Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
NZ_CP020590 | Acinetobacter baumannii strain 15A34 chromosome, complete genome | 1 crisprs | DEDDh,WYL,cas3,csa3,RT | 0 | 0 | 7 | 0 |
NZ_CP020589 | Acinetobacter baumannii strain 15A34 plasmid p15A34_1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NZ_CP020590_1 | 2129762-2129847 | Orphan |
NA
Consensus repeat of NZ_CP020590_1
|
1 spacers
spacers of NZ_CP020590_1
>1.1|2129785|40|NZ_CP020590|CRISPRCasFinder GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020590_1
The CRISPR arrays of NZ_CP020590_1 >merge|NZ_CP020590|1|2129762-2129847|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA >NZ_CP020590|1|1|2129762-2129847|CRISPRCasFinder CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA
>NZ_CP020590.1|WP_000795915.1|2128524_2128761_+|hypothetical-protein MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS >NZ_CP020590.1|WP_001124846.1|2127630_2128242_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR >NZ_CP020590.1|WP_000885229.1|2126948_2127560_+|LysE-family-translocator MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI >NZ_CP020590.1|WP_000376215.1|2126336_2126792_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG >NZ_CP020590.1|WP_001990047.1|2124631_2126278_+|allantoin-permease MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA >NZ_CP020590.1|WP_156878064.1|2121001_2124466_-|response-regulator MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVCIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ >NZ_CP020590.1|WP_000107128.1|2120045_2121005_-|response-regulator-transcription-factor MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH >NZ_CP020590.1|WP_001025680.1|2119617_2119902_-|N-acetyltransferase MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK >NZ_CP020590.1|WP_002017921.1|2119394_2119508_+|hypothetical-protein MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS >NZ_CP020590.1|WP_000937460.1|2118670_2119306_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT >NZ_CP020590.1|WP_000983628.1|2130478_2130892_+|hypothetical-protein MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII >NZ_CP020590.1|WP_000432330.1|2131033_2131912_+|glucose-1-dehydrogenase MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG >NZ_CP020590.1|WP_001990041.1|2131968_2134113_-|catalase-HPII MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEHGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLSYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA >NZ_CP020590.1|WP_001145693.1|2134167_2135577_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNQYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN >NZ_CP020590.1|WP_000482091.1|2135892_2136372_+|CinA-family-protein MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR >NZ_CP020590.1|WP_000108365.1|2136656_2136878_+|hypothetical-protein MSTTNNQANQRNNQQQQQQQNDNRNQQQHGNQQQNDQQQQNNQQQQQNDNRGQQQGSNQKDSGQQNSNNNQQR >NZ_CP020590.1|WP_000132044.1|2136983_2137301_+|hypothetical-protein MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDI >NZ_CP020590.1|WP_000498477.1|2137385_2137607_-|hypothetical-protein MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF >NZ_CP020590.1|WP_001136759.1|2137694_2138123_-|hypothetical-protein MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS >NZ_CP020590.1|WP_000251637.1|2138392_2138536_-|hypothetical-protein MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSRNDGMHEASDPATSHDMNKNS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
182978 : 265033
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP020590|182978:265033|DBSCAN-SWA TATGAAAAAATTGAGTGACGAATACTTACCTGTTAGAAAAGCTCAAACTGTTTATGGGAGTATTTCGGGAAATTATGCCTTTAGAGGTGAGAAAACCATTTGGTTTGAATCGACCCTTGAGCGTGATTTCATACTTAAGCAAGAATTTAATAACAATGTGATTGATGTTATCGGTCAACCTGTAGTTATCCCCTACATCACTGAATTGGGTAACCAATCAACCTACACTCCTGACTTTTTAGTGCAGTTTTCAAGCTCGAATTGTGATGATTTTGAGGATTTTCCTGTACCAATGCTCATCGAAATTAAGCCTAAGAAAAAGCTTGTTGAGGACTGGGATAAGTTAAAACCAAAATTCAGAGCAGCCCATCGTTTTGCTGCTGATAAAGGATGGAAGTTCAAAATTATCAGTGAAACAAGATTATATGATCAGTATTGGGAAAATATTAATTTCTTAAAAAAATTTAGACGCTCTCATGTAGGTGCCGTTGATCAACAACTATTACTCGATACCCTACAAGAGTTAGGTCAATCAACAATTAATCAATTACCTGCCCATATTTTTAAAGATAAAACCAATGTTTTAAAAGGAATTCACCAAGTTTGGGCATTAGTGGCAAAGCGCATGATTGCTTGTGACTTGTATTGCCCTTTAACGGCTGAAACAGTGATATGGGTGAACCAAAATGATGCATTTGCGAGGAATATCTAAATGATTGAATCTAATGCTGTCAATATCGATCGTAGTCGTATCATTCTAAAACCCAATGTGGTTGTCGGTTATGAGGGGCAACCCTATAAAATTGTGAATGTTTTAAATGCCAATGACATTGTTATATCAAGTCTTGATTCGGTACGTAGTCTACAGGTCAATGCTAGAAGTTTGACCATTTTTAATGGGGGAAATACGCTAACTGAGCGTTTGAATAAGGGTGATCAGGATATTAGTAATGAAGCTTGGCAGATTGCTTTACAACGTTATGAGATTATTAAGCCTTTGATTGAGTATTCAACGACTGAACTGGTCGAAAATAGGGCGAATGAATATGATGTGAATCGCTCAACATTGTGGAAATGGCTTAAAGATTATCGGGAAAATAATTCTCTAATGGCATTGATTCCCAAAAAACGAGGTTGGACAACTGAAAAATCAAGGTTGTCACCTCAAGTGAGCAATATCATTAAACAAGCTATCAATGATGAATATTTGAATGCGAAGAAACCCAGTATTTCCAAAACGATTGAAATTGTAAAAGCAGAGTGTTCTCGGCTTCAGCTTGAAGCACCGCATGAAAACTCTATTCGTAGAAGAATCGAGGCTTTAAATGATTACCAAGTAACGAAAGCACGTCTTGGATCTAAAGCTGCAATAGATAAATTTAAGGCTGCTGCTGGTTCATTTCCAAATGCTGATTACCCTTTGGCATATGTGCAGATTGATCATACACCTCTAGATATTGAAATCGTGGATGACGAGTTTAGAGAAGCGATTGGAAAACCTCATTTAACCTTGGCAATCGATGTTTTCAGTCGGATGATCGTAGGGTATTACCTATCACTAGAAGCGCCAAGTACGACTTCAGTGGCGATGTGTATCGCATCTTGTATTTTGTCAAAAAAACGTAAGTTGATCGAACTCGATATTGATGCTGAATGGCAGGTCGAAGGGATTATGGACTCGGTGCATACAGATAATGGCCCCGATTTTAGAACCAATCACATCAGTAAAGCTTGTCTAAAGTATGGGATTCATTGGGAATACCGACCAATTGGTGGGGCAAGATTTGGCGGTCATATCGAGCGTATGCTTGGTATCGTCAATCTTGAAATGCATGTCTTGGATGGTACAACTTTTTCAAATGTACAGCAGCGTGGGACTTATGATTCCGCTAAACAAGCCTGTATGACATTAAAAGAGCTTGAATACTATATCGTGTATTGGATTACTAAAGTTTATCACCAGAAGAAACATTCCGCTTTAGGAACATCCCCAATCGTTAAATGGGAAGAAGGTGTTTGGGGGACGAAGACGACAGCAGGTACAGGTTTGAAAGAACGTGTATCAGATGAAGATACCTTGTTTATTGATTTTCTACCTGAATTTGAAGCGACTATTCAGCGTACAGGGGTGCAAAAAGATAACTTATTCTATTTTGCCGACTGTTTAAGACAATGGGTTAATTCTATTGATCCAGAGGACAATAATCGAAAGCGCAAAAGAAAATTCTTGTTTAAACGTGATCCGAGGGATATTTCACAGATTTGGTTTTATGAGCCATATTCTAATACCTATTTTAAAGTACCTACCGCAAAGCGAGAGATACCACCGATTAGCTTATTTGAATATAAGCAGGTTCAGAACTATCTCAAAAGTGAACGTCAGGATGTTCAGAATCAGGATGAGATTTACAAGGCGATTTTGCATCTACGTGATCAACTTAATCAGGCTAGAAGCTTGACTCGAAAGCAACGTCGCTCAAACCAAAGAAAAAAGGAAAATGCAAAAGCCATTACTCAGCTTTCCGAACAGAATCAGTCTAAAAAGGCTGTAGTTTCTGAAAGTCTTCAGACAAGTGATGATTTGTGGAGTACTCCTTTAACTGCATTTGACGATTTAAGGTGATGCAATGGAAAAATATGAACATCTTGCAGAGCATGTACTTGAAATCATGCAATTAAGCGATAGTGAACGGATTGAGACATTATTTACTGATAGATGGATTGGCTATAAGAAAGCCATTACCATCATGAACACATTGACCGATATTTTGAATCGCCCTAGGAAATTAAGACCTGAATGCTTGTTGATTGTTGGTGACTCCAATATGGGCAAAACAACTATCATTCATGAGTTTGCTAGACAGTATTATACAAAAACCGTAAGTGATGCTGACATGGATTTATTGTCCGTAACTAAGCCAGTTTTACCGATACTTGCTCCAGCAAAAGCCAATGTTAAAGAACTCTATATTAATATTTTAAATCACTTCTTTGTGCCATTTCGGGCAAGTGATCCTGAAGCCAAATTACGAAATCAAGCCGTACACTTGATGCGTAAGTATGAAACAAAAATGTTGATTATCGATGAAATTCATAATTGTCTGACAGGTTCAGCCAAATTGCTTCCCAGAAATGGGCTTAGGTATTTTCATCAACTTCCTTACATAGATGCTCTAAAGATTAAAACGGAAATGATTACTGAGATTGAGGATGGTTTTACTGTTGTGCTTAATGGGCAATATTATTGGTTGCCAAAAACACAATAAGTTGAAGCACTTAAAATAATGATCAGCGAGTTAGCTGATCATTATTATTGAGATTTCAGCAGATTATTTTAGTAATTGTCACACCGATCATTAATGAAATATTAAAAGACGCGCTGAAAATTCTGAGATAGTAGTATGTGAGACCTTTATAGAGTAGATTTCCATGTGTTAATTAAGTTATCACCACCACCTAAAAAGTCACCTAATGAAGCTTTAAATGCTGTGTTTACACAATAAAGTTTTAAACTCATAAAGATGAAAATCAATAACTTATAACAAAAACAATTGAATAGATTTACATTATAGTTCTAAACTCAATCAAACATAAGTTTAGAACTATATGCAATTTTTGACATAATAGATTTAAACTCAGACTAATAATTAGCCCAAATATCATTAATCATGTATTGGTTTGAAGTTTCAAATAAAACACAAACCAATAGCTTATGTTTTGAAATCTTTTTAGCGTCTGAAATCGCTTTTTGTGGTTCATCATATATCATCGCTAATTCAGGTGTCCGAGCATAAGCAACTGAAAAAGAAATATTATTGTCATTAATTGCAGCTACAAATTCATCTTTTTCAGGTAGATGGATAACATAACCTTTTACTGTACTTTCTTTTGGTAAGCCTAGTTCAGCTAGAACTTCTGCTACACTTCTTTCAGTTCCATAAAAATCATCTTTTTGTTCTTGAGCTTGCTTTACTCTTTGCTCAAGTGTACCCCTTTGTTTAGCTTGTCCCATTTATTCAACCTTTTGGTTTACAAATATATTGTTTAAGTTTAGAACATTAATGTCTAGTTTACGACCTGATTGTCAAACTACAAATGCATAACGTAGAACAATCACATTAAGGCAATCGCCTATCAATTGAGTAGGCATATCGGATATATCATCTAAATTGATAGATGTTCTTAAATGACAATCACACAAAAAAAGTTTAATAATTTCAGAATGTTCATTATTTGCTATAACCATCTCTGTTAATTTTAAAAGAGAATCTACGCCTTTTCGATAAGCTTGTTCATGAGATACACCAAAGTATGAGGATATTTTTAACAGCACATTTTCGGAACAAGAAACATTTAGAGTTGGGCTTATTAACATCGTATTCATATTTATGATTCCTTTTATAACTTATTAAAAATAAAGGGATAGATCAAAATTCTACCCCTTCATGAAATTATCGTAGTAACAGGACTGGTTTATTAGCGCTTGTGATCACTTTTGTGGTGGTGCTGCCAATAAAAAATTGACGTATCTTTGAATGACCATAAGCCCCAACCACAATCAAATCGATTTGATGCTGTTCAGCGTAATTGATAATTGCCTTATCAACTTCACCATCCAACGTATTCGAGGTGATATTAAAACCTTGTGATTCAAGTTGCTCTTTTGCCCAAGAGAGCTGATTTTGCATTTCACTATTCGGATTTCCGACATAAACCAAATGTACTGCAAGACCTTTAAGTAATGGACTTGACGCAATGCGTTCAACACATTTTCTTGCAGTCTGACTTCCATCAAAAGCAATTAAAAAAGACTTAGGTGGACTAAATGGTGCAGACGTTATTAATACGGGTTTATGAAGGGCACGAACAACATTTTCAATATGGGTTCCAATTTTACTGGAATCATGCTCGGTTTCATTCCCATGCTTACCCATAACAAGAACTCTAATGTCGTCTTCCATTCCCATGATTGTTTCTAAAACACTGCCATGGCGTTGAAA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80 | uncultured_Caudovirales_phage(22.22%) | tRNA,integrase,transposase | attL 186105:186164|attR 214944:225625 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1085832 : 1098180
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >NZ_CP020590|1085832:1098180|DBSCAN-SWA 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24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1102138 : 1156192
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >NZ_CP020590|1102138:1156192|DBSCAN-SWA 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61 | Acinetobacter_phage(85.29%) | terminase,integrase,transposase,capsid | attL 1122697:1122713|attR 1150224:1150240 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1347399 : 1365116
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >NZ_CP020590|1347399:1365116|DBSCAN-SWA 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27 | Acinetobacter_phage(92.31%) | integrase | attL 1340737:1340751|attR 1353417:1353431 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2243212 : 2314204
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >NZ_CP020590|2243212:2314204|DBSCAN-SWA 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58 | uncultured_Caudovirales_phage(22.22%) | plate,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2628283 : 2643080
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >NZ_CP020590|2628283:2643080|DBSCAN-SWA 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10 | Acinetobacter_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
3282098 : 3355244
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >NZ_CP020590|3282098:3355244|DBSCAN-SWA 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83 | Pseudomonas_phage(21.21%) | plate,integrase,tRNA,transposase,protease,tail,head | attL 3319343:3319358|attR 3360557:3360572 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
30200 : 37787
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP020589|30200:37787|DBSCAN-SWA AATGGAAGATATGCAAACTATCATAGATAAAATTAGTAAGTGCCTAGCATTATCAAAAAGTGCCAATGAGCATGAAGCAGCCGTTGCACTTAAGCAAGCACAGACATTGATGCAGAAGTACAAAATAAGTGAAAAACAGATACTAATTAGTGATATTAAAGAGCGAATTATTCAGACAAAAACTCAAAGAACTAAAGATATTGAAAGACGGCTTAAAGTAATGATCGCAAATGTCTTTGAATGCGGAAGTTACTCAGGTTTTTACACTTTAGAAGGTGTGAAATATCAACAACATGTTTTTTATGGAGTTGAACCAAATGTGTCTATTGCAACATATGCATATACTGTTTTACTCCCTATTTTGATTAAAAATAAACAAAGTTATTTAGCCACTTTACATGGAAATACTAAACTTAAATCTAAGAGACGTTTAGGCATAAGCTATCATAGAGGGTGGATTCTTGGAGTTGAAAAAAAGTGTAGGAACTTAAATCCAGATAAAGAGCTAAAGGAAAAACTGAGCGAATATGAGAAAACTCTTAATCTTATATATTGCGAAGTTAAAAGTGTTAAACATTATAATAAAGATATGCTTAATCAAGCACGAGTAAAAGGGTATTCGGACGGGAGTAAGGTGAACTTACATCATGCTATTGATCCTAATGAAACGAAAAAGATTTTCTTGAGTTGATTGAATGAGTAACGTTGATCCTCAACTTGAGCATGTTGATCCAGCTCATCCTGCTGCACCGGATGCTTACATGAGAGTTCTGAACTGTAAGAGTAATTATGTAAATATATTAGCTGGATGGTTTCTTAAAGATGGTAAGAAGAAATTTTATATTGCAGATGTAAGAGGCAATGAAGTTGAAGCCGGTTTTAACAGGCTTGATTGGTTGACAGAGTTTGACACAATTTATAAGGGCAAATAGGTTTTCTATTTGTCCTTATTTTTTTTATTCTTTTTGCGATTTTCAATAGTTTGTTGAACATCTTCAAAGCTAATTGTCTTTATATATCTTTGAACCAATGTTTCAACAATATCTGAAGTTTTAACCATTTGACGTTGCTCTTGTTGCATATCTAATGCGGTATCCATAACAAGTTGAGCTGTTGGATCCCGGAGACGTACTGTAGATCCCATAACAAATCCTCCTTTCAGTAATTTATTATATGTGATTTATTTAATTTATATACAAAAAATATTACAAGTTTAATTTTGTTTTTGATCATATTTGTTAATTCTAGCCATGTTTTATTTCTTTGGTAGTTAGGCTACCTTGTTTCTATAAAATTGAATCTAGGAGCAAATAGAGCGATTTAGAGGGCTATTTGTCGCAACCCTGCGGGATTGCTTTGTTATTACCGGATAAGGTCCAATGGGAGAAGTTTCACTTCTTCGGTCGTCTAGTCAAAATCACAGATTTTGACTGACTCGCTCGAAGTTTGAAACGGTAATCAAGGAGGGGGATGCTCGCAAATTTCATCAGTTCGCAACGTGGACACGTTGCTCTGCAAAAGTATTTTATAAAACGAAAAATTACACTAAATATATGTTTTTTCTTAATAAAAAGACATGAAAATGTAGTATAATTGAGGGGTGAAATCGGGTAGGCTGGTTTCTATATATGAGCTGAAAAGCTTAAGGTGAATTGAATGAAAAATAATGCTTTATATAAAGAGCTTGATAGACATGATGATGTGAATGTTATTCCTAATGTATTAAAAAATGCTATAGGACAGGCACTTGCATCTGAAGGTAAGTTGTTCTCTGTCTCAGAAATAGATTTAGATATTTATGATTTAATTATCGTCAGTATGAGTGGCGGAAAAGATAGTATTGCTTCTTTGCTCTATTTAATAGAGAAAGGCGTGGACATGTCAAAGGTTGAATTGTGGCATAACCTTGTTGACGGTAAGAGTGAGCCGTTTATGGATTGGCTGTTTATGGATAGCTACAACAAACAGCTTGCCAAAGCATTTAATTTACCAATTTATAATAGCTGGTTAATGCATGGCTTCGAGGGGGAGATGCTAAAAAATAATTCCATAAGCCATGAATATGAGATTGAAACACCGAGTGGGAATATCATTATTCCAAGAAAACGAGCAAAAGCTGGAACGAGATTGCGGTTTCCTCAACAATCAGCAGATCTCCGTATTAGATGGTGTTCTTCAGCTCTGAAGATCGAGGTAGGGCGTAGAGCTTTATCAAACCAGGAGCGTTTTAATAACTCTAAAGTTTTATTTGTTACTGGAGAGCGTCGAGAAGAAAGTCCTAATCGAGCAAAATACTTCCAATTAGAAACACATTTTTGTGATAATCGTAATGGGAAAAAAGGTCGTCTAATTGATGCATATCGACCAGTTCTTGATTTTACAGAACGTCAAGTGTGGGAAATTTTAGAGCGTCATAATGTCGCAGCGCCAGTACCATATCGCTTAGGATGGTCGAGATCAAGCTGTATGACTTGTATCTATAATAGCCCGAAAGTTTGGGCAACCATCAAACATTATTTTCCCAATCGTATTGATCGAATTTTTAAATACGAAGAACAATTTGCAACTACAATTAGTCGAAAAAAAATCAATGTCATAAATATAAGTGAGGGTATTCAGCCTTTTAATATCAATGATTTAGTAGCTTTGGATCAGGCAATGAGAAAAGAATATACCTTGCCTATATTTACAAAAAACTGGGAGCTACCTATGGGGGCCTTTAATAAAGAGGGATGCGGTTCAGATTAAAAATTATAAAAGGCTAAAACAATTGAGATTCGAGCAGAAATGCTTAAGGTGAAATTAATGAAATCATATTATCAAATTAGCTTTAGTGGTGGACGTACTTCAGCATATTTAACCTGGTACTTGCTTAATAACTATAGCCACCTTTATAACTTTATAGTCACATTTGCAAATACAGGCATTGAGCATGAGAAAACTTTAGAGTTTGTCGATAAATGTGATAAATATTTTAATTTCAATACAGTTTGGTTAGAAGCAGTTATTCACCCTAAAAAAAGAGTAGGTACGACGCATAAAGTTGTCAATTTTAAGACAGCTACCAGGGGGCCAGTACTTTTTGAACAGATGATTGAGAAATACGGAATTCCTAATAAAGTTTATAAGCATTGCACCCGTGAATTAAAAATAAGACCAATGGATTCATATATTCGTAGTATTGGGATGAAACCTAAAGATATCCCTACTGCAATCGGTATCCGGGCTGATGAATCTAAACGTTGTGCTAAGGATGCAGAAGCAAATAACTTTATTTATCCATTAGTCACAGAACATCCAGTGGATAAGCAATTCATATTAGATTGGTGGTCAAAGCAAGCGTTTGATCTAGAGCTAAATGAATGGGATGGAAATTGTAATATGTGTTTTGAGAAATCATTTCCAAAATTATTGAAGCAGCTTGAATCAAATCCGTTTGCTTTAGAGTTTCATTTACGAATGGAAAGGATCCACGGGCAAACTAACAATCAACCAGGCAGGCCTGATAGAGTTTTTTTTCGTCAAAATACTTCAGCAATTGATATCTTAAATATGTTTAACCAAGCGAATGTAGCTTAGACATGTGTTATGTGATTTTTAAAGTAGGTGTAGGTAAGTATATCTATCCCTAACACACTAGAATATTAAAAAATGCTGTCAGTTCCATTAATTAACTAGAGTGGATGAACCTAAAATCAATTAGATTCGCAATTTAGAAGCGCAACCCTGCGGGATTGCTTTGTTACTCCCGGATAAGCTCCAATGGGAGAAGTTTCACTTCTTCGGTCGTCTAGTCAAAATCACAGATTTTGACTGACTCGCTCGAAGTTTGAAACGGTAATCAAGTAGGGAGATGCTCGCAAATTCCTTCAGTTCGCAACGTGGACACGTTGCTCTGTTAGTAATGTTTAATTCGAAAATATATTTCATTAAATTAATGTTTTTTAACAATATTAACGTTTAAAGATCTTGATTAAAATACATCATTGTATTACAATTTTGGTTAGAAATCGGATAGGCTGATTTCGTATTTTGAGCTGAAAAGCTTATGGTGAAAAAATGAATAATTATTTTAATGTATTAATCATAACTGATTTAAAAATTGGTCGTTTAAAGACTCCATCACATTGTGCATGTGCTGTTGGCCATATTGATATTATGAAGCCATCTTTTGAATACAATACTGGCTTAGTTGCCTTATCTACTACTATGTATGATTGTAAGGACTTTAATGTTTATACATTAAGTACAAAAGAGTCATTTAATAAGTTTATTTCAACATTAAAAGTTCTTGAAGAATTGATTGGTATTCCTTGTCCTTTCTTAACCGCTATTCAAGAAACATATGAGTTCTATGGTGACTTCATTTTTGAATGTTTGACCTGGTTTAATAATAACGCAGATATATTATTCAGACCTGACCACTTGGGAGAATTCACTAAAACAGCAGATGAGTCTCTTAATTTCCAATTAATGTATTTCAAAGTCTTAGAAACTTTTCGTAAAGCCGGTTTAAATGGTTTTATACAATTCAATACATTGAAAACTATTAATTGATTGAGCTGAAGAGCTTGCGGAGAAAAAAGTGAATTCAAAAGTTAACATTGGTAAAACTTATAGTGTTTTGAAAAGTGAGTTTATACATACCTTAAAAAGTATCGACCAATCTAAAAACATTTATGAAATATTTCATGACTTTGTTTTTTGTTCAGCAGCAGCATTAAGAAACTCAATTGGTCATAGATATCAAAATTTGTTTAACCACAATATTGAAAATGAATATCTTCAACGTATCAATCGTTACGACGTTAGTGGACGTTTAAAAATAAAAAAATTGTTTTATCTGTTGGTGGATTTATGCGAAGCAAAGGGTGAGCCATATGATGTGTTAGGTAGCATTTACATGGAATTAGAAATTGGGAATGATCATATCGGCCAATATTTTACACCAAGTGAGGTATCAAATTTATGTGCTCAAGTTGTAATGACCGACCTTAAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >NZ_CP020589|30200:37787|30894_31131_+|WP_000072937.1|DBSCAN-SWA MSNVDPQLEHVDPAHPAAPDAYMRVLNCKSNYVNILAGWFLKDGKKKFYIADVRGNEVEAGFNRLDWLTEFDTIYKGK >NZ_CP020589|30200:37787|33004_33778_+|WP_000844619.1|DBSCAN-SWA MKSYYQISFSGGRTSAYLTWYLLNNYSHLYNFIVTFANTGIEHEKTLEFVDKCDKYFNFNTVWLEAVIHPKKRVGTTHKVVNFKTATRGPVLFEQMIEKYGIPNKVYKHCTRELKIRPMDSYIRSIGMKPKDIPTAIGIRADESKRCAKDAEANNFIYPLVTEHPVDKQFILDWWSKQAFDLELNEWDGNCNMCFEKSFPKLLKQLESNPFALEFHLRMERIHGQTNNQPGRPDRVFFRQNTSAIDILNMFNQANVA >NZ_CP020589|30200:37787|31855_32947_+|WP_000794252.1|DBSCAN-SWA MKNNALYKELDRHDDVNVIPNVLKNAIGQALASEGKLFSVSEIDLDIYDLIIVSMSGGKDSIASLLYLIEKGVDMSKVELWHNLVDGKSEPFMDWLFMDSYNKQLAKAFNLPIYNSWLMHGFEGEMLKNNSISHEYEIETPSGNIIIPRKRAKAGTRLRFPQQSADLRIRWCSSALKIEVGRRALSNQERFNNSKVLFVTGERREESPNRAKYFQLETHFCDNRNGKKGRLIDAYRPVLDFTERQVWEILERHNVAAPVPYRLGWSRSSCMTCIYNSPKVWATIKHYFPNRIDRIFKYEEQFATTISRKKINVINISEGIQPFNINDLVALDQAMRKEYTLPIFTKNWELPMGAFNKEGCGSD >NZ_CP020589|30200:37787|30200_30890_+|WP_000389917.1|DBSCAN-SWA MEDMQTIIDKISKCLALSKSANEHEAAVALKQAQTLMQKYKISEKQILISDIKERIIQTKTQRTKDIERRLKVMIANVFECGSYSGFYTLEGVKYQQHVFYGVEPNVSIATYAYTVLLPILIKNKQSYLATLHGNTKLKSKRRLGISYHRGWILGVEKKCRNLNPDKELKEKLSEYEKTLNLIYCEVKSVKHYNKDMLNQARVKGYSDGSKVNLHHAIDPNETKKIFLS >NZ_CP020589|30200:37787|36530_37787_+|WP_000096599.1|DBSCAN-SWA MSSLLGDLNAVDSSLTSANLNANNNSDRTILKLPLNRVKLDPQNVRLEYDQDYVKELANTILRDGLLQPISVRADSDNPGEYIINMGHYRYLAHKHLNLDTIEATIDNKLGSRRVKMSENLFRKDMSLLEVATNLKLMLEEGVAENPKYSYDDLANEINKSKTWVSRRLQLLESDDYLKSLMANKMVNDAETGTIIKNLLAEYPEEVKALVADHEGAISSKLARVWSKELKGEIITSSTSEVTQSSLELQNSPKAGEKDEDSKVDNTQELITETKETLQQPAKVQESVENTEAVKDEKSFTTTTQKQTKEIVKQANEKAFSELETAYFNGILESYVSILDLTESEDEDLVSVACGFLRSFNDENTANLFSWKSLIQYPVLVNELATILDSMAQLHVFVPSSNVEDSRMQVILNQQDLI >NZ_CP020589|30200:37787|34784_35561_+|WP_001086346.1|DBSCAN-SWA MNSKVNIGKTYSVLKSEFIHTLKSIDQSKNIYEIFHDFVFCSAAALRNSIGHRYQNLFNHNIENEYLQRINRYDVSGRLKIKKLFYLLVDLCEAKGEPYDVLGSIYMELEIGNDHIGQYFTPSEVSNLCAQVVMTDLKKQLEEEGVISISDPACGAGSTLLSTVKLCLESKIQVQDHLYIEAADIDRNVALMCYIQLSLWAVPCRIFVGDTLKLKYRECWCSLMYYVKGWDIKLHSQKLKEIVHKAEDYVPNFILIND >NZ_CP020589|30200:37787|31136_31343_-|WP_065285204.1|DBSCAN-SWA MGSTVRLRDPTAQLVMDTALDMQQEQRQMVKTSDIVETLVQRYIKTISFEDVQQTIENRKKNKKNKDK >NZ_CP020589|30200:37787|35753_36527_+|WP_000724906.1|DBSCAN-SWA MKKIVITNEKGGIGKTSVAVHLAHYCYERGMRVLFVDMDKQGNSGFSLSKVAVEIKDTHSLFTDIQNFETLDKYFVLFKGNKSLKSLFDPTEQEFKLDKVEEYQRNFKSNIAKANEFFDICIFDTPPTDGPFQRLPLLVSEFALSPFLLDKYSILGLRGIIDTTQEIKEVNPKIQFLGLLPNMVSANSVTQKTTLNELQKQLSHLMLDKTAFIPNRSAIADASEQQVPVWKIDKTSAKDVGRKIKKINQLVLEKMGV >NZ_CP020589|30200:37787|34258_34756_+|WP_001067229.1|DBSCAN-SWA MNNYFNVLIITDLKIGRLKTPSHCACAVGHIDIMKPSFEYNTGLVALSTTMYDCKDFNVYTLSTKESFNKFISTLKVLEELIGIPCPFLTAIQETYEFYGDFIFECLTWFNNNADILFRPDHLGEFTKTADESLNFQLMYFKVLETFRKAGLNGFIQFNTLKTIN |
9 | Alteromonadaceae_phage(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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