTGTAACAAAAAATGGCATTCAGAGGATATAGTTCATAGACTGTTTAAAAATTTTTAGTCTGTTTTTGGCAAAGGCCTTCTTGTATAAGGAATCATATAGATGGAAAACCTAAGATTAAAAACCTATACAAGGAGGAGAATTATGAAAAGAATTTTTGTGAAAACGATCTTTGTTTTATTCGTCATTACTATGATTTTTAGCAGCTATATCACTGTAGCTGCAGAAACACAACCATTTGATATAAATGCTAAAGCAGCTATATTAATGGATGCATCAACTGGTACAATACTGTATGAGAAAAATATACATGAGGCACTACCTCCTGCCAGTGTAACAAAGATTATGACAATGTTATTAACAATGGAGGCGATAGAAGCCAATAAAATTACCTTAGCAGATAAGGTTGTTGTTAGCGAAAGAGCCTCTTCTATGGGTGGAACACAGCTTTATTTAGAACCAGGGGAAGTAAAAACAGTGGAGGATTTAATCAAGGGCATGGCTATAAGATCTGCCAATGATGCCTGTGTAGCCATTGGCGAACATCTTGCTGGAAGCGAAGAAGGTTTTGTTGAACAGATGAATGCAAGAGCCAAAGAATTAGGCATGAAGAATACACACTTTGTGAATACCAATGGTTTACCAGCAGAAGGACATGTTACCTCTGCCTATGATATCGCTTTAATGTCAAGAGAGCTTTTAAAACATAAAGAGATACATAAGTGGTTAACTACTTGGATGGATACTGTTGATGTAGGAATAAAAAATGTCTCCACACAAGAACTAGTCAATACCAATAAACTCATAAGAACTTATAAGGGGGCCAATGGGATAAAAACAGGTTCTACTTCAGAAGCTAAGTATTGTCTTTCTGCCTCTGCAACAAGAGGAAATACTACTTATATAGCAGTAATTTTAACGGCGCCTACTTCTCCAATTCGTTTTAGCGAAGCAGCTAAGTTGCTGGATTATGGTTTTGCAAATTATAATACTGTAAAGGTAGTTGAAAAAGGTGGTGCTTTAGGTACTGTAGCGGTAGAAAAAGGAAAAAATACTCAAGCCAATCTGGTAGCTAAGGATGATCTAAGTATTTTGGTGAAAAAGGGAGAAGAATCCAAGGTGAAAAAGGAAATGATTATTCCCCAATCAGTAAAGGCACCTATTATGCAAGGAGAAAAAATCGGCGAGGTTATCGTTACTTTAGAAGGAAAAGAAGTTGGAAAAGTGGATATCATAGGTGAAGAAACCATAGAATCTGCTTCCATTATCGATATATTAACGAGAATGTTTCAAAGAATGGTGGGTCACTAAGAGGAAAGGAACCTATAAAAAGATTACCTGGCAAAGTAGTACAGCAATGTACTGCTTTGCTTTTTAATAGGATATATGTGTGTTATAATAAGTGAGTAAATTTTGTGAAGGGGAGATGTTATGAAGGTAATCGTTAGTCATGAAAACTTAGATTTTGATGGAATTGCCAGCATGATAGCATGTTCCAAACTACATCCTGAAGCTATTGTGGTCTTTAGTGGACGCGTGAATAATGATGTTAAAAAGTTCTATAGTTTATATAAAAATATTTTAGCTATAAAGTCTGCCAATGAAATTGATCTTAAAGCAATTAAAGAACTAATGATTGTAGATGTAAATAGCTTTAAGAGGGTAGGAAAATTTAAAGAATTAGCCAATCATAGTATTCCTATCACCATTTATGACCATCATCAAGAGACAGAAGATACCATTGTCAAAGCCCGTAAAATTATGAAGCCCTATGGCTCTTGCACAGCTATTTTGGTGGAGTTAATTAAGGAAAAAGAGGTAACTATTACCTCCTTTGAGGCCACCTTGTTTCTTATGGGCATCTATACCGATACTAACTGTCTAACCTTCTCCAGTACAAAACCACAGGATGCAGCCGCCGCAGCTTATCTATTAGAAAAAGGAGCAGATCTAGAAATTGTTAATACTTTTATTCAAACATCCTTTGGTAATGAGCATGACCAGTTATTTTTAGATCTTTTGTTAAATATGGAGACTATGGAGGTAAATAATTATAGGATTATACTTTCTCTTTATGAAAATGATCGTTTTATTGGAGAACTAGGACATATCGCCAGTAAAATGTTAGAAATCAAAAACTGTGATGCTGTGTTTTTGATTGCAAAAATGGAAAACCGTTGTTATTTGGTGGGTAGGAGTTTAAAGGAGGATATCAATGTTCCTTTTATTTTAAAAGAATTTAATGGGGCAGGACATGATAAAGCTGCATCGGCTGTAGTGAAAAATGGTGAACCACAGGTTTTAAGAGAAGCATTGCTAGAGGCATTACATACAAAGATAAAACCACAAATAACAGCAAGAGATATTATGAATTATCCTGTAAAAATCGTATTTGAGGATATGAACATTGAAGAAGTAAGCAAAATCATGCTCAGATATGGTCATACAGGTATGCCGGTGATTAAAGATAACTACATTATTGGTATTATTTCTAGAACGGATGTTGATAAAGCGATGCAGCATGGGTTAGGACATGCCCCCGTGAAGGGATTTATGACAAGAGAAGTAAAAACCATTAGTCCTACAACCTCTCTTAGTGAGATCAATGATCTGCTTGTTAAAAATAATATTGGTCGATTGCCTGTAGTAGAGGAGGATAAGATCATTGGCATTGTAACAAGAACAGATTTATTGAGAATGTTACATGGTAATAATCATCCTTATTGGTATAAAAAGACCTTTACAGAGAATGAAAAAGCAATAAACTGTTTAAATAAAATAAAACAACTTCCAGAAGAAACCTATAATCTTTTAAAGCTTGTGGGAAAAGTAGGAGATTCATTAGATAAAAAAGTTTATGTGGTAGGGGGATTTGTTAGG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP020559|2114008:2122624|2116319_2117438_+|WP_156778903.1|DBSCAN-SWA MIFSSYITVAAETQPFDINAKAAILMDASTGTILYEKNIHEALPPASVTKIMTMLLTMEAIEANKITLADKVVVSERASSMGGTQLYLEPGEVKTVEDLIKGMAIRSANDACVAIGEHLAGSEEGFVEQMNARAKELGMKNTHFVNTNGLPAEGHVTSAYDIALMSRELLKHKEIHKWLTTWMDTVDVGIKNVSTQELVNTNKLIRTYKGANGIKTGSTSEAKYCLSASATRGNTTYIAVILTAPTSPIRFSEAAKLLDYGFANYNTVKVVEKGGALGTVAVEKGKNTQANLVAKDDLSILVKKGEESKVKKEMIIPQSVKAPIMQGEKIGEVIVTLEGKEVGKVDIIGEETIESASIIDILTRMFQRMVGH >NZ_CP020559|2114008:2122624|2120804_2121548_+|WP_070969869.1|DBSCAN-SWA MSCRIKIQAFEGAFDLLFHLIEKNEIDIYDIPINEITEQYLHYLYQMEKLDLEVASEFLVMAATLIEIKSKMLLPKEVVKEDKVEAETVDPRSELVERLLEYKRYKCMAEELKQREDHYNKLYFKQKEEIIMETSEADVALENLKLDDLVKVFEKLLLNYEKHKNDRPYNVRHISRDTYTIEDKITSILTMLQHHKKITFDSIFILAKEKLEVVVTFLALLELIKGKKIKVMQEKSFEGIVIEGISN >NZ_CP020559|2114008:2122624|2122210_2122624_-|WP_070969872.1|DBSCAN-SWA MKMEQLGRHILAEFYNCDSDILNDHKLIEKYMVEAAEAANATVVTSNFHMFNPWGVSGVVVIQESHLTIHTWPEYGYASIDVFTCGGEVNPWASFEYLKEKLKAEVTDTEELPRGIVSRIRKHSKNKYTDIKYKISV >NZ_CP020559|2114008:2122624|2121567_2122134_+|WP_070973305.1|DBSCAN-SWA MNREEIKCIIEAVLFAWSEPISIKELSRVLSIEGKEIKKILEEMIDAFNFHKRGIQIIKMNDYYQLATRQEYYPYIRKLLEPKENKGLTQAALETLAIIAYKQPITKAEIEGIRGVKCDKALSTLQEKSLIEEQGRLEKIGRPIVYGTTMQFLKTFGLKAIDDLPDISGFKLLAENSEMGGEKDIFSK >NZ_CP020559|2114008:2122624|2117558_2120180_+|WP_070969861.1|DBSCAN-SWA MKVIVSHENLDFDGIASMIACSKLHPEAIVVFSGRVNNDVKKFYSLYKNILAIKSANEIDLKAIKELMIVDVNSFKRVGKFKELANHSIPITIYDHHQETEDTIVKARKIMKPYGSCTAILVELIKEKEVTITSFEATLFLMGIYTDTNCLTFSSTKPQDAAAAAYLLEKGADLEIVNTFIQTSFGNEHDQLFLDLLLNMETMEVNNYRIILSLYENDRFIGELGHIASKMLEIKNCDAVFLIAKMENRCYLVGRSLKEDINVPFILKEFNGAGHDKAASAVVKNGEPQVLREALLEALHTKIKPQITARDIMNYPVKIVFEDMNIEEVSKIMLRYGHTGMPVIKDNYIIGIISRTDVDKAMQHGLGHAPVKGFMTREVKTISPTTSLSEINDLLVKNNIGRLPVVEEDKIIGIVTRTDLLRMLHGNNHPYWYKKTFTENEKAINCLNKIKQLPEETYNLLKLVGKVGDSLDKKVYVVGGFVRDLLLKRENYDVDIVVEGDGVLFAEELNQKLQGKLLVHEAFGTASIRLEKNNVIDIVSARREYYEYPAALPKVEKSSIWNDLFRRDFTINCMAIQLNTESFGKLIDYFDGLQDMKHRRIRVLYNLSFIEDPTRIFRAIRFAARMDFTIENETKNFMMEAIRDHMIEKVSDDRIREEISPMLEDENFIKYILSMQAFNLFEAIDPDLVLTKESIKKLSSIQSAIDAFREFFSIIPSVRRIIITGIFRDFPMDRLHDVLTKFVANKQLATNIYHTLENKENIYQLLTKEDVDRFTLYRVLNQHDLEDLIFYYNDCEDGYIKHYIMYYMLHLKNIKLSMSGEDLINLNIKPGPIYKKVLESVLKAKVSGEIYNKDDEINYAYDLYQELKGEENV >NZ_CP020559|2114008:2122624|2114008_2114839_+|WP_070969853.1|DBSCAN-SWA MEGLLQKVQQAKDYILGKINTMPQIGLILGSGLGSLADEVEDAVVIDYKDIPNFPVSTVEGHAGELVIGQLQGKSVVVMKGRFHYYEGYSMQQVTFPVRVMKAIGIELLFVTNACGGLNPQLYPGALMMIQDHINFIGANPLIGPNYHELGPRFPDMSSAYDKDLIQLAHRVGKDLSIETHEGVYIAISGPNYLTKAELKMIIAVGADTVGMSTVPEVIVARHSGLRVLGISCVTDMAIPDQLESISHEEVMEVANKTKPKFISLVKEILKEVTLS >NZ_CP020559|2114008:2122624|2120172_2120793_+|WP_070969866.1|protease|DBSCAN-SWA MFSLDIVTILLTLPGILLALTIHEFSHAYSAYLLGDDTAKYYGRLTLNPLAHIDLVGFLMLIFFRFGWAKPVPINPKNFSDRRKGYFLVSIAGPLSNIVLAILSTFFFALAIRLALSEFIHTMLYFSIFINLVLAVFNLFPIPPLDGSKILLSILPSSFEETYYRLQKYTYILLFLLVYFRVINRVLFPIVQYLLNLLLGFVMYLV >NZ_CP020559|2114008:2122624|2114835_2116161_+|WP_070969856.1|DBSCAN-SWA MRMYDLILKKRKGEALTKEEIYFFIEGYTKGSIPDYQVSALLMAVYFQKMNKEETVYLTEAMMHSGEVIDLSSIEGIKVDKHSTGGVGDKTTIALAPIAAACGIPVAKMSGRGLGHTGGTIDKLESIPGFCVEMTKETFIQNVNVMKLAIAGQTANLTPADKKLYALRDVTATVDNISLIASSIMSKKLASGADAIVLDVKTGSGAFMQDIDEAFLLAKEMVDIGNRVGRETVAIVTDMNQPLGYAIGNSLEVKEAVQLLKGEGPKDLEKLCITLGAHMLLLGKKVGTEYEGKRMAKAAIDSGEALNVLKNFVKQQNGQIDCIENLDLLPKTKEVYSLKADKRGYIHKIQGDIVGASALTLGAGRDTKDSKIDLSVGILLNKKMGDYVETGEVLAYIHYNDENRRDLAIEQLLKAYEIEDEAPEHRPLIFGVVTKNGIQRI |
8 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2185768 : 2261211
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >NZ_CP020559|2185768:2261211|DBSCAN-SWA 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95 | Clostridium_phage(23.91%) | portal,plate,integrase,tRNA,tail | attL 2186112:2186128|attR 2228773:2228789 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3328303 : 3343758
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >NZ_CP020559|3328303:3343758|DBSCAN-SWA 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11 | Bacillus_phage(62.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3611405 : 3660084
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >NZ_CP020559|3611405:3660084|DBSCAN-SWA 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49 | Leptospira_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3683121 : 3694526
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP020559|3683121:3694526|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >NZ_CP020559|3683121:3694526|3686621_3686777_-|WP_156778683.1|DBSCAN-SWA MKIGRLIEILKAYDKEYKLYDSENPEFYLSSLEYQEEEDRFYMYFQEEEEK >NZ_CP020559|3683121:3694526|3683121_3685830_-|WP_070963608.1|DBSCAN-SWA MNLEGRIDYLKFYQKHIQKGKISGENLVGLCPFHEDTKPSFGANIKTGVYNCLACGEKGNAITFLAKLYRIDNKEAYRLLLQEEGLYEENHQGRKDANNHRNRFINTTDNKESNHSTRKPSDSEGSKHNNQKNNIQDTKTPEYMTTKATTKKEVPKYIVEDYCKEKRLPEDFIRSLGIRDGKTGITIPYKDEAGKILSNRQRYHRDSPTRFSWARGSKINLYGLWQIEKIKSIGRVILVEGESDCHTLWHHGIEEILGVPGATTFHGDWVEMLEGLDVYIHHEGDMGGDTFFNKISKTLKERNFKARIYKIQCSSLGVKDPSDLHIKDPNTFKENWQRVMAEAEEIFLINLQEEEENLIPNAPVKLRQPTGWRITEGGVEMINAKTRLPYLVCRTPILISRRIKALGMEEEKVEIAFFRDKKWHFVREQRSTIFQARTIIKLADVGVTVTSENAKFLVRFLENLEAENFDIIETLQSVNQLGWHGENFLPGREGELVLDMEHGERRWVEAYSKRGELKDWIKMMKPLRQNTIFRFILASSFAAPLLKLLNHRIFFVHNWGDSRGGKTAALKAALSVWGNPEELMTSFNATNVGLERLASFFNDLPLGIDERQVAGGKQEYIETLVYMLSMGYSKVRGTKTGGLENQKSWRSIVLTTGEEPLTTMGSQTGVHTRALEIHGSPFEREEEARSMHNFITMNYGVTGPFFIEKLMEDMKPHELQDRHKEIQETLMGINENHKKIGSHVSSVAVVILADELMNKWLFLEKENISIAMGNEILSNLEDMMHTDIVERAYEFIQGWLISNIEQFRGNPRRESYGVMEDNRFYVFPQILQEALDKQGYSYKKIIQGLGDRGYIDITYEKSGKKRQTVVKKIEGKACRMVSFDLSGIEDLEETPPFKAVTL >NZ_CP020559|3683121:3694526|3686791_3687199_-|WP_070963611.1|DBSCAN-SWA MKEIFTLADSLKELKEWKKQLDQERKEVNGKIEALEESLSQAMIQEELENFNRGGMMYYLNTKLYANAIPQRKEALFTALKKEGYGDLVYETVNANSLAAFIKEQVEENDEKLPSWLEGLVNTYEKISVGMRKGK >NZ_CP020559|3683121:3694526|3688804_3688960_-|WP_156778684.1|DBSCAN-SWA MKSKLAAILWPNSKEVGVKEAIAPMPIKVKAFQHQVQGYNMALRTMGVMEG >NZ_CP020559|3683121:3694526|3689687_3690080_+|WP_081562170.1|DBSCAN-SWA MTIGERIRKMRKEKRYSIMDIRDLTGLSKSTISEVENDKSNPTTETLQKIAKALGVSVDTFFKEETDQDEAPALPIEFTTPQKAMEFILKQPAIMGFGGFDVNKLGDEEIVEFANELLRQLELLSYKYKK >NZ_CP020559|3683121:3694526|3690629_3691760_+|WP_070963618.1|integrase|DBSCAN-SWA MQGGVRKRGDSWYYFFEAGKVGGKRKKIERKGGNTKKEAQEALRQALNEFEKAGAVITESQLSVADYFDYWYKEYVLINCKYNTQQGYRNIIENHIKPTLGVYKVKSLSPAVLQEFLNKKYRDGFTKNTLAGFYGVLSGALKMAVYPYQFMKENPMQYVSMPKYDNTKKDKEDLKVIALEDFKRIIDRFPEGSSFYIPLQIAFHTGMRATEVCGLTWDCVNLEKRSIKVEKIVIKKDREWVFGTPKTLSSNREIFIGDTLVNILKKHRKAQMENKLEYGKHYIKSHFVCTKENGELVSPDSLKYLSRVVNYELMIPFNFHSLRHTHATMLLEAGANIKEIQERLGHSKLATTMDTYSHITNKLKQDSVDRFESIIK >NZ_CP020559|3683121:3694526|3694115_3694526_-|WP_070963623.1|DBSCAN-SWA MYLGQDDRVTVEHQFDRLCKKVMLGEARSCKKERAKRSQKEISINEVKEIATYDEYEIENTFQWGDEVFTFKNDFLYEAVRLLEKDKRNIILLSYFLEMTDEEIARTLKAIRRTINYKRNRALKELKKRLEDWNEY >NZ_CP020559|3683121:3694526|3685879_3686620_-|WP_070963610.1|DBSCAN-SWA MSENKGDKKAIEKTGFQLPIAQEEIKEAMLQEMEGLELSFDRAKIPSGGGLAFEVPGEEADRPQLLQELVGVMVDHHPVNGYWQEKYTGGSNPPDCSSMDGKKGEGSPGGDCKTCPLNEFGSDEDRKGKACKNMHRIYLLKSGEMLPLLLTLPPTSLKNFSNYMAKRIITKGHRSYSVVTKITLKRTQSSSGIPYSQAQFTVAEVLEKDIAQQLAEFAEEIKRITREVEVMEDYMPETEEAGELPF >NZ_CP020559|3683121:3694526|3693853_3694126_-|WP_070963622.1|DBSCAN-SWA MSINTVSKTISYETIVKATQGDTHSIDQIIGFYTPYMQALATVEYVGDNGKIYFAVDEEMLGRMRAKLMKRVMKFKPVPYQRKEKERCRC >NZ_CP020559|3683121:3694526|3690097_3690562_+|WP_070963617.1|DBSCAN-SWA MMWIDEVVTGLLDLYATKDVYELYEALEISIVYLEEDSILLQGHDALYNRNYLDREVVFLRGGLSLEYERFILAHELGHALLHTHLVSNTFHSLTNLDKLEKQASYFAVRLLDVKLDSIALEGFTIEQIASTLELPMECLEIIREMEEGYGLNP >NZ_CP020559|3683121:3694526|3689271_3689481_-|WP_070963615.1|DBSCAN-SWA MKNKIKEVLRKRGIKVSYVLSVTGFSKSYFYDVMKGKTVPSLMNARKIAEVIEVPLDELFPVEKLSKQE >NZ_CP020559|3683121:3694526|3688990_3689206_-|WP_070963613.1|DBSCAN-SWA MHHGDYLYTVEEVAQILKVNKNAVYDLINAKVLRALKLGRLKITRFEVLRFLKEYTGKDLSNLNEIKELNH >NZ_CP020559|3683121:3694526|3691856_3693590_-|WP_156778879.1|DBSCAN-SWA MKANKTFVNRKLGQTLEQIRVAPYCRVSTDSEDQAKSYKSQIKYYSDLVKEKKEWVLVDIYADEAITGTRDDKRSDFLRMIEDCKKGLIDMIITKSIARFARNTVDTLRYVRMLKEMGIAVYFEEENINTLTMDGELLLTILASVAQQAVENTSADVKKGLKMKMKRGELVGFNSCLGYDYDKEAQTISINETEAIAVRYIYGRYLEGAGAFTIARELNDLKYKTKNGSTKWHDSSVRKILKNEKYKGDLLQGKTFTIDPITKRRLENFGEEDKFYCEDHHQAIISREDWDEVQRIMQVRGEARKTIKGTVRQKLSRQYAFSSKLECAFCGTNFSRRSWNANTPHQKTTWQCVTSTKKGKKYCEHSKGIPETVVEGAFMKSFALLVRDKSKILDEFLERVEQSFNDNSSEKKVKQIEKRIDVLKKKISKLTDLYLEEAIEKKEYQTKYTELNKELDELVETYEDLNSRMVDEIQMKKRIRKLKNMLEADEIVTEFDRQVFENLIEKVVVGEIDENGSINPYKLTFIYRTGLKDKINPPYDGSKKRKKKSSDVVCSDQANDVKTICSDQGHDTCGNCR |
13 | Thermoanaerobacterium_phage(50.0%) | integrase | attL 3675141:3675155|attR 3695533:3695547 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
4028730 : 4046650
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP020559|4028730:4046650|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >NZ_CP020559|4028730:4046650|4040552_4041398_-|WP_070964120.1|transposase|DBSCAN-SWA MAKRNSNFSMDKLNRMIREGRGQGTGKNYIPWLTIQDFPSKGRASRLVGWKTDRIHHFLTDTETRYFYLLEWNDSVVDIREHYPLLDFQEIVKEKEDLYIDLFKDKESGVLYVLSTSFLITLKDEKGDTFYAARSIKADYELERKLVLERLEIERRYWRSKNIDWGIVTQKDISVIKAKNIAWIHSSLLSSAERGLTIDEMNYYCIRFIERIHGNSKSIRVFTADFDKEFNLDVGTGLFIFKHLIASKKIQIDMLKKINISESIEDISITNKIGFKEVRVI >NZ_CP020559|4028730:4046650|4043254_4043605_-|WP_070963578.1|DBSCAN-SWA MLNIDKVDKVYLACGVTDLRKNIDGLSMIVQTEFKLDPFEKALFVFCNRQMNKLKILHFDDGFWLYYHRLERNKFRWPMSKEEALKVSIEELRWLLKGYEVRTISKFKPVKERNHF >NZ_CP020559|4028730:4046650|4032041_4032920_-|WP_070964106.1|DBSCAN-SWA MNWQDKYLSPFIEREKVSYSKIKKIIKDFTFLFKHSLSFHEQPKEPAEQLPDFISEDTDIIYNVCKEFFDNANSRIDKLEDKAITLLSYVSALFAFISFIFINASNWVTKTMLIFSMGLLILSILISFRCVNVKGRKTFFLPDIFDFNSEVPAENFDRKSISKTLLNSAIYNQNIADNTADILKAARYTLVLAVIIGTTGFLLGVGEYFGTTESIEIVRIDNQIELTDIERQLDNAHKVLNEINHNINTLNNEKKLQEQIDKLMDEMKLIETNYQNLFEKLDRLENDTGANQ 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15 | Leptospira_phage(100.0%) | integrase,transposase | attL 4041154:4041169|attR 4046424:4046439 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
4523334 : 4573573
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >NZ_CP020559|4523334:4573573|DBSCAN-SWA TATGACTGTTGAGCCAATCAGGGATAAAACGAAAATTAAACAAATGTATCAATATTTAAATGGAAAAGATCCAAAATATGGTTTATTATTTAAATTTGGTCTTAATACTGGACTAAGAATTAGCGATATATTACCAATAAAAGTGAAAGACATTCTAAATAATGATGGACAATTTAAAGACTATTTAGTTTTAAGAGAAAAGAAAACTGGAAAAGAAAAAAAAATCAAATTAAATGAGACGCTTCGTAAAACCATCCTTATATACATAAAAAACTATAGTCTTTTGCCTGAAAGTTATTTATTTTCAAGTGTCAAAGGAAACCATATTGGTAGAGTTCAAGCCTATCGTGTGCTTAAGGAAGCAGCAACTGTGCTAGGTATTGAAAACTTTGGTACCCATAGCCTGCGTAAAACCTGGGGCTATTGGACGTATAAGATATCACGTTATAACGTTGGACTCATAATGGATACTTTTAATCATAGTTCACAAAATATCACGCTCCGTTATATTGGTGTTAATCAAGATCAAAAAGACGAACTGTATTCGTTAGTACAATTTTAATTTAATAAAAAAGGCCGGGTATTTTTTCCTACCAGGCCTTTTTATATTTCACAAATATAATATAAAATTTTACATTTTTACTAATTTTGTGCAGGAAATTTACCATTTGTGTCGAATTATTTCAAGATATGTATTAAGTAACATTTTAACCATATTGTTACATTAAAAAACTAAAAAACCTCTATTCCTTGATTTAACTTCATAGTTTCTAATAAATAAGACATGGTTTAAGAAAGGATTTTTGCCTCTCTACAACCATGTCCTATGACAAAACTTTATCCTTCGGTGTATTGCTAAGACGCCCACTTTAGCAAGTGGGAGATCAAGCACTACATCCTCGAAGTAAATTCGGCTACAATTCAGGGGGAGTTTTTACTCCCCCTGAATTGTAGCCGAATTTTATTTTCTTTAATAGAACTTTATTTGATACATACATTTCATGTATACACCAAATAAACATTTTTCACCCTGCAAATAAACATTTATCATAATTCTCCCCACAAGCCCCTACTCAAGCCAATCCCCATTTTTATCCATTTTATCATCCATTCTCAATTCCATTCACTTTTCCCTTAAATCTTAGGCCTTAATCCTGCTGAAATGCAAATAAAGTTGTTTCAGAATTAAGGGTTAAGGATCAAGGGTTAAGAGATGTTTTTATCCATTTTTCTTTTCCATTCTGTTTTCCATTTAGGGGCTTCAGGTCTTTATTTCAGGGCTTTTTAGGGACTAGGTTTAAGGTACAAGGGGGTAAGTCCTAAAAACGAAAAAACATGGTACAGGGAGGTTTTTACGCTTCCTGAAACCATGTTTATGATAGAACTTTCGTGTTGAATTTGATTTTTGATATAAGTTTATTTGGGTAATACATAGTAAGAATTCATGTTTTAAGGGCTATGAATTAAGATTTCATAGAATCTTTTAAATATATGTTTATTTGTGTGATTTAAATAGTAATATTACCTTATTGTTATTTCAATATTGTTCTTTCGTTGAGTTTCTTTTGTGCCTTCAATAGGATACAAAAACCAGCCTAGATTATCAGTATTATCTTGATAATCTTTGCTTAGTAAATATGTAATCTCAATACAATTAGTAATAAAATACGAAAATGATAGATTAGATAATTCATATAAACTCATACAAGGATTTCCATTATTTAGACTTGGATTTCCTTCTTCCCAAAACTTAATAAACTGATTTTCTCCTATAGCAATATGATTAACCTTGCCAACTGTATTTTGCAATACATTTCTGAAGTTTAGATTTATTTCTTCTTCTTCAAAATATACCCCTTGGTTACTCTCATAATAAAAAATTCCATTAAAAATCCTTCTATTTATTAATTGTCCAATTTCTTCTGATTTTTTTATTACACTTTCAAATCTTGAATTATCAAACTTACTTTTAACTTCTATTACTCCAACAACATTTGCTGAATTAACAACTACAAAATCACCTTCTTTAAATAGTATTGGATAGGTATTCTCGTATATTATTATATCTATCTGCGTTGAAATAGATTCATAATCATCATTGTTCATGATAAATCCAGTACCAACTGAAAAATTCTTTGGTAGATACTTCTTCAAAACATTCATTAGTATTATTTCCTTGTATCTTCCATCTTCTCCCCAATGACTGTCTCCGATTAAATATCTAACTCTATCTTTTATAATATTAAACTCAAGAGATATAGATTTATGATAATCTTTTATTCTTAACTCTAATCTATTTCTAGGCATTCACGACCCACTTCCTTAACTAATTTGCTTTTTTAAGATACCTCAATGTTATTAGAACTTGAATTAAAATTCTCTATATCTTATATGGATTACTTGTCCTCTTGATTTCATAACTTAATAAATCTATTTTATAGTTTAAAATCTCGACTCTTTTCCAGCATTCTTCAACTTCATCACTATAATATTCTCGCTTACCTTCTCTAATTATTTCAAATAAATGATTCATCCCATTATTCAATAGTTCAATTAAATGATCTACTGTAATAACAGGATCACATAAATCACATCCATTCCCCGAACCAATAGATTCTTTTATTGCAACTAGATATTCAATATCGCTAGGTTTAACTTGTTTCCATTCTTCTCCAAAATATTCTTGTAAGATTGTATCTAGGTTATGTGCAACATATTTCTTTGCATCACTTAATCTTTCCACCCCTTTTTTAACTTTTTTATCTATCCCTATAACCTCTTTAATATCATAGGGCGGAATATTCCACTTTAACTCAACTACCAATAGTTTCAGACTATGGGTATCAAAAATCAATAGGTCCATACCCGGTCTTACTGACTGTTCCTTTGTTTTTTCTTTGTTATAAATTATGGATCTATTGGTTACAAAATTTTTGATAAGGCTTTCTTGCATATCTTCACAATCATTTGATAGATTATTAAATTTCTTTTCATATAGTTTGGGGATAAGGTTGAGAAAGTTTCTCTCGGGTCTTACCATTAGATTAACAAATCGAGAAGAAAGCATCAGTTTATCCTCAACGGGAATAAAAAACTGAAACGATATTTCCGTATTTTTTATGTCTGGATTATAAGTCAGGTCATCAATTATACTCGTTATAATTTCAATATTTAAACCTGTTTCCTTTAACAACAATGATGTCCACCAATCTTTCTTCTCATTAATAATATACCTTTCTGAATCCTCTCTTTTTAAACTAATCGTTACTAAACCATCTTTTTTAGCCTTTTCAATTTCTTTCATATTTAATCGAGTTAAATAATTGTCTAATGCAGAACTAAATTTCTTGAAGTCACTCCATGTATAACCATTTATTTCCCATTCGTTCATGATTTCAAAATCACTCTCATGTGCCTTTTGCATCGCCTTATAAATATCTTCTCTACAGTCTTTTATATTACCTAATATTTGGTTTTCTCTACATACTTTCCTCCAATTATTATATCCTATAAAGTGTTTCTCATCTGGATTTTTACTTACAAACTTAATATGCTCACCATCAATAATTACATCAGTTAGTTTATTATAGGTAGCATACCAGTTTAAAAAAAATAGTTCATATGCAAATGCATAATTCAAAAATTCAACTACTTCGATTAATTTTGGCACAAAATTCTCACCTTGCTTTTGATTACAATAATCATATATCCACCTAATTCCCCATTTTATTGATTCTTGTAAAACAGTTTCATAAGTGAAATCACTTATATCAAATTTGATAGGGCTATTCTTAAATACCTCTTTTAAATTTAATTGCTTATGCATATAAAGTAATATTAAATCAGAATGTCTCAATAAAGTCTCATGTACAGCGTCTTTAAAGGATAACTTAGTTATAGAAAACTCCTTAATATGATCCTCTATTTCTCCTTTAACTTTATATATATGTTCCATTGCCATTTGTCTTTGACTATCTATTGATGAATCTAAAAGCATTGTATTCCCACCTTAACTTTTCTAATTTTATTCACTAAACCTTTATATCTTATATATCATTTAGAGTTCTGACCTCATTATCCTCTAAAACTCTAATTCCTTATCTCATCAATCAATCCTTGAACCAATTGTATTACCTCATTAAGTTTGCTTTCCTTTAATATATCTAAAGAATGTTTGTTTATTATGTATTTAAAAAAACTGTTTTCTGATATATAAATCCTTTTAACATTTTCAATTATTTCATCTCTCACCTTTAAATAATTATCTATTTTATATTTATTTTCACATTGACAATCATCAGATAACCTTTCCCATCTATCTTTAAATGACTTTTCTTTATACTCTCTATCTCTTTCTTTAGCATCAGGATAGCCCTTTAAAAATCGTTTTGGTTGGAAATACGCCTCAAAATTATTAACTTGGTTATTTCCGTTTAATGCTTCTCTCAACTGCTTTCTATACTGACATTCATAACATTCTATAGCACAGTTAAGTTCTTCTAAATCAGATGCGAATTCATATAAAAATTTATCTTCAATAAAATAATACTCAATAGAATGTTCTAATAAAACATATATACTTGATTTTAATTTATCTTTTTTGTTTGTTAATTCTTCTTCTTCAAAATCCAAAAATTGAGGTTCTTCTAGTAATGTTGCTGCTATCTCCCCATACAAACTTTCTTTTAAAACATTTGGATCTTTTACATCTGAATCTCGTAAAATTAAAACAGGGATATTGAAATTAATATTCATTAACAATTCAGCATTAGCATAAAACTTTAGATTTTGACATGAATGTGCTTGTATTACATTTATTTTATCAATCAAATTGTTGTCAATCTTATTAATTAGCGACACTACTACTTCATAATCATCTTTTCCTTCTACAAAAATAATGCCCTTATAATACAAGATATCATCTGGCTTTATTCCTAACTCATTAATAATTTTTTTGGGACTAATACACAAAATTCTTGCTTCTCCATTTTGTTTCTCAA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44 | Streptococcus_phage(25.0%) | integrase,transposase,protease | attL 4524335:4524394|attR 4566565:4566996 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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