CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
NZ_CP020576	Acinetobacter baumannii strain SSA12 plasmid pSSA12_2, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	0	0
NZ_CP020578	Acinetobacter baumannii strain SSA12 chromosome, complete genome	1 crisprs	csa3,RT,DEDDh,WYL,cas3	0	0	6	0
NZ_CP020577	Acinetobacter baumannii strain SSA12 plasmid pSSA12_1, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0

1. NZ_CP020578

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: NZ_CP020578_1

• CRISPR_ID: NZ_CP020578_1
• CRISPR_location: 677179-677264
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of NZ_CP020578_1

Consensus_repeat	Method
CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA	CRISPRCasFinder

spacers of NZ_CP020578_1

>1.1|677202|40|NZ_CP020578|CRISPRCasFinder
GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG

CRISPR arrays and Neighbor proteins around NZ_CP020578_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of NZ_CP020578_1

>merge|NZ_CP020578|1|677179-677264|CRISPRCasFinder
CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGAGGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGGCCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA

>NZ_CP020578|1|1|677179-677264|CRISPRCasFinder
CCAGCTTCACGAGCCTCTTCTGA	GGTAAATTCATGTGCGTTACCACTGGCATGTGCAGCACGG
CCAGCTTCACGAGCTTCTTCTGA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
NZ_CP020578.1|WP_001025680.1|667034_667319_-|N-acetyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|379642
NZ_CP020578.1|WP_001124846.1|675047_675659_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|182350
NZ_CP020578.1|WP_000432330.1|678450_679329_+|glucose-1-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|187613
NZ_CP020578.1|WP_000376215.1|673753_674209_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|224439
NZ_CP020578.1|WP_000251637.1|685809_685953_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020578.1|WP_001136759.1|685111_685540_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020578.1|WP_001990047.1|672048_673695_+|allantoin-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|224374
NZ_CP020578.1|WP_001145693.1|681584_682994_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|379634
NZ_CP020578.1|WP_000107128.1|667462_668422_-|response-regulator-transcription-factor	unknown	unknown	gnl|CDD|381147
NZ_CP020578.1|WP_000108365.1|684073_684295_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|237171
NZ_CP020578.1|WP_000132044.1|684400_684718_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020578.1|WP_002017921.1|666811_666925_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020578.1|WP_000983628.1|677895_678309_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020578.1|WP_000498477.1|684802_685024_-|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020578.1|WP_000795915.1|675941_676178_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
NZ_CP020578.1|WP_000937460.1|666087_666723_-|amino-acid-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|223836
NZ_CP020578.1|WP_000482091.1|683309_683789_+|CinA-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224463
NZ_CP020578.1|WP_000885229.1|674365_674977_+|LysE-family-translocator	unknown	unknown	gnl|CDD|224199
NZ_CP020578.1|WP_001990041.1|679385_681530_-|catalase-HPII	unknown	unknown	gnl|CDD|236886
NZ_CP020578.1|WP_000115408.1|668418_671883_-|response-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|274362

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
NZ_CP020578.1|WP_001025680.1|667034_667319_-|N-acetyltransferase	gnl|CDD|379642	pfam14542, Acetyltransf_CG, GCN5-related N-acetyl-transferase. This family of GCN5-related N-acetyl-transferases bind both CoA and acetyl-CoA. They are characterized by highly conserved glycine, a cysteine residue in the acetyl-CoA binding site near the acetyl group, their small size compared with other GNATs and a lack of of an obvious substrate-binding site. It is proposed that they transfer an acetyl group from acetyl-CoA to one or more unidentified aliphatic amines via an acetyl (cysteine) enzyme intermediate. The substrate might be another macromolecule.	1.0722e-24
NZ_CP020578.1|WP_000432330.1|678450_679329_+|glucose-1-dehydrogenase	gnl|CDD|187613	cd05355, SDR_c1, classical (c) SDR, subgroup 1. These proteins are members of the classical SDR family, with a canonical active site tetrad and a typical Gly-rich NAD-binding motif. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold (alpha/beta folding pattern with a central beta-sheet), an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Classical SDRs are typically about 250 residues long, while extended SDRs are approximately 350 residues. Sequence identity between different SDR enzymes are typically in the 15-30% range, but the enzymes share the Rossmann fold NAD-binding motif and characteristic NAD-binding and catalytic sequence patterns. These enzymes catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase (15-PGDH) numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser (Ser-138, 15-PGDH numbering) and/or an Asn (Asn-107, 15-PGDH numbering) contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. Extended SDRs have additional elements in the C-terminal region, and typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif. Some atypical SDRs have lost catalytic activity and/or have an unusual NAD(P)-binding motif and missing or unusual active site residues. Reactions catalyzed within the SDR family include isomerization, decarboxylation, epimerization, C=N bond reduction, dehydratase activity, dehalogenation, Enoyl-CoA reduction, and carbonyl-alcohol oxidoreduction.	1.69173e-160
NZ_CP020578.1|WP_000376215.1|673753_674209_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator	gnl|CDD|224439	COG1522, Lrp, Transcriptional regulators [Transcription].	8.76675e-40
NZ_CP020578.1|WP_000108365.1|684073_684295_+|hypothetical-protein	gnl|CDD|237171	PRK12678, PRK12678, transcription termination factor Rho; Provisional.	5.30417e-06
NZ_CP020578.1|WP_001145693.1|681584_682994_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein	gnl|CDD|379634	pfam14518, Haem_oxygenas_2, Iron-containing redox enzyme. The CADD, Chlamydia protein associating with death domains, crystal structure reveals a dimer of seven-helical bundles. Each bundle contains a di-iron centre adjacent to an internal cavity that forms an active site similar to that of methane mono-oxygenase hydrolase.	1.51279e-18
NZ_CP020578.1|WP_000107128.1|667462_668422_-|response-regulator-transcription-factor	gnl|CDD|381147	cd19920, REC_PA4781-like, phosphoacceptor receiver (REC) domain of cyclic di-GMP phosphodiesterase PA4781 and similar domains. Pseudomonas aeruginosa cyclic di-GMP phosphodiesterase PA4781 contains an N-terminal REC domain and a C-terminal catalytic HD-GYP domain, characteristics of RpfG family response regulators. PA4781 is involved in cyclic di-3',5'-GMP (c-di-GMP) hydrolysis/degradation in a two-step reaction via the linear intermediate pGpG to produce GMP. Its unphosphorylated REC domain prevents accessibility of c-di-GMP to the active site. REC domains function as phosphorylation-mediated switches within response regulators, but some also transfer phosphoryl groups in multistep phosphorelays.	6.21476e-55
NZ_CP020578.1|WP_001124846.1|675047_675659_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit	gnl|CDD|182350	PRK10276, PRK10276, translesion error-prone DNA polymerase V autoproteolytic subunit.	2.36027e-39
NZ_CP020578.1|WP_001990047.1|672048_673695_+|allantoin-permease	gnl|CDD|224374	COG1457, CodB, Purine-cytosine permease and related proteins [Nucleotide transport and metabolism].	9.5172e-23
NZ_CP020578.1|WP_000937460.1|666087_666723_-|amino-acid-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|223836	COG0765, HisM, ABC-type amino acid transport system, permease component [Amino acid transport and metabolism].	2.9036e-64
NZ_CP020578.1|WP_000482091.1|683309_683789_+|CinA-family-protein	gnl|CDD|224463	COG1546, CinA, Uncharacterized protein (competence- and mitomycin-induced) [General function prediction only].	5.88094e-21
NZ_CP020578.1|WP_000885229.1|674365_674977_+|LysE-family-translocator	gnl|CDD|224199	COG1280, RhtB, Putative threonine efflux protein [Amino acid transport and metabolism].	2.70108e-23
NZ_CP020578.1|WP_001990041.1|679385_681530_-|catalase-HPII	gnl|CDD|236886	PRK11249, katE, hydroperoxidase II; Provisional.	0
NZ_CP020578.1|WP_000115408.1|668418_671883_-|response-regulator	gnl|CDD|274362	TIGR02956, sensor_protein_TorS, TMAO reductase sytem sensor TorS. This protein, TorS, is part of a regulatory system for the torCAD operon that encodes the pterin molybdenum cofactor-containing enzyme trimethylamine-N-oxide (TMAO) reductase (TorA), a cognate chaperone (TorD), and a penta-haem cytochrome (TorC). TorS works together with the inducer-binding protein TorT and the response regulator TorR. TorS contains histidine kinase ATPase (pfam02518), HAMP (pfam00672), phosphoacceptor (pfam00512), and phosphotransfer (pfam01627) domains and a response regulator receiver domain (pfam00072). [Signal transduction, Two-component systems].	3.64852e-57

Protein sequences

>NZ_CP020578.1|WP_000795915.1|675941_676178_+|hypothetical-protein
MKNQRDAVLGYADEQHAYYIRLIENDAVLGESYGIFCENPESEAAESIMTTLFLKKSFWLNGSEFTDIVKGLHPLTHS
>NZ_CP020578.1|WP_001124846.1|675047_675659_-|translesion-error-prone-DNA-polymerase-V-autoproteolytic-subunit
MPKKKEFEHGGARENAGRKAQFNEPTKVIRVPESQVNFIKNWLLNNVKTNNQTDFTSKLKIQQVHPNNDKIYHIPLATERVAAGFPSPAQDDIEQALDLNEYLIRNENATFIVKANSLSMLDAGIDIDDPLIVDRSIPAKSGDIVIALIDNDFTVKRLMIDTQFHPPKVWLKAENPDYQNIYIEEGQELVIWGVVTYNLKRMR
>NZ_CP020578.1|WP_000885229.1|674365_674977_+|LysE-family-translocator
MAFNIFIAFWSVSILFIITPGADWAYAISAGIKGKVVVPAVAGMLFGHFITILLVAAGVGLLVANNPTALMILTVAGSAYLLWMGINLLLTPPTPNESGSEKAQSWLRWATKGVYVSGLNPKVFLLFLALLPQFIDTTASWSVTTQILAFGVVHIISCAIIYLMVGYGSEAILKTRPQAAQLVGRFSGGLMVVIATCLLIGQI
>NZ_CP020578.1|WP_000376215.1|673753_674209_-|Lrp/AsnC-family-transcriptional-regulator
MDRTDKKILAELQLNGRLSITELAEKVGLSISPCHRRVKALEESGAIKGYRAELDPNLVGFEFSAIVFITLKEGDKQAVEKFENAVIEIPQIIQAQRLFGEPDYLLHVVARDLPAFQRLYDEKLSAIPSVQRLISTIVMKDVVPERLFPIG
>NZ_CP020578.1|WP_001990047.1|672048_673695_+|allantoin-permease
MTENDWEIDVMSVSEHPNLDTVQGADSQKAVNETLEDYTLRYAPHSFRRWSPKVVAITALGGIAYLADFSIGASIGMSYGTTNAVFSILFAAIIIFLTGIPLAYYAARYNIDLDLITRGAGFGYIGSVLTSIIFASFTFIFFALEGSIMAQGLLLGLGIPLWAGYLISTVMVIPLVIYGMKALSKLQVWTTPLWLVLMIGPVAYLIYQEPTLVSQFATFTGHEGFAPVDMAAIMLGAGICLSLIMQIGEQIDYLRFMPAKTKENSKAWWAAVISAGPGWVILGAIKQIIGAFLGFYLLTKIPGVNSTEPVQQFNAAFHDMLPGWAALTLAVILVVISQIKINVTNAYSGSLAWTSAYTRISKHYPGRIVFVIVNLAIALALMEGNMFAVLGKILGFYSNFAIAWVVVVATDISINKYVLKLSPKEPEYRRDMLYNVNPVGMVAFLVSAGLSIAAFFGLLGSFLAPYSPIIALVLAFVLTPIMGLLTKGKYYIKSHDDGVKEPRYDAEGTPVATVYHCRVCEQGYERPDIMFSHKHNGTICSLCKTLDA
>NZ_CP020578.1|WP_000115408.1|668418_671883_-|response-regulator
MSVMPDTSRPQQAPQRVIKTRREYNIWVADESIEDYALRYAPTSVRKWSPWTVTNTAISTVSFLAMEAIGATMLWQYGFSNALWAAIVVCTIIFLTSWPISYYAAKYNVDVDLLTRGAGFGYIGSTITSLIYASFTFILLAFEAAIMAMALELALGIPQVIGYLISALVILPLVVKGIGFINKVQAVTQPIWLLLLLLPWFFVLWKQPQILSSSLHFVGAVSNSTDFNLYYFGAACTLIFSFVIQIGEQADYLRFLPQKEKNRTAWRFAVFLGGPSWIIFGFLKVLMGMLLMVLAFQLFIPVSELDNPTYLYWVAYQQFIPNPQLALILTLALVCLAQIKINMTNAYAGSLAWSNFFARLTHSHPGRIVWLLFNVFIAIVLMEMGISHAVERILGLYSNIALAWIGAVVADLIICKPLGLSPKGIEFRRAYLYDINPVGVGALLIASVLSMLSYLGFFGLMAKGLASFIALGSAVLCVPVIAYLTTGKYYIARQPEKIQATLVANCVVCERDYELADMAGCPAYNGTICSLCCSLEARCHDLCKPDARWSVQLKKAIWHYLPERWASRLNSRVSLYLLLTLGLSIVLAVSLSLVYIQEKTYLETINAAAVPQLFTLFVKIYTILFLLMSVAAWWLVLNDESRRNAEIETHQQTALLIDEIAAHEVTSKDLQDARIAAERANDAKSRYVIGISHELRTPLNSILGYSQLLQKQEQLSEQGKMALGVISRSGQHLTSLIDGLLDLARIETGKISLNVVDVHFPNFIEQIIQMFQPQFEQKNLQFVYEIGENLPHYVRTDKKRLEQVLINLLGNALKFTTSGTITLKVEYRFQTAYFEIRDTGCGIAEADLERIFNPFERGSNVVQGGFTGIGLGLPIVKLLVDLLGGQLSVTSQLNQGSQFKIKFYLPSKEVVHPISNVYSNQITGYQGERKRILVVDNEAVDRGLVANFLKPLGFMIEEAESGIDCLRRVPIFQPNLILMDLNMPLMGGWETARLLRQNNITNVPILIISANAGEREVNPQDAVLSEDFMLKPIDLNLLLSKIGDKLGLVWIDSKSETLLENNEVQALDLNIYKQEQVAVHTLIQQPENNELLDFPQSLQQLNDLIGQGYIRGIQQTLTQCRQNFPKHNELWEQLEQAIQKFDLKHAQRLIQDKQ
>NZ_CP020578.1|WP_000107128.1|667462_668422_-|response-regulator-transcription-factor
MSTQHVSFQQASPNEQAVILIVDDVPENLGLLHESLDQAGYRVLVTTDGLSAIEIAHRCLPDMILLDGNMPHMDGFESCIQLKASPITQFIPVIFMTGLSETEHIVRGFQVGGVDYVTKPLNIEEVLARVKTHLAHAKLLQQQKQVIDATETAILALDVHGKIVWKTQKASDLLNQYLPELEGFEAGLKAWFSDLEHEKDPKKLTSCSYSTPSQQLQLLLLTPWETEPSVAKNYLIQIKTSTPALEMADILKYCPQLTQREAEVMHWLLLGKTNKDIAEILELSPRTVNKHLEHVFEKLCVENRTAAVAHINSLVQEFH
>NZ_CP020578.1|WP_001025680.1|667034_667319_-|N-acetyltransferase
MNIQQKDDTKHGSFSLLDGETVAGEMTYTWAGESMLIIDATDVNENYRGQGVGRQLLDALVAFVREKDVKVIPLCPYAKSVFDKDPSIGDVLRK
>NZ_CP020578.1|WP_002017921.1|666811_666925_+|hypothetical-protein
MCNKFIFFPIGLKLFLLDKLFYKFDKFDLAIENLQIS
>NZ_CP020578.1|WP_000937460.1|666087_666723_-|amino-acid-ABC-transporter-permease
MLPQFFSATLTTLKISIISIILAIIVGLICSILITYHVRVLNRIAQFYIELSRNTPLLIQLFFLYYGLPKLGIKIDGFACGVIGLTFLGGSYMAEAFRAGLQSVAKGQIDSAKSIGLKPTQIFRYVIFPQALAISIPAIGANCLFLIKESSVVSAIAVVELLFVTKDLIGMDYKTTEALFLLIMAYLIILLPVSILTSYLEHRSRKVSHGT
>NZ_CP020578.1|WP_000983628.1|677895_678309_+|hypothetical-protein
MMQPTHTHSTLQYIHISVPEILLSNIQIKNSWQDYNQEWSYRLDPPHASHPFQRDLYIIKSKNIETEDIKKILDNIVVKNSKNKDDLKNIVEAETVIKEILDLSNYIPIENWLNDTGNRSIVESMIDKNKVKLLDII
>NZ_CP020578.1|WP_000432330.1|678450_679329_+|glucose-1-dehydrogenase
MENTTNQYPSEVPAQVQPHQPGDQEKMHPEPEIIKASHKGSEKLKGKVAVISGGDSGIGRSVAVLFAREGADIAVLYLKEDQDAEITKQLIEKEGQQCLLLKGDISDPDLAKQNIDKVLQHFGKINILVNNAGVQYQQKEIESISNEQLEKTFKTNIFTMFYLTKEAIPYMEEGDSIINTTSITSYQGHDELIDYASTKGAITSFTRSLSNNLMKQKKGIRVNGVAPGPIWTPLIPSSFDAETVEKFGKDTPMGRMGQPSEVAPAYLFLASDDASYITGQVIHVNGGQIVNG
>NZ_CP020578.1|WP_001990041.1|679385_681530_-|catalase-HPII
MDMNDNTKSTNKTSEMAGADAANKANTTQKTEQLDTVRDDATNEALTTNQGVKIADNQNSLRAGIRGSTLLEDFILREKITHFDHERIPERIVHARGVGAHGYFQAYEGNERLTKAGFLTDPTIQTPIFVRFSTVQGPRGSADTVRDIRGFAIKFYTQEGNFDLVGNNAPVFFVQDGIKFPDFVHAVKPEPDTEIPTGATAHDTFWDFVSLVPESAHAVIWAMSDRAIPRNLRSIQGFGVHTFRLINAEGKSHFVKFHWTPKQGLSALVWDEAQKLAGKDPDFHRRDLYEAIEHGFYPEWELGVQIVEEEDEMNFDFDLLDPTKIIPEELVPVTPIGRFVLNRNVDNFFAETEQVAFCPGHVVPGIDFTDDPLLQARLFSYTDTQLSRLGGPNFHQIPINKPVCPFHNNQRDGIHQHTIHKGQAAYQPNSIDGNWPVETPPAASNGGFESYPEKISGHKLRQRSETFSDYFSQPRLYYKSLAPHEQKHVVDAYTFELSKVQRKHIRERQVQQILANIDLDLARQVGANLGIEVPDLTLSYKKTAVEKSAKLSFLAFPPEDIQGRKVAVLIHNMVKSDALEAIKNWAIKEGVILHLLAPSLAPVKDHKDNVIVADGMQMSEPSIAYDAVIIPDGDNLNTVMQDGVARHYLLEAYKHLKPIVFLGNKSDLLEPLGLVADEGTLIEDEFQHVAEKFKNLIKAHRVWSREQIAAHVPA
>NZ_CP020578.1|WP_001145693.1|681584_682994_-|iron-containing-redox-enzyme-family-protein
MPVVVKKRLLDLLQDNQQNYYELFVFFLDPDVSSFEKEKKARDFLVKEIDKLEMKEIDFPSDINLIKAWCENDNKKNCQEFQAYLNRRQSGQDREYFKNVAQAFEFLIKVSPTKKVDGAWLYSSVHYWNDPIFHELIITYLEELGLGEPKANHVCIYDDLLRSLGLDSFDLLLEDEYYHQAVVQLALGYAPPEFIPEIVGFNLGYEQLPLHLLISNYELAELGIDSKYFNLHITIDNIDNGHAYKAIKVIEDIYNQYRDKELFLTKLKRGFALNNHGVSSSNIIKNLNTEDFVHRIFKRKALVGQLIHNETRQFGCKTINQWLSNPDDIAGLITHLTEHKWIKFNTDPEQSVFWRMINEENGKMFGVFNPVERQIIHDWIAGSDHSSSFLAYSRELKNSQRIQDYLFSYISDGELDALQERVQQSSDLAIKICKLTPFLAPDSHHKSIGLWSTRKYVELLFPYLGTFKN
>NZ_CP020578.1|WP_000482091.1|683309_683789_+|CinA-family-protein
MFNKCCELLAKEKIKIAFFESASAGYLAYRFSLSPYSGDILIGSLVSYDLRVKENTLHISEELIEKYTAESMQVTVEMINKGKELLHADLYVACTGLLKKGGSETPEKPVGTFFYSIYYKNNFYNFRRVLRGPAFLKLRKLIYYVTQDIKLIILEDKRR
>NZ_CP020578.1|WP_000108365.1|684073_684295_+|hypothetical-protein
MSTTNNQANQRNNQQQQQQQNDNRNQQQHGNQQQNDQQQQNNQQQQQNDNRGQQQGSNQKDSGQQNSNNNQQR
>NZ_CP020578.1|WP_000132044.1|684400_684718_+|hypothetical-protein
MTDQNTDHAQLVAGDHNYSDSRWRESYLTRPYYQEAQLTTPDLDYDRDFSAAYELGHRARSESKEGTQFEDMEGSLQQKWEELKAESRLKWEHAKQAIKDAWDDI
>NZ_CP020578.1|WP_000498477.1|684802_685024_-|hypothetical-protein
MFVYFTDGTCINDSEIYGVKAKYEQNKYVVEVTIKPTHVLATTPSVQFKKEVFDDPNLANQYLSHNFNMPPFF
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MPQYLKIAEKIYQNVKEKKGFTDDPMEDLNNLMIELRQEIKGTKLKLLYNYIDFAEILIKPLQESKIKLDLSLIPKSKNTQEFVLWLAGFIERITTGGQEKLPPIRAKITLPAYAYEETYPSQKKPVNNGEEIIEYFKKNQS
>NZ_CP020578.1|WP_000251637.1|685809_685953_-|hypothetical-protein
MVRIFCAVSMVLAIAMGMSACQDRNSRNDGMHEASDPATSHDMNKNS

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	1008844 : 1037518	38	Acinetobacter_phage(93.55%)	capsid,terminase	NA
DBSCAN-SWA_2	1041476 : 1053824	24	Acinetobacter_phage(95.65%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_3	1271806 : 1284590	19	Acinetobacter_phage(53.85%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_4	3098686 : 3143184	50	Pseudomonas_phage(18.52%)	head,integrase,protease,tail,tRNA,transposase	attL 3083717:3083731|attR 3128139:3128153
DBSCAN-SWA_5	3434506 : 3553121	165	Acinetobacter_phage(96.62%)	capsid,terminase,integrase,tail	attL 3449296:3449312|attR 3549468:3549484
DBSCAN-SWA_6	3712437 : 3733624	19	Escherichia_phage(37.5%)	transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP020578|1008844:1037518|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_000598554.1|1009888_1013314_-	hypothetical protein	A0A0P0HSH9	Acinetobacter_phage	0.0e+00	94.2
WP_000835160.1|1013306_1013669_-	hypothetical protein	A0A0P0J0A2	Acinetobacter_phage	8.1e-51	79.2
WP_000368388.1|1013665_1014172_-	DUF1833 family protein	J7HXQ5	Acinetobacter_phage	1.5e-90	97.0
WP_000277448.1|1014171_1014570_-	hypothetical protein	J7I0X8	Acinetobacter_phage	4.1e-72	97.7
WP_000721057.1|1014662_1015250_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000046573.1|1015340_1019651_-	tape measure protein	A0A0D4DC37	Acinetobacter_phage	0.0e+00	98.3
WP_001275792.1|1019778_1020042_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000721572.1|1020043_1020724_-	hypothetical protein	A0A0R6PJY5	Moraxella_phage	2.5e-53	49.3
WP_000274931.1|1020828_1021287_-	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A0P0IRJ4	Acinetobacter_phage	1.1e-84	100.0
WP_000335868.1|1021295_1021595_-	DUF4258 domain-containing protein	A0A0P0IE58	Acinetobacter_phage	7.4e-50	100.0
WP_001185585.1|1022097_1022613_-	hypothetical protein	A0A0N7IRG3	Acinetobacter_phage	2.5e-77	96.6
WP_000094278.1|1022682_1023600_-	hypothetical protein	J7HXP7	Acinetobacter_phage	2.0e-170	100.0
WP_000002408.1|1023652_1024831_-	hypothetical protein	A0A0D4DCQ4	Acinetobacter_phage	1.2e-103	66.3
WP_000064593.1|1024830_1025184_-	hypothetical protein	A0A0D4DCF7	Acinetobacter_phage	3.3e-57	96.6
WP_000749909.1|1025280_1025802_-	SH3 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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MFEQILKRRPKGATHWQAGYYYNSDECGIWSIWENGKWHGDFKFPDGVMTKLPEEKEPVMSEFEGKSGKWAWEIQKEQQANLVELRSSIENLVQKYKHDAHASSLFGDQDKARVYNCFANQLKNLLKGGA
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MKISDLMTYHGCKNRKELSEKTGYSTVTLWKWENNGIPARTQAVLQVKTKGKLKADLQALTA
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MKDYNCPTCKKMIPVDRSKIKAGDEVSFCRVTQSSKSARFSSKEGIVDCREGDVVLVKYRKEIIPLNIKDVSPVDAPSPLTYAFVGACECKEAEHV
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MSKVLNELPASASNNESLILQALNASNQRQVAEMINVDASILSRMKTEKKSNGWTEIEFISFLLTAIGLKVVQESDVYCSPEIAEATRVYLAHAFTSPEYMRILFK
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MKASKLIRDKGLQYAKEIVDSAPSNATEWNEGFEFQCGQSVEISKADREKYFVDLSELKRLVESVDLVESWGGIDDVKLYDLSHCKNRPESAGYKLLQAIADYESIYGGGYV
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MSESTLWAVAMRPEGYSPFKQTPAASKEIAERAVERYRKMHEKEGNNFFLEIFDDVIKVQKWHGSRKDHIKNLFYVESWFSEPMYQCFDLKTAERVFKFDEIVICYKKGSAPLVTKSFDEAKLFYGSSETGFKYQIQPIEPPENLFNWFHPDIELFDTIEEGAEAYTREQWAQLQMNLRVEIETQLLDYDEIPNIPEDAVVWPNWKPEPPEQGLFLIAAFDSEDGPVLWWANPKAESKEK
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MQNNLSNQTTERNQPEFLVGDVVVLTKECRTFKSNDLFEVKNKTLTRLWTIKSENHLILVSSKEIRTATVAELNAKRRLTSAEQALAEVS

Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_000647826.1|1042735_1043074_-	hypothetical protein	A0A0P0IKW4	Acinetobacter_phage	1.1e-30	56.3
WP_001003671.1|1043070_1043871_-	hypothetical protein	A0A0P0IDV1	Acinetobacter_phage	2.8e-144	95.5
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WP_000602535.1|1044747_1044972_-	hypothetical protein	A0A0P0I444	Acinetobacter_phage	3.2e-34	97.3
WP_001180660.1|1045043_1045316_-	hypothetical protein	J7I0V3	Acinetobacter_phage	7.2e-36	90.0
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WP_000698529.1|1051511_1052444_+	hypothetical protein	A0A0P0I438	Acinetobacter_phage	2.2e-137	80.0
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WP_000004579.1|1053101_1053824_+	hypothetical protein	A0A0P0HSE1	Acinetobacter_phage	1.7e-55	88.2

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>NZ_CP020578|1271806:1284590|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_031944289.1|1274008_1275052_-	hypothetical protein	A0A2H4J580	uncultured_Caudovirales_phage	4.3e-28	52.8
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WP_000648413.1|1276682_1277105_-	hypothetical protein	A0A0P0I8A5	Acinetobacter_phage	1.0e-76	100.0
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WP_000544506.1|1277222_1277972_-	hypothetical protein	A0A0N7IRF0	Acinetobacter_phage	1.2e-136	98.4
WP_001110396.1|1277964_1278915_-	YdaU family protein	A0A0P0I481	Acinetobacter_phage	2.9e-100	64.2
WP_020752534.1|1278911_1279958_-	site-specific DNA-methyltransferase	A0A1B0VM49	Pseudomonas_phage	4.5e-110	57.9
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WP_000200037.1|1282717_1282903_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000290738.1|1282899_1283100_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000818521.1|1283133_1283508_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000335919.1|1283540_1283774_-	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>NZ_CP020578|3098686:3143184|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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3083717:3083731	attL	NA	NA	NA	NA
WP_000984535.1|3098686_3099592_-|protease	protease HtpX	NA	NA	NA	NA
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WP_000271249.1|3101216_3102122_+|tRNA	tRNA 2-thiocytidine(32) synthetase TtcA	A0A0U2S5Z2	Escherichia_phage	6.2e-92	64.6
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WP_000270080.1|3105041_3105596_-	SgcJ/EcaC family oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
WP_001071463.1|3106179_3110178_+	non-ribosomal peptide synthetase	A0A2K9KZV5	Tupanvirus	3.0e-69	33.3
WP_001090811.1|3110638_3111724_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_002018186.1|3112285_3112966_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_005074137.1|3113645_3114095_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_060853588.1|3114214_3114652_-	regulatory protein GemA	Q6QIE7	Burkholderia_phage	5.0e-23	43.9
WP_001004234.1|3114653_3114878_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_060853589.1|3114874_3115588_-	DUF2786 domain-containing protein	A0A2H4JCP9	uncultured_Caudovirales_phage	5.0e-28	39.2
WP_060853590.1|3115727_3115907_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_060853591.1|3115906_3116179_-	HU family DNA-binding protein	A7KV42	Bacillus_phage	2.2e-21	62.9
WP_060853592.1|3116328_3116943_-	DUF3164 family protein	A0A0M3LQ92	Mannheimia_phage	3.6e-59	54.5
WP_060853593.1|3116935_3117622_-	hypothetical protein	A0A2H4JFV8	uncultured_Caudovirales_phage	5.7e-29	48.8
WP_060853594.1|3117622_3117859_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_017398481.1|3117855_3118074_-	TraR/DksA family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_060853595.1|3118168_3119446_-	AAA family ATPase	Q6QIE1	Burkholderia_phage	7.2e-94	47.0
WP_070419689.1|3119458_3121210_-|integrase,transposase	DDE-type integrase/transposase/recombinase	Q5ZR04	Pseudomonas_phage	4.1e-100	36.1
WP_060853597.1|3121212_3122097_-	DUF3102 domain-containing protein	Q6QID9	Burkholderia_phage	3.1e-27	33.8
WP_001985437.1|3122109_3122406_-	MarR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_162986047.1|3122389_3122557_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000550335.1|3122600_3122807_-	DNA-binding protein	A0A0S4L0D0	Pseudomonas_phage	3.0e-10	54.5
WP_000151899.1|3122907_3123555_+	hypothetical protein	A0A2I7S9A5	Vibrio_phage	6.1e-25	35.5
WP_060853598.1|3123556_3124111_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_004716196.1|3124197_3124698_+	glycoside hydrolase family 108 protein	Q775E1	Bordetella_phage	1.5e-42	54.0
WP_060853599.1|3124694_3125051_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000151293.1|3125047_3125392_+	hypothetical protein	A0A0S4L2V7	Pseudomonas_phage	3.7e-13	37.5
WP_000006949.1|3125388_3125700_+	hypothetical protein	A0A0S4L0A3	Pseudomonas_phage	3.8e-25	52.0
WP_060853600.1|3125708_3126254_+	DUF3486 family protein	Q6QIC2	Burkholderia_phage	1.4e-43	49.7
WP_060853601.1|3126253_3127813_+	hypothetical protein	A0A2H4JF57	uncultured_Caudovirales_phage	4.7e-156	55.5
WP_060853602.1|3127806_3128181_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
3128139:3128153	attR	NA	NA	NA	NA
WP_060853603.1|3128382_3129150_+	DNA adenine methylase	A2I2Y7	Vibrio_virus	1.8e-87	60.9
WP_060853604.1|3129350_3130934_+	DUF935 domain-containing protein	A0A0M5MS00	Ralstonia_phage	1.1e-102	40.5
WP_060853605.1|3130933_3132184_+|head	phage head morphogenesis protein	I6PBD2	Pseudomonas_phage	4.2e-70	36.8
WP_060853606.1|3132180_3132684_+	phage virion morphogenesis protein	B7SDN8	Haemophilus_phage	9.6e-10	32.5
WP_060853607.1|3132772_3133858_+	hypothetical protein	A0A0M5N0Q6	Ralstonia_phage	1.7e-32	32.0
WP_060853608.1|3133854_3134274_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000237123.1|3134277_3135210_+|head	Mu-like prophage major head subunit gpT family protein	A0A2P9JZJ2	Alteromonadaceae_phage	7.8e-90	55.4
WP_005076057.1|3135221_3135650_+	DUF1320 family protein	M4SPQ8	Rhodobacter_phage	1.9e-14	38.5
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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

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Homologous phage analysis in the prophage region

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WP_001164226.1|3439200_3440184_+	xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC	A0A0P0IKN7	Acinetobacter_phage	2.0e-189	100.0
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WP_001982145.1|3441715_3442765_-	anthranilate phosphoribosyltransferase	A0A0N7IRD9	Acinetobacter_phage	9.8e-190	100.0
WP_000281127.1|3443120_3445853_+	TonB-dependent receptor	A0A0P0I887	Acinetobacter_phage	0.0e+00	99.9
WP_000960548.1|3445932_3448632_+	M1 family metallopeptidase	A0A0P0IY26	Acinetobacter_phage	0.0e+00	100.0
WP_000566784.1|3448727_3449303_-	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	3.2e-110	100.0
3449296:3449312	attL	NA	NA	NA	NA
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WP_000877062.1|3449696_3450032_-	hypothetical protein	A0A0P0HSE1	Acinetobacter_phage	3.7e-34	62.4
WP_000004577.1|3450028_3450424_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_038405739.1|3450420_3450828_-	hypothetical protein	A0A0P0I8H3	Acinetobacter_phage	1.3e-12	97.0
WP_000654847.1|3450831_3451077_-	hypothetical protein	A0A0P0IVN4	Acinetobacter_phage	1.5e-40	100.0
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WP_070423392.1|3453284_3453608_-	hypothetical protein	A0A0P0IKP4	Acinetobacter_phage	1.2e-53	95.3
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WP_041172434.1|3453873_3454314_-	hypothetical protein	A0A0D4DBH9	Acinetobacter_phage	1.3e-74	97.9
WP_001129671.1|3454522_3455026_-	hypothetical protein	A0A0P0I896	Acinetobacter_phage	1.2e-65	82.6
WP_000048049.1|3455028_3456030_-	hypothetical protein	A0A0P0IRH5	Acinetobacter_phage	4.2e-182	100.0
WP_000370477.1|3456080_3456296_-	hypothetical protein	A0A0P0I8I5	Acinetobacter_phage	2.5e-31	100.0
WP_001093662.1|3456310_3457075_-	LexA family transcriptional regulator	A0A0P0J076	Acinetobacter_phage	1.6e-144	98.8
WP_000996060.1|3457183_3457435_+	hypothetical protein	A0A0N7IRE1	Acinetobacter_phage	2.4e-38	95.2
WP_000048916.1|3457445_3457766_+	hypothetical protein	A0A0P0HSE9	Acinetobacter_phage	1.2e-42	87.7
WP_002055029.1|3457825_3458116_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_070423390.1|3458112_3459159_+	site-specific DNA-methyltransferase	A0A1B0VM49	Pseudomonas_phage	1.0e-109	57.9
WP_001110399.1|3459155_3460106_+	YdaU family protein	A0A0P0I481	Acinetobacter_phage	1.6e-98	63.3
WP_000544506.1|3460098_3460848_+	hypothetical protein	A0A0N7IRF0	Acinetobacter_phage	1.2e-136	98.4
WP_001031749.1|3460844_3460979_+	putative phage replication protein	A0A0P0IR92	Acinetobacter_phage	1.1e-18	100.0
WP_000648413.1|3460965_3461388_+	hypothetical protein	A0A0P0I8A5	Acinetobacter_phage	1.0e-76	100.0
WP_095357150.1|3461437_3461800_+	hypothetical protein	A0A0N7IRE2	Acinetobacter_phage	3.3e-68	99.2
WP_070423389.1|3461871_3462918_+	site-specific DNA-methyltransferase	A0A1B0VM49	Pseudomonas_phage	8.5e-109	57.6
WP_039257883.1|3462914_3463865_+	YdaU family protein	A0A0P0I481	Acinetobacter_phage	8.5e-100	63.9
WP_070423388.1|3463857_3464607_+	hypothetical protein	A0A0N7IRF0	Acinetobacter_phage	1.4e-134	97.2
WP_000017854.1|3464603_3465011_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_070423387.1|3465007_3465406_+	HNH endonuclease	K7P7B7	Enterobacteria_phage	8.9e-27	49.2
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Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

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MSLIIKARNIRLDYAGRDVLDIDELEIHSYDRIGLVGDNGAGKSSLLKVLNGEIVLAEATLQRFGDFAHISQLGGIEIETVEDRAMLSRLGVSNVQNDTMSGGEETRAKIAAAFSQQVHGILADEPTSHLDLNGIDLLIGQLKAFDGALLVISHDRYFLDMVVDKIWELKDGKITEYWGGYSDYLRQKEEERQHQAVEYELMMKERERLESAVQEKRQQANRLDNKKKGEKSKNSTESAGRLGHAKMTGTKQRKLYQAAKSMEKRLAALEDIQAPEHLRSIRFRQSSALELHNKFPITADGLSLKFGSRTIFDDANFIIPLGAKVAITGSNGTGKTSLLKMISERADGLTISPKAEIGYFTQTGYKFNTHKSVLSFMQEECEYTVAEIRAVLASMGIGANDIQKNLSDLSGGEIIKLLLSKMLLGKYNILLMDEPGNYLDLKSIAALETMMKSYAGTIIFVSHDKQLVDNIADIIYEIKDHKIIKTFERDC
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MKMFLDVPQVYLHKQPVDFRKSINGLSLLVEQEMQLSPFSGALFVFCNQQRTRLKVLYWDSTGFCLWYKRLEKDKFRWPRQMPGKILSISEQQWHWLLQGVDIQKITAHQPLHYQSVG
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MNPFKGRHFQRDIILWAVRWYCKYGISYRELQEMLAERGVNVDHSTIYRWVQRYAPEMEKRLRWYWRNPSDLCPWHMDETYVKVNGRWAYLYRAVDSRGRTVDFYLSSRRNSKAAYRFLGKILNNVKKWQIPRFINTDKAPAYGRALALLKREGRCPSDVEHRQIKYRNNVIECDHGKLKRIINATLGFKSMKTAYATIKGIEVMRALRKGQASAFYYGDPLGEMRLVSRVFEM
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MFPNQLTFYFNYRISGDTSGGLQLFGLIGLIYGPIIFALTMVLLRLYTIEFKDFLERQDNS
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MLTMNVKAMLADFLTFVTPKSMHKARFSVLLDAVTALAKDACCTVTAIGRAMPGSSDKVSIKRADRLLNNPNLQRELPLIYAALTASIVGHKTKPMILVDWSNADTAKRHFILRASIAADGRALTLLQKIAAAEDYTCPHLHGAFLKQLKAMLPKDCKPVIVTDAGFKVPWLKQVRKLGWHYVARVRGNVKLKLAEQDKFISVNQLYRQAKKDPKSVGKIMLAQTQHYETQAVLVGKGYKLLKRDKNKTYKEPWLLVSSLADCHGYADKIAKCYSSRMQIEESFRDQKSHRYGLGSDLHGTKKKSRLEILLLLAALVNWFHYLLGSAAEKAGLHLRYQANTVKNRRVLALNFLGILLCKEPKQRIRRQYYQQGLKQILQWVVQWDWAVIKQADS
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MKGWLFLVIAIVGEVIATSALKSSEGFTKLAPSAVVIIGYGIAFYFLSLVLKSIPVGVAYAVWSGLGVVIITAIAWLLHGQKLDAWGFVGMGLIIAAFLLARSPSWKSLRRPTPW
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MLYVVQGKDNPKLWKNIVSVSELHLINETSLLNNNYTASIRYRSQDTPVKVTQNENGYIFEFSAPQWAPAVGQSLVLFQENECLGGGVISEIH
>NZ_CP020578|3712437:3733624|3725157_3726042_+|WP_000155092.1|DBSCAN-SWA
MTIQDIQSLAEAHGLLLTDKMNFNEMGIDFKVVFALDTKGQQWLLRIPRRDGMREQIKKEKRILELVKKHLSVEVPDWRISSTELVAYPILKDNPVLNLDAETYEIIWNMDKDSPKYITSLAKTLFEIHSIPEKEVRENDLKIMKPSDLRPEIANNLQLVKSEIGISEQLETRYRKWLDNDVLWADFTQFIHGDLYAGHVLASKDGAVSGVIDWSTAHIDDPAIDFAGHVTLFGEESLKTLIIEYEKLGGKVWNKLYEQTLERAAASPLMYGLFALETQNESLIVGAKAQLGVI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_001067858.1|3712437_3713142_+|transposase	IS6-like element IS26 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.2e-138	99.6
WP_014454105.1|3713737_3714292_+	aminoglycoside N-acetyltransferase AAC(6')-Ib'	NA	NA	NA	NA
WP_002075262.1|3714384_3715017_+	type B-3 chloramphenicol O-acetyltransferase CatB8	A0A2R8FE91	Brazilian_cedratvirus	3.5e-25	40.1
WP_001206316.1|3715074_3715866_+	ANT(3'')-Ia family aminoglycoside nucleotidyltransferase AadA1	NA	NA	NA	NA
WP_000679427.1|3716029_3716377_+	quaternary ammonium compound efflux SMR transporter QacE delta 1	NA	NA	NA	NA
WP_000259031.1|3716370_3717210_+	sulfonamide-resistant dihydropteroate synthase Sul1	NA	NA	NA	NA
WP_000050481.1|3717614_3719156_+|transposase	IS91 family transposase	NA	NA	NA	NA
WP_000359986.1|3720554_3721328_+	ArmA family 16S rRNA (guanine(1405)-N(7))-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
WP_077252464.1|3721308_3721590_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_002026779.1|3721809_3721995_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_002001451.1|3722043_3723228_+|transposase	IS4-like element ISEc29 family transposase	A0A0F7LAS3	uncultured_marine_virus	4.5e-50	35.4
WP_000052512.1|3723626_3725102_+	ABC-F type ribosomal protection protein Msr(E)	A0A1B0RXA0	Streptococcus_phage	2.3e-160	59.0
WP_000155092.1|3725157_3726042_+	Mph(E) family macrolide 2'-phosphotransferase	NA	NA	NA	NA
WP_000753551.1|3726685_3728245_-|transposase	IS66-like element ISAba24 family transposase	S5VTD3	Leptospira_phage	4.0e-70	34.2
WP_000781558.1|3728337_3728694_-	IS66 family insertion sequence element accessory protein TnpB	S5VXZ8	Leptospira_phage	1.6e-22	45.9
WP_000555098.1|3728696_3728981_-	IS66 family insertion sequence hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_001067858.1|3730256_3730961_+|transposase	IS6-like element IS26 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.2e-138	99.6
WP_001151708.1|3731857_3732424_-	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
WP_001067858.1|3732919_3733624_-|transposase	IS6-like element IS26 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.2e-138	99.6

2. NZ_CP020577

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	40384 : 47971	9	Leptospira_phage(14.29%)	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP020577|40384:47971|DBSCAN-SWA
TTTAAATAAGGTCTTGTTGATTTAAAATAACTTGCATACGAGAGTCTTCAACATTAGAAGATGGAACAAATACATGTAATTGCGCCATAGAATCTAAAATAGTCGCCAACTCATTAACTAGTACTGGATATTGAATTAAGCTTTTCCACGAAAACAAATTAGCTGTATTTTCATCATTAAAGCTTCTTAAAAAGCCACAAGCTACTGATACTAAGTCTTCATCTTCGCTTTCTGTTAAATCTAAAATACTGACGTAACTTTCCAAAATACCATTAAAATAAGCTGTCTCAAGCTCTGAAAATGCCTTTTCATTTGCTTGTTTTACAATCTCTTTTGTTTGCTTTTGAGTAGTAGTCGTAAAAGATTTTTCATCTTTCACTGCTTCAGTATTTTCAACCGATTCTTGAACTTTTGCAGGTTGCTGTAAAGTCTCTTTAGTTTCGGTAATGAGCTCTTGAGTATTGTCCACTTTACTATCTTCATCTTTTTCACCAGCCTTTGGCGAATTCTGAAGTTCTAAAGATGACTGTGTTACCTCTGAAGTGCTTGAGGTAATAATTTCACCCTTCAGCTCTTTAGACCATACACGGGCTAATTTTGATGAAATAGCACCTTCATGATCTGCTACTAACGCTTTTACTTCTTCTGGATACTCAGCTAATAAGTTTTTAATGATCGTGCCAGTTTCAGCATCATTTACCATTTTATTAGCCATAAGGCTTTTTAGATAATCATCTGATTCAAGCAATTGTAATCTTCGAGAAACCCATGTCTTTGACTTATTAATTTCATTAGCTAAATCGTCATAACTATACTTTGGATTCTCTGCCACGCCTTCTTCTAGCATCAATTTTAAATTCGTAGCAACTTCAAGCAAACTCATGTCTTTTCTAAATAAGTTTTCTGACATTTTTACTCGGCGTGAACCAAGTTTGTTATCAATCGTTGCTTCGATAGTATCCAAGTTCAAATGTTTATGAGCTAAATAACGATAATGGCCCATATTAATAATATATTCACCAGGATTATCAGAATCGGCTCTAACTGAAATAGGCTGAAGTAAACCATCTCTCAAAATAGTATTTGCCAGTTCTTTTACATAATCTTGATCATATTCAAGACGTACATTCTGAGGATCCAACTTAACCCGATTAAGCGGCAATTTTAGAATTGTGCGGTCAGAGTTATTGTTAGCATTTAAGTTTGCTGAAGTTAATGAGCTATCAACAGCGTTTAAATCACCTAATAAAGAAGACATAGCTTAAACCCCCATTTTCTCTAAAACTAATTGATTAATTTTTTTGATTTTTCGCCCTACATCTTTTGCTGACGTTTTATCAATTTTCCATACTGGAACTTGTTGTTCACTTGCATCAGCAATTGCAGATCGATTAGGTATGAAAGCAGTCTTATCAAGCATTAAATGACTCAGTTGTTTCTGCAATTCATTTAAAGTTGTTTTTTGAGTAACAGAGTTAGCACTAACCATATTTGGAAGCAGCCCTAGAAACTGAATTTTTGGGTTTACTTCTTTAATTTCTTGTGTGGTATCAATAATACCTCTTAGCCCTAGAATTGAATATTTATCCAATAAAAAAGGAGATAGAGCAAATTCAGAAACTAACAAAGGTAATCGCTGAAACGGGCCGTCTGTAGGAGGTGTATCAAAAATACAGATATCAAAAAATTCGTTAGCCTTAGCAATATTTGATTTGAAATTACGTTGGTATTCTTCAACTTTATCTAGCTTAAACTCTTGTTCTGTAGGATCAAAAAGTGATTTTAAACTCTTATTACCTTTAAAAAGAACAAAATATTTATCTAAAGTTTCAAAGTTTTGGATATCCGTAAATAGACTATGGGTATCTTTAATCTCAACCGCAACTTTACTAAGTGAGAAACCACTATTACCTTGTTTATCCATGTCTACAAATAGAACACGCATACCGCGCTCATAACAGTAATGTGCCAAATGAACAGCAACAGAGGTTTTGCCAATCCCACCCTTTTCGTTAGTGATTACGATTTTTTTCATTGTTCTTTACTCCAAGCATTTCTGCTCAATTTTGAAATCAGCCTATCCGATTTCTGAATAAATTATACTACTAAAACATACTTTTTTGCAAGAAAAAGATTAAATTTTATAGCGCCAATTTGTCTTAAATAGGTTGTTGCGGATCCGCAACAACCTAAGCTTGTGTAAGTTACATCTATGCATATAAAAAAATCAATCATTAATTAAAATGAAATTAGGCACATAATCTTCAGCTTTATGTACAATTTCCTTTAATTTTTGACTATGCAATTTTATGTCCCACCCTTTTACGTAATACATTAAGCTACACCAGCATTCACGATACTTTAACTTGAGGGTATCACCAACAAAAATACGGCAAGGCACTGCCCACAAACTTAGTTGTATATAACACATTAAAGCAACGTTTCTATCAATGTCTGCTGCCTCAATATACAAGTGATCTTGCACTTGTATCTTAGATTCCAAACAGAGTTTTACAGTTGAAAGTAAAGTTGAGCCAGCTCCACAAGCTGGATCGGAAATCGAAATCACCCCCTCTTCCTCAAGTTGTTTTTTAAGGTCGGTCATTACAACTTGAGCACATAAATTTGATACCTCACTTGGTGTAAAATATTGGCCGATATGATCATTCCCAATTTCTAATTCCATGTAAATGCTACCTAACACATCATATGGCTCACCCTTTGCTTCGCATAAATCCACCAACAGATAAAACAATTTTTTTATTTTTAAACGTCCACTAACGTCGTAACGATTGATACGTTGAAGATATTCATTTTCAATATTGTGGTTAAACAAATTTTGATATCTATGACCAATTGAGTTTCTTAATGCTGCTGCTGAACAAAAAACAAAGTCATGAAATATTTCATAAATGTTTTTAGATTGGTCGATACTTTTTAAGGTATGTATAAACTCACTTTTCAAAACACTATAAGTTTTACCAATGTTAACTTTTGAATTCACTTTTTTCTCCGCAAGCTCTTCAGCTCAATCAATTAATAGTTTTCAATGTATTGAATTGTATAAAACCATTTAAACCGGCTTTACGAAAAGTTTCTAAGACTTTGAAATACATTAATTGGAAATTAAGAGACTCATCTGCTGTTTTAGTGAATTCTCCCAAGTGGTCAGGTCTGAATAATATATCTGCGTTATTATTAAACCAGGTCAAACATTCAAAAATGAAGTCACCATAGAACTCATATGTTTCTTGAATAGCGGTTAAGAAAGGACAAGGAATACCAATCAATTCTTCAAGAACTTTTAATGTTGAAATAAACTTATTAAATGACTCTTTTGTACTTAATGTATAAACATTAAAGTCCTTACAATCATACATAGTAGTAGATAAGGCAACTAAGCCAGTATTGTATTCAAAAGATGGCTTCATAATATCAATATGGCCAACAGCACATGCACAATGTGATGGAGTCTTTAAACGACCAATTTTTAAATCAGTTATGATTAATACATTAAAATAATTATTCATTTTTTCACCATAAGCTTTTCAGCTCAAAATACGAAATCAGCCTATCCGATTTCTAACCAAAATTGTAATACAATGATGTATTTTAATCAAGATCTTTAAACGTTAATATTGTTAAAAAACATTAATTTAATGAAATATATTTTCGAATTAAACATTACTAACAGAGCAACGTGTCCACGTTGCGAACTGAAGGAATTTGCGAGCATCTCCCTACTTGATTACCGTTTCAAACTTCGAGCGAGTCAGTCAAAATCTGTGATTTTGACTAGACGACCGAAGAAGTGAAACTTCTCCCATTGGAGCTTATCCGGGAGTAACAAAGCAATCCCGCAGGGTTGCGCTTCTAAATTGCGAATCTAATTGATTTTAGGTTCATCCACTCTAGTTAATTAATGGAACTGACAGCATTTTTTAATATTCTAGTGTGTTAGGGATAGATATACTTACCTACACCTACTTTAAAAATCACATAACACATGTCTAAGCTACATTCGCTTGGTTAAACATATTTAAGATATCAATTGCTGAAGTATTTTGACGAAAAAAAACTCTATCAGGCCTGCCTGGTTGATTGTTAGTTTGCCCGTGGATCCTTTCCATTCGTAAATGAAACTCTAAAGCAAACGGATTTGATTCAAGCTGCTTCAATAATTTTGGAAATGATTTCTCAAAACACATATTACAATTTCCATCCCATTCATTTAGCTCTAGATCAAACGCTTGCTTTGACCACCAATCTAATATGAATTGCTTATCCACTGGATGTTCTGTGACTAATGGATAAATAAAGTTATTTGCTTCTGCATCCTTAGCACAACGTTTAGATTCATCAGCCCGGATACCGATTGCAGTAGGGATATCTTTAGGTTTCATCCCAATACTACGAATATATGAATCCATTGGTCTTATTTTTAATTCACGGGTGCAATGCTTATAAACTTTATTAGGAATTCCGTATTTCTCAATCATCTGTTCAAAAAGTACTGGCCCCCTGGTAGCTGTCTTAAAATTGACAACTTTATGCGTCGTACCTACTCTTTTTTTAGGGTGAATAACTGCTTCTAACCAAACTGTATTGAAATTAAAATATTTATCACATTTATCGACAAACTCTAAAGTTTTCTCATGCTCAATGCCTGTATTTGCAAATGTGACTATAAAGTTATAAAGGTGGCTATAGTTATTAAGCAAGTACCAGGTTAAATATGCTGAAGTACGTCCACCACTAAAGCTAATTTGATAATATGATTTCATTAATTTCACCTTAAGCATTTCTGCTCGAATCTCAATTGTTTTAGCCTTTTATAATTTTTAATCTGAACCGCATCCCTCTTTATTAAAGGCCCCCATAGGTAGCTCCCAGTTTTTTGTAAATATAGGCAAGGTATATTCTTTTCTCATTGCCTGATCCAAAGCTACTAAATCATTGATATTAAAAGGCTGAATACCCTCACTTATATTTATGACATTGATTTTTTTTCGACTAATTGTAGTTGCAAATTGTTCTTCGTATTTAAAAATTCGATCAATACGATTGGGAAAATAATGTTTGATGGTTGCCCAAACTTTCGGGCTATTATAGATACAAGTCATACAGCTTGATCTCGACCATCCTAAGCGATATGGTACTGGCGCTGCGACATTATGACGCTCTAAAATTTCCCACACTTGACGTTCTGTAAAATCAAGAACTGGTCGATATGCATCAATTAGACGACCTTTTTTCCCATTACGATTATCACAAAAATGTGTTTCTAATTGGAAGTATTTTGCTCGATTAGGACTTTCTTCTCGACGCTCTCCAGTAACAAATAAAACTTTAGAGTTATTAAAACGCTCCTGGTTTGATAAAGCTCTACGCCCTACCTCGATCTTCAGAGCTGAAGAACACCATCTAATACGGAGATCTGCTGATTGTTGAGGAAACCGCAATCTCGTTCCAGCTTTTGCTCGTTTTCTTGGAATAATGATATTCCCACTCGGTGTTTCAATCTCATATTCATGGCTTATGGAATTATTTTTTAGCATCTCCCCCTCGAAGCCATGCATTAACCAGCTATTATAAATTGGTAAATTAAATGCTTTGGCAAGCTGTTTGTTGTAGCTATCCATAAACAGCCAATCCATAAACGGCTCACTCTTACCGTCAACAAGGTTATGCCACAATTCAACCTTTGACATGTCCACGCCTTTCTCTATTAAATAGAGCAAAGAAGCAATACTATCTTTTCCGCCACTCATACTGACGATAATTAAATCATAAATATCTAAATCTATTTCTGAGACAGAGAACAACTTACCTTCAGATGCAAGTGCCTGTCCTATAGCATTTTTTAATACATTAGGAATAACATTCACATCATCATGTCTATCAAGCTCTTTATATAAAGCATTATTTTTCATTCAATTCACCTTAAGCTTTTCAGCTCATATATAGAAACCAGCCTACCCGATTTCACCCCTCAATTATACTACATTTTCATGTCTTTTTATTAAGAAAAAACATATATTTAGTGTAATTTTTCGTTTTATAAAATACTTTTGCAGAGCAACGTGTCCACGTTGCGAACTGATGAAATTTGCGAGCATCCCCCTCCTTGATTACCGTTTCAAACTTCGAGCGAGTCAGTCAAAATCTGTGATTTTGACTAGACGACCGAAGAAGTGAAACTTCTCCCATTGGACCTTATCCGGTAATAACAAAGCAATCCCGCAGGGTTGCGACAAATAGCCCTCTAAATCGCTCTATTTGCTCCTAGATTCAATTTTATAGAAACAAGGTAGCCTAACTACCAAAGAAATAAAACATGGCTAGAATTAACAAATATGATCAAAAACAAAATTAAACTTGTAATATTTTTTGTATATAAATTAAATAAATCACATATAATAAATTACTGAAAGGAGGATTTGTTATGGGATCTACAGTACGTCTCCGGGATCCAACAGCTCAACTTGTTATGGATACCGCATTAGATATGCAACAAGAGCAACGTCAAATGGTTAAAACTTCAGATATTGTTGAAACATTGGTTCAAAGATATATAAAGACAATTAGCTTTGAAGATGTTCAACAAACTATTGAAAATCGCAAAAAGAATAAAAAAAATAAGGACAAATAGAAAACCTATTTGCCCTTATAAATTGTGTCAAACTCTGTCAACCAATCAAGCCTGTTAAAACCGGCTTCAACTTCATTGCCTCTTACATCTGCAATATAAAATTTCTTCTTACCATCTTTAAGAAACCATCCAGCTAATATATTTACATAATTACTCTTACAGTTCAGAACTCTCATGTAAGCATCCGGTGCAGCAGGATGAGCTGGATCAACATGCTCAAGTTGAGGATCAACGTTACTCATTCAATCAACTCAAGAAAATCTTTTTCGTTTCATTAGGATCAATAGCATGATGTAAGTTCACCTTACTCCCGTCCGAATACCCTTTTACTCGTGCTTGATTAAGCATATCTTTATTATAATGTTTAACACTTTTAACTTCGCAATATATAAGATTAAGAGTTTTCTCATATTCGCTCAGTTTTTCCTTTAGCTCTTTATCTGGATTTAAGTTCCTACACTTTTTTTCAACTCCAAGAATCCACCCTCTATGATAGCTTATGCCTAAACGTCTCTTAGATTTAAGTTTAGTATTTCCATGTAAAGTGGCTAAATAACTTTGTTTATTTTTAATCAAAATAGGGAGTAAAACAGTATATGCATATGTTGCAATAGACACATTTGGTTCAACTCCATAAAAAACATGTTGTTGATATTTCACACCTTCTAAAGTGTAAAAACCTGAGTAACTTCCGCATTCAAAGACATTTGCGATCATTACTTTAAGCCGTCTTTCAATATCTTTAGTTCTTTGAGTTTTTGTCTGAATAATTCGCTCTTTAATATCACTAATTAGTATCTGTTTTTCACTTATTTTGTACTTCTGCATCAATGTCTGTGCTTGCTTAAGTGCAACGGCTGCTTCATGCTCATTGGCACTTTTTGATAATGCTAGGCACTTACTAATTTTATCTATGATAGTTTGCATATCTTCCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

>NZ_CP020577|40384:47971|47040_47277_-|WP_000072937.1|DBSCAN-SWA
MSNVDPQLEHVDPAHPAAPDAYMRVLNCKSNYVNILAGWFLKDGKKKFYIADVRGNEVEAGFNRLDWLTEFDTIYKGK
>NZ_CP020577|40384:47971|43415_43913_-|WP_001067229.1|DBSCAN-SWA
MNNYFNVLIITDLKIGRLKTPSHCACAVGHIDIMKPSFEYNTGLVALSTTMYDCKDFNVYTLSTKESFNKFISTLKVLEELIGIPCPFLTAIQETYEFYGDFIFECLTWFNNNADILFRPDHLGEFTKTADESLNFQLMYFKVLETFRKAGLNGFIQFNTLKTIN
>NZ_CP020577|40384:47971|42610_43387_-|WP_001086346.1|DBSCAN-SWA
MNSKVNIGKTYSVLKSEFIHTLKSIDQSKNIYEIFHDFVFCSAAALRNSIGHRYQNLFNHNIENEYLQRINRYDVSGRLKIKKLFYLLVDLCEAKGEPYDVLGSIYMELEIGNDHIGQYFTPSEVSNLCAQVVMTDLKKQLEEEGVISISDPACGAGSTLLSTVKLCLESKIQVQDHLYIEAADIDRNVALMCYIQLSLWAVPCRIFVGDTLKLKYRECWCSLMYYVKGWDIKLHSQKLKEIVHKAEDYVPNFILIND
>NZ_CP020577|40384:47971|40384_41641_-|WP_000096599.1|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
WP_000096599.1|40384_41641_-	ParB/RepB/Spo0J family partition protein	S5VSZ7	Leptospira_phage	7.2e-06	28.2
WP_000724906.1|41644_42418_-	ParA family protein	A0A1X9I765	Streptococcus_phage	4.8e-08	24.5
WP_001086346.1|42610_43387_-	SAM-dependent DNA methyltransferase	A0A2K9V411	Faecalibacterium_phage	7.6e-22	34.3
WP_001067229.1|43415_43913_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000844619.1|44393_45167_-	hypothetical protein	A0A2K9VK66	Klebsiella_phage	1.3e-53	44.5
WP_000794252.1|45224_46316_-	phosphoadenosine phosphosulfate reductase family protein	H7BVI4	unidentified_phage	1.1e-15	32.2
WP_065285204.1|46828_47035_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
WP_000072937.1|47040_47277_-	hypothetical protein	A0A2H4J8L3	uncultured_Caudovirales_phage	2.2e-09	43.1
WP_000389917.1|47281_47971_-	DUF2786 domain-containing protein	A0A2P9JZH4	Alteromonadaceae_phage	3.4e-13	30.9